INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 884 890 1774 403.547385505134 483.713605090985 -80.166219585851 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000149559341184915 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 986187 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_986106_986217:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_986106_986217:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_986106_986217:AGRN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 990280 C/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_990204_991496:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_990204_991492:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000461111:exon_990204_991492:AGRN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 1390875 C/T 0 16 0 16 7.304025077016 0 7.304025077016 C C 10 0.5434984326865 6.15228590326619e-05 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1390840_1390899:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000475091:exon_1390840_1390899:ATAD3C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 1684472 C/T 1 54 21 75 24.651084634929 11.4134670864165 13.2376175485125 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0023679689678132 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1682671_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1682678_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1683910_1684499:NADK;ENSG00000008130:ENST00000498806:exon_1684414_1684499:NADK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 3703710 G/A 1 23 20 43 10.4995360482105 10.86996865373 -0.3704326055195 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 3761479 C/T 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 6704635 A/G 1 13 5 18 5.9345203750755 2.7174921634325 3.217028211643 A:G A G 10 0.5434984326865 0.157947399738030 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6704618_6704734:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6704618_6704734:DNAJC11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 84 76 160 38.346131654334 41.305880884174 -2.95974922984 T:C C T 10 0.5434984326865 0.635164598547427 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 10473200 G/A 1 83 76 159 37.8896300870205 41.305880884174 -3.4162507971535 A:G G A 10 0.5434984326865 0.633046753686226 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 10521649 C/T 1 49 26 75 22.3685767983615 14.130959249849 8.2376175485125 T:C C T 10 0.5434984326865 0.063393424617154 ENSG00000160049:ENST00000377038:exon_10516579_10521759:DFFA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 11159799 C/G 1 9 5 14 4.1085141058215 2.7174921634325 1.391021942389 C:G C G 10 0.5434984326865 0.594459609035139 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 14105049 C/T 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14104913_14105152:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000407521:exon_14104913_14105127:PRDM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 16 13 29 7.304025077016 7.0654796249245 0.2385454520915 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 9 12 21 4.1085141058215 6.521981192238 -2.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.381551703468518 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 11 13 24 5.0215172404485 7.0654796249245 -2.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 0.419840167312213 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 28 19 47 12.782043884778 10.3264702210435 2.4555736637345 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.558664837303248 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 38 53 91 17.347059557913 28.8054169323845 -11.4583573744715 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0201121754991817 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 19415439 C/T 1 29 29 58 13.2385454520915 15.7614545479085 -2.522909095817 T:C C T 10 0.5434984326865 0.513024466361985 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 19433449 A/G 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19433331_19433460:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000494503:exon_19433331_19433460:UBR4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 61 74 135 27.8465956061235 40.218884018801 -12.3722884126775 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0377914413861355 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 118 119 237 53.867184942993 64.6763134896935 -10.8091285467005 A:G G A 10 0.5434984326865 0.170882793034580 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 20829761 A/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:C A C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000090432:ENST00000264198:exon_20829715_20829802:MUL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 20982631 G/A 1 107 99 206 48.8456677025445 53.8063448359635 -4.960677133419 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.529153387894388 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20982594_20982680:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20982594_20982680:DDOST HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 8 12 20 3.652012538508 6.521981192238 -2.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.261780206050886 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 52 49 101 23.738081500302 26.6314232016385 -2.8933417013365 T:C C T 10 0.5434984326865 0.617732829998661 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 19 10 29 8.6735297789565 5.434984326865 3.2385454520915 T:C T C 10 0.5434984326865 0.265790726273256 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 5 13 18 2.2825078365675 7.0654796249245 -4.782971788357 A:T A T 10 0.5434984326865 0.0313510638317915 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 15 17 32 6.8475235097025 9.2394733556705 -2.391949845968 T:C C T 10 0.5434984326865 0.478550518683793 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 26873700 C/T 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000524436:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000529454:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000366866:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530607:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26873680_26873761:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000525582:exon_26873680_26874081:RPS6KA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 27677295 C/T 1 14 23 37 6.391021942389 12.5004639517895 -6.1094420094005 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0481662574977484 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27675889_27678549:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27675889_27677827:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000496001:exon_27677285_27677443:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000485269:exon_27677285_27677443:SYTL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 29475181 C/T 1 147 134 281 67.1057303950845 72.828789979991 -5.72305958490649 T:C C T 10 0.5434984326865 0.510328383592722 ENSG00000116350:ENST00000373795:exon_29474255_29475738:SRSF4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 157 181 338 71.6707460682195 98.3732163162565 -26.702470248037 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00377122098509286 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 31769560 C/G 1 23 29 52 10.4995360482105 15.7614545479085 -5.261918499698 C:G C G 10 0.5434984326865 0.164070604265400 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31769458_31769617:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000446633:exon_31769458_31769620:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000463988:exon_31769458_31769629:SNRNP40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 68 84 152 31.042106577318 45.653868345666 -14.611761768348 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0182013362844220 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 33409693 G/A 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000116514:ENST00000373456:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000401899:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000356990:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000405457:exon_33409620_33409760:RNF19B;ENSG00000116514:ENST00000235150:exon_33409620_33409760:RNF19B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 30 31 61 13.695047019405 16.8484514132815 -3.1534043938765 T:C C T 10 0.5434984326865 0.442319883642751 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 29 27 56 13.2385454520915 14.6744576825355 -1.435912230444 A:G G A 10 0.5434984326865 0.788771962979182 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 37948912 C/T 1 16 8 24 7.304025077016 4.347987461492 2.956037615524 T:C C T 10 0.5434984326865 0.305762550366789 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948338_37949978:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948338_37949817:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 37 30 67 16.8905579905995 16.304952980595 0.5856050100045 T:G G T 10 0.5434984326865 0.903118424542717 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 38338795 A/G 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 38463504 C/T 1 18 16 34 8.217028211643 8.695974922984 -0.478946711340999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.865422613408382 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000485803:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000475084:exon_38463356_38463542:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38463356_38463542:FHL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 39797055 A/G 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 40349131 G/A 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40348990_40349177:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40348990_40349145:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000462797:exon_40348990_40349176:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40348990_40349178:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40348990_40349183:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40348990_40349152:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40348990_40349153:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40348990_40349147:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000489945:exon_40348990_40349168:TRIT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 40557033 A/G 1 19 16 35 8.6735297789565 8.695974922984 -0.0224451440275004 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000131238:ENST00000433473:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372783:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372776:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000529905:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000530704:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000439754:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527311:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000372779:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000527107:exon_40557001_40557071:PPT1;ENSG00000131238:ENST00000526547:exon_40557001_40557071:PPT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 40773123 G/C 1 7 10 17 3.1955109711945 5.434984326865 -2.2394733556705 C:G G C 10 0.5434984326865 0.333330524865813 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 40961738 A/G 1 27 26 53 12.3255423174645 14.130959249849 -1.8054169323845 A:G A G 10 0.5434984326865 0.67979002099681 ENSG00000187815:ENST00000372706:exon_40960593_40962015:ZNF642;ENSG00000187815:ENST00000372705:exon_40960593_40961960:ZNF642 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 40980731 G/T 1 5 12 17 2.2825078365675 6.521981192238 -4.2394733556705 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0502092065252103 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 41454328 A/G 1 29 22 51 13.2385454520915 11.956965519103 1.2815799329885 A:G A G 10 0.5434984326865 0.77951346187152 ENSG00000171793:ENST00000372621:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000479480:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000372616:exon_41454266_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000480420:exon_41454169_41454382:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000484267:exon_41454220_41454382:CTPS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 41976320 G/A 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 43215930 C/T 1 9 15 24 4.1085141058215 8.1524764902975 -4.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 0.10502586566013 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 13 17 30 5.9345203750755 9.2394733556705 -3.304952980595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.272133535840955 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 13 9 22 5.9345203750755 4.8914858941785 1.043034480897 A:G G A 10 0.5434984326865 0.676458559400952 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 71 80 151 32.4116112792585 43.47987461492 -11.0682633356615 A:G A G 10 0.5434984326865 0.072675535180279 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 46743900 C/T 1 32 32 64 14.608050154032 17.391949845968 -2.783899691936 T:C C T 10 0.5434984326865 0.531136816561465 ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46743744_46744145:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46743744_46744144:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000488942:exon_46743744_46744111:RAD54L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 46746164 C/T 1 29 29 58 13.2385454520915 15.7614545479085 -2.522909095817 T:C C T 10 0.5434984326865 0.513024466361985 ENSG00000132128:ENST00000496156:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46746068_46746232:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46746068_46746232:LRRC41 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 16 7 23 7.304025077016 3.8044890288055 3.4995360482105 A:G A G 10 0.5434984326865 0.20824371770393 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 48 52 100 21.912075231048 28.261918499698 -6.34984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.228337146359866 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 51826853 T/C 1 23 15 38 10.4995360482105 8.1524764902975 2.347059557913 T:C T C 10 0.5434984326865 0.516156273672487 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 52266242 G/A 1 79 69 148 36.0636238177665 37.5013918553685 -1.43776803760201 A:G G A 10 0.5434984326865 0.868994820544036 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 52290984 T/G 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 T:C:G T G 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000473805:exon_52290959_52291054:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000475715:exon_52290969_52291054:NRD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 52822726 T/C 0 13 0 13 5.9345203750755 0 5.9345203750755 T T 10 0.5434984326865 0.00039844821904971 ENSG00000154222:ENST00000441197:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371586:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000491136:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000284376:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438021:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000460261:exon_52822673_52822846:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000371573:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000450942:exon_52822673_52822798:CC2D1B;ENSG00000154222:ENST00000438831:exon_52822673_52822798:CC2D1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 52859391 G/A 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 A:G G A 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000085840:ENST00000371568:exon_52859115_52859475:ORC1;ENSG00000085840:ENST00000371566:exon_52859115_52859475:ORC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 53676401 T/G 1 16 21 37 7.304025077016 11.4134670864165 -4.1094420094005 T:G T G 10 0.5434984326865 0.189336795814197 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 159 162 321 72.5837492028465 88.046746095213 -15.4629968923665 C:G G C 10 0.5434984326865 0.092643720472669 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 462 423 885 210.903724098837 229.899837026389 -18.9961129275525 C:G C G 10 0.5434984326865 0.199977568799115 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 54683925 G/A 1 178 181 359 81.257278981803 98.3732163162565 -17.1159373344535 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0717471553178914 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 12 15 27 5.478018807762 8.1524764902975 -2.6744576825355 A:G A G 10 0.5434984326865 0.337308055174249 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 55538462 C/T 1 4 8 12 1.826006269254 4.347987461492 -2.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.159074080491796 ENSG00000162402:ENST00000294383:exon_55538459_55538534:USP24;ENSG00000162402:ENST00000407756:exon_55538459_55538534:USP24;ENSG00000162402:ENST00000484447:exon_55538459_55538534:USP24;ENSG00000162402:ENST00000480962:exon_55538459_55538665:USP24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 55541174 A/G 1 11 18 29 5.0215172404485 9.782971788357 -4.7614545479085 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0929389738857532 ENSG00000162402:ENST00000294383:exon_55541130_55541196:USP24;ENSG00000162402:ENST00000407756:exon_55541130_55541196:USP24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 62579907 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 80 57 137 36.52012538508 30.9794106631305 5.5407147219495 T:G G T 10 0.5434984326865 0.347215735639784 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 75172652 T/C 1 80 36 116 36.52012538508 19.565943576714 16.954181808366 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00147684099485937 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75172583_75174511:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75172583_75172678:CRYZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 18 49 67 8.217028211643 26.6314232016385 -18.4143949899955 T:C T C 10 0.5434984326865 6.44310116582413e-06 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 50 53 103 22.825078365675 28.8054169323845 -5.9803385667095 A:G A G 10 0.5434984326865 0.237358150099796 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 117 71 188 53.4106833756795 38.5883887207415 14.822294654938 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0335106548825905 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 16 7 23 7.304025077016 3.8044890288055 3.4995360482105 C:G G C 10 0.5434984326865 0.20824371770393 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 79093818 A/G 1 19 56 75 8.6735297789565 30.435912230444 -21.7623824514875 A:G A G 10 0.5434984326865 5.49363402471497e-07 ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 79093910 G/A 1 22 55 77 10.043034480897 29.8924137977575 -19.8493793168605 A:G G A 10 0.5434984326865 5.60990779939844e-06 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 86822231 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86822196_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86822145_86822285:ODF2L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 A:G G A 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 39 36 75 17.8035611252265 19.565943576714 -1.7623824514875 T:C T C 10 0.5434984326865 0.728561513710981 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 23 16 39 10.4995360482105 8.695974922984 1.8035611252265 C:G G C 10 0.5434984326865 0.631200662445808 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 89582702 A/G 1 17 25 42 7.7605266443295 13.5874608171625 -5.826934172833 A:G A G 10 0.5434984326865 0.087634018130078 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 34 34 68 15.521053288659 18.478946711341 -2.957893422682 A:G G A 10 0.5434984326865 0.5430648649755 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 17 15 32 7.7605266443295 8.1524764902975 -0.391949845968 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 15 10 25 6.8475235097025 5.434984326865 1.4125391828375 C:G C G 10 0.5434984326865 0.689279097352172 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 93730416 G/A 1 20 15 35 9.13003134627 8.1524764902975 0.9775548559725 A:G G A 10 0.5434984326865 0.865611401459939 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93730258_93730504:CCDC18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 93826178 A/T 1 40 39 79 18.26006269254 21.1964388747735 -2.9363761822335 A:T A T 10 0.5434984326865 0.572564478160094 ENSG00000117505:ENST00000370272:exon_93826050_93828149:DR1;ENSG00000117505:ENST00000370267:exon_93826050_93826725:DR1;ENSG00000117505:ENST00000481583:exon_93826050_93826492:DR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 101704532 G/T 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:G G T 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000170989:ENST00000305352:exon_101704378_101707074:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000424264:exon_101704378_101705491:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475821:exon_101704378_101705075:S1PR1;ENSG00000170989:ENST00000475289:exon_101704378_101704720:S1PR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 109325118 G/A 1 15 6 21 6.8475235097025 3.260990596119 3.5865329135835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.129736652144383 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109325044_109325139:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000495245:exon_109324483_109325139:STXBP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 24 18 42 10.956037615524 9.782971788357 1.173065827167 T:C C T 10 0.5434984326865 0.758665547909227 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 110466338 C/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:C C A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 622 519 1141 283.943974868997 282.075686564294 1.86828830470347 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.928970408094337 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 C:G C G 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 111957311 G/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 C:G G C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 111957693 A/G 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 112269872 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 112308895 A/C 1 20 10 30 9.13003134627 5.434984326865 3.695047019405 A:C A C 10 0.5434984326865 0.201922119852062 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 113456546 A/T 1 27 30 57 12.3255423174645 16.304952980595 -3.9794106631305 A:T A T 10 0.5434984326865 0.291504686242550 ENSG00000155380:ENST00000369626:exon_113454469_113456787:SLC16A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 117568200 G/A 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000134256:ENST00000256652:exon_117568131_117568526:CD101;ENSG00000134256:ENST00000437666:exon_117568131_117568526:CD101;ENSG00000134256:ENST00000369470:exon_117568131_117568526:CD101 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 17 11 28 7.7605266443295 5.9784827595515 1.782043884778 A:G A G 10 0.5434984326865 0.571892262439823 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 8 11 19 3.652012538508 5.9784827595515 -2.3264702210435 T:C C T 10 0.5434984326865 0.358365878943715 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 52 52 0 28.261918499698 -28.261918499698 C T C 10 0.5434984326865 1.95433132427007e-18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 46 46 0 25.000927903579 -25.000927903579 T G T 10 0.5434984326865 2.15945697382071e-16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 47 47 0 25.5444263362655 -25.5444263362655 A C A 10 0.5434984326865 9.8579549309522e-17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 79 0 79 36.0636238177665 0 36.0636238177665 G G 10 0.5434984326865 1.37611747463026e-21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 61 61 0 33.1534043938765 -33.1534043938765 C T C 10 0.5434984326865 1.68259134055016e-21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 62 62 0 33.696902826563 -33.696902826563 T C T 10 0.5434984326865 7.68105584109263e-22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 146714427 G/C 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146714291_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000488864:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146714334_146714480:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000492728:exon_146714396_146714480:CHD1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 146736176 C/G 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 C:G C G 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146736081_146736243:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000436230:exon_146736081_146736243:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146736081_146736243:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146736081_146736243:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000254086:exon_146736081_146736188:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000361293:exon_146736081_146736243:CHD1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 146759320 C/G 1 25 49 74 11.4125391828375 26.6314232016385 -15.218884018801 C:G C G 10 0.5434984326865 0.000415213727299076 ENSG00000131778:ENST00000431239:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369259:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000369258:exon_146759314_146759412:CHD1L;ENSG00000131778:ENST00000467213:exon_146759314_146759412:CHD1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 39 30 69 17.8035611252265 16.304952980595 1.4986081446315 A:G G A 10 0.5434984326865 0.809243377966814 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 150471748 T/A 1 45 40 85 20.5425705291075 21.73993730746 -1.1973667783525 A:T T A 10 0.5434984326865 0.82804382042695 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000480070:exon_150471692_150471769:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000463555:exon_150471692_150471769:TARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 150915361 A/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000143379:ENST00000271640:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368960:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368962:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000534805:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000368969:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000498193:exon_150915328_150915529:SETDB1;ENSG00000143379:ENST00000413562:exon_150915328_150915529:SETDB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 151236495 C/T 1 59 59 118 26.9335924714965 32.0664075285035 -5.132815057007 T:C C T 10 0.5434984326865 0.356411488739511 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000462970:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000437736:exon_151236390_151236504:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000469786:exon_151236250_151236504:PSMD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 151316751 A/G 1 16 16 32 7.304025077016 8.695974922984 -1.391949845968 A:G A G 10 0.5434984326865 0.723350742872682 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436637:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000475144:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000422595:exon_151316673_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000450506:exon_151316675_151316754:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000458484:exon_151316732_151316754:RFX5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 273 124 397 124.624927876586 67.393805653126 57.2311222234595 A:G G A 10 0.5434984326865 5.48525729571709e-09 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 676 1224 1900 308.595059503926 665.242081608276 -356.64702210435 A:T:C:G T C 10 0.5434984326865 1.12834890551607e-60 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 151735545 A/G 1 41 35 76 18.7165642598535 19.0224451440275 -0.305880884174002 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000143436:ENST00000368830:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000467306:exon_151735426_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000368829:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000478926:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000486707:exon_151735431_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000481777:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000461182:exon_151735466_151735622:MRPL9;ENSG00000143436:ENST00000462783:exon_151735093_151735622:MRPL9;ENSG00000143450:ENST00000418982:exon_151735445_151735643:OAZ3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 C:G G C 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 57 46 103 26.0205893368695 25.000927903579 1.0196614332905 A:G A G 10 0.5434984326865 0.921274116728208 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 155217739 C/T 1 27 11 38 12.3255423174645 5.9784827595515 6.347059557913 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0494635278531064 ENSG00000160767:ENST00000350210:exon_155216996_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368370:exon_155216997_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000423573:exon_155216997_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368366:exon_155217008_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000368368:exon_155217008_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000361361:exon_155217008_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000487649:exon_155217218_155217746:FAM189B;ENSG00000160767:ENST00000323361:exon_155217669_155217746:FAM189B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 155735901 C/T 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000497369:exon_155735240_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000476028:exon_155735249_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471442:exon_155735249_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000477831:exon_155735250_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000495937:exon_155735250_155736500:GON4L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 15 28 43 6.8475235097025 15.217956115222 -8.3704326055195 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0134825477176022 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.126419205254674 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 12 23 35 5.478018807762 12.5004639517895 -7.0224451440275 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0259251341674535 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 134 125 259 61.171210020009 67.9373040858125 -6.7660940658035 C:G G C 10 0.5434984326865 0.417640519543072 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 128 107 235 58.432200616128 58.1543322974555 0.277868318672503 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 69 68 137 31.4986081446315 36.957893422682 -5.4592852780505 A:C C A 10 0.5434984326865 0.391178009946660 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 62 59 121 28.303097173437 32.0664075285035 -3.7633103550665 A:T T A 10 0.5434984326865 0.523398644976806 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 691 716 1407 315.442583013629 389.144877803534 -73.7022947899055 A:T:G A T 10 0.5434984326865 8.28567577388917e-05 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 160303416 G/A 1 13 9 22 5.9345203750755 4.8914858941785 1.043034480897 A:G G A 10 0.5434984326865 0.676458559400952 ENSG00000122218:ENST00000368069:exon_160303393_160303469:COPA;ENSG00000122218:ENST00000241704:exon_160303393_160303469:COPA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 160461060 C/T 1 15 12 27 6.8475235097025 6.521981192238 0.3255423174645 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460915_160461178:SLAMF6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 160793442 A/G 1 9 5 14 4.1085141058215 2.7174921634325 1.391021942389 A:G A G 10 0.5434984326865 0.594459609035139 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 160793560 A/G 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160793416_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160793255_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160793297_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160793419_160793586:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160793297_160793586:LY9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 146 159 305 66.649228827771 86.4162507971535 -19.7670219693825 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0248891566987352 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 106 93 199 48.389166135231 50.5453542398445 -2.1561881046135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.776207941067633 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 217 202 419 99.0608401070295 109.786683402673 -10.7258432956435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.303225406359807 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 56 62 118 25.564087769556 33.696902826563 -8.132815057007 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.139779166722132 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 167973976 C/T 1 29 30 59 13.2385454520915 16.304952980595 -3.0664075285035 T:C C T 10 0.5434984326865 0.435697476531133 ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000470721:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_167973771_167974031:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_167973771_167974031:DCAF6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 14 18 32 6.391021942389 9.782971788357 -3.391949845968 T:G T G 10 0.5434984326865 0.287042724213305 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 169823718 T/C 1 14 16 30 6.391021942389 8.695974922984 -2.304952980595 T:C T C 10 0.5434984326865 0.464847863020226 ENSG00000000457:ENST00000367772:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367771:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000367770:exon_169823411_169824105:SCYL3;ENSG00000000457:ENST00000423670:exon_169823652_169824105:SCYL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 15 18 33 6.8475235097025 9.782971788357 -2.9354482786545 T:C C T 10 0.5434984326865 0.382603756937693 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 171509327 G/A 1 18 16 34 8.217028211643 8.695974922984 -0.478946711340999 A:G G A 10 0.5434984326865 0.865422613408382 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 171511039 C/G 1 15 9 24 6.8475235097025 4.8914858941785 1.956037615524 C:G C G 10 0.5434984326865 0.53990005232013 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171509400_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171510969_171511368:BAT2L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 171514731 C/G 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 C:G C G 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171514618_171514826:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171514618_171514826:BAT2L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 171556165 G/C 1 9 14 23 4.1085141058215 7.608978057611 -3.5004639517895 C:G G C 10 0.5434984326865 0.149533600784392 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171556142_171556360:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171556142_171556360:BAT2L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 180063526 T/C 1 10 17 27 4.565015673135 9.2394733556705 -4.6744576825355 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0825835679856458 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180062849_180063751:CEP350 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 180953853 A/G 1 18 14 32 8.217028211643 7.608978057611 0.608050154032001 A:G A G 10 0.5434984326865 0.861129900266574 ENSG00000135823:ENST00000258301:exon_180953813_180953907:STX6;ENSG00000135823:ENST00000469135:exon_180953813_180953907:STX6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 22 24 46 10.043034480897 13.043962384476 -3.000927903579 A:G G A 10 0.5434984326865 0.379220375370373 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 183093875 T/C 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183093766_183094011:LAMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 24 10 34 10.956037615524 5.434984326865 5.521053288659 T:C T C 10 0.5434984326865 0.059987726314248 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 25 16 41 11.4125391828375 8.695974922984 2.7165642598535 A:G G A 10 0.5434984326865 0.435766479725151 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 11 5 16 5.0215172404485 2.7174921634325 2.304025077016 A:C A C 10 0.5434984326865 0.31866452342011 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 186316488 C/T 1 10 13 23 4.565015673135 7.0654796249245 -2.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.304445604018253 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186316424_186316590:TPR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 186363119 C/G 1 8 2 10 3.652012538508 1.086996865373 2.565015673135 C:G C G 10 0.5434984326865 0.122678215119332 ENSG00000157181:ENST00000287859:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000419367:exon_186363079_186363147:C1orf27;ENSG00000157181:ENST00000432021:exon_186363079_186363147:C1orf27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 193038289 G/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:G G T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000116747:ENST00000400968:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000415442:exon_193038164_193038311:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000506303:exon_193038164_193038309:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000400969:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000416058:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367446:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367443:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367445:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367444:exon_193038164_193038764:TROVE2;ENSG00000116747:ENST00000367441:exon_193038146_193038764:TROVE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 13 7 20 5.9345203750755 3.8044890288055 2.13003134627 T:C C T 10 0.5434984326865 0.377414731649604 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 201938685 C/G 1 143 128 271 65.2797241258305 69.567799383872 -4.2880752580415 T:C:G C G 10 0.5434984326865 0.625834788636007 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201938597_201939789:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201938597_201938845:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201938597_201939479:TIMM17A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 203743653 C/T 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 21 23 44 9.5865329135835 12.5004639517895 -2.913931038206 A:C C A 10 0.5434984326865 0.449679990168436 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 A:C C A 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 7 14 21 3.1955109711945 7.608978057611 -4.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0773597410972235 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 209950681 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 89 101 190 40.6286394909015 54.8933417013365 -14.264702210435 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0412937970714979 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 211451467 T/C 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000117625:ENST00000533469:exon_211451459_211451565:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367006:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452325:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000435653:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000452621:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000528926:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000419091:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000529572:exon_211451459_211451583:RCOR3;ENSG00000117625:ENST00000367005:exon_211451459_211451583:RCOR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 18 23 41 8.217028211643 12.5004639517895 -4.2834357401465 A:G A G 10 0.5434984326865 0.210099008684555 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 212617723 A/G 1 79 49 128 36.0636238177665 26.6314232016385 9.432200616128 A:G A G 10 0.5434984326865 0.109917146338329 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212617681_212617784:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212617681_212617784:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212617681_212617784:NENF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 32 27 59 14.608050154032 14.6744576825355 -0.0664075285035004 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 214814571 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 214820099 A/G 1 39 32 71 17.8035611252265 17.391949845968 0.411611279258501 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 214826196 G/A 1 42 26 68 19.173065827167 14.130959249849 5.042106577318 A:G G A 10 0.5434984326865 0.22636861838692 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000391896:exon_214826171_214826332:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000467765:exon_214826171_214826332:CENPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 48 42 90 21.912075231048 22.826934172833 -0.914858941784999 A:G A G 10 0.5434984326865 0.915811709108293 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 51 74 125 23.2815799329885 40.218884018801 -16.9373040858125 C:G C G 10 0.5434984326865 0.00290445645071688 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 40 36 76 18.26006269254 19.565943576714 -1.305880884174 T:C C T 10 0.5434984326865 0.818158002158911 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 220321023 A/G 1 253 230 483 115.494896530316 125.004639517895 -9.5097429875795 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 0.38592523223343 ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220320835_220321380:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220320835_220321380:IARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 T:C T C 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 222802926 C/T 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226019653 G/A 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000143819:ENST00000445856:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000448202:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226019480_226019660:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000467015:exon_226019480_226019864:EPHX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:G T G 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226555302 A/G 1 115 107 222 52.4976802410525 58.1543322974555 -5.656652056403 A:G A G 10 0.5434984326865 0.45910091483935 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226555181_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226553655_226555309:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226555181_226555309:PARP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226570840 T/C 1 79 98 177 36.0636238177665 53.262846403277 -17.1992225855105 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0102129232889038 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226570737_226570884:PARP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 83 43 126 37.8896300870205 23.3704326055195 14.519197481501 A:T:G A G 10 0.5434984326865 0.00943683223574146 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 66 58 124 30.129103442691 31.522909095817 -1.393805653126 A:G G A 10 0.5434984326865 0.857025083712806 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 226595647 C/G 1 22 7 29 10.043034480897 3.8044890288055 6.2385454520915 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0240975345748898 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226595511_226595774:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226595511_226595776:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226595511_226595717:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226595511_226595683:PARP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 227954742 C/T 1 26 16 42 11.869040750151 8.695974922984 3.173065827167 T:C C T 10 0.5434984326865 0.355785827583895 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 228288896 C/T 1 16 19 35 7.304025077016 10.3264702210435 -3.0224451440275 T:C C T 10 0.5434984326865 0.314169389001376 ENSG00000143793:ENST00000469781:exon_228288427_228288955:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000272139:exon_228288432_228288955:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000485896:exon_228288432_228288955:C1orf35;ENSG00000143793:ENST00000472617:exon_228288434_228288955:C1orf35 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:G T G 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 229738236 G/A 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 230415148 G/A 1 12 11 23 5.478018807762 5.9784827595515 -0.5004639517895 A:G G A 10 0.5434984326865 0.837650237750388 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 230810756 T/A 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 A:T T A 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230810744_230810870:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230810744_230810870:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230810744_230810870:COG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 A:T T A 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 234509972 A/G 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 A:G A G 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 234529519 C/T 1 23 5 28 10.4995360482105 2.7174921634325 7.782043884778 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00362494441784865 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 234529540 G/A 0 22 0 22 10.043034480897 0 10.043034480897 G G 10 0.5434984326865 2.36938916076858e-06 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 234541801 A/G 1 12 6 18 5.478018807762 3.260990596119 2.217028211643 A:G A G 10 0.5434984326865 0.349542691073942 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234541649_234541845:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234541649_234543701:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234541649_234542126:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234541649_234541845:TARBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 234744250 G/A 1 45 58 103 20.5425705291075 31.522909095817 -10.9803385667095 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0372753958773158 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 17 23 40 7.7605266443295 12.5004639517895 -4.73993730746 A:C C A 10 0.5434984326865 0.153505600262966 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 20 21 41 9.13003134627 11.4134670864165 -2.2834357401465 A:G A G 10 0.5434984326865 0.531753840069921 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 16 8 24 7.304025077016 4.347987461492 2.956037615524 T:C T C 10 0.5434984326865 0.305762550366789 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 236389999 C/T 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236389947_236390039:ERO1LB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 241755348 C/T 1 21 25 46 9.5865329135835 13.5874608171625 -4.000927903579 T:C C T 10 0.5434984326865 0.240678034879676 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241755255_241755590:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241755255_241758944:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366555:exon_241755255_241755451:KMO;ENSG00000054277:ENST00000462265:exon_241755312_241755422:OPN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 242030151 A/G 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242030132_242030357:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242030132_242030357:EXO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 242035438 G/A 1 12 6 18 5.478018807762 3.260990596119 2.217028211643 A:G G A 10 0.5434984326865 0.349542691073942 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 18 15 33 8.217028211643 8.1524764902975 0.0645517213455005 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 18 24 42 8.217028211643 13.043962384476 -4.826934172833 T:C C T 10 0.5434984326865 0.163004545679886 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 242045283 T/A 1 25 19 44 11.4125391828375 10.3264702210435 1.086068961794 A:T T A 10 0.5434984326865 0.764705161075405 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 243579112 G/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000054282:ENST00000355875:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000366541:exon_243579004_243579131:SDCCAG8;ENSG00000054282:ENST00000493334:exon_243579004_243579131:SDCCAG8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 246021875 G/A 1 13 7 20 5.9345203750755 3.8044890288055 2.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 0.377414731649604 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 246021941 T/C 1 12 11 23 5.478018807762 5.9784827595515 -0.5004639517895 T:C T C 10 0.5434984326865 0.837650237750388 ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 11 12 23 5.0215172404485 6.521981192238 -1.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.538430560562157 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 C:G G C 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 3150898 C/T 1 38 28 66 17.347059557913 15.217956115222 2.129103442691 T:C C T 10 0.5434984326865 0.62324713116406 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 3150973 C/T 1 34 38 72 15.521053288659 20.652940442087 -5.131887153428 T:C C T 10 0.5434984326865 0.238137953535752 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3150893_3150985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000468050:exon_3150893_3150985:PFKP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 3155353 C/T 1 62 55 117 28.303097173437 29.8924137977575 -1.5893166243205 T:C C T 10 0.5434984326865 0.781333846848765 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155311_3155380:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155311_3155380:PFKP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 29 24 53 13.2385454520915 13.043962384476 0.1945830676155 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 69 68 137 31.4986081446315 36.957893422682 -5.4592852780505 T:C C T 10 0.5434984326865 0.391178009946660 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 5498693 A/G 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 5498752 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 6150677 C/A 1 44 53 97 20.086068961794 28.8054169323845 -8.7193479705905 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0831190783094945 ENSG00000134453:ENST00000372795:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418869:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000379888:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000429138:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000437845:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000432931:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000446108:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418631:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000447032:exon_6150649_6150705:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000481147:exon_6150451_6150705:RBM17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 11299735 A/T 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 A:T A T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 1 1 9 10 0.4565015673135 4.8914858941785 -4.434984326865 C:G C G 10 0.5434984326865 0.00732127064900624 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 207 200 407 94.4958244338945 108.6996865373 -14.2038621034055 A:G A G 10 0.5434984326865 0.163642070239931 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 20 19 39 9.13003134627 10.3264702210435 -1.1964388747735 A:G A G 10 0.5434984326865 0.74916071169288 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 16796919 C/A 1 20 22 42 9.13003134627 11.956965519103 -2.826934172833 A:C C A 10 0.5434984326865 0.439439099332362 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16796870_16796988:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16796870_16796988:RSU1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 6 16 22 2.739009403881 8.695974922984 -5.956965519103 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0165117654975061 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 25313818 C/T 1 20 18 38 9.13003134627 9.782971788357 -0.652940442086999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.871533201986291 ENSG00000185875:ENST00000524413:exon_25312105_25315593:THNSL1;ENSG00000185875:ENST00000376356:exon_25312105_25315593:THNSL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27303605 A/T 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:T A T 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27317840 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27322303 C/G 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 C:G C G 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27322154_27322306:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27322154_27322306:ANKRD26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27434483 G/A 1 20 12 32 9.13003134627 6.521981192238 2.608050154032 A:G G A 10 0.5434984326865 0.38057970811461 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27459670 C/T 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27459746 C/G 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27475444 T/C 1 20 29 49 9.13003134627 15.7614545479085 -6.6314232016385 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0626914569427348 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 27475494 T/C 1 28 34 62 12.782043884778 18.478946711341 -5.696902826563 T:C T C 10 0.5434984326865 0.161388797074134 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27475308_27475848:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27475308_27475647:MASTL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 32557962 C/T 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 T:C C T 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32556679_32558063:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32556679_32558063:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32557859_32558063:EPC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 33209266 G/T 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 T:G G T 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33209173_33209313:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33209173_33209313:ITGB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 33211227 T/G 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:G T G 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33211185_33211274:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33211185_33211274:ITGB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 38404188 G/C 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 C:G G C 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38404123_38404218:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000479469:exon_38404123_38404313:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000463776:exon_38404123_38404250:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000477790:exon_38404123_38404621:ZNF37A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 43279810 G/A 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43279810_43280018:BMS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 43292647 A/G 1 17 19 36 7.7605266443295 10.3264702210435 -2.565943576714 A:G A G 10 0.5434984326865 0.407364257240417 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43291922_43292679:BMS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 43678796 C/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000169826:ENST00000374466:exon_43678698_43680756:CSGALNACT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 43883342 T/A 1 86 86 172 39.259134788961 46.740865211039 -7.481730422078 A:T T A 10 0.5434984326865 0.252202764121119 ENSG00000169813:ENST00000357065:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000356053:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000443950:exon_43881065_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000337970:exon_43881470_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000477108:exon_43883037_43883384:HNRNPF;ENSG00000169813:ENST00000498176:exon_43883091_43883384:HNRNPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 45878050 G/A 1 6 10 16 2.739009403881 5.434984326865 -2.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.212818328356362 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45877931_45878129:ALOX5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 45939617 A/G 1 10 19 29 4.565015673135 10.3264702210435 -5.7614545479085 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0393404244602306 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45939564_45939734:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000481117:exon_45939564_45939680:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000498461:exon_45939176_45939662:ALOX5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 50943248 G/A 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000197444:ENST00000374103:exon_50942689_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000419399:exon_50942690_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000432695:exon_50942690_50943397:OGDHL;ENSG00000197444:ENST00000490844:exon_50942692_50943397:OGDHL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 51582894 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138293:ENST00000438493:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000452682:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000414907:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000430396:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000330923:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000498586:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374087:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000344348:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000374082:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000431200:exon_51582796_51582939:NCOA4;ENSG00000138293:ENST00000443446:exon_51582796_51582939:NCOA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 39 35 74 17.8035611252265 19.0224451440275 -1.218884018801 A:G A G 10 0.5434984326865 0.815933688669482 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 16 14 30 7.304025077016 7.608978057611 -0.304952980595 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 40 51 91 18.26006269254 27.7184200670115 -9.4583573744715 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0576160948904652 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 64927823 C/G 1 54 30 84 24.651084634929 16.304952980595 8.346131654334 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0792421840925957 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000467356:exon_64926981_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64926990_64927894:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64926990_64927894:JMJD1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 64945364 G/A 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64945323_64945413:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64945323_64945413:JMJD1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 69676098 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000096717:ENST00000212015:exon_69676022_69678147:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000432464:exon_69676022_69678146:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000406900:exon_69676022_69678147:SIRT1;ENSG00000096717:ENST00000403579:exon_69676022_69678143:SIRT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 69773841 G/A 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000148634:ENST00000277817:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000412272:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395198:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000427635:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000473533:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000373700:exon_69773783_69773943:HERC4;ENSG00000148634:ENST00000395187:exon_69773783_69773943:HERC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.100680878973953 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 70696713 C/T 1 34 26 60 15.521053288659 14.130959249849 1.39009403881 T:C C T 10 0.5434984326865 0.795907511656434 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70696692_70696851:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70696692_70696851:DDX50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 75 72 147 34.2376175485125 39.131887153428 -4.89426960491549 A:G A G 10 0.5434984326865 0.45632939222249 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 70748784 G/A 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70748487_70749014:KIAA1279 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 62 43 105 28.303097173437 23.3704326055195 4.9326645679175 A:G G A 10 0.5434984326865 0.378131902184123 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 44 36 80 20.086068961794 19.565943576714 0.52012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 71874784 C/T 1 18 18 36 8.217028211643 9.782971788357 -1.565943576714 T:C C T 10 0.5434984326865 0.619354655164741 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 42 56 98 19.173065827167 30.435912230444 -11.262846403277 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.0254004242637865 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 73594223 C/T 1 76 79 155 34.694119115826 42.9363761822335 -8.2422570664075 T:C C T 10 0.5434984326865 0.197198678851169 ENSG00000197746:ENST00000394936:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000373120:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000357471:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394934:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394940:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000402059:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394929:exon_73594129_73594262:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000404083:exon_73594129_73594262:PSAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 75148112 T/C 1 66 63 129 30.129103442691 34.2404012592495 -4.1112978165585 T:C T C 10 0.5434984326865 0.480524670485666 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 15 11 26 6.8475235097025 5.9784827595515 0.869040750150999 T:C T C 10 0.5434984326865 0.84477662201796 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 88730312 T/C 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000148671:ENST00000372013:exon_88730233_88730672:C10orf116;ENSG00000148671:ENST00000372012:exon_88730233_88730487:C10orf116 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 88930249 A/T 1 10 4 14 4.565015673135 2.173993730746 2.391021942389 A:T A T 10 0.5434984326865 0.284250115489834 ENSG00000122376:ENST00000298784:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000298786:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000358313:exon_88930235_88930429:FAM35A;ENSG00000122376:ENST00000342900:exon_88930235_88930429:FAM35A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 90342837 C/G 1 4 8 12 1.826006269254 4.347987461492 -2.521981192238 C:G C G 10 0.5434984326865 0.159074080491796 ENSG00000184719:ENST00000371947:exon_90342830_90344287:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000437752:exon_90342830_90342947:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000331772:exon_90342830_90342970:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000466945:exon_90342830_90343089:RNLS;ENSG00000184719:ENST00000481793:exon_90342830_90343087:RNLS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91066446 G/C 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 C:G G C 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000119922:ENST00000371826:exon_91065719_91069033:IFIT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 63 65 128 28.7595987407505 35.3273981246225 -6.567799383872 T:C T C 10 0.5434984326865 0.249864600223552 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 7 12 19 3.1955109711945 6.521981192238 -3.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.166463653686349 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 30 13 43 13.695047019405 7.0654796249245 6.6295673944805 A:T:G A G 10 0.5434984326865 0.0466153553782489 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 20 8 28 9.13003134627 4.347987461492 4.782043884778 A:T T A 10 0.5434984326865 0.0870172359884833 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 17 9 26 7.7605266443295 4.8914858941785 2.869040750151 A:G A G 10 0.5434984326865 0.326006011364416 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 19 15 34 8.6735297789565 8.1524764902975 0.521053288658999 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 94100461 T/C 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000198060:ENST00000358935:exon_94100430_94100560:MARCH5;ENSG00000198060:ENST00000467521:exon_94100430_94100560:MARCH5;ENSG00000198060:ENST00000462465:exon_94100430_94100560:MARCH5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 26 28 54 11.869040750151 15.217956115222 -3.348915365071 C:G G C 10 0.5434984326865 0.412909581337624 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 18 16 34 8.217028211643 8.695974922984 -0.478946711340999 A:G A G 10 0.5434984326865 0.865422613408382 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 96104665 T/G 1 2 11 13 0.913003134627 5.9784827595515 -5.0654796249245 T:G T G 10 0.5434984326865 0.00905344703510859 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96104610_96104690:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96104610_96104690:NOC3L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 7 17 24 3.1955109711945 9.2394733556705 -6.043962384476 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0220952761663659 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1865 1628 3493 851.375423039677 884.815448413622 -33.4400253739445 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 0.262297217140358 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 1053 1060 2113 480.696150381116 576.10833864769 -95.4121882665744 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 3.30399749033265e-05 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 97599537 G/C 1 61 83 144 27.8465956061235 45.1103699129795 -17.263774306856 C:G G C 10 0.5434984326865 0.00434181265174285 ENSG00000138185:ENST00000453258:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371206:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000481316:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371207:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000490659:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000494070:exon_97599448_97599565:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000461927:exon_97599057_97599565:ENTPD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 99125949 C/T 1 12 37 49 5.478018807762 20.1094420094005 -14.6314232016385 T:C C T 10 0.5434984326865 3.57883942002323e-05 ENSG00000052749:ENST00000491313:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99125865_99125990:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000487612:exon_99125647_99125990:RRP12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 26 6 32 11.869040750151 3.260990596119 8.608050154032 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00214465039298110 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 99225846 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99225816_99225913:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99225816_99225916:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99225816_99225916:MMS19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 A:C A C 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 101639796 G/A 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 A:G G A 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 101639877 A/C 1 13 2 15 5.9345203750755 1.086996865373 4.8475235097025 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0166403625184673 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101639568_101640118:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101639568_101640118:DNMBP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 101977883 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000213341:ENST00000370397:exon_101977752_101977887:CHUK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 102116311 A/C 1 12 9 21 5.478018807762 4.8914858941785 0.5865329135835 A:C A C 10 0.5434984326865 0.830554848512144 ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 98 51 149 44.737153596723 27.7184200670115 17.0187335297115 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00510283580351348 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 12 8 20 5.478018807762 4.347987461492 1.13003134627 A:G A G 10 0.5434984326865 0.65993989106057 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 102766604 A/C 0 19 0 19 8.6735297789565 0 8.6735297789565 A A 10 0.5434984326865 1.72989060848334e-05 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 103577726 G/A 0 12 0 12 5.478018807762 0 5.478018807762 G G 10 0.5434984326865 0.000746227811175491 ENSG00000198408:ENST00000439817:exon_103577581_103578222:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000361464:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000357797:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000370094:exon_103577581_103578175:MGEA5;ENSG00000198408:ENST00000419011:exon_103577581_103578180:MGEA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 104184953 C/G 1 21 12 33 9.5865329135835 6.521981192238 3.0645517213455 C:G C G 10 0.5434984326865 0.300610071215382 ENSG00000107874:ENST00000369937:exon_104184872_104184955:CUEDC2;ENSG00000107874:ENST00000477994:exon_104184872_104184955:CUEDC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 104679371 C/T 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000148842:ENST00000457502:exon_104678071_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000433628:exon_104678071_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369875:exon_104678074_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369878:exon_104678114_104679858:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000345419:exon_104678114_104679858:CNNM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 104849453 T/C 1 31 23 54 14.1515485867185 12.5004639517895 1.651084634929 T:C T C 10 0.5434984326865 0.684020449591843 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 26 11 37 11.869040750151 5.9784827595515 5.8905579905995 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0681640854380513 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 78 85 163 35.607122250453 46.1973667783525 -10.5902445278995 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0990989278480676 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 11 33 44 5.0215172404485 17.9354482786545 -12.913931038206 T:C T C 10 0.5434984326865 0.000105228235074007 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 105361871 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 364 297 661 166.166570502114 161.419034507891 4.74753599422351 A:C:G C A 10 0.5434984326865 0.725392156587712 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 112270103 C/G 1 57 33 90 26.0205893368695 17.9354482786545 8.085141058215 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0911515381676367 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112269778_112271302:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112269778_112270195:DUSP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 120828969 A/G 1 31 26 57 14.1515485867185 14.130959249849 0.0205893368695005 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120828958_120829166:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120828958_120828985:EIF3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 14 7 21 6.391021942389 3.8044890288055 2.5865329135835 T:C T C 10 0.5434984326865 0.281934153985525 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 120928705 G/A 1 85 80 165 38.8026332216475 43.47987461492 -4.6772413932725 A:G G A 10 0.5434984326865 0.48240283949191 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120928689_120928854:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120928689_120928854:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000494433:exon_120928689_120930500:PRDX3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 121196335 G/A 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000198873:ENST00000392870:exon_121196163_121196353:GRK5;ENSG00000198873:ENST00000369108:exon_121196163_121196353:GRK5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 A:G A G 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 122665459 C/G 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 C:G C G 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 124610027 G/A 1 12 4 16 5.478018807762 2.173993730746 3.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 0.131696716739933 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 11 8 19 5.0215172404485 4.347987461492 0.6735297789565 C:G G C 10 0.5434984326865 0.821132279555771 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 126172863 A/G 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000107902:ENST00000392757:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368842:exon_126172708_126172895:LHPP;ENSG00000107902:ENST00000368839:exon_126172708_126172895:LHPP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 68 54 122 31.042106577318 29.348915365071 1.693191212247 C:G G C 10 0.5434984326865 0.785678946823446 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 133786586 T/C 1 18 36 54 8.217028211643 19.565943576714 -11.348915365071 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00238082581605170 ENSG00000176171:ENST00000368636:exon_133786538_133786622:BNIP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 134013990 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000151640:ENST00000338492:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368629:exon_134013860_134014016:DPYSL4;ENSG00000151640:ENST00000368627:exon_134013860_134014016:DPYSL4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 10 134021576 C/T 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134020994_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134020996_134021655:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134020996_134021655:STK32C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 58 49 107 26.477090904183 26.6314232016385 -0.1543322974555 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 259 577 836 118.233905934196 313.598595660111 -195.364689725914 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 3.02246638687652e-42 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 161 131 292 73.4967523374735 71.1982946819315 2.29845765554199 C:G G C 10 0.5434984326865 0.814352327633277 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 499059 C/T 1 115 95 210 52.4976802410525 51.6323511052175 0.865329135834997 T:C C T 10 0.5434984326865 0.94481335744759 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499015_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499031_499185:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499047_499185:RNH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 534242 A/G 1 15 24 39 6.8475235097025 13.043962384476 -6.1964388747735 A:G A G 10 0.5434984326865 0.053549688044812 ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 562219 C/G 1 9 5 14 4.1085141058215 2.7174921634325 1.391021942389 C:G C G 10 0.5434984326865 0.594459609035139 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 610277 T/C 1 13 13 26 5.9345203750755 7.0654796249245 -1.130959249849 T:C T C 10 0.5434984326865 0.696932813908347 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 614864 C/T 1 59 49 108 26.9335924714965 26.6314232016385 0.302169269857998 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 644568 C/G 1 53 34 87 24.1945830676155 18.478946711341 5.7156363562745 C:G C G 10 0.5434984326865 0.237324508885200 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527658:exon_644234_644654:DEAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 653968 T/C 1 36 26 62 16.434056423286 14.130959249849 2.303097173437 T:C T C 10 0.5434984326865 0.611095289438083 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_653962_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_653941_654051:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000530813:exon_653962_654051:DEAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 674499 G/A 0 11 0 11 5.0215172404485 0 5.0215172404485 G G 10 0.5434984326865 0.00140172727774491 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 802379 T/C 1 10 4 14 4.565015673135 2.173993730746 2.391021942389 T:C T C 10 0.5434984326865 0.284250115489834 ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802195_802396:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802195_802396:LRDD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 811853 C/T 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245379774745917 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 993907 C/G 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 C:G C G 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 1309956 C/T 1 13 13 26 5.9345203750755 7.0654796249245 -1.130959249849 T:C C T 10 0.5434984326865 0.696932813908347 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 1309994 T/C 1 18 26 44 8.217028211643 14.130959249849 -5.913931038206 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0949443675386264 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1309854_1310006:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000528719:exon_1309866_1310006:TOLLIP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 1974029 G/A 1 241 200 441 110.016877722554 108.6996865373 1.31719118525351 A:G G A 10 0.5434984326865 0.923869376357575 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1974012_1974085:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1974012_1974552:MRPL23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 286 293 579 130.559448251661 159.245040777145 -28.6855925254835 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.0173861445360228 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 3026622 A/G 1 30 44 74 13.695047019405 23.913931038206 -10.218884018801 A:G A G 10 0.5434984326865 0.019316408808693 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3026596_3026663:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3026596_3026663:CARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 16 19 35 7.304025077016 10.3264702210435 -3.0224451440275 C:G G C 10 0.5434984326865 0.314169389001376 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 4621485 C/G 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 C:G C G 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4619902_4622056:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4620010_4622056:TRIM68 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 31 9 40 14.1515485867185 4.8914858941785 9.26006269254 A:C C A 10 0.5434984326865 0.00373964300062462 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 T:C T C 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 5701074 C/A 1 8 13 21 3.652012538508 7.0654796249245 -3.4134670864165 A:C C A 10 0.5434984326865 0.1876633788445 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700991_5701087:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700991_5701161:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 17 7 24 7.7605266443295 3.8044890288055 3.956037615524 A:G G A 10 0.5434984326865 0.150073663112285 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 61 75 136 27.8465956061235 40.7623824514875 -12.915786845364 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0310505193755465 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 87 62 149 39.7156363562745 33.696902826563 6.0187335297115 A:G G A 10 0.5434984326865 0.365728432051911 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 6415463 G/A 1 16 17 33 7.304025077016 9.2394733556705 -1.9354482786545 A:G G A 10 0.5434984326865 0.6008174059021 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6415428_6416225:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6415428_6416221:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6415428_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531303:exon_6415408_6416008:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000526280:exon_6415428_6416228:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000531336:exon_6415126_6415603:SMPD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 8486310 C/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:C C A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 A:G A G 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 9225486 C/G 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 C:G C G 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000526707:exon_9225207_9225864:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000532696:exon_9225079_9225864:DENND5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 23 10 33 10.4995360482105 5.434984326865 5.0645517213455 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0825066204661177 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 18 21 39 8.217028211643 11.4134670864165 -3.1964388747735 T:C C T 10 0.5434984326865 0.336750534989634 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 24 16 40 10.956037615524 8.695974922984 2.26006269254 C:G C G 10 0.5434984326865 0.5276294959487 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 10521764 T/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000133805:ENST00000256183:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000444303:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396554:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000534047:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000396553:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529834:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000431080:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000528723:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529507:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000530864:exon_10521633_10521796:AMPD3;ENSG00000133805:ENST00000529744:exon_10521732_10521796:AMPD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 10555589 A/G 1 9 18 27 4.1085141058215 9.782971788357 -5.6744576825355 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0332201062262774 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10555563_10555752:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000530156:exon_10555563_10555752:RNF141 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 C:G G C 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 11977573 T/C 1 68 61 129 31.042106577318 33.1534043938765 -2.1112978165585 T:C T C 10 0.5434984326865 0.724339475766136 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11977548_11977968:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11977548_11980870:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11977548_11980701:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11977548_11978492:USP47 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 105 78 183 47.9326645679175 42.392877749547 5.5397868183705 A:C:G C G 10 0.5434984326865 0.415680975677041 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 17981047 C/T 1 18 21 39 8.217028211643 11.4134670864165 -3.1964388747735 T:C C T 10 0.5434984326865 0.336750534989634 ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000533241:exon_17981017_17981183:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525168:exon_17981017_17981170:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529728:exon_17981000_17981183:SERGEF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 22647366 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000183161:ENST00000327470:exon_22644079_22647387:FANCF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 27362257 T/C 1 33 36 69 15.0645517213455 19.565943576714 -4.5013918553685 T:C T C 10 0.5434984326865 0.279770442888257 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 27362359 T/G 1 18 22 40 8.217028211643 11.956965519103 -3.73993730746 T:G T G 10 0.5434984326865 0.267636879374905 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 27384585 G/A 1 22 23 45 10.043034480897 12.5004639517895 -2.4574294708925 A:G G A 10 0.5434984326865 0.549945357023315 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 4 11 15 1.826006269254 5.9784827595515 -4.1524764902975 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0380096891755768 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 43 48 91 19.6295673944805 26.087924768952 -6.4583573744715 T:C C T 10 0.5434984326865 0.206431790578945 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 52 35 87 23.738081500302 19.0224451440275 4.7156363562745 T:G T G 10 0.5434984326865 0.333882309069118 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 19 32 51 8.6735297789565 17.391949845968 -8.7184200670115 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0164541646828294 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 24 12 36 10.956037615524 6.521981192238 4.434056423286 A:G G A 10 0.5434984326865 0.180119539775369 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 34991727 T/C 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34991686_34991833:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34991686_34991833:PDHX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 43776481 C/T 1 8 1 9 3.652012538508 0.5434984326865 3.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0455044848393489 ENSG00000149084:ENST00000395700:exon_43776423_43777086:HSD17B12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 41 15 56 18.7165642598535 8.1524764902975 10.564087769556 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00459944784607882 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 44636833 G/A 1 52 59 111 23.738081500302 32.0664075285035 -8.3283260282015 A:G G A 10 0.5434984326865 0.127191958196065 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 44636848 G/A 1 55 59 114 25.1075862022425 32.0664075285035 -6.958821326261 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.221459956727881 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 90 71 161 41.085141058215 38.5883887207415 2.4967523374735 A:G A G 10 0.5434984326865 0.751780900028691 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 29 48 77 13.2385454520915 26.087924768952 -12.8493793168605 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00398810847735638 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 47772545 T/C 1 21 19 40 9.5865329135835 10.3264702210435 -0.73993730746 T:C T C 10 0.5434984326865 0.874437232004936 ENSG00000109920:ENST00000263773:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000526109:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000532646:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000534003:exon_47772468_47772588:FNBP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 12 5 17 5.478018807762 2.7174921634325 2.7605266443295 A:G A G 10 0.5434984326865 0.226256100708807 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 11 15 26 5.0215172404485 8.1524764902975 -3.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.241256155605839 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 58978940 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 59573999 C/T 1 327 308 635 149.276012511514 167.397517267442 -18.1215047559275 T:C C T 10 0.5434984326865 0.151670959086294 ENSG00000166902:ENST00000300151:exon_59573608_59574305:MRPL16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 60705372 C/T 1 103 129 232 47.0196614332905 70.1112978165585 -23.091636383268 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00241304563453306 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60705342_60705497:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60705342_60705497:SLC15A3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 61897359 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61897254_61897500:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 61906453 G/C 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 62288649 G/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 62652779 C/T 1 161 210 371 73.4967523374735 114.134670864165 -40.6379185266915 T:C C T 10 0.5434984326865 2.85418809660575e-05 ENSG00000168003:ENST00000377891:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377892:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377889:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000377890:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000338663:exon_62652649_62652829:SLC3A2;ENSG00000168003:ENST00000422606:exon_62652649_62652829:SLC3A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 204 181 385 93.126319731954 98.3732163162565 -5.2468965843025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.609080434598677 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 63991801 T/C 1 100 130 230 45.65015673135 70.654796249245 -25.004639517895 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00113628112273032 ENSG00000149743:ENST00000394547:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63991757_63991813:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63991757_63991813:TRPT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 63996908 G/A 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.740503731586123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 63997329 A/G 1 138 122 260 62.997216289263 66.306808787753 -3.30959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.708883154898402 ENSG00000149761:ENST00000441250:exon_63997322_63997487:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000428347:exon_63997322_63997487:NUDT22;ENSG00000149761:ENST00000279206:exon_63997322_63997487:NUDT22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64001432 C/G 1 158 81 239 72.127247635533 44.0233730476065 28.1038745879265 C:G C G 10 0.5434984326865 0.000262068939092691 ENSG00000110011:ENST00000321685:exon_64001366_64001452:DNAJC4;ENSG00000110011:ENST00000321460:exon_64001366_64001452:DNAJC4;ENSG00000110011:ENST00000355040:exon_64001366_64001452:DNAJC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64033360 G/T 1 13 7 20 5.9345203750755 3.8044890288055 2.13003134627 T:G G T 10 0.5434984326865 0.377414731649604 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64033358_64033511:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64033358_64033511:PLCB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64034866 G/A 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64081445 G/A 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000173153:ENST00000406310:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000000442:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000405666:exon_64081423_64081539:ESRRA;ENSG00000173153:ENST00000467987:exon_64081243_64081539:ESRRA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64108207 C/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64108079_64108224:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64108079_64108224:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64108079_64108224:CCDC88B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64109160 G/C 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 C:G G C 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64111665 C/T 1 15 13 28 6.8475235097025 7.0654796249245 -0.217956115222 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 19 15 34 8.6735297789565 8.1524764902975 0.521053288658999 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64121190 C/G 1 40 33 73 18.26006269254 17.9354482786545 0.324614413885499 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64121187_64121285:CCDC88B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 9 15 24 4.1085141058215 8.1524764902975 -4.043962384476 T:C T C 10 0.5434984326865 0.10502586566013 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 14 11 25 6.391021942389 5.9784827595515 0.4125391828375 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64799998 T/C 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000529673:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000534637:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000524831:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64799903_64800023:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000525648:exon_64799903_64800023:SNX15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64882789 C/T 1 26 18 44 11.869040750151 9.782971788357 2.086068961794 T:C C T 10 0.5434984326865 0.549164602044803 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 28 36 64 12.782043884778 19.565943576714 -6.783899691936 T:C C T 10 0.5434984326865 0.102571228525029 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65266541 G/T 1 1120 305 1425 511.28175539112 165.767021969383 345.514733421737 T:G G T 10 0.5434984326865 5.589487315969e-81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65306073 C/T 1 117 92 209 53.4106833756795 50.001855807158 3.4088275685215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.677113748002741 ENSG00000142186:ENST00000270176:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000525364:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000420247:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000533862:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527630:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000349495:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000279270:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000417543:exon_65305913_65306172:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000524944:exon_65305741_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000527009:exon_65305913_65306146:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000528545:exon_65305913_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000534462:exon_65305918_65306175:SCYL1;ENSG00000142186:ENST00000532290:exon_65305320_65306175:SCYL1;ENSG00000168056:ENST00000301874:exon_65306031_65306702:LTBP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65349756 T/G 1 6 13 19 2.739009403881 7.0654796249245 -4.3264702210435 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0634141897264214 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65351074 G/A 1 32 19 51 14.608050154032 10.3264702210435 4.2815799329885 A:G G A 10 0.5434984326865 0.261710504990554 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533465:exon_65351063_65351236:EHBP1L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65487616 G/A 1 174 170 344 79.431272712549 92.394733556705 -12.963460844156 A:G G A 10 0.5434984326865 0.175952997511673 ENSG00000172922:ENST00000534482:exon_65487516_65487635:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000308418:exon_65487516_65487635:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000533698:exon_65487516_65487635:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000531596:exon_65487516_65487635:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000528220:exon_65487516_65487635:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000527610:exon_65487192_65487635:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000530192:exon_65487525_65487888:RNASEH2C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 2032 2018 4050 927.611184781032 1096.77983716136 -169.168652380325 A:G G A 10 0.5434984326865 1.04625540553241e-07 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65623739 A/G 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65629932 T/C 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65629934 G/C 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525768:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533555:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65629915_65630000:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530111:exon_65629915_65630000:MUS81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 A:G G A 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 20 23 43 9.13003134627 12.5004639517895 -3.3704326055195 T:G G T 10 0.5434984326865 0.358727344946398 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 26 24 50 11.869040750151 13.043962384476 -1.174921634325 A:G G A 10 0.5434984326865 0.777492953163059 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65733393 C/T 1 64 65 129 29.216100308064 35.3273981246225 -6.1112978165585 T:C C T 10 0.5434984326865 0.289823694493883 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733358_65733457:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733358_65733457:SART1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 54 41 95 24.651084634929 22.2834357401465 2.3676488947825 C:G G C 10 0.5434984326865 0.680781305399627 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 65826704 G/A 1 194 186 380 88.561304058819 101.090708479689 -12.52940442087 A:G G A 10 0.5434984326865 0.198386694047770 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 66031660 C/T 1 12 8 20 5.478018807762 4.347987461492 1.13003134627 T:C C T 10 0.5434984326865 0.65993989106057 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66031517_66031690:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66031517_66031690:KLC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 6 17 23 2.739009403881 9.2394733556705 -6.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0103109214666343 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 80 75 155 36.52012538508 40.7623824514875 -4.2422570664075 A:G G A 10 0.5434984326865 0.519301980988691 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 48 29 77 21.912075231048 15.7614545479085 6.1506206831395 T:C C T 10 0.5434984326865 0.170911647087290 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 66313203 T/C 0 27 0 27 12.3255423174645 0 12.3255423174645 T T 10 0.5434984326865 9.20049942430516e-08 ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66313194_66313507:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66313194_66313706:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000310442:exon_66313194_66313709:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000525925:exon_66313194_66313477:ZDHHC24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 67068572 C/T 1 19 31 50 8.6735297789565 16.8484514132815 -8.174921634325 T:C C T 10 0.5434984326865 0.022858792460078 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068461_67068618:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000506119:exon_67068461_67068599:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068247_67068618:ANKRD13D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 67177154 C/T 1 39 49 88 17.8035611252265 26.6314232016385 -8.827862076412 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.0684726327896081 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67176878_67177560:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67176878_67177560:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67176878_67177557:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67176878_67177559:TBC1D10C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 67804074 C/T 1 177 202 379 80.8007774144895 109.786683402673 -28.9859059881835 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00324089354961209 ENSG00000110717:ENST00000313468:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000528492:exon_67803929_67804106:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000524810:exon_67803929_67804111:NDUFS8;ENSG00000110717:ENST00000531282:exon_67803929_67804111:NDUFS8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 68029887 G/A 1 33 16 49 15.0645517213455 8.695974922984 6.3685767983615 A:G G A 10 0.5434984326865 0.084439476926115 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 68030015 C/T 1 12 26 38 5.478018807762 14.130959249849 -8.652940442087 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00535834450370339 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 68192690 G/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 68216333 G/T 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68216277_68216743:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68216277_68216740:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529702:exon_68216277_68216606:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529481:exon_68216277_68216650:LRP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 68855363 G/A 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.100680878973953 ENSG00000162341:ENST00000294309:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000442692:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000356782:exon_68855343_68858072:TPCN2;ENSG00000162341:ENST00000450354:exon_68855343_68858072:TPCN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 13 14 27 5.9345203750755 7.608978057611 -1.6744576825355 A:G A G 10 0.5434984326865 0.56537974762447 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 71718413 C/T 0 65 0 65 29.6726018753775 0 29.6726018753775 C C 10 0.5434984326865 1.17436192462285e-17 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71718235_71718481:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71718235_71718481:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71718235_71718481:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71718235_71718481:NUMA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 71720030 G/A 1 24 32 56 10.956037615524 17.391949845968 -6.435912230444 A:G G A 10 0.5434984326865 0.10665581089562 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71720013_71720231:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71720013_71720231:NUMA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 71942104 C/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71942037_71942233:INPPL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 71943960 C/A 1 17 7 24 7.7605266443295 3.8044890288055 3.956037615524 A:C C A 10 0.5434984326865 0.150073663112285 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71943919_71944018:INPPL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 71943961 C/A 1 17 7 24 7.7605266443295 3.8044890288055 3.956037615524 A:C C A 10 0.5434984326865 0.150073663112285 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71943919_71944018:INPPL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 72408055 G/C 1 47 33 80 21.4555736637345 17.9354482786545 3.52012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.500950339133875 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72407594_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72408028_72408240:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72408028_72408240:ARAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 72535885 C/T 1 6 9 15 2.739009403881 4.8914858941785 -2.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.306258513762735 ENSG00000168010:ENST00000321297:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000435507:exon_72535779_72535887:ATG16L2;ENSG00000168010:ENST00000439504:exon_72533893_72535887:ATG16L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 73620537 C/G 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 C:G C G 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 96 106 202 43.824150462096 57.610833864769 -13.786683402673 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.0563759399344049 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 14 11 25 6.391021942389 5.9784827595515 0.4125391828375 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 77378388 T/C 1 18 13 31 8.217028211643 7.0654796249245 1.1515485867185 T:C T C 10 0.5434984326865 0.721663380389718 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 77378505 A/G 1 18 18 36 8.217028211643 9.782971788357 -1.565943576714 A:G A G 10 0.5434984326865 0.619354655164741 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 77409568 T/C 1 6 14 20 2.739009403881 7.608978057611 -4.86996865373 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0410079712081252 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 20 19 39 9.13003134627 10.3264702210435 -1.1964388747735 T:C T C 10 0.5434984326865 0.74916071169288 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 77583266 G/A 1 14 12 26 6.391021942389 6.521981192238 -0.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 82564312 C/T 1 10 14 24 4.565015673135 7.608978057611 -3.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 0.225358769194005 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 82644904 G/A 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000165490:ENST00000528759:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000533655:exon_82642774_82645701:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000329143:exon_82642774_82645697:C11orf82;ENSG00000165490:ENST00000430323:exon_82642774_82645697:C11orf82 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:C A C 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 4 10 14 1.826006269254 5.434984326865 -3.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0624180255724271 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 20 10 30 9.13003134627 5.434984326865 3.695047019405 T:G G T 10 0.5434984326865 0.201922119852062 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 93464175 A/C 1 24 23 47 10.956037615524 12.5004639517895 -1.5444263362655 A:C A C 10 0.5434984326865 0.663232845202314 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000530769:exon_93463843_93464382:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529900:exon_93463833_93464382:TAF1D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 93529655 G/A 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 A:G G A 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000427225:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000525026:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533367:exon_93529576_93529706:MED17;ENSG00000042429:ENST00000531920:exon_93529576_93529706:MED17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 94862577 G/T 0 0 8 8 0 4.347987461492 -4.347987461492 T G T 10 0.5434984326865 0.00188598477958497 ENSG00000149218:ENST00000278505:exon_94861541_94865815:ENDOD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 95512060 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000077458:ENST00000358780:exon_95511986_95512121:FAM76B;ENSG00000077458:ENST00000398187:exon_95511986_95512121:FAM76B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 46 51 97 20.999072096421 27.7184200670115 -6.7193479705905 A:G A G 10 0.5434984326865 0.185511962321774 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 95580926 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000087053:ENST00000346299:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000393223:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000409459:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000352297:exon_95580878_95581063:MTMR2;ENSG00000087053:ENST00000444541:exon_95580878_95581063:MTMR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 96116444 T/C 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96116433_96116637:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96113701_96116637:CCDC82 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 102201848 G/A 1 40 33 73 18.26006269254 17.9354482786545 0.324614413885499 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102201730_102201972:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102201730_102201972:BIRC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 40 50 90 18.26006269254 27.174921634325 -8.914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0714996452091106 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 102272277 G/T 1 63 65 128 28.7595987407505 35.3273981246225 -6.567799383872 T:G G T 10 0.5434984326865 0.249864600223552 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272270_102272423:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272270_102272423:TMEM123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 102272839 C/A 1 30 50 80 13.695047019405 27.174921634325 -13.47987461492 A:C C A 10 0.5434984326865 0.00327022500154162 ENSG00000152558:ENST00000361236:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000398136:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000532161:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000528969:exon_102272647_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000529492:exon_102272475_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000525577:exon_102272656_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000531103:exon_102272765_102272937:TMEM123;ENSG00000152558:ENST00000526676:exon_102272830_102272937:TMEM123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 107197640 T/C 1 16 18 34 7.304025077016 9.782971788357 -2.478946711341 T:C T C 10 0.5434984326865 0.396269069851091 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 243 201 444 110.929880857181 109.243184969987 1.68669588719401 A:C A C 10 0.5434984326865 0.886442053950124 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 113669979 T/C 1 6 9 15 2.739009403881 4.8914858941785 -2.1524764902975 T:C T C 10 0.5434984326865 0.306258513762735 ENSG00000048028:ENST00000260188:exon_113668598_113670137:USP28;ENSG00000048028:ENST00000003302:exon_113668598_113670137:USP28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117096652 G/A 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 A:G G A 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117096647_117096737:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117095417_117097592:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117096647_117096737:PCSK7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117097952 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117099025 A/G 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117098932_117099066:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117098932_117099066:PCSK7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117163824 C/G 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 C:G C G 10 0.5434984326865 0.126419205254674 ENSG00000186318:ENST00000313005:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000392937:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000528053:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510630:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000428381:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000513780:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000445823:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000292095:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530824:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000530844:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000510915:exon_117163770_117163904:BACE1;ENSG00000186318:ENST00000504995:exon_117163787_117163904:BACE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117864047 A/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 117864113 G/A 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000110324:ENST00000227752:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530761:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000533700:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000526544:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534574:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000529924:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000534335:exon_117863956_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000530178:exon_117863723_117864125:IL10RA;ENSG00000110324:ENST00000532009:exon_117863773_117864125:IL10RA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 37 41 78 16.8905579905995 22.2834357401465 -5.392877749547 T:C C T 10 0.5434984326865 0.255634094410378 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 13 14 27 5.9345203750755 7.608978057611 -1.6744576825355 A:G G A 10 0.5434984326865 0.56537974762447 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118890022 C/T 1 57 86 143 26.0205893368695 46.740865211039 -20.7202758741695 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000548675479597563 ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 56 56 112 25.564087769556 30.435912230444 -4.871824460888 T:C T C 10 0.5434984326865 0.393459735892523 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 16 7 23 7.304025077016 3.8044890288055 3.4995360482105 A:G G A 10 0.5434984326865 0.20824371770393 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.186484502076330 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 18 17 35 8.217028211643 9.2394733556705 -1.0224451440275 T:C C T 10 0.5434984326865 0.737611853756657 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 38 41 79 17.347059557913 22.2834357401465 -4.9363761822335 T:C T C 10 0.5434984326865 0.309411316408431 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 12 6 18 5.478018807762 3.260990596119 2.217028211643 A:C C A 10 0.5434984326865 0.349542691073942 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 119205830 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 119206375 G/A 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 A:G G A 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 120099679 G/A 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 120099791 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000184232:ENST00000328965:exon_120099577_120101001:OAF;ENSG00000184232:ENST00000531220:exon_120099577_120099949:OAF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2789 3040 5829 1273.18287123735 1652.23523536696 -379.052364129609 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 2.78309723872381e-23 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 122928634 A/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:T A T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 13 9 22 5.9345203750755 4.8914858941785 1.043034480897 A:G A G 10 0.5434984326865 0.676458559400952 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 33 33 66 15.0645517213455 17.9354482786545 -2.870896557309 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.537121624692167 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 68 97 165 31.042106577318 52.7193479705905 -21.6772413932725 C:G C G 10 0.5434984326865 0.000751659953963656 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:C T C 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 11 128350102 G/C 1 19 17 36 8.6735297789565 9.2394733556705 -0.565943576714 C:G G C 10 0.5434984326865 0.868528013180574 ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128350086_128350346:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128350086_128350346:ETS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 12 1 13 5.478018807762 0.5434984326865 4.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00491958291668485 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 2937013 G/C 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 C:G G C 10 0.5434984326865 0.362188250027106 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 43 39 82 19.6295673944805 21.1964388747735 -1.566871480293 A:G G A 10 0.5434984326865 0.74062721391516 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 4388084 C/G 1 68 63 131 31.042106577318 34.2404012592495 -3.1982946819315 C:G C G 10 0.5434984326865 0.59928467019304 ENSG00000118971:ENST00000261254:exon_4387926_4388085:CCND2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 19 26 45 8.6735297789565 14.130959249849 -5.4574294708925 A:G G A 10 0.5434984326865 0.133649989818961 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 23 38 61 10.4995360482105 20.652940442087 -10.1534043938765 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0099647358799641 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 6560573 G/T 1 141 73 214 64.3667209912035 39.6753855861145 24.691335405089 T:G G T 10 0.5434984326865 0.00073797913201798 ENSG00000139193:ENST00000266557:exon_6560434_6560884:CD27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 6675767 A/G 1 21 24 45 9.5865329135835 13.043962384476 -3.4574294708925 A:G A G 10 0.5434984326865 0.369446372780068 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6675695_6675783:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6675695_6675783:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6675695_6675783:NOP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 38 33 71 17.347059557913 17.9354482786545 -0.588388720741502 A:G G A 10 0.5434984326865 0.905638933730076 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 22 21 43 10.043034480897 11.4134670864165 -1.3704326055195 A:G A G 10 0.5434984326865 0.759976008303443 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 17 21 38 7.7605266443295 11.4134670864165 -3.652940442087 A:G A G 10 0.5434984326865 0.256620626722929 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 7242204 C/T 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 T:C C T 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7242183_7242329:C1R HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 7242299 G/A 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000159403:ENST00000290575:exon_7242183_7242329:C1R HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 7310163 G/A 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000139182:ENST00000266546:exon_7310085_7310287:CLSTN3;ENSG00000139182:ENST00000331148:exon_7310085_7310342:CLSTN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 7592035 G/T 0 28 0 28 12.782043884778 0 12.782043884778 G G 10 0.5434984326865 4.85112010195537e-08 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 10865873 G/A 1 39 59 98 17.8035611252265 32.0664075285035 -14.262846403277 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00435764316201449 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10865810_10865932:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10865810_10865932:CSDA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 14577892 A/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:T A T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 14587301 A/G 1 6 11 17 2.739009403881 5.9784827595515 -3.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 0.144759175784590 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14587271_14587357:ATF7IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 14656768 G/C 1 17 7 24 7.7605266443295 3.8044890288055 3.956037615524 C:G G C 10 0.5434984326865 0.150073663112285 ENSG00000121316:ENST00000240617:exon_14656597_14656888:PLBD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 14664595 A/G 1 1 8 9 0.4565015673135 4.347987461492 -3.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0142241674807915 ENSG00000121316:ENST00000240617:exon_14664445_14664645:PLBD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 21623122 T/G 1 21 25 46 9.5865329135835 13.5874608171625 -4.000927903579 T:G T G 10 0.5434984326865 0.240678034879676 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21621845_21623280:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21622697_21623280:RECQL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:G A G 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 56 64 120 25.564087769556 34.783899691936 -9.21981192238 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0990804391042461 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 25362777 A/G 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000133703:ENST00000311936:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000256078:exon_25358182_25362845:KRAS;ENSG00000133703:ENST00000406761:exon_25362729_25362845:KRAS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 28605426 G/A 1 36 40 76 16.434056423286 21.73993730746 -5.305880884174 A:G G A 10 0.5434984326865 0.249729001653518 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28605411_28605587:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28605411_28605587:CCDC91 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 38714929 A/G 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000175548:ENST00000308742:exon_38713963_38723527:ALG10B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 46320421 G/A 1 56 38 94 25.564087769556 20.652940442087 4.911147327469 A:G G A 10 0.5434984326865 0.35162972406019 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 46321514 A/T 1 18 15 33 8.217028211643 8.1524764902975 0.0645517213455005 A:T:C A T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 15 8 23 6.8475235097025 4.347987461492 2.4995360482105 T:C C T 10 0.5434984326865 0.403070581678078 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 49230035 T/G 1 31 43 74 14.1515485867185 23.3704326055195 -9.218884018801 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0354262024924543 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49229904_49230049:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49229904_49230049:DDX23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 18 14 32 8.217028211643 7.608978057611 0.608050154032001 A:G G A 10 0.5434984326865 0.861129900266574 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 51488972 C/T 1 27 14 41 12.3255423174645 7.608978057611 4.7165642598535 T:C C T 10 0.5434984326865 0.159243841973485 ENSG00000135457:ENST00000257915:exon_51488624_51489061:TFCP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 27 43 70 12.3255423174645 23.3704326055195 -11.044890288055 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0112032949196201 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 51696500 G/A 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51696470_51696564:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51696470_51696564:BIN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 53647373 T/C 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 T:C T C 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 54109659 C/T 1 13 6 19 5.9345203750755 3.260990596119 2.6735297789565 T:C C T 10 0.5434984326865 0.255120707369053 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 14 8 22 6.391021942389 4.347987461492 2.043034480897 A:G A G 10 0.5434984326865 0.40272054551298 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 54575458 T/C 1 70 36 106 31.955109711945 19.565943576714 12.389166135231 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0188646873451657 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54573783_54576174:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54575252_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54575253_54576407:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54575269_54576407:SMUG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 58 43 101 26.477090904183 23.3704326055195 3.1066582986635 A:G A G 10 0.5434984326865 0.550658779150921 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 56151291 T/C 1 91 111 202 41.5416426255285 60.3283260282015 -18.786683402673 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00885166881079216 ENSG00000205323:ENST00000444631:exon_56151167_56151337:SARNP;ENSG00000205323:ENST00000336133:exon_56151058_56151337:SARNP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 22 18 40 10.043034480897 9.782971788357 0.26006269254 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 16 12 28 7.304025077016 6.521981192238 0.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.850691379316868 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 14 18 32 6.391021942389 9.782971788357 -3.391949845968 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.287042724213305 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 56822378 T/A 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:T T A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56822333_56822436:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56822333_56822436:TIMELESS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 139 173 312 63.4537178565765 94.0252288547645 -30.571510998188 T:G G T 10 0.5434984326865 0.000627166790844764 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 37 39 76 16.8905579905995 21.1964388747735 -4.305880884174 A:G G A 10 0.5434984326865 0.35737597495503 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 39 40 79 17.8035611252265 21.73993730746 -3.9363761822335 A:G A G 10 0.5434984326865 0.429386235457516 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 58176614 T/C 1 23 18 41 10.4995360482105 9.782971788357 0.7165642598535 T:C T C 10 0.5434984326865 0.876310336009227 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58176372_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58176559_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000417094:exon_58176564_58176641:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000434359:exon_58176586_58176660:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000457189:exon_58176601_58176690:TSFM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 13 7 20 5.9345203750755 3.8044890288055 2.13003134627 C:G C G 10 0.5434984326865 0.377414731649604 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 64875787 T/A 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 A:T T A 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000183735:ENST00000331710:exon_64875622_64875801:TBK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 150 174 324 68.475235097025 94.568727287451 -26.093492190426 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00371698162770531 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 68709892 C/T 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68709858_68710033:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68709858_68710033:MDM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 69090684 A/G 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69090599_69090702:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69090599_69090702:NUP107 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 69233215 A/G 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 A:G A G 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69233054_69233629:MDM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 72307637 C/G 1 19 18 37 8.6735297789565 9.782971788357 -1.1094420094005 C:G C G 10 0.5434984326865 0.743477813502884 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 16 16 32 7.304025077016 8.695974922984 -1.391949845968 T:C T C 10 0.5434984326865 0.723350742872682 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 19 16 35 8.6735297789565 8.695974922984 -0.0224451440275004 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 T:C T C 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 93202801 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93202793_93202932:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93202793_93202932:EEA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 95694394 G/A 1 76 91 167 34.694119115826 49.4583573744715 -14.7642382586455 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0241100455860266 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 96252833 A/G 1 315 304 619 143.797993703752 165.223523536696 -21.4255298329435 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 0.0900838185221212 ENSG00000139343:ENST00000266735:exon_96252709_96252854:SNRPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 96676330 C/A 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:C C A 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000059758:ENST00000261211:exon_96676287_96676377:CDK17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 98928103 C/T 1 14 12 26 6.391021942389 6.521981192238 -0.130959249849 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 102455729 G/A 1 47 34 81 21.4555736637345 18.478946711341 2.9766269523935 A:G G A 10 0.5434984326865 0.577371428396882 ENSG00000120860:ENST00000240079:exon_102455690_102455899:CCDC53 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 104376693 G/A 0 0 15 15 0 8.1524764902975 -8.1524764902975 A G A 10 0.5434984326865 7.79173357445114e-06 ENSG00000139372:ENST00000392872:exon_104376577_104376712:TDG;ENSG00000139372:ENST00000266775:exon_104376577_104376712:TDG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 104698582 A/G 1 1 11 12 0.4565015673135 5.9784827595515 -5.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00191638591448130 ENSG00000255150:ENST00000527879:exon_104697517_104698980:EID3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 104709559 C/T 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000198431:ENST00000525566:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000429002:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526266:exon_104709555_104709604:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000503506:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526691:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531691:exon_104709555_104709679:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000388854:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526390:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000531689:exon_104709555_104709610:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000529546:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526580:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000354940:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000524698:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527688:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000378070:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000527335:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000397736:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000427956:exon_104709555_104709674:TXNRD1;ENSG00000198431:ENST00000526950:exon_104709555_104709674:TXNRD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 110841379 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000196510:ENST00000455511:exon_110841332_110841535:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000354390:exon_110841332_110841485:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000450008:exon_110841332_110841535:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000452721:exon_110841332_110841512:ANAPC7;ENSG00000196510:ENST00000464697:exon_110841332_110841494:ANAPC7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 112221055 C/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112220962_112221102:ALDH2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 87 49 136 39.7156363562745 26.6314232016385 13.084213154636 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0251821476074907 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 113610294 G/A 1 28 19 47 12.782043884778 10.3264702210435 2.4555736637345 A:G G A 10 0.5434984326865 0.558664837303248 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113610158_113610368:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113610158_113610368:DDX54 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 114282496 C/T 1 11 5 16 5.0215172404485 2.7174921634325 2.304025077016 T:C C T 10 0.5434984326865 0.31866452342011 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 114387900 G/A 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114387888_114387959:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114387888_114387959:RBM19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 120171995 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120171969_120172162:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120171969_120172162:CIT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 120589064 G/C 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 34 10 44 15.521053288659 5.434984326865 10.086068961794 A:C C A 10 0.5434984326865 0.00219715439445858 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 A:T T A 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 121442214 G/A 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.126419205254674 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 121458400 C/T 1 23 23 46 10.4995360482105 12.5004639517895 -2.000927903579 T:C C T 10 0.5434984326865 0.557930054342308 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121458121_121458861:OASL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 29 43 72 13.2385454520915 23.3704326055195 -10.131887153428 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0178904236438639 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 48 72 120 21.912075231048 39.131887153428 -17.21981192238 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.00176378193737913 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 122218808 G/A 1 68 69 137 31.042106577318 37.5013918553685 -6.4592852780505 A:G G A 10 0.5434984326865 0.30339395808562 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122213515_122219974:TMEM120B;ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122218778_122218912:RHOF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 4 11 15 1.826006269254 5.9784827595515 -4.1524764902975 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0380096891755768 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 29 26 55 13.2385454520915 14.130959249849 -0.892413797757499 T:C C T 10 0.5434984326865 0.892506881674898 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123466111 C/T 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123664514 G/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123664473_123664537:MPHOSPH9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123705962 C/T 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123705919_123706441:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123705919_123706441:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000392425:exon_123705919_123706441:MPHOSPH9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123738494 C/T 1 54 51 105 24.651084634929 27.7184200670115 -3.0673354320825 T:C C T 10 0.5434984326865 0.558054858213257 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123794104 G/T 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 T:G G T 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123794036_123794130:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123794036_123794130:SBNO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123799938 C/T 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 123810873 G/A 1 8 17 25 3.652012538508 9.2394733556705 -5.5874608171625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0276077727212527 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123810699_123810881:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123810699_123810881:SBNO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 124069214 C/T 1 32 23 55 14.608050154032 12.5004639517895 2.1075862022425 T:C C T 10 0.5434984326865 0.591138010711039 ENSG00000086598:ENST00000262225:exon_124069076_124069363:TMED2;ENSG00000086598:ENST00000438031:exon_124069076_124069363:TMED2;ENSG00000086598:ENST00000432022:exon_124069184_124069267:TMED2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 125263061 C/T 1 25 30 55 11.4125391828375 16.304952980595 -4.8924137977575 T:C C T 10 0.5434984326865 0.222925723300487 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125262186_125263132:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125262186_125263132:SCARB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 125298877 G/A 1 17 14 31 7.7605266443295 7.608978057611 0.1515485867185 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125298748_125298951:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125298748_125298951:SCARB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 1292 1292 2584 589.800024969042 702.199975030958 -112.399950061916 A:T:C:G G C 10 0.5434984326865 9.61637695148693e-06 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 125626685 C/T 1 30 15 45 13.695047019405 8.1524764902975 5.5425705291075 T:C C T 10 0.5434984326865 0.101927670377742 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125626638_125627871:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125626638_125627861:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125626638_125627861:AACS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 22 24 46 10.043034480897 13.043962384476 -3.000927903579 A:G A G 10 0.5434984326865 0.379220375370373 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 26 26 52 11.869040750151 14.130959249849 -2.261918499698 T:C C T 10 0.5434984326865 0.578649489861728 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 129299385 G/A 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129299320_129299615:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129299320_129299615:SLC15A4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 132624252 G/A 1 8 13 21 3.652012538508 7.0654796249245 -3.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.1876633788445 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 5 13 18 2.2825078365675 7.0654796249245 -4.782971788357 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0313510638317915 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 132626668 T/C 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 T:C T C 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626664_132626735:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626664_132626735:DDX51 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 132627365 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132627273_132627423:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132627273_132627423:DDX51 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 30 19 49 13.695047019405 10.3264702210435 3.3685767983615 T:C C T 10 0.5434984326865 0.390296943797341 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133212582 G/A 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 A:G G A 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133215767 A/G 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133215711_133215884:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133215711_133215884:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133215711_133215884:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133215711_133215884:POLE HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133272470 G/T 1 19 11 30 8.6735297789565 5.9784827595515 2.695047019405 T:G G T 10 0.5434984326865 0.363343516275521 ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133303973 C/G 1 44 42 86 20.086068961794 22.826934172833 -2.740865211039 C:G C G 10 0.5434984326865 0.58902743922089 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133302255_133304029:ANKLE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133306710 C/T 1 20 32 52 9.13003134627 17.391949845968 -8.261918499698 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0253746760789658 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133331364 G/A 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 T:C T C 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133423695 A/G 1 4 10 14 1.826006269254 5.434984326865 -3.608978057611 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0624180255724271 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133683020 C/T 1 7 10 17 3.1955109711945 5.434984326865 -2.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.333330524865813 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140;ENSG00000196387:ENST00000433577:exon_133682901_133683171:ZNF140 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 12 133683261 T/C 1 19 10 29 8.6735297789565 5.434984326865 3.2385454520915 T:C T C 10 0.5434984326865 0.265790726273256 ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 21086599 G/A 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21086582_21086689:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21086582_21086689:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21086582_21086689:CRYL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 21742311 C/T 0 57 0 57 26.0205893368695 0 26.0205893368695 C C 10 0.5434984326865 8.96258866726373e-16 ENSG00000165480:ENST00000298260:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000314759:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000400018:exon_21742127_21742538:SKA3;ENSG00000165480:ENST00000465471:exon_21742127_21742538:SKA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 25823441 C/T 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25820339_25823630:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25820343_25823630:MTMR6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 25823451 A/G 1 10 2 12 4.565015673135 1.086996865373 3.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0776155508599071 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25820339_25823630:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25820343_25823630:MTMR6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 25914221 A/G 1 3 9 12 1.3695047019405 4.8914858941785 -3.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0466833058359445 ENSG00000139496:ENST00000381736:exon_25914103_25916544:NUPL1;ENSG00000139496:ENST00000381718:exon_25914103_25914856:NUPL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 28197436 C/T 1 255 194 449 116.407899664943 105.438695941181 10.9692037237615 T:C C T 10 0.5434984326865 0.319828143235219 ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 28239940 G/C 1 130 112 242 59.345203750755 60.871824460888 -1.526620710133 C:G G C 10 0.5434984326865 0.846785647865021 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 28239999 A/G 1 157 177 334 71.6707460682195 96.1992225855105 -24.528476517291 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00828052340297681 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 31725260 A/G 1 18 16 34 8.217028211643 8.695974922984 -0.478946711340999 A:G A G 10 0.5434984326865 0.865422613408382 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31725084_31725328:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31725084_31725328:HSPH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 31729729 A/G 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:C T C 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 51 28 79 23.2815799329885 15.217956115222 8.0636238177665 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0714282074916044 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 88 70 158 40.172137923588 38.044890288055 2.127247635533 A:G G A 10 0.5434984326865 0.750038268767411 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 18 34 52 8.217028211643 18.478946711341 -10.261918499698 C:G G C 10 0.5434984326865 0.00502914177718525 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 27 20 47 12.3255423174645 10.86996865373 1.4555736637345 A:G A G 10 0.5434984326865 0.770079171522617 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 8 12 20 3.652012538508 6.521981192238 -2.86996865373 A:G A G 10 0.5434984326865 0.261780206050886 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 9 14 23 4.1085141058215 7.608978057611 -3.5004639517895 A:C A C 10 0.5434984326865 0.149533600784392 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 11 17 28 5.0215172404485 9.2394733556705 -4.217956115222 T:C T C 10 0.5434984326865 0.129637534329455 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 41834744 C/T 1 8 12 20 3.652012538508 6.521981192238 -2.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.261780206050886 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 42032572 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000102760:ENST00000379359:exon_42032421_42032606:C13orf15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 40 47 87 18.26006269254 25.5444263362655 -7.2843636437255 A:T A T 10 0.5434984326865 0.131787447647864 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 59 51 110 26.9335924714965 27.7184200670115 -0.784827595515001 A:C A C 10 0.5434984326865 0.923848347541402 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 46619152 G/A 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46619090_46619199:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46619090_46619199:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46619090_46619199:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000431251:exon_46619090_46619199:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000428921:exon_46619090_46619199:ZC3H13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 46919762 T/G 1 1 7 8 0.4565015673135 3.8044890288055 -3.347987461492 T:G T G 10 0.5434984326865 0.027462740321805 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 16 24 40 7.304025077016 13.043962384476 -5.73993730746 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0805484816749472 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 48619942 G/A 1 2 9 11 0.913003134627 4.8914858941785 -3.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0290321460090728 ENSG00000136159:ENST00000258662:exon_48619796_48621282:NUDT15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 193 147 340 88.1048024915055 79.8942696049155 8.21053288659 A:G G A 10 0.5434984326865 0.384057560658889 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 16 9 25 7.304025077016 4.8914858941785 2.4125391828375 A:G G A 10 0.5434984326865 0.423091520628089 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 50205025 T/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 50283819 T/C 1 7 15 22 3.1955109711945 8.1524764902975 -4.956965519103 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0515740503968818 ENSG00000102753:ENST00000261667:exon_50283708_50283836:KPNA3;ENSG00000102753:ENST00000457886:exon_50283708_50283836:KPNA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 61060049 G/A 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000083544:ENST00000196169:exon_61059933_61060082:TDRD3;ENSG00000083544:ENST00000484389:exon_61059933_61060082:TDRD3;ENSG00000083544:ENST00000377881:exon_61059933_61060082:TDRD3;ENSG00000083544:ENST00000377894:exon_61059933_61060082:TDRD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 32 36 68 14.608050154032 19.565943576714 -4.957893422682 A:G G A 10 0.5434984326865 0.273144104279134 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 16 18 34 7.304025077016 9.782971788357 -2.478946711341 T:C C T 10 0.5434984326865 0.396269069851091 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 13 17 30 5.9345203750755 9.2394733556705 -3.304952980595 T:C T C 10 0.5434984326865 0.272133535840955 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 36 23 59 16.434056423286 12.5004639517895 3.9335924714965 A:G G A 10 0.5434984326865 0.3605622713125 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 413 307 720 188.535147300476 166.854018834755 21.68112846572 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.107738277023704 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 57 107 164 26.0205893368695 58.1543322974555 -32.133742960586 A:C C A 10 0.5434984326865 5.78220011129341e-07 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 103275386 T/C 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103275227_103275390:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103275227_103275390:TPP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 37 51 88 16.8905579905995 27.7184200670115 -10.827862076412 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0242040105154935 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 4 8 12 1.826006269254 4.347987461492 -2.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.159074080491796 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 114 131 245 52.041178673739 71.1982946819315 -19.1571160081925 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0147629630895398 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 15 22 37 6.8475235097025 11.956965519103 -5.1094420094005 A:G G A 10 0.5434984326865 0.100313651452199 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 125 118 243 57.0626959141875 64.132815057007 -7.07011914281949 T:G T G 10 0.5434984326865 0.367967347652795 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 27 32 59 12.3255423174645 17.391949845968 -5.0664075285035 A:G A G 10 0.5434984326865 0.193412908067863 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 111340342 G/A 1 22 20 42 10.043034480897 10.86996865373 -0.826934172833001 A:G G A 10 0.5434984326865 0.87724105140099 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111340294_111340365:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111340294_111340365:CARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 27 26 53 12.3255423174645 14.130959249849 -1.8054169323845 A:G A G 10 0.5434984326865 0.67979002099681 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 13 115091019 C/G 1 25 17 42 11.4125391828375 9.2394733556705 2.173065827167 C:G C G 10 0.5434984326865 0.538622743741975 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 20757804 C/A 1 9 12 21 4.1085141058215 6.521981192238 -2.4134670864165 A:C C A 10 0.5434984326865 0.381551703468518 ENSG00000136319:ENST00000383029:exon_20757290_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000258821:exon_20757304_20757905:TTC5;ENSG00000136319:ENST00000423949:exon_20757688_20757905:TTC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 62 54 116 28.303097173437 29.348915365071 -1.045818191634 A:C A C 10 0.5434984326865 0.852654615780654 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 20924204 A/G 1 131 140 271 59.8017053180685 76.08978057611 -16.2880752580415 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0509083597705419 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20924073_20924260:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20924073_20924260:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20924073_20924260:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000438886:exon_20924166_20924260:APEX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 15 12 27 6.8475235097025 6.521981192238 0.3255423174645 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 14 1 15 6.391021942389 0.5434984326865 5.8475235097025 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00275698996606679 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 12 0 12 5.478018807762 0 5.478018807762 A A 10 0.5434984326865 0.000746227811175491 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 12 0 12 5.478018807762 0 5.478018807762 T T 10 0.5434984326865 0.000746227811175491 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 32 28 60 14.608050154032 15.217956115222 -0.60990596119 T:C T C 10 0.5434984326865 0.897436812439016 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 30 24 54 13.695047019405 13.043962384476 0.651084634928999 A:G G A 10 0.5434984326865 0.892120001697723 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 55 64 119 25.1075862022425 34.783899691936 -9.6763134896935 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0804971052744705 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 128 111 239 58.432200616128 60.3283260282015 -1.8961254120735 T:C T C 10 0.5434984326865 0.845610053850188 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 17 2 19 7.7605266443295 1.086996865373 6.6735297789565 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00192384323660562 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 13 15 28 5.9345203750755 8.1524764902975 -2.217956115222 C:G G C 10 0.5434984326865 0.45051072782016 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 8 12 20 3.652012538508 6.521981192238 -2.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.261780206050886 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 20 18 38 9.13003134627 9.782971788357 -0.652940442086999 A:G A G 10 0.5434984326865 0.871533201986291 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24458211 A/T 1 40 11 51 18.26006269254 5.9784827595515 12.2815799329885 A:T A T 10 0.5434984326865 0.000591907255675721 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24458027_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24458031_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24458157_24458284:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24458163_24458284:DHRS4L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24568323 C/T 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24568258_24568445:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24568258_24568445:PCK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24587639 G/A 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24587667 C/T 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24587597_24587679:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24587597_24587743:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24587597_24587743:DCAF11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24612645 C/T 1 636 689 1325 290.334996811386 374.470420120998 -84.1354233096125 A:T:C C T 10 0.5434984326865 4.00519616636799e-06 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24612571_24612698:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24612575_24612698:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24612575_24612698:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000471700:exon_24612580_24612698:PSME2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24615435 T/C 1 895 842 1737 408.568902745582 457.625680322033 -49.0567775764505 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0182631543069972 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 83 83 166 37.8896300870205 45.1103699129795 -7.220739825959 T:C C T 10 0.5434984326865 0.275704107865687 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24653523 G/C 1 32 25 57 14.608050154032 13.5874608171625 1.0205893368695 C:G G C 10 0.5434984326865 0.894379292667954 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653504_24653624:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653504_24653624:IPO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24653954 G/A 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24653856_24653969:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24653856_24653969:IPO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24654489 T/C 1 18 12 30 8.217028211643 6.521981192238 1.695047019405 T:C T C 10 0.5434984326865 0.586147274674276 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 46 34 80 20.999072096421 18.478946711341 2.52012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.653760991472406 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 36 21 57 16.434056423286 11.4134670864165 5.0205893368695 T:C T C 10 0.5434984326865 0.186994456038568 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 24761805 A/C 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 A:C A C 10 0.5434984326865 1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 31355096 C/G 1 21 10 31 9.5865329135835 5.434984326865 4.1515485867185 C:G C G 10 0.5434984326865 0.151508861811875 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31355002_31355518:COCH;ENSG00000100473:ENST00000475087:exon_31355002_31355518:COCH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 31647241 G/A 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31647226_31647460:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31647226_31647460:HECTD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 35231353 G/A 1 22 48 70 10.043034480897 26.087924768952 -16.044890288055 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000157211422985947 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35230963_35231429:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35230963_35231429:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35230963_35231429:BAZ1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 35234474 T/C 1 24 25 49 10.956037615524 13.5874608171625 -2.6314232016385 T:C T C 10 0.5434984326865 0.475718887138034 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35234227_35234474:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35234227_35234474:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35234227_35234474:BAZ1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 367 339 706 167.536075204054 184.245968680724 -16.709893476669 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.212570820480807 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 35873773 C/T 1 71 73 144 32.4116112792585 39.6753855861145 -7.263774306856 T:C C T 10 0.5434984326865 0.241743650344763 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 45700409 C/T 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45700344_45700501:C14orf106 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 51224417 G/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 14 12 26 6.391021942389 6.521981192238 -0.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 19 13 32 8.6735297789565 7.0654796249245 1.608050154032 A:G A G 10 0.5434984326865 0.599419255187098 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 62207557 C/T 1 28 17 45 12.782043884778 9.2394733556705 3.5425705291075 T:C C T 10 0.5434984326865 0.299857300538873 ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62207473_62207906:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62207473_62207906:HIF1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 64988279 A/G 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 A:G A G 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 64988924 T/C 1 17 13 30 7.7605266443295 7.0654796249245 0.695047019405001 T:C T C 10 0.5434984326865 0.856121239847662 ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 66096297 G/A 1 5 11 16 2.2825078365675 5.9784827595515 -3.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0791893749967246 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 66188593 C/T 1 11 3 14 5.0215172404485 1.6304952980595 3.391021942389 T:C C T 10 0.5434984326865 0.104744243021501 ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66188493_66188739:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66188493_66188739:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66188493_66188739:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66188493_66188739:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66188493_66188739:FUT8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 68353827 A/T 1 3 9 12 1.3695047019405 4.8914858941785 -3.521981192238 A:T A T 10 0.5434984326865 0.0466833058359445 ENSG00000182185:ENST00000487861:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000479335:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000403044:exon_68353738_68353930:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000471583:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000487270:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000344360:exon_68353738_68354043:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000488612:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000390683:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000402498:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000342389:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000474051:exon_68353738_68354267:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000497460:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000492236:exon_68353738_68353921:RAD51L1;ENSG00000182185:ENST00000478014:exon_68353819_68353921:RAD51L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 72175959 C/T 1 18 20 38 8.217028211643 10.86996865373 -2.652940442087 T:C C T 10 0.5434984326865 0.418270104386791 ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72175939_72176381:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72175939_72176381:SIPA1L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 32 22 54 14.608050154032 11.956965519103 2.651084634929 T:C T C 10 0.5434984326865 0.497331488639849 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 74203789 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74203701_74204000:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74203701_74204000:C14orf43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 74388908 T/C 1 14 27 41 6.391021942389 14.6744576825355 -8.2834357401465 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0114782396687900 ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 74424938 T/C 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:C T C 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74424850_74424980:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74424850_74424980:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74424850_74424980:COQ6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 A:T:G A T 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 56 57 113 25.564087769556 30.9794106631305 -5.4153228935745 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.345071004210717 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 88477413 C/T 1 13 11 24 5.9345203750755 5.9784827595515 -0.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 90744672 G/A 1 3 10 13 1.3695047019405 5.434984326865 -4.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0270995591275361 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 90745422 T/C 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 915 604 1519 417.698934091852 328.273053342646 89.4258807492065 T:C:G T G 10 0.5434984326865 3.93394283462430e-06 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 93652644 G/A 1 5 12 17 2.2825078365675 6.521981192238 -4.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0502092065252103 ENSG00000153485:ENST00000283534:exon_93652605_93653431:C14orf109;ENSG00000153485:ENST00000415050:exon_93652605_93653425:C14orf109 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 94528875 C/T 1 82 71 153 37.433128519707 38.5883887207415 -1.1552602010345 T:C C T 10 0.5434984326865 0.87128353845197 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 94568224 C/T 1 16 5 21 7.304025077016 2.7174921634325 4.5865329135835 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0495571727862335 ENSG00000165948:ENST00000298901:exon_94568160_94568321:IFI27L1;ENSG00000165948:ENST00000393115:exon_94568160_94568321:IFI27L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 95910933 T/C 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95910822_95910965:C14orf49 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 100996312 T/C 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:C T C 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100996157_100996625:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100996157_100996640:WDR25 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 55 67 122 25.1075862022425 36.4143949899955 -11.306808787753 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0452710148969010 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 105393556 G/C 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 C:G G C 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000166428:ENST00000392593:exon_105393478_105393567:PLD4;ENSG00000166428:ENST00000472901:exon_105393478_105393567:PLD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 0 57 0 57 26.0205893368695 0 26.0205893368695 T T 10 0.5434984326865 8.96258866726373e-16 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 23 18 41 10.4995360482105 9.782971788357 0.7165642598535 A:G G A 10 0.5434984326865 0.876310336009227 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 106174261 C/G 1 19 32 51 8.6735297789565 17.391949845968 -8.7184200670115 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0164541646828294 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 106236141 G/A 1 32 35 67 14.608050154032 19.0224451440275 -4.4143949899955 A:G G A 10 0.5434984326865 0.326613662321878 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 106307418 G/A 1 119 841 960 54.3236865103065 457.082181889346 -402.75849537904 A:T:C:G G A 10 0.5434984326865 1.15644959453840e-163 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 106370603 G/C 0 0 53 53 0 28.8054169323845 -28.8054169323845 C G C 10 0.5434984326865 8.9215531257915e-19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 14 107013129 A/C 1 7526 4 7530 3435.6307956014 2.173993730746 3433.45680187065 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 4.94065645841247e-324 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 7 10 17 3.1955109711945 5.434984326865 -2.2394733556705 A:C:G G C 10 0.5434984326865 0.333330524865813 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 34651297 C/T 1 28 58 86 12.782043884778 31.522909095817 -18.740865211039 T:C C T 10 0.5434984326865 5.18937847574455e-05 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34651089_34651503:LPCAT4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 40764549 G/A 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:G G A 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000169105:ENST00000306243:exon_40763213_40765351:CHST14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 40855210 T/A 1 30 20 50 13.695047019405 10.86996865373 2.825078365675 A:T T A 10 0.5434984326865 0.4789783933907 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 6 11 17 2.739009403881 5.9784827595515 -3.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.144759175784590 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 41813279 C/T 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 T:C C T 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41812589_41813345:RPAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 42211486 A/G 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 A:G A G 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 42459034 T/C 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42458970_42459111:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42458970_42459111:VPS39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 42734320 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42734271_42734612:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42734271_42734612:ZFP106 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 42820589 G/A 1 39 26 65 17.8035611252265 14.130959249849 3.6726018753775 A:G G A 10 0.5434984326865 0.385497007613617 ENSG00000092531:ENST00000249647:exon_42820460_42820618:SNAP23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 43632549 T/C 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000168803:ENST00000428046:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000422466:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000389651:exon_43632463_43632550:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000305605:exon_43632463_43632550:ADAL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 44038899 C/T 1 59 94 153 26.9335924714965 51.088852672531 -24.1552602010345 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000121257954785391 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 44061802 C/T 1 82 159 241 37.433128519707 86.4162507971535 -48.9831222774465 T:C C T 10 0.5434984326865 3.10463713450202e-10 ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44061716_44061844:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44061716_44061844:PDIA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 225 210 435 102.712852645537 114.134670864165 -11.4218182186275 T:C:G T C 10 0.5434984326865 0.289667008794647 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 30 32 62 13.695047019405 17.391949845968 -3.696902826563 A:C A C 10 0.5434984326865 0.373442872014741 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 44943757 A/G 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G A G 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44943689_44944137:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44943689_44944137:SPG11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 34 46 80 15.521053288659 25.000927903579 -9.47987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0426885101661652 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 30 35 65 13.695047019405 19.0224451440275 -5.3273981246225 A:T T A 10 0.5434984326865 0.213094464906084 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 9 5 14 4.1085141058215 2.7174921634325 1.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 0.594459609035139 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 48433277 A/C 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 A:C A C 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000104177:ENST00000267836:exon_48431629_48435268:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000324324:exon_48431629_48435268:MYEF2;ENSG00000104177:ENST00000454655:exon_48431629_48435268:MYEF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 48623707 G/T 1 35 34 69 15.9775548559725 18.478946711341 -2.5013918553685 T:G G T 10 0.5434984326865 0.548458183611427 ENSG00000128951:ENST00000331200:exon_48623621_48623992:DUT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 50867082 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50867049_50867332:TRPM7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 52017273 T/C 1 17 18 35 7.7605266443295 9.782971788357 -2.0224451440275 T:C T C 10 0.5434984326865 0.502602930260338 ENSG00000140280:ENST00000267838:exon_52016987_52017318:LYSMD2;ENSG00000140280:ENST00000454181:exon_52016987_52017318:LYSMD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 52258697 A/G 1 29 19 48 13.2385454520915 10.3264702210435 2.912075231048 A:G A G 10 0.5434984326865 0.469450227168335 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52257946_52258701:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52257946_52258701:LEO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 55669169 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55669147_55669348:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55669147_55669348:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000425574:exon_55669147_55669348:CCPG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 0.100680878973953 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 37 28 65 16.8905579905995 15.217956115222 1.6726018753775 A:G G A 10 0.5434984326865 0.71022528237614 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 64710827 T/C 1 19 15 34 8.6735297789565 8.1524764902975 0.521053288658999 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64710740_64710927:TRIP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 65110472 G/A 1 15 9 24 6.8475235097025 4.8914858941785 1.956037615524 A:G G A 10 0.5434984326865 0.53990005232013 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65110456_65110543:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65110456_65110543:PIF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 66625470 G/A 1 33 38 71 15.0645517213455 20.652940442087 -5.5883887207415 A:G G A 10 0.5434984326865 0.191604417530921 ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66625342_66626236:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66625342_66626082:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66625342_66626066:DIS3L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 17 34 51 7.7605266443295 18.478946711341 -10.7184200670115 C:G G C 10 0.5434984326865 0.00293140329575485 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 66793795 G/A 1 286 522 808 130.559448251661 283.706181862353 -153.146733610692 A:T:G G A 10 0.5434984326865 3.58379093466378e-27 ENSG00000174444:ENST00000307961:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000432669:exon_66793713_66793842:RPL4;ENSG00000174444:ENST00000436058:exon_66793713_66793842:RPL4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 11 11 22 5.0215172404485 5.9784827595515 -0.956965519103001 T:C C T 10 0.5434984326865 0.83116251385671 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 20 14 34 9.13003134627 7.608978057611 1.521053288659 T:C C T 10 0.5434984326865 0.731192583939071 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 70350607 C/T 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:C C T 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70350489_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70350498_70350630:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70350489_70350630:TLE3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 29 33 62 13.2385454520915 17.9354482786545 -4.696902826563 T:G G T 10 0.5434984326865 0.25221419233479 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 37 43 80 16.8905579905995 23.3704326055195 -6.47987461492 C:G G C 10 0.5434984326865 0.177680059408382 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 50 17 67 22.825078365675 9.2394733556705 13.5856050100045 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000820089314732546 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 24 22 46 10.956037615524 11.956965519103 -1.000927903579 T:C T C 10 0.5434984326865 0.769622865696112 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 10 15 25 4.565015673135 8.1524764902975 -3.5874608171625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.163877041893024 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 13 11 24 5.9345203750755 5.9784827595515 -0.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 193 195 388 88.1048024915055 105.982194373868 -17.877391882362 T:C C T 10 0.5434984326865 0.074370446662635 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 0 10 0 10 4.565015673135 0 4.565015673135 T T 10 0.5434984326865 0.00264199367542325 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75146366 G/T 1 35 27 62 15.9775548559725 14.6744576825355 1.303097173437 T:G G T 10 0.5434984326865 0.799357965442251 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75146362_75146460:SCAMP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75185670 A/G 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.126419205254674 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75188584 C/T 1 8 20 28 3.652012538508 10.86996865373 -7.217956115222 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00728028214667468 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75188493_75188666:MPI;ENSG00000178802:ENST00000379693:exon_75188493_75188842:MPI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 56 75 131 25.564087769556 40.7623824514875 -15.1982946819315 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00838976754263933 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75336729 A/G 1 31 31 62 14.1515485867185 16.8484514132815 -2.696902826563 A:G A G 10 0.5434984326865 0.52511875183695 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75336727_75336855:PPCDC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 20 14 34 9.13003134627 7.608978057611 1.521053288659 A:C C A 10 0.5434984326865 0.731192583939071 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75499619 T/C 1 19 15 34 8.6735297789565 8.1524764902975 0.521053288658999 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 16 19 35 7.304025077016 10.3264702210435 -3.0224451440275 A:G G A 10 0.5434984326865 0.314169389001376 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75503147 G/A 1 88 89 177 40.172137923588 48.3713605090985 -8.1992225855105 A:G G A 10 0.5434984326865 0.227653627011993 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75503090_75504510:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000446981:exon_75503090_75504508:C15orf39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75631587 A/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:T A T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75648650 C/T 1 28 28 56 12.782043884778 15.217956115222 -2.435912230444 T:C C T 10 0.5434984326865 0.591971342672065 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648642_75648790:MAN2C1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75649115 T/C 0 8 0 8 3.652012538508 0 3.652012538508 T T 10 0.5434984326865 0.00949952012420876 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75893521 G/T 1 21 14 35 9.5865329135835 7.608978057611 1.9775548559725 T:G G T 10 0.5434984326865 0.61145493262932 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75893479_75893559:SNUPN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75893532 G/A 1 14 18 32 6.391021942389 9.782971788357 -3.391949845968 A:G G A 10 0.5434984326865 0.287042724213305 ENSG00000169371:ENST00000308588:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000371091:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000432476:exon_75893479_75893559:SNUPN;ENSG00000169371:ENST00000394932:exon_75893479_75893559:SNUPN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 73 91 164 33.3246144138855 49.4583573744715 -16.133742960586 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0120783828676638 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 77329400 G/A 1 4 22 26 1.826006269254 11.956965519103 -10.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 8.1681772467211e-05 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77329386_77329671:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77329386_77329671:PSTPIP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 48 50 98 21.912075231048 27.174921634325 -5.262846403277 A:T T A 10 0.5434984326865 0.310994043378693 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 78441769 T/C 1 11 6 17 5.0215172404485 3.260990596119 1.7605266443295 T:C T C 10 0.5434984326865 0.470234227697998 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78441663_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78441719_78441772:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000379576:exon_78441720_78441772:IDH3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 78585106 C/T 1 45 46 91 20.5425705291075 25.000927903579 -4.4583573744715 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400007391632878 ENSG00000140395:ENST00000267973:exon_78584958_78585130:WDR61 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 106 98 204 48.389166135231 53.262846403277 -4.873680268046 T:C C T 10 0.5434984326865 0.527173259742316 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 33 96 129 15.0645517213455 52.175849537904 -37.1112978165585 T:C T C 10 0.5434984326865 5.78481049007861e-11 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 80263217 C/T 1 505 487 992 230.533291493318 264.683736718326 -34.150445225008 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.0302130801285846 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 268 288 556 122.342420040018 156.527548613712 -34.185128573694 A:C A C 10 0.5434984326865 0.00377425432507787 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 80263406 C/T 1 232 210 442 105.908363616732 114.134670864165 -8.226307247433 T:C C T 10 0.5434984326865 0.445054914605722 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 80452172 G/C 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 C:G G C 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80452098_80452219:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80452098_80452219:FAH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 80472561 C/T 1 26 29 55 11.869040750151 15.7614545479085 -3.8924137977575 T:C C T 10 0.5434984326865 0.343568648010742 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80472466_80472567:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80472466_80472567:FAH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 92 84 176 41.998144192842 45.653868345666 -3.655724152824 A:C C A 10 0.5434984326865 0.596862597946472 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 94 90 184 42.911147327469 48.914858941785 -6.003711614316 A:T:G A G 10 0.5434984326865 0.375694811019779 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 81598269 T/G 1 76 92 168 34.694119115826 50.001855807158 -15.307736691332 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0199604353311215 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 82 80 162 37.433128519707 43.47987461492 -6.046746095213 A:G G A 10 0.5434984326865 0.345034926932733 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 A:C A C 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 C:G C G 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:G T G 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 85200520 G/T 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 T:G G T 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000197696:ENST00000360476:exon_85200407_85200579:NMB;ENSG00000197696:ENST00000394588:exon_85200407_85200579:NMB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 86284342 C/T 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86284277_86284726:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86284277_86284726:AKAP13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 4 10 14 1.826006269254 5.434984326865 -3.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0624180255724271 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 89804043 C/T 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 20 5 25 9.13003134627 2.7174921634325 6.4125391828375 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0142368416958673 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 90170237 C/T 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90170187_90171250:C15orf42 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 90814664 C/T 1 32 64 96 14.608050154032 34.783899691936 -20.175849537904 T:C C T 10 0.5434984326865 5.09344935750336e-05 ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:G G A 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 6 9 15 2.739009403881 4.8914858941785 -2.1524764902975 C:G G C 10 0.5434984326865 0.306258513762735 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 91474738 G/C 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 C:G G C 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 91478544 A/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:C A C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 T:C C T 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 100269680 G/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 C:G G C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 100269749 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000484050:exon_100269703_100269936:LYSMD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 101113862 C/T 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101113856_101114446:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101113767_101114446:LINS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 2 11 13 0.913003134627 5.9784827595515 -5.0654796249245 T:G G T 10 0.5434984326865 0.00905344703510859 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 102192540 T/G 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000184277:ENST00000428002:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000347970:exon_102192474_102192594:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000333202:exon_102192474_102192570:TM2D3;ENSG00000184277:ENST00000453041:exon_102192474_102192594:TM2D3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 15 102224341 G/A 1 12 9 21 5.478018807762 4.8914858941785 0.5865329135835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.830554848512144 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102224278_102224440:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102224278_102224440:TARSL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 101645 C/T 1 64 46 110 29.216100308064 25.000927903579 4.215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.444858342865327 ENSG00000161980:ENST00000293860:exon_101558_101645:POLR3K;ENSG00000161980:ENST00000481810:exon_101558_102142:POLR3K HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 73 74 147 33.3246144138855 40.218884018801 -6.8942696049155 T:C C T 10 0.5434984326865 0.281781993096664 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 160602 T/G 1 11 11 22 5.0215172404485 5.9784827595515 -0.956965519103001 T:G T G 10 0.5434984326865 0.83116251385671 ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000473674:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000483663:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000457916:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000468260:exon_160523_160604:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000456528:exon_160523_160604:NPRL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 304514 C/T 1 8 2 10 3.652012538508 1.086996865373 2.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.122678215119332 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000419173:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000426695:exon_304328_304564:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000438220:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000447499:exon_304380_304673:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_304387_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000417499:exon_304328_304618:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_304380_304680:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000496874:exon_304121_304680:ITFG3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 315008 A/G 1 16 17 33 7.304025077016 9.2394733556705 -1.9354482786545 A:G A G 10 0.5434984326865 0.6008174059021 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_314810_316124:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_314810_316119:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_314810_316090:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000424016:exon_314810_315089:ITFG3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 164 151 315 74.866257039414 82.0682633356615 -7.2020062962475 A:G A G 10 0.5434984326865 0.428716731126046 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 420189 G/A 0 275 0 275 125.537931011213 0 125.537931011213 G G 10 0.5434984326865 1.73011067945593e-73 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 112 113 225 51.128175539112 61.4153228935745 -10.2871473544625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.180778796373145 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 193 167 360 88.1048024915055 90.7642382586455 -2.65943576714001 T:C C T 10 0.5434984326865 0.79151829548719 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:C C A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 602481 C/T 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 0 0 10 10 0 5.434984326865 -5.434984326865 T C T 10 0.5434984326865 0.000393027310451646 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 35 21 56 15.9775548559725 11.4134670864165 4.564087769556 T:C C T 10 0.5434984326865 0.230521181532604 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 1400822 G/A 1 84 62 146 38.346131654334 33.696902826563 4.649228827771 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.455686699289072 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400808_1401001:C16orf42 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 1818783 C/T 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818704_1820318:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818704_1820317:MAPK8IP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 34 28 62 15.521053288659 15.217956115222 0.303097173437001 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 32 27 59 14.608050154032 14.6744576825355 -0.0664075285035004 A:C C A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 52 56 108 23.738081500302 30.435912230444 -6.697830730142 T:C T C 10 0.5434984326865 0.209689181839903 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2013198 A/G 1 873 1374 2247 398.525868264686 746.766846511251 -348.240978246565 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 4.17321027824716e-49 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526586:exon_2013150_2013259:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000532746:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533872:exon_2012737_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2012911_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2012498_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000526908:exon_2013150_2013257:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2012951_2013257:RPS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 4 10 14 1.826006269254 5.434984326865 -3.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0624180255724271 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 11 27 38 5.0215172404485 14.6744576825355 -9.652940442087 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00179476951312056 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2818176 G/A 1 64 79 143 29.216100308064 42.9363761822335 -13.7202758741695 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0232730469138298 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2817857_2818262:SRRM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 303 267 570 138.31997489599 145.114081527295 -6.794106631305 A:T:G G T 10 0.5434984326865 0.584739407456547 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2821525 G/A 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2867450 G/C 0 15 0 15 6.8475235097025 0 6.8475235097025 G G 10 0.5434984326865 0.000114445068630657 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2867431_2867457:PRSS21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2871121 T/C 0 21 0 21 9.5865329135835 0 9.5865329135835 T T 10 0.5434984326865 4.5824929889477e-06 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2871555 G/A 0 38 0 38 17.347059557913 0 17.347059557913 G G 10 0.5434984326865 9.1898154967214e-11 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2871367_2871720:PRSS21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 34 10 44 15.521053288659 5.434984326865 10.086068961794 T:C:G G T 10 0.5434984326865 0.00219715439445858 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 38 33 71 17.347059557913 17.9354482786545 -0.588388720741502 T:C C T 10 0.5434984326865 0.905638933730076 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 12 2 14 5.478018807762 1.086996865373 4.391021942389 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0280899078383097 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 3558389 C/T 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000103351:ENST00000341633:exon_3558289_3558468:CLUAP1;ENSG00000103351:ENST00000417763:exon_3558289_3558468:CLUAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 13 14 27 5.9345203750755 7.608978057611 -1.6744576825355 T:C C T 10 0.5434984326865 0.56537974762447 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 4747019 G/A 0 12 0 12 5.478018807762 0 5.478018807762 G G 10 0.5434984326865 0.000746227811175491 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747018_4747105:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747018_4747105:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747018_4747105:ANKS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 4848178 A/G 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000067836:ENST00000322048:exon_4848072_4848185:ROGDI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 8722629 G/C 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 C:G G C 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 10862964 A/G 1 125 143 268 57.0626959141875 77.7202758741695 -20.657579959982 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0118918747522844 ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10862904_10863208:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10862904_10863208:NUBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 11001421 C/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:C C A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 11001743 G/A 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 15 7 22 6.8475235097025 3.8044890288055 3.043034480897 T:C C T 10 0.5434984326865 0.207416312209616 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 13 9 22 5.9345203750755 4.8914858941785 1.043034480897 T:C C T 10 0.5434984326865 0.676458559400952 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 96 71 167 43.824150462096 38.5883887207415 5.2357617413545 C:G C G 10 0.5434984326865 0.4378742010639 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 12 26 38 5.478018807762 14.130959249849 -8.652940442087 A:C A C 10 0.5434984326865 0.00535834450370339 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 16 16 32 7.304025077016 8.695974922984 -1.391949845968 A:G A G 10 0.5434984326865 0.723350742872682 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 114 111 225 52.041178673739 60.3283260282015 -8.2871473544625 A:G A G 10 0.5434984326865 0.284409810128589 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 100 89 189 45.65015673135 48.3713605090985 -2.7212037777485 T:G G T 10 0.5434984326865 0.715315248702048 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 25 27 52 11.4125391828375 14.6744576825355 -3.261918499698 T:G T G 10 0.5434984326865 0.404572499785401 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 15818141 A/C 1 9 5 14 4.1085141058215 2.7174921634325 1.391021942389 A:C A C 10 0.5434984326865 0.594459609035139 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818018_15818266:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818018_15818266:MYH11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 11 8 19 5.0215172404485 4.347987461492 0.6735297789565 A:G G A 10 0.5434984326865 0.821132279555771 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 20792321 G/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 C:G G C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000005187:ENST00000289416:exon_20792296_20792452:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000440284:exon_20792296_20792452:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000450120:exon_20792296_20792452:ACSM3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 20796387 G/C 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 C:G G C 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000005187:ENST00000289416:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000440284:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000450120:exon_20796306_20796429:ACSM3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 20807685 A/G 1 51 6 57 23.2815799329885 3.260990596119 20.0205893368695 A:G A G 10 0.5434984326865 2.33998306679024e-08 ENSG00000196678:ENST00000357967:exon_20807666_20810389:ERI2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 20811681 C/T 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000196678:ENST00000300005:exon_20811624_20811724:ERI2;ENSG00000196678:ENST00000396074:exon_20811624_20811724:ERI2;ENSG00000196678:ENST00000357967:exon_20811624_20811724:ERI2;ENSG00000196678:ENST00000389345:exon_20811624_20811724:ERI2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 23503040 C/T 1 13 14 27 5.9345203750755 7.608978057611 -1.6744576825355 T:C C T 10 0.5434984326865 0.56537974762447 ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23502998_23503121:GGA2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 18 14 32 8.217028211643 7.608978057611 0.608050154032001 T:C T C 10 0.5434984326865 0.861129900266574 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 118 74 192 53.867184942993 40.218884018801 13.648300924192 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0504598544054743 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 27374340 G/A 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 28508069 C/T 0 0 10 10 0 5.434984326865 -5.434984326865 T C T 10 0.5434984326865 0.000393027310451646 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 0 0 8 8 0 4.347987461492 -4.347987461492 G A G 10 0.5434984326865 0.00188598477958497 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 12 10 22 5.478018807762 5.434984326865 0.043034480897 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 28944700 G/T 1 31 32 63 14.1515485867185 17.391949845968 -3.2404012592495 T:G G T 10 0.5434984326865 0.448940797931293 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944555_28944830:CD19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 77 69 146 35.1506206831395 37.5013918553685 -2.350771172229 T:C C T 10 0.5434984326865 0.739824985732401 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 29816237 G/A 1 97 115 212 44.2806520294095 62.5023197589475 -18.221667729538 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0129721116406494 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29816135_29816347:KIF22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:G G T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 30783282 C/T 1 21 16 37 9.5865329135835 8.695974922984 0.8905579905995 T:C C T 10 0.5434984326865 0.869374398969832 ENSG00000103549:ENST00000324685:exon_30783154_30783294:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000357890:exon_30783154_30783294:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000380329:exon_30783154_30783294:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000402121:exon_30783154_30783294:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000493683:exon_30783154_30783294:RNF40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 31072620 G/A 1 22 13 35 10.043034480897 7.0654796249245 2.9775548559725 A:G G A 10 0.5434984326865 0.396639731916959 ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 46642286 G/A 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46642209_46642301:SHCBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 46723598 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000091651:ENST00000219097:exon_46723558_46723682:ORC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 8 11 19 3.652012538508 5.9784827595515 -2.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.358365878943715 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 53504721 T/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 56500132 C/T 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 56500176 T/A 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 A:T T A 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56500064_56500180:OGFOD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 57392733 A/C 1 120 152 272 54.78018807762 82.611761768348 -27.831573690728 A:C A C 10 0.5434984326865 0.000790310138289196 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57392684_57392801:CCL22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 57786711 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786690_57786840:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786690_57786840:KATNB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 57787906 C/T 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57787857_57787907:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57787857_57787907:KATNB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 58743454 A/C 1 46 23 69 20.999072096421 12.5004639517895 8.4986081446315 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0405207441530353 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58743321_58743471:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000494627:exon_58742953_58743471:GOT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 58750604 G/A 1 39 20 59 17.8035611252265 10.86996865373 6.9335924714965 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0885125300701542 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58750567_58750717:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58750567_58750717:GOT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 58757668 A/C 1 23 10 33 10.4995360482105 5.434984326865 5.0645517213455 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0825066204661177 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 23 9 32 10.4995360482105 4.8914858941785 5.608050154032 A:G A G 10 0.5434984326865 0.051340711277454 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 67685900 C/T 1 23 18 41 10.4995360482105 9.782971788357 0.7165642598535 T:C C T 10 0.5434984326865 0.876310336009227 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67685824_67685911:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67685824_67685911:RLTPR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 67691515 C/A 1 89 55 144 40.6286394909015 29.8924137977575 10.736225693144 A:C C A 10 0.5434984326865 0.078895354455148 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691433_67691587:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691435_67691587:ACD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 67691668 A/G 1 69 42 111 31.4986081446315 22.826934172833 8.6716739717985 A:G A G 10 0.5434984326865 0.105566061231794 ENSG00000102977:ENST00000219251:exon_67691665_67691756:ACD;ENSG00000102977:ENST00000393919:exon_67691665_67691756:ACD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 68336360 A/G 1 13 13 26 5.9345203750755 7.0654796249245 -1.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.696932813908347 ENSG00000103061:ENST00000263997:exon_68336284_68336404:SLC7A6OS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 27 21 48 12.3255423174645 11.4134670864165 0.912075231048 T:C C T 10 0.5434984326865 0.885076493030178 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 35 32 67 15.9775548559725 17.391949845968 -1.4143949899955 A:G G A 10 0.5434984326865 0.806478365768894 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 69782855 C/T 1 84 105 189 38.346131654334 57.0673354320825 -18.7212037777485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00681259010096045 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69782821_69783021:NOB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 69967897 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69967873_69968032:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69967873_69968032:WWP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 69973825 G/A 1 2 9 11 0.913003134627 4.8914858941785 -3.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0290321460090728 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973744_69975644:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973744_69975643:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973744_69975643:WWP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 70285715 G/A 0 28 0 28 12.782043884778 0 12.782043884778 G G 10 0.5434984326865 4.85112010195537e-08 ENSG00000223496:ENST00000435634:exon_70284134_70285833:EXOSC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 70601320 G/T 1 63 70 133 28.7595987407505 38.044890288055 -9.2852915473045 T:G G T 10 0.5434984326865 0.117069900721531 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70601314_70601439:SF3B3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 70726810 C/T 0 15 0 15 6.8475235097025 0 6.8475235097025 C C 10 0.5434984326865 0.000114445068630657 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70726724_70726874:VAC14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 71961535 A/C 1 28 43 71 12.782043884778 23.3704326055195 -10.5883887207415 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0123341860482586 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71961517_71962913:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71961517_71962906:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71961517_71962906:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71961517_71962913:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71961517_71962906:KIAA0174 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:C:G C G 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 6 11 17 2.739009403881 5.9784827595515 -3.2394733556705 A:C C A 10 0.5434984326865 0.144759175784590 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:C T C 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 72137561 G/A 1 6 11 17 2.739009403881 5.9784827595515 -3.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.144759175784590 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72137501_72137687:DHX38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 72139184 C/A 1 30 11 41 13.695047019405 5.9784827595515 7.7165642598535 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0179262691597339 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72139131_72139247:DHX38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 1 39 3 42 17.8035611252265 1.6304952980595 16.173065827167 T:C C T 10 0.5434984326865 6.76082523899953e-08 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 75204282 C/A 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000184517:ENST00000332307:exon_75203151_75206129:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000464850:exon_75203151_75205898:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000393430:exon_75203151_75206114:ZFP1;ENSG00000184517:ENST00000378686:exon_75203151_75206129:ZFP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 75269727 G/A 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 75681756 C/A 1 20 13 33 9.13003134627 7.0654796249245 2.0645517213455 A:C C A 10 0.5434984326865 0.49099550554076 ENSG00000166848:ENST00000300086:exon_75681684_75682450:TERF2IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 77775672 A/G 1 11 2 13 5.0215172404485 1.086996865373 3.9345203750755 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0469678452157161 ENSG00000140876:ENST00000268533:exon_77775479_77776151:NUDT7;ENSG00000140876:ENST00000437314:exon_77775479_77776151:NUDT7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 140 167 307 63.91021942389 90.7642382586455 -26.8540188347555 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00234886621701412 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 20 21 41 9.13003134627 11.4134670864165 -2.2834357401465 A:G A G 10 0.5434984326865 0.531753840069921 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 41 41 82 18.7165642598535 22.2834357401465 -3.566871480293 T:C C T 10 0.5434984326865 0.439722086860702 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 81957137 C/T 1 60 47 107 27.39009403881 25.5444263362655 1.8456677025445 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.771273040321883 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81957090_81957199:PLCG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 81971403 T/C 1 126 175 301 57.519197481501 95.1122257201375 -37.5930282386365 T:C T C 10 0.5434984326865 1.69139680801438e-05 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 82182286 C/G 1 14 25 39 6.391021942389 13.5874608171625 -7.1964388747735 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0239823445633393 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 82182354 G/A 1 18 30 48 8.217028211643 16.304952980595 -8.087924768952 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0205238812070601 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 0 9 0 9 4.1085141058215 0 4.1085141058215 T T 10 0.5434984326865 0.00499889953481625 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 82203758 C/T 0 11 0 11 5.0215172404485 0 5.0215172404485 C C 10 0.5434984326865 0.00140172727774491 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 10 0 10 4.565015673135 0 4.565015673135 G G 10 0.5434984326865 0.00264199367542325 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 84691044 C/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84690477_84691550:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84690477_84691519:KLHL36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 0 0 10 10 0 5.434984326865 -5.434984326865 C A C 10 0.5434984326865 0.000393027310451646 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 586 753 1339 267.509918445711 409.254319812935 -141.744401367224 A:G G A 10 0.5434984326865 1.01794251259447e-14 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 85840474 G/A 1 1209 993 2202 551.910394882021 539.693943657694 12.216451224327 A:T:C:G G A 10 0.5434984326865 0.60771839452617 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85840344_85840608:COX4I1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 498 589 1087 227.337780522123 320.120576852349 -92.7827963302255 A:T:G A G 10 0.5434984326865 1.96321689726031e-08 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 88724347 G/T 1 22 21 43 10.043034480897 11.4134670864165 -1.3704326055195 T:G G T 10 0.5434984326865 0.759976008303443 ENSG00000167508:ENST00000301012:exon_88724323_88724437:MVD;ENSG00000167508:ENST00000378400:exon_88724323_88724437:MVD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 88779032 G/C 1 14 3 17 6.391021942389 1.6304952980595 4.7605266443295 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0261739334625715 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 88779739 A/G 1 9 14 23 4.1085141058215 7.608978057611 -3.5004639517895 A:G A G 10 0.5434984326865 0.149533600784392 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779720_88779855:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779720_88779855:CTU2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 88781040 A/G 1 9 25 34 4.1085141058215 13.5874608171625 -9.478946711341 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00152913026326754 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 89349128 G/A 1 14 19 33 6.391021942389 10.3264702210435 -3.9354482786545 A:G G A 10 0.5434984326865 0.220723036124753 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 89349377 G/C 1 14 22 36 6.391021942389 11.956965519103 -5.565943576714 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0671451655397904 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 11 12 23 5.0215172404485 6.521981192238 -1.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.538430560562157 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 32 21 53 14.608050154032 11.4134670864165 3.1945830676155 A:G G A 10 0.5434984326865 0.410332641876094 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 89712374 A/C 1 21 9 30 9.5865329135835 4.8914858941785 4.695047019405 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0996049809164415 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 16 89712380 G/A 1 23 8 31 10.4995360482105 4.347987461492 6.1515485867185 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0299486288554075 ENSG00000131165:ENST00000253475:exon_89710846_89712495:CHMP1A;ENSG00000131165:ENST00000397901:exon_89710846_89712495:CHMP1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 650206 C/T 1 14 8 22 6.391021942389 4.347987461492 2.043034480897 T:C C T 10 0.5434984326865 0.40272054551298 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_649871_650522:GEMIN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 685640 G/T 1 15 17 32 6.8475235097025 9.2394733556705 -2.391949845968 T:G G T 10 0.5434984326865 0.478550518683793 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685482_685691:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1373518 T/C 1 16 9 25 7.304025077016 4.8914858941785 2.4125391828375 T:C T C 10 0.5434984326865 0.423091520628089 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1373612 C/T 1 13 17 30 5.9345203750755 9.2394733556705 -3.304952980595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.272133535840955 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1637302 A/G 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1637458 G/A 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1639458 A/G 1 8 2 10 3.652012538508 1.086996865373 2.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.122678215119332 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1639333_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1638866_1639512:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1639333_1639512:WDR81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1640793 C/T 1 8 14 22 3.652012538508 7.608978057611 -3.956965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.132270151688259 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 1782957 C/T 1 71 54 125 32.4116112792585 29.348915365071 3.0626959141875 T:C C T 10 0.5434984326865 0.591619640305587 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1782854_1782993:RPA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 2202514 G/C 1 8 1 9 3.652012538508 0.5434984326865 3.1085141058215 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0455044848393489 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 32 20 52 14.608050154032 10.86996865373 3.738081500302 A:G G A 10 0.5434984326865 0.331472278347856 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 10 14 24 4.565015673135 7.608978057611 -3.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.225358769194005 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 3568012 A/G 1 11 1 12 5.0215172404485 0.5434984326865 4.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0086122214100085 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 52 46 98 23.738081500302 25.000927903579 -1.262846403277 T:C C T 10 0.5434984326865 0.839540634694491 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 3628212 T/C 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 13 19 32 5.9345203750755 10.3264702210435 -4.391949845968 T:C T C 10 0.5434984326865 0.154832957446916 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 3844787 C/G 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 C:G C G 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4446227 T/G 1 29 32 61 13.2385454520915 17.391949845968 -4.1534043938765 T:G T G 10 0.5434984326865 0.30542093276485 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4457571 C/T 1 16 10 26 7.304025077016 5.434984326865 1.869040750151 T:C C T 10 0.5434984326865 0.556526773934017 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4457490_4457573:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4457490_4457573:MYBBP1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 1 62 37 99 28.303097173437 20.1094420094005 8.1936551640365 A:G G A 10 0.5434984326865 0.106699524829841 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4796286 C/T 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4856580 T/C 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000108515:ENST00000520221:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522798:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522301:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521811:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519602:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519834:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522249:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000517627:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4856567_4856636:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4856567_4856636:ENO3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 T:C T C 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 4926882 A/G 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 A:G A G 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 63 49 112 28.7595987407505 26.6314232016385 2.128175539112 A:G A G 10 0.5434984326865 0.705424317925834 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5126689 G/A 1 60 47 107 27.39009403881 25.5444263362655 1.8456677025445 A:G G A 10 0.5434984326865 0.771273040321883 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5264916 C/T 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 T:C C T 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5264503_5264970:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5264503_5264970:RABEP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5284770 G/A 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 202 208 410 92.213316597327 113.047673998792 -20.834357401465 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0419981724051962 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 147 119 266 67.1057303950845 64.6763134896935 2.42941690539101 T:C T C 10 0.5434984326865 0.80560887939293 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 34 23 57 15.521053288659 12.5004639517895 3.0205893368695 A:T T A 10 0.5434984326865 0.506533980280844 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5418107 G/A 1 19 8 27 8.6735297789565 4.347987461492 4.3255423174645 A:G G A 10 0.5434984326865 0.121548457970906 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 10 16 26 4.565015673135 8.695974922984 -4.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.117222447360552 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5424886 G/A 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 8 13 21 3.652012538508 7.0654796249245 -3.4134670864165 T:C T C 10 0.5434984326865 0.1876633788445 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7132556 C/T 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 T:C C T 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7132454_7132593:DVL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7154534 G/A 1 46 28 74 20.999072096421 15.217956115222 5.781115981199 A:G G A 10 0.5434984326865 0.199642829667633 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7245371 A/G 1 28 31 59 12.782043884778 16.8484514132815 -4.0664075285035 A:G A G 10 0.5434984326865 0.298431755939427 ENSG00000072818:ENST00000158762:exon_7245267_7245386:ACAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7293715 C/T 1 22 26 48 10.043034480897 14.130959249849 -4.087924768952 T:C C T 10 0.5434984326865 0.249096182216153 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7293055_7293760:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7293055_7293760:PLSCR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7297452 A/G 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 A:G A G 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000187838:ENST00000324822:exon_7297423_7297590:PLSCR3;ENSG00000187838:ENST00000380658:exon_7297423_7297590:PLSCR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7400815 T/C 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 T:C T C 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400675_7400836:POLR2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7478498 G/A 1 472 392 864 215.468739771972 213.051385613108 2.41735415886399 A:G G A 10 0.5434984326865 0.89136035258393 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7478437_7478576:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7478437_7478720:EIF4A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7496411 G/A 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000129245:ENST00000250113:exon_7496302_7496499:FXR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7760397 G/A 1 263 326 589 120.05991220345 177.180489055799 -57.1205768523485 A:G G A 10 0.5434984326865 2.76592089624706e-06 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 7760704 A/G 1 84 81 165 38.346131654334 44.0233730476065 -5.6772413932725 A:G A G 10 0.5434984326865 0.39054668108704 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 170 112 282 77.605266443295 60.871824460888 16.733441982407 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0484487855070462 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 44 36 80 20.086068961794 19.565943576714 0.52012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 13 7 20 5.9345203750755 3.8044890288055 2.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 0.377414731649604 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C T C 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 16321032 G/C 1 10 18 28 4.565015673135 9.782971788357 -5.217956115222 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0573689366969762 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 16852206 A/C 1 270 326 596 123.255423174645 177.180489055799 -53.925065881154 A:C A C 10 0.5434984326865 1.03567729092778e-05 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16852052_16852297:TNFRSF13B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 17062241 C/G 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 C:G C G 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395804:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000429184:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000442194:exon_17061746_17062316:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000423885:exon_17061811_17062316:MPRIP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 57 56 113 26.0205893368695 30.435912230444 -4.4153228935745 A:G G A 10 0.5434984326865 0.450140566684408 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 18193941 G/A 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18193871_18194000:TOP3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 18232096 G/A 1 20 13 33 9.13003134627 7.0654796249245 2.0645517213455 A:G G A 10 0.5434984326865 0.49099550554076 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 18775900 A/G 1 29 24 53 13.2385454520915 13.043962384476 0.1945830676155 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 19578873 A/T 1 37 38 75 16.8905579905995 20.652940442087 -3.7623824514875 A:T A T 10 0.5434984326865 0.417838959638304 ENSG00000072210:ENST00000176643:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000395575:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000339618:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000472059:exon_19578871_19580909:ALDH3A2;ENSG00000072210:ENST00000476965:exon_19578871_19579060:ALDH3A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 27 0 27 12.3255423174645 0 12.3255423174645 T T 10 0.5434984326865 9.20049942430516e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 25 0 25 11.4125391828375 0 11.4125391828375 T T 10 0.5434984326865 3.34071326092031e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 28 0 28 12.782043884778 0 12.782043884778 G G 10 0.5434984326865 4.85112010195537e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 30 0 30 13.695047019405 0 13.695047019405 G G 10 0.5434984326865 1.36040752853445e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 29 0 29 13.2385454520915 0 13.2385454520915 C C 10 0.5434984326865 2.56538616424384e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 21 0 21 9.5865329135835 0 9.5865329135835 C C 10 0.5434984326865 4.5824929889477e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 24 0 24 10.956037615524 0 10.956037615524 C C 10 0.5434984326865 6.39716129424473e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 23 0 23 10.4995360482105 0 10.4995360482105 C C 10 0.5434984326865 1.22910232651717e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 14 0 14 6.391021942389 0 6.391021942389 C C 10 0.5434984326865 0.000213303214080523 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 21 0 21 9.5865329135835 0 9.5865329135835 C C 10 0.5434984326865 4.5824929889477e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 24 0 24 10.956037615524 0 10.956037615524 G G 10 0.5434984326865 6.39716129424473e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 51 0 51 23.2815799329885 0 23.2815799329885 G G 10 0.5434984326865 3.92702609978177e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 43 45 88 19.6295673944805 24.4574294708925 -4.827862076412 A:G G A 10 0.5434984326865 0.335765985848966 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 11 16 27 5.0215172404485 8.695974922984 -3.6744576825355 A:G G A 10 0.5434984326865 0.178233060083669 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 26519204 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000087095:ENST00000407008:exon_26519146_26519239:NLK;ENSG00000087095:ENST00000262393:exon_26519146_26519239:NLK;ENSG00000087095:ENST00000496808:exon_26519146_26519239:NLK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 26874314 G/A 1 71 58 129 32.4116112792585 31.522909095817 0.888702183441502 A:G G A 10 0.5434984326865 0.929644833577287 ENSG00000109103:ENST00000335765:exon_26873725_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000484980:exon_26873726_26874427:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000301032:exon_26873726_26874867:UNC119;ENSG00000109103:ENST00000470125:exon_26873729_26874867:UNC119 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 26905104 T/G 1 119 126 245 54.3236865103065 68.480802518499 -14.1571160081925 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0726092366543524 ENSG00000076382:ENST00000321765:exon_26905028_26905108:SPAG5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 27050724 G/A 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.76307909351412 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 27613677 G/A 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000108256:ENST00000225388:exon_27613010_27614734:NUFIP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 68 71 139 31.042106577318 38.5883887207415 -7.5462821434235 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202608103155793 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 6 10 16 2.739009403881 5.434984326865 -2.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.212818328356362 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 A:T T A 10 0.5434984326865 0.496659638628799 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 46 73 119 20.999072096421 39.6753855861145 -18.6763134896935 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000628724976349799 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 30222002 T/C 1 27 21 48 12.3255423174645 11.4134670864165 0.912075231048 T:C T C 10 0.5434984326865 0.885076493030178 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30221989_30222030:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000490218:exon_30221989_30222030:UTP6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 33288882 T/G 1 8 14 22 3.652012538508 7.608978057611 -3.956965519103 T:G T G 10 0.5434984326865 0.132270151688259 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 4 8 12 1.826006269254 4.347987461492 -2.521981192238 A:G G A 10 0.5434984326865 0.159074080491796 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 34252537 A/C 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:C A C 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000187456:ENST00000293273:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000419453:exon_34252519_34252554:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394529:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000431884:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000436836:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000430160:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000425909:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394528:exon_34252519_34252641:RDM1;ENSG00000187456:ENST00000394527:exon_34252519_34252641:RDM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 512 461 973 233.728802464512 250.552777468477 -16.8239750039645 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.288270266747303 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 34842521 A/G 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34842479_34842629:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34842501_34842629:ZNHIT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 34854280 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000141140:ENST00000431794:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000268852:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000378326:exon_34854110_34854403:MYO19;ENSG00000141140:ENST00000415126:exon_34854110_34854403:MYO19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 41 63 104 18.7165642598535 34.2404012592495 -15.523836999396 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00296121044311848 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 36453208 T/C 1 46 38 84 20.999072096421 20.652940442087 0.346131654333998 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36452990_36453215:MRPL45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 36474601 A/G 1 28 43 71 12.782043884778 23.3704326055195 -10.5883887207415 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0123341860482586 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36474586_36474634:MRPL45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 308 197 505 140.602482732558 107.06919123924 33.5332914933175 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00274386947084991 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 36909499 A/T 1 226 173 399 103.169354212851 94.0252288547645 9.1441253580865 A:T A T 10 0.5434984326865 0.36607876959713 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909403_36909587:PSMB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 37334243 G/A 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000067191:ENST00000394303:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000344140:exon_37334237_37334332:CACNB1;ENSG00000067191:ENST00000394310:exon_37334237_37334332:CACNB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 37359216 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 37922259 G/A 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 38179492 A/G 1 18 10 28 8.217028211643 5.434984326865 2.782043884778 A:G A G 10 0.5434984326865 0.345175694422958 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38179384_38179648:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38179384_38179760:MED24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 39 26 65 17.8035611252265 14.130959249849 3.6726018753775 A:G G A 10 0.5434984326865 0.385497007613617 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 32 28 60 14.608050154032 15.217956115222 -0.60990596119 T:C T C 10 0.5434984326865 0.897436812439016 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 41244000 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 9 1 10 4.1085141058215 0.5434984326865 3.565015673135 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0262110522693532 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.430226731556452 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 A:C A C 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 C:G C G 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 42268274 C/T 1 17 12 29 7.7605266443295 6.521981192238 1.2385454520915 T:C C T 10 0.5434984326865 0.711729652143047 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 77 72 149 35.1506206831395 39.131887153428 -3.9812664702885 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.51206307364423 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 A:G A G 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 15 13 28 6.8475235097025 7.0654796249245 -0.217956115222 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 34 29 63 15.521053288659 15.7614545479085 -0.240401259249499 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 47293956 G/A 1 21 25 46 9.5865329135835 13.5874608171625 -4.000927903579 A:G G A 10 0.5434984326865 0.240678034879676 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 47783602 G/A 1 48 52 100 21.912075231048 28.261918499698 -6.34984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.228337146359866 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47782486_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47783228_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000503334:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508520:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000435059:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000514907:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000515850:exon_47783566_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511763:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508926:exon_47783566_47783717:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000511657:exon_47783566_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000509781:exon_47783230_47783696:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508607:exon_47783438_47783671:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000505765:exon_47783564_47783671:SLC35B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 48456193 T/C 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510007:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000510246:exon_48456135_48456256:EME1;ENSG00000154920:ENST00000513077:exon_48456135_48456256:EME1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 48628160 A/G 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 A:G A G 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628095_48628278:SPATA20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 48628470 T/A 1 14 7 21 6.391021942389 3.8044890288055 2.5865329135835 A:T T A 10 0.5434984326865 0.281934153985525 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 48629458 A/G 1 18 14 32 8.217028211643 7.608978057611 0.608050154032001 A:G A G 10 0.5434984326865 0.861129900266574 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48629330_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48629146_48629541:SPATA20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 48633043 G/A 1 87 92 179 39.7156363562745 50.001855807158 -10.2862194508835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.133416065729205 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48632853_48633213:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48632853_48633211:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512071:exon_48632853_48633137:SPATA20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 48940422 T/C 1 14 27 41 6.391021942389 14.6744576825355 -8.2834357401465 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0114782396687900 ENSG00000141232:ENST00000499247:exon_48939584_48941524:TOB1;ENSG00000141232:ENST00000268957:exon_48940341_48941524:TOB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 49338257 C/T 1 20 14 34 9.13003134627 7.608978057611 1.521053288659 T:C C T 10 0.5434984326865 0.731192583939071 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 55183716 T/C 1 7 14 21 3.1955109711945 7.608978057611 -4.4134670864165 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0773597410972235 ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000314126:exon_55182802_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55182818_55184539:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55182802_55184539:AKAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 57743595 G/A 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 A:G G A 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000141367:ENST00000269122:exon_57743464_57743601:CLTC;ENSG00000141367:ENST00000393043:exon_57743464_57743601:CLTC;ENSG00000141367:ENST00000458188:exon_57743464_57743601:CLTC;ENSG00000141367:ENST00000466513:exon_57743464_57743601:CLTC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 287 253 540 131.015949818974 137.505103469685 -6.48915365071002 T:C C T 10 0.5434984326865 0.574772106139427 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 112 116 228 51.128175539112 63.045818191634 -11.917642652522 A:G A G 10 0.5434984326865 0.126088715744272 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 62476429 G/A 1 27 18 45 12.3255423174645 9.782971788357 2.5425705291075 A:G G A 10 0.5434984326865 0.459562590498784 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62476406_62476506:POLG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 62492582 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000136480:ENST00000322670:exon_62492525_62493169:POLG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 65717525 T/C 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 65739627 A/G 1 53 43 96 24.1945830676155 23.3704326055195 0.824150462096 A:G A G 10 0.5434984326865 0.918549395187909 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65739595_65739702:NOL11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 54 40 94 24.651084634929 21.73993730746 2.911147327469 A:G A G 10 0.5434984326865 0.605043106206321 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 66253095 T/A 1 245 195 440 111.842883991807 105.982194373868 5.86068961794 A:T T A 10 0.5434984326865 0.598711750459156 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 66449122 G/A 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000070540:ENST00000262139:exon_66449051_66449133:WIPI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 71166544 T/C 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000180616:ENST00000357585:exon_71165367_71168060:SSTR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 13 14 27 5.9345203750755 7.608978057611 -1.6744576825355 T:C C T 10 0.5434984326865 0.56537974762447 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 72769739 A/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 C:G C G 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 72860654 G/A 1 29 15 44 13.2385454520915 8.1524764902975 5.086068961794 A:G G A 10 0.5434984326865 0.132436970685440 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 72949146 C/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167861:ENST00000525426:exon_72949101_72949181:C17orf28;ENSG00000167861:ENST00000532395:exon_72949101_72949181:C17orf28;ENSG00000167861:ENST00000425042:exon_72949101_72949181:C17orf28;ENSG00000167861:ENST00000305419:exon_72949101_72949181:C17orf28;ENSG00000167861:ENST00000318565:exon_72949101_72949181:C17orf28;ENSG00000167861:ENST00000534480:exon_72949101_72949181:C17orf28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 79 72 151 36.0636238177665 39.131887153428 -3.0682633356615 T:C C T 10 0.5434984326865 0.624888408569644 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 139 165 304 63.4537178565765 89.6772413932725 -26.223523536696 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00271964977968165 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 73518284 G/C 1 22 17 39 10.043034480897 9.2394733556705 0.8035611252265 C:G G C 10 0.5434984326865 0.87293519494449 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517786_73518414:TSEN54 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 73519413 C/T 1 15 9 24 6.8475235097025 4.8914858941785 1.956037615524 T:C C T 10 0.5434984326865 0.53990005232013 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 73897309 A/G 1 40 40 80 18.26006269254 21.73993730746 -3.47987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 0.43498900893338 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477371:exon_73897282_73897505:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000471434:exon_73897282_73897598:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73897282_73897354:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73897264_73898001:MRPL38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 40 36 76 18.26006269254 19.565943576714 -1.305880884174 T:C T C 10 0.5434984326865 0.818158002158911 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 22 20 42 10.043034480897 10.86996865373 -0.826934172833001 T:C C T 10 0.5434984326865 0.87724105140099 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 74077497 G/C 1 55 44 99 25.1075862022425 23.913931038206 1.1936551640365 C:G G C 10 0.5434984326865 0.840608642824495 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 74307737 T/C 1 24 24 48 10.956037615524 13.043962384476 -2.087924768952 T:C T C 10 0.5434984326865 0.564921146161883 ENSG00000161542:ENST00000448426:exon_74306868_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000446526:exon_74307014_74307781:PRPSAP1;ENSG00000161542:ENST00000324684:exon_74307015_74307781:PRPSAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76113954 G/A 1 41 49 90 18.7165642598535 26.6314232016385 -7.914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.112006217111651 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76113883_76114016:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76113883_76114016:TMC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76121318 G/A 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121239_76121344:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121239_76121344:TMC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 100 81 181 45.65015673135 44.0233730476065 1.6267836837435 C:G C G 10 0.5434984326865 0.823292692323273 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 41 19 60 18.7165642598535 10.3264702210435 8.39009403881 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0372758356868929 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76183043 A/G 0 0 62 62 0 33.696902826563 -33.696902826563 G A G 10 0.5434984326865 7.68105584109263e-22 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76219591 G/A 1 78 50 128 35.607122250453 27.174921634325 8.432200616128 A:G G A 10 0.5434984326865 0.155486259906836 ENSG00000089685:ENST00000374948:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000301633:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000350051:exon_76219546_76221715:BIRC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 76803717 C/T 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 12 9 21 5.478018807762 4.8914858941785 0.5865329135835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.830554848512144 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 78093133 G/A 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78093071_78093678:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78093071_78093678:GAA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 78350110 G/A 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78350101_78350343:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78350101_78350343:RNF213 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 78865630 A/G 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000141564:ENST00000306801:exon_78865520_78865637:RPTOR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 79508400 T/C 1 14 25 39 6.391021942389 13.5874608171625 -7.1964388747735 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0239823445633393 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79508335_79508421:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79508335_79508421:C17orf70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 79511135 A/G 1 15 22 37 6.8475235097025 11.956965519103 -5.1094420094005 A:G A G 10 0.5434984326865 0.100313651452199 ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79511030_79511146:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79511030_79511146:C17orf70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 79514129 G/A 1 7 12 19 3.1955109711945 6.521981192238 -3.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.166463653686349 ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 79974731 T/C 1 24 16 40 10.956037615524 8.695974922984 2.26006269254 T:C T C 10 0.5434984326865 0.5276294959487 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 79991603 C/T 1 6 15 21 2.739009403881 8.1524764902975 -5.4134670864165 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0261727220789082 ENSG00000169750:ENST00000306897:exon_79991575_79992077:RAC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 79993919 C/T 1 161 138 299 73.4967523374735 75.002783710737 -1.50603137326351 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.86196675673016 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79993757_79993939:DCXR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 33 37 70 15.0645517213455 20.1094420094005 -5.044890288055 A:G G A 10 0.5434984326865 0.232472157712238 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 47 60 107 21.4555736637345 32.60990596119 -11.1543322974555 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0327224504575073 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 34 33 67 15.521053288659 17.9354482786545 -2.4143949899955 T:C C T 10 0.5434984326865 0.624098212473971 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 30 27 57 13.695047019405 14.6744576825355 -0.979410663130501 A:G G A 10 0.5434984326865 0.792208099694784 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80863857 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000397466:exon_80863812_80863929:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80863812_80863929:TBCD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 24 47 71 10.956037615524 25.5444263362655 -14.5883887207415 T:C T C 10 0.5434984326865 0.000730232619236241 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80899281 G/A 1 30 32 62 13.695047019405 17.391949845968 -3.696902826563 A:G G A 10 0.5434984326865 0.373442872014741 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80899275_80899359:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80899275_80899338:TBCD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 80904844 C/T 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80904755_80904859:B3GNTL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 81043039 A/G 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81042814_81043199:METRNL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 81050913 G/A 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81050912_81050971:METRNL;ENSG00000176845:ENST00000400683:exon_81050912_81050971:METRNL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 17 81050939 A/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:C A C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000176845:ENST00000320095:exon_81050912_81050971:METRNL;ENSG00000176845:ENST00000400683:exon_81050912_81050971:METRNL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 275 319 594 125.537931011213 173.376000026993 -47.838069015781 T:C C T 10 0.5434984326865 8.8860487577504e-05 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 82 40 122 37.433128519707 21.73993730746 15.693191212247 A:C:G A G 10 0.5434984326865 0.00467702157252021 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 30 24 54 13.695047019405 13.043962384476 0.651084634928999 C:G G C 10 0.5434984326865 0.892120001697723 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 11886563 C/G 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 C:G C G 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11886498_11886620:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000399978:exon_11886498_11886620:MPPE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 59 82 141 26.9335924714965 44.566871480293 -17.6332790087965 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0030371935984717 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 106 93 199 48.389166135231 50.5453542398445 -2.1561881046135 C:G C G 10 0.5434984326865 0.776207941067633 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 40 33 73 18.26006269254 17.9354482786545 0.324614413885499 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 33 25 58 15.0645517213455 13.5874608171625 1.477090904183 T:C C T 10 0.5434984326865 0.79237885066093 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 12718593 A/G 1 87 67 154 39.7156363562745 36.4143949899955 3.301241366279 A:G A G 10 0.5434984326865 0.627834060595488 ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 25 18 43 11.4125391828375 9.782971788357 1.6295673944805 A:C C A 10 0.5434984326865 0.649138587487918 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:G G T 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 21109250 T/C 1 20 11 31 9.13003134627 5.9784827595515 3.1515485867185 T:C T C 10 0.5434984326865 0.283546222705844 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 15 4 19 6.8475235097025 2.173993730746 4.6735297789565 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0372672339219625 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 T:C T C 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 32822382 G/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:G G T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000186812:ENST00000330501:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000261333:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000355632:exon_32822355_32822848:ZNF397;ENSG00000186812:ENST00000421371:exon_32822355_32822848:ZNF397 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 43565380 A/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 43565399 C/A 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:C C A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43563502_43565416:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43563502_43565416:PSTPIP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 43678225 T/C 1 81 107 188 36.9766269523935 58.1543322974555 -21.177705345062 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00206428274793499 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 43684365 G/C 1 10 52 62 4.565015673135 28.261918499698 -23.696902826563 C:G G C 10 0.5434984326865 6.74286820053464e-10 ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43684298_43684407:HAUS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 47908556 G/A 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 A:G G A 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47908499_47908596:SKA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 9 12 21 4.1085141058215 6.521981192238 -2.4134670864165 A:C A C 10 0.5434984326865 0.381551703468518 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 25 21 46 11.4125391828375 11.4134670864165 -0.000927903578999079 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 9 19 28 4.1085141058215 10.3264702210435 -6.217956115222 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0220452616234988 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56191053 G/A 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56191038_56191073:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56196451 C/T 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 T:C C T 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56202120 G/A 1 15 20 35 6.8475235097025 10.86996865373 -4.0224451440275 A:G G A 10 0.5434984326865 0.179039175945618 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56202394 C/T 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.100680878973953 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56202683 T/C 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56202768 C/A 1 13 15 28 5.9345203750755 8.1524764902975 -2.217956115222 A:T:C C A 10 0.5434984326865 0.45051072782016 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 A:T A T 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56203074 G/A 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 A:G G A 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56203120 C/T 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 24 10 34 10.956037615524 5.434984326865 5.521053288659 C:G G C 10 0.5434984326865 0.059987726314248 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 21 7 28 9.5865329135835 3.8044890288055 5.782043884778 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0354922955758234 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 11 4 15 5.0215172404485 2.173993730746 2.8475235097025 T:G G T 10 0.5434984326865 0.195194257053515 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:G T G 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 10 19 29 4.565015673135 10.3264702210435 -5.7614545479085 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0393404244602306 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:G T G 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204671 A/T 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:T A T 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204932 T/G 1 18 2 20 8.217028211643 1.086996865373 7.13003134627 T:G T G 10 0.5434984326865 0.00111060165112846 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204945 C/G 1 19 2 21 8.6735297789565 1.086996865373 7.5865329135835 C:G C G 10 0.5434984326865 0.000639593004199333 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204977 C/T 1 21 2 23 9.5865329135835 1.086996865373 8.4995360482105 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000211039091372849 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56204991 C/T 1 22 2 24 10.043034480897 1.086996865373 8.956037615524 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000121006381751467 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56205262 A/C 1 11 16 27 5.0215172404485 8.695974922984 -3.6744576825355 A:C A C 10 0.5434984326865 0.178233060083669 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 56205481 G/A 1 15 11 26 6.8475235097025 5.9784827595515 0.869040750150999 A:G G A 10 0.5434984326865 0.84477662201796 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 57022754 T/C 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 61022791 C/T 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 21 25 46 9.5865329135835 13.5874608171625 -4.000927903579 A:G A G 10 0.5434984326865 0.240678034879676 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 67531642 T/C 1 11 14 25 5.0215172404485 7.608978057611 -2.5874608171625 T:C T C 10 0.5434984326865 0.321134709174457 ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 75 46 121 34.2376175485125 25.000927903579 9.2366896449335 T:C C T 10 0.5434984326865 0.100466668320637 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 71959075 G/A 1 17 24 41 7.7605266443295 13.043962384476 -5.2834357401465 A:G G A 10 0.5434984326865 0.116626771198279 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71958982_71959251:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71958982_71959170:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71958982_71959179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71958982_71959179:CYB5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 77473127 C/T 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77472972_77473138:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77472972_77473138:CTDP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 18 77474626 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 648173 G/C 1 101 81 182 46.1066582986635 44.0233730476065 2.083285251057 C:G G C 10 0.5434984326865 0.766606855673185 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_647530_648277:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_648139_648277:RNF126 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 808577 C/T 1 46 38 84 20.999072096421 20.652940442087 0.346131654333998 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808546_808762:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808546_808762:PTBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 990281 G/A 0 74 0 74 33.781115981199 0 33.781115981199 G G 10 0.5434984326865 3.25193968373355e-20 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_990223_990364:WDR18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 52 56 108 23.738081500302 30.435912230444 -6.697830730142 A:G A G 10 0.5434984326865 0.209689181839903 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1095336 C/T 1 46 39 85 20.999072096421 21.1964388747735 -0.197366778352499 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1095352 C/G 1 12 11 23 5.478018807762 5.9784827595515 -0.5004639517895 C:G C G 10 0.5434984326865 0.837650237750388 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1095355 C/T 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 T:C C T 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000099817:ENST00000215587:exon_1095258_1095391:POLR2E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 70 64 134 31.955109711945 34.783899691936 -2.828789979991 T:C C T 10 0.5434984326865 0.664829798754711 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 0 84 0 84 38.346131654334 0 38.346131654334 G G 10 0.5434984326865 6.12033363122291e-23 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1854557 A/G 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 42 34 76 19.173065827167 18.478946711341 0.694119115826002 A:G A G 10 0.5434984326865 0.908720462009788 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 58 45 103 26.477090904183 24.4574294708925 2.0196614332905 A:G G A 10 0.5434984326865 0.766843782139013 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 1997363 A/G 1 9 17 26 4.1085141058215 9.2394733556705 -5.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0494410678276405 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2037842 A/C 1 357 314 671 162.971059530919 170.658507863561 -7.68744833264151 A:C A C 10 0.5434984326865 0.561175798622917 ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2037481_2039855:MKNK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 41 52 93 18.7165642598535 28.261918499698 -9.5453542398445 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0484313679652711 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 12 18 30 5.478018807762 9.782971788357 -4.304952980595 C:G G C 10 0.5434984326865 0.142196443691064 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 A:C C A 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2427266 G/A 1 265 269 534 120.972915338077 146.201078392669 -25.228163054591 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0298176539891180 ENSG00000099800:ENST00000215570:exon_2427254_2427322:TIMM13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 A:C C A 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3186085 G/T 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3185875_3186212:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3185875_3186212:NCLN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 55 22 77 25.1075862022425 11.956965519103 13.1506206831395 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00274230907197819 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 74 41 115 33.781115981199 22.2834357401465 11.4976802410525 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0315526353225116 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3534842 G/A 1 19 17 36 8.6735297789565 9.2394733556705 -0.565943576714 A:G G A 10 0.5434984326865 0.868528013180574 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3534793_3536755:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3534793_3538325:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3534793_3538325:FZR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3611972 G/A 1 13 6 19 5.9345203750755 3.260990596119 2.6735297789565 A:G G A 10 0.5434984326865 0.255120707369053 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3610626_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3611902_3612411:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3611925_3612411:C19orf29;ENSG00000226800:ENST00000447295:exon_3611729_3612412:C19orf29OS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3614581 C/T 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3614395_3614587:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3614395_3614587:C19orf29 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3752874 A/G 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3753769 C/T 1 19 4 23 8.6735297789565 2.173993730746 6.4995360482105 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00608616350513947 ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3753763_3753924:APBA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 3762698 C/T 1 15 10 25 6.8475235097025 5.434984326865 1.4125391828375 T:C C T 10 0.5434984326865 0.689279097352172 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3762665_3762816:MRPL54 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 33 37 70 15.0645517213455 20.1094420094005 -5.044890288055 T:G G T 10 0.5434984326865 0.232472157712238 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 6 16 22 2.739009403881 8.695974922984 -5.956965519103 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0165117654975061 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 4446593 C/T 1 70 78 148 31.955109711945 42.392877749547 -10.437768037602 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0985718453351843 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4446497_4446716:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4446497_4446716:UBXN6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 32 24 56 14.608050154032 13.043962384476 1.564087769556 A:G A G 10 0.5434984326865 0.690135138705309 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 27 21 48 12.3255423174645 11.4134670864165 0.912075231048 T:C C T 10 0.5434984326865 0.885076493030178 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 89 58 147 40.6286394909015 31.522909095817 9.1057303950845 A:G G A 10 0.5434984326865 0.136760273218712 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 11 14 25 5.0215172404485 7.608978057611 -2.5874608171625 T:G G T 10 0.5434984326865 0.321134709174457 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 25 18 43 11.4125391828375 9.782971788357 1.6295673944805 T:C T C 10 0.5434984326865 0.649138587487918 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:C T C 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 49 46 95 22.3685767983615 25.000927903579 -2.6323511052175 T:C T C 10 0.5434984326865 0.607634789160402 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 57 50 107 26.0205893368695 27.174921634325 -1.1543322974555 A:G A G 10 0.5434984326865 0.846482550581732 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 7754226 G/A 0 748 0 748 341.463172350498 0 341.463172350498 G G 10 0.5434984326865 9.7043996175276e-199 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 437 479 916 199.491184915999 260.335749256833 -60.844564340834 A:G A G 10 0.5434984326865 5.8770866965997e-05 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 8320555 G/A 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 8321562 C/T 1 21 8 29 9.5865329135835 4.347987461492 5.2385454520915 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.061592820731939 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8321502_8321594:LASS4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 9267319 G/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:G G T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000130803:ENST00000419608:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9267288_9267424:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9267288_9267424:ZNF317 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 79 105 184 36.0636238177665 57.0673354320825 -21.003711614316 C:G C G 10 0.5434984326865 0.00232375995714854 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10221228 G/A 1 157 197 354 71.6707460682195 107.06919123924 -35.398445171021 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000180560089393240 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10221161_10221290:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10221161_10221290:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000468881:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000444703:exon_10221161_10221290:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 18 20 38 8.217028211643 10.86996865373 -2.652940442087 T:C C T 10 0.5434984326865 0.418270104386791 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 498 435 933 227.337780522123 236.421818218627 -9.08403769650448 A:C:G A G 10 0.5434984326865 0.554304941770043 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 409 350 759 186.709141031221 190.224451440275 -3.51531040905351 A:G A G 10 0.5434984326865 0.798805489212856 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 247 268 515 112.755887126435 145.657579959982 -32.9016928335475 A:T:G T A 10 0.5434984326865 0.00399913669361381 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10394736 T/G 1 13 14 27 5.9345203750755 7.608978057611 -1.6744576825355 T:G T G 10 0.5434984326865 0.56537974762447 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10394709_10394996:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10394709_10394996:ICAM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10395683 A/G 1 30 36 66 13.695047019405 19.565943576714 -5.870896557309 A:G A G 10 0.5434984326865 0.173784631838953 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000444336:exon_10395605_10395685:ICAM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10395973 G/A 1 43 44 87 19.6295673944805 23.913931038206 -4.2843636437255 A:G G A 10 0.5434984326865 0.389737214679901 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395791_10397291:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395791_10397291:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395791_10397291:ICAM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10431799 G/T 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 T:G G T 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10431724_10431935:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10431766_10431935:RAVER1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10450285 G/A 1 60 47 107 27.39009403881 25.5444263362655 1.8456677025445 A:G G A 10 0.5434984326865 0.771273040321883 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10450215_10450345:ICAM3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 0 0 9 9 0 4.8914858941785 -4.8914858941785 G A G 10 0.5434984326865 0.000860955007809944 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10475652 C/A 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:C C A 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10793295 C/G 1 27 27 54 12.3255423174645 14.6744576825355 -2.348915365071 C:G C G 10 0.5434984326865 0.585364954825716 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10793213_10793380:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10793213_10793380:ILF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 64 48 112 29.216100308064 26.087924768952 3.128175539112 T:G G T 10 0.5434984326865 0.57063972641632 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 35 22 57 15.9775548559725 11.956965519103 4.0205893368695 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.352096606847939 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 19 22 41 8.6735297789565 11.956965519103 -3.2834357401465 T:C T C 10 0.5434984326865 0.347824260668338 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 11170839 T/C 1 75 76 151 34.2376175485125 41.305880884174 -7.0682633356615 T:C T C 10 0.5434984326865 0.253732903819780 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11170721_11170863:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11170721_11170863:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11170721_11170863:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11170721_11170863:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11170721_11170863:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11170721_11170863:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11170721_11170863:SMARCA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 11617079 C/T 1 49 60 109 22.3685767983615 32.60990596119 -10.2413291628285 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0543016326281065 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11616745_11617243:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11616745_11617243:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11616745_11617243:ECSIT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 11625029 C/T 1 16 17 33 7.304025077016 9.2394733556705 -1.9354482786545 T:C C T 10 0.5434984326865 0.6008174059021 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11624619_11625036:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11624619_11625036:ECSIT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 C:G G C 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 12384580 T/C 1 1 8 9 0.4565015673135 4.347987461492 -3.8914858941785 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0142241674807915 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 16 23 39 7.304025077016 12.5004639517895 -5.1964388747735 A:G G A 10 0.5434984326865 0.108367497919011 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 13035006 G/A 1 76 118 194 34.694119115826 64.132815057007 -29.438695941181 A:G G A 10 0.5434984326865 2.58388124685798e-05 ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13034965_13035079:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13034965_13035079:FARSA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 598 713 1311 272.987937253473 387.514382505474 -114.526445252002 T:G G T 10 0.5434984326865 2.80938512025809e-10 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 13226455 C/G 1 16 28 44 7.304025077016 15.217956115222 -7.913931038206 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0221819648665872 ENSG00000104907:ENST00000221504:exon_13226440_13226582:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13226440_13226582:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13226440_13226582:TRMT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 42 45 87 19.173065827167 24.4574294708925 -5.2843636437255 T:C C T 10 0.5434984326865 0.282153734920752 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14030689 T/C 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14031611 A/G 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14031563_14031735:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14031563_14031735:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14031571_14031735:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14031563_14031735:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14031563_14031735:CC2D1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14211676 C/T 1 10 12 22 4.565015673135 6.521981192238 -1.956965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.521832905939548 ENSG00000072062:ENST00000308677:exon_14211638_14211720:PRKACA;ENSG00000072062:ENST00000350356:exon_14211638_14211720:PRKACA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 122 122 244 55.693191212247 66.306808787753 -10.613617575506 A:G A G 10 0.5434984326865 0.177536151277364 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14582468 G/A 0 159 0 159 72.5837492028465 0 72.5837492028465 G G 10 0.5434984326865 8.30645576794497e-43 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 14 15 29 6.391021942389 8.1524764902975 -1.7614545479085 T:C C T 10 0.5434984326865 0.577820071884129 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14590279 G/C 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 C:G G C 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14590224_14590336:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14590224_14590336:GIPC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 14682804 G/C 1 134 136 270 61.171210020009 73.915786845364 -12.744576825355 C:G G C 10 0.5434984326865 0.126711056631639 ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14682701_14682886:NDUFB7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 15465960 G/A 1 31 15 46 14.1515485867185 8.1524764902975 5.999072096421 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0777838182141254 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15464341_15466181:AKAP8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 15480979 G/A 1 10 14 24 4.565015673135 7.608978057611 -3.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.225358769194005 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15480957_15480990:AKAP8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 47 46 93 21.4555736637345 25.000927903579 -3.5453542398445 T:C C T 10 0.5434984326865 0.468091715420591 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 16339715 C/T 1 12 18 30 5.478018807762 9.782971788357 -4.304952980595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.142196443691064 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16339581_16339739:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16339581_16339739:AP1M1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17337871 A/G 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17337882 C/G 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 35 37 72 15.9775548559725 20.1094420094005 -4.131887153428 A:G G A 10 0.5434984326865 0.345524626004082 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17395055 C/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000438921:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17394898_17395075:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17394898_17395075:ANKLE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17396549 T/C 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000160117:ENST00000404261:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000433424:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000291449:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000392729:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000404085:exon_17396490_17396628:ANKLE1;ENSG00000160117:ENST00000394458:exon_17396490_17396628:ANKLE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:C:G A C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17451981 G/A 1 11 16 27 5.0215172404485 8.695974922984 -3.6744576825355 A:G G A 10 0.5434984326865 0.178233060083669 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17451853_17452131:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17451853_17452131:GTPBP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 113 102 215 51.5846771064255 55.436840134023 -3.8521630275975 A:G A G 10 0.5434984326865 0.631922504261644 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 3 11 14 1.3695047019405 5.9784827595515 -4.608978057611 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0154917950977014 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17654181 C/T 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17654126_17654242:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17654126_17654242:FAM129C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17660300 G/A 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 A:G G A 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17660253_17660336:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17660253_17660494:FAM129C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17691701 G/A 1 18 22 40 8.217028211643 11.956965519103 -3.73993730746 A:G G A 10 0.5434984326865 0.267636879374905 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17691508_17691714:GLT25D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17837090 C/T 1 11 6 17 5.0215172404485 3.260990596119 1.7605266443295 T:C C T 10 0.5434984326865 0.470234227697998 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17837512 G/A 1 9 12 21 4.1085141058215 6.521981192238 -2.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.381551703468518 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18186618 T/C 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 497 399 896 226.881278954809 216.855874641913 10.025404312896 A:T:C:G G A 10 0.5434984326865 0.524041726841172 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 572 535 1107 261.118896503322 290.771661487278 -29.6527649839555 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0750869263639368 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18304700 A/G 1 18 17 35 8.217028211643 9.2394733556705 -1.0224451440275 A:G A G 10 0.5434984326865 0.737611853756657 ENSG00000254858:ENST00000534421:exon_18304674_18304970:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18304674_18304828:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18304042_18304844:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18304674_18304844:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18304674_18304833:MPV17L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 29 18 47 13.2385454520915 9.782971788357 3.4555736637345 T:C C T 10 0.5434984326865 0.379971744998724 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18497024 G/C 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C:G G C 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18497141 T/A 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:T T A 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18496968_18497276:GDF15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18499238 G/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:G G T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18499780 A/G 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18538742 A/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:C A C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000130511:ENST00000348495:exon_18538708_18538792:SSBP4;ENSG00000130511:ENST00000270061:exon_18538708_18538792:SSBP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18545786 G/T 1 24 39 63 10.956037615524 21.1964388747735 -10.2404012592495 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0110794267369676 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18545625_18545927:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18545625_18545927:ISYNA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 18546678 T/C 1 37 31 68 16.8905579905995 16.8484514132815 0.0421065773180018 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000105655:ENST00000317018:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000457269:exon_18546567_18546731:ISYNA1;ENSG00000105655:ENST00000338128:exon_18546567_18546731:ISYNA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 19243175 C/T 1 6 12 18 2.739009403881 6.521981192238 -3.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0966180060940715 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19243161_19243317:TMEM161A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 19312496 C/G 1 129 144 273 58.8887021834415 78.263774306856 -19.3750721234145 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0208165289910014 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 114 109 223 52.041178673739 59.2413291628285 -7.2001504890895 C:G C G 10 0.5434984326865 0.346995720609891 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 19790159 A/C 1 20 18 38 9.13003134627 9.782971788357 -0.652940442086999 A:C A C 10 0.5434984326865 0.871533201986291 ENSG00000181896:ENST00000318110:exon_19789990_19791412:ZNF101;ENSG00000181896:ENST00000415440:exon_19789990_19791412:ZNF101 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 19822443 A/G 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:C:G A G 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000105708:ENST00000344099:exon_19821282_19823898:ZNF14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 20002439 G/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:G G T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20002283_20002917:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20002283_20002574:ZNF90 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 20044041 G/T 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 T:G G T 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 20150175 G/C 1 3 9 12 1.3695047019405 4.8914858941785 -3.521981192238 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0466833058359445 ENSG00000197124:ENST00000397165:exon_20150152_20150277:ZNF682;ENSG00000197124:ENST00000358523:exon_20150152_20150277:ZNF682 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33098632 G/C 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 C:G G C 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33098541_33098738:ANKRD27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33110204 T/C 1 3 11 14 1.3695047019405 5.9784827595515 -4.608978057611 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0154917950977014 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33370070 A/G 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:T T A 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:C A C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33390796 G/A 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33390763_33390904:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33390763_33390904:CCDC123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33467620 T/C 1 7 10 17 3.1955109711945 5.434984326865 -2.2394733556705 T:C T C 10 0.5434984326865 0.333330524865813 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 T:C T C 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33605300 A/G 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33605312 T/C 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 T:C T C 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 12 4 16 5.478018807762 2.173993730746 3.304025077016 A:C C A 10 0.5434984326865 0.131696716739933 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 33663354 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 124 122 246 56.606194346874 66.306808787753 -9.700614440879 T:G T G 10 0.5434984326865 0.224193773111495 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 216 225 441 98.604338539716 122.287147354463 -23.6828088147465 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0246322875540829 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 35757596 T/G 1 30 30 60 13.695047019405 16.304952980595 -2.60990596119 T:G T G 10 0.5434984326865 0.519077359275743 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757582_35757641:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757582_35757641:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757582_35757641:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757582_35757641:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757582_35757641:LSR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 35770056 G/A 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.362188250027106 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 35770064 C/T 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.202270696540265 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 35836530 G/A 1 155 126 281 70.7577429335925 68.480802518499 2.27694041509349 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.810840427326589 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35836505_35836623:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35836505_35836623:CD22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 510 548 1058 232.815799329885 297.837141112202 -65.021341782317 T:C:G C T 10 0.5434984326865 6.73247820537816e-05 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 36233494 A/G 1 23 25 48 10.4995360482105 13.5874608171625 -3.087924768952 A:G A G 10 0.5434984326865 0.387711265343278 ENSG00000161265:ENST00000292879:exon_36233430_36233704:U2AF1L4;ENSG00000161265:ENST00000378975:exon_36233430_36233704:U2AF1L4;ENSG00000161265:ENST00000412391:exon_36233430_36233704:U2AF1L4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 36594369 C/T 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 5 12 17 2.2825078365675 6.521981192238 -4.2394733556705 A:T A T 10 0.5434984326865 0.0502092065252103 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 A:C A C 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 5 11 16 2.2825078365675 5.9784827595515 -3.695974922984 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0791893749967246 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 37854040 G/A 1 19 19 38 8.6735297789565 10.3264702210435 -1.652940442087 A:G G A 10 0.5434984326865 0.62745803520325 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 37854580 C/T 1 28 36 64 12.782043884778 19.565943576714 -6.783899691936 T:C C T 10 0.5434984326865 0.102571228525029 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 38055612 A/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:T A T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000180479:ENST00000328550:exon_38054726_38057193:ZNF571;ENSG00000180479:ENST00000451802:exon_38055156_38057193:ZNF571 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 73 56 129 33.3246144138855 30.435912230444 2.8887021834415 T:C T C 10 0.5434984326865 0.658838164547927 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 48 52 100 21.912075231048 28.261918499698 -6.34984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.228337146359866 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 38894102 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38893978_38894126:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38893978_38894126:FAM98C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 38899548 G/A 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 52 45 97 23.738081500302 24.4574294708925 -0.719347970590498 T:C T C 10 0.5434984326865 0.918980702311252 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 21 30 51 9.5865329135835 16.304952980595 -6.7184200670115 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0674748401733571 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 26 23 49 11.869040750151 12.5004639517895 -0.6314232016385 T:C C T 10 0.5434984326865 0.886645312965562 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39421388 A/G 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421348_39421638:MRPS12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39914644 G/A 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 16 13 29 7.304025077016 7.0654796249245 0.2385454520915 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 40030654 G/C 1 3 10 13 1.3695047019405 5.434984326865 -4.0654796249245 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0270995591275361 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 40929204 C/T 1 17 19 36 7.7605266443295 10.3264702210435 -2.565943576714 T:C C T 10 0.5434984326865 0.407364257240417 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 40929363 T/C 1 21 15 36 9.5865329135835 8.1524764902975 1.434056423286 T:C T C 10 0.5434984326865 0.738613318412709 ENSG00000197019:ENST00000357949:exon_40928411_40929453:SERTAD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 40947448 A/G 1 9 18 27 4.1085141058215 9.782971788357 -5.6744576825355 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0332201062262774 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 40947751 G/A 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41082868 T/C 1 18 24 42 8.217028211643 13.043962384476 -4.826934172833 T:C T C 10 0.5434984326865 0.163004545679886 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41082757_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41082790_41082891:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41082790_41082891:SHKBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41096189 A/G 1 28 37 65 12.782043884778 20.1094420094005 -7.3273981246225 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0807839060930255 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41096150_41096328:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41096150_41096328:SHKBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41129842 C/T 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41135475 G/A 1 14 12 26 6.391021942389 6.521981192238 -0.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41135301_41135725:LTBP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41209477 C/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41209446_41209527:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41209446_41209527:ADCK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 11 5 16 5.0215172404485 2.7174921634325 2.304025077016 T:C T C 10 0.5434984326865 0.31866452342011 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 60 45 105 27.39009403881 24.4574294708925 2.9326645679175 A:G G A 10 0.5434984326865 0.624551298467132 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 57 73 130 26.0205893368695 39.6753855861145 -13.654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0173672191901721 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 83 99 182 37.8896300870205 53.8063448359635 -15.916714748943 A:G A G 10 0.5434984326865 0.020836605498769 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 8 11 19 3.652012538508 5.9784827595515 -2.3264702210435 C:G C G 10 0.5434984326865 0.358365878943715 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 21 20 41 9.5865329135835 10.86996865373 -1.2834357401465 T:C T C 10 0.5434984326865 0.754659472010403 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 42799049 C/T 1 20 10 30 9.13003134627 5.434984326865 3.695047019405 T:C C T 10 0.5434984326865 0.201922119852062 ENSG00000079432:ENST00000160740:exon_42798976_42799949:CIC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44031324 C/T 1 32 18 50 14.608050154032 9.782971788357 4.825078365675 T:C C T 10 0.5434984326865 0.201580990367399 ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44057227 T/C 1 29 18 47 13.2385454520915 9.782971788357 3.4555736637345 T:C T C 10 0.5434984326865 0.379971744998724 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44057574 G/A 1 20 27 47 9.13003134627 14.6744576825355 -5.5444263362655 A:G G A 10 0.5434984326865 0.109304834009348 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 16 14 30 7.304025077016 7.608978057611 -0.304952980595 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 7 10 17 3.1955109711945 5.434984326865 -2.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.333330524865813 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 11 4 15 5.0215172404485 2.173993730746 2.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.195194257053515 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 44418824 C/T 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45395714 T/C 1 42 43 85 19.173065827167 23.3704326055195 -4.1973667783525 T:C T C 10 0.5434984326865 0.384662543339701 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45397229 G/A 1 23 61 84 10.4995360482105 33.1534043938765 -22.653868345666 A:G G A 10 0.5434984326865 8.0181849069809e-07 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45397218_45397323:TOMM40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45854919 T/G 1 20 11 31 9.13003134627 5.9784827595515 3.1515485867185 T:G T G 10 0.5434984326865 0.283546222705844 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45854246_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45854853_45854979:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45854853_45854979:ERCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45855524 G/A 1 38 31 69 17.347059557913 16.8484514132815 0.4986081446315 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45855467_45855610:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45855467_45855610:ERCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45867259 C/T 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391944:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45867244_45867377:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45867244_45867377:ERCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45868309 T/G 1 15 6 21 6.8475235097025 3.260990596119 3.5865329135835 T:G T G 10 0.5434984326865 0.129736652144383 ENSG00000104884:ENST00000391941:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391942:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000485403:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391945:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000221481:exon_45868300_45868416:ERCC2;ENSG00000104884:ENST00000391940:exon_45868300_45868416:ERCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 19 17 36 8.6735297789565 9.2394733556705 -0.565943576714 A:C A C 10 0.5434984326865 0.868528013180574 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 23 13 36 10.4995360482105 7.0654796249245 3.434056423286 A:G A G 10 0.5434984326865 0.315711353010579 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 18 15 33 8.217028211643 8.1524764902975 0.0645517213455005 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 12 9 21 5.478018807762 4.8914858941785 0.5865329135835 A:C C A 10 0.5434984326865 0.830554848512144 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 45912750 G/A 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46133251 C/T 1 17 11 28 7.7605266443295 5.9784827595515 1.782043884778 T:C C T 10 0.5434984326865 0.571892262439823 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46133256 G/A 1 18 10 28 8.217028211643 5.434984326865 2.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.345175694422958 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46133209_46133304:EML2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46141845 T/C 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46141763_46141892:EML2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 35 47 82 15.9775548559725 25.5444263362655 -9.566871480293 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0354681625907543 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 18 17 35 8.217028211643 9.2394733556705 -1.0224451440275 T:C C T 10 0.5434984326865 0.737611853756657 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 13 11 24 5.9345203750755 5.9784827595515 -0.043962384476 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 31 31 62 14.1515485867185 16.8484514132815 -2.696902826563 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.52511875183695 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 46878989 G/A 1 34 28 62 15.521053288659 15.217956115222 0.303097173437001 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46878861_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000467902:exon_46878860_46879008:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000527193:exon_46878884_46879008:PPP5C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 58 55 113 26.477090904183 29.8924137977575 -3.4153228935745 A:G G A 10 0.5434984326865 0.571200699976949 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47285802 G/C 1 38 22 60 17.347059557913 11.956965519103 5.39009403881 C:G G C 10 0.5434984326865 0.194822364644195 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47285640_47285806:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47285640_47285806:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47285640_47285806:SLC1A5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 13 15 28 5.9345203750755 8.1524764902975 -2.217956115222 C:G G C 10 0.5434984326865 0.45051072782016 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47761646 G/C 1 15 8 23 6.8475235097025 4.347987461492 2.4995360482105 C:G G C 10 0.5434984326865 0.403070581678078 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47761587_47761660:CCDC9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 7 12 19 3.1955109711945 6.521981192238 -3.3264702210435 A:C A C 10 0.5434984326865 0.166463653686349 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47774680 C/G 1 25 24 49 11.4125391828375 13.043962384476 -1.6314232016385 C:G C G 10 0.5434984326865 0.6688391572748 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 14 6 20 6.391021942389 3.260990596119 3.13003134627 T:C T C 10 0.5434984326865 0.183227568315245 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 47980153 G/A 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47980060_47980195:KPTN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 23 21 44 10.4995360482105 11.4134670864165 -0.913931038206 C:G C G 10 0.5434984326865 0.879946832285625 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 17 22 39 7.7605266443295 11.956965519103 -4.1964388747735 A:G A G 10 0.5434984326865 0.199700925872768 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 48654553 G/T 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 T:G G T 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48654489_48654596:LIG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 6 13 19 2.739009403881 7.0654796249245 -4.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0634141897264214 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 48954421 G/A 1 18 20 38 8.217028211643 10.86996865373 -2.652940442087 A:G G A 10 0.5434984326865 0.418270104386791 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48954291_48954488:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48954291_48954488:GRWD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49340746 T/C 1 11 1 12 5.0215172404485 0.5434984326865 4.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0086122214100085 ENSG00000105559:ENST00000263265:exon_49340355_49340808:PLEKHA4;ENSG00000105559:ENST00000355496:exon_49340355_49340808:PLEKHA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49376584 G/A 1 18 19 37 8.217028211643 10.3264702210435 -2.1094420094005 A:G G A 10 0.5434984326865 0.512560262501789 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 105 59 164 47.9326645679175 32.0664075285035 15.866257039414 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0148564012032605 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 78 69 147 35.607122250453 37.5013918553685 -1.8942696049155 A:G A G 10 0.5434984326865 0.803952634092531 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 65 44 109 29.6726018753775 23.913931038206 5.7586708371715 A:G G A 10 0.5434984326865 0.290820221241852 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 63 49 112 28.7595987407505 26.6314232016385 2.128175539112 C:G G C 10 0.5434984326865 0.705424317925834 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 710 752 1462 324.116112792585 408.710821380248 -84.594708587663 T:C T C 10 0.5434984326865 1.00991121731394e-05 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49513273 C/T 1 168 147 315 76.692263308668 79.8942696049155 -3.20200629624749 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.734512390318899 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 0 12 0 12 5.478018807762 0 5.478018807762 C C 10 0.5434984326865 0.000746227811175491 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 49969020 G/A 1 11 6 17 5.0215172404485 3.260990596119 1.7605266443295 A:G G A 10 0.5434984326865 0.470234227697998 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50154813 G/A 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50154125_50156962:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50154125_50156962:SCAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50156329 A/G 1 52 60 112 23.738081500302 32.60990596119 -8.871824460888 A:G A G 10 0.5434984326865 0.106526719341162 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50154125_50156962:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50154125_50156962:SCAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50157946 T/C 1 34 23 57 15.521053288659 12.5004639517895 3.0205893368695 T:C T C 10 0.5434984326865 0.506533980280844 ENSG00000126461:ENST00000360565:exon_50157909_50158127:SCAF1;ENSG00000126461:ENST00000447618:exon_50157909_50158127:SCAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 17 15 32 7.7605266443295 8.1524764902975 -0.391949845968 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50322482 C/G 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 C:G C G 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50322429_50322553:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50322429_50322553:MED25 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 19 25 44 8.6735297789565 13.5874608171625 -4.913931038206 T:G T G 10 0.5434984326865 0.172586780773862 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50387750 G/C 1 21 21 42 9.5865329135835 11.4134670864165 -1.826934172833 C:G G C 10 0.5434984326865 0.642960703552169 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50387716_50387816:TBC1D17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 132 278 410 60.258206885382 151.092564286847 -90.834357401465 A:G A G 10 0.5434984326865 1.87083425440231e-19 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 1 35 44 79 15.9775548559725 23.913931038206 -7.9363761822335 C:G C G 10 0.5434984326865 0.089633854179852 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50412650 C/T 1 23 35 58 10.4995360482105 19.0224451440275 -8.522909095817 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0340258317212095 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50435978 G/C 1 89 34 123 40.6286394909015 18.478946711341 22.1496927795605 C:G G C 10 0.5434984326865 5.74209891440402e-05 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 35 11 46 15.9775548559725 5.9784827595515 9.999072096421 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00286966818098321 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 40 13 53 18.26006269254 7.0654796249245 11.1945830676155 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00214029831912666 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50967640 G/A 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 50979801 G/A 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000142530:ENST00000391816:exon_50979387_50980003:FAM71E1;ENSG00000142530:ENST00000270620:exon_50979387_50980003:FAM71E1;ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50979387_50979915:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50979736_50979915:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50979736_50979915:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50979736_50979915:C19orf63 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:G G T 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 15 19 34 6.8475235097025 10.3264702210435 -3.478946711341 A:G A G 10 0.5434984326865 0.234470475786584 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 52519089 G/T 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:G G T 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 52519608 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000142556:ENST00000270649:exon_52516577_52520612:ZNF614 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 52869534 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167554:ENST00000403906:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000321287:exon_52868951_52870366:ZNF610;ENSG00000167554:ENST00000327920:exon_52868951_52870111:ZNF610 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 53085659 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167562:ENST00000301093:exon_53085455_53088049:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391786:exon_53085455_53085751:ZNF701;ENSG00000167562:ENST00000391785:exon_53085455_53088049:ZNF701 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 A:C C A 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 53571306 T/C 1 10 4 14 4.565015673135 2.173993730746 2.391021942389 T:C T C 10 0.5434984326865 0.284250115489834 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 54610170 C/T 1 303 271 574 138.31997489599 147.288075258041 -8.96810036205099 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.451168221227023 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 17 20 37 7.7605266443295 10.86996865373 -3.1094420094005 A:T A T 10 0.5434984326865 0.32552428531704 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 54677897 G/A 1 8 18 26 3.652012538508 9.782971788357 -6.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0179087161651320 ENSG00000125505:ENST00000437868:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000245615:exon_54677109_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000494142:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000431666:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000338624:exon_54677113_54678125:MBOAT7;ENSG00000125505:ENST00000449249:exon_54677768_54678125:MBOAT7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 23 15 38 10.4995360482105 8.1524764902975 2.347059557913 C:G C G 10 0.5434984326865 0.516156273672487 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 T:C T C 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 14 13 27 6.391021942389 7.0654796249245 -0.6744576825355 T:G G T 10 0.5434984326865 0.848145407230822 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 14 19 33 6.391021942389 10.3264702210435 -3.9354482786545 T:C T C 10 0.5434984326865 0.220723036124753 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 23 50 73 10.4995360482105 27.174921634325 -16.6753855861145 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000132993339919453 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 55179364 A/G 1 84 35 119 38.346131654334 19.0224451440275 19.3236865103065 A:G A G 10 0.5434984326865 0.000422789243540927 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55179324_55181810:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55179324_55179844:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55179324_55179855:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55179324_55179848:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55179324_55179848:LILRB4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 20 8 28 9.13003134627 4.347987461492 4.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0870172359884833 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 56162761 G/A 1 34 20 54 15.521053288659 10.86996865373 4.651084634929 A:G G A 10 0.5434984326865 0.220908412388284 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 56599405 C/G 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 C:G C G 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000142409:ENST00000270459:exon_56598732_56600461:ZNF787 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 57956828 T/G 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57954659_57957191:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57954659_57956853:ZNF749 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 58319906 C/G 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 C:G C G 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000178935:ENST00000391701:exon_58318450_58320471:ZNF552 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 11 2 13 5.0215172404485 1.086996865373 3.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0469678452157161 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 13 5 18 5.9345203750755 2.7174921634325 3.217028211643 A:G G A 10 0.5434984326865 0.157947399738030 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 12 1 13 5.478018807762 0.5434984326865 4.9345203750755 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00491958291668485 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 58929200 A/C 0 11 0 11 5.0215172404485 0 5.0215172404485 A A 10 0.5434984326865 0.00140172727774491 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 58989495 A/C 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:C A C 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58989454_58989548:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58989454_58989548:ZNF446 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 9 1 10 4.1085141058215 0.5434984326865 3.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0262110522693532 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 224919 A/G 0 9 0 9 4.1085141058215 0 4.1085141058215 A A 10 0.5434984326865 0.00499889953481625 ENSG00000035115:ENST00000463865:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000405430:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000415006:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000356150:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000468321:exon_224864_224920:SH3YL1;ENSG00000035115:ENST00000472012:exon_224868_224920:SH3YL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 16 29 45 7.304025077016 15.7614545479085 -8.4574294708925 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0157076654727247 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 129 158 287 58.8887021834415 85.872752364467 -26.9840501810255 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00164194632012226 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 3481531 T/C 1 42 40 82 19.173065827167 21.73993730746 -2.566871480293 T:C:G T C 10 0.5434984326865 0.581096559351201 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3481463_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3481466_3481872:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3481466_3481566:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000452495:exon_3481486_3481566:TTC15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 3627648 G/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 C:G G C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7;ENSG00000171863:ENST00000472966:exon_3627409_3627850:RPS7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 8871342 C/A 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:C C A 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 398 342 740 181.687623790773 185.876463978783 -4.18884018801 A:G G A 10 0.5434984326865 0.767904011402232 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 58 53 111 26.477090904183 28.8054169323845 -2.3283260282015 T:C C T 10 0.5434984326865 0.703386926750093 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 14 22 36 6.391021942389 11.956965519103 -5.565943576714 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0671451655397904 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10929938 G/A 1 192 178 370 87.648300924192 96.742721018197 -9.094420094005 A:G G A 10 0.5434984326865 0.347935760292923 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10929875_10930015:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10929875_10930015:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10929875_10930015:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10929875_10930015:PDIA6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10930903 T/C 1 142 131 273 64.823222558517 71.1982946819315 -6.3750721234145 T:C T C 10 0.5434984326865 0.466064987762091 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10930845_10930959:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10930845_10930959:PDIA6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 91 112 203 41.5416426255285 60.871824460888 -19.3301818353595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00730245493142703 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 30 21 51 13.695047019405 11.4134670864165 2.2815799329885 T:C C T 10 0.5434984326865 0.575370460258131 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 25 14 39 11.4125391828375 7.608978057611 3.8035611252265 T:C C T 10 0.5434984326865 0.261457083609596 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 63 41 104 28.7595987407505 22.2834357401465 6.476163000604 A:G G A 10 0.5434984326865 0.237394685172999 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 69 85 154 31.4986081446315 46.1973667783525 -14.698758633721 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0188698549408844 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 27466368 C/T 1 63 67 130 28.7595987407505 36.4143949899955 -7.654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.187147218468103 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27466284_27466660:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27466284_27466653:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27466284_27466458:CAD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 27566410 G/A 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27566175_27566445:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27566175_27566445:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27566175_27566499:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457748:exon_27566175_27566445:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000423998:exon_27566198_27566445:GTF3C2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 43 32 75 19.6295673944805 17.391949845968 2.2376175485125 T:C T C 10 0.5434984326865 0.644005038833605 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 32750060 A/G 1 15 16 31 6.8475235097025 8.695974922984 -1.8484514132815 A:G A G 10 0.5434984326865 0.589619186731053 ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32749955_32750086:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32749955_32750086:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32749825_32750086:BIRC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 32983526 C/T 1 15 4 19 6.8475235097025 2.173993730746 4.6735297789565 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0372672339219625 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 33774761 T/C 1 25 36 61 11.4125391828375 19.565943576714 -8.1534043938765 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0397260786595102 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33774671_33774818:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33774671_33774818:RASGRP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 37230728 T/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37230685_37230829:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37230685_37230829:HEATR5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 37241050 G/A 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000008869:ENST00000233099:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000354531:exon_37240984_37241163:HEATR5B;ENSG00000008869:ENST00000471051:exon_37240984_37241138:HEATR5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 137 102 239 62.5407147219495 55.436840134023 7.1038745879265 A:G G A 10 0.5434984326865 0.364096937139666 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 18 23 41 8.217028211643 12.5004639517895 -4.2834357401465 A:G G A 10 0.5434984326865 0.210099008684555 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 37505105 T/G 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:G T G 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37505009_37506533:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37505009_37505132:PRKD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 38536626 T/G 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:G T G 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38536521_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000449130:exon_38536520_38536648:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000443098:exon_38536573_38536648:ATL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 42990010 C/A 1 16 7 23 7.304025077016 3.8044890288055 3.4995360482105 A:C C A 10 0.5434984326865 0.20824371770393 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 42990101 G/C 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 14 7 21 6.391021942389 3.8044890288055 2.5865329135835 A:T T A 10 0.5434984326865 0.281934153985525 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 43519977 C/T 1 11 6 17 5.0215172404485 3.260990596119 1.7605266443295 T:C C T 10 0.5434984326865 0.470234227697998 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43519973_43520352:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43519973_43520205:THADA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 43625184 T/A 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:T T A 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43625110_43625197:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 44004010 T/C 1 10 13 23 4.565015673135 7.0654796249245 -2.5004639517895 T:C T C 10 0.5434984326865 0.304445604018253 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000496980:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44003921_44004038:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44003962_44004038:DYNC2LI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 27 45 72 12.3255423174645 24.4574294708925 -12.131887153428 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00440837627356787 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 46842225 G/A 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46842076_46842324:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46842076_46842324:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46842076_46842324:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46840833_46844169:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000474980:exon_46842157_46842324:PIGF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 48030692 T/A 1 61 75 136 27.8465956061235 40.7623824514875 -12.915786845364 A:T T A 10 0.5434984326865 0.0310505193755465 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48030559_48030824:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48030559_48030824:MSH6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 16 4 20 7.304025077016 2.173993730746 5.13003134627 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0239563622006791 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 23 16 39 10.4995360482105 8.695974922984 1.8035611252265 A:G A G 10 0.5434984326865 0.631200662445808 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 54133744 T/C 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54133735_54133830:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54133735_54133830:PSME4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 30 18 48 13.695047019405 9.782971788357 3.912075231048 T:C C T 10 0.5434984326865 0.310729775294692 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 55201038 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000115310:ENST00000491592:exon_55200699_55201155:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000485749:exon_55200957_55201327:RTN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 55473507 T/C 1 27 40 67 12.3255423174645 21.73993730746 -9.4143949899955 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0265831539228976 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55473473_55473597:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55473473_55473597:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55473473_55473597:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000418823:exon_55473473_55473597:MTIF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 55771161 A/G 1 71 62 133 32.4116112792585 33.696902826563 -1.2852915473045 A:G A G 10 0.5434984326865 0.861943023741411 ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 55872526 A/C 1 23 33 56 10.4995360482105 17.9354482786545 -7.435912230444 A:C A C 10 0.5434984326865 0.059442256947152 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 11 2 13 5.0215172404485 1.086996865373 3.9345203750755 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0469678452157161 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 60689441 T/C 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 T:C T C 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000119866:ENST00000356842:exon_60687817_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000359629:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000378117:exon_60688487_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000489516:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000492272:exon_60689417_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000335712:exon_60684333_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000477659:exon_60686955_60689559:BCL11A;ENSG00000119866:ENST00000358510:exon_60687409_60689559:BCL11A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 64321823 A/G 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000197329:ENST00000358912:exon_64319786_64322402:PELI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65217089 G/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 C:G G C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65296657 A/G 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65296533_65296935:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65296533_65296935:CEP68 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65315711 G/A 1 148 120 268 67.562231962398 65.21981192238 2.342420040018 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.806359437425183 ENSG00000138069:ENST00000409784:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409892:exon_65313989_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000409751:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000398529:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000356214:exon_65315005_65315824:RAB1A;ENSG00000138069:ENST00000260638:exon_65315014_65315824:RAB1A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 80 73 153 36.52012538508 39.6753855861145 -3.1552602010345 A:G G A 10 0.5434984326865 0.626875742955779 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 68385097 A/G 1 21 23 44 9.5865329135835 12.5004639517895 -2.913931038206 A:G A G 10 0.5434984326865 0.449679990168436 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 6 14 20 2.739009403881 7.608978057611 -4.86996865373 A:T A T 10 0.5434984326865 0.0410079712081252 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 70033584 C/T 1 21 14 35 9.5865329135835 7.608978057611 1.9775548559725 T:C C T 10 0.5434984326865 0.61145493262932 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 70047833 C/T 1 55 33 88 25.1075862022425 17.9354482786545 7.172137923588 T:C C T 10 0.5434984326865 0.134666604817938 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70047831_70047953:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70047831_70047953:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70047831_70047953:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000471395:exon_70047831_70047953:ANXA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 62 66 128 28.303097173437 35.870896557309 -7.567799383872 A:G G A 10 0.5434984326865 0.184185731323721 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 245 239 484 111.842883991807 129.896125412074 -18.053241420266 A:T A T 10 0.5434984326865 0.100642753208535 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 18 21 39 8.217028211643 11.4134670864165 -3.1964388747735 A:G G A 10 0.5434984326865 0.336750534989634 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 20 16 36 9.13003134627 8.695974922984 0.434056423286 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 162 106 268 73.953253904787 57.610833864769 16.342420040018 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0495748505308798 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 74758934 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000115317:ENST00000482331:exon_74758466_74759039:HTRA2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 C:G C G 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 13 9 22 5.9345203750755 4.8914858941785 1.043034480897 T:C T C 10 0.5434984326865 0.676458559400952 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 598 400 998 272.987937253473 217.3993730746 55.588564178873 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.000415732393280911 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 16 27 43 7.304025077016 14.6744576825355 -7.3704326055195 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0310591127333691 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 86385728 C/T 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86385715_86385793:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 86693750 G/A 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86693495_86693956:KDM3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 86993040 A/G 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000153561:ENST00000283632:exon_86992982_86993147:RMND5A;ENSG00000153561:ENST00000472843:exon_86992982_86993147:RMND5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 88874891 C/A 1 14 6 20 6.391021942389 3.260990596119 3.13003134627 A:C C A 10 0.5434984326865 0.183227568315245 ENSG00000172071:ENST00000419748:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000303236:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000415570:exon_88874184_88874964:EIF2AK3;ENSG00000172071:ENST00000470706:exon_88874879_88874926:EIF2AK3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 96521726 G/A 1 15 5 20 6.8475235097025 2.7174921634325 4.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0737895272843234 ENSG00000174501:ENST00000456556:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000420871:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000419039:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000488721:exon_96521014_96521928:AC073995.2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 96684975 C/T 1 11 1 12 5.0215172404485 0.5434984326865 4.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0086122214100085 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 96685307 G/A 1 11 3 14 5.0215172404485 1.6304952980595 3.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 0.104744243021501 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 10 12 22 4.565015673135 6.521981192238 -1.956965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.521832905939548 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 73 97 170 33.3246144138855 52.7193479705905 -19.394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00333049214956925 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 97213229 G/T 1 16 11 27 7.304025077016 5.9784827595515 1.3255423174645 T:G G T 10 0.5434984326865 0.700975229232559 ENSG00000196843:ENST00000359765:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000470579:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000357485:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000412735:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000467498:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000454558:exon_97213139_97213254:ARID5A;ENSG00000196843:ENST00000497920:exon_97213127_97213254:ARID5A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 97519271 G/A 0 40 0 40 18.26006269254 0 18.26006269254 G G 10 0.5434984326865 2.67420412573452e-11 ENSG00000213337:ENST00000443120:exon_97519138_97519341:ANKRD39;ENSG00000213337:ENST00000393537:exon_97519138_97519341:ANKRD39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 97523655 G/C 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 C:G G C 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000163126:ENST00000462692:exon_97523625_97523671:ANKRD23;ENSG00000213337:ENST00000443120:exon_97523625_97523751:ANKRD39;ENSG00000213337:ENST00000393537:exon_97523625_97523832:ANKRD39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 16 18 34 7.304025077016 9.782971788357 -2.478946711341 C:G G C 10 0.5434984326865 0.396269069851091 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 99193496 C/T 1 8 1 9 3.652012538508 0.5434984326865 3.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0455044848393489 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409463:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99193452_99193606:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000498026:exon_99193452_99193606:INPP4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 99778985 T/C 1 12 16 28 5.478018807762 8.695974922984 -3.217956115222 T:C T C 10 0.5434984326865 0.256861842582542 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 99779131 T/C 1 23 25 48 10.4995360482105 13.5874608171625 -3.087924768952 T:C T C 10 0.5434984326865 0.387711265343278 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 52 33 85 23.738081500302 17.9354482786545 5.8026332216475 A:G G A 10 0.5434984326865 0.231376920994003 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 99995517 C/T 1 90 100 190 41.085141058215 54.34984326865 -13.264702210435 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0581700390602478 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995482_99995589:EIF5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 48 45 93 21.912075231048 24.4574294708925 -2.5453542398445 T:C T C 10 0.5434984326865 0.604324178384942 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 18 17 35 8.217028211643 9.2394733556705 -1.0224451440275 A:G A G 10 0.5434984326865 0.737611853756657 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 T:C T C 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 10 12 22 4.565015673135 6.521981192238 -1.956965519103 A:G A G 10 0.5434984326865 0.521832905939548 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 100058870 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100058779_100058931:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100058779_100058931:REV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 101010082 G/C 1 4 14 18 1.826006269254 7.608978057611 -5.782971788357 C:G G C 10 0.5434984326865 0.00787961219871969 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 101635538 C/T 1 55 7 62 25.1075862022425 3.8044890288055 21.303097173437 T:C C T 10 0.5434984326865 9.7025281860469e-09 ENSG00000071082:ENST00000409028:exon_101635460_101636078:RPL31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 103334969 G/A 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000135953:ENST00000258436:exon_103332299_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000438943:exon_103333497_103335666:MFSD9;ENSG00000135953:ENST00000437075:exon_103334030_103335666:MFSD9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 105977776 G/A 1 8 2 10 3.652012538508 1.086996865373 2.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.122678215119332 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 113496520 T/A 1 11 1 12 5.0215172404485 0.5434984326865 4.478018807762 A:T T A 10 0.5434984326865 0.0086122214100085 ENSG00000144130:ENST00000491170:exon_113496490_113496624:NT5DC4;ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113494184_113496625:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113495444_113496625:CKAP2L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 16 18 34 7.304025077016 9.782971788357 -2.478946711341 T:C T C 10 0.5434984326865 0.396269069851091 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 56 55 111 25.564087769556 29.8924137977575 -4.3283260282015 C:G C G 10 0.5434984326865 0.446219984486037 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 118583940 C/T 1 22 21 43 10.043034480897 11.4134670864165 -1.3704326055195 T:C C T 10 0.5434984326865 0.759976008303443 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 51 47 98 23.2815799329885 25.5444263362655 -2.262846403277 T:C T C 10 0.5434984326865 0.685478296417293 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 26 27 53 11.869040750151 14.6744576825355 -2.8054169323845 T:C T C 10 0.5434984326865 0.491320424812946 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 127826533 A/G 1 19 18 37 8.6735297789565 9.782971788357 -1.1094420094005 A:G A G 10 0.5434984326865 0.743477813502884 ENSG00000136717:ENST00000376113:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000357970:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393040:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000348750:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000259238:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000346226:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000393041:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000351659:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000352848:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000316724:exon_127826500_127826607:BIN1;ENSG00000136717:ENST00000409400:exon_127826500_127826607:BIN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 128394955 A/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000169994:ENST00000428314:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000272666:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000389524:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409816:exon_128394891_128395303:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000496841:exon_128394891_128395304:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000409090:exon_128394891_128395301:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000491278:exon_128394369_128395300:MYO7B;ENSG00000169994:ENST00000494959:exon_128394891_128395271:MYO7B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 11 19 30 5.0215172404485 10.3264702210435 -5.304952980595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0657441350013882 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 132277686 C/T 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245677325228346 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 143798189 A/G 1 52 66 118 23.738081500302 35.870896557309 -12.132815057007 A:G A G 10 0.5434984326865 0.02654754860475 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143797997_143798227:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143797997_143798227:KYNU HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 6 18 24 2.739009403881 9.782971788357 -7.043962384476 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00638109002034019 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 70 60 130 31.955109711945 32.60990596119 -0.654796249245003 T:C T C 10 0.5434984326865 0.92998690213129 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 152139416 G/A 1 59 53 112 26.9335924714965 28.8054169323845 -1.871824460888 A:G G A 10 0.5434984326865 0.776161982457395 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000491771:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000414946:exon_152139382_152139468:NMI;ENSG00000123609:ENST00000477072:exon_152139285_152139468:NMI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160105007 A/G 1 14 25 39 6.391021942389 13.5874608171625 -7.1964388747735 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0239823445633393 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 18 20 38 8.217028211643 10.86996865373 -2.652940442087 T:G G T 10 0.5434984326865 0.418270104386791 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160114315 G/A 1 16 8 24 7.304025077016 4.347987461492 2.956037615524 A:G G A 10 0.5434984326865 0.305762550366789 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160114269_160114375:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160114269_160114375:WDSUB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160132089 T/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160132057_160132149:WDSUB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160604379 C/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 160673526 A/G 1 9 18 27 4.1085141058215 9.782971788357 -5.6744576825355 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0332201062262774 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160673317_160673543:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160673317_160673543:RP11-357L2.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 162091932 G/A 1 21 33 54 9.5865329135835 17.9354482786545 -8.348915365071 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0280740940738012 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162091853_162092698:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162091853_162092683:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162091853_162092732:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162091853_162092677:TANK;ENSG00000136560:ENST00000439442:exon_162091853_162092159:TANK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 163124051 C/T 1 119 105 224 54.3236865103065 57.0673354320825 -2.743648921776 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.737548034710246 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123989_163124079:IFIH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 54 52 106 24.651084634929 28.261918499698 -3.610833864769 T:C T C 10 0.5434984326865 0.49611728310106 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 26 22 48 11.869040750151 11.956965519103 -0.087924768952 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 170938389 C/T 1 16 8 24 7.304025077016 4.347987461492 2.956037615524 T:C C T 10 0.5434984326865 0.305762550366789 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170938236_170940630:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170938236_170940637:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170938236_170938769:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170938236_170940641:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170938236_170940641:UBR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 171910313 C/T 1 19 12 31 8.6735297789565 6.521981192238 2.1515485867185 T:C C T 10 0.5434984326865 0.475606449773382 ENSG00000198586:ENST00000431350:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000360843:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000442919:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000359766:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000521943:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000434911:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000409443:exon_171910271_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000478683:exon_171910271_171911639:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000486857:exon_171910227_171910363:TLK1;ENSG00000198586:ENST00000453628:exon_171910292_171910363:TLK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 174820750 T/C 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000172845:ENST00000310015:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000416195:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000418194:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000455789:exon_174819601_174820960:SP3;ENSG00000172845:ENST00000462904:exon_174820545_174820956:SP3;ENSG00000172845:ENST00000475175:exon_174820658_174820960:SP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 30 22 52 13.695047019405 11.956965519103 1.738081500302 A:C A C 10 0.5434984326865 0.67771001145901 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 180810180 C/T 1 92 76 168 41.998144192842 41.305880884174 0.692263308667997 T:C C T 10 0.5434984326865 0.938389731701557 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 180810358 C/T 1 64 59 123 29.216100308064 32.0664075285035 -2.8503072204395 T:C C T 10 0.5434984326865 0.651106687261402 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 16 5 21 7.304025077016 2.7174921634325 4.5865329135835 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0495571727862335 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 40 39 79 18.26006269254 21.1964388747735 -2.9363761822335 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.572564478160094 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 183593697 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183593590_183593721:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000494462:exon_183593303_183593834:DNAJC10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 183622547 T/G 1 30 8 38 13.695047019405 4.347987461492 9.347059557913 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0028438937876416 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183622419_183622552:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183622419_183622552:DNAJC10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 27 19 46 12.3255423174645 10.3264702210435 1.999072096421 A:G A G 10 0.5434984326865 0.657527788707156 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 191064753 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000187699:ENST00000396974:exon_191064423_191065205:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409545:exon_191064423_191064789:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000409870:exon_191064423_191064935:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000340623:exon_191064423_191068210:C2orf88;ENSG00000187699:ENST00000443551:exon_191064423_191064940:C2orf88 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 25 19 44 11.4125391828375 10.3264702210435 1.086068961794 T:C T C 10 0.5434984326865 0.764705161075405 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 191184475 A/G 1 17 14 31 7.7605266443295 7.608978057611 0.1515485867185 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191184442_191184616:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191184442_191184771:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191184442_191184771:HIBCH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 191224927 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 T:C:G G T 10 0.5434984326865 0.126419205254674 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 191231503 G/A 1 9 1 10 4.1085141058215 0.5434984326865 3.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0262110522693532 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 197021276 T/C 1 5 15 20 2.2825078365675 8.1524764902975 -5.86996865373 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0117598512628242 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 15 16 31 6.8475235097025 8.695974922984 -1.8484514132815 T:C T C 10 0.5434984326865 0.589619186731053 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 48 32 80 21.912075231048 17.391949845968 4.52012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.369365364566243 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 16 110 126 7.304025077016 59.784827595515 -52.480802518499 A:G G A 10 0.5434984326865 3.08302598869275e-22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 24 30 54 10.956037615524 16.304952980595 -5.348915365071 A:G A G 10 0.5434984326865 0.171634581966127 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 203139844 T/C 1 65 76 141 29.6726018753775 41.305880884174 -11.6332790087965 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0519438041810853 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000426814:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000488403:exon_203139836_203139912:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492740:exon_203139836_203140406:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000472050:exon_203139836_203139912:NOP58 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 203155936 A/C 1 125 127 252 57.0626959141875 69.0243009511855 -11.961605036998 A:C A C 10 0.5434984326865 0.145689721658080 ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155848_203155993:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155848_203155993:NOP58 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 204154552 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204154488_204154599:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431075:exon_204154488_204154599:CYP20A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 12 16 28 5.478018807762 8.695974922984 -3.217956115222 A:G A G 10 0.5434984326865 0.256861842582542 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:C C A 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 216190020 C/G 1 53 66 119 24.1945830676155 35.870896557309 -11.6763134896935 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0342255163466923 ENSG00000138363:ENST00000236959:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000444305:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000488712:exon_216189903_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000443953:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000435675:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000427397:exon_216189964_216190052:ATIC;ENSG00000138363:ENST00000413174:exon_216189964_216190052:ATIC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 216904019 A/T 1 23 16 39 10.4995360482105 8.695974922984 1.8035611252265 A:T A T 10 0.5434984326865 0.631200662445808 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 216923679 C/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 180 172 352 82.17028211643 93.481730422078 -11.311448305648 A:G A G 10 0.5434984326865 0.239195451919343 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 217363597 C/T 1 3607 2473 6080 1646.60115329979 1344.07162403371 302.52952926608 A:T:C:G C T 10 0.5434984326865 5.82033733429864e-15 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217362912_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363548_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363567_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363578_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363585_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 217363638 G/A 0 8 0 8 3.652012538508 0 3.652012538508 G G 10 0.5434984326865 0.00949952012420876 ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 219267781 C/T 1 18 16 34 8.217028211643 8.695974922984 -0.478946711340999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.865422613408382 ENSG00000144579:ENST00000491064:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000443891:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000473420:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000498160:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000273062:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000497677:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000452977:exon_219267734_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000428361:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000488627:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000482272:exon_219267758_219267850:CTDSP1;ENSG00000144579:ENST00000464255:exon_219267758_219267850:CTDSP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 27 15 42 12.3255423174645 8.1524764902975 4.173065827167 A:G G A 10 0.5434984326865 0.217477872568822 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 17 11 28 7.7605266443295 5.9784827595515 1.782043884778 A:G A G 10 0.5434984326865 0.571892262439823 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 22 19 41 10.043034480897 10.3264702210435 -0.283435740146501 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 23 12 35 10.4995360482105 6.521981192238 3.9775548559725 A:G A G 10 0.5434984326865 0.234536154560202 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220046122 T/C 1 24 14 38 10.956037615524 7.608978057611 3.347059557913 T:C T C 10 0.5434984326865 0.329458519566248 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 10 18 28 4.565015673135 9.782971788357 -5.217956115222 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0573689366969762 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 11 16 27 5.0215172404485 8.695974922984 -3.6744576825355 T:C C T 10 0.5434984326865 0.178233060083669 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 12 15 27 5.478018807762 8.1524764902975 -2.6744576825355 T:C T C 10 0.5434984326865 0.337308055174249 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 223488419 G/T 1 149 142 291 68.0187335297115 77.176777441483 -9.1580439117715 T:G G T 10 0.5434984326865 0.289820377036407 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223488369_223488449:FARSB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 223504326 T/C 1 39 25 64 17.8035611252265 13.5874608171625 4.216100308064 T:C T C 10 0.5434984326865 0.316947527541494 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223504299_223504414:FARSB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 8 11 19 3.652012538508 5.9784827595515 -2.3264702210435 A:C A C 10 0.5434984326865 0.358365878943715 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231149097 T/C 1 19 23 42 8.6735297789565 12.5004639517895 -3.826934172833 T:C T C 10 0.5434984326865 0.278576164298404 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000476126:exon_231149061_231149126:SP140 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:G G T 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231222675 T/C 1 15 9 24 6.8475235097025 4.8914858941785 1.956037615524 T:C T C 10 0.5434984326865 0.53990005232013 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231248261 C/T 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231248225_231248290:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231248225_231248290:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231248225_231248290:SP140L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 104 119 223 47.476163000604 64.6763134896935 -17.2001504890895 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0222040534456688 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 156 167 323 71.214244500906 90.7642382586455 -19.5499937577395 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0294551360046347 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231406680 T/C 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231406607_231406750:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231406607_231406750:SP100 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 T:C C T 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 8 1 9 3.652012538508 0.5434984326865 3.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0455044848393489 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 61 55 116 27.8465956061235 29.8924137977575 -2.045818191634 T:C T C 10 0.5434984326865 0.710276753376585 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 29 34 63 13.2385454520915 18.478946711341 -5.2404012592495 T:C T C 10 0.5434984326865 0.206441822415638 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 242105788 C/T 1 144 142 286 65.736225693144 77.176777441483 -11.440551748339 T:C C T 10 0.5434984326865 0.191516745763423 ENSG00000115685:ENST00000438799:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000402734:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000423280:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000407025:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000272983:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000234038:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000404405:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000406106:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000401987:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000450367:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000485630:exon_242105752_242105854:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000491715:exon_242105752_242105856:PPP1R7;ENSG00000115685:ENST00000479821:exon_242105756_242105856:PPP1R7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 35 40 75 15.9775548559725 21.73993730746 -5.7623824514875 A:G A G 10 0.5434984326865 0.202553716996338 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 29 18 47 13.2385454520915 9.782971788357 3.4555736637345 T:C T C 10 0.5434984326865 0.379971744998724 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 259818 G/A 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 278806 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 32 45 77 14.608050154032 24.4574294708925 -9.8493793168605 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0292018735595016 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 390652 C/T 1 80 97 177 36.52012538508 52.7193479705905 -16.1992225855105 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0156582137991677 ENSG00000125826:ENST00000411647:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000382214:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000356286:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000415942:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000420170:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000441733:exon_390528_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_390474_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400244:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400243:exon_390525_390669:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000414880:exon_390528_390669:RBCK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 40 49 89 18.26006269254 26.6314232016385 -8.3713605090985 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0882058041461766 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 23 20 43 10.4995360482105 10.86996865373 -0.3704326055195 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5843812 T/C 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5844121 C/T 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5844122 A/G 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 A:C:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 29 21 50 13.2385454520915 11.4134670864165 1.825078365675 T:C T C 10 0.5434984326865 0.67119609630929 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 28 22 50 12.782043884778 11.956965519103 0.825078365674999 T:C T C 10 0.5434984326865 0.887507408057495 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G A G 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 10019093 A/G 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000132623:ENST00000378392:exon_10018906_10019295:ANKRD5;ENSG00000132623:ENST00000378380:exon_10018906_10019295:ANKRD5;ENSG00000132623:ENST00000488991:exon_10018906_10019295:ANKRD5;ENSG00000132623:ENST00000426133:exon_10018904_10019295:ANKRD5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 19 34 53 8.6735297789565 18.478946711341 -9.8054169323845 A:C C A 10 0.5434984326865 0.00832389141705481 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 19 35 54 8.6735297789565 19.0224451440275 -10.348915365071 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00585490312663883 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 13695680 C/T 1 43 52 95 19.6295673944805 28.261918499698 -8.6323511052175 T:C C T 10 0.5434984326865 0.080292809030626 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 13763601 A/G 1 37 37 74 16.8905579905995 20.1094420094005 -3.218884018801 A:G A G 10 0.5434984326865 0.48479031313183 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 13779113 T/C 1 25 11 36 11.4125391828375 5.9784827595515 5.434056423286 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0930008569212228 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000485738:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000477732:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000481249:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476536:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000464269:exon_13779107_13779146:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479716:exon_13779107_13779146:C20orf7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 34 31 65 15.521053288659 16.8484514132815 -1.3273981246225 A:C C A 10 0.5434984326865 0.80367896232435 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 67 55 122 30.5856050100045 29.8924137977575 0.693191212247001 A:G G A 10 0.5434984326865 0.927781087701974 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 18143355 C/T 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000489634:exon_18143021_18143589:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000434922:exon_18143021_18143589:CSRP2BP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 21142523 C/G 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 C:G C G 10 0.5434984326865 0.740503731586123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 12 6 18 5.478018807762 3.260990596119 2.217028211643 T:C T C 10 0.5434984326865 0.349542691073942 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 42 45 87 19.173065827167 24.4574294708925 -5.2843636437255 T:C C T 10 0.5434984326865 0.282153734920752 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 33591006 G/A 1 25 13 38 11.4125391828375 7.0654796249245 4.347059557913 A:G G A 10 0.5434984326865 0.192681484263785 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33590207_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33590215_33591086:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33590215_33591086:TRPC4AP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 34828303 G/A 1 22 18 40 10.043034480897 9.782971788357 0.26006269254 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000131043:ENST00000397286:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34827743_34828547:C20orf4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 17 11 28 7.7605266443295 5.9784827595515 1.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.571892262439823 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 37570725 C/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000101447:ENST00000217429:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000449225:exon_37570602_37570769:FAM83D;ENSG00000101447:ENST00000424027:exon_37570602_37570769:FAM83D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 159 144 303 72.5837492028465 78.263774306856 -5.68002510400949 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.526143645524764 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 17 16 33 7.7605266443295 8.695974922984 -0.9354482786545 A:G G A 10 0.5434984326865 0.861627917154420 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 12 3 15 5.478018807762 1.6304952980595 3.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0667649802319761 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 55093178 C/T 1 108 93 201 49.302169269858 50.5453542398445 -1.2431849699865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.88748649138587 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55093143_55093938:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55093143_55093938:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477485:exon_55093143_55093301:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477573:exon_55093143_55093943:C20orf43;ENSG00000124103:ENST00000481560:exon_55093143_55093353:C20orf106 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 9 18 27 4.1085141058215 9.782971788357 -5.6744576825355 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0332201062262774 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 35 17 52 15.9775548559725 9.2394733556705 6.738081500302 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0700311742912527 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 A:G G A 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 62191919 G/A 1 8 12 20 3.652012538508 6.521981192238 -2.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.261780206050886 ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191832_62192050:RP4-697K14.7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 62322288 T/C 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62322158_62322300:RTEL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 62326770 G/A 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62326681_62326833:RTEL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 62331989 T/G 1 42 28 70 19.173065827167 15.217956115222 3.955109711945 T:G T G 10 0.5434984326865 0.401236588001261 ENSG00000101246:ENST00000359715:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000440854:exon_62329996_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000485858:exon_62331954_62332129:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000217224:exon_62331954_62332054:ARFRP1;ENSG00000101246:ENST00000324228:exon_62331954_62332054:ARFRP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 62373707 G/T 1 14 19 33 6.391021942389 10.3264702210435 -3.9354482786545 T:G G T 10 0.5434984326865 0.220723036124753 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000485897:exon_62373689_62373843:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62373689_62373968:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000491109:exon_62373689_62373887:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62373689_62373717:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000482718:exon_62373483_62373888:SLC2A4RG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 20 62492922 T/A 1 9 5 14 4.1085141058215 2.7174921634325 1.391021942389 A:T T A 10 0.5434984326865 0.594459609035139 ENSG00000183260:ENST00000369916:exon_62492851_62494341:C20orf135 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 15918577 G/C 1 56 20 76 25.564087769556 10.86996865373 14.694119115826 C:G G C 10 0.5434984326865 0.000736404469247993 ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15918526_15918664:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15918526_15918662:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000493640:exon_15918526_15918634:SAMSN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 17203785 A/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:T A T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000155313:ENST00000285681:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000285679:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000400183:exon_17203720_17203948:USP25;ENSG00000155313:ENST00000453553:exon_17203720_17203948:USP25 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 18966406 C/T 1 57 35 92 26.0205893368695 19.0224451440275 6.998144192842 T:C C T 10 0.5434984326865 0.173330095395410 ENSG00000154640:ENST00000339775:exon_18965971_18966650:BTG3;ENSG00000154640:ENST00000348354:exon_18965971_18966650:BTG3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 62 57 119 28.303097173437 30.9794106631305 -2.6763134896935 T:C C T 10 0.5434984326865 0.646072316256635 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 68 69 137 31.042106577318 37.5013918553685 -6.4592852780505 T:C C T 10 0.5434984326865 0.30339395808562 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34614250 T/C 1 12 18 30 5.478018807762 9.782971788357 -4.304952980595 T:C T C 10 0.5434984326865 0.142196443691064 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 11 19 30 5.0215172404485 10.3264702210435 -5.304952980595 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0657441350013882 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 16 9 25 7.304025077016 4.8914858941785 2.4125391828375 A:G A G 10 0.5434984326865 0.423091520628089 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34787312 A/G 1 32 36 68 14.608050154032 19.565943576714 -4.957893422682 A:G A G 10 0.5434984326865 0.273144104279134 ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34878407 C/T 1 48 23 71 21.912075231048 12.5004639517895 9.4116112792585 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0312826514990818 ENSG00000159131:ENST00000414353:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34878281_34878411:GART;ENSG00000159131:ENST00000482663:exon_34878347_34878411:GART HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 19 26 45 8.6735297789565 14.130959249849 -5.4574294708925 A:G G A 10 0.5434984326865 0.133649989818961 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 27 26 53 12.3255423174645 14.130959249849 -1.8054169323845 T:C C T 10 0.5434984326865 0.67979002099681 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 7 12 19 3.1955109711945 6.521981192238 -3.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 0.166463653686349 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 491 523 1014 224.142269550928 284.24968029504 -60.107410744111 A:C:G A G 10 0.5434984326865 0.000173116655199371 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 35890409 C/T 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000159200:ENST00000487990:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000313806:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000489903:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381132:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000399272:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000481448:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000482533:exon_35888782_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000381135:exon_35888788_35890554:RCAN1;ENSG00000159200:ENST00000443408:exon_35888788_35890554:RCAN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 10 2 12 4.565015673135 1.086996865373 3.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0776155508599071 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 48 39 87 21.912075231048 21.1964388747735 0.715636356274501 C:G G C 10 0.5434984326865 0.914588015243438 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 69 107 176 31.4986081446315 58.1543322974555 -26.655724152824 T:C:G C T 10 0.5434984326865 7.41322961087866e-05 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 11 1 12 5.0215172404485 0.5434984326865 4.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0086122214100085 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 13 4 17 5.9345203750755 2.173993730746 3.7605266443295 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0875276822954765 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 4 11 15 1.826006269254 5.9784827595515 -4.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0380096891755768 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 40549466 T/C 1 106 149 255 48.389166135231 80.9812664702885 -32.5921003350575 T:C T C 10 0.5434984326865 5.26959116865253e-05 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000481921:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40549361_40549497:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40549361_40549497:PSMG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 46 60 106 20.999072096421 32.60990596119 -11.610833864769 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0249488999321758 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 40555351 G/C 1 19 11 30 8.6735297789565 5.9784827595515 2.695047019405 C:G G C 10 0.5434984326865 0.363343516275521 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40555178_40555777:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40555178_40555414:PSMG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 40670460 G/C 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 C:G G C 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 19 20 39 8.6735297789565 10.86996865373 -2.1964388747735 T:C T C 10 0.5434984326865 0.522280512558798 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 336 441 777 153.384526617336 239.682808814746 -86.2982821974105 A:T:G G A 10 0.5434984326865 6.32309805970661e-10 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 392 284 676 178.948614386892 154.353554882966 24.595059503926 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0585558211183416 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 5 12 17 2.2825078365675 6.521981192238 -4.2394733556705 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0502092065252103 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 44323461 G/A 1 6 20 26 2.739009403881 10.86996865373 -8.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00141913812947189 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 5 29 34 2.2825078365675 15.7614545479085 -13.478946711341 T:G T G 10 0.5434984326865 2.45159758846204e-06 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 8 30 38 3.652012538508 16.304952980595 -12.652940442087 A:G G A 10 0.5434984326865 5.03932374417333e-05 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 45217559 T/C 1 99 76 175 45.1936551640365 41.305880884174 3.8877742798625 T:C T C 10 0.5434984326865 0.595524089328492 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 45648905 G/C 1 10 12 22 4.565015673135 6.521981192238 -1.956965519103 C:G G C 10 0.5434984326865 0.521832905939548 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45642874_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45646717_45648927:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45646717_45649972:ICOSLG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 59 27 86 26.9335924714965 14.6744576825355 12.259134788961 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00903513438858013 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 47787002 T/C 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 47851796 G/A 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 47855876 A/G 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47855817_47856061:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47855817_47856061:PCNT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 14 5 19 6.391021942389 2.7174921634325 3.6735297789565 A:C A C 10 0.5434984326865 0.108651058093492 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 21 47966977 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47966828_47967118:DIP2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 17590535 C/T 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000177663:ENST00000425985:exon_17589197_17590825:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000319363:exon_17589197_17596583:IL17RA;ENSG00000177663:ENST00000399876:exon_17589197_17590710:IL17RA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 19 21 40 8.6735297789565 11.4134670864165 -2.73993730746 A:C C A 10 0.5434984326865 0.428966278029421 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 35 39 74 15.9775548559725 21.1964388747735 -5.218884018801 T:C T C 10 0.5434984326865 0.243893692290782 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 20 16 36 9.13003134627 8.695974922984 0.434056423286 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 254 312 566 115.951398097629 169.571510998188 -53.620112900559 A:C:G A G 10 0.5434984326865 7.29257419995206e-06 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19121721 C/T 1 51 37 88 23.2815799329885 20.1094420094005 3.172137923588 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522343070660426 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19117792_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19121450_19121988:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19121481_19121988:DGCR14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19124866 G/A 1 14 22 36 6.391021942389 11.956965519103 -5.565943576714 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0671451655397904 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19124836_19124945:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19124836_19124945:DGCR14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 25 12 37 11.4125391828375 6.521981192238 4.8905579905995 A:C A C 10 0.5434984326865 0.136706739340960 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19868218 A/G 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19868145_19868870:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19868145_19868240:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19868145_19868240:TXNRD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 60 44 104 27.39009403881 23.913931038206 3.476163000604 T:C C T 10 0.5434984326865 0.555027484722872 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 45 59 104 20.5425705291075 32.0664075285035 -11.523836999396 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0298497376748077 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 141 100 241 64.3667209912035 54.34984326865 10.0168777225535 A:G G A 10 0.5434984326865 0.219151955493816 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 23 10 33 10.4995360482105 5.434984326865 5.0645517213455 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0825066204661177 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 68 44 112 31.042106577318 23.913931038206 7.128175539112 T:C C T 10 0.5434984326865 0.185149732240903 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 21984205 A/G 1 39 37 76 17.8035611252265 20.1094420094005 -2.305880884174 A:G A G 10 0.5434984326865 0.645587023881818 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21984140_21984301:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21983597_21984320:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21984140_21984353:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21984140_21984332:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21984140_21984327:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21984140_21984303:YDJC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 22330082 T/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22330012_22330087:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449517:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000424393:exon_22330012_22330116:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437929:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000430142:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000489581:exon_22330012_22330168:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000456075:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000449704:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000442653:exon_22330012_22330341:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000437103:exon_22330012_22330179:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000434517:exon_22330018_22330179:TOP3B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 14 9 23 6.391021942389 4.8914858941785 1.4995360482105 A:G A G 10 0.5434984326865 0.676494303927597 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24108288 C/G 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 C:G C G 10 0.5434984326865 1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 205 191 396 93.5828212992675 103.808200643121 -10.225379343854 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.313184026940938 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24167513 G/A 1 132 82 214 60.258206885382 44.566871480293 15.691335405089 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0332948951332516 ENSG00000099956:ENST00000344921:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000263121:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407422:exon_24167412_24167602:SMARCB1;ENSG00000099956:ENST00000407082:exon_24167412_24167602:SMARCB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24179132 G/A 1 30 43 73 13.695047019405 23.3704326055195 -9.6753855861145 A:G G A 10 0.5434984326865 0.025425127358895 ENSG00000099958:ENST00000404056:exon_24176690_24179404:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000290730:exon_24176690_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464034:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000488272:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000318109:exon_24178921_24179149:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000476077:exon_24178921_24179341:DERL3;ENSG00000099958:ENST00000464110:exon_24178954_24179341:DERL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24217368 C/T 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000133460:ENST00000345044:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398356:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398359:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000407566:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405847:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000467660:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405286:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000255830:exon_24217308_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000489322:exon_24217308_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000473740:exon_24217304_24217398:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000423972:exon_24217308_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000418102:exon_24217304_24217376:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000436643:exon_24217272_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000405340:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000461809:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000316185:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000398363:exon_24217304_24217428:SLC2A11;ENSG00000133460:ENST00000482576:exon_24217347_24217428:SLC2A11;ENSG00000251357:ENST00000421180:exon_24217304_24217428:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000447957:exon_24217304_24217428:AP000350.10;ENSG00000251357:ENST00000433835:exon_24217304_24217428:AP000350.10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24562759 G/A 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24562607_24563281:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24562607_24563281:CABIN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24564477 C/T 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000099991:ENST00000263119:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000405822:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000398319:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000403176:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000337989:exon_24564415_24564489:CABIN1;ENSG00000099991:ENST00000485008:exon_24564415_24564489:CABIN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 20 17 37 9.13003134627 9.2394733556705 -0.1094420094005 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 26884451 C/T 1 24 19 43 10.956037615524 10.3264702210435 0.6295673944805 T:C C T 10 0.5434984326865 0.879514747260008 ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26884356_26884454:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26884356_26884454:SRRD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 26936766 G/A 1 17 11 28 7.7605266443295 5.9784827595515 1.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.571892262439823 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000445720:exon_26936755_26936837:TPST2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 26936811 G/A 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000128294:ENST00000338754:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000528868:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000403880:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000398110:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000422943:exon_26936755_26937684:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000455980:exon_26936755_26937601:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000446035:exon_26936755_26937600:TPST2;ENSG00000128294:ENST00000445720:exon_26936755_26936837:TPST2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 29726395 C/T 1 42 32 74 19.173065827167 17.391949845968 1.781115981199 T:C C T 10 0.5434984326865 0.727024666560323 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29726367_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29726181_29726521:AP1B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 19 25 44 8.6735297789565 13.5874608171625 -4.913931038206 T:C C T 10 0.5434984326865 0.172586780773862 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 29957570 G/A 1 49 57 106 22.3685767983615 30.9794106631305 -8.610833864769 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0979010784394511 ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957495_29957635:NIPSNAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 30184982 C/G 1 77 78 155 35.1506206831395 42.392877749547 -7.2422570664075 C:G C G 10 0.5434984326865 0.259244711028027 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 30189642 C/T 0 69 0 69 31.4986081446315 0 31.4986081446315 C C 10 0.5434984326865 8.26807700314322e-19 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30189349_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000411532:exon_30189566_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000483380:exon_30189576_30189665:ASCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 30198025 C/T 1 50 40 90 22.825078365675 21.73993730746 1.085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.833313891570658 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30197983_30198197:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30197983_30198197:ASCC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 19 12 31 8.6735297789565 6.521981192238 2.1515485867185 A:G G A 10 0.5434984326865 0.475606449773382 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 30 38 68 13.695047019405 20.652940442087 -6.957893422682 T:C T C 10 0.5434984326865 0.112867735724232 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:C T C 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 31838085 G/A 1 16 19 35 7.304025077016 10.3264702210435 -3.0224451440275 A:G G A 10 0.5434984326865 0.314169389001376 ENSG00000184708:ENST00000344710:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000495101:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31837760_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000445424:exon_31837789_31838104:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000475437:exon_31838021_31838104:EIF4ENIF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 32435511 G/A 0 224 0 224 102.256351078224 0 102.256351078224 G G 10 0.5434984326865 5.69435825837932e-60 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 90 124 214 41.085141058215 67.393805653126 -26.308664594911 T:C T C 10 0.5434984326865 0.000342143116918981 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 40 54 94 18.26006269254 29.348915365071 -11.088852672531 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0228007799086352 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 32871365 G/A 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36623920 G/A 1 38 41 79 17.347059557913 22.2834357401465 -4.9363761822335 A:G G A 10 0.5434984326865 0.309411316408431 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 3 13 16 1.3695047019405 7.0654796249245 -5.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00487479306384941 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36661455 C/T 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 T:C C T 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 10 12 22 4.565015673135 6.521981192238 -1.956965519103 A:C C A 10 0.5434984326865 0.521832905939548 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 13 17 30 5.9345203750755 9.2394733556705 -3.304952980595 A:G G A 10 0.5434984326865 0.272133535840955 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 14 7 21 6.391021942389 3.8044890288055 2.5865329135835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.281934153985525 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 75 94 169 34.2376175485125 51.088852672531 -16.8512351240185 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0106504660722800 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 87 58 145 39.7156363562745 31.522909095817 8.1927272604575 T:C T C 10 0.5434984326865 0.182713145867793 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 87 44 131 39.7156363562745 23.913931038206 15.8017053180685 A:C C A 10 0.5434984326865 0.00634445803195351 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 T:G G T 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 357 377 734 162.971059530919 204.89890912281 -41.927849591891 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00208391397024927 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 63 96 159 28.7595987407505 52.175849537904 -23.4162507971535 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000229652300056492 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 15 3 18 6.8475235097025 1.6304952980595 5.217028211643 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0161588702294649 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 38205989 T/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38205956_38206164:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38205956_38206164:GCAT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 21 40 61 9.5865329135835 21.73993730746 -12.1534043938765 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00192475377338410 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 38273749 T/C 1 648 660 1308 295.813015619148 358.70896557309 -62.895949953942 T:C:G T C 10 0.5434984326865 0.000517400559286328 ENSG00000100129:ENST00000412331:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000262832:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000381683:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000433002:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000425539:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000477256:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000406934:exon_38273681_38274178:EIF3L;ENSG00000100129:ENST00000482600:exon_38273681_38274178:EIF3L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 38323507 G/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 19 27 46 8.6735297789565 14.6744576825355 -6.000927903579 T:C C T 10 0.5434984326865 0.102455643140490 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 39178701 A/G 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100246:ENST00000216068:exon_39178668_39178875:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000437501:exon_39178668_39178750:DNAL4;ENSG00000100246:ENST00000406199:exon_39178668_39178875:DNAL4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 39477123 T/C 1 83 60 143 37.8896300870205 32.60990596119 5.2797241258305 T:C T C 10 0.5434984326865 0.401731710339926 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39476938_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000486357:exon_39476938_39477199:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39475667_39477232:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39476640_39477232:APOBEC3G HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 40814500 T/C 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000469304:exon_40814378_40814524:MKL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 40814594 C/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 41610024 G/A 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41609855_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000489136:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41609897_41610030:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000450939:exon_41609897_41610030:L3MBTL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 21 24 45 9.5865329135835 13.043962384476 -3.4574294708925 A:C A C 10 0.5434984326865 0.369446372780068 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 42059768 G/T 1 634 507 1141 289.421993676759 275.553705372056 13.8682883047035 T:G G T 10 0.5434984326865 0.422376774877867 ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 42336172 G/A 1 18 13 31 8.217028211643 7.0654796249245 1.1515485867185 A:G G A 10 0.5434984326865 0.721663380389718 ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42336143_42336223:CENPM HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 47 39 86 21.4555736637345 21.1964388747735 0.259134788961003 A:C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44368122 A/G 1 32 22 54 14.608050154032 11.956965519103 2.651084634929 A:G A G 10 0.5434984326865 0.497331488639849 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 40 42 82 18.26006269254 22.826934172833 -4.566871480293 A:G A G 10 0.5434984326865 0.320365927203380 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 97 72 169 44.2806520294095 39.131887153428 5.14876487598151 T:C C T 10 0.5434984326865 0.440917121007881 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 48 54 102 21.912075231048 29.348915365071 -7.436840134023 T:C T C 10 0.5434984326865 0.163763587641331 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44379838 A/G 1 59 62 121 26.9335924714965 33.696902826563 -6.7633103550665 A:G A G 10 0.5434984326865 0.235711867012608 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44489868 T/C 1 66 76 142 30.129103442691 41.305880884174 -11.176777441483 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0638726047409516 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 81 87 168 36.9766269523935 47.2843636437255 -10.307736691332 T:C T C 10 0.5434984326865 0.12128868885403 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 40 47 87 18.26006269254 25.5444263362655 -7.2843636437255 T:C C T 10 0.5434984326865 0.131787447647864 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 60 57 117 27.39009403881 30.9794106631305 -3.5893166243205 C:G C G 10 0.5434984326865 0.517110085622342 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 45128232 T/C 1 3 11 14 1.3695047019405 5.9784827595515 -4.608978057611 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0154917950977014 ENSG00000186654:ENST00000432186:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000492475:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000457960:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000477331:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45128131_45128271:PRR5;ENSG00000241484:ENST00000517296:exon_45128131_45128271:ARHGAP8;ENSG00000248405:ENST00000352766:exon_45128131_45128271:PRR5-ARHGAP8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 46748199 A/G 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100416:ENST00000486620:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485175:exon_46748161_46748226:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000463785:exon_46748161_46748227:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000479648:exon_46748161_46748209:TRMU HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 47085924 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47085889_47086097:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47085889_47086097:CERK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 47087670 G/A 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47087469_47087674:CERK;ENSG00000100422:ENST00000471929:exon_47087469_47087674:CERK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 39 36 75 17.8035611252265 19.565943576714 -1.7623824514875 T:C T C 10 0.5434984326865 0.728561513710981 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 94 80 174 42.911147327469 43.47987461492 -0.568727287450997 C:G G C 10 0.5434984326865 0.939473935547566 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50646936 G/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 T:C T C 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50699668 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50699596_50699737:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50699596_50700137:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50699596_50699725:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50699596_50699725:MAPK12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 17 21 38 7.7605266443295 11.4134670864165 -3.652940442087 A:G G A 10 0.5434984326865 0.256620626722929 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 A:G A G 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50752150 C/T 1 40 33 73 18.26006269254 17.9354482786545 0.324614413885499 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50752064_50752153:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50752064_50752153:FAM116B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50877166 G/C 1 17 17 34 7.7605266443295 9.2394733556705 -1.478946711341 C:G G C 10 0.5434984326865 0.61102443350199 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 33 49 82 15.0645517213455 26.6314232016385 -11.566871480293 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0107919751323878 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50893007 G/A 1 13 19 32 5.9345203750755 10.3264702210435 -4.391949845968 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.154832957446916 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50892941_50893135:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50892941_50893171:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50892941_50893171:SBF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50893287 T/C 1 21 22 43 9.5865329135835 11.956965519103 -2.3704326055195 T:C:G T C 10 0.5434984326865 0.540975696800769 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50893243_50893373:SBF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50895020 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 13 6 19 5.9345203750755 3.260990596119 2.6735297789565 A:G G A 10 0.5434984326865 0.255120707369053 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 20 7 27 9.13003134627 3.8044890288055 5.3255423174645 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0517763243452372 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 C:G G C 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 2 15 17 0.913003134627 8.1524764902975 -7.2394733556705 C:G G C 10 0.5434984326865 0.000379010577761579 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 0 13 0 13 5.9345203750755 0 5.9345203750755 T T 10 0.5434984326865 0.00039844821904971 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 A:G A G 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 3197918 A/G 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 A:G A G 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3195108_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3195108_3198468:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000482844:exon_3197903_3197965:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000480249:exon_3197774_3197965:CRBN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 43 46 89 19.6295673944805 25.000927903579 -5.3713605090985 T:C T C 10 0.5434984326865 0.287356087039934 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 13 16 29 5.9345203750755 8.695974922984 -2.7614545479085 T:C T C 10 0.5434984326865 0.352945890481158 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 17 12 29 7.7605266443295 6.521981192238 1.2385454520915 T:C T C 10 0.5434984326865 0.711729652143047 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 42 31 73 19.173065827167 16.8484514132815 2.3246144138855 A:G G A 10 0.5434984326865 0.639116483979724 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9798773 C/G 1 11 10 21 5.0215172404485 5.434984326865 -0.4134670864165 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000114026:ENST00000302003:exon_9798728_9799091:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000344629:exon_9798745_9799197:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339542:exon_9798745_9799087:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000416333:exon_9798728_9798875:OGG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 12 10 22 5.478018807762 5.434984326865 0.043034480897 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9885615 G/C 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 C:G G C 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9885574_9885698:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9885574_9885678:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9885409_9885626:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9885574_9885670:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9885574_9885700:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9885574_9885686:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9885149_9885702:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9885574_9885743:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9885574_9885660:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9885409_9885679:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000460909:exon_9885574_9885700:RPUSD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 59 46 105 26.9335924714965 25.000927903579 1.9326645679175 T:C T C 10 0.5434984326865 0.769057824392733 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 10142949 C/T 1 27 31 58 12.3255423174645 16.8484514132815 -4.522909095817 T:C C T 10 0.5434984326865 0.238576233949116 ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10142872_10143614:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10142872_10143610:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10142872_10142966:FANCD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 10312507 A/G 1 15 20 35 6.8475235097025 10.86996865373 -4.0224451440275 A:G A G 10 0.5434984326865 0.179039175945618 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 11880760 T/C 1 18 15 33 8.217028211643 8.1524764902975 0.0645517213455005 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11880696_11880788:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11880696_11880788:C3orf31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 11887991 C/G 1 17 10 27 7.7605266443295 5.434984326865 2.3255423174645 C:G C G 10 0.5434984326865 0.441766848529384 ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 13383540 A/G 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13383496_13383623:NUP210 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:C T C 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 34 38 72 15.521053288659 20.652940442087 -5.131887153428 T:G G T 10 0.5434984326865 0.238137953535752 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 15610040 A/G 1 22 29 51 10.043034480897 15.7614545479085 -5.7184200670115 A:G A G 10 0.5434984326865 0.122291961804376 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 17051426 A/G 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 23930669 T/C 1 73 106 179 33.3246144138855 57.610833864769 -24.2862194508835 T:C T C 10 0.5434984326865 0.000298426460357079 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000442670:exon_23930603_23930707:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000467766:exon_23930603_23930917:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23930603_23930750:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23930603_23930750:UBE2E1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 23932105 T/A 1 91 115 206 41.5416426255285 62.5023197589475 -20.960677133419 A:T T A 10 0.5434984326865 0.0040316176094301 ENSG00000170142:ENST00000306627:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000346855:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000424381:exon_23932000_23932805:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000475680:exon_23932000_23932580:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000452012:exon_23932000_23932807:UBE2E1;ENSG00000170142:ENST00000493707:exon_23932000_23932363:UBE2E1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 15 10 25 6.8475235097025 5.434984326865 1.4125391828375 A:G G A 10 0.5434984326865 0.689279097352172 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 15 13 28 6.8475235097025 7.0654796249245 -0.217956115222 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 40 30 70 18.26006269254 16.304952980595 1.955109711945 T:C C T 10 0.5434984326865 0.71923071536496 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 62 43 105 28.303097173437 23.3704326055195 4.9326645679175 A:G A G 10 0.5434984326865 0.378131902184123 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 37035011 A/G 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37034823_37035154:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37035007_37035154:MLH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 37367628 A/G 1 11 11 22 5.0215172404485 5.9784827595515 -0.956965519103001 A:G A G 10 0.5434984326865 0.83116251385671 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 39185248 A/G 1 5 11 16 2.2825078365675 5.9784827595515 -3.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0791893749967246 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 165 89 254 75.3227586067275 48.3713605090985 26.951398097629 A:T:C:G T C 10 0.5434984326865 0.00065360375611262 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 252 238 490 115.038394963002 129.352626979387 -14.314232016385 A:G G A 10 0.5434984326865 0.204183647908830 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 18 47 65 8.217028211643 25.5444263362655 -17.3273981246225 T:C C T 10 0.5434984326865 1.61959704840682e-05 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 6 10 16 2.739009403881 5.434984326865 -2.695974922984 C:G C G 10 0.5434984326865 0.212818328356362 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 17 13 30 7.7605266443295 7.0654796249245 0.695047019405001 A:G G A 10 0.5434984326865 0.856121239847662 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 47459679 C/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47459624_47459739:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47459624_47459739:SCAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 14 11 25 6.391021942389 5.9784827595515 0.4125391828375 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 49051059 G/A 0 92 0 92 41.998144192842 0 41.998144192842 G G 10 0.5434984326865 7.0671465929388e-25 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49049068_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49049068_49051726:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49049068_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49050724_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49048854_49051549:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49049068_49051726:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49049068_49051549:WDR6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 49141859 G/A 1 48 40 88 21.912075231048 21.73993730746 0.172137923588 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49141806_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49141764_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49141790_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49141757_49141944:QARS;ENSG00000172053:ENST00000452739:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482261:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470619:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000479495:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000418549:exon_49141806_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000417025:exon_49141757_49141904:QARS;ENSG00000172053:ENST00000482438:exon_49141448_49141904:QARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 0 0 15 15 0 8.1524764902975 -8.1524764902975 G T G 10 0.5434984326865 7.79173357445114e-06 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52237970 C/T 1 66 53 119 30.129103442691 28.8054169323845 1.3236865103065 T:C C T 10 0.5434984326865 0.85419695933514 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52237879_52238028:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52237879_52238028:ALAS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52256697 C/T 1 11 18 29 5.0215172404485 9.782971788357 -4.7614545479085 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0929389738857532 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52263948 G/A 1 42 58 100 19.173065827167 31.522909095817 -12.34984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0156373874784780 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52263936_52264086:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52263936_52264086:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52263936_52264086:TWF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 85 73 158 38.8026332216475 39.6753855861145 -0.872752364467004 A:T:C T C 10 0.5434984326865 0.936388005321896 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52265215 G/A 1 91 76 167 41.5416426255285 41.305880884174 0.235761741354501 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265143_52265247:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265143_52265247:TWF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52325106 C/G 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168237:ENST00000461183:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000486393:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000473032:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000404703:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000305690:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000358709:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000340877:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000354773:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000471180:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000436784:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000473583:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000477382:exon_52324976_52325127:GLYCTK;ENSG00000168237:ENST00000489173:exon_52324976_52325938:GLYCTK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 28 29 57 12.782043884778 15.7614545479085 -2.9794106631305 A:C A C 10 0.5434984326865 0.429087995952981 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52734488 G/A 1 9 12 21 4.1085141058215 6.521981192238 -2.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.381551703468518 ENSG00000016864:ENST00000478968:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394783:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000266014:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000407584:exon_52734461_52734513:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000491606:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000394786:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000484163:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000344383:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000485899:exon_52734461_52734513:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000479553:exon_52734461_52734673:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000489119:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000497436:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000497953:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000487642:exon_52734461_52734512:GLT8D1;ENSG00000016864:ENST00000464705:exon_52734461_52734512:GLT8D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 69 59 128 31.4986081446315 32.0664075285035 -0.567799383871996 T:C T C 10 0.5434984326865 0.929511864499755 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 56 66 122 25.564087769556 35.870896557309 -10.306808787753 T:C C T 10 0.5434984326865 0.068856259258341 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 53269005 G/T 1 218 255 473 99.517341674343 138.592100335057 -39.0747586607145 T:C:G G T 10 0.5434984326865 0.000369043816357900 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 A:C A C 10 0.5434984326865 0.797590528899377 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 34 26 60 15.521053288659 14.130959249849 1.39009403881 T:C C T 10 0.5434984326865 0.795907511656434 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 56653424 A/T 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:T A T 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 56653427 T/C 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000480884:exon_56653299_56653555:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000476142:exon_56651129_56653555:CCDC66 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 2 9 11 0.913003134627 4.8914858941785 -3.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0290321460090728 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 17 9 26 7.7605266443295 4.8914858941785 2.869040750151 A:G A G 10 0.5434984326865 0.326006011364416 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 22 9 31 10.043034480897 4.8914858941785 5.1515485867185 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0718676183104231 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 66430811 T/G 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:G T G 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66430541_66431377:SLC25A26;ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66429221_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66429222_66430913:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66430649_66430913:LRIG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 69082708 C/G 1 10 24 34 4.565015673135 13.043962384476 -8.478946711341 C:G C G 10 0.5434984326865 0.00508214816234751 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69082699_69082855:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69082699_69082855:TMF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 37 33 70 16.8905579905995 17.9354482786545 -1.044890288055 A:C C A 10 0.5434984326865 0.811469683444022 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 72799703 C/T 1 29 23 52 13.2385454520915 12.5004639517895 0.738081500302 T:C C T 10 0.5434984326865 0.889853997731658 ENSG00000144736:ENST00000468371:exon_72798428_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000325599:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000444040:exon_72798430_72799987:SHQ1;ENSG00000144736:ENST00000463369:exon_72799110_72799987:SHQ1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 18 9 27 8.217028211643 4.8914858941785 3.3255423174645 T:C T C 10 0.5434984326865 0.247325180746459 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 67 43 110 30.5856050100045 23.3704326055195 7.215172404485 A:C C A 10 0.5434984326865 0.180726860430422 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 101283792 C/G 1 48 52 100 21.912075231048 28.261918499698 -6.34984326865 C:G C G 10 0.5434984326865 0.228337146359866 ENSG00000174173:ENST00000309922:exon_101283614_101285290:RG9MTD1;ENSG00000174173:ENST00000495642:exon_101283614_101284561:RG9MTD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 111842431 T/C 1 84 100 184 38.346131654334 54.34984326865 -16.003711614316 T:C:G T C 10 0.5434984326865 0.0215300830289625 ENSG00000174500:ENST00000308910:exon_111839688_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000438451:exon_111839692_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000484193:exon_111841943_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000470085:exon_111842072_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000495418:exon_111842152_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000460387:exon_111842302_111842619:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000383684:exon_111842302_111842622:GCET2;ENSG00000174500:ENST00000488580:exon_111842408_111842619:GCET2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 32 47 79 14.608050154032 25.5444263362655 -10.9363761822335 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0171708440565552 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 14 13 27 6.391021942389 7.0654796249245 -0.6744576825355 A:T A T 10 0.5434984326865 0.848145407230822 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 112727199 G/A 1 16 17 33 7.304025077016 9.2394733556705 -1.9354482786545 A:G G A 10 0.5434984326865 0.6008174059021 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 118948716 G/A 1 14 19 33 6.391021942389 10.3264702210435 -3.9354482786545 A:G G A 10 0.5434984326865 0.220723036124753 ENSG00000121578:ENST00000483209:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000467604:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000471675:exon_118948694_118948900:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000359213:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000393765:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000480814:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000475803:exon_118948694_118949091:B4GALT4;ENSG00000121578:ENST00000479150:exon_118948694_118949091:B4GALT4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 181 178 359 82.6267836837435 96.742721018197 -14.1159373344535 T:C T C 10 0.5434984326865 0.138159506156044 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 227 170 397 103.625855780164 92.394733556705 11.2311222234595 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.267894900799916 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121412892 A/G 1 8 20 28 3.652012538508 10.86996865373 -7.217956115222 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00728028214667468 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121413637 G/A 1 23 13 36 10.4995360482105 7.0654796249245 3.434056423286 A:G G A 10 0.5434984326865 0.315711353010579 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121414217 C/A 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 A:C C A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121500699 C/T 1 50 37 87 22.825078365675 20.1094420094005 2.7156363562745 T:C C T 10 0.5434984326865 0.591654179179789 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121500590_121500721:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121500590_121500721:IQCB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 121838319 G/A 1 73 55 128 33.3246144138855 29.8924137977575 3.432200616128 A:G G A 10 0.5434984326865 0.594718456193591 ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121838285_121838921:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121838285_121839175:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121838285_121839983:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121838285_121839982:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121838285_121838667:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121838285_121838440:CD86 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 21 6 27 9.5865329135835 3.260990596119 6.3255423174645 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0188445613400161 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 19 36 55 8.6735297789565 19.565943576714 -10.8924137977575 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00409002733830852 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 21 30 51 9.5865329135835 16.304952980595 -6.7184200670115 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0674748401733571 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 10 14 24 4.565015673135 7.608978057611 -3.043962384476 A:G A G 10 0.5434984326865 0.225358769194005 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 21 16 37 9.5865329135835 8.695974922984 0.8905579905995 A:G G A 10 0.5434984326865 0.869374398969832 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 122869147 G/C 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 C:G G C 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122869081_122869212:PDIA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 124738107 C/T 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124738106_124738441:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000477536:exon_124738106_124738340:HEG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 91 73 164 41.5416426255285 39.6753855861145 1.866257039414 A:G A G 10 0.5434984326865 0.814245816518472 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 49 28 77 22.3685767983615 15.217956115222 7.1506206831395 A:T:G A G 10 0.5434984326865 0.109825815904763 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 49 30 79 22.3685767983615 16.304952980595 6.0636238177665 T:C C T 10 0.5434984326865 0.177213634875120 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 T:G G T 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 127292333 G/A 1 35 30 65 15.9775548559725 16.304952980595 -0.327398124622501 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 22 28 50 10.043034480897 15.217956115222 -5.174921634325 T:C C T 10 0.5434984326865 0.156616622632325 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 128344786 G/A 1 165 157 322 75.3227586067275 85.3292539317805 -10.006495325053 A:G G A 10 0.5434984326865 0.263845275245235 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344717_128344855:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344717_128344855:RPN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 69 101 170 31.4986081446315 54.8933417013365 -23.394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000371446299957426 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 128618283 T/C 1 15 18 33 6.8475235097025 9.782971788357 -2.9354482786545 T:C T C 10 0.5434984326865 0.382603756937693 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128618208_128618304:ACAD9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 21 12 33 9.5865329135835 6.521981192238 3.0645517213455 T:C C T 10 0.5434984326865 0.300610071215382 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 132401600 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000474871:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000493732:exon_132400126_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000490993:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000465756:exon_132401547_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000337331:exon_132401547_132401662:NPHP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 134225969 T/C 1 15 17 32 6.8475235097025 9.2394733556705 -2.391949845968 T:C T C 10 0.5434984326865 0.478550518683793 ENSG00000182923:ENST00000332047:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000354446:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000511574:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000413794:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000438820:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000383229:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000504013:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000512894:exon_134225951_134226095:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134225951_134226128:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134225951_134226128:CEP63 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 134278270 C/T 1 10 1 11 4.565015673135 0.5434984326865 4.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0150446576522067 ENSG00000182923:ENST00000337090:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000513612:exon_134277992_134278271:CEP63;ENSG00000182923:ENST00000427599:exon_134277992_134278271:CEP63 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 141162730 T/C 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 26 23 49 11.869040750151 12.5004639517895 -0.6314232016385 T:C C T 10 0.5434984326865 0.886645312965562 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 148881673 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000163755:ENST00000296051:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460120:exon_148881629_148881736:HPS3;ENSG00000163755:ENST00000460822:exon_148881629_148881736:HPS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 22 16 38 10.043034480897 8.695974922984 1.347059557913 T:G T G 10 0.5434984326865 0.745645975271931 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 13 11 24 5.9345203750755 5.9784827595515 -0.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 149700519 T/C 0 84 0 84 38.346131654334 0 38.346131654334 T T 10 0.5434984326865 6.12033363122291e-23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 150280445 C/G 1 43 22 65 19.6295673944805 11.956965519103 7.6726018753775 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0618007269516139 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 21 17 38 9.5865329135835 9.2394733556705 0.347059557913001 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 135 129 264 61.6277115873225 70.1112978165585 -8.483586229236 T:C C T 10 0.5434984326865 0.294457872898311 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 158366900 G/A 1 15 2 17 6.8475235097025 1.086996865373 5.7605266443295 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00571493155570556 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000312756:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158366830_158366946:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478251:exon_158366830_158368809:GFM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 158388780 T/C 1 12 10 22 5.478018807762 5.434984326865 0.043034480897 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000079257:ENST00000264265:exon_158388746_158388808:LXN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 167728054 C/T 1 19 9 28 8.6735297789565 4.8914858941785 3.782043884778 T:C C T 10 0.5434984326865 0.184976526969138 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167726465_167728206:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167728023_167728206:GOLIM4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 169835124 T/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000173889:ENST00000494943:exon_169835014_169835264:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000495893:exon_169835014_169835264:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000413540:exon_169835014_169835264:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000467570:exon_169835014_169835264:PHC3;ENSG00000173889:ENST00000486042:exon_169834911_169835264:PHC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 22 26 48 10.043034480897 14.130959249849 -4.087924768952 A:G G A 10 0.5434984326865 0.249096182216153 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 13 13 26 5.9345203750755 7.0654796249245 -1.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.696932813908347 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 0 0 15 15 0 8.1524764902975 -8.1524764902975 C T C 10 0.5434984326865 7.79173357445114e-06 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 178785549 G/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178785271_178785598:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178785271_178785597:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178785271_178785597:ZMAT3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 179051472 A/G 1 25 22 47 11.4125391828375 11.956965519103 -0.5444263362655 A:G A G 10 0.5434984326865 0.884615348994713 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466264:exon_179051057_179051617:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000466663:exon_179051057_179051518:ZNF639 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 179082937 G/A 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000171109:ENST00000471841:exon_179082906_179083013:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000280653:exon_179082906_179083013:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000357390:exon_179082906_179083013:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000263969:exon_179082906_179083013:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000489329:exon_179082906_179083013:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000474903:exon_179082906_179083013:MFN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 19 16 35 8.6735297789565 8.695974922984 -0.0224451440275004 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 22 12 34 10.043034480897 6.521981192238 3.521053288659 T:C C T 10 0.5434984326865 0.301571760530527 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 183975341 G/A 1 12 16 28 5.478018807762 8.695974922984 -3.217956115222 A:G G A 10 0.5434984326865 0.256861842582542 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000351385:exon_183975261_183975544:ECE2;ENSG00000145194:ENST00000402825:exon_183975261_183975544:ECE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 27 25 52 12.3255423174645 13.5874608171625 -1.261918499698 T:C T C 10 0.5434984326865 0.781326945753933 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 27 27 54 12.3255423174645 14.6744576825355 -2.348915365071 A:G A G 10 0.5434984326865 0.585364954825716 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:C C A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 185135338 T/A 0 2599 2 2601 1186.44757344779 1.086996865373 1185.36057658241 T:C T C 10 0.5434984326865 0 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 1353 13 1366 617.646620575165 7.0654796249245 610.581140950241 T:G G T 10 0.5434984326865 0 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 191093285 G/T 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:G G T 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 81 62 143 36.9766269523935 33.696902826563 3.2797241258305 A:C C A 10 0.5434984326865 0.614989981113346 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 20 16 36 9.13003134627 8.695974922984 0.434056423286 A:T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 194408704 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 196215549 C/T 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196215478_196215554:RNF168 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 196457870 G/C 1 18 8 26 8.217028211643 4.347987461492 3.869040750151 C:G G C 10 0.5434984326865 0.167672891645184 ENSG00000163964:ENST00000426755:exon_196457863_196457964:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196457863_196457963:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196457863_196457963:PIGX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 196534706 T/C 1 10 9 19 4.565015673135 4.8914858941785 -0.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000180370:ENST00000327134:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000488224:exon_196534653_196534785:PAK2;ENSG00000180370:ENST00000481344:exon_196534653_196534915:PAK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 196613111 A/G 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 196735687 C/T 1 8 2 10 3.652012538508 1.086996865373 2.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.122678215119332 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196735680_196735836:MFI2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 196743994 G/A 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743974_196744161:MFI2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 3 197579466 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000452660:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000433298:exon_197579432_197579491:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197579199_197579491:LRCH3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 19 9 28 8.6735297789565 4.8914858941785 3.782043884778 T:C C T 10 0.5434984326865 0.184976526969138 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 87113 T/C 1 35 22 57 15.9775548559725 11.956965519103 4.0205893368695 T:C T C 10 0.5434984326865 0.352096606847939 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 517376 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 23 9 32 10.4995360482105 4.8914858941785 5.608050154032 T:C T C 10 0.5434984326865 0.051340711277454 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 25 13 38 11.4125391828375 7.0654796249245 4.347059557913 T:C C T 10 0.5434984326865 0.192681484263785 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 118 113 231 53.867184942993 61.4153228935745 -7.5481379505815 A:G G A 10 0.5434984326865 0.322590663666561 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 26 39 65 11.869040750151 21.1964388747735 -9.3273981246225 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0244360286603622 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 2240484 C/T 1 17 6 23 7.7605266443295 3.260990596119 4.4995360482105 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0627304412652172 ENSG00000214367:ENST00000506763:exon_2240331_2240770:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2240331_2240770:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2240331_2240770:HAUS3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 2822467 G/T 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:G G T 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2822341_2822480:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2822396_2822480:SH3BP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 25 41 66 11.4125391828375 22.2834357401465 -10.870896557309 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00901134977936336 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 62 44 106 28.303097173437 23.913931038206 4.389166135231 A:G A G 10 0.5434984326865 0.435718151675741 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 68 35 103 31.042106577318 19.0224451440275 12.0196614332905 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0176078630429788 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 3516559 C/T 1 41 31 72 18.7165642598535 16.8484514132815 1.868112846572 T:C C T 10 0.5434984326865 0.723153957597978 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3516479_3516655:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3516479_3516655:LRPAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 3526645 C/T 1 49 64 113 22.3685767983615 34.783899691936 -12.4153228935745 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0230333081966947 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3526634_3526778:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3526634_3526873:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3526634_3526778:LRPAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 6304242 T/C 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 8229713 A/G 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 8230070 T/C 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.126419205254674 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 17503433 C/T 1 15 12 27 6.8475235097025 6.521981192238 0.3255423174645 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17503342_17503482:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17503342_17503482:QDPR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 25417109 T/A 1 31 34 65 14.1515485867185 18.478946711341 -4.3273981246225 A:T:C T A 10 0.5434984326865 0.319525138007056 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25417088_25417162:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25416774_25418220:ANAPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 39 41 80 17.8035611252265 22.2834357401465 -4.47987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.315374767430746 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 37836302 T/C 1 11 11 22 5.0215172404485 5.9784827595515 -0.956965519103001 T:C T C 10 0.5434984326865 0.83116251385671 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000515668:exon_37836240_37836346:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000505986:exon_37836240_37836346:PGM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 29 33 62 13.2385454520915 17.9354482786545 -4.696902826563 C:G G C 10 0.5434984326865 0.25221419233479 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 37903756 T/C 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 T:C T C 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 37904082 T/C 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 177 138 315 80.8007774144895 75.002783710737 5.7979937037525 A:G A G 10 0.5434984326865 0.534064528616317 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38774889 T/C 1 123 102 225 56.1496927795605 55.436840134023 0.712852645537502 T:C T C 10 0.5434984326865 0.946716229997894 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 100 99 199 45.65015673135 53.8063448359635 -8.1561881046135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.25532480712884 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38776070 C/T 1 29 46 75 13.2385454520915 25.000927903579 -11.7623824514875 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00740214809756026 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38776107 T/G 1 44 27 71 20.086068961794 14.6744576825355 5.4116112792585 T:G T G 10 0.5434984326865 0.233459445911957 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 33 40 73 15.0645517213455 21.73993730746 -6.6753855861145 A:C C A 10 0.5434984326865 0.127127253554284 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38776355 T/C 1 25 25 50 11.4125391828375 13.5874608171625 -2.174921634325 T:C T C 10 0.5434984326865 0.571831778036103 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38776491 T/G 1 65 130 195 29.6726018753775 70.654796249245 -40.9821943738675 T:G T G 10 0.5434984326865 3.74067747149541e-09 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38798515 G/A 1 17 8 25 7.7605266443295 4.347987461492 3.4125391828375 A:G G A 10 0.5434984326865 0.228140761083430 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 38800323 A/G 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000174125:ENST00000308979:exon_38797880_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000502213:exon_38797904_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000505940:exon_38799970_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000515861:exon_38800182_38800519:TLR1;ENSG00000174125:ENST00000506146:exon_38800307_38800519:TLR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 19 19 38 8.6735297789565 10.3264702210435 -1.652940442087 T:C T C 10 0.5434984326865 0.62745803520325 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 15 16 31 6.8475235097025 8.695974922984 -1.8484514132815 A:G A G 10 0.5434984326865 0.589619186731053 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 136 2 138 62.084213154636 1.086996865373 60.997216289263 A:G A G 10 0.5434984326865 3.91364650608481e-33 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 39463903 C/A 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 A:C C A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000121897:ENST00000340169:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000261434:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000424936:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000381846:exon_39463816_39463909:LIAS;ENSG00000121897:ENST00000515061:exon_39463816_39463909:LIAS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G A G 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 48424058 C/T 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 T:C C T 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000109171:ENST00000264313:exon_48424028_48428076:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000512093:exon_48424028_48427032:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000388965:exon_48424028_48428215:SLAIN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 48503730 T/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507873:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000503339:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000512810:exon_48503640_48503750:FRYL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 21 21 42 9.5865329135835 11.4134670864165 -1.826934172833 T:C C T 10 0.5434984326865 0.642960703552169 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 54011603 C/T 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54011500_54011749:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54011500_54011749:SCFD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 54232110 G/A 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 54327235 T/C 1 4 8 12 1.826006269254 4.347987461492 -2.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.159074080491796 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 54327584 A/G 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.202270696540265 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 8 1 9 3.652012538508 0.5434984326865 3.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0455044848393489 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57248716 G/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 C:G G C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57248643_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57247925_57248763:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57248590_57248763:AASDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57250285 T/C 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000510012:exon_57250236_57250507:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514796:exon_57250236_57250465:AASDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57356588 A/G 1 29 34 63 13.2385454520915 18.478946711341 -5.2404012592495 A:G A G 10 0.5434984326865 0.206441822415638 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57356499_57356602:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57356499_57356602:SRP72 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 69 70 139 31.4986081446315 38.044890288055 -6.5462821434235 A:G A G 10 0.5434984326865 0.269557890460751 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57796900 G/A 1 5 14 19 2.2825078365675 7.608978057611 -5.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0193146361526291 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57798174 C/G 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 C:G C G 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57830663 T/C 1 34 29 63 15.521053288659 15.7614545479085 -0.240401259249499 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57830572_57830692:C4orf14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 118 102 220 53.867184942993 55.436840134023 -1.56965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.839385223660619 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 76836110 C/T 1 5 13 18 2.2825078365675 7.0654796249245 -4.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0313510638317915 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 76857309 C/T 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 34 31 65 15.521053288659 16.8484514132815 -1.3273981246225 A:G G A 10 0.5434984326865 0.80367896232435 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 76881233 G/T 1 41 42 83 18.7165642598535 22.826934172833 -4.1103699129795 T:G G T 10 0.5434984326865 0.379639065892393 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76881219_76881345:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76881219_76881345:SDAD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 79800080 G/A 1 16 11 27 7.304025077016 5.9784827595515 1.3255423174645 A:G G A 10 0.5434984326865 0.700975229232559 ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 6 13 19 2.739009403881 7.0654796249245 -4.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0634141897264214 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 104059542 G/A 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104059508_104059609:CENPE HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 104066461 A/G 1 17 22 39 7.7605266443295 11.956965519103 -4.1964388747735 A:G A G 10 0.5434984326865 0.199700925872768 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000515478:exon_104066460_104066491:CENPE HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 9 14 23 4.1085141058215 7.608978057611 -3.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.149533600784392 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 106 80 186 48.389166135231 43.47987461492 4.909291520311 A:G A G 10 0.5434984326865 0.507876966736915 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 3 8 11 1.3695047019405 4.347987461492 -2.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.126419205254674 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 6 14 20 2.739009403881 7.608978057611 -4.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0410079712081252 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 4 8 12 1.826006269254 4.347987461492 -2.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.159074080491796 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 A:G A G 10 0.5434984326865 1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 123814308 C/T 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000138685:ENST00000264498:exon_123813366_123819391:FGF2;ENSG00000138685:ENST00000394350:exon_123813366_123819376:FGF2;ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123813730_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123813799_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123813801_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000510735:exon_123813805_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123813806_123814380:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000502270:exon_123813896_123814380:NUDT6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 128807219 T/A 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:T T A 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128806863_128807883:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128806863_128807781:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128806863_128807883:PLK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 128814492 G/A 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814440_128814573:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814355_128814573:PLK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 128814964 G/T 1 19 17 36 8.6735297789565 9.2394733556705 -0.565943576714 T:G G T 10 0.5434984326865 0.868528013180574 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 129867280 T/A 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 A:T T A 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 T:C T C 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 146048735 G/C 1 32 46 78 14.608050154032 25.000927903579 -10.392877749547 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0224603581984695 ENSG00000164163:ENST00000296577:exon_146048678_146050331:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000455563:exon_146048678_146050676:ABCE1;ENSG00000164163:ENST00000504683:exon_146048678_146048795:ABCE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 146572227 G/A 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.100680878973953 ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146572214_146572299:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000503730:exon_146572071_146572299:MMAA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 148944467 A/G 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G A G 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000071205:ENST00000336498:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000414545:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506054:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000507661:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000506020:exon_148944414_148944564:ARHGAP10;ENSG00000071205:ENST00000513548:exon_148944205_148944564:ARHGAP10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 154276856 A/G 1 16 12 28 7.304025077016 6.521981192238 0.782043884778 A:G A G 10 0.5434984326865 0.850691379316868 ENSG00000121211:ENST00000240488:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000503967:exon_154276806_154276961:MND1;ENSG00000121211:ENST00000509752:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000508731:exon_154276806_154276863:MND1;ENSG00000121211:ENST00000504860:exon_154276806_154276863:MND1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 154525458 C/T 1 40 30 70 18.26006269254 16.304952980595 1.955109711945 T:C C T 10 0.5434984326865 0.71923071536496 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 76 62 138 34.694119115826 33.696902826563 0.997216289263001 A:T A T 10 0.5434984326865 0.931945961448208 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 63 57 120 28.7595987407505 30.9794106631305 -2.21981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.714383889175848 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 159601676 C/T 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159601619_159601759:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000436096:exon_159601619_159601759:ETFDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 10 10 20 4.565015673135 5.434984326865 -0.86996865373 T:C T C 10 0.5434984326865 0.823246680509736 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 55 66 121 25.1075862022425 35.870896557309 -10.7633103550665 A:T:C:G A C 10 0.5434984326865 0.0551084412891699 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 109 91 200 49.7586708371715 49.4583573744715 0.300313462700004 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 A:G G A 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 170634390 C/T 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 184615117 A/C 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:C A C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184615070_184615191:C4orf41 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 30 44 74 13.695047019405 23.913931038206 -10.218884018801 T:C C T 10 0.5434984326865 0.019316408808693 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 442586 G/C 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 C:G G C 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 442790 G/A 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 21 21 42 9.5865329135835 11.4134670864165 -1.826934172833 A:G G A 10 0.5434984326865 0.642960703552169 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 1466919 G/A 1 17 9 26 7.7605266443295 4.8914858941785 2.869040750151 A:G G A 10 0.5434984326865 0.326006011364416 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 11 17 28 5.0215172404485 9.2394733556705 -4.217956115222 A:G A G 10 0.5434984326865 0.129637534329455 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 48 13 61 21.912075231048 7.0654796249245 14.8465956061235 T:C C T 10 0.5434984326865 9.39432978396489e-05 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 5463668 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 129 92 221 58.8887021834415 50.001855807158 8.8868463762835 A:G G A 10 0.5434984326865 0.251030923373046 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 63 57 120 28.7595987407505 30.9794106631305 -2.21981192238 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.714383889175848 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 C:G C G 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 11 16 27 5.0215172404485 8.695974922984 -3.6744576825355 A:G G A 10 0.5434984326865 0.178233060083669 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 10761182 A/G 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000112977:ENST00000230895:exon_10761126_10761384:DAP;ENSG00000112977:ENST00000360512:exon_10761126_10761344:DAP;ENSG00000112977:ENST00000432074:exon_10761126_10761340:DAP;ENSG00000112977:ENST00000514882:exon_10761126_10761248:DAP;ENSG00000112977:ENST00000508253:exon_10761126_10761337:DAP;ENSG00000112977:ENST00000510546:exon_10761126_10761311:DAP;ENSG00000112977:ENST00000508646:exon_10761126_10761213:DAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 T:C T C 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 17 18 35 7.7605266443295 9.782971788357 -2.0224451440275 T:C T C 10 0.5434984326865 0.502602930260338 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 33989518 C/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 34911914 G/C 1 15 14 29 6.8475235097025 7.608978057611 -0.7614545479085 C:G G C 10 0.5434984326865 0.852917435093243 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000341754:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000325577:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000513914:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000511456:exon_34911723_34911917:RAD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 37036492 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_37036481_37036589:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_37036481_37036589:NIPBL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 42800808 C/T 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000198865:ENST00000361970:exon_42799761_42802462:CCDC152;ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42799982_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42799985_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42800214_42801433:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42800233_42801433:SEPP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 43297144 A/G 1 26 17 43 11.869040750151 9.2394733556705 2.6295673944805 A:G A G 10 0.5434984326865 0.447879832532732 ENSG00000112972:ENST00000325110:exon_43297104_43297268:HMGCS1;ENSG00000112972:ENST00000433297:exon_43297104_43297268:HMGCS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 18 17 35 8.217028211643 9.2394733556705 -1.0224451440275 C:G G C 10 0.5434984326865 0.737611853756657 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 21 25 46 9.5865329135835 13.5874608171625 -4.000927903579 C:G G C 10 0.5434984326865 0.240678034879676 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 143 111 254 65.2797241258305 60.3283260282015 4.951398097629 A:G A G 10 0.5434984326865 0.570915508150631 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 1 60 79 139 27.39009403881 42.9363761822335 -15.5462821434235 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0103787083471157 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 61694379 T/C 1 17 13 30 7.7605266443295 7.0654796249245 0.695047019405001 T:C T C 10 0.5434984326865 0.856121239847662 ENSG00000086189:ENST00000199320:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000506390:exon_61694338_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000514911:exon_61694256_61694387:DIMT1L;ENSG00000086189:ENST00000509182:exon_61694338_61694387:DIMT1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 16 14 30 7.304025077016 7.608978057611 -0.304952980595 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 67 48 115 30.5856050100045 26.087924768952 4.4976802410525 A:C:G C G 10 0.5434984326865 0.454100088496124 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 64273018 G/A 1 67 68 135 30.5856050100045 36.957893422682 -6.3722884126775 A:G G A 10 0.5434984326865 0.299904669102274 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 10 16 26 4.565015673135 8.695974922984 -4.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.117222447360552 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 66478626 T/C 1 32 58 90 14.608050154032 31.522909095817 -16.914858941785 T:C T C 10 0.5434984326865 0.000421958905978466 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 66478729 A/G 1 13 22 35 5.9345203750755 11.956965519103 -6.0224451440275 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0430841981098462 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 66480374 G/C 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 C:G G C 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180;ENSG00000134061:ENST00000515027:exon_66480350_66480413:CD180 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 68417643 C/T 0 0 18 18 0 9.782971788357 -9.782971788357 T C T 10 0.5434984326865 7.41243525473021e-07 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000296670:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68417580_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000507354:exon_68417521_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000513937:exon_68417574_68417722:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000512367:exon_68417521_68417722:SLC30A5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 26 22 48 11.869040750151 11.956965519103 -0.087924768952 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 13 12 25 5.9345203750755 6.521981192238 -0.5874608171625 T:C C T 10 0.5434984326865 0.843063936252743 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 68695940 T/G 1 20 35 55 9.13003134627 19.0224451440275 -9.8924137977575 A:T:G T G 10 0.5434984326865 0.00953641839142437 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68695876_68695996:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000513214:exon_68695876_68695996:RAD17 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 1118 1107 2225 510.368752256493 601.652764983956 -91.2840127274625 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 0.000106803375411750 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 75001582 A/G 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_75001529_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75001064_75001612:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75001398_75001612:POC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 75003678 T/C 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000512125:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000508467:exon_75003562_75003700:POC5;ENSG00000152359:ENST00000507421:exon_75003309_75003700:POC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 77477403 C/T 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 T:C C T 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77477331_77477486:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77477331_77477486:AP3B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 80149981 A/G 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 A:G A G 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80149949_80150135:MSH3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 80169035 T/C 1 16 13 29 7.304025077016 7.0654796249245 0.2385454520915 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 2929 4676 7605 1337.09309066124 2541.39867124207 -1204.30558058083 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 7.03282569166608e-169 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 37 30 67 16.8905579905995 16.304952980595 0.5856050100045 T:C C T 10 0.5434984326865 0.903118424542717 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 82500734 G/T 1 23 14 37 10.4995360482105 7.608978057611 2.8905579905995 A:T:G G T 10 0.5434984326865 0.410166442357175 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000514538:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000509268:exon_82500634_82500740:XRCC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 38 27 65 17.347059557913 14.6744576825355 2.6726018753775 C:G C G 10 0.5434984326865 0.535587200761015 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 94050447 C/T 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.797590528899377 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 94050487 T/A 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 A:T T A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94050482_94050591:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94050482_94050591:MCTP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 94230426 T/C 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:C T C 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000512425:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505208:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000415885:exon_94230354_94230540:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000506568:exon_94230354_94230540:MCTP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 A:C C A 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 96118852 G/C 1 8 4 12 3.652012538508 2.173993730746 1.478018807762 C:G G C 10 0.5434984326865 0.564515870115594 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 96121524 C/T 1 14 7 21 6.391021942389 3.8044890288055 2.5865329135835 T:C C T 10 0.5434984326865 0.281934153985525 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96121492_96121675:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96121343_96121675:ERAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 96124330 T/C 1 6 10 16 2.739009403881 5.434984326865 -2.695974922984 T:C T C 10 0.5434984326865 0.212818328356362 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96124234_96124388:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96124234_96124388:ERAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 98199204 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 110440003 C/T 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110439876_110440051:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110439876_110440051:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110439876_110440051:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110439876_110440051:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505303:exon_110439876_110440051:WDR36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 110819753 G/C 1 17 15 32 7.7605266443295 8.1524764902975 -0.391949845968 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000152495:ENST00000512453:exon_110819724_110820283:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000282356:exon_110819724_110830584:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000515231:exon_110819724_110820464:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000509645:exon_110819724_110821293:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000510858:exon_110819724_110820296:CAMK4;ENSG00000152495:ENST00000512890:exon_110819724_110820230:CAMK4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 14 23 37 6.391021942389 12.5004639517895 -6.1094420094005 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0481662574977484 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 14 16 30 6.391021942389 8.695974922984 -2.304952980595 A:T T A 10 0.5434984326865 0.464847863020226 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 31 27 58 14.1515485867185 14.6744576825355 -0.522909095817001 A:G A G 10 0.5434984326865 0.89595400137925 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 122682334 C/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 122685727 C/G 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 C:G C G 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122685638_122685783:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122685638_122685783:CEP120 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 139940302 G/A 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000504872:exon_139940284_139940339:APBB3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 30 31 61 13.695047019405 16.8484514132815 -3.1534043938765 T:C T C 10 0.5434984326865 0.442319883642751 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 141026182 G/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:G G T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141025654_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141026170_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522763:exon_141026075_141026289:FCHSD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 82 65 147 37.433128519707 35.3273981246225 2.1057303950845 T:C C T 10 0.5434984326865 0.741288296769442 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 40 36 76 18.26006269254 19.565943576714 -1.305880884174 A:G A G 10 0.5434984326865 0.818158002158911 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 38 37 75 17.347059557913 20.1094420094005 -2.7623824514875 A:G G A 10 0.5434984326865 0.562914017662165 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 21 27 48 9.5865329135835 14.6744576825355 -5.087924768952 A:G G A 10 0.5434984326865 0.149290333900887 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 24 5 29 10.956037615524 2.7174921634325 8.2385454520915 T:G T G 10 0.5434984326865 0.00226702482967846 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 4065 3757 7822 1855.67887112938 2041.92361160318 -186.244740473803 A:T:C:G C T 10 0.5434984326865 2.41421936284053e-05 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 149827098 G/A 1 17 6 23 7.7605266443295 3.260990596119 4.4995360482105 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0627304412652172 ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 150425467 G/A 1 101 63 164 46.1066582986635 34.2404012592495 11.866257039414 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.0711420204328016 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150425422_150425511:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521782:exon_150425422_150425922:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522100:exon_150425427_150425511:TNIP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 154 143 297 70.301241366279 77.7202758741695 -7.4190345078905 A:G G A 10 0.5434984326865 0.414859460922125 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 10 13 23 4.565015673135 7.0654796249245 -2.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.304445604018253 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 150578574 A/G 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 A:G A G 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 150639360 G/A 1 20 12 32 9.13003134627 6.521981192238 2.608050154032 A:G G A 10 0.5434984326865 0.38057970811461 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 42 31 73 19.173065827167 16.8484514132815 2.3246144138855 C:G G C 10 0.5434984326865 0.639116483979724 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 29 29 58 13.2385454520915 15.7614545479085 -2.522909095817 C:G C G 10 0.5434984326865 0.513024466361985 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 46 45 91 20.999072096421 24.4574294708925 -3.4583573744715 T:C C T 10 0.5434984326865 0.528023372103246 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 171533629 A/G 1 10 15 25 4.565015673135 8.1524764902975 -3.5874608171625 A:G A G 10 0.5434984326865 0.163877041893024 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 171533656 C/T 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 T:C C T 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 T:C T C 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 174936038 A/G 1 11 11 22 5.0215172404485 5.9784827595515 -0.956965519103001 A:G A G 10 0.5434984326865 0.83116251385671 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174936035_174936205:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174936035_174936205:SFXN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 17 11 28 7.7605266443295 5.9784827595515 1.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.571892262439823 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 6 11 17 2.739009403881 5.9784827595515 -3.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.144759175784590 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176378574 G/T 1 11 8 19 5.0215172404485 4.347987461492 0.6735297789565 T:G G T 10 0.5434984326865 0.821132279555771 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176378475_176378578:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176378475_176378578:UIMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176402401 G/A 1 23 14 37 10.4995360482105 7.608978057611 2.8905579905995 A:G G A 10 0.5434984326865 0.410166442357175 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000509236:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000417486:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000515488:exon_176402397_176402481:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000507513:exon_176402397_176402481:UIMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 277 203 480 126.450934145839 110.330181835359 16.12075231048 A:G A G 10 0.5434984326865 0.142781570625495 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176761336 T/C 1 118 130 248 53.867184942993 70.654796249245 -16.787611306252 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0352901090710918 ENSG00000169223:ENST00000303127:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000504071:exon_176761285_176761553:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000515209:exon_176761285_176761404:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000514458:exon_176761285_176761337:LMAN2;ENSG00000169223:ENST00000502560:exon_176761310_176761404:LMAN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176798502 G/A 1 28 17 45 12.782043884778 9.2394733556705 3.5425705291075 A:G G A 10 0.5434984326865 0.299857300538873 ENSG00000169220:ENST00000408923:exon_176798476_176798590:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000398128:exon_176798476_176798590:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000336477:exon_176798476_176798590:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000511890:exon_176798476_176798590:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000425155:exon_176798476_176798590:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000502731:exon_176798476_176798579:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000514102:exon_176798476_176798590:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000509289:exon_176798351_176798583:RGS14;ENSG00000169220:ENST00000506944:exon_176798476_176798590:RGS14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 176894493 C/T 1 90 2 92 41.085141058215 1.086996865373 39.998144192842 T:C C T 10 0.5434984326865 1.41838652724799e-21 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894482_176894628:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894482_176894628:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894482_176894628:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894482_176894628:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894482_176894628:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894482_176894628:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000471767:exon_176894482_176894599:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894491_176894628:DBN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 177659519 C/G 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 C:G C G 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177659493_177659786:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177658670_177659792:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000474052:exon_177659493_177659791:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177659493_177659769:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177658672_177659774:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177659493_177659631:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000511716:exon_177659493_177659542:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000476170:exon_177659493_177659572:AGXT2L2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 178310446 C/T 1 2 6 8 0.913003134627 3.260990596119 -2.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.153474374624694 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 22 18 40 10.043034480897 9.782971788357 0.26006269254 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179193598 C/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000161021:ENST00000292599:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000376951:exon_179192327_179193742:MAML1;ENSG00000161021:ENST00000503050:exon_179192327_179193742:MAML1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 126 108 234 57.519197481501 58.697830730142 -1.178633248641 T:C C T 10 0.5434984326865 0.895688423392626 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179260213 G/A 1 164 148 312 74.866257039414 80.437768037602 -5.571510998188 A:G G A 10 0.5434984326865 0.532357826227322 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 17 40 57 7.7605266443295 21.73993730746 -13.9794106631305 T:C T C 10 0.5434984326865 0.000257962021881571 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 9 28 37 4.1085141058215 15.217956115222 -11.1094420094005 T:G G T 10 0.5434984326865 0.000364935694201935 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179267949 T/C 1 8 2 10 3.652012538508 1.086996865373 2.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.122678215119332 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179267240_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179267590_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179267713_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179267809_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179267921_179267959:C5orf45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179280379 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000524068:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522157:exon_179280197_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523835:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519213:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519318:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000517338:exon_179280378_179280437:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519398:exon_179280283_179280437:C5orf45 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 27 14 41 12.3255423174645 7.608978057611 4.7165642598535 T:G T G 10 0.5434984326865 0.159243841973485 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 5 179665371 C/T 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000050748:ENST00000452135:exon_179665332_179665403:MAPK9;ENSG00000050748:ENST00000393360:exon_179665332_179665403:MAPK9;ENSG00000050748:ENST00000455781:exon_179665332_179665403:MAPK9;ENSG00000050748:ENST00000343111:exon_179665332_179665403:MAPK9;ENSG00000050748:ENST00000347470:exon_179665332_179665403:MAPK9;ENSG00000050748:ENST00000520212:exon_179663526_179665403:MAPK9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 11 119 130 5.0215172404485 64.6763134896935 -59.654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 1.22665100123231e-28 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 68 70 138 31.042106577318 38.044890288055 -7.002783710737 A:G A G 10 0.5434984326865 0.232983507397928 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 108 102 210 49.302169269858 55.436840134023 -6.134670864165 A:C:G G A 10 0.5434984326865 0.406390895579436 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 5431340 A/G 1 14 10 24 6.391021942389 5.434984326865 0.956037615524 A:G A G 10 0.5434984326865 0.838299081629261 ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 7602857 C/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7602856_7602977:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7602856_7602977:SNRNP48 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 7609117 T/C 1 11 14 25 5.0215172404485 7.608978057611 -2.5874608171625 T:C T C 10 0.5434984326865 0.321134709174457 ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7609058_7612091:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7609058_7609439:SNRNP48 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 15 12 27 6.8475235097025 6.521981192238 0.3255423174645 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 42 53 95 19.173065827167 28.8054169323845 -9.6323511052175 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0504969541893875 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 18237661 C/T 1 54 48 102 24.651084634929 26.087924768952 -1.436840134023 T:C C T 10 0.5434984326865 0.842553502824383 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000507591:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515770:exon_18237612_18237747:DEK;ENSG00000124795:ENST00000512145:exon_18237281_18237747:DEK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 18264210 G/A 1 9 14 23 4.1085141058215 7.608978057611 -3.5004639517895 A:G G A 10 0.5434984326865 0.149533600784392 ENSG00000124795:ENST00000397239:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000424923:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000505224:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000244776:exon_18264074_18264227:DEK;ENSG00000124795:ENST00000515742:exon_18264074_18264439:DEK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 10 1 11 4.565015673135 0.5434984326865 4.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0150446576522067 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 24415380 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24415261_24415391:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24415261_24415391:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24415261_24415391:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24415261_24415391:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24415261_24415391:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24415276_24415391:MRS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 12 19 31 5.478018807762 10.3264702210435 -4.8484514132815 T:C T C 10 0.5434984326865 0.103590521196448 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 16 31 47 7.304025077016 16.8484514132815 -9.5444263362655 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0076943017336327 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 10 14 24 4.565015673135 7.608978057611 -3.043962384476 T:C T C 10 0.5434984326865 0.225358769194005 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 15 13 28 6.8475235097025 7.0654796249245 -0.217956115222 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26393021 G/A 1 13 12 25 5.9345203750755 6.521981192238 -0.5874608171625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.843063936252743 ENSG00000124508:ENST00000356709:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000352867:exon_26392603_26395102:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000482536:exon_26392603_26393235:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000432533:exon_26392450_26393236:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000416795:exon_26392603_26394220:BTN2A2;ENSG00000124508:ENST00000495632:exon_26391031_26394197:BTN2A2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26413895 C/T 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26413397_26415444:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26413397_26414301:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26413397_26415432:BTN3A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26468660 G/A 1 4 10 14 1.826006269254 5.434984326865 -3.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0624180255724271 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26545418 C/T 1 55 51 106 25.1075862022425 27.7184200670115 -2.610833864769 T:C C T 10 0.5434984326865 0.626906408107354 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 30 19 49 13.695047019405 10.3264702210435 3.3685767983615 A:G A G 10 0.5434984326865 0.390296943797341 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 27775674 A/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000185130:ENST00000377401:exon_27775257_27775709:HIST1H2BL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 27839746 T/C 1 12 4 16 5.478018807762 2.173993730746 3.304025077016 T:C T C 10 0.5434984326865 0.131696716739933 ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 28270064 T/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:T T A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 22 24 46 10.043034480897 13.043962384476 -3.000927903579 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.379220375370373 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 29693938 G/A 1 8 16 24 3.652012538508 8.695974922984 -5.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0420124763432889 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 29910402 G/A 1 188 37 225 85.822294654938 20.1094420094005 65.7128526455375 A:G G A 10 0.5434984326865 3.56338265800099e-20 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910181_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910022_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910278_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910287_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29910325_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910326_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910329_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910331_29910403:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910331_29910403:HLA-A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 29912297 A/G 1 41 148 189 18.7165642598535 80.437768037602 -61.7212037777485 A:G A G 10 0.5434984326865 8.06953415214226e-20 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 29912386 G/C 1 1 167 168 0.4565015673135 90.7642382586455 -90.307736691332 C:G G C 10 0.5434984326865 1.22894669293641e-55 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 21 15 36 9.5865329135835 8.1524764902975 1.434056423286 T:C T C 10 0.5434984326865 0.738613318412709 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30314566 T/G 1 66 41 107 30.129103442691 22.2834357401465 7.8456677025445 T:G T G 10 0.5434984326865 0.145346928977151 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30314567 C/A 1 67 40 107 30.5856050100045 21.73993730746 8.8456677025445 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0986983022443285 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314490_30314631:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314490_30314631:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314490_30314661:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314490_30314634:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314490_30314634:RPP21 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 34 37 71 15.521053288659 20.1094420094005 -4.5883887207415 A:G G A 10 0.5434984326865 0.285563086693884 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 11 21 32 5.0215172404485 11.4134670864165 -6.391949845968 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0317317065661076 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30891144 C/T 1 17 9 26 7.7605266443295 4.8914858941785 2.869040750151 T:C C T 10 0.5434984326865 0.326006011364416 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30891130_30891282:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 0 0 11 11 0 5.9784827595515 -5.9784827595515 T C T 10 0.5434984326865 0.000179417583218186 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 5 16 21 2.2825078365675 8.695974922984 -6.4134670864165 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00708650274939712 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 63 26 89 28.7595987407505 14.130959249849 14.6286394909015 A:G G A 10 0.5434984326865 0.00189607751078979 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 37 32 69 16.8905579905995 17.391949845968 -0.5013918553685 A:T T A 10 0.5434984326865 0.90449843964702 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31111180 T/C 1 15 23 38 6.8475235097025 12.5004639517895 -5.652940442087 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0737113729143446 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31113030 A/G 1 22 18 40 10.043034480897 9.782971788357 0.26006269254 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 15 15 30 6.8475235097025 8.1524764902975 -1.304952980595 A:G G A 10 0.5434984326865 0.715052163078841 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31118565 C/G 1 16 8 24 7.304025077016 4.347987461492 2.956037615524 C:G C G 10 0.5434984326865 0.305762550366789 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31129616 A/G 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31129642 A/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:C A C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31130502 T/C 1 25 19 44 11.4125391828375 10.3264702210435 1.086068961794 T:C T C 10 0.5434984326865 0.764705161075405 ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 1873 950 2823 855.027435578186 516.323511052175 338.70392452601 T:C:G T C 10 0.5434984326865 2.41637092519567e-38 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 1916 649 2565 874.657002972666 352.730482813539 521.926520159127 T:C:G C G 10 0.5434984326865 2.31997587684694e-100 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 641 21 662 292.617504647954 11.4134670864165 281.204037561537 T:G T G 10 0.5434984326865 4.31422803985272e-138 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 657 75 732 299.92152972497 40.7623824514875 259.159147273482 T:C C T 10 0.5434984326865 3.40362975428413e-96 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31239821 G/T 0 479 0 479 218.664250743166 0 218.664250743166 G G 10 0.5434984326865 1.54811357126369e-127 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31322402 C/T 1 13 8 21 5.9345203750755 4.347987461492 1.5865329135835 T:C C T 10 0.5434984326865 0.520118476668358 ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31322459 T/C 1 19 16 35 8.6735297789565 8.695974922984 -0.0224451440275004 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31322473 T/C 0 21 0 21 9.5865329135835 0 9.5865329135835 T T 10 0.5434984326865 4.5824929889477e-06 ENSG00000234745:ENST00000497377:exon_31322410_31322853:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000481849:exon_31322256_31322583:HLA-B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 1396 792 2188 637.276187969646 430.450758687708 206.825429281938 A:T:C C T 10 0.5434984326865 4.15107901971455e-19 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 A:G A G 10 0.5434984326865 0.502111595945777 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31431813 A/G 1 15 16 31 6.8475235097025 8.695974922984 -1.8484514132815 A:G A G 10 0.5434984326865 0.589619186731053 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31548451 A/G 1 230 171 401 104.995360482105 92.9382319893915 12.0571284927135 A:G A G 10 0.5434984326865 0.229411570900688 ENSG00000227507:ENST00000483972:exon_31548302_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000429299:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000446745:exon_31548332_31548940:LTB;ENSG00000227507:ENST00000482429:exon_31548401_31548940:LTB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31556922 C/T 1 50 68 118 22.825078365675 36.957893422682 -14.132815057007 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00959322848302718 ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31583312 G/A 1 14 15 29 6.391021942389 8.1524764902975 -1.7614545479085 A:G G A 10 0.5434984326865 0.577820071884129 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000497362:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31583298_31583359:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583298_31583359:AIF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31600304 G/C 1 17 24 41 7.7605266443295 13.043962384476 -5.2834357401465 T:C:G G C 10 0.5434984326865 0.116626771198279 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 25 22 47 11.4125391828375 11.956965519103 -0.5444263362655 T:C T C 10 0.5434984326865 0.884615348994713 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 51 39 90 23.2815799329885 21.1964388747735 2.085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.673773597667999 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31605167 G/A 1 11 13 24 5.0215172404485 7.0654796249245 -2.043962384476 A:G G A 10 0.5434984326865 0.419840167312213 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 11 12 23 5.0215172404485 6.521981192238 -1.5004639517895 T:C C T 10 0.5434984326865 0.538430560562157 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 31 40 71 14.1515485867185 21.73993730746 -7.5883887207415 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.074599595469701 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 213 277 490 97.2348338377755 150.54906585416 -53.314232016385 T:C:G T C 10 0.5434984326865 1.43076584011146e-06 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31639757 G/A 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31657413 T/C 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31732207 C/T 1 9 12 21 4.1085141058215 6.521981192238 -2.4134670864165 T:C C T 10 0.5434984326865 0.381551703468518 ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31732043_31732628:MSH5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31747041 C/T 1 45 32 77 20.5425705291075 17.391949845968 3.1506206831395 T:C C T 10 0.5434984326865 0.494401599143616 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31746744_31747069:VARS;ENSG00000204394:ENST00000463184:exon_31747007_31747069:VARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 21 23 44 9.5865329135835 12.5004639517895 -2.913931038206 T:C C T 10 0.5434984326865 0.449679990168436 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31938072 T/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32093933 C/T 1 26 11 37 11.869040750151 5.9784827595515 5.8905579905995 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0681640854380513 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32097475 T/C 1 15 8 23 6.8475235097025 4.347987461492 2.4995360482105 T:C T C 10 0.5434984326865 0.403070581678078 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 598 653 1251 272.987937253473 354.904476544284 -81.9165392908115 A:T:C C A 10 0.5434984326865 3.63072458654976e-06 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 2750 2869 5619 1255.37931011213 1559.29700337757 -303.917693265443 A:T:C:G A C 10 0.5434984326865 4.57647948384613e-16 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.194531225591664 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 3243 2647 5890 1480.43458279768 1438.64035132117 41.7942314765151 A:T:C:G T G 10 0.5434984326865 0.277663036748254 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32411712 G/A 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 0.100680878973953 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32781554 G/A 1 32 34 66 14.608050154032 18.478946711341 -3.870896557309 A:G G A 10 0.5434984326865 0.387359060495051 ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32781500_32781610:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32781500_32782378:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32781544_32781610:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32781544_32781610:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32811629 G/T 1 174 146 320 79.431272712549 79.350771172229 0.0805015403200002 T:G G T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32811627_32811797:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32811627_32811824:PSMB8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32904981 G/A 1 146 156 302 66.649228827771 84.785755499094 -18.136526671323 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0375845758319985 ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32944094 G/C 1 34 33 67 15.521053288659 17.9354482786545 -2.4143949899955 C:G G C 10 0.5434984326865 0.624098212473971 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32944027_32944241:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944027_32944241:BRD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 6 12 18 2.739009403881 6.521981192238 -3.782971788357 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0966180060940715 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 108 120 228 49.302169269858 65.21981192238 -15.917642652522 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0390981603574312 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 32948426 C/T 1 237 202 439 108.190871453299 109.786683402673 -1.59581194937351 T:C C T 10 0.5434984326865 0.885804213473308 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32948359_32949281:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32948359_32949282:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32948359_32949063:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482838:exon_32948359_32948543:BRD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33173842 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33179689 C/T 1 14 12 26 6.391021942389 6.521981192238 -0.130959249849 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000204227:ENST00000374656:exon_33179506_33179779:RING1;ENSG00000204227:ENST00000478431:exon_33179506_33179779:RING1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33239905 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33254665 A/G 1 57 63 120 26.0205893368695 34.2404012592495 -8.21981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.142758928669977 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33254572_33254671:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33254572_33254671:WDR46 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33256397 G/A 1 43 36 79 19.6295673944805 19.565943576714 0.0636238177665014 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000444176:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000477718:exon_33256391_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000468157:exon_33256341_33256471:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000481025:exon_33256391_33256471:WDR46 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 7 12 19 3.1955109711945 6.521981192238 -3.3264702210435 C:G C G 10 0.5434984326865 0.166463653686349 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 33747935 C/T 0 21 0 21 9.5865329135835 0 9.5865329135835 C C 10 0.5434984326865 4.5824929889477e-06 ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33746019_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000510598:exon_33747877_33748076:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000502643:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000513832:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000442696:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000512368:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000513701:exon_33747877_33747956:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000514636:exon_33747779_33747956:LEMD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 61 41 102 27.8465956061235 22.2834357401465 5.563159865977 C:G C G 10 0.5434984326865 0.276203316525651 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36106756 T/C 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000156711:ENST00000373761:exon_36106656_36106832:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000211287:exon_36106656_36106832:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373770:exon_36106662_36106832:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373766:exon_36106656_36106832:MAPK13;ENSG00000156711:ENST00000373759:exon_36106479_36106984:MAPK13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36446975 G/C 0 0 8 8 0 4.347987461492 -4.347987461492 C G C 10 0.5434984326865 0.00188598477958497 ENSG00000112078:ENST00000373731:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000481911:exon_36446898_36447000:KCTD20;ENSG00000112078:ENST00000265344:exon_36446898_36447000:KCTD20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36824399 C/T 1 25 27 52 11.4125391828375 14.6744576825355 -3.261918499698 T:C C T 10 0.5434984326865 0.404572499785401 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36824362_36824430:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36824362_36824430:PPIL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.780049669700148 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36976637 G/C 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 C:G G C 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 36995222 G/A 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 A:G G A 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36995205_36995351:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487920:exon_36995205_36996845:FGD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 38670837 G/A 1 34 17 51 15.521053288659 9.2394733556705 6.2815799329885 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0912800840136088 ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38670747_38670917:GLO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 54 43 97 24.651084634929 23.3704326055195 1.2806520294095 T:C C T 10 0.5434984326865 0.838832126994158 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 53 53 106 24.1945830676155 28.8054169323845 -4.610833864769 T:C T C 10 0.5434984326865 0.381449432644583 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 22 21 43 10.043034480897 11.4134670864165 -1.3704326055195 A:C A C 10 0.5434984326865 0.759976008303443 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 T:C C T 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 22 29 51 10.043034480897 15.7614545479085 -5.7184200670115 T:C T C 10 0.5434984326865 0.122291961804376 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 25 28 53 11.4125391828375 15.217956115222 -3.8054169323845 C:G C G 10 0.5434984326865 0.334989832902192 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 101 81 182 46.1066582986635 44.0233730476065 2.083285251057 A:G A G 10 0.5434984326865 0.766606855673185 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 8 11 19 3.652012538508 5.9784827595515 -2.3264702210435 T:C C T 10 0.5434984326865 0.358365878943715 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 43013384 G/A 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43013325_43013420:CUL7;ENSG00000044090:ENST00000478630:exon_43013325_43013420:CUL7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 43492578 G/A 1 73 61 134 33.3246144138855 33.1534043938765 0.171210020008999 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 43578360 C/T 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 T:C C T 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43578291_43578460:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43578291_43578460:POLH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 43581755 A/G 1 14 17 31 6.391021942389 9.2394733556705 -2.8484514132815 A:G A G 10 0.5434984326865 0.368042910630599 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 107 91 198 48.8456677025445 49.4583573744715 -0.612689671926994 T:C C T 10 0.5434984326865 0.943220462325528 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 44219710 A/C 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:C A C 10 0.5434984326865 0.740503731586123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 29 24 53 13.2385454520915 13.043962384476 0.1945830676155 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 56 47 103 25.564087769556 25.5444263362655 0.0196614332905014 A:T T A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 17 21 38 7.7605266443295 11.4134670864165 -3.652940442087 T:C T C 10 0.5434984326865 0.256620626722929 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 49412433 C/T 1 14 20 34 6.391021942389 10.86996865373 -4.478946711341 T:C C T 10 0.5434984326865 0.167490035500818 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 49425521 C/T 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49425404_49425771:MUT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 49439805 G/A 1 15 9 24 6.8475235097025 4.8914858941785 1.956037615524 A:G G A 10 0.5434984326865 0.53990005232013 ENSG00000031691:ENST00000335783:exon_49439776_49439896:CENPQ;ENSG00000031691:ENST00000371200:exon_49439776_49439896:CENPQ HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 11 9 20 5.0215172404485 4.8914858941785 0.13003134627 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 12 11 23 5.478018807762 5.9784827595515 -0.5004639517895 A:G G A 10 0.5434984326865 0.837650237750388 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 19 0 19 8.6735297789565 0 8.6735297789565 G G 10 0.5434984326865 1.72989060848334e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 14 0 14 6.391021942389 0 6.391021942389 A A 10 0.5434984326865 0.000213303214080523 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 13 13 0 7.0654796249245 -7.0654796249245 G A G 10 0.5434984326865 3.73894905957278e-05 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 18 18 0 9.782971788357 -9.782971788357 A G A 10 0.5434984326865 7.41243525473021e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 19 19 0 10.3264702210435 -10.3264702210435 G T G 10 0.5434984326865 3.38378831139418e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 17 0 17 7.7605266443295 0 7.7605266443295 C C 10 0.5434984326865 3.31281349510921e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 15 15 0 8.1524764902975 -8.1524764902975 C T C 10 0.5434984326865 7.79173357445114e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 8 8 0 4.347987461492 -4.347987461492 A G A 10 0.5434984326865 0.00188598477958497 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 70407465 A/T 1 32 56 88 14.608050154032 30.435912230444 -15.827862076412 A:T A T 10 0.5434984326865 0.00082722831698904 ENSG00000168216:ENST00000370577:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000370570:exon_70407455_70407533:LMBRD1;ENSG00000168216:ENST00000472827:exon_70407455_70407533:LMBRD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 71289189 A/G 1 15 27 42 6.8475235097025 14.6744576825355 -7.826934172833 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0193001714632864 ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 74138503 G/A 1 5 13 18 2.2825078365675 7.0654796249245 -4.782971788357 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0313510638317915 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74138432_74138534:C6orf150 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 74155346 G/T 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 T:G G T 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74155251_74155470:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000459924:exon_74155251_74155408:C6orf150 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 74228049 A/G 1 40 28 68 18.26006269254 15.217956115222 3.042106577318 A:G A G 10 0.5434984326865 0.468607434969719 ENSG00000156508:ENST00000490569:exon_74227753_74228333:EEF1A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 51 30 81 23.2815799329885 16.304952980595 6.9766269523935 C:G C G 10 0.5434984326865 0.146614692514162 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 88318883 G/A 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000135336:ENST00000392844:exon_88318814_88318947:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000452292:exon_88318817_88318947:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000417380:exon_88318814_88318947:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000257789:exon_88318814_88318947:ORC3;ENSG00000135336:ENST00000478028:exon_88318814_88319249:ORC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 85 72 157 38.8026332216475 39.131887153428 -0.329253931780499 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 90573092 A/T 1 5 4 9 2.2825078365675 2.173993730746 0.1085141058215 A:T A T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90571845_90574090:CASP8AP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 90577984 C/T 1 7 1 8 3.1955109711945 0.5434984326865 2.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0786215383398633 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 90578661 C/A 1 13 13 26 5.9345203750755 7.0654796249245 -1.130959249849 A:C C A 10 0.5434984326865 0.696932813908347 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 99858695 T/C 1 36 35 71 16.434056423286 19.0224451440275 -2.5883887207415 T:C T C 10 0.5434984326865 0.553262439479585 ENSG00000132424:ENST00000369239:exon_99858617_99858840:SFRS18;ENSG00000132424:ENST00000438806:exon_99858617_99858840:SFRS18;ENSG00000132424:ENST00000478777:exon_99858617_99858840:SFRS18;ENSG00000132424:ENST00000463021:exon_99857049_99858868:SFRS18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 49 42 91 22.3685767983615 22.826934172833 -0.4583573744715 T:C C T 10 0.5434984326865 0.91672370844664 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 106555025 G/A 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 106756282 T/C 1 13 11 24 5.9345203750755 5.9784827595515 -0.043962384476 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000057663:ENST00000369076:exon_106756239_106756366:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000343245:exon_106756239_106756366:ATG5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 7 10 17 3.1955109711945 5.434984326865 -2.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.333330524865813 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 107003686 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_107003643_107003772:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_107003643_107003772:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_107003643_107003772:AIM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 34 26 60 15.521053288659 14.130959249849 1.39009403881 A:G G A 10 0.5434984326865 0.795907511656434 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 109762332 C/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000185250:ENST00000440797:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000521072:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000185250:ENST00000368958:exon_109761659_109762374:PPIL6;ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109761966_109762374:SMPD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 109762600 A/C 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:C A C 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 35 8 43 15.9775548559725 4.347987461492 11.6295673944805 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000318918361615867 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 4 6 10 1.826006269254 3.260990596119 -1.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.528019401562558 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 116599665 T/C 1 15 17 32 6.8475235097025 9.2394733556705 -2.391949845968 T:C T C 10 0.5434984326865 0.478550518683793 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 10 3 13 4.565015673135 1.6304952980595 2.9345203750755 C:G C G 10 0.5434984326865 0.161870225087798 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 A:G G A 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 11 6 17 5.0215172404485 3.260990596119 1.7605266443295 T:C T C 10 0.5434984326865 0.470234227697998 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 118320421 G/A 0 241 0 241 110.016877722554 0 110.016877722554 G G 10 0.5434984326865 2.27723814616183e-64 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:C C A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 119515005 C/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119514942_119515057:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119514942_119515057:MAN1A1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 133135864 T/G 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:G T G 10 0.5434984326865 0.303869012868413 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 2329 1190 3519 1063.19215027314 646.763134896935 416.429015376207 A:T:G A G 10 0.5434984326865 4.54464889382896e-46 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 8 13 21 3.652012538508 7.0654796249245 -3.4134670864165 T:C T C 10 0.5434984326865 0.1876633788445 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 79 0 79 36.0636238177665 0 36.0636238177665 T T 10 0.5434984326865 1.37611747463026e-21 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 94 0 94 42.911147327469 0 42.911147327469 A A 10 0.5434984326865 1.90224161837714e-25 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 94 0 94 42.911147327469 0 42.911147327469 A A 10 0.5434984326865 1.90224161837714e-25 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 17 0 17 7.7605266443295 0 7.7605266443295 G G 10 0.5434984326865 3.31281349510921e-05 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 23 0 23 10.4995360482105 0 10.4995360482105 T T 10 0.5434984326865 1.22910232651717e-06 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 137519238 A/G 1 416 187 603 189.904652002416 101.634206912376 88.2704450900405 A:G A G 10 0.5434984326865 2.39617584670352e-13 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 139097232 C/T 1 28 22 50 12.782043884778 11.956965519103 0.825078365674999 T:C C T 10 0.5434984326865 0.887507408057495 ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 143382110 T/C 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 143816859 C/T 1 79 110 189 36.0636238177665 59.784827595515 -23.7212037777485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000576720419357249 ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143815949_143816984:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143816614_143816984:FUCA2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 144181619 A/G 1 38 19 57 17.347059557913 10.3264702210435 7.0205893368695 A:C:G A G 10 0.5434984326865 0.0638135614734503 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144181563_144181690:LTV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 144416308 A/C 1 618 597 1215 282.117968599743 324.46856431384 -42.3505957140975 A:T:C A C 10 0.5434984326865 0.0155334118780924 ENSG00000169976:ENST00000367569:exon_144416018_144416754:SF3B5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 13 10 23 5.9345203750755 5.434984326865 0.4995360482105 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 150114761 A/G 1 66 44 110 30.129103442691 23.913931038206 6.215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 0.251464820302764 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 21 11 32 9.5865329135835 5.9784827595515 3.608050154032 C:G C G 10 0.5434984326865 0.218468732265838 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 30 16 46 13.695047019405 8.695974922984 4.999072096421 T:C C T 10 0.5434984326865 0.182225797075041 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 56 58 114 25.564087769556 31.522909095817 -5.958821326261 C:G G C 10 0.5434984326865 0.301026953778379 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 152469331 C/T 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152469180_152469513:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000472563:exon_152469018_152469513:SYNE1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 19 16 35 8.6735297789565 8.695974922984 -0.0224451440275004 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:C A C 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 4 9 13 1.826006269254 4.8914858941785 -3.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.100680878973953 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 12 10 22 5.478018807762 5.434984326865 0.043034480897 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 16 25 41 7.304025077016 13.5874608171625 -6.2834357401465 A:T T A 10 0.5434984326865 0.0592212543521291 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 159398633 T/C 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 T:C T C 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159397312_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159397866_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159398268_159398880:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159398268_159398880:RSPH3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 166736362 C/T 1 156 188 344 71.214244500906 102.177705345062 -30.963460844156 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000936162353506775 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166736345_166736374:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166736345_166738083:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000479490:exon_166736345_166738176:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166736345_166736374:SFT2D1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 167343199 C/T 1 424 359 783 193.556664540924 195.115937334453 -1.55927279352949 T:C C T 10 0.5434984326865 0.914341076243432 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 379 424 803 173.014094011816 230.443335459076 -57.4292414472595 A:C:G A G 10 0.5434984326865 5.25297279257643e-05 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 170627174 C/T 1 1 8 9 0.4565015673135 4.347987461492 -3.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0142241674807915 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 39 27 66 17.8035611252265 14.6744576825355 3.129103442691 A:T A T 10 0.5434984326865 0.460976589520377 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 204 178 382 93.126319731954 96.742721018197 -3.616401286243 C:G G C 10 0.5434984326865 0.719425418791037 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 T:C T C 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 6 6 12 2.739009403881 3.260990596119 -0.521981192238 T:C T C 10 0.5434984326865 0.780049669700148 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 11 7 18 5.0215172404485 3.8044890288055 1.217028211643 A:G A G 10 0.5434984326865 0.64118689112897 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 47 48 95 21.4555736637345 26.087924768952 -4.6323511052175 T:C C T 10 0.5434984326865 0.355182960011795 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 1976457 C/T 1 21 16 37 9.5865329135835 8.695974922984 0.8905579905995 T:C C T 10 0.5434984326865 0.869374398969832 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000450235:exon_1976323_1976533:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000437877:exon_1976323_1976533:MAD1L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 2581440 G/A 0 9 0 9 4.1085141058215 0 4.1085141058215 G G 10 0.5434984326865 0.00499889953481625 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2581352_2581470:C7orf27 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 89 118 207 40.6286394909015 64.132815057007 -23.5041755661055 T:C T C 10 0.5434984326865 0.00127568486530438 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 6370077 C/T 1 15 9 24 6.8475235097025 4.8914858941785 1.956037615524 T:C C T 10 0.5434984326865 0.53990005232013 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 6370575 C/T 1 7 8 15 3.1955109711945 4.347987461492 -1.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.61015911396581 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000524898:exon_6370426_6370866:C7orf70;ENSG00000178397:ENST00000530143:exon_6370459_6370866:C7orf70 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 21956405 G/A 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000373934:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000405437:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000465490:exon_21956372_21956515:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000396561:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000447180:exon_21956372_21956512:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000435031:exon_21956372_21956512:CDCA7L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 23164701 C/T 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000122550:ENST00000521082:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322231:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000339077:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000322275:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000459661:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000491352:exon_23164667_23164821:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000409689:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000410047:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000479700:exon_23164667_23164791:KLHL7;ENSG00000122550:ENST00000477076:exon_23164599_23164791:KLHL7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 24756951 C/T 1 14 22 36 6.391021942389 11.956965519103 -5.565943576714 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0671451655397904 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000446822:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24756873_24756993:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24756088_24756993:DFNA5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 29980471 C/T 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 T:C C T 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000136193:ENST00000242059:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000416113:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000426154:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000425819:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000409497:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000434476:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000421434:exon_29980300_29980492:SCRN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 44 44 88 20.086068961794 23.913931038206 -3.827862076412 A:G G A 10 0.5434984326865 0.454203632476889 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 30634630 G/C 1 45 26 71 20.5425705291075 14.130959249849 6.4116112792585 C:G G C 10 0.5434984326865 0.152447601707184 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 26 20 46 11.869040750151 10.86996865373 0.999072096421001 C:G C G 10 0.5434984326865 0.88255751424418 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 16 10 26 7.304025077016 5.434984326865 1.869040750151 A:G G A 10 0.5434984326865 0.556526773934017 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 9 4 13 4.1085141058215 2.173993730746 1.9345203750755 A:G A G 10 0.5434984326865 0.405466121475058 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 58 50 108 26.477090904183 27.174921634325 -0.697830730141998 T:C T C 10 0.5434984326865 0.923203604875048 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 43843423 G/A 1 143 111 254 65.2797241258305 60.3283260282015 4.951398097629 A:G G A 10 0.5434984326865 0.570915508150631 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43843275_43843446:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000486984:exon_43843275_43843434:BLVRA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 43906513 A/G 1 223 206 429 101.799849510911 111.960677133419 -10.1608276225085 A:T:C:G A G 10 0.5434984326865 0.332623187057499 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 13 7 20 5.9345203750755 3.8044890288055 2.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 0.377414731649604 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 44154374 C/A 1 212 175 387 96.778332270462 95.1122257201375 1.6661065503245 A:C C A 10 0.5434984326865 0.878449891315032 ENSG00000106628:ENST00000406581:exon_44154286_44154544:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000489883:exon_44154287_44154544:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000395803:exon_44154287_44154544:POLD2;ENSG00000106628:ENST00000223361:exon_44154298_44154544:POLD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 40 30 70 18.26006269254 16.304952980595 1.955109711945 A:G G A 10 0.5434984326865 0.71923071536496 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 31 22 53 14.1515485867185 11.956965519103 2.1945830676155 T:C C T 10 0.5434984326865 0.583368154688726 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 30 33 63 13.695047019405 17.9354482786545 -4.2404012592495 A:G G A 10 0.5434984326865 0.312456714020006 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 32 34 66 14.608050154032 18.478946711341 -3.870896557309 T:C C T 10 0.5434984326865 0.387359060495051 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 14 8 22 6.391021942389 4.347987461492 2.043034480897 A:G G A 10 0.5434984326865 0.40272054551298 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 48016416 T/C 1 11 5 16 5.0215172404485 2.7174921634325 2.304025077016 T:C T C 10 0.5434984326865 0.31866452342011 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000442024:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432627:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000433977:exon_48016327_48016434:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000446009:exon_48016327_48016434:HUS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 1 26 23 49 11.869040750151 12.5004639517895 -0.6314232016385 A:C A C 10 0.5434984326865 0.886645312965562 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 56136194 C/T 1 43 32 75 19.6295673944805 17.391949845968 2.2376175485125 T:C C T 10 0.5434984326865 0.644005038833605 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56136175_56136340:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56136175_56136331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56136175_56136331:SUMF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 56174115 A/C 1 474 346 820 216.381742906599 188.050457709529 28.33128519707 A:C:G A C 10 0.5434984326865 0.049587003564979 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2;ENSG00000106153:ENST00000473095:exon_56174057_56174124:CHCHD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 56174140 G/T 1 187 161 348 85.3657930876245 87.5032476625265 -2.13745457490201 T:C:G G T 10 0.5434984326865 0.829717635405203 ENSG00000106153:ENST00000395422:exon_56174057_56174269:CHCHD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 65557564 C/T 1 45 39 84 20.5425705291075 21.1964388747735 -0.653868345665998 T:C C T 10 0.5434984326865 0.913059567029856 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000493708:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000249319:ENST00000450043:exon_65557544_65557650:AC068533.7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 72300332 G/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 72718278 G/A 1 21 11 32 9.5865329135835 5.9784827595515 3.608050154032 A:G G A 10 0.5434984326865 0.218468732265838 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72718227_72718401:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72718227_72718405:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72718227_72718700:NSUN5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 15 12 27 6.8475235097025 6.521981192238 0.3255423174645 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 72992847 C/T 0 11 0 11 5.0215172404485 0 5.0215172404485 C C 10 0.5434984326865 0.00140172727774491 ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72992750_72992906:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72992750_72992920:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72992750_72993121:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72992750_72992884:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72992750_72992929:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000426966:exon_72992750_72992949:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000452475:exon_72992750_72992964:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000435792:exon_72992750_72993006:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000496056:exon_72992750_72992906:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000458466:exon_72992750_72992929:TBL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 73097238 G/A 1 23 25 48 10.4995360482105 13.5874608171625 -3.087924768952 A:G G A 10 0.5434984326865 0.387711265343278 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 20 14 34 9.13003134627 7.608978057611 1.521053288659 C:G G C 10 0.5434984326865 0.731192583939071 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 73152763 G/A 1 9 11 20 4.1085141058215 5.9784827595515 -1.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.502111595945777 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73152663_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73152658_73152772:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73152663_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000322862:exon_73152658_73152772:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000458339:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000412965:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000395147:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000486114:exon_73152658_73152840:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000474130:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000480445:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000468998:exon_73152658_73152793:ABHD11 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 73969541 A/G 1 8 1 9 3.652012538508 0.5434984326865 3.1085141058215 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0455044848393489 ENSG00000006704:ENST00000265755:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000455841:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000424337:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000476977:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000489094:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1;ENSG00000006704:ENST00000470715:exon_73969504_73969553:GTF2IRD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 75513062 A/G 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75513016_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75512808_75513166:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75512839_75513166:RHBDD2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 18 8 26 8.217028211643 4.347987461492 3.869040750151 A:G A G 10 0.5434984326865 0.167672891645184 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 56 14 70 25.564087769556 7.608978057611 17.955109711945 T:C T C 10 0.5434984326865 1.04244036047043e-05 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 45 21 66 20.5425705291075 11.4134670864165 9.129103442691 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0259181453223461 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 76111835 G/A 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 12 12 24 5.478018807762 6.521981192238 -1.043962384476 T:C C T 10 0.5434984326865 0.68703592506408 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 5 11 16 2.2825078365675 5.9784827595515 -3.695974922984 T:G T G 10 0.5434984326865 0.0791893749967246 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 89984409 A/G 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89984400_89984544:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000474503:exon_89984400_89984544:GTPBP10 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 83 23 106 37.8896300870205 12.5004639517895 25.389166135231 A:G G A 10 0.5434984326865 4.04484591975832e-07 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 17 23 40 7.7605266443295 12.5004639517895 -4.73993730746 T:G G T 10 0.5434984326865 0.153505600262966 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91700276 G/A 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91700219_91700323:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91700219_91700323:AKAP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:G A G 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C C T 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 17 13 30 7.7605266443295 7.0654796249245 0.695047019405001 A:C A C 10 0.5434984326865 0.856121239847662 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 24 40 64 10.956037615524 21.73993730746 -10.783899691936 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00805267849622381 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 4 10 14 1.826006269254 5.434984326865 -3.608978057611 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0624180255724271 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 119 92 211 54.3236865103065 50.001855807158 4.3218307031485 A:T A T 10 0.5434984326865 0.580644281547833 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 97922851 C/T 1 11 26 37 5.0215172404485 14.130959249849 -9.1094420094005 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00280967484967082 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97920963_97922908:BAIAP2L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 99161604 C/G 1 30 12 42 13.695047019405 6.521981192238 7.173065827167 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0296025459537350 ENSG00000197343:ENST00000320583:exon_99161486_99162328:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000467680:exon_99161486_99162328:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000357864:exon_99161486_99162326:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000452314:exon_99161486_99161646:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000416144:exon_99161486_99162309:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000423973:exon_99161486_99162328:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000422422:exon_99161486_99161969:ZNF655;ENSG00000197343:ENST00000440391:exon_99161486_99162328:ZNF655 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 99817859 A/G 0 46 0 46 20.999072096421 0 20.999072096421 A A 10 0.5434984326865 9.8820960913535e-13 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99817737_99818087:PVRIG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100458795 T/C 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000146828:ENST00000448342:exon_100458634_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000418037:exon_100458760_100458802:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000416675:exon_100458760_100458852:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100457772_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100458760_100458884:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100466441 G/A 1 36 36 72 16.434056423286 19.565943576714 -3.131887153428 A:G G A 10 0.5434984326865 0.479420428680856 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000437505:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100466117_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100465918_100466488:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100466433_100466488:TRIP6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 44 46 90 20.086068961794 25.000927903579 -4.914858941785 A:G A G 10 0.5434984326865 0.341012585265054 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100468398 T/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 54 60 114 24.651084634929 32.60990596119 -7.958821326261 T:C T C 10 0.5434984326865 0.158166383373945 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 28 19 47 12.782043884778 10.3264702210435 2.4555736637345 T:C C T 10 0.5434984326865 0.558664837303248 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100486656 T/G 1 10 6 16 4.565015673135 3.260990596119 1.304025077016 T:G T G 10 0.5434984326865 0.619627553421886 ENSG00000176125:ENST00000388761:exon_100486346_100487339:UFSP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100855876 A/T 1 8 7 15 3.652012538508 3.8044890288055 -0.1524764902975 A:T A T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478082:exon_100855811_100855936:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000478264:exon_100855825_100855936:PLOD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:G T G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 101916647 A/G 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101916637_101916764:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101916637_101916764:CUX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 101917521 G/A 1 7 7 14 3.1955109711945 3.8044890288055 -0.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.79308339785957 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101917515_101917581:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101917445_101917581:CUX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 101926407 G/A 1 12 15 27 5.478018807762 8.1524764902975 -2.6744576825355 A:G G A 10 0.5434984326865 0.337308055174249 ENSG00000160967:ENST00000292538:exon_101926313_101927249:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000419439:exon_101926313_101927249:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000437600:exon_101926313_101927250:CUX1;ENSG00000160967:ENST00000487284:exon_101926313_101927224:CUX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 102098010 G/A 1 12 14 26 5.478018807762 7.608978057611 -2.130959249849 A:G G A 10 0.5434984326865 0.435513818944155 ENSG00000160993:ENST00000292566:exon_102096685_102098428:ALKBH4;ENSG00000160993:ENST00000490528:exon_102097281_102098428:ALKBH4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 102108532 G/A 1 6 16 22 2.739009403881 8.695974922984 -5.956965519103 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0165117654975061 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 102114090 T/C 1 41 101 142 18.7165642598535 54.8933417013365 -36.176777441483 T:C T C 10 0.5434984326865 1.02356796881514e-09 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 103838221 T/C 1 7 6 13 3.1955109711945 3.260990596119 -0.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103838173_103838247:ORC5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 18 21 39 8.217028211643 11.4134670864165 -3.1964388747735 T:C C T 10 0.5434984326865 0.336750534989634 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 105135603 G/A 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000091127:ENST00000481939:exon_105135589_105135700:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000356362:exon_105135589_105135700:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000469408:exon_105135589_105135700:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000487277:exon_105135589_105135794:PUS7;ENSG00000091127:ENST00000482157:exon_105135589_105135700:PUS7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 24 21 45 10.956037615524 11.4134670864165 -0.4574294708925 T:C T C 10 0.5434984326865 0.88255232471474 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 12 16 28 5.478018807762 8.695974922984 -3.217956115222 A:G G A 10 0.5434984326865 0.256861842582542 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 28 40 68 12.782043884778 21.73993730746 -8.957893422682 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0377289779783781 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 127721507 T/C 1 106 80 186 48.389166135231 43.47987461492 4.909291520311 T:C T C 10 0.5434984326865 0.507876966736915 ENSG00000197157:ENST00000438400:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000354725:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000486037:exon_127721412_127721553:SND1;ENSG00000197157:ENST00000470463:exon_127721412_127721553:SND1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 131347009 T/C 0 503 1 504 229.62028835869 0.5434984326865 229.076789926004 T:G T G 10 0.5434984326865 1.64616251079087e-131 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 132719349 G/A 1 7900 4 7904 3606.36238177665 2.173993730746 3604.1883880459 A:C:G G A 10 0.5434984326865 4.94065645841247e-324 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 133059736 A/C 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:C A C 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133059582_133059756:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000486013:exon_133059582_133059756:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000393161:exon_133059582_133059756:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000462055:exon_133059582_133059756:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000480840:exon_133059582_133059782:EXOC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 14 17 31 6.391021942389 9.2394733556705 -2.8484514132815 A:G G A 10 0.5434984326865 0.368042910630599 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:T A T 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 1 10 2 12 4.565015673135 1.086996865373 3.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0776155508599071 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 A:C A C 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 135330254 C/T 1 48 54 102 21.912075231048 29.348915365071 -7.436840134023 T:C C T 10 0.5434984326865 0.163763587641331 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135330216_135330344:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135330216_135330344:NUP205 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 138732457 G/A 1 14 6 20 6.391021942389 3.260990596119 3.13003134627 A:G G A 10 0.5434984326865 0.183227568315245 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 9 3 12 4.1085141058215 1.6304952980595 2.478018807762 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245677325228346 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 17 17 34 7.7605266443295 9.2394733556705 -1.478946711341 C:G G C 10 0.5434984326865 0.61102443350199 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 139415775 G/C 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000064393:ENST00000406875:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000263551:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000428878:exon_139415731_139416814:HIPK2;ENSG00000064393:ENST00000342645:exon_139415731_139416814:HIPK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 18 10 28 8.217028211643 5.434984326865 2.782043884778 A:G G A 10 0.5434984326865 0.345175694422958 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C C T 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 10 15 25 4.565015673135 8.1524764902975 -3.5874608171625 T:C T C 10 0.5434984326865 0.163877041893024 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 142494606 C/G 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 C:G C G 10 0.5434984326865 1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 100 73 173 45.65015673135 39.6753855861145 5.9747711452355 A:G G A 10 0.5434984326865 0.40127020389757 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 202 0 202 92.213316597327 0 92.213316597327 T T 10 0.5434984326865 3.63895593662203e-54 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 148489820 G/A 1 33 32 65 15.0645517213455 17.391949845968 -2.3273981246225 A:G G A 10 0.5434984326865 0.618987829174956 ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148489818_148489910:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148489818_148489910:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148489818_148489910:CUL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 148712092 G/A 1 51 48 99 23.2815799329885 26.087924768952 -2.8063448359635 A:G G A 10 0.5434984326865 0.61434469225407 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148711996_148712134:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148711996_148712134:PDIA4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 149129829 C/T 1 6 9 15 2.739009403881 4.8914858941785 -2.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.306258513762735 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 4 11 15 1.826006269254 5.9784827595515 -4.1524764902975 A:C A C 10 0.5434984326865 0.0380096891755768 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 28 24 52 12.782043884778 13.043962384476 -0.261918499698 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 14 42 56 6.391021942389 22.826934172833 -16.435912230444 T:C C T 10 0.5434984326865 1.06847340116090e-05 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 16 36 52 7.304025077016 19.565943576714 -12.261918499698 T:C C T 10 0.5434984326865 0.000720618705575547 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 31 40 71 14.1515485867185 21.73993730746 -7.5883887207415 T:C T C 10 0.5434984326865 0.074599595469701 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 6302922 G/T 1 20 20 40 9.13003134627 10.86996865373 -1.73993730746 T:G G T 10 0.5434984326865 0.635327390672032 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 6566351 C/G 1 25 12 37 11.4125391828375 6.521981192238 4.8905579905995 C:G C G 10 0.5434984326865 0.136706739340960 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6565878_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6566187_6566408:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6566214_6566408:AGPAT5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 6 14 20 2.739009403881 7.608978057611 -4.86996865373 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0410079712081252 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 7 2 9 3.1955109711945 1.086996865373 2.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.194531225591664 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 10623240 T/C 1 39 40 79 17.8035611252265 21.73993730746 -3.9363761822335 T:C T C 10 0.5434984326865 0.429386235457516 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17796382 A/G 1 7 5 12 3.1955109711945 2.7174921634325 0.478018807762 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17796383 C/T 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17796249_17796518:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17796348_17796525:PCM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17814915 A/G 1 10 11 21 4.565015673135 5.9784827595515 -1.4134670864165 A:G A G 10 0.5434984326865 0.66244083231073 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17814773_17814930:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17814773_17814930:PCM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 14 15 29 6.391021942389 8.1524764902975 -1.7614545479085 T:G G T 10 0.5434984326865 0.577820071884129 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 9 9 18 4.1085141058215 4.8914858941785 -0.782971788356999 A:T A T 10 0.5434984326865 0.814399728250921 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17915126 C/T 1 27 38 65 12.3255423174645 20.652940442087 -8.3273981246225 A:T:C C T 10 0.5434984326865 0.0457433824653487 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17913925_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17913934_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17913935_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17913961_17915132:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17914707_17915132:ASAH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 36 45 81 16.434056423286 24.4574294708925 -8.0233730476065 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0753324170888754 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 24 31 55 10.956037615524 16.8484514132815 -5.8924137977575 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.135905839084540 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 19192332 G/T 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 T:G G T 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000104611:ENST00000265807:exon_19192197_19192368:SH2D4A;ENSG00000104611:ENST00000518040:exon_19192197_19192368:SH2D4A;ENSG00000104611:ENST00000519207:exon_19192197_19192368:SH2D4A;ENSG00000104611:ENST00000523736:exon_19192197_19192368:SH2D4A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 22105502 T/C 1 16 14 30 7.304025077016 7.608978057611 -0.304952980595 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000519237:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22105370_22105521:POLR3D HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 7 16 23 3.1955109711945 8.695974922984 -5.5004639517895 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0339486322544232 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 22900701 G/A 1 5 5 10 2.2825078365675 2.7174921634325 -0.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519910:exon_22900651_22900756:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22900417_22900756:TNFRSF10B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 26510792 T/C 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C T C 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000092964:ENST00000521913:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000311151:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000522745:exon_26510748_26510913:DPYSL2;ENSG00000092964:ENST00000523027:exon_26510748_26510913:DPYSL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 21 19 40 9.5865329135835 10.3264702210435 -0.73993730746 A:G G A 10 0.5434984326865 0.874437232004936 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 115 99 214 52.4976802410525 53.8063448359635 -1.308664594911 A:C A C 10 0.5434984326865 0.89090579146045 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 71 72 143 32.4116112792585 39.131887153428 -6.7202758741695 T:C T C 10 0.5434984326865 0.275534422072605 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 157 75 232 71.6707460682195 40.7623824514875 30.908363616732 A:T:G A G 10 0.5434984326865 4.05575506394687e-05 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 166 89 255 75.779260174041 48.3713605090985 27.4078996649425 A:G A G 10 0.5434984326865 0.000531938592742968 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 C:G G C 10 0.5434984326865 0.629584123396652 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 28304769 C/T 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 31024638 C/T 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 T:C C T 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 31024654 T/C 1 14 11 25 6.391021942389 5.9784827595515 0.4125391828375 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_31024538_31024746:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_31024538_31024746:WRN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 52746153 C/T 1 3 11 14 1.3695047019405 5.9784827595515 -4.608978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0154917950977014 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 52746173 T/G 0 8 0 8 3.652012538508 0 3.652012538508 T T 10 0.5434984326865 0.00949952012420876 ENSG00000168300:ENST00000360540:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519559:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000522514:exon_52746078_52746249:PCMTD1;ENSG00000168300:ENST00000519554:exon_52746078_52746249:PCMTD1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 59512334 G/A 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59512309_59512429:NSMAF HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 63948265 C/T 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63948215_63948329:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63948215_63948329:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63948215_63948329:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63948215_63948329:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63948215_63948329:GGH HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 6 13 19 2.739009403881 7.0654796249245 -4.3264702210435 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0634141897264214 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 19 15 34 8.6735297789565 8.1524764902975 0.521053288658999 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 39 34 73 17.8035611252265 18.478946711341 -0.675385586114498 A:G G A 10 0.5434984326865 0.90677876889664 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 5 8 13 2.2825078365675 4.347987461492 -2.0654796249245 T:C T C 10 0.5434984326865 0.276978941365881 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 68115346 G/A 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 A:G G A 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000522878:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000517743:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518789:exon_68115318_68115486:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518230:exon_68115318_68115486:ARFGEF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 71550058 G/C 1 11 14 25 5.0215172404485 7.608978057611 -2.5874608171625 C:G G C 10 0.5434984326865 0.321134709174457 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550050_71550138:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71549491_71550138:LACTB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 73951418 G/A 1 2 15 17 0.913003134627 8.1524764902975 -7.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000379010577761579 ENSG00000147601:ENST00000276603:exon_73951351_73951454:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000276602:exon_73951351_73951454:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000518961:exon_73951351_73951454:TERF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 82592967 G/A 1 6 9 15 2.739009403881 4.8914858941785 -2.1524764902975 A:G G A 10 0.5434984326865 0.306258513762735 ENSG00000133731:ENST00000256108:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000311489:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000449740:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000523942:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000518188:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000523710:exon_82592885_82593014:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000519964:exon_82592885_82593014:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000521360:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000521979:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000522997:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000518202:exon_82592885_82593018:IMPA1;ENSG00000133731:ENST00000519816:exon_82592885_82593018:IMPA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C T C 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 95751724 C/T 1 5 10 15 2.2825078365675 5.434984326865 -3.1524764902975 T:C C T 10 0.5434984326865 0.122736814788687 ENSG00000156162:ENST00000522422:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000520774:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000414645:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000342856:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000396156:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000396155:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000519353:exon_95751641_95751762:DPY19L4;ENSG00000156162:ENST00000519176:exon_95751641_95751762:DPY19L4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 32 34 66 14.608050154032 18.478946711341 -3.870896557309 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.387359060495051 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 99152322 A/C 1 12 4 16 5.478018807762 2.173993730746 3.304025077016 A:C A C 10 0.5434984326865 0.131696716739933 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152306_99152417:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152306_99152417:POP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 99170334 A/T 1 7 25 32 3.1955109711945 13.5874608171625 -10.391949845968 A:T:C A T 10 0.5434984326865 0.000255448805334275 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 99170350 G/T 1 8 24 32 3.652012538508 13.043962384476 -9.391949845968 T:G G T 10 0.5434984326865 0.00107552275108759 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 101196929 A/G 1 5 11 16 2.2825078365675 5.9784827595515 -3.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0791893749967246 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101196856_101196961:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101196856_101196961:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101196856_101196961:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101196856_101196961:SPAG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:C T C 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 26 13 39 11.869040750151 7.0654796249245 4.8035611252265 A:G G A 10 0.5434984326865 0.147957997187953 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 103851052 T/C 1 12 16 28 5.478018807762 8.695974922984 -3.217956115222 T:C T C 10 0.5434984326865 0.256861842582542 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000521536:exon_103850972_103851144:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000522311:exon_103850972_103851144:AZIN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 52 28 80 23.738081500302 15.217956115222 8.52012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0570975002939936 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 81 71 152 36.9766269523935 38.5883887207415 -1.611761768348 T:C C T 10 0.5434984326865 0.807423839782092 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 123963996 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 123964038 T/C 1 3 5 8 1.3695047019405 2.7174921634325 -1.347987461492 T:C T C 10 0.5434984326865 0.482104542013952 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 123966114 G/A 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 A:G G A 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 123966159 G/C 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 124440174 A/G 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 A:G A G 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000522194:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124440164_124440263:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124440164_124440263:WDYHV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 124448736 A/G 1 10 5 15 4.565015673135 2.7174921634325 1.8475235097025 A:G A G 10 0.5434984326865 0.440148981020626 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 12 5 17 5.478018807762 2.7174921634325 2.7605266443295 A:T T A 10 0.5434984326865 0.226256100708807 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 11 4 15 5.0215172404485 2.173993730746 2.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.195194257053515 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 C:G C G 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 38 31 69 17.347059557913 16.8484514132815 0.4986081446315 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 45 44 89 20.5425705291075 23.913931038206 -3.3713605090985 A:G G A 10 0.5434984326865 0.52350204311974 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 126448497 C/T 1 13 17 30 5.9345203750755 9.2394733556705 -3.304952980595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.272133535840955 ENSG00000173334:ENST00000311922:exon_126448248_126450647:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000520847:exon_126448248_126449170:TRIB1;ENSG00000173334:ENST00000519576:exon_126448248_126449433:TRIB1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 19 8 27 8.6735297789565 4.347987461492 4.3255423174645 A:G A G 10 0.5434984326865 0.121548457970906 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 141263015 G/A 1 4 5 9 1.826006269254 2.7174921634325 -0.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.740503731586123 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520532:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000518839:exon_141262876_141263028:TRAPPC9 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 142199229 G/A 1 22 13 35 10.043034480897 7.0654796249245 2.9775548559725 A:G G A 10 0.5434984326865 0.396639731916959 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142199085_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142199085_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142199085_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142199085_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142199085_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142199085_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142198448_142199245:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520571:exon_142198997_142199245:DENND3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144358381 G/A 1 7 13 20 3.1955109711945 7.0654796249245 -3.86996865373 A:G G A 10 0.5434984326865 0.114391897282171 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144392368 G/A 1 34 43 77 15.521053288659 23.3704326055195 -7.8493793168605 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0856839685943346 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144392238_144392673:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144392238_144392387:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144391892_144392387:TOP1MT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144403485 G/C 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 C:G G C 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144406705 C/T 1 12 18 30 5.478018807762 9.782971788357 -4.304952980595 T:C C T 10 0.5434984326865 0.142196443691064 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:C A C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144874957 G/A 1 22 30 52 10.043034480897 16.304952980595 -6.261918499698 A:G G A 10 0.5434984326865 0.094569923707074 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144874878_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144874655_144875037:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144874878_144875037:SCRIB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 7 3 10 3.1955109711945 1.6304952980595 1.565015673135 T:C C T 10 0.5434984326865 0.362188250027106 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 145662149 G/A 1 2 7 9 0.913003134627 3.8044890288055 -2.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.089437903944631 ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145662140_145662303:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000388808:exon_145662140_145662303:NFKBIL2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 145947776 G/A 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 A:G G A 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000198169:ENST00000292562:exon_145946514_145948767:ZNF251 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 5 9 14 2.2825078365675 4.8914858941785 -2.608978057611 A:C C A 10 0.5434984326865 0.186484502076330 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 2073292 A/G 1 5 12 17 2.2825078365675 6.521981192238 -4.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0502092065252103 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2073212_2073342:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2073212_2073342:SMARCA2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 73 77 150 33.3246144138855 41.8493793168605 -8.524764902975 A:T:G G A 10 0.5434984326865 0.164489158246177 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 2828765 C/G 1 52 56 108 23.738081500302 30.435912230444 -6.697830730142 C:G C G 10 0.5434984326865 0.209689181839903 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 64 63 127 29.216100308064 34.2404012592495 -5.0243009511855 A:G A G 10 0.5434984326865 0.37461645969077 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 5126343 G/A 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 A:G G A 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000096968:ENST00000381652:exon_5126333_5126446:JAK2;ENSG00000096968:ENST00000487310:exon_5125965_5126446:JAK2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 T:G T G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 6506038 C/T 1 20 6 26 9.13003134627 3.260990596119 5.869040750151 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0284472809996113 ENSG00000147854:ENST00000468435:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000276893:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000485617:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000492853:exon_6506033_6507054:UHRF2;ENSG00000147854:ENST00000481243:exon_6506033_6506112:UHRF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 A:G G A 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 7798600 G/C 1 256 215 471 116.864401232256 116.852163027597 0.0122382046585017 C:G G C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7796490_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000484082:exon_7798199_7798637:C9orf123;ENSG00000137038:ENST00000469050:exon_7798344_7798637:C9orf123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 7799606 C/A 1 71 37 108 32.4116112792585 20.1094420094005 12.302169269858 A:C C A 10 0.5434984326865 0.0200677343493155 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 60 56 116 27.39009403881 30.435912230444 -3.045818191634 T:G G T 10 0.5434984326865 0.577339129830146 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 15459821 A/C 1 28 15 43 12.782043884778 8.1524764902975 4.6295673944805 A:C A C 10 0.5434984326865 0.170529969602246 ENSG00000164975:ENST00000380821:exon_15459717_15464132:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000467062:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000380807:exon_15459717_15460311:SNAPC3;ENSG00000164975:ENST00000490969:exon_15459717_15460311:SNAPC3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 7 14 21 3.1955109711945 7.608978057611 -4.4134670864165 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0773597410972235 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 6 7 13 2.739009403881 3.8044890288055 -1.0654796249245 T:G T G 10 0.5434984326865 0.588193225068198 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 33026572 T/C 1 154 161 315 70.301241366279 87.5032476625265 -17.2020062962475 T:C T C 10 0.5434984326865 0.0544544597929261 ENSG00000086061:ENST00000330899:exon_33026473_33026614:DNAJA1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C C T 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 35089403 G/A 1 9 7 16 4.1085141058215 3.8044890288055 0.304025077016 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000165282:ENST00000298004:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35088690_35090281:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000361778:exon_35089377_35089447:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000491687:exon_35089377_35089447:PIGO HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 35606884 G/A 1 7 4 11 3.1955109711945 2.173993730746 1.0215172404485 A:G G A 10 0.5434984326865 0.763928740866143 ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35606834_35606980:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35606834_35606980:TESK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 4 13 17 1.826006269254 7.0654796249245 -5.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 0.0134795423156013 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 35662251 T/C 1 18 8 26 8.217028211643 4.347987461492 3.869040750151 T:C T C 10 0.5434984326865 0.167672891645184 ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35662176_35662264:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000490970:exon_35662176_35662264:C9orf100 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 35752124 G/A 1 3 6 9 1.3695047019405 3.260990596119 -1.8914858941785 A:G G A 10 0.5434984326865 0.316578423200498 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35751953_35752142:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000496906:exon_35751953_35752142:RGP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 29 16 45 13.2385454520915 8.695974922984 4.5425705291075 T:G G T 10 0.5434984326865 0.181787142597915 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 29 24 53 13.2385454520915 13.043962384476 0.1945830676155 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 55 41 96 25.1075862022425 22.2834357401465 2.824150462096 T:C T C 10 0.5434984326865 0.609046971778314 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 78 55 133 35.607122250453 29.8924137977575 5.7147084526955 A:G G A 10 0.5434984326865 0.339085281780954 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 0 20 0 20 9.13003134627 0 9.13003134627 G G 10 0.5434984326865 8.89048746510572e-06 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 9 18 27 4.1085141058215 9.782971788357 -5.6744576825355 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0332201062262774 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 38396065 G/T 1 7 9 16 3.1955109711945 4.8914858941785 -1.695974922984 T:G G T 10 0.5434984326865 0.456637665017715 ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 T:C C T 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 77761642 T/C 1 34 40 74 15.521053288659 21.73993730746 -6.218884018801 T:C T C 10 0.5434984326865 0.161768478182958 ENSG00000134996:ENST00000346234:exon_77761599_77762181:OSTF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 5 7 12 2.2825078365675 3.8044890288055 -1.521981192238 A:G A G 10 0.5434984326865 0.400849044596308 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 41 34 75 18.7165642598535 18.478946711341 0.2376175485125 A:C C A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 19 21 40 8.6735297789565 11.4134670864165 -2.73993730746 A:C C A 10 0.5434984326865 0.428966278029421 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 14 1 15 6.391021942389 0.5434984326865 5.8475235097025 T:C C T 10 0.5434984326865 0.00275698996606679 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 90322023 G/A 1 31 6 37 14.1515485867185 3.260990596119 10.8905579905995 A:G G A 10 0.5434984326865 0.000214966753233651 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 93641151 T/C 1 22 11 33 10.043034480897 5.9784827595515 4.0645517213455 T:C T C 10 0.5434984326865 0.166352696733609 ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93641046_93641235:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93641046_93641235:SYK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 97220740 C/T 1 8 10 18 3.652012538508 5.434984326865 -1.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.480480949921762 ENSG00000148110:ENST00000375344:exon_97220604_97220746:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000277183:exon_97220604_97220746:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000428393:exon_97220604_97220746:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000447692:exon_97220663_97220746:HIATL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 97221463 G/A 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000148110:ENST00000375344:exon_97221443_97223324:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000277183:exon_97221443_97223324:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000428393:exon_97221443_97223201:HIATL1;ENSG00000148110:ENST00000447692:exon_97221442_97221525:HIATL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 99521123 T/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99518147_99522759:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99520366_99522759:ZNF510 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 99581811 C/T 1 3 7 10 1.3695047019405 3.8044890288055 -2.434984326865 T:C C T 10 0.5434984326865 0.202270696540265 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 99581916 C/G 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 C:G C G 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 T:C C T 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 103054951 T/C 0 8 0 8 3.652012538508 0 3.652012538508 T T 10 0.5434984326865 0.00949952012420876 ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 104302625 A/G 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 A:G A G 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000155827:ENST00000389120:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000478347:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000488264:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000374819:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000479306:exon_104302485_104302652:RNF20;ENSG00000155827:ENST00000466817:exon_104302485_104302652:RNF20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 32 24 56 14.608050154032 13.043962384476 1.564087769556 A:G G A 10 0.5434984326865 0.690135138705309 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 110084328 C/T 1 25 24 49 11.4125391828375 13.043962384476 -1.6314232016385 T:C C T 10 0.5434984326865 0.6688391572748 ENSG00000119318:ENST00000416373:exon_110084264_110084399:RAD23B;ENSG00000119318:ENST00000358015:exon_110084264_110084399:RAD23B HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 111641806 G/A 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 A:G G A 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 111653574 C/G 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111653483_111653684:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111653483_111653684:IKBKAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 111659483 T/G 1 5 6 11 2.2825078365675 3.260990596119 -0.9784827595515 T:G T G 10 0.5434984326865 0.563171552895014 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111659428_111659565:IKBKAP HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 111727670 C/G 1 44 45 89 20.086068961794 24.4574294708925 -4.3713605090985 C:G C G 10 0.5434984326865 0.394854724142028 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111727658_111727808:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111727658_111727808:CTNNAL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 111755008 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111754912_111755099:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374593:exon_111754912_111755099:CTNNAL1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 112900785 A/G 1 2 8 10 0.913003134627 4.347987461492 -3.434984326865 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0512806456181059 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 6 4 10 2.739009403881 2.173993730746 0.565015673135 T:C T C 10 0.5434984326865 0.76307909351412 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 114190337 G/A 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114190322_114190441:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114190322_114190441:KIAA0368 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G A G 10 0.5434984326865 0.804428035014948 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 13 35 48 5.9345203750755 19.0224451440275 -13.087924768952 A:G A G 10 0.5434984326865 0.000209724049443419 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 27 13 40 12.3255423174645 7.0654796249245 5.26006269254 A:G G A 10 0.5434984326865 0.112426073233386 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 116122954 A/G 1 4 4 8 1.826006269254 2.173993730746 -0.347987461492 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000119411:ENST00000374183:exon_116122787_116123017:BSPRY;ENSG00000119411:ENST00000462085:exon_116122787_116123017:BSPRY HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 20 25 45 9.13003134627 13.5874608171625 -4.4574294708925 T:C C T 10 0.5434984326865 0.23088520002328 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 25 20 45 11.4125391828375 10.86996865373 0.5425705291075 C:G C G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 89 86 175 40.6286394909015 46.740865211039 -6.1122257201375 A:G A G 10 0.5434984326865 0.363256116270473 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 99 97 196 45.1936551640365 52.7193479705905 -7.525692806554 A:G G A 10 0.5434984326865 0.283099490967941 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 124083614 C/T 1 19 17 36 8.6735297789565 9.2394733556705 -0.565943576714 T:C C T 10 0.5434984326865 0.868528013180574 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124083546_124083679:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373807:exon_124083546_124083679:GSN HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 70 70 140 31.955109711945 38.044890288055 -6.08978057611 T:C C T 10 0.5434984326865 0.309650533738857 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 4 7 11 1.826006269254 3.8044890288055 -1.9784827595515 A:G G A 10 0.5434984326865 0.245379774745917 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 104 85 189 47.476163000604 46.1973667783525 1.2787962222515 A:G A G 10 0.5434984326865 0.88403014777729 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 110 134 244 50.215172404485 72.828789979991 -22.613617575506 A:G A G 10 0.5434984326865 0.00380354704482397 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 35 38 73 15.9775548559725 20.652940442087 -4.6753855861145 A:G G A 10 0.5434984326865 0.291434467181874 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 15 10 25 6.8475235097025 5.434984326865 1.4125391828375 A:G A G 10 0.5434984326865 0.689279097352172 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 130494493 C/T 1 7 11 18 3.1955109711945 5.9784827595515 -2.782971788357 T:C C T 10 0.5434984326865 0.237932269196535 ENSG00000160404:ENST00000336067:exon_130493803_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373284:exon_130493803_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000373281:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463577:exon_130493804_130495839:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000472723:exon_130493806_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000463256:exon_130494059_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000496460:exon_130494123_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000494135:exon_130494191_130494557:TOR2A;ENSG00000160404:ENST00000493439:exon_130494448_130494970:TOR2A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 130575585 C/T 1 34 35 69 15.521053288659 19.0224451440275 -3.5013918553685 T:C C T 10 0.5434984326865 0.400719771292162 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130575474_130576343:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130575474_130575703:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130575474_130576337:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130575474_130576338:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000467826:exon_130575474_130575602:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475270:exon_130575474_130575853:FPGS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 12 7 19 5.478018807762 3.8044890288055 1.6735297789565 T:G G T 10 0.5434984326865 0.496659638628799 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 51 66 117 23.2815799329885 35.870896557309 -12.5893166243205 C:G G C 10 0.5434984326865 0.0203698389350731 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 130698845 C/T 1 50 44 94 22.825078365675 23.913931038206 -1.088852672531 T:C C T 10 0.5434984326865 0.836556100339215 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130698832_130699802:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000373110:exon_130698313_130698934:DPM2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 9 14 23 4.1085141058215 7.608978057611 -3.5004639517895 A:G G A 10 0.5434984326865 0.149533600784392 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 8 5 13 3.652012538508 2.7174921634325 0.9345203750755 C:G G C 10 0.5434984326865 0.782450047221824 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 19 31 50 8.6735297789565 16.8484514132815 -8.174921634325 A:C A C 10 0.5434984326865 0.022858792460078 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 10 8 18 4.565015673135 4.347987461492 0.217028211643 T:C C T 10 0.5434984326865 1 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 132395015 A/G 1 39 42 81 17.8035611252265 22.826934172833 -5.0233730476065 A:G A G 10 0.5434984326865 0.266984835518601 ENSG00000148335:ENST00000372486:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372483:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000481189:exon_132394929_132395080:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000459968:exon_132394929_132395607:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372481:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000372480:exon_132394929_132395144:METTL11A;ENSG00000148335:ENST00000486391:exon_132394929_132395080:METTL11A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 6 8 14 2.739009403881 4.347987461492 -1.608978057611 A:G G A 10 0.5434984326865 0.430226731556452 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 9 2 11 4.1085141058215 1.086996865373 3.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0764598280465125 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 132638496 C/T 1 8 3 11 3.652012538508 1.6304952980595 2.0215172404485 T:C C T 10 0.5434984326865 0.364887816804759 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 134371165 C/T 1 10 7 17 4.565015673135 3.8044890288055 0.7605266443295 T:C C T 10 0.5434984326865 0.810282319356203 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134371127_134375558:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134371127_134371710:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000320547:exon_134371127_134375584:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000465931:exon_134371127_134375584:BAT2L1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 134387488 T/C 1 6 2 8 2.739009403881 1.086996865373 1.652012538508 T:C T C 10 0.5434984326865 0.303869012868413 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135139826 T/C 1 33 17 50 15.0645517213455 9.2394733556705 5.825078365675 T:C T C 10 0.5434984326865 0.117987609544689 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135139901 T/C 1 30 16 46 13.695047019405 8.695974922984 4.999072096421 T:C T C 10 0.5434984326865 0.182225797075041 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135147182 C/T 1 18 17 35 8.217028211643 9.2394733556705 -1.0224451440275 T:C C T 10 0.5434984326865 0.737611853756657 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135147097_135147195:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135147097_135147195:SETX HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135470176 C/G 1 12 13 25 5.478018807762 7.0654796249245 -1.5874608171625 C:G C G 10 0.5434984326865 0.55226028315819 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135470414 T/C 1 19 13 32 8.6735297789565 7.0654796249245 1.608050154032 T:C T C 10 0.5434984326865 0.599419255187098 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 9 10 19 4.1085141058215 5.434984326865 -1.3264702210435 A:G G A 10 0.5434984326865 0.646896308716277 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 20 26 46 9.13003134627 14.130959249849 -5.000927903579 C:G G C 10 0.5434984326865 0.142110014204701 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 136216882 G/A 1 1958 2095 4053 893.830068799833 1138.62921647822 -244.799147678385 A:T:C:G G A 10 0.5434984326865 1.49453961289725e-14 ENSG00000148303:ENST00000323345:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000496554:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000463740:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000426651:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000468019:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000485706:exon_136216767_136217238:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000315731:exon_136216856_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000489392:exon_136216767_136216907:RPL7A;ENSG00000148303:ENST00000412126:exon_136216856_136216907:RPL7A HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 136219594 G/A 1 95 71 166 43.3676488947825 38.5883887207415 4.779260174041 A:G G A 10 0.5434984326865 0.483638851821898 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219549_136219621:SURF1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 136223537 C/T 1 27 17 44 12.3255423174645 9.2394733556705 3.086068961794 T:C C T 10 0.5434984326865 0.368378688005584 ENSG00000148290:ENST00000463965:exon_136223276_136223552:SURF1;ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136223428_136223546:SURF2;ENSG00000148291:ENST00000495524:exon_136223454_136223546:SURF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 136228006 G/A 1 59 59 118 26.9335924714965 32.0664075285035 -5.132815057007 A:G G A 10 0.5434984326865 0.356411488739511 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227932_136228045:SURF2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 136277482 T/C 1 14 8 22 6.391021942389 4.347987461492 2.043034480897 T:C T C 10 0.5434984326865 0.40272054551298 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 10 18 28 4.565015673135 9.782971788357 -5.217956115222 T:C C T 10 0.5434984326865 0.0573689366969762 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 137005023 C/T 1 6 3 9 2.739009403881 1.6304952980595 1.1085141058215 T:C C T 10 0.5434984326865 0.522544587421912 ENSG00000196363:ENST00000358625:exon_137004942_137005080:WDR5;ENSG00000196363:ENST00000425041:exon_137004914_137005080:WDR5 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 138839708 C/T 1 15 14 29 6.8475235097025 7.608978057611 -0.7614545479085 T:C C T 10 0.5434984326865 0.852917435093243 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138839644_138839751:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138839644_138839890:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138839362_138839751:UBAC1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 31 25 56 14.1515485867185 13.5874608171625 0.564087769556 A:G A G 10 0.5434984326865 0.89430909571207 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 9 6 15 4.1085141058215 3.260990596119 0.8475235097025 T:C T C 10 0.5434984326865 0.797590528899377 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 6 5 11 2.739009403881 2.7174921634325 0.0215172404485 A:C A C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 5 3 8 2.2825078365675 1.6304952980595 0.652012538508 C:G G C 10 0.5434984326865 0.734746993012173 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 24 20 44 10.956037615524 10.86996865373 0.086068961794 A:G A G 10 0.5434984326865 1 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 53 49 102 24.1945830676155 26.6314232016385 -2.436840134023 T:C C T 10 0.5434984326865 0.69115014442746 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 8 9 17 3.652012538508 4.8914858941785 -1.2394733556705 A:G A G 10 0.5434984326865 0.629584123396652 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 139621168 G/A 1 8 8 16 3.652012538508 4.347987461492 -0.695974922984 A:G G A 10 0.5434984326865 0.804428035014948 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140002989 T/C 1 40 23 63 18.26006269254 12.5004639517895 5.7595987407505 T:C T C 10 0.5434984326865 0.164531465054791 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140002995 C/T 1 39 22 61 17.8035611252265 11.956965519103 5.8465956061235 T:C C T 10 0.5434984326865 0.157236148415594 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140002840_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001983_140003635:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140002840_140003633:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000475449:exon_140002983_140003529:MAN1B1 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 199 125 324 90.8438118953865 67.9373040858125 22.906507809574 C:G C G 10 0.5434984326865 0.0119721079065070 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140008750 G/C 1 27 13 40 12.3255423174645 7.0654796249245 5.26006269254 C:G G C 10 0.5434984326865 0.112426073233386 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008695_140008830:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008695_140008834:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140008934 A/G 1 11 5 16 5.0215172404485 2.7174921634325 2.304025077016 A:G A G 10 0.5434984326865 0.31866452342011 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140008915_140009165:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140008915_140008944:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000472306:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000485456:exon_140008915_140009170:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000478597:exon_140008915_140009178:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000497375:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473703:exon_140008915_140009028:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000491807:exon_140008695_140009028:DPP7 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 8 14 22 3.652012538508 7.608978057611 -3.956965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.132270151688259 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . 9 140267490 G/A 1 9 8 17 4.1085141058215 4.347987461492 -0.2394733556705 A:G G A 10 0.5434984326865 1 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 8 6 14 3.652012538508 3.260990596119 0.391021942389 T:C T C 10 0.5434984326865 1 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 11 15 26 5.0215172404485 8.1524764902975 -3.130959249849 A:G A G 10 0.5434984326865 0.241256155605839 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 1508324 G/A 1 912 920 1832 416.329429389912 500.01855807158 -83.689128681668 A:C:G G A 10 0.5434984326865 8.92527874669367e-05 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000447786:exon_1508256_1508620:SLC25A6 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 34 42 76 15.521053288659 22.826934172833 -7.305880884174 T:C C T 10 0.5434984326865 0.106655478181661 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 9 13 22 4.1085141058215 7.0654796249245 -2.956965519103 T:C C T 10 0.5434984326865 0.284374964852705 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 2161129 C/G 1 12 5 17 5.478018807762 2.7174921634325 2.7605266443295 C:G C G 10 0.5434984326865 0.226256100708807 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000412516:exon_2161103_2161271:DHRSX HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 85 101 186 38.8026332216475 54.8933417013365 -16.090708479689 T:C:G C T 10 0.5434984326865 0.0185194936614344 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 2656261 A/G 1 228 149 377 104.082357347478 80.9812664702885 23.1010908771895 A:G A G 10 0.5434984326865 0.0173611180813374 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 2656283 A/T 1 298 182 480 136.037467059423 98.916714748943 37.12075231048 A:T A T 10 0.5434984326865 0.000684222584335103 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2656241_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381177:exon_2655922_2656297:CD99;ENSG00000002586:ENST00000417575:exon_2656071_2656297:CD99 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 48887139 C/A 0 47 0 47 21.4555736637345 0 21.4555736637345 C C 10 0.5434984326865 5.15026441666376e-13 ENSG00000068323:ENST00000315869:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000493583:exon_48886242_48888112:TFE3;ENSG00000068323:ENST00000478476:exon_48886242_48888112:TFE3 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 54837340 C/T 0 79 0 79 36.0636238177665 0 36.0636238177665 C C 10 0.5434984326865 1.37611747463026e-21 ENSG00000102316:ENST00000375068:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000343474:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375053:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000347546:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000463787:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000218439:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000375058:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000396224:exon_54837254_54837562:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000497484:exon_54837254_54837563:MAGED2;ENSG00000102316:ENST00000453210:exon_54837254_54837562:MAGED2 HGDP00964_parsed_pileup.txt . X 129283520 A/G 0 0 60 60 0 32.60990596119 -32.60990596119 C:G A G 10 0.5434984326865 3.68583913183945e-21 ENSG00000156709:ENST00000416073:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000527892:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000319908:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000287295:exon_129283444_129283543:AIFM1;ENSG00000156709:ENST00000529877:exon_129283444_129283543:AIFM1