INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 881627 G/A 1 56 54 110 25.8924518940082 29.0322785307778 -3.13982663676956 A:G G A 10 0.537634787606996 0.567114030587206 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 900505 G/C 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 C:G G C 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 1047 958 2005 484.096377375475 515.054126527502 -30.957749152027 A:G G A 10 0.537634787606996 0.171868355315659 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1139565 G/A 1 23 22 45 10.6343998850391 11.8279653273539 -1.19356544231482 A:G G A 10 0.537634787606996 0.766063528656386 ENSG00000186891:ENST00000379268:exon_1139414_1139616:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000486728:exon_1139414_1139616:TNFRSF18;ENSG00000186891:ENST00000379265:exon_1139435_1139616:TNFRSF18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 18 17 35 8.32257382307407 9.13979138931893 -0.81721756624486 T:C C T 10 0.537634787606996 0.865865428364802 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1246018 C/G 1 22 14 36 10.1720346726461 7.52688702649794 2.64514764614814 C:G C G 10 0.537634787606996 0.407498697034498 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1246014_1246068:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1246014_1246068:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1246014_1246068:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1245416_1246451:PUSL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 43 39 82 19.8817041328992 20.9677567166728 -1.08605258377368 C:G C G 10 0.537634787606996 0.82546956624635 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 19 14 33 8.78493903546708 7.52688702649794 1.25805200896913 T:C C T 10 0.537634787606996 0.728787781432511 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1263144 G/A 1 20 10 30 9.24730424786008 5.37634787606996 3.87095637179012 A:G G A 10 0.537634787606996 0.199814517026426 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1271750 C/T 1 9 2 11 4.16128691153704 1.07526957521399 3.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0736764045328896 ENSG00000107404:ENST00000378891:exon_1270656_1271895:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000378888:exon_1270656_1271895:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000345100:exon_1270659_1271895:DVL1;ENSG00000107404:ENST00000263743:exon_1270659_1271895:DVL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 105 98 203 48.5483473012654 52.6882091854856 -4.1398618842202 A:G A G 10 0.537634787606996 0.57388370329304 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1562536 G/A 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562217_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562454_1562587:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562454_1562587:MIB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 36 11 47 16.6451476461481 5.91398266367696 10.7311649824712 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00182714772122066 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 18 10 28 8.32257382307407 5.37634787606996 2.94622594700411 A:C C A 10 0.537634787606996 0.343738653564769 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 1686040 G/T 1 23 31 54 10.6343998850391 16.6666784158169 -6.03227853077778 T:G G T 10 0.537634787606996 0.103344976581994 ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685983_1686305:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000489538:exon_1685983_1686137:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497615:exon_1685983_1686335:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497186:exon_1685983_1686137:NADK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 19 19 38 8.78493903546708 10.2150609645329 -1.43012192906585 T:C C T 10 0.537634787606996 0.74540897070384 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 2340200 T/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2339891_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2339895_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000508384:exon_2339969_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000515760:exon_2340022_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000502666:exon_2340043_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000504111:exon_2340074_2340297:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000514502:exon_2340194_2340297:PEX10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 T:C T C 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 3659742 C/T 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C C T 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 3703710 G/A 1 28 35 63 12.9462259470041 18.8172175662449 -5.87099161924075 A:G G A 10 0.537634787606996 0.164233885965791 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3703413_3703874:LRRC47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 3745924 G/A 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3745830_3745937:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000461667:exon_3745830_3745937:KIAA0562 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 30 30 60 13.8709563717901 16.1290436282099 -2.25808725641976 A:G A G 10 0.537634787606996 0.605433743282452 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 6693097 A/G 1 26 32 58 12.0214955222181 17.2043132034239 -5.18281768120577 A:G A G 10 0.537634787606996 0.188819218208868 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 6694574 G/A 1 39 37 76 18.0322432833272 19.8924871414589 -1.8602438581317 A:G G A 10 0.537634787606996 0.730339290076157 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 7909737 C/T 0 0 43 43 0 23.1182958671008 -23.1182958671008 T C T 10 0.537634787606996 3.92971897888255e-15 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000400910:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000361696:exon_7909700_7909743:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7909700_7909743:UTS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 7913430 G/A 0 71 0 71 32.8279300799033 0 32.8279300799033 G G 10 0.537634787606996 7.885110504441e-20 ENSG00000049247:ENST00000377516:exon_7913367_7913572:UTS2;ENSG00000049247:ENST00000054668:exon_7913367_7913491:UTS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 10460485 T/C 1 52 47 99 24.0429910444362 25.2688350175288 -1.2258439730926 T:C T C 10 0.537634787606996 0.840549867138501 ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10460433_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10460450_10460629:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10460450_10460629:PGD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 10473196 C/T 1 113 74 187 52.2472690004095 39.7849742829177 12.4622947174918 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0781200774792781 ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 10596341 C/T 1 19 19 38 8.78493903546708 10.2150609645329 -1.43012192906585 T:C C T 10 0.537634787606996 0.74540897070384 ENSG00000142655:ENST00000472851:exon_10596270_10596629:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000356607:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000491661:exon_10596270_10596354:PEX14;ENSG00000142655:ENST00000492696:exon_10596270_10596346:PEX14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 10713765 T/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000130940:ENST00000377022:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000344008:exon_10713434_10714275:CASZ1;ENSG00000130940:ENST00000496432:exon_10713041_10714275:CASZ1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 514 489 1003 237.655719170004 262.903411139821 -25.247691969817 T:C:G G T 10 0.537634787606996 0.113359050770344 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 73 47 120 33.7526605046893 25.2688350175288 8.48382548716048 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.142668666893392 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 11137661 A/G 1 32 34 66 14.7956867965761 18.2795827786379 -3.48389598206174 A:G A G 10 0.537634787606996 0.391100005266469 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11136899_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000470611:exon_11137658_11137708:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000498576:exon_11137658_11137708:EXOSC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 11150682 C/T 1 16 16 32 7.39784339828806 8.60215660171194 -1.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.724633964891837 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11150611_11150725:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11150611_11150725:EXOSC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 11159823 T/C 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11159778_11159938:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11159778_11159926:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11159778_11159911:EXOSC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 12009956 G/A 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 A:G G A 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 12010469 G/T 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12010414_12010565:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12010414_12010577:PLOD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 12024235 C/T 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 T:C C T 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12024232_12024357:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12024232_12024357:PLOD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 12082334 A/T 1 29 38 67 13.4085911593971 20.4301219290658 -7.02153076966873 A:T A T 10 0.537634787606996 0.0876928218427186 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12082152_12082499:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12082279_12082499:MIIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 12090001 T/C 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 25 25 50 11.5591303098251 13.4408696901749 -1.8817393803498 A:G G A 10 0.537634787606996 0.671003231617984 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 14107932 C/T 1 6 13 19 2.77419127435802 6.98925223889095 -4.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0652151303023661 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 26 26 52 12.0214955222181 13.9785044777819 -1.95700895556379 A:G A G 10 0.537634787606996 0.676932569451128 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 16259813 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 16262404 C/T 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 7 13 20 3.23655648675103 6.98925223889095 -3.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.116362777464643 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 16577794 C/T 1 22 33 55 10.1720346726461 17.7419479910309 -7.56991331838478 T:C C T 10 0.537634787606996 0.043033743075266 ENSG00000037637:ENST00000375592:exon_16573334_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000456164:exon_16577577_16578280:FBXO42;ENSG00000037637:ENST00000444116:exon_16577577_16578280:FBXO42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 42 28 70 19.4193389205062 15.0537740529959 4.36556486751028 T:C C T 10 0.537634787606996 0.338008034745731 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17313343 G/A 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 A:G G A 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17313654 C/T 1 9 16 25 4.16128691153704 8.60215660171194 -4.4408696901749 T:C C T 10 0.537634787606996 0.106777127582249 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17313541_17313764:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313541_17313764:ATP13A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17314702 C/T 1 12 18 30 5.54838254871605 9.67742617692593 -4.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.145192067224671 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17314942 G/A 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 A:G G A 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314817_17314969:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314817_17314969:ATP13A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17319011 G/A 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 28 19 47 12.9462259470041 10.2150609645329 2.73116498247119 A:G G A 10 0.537634787606996 0.466613252234892 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 16 25 41 7.39784339828806 13.4408696901749 -6.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0615733919934969 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 23399824 T/C 1 19 16 35 8.78493903546708 8.60215660171194 0.18278243375514 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000004487:ENST00000356634:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000400181:exon_23399785_23399896:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000465864:exon_23399767_23399896:KDM1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 23885493 C/T 1 83 54 137 38.3763126286193 29.0322785307778 9.34403409784155 T:C C T 10 0.537634787606996 0.122847386372236 ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885426_23885510:ID3;ENSG00000117318:ENST00000463312:exon_23885426_23885566:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23884936_23885510:ID3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 53 46 99 24.5053562568292 24.7312002299218 -0.225843973092605 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 24134721 T/C 1 45 46 91 20.8064345576852 24.7312002299218 -3.92476567223664 A:T:C T C 10 0.537634787606996 0.462003101138278 ENSG00000117305:ENST00000374490:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000436439:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374487:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000235958:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000496907:exon_24134625_24134813:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374483:exon_24134625_24134813:HMGCL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 26 20 46 12.0214955222181 10.7526957521399 1.26879977007818 T:C T C 10 0.537634787606996 0.7685172829493 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 24201162 G/A 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 26610891 A/C 1 16 21 37 7.39784339828806 11.2903305397469 -3.89248714145885 A:C A C 10 0.537634787606996 0.2483115445304 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 26612412 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374215:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000452980:exon_26612367_26612528:UBXN11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 2194 2028 4222 1014.42927599025 1090.32334926699 -75.8940732767371 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.0197692625492931 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 2219 2047 4266 1025.98840630008 1100.53841023152 -74.550003931445 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.0221549951176396 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 27206235 A/C 1 51 33 84 23.5806258320432 17.7419479910309 5.83867784101233 A:C A C 10 0.537634787606996 0.228890171370536 ENSG00000142751:ENST00000374135:exon_27205773_27206240:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374133:exon_27205867_27206240:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000374131:exon_27205873_27206240:GPN2;ENSG00000142751:ENST00000477418:exon_27205992_27206240:GPN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 63 23 86 29.1290083807593 12.3656001149609 16.7634082657983 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000305328036280987 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 66 19 85 30.5161040179383 10.2150609645329 20.3010430534053 T:C T C 10 0.537634787606996 6.04766305940137e-06 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 28209366 A/G 1 66 18 84 30.5161040179383 9.67742617692593 20.8386778410123 A:G A G 10 0.537634787606996 2.92539002945949e-06 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 288 251 539 133.161181169185 134.946331689356 -1.78515052017084 T:C T C 10 0.537634787606996 0.89692066923655 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 31426815 A/G 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:G A G 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000498419:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31426561_31426828:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31426561_31426828:PUM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 33502376 G/A 0 61 0 61 28.2042779559732 0 28.2042779559732 G G 10 0.537634787606996 4.56175978826381e-17 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33502337_33502471:AK2;ENSG00000004455:ENST00000467905:exon_33502337_33502487:AK2;ENSG00000004455:ENST00000354858:exon_33502337_33502593:AK2;ENSG00000004455:ENST00000480134:exon_33502337_33502478:AK2;ENSG00000004455:ENST00000398192:exon_33502337_33502467:AK2;ENSG00000004455:ENST00000487289:exon_33502337_33502445:AK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 33 18 51 15.2580520089691 9.67742617692593 5.5806258320432 A:G A G 10 0.537634787606996 0.124268748846173 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 10 21 31 4.62365212393004 11.2903305397469 -6.66667841581688 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0187644049050323 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 38 47 85 17.5698780709342 25.2688350175288 -7.69895694659466 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.102909554467311 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 48 58 106 22.1935301948642 31.1828176812058 -8.98928748634158 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0972769004522365 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 37 34 71 17.1075128585411 18.2795827786379 -1.17206992009671 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.812497513249578 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 40310260 C/T 1 5 11 16 2.31182606196502 5.91398266367696 -3.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0820611100594456 ENSG00000043514:ENST00000046894:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372825:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000441669:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000316891:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000372818:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000495175:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000491865:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000465417:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000492612:exon_40310203_40310312:TRIT1;ENSG00000043514:ENST00000486825:exon_40310210_40310312:TRIT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 14 15 29 6.47311297350206 8.06452181410494 -1.59140884060288 A:T A T 10 0.537634787606996 0.580786129565456 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 40773149 T/C 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 T:C T C 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40773118_40773171:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40773118_40773171:COL9A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 41204569 C/T 1 13 5 18 6.01074776110905 2.68817393803498 3.32257382307407 T:C C T 10 0.537634787606996 0.155898486841443 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 12 8 20 5.54838254871605 4.30107830085597 1.24730424786008 A:G A G 10 0.537634787606996 0.657566913300005 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 18 13 31 8.32257382307407 6.98925223889095 1.33332158418312 T:C T C 10 0.537634787606996 0.720027331176985 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 43213103 A/C 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:C A C 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000117385:ENST00000472802:exon_43212924_43213247:LEPRE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 43215930 C/T 1 11 17 28 5.08601733632304 9.13979138931893 -4.05377405299589 T:C C T 10 0.537634787606996 0.133275989284545 ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 43395635 C/T 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43395544_43395706:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43395544_43395646:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43395544_43395706:SLC2A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45205598 T/C 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000142945:ENST00000452259:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45205490_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45205492_45205674:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000493027:exon_45205497_45205674:KIF2C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45218895 A/T 1 22 22 44 10.1720346726461 11.8279653273539 -1.65593065470782 A:T A T 10 0.537634787606996 0.652045375196476 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45224998 A/C 1 43 36 79 19.8817041328992 19.3548523538519 0.526851779047313 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45224878_45225020:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45224878_45225020:KIF2C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45226084 G/A 1 45 42 87 20.8064345576852 22.5806610794938 -1.77422652180865 A:G G A 10 0.537634787606996 0.74744564080563 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45225952_45226156:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45225952_45226156:KIF2C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45269333 A/G 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 A:G A G 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45269272_45269363:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45269272_45269696:PLK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45270024 G/C 1 15 16 31 6.93547818589506 8.60215660171194 -1.66667841581688 C:G G C 10 0.537634787606996 0.591800204585549 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 14 16 30 6.47311297350206 8.60215660171194 -2.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.467935176210095 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 26 22 48 12.0214955222181 11.8279653273539 0.193530194864191 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 19 17 36 8.78493903546708 9.13979138931893 -0.354852353851856 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 51 47 98 23.5806258320432 25.2688350175288 -1.68820918548561 A:G A G 10 0.537634787606996 0.76173198483361 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 25 24 49 11.5591303098251 12.9032349025679 -1.3441045927428 C:G C G 10 0.537634787606996 0.774944644411224 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45808589 G/C 1 34 13 47 15.7204172213621 6.98925223889095 8.73116498247119 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0122418970816171 ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808515_45808674:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000471337:exon_45808407_45808650:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808407_45808674:TOE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 45973928 G/A 1 2 9 11 0.924730424786008 4.83871308846296 -3.91398266367696 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0295478960306494 ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 133 104 237 61.4945732482695 55.9140179111276 5.58055533714194 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.474479339748653 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 157 101 258 72.5913383457016 54.3011135483066 18.290224797395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0244469198224733 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 65 40 105 30.0537388055453 21.5053915042798 8.54834730126542 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0970093434673112 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 67 76 143 30.9784692303313 40.8602438581317 -9.88177462780043 T:C T C 10 0.537634787606996 0.110811356754730 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46159018 A/G 1 77 59 136 35.6021213542613 31.7204524688128 3.88166888544854 A:G A G 10 0.537634787606996 0.547494622957204 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46195375 T/C 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C T C 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000197429:ENST00000359942:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396478:exon_46195286_46195441:IPP;ENSG00000197429:ENST00000396474:exon_46195286_46195441:IPP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46496709 A/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G A G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46496679_46496962:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000432341:exon_46496679_46496709:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46496679_46496962:MAST2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 A:G A G 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 46810530 A/G 1 20 13 33 9.24730424786008 6.98925223889095 2.25805200896913 A:G A G 10 0.537634787606996 0.48755118744603 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 47717189 A/G 1 5 10 15 2.31182606196502 5.37634787606996 -3.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.126573460617385 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 52991638 C/T 1 5 17 22 2.31182606196502 9.13979138931893 -6.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00445110600401729 ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 37 34 71 17.1075128585411 18.2795827786379 -1.17206992009671 A:G G A 10 0.537634787606996 0.812497513249578 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:G G A 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 53732315 G/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:G G T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53732145_53732319:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53732145_53734270:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000475501:exon_53732145_53732319:LRP8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 126 130 256 58.2580167615185 69.8925223889095 -11.634505627391 C:G G C 10 0.537634787606996 0.149672252029432 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 367 314 681 169.688032948232 168.817323308597 0.87070963963572 A:T:C:G C G 10 0.537634787606996 0.969351746653463 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 55224131 T/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000162396:ENST00000371279:exon_55222571_55224863:PARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 55337260 G/A 1 10 18 28 4.62365212393004 9.67742617692593 -5.05377405299589 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0598522173708974 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55337023_55337286:DHCR24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 A:G G A 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 8 18 26 3.69892169914403 9.67742617692593 -5.9785044777819 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0284916473984284 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 59002282 A/C 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 59004617 G/A 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000453710:exon_59004467_59004982:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000482274:exon_59004467_59004982:OMA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 19 17 36 8.78493903546708 9.13979138931893 -0.354852353851856 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 64114301 T/C 1 27 32 59 12.4838607346111 17.2043132034239 -4.72045246881276 T:C T C 10 0.537634787606996 0.240795085097008 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64114188_64114323:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64114188_64114323:PGM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 20 7 27 9.24730424786008 3.76344351324897 5.48386073461111 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0351217006244279 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 70904800 G/T 1 55 39 94 25.4300866816152 20.9677567166728 4.46232996494237 T:G G T 10 0.537634787606996 0.408134221978295 ENSG00000116761:ENST00000370938:exon_70904784_70905253:CTH;ENSG00000116761:ENST00000411986:exon_70904784_70905252:CTH;ENSG00000116761:ENST00000346806:exon_70904784_70904887:CTH;ENSG00000116761:ENST00000482383:exon_70904784_70904915:CTH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 75172652 T/C 1 63 33 96 29.1290083807593 17.7419479910309 11.3870603897284 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0238478650898116 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000492102:exon_75172583_75174511:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75172583_75172678:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75172583_75172678:CRYZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 17 21 38 7.86020861068107 11.2903305397469 -3.43012192906585 T:C T C 10 0.537634787606996 0.329123785750821 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 75214441 A/G 1 42 33 75 19.4193389205062 17.7419479910309 1.6773909294753 A:G A G 10 0.537634787606996 0.729440346200438 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75214435_75214506:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75214325_75214506:TYW3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 77558057 G/C 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000142892:ENST00000370812:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000445065:exon_77554675_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000370813:exon_77557389_77558175:PIGK;ENSG00000142892:ENST00000487906:exon_77557887_77558175:PIGK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 79093910 G/A 1 80 53 133 36.9892169914403 28.4946437431708 8.49457324826953 A:G G A 10 0.537634787606996 0.163875775244694 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 48 107 155 22.1935301948642 57.5269222739486 -35.3333920790844 A:G G A 10 0.537634787606996 1.55955754856562e-08 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 79102726 C/T 1 36 56 92 16.6451476461481 30.1075481059918 -13.4624004598436 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00625363634817705 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 37 29 66 17.1075128585411 15.5914088406029 1.51610401793826 T:C T C 10 0.537634787606996 0.805227378073612 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 84944989 A/G 1 61 49 110 28.2042779559732 26.3441045927428 1.86017336323044 A:G A G 10 0.537634787606996 0.774500822054135 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G G A 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 85742012 G/C 1 9 6 15 4.16128691153704 3.22580872564198 0.93547818589506 C:G G C 10 0.537634787606996 0.79707128563146 ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85741979_85742480:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85741979_85742773:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85741979_85742479:BCL10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 100575933 G/A 1 2 9 11 0.924730424786008 4.83871308846296 -3.91398266367696 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0295478960306494 ENSG00000156876:ENST00000287482:exon_100575848_100576039:SASS6;ENSG00000156876:ENST00000462159:exon_100575848_100576039:SASS6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 11 2 13 5.08601733632304 1.07526957521399 4.01074776110905 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0272749448200266 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 109351501 A/G 1 7 11 18 3.23655648675103 5.91398266367696 -2.67742617692593 A:G A G 10 0.537634787606996 0.241209079822295 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109351405_109352148:STXBP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 110169909 C/T 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110169797_110169938:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000524975:exon_110169545_110170140:AMPD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 1 10 11 0.462365212393004 5.37634787606996 -4.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00393206454661515 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 C:G C G 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 112269872 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 112308953 T/C 1 33 18 51 15.2580520089691 9.67742617692593 5.5806258320432 T:C T C 10 0.537634787606996 0.124268748846173 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 112308972 G/A 1 34 23 57 15.7204172213621 12.3656001149609 3.35481710640123 A:G G A 10 0.537634787606996 0.426207948956575 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 113236681 C/T 1 16 18 34 7.39784339828806 9.67742617692593 -2.27958277863786 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.492958608233671 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113236640_113236794:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113236527_113236794:MOV10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 113237171 A/G 1 19 21 40 8.78493903546708 11.2903305397469 -2.50539150427984 A:G A G 10 0.537634787606996 0.433193503612973 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113237075_113237251:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000479858:exon_113237075_113237206:MOV10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 113239382 G/A 1 18 19 37 8.32257382307407 10.2150609645329 -1.89248714145885 A:G G A 10 0.537634787606996 0.62158669511674 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239252_113239468:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113239361_113239468:MOV10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 47 48 95 21.7311649824712 25.8064698051358 -4.07530482266462 T:C T C 10 0.537634787606996 0.412110476666801 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 113243048 C/T 1 118 110 228 54.5590950623745 59.1398266367696 -4.5807315743951 T:C C T 10 0.537634787606996 0.550630663297852 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113243038_113243368:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113243038_113243367:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113243038_113243356:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113243038_113243348:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113243038_113243332:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113243038_113243361:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000495374:exon_113243038_113243344:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000494319:exon_113242841_113243347:MOV10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 114377568 A/G 1 28 21 49 12.9462259470041 11.2903305397469 1.6558954072572 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.669607584542965 ENSG00000134242:ENST00000359785:exon_114377532_114377615:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000528414:exon_114377532_114377615:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000532224:exon_114377532_114377615:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000420377:exon_114377532_114377615:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000525799:exon_114377532_114377615:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000484147:exon_114377532_114377615:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000354605:exon_114377532_114377615:PTPN22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 26 24 50 12.0214955222181 12.9032349025679 -0.881739380349801 A:G A G 10 0.537634787606996 0.887432013207721 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 114948281 A/G 1 20 24 44 9.24730424786008 12.9032349025679 -3.65593065470783 A:G A G 10 0.537634787606996 0.292061765241726 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114948032_114948381:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000476908:exon_114946948_114948381:TRIM33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 117617705 A/G 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 A:G A G 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 117618067 C/T 1 17 11 28 7.86020861068107 5.91398266367696 1.94622594700411 T:C C T 10 0.537634787606996 0.570676975485111 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 120285546 G/A 1 53 41 94 24.5053562568292 22.0430262918868 2.46232996494238 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.679318212076222 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120285430_120285667:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120285430_120285667:PHGDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 13 0 13 6.01074776110905 0 6.01074776110905 C C 10 0.537634787606996 0.000357708287874443 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 12 0 12 5.54838254871605 0 5.54838254871605 C C 10 0.537634787606996 0.000678701483351107 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 144917546 A/G 0 12 0 12 5.54838254871605 0 5.54838254871605 A A 10 0.537634787606996 0.000678701483351107 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144917499_144917636:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144917499_144917636:PDE4DIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 144921924 G/A 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 G G 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144921835_144922047:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144921835_144922065:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000532801:exon_144921835_144922020:PDE4DIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145103928 G/A 0 0 56 56 0 30.1075481059918 -30.1075481059918 A G A 10 0.537634787606996 1.73447665038914e-19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 55 55 0 29.5699133183848 -29.5699133183848 C T C 10 0.537634787606996 3.75131303977699e-19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 37 37 0 19.8924871414589 -19.8924871414589 T G T 10 0.537634787606996 4.02207892186336e-13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 41 41 0 22.0430262918868 -22.0430262918868 A C A 10 0.537634787606996 1.83819335690286e-14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 76 0 76 35.1397561418683 0 35.1397561418683 G G 10 0.537634787606996 3.42517272609227e-21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 44 44 0 23.6559306547078 -23.6559306547078 C T C 10 0.537634787606996 1.81696535031585e-15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 75 75 0 40.3226090705247 -40.3226090705247 T C T 10 0.537634787606996 7.47973699469666e-26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 95 0 95 43.9246951773354 0 43.9246951773354 C C 10 0.537634787606996 2.82429158912139e-26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 147124310 T/G 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147124252_147124352:ACP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 150445819 A/G 1 34 29 63 15.7204172213621 15.5914088406029 0.129008380759251 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163125:ENST00000492220:exon_150443037_150446032:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000401000:exon_150443037_150449042:RPRD2;ENSG00000163125:ENST00000369068:exon_150443037_150446032:RPRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 394 417 811 182.171893682844 224.193706432117 -42.0218127492737 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.00344357288914046 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151259043 C/T 1 8 1 9 3.69892169914403 0.537634787606996 3.16128691153704 A:T:C C A 10 0.537634787606996 0.043874250082235 ENSG00000143373:ENST00000443959:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000528005:exon_151258751_151259181:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151259543 G/A 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G G A 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151288172 G/A 1 13 16 29 6.01074776110905 8.60215660171194 -2.59140884060288 A:G G A 10 0.537634787606996 0.356797644500513 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 109 130 239 50.3978081508374 69.8925223889095 -19.494714238072 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0135336624507874 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 151374025 T/C 1 532 450 982 245.978292993078 241.935654423148 4.04263856992992 A:T:C T C 10 0.537634787606996 0.79805218886085 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151374018_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151374018_151374410:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000474100:exon_151373715_151374106:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000466425:exon_151374018_151374106:PSMB4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 152777574 G/A 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000197084:ENST00000368768:exon_152777311_152777974:LCE1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 153909069 G/C 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 C:G G C 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000198837:ENST00000361217:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000368646:exon_153909018_153909224:DENND4B;ENSG00000198837:ENST00000477746:exon_153909018_153909118:DENND4B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 90 71 161 41.6128691153704 38.1720699200967 3.44079919527364 A:G A G 10 0.537634787606996 0.635519556141536 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 T:C T C 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 153941514 C/T 1 7 9 16 3.23655648675103 4.83871308846296 -1.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.460514092364166 ENSG00000143578:ENST00000449724:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368607:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000271889:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000461688:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368601:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368603:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000368600:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000479010:exon_153941406_153941787:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000492729:exon_153941406_153941931:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000473340:exon_153940998_153941830:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000431292:exon_153941406_153941652:CREB3L4;ENSG00000143578:ENST00000405694:exon_153941406_153941652:CREB3L4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 27 31 58 12.4838607346111 16.6666784158169 -4.18281768120577 T:C T C 10 0.537634787606996 0.29349256054431 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 26 24 50 12.0214955222181 12.9032349025679 -0.881739380349801 C:G C G 10 0.537634787606996 0.887432013207721 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 155289561 G/C 1 24 7 31 11.0967650974321 3.76344351324897 7.33332158418312 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0105139743089449 ENSG00000160752:ENST00000492887:exon_155289402_155289676:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489324:exon_155289446_155289719:FDPS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156202173 A/G 1 74 46 120 34.2150257170823 24.7312002299218 9.48382548716048 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0989760142177765 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368279:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000466489:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368276:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000320139:exon_156202111_156202216:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156202111_156202216:PMF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156206121 G/A 1 77 64 141 35.6021213542613 34.4086264068477 1.19349494741356 A:G G A 10 0.537634787606996 0.866165916245085 ENSG00000160783:ENST00000490491:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368273:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000368277:exon_156206079_156206274:PMF1;ENSG00000160783:ENST00000497069:exon_156206079_156206274:PMF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156213921 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000160781:ENST00000292291:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000492619:exon_156213206_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000360733:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000335852:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000356983:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368271:exon_156213207_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000340183:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000491107:exon_156213213_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000368270:exon_156213214_156214194:PAQR6;ENSG00000160781:ENST00000468632:exon_156213214_156214194:PAQR6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156264648 C/T 1 21 10 31 9.70966946025308 5.37634787606996 4.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.149263074371145 ENSG00000198715:ENST00000472870:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156264550_156264807:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156264156_156264783:C1orf85 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156446903 T/C 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 T:C T C 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000353795:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000340875:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000454816:exon_156446804_156446994:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000493077:exon_156446721_156446994:MEF2D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 A:G G A 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156566196 C/A 1 87 68 155 40.2257734781913 36.5591655572757 3.66660792091562 A:C:G C A 10 0.537634787606996 0.573660398590769 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000494414:exon_156565873_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156566179_156566297:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000529520:exon_156565873_156566294:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000473910:exon_156565873_156567913:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531129:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156566179_156566270:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156566086_156566270:GPATCH4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 29 29 0 15.5914088406029 -15.5914088406029 C:G A G 10 0.537634787606996 1.92561464342801e-10 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 156760887 C/A 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156760859_156760954:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156760859_156760954:PRCC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 158813819 A/G 1 34 51 85 15.7204172213621 27.4193741679568 -11.6989569465947 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0121415957293682 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 186 170 356 85.9999295050987 91.3979138931893 -5.39798438809058 C:G G C 10 0.537634787606996 0.595137402923066 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 240 262 502 110.967650974321 140.860314353033 -29.892663378712 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00821314376734393 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 165 154 319 76.2902600448457 82.7957572914774 -6.50549724663173 A:C C A 10 0.537634787606996 0.466087777365317 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 153 140 293 70.7418774961296 75.2688702649794 -4.52699276884984 A:T T A 10 0.537634787606996 0.598554101193833 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 160461060 C/T 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000162739:ENST00000368059:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368057:exon_160460915_160461178:SLAMF6;ENSG00000162739:ENST00000368055:exon_160460915_160461178:SLAMF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161013121 C/T 1 35 30 65 16.1827824337551 16.1290436282099 0.0537388055452581 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 108 112 220 49.9354429384444 60.2150962119835 -10.2796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.176327023926282 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 117 106 223 54.0967298499815 56.9892874863416 -2.89255763636011 C:G G C 10 0.537634787606996 0.737132713829596 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161132777 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000143258:ENST00000368002:exon_161132709_161132864:USP21;ENSG00000143258:ENST00000289865:exon_161132709_161132864:USP21;ENSG00000143258:ENST00000368001:exon_161132709_161132864:USP21;ENSG00000143258:ENST00000401988:exon_161132709_161132864:USP21;ENSG00000143258:ENST00000487163:exon_161132709_161132864:USP21;ENSG00000143258:ENST00000482385:exon_161132709_161132864:USP21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 128 119 247 59.1827471863045 63.9785397252325 -4.79579253892801 T:C C T 10 0.537634787606996 0.565952062000602 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 172 303 475 79.5268165315967 162.90334064492 -83.3765241133231 A:G G A 10 0.537634787606996 1.74984704473335e-14 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161695639 G/T 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:G G T 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161695611_161695877:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161695611_161695877:FCRLB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 29 26 55 13.4085911593971 13.9785044777819 -0.569913318384781 T:C C T 10 0.537634787606996 0.893186882383952 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 45 50 95 20.8064345576852 26.8817393803498 -6.07530482266462 A:G A G 10 0.537634787606996 0.218335675110615 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 166818566 A/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 166819115 T/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000143157:ENST00000367876:exon_166818175_166819660:POGK;ENSG00000143157:ENST00000367875:exon_166818175_166823710:POGK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 16 15 31 7.39784339828806 8.06452181410494 -0.666678415816877 T:C T C 10 0.537634787606996 0.858217650481407 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 171753039 A/G 1 16 19 35 7.39784339828806 10.2150609645329 -2.81721756624486 A:G A G 10 0.537634787606996 0.397650063326115 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171752880_171753179:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171752880_171753639:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367736:exon_171752976_171753592:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000341850:exon_171752985_171753590:METTL13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 171755170 G/A 1 16 25 41 7.39784339828806 13.4408696901749 -6.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0615733919934969 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 172411496 A/G 1 10 3 13 4.62365212393004 1.61290436282099 3.01074776110905 A:G A G 10 0.537634787606996 0.104163295807923 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 172411768 T/C 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 T:C T C 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 173457017 C/T 1 220 188 408 101.720346726461 101.075340070115 0.645006656345629 T:C C T 10 0.537634787606996 0.96044063073241 ENSG00000117592:ENST00000340385:exon_173456874_173457946:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000431633:exon_173456874_173457150:PRDX6;ENSG00000117592:ENST00000470017:exon_173456874_173457154:PRDX6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 173907812 C/T 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C C T 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000135870:ENST00000367696:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000258349:exon_173900352_173908009:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000367694:exon_173907549_173908012:RC3H1;ENSG00000135870:ENST00000479099:exon_173907714_173908009:RC3H1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 174969271 C/T 1 73 53 126 33.7526605046893 28.4946437431708 5.2580167615185 T:C C T 10 0.537634787606996 0.372253706429727 ENSG00000116161:ENST00000426793:exon_174969225_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174968869_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000483307:exon_174969081_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000473925:exon_174969091_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174969204_174969331:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174969204_174969331:CACYBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 179051300 T/C 1 53 50 103 24.5053562568292 26.8817393803498 -2.37638312352059 T:C T C 10 0.537634787606996 0.692896698546975 ENSG00000186283:ENST00000367627:exon_179050512_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000367625:exon_179051205_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000483887:exon_179051213_179051522:TOR3A;ENSG00000186283:ENST00000352445:exon_179051221_179051522:TOR3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 180257620 G/A 1 164 172 336 75.8278948324527 92.4731834684033 -16.6452886359507 A:G G A 10 0.537634787606996 0.07106511378346 ENSG00000135847:ENST00000496993:exon_180257405_180257652:ACBD6;ENSG00000135847:ENST00000475338:exon_180257405_180257652:ACBD6;ENSG00000135847:ENST00000367595:exon_180257365_180257652:ACBD6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 13 15 28 6.01074776110905 8.06452181410494 -2.05377405299589 A:G A G 10 0.537634787606996 0.45452184329692 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 31 23 54 14.3333215841831 12.3656001149609 1.96772146922221 A:G G A 10 0.537634787606996 0.682678172464324 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 181725110 T/C 1 3 8 11 1.38709563717901 4.30107830085597 -2.91398266367696 T:C T C 10 0.537634787606996 0.127234760608112 ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181725092_181725229:CACNA1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 183542387 T/C 1 17 23 40 7.86020861068107 12.3656001149609 -4.50539150427984 T:C T C 10 0.537634787606996 0.157480961867148 ENSG00000116701:ENST00000367536:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000392014:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000413720:exon_183542320_183542427:NCF2;ENSG00000116701:ENST00000367535:exon_183542320_183542427:NCF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 184023529 A/C 1 18 7 25 8.32257382307407 3.76344351324897 4.5591303098251 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0733259257172696 ENSG00000198860:ENST00000361641:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000485209:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000533373:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000367518:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000423085:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000462677:exon_184023488_184023569:TSEN15;ENSG00000198860:ENST00000457455:exon_184023495_184023569:TSEN15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 39 43 82 18.0322432833272 23.1182958671008 -5.08605258377368 A:G A G 10 0.537634787606996 0.269775079323043 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 186313108 C/T 1 3 13 16 1.38709563717901 6.98925223889095 -5.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00535376088517454 ENSG00000047410:ENST00000367478:exon_186313038_186313222:TPR;ENSG00000047410:ENST00000481347:exon_186313038_186313222:TPR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 197070442 G/T 1 9 6 15 4.16128691153704 3.22580872564198 0.93547818589506 T:G G T 10 0.537634787606996 0.79707128563146 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 197070697 T/C 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 T:C T C 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 197070707 G/A 1 10 15 25 4.62365212393004 8.06452181410494 -3.4408696901749 A:G G A 10 0.537634787606996 0.228198563346042 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 197070776 C/T 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 T:C C T 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 201973565 G/A 1 55 85 140 25.4300866816152 45.6989569465947 -20.2688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000658356741596927 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201973482_201973624:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479531:exon_201973482_201973624:RNPEP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 24 28 52 11.0967650974321 15.0537740529959 -3.95700895556379 T:C T C 10 0.537634787606996 0.330356577413624 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 202935911 T/C 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 T:C T C 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000473599:exon_202935877_202936026:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000478009:exon_202935877_202936026:CYB5R1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 203743653 C/T 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000122188:ENST00000442561:exon_203743003_203745245:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367217:exon_203743003_203743850:LAX1;ENSG00000122188:ENST00000367215:exon_203743003_203745361:LAX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 203818973 C/A 1 51 35 86 23.5806258320432 18.8172175662449 4.76340826579834 A:C C A 10 0.537634787606996 0.331223726777146 ENSG00000058673:ENST00000367214:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367212:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000332127:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000495527:exon_203818839_203819154:ZC3H11A;ENSG00000058673:ENST00000367210:exon_203818839_203819154:ZC3H11A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:C C T 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 13 5 18 6.01074776110905 2.68817393803498 3.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155898486841443 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 206665052 C/T 1 8 2 10 3.69892169914403 1.07526957521399 2.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.119333604831037 ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 206757857 C/A 1 19 18 37 8.78493903546708 9.67742617692593 -0.892487141458853 A:C C A 10 0.537634787606996 0.869371317266974 ENSG00000136653:ENST00000355294:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367117:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000338603:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000367118:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000435226:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000304534:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000491368:exon_206757719_206758016:RASSF5;ENSG00000136653:ENST00000481486:exon_206757807_206758627:RASSF5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 207642151 G/A 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207642145_207642244:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207642145_207642244:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207642145_207642244:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207642145_207642244:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207642145_207642244:CR2;ENSG00000117322:ENST00000485707:exon_207642145_207642244:CR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 207646322 G/A 1 28 29 57 12.9462259470041 15.5914088406029 -2.64518289359877 A:G G A 10 0.537634787606996 0.508485141712085 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 207646462 G/A 1 21 12 33 9.70966946025308 6.45161745128395 3.25805200896913 A:G G A 10 0.537634787606996 0.29687421642475 ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207646117_207646524:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207646218_207646524:CR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 211846876 A/G 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211846825_211847065:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000366998:exon_211846825_211847065:NEK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212276276 A/G 1 15 11 26 6.93547818589506 5.91398266367696 1.0214955222181 A:G A G 10 0.537634787606996 0.844575818070943 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212276184_212278348:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212276184_212278186:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212276184_212277936:DTL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212515613 C/T 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000066027:ENST00000261461:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000498129:exon_212515530_212515622:PPP2R5A;ENSG00000066027:ENST00000479259:exon_212515530_212515622:PPP2R5A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212619339 T/C 1 214 168 382 98.9461554521029 90.3226443179753 8.62351113412753 T:C T C 10 0.537634787606996 0.383493284462776 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212788567 C/T 1 29 12 41 13.4085911593971 6.45161745128395 6.95697370811316 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0404097591282599 ENSG00000162772:ENST00000366981:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366987:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000426071:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000391902:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000341491:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000465155:exon_212788360_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366985:exon_212788494_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000464547:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366983:exon_212788364_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000336937:exon_212788490_212788603:ATF3;ENSG00000162772:ENST00000366984:exon_212788490_212788603:ATF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 28 34 62 12.9462259470041 18.2795827786379 -5.33335683163375 T:C T C 10 0.537634787606996 0.202739358424526 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212985592 G/A 1 4 9 13 1.84946084957202 4.83871308846296 -2.98925223889095 A:G G A 10 0.537634787606996 0.16185612659808 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212985569_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000533650:exon_212985590_212985624:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212985590_212985670:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212985590_212985670:TATDN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 212988540 G/C 1 14 20 34 6.47311297350206 10.7526957521399 -4.27958277863786 C:G G C 10 0.537634787606996 0.16898586004006 ENSG00000203705:ENST00000532324:exon_212988355_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366974:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526641:exon_212988355_212988757:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000531963:exon_212988389_212988939:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000366973:exon_212988355_212989959:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000526997:exon_212988355_212988567:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000525574:exon_212988355_212989968:TATDN3;ENSG00000203705:ENST00000527693:exon_212988355_212989186:TATDN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 213031948 G/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213031597_213032532:FLVCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 18 10 28 8.32257382307407 5.37634787606996 2.94622594700411 T:C C T 10 0.537634787606996 0.343738653564769 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 214492286 G/A 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214492202_214492326:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214492202_214492326:SMYD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 214510115 T/G 1 37 35 72 17.1075128585411 18.8172175662449 -1.70970470770371 T:G T G 10 0.537634787606996 0.723661449604658 ENSG00000143499:ENST00000491455:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000471645:exon_214510047_214510473:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000415093:exon_214510047_214510445:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000460580:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000366957:exon_214510047_214510474:SMYD2;ENSG00000143499:ENST00000416415:exon_214510047_214510474:SMYD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 214830617 A/G 1 61 52 113 28.2042779559732 27.9570089555638 0.24726900040945 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 214837110 C/G 1 64 61 125 29.5913735931523 32.7957220440268 -3.2043484508745 C:G C G 10 0.537634787606996 0.591030296408254 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214836934_214837931:CENPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 218480958 A/G 1 46 43 89 21.2687997700782 23.1182958671008 -1.84949609702265 A:G A G 10 0.537634787606996 0.750071472238165 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218480773_218480974:RRP15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 36 28 64 16.6451476461481 15.0537740529959 1.59137359315226 T:C C T 10 0.537634787606996 0.708894675178959 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 220935081 G/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G G A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000117791:ENST00000359316:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000366913:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000425560:exon_220935000_220935162:MOSC2;ENSG00000117791:ENST00000496078:exon_220935000_220935106:MOSC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 221912361 T/C 1 17 13 30 7.86020861068107 6.98925223889095 0.870956371790119 T:C T C 10 0.537634787606996 0.855382105439278 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 221912808 T/C 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 T:C T C 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 224586644 A/G 1 26 13 39 12.0214955222181 6.98925223889095 5.03224328332715 A:G A G 10 0.537634787606996 0.111216564106796 ENSG00000162923:ENST00000414423:exon_224586591_224586736:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000295024:exon_224586591_224586736:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000480676:exon_224586591_224586736:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000486652:exon_224586591_224586736:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000366852:exon_224586591_224586736:WDR26;ENSG00000162923:ENST00000479727:exon_224586591_224586736:WDR26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 226033030 G/C 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 C:G G C 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 226034774 C/T 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 T:C C T 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 226046974 T/C 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 14 8 22 6.47311297350206 4.30107830085597 2.17203467264609 T:G T G 10 0.537634787606996 0.398402068910229 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 226923938 A/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:C A C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227069737 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000495488:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227069589_227069749:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227069589_227069749:PSEN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227149203 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227149078_227149203:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000489044:exon_227149078_227149263:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227149087_227149263:ADCK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 18 11 29 8.32257382307407 5.91398266367696 2.40859115939712 T:C C T 10 0.537634787606996 0.45740998643831 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 T:C T C 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 13 15 28 6.01074776110905 8.06452181410494 -2.05377405299589 A:C A C 10 0.537634787606996 0.45452184329692 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 14 14 28 6.47311297350206 7.52688702649794 -1.05377405299589 A:G A G 10 0.537634787606996 0.708696110001731 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 17 12 29 7.86020861068107 6.45161745128395 1.40859115939712 A:G G A 10 0.537634787606996 0.710575852780221 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 227954742 C/T 1 18 23 41 8.32257382307407 12.3656001149609 -4.04302629188684 T:C C T 10 0.537634787606996 0.213992367371181 ENSG00000143740:ENST00000366760:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000418653:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227954660_227954784:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000478768:exon_227954660_227954784:SNAP47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 228588680 A/C 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228588665_228588895:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228588640_228588892:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000366699:exon_228588665_228588895:TRIM11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 229622162 A/G 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 A:G A G 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229622118_229622275:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229622118_229622275:NUP133 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 229623338 T/C 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229623213_229623360:NUP133 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 229635521 A/G 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229635431_229635565:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366678:exon_229635431_229635565:NUP133 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 229738170 T/G 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229737942_229738666:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000366675:exon_229734941_229738666:TAF5L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 21 19 40 9.70966946025308 10.2150609645329 -0.50539150427984 T:C T C 10 0.537634787606996 0.87555079212786 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 230814668 A/G 1 13 9 22 6.01074776110905 4.83871308846296 1.17203467264609 A:G A G 10 0.537634787606996 0.673592113272102 ENSG00000135775:ENST00000494371:exon_230814659_230819174:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230814659_230814798:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230814659_230814798:COG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 230829088 C/T 1 31 20 51 14.3333215841831 10.7526957521399 3.5806258320432 T:C C T 10 0.537634787606996 0.329401553003132 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 230829139 A/G 1 20 29 49 9.24730424786008 15.5914088406029 -6.34410459274281 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0848317990750537 ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 231408091 A/G 1 28 34 62 12.9462259470041 18.2795827786379 -5.33335683163375 A:G A G 10 0.537634787606996 0.202739358424526 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231408058_231408137:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231408058_231408137:GNPAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 233091463 T/A 1 23 3 26 10.6343998850391 1.61290436282099 9.0214955222181 A:T T A 10 0.537634787606996 0.000250661597786791 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000487953:exon_233091404_233091465:C1orf57 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 32 25 57 14.7956867965761 13.4408696901749 1.35481710640123 T:C C T 10 0.537634787606996 0.791016730040995 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 33 27 60 15.2580520089691 14.5161392653889 0.74191274358024 A:G G A 10 0.537634787606996 0.897424866500941 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 234744250 G/A 1 85 104 189 39.3010430534053 55.9140179111276 -16.6129748577223 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0160488007007022 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 43 45 88 19.8817041328992 24.1935654423148 -4.31186130941565 A:C:G C A 10 0.537634787606996 0.39281437766745 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 234744480 G/A 1 60 42 102 27.7419127435802 22.5806610794938 5.16125166408641 A:G G A 10 0.537634787606996 0.321990282054216 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 46 32 78 21.2687997700782 17.2043132034239 4.06448656665431 A:G A G 10 0.537634787606996 0.366392005065331 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 26 38 64 12.0214955222181 20.4301219290658 -8.40862640684774 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0441011872111523 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 242042301 G/A 1 22 9 31 10.1720346726461 4.83871308846296 5.33332158418312 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0704177745600055 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 242042545 A/G 1 10 16 26 4.62365212393004 8.60215660171194 -3.9785044777819 A:G A G 10 0.537634787606996 0.167373121747452 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 242048674 C/T 1 25 38 63 11.5591303098251 20.4301219290658 -8.87099161924075 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0310107287842122 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 245021383 A/C 1 174 283 457 80.4515469563827 152.15064489278 -71.6990979363972 A:C A C 10 0.537634787606996 1.90901587323342e-11 ENSG00000153187:ENST00000427948:exon_245021313_245021576:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000413625:exon_245021313_245021576:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000444376:exon_245021313_245021576:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000283179:exon_245021313_245021576:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000366525:exon_245021313_245021576:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000483966:exon_245021313_245021576:HNRNPU HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 14 7 21 6.47311297350206 3.76344351324897 2.70966946025308 C:G G C 10 0.537634787606996 0.27805722506375 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 249142169 C/T 1 30 16 46 13.8709563717901 8.60215660171194 5.26879977007818 T:C C T 10 0.537634787606996 0.139394684131293 ENSG00000171161:ENST00000306562:exon_249141251_249143716:ZNF672;ENSG00000171161:ENST00000394454:exon_249141474_249142832:ZNF672 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 1 249150116 G/C 1 7 16 23 3.23655648675103 8.60215660171194 -5.36560011496091 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0345204318444650 ENSG00000171163:ENST00000463519:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000306601:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000427146:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366471:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000533927:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000476503:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000366469:exon_249149924_249150138:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000477070:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000412341:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000451251:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000315492:exon_249149924_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000470787:exon_249149757_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000474351:exon_249149924_249150285:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000478107:exon_249149924_249150142:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000491971:exon_249149794_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000496411:exon_249149927_249150145:ZNF692;ENSG00000171163:ENST00000468455:exon_249149981_249150142:ZNF692 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3154461 G/A 1 79 60 139 36.5268517790473 32.2580872564198 4.26876452262755 A:G G A 10 0.537634787606996 0.496764952612383 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3154414_3154478:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3154414_3154478:PFKP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 34 37 71 15.7204172213621 19.8924871414589 -4.17206992009672 A:G A G 10 0.537634787606996 0.342318814405519 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3155698 C/T 1 84 85 169 38.8386778410123 45.6989569465947 -6.86027910558233 T:C C T 10 0.537634787606996 0.316005346753293 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3155650_3155710:PFKP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3181107 G/A 1 101 100 201 46.6988864516934 53.7634787606996 -7.06459230900619 A:G G A 10 0.537634787606996 0.322843414739107 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 19 11 30 8.78493903546708 5.91398266367696 2.87095637179012 A:G G A 10 0.537634787606996 0.360976107545321 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3202065 T/C 1 29 18 47 13.4085911593971 9.67742617692593 3.73116498247119 T:C T C 10 0.537634787606996 0.307592761495415 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 5498223 T/C 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498050_5498236:NET1;ENSG00000173848:ENST00000484741:exon_5498050_5498493:NET1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 5498693 A/G 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G A G 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000173848:ENST00000355029:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380359:exon_5498551_5500426:NET1;ENSG00000173848:ENST00000380337:exon_5498551_5500401:NET1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 5799613 A/G 1 2 10 12 0.924730424786008 5.37634787606996 -4.45161745128395 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0165483848773995 ENSG00000108021:ENST00000328090:exon_5799483_5799636:C10orf18;ENSG00000108021:ENST00000442808:exon_5799483_5799636:C10orf18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 5963427 C/T 1 12 26 38 5.54838254871605 13.9785044777819 -8.43012192906585 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00838259586908644 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000485558:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000475867:exon_5963411_5963532:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000461504:exon_5963411_5963532:FBXO18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 5995052 C/T 1 9 16 25 4.16128691153704 8.60215660171194 -4.4408696901749 T:C C T 10 0.537634787606996 0.106777127582249 ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_5994334_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_5994349_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_5994356_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_5994756_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_5994784_5995289:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_5994861_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_5995008_5995169:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_5995014_5995169:IL15RA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 11312691 C/T 1 24 21 45 11.0967650974321 11.2903305397469 -0.193565442314821 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11312629_11312787:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11312629_11312787:CELF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 146 174 320 67.5053210093786 93.5484530436173 -26.0431320342387 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00417642220503034 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 12292348 G/T 1 178 148 326 82.3010078059547 79.5699485658354 2.73105924011931 T:G G T 10 0.537634787606996 0.78140519095007 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 13152400 T/A 1 37 77 114 17.1075128585411 41.3978786457387 -24.2903657871975 A:T T A 10 0.537634787606996 5.10378963238346e-06 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13152180_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13152274_13152476:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13152274_13152476:OPTN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 14943176 C/G 1 13 7 20 6.01074776110905 3.76344351324897 2.24730424786008 C:G C G 10 0.537634787606996 0.373960999192447 ENSG00000152455:ENST00000378331:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000433779:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000378325:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000354919:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000313519:exon_14943132_14943261:SUV39H2;ENSG00000152455:ENST00000358298:exon_14943132_14943261:SUV39H2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 14974905 T/C 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000152457:ENST00000378289:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14974853_14974954:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000418843:exon_14974853_14974954:DCLRE1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 22839628 T/C 1 11 26 37 5.08601733632304 13.9785044777819 -8.89248714145885 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00444193667544484 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 30629226 G/A 1 30 11 41 13.8709563717901 5.91398266367696 7.95697370811316 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0176878457590519 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 30728101 T/C 1 148 151 299 68.4300514341646 81.1828529286564 -12.7528014944918 T:C T C 10 0.537634787606996 0.147110242534526 ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 16 18 34 7.39784339828806 9.67742617692593 -2.27958277863786 A:G G A 10 0.537634787606996 0.492958608233671 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 43319197 G/A 1 73 61 134 33.7526605046893 32.7957220440268 0.956938460662535 A:G G A 10 0.537634787606996 0.931012248390886 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43319057_43319232:BMS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 45499009 A/G 1 32 35 67 14.7956867965761 18.8172175662449 -4.02153076966873 A:G A G 10 0.537634787606996 0.3299984062449 ENSG00000165512:ENST00000298299:exon_45498728_45500774:ZNF22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 45499272 C/G 1 42 29 71 19.4193389205062 15.5914088406029 3.82793007990328 C:G C G 10 0.537634787606996 0.405485040457742 ENSG00000165512:ENST00000298299:exon_45498728_45500774:ZNF22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 45869713 C/G 0 22 0 22 10.1720346726461 0 10.1720346726461 C C 10 0.537634787606996 2.30990924467808e-06 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45869675_45869877:ALOX5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 45869748 C/T 1 21 2 23 9.70966946025308 1.07526957521399 8.63439988503909 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000193705545468388 ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45869675_45869877:ALOX5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 46122051 C/T 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46121399_46122553:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46121399_46122553:ANUBL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 46143929 C/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000172671:ENST00000374366:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374376:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000344646:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374371:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000374370:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000465407:exon_46143742_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000495747:exon_46143867_46143982:ANUBL1;ENSG00000172671:ENST00000497028:exon_46143923_46143982:ANUBL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 51827763 A/G 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 A:G A G 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000099290:ENST00000434114:exon_51827684_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000282633:exon_51827721_51827768:FAM21A;ENSG00000099290:ENST00000351071:exon_51827721_51827768:FAM21A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 61 47 108 28.2042779559732 25.2688350175288 2.93544293844443 A:G A G 10 0.537634787606996 0.629718138316457 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 54 53 107 24.9677214692222 28.4946437431708 -3.52692227394857 A:G G A 10 0.537634787606996 0.499106140072476 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 72179746 C/T 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 T:C C T 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 73520632 A/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:C A C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73520625_73520681:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73520288_73520681:C10orf54 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 73533177 A/G 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73533115_73533255:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73533115_73533196:C10orf54 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 75533448 A/G 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 A:G A G 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000196968:ENST00000372841:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000394790:exon_75532948_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000465695:exon_75532952_75534881:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000489264:exon_75533363_75533573:FUT11;ENSG00000196968:ENST00000462704:exon_75533396_75533573:FUT11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 75936611 C/T 1 10 14 24 4.62365212393004 7.52688702649794 -2.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.30623055932798 ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_75936444_75936644:ADK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 139 110 249 64.2687645226275 59.1398266367696 5.12893788585799 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.525708943963757 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 11 13 24 5.08601733632304 6.98925223889095 -1.9032349025679 T:C T C 10 0.537634787606996 0.540200791347127 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 88203068 T/C 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 T:C T C 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000484070:exon_88203032_88203789:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88203032_88203120:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88203032_88203120:WAPAL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 13 24 37 6.01074776110905 12.9032349025679 -6.89248714145885 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0308109263539736 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 9 15 24 4.16128691153704 8.06452181410494 -3.90323490256791 A:G G A 10 0.537634787606996 0.150610778150999 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91497207 A/G 1 38 27 65 17.5698780709342 14.5161392653889 3.05373880554526 A:G A G 10 0.537634787606996 0.458872708251782 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 12 17 29 5.54838254871605 9.13979138931893 -3.59140884060288 A:T T A 10 0.537634787606996 0.196225448340524 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 14 18 32 6.47311297350206 9.67742617692593 -3.20431320342387 A:G A G 10 0.537634787606996 0.289546690751015 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 34 23 57 15.7204172213621 12.3656001149609 3.35481710640123 A:G A G 10 0.537634787606996 0.426207948956575 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 23 21 44 10.6343998850391 11.2903305397469 -0.655930654707825 A:G A G 10 0.537634787606996 0.880554782000762 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 95276742 G/C 1 22 13 35 10.1720346726461 6.98925223889095 3.18278243375514 C:G G C 10 0.537634787606996 0.312333354467227 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 43 26 69 19.8817041328992 13.9785044777819 5.90319965511727 C:G G C 10 0.537634787606996 0.183922501506699 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 31 22 53 14.3333215841831 11.8279653273539 2.50535625682921 A:G A G 10 0.537634787606996 0.58205783148814 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 97386497 G/T 1 24 17 41 11.0967650974321 9.13979138931893 1.95697370811316 T:G G T 10 0.537634787606996 0.639099262185329 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97386460_97386533:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97386460_97386533:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97386460_97386533:ALDH18A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 97388162 G/A 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 A:G G A 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97388125_97388249:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000489386:exon_97388125_97388249:ALDH18A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:T A T 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 97920062 G/A 1 7 1 8 3.23655648675103 0.537634787606996 2.69892169914403 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0765265846100734 ENSG00000177853:ENST00000316045:exon_97917647_97920530:ZNF518A;ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 99129230 T/C 1 16 10 26 7.39784339828806 5.37634787606996 2.0214955222181 T:C T C 10 0.537634787606996 0.556048478872558 ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 99139140 G/A 1 13 11 24 6.01074776110905 5.91398266367696 0.0967650974320957 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99139050_99139171:RRP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 99221827 T/C 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 T:C T C 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000495415:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99221768_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99221774_99221876:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000478452:exon_99221774_99221876:MMS19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 100195130 G/A 1 16 12 28 7.39784339828806 6.45161745128395 0.946225947004112 A:G G A 10 0.537634787606996 0.850211563621615 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100195089_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100195029_100195171:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100194843_100195171:HPS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 102006681 C/T 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102006552_102006692:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102006552_102006692:CWF19L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 102746503 C/T 1 123 74 197 56.8709211243395 39.7849742829177 17.0859468414218 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0150631617726185 ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 102750783 C/A 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000107815:ENST00000476766:exon_102750626_102750811:C10orf2;ENSG00000107815:ENST00000370228:exon_102750626_102750811:C10orf2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 102762256 C/T 1 2 9 11 0.924730424786008 4.83871308846296 -3.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0295478960306494 ENSG00000107816:ENST00000426584:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000489526:exon_102762254_102762934:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000429732:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000481129:exon_102762254_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102759233_102762703:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000454422:exon_102762254_102762703:LZTS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 102766574 A/G 1 20 25 45 9.24730424786008 13.4408696901749 -4.19356544231482 A:G A G 10 0.537634787606996 0.233043355000124 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 104436641 C/T 1 44 53 97 20.3440693452922 28.4946437431708 -8.15057439787861 T:C C T 10 0.537634787606996 0.103629749358236 ENSG00000138175:ENST00000260746:exon_104436315_104436698:ARL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 43 44 87 19.8817041328992 23.6559306547078 -3.77422652180865 A:G G A 10 0.537634787606996 0.452261905245187 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 105174869 G/A 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105174762_105174908:PDCD11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 32 28 60 14.7956867965761 15.0537740529959 -0.25808725641976 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 105362104 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 105362179 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 222 170 392 102.645077151247 91.3979138931893 11.2471632580576 A:C C A 10 0.537634787606996 0.265296394266558 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 115489152 C/G 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 C:G C G 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 115489167 G/A 1 9 20 29 4.16128691153704 10.7526957521399 -6.59140884060289 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0154339888013786 ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115489070_115490655:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115489070_115490662:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000487232:exon_115489070_115489262:CASP7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 9 20 29 4.16128691153704 10.7526957521399 -6.59140884060289 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0154339888013786 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 A:G G A 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 121432157 G/A 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 A:G G A 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121431767_121432168:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121431767_121432168:BAG3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 121436068 T/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 T:G T G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121435979_121436219:BAG3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 121436286 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 121436362 A/G 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 122665514 G/A 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 126480381 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000203791:ENST00000466270:exon_126480293_126480437:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000368837:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000368836:exon_126480293_126480439:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000464099:exon_126480293_126480437:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000358960:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000426050:exon_126480293_126480407:METTL10;ENSG00000203791:ENST00000483542:exon_126480293_126480446:METTL10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 127441439 G/A 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000107938:ENST00000419769:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000481600:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000356792:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368815:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000337623:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000433226:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000450404:exon_127441368_127441483:C10orf137;ENSG00000107938:ENST00000368812:exon_127441368_127441483:C10orf137 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 17 26 43 7.86020861068107 13.9785044777819 -6.11829586710083 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0671186434290475 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 378 382 760 174.774050284555 205.376488865872 -30.602438581317 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0264923121365793 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 462 403 865 213.612728125568 216.666819405619 -3.05409128005155 A:C:G G C 10 0.537634787606996 0.837971692462234 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129900858 C/T 1 207 221 428 95.7095989653518 118.817288061146 -23.1076890957943 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0257647400193986 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129900843_129901392:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129901501 G/C 1 185 180 365 85.5375642927057 96.7742617692593 -11.2366974765535 C:G G C 10 0.537634787606996 0.248283172938456 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129901747 C/T 1 154 163 317 71.2042427085226 87.6344703799404 -16.4302276714177 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0713198012116321 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 188 184 372 86.9246599298848 98.9248009196873 -12.0001409898025 A:G G A 10 0.537634787606996 0.212587920663267 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 126 91 217 58.2580167615185 48.9247656722366 9.33325108928187 T:C T C 10 0.537634787606996 0.220480452634829 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129903465 A/G 1 83 107 190 38.3763126286193 57.5269222739486 -19.1506096453292 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00564118121141242 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129904119 G/A 1 73 55 128 33.7526605046893 29.5699133183848 4.18274718630451 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.479227106002298 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129904917 G/A 1 48 49 97 22.1935301948642 26.3441045927428 -4.15057439787861 A:G G A 10 0.537634787606996 0.416424220123954 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129905896 T/A 1 29 22 51 13.4085911593971 11.8279653273539 1.5806258320432 A:T T A 10 0.537634787606996 0.676439276471674 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129906980 C/T 1 40 26 66 18.4946084957202 13.9785044777819 4.51610401793826 T:C C T 10 0.537634787606996 0.323393787226545 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 129917560 T/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 133761285 G/A 1 24 49 73 11.0967650974321 26.3441045927428 -15.2473394953107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000377119230500782 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133761034_133761295:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000470416:exon_133761034_133761295:PPP2R2D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 134145136 A/G 1 32 4 36 14.7956867965761 2.15053915042798 12.6451476461481 A:G A G 10 0.537634787606996 1.23820505668407e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 134145138 C/G 1 32 4 36 14.7956867965761 2.15053915042798 12.6451476461481 C:G C G 10 0.537634787606996 1.23820505668407e-05 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 134145166 T/C 1 24 1 25 11.0967650974321 0.537634787606996 10.5591303098251 T:C T C 10 0.537634787606996 5.95070675079843e-06 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 134145293 G/T 1 21 5 26 9.70966946025308 2.68817393803498 7.0214955222181 T:G G T 10 0.537634787606996 0.00547845922895973 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 134145314 A/G 1 2 10 12 0.924730424786008 5.37634787606996 -4.45161745128395 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0165483848773995 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 107 59 166 49.4730777260514 31.7204524688128 17.7526252572387 A:C C A 10 0.537634787606996 0.006294775128366 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 59 41 100 27.2795475311872 22.0430262918868 5.2365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.316737712581219 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 12 14 26 5.54838254871605 7.52688702649794 -1.9785044777819 A:G A G 10 0.537634787606996 0.440467677457136 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 T:C C T 10 0.537634787606996 0.829141081785639 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135085426 A/G 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 A:G A G 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135087521 G/A 1 10 3 13 4.62365212393004 1.61290436282099 3.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.104163295807923 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135089035 A/G 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.241086138959429 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135097434 A/G 1 32 25 57 14.7956867965761 13.4408696901749 1.35481710640123 A:G A G 10 0.537634787606996 0.791016730040995 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135097386_135097506:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135097386_135097506:TUBGCP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 22 38 60 10.1720346726461 20.4301219290658 -10.2580872564198 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00923511337228414 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135112940 C/T 1 13 16 29 6.01074776110905 8.60215660171194 -2.59140884060288 T:C C T 10 0.537634787606996 0.356797644500513 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000487796:exon_135112931_135113107:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135112939_135113107:TUBGCP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135122507 G/A 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135122327_135122644:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000470829:exon_135122327_135122638:TUBGCP2;ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135121979_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122445_135122600:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122453_135122600:ZNF511 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 10 135186806 A/G 1 46 37 83 21.2687997700782 19.8924871414589 1.37631262861933 A:G A G 10 0.537634787606996 0.826021547506744 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135186750_135187193:ECHS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 212479 C/T 1 45 50 95 20.8064345576852 26.8817393803498 -6.07530482266462 T:C C T 10 0.537634787606996 0.218335675110615 ENSG00000177963:ENST00000526104:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000325207:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527696:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527728:exon_212416_212511:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000527039:exon_212416_212591:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000530149:exon_210364_213780:RIC8A;ENSG00000177963:ENST00000532241:exon_212468_212511:RIC8A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 428489 T/C 1 1 9 10 0.462365212393004 4.83871308846296 -4.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00765653759058032 ENSG00000185101:ENST00000412024:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000534161:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000528927:exon_428475_428639:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000332826:exon_428475_428639:ANO9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 771034 A/G 1 11 21 32 5.08601733632304 11.2903305397469 -6.20431320342387 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0328377121480844 ENSG00000177225:ENST00000465313:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_768386_771467:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_770550_771426:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_770993_771104:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_770993_771212:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000533960:exon_770844_771104:PDDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 772490 G/A 1 13 4 17 6.01074776110905 2.15053915042798 3.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0863642416395042 ENSG00000177225:ENST00000528309:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526650:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532320:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000530209:exon_772427_772614:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529966:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000532839:exon_772427_772521:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_772427_772521:PDDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 829539 A/G 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000177685:ENST00000528542:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000450448:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000321883:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000327417:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000525077:exon_829360_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000530688:exon_829297_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000527763:exon_829305_829540:EFCAB4A;ENSG00000177685:ENST00000528694:exon_829307_831295:EFCAB4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 837582 G/A 1 37 75 112 17.1075128585411 40.3226090705247 -23.2150962119835 A:G G A 10 0.537634787606996 1.07706092775421e-05 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_837460_837613:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528143:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_837460_837612:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532075:exon_837460_837618:CD151;ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_837356_837605:POLR2L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 840363 C/T 1 271 289 560 125.300972558504 155.376453618422 -30.0754810599177 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0109980055863528 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 840477 A/G 1 487 411 898 225.171858435393 220.967897706475 4.20396072891759 A:G A G 10 0.537634787606996 0.788981024047372 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 35 58 93 16.1827824337551 31.1828176812058 -15.0000352474506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00238051707322205 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 20 12 32 9.24730424786008 6.45161745128395 2.79568679657613 T:C C T 10 0.537634787606996 0.377303175258482 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 1011490 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_1010548_1012240:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_1010967_1011602:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_1010548_1012239:AP2A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 463 472 935 214.075093337961 253.763619750502 -39.6885264125413 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00955465815035475 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 1977552 G/A 1 412 304 716 190.494467505918 163.440975432527 27.0534920733909 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.0430227412691308 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000484918:exon_1977486_1977576:MRPL23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 2356823 C/T 0 203 0 203 93.8601381157798 0 93.8601381157798 C C 10 0.537634787606996 2.68389565692045e-55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 3028140 G/A 1 75 90 165 34.6773909294753 48.3871308846296 -13.7097399551543 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0349274121514741 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000484484:exon_3028109_3028240:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000466442:exon_3028109_3030127:CARS;ENSG00000110619:ENST00000470221:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3028109_3028189:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3028109_3028189:CARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 19 18 37 8.78493903546708 9.67742617692593 -0.892487141458853 C:G G C 10 0.537634787606996 0.869371317266974 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 4103524 A/G 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:G A G 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 4141132 C/A 1 23 28 51 10.6343998850391 15.0537740529959 -4.4193741679568 A:C C A 10 0.537634787606996 0.261118975927049 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528442:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4141075_4141200:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000526304:exon_4141075_4141158:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000528470:exon_4141075_4141158:RRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 4159457 A/G 1 171 141 312 79.0644513192037 75.8065050525864 3.25794626661725 A:G A G 10 0.537634787606996 0.733554535908104 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 15 10 25 6.93547818589506 5.37634787606996 1.5591303098251 T:C T C 10 0.537634787606996 0.555320408127842 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 5701281 G/A 1 15 13 28 6.93547818589506 6.98925223889095 -0.0537740529958883 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700991_5701462:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700991_5701468:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000419850:exon_5701192_5701468:TRIM5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 74 81 155 34.2150257170823 43.5484177961667 -9.33339207908438 T:C T C 10 0.537634787606996 0.146965122934523 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 109 92 201 50.3978081508374 49.4624004598436 0.935407690993799 A:G G A 10 0.537634787606996 0.943637219124174 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 6239344 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000532797:exon_6239035_6239380:FAM160A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 56 61 117 25.8924518940082 32.7957220440268 -6.90327015001853 T:C C T 10 0.537634787606996 0.227990360769117 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 119 86 205 55.0214602747675 46.2365917342017 8.78486854056582 A:G G A 10 0.537634787606996 0.233937509769444 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 6632857 A/T 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 A:T A T 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632619_6633179:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000532344:exon_6632632_6633049:TAF10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 49 82 131 22.6558954072572 44.0860525837737 -21.4301571765165 A:T A T 10 0.537634787606996 0.000208765242620998 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 7694013 T/G 1 45 40 85 20.8064345576852 21.5053915042798 -0.698956946594663 T:G T G 10 0.537634787606996 0.913605187265554 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7693979_7694686:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7693979_7694121:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7693979_7694037:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000525307:exon_7693859_7694122:CYB5R2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 8977830 A/G 1 16 8 24 7.39784339828806 4.30107830085597 3.0967650974321 A:G A G 10 0.537634787606996 0.225469869657442 ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 9537904 G/C 1 13 11 24 6.01074776110905 5.91398266367696 0.0967650974320957 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166478:ENST00000396604:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396602:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000530463:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000396597:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000299606:exon_9537748_9537909:ZNF143;ENSG00000166478:ENST00000447186:exon_9537748_9537909:ZNF143 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 9607032 A/G 1 23 25 48 10.6343998850391 13.4408696901749 -2.80646980513581 A:G A G 10 0.537634787606996 0.470080372152311 ENSG00000166483:ENST00000450114:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000299613:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000524612:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530712:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000530175:exon_9606989_9607074:WEE1;ENSG00000166483:ENST00000532275:exon_9606989_9607074:WEE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 11292700 G/C 1 12 3 15 5.54838254871605 1.61290436282099 3.93547818589506 C:G G C 10 0.537634787606996 0.066339190499547 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 11354346 T/C 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 T:C T C 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11354241_11354378:GALNTL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 11976628 G/A 1 19 22 41 8.78493903546708 11.8279653273539 -3.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.351821111193613 ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 17351683 C/G 1 58 54 112 26.8171823187942 29.0322785307778 -2.21509621198355 C:G C G 10 0.537634787606996 0.705146635299501 ENSG00000070081:ENST00000532658:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000533773:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000405119:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000323688:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000529010:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000458064:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000527580:exon_17351674_17351844:NUCB2;ENSG00000070081:ENST00000531242:exon_17351674_17351844:NUCB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 20398154 A/G 1 24 14 38 11.0967650974321 7.52688702649794 3.56987807093415 A:G A G 10 0.537634787606996 0.259608331084328 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20398126_20398263:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20398126_20398263:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20398126_20398263:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20398126_20398263:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20398126_20398263:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20397563_20398263:HTATIP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 36 29 65 16.6451476461481 15.5914088406029 1.05373880554526 T:G T G 10 0.537634787606996 0.805137208536451 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 55 61 116 25.4300866816152 32.7957220440268 -7.36563536241153 T:C T C 10 0.537634787606996 0.192258543787009 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 20529886 G/A 1 15 6 21 6.93547818589506 3.22580872564198 3.70966946025308 A:G G A 10 0.537634787606996 0.126802656559472 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 27384396 G/T 1 39 42 81 18.0322432833272 22.5806610794938 -4.54841779616668 T:C:G G T 10 0.537634787606996 0.318103654305612 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 4 14 18 1.84946084957202 7.52688702649794 -5.67742617692593 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00845347256550257 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 33106616 C/T 1 61 22 83 28.2042779559732 11.8279653273539 16.3763126286193 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000254592607222739 ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 33880896 T/A 1 59 71 130 27.2795475311872 38.1720699200967 -10.8925223889095 A:T:G T A 10 0.537634787606996 0.0643694798582609 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 33881016 T/C 1 66 45 111 30.5161040179383 24.1935654423148 6.32253857562344 T:C T C 10 0.537634787606996 0.253583950872827 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 33886294 A/G 1 11 19 30 5.08601733632304 10.2150609645329 -5.12904362820988 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0678966504481267 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33886148_33886363:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33886148_33886475:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33886148_33886697:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33886148_33886363:LMO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 34154645 C/T 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 T:C C T 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 34482908 C/T 1 13 13 26 6.01074776110905 6.98925223889095 -0.978504477781897 T:C C T 10 0.537634787606996 0.699994963282250 ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34482798_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34482280_34482936:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34482750_34482936:CAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 15 30 45 6.93547818589506 16.1290436282099 -9.19356544231482 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00678169310408333 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 34916657 C/T 1 22 12 34 10.1720346726461 6.45161745128395 3.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.230589279923386 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34916557_34916657:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34916557_34916657:APIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 12 13 25 5.54838254871605 6.98925223889095 -1.4408696901749 A:G G A 10 0.537634787606996 0.689190544257236 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 34969112 A/G 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 35226155 A/G 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35226059_35226456:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525241:exon_35226059_35226358:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526553:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534082:exon_35226059_35226187:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528672:exon_35226059_35226187:CD44 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 35827958 A/G 1 15 20 35 6.93547818589506 10.7526957521399 -3.81721756624486 A:G A G 10 0.537634787606996 0.235647605148217 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35827908_35829775:TRIM44;ENSG00000166326:ENST00000532066:exon_35827908_35828171:TRIM44 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 43472746 C/T 1 7 13 20 3.23655648675103 6.98925223889095 -3.75269575213992 T:C C T 10 0.537634787606996 0.116362777464643 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525135:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000525543:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000533554:exon_43472732_43472815:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000418561:exon_43472730_43472815:TTC17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 43876698 C/T 1 36 23 59 16.6451476461481 12.3656001149609 4.27954753118723 T:C C T 10 0.537634787606996 0.297184491758251 ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 55 42 97 25.4300866816152 22.5806610794938 2.84942560212139 T:G G T 10 0.537634787606996 0.611146682105949 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 280 228 508 129.462259470041 122.580731574395 6.88152789564603 A:G A G 10 0.537634787606996 0.563055768296808 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 44640640 C/G 1 242 279 521 111.892381399107 150.000105742352 -38.1077243432449 C:G C G 10 0.537634787606996 0.000833543225345088 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640599_44641913:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640599_44641313:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640599_44640676:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640599_44640884:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640599_44640933:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640599_44640825:CD82;ENSG00000085117:ENST00000524750:exon_44640599_44641259:CD82 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 45827350 A/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000181830:ENST00000314134:exon_45825957_45827887:SLC35C1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 46339011 G/A 1 16 11 27 7.39784339828806 5.91398266367696 1.48386073461111 A:G G A 10 0.537634787606996 0.700336022866229 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 44 53 97 20.3440693452922 28.4946437431708 -8.15057439787861 T:C C T 10 0.537634787606996 0.103629749358236 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 47772545 T/C 1 22 17 39 10.1720346726461 9.13979138931893 1.03224328332716 T:C T C 10 0.537634787606996 0.872688550094881 ENSG00000109920:ENST00000263773:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000526109:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000532646:exon_47772468_47772588:FNBP4;ENSG00000109920:ENST00000534003:exon_47772468_47772588:FNBP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 T:C T C 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 57509690 G/A 1 500 552 1052 231.182606196502 296.774402759062 -65.5917965625598 A:G G A 10 0.537634787606996 5.71422395361945e-05 ENSG00000211450:ENST00000534355:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000533321:exon_57509281_57510529:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000388857:exon_57509589_57510129:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000528798:exon_57509589_57509699:C11orf31;ENSG00000211450:ENST00000534386:exon_57509589_57509719:C11orf31;ENSG00000254732:ENST00000531074:exon_57509635_57509719:RP11-691N7.6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 17 13 30 7.86020861068107 6.98925223889095 0.870956371790119 T:C C T 10 0.537634787606996 0.855382105439278 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 58893761 C/G 1 50 33 83 23.1182606196502 17.7419479910309 5.37631262861933 C:G C G 10 0.537634787606996 0.271139452202696 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 13 35 48 6.01074776110905 18.8172175662449 -12.8064698051358 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000228793992939126 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 59405833 A/G 1 49 20 69 22.6558954072572 10.7526957521399 11.9031996551173 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00510597809556555 ENSG00000166889:ENST00000300146:exon_59404189_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000428532:exon_59404194_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000435054:exon_59404550_59405884:PATL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 59405837 A/T 1 46 12 58 21.2687997700782 6.45161745128395 14.8171823187942 A:T:G A T 10 0.537634787606996 9.56063470329484e-05 ENSG00000166889:ENST00000300146:exon_59404189_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000428532:exon_59404194_59405884:PATL1;ENSG00000166889:ENST00000435054:exon_59404550_59405884:PATL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 59573999 C/T 1 233 229 462 107.73109448757 123.118366362002 -15.3872718744322 T:C C T 10 0.537634787606996 0.161547475617957 ENSG00000166902:ENST00000300151:exon_59573608_59574305:MRPL16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60184191 G/A 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G G A 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000166928:ENST00000531787:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000300187:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000395005:exon_60182910_60185161:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000530662:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000527841:exon_60182910_60185158:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000525397:exon_60182910_60185036:MS4A14;ENSG00000166928:ENST00000531783:exon_60182910_60185161:MS4A14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 32 43 75 14.7956867965761 23.1182958671008 -8.3226090705247 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0634207034881647 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60610065 G/A 1 39 33 72 18.0322432833272 17.7419479910309 0.290295292296285 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 231 175 406 106.806364062784 94.0860878312243 12.7202762315596 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.213551742998705 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60673868 T/C 1 65 81 146 30.0537388055453 43.5484177961667 -13.4946789906214 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0305815201748326 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60703777 G/A 1 14 4 18 6.47311297350206 2.15053915042798 4.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0563281922879415 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60704213 C/T 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 T:C C T 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 60705372 C/T 1 308 226 534 142.408485417045 121.505461999181 20.9030234178641 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0751017668464614 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60705342_60705497:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60705342_60705497:SLC15A3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 61906374 T/C 1 8 12 20 3.69892169914403 6.45161745128395 -2.75269575213992 T:C T C 10 0.537634787606996 0.264150080115426 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64111076 C/G 1 11 17 28 5.08601733632304 9.13979138931893 -4.05377405299589 C:G C G 10 0.537634787606996 0.133275989284545 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64110979_64111087:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111011_64111087:CCDC88B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64572018 T/C 1 43 27 70 19.8817041328992 14.5161392653889 5.36556486751028 T:C T C 10 0.537634787606996 0.230741885219935 ENSG00000133895:ENST00000377316:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64570988_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64570996_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64571806_64572288:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64571847_64572288:MEN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64572602 G/A 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 A:G G A 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000133895:ENST00000377321:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377326:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000312049:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000315422:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000448517:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000449150:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000337652:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394376:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394373:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000443283:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000394374:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000417021:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000377313:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000478548:exon_64572506_64572670:MEN1;ENSG00000133895:ENST00000487019:exon_64572598_64572670:MEN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 13 16 29 6.01074776110905 8.60215660171194 -2.59140884060288 T:C C T 10 0.537634787606996 0.356797644500513 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64812857 G/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G G A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64812295_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64812297_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64812698_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64812708_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64812743_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64812776_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64812785_64812929:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64812823_64812929:NAALADL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64884052 G/A 1 23 25 48 10.6343998850391 13.4408696901749 -2.80646980513581 A:G G A 10 0.537634787606996 0.470080372152311 ENSG00000174276:ENST00000310597:exon_64883876_64885170:ZNHIT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 64950970 C/T 1 59 39 98 27.2795475311872 20.9677567166728 6.31179081451439 T:C C T 10 0.537634787606996 0.224339675210512 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950945_64951139:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950946_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950945_64951053:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950945_64951014:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950945_64950974:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950945_64951052:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64950945_64951063:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526468:exon_64950807_64951063:CAPN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65064690 G/A 1 25 22 47 11.5591303098251 11.8279653273539 -0.268835017528811 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000014138:ENST00000265465:exon_65064591_65066156:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000527618:exon_65064591_65065087:POLA2;ENSG00000014138:ENST00000534785:exon_65064591_65065023:POLA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65101378 T/C 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 T:C T C 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000133884:ENST00000528416:exon_65101225_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000444314:exon_65101323_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000415073:exon_65101326_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000530993:exon_65101333_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000252268:exon_65101338_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000524666:exon_65101344_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532264:exon_65101346_65101389:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532102:exon_65101348_65101389:DPF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65161129 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000528854:exon_65161044_65161226:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000533782:exon_65161044_65161145:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65161044_65161145:FRMD8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65408937 C/T 1 20 28 48 9.24730424786008 15.0537740529959 -5.80646980513581 T:C C T 10 0.537634787606996 0.110889470500708 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65408302_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65408272_65409071:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65408300_65409071:SIPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65546857 A/C 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 A:C A C 10 0.537634787606996 0.241086138959429 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65547455 C/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:C C A 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65732651 G/A 1 44 49 93 20.3440693452922 26.3441045927428 -6.00003524745063 A:G G A 10 0.537634787606996 0.214130647472533 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 65735174 G/C 1 74 80 154 34.2150257170823 43.0107830085597 -8.79575729147739 C:G G C 10 0.537634787606996 0.169495870537554 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65735150_65735292:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65735150_65735292:SART1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66033430 C/T 1 15 16 31 6.93547818589506 8.60215660171194 -1.66667841581688 T:C C T 10 0.537634787606996 0.591800204585549 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033325_66033483:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033325_66033483:KLC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66056457 G/A 1 36 24 60 16.6451476461481 12.9032349025679 3.74191274358024 A:G G A 10 0.537634787606996 0.366218091258373 ENSG00000174851:ENST00000471387:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000359461:exon_66056426_66056616:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376901:exon_66056426_66056641:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376904:exon_66056426_66056620:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000484814:exon_66056426_66056599:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000431556:exon_66056426_66056478:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000528575:exon_66056426_66056508:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000376899:exon_66056426_66056614:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000474986:exon_66056426_66056608:YIF1A;ENSG00000174851:ENST00000534374:exon_66056426_66056606:YIF1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66105194 G/A 1 125 89 214 57.7956515491255 47.8494960970226 9.94615545210286 A:G G A 10 0.537634787606996 0.192638302151874 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66104804_66105278:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66104810_66105360:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66104840_66105360:BRMS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66108483 C/T 1 71 59 130 32.8279300799033 31.7204524688128 1.10747761109052 T:C C T 10 0.537634787606996 0.860841376422674 ENSG00000174744:ENST00000425825:exon_66108438_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000524699:exon_66108438_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000359957:exon_66108438_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530238:exon_66108438_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000394043:exon_66108444_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000527375:exon_66108438_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000530756:exon_66108438_66108517:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000534617:exon_66108245_66108804:BRMS1;ENSG00000174744:ENST00000525127:exon_66108245_66108517:BRMS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66206169 C/T 1 35 32 67 16.1827824337551 17.2043132034239 -1.02153076966873 T:C C T 10 0.537634787606996 0.807746227920153 ENSG00000174547:ENST00000310999:exon_66206103_66206319:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000534488:exon_66206103_66206297:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000329819:exon_66206103_66206305:MRPL11;ENSG00000174547:ENST00000394025:exon_66206103_66206295:MRPL11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66260623 G/A 1 39 27 66 18.0322432833272 14.5161392653889 3.51610401793826 A:G G A 10 0.537634787606996 0.459163229005015 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260538_66260650:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260538_66260650:DPP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 66272142 A/G 1 37 47 84 17.1075128585411 25.2688350175288 -8.16132215898766 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0802020700631325 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 67378838 C/G 1 6 13 19 2.77419127435802 6.98925223889095 -4.21506096453292 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0652151303023661 ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 67926218 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000110066:ENST00000304363:exon_67922330_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000424360:exon_67923507_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000441488:exon_67925047_67926638:SUV420H1;ENSG00000110066:ENST00000427752:exon_67925760_67926638:SUV420H1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 68703959 A/G 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G A G 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 68704264 C/T 1 9 16 25 4.16128691153704 8.60215660171194 -4.4408696901749 T:C C T 10 0.537634787606996 0.106777127582249 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 71193052 C/T 0 68 0 68 31.4408344427243 0 31.4408344427243 C C 10 0.537634787606996 5.23453027332417e-19 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527852:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71192969_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71193047_71193071:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71191857_71193071:NADSYN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 113 68 181 52.2472690004095 36.5591655572757 15.6881034431337 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0207003480492721 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 111 75 186 51.3225385756234 40.3226090705247 10.9999295050987 A:T:G T G 10 0.537634787606996 0.122308921290903 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 72040784 T/C 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 T:C T C 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72040751_72040848:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72040751_72040848:CLPB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 72415329 G/A 1 12 17 29 5.54838254871605 9.13979138931893 -3.59140884060288 A:G G A 10 0.537634787606996 0.196225448340524 ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72415197_72415379:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72415197_72415379:ARAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 73106237 A/C 1 10 9 19 4.62365212393004 4.83871308846296 -0.215060964532925 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 73106294 A/C 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:C A C 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 73760413 G/T 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:G G T 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73760382_73760587:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73760382_73760587:C2CD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 73785326 T/C 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000168014:ENST00000334126:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313663:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000313681:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000289350:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000414160:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000442398:exon_73785298_73785645:C2CD3;ENSG00000168014:ENST00000415191:exon_73785298_73785645:C2CD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75277621 C/T 1 14 7 21 6.47311297350206 3.76344351324897 2.70966946025308 T:C C T 10 0.537634787606996 0.27805722506375 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75277628 A/G 1 13 9 22 6.01074776110905 4.83871308846296 1.17203467264609 A:G A G 10 0.537634787606996 0.673592113272102 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277512_75277726:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277395_75277700:SERPINH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 10 3 13 4.62365212393004 1.61290436282099 3.01074776110905 C:G C G 10 0.537634787606996 0.104163295807923 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 14 16 30 6.47311297350206 8.60215660171194 -2.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.467935176210095 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 29 16 45 13.4085911593971 8.60215660171194 4.80643455768518 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.178666062489021 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 75851997 T/C 1 30 17 47 13.8709563717901 9.13979138931893 4.73116498247119 T:C T C 10 0.537634787606996 0.188957263346235 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 76257215 T/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000158636:ENST00000524490:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000334736:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000393457:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000524767:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000533248:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525919:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000525038:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000529032:exon_76256841_76257341:C11orf30;ENSG00000158636:ENST00000531793:exon_76256992_76257341:C11orf30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 2 12 14 0.924730424786008 6.45161745128395 -5.52688702649794 T:G T G 10 0.537634787606996 0.00506194045584868 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 82535963 C/T 1 54 38 92 24.9677214692222 20.4301219290658 4.53759954015637 T:C C T 10 0.537634787606996 0.349269869819418 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82534544_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532767:exon_82535409_82542480:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82535410_82536164:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532709:exon_82535415_82536164:PRCP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 59 32 91 27.2795475311872 17.2043132034239 10.0752343277634 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0355970637424776 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 82996986 A/C 1 18 12 30 8.32257382307407 6.45161745128395 1.87095637179012 A:C A C 10 0.537634787606996 0.584234293333663 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82996916_82997450:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82996596_82997394:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82996916_82997397:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82996170_82997041:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82996916_82997253:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82996916_82997398:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82996916_82997022:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82996916_82997021:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000534753:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527025:exon_82996916_82997033:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000528149:exon_82996596_82997128:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526265:exon_82996916_82997031:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525916:exon_82996596_82997011:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000530253:exon_82996916_82997007:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000526631:exon_82996916_82997021:CCDC90B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 85692181 A/C 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 A:C A C 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530692:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532603:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85692172_85692271:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85692172_85692271:PICALM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 85725937 C/T 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000534412:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531771:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531558:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000531930:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532041:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000525162:exon_85725913_85726006:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528256:exon_85725913_85726006:PICALM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 85968623 C/T 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85968557_85968638:EED;ENSG00000074266:ENST00000525244:exon_85968557_85968638:EED HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:G G A 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 25 13 38 11.5591303098251 6.98925223889095 4.56987807093415 T:G G T 10 0.537634787606996 0.146285529665851 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 93212245 C/T 1 51 43 94 23.5806258320432 23.1182958671008 0.462329964942374 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 40 46 86 18.4946084957202 24.7312002299218 -6.23659173420166 T:C C T 10 0.537634787606996 0.194730549127742 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 54 66 120 24.9677214692222 35.4838959820617 -10.5161745128395 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0550718834635053 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 102196019 A/G 1 42 41 83 19.4193389205062 22.0430262918868 -2.62368737138067 A:G A G 10 0.537634787606996 0.583381452632444 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102195694_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527309:exon_102195952_102196093:BIRC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 25 39 64 11.5591303098251 20.9677567166728 -9.40862640684774 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0233386683945444 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 15 21 36 6.93547818589506 11.2903305397469 -4.35485235385186 C:G G C 10 0.537634787606996 0.180786316268929 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 107682509 G/C 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 C:G G C 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000110660:ENST00000525815:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000525071:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000265836:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000533664:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000375682:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000429869:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000532513:exon_107682393_107682520:SLC35F2;ENSG00000110660:ENST00000524991:exon_107682393_107682520:SLC35F2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 111724133 C/T 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000086848:ENST00000524457:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000532374:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000531154:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000398006:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527228:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000433884:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000320165:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000530851:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527883:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527714:exon_111724103_111724208:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000524386:exon_111724103_111724208:FDXACB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 111747297 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000086848:ENST00000524880:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000428306:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000086848:ENST00000527377:exon_111747205_111747363:FDXACB1;ENSG00000255561:ENST00000260257:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000531487:exon_111747205_111747363:AP001781.3;ENSG00000255561:ENST00000528274:exon_111747205_111747363:AP001781.3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 90 75 165 41.6128691153704 40.3226090705247 1.29026004484566 A:C A C 10 0.537634787606996 0.876071525782175 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 111908162 T/C 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111907997_111908184:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111907997_111908184:DLAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 111916647 G/A 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:G G A 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000452417:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111916587_111916694:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111916587_111916694:DLAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 113194168 A/C 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:C A C 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000149292:ENST00000529221:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000429951:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000442859:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000531164:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000529850:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000436332:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000314756:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000278593:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000504025:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000520742:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000525965:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000464224:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000494714:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000393020:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000455306:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000489064:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000527781:exon_113194010_113194173:TTC12;ENSG00000149292:ENST00000483239:exon_113194010_113194173:TTC12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 T:C C T 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 117063003 G/A 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 25 15 40 11.5591303098251 8.06452181410494 3.49460849572016 A:G A G 10 0.537634787606996 0.341538836630786 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 117266312 C/G 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 C:G C G 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117266263_117266438:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117266263_117266438:CEP164 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 117267884 A/G 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 A:G A G 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117267807_117268029:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117267807_117268029:CEP164 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118925341 G/A 1 15 17 32 6.93547818589506 9.13979138931893 -2.20431320342387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.48073676974361 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925206_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925211_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925249_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925280_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925297_118925387:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925333_118925387:HYOU1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 C:G C G 10 0.537634787606996 0.613543744758255 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 18 7 25 8.32257382307407 3.76344351324897 4.5591303098251 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0733259257172696 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118949331 C/T 1 8 15 23 3.69892169914403 8.06452181410494 -4.36560011496091 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0926563791565774 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 65 49 114 30.0537388055453 26.3441045927428 3.70963421280245 A:G A G 10 0.537634787606996 0.511820278268995 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118955679 C/T 1 20 16 36 9.24730424786008 8.60215660171194 0.645147646148143 T:C C T 10 0.537634787606996 0.868665308863489 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118955716 A/C 1 12 19 31 5.54838254871605 10.2150609645329 -4.66667841581688 A:C A C 10 0.537634787606996 0.105911893174481 ENSG00000149397:ENST00000278715:exon_118955587_118955776:HMBS;ENSG00000149397:ENST00000442944:exon_118955624_118955776:HMBS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 44 40 84 20.3440693452922 21.5053915042798 -1.16132215898767 T:C T C 10 0.537634787606996 0.827303024292308 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 15 7 22 6.93547818589506 3.76344351324897 3.17203467264609 T:C C T 10 0.537634787606996 0.203403174234821 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 119052826 C/A 1 14 8 22 6.47311297350206 4.30107830085597 2.17203467264609 A:C C A 10 0.537634787606996 0.398402068910229 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 121475922 T/A 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:T T A 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121475822_121475948:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121475822_121475948:SORL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 122928622 A/G 1 2174 2413 4587 1005.18197174239 1297.31274249568 -292.130770753291 A:C:G A G 10 0.537634787606996 6.18723682645711e-18 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122928197_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928204_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122928205_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122928206_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122928409_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122928487_122928627:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122928587_122928627:HSPA8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 2030 1800 3830 938.601381157798 967.742617692593 -29.1412365347948 A:T:C:G T G 10 0.537634787606996 0.347319174745913 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 124502114 C/T 1 29 28 57 13.4085911593971 15.0537740529959 -1.64518289359877 T:C C T 10 0.537634787606996 0.691670698016804 ENSG00000154144:ENST00000473629:exon_124501989_124502330:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000530731:exon_124501989_124502348:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000284290:exon_124501989_124505287:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000441174:exon_124501989_124504698:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000375005:exon_124501989_124502331:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000529543:exon_124501989_124503320:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000438907:exon_124501989_124502134:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000491010:exon_124500284_124502339:TBRG1;ENSG00000154144:ENST00000531033:exon_124501989_124502301:TBRG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 124506967 C/T 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000110013:ENST00000263593:exon_124503009_124507098:SIAE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 27 7 34 12.4838607346111 3.76344351324897 8.72041722136214 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00292391307554008 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 124863136 C/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000149548:ENST00000529051:exon_124863065_124863139:CCDC15;ENSG00000149548:ENST00000344762:exon_124863065_124863139:CCDC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 38 24 62 17.5698780709342 12.9032349025679 4.66664316836625 A:G A G 10 0.537634787606996 0.253419009050759 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 49 41 90 22.6558954072572 22.0430262918868 0.612869115370358 A:G G A 10 0.537634787606996 0.916224215589184 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 59 48 107 27.2795475311872 25.8064698051358 1.47307772605143 C:G C G 10 0.537634787606996 0.84638067859697 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 11 8 19 5.08601733632304 4.30107830085597 0.784939035467076 A:C C A 10 0.537634787606996 0.819985066606254 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 125769354 T/C 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 126074192 A/G 1 14 15 29 6.47311297350206 8.06452181410494 -1.59140884060288 A:G A G 10 0.537634787606996 0.580786129565456 ENSG00000165526:ENST00000298317:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000533628:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000526942:exon_126074126_126074223:RPUSD4;ENSG00000165526:ENST00000530903:exon_126074126_126074223:RPUSD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 126135973 C/T 1 40 71 111 18.4946084957202 38.1720699200967 -19.6774614243766 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000187933728011789 ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126135858_126135976:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000527817:exon_126135858_126135976:SRPR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 126174038 C/T 1 23 33 56 10.6343998850391 17.7419479910309 -7.10754810599178 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0611330399831583 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 60 49 109 27.7419127435802 26.3441045927428 1.39780815083743 T:C C T 10 0.537634787606996 0.847819284716913 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 71 52 123 32.8279300799033 27.9570089555638 4.87092112433949 T:C T C 10 0.537634787606996 0.41604671382397 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 128333503 T/C 1 22 20 42 10.1720346726461 10.7526957521399 -0.580661079493833 T:C T C 10 0.537634787606996 0.878096448120565 ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 128350102 G/C 1 13 21 34 6.01074776110905 11.2903305397469 -5.27958277863786 C:G G C 10 0.537634787606996 0.084822142447569 ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128350086_128350346:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128350086_128350346:ETS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 128628087 C/T 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000151702:ENST00000527767:exon_128628010_128628221:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128628010_128628221:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128628010_128628221:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128628010_128628221:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128628010_128628221:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128628010_128628221:FLI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 134022846 G/T 1 63 48 111 29.1290083807593 25.8064698051358 3.32253857562344 A:T:G G T 10 0.537634787606996 0.568425793585503 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134022337_134022947:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134022337_134022947:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134022340_134022947:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000533460:exon_134022341_134022947:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134022742_134022947:NCAPD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 11 134244123 C/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 C:G C G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000149328:ENST00000339772:exon_134244039_134244150:GLB1L2;ENSG00000149328:ENST00000389881:exon_134244039_134244150:GLB1L2;ENSG00000149328:ENST00000525089:exon_134244039_134244150:GLB1L2;ENSG00000149328:ENST00000529077:exon_134244039_134244150:GLB1L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 23 20 43 10.6343998850391 10.7526957521399 -0.11829586710083 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 520947 A/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:C A C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_520913_521144:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_520913_521144:CCDC77 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 15 6 21 6.93547818589506 3.22580872564198 3.70966946025308 A:G G A 10 0.537634787606996 0.126802656559472 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 4461485 G/A 1 26 19 45 12.0214955222181 10.2150609645329 1.80643455768518 A:G G A 10 0.537634787606996 0.655035280486387 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 4083 3946 8029 1887.83716220064 2121.50687189721 -233.669709696571 A:T:C:G C G 10 0.537634787606996 1.82021916329864e-07 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4017 3881 7898 1857.3210581827 2086.56061070275 -229.239552520055 A:T:C:G T C 10 0.537634787606996 2.49164078788503e-07 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 6715527 G/A 1 20 22 42 9.24730424786008 11.8279653273539 -2.58066107949383 A:G G A 10 0.537634787606996 0.442745837417781 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6715440_6715617:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6715440_6715617:CHD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 45 43 88 20.8064345576852 23.1182958671008 -2.31186130941565 A:G G A 10 0.537634787606996 0.66933509918334 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 7022085 T/A 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:T T A 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7021894_7022191:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7021894_7022191:LRRC23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 9 14 23 4.16128691153704 7.52688702649794 -3.36560011496091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.209214096015871 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 10854718 G/A 1 167 253 420 77.2149904696317 136.02160126457 -58.8066107949383 A:G G A 10 0.537634787606996 1.11299386233693e-08 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 12814330 T/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C T C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 33 20 53 15.2580520089691 10.7526957521399 4.50535625682921 T:C C T 10 0.537634787606996 0.270297368908178 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 14924028 A/G 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G A G 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000197837:ENST00000358064:exon_14923613_14924065:HIST4H4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 14976021 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 14976553 G/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 C:G G C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 2111 1861 3972 976.052963361631 1000.53833973662 -24.4853763749882 A:T:C:G C G 10 0.537634787606996 0.435628059839107 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 16189694 T/A 1 31 19 50 14.3333215841831 10.2150609645329 4.1182606196502 A:T T A 10 0.537634787606996 0.259426212001916 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16189624_16190220:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16189624_16190214:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16189624_16190209:DERA;ENSG00000023697:ENST00000530274:exon_16189624_16189747:DERA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 16516994 G/A 1 42 40 82 19.4193389205062 21.5053915042798 -2.08605258377368 A:G G A 10 0.537634787606996 0.659153964970889 ENSG00000008394:ENST00000010404:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396210:exon_16516729_16517342:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396209:exon_16516729_16517343:MGST1;ENSG00000008394:ENST00000396207:exon_16516729_16517343:MGST1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 21623969 A/G 1 34 65 99 15.7204172213621 34.9462611944547 -19.2258439730926 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000112541742664884 ENSG00000121350:ENST00000240651:exon_21621440_21624176:PYROXD1;ENSG00000004700:ENST00000396093:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000444129:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000421138:exon_21623903_21624032:RECQL;ENSG00000004700:ENST00000314748:exon_21623903_21624032:RECQL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 22213786 C/T 1 37 39 76 17.1075128585411 20.9677567166728 -3.8602438581317 T:C C T 10 0.537634787606996 0.42100526791243 ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 3 9 12 1.38709563717901 4.83871308846296 -3.45161745128395 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0780364380088052 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 22814036 A/G 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 A:G A G 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000139163:ENST00000381409:exon_22813997_22814139:ETNK1;ENSG00000139163:ENST00000266517:exon_22813997_22814139:ETNK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 57 43 100 26.3548171064012 23.1182958671008 3.2365212393004 C:G C G 10 0.537634787606996 0.548284647886955 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 32481093 G/C 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 C:G G C 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000151746:ENST00000457150:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000281474:exon_32480395_32481489:BICD1;ENSG00000151746:ENST00000395758:exon_32480395_32481489:BICD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 46322449 C/T 1 13 11 24 6.01074776110905 5.91398266367696 0.0967650974320957 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46319925_46322642:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000465950:exon_46319925_46323748:SRSF2IP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 46328251 A/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G A G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000139218:ENST00000369367:exon_46328230_46328288:SRSF2IP;ENSG00000139218:ENST00000484275:exon_46328230_46328288:SRSF2IP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 48359984 C/T 1 6 15 21 2.77419127435802 8.06452181410494 -5.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0269830701497456 ENSG00000134291:ENST00000256686:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000434888:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000429772:exon_48359872_48360012:TMEM106C;ENSG00000134291:ENST00000424902:exon_48359872_48360012:TMEM106C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 12 24 36 5.54838254871605 12.9032349025679 -7.35485235385186 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0182077826494164 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 50189807 C/A 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167566:ENST00000335999:exon_50188548_50191177:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000433948:exon_50188548_50190785:NCKAP5L;ENSG00000167566:ENST00000354423:exon_50189321_50191177:NCKAP5L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 50232169 A/T 1 8 19 27 3.69892169914403 10.2150609645329 -6.51613926538889 A:T A T 10 0.537634787606996 0.0187885136530656 ENSG00000186666:ENST00000333924:exon_50231560_50232798:BCDIN3D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 50529736 G/A 1 13 15 28 6.01074776110905 8.06452181410494 -2.05377405299589 A:G G A 10 0.537634787606996 0.45452184329692 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50529724_50529852:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50529724_50529852:LASS5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 50537815 A/G 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50537735_50537840:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50537735_50537840:LASS5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 51488972 C/T 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000135457:ENST00000257915:exon_51488624_51489061:TFCP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 53670545 C/A 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:C C A 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53670404_53670643:ESPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 A:G G A 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 53682457 G/A 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 53777171 A/G 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:G A G 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000185591:ENST00000327443:exon_53775894_53777406:SP1;ENSG00000185591:ENST00000426431:exon_53775894_53777406:SP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 54651471 A/G 1 44 43 87 20.3440693452922 23.1182958671008 -2.77422652180865 A:G A G 10 0.537634787606996 0.591429045711947 ENSG00000094916:ENST00000439541:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000454593:exon_54651298_54651476:CBX5;ENSG00000094916:ENST00000209875:exon_54651298_54651476:CBX5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 55355033 C/T 1 70 29 99 32.3655648675103 15.5914088406029 16.7741560269074 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00079486240355752 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 55368245 G/A 1 22 2 24 10.1720346726461 1.07526957521399 9.0967650974321 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000109461487198179 ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000525978:exon_55368184_55368342:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524668:exon_55368184_55368391:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533607:exon_55368204_55368391:KIAA0748 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 16 5 21 7.39784339828806 2.68817393803498 4.70966946025308 C:G C G 10 0.537634787606996 0.047937054631284 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 56814653 G/A 1 18 23 41 8.32257382307407 12.3656001149609 -4.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.213992367371181 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56814597_56814665:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56814597_56814665:TIMELESS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57106810 G/A 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.484061368023196 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 2838 2870 5708 1312.19247277135 1543.01184043208 -230.819367660733 A:T:G A G 10 0.537634787606996 1.00176610677936e-09 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57133140 T/G 1 33 18 51 15.2580520089691 9.67742617692593 5.5806258320432 T:G T G 10 0.537634787606996 0.124268748846173 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57133078_57133147:PRIM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57146069 T/G 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000198056:ENST00000338193:exon_57145980_57146146:PRIM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 262 270 532 121.139685646967 145.161392653889 -24.0217070069219 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0369643084944743 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 T:C C T 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 57926791 T/G 1 93 81 174 42.9999647525494 43.5484177961667 -0.5484530436173 T:G T G 10 0.537634787606996 0.9395463574505 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57926767_57926805:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57926767_57926805:DCTN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 62979216 G/A 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000061987:ENST00000393632:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393630:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000280379:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000393629:exon_62979074_62979281:MON2;ENSG00000061987:ENST00000261188:exon_62979074_62979281:MON2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 36 24 60 16.6451476461481 12.9032349025679 3.74191274358024 A:G A G 10 0.537634787606996 0.366218091258373 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 66725202 C/T 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:C C T 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 68707287 G/A 1 9 2 11 4.16128691153704 1.07526957521399 3.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0736764045328896 ENSG00000111554:ENST00000411698:exon_68707223_68707332:MDM1;ENSG00000111554:ENST00000303145:exon_68707223_68707332:MDM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 69233215 A/G 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 A:G A G 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69233054_69233629:MDM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 69646914 G/A 1 35 37 72 16.1827824337551 19.8924871414589 -3.70970470770371 A:G G A 10 0.537634787606996 0.409119227443947 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69646831_69646934:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69646831_69646934:CPSF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 75900588 A/G 1 11 22 33 5.08601733632304 11.8279653273539 -6.74194799103087 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0224446403984102 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900562_75900696:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900562_75900696:KRR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 75902186 T/C 1 19 20 39 8.78493903546708 10.7526957521399 -1.96775671667285 T:C T C 10 0.537634787606996 0.526456738496174 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 80190650 C/G 1 107 119 226 49.4730777260514 63.9785397252325 -14.5054619991811 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0615426311529575 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 88440676 G/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 C:G G C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000133641:ENST00000356891:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000453037:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000332476:exon_88440584_88440753:C12orf29;ENSG00000133641:ENST00000413893:exon_88440584_88440753:C12orf29 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 88500847 T/C 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88500773_88500875:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88500773_88500875:CEP290 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 94975799 G/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G G A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 94976084 T/C 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 T:C T C 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 94976159 T/C 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000057704:ENST00000261226:exon_94975398_94976314:TMCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 105380152 A/C 1 6 17 23 2.77419127435802 9.13979138931893 -6.36560011496091 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0106176688746952 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105380098_105380245:C12orf45 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 105551056 A/G 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:G A G 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000136051:ENST00000332180:exon_105551014_105551100:KIAA1033 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 106633569 C/T 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C C T 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 106903321 T/C 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 T:C T C 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000013503:ENST00000228347:exon_106903198_106903974:POLR3B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 75 87 162 34.6773909294753 46.7742265218087 -12.0968355923333 A:T A T 10 0.537634787606996 0.0588160806725595 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 T:G G T 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 14 16 30 6.47311297350206 8.60215660171194 -2.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.467935176210095 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 110295436 G/T 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:G G T 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000139433:ENST00000318348:exon_110295331_110295464:GLTP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 112191641 G/A 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112191576_112191719:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000512792:exon_112191511_112191719:ACAD10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 112460147 T/G 1 287 328 615 132.698815956792 176.344210335095 -43.6453943783025 T:C:G T G 10 0.537634787606996 0.000429817415219848 ENSG00000089248:ENST00000261735:exon_112459954_112461024:ERP29;ENSG00000089248:ENST00000455836:exon_112459954_112461024:ERP29 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 112580071 C/T 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C C T 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 113875765 C/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:C C A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113875691_113876080:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113875691_113876080:SDSL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 114261053 G/A 1 21 13 34 9.70966946025308 6.98925223889095 2.72041722136214 A:G G A 10 0.537634787606996 0.392789340374168 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114259863_114261126:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114261014_114261126:RBM19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 114377885 G/C 1 12 13 25 5.54838254871605 6.98925223889095 -1.4408696901749 C:G G C 10 0.537634787606996 0.689190544257236 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 117584066 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000135108:ENST00000330622:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000427718:exon_117581586_117584082:FBXO21;ENSG00000135108:ENST00000257563:exon_117581586_117584082:FBXO21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 22 23 45 10.1720346726461 12.3656001149609 -2.19356544231482 T:C T C 10 0.537634787606996 0.551643147949618 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 118682751 C/T 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000135090:ENST00000392533:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000359811:exon_118682699_118682770:TAOK3;ENSG00000135090:ENST00000419821:exon_118682699_118682770:TAOK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 120589160 A/G 1 3 8 11 1.38709563717901 4.30107830085597 -2.91398266367696 A:G A G 10 0.537634787606996 0.127234760608112 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121017171 A/G 1 86 91 177 39.7634082657983 48.9247656722366 -9.1613574064383 A:G A G 10 0.537634787606996 0.175179804900355 ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121174938 C/T 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121176083 G/A 1 23 12 35 10.6343998850391 6.45161745128395 4.18278243375514 A:G G A 10 0.537634787606996 0.176949798947407 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176083_121176253:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176083_121176253:ACADS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121177272 G/C 1 38 36 74 17.5698780709342 19.3548523538519 -1.78497428291771 C:G G C 10 0.537634787606996 0.727021401548348 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121177099_121177810:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121177099_121177810:ACADS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121454257 T/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:T T A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121454133_121454300:C12orf43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121458400 C/T 1 27 18 45 12.4838607346111 9.67742617692593 2.80643455768518 T:C C T 10 0.537634787606996 0.456159000104129 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121458121_121458861:OASL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121471337 G/A 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121471264_121471546:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121471264_121471546:OASL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121878659 C/T 1 24 24 48 11.0967650974321 12.9032349025679 -1.80646980513581 T:C C T 10 0.537634787606996 0.664883231073284 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121878619_121878780:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121878619_121878780:KDM2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121880520 G/A 1 16 22 38 7.39784339828806 11.8279653273539 -4.43012192906585 A:G G A 10 0.537634787606996 0.192481638651843 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121879960_121880639:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121879960_121880642:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121879960_121880639:KDM2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 121881848 G/A 1 19 35 54 8.78493903546708 18.8172175662449 -10.0322785307778 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00886909434017984 ENSG00000089094:ENST00000377069:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000377071:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000397480:exon_121881815_121882075:KDM2B;ENSG00000089094:ENST00000261824:exon_121881815_121882084:KDM2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 122079441 T/C 1 88 86 174 40.6881386905844 46.2365917342017 -5.54845304361731 T:C T C 10 0.537634787606996 0.404029418648765 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 122186317 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122186232_122186348:TMEM120B;ENSG00000188735:ENST00000342607:exon_122186232_122186348:TMEM120B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 42 49 91 19.4193389205062 26.3441045927428 -6.92476567223664 A:G A G 10 0.537634787606996 0.171421556110022 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 122617989 A/G 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 A:G A G 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122617982_122618077:MLXIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 122618131 A/G 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000175727:ENST00000319080:exon_122617895_122618534:MLXIP;ENSG00000175727:ENST00000377037:exon_122618129_122618689:MLXIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 122812503 G/C 1 24 20 44 11.0967650974321 10.7526957521399 0.344069345292175 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000130779:ENST00000361654:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000358808:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000302528:exon_122812494_122812709:CLIP1;ENSG00000130779:ENST00000392458:exon_122812494_122812709:CLIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 123105143 C/T 1 31 45 76 14.3333215841831 24.1935654423148 -9.8602438581317 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0282770589840200 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123105026_123105155:KNTC1;ENSG00000196917:ENST00000356987:exon_123104824_123105249:GPR81 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 62 41 103 28.6666431683662 22.0430262918868 6.62361687647941 A:G A G 10 0.537634787606996 0.200057235477737 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 51 45 96 23.5806258320432 24.1935654423148 -0.612939610271617 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.918752056587509 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 16 15 31 7.39784339828806 8.06452181410494 -0.666678415816877 A:G A G 10 0.537634787606996 0.858217650481407 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 124209332 T/C 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C T C 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124209201_124209338:ATP6V0A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125434580 C/T 1 18 15 33 8.32257382307407 8.06452181410494 0.25805200896913 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434532_125434605:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125434716 G/A 1 13 16 29 6.01074776110905 8.60215660171194 -2.59140884060288 A:G G A 10 0.537634787606996 0.356797644500513 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125434695_125434789:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125437019 T/C 1 14 7 21 6.47311297350206 3.76344351324897 2.70966946025308 T:C T C 10 0.537634787606996 0.27805722506375 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125436944_125437116:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125438516 T/C 1 18 5 23 8.32257382307407 2.68817393803498 5.63439988503909 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0206331180675183 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125438523 C/T 1 18 5 23 8.32257382307407 2.68817393803498 5.63439988503909 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0206331180675183 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125438426_125438542:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125441359 T/C 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 T:C T C 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 10 15 25 4.62365212393004 8.06452181410494 -3.4408696901749 T:C C T 10 0.537634787606996 0.228198563346042 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 125561151 A/G 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000081760:ENST00000316519:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000261686:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000418937:exon_125561037_125561157:AACS;ENSG00000081760:ENST00000316543:exon_125561037_125561157:AACS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 39 57 96 18.0322432833272 30.6451828935988 -12.6129396102716 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0104281157220534 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 132624720 C/T 1 24 14 38 11.0967650974321 7.52688702649794 3.56987807093415 T:C C T 10 0.537634787606996 0.259608331084328 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624643_132624744:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624643_132624744:DDX51 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 132635581 C/T 1 18 35 53 8.32257382307407 18.8172175662449 -10.4946437431708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00535477857847182 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132635526_132635586:NOC4L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 22 12 34 10.1720346726461 6.45161745128395 3.72041722136214 T:C T C 10 0.537634787606996 0.230589279923386 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133219831 T/C 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133219810_133219916:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133219810_133219916:POLE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133306589 C/T 1 44 53 97 20.3440693452922 28.4946437431708 -8.15057439787861 T:C C T 10 0.537634787606996 0.103629749358236 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 7 13 20 3.23655648675103 6.98925223889095 -3.75269575213992 A:G G A 10 0.537634787606996 0.116362777464643 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133357412 T/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133363006 G/A 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133362925_133363141:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133362925_133363141:GOLGA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133384864 G/A 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133384477_133385135:GOLGA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133384887 C/T 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 T:C C T 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133384477_133385135:GOLGA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133393323 C/T 1 11 18 29 5.08601733632304 9.67742617692593 -4.59140884060288 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0957903136658136 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133393246_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133393126_133393398:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133393126_133393398:GOLGA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 21535837 T/G 1 274 3 277 126.688068195683 1.61290436282099 125.075163832862 T:C:G T C 10 0.537634787606996 6.76311152204785e-69 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 23905711 A/G 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 24243204 G/A 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 134 107 241 61.9569384606625 57.5269222739486 4.43001618671396 C:G C G 10 0.537634787606996 0.605423795217669 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 53 37 90 24.5053562568292 19.8924871414589 4.61286911537036 T:G G T 10 0.537634787606996 0.343287233269169 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 26 26 52 12.0214955222181 13.9785044777819 -1.95700895556379 T:C:G C G 10 0.537634787606996 0.676932569451128 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 16 18 34 7.39784339828806 9.67742617692593 -2.27958277863786 T:C:G C G 10 0.537634787606996 0.492958608233671 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 5 10 15 2.31182606196502 5.37634787606996 -3.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.126573460617385 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25029295 C/T 1 14 4 18 6.47311297350206 2.15053915042798 4.32257382307407 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0563281922879415 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25034161 G/A 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25034110_25034274:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 25052261 C/T 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25052231_25052414:PARP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 28239970 G/A 1 182 168 350 84.1504686555267 90.3226443179753 -6.17217566244861 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 0.520325831115369 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 28239999 A/G 1 191 181 372 88.3117555670638 97.3118965568663 -9.00014098980252 A:G A G 10 0.537634787606996 0.349912471661572 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 33700374 T/G 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:G T G 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 37 48 85 17.1075128585411 25.8064698051358 -8.69895694659466 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0643856760290334 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 55 42 97 25.4300866816152 22.5806610794938 2.84942560212139 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.611146682105949 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 22 18 40 10.1720346726461 9.67742617692593 0.49460849572016 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 29 33 62 13.4085911593971 17.7419479910309 -4.33335683163375 A:C A C 10 0.537634787606996 0.308539788086688 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 29 29 58 13.4085911593971 15.5914088406029 -2.18281768120577 T:C T C 10 0.537634787606996 0.599770931239957 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 41515286 T/A 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:T T A 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 11 16 27 5.08601733632304 8.60215660171194 -3.51613926538889 A:G A G 10 0.537634787606996 0.182688102275838 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 43462422 A/T 1 48 54 102 22.1935301948642 29.0322785307778 -6.83874833591359 A:T A T 10 0.537634787606996 0.196687102934576 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 43462607 G/A 1 50 34 84 23.1182606196502 18.2795827786379 4.83867784101234 A:G G A 10 0.537634787606996 0.325148934039072 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43460524_43462638:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43462118_43462638:EPSTI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 43639845 A/C 1 44 48 92 20.3440693452922 25.8064698051358 -5.46240045984363 A:C A C 10 0.537634787606996 0.295729692888567 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 45563464 G/C 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 C:G G C 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45563160_45563618:NUFIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 48547467 A/T 1 9 15 24 4.16128691153704 8.06452181410494 -3.90323490256791 A:T A T 10 0.537634787606996 0.150610778150999 ENSG00000136143:ENST00000378654:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378645:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000378642:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000331052:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000434484:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000433022:exon_48547399_48547527:SUCLA2;ENSG00000136143:ENST00000497202:exon_48547399_48547527:SUCLA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 51530530 G/T 1 28 17 45 12.9462259470041 9.13979138931893 3.80643455768518 T:G G T 10 0.537634787606996 0.296283990492771 ENSG00000136104:ENST00000336617:exon_51530494_51530866:RNASEH2B;ENSG00000136104:ENST00000465541:exon_51530494_51530638:RNASEH2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 52313195 C/T 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52313185_52313311:WDFY2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 11 26 37 5.08601733632304 13.9785044777819 -8.89248714145885 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00444193667544484 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 19 23 42 8.78493903546708 12.3656001149609 -3.58066107949383 T:C C T 10 0.537634787606996 0.282149325735374 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 17 10 27 7.86020861068107 5.37634787606996 2.48386073461111 T:C T C 10 0.537634787606996 0.440806079300057 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 75884290 G/A 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 76423248 T/C 1 15 11 26 6.93547818589506 5.91398266367696 1.0214955222181 T:C T C 10 0.537634787606996 0.844575818070943 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 98645253 A/G 1 25 17 42 11.5591303098251 9.13979138931893 2.41933892050617 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.536695589247545 ENSG00000065150:ENST00000261574:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000357602:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000490680:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000389591:exon_98645146_98645268:IPO5;ENSG00000065150:ENST00000469360:exon_98645146_98645268:IPO5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 99105395 G/A 1 49 42 91 22.6558954072572 22.5806610794938 0.0752343277633614 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 99947261 C/T 1 294 210 504 135.935372443543 112.903305397469 23.032067046074 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.0399505647636940 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 68 102 170 31.4408344427243 54.8387483359136 -23.3979138931893 A:C:G C A 10 0.537634787606996 0.000375757114049475 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 A:G A G 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 103504517 T/C 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 T:C T C 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472151:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375958:exon_103504468_103504643:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103504468_103504643:ERCC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 86 88 174 39.7634082657983 47.3118613094156 -7.54845304361731 C:G G C 10 0.537634787606996 0.255068705684545 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 111176519 G/T 1 17 12 29 7.86020861068107 6.45161745128395 1.40859115939712 T:G G T 10 0.537634787606996 0.710575852780221 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 111290630 T/C 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 111290880 G/A 1 28 27 55 12.9462259470041 14.5161392653889 -1.56991331838478 A:G G A 10 0.537634787606996 0.687033074671747 ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 111293915 T/G 1 102 152 254 47.1612516640864 81.7204877162634 -34.559236052177 T:G T G 10 0.537634787606996 1.68295045776481e-05 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000375781:exon_111293759_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000490421:exon_111293764_111293955:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111293764_111293957:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111293787_111293955:CARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 111870037 T/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000102606:ENST00000317133:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375741:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375739:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000449979:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000491775:exon_111870026_111870147:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000469877:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000466143:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375737:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000467053:exon_111870026_111870212:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111870026_111870227:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426768:exon_111870026_111870232:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375723:exon_111870026_111870227:ARHGEF7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 111955465 T/C 1 14 19 33 6.47311297350206 10.2150609645329 -3.74194799103087 T:C T C 10 0.537634787606996 0.222732740995836 ENSG00000102606:ENST00000370623:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000218789:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000375736:exon_111955338_111958078:ARHGEF7;ENSG00000102606:ENST00000426073:exon_111955338_111958084:ARHGEF7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 113153363 A/G 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000126216:ENST00000261965:exon_113153359_113153499:TUBGCP3;ENSG00000126216:ENST00000375669:exon_113153359_113153499:TUBGCP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 113909339 A/G 1 30 26 56 13.8709563717901 13.9785044777819 -0.107548105991777 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113909267_113909439:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000472083:exon_113909267_113909439:CUL4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 113973832 C/T 1 60 58 118 27.7419127435802 31.1828176812058 -3.44090493762553 T:C C T 10 0.537634787606996 0.579822834487544 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113973784_113973971:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113973784_113973971:LAMP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 113975768 T/C 1 53 63 116 24.5053562568292 33.8709916192407 -9.36563536241153 T:C T C 10 0.537634787606996 0.093399769174493 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 113975894 C/T 1 31 33 64 14.3333215841831 17.7419479910309 -3.40862640684775 T:C C T 10 0.537634787606996 0.452276724387329 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975872_113976042:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975872_113976042:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113975872_113977745:LAMP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 114780764 A/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114780685_114780808:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114780685_114780808:RASA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 17 14 31 7.86020861068107 7.52688702649794 0.333321584183124 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 115004914 C/T 1 12 18 30 5.54838254871605 9.67742617692593 -4.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.145192067224671 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 115004935 T/C 1 21 34 55 9.70966946025308 18.2795827786379 -8.56991331838478 T:C T C 10 0.537634787606996 0.021665739366666 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115004785_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115004825_115004965:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115004825_115004965:CDC16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 84 120 204 38.8386778410123 64.5161745128395 -25.6774966718272 T:C T C 10 0.537634787606996 0.000328871146464839 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 20824181 T/C 1 31 35 66 14.3333215841831 18.8172175662449 -4.48389598206174 T:C T C 10 0.537634787606996 0.269971989470259 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 20928359 C/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:C C A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20928351_20928457:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20928351_20928457:TMEM55B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23248112 A/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23248002_23248146:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23248002_23248146:SLC7A7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 130 93 223 60.1074776110905 50.0000352474506 10.1074423636399 T:G G T 10 0.537634787606996 0.179753874769930 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23371055 G/C 1 33 36 69 15.2580520089691 19.3548523538519 -4.09680034488273 C:G G C 10 0.537634787606996 0.336159285683991 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23374435 G/A 1 7 25 32 3.23655648675103 13.4408696901749 -10.2043132034239 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000291470057542105 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374303_23374455:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374303_23374455:RBM23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23374862 C/T 1 7 17 24 3.23655648675103 9.13979138931893 -5.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0224233335583136 ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23374815_23374868:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000307814:exon_23374815_23374868:RBM23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 23 25 48 10.6343998850391 13.4408696901749 -2.80646980513581 A:G A G 10 0.537634787606996 0.470080372152311 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23549785 T/C 1 39 35 74 18.0322432833272 18.8172175662449 -0.784974282917705 T:C T C 10 0.537634787606996 0.907374535037487 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23745533 C/T 1 16 11 27 7.39784339828806 5.91398266367696 1.48386073461111 T:C C T 10 0.537634787606996 0.700336022866229 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23944505 G/A 1 18 21 39 8.32257382307407 11.2903305397469 -2.96775671667285 A:G G A 10 0.537634787606996 0.422385976086073 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 31 30 61 14.3333215841831 16.1290436282099 -1.79572204402676 A:C C A 10 0.537634787606996 0.700681951782187 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24029436 C/A 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:C C A 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 27 12 39 12.4838607346111 6.45161745128395 6.03224328332716 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0552010678941389 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24568323 C/T 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24568258_24568445:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24568258_24568445:PCK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 165 169 334 76.2902600448457 90.8602791055823 -14.5700190607367 T:C C T 10 0.537634787606996 0.111785063293619 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 54 51 105 24.9677214692222 27.4193741679568 -2.45165269873458 A:G G A 10 0.537634787606996 0.695642568808108 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 48 36 84 22.1935301948642 19.3548523538519 2.83867784101233 T:C T C 10 0.537634787606996 0.584912711332444 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 24901433 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24900669_24901816:KHNYN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 34985645 G/A 1 38 28 66 17.5698780709342 15.0537740529959 2.51610401793826 A:G G A 10 0.537634787606996 0.621807109437031 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 17 14 31 7.86020861068107 7.52688702649794 0.333321584183124 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 11 14 25 5.08601733632304 7.52688702649794 -2.4408696901749 T:C T C 10 0.537634787606996 0.423024937923135 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 12 14 26 5.54838254871605 7.52688702649794 -1.9785044777819 C:G C G 10 0.537634787606996 0.440467677457136 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 35761675 C/G 1 85 87 172 39.3010430534053 46.7742265218087 -7.47318346840331 C:G C G 10 0.537634787606996 0.284343546566670 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 328 409 737 151.655789664905 219.892628131261 -68.2368384663561 A:G G A 10 0.537634787606996 5.7149735428375e-07 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 35873770 G/A 1 153 221 374 70.7418774961296 118.817288061146 -48.0754105650165 A:C:G G A 10 0.537634787606996 7.36269419881083e-07 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35873624_35873952:NFKBIA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 27 34 61 12.4838607346111 18.2795827786379 -5.79572204402676 A:G G A 10 0.537634787606996 0.157755033892735 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 45711316 C/T 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45711237_45711721:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45711237_45711683:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000492652:exon_45711237_45711589:C14orf106 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 50235184 A/G 1 3 8 11 1.38709563717901 4.30107830085597 -2.91398266367696 A:G A G 10 0.537634787606996 0.127234760608112 ENSG00000165516:ENST00000298307:exon_50234326_50235339:KLHDC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 T:C C T 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 51192659 G/A 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:G G A 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 51223789 C/T 1 11 3 14 5.08601733632304 1.61290436282099 3.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.104464195382944 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 51224374 T/G 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 T:G T G 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 51227000 A/G 1 49 36 85 22.6558954072572 19.3548523538519 3.30104305340534 A:G A G 10 0.537634787606996 0.514751099199479 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51226575_51227077:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51226575_51227077:NIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 52433420 C/T 1 59 80 139 27.2795475311872 43.0107830085597 -15.7312354773725 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.00822814187256678 ENSG00000186469:ENST00000335281:exon_52433277_52436517:GNG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 54417522 A/G 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000125378:ENST00000245451:exon_54416454_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000417573:exon_54416457_54417606:BMP4;ENSG00000125378:ENST00000395600:exon_54416457_54417606:BMP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55310492 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55605036 A/C 1 35 48 83 16.1827824337551 25.8064698051358 -9.62368737138067 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0365487674115613 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55643908 A/G 1 29 34 63 13.4085911593971 18.2795827786379 -4.87099161924075 A:G A G 10 0.537634787606996 0.255472432331173 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55655692 C/T 1 18 21 39 8.32257382307407 11.2903305397469 -2.96775671667285 T:C C T 10 0.537634787606996 0.422385976086073 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 3 9 12 1.38709563717901 4.83871308846296 -3.45161745128395 A:T T A 10 0.537634787606996 0.0780364380088052 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55818706 T/C 1 13 4 17 6.01074776110905 2.15053915042798 3.86020861068107 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0863642416395042 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 55819219 G/T 1 26 23 49 12.0214955222181 12.3656001149609 -0.344104592742806 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 35 25 60 16.1827824337551 13.4408696901749 2.74191274358024 A:G A G 10 0.537634787606996 0.518930958567375 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 58832302 G/A 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 A:G G A 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58832236_58832340:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58832236_58832340:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58832236_58832340:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58832236_58832340:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58832236_58832340:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58832193_58832340:ARID4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 16 9 25 7.39784339828806 4.83871308846296 2.5591303098251 A:G A G 10 0.537634787606996 0.32434367374583 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 T:C C T 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 60622852 A/G 1 33 40 73 15.2580520089691 21.5053915042798 -6.24733949531071 A:G A G 10 0.537634787606996 0.159168676631261 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60622718_60622870:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60622718_60622870:DHRS7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 61924239 G/A 1 17 3 20 7.86020861068107 1.61290436282099 6.24730424786008 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00577791676348129 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 61924241 A/C 1 18 3 21 8.32257382307407 1.61290436282099 6.70966946025308 A:C A C 10 0.537634787606996 0.00346342747305411 ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 24 13 37 11.0967650974321 6.98925223889095 4.10751285854115 T:G G T 10 0.537634787606996 0.190467409608763 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 64908845 G/A 1 125 146 271 57.7956515491255 78.4946789906214 -20.6990274414959 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0124346053589986 ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64908772_64908883:MTHFD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 64954683 A/G 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 A:G A G 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000089775:ENST00000261683:exon_64953555_64954775:ZBTB25;ENSG00000089775:ENST00000394715:exon_64953557_64954775:ZBTB25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 73958812 T/C 1 32 32 64 14.7956867965761 17.2043132034239 -2.40862640684774 T:C T C 10 0.537634787606996 0.616452493917277 ENSG00000255242:ENST00000531973:exon_73957669_73960096:C14orf169 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 74036216 A/G 1 29 12 41 13.4085911593971 6.45161745128395 6.95697370811316 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0404097591282599 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 74188164 T/C 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000156030:ENST00000394071:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000476562:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000286523:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000423556:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000478847:exon_74188000_74188327:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000451078:exon_74188000_74188212:C14orf43;ENSG00000156030:ENST00000435371:exon_74188000_74188212:C14orf43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 33 25 58 15.2580520089691 13.4408696901749 1.81718231879423 A:G G A 10 0.537634787606996 0.693646361663035 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 12 11 23 5.54838254871605 5.91398266367696 -0.365600114960908 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 74759301 G/T 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 T:G G T 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759254_74759345:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759254_74759345:ABCD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 75245368 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75245150_75245386:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75245150_75245386:YLPM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 75248669 G/T 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75248626_75249028:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75248626_75249028:YLPM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 75279395 T/A 1 32 24 56 14.7956867965761 12.9032349025679 1.89245189400822 A:T T A 10 0.537634787606996 0.68824709089556 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 75367807 C/T 1 22 29 51 10.1720346726461 15.5914088406029 -5.4193741679568 T:C C T 10 0.537634787606996 0.159638416451155 ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75367769_75367936:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75367769_75367936:DLST HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 T:C T C 10 0.537634787606996 0.829141081785639 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:G G A 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 77492944 G/A 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 A:G G A 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 77793207 G/A 1 7 17 24 3.23655648675103 9.13979138931893 -5.9032349025679 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0224233335583136 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 A:G G A 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 90756760 A/T 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:T A T 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90756565_90756951:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90756565_90756951:C14orf102 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 91666162 G/A 1 21 24 45 9.70966946025308 12.9032349025679 -3.19356544231482 A:G G A 10 0.537634787606996 0.371557212278348 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 28 18 46 12.9462259470041 9.67742617692593 3.26879977007818 A:G G A 10 0.537634787606996 0.376572573900051 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 21 13 34 9.70966946025308 6.98925223889095 2.72041722136214 A:G A G 10 0.537634787606996 0.392789340374168 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 91927717 G/A 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:G G A 10 0.537634787606996 0.300163849932424 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 10 3 13 4.62365212393004 1.61290436282099 3.01074776110905 T:C C T 10 0.537634787606996 0.104163295807923 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 449 338 787 207.601980364459 181.720558211165 25.8814221532942 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0682246468151157 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 17 20 37 7.86020861068107 10.7526957521399 -2.89248714145885 T:C C T 10 0.537634787606996 0.410254465016945 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 93118669 G/A 1 20 18 38 9.24730424786008 9.67742617692593 -0.43012192906585 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 93119407 C/T 1 26 10 36 12.0214955222181 5.37634787606996 6.64514764614814 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0293680862750493 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 93180727 A/G 1 93 127 220 42.9999647525494 68.2796180260885 -25.2796532735391 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000696656495247601 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93180721_93180796:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93180721_93180796:LGMN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 71 47 118 32.8279300799033 25.2688350175288 7.55909506237447 T:C C T 10 0.537634787606996 0.167329201148252 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 93685577 G/A 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 A:G G A 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93685558_93685707:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93685558_93685707:UBR7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 103342049 T/C 1 37 28 65 17.1075128585411 15.0537740529959 2.05373880554526 T:C T C 10 0.537634787606996 0.621619705629276 ENSG00000131323:ENST00000392745:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000347662:exon_103341961_103342065:TRAF3;ENSG00000131323:ENST00000351691:exon_103341961_103342065:TRAF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 104029449 G/A 1 54 33 87 24.9677214692222 17.7419479910309 7.22577347819135 A:G G A 10 0.537634787606996 0.132508302243135 ENSG00000126214:ENST00000409074:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000472726:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000247618:exon_104029299_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000445352:exon_104029300_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000440963:exon_104029302_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000458117:exon_104029316_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000489117:exon_104029390_104029461:C14orf153;ENSG00000126214:ENST00000495778:exon_104029414_104029461:C14orf153 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 74 66 140 34.2150257170823 35.4838959820617 -1.26887026497944 T:C C T 10 0.537634787606996 0.865541701438074 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 105477670 C/A 1 48 54 102 22.1935301948642 29.0322785307778 -6.83874833591359 A:C C A 10 0.537634787606996 0.196687102934576 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 34 33 67 15.7204172213621 17.7419479910309 -2.02153076966873 A:G G A 10 0.537634787606996 0.626437584878588 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 T:C C T 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 105930406 G/A 1 30 19 49 13.8709563717901 10.2150609645329 3.6558954072572 A:G G A 10 0.537634787606996 0.318630588190441 ENSG00000182979:ENST00000435036:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000414153:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000331320:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000406191:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000405646:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000438610:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000434050:exon_105930369_105930484:MTA1;ENSG00000182979:ENST00000490198:exon_105930369_105930484:MTA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 106091555 C/T 1 107 2 109 49.4730777260514 1.07526957521399 48.3978081508374 T:C C T 10 0.537634787606996 2.02784179478064e-26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 106092383 C/G 1 2 44 46 0.924730424786008 23.6559306547078 -22.7312002299218 C:G C G 10 0.537634787606996 9.65073435637916e-13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 106110966 C/T 1 63 26 89 29.1290083807593 13.9785044777819 15.1505039029774 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00131448198614365 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 106791131 A/G 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 A A 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 14 107013129 A/C 1 16 2 18 7.39784339828806 1.07526957521399 6.32257382307407 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0032359661871081 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 22960868 G/C 1 17 28 45 7.86020861068107 15.0537740529959 -7.19356544231482 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0360418853832392 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 23006707 C/A 1 32 38 70 14.7956867965761 20.4301219290658 -5.63443513248972 A:C:G C A 10 0.537634787606996 0.188491447271609 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23004684_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23005349_23006855:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23005349_23006855:NIPA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 23021238 C/T 1 18 9 27 8.32257382307407 4.83871308846296 3.48386073461111 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246443595808427 ENSG00000140157:ENST00000337451:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000359727:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398014:exon_23021198_23021429:NIPA2;ENSG00000140157:ENST00000398013:exon_23021198_23021429:NIPA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 34159986 T/C 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 T:C T C 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34159696_34160056:AVEN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 34634124 C/G 1 615 6 621 284.354605621697 3.22580872564198 281.128796896055 C:G C G 10 0.537634787606996 1.46546040145823e-154 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 34634138 G/A 1 652 36 688 301.462118480239 19.3548523538519 282.107266126387 A:G G A 10 0.537634787606996 3.97066892114091e-128 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 34634139 T/C 1 625 54 679 288.978257745628 29.0322785307778 259.94597921485 A:T:C:G T C 10 0.537634787606996 1.57528602685163e-106 ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 40327290 A/G 1 71 90 161 32.8279300799033 48.3871308846296 -15.5592008047264 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.0143058213569620 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 40327301 G/A 1 81 97 178 37.4515822038333 52.1505743978786 -14.6989921940453 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0291734912966139 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40327228_40327797:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40327228_40327797:EIF2AK4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 40328665 G/A 1 798 753 1551 368.967439489617 404.838995068068 -35.8715555784509 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0705859226855803 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40327891_40328701:SRP14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 40685797 A/C 1 25 22 47 11.5591303098251 11.8279653273539 -0.268835017528811 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40685670_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40685394_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40685670_40686488:C15orf23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 41148250 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 41186990 C/T 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000104142:ENST00000220509:exon_41186627_41187057:VPS18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 42453963 T/C 1 27 19 46 12.4838607346111 10.2150609645329 2.26879977007818 T:C T C 10 0.537634787606996 0.555894755619514 ENSG00000166887:ENST00000318006:exon_42453880_42453971:VPS39;ENSG00000166887:ENST00000348544:exon_42453880_42453971:VPS39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 42740369 C/T 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42740270_42740903:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42740270_42740903:ZFP106 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45059871 C/A 1 26 27 53 12.0214955222181 14.5161392653889 -2.49464374317079 A:C C A 10 0.537634787606996 0.494978027389235 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45059429_45060025:TRIM69;ENSG00000185880:ENST00000338264:exon_45059429_45060023:TRIM69 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45467540 C/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138606:ENST00000290894:exon_45467417_45467623:SHF;ENSG00000138606:ENST00000361989:exon_45467417_45467623:SHF;ENSG00000138606:ENST00000437903:exon_45467417_45467623:SHF;ENSG00000138606:ENST00000318390:exon_45467417_45467623:SHF;ENSG00000138606:ENST00000458022:exon_45467417_45467623:SHF;ENSG00000138606:ENST00000413198:exon_45467417_45467623:SHF;ENSG00000138606:ENST00000438760:exon_45467417_45467623:SHF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45654327 A/G 1 25 47 72 11.5591303098251 25.2688350175288 -13.7097047077037 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00131312501533946 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45653322_45654419:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45653324_45654419:GATM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 33 36 69 15.2580520089691 19.3548523538519 -4.09680034488273 A:T T A 10 0.537634787606996 0.336159285683991 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45695382 G/A 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G G A 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45695695 G/A 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 45968331 C/G 1 20 20 40 9.24730424786008 10.7526957521399 -1.50539150427984 C:G C G 10 0.537634787606996 0.63837555969875 ENSG00000137767:ENST00000260324:exon_45968299_45968508:SQRDL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 49054772 C/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49054588_49054869:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49054588_49054869:CEP152 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 52254682 T/C 1 25 22 47 11.5591303098251 11.8279653273539 -0.268835017528811 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52254586_52254690:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52254586_52254690:LEO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 52611451 A/G 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52611257_52611539:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52611257_52611539:MYO5A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 61 69 130 28.2042779559732 37.0968003448827 -8.89252238890948 A:G G A 10 0.537634787606996 0.134593239177105 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 30 30 60 13.8709563717901 16.1290436282099 -2.25808725641976 A:G A G 10 0.537634787606996 0.605433743282452 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 81 51 132 37.4515822038333 27.4193741679568 10.0322080358765 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0814721567283156 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 55652719 A/G 1 25 30 55 11.5591303098251 16.1290436282099 -4.56991331838478 A:G A G 10 0.537634787606996 0.226108026496633 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 55652845 A/G 1 32 24 56 14.7956867965761 12.9032349025679 1.89245189400822 A:G A G 10 0.537634787606996 0.68824709089556 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 A:G A G 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 59408918 A/G 1 115 104 219 53.1719994251955 55.9140179111276 -2.74201848593213 A:G A G 10 0.537634787606996 0.734937104064223 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 59409495 G/A 1 87 77 164 40.2257734781913 41.3978786457387 -1.17210516754734 A:G G A 10 0.537634787606996 0.875733251107592 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 59429565 G/C 1 94 71 165 43.4623299649424 38.1720699200967 5.29026004484566 C:G G C 10 0.537634787606996 0.435379055970266 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59428169_59429655:MYO1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 59453384 T/C 1 52 42 94 24.0429910444362 22.5806610794938 1.46232996494237 T:C T C 10 0.537634787606996 0.836265862116744 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59453272_59453429:MYO1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 59510189 G/A 1 19 24 43 8.78493903546708 12.9032349025679 -4.11829586710083 A:G G A 10 0.537634787606996 0.223541749313646 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 59963488 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000140299:ENST00000267859:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000415213:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000409352:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000439052:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000448414:exon_59963382_59963513:BNIP2;ENSG00000140299:ENST00000464390:exon_59963380_59963513:BNIP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 66629403 C/A 1 39 30 69 18.0322432833272 16.1290436282099 1.90319965511727 A:C C A 10 0.537634787606996 0.71763556619263 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66629052_66629519:TIPIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 14 14 28 6.47311297350206 7.52688702649794 -1.05377405299589 C:G G C 10 0.537634787606996 0.708696110001731 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 66679684 A/G 1 39 36 75 18.0322432833272 19.3548523538519 -1.3226090705247 A:G A G 10 0.537634787606996 0.817133169144406 ENSG00000169032:ENST00000307102:exon_66679155_66679765:MAP2K1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 66793480 C/T 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.283623583656103 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 67457335 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000166949:ENST00000327367:exon_67457233_67457426:SMAD3;ENSG00000166949:ENST00000439724:exon_67457233_67457426:SMAD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 67528374 T/G 1 17 11 28 7.86020861068107 5.91398266367696 1.94622594700411 T:G T G 10 0.537634787606996 0.570676975485111 ENSG00000103591:ENST00000261880:exon_67528317_67528406:AAGAB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G A G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 12 8 20 5.54838254871605 4.30107830085597 1.24730424786008 T:C C T 10 0.537634787606996 0.657566913300005 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 70345626 C/T 1 9 14 23 4.16128691153704 7.52688702649794 -3.36560011496091 T:C C T 10 0.537634787606996 0.209214096015871 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70345566_70345713:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70345566_70345713:TLE3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 70346923 C/T 1 15 14 29 6.93547818589506 7.52688702649794 -0.591408840602884 T:C C T 10 0.537634787606996 0.854036703051874 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70346777_70347024:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70346777_70347024:TLE3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 17 13 30 7.86020861068107 6.98925223889095 0.870956371790119 T:C T C 10 0.537634787606996 0.855382105439278 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 74277795 T/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C T C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74277659_74277854:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74277659_74277854:STOML1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 77 53 130 35.6021213542613 28.4946437431708 7.10747761109052 A:G A G 10 0.537634787606996 0.219229191189914 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 73 54 127 33.7526605046893 29.0322785307778 4.7203819739115 T:G G T 10 0.537634787606996 0.423999166681754 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 35 60 95 16.1827824337551 32.2580872564198 -16.0753048226646 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00129786197896318 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 74948095 C/T 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000179151:ENST00000315127:exon_74948074_74948409:EDC3;ENSG00000179151:ENST00000426797:exon_74948074_74948409:EDC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 310 289 599 143.333215841831 155.376453618422 -12.0432377765906 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.325711602570177 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 75189556 C/T 1 53 35 88 24.5053562568292 18.8172175662449 5.68813869058435 T:C C T 10 0.537634787606996 0.240627855758788 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189352_75189560:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189352_75189560:MPI HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 79215311 A/C 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:C A C 10 0.537634787606996 0.764228176543362 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 223 172 395 103.10744236364 92.4731834684033 10.6342588952366 T:C C T 10 0.537634787606996 0.289669837052380 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 79277511 A/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000058335:ENST00000419573:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394741:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000261752:exon_79277349_79277546:RASGRF1;ENSG00000058335:ENST00000394745:exon_79277349_79277546:RASGRF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 81271557 C/A 1 90 99 189 41.6128691153704 53.2258439730926 -11.6129748577223 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0936430693359057 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 81592802 A/G 1 151 154 305 69.8171470713436 82.7957572914774 -12.9786102201338 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.15100375661631 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 82444437 A/G 1 18 37 55 8.32257382307407 19.8924871414589 -11.5699133183848 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00258862697987575 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 85159553 C/T 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:C C T 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000176371:ENST00000379358:exon_85159540_85159839:ZSCAN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 85188775 G/A 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 A:G G A 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85188702_85189067:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85188702_85189067:WDR73 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 85189464 T/G 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 T:G T G 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000177082:ENST00000434634:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000398528:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000323189:exon_85189415_85189579:WDR73;ENSG00000177082:ENST00000419751:exon_85189293_85189579:WDR73 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 85200520 G/T 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000197696:ENST00000360476:exon_85200407_85200579:NMB;ENSG00000197696:ENST00000394588:exon_85200407_85200579:NMB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 85333953 A/G 1 8 1 9 3.69892169914403 0.537634787606996 3.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.043874250082235 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85333936_85334114:ZNF592 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 86125031 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 86287867 G/A 1 17 17 34 7.86020861068107 9.13979138931893 -1.27958277863786 A:G G A 10 0.537634787606996 0.731942963284519 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86287859_86289400:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86287859_86292586:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86287859_86292586:AKAP13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 89169614 A/G 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 A:G A G 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 357 299 656 165.064380824302 160.752801494492 4.3115793298106 A:G A G 10 0.537634787606996 0.754164769982513 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 89804072 G/A 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89803944_89804074:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89803944_89804074:FANCI HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 90168108 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 90168737 G/A 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 A:G G A 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90166854_90169017:C15orf42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 90628537 G/A 1 221 228 449 102.182711938854 122.580731574395 -20.3980196355412 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0582372381769913 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 90774259 G/C 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 C:G G C 10 0.537634787606996 0.483393674755954 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 91424574 G/C 1 14 22 36 6.47311297350206 11.8279653273539 -5.35485235385186 C:G G C 10 0.537634787606996 0.093615540657152 ENSG00000140564:ENST00000268171:exon_91424516_91426688:FURIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 25 23 48 11.5591303098251 12.3656001149609 -0.806469805135809 T:C C T 10 0.537634787606996 0.885219555592337 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 7 10 17 3.23655648675103 5.37634787606996 -2.13979138931893 A:C A C 10 0.537634787606996 0.337092606840783 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 20 23 43 9.24730424786008 12.3656001149609 -3.11829586710083 A:C C A 10 0.537634787606996 0.361779982238563 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 20 20 40 9.24730424786008 10.7526957521399 -1.50539150427984 C:G C G 10 0.537634787606996 0.63837555969875 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 16 18 34 7.39784339828806 9.67742617692593 -2.27958277863786 A:G G A 10 0.537634787606996 0.492958608233671 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 27 9 36 12.4838607346111 4.83871308846296 7.64514764614814 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0115552887821613 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101110265 T/A 1 17 6 23 7.86020861068107 3.22580872564198 4.63439988503909 A:T T A 10 0.537634787606996 0.0603602513650505 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101110302 C/G 1 15 6 21 6.93547818589506 3.22580872564198 3.70966946025308 C:G C G 10 0.537634787606996 0.126802656559472 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101120963 T/C 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 15 101606261 C/T 1 5 12 17 2.31182606196502 6.45161745128395 -4.13979138931893 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0522564763016474 ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101605557_101606410:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101605557_101606410:LRRK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 396264 A/G 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:G A G 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000103126:ENST00000262320:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000461023:exon_396148_396322:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000354866:exon_396148_397106:AXIN1;ENSG00000103126:ENST00000421566:exon_396148_396444:AXIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 173 126 299 79.9891817439897 67.7419832384815 12.2471985055082 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.164039011417996 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 424277 G/A 1 27 12 39 12.4838607346111 6.45161745128395 6.03224328332716 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0552010678941389 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000448854:exon_424221_424399:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000467452:exon_424221_424399:TMEM8A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 13 13 26 6.01074776110905 6.98925223889095 -0.978504477781897 T:C T C 10 0.537634787606996 0.699994963282250 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 25 12 37 11.5591303098251 6.45161745128395 5.10751285854115 T:C T C 10 0.537634787606996 0.100800812141149 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 11 4 15 5.08601733632304 2.15053915042798 2.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.194249391282824 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 450165 T/C 1 2 12 14 0.924730424786008 6.45161745128395 -5.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00506194045584868 ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_450109_450190:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 460274 C/T 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:C C T 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_460243_460367:NME4;ENSG00000242612:ENST00000219481:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000397710:exon_460209_460354:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000382934:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000424398:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000439661:exon_460209_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000437024:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000445291:exon_460243_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000461947:exon_460243_460404:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000465166:exon_460209_460295:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000429116:exon_460243_460404:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000461749:exon_459599_460367:DECR2;ENSG00000242612:ENST00000469922:exon_460112_460367:DECR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 538893 C/T 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C C T 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000413925:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000452814:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000483002:exon_538851_539101:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000449879:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_538851_539000:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000412256:exon_538851_539000:RAB11FIP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 597257 C/T 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 C C 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_596817_598287:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_596839_597901:SOLH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 597764 G/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_596817_598287:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_596839_597901:SOLH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 597905 T/C 1 1 11 12 0.462365212393004 5.91398266367696 -5.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00201070468684902 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_596817_598287:SOLH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 602313 C/A 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:T:C C A 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 43 38 81 19.8817041328992 20.4301219290658 -0.548417796166678 A:G A G 10 0.537634787606996 0.911738554820646 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 781633 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_781565_781702:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_781565_781702:NARFL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 847743 C/T 1 25 30 55 11.5591303098251 16.1290436282099 -4.56991331838478 T:C C T 10 0.537634787606996 0.226108026496633 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 3 9 12 1.38709563717901 4.83871308846296 -3.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0780364380088052 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1544301 G/C 1 14 5 19 6.47311297350206 2.68817393803498 3.78493903546708 C:G G C 10 0.537634787606996 0.106639303162675 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1544302 A/G 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 A:G A G 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1544247_1544617:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1544247_1544617:TELO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1547477 T/C 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 1 21 17 38 9.70966946025308 9.13979138931893 0.569878070934152 A:G A G 10 0.537634787606996 0.872492776211888 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1735575 G/A 1 64 46 110 29.5913735931523 24.7312002299218 4.86017336323044 A:G G A 10 0.537634787606996 0.389815534373075 ENSG00000007545:ENST00000454337:exon_1735440_1735588:CRAMP1L;ENSG00000206053:ENST00000248098:exon_1735440_1735588:HN1L;ENSG00000206053:ENST00000414325:exon_1735440_1735588:HN1L;ENSG00000206053:ENST00000382711:exon_1735440_1735588:HN1L;ENSG00000206053:ENST00000382710:exon_1735440_1735588:HN1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1814440 A/G 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G A G 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1814302_1814460:MAPK8IP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1827836 T/C 1 38 29 67 17.5698780709342 15.5914088406029 1.97846923033127 T:C T C 10 0.537634787606996 0.71352969955148 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1827748_1827873:SPSB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1836796 C/A 1 39 35 74 18.0322432833272 18.8172175662449 -0.784974282917705 A:C C A 10 0.537634787606996 0.907374535037487 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1836758_1836956:NUBP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1838640 T/C 1 102 96 198 47.1612516640864 51.6129396102716 -4.45168794618521 T:C T C 10 0.537634787606996 0.568682156120286 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 1867190 C/T 1 14 18 32 6.47311297350206 9.67742617692593 -3.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.289546690751015 ENSG00000063854:ENST00000397356:exon_1867169_1867272:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000397353:exon_1867169_1867272:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000262303:exon_1867169_1867272:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000455446:exon_1867169_1867272:HAGH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2014591 C/T 1 632 133 765 292.214814232379 71.5054267517305 220.709387480648 T:C C T 10 0.537634787606996 3.36282385144645e-63 ENSG00000140988:ENST00000526522:exon_2014450_2014804:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527109:exon_2014450_2014631:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527871:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000530225:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531065:exon_2014450_2014632:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000533161:exon_2014450_2014814:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000343262:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000529806:exon_2014450_2014813:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000531182:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527302:exon_2014450_2014629:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000527826:exon_2014277_2014806:RPS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 81 80 161 37.4515822038333 43.0107830085597 -5.55920080472636 A:C A C 10 0.537634787606996 0.385698945970897 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2049831 G/C 1 26 27 53 12.0214955222181 14.5161392653889 -2.49464374317079 C:G G C 10 0.537634787606996 0.494978027389235 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2052216 G/A 1 16 19 35 7.39784339828806 10.2150609645329 -2.81721756624486 A:G G A 10 0.537634787606996 0.397650063326115 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2052207_2052424:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2052207_2052424:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2052207_2052424:ZNF598 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2505490 T/A 1 3 11 14 1.38709563717901 5.91398266367696 -4.52688702649794 A:T T A 10 0.537634787606996 0.0280872426951532 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2505396_2505565:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2505396_2505565:CCNF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2511114 G/A 1 11 5 16 5.08601733632304 2.68817393803498 2.39784339828806 A:G G A 10 0.537634787606996 0.317062980975179 ENSG00000162062:ENST00000361837:exon_2510817_2511225:C16orf59;ENSG00000162062:ENST00000483320:exon_2510817_2511225:C16orf59 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 T:C C T 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2867450 G/C 1 17 3 20 7.86020861068107 1.61290436282099 6.24730424786008 C:G G C 10 0.537634787606996 0.00577791676348129 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2867431_2867457:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2867431_2867457:PRSS21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2871121 T/C 1 30 6 36 13.8709563717901 3.22580872564198 10.6451476461481 T:C T C 10 0.537634787606996 0.000312754958059018 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2871555 G/A 1 34 13 47 15.7204172213621 6.98925223889095 8.73116498247119 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0122418970816171 ENSG00000007038:ENST00000455114:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000450020:exon_2871367_2871720:PRSS21;ENSG00000007038:ENST00000005995:exon_2871367_2871720:PRSS21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 27 31 58 12.4838607346111 16.6666784158169 -4.18281768120577 T:G G T 10 0.537634787606996 0.29349256054431 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 2946433 C/T 1 52 43 95 24.0429910444362 23.1182958671008 0.924695177335376 T:C C T 10 0.537634787606996 0.918142754717099 ENSG00000162076:ENST00000396958:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000431751:exon_2946353_2946772:FLYWCH2;ENSG00000162076:ENST00000293981:exon_2946353_2946772:FLYWCH2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 3170188 C/T 1 1 18 19 0.462365212393004 9.67742617692593 -9.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 1.75314822031507e-05 ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 3533577 C/G 1 14 14 28 6.47311297350206 7.52688702649794 -1.05377405299589 C:G C G 10 0.537634787606996 0.708696110001731 ENSG00000122390:ENST00000424546:exon_3533363_3533598:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3533363_3533597:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000360862:exon_3533363_3533598:NAT15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 3534892 G/A 1 16 20 36 7.39784339828806 10.7526957521399 -3.35485235385186 A:G G A 10 0.537634787606996 0.316324009908038 ENSG00000122390:ENST00000407558:exon_3534699_3535061:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000414063:exon_3534699_3535083:NAT15;ENSG00000122390:ENST00000421765:exon_3534691_3534926:NAT15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 166 148 314 76.7526252572387 79.5699485658354 -2.81732330859674 C:G G C 10 0.537634787606996 0.777282001429463 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 3778337 G/A 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 4445327 C/T 1 11 18 29 5.08601733632304 9.67742617692593 -4.59140884060288 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0957903136658136 ENSG00000103426:ENST00000251166:exon_4445290_4445340:CORO7;ENSG00000103426:ENST00000423908:exon_4445290_4445340:CORO7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 20 6 26 9.24730424786008 3.22580872564198 6.0214955222181 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0183200515198115 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 4484396 A/T 1 24 7 31 11.0967650974321 3.76344351324897 7.33332158418312 A:T A T 10 0.537634787606996 0.0105139743089449 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 4496973 T/A 1 19 11 30 8.78493903546708 5.91398266367696 2.87095637179012 A:T T A 10 0.537634787606996 0.360976107545321 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 8729124 G/A 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 A:G G A 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 62 63 125 28.6666431683662 33.8709916192407 -5.2043484508745 C:G C G 10 0.537634787606996 0.370343082934131 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 C:G G C 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11001421 C/A 1 22 21 43 10.1720346726461 11.2903305397469 -1.11829586710083 A:C C A 10 0.537634787606996 0.761392383289211 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11001770 G/T 1 10 20 30 4.62365212393004 10.7526957521399 -6.12904362820988 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0279537080620540 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11002904 G/A 1 14 9 23 6.47311297350206 4.83871308846296 1.63439988503909 A:G G A 10 0.537634787606996 0.536978589431628 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 T:C C T 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 14 11 25 6.47311297350206 5.91398266367696 0.5591303098251 T:C C T 10 0.537634787606996 0.844336813679508 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 91 95 186 42.0752343277634 51.0753048226646 -9.00007049490126 C:G C G 10 0.537634787606996 0.186605076728238 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:C A C 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 48 57 105 22.1935301948642 30.6451828935988 -8.45165269873458 C:G G C 10 0.537634787606996 0.116956438794822 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 11981487 G/A 1 39 42 81 18.0322432833272 22.5806610794938 -4.54841779616668 A:G G A 10 0.537634787606996 0.318103654305612 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11981427_11981607:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11981427_11981607:GSPT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 12009781 G/A 1 13 19 32 6.01074776110905 10.2150609645329 -4.20431320342387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.157109349002679 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_12009226_12009825:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_12009226_12009825:GSPT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 12223637 A/G 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G A G 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 12758966 T/C 1 13 5 18 6.01074776110905 2.68817393803498 3.32257382307407 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155898486841443 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12753657_12758972:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12756937_12758972:CPPED1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 12897578 G/T 1 10 3 13 4.62365212393004 1.61290436282099 3.01074776110905 T:G G T 10 0.537634787606996 0.104163295807923 ENSG00000103381:ENST00000433677:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12897564_12897744:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12897564_12897728:CPPED1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 A:C C A 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 3 11 14 1.38709563717901 5.91398266367696 -4.52688702649794 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0280872426951532 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 16 35 51 7.39784339828806 18.8172175662449 -11.4193741679568 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00173469111687710 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 16232365 C/T 1 15 13 28 6.93547818589506 6.98925223889095 -0.0537740529958883 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16232221_16232415:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16232221_16232415:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16232221_16232415:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16232221_16232415:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16232221_16232415:ABCC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 T:C C T 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 20748331 C/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:C C A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000066654:ENST00000381337:exon_20748182_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000396083:exon_20744991_20748608:THUMPD1;ENSG00000066654:ENST00000431224:exon_20746723_20748608:THUMPD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 20796387 G/C 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000005187:ENST00000289416:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000440284:exon_20796306_20796429:ACSM3;ENSG00000005187:ENST00000450120:exon_20796306_20796429:ACSM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 21190853 A/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:C A C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21190796_21191937:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21190796_21191935:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21190796_21191935:TMEM159 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 23847575 C/A 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:C C A 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_23847322_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_23847345_23847669:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000498058:exon_23847403_23847669:PRKCB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 24166130 T/C 1 19 13 32 8.78493903546708 6.98925223889095 1.79568679657613 T:C T C 10 0.537634787606996 0.596845172220144 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 65 52 117 30.0537388055453 27.9570089555638 2.09672984998146 T:C C T 10 0.537634787606996 0.711825184141197 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 24801737 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 24835168 G/A 1 18 12 30 8.32257382307407 6.45161745128395 1.87095637179012 A:G G A 10 0.537634787606996 0.584234293333663 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24834753_24836196:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24834753_24837545:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24834753_24837548:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000432286:exon_24834753_24836090:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000450465:exon_24834753_24836107:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000464539:exon_24834753_24836107:TNRC6A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 87 94 181 40.2257734781913 50.5376700350576 -10.3118965568663 T:C C T 10 0.537634787606996 0.135922194206817 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 27246617 T/C 1 69 52 121 31.9031996551173 27.9570089555638 3.94619069955348 T:C T C 10 0.537634787606996 0.523578025815289 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27246499_27246620:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27246499_27246620:NSMCE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 27356203 A/G 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27356190_27356341:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27356190_27356341:IL4R HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 27460063 G/T 1 99 91 190 45.7741560269074 48.9247656722366 -3.15060964532925 T:G G T 10 0.537634787606996 0.662896090208215 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27459855_27461879:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27459855_27462115:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27459855_27462115:IL21R HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 28506872 A/G 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:G A G 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 14 7 21 6.47311297350206 3.76344351324897 2.70966946025308 A:G A G 10 0.537634787606996 0.27805722506375 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 28603012 A/G 1 29 19 48 13.4085911593971 10.2150609645329 3.19353019486419 A:G A G 10 0.537634787606996 0.387551334462482 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 21 11 32 9.70966946025308 5.91398266367696 3.79568679657613 A:G A G 10 0.537634787606996 0.215419394388812 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 28944396 C/G 1 60 52 112 27.7419127435802 27.9570089555638 -0.215096211983553 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 29675928 C/T 1 85 91 176 39.3010430534053 48.9247656722366 -9.6237226188313 T:C C T 10 0.537634787606996 0.151340072383906 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 29999225 G/A 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 A:G G A 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 T:G G T 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30198151 A/G 1 1031 1109 2140 476.698533977187 596.236979456159 -119.538445478971 A:T:G A G 10 0.537634787606996 2.41309885477564e-07 ENSG00000102879:ENST00000219150:exon_30198137_30198266:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000440463:exon_30198137_30198316:CORO1A;ENSG00000102879:ENST00000421578:exon_30198137_30198266:CORO1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30199579 C/T 1 27 23 50 12.4838607346111 12.3656001149609 0.118260619650199 T:C C T 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 14 5 19 6.47311297350206 2.68817393803498 3.78493903546708 T:C T C 10 0.537634787606996 0.106639303162675 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30390314 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30393660 G/A 1 96 83 179 44.3870603897284 44.6236873713807 -0.236626981652286 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 30680976 G/C 1 23 23 46 10.6343998850391 12.3656001149609 -1.73120022992182 C:G G C 10 0.537634787606996 0.658565954713003 ENSG00000156860:ENST00000356166:exon_30680390_30682131:FBRS;ENSG00000156860:ENST00000402749:exon_30680390_30682130:FBRS;ENSG00000156860:ENST00000287468:exon_30680390_30682131:FBRS;ENSG00000156860:ENST00000494101:exon_30680390_30682130:FBRS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 31374256 A/C 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:C A C 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374256_31374396:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374256_31374396:ITGAX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 31374535 C/G 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 C:G C G 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31374486_31374695:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31374486_31374695:ITGAX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 46652209 A/C 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000171241:ENST00000303383:exon_46652117_46652284:SHCBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 50402642 T/C 1 13 11 24 6.01074776110905 5.91398266367696 0.0967650974320957 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166164:ENST00000394688:exon_50402637_50402845:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000394689:exon_50402637_50402690:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000401491:exon_50402637_50402831:BRD7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 17 8 25 7.86020861068107 4.30107830085597 3.5591303098251 A:G G A 10 0.537634787606996 0.165963674291836 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 50745583 T/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167207:ENST00000526417:exon_50744469_50746284:NOD2;ENSG00000167207:ENST00000300589:exon_50744469_50746284:NOD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 53262964 C/T 1 27 20 47 12.4838607346111 10.7526957521399 1.73116498247119 T:C C T 10 0.537634787606996 0.662480005398447 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 56396430 C/A 1 63 85 148 29.1290083807593 45.6989569465947 -16.5699485658354 A:C C A 10 0.537634787606996 0.00649861997515768 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 96 62 158 44.3870603897284 33.3333568316338 11.0537035580946 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0796490842080867 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 56839439 C/T 1 27 11 38 12.4838607346111 5.91398266367696 6.56987807093415 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0346696566300355 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56839416_56839544:NUP93 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 56871605 G/A 1 58 52 110 26.8171823187942 27.9570089555638 -1.13982663676956 A:G G A 10 0.537634787606996 0.848733052728384 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56871520_56871638:NUP93 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 57080528 C/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:C C A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57080464_57080553:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57080464_57080553:NLRC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 T:C C T 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 16 15 31 7.39784339828806 8.06452181410494 -0.666678415816877 T:C C T 10 0.537634787606996 0.858217650481407 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 57609000 C/G 1 24 18 42 11.0967650974321 9.67742617692593 1.41933892050617 C:G C G 10 0.537634787606996 0.757534019128328 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57608727_57609004:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57608727_57609004:GPR114 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 66638804 G/A 1 14 23 37 6.47311297350206 12.3656001149609 -5.89248714145885 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0684593171722661 ENSG00000140931:ENST00000424011:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000360086:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000361909:exon_66638634_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000394108:exon_66638567_66638855:CMTM3;ENSG00000140931:ENST00000332807:exon_66638635_66638832:CMTM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 67576281 A/G 1 15 14 29 6.93547818589506 7.52688702649794 -0.591408840602884 A:G A G 10 0.537634787606996 0.854036703051874 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67575770_67577167:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67575770_67577167:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67575770_67577167:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67575770_67577167:FAM65A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 67865937 T/C 1 20 17 37 9.24730424786008 9.13979138931893 0.107512858541147 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67865915_67866011:CENPT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 69973297 C/T 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69973244_69973316:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69973244_69973316:WWP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 65 53 118 30.0537388055453 28.4946437431708 1.55909506237447 A:G G A 10 0.537634787606996 0.782770162898796 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 22 27 49 10.1720346726461 14.5161392653889 -4.3441045927428 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.251844055097628 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 9 2 11 4.16128691153704 1.07526957521399 3.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0736764045328896 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 21 12 33 9.70966946025308 6.45161745128395 3.25805200896913 A:T A T 10 0.537634787606996 0.29687421642475 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 107 87 194 49.4730777260514 46.7742265218087 2.69885120424278 T:C C T 10 0.537634787606996 0.719261961948422 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 70819763 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70819605_70819772:VAC14;ENSG00000103043:ENST00000254957:exon_70819605_70819772:VAC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 71318577 T/C 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:C T C 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000180917:ENST00000338099:exon_71316203_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000434935:exon_71316206_71319842:FTSJD1;ENSG00000180917:ENST00000393548:exon_71316206_71319842:FTSJD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 71950450 C/T 1 15 13 28 6.93547818589506 6.98925223889095 -0.0537740529958883 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000182149:ENST00000378799:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000378798:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000439924:exon_71950365_71950511:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000424485:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000329908:exon_71950365_71950545:KIAA0174;ENSG00000182149:ENST00000456820:exon_71950365_71950545:KIAA0174 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 1 38 1 39 17.5698780709342 0.537634787606996 17.0322432833272 T:C C T 10 0.537634787606996 1.15508195056091e-09 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 74664743 T/C 1 8 2 10 3.69892169914403 1.07526957521399 2.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.119333604831037 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 74664810 A/T 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:T A T 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74664679_74664855:RFWD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 74708886 A/G 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G A G 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000168404:ENST00000306247:exon_74708858_74708998:MLKL;ENSG00000168404:ENST00000308807:exon_74708858_74708998:MLKL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 T:C T C 10 0.537634787606996 0.283623583656103 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81010073 C/T 1 110 113 223 50.8601733632304 60.7527309995905 -9.89255763636011 T:C C T 10 0.537634787606996 0.201894852659377 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81061827 G/A 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81061776_81061902:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000393335:exon_81061776_81061902:CENPN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81062264 G/A 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81062174_81062927:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81062174_81065090:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81062174_81065090:CENPN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81077016 A/G 1 10 15 25 4.62365212393004 8.06452181410494 -3.4408696901749 A:G A G 10 0.537634787606996 0.228198563346042 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81077384 T/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81077915 T/C 1 31 24 55 14.3333215841831 12.9032349025679 1.43008668161522 T:C T C 10 0.537634787606996 0.787195565734732 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81078081 A/G 1 26 23 49 12.0214955222181 12.3656001149609 -0.344104592742806 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 48 40 88 22.1935301948642 21.5053915042798 0.688138690584349 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.915178880206538 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 86 63 149 39.7634082657983 33.8709916192407 5.89241664655759 T:C C T 10 0.537634787606996 0.366307192946815 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 81957137 C/T 1 93 99 192 42.9999647525494 53.2258439730926 -10.2258792205432 T:C C T 10 0.537634787606996 0.147857625854761 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81957090_81957199:PLCG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 23 18 41 10.6343998850391 9.67742617692593 0.956973708113162 T:C C T 10 0.537634787606996 0.875832612545911 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 30 19 49 13.8709563717901 10.2150609645329 3.6558954072572 A:T:C C A 10 0.537634787606996 0.318630588190441 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84213114 C/T 1 12 18 30 5.54838254871605 9.67742617692593 -4.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.145192067224671 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84213434 A/T 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 A:T A T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84213439 G/A 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 A:G G A 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84695361 G/A 1 9 14 23 4.16128691153704 7.52688702649794 -3.36560011496091 A:G G A 10 0.537634787606996 0.209214096015871 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84778685 A/G 1 3 32 35 1.38709563717901 17.2043132034239 -15.8172175662449 A:G A G 10 0.537634787606996 3.24283357271107e-08 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 0 31 0 31 14.3333215841831 0 14.3333215841831 C C 10 0.537634787606996 5.94186745660387e-09 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 84778697 G/C 1 31 2 33 14.3333215841831 1.07526957521399 13.2580520089691 C:G G C 10 0.537634787606996 6.18182650699097e-07 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 85009970 A/G 1 13 11 24 6.01074776110905 5.91398266367696 0.0967650974320957 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000153786:ENST00000313732:exon_85007787_85010125:ZDHHC7;ENSG00000153786:ENST00000344861:exon_85008069_85010125:ZDHHC7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 85706047 A/C 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 A:C A C 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 85834818 G/A 1 697 798 1495 322.268553037924 429.032560510383 -106.764007472459 A:G G A 10 0.537634787606996 3.63794924906523e-08 ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 16 20 36 7.39784339828806 10.7526957521399 -3.35485235385186 A:G G A 10 0.537634787606996 0.316324009908038 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 614 646 1260 283.892240409304 347.312072794119 -63.419832384815 A:T:C:G A G 10 0.537634787606996 0.000367636556682082 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 88872229 A/G 1 56 58 114 25.8924518940082 31.1828176812058 -5.29036578719754 A:G A G 10 0.537634787606996 0.347922526842247 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88872132_88872277:CDT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 88874632 C/G 1 73 76 149 33.7526605046893 40.8602438581317 -7.10758335344241 C:G C G 10 0.537634787606996 0.250856238536158 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 89623393 G/A 1 37 26 63 17.1075128585411 13.9785044777819 3.12900838075925 A:G G A 10 0.537634787606996 0.450976624895607 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89623295_89624174:SPG7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 89644001 T/C 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C T C 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89643947_89644129:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000525982:exon_89643947_89644129:CPNE7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 89661807 C/T 1 11 2 13 5.08601733632304 1.07526957521399 4.01074776110905 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0272749448200266 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89661775_89662011:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000529800:exon_89661775_89661831:CPNE7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 89971316 G/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:G G T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 90075226 C/T 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000003249:ENST00000304733:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000002501:exon_90075192_90075332:DBNDD1;ENSG00000003249:ENST00000392973:exon_90075192_90075332:DBNDD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 16 90102833 G/A 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:G G A 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 A:C A C 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 526907 G/T 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 T:G G T 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_526773_526914:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_526773_526914:VPS53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 970413 C/T 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000382259:exon_970317_970482:ABR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 1640709 C/T 1 21 19 40 9.70966946025308 10.2150609645329 -0.50539150427984 T:C C T 10 0.537634787606996 0.87555079212786 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 1684643 C/T 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 1703543 G/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1703151_1704318:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000491788:exon_1703151_1704099:SMYD4;ENSG00000186532:ENST00000495309:exon_1703510_1704011:SMYD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 2595964 G/A 1 32 40 72 14.7956867965761 21.5053915042798 -6.70970470770371 A:G G A 10 0.537634787606996 0.124669300649177 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2595865_2595990:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2595865_2595990:KIAA0664 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 2600186 G/A 1 21 13 34 9.70966946025308 6.98925223889095 2.72041722136214 A:G G A 10 0.537634787606996 0.392789340374168 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2600013_2600236:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2600013_2600236:KIAA0664 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 2606715 G/A 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2606612_2606783:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2606612_2606783:KIAA0664 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 3577146 C/T 1 25 33 58 11.5591303098251 17.7419479910309 -6.18281768120577 T:C C T 10 0.537634787606996 0.114493322449837 ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3576521_3577171:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000345901:exon_3576524_3577171:P2RX5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 3845993 G/A 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 A:G G A 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 3910165 A/G 1 17 7 24 7.86020861068107 3.76344351324897 4.0967650974321 A:G A G 10 0.537634787606996 0.10430805333573 ENSG00000074755:ENST00000381638:exon_3907739_3910264:ZZEF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 4443756 C/T 1 58 65 123 26.8171823187942 34.9462611944547 -8.12907887566051 T:C C T 10 0.537634787606996 0.148509825115477 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4443643_4443779:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4443643_4443779:MYBBP1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 4622638 C/T 1 27 41 68 12.4838607346111 22.0430262918868 -9.55916555727573 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0210025430010050 ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4622578_4622715:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4622578_4622715:ARRB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 4701402 C/T 1 392 337 729 181.247163258058 181.182923423558 0.0642398344998867 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4701304_4701448:PSMB6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 4797305 G/A 1 20 19 39 9.24730424786008 10.2150609645329 -0.967756716672845 A:G G A 10 0.537634787606996 0.751567535707531 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4797283_4797388:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4797283_4797388:MINK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 6493198 T/C 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:C T C 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000198920:ENST00000361413:exon_6493099_6493323:KIAA0753 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 6661584 T/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C T C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 16 12 28 7.39784339828806 6.45161745128395 0.946225947004112 C:G C G 10 0.537634787606996 0.850211563621615 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 10 9 19 4.62365212393004 4.83871308846296 -0.215060964532925 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 17 13 30 7.86020861068107 6.98925223889095 0.870956371790119 A:G G A 10 0.537634787606996 0.855382105439278 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7144146 C/A 1 480 566 1046 221.935301948642 304.30128978556 -82.3659878369178 A:T:C C A 10 0.537634787606996 3.51160233129354e-07 ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7214824 C/T 1 14 9 23 6.47311297350206 4.83871308846296 1.63439988503909 T:C C T 10 0.537634787606996 0.536978589431628 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7216540 G/A 1 124 138 262 57.3332863367325 74.1936006897654 -16.860314353033 A:G G A 10 0.537634787606996 0.040729546728251 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216531_7216610:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216531_7216610:GPS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7221385 G/A 1 19 16 35 8.78493903546708 8.60215660171194 0.18278243375514 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7221384_7221491:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7221384_7221491:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7221384_7221491:NEURL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7224728 G/T 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7224680_7224778:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7224680_7224778:NEURL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7460685 G/A 1 14 8 22 6.47311297350206 4.30107830085597 2.17203467264609 A:G G A 10 0.537634787606996 0.398402068910229 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7462969 A/G 1 8 1 9 3.69892169914403 0.537634787606996 3.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.043874250082235 ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7477938 G/C 1 235 197 432 108.655824912356 105.914053158578 2.74177175377773 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.80947267356919 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7530271 C/T 1 48 29 77 22.1935301948642 15.5914088406029 6.60212135426131 T:C C T 10 0.537634787606996 0.138549357269037 ENSG00000141504:ENST00000380466:exon_7530261_7530362:SAT2;ENSG00000141504:ENST00000269298:exon_7530261_7530362:SAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7579472 G/C 1 68 57 125 31.4408344427243 30.6451828935988 0.795651549125498 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.928641241130103 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 18 10 28 8.32257382307407 5.37634787606996 2.94622594700411 C:G C G 10 0.537634787606996 0.343738653564769 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7751388 C/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:C C A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7751751 C/T 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7750864_7753046:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7750864_7753046:KDM6B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7754460 C/A 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:C C A 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000132510:ENST00000254846:exon_7754339_7754544:KDM6B;ENSG00000132510:ENST00000448097:exon_7754339_7754544:KDM6B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7843053 C/T 1 15 18 33 6.93547818589506 9.67742617692593 -2.74194799103087 T:C C T 10 0.537634787606996 0.384551725543012 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7847955 C/A 1 23 14 37 10.6343998850391 7.52688702649794 3.10751285854115 A:C:G C A 10 0.537634787606996 0.327167687629949 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 7849087 C/G 1 20 10 30 9.24730424786008 5.37634787606996 3.87095637179012 C:G C G 10 0.537634787606996 0.199814517026426 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 17 9 26 7.86020861068107 4.83871308846296 3.0214955222181 T:C T C 10 0.537634787606996 0.246429877996880 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 17 23 40 7.86020861068107 12.3656001149609 -4.50539150427984 A:G G A 10 0.537634787606996 0.157480961867148 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8053085 T/G 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:G T G 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8053073_8053194:PER1;ENSG00000179094:ENST00000413754:exon_8053073_8053194:PER1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8108331 A/G 1 191 116 307 88.3117555670638 62.3656353624115 25.9461202046522 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00289978026388140 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8108339 G/A 1 197 115 312 91.0859468414218 61.8280005748045 29.2579462666172 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000962274316992682 ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8132763 T/C 1 15 18 33 6.93547818589506 9.67742617692593 -2.74194799103087 T:C T C 10 0.537634787606996 0.384551725543012 ENSG00000178971:ENST00000315684:exon_8132620_8132764:C17orf68;ENSG00000178971:ENST00000449476:exon_8132620_8132764:C17orf68 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8192922 C/T 1 39 26 65 18.0322432833272 13.9785044777819 4.05373880554526 T:C C T 10 0.537634787606996 0.323006435125571 ENSG00000125434:ENST00000312524:exon_8192892_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000380067:exon_8191082_8192961:SLC25A35;ENSG00000125434:ENST00000396278:exon_8192892_8192961:SLC25A35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8281059 A/C 1 23 26 49 10.6343998850391 13.9785044777819 -3.34410459274281 A:C A C 10 0.537634787606996 0.390544789958225 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8384693 G/A 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 A:G G A 10 0.537634787606996 0.283623583656103 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8384640_8384728:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8384640_8384728:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8384640_8384728:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8384640_8384728:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000476737:exon_8384640_8384763:MYH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 8402669 C/T 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C C T 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8402588_8402794:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8402588_8402794:MYH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 31 28 59 14.3333215841831 15.0537740529959 -0.720452468812764 A:G A G 10 0.537634787606996 0.89647059434868 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 15930690 C/A 1 20 15 35 9.24730424786008 8.06452181410494 1.18278243375514 A:C C A 10 0.537634787606996 0.736938630785945 ENSG00000011295:ENST00000261647:exon_15930688_15932100:TTC19;ENSG00000011295:ENST00000486880:exon_15930688_15931161:TTC19;ENSG00000011295:ENST00000475723:exon_15930688_15932100:TTC19;ENSG00000011295:ENST00000497842:exon_15930688_15930849:TTC19;ENSG00000011295:ENST00000481107:exon_15930688_15932100:TTC19;ENSG00000011295:ENST00000465567:exon_15929854_15932100:TTC19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 16321032 G/C 1 10 18 28 4.62365212393004 9.67742617692593 -5.05377405299589 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0598522173708974 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 16842991 G/A 1 348 333 681 160.903093912765 179.03238427313 -18.1292903603643 A:G G A 10 0.537634787606996 0.166638430999293 ENSG00000240505:ENST00000437538:exon_16842970_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 19 22 41 8.78493903546708 11.8279653273539 -3.04302629188684 T:C C T 10 0.537634787606996 0.351821111193613 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 17707105 T/C 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 17997209 G/A 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 A:G G A 10 0.537634787606996 0.261199351101203 ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 19839625 G/A 1 7 11 18 3.23655648675103 5.91398266367696 -2.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.241209079822295 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19839599_19839743:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19839599_19839743:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000460046:exon_19839315_19839743:AKAP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 20107773 T/C 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 20108239 A/T 1 18 11 29 8.32257382307407 5.91398266367696 2.40859115939712 A:T:C A T 10 0.537634787606996 0.45740998643831 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 20109189 C/T 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 20163529 A/G 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20163505_20163607:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20163505_20163607:SPECC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 20924523 G/A 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000124422:ENST00000455117:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000261497:exon_20924426_20924539:USP22;ENSG00000124422:ENST00000476111:exon_20924426_20924539:USP22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 31 0 31 14.3333215841831 0 14.3333215841831 T T 10 0.537634787606996 5.94186745660387e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 27 0 27 12.4838607346111 0 12.4838607346111 T T 10 0.537634787606996 8.20436526373805e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 30 0 30 13.8709563717901 0 13.8709563717901 G G 10 0.537634787606996 1.14101173825036e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 33 0 33 15.2580520089691 0 15.2580520089691 G G 10 0.537634787606996 1.62317933656447e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 32 0 32 14.7956867965761 0 14.7956867965761 C C 10 0.537634787606996 3.10189616561758e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 54 0 54 24.9677214692222 0 24.9677214692222 C C 10 0.537634787606996 4.41613424089275e-15 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 50 0 50 23.1182606196502 0 23.1182606196502 C C 10 0.537634787606996 6.39011474597457e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 34 0 34 15.7204172213621 0 15.7204172213621 C C 10 0.537634787606996 8.51328500367708e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 45 0 45 20.8064345576852 0 20.8064345576852 C C 10 0.537634787606996 7.89413125570202e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 50 0 50 23.1182606196502 0 23.1182606196502 G G 10 0.537634787606996 6.39011474597457e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 83 0 83 38.3763126286193 0 38.3763126286193 G G 10 0.537634787606996 6.60047086671588e-23 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C T C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 25958304 G/A 1 109 84 193 50.3978081508374 45.1613221589877 5.23648599184977 A:G G A 10 0.537634787606996 0.470867681645975 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 20 32 52 9.24730424786008 17.2043132034239 -7.95700895556379 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0359605526545572 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 26676135 C/T 1 87 84 171 40.2257734781913 45.1613221589877 -4.93554868079632 T:C C T 10 0.537634787606996 0.490177956369379 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 26686416 G/A 1 11 17 28 5.08601733632304 9.13979138931893 -4.05377405299589 A:G G A 10 0.537634787606996 0.133275989284545 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26686338_26686427:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26686338_26686427:TMEM199 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 26955330 A/C 1 18 12 30 8.32257382307407 6.45161745128395 1.87095637179012 A:C A C 10 0.537634787606996 0.584234293333663 ENSG00000007202:ENST00000389003:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000005905:exon_26955283_26955577:KIAA0100;ENSG00000007202:ENST00000528896:exon_26955283_26955577:KIAA0100 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27014396 C/T 1 18 21 39 8.32257382307407 11.2903305397469 -2.96775671667285 T:C C T 10 0.537634787606996 0.422385976086073 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 33 23 56 15.2580520089691 12.3656001149609 2.89245189400822 A:C C A 10 0.537634787606996 0.503472923393113 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27052358 C/T 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000160606:ENST00000292090:exon_27052322_27052404:TLCD1;ENSG00000160606:ENST00000394933:exon_27052322_27052404:TLCD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 62 56 118 28.6666431683662 30.1075481059918 -1.44090493762553 T:C C T 10 0.537634787606996 0.85361128401071 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 A:G A G 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27185827 C/T 1 74 68 142 34.2150257170823 36.5591655572757 -2.34413984019343 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.736578940393065 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27185594_27185842:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27185594_27185842:ERAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 79 60 139 36.5268517790473 32.2580872564198 4.26876452262755 T:C C T 10 0.537634787606996 0.496764952612383 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27225586 A/T 1 10 14 24 4.62365212393004 7.52688702649794 -2.9032349025679 A:T A T 10 0.537634787606996 0.30623055932798 ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27442042 C/G 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 C:G C G 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27441925_27442117:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27441925_27442117:MYO18A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27835138 C/T 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000160551:ENST00000261716:exon_27834914_27835150:TAOK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27889963 C/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27889986 T/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C T C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 28511884 G/A 1 164 182 346 75.8278948324527 97.8495313444733 -22.0216365120206 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0203003850762141 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 29111125 T/G 1 15 12 27 6.93547818589506 6.45161745128395 0.483860734611108 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 29113016 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29112937_29113049:CRLF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 29162173 T/C 1 1 10 11 0.462365212393004 5.37634787606996 -4.91398266367696 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00393206454661515 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 29226228 T/C 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000172171:ENST00000306049:exon_29226001_29226624:C17orf42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 29226630 T/A 1 7 10 17 3.23655648675103 5.37634787606996 -2.13979138931893 A:T T A 10 0.537634787606996 0.337092606840783 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 30179173 G/A 1 72 56 128 33.2902952922963 30.1075481059918 3.18274718630451 A:G G A 10 0.537634787606996 0.595718136644029 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30178883_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30178890_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30178890_30179327:C17orf79 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 232 218 450 107.268729275177 117.204383698325 -9.93565442314821 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.369088070619965 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 30533970 A/G 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30533929_30534048:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30533929_30534048:RHOT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 33464864 C/T 1 7 9 16 3.23655648675103 4.83871308846296 -1.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.460514092364166 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33464833_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33464833_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33464829_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000479807:exon_33464833_33464909:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000473567:exon_33464833_33464909:NLE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:C A C 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 34416537 G/A 1 460 320 780 212.687997700782 172.043132034239 40.6448656665431 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 0.00361149161209116 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34416529_34416643:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34416529_34417515:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34416529_34416634:CCL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 34432581 T/C 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.78230937649714 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 34432586 A/G 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G A G 10 0.537634787606996 0.78230937649714 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 34432663 A/G 1 400 226 626 184.946084957202 121.505461999181 63.4406229580205 A:T:G A G 10 0.537634787606996 3.28353263295984e-07 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 34432664 T/A 1 397 227 624 183.558989320023 122.043096786788 61.5158925332345 A:T:C T A 10 0.537634787606996 7.31028894951108e-07 ENSG00000129277:ENST00000250151:exon_34432618_34433011:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000389070:exon_34432618_34432701:CCL4;ENSG00000129277:ENST00000394495:exon_34432618_34433014:CCL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 T:C T C 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 17 18 35 7.86020861068107 9.67742617692593 -1.81721756624486 C:G C G 10 0.537634787606996 0.612162094837479 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 T:C T C 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 13 11 24 6.01074776110905 5.91398266367696 0.0967650974320957 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 36474601 A/G 1 28 22 50 12.9462259470041 11.8279653273539 1.1182606196502 A:G A G 10 0.537634787606996 0.778522652035765 ENSG00000174100:ENST00000312513:exon_36474586_36474634:MRPL45 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 37884037 C/G 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 C:G C G 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000141736:ENST00000406381:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000269571:exon_37883942_37884915:ERBB2;ENSG00000141736:ENST00000445658:exon_37883942_37884915:ERBB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 38062196 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 10 1 11 4.62365212393004 0.537634787606996 4.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0141945240310668 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 38991003 T/C 1 24 19 43 11.0967650974321 10.2150609645329 0.881704132899172 T:C T C 10 0.537634787606996 0.878817482439178 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 35 24 59 16.1827824337551 12.9032349025679 3.27954753118724 A:T T A 10 0.537634787606996 0.434647954665004 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 A:G A G 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 86 5 91 39.7634082657983 2.68817393803498 37.0752343277634 C:G G C 10 0.537634787606996 8.07582967702746e-18 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 92 5 97 42.5375995401564 2.68817393803498 39.8494256021214 A:G G A 10 0.537634787606996 4.3316317856552e-19 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 39983849 G/C 1 127 20 147 58.7203819739115 10.7526957521399 47.9676862217716 C:G G C 10 0.537634787606996 5.74939708186635e-17 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 40065774 T/G 1 19 40 59 8.78493903546708 21.5053915042798 -12.7204524688128 T:G T G 10 0.537634787606996 0.000985767175729208 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 41 57 98 18.9569737081132 30.6451828935988 -11.6882091854856 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0196343840628528 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 40696233 C/A,G 0 0 36 36 0 19.3548523538519 -19.3548523538519 A:G C G 10 0.537634787606996 8.6989220080957e-13 ENSG00000108784:ENST00000225927:exon_40695046_40696464:NAGLU;ENSG00000108784:ENST00000377405:exon_40695046_40696464:NAGLU HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 40849767 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 40926695 A/T 1 106 85 191 49.0107125136584 45.6989569465947 3.31175556706376 A:T A T 10 0.537634787606996 0.663562105593222 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C T C 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 41234470 A/G 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 A:G A G 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000487825:exon_41234421_41234592:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461574:exon_41234421_41234592:BRCA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 41291953 C/G 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 C:G C G 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41291833_41292300:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41291833_41292350:NBR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 41352643 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 21 21 42 9.70966946025308 11.2903305397469 -1.58066107949383 A:G G A 10 0.537634787606996 0.645316431091822 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42225547 A/C 1 7 10 17 3.23655648675103 5.37634787606996 -2.13979138931893 A:C A C 10 0.537634787606996 0.337092606840783 ENSG00000125319:ENST00000319977:exon_42225226_42226395:C17orf53;ENSG00000125319:ENST00000245382:exon_42225226_42226395:C17orf53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42254011 C/G 1 13 15 28 6.01074776110905 8.06452181410494 -2.05377405299589 C:G C G 10 0.537634787606996 0.45452184329692 ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42254281 A/G 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000161664:ENST00000293414:exon_42254106_42254598:ASB16;ENSG00000168597:ENST00000303061:exon_42253354_42255184:C17orf65 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42268274 C/T 1 20 14 34 9.24730424786008 7.52688702649794 1.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.608615359283045 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42267869_42269098:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42267869_42269098:TMUB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 83 83 166 38.3763126286193 44.6236873713807 -6.24737474276134 T:C C T 10 0.537634787606996 0.35061192564463 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42429780 C/T 1 299 265 564 138.247198505508 142.473218715854 -4.22602021034575 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73558332367897 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42429709_42429939:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42429709_42429939:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42429709_42429939:GRN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42449789 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000005961:ENST00000262407:exon_42449550_42449791:ITGA2B;ENSG00000005961:ENST00000353281:exon_42449550_42449791:ITGA2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 16 10 26 7.39784339828806 5.37634787606996 2.0214955222181 C:G G C 10 0.537634787606996 0.556048478872558 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 20 12 32 9.24730424786008 6.45161745128395 2.79568679657613 T:C T C 10 0.537634787606996 0.377303175258482 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 43111558 G/A 1 10 18 28 4.62365212393004 9.67742617692593 -5.05377405299589 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0598522173708974 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43111555_43111758:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000310604:exon_43111555_43111758:DCAKD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 154 99 253 71.2042427085226 53.2258439730926 17.97839873543 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0233010991856303 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 43316360 G/A 1 20 33 53 9.24730424786008 17.7419479910309 -8.49464374317079 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0265636323724764 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43316322_43316432:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43316322_43316432:FMNL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 19 14 33 8.78493903546708 7.52688702649794 1.25805200896913 C:G G C 10 0.537634787606996 0.728787781432511 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 39 33 72 18.0322432833272 17.7419479910309 0.290295292296285 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 80 72 152 36.9892169914403 38.7097047077037 -1.7204877162634 T:C T C 10 0.537634787606996 0.807454291056424 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 11 8 19 5.08601733632304 4.30107830085597 0.784939035467076 T:C C T 10 0.537634787606996 0.819985066606254 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 13 18 31 6.01074776110905 9.67742617692593 -3.66667841581688 T:C T C 10 0.537634787606996 0.209584119262626 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 17 15 32 7.86020861068107 8.06452181410494 -0.204313203423873 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46020698 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46020672_46020796:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46020672_46020796:PNPO HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46053269 G/A 1 75 105 180 34.6773909294753 56.4516526987346 -21.7742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00126118321577439 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46053235_46053379:CDK5RAP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46136133 G/C 1 79 72 151 36.5268517790473 38.7097047077037 -2.1828529286564 A:C:G G C 10 0.537634787606996 0.744468220319266 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46198876 G/C 1 40 31 71 18.4946084957202 16.6666784158169 1.82793007990328 C:G G C 10 0.537634787606996 0.7216549387044 ENSG00000002919:ENST00000393405:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000359238:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000439357:exon_46198597_46200105:SNX11;ENSG00000002919:ENST00000452859:exon_46198597_46200105:SNX11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 22 47 69 10.1720346726461 25.2688350175288 -15.0968003448827 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.000381818538206504 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46926615 G/A 1 78 72 150 36.0644865666543 38.7097047077037 -2.6452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 0.682783850106534 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509415:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000505071:exon_46926614_46926631:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000502761:exon_46926614_46926739:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46926614_46926739:CALCOCO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 72 68 140 33.2902952922963 36.5591655572757 -3.26887026497944 C:G C G 10 0.537634787606996 0.611429675993116 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 41 29 70 18.9569737081132 15.5914088406029 3.36556486751028 T:C C T 10 0.537634787606996 0.472632621401306 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 47007963 C/T 1 171 141 312 79.0644513192037 75.8065050525864 3.25794626661725 T:C C T 10 0.537634787606996 0.733554535908104 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47006678_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47007733_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47007736_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514089:exon_47007743_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515572:exon_47007750_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000504000:exon_47007752_47007974:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509989:exon_47007788_47007974:SNF8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 47293906 G/A 1 62 64 126 28.6666431683662 34.4086264068477 -5.7419832384815 A:G G A 10 0.537634787606996 0.326154459991762 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47293893_47294060:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47293893_47294042:ABI3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 48174908 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000005882:ENST00000007708:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508030:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503176:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000503614:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000442211:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000508960:exon_48174787_48175160:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505897:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000505440:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000512238:exon_48174787_48174928:PDK2;ENSG00000005882:ENST00000515040:exon_48174877_48174928:PDK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 48226811 C/T 1 39 29 68 18.0322432833272 15.5914088406029 2.44083444272427 T:C C T 10 0.537634787606996 0.627058742111964 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 48437456 C/G 1 18 17 35 8.32257382307407 9.13979138931893 -0.81721756624486 C:G C G 10 0.537634787606996 0.865865428364802 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 48549791 C/G 1 25 27 52 11.5591303098251 14.5161392653889 -2.95700895556379 C:G C G 10 0.537634787606996 0.487202490699574 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000508245:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000510262:exon_48549789_48549807:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512119:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000512537:exon_48549789_48549940:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000503295:exon_48549492_48549940:ACSF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 54978794 G/A 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000121060:ENST00000316881:exon_54978780_54978939:TRIM25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 61805747 G/A 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000125695:ENST00000336174:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375840:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000447001:exon_61805694_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000392950:exon_61805718_61805773:STRADA;ENSG00000125695:ENST00000375841:exon_61805694_61805773:STRADA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 61901197 T/A 1 53 55 108 24.5053562568292 29.5699133183848 -5.06455706155557 A:T T A 10 0.537634787606996 0.336074775136299 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61901177_61901312:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61901177_61901312:FTSJ3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 61903445 G/C 1 8 15 23 3.69892169914403 8.06452181410494 -4.36560011496091 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.0926563791565774 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903416_61903495:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903416_61903495:FTSJ3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 61908271 C/T 1 211 192 403 97.5590598149238 103.225879220543 -5.66681940561939 T:C C T 10 0.537634787606996 0.582878077380978 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908169_61908295:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908169_61908295:PSMC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 61908556 C/T 1 265 254 519 122.526781284146 136.559236052177 -14.0324547680309 T:C C T 10 0.537634787606996 0.218058948414623 ENSG00000087191:ENST00000310144:exon_61908396_61908586:PSMC5;ENSG00000087191:ENST00000375812:exon_61908396_61908586:PSMC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 66246416 A/G 1 72 79 151 33.2902952922963 42.4731482209527 -9.1828529286564 A:G A G 10 0.537634787606996 0.142074903182925 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 70645013 G/A 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70644942_70645100:SLC39A11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 70645032 G/A 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 A:G G A 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_70644942_70645100:SLC39A11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 71192663 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71192646_71192890:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71192646_71192890:COG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 71196809 A/G 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71196705_71196915:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71196705_71196915:COG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 19 22 41 8.78493903546708 11.8279653273539 -3.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.351821111193613 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 C:G G C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 72860653 G/A 1 24 46 70 11.0967650974321 24.7312002299218 -13.6344351324897 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00113749441709451 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860602_72860686:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860602_72860686:FDXR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 47 47 94 21.7311649824712 25.2688350175288 -3.53767003505762 T:C C T 10 0.537634787606996 0.470976051449983 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 117 119 236 54.0967298499815 63.9785397252325 -9.88180987525106 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.214807324902897 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73488794 C/T 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73488555_73488870:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73488555_73488870:KIAA0195 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73775054 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73816026 A/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G A G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000132478:ENST00000293218:exon_73816001_73816189:UNK;ENSG00000178932:ENST00000326348:exon_73815663_73816134:AC087289.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73831016 G/A 1 19 28 47 8.78493903546708 15.0537740529959 -6.26883501752881 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0787624759270688 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73831001_73831144:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73831001_73831144:UNC13D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73839137 G/A 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73839095_73839154:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73839095_73839154:UNC13D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73886888 A/G 1 4 12 16 1.84946084957202 6.45161745128395 -4.60215660171194 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0241945022903132 ENSG00000141569:ENST00000269383:exon_73885041_73887428:TRIM65 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 60 42 102 27.7419127435802 22.5806610794938 5.16125166408641 T:C T C 10 0.537634787606996 0.321990282054216 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 74077797 C/T 1 36 45 81 16.6451476461481 24.1935654423148 -7.54841779616668 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0956784417470664 ENSG00000186919:ENST00000334586:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000425015:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000441571:exon_74077626_74077836:ZACN;ENSG00000186919:ENST00000421794:exon_74077681_74077836:ZACN;ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 24 21 45 11.0967650974321 11.2903305397469 -0.193565442314821 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 111 89 200 51.3225385756234 47.8494960970226 3.4730424786008 A:G A G 10 0.537634787606996 0.670609192047409 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76166939 C/G 1 136 118 254 62.8816688854485 63.4409049376255 -0.559236052176992 T:C:G C G 10 0.537634787606996 0.94990729862849 ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76187108 G/C 1 34 23 57 15.7204172213621 12.3656001149609 3.35481710640123 C:G G C 10 0.537634787606996 0.426207948956575 ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000481282:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000409431:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000475701:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000409722:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000424020:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000392388:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000458315:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000472544:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000498191:exon_76187051_76187141:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000484578:exon_76186792_76187141:AFMID HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 17 15 32 7.86020861068107 8.06452181410494 -0.204313203423873 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76795805 G/C 1 27 31 58 12.4838607346111 16.6666784158169 -4.18281768120577 C:G G C 10 0.537634787606996 0.29349256054431 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76795749_76795850:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76795749_76795850:USP36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 26 24 50 12.0214955222181 12.9032349025679 -0.881739380349801 A:G G A 10 0.537634787606996 0.887432013207721 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76799835 C/A 1 16 11 27 7.39784339828806 5.91398266367696 1.48386073461111 A:C C A 10 0.537634787606996 0.700336022866229 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 77768654 C/A 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 77807720 C/G 1 22 26 48 10.1720346726461 13.9785044777819 -3.80646980513581 C:G C G 10 0.537634787606996 0.311496519779720 ENSG00000141582:ENST00000269397:exon_77806955_77809194:CBX4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 78084769 G/A 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78084740_78084824:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78084740_78084824:GAA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 78091405 G/A 1 11 18 29 5.08601733632304 9.67742617692593 -4.59140884060288 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0957903136658136 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 78341776 G/A 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 A:G G A 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78341761_78341943:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78341761_78341943:RNF213 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 78345775 A/G 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78345674_78345785:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78345674_78345785:RNF213 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 78354661 C/T 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78354631_78354787:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78354631_78354787:RNF213 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79163758 G/A 1 25 26 51 11.5591303098251 13.9785044777819 -2.4193741679568 A:G G A 10 0.537634787606996 0.574780130997295 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79163715_79163775:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79163715_79163775:AZI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79164707 C/T 1 22 30 52 10.1720346726461 16.1290436282099 -5.95700895556379 T:C C T 10 0.537634787606996 0.125261464544239 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164707_79164884:AZI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 T:C T C 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79182778 T/C 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79182728_79182822:AZI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 544 616 1160 251.526675541794 331.18302916591 -79.6563536241154 A:G A G 10 0.537634787606996 3.17489291229612e-06 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79803433 G/A 1 7 19 26 3.23655648675103 10.2150609645329 -6.9785044777819 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 0.00916164201572642 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79805134 G/A 1 354 367 721 163.677285187123 197.311967051768 -33.6346818646441 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0123252431317686 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79805119_79805203:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79805119_79805206:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79805119_79805223:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000484286:exon_79805119_79805724:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79805119_79805223:P4HB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79845968 C/T 1 97 79 176 44.8494256021214 42.4731482209527 2.3762773811687 T:C C T 10 0.537634787606996 0.762535687660445 ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79845717_79846021:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79845721_79846021:THOC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 33 18 51 15.2580520089691 9.67742617692593 5.5806258320432 A:T T A 10 0.537634787606996 0.124268748846173 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80012407 C/T 1 66 65 131 30.5161040179383 34.9462611944547 -4.43015717651648 T:C C T 10 0.537634787606996 0.483480723680656 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 30 42 72 13.8709563717901 22.5806610794938 -8.70970470770371 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0443066876295592 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80041950 G/A 1 28 21 49 12.9462259470041 11.2903305397469 1.6558954072572 A:G G A 10 0.537634787606996 0.669607584542965 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80041851_80042029:FASN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80043739 A/G 1 18 17 35 8.32257382307407 9.13979138931893 -0.81721756624486 A:G A G 10 0.537634787606996 0.865865428364802 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80043358_80043747:FASN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 18 27 45 8.32257382307407 14.5161392653889 -6.19356544231482 A:G G A 10 0.537634787606996 0.072853131972327 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80377690 T/G 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 T:G T G 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80377625_80377759:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80377665_80377759:HEXDC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80401946 A/G 1 26 23 49 12.0214955222181 12.3656001149609 -0.344104592742806 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80400520_80402000:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80401498_80401980:C17orf62 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 80923536 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_80923527_80923622:B3GNTL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 17 81006387 G/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006347_81006446:B3GNTL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 224131 G/A 1 24 14 38 11.0967650974321 7.52688702649794 3.56987807093415 A:G G A 10 0.537634787606996 0.259608331084328 ENSG00000079134:ENST00000261600:exon_224084_224179:THOC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 180 192 372 83.2257382307407 103.225879220543 -20.0001409898025 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0424336569416191 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 674320 A/G 1 43 38 81 19.8817041328992 20.4301219290658 -0.548417796166678 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.911738554820646 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 2616457 G/C 1 12 8 20 5.54838254871605 4.30107830085597 1.24730424786008 C:G G C 10 0.537634787606996 0.657566913300005 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2616436_2616634:NDC80 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 2750477 A/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2750348_2750505:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2750348_2750505:SMCHD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 9936132 T/C 1 28 41 69 12.9462259470041 22.0430262918868 -9.09680034488272 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0298897588400114 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9936107_9936210:VAPA;ENSG00000101558:ENST00000400000:exon_9936107_9936210:VAPA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 9944956 T/C 0 9 0 9 4.16128691153704 0 4.16128691153704 T T 10 0.537634787606996 0.00471882013301929 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 9944960 A/G 0 9 0 9 4.16128691153704 0 4.16128691153704 A A 10 0.537634787606996 0.00471882013301929 ENSG00000101558:ENST00000340541:exon_9944921_9945055:VAPA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 52 117 169 24.0429910444362 62.9032701500185 -38.8602791055823 C:G G C 10 0.537634787606996 2.40950397095619e-09 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 91 99 190 42.0752343277634 53.2258439730926 -11.1506096453292 C:G C G 10 0.537634787606996 0.109664799748413 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 12348285 T/C 1 37 50 87 17.1075128585411 26.8817393803498 -9.77422652180865 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0407168165971500 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 31 38 69 14.3333215841831 20.4301219290658 -6.09680034488273 T:C C T 10 0.537634787606996 0.148676343150602 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 12984144 C/A 1 34 26 60 15.7204172213621 13.9785044777819 1.74191274358024 A:C C A 10 0.537634787606996 0.698882913897192 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12984039_12984189:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12984039_12984189:SEH1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 13116432 G/T 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:G G T 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000101639:ENST00000506447:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513432:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000325971:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000511820:exon_13116022_13116735:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000510237:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000399863:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000430049:exon_13116373_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000508539:exon_13116376_13116502:CEP192;ENSG00000101639:ENST00000513183:exon_13116403_13116502:CEP192 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 19154143 G/A 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 20516790 A/G 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20516717_20516923:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20516717_20516923:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20516717_20516923:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20516717_20516923:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20516717_20516923:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20516717_20516923:RBBP8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 20793995 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000134508:ENST00000256925:exon_20793941_20794018:CABLES1;ENSG00000134508:ENST00000420687:exon_20793941_20794018:CABLES1;ENSG00000134508:ENST00000400473:exon_20793941_20794018:CABLES1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 21120444 T/C 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:C T C 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 24035675 T/C 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000134504:ENST00000317932:exon_24034874_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000417602:exon_24034877_24035865:KCTD1;ENSG00000134504:ENST00000408011:exon_24034877_24035865:KCTD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 29122799 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29122483_29122815:DSG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 29126670 T/C 1 13 7 20 6.01074776110905 3.76344351324897 2.24730424786008 T:C T C 10 0.537634787606996 0.373960999192447 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 29432624 T/C 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 T:C T C 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29432558_29432626:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29432558_29432626:TRAPPC8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 39 35 74 18.0322432833272 18.8172175662449 -0.784974282917705 A:G A G 10 0.537634787606996 0.907374535037487 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 33754507 A/G 1 69 49 118 31.9031996551173 26.3441045927428 5.55909506237447 A:G A G 10 0.537634787606996 0.311630236861862 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33754448_33757909:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33754448_33754618:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33754448_33754618:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33754448_33754618:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33754448_33754618:ELP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 43678225 T/C 1 136 145 281 62.8816688854485 77.9570442030144 -15.0753753175659 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0728779567022185 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43678138_43678319:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43678138_43678261:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000484856:exon_43678138_43678245:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000475026:exon_43678138_43678239:ATP5A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 43796497 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000152242:ENST00000282059:exon_43795777_43796561:C18orf25;ENSG00000152242:ENST00000321319:exon_43795777_43796561:C18orf25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 47803354 C/T 1 15 17 32 6.93547818589506 9.13979138931893 -2.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.48073676974361 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47803202_47803368:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47803202_47803368:MBD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 47809871 G/T 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:G G T 10 0.537634787606996 0.760798936826728 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 47811374 G/A 1 88 100 188 40.6881386905844 53.7634787606996 -13.0753400701152 A:G G A 10 0.537634787606996 0.057424075376387 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47811372_47811617:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47811372_47811617:CXXC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 47908556 G/A 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 A:G G A 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47908499_47908596:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47908499_47908596:SKA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 47918639 A/C 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:C A C 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 51820805 G/A 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 52895531 T/C 1 98 83 181 45.3117908145144 44.6236873713807 0.68810344313372 T:C T C 10 0.537634787606996 0.940686925331534 ENSG00000196628:ENST00000354452:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000457482:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000356073:exon_52895452_52895592:TCF4;ENSG00000196628:ENST00000398339:exon_52895452_52895592:TCF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 55221648 T/C 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55221492_55221656:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55221492_55221656:FECH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 55226383 G/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 C:G G C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55226377_55226475:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55226377_55226475:FECH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 55240505 C/T 1 10 3 13 4.62365212393004 1.61290436282099 3.01074776110905 T:C C T 10 0.537634787606996 0.104163295807923 ENSG00000066926:ENST00000262093:exon_55240478_55240597:FECH;ENSG00000066926:ENST00000382873:exon_55240478_55240597:FECH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 73 52 125 33.7526605046893 27.9570089555638 5.79565154912549 T:C C T 10 0.537634787606996 0.324219449108315 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 10 2 12 4.62365212393004 1.07526957521399 3.54838254871605 A:G A G 10 0.537634787606996 0.045018410432618 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56202982 A/T 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:T A T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56203411 G/C 1 14 7 21 6.47311297350206 3.76344351324897 2.70966946025308 C:G G C 10 0.537634787606996 0.27805722506375 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56203447 A/G 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 T:G G T 10 0.537634787606996 0.283623583656103 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56203898 T/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:C A C 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56204489 C/G 1 5 13 18 2.31182606196502 6.98925223889095 -4.67742617692593 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0327513793510114 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56204644 T/G 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:G T G 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 10 2 12 4.62365212393004 1.07526957521399 3.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.045018410432618 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 60241732 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60241290_60242783:ZCCHC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 60985879 T/C 1 30 19 49 13.8709563717901 10.2150609645329 3.6558954072572 T:C T C 10 0.537634787606996 0.318630588190441 ENSG00000171791:ENST00000398117:exon_60985315_60987361:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000333681:exon_60985315_60986185:BCL2;ENSG00000171791:ENST00000444484:exon_60985187_60986185:BCL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 26 36 62 12.0214955222181 19.3548523538519 -7.33335683163375 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0739778292100803 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 61587053 G/A 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 12 17 29 5.54838254871605 9.13979138931893 -3.59140884060288 T:C C T 10 0.537634787606996 0.196225448340524 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 25 23 48 11.5591303098251 12.3656001149609 -0.806469805135809 T:C C T 10 0.537634787606996 0.885219555592337 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 61602495 C/T 1 36 45 81 16.6451476461481 24.1935654423148 -7.54841779616668 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0956784417470664 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 71816278 G/A 1 38 29 67 17.5698780709342 15.5914088406029 1.97846923033127 A:G G A 10 0.537634787606996 0.71352969955148 ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 66 28 94 30.5161040179383 15.0537740529959 15.4623299649424 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00128153060337835 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 60 36 96 27.7419127435802 19.3548523538519 8.38706038972838 T:C T C 10 0.537634787606996 0.101086068504275 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 22 30 52 10.1720346726461 16.1290436282099 -5.95700895556379 T:C T C 10 0.537634787606996 0.125261464544239 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 72913950 C/T 1 16 10 26 7.39784339828806 5.37634787606996 2.0214955222181 T:C C T 10 0.537634787606996 0.556048478872558 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 72914280 G/A 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G G A 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000180011:ENST00000322342:exon_72907063_72914295:ZADH2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 77211764 T/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77211676_77211816:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77211676_77211816:NFATC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 26 22 48 12.0214955222181 11.8279653273539 0.193530194864191 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 18 77246406 T/G 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 T:G T G 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77246248_77246630:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77246248_77246937:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77246248_77246937:NFATC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 532066 C/T 1 17 15 32 7.86020861068107 8.06452181410494 -0.204313203423873 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000099804:ENST00000215574:exon_531733_532108:CDC34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 315 277 592 145.645041903796 148.924836167138 -3.27979426334164 T:C T C 10 0.537634787606996 0.804722602610306 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 619021 G/C 1 15 1 16 6.93547818589506 0.537634787606996 6.39784339828806 C:G G C 10 0.537634787606996 0.00080478678961129 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_618997_619110:POLRMT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 A:G G A 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 622336 T/G 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 T:G T G 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 648173 G/C 1 160 149 309 73.9784339828806 80.1075833534424 -6.12914937056178 C:G G C 10 0.537634787606996 0.493979833331949 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_647530_648277:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_648139_648277:RNF126 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 651650 C/T 1 53 64 117 24.5053562568292 34.4086264068477 -9.90327015001853 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0777401665666038 ENSG00000070423:ENST00000292363:exon_651611_651855:RNF126;ENSG00000070423:ENST00000340092:exon_651611_651855:RNF126 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 808412 C/T 1 85 102 187 39.3010430534053 54.8387483359136 -15.5377052825083 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0230986514569579 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_808360_808452:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000350092:exon_808360_808452:PTBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 38 30 68 17.5698780709342 16.1290436282099 1.44083444272427 A:G A G 10 0.537634787606996 0.808098739226345 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 966693 C/T 1 29 38 67 13.4085911593971 20.4301219290658 -7.02153076966873 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0876928218427186 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 991129 G/A 1 103 99 202 47.6236168764794 53.2258439730926 -5.6022270966132 A:G G A 10 0.537634787606996 0.438341854356712 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1014398 A/G 1 32 22 54 14.7956867965761 11.8279653273539 2.96772146922222 A:G A G 10 0.537634787606996 0.495441898204939 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1064193 G/A 0 12 0 12 5.54838254871605 0 5.54838254871605 G G 10 0.537634787606996 0.000678701483351107 ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1064160_1064252:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000531478:exon_1064051_1064252:ABCA7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1112943 G/C 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 C:G G C 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1112817_1112948:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1112817_1112948:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1112817_1112948:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1112817_1112948:SBNO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1113701 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1113534_1113703:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1113534_1113703:SBNO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1223125 C/G 1 62 67 129 28.6666431683662 36.0215307696687 -7.35488760130249 C:G C G 10 0.537634787606996 0.216358917305592 ENSG00000118046:ENST00000326873:exon_1222984_1223171:STK11;ENSG00000118046:ENST00000405031:exon_1222984_1223171:STK11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1615796 G/A 1 74 114 188 34.2150257170823 61.2903657871975 -27.0753400701152 A:G G A 10 0.537634787606996 9.57481492806466e-05 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1619333 G/A 1 98 16 114 45.3117908145144 8.60215660171194 36.7096342128025 A:G G A 10 0.537634787606996 4.57836637762067e-13 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1619348 G/A 1 99 11 110 45.7741560269074 5.91398266367696 39.8601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 2.92951906827609e-16 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1619350 C/T 1 103 12 115 47.6236168764794 6.45161745128395 41.1719994251955 T:C C T 10 0.537634787606996 1.43225672496306e-16 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1619315_1619473:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1619315_1619473:TCF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1819125 T/C 1 15 14 29 6.93547818589506 7.52688702649794 -0.591408840602884 T:C T C 10 0.537634787606996 0.854036703051874 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1821637 A/G 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1821518_1821681:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1821518_1821681:REXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1827517 C/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1986455 A/G 1 88 72 160 40.6881386905844 38.7097047077037 1.97843398288064 A:G A G 10 0.537634787606996 0.81209814817502 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 1986520 G/A 1 93 75 168 42.9999647525494 40.3226090705247 2.67735568202468 A:G G A 10 0.537634787606996 0.699420437465122 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2037842 A/C 1 404 389 793 186.795545806774 209.139932379121 -22.3443865723478 A:C A C 10 0.537634787606996 0.117094173089934 ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2037481_2039855:MKNK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2078221 G/C 1 64 58 122 29.5913735931523 31.1828176812058 -1.59144408805351 C:G G C 10 0.537634787606996 0.78593449626159 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 47 45 92 21.7311649824712 24.1935654423148 -2.46240045984363 A:G A G 10 0.537634787606996 0.676016232942371 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 46 51 97 21.2687997700782 27.4193741679568 -6.15057439787861 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.222594770413185 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2115383 C/T 1 46 66 112 21.2687997700782 35.4838959820617 -14.2150962119836 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00781307774063765 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2115218_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2115218_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2115330_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2115218_2115417:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2115218_2115417:AP3D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2337468 G/A 1 9 6 15 4.16128691153704 3.22580872564198 0.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.79707128563146 ENSG00000005206:ENST00000382189:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000432705:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2337442_2337624:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2337442_2337624:AC004410.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 27 26 53 12.4838607346111 13.9785044777819 -1.49464374317079 A:C C A 10 0.537634787606996 0.682310315722333 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 22 27 49 10.1720346726461 14.5161392653889 -4.3441045927428 A:G A G 10 0.537634787606996 0.251844055097628 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/T 1 36 33 69 16.6451476461481 17.7419479910309 -1.09680034488273 A:T A T 10 0.537634787606996 0.810135447049758 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2917186 T/C 1 4 12 16 1.84946084957202 6.45161745128395 -4.60215660171194 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0241945022903132 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2917287 C/A 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 A:C C A 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 2917612 T/C 1 12 3 15 5.54838254871605 1.61290436282099 3.93547818589506 T:C T C 10 0.537634787606996 0.066339190499547 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 3119239 C/T 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000088256:ENST00000078429:exon_3119204_3119357:GNA11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 15 13 28 6.93547818589506 6.98925223889095 -0.0537740529958883 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 43 54 97 19.8817041328992 29.0322785307778 -9.15057439787861 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0669773796570043 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4180836 C/T 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4180779_4180906:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4180779_4180906:SIRT6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 327 232 559 151.193424452512 124.731270724823 26.4621537276892 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.0273204317720714 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 273 218 491 126.22570298329 117.204383698325 9.02131928496496 A:G A G 10 0.537634787606996 0.441696734195473 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4251069 T/C 1 23 20 43 10.6343998850391 10.7526957521399 -0.11829586710083 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 37 30 67 17.1075128585411 16.1290436282099 0.978469230331267 T:C C T 10 0.537634787606996 0.902618426856129 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 A:G G A 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4362691 G/C 1 16 18 34 7.39784339828806 9.67742617692593 -2.27958277863786 C:G G C 10 0.537634787606996 0.492958608233671 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4362609_4362733:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4362609_4362733:SH3GL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 42 45 87 19.4193389205062 24.1935654423148 -4.77422652180865 A:G A G 10 0.537634787606996 0.333689518970120 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4538599 G/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G G A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000171236:ENST00000306390:exon_4537227_4538963:LRG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4816719 G/A 1 33 40 73 15.2580520089691 21.5053915042798 -6.24733949531071 A:G G A 10 0.537634787606996 0.159168676631261 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1;ENSG00000127666:ENST00000343192:exon_4816494_4817903:TICAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4818295 G/A 1 25 21 46 11.5591303098251 11.2903305397469 0.268799770078184 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4818378 T/C 1 22 24 46 10.1720346726461 12.9032349025679 -2.73120022992182 T:C T C 10 0.537634787606996 0.461190624805978 ENSG00000127666:ENST00000248244:exon_4815939_4818528:TICAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 61 60 121 28.2042779559732 32.2580872564198 -4.05380930044652 T:C T C 10 0.537634787606996 0.467203921217127 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4929413 T/C 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 4929473 A/G 1 13 9 22 6.01074776110905 4.83871308846296 1.17203467264609 A:G A G 10 0.537634787606996 0.673592113272102 ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 96 72 168 44.3870603897284 38.7097047077037 5.67735568202467 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.395480956950401 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 5914605 A/G 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 5917616 G/A 1 80 49 129 36.9892169914403 26.3441045927428 10.6451123986975 A:G G A 10 0.537634787606996 0.063791368522136 ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5916154_5917664:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5916154_5917664:RANBP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 6586268 G/A 1 1000 935 1935 462.365212393004 502.688526412541 -40.3233140195372 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.0681597905453285 ENSG00000125726:ENST00000423145:exon_6586165_6586416:CD70;ENSG00000125726:ENST00000245903:exon_6585867_6586416:CD70 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 T:C T C 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 6763718 A/G 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6763691_6763827:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6763691_6763827:SH2D3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7166388 G/A 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7166165_7166415:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7166165_7166415:INSR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7524846 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7524789_7524880:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7524789_7524880:ARHGEF18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7532252 G/C 1 8 2 10 3.69892169914403 1.07526957521399 2.62365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.119333604831037 ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7532100_7532570:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7532100_7532570:ARHGEF18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7712193 G/A 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 0.310982650884617 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7712277 A/G 1 124 105 229 57.3332863367325 56.4516526987346 0.881633637997908 A:G A G 10 0.537634787606996 0.94719302928877 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7975586 C/T 1 19 13 32 8.78493903546708 6.98925223889095 1.79568679657613 T:C C T 10 0.537634787606996 0.596845172220144 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7975581_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000494348:exon_7975145_7975688:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000465324:exon_7975581_7975620:MAP2K7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7986638 C/G 1 29 15 44 13.4085911593971 8.06452181410494 5.34406934529217 C:G C G 10 0.537634787606996 0.130101718122353 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986590_7986658:SNAPC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 7992976 T/C 1 23 21 44 10.6343998850391 11.2903305397469 -0.655930654707825 T:C T C 10 0.537634787606996 0.880554782000762 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7992962_7993051:TIMM44 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 8319455 C/T 1 16 12 28 7.39784339828806 6.45161745128395 0.946225947004112 T:C C T 10 0.537634787606996 0.850211563621615 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8319383_8319500:LASS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 8320555 G/A 1 10 14 24 4.62365212393004 7.52688702649794 -2.9032349025679 A:G G A 10 0.537634787606996 0.30623055932798 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8320491_8320609:LASS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 134 145 279 61.9569384606625 77.9570442030144 -16.0001057423519 T:C C T 10 0.537634787606996 0.062519273960296 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 8468485 C/T 1 120 128 248 55.4838254871605 68.8172528136955 -13.333427326535 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.0976553751397612 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 8503345 G/C 1 9 14 23 4.16128691153704 7.52688702649794 -3.36560011496091 C:G G C 10 0.537634787606996 0.209214096015871 ENSG00000099785:ENST00000381035:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8503272_8503895:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8503272_8503895:MARCH2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 20 15 35 9.24730424786008 8.06452181410494 1.18278243375514 T:C T C 10 0.537634787606996 0.736938630785945 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 22 31 53 10.1720346726461 16.6666784158169 -6.49464374317079 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0973906405507704 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 A:T A T 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 9922223 G/A 1 16 12 28 7.39784339828806 6.45161745128395 0.946225947004112 A:G G A 10 0.537634787606996 0.850211563621615 ENSG00000127452:ENST00000247977:exon_9920947_9922393:FBXL12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10218524 C/G 1 163 165 328 75.3655296200596 88.7097399551543 -13.3442103350947 C:G C G 10 0.537634787606996 0.149891844608 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10218480_10218530:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000446223:exon_10218480_10218530:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000430370:exon_10218480_10218530:PPAN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10221151 C/G 1 13 18 31 6.01074776110905 9.67742617692593 -3.66667841581688 C:G C G 10 0.537634787606996 0.209584119262626 ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10224526 C/T 1 57 59 116 26.3548171064012 31.7204524688128 -5.36563536241154 T:C C T 10 0.537634787606996 0.351929640833902 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10224548 G/A 1 61 57 118 28.2042779559732 30.6451828935988 -2.44090493762553 A:G G A 10 0.537634787606996 0.712089167903189 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10225777 A/G 1 446 478 924 206.21488472728 256.989428476144 -50.7745437488643 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.00085484967905773 ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10226256 A/G 1 438 473 911 202.515963028136 254.301254538109 -51.7852915099733 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000615159428578455 ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226155_10226261:EIF3G HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10385743 C/G 1 9 3 12 4.16128691153704 1.61290436282099 2.54838254871605 C:G C G 10 0.537634787606996 0.159650386833704 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10395520 G/A 1 30 36 66 13.8709563717901 19.3548523538519 -5.48389598206174 A:G G A 10 0.537634787606996 0.216735638624402 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10395973 G/A 1 76 70 146 35.1397561418683 37.6344351324897 -2.49467899062142 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.679215805932336 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395791_10397291:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395791_10397291:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395791_10397291:ICAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10577843 C/A 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:C C A 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10577563_10580305:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10577563_10580305:PDE4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 28 24 52 12.9462259470041 12.9032349025679 0.0429910444362083 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10600043 G/T 1 38 32 70 17.5698780709342 17.2043132034239 0.36556486751028 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 34 24 58 15.7204172213621 12.9032349025679 2.81718231879423 C:G C G 10 0.537634787606996 0.51130076913594 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 21 17 38 9.70966946025308 9.13979138931893 0.569878070934152 T:C C T 10 0.537634787606996 0.872492776211888 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 118 106 224 54.5590950623745 56.9892874863416 -2.43019242396711 T:G G T 10 0.537634787606996 0.788754695955863 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11039724 C/G 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000142444:ENST00000270502:exon_11039690_11040914:C19orf52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 63 66 129 29.1290083807593 35.4838959820617 -6.35488760130249 T:C T C 10 0.537634787606996 0.28941783519417 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11227554 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11233941 A/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11233850_11234020:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11233850_11234020:LDLR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11453669 G/A 1 124 98 222 57.3332863367325 52.6882091854856 4.64507715124688 A:G G A 10 0.537634787606996 0.545315128025622 ENSG00000105518:ENST00000222124:exon_11453452_11453796:TMEM205;ENSG00000105518:ENST00000447337:exon_11453452_11453796:TMEM205;ENSG00000105518:ENST00000354882:exon_11453459_11453796:TMEM205;ENSG00000105518:ENST00000433863:exon_11453461_11453796:TMEM205 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 23 16 39 10.6343998850391 8.60215660171194 2.03224328332715 C:G G C 10 0.537634787606996 0.630554836774431 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 11598483 T/C 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 12256358 T/G 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 55 60 115 25.4300866816152 32.2580872564198 -6.82800057480454 T:C C T 10 0.537634787606996 0.224119256835655 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 35 25 60 16.1827824337551 13.4408696901749 2.74191274358024 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518930958567375 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 666 746 1412 307.935231453741 401.075551554819 -93.1403201010784 A:T:G G T 10 0.537634787606996 7.65142854565761e-07 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 13059147 A/G 1 151 197 348 69.8171470713436 105.914053158578 -36.0969060872346 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000128436608468588 ENSG00000179262:ENST00000316856:exon_13058991_13059172:RAD23A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 13264549 C/T 1 99 97 196 45.7741560269074 52.1505743978786 -6.37641837097122 T:C C T 10 0.537634787606996 0.390112707203436 ENSG00000160888:ENST00000292433:exon_13263758_13265716:IER2;ENSG00000160888:ENST00000393152:exon_13263893_13265716:IER2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 7 16 23 3.23655648675103 8.60215660171194 -5.36560011496091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0345204318444650 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 13885309 C/T 1 164 140 304 75.8278948324527 75.2688702649794 0.559024567473216 T:C C T 10 0.537634787606996 0.95421479652708 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 13885484 A/G 1 474 482 956 219.161110674284 259.139967626572 -39.9788569522882 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0103609421986920 ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 14037399 C/T 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 T:C C T 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14037330_14037403:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14037330_14037403:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14037330_14037403:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14037330_14037403:CC2D1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 14038791 C/T 1 16 16 32 7.39784339828806 8.60215660171194 -1.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.724633964891837 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 14231256 T/C 1 53 69 122 24.5053562568292 37.0968003448827 -12.5914440880535 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0232538769468393 ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 34 22 56 15.7204172213621 11.8279653273539 3.89245189400822 A:G G A 10 0.537634787606996 0.348602794334694 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 31 25 56 14.3333215841831 13.4408696901749 0.892451894008223 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.893628711172208 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 21 28 49 9.70966946025308 15.0537740529959 -5.3441045927428 A:G A G 10 0.537634787606996 0.151562947180737 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 15350594 G/A 1 43 26 69 19.8817041328992 13.9785044777819 5.90319965511727 A:G G A 10 0.537634787606996 0.183922501506699 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15350470_15350632:BRD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 16666101 G/C 1 12 11 23 5.54838254871605 5.91398266367696 -0.365600114960908 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000127526:ENST00000436494:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000409648:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000248069:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000421082:exon_16665963_16666208:SLC35E1;ENSG00000127526:ENST00000469055:exon_16665963_16666412:SLC35E1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17448961 A/C 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17450016 T/C 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 T:C T C 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17622614 C/T 1 68 23 91 31.4408344427243 12.3656001149609 19.0752343277634 T:C C T 10 0.537634787606996 5.17710434827029e-05 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17622432_17622769:PGLS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17628587 A/G 1 110 37 147 50.8601733632304 19.8924871414589 30.9676862217716 A:G A G 10 0.537634787606996 1.95518950359751e-07 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17628519_17628659:PGLS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17644434 C/T 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 T:C C T 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17644396_17644510:FAM129C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17648350 T/C 1 8 15 23 3.69892169914403 8.06452181410494 -4.36560011496091 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0926563791565774 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17648185_17648352:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17648185_17648352:FAM129C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17651370 A/G 1 19 13 32 8.78493903546708 6.98925223889095 1.79568679657613 A:G A G 10 0.537634787606996 0.596845172220144 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17651201_17651391:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17651201_17651391:FAM129C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17688793 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17688766_17688898:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17688766_17688898:GLT25D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17692286 G/A 1 18 22 40 8.32257382307407 11.8279653273539 -3.50539150427984 A:G G A 10 0.537634787606996 0.272122595653034 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17691986_17693965:GLT25D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17886940 G/A 1 7 11 18 3.23655648675103 5.91398266367696 -2.67742617692593 A:G G A 10 0.537634787606996 0.241209079822295 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17892591 A/G 1 19 22 41 8.78493903546708 11.8279653273539 -3.04302629188684 A:G A G 10 0.537634787606996 0.351821111193613 ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 17973573 G/A 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 A:G G A 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 18248146 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000099308:ENST00000262811:exon_18248049_18248171:MAST3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 18273047 T/C 1 1 11 12 0.462365212393004 5.91398266367696 -5.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00201070468684902 ENSG00000105647:ENST00000222254:exon_18273012_18273120:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000444315:exon_18273012_18273120:PIK3R2;ENSG00000105647:ENST00000426902:exon_18273012_18273120:PIK3R2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 18288069 A/G 1 848 640 1488 392.085700109267 344.086264068477 47.9994360407899 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.0125677839065950 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18287950_18288102:IFI30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 19121086 C/T 1 12 22 34 5.54838254871605 11.8279653273539 -6.27958277863786 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0380777025149244 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19120664_19121151:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19120664_19121151:SUGP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 19606634 G/A 1 22 35 57 10.1720346726461 18.8172175662449 -8.64518289359877 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0238055075378965 ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19606563_19606694:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19606563_19606694:GATAD2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 19737686 C/T 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19737352_19738093:LPAR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 19740729 C/G 1 183 152 335 84.6128338679197 81.7204877162634 2.89234615165634 C:G C G 10 0.537634787606996 0.784191946893252 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 19790159 A/C 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 A:C A C 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000181896:ENST00000318110:exon_19789990_19791412:ZNF101;ENSG00000181896:ENST00000415440:exon_19789990_19791412:ZNF101 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 20003109 A/G 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:G A G 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000427401:exon_20003035_20003166:ZNF90 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 20003576 C/G 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 C:G C G 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 21131728 A/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G A G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000105750:ENST00000328178:exon_21131550_21133501:ZNF85;ENSG00000105750:ENST00000345030:exon_21131550_21133108:ZNF85 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 21300142 A/C 1 2 9 11 0.924730424786008 4.83871308846296 -3.91398266367696 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0295478960306494 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 30165639 C/T 1 22 26 48 10.1720346726461 13.9785044777819 -3.80646980513581 T:C C T 10 0.537634787606996 0.311496519779720 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 10 2 12 4.62365212393004 1.07526957521399 3.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.045018410432618 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 32873698 A/G 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000168813:ENST00000355898:exon_32873623_32878572:ZNF507;ENSG00000168813:ENST00000311921:exon_32873623_32878572:ZNF507 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33076729 C/T 1 249 222 471 115.128937885858 119.354922848753 -4.22598496289513 T:C C T 10 0.537634787606996 0.711736630197068 ENSG00000105185:ENST00000221784:exon_33076722_33076813:PDCD5;ENSG00000105185:ENST00000419343:exon_33076722_33076945:PDCD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33183291 G/A 1 19 8 27 8.78493903546708 4.30107830085597 4.48386073461111 A:G G A 10 0.537634787606996 0.120981607522106 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33183316 A/G 1 18 13 31 8.32257382307407 6.98925223889095 1.33332158418312 A:G A G 10 0.537634787606996 0.720027331176985 ENSG00000213965:ENST00000397061:exon_33182867_33183580:NUDT19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33444707 C/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33444521_33444707:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33444521_33444707:CCDC123 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33467357 G/A 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:C:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33600764 T/C 1 2 10 12 0.924730424786008 5.37634787606996 -4.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0165483848773995 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33600623_33600922:GPATCH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33602757 C/T 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33602630_33602808:GPATCH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 33608733 C/A 1 11 1 12 5.08601733632304 0.537634787606996 4.54838254871605 A:C C A 10 0.537634787606996 0.00802974675075654 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 34868455 G/A 1 407 408 815 188.182641443953 219.354993343654 -31.1723518997017 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0293963635200206 ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868408_34868491:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868408_34868491:GPI HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35175775 C/T 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 T:C C T 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 258 233 491 119.290224797395 125.26890551243 -5.97868071503504 T:G T G 10 0.537634787606996 0.587472383495718 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35660450 T/C 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C T C 10 0.537634787606996 0.561464717515668 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 526 453 979 243.20410171872 243.548558785969 -0.344457067249095 A:T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35741456 T/C 1 7 19 26 3.23655648675103 10.2150609645329 -6.9785044777819 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00916164201572642 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35741228_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35741218_35741562:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35741218_35741562:LSR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35757427 G/A 1 32 39 71 14.7956867965761 20.9677567166728 -6.17206992009672 A:G G A 10 0.537634787606996 0.153887695909362 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35757262_35757435:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35757262_35757435:LSR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 35828635 C/T 1 14 6 20 6.47311297350206 3.22580872564198 3.24730424786008 T:C C T 10 0.537634787606996 0.18020643240718 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36038390 A/G 1 20 55 75 9.24730424786008 29.5699133183848 -20.3226090705247 A:G A G 10 0.537634787606996 2.30689533991990e-06 ENSG00000105677:ENST00000392204:exon_36038226_36038397:TMEM147;ENSG00000105677:ENST00000222284:exon_36038226_36038428:TMEM147 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 490 484 974 226.558954072572 260.215237201786 -33.6562831292141 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.0313176446459678 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36224705 A/G 1 14 10 24 6.47311297350206 5.37634787606996 1.0967650974321 A:G A G 10 0.537634787606996 0.68784243201575 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36224664_36224773:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36224664_36224773:AD000671.3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36230247 C/G 1 87 67 154 40.2257734781913 36.0215307696687 4.20424270852261 C:G C G 10 0.537634787606996 0.518676016430023 ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230153_36230527:TMEM149;ENSG00000126246:ENST00000344990:exon_36230153_36230527:TMEM149 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36259415 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000167595:ENST00000396911:exon_36259306_36260077:C19orf55;ENSG00000167595:ENST00000396908:exon_36259306_36259447:C19orf55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36435564 G/A 1 5 10 15 2.31182606196502 5.37634787606996 -3.06452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 0.126573460617385 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36435450_36436084:LRFN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36594659 A/T 1 15 22 37 6.93547818589506 11.8279653273539 -4.89248714145885 A:T A T 10 0.537634787606996 0.136979634095428 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 A:C A C 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 36605647 T/C 1 15 10 25 6.93547818589506 5.37634787606996 1.5591303098251 T:C T C 10 0.537634787606996 0.555320408127842 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 37210805 C/T 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 38573669 G/T 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 T:G G T 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38571896_38573739:SIPA1L3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 38610504 G/A 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000105738:ENST00000222345:exon_38609946_38610522:SIPA1L3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 105 94 199 48.5483473012654 50.5376700350576 -1.98932273379221 T:C T C 10 0.537634787606996 0.776710113387608 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 64 62 126 29.5913735931523 33.3333568316338 -3.7419832384815 T:C C T 10 0.537634787606996 0.532211615900188 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 38872778 C/T 1 281 247 528 129.924624682434 132.795792538928 -2.87116785649391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.827291198036427 ENSG00000099341:ENST00000215071:exon_38872757_38872868:PSMD8;ENSG00000099341:ENST00000404323:exon_38872757_38872868:PSMD8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 74 74 148 34.2150257170823 39.7849742829177 -5.5699485658354 T:C T C 10 0.537634787606996 0.365627426702834 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39100594 G/A 1 75 69 144 34.6773909294753 37.0968003448827 -2.41940941540742 A:G G A 10 0.537634787606996 0.738301653127914 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39100549_39100665:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39100549_39100665:MAP4K1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.639353164025908 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39196745 C/T 1 57 61 118 26.3548171064012 32.7957220440268 -6.44090493762553 T:C C T 10 0.537634787606996 0.267862494010191 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39196684_39196771:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39196684_39196771:ACTN4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 255 259 514 117.903129160216 139.247409990212 -21.344280829996 A:T:G T G 10 0.537634787606996 0.0631162830555273 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39416887 C/T 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 39955515 C/T 1 66 32 98 30.5161040179383 17.2043132034239 13.3117908145144 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0081315404124414 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 40023088 T/G 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:G T G 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000176401:ENST00000326282:exon_40021630_40023494:EID2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 40030704 C/T 1 11 3 14 5.08601733632304 1.61290436282099 3.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.104464195382944 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 40197924 T/C 1 9 19 28 4.16128691153704 10.2150609645329 -6.05377405299589 T:C T C 10 0.537634787606996 0.023446893608627 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197818_40198028:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197818_40198028:LGALS14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 40199914 C/G 1 35 28 63 16.1827824337551 15.0537740529959 1.12900838075925 C:G C G 10 0.537634787606996 0.801771245056534 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 40331118 A/G 1 345 357 702 159.515998275586 191.935619175698 -32.4196209001112 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.0153625089502304 ENSG00000105202:ENST00000221801:exon_40331054_40331155:FBL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41211056 T/C 1 17 9 26 7.86020861068107 4.83871308846296 3.0214955222181 T:C T C 10 0.537634787606996 0.246429877996880 ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 242 151 393 111.892381399107 81.1828529286564 30.7095284704506 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00199638664448523 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 184 140 324 85.0751990803127 75.2688702649794 9.80632881533329 T:C T C 10 0.537634787606996 0.289924440873444 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41307170 G/A 1 34 33 67 15.7204172213621 17.7419479910309 -2.02153076966873 A:G G A 10 0.537634787606996 0.626437584878588 ENSG00000171570:ENST00000303961:exon_41306244_41307320:EGLN2;ENSG00000171570:ENST00000406058:exon_41306181_41307320:EGLN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41869392 T/C 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000123810:ENST00000243578:exon_41869337_41869428:B9D2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41889748 T/C 1 6 18 24 2.77419127435802 9.67742617692593 -6.9032349025679 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00655670907363702 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41889620_41889985:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41889466_41889985:TMEM91 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41903220 G/A 1 53 53 106 24.5053562568292 28.4946437431708 -3.98928748634157 A:G G A 10 0.537634787606996 0.437976535008629 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41903086_41903256:EXOSC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41928652 C/T 1 97 67 164 44.8494256021214 36.0215307696687 8.82789483245265 T:C C T 10 0.537634787606996 0.183117522317919 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41928534_41928675:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41928534_41928675:BCKDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41930396 A/G 1 126 115 241 58.2580167615185 61.8280005748045 -3.56998381328604 A:G A G 10 0.537634787606996 0.651640559495844 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41930343_41930909:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41930343_41930906:BCKDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41938222 C/T 1 20 27 47 9.24730424786008 14.5161392653889 -5.26883501752881 T:C C T 10 0.537634787606996 0.143530961087770 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41937224_41938313:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41937236_41938313:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41937236_41938313:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41937236_41938313:ATP5SL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41939297 C/G 1 8 19 27 3.69892169914403 10.2150609645329 -6.51613926538889 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0187885136530656 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 17 12 29 7.86020861068107 6.45161745128395 1.40859115939712 T:C T C 10 0.537634787606996 0.710575852780221 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 42083849 C/A 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 A:C C A 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 42085873 A/G 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 A:G A G 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 42392310 C/T 1 36 49 85 16.6451476461481 26.3441045927428 -9.69895694659466 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0385917260601974 ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 42703833 A/G 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:G A G 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42702752_42703981:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42702752_42703981:DEDD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 42753283 G/A 1 17 26 43 7.86020861068107 13.9785044777819 -6.11829586710083 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0671186434290475 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 42753649 G/C 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 43991217 C/T 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C C T 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43991176_43991275:PHLDB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 43999432 A/T 1 1 8 9 0.462365212393004 4.30107830085597 -3.83871308846296 A:T A T 10 0.537634787606996 0.0148255598114241 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43999408_43999491:PHLDB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44001345 C/T 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 T:C C T 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_44001270_44001431:PHLDB3;ENSG00000176531:ENST00000314735:exon_44000186_44001431:PHLDB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44057574 G/A 1 47 39 86 21.7311649824712 20.9677567166728 0.763408265798343 A:G G A 10 0.537634787606996 0.914116194729825 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44153003 C/T 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 T:C C T 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44418680 G/C 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44515074 C/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44515352 T/G 1 10 9 19 4.62365212393004 4.83871308846296 -0.215060964532925 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44515514 C/A 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:C C A 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44611066 T/C 1 5 10 15 2.31182606196502 5.37634787606996 -3.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 0.126573460617385 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44611162 G/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44611420 A/G 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:G A G 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44611957 T/C 1 10 2 12 4.62365212393004 1.07526957521399 3.54838254871605 T:C T C 10 0.537634787606996 0.045018410432618 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44612005 A/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G A G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44612014 A/T 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:T A T 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 44612231 A/G 1 26 14 40 12.0214955222181 7.52688702649794 4.49460849572016 A:G A G 10 0.537634787606996 0.204048278602708 ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 137 89 226 63.3440340978415 47.8494960970226 15.4945380008189 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0388216466689727 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 7 9 16 3.23655648675103 4.83871308846296 -1.60215660171194 C:G G C 10 0.537634787606996 0.460514092364166 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46319415 G/C 1 107 83 190 49.4730777260514 44.6236873713807 4.84939035467076 C:G G C 10 0.537634787606996 0.512857115830659 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46319109_46319441:SYMPK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 63 56 119 29.1290083807593 30.1075481059918 -0.978539725232523 T:C C T 10 0.537634787606996 0.854785651727725 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 59 61 120 27.2795475311872 32.7957220440268 -5.51617451283952 A:G G A 10 0.537634787606996 0.31562025546883 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46341824 C/T 1 35 41 76 16.1827824337551 22.0430262918868 -5.8602438581317 T:C C T 10 0.537634787606996 0.205607716944738 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46341719_46341873:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46341719_46341873:SYMPK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46352122 A/G 1 15 18 33 6.93547818589506 9.67742617692593 -2.74194799103087 A:G A G 10 0.537634787606996 0.384551725543012 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46352008_46352134:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46352008_46352134:SYMPK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 24 28 52 11.0967650974321 15.0537740529959 -3.95700895556379 T:C T C 10 0.537634787606996 0.330356577413624 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 16 24 40 7.39784339828806 12.9032349025679 -5.50539150427984 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0835872508973634 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46518651 A/G 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 A:G A G 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46518682 G/A 1 15 11 26 6.93547818589506 5.91398266367696 1.0214955222181 A:G G A 10 0.537634787606996 0.844575818070943 ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46518603_46518685:CCDC61 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 46857015 C/T 1 35 37 72 16.1827824337551 19.8924871414589 -3.70970470770371 T:C C T 10 0.537634787606996 0.409119227443947 ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46857005_46857164:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46857005_46857246:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46857005_46857246:PPP5C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 47282162 G/A 1 62 97 159 28.6666431683662 52.1505743978786 -23.4839312295124 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000231428530269862 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 47291174 G/C 1 29 32 61 13.4085911593971 17.2043132034239 -3.79572204402676 C:G G C 10 0.537634787606996 0.369367390389892 ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47290657_47291851:SLC1A5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 16 9 25 7.39784339828806 4.83871308846296 2.5591303098251 C:G G C 10 0.537634787606996 0.32434367374583 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 20 21 41 9.24730424786008 11.2903305397469 -2.04302629188684 A:C A C 10 0.537634787606996 0.535083538842443 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 24 14 38 11.0967650974321 7.52688702649794 3.56987807093415 T:C T C 10 0.537634787606996 0.259608331084328 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48205725 T/C 1 8 12 20 3.69892169914403 6.45161745128395 -2.75269575213992 T:C T C 10 0.537634787606996 0.264150080115426 ENSG00000063169:ENST00000396720:exon_48204585_48206534:GLTSCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 242 344 586 111.892381399107 184.946366936807 -73.0539855376997 A:C:G A G 10 0.537634787606996 1.59102363726344e-09 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48621036 C/G 1 30 28 58 13.8709563717901 15.0537740529959 -1.18281768120577 C:G C G 10 0.537634787606996 0.793089718745709 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48620895_48621038:LIG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48622427 A/G 1 28 28 56 12.9462259470041 15.0537740529959 -2.10754810599177 A:G A G 10 0.537634787606996 0.594008121580098 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48715153 T/C 1 14 8 22 6.47311297350206 4.30107830085597 2.17203467264609 T:C T C 10 0.537634787606996 0.398402068910229 ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48711361_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48711513_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48712901_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48713744_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48714044_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48714045_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48714047_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48714409_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48714634_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48714823_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48714874_48715232:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48715084_48715232:CARD8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48722180 C/T 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105483:ENST00000518450:exon_48722128_48722210:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48722128_48722269:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48722128_48722269:CARD8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 48949286 G/T 1 27 18 45 12.4838607346111 9.67742617692593 2.80643455768518 T:G G T 10 0.537634787606996 0.456159000104129 ENSG00000105447:ENST00000253237:exon_48949062_48949449:GRWD1;ENSG00000105447:ENST00000430343:exon_48949251_48949449:GRWD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49129393 C/T 1 21 12 33 9.70966946025308 6.45161745128395 3.25805200896913 T:C C T 10 0.537634787606996 0.29687421642475 ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49129148_49129619:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49129148_49129619:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49128218_49129619:SPHK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:G A G 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 1117 1351 2468 516.461942242985 726.344598057052 -209.882655814066 T:C T C 10 0.537634787606996 2.75153373480479e-17 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49496388 G/T 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 T:G G T 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49496252_49496566:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49496252_49496567:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000457974:exon_49496252_49496540:GYS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49949652 G/A 1 38 26 64 17.5698780709342 13.9785044777819 3.59137359315226 A:G G A 10 0.537634787606996 0.383200650449217 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49950298 C/T 1 123 97 220 56.8709211243395 52.1505743978786 4.72034672646087 T:C C T 10 0.537634787606996 0.543305257406273 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 100 95 195 46.2365212393004 51.0753048226646 -4.83878358336422 C:G C G 10 0.537634787606996 0.51823362469393 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 121 71 192 55.9461906995535 38.1720699200967 17.7741207794568 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0111401186301709 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 120 69 189 55.4838254871605 37.0968003448827 18.3870251422778 T:G T G 10 0.537634787606996 0.00846536504418357 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49964977 C/G 1 8 2 10 3.69892169914403 1.07526957521399 2.62365212393004 C:G C G 10 0.537634787606996 0.119333604831037 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49964876_49965057:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49967981 T/G 1 18 11 29 8.32257382307407 5.91398266367696 2.40859115939712 T:G T G 10 0.537634787606996 0.45740998643831 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 49969085 C/T 1 20 14 34 9.24730424786008 7.52688702649794 1.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.608615359283045 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 176 192 368 81.3762773811687 103.225879220543 -21.8496018393745 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0244732799318647 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50484234 G/A 1 29 20 49 13.4085911593971 10.7526957521399 2.65589540725719 A:G G A 10 0.537634787606996 0.476699286291774 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50484212_50484270:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50484212_50484270:VRK3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50863023 A/G 1 3 8 11 1.38709563717901 4.30107830085597 -2.91398266367696 A:G A G 10 0.537634787606996 0.127234760608112 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50862997_50863119:NAPSA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50865535 A/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50865429_50865570:NAPSA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50926264 T/C 1 77 61 138 35.6021213542613 32.7957220440268 2.80639931023455 T:C T C 10 0.537634787606996 0.669884379744725 ENSG00000142539:ENST00000270632:exon_50926080_50926294:SPIB;ENSG00000142539:ENST00000417618:exon_50926080_50926294:SPIB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50965272 T/C 1 2 16 18 0.924730424786008 8.60215660171194 -7.67742617692593 T:C T C 10 0.537634787606996 0.000227482227170202 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50965157_50965293:MYBPC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50967605 G/A 1 30 4 34 13.8709563717901 2.15053915042798 11.7204172213621 A:G G A 10 0.537634787606996 3.66506061463795e-05 ENSG00000086967:ENST00000357701:exon_50967603_50967789:MYBPC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 42 40 82 19.4193389205062 21.5053915042798 -2.08605258377368 T:C C T 10 0.537634787606996 0.659153964970889 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 51742952 C/T 0 18 0 18 8.32257382307407 0 8.32257382307407 C C 10 0.537634787606996 1.50181881251783e-05 ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51742773_51743274:CD33;ENSG00000105383:ENST00000421133:exon_51742773_51743274:CD33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 51850304 G/A 1 152 148 300 70.2795122837366 79.5699485658354 -9.2904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.297421769412999 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 51870438 C/A 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 A:C C A 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000160318:ENST00000291715:exon_51870352_51870469:CLDND2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 51917002 C/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:C C A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000142512:ENST00000353836:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000357375:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000432469:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000442846:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000441969:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000525998:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000436984:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000439889:exon_51916966_51917077:SIGLEC10;ENSG00000142512:ENST00000339313:exon_51916966_51917077:SIGLEC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52115645 G/C 1 16 16 32 7.39784339828806 8.60215660171194 -1.20431320342387 C:G G C 10 0.537634787606996 0.724633964891837 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52114781_52115675:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52115184_52115675:SIGLEC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52130488 G/A 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130402_52130501:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130402_52130501:SIGLEC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52130788 G/A 1 11 5 16 5.08601733632304 2.68817393803498 2.39784339828806 A:G G A 10 0.537634787606996 0.317062980975179 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130715_52130999:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130715_52130999:SIGLEC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52130830 C/A 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 A:C C A 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130715_52130999:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130715_52130999:SIGLEC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52130925 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52130715_52130999:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52130715_52130999:SIGLEC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52132325 A/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:T A T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105501:ENST00000222107:exon_52132291_52132329:SIGLEC14;ENSG00000105501:ENST00000429354:exon_52132291_52132329:SIGLEC14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 52537576 T/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:G T G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000197619:ENST00000221315:exon_52536361_52538693:ZNF615 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 53117461 C/T 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:C C T 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 53117531 C/T 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 53117809 C/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:C C A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53117014_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53117014_53118056:ZNF83 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 53959568 G/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 C:G G C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 54656709 A/T 1 27 26 53 12.4838607346111 13.9785044777819 -1.49464374317079 A:T A T 10 0.537634787606996 0.682310315722333 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000457463:exon_54656604_54656736:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000496327:exon_54656604_54656736:CNOT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 50 30 80 23.1182606196502 16.1290436282099 6.98921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.144479765920483 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:C A C 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 8 33 41 3.69892169914403 17.7419479910309 -14.0430262918868 T:C T C 10 0.537634787606996 1.09966988552584e-05 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 18 28 46 8.32257382307407 15.0537740529959 -6.73120022992182 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0541942688934914 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 25 35 60 11.5591303098251 18.8172175662449 -7.25808725641976 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0695653460095713 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 T:C T C 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55175009 G/T 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 T:G G T 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174990_55175025:LILRB4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 12 15 27 5.54838254871605 8.06452181410494 -2.51613926538889 T:C C T 10 0.537634787606996 0.342112725785261 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55496491 G/A 1 20 21 41 9.24730424786008 11.2903305397469 -2.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.535083538842443 ENSG00000022556:ENST00000448584:exon_55496415_55496585:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000339757:exon_55496415_55496585:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000391721:exon_55496415_55496585:NLRP2;ENSG00000022556:ENST00000263437:exon_55496415_55496585:NLRP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55738746 G/A 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55738116_55738931:TMEM86B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55739689 G/A 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 24 16 40 11.0967650974321 8.60215660171194 2.49460849572016 T:C C T 10 0.537634787606996 0.526471435209844 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 62 42 104 28.6666431683662 22.5806610794938 6.08598208887241 A:G G A 10 0.537634787606996 0.239539791546645 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 56162776 C/T 1 38 51 89 17.5698780709342 27.4193741679568 -9.84949609702264 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0429239361740618 ENSG00000173581:ENST00000308964:exon_56162649_56162861:CCDC106 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 156 163 319 72.1289731333086 87.6344703799404 -15.5054972466317 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0820602426111641 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 56935527 A/G 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198440:ENST00000291598:exon_56934260_56936400:ZNF583 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 57931553 C/T 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000186272:ENST00000307658:exon_57931003_57933307:ZNF17;ENSG00000186272:ENST00000449441:exon_57931003_57933307:ZNF17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 57946924 G/C 1 10 2 12 4.62365212393004 1.07526957521399 3.54838254871605 C:G G C 10 0.537634787606996 0.045018410432618 ENSG00000186230:ENST00000380830:exon_57946693_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000334181:exon_57946697_57946961:ZNF749;ENSG00000186230:ENST00000415248:exon_57946711_57946961:ZNF749 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:G A G 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58132106 A/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58152361 T/A 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:T T A 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 T:C C T 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 11 5 16 5.08601733632304 2.68817393803498 2.39784339828806 C:G G C 10 0.537634787606996 0.317062980975179 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 T:C C T 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 6 11 17 2.77419127435802 5.91398266367696 -3.13979138931893 T:C T C 10 0.537634787606996 0.148072193728028 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 29 23 52 13.4085911593971 12.3656001149609 1.04299104443621 A:G A G 10 0.537634787606996 0.78320169659137 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 T:C T C 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 58904396 G/A 1 2908 2959 5867 1344.55803763886 1590.8613365291 -246.303298890246 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 1.25851898074903e-10 ENSG00000083845:ENST00000196551:exon_58904343_58904552:RPS5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 19 59073692 C/T 1 18 14 32 8.32257382307407 7.52688702649794 0.795686796576128 T:C C T 10 0.537634787606996 0.86014885088268 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 272203 C/T 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 T:C C T 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_272037_272557:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_272192_272630:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_272192_272305:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_272192_273155:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_272192_272305:ACP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 105 107 212 48.5483473012654 57.5269222739486 -8.97857497268316 A:G A G 10 0.537634787606996 0.241571582297279 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 3391826 C/T 1 27 5 32 12.4838607346111 2.68817393803498 9.79568679657613 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000516423289692253 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 3392075 T/C 1 30 18 48 13.8709563717901 9.67742617692593 4.19353019486419 T:C T C 10 0.537634787606996 0.248711062986678 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 3392295 A/G 1 32 37 69 14.7956867965761 19.8924871414589 -5.09680034488272 A:G A G 10 0.537634787606996 0.229050341361418 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 33 40 73 15.2580520089691 21.5053915042798 -6.24733949531071 C:G G C 10 0.537634787606996 0.159168676631261 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 78 77 155 36.0644865666543 41.3978786457387 -5.33339207908438 T:C C T 10 0.537634787606996 0.420725223266027 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 3627648 G/C 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 C:G G C 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7;ENSG00000171863:ENST00000472966:exon_3627409_3627850:RPS7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 8870862 T/C 1 14 9 23 6.47311297350206 4.83871308846296 1.63439988503909 T:C T C 10 0.537634787606996 0.536978589431628 ENSG00000134313:ENST00000256707:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000427284:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000418530:exon_8868987_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000473731:exon_8869059_8872112:KIDINS220;ENSG00000134313:ENST00000488729:exon_8870331_8872112:KIDINS220 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 10059770 G/T 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 T:G G T 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 10059844 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10059727_10059949:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10059727_10059949:TAF1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 122 131 253 56.4085559119465 70.4301571765165 -14.02160126457 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0778378833705687 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 42 53 95 19.4193389205062 28.4946437431708 -9.07530482266462 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0644929348900995 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 10717806 C/T 1 49 40 89 22.6558954072572 21.5053915042798 1.15050390297735 T:C C T 10 0.537634787606996 0.832339317105825 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10717762_10717864:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10717762_10717864:NOL10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 10784491 A/G 1 14 19 33 6.47311297350206 10.2150609645329 -3.74194799103087 A:G A G 10 0.537634787606996 0.222732740995836 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10784446_10784498:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000431319:exon_10784446_10784498:NOL10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 19 11 30 8.78493903546708 5.91398266367696 2.87095637179012 T:C T C 10 0.537634787606996 0.360976107545321 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 15747393 C/T 1 19 17 36 8.78493903546708 9.13979138931893 -0.354852353851856 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15747299_15747437:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15747299_15747437:DDX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 T:C C T 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 20824559 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 20838318 G/A 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 A:G G A 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000237821:exon_20838196_20838412:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000402541:exon_20834476_20838412:HS1BP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 25016077 G/C 1 78 62 140 36.0644865666543 33.3333568316338 2.73112973502056 C:G G C 10 0.537634787606996 0.672284717868998 ENSG00000184924:ENST00000328379:exon_25015995_25016251:C2orf79;ENSG00000138092:ENST00000380834:exon_25016014_25016370:CENPO;ENSG00000138092:ENST00000473706:exon_25016014_25016370:CENPO HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 41 35 76 18.9569737081132 18.8172175662449 0.139756141868304 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 16 14 30 7.39784339828806 7.52688702649794 -0.12904362820988 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 26455127 G/A 1 53 45 98 24.5053562568292 24.1935654423148 0.311790814514392 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000457468:exon_26455028_26455147:HADHA;ENSG00000084754:ENST00000461025:exon_26455070_26455147:HADHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 26502875 T/C 1 55 77 132 25.4300866816152 41.3978786457387 -15.9677919641235 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00659442569562896 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26502862_26502983:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26502862_26502983:HADHB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 38 33 71 17.5698780709342 17.7419479910309 -0.172069920096718 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 27356180 T/C 1 36 53 89 16.6451476461481 28.4946437431708 -11.8494960970226 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0141011300737483 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB;ENSG00000138073:ENST00000416802:exon_27355992_27356205:PREB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 27532768 A/C 1 152 147 299 70.2795122837366 79.0323137782284 -8.75280149449181 A:C A C 10 0.537634787606996 0.324326973850940 ENSG00000115204:ENST00000435114:exon_27532360_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000402310:exon_27532360_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000233545:exon_27532360_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000380044:exon_27532362_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000357186:exon_27532362_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000429669:exon_27532362_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000402722:exon_27532398_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000426513:exon_27532408_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000405983:exon_27532514_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000405076:exon_27532575_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000430991:exon_27532663_27532849:MPV17;ENSG00000115204:ENST00000489478:exon_27532718_27532849:MPV17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 27838058 C/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:C C A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000243943:ENST00000416005:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000379717:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000355467:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000505973:exon_27838035_27838136:ZNF512;ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27838035_27838136:ZNF512 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 27887034 C/A 1 11 13 24 5.08601733632304 6.98925223889095 -1.9032349025679 A:C C A 10 0.537634787606996 0.540200791347127 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 27900651 A/C 1 35 34 69 16.1827824337551 18.2795827786379 -2.09680034488272 A:C A C 10 0.537634787606996 0.630814824743047 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27900605_27900791:SLC4A1AP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 29129418 A/G 1 12 6 18 5.54838254871605 3.22580872564198 2.32257382307407 A:G A G 10 0.537634787606996 0.346995716390543 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 15 5 20 6.93547818589506 2.68817393803498 4.24730424786008 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0719372839496744 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 23 23 46 10.6343998850391 12.3656001149609 -1.73120022992182 A:G A G 10 0.537634787606996 0.658565954713003 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 120 88 208 55.4838254871605 47.3118613094156 8.17196417774483 T:C T C 10 0.537634787606996 0.266416042041322 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 32983480 G/A 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000018699:ENST00000317907:exon_32983359_32983586:TTC27;ENSG00000018699:ENST00000433416:exon_32983359_32983586:TTC27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 36782886 G/A 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 A:G G A 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37438993 G/A 1 94 69 163 43.4623299649424 37.0968003448827 6.36552962005965 A:G G A 10 0.537634787606996 0.346069840575213 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37438986_37439182:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37438986_37439251:CEBPZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37458668 G/A 1 19 33 52 8.78493903546708 17.7419479910309 -8.95700895556379 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0172264564697201 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37458711 G/A 1 18 7 25 8.32257382307407 3.76344351324897 4.5591303098251 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0733259257172696 ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37458555_37458856:CEBPZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37469833 T/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000003509:ENST00000455230:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37468721_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000431821:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000483999:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000439218:exon_37469778_37469836:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37469082_37469836:C2orf56 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37505105 T/G 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37505009_37505132:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000469275:exon_37505009_37506533:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37505009_37505132:PRKD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37506939 A/G 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G A G 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000115825:ENST00000379066:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000234179:exon_37506889_37507072:PRKD3;ENSG00000115825:ENST00000494667:exon_37506889_37507072:PRKD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37599963 A/C 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:C A C 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000115828:ENST00000338415:exon_37599825_37600465:QPCT;ENSG00000115828:ENST00000469098:exon_37599825_37600173:QPCT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 37599988 G/T 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 T:G G T 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000115828:ENST00000338415:exon_37599825_37600465:QPCT;ENSG00000115828:ENST00000469098:exon_37599825_37600173:QPCT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 42396722 A/G 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42396490_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42396493_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000409040:exon_42396521_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000482660:exon_42396531_42396776:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42396601_42396776:EML4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 42515437 A/G 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:G A G 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42515367_42515462:EML4;ENSG00000143924:ENST00000480320:exon_42515367_42517053:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42515367_42515462:EML4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 42990336 T/G 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:G T G 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000162881:ENST00000378661:exon_42989642_42991401:OXER1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 43015704 T/A 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 A:T T A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000162882:ENST00000294973:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402698:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000404451:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000431905:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000406924:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000402268:exon_43015669_43015747:HAAO;ENSG00000162882:ENST00000414285:exon_43015669_43015747:HAAO HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 44209477 C/T 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409946:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000409659:exon_44209377_44209573:LRPPRC;ENSG00000138095:ENST00000447246:exon_44209377_44209573:LRPPRC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 44547574 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000138079:ENST00000260649:exon_44547338_44548633:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409380:exon_44547338_44547960:SLC3A1;ENSG00000138079:ENST00000409740:exon_44547338_44547937:SLC3A1;ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44546145_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44545902_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44545905_44548584:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44547405_44547782:PREPL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 A:C C A 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 T:C C T 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 47221525 G/C 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47221496_47221653:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47221370_47221653:TTC7A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 47251469 G/C 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 C:G G C 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47251426_47251498:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47251426_47251498:TTC7A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 47278901 G/A 1 10 2 12 4.62365212393004 1.07526957521399 3.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.045018410432618 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47278885_47279019:TTC7A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 48010488 G/A 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 A:G G A 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000445503:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48010221_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48010267_48010632:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000493177:exon_48010309_48010632:MSH6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 48718248 C/T 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 T:C C T 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000162869:ENST00000431614:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000416913:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000281394:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000442041:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000449090:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000443895:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000294952:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000407194:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000405538:exon_48718157_48718309:KLRAQ1;ENSG00000162869:ENST00000455978:exon_48718157_48718309:KLRAQ1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 T:C C T 10 0.537634787606996 0.829141081785639 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 12 14 26 5.54838254871605 7.52688702649794 -1.9785044777819 A:G A G 10 0.537634787606996 0.440467677457136 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 27 19 46 12.4838607346111 10.2150609645329 2.26879977007818 A:G A G 10 0.537634787606996 0.555894755619514 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54120025 A/T 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:T A T 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54119945_54120097:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54119945_54120097:PSME4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54856407 G/A 1 15 17 32 6.93547818589506 9.13979138931893 -2.20431320342387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.48073676974361 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54856070_54856940:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54856070_54856940:SPTBN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 46 47 93 21.2687997700782 25.2688350175288 -4.00003524745063 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.407817787061209 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 55844445 T/C 1 7 11 18 3.23655648675103 5.91398266367696 -2.67742617692593 T:C T C 10 0.537634787606996 0.241209079822295 ENSG00000138041:ENST00000272313:exon_55844280_55844749:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000407823:exon_55844280_55844758:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000345102:exon_55844280_55844723:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000424063:exon_55844280_55844796:SMEK2;ENSG00000138041:ENST00000477749:exon_55844280_55845113:SMEK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 55883317 G/T 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:G G T 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55883266_55883355:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415489:exon_55883266_55883355:PNPT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 50 56 106 23.1182606196502 30.1075481059918 -6.98928748634157 A:G A G 10 0.537634787606996 0.174381738078164 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 17 21 38 7.86020861068107 11.2903305397469 -3.43012192906585 A:G G A 10 0.537634787606996 0.329123785750821 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 65217089 G/C 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 C:G G C 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65216535_65217304:SLC1A4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 65245365 G/A 1 16 14 30 7.39784339828806 7.52688702649794 -0.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 67624779 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67624451_67624803:ETAA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 67630476 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 67631129 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 67631395 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 67631831 G/A 1 22 19 41 10.1720346726461 10.2150609645329 -0.0430262918868358 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 67632214 C/T 1 20 19 39 9.24730424786008 10.2150609645329 -0.967756716672845 T:C C T 10 0.537634787606996 0.751567535707531 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1;ENSG00000143971:ENST00000462772:exon_67632129_67632467:ETAA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 68364478 T/C 1 11 8 19 5.08601733632304 4.30107830085597 0.784939035467076 T:C T C 10 0.537634787606996 0.819985066606254 ENSG00000243667:ENST00000492039:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295122:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000295121:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000457114:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000406245:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000243667:ENST00000409164:exon_68364431_68364565:WDR92;ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68364431_68364565:PPP3R1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 68388823 A/G 1 18 29 47 8.32257382307407 15.5914088406029 -7.26883501752881 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0399288491410749 ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68388815_68388898:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68388815_68388898:PNO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 68415767 G/A 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000234310:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409752:exon_68415646_68415822:PPP3R1;ENSG00000221823:ENST00000409377:exon_68415646_68415822:PPP3R1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 38 46 84 17.5698780709342 24.7312002299218 -7.16132215898767 A:G G A 10 0.537634787606996 0.126029351650741 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 68622914 G/A 1 152 163 315 70.2795122837366 87.6344703799404 -17.3549580962037 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 0.0545765304921995 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 216 206 422 99.8708858768889 110.752766247041 -10.8818803701523 C:G G C 10 0.537634787606996 0.305295000008642 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 69040500 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163219:ENST00000463483:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409202:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000295381:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000456116:exon_69040419_69040526:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000467265:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000488795:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409030:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000409220:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000473986:exon_69040421_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497079:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000482106:exon_69040419_69040551:ARHGAP25;ENSG00000163219:ENST00000497259:exon_69040419_69040551:ARHGAP25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 70377639 T/G 1 13 13 26 6.01074776110905 6.98925223889095 -0.978504477781897 T:G T G 10 0.537634787606996 0.699994963282250 ENSG00000115998:ENST00000264434:exon_70377012_70377696:C2orf42;ENSG00000115998:ENST00000420306:exon_70377030_70377696:C2orf42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 70524577 G/A 1 86 89 175 39.7634082657983 47.8494960970226 -8.0860878312243 A:G G A 10 0.537634787606996 0.225878489772273 ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70523107_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70523108_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70524143_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70524308_70524609:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70524558_70524609:FAM136A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 48 46 94 22.1935301948642 24.7312002299218 -2.53767003505763 A:C A C 10 0.537634787606996 0.606666809988173 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 59 80 139 27.2795475311872 43.0107830085597 -15.7312354773725 T:G G T 10 0.537634787606996 0.00822814187256678 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 45 38 83 20.8064345576852 20.4301219290658 0.376312628619331 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71365805 A/G 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71366957 C/A 1 50 32 82 23.1182606196502 17.2043132034239 5.91394741622633 A:C C A 10 0.537634787606996 0.223037796945523 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71366925_71366992:MPHOSPH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 47 55 102 21.7311649824712 29.5699133183848 -7.83874833591359 A:G G A 10 0.537634787606996 0.136147955784668 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71633275 T/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C T C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 14 11 25 6.47311297350206 5.91398266367696 0.5591303098251 T:C C T 10 0.537634787606996 0.844336813679508 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 56 36 92 25.8924518940082 19.3548523538519 6.53759954015637 A:G G A 10 0.537634787606996 0.175889798306881 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 73461483 C/A 1 66 207 273 30.5161040179383 111.290401034648 -80.7742970167099 A:T:C:G C A 10 0.537634787606996 2.65990737653860e-23 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73461366_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000461290:exon_73461397_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000464397:exon_73461435_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000399032:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73461436_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000480489:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73461437_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73461448_73461512:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73461464_73461512:CCT7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 378 334 712 174.774050284555 179.570019060737 -4.79596877618116 A:T:C A T 10 0.537634787606996 0.735221746041185 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 73828538 G/A 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000116127:ENST00000409009:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000264448:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000484298:exon_73828322_73828563:ALMS1;ENSG00000116127:ENST00000464408:exon_73828322_73828563:ALMS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 73957124 A/G 1 22 32 54 10.1720346726461 17.2043132034239 -7.03227853077778 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.0571245727319603 ENSG00000144034:ENST00000272424:exon_73956957_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000495950:exon_73957012_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000485758:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000409716:exon_73957017_73957156:TPRKB;ENSG00000144034:ENST00000318190:exon_73957017_73957156:TPRKB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 28 27 55 12.9462259470041 14.5161392653889 -1.56991331838478 A:G G A 10 0.537634787606996 0.687033074671747 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 25 26 51 11.5591303098251 13.9785044777819 -2.4193741679568 T:C C T 10 0.537634787606996 0.574780130997295 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 143 94 237 66.1182253721996 50.5376700350576 15.580555337142 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0435098362403246 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 74761539 T/A 1 25 9 34 11.5591303098251 4.83871308846296 6.72041722136214 A:T T A 10 0.537634787606996 0.024444976283776 ENSG00000115318:ENST00000470907:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000264094:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000393937:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409549:exon_74761443_74761558:LOXL3;ENSG00000115318:ENST00000409986:exon_74761443_74761558:LOXL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 C:G C G 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 75115108 A/G 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 A:G A G 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75115030_75115185:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75115030_75115185:HK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 75116527 G/A 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75116372_75116605:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75116372_75116605:HK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 66 45 111 30.5161040179383 24.1935654423148 6.32253857562344 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 0.253583950872827 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 75915035 C/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75914953_75915103:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75914953_75915103:C2orf3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 T:C T C 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 36 61 97 16.6451476461481 32.7957220440268 -16.1505743978786 C:G C G 10 0.537634787606996 0.00106614122055712 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 381 272 653 176.161145921735 146.236662229103 29.9244836926316 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0205197157899568 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 418 338 756 193.268658780276 181.720558211165 11.548100569111 A:G A G 10 0.537634787606996 0.401839172945414 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 423 338 761 195.580484842241 181.720558211165 13.859926631076 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.326365367873293 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 607 490 1097 280.655683922553 263.441045927428 17.2146379951254 T:C T C 10 0.537634787606996 0.303345600200556 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 85852667 G/A 1 20 26 46 9.24730424786008 13.9785044777819 -4.73120022992182 A:G G A 10 0.537634787606996 0.183876982071972 ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 7 9 16 3.23655648675103 4.83871308846296 -1.60215660171194 A:G A G 10 0.537634787606996 0.460514092364166 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 86364653 A/G 1 69 95 164 31.9031996551173 51.0753048226646 -19.1721051675473 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00286455379035692 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86364592_86369280:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86364592_86365316:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000455260:exon_86364592_86369280:PTCD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 89160080 G/C 1 134 2 136 61.9569384606625 1.07526957521399 60.8816688854485 C:G G C 10 0.537634787606996 1.65374245666847e-33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 89185520 C/T 1 111 3 114 51.3225385756234 1.61290436282099 49.7096342128024 T:C:G C T 10 0.537634787606996 4.23985851722344e-26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 96685307 G/A 1 9 6 15 4.16128691153704 3.22580872564198 0.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.79707128563146 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 96688990 C/T 1 16 12 28 7.39784339828806 6.45161745128395 0.946225947004112 T:C C T 10 0.537634787606996 0.850211563621615 ENSG00000186281:ENST00000335448:exon_96688706_96689040:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000484440:exon_96688706_96689188:GPAT2;ENSG00000186281:ENST00000482704:exon_96688854_96689748:GPAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 30 21 51 13.8709563717901 11.2903305397469 2.5806258320432 A:G A G 10 0.537634787606996 0.486435874890253 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 96992761 T/C 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 T:C T C 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000198885:ENST00000420176:exon_96992380_96992934:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 17 23 40 7.86020861068107 12.3656001149609 -4.50539150427984 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.157480961867148 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 23 21 44 10.6343998850391 11.2903305397469 -0.655930654707825 A:G A G 10 0.537634787606996 0.880554782000762 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 12 23 35 5.54838254871605 12.3656001149609 -6.81721756624486 T:C T C 10 0.537634787606996 0.026464846842611 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 97030247 T/C 1 39 45 84 18.0322432833272 24.1935654423148 -6.16132215898767 T:C T C 10 0.537634787606996 0.189948133077429 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97030219_97030329:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97030218_97030329:NCAPH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 98274527 G/C 1 29 33 62 13.4085911593971 17.7419479910309 -4.33335683163375 C:G G C 10 0.537634787606996 0.308539788086688 ENSG00000115073:ENST00000289228:exon_98274406_98274580:ACTR1B;ENSG00000115073:ENST00000451664:exon_98274441_98274580:ACTR1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 99172019 A/G 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000040933:ENST00000409016:exon_99172016_99172154:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409851:exon_99172016_99172271:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000074304:exon_99172016_99172271:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000409540:exon_99172016_99172154:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000523221:exon_99172016_99172271:INPP4A;ENSG00000040933:ENST00000468638:exon_99172016_99172585:INPP4A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 99995804 T/C 1 111 107 218 51.3225385756234 57.5269222739486 -6.20438369832513 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.415402002543851 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_99995781_99995891:EIF5B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 100019496 A/G 1 18 16 34 8.32257382307407 8.60215660171194 -0.279582778637865 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100019352_100019569:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100019352_100019893:REV1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 100055506 A/G 1 4 11 15 1.84946084957202 5.91398266367696 -4.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0401081696281839 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 101624471 T/C 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 T:C T C 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000204634:ENST00000463751:exon_101622395_101624492:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000376840:exon_101624079_101624735:TBC1D8;ENSG00000204634:ENST00000409318:exon_101624079_101624735:TBC1D8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 20 13 33 9.24730424786008 6.98925223889095 2.25805200896913 C:G G C 10 0.537634787606996 0.48755118744603 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 113089267 T/C 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000188177:ENST00000409871:exon_113088582_113097634:ZC3H6;ENSG00000188177:ENST00000343936:exon_113088582_113097640:ZC3H6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 113940207 T/A 1 15 16 31 6.93547818589506 8.60215660171194 -1.66667841581688 A:T T A 10 0.537634787606996 0.591800204585549 ENSG00000125637:ENST00000465917:exon_113939923_113940621:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 113956371 G/C 1 55 45 100 25.4300866816152 24.1935654423148 1.2365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.841443125963158 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000460725:exon_113956317_113956461:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000465592:exon_113956317_113956407:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000464559:exon_113956135_113956803:PSD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 120060082 T/C 1 23 17 40 10.6343998850391 9.13979138931893 1.49460849572016 T:C T C 10 0.537634787606996 0.751625769863771 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120059801_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120059804_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120060020_120060124:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120060020_120060124:C2orf76 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 120078778 T/C 1 27 20 47 12.4838607346111 10.7526957521399 1.73116498247119 T:C T C 10 0.537634787606996 0.662480005398447 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000414534:exon_120078745_120078780:C2orf76 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 120438515 G/C 1 14 7 21 6.47311297350206 3.76344351324897 2.70966946025308 C:G G C 10 0.537634787606996 0.27805722506375 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 120438523 A/G 1 7 14 21 3.23655648675103 7.52688702649794 -4.29033053974692 A:G A G 10 0.537634787606996 0.078748258748353 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000445518:exon_120438408_120438771:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000409951:exon_120438408_120438699:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120438430_120439035:TMEM177 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 120439230 C/G 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 C:G C G 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000144120:ENST00000401466:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000424086:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000272521:exon_120438408_120439694:TMEM177;ENSG00000144120:ENST00000415646:exon_120439135_120439242:TMEM177 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 127453585 A/T 1 315 202 517 145.645041903796 108.602227096613 37.0428148071831 A:T A T 10 0.537634787606996 0.00108594530805026 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 127453588 G/T 1 317 199 516 146.569772328582 106.989322733792 39.5804495947901 A:T:G G T 10 0.537634787606996 0.000478006086691275 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 320 236 556 147.956867965761 126.881809875251 21.0750580905102 A:C:G A C 10 0.537634787606996 0.0741469539858215 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 128757658 G/C 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757630_128757720:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757630_128757720:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757630_128757720:SAP130 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 128757995 A/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:C A C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128757881_128758028:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128757881_128758028:SAP130 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:C C T 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 131100496 G/A 1 37 12 49 17.1075128585411 6.45161745128395 10.6558954072572 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00233736740287212 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131099798_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131100450_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131100467_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131100467_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131100467_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131100469_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000470672:exon_131100470_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131100470_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131100483_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000456713:exon_131100485_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000495606:exon_131100491_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131100495_131100767:IMP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 131100734 G/A 1 54 41 95 24.9677214692222 22.0430262918868 2.92469517733538 A:G G A 10 0.537634787606996 0.607259138042931 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131100467_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000470672:exon_131100470_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000456713:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000495606:exon_131100659_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131100495_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131100659_131100767:IMP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 135893372 A/G 1 28 41 69 12.9462259470041 22.0430262918868 -9.09680034488272 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0298897588400114 ENSG00000115839:ENST00000264158:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000442034:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1;ENSG00000115839:ENST00000487003:exon_135893134_135893502:RAB3GAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 136409574 A/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 A:C A C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136409303_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000429703:exon_136409300_136409602:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000487294:exon_136409300_136409591:R3HDM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 152317669 G/A 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152317652_152317803:RIF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 158290914 G/C 1 152 145 297 70.2795122837366 77.9570442030144 -7.67753191927781 C:G G C 10 0.537634787606996 0.383044771190534 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000418920:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000497432:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158290882_158290936:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158290673_158290936:CYTIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 160604452 C/T 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000473749:exon_160604316_160604637:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 11 13 24 5.08601733632304 6.98925223889095 -1.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.540200791347127 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 163208893 T/G 1 15 17 32 6.93547818589506 9.13979138931893 -2.20431320342387 T:G T G 10 0.537634787606996 0.48073676974361 ENSG00000115271:ENST00000473240:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000446271:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000429691:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000437150:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000481161:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000453113:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000487445:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000479199:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000233612:exon_163208848_163208917:GCA;ENSG00000115271:ENST00000421131:exon_163208848_163208917:GCA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 170402752 T/C 1 30 29 59 13.8709563717901 15.5914088406029 -1.72045246881276 T:C T C 10 0.537634787606996 0.696220777255589 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 170493103 T/A 1 404 403 807 186.795545806774 216.666819405619 -29.8712735988458 A:T T A 10 0.537634787606996 0.0372125726746432 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000433207:exon_170492923_170493251:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000482772:exon_170492923_170493324:PPIG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 170917648 A/G 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 A:G A G 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 172188368 C/T 1 2 9 11 0.924730424786008 4.83871308846296 -3.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0295478960306494 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000483284:exon_172188314_172189305:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000438609:exon_172188275_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172188318_172188377:METTL8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 172411273 G/A 1 37 49 86 17.1075128585411 26.3441045927428 -9.23659173420166 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0513602012058751 ENSG00000071967:ENST00000409484:exon_172411034_172412117:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000321348:exon_172411034_172414643:CYBRD1;ENSG00000071967:ENST00000375252:exon_172411034_172414156:CYBRD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 175260355 G/T 1 34 30 64 15.7204172213621 16.1290436282099 -0.408626406847747 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138433:ENST00000414336:exon_175260279_175260429:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000342016:exon_175260279_175260443:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000362053:exon_175260279_175260397:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000425101:exon_175260279_175260412:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000461454:exon_175260279_175260434:CIR1;ENSG00000138433:ENST00000472169:exon_175260279_175260437:CIR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 177161617 T/C 1 31 20 51 14.3333215841831 10.7526957521399 3.5806258320432 T:C T C 10 0.537634787606996 0.329401553003132 ENSG00000128654:ENST00000420864:exon_177161588_177161635:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000392529:exon_177161588_177161635:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000249442:exon_177161588_177161635:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000423461:exon_177161588_177161635:MTX2;ENSG00000128654:ENST00000452865:exon_177161588_177161635:MTX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 190331262 T/C 1 20 23 43 9.24730424786008 12.3656001149609 -3.11829586710083 T:C T C 10 0.537634787606996 0.361779982238563 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190331151_190331308:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190331151_190331308:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190331151_190331308:WDR75 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 198001319 A/G 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 A:G A G 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 198352705 A/G 1 245 299 544 113.279477036286 160.752801494492 -47.4733244582058 A:T:G A G 10 0.537634787606996 5.10525372112749e-05 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198352582_198352760:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198352582_198352760:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000491249:exon_198352698_198352760:HSPD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 33 20 53 15.2580520089691 10.7526957521399 4.50535625682921 C:G C G 10 0.537634787606996 0.270297368908178 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 201437328 C/A 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 201437334 T/C 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:C T C 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 216908679 C/T 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.283623583656103 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216908627_216908738:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216908627_216908738:PECR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 217315787 T/C 1 37 31 68 17.1075128585411 16.6666784158169 0.440834442724274 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000486983:exon_217315569_217316324:SMARCAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 218940259 C/T 1 3 10 13 1.38709563717901 5.37634787606996 -3.98925223889095 T:C C T 10 0.537634787606996 0.047121248353007 ENSG00000188282:ENST00000457754:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000344321:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000374155:exon_218939816_218940463:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000463872:exon_218939816_218940443:RUFY4;ENSG00000188282:ENST00000441828:exon_218939816_218940463:RUFY4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 11 14 25 5.08601733632304 7.52688702649794 -2.4408696901749 C:G G C 10 0.537634787606996 0.423024937923135 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 219498300 A/G 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 A:G A G 10 0.537634787606996 0.261199351101203 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 219503384 C/T 1 20 12 32 9.24730424786008 6.45161745128395 2.79568679657613 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.377303175258482 ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 16 12 28 7.39784339828806 6.45161745128395 0.946225947004112 A:G G A 10 0.537634787606996 0.850211563621615 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 55 46 101 25.4300866816152 24.7312002299218 0.698886451693401 A:G A G 10 0.537634787606996 0.920757330184488 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 57 53 110 26.3548171064012 28.4946437431708 -2.13982663676956 A:G A G 10 0.537634787606996 0.702835415156569 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 25 30 55 11.5591303098251 16.1290436282099 -4.56991331838478 A:G A G 10 0.537634787606996 0.226108026496633 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 14 16 30 6.47311297350206 8.60215660171194 -2.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.467935176210095 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220046122 T/C 1 44 23 67 20.3440693452922 12.3656001149609 7.97846923033127 T:C T C 10 0.537634787606996 0.065281940428058 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220046091_220046185:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220046975 C/A 1 28 35 63 12.9462259470041 18.8172175662449 -5.87099161924075 A:C C A 10 0.537634787606996 0.164233885965791 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220046735_220047030:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220046735_220047030:FAM134A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 24 16 40 11.0967650974321 8.60215660171194 2.49460849572016 T:C C T 10 0.537634787606996 0.526471435209844 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220085845 A/G 1 26 14 40 12.0214955222181 7.52688702649794 4.49460849572016 A:G A G 10 0.537634787606996 0.204048278602708 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220097027 C/T 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000453432:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000474225:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000461731:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000435521:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000465550:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000489580:exon_220096982_220097084:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000493563:exon_220096904_220097084:ANKZF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220097257 G/C 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 C:G G C 10 0.537634787606996 0.261199351101203 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220097212_220097415:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000453432:exon_220097212_220097388:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000475202:exon_220097212_220097692:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000474225:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000467884:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000461731:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000496346:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000435521:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220097212_220097756:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220097212_220097269:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220097212_220097503:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000465550:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000489580:exon_220097212_220097481:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000493563:exon_220097212_220097601:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000490526:exon_220097212_220097405:ANKZF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220250800 C/T 1 61 39 100 28.2042779559732 20.9677567166728 7.2365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.160621803078204 ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220250704_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220250760_220250820:DNPEP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220404579 C/T 1 49 26 75 22.6558954072572 13.9785044777819 8.6773909294753 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0488577191495523 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220404648 C/T 1 27 37 64 12.4838607346111 19.8924871414589 -7.40862640684774 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0785128280649845 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220404726 G/A 1 22 28 50 10.1720346726461 15.0537740529959 -4.8817393803498 A:G G A 10 0.537634787606996 0.201512077269074 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220405230 G/A 1 14 17 31 6.47311297350206 9.13979138931893 -2.66667841581688 A:G G A 10 0.537634787606996 0.370939869856219 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220403669_220405364:CHPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 220406722 T/C 1 25 11 36 11.5591303098251 5.91398266367696 5.64514764614814 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0663347725231789 ENSG00000123989:ENST00000243776:exon_220406338_220406911:CHPF;ENSG00000123989:ENST00000373891:exon_220406182_220406911:CHPF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 220 196 416 101.720346726461 105.376418370971 -3.65607164451035 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.730874198081397 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 230668858 T/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230668715_230668943:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000487178:exon_230668715_230668943:TRIP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 134 141 275 61.9569384606625 75.8065050525864 -13.8495665919239 A:G A G 10 0.537634787606996 0.102389353537518 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231072709 C/T 1 85 92 177 39.3010430534053 49.4624004598436 -10.1613574064383 T:C C T 10 0.537634787606996 0.131905035768283 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231072706_231072774:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231072706_231072774:SP110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 142 118 260 65.6558601598066 63.4409049376255 2.21495522218103 A:G G A 10 0.537634787606996 0.803745339206592 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 15 32 47 6.93547818589506 17.2043132034239 -10.2688350175288 A:C A C 10 0.537634787606996 0.00312382366733823 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231149097 T/C 1 32 33 65 14.7956867965761 17.7419479910309 -2.94626119445474 T:C T C 10 0.537634787606996 0.534308662068306 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231149061_231149126:SP140;ENSG00000079263:ENST00000476126:exon_231149061_231149126:SP140 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231222655 G/T 1 14 26 40 6.47311297350206 13.9785044777819 -7.50539150427984 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0251577054249781 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231222675 T/C 1 19 25 44 8.78493903546708 13.4408696901749 -4.65593065470782 T:C T C 10 0.537634787606996 0.175053581576094 ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231222520_231222682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231222518_231222682:SP140L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231333763 A/G 1 183 165 348 84.6128338679197 88.7097399551543 -4.09690608723461 A:G A G 10 0.537634787606996 0.667451929246791 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231333758_231333811:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494508:exon_231333547_231333811:SP100 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 231774844 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000135898:ENST00000444078:exon_231774337_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392040:exon_231772043_231775811:GPR55;ENSG00000135898:ENST00000392039:exon_231774581_231775811:GPR55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 232320581 T/G 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:G T G 10 0.537634787606996 0.564673248580388 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G A G 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 60 31 91 27.7419127435802 16.6666784158169 11.0752343277634 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0206595990420162 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 109 87 196 50.3978081508374 46.7742265218087 3.62358162902878 A:G A G 10 0.537634787606996 0.616793009006017 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 147 131 278 67.9676862217716 70.4301571765165 -2.46247095474489 C:G C G 10 0.537634787606996 0.809927248476073 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 239237953 G/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241463453 C/A 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:C C A 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000144504:ENST00000373318:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000272972:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000361678:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000391987:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000403283:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000401804:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000373320:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405523:exon_241463302_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000405002:exon_241461355_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000480230:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000484526:exon_241461356_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000459901:exon_241462675_241463798:ANKMY1;ENSG00000144504:ENST00000496300:exon_241463240_241463798:ANKMY1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241516094 G/C 1 40 47 87 18.4946084957202 25.2688350175288 -6.77422652180865 C:G G C 10 0.537634787606996 0.162245809349790 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241515952_241516144:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000464550:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000471657:exon_241515952_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000437406:exon_241515985_241516182:RNPEPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 A:G A G 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241537421 G/A 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 A:G G A 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000352879:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000357048:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000416591:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000354082:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000391983:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241537305_241537504:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000493058:exon_241537305_241537504:CAPN10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241569849 C/T 1 3 8 11 1.38709563717901 4.30107830085597 -2.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.127234760608112 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241570092 C/T 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C C T 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241570127 C/T 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 A:C A C 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242082262 T/C 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000437780:exon_242082252_242082489:PASK;ENSG00000115687:ENST00000452907:exon_242082252_242082489:PASK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242179134 G/A 1 134 178 312 61.9569384606625 95.6989921940453 -33.7420537333828 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000136820299295474 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242179017_242179151:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479169:exon_242179017_242179235:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427487:exon_242179017_242179235:HDLBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 47 51 98 21.7311649824712 27.4193741679568 -5.68820918548561 T:C T C 10 0.537634787606996 0.265854630491392 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242407746 A/G 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000006607:ENST00000264042:exon_242407555_242407792:FARP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 30 40 70 13.8709563717901 21.5053915042798 -7.63443513248972 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0725316939758669 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242610738 T/C 1 36 34 70 16.6451476461481 18.2795827786379 -1.63443513248972 T:C T C 10 0.537634787606996 0.720261402691009 ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610727_242610781:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242618050 A/G 1 42 39 81 19.4193389205062 20.9677567166728 -1.54841779616668 A:G A G 10 0.537634787606996 0.739464414690902 ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242793273 A/G 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 2 242793433 G/A 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000188389:ENST00000334409:exon_242792033_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000418831:exon_242792849_242793449:PDCD1;ENSG00000188389:ENST00000343705:exon_242793385_242793449:PDCD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:T T A 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 257733 A/G 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257685_257786:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257457_257786:C20orf96 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 30 27 57 13.8709563717901 14.5161392653889 -0.645182893598772 T:C T C 10 0.537634787606996 0.894846206427243 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 371972 T/C 1 16 42 58 7.39784339828806 22.5806610794938 -15.1828176812058 T:C T C 10 0.537634787606996 6.15258914301067e-05 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000449710:exon_371931_372223:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_371931_372223:TRIB3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 74 105 179 34.2150257170823 56.4516526987346 -22.2366269816523 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.000937485308838957 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 1099339 C/T 1 61 46 107 28.2042779559732 24.7312002299218 3.47307772605143 T:C C T 10 0.537634787606996 0.560999827122321 ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 65 63 128 30.0537388055453 33.8709916192407 -3.81725281369549 T:C C T 10 0.537634787606996 0.535246184060252 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 2097688 T/C 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000125834:ENST00000381482:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000246032:exon_2097312_2098061:STK35;ENSG00000125834:ENST00000493263:exon_2097312_2098061:STK35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 2633296 G/C 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2632791_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633178_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633278_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633279_2633309:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633292_2633577:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633295_2633309:NOP56 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 2996497 C/T 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 3090848 T/G 1 9 3 12 4.16128691153704 1.61290436282099 2.54838254871605 T:G T G 10 0.537634787606996 0.159650386833704 ENSG00000185019:ENST00000217173:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000348031:exon_3088219_3090960:UBOX5;ENSG00000185019:ENST00000440298:exon_3088219_3090960:UBOX5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 3564672 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000088812:ENST00000379943:exon_3564545_3564730:ATRN;ENSG00000088812:ENST00000340500:exon_3564545_3564730:ATRN;ENSG00000088812:ENST00000262919:exon_3564545_3564730:ATRN;ENSG00000088812:ENST00000446916:exon_3564545_3564730:ATRN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 3784110 C/T 1 27 16 43 12.4838607346111 8.60215660171194 3.88170413289917 T:C C T 10 0.537634787606996 0.284701467404654 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3784051_3784184:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3784051_3784184:CDC25B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 30 22 52 13.8709563717901 11.8279653273539 2.04299104443621 T:C T C 10 0.537634787606996 0.581938678714314 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 30 21 51 13.8709563717901 11.2903305397469 2.5806258320432 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.486435874890253 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 10386013 C/A 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 10386059 G/A 1 14 13 27 6.47311297350206 6.98925223889095 -0.516139265388892 A:G G A 10 0.537634787606996 0.849589395327245 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 10393629 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 17596155 C/A 1 43 44 87 19.8817041328992 23.6559306547078 -3.77422652180865 A:C C A 10 0.537634787606996 0.452261905245187 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17596076_17596174:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17596076_17596174:RRBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 17600357 G/A 1 42 33 75 19.4193389205062 17.7419479910309 1.6773909294753 A:G G A 10 0.537634787606996 0.729440346200438 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000468428:exon_17599241_17600462:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000470422:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17600278_17600373:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17600278_17600373:RRBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 20032998 T/C 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:C T C 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000101343:ENST00000377327:exon_20032936_20033366:CRNKL1;ENSG00000101343:ENST00000377340:exon_20032936_20033402:CRNKL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 21142813 T/C 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:C T C 10 0.537634787606996 0.781974621542372 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 23345589 A/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G A G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23345000_23346384:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23345021_23346384:GZF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 24964556 T/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24964539_24964655:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24964539_24964655:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24964539_24964655:C20orf3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 T:C T C 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 32212690 C/T 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 T:C C T 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000078699:ENST00000375279:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000342704:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000346541:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397800:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000492345:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000359606:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000397803:exon_32212570_32212823:CBFA2T2;ENSG00000078699:ENST00000491618:exon_32212570_32212823:CBFA2T2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 13 16 29 6.01074776110905 8.60215660171194 -2.59140884060288 T:C C T 10 0.537634787606996 0.356797644500513 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 33971914 C/T 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000101019:ENST00000349714:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000359226:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374394:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374384:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374385:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000374377:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000453855:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000407996:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397556:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000443429:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000438533:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397554:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000491125:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000397553:exon_33971841_33971936:UQCC;ENSG00000101019:ENST00000495752:exon_33971841_33971936:UQCC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 34090519 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425525:exon_34090218_34090632:CEP250 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 226 243 469 104.494538000819 130.6452533885 -26.1507153876811 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0160175372144378 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 42089511 T/C 1 128 106 234 59.1827471863045 56.9892874863416 2.19345969996294 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.793412555517602 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 42328639 T/C 1 82 48 130 37.9139474162263 25.8064698051358 12.1074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0347647215612312 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42328397_42328684:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42328397_42328684:MYBL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 71 51 122 32.8279300799033 27.4193741679568 5.40855591194649 T:C C T 10 0.537634787606996 0.364078020335682 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 60 53 113 27.7419127435802 28.4946437431708 -0.752730999590547 A:C A C 10 0.537634787606996 0.924951685143768 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 43571822 G/A 1 70 82 152 32.3655648675103 44.0860525837737 -11.7204877162634 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0612848610072263 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43570771_43571854:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43570860_43571854:TOMM34 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 44052992 G/A 1 25 19 44 11.5591303098251 10.2150609645329 1.34406934529218 A:G G A 10 0.537634787606996 0.763157375301028 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 44054349 T/C 1 29 27 56 13.4085911593971 14.5161392653889 -1.10754810599178 T:C T C 10 0.537634787606996 0.789890611914913 ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44054214_44054884:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44054214_44054882:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44054214_44054882:PIGT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 44420682 T/C 1 15 17 32 6.93547818589506 9.13979138931893 -2.20431320342387 T:C T C 10 0.537634787606996 0.48073676974361 ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 44533584 G/C 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 C:G G C 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000100979:ENST00000372420:exon_44533581_44533757:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000372431:exon_44533581_44533757:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000354050:exon_44533581_44533757:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000477313:exon_44533581_44533757:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000420868:exon_44533581_44533757:PLTP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 A:G G A 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 17 9 26 7.86020861068107 4.83871308846296 3.0214955222181 A:G G A 10 0.537634787606996 0.246429877996880 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 15 8 23 6.93547818589506 4.30107830085597 2.63439988503909 C:G C G 10 0.537634787606996 0.302039304046821 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47262549 C/T 1 17 18 35 7.86020861068107 9.67742617692593 -1.81721756624486 T:C C T 10 0.537634787606996 0.612162094837479 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47268002 C/T 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 T:C C T 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47267934_47268121:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47267934_47268121:PREX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47307618 G/A 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47307485_47307634:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47307485_47307634:PREX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47734418 C/T 1 34 26 60 15.7204172213621 13.9785044777819 1.74191274358024 T:C C T 10 0.537634787606996 0.698882913897192 ENSG00000124214:ENST00000396163:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000433926:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371828:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000340954:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371856:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000360426:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000347458:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371805:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371802:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371792:exon_47734314_47734633:STAU1;ENSG00000124214:ENST00000371830:exon_47734314_47734633:STAU1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47841660 G/T 1 20 20 40 9.24730424786008 10.7526957521399 -1.50539150427984 T:G G T 10 0.537634787606996 0.63837555969875 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000462328:exon_47841650_47841736:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47841650_47841736:DDX27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47865784 C/T 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C C T 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47871197 G/C 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 C:G G C 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 47874005 A/G 1 16 11 27 7.39784339828806 5.91398266367696 1.48386073461111 A:G A G 10 0.537634787606996 0.700336022866229 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47873954_47874201:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000455070:exon_47873954_47874201:ZNFX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 48522392 G/A 1 24 26 50 11.0967650974321 13.9785044777819 -2.8817393803498 A:G G A 10 0.537634787606996 0.478749985605362 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 13 24 37 6.01074776110905 12.9032349025679 -6.89248714145885 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0308109263539736 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 48524827 A/G 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48524692_48525129:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48524692_48525129:SPATA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 49196284 C/T 1 30 31 61 13.8709563717901 16.6666784158169 -2.79572204402676 T:C C T 10 0.537634787606996 0.5216045612838 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49196240_49196463:PTPN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 50769183 G/A 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 A:G G A 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 50769379 C/T 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G A G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 54948572 G/C 1 11 16 27 5.08601733632304 8.60215660171194 -3.51613926538889 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.182688102275838 ENSG00000087586:ENST00000395914:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395909:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000347343:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395915:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000312783:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000371356:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395913:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395911:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000395907:exon_54948464_54948612:AURKA;ENSG00000087586:ENST00000441357:exon_54948504_54948612:AURKA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 57244493 G/A 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:G G A 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000254995:ENST00000371138:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000435446:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57244347_57244509:RP11-261P9.5;ENSG00000124222:ENST00000355957:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000312283:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000359617:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371141:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000371132:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000358029:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000464640:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361830:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000361770:exon_57244347_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000468590:exon_57244358_57244509:STX16;ENSG00000124222:ENST00000438253:exon_57244347_57244509:STX16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 57268867 C/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:C C A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57268793_57268978:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57268793_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57268225_57268978:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57268235_57268978:NPEPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 57290347 C/G 1 18 11 29 8.32257382307407 5.91398266367696 2.40859115939712 C:G C G 10 0.537634787606996 0.45740998643831 ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57290224_57290466:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57290224_57290689:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57290224_57290606:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57290224_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57290224_57290466:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57290224_57291367:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57290224_57290900:NPEPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 194 199 393 89.6988512042428 106.989322733792 -17.2904715295494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0853789086847775 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 57572839 G/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:G G T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 38 34 72 17.5698780709342 18.2795827786379 -0.709704707703711 A:C C A 10 0.537634787606996 0.906191494604093 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 60575191 A/T 1 11 5 16 5.08601733632304 2.68817393803498 2.39784339828806 A:T A T 10 0.537634787606996 0.317062980975179 ENSG00000130699:ENST00000252996:exon_60575180_60575310:TAF4;ENSG00000130699:ENST00000436129:exon_60575180_60575310:TAF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 60768497 C/T 1 24 30 54 11.0967650974321 16.1290436282099 -5.03227853077779 T:C C T 10 0.537634787606996 0.175052625729492 ENSG00000101181:ENST00000436421:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466933:exon_60768472_60769109:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60768472_60768680:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60768472_60768680:GTPBP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 60963494 C/T 1 39 12 51 18.0322432833272 6.45161745128395 11.5806258320432 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00107692593092136 ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 60966318 G/T 1 1 9 10 0.462365212393004 4.83871308846296 -4.37634787606996 T:G G T 10 0.537634787606996 0.00765653759058032 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 61288355 G/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 61588159 A/G 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61588117_61588314:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000411611:exon_61588117_61588314:SLC17A9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 61595636 C/T 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61595580_61595667:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61595580_61595667:SLC17A9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 11 21 32 5.08601733632304 11.2903305397469 -6.20431320342387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0328377121480844 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 62126299 C/T 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62126158_62126454:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62126158_62126454:EEF1A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 62127326 G/A 1 9 6 15 4.16128691153704 3.22580872564198 0.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.79707128563146 ENSG00000101210:ENST00000298049:exon_62127209_62127388:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000217182:exon_62127209_62127388:EEF1A2;ENSG00000101210:ENST00000449908:exon_62127209_62130101:EEF1A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 62322288 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62322158_62322300:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62322158_62322300:RTEL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 62324280 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 62324289 C/T 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62323095_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62324158_62324356:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62324158_62324356:RTEL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 20 62326770 G/A 1 16 8 24 7.39784339828806 4.30107830085597 3.0967650974321 A:G G A 10 0.537634787606996 0.225469869657442 ENSG00000026036:ENST00000370018:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000318100:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000508582:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000360203:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000492259:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000482936:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000342852:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370006:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000480273:exon_62326681_62326833:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496281:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000496816:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000370003:exon_62326681_62327003:RTEL1;ENSG00000026036:ENST00000369993:exon_62326681_62326833:RTEL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 18966406 C/T 1 28 23 51 12.9462259470041 12.3656001149609 0.580625832043204 T:C C T 10 0.537634787606996 0.889399017616036 ENSG00000154640:ENST00000339775:exon_18965971_18966650:BTG3;ENSG00000154640:ENST00000348354:exon_18965971_18966650:BTG3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 26965148 G/A 1 53 93 146 24.5053562568292 50.0000352474506 -25.4946789906214 A:G G A 10 0.537634787606996 2.81428054028308e-05 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 26965205 T/C 1 78 108 186 36.0644865666543 58.0645570615556 -22.0000704949013 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00149996371439018 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26965124_26965277:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26965124_26965277:MRPL39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 26969703 T/C 1 24 34 58 11.0967650974321 18.2795827786379 -7.18281768120577 T:C T C 10 0.537634787606996 0.065281760948579 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26969614_26969726:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26969614_26969726:MRPL39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 26976222 C/T 1 67 57 124 30.9784692303313 30.6451828935988 0.333286336732495 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 26976237 C/T 1 73 58 131 33.7526605046893 31.1828176812058 2.56984282348352 T:C C T 10 0.537634787606996 0.662528276774221 ENSG00000154719:ENST00000352957:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000307301:exon_26976108_26976247:MRPL39;ENSG00000154719:ENST00000419219:exon_26976108_26976247:MRPL39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 34640788 A/G 1 20 21 41 9.24730424786008 11.2903305397469 -2.04302629188684 A:G A G 10 0.537634787606996 0.535083538842443 ENSG00000249624:ENST00000433395:exon_34640699_34640822:AP000295.9;ENSG00000243646:ENST00000290200:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000422891:exon_34640699_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000493295:exon_34640233_34640822:IL10RB;ENSG00000243646:ENST00000498371:exon_34640587_34640822:IL10RB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 37420650 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000185917:ENST00000399215:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399212:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000332131:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399205:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399208:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399201:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000399207:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000414900:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000424303:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000429161:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000485865:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000446166:exon_37420606_37420694:SETD4;ENSG00000185917:ENST00000442559:exon_37420620_37420694:SETD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 37442632 G/C 1 36 51 87 16.6451476461481 27.4193741679568 -10.7742265218087 A:C:G G C 10 0.537634787606996 0.0236008679714502 ENSG00000159228:ENST00000466328:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37442239_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000439427:exon_37442313_37442702:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000399191:exon_37442333_37442702:CBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 37444973 C/T 1 70 76 146 32.3655648675103 40.8602438581317 -8.49467899062142 T:C C T 10 0.537634787606996 0.159414813056346 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 T:C T C 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 38538018 T/C 1 37 34 71 17.1075128585411 18.2795827786379 -1.17206992009671 T:C T C 10 0.537634787606996 0.812497513249578 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38537852_38538053:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000487711:exon_38537852_38538067:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000469939:exon_38537852_38538067:TTC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 38568009 G/C 1 28 20 48 12.9462259470041 10.7526957521399 2.19353019486419 C:G G C 10 0.537634787606996 0.564920581462792 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 38568215 C/T 1 11 14 25 5.08601733632304 7.52688702649794 -2.4408696901749 T:C C T 10 0.537634787606996 0.423024937923135 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 38568259 C/T 1 12 11 23 5.54838254871605 5.91398266367696 -0.365600114960908 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 38597878 C/T 1 15 22 37 6.93547818589506 11.8279653273539 -4.89248714145885 T:C C T 10 0.537634787606996 0.136979634095428 ENSG00000157538:ENST00000309117:exon_38595721_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399000:exon_38595721_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000497493:exon_38595721_38600107:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000288304:exon_38595728_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399001:exon_38597600_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000476950:exon_38597773_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000488368:exon_38597817_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000398998:exon_38597845_38597927:DSCR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 40191431 T/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:G T G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 40191638 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000157557:ENST00000360214:exon_40191427_40191690:ETS2;ENSG00000157557:ENST00000360938:exon_40191427_40191690:ETS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 40670451 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000185658:ENST00000333229:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000342449:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380804:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380800:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000380783:exon_40670358_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000341322:exon_40668363_40670508:BRWD1;ENSG00000185658:ENST00000470108:exon_40670016_40670508:BRWD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 390 552 942 180.322432833272 296.774402759062 -116.45196992579 A:G G A 10 0.537634787606996 3.31854155177220e-14 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 43221826 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000465955:exon_43221788_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000477633:exon_43221817_43221882:PRDM15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 12 1 13 5.54838254871605 0.537634787606996 5.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00453061982907107 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45209559 C/T 1 36 26 62 16.6451476461481 13.9785044777819 2.66664316836625 T:C C T 10 0.537634787606996 0.526369206297682 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45209394_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000475534:exon_45209394_45209576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45209440_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45209446_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45209457_45209643:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000492638:exon_45209458_45209643:RRP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 41 36 77 18.9569737081132 19.3548523538519 -0.397878645738693 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45219524 T/C 1 56 45 101 25.8924518940082 24.1935654423148 1.6988864516934 T:C T C 10 0.537634787606996 0.765349970376467 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45503121 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 18 14 32 8.32257382307407 7.52688702649794 0.795686796576128 T:C C T 10 0.537634787606996 0.86014885088268 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45538647 T/C 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45538644_45538714:PWP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45540919 A/G 1 29 23 52 13.4085911593971 12.3656001149609 1.04299104443621 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.78320169659137 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45540833_45540983:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 20 29 49 9.24730424786008 15.5914088406029 -6.34410459274281 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0848317990750537 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45553596 T/C 1 45 30 75 20.8064345576852 16.1290436282099 4.6773909294753 T:C T C 10 0.537634787606996 0.298828629359589 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45553487_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45553498_45554036:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45553500_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45553521_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45553556_45553720:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45553562_45553720:C21orf33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45564766 C/G 1 132 124 256 61.0322080358765 66.6667136632675 -5.63450562739097 C:G C G 10 0.537634787606996 0.490986630766743 ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45564702_45564894:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45564703_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45564702_45565605:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45564703_45564798:C21orf33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45732116 C/T 1 59 68 127 27.2795475311872 36.5591655572757 -9.27961802608849 T:C C T 10 0.537634787606996 0.109091011539584 ENSG00000141959:ENST00000349048:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000397961:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000496824:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000466134:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000491298:exon_45731988_45732177:PFKL;ENSG00000141959:ENST00000403390:exon_45731988_45732177:PFKL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45750112 C/T 1 36 31 67 16.6451476461481 16.6666784158169 -0.0215307696687326 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45750145 T/C 1 28 24 52 12.9462259470041 12.9032349025679 0.0429910444362083 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 45750248 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 46271460 T/C 1 15 4 19 6.93547818589506 2.15053915042798 4.78493903546708 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0362941544119347 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 46313442 G/T 1 95 92 187 43.9246951773354 49.4624004598436 -5.53770528250826 T:G G T 10 0.537634787606996 0.42084869489716 ENSG00000160255:ENST00000475170:exon_46313319_46313942:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46313319_46313459:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46313319_46313459:ITGB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 46330674 C/A 1 33 32 65 15.2580520089691 17.2043132034239 -1.94626119445474 A:C C A 10 0.537634787606996 0.709336064734608 ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46330640_46330741:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523663:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522931:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517563:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000522688:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000520389:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000524251:exon_46330515_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000517819:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397846:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000521995:exon_46330640_46330700:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000518033:exon_46330236_46330700:ITGB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 46951556 A/G 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 46957794 T/C 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47614443 A/G 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 A:G A G 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47614469 A/C 1 19 11 30 8.78493903546708 5.91398266367696 2.87095637179012 A:C A C 10 0.537634787606996 0.360976107545321 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 4 11 15 1.84946084957202 5.91398266367696 -4.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0401081696281839 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47836653 C/T 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 8 12 20 3.69892169914403 6.45161745128395 -2.75269575213992 C:G G C 10 0.537634787606996 0.264150080115426 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 21 47863757 A/C 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 A:T:C A C 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47863723_47863861:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47863723_47863861:PCNT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 17690430 C/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17690246_17690575:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17690246_17690779:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17690246_17690614:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000441548:exon_17690246_17690613:CECR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 18165995 T/G 1 20 15 35 9.24730424786008 8.06452181410494 1.18278243375514 T:G T G 10 0.537634787606996 0.736938630785945 ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 18209613 A/G 1 18 5 23 8.32257382307407 2.68817393803498 5.63439988503909 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0206331180675183 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 18209718 C/T 1 18 16 34 8.32257382307407 8.60215660171194 -0.279582778637865 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 18220831 A/G 1 275 236 511 127.150433408076 126.881809875251 0.268623532825032 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000399765:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000494097:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18220783_18220995:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18220824_18220995:BID HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19122665 C/T 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 T:C C T 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19122573_19122688:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19122573_19122688:DGCR14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19165478 A/G 1 82 65 147 37.9139474162263 34.9462611944547 2.96768622177159 A:G A G 10 0.537634787606996 0.679350919240689 ENSG00000100075:ENST00000215882:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000451283:exon_19165455_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000470922:exon_19165240_19165554:SLC25A1;ENSG00000100075:ENST00000461267:exon_19165455_19165554:SLC25A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19365538 C/T 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 T:C C T 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000100084:ENST00000340170:exon_19365392_19365589:HIRA;ENSG00000100084:ENST00000263208:exon_19365392_19365589:HIRA;ENSG00000242259:ENST00000509549:exon_19365392_19365589:C22orf39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19789541 A/C 1 37 20 57 17.1075128585411 10.7526957521399 6.35481710640123 A:C A C 10 0.537634787606996 0.110413250996330 ENSG00000185838:ENST00000329517:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000403325:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000460402:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000451413:exon_19789524_19789739:GNB1L;ENSG00000185838:ENST00000481086:exon_19789522_19789739:GNB1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19867771 C/T 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19867702_19867794:TXNRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 19 15 34 8.78493903546708 8.06452181410494 0.720417221362135 T:G T G 10 0.537634787606996 0.864562502288305 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19907099 C/A 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 A:C C A 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19907118 G/A 1 8 13 21 3.69892169914403 6.98925223889095 -3.29033053974692 A:G G A 10 0.537634787606996 0.189499969831395 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 49 55 104 22.6558954072572 29.5699133183848 -6.91401791112759 C:G C G 10 0.537634787606996 0.200919641345079 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 20307256 G/A 1 30 15 45 13.8709563717901 8.06452181410494 5.80643455768518 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0995862920320049 ENSG00000128185:ENST00000248879:exon_20307162_20307322:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000405465:exon_20307162_20307309:DGCR6L;ENSG00000128185:ENST00000443409:exon_20307162_20307322:DGCR6L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 7 13 20 3.23655648675103 6.98925223889095 -3.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.116362777464643 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 20940085 G/A 1 41 29 70 18.9569737081132 15.5914088406029 3.36556486751028 A:G G A 10 0.537634787606996 0.472632621401306 ENSG00000099917:ENST00000433831:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000437399:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000425759:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000292733:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000263205:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000406969:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000382974:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000492381:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000489651:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000473244:exon_20940015_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000493216:exon_20937617_20940113:MED15;ENSG00000099917:ENST00000461076:exon_20939388_20940090:MED15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 21084208 G/A 1 12 8 20 5.54838254871605 4.30107830085597 1.24730424786008 A:G G A 10 0.537634787606996 0.657566913300005 ENSG00000241973:ENST00000255882:exon_21084180_21084299:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000477245:exon_21084180_21084299:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000414196:exon_21084180_21084299:PI4KA;ENSG00000241973:ENST00000437178:exon_21084180_21084299:PI4KA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 21982892 C/T 1 66 58 124 30.5161040179383 31.1828176812058 -0.666713663267505 T:C C T 10 0.537634787606996 0.928388937514856 ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 22049783 C/T 1 29 4 33 13.4085911593971 2.15053915042798 11.2580520089691 T:C C T 10 0.537634787606996 6.28167241162718e-05 ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22049687_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22049683_22050712:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22049683_22052201:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22049683_22049785:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000462188:exon_22049226_22049785:PPIL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 22318538 C/T 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 T:C C T 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 22318671 G/A 1 12 6 18 5.54838254871605 3.22580872564198 2.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.346995716390543 ENSG00000100038:ENST00000398789:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000357179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457270:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000457179:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000398793:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000444502:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000436282:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000403680:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000450071:exon_22318533_22318687:TOP3B;ENSG00000100038:ENST00000413067:exon_22318533_22318687:TOP3B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 22453513 C/T 0 26 0 26 12.0214955222181 0 12.0214955222181 C C 10 0.537634787606996 1.59171299742906e-07 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 22550401 C/G 1 82 2 84 37.9139474162263 1.07526957521399 36.8386778410123 C:G C G 10 0.537634787606996 6.58797563443557e-20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 23165701 C/T 1 25 2 27 11.5591303098251 1.07526957521399 10.4838607346111 T:C C T 10 0.537634787606996 1.9602612095231e-05 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 23223404 A/T 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 A A 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 23627369 A/G 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 A:G A G 10 0.537634787606996 0.283623583656103 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23627220_23627388:BCR;ENSG00000186716:ENST00000466076:exon_23627220_23627388:BCR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 525 531 1056 242.741736506327 285.484072219315 -42.7423357129878 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00869304996637262 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 24109550 T/C 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C T C 10 0.537634787606996 0.73270668826792 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 13 22 35 6.01074776110905 11.8279653273539 -5.81721756624486 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0611899191838794 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 24921729 G/A 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G G A 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 455 431 886 210.376171638817 231.720593458615 -21.3444218197984 A:T:C T C 10 0.537634787606996 0.157038194859626 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 26860269 G/C 1 22 22 44 10.1720346726461 11.8279653273539 -1.65593065470782 C:G G C 10 0.537634787606996 0.652045375196476 ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000312736:exon_26860210_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000422379:exon_26860205_26860792:HPS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 26888024 C/T 1 42 41 83 19.4193389205062 22.0430262918868 -2.62368737138067 T:C C T 10 0.537634787606996 0.583381452632444 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26887191_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000492137:exon_26887893_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000412662:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26887897_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26887952_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26887952_26888334:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26887977_26888334:TFIP11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 C:G C G 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29659960 C/T 1 7 21 28 3.23655648675103 11.2903305397469 -8.05377405299589 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00361032442954602 ENSG00000100263:ENST00000216085:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000439641:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000496342:exon_29659824_29660390:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000414672:exon_29659824_29660207:RHBDD3;ENSG00000100263:ENST00000406335:exon_29659946_29660207:RHBDD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 36 42 78 16.6451476461481 22.5806610794938 -5.93551343334569 T:C C T 10 0.537634787606996 0.211391048380823 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29755888 T/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 T:C T C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000421126:exon_29755813_29755948:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000473606:exon_29755662_29755948:AP1B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29908072 C/T 1 37 18 55 17.1075128585411 9.67742617692593 7.43008668161522 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0573677604948921 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29908010_29908125:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29908010_29908125:THOC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29913272 C/T 1 21 23 44 9.70966946025308 12.3656001149609 -2.65593065470783 T:C C T 10 0.537634787606996 0.452079066355344 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29913252_29913355:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29913252_29913355:THOC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 29925221 C/T 1 14 10 24 6.47311297350206 5.37634787606996 1.0967650974321 T:C C T 10 0.537634787606996 0.68784243201575 ENSG00000100296:ENST00000490103:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397872:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397871:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000442555:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000446338:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000358079:exon_29924926_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000397873:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000435403:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000484924:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000443089:exon_29925151_29925228:THOC5;ENSG00000100296:ENST00000492707:exon_29925151_29925228:THOC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 30689998 G/A 1 18 9 27 8.32257382307407 4.83871308846296 3.48386073461111 A:G G A 10 0.537634787606996 0.246443595808427 ENSG00000248751:ENST00000330168:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434987:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000434291:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000418047:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000248751:ENST00000447976:exon_30689910_30690099:RP1-130H16.18;ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30689974_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30689640_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000466666:exon_30689910_30690099:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000437122:exon_30689910_30690099:TBC1D10A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 30823196 T/C 1 42 55 97 19.4193389205062 29.5699133183848 -10.1505743978786 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.0417047837566118 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 30973025 G/A 1 108 107 215 49.9354429384444 57.5269222739486 -7.59147933550414 A:G G A 10 0.537634787606996 0.30559049808262 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30972615_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30972617_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30972619_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30972623_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30972652_30973116:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30972822_30973116:PES1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 30987864 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 T:C T C 10 0.537634787606996 0.261199351101203 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 31342376 G/C 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 C:G G C 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31342328_31342436:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000476152:exon_31342328_31342436:MORC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 31491295 G/C 1 11 2 13 5.08601733632304 1.07526957521399 4.01074776110905 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0272749448200266 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 31491332 C/T 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 31859859 A/G 1 9 15 24 4.16128691153704 8.06452181410494 -3.90323490256791 A:G A G 10 0.537634787606996 0.150610778150999 ENSG00000184708:ENST00000397525:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000330125:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000382180:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000397523:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000420671:exon_31859667_31859953:EIF4ENIF1;ENSG00000184708:ENST00000423097:exon_31859686_31859953:EIF4ENIF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 31998612 G/A 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31998593_31998771:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31998593_31998771:SFI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 32011225 T/C 1 33 30 63 15.2580520089691 16.1290436282099 -0.870991619240749 T:C T C 10 0.537634787606996 0.89961399183648 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 32784051 T/C 1 68 84 152 31.4408344427243 45.1613221589877 -13.7204877162634 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0279327168906011 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32783569_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32783588_32784086:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32783588_32784086:C22orf28 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 46 54 100 21.2687997700782 29.0322785307778 -7.7634787606996 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.132498659643337 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 35811877 G/C 1 67 94 161 30.9784692303313 50.5376700350576 -19.5592008047264 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.00256012644189419 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35811822_35811901:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35811822_35811965:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493569:exon_35811822_35811958:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000465557:exon_35811822_35811965:MCM5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 180 255 435 83.2257382307407 137.096870839784 -53.8711326090433 T:C C T 10 0.537634787606996 2.38934762827005e-07 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 36684354 T/C 1 209 147 356 96.6343293901378 79.0323137782284 17.6020156119094 T:C T C 10 0.537634787606996 0.062921935749762 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 36684358 C/A 1 211 137 348 97.5590598149238 73.6559659021585 23.9030939127654 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0114096487912555 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 37271882 T/C 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 T:C T C 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 37524619 G/T 1 16 32 48 7.39784339828806 17.2043132034239 -9.80646980513581 T:G G T 10 0.537634787606996 0.00550771146809456 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 37603021 G/A 0 0 8 8 0 4.30107830085597 -4.30107830085597 A G A 10 0.537634787606996 0.00208872472775923 ENSG00000183473:ENST00000328544:exon_37600278_37603878:SSTR3;ENSG00000183473:ENST00000402501:exon_37602520_37603878:SSTR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 37637653 G/C 1 540 444 984 249.677214692222 238.709845697506 10.9673689947159 C:G G C 10 0.537634787606996 0.502013896524 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 72 73 145 33.2902952922963 39.2473394953107 -5.95704420301443 T:C C T 10 0.537634787606996 0.359656408559777 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 38151170 G/A 1 10 17 27 4.62365212393004 9.13979138931893 -4.51613926538889 A:G G A 10 0.537634787606996 0.085865309074037 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38151108_38151197:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000407319:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000428075:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000413051:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000418339:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000452519:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000417857:exon_38151108_38151197:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000331103:exon_38151108_38151517:TRIOBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 38164106 C/T 1 11 16 27 5.08601733632304 8.60215660171194 -3.51613926538889 T:C C T 10 0.537634787606996 0.182688102275838 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38164081_38164183:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38164081_38164183:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38164081_38164183:TRIOBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 38204089 C/T 1 17 9 26 7.86020861068107 4.83871308846296 3.0214955222181 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246429877996880 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38203912_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38203919_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000445195:exon_38203923_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000415371:exon_38203930_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000478203:exon_38203941_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000426858:exon_38203945_38204170:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000451984:exon_38204021_38204170:GCAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 38877461 T/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000100196:ENST00000216014:exon_38877217_38877469:KDELR3;ENSG00000100196:ENST00000409006:exon_38877217_38877640:KDELR3;ENSG00000100196:ENST00000471268:exon_38877217_38877469:KDELR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 26 14 40 12.0214955222181 7.52688702649794 4.49460849572016 T:C T C 10 0.537634787606996 0.204048278602708 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39095987 A/G 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 A:G A G 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000100221:ENST00000216039:exon_39095808_39096672:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000427389:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000412832:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000417712:exon_39095806_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000456626:exon_39095808_39096623:JOSD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39122038 C/T 1 18 24 42 8.32257382307407 12.9032349025679 -4.58066107949383 T:C C T 10 0.537634787606996 0.166248600732993 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000460605:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000475959:exon_39121812_39122155:GTPBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39125529 G/A 1 16 10 26 7.39784339828806 5.37634787606996 2.0214955222181 A:G G A 10 0.537634787606996 0.556048478872558 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000462332:exon_39124261_39125667:GTPBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39134207 C/T 1 34 39 73 15.7204172213621 20.9677567166728 -5.24733949531071 T:C C T 10 0.537634787606996 0.240985939341953 ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39133956_39134304:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000489527:exon_39133956_39134300:GTPBP1;ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134178_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39133765_39134270:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134040_39134270:SUN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39138332 G/A 1 24 47 71 11.0967650974321 25.2688350175288 -14.1720699200967 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000791535900915714 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39138306_39138560:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000477262:exon_39138306_39138443:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000469086:exon_39138306_39138486:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000464202:exon_39138306_39138583:SUN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 16 13 29 7.39784339828806 6.98925223889095 0.408591159397115 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G G A 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 23 11 34 10.6343998850391 5.91398266367696 4.72041722136214 A:C C A 10 0.537634787606996 0.122195356082048 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 26 14 40 12.0214955222181 7.52688702649794 4.49460849572016 T:C T C 10 0.537634787606996 0.204048278602708 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39477566 A/G 1 78 68 146 36.0644865666543 36.5591655572757 -0.494678990621416 A:G A G 10 0.537634787606996 0.934089164375664 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39496336 G/T 1 34 10 44 15.7204172213621 5.37634787606996 10.3440693452922 T:G G T 10 0.537634787606996 0.00211403035675779 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39496412 G/C 1 64 37 101 29.5913735931523 19.8924871414589 9.6988864516934 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0578527837945003 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000474235:exon_39496277_39496541:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39496277_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39496280_39496433:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39496280_39496433:APOBEC3H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39497404 G/C 1 49 16 65 22.6558954072572 8.60215660171194 14.0537388055453 C:G G C 10 0.537634787606996 0.000424895435632866 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39497452 A/G 0 20 0 20 9.24730424786008 0 9.24730424786008 A A 10 0.537634787606996 4.27082233522377e-06 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39497454 G/C 1 22 2 24 10.1720346726461 1.07526957521399 9.0967650974321 C:G G C 10 0.537634787606996 0.000109461487198179 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000421988:exon_39497242_39497509:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497242_39497509:APOBEC3H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39498038 G/C 1 39 29 68 18.0322432833272 15.5914088406029 2.44083444272427 C:G G C 10 0.537634787606996 0.627058742111964 ENSG00000100298:ENST00000348946:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000401756:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000442487:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000342641:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000448746:exon_39497923_39498047:APOBEC3H;ENSG00000100298:ENST00000396749:exon_39497923_39498053:APOBEC3H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 39918046 T/C 1 712 563 1275 329.204031223819 302.688385422739 26.5156458010801 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.136733155409004 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917778_39918691:ATF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50684296 T/C 1 8 14 22 3.69892169914403 7.52688702649794 -3.82796532735391 T:C T C 10 0.537634787606996 0.133573031276560 ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50688348 A/G 1 21 21 42 9.70966946025308 11.2903305397469 -1.58066107949383 A:G A G 10 0.537634787606996 0.645316431091822 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496909:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000488270:exon_50688289_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000489424:exon_50688288_50688393:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000470965:exon_50688297_50688393:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50688289_50688393:MAPK12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50694297 A/G 1 18 13 31 8.32257382307407 6.98925223889095 1.33332158418312 A:G A G 10 0.537634787606996 0.720027331176985 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000496942:exon_50694044_50694628:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50694239_50694310:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000497738:exon_50694239_50694582:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50694239_50694310:MAPK12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50696678 G/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000438835:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000215659:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000488504:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395780:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000467891:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000449719:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000482969:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000426747:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000492218:exon_50696672_50696730:MAPK12;ENSG00000188130:ENST00000395778:exon_50696672_50696730:MAPK12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 71 70 141 32.8279300799033 37.6344351324897 -4.80650505258644 A:G A G 10 0.537634787606996 0.447479992304063 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50893287 T/C 1 25 24 49 11.5591303098251 12.9032349025679 -1.3441045927428 T:C T C 10 0.537634787606996 0.774944644411224 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50893243_50893373:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50893243_50893373:SBF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 A:G G A 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 171 150 321 79.0644513192037 80.6452181410494 -1.58076682184571 T:C:G T G 10 0.537634787606996 0.866799293072187 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 82 73 155 37.9139474162263 39.2473394953107 -1.33339207908438 C:G C G 10 0.537634787606996 0.872106800870075 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 22 50964236 G/A 1 142 109 251 65.6558601598066 58.6021918491626 7.053668310644 A:G G A 10 0.537634787606996 0.376406931191072 ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964181_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964184_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964185_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964186_50964347:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964214_50964347:TYMP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 8590313 T/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 13 5 18 6.01074776110905 2.68817393803498 3.32257382307407 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155898486841443 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 17 9 26 7.86020861068107 4.83871308846296 3.0214955222181 T:C T C 10 0.537634787606996 0.246429877996880 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9425911 G/A 1 28 23 51 12.9462259470041 12.3656001149609 0.580625832043204 A:G G A 10 0.537634787606996 0.889399017616036 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9867625 C/T 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 T:C C T 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9870857 G/A 1 22 19 41 10.1720346726461 10.2150609645329 -0.0430262918868358 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9871030 T/G 1 23 17 40 10.6343998850391 9.13979138931893 1.49460849572016 T:G T G 10 0.537634787606996 0.751625769863771 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9883709 C/T 1 24 41 65 11.0967650974321 22.0430262918868 -10.9462611944547 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0084970387005709 ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000475470:exon_9883667_9885255:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000484134:exon_9881585_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000418713:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000472381:exon_9883667_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433972:exon_9882941_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433555:exon_9883092_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000451405:exon_9883382_9883927:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000485705:exon_9883420_9883766:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000473522:exon_9883538_9883766:RPUSD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9934605 T/C 1 65 67 132 30.0537388055453 36.0215307696687 -5.96779196412348 T:C T C 10 0.537634787606996 0.33699845835721 ENSG00000171135:ENST00000307768:exon_9934599_9936033:JAGN1;ENSG00000171135:ENST00000489724:exon_9934493_9934655:JAGN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9975003 T/C 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163702:ENST00000383812:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000466046:exon_9974637_9975277:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000295981:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451231:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000483582:exon_9974504_9975314:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000494365:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000498214:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000403601:exon_9974637_9975305:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000416074:exon_9974637_9975304:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000451271:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000455057:exon_9974637_9975301:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000413608:exon_9974637_9975300:IL17RC;ENSG00000163702:ENST00000497387:exon_9974637_9975304:IL17RC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 C:G C G 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 10067794 A/G 1 12 4 16 5.54838254871605 2.15053915042798 3.39784339828806 A:G A G 10 0.537634787606996 0.130574356205338 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 12 4 16 5.54838254871605 2.15053915042798 3.39784339828806 T:C T C 10 0.537634787606996 0.130574356205338 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 11 16 27 5.08601733632304 8.60215660171194 -3.51613926538889 T:G T G 10 0.537634787606996 0.182688102275838 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 10320592 T/C 1 40 40 80 18.4946084957202 21.5053915042798 -3.01078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 0.503591177687202 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10320569_10320747:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10320569_10320718:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000426850:exon_10320569_10320849:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000496355:exon_10320569_10320718:TATDN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 40 34 74 18.4946084957202 18.2795827786379 0.215025717082295 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 14175262 T/C 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 T:C T C 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14175239_14175309:TMEM43 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 14187449 G/T 1 69 47 116 31.9031996551173 25.2688350175288 6.63436463758847 T:G G T 10 0.537634787606996 0.227136682170269 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14186647_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14186650_14187659:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14187229_14187659:XPC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 14220023 G/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 C:G G C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14219966_14220283:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14219966_14220172:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14219966_14220101:XPC;ENSG00000154767:ENST00000511155:exon_14219984_14220121:XPC;ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14219858_14220381:LSM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 15115270 G/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:G G T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000131381:ENST00000253699:exon_15111580_15116437:ZFYVE20;ENSG00000131381:ENST00000476527:exon_15115112_15116437:ZFYVE20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 15610040 A/G 1 17 17 34 7.86020861068107 9.13979138931893 -1.27958277863786 A:G A G 10 0.537634787606996 0.731942963284519 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000435217:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15609939_15610093:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15609939_15610093:HACL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 16364919 A/C 1 218 143 361 100.795616301675 76.8817746278004 23.9138416738744 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0130030077270340 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 20212621 T/G 1 14 15 29 6.47311297350206 8.06452181410494 -1.59140884060288 T:G T G 10 0.537634787606996 0.580786129565456 ENSG00000129810:ENST00000306698:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000429446:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522489:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000529155:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000452020:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000440105:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000442720:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000460637:exon_20212535_20212759:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000427162:exon_20212535_20212724:SGOL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 33038747 C/G 1 15 14 29 6.93547818589506 7.52688702649794 -0.591408840602884 C:G C G 10 0.537634787606996 0.854036703051874 ENSG00000170266:ENST00000399402:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307363:exon_33038112_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000307377:exon_33038221_33038836:GLB1;ENSG00000170266:ENST00000445488:exon_33038226_33038836:GLB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 37367112 C/T 1 26 33 59 12.0214955222181 17.7419479910309 -5.72045246881277 T:C C T 10 0.537634787606996 0.151333208402578 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 37367628 A/G 1 24 19 43 11.0967650974321 10.2150609645329 0.881704132899172 A:G A G 10 0.537634787606996 0.878817482439178 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 38047680 G/A 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 A:G G A 10 0.537634787606996 0.829141081785639 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047672_38047743:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000488209:exon_38047672_38047695:VILL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 C:G G C 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39184959 C/T 1 14 6 20 6.47311297350206 3.22580872564198 3.24730424786008 T:C C T 10 0.537634787606996 0.18020643240718 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39185077 G/A 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 A:G G A 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39186728 C/T 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39188182 C/T 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39187969_39188213:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39187969_39188218:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39188154_39188213:CSRNP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39431081 G/A 1 2 9 11 0.924730424786008 4.83871308846296 -3.91398266367696 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0295478960306494 ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39430986_39431107:SLC25A38;ENSG00000144659:ENST00000431510:exon_39430986_39431107:SLC25A38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39449137 T/C 1 113 57 170 52.2472690004095 30.6451828935988 21.6020861068107 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00089890378690297 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39450065 C/T 1 14 3 17 6.47311297350206 1.61290436282099 4.86020861068107 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0257220973594464 ENSG00000168028:ENST00000490490:exon_39449695_39450215:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39450028_39450215:RPSA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 39453160 G/A 1 237 235 472 109.580555337142 126.344175087644 -16.7636197505021 A:G G A 10 0.537634787606996 0.127684754451032 ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000478027:exon_39453140_39453268:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000495394:exon_39451750_39453268:RPSA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 40498845 C/T 1 22 35 57 10.1720346726461 18.8172175662449 -8.64518289359877 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0238055075378965 ENSG00000188846:ENST00000338970:exon_40498783_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000465325:exon_40498794_40498854:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000396203:exon_40498831_40498965:RPL14;ENSG00000188846:ENST00000416518:exon_40498845_40498965:RPL14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 42680325 A/T 1 37 35 72 17.1075128585411 18.8172175662449 -1.70970470770371 A:T A T 10 0.537634787606996 0.723661449604658 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 44884647 C/A 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44884617_44884726:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000422209:exon_44884615_44884726:KIF15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 37 20 57 17.1075128585411 10.7526957521399 6.35481710640123 C:G C G 10 0.537634787606996 0.110413250996330 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 18 27 45 8.32257382307407 14.5161392653889 -6.19356544231482 A:G G A 10 0.537634787606996 0.072853131972327 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 47162661 A/G 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 A:G A G 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47161672_47165277:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47161672_47165740:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47161672_47164616:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47161672_47166038:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47161672_47165025:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000412450:exon_47161973_47166038:SETD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 47448825 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448799_47448857:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448799_47448857:PTPN23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 47452118 G/A 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 20 17 37 9.24730424786008 9.13979138931893 0.107512858541147 A:C:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 131 114 245 60.5698428234835 61.2903657871975 -0.720522963714025 T:C C T 10 0.537634787606996 0.948956356370138 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 49151697 C/T 1 16 16 32 7.39784339828806 8.60215660171194 -1.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.724633964891837 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151607_49151717:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151607_49151717:USP19 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50326020 G/A 1 67 63 130 30.9784692303313 33.8709916192407 -2.89252238890948 A:G G A 10 0.537634787606996 0.66028664082308 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50327429 A/G 1 16 18 34 7.39784339828806 9.67742617692593 -2.27958277863786 A:G A G 10 0.537634787606996 0.492958608233671 ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50334231 T/A 1 12 23 35 5.54838254871605 12.3656001149609 -6.81721756624486 A:T T A 10 0.537634787606996 0.026464846842611 ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50336661 T/C 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000186792:ENST00000336307:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000415204:exon_50336644_50336832:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000513170:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000450982:exon_50336644_50336663:HYAL3;ENSG00000186792:ENST00000066014:exon_50336644_50336899:HYAL3;ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50336644_50336847:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50336644_50336852:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50336644_50336831:NAT6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50355730 T/G 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 T:G T G 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50378176 T/G 1 2 8 10 0.924730424786008 4.30107830085597 -3.37634787606996 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0521780855970265 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50377987_50378367:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50377987_50378343:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000482447:exon_50377987_50378343:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50377987_50378272:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000478619:exon_50377987_50378411:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000488024:exon_50377987_50378261:RASSF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 T:G T G 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 51430657 A/C 1 81 63 144 37.4515822038333 33.8709916192407 3.58059058459258 A:C A C 10 0.537634787606996 0.559820440842274 ENSG00000179837:ENST00000323686:exon_51428731_51435330:RBM15B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 39 57 96 18.0322432833272 30.6451828935988 -12.6129396102716 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0104281157220534 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 51979120 C/T 1 21 10 31 9.70966946025308 5.37634787606996 4.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.149263074371145 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51979014_51979240:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000475782:exon_51978803_51979240:PARP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 51994587 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000090097:ENST00000355852:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000492809:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000497390:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000461554:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000484633:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000322099:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000471308:exon_51994542_51994653:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000498822:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000395013:exon_51994542_51994694:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000395014:exon_51994542_51994694:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000428823:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000471622:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000294192:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000468324:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000466412:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000497653:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000489595:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000490063:exon_51994538_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000483411:exon_51994573_51994658:PCBP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52255431 C/G 1 17 24 41 7.86020861068107 12.9032349025679 -5.04302629188684 C:G C G 10 0.537634787606996 0.119866461502604 ENSG00000239732:ENST00000360658:exon_52255096_52258328:TLR9;ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52255097_52258328:RP11-330H6.5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52266056 G/A 1 41 40 81 18.9569737081132 21.5053915042798 -2.54841779616668 A:G G A 10 0.537634787606996 0.579336267277436 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52265960_52266138:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52265960_52266138:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000472755:exon_52265960_52266244:TWF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52610651 T/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:T T A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52610557_52610714:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52610557_52610714:PBRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52643685 T/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C T C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52643329_52643971:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000480064:exon_52643102_52643971:PBRM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52720080 A/C 1 25 15 40 11.5591303098251 8.06452181410494 3.49460849572016 A:C A C 10 0.537634787606996 0.341538836630786 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52721305 G/A 1 140 97 237 64.7311297350206 52.1505743978786 12.5805553371419 A:G G A 10 0.537634787606996 0.103732050928980 ENSG00000163938:ENST00000479230:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000474423:exon_52721262_52721399:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000460073:exon_52721262_52721399:GNL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52727224 C/A 1 187 206 393 86.4622947174917 110.752766247041 -24.2904715295494 A:T:C C A 10 0.537634787606996 0.0151001446336321 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 206 200 406 95.2472337529588 107.526957521399 -12.2797237684404 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.232336554569007 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 52874446 C/T 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000213533:ENST00000355083:exon_52870772_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000477591:exon_52874234_52874626:TMEM110;ENSG00000213533:ENST00000464769:exon_52874310_52874626:TMEM110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 96 81 177 44.3870603897284 43.5484177961667 0.838642593561708 A:G G A 10 0.537634787606996 0.939968161487286 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 72 74 146 33.2902952922963 39.7849742829177 -6.49467899062142 T:C C T 10 0.537634787606996 0.28209848000514 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53259850 C/T 1 647 471 1118 299.150292418274 253.225984962895 45.9243074553785 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.00632110538381174 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53258723_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53259767_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53259655_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53259668_53262165:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53259673_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53259675_53259947:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53259718_53259947:TKT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 397 272 669 183.558989320023 146.236662229103 37.3223270909197 A:T:G A G 10 0.537634787606996 0.00408333102384862 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53267342 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000494523:exon_53267172_53269035:TKT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 313 181 494 144.72031147901 97.3118965568663 47.408414922144 T:C T C 10 0.537634787606996 1.73576692238014e-05 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 133 85 218 61.4945732482695 45.6989569465947 15.7956163016749 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0350577150966598 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 46 32 78 21.2687997700782 17.2043132034239 4.06448656665431 A:C A C 10 0.537634787606996 0.366392005065331 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 56657197 T/C 1 21 35 56 9.70966946025308 18.8172175662449 -9.10754810599178 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0157847062035726 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56654161_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56654573_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56656766_56657871:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56656887_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56656974_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56657065_56657594:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000485156:exon_56657145_56657871:C3orf63 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 56763316 G/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 56763328 T/C 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 T:C T C 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 56763525 A/G 0 10 0 10 4.62365212393004 0 4.62365212393004 A A 10 0.537634787606996 0.00246430999279537 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56761446_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56761449_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56762260_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56763015_56763650:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56763049_56763650:ARHGEF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 56766435 C/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 C:G C G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000163947:ENST00000296315:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000338458:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000413728:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000465659:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000496106:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000497267:exon_56766266_56766452:ARHGEF3;ENSG00000163947:ENST00000495373:exon_56765621_56766452:ARHGEF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 57882601 C/T 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000163681:ENST00000295951:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000295952:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416870:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000383718:exon_57882600_57887872:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000428312:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000449503:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000416658:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000442599:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000459654:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000472546:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000417128:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000438794:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000495364:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000494088:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000461354:exon_57882600_57882659:SLMAP;ENSG00000163681:ENST00000466255:exon_57882600_57882659:SLMAP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 59908126 A/G 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000189283:ENST00000492590:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000476844:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000466788:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000468189:exon_59908072_59908140:FHIT;ENSG00000189283:ENST00000341848:exon_59908072_59908140:FHIT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 63981424 A/G 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:G A G 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000477516:exon_63981181_63981553:ATXN7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:G A G 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 66419956 C/T 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 T:C C T 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 44 31 75 20.3440693452922 16.6666784158169 3.6773909294753 A:C C A 10 0.537634787606996 0.419316339915526 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 73114003 T/C 1 12 14 26 5.54838254871605 7.52688702649794 -1.9785044777819 T:C T C 10 0.537634787606996 0.440467677457136 ENSG00000163605:ENST00000356692:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000482242:exon_73114003_73114133:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000488810:exon_73114003_73114117:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000394284:exon_73114003_73114292:PPP4R2;ENSG00000163605:ENST00000460360:exon_73114003_73114441:PPP4R2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 81627175 T/C 1 20 31 51 9.24730424786008 16.6666784158169 -7.4193741679568 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0482879645882082 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81627076_81627247:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81627076_81627247:GBE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 81698119 C/T 1 9 15 24 4.16128691153704 8.06452181410494 -3.90323490256791 T:C C T 10 0.537634787606996 0.150610778150999 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 81720076 G/A 1 23 17 40 10.6343998850391 9.13979138931893 1.49460849572016 A:G G A 10 0.537634787606996 0.751625769863771 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81719989_81720104:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000477426:exon_81719989_81720133:GBE1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 93768268 C/G 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 C:G C G 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000169379:ENST00000303097:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000394222:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000471138:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000460371:exon_93768250_93768366:ARL13B;ENSG00000169379:ENST00000335438:exon_93768250_93768366:ARL13B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 98250986 C/T 1 114 90 204 52.7096342128025 48.3871308846296 4.32250332817281 T:C C T 10 0.537634787606996 0.574589124036686 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 98304319 G/C 1 30 25 55 13.8709563717901 13.4408696901749 0.43008668161522 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000080819:ENST00000512905:exon_98304285_98304342:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 98304467 T/C 1 17 18 35 7.86020861068107 9.67742617692593 -1.81721756624486 T:C T C 10 0.537634787606996 0.612162094837479 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 98307630 C/T 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 62 43 105 28.6666431683662 23.1182958671008 5.54834730126542 T:C T C 10 0.537634787606996 0.283692319235934 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 105421034 C/T 1 21 15 36 9.70966946025308 8.06452181410494 1.64514764614814 T:C C T 10 0.537634787606996 0.61963503509477 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105420938_105421045:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105420938_105421303:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105420938_105421303:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105420938_105421303:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105420938_105421303:CBLB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 35 30 65 16.1827824337551 16.1290436282099 0.0537388055452581 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 18 14 32 8.32257382307407 7.52688702649794 0.795686796576128 A:T A T 10 0.537634787606996 0.86014885088268 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 112727199 G/A 1 17 20 37 7.86020861068107 10.7526957521399 -2.89248714145885 A:G G A 10 0.537634787606996 0.410254465016945 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 119263680 C/T 1 60 45 105 27.7419127435802 24.1935654423148 3.54834730126542 T:C C T 10 0.537634787606996 0.495400418760141 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119263397_119263714:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119263190_119263714:CD80 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122133830 T/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:G T G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000196981:ENST00000330689:exon_122130715_122134882:WDR5B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122274757 G/C 1 25 15 40 11.5591303098251 8.06452181410494 3.49460849572016 C:G G C 10 0.537634787606996 0.341538836630786 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122274133_122274968:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000466126:exon_122274711_122274968:PARP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 61 41 102 28.2042779559732 22.0430262918868 6.16125166408641 A:G A G 10 0.537634787606996 0.234454048423982 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 62 46 108 28.6666431683662 24.7312002299218 3.93544293844443 A:G G A 10 0.537634787606996 0.499614309252622 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122419083 C/A 1 10 1 11 4.62365212393004 0.537634787606996 4.08601733632304 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0141945240310668 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 T:C C T 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 125726048 G/C 1 14 23 37 6.47311297350206 12.3656001149609 -5.89248714145885 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0684593171722661 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725957_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000508835:exon_125725699_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125725916_125726068:SLC41A3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 126451937 G/T 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:G G T 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 128356852 C/T 1 127 105 232 58.7203819739115 56.4516526987346 2.26872927517692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.792465865651831 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 128618283 T/C 1 19 13 32 8.78493903546708 6.98925223889095 1.79568679657613 T:C T C 10 0.537634787606996 0.596845172220144 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128618130_128618304:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128618208_128618304:ACAD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 128627082 G/A 1 34 22 56 15.7204172213621 11.8279653273539 3.89245189400822 A:G G A 10 0.537634787606996 0.348602794334694 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627028_128627107:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627028_128627107:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128627028_128627467:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627028_128627107:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627028_128627107:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627028_128627107:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627028_128627107:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627028_128627107:ACAD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 128627933 C/T 1 23 16 39 10.6343998850391 8.60215660171194 2.03224328332715 T:C C T 10 0.537634787606996 0.630554836774431 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 129034578 G/A 1 77 82 159 35.6021213542613 44.0860525837737 -8.48393122951236 A:G G A 10 0.537634787606996 0.203046069263671 ENSG00000184897:ENST00000333762:exon_129033615_129035117:H1FX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 133341988 T/C 1 6 12 18 2.77419127435802 6.45161745128395 -3.67742617692593 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0991256078485629 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133341935_133342037:TOPBP1;ENSG00000163781:ENST00000513818:exon_133341935_133342037:TOPBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 137881265 T/A 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 A:T T A 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 142178144 C/T 1 16 19 35 7.39784339828806 10.2150609645329 -2.81721756624486 T:C C T 10 0.537634787606996 0.397650063326115 ENSG00000175054:ENST00000350721:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000513291:exon_142178069_142178225:ATR;ENSG00000175054:ENST00000383101:exon_142178069_142178225:ATR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 149459341 A/G 1 34 21 55 15.7204172213621 11.2903305397469 4.43008668161522 A:G A G 10 0.537634787606996 0.279371645712322 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 149468530 T/G 1 20 19 39 9.24730424786008 10.2150609645329 -0.967756716672845 T:G T G 10 0.537634787606996 0.751567535707531 ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149468465_149468638:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000469896:exon_149468290_149468638:COMMD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 16 24 40 7.39784339828806 12.9032349025679 -5.50539150427984 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0835872508973634 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 79 93 172 36.5268517790473 50.0000352474506 -13.4731834684033 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0464824862577317 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 174951756 T/C 1 12 19 31 5.54838254871605 10.2150609645329 -4.66667841581688 T:C T C 10 0.537634787606996 0.105911893174481 ENSG00000177694:ENST00000454872:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000485853:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000473253:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000316366:exon_174951721_174951994:NAALADL2;ENSG00000177694:ENST00000489299:exon_174951721_174951994:NAALADL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 179298999 C/T 1 44 33 77 20.3440693452922 17.7419479910309 2.60212135426131 T:C C T 10 0.537634787606996 0.569860196512284 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179298928_179299008:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000484312:exon_179298952_179299008:ACTL6A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 182614493 T/C 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000058063:ENST00000323116:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000433285:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000498086:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000442545:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000466758:exon_182614488_182614553:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000482070:exon_182614488_182614553:ATP11B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 182871962 C/T 1 68 33 101 31.4408344427243 17.7419479910309 13.6988864516934 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00682495197409979 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000470251:exon_182871728_182872179:LAMP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 85 59 144 39.3010430534053 31.7204524688128 7.58059058459257 C:G C G 10 0.537634787606996 0.211065624296813 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 38 33 71 17.5698780709342 17.7419479910309 -0.172069920096718 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 23 23 46 10.6343998850391 12.3656001149609 -1.73120022992182 T:C T C 10 0.537634787606996 0.658565954713003 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 184039666 A/G 1 43 54 97 19.8817041328992 29.0322785307778 -9.15057439787861 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0669773796570043 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 184429414 C/A 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 A:C C A 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 185135448 G/A 0 2225 16 2241 1028.76259757443 8.60215660171194 1020.16044097272 T:C:G G T 10 0.537634787606996 0 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 85 92 177 39.3010430534053 49.4624004598436 -10.1613574064383 A:G A G 10 0.537634787606996 0.131905035768283 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 186504407 A/G 1 49 75 124 22.6558954072572 40.3226090705247 -17.6667136632675 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.00156545800685545 ENSG00000156976:ENST00000323963:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000426808:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000425053:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000440191:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000429589:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000356531:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000396527:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000485101:exon_186503953_186507683:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000475653:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000443963:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000468362:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000492144:exon_186504291_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000465792:exon_186503865_186504434:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000475409:exon_186504280_186505053:EIF4A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 54 46 100 24.9677214692222 24.7312002299218 0.236521239300398 A:T:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 15 7 22 6.93547818589506 3.76344351324897 3.17203467264609 T:C C T 10 0.537634787606996 0.203403174234821 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 21 14 35 9.70966946025308 7.52688702649794 2.18278243375514 A:C C A 10 0.537634787606996 0.501285217969024 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 187089031 C/A 1 19 19 38 8.78493903546708 10.2150609645329 -1.43012192906585 A:C C A 10 0.537634787606996 0.74540897070384 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 189713205 T/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C T C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 82 56 138 37.9139474162263 30.1075481059918 7.80639931023455 A:C C A 10 0.537634787606996 0.200475000417652 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 16 6 22 7.39784339828806 3.22580872564198 4.17203467264609 T:C T C 10 0.537634787606996 0.08801879952772 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 16 6 22 7.39784339828806 3.22580872564198 4.17203467264609 A:G G A 10 0.537634787606996 0.08801879952772 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 194387186 C/T 1 8 1 9 3.69892169914403 0.537634787606996 3.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.043874250082235 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194387181_194387301:LSG1;ENSG00000041802:ENST00000427461:exon_194387181_194387301:LSG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 195594950 G/A 1 12 13 25 5.54838254871605 6.98925223889095 -1.4408696901749 A:G G A 10 0.537634787606996 0.689190544257236 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 17 15 32 7.86020861068107 8.06452181410494 -0.204313203423873 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 15 32 47 6.93547818589506 17.2043132034239 -10.2688350175288 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00312382366733823 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 196388407 G/A 1 86 103 189 39.7634082657983 55.3763831235206 -15.6129748577223 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0237367994607526 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 196735687 C/T 1 14 13 27 6.47311297350206 6.98925223889095 -0.516139265388892 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.849589395327245 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196735680_196735836:MFI2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 196743130 T/C 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743060_196743240:MFI2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 196743994 G/A 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163975:ENST00000296350:exon_196743974_196744161:MFI2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 196746629 T/C 1 15 5 20 6.93547818589506 2.68817393803498 4.24730424786008 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0719372839496744 ENSG00000163975:ENST00000296351:exon_196745824_196746672:MFI2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:C T C 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 197495334 G/A 1 13 18 31 6.01074776110905 9.67742617692593 -3.66667841581688 A:G G A 10 0.537634787606996 0.209584119262626 ENSG00000122068:ENST00000428738:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000494309:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000415708:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000241502:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000392374:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000412924:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000418169:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000426031:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000424384:exon_197495310_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000428395:exon_197495306_197495458:FYTTD1;ENSG00000122068:ENST00000463136:exon_197495310_197495458:FYTTD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 3 197670652 G/A 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197670628_197670922:IQCG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 515489 G/A 1 10 1 11 4.62365212393004 0.537634787606996 4.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0141945240310668 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504187:exon_515449_515750:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503111:exon_515449_516631:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506402:exon_515449_515641:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000509768:exon_515449_516632:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000506898:exon_515449_515730:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000507493:exon_515449_515730:PIGG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 517461 T/C 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 517622 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508562:exon_517248_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511247:exon_517309_517702:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_517621_517702:PIGG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 520853 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 527677 T/C 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C T C 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_524629_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_525903_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504879:exon_527607_527770:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_527421_527770:PIGG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 533001 T/C 1 14 15 29 6.47311297350206 8.06452181410494 -1.59140884060288 T:C T C 10 0.537634787606996 0.580786129565456 ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_532942_533317:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_532942_533154:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513239:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000513192:exon_532942_533314:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508144:exon_532942_533985:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000515237:exon_532942_533318:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000505800:exon_532942_533312:PIGG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 663908 A/G 1 14 14 28 6.47311297350206 7.52688702649794 -1.05377405299589 A:G A G 10 0.537634787606996 0.708696110001731 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 673772 C/T 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 T:C C T 10 0.537634787606996 0.261199351101203 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_673703_673807:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000507804:exon_673703_673807:MYL5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 858924 G/A 1 39 31 70 18.0322432833272 16.6666784158169 1.36556486751028 A:G G A 10 0.537634787606996 0.810906639440423 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_858910_859032:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_858910_859032:GAK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 882643 G/A 1 17 23 40 7.86020861068107 12.3656001149609 -4.50539150427984 A:G G A 10 0.537634787606996 0.157480961867148 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_882635_882758:GAK;ENSG00000178950:ENST00000504435:exon_879571_882758:GAK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 T:C T C 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 951947 T/C 1 19 17 36 8.78493903546708 9.13979138931893 -0.354852353851856 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1244879 A/G 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 A:G A G 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000196810:ENST00000514984:exon_1244684_1244975:C4orf42;ENSG00000196810:ENST00000357591:exon_1244177_1246616:C4orf42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1701317 G/A 1 113 109 222 52.2472690004095 58.6021918491626 -6.35492284875311 A:G G A 10 0.537634787606996 0.419389238288392 ENSG00000163950:ENST00000429429:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000489418:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000460392:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000318386:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000483348:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000488267:exon_1701291_1701428:SLBP;ENSG00000163950:ENST00000480936:exon_1701291_1701428:SLBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1729953 G/A 1 102 101 203 47.1612516640864 54.3011135483066 -7.13986188422019 A:G G A 10 0.537634787606996 0.324964013172855 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000467746:exon_1729435_1729959:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 109 92 201 50.3978081508374 49.4624004598436 0.935407690993799 A:G G A 10 0.537634787606996 0.943637219124174 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 123 90 213 56.8709211243395 48.3871308846296 8.48379023970985 A:G A G 10 0.537634787606996 0.271548157258661 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 51 56 107 23.5806258320432 30.1075481059918 -6.52692227394857 A:G G A 10 0.537634787606996 0.209103698337499 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1737502 C/T 1 29 39 68 13.4085911593971 20.9677567166728 -7.55916555727573 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0689459890296582 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737458_1737561:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1737458_1737554:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737458_1737561:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1746229 G/T 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:G G T 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746166_1746351:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 1746455 G/A 1 258 248 506 119.290224797395 133.333427326535 -14.04320252914 A:G G A 10 0.537634787606996 0.212229298080615 ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1746439_1746559:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1746439_1746559:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484264:exon_1746439_1746803:TACC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 2906707 G/T 1 44 37 81 20.3440693452922 19.8924871414589 0.451582203833325 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503169:exon_2906491_2907448:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2906491_2906835:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2906491_2906742:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2906491_2906835:ADD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 62 53 115 28.6666431683662 28.4946437431708 0.171999425195459 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 8 12 20 3.69892169914403 6.45161745128395 -2.75269575213992 A:G G A 10 0.537634787606996 0.264150080115426 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 2943361 T/C 1 68 48 116 31.4408344427243 25.8064698051358 5.63436463758846 T:C T C 10 0.537634787606996 0.306979183035405 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2943309_2943443:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2943309_2943456:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2943309_2943456:NOP14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 51 66 117 23.5806258320432 35.4838959820617 -11.9032701500185 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0325645920508411 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 154 147 301 71.2042427085226 79.0323137782284 -7.8280710697058 A:C:G C A 10 0.537634787606996 0.386012537245167 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 6619204 G/A 1 11 8 19 5.08601733632304 4.30107830085597 0.784939035467076 A:G G A 10 0.537634787606996 0.819985066606254 ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6619107_6619219:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6619107_6624128:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000510427:exon_6619175_6619219:MAN2B2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 17506042 G/A 1 10 15 25 4.62365212393004 8.06452181410494 -3.4408696901749 A:G G A 10 0.537634787606996 0.228198563346042 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000508623:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17506002_17506098:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17506002_17506098:QDPR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 25419283 T/C 1 30 39 69 13.8709563717901 20.9677567166728 -7.09680034488273 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0917765373190049 ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 37904089 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000065882:ENST00000508802:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000261439:exon_37903624_37904133:TBC1D1;ENSG00000065882:ENST00000402522:exon_37903624_37904133:TBC1D1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 38776070 C/T 1 17 19 36 7.86020861068107 10.2150609645329 -2.35485235385186 T:C C T 10 0.537634787606996 0.50463353840393 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 39302029 T/C 1 14 21 35 6.47311297350206 11.2903305397469 -4.81721756624486 T:C T C 10 0.537634787606996 0.126549583522655 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39301880_39302034:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39301936_39302034:RFC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 39303925 A/G 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 A:G A G 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39303898_39303996:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000505077:exon_39303898_39303996:RFC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 40245517 G/A 1 160 138 298 73.9784339828806 74.1936006897654 -0.215166706884816 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000168421:ENST00000505618:exon_40244798_40245615:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000381799:exon_40244798_40246281:RHOH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 40428010 T/C 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:C T C 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000163694:ENST00000319592:exon_40425272_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381793:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000381795:exon_40425284_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000510871:exon_40425698_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000295971:exon_40426355_40428160:RBM47;ENSG00000163694:ENST00000514014:exon_40427429_40428160:RBM47 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 48503730 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507873:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000503339:exon_48503640_48503750:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000512810:exon_48503640_48503750:FRYL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 53751932 C/T 1 30 29 59 13.8709563717901 15.5914088406029 -1.72045246881276 T:C C T 10 0.537634787606996 0.696220777255589 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 56756531 T/C 1 4 9 13 1.84946084957202 4.83871308846296 -2.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.16185612659808 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 57268328 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57268275_57268347:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000507648:exon_57268275_57268347:PPAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 57357630 G/C 1 44 60 104 20.3440693452922 32.2580872564198 -11.9140179111276 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0232780177328714 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57357597_57357734:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57357597_57357734:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57357597_57357731:SRP72 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 57361553 A/G 1 97 76 173 44.8494256021214 40.8602438581317 3.98918174398969 A:G A G 10 0.537634787606996 0.593672476135828 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 57843295 C/A 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 A:C C A 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 57843320 A/G 0 0 12 12 0 6.45161745128395 -6.45161745128395 G A G 10 0.537634787606996 9.54600840399969e-05 ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57842608_57844989:C4orf14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 69203080 T/C 1 46 43 89 21.2687997700782 23.1182958671008 -1.84949609702265 T:C T C 10 0.537634787606996 0.750071472238165 ENSG00000083896:ENST00000344157:exon_69202745_69203168:YTHDC1;ENSG00000083896:ENST00000355665:exon_69202745_69203168:YTHDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 17 24 41 7.86020861068107 12.9032349025679 -5.04302629188684 A:G G A 10 0.537634787606996 0.119866461502604 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 76857309 C/T 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 T:C C T 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 T:C C T 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 76878688 G/A 1 54 39 93 24.9677214692222 20.9677567166728 3.99996475254937 A:G G A 10 0.537634787606996 0.466849215801513 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 77055474 A/G 1 7 11 18 3.23655648675103 5.91398266367696 -2.67742617692593 A:G A G 10 0.537634787606996 0.241209079822295 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77055328_77055515:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77055329_77055515:NUP54 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 77057501 A/G 1 4 11 15 1.84946084957202 5.91398266367696 -4.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0401081696281839 ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77057339_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77057341_77057565:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77057474_77057565:NUP54 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 77065580 T/C 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514307:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000506098:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510569:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000510884:exon_77065543_77065626:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77065543_77065626:NUP54 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 77069474 G/A 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000138750:ENST00000507257:exon_77069461_77069569:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000264883:exon_77069461_77069668:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000458189:exon_77069461_77069655:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000342467:exon_77069461_77069655:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000502850:exon_77069461_77069558:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514987:exon_77069461_77069550:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000512151:exon_77069461_77069550:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000420322:exon_77069461_77069655:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000504173:exon_77069461_77069597:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000515460:exon_77069461_77069530:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000508583:exon_77069461_77069587:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000514901:exon_77069461_77069551:NUP54;ENSG00000138750:ENST00000513352:exon_77069461_77069550:NUP54 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 83795806 T/C 1 14 9 23 6.47311297350206 4.83871308846296 1.63439988503909 T:C T C 10 0.537634787606996 0.536978589431628 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83795764_83795904:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83795764_83795904:SEC31A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 95197520 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000163104:ENST00000359052:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000457823:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000510105:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000354268:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000394961:exon_95197490_95197625:SMARCAD1;ENSG00000163104:ENST00000509418:exon_95197490_95197625:SMARCAD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 102751076 G/A 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102750965_102751363:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102750965_102751363:BANK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 102839287 G/A 1 9 5 14 4.16128691153704 2.68817393803498 1.47311297350206 A:G G A 10 0.537634787606996 0.593878266027028 ENSG00000153064:ENST00000504592:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000322953:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000428908:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000508653:exon_102839150_102839346:BANK1;ENSG00000153064:ENST00000444316:exon_102839150_102839346:BANK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 103225513 T/C 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 T:C T C 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103225474_103225638:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512337:exon_103225474_103225645:SLC39A8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 103228734 C/T 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000138821:ENST00000424970:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000356736:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000394833:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000510255:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000512657:exon_103228593_103228762:SLC39A8;ENSG00000138821:ENST00000502903:exon_103228714_103228762:SLC39A8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 104059542 G/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104059508_104059606:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104059508_104059609:CENPE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 104066461 A/G 1 32 37 69 14.7956867965761 19.8924871414589 -5.09680034488272 A:G A G 10 0.537634787606996 0.229050341361418 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000515478:exon_104066460_104066491:CENPE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 104102563 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104102494_104102613:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000509120:exon_104102494_104103120:CENPE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 107249244 C/G 1 99 91 190 45.7741560269074 48.9247656722366 -3.15060964532925 C:G C G 10 0.537634787606996 0.662896090208215 ENSG00000164022:ENST00000510207:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107249233_107249400:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107249233_107249400:AIMP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 110384790 A/G 1 7 1 8 3.23655648675103 0.537634787606996 2.69892169914403 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0765265846100734 ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110384057_110384800:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110384057_110384800:SEC24B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 159 147 306 73.5160687704876 79.0323137782284 -5.51624500774078 A:T A T 10 0.537634787606996 0.528906725033181 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 113 90 203 52.2472690004095 48.3871308846296 3.86013811577981 A:G A G 10 0.537634787606996 0.622434316183483 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113350415 C/T 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:C C T 10 0.537634787606996 0.300163849932424 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 A:G G A 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113352628 A/G 1 6 14 20 2.77419127435802 7.52688702649794 -4.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0422425154462778 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113352899 G/A 1 7 8 15 3.23655648675103 4.30107830085597 -1.06452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 0.613543744758255 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 21 14 35 9.70966946025308 7.52688702649794 2.18278243375514 T:C T C 10 0.537634787606996 0.501285217969024 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113360925 G/A 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113360842_113361028:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113360842_113361028:ALPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:G A G 10 0.537634787606996 0.40524896228547 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 113468564 C/T 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000138658:ENST00000505019:exon_113468441_113468564:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000445413:exon_113468441_113468564:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000313239:exon_113468441_113468564:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000506675:exon_113468441_113468564:C4orf21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 9 15 24 4.16128691153704 8.06452181410494 -3.90323490256791 A:C A C 10 0.537634787606996 0.150610778150999 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 129913345 G/A 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 A:G G A 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000434680:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000503215:exon_129913322_129913392:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129913322_129913392:SCLT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 130030644 C/T 1 20 9 29 9.24730424786008 4.83871308846296 4.40859115939711 T:C C T 10 0.537634787606996 0.135169321383582 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 130032843 A/G 1 13 16 29 6.01074776110905 8.60215660171194 -2.59140884060288 A:G A G 10 0.537634787606996 0.356797644500513 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:C T C 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 13 13 26 6.01074776110905 6.98925223889095 -0.978504477781897 T:C C T 10 0.537634787606996 0.699994963282250 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 146576418 G/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 C:G G C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000151611:ENST00000281317:exon_146576299_146581187:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000511969:exon_146576299_146576720:MMAA;ENSG00000151611:ENST00000503730:exon_146576299_146576646:MMAA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 154479430 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154479410_154479520:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000462540:exon_154479410_154479923:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154479410_154479520:KIAA0922 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 164085425 T/C 1 11 7 18 5.08601733632304 3.76344351324897 1.32257382307407 T:C T C 10 0.537634787606996 0.639353164025908 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 177249533 A/G 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177249349_177253396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177249349_177249557:SPCS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 184366145 C/T 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000168564:ENST00000504169:exon_184365744_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000302350:exon_184365788_184366222:CDKN2AIP;ENSG00000168564:ENST00000510928:exon_184365850_184366222:CDKN2AIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 184572218 G/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510968:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000512740:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184572137_184572284:RWDD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 184615117 A/C 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184615070_184615191:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184615070_184615191:C4orf41 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 62 56 118 28.6666431683662 30.1075481059918 -1.44090493762553 T:C C T 10 0.537634787606996 0.85361128401071 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 185686065 G/A 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 A:G G A 10 0.537634787606996 0.829141081785639 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000503407:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185686007_185686079:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185686007_185686079:ACSL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 24 17 41 11.0967650974321 9.13979138931893 1.95697370811316 A:G G A 10 0.537634787606996 0.639099262185329 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 69 78 147 31.9031996551173 41.9355134333457 -10.0323137782284 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0987299282623278 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 52 48 100 24.0429910444362 25.8064698051358 -1.7634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.763881342733628 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 231111 T/C 1 69 66 135 31.9031996551173 35.4838959820617 -3.58069632694446 T:C T C 10 0.537634787606996 0.54676724404473 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_231031_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_230991_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_231058_231115:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_231058_231115:SDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 101 101 202 46.6988864516934 54.3011135483066 -7.60222709661319 A:C:G C G 10 0.537634787606996 0.290517004184854 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 226 114 340 104.494538000819 61.2903657871975 43.2041722136214 A:G G A 10 0.537634787606996 2.57844896885597e-06 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 220 112 332 101.720346726461 60.2150962119835 41.5052505144773 A:G G A 10 0.537634787606996 4.44126474300062e-06 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 311478 T/C 1 146 127 273 67.5053210093786 68.2796180260885 -0.774297016709923 T:C T C 10 0.537634787606996 0.951629166343804 ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_311408_311609:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_311408_312526:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507473:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000511482:exon_311408_311517:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000512466:exon_308312_311517:PDCD6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 434981 G/C 1 19 19 38 8.78493903546708 10.2150609645329 -1.43012192906585 C:G G C 10 0.537634787606996 0.74540897070384 ENSG00000063438:ENST00000316418:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000443907:exon_433968_438406:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000512529:exon_433968_435008:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000506456:exon_433968_435225:AHRR;ENSG00000063438:ENST00000507048:exon_433968_435224:AHRR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 32 27 59 14.7956867965761 14.5161392653889 0.279547531187236 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 20 13 33 9.24730424786008 6.98925223889095 2.25805200896913 T:C C T 10 0.537634787606996 0.48755118744603 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 5463668 C/T 1 2 8 10 0.924730424786008 4.30107830085597 -3.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0521780855970265 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 6600150 G/A 1 146 124 270 67.5053210093786 66.6667136632675 0.838607346111075 A:G G A 10 0.537634787606996 0.95136335702611 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6600143_6600345:NSUN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 6604787 C/T 1 56 39 95 25.8924518940082 20.9677567166728 4.92469517733538 T:C C T 10 0.537634787606996 0.354604055751593 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6604718_6604995:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000514127:exon_6604718_6604798:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000502932:exon_6604718_6604821:NSUN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 6605532 C/A 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 A:C C A 10 0.537634787606996 0.40395764321088 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 6623354 C/T 1 24 19 43 11.0967650974321 10.2150609645329 0.881704132899172 T:C C T 10 0.537634787606996 0.878817482439178 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6623327_6623398:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505264:exon_6623327_6623398:NSUN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 6633779 C/G 1 7 9 16 3.23655648675103 4.83871308846296 -1.60215660171194 C:G C G 10 0.537634787606996 0.460514092364166 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 7897319 G/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 26 17 43 12.0214955222181 9.13979138931893 2.88170413289917 T:C T C 10 0.537634787606996 0.445316834524763 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 32403346 C/T 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32403211_32403502:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32403211_32403502:ZFR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 33462034 G/A 1 96 62 158 44.3870603897284 33.3333568316338 11.0537035580946 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0796490842080867 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 33998768 C/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:C C A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 A:G A G 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 43175103 C/T 1 4 9 13 1.84946084957202 4.83871308846296 -2.98925223889095 T:C C T 10 0.537634787606996 0.16185612659808 ENSG00000172262:ENST00000510026:exon_43174549_43175836:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509156:exon_43174549_43175390:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000306938:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000399534:exon_43174549_43175821:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000505606:exon_43174549_43176342:ZNF131;ENSG00000172262:ENST00000509634:exon_43174549_43176349:ZNF131 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 44809162 G/C 1 28 21 49 12.9462259470041 11.2903305397469 1.6558954072572 C:G G C 10 0.537634787606996 0.669607584542965 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 44809408 T/A 1 37 27 64 17.1075128585411 14.5161392653889 2.59137359315226 A:T T A 10 0.537634787606996 0.533621319664643 ENSG00000112996:ENST00000507110:exon_44809027_44809665:MRPS30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 52096889 C/A 1 33 26 59 15.2580520089691 13.9785044777819 1.27954753118724 A:C C A 10 0.537634787606996 0.79471613364932 ENSG00000152684:ENST00000274311:exon_52095719_52096954:PELO;ENSG00000152684:ENST00000381463:exon_52095956_52096954:PELO HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 9 16 25 4.16128691153704 8.60215660171194 -4.4408696901749 C:G G C 10 0.537634787606996 0.106777127582249 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 84 72 156 38.8386778410123 38.7097047077037 0.128973133308619 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 55246001 A/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 55 59 114 25.4300866816152 31.7204524688128 -6.29036578719755 C:G C G 10 0.537634787606996 0.259895880428278 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 65108215 A/G 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:G A G 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65108082_65108218:NLN;ENSG00000123213:ENST00000509935:exon_65108082_65108218:NLN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 9 20 29 4.16128691153704 10.7526957521399 -6.59140884060289 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0154339888013786 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 41 40 81 18.9569737081132 21.5053915042798 -2.54841779616668 T:G G T 10 0.537634787606996 0.579336267277436 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 68531253 C/T 1 21 13 34 9.70966946025308 6.98925223889095 2.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.392789340374168 ENSG00000134058:ENST00000506563:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512687:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000256443:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515391:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000512985:exon_68531221_68531322:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000515180:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000506789:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000510106:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000514676:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000504147:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000508726:exon_68531221_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000502604:exon_68530944_68531280:CDK7;ENSG00000134058:ENST00000513629:exon_68530970_68531280:CDK7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 17 15 32 7.86020861068107 8.06452181410494 -0.204313203423873 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 A:T T A 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 C:G C G 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 2 11 13 0.924730424786008 5.91398266367696 -4.98925223889095 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00918547301519994 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 21 24 45 9.70966946025308 12.9032349025679 -3.19356544231482 T:C C T 10 0.537634787606996 0.371557212278348 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 25 24 49 11.5591303098251 12.9032349025679 -1.3441045927428 A:T A T 10 0.537634787606996 0.774944644411224 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 72184098 C/T 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000083312:ENST00000337273:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000454282:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000415341:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000523768:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000396346:exon_72183954_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000447967:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000506351:exon_72183905_72184130:TNPO1;ENSG00000083312:ENST00000519220:exon_72184065_72184130:TNPO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 756 725 1481 349.548100569111 389.785221015072 -40.2371204459611 A:T:C:G A G 10 0.537634787606996 0.0370794417597029 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 72868447 T/C 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72868314_72868449:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000512550:exon_72868314_72868449:UTP15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 74017499 C/T 1 31 17 48 14.3333215841831 9.13979138931893 5.19353019486419 T:C C T 10 0.537634787606996 0.148705357519806 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74017029_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74017031_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74017083_74017608:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000515125:exon_74017098_74017608:GFM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 74037386 T/A 1 13 2 15 6.01074776110905 1.07526957521399 4.93547818589506 A:T T A 10 0.537634787606996 0.0165620817545884 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000427854:exon_74037354_74037434:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000513331:exon_74037354_74037673:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509097:exon_74037354_74037434:GFM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 116 198 314 53.6343646375885 106.451687946185 -52.8173233085968 C:G C G 10 0.537634787606996 2.84237255078375e-09 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 74065177 A/G 1 133 357 490 61.4945732482695 191.935619175698 -130.441045927428 A:C:G A G 10 0.537634787606996 7.81865545642544e-33 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74065039_74065189:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74065039_74065379:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74065039_74065189:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000515524:exon_74065123_74065189:NSA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 262 337 599 121.139685646967 181.182923423558 -60.0432377765906 A:G A G 10 0.537634787606996 1.00332783817095e-06 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 74998606 G/A 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 76342388 G/A 1 13 5 18 6.01074776110905 2.68817393803498 3.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155898486841443 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76342172_76342502:AGGF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 8 14 22 3.69892169914403 7.52688702649794 -3.82796532735391 A:C C A 10 0.537634787606996 0.133573031276560 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 12 18 30 5.54838254871605 9.67742617692593 -4.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.145192067224671 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 51 40 91 23.5806258320432 21.5053915042798 2.07523432776336 A:G A G 10 0.537634787606996 0.675770278456471 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 77473165 A/G 1 9 11 20 4.16128691153704 5.91398266367696 -1.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.504106387864749 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77473163_77473260:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77473163_77473260:AP3B1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 79950512 A/G 1 7 1 8 3.23655648675103 0.537634787606996 2.69892169914403 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0765265846100734 ENSG00000228716:ENST00000439211:exon_79950223_79950802:DHFR;ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_79950467_79950783:MSH3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 24 31 55 11.0967650974321 16.6666784158169 -5.56991331838478 A:G G A 10 0.537634787606996 0.138699911961275 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 82500734 G/T 1 34 26 60 15.7204172213621 13.9785044777819 1.74191274358024 T:C:G G T 10 0.537634787606996 0.698882913897192 ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000514538:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82500634_82500740:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000509268:exon_82500634_82500740:XRCC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 89703641 C/G 1 58 29 87 26.8171823187942 15.5914088406029 11.2257734781913 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0176520848425831 ENSG00000153140:ENST00000283122:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522083:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522864:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000518458:exon_89703516_89703647:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522565:exon_89703516_89703651:CETN3;ENSG00000153140:ENST00000522842:exon_89703516_89703651:CETN3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 95234350 A/G 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 A:G A G 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 14 4 18 6.47311297350206 2.15053915042798 4.32257382307407 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0563281922879415 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 95236415 G/A 1 14 15 29 6.47311297350206 8.06452181410494 -1.59140884060288 A:G G A 10 0.537634787606996 0.580786129565456 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 95236459 C/T 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000504288:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000513343:exon_95236397_95236484:ELL2;ENSG00000118985:ENST00000505584:exon_95235932_95236484:ELL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96112083 T/G 1 15 11 26 6.93547818589506 5.91398266367696 1.0214955222181 T:G T G 10 0.537634787606996 0.844575818070943 ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96110188_96112255:ERAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96118866 C/T 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96118755_96118939:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96118755_96118939:ERAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96122210 C/T 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 T:C C T 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96122174_96122253:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507859:exon_96122174_96122253:ERAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96127833 G/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G G A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96127764_96127895:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503311:exon_96127764_96127895:ERAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96232142 T/A 0 31 0 31 14.3333215841831 0 14.3333215841831 T T 10 0.537634787606996 5.94186745660387e-09 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96232077_96232208:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96232107_96232208:ERAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96237326 G/A 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 G G 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96237210_96237385:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96237210_96237385:ERAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96245343 C/T 1 35 5 40 16.1827824337551 2.68817393803498 13.4946084957202 T:C C T 10 0.537634787606996 8.6446001370794e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 45 11 56 20.8064345576852 5.91398266367696 14.8924518940082 T:C C T 10 0.537634787606996 4.26593691811478e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 44 2 46 20.3440693452922 1.07526957521399 19.2687997700782 T:C C T 10 0.537634787606996 4.48398237445474e-10 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 96513471 G/C 1 12 10 22 5.54838254871605 5.37634787606996 0.172034672646087 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 108672946 C/T 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 T:C C T 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108670410_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108670411_108673057:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108670411_108673057:PJA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 108713970 C/T 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 110456704 A/T 1 14 11 25 6.47311297350206 5.91398266367696 0.5591303098251 A:T A T 10 0.537634787606996 0.844336813679508 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456694_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456697_110456839:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456694_110456839:WDR36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 111066697 T/C 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 T:C T C 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000513100:exon_111066629_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000504018:exon_111066651_111066743:C5orf13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 112257908 T/C 1 14 16 30 6.47311297350206 8.60215660171194 -2.12904362820988 T:C T C 10 0.537634787606996 0.467935176210095 ENSG00000129625:ENST00000379638:exon_112257770_112258236:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000513339:exon_112257770_112257924:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000511865:exon_112257770_112257927:REEP5;ENSG00000129625:ENST00000504247:exon_112257770_112257986:REEP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 26 19 45 12.0214955222181 10.2150609645329 1.80643455768518 A:G A G 10 0.537634787606996 0.655035280486387 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 128430757 T/C 1 10 14 24 4.62365212393004 7.52688702649794 -2.9032349025679 T:C T C 10 0.537634787606996 0.30623055932798 ENSG00000066583:ENST00000506986:exon_128430529_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000173527:exon_128430444_128430768:ISOC1;ENSG00000066583:ENST00000513879:exon_128430530_128430768:ISOC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 28 17 45 12.9462259470041 9.13979138931893 3.80643455768518 T:C T C 10 0.537634787606996 0.296283990492771 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 132099999 A/G 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 A:G A G 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000164402:ENST00000378719:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378721:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000296873:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000412572:exon_132099951_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000448933:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378706:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378699:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000378701:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000458488:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371478:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000453480:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000414594:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000371493:exon_132099916_132100111:SEPT8;ENSG00000164402:ENST00000481794:exon_132099653_132100111:SEPT8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 133451683 C/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:C C A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000081059:ENST00000342854:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000334185:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000321603:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000340914:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000321584:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000378564:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000361590:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000432532:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000395029:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000518887:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000522653:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000517851:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000521639:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000522375:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000378560:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000520958:exon_133451301_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000518915:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000395023:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000519447:exon_133451600_133451777:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000517741:exon_133451350_133451777:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000395021:exon_133451600_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000519165:exon_133451602_133451724:TCF7;ENSG00000081059:ENST00000520652:exon_133451647_133451724:TCF7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 133956668 G/A 1 15 6 21 6.93547818589506 3.22580872564198 3.70966946025308 A:G G A 10 0.537634787606996 0.126802656559472 ENSG00000152700:ENST00000402673:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000507419:exon_133956623_133956691:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000394992:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000282606:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000439578:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000503318:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000505758:exon_133956623_133956742:SAR1B;ENSG00000152700:ENST00000502286:exon_133956623_133956742:SAR1B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 134044450 C/T 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 T:C C T 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000113615:ENST00000398844:exon_134044403_134044578:SEC24A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 134223593 A/G 1 35 29 64 16.1827824337551 15.5914088406029 0.591373593152255 A:G A G 10 0.537634787606996 0.900981337630267 ENSG00000113621:ENST00000441965:exon_134223465_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000358387:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000506916:exon_134223391_134223752:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000507024:exon_134223385_134223872:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508810:exon_134223385_134223870:TXNDC15;ENSG00000113621:ENST00000508779:exon_134223385_134223872:TXNDC15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 138362520 C/T 1 33 30 63 15.2580520089691 16.1290436282099 -0.870991619240749 T:C C T 10 0.537634787606996 0.89961399183648 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138362490_138362681:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138362490_138362681:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138362490_138362681:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000503732:exon_138362490_138362681:SIL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 138760701 T/G 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 T:G T G 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000170464:ENST00000302060:exon_138760694_138760803:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000508445:exon_138760694_138760803:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000514052:exon_138760694_138760737:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000507405:exon_138760694_138760803:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000505568:exon_138760694_138760803:DNAJC18;ENSG00000170464:ENST00000506870:exon_138760694_138760803:DNAJC18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 138856982 C/T 0 9 0 9 4.16128691153704 0 4.16128691153704 C C 10 0.537634787606996 0.00471882013301929 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138856914_138857100:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138856953_138857100:TMEM173 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 138857925 C/G 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 C:G C G 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 138861078 C/T 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138860375_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138861063_138861214:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514119:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000515507:exon_138861063_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511850:exon_138860744_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502362:exon_138860831_138861289:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000514348:exon_138861004_138861289:TMEM173 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 139574050 G/A 1 110 70 180 50.8601733632304 37.6344351324897 13.2257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.051840548033393 ENSG00000120306:ENST00000261811:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000509589:exon_139574031_139574237:C5orf32;ENSG00000120306:ENST00000504227:exon_139574031_139574237:C5orf32 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 140023238 C/G 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 C:G C G 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000113119:ENST00000394671:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000252100:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000510336:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509605:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000515265:exon_140023149_140023260:TMCO6;ENSG00000113119:ENST00000509269:exon_140022948_140023260:TMCO6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 10 9 19 4.62365212393004 4.83871308846296 -0.215060964532925 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 140048544 C/T 1 19 6 25 8.78493903546708 3.22580872564198 5.5591303098251 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0275084042247457 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048476_140048833:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048476_140048575:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140048506_140048575:WDR55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 140057535 G/A 1 60 49 109 27.7419127435802 26.3441045927428 1.39780815083743 A:G G A 10 0.537634787606996 0.847819284716913 ENSG00000170445:ENST00000504156:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000457527:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000431330:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000504366:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000307633:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000448240:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000438307:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000415192:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000512655:exon_140057493_140057600:HARS;ENSG00000170445:ENST00000506579:exon_140057240_140058712:HARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 140857798 T/C 1 3 8 11 1.38709563717901 4.30107830085597 -2.91398266367696 T:C T C 10 0.537634787606996 0.127234760608112 ENSG00000240184:ENST00000308177:exon_140855580_140858113:PCDHGC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 141309824 G/A 1 24 25 49 11.0967650974321 13.4408696901749 -2.3441045927428 A:G G A 10 0.537634787606996 0.567289019660077 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309743_141309839:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000502729:exon_141309812_141309839:KIAA0141 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 145499996 C/T 1 94 91 185 43.4623299649424 48.9247656722366 -5.46243570729426 T:C C T 10 0.537634787606996 0.461025103199179 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145499934_145500066:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145499934_145500066:LARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 145508340 A/G 1 53 47 100 24.5053562568292 25.2688350175288 -0.763478760699599 A:G A G 10 0.537634787606996 0.920246374928411 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508235_145508345:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508235_145508345:LARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 145519821 G/A 1 33 31 64 15.2580520089691 16.6666784158169 -1.40862640684774 A:G G A 10 0.537634787606996 0.80229149044817 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145519767_145519824:LARS;ENSG00000133706:ENST00000512412:exon_145519767_145519824:LARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 145523105 G/A 1 20 22 42 9.24730424786008 11.8279653273539 -2.58066107949383 A:G G A 10 0.537634787606996 0.442745837417781 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000514104:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000504323:exon_145522975_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508667:exon_145522807_145523113:LARS;ENSG00000133706:ENST00000507095:exon_145523050_145523113:LARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 145539996 T/G 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 T:G T G 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145539937_145540049:LARS;ENSG00000133706:ENST00000511505:exon_145539937_145540049:LARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 145890169 C/T 1 61 52 113 28.2042779559732 27.9570089555638 0.24726900040945 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145890004_145891524:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145890004_145890586:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145890004_145891071:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000511077:exon_145890004_145891068:TCERG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 12 4 16 5.54838254871605 2.15053915042798 3.39784339828806 T:C T C 10 0.537634787606996 0.130574356205338 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 149776232 C/T 1 95 85 180 43.9246951773354 45.6989569465947 -1.77426176925928 T:C C T 10 0.537634787606996 0.822712858188947 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149775845_149776405:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149775845_149776405:TCOF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 149782704 C/T 1 95 38 133 43.9246951773354 20.4301219290658 23.4945732482695 T:C C T 10 0.537634787606996 3.74968354345052e-05 ENSG00000019582:ENST00000518797:exon_149782684_149782875:CD74;ENSG00000019582:ENST00000009530:exon_149782684_149782875:CD74;ENSG00000019582:ENST00000523208:exon_149782684_149782875:CD74 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 150512740 G/A 1 295 244 539 136.397737655936 131.182888176107 5.21484947982916 A:G G A 10 0.537634787606996 0.665932144517734 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150512655_150512748:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517707:exon_150512655_150512884:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150512655_150512748:ANXA6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 150518988 G/A 1 208 179 387 96.1719641777448 96.2366269816523 -0.064662803907467 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517486:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000519644:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517677:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521749:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000517757:exon_150518914_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000520378:exon_150518239_150519008:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523164:exon_150518914_150519008:ANXA6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 12 20 32 5.54838254871605 10.7526957521399 -5.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0762348824813531 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 151043103 G/C 1 45 18 63 20.8064345576852 9.67742617692593 11.1290083807593 C:G G C 10 0.537634787606996 0.00516240625971582 ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151040657_151043160:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000520687:exon_151042049_151043160:SPARC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 154275786 G/A 1 11 18 29 5.08601733632304 9.67742617692593 -4.59140884060288 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0957903136658136 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 154282235 T/C 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154282099_154282236:GEMIN5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 154346259 A/G 1 125 115 240 57.7956515491255 61.8280005748045 -4.03234902567904 A:G A G 10 0.537634787606996 0.605207594129592 ENSG00000082515:ENST00000523037:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000265229:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000439747:exon_154346246_154346526:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000522038:exon_154346246_154348971:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000342738:exon_154346246_154346528:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000519059:exon_154346246_154346453:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000520040:exon_154346246_154346505:MRPL22;ENSG00000082515:ENST00000518364:exon_154346246_154346531:MRPL22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 36 21 57 16.6451476461481 11.2903305397469 5.35481710640123 T:C T C 10 0.537634787606996 0.183981105649963 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 158204425 A/G 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 A A 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 ENSG00000164330:ENST00000519890:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000519739:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000518836:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000313708:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000380654:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000517373:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000522192:exon_158204421_158204547:EBF1;ENSG00000164330:ENST00000523464:exon_158204421_158204547:EBF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 159912418 C/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 C:G C G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 167937607 G/A 1 79 74 153 36.5268517790473 39.7849742829177 -3.25812250387039 A:G G A 10 0.537634787606996 0.626981562834097 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 169021610 C/T 1 12 20 32 5.54838254871605 10.7526957521399 -5.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0762348824813531 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000510751:exon_169021575_169021685:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000505977:exon_169021575_169021685:CCDC99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 169028481 T/C 1 16 28 44 7.39784339828806 15.0537740529959 -7.65593065470782 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0231117317495389 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 169031150 T/C 1 23 34 57 10.6343998850391 18.2795827786379 -7.64518289359877 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0464001071805437 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 169031218 G/T 1 17 24 41 7.86020861068107 12.9032349025679 -5.04302629188684 T:G G T 10 0.537634787606996 0.119866461502604 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169031064_169031782:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169031064_169031779:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169031064_169031776:CCDC99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 169435713 A/C 1 34 31 65 15.7204172213621 16.6666784158169 -0.94626119445474 A:C A C 10 0.537634787606996 0.901133370334336 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169435692_169435750:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169435692_169435750:DOCK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 175772208 C/T 1 8 13 21 3.69892169914403 6.98925223889095 -3.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.189499969831395 ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175772186_175772569:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175772186_175772994:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175772186_175772992:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175772186_175772988:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175772186_175772992:C5orf25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176081907 C/T 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000048140:ENST00000310032:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000405525:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000514705:exon_176079744_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000508164:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000504168:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000503045:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000515708:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000507471:exon_176081896_176082021:TSPAN17;ENSG00000048140:ENST00000414405:exon_176081380_176082021:TSPAN17 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176382995 G/A 1 9 6 15 4.16128691153704 3.22580872564198 0.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.79707128563146 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176382960_176383036:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176382960_176383036:UIMC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176721198 T/C 1 15 14 29 6.93547818589506 7.52688702649794 -0.591408840602884 T:C T C 10 0.537634787606996 0.854036703051874 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176720833_176727216:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176720833_176722763:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176720833_176727211:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176720833_176727211:NSD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 260 204 464 120.214955222181 109.677496671827 10.5374585503538 A:G A G 10 0.537634787606996 0.328736825452065 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 311 255 566 143.795581054224 137.096870839784 6.69871021444027 A:T:C T C 10 0.537634787606996 0.58388966416543 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 85 70 155 39.3010430534053 37.6344351324897 1.66660792091562 C:G G C 10 0.537634787606996 0.80947539426564 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 52 28 80 24.0429910444362 15.0537740529959 8.98921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0442036484407813 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 21 28 49 9.70966946025308 15.0537740529959 -5.3441045927428 T:C T C 10 0.537634787606996 0.151562947180737 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 21 27 48 9.70966946025308 14.5161392653889 -4.80646980513581 T:C C T 10 0.537634787606996 0.192701617941440 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 2397 1 2398 1108.28941410603 0.537634787606996 1107.75177931842 A:T T A 10 0.537634787606996 0 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 177547336 G/A 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000145911:ENST00000274605:exon_177547179_177547700:N4BP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 178140090 C/T 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000169131:ENST00000335815:exon_178138593_178140622:ZNF354A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 179291128 C/T 1 34 19 53 15.7204172213621 10.2150609645329 5.50535625682921 T:C C T 10 0.537634787606996 0.167742242118896 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 5 180651383 C/T 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 T:C C T 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 18 89 107 8.32257382307407 47.8494960970226 -39.5269222739486 A:G G A 10 0.537634787606996 3.98967965634937e-15 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 564145 A/G 1 9 1 10 4.16128691153704 0.537634787606996 3.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0250094113950346 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_564033_564154:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_564033_564154:EXOC2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 20 28 48 9.24730424786008 15.0537740529959 -5.80646980513581 A:G A G 10 0.537634787606996 0.110889470500708 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 2784571 G/A 1 19 7 26 8.78493903546708 3.76344351324897 5.0214955222181 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0509951335840506 ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 2838851 G/A 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000021355:ENST00000380739:exon_2838783_2838920:SERPINB1;ENSG00000021355:ENST00000490094:exon_2838783_2838920:SERPINB1;ENSG00000021355:ENST00000476896:exon_2838783_2838920:SERPINB1;ENSG00000021355:ENST00000460260:exon_2838783_2838920:SERPINB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 3010390 C/T 1 9 12 21 4.16128691153704 6.45161745128395 -2.29033053974692 T:C C T 10 0.537634787606996 0.383362950545768 ENSG00000124588:ENST00000426637:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380441:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380454:exon_3010259_3010423:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3010259_3010423:NQO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 3015790 A/G 1 9 2 11 4.16128691153704 1.07526957521399 3.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0736764045328896 ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 11185361 C/T 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 13612048 C/T 1 31 24 55 14.3333215841831 12.9032349025679 1.43008668161522 T:C C T 10 0.537634787606996 0.787195565734732 ENSG00000124523:ENST00000379250:exon_13612022_13612524:SIRT5;ENSG00000124523:ENST00000359782:exon_13612022_13612520:SIRT5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 13616712 A/T 1 121 115 236 55.9461906995535 61.8280005748045 -5.88180987525106 A:T A T 10 0.537634787606996 0.472811679882772 ENSG00000225921:ENST00000451315:exon_13616695_13616753:NOL7;ENSG00000225921:ENST00000420088:exon_13616695_13616753:NOL7;ENSG00000225921:ENST00000474485:exon_13616695_13616753:NOL7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 13801615 T/C 1 47 34 81 21.7311649824712 18.2795827786379 3.45158220383333 T:C T C 10 0.537634787606996 0.504082780191207 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13801520_13801621:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13801520_13801621:CCDC90A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 13814340 T/C 1 31 22 53 14.3333215841831 11.8279653273539 2.50535625682921 T:C T C 10 0.537634787606996 0.58205783148814 ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13814247_13814800:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13814247_13814800:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000359495:exon_13814247_13814789:CCDC90A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 14131804 G/A 1 74 66 140 34.2150257170823 35.4838959820617 -1.26887026497944 A:G G A 10 0.537634787606996 0.865541701438074 ENSG00000112149:ENST00000379153:exon_14131751_14131979:CD83 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 21201493 G/A 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21201341_21201505:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000476517:exon_21201341_21201505:CDKAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 24403455 C/T 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24403153_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24403182_24403464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24403420_24403464:MRS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 24418348 G/A 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418312_24418464:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418312_24418395:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418312_24418464:MRS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 24418786 T/C 1 14 18 32 6.47311297350206 9.67742617692593 -3.20431320342387 T:C T C 10 0.537634787606996 0.289546690751015 ENSG00000124532:ENST00000443868:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000274747:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378386:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000378353:exon_24418689_24418806:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000483634:exon_24418689_24419469:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000465103:exon_24418689_24418791:MRS2;ENSG00000124532:ENST00000446191:exon_24418689_24418789:MRS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 24653376 G/A 1 22 16 38 10.1720346726461 8.60215660171194 1.56987807093415 A:G G A 10 0.537634787606996 0.629981554630404 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 25967068 C/T 1 22 16 38 10.1720346726461 8.60215660171194 1.56987807093415 T:C C T 10 0.537634787606996 0.629981554630404 ENSG00000112343:ENST00000349458:exon_25966563_25967161:TRIM38;ENSG00000112343:ENST00000357085:exon_25966744_25967161:TRIM38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26027433 G/A 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 A:G G A 10 0.537634787606996 0.829141081785639 ENSG00000124529:ENST00000377364:exon_26027124_26027480:HIST1H4B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26056072 G/C 1 81 73 154 37.4515822038333 39.2473394953107 -1.79575729147739 C:G G C 10 0.537634787606996 0.808605943975561 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 88 49 137 40.6881386905844 26.3441045927428 14.3440340978415 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0161464958623009 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26184041 A/G 1 2 8 10 0.924730424786008 4.30107830085597 -3.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0521780855970265 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26184102 G/A 1 12 4 16 5.54838254871605 2.15053915042798 3.39784339828806 A:G G A 10 0.537634787606996 0.130574356205338 ENSG00000197697:ENST00000356530:exon_26183958_26184454:HIST1H2BE HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26189312 C/G 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 C:G C G 10 0.537634787606996 0.564673248580388 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26199222 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26199822 A/G 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000197846:ENST00000359985:exon_26199748_26200942:HIST1H2BF HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26216656 T/C 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26234748 C/A 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 A:C C A 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26234883 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26234952 A/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000124575:ENST00000244534:exon_26234440_26235216:HIST1H1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26240649 C/T 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000198327:ENST00000377745:exon_26240561_26240976:HIST1H4F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26285503 C/T 1 20 14 34 9.24730424786008 7.52688702649794 1.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.608615359283045 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 38 47 85 17.5698780709342 25.2688350175288 -7.69895694659466 T:C T C 10 0.537634787606996 0.102909554467311 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26370660 G/A 1 26 43 69 12.0214955222181 23.1182958671008 -11.0968003448827 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00781975537877323 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26374549 T/C 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 T:C T C 10 0.537634787606996 0.561464717515668 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 116 97 213 53.6343646375885 52.1505743978786 1.48379023970985 A:G G A 10 0.537634787606996 0.890736782407963 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 24 24 48 11.0967650974321 12.9032349025679 -1.80646980513581 A:G A G 10 0.537634787606996 0.664883231073284 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 36 30 66 16.6451476461481 16.1290436282099 0.516104017938261 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 26598798 G/A 1 59 49 108 27.2795475311872 26.3441045927428 0.935442938444428 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.92319728975773 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598493_26600278:ABT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 A:C C A 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 32 33 65 14.7956867965761 17.7419479910309 -2.94626119445474 C:G G C 10 0.537634787606996 0.534308662068306 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 38 34 72 17.5698780709342 18.2795827786379 -0.709704707703711 A:G A G 10 0.537634787606996 0.906191494604093 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 21 38 59 9.70966946025308 20.4301219290658 -10.7204524688128 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0058311567397441 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 205 318 523 94.7848685405658 170.967862459025 -76.1829939184589 A:G G A 10 0.537634787606996 2.64119413534362e-11 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 A:C A C 10 0.537634787606996 0.169093333030703 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29691744 C/G 1 12 14 26 5.54838254871605 7.52688702649794 -1.9785044777819 C:G C G 10 0.537634787606996 0.440467677457136 ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 17 3 20 7.86020861068107 1.61290436282099 6.24730424786008 A:C A C 10 0.537634787606996 0.00577791676348129 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 17 3 20 7.86020861068107 1.61290436282099 6.24730424786008 A:T A T 10 0.537634787606996 0.00577791676348129 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29910663 G/A 1 248 1161 1409 114.666572673465 624.193988411722 -509.527415738257 A:G G A 10 0.537634787606996 5.34059428048369e-173 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29910801 C/A 1 383 112 495 177.085876346521 60.2150962119835 116.870780134537 A:C C A 10 0.537634787606996 1.84409935061140e-27 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29911356 G/A 1 2 15 17 0.924730424786008 8.06452181410494 -7.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000439020129774973 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 1 1265 1 1266 584.89199367715 0.537634787606996 584.354358889543 A:C A C 10 0.537634787606996 0 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 67 92 159 30.9784692303313 49.4624004598436 -18.4839312295124 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00405383537212082 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 26 38 64 12.0214955222181 20.4301219290658 -8.40862640684774 A:C C A 10 0.537634787606996 0.0441011872111523 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30041009 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000204618:ENST00000244360:exon_30040934_30041025:RNF39;ENSG00000204618:ENST00000376751:exon_30040934_30041025:RNF39 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30164497 G/A 1 29 20 49 13.4085911593971 10.7526957521399 2.65589540725719 A:G G A 10 0.537634787606996 0.476699286291774 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30164293_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30164313_30164523:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30164356_30164523:TRIM26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30529816 G/A 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 A:G G A 10 0.537634787606996 0.246034893012951 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30529611_30529901:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30527808_30529901:PRR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30530203 A/G 1 10 4 14 4.62365212393004 2.15053915042798 2.47311297350206 A:G A G 10 0.537634787606996 0.283623583656103 ENSG00000204576:ENST00000376560:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000376557:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000481741:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000498336:exon_30530166_30531500:PRR3;ENSG00000204576:ENST00000470703:exon_30530166_30531500:PRR3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30647005 C/G 1 76 62 138 35.1397561418683 33.3333568316338 1.80639931023455 C:G C G 10 0.537634787606996 0.798133430903998 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000488324:exon_30646956_30647166:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000467662:exon_30646956_30647166:KIAA1949 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30671989 G/C 1 34 26 60 15.7204172213621 13.9785044777819 1.74191274358024 C:G G C 10 0.537634787606996 0.698882913897192 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30695920 C/T 1 469 390 859 216.849284612319 209.677567166728 7.17171744559045 T:C C T 10 0.537634787606996 0.632045175939021 ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30695486_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30695513_30695922:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30695513_30695922:FLOT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 10 7 17 4.62365212393004 3.76344351324897 0.860208610681068 A:C A C 10 0.537634787606996 0.809430925630652 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30882634 C/T 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30882781 G/T 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 T:G G T 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30881588_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30881982_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000428017:exon_30882582_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000421263:exon_30882587_30882814:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000413959:exon_30882614_30882814:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30888169 G/A 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 5 17 22 2.31182606196502 9.13979138931893 -6.82796532735391 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00445110600401729 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30890483 G/T 1 17 15 32 7.86020861068107 8.06452181410494 -0.204313203423873 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30890483_30890551:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000477052:exon_30890360_30890551:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30892322 C/T 1 22 12 34 10.1720346726461 6.45161745128395 3.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.230589279923386 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30892131_30892337:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30892131_30892341:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30891130_30892337:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 12 21 33 5.54838254871605 11.2903305397469 -5.74194799103087 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0541931126158189 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 30893428 G/A 1 28 27 55 12.9462259470041 14.5161392653889 -1.56991331838478 A:G G A 10 0.537634787606996 0.687033074671747 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893321_30893496:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000465948:exon_30893321_30893451:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893321_30893496:VARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 69 62 131 31.9031996551173 33.3333568316338 -1.43015717651647 T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.860978753946428 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 55 43 98 25.4300866816152 23.1182958671008 2.31179081451439 A:T T A 10 0.537634787606996 0.685836940661027 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31112737 C/A 1 31 23 54 14.3333215841831 12.3656001149609 1.96772146922221 A:C C A 10 0.537634787606996 0.682678172464324 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31116210 G/A 1 16 16 32 7.39784339828806 8.60215660171194 -1.20431320342387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.724633964891837 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31116220 G/A 1 16 11 27 7.39784339828806 5.91398266367696 1.48386073461111 A:G G A 10 0.537634787606996 0.700336022866229 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31116246 G/A 1 17 8 25 7.86020861068107 4.30107830085597 3.5591303098251 A:G G A 10 0.537634787606996 0.165963674291836 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31122315 G/C 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 C:G G C 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31122330 G/A 1 17 19 36 7.86020861068107 10.2150609645329 -2.35485235385186 A:G G A 10 0.537634787606996 0.50463353840393 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31122482 G/A 1 9 15 24 4.16128691153704 8.06452181410494 -3.90323490256791 A:G G A 10 0.537634787606996 0.150610778150999 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31122500 G/A 1 13 18 31 6.01074776110905 9.67742617692593 -3.66667841581688 A:G G A 10 0.537634787606996 0.209584119262626 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31124849 C/T 1 11 13 24 5.08601733632304 6.98925223889095 -1.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.540200791347127 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31239335 G/A 1 17 5 22 7.86020861068107 2.68817393803498 5.17203467264609 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0316005143093505 ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 1 492 72 564 227.483684497358 38.7097047077037 188.773979789654 T:G T G 10 0.537634787606996 5.26860205114457e-65 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 136 820 956 62.8816688854485 440.860525837737 -377.978856952288 T:C C T 10 0.537634787606996 1.41955850975662e-143 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31239430 C/T 1 903 136 1039 417.515786790883 73.1183311145515 344.397455676331 T:C C T 10 0.537634787606996 1.11291248189226e-115 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31239506 C/G 1 70 691 761 32.3655648675103 371.505638236434 -339.140073368924 T:C:G C G 10 0.537634787606996 9.60420667475032e-151 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31322911 C/T 1 2638 911 3549 1219.71943029274 489.785291509973 729.934138782771 T:C:G C T 10 0.537634787606996 1.91209347187784e-140 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31322884_31323000:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31322899_31323000:HLA-B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 396 259 655 183.09662410763 139.247409990212 43.8492141174176 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000640896372294031 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31378864 A/G 0 13 0 13 6.01074776110905 0 6.01074776110905 A A 10 0.537634787606996 0.000357708287874443 ENSG00000204520:ENST00000484008:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000364810:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000458313:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000449934:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000376219:exon_31378849_31379136:AL645933.1;ENSG00000204520:ENST00000468458:exon_31378640_31379136:AL645933.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 22 16 38 10.1720346726461 8.60215660171194 1.56987807093415 A:G A G 10 0.537634787606996 0.629981554630404 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31431780 T/G 1 19 26 45 8.78493903546708 13.9785044777819 -5.19356544231482 T:G T G 10 0.537634787606996 0.135558907616476 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31473957 C/G 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 C:G C G 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31474820 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31474799_31475077:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31474799_31475077:MICB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 103 77 180 47.6236168764794 41.3978786457387 6.22573823074072 T:C T C 10 0.537634787606996 0.370260015214712 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 103 136 239 47.6236168764794 73.1183311145515 -25.494714238072 A:C C A 10 0.537634787606996 0.00113727817748438 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31592064 C/T 1 13 14 27 6.01074776110905 7.52688702649794 -1.51613926538889 T:C C T 10 0.537634787606996 0.569163783914877 ENSG00000204469:ENST00000414096:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469577:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31592038_31592137:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31592038_31592137:BAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 6 14 20 2.77419127435802 7.52688702649794 -4.75269575213992 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0422425154462778 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31602967 G/A 1 88 75 163 40.6881386905844 40.3226090705247 0.365529620059654 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 238 209 447 110.042920549535 112.365670609862 -2.32275006032721 A:G A G 10 0.537634787606996 0.849558620845967 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 143 161 304 66.1182253721996 86.5592008047264 -20.4409754325268 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0212610873283538 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 21 22 43 9.70966946025308 11.8279653273539 -2.11829586710083 C:G G C 10 0.537634787606996 0.543478990898143 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 60 69 129 27.7419127435802 37.0968003448827 -9.35488760130248 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.111735434827638 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31612866 G/A 1 61 48 109 28.2042779559732 25.8064698051358 2.39780815083743 A:G G A 10 0.537634787606996 0.70109820531383 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000469182:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000453833:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000435080:exon_31612723_31612975:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000462682:exon_31612723_31612962:BAT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 57 48 105 26.3548171064012 25.8064698051358 0.548347301265419 T:C C T 10 0.537634787606996 0.922451013544495 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31630318 C/G 1 53 39 92 24.5053562568292 20.9677567166728 3.53759954015637 A:C:G C G 10 0.537634787606996 0.466791161405108 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 49 50 99 22.6558954072572 26.8817393803498 -4.2258439730926 A:C C A 10 0.537634787606996 0.420754340488341 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31639979 C/T 1 30 14 44 13.8709563717901 7.52688702649794 6.34406934529218 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0687021488262466 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31655438 G/A 1 18 18 36 8.32257382307407 9.67742617692593 -1.35485235385186 A:G G A 10 0.537634787606996 0.738857567386167 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 78 67 145 36.0644865666543 36.0215307696687 0.0429557969855736 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31778272 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000204390:ENST00000375654:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000417199:exon_31777396_31779762:HSPA1L;ENSG00000204390:ENST00000375653:exon_31777824_31779230:HSPA1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31860337 T/C 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31860184_31860339:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000463484:exon_31860195_31860339:EHMT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31868075 G/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 C:G G C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000204366:ENST00000375527:exon_31867384_31869102:ZBTB12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31929808 C/T 1 15 13 28 6.93547818589506 6.98925223889095 -0.0537740529958883 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000477400:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31929686_31929831:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000466290:exon_31929686_31929831:SKIV2L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31938412 G/T 1 23 14 37 10.6343998850391 7.52688702649794 3.10751285854115 T:G G T 10 0.537634787606996 0.327167687629949 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 31938451 T/C 1 19 11 30 8.78493903546708 5.91398266367696 2.87095637179012 T:C T C 10 0.537634787606996 0.360976107545321 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32097290 C/T 1 8 16 24 3.69892169914403 8.60215660171194 -4.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.063345423710019 ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32147696 G/A 0 31 0 31 14.3333215841831 0 14.3333215841831 G G 10 0.537634787606996 5.94186745660387e-09 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32148031 A/G 1 89 36 125 41.1505039029774 19.3548523538519 21.7956515491255 A:G A G 10 0.537634787606996 9.84602941113025e-05 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32157639 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000204304:ENST00000375050:exon_32157472_32157963:PBX2;ENSG00000204304:ENST00000478678:exon_32157472_32157719:PBX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 163 153 316 75.3655296200596 82.2581225038704 -6.89259288381075 T:C T C 10 0.537634787606996 0.463390786264202 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32163274 G/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G G A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32163203_32163300:GPSM3;ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32407709 C/A 1 518 615 1133 239.505180019576 330.645394378303 -91.1402143587265 A:C C A 10 0.537634787606996 6.53391702467899e-08 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C T C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 7 7 14 3.23655648675103 3.76344351324897 -0.526887026497944 T:C T C 10 0.537634787606996 0.79518340877076 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32410941 T/C 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C T C 10 0.537634787606996 1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1667 1696 3363 770.762809059138 911.828599781465 -141.065790722328 A:C:G A C 10 0.537634787606996 1.16224923612043e-06 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 2532 3176 5708 1170.70871777909 1707.52808543982 -536.819367660733 A:T:C:G T G 10 0.537634787606996 7.06350742415465e-46 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 1482 0 1482 685.225244766432 0 685.225244766432 C C 10 0.537634787606996 0 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32605336 G/A 0 10 0 10 4.62365212393004 0 4.62365212393004 G G 10 0.537634787606996 0.00246430999279537 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32797297 T/C 1 22 47 69 10.1720346726461 25.2688350175288 -15.0968003448827 T:C T C 10 0.537634787606996 0.000381818538206504 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 231 214 445 106.806364062784 115.053844547897 -8.24748048511321 A:G G A 10 0.537634787606996 0.447013039787329 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32826233 A/G 1 522 421 943 241.354640869148 226.344245582545 15.0103952866028 A:G A G 10 0.537634787606996 0.343613581291786 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32826141_32826677:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000395333:exon_32826141_32826282:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32826141_32826499:PSMB9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32942302 G/A 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 A:G G A 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32942354 G/T 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:G G T 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32942355 C/G 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000456339:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32942239_32942542:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32942239_32942542:BRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32944575 T/C 1 106 86 192 49.0107125136584 46.2365917342017 2.77412077945677 T:C T C 10 0.537634787606996 0.717742718236466 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000495733:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32944339_32944713:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000481259:exon_32944346_32944713:BRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32944746 G/A 1 4 13 17 1.84946084957202 6.98925223889095 -5.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0143905965818557 ENSG00000204256:ENST00000464592:exon_32944339_32945347:BRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32946133 T/C 1 160 192 352 73.9784339828806 103.225879220543 -29.2474452376626 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00190531762798673 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 15 24 39 6.93547818589506 12.9032349025679 -5.96775671667284 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0759661594037867 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 1450 1220 2670 670.429557969856 655.914440880535 14.5151170893206 A:T:C:G G C 10 0.537634787606996 0.58684825605652 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 1189 78 1267 549.752237535282 41.9355134333457 507.816724101936 T:C C T 10 0.537634787606996 4.59941072803087e-221 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1357 148 1505 627.429593217306 79.5699485658354 547.859644651471 A:T:C T C 10 0.537634787606996 3.10267337746115e-207 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037080 G/A 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 G G 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 2173 202 2375 1004.71960653 108.602227096613 896.117379433384 A:C:G G A 10 0.537634787606996 4.94065645841247e-324 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 2080 208 2288 961.719641777448 111.828035822255 849.891605955193 T:C:G T C 10 0.537634787606996 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 868 189 1057 401.333004357127 101.612974857722 299.720029499405 T:C:G T C 10 0.537634787606996 1.18235616454683e-83 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 1 718 2 720 331.978222498177 1.07526957521399 330.902952922963 T:C C T 10 0.537634787606996 2.56428102314572e-189 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 704 0 704 325.505109524675 0 325.505109524675 G G 10 0.537634787606996 3.1263354319271e-190 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 1 714 2 716 330.128761648605 1.07526957521399 329.053492073391 A:T A T 10 0.537634787606996 3.61517847736270e-188 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 0 1450 0 1450 670.429557969856 0 670.429557969856 A A 10 0.537634787606996 0 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 1188 374 1562 549.289872322889 201.075410565017 348.214461757872 T:C T C 10 0.537634787606996 5.87786337149753e-74 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 1387 473 1860 641.300549589096 254.301254538109 386.999295050987 T:C C T 10 0.537634787606996 3.48004281474608e-76 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33052981 C/A 1 369 1114 1483 170.612763373018 598.925153394194 -428.312390021175 A:C:G C A 10 0.537634787606996 2.23818719644081e-113 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 1145 396 1541 529.40816818999 212.90337589237 316.504792297619 T:C T C 10 0.537634787606996 1.04428894454733e-61 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 11 6 17 5.08601733632304 3.22580872564198 1.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.468267943713486 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 11 8 19 5.08601733632304 4.30107830085597 0.784939035467076 A:G G A 10 0.537634787606996 0.819985066606254 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:C C A 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 95 86 181 43.9246951773354 46.2365917342017 -2.31189655686628 C:G G C 10 0.537634787606996 0.765730041839118 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 T:C T C 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33288271 A/G 1 68 78 146 31.4408344427243 41.9355134333457 -10.4946789906214 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0965890415319223 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000468536:exon_33288157_33288368:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000477162:exon_33288157_33288368:DAXX HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33359716 G/C 1 25 23 48 11.5591303098251 12.3656001149609 -0.806469805135809 C:G G C 10 0.537634787606996 0.885219555592337 ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 33740382 G/A 1 23 17 40 10.6343998850391 9.13979138931893 1.49460849572016 A:G G A 10 0.537634787606996 0.751625769863771 ENSG00000161904:ENST00000506578:exon_33738979_33740552:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000293760:exon_33738979_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000511171:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000374196:exon_33738999_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000450389:exon_33739474_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000421671:exon_33739209_33740555:LEMD2;ENSG00000161904:ENST00000508327:exon_33740102_33740555:LEMD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:C C A 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36334732 G/A 1 42 38 80 19.4193389205062 20.4301219290658 -1.01078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 0.823626103986592 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36334652_36334752:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36334652_36334752:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36334652_36334752:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36334652_36334752:ETV7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36355372 T/C 1 9 10 19 4.16128691153704 5.37634787606996 -1.21506096453292 T:C T C 10 0.537634787606996 0.648723240951363 ENSG00000010030:ENST00000339796:exon_36355313_36356164:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000340181:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373737:exon_36355313_36355560:ETV7;ENSG00000010030:ENST00000373738:exon_36355313_36356164:ETV7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36463627 C/T 1 19 8 27 8.78493903546708 4.30107830085597 4.48386073461111 T:C C T 10 0.537634787606996 0.120981607522106 ENSG00000112079:ENST00000229812:exon_36461669_36463691:STK38;ENSG00000112079:ENST00000407753:exon_36461676_36463691:STK38 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 121 110 231 55.9461906995535 59.1398266367696 -3.19363593721608 A:T:C C A 10 0.537634787606996 0.692455866785393 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 96 80 176 44.3870603897284 43.0107830085597 1.3762773811687 T:C C T 10 0.537634787606996 0.879919752145614 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36713263 A/G 1 11 14 25 5.08601733632304 7.52688702649794 -2.4408696901749 A:G A G 10 0.537634787606996 0.423024937923135 ENSG00000124772:ENST00000459703:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000244751:exon_36713165_36713292:CPNE5;ENSG00000124772:ENST00000493411:exon_36713164_36713292:CPNE5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 13 7 20 6.01074776110905 3.76344351324897 2.24730424786008 A:G A G 10 0.537634787606996 0.373960999192447 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 1 9 10 0.462365212393004 4.83871308846296 -4.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00765653759058032 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 37349033 G/A 1 6 10 16 2.77419127435802 5.37634787606996 -2.60215660171194 A:G G A 10 0.537634787606996 0.216931793595914 ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 41652514 C/T 1 165 135 300 76.2902600448457 72.5806963269445 3.70956371790119 T:C C T 10 0.537634787606996 0.685540194606123 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 38 46 84 17.5698780709342 24.7312002299218 -7.16132215898767 T:C C T 10 0.537634787606996 0.126029351650741 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 41895150 G/A 1 26 27 53 12.0214955222181 14.5161392653889 -2.49464374317079 A:G G A 10 0.537634787606996 0.494978027389235 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 41900406 C/T 1 70 61 131 32.3655648675103 32.7957220440268 -0.430157176516474 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41900099_41900784:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41900099_41900734:BYSL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 53 39 92 24.5053562568292 20.9677567166728 3.53759954015637 A:C A C 10 0.537634787606996 0.466791161405108 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 42933526 C/T 1 15 19 34 6.93547818589506 10.2150609645329 -3.27958277863786 T:C C T 10 0.537634787606996 0.303132807516484 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42933419_42933527:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42933419_42933527:PEX6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 42992808 T/C 1 26 28 54 12.0214955222181 15.0537740529959 -3.03227853077778 T:C T C 10 0.537634787606996 0.416437987986033 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 42992825 C/G 1 23 28 51 10.6343998850391 15.0537740529959 -4.4193741679568 C:G C G 10 0.537634787606996 0.261118975927049 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42992723_42992870:RRP36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 89 94 183 41.1505039029774 50.5376700350576 -9.38716613208027 A:G A G 10 0.537634787606996 0.181963337048281 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 43008298 C/T 1 7 15 22 3.23655648675103 8.06452181410494 -4.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0524946900816706 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43008268_43008484:CUL7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 92 47 139 42.5375995401564 25.2688350175288 17.2687645226276 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00368366457329668 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 44117607 C/T 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C C T 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44117596_44117702:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000482966:exon_44117596_44117702:TMEM63B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 44217561 T/C 1 1170 1159 2329 540.967298499815 623.118718836508 -82.1514203366937 A:T:C:G T C 10 0.537634787606996 0.000652883558886133 ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44217412_44217571:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44217412_44217571:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000441736:exon_44217421_44217571:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371565:exon_44217412_44217571:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371556:exon_44217412_44217571:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371562:exon_44217412_44217571:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44217412_44217571:HSP90AB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 44223010 G/T 1 44 38 82 20.3440693452922 20.4301219290658 -0.0860525837736716 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000157593:ENST00000495706:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393810:exon_44221833_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000393812:exon_44221843_44223381:SLC35B2;ENSG00000157593:ENST00000341553:exon_44222931_44223381:SLC35B2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 37 30 67 17.1075128585411 16.1290436282099 0.978469230331267 T:C C T 10 0.537634787606996 0.902618426856129 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 44413463 T/A 1 31 20 51 14.3333215841831 10.7526957521399 3.5806258320432 A:T T A 10 0.537634787606996 0.329401553003132 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44413392_44413604:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44413392_44413604:CDC5L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 12 0 12 5.54838254871605 0 5.54838254871605 G G 10 0.537634787606996 0.000678701483351107 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 15 15 0 8.06452181410494 -8.06452181410494 G A G 10 0.537634787606996 9.43576824426962e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 15 15 0 8.06452181410494 -8.06452181410494 A G A 10 0.537634787606996 9.43576824426962e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 15 15 0 8.06452181410494 -8.06452181410494 G T G 10 0.537634787606996 9.43576824426962e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 9 0 9 4.16128691153704 0 4.16128691153704 C C 10 0.537634787606996 0.00471882013301929 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 57512565 T/C 0 0 14 14 0 7.52688702649794 -7.52688702649794 C T C 10 0.537634787606996 2.04076085124011e-05 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 T:C C T 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 20 29 49 9.24730424786008 15.5914088406029 -6.34410459274281 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0848317990750537 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 79656562 A/T 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 A:T A T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 A:G G A 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 79675701 A/G 1 9 8 17 4.16128691153704 4.30107830085597 -0.139791389318932 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 79692751 G/A 1 70 100 170 32.3655648675103 53.7634787606996 -21.3979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00117751830510019 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79692603_79692834:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79692603_79692834:PHIP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 83880167 C/T 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 T:C C T 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000083097:ENST00000484282:exon_83880008_83881069:DOPEY1;ENSG00000013375:ENST00000504780:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83880024_83880197:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83880092_83880197:PGM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 83881740 T/C 1 4 12 16 1.84946084957202 6.45161745128395 -4.60215660171194 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0241945022903132 ENSG00000013375:ENST00000513973:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000512866:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000369731:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000283977:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000416472:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000506587:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000509219:exon_83881656_83881778:PGM3;ENSG00000013375:ENST00000503356:exon_83881639_83881778:PGM3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C T C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 25 21 46 11.5591303098251 11.2903305397469 0.268799770078184 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 87970301 C/G 1 74 67 141 34.2150257170823 36.0215307696687 -1.80650505258644 C:G C G 10 0.537634787606996 0.800161545106333 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 88046800 G/A 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 A:G G A 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000111850:ENST00000392863:exon_88046727_88046884:C6orf162;ENSG00000111850:ENST00000229570:exon_88046727_88046884:C6orf162 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 89793894 G/C 1 58 68 126 26.8171823187942 36.5591655572757 -9.7419832384815 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0895387469350394 ENSG00000146278:ENST00000369472:exon_89793472_89794064:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000336032:exon_89793472_89794879:PNRC1;ENSG00000146278:ENST00000354922:exon_89793472_89793916:PNRC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 90039425 G/A 1 56 52 108 25.8924518940082 27.9570089555638 -2.06455706155557 A:G G A 10 0.537634787606996 0.700529256682263 ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 90347511 T/C 1 44 20 64 20.3440693452922 10.7526957521399 9.59137359315226 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0170321294739451 ENSG00000083099:ENST00000520897:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000412237:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523793:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520441:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523377:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000517396:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000524153:exon_90347461_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000520318:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000521961:exon_90347444_90347601:LYRM2;ENSG00000083099:ENST00000523075:exon_90347461_90347601:LYRM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 90362783 A/C 1 11 9 20 5.08601733632304 4.83871308846296 0.24730424786008 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90362711_90362874:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90362711_90362874:MDN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 90577602 C/T 1 9 2 11 4.16128691153704 1.07526957521399 3.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0736764045328896 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90575672_90578801:CASP8AP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 100957344 T/C 1 34 31 65 15.7204172213621 16.6666784158169 -0.94626119445474 T:C T C 10 0.537634787606996 0.901133370334336 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 100964147 G/C 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 C:G G C 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100964056_100964203:ASCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 100966006 C/T 1 22 23 45 10.1720346726461 12.3656001149609 -2.19356544231482 T:C C T 10 0.537634787606996 0.551643147949618 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 101296389 G/A 1 1 8 9 0.462365212393004 4.30107830085597 -3.83871308846296 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0148255598114241 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101296024_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000468245:exon_101295880_101296583:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324723:exon_101296296_101296583:ASCC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 57 44 101 26.3548171064012 23.6559306547078 2.6988864516934 T:C C T 10 0.537634787606996 0.618825196828529 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 105776792 G/A 1 2 8 10 0.924730424786008 4.30107830085597 -3.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0521780855970265 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 106547372 C/G 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 C:G C G 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000450060:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106547175_106547427:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000481163:exon_106547175_106547584:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106547175_106547427:PRDM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 106999822 G/A 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106999727_106999853:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000487681:exon_106999727_107000189:AIM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 107110855 A/C 1 16 15 31 7.39784339828806 8.06452181410494 -0.666678415816877 A:C A C 10 0.537634787606996 0.858217650481407 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107110855_107111060:QRSL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 21 12 33 9.70966946025308 6.45161745128395 3.25805200896913 A:G G A 10 0.537634787606996 0.29687421642475 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109762600 A/C 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 A:C A C 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109762560_109762656:SMPD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 T:G G T 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 59 49 108 27.2795475311872 26.3441045927428 0.935442938444428 T:G G T 10 0.537634787606996 0.92319728975773 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 46 48 94 21.2687997700782 25.8064698051358 -4.53767003505763 A:G G A 10 0.537634787606996 0.353892206207830 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109775366 C/T 1 13 7 20 6.01074776110905 3.76344351324897 2.24730424786008 T:C C T 10 0.537634787606996 0.373960999192447 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109775436 T/C 1 16 8 24 7.39784339828806 4.30107830085597 3.0967650974321 T:C T C 10 0.537634787606996 0.225469869657442 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 T:C T C 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 110146475 C/T 1 23 14 37 10.6343998850391 7.52688702649794 3.10751285854115 T:C C T 10 0.537634787606996 0.327167687629949 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 116574455 G/A 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 8 13 21 3.69892169914403 6.98925223889095 -3.29033053974692 C:G C G 10 0.537634787606996 0.189499969831395 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 116600810 G/A 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 A:G G A 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 4 11 15 1.84946084957202 5.91398266367696 -4.06452181410494 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0401081696281839 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 119510941 C/A 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:C C A 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000111885:ENST00000368468:exon_119510829_119511048:MAN1A1;ENSG00000111885:ENST00000368466:exon_119510829_119511048:MAN1A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 126249914 T/G 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000111912:ENST00000368357:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000392477:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000368353:exon_126249782_126252266:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000438495:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000444128:exon_126249782_126252257:NCOA7;ENSG00000111912:ENST00000229634:exon_126249782_126252266:NCOA7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 129899632 T/C 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000146376:ENST00000368149:exon_129897277_129899749:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_129898241_129899749:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000483367:exon_129899564_129899749:ARHGAP18;ENSG00000146376:ENST00000463225:exon_129899564_129899749:ARHGAP18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 2225 1017 3242 1028.76259757443 546.774578996315 481.988018578119 A:G A G 10 0.537634787606996 1.47351737025852e-66 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.529014607492245 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 159 0 159 73.5160687704876 0 73.5160687704876 T T 10 0.537634787606996 1.49826888997042e-43 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 180 0 180 83.2257382307407 0 83.2257382307407 A A 10 0.537634787606996 3.62496795478741e-49 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 184 0 184 85.0751990803127 0 85.0751990803127 A A 10 0.537634787606996 2.85603253691465e-50 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 55 0 55 25.4300866816152 0 25.4300866816152 G G 10 0.537634787606996 2.28003971400895e-15 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 60 0 60 27.7419127435802 0 27.7419127435802 T T 10 0.537634787606996 8.70221784411847e-17 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 94 148 242 43.4623299649424 79.5699485658354 -36.107618600893 A:C A C 10 0.537634787606996 4.0446080194371e-06 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 137519780 T/C 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C T C 10 0.537634787606996 0.365640645316222 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 138195991 A/G 1 25 18 43 11.5591303098251 9.67742617692593 1.88170413289917 A:G A G 10 0.537634787606996 0.647250166966958 ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 16 19 35 7.39784339828806 10.2150609645329 -2.81721756624486 T:C C T 10 0.537634787606996 0.397650063326115 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 150004779 A/G 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:G A G 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 41 35 76 18.9569737081132 18.8172175662449 0.139756141868304 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 151336739 C/G 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 C:G C G 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151336652_151336829:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000420192:exon_151336652_151336829:MTHFD1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 18 27 45 8.32257382307407 14.5161392653889 -6.19356544231482 T:C C T 10 0.537634787606996 0.072853131972327 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 42 55 97 19.4193389205062 29.5699133183848 -10.1505743978786 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0417047837566118 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 151766552 G/A 1 12 6 18 5.54838254871605 3.22580872564198 2.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.346995716390543 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 151789709 A/G 1 14 18 32 6.47311297350206 9.67742617692593 -3.20431320342387 A:G A G 10 0.537634787606996 0.289546690751015 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 151789912 C/T 1 19 23 42 8.78493903546708 12.3656001149609 -3.58066107949383 T:C C T 10 0.537634787606996 0.282149325735374 ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 153296541 G/C 1 36 34 70 16.6451476461481 18.2795827786379 -1.63443513248972 C:G G C 10 0.537634787606996 0.720261402691009 ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 153323806 A/G 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 155635585 A/C 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 4 7 11 1.84946084957202 3.76344351324897 -1.91398266367696 T:C C T 10 0.537634787606996 0.365640645316222 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 159184462 A/G 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 A:G A G 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 16 20 36 7.39784339828806 10.7526957521399 -3.35485235385186 A:T T A 10 0.537634787606996 0.316324009908038 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 159420574 T/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000130363:ENST00000367069:exon_159420467_159421219:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000449822:exon_159420467_159420813:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000252655:exon_159420467_159421198:RSPH3;ENSG00000130363:ENST00000297262:exon_159420467_159421198:RSPH3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 14 21 35 6.47311297350206 11.2903305397469 -4.81721756624486 A:G A G 10 0.537634787606996 0.126549583522655 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 160196343 A/G 1 118 150 268 54.5590950623745 80.6452181410494 -26.0861230786749 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00173108164937655 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160196202_160196345:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160196318_160197304:ACAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 86 103 189 39.7634082657983 55.3763831235206 -15.6129748577223 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0237367994607526 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 160198395 G/A 1 145 105 250 67.0429557969856 56.4516526987346 10.591303098251 A:G G A 10 0.537634787606996 0.183398609327301 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170176146 G/A 1 17 10 27 7.86020861068107 5.37634787606996 2.48386073461111 A:G G A 10 0.537634787606996 0.440806079300057 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000492738:exon_170176036_170176161:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170175974_170176161:C6orf70 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 15 4 19 6.93547818589506 2.15053915042798 4.78493903546708 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.0362941544119347 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 16 4 20 7.39784339828806 2.15053915042798 5.24730424786008 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0231395823602888 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170627614 T/C 1 21 16 37 9.70966946025308 8.60215660171194 1.10751285854115 T:C T C 10 0.537634787606996 0.744548544078617 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 22 17 39 10.1720346726461 9.13979138931893 1.03224328332716 A:G A G 10 0.537634787606996 0.872688550094881 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 21 15 36 9.70966946025308 8.06452181410494 1.64514764614814 T:G T G 10 0.537634787606996 0.61963503509477 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170862300 G/C 1 188 100 288 86.9246599298848 53.7634787606996 33.1611811691852 C:G G C 10 0.537634787606996 9.01578862569796e-05 ENSG00000008018:ENST00000262193:exon_170862218_170862429:PSMB1;ENSG00000008018:ENST00000392093:exon_170862218_170862417:PSMB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170878793 T/C 1 3 11 14 1.38709563717901 5.91398266367696 -4.52688702649794 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0280872426951532 ENSG00000112592:ENST00000392091:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000392092:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000230354:exon_170878700_170878867:TBP;ENSG00000112592:ENST00000446829:exon_170878700_170878828:TBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170892100 T/C 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170890836_170892276:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170890836_170892276:PDCD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 6 170893407 G/A 1 57 44 101 26.3548171064012 23.6559306547078 2.6988864516934 A:G G A 10 0.537634787606996 0.618825196828529 ENSG00000071994:ENST00000392090:exon_170893387_170893480:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000167218:exon_170893387_170893698:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000443345:exon_170893387_170893518:PDCD2;ENSG00000071994:ENST00000453163:exon_170893387_170893748:PDCD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 1510282 G/A 1 72 75 147 33.2902952922963 40.3226090705247 -7.03231377822841 A:G G A 10 0.537634787606996 0.248062478572958 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1509913_1510328:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1509913_1510328:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000493446:exon_1510114_1510347:INTS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 25 23 48 11.5591303098251 12.3656001149609 -0.806469805135809 A:G G A 10 0.537634787606996 0.885219555592337 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 2472429 C/A 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 A:C C A 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 2472455 A/T 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:T A T 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 4722377 G/A 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:G G A 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4721940_4722499:FOXK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 4823070 A/G 1 16 25 41 7.39784339828806 13.4408696901749 -6.04302629188684 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0615733919934969 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4822947_4823091:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4822954_4823429:KIAA0415 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 12 9 21 5.54838254871605 4.83871308846296 0.709669460253084 T:C C T 10 0.537634787606996 0.829141081785639 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 4825307 T/A 1 25 21 46 11.5591303098251 11.2903305397469 0.268799770078184 A:T T A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 4825314 C/T 1 28 22 50 12.9462259470041 11.8279653273539 1.1182606196502 T:C C T 10 0.537634787606996 0.778522652035765 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4825153_4825315:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4825153_4825315:KIAA0415 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 4827330 C/T 1 12 12 24 5.54838254871605 6.45161745128395 -0.903234902567904 T:C C T 10 0.537634787606996 0.838399759689691 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4827265_4827407:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4827265_4827407:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4827265_4827407:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4827265_4827407:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000482480:exon_4827265_4827508:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4827265_4827407:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477454:exon_4827227_4827407:KIAA0415 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 5347749 G/A 1 21 14 35 9.70966946025308 7.52688702649794 2.18278243375514 A:G G A 10 0.537634787606996 0.501285217969024 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 5347914 G/A 1 12 6 18 5.54838254871605 3.22580872564198 2.32257382307407 A:G G A 10 0.537634787606996 0.346995716390543 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 16 13 29 7.39784339828806 6.98925223889095 0.408591159397115 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 5410425 G/C 1 8 2 10 3.69892169914403 1.07526957521399 2.62365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.119333604831037 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 T:C T C 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 6193464 T/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:G T G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193387_6193513:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 6193521 G/C 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 C:G G C 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193518_6193612:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 11 20 31 5.08601733632304 10.7526957521399 -5.66667841581688 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0475048531580989 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 6456302 C/T 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000497308:exon_6456258_6456342:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 6647738 T/C 1 21 9 30 9.70966946025308 4.83871308846296 4.87095637179012 T:C T C 10 0.537634787606996 0.098141685377436 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6647591_6648357:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000359073:exon_6647591_6648355:C7orf26 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 24703298 G/A 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24703209_24703340:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24703093_24703340:MPP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 24742436 T/C 1 44 155 199 20.3440693452922 83.3333920790844 -62.9893227337922 T:C T C 10 0.537634787606996 1.18982109035966e-19 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000479636:exon_24742379_24745656:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24742379_24742452:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000430096:exon_24742046_24742452:DFNA5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 24758753 C/T 1 63 18 81 29.1290083807593 9.67742617692593 19.4515822038333 T:C C T 10 0.537634787606996 9.86197856136154e-06 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 24758818 G/T 1 65 33 98 30.0537388055453 17.7419479910309 12.3117908145144 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0146646701405487 ENSG00000105928:ENST00000342947:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000419307:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409970:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000409775:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000411476:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000493723:exon_24758666_24758837:DFNA5;ENSG00000105928:ENST00000414428:exon_24758694_24758837:DFNA5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 24758852 C/T 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 C C 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 25181912 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000153790:ENST00000409280:exon_25181860_25181951:C7orf31;ENSG00000153790:ENST00000283905:exon_25181860_25181951:C7orf31 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 32909182 G/A 1 11 19 30 5.08601733632304 10.2150609645329 -5.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0678966504481267 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 37936530 T/C 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 T:C T C 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000086288:ENST00000199447:exon_37936472_37936709:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000440017:exon_37936472_37936694:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000476435:exon_37936419_37936709:TXNDC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 39606107 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39605975_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39605984_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39605993_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39606009_39606146:C7orf36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 39610177 A/G 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G A G 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 40027484 A/G 1 17 16 33 7.86020861068107 8.60215660171194 -0.741947991030869 A:G A G 10 0.537634787606996 0.862153788104146 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40027198_40027857:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40027435_40027857:CDK13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 40037157 C/T 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40037093_40037263:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000326351:exon_40037093_40037263:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40037093_40037263:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000484589:exon_40037093_40037263:CDK13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 40127767 G/A 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000065883:ENST00000181839:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000340829:exon_40127725_40127930:CDK13;ENSG00000065883:ENST00000478563:exon_40127725_40127930:CDK13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 45 54 99 20.8064345576852 29.0322785307778 -8.2258439730926 T:C T C 10 0.537634787606996 0.106858873080514 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 115 116 231 53.1719994251955 62.3656353624115 -9.19363593721608 A:G A G 10 0.537634787606996 0.235219410763739 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 43906513 A/G 1 172 152 324 79.5268165315967 81.7204877162634 -2.19367118466671 A:C:G A G 10 0.537634787606996 0.823768263027532 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 43916727 T/G 1 14 10 24 6.47311297350206 5.37634787606996 1.0967650974321 T:G T G 10 0.537634787606996 0.68784243201575 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 43917013 G/A 1 5 16 21 2.31182606196502 8.60215660171194 -6.29033053974692 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00745130946160141 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 44612229 G/A 1 37 35 72 17.1075128585411 18.8172175662449 -1.70970470770371 A:G G A 10 0.537634787606996 0.723661449604658 ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 44747499 G/A 1 79 95 174 36.5268517790473 51.0753048226646 -14.5484530436173 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0275870714703381 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 44747514 C/T 1 73 71 144 33.7526605046893 38.1720699200967 -4.41940941540743 T:C C T 10 0.537634787606996 0.503921041350163 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 44747578 G/A 1 83 52 135 38.3763126286193 27.9570089555638 10.4193036730555 A:T:G G A 10 0.537634787606996 0.0839509724219736 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 44747589 C/T 1 91 55 146 42.0752343277634 29.5699133183848 12.5053210093786 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0382359383148313 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 44836314 A/G 1 22 24 46 10.1720346726461 12.9032349025679 -2.73120022992182 A:G A G 10 0.537634787606996 0.461190624805978 ENSG00000196262:ENST00000468812:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000481437:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000451562:exon_44836279_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000355968:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000489459:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000479021:exon_44836280_44836392:PPIA;ENSG00000196262:ENST00000415933:exon_44836281_44836392:PPIA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 198 134 332 91.5483120538148 72.0430615393375 19.5052505144773 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0319106545369589 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 83 79 162 38.3763126286193 42.4731482209527 -4.09683559233336 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529304590345915 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 80 86 166 36.9892169914403 46.2365917342017 -9.24737474276134 A:G G A 10 0.537634787606996 0.161283853948259 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 39 48 87 18.0322432833272 25.8064698051358 -7.77422652180865 A:C C A 10 0.537634787606996 0.106647355386269 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 C:G G C 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 55433884 A/C 1 3 5 8 1.38709563717901 2.68817393803498 -1.30107830085597 A:C A C 10 0.537634787606996 0.484061368023196 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 15 3 18 6.93547818589506 1.61290436282099 5.32257382307407 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0157641233820968 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 7 15 22 3.23655648675103 8.06452181410494 -4.82796532735391 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0524946900816706 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 56122076 A/T 1 84 74 158 38.8386778410123 39.7849742829177 -0.946296441905368 A:T:C:G A T 10 0.537634787606996 0.936443600715747 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56122062_56122196:CCT6A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 56126360 T/C 1 205 228 433 94.7848685405658 122.580731574395 -27.7958630338293 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0079788809950627 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56126313_56126395:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56126313_56126703:CCT6A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 64291976 G/A 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 A:G G A 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 64389089 A/C 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:C A C 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000198039:ENST00000527278:exon_64388032_64389502:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000476120:exon_64388032_64389635:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000319636:exon_64388032_64389416:ZNF273;ENSG00000198039:ENST00000395375:exon_64388032_64391344:ZNF273 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 64439701 C/T 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000152926:ENST00000398695:exon_64439109_64439914:ZNF117;ENSG00000152926:ENST00000282869:exon_64438360_64439914:ZNF117 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 64864607 G/A 1 4 9 13 1.84946084957202 4.83871308846296 -2.98925223889095 A:G G A 10 0.537634787606996 0.16185612659808 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 A:G A G 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 65557564 C/T 1 49 36 85 22.6558954072572 19.3548523538519 3.30104305340534 T:C C T 10 0.537634787606996 0.514751099199479 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000493708:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000249319:ENST00000450043:exon_65557544_65557650:AC068533.7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 72717933 C/T 1 47 39 86 21.7311649824712 20.9677567166728 0.763408265798343 T:C C T 10 0.537634787606996 0.914116194729825 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717823_72718033:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000478977:exon_72717928_72718033:NSUN5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 73097654 C/T 1 16 15 31 7.39784339828806 8.06452181410494 -0.666678415816877 T:C C T 10 0.537634787606996 0.858217650481407 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 13 19 32 6.01074776110905 10.2150609645329 -4.20431320342387 C:G G C 10 0.537634787606996 0.157109349002679 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 75511222 G/A 1 11 16 27 5.08601733632304 8.60215660171194 -3.51613926538889 A:G G A 10 0.537634787606996 0.182688102275838 ENSG00000005486:ENST00000466232:exon_75511147_75511442:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468644:exon_75511147_75511483:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75511147_75511554:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75511147_75511554:RHBDD2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 75609677 A/G 1 8 15 23 3.69892169914403 8.06452181410494 -4.36560011496091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0926563791565774 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75609657_75609711:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75609657_75610056:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75609657_75609729:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75609657_75609789:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75609657_75609806:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75609657_75610040:POR;ENSG00000127948:ENST00000426184:exon_75609657_75609757:POR;ENSG00000127948:ENST00000475509:exon_75609657_75609678:POR HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 75630274 T/C 1 50 36 86 23.1182606196502 19.3548523538519 3.76340826579834 T:C T C 10 0.537634787606996 0.450001848715901 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000438695:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75630208_75630320:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75630208_75630320:STYXL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 75659815 T/C 1 32 16 48 14.7956867965761 8.60215660171194 6.19353019486419 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0825119257948168 ENSG00000127952:ENST00000248600:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000359697:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000340062:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000404050:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000360591:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000431581:exon_75659739_75659845:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000441791:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000451157:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000474328:exon_75659739_75659842:STYXL1;ENSG00000127952:ENST00000460184:exon_75659739_75659842:STYXL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 75687343 G/T 1 327 309 636 151.193424452512 166.129149370562 -14.9357249180495 A:T:C:G G T 10 0.537634787606996 0.248810609918090 ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75687287_75687396:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75687287_75687396:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000461665:exon_75687287_75687493:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75687287_75687396:MDH2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 75959188 G/A 1 30 28 58 13.8709563717901 15.0537740529959 -1.18281768120577 A:G G A 10 0.537634787606996 0.793089718745709 ENSG00000170027:ENST00000307630:exon_75956116_75959550:YWHAG;ENSG00000170027:ENST00000453207:exon_75958894_75959235:YWHAG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 76111994 C/G 1 29 24 53 13.4085911593971 12.9032349025679 0.505356256829211 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 38 17 55 17.5698780709342 9.13979138931893 8.43008668161522 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0295608650378384 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 17 7 24 7.86020861068107 3.76344351324897 4.0967650974321 A:G A G 10 0.537634787606996 0.10430805333573 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 24 21 45 11.0967650974321 11.2903305397469 -0.193565442314821 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 89983808 T/G 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:G T G 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89983772_89983863:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89983772_89983863:GTPBP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 50 16 66 23.1182606196502 8.60215660171194 14.5161040179383 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000291453867090187 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 53 47 100 24.5053562568292 25.2688350175288 -0.763478760699599 T:G G T 10 0.537634787606996 0.920246374928411 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 16 17 33 7.39784339828806 9.13979138931893 -1.74194799103087 T:C C T 10 0.537634787606996 0.602245778313562 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91712698 A/G 1 10 13 23 4.62365212393004 6.98925223889095 -2.36560011496091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.403929327441943 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91712484_91713009:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91712484_91712969:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91712484_91712969:AKAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91713972 C/T 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 T:C C T 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91713954_91714017:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91713954_91714017:AKAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91715662 C/T 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000414321:exon_91715542_91715730:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000435423:exon_91715542_91715730:AKAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 17 19 36 7.86020861068107 10.2150609645329 -2.35485235385186 A:C A C 10 0.537634787606996 0.50463353840393 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 23 30 53 10.6343998850391 16.1290436282099 -5.49464374317079 A:G A G 10 0.537634787606996 0.132508951015628 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 T:C T C 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 C:G C G 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 51 42 93 23.5806258320432 22.5806610794938 0.999964752549371 A:G G A 10 0.537634787606996 0.917252285739195 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 92970847 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000480943:exon_92970739_92970887:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92970739_92970887:CCDC132 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 10 10 20 4.62365212393004 5.37634787606996 -0.752695752139921 T:C T C 10 0.537634787606996 0.824032199125029 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 93551428 C/T 1 21 33 54 9.70966946025308 17.7419479910309 -8.03227853077779 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0294952021527267 ENSG00000127920:ENST00000248564:exon_93551011_93551545:GNG11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 79 94 173 36.5268517790473 50.5376700350576 -14.0108182560103 A:T:G A T 10 0.537634787606996 0.0392187179467369 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 97599548 G/T 1 4 8 12 1.84946084957202 4.30107830085597 -2.45161745128395 T:G G T 10 0.537634787606996 0.246034893012951 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 97933601 C/T 1 20 23 43 9.24730424786008 12.3656001149609 -3.11829586710083 T:C C T 10 0.537634787606996 0.361779982238563 ENSG00000006453:ENST00000005260:exon_97933508_97933688:BAIAP2L1;ENSG00000006453:ENST00000480580:exon_97933508_97933677:BAIAP2L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 99500899 T/C 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 T:C T C 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 99500911 A/G 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000146833:ENST00000447480:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99500841_99500938:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000354241:exon_99500841_99500938:TRIM4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 99696797 T/C 1 99 100 199 45.7741560269074 53.7634787606996 -7.98932273379221 T:C T C 10 0.537634787606996 0.256441439012022 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99696646_99697026:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99696646_99696826:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99696646_99696968:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99696646_99697376:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99696646_99696826:MCM7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 40 19 59 18.4946084957202 10.2150609645329 8.27954753118723 A:T A T 10 0.537634787606996 0.0360645021897903 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 58 26 84 26.8171823187942 13.9785044777819 12.8386778410123 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00590401813574667 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 99707712 A/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G A G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000106290:ENST00000487115:exon_99707700_99707897:TAF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 100175473 T/C 1 54 60 114 24.9677214692222 32.2580872564198 -7.29036578719755 T:C T C 10 0.537634787606996 0.188576070674557 ENSG00000077454:ENST00000485071:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000310300:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000467201:exon_100175445_100178496:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000422462:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000438884:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000497245:exon_100175445_100175535:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000498539:exon_100175445_100175507:LRCH4;ENSG00000077454:ENST00000487697:exon_100175469_100176134:LRCH4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 100731505 C/G 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 C:G C G 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 100731829 T/C 1 17 21 38 7.86020861068107 11.2903305397469 -3.43012192906585 T:C T C 10 0.537634787606996 0.329123785750821 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 21 18 39 9.70966946025308 9.67742617692593 0.0322432833271549 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 28 15 43 12.9462259470041 8.06452181410494 4.88170413289917 A:G G A 10 0.537634787606996 0.168302231237408 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 102114087 C/T 1 164 38 202 75.8278948324527 20.4301219290658 55.3977729033868 T:C C T 10 0.537634787606996 4.52987598562552e-16 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 103838221 T/C 1 12 4 16 5.54838254871605 2.15053915042798 3.39784339828806 T:C T C 10 0.537634787606996 0.130574356205338 ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103838173_103838247:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103838173_103838247:ORC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 104717517 C/T 1 54 51 105 24.9677214692222 27.4193741679568 -2.45165269873458 T:C C T 10 0.537634787606996 0.695642568808108 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478990:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000476671:exon_104717410_104717640:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000482560:exon_104717410_104717640:MLL5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 105752691 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000008282:ENST00000455385:exon_105752586_105752777:SYPL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 107002806 A/G 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000164597:ENST00000347053:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000297135:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000393603:exon_107002753_107002865:COG5;ENSG00000164597:ENST00000484237:exon_107002753_107002865:COG5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 107218033 T/C 1 6 18 24 2.77419127435802 9.67742617692593 -6.9032349025679 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00655670907363702 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107217758_107218460:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107217758_107218906:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107217758_107218354:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107217758_107218295:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107217758_107218750:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107217758_107218101:DUS4L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 12 22 34 5.54838254871605 11.8279653273539 -6.27958277863786 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.0380777025149244 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 19 17 36 8.78493903546708 9.13979138931893 -0.354852353851856 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 24 29 53 11.0967650974321 15.5914088406029 -4.49464374317079 A:G G A 10 0.537634787606996 0.218786375851869 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 112407377 A/G 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 A:G A G 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 7 9 16 3.23655648675103 4.83871308846296 -1.60215660171194 A:G G A 10 0.537634787606996 0.460514092364166 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 129664312 T/C 1 9 18 27 4.16128691153704 9.67742617692593 -5.51613926538889 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0515275119939011 ENSG00000091732:ENST00000358303:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000360708:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000467642:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000311873:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000435129:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000477578:exon_129664103_129664346:ZC3HC1;ENSG00000091732:ENST00000471022:exon_129664103_129664346:ZC3HC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 129813738 T/C 1 15 12 27 6.93547818589506 6.45161745128395 0.483860734611108 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000146842:ENST00000397622:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000336804:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000462753:exon_129813665_129813779:TMEM209;ENSG00000146842:ENST00000473456:exon_129813665_129813779:TMEM209 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 8 2 10 3.69892169914403 1.07526957521399 2.62365212393004 C:G G C 10 0.537634787606996 0.119333604831037 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 12 5 17 5.54838254871605 2.68817393803498 2.86020861068107 A:G G A 10 0.537634787606996 0.224337040745635 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 6 11 17 2.77419127435802 5.91398266367696 -3.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.148072193728028 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 134849213 G/A 1 16 10 26 7.39784339828806 5.37634787606996 2.0214955222181 A:G G A 10 0.537634787606996 0.556048478872558 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 134849577 A/C 1 13 14 27 6.01074776110905 7.52688702649794 -1.51613926538889 A:C A C 10 0.537634787606996 0.569163783914877 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 134853484 G/A 1 21 8 29 9.70966946025308 4.30107830085597 5.40859115939712 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0607848542485347 ENSG00000122783:ENST00000487774:exon_134853056_134853812:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000486115:exon_134853348_134853812:C7orf49 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 55 49 104 25.4300866816152 26.3441045927428 -0.914017911127587 T:C T C 10 0.537634787606996 0.921729563465063 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 138761034 G/C 1 22 16 38 10.1720346726461 8.60215660171194 1.56987807093415 C:G G C 10 0.537634787606996 0.629981554630404 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000460845:exon_138761032_138761155:ZC3HAV1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 138764233 C/T 1 3 13 16 1.38709563717901 6.98925223889095 -5.60215660171194 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00535376088517454 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 139102490 A/G 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 A:G A G 10 0.537634787606996 0.241086138959429 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 23 9 32 10.6343998850391 4.83871308846296 5.79568679657613 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0499768893743382 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 10 13 23 4.62365212393004 6.98925223889095 -2.36560011496091 T:C C T 10 0.537634787606996 0.403929327441943 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 9 3 12 4.16128691153704 1.61290436282099 2.54838254871605 A:G G A 10 0.537634787606996 0.159650386833704 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 140373326 A/G 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G A G 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 140374049 T/C 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C T C 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000476491:exon_140372953_140374063:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000483369:exon_140373619_140374063:ADCK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 140394587 C/T 1 30 29 59 13.8709563717901 15.5914088406029 -1.72045246881276 T:C C T 10 0.537634787606996 0.696220777255589 ENSG00000133597:ENST00000072869:exon_140394463_140394921:ADCK2;ENSG00000133597:ENST00000473512:exon_140394463_140394881:ADCK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 0 0 420 420 0 225.806610794938 -225.806610794938 A G A 10 0.537634787606996 1.96681464281695e-141 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 513 0 513 237.193353957611 0 237.193353957611 T T 10 0.537634787606996 5.96163537215103e-139 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 143884103 G/A 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 A:G G A 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000213214:ENST00000378115:exon_143883176_143885488:ARHGEF35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 148709346 T/C 1 101 87 188 46.6988864516934 46.7742265218087 -0.0753400701152458 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000155660:ENST00000414033:exon_148709247_148709452:PDIA4;ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148709247_148709452:PDIA4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 149129829 C/T 1 17 23 40 7.86020861068107 12.3656001149609 -4.50539150427984 T:C C T 10 0.537634787606996 0.157480961867148 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 149152673 G/A 1 15 12 27 6.93547818589506 6.45161745128395 0.483860734611108 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149152268_149153128:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149152268_149153128:ZNF777 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150028098 A/G 1 11 5 16 5.08601733632304 2.68817393803498 2.39784339828806 A:G A G 10 0.537634787606996 0.317062980975179 ENSG00000188707:ENST00000343855:exon_150027401_150029808:C7orf29 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 T:C T C 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 28 13 41 12.9462259470041 6.98925223889095 5.95697370811316 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0836768836425696 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 23 11 34 10.6343998850391 5.91398266367696 4.72041722136214 T:C C T 10 0.537634787606996 0.122195356082048 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 37 30 67 17.1075128585411 16.1290436282099 0.978469230331267 T:C T C 10 0.537634787606996 0.902618426856129 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 16 7 23 7.39784339828806 3.76344351324897 3.63439988503909 A:G A G 10 0.537634787606996 0.146624605643604 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150094853 G/A 1 7 17 24 3.23655648675103 9.13979138931893 -5.9032349025679 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0224233335583136 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150217089 G/A 1 24 11 35 11.0967650974321 5.91398266367696 5.18278243375514 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0904924146884516 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150217335 G/T 1 14 37 51 6.47311297350206 19.8924871414589 -13.4193741679568 A:T:G G T 10 0.537634787606996 0.000195265598435574 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150269542 G/T 1 21 32 53 9.70966946025308 17.2043132034239 -7.49464374317079 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0527426096113481 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000478135:exon_150269217_150269621:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000479232:exon_150269217_150269569:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150324825 C/T 1 24 13 37 11.0967650974321 6.98925223889095 4.10751285854115 T:C C T 10 0.537634787606996 0.190467409608763 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150325494 G/A 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000477013:exon_150325475_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 30 47 77 13.8709563717901 25.2688350175288 -11.3978786457387 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0114756683812618 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150389677 G/C 1 38 26 64 17.5698780709342 13.9785044777819 3.59137359315226 C:G G C 10 0.537634787606996 0.383200650449217 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 38 33 71 17.5698780709342 17.7419479910309 -0.172069920096718 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150418045 G/A 1 13 23 36 6.01074776110905 12.3656001149609 -6.35485235385186 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0436489535595628 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150439500 C/T 1 53 86 139 24.5053562568292 46.2365917342017 -21.7312354773724 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.000236024130410042 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150439271_150439605:GIMAP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150440043 C/T 1 88 143 231 40.6881386905844 76.8817746278004 -36.1936359372161 T:C C T 10 0.537634787606996 2.34098058096715e-06 ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150439271_150441151:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150439271_150440736:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000479556:exon_150439280_150440703:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150439271_150440734:GIMAP5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 10 5 15 4.62365212393004 2.68817393803498 1.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.4390253164823 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150773165 C/T 1 44 50 94 20.3440693452922 26.8817393803498 -6.53767003505762 T:C C T 10 0.537634787606996 0.180275178744589 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150773100_150773273:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469467:exon_150773070_150773273:SLC4A2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150774308 G/A 1 64 67 131 29.5913735931523 36.0215307696687 -6.43015717651648 A:G G A 10 0.537634787606996 0.29304009578638 ENSG00000164896:ENST00000483105:exon_150774245_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000489884:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000467237:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000353841:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297532:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482571:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000297530:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000460980:exon_150774188_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000469237:exon_150774000_150774867:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000482806:exon_150774188_150774488:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000483953:exon_150774000_150774323:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000466855:exon_150774000_150775179:FASTK;ENSG00000164896:ENST00000459800:exon_150774188_150774599:FASTK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150916228 G/A 1 29 34 63 13.4085911593971 18.2795827786379 -4.87099161924075 A:G G A 10 0.537634787606996 0.255472432331173 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150916150_150916245:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000473874:exon_150916150_150916245:ABCF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150931268 C/G 1 28 18 46 12.9462259470041 9.67742617692593 3.26879977007818 C:G C G 10 0.537634787606996 0.376572573900051 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150931172_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150929585_150931360:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150929585_150931360:CHPF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 150934975 C/G 1 34 37 71 15.7204172213621 19.8924871414589 -4.17206992009672 A:C:G C G 10 0.537634787606996 0.342318814405519 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000377851:exon_150934460_150935359:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 17 11 28 7.86020861068107 5.91398266367696 1.94622594700411 T:C C T 10 0.537634787606996 0.570676975485111 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 151074296 A/G 1 23 28 51 10.6343998850391 15.0537740529959 -4.4193741679568 A:G A G 10 0.537634787606996 0.261118975927049 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151074133_151075535:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000460712:exon_151074133_151074367:NUB1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 154738409 T/C 1 21 19 40 9.70966946025308 10.2150609645329 -0.50539150427984 T:C T C 10 0.537634787606996 0.87555079212786 ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 156742965 G/C 1 13 14 27 6.01074776110905 7.52688702649794 -1.51613926538889 C:G G C 10 0.537634787606996 0.569163783914877 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 12 13 25 5.54838254871605 6.98925223889095 -1.4408696901749 C:G G C 10 0.537634787606996 0.689190544257236 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 15 17 32 6.93547818589506 9.13979138931893 -2.20431320342387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.48073676974361 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158526880 G/A 1 28 21 49 12.9462259470041 11.2903305397469 1.6558954072572 A:G G A 10 0.537634787606996 0.669607584542965 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158523686_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158523689_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158526140_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158526302_158526943:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158526304_158526943:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 19 18 37 8.78493903546708 9.67742617692593 -0.892487141458853 A:G A G 10 0.537634787606996 0.869371317266974 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 A:G G A 10 0.537634787606996 0.261199351101203 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 C:G G C 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 T:C T C 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158536334 G/A 1 19 10 29 8.78493903546708 5.37634787606996 3.40859115939712 A:G G A 10 0.537634787606996 0.263957238347242 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 19 7 26 8.78493903546708 3.76344351324897 5.0214955222181 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0509951335840506 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 381344 C/G 1 14 5 19 6.47311297350206 2.68817393803498 3.78493903546708 C:G C G 10 0.537634787606996 0.106639303162675 ENSG00000147364:ENST00000518240:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_381341_381444:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000524125:exon_381341_381444:FBXO25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 623593 G/A 1 64 68 132 29.5913735931523 36.5591655572757 -6.96779196412347 A:G G A 10 0.537634787606996 0.256399808024298 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_623289_624047:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_623289_623657:ERICH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 6303025 G/A 1 29 23 52 13.4085911593971 12.3656001149609 1.04299104443621 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78320169659137 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 6478986 C/T 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6478975_6479142:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 11 4 15 5.08601733632304 2.15053915042798 2.93547818589506 A:C C A 10 0.537634787606996 0.194249391282824 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 8176221 C/T 1 19 43 62 8.78493903546708 23.1182958671008 -14.3333568316338 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000299115023588946 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 20 37 57 9.24730424786008 19.8924871414589 -10.6451828935988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00509844247716411 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 8234077 G/C 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 C:G G C 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 8234192 G/C 1 7 1 8 3.23655648675103 0.537634787606996 2.69892169914403 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0765265846100734 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 8234714 C/T 1 3 11 14 1.38709563717901 5.91398266367696 -4.52688702649794 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0280872426951532 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 10623240 T/C 1 47 49 96 21.7311649824712 26.3441045927428 -4.61293961027162 T:C T C 10 0.537634787606996 0.358318929724127 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 30 26 56 13.8709563717901 13.9785044777819 -0.107548105991777 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 109 93 202 50.3978081508374 50.0000352474506 0.397772903386809 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11418773 C/T 1 9 9 18 4.16128691153704 4.83871308846296 -0.677426176925929 T:C C T 10 0.537634787606996 0.815578185118553 ENSG00000136573:ENST00000526097:exon_11417842_11418961:BLK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11637276 G/A 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000154328:ENST00000530433:exon_11637107_11637461:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11637107_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11637254_11637459:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11637107_11637459:NEIL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11643553 G/T 1 13 9 22 6.01074776110905 4.83871308846296 1.17203467264609 A:T:G G T 10 0.537634787606996 0.673592113272102 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11643472_11643606:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11643803 C/T 1 10 14 24 4.62365212393004 7.52688702649794 -2.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.30623055932798 ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 11667179 C/T 1 150 154 304 69.3547818589506 82.7957572914774 -13.4409754325268 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.134669333313421 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17125768 T/C 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000324815:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000519381:exon_17125767_17125782:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000518038:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17125767_17125881:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17125767_17125881:VPS37A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17142065 C/T 1 12 7 19 5.54838254871605 3.76344351324897 1.78493903546708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.493910634269085 ENSG00000155975:ENST00000324849:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000520140:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000425020:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521829:exon_17141982_17142125:VPS37A;ENSG00000155975:ENST00000521976:exon_17141982_17142125:VPS37A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17794792 G/A 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 A:G G A 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518936:exon_17794643_17794830:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17794685_17794888:PCM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17817553 G/T 1 26 25 51 12.0214955222181 13.4408696901749 -1.4193741679568 T:G G T 10 0.537634787606996 0.779165312287783 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17819572 C/T 1 19 15 34 8.78493903546708 8.06452181410494 0.720417221362135 T:C C T 10 0.537634787606996 0.864562502288305 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 8 9 17 3.69892169914403 4.83871308846296 -1.13979138931893 A:T A T 10 0.537634787606996 0.632157097796148 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17830068 C/G 1 57 55 112 26.3548171064012 29.5699133183848 -3.21509621198355 C:G C G 10 0.537634787606996 0.570281007982929 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17829838_17830196:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523540:exon_17829838_17830151:PCM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 30 28 58 13.8709563717901 15.0537740529959 -1.18281768120577 T:C T C 10 0.537634787606996 0.793089718745709 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 29 21 50 13.4085911593971 11.2903305397469 2.1182606196502 T:C C T 10 0.537634787606996 0.5735948475003 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 21768285 G/A 1 3 6 9 1.38709563717901 3.22580872564198 -1.83871308846296 A:G G A 10 0.537634787606996 0.318351477973387 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21768184_21768368:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21768184_21768368:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21768184_21768368:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21768184_21768368:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000523932:exon_21768184_21768368:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000522011:exon_21768184_21768586:DOK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 21846586 G/C 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 C:G G C 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21846514_21846594:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000518808:exon_21845859_21846594:XPO7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 21862551 A/G 1 23 31 54 10.6343998850391 16.6666784158169 -6.03227853077778 A:G A G 10 0.537634787606996 0.103344976581994 ENSG00000130227:ENST00000434536:exon_21862506_21864095:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000252512:exon_21862506_21864096:XPO7;ENSG00000130227:ENST00000433566:exon_21862506_21864095:XPO7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 21959638 A/G 0 8 0 8 3.69892169914403 0 3.69892169914403 A A 10 0.537634787606996 0.00906942346070992 ENSG00000158863:ENST00000496599:exon_21959219_21959826:FAM160B2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 13 21 34 6.01074776110905 11.2903305397469 -5.27958277863786 T:C T C 10 0.537634787606996 0.084822142447569 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 22105502 T/C 1 25 29 54 11.5591303098251 15.5914088406029 -4.03227853077778 T:C T C 10 0.537634787606996 0.278314475980930 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000519237:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22105370_22105521:POLR3D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 22471824 G/A 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000522599:exon_22471605_22471827:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000521020:exon_22471398_22471827:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 22473725 G/C 1 31 27 58 14.3333215841831 14.5161392653889 -0.182817681205769 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473525_22473761:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000413738:exon_22473584_22473761:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 20 17 37 9.24730424786008 9.13979138931893 0.107512858541147 C:G G C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 22926313 G/A 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22926264_22926692:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22926264_22926534:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22926264_22926544:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000519028:exon_22926264_22926535:TNFRSF10B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 23294761 T/C 1 4 9 13 1.84946084957202 4.83871308846296 -2.98925223889095 T:C T C 10 0.537634787606996 0.16185612659808 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23294447_23294771:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23294547_23294771:ENTPD4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 26240637 C/G 1 20 9 29 9.24730424786008 4.83871308846296 4.40859115939711 C:G C G 10 0.537634787606996 0.135169321383582 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27145133 G/A 1 9 2 11 4.16128691153704 1.07526957521399 3.08601733632304 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0736764045328896 ENSG00000104228:ENST00000305364:exon_27142404_27145644:TRIM35;ENSG00000104228:ENST00000380544:exon_27143269_27145644:TRIM35 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 215 188 403 99.4085206644959 101.075340070115 -1.66681940561939 A:C A C 10 0.537634787606996 0.880945462215913 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 112 98 210 51.7849037880165 52.6882091854856 -0.903305397469161 A:T:C T C 10 0.537634787606996 0.944851374897559 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 170 102 272 78.6020861068107 54.8387483359136 23.7633377708971 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00418772461434453 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 175 111 286 80.9139121687757 59.6774614243766 21.2364507443991 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0126478050181210 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 26 17 43 12.0214955222181 9.13979138931893 2.88170413289917 C:G C G 10 0.537634787606996 0.445316834524763 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 27679981 T/C 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C T C 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27679836_27680005:PBK;ENSG00000168078:ENST00000521226:exon_27679836_27680005:PBK HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 29197672 A/G 1 35 64 99 16.1827824337551 34.4086264068477 -18.2258439730926 A:G A G 10 0.537634787606996 0.000257329832637955 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29197615_29197760:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000462477:exon_29197615_29197760:DUSP4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 33246538 A/G 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 33246591 G/C 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 C:G G C 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000172728:ENST00000327671:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000380081:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518672:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000517942:exon_33246481_33246768:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000524021:exon_33246481_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000520767:exon_33246414_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000335589:exon_33246433_33247316:FUT10;ENSG00000172728:ENST00000518076:exon_33246481_33247316:FUT10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G A G 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 T:C T C 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 11 15 26 5.08601733632304 8.06452181410494 -2.9785044777819 A:G A G 10 0.537634787606996 0.325516303025833 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 33408901 C/G 1 3 13 16 1.38709563717901 6.98925223889095 -5.60215660171194 C:G C G 10 0.537634787606996 0.00535376088517454 ENSG00000133874:ENST00000256257:exon_33408862_33408907:RNF122 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 37635649 A/G 1 18 10 28 8.32257382307407 5.37634787606996 2.94622594700411 A:G A G 10 0.537634787606996 0.343738653564769 ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37635491_37637283:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000437582:exon_37635491_37637285:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000521494:exon_37635491_37635880:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000517377:exon_37635491_37635918:PROSC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 28 24 52 12.9462259470041 12.9032349025679 0.0429910444362083 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 59329468 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000215114:ENST00000399598:exon_59329409_59329512:UBXN2B;ENSG00000215114:ENST00000522978:exon_59329409_59329512:UBXN2B;ENSG00000215114:ENST00000520732:exon_59329409_59329512:UBXN2B;ENSG00000215114:ENST00000523409:exon_59329409_59329512:UBXN2B HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 66525548 T/C 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66525479_66525668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66525479_66525668:ARMC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 67341938 G/T 1 25 23 48 11.5591303098251 12.3656001149609 -0.806469805135809 T:G G T 10 0.537634787606996 0.885219555592337 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 67592152 T/C 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 T:C T C 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000104205:ENST00000520044:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000104205:ENST00000519289:exon_67591956_67592259:SGK3;ENSG00000213865:ENST00000521113:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000519561:exon_67591956_67593393:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000390159:exon_67591956_67593235:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000396609:exon_67591956_67592259:C8orf44;ENSG00000213865:ENST00000518860:exon_67591774_67592259:C8orf44 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 0 9 0 9 4.16128691153704 0 4.16128691153704 T T 10 0.537634787606996 0.00471882013301929 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 19 31 50 8.78493903546708 16.6666784158169 -7.8817393803498 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0324618391789648 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 39 39 78 18.0322432833272 20.9677567166728 -2.93551343334569 A:G A G 10 0.537634787606996 0.57049163674468 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 17 10 27 7.86020861068107 5.37634787606996 2.48386073461111 C:G C G 10 0.537634787606996 0.440806079300057 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 3 9 12 1.38709563717901 4.83871308846296 -3.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0780364380088052 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 95877787 T/C 1 12 16 28 5.54838254871605 8.60215660171194 -3.05377405299589 T:C T C 10 0.537634787606996 0.261199351101203 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 95888307 C/T 1 26 31 57 12.0214955222181 16.6666784158169 -4.64518289359877 T:C C T 10 0.537634787606996 0.233447914048644 ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95888302_95888375:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000521155:exon_95888302_95888370:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523998:exon_95888179_95888513:INTS8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 98656966 G/T 1 61 36 97 28.2042779559732 19.3548523538519 8.84942560212139 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0830577877500991 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98656407_98657115:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519934:exon_98656774_98657115:MTDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 98703317 A/G 1 201 142 343 92.9354076909938 76.3441398401934 16.5912678508004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0740770068327149 ENSG00000147649:ENST00000336273:exon_98703180_98703416:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519934:exon_98703180_98703416:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000522313:exon_98703180_98703392:MTDH;ENSG00000147649:ENST00000519293:exon_98703247_98703416:MTDH HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 99054018 G/A 1 4088 3908 7996 1890.1489882626 2101.07674996814 -210.92776170554 A:T:C:G G A 10 0.537634787606996 2.33042625072771e-06 ENSG00000156482:ENST00000521534:exon_99053947_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521291:exon_99053949_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000396070:exon_99053949_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99053949_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000287038:exon_99053949_99054078:RPL30 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:C A C 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 99168383 T/C 1 13 5 18 6.01074776110905 2.68817393803498 3.32257382307407 T:C T C 10 0.537634787606996 0.155898486841443 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 8 10 18 3.69892169914403 5.37634787606996 -1.67742617692593 T:C T C 10 0.537634787606996 0.483393674755954 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 101253184 G/A 1 24 12 36 11.0967650974321 6.45161745128395 4.64514764614814 A:G G A 10 0.537634787606996 0.134260904330002 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 103845372 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000155096:ENST00000337198:exon_103845284_103845446:AZIN1;ENSG00000155096:ENST00000347770:exon_103845284_103845446:AZIN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 2 15 17 0.924730424786008 8.06452181410494 -7.13979138931893 A:G G A 10 0.537634787606996 0.000439020129774973 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 118819578 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000182197:ENST00000378204:exon_118819456_118819616:EXT1;ENSG00000182197:ENST00000437196:exon_118819456_118819616:EXT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 120847188 T/C 1 5 13 18 2.31182606196502 6.98925223889095 -4.67742617692593 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0327513793510114 ENSG00000136982:ENST00000313655:exon_120846216_120847241:DSCC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 123963996 C/T 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 T:C C T 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 123964038 T/C 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 T:C T C 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 123964767 G/A 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 123966114 G/A 1 3 7 10 1.38709563717901 3.76344351324897 -2.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.203577684288214 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 124138855 G/A 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000378080:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124138748_124138927:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518577:exon_124138748_124138927:WDR67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 125463250 T/C 1 10 6 16 4.62365212393004 3.22580872564198 1.39784339828806 T:C T C 10 0.537634787606996 0.618387357096005 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 125463435 C/G 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 C:G C G 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000521443:exon_125463061_125463498:TRMT12;ENSG00000183665:ENST00000522518:exon_125463158_125463498:TRMT12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 125498547 C/T 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 125499363 G/A 1 14 12 26 6.47311297350206 6.45161745128395 0.0214955222181041 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 125528135 G/A 1 21 12 33 9.70966946025308 6.45161745128395 3.25805200896913 A:C:G G A 10 0.537634787606996 0.29687421642475 ENSG00000147687:ENST00000276692:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523214:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519548:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522810:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000517678:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519776:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521546:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000521973:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520321:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000522310:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000519232:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000520938:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523888:exon_125528128_125528271:TATDN1;ENSG00000147687:ENST00000523152:exon_125528128_125528271:TATDN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 128098838 G/A 0 14 0 14 6.47311297350206 0 6.47311297350206 G G 10 0.537634787606996 0.000188994214369233 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 T:C C T 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 56 46 102 25.8924518940082 24.7312002299218 1.16125166408641 T:G G T 10 0.537634787606996 0.843131668230048 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 143808951 C/T 1 8 4 12 3.69892169914403 2.15053915042798 1.54838254871605 T:C C T 10 0.537634787606996 0.40395764321088 ENSG00000130193:ENST00000336138:exon_143808621_143809277:C8orf55;ENSG00000130193:ENST00000443814:exon_143808765_143809118:C8orf55 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144620183 T/C 1 19 14 33 8.78493903546708 7.52688702649794 1.25805200896913 T:C T C 10 0.537634787606996 0.728787781432511 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144623574 T/C 1 2 7 9 0.924730424786008 3.76344351324897 -2.83871308846296 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0908824132809818 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144623546_144623623:ZC3H3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144658711 G/A 0 0 24 24 0 12.9032349025679 -12.9032349025679 A G A 10 0.537634787606996 9.11262764492327e-09 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144662353 G/A 1 965 959 1924 446.182429959249 515.591761315109 -69.4093313558603 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00159834348271069 ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 A:C C A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144671922 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526710:exon_144671351_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531281:exon_144671481_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532596:exon_144671681_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524883:exon_144671710_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531670:exon_144671715_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528519:exon_144671780_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529832:exon_144671814_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530306:exon_144671865_144672251:EEF1D HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144681777 G/T 1 3 10 13 1.38709563717901 5.37634787606996 -3.98925223889095 T:G G T 10 0.537634787606996 0.047121248353007 ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144687092 T/C 1 20 26 46 9.24730424786008 13.9785044777819 -4.73120022992182 T:C T C 10 0.537634787606996 0.183876982071972 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144689146 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144886809 C/T 1 9 13 22 4.16128691153704 6.98925223889095 -2.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.285801135067994 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144990528 A/G 1 11 12 23 5.08601733632304 6.45161745128395 -1.36560011496091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.67699680546269 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144991176 T/C 1 16 25 41 7.39784339828806 13.4408696901749 -6.04302629188684 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0615733919934969 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144992103 T/C 1 13 4 17 6.01074776110905 2.15053915042798 3.86020861068107 T:C T C 10 0.537634787606996 0.0863642416395042 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144992862 A/G 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144993324 C/T 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144995494 C/T 1 5 7 12 2.31182606196502 3.76344351324897 -1.45161745128395 T:C C T 10 0.537634787606996 0.564673248580388 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144996408 T/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:G T G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527303:exon_144996100_144996563:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144997656 C/T 1 8 3 11 3.69892169914403 1.61290436282099 2.08601733632304 T:C C T 10 0.537634787606996 0.241086138959429 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144997927 G/A 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144998169 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144998190 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 144998444 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145057852 C/T 1 29 19 48 13.4085911593971 10.2150609645329 3.19353019486419 T:C C T 10 0.537634787606996 0.387551334462482 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145057868 A/G 1 28 21 49 12.9462259470041 11.2903305397469 1.6558954072572 A:G A G 10 0.537634787606996 0.669607584542965 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145058037 A/G 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:G A G 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058010_145058272:PARP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145058539 T/C 1 10 16 26 4.62365212393004 8.60215660171194 -3.9785044777819 T:C T C 10 0.537634787606996 0.167373121747452 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145058378_145058599:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528963:exon_145058378_145058599:PARP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145060112 G/A 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 A:G G A 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000533665:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000526985:exon_145059660_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525879:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528625:exon_145059889_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525486:exon_145059886_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531537:exon_145059892_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529842:exon_145059893_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528914:exon_145059918_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528136:exon_145059939_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000529311:exon_145060005_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000528580:exon_145060017_145060401:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000530478:exon_145060059_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000532311:exon_145060076_145060143:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000531707:exon_145060082_145060143:PARP10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145623963 G/A 1 13 9 22 6.01074776110905 4.83871308846296 1.17203467264609 A:G G A 10 0.537634787606996 0.673592113272102 ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145623915_145624028:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000527916:exon_145623913_145624028:CPSF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145737816 C/T 1 14 16 30 6.47311297350206 8.60215660171194 -2.12904362820988 T:C C T 10 0.537634787606996 0.467935176210095 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145737775_145737944:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000531875:exon_145737775_145737944:RECQL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 145741765 G/A 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 A:G G A 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 146068322 C/T 1 34 39 73 15.7204172213621 20.9677567166728 -5.24733949531071 T:C C T 10 0.537634787606996 0.240985939341953 ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 8 146076708 C/T 1 20 16 36 9.24730424786008 8.60215660171194 0.645147646148143 T:C C T 10 0.537634787606996 0.868665308863489 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 421032 C/G 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_420949_421078:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000493666:exon_420949_421078:DOCK8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 50 46 96 23.1182606196502 24.7312002299218 -1.61293961027162 A:G A G 10 0.537634787606996 0.759578121279193 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 14 14 28 6.47311297350206 7.52688702649794 -1.05377405299589 A:G A G 10 0.537634787606996 0.708696110001731 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 6012734 A/C 1 5 5 10 2.31182606196502 2.68817393803498 -0.376347876069961 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000137040:ENST00000259569:exon_6011020_6015618:RANBP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 6984169 C/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 C:G C G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 6984172 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 5 9 14 2.31182606196502 4.83871308846296 -2.52688702649794 A:G G A 10 0.537634787606996 0.191313679302219 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 7046917 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7046862_7046917:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7046862_7046917:KDM4C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 7174673 G/A 1 12 19 31 5.54838254871605 10.2150609645329 -4.66667841581688 A:G G A 10 0.537634787606996 0.105911893174481 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7174553_7175647:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7174553_7175648:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7174553_7175647:KDM4C HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 15479635 T/C 1 35 55 90 16.1827824337551 29.5699133183848 -13.3871308846296 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00571174993323497 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15479589_15479685:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15479589_15479685:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380715:exon_15479589_15479685:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380716:exon_15479589_15479685:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000397519:exon_15479589_15479685:PSIP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 20948311 A/G 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G A G 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20948270_20948392:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20948270_20948392:KIAA1797 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 21816758 G/A 1 2 6 8 0.924730424786008 3.22580872564198 -2.30107830085597 A:G G A 10 0.537634787606996 0.155602396825503 ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 27009100 T/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_27009018_27009156:IFT74 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 27062721 C/T 1 8 6 14 3.69892169914403 3.22580872564198 0.473112973502056 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27062616_27062923:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27062616_27062923:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27062616_27062928:IFT74 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 32425910 A/G 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G A G 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000122729:ENST00000432017:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32425836_32425995:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379921:exon_32425836_32425943:ACO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 22 14 36 10.1720346726461 7.52688702649794 2.64514764614814 T:C T C 10 0.537634787606996 0.407498697034498 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 32457189 T/C 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 T:C T C 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32455300_32457416:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32455703_32457416:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32455703_32457416:DDX58 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 32552462 C/G 1 62 76 138 28.6666431683662 40.8602438581317 -12.1936006897655 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0403886043053631 ENSG00000197579:ENST00000360538:exon_32552432_32552551:TOPORS;ENSG00000197579:ENST00000379858:exon_32552432_32552551:TOPORS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 33941759 T/C 1 13 14 27 6.01074776110905 7.52688702649794 -1.51613926538889 T:C T C 10 0.537634787606996 0.569163783914877 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33941647_33941860:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379225:exon_33941647_33941860:UBAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 33971740 A/G 1 13 10 23 6.01074776110905 5.37634787606996 0.634399885039091 A:G A G 10 0.537634787606996 0.837187872661612 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_33971649_33971752:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000421278:exon_33971649_33971752:UBAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 34017106 C/T 1 9 4 13 4.16128691153704 2.15053915042798 2.01074776110905 T:C C T 10 0.537634787606996 0.40524896228547 ENSG00000137073:ENST00000379238:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000449054:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000360802:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379239:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000431417:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000379260:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000351580:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000412543:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000480885:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000459988:exon_34017048_34017187:UBAP2;ENSG00000137073:ENST00000418786:exon_34017048_34017146:UBAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 34107505 C/T 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 T:C C T 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G G A 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 35650458 G/A 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 A:G G A 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 35712003 G/A 1 23 23 46 10.6343998850391 12.3656001149609 -1.73120022992182 A:G G A 10 0.537634787606996 0.658565954713003 ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35712002_35712121:TLN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 32 14 46 14.7956867965761 7.52688702649794 7.26879977007818 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0376577308641342 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 37 20 57 17.1075128585411 10.7526957521399 6.35481710640123 T:C C T 10 0.537634787606996 0.110413250996330 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 41 36 77 18.9569737081132 19.3548523538519 -0.397878645738693 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 74 72 146 34.2150257170823 38.7097047077037 -4.49467899062142 A:G G A 10 0.537634787606996 0.45658837482906 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 37537557 G/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 37782111 C/T 1 28 4 32 12.9462259470041 2.15053915042798 10.7956867965761 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000107335271662209 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 72913078 G/A 1 6 4 10 2.77419127435802 2.15053915042798 0.62365212393004 A:G G A 10 0.537634787606996 0.760798936826728 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72912882_72913137:SMC5 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 77563087 C/T 1 19 12 31 8.78493903546708 6.45161745128395 2.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.472956711179478 ENSG00000135045:ENST00000376854:exon_77561497_77563122:C9orf40 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 7 4 11 3.23655648675103 2.15053915042798 1.08601733632304 A:C A C 10 0.537634787606996 0.561464717515668 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 41 37 78 18.9569737081132 19.8924871414589 -0.935513433345687 A:C C A 10 0.537634787606996 0.909690815972197 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 31 29 60 14.3333215841831 15.5914088406029 -1.25808725641976 A:C C A 10 0.537634787606996 0.796223030103804 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 86571378 A/T 1 14 9 23 6.47311297350206 4.83871308846296 1.63439988503909 A:T A T 10 0.537634787606996 0.536978589431628 ENSG00000165118:ENST00000376344:exon_86571079_86571632:C9orf64 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 88692336 C/T 1 8 7 15 3.69892169914403 3.76344351324897 -0.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88692313_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88692327_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000470762:exon_88692322_88692506:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000472919:exon_88692327_88692454:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000486130:exon_88692325_88692506:GOLM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 90321583 C/T 1 4 11 15 1.84946084957202 5.91398266367696 -4.06452181410494 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0401081696281839 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 94172147 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000165030:ENST00000375724:exon_94171327_94173370:NFIL3;ENSG00000165030:ENST00000297689:exon_94171331_94173188:NFIL3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 95768448 G/A 1 8 11 19 3.69892169914403 5.91398266367696 -2.21506096453292 A:G G A 10 0.537634787606996 0.361149326694919 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95768306_95768462:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95768306_95768462:FGD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 95782667 C/T 1 7 12 19 3.23655648675103 6.45161745128395 -3.21506096453292 T:C C T 10 0.537634787606996 0.169093333030703 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 95797806 G/T 1 11 23 34 5.08601733632304 12.3656001149609 -7.27958277863786 T:G G T 10 0.537634787606996 0.0151808108887272 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95797620_95798518:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95797620_95798518:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95797620_95798518:FGD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 95838070 G/C 1 6 15 21 2.77419127435802 8.06452181410494 -5.29033053974692 C:G G C 10 0.537634787606996 0.0269830701497456 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95838066_95838254:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95838066_95838254:SUSD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 95840256 A/G 1 31 25 56 14.3333215841831 13.4408696901749 0.892451894008223 A:G A G 10 0.537634787606996 0.893628711172208 ENSG00000157303:ENST00000375472:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000465709:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000375469:exon_95840128_95840275:SUSD3;ENSG00000157303:ENST00000471462:exon_95840125_95840275:SUSD3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 100459578 T/C 1 7 21 28 3.23655648675103 11.2903305397469 -8.05377405299589 T:C T C 10 0.537634787606996 0.00361032442954602 ENSG00000136936:ENST00000375128:exon_100459403_100459639:XPA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 100672338 C/T 1 8 8 16 3.69892169914403 4.30107830085597 -0.602156601711936 T:C C T 10 0.537634787606996 0.806041713335304 ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 100895443 C/T 1 1 7 8 0.462365212393004 3.76344351324897 -3.30107830085597 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0284994505523469 ENSG00000106789:ENST00000343933:exon_100895320_100895499:CORO2A;ENSG00000106789:ENST00000375077:exon_100895320_100895499:CORO2A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 103064530 G/A 1 13 14 27 6.01074776110905 7.52688702649794 -1.51613926538889 A:G G A 10 0.537634787606996 0.569163783914877 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103064366_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000477648:exon_103064368_103064586:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103064372_103064586:TEX10 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 107515214 G/A 1 10 8 18 4.62365212393004 4.30107830085597 0.322573823074071 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136783:ENST00000374767:exon_107515187_107515345:NIPSNAP3A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 8 5 13 3.69892169914403 2.68817393803498 1.01074776110905 T:G T G 10 0.537634787606996 0.78230937649714 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 111656228 T/A 1 11 5 16 5.08601733632304 2.68817393803498 2.39784339828806 A:T T A 10 0.537634787606996 0.317062980975179 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111656223_111656346:IKBKAP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 112900199 T/C 1 15 13 28 6.93547818589506 6.98925223889095 -0.0537740529958883 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 114694486 A/G 1 6 9 15 2.77419127435802 4.83871308846296 -2.06452181410494 A:G A G 10 0.537634787606996 0.310982650884617 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114694450_114694639:UGCG HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 31 46 77 14.3333215841831 24.7312002299218 -10.3978786457387 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0217076590436670 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 115950156 G/A 1 2 10 12 0.924730424786008 5.37634787606996 -4.45161745128395 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0165483848773995 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950073_115950179:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115948716_115950179:FKBP15 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 116044998 A/G 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136875:ENST00000374199:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000374198:exon_116044926_116045013:PRPF4;ENSG00000136875:ENST00000488937:exon_116044926_116045456:PRPF4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 116152940 G/A 1 6 3 9 2.77419127435802 1.61290436282099 1.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518872038882255 ENSG00000148218:ENST00000409155:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000482847:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000277315:exon_116152873_116152956:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000468504:exon_116152873_116153213:ALAD;ENSG00000148218:ENST00000464749:exon_116152908_116153213:ALAD HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 116346287 C/T 1 15 15 30 6.93547818589506 8.06452181410494 -1.12904362820988 A:T:C C T 10 0.537634787606996 0.71689690634553 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 54 75 129 24.9677214692222 40.3226090705247 -15.3548876013025 A:G A G 10 0.537634787606996 0.00786484649404173 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 A:G G A 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 119187839 C/T 1 7 11 18 3.23655648675103 5.91398266367696 -2.67742617692593 T:C C T 10 0.537634787606996 0.241209079822295 ENSG00000148219:ENST00000288520:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000341734:exon_119187507_119187905:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373986:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000361209:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000313400:exon_119187507_119188367:ASTN2;ENSG00000148219:ENST00000373996:exon_119187507_119188367:ASTN2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123220829 A/G 1 7 5 12 3.23655648675103 2.68817393803498 0.548382548716048 A:G A G 10 0.537634787606996 0.781974621542372 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123220728_123220900:CDK5RAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 11 10 21 5.08601733632304 5.37634787606996 -0.290330539746916 C:G C G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123301346 T/G 1 7 6 13 3.23655648675103 3.22580872564198 0.0107477611090521 T:G T G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123301315_123301442:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123301319_123301398:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123301319_123301442:CDK5RAP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123671520 G/A 1 141 136 277 65.1934949474136 73.1183311145515 -7.92483616713788 A:G G A 10 0.537634787606996 0.366118643315273 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 6 8 14 2.77419127435802 4.30107830085597 -1.52688702649794 A:T T A 10 0.537634787606996 0.435105472612624 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 123929770 C/T 1 25 25 50 11.5591303098251 13.4408696901749 -1.8817393803498 T:C C T 10 0.537634787606996 0.671003231617984 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123929767_123929955:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123929767_123929955:CEP110 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 124914613 C/T 1 27 45 72 12.4838607346111 24.1935654423148 -11.7097047077037 T:C C T 10 0.537634787606996 0.00633737956013786 ENSG00000119421:ENST00000373768:exon_124914524_124914687:NDUFA8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 A:G G A 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 14 10 24 6.47311297350206 5.37634787606996 1.0967650974321 A:G G A 10 0.537634787606996 0.68784243201575 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 127643456 T/C 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127643450_127643536:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127643450_127643536:GOLGA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 128246786 G/A 1 38 44 82 17.5698780709342 23.6559306547078 -6.08605258377367 A:G G A 10 0.537634787606996 0.185222030759829 ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128246722_128246862:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128246722_128246862:MAPKAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130191186 C/T 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 T:C C T 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130191111_130191199:ZNF79 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130197414 A/G 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130197369_130197495:ZNF79 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 20 11 31 9.24730424786008 5.91398266367696 3.33332158418312 T:C C T 10 0.537634787606996 0.280758768237576 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130219669 C/T 1 6 6 12 2.77419127435802 3.22580872564198 -0.451617451283952 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130219595_130219672:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000485704:exon_130219595_130219692:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130219595_130219672:LRSAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 13 12 25 6.01074776110905 6.45161745128395 -0.440869690174901 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130677112 G/A 1 14 20 34 6.47311297350206 10.7526957521399 -4.27958277863786 A:G G A 10 0.537634787606996 0.16898586004006 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130698029 G/C 1 101 75 176 46.6988864516934 40.3226090705247 6.37627738116871 C:G G C 10 0.537634787606996 0.364511278348314 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130697378_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130697620_130698059:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000473360:exon_130697662_130698059:DPM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130698845 C/T 1 53 71 124 24.5053562568292 38.1720699200967 -13.6667136632675 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0149203026833735 ENSG00000136908:ENST00000314392:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000495270:exon_130698832_130699802:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000470181:exon_130698832_130698934:DPM2;ENSG00000136908:ENST00000373110:exon_130698313_130698934:DPM2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130707081 A/G 1 5 8 13 2.31182606196502 4.30107830085597 -1.98925223889095 A:G A G 10 0.537634787606996 0.282608747241838 ENSG00000167106:ENST00000373095:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000465821:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000373084:exon_130707056_130707177:FAM102A;ENSG00000167106:ENST00000300434:exon_130707056_130707177:FAM102A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130863601 G/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:G G T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000148339:ENST00000373068:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000373069:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000432073:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000373066:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000373064:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000472769:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000433501:exon_130863588_130863675:SLC25A25;ENSG00000148339:ENST00000445012:exon_130863588_130863675:SLC25A25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 130942789 C/T 1 17 16 33 7.86020861068107 8.60215660171194 -0.741947991030869 T:C C T 10 0.537634787606996 0.862153788104146 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130942694_130942802:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130942727_130942802:CIZ1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131027963 A/G 1 15 12 27 6.93547818589506 6.45161745128395 0.483860734611108 A:G A G 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000490257:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000468488:exon_131027864_131027970:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131027864_131027970:GOLGA2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131088076 G/A 1 16 13 29 7.39784339828806 6.98925223889095 0.408591159397115 A:T:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167113:ENST00000300452:exon_131088058_131088160:COQ4;ENSG00000167113:ENST00000372875:exon_131088058_131088679:COQ4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131095112 A/C 1 6 5 11 2.77419127435802 2.68817393803498 0.0860173363230436 A:C A C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000167113:ENST00000461102:exon_131092691_131095222:COQ4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131196695 C/T 1 13 2 15 6.01074776110905 1.07526957521399 4.93547818589506 T:C C T 10 0.537634787606996 0.0165620817545884 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131196704 G/A 1 13 2 15 6.01074776110905 1.07526957521399 4.93547818589506 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0165620817545884 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131196689_131196892:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131196689_131196886:CERCAM HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 T:G G T 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 46 57 103 21.2687997700782 30.6451828935988 -9.37638312352059 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0748684780143054 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 131771505 C/T 1 11 13 24 5.08601733632304 6.98925223889095 -1.9032349025679 T:C C T 10 0.537634787606996 0.540200791347127 ENSG00000148341:ENST00000372564:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000479237:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372559:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000372554:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000461811:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000417224:exon_131771385_131771625:SH3GLB2;ENSG00000148341:ENST00000416629:exon_131771385_131771625:SH3GLB2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132585058 G/A 1 35 25 60 16.1827824337551 13.4408696901749 2.74191274358024 A:G G A 10 0.537634787606996 0.518930958567375 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132585004_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132590431 C/G 1 76 44 120 35.1397561418683 23.6559306547078 11.4838254871605 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0355630953075854 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132591509 A/G 1 70 58 128 32.3655648675103 31.1828176812058 1.18274718630451 A:G A G 10 0.537634787606996 0.859648894671528 ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132597021 C/T 1 35 37 72 16.1827824337551 19.8924871414589 -3.70970470770371 T:C C T 10 0.537634787606996 0.409119227443947 ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132637712 G/A 1 10 11 21 4.62365212393004 5.91398266367696 -1.29033053974692 A:G G A 10 0.537634787606996 0.66357986209974 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 136 122 258 62.8816688854485 65.5914440880535 -2.70977520260497 T:C C T 10 0.537634787606996 0.755096373214009 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 76 89 165 35.1397561418683 47.8494960970226 -12.7097399551543 A:G A G 10 0.537634787606996 0.050885318192086 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 134021630 A/G 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:G A G 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134021549_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134021516_134021691:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134021516_134021691:NUP214 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 134473655 C/T 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134473586_134473697:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000414781:exon_134473586_134473697:RAPGEF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 134501420 G/C 1 13 20 33 6.01074776110905 10.7526957521399 -4.74194799103087 C:G G C 10 0.537634787606996 0.116180154370847 ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134501309_134501809:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134501309_134501809:RAPGEF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 135974079 G/C 1 32 31 63 14.7956867965761 16.6666784158169 -1.87099161924075 C:G G C 10 0.537634787606996 0.70505368109245 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 37 36 73 17.1075128585411 19.3548523538519 -2.24733949531071 A:G G A 10 0.537634787606996 0.63944537040144 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 136199466 G/A 1 36 36 72 16.6451476461481 19.3548523538519 -2.70970470770371 A:G G A 10 0.537634787606996 0.55558563628641 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 136199503 G/A 1 35 31 66 16.1827824337551 16.6666784158169 -0.483895982061735 A:G G A 10 0.537634787606996 0.90255074435685 ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136199384_136199596:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136199384_136199775:SURF6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 136219594 G/A 1 112 69 181 51.7849037880165 37.0968003448827 14.6881034431337 A:G G A 10 0.537634787606996 0.0305134077901966 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219549_136219621:SURF1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 59 62 121 27.2795475311872 33.3333568316338 -6.05380930044652 A:G A G 10 0.537634787606996 0.275306192086414 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 4 5 9 1.84946084957202 2.68817393803498 -0.838713088462964 A:C C A 10 0.537634787606996 0.741328870812674 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 136338580 G/A 1 13 8 21 6.01074776110905 4.30107830085597 1.70966946025308 A:G G A 10 0.537634787606996 0.516641416466328 ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136338537_136339210:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136338537_136338722:SLC2A6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139100889 G/A 1 13 6 19 6.01074776110905 3.22580872564198 2.78493903546708 A:G G A 10 0.537634787606996 0.252217713167436 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139266405 G/A 1 7 2 9 3.23655648675103 1.07526957521399 2.16128691153704 A:G G A 10 0.537634787606996 0.190809755457508 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139266496 C/T 1 4 4 8 1.84946084957202 2.15053915042798 -0.301078300855968 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371734:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000489932:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000371732:exon_139266347_139266546:CARD9;ENSG00000187796:ENST00000315908:exon_139266347_139266546:CARD9 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 41 45 86 18.9569737081132 24.1935654423148 -5.23659173420166 A:G A G 10 0.537634787606996 0.280083882985637 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 11 11 22 5.08601733632304 5.91398266367696 -0.827965327353912 T:C T C 10 0.537634787606996 0.831590553290945 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139275204 A/C 1 4 10 14 1.84946084957202 5.37634787606996 -3.52688702649794 A:C A C 10 0.537634787606996 0.0654324638417358 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 6 7 13 2.77419127435802 3.76344351324897 -0.989252238890948 C:G G C 10 0.537634787606996 0.592462613061062 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139276407 C/T 1 5 6 11 2.31182606196502 3.22580872564198 -0.913982663676956 T:C C T 10 0.537634787606996 0.764228176543362 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139276276_139276525:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139276430 G/A 1 4 6 10 1.84946084957202 3.22580872564198 -1.37634787606996 A:G G A 10 0.537634787606996 0.529014607492245 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139276276_139276525:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139279173 G/A 1 5 4 9 2.31182606196502 2.15053915042798 0.161286911537036 A:G G A 10 0.537634787606996 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139279172_139279266:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139289825 A/G 1 6 2 8 2.77419127435802 1.07526957521399 1.69892169914403 A:G A G 10 0.537634787606996 0.300163849932424 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139289750_139289875:SNAPC4 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 15 22 37 6.93547818589506 11.8279653273539 -4.89248714145885 A:G A G 10 0.537634787606996 0.136979634095428 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 57 70 127 26.3548171064012 37.6344351324897 -11.2796180260885 T:C:G C T 10 0.537634787606996 0.0500207679599136 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139324737 C/A 1 7 3 10 3.23655648675103 1.61290436282099 1.62365212393004 A:C C A 10 0.537634787606996 0.357587440252607 ENSG00000148384:ENST00000371712:exon_139324729_139324865:INPP5E;ENSG00000148384:ENST00000445731:exon_139324729_139324865:INPP5E HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 139357939 A/G 1 14 13 27 6.47311297350206 6.98925223889095 -0.516139265388892 A:G A G 10 0.537634787606996 0.849589395327245 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139357915_139358053:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139357915_139358053:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139357915_139358053:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139357915_139358053:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139357915_139358053:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139357915_139358053:SEC16A HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 140611436 T/C 1 17 14 31 7.86020861068107 7.52688702649794 0.333321584183124 T:C T C 10 0.537634787606996 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140611078_140611634:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000492232:exon_140611078_140611502:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460486:exon_140611078_140611631:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140611078_140611634:EHMT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 31 18 49 14.3333215841831 9.67742617692593 4.65589540725719 T:C T C 10 0.537634787606996 0.199160323905035 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 9 7 16 4.16128691153704 3.76344351324897 0.397843398288064 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 229493 G/A 1 23 22 45 10.6343998850391 11.8279653273539 -1.19356544231482 A:G G A 10 0.537634787606996 0.766063528656386 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 24 15 39 11.0967650974321 8.06452181410494 3.03224328332715 A:G G A 10 0.537634787606996 0.341409134891855 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 295097 C/T 1 34 5 39 15.7204172213621 2.68817393803498 13.0322432833272 T:C C T 10 0.537634787606996 1.45494336223535e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 299360 G/A 1 34 5 39 15.7204172213621 2.68817393803498 13.0322432833272 A:G G A 10 0.537634787606996 1.45494336223535e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299339_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 322193 C/T 1 5 3 8 2.31182606196502 1.61290436282099 0.698921699144032 T:C C T 10 0.537634787606996 0.73270668826792 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_322140_322325:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000496630:exon_322140_322251:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000381625:exon_322140_322325:PPP2R3B HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 69 72 141 31.9031996551173 38.7097047077037 -6.80650505258644 T:C C T 10 0.537634787606996 0.272378742500842 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 44 41 85 20.3440693452922 22.0430262918868 -1.69895694659466 T:C C T 10 0.537634787606996 0.744801054725712 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 1585079 C/T 1 10 9 19 4.62365212393004 4.83871308846296 -0.215060964532925 T:C C T 10 0.537634787606996 1 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 26 18 44 12.0214955222181 9.67742617692593 2.34406934529217 T:C C T 10 0.537634787606996 0.546494595010782 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 27 42 69 12.4838607346111 22.5806610794938 -10.0968003448827 C:G C G 10 0.537634787606996 0.0157235750895664 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 2139186 C/T 1 13 18 31 6.01074776110905 9.67742617692593 -3.66667841581688 T:C C T 10 0.537634787606996 0.209584119262626 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 2161094 C/T 1 29 17 46 13.4085911593971 9.13979138931893 4.26879977007818 T:C C T 10 0.537634787606996 0.237808596521495 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2161064_2161271:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2161064_2161271:DHRSX HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 2632463 A/G 1 103 63 166 47.6236168764794 33.8709916192407 13.7526252572387 A:G A G 10 0.537634787606996 0.0353880660998925 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 2632482 C/T 1 101 70 171 46.6988864516934 37.6344351324897 9.06445131920368 T:C C T 10 0.537634787606996 0.168277478554254 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2632463_2632495:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2632463_2632495:CD99 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 6995417 C/T 1 10 12 22 4.62365212393004 6.45161745128395 -1.82796532735391 T:C C T 10 0.537634787606996 0.522957315887545 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 6995438 C/T 1 16 16 32 7.39784339828806 8.60215660171194 -1.20431320342387 T:C C T 10 0.537634787606996 0.724633964891837 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000412827:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_6995261_6995490:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_6995261_6995490:HDHD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 7023678 G/A 1 30 23 53 13.8709563717901 12.3656001149609 1.50535625682921 A:G G A 10 0.537634787606996 0.783247013014297 ENSG00000130021:ENST00000381077:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000424830:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000486446:exon_7023661_7023879:HDHD1;ENSG00000130021:ENST00000498474:exon_7023661_7023879:HDHD1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 13397397 C/T 0 230 0 230 106.343998850391 0 106.343998850391 C C 10 0.537634787606996 1.55184158189998e-62 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 16627756 C/T 1 18 1 19 8.32257382307407 0.537634787606996 7.78493903546708 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000240977147433315 ENSG00000047230:ENST00000443824:exon_16627664_16627808:CTPS2;ENSG00000047230:ENST00000380241:exon_16627664_16627808:CTPS2;ENSG00000047230:ENST00000359276:exon_16627664_16627808:CTPS2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 16859628 G/A 1 10 32 42 4.62365212393004 17.2043132034239 -12.5806610794938 A:G G A 10 0.537634787606996 0.00013277117549377 ENSG00000086712:ENST00000380122:exon_16859551_16862642:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000398155:exon_16859551_16860296:TXLNG;ENSG00000086712:ENST00000485153:exon_16859551_16862642:TXLNG HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 19375782 A/C 1 134 2 136 61.9569384606625 1.07526957521399 60.8816688854485 A:T:C A C 10 0.537634787606996 1.65374245666847e-33 ENSG00000131828:ENST00000422285:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379806:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379815:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000481733:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000379804:exon_19375770_19375837:PDHA1;ENSG00000131828:ENST00000478795:exon_19375500_19375837:PDHA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 23858452 G/A 1 1 57 58 0.462365212393004 30.6451828935988 -30.1828176812058 A:G G A 10 0.537634787606996 2.5378223557766e-18 ENSG00000184831:ENST00000379226:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000476598:exon_23858430_23858522:APOO;ENSG00000184831:ENST00000439528:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000379220:exon_23858430_23858494:APOO;ENSG00000184831:ENST00000490078:exon_23858430_23858494:APOO HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 30577846 A/C 1 1 25 26 0.462365212393004 13.4408696901749 -12.9785044777819 A:C A C 10 0.537634787606996 6.08446118378567e-08 ENSG00000120280:ENST00000378962:exon_30576941_30578473:CXorf21 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 37701048 G/A 0 0 13 13 0 6.98925223889095 -6.98925223889095 A G A 10 0.537634787606996 4.41374220322071e-05 ENSG00000165169:ENST00000378581:exon_37701035_37701158:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000378578:exon_37701035_37701158:DYNLT3;ENSG00000165169:ENST00000432389:exon_37701035_37701158:DYNLT3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 38147170 C/T 0 0 18 18 0 9.67742617692593 -9.67742617692593 T C T 10 0.537634787606996 9.32680117087082e-07 ENSG00000156313:ENST00000309513:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000339363:exon_38146347_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000338898:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000482855:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000318842:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000342811:exon_38147114_38147294:RPGR;ENSG00000156313:ENST00000378505:exon_38147114_38147294:RPGR HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 40460040 T/C 1 49 3 52 22.6558954072572 1.61290436282099 21.0429910444362 T:C T C 10 0.537634787606996 1.68810759529366e-10 ENSG00000182220:ENST00000378438:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000486558:exon_40460014_40460133:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000447485:exon_40460014_40460128:ATP6AP2;ENSG00000182220:ENST00000423649:exon_40460014_40460133:ATP6AP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 44401295 T/G 1 5 22 27 2.31182606196502 11.8279653273539 -9.51613926538889 T:G T G 10 0.537634787606996 0.000301429660845227 ENSG00000069509:ENST00000378045:exon_44401191_44401347:FUNDC1;ENSG00000069509:ENST00000483115:exon_44401191_44401550:FUNDC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 47062534 G/A 1 136 23 159 62.8816688854485 12.3656001149609 50.5160687704876 A:G G A 10 0.537634787606996 3.12802983201390e-17 ENSG00000130985:ENST00000377351:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000335972:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000424033:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000377271:exon_47062533_47062613:UBA1;ENSG00000130985:ENST00000490869:exon_47062533_47062613:UBA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 47498400 C/T 0 13 0 13 6.01074776110905 0 6.01074776110905 C C 10 0.537634787606996 0.000357708287874443 ENSG00000126767:ENST00000247161:exon_47498294_47498737:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000376983:exon_47498294_47498737:ELK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 47500700 C/T 1 17 1 18 7.86020861068107 0.537634787606996 7.32257382307407 T:C C T 10 0.537634787606996 0.000445525558693855 ENSG00000126767:ENST00000247161:exon_47500631_47500874:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000376983:exon_47500631_47500874:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000480157:exon_47500631_47500874:ELK1;ENSG00000126767:ENST00000343894:exon_47500631_47500874:ELK1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 47705684 C/T 0 13 0 13 6.01074776110905 0 6.01074776110905 C C 10 0.537634787606996 0.000357708287874443 ENSG00000197779:ENST00000376954:exon_47705504_47705720:ZNF81;ENSG00000197779:ENST00000334937:exon_47705504_47705720:ZNF81;ENSG00000197779:ENST00000376950:exon_47705504_47705720:ZNF81;ENSG00000197779:ENST00000338637:exon_47705471_47705720:ZNF81;ENSG00000197779:ENST00000483520:exon_47705572_47705720:ZNF81;ENSG00000197779:ENST00000399918:exon_47705667_47705720:ZNF81 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 48382174 G/T 1 189 2 191 87.3870251422777 1.07526957521399 86.3117555670638 T:G G T 10 0.537634787606996 4.85179660957896e-48 ENSG00000147155:ENST00000495186:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000498425:exon_48382142_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000446158:exon_48382087_48382460:EBP;ENSG00000147155:ENST00000414061:exon_48382087_48382460:EBP HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 48418126 A/G 0 19 0 19 8.78493903546708 0 8.78493903546708 A A 10 0.537634787606996 8.0040979466985e-06 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000481090:exon_48418002_48418274:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 48418659 G/A 0 28 0 28 12.9462259470041 0 12.9462259470041 G G 10 0.537634787606996 4.23974390022879e-08 ENSG00000068354:ENST00000376771:exon_48418002_48420997:TBC1D25;ENSG00000068354:ENST00000427713:exon_48418002_48419449:TBC1D25 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 48751471 A/G 1 5 153 158 2.31182606196502 82.2581225038704 -79.9462964419054 A:T:G A G 10 0.537634787606996 1.96672535603360e-44 ENSG00000126768:ENST00000376582:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000466995:exon_48751183_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000396779:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000495490:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000472645:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000465150:exon_48751380_48751508:TIMM17B;ENSG00000126768:ENST00000490755:exon_48751380_48751508:TIMM17B HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 48847497 T/C 1 43 1 44 19.8817041328992 0.537634787606996 19.3440693452922 T:C T C 10 0.537634787606996 9.40445518439407e-11 ENSG00000068400:ENST00000376425:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376444:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376441:exon_48847338_48847522:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000473581:exon_48847338_48847798:GRIPAP1;ENSG00000068400:ENST00000376423:exon_48847338_48847514:GRIPAP1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 49103224 G/A 1 24 2 26 11.0967650974321 1.07526957521399 10.0214955222181 A:G G A 10 0.537634787606996 3.48118368983097e-05 ENSG00000101997:ENST00000376227:exon_49103192_49103386:CCDC22 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 54471028 A/G 1 2 76 78 0.924730424786008 40.8602438581317 -39.9355134333457 A:G A G 10 0.537634787606996 3.06973221105089e-23 ENSG00000158526:ENST00000375151:exon_54470849_54471920:TSR2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 68381912 G/A 0 41 0 41 18.9569737081132 0 18.9569737081132 G G 10 0.537634787606996 9.8068679668782e-12 ENSG00000181191:ENST00000374584:exon_68380697_68382224:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374583:exon_68380697_68383388:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000361478:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000396010:exon_68380705_68383309:PJA1;ENSG00000181191:ENST00000374571:exon_68380734_68382983:PJA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 70352767 C/T 0 0 12 12 0 6.45161745128395 -6.45161745128395 T C T 10 0.537634787606996 9.54600840399969e-05 ENSG00000184634:ENST00000333646:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374102:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000374080:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000430072:exon_70352695_70352806:MED12;ENSG00000184634:ENST00000439750:exon_70352695_70352806:MED12 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 71549512 G/C 0 0 31 31 0 16.6666784158169 -16.6666784158169 C G C 10 0.537634787606996 4.11660959489208e-11 ENSG00000147099:ENST00000373573:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373583:exon_71549366_71549559:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000373589:exon_71549366_71549926:HDAC8;ENSG00000147099:ENST00000429103:exon_71549367_71549926:HDAC8 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 100608191 G/A 1 236 4 240 109.118190124749 2.15053915042798 106.967650974321 A:G G A 10 0.537634787606996 2.12502688220117e-57 ENSG00000010671:ENST00000372880:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372869:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372855:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372859:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000372860:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000395179:exon_100608182_100608203:BTK;ENSG00000010671:ENST00000308731:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000443591:exon_100608182_100608339:BTK;ENSG00000010671:ENST00000470069:exon_100608031_100608339:BTK HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 117819773 A/C 1 2 64 66 0.924730424786008 34.4086264068477 -33.4838959820617 A:C A C 10 0.537634787606996 2.30642963999386e-19 ENSG00000147251:ENST00000276204:exon_117819651_117820126:DOCK11;ENSG00000147251:ENST00000276202:exon_117819651_117820110:DOCK11 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 118893413 T/C 0 19 0 19 8.78493903546708 0 8.78493903546708 T T 10 0.537634787606996 8.0040979466985e-06 ENSG00000187808:ENST00000343905:exon_118892576_118894127:ANKRD58 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 119005587 T/C 1 2 112 114 0.924730424786008 60.2150962119835 -59.2903657871975 T:C T C 10 0.537634787606996 5.68688886831246e-35 ENSG00000125352:ENST00000371442:exon_119004497_119005791:RNF113A;ENSG00000125356:ENST00000371437:exon_119005450_119005976:NDUFA1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 119590533 T/A 0 13 0 13 6.01074776110905 0 6.01074776110905 T T 10 0.537634787606996 0.000357708287874443 ENSG00000005893:ENST00000434600:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000200639:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371335:exon_119590506_119590624:LAMP2;ENSG00000005893:ENST00000371345:exon_119590506_119590624:LAMP2 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 131348214 T/G 0 17 0 17 7.86020861068107 0 7.86020861068107 T T 10 0.537634787606996 2.82162199607238e-05 ENSG00000123728:ENST00000342983:exon_131348162_131348474:RAP2C;ENSG00000123728:ENST00000370874:exon_131348162_131348474:RAP2C;ENSG00000123728:ENST00000460462:exon_131348162_131348474:RAP2C HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 134713855 G/A 0 0 34 34 0 18.2795827786379 -18.2795827786379 A G A 10 0.537634787606996 4.06906975624109e-12 ENSG00000165359:ENST00000370752:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000481908:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000356856:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000493637:exon_134713713_134714087:DDX26B;ENSG00000165359:ENST00000494957:exon_134713810_134714087:DDX26B HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 135310785 T/C 1 1 76 77 0.462365212393004 40.8602438581317 -40.3978786457387 T:C T C 10 0.537634787606996 1.44768219262167e-24 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135310782_135310917:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000495432:exon_135310782_135311154:MAP7D3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 135313034 T/G 1 1 20 21 0.462365212393004 10.7526957521399 -10.2903305397469 T:G T G 10 0.537634787606996 4.53231184852545e-06 ENSG00000129680:ENST00000370661:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000316077:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370663:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000399283:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000218318:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000370660:exon_135312998_135313125:MAP7D3;ENSG00000129680:ENST00000477124:exon_135312998_135313314:MAP7D3 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 152018832 T/G 0 0 28 28 0 15.0537740529959 -15.0537740529959 G T G 10 0.537634787606996 4.16470485195426e-10 ENSG00000147383:ENST00000370274:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000440023:exon_152018809_152018967:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000432467:exon_152018809_152018967:NSDHL HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 153215839 G/A 1 2 69 71 0.924730424786008 37.0968003448827 -36.1720699200967 A:G G A 10 0.537634787606996 5.63566152510626e-21 ENSG00000172534:ENST00000310441:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000444191:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000369984:exon_153215694_153215994:HCFC1;ENSG00000172534:ENST00000354233:exon_153215694_153215994:HCFC1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 153581932 A/G 1 7 256 263 3.23655648675103 137.634505627391 -134.39794914064 A:G A G 10 0.537634787606996 3.64889094778068e-75 ENSG00000196924:ENST00000420627:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000360319:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369854:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369863:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369852:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000422373:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000428077:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000369850:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000490936:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000344736:exon_153581922_153582095:FLNA;ENSG00000196924:ENST00000415241:exon_153581922_153581966:FLNA HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 153608724 C/T 1 4 238 242 1.84946084957202 127.957079450465 -126.107618600893 T:C C T 10 0.537634787606996 2.1823217485237e-73 ENSG00000102119:ENST00000369842:exon_153608594_153608727:EMD;ENSG00000102119:ENST00000369835:exon_153608594_153608727:EMD;ENSG00000102119:ENST00000486738:exon_153608302_153608727:EMD;ENSG00000102119:ENST00000428228:exon_153608594_153608727:EMD;ENSG00000102119:ENST00000485261:exon_153608302_153608727:EMD;ENSG00000102119:ENST00000494443:exon_153608302_153608822:EMD;ENSG00000102119:ENST00000468294:exon_153608594_153608727:EMD;ENSG00000102119:ENST00000492448:exon_153608594_153608727:EMD HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 153633359 G/C 0 16 0 16 7.39784339828806 0 7.39784339828806 G G 10 0.537634787606996 5.30929257885722e-05 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000451865:exon_153633336_153633424:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000424626:exon_153633336_153633424:DNASE1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 153633953 T/C 1 24 1 25 11.0967650974321 0.537634787606996 10.5591303098251 T:C T C 10 0.537634787606996 5.95070675079843e-06 ENSG00000013563:ENST00000393638:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369809:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000014935:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369808:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000369807:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000309585:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000451865:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000412184:exon_153633775_153633959:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000424626:exon_153633775_153633996:DNASE1L1;ENSG00000013563:ENST00000432135:exon_153633830_153633996:DNASE1L1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 153667176 T/C 0 0 59 59 0 31.7204524688128 -31.7204524688128 C T C 10 0.537634787606996 1.71444639534485e-20 ENSG00000203879:ENST00000447750:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000445564:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000475976:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000369741:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000434049:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000415109:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000481304:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000485143:exon_153667111_153667210:GDI1;ENSG00000203879:ENST00000491154:exon_153667111_153667210:GDI1 HGDP00967_parsed_pileup.txt . X 155235014 C/T 0 10 0 10 4.62365212393004 0 4.62365212393004 C C 10 0.537634787606996 0.00246430999279537 ENSG00000124334:ENST00000244174:exon_155234943_155235144:IL9R;ENSG00000124334:ENST00000424344:exon_155234943_155235144:IL9R;ENSG00000124334:ENST00000369423:exon_155234943_155235144:IL9R