INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 880944 G/A 1 22 21 43 10.6325522036365 10.8507456238015 -0.218193420164926 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_880898_881033:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_880898_881033:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_880898_881033:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 881589 G/A 1 14 29 43 6.76616958413235 14.9843630042973 -8.21819342016493 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0140775843718266 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 883562 G/A 1 5 11 16 2.41648913719012 5.68372389818173 -3.2672347609916 A:G G A 10 0.516702172561975 0.133473626885738 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_883511_883612:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_883511_883612:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 887409 G/C 1 10 14 24 4.83297827438025 7.23383041586765 -2.4008521414874 C:G G C 10 0.516702172561975 0.414865474205065 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_887380_887519:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_887380_887519:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 889216 G/A 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_889162_889272:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_889162_889272:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 891393 G/A 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.121535928231048 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_891303_891393:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_891303_891393:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000487214:exon_891303_891393:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 892370 T/C 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 T:C T C 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_892274_892405:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_892274_892405:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000487214:exon_892274_892405:NOC2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 949422 G/A 1 239 258 497 115.508180757688 133.30916052099 -17.8009797633016 A:G G A 10 0.516702172561975 0.116185897881535 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 426 545 971 205.884874488599 281.602684046276 -75.7178095576778 A:G G A 10 0.516702172561975 1.19544550138342e-06 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 497 371 868 240.199020236698 191.696506020493 48.5025142162057 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00098143235899424 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 982994 T/C 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000478677:exon_982855_983067:AGRN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 985826 G/A 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985807_985971:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985807_985971:AGRN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 985900 C/T 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 T:C C T 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985807_985971:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985807_985971:AGRN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 986737 T/C 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 T:C T C 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_986633_986749:AGRN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 987142 C/T 1 36 31 67 17.3987217877689 16.0177673494212 1.38095443834767 T:C C T 10 0.516702172561975 0.807190943771226 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_987108_987195:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_987108_987195:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_987108_987195:AGRN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 34 42 76 16.4321261328928 21.701491247603 -5.26936511471011 T:C C T 10 0.516702172561975 0.251534648260353 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1154019 A/G 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000078808:ENST00000478938:exon_1153838_1155673:SDF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1248180 G/A 1 103 79 182 49.7796762261166 40.819471632396 8.96020459372054 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.207259584626345 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1247973_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000461514:exon_1247640_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525164:exon_1247973_1248504:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1248167_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525769:exon_1247973_1248329:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1248167_1248329:CPSF3L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1430915 C/T 1 52 22 74 25.1314870267773 11.3674477963635 13.7640392304138 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.00152479255064378 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1560673 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000467597:exon_1560666_1560808:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000508148:exon_1560666_1561143:MIB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1562702 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1562676_1562824:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562676_1563210:MIB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1563100 C/T 1 13 5 18 6.28287175669432 2.58351086280988 3.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0995712690058681 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562676_1563210:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1562840_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1562902_1563209:MIB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1563105 G/A 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563053_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505370:exon_1562676_1563210:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1562840_1563209:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1562902_1563209:MIB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1563401 C/T 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1563399_1563779:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378708:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000506488:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514234:exon_1563399_1563559:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000473511:exon_1563399_1563779:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000464570:exon_1563399_1563559:MIB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 1572125 A/G 1 25 20 45 12.0824456859506 10.3340434512395 1.74840223471112 A:G A G 10 0.516702172561975 0.656047506256095 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572044_1572160:CDK11A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 19 5 24 9.18265872132247 2.58351086280988 6.5991478585126 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00731562652228718 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 2441358 T/C 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000435556:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000505228:exon_2441301_2441369:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502512:exon_2441232_2441369:PANK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 2452569 T/C 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000157881:ENST00000378466:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000425477:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000486396:exon_2452540_2452754:PANK4;ENSG00000157881:ENST00000502770:exon_2452540_2453380:PANK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 67 42 109 32.3809544383477 21.701491247603 10.6794631907447 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0440504379773935 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 2491305 C/T 1 62 57 119 29.9644653011575 29.4520238360326 0.512441465124972 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000475523:exon_2490791_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2491262_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000466750:exon_2489782_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000471768:exon_2491019_2491417:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000427661:exon_2491210_2491417:TNFRSF14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 2494561 G/A 1 69 97 166 33.3475500932237 50.1201107385116 -16.7725606452879 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0102265086828269 ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2492933_2495188:TNFRSF14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 3544154 C/T 1 2 10 12 0.96659565487605 5.16702172561975 -4.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0189238412479094 ENSG00000158109:ENST00000378344:exon_3544064_3544217:TPRG1L;ENSG00000158109:ENST00000344579:exon_3544064_3544217:TPRG1L;ENSG00000158109:ENST00000456805:exon_3544064_3544217:TPRG1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 3548008 G/A 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:G G A 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 6272813 C/T 1 12 19 31 5.7995739292563 9.81734127867753 -4.01776734942123 T:C C T 10 0.516702172561975 0.155403068784301 ENSG00000158286:ENST00000496676:exon_6272742_6273243:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000492476:exon_6272742_6272896:RNF207;ENSG00000158286:ENST00000483336:exon_6272798_6272963:RNF207 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 6292070 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000116237:ENST00000343813:exon_6291962_6292179:ICMT;ENSG00000116237:ENST00000489498:exon_6291962_6292179:ICMT;ENSG00000116237:ENST00000474756:exon_6291962_6292179:ICMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 22 34 56 10.6325522036365 17.5678738671072 -6.9353216634706 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0812983921807866 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 6649302 C/A 1 29 20 49 14.0156369957027 10.3340434512395 3.68159354446322 A:C C A 10 0.516702172561975 0.319196661076663 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 6694723 C/T 1 23 16 39 11.1158500310746 8.2672347609916 2.84861527008297 T:C C T 10 0.516702172561975 0.424107664676249 ENSG00000041988:ENST00000377627:exon_6694080_6695646:THAP3;ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000451196:exon_6694228_6694844:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000465508:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6694228_6695760:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000349363:exon_6694586_6694844:DNAJC11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 6705130 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705101_6705186:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705101_6705186:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705101_6705186:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000472414:exon_6705101_6705172:DNAJC11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 28 15 43 13.5323391682647 7.75053258842963 5.78180657983507 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0928440324511562 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 9795987 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9795943_9796100:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9795943_9796100:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9795943_9796100:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9795943_9796100:CLSTN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 9811541 A/G 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:G A G 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9811531_9811739:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9811531_9811639:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9811531_9811739:CLSTN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 11082522 T/C 1 55 38 93 26.5813805090914 19.6346825573551 6.94669795173632 T:C T C 10 0.516702172561975 0.177120726126384 ENSG00000120948:ENST00000440386:exon_11082407_11082711:TARDBP;ENSG00000120948:ENST00000240185:exon_11082181_11084100:TARDBP;ENSG00000120948:ENST00000439080:exon_11082181_11084094:TARDBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 113 103 216 54.6126545004968 53.2203237738834 1.39233072661339 T:G G T 10 0.516702172561975 0.891751995208584 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 11147565 G/A 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11147505_11147648:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11147505_11147648:EXOSC10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 11184650 A/G 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000198793:ENST00000361445:exon_11184555_11184690:MTOR;ENSG00000198793:ENST00000376838:exon_11184555_11184690:MTOR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 11854457 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 11854476 T/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000177000:ENST00000376592:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376583:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376590:exon_11854415_11854595:MTHFR;ENSG00000177000:ENST00000376585:exon_11854415_11854595:MTHFR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12009956 G/A 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12009830_12009963:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12009830_12009963:PLOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12010469 G/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:G G T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000083444:ENST00000485046:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000449038:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000358133:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000429000:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12010414_12010565:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12010414_12010577:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12010414_12010577:PLOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12034805 T/C 1 34 26 60 16.4321261328928 13.4342564866114 2.9978696462815 T:C T C 10 0.516702172561975 0.518725473710613 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12089165 C/G 1 18 22 40 8.69936089388445 11.3674477963635 -2.668086902479 C:G C G 10 0.516702172561975 0.43164377138054 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089090_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000492256:exon_12088778_12089198:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089153_12089198:MIIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12091847 C/T 1 70 70 140 33.8308479206617 36.1691520793383 -2.33830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 0.735386521372963 ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12091779_12092102:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12091779_12092100:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12091779_12092032:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12091779_12092100:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12091598_12092082:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478299:exon_12091779_12092096:MIIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12186058 A/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000417814:exon_12186008_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12185956_12186109:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000479933:exon_12185991_12186109:TNFRSF8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12248942 A/G 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 12252955 T/G 1 22 18 40 10.6325522036365 9.30063910611555 1.331913097521 T:G T G 10 0.516702172561975 0.752563259473963 ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 27 21 48 13.0490413408267 10.8507456238015 2.1982957170252 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.565565017376882 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 13 19 32 6.28287175669432 9.81734127867753 -3.5344695219832 A:G A G 10 0.516702172561975 0.221053717760637 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 15752379 G/A 1 46 41 87 22.2317000621491 21.184789075041 1.04691098710817 A:T:C:G G A 10 0.516702172561975 0.831118932858108 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15752367_15752514:EFHD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 15755221 C/T 1 66 64 130 31.8976566109096 33.0689390439664 -1.17128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.86097109963228 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 15755225 G/A 1 63 64 127 30.4477631285956 33.0689390439664 -2.62117591537083 A:G G A 10 0.516702172561975 0.657930051704881 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 72 72 144 34.7974435755378 37.2025564244622 -2.4051128489244 T:C C T 10 0.516702172561975 0.738894056495246 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 15900115 G/A 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15898848_15900219:AGMAT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 16056364 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 16271260 G/A 1 14 15 29 6.76616958413235 7.75053258842963 -0.984363004297276 A:G G A 10 0.516702172561975 0.715533472379847 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 17380483 C/T 1 23 15 38 11.1158500310746 7.75053258842963 3.36531744264495 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.330749831507086 ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17380443_17380665:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000485515:exon_17380443_17380502:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000466613:exon_17380443_17380526:SDHB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 22 19 41 10.6325522036365 9.81734127867753 0.815210924959024 A:T T A 10 0.516702172561975 0.876318912969931 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 22 26 48 10.6325522036365 13.4342564866114 -2.8017042829748 T:C C T 10 0.516702172561975 0.47124984750544 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 19426948 C/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19426870_19427067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19426870_19427067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19426870_19427067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19426870_19427067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19426870_19427067:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19426870_19427067:UBR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 18 21 39 8.69936089388445 10.8507456238015 -2.15138472991703 A:G G A 10 0.516702172561975 0.524508429739444 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 38 47 85 18.3653174426449 24.2850021104128 -5.91968466776788 A:G G A 10 0.516702172561975 0.232427165769828 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 19653753 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19653721_19653906:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19653721_19653906:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19653721_19653906:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19653721_19653906:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19653721_19653906:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19653721_19653906:PQLC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 13 4 17 6.28287175669432 2.0668086902479 4.21606306644642 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0511524645234594 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 21071267 G/C 1 15 22 37 7.24946741157037 11.3674477963635 -4.11798038479308 C:G G C 10 0.516702172561975 0.190850720529080 ENSG00000127483:ENST00000312239:exon_21069154_21071584:HP1BP3;ENSG00000127483:ENST00000375004:exon_21069175_21071584:HP1BP3;ENSG00000127483:ENST00000375003:exon_21069175_21071584:HP1BP3;ENSG00000127483:ENST00000488722:exon_21071237_21071584:HP1BP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 21071359 T/C 1 38 23 61 18.3653174426449 11.8841499689254 6.48116747371952 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.123523471449797 ENSG00000127483:ENST00000312239:exon_21069154_21071584:HP1BP3;ENSG00000127483:ENST00000375004:exon_21069175_21071584:HP1BP3;ENSG00000127483:ENST00000375003:exon_21069175_21071584:HP1BP3;ENSG00000127483:ENST00000488722:exon_21071237_21071584:HP1BP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 21180098 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21180053_21180170:EIF4G3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 23419219 A/G 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 24083494 C/T 1 35 29 64 16.9154239603309 14.9843630042973 1.9310609560336 T:C C T 10 0.516702172561975 0.70788593884327 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 24180962 T/C 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24180850_24181050:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24180850_24181050:FUCA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 24993386 G/A 1 22 21 43 10.6325522036365 10.8507456238015 -0.218193420164926 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24993306_24993416:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24993306_24993416:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000374389:exon_24993306_24993416:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000479034:exon_24993306_24993416:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000489130:exon_24993306_24993416:SRRM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 39 25 64 18.848615270083 12.9175543140494 5.9310609560336 A:T A T 10 0.516702172561975 0.168476478616793 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 25554663 C/T 1 40 34 74 19.331913097521 17.5678738671072 1.76403923041385 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.72784572812252 ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25554609_25554726:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25554609_25554726:SYF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 25785052 A/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:T A T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000204178:ENST00000374343:exon_25784882_25785383:TMEM57;ENSG00000204178:ENST00000470035:exon_25784882_25785274:TMEM57 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 26189652 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000182749:ENST00000374296:exon_26187701_26190352:PAQR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 26881701 A/G 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26881675_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26881642_26881712:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000488985:exon_26881690_26881712:RPS6KA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 26887592 T/C 1 25 16 41 12.0824456859506 8.2672347609916 3.81521092495902 T:C T C 10 0.516702172561975 0.274752754417227 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887536_26887625:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887536_26887625:RPS6KA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 26900735 C/G 1 69 74 143 33.3475500932237 38.2359607695861 -4.88841067636243 C:G C G 10 0.516702172561975 0.451603214922959 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 27680292 A/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G A G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27680204_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27680204_27680421:SYTL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 79 47 126 38.180528367604 24.2850021104128 13.8955262571911 T:C T C 10 0.516702172561975 0.015772027574756 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28476817 G/A 1 20 7 27 9.6659565487605 3.61691520793383 6.04904134082667 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0209403464222441 ENSG00000169403:ENST00000373857:exon_28473677_28477570:PTAFR;ENSG00000169403:ENST00000305392:exon_28476184_28477570:PTAFR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 215 229 444 103.909032899175 118.324797516692 -14.4157646175169 A:G A G 10 0.516702172561975 0.183610567051271 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 16 4 20 7.7327652390084 2.0668086902479 5.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0127309252361117 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 38 3 41 18.3653174426449 1.55010651768593 16.815210924959 A:G A G 10 0.516702172561975 3.31063831451778e-08 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28657128 G/C 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 C:G G C 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000130772:ENST00000479574:exon_28657108_28657246:MED18;ENSG00000130772:ENST00000373842:exon_28657108_28657246:MED18;ENSG00000130772:ENST00000398997:exon_28657108_28657246:MED18;ENSG00000130772:ENST00000475655:exon_28657108_28657303:MED18;ENSG00000130772:ENST00000474683:exon_28657108_28657246:MED18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28793041 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000463428:exon_28792893_28793752:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28792893_28793279:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28792893_28793279:PHACTR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28800277 C/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204138:ENST00000373839:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000493669:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373836:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373835:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373837:exon_28800066_28800663:PHACTR4;ENSG00000204138:ENST00000373838:exon_28800066_28800663:PHACTR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28818151 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28833834 T/A 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:T T A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 28906984 T/G 1 27 12 39 13.0490413408267 6.2004260707437 6.84861527008297 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0360890847610030 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 31206719 T/C 1 556 368 924 268.713592055542 190.146399502807 78.5671925527351 T:C T C 10 0.516702172561975 2.23193825090424e-07 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31205316_31206764:LAPTM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 53 39 92 25.6147848542153 20.151384729917 5.4634001242983 A:G G A 10 0.516702172561975 0.296865541769405 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 31897643 G/A 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000487207:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31897530_31897720:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31897530_31897720:SERINC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 31901869 C/T 1 30 20 50 14.4989348231407 10.3340434512395 4.16489137190125 T:C C T 10 0.516702172561975 0.259686227954463 ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31901825_31901915:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31901825_31901915:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31901825_31901915:SERINC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 32833920 T/C 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000160058:ENST00000341071:exon_32830772_32834151:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000463967:exon_32833626_32834151:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000373520:exon_32833634_32834151:BSDC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 33291838 A/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:T A T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000116497:ENST00000530710:exon_33291699_33292090:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000373476:exon_33291699_33292531:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000373475:exon_33291699_33292531:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000439419:exon_33291699_33292531:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000531123:exon_33291699_33292531:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000398243:exon_33291699_33292531:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000356689:exon_33291699_33292531:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000526230:exon_33291699_33292061:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000531256:exon_33291699_33292214:S100PBP;ENSG00000116497:ENST00000482212:exon_33291699_33292139:S100PBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 35320991 G/A 1 52 84 136 25.1314870267773 43.4029824952059 -18.2714954684286 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00192226710289961 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 35321242 A/C 1 52 51 103 25.1314870267773 26.3518108006607 -1.22032377388343 A:C A C 10 0.516702172561975 0.844017065744017 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000423898:exon_35320950_35321583:C1orf212 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 35452711 T/C 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 36807563 C/T 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36805225_36809049:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36805225_36807574:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36805225_36807574:STK40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 36809726 A/G 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 A:G A G 10 0.516702172561975 0.121535928231048 ENSG00000196182:ENST00000373129:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000359297:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373130:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000373132:exon_36809721_36809865:STK40;ENSG00000196182:ENST00000425273:exon_36809721_36809865:STK40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 37941196 G/T 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37941060_37941540:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37941063_37941540:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37941060_37941257:ZC3H12A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 37948096 A/G 1 19 12 31 9.18265872132247 6.2004260707437 2.98223265057877 A:G A G 10 0.516702172561975 0.369231919605051 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37948035_37948141:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37948035_37948141:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37948035_37949976:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000471012:exon_37947955_37948203:ZC3H12A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 38034514 C/T 1 55 43 98 26.5813805090914 22.2181934201649 4.36318708892645 T:C C T 10 0.516702172561975 0.419114469201596 ENSG00000134697:ENST00000373062:exon_38034452_38034903:GNL2;ENSG00000134697:ENST00000462812:exon_38034452_38036494:GNL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 38327982 G/T 1 13 29 42 6.28287175669432 14.9843630042973 -8.70149124760295 T:G G T 10 0.516702172561975 0.00820769639386463 ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 38423853 G/C 1 55 79 134 26.5813805090914 40.819471632396 -14.2380911233047 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0153180124946224 ENSG00000183431:ENST00000373019:exon_38422647_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000448721:exon_38423631_38423935:SF3A3;ENSG00000183431:ENST00000487062:exon_38423735_38423935:SF3A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 39797756 A/G 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 39798303 A/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:T A T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 39798767 A/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 39909159 A/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39909118_39909246:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39909118_39909246:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39909118_39909246:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39909118_39909246:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39909118_39909246:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39909118_39909246:MACF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:T A T 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 41204572 A/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000066136:ENST00000397229:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372657:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000413180:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372658:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000467203:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000424419:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000427410:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372655:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000447388:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000425457:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000453631:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000456393:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372654:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000534399:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372653:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372669:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372652:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000372651:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000531464:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000440226:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000525290:exon_41204506_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000530965:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000416859:exon_41204508_41204620:NFYC;ENSG00000066136:ENST00000308733:exon_41204510_41204620:NFYC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 41494394 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000472037:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000460215:exon_41494256_41494398:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000498793:exon_41494314_41494398:SCMH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 41976291 C/A 1 14 15 29 6.76616958413235 7.75053258842963 -0.984363004297276 A:C C A 10 0.516702172561975 0.715533472379847 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 41976529 C/T 1 2 17 19 0.96659565487605 8.78393693355358 -7.81734127867753 T:C C T 10 0.516702172561975 0.000283654171924963 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 41979163 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 43212926 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43212046_43213083:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000462474:exon_43212924_43213083:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000472802:exon_43212924_43213247:LEPRE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 43632536 C/T 1 73 82 155 35.2807414029758 42.369578150082 -7.08883674710614 T:C C T 10 0.516702172561975 0.261455725956328 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 43636484 C/G 1 30 27 57 14.4989348231407 13.9509586591733 0.547976163967423 C:G C G 10 0.516702172561975 0.895516456667676 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43636427_43636550:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43636427_43636792:EBNA1BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 43824865 C/T 1 21 24 45 10.1492543761985 12.4008521414874 -2.25159776528888 T:C C T 10 0.516702172561975 0.552212064937861 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 43828776 C/T 1 57 65 122 27.5479761639674 33.5856412165284 -6.03766505256096 T:C C T 10 0.516702172561975 0.278571895084055 ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43828622_43828874:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43828622_43828858:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43828622_43828874:CDC20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 44433361 C/A 1 53 49 102 25.6147848542153 25.3184064555368 0.296378398678545 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44433258_44433694:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000483886:exon_44433258_44433641:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000372339:exon_44433258_44433424:IPO13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 44437585 G/A 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000132768:ENST00000255108:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000524776:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000495421:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000412950:exon_44437059_44437742:DPH2;ENSG00000132768:ENST00000459879:exon_44437332_44437742:DPH2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45232619 G/A 1 34 36 70 16.4321261328928 18.6012782122311 -2.16915207933825 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63367250862331 ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45232498_45232621:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45232498_45232621:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45232498_45232621:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45232498_45232621:KIF2C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45270052 G/C 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000173846:ENST00000372201:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000465443:exon_45270011_45270451:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000492398:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461358:exon_45270011_45270173:PLK3;ENSG00000173846:ENST00000461769:exon_45270011_45270173:PLK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45469155 C/T 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45468212_45469248:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45468220_45469248:HECTD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45469586 G/A 1 26 14 40 12.5657435133886 7.23383041586765 5.331913097521 A:G G A 10 0.516702172561975 0.113043689291216 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45475278 G/A 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 G G 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45475240_45475355:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45475240_45475286:HECTD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 26 29 55 12.5657435133886 14.9843630042973 -2.41861949090863 A:G A G 10 0.516702172561975 0.589901516453372 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45480059 G/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000472254:exon_45479722_45480248:UROD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 45796958 G/A 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 A:G G A 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45796854_45797006:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45796854_45797006:MUTYH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 26 27 53 12.5657435133886 13.9509586591733 -1.38521514578468 A:G A G 10 0.516702172561975 0.783803144424073 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 35 27 62 16.9154239603309 13.9509586591733 2.96446530115755 T:C C T 10 0.516702172561975 0.525572765232914 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 46159376 A/C 1 31 42 73 14.9822326505788 21.701491247603 -6.71925859702418 A:C:G A C 10 0.516702172561975 0.128142856214649 ENSG00000159596:ENST00000372025:exon_46158876_46160115:TMEM69;ENSG00000159596:ENST00000496366:exon_46158876_46159517:TMEM69 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 46715676 C/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 C:G C G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000085999:ENST00000463715:exon_46715672_46715791:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000442598:exon_46715672_46715791:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000493985:exon_46715672_46715791:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000371975:exon_46715672_46715791:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000469835:exon_46715672_46715791:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000487700:exon_46715672_46715791:RAD54L;ENSG00000085999:ENST00000493032:exon_46715672_46715791:RAD54L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 47842431 G/A 1 21 17 38 10.1492543761985 8.78393693355358 1.36531744264495 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746255675426388 ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47842376_47844511:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47842376_47844510:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47842376_47842882:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47842376_47842795:CMPK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 52226449 C/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 C:G C G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000117859:ENST00000371714:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371709:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000337809:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371710:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435274:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000435686:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000371707:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000447887:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000495776:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000428468:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000453295:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000530544:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000532975:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000527631:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531828:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000361556:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000526917:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000462759:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000486942:exon_52226362_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000528603:exon_52226338_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000475697:exon_52225296_52226452:OSBPL9;ENSG00000117859:ENST00000531061:exon_52226378_52226452:OSBPL9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 52271205 C/T 1 29 15 44 14.0156369957027 7.75053258842963 6.2651044072731 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0697631839666694 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52271182_52271233:NRD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 52881055 A/C 1 39 25 64 18.848615270083 12.9175543140494 5.9310609560336 A:C A C 10 0.516702172561975 0.168476478616793 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52881010_52881058:PRPF38A;ENSG00000134748:ENST00000474048:exon_52881010_52881058:PRPF38A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 53364889 A/T 1 15 17 32 7.24946741157037 8.78393693355358 -1.5344695219832 A:T A T 10 0.516702172561975 0.600958499169707 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000479183:exon_53363109_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000463923:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000371522:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000371520:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000498544:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000479593:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000487866:exon_53364846_53364896:ECHDC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 53370699 C/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000121310:ENST00000498544:exon_53370318_53370844:ECHDC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 53679066 G/A 1 22 23 45 10.6325522036365 11.8841499689254 -1.25159776528888 A:G G A 10 0.516702172561975 0.766399085730726 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 53723993 C/T 1 14 18 32 6.76616958413235 9.30063910611555 -2.5344695219832 T:C C T 10 0.516702172561975 0.382851938905623 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000459674:exon_53723991_53724143:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000460214:exon_53723991_53724143:LRP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 54433536 A/G 1 55 56 111 26.5813805090914 28.9353216634706 -2.35394115437923 A:G A G 10 0.516702172561975 0.704306546691879 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54433338_54433841:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54433338_54433841:LRRC42 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 50 42 92 24.1648913719012 21.701491247603 2.4634001242983 C:G G C 10 0.516702172561975 0.676736556552509 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 136 113 249 65.7285045315714 58.3873454995032 7.34115903206821 C:G C G 10 0.516702172561975 0.374843510573085 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 55197320 G/A 1 7 17 24 3.38308479206617 8.78393693355358 -5.4008521414874 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0390099403344458 ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55197159_55197373:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55197159_55197373:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55197159_55197373:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55197159_55197373:TTC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 58999651 T/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:G T G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999621_58999732:OMA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C T C 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 59247993 C/T 1 54 76 130 26.0980826816533 39.2693651147101 -13.1712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0223877823276662 ENSG00000177606:ENST00000371222:exon_59246465_59249785:JUN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 62579823 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 62579901 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62579725_62579922:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62579725_62579918:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62579762_62579918:INADL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 62579926 C/T 1 1 7 8 0.483297827438025 3.61691520793383 -3.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0335158533751347 ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62579725_62580597:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62579725_62580582:INADL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 62675619 C/T 0 0 14 14 0 7.23383041586765 -7.23383041586765 T C T 10 0.516702172561975 3.79321797694429e-05 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 62677050 C/T 0 24 0 24 11.5991478585126 0 11.5991478585126 C C 10 0.516702172561975 1.57522378823987e-07 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 62677118 A/G 0 38 0 38 18.3653174426449 0 18.3653174426449 A A 10 0.516702172561975 1.36807186621231e-11 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 63329784 A/G 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000125703:ENST00000317868:exon_63329663_63331184:ATG4C;ENSG00000125703:ENST00000371120:exon_63329663_63331184:ATG4C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 64095111 A/G 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64095096_64095258:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64095096_64095258:PGM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 64101993 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64101905_64102059:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64101905_64102059:PGM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 67833522 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67833508_67833708:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67833508_67833708:IL12RB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 67861270 G/T 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 T:G G T 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000081985:ENST00000262345:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000371000:exon_67861230_67862583:IL12RB2;ENSG00000081985:ENST00000465396:exon_67861230_67861446:IL12RB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 71538191 A/G 1 30 25 55 14.4989348231407 12.9175543140494 1.58138050909137 A:G A G 10 0.516702172561975 0.68806606133785 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71538155_71538231:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71538155_71538231:ZRANB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 75175886 T/C 1 20 17 37 9.6659565487605 8.78393693355358 0.882019615206923 T:C T C 10 0.516702172561975 0.869763154666625 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 76227022 A/G 1 33 35 68 15.9488283054548 18.0845760396691 -2.1357477342143 A:G A G 10 0.516702172561975 0.628982969133464 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76226807_76227300:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76226807_76227055:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000481374:exon_76226807_76227055:ACADM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 78429831 G/A 1 32 19 51 15.4655304780168 9.81734127867753 5.64818919933927 A:G G A 10 0.516702172561975 0.124303922129108 ENSG00000162613:ENST00000294623:exon_78429747_78429847:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000370773:exon_78429747_78429847:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000436586:exon_78429747_78429847:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000394922:exon_78429747_78429847:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000370768:exon_78429747_78429847:FUBP1;ENSG00000162613:ENST00000370767:exon_78429747_78429847:FUBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 89473514 C/G 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 C:G C G 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89472363_89473535:GBP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 89473532 G/C 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C:G G C 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89472363_89473535:GBP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 90400338 T/C 1 10 22 32 4.83297827438025 11.3674477963635 -6.5344695219832 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0218947991099638 ENSG00000171492:ENST00000337338:exon_90398626_90402170:LRRC8D;ENSG00000171492:ENST00000394593:exon_90398626_90401560:LRRC8D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 92712203 C/T 1 12 15 27 5.7995739292563 7.75053258842963 -1.95095865917333 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.564379305884164 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92711959_92712203:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92712047_92712203:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000471465:exon_92712049_92712203:GLMN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 92755764 A/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:T A T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92755755_92755863:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92755755_92755863:GLMN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 93646348 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000448243:exon_93646273_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000479653:exon_93646316_93646409:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 93672784 G/A 1 4 13 17 1.9331913097521 6.71712824330568 -4.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0268550497470769 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 23 22 45 11.1158500310746 11.3674477963635 -0.251597765288876 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 94342203 C/G 1 73 84 157 35.2807414029758 43.4029824952059 -8.12224109223008 C:G C G 10 0.516702172561975 0.202008303401865 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 99225627 G/A 1 9 27 36 4.34968044694222 13.9509586591733 -9.6012782122311 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00135471435497997 ENSG00000162627:ENST00000529992:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000306121:exon_99225610_99226056:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000439833:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000351590:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000415097:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000528824:exon_99225610_99226056:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000370189:exon_99225610_99226056:SNX7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 99225688 T/G 1 7 33 40 3.38308479206617 17.0511716945452 -13.668086902479 T:G T G 10 0.516702172561975 1.04015657351236e-05 ENSG00000162627:ENST00000529992:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000306121:exon_99225610_99226056:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000439833:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000351590:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000415097:exon_99225610_99226054:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000528824:exon_99225610_99226056:SNX7;ENSG00000162627:ENST00000370189:exon_99225610_99226056:SNX7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 109952589 T/C 1 169 171 340 81.6773328370262 88.3560715080977 -6.67873867107151 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.480848016921709 ENSG00000143106:ENST00000271308:exon_109952550_109952636:PSMA5;ENSG00000143106:ENST00000490870:exon_109952550_109952636:PSMA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 110171746 C/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110171731_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000532851:exon_110171731_110172314:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000533132:exon_110171731_110172174:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000467071:exon_110171336_110171857:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000479919:exon_110171715_110171857:AMPD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 110466185 G/C 1 22 17 39 10.6325522036365 8.78393693355358 1.84861527008297 C:G G C 10 0.516702172561975 0.631830397141998 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110465788_110466333:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000488198:exon_110465788_110466221:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110465788_110466333:CSF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 110883874 G/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:G G T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 229 165 394 110.675202483308 85.2558584727259 25.4193440105818 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0116294022882331 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 111494194 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000121931:ENST00000369763:exon_111493910_111495437:C1orf103;ENSG00000121931:ENST00000443367:exon_111493910_111495437:C1orf103 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 111726098 G/A 1 6 19 25 2.89978696462815 9.81734127867753 -6.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00794870223416112 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000483427:exon_111726084_111726173:CEPT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 111778325 C/T 1 132 5 137 63.7953132218193 2.58351086280988 61.2118023590094 T:C C T 10 0.516702172561975 1.5826712575687e-31 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000528451:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000486561:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000474304:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000477185:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000467038:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497587:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111778261_111778385:CHI3L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 111778329 C/T 1 116 5 121 56.0625479828109 2.58351086280988 53.479037120001 T:C C T 10 0.516702172561975 3.64724786039975e-27 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000528451:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000486561:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000474304:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000477185:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000467038:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497587:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111778261_111778385:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111778261_111778385:CHI3L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 112298582 A/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G A G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000064703:ENST00000533164:exon_112298435_112298847:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112297927_112298847:DDX20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 112309123 C/A 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:C C A 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 112309331 T/C 1 12 24 36 5.7995739292563 12.4008521414874 -6.6012782122311 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0302806260062048 ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 113234410 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113234287_113234421:MOV10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 115262398 T/C 1 1 10 11 0.483297827438025 5.16702172561975 -4.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00498857440724258 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 117617844 A/G 1 3 9 12 1.44989348231407 4.65031955305778 -3.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0834942591884686 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 117635507 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117635353_117635523:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000492682:exon_117635409_117635523:TTF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 118492397 A/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118492374_118492459:WDR3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 120284423 G/A 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120284390_120284520:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120284390_120284520:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120284390_120284520:PHGDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 32 32 0 16.5344695219832 -16.5344695219832 C T C 10 0.516702172561975 7.85009606979207e-11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 1 1 28 29 0.483297827438025 14.4676608317353 -13.9843630042973 T:G G T 10 0.516702172561975 2.70858837344169e-08 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 26 26 0 13.4342564866114 -13.4342564866114 A C A 10 0.516702172561975 6.16007378996191e-09 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 53 0 53 25.6147848542153 0 25.6147848542153 G G 10 0.516702172561975 6.51822872090269e-16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 33 33 0 17.0511716945452 -17.0511716945452 C T C 10 0.516702172561975 3.79393437571029e-11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 45 45 0 23.2515977652889 -23.2515977652889 T C T 10 0.516702172561975 6.16123720036657e-15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 57 0 57 27.5479761639674 0 27.5479761639674 C C 10 0.516702172561975 4.61545838900189e-17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 150463918 A/C 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150463870_150463987:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150463870_150463987:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150463870_150463987:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150463870_150463987:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000466989:exon_150463870_150463987:TARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 150470030 T/G 1 11 16 27 5.31627610181827 8.2672347609916 -2.95095865917333 T:G T G 10 0.516702172561975 0.335879253897204 ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000480070:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000463555:exon_150470006_150470223:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000460794:exon_150470006_150470073:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000462578:exon_150470006_150470063:TARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 150551602 C/A 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143384:ENST00000369026:exon_150551319_150552066:MCL1;ENSG00000143384:ENST00000439749:exon_150551319_150551679:MCL1;ENSG00000143384:ENST00000307940:exon_150551319_150552006:MCL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 150938616 G/A 1 24 25 49 11.5991478585126 12.9175543140494 -1.31840645553678 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775566296958739 ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150937739_150938764:LASS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 151006539 C/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143363:ENST00000271620:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000271619:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000302413:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368937:exon_151006282_151007683:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000431193:exon_151006282_151006589:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368936:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368935:exon_151006282_151008189:PRUNE;ENSG00000143363:ENST00000368934:exon_151006282_151008187:PRUNE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 151026815 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 151288391 A/G 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000143393:ENST00000368874:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368875:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000271657:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368873:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000392756:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000414081:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000368872:exon_151288049_151288985:PI4KB;ENSG00000143393:ENST00000438243:exon_151288116_151288985:PI4KB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 151316161 G/A 1 16 17 33 7.7327652390084 8.78393693355358 -1.05117169454518 A:G G A 10 0.516702172561975 0.731077391443214 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436637:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151316157_151316358:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151316157_151316358:RFX5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 151373200 T/C 1 16 6 22 7.7327652390084 3.10021303537185 4.63255220363655 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0553424742719923 ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372918_151373528:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372918_151373831:PSMB4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 151955625 C/T 0 0 9 9 0 4.65031955305778 -4.65031955305778 T C T 10 0.516702172561975 0.00143857856770658 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 152009397 A/C 1 177 282 459 85.5437154565304 145.710012662477 -60.1662972059465 A:C A C 10 0.516702172561975 1.80357369101570e-08 ENSG00000163191:ENST00000271638:exon_152009389_152009511:S100A11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 153234295 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000203782:ENST00000368742:exon_153233403_153234598:LOR;ENSG00000203782:ENST00000392652:exon_153233402_153234593:LOR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 153507176 C/T 1 73 129 202 35.2807414029758 66.6545802604948 -31.373838857519 T:C C T 10 0.516702172561975 1.10120822275215e-05 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 153591364 G/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000189171:ENST00000476133:exon_153591263_153591514:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000339556:exon_153591275_153591514:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000368699:exon_153591280_153591514:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000440685:exon_153591280_153591514:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000392623:exon_153591280_153591514:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000392622:exon_153591280_153591514:S100A13;ENSG00000189171:ENST00000491177:exon_153591284_153591514:S100A13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 153642354 C/T 1 23 15 38 11.1158500310746 7.75053258842963 3.36531744264495 T:C C T 10 0.516702172561975 0.330749831507086 ENSG00000143621:ENST00000361891:exon_153642312_153642354:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000368684:exon_153642312_153642354:ILF2;ENSG00000143621:ENST00000368681:exon_153642312_153642354:ILF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 153723634 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153723571_153723715:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153723571_153723715:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153723571_153723715:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153723571_153723715:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153723571_153723715:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153723330_153723715:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153723611_153723715:INTS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 153745128 G/C 1 50 41 91 24.1648913719012 21.184789075041 2.98010229686027 C:G G C 10 0.516702172561975 0.600231760140086 ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 154186406 C/T 1 46 49 95 22.2317000621491 25.3184064555368 -3.08670639338763 T:C C T 10 0.516702172561975 0.539517438735536 ENSG00000143612:ENST00000350592:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368521:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368518:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368516:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000470180:exon_154186369_154186422:C1orf43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 154573967 T/C 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 T:C T C 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000463920:exon_154572653_154574724:ADAR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 154904840 T/C 1 27 14 41 13.0490413408267 7.23383041586765 5.81521092495902 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0849123257114252 ENSG00000163344:ENST00000368467:exon_154904828_154904891:PMVK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 15 15 30 7.24946741157037 7.75053258842963 -0.501065176859251 T:C C T 10 0.516702172561975 0.857608347222054 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 154938235 G/C 1 12 2 14 5.7995739292563 1.03340434512395 4.76616958413235 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0136115374114993 ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000490667:exon_154938115_154938238:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938019_154938257:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938019_154938257:SHC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 155165848 C/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 C:G C G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000169231:ENST00000498500:exon_155165778_155166233:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000487250:exon_155165778_155165917:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000368378:exon_155165778_155165917:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000457183:exon_155165778_155165917:THBS3;ENSG00000169231:ENST00000469769:exon_155165778_155165917:THBS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 155699032 G/T 1 28 34 62 13.5323391682647 17.5678738671072 -4.03553469884245 T:G G T 10 0.516702172561975 0.312543446628974 ENSG00000132676:ENST00000471214:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497826:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463575:exon_155698999_155699082:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000479151:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000466384:exon_155698999_155699052:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000462978:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155698999_155699157:DAP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 155932940 T/C 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000116584:ENST00000313695:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000361247:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000368315:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000435736:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000368316:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000313667:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000462460:exon_155932724_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000470874:exon_155932918_155932974:ARHGEF2;ENSG00000116584:ENST00000471589:exon_155932931_155932974:ARHGEF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156235939 G/A 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 A:G G A 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000198952:ENST00000361813:exon_156235572_156236171:SMG5;ENSG00000198952:ENST00000489907:exon_156235891_156236171:SMG5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156263873 G/A 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156450740 G/A 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156563813 G/A 1 29 26 55 14.0156369957027 13.4342564866114 0.581380509091373 A:G G A 10 0.516702172561975 0.893564646129122 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156563852 C/T 1 65 36 101 31.4143587834716 18.6012782122311 12.8130805712405 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0124736843220777 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156565218 C/T 1 64 51 115 30.9310609560336 26.3518108006607 4.57925015537287 T:C C T 10 0.516702172561975 0.40270219702045 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156565050_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156565005_156565641:GPATCH4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156568252 A/G 1 47 23 70 22.7149978895872 11.8841499689254 10.8308479206617 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0115338758825257 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156568213_156568286:GPATCH4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 156697056 T/C 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 T:C T C 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000143319:ENST00000313146:exon_156696698_156698227:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000368219:exon_156696698_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000496538:exon_156696698_156697178:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000470713:exon_156697003_156697561:ISG20L2;ENSG00000143319:ENST00000469074:exon_156697034_156697600:ISG20L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 157650539 G/A 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000160856:ENST00000477837:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000492769:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000480682:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000494724:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000368186:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000485028:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000368184:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000292392:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000392274:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000473231:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000468507:exon_157650492_157650560:FCRL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 158986477 G/C 1 76 74 150 36.7306348852899 38.2359607695861 -1.50532588429625 C:G G C 10 0.516702172561975 0.807065455312274 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 44 44 88 21.2651044072731 22.7348955927269 -1.4697911854538 A:G A G 10 0.516702172561975 0.83123049451749 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 159854251 T/C 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000213085:ENST00000426543:exon_159854226_159854355:CCDC19;ENSG00000213085:ENST00000368099:exon_159854226_159854355:CCDC19;ENSG00000213085:ENST00000476696:exon_159854226_159854355:CCDC19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 159890226 T/A 1 132 133 265 63.7953132218193 68.7213889507427 -4.92607572892339 A:T T A 10 0.516702172561975 0.58023670962849 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159890120_159890327:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159890120_159890327:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159890120_159890327:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159890120_159890327:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159890120_159890327:TAGLN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 160327865 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 160616742 A/G 1 20 21 41 9.6659565487605 10.8507456238015 -1.18478907504098 A:G A G 10 0.516702172561975 0.756110170705008 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 160654792 C/T 1 529 349 878 255.664550714715 180.329058224129 75.3354924905859 T:C C T 10 0.516702172561975 3.83326861961866e-07 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 160720203 G/C 1 25 14 39 12.0824456859506 7.23383041586765 4.84861527008297 C:G G C 10 0.516702172561975 0.148898460277858 ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160720094_160720213:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160720094_160720213:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160720094_160720213:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160720094_160720213:SLAMF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 160811488 T/C 1 16 8 24 7.7327652390084 4.1336173804958 3.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.157059041871443 ENSG00000122223:ENST00000368034:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368033:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000492063:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000322302:exon_160811374_160811691:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368032:exon_160811374_160811691:CD244 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161092910 G/A 1 19 12 31 9.18265872132247 6.2004260707437 2.98223265057877 A:G G A 10 0.516702172561975 0.369231919605051 ENSG00000158796:ENST00000368006:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000392188:exon_161092775_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000458050:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000489249:exon_161092865_161092964:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000486041:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000368005:exon_161092775_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000464113:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000473679:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000490843:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000463227:exon_161092865_161093011:DEDD;ENSG00000158796:ENST00000496632:exon_161092865_161093011:DEDD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161140517 A/C 1 16 11 27 7.7327652390084 5.68372389818173 2.04904134082667 A:C A C 10 0.516702172561975 0.448966948977557 ENSG00000143224:ENST00000352210:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000432542:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000435935:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000367999:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000497522:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000495483:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000462866:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000466452:exon_161140051_161140559:PPOX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161143713 G/T 1 7 21 28 3.38308479206617 10.8507456238015 -7.4676608317353 T:G G T 10 0.516702172561975 0.00696293298631101 ENSG00000158850:ENST00000319769:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000470882:exon_161143395_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000407555:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000310413:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367998:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000367997:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000466504:exon_161143649_161143839:B4GALT3;ENSG00000158850:ENST00000465740:exon_161143649_161143839:B4GALT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 50 62 112 24.1648913719012 32.0355346988425 -7.87064332694121 A:G G A 10 0.516702172561975 0.155946392451943 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161821608 C/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161821512_161821625:ATF6;ENSG00000118217:ENST00000476437:exon_161821512_161821625:ATF6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 24 22 46 11.5991478585126 11.3674477963635 0.231700062149148 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 162560114 A/C 1 16 17 33 7.7327652390084 8.78393693355358 -1.05117169454518 A:C A C 10 0.516702172561975 0.731077391443214 ENSG00000117143:ENST00000367926:exon_162560113_162560301:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000271469:exon_162560113_162560301:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000414807:exon_162560113_162560301:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367925:exon_162560113_162560301:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367924:exon_162560113_162560301:UAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 165648710 G/A 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165648679_165648819:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000491436:exon_165648679_165648819:ALDH9A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 168195363 C/T 0 11 0 11 5.31627610181827 0 5.31627610181827 C C 10 0.516702172561975 0.00103689775134077 ENSG00000213064:ENST00000471981:exon_168195176_168195380:SFT2D2;ENSG00000213064:ENST00000367829:exon_168195188_168195380:SFT2D2;ENSG00000213064:ENST00000271375:exon_168195246_168195380:SFT2D2;ENSG00000213064:ENST00000367825:exon_168195255_168195380:SFT2D2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 169762807 T/G 1 7 19 26 3.38308479206617 9.81734127867753 -6.43425648661135 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0168288098734415 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000454472:exon_169762283_169763038:C1orf156 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 169951997 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000075945:ENST00000361580:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367765:exon_169951843_169952008:KIFAP3;ENSG00000075945:ENST00000367767:exon_169951843_169952008:KIFAP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 171535401 C/T 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 T:C C T 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000412837:exon_171535372_171535560:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000495585:exon_171535372_171535560:BAT2L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 172410967 G/A 1 27 21 48 13.0490413408267 10.8507456238015 2.1982957170252 A:G G A 10 0.516702172561975 0.565565017376882 ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 175958578 T/C 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000143207:ENST00000461830:exon_175957424_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367667:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367669:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000314478:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367666:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367665:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000308769:exon_175958498_175958615:RFWD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 179310244 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179310163_179310445:SOAT1;ENSG00000057252:ENST00000426956:exon_179310163_179310445:SOAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 179319541 C/G 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 181018236 A/G 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 A:G A G 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000153029:ENST00000486453:exon_181018188_181018833:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181018188_181018448:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181018188_181018448:MR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 23 9 32 11.1158500310746 4.65031955305778 6.4655304780168 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0321365565649403 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 182569446 T/G 1 71 68 139 34.3141457480998 35.1357477342143 -0.82160198611453 T:G T G 10 0.516702172561975 0.932433369706753 ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 182827297 G/A 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182827239_182827375:DHX9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 185108543 A/G 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G A G 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000121486:ENST00000367504:exon_185108499_185108711:C1orf25;ENSG00000121486:ENST00000367506:exon_185108499_185108711:C1orf25;ENSG00000121486:ENST00000458395:exon_185108499_185108692:C1orf25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 41 37 78 19.815210924959 19.1179803847931 0.697230540165947 A:G A G 10 0.516702172561975 0.91012877949345 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 192548229 G/T 1 24 11 35 11.5991478585126 5.68372389818173 5.91542396033087 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0613679261503642 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 192779329 C/G 1 15 42 57 7.24946741157037 21.701491247603 -14.4520238360326 C:G C G 10 0.516702172561975 0.000153635263243271 ENSG00000116741:ENST00000483295:exon_192779296_192780029:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000235382:exon_192779296_192779397:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000464302:exon_192779296_192779561:RGS2;ENSG00000116741:ENST00000487236:exon_192779296_192779397:RGS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 198725169 T/C 1 44 27 71 21.2651044072731 13.9509586591733 7.31414574809977 T:C T C 10 0.516702172561975 0.096065931074559 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198725035_198726545:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198725035_198726412:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198725035_198726412:PTPRC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 22 22 44 10.6325522036365 11.3674477963635 -0.7348955927269 A:G A G 10 0.516702172561975 0.880656348233704 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201355761 A/G 1 24 25 49 11.5991478585126 12.9175543140494 -1.31840645553678 A:G A G 10 0.516702172561975 0.775566296958739 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201355898 G/A 1 20 13 33 9.6659565487605 6.71712824330568 2.94882830545482 A:G G A 10 0.516702172561975 0.384275391484244 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201355943 C/T 1 26 26 52 12.5657435133886 13.4342564866114 -0.868512973222703 T:C C T 10 0.516702172561975 0.88987681601677 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201355463_201356306:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201355463_201356306:LAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201358304 C/A 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 A:C C A 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000159166:ENST00000391967:exon_201358288_201358431:LAD1;ENSG00000159166:ENST00000367313:exon_201358288_201358431:LAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201832685 C/G 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 C:G C G 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201832576_201832735:IPO9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201843421 A/C 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201843378_201843500:IPO9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201843436 C/T 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198700:ENST00000361565:exon_201843378_201843500:IPO9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201934578 G/A 1 33 44 77 15.9488283054548 22.7348955927269 -6.78606728727208 A:G G A 10 0.516702172561975 0.138196122733628 ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201974712 G/C 1 28 36 64 13.5323391682647 18.6012782122311 -5.0689390439664 C:G G C 10 0.516702172561975 0.213268774393069 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201974686_201975275:RNPEP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 201981862 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000163435:ENST00000359651:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367284:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367283:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000490203:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000446188:exon_201981768_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000470384:exon_201981573_201981887:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000479874:exon_201981697_201981887:ELF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 202304868 T/C 1 4 11 15 1.9331913097521 5.68372389818173 -3.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0693401729118476 ENSG00000077152:ENST00000367274:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000487227:exon_202304774_202304946:UBE2T;ENSG00000077152:ENST00000460852:exon_202304774_202304946:UBE2T HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 202911183 C/T 1 25 26 51 12.0824456859506 13.4342564866114 -1.35181080066073 T:C C T 10 0.516702172561975 0.779790880307479 ENSG00000159346:ENST00000340990:exon_202911153_202911346:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000495562:exon_202911153_202911346:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000436244:exon_202911153_202911346:ADIPOR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 202933779 G/T 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:G G T 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000159348:ENST00000367249:exon_202933740_202933823:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000497655:exon_202932770_202934512:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000482572:exon_202933740_202933823:CYB5R1;ENSG00000159348:ENST00000446185:exon_202933740_202933823:CYB5R1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 205744122 T/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:G T G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000117280:ENST00000367139:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000235932:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000528078:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000367140:exon_205743961_205744214:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000446390:exon_205743961_205744361:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000414729:exon_205743961_205744587:RAB7L1;ENSG00000117280:ENST00000492534:exon_205743961_205744279:RAB7L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 206766975 T/C 1 49 38 87 23.6815935444632 19.6346825573551 4.04691098710817 T:C T C 10 0.516702172561975 0.393276876971329 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 206767029 C/T 1 25 16 41 12.0824456859506 8.2672347609916 3.81521092495902 T:C C T 10 0.516702172561975 0.274752754417227 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 206769111 A/G 1 26 27 53 12.5657435133886 13.9509586591733 -1.38521514578468 A:G A G 10 0.516702172561975 0.783803144424073 ENSG00000143486:ENST00000496193:exon_206769067_206769187:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206769067_206769187:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206769067_206769187:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206769067_206769187:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000468891:exon_206769051_206769187:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000484492:exon_206769052_206769187:LGTN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 206904516 C/T 1 11 7 18 5.31627610181827 3.61691520793383 1.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.485136060235083 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904483_206904607:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904483_206904607:MAPKAPK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 206906071 C/T 1 21 24 45 10.1492543761985 12.4008521414874 -2.25159776528888 T:C C T 10 0.516702172561975 0.552212064937861 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206905383_206906208:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206905920_206907628:MAPKAPK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 207269919 C/T 0 17 0 17 8.21606306644642 0 8.21606306644642 C C 10 0.516702172561975 1.76198770091202e-05 ENSG00000123843:ENST00000367078:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391924:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000452902:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000243611:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000367076:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000391923:exon_207269867_207269960:C4BPB;ENSG00000123843:ENST00000469326:exon_207268279_207269960:C4BPB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 209933331 A/G 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 A:G A G 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 209933540 A/G 1 29 19 48 14.0156369957027 9.81734127867753 4.1982957170252 A:G A G 10 0.516702172561975 0.249596640585508 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 209953802 G/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 C:G G C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000009790:ENST00000460314:exon_209951712_209953951:TRAF3IP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 210024841 T/G 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 T:G T G 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210024549_210030910:C1orf107 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 211836789 T/C 1 11 13 24 5.31627610181827 6.71712824330568 -1.4008521414874 T:C T C 10 0.516702172561975 0.68401647134037 ENSG00000117650:ENST00000366999:exon_211836114_211836994:NEK2;ENSG00000117650:ENST00000462283:exon_211836745_211836970:NEK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 212273639 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 212911836 T/C 1 14 7 21 6.76616958413235 3.61691520793383 3.14925437619852 T:C T C 10 0.516702172561975 0.194433587736325 ENSG00000117697:ENST00000366977:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366975:exon_212910298_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000422588:exon_212910933_212912028:NSL1;ENSG00000117697:ENST00000366976:exon_212911825_212912028:NSL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 218475648 C/T 1 23 15 38 11.1158500310746 7.75053258842963 3.36531744264495 T:C C T 10 0.516702172561975 0.330749831507086 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218475636_218475901:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218475636_218476013:RRP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 220178676 G/C 1 12 18 30 5.7995739292563 9.30063910611555 -3.50106517685925 C:G G C 10 0.516702172561975 0.207473070431477 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220178590_220178702:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220178590_220178702:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000464052:exon_220178590_220178702:EPRS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 222803088 T/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000154305:ENST00000344922:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000470521:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000344441:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000320831:exon_222800917_222803731:MIA3;ENSG00000154305:ENST00000354906:exon_222801816_222803731:MIA3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 223900408 C/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 C:G C G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223900034_223900579:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000433674:exon_223900119_223900579:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223900119_223900579:CAPN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 226034909 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 226046974 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226046896_226047049:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000487971:exon_226046896_226047241:TMEM63A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 226109699 T/C 1 49 40 89 23.6815935444632 20.668086902479 3.01350664198422 T:C T C 10 0.516702172561975 0.596158997309948 ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226109558_226111471:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000446534:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000489681:exon_226109558_226109779:PYCR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 226175743 T/C 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000143751:ENST00000272091:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366818:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366817:exon_226175597_226176089:C1orf55 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 226573364 A/G 1 48 45 93 23.1982957170252 23.2515977652889 -0.0533020482636815 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226573205_226573381:PARP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 26 32 58 12.5657435133886 16.5344695219832 -3.96872600859455 A:G G A 10 0.516702172561975 0.357876791001119 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 T:C T C 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 227920095 A/G 1 25 19 44 12.0824456859506 9.81734127867753 2.2651044072731 A:G A G 10 0.516702172561975 0.547899287460427 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 27 12 39 13.0490413408267 6.2004260707437 6.84861527008297 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0360890847610030 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 227922918 A/C 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227922697_227923200:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922713_227923112:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922713_227923090:JMJD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 227935444 A/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 228285645 C/T 1 263 259 522 127.107328616201 133.825862693552 -6.71853407735097 T:C C T 10 0.516702172561975 0.569290956786441 ENSG00000143761:ENST00000272102:exon_228285553_228286910:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000470670:exon_228285553_228285728:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000478424:exon_228285553_228286080:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000470558:exon_228285553_228285889:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000478336:exon_228285553_228285823:ARF1;ENSG00000143761:ENST00000469235:exon_228285553_228285649:ARF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 228294429 T/C 1 54 40 94 26.0980826816533 20.668086902479 5.42999577917435 T:C T C 10 0.516702172561975 0.30211642325341 ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228294380_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228294381_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228294381_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228294381_228294619:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228294381_228294619:MRPL55 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 228582843 G/A 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000154370:ENST00000284551:exon_228581377_228582953:TRIM11;ENSG00000154370:ENST00000460651:exon_228582157_228582953:TRIM11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 229438649 C/T 1 3 13 16 1.44989348231407 6.71712824330568 -5.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0105610415694978 ENSG00000168118:ENST00000366690:exon_229438609_229438736:RAB4A;ENSG00000168118:ENST00000452890:exon_229438609_229438736:RAB4A;ENSG00000168118:ENST00000473894:exon_229438609_229438736:RAB4A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 229584911 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229584873_229584937:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229584873_229584937:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229584873_229584937:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000490352:exon_229584873_229584937:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000485119:exon_229584519_229584937:NUP133 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 230415244 T/C 1 16 32 48 7.7327652390084 16.5344695219832 -8.8017042829748 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0134171853798154 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 231700659 C/T 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 T:C C T 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000116918:ENST00000366639:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000420593:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000475168:exon_231700274_231702270:TSNAX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 231700685 G/A 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000116918:ENST00000366639:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000420593:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000475168:exon_231700274_231702270:TSNAX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 234529552 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 234529570 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000483404:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000462259:exon_234529392_234529583:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000496673:exon_234529392_234529583:TARBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 234743237 G/A 1 85 71 156 41.0803153322321 36.6858542519002 4.3944610803319 A:G G A 10 0.516702172561975 0.521815833787673 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 234743492 C/T 1 44 37 81 21.2651044072731 19.1179803847931 2.14712402248002 T:C C T 10 0.516702172561975 0.657880994846147 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 234743528 G/A 1 57 43 100 27.5479761639674 22.2181934201649 5.3297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.317361512828397 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 234745009 A/G 0 0 13 13 0 6.71712824330568 -6.71712824330568 G A G 10 0.516702172561975 7.8486137565572e-05 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 30 27 57 14.4989348231407 13.9509586591733 0.547976163967423 A:G A G 10 0.516702172561975 0.895516456667676 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 23 29 52 11.1158500310746 14.9843630042973 -3.8685129732227 T:C T C 10 0.516702172561975 0.331741179314814 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236689342 G/T 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:G G T 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000475670:exon_236689268_236689735:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236689268_236689415:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236689268_236689415:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236700807 T/A 1 18 4 22 8.69936089388445 2.0668086902479 6.63255220363655 A:T T A 10 0.516702172561975 0.00480346847647182 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236700823 T/C 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236700857 C/T 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 T:C C T 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236702210 A/G 1 4 10 14 1.9331913097521 5.16702172561975 -3.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.108891126564131 ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236702374 G/A 1 13 16 29 6.28287175669432 8.2672347609916 -1.98436300429728 A:G G A 10 0.516702172561975 0.578060435519144 ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236706913 C/T 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236706842_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532640:exon_236706860_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236706327_236706948:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525789:exon_236706596_236706948:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 33 49 82 15.9488283054548 25.3184064555368 -9.36957815008195 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0461480783265715 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236716959 C/T 1 17 12 29 8.21606306644642 6.2004260707437 2.01563699570272 T:C C T 10 0.516702172561975 0.465548101282052 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 13 21 34 6.28287175669432 10.8507456238015 -4.56787386710715 T:C T C 10 0.516702172561975 0.125313468307178 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236718620 T/C 1 18 26 44 8.69936089388445 13.4342564866114 -4.7348955927269 T:C T C 10 0.516702172561975 0.175239067814171 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236719193 A/G 1 12 18 30 5.7995739292563 9.30063910611555 -3.50106517685925 A:G A G 10 0.516702172561975 0.207473070431477 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 236721610 G/A 1 14 9 23 6.76616958413235 4.65031955305778 2.11585003107457 A:G G A 10 0.516702172561975 0.410933125671882 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 241663789 G/A 1 58 42 100 28.0312739914054 21.701491247603 6.3297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.230008590609173 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241663737_241663890:FH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 12 1 13 5.7995739292563 0.516702172561975 5.28287175669432 C:G G C 10 0.516702172561975 0.00363176502686701 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 1043198 C/G 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 C:G C G 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1043148_1043248:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1042046_1043248:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000360059:exon_1043148_1043248:GTPBP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 1065787 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 3143161 G/A 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3143113_3143192:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3143113_3143192:PFKP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 15 19 34 7.24946741157037 9.81734127867753 -2.56787386710715 A:G A G 10 0.516702172561975 0.396096284976245 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 34 31 65 16.4321261328928 16.0177673494212 0.41435878347162 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 3177944 C/T 1 35 21 56 16.9154239603309 10.8507456238015 6.0646783365294 T:C C T 10 0.516702172561975 0.110219434759132 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3177928_3178030:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3177928_3178030:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3177928_3178030:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3177928_3178030:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3177928_3178030:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3177928_3178030:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000433193:exon_3177928_3178030:PFKP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 3200292 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 3206027 A/G 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 9 1 10 4.34968044694222 0.516702172561975 3.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0221724159583656 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 5920244 T/C 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 34 40 74 16.4321261328928 20.668086902479 -4.23596076958615 T:C T C 10 0.516702172561975 0.353016340574936 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 7409532 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 95 82 177 45.9132936066124 42.369578150082 3.54371545653041 A:G G A 10 0.516702172561975 0.599618996097303 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 13736086 G/A 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.651129112719795 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 15145917 A/C 1 42 42 84 20.298508752397 21.701491247603 -1.4029824952059 A:C A C 10 0.516702172561975 0.827353258155995 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 17275822 G/A 1 366 384 750 176.887004842317 198.413634263798 -21.5266294214813 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.116335102524417 ENSG00000026025:ENST00000224237:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000487938:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000469543:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000421459:exon_17275769_17275930:VIM;ENSG00000026025:ENST00000495528:exon_17275769_17275930:VIM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 22862282 T/C 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000422321:exon_22862240_22862386:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376565:exon_22862240_22862386:PIP4K2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 27037496 A/G 1 31 15 46 14.9822326505788 7.75053258842963 7.23170006214915 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0383030937241206 ENSG00000136754:ENST00000376138:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376170:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376166:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376160:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376142:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000359188:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376139:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000346832:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376134:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000355394:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376137:exon_27035525_27037674:ABI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 30625927 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30625732_30625956:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30625732_30625956:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30625732_30625956:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30625732_30625956:MTPAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 30629254 C/T 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 21 12 33 10.1492543761985 6.2004260707437 3.94882830545482 A:C C A 10 0.516702172561975 0.222321734051643 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/G 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G A G 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 70105560 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204130:ENST00000466493:exon_70105459_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000466187:exon_70103183_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000388768:exon_70103266_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000265865:exon_70104902_70105668:RUFY2;ENSG00000204130:ENST00000473398:exon_70105490_70105668:RUFY2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 70706147 G/A 1 41 29 70 19.815210924959 14.9843630042973 4.83084792066175 A:G G A 10 0.516702172561975 0.28214954756757 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70706108_70706603:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70706108_70706309:DDX50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 343 365 708 165.771154811243 188.596292985121 -22.8251381738783 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0905744217556025 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 70892791 C/T 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000122958:ENST00000373382:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000477667:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000263559:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000395098:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489656:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000490696:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000467852:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489794:exon_70892654_70892803:VPS26A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 18 19 37 8.69936089388445 9.81734127867753 -1.11798038479308 A:G G A 10 0.516702172561975 0.744448511397302 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71158513 C/T 1 25 24 49 12.0824456859506 12.4008521414874 -0.318406455536778 A:T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71158351_71158584:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71158351_71158584:HK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71160750 C/T 1 32 37 69 15.4655304780168 19.1179803847931 -3.65244990677628 T:C C T 10 0.516702172561975 0.400829190711298 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71160828 C/T 1 21 27 48 10.1492543761985 13.9509586591733 -3.8017042829748 T:C C T 10 0.516702172561975 0.312754715317194 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71243626 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000099282:ENST00000373290:exon_71243447_71243632:TSPAN15;ENSG00000099282:ENST00000478112:exon_71243447_71243848:TSPAN15;ENSG00000099282:ENST00000475069:exon_71243581_71243632:TSPAN15;ENSG00000099282:ENST00000452130:exon_71243624_71243632:TSPAN15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 43 42 85 20.7818065798351 21.701491247603 -0.919684667767878 A:G G A 10 0.516702172561975 0.913671173343735 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 37 36 73 17.8820196152069 18.6012782122311 -0.719258597024176 T:C C T 10 0.516702172561975 0.907057135687815 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 45 53 98 21.7484022347111 27.3852151457847 -5.63681291107356 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.267353343324004 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 73521779 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 74767998 C/G 1 42 32 74 20.298508752397 16.5344695219832 3.76403923041385 C:G C G 10 0.516702172561975 0.416500818116068 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74766975_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000373008:exon_74766975_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74766982_74768050:P4HA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 75135964 T/C 1 107 82 189 51.7128675358687 42.369578150082 9.34328938578671 T:C T C 10 0.516702172561975 0.190168824861597 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75135203_75135975:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75135203_75135975:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000463788:exon_75135407_75135975:ANXA7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 75143371 C/T 1 62 50 112 29.9644653011575 25.8351086280988 4.1293566730588 T:C C T 10 0.516702172561975 0.450776905925125 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75143335_75143448:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75143335_75143448:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75143335_75143448:ANXA7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 76285163 T/C 1 14 22 36 6.76616958413235 11.3674477963635 -4.6012782122311 T:C T C 10 0.516702172561975 0.135658070691423 ENSG00000156110:ENST00000286621:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000372734:exon_76285014_76285184:ADK;ENSG00000156110:ENST00000467840:exon_76285122_76285184:ADK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 77807027 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000148655:ENST00000354343:exon_77806922_77807061:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000372499:exon_77806922_77807061:C10orf11;ENSG00000148655:ENST00000496424:exon_77806637_77807061:C10orf11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 76 82 158 36.7306348852899 42.369578150082 -5.63894326479206 A:G G A 10 0.516702172561975 0.382037521915845 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 81928887 C/A 1 107 77 184 51.7128675358687 39.7860672872721 11.9268002485966 A:C C A 10 0.516702172561975 0.089530436678117 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000445524:exon_81928725_81929114:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000437799:exon_81928836_81929114:ANXA11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 86237331 G/A 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86237331_86237420:FAM190B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 90762801 G/A 1 22 15 37 10.6325522036365 7.75053258842963 2.88201961520692 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411626940897304 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91099630 T/C 1 35 26 61 16.9154239603309 13.4342564866114 3.48116747371952 T:C T C 10 0.516702172561975 0.442383499379473 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91162182 C/T 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91177029 C/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 C:G C G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91176962_91177430:IFIT5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91484780 G/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91497631 T/A 1 11 14 25 5.31627610181827 7.23383041586765 -1.91755431404938 A:T T A 10 0.516702172561975 0.549349590631841 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91498254 A/G 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 A:G A G 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91498318 A/G 1 17 18 35 8.21606306644642 9.30063910611555 -1.08457603966913 A:G A G 10 0.516702172561975 0.738002004373168 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 91503660 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 95430585 T/G 1 22 20 42 10.6325522036365 10.3340434512395 0.29850875239705 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000460752:exon_95430527_95435061:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000483229:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000462771:exon_95430532_95430605:FRA10AC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 18 22 40 8.69936089388445 11.3674477963635 -2.668086902479 C:G G C 10 0.516702172561975 0.43164377138054 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 14 21 35 6.76616958413235 10.8507456238015 -4.08457603966913 A:G A G 10 0.516702172561975 0.179358249450845 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 14 20 34 6.76616958413235 10.3340434512395 -3.56787386710715 T:C C T 10 0.516702172561975 0.234114946287148 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 96094425 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96094391_96094475:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96094391_96094475:NOC3L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 798 722 1520 385.671666295544 373.058968589746 12.6126977057979 A:T:C:G A G 10 0.516702172561975 0.521238380303434 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 233 259 492 112.60839379306 133.825862693552 -21.2174689004917 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0581232607314832 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 97447373 A/T 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:T A T 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 97605057 C/G 1 9 12 21 4.34968044694222 6.2004260707437 -1.85074562380148 C:G C G 10 0.516702172561975 0.514228237115183 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 97920551 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 98282082 T/A 1 12 17 29 5.7995739292563 8.78393693355358 -2.98436300429728 A:T T A 10 0.516702172561975 0.353140328010404 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98277866_98282087:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98282034_98282087:TM9SF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 99139140 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99139050_99139171:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99139050_99139171:RRP12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 99203050 C/T 1 13 4 17 6.28287175669432 2.0668086902479 4.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0511524645234594 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000477692:exon_99202994_99203063:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000471049:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000472345:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99202994_99203068:EXOSC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 101180552 C/T 1 33 27 60 15.9488283054548 13.9509586591733 1.9978696462815 T:C C T 10 0.516702172561975 0.698724773230171 ENSG00000120053:ENST00000370508:exon_101180381_101180562:GOT1;ENSG00000120053:ENST00000471741:exon_101180024_101180562:GOT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 102766364 T/G 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000107816:ENST00000370223:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000315797:exon_102766242_102766586:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000370220:exon_102766242_102767593:LZTS2;ENSG00000107816:ENST00000459989:exon_102766242_102766449:LZTS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 103541595 A/T 1 43 49 92 20.7818065798351 25.3184064555368 -4.5365998757017 A:T A T 10 0.516702172561975 0.349999618490672 ENSG00000107833:ENST00000370110:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000474993:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000462391:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000468544:exon_103541484_103541611:NPM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 103825309 G/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000166189:ENST00000299238:exon_103825147_103827790:HPS6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 104140023 G/A 1 35 29 64 16.9154239603309 14.9843630042973 1.9310609560336 A:G G A 10 0.516702172561975 0.70788593884327 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140006_104140119:GBF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:G G A 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 105184867 C/T 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105184741_105185282:PDCD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 105194086 C/T 1 7 15 22 3.38308479206617 7.75053258842963 -4.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 0.086085110143936 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105194005_105194107:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000466959:exon_105194005_105194459:PDCD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 105209429 C/T 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 T:C C T 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105209144_105209856:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105209144_105209856:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000393235:exon_105208871_105210557:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000494180:exon_105209382_105209856:CALHM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 21 16 37 10.1492543761985 8.2672347609916 1.88201961520692 A:G G A 10 0.516702172561975 0.622631364606705 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 116 106 222 56.0625479828109 54.7704302915694 1.29211769124154 A:T:C C A 10 0.516702172561975 0.89324781736826 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 111625041 G/C 1 37 43 80 17.8820196152069 22.2181934201649 -4.336173804958 C:G G C 10 0.516702172561975 0.371205284788677 ENSG00000108039:ENST00000502895:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000488118:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000502935:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369683:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369680:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000322238:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369661:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369659:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369658:exon_111624812_111625070:XPNPEP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 115602155 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115602102_115602247:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115602102_115602247:DCLRE1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 115922774 G/A 1 5 13 18 2.41648913719012 6.71712824330568 -4.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0572968730202378 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 116056779 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116056737_116056859:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116056737_116056859:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000491814:exon_116054585_116056859:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116056737_116056859:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000481462:exon_116056737_116056859:AFAP1L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 121591061 C/A 1 42 41 83 20.298508752397 21.184789075041 -0.88628032264393 A:C C A 10 0.516702172561975 0.912654802903562 ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121588972_121591112:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121590709_121591112:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121590713_121591112:C10orf119 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 121685579 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121685548_121685739:SEC23IP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 122665489 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000415501:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122665388_122665533:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122665388_122666367:WDR11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 130 145 275 62.8287175669432 74.9218150214864 -12.0930974545431 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.147940888869341 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 137 179 316 66.2118023590094 92.4896888885935 -26.2778865295841 C:G G C 10 0.516702172561975 0.00337261543585408 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 75 106 181 36.2473370578519 54.7704302915694 -18.5230932337175 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00725134678088338 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 102 113 215 49.2963783986785 58.3873454995032 -9.09096710082463 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.219941679041031 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 50 65 115 24.1648913719012 33.5856412165284 -9.42074984462713 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0926663259568744 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 63 81 144 30.4477631285956 41.85287597752 -11.4051128489244 T:C T C 10 0.516702172561975 0.066262001964547 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 47 58 105 22.7149978895872 29.9687260085946 -7.25372811900738 A:G G A 10 0.516702172561975 0.171793828631593 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 40 42 82 19.331913097521 21.701491247603 -2.36957815008195 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.658876635715297 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 134145288 C/A 1 10 16 26 4.83297827438025 8.2672347609916 -3.43425648661135 A:C C A 10 0.516702172561975 0.238643810373624 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 134161814 G/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:G G T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000472387:exon_134161696_134161860:LRRC27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 98 111 209 47.3631870889264 57.3539411543792 -9.99075406545278 A:C C A 10 0.516702172561975 0.188383988533382 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 60 76 136 28.9978696462815 39.2693651147101 -10.2714954684286 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0860377061441743 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135082346 A/G 1 7 15 22 3.38308479206617 7.75053258842963 -4.36744779636345 A:G A G 10 0.516702172561975 0.086085110143936 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135084509 G/A 1 35 18 53 16.9154239603309 9.30063910611555 7.61478485421532 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0393053555044289 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135122913 A/T 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 A:T A T 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135122894_135122967:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135122894_135122967:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000482153:exon_135122894_135122967:ZNF511 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135180430 A/G 1 85 80 165 41.0803153322321 41.336173804958 -0.255858472725876 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135180393_135180497:ECHS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135184122 G/A 1 36 68 104 17.3987217877689 35.1357477342143 -17.7370259464454 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.000543975049940855 ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135204950 C/G 1 27 30 57 13.0490413408267 15.5010651768593 -2.45202383603258 C:G C G 10 0.516702172561975 0.596447752248135 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 26 12 38 12.5657435133886 6.2004260707437 6.36531744264495 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0502027624192973 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 233067 C/T 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 233212 C/A 1 21 16 37 10.1492543761985 8.2672347609916 1.88201961520692 A:C:G C A 10 0.516702172561975 0.622631364606705 ENSG00000142082:ENST00000382743:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532837:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525319:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000524564:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000532956:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529382:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000531753:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000526854:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000529055:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528702:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000530067:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000528469:exon_232983_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525776:exon_233192_233215:SIRT3;ENSG00000142082:ENST00000525237:exon_233209_233215:SIRT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 237087 A/G 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 A:G A G 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_236546_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_236966_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_236977_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_236981_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_237000_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_237004_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_237026_237144:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_237038_237144:PSMD13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 244197 T/C 1 21 5 26 10.1492543761985 2.58351086280988 7.56574351338865 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00284332864927301 ENSG00000185627:ENST00000532097:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000529372:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000534590:exon_244041_244469:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000431206:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000528906:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000525665:exon_244041_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000527047:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000352303:exon_244161_244216:PSMD13;ENSG00000185627:ENST00000382671:exon_244161_244216:PSMD13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 40 23 63 19.331913097521 11.8841499689254 7.44776312859557 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0767823140070062 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 294757 C/T 1 64 32 96 30.9310609560336 16.5344695219832 14.3965914340504 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00400979911789001 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294556_295678:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294556_296107:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294556_295688:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294556_295676:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294556_295258:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294556_295683:ATHL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 334 273 607 161.4214743643 141.059693109419 20.3617812548812 A:G A G 10 0.516702172561975 0.104222642626594 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 3 12 15 1.44989348231407 6.2004260707437 -4.75053258842963 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0180458677713663 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 419516 C/G 1 22 15 37 10.6325522036365 7.75053258842963 2.88201961520692 C:G C G 10 0.516702172561975 0.411626940897304 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 419765 C/T 1 9 12 21 4.34968044694222 6.2004260707437 -1.85074562380148 T:C C T 10 0.516702172561975 0.514228237115183 ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_419582_420615:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_419582_420860:ANO9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 83 90 173 40.1137196773561 46.5031955305778 -6.38947585322168 C:G G C 10 0.516702172561975 0.361413034450177 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 495074 G/A 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.253714749912099 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 21 25 46 10.1492543761985 12.9175543140494 -2.76829993785085 T:C C T 10 0.516702172561975 0.462053008424829 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 607827 C/A 1 14 3 17 6.76616958413235 1.55010651768593 5.21606306644642 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0135403595828752 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 608593 G/A 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 A:G G A 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 609451 C/T 1 31 22 53 14.9822326505788 11.3674477963635 3.61478485421532 T:C C T 10 0.516702172561975 0.338950235535203 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 609577 C/T 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 613165 G/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 92 80 172 44.4634001242983 41.336173804958 3.12722631934029 T:C T C 10 0.516702172561975 0.647832729821613 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 91 127 218 43.9801022968603 65.6211759153708 -21.6410736185106 T:C:G T G 10 0.516702172561975 0.00351945794430745 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 31 41 72 14.9822326505788 21.184789075041 -6.2025564244622 T:C T C 10 0.516702172561975 0.157572176790378 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 615106 G/T 1 54 63 117 26.0980826816533 32.5522368714044 -6.45415418975108 T:G G T 10 0.516702172561975 0.266923520075535 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_615097_615728:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_615097_615647:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_615097_615647:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_615097_615259:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 678716 C/T 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_678694_678779:DEAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 836406 C/T 1 10 15 25 4.83297827438025 7.75053258842963 -2.91755431404938 T:C C T 10 0.516702172561975 0.317309137874082 ENSG00000177697:ENST00000397420:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000525718:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530155:exon_836063_836480:CD151;ENSG00000177697:ENST00000397421:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000436957:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000322008:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000441766:exon_836251_836707:CD151;ENSG00000177697:ENST00000529810:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000526693:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000525868:exon_836251_836525:CD151;ENSG00000177697:ENST00000531999:exon_836063_836539:CD151;ENSG00000177697:ENST00000524748:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000527341:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000526661:exon_836251_837023:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530726:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000532045:exon_836251_836843:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528867:exon_836251_836436:CD151;ENSG00000177697:ENST00000530320:exon_836251_836442:CD151;ENSG00000177697:ENST00000528011:exon_836251_836442:CD151 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 993814 C/T 1 12 16 28 5.7995739292563 8.2672347609916 -2.4676608317353 T:C C T 10 0.516702172561975 0.450090452987714 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 249 178 427 120.341159032068 91.9729867160316 28.3681723160367 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00663193286729292 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 1901356 C/T 1 233 199 432 112.60839379306 102.823732339833 9.78466145322679 T:C C T 10 0.516702172561975 0.360506269511421 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1901317_1901454:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1901317_1901454:LSP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 4 14 18 1.9331913097521 7.23383041586765 -5.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0163883126972169 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 1972212 C/T 1 19 17 36 9.18265872132247 8.78393693355358 0.398721787768897 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 1977651 C/A 1 95 108 203 45.9132936066124 55.8038346366933 -9.89054103008093 A:C C A 10 0.516702172561975 0.182016103049770 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 2417893 C/T 1 222 187 409 107.292117691242 96.6233062690893 10.6688114221522 T:C C T 10 0.516702172561975 0.299090307100489 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 2417935 T/C 1 230 192 422 111.158500310746 99.2068171318992 11.9516831788465 T:C T C 10 0.516702172561975 0.262591587952077 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 41 32 73 19.815210924959 16.5344695219832 3.28074140297582 C:G C G 10 0.516702172561975 0.483191281503149 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 2424647 G/A 1 34 33 67 16.4321261328928 17.0511716945452 -0.619045561652328 A:G G A 10 0.516702172561975 0.903210190522932 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 12 18 30 5.7995739292563 9.30063910611555 -3.50106517685925 C:G G C 10 0.516702172561975 0.207473070431477 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 5686185 C/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:C C A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5684787_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5684788_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5684788_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5684794_5686625:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5684847_5686912:TRIM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 34 39 73 16.4321261328928 20.151384729917 -3.71925859702418 T:C T C 10 0.516702172561975 0.413457240483618 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 28 42 70 13.5323391682647 21.701491247603 -8.16915207933825 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0556991189852472 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 5719649 T/C 1 39 35 74 18.848615270083 18.0845760396691 0.764039230413847 T:C T C 10 0.516702172561975 0.907666326515335 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 27 32 59 13.0490413408267 16.5344695219832 -3.48542818115653 T:C T C 10 0.516702172561975 0.434732783468217 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6238844 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 15 35 50 7.24946741157037 18.0845760396691 -10.8351086280988 A:T A T 10 0.516702172561975 0.00263109816142024 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6341365 C/T 1 10 20 30 4.83297827438025 10.3340434512395 -5.50106517685925 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0659201910521876 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6341323_6341385:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6341748 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6341323_6341877:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6341323_6341762:PRKCDBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6501613 C/T 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000132254:ENST00000254584:exon_6501553_6501653:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000396777:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000423813:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000445086:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000531037:exon_6501553_6501653:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000525235:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000530410:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000529847:exon_6500887_6501693:ARFIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:G G A 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6638599 T/C 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6638532_6638646:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6638221_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6638532_6638659:TPP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6638938 T/C 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6638857_6639007:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000530040:exon_6638857_6639007:TPP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 152 170 322 73.4612697705798 87.8393693355357 -14.378099564956 A:G A G 10 0.516702172561975 0.118359461851333 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 7673029 T/C 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 18 22 40 8.69936089388445 11.3674477963635 -2.668086902479 A:T A T 10 0.516702172561975 0.43164377138054 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 7689029 A/C 0 0 9 9 0 4.65031955305778 -4.65031955305778 C A C 10 0.516702172561975 0.00143857856770658 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7688774_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689003_7689044:CYB5R2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 7694002 G/A 1 11 2 13 5.31627610181827 1.03340434512395 4.28287175669433 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0233985038423332 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7693979_7694686:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7693979_7694121:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7693979_7694037:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000525307:exon_7693859_7694122:CYB5R2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 8936422 G/A 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000426510:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529876:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000525005:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000524577:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534506:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000530281:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8936373_8936477:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8936373_8936477:C11orf17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 10821185 G/A 1 52 62 114 25.1314870267773 32.0355346988425 -6.90404767206516 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.223031698232189 ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 14487964 T/C 1 42 35 77 20.298508752397 18.0845760396691 2.21393271272792 T:C T C 10 0.516702172561975 0.649375901258665 ENSG00000129083:ENST00000437479:exon_14487828_14487972:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000249923:exon_14487828_14487972:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000439561:exon_14487828_14487972:COPB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 20388758 C/T 1 16 6 22 7.7327652390084 3.10021303537185 4.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0553424742719923 ENSG00000109854:ENST00000530266:exon_20388720_20389171:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20388720_20388827:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20388720_20388827:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20388720_20388827:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20388720_20388827:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20388720_20388827:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000532505:exon_20388720_20389059:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000532081:exon_20388720_20389201:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20388720_20388827:HTATIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 20529892 A/G 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 A:G A G 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 32852172 G/A 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 A:G G A 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32852054_32852178:PRRG4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 32874919 C/A 1 13 14 27 6.28287175669432 7.23383041586765 -0.950958659173327 A:C C A 10 0.516702172561975 0.847787224060471 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 32874926 G/A 1 16 12 28 7.7327652390084 6.2004260707437 1.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.5776188734531 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34144062 T/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:G T G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34144006_34144139:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34144006_34144139:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34144013_34144139:NAT10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34154641 C/T 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34154573_34154689:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34154573_34154689:NAT10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34162707 G/C 1 9 19 28 4.34968044694222 9.81734127867753 -5.4676608317353 C:G G C 10 0.516702172561975 0.05668700140961 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34162636_34162755:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34162636_34162755:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34162636_34162755:NAT10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34909926 T/G 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 T:G T G 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34909840_34909975:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34909840_34909975:APIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34937813 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34937775_34938046:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34937775_34937939:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34937775_34937898:APIP;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34937677_34938033:PDHX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34969150 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000110435:ENST00000533550:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34969053_34969153:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34969053_34969153:PDHX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 34988343 T/C 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000110435:ENST00000448838:exon_34988187_34988361:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34988187_34988361:PDHX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 43464894 C/T 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43464875_43465134:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000299240:exon_43464875_43465134:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000526774:exon_43464875_43465134:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000534417:exon_43464875_43465134:TTC17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 20 26 46 9.6659565487605 13.4342564866114 -3.76829993785085 T:G G T 10 0.516702172561975 0.302741003181652 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 44129526 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000151348:ENST00000533608:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000395673:exon_44129178_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000527014:exon_44129233_44129599:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000358681:exon_44129233_44129798:EXT2;ENSG00000151348:ENST00000343631:exon_44129233_44129798:EXT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 44636839 C/T 1 262 294 556 126.624030788763 151.910438733221 -25.2864079444581 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.0338043733051086 ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46338977 C/T 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46419276 C/T 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000452566:exon_46417964_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46417965_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000526545:exon_46418934_46419493:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46419000_46419493:AMBRA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46564091 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46563495_46564948:AMBRA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46689353 T/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C T C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000175224:ENST00000395549:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000434074:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000312040:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000451945:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000343175:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000529655:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000530500:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000526508:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000524625:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000359513:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000528494:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000527907:exon_46689323_46689415:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000533316:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000525009:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000529395:exon_46689323_46689437:ATG13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46690083 T/C 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000175224:ENST00000395549:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000434074:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000312040:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000451945:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000343175:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000529655:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000530500:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000526508:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000524625:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000359513:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000528494:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000533316:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000525009:exon_46690049_46690126:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000529395:exon_46690049_46690460:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000532067:exon_46690049_46690240:ATG13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46772770 G/A 1 22 19 41 10.6325522036365 9.81734127867753 0.815210924959024 A:G G A 10 0.516702172561975 0.876318912969931 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46772668_46772805:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46772668_46772826:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46772668_46772805:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46772668_46772805:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46772668_46772805:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46772668_46772805:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000525896:exon_46772668_46772805:CKAP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46773063 G/A 1 16 12 28 7.7327652390084 6.2004260707437 1.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.5776188734531 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46772896_46773084:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46772896_46773084:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46772896_46773084:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46772896_46773084:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46772896_46773084:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46772896_46773084:CKAP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 46797844 A/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46797805_46797933:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46797805_46797933:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46797805_46797933:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46797805_46797933:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46797805_46797933:CKAP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 31 23 54 14.9822326505788 11.8841499689254 3.09808268165335 T:C C T 10 0.516702172561975 0.417166719584535 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 47290208 C/G 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 C:G C G 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000025434:ENST00000529540:exon_47290101_47290389:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000298843:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000395397:exon_47290101_47290363:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405576:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481020:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481889:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000532630:exon_47290101_47290367:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000407404:exon_47290101_47290332:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000441012:exon_47290101_47290335:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000467728:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000514400:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000518032:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000528825:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405853:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000344715:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000527949:exon_47290101_47290368:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000462051:exon_47290101_47290395:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000494018:exon_47290101_47290395:NR1H3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 47431728 A/G 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000531974:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000531419:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000531865:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47431617_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000526614:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000527091:exon_47431638_47431946:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47431636_47431946:SLC39A13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 47444462 T/C 1 74 67 141 35.7640392304139 34.6190455616523 1.14499366876152 T:C T C 10 0.516702172561975 0.866505649352218 ENSG00000165916:ENST00000298852:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530912:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000524447:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000531051:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530887:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530651:exon_47444381_47444524:PSMC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 57463500 T/C 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57463392_57463515:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529447:exon_57463392_57463515:ZDHHC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 57466534 C/T 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 T:C C T 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57466031_57466890:ZDHHC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 57466563 G/A 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000156599:ENST00000527985:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000287169:exon_57466031_57466890:ZDHHC5;ENSG00000156599:ENST00000529480:exon_57466031_57466890:ZDHHC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:G A G 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 59377858 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000110048:ENST00000263847:exon_59377854_59378062:OSBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 60666341 G/A 1 48 48 96 23.1982957170252 24.8017042829748 -1.60340856594961 A:G G A 10 0.516702172561975 0.760215846935736 ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 60689445 T/C 1 21 16 37 10.1492543761985 8.2672347609916 1.88201961520692 T:C T C 10 0.516702172561975 0.622631364606705 ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 60711203 G/A 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 A:G G A 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000110446:ENST00000227880:exon_60711161_60711308:SLC15A3;ENSG00000110446:ENST00000442626:exon_60711161_60711308:SLC15A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 61908440 T/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61908385_61908516:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61908385_61908516:INCENP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 155 110 265 74.9111632528939 56.8372389818173 18.0739242710766 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0269301621545764 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 91 40 131 43.9801022968603 20.668086902479 23.3120153943813 A:G A G 10 0.516702172561975 4.88295165528739e-05 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 81 53 134 39.14712402248 27.3852151457847 11.7619088766953 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0465831957174554 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 22 16 38 10.6325522036365 8.2672347609916 2.36531744264495 T:C T C 10 0.516702172561975 0.517227849727042 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62342763 C/T 1 34 38 72 16.4321261328928 19.6346825573551 -3.20255642446221 T:C C T 10 0.516702172561975 0.480491316423819 ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62346420 G/A 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 A:G G A 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000278279:exon_62346281_62346502:TUT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62361478 G/T 1 167 188 355 80.7107371821502 97.1400084416513 -16.4292712595011 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0891231217538083 ENSG00000149480:ENST00000278823:exon_62360686_62361512:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000524902:exon_62360687_62361512:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000527204:exon_62361314_62361512:MTA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62365581 G/A 1 34 22 56 16.4321261328928 11.3674477963635 5.0646783365294 A:G G A 10 0.516702172561975 0.183755995566827 ENSG00000149480:ENST00000278823:exon_62365496_62365613:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000524902:exon_62365496_62365613:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000527204:exon_62365496_62365613:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000531261:exon_62365496_62365601:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62377144 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62377101_62377168:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62377101_62377168:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62377101_62377168:EML3;ENSG00000149499:ENST00000531557:exon_62377101_62377168:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62377101_62377168:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62377101_62377168:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62377101_62377168:EML3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62383981 A/C 1 36 37 73 17.3987217877689 19.1179803847931 -1.71925859702418 A:C A C 10 0.516702172561975 0.726117896387594 ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62437425 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000162194:ENST00000354588:exon_62437354_62437513:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000431002:exon_62437113_62439237:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000532208:exon_62437354_62437637:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000415855:exon_62437354_62437487:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000527679:exon_62437354_62437513:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000528115:exon_62437354_62437486:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000377954:exon_62437354_62437487:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000526490:exon_62437354_62438157:C11orf48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62556597 G/C 1 10 25 35 4.83297827438025 12.9175543140494 -8.08457603966913 C:G G C 10 0.516702172561975 0.00657321052967653 ENSG00000185475:ENST00000533861:exon_62556495_62556682:TMEM179B;ENSG00000185475:ENST00000333449:exon_62556495_62556682:TMEM179B;ENSG00000185475:ENST00000532345:exon_62556532_62557151:TMEM179B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62559927 G/A 1 65 90 155 31.4143587834716 46.5031955305778 -15.0888367471061 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0158830885476687 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62559598_62559986:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62559603_62559986:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62559643_62559986:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000527902:exon_62559703_62559986:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62559825_62559986:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533499:exon_62559887_62560173:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000527497:exon_62559890_62559986:NXF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 62563383 G/C 1 26 15 41 12.5657435133886 7.75053258842963 4.81521092495902 C:G G C 10 0.516702172561975 0.159543784549554 ENSG00000162231:ENST00000294172:exon_62563373_62563415:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000531709:exon_62563373_62563415:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000532297:exon_62563373_62563415:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000527902:exon_62563373_62563415:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533048:exon_62563373_62563415:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000530875:exon_62563373_62563415:NXF1;ENSG00000162231:ENST00000533440:exon_62563373_62563415:NXF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 63426268 C/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000184743:ENST00000332645:exon_63426233_63426376:ATL3;ENSG00000184743:ENST00000398868:exon_63426233_63426376:ATL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 63742174 C/T 1 145 130 275 70.0781849785136 67.1712824330568 2.90690254545686 T:C C T 10 0.516702172561975 0.762979610263178 ENSG00000176340:ENST00000314133:exon_63742079_63742266:COX8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 63978759 C/T 1 42 40 82 20.298508752397 20.668086902479 -0.369578150081953 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63978747_63978915:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63978747_63978915:FERMT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 63979215 C/G 1 101 93 194 48.8130805712405 48.0533020482637 0.759778522976838 C:G C G 10 0.516702172561975 0.942795789900189 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 63988102 C/T 1 152 116 268 73.4612697705798 59.9374520171891 13.5238177533907 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0992950222907159 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64032784 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64032782_64032974:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64032782_64032974:PLCB3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64032798 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64032782_64032974:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64032782_64032974:PLCB3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64034975 G/A 1 18 18 36 8.69936089388445 9.30063910611555 -0.601278212231101 A:G G A 10 0.516702172561975 0.868903889692238 ENSG00000149782:ENST00000325234:exon_64034825_64035394:PLCB3;ENSG00000149782:ENST00000279230:exon_64034825_64035394:PLCB3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64085785 A/G 1 120 122 242 57.995739292563 63.037665052561 -5.04192575999796 A:G A G 10 0.516702172561975 0.52086728576297 ENSG00000126432:ENST00000347941:exon_64085569_64085858:PRDX5;ENSG00000126432:ENST00000265462:exon_64085569_64085858:PRDX5;ENSG00000126432:ENST00000352435:exon_64085569_64085858:PRDX5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 11 16 27 5.31627610181827 8.2672347609916 -2.95095865917333 T:G T G 10 0.516702172561975 0.335879253897204 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 34 48 82 16.4321261328928 24.8017042829748 -8.36957815008196 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.076560587750056 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64119060 G/A 1 33 37 70 15.9488283054548 19.1179803847931 -3.16915207933825 A:G G A 10 0.516702172561975 0.474568114857208 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64118632_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64118948_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64118632_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64118948_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64118948_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64118948_64119088:CCDC88B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64121190 C/G 1 148 149 297 71.5280784608277 76.9886237117343 -5.46054525090658 C:G C G 10 0.516702172561975 0.561596041967272 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64121187_64121285:CCDC88B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64138895 C/T 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 T:C C T 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000162302:ENST00000528057:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000294261:exon_64138755_64139686:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000334205:exon_64138755_64139687:RPS6KA4;ENSG00000162302:ENST00000528355:exon_64138755_64139157:RPS6KA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64627840 G/A 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64662423 C/T 1 35 24 59 16.9154239603309 12.4008521414874 4.51457181884347 T:C C T 10 0.516702172561975 0.244712763738291 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662019_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662019_64662681:ATG2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64662849 A/G 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662762_64662914:ATG2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64665358 T/G 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 T:G T G 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665311_64665446:ATG2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64665394 T/C 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 T:C T C 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665311_64665446:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665311_64665446:ATG2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 2 8 10 0.96659565487605 4.1336173804958 -3.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0579335952414094 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 A:T T A 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64896139 G/A 1 29 30 59 14.0156369957027 15.5010651768593 -1.48542818115653 A:G G A 10 0.516702172561975 0.698710987469276 ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64896035_64896186:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64896035_64896186:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64896035_64896186:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64894753_64897387:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64896035_64896186:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64896035_64896186:SYVN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64950331 G/A 1 31 35 66 14.9822326505788 18.0845760396691 -3.10234338909035 A:G G A 10 0.516702172561975 0.462186865511034 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000532285:exon_64950172_64950361:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64949933_64950439:CAPN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64955948 C/T 1 41 34 75 19.815210924959 17.5678738671072 2.24733705785187 T:C C T 10 0.516702172561975 0.644908421636662 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533079:exon_64955885_64955959:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527887:exon_64955716_64955959:CAPN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 64972286 G/C 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533079:exon_64972154_64972329:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530495:exon_64972154_64972329:CAPN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65113459 G/T 1 20 16 36 9.6659565487605 8.2672347609916 1.3987217877689 T:G G T 10 0.516702172561975 0.739470758601549 ENSG00000133884:ENST00000528416:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000252268:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000524666:exon_65113401_65116402:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532264:exon_65113401_65113500:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000530973:exon_65113137_65113590:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000532052:exon_65113401_65113529:DPF2;ENSG00000133884:ENST00000531989:exon_65113401_65113529:DPF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65144405 C/T 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000162241:ENST00000534338:exon_65144289_65145496:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65144289_65147409:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000533629:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526259:exon_65144382_65144547:SLC25A45 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65265845 G/A 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:G G A 10 0.516702172561975 0.784975298222871 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65266849 C/T 1 4428 3527 7955 2140.04277989557 1822.40856262609 317.634217269488 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 1.02394454863138e-12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65348583 G/A 1 26 14 40 12.5657435133886 7.23383041586765 5.331913097521 A:G G A 10 0.516702172561975 0.113043689291216 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65348529_65348597:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65348529_65348597:EHBP1L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65349849 A/T 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 A:T A T 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65367046 C/A 1 29 40 69 14.0156369957027 20.668086902479 -6.65244990677628 A:C C A 10 0.516702172561975 0.117997463305597 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000532507:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000530153:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524848:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000534432:exon_65366922_65367239:MAP3K11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65418048 G/A 1 128 143 271 61.8621219120672 73.8884106763624 -12.0262887642952 A:G G A 10 0.516702172561975 0.145157801455736 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65418040_65418401:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65418040_65418351:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65418040_65418389:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65418040_65418058:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000528699:exon_65418040_65418389:SIPA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65635401 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000172638:ENST00000531972:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526628:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526911:exon_65635332_65635478:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531645:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528176:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000307998:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528409:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000530806:exon_65635332_65635484:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000525392:exon_65635144_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000532084:exon_65635357_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531005:exon_65635361_65635527:EFEMP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65664346 T/C 1 2 9 11 0.96659565487605 4.65031955305778 -3.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0333238555970313 ENSG00000175592:ENST00000455710:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000312562:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000531493:exon_65664280_65664477:FOSL1;ENSG00000175592:ENST00000532401:exon_65664280_65664477:FOSL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65824472 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 65998402 C/T 1 14 17 31 6.76616958413235 8.78393693355358 -2.01776734942123 T:C C T 10 0.516702172561975 0.479021533266739 ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_65998276_65998411:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_65998276_65998411:PACS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 66001337 G/A 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:G G A 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000528935:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529795:exon_66001291_66001410:PACS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 66260341 C/T 1 14 10 24 6.76616958413235 5.16702172561975 1.5991478585126 T:C C T 10 0.516702172561975 0.546705336419487 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533799:exon_66260187_66260381:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000525738:exon_66260187_66260381:DPP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 66263137 G/C 1 27 39 66 13.0490413408267 20.151384729917 -7.10234338909035 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0853847955586088 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526250:exon_66263101_66263221:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526667:exon_66263101_66263221:DPP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 66288733 G/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 C:G G C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000174483:ENST00000532283:exon_66288250_66288773:BBS1;ENSG00000174165:ENST00000534073:exon_66288108_66288937:ZDHHC24;ENSG00000174165:ENST00000526986:exon_66288553_66288937:ZDHHC24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67166316 G/A 1 285 212 497 137.739880819837 109.540860583139 28.1990202366984 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0119103874088034 ENSG00000172531:ENST00000312989:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000451458:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532446:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000526510:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000376745:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000358239:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532279:exon_67166193_67166634:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000527663:exon_67166211_67166327:PPP1CA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67173125 C/T 1 12 15 27 5.7995739292563 7.75053258842963 -1.95095865917333 T:C C T 10 0.516702172561975 0.564379305884164 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67173066_67173219:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000533745:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529132:exon_67173066_67173559:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67173066_67176604:TBC1D10C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67209515 C/T 1 18 15 33 8.69936089388445 7.75053258842963 0.948828305454824 T:C C T 10 0.516702172561975 0.862114069790544 ENSG00000172725:ENST00000393893:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000341356:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000393886:exon_67209437_67209559:CORO1B;ENSG00000172725:ENST00000453768:exon_67209437_67209559:CORO1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67257556 C/T 1 110 113 223 53.1627610181827 58.3873454995032 -5.22458448132043 T:C C T 10 0.516702172561975 0.503192026547236 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257509_67257685:AIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67260525 C/T 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67260405_67260533:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67260405_67260533:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000527370:exon_67260405_67260533:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67260405_67260533:PITPNM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67353896 C/T 1 1049 1113 2162 506.979420982488 575.089518061478 -68.11009707899 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.00342349706232809 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000495996:exon_67353860_67353910:GSTP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67377890 C/G 1 102 105 207 49.2963783986785 54.2537281190074 -4.95734972032883 C:G C G 10 0.516702172561975 0.531489469261735 ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532244:exon_67377852_67378053:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532343:exon_67377852_67377931:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533075:exon_67377852_67377897:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529867:exon_67377852_67377912:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000530638:exon_67377852_67377891:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67377852_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67377864_67378041:NDUFV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 67378584 C/T 1 117 100 217 56.5458458102489 51.6702172561975 4.87562855405142 T:C C T 10 0.516702172561975 0.541169989841517 ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000453836:exon_67378479_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67377852_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000527355:exon_67378477_67378678:NDUFV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 68213989 C/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68213904_68214001:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68213904_68214001:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529702:exon_68213904_68214001:LRP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 70049523 A/G 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 70049565 C/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000168040:ENST00000301838:exon_70049269_70049851:FADD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 70279811 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 70282394 C/T 1 14 14 28 6.76616958413235 7.23383041586765 -0.467660831735301 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70281132_70282690:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70281132_70282681:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70282388_70282685:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70282388_70282668:CTTN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 28 19 47 13.5323391682647 9.81734127867753 3.71499788958717 A:G G A 10 0.516702172561975 0.308738923310519 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 18 19 37 8.69936089388445 9.81734127867753 -1.11798038479308 A:G A G 10 0.516702172561975 0.744448511397302 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71155171 C/T 1 16 15 31 7.7327652390084 7.75053258842963 -0.0177673494212263 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000524694:exon_71155003_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000526780:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525346:exon_71155039_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000531364:exon_71155043_71155261:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000529990:exon_71155080_71155299:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000527452:exon_71155087_71155261:DHCR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71185443 C/T 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71701763 G/A 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000490867:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000528683:exon_71701643_71701842:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71701643_71701763:RNF121 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71706544 A/G 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 A:G A G 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000533380:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71706486_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71706496_71706597:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000532379:exon_71706292_71706597:RNF121 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 57 36 93 27.5479761639674 18.6012782122311 8.94669795173632 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0772172978053812 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 58 37 95 28.0312739914054 19.1179803847931 8.91329360661237 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0804605557800609 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71717106 G/A 1 23 21 44 11.1158500310746 10.8507456238015 0.265104407273098 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71717081_71717309:NUMA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71945332 A/G 1 14 16 30 6.76616958413235 8.2672347609916 -1.50106517685925 A:G A G 10 0.516702172561975 0.590174422955896 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71945325_71945438:INPPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 71948536 C/G 1 25 24 49 12.0824456859506 12.4008521414874 -0.318406455536778 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000165458:ENST00000298229:exon_71948168_71948840:INPPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 72004419 T/C 1 30 20 50 14.4989348231407 10.3340434512395 4.16489137190125 T:C T C 10 0.516702172561975 0.259686227954463 ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72003474_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72004347_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72004347_72004659:CLPB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 72410080 C/G 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 C:G C G 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000186635:ENST00000495878:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000465814:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000359373:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000452383:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000427971:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393609:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000455638:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000334211:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000393605:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000426523:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000429686:exon_72410050_72410152:ARAP1;ENSG00000186635:ENST00000340247:exon_72410072_72410101:ARAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 73106186 G/A 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 73106294 A/C 1 16 7 23 7.7327652390084 3.61691520793383 4.11585003107457 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0973137836791482 ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 73686548 G/C 1 190 151 341 91.8265872132247 78.0220280568582 13.8045591563665 C:G G C 10 0.516702172561975 0.143463804599876 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73686536_73686716:UCP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 73687738 C/T 1 183 154 337 88.4435024211586 79.5721345745442 8.87136784661442 T:C C T 10 0.516702172561975 0.354225043546694 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73687686_73687787:UCP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 73689041 C/T 1 43 66 109 20.7818065798351 34.1023433890904 -13.3205368092553 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0124178211022652 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75115640 G/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:G G T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75277376 C/T 0 14 0 14 6.76616958413235 0 6.76616958413235 C C 10 0.516702172561975 0.000134618276214061 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526242:exon_75277361_75277436:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277361_75277511:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75277757 C/G 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 C:G C G 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000529643:exon_75277361_75277894:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525492:exon_75277653_75277963:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528990:exon_75277361_75277889:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000533449:exon_75277361_75277846:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75277992 C/T 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75277361_75278016:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000528760:exon_75277361_75278004:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75277764_75278016:SERPINH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75279846 C/T 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000526397:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000530284:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000532356:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525611:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75279776_75279874:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75278827_75279874:SERPINH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75282882 G/A 1 30 25 55 14.4989348231407 12.9175543140494 1.58138050909137 A:G G A 10 0.516702172561975 0.68806606133785 ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75511469 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 18 11 29 8.69936089388445 5.68372389818173 3.01563699570272 T:C T C 10 0.516702172561975 0.272663820448322 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 75852182 G/A 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75851755_75854239:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75851755_75852838:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75851755_75852544:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75851755_75853695:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75851755_75852827:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000525183:exon_75851755_75852704:UVRAG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 77614610 A/G 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G A G 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000149262:ENST00000433818:exon_77614586_77614666:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000534064:exon_77614586_77614666:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000354849:exon_77614586_77614666:INTS4;ENSG00000149262:ENST00000533180:exon_77614586_77614666:INTS4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 77823732 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000159063:ENST00000530608:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525783:exon_77823696_77823797:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77823426_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77823713_77823816:ALG8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 82564294 T/G 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 T:G T G 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 85375601 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000137504:ENST00000490820:exon_85374568_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000260058:exon_85374859_85375697:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000525639:exon_85374859_85376146:CREBZF;ENSG00000137504:ENST00000527447:exon_85372110_85376146:CREBZF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 85707928 G/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 C:G G C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000073921:ENST00000341783:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000349405:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000532317:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526033:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000447890:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000454118:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393346:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529760:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000528398:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000356360:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000529016:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000526961:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000393343:exon_85707869_85707972:PICALM;ENSG00000073921:ENST00000530542:exon_85707869_85707972:PICALM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 85956283 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85955586_85956385:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85955795_85956385:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85955815_85956385:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85956182_85956385:EED;ENSG00000074266:ENST00000534595:exon_85956276_85956385:EED HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 92881783 T/C 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000180773:ENST00000326402:exon_92880307_92882010:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000527503:exon_92881314_92882010:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000529184:exon_92881481_92882010:SLC36A4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 93469908 A/C 1 44 48 92 21.2651044072731 24.8017042829748 -3.5365998757017 A:C A C 10 0.516702172561975 0.467406714993047 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000526015:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000393259:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529794:exon_93469307_93469972:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527068:exon_93469860_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000448108:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000528734:exon_93469860_93470133:TAF1D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 93488542 A/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:T:C A T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530620:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000524485:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93488376_93488559:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533154:exon_93488039_93488552:C11orf54 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 93517655 C/T 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000042429:ENST00000251871:exon_93517393_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000530819:exon_93517448_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533359:exon_93517528_93517929:MED17;ENSG00000042429:ENST00000533133:exon_93517577_93517929:MED17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 94153326 T/C 1 16 20 36 7.7327652390084 10.3340434512395 -2.6012782122311 T:C T C 10 0.516702172561975 0.408601526257631 ENSG00000020922:ENST00000323977:exon_94150475_94153347:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000323929:exon_94150475_94153347:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000393241:exon_94150475_94153347:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000407439:exon_94150475_94153347:MRE11A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 94192661 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000020922:ENST00000323977:exon_94192574_94192747:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000323929:exon_94192574_94192747:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000393241:exon_94192574_94192747:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000407439:exon_94192574_94192747:MRE11A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 94231257 C/G 1 14 11 25 6.76616958413235 5.68372389818173 1.08244568595062 C:G C G 10 0.516702172561975 0.694163042854475 ENSG00000168876:ENST00000302755:exon_94231237_94232737:ANKRD49 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 94704159 T/C 1 35 52 87 16.9154239603309 26.8685129732227 -9.95308901289183 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0409264704440411 ENSG00000150316:ENST00000279839:exon_94704141_94704229:CWC15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 102239234 A/G 1 8 15 23 3.8663826195042 7.75053258842963 -3.88414996892543 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.142982545571929 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000534130:exon_102239037_102239279:BIRC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 102239238 G/A 1 10 14 24 4.83297827438025 7.23383041586765 -2.4008521414874 A:G G A 10 0.516702172561975 0.414865474205065 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000534130:exon_102239037_102239279:BIRC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 102239272 G/A 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000534130:exon_102239037_102239279:BIRC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 107299631 G/A 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 A:G G A 10 0.516702172561975 0.833864825621324 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 107299671 T/C 1 14 14 28 6.76616958413235 7.23383041586765 -0.467660831735301 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 108031739 C/T 1 5 11 16 2.41648913719012 5.68372389818173 -3.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.133473626885738 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108031607_108032741:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530859:exon_108031607_108032741:NPAT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 110108244 G/A 1 16 7 23 7.7327652390084 3.61691520793383 4.11585003107457 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0973137836791482 ENSG00000137710:ENST00000530749:exon_110108217_110108377:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528498:exon_110108217_110108377:RDX;ENSG00000137710:ENST00000405097:exon_110108217_110108377:RDX;ENSG00000137710:ENST00000528900:exon_110108217_110108377:RDX;ENSG00000137710:ENST00000532461:exon_110108217_110108582:RDX;ENSG00000137710:ENST00000343115:exon_110108217_110108377:RDX;ENSG00000137710:ENST00000530131:exon_110108217_110108377:RDX;ENSG00000137710:ENST00000530085:exon_110108217_110108377:RDX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 116633650 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 116658295 G/A 1 19 21 40 9.18265872132247 10.8507456238015 -1.668086902479 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63729998462501 ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116658198_116658359:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116658198_116658359:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000431973:exon_116658198_116658318:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000425791:exon_116658198_116658359:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000487030:exon_116658198_116658703:ZNF259 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 116728630 G/C 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 C:G G C 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000160584:ENST00000488337:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000445177:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375300:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000292055:exon_116728526_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000375288:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000465421:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000415541:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000446921:exon_116728526_116729235:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000480468:exon_116727630_116729415:SIK3;ENSG00000160584:ENST00000434315:exon_116728473_116729415:SIK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 117062989 C/T 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 T:C C T 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 117066551 G/A 1 28 17 45 13.5323391682647 8.78393693355358 4.74840223471112 A:G G A 10 0.516702172561975 0.180130010529629 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117066518_117066631:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117066518_117066752:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000392956:exon_117066518_117066631:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117066518_117066631:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525478:exon_117066518_117066631:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000532062:exon_117066518_117066631:SIDT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 117077034 A/G 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117075053_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000534529:exon_117075790_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000529458:exon_117076663_117077072:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000527037:exon_117076864_117077072:PCSK7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118415625 A/G 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 A:G A G 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118415243_118415726:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118415258_118415726:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118415307_118415726:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531201:exon_118415616_118415726:IFT46 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C T C 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118769442 A/G 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000186174:ENST00000334801:exon_118764584_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000417092:exon_118766849_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000526143:exon_118768455_118770217:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000525300:exon_118768459_118769773:BCL9L;ENSG00000186174:ENST00000431085:exon_118769124_118769771:BCL9L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118919892 C/T 1 80 72 152 38.663826195042 37.2025564244622 1.4612697705798 T:C C T 10 0.516702172561975 0.871133867804869 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919730_118920082:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118919752_118919915:HYOU1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118947634 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118952173 A/G 1 53 57 110 25.6147848542153 29.4520238360326 -3.83723898181725 A:G A G 10 0.516702172561975 0.504615425056915 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 30 30 60 14.4989348231407 15.5010651768593 -1.0021303537185 T:C T C 10 0.516702172561975 0.797924074683911 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 118972393 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118972205_118972487:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118972205_118972852:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118972205_118972588:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118971728_118972852:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118972205_118972570:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118972205_118972535:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000445653:exon_118972205_118972542:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000460183:exon_118971728_118972570:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000472016:exon_118972205_118972563:DPAGT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 121460846 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121460749_121460883:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121460749_121460883:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121460749_121460883:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121460749_121460883:SORL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 121495870 A/G 1 14 7 21 6.76616958413235 3.61691520793383 3.14925437619852 A:G A G 10 0.516702172561975 0.194433587736325 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121495794_121495986:SORL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 122929356 A/G 1 532 810 1342 257.114444197029 418.5287597752 -161.41431557817 A:C:G A G 10 0.516702172561975 1.25565618090246e-18 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 492 448 940 237.782531099508 231.482573307765 6.29995779174345 T:G T G 10 0.516702172561975 0.695392766143091 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 124955032 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000134955:ENST00000403796:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000407458:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000298280:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000526405:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000308074:exon_124954962_124955035:SLC37A2;ENSG00000134955:ENST00000525837:exon_124954962_124955035:SLC37A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 124971123 A/G 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124971097_124974937:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124971097_124971152:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124971097_124971152:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124971097_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000524373:exon_124971098_124971199:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000533273:exon_124971099_124971199:TMEM218 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 125465862 T/C 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000134910:ENST00000527606:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525652:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529886:exon_125465776_125465898:STT3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 28 24 52 13.5323391682647 12.4008521414874 1.1314870267773 A:G G A 10 0.516702172561975 0.78291131466485 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 125482976 G/A 1 29 22 51 14.0156369957027 11.3674477963635 2.64818919933927 A:G G A 10 0.516702172561975 0.486250961597664 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125482884_125483072:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125482884_125483072:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125482884_125483072:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125482884_125483046:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531599:exon_125482884_125483035:STT3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 77 75 152 37.2139327127279 38.7526629421481 -1.5387302294202 T:C C T 10 0.516702172561975 0.808229320933496 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 125503065 C/T 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000149554:ENST00000438015:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000427383:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000428830:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000532449:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000528761:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000527013:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000526937:exon_125503058_125503145:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000534070:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000524737:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000531607:exon_125503058_125503088:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000532669:exon_125503058_125503246:CHEK1;ENSG00000149554:ENST00000278916:exon_125503058_125503246:CHEK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 125770179 T/C 1 14 23 37 6.76616958413235 11.8841499689254 -5.11798038479308 T:C T C 10 0.516702172561975 0.101360353639269 ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 126201403 T/C 1 25 31 56 12.0824456859506 16.0177673494212 -3.9353216634706 T:C T C 10 0.516702172561975 0.349456111934555 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126201300_126201445:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126201299_126201445:DCPS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 128638198 A/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G A G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 128651893 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128651853_128651918:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128651853_128651918:FLI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 134029803 A/G 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525977:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000527944:exon_134029785_134029969:NCAPD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 406267 T/C 1 17 7 24 8.21606306644642 3.61691520793383 4.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0674411545830007 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 7 17 24 3.38308479206617 8.78393693355358 -5.4008521414874 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0390099403344458 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2061614 G/A 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 A:G G A 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2061982 G/A 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2062075 C/T 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2062135 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2930027 G/A 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000111203:ENST00000228799:exon_2929890_2930038:ITFG2;ENSG00000111203:ENST00000419778:exon_2929890_2930038:ITFG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2968169 A/G 1 16 25 41 7.7327652390084 12.9175543140494 -5.18478907504098 A:G A G 10 0.516702172561975 0.118826349910931 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 2997397 G/A 1 18 17 35 8.69936089388445 8.78393693355358 -0.0845760396691269 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 4461853 G/A 1 13 14 27 6.28287175669432 7.23383041586765 -0.950958659173327 A:G G A 10 0.516702172561975 0.847787224060471 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4461426_4469188:C12orf5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 4653017 G/A 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4652929_4653070:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4652929_4653070:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4652929_4653070:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4652929_4653070:RAD51AP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 4716513 C/T 1 4 13 17 1.9331913097521 6.71712824330568 -4.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0268550497470769 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4716493_4716553:DYRK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 21 12 33 10.1492543761985 6.2004260707437 3.94882830545482 A:G A G 10 0.516702172561975 0.222321734051643 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 25 8 33 12.0824456859506 4.1336173804958 7.94882830545482 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00795384103092441 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6562823 C/T 1 27 11 38 13.0490413408267 5.68372389818173 7.36531744264495 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0218925469464210 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6575044 G/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139190:ENST00000400911:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396943:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000361716:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000355479:exon_6575008_6575166:VAMP1;ENSG00000139190:ENST00000396308:exon_6575008_6575166:VAMP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6639955 A/G 1 36 40 76 17.3987217877689 20.668086902479 -3.2693651147101 A:G A G 10 0.516702172561975 0.49184336359732 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 3439 3284 6723 1662.06122855937 1696.84993469353 -34.788706134158 A:T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.399797455889502 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4310 3109 7419 2083.01363625789 1606.42705449518 476.586581762708 A:T:C:G T C 10 0.516702172561975 1.29599815272451e-28 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4293 3597 7890 2074.79757319144 1858.57771470542 216.219858486017 A:T:C:G T C 10 0.516702172561975 1.13128091113666e-06 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6673109 G/T 1 21 14 35 10.1492543761985 7.23383041586765 2.91542396033087 T:G G T 10 0.516702172561975 0.398376363469485 ENSG00000111641:ENST00000322166:exon_6673057_6673112:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000382421:exon_6673057_6673112:NOP2;ENSG00000111641:ENST00000399466:exon_6673057_6673112:NOP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6839913 C/T 1 19 28 47 9.18265872132247 14.4676608317353 -5.28500211041283 T:C C T 10 0.516702172561975 0.144393603402518 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6839835_6839986:COPS7A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6859924 A/G 1 38 59 97 18.3653174426449 30.4854281811565 -12.1201107385116 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0146583436942916 ENSG00000089693:ENST00000435120:exon_6859879_6859932:MLF2;ENSG00000089693:ENST00000203630:exon_6859879_6859932:MLF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 6928075 T/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C T C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000010610:ENST00000011653:exon_6928013_6928080:CD4;ENSG00000010610:ENST00000437800:exon_6928013_6928080:CD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 8074192 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000059804:ENST00000075120:exon_8071826_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000486749:exon_8071827_8074227:SLC2A3;ENSG00000059804:ENST00000469295:exon_8073667_8074227:SLC2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 8248662 G/A 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000089818:ENST00000450991:exon_8248638_8250373:NECAP1;ENSG00000089818:ENST00000339754:exon_8248638_8250373:NECAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 8757859 G/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:G G T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8757811_8758081:AICDA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 9822387 C/G 1 51 53 104 24.6481891993393 27.3852151457847 -2.7370259464454 C:G C G 10 0.516702172561975 0.624355301731649 ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9822309_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9822313_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9822324_9822391:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9822325_9822391:CLEC2D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 9833628 C/T 1 111 108 219 53.6460588456208 55.8038346366933 -2.15777579107253 T:C C T 10 0.516702172561975 0.787092036090788 ENSG00000069493:ENST00000479410:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000487752:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261339:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000325960:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000261340:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000492359:exon_9833519_9833646:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000479877:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000290855:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000444971:exon_9833519_9833629:CLEC2D;ENSG00000069493:ENST00000430909:exon_9833521_9833629:CLEC2D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 9875347 C/A 1 46 49 95 22.2317000621491 25.3184064555368 -3.08670639338763 A:C C A 10 0.516702172561975 0.539517438735536 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9875094_9875409:CLECL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 9906067 T/C 1 40 37 77 19.331913097521 19.1179803847931 0.213932712727924 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000110848:ENST00000228434:exon_9905082_9906185:CD69 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 10659799 T/C 0 131 0 131 63.3120153943813 0 63.3120153943813 T T 10 0.516702172561975 2.77989746155737e-38 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 56 63 119 27.0646783365294 32.5522368714044 -5.48755853487503 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.359087994978432 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 12871099 T/G 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 T:G T G 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12870397_12871248:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000396340:exon_12870756_12871248:CDKN1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 12966354 T/C 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12966280_12966388:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12966280_12966388:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12966295_12966388:DDX47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 12967127 C/T 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000213782:ENST00000352940:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000358007:exon_12967065_12967158:DDX47;ENSG00000213782:ENST00000426619:exon_12967065_12967158:DDX47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 14976398 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000182993:ENST00000330828:exon_14975846_14977349:C12orf60 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 444 429 873 214.584235382483 221.665232029087 -7.08099664660421 A:T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.635584813719247 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 47630062 C/T 1 16 15 31 7.7327652390084 7.75053258842963 -0.0177673494212263 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000179715:ENST00000321382:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000432328:exon_47628790_47630439:FAM113B;ENSG00000179715:ENST00000330951:exon_47629880_47630155:FAM113B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 49523404 C/T 1 361 350 711 174.470515705127 180.845760396691 -6.37524469156426 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.652545025816927 ENSG00000123416:ENST00000336023:exon_49523283_49523505:TUBA1B;ENSG00000123416:ENST00000429203:exon_49523283_49523505:TUBA1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 50035723 C/T 1 25 24 49 12.0824456859506 12.4008521414874 -0.318406455536778 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000110844:ENST00000261897:exon_50035712_50035807:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000419405:exon_50035691_50035807:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000380281:exon_50035691_50035807:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000341308:exon_50035712_50035807:PRPF40B;ENSG00000110844:ENST00000395012:exon_50035691_50035807:PRPF40B;ENSG00000161791:ENST00000335154:exon_50031724_50039686:FMNL3;ENSG00000161791:ENST00000352151:exon_50031724_50039686:FMNL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 50524472 C/T 1 32 29 61 15.4655304780168 14.9843630042973 0.481167473719523 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50523608_50524477:LASS5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 50571275 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000050405:ENST00000394943:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000341247:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000420992:exon_50569573_50571852:LIMA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 51489009 C/T 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 T:C C T 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000135457:ENST00000257915:exon_51488624_51489061:TFCP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 51500373 C/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 C:G C G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000135457:ENST00000257915:exon_51500308_51500396:TFCP2;ENSG00000135457:ENST00000307660:exon_51500308_51500396:TFCP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 51681903 T/C 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 T:C T C 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51681892_51681972:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51681892_51681972:BIN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 51685831 T/C 1 10 23 33 4.83297827438025 11.8841499689254 -7.05117169454518 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0148051331928203 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53433486 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000063046:ENST00000420463:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53433414_53433486:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53433414_53433486:EIF4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53587468 T/G 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:G T G 10 0.516702172561975 0.213290861679303 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53680241 G/A 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53679708_53680696:ESPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53683222 G/A 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53683188_53683378:ESPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53693532 A/G 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 A:G A G 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53693533 A/C 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 A:C A C 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693470_53693737:C12orf10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53700860 A/G 1 67 68 135 32.3809544383477 35.1357477342143 -2.75479329586663 A:G A G 10 0.516702172561975 0.667181718387713 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53701317 C/T 1 43 44 87 20.7818065798351 22.7348955927269 -1.95308901289183 T:C C T 10 0.516702172561975 0.747811496149306 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53701241_53701497:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53701241_53701497:AAAS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53701399 A/G 1 28 26 54 13.5323391682647 13.4342564866114 0.0980826816533469 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53701241_53701497:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53701241_53701497:AAAS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53702123 C/G 1 26 18 44 12.5657435133886 9.30063910611555 3.2651044072731 C:G C G 10 0.516702172561975 0.366957673909183 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53702066_53702133:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53702066_53702133:AAAS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53853100 C/T 1 102 92 194 49.2963783986785 47.5365998757017 1.75977852297684 T:C C T 10 0.516702172561975 0.82955432833155 ENSG00000197111:ENST00000437231:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000455667:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000447282:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000359282:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000439930:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000359462:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000379777:exon_53853056_53853187:PCBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 53900625 C/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139574:ENST00000267017:exon_53900474_53900677:NPFF;ENSG00000139574:ENST00000448979:exon_53900474_53900677:NPFF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 54577718 G/A 1 11 7 18 5.31627610181827 3.61691520793383 1.69936089388445 A:G G A 10 0.516702172561975 0.485136060235083 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54577532_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000506595:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000514685:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000513838:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000243112:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54577549_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000401977:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000514196:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000504338:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000509078:exon_54577549_54578080:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000507904:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000503447:exon_54577201_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000504797:exon_54577438_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000506169:exon_54577454_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000503306:exon_54577479_54577743:SMUG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 54741814 G/C 1 63 63 126 30.4477631285956 32.5522368714044 -2.10447374280885 C:G G C 10 0.516702172561975 0.722193039614049 ENSG00000111481:ENST00000262061:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000416254:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000455864:exon_54741784_54741835:COPZ1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 54905833 T/A 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 A:T T A 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54905733_54905889:NCKAP1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 55354987 T/G 1 16 5 21 7.7327652390084 2.58351086280988 5.14925437619852 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0283428102801955 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56120523 G/A 1 249 275 524 120.341159032068 142.093097454543 -21.7519384224749 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.0601326761858736 ENSG00000135404:ENST00000257857:exon_56120484_56120579:CD63;ENSG00000135404:ENST00000420846:exon_56120484_56120579:CD63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56215793 G/T 1 16 20 36 7.7327652390084 10.3340434512395 -2.6012782122311 A:T:G G T 10 0.516702172561975 0.408601526257631 ENSG00000135392:ENST00000317269:exon_56214744_56215971:DNAJC14;ENSG00000135392:ENST00000317287:exon_56215781_56215891:DNAJC14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56345408 T/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:G T G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56345407_56345567:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56345407_56345567:DGKA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56397687 A/G 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56398454 G/C 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139531:ENST00000266971:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394115:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000356124:exon_56397402_56399305:SUOX;ENSG00000139531:ENST00000394109:exon_56397402_56399309:SUOX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56435920 C/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 C:G C G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56435929 C/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 C:G C G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000197728:ENST00000356464:exon_56435686_56435953:RPS26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56737255 C/T 1 17 20 37 8.21606306644642 10.3340434512395 -2.11798038479308 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.514174537875676 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56735384_56737315:STAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56740380 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740226_56740408:STAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56740682 C/G 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 C:G C G 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740603_56740739:STAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56815168 C/G 1 6 20 26 2.89978696462815 10.3340434512395 -7.43425648661135 C:G C G 10 0.516702172561975 0.00496120449117322 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56815135_56815277:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815135_56815277:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815135_56815277:TIMELESS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56815717 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000111602:ENST00000447258:exon_56815683_56815765:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815683_56815800:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815683_56815800:TIMELESS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56815922 C/T 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56815890_56815975:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56815890_56815975:TIMELESS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 56818898 G/A 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000111602:ENST00000229201:exon_56818799_56818936:TIMELESS;ENSG00000111602:ENST00000452204:exon_56818799_56818936:TIMELESS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 57004268 G/A 1 1 9 10 0.483297827438025 4.65031955305778 -4.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0094848757557616 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_57004193_57004301:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_57004193_57004301:BAZ2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 57005793 A/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:T A T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_57005557_57006030:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_57005557_57006030:BAZ2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 57870155 A/C 1 27 30 57 13.0490413408267 15.5010651768593 -2.45202383603258 A:C A C 10 0.516702172561975 0.596447752248135 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870147_57870237:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870147_57870237:ARHGAP9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 57870952 G/A 1 24 23 47 11.5991478585126 11.8841499689254 -0.285002110412828 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57870939_57871052:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57870939_57871052:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57870939_57871052:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57870939_57871052:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57870939_57871052:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57870939_57871052:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57870939_57871052:ARHGAP9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 42 37 79 20.298508752397 19.1179803847931 1.18052836760397 A:G G A 10 0.516702172561975 0.822541656192217 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 143 151 294 69.1115893236376 78.0220280568582 -8.91043873322066 A:G A G 10 0.516702172561975 0.321213085607388 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 58145122 C/T 1 41 62 103 19.815210924959 32.0355346988425 -12.2203237738834 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0177388804742163 ENSG00000135446:ENST00000257904:exon_58144990_58145125:CDK4;ENSG00000135446:ENST00000312990:exon_58145080_58145125:CDK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 24 17 41 11.5991478585126 8.78393693355358 2.81521092495902 A:G A G 10 0.516702172561975 0.435889184910351 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 58190340 G/C 1 25 39 64 12.0824456859506 20.151384729917 -8.0689390439664 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0458250358444074 ENSG00000123297:ENST00000454289:exon_58189960_58191334:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000323833:exon_58189960_58190517:TSFM;ENSG00000123297:ENST00000350762:exon_58189960_58190517:TSFM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 T:C C T 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 62785663 T/C 1 23 6 29 11.1158500310746 3.10021303537185 8.01563699570272 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00268491570916713 ENSG00000135655:ENST00000353364:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000280377:exon_62785596_62785666:USP15;ENSG00000135655:ENST00000393654:exon_62785596_62785666:USP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 66546100 A/G 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 A:G A G 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000155957:ENST00000426857:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66546051_66546156:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000398033:exon_66546051_66546156:TMBIM4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 66725160 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66724934_66725425:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66724934_66725425:HELB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 66731864 C/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000127311:ENST00000247815:exon_66731781_66732003:HELB;ENSG00000127311:ENST00000440906:exon_66731781_66732003:HELB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 68052166 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000127334:ENST00000344096:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000319833:exon_68050886_68056444:DYRK2;ENSG00000127334:ENST00000393555:exon_68050886_68056444:DYRK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 72164395 C/T 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 72176401 C/T 1 18 17 35 8.69936089388445 8.78393693355358 -0.0845760396691269 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72176350_72176438:RAB21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 72179369 G/A 1 27 18 45 13.0490413408267 9.30063910611555 3.74840223471112 A:G G A 10 0.516702172561975 0.297862717587962 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72179311_72181150:RAB21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 72312268 G/A 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72312231_72312328:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72312231_72312328:TBC1D15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 79986405 C/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_79985747_79986473:PAWR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 82792787 C/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:C C A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 88512485 A/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G A G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88512420_88512520:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88512420_88512520:CEP290 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 89985004 C/A 1 14 8 22 6.76616958413235 4.1336173804958 2.63255220363655 A:C C A 10 0.516702172561975 0.292213820299823 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_89981828_89985072:ATP2B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 94653394 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94653386_94653510:PLXNC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 95907635 G/A 1 62 67 129 29.9644653011575 34.6190455616523 -4.65458026049478 A:G G A 10 0.516702172561975 0.428767154426207 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95907428_95909615:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95907428_95909615:METAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 102302125 C/T 1 30 14 44 14.4989348231407 7.23383041586765 7.2651044072731 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0339269567631881 ENSG00000136048:ENST00000258534:exon_102301964_102302141:DRAM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 106633048 G/A 1 31 44 75 14.9822326505788 22.7348955927269 -7.75266294214813 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0829080357569983 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 106633327 C/T 1 16 19 35 7.7327652390084 9.81734127867753 -2.08457603966913 T:C C T 10 0.516702172561975 0.503196579306069 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 108910962 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000198855:ENST00000361549:exon_108910692_108911050:FICD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 108920229 C/T 1 22 17 39 10.6325522036365 8.78393693355358 1.84861527008297 T:C C T 10 0.516702172561975 0.631830397141998 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108919876_108920330:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108919876_108920330:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108919926_108920325:SART3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 108954823 C/T 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 C:G G C 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 110029057 C/A 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110029046_110029162:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110029046_110029162:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110029046_110029162:MVK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 111160003 G/A 1 25 27 52 12.0824456859506 13.9509586591733 -1.8685129732227 A:G G A 10 0.516702172561975 0.677791113888664 ENSG00000186298:ENST00000335007:exon_111159940_111160074:PPP1CC;ENSG00000186298:ENST00000340766:exon_111159940_111160074:PPP1CC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 112194244 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112194137_112194898:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112194137_112194901:ACAD10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 112229927 G/T 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 T:G G T 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000111275:ENST00000261733:exon_112229865_112229967:ALDH2;ENSG00000111275:ENST00000416293:exon_112229865_112229967:ALDH2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 112579900 A/G 1 23 24 47 11.1158500310746 12.4008521414874 -1.28500211041283 A:G A G 10 0.516702172561975 0.771109779196955 ENSG00000135148:ENST00000257604:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000412615:exon_112579893_112580099:TRAFD1;ENSG00000135148:ENST00000432758:exon_112579893_112580099:TRAFD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 6 17 23 2.89978696462815 8.78393693355358 -5.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0198219987505779 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113435439 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113435325_113435560:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113435325_113435560:OAS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113445605 G/A 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113445510_113445748:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113445510_113445748:OAS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113534591 C/T 1 4 16 20 1.9331913097521 8.2672347609916 -6.3340434512395 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.00590757357182335 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113534633 C/T 1 4 20 24 1.9331913097521 10.3340434512395 -8.4008521414874 T:C C T 10 0.516702172561975 0.000692340174170852 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113737569 T/C 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:C T C 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000089060:ENST00000202831:exon_113736572_113737779:SLC24A6;ENSG00000089060:ENST00000377458:exon_113736572_113737779:SLC24A6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113866981 C/T 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113866965_113867104:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113866965_113867104:SDSL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 113874669 A/T 1 9 18 27 4.34968044694222 9.30063910611555 -4.95095865917333 A:T A T 10 0.516702172561975 0.0812165378882992 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113874556_113874680:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113874556_113874680:SDSL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 114374887 T/A 1 16 8 24 7.7327652390084 4.1336173804958 3.5991478585126 A:T T A 10 0.516702172561975 0.157059041871443 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114374812_114374941:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114374812_114374941:RBM19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 114377835 A/G 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G A G 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 114386639 A/G 1 14 8 22 6.76616958413235 4.1336173804958 2.63255220363655 A:G A G 10 0.516702172561975 0.292213820299823 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114386638_114386841:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114386638_114386841:RBM19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 17 12 29 8.21606306644642 6.2004260707437 2.01563699570272 T:C T C 10 0.516702172561975 0.465548101282052 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 114395842 G/A 1 26 11 37 12.5657435133886 5.68372389818173 6.88201961520692 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.0311724794006175 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 116972685 G/T 0 12 0 12 5.7995739292563 0 5.7995739292563 G G 10 0.516702172561975 0.00052454284076193 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 117290433 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117290143_117291434:RNFT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 120576637 G/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120576499_120576660:GCN1L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 120636549 C/A 1 22 14 36 10.6325522036365 7.23383041586765 3.3987217877689 A:C C A 10 0.516702172561975 0.3174146376039 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 120941872 T/C 1 15 15 30 7.24946741157037 7.75053258842963 -0.501065176859251 T:C T C 10 0.516702172561975 0.857608347222054 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120941773_120941884:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120941773_120941884:COQ5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 121176428 T/C 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 T:C T C 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121176336_121176473:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121176336_121176473:ACADS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 121221518 C/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000157837:ENST00000353487:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000405631:exon_121221477_121221555:AC069214.1;ENSG00000157837:ENST00000392495:exon_121221477_121221555:AC069214.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 121469370 T/G 1 1 7 8 0.483297827438025 3.61691520793383 -3.1336173804958 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0335158533751347 ENSG00000135114:ENST00000257570:exon_121469245_121469420:OASL;ENSG00000135114:ENST00000339275:exon_121469245_121469420:OASL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 121691157 C/T 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121691076_121691275:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121691076_121691275:CAMKK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 121712077 T/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000110931:ENST00000347034:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000324774:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392474:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000337174:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000446440:exon_121711859_121712388:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000402834:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000404169:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000412367:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000360452:exon_121711859_121712329:CAMKK2;ENSG00000110931:ENST00000392473:exon_121711859_121712388:CAMKK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 49 42 91 23.6815935444632 21.701491247603 1.98010229686027 T:C C T 10 0.516702172561975 0.753225465130265 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 122218783 T/G 1 81 87 168 39.14712402248 44.9530890128918 -5.80596499041181 T:G T G 10 0.516702172561975 0.396052937020195 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122213515_122219974:TMEM120B;ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122218778_122218912:RHOF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 26 28 54 12.5657435133886 14.4676608317353 -1.90191731834665 A:G A G 10 0.516702172561975 0.683393924622453 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 123738494 C/T 1 46 57 103 22.2317000621491 29.4520238360326 -7.22032377388343 T:C C T 10 0.516702172561975 0.167823302868585 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 123749783 C/T 1 17 15 32 8.21606306644642 7.75053258842963 0.465530478016798 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000111328:ENST00000261692:exon_123749743_123749869:CDK2AP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 123787443 A/G 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123787371_123787447:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123787371_123787447:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123787371_123787447:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123787371_123787447:SBNO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 21 16 37 10.1492543761985 8.2672347609916 1.88201961520692 A:G A G 10 0.516702172561975 0.622631364606705 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124104642 C/T 1 21 35 56 10.1492543761985 18.0845760396691 -7.9353216634706 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0439630085300476 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 33 41 74 15.9488283054548 21.184789075041 -5.23596076958616 A:G G A 10 0.516702172561975 0.245424001744339 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124132669 C/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124132510_124132673:GTF2H3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124421764 C/T 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C C T 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124420983_124422377:CCDC92 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124421844 C/T 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124420983_124422377:CCDC92 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124821413 G/A 1 18 13 31 8.69936089388445 6.71712824330568 1.98223265057877 A:G G A 10 0.516702172561975 0.590584117684727 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124821416 C/T 1 19 13 32 9.18265872132247 6.71712824330568 2.4655304780168 T:C C T 10 0.516702172561975 0.479937631108408 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124821299_124821676:NCOR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 124856660 T/A 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:T T A 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124856568_124857156:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124856568_124857156:NCOR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 129278745 G/A 1 22 6 28 10.6325522036365 3.10021303537185 7.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00424298820258652 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278574_129278759:SLC15A4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 129285445 C/T 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129285399_129285554:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129285399_129285554:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129285399_129285554:SLC15A4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 21 1 22 10.1492543761985 0.516702172561975 9.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 1.33682401804176e-05 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 132195855 C/T 1 8 13 21 3.8663826195042 6.71712824330568 -2.85074562380148 T:C C T 10 0.516702172561975 0.275577945999374 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132195635_132195992:SFSWAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 132210063 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132209950_132210175:SFSWAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 132636075 C/G 1 20 26 46 9.6659565487605 13.4342564866114 -3.76829993785085 C:G C G 10 0.516702172561975 0.302741003181652 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132636029_132636189:NOC4L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133208979 T/C 1 5 11 16 2.41648913719012 5.68372389818173 -3.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.133473626885738 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133212520 G/A 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133212478_133212610:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133212478_133212610:POLE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133294662 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294573_133294706:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294573_133294706:PGAM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133306780 A/G 1 42 25 67 20.298508752397 12.9175543140494 7.38095443834767 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0863934703196542 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133312084 G/A 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 A:G G A 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133311992_133312098:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133311992_133312098:ANKLE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133324834 C/A 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 A:C C A 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133324724_133324917:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133324724_133324917:ANKLE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133331233 G/A 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.121535928231048 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133331459 G/C 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 C:G G C 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133331537 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133384863 C/T 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133384477_133385135:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133384477_133385135:GOLGA3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133390008 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 12 133428242 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133428204_133428323:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133428204_133428323:CHFR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 20220615 G/A 1 40 97 137 19.331913097521 50.1201107385116 -30.7881976409906 A:G G A 10 0.516702172561975 1.19864013968046e-07 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20220583_20221431:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20220583_20221431:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20220583_20221431:MPHOSPH8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 23928912 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000476776:exon_23928658_23929029:SACS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 24876752 T/C 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000182957:ENST00000466831:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382095:exon_24876736_24881210:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000424834:exon_24876736_24881207:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000382108:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000438694:exon_24876736_24881204:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000434675:exon_24876736_24877259:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000399949:exon_24876736_24878042:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000409126:exon_24876736_24877344:SPATA13;ENSG00000182957:ENST00000343003:exon_24876736_24881204:SPATA13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 25009288 C/T 1 23 26 49 11.1158500310746 13.4342564866114 -2.31840645553678 T:C C T 10 0.516702172561975 0.568386696022871 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 25457372 G/A 1 23 20 43 11.1158500310746 10.3340434512395 0.781806579835074 A:G G A 10 0.516702172561975 0.879264719759571 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25457171_25457507:CENPJ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 T:C T C 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 25480616 T/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:T T A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 82 92 174 39.630421849918 47.5365998757017 -7.90617802578366 A:C:G G C 10 0.516702172561975 0.255183537105410 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 28014417 T/A 1 38 34 72 18.3653174426449 17.5678738671072 0.797443575537795 A:T T A 10 0.516702172561975 0.906365369436459 ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28014126_28014612:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000460973:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000471771:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000493719:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000485650:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000484342:exon_28014343_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000485959:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000483903:exon_28014413_28014586:MTIF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 28240002 G/A 1 101 124 225 48.8130805712405 64.0710693976849 -15.2579888264444 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0452565763225369 ENSG00000186184:ENST00000399697:exon_28239823_28241548:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000465887:exon_28239823_28241547:POLR1D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 31036681 A/G 1 35 24 59 16.9154239603309 12.4008521414874 4.51457181884347 A:G A G 10 0.516702172561975 0.244712763738291 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 31036837 G/A 1 33 40 73 15.9488283054548 20.668086902479 -4.71925859702418 A:G G A 10 0.516702172561975 0.292810630326116 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000432889:exon_31036709_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000426225:exon_31036709_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 31715367 T/C 1 22 14 36 10.6325522036365 7.23383041586765 3.3987217877689 T:C T C 10 0.516702172561975 0.3174146376039 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31715345_31715395:HSPH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 31729777 T/C 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 32972673 C/T 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 34404147 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000133119:ENST00000380071:exon_34403973_34404154:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000434425:exon_34403973_34404154:RFC3;ENSG00000133119:ENST00000399354:exon_34403973_34404154:RFC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 36886469 T/C 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C T C 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36886456_36886721:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36886456_36886548:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000482146:exon_36886456_36886614:SPG20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 36909408 T/C 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36909158_36909969:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36909158_36909969:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36909158_36909969:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36909158_36909969:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000495510:exon_36909158_36909969:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494703:exon_36909370_36909969:SPG20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 37393953 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000133111:ENST00000255476:exon_37393361_37394094:RFXAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 20 15 35 9.6659565487605 7.75053258842963 1.91542396033087 C:G G C 10 0.516702172561975 0.612752742841213 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 21 22 43 10.1492543761985 11.3674477963635 -1.21819342016493 A:G A G 10 0.516702172561975 0.76140888237017 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 39587865 A/C 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:C A C 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 39587889 T/C 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 41134056 G/A 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000150907:ENST00000379561:exon_41133646_41134997:FOXO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 41508077 G/C 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 C:G G C 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41506056_41508164:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41506168_41508164:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41506170_41508164:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41506177_41508164:ELF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 41797397 T/C 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41797392_41797490:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41797392_41797490:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000473492:exon_41797392_41797490:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41797392_41797490:MTRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 41834756 G/A 1 2 9 11 0.96659565487605 4.65031955305778 -3.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0333238555970313 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 46538127 G/A 1 16 27 43 7.7327652390084 13.9509586591733 -6.21819342016493 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0668749303658943 ENSG00000123200:ENST00000242848:exon_46537977_46538177:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000378921:exon_46537977_46538177:ZC3H13;ENSG00000123200:ENST00000282007:exon_46536314_46538177:ZC3H13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 51943349 C/T 1 18 15 33 8.69936089388445 7.75053258842963 0.948828305454824 T:C C T 10 0.516702172561975 0.862114069790544 ENSG00000102786:ENST00000440606:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000469430:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000311234:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000398119:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000497989:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000420668:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000483441:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000425000:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000490542:exon_51943075_51943446:INTS6;ENSG00000102786:ENST00000463928:exon_51943075_51943446:INTS6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 52603119 T/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:G T G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 52603433 C/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 16 17 33 7.7327652390084 8.78393693355358 -1.05117169454518 A:G G A 10 0.516702172561975 0.731077391443214 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C T C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:G A G 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 99947829 T/C 1 14 25 39 6.76616958413235 12.9175543140494 -6.15138472991703 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0546785177904694 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 100204547 G/A 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 A:G G A 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000125304:ENST00000376387:exon_100204421_100204580:TM9SF2;ENSG00000125304:ENST00000419976:exon_100204421_100204580:TM9SF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 30 23 53 14.4989348231407 11.8841499689254 2.61478485421532 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494921092357735 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 103418728 A/G 1 24 16 40 11.5991478585126 8.2672347609916 3.331913097521 A:G A G 10 0.516702172561975 0.343419277511162 ENSG00000151287:ENST00000376027:exon_103418340_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376019:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376022:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376021:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376032:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376029:exon_103418460_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000376031:exon_103418467_103418930:C13orf27;ENSG00000151287:ENST00000455589:exon_103418467_103418930:C13orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 103518036 A/G 1 21 21 42 10.1492543761985 10.8507456238015 -0.701491247602952 A:G A G 10 0.516702172561975 0.877997089651042 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103518017_103518261:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103517068_103518731:ERCC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 103519119 G/A 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103518982_103519195:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103518982_103519195:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103518982_103519195:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000481099:exon_103518982_103519195:ERCC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 103528002 G/C 1 99 67 166 47.8464849163645 34.6190455616523 13.2274393547121 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0433292680873676 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 114149891 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 114277541 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000198176:ENST00000475254:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000465174:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000408980:exon_114277495_114277601:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000453989:exon_114277495_114277601:TFDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 114290333 G/A 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 A:G G A 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114290292_114290443:TFDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 114292173 G/A 1 17 14 31 8.21606306644642 7.23383041586765 0.982232650578773 A:G G A 10 0.516702172561975 0.85777700870536 ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114292133_114292211:TFDP1;ENSG00000198176:ENST00000494812:exon_114292133_114292211:TFDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 114762027 C/T 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000185989:ENST00000334062:exon_114762007_114762215:RASA3;ENSG00000185989:ENST00000389544:exon_114762007_114762215:RASA3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 115067327 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115067206_115067500:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115067206_115067500:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115067206_115067342:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115067206_115067500:UPF3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 20823095 G/A 1 15 19 34 7.24946741157037 9.81734127867753 -2.56787386710715 A:G G A 10 0.516702172561975 0.396096284976245 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20822968_20823106:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527384:exon_20822801_20823106:PARP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 20916958 T/C 1 22 18 40 10.6325522036365 9.30063910611555 1.331913097521 T:C T C 10 0.516702172561975 0.752563259473963 ENSG00000092094:ENST00000206542:exon_20916892_20916970:OSGEP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 84 97 181 40.5970175047941 50.1201107385116 -9.52309323371748 T:G T G 10 0.516702172561975 0.158472200937459 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 20926699 A/G 1 19 23 42 9.18265872132247 11.8841499689254 -2.70149124760295 A:G A G 10 0.516702172561975 0.442288545571072 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20926012_20926861:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20926017_20926861:TMEM55B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21829404 T/C 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C T C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21860866 A/G 1 10 16 26 4.83297827438025 8.2672347609916 -3.43425648661135 A:G A G 10 0.516702172561975 0.238643810373624 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21860666_21860968:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21860666_21860968:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21860666_21860968:CHD8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21860900 G/A 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21860666_21860968:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21860666_21860968:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21860666_21860968:CHD8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21960816 T/C 1 22 10 32 10.6325522036365 5.16702172561975 5.4655304780168 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0752961932604552 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21960969 G/A 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:G G A 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000448790:exon_21960667_21961416:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000463119:exon_21960667_21960971:TOX4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21967916 A/G 1 43 44 87 20.7818065798351 22.7348955927269 -1.95308901289183 A:G A G 10 0.516702172561975 0.747811496149306 ENSG00000165819:ENST00000298717:exon_21967908_21967946:METTL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 22963863 C/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 255 295 550 123.240945996696 152.427140905783 -29.1861949090863 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0133069032983580 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 23236524 C/T 1 6 16 22 2.89978696462815 8.2672347609916 -5.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0307983149580302 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 34 28 62 16.4321261328928 14.4676608317353 1.96446530115755 T:G G T 10 0.516702172561975 0.703401259894103 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 23549183 T/C 1 15 17 32 7.24946741157037 8.78393693355358 -1.5344695219832 T:C T C 10 0.516702172561975 0.600958499169707 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 18 20 38 8.69936089388445 10.3340434512395 -1.63468255735505 A:C C A 10 0.516702172561975 0.629088378265371 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24567817 G/T 1 19 6 25 9.18265872132247 3.10021303537185 6.08244568595062 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0159853157431745 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567684_24567887:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567684_24567887:PCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24568346 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24568258_24568445:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24568258_24568445:PCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24569408 A/T 1 33 22 55 15.9488283054548 11.3674477963635 4.58138050909137 A:T A T 10 0.516702172561975 0.227411597916123 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24619630 T/C 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 T:C T C 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24619270_24619657:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24619270_24619657:RNF31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24647328 G/A 1 6 13 19 2.89978696462815 6.71712824330568 -3.81734127867753 A:G G A 10 0.516702172561975 0.106867359802540 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647297_24647428:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647297_24647428:REC8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24649669 C/T 1 21 31 52 10.1492543761985 16.0177673494212 -5.8685129732227 T:C C T 10 0.516702172561975 0.126369797559069 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24650967 C/T 1 20 14 34 9.6659565487605 7.23383041586765 2.43212613289285 T:C C T 10 0.516702172561975 0.493246817938414 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24650917_24651049:IPO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24654418 T/C 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 T:C T C 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24654389_24654518:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24654389_24654518:IPO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24656615 A/G 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 A:G A G 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24656606_24656785:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24656606_24656785:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24656606_24656785:IPO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24707771 T/C 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 T:C T C 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24707452_24707984:GMPR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24709433 G/A 1 38 21 59 18.3653174426449 10.8507456238015 7.51457181884347 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0516132302779165 ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24708853_24710081:TINF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24736027 G/A 1 24 17 41 11.5991478585126 8.78393693355358 2.81521092495902 A:G G A 10 0.516702172561975 0.435889184910351 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 20 19 39 9.6659565487605 9.81734127867753 -0.151384729917027 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24775619 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000196943:ENST00000267425:exon_24774144_24778330:C14orf21;ENSG00000136305:ENST00000258807:exon_24775580_24775729:CIDEB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 24806331 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24806292_24806666:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24806292_24806666:RIPK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 31578762 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 32623861 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000100852:ENST00000345122:exon_32623827_32628934:ARHGAP5;ENSG00000100852:ENST00000432921:exon_32623827_32628934:ARHGAP5;ENSG00000100852:ENST00000396582:exon_32623827_32626285:ARHGAP5;ENSG00000100852:ENST00000433497:exon_32623827_32626285:ARHGAP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 34395070 A/C 1 16 9 25 7.7327652390084 4.65031955305778 3.08244568595062 A:C A C 10 0.516702172561975 0.236024485273226 ENSG00000129521:ENST00000250457:exon_34393437_34395128:EGLN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 34985506 G/C 1 18 8 26 8.69936089388445 4.1336173804958 4.56574351338865 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0797299920371934 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35242828 G/A 1 10 1 11 4.83297827438025 0.516702172561975 4.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0121998219531107 ENSG00000198604:ENST00000382422:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000360310:exon_35242778_35242932:BAZ1A;ENSG00000198604:ENST00000358716:exon_35242778_35242932:BAZ1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35487908 G/A 1 45 31 76 21.7484022347111 16.0177673494212 5.73063488528989 A:G G A 10 0.516702172561975 0.207400405825555 ENSG00000100883:ENST00000216774:exon_35487898_35487971:SRP54 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35591174 T/C 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000092020:ENST00000261475:exon_35591108_35591519:PPP2R3C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35592538 C/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 C:G C G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000100890:ENST00000321130:exon_35592158_35593437:KIAA0391;ENSG00000100890:ENST00000250377:exon_35592158_35593437:KIAA0391 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35761640 T/G 1 6 12 18 2.89978696462815 6.2004260707437 -3.30063910611555 T:G T G 10 0.516702172561975 0.156942134254247 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35761563_35761758:PSMA6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35783656 A/G 1 107 219 326 51.7128675358687 113.157775791073 -61.4449082552039 A:C:G A G 10 0.516702172561975 8.0204707493755e-12 ENSG00000100902:ENST00000261479:exon_35783567_35783661:PSMA6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 35871960 G/A 1 39 57 96 18.848615270083 29.4520238360326 -10.6034085659496 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0320440781702015 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 70 68 138 33.8308479206617 35.1357477342143 -1.30489981355256 T:C C T 10 0.516702172561975 0.864878339341852 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 39818145 G/A 1 34 32 66 16.4321261328928 16.5344695219832 -0.102343389090354 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 45696913 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45696866_45697017:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45696866_45697017:C14orf106 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 45700352 T/C 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 T:C T C 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45700344_45700501:C14orf106 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 45716000 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45715946_45716580:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45715946_45716580:C14orf106 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50092471 T/C 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50091892_50092766:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50091907_50092766:C14orf104 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50100374 C/T 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50251369 A/G 1 18 20 38 8.69936089388445 10.3340434512395 -1.63468255735505 A:G A G 10 0.516702172561975 0.629088378265371 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50249997_50251431:SDCCAG1;ENSG00000165525:ENST00000382135:exon_50250532_50251431:SDCCAG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50295846 C/T 1 46 47 93 22.2317000621491 24.2850021104128 -2.05330204826368 T:C C T 10 0.516702172561975 0.679564972575133 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50295772_50295980:SDCCAG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50585222 C/T 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 A:T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50585248 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 50792382 C/A 1 22 20 42 10.6325522036365 10.3340434512395 0.29850875239705 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000125375:ENST00000311459:exon_50792327_50792668:ATP5S;ENSG00000125375:ENST00000245448:exon_50792327_50792668:ATP5S HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 51716467 G/A 1 15 6 21 7.24946741157037 3.10021303537185 4.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.081820513544553 ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716411_51716483:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716411_51716483:TMX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 53529669 A/T 1 4 10 14 1.9331913097521 5.16702172561975 -3.23383041586765 A:T A T 10 0.516702172561975 0.108891126564131 ENSG00000100523:ENST00000357758:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395606:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000323669:exon_53529661_53529923:DDHD1;ENSG00000100523:ENST00000395610:exon_53529661_53529923:DDHD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 55310523 T/C 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000131979:ENST00000477011:exon_55310500_55310587:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000395524:exon_55310512_55310587:GCH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 55408294 C/T 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 T:C C T 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 55643857 T/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 55818517 T/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:T T A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000178974:ENST00000313833:exon_55817099_55820329:FBXO34;ENSG00000178974:ENST00000440021:exon_55817099_55819801:FBXO34 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 57676330 G/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:G G T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000070367:ENST00000340918:exon_57676285_57676500:EXOC5;ENSG00000070367:ENST00000413566:exon_57676285_57676500:EXOC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 57741563 G/C 1 1 9 10 0.483297827438025 4.65031955305778 -4.16702172561975 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0094848757557616 ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 15 14 29 7.24946741157037 7.23383041586765 0.0156369957027236 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 58838668 A/G 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000466065:exon_58838604_58838678:ARID4A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 58838701 C/T 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58838604_58840451:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58838604_58840448:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58838604_58839012:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58838604_58838944:ARID4A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 59113430 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 59113537 C/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 C:G C G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000165617:ENST00000395151:exon_59111976_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000395153:exon_59112087_59115039:DACT1;ENSG00000165617:ENST00000335867:exon_59111976_59113888:DACT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 59939804 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000126790:ENST00000247194:exon_59939335_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000463432:exon_59939579_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000532049:exon_59939583_59939808:C14orf149;ENSG00000126790:ENST00000478430:exon_59939585_59939808:C14orf149 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 59970679 G/A 1 15 15 30 7.24946741157037 7.75053258842963 -0.501065176859251 A:G G A 10 0.516702172561975 0.857608347222054 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59970572_59972081:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59970572_59972081:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59970572_59971423:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000356057:exon_59970572_59971423:JKAMP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 60591509 G/A 1 11 3 14 5.31627610181827 1.55010651768593 3.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0592840474220576 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406949:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60590936_60591969:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000483571:exon_60590936_60591969:C14orf135 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 60600801 T/C 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60600688_60601532:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60600688_60601532:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60600688_60601527:C14orf135 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 60600992 T/C 1 15 15 30 7.24946741157037 7.75053258842963 -0.501065176859251 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.857608347222054 ENSG00000126773:ENST00000317623:exon_60600688_60601532:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000406854:exon_60600688_60601532:C14orf135;ENSG00000126773:ENST00000404681:exon_60600688_60601527:C14orf135 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 64637147 C/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64636946_64637180:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64636946_64637180:SYNE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 64692038 G/A 1 7 20 27 3.38308479206617 10.3340434512395 -6.95095865917333 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0108771189439457 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64692037_64693150:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64692037_64693151:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64692037_64693165:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64692037_64693165:SYNE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 68217778 A/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G A G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000072121:ENST00000394455:exon_68217769_68217813:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000347230:exon_68217769_68217813:ZFYVE26;ENSG00000072121:ENST00000411699:exon_68217769_68217813:ZFYVE26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 69520862 G/A 1 25 43 68 12.0824456859506 22.2181934201649 -10.1357477342143 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0150552096361684 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 T:C T C 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 21 15 36 10.1492543761985 7.75053258842963 2.3987217877689 A:G G A 10 0.516702172561975 0.505643653771055 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 74759006 C/T 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74758990_74759079:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74758990_74759079:ABCD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 74759477 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000119688:ENST00000356924:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000298816:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000481935:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000474270:exon_74759451_74759529:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000496015:exon_74759451_74759951:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000469672:exon_74759451_74759572:ABCD4;ENSG00000119688:ENST00000460308:exon_74759451_74759572:ABCD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 75137533 T/C 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000119682:ENST00000356357:exon_75137465_75137574:KIAA0317;ENSG00000119682:ENST00000481010:exon_75137465_75137574:KIAA0317;ENSG00000119682:ENST00000469797:exon_75137345_75137574:KIAA0317 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 76368544 T/C 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 T:C T C 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 77492891 G/A 1 3 9 12 1.44989348231407 4.65031955305778 -3.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0834942591884686 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 77493526 G/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:G G T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000119669:ENST00000238647:exon_77490888_77495034:C14orf4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 78140329 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 78140355 T/A 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:T T A 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000100601:ENST00000216489:exon_78138749_78140584:ALKBH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 70 61 131 33.8308479206617 31.5188325262805 2.31201539438127 A:C C A 10 0.516702172561975 0.726895093125149 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 89039308 A/G 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 A:G A G 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000100722:ENST00000302216:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000251038:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393514:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000406216:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000353091:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000380684:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393530:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000359301:exon_89038922_89039351:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000336693:exon_89038922_89039351:ZC3H14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 90429749 A/G 1 16 12 28 7.7327652390084 6.2004260707437 1.5323391682647 A:G A G 10 0.516702172561975 0.5776188734531 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 90429858 G/A 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 91671124 G/A 1 18 4 22 8.69936089388445 2.0668086902479 6.63255220363655 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00480346847647182 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 A:G A G 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 92470251 G/T 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:G G T 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 92471242 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93118198 C/T 1 13 13 26 6.28287175669432 6.71712824330568 -0.434256486611352 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 50 59 109 24.1648913719012 30.4854281811565 -6.32053680925528 T:C C T 10 0.516702172561975 0.250266508550943 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 46 55 101 22.2317000621491 28.4186194909086 -6.18691942875948 T:C C T 10 0.516702172561975 0.232893573076625 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 16 9 25 7.7327652390084 4.65031955305778 3.08244568595062 T:C C T 10 0.516702172561975 0.236024485273226 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 C:G C G 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 93681613 C/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000012963:ENST00000013070:exon_93681522_93681627:UBR7;ENSG00000012963:ENST00000416753:exon_93681522_93681627:UBR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 14 27 41 6.76616958413235 13.9509586591733 -7.18478907504098 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0282791806929292 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 94423294 T/C 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94423112_94423767:ASB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 94776112 C/T 0 0 11 11 0 5.68372389818173 -5.68372389818173 T C T 10 0.516702172561975 0.000336018564016785 ENSG00000170099:ENST00000341584:exon_94776073_94776343:SERPINA6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 94847285 A/G 1 60 3 63 28.9978696462815 1.55010651768593 27.4477631285956 A:G A G 10 0.516702172561975 4.00143892004199e-14 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94846988_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94847208_94847478:SERPINA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 94847415 A/G 1 69 3 72 33.3475500932237 1.55010651768593 31.7974435755378 A:G A G 10 0.516702172561975 1.41338596942347e-16 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94846988_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94847208_94847478:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94847208_94847478:SERPINA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 94849029 G/A 1 1 42 43 0.483297827438025 21.701491247603 -21.2181934201649 A:G G A 10 0.516702172561975 1.70603514221691e-12 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94848929_94849583:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94848929_94849578:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000402629:exon_94848929_94849578:SERPINA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 95669487 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95669175_95670800:CLMN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 99870572 A/G 1 20 18 38 9.6659565487605 9.30063910611555 0.365317442644949 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99870562_99870647:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99870562_99870647:SETD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 99871598 T/C 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 T:C T C 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99871542_99871708:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000446066:exon_99871542_99871708:SETD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 100808845 G/A 1 131 89 220 63.3120153943813 45.9864933580158 17.3255220363655 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0216333091650352 ENSG00000140105:ENST00000392882:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000355338:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000358655:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000344102:exon_100808735_100808908:WARS;ENSG00000140105:ENST00000392880:exon_100808735_100808908:WARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102323093 T/C 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C T C 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000445439:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000422945:exon_102323023_102323222:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102323023_102323222:PPP2R5C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102495878 G/A 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 A:G G A 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102495876_102496049:DYNC1H1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102504838 C/T 1 19 16 35 9.18265872132247 8.2672347609916 0.915423960330873 T:C C T 10 0.516702172561975 0.866093820681115 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102504797_102504943:DYNC1H1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102507927 C/G 1 16 11 27 7.7327652390084 5.68372389818173 2.04904134082667 C:G C G 10 0.516702172561975 0.448966948977557 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102514227 T/C 1 44 36 80 21.2651044072731 18.6012782122311 2.663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.577384480582501 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102514154_102514365:DYNC1H1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 225 205 430 108.742011173556 105.923945375205 2.81806579835073 A:G G A 10 0.516702172561975 0.809424942787642 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102675410 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102676082 G/A 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102676124 A/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 102808330 C/T 1 20 9 29 9.6659565487605 4.65031955305778 5.01563699570272 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0655983367438953 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102807660_102809044:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102807660_102809044:ZNF839 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 104000953 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000166166:ENST00000389749:exon_104000887_104003408:TRMT61A;ENSG00000166166:ENST00000299202:exon_104000887_104002352:TRMT61A;ENSG00000166166:ENST00000299201:exon_104000887_104001132:TRMT61A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 104199336 A/G 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 A:G A G 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 78 62 140 37.6972305401659 32.0355346988425 5.66169584132349 T:C T C 10 0.516702172561975 0.353156220417681 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 105181111 G/A 1 22 12 34 10.6325522036365 6.2004260707437 4.43212613289285 A:G G A 10 0.516702172561975 0.169058173029874 ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 105477973 C/T 1 16 16 32 7.7327652390084 8.2672347609916 -0.534469521983201 T:C C T 10 0.516702172561975 0.861671663830205 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 105517296 C/T 1 15 22 37 7.24946741157037 11.3674477963635 -4.11798038479308 T:C C T 10 0.516702172561975 0.190850720529080 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 105517745 C/T 1 6 13 19 2.89978696462815 6.71712824330568 -3.81734127867753 T:C C T 10 0.516702172561975 0.106867359802540 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 105517967 G/C 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 C:G G C 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000183484:ENST00000392585:exon_105515728_105518439:GPR132;ENSG00000183484:ENST00000329797:exon_105515739_105518439:GPR132 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 105964969 C/T 1 22 18 40 10.6325522036365 9.30063910611555 1.331913097521 T:C C T 10 0.516702172561975 0.752563259473963 ENSG00000185347:ENST00000329886:exon_105964954_105965516:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000432805:exon_105964954_105965033:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392527:exon_105964954_105965523:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392528:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000334656:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392523:exon_105964954_105965585:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392522:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000334643:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000354560:exon_105964954_105965546:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000450383:exon_105964954_105965283:C14orf80 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 106209340 T/C 0 324 1 325 156.58849608992 0.516702172561975 156.071793917358 A:T T A 10 0.516702172561975 2.03540759318764e-91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 106321663 T/C 1 68 279 347 32.8642522657857 144.159906144791 -111.295653879005 T:C T C 10 0.516702172561975 1.11837239076254e-34 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 106367047 C/A 0 0 34 34 0 17.5678738671072 -17.5678738671072 A C A 10 0.516702172561975 1.83360024122323e-11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 14 107170011 C/T 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 C C 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 8 14 22 3.8663826195042 7.23383041586765 -3.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.200185713790216 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 25207273 C/T 0 0 81 81 0 41.85287597752 -41.85287597752 A:T C T 10 0.516702172561975 2.63877446052176e-26 ENSG00000128739:ENST00000400098:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000444203:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400100:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400097:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000390687:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000214265:ENST00000401453:exon_25207261_25207356:SNURF;ENSG00000214265:ENST00000403911:exon_25207261_25207356:SNURF;ENSG00000214265:ENST00000338327:exon_25207261_25207356:SNURF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 32929643 A/C 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:C A C 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000198826:ENST00000361627:exon_32928458_32932150:ARHGAP11A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 35149048 G/A 1 24 27 51 11.5991478585126 13.9509586591733 -2.35181080066073 A:G G A 10 0.516702172561975 0.57589558509599 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 35159799 A/G 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G A G 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35159725_35159810:AQR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 35830665 C/T 1 3 9 12 1.44989348231407 4.65031955305778 -3.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0834942591884686 ENSG00000134146:ENST00000256538:exon_35830475_35830668:ATPBD4;ENSG00000134146:ENST00000440392:exon_35830475_35830668:ATPBD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 40226385 C/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:C C A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40226347_40226540:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40226347_40226540:EIF2AK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 40308859 G/T 1 3 9 12 1.44989348231407 4.65031955305778 -3.2004260707437 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0834942591884686 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40308703_40308873:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40308703_40308873:EIF2AK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 40318183 G/A 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40318178_40318290:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40318178_40318290:EIF2AK4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 87 103 190 42.0469109871082 53.2203237738834 -11.1734127867753 T:G T G 10 0.516702172561975 0.110430962166244 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 40488851 G/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 40854989 C/T 1 42 56 98 20.298508752397 28.9353216634706 -8.63681291107356 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0860804636776462 ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 42851600 T/C 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000137814:ENST00000260372:exon_42851537_42851606:HAUS2;ENSG00000137814:ENST00000391623:exon_42851537_42851606:HAUS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44046013 C/T 1 16 16 32 7.7327652390084 8.2672347609916 -0.534469521983201 T:C C T 10 0.516702172561975 0.861671663830205 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44087612 G/A 1 15 6 21 7.24946741157037 3.10021303537185 4.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.081820513544553 ENSG00000184716:ENST00000417761:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000319327:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000448553:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000457418:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000299969:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000412697:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000396823:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000249714:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000140264:ENST00000445816:exon_44086572_44088287:SERF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 35 26 61 16.9154239603309 13.4342564866114 3.48116747371952 T:C T C 10 0.516702172561975 0.442383499379473 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44093983 G/A 1 40 36 76 19.331913097521 18.6012782122311 0.730634885289899 A:G G A 10 0.516702172561975 0.908919843260506 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44105228 G/T 1 30 31 61 14.4989348231407 16.0177673494212 -1.51883252628048 T:G G T 10 0.516702172561975 0.703071096349278 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44105185_44105345:MFAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44673032 C/T 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000166734:ENST00000299957:exon_44673004_44673174:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000416522:exon_44673004_44673174:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000360824:exon_44673004_44673174:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000345795:exon_44673004_44673174:CASC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 44849698 G/A 1 40 37 77 19.331913097521 19.1179803847931 0.213932712727924 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104131:ENST00000261868:exon_44849687_44849848:EIF3J HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 45047402 A/G 1 17 6 23 8.21606306644642 3.10021303537185 5.11585003107457 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0369800264063616 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 45059440 C/T 1 46 47 93 22.2317000621491 24.2850021104128 -2.05330204826368 T:C C T 10 0.516702172561975 0.679564972575133 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45059429_45060025:TRIM69;ENSG00000185880:ENST00000338264:exon_45059429_45060023:TRIM69 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 45661678 T/A 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:T T A 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000171766:ENST00000396659:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000305575:exon_45661524_45661719:GATM;ENSG00000171766:ENST00000432007:exon_45661524_45661719:GATM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 45724285 A/G 1 12 1 13 5.7995739292563 0.516702172561975 5.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00363176502686701 ENSG00000166920:ENST00000396650:exon_45724270_45724330:C15orf48;ENSG00000166920:ENST00000344300:exon_45724270_45724330:C15orf48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 49030665 T/C 1 3 11 14 1.44989348231407 5.68372389818173 -4.23383041586765 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0304842736699090 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49030136_49031485:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49030136_49031485:CEP152 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 49048128 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000103995:ENST00000399334:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000380950:exon_49048100_49048750:CEP152;ENSG00000103995:ENST00000325747:exon_49048100_49048750:CEP152 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 T:C T C 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 52258070 A/T 1 15 16 31 7.24946741157037 8.2672347609916 -1.01776734942123 A:T A T 10 0.516702172561975 0.723612516546729 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52257946_52258701:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52257946_52258701:LEO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 55489065 G/A 1 25 43 68 12.0824456859506 22.2181934201649 -10.1357477342143 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0150552096361684 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 55489104 A/G 1 11 22 33 5.31627610181827 11.3674477963635 -6.05117169454518 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0373971155262104 ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 37 17 54 17.8820196152069 8.78393693355358 9.09808268165335 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0140263874848363 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 32 30 62 15.4655304780168 15.5010651768593 -0.0355346988424525 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 55664220 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55663991_55664242:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55663991_55664264:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55663991_55664242:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000425574:exon_55663991_55664242:CCPG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 56924103 C/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000137871:ENST00000267807:exon_56922379_56924320:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000455329:exon_56922379_56924320:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396250:exon_56922379_56924320:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000260435:exon_56922379_56924320:ZNF280D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 59179667 G/A 1 73 77 150 35.2807414029758 39.7860672872721 -4.50532588429625 A:G G A 10 0.516702172561975 0.463674920145292 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59179425_59179739:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59179425_59179739:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59179425_59179739:SLTM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 20 15 35 9.6659565487605 7.75053258842963 1.91542396033087 T:G T G 10 0.516702172561975 0.612752742841213 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 63882944 C/T 1 17 25 42 8.21606306644642 12.9175543140494 -4.70149124760295 T:C C T 10 0.516702172561975 0.165634916238393 ENSG00000140455:ENST00000380324:exon_63882860_63883659:USP3;ENSG00000140455:ENST00000268049:exon_63882860_63883643:USP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 64418397 G/A 1 14 17 31 6.76616958413235 8.78393693355358 -2.01776734942123 A:G G A 10 0.516702172561975 0.479021533266739 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64418278_64418419:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64418278_64418419:SNX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 64428564 C/T 1 14 18 32 6.76616958413235 9.30063910611555 -2.5344695219832 T:C C T 10 0.516702172561975 0.382851938905623 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64428529_64428609:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64428529_64428609:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64428529_64428609:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64428529_64428609:SNX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 65114484 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 65443209 T/A 1 20 25 45 9.6659565487605 12.9175543140494 -3.25159776528888 A:T T A 10 0.516702172561975 0.372202004233779 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65440557_65443251:CLPX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 72637795 T/C 1 66 83 149 31.8976566109096 42.8862803226439 -10.9886237117343 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0848437193125427 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72637787_72637891:HEXA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 72638892 T/C 1 43 37 80 20.7818065798351 19.1179803847931 1.663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.738190619039071 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72638868_72639051:HEXA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 74276228 A/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000067221:ENST00000316900:exon_74275547_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000359750:exon_74275561_74276471:STOML1;ENSG00000067221:ENST00000316911:exon_74275561_74276471:STOML1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 42 40 82 20.298508752397 20.668086902479 -0.369578150081953 T:C:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 74328206 G/C 1 47 48 95 22.7149978895872 24.8017042829748 -2.08670639338763 C:G G C 10 0.516702172561975 0.682567519937106 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 74963892 C/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000179151:ENST00000315127:exon_74963796_74964115:EDC3;ENSG00000179151:ENST00000426797:exon_74963796_74964115:EDC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 75093389 C/T 1 160 111 271 77.327652390084 57.3539411543792 19.9737112357048 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0176061714768776 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 75130093 T/C 1 21 3 24 10.1492543761985 1.55010651768593 8.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.000326216493813 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75130092_75130139:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75130092_75130139:ULK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 75131661 A/G 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G A G 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000140474:ENST00000440863:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000418051:exon_75131609_75131714:ULK3;ENSG00000140474:ENST00000268074:exon_75131609_75131714:ULK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 A:G G A 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 75932129 G/T 1 46 41 87 22.2317000621491 21.184789075041 1.04691098710817 T:G G T 10 0.516702172561975 0.831118932858108 ENSG00000177971:ENST00000314852:exon_75931426_75932609:IMP3;ENSG00000177971:ENST00000403490:exon_75931690_75932552:IMP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 76523620 C/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:C C A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 78834533 C/T 1 50 56 106 24.1648913719012 28.9353216634706 -4.77043029156935 T:C C T 10 0.516702172561975 0.382280089433397 ENSG00000041357:ENST00000417370:exon_78834519_78834561:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000413382:exon_78834519_78834561:PSMA4;ENSG00000041357:ENST00000044462:exon_78834519_78834561:PSMA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 80181459 C/G 1 24 20 44 11.5991478585126 10.3340434512395 1.2651044072731 C:G C G 10 0.516702172561975 0.763954150963064 ENSG00000136371:ENST00000258874:exon_80181435_80181696:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000479961:exon_80181435_80181696:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000494999:exon_80181435_80181696:MTHFS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 13 45 58 6.28287175669432 23.2515977652889 -16.9687260085946 T:C T C 10 0.516702172561975 8.22820181231154e-06 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 65 66 131 31.4143587834716 34.1023433890904 -2.68798460561873 A:C A C 10 0.516702172561975 0.662629239649817 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 80415048 A/G 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G A G 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000086666:ENST00000261749:exon_80415042_80415142:ZFAND6;ENSG00000086666:ENST00000396790:exon_80415042_80415142:ZFAND6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 81592384 C/T 1 12 25 37 5.7995739292563 12.9175543140494 -7.11798038479308 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0211130608671727 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 81593757 C/T 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 T:C C T 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81593685_81593853:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81593685_81593853:IL16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 205 161 366 99.0760546247951 83.189049782478 15.8870048423171 A:G A G 10 0.516702172561975 0.104848941867456 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 89195526 A/G 1 149 159 308 72.0113762882657 82.155645437354 -10.1442691490883 A:G A G 10 0.516702172561975 0.254516635374009 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 89836228 G/C 1 13 5 18 6.28287175669432 2.58351086280988 3.69936089388445 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0995712690058681 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89836173_89836294:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89836173_89836294:FANCI HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 89862296 G/A 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89862162_89862330:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89862162_89862330:POLG;ENSG00000140521:ENST00000530292:exon_89862162_89862330:POLG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 89864158 G/A 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000140521:ENST00000268124:exon_89863997_89864243:POLG;ENSG00000140521:ENST00000442287:exon_89863997_89864243:POLG;ENSG00000140521:ENST00000528881:exon_89864051_89864243:POLG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 90328551 G/C 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000166825:ENST00000300060:exon_90328120_90328732:ANPEP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 90623052 T/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 90771385 T/A 1 13 17 30 6.28287175669432 8.78393693355358 -2.50106517685925 A:T T A 10 0.516702172561975 0.368796400932296 ENSG00000185033:ENST00000332496:exon_90771136_90772892:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000379122:exon_90771141_90771496:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000437083:exon_90771136_90772890:SEMA4B;ENSG00000185033:ENST00000411539:exon_90771136_90772892:SEMA4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 91354521 G/A 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 91525093 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 91543131 T/A 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:T T A 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000184056:ENST00000333371:exon_91543130_91543205:VPS33B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 17 14 31 8.21606306644642 7.23383041586765 0.982232650578773 A:C A C 10 0.516702172561975 0.85777700870536 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 101112208 G/A 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101112099_101112270:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101112099_101112270:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101112099_101112270:LINS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 15 101718097 C/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 C:G C G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 107162 C/G 1 77 108 185 37.2139327127279 55.8038346366933 -18.5899019239654 C:G C G 10 0.516702172561975 0.00644676146274306 ENSG00000161981:ENST00000293861:exon_107086_107669:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000383018:exon_107086_107668:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000397876:exon_107086_107372:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000466183:exon_107086_107444:SNRNP25;ENSG00000161981:ENST00000481947:exon_107086_107453:SNRNP25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 129654 C/T 1 42 39 81 20.298508752397 20.151384729917 0.147124022480021 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 139784 G/C 1 9 18 27 4.34968044694222 9.30063910611555 -4.95095865917333 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0812165378882992 ENSG00000103148:ENST00000463178:exon_138697_141084:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_139711_139900:NPRL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 249154 A/C 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:C A C 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000419516:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397780:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000495349:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000418978:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000430864:exon_249061_249237:LUC7L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 83 85 168 40.1137196773561 43.9196846677679 -3.8059649904118 A:G A G 10 0.516702172561975 0.589219722664805 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 426184 G/A 1 16 6 22 7.7327652390084 3.10021303537185 4.63255220363655 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0553424742719923 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 426432 T/C 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 T:C T C 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_426136_426455:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000475348:exon_426136_426475:TMEM8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 427479 T/C 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C T C 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 427516 T/C 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:C T C 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000427313:exon_427378_427585:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427378_427585:TMEM8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 427784 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_427671_427805:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_427671_427807:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 427820 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_427671_427848:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000476735:exon_427671_427848:TMEM8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 1 35 52 87 16.9154239603309 26.8685129732227 -9.95308901289183 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0409264704440411 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 55 147 202 26.5813805090914 75.9552193666103 -49.373838857519 T:C C T 10 0.516702172561975 2.02352013634870e-12 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 603471 A/G 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_603339_604636:SOLH;ENSG00000103326:ENST00000397687:exon_603339_604634:SOLH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 633125 T/C 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:C T C 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 16 13 29 7.7327652390084 6.71712824330568 1.01563699570272 T:C T C 10 0.516702172561975 0.853025168370478 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 16 13 29 7.7327652390084 6.71712824330568 1.01563699570272 A:G G A 10 0.516702172561975 0.853025168370478 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 718514 C/G 1 20 7 27 9.6659565487605 3.61691520793383 6.04904134082667 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0209403464222441 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_718488_718569:RHOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 720683 C/T 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 T:C C T 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720675_720773:RHOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 721186 G/A 1 11 19 30 5.31627610181827 9.81734127867753 -4.50106517685925 A:G G A 10 0.516702172561975 0.104214559707980 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_721083_721203:RHOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 722331 C/T 1 20 11 31 9.6659565487605 5.68372389818173 3.98223265057877 T:C C T 10 0.516702172561975 0.207752318020916 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 722997 G/A 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 A:G G A 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722928_723130:RHOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 772401 G/T 1 16 11 27 7.7327652390084 5.68372389818173 2.04904134082667 T:G G T 10 0.516702172561975 0.448966948977557 ENSG00000103254:ENST00000219535:exon_772309_772590:FAM173A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 774692 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000162004:ENST00000463539:exon_774322_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000485091:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000293889:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000482878:exon_772582_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000478979:exon_772583_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000345165:exon_774681_774806:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000479742:exon_774322_775293:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000481804:exon_774106_775880:CCDC78;ENSG00000162004:ENST00000466708:exon_774322_774806:CCDC78 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 780339 A/G 1 16 27 43 7.7327652390084 13.9509586591733 -6.21819342016493 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0668749303658943 ENSG00000103245:ENST00000251588:exon_779753_780655:NARFL;ENSG00000103245:ENST00000301694:exon_779771_780655:NARFL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 836081 C/A 1 15 7 22 7.24946741157037 3.61691520793383 3.63255220363655 A:C C A 10 0.516702172561975 0.138559169128612 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 836111 G/T 1 8 15 23 3.8663826195042 7.75053258842963 -3.88414996892543 T:G G T 10 0.516702172561975 0.142982545571929 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 836149 A/G 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 A:G A G 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_834974_836377:RPUSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 837170 G/A 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000007376:ENST00000007264:exon_837077_837179:RPUSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 845819 A/G 1 8 16 24 3.8663826195042 8.2672347609916 -4.4008521414874 A:G A G 10 0.516702172561975 0.100548574689849 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 846720 C/T 1 45 17 62 21.7484022347111 8.78393693355358 12.9644653011575 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00088818225422696 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_846717_846758:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_846615_846861:CHTF18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1400228 T/C 1 62 64 126 29.9644653011575 33.0689390439664 -3.10447374280885 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.593795551937717 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1400059_1400235:C16orf42 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1412633 A/T 1 28 41 69 13.5323391682647 21.184789075041 -7.65244990677628 A:T A T 10 0.516702172561975 0.0710201616346532 ENSG00000090581:ENST00000204679:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000529957:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000527168:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000527076:exon_1412207_1412743:GNPTG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1555589 A/G 0 0 25 25 0 12.9175543140494 -12.9175543140494 G A G 10 0.516702172561975 1.27459165761548e-08 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1555411_1555602:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1555411_1555602:TELO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 22 9 31 10.6325522036365 4.65031955305778 5.98223265057877 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0462841452867747 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 77 98 175 37.2139327127279 50.6368129110736 -13.4228801983456 A:T T A 10 0.516702172561975 0.0489452225637054 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1828282 G/A 1 22 12 34 10.6325522036365 6.2004260707437 4.43212613289285 A:G G A 10 0.516702172561975 0.169058173029874 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1828135_1828322:SPSB3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1838691 C/T 1 39 40 79 18.848615270083 20.668086902479 -1.81947163239603 T:C C T 10 0.516702172561975 0.735992285811028 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1838570_1839192:NUBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1859374 C/T 1 26 26 52 12.5657435133886 13.4342564866114 -0.868512973222703 T:C C T 10 0.516702172561975 0.88987681601677 ENSG00000063854:ENST00000397356:exon_1859104_1859383:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000397353:exon_1859104_1859383:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000262303:exon_1859108_1859383:HAGH;ENSG00000063854:ENST00000455446:exon_1859108_1859383:HAGH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 12 18 30 5.7995739292563 9.30063910611555 -3.50106517685925 T:C T C 10 0.516702172561975 0.207473070431477 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2025206 A/C 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:C A C 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2025188_2025263:TBL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2027516 G/A 1 44 34 78 21.2651044072731 17.5678738671072 3.69723054016595 A:G G A 10 0.516702172561975 0.429124690787897 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2027515_2027671:TBL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 46 63 109 22.2317000621491 32.5522368714044 -10.3205368092553 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0549223686496629 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2049003 A/T 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:T A T 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2048966_2049122:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2048966_2049122:ZNF598 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2049831 G/C 0 20 0 20 9.6659565487605 0 9.6659565487605 G G 10 0.516702172561975 2.32333796454416e-06 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2050221 T/C 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2094757 T/G 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:G T G 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000065057:ENST00000219066:exon_2094631_2094801:NTHL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2129192 G/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 C:G G C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2129036_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000483020:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000471143:exon_2129036_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2128240_2129197:TSC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2129607 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2129558_2129670:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2129558_2129670:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2129558_2129670:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2129558_2129670:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2129558_2129670:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2129558_2129670:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000471143:exon_2129558_2129624:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2129558_2129670:TSC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2138071 C/T 1 17 11 28 8.21606306644642 5.68372389818173 2.5323391682647 T:C C T 10 0.516702172561975 0.3524780056209 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138049_2138140:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138049_2138140:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138049_2138140:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138049_2138140:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138049_2138140:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138049_2138140:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138049_2138140:TSC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2257105 C/G 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 C:G C G 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2499297 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000162063:ENST00000293968:exon_2499283_2499463:CCNF;ENSG00000162063:ENST00000397066:exon_2499283_2499463:CCNF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2580546 A/C 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 A:C A C 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000413459:exon_2580258_2580760:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2880232 T/A 1 2 12 14 0.96659565487605 6.2004260707437 -5.23383041586765 A:T T A 10 0.516702172561975 0.00591395177061578 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880170_2880329:ZG16B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2880482 A/T 1 3 17 20 1.44989348231407 8.78393693355358 -7.3340434512395 A:T:C A T 10 0.516702172561975 0.00113131565732338 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880416_2880494:ZG16B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2882156 G/A 1 13 51 64 6.28287175669432 26.3518108006607 -20.0689390439664 A:G G A 10 0.516702172561975 4.50685807632278e-07 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 62 19 81 29.9644653011575 9.81734127867753 20.14712402248 T:G G T 10 0.516702172561975 5.7986825908071e-06 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2983483 C/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 C:G C G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2983131_2983583:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2983131_2983583:FLYWCH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 2998732 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000059122:ENST00000416288:exon_2998689_3001208:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000253928:exon_2998689_3001208:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000399667:exon_2998689_3001208:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000344592:exon_2998689_3001208:FLYWCH1;ENSG00000059122:ENST00000445831:exon_2998689_3001208:FLYWCH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3025376 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3025320_3025813:PKMYT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3025552 G/A 1 18 11 29 8.69936089388445 5.68372389818173 3.01563699570272 A:G G A 10 0.516702172561975 0.272663820448322 ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3025320_3025813:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3025320_3025813:PKMYT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3119344 A/C 0 0 1963 1963 0 1014.28636473916 -1014.28636473916 C A C 10 0.516702172561975 0 ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382210:exon_3119282_3119356:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3119282_3119376:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3118991_3119377:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529699:exon_3118991_3119356:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529550:exon_3118991_3119369:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3118991_3119441:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3118991_3119553:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3118991_3119541:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3118991_3119549:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3118991_3119820:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3118991_3119384:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525003:exon_3118991_3119412:IL32 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3119367 A/G 1 4 1897 1901 1.9331913097521 980.184021350067 -978.250830040315 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0 ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3119282_3119376:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3118991_3119377:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529550:exon_3118991_3119369:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3118991_3119441:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3118991_3119553:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3118991_3119541:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3118991_3119549:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3118991_3119820:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3118991_3119384:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525003:exon_3118991_3119412:IL32 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3433014 A/G 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3432483_3433711:ZNF434 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3433146 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3432483_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000439568:exon_3433056_3433332:ZNF434 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3452301 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000103343:ENST00000344823:exon_3451190_3452406:ZNF174;ENSG00000103343:ENST00000268655:exon_3451420_3452406:ZNF174 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3708137 C/T 1 51 31 82 24.6481891993393 16.0177673494212 8.63042184991805 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0605120511109151 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708038_3708231:TRAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 28 28 56 13.5323391682647 14.4676608317353 -0.935321663470603 C:G G C 10 0.516702172561975 0.893802027564854 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 3779609 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 4511988 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 4659825 C/T 0 21 0 21 10.1492543761985 0 10.1492543761985 C C 10 0.516702172561975 1.18432647739827e-06 ENSG00000153443:ENST00000283474:exon_4658885_4659984:FAM100A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 4745051 T/C 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 T:C T C 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000168101:ENST00000304301:exon_4744959_4745860:NUDT16L1;ENSG00000168101:ENST00000405142:exon_4743979_4745856:NUDT16L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 4748033 C/G 1 9 12 21 4.34968044694222 6.2004260707437 -1.85074562380148 C:G C G 10 0.516702172561975 0.514228237115183 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 4748825 C/T 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4748801_4748942:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4748801_4748942:ANKS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 4930100 C/T 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4930084_4932361:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4930084_4932361:UBN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 5123201 A/C 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:C A C 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5123154_5123257:ALG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 5128001 C/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8722642 A/G 1 12 3 15 5.7995739292563 1.55010651768593 4.24946741157037 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0366469998551520 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8722732 T/C 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8722587_8722967:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8722587_8722967:C16orf68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8736028 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8735984_8736064:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8735984_8736064:C16orf68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8738499 G/A 1 11 2 13 5.31627610181827 1.03340434512395 4.28287175669433 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0233985038423332 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8738579 A/G 0 12 0 12 5.7995739292563 0 5.7995739292563 A A 10 0.516702172561975 0.00052454284076193 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8740015 A/C 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:C A C 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8739965_8740079:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8739965_8740072:C16orf68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 18 12 30 8.69936089388445 6.2004260707437 2.49893482314075 C:G C G 10 0.516702172561975 0.465598635369486 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 10574796 C/T 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 10574813 G/A 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11000848 G/C 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 C:G G C 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11114174 A/G 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000494853:exon_11114050_11114182:CLEC16A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11118702 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11118678_11118778:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11118678_11118778:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000494853:exon_11118678_11118776:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000463896:exon_11118678_11118778:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000476025:exon_11118678_11118778:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000465491:exon_11118678_11118778:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000487189:exon_11118675_11118778:CLEC16A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11769948 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 10 15 25 4.83297827438025 7.75053258842963 -2.91755431404938 A:C A C 10 0.516702172561975 0.317309137874082 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 11855825 G/A 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.171565918300221 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11855766_11855899:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11855766_11855899:ZC3H7A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 12060163 A/G 1 60 64 124 28.9978696462815 33.0689390439664 -4.07106939768491 A:G A G 10 0.516702172561975 0.473622627927957 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12060052_12060198:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12060052_12060198:TNFRSF17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 12061515 G/A 1 117 101 218 56.5458458102489 52.1869194287595 4.35892638148944 A:G G A 10 0.516702172561975 0.587912858735094 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 165 167 332 79.7441415272741 86.2892628178498 -6.54512129057571 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.475881112540517 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 12371875 C/T 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12371790_12371893:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12371790_12371893:SNX29 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15116625 G/T 1 1 13 14 0.483297827438025 6.71712824330568 -6.23383041586765 T:G G T 10 0.516702172561975 0.000702373685359869 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15127200 G/T 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 T:G G T 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15127135_15127256:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15127135_15127256:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15127135_15127256:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15127135_15127256:PDXDC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15129970 A/G 1 10 20 30 4.83297827438025 10.3340434512395 -5.50106517685925 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0659201910521876 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15129873_15131550:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15129873_15131543:PDXDC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15131962 A/G 1 31 19 50 14.9822326505788 9.81734127867753 5.16489137190125 A:G A G 10 0.516702172561975 0.158316562455558 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15131974 G/T 1 31 17 48 14.9822326505788 8.78393693355358 6.1982957170252 T:C:G G T 10 0.516702172561975 0.083193665071329 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15131710_15132067:NTAN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15133889 T/G 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 T:G T G 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000157045:ENST00000287706:exon_15133826_15133923:NTAN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 15793615 C/T 1 22 40 62 10.6325522036365 20.668086902479 -10.0355346988425 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0110542033773135 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 16208683 G/C 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 C:G G C 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16208623_16208933:ABCC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 21172472 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000011638:ENST00000233047:exon_21172406_21172599:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000261388:exon_21172299_21172599:TMEM159;ENSG00000011638:ENST00000451578:exon_21172299_21172599:TMEM159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 37 51 88 17.8820196152069 26.3518108006607 -8.4697911854538 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0873320741603592 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 22337476 C/T 1 23 19 42 11.1158500310746 9.81734127867753 1.29850875239705 T:C C T 10 0.516702172561975 0.75844748833743 ENSG00000058600:ENST00000299853:exon_22337082_22337599:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000359210:exon_22337082_22337599:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000431699:exon_22337082_22337698:POLR3E;ENSG00000058600:ENST00000418581:exon_22337082_22337599:POLR3E HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 12 13 25 5.7995739292563 6.71712824330568 -0.917554314049377 A:G A G 10 0.516702172561975 0.841973379793163 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 23436179 G/A 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23436070_23436268:COG7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 23535680 A/C 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:C A C 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000103356:ENST00000449606:exon_23533335_23535775:EARS2;ENSG00000103356:ENST00000341597:exon_23534832_23535775:EARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 23607504 G/C 1 32 21 53 15.4655304780168 10.8507456238015 4.61478485421532 C:G G C 10 0.516702172561975 0.218425121915323 ENSG00000004779:ENST00000007516:exon_23607444_23607677:NDUFAB1;ENSG00000004779:ENST00000484769:exon_23607444_23607624:NDUFAB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 24231449 C/T 1 45 36 81 21.7484022347111 18.6012782122311 3.14712402248002 T:C C T 10 0.516702172561975 0.506406308863074 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24231282_24231932:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 87 82 169 42.0469109871082 42.369578150082 -0.322667162973787 A:C:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 25175990 A/G 1 8 13 21 3.8663826195042 6.71712824330568 -2.85074562380148 A:G A G 10 0.516702172561975 0.275577945999374 ENSG00000205629:ENST00000380966:exon_25175919_25176039:LCMT1;ENSG00000205629:ENST00000399069:exon_25175919_25176039:LCMT1;ENSG00000205629:ENST00000380963:exon_25175919_25176039:LCMT1;ENSG00000205629:ENST00000380962:exon_25175919_25176039:LCMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 27237088 C/T 1 59 58 117 28.5145718188435 29.9687260085946 -1.45415418975108 T:C C T 10 0.516702172561975 0.85332916280382 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27237047_27237167:NSMCE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 27374400 A/G 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 27375157 T/C 1 12 18 30 5.7995739292563 9.30063910611555 -3.50106517685925 T:C T C 10 0.516702172561975 0.207473070431477 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 27441410 C/T 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27441377_27441441:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27441377_27441441:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27441377_27441441:IL21R HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 T:C C T 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 27474910 A/G 1 12 13 25 5.7995739292563 6.71712824330568 -0.917554314049377 A:G A G 10 0.516702172561975 0.841973379793163 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27474862_27474913:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27474862_27474913:GTF3C1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:T T A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 20 32 52 9.6659565487605 16.5344695219832 -6.8685129732227 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0704268543691718 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G A G 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28844448 C/A 1 29 30 59 14.0156369957027 15.5010651768593 -1.48542818115653 A:C C A 10 0.516702172561975 0.698710987469276 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28845448 G/A 1 34 27 61 16.4321261328928 13.9509586591733 2.48116747371952 A:G G A 10 0.516702172561975 0.608732024754641 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28846840 T/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:G T G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28846866 G/A 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.181883103647470 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28847246 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28854272 G/A 1 233 278 511 112.60839379306 143.643203972229 -31.0348101791692 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00605857294110783 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28853732_28854469:TUFM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28857282 G/A 1 56 44 100 27.0646783365294 22.7348955927269 4.3297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.423905691510283 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28857233_28857427:TUFM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G A G 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 28997038 C/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 C:G C G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000213658:ENST00000395461:exon_28997034_28997061:LAT;ENSG00000213658:ENST00000354453:exon_28997034_28997061:LAT;ENSG00000213658:ENST00000454369:exon_28997034_28997061:LAT;ENSG00000213658:ENST00000395456:exon_28997034_28997061:LAT;ENSG00000213658:ENST00000360872:exon_28997034_28997061:LAT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 71 65 136 34.3141457480998 33.5856412165284 0.728504531571396 T:C C T 10 0.516702172561975 0.93175229745077 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 29755576 A/G 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 A:G A G 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000185905:ENST00000329410:exon_29753784_29756272:C16orf54 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30002604 T/C 1 14 9 23 6.76616958413235 4.65031955305778 2.11585003107457 T:C T C 10 0.516702172561975 0.410933125671882 ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_30002368_30003582:TAOK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30078907 A/G 1 1417 1497 2914 684.833021479681 773.503152325277 -88.6701308455953 A:T:C:G A G 10 0.516702172561975 0.00103316076355604 ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30078771_30078982:ALDOA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30081367 G/T 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 T:G G T 10 0.516702172561975 0.508249950238173 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30495496 C/T 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000005844:ENST00000358164:exon_30495434_30495584:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000356798:exon_30495434_30495584:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000315171:exon_30495434_30495584:ITGAL;ENSG00000005844:ENST00000454514:exon_30495434_30495584:ITGAL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30536672 A/G 1 27 30 57 13.0490413408267 15.5010651768593 -2.45202383603258 A:G A G 10 0.516702172561975 0.596447752248135 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30594521 A/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:C A C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000197162:ENST00000470110:exon_30593832_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000321694:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000443190:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395222:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395216:exon_30591977_30594764:ZNF785 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30594744 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000197162:ENST00000470110:exon_30593832_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000321694:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000443190:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395222:exon_30593674_30594764:ZNF785;ENSG00000197162:ENST00000395216:exon_30591977_30594764:ZNF785 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30665621 T/C 1 18 12 30 8.69936089388445 6.2004260707437 2.49893482314075 T:C T C 10 0.516702172561975 0.465598635369486 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665551_30665660:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665551_30665660:PRR14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 30735348 C/G 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:C:G C G 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000080603:ENST00000262518:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000395059:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000344771:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000437252:exon_30734905_30736478:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000380361:exon_30734905_30736403:SRCAP;ENSG00000080603:ENST00000483083:exon_30734905_30736689:SRCAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 31049306 C/G 1 38 43 81 18.3653174426449 22.2181934201649 -3.85287597751998 C:G C G 10 0.516702172561975 0.436837748389291 ENSG00000103496:ENST00000493902:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000394998:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000313843:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000454874:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000487411:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000460668:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000496977:exon_31049247_31049355:STX4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 31121793 G/A 1 28 12 40 13.5323391682647 6.2004260707437 7.331913097521 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0256981861521122 ENSG00000103507:ENST00000394951:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000219794:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394950:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000287507:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000394952:exon_31121722_31121820:BCKDK;ENSG00000103507:ENST00000441132:exon_31121722_31121801:BCKDK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 31141444 G/A 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000103510:ENST00000219797:exon_31141338_31141478:MYST1;ENSG00000103510:ENST00000448516:exon_31141338_31141478:MYST1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 31477460 G/A 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 31488916 C/G 1 30 13 43 14.4989348231407 6.71712824330568 7.78180657983507 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0212424469526162 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31488631_31489281:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31488631_31489279:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31488631_31489281:TGFB1I1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 48385533 G/A 1 21 23 44 10.1492543761985 11.8841499689254 -1.7348955927269 A:G G A 10 0.516702172561975 0.652310811044673 ENSG00000102910:ENST00000285737:exon_48385492_48389415:LONP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 48396190 C/T 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C C T 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000196470:ENST00000356721:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000394725:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000380006:exon_48394442_48397793:SIAH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 50707782 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 53262907 C/T 1 17 14 31 8.21606306644642 7.23383041586765 0.982232650578773 T:C C T 10 0.516702172561975 0.85777700870536 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 56501844 C/G 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 C:G C G 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000087263:ENST00000336111:exon_56501817_56501930:OGFOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 56873495 C/T 1 16 8 24 7.7327652390084 4.1336173804958 3.5991478585126 T:C C T 10 0.516702172561975 0.157059041871443 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56873433_56873516:NUP93 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 56970592 T/G 1 8 16 24 3.8663826195042 8.2672347609916 -4.4008521414874 T:G T G 10 0.516702172561975 0.100548574689849 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 57060724 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57059280_57060930:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57059280_57060930:NLRC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 57101340 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57101299_57101382:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57101299_57101382:NLRC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 2 10 12 0.96659565487605 5.16702172561975 -4.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0189238412479094 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 57188397 G/A 1 34 52 86 16.4321261328928 26.8685129732227 -10.4363868403299 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0303586605869724 ENSG00000172775:ENST00000309137:exon_57186387_57188419:FAM192A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 57552088 T/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 58550484 G/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000418480:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58550382_58550576:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000467320:exon_58550036_58550576:SETD6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 58575489 G/A 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.171565918300221 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58575405_58575524:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58575405_58575524:CNOT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 58579274 C/T 1 15 8 23 7.24946741157037 4.1336173804958 3.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.215894266846356 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58579265_58579395:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58579265_58579395:CNOT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 58757683 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67210855 G/C 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 C:G G C 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000196123:ENST00000440525:exon_67209507_67210878:KIAA0895L;ENSG00000196123:ENST00000290881:exon_67209509_67210878:KIAA0895L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67262775 C/T 1 87 52 139 42.0469109871082 26.8685129732227 15.1783980138855 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0107383923005353 ENSG00000168701:ENST00000304800:exon_67262700_67262784:TMEM208;ENSG00000168701:ENST00000404299:exon_67262741_67262784:TMEM208 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67264629 C/T 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 T:C C T 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67264504_67264694:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67264504_67264694:FHOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67265360 C/A 1 27 23 50 13.0490413408267 11.8841499689254 1.16489137190125 A:C C A 10 0.516702172561975 0.778573693488037 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265333_67265452:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265333_67265452:FHOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67268089 C/T 1 17 7 24 8.21606306644642 3.61691520793383 4.5991478585126 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0674411545830007 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67578257 C/T 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.171565918300221 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67685832 G/A 1 11 22 33 5.31627610181827 11.3674477963635 -6.05117169454518 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0373971155262104 ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67685824_67685911:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67685824_67685911:RLTPR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67696365 G/A 1 15 16 31 7.24946741157037 8.2672347609916 -1.01776734942123 A:G G A 10 0.516702172561975 0.723612516546729 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67697351 C/T 1 21 12 33 10.1492543761985 6.2004260707437 3.94882830545482 T:C C T 10 0.516702172561975 0.222321734051643 ENSG00000124074:ENST00000243878:exon_67697323_67697459:C16orf48;ENSG00000124074:ENST00000414445:exon_67697323_67697459:C16orf48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67862100 G/A 1 45 51 96 21.7484022347111 26.3518108006607 -4.6034085659496 A:G G A 10 0.516702172561975 0.359603364655377 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67862064_67862293:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67862064_67862293:CENPT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67865957 G/A 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:G G A 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000436104:exon_67865915_67866011:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000445712:exon_67865915_67866011:CENPT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67913396 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67913315_67913406:EDC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67914521 C/T 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67914460_67914893:EDC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 138 118 256 66.6951001864474 60.9708563623131 5.72424382413439 A:G A G 10 0.516702172561975 0.491884422143018 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 68055496 G/A 1 18 26 44 8.69936089388445 13.4342564866114 -4.7348955927269 A:G G A 10 0.516702172561975 0.175239067814171 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 68055759 G/A 1 19 21 40 9.18265872132247 10.8507456238015 -1.668086902479 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63729998462501 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 10 14 24 4.83297827438025 7.23383041586765 -2.4008521414874 T:C C T 10 0.516702172561975 0.414865474205065 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 69356612 C/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 C:G C G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 69402305 C/T 1 6 13 19 2.89978696462815 6.71712824330568 -3.81734127867753 T:C C T 10 0.516702172561975 0.106867359802540 ENSG00000132604:ENST00000254942:exon_69402279_69402385:TERF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 69786207 T/A 1 26 23 49 12.5657435133886 11.8841499689254 0.681593544463222 A:T T A 10 0.516702172561975 0.88704201457175 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69786144_69786274:NOB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 69970329 A/G 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G A G 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000198373:ENST00000359154:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000448661:exon_69970215_69970355:WWP2;ENSG00000198373:ENST00000356003:exon_69970215_69970355:WWP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 70285102 T/G 1 20 12 32 9.6659565487605 6.2004260707437 3.4655304780168 T:G T G 10 0.516702172561975 0.288521126891484 ENSG00000223496:ENST00000435634:exon_70284134_70285833:EXOSC6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 70303580 G/A 1 28 26 54 13.5323391682647 13.4342564866114 0.0980826816533469 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70303521_70303666:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70303521_70303666:AARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 70731101 C/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000103043:ENST00000261776:exon_70731042_70731160:VAC14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 71482980 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167377:ENST00000393539:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000497160:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000357254:exon_71481500_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000417828:exon_71481513_71483785:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000428724:exon_71481513_71483788:ZNF23;ENSG00000167377:ENST00000358700:exon_71482766_71483327:ZNF23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 72120521 A/G 1 7 14 21 3.38308479206617 7.23383041586765 -3.85074562380148 A:G A G 10 0.516702172561975 0.125191054243280 ENSG00000140830:ENST00000268483:exon_72118752_72120701:TXNL4B;ENSG00000140830:ENST00000426362:exon_72118758_72120701:TXNL4B;ENSG00000140830:ENST00000423037:exon_72118758_72120701:TXNL4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 74908146 G/A 1 20 14 34 9.6659565487605 7.23383041586765 2.43212613289285 A:G G A 10 0.516702172561975 0.493246817938414 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74907474_74908342:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74907474_74908342:WDR59 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 74908245 C/T 1 6 12 18 2.89978696462815 6.2004260707437 -3.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.156942134254247 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_74907474_74908342:WDR59;ENSG00000103091:ENST00000205064:exon_74907474_74908342:WDR59 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 75018874 G/A 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_75018862_75019017:WDR59 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 75661803 G/C 1 46 52 98 22.2317000621491 26.8685129732227 -4.63681291107356 C:G G C 10 0.516702172561975 0.364287386240989 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75661628_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75661628_75661891:KARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 77232182 A/G 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77232005_77236302:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77232005_77232686:MON1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 81009999 G/A 1 134 118 252 64.7619088766953 60.9708563623131 3.79105251438229 A:G G A 10 0.516702172561975 0.659277613252232 ENSG00000103121:ENST00000219400:exon_81009699_81010076:C16orf61;ENSG00000103121:ENST00000486645:exon_81009699_81010076:C16orf61 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 81819768 T/C 1 24 17 41 11.5991478585126 8.78393693355358 2.81521092495902 A:T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.435889184910351 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81819548_81819787:PLCG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 32 23 55 15.4655304780168 11.8841499689254 3.58138050909137 T:C C T 10 0.516702172561975 0.348289230478585 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 82182316 C/T 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 83948890 C/T 1 2 8 10 0.96659565487605 4.1336173804958 -3.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0579335952414094 ENSG00000103150:ENST00000262430:exon_83948561_83949785:MLYCD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 23 20 43 11.1158500310746 10.3340434512395 0.781806579835074 T:C C T 10 0.516702172561975 0.879264719759571 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 84212853 G/C 1 34 18 52 16.4321261328928 9.30063910611555 7.1314870267773 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0522284734078161 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 84808827 T/C 1 20 30 50 9.6659565487605 15.5010651768593 -5.83510862809875 T:C T C 10 0.516702172561975 0.119098203879603 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 84812586 C/T 1 31 31 62 14.9822326505788 16.0177673494212 -1.03553469884245 T:C C T 10 0.516702172561975 0.800891666394959 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84812501_84813525:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84812501_84813525:USP10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 87760445 T/C 1 14 11 25 6.76616958413235 5.68372389818173 1.08244568595062 T:C T C 10 0.516702172561975 0.694163042854475 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87760371_87760530:KLHDC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 87788864 G/A 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 87872355 G/A 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87872320_87872423:SLC7A5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 87874736 G/C 1 5 11 16 2.41648913719012 5.68372389818173 -3.2672347609916 C:G G C 10 0.516702172561975 0.133473626885738 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87874656_87874761:SLC7A5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 87902684 G/T 1 6 11 17 2.89978696462815 5.68372389818173 -2.78393693355358 T:G G T 10 0.516702172561975 0.226390605017796 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87902491_87903125:SLC7A5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88763958 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000158717:ENST00000312838:exon_88762903_88764041:RNF166 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88779257 A/G 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88780090 G/A 1 1 12 13 0.483297827438025 6.2004260707437 -5.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00135644941582011 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780055_88780186:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780055_88780186:CTU2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88781078 C/G 1 22 18 40 10.6325522036365 9.30063910611555 1.331913097521 C:G C G 10 0.516702172561975 0.752563259473963 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88781083 G/A 1 17 22 39 8.21606306644642 11.3674477963635 -3.15138472991703 A:G G A 10 0.516702172561975 0.339299989994280 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 88877004 A/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 13 2 15 6.28287175669432 1.03340434512395 5.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00785267180058611 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 12 2 14 5.7995739292563 1.03340434512395 4.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0136115374114993 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 11 0 11 5.31627610181827 0 5.31627610181827 G G 10 0.516702172561975 0.00103689775134077 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 10 2 12 4.83297827438025 1.03340434512395 3.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0398349228801247 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89167650 C/T 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89220658 G/A 1 42 23 65 20.298508752397 11.8841499689254 8.41435878347162 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0462724054384567 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89220498_89222171:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89220498_89220997:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89220498_89220997:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89220498_89220997:ACSF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89346547 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89347765 C/T 1 20 21 41 9.6659565487605 10.8507456238015 -1.18478907504098 T:C C T 10 0.516702172561975 0.756110170705008 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89348038 G/C 1 36 35 71 17.3987217877689 18.0845760396691 -0.685854251900228 C:G G C 10 0.516702172561975 0.905820320891972 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89349455 C/T 1 66 69 135 31.8976566109096 35.6524499067763 -3.75479329586663 T:C C T 10 0.516702172561975 0.54711511818734 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 73 106 179 35.2807414029758 54.7704302915694 -19.4896888885935 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.00435384381813406 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89351106 G/C 1 78 83 161 37.6972305401659 42.8862803226439 -5.18904978247798 A:C:G G C 10 0.516702172561975 0.430972559664175 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89598317 A/G 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89598312_89598474:SPG7;ENSG00000197912:ENST00000341316:exon_89598312_89598474:SPG7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89611021 T/C 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89627460 T/G 1 560 501 1061 270.646783365294 258.86778845355 11.7789949117445 T:G T G 10 0.516702172561975 0.479939716315584 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627348_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627119_89627471:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 1238 1136 2374 598.322710368275 586.973668030404 11.3490423378713 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.651445815693013 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89663072 G/A 1 34 4 38 16.4321261328928 2.0668086902479 14.3653174426449 A:G G A 10 0.516702172561975 1.62122769117769e-06 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 89790054 G/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:G G T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 16 90109626 C/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90109604_90111383:GAS8;ENSG00000222019:ENST00000517889:exon_90109310_90110397:AC133919.6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 465775 G/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_465743_465985:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_465743_465985:VPS53 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 649037 G/A 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 649232 C/T 1 23 23 46 11.1158500310746 11.8841499689254 -0.768299937850852 T:C C T 10 0.516702172561975 0.883160180876831 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 651025 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4;ENSG00000179409:ENST00000437269:exon_650785_651272:GEMIN4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 679124 G/A 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 A:G G A 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000167699:ENST00000301329:exon_679015_679159:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_679015_679159:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000301328:exon_679015_679159:GLOD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 685846 C/T 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685799_685931:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 961900 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 970413 C/T 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000382259:exon_970317_970482:ABR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1399622 G/A 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 A:G G A 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000132376:ENST00000397335:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000421807:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000406424:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000350761:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000320345:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000487039:exon_1399354_1399755:INPP5K HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1479936 C/T 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1479891_1480014:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1479891_1480014:SLC43A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1531043 T/C 0 0 9 9 0 4.65031955305778 -4.65031955305778 C T C 10 0.516702172561975 0.00143857856770658 ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1531009_1531214:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1531009_1531214:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1531009_1531214:SLC43A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1538546 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1538628 C/G 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 C:G C G 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1538692 C/T 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1549771 G/C 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 C:G G C 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000167705:ENST00000301336:exon_1549444_1549913:RILP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1564292 A/G 1 20 21 41 9.6659565487605 10.8507456238015 -1.18478907504098 A:G A G 10 0.516702172561975 0.756110170705008 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1564287_1564456:PRPF8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1640673 C/T 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1640856 G/A 1 6 14 20 2.89978696462815 7.23383041586765 -4.3340434512395 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0716012253169818 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1733399 A/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1733266_1733420:RPA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 1795180 T/C 1 14 20 34 6.76616958413235 10.3340434512395 -3.56787386710715 T:C T C 10 0.516702172561975 0.234114946287148 ENSG00000132383:ENST00000254719:exon_1795127_1795234:RPA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C T C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:G T G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 2227672 G/C 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 ENSG00000167720:ENST00000344595:exon_2226949_2228554:SRR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 2236319 C/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:C C A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 2323541 T/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127804:ENST00000263092:exon_2319352_2323890:METT10D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 2598694 C/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2598668_2598820:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2598668_2598820:KIAA0664 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3801102 C/T 1 8 14 22 3.8663826195042 7.23383041586765 -3.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 0.200185713790216 ENSG00000108405:ENST00000225538:exon_3799891_3801173:P2RX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3828702 T/C 1 19 5 24 9.18265872132247 2.58351086280988 6.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00731562652228718 ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3827169_3828732:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3827169_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3828690_3828735:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3827169_3828735:ATP2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3832733 C/T 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3832622_3832739:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3832622_3832739:ATP2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3833680 C/T 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3833595_3833728:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3833595_3833728:ATP2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 3850910 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3850685_3851149:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3850685_3851149:ATP2A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4575740 A/G 1 17 29 46 8.21606306644642 14.9843630042973 -6.76829993785085 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0545315679451437 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4575910 G/A 1 24 25 49 11.5991478585126 12.9175543140494 -1.31840645553678 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775566296958739 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4575409_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4576620 C/T 1 37 25 62 17.8820196152069 12.9175543140494 4.96446530115755 T:C C T 10 0.516702172561975 0.252616291924485 ENSG00000141456:ENST00000436683:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4576545_4576751:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4576545_4576751:PELP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4634759 T/C 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000161920:ENST00000293777:exon_4634708_4634869:MED11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4699552 G/A 0 35 0 35 16.9154239603309 0 16.9154239603309 G G 10 0.516702172561975 1.00781760886432e-10 ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4722825 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4722876 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4796274 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4859364 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000108515:ENST00000441285:exon_4859237_4859438:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000381335:exon_4859237_4859438:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000323997:exon_4859237_4859438:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000422083:exon_4859237_4859438:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000519584:exon_4859237_4859438:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000518175:exon_4859237_4859438:ENO3;ENSG00000108515:ENST00000522425:exon_4859095_4859438:ENO3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 4925701 C/T 1 54 46 100 26.0980826816533 23.7682999378509 2.3297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.689403826416486 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4925387_4926004:KIF1C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5126674 A/G 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:G A G 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5286525 C/G 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 C:G C G 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5286417_5286720:RABEP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 59 53 112 28.5145718188435 27.3852151457847 1.12935667305879 A:G A G 10 0.516702172561975 0.850525405694241 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5312223 C/T 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5312053_5312229:NUP88 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 60 56 116 28.9978696462815 28.9353216634706 0.0625479828108944 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 58 58 116 28.0312739914054 29.9687260085946 -1.9374520171891 C:G C G 10 0.516702172561975 0.780626949193809 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 12 15 27 5.7995739292563 7.75053258842963 -1.95095865917333 T:C T C 10 0.516702172561975 0.564379305884164 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 5461871 A/G 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6663753 A/G 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 A:G A G 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 19 7 26 9.18265872132247 3.61691520793383 5.56574351338865 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0312553847406553 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6665487 A/G 1 15 18 33 7.24946741157037 9.30063910611555 -2.05117169454518 A:G A G 10 0.516702172561975 0.491505449600174 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000431790:exon_6665474_6665559:XAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6674216 T/C 1 22 10 32 10.6325522036365 5.16702172561975 5.4655304780168 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0752961932604552 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6673962_6674303:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6673962_6674303:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6673962_6674303:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6673962_6674360:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000431790:exon_6673962_6674303:XAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6918461 C/T 1 71 90 161 34.3141457480998 46.5031955305778 -12.189049782478 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0583933040082174 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6918381_6918475:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000455303:exon_6918381_6918475:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6918381_6918475:C17orf49 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 117 105 222 56.5458458102489 54.2537281190074 2.29211769124154 T:C T C 10 0.516702172561975 0.788393604713342 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 6943266 G/A 1 7 17 24 3.38308479206617 8.78393693355358 -5.4008521414874 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0390099403344458 ENSG00000174327:ENST00000308027:exon_6943082_6943438:SLC16A13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7124115 A/G 1 70 44 114 33.8308479206617 22.7348955927269 11.0959523279348 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0393185569152277 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7124085_7124149:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7124085_7124149:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7124085_7124149:ACADVL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7127718 T/C 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.537244131175437 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7129840 T/C 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C T C 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7129740_7129958:DVL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7133162 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133127_7133262:DVL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7133609 G/A 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7133604_7133749:DVL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7216763 C/T 1 35 26 61 16.9154239603309 13.4342564866114 3.48116747371952 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442383499379473 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7400815 T/C 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400675_7400836:POLR2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7404396 G/A 1 14 11 25 6.76616958413235 5.68372389818173 1.08244568595062 A:G G A 10 0.516702172561975 0.694163042854475 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7404259_7404427:POLR2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7412349 G/A 1 14 17 31 6.76616958413235 8.78393693355358 -2.01776734942123 A:G G A 10 0.516702172561975 0.479021533266739 ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7460517 G/C 1 21 19 40 10.1492543761985 9.81734127867753 0.331913097520998 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7460416_7461207:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7460416_7460549:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7460416_7460891:TNFSF12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 1 1 9 10 0.483297827438025 4.65031955305778 -4.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0094848757557616 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7478498 G/A 1 121 107 228 58.479037120001 55.2871324641313 3.19190465586968 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.69129828908201 ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7478437_7478576:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7478437_7478720:EIF4A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7483018 C/T 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7482922_7483044:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7482957_7483044:CD68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7484101 C/A 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 A:C C A 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000129226:ENST00000250092:exon_7484029_7484101:CD68;ENSG00000129226:ENST00000380498:exon_7484029_7484101:CD68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7490810 G/A 1 35 45 80 16.9154239603309 23.2515977652889 -6.336173804958 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.179376781474893 ENSG00000129255:ENST00000250124:exon_7490744_7491523:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000449455:exon_7490744_7491504:MPDU1;ENSG00000129255:ENST00000359822:exon_7490744_7491027:MPDU1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7579579 C/T 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000396473:exon_7579512_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 7849274 G/A 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 A:G G A 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8025162 C/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8024299_8025340:HES7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8046664 C/T 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8048169 T/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C T C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8048283 G/A 1 7 12 19 3.38308479206617 6.2004260707437 -2.81734127867753 A:G G A 10 0.516702172561975 0.252027255956844 ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8048069_8048311:PER1;ENSG00000179094:ENST00000354903:exon_8047507_8048311:PER1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8064779 C/G 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 C:G C G 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000220205:ENST00000404970:exon_8063724_8064842:VAMP2;ENSG00000220205:ENST00000481878:exon_8064637_8064842:VAMP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8272571 G/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 C:G G C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000184619:ENST00000396267:exon_8271955_8273704:KRBA2;ENSG00000184619:ENST00000331336:exon_8271973_8273704:KRBA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8701287 A/G 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8726317 G/C 1 18 5 23 8.69936089388445 2.58351086280988 6.11585003107457 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0115960221221812 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 8809075 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 9153925 G/A 1 37 26 63 17.8820196152069 13.4342564866114 4.44776312859557 A:G G A 10 0.516702172561975 0.313290599366444 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9153789_9153962:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9153789_9153962:STX8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 25 15 40 12.0824456859506 7.75053258842963 4.331913097521 A:G G A 10 0.516702172561975 0.205803887471226 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 9846527 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000007237:ENST00000323816:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000396115:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000437099:exon_9846438_9846553:GAS7;ENSG00000007237:ENST00000432992:exon_9846438_9846553:GAS7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 10614442 A/G 1 19 15 34 9.18265872132247 7.75053258842963 1.43212613289285 A:G A G 10 0.516702172561975 0.732144357326082 ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16285350 C/T 1 832 851 1683 402.103792428437 439.713548850241 -37.609756421804 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.0673875814122393 ENSG00000170315:ENST00000302182:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395839:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395837:exon_16285216_16286054:UBB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 39 25 64 18.848615270083 12.9175543140494 5.9310609560336 A:G A G 10 0.516702172561975 0.168476478616793 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 28 22 50 13.5323391682647 11.3674477963635 2.16489137190125 A:C A C 10 0.516702172561975 0.57370941898492 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16336828 G/A 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16336992 C/G 1 55 40 95 26.5813805090914 20.668086902479 5.91329360661237 C:G C G 10 0.516702172561975 0.258791950275456 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16336888_16337012:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000475513:exon_16336546_16337012:TRPV2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16342813 T/C 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:C T C 10 0.516702172561975 0.167939326589619 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 7 12 19 3.38308479206617 6.2004260707437 -2.81734127867753 T:C T C 10 0.516702172561975 0.252027255956844 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 C:G G C 10 0.516702172561975 0.347762918852962 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 17168164 G/A 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 17719989 C/T 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17719771_17720032:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17719839_17720032:SREBF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 17720391 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 17723648 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17723404_17723835:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17723404_17723835:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17723404_17723835:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17723404_17723835:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17723489_17723835:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17723404_17723835:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000476994:exon_17723322_17723835:SREBF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 17750907 G/A 1 2 9 11 0.96659565487605 4.65031955305778 -3.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0333238555970313 ENSG00000175662:ENST00000379504:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000318094:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000478943:exon_17750139_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000395739:exon_17750663_17751097:TOM1L2;ENSG00000175662:ENST00000486413:exon_17750866_17751097:TOM1L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 17921939 C/T 1 9 18 27 4.34968044694222 9.30063910611555 -4.95095865917333 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0812165378882992 ENSG00000171953:ENST00000302530:exon_17921379_17922000:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000474627:exon_17921576_17922000:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000496852:exon_17921576_17922000:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000467560:exon_17921576_17922000:ATPAF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 18088094 C/T 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 T:C C T 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000091542:ENST00000261650:exon_18086867_18088327:ALKBH5;ENSG00000091542:ENST00000399138:exon_18087289_18088327:ALKBH5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 18148944 C/G 1 72 92 164 34.7974435755378 47.5365998757017 -12.7391563001639 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0506552254446828 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 18181100 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 18181176 G/A 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 ENSG00000177302:ENST00000321105:exon_18180989_18181671:TOP3A;ENSG00000177302:ENST00000469739:exon_18180989_18181671:TOP3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 18232136 G/A 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 19861458 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19861327_19861884:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19861327_19861884:AKAP10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 18 0 18 8.69936089388445 0 8.69936089388445 T T 10 0.516702172561975 8.96118945900584e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21203907 T/C 0 19 0 19 9.18265872132247 0 9.18265872132247 T T 10 0.516702172561975 4.56113549286921e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 25 0 25 12.0824456859506 0 12.0824456859506 G G 10 0.516702172561975 8.05111892777866e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21203941 G/A 0 25 0 25 12.0824456859506 0 12.0824456859506 G G 10 0.516702172561975 8.05111892777866e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 25 0 25 12.0824456859506 0 12.0824456859506 C C 10 0.516702172561975 8.05111892777866e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21203964 C/G 0 25 0 25 12.0824456859506 0 12.0824456859506 C C 10 0.516702172561975 8.05111892777866e-08 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 47 0 47 22.7149978895872 0 22.7149978895872 C C 10 0.516702172561975 3.47275677283469e-14 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21215424 G/A 0 12 0 12 5.7995739292563 0 5.7995739292563 G G 10 0.516702172561975 0.00052454284076193 ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21215446 C/T 0 10 0 10 4.83297827438025 0 4.83297827438025 C C 10 0.516702172561975 0.00205170904241076 ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 41 0 41 19.815210924959 0 19.815210924959 C C 10 0.516702172561975 1.8621794355092e-12 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 1 25 1 26 12.0824456859506 0.516702172561975 11.5657435133886 A:C C A 10 0.516702172561975 1.06392748574371e-06 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 34 0 34 16.4321261328928 0 16.4321261328928 C C 10 0.516702172561975 1.96233475343172e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 35 0 35 16.9154239603309 0 16.9154239603309 G G 10 0.516702172561975 1.00781760886432e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 67 0 67 32.3809544383477 0 32.3809544383477 G G 10 0.516702172561975 1.11775133360157e-19 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 25630388 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000109046:ENST00000487603:exon_25629461_25630661:WSB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 25967662 T/C 1 18 10 28 8.69936089388445 5.16702172561975 3.5323391682647 T:C T C 10 0.516702172561975 0.191787589780294 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25967598_25967799:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25967598_25967799:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25967598_25967799:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25967598_25967799:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25967598_25967799:LGALS9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 26901562 A/G 1 262 314 576 126.624030788763 162.24448218446 -35.6204513956976 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00306067321077150 ENSG00000109107:ENST00000226253:exon_26901512_26901595:ALDOC;ENSG00000109107:ENST00000395321:exon_26901512_26901595:ALDOC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 26982341 A/G 1 28 10 38 13.5323391682647 5.16702172561975 8.36531744264495 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00853727554394431 ENSG00000132581:ENST00000247020:exon_26982305_26982501:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000491945:exon_26982305_26982501:SDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 26988852 C/T 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C C T 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000132581:ENST00000247020:exon_26988744_26989122:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000475425:exon_26988744_26988934:SDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27014383 A/G 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 A:G A G 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27051627 G/A 1 20 21 41 9.6659565487605 10.8507456238015 -1.18478907504098 A:G G A 10 0.516702172561975 0.756110170705008 ENSG00000160606:ENST00000292090:exon_27051366_27051911:TLCD1;ENSG00000160606:ENST00000394933:exon_27051471_27051911:TLCD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 49 38 87 23.6815935444632 19.6346825573551 4.04691098710817 T:C C T 10 0.516702172561975 0.393276876971329 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27085353 C/T 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27085564 A/G 1 2 9 11 0.96659565487605 4.65031955305778 -3.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0333238555970313 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27207571 C/T 1 32 27 59 15.4655304780168 13.9509586591733 1.51457181884347 T:C C T 10 0.516702172561975 0.794730395016501 ENSG00000132589:ENST00000394906:exon_27206353_27207617:FLOT2;ENSG00000132589:ENST00000394908:exon_27206353_27207617:FLOT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27251052 G/A 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 A:G G A 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000109118:ENST00000332830:exon_27250927_27251320:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000378879:exon_27250927_27251400:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000268756:exon_27250927_27251320:PHF12;ENSG00000109118:ENST00000483934:exon_27250927_27251320:PHF12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27417836 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000196535:ENST00000529578:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27417828_27417944:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527859:exon_27417828_27417848:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531892:exon_27417828_27417853:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529889:exon_27417828_27418111:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531370:exon_27417828_27417944:MYO18A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27424866 T/C 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424806_27424898:MYO18A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27424891 C/T 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27424806_27424917:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527686:exon_27424806_27424898:MYO18A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27438469 G/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27438442_27438601:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27438442_27438601:MYO18A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 27903138 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000491377:exon_27903096_27903692:GIT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 95 76 171 45.9132936066124 39.2693651147101 6.64392849190227 A:G G A 10 0.516702172561975 0.320653519256318 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 28575994 C/T 1 48 45 93 23.1982957170252 23.2515977652889 -0.0533020482636815 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28575223_28576186:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28575223_28576186:BLMH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 28612448 G/C 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 C:G G C 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000108578:ENST00000261714:exon_28612406_28612498:BLMH;ENSG00000108578:ENST00000394819:exon_28612406_28612498:BLMH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29096004 C/G 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 C:G C G 10 0.516702172561975 0.775920176313447 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29097000 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29119559 C/G 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29119458_29119590:CRLF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29162826 A/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29631870 C/A 1 56 45 101 27.0646783365294 23.2515977652889 3.81308057124052 A:T:C C A 10 0.516702172561975 0.486392322940579 ENSG00000185862:ENST00000330927:exon_29630790_29632648:EVI2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29632471 C/T 1 37 37 74 17.8820196152069 19.1179803847931 -1.23596076958615 T:C C T 10 0.516702172561975 0.816544282575495 ENSG00000185862:ENST00000330927:exon_29630790_29632648:EVI2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 29646032 G/A 1 9 16 25 4.34968044694222 8.2672347609916 -3.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.160159524116636 ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 30190348 A/G 1 74 89 163 35.7640392304139 45.9864933580158 -10.2224541276019 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.117088040102608 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 30986166 C/T 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000176658:ENST00000318217:exon_30986133_30986356:MYO1D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 31268024 A/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:T A T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000006042:ENST00000394642:exon_31267804_31268646:TMEM98;ENSG00000006042:ENST00000261713:exon_31267804_31268667:TMEM98 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33288882 T/G 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33318796 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33318690_33318856:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33318690_33318856:LIG3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33328436 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33591523 G/A 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33591202_33591922:SLFN5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33592621 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33738752 A/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33738079_33738946:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33738083_33738946:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33738088_33738946:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000460530:exon_33738336_33738946:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000479326:exon_33738387_33738946:SLFN12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33749288 T/C 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:C A C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33769206 G/A 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000532774:exon_33768909_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000532210:exon_33769119_33769305:SLFN13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 33769211 C/T 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 T:C C T 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33768582_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000532774:exon_33768909_33769305:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000532210:exon_33769119_33769305:SLFN13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 34205582 G/A 1 46 13 59 22.2317000621491 6.71712824330568 15.5145718188435 A:G G A 10 0.516702172561975 3.95567842095615e-05 ENSG00000161570:ENST00000293272:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000366113:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000463941:exon_34205532_34205643:CCL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 34205589 C/A 1 13 45 58 6.28287175669432 23.2515977652889 -16.9687260085946 A:C C A 10 0.516702172561975 8.22820181231154e-06 ENSG00000161570:ENST00000293272:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000366113:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000463941:exon_34205532_34205643:CCL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 34849843 G/T 1 26 30 56 12.5657435133886 15.5010651768593 -2.9353216634706 T:G G T 10 0.516702172561975 0.504200622466784 ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34849770_34849850:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34849770_34849850:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000434102:exon_34849770_34849850:ZNHIT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 35307672 G/A 1 31 32 63 14.9822326505788 16.5344695219832 -1.55223687140443 A:G G A 10 0.516702172561975 0.707267657861488 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35307514_35307705:AATF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 35896123 T/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35896081_35896229:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000508220:exon_35896081_35897580:SYNRG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 C:G C G 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 37074869 C/T 1 18 12 30 8.69936089388445 6.2004260707437 2.49893482314075 T:C C T 10 0.516702172561975 0.465598635369486 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 37682124 T/C 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000167258:ENST00000300647:exon_37682117_37682419:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000430627:exon_37682117_37682569:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000447079:exon_37682117_37682569:CDK12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 37813338 T/C 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C T C 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000460894:exon_37813151_37813338:STARD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 37815749 G/A 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 A:G G A 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37815714_37815806:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37815714_37815806:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37815714_37815806:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37815714_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37815714_37816779:STARD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 37818561 T/C 1 18 16 34 8.69936089388445 8.2672347609916 0.432126132892849 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37818504_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37818504_37818597:STARD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38062139 G/A 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000486560:exon_38062100_38062191:GSDMB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38137364 G/A 1 65 65 130 31.4143587834716 33.5856412165284 -2.17128243305676 A:G G A 10 0.516702172561975 0.726117224100548 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38137050_38137443:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38137312_38137443:PSMD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38146154 T/C 1 92 92 184 44.4634001242983 47.5365998757017 -3.07319975140341 T:C T C 10 0.516702172561975 0.658778259930177 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38175791 A/G 1 26 38 64 12.5657435133886 19.6346825573551 -7.0689390439664 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.080901334676055 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000476821:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38175351_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38175355_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38175361_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000491466:exon_38175398_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38175756_38175898:MED24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38175866 G/A 1 45 34 79 21.7484022347111 17.5678738671072 4.18052836760397 A:G G A 10 0.516702172561975 0.369247816290365 ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000476821:exon_38175350_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38175351_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38175355_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38175361_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000491466:exon_38175398_38175898:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38175756_38175898:MED24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38251866 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000126368:ENST00000246672:exon_38251697_38252340:NR1D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38251883 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000126368:ENST00000246672:exon_38251697_38252340:NR1D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38545824 C/A 1 60 55 115 28.9978696462815 28.4186194909086 0.579250155372872 A:C C A 10 0.516702172561975 0.925961840517547 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38544768_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38544795_38545899:TOP2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38547868 C/T 1 44 32 76 21.2651044072731 16.5344695219832 4.7306348852899 T:C C T 10 0.516702172561975 0.302597121780105 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38547758_38547892:TOP2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38548586 T/G 1 64 38 102 30.9310609560336 19.6346825573551 11.2963783986785 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0289111212816142 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548466_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548470_38548593:TOP2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38559242 A/G 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38559158_38559306:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38559158_38559306:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38559158_38559306:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38559158_38559306:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38559158_38559306:TOP2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38711669 G/T 1 99 141 240 47.8464849163645 72.8550063312385 -25.008521414874 T:G G T 10 0.516702172561975 0.00149967076416153 ENSG00000126353:ENST00000246657:exon_38710021_38712070:CCR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 38990834 G/C 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 C:G G C 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40065774 T/G 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40142302 T/C 1 21 14 35 10.1492543761985 7.23383041586765 2.91542396033087 T:C T C 10 0.516702172561975 0.398376363469485 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40142282_40142400:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40142282_40142400:DNAJC7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40169383 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40169358_40169671:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40169358_40169434:DNAJC7;ENSG00000168256:ENST00000307641:exon_40169038_40169644:NKIRAS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40344643 T/G 1 5 12 17 2.41648913719012 6.2004260707437 -3.78393693355358 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0881633825434838 ENSG00000167925:ENST00000454210:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000393854:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000428494:exon_40344259_40344727:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000301671:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000414034:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000377472:exon_40344259_40344760:GHDC;ENSG00000167925:ENST00000436923:exon_40344259_40344760:GHDC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40442037 C/T 1 22 17 39 10.6325522036365 8.78393693355358 1.84861527008297 T:C C T 10 0.516702172561975 0.631830397141998 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000469124:exon_40441884_40442197:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000444283:exon_40441884_40442040:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000478897:exon_40441884_40442040:STAT5A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40459737 C/T 1 59 48 107 28.5145718188435 24.8017042829748 3.71286753586867 T:C C T 10 0.516702172561975 0.499257255285783 ENSG00000126561:ENST00000345506:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000452307:exon_40459611_40459741:STAT5A;ENSG00000126561:ENST00000468096:exon_40459611_40459741:STAT5A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40650971 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000033627:ENST00000343619:exon_40650942_40651060:ATP6V0A1;ENSG00000033627:ENST00000393829:exon_40650942_40651060:ATP6V0A1;ENSG00000033627:ENST00000264649:exon_40650942_40651060:ATP6V0A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40714804 C/A 1 10 2 12 4.83297827438025 1.03340434512395 3.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0398349228801247 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 40716520 A/G 1 26 19 45 12.5657435133886 9.81734127867753 2.74840223471112 A:G A G 10 0.516702172561975 0.457596072735811 ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 41197659 G/C 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41196312_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41196314_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41196822_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41197646_41197819:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41197646_41197819:BRCA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 41223094 T/C 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000351666:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000352993:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000468300:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000491747:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000478531:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000484087:exon_41222945_41223255:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493919:exon_41222945_41223255:BRCA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 41341625 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000188554:ENST00000389312:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000422280:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000341165:exon_41341605_41341819:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000389311:exon_41341605_41341819:NBR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 41365921 C/G 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 C:G C G 10 0.516702172561975 0.632357252813595 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 43138741 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43138680_43138828:NMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 39 38 77 18.848615270083 19.6346825573551 -0.786067287272079 T:C C T 10 0.516702172561975 0.909406968885681 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 72 74 146 34.7974435755378 38.2359607695861 -3.43851719404835 A:G G A 10 0.516702172561975 0.619463179934363 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 43311463 C/T 1 18 23 41 8.69936089388445 11.8841499689254 -3.18478907504098 T:C C T 10 0.516702172561975 0.350760882885465 ENSG00000184922:ENST00000328118:exon_43311439_43311567:FMNL1;ENSG00000184922:ENST00000331495:exon_43311439_43311567:FMNL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 43311620 A/G 1 23 9 32 11.1158500310746 4.65031955305778 6.4655304780168 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0321365565649403 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45219320 C/T 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 C C 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45219219_45219388:CDC27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45735975 G/A 1 23 21 44 11.1158500310746 10.8507456238015 0.265104407273098 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45750468 T/C 1 22 25 47 10.6325522036365 12.9175543140494 -2.28500211041283 T:C T C 10 0.516702172561975 0.560502979227703 ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45811210 A/G 1 11 14 25 5.31627610181827 7.23383041586765 -1.91755431404938 A:G A G 10 0.516702172561975 0.549349590631841 ENSG00000073861:ENST00000177694:exon_45810610_45811311:TBX21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 T:C C T 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45904420 C/T 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C C T 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000159111:ENST00000351111:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000290208:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000414011:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000421763:exon_45904406_45904570:MRPL10;ENSG00000159111:ENST00000466016:exon_45904261_45904570:MRPL10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 14 10 24 6.76616958413235 5.16702172561975 1.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.546705336419487 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45917596 A/G 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 A:G A G 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45917557_45917738:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45917557_45917738:SCRN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 46053353 C/A 1 59 61 120 28.5145718188435 31.5188325262805 -3.00426070743701 A:C C A 10 0.516702172561975 0.585298447171936 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46053235_46053379:CDK5RAP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 46628547 G/T 1 13 14 27 6.28287175669432 7.23383041586765 -0.950958659173327 T:G G T 10 0.516702172561975 0.847787224060471 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 46929908 T/C 1 22 20 42 10.6325522036365 10.3340434512395 0.29850875239705 A:T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 45 28 73 21.7484022347111 14.4676608317353 7.28074140297582 C:G C G 10 0.516702172561975 0.100910132920554 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 46998572 G/A 1 10 2 12 4.83297827438025 1.03340434512395 3.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0398349228801247 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000508468:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_46998564_46998634:UBE2Z HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 17 15 32 8.21606306644642 7.75053258842963 0.465530478016798 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 47018293 C/T 1 25 27 52 12.0824456859506 13.9509586591733 -1.8685129732227 T:C C T 10 0.516702172561975 0.677791113888664 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 47778793 C/T 1 18 22 40 8.69936089388445 11.3674477963635 -2.668086902479 T:C C T 10 0.516702172561975 0.43164377138054 ENSG00000121073:ENST00000240333:exon_47778305_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000504260:exon_47778649_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000415270:exon_47778682_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000502406:exon_47778683_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000508749:exon_47778690_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507477:exon_47778690_47780373:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000507773:exon_47778701_47778872:SLC35B1;ENSG00000121073:ENST00000376622:exon_47778701_47778872:SLC35B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 49248997 C/T 1 242 238 480 116.958074240002 122.97511706975 -6.01704282974802 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.584061121467633 ENSG00000011052:ENST00000376392:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393199:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393183:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000514264:exon_49248848_49249028:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393185:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000513177:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000512737:exon_49248848_49249108:NME2;ENSG00000011052:ENST00000426182:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000503064:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393190:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000445778:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000243678:ENST00000393193:exon_49248848_49249105:NME1-NME2;ENSG00000243678:ENST00000393198:exon_49248848_49249103:NME1-NME2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 49365510 T/A 1 26 34 60 12.5657435133886 17.5678738671072 -5.0021303537185 A:T T A 10 0.516702172561975 0.199636247823605 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49365390_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000514174:exon_49365390_49365541:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000515179:exon_49365485_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000504660:exon_49365390_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000506849:exon_49365390_49365564:UTP18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 55079471 T/C 1 26 24 50 12.5657435133886 12.4008521414874 0.164891371901247 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55079379_55079542:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55079379_55079542:SCPEP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 56283880 C/T 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000011143:ENST00000393119:exon_56283826_56283908:MKS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 56584205 A/C 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:C A C 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000108389:ENST00000323456:exon_56584104_56584232:MTMR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 16 18 34 7.7327652390084 9.30063910611555 -1.56787386710715 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610984576422366 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 57760151 A/G 1 54 51 105 26.0980826816533 26.3518108006607 -0.253728119007377 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000141367:ENST00000269122:exon_57759990_57760154:CLTC;ENSG00000141367:ENST00000393043:exon_57759990_57760154:CLTC;ENSG00000141367:ENST00000458188:exon_57759990_57760154:CLTC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 58121264 C/T 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 T:C C T 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58120562_58121495:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58120562_58121495:HEATR6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 58734091 A/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:C A C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000170836:ENST00000305921:exon_58733960_58734202:PPM1D;ENSG00000170836:ENST00000392995:exon_58733960_58734202:PPM1D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 59147471 G/A 1 12 1 13 5.7995739292563 0.516702172561975 5.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00363176502686701 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61666555 C/T 1 31 22 53 14.9822326505788 11.3674477963635 3.61478485421532 T:C C T 10 0.516702172561975 0.338950235535203 ENSG00000136485:ENST00000310827:exon_61666362_61671639:DCAF7;ENSG00000136485:ENST00000415273:exon_61666362_61666599:DCAF7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61770954 G/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000198909:ENST00000361357:exon_61770909_61773667:MAP3K3;ENSG00000198909:ENST00000361733:exon_61770909_61773667:MAP3K3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61843545 A/T 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:T A T 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000108588:ENST00000225726:exon_61843272_61843554:CCDC47;ENSG00000108588:ENST00000403162:exon_61843272_61843554:CCDC47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61883966 C/T 1 9 2 11 4.34968044694222 1.03340434512395 3.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0670490889820124 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61883895_61884014:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61883895_61884014:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61883895_61884014:DDX42 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61895704 C/T 1 73 76 149 35.2807414029758 39.2693651147101 -3.98862371173428 T:C C T 10 0.516702172561975 0.513514046820429 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61895054_61896676:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61895054_61896676:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61895054_61896676:DDX42 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61903932 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903927_61904032:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903927_61904032:FTSJ3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 61910514 A/G 1 42 51 93 20.298508752397 26.3518108006607 -6.05330204826368 A:G A G 10 0.516702172561975 0.214788830083541 ENSG00000108604:ENST00000450364:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000448276:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000225742:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000323347:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000228253:exon_61910429_61910530:SMARCD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 45 59 104 21.7484022347111 30.4854281811565 -8.73702594644541 A:G A G 10 0.516702172561975 0.095295149490349 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 65907503 A/G 1 21 12 33 10.1492543761985 6.2004260707437 3.94882830545482 A:G A G 10 0.516702172561975 0.222321734051643 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 15 7 22 7.24946741157037 3.61691520793383 3.63255220363655 A:C A C 10 0.516702172561975 0.138559169128612 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 71197323 G/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 C:G G C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 1 24 33 57 11.5991478585126 17.0511716945452 -5.45202383603258 T:C:G G T 10 0.516702172561975 0.184626153637799 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72758210 C/T 1 12 19 31 5.7995739292563 9.81734127867753 -4.01776734942123 T:C C T 10 0.516702172561975 0.155403068784301 ENSG00000109062:ENST00000262613:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1;ENSG00000109062:ENST00000413388:exon_72758151_72758312:SLC9A3R1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72769790 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72769715_72769827:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72769715_72769824:NAT9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72771766 C/G 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 C:G C G 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000109065:ENST00000357814:exon_72771761_72771846:NAT9;ENSG00000109065:ENST00000417297:exon_72771761_72771846:NAT9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72859264 C/A 1 30 29 59 14.4989348231407 14.9843630042973 -0.485428181156527 A:C C A 10 0.516702172561975 0.897357901102758 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72859198_72859368:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72859198_72859368:FDXR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72860952 G/A 1 34 16 50 16.4321261328928 8.2672347609916 8.16489137190125 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0231878038007108 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860946_72861071:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860946_72861053:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860946_72861053:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860946_72861053:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860946_72861053:FDXR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 72861935 G/A 1 18 10 28 8.69936089388445 5.16702172561975 3.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.191787589780294 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72861841_72861942:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72861841_72861942:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72861841_72861942:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72861841_72861942:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72861841_72861942:FDXR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73016489 C/T 1 38 35 73 18.3653174426449 18.0845760396691 0.280741402975821 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016408_73016490:ICT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73035107 A/G 1 167 170 337 80.7107371821502 87.8393693355357 -7.12863215338558 A:G A G 10 0.516702172561975 0.445823630511441 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73034955_73035158:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73034955_73035158:ATP5H HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73230781 C/T 1 10 26 36 4.83297827438025 13.4342564866114 -8.6012782122311 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00432066907031944 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73269577 G/A 1 25 24 49 12.0824456859506 12.4008521414874 -0.318406455536778 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73269062_73269720:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73269062_73269720:SLC25A19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73494531 C/T 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000177728:ENST00000314256:exon_73494525_73494619:KIAA0195;ENSG00000177728:ENST00000375248:exon_73494525_73494803:KIAA0195 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73520485 G/C 1 26 21 47 12.5657435133886 10.8507456238015 1.71499788958717 C:G G C 10 0.516702172561975 0.663177761471479 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73520343_73520820:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73520454_73520656:TSEN54 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73569158 A/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:C A C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000073350:ENST00000167462:exon_73569095_73569359:LLGL2;ENSG00000073350:ENST00000392550:exon_73569095_73569359:LLGL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C T C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73826490 C/T 1 21 24 45 10.1492543761985 12.4008521414874 -2.25159776528888 T:C C T 10 0.516702172561975 0.552212064937861 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73826443_73826563:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73826443_73826563:UNC13D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73830426 C/T 1 21 18 39 10.1492543761985 9.30063910611555 0.848615270082973 T:C C T 10 0.516702172561975 0.873160767498915 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73830406_73830612:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73830406_73830612:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73830406_73830612:UNC13D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73836146 G/A 1 11 18 29 5.31627610181827 9.30063910611555 -3.98436300429728 A:G G A 10 0.516702172561975 0.192545740919314 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73895688 C/G 1 23 13 36 11.1158500310746 6.71712824330568 4.3987217877689 C:G C G 10 0.516702172561975 0.181692204595518 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000480203:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000483393:exon_73895597_73895949:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477371:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477023:exon_73895597_73895755:MRPL38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 22 14 36 10.6325522036365 7.23383041586765 3.3987217877689 T:C T C 10 0.516702172561975 0.3174146376039 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74056413 C/T 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74056389_74056471:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74056389_74056471:SRP68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74099729 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74099714_74099856:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74099714_74099827:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74099714_74099827:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74099714_74099839:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74099714_74099802:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74099714_74099802:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74099714_74099773:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405068:exon_74099714_74099824:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000406660:exon_74099714_74099815:EXOC7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74383475 T/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000176170:ENST00000323374:exon_74382887_74383941:SPHK1;ENSG00000176170:ENST00000392496:exon_74382887_74383941:SPHK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74469779 T/C 1 15 12 27 7.24946741157037 6.2004260707437 1.04904134082667 T:C T C 10 0.516702172561975 0.705414871424267 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74469730_74469824:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74469730_74469824:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74469730_74469824:RHBDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74472998 G/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74472912_74473106:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74472912_74473106:RHBDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74474947 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74475024 G/A 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 A:G G A 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74475975 C/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475815_74476023:RHBDF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 78 93 171 37.6972305401659 48.0533020482637 -10.3560715080977 A:G G A 10 0.516702172561975 0.125783220408416 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 74733168 G/A 1 75 67 142 36.2473370578519 34.6190455616523 1.62829149619954 A:G G A 10 0.516702172561975 0.801640952200038 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 13 15 28 6.28287175669432 7.75053258842963 -1.4676608317353 T:C C T 10 0.516702172561975 0.70606093772356 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 35 16 51 16.9154239603309 8.2672347609916 8.64818919933927 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0168623463529063 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76115136 G/T 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:G G T 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76118791 G/A 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76118686_76118830:TMC6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76121031 C/T 0 27 0 27 13.0490413408267 0 13.0490413408267 C C 10 0.516702172561975 2.10691997078402e-08 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76121864 A/G 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121807_76121965:TMC6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76130604 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130475_76130645:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130537_76130645:TMC8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76219646 C/T 1 18 17 35 8.69936089388445 8.78393693355358 -0.0845760396691269 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000089685:ENST00000374948:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000301633:exon_76219546_76221715:BIRC5;ENSG00000089685:ENST00000350051:exon_76219546_76221715:BIRC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 3 9 12 1.44989348231407 4.65031955305778 -3.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0834942591884686 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 32 12 44 15.4655304780168 6.2004260707437 9.2651044072731 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0060667479000779 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76799860 T/C 1 13 20 33 6.28287175669432 10.3340434512395 -4.05117169454518 T:C T C 10 0.516702172561975 0.167540858962301 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76799898 A/G 1 16 20 36 7.7327652390084 10.3340434512395 -2.6012782122311 A:G A G 10 0.516702172561975 0.408601526257631 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76967805 G/A 1 30 43 73 14.4989348231407 22.2181934201649 -7.71925859702418 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0789216837277156 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76968309 G/A 1 17 23 40 8.21606306644642 11.8841499689254 -3.668086902479 A:G G A 10 0.516702172561975 0.270385427914325 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 76968417 A/G 1 21 20 41 10.1492543761985 10.3340434512395 -0.184789075040976 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000108679:ENST00000262776:exon_76967337_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000418895:exon_76967338_76968786:LGALS3BP;ENSG00000108679:ENST00000431152:exon_76967658_76968641:LGALS3BP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 78263486 T/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C T C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 78263492 C/T 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 78263514 G/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79244732 C/T 1 13 14 27 6.28287175669432 7.23383041586765 -0.950958659173327 T:C C T 10 0.516702172561975 0.847787224060471 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79244718_79244824:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79244718_79244824:SLC38A10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79477716 T/C 1 3646 3263 6909 1762.10387883904 1685.99918906972 76.1046897693145 A:T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.0673002313563306 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79477818 A/G 1 3043 2064 5107 1470.67528889391 1066.47328416792 404.202004725993 A:T:C:G A G 10 0.516702172561975 7.37048938356803e-30 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79477830 C/T 1 2907 1895 4802 1404.94678436234 979.150617004943 425.796167357396 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 4.98138507858071e-35 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79477891 A/G 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 A:G A G 10 0.516702172561975 0.805365604430727 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79478584 G/A 1 1179 1117 2296 569.808138549431 577.156326751726 -7.34818820229475 A:G G A 10 0.516702172561975 0.770039555795503 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478214_79478652:ACTG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79478617 G/A 1 1128 1155 2283 545.159949350092 596.791009309081 -51.631059958989 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0310133563933694 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478214_79478652:ACTG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79639684 G/A 1 7 15 22 3.38308479206617 7.75053258842963 -4.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.086085110143936 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79660950 G/T 1 9 13 22 4.34968044694222 6.71712824330568 -2.36744779636345 T:G G T 10 0.516702172561975 0.394703182135892 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79660900_79660995:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79660900_79660995:HGS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79661874 C/T 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661845_79661883:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661845_79661883:HGS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 321 386 707 155.138602607606 199.447038608922 -44.3084360013164 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.000917026613512206 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79804482 G/A 1 397 329 726 191.869237492896 169.99501477289 21.8742227200061 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.110269377299867 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79804305_79804505:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79804305_79804505:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79804305_79804505:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79804305_79804505:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79804305_79804547:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79804305_79804505:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000478034:exon_79804236_79804505:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79804386_79804505:P4HB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79826935 G/A 1 346 242 588 167.221048293557 125.041925759998 42.1791225335587 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000519255540153176 ENSG00000141522:ENST00000269321:exon_79825598_79826951:ARHGDIA;ENSG00000141522:ENST00000400721:exon_79826924_79826951:ARHGDIA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79871981 A/G 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 A:G A G 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000187531:ENST00000328666:exon_79871963_79872043:SIRT7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79892586 A/G 1 32 33 65 15.4655304780168 17.0511716945452 -1.58564121652838 A:G A G 10 0.516702172561975 0.711310588892486 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79892529_79892621:PYCR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 A:T T A 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 79966931 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79966913_79967067:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79966913_79967067:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79966913_79967067:ASPSCR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80011886 T/C 1 26 14 40 12.5657435133886 7.23383041586765 5.331913097521 T:C T C 10 0.516702172561975 0.113043689291216 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80011744_80011925:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80017902 C/T 1 27 31 58 13.0490413408267 16.0177673494212 -2.96872600859455 T:C C T 10 0.516702172561975 0.511607542000333 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80017824_80017969:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80017824_80017969:DUS1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80020812 C/T 1 17 8 25 8.21606306644642 4.1336173804958 4.08244568595062 T:C C T 10 0.516702172561975 0.112640979957940 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80020737_80020849:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80020737_80020820:DUS1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80040895 T/C 1 30 18 48 14.4989348231407 9.30063910611555 5.1982957170252 T:C T C 10 0.516702172561975 0.149530043330721 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80040790_80040991:FASN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80041948 G/A 1 16 19 35 7.7327652390084 9.81734127867753 -2.08457603966913 A:G G A 10 0.516702172561975 0.503196579306069 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80041851_80042029:FASN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80043276 G/A 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80043114_80043278:FASN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80045674 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80045561_80045737:FASN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80059532 T/G 1 37 29 66 17.8820196152069 14.9843630042973 2.89765661090965 T:G T G 10 0.516702172561975 0.538521139774023 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80193882 G/A 1 21 22 43 10.1492543761985 11.3674477963635 -1.21819342016493 A:G G A 10 0.516702172561975 0.76140888237017 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80350325 G/A 1 25 13 38 12.0824456859506 6.71712824330568 5.36531744264495 A:G G A 10 0.516702172561975 0.103659135684863 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80403797 T/C 1 5 13 18 2.41648913719012 6.71712824330568 -4.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0572968730202378 ENSG00000178927:ENST00000306645:exon_80403740_80403836:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000437807:exon_80403740_80403836:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000434650:exon_80403740_80403836:C17orf62;ENSG00000178927:ENST00000342572:exon_80403740_80403836:C17orf62 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80885793 C/T 1 22 14 36 10.6325522036365 7.23383041586765 3.3987217877689 T:C C T 10 0.516702172561975 0.3174146376039 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80885781_80885864:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80885781_80885864:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80885781_80885864:TBCD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 23 18 41 11.1158500310746 9.30063910611555 1.81521092495902 T:C T C 10 0.516702172561975 0.640424958157084 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 670888 T/C 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 0.347762918852962 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 672836 A/G 1 14 16 30 6.76616958413235 8.2672347609916 -1.50106517685925 A:G A G 10 0.516702172561975 0.590174422955896 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 3457695 C/T 1 5 23 28 2.41648913719012 11.8841499689254 -9.4676608317353 T:C C T 10 0.516702172561975 0.000417345106972818 ENSG00000177426:ENST00000401449:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000345133:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000405385:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000407501:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000340165:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000343820:exon_3457363_3458388:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000457420:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000330513:exon_3457363_3458409:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000400167:exon_3457363_3458404:TGIF1;ENSG00000177426:ENST00000472042:exon_3457363_3458409:TGIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 9126876 G/T 1 60 108 168 28.9978696462815 55.8038346366933 -26.8059649904118 T:G G T 10 0.516702172561975 3.77729888141494e-05 ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9126829_9126905:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9126829_9126905:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000465096:exon_9126829_9126905:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474740:exon_9126829_9126905:NDUFV2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 9255889 C/T 1 103 105 208 49.7796762261166 54.2537281190074 -4.47405189289081 T:C C T 10 0.516702172561975 0.578993900341407 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255875_9255900:ANKRD12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 108 109 217 52.1961653633067 56.3205368092553 -4.12437144594858 A:G A G 10 0.516702172561975 0.5874178630855 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 9570586 T/C 1 2 8 10 0.96659565487605 4.1336173804958 -3.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0579335952414094 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9570155_9570681:PPP4R1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 11851804 G/A 1 22 25 47 10.6325522036365 12.9175543140494 -2.28500211041283 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.560502979227703 ENSG00000255112:ENST00000526991:exon_11851439_11854448:CHMP1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 11884474 C/G 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 C:G C G 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000141404:ENST00000334049:exon_11880988_11885684:GNAL;ENSG00000154889:ENST00000317235:exon_11883470_11884626:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000496196:exon_11883689_11884626:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000309976:exon_11884048_11884626:MPPE1;ENSG00000154889:ENST00000344987:exon_11884069_11884626:MPPE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 74 97 171 35.7640392304139 50.1201107385116 -14.3560715080977 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0319045509240379 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 12351342 C/T 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 T:C C T 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12351305_12351412:AFG3L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 12356693 T/C 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 T:C T C 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12356693_12356830:AFG3L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 13666602 C/A 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:C C A 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13663346_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13663350_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13663350_13666712:C18orf19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 13681750 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13681604_13682104:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13681604_13682111:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13681604_13682104:C18orf19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 21107740 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 29125936 A/C 1 11 15 26 5.31627610181827 7.75053258842963 -2.43425648661135 A:C A C 10 0.516702172561975 0.433246399406951 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 15 12 27 7.24946741157037 6.2004260707437 1.04904134082667 A:G A G 10 0.516702172561975 0.705414871424267 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 33751048 G/A 1 38 22 60 18.3653174426449 11.3674477963635 6.9978696462815 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0922746891369328 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33751010_33751123:ELP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 34205508 C/T 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.171565918300221 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34205474_34205712:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34205474_34205712:FHOD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 34324091 G/A 1 4 10 14 1.9331913097521 5.16702172561975 -3.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.108891126564131 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34323995_34324156:FHOD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 34340651 C/T 1 27 9 36 13.0490413408267 4.65031955305778 8.3987217877689 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0067709206431968 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34340571_34340745:FHOD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 42281536 G/A 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 A:G G A 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000152217:ENST00000426838:exon_42281140_42281797:SETBP1;ENSG00000152217:ENST00000282030:exon_42281140_42281797:SETBP1;ENSG00000152217:ENST00000383046:exon_42281140_42281797:SETBP1;ENSG00000152217:ENST00000426288:exon_42281140_42281797:SETBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 44470637 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000078043:ENST00000398654:exon_44470543_44471017:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000262161:exon_44470543_44471017:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000398651:exon_44470543_44471017:PIAS2;ENSG00000078043:ENST00000324794:exon_44470543_44471017:PIAS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 47800179 G/C 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 C:G G C 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000141644:ENST00000353909:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269471:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000424334:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000436910:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000349085:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000347968:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000269468:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000457839:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000382948:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398495:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398493:exon_47799934_47800233:MBD1;ENSG00000141644:ENST00000398488:exon_47799934_47800233:MBD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 47809017 C/T 1 56 67 123 27.0646783365294 34.6190455616523 -7.55436722512293 T:C C T 10 0.516702172561975 0.177086572880030 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47808713_47809109:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47808715_47809109:CXXC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 47911594 G/T 1 9 1 10 4.34968044694222 0.516702172561975 3.83297827438025 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0221724159583656 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 47911631 A/G 1 11 2 13 5.31627610181827 1.03340434512395 4.28287175669433 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0233985038423332 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 78 80 158 37.6972305401659 41.336173804958 -3.63894326479205 T:C T C 10 0.516702172561975 0.578104581652227 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 36 47 83 17.3987217877689 24.2850021104128 -6.88628032264393 T:C C T 10 0.516702172561975 0.153057023100148 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 55269007 G/A 1 39 24 63 18.848615270083 12.4008521414874 6.44776312859557 A:G G A 10 0.516702172561975 0.129738161296751 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 56824846 A/G 1 234 146 380 113.091691620498 75.4385171940484 37.6531744264495 A:G A G 10 0.516702172561975 0.000113484345728226 ENSG00000166562:ENST00000299714:exon_56824840_56824897:SEC11C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 60036404 T/G 1 6 12 18 2.89978696462815 6.2004260707437 -3.30063910611555 T:G T G 10 0.516702172561975 0.156942134254247 ENSG00000141655:ENST00000269485:exon_60035934_60036717:TNFRSF11A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 61570529 C/G 1 9 1 10 4.34968044694222 0.516702172561975 3.83297827438025 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0221724159583656 ENSG00000197632:ENST00000299502:exon_61570135_61571124:SERPINB2;ENSG00000197632:ENST00000457692:exon_61570135_61571113:SERPINB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 61597418 C/T 1 13 3 16 6.28287175669432 1.55010651768593 4.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0223902666277186 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61597279_61597421:SERPINB10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 72168608 G/A 1 23 14 37 11.1158500310746 7.23383041586765 3.88201961520692 A:G G A 10 0.516702172561975 0.249649526632086 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72168564_72168707:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72168564_72168707:CNDP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 72176083 T/C 1 24 23 47 11.5991478585126 11.8841499689254 -0.285002110412828 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72176075_72176163:CNDP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 72178161 T/C 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 T:C T C 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72178048_72178248:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72178048_72178248:CNDP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 77227476 A/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397790:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77227450_77227582:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77227450_77227582:NFATC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 77513721 T/C 1 9 12 21 4.34968044694222 6.2004260707437 -1.85074562380148 T:C T C 10 0.516702172561975 0.514228237115183 ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 60 39 99 28.9978696462815 20.151384729917 8.84648491636447 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0869923583926277 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 18 77895963 C/T 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000101544:ENST00000262198:exon_77893495_77898226:ADNP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 580665 T/C 1 143 101 244 69.1115893236376 52.1869194287595 16.9246698948781 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0343250101419836 ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580646_580782:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580646_580782:BSG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 30 44 74 14.4989348231407 22.7348955927269 -8.23596076958615 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0625174657794995 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 617862 G/A 1 16 4 20 7.7327652390084 2.0668086902479 5.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0127309252361117 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617777_617870:POLRMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 621567 C/G 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 C:G C G 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 622368 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 629846 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_629540_630168:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_629540_630168:POLRMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 875389 G/A 1 16 16 32 7.7327652390084 8.2672347609916 -0.534469521983201 A:G G A 10 0.516702172561975 0.861671663830205 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_875244_875454:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_875244_875454:MED16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 13 13 26 6.28287175669432 6.71712824330568 -0.434256486611352 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 897433 G/A 1 32 31 63 15.4655304780168 16.0177673494212 -0.552236871404428 A:G G A 10 0.516702172561975 0.900398486297006 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_896503_897540:C19orf22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 901507 A/G 1 17 8 25 8.21606306644642 4.1336173804958 4.08244568595062 A:G A G 10 0.516702172561975 0.112640979957940 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_901422_901546:C19orf22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 968399 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 985936 C/T 1 27 26 53 13.0490413408267 13.4342564866114 -0.385215145784677 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_985865_985975:WDR18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 992031 G/T 1 28 30 58 13.5323391682647 15.5010651768593 -1.96872600859455 T:G G T 10 0.516702172561975 0.693842210958923 ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1011894 G/A 1 47 49 96 22.7149978895872 25.3184064555368 -2.6034085659496 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610943258733416 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1011891_1011991:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1011891_1011991:C19orf6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 52 41 93 25.1314870267773 21.184789075041 3.94669795173632 C:G C G 10 0.516702172561975 0.467908201461277 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 53 43 96 25.6147848542153 22.2181934201649 3.3965914340504 A:G A G 10 0.516702172561975 0.540405923378544 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1036552 T/C 1 124 98 222 59.9289306023151 50.6368129110736 9.29211769124154 T:C T C 10 0.516702172561975 0.226872617973548 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1037563 A/G 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.291257287751457 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1037584 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1085966 A/G 1 69 66 135 33.3475500932237 34.1023433890904 -0.754793295866627 A:G A G 10 0.516702172561975 0.931470396286202 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1278793 C/T 1 46 53 99 22.2317000621491 27.3852151457847 -5.15351508363553 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.315704857550634 ENSG00000228300:ENST00000409293:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000492647:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000513897:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000518332:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000530634:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000469144:exon_1278776_1279227:C19orf24;ENSG00000228300:ENST00000485191:exon_1278776_1279221:C19orf24;ENSG00000226593:ENST00000416408:exon_1278776_1279242:AC004258.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1360644 G/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 C:G G C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1430303 T/C 1 20 32 52 9.6659565487605 16.5344695219832 -6.8685129732227 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0704268543691718 ENSG00000071626:ENST00000233078:exon_1430221_1430361:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000395533:exon_1430221_1430361:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000336761:exon_1430221_1430361:DAZAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1615802 G/A 1 29 29 58 14.0156369957027 14.9843630042973 -0.968726008594551 A:G G A 10 0.516702172561975 0.895625377248882 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 1997383 G/A 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G G A 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 37 38 75 17.8820196152069 19.6346825573551 -1.75266294214813 A:G A G 10 0.516702172561975 0.729515958473534 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 37 34 71 17.8820196152069 17.5678738671072 0.314145748099772 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2097986 T/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C T C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2098015 T/C 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097928_2098126:IZUMO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 30 38 68 14.4989348231407 19.6346825573551 -5.1357477342143 A:G G A 10 0.516702172561975 0.226456955543866 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2216984 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2216954_2217089:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2216954_2217089:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2216954_2217089:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000482433:exon_2216954_2217089:DOT1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2226772 G/C 1 33 21 54 15.9488283054548 10.8507456238015 5.09808268165335 C:G G C 10 0.516702172561975 0.175432873725080 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2353150 C/A 1 14 16 30 6.76616958413235 8.2672347609916 -1.50106517685925 A:C C A 10 0.516702172561975 0.590174422955896 ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2417991 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2433890 A/G 1 22 24 46 10.6325522036365 12.4008521414874 -1.76829993785085 A:G A G 10 0.516702172561975 0.659196741670368 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2433824_2433897:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2433824_2434103:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000490554:exon_2433824_2434103:LMNB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2438119 C/T 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 C C 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2732986 T/C 1 15 22 37 7.24946741157037 11.3674477963635 -4.11798038479308 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.190850720529080 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2762585 A/C 1 15 4 19 7.24946741157037 2.0668086902479 5.18265872132247 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0204537324445867 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2767210 C/T 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2810310 C/T 1 55 52 107 26.5813805090914 26.8685129732227 -0.287132464131329 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172009:ENST00000307741:exon_2810302_2810488:THOP1;ENSG00000172009:ENST00000395212:exon_2810302_2810488:THOP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2933480 C/T 1 9 2 11 4.34968044694222 1.03340434512395 3.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0670490889820124 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 2934519 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3155736 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3162984 C/T 1 28 34 62 13.5323391682647 17.5678738671072 -4.03553469884245 T:C C T 10 0.516702172561975 0.312543446628974 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3162791_3163766:GNA15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3207398 G/A 1 28 34 62 13.5323391682647 17.5678738671072 -4.03553469884245 A:G G A 10 0.516702172561975 0.312543446628974 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 25 28 53 12.0824456859506 14.4676608317353 -2.38521514578468 T:C T C 10 0.516702172561975 0.583058556551689 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 28 33 61 13.5323391682647 17.0511716945452 -3.51883252628048 A:G A G 10 0.516702172561975 0.373415283696759 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3496596 T/C 1 15 15 30 7.24946741157037 7.75053258842963 -0.501065176859251 T:C T C 10 0.516702172561975 0.857608347222054 ENSG00000129932:ENST00000250937:exon_3496539_3496884:DOHH;ENSG00000129932:ENST00000427575:exon_3496539_3496884:DOHH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3496833 G/A 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 A:G G A 10 0.516702172561975 0.833864825621324 ENSG00000129932:ENST00000250937:exon_3496539_3496884:DOHH;ENSG00000129932:ENST00000427575:exon_3496539_3496884:DOHH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3573792 G/A 1 49 16 65 23.6815935444632 8.2672347609916 15.4143587834716 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000150744774521234 ENSG00000064961:ENST00000416526:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000470356:exon_3573690_3574267:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000333651:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000417382:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000453933:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000435022:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000402569:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000262949:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000488973:exon_3573690_3574584:HMG20B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3624005 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000105298:ENST00000429344:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000248420:exon_3623686_3624160:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000446452:exon_3623786_3624125:C19orf29;ENSG00000105298:ENST00000221899:exon_3623686_3624160:C19orf29 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3976549 C/T 1 1824 1675 3499 881.535237246958 865.476139041308 16.0590982056493 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.588366535884172 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3976055_3976745:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3976055_3976745:EEF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 224 209 433 108.258713346118 107.990754065453 0.267959280664812 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 3983220 G/A 1 347 275 622 167.704346120995 142.093097454543 25.6112486664515 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0407593993896584 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4013263 G/A 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4013322 T/C 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4012921_4013347:PIAS4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4110552 C/G 1 33 19 52 15.9488283054548 9.81734127867753 6.1314870267773 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0967222427534044 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4110507_4110653:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4110507_4110653:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4110507_4110653:MAP2K2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4231323 C/T 1 55 42 97 26.5813805090914 21.701491247603 4.87988926148842 T:C C T 10 0.516702172561975 0.360792194658150 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4234811 G/A 1 188 229 417 90.8599915583487 118.324797516692 -27.4648059583436 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.00807250558423078 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4234664_4234821:EBI3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 305 216 521 147.405837368598 111.607669273387 35.798168095211 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00183113409573839 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 4251033 G/A 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 5654449 G/A 1 62 57 119 29.9644653011575 29.4520238360326 0.512441465124972 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000160633:ENST00000433404:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000292123:exon_5654379_5654467:SAFB;ENSG00000160633:ENST00000454510:exon_5654379_5654467:SAFB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 5696146 G/A 1 42 44 86 20.298508752397 22.7348955927269 -2.43638684032985 A:G G A 10 0.516702172561975 0.666320264105956 ENSG00000196365:ENST00000360614:exon_5696065_5696181:LONP1;ENSG00000196365:ENST00000358403:exon_5696065_5696181:LONP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 5914605 A/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G A G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 5921255 A/G 1 21 23 44 10.1492543761985 11.8841499689254 -1.7348955927269 A:G A G 10 0.516702172561975 0.652310811044673 ENSG00000031823:ENST00000034275:exon_5921212_5921332:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000340578:exon_5921212_5921332:RANBP3;ENSG00000031823:ENST00000439268:exon_5921212_5921332:RANBP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6368570 G/A 1 119 128 247 57.512441465125 66.1378780879328 -8.62543662280783 A:G G A 10 0.516702172561975 0.279613640530353 ENSG00000125656:ENST00000245816:exon_6368549_6368915:CLPP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6468959 C/A 1 23 29 52 11.1158500310746 14.9843630042973 -3.8685129732227 A:C C A 10 0.516702172561975 0.331741179314814 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468857_6468964:DENND1C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6477256 G/T 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6477229_6477294:DENND1C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6734292 T/C 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6734194_6734318:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6734194_6734318:GPR108 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6742955 C/G 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 6755155 T/C 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 7619522 G/A 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7619441_7619609:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7619441_7619609:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7619441_7619609:PNPLA6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 7677611 C/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000076826:ENST00000160298:exon_7676573_7678049:KIAA1543;ENSG00000076826:ENST00000446248:exon_7676573_7678049:KIAA1543 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 199 115 314 96.176267660167 59.4207498446271 36.7555178155398 A:C:G G A 10 0.516702172561975 3.48743236273966e-05 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 7977293 C/A 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:C C A 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000076984:ENST00000397981:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397983:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000468058:exon_7977182_7977450:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000397979:exon_7977182_7979363:MAP2K7;ENSG00000076984:ENST00000425613:exon_7977182_7977316:MAP2K7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 7992052 A/C 1 34 49 83 16.4321261328928 25.3184064555368 -8.88628032264393 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0613261971621193 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 7992126 G/A 1 32 52 84 15.4655304780168 26.8685129732227 -11.4029824952059 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0158375593705129 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7991604_7992191:TIMM44 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8000001 C/T 1 35 35 70 16.9154239603309 18.0845760396691 -1.16915207933825 T:C C T 10 0.516702172561975 0.811696383184321 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7999950_8000030:TIMM44 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8028544 A/G 1 75 66 141 36.2473370578519 34.1023433890904 2.14499366876152 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.736708146377638 ENSG00000066044:ENST00000351593:exon_8023458_8028691:ELAVL1;ENSG00000066044:ENST00000407627:exon_8023458_8028691:ELAVL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 49 37 86 23.6815935444632 19.1179803847931 4.56361315967015 A:G G A 10 0.516702172561975 0.333811621818799 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8367400 C/T 1 22 29 51 10.6325522036365 14.9843630042973 -4.35181080066073 T:C C T 10 0.516702172561975 0.262523482172789 ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8369961 G/A 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8369915_8370040:CD320 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8466991 C/T 1 88 64 152 42.5302088145462 33.0689390439664 9.4612697705798 T:C C T 10 0.516702172561975 0.143828150394213 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8466970_8467163:RAB11B;ENSG00000185236:ENST00000449488:exon_8466970_8467163:RAB11B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 8468337 C/T 1 88 67 155 42.5302088145462 34.6190455616523 7.91116325289387 T:C C T 10 0.516702172561975 0.227953738469371 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 9271969 C/A 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 9453637 C/G 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000188321:ENST00000317221:exon_9452371_9453744:ZNF559;ENSG00000188321:ENST00000393883:exon_9452371_9454519:ZNF559 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 9639355 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000130818:ENST00000253115:exon_9638683_9640312:ZNF426 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 9677062 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197961:ENST00000320451:exon_9676292_9677785:ZNF121 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 9939092 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 9949152 G/A 1 72 55 127 34.7974435755378 28.4186194909086 6.37882408462917 A:G G A 10 0.516702172561975 0.286775047000203 ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10225138 G/A 1 32 23 55 15.4655304780168 11.8841499689254 3.58138050909137 A:G G A 10 0.516702172561975 0.348289230478585 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10225434 C/G 1 35 30 65 16.9154239603309 15.5010651768593 1.41435878347162 C:G C G 10 0.516702172561975 0.804269897116631 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10334663 T/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000175898:ENST00000317726:exon_10332109_10335623:S1PR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10370444 A/C 1 124 141 265 59.9289306023151 72.8550063312385 -12.9260757289234 A:C A C 10 0.516702172561975 0.124244701854063 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10385417 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10385540 A/T 1 40 40 80 19.331913097521 20.668086902479 -1.336173804958 A:T A T 10 0.516702172561975 0.823234448002647 ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10385441_10385704:ICAM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 A:G G A 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10489072 C/T 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10488890_10489184:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000531836:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530829:exon_10488890_10489102:TYK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10514198 A/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G A G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000105401:ENST00000222005:exon_10514054_10514271:CDC37 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10742831 C/T 1 18 20 38 8.69936089388445 10.3340434512395 -1.63468255735505 T:C C T 10 0.516702172561975 0.629088378265371 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742720_10742832:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742720_10742832:SLC44A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 10883234 C/T 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10883155_10883304:DNM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 11132541 C/T 1 19 18 37 9.18265872132247 9.30063910611555 -0.117980384793077 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11132401_11132643:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11132401_11132643:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11132401_11132643:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11132401_11132643:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11132401_11132643:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11132401_11132643:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11132401_11132643:SMARCA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 11221324 G/A 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.510005655959431 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 11223929 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 11230881 T/C 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 T:C T C 10 0.516702172561975 0.171565918300221 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 11598566 T/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:T T A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000161914:ENST00000293771:exon_11598107_11598718:ZNF653 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 13869757 C/T 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13869682_13869824:CCDC130 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 13936385 C/T 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13936364_13936527:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13936364_13936527:ZSWIM4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14142705 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000104998:ENST00000263379:exon_14142262_14142784:IL27RA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14492265 T/C 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14492272 T/C 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 T:C T C 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14492213_14492357:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14492213_14492357:CD97 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14554346 G/A 1 6 14 20 2.89978696462815 7.23383041586765 -4.3340434512395 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.0716012253169818 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14554282_14554433:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14554282_14554433:PKN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 1 12 13 0.483297827438025 6.2004260707437 -5.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00135644941582011 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14629150 G/A 1 10 15 25 4.83297827438025 7.75053258842963 -2.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.317309137874082 ENSG00000132002:ENST00000254322:exon_14628951_14629201:DNAJB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14674068 C/G 1 28 32 60 13.5323391682647 16.5344695219832 -3.0021303537185 C:G C G 10 0.516702172561975 0.442139910242096 ENSG00000099797:ENST00000215567:exon_14674018_14674069:TECR;ENSG00000099797:ENST00000436007:exon_14674018_14674069:TECR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14705499 G/A 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G G A 10 0.516702172561975 0.768176255959594 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 14705509 T/C 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 T:C T C 10 0.516702172561975 0.411436749794389 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15226084 G/A 1 41 41 82 19.815210924959 21.184789075041 -1.36957815008196 A:G G A 10 0.516702172561975 0.825325614076628 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15225795_15226732:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15225798_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15225827_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15225965_15226133:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226083_15226241:ILVBL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 25 19 44 12.0824456859506 9.81734127867753 2.2651044072731 A:G G A 10 0.516702172561975 0.547899287460427 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15233581 C/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:C C A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15233504_15233841:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15233504_15233615:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15233504_15233615:ILVBL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15234308 G/A 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 A:G G A 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15234186_15234845:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000527093:exon_15234186_15234387:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533747:exon_15234186_15234387:ILVBL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15366205 G/A 1 35 31 66 16.9154239603309 16.0177673494212 0.897656610909646 A:G G A 10 0.516702172561975 0.902145097395467 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15366108_15366403:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000371835:exon_15366108_15366403:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000392878:exon_15366108_15366403:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000360016:exon_15366108_15366403:BRD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15465715 G/A 1 19 21 40 9.18265872132247 10.8507456238015 -1.668086902479 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63729998462501 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15464341_15466181:AKAP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15480981 G/A 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15480957_15480990:AKAP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 15537984 G/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000011451:ENST00000263381:exon_15537793_15538344:WIZ;ENSG00000011451:ENST00000389282:exon_15537793_15538344:WIZ;ENSG00000011451:ENST00000416927:exon_15537793_15538344:WIZ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 16238279 C/T 1 19 15 34 9.18265872132247 7.75053258842963 1.43212613289285 T:C C T 10 0.516702172561975 0.732144357326082 ENSG00000167461:ENST00000300935:exon_16238247_16238336:RAB8A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 16345274 T/C 1 18 17 35 8.69936089388445 8.78393693355358 -0.0845760396691269 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16345224_16346156:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16345224_16346156:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000429941:exon_16345224_16346149:AP1M1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 16532230 G/C 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 C:G G C 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000127527:ENST00000455140:exon_16532130_16532287:EPS15L1;ENSG00000127527:ENST00000248070:exon_16532130_16532287:EPS15L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17163775 G/A 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17213061 C/T 1 17 20 37 8.21606306644642 10.3340434512395 -2.11798038479308 T:C C T 10 0.516702172561975 0.514174537875676 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17212466_17213367:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17212466_17213367:MYO9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17301968 C/T 1 15 7 22 7.24946741157037 3.61691520793383 3.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.138559169128612 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17301906_17302028:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17301906_17302028:MYO9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17303774 T/G 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 T:G T G 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17303555_17303871:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17303555_17303871:MYO9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 18 18 36 8.69936089388445 9.30063910611555 -0.601278212231101 T:C T C 10 0.516702172561975 0.868903889692238 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17305781 T/G 1 30 20 50 14.4989348231407 10.3340434512395 4.16489137190125 T:G T G 10 0.516702172561975 0.259686227954463 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17308692 G/A 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 A:G G A 10 0.516702172561975 0.214197131356958 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17337557 G/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:G G T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17337928 C/T 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337803_17338008:OCEL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17452287 G/C 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 C:G G C 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17452287_17453539:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17452287_17453539:GTPBP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17516142 A/G 1 353 308 661 170.604133085623 159.144269149088 11.4598639365345 A:G A G 10 0.516702172561975 0.391918730991982 ENSG00000130303:ENST00000416178:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000252593:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000446020:exon_17516100_17516427:BST2;ENSG00000130303:ENST00000527220:exon_17516100_17516339:BST2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17835962 G/C 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17835858_17835998:MAP1S HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17837806 C/A 1 24 17 41 11.5991478585126 8.78393693355358 2.81521092495902 A:C C A 10 0.516702172561975 0.435889184910351 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17837819 C/G 1 16 21 37 7.7327652390084 10.8507456238015 -3.11798038479308 C:G C G 10 0.516702172561975 0.327297418610929 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 20 10 30 9.6659565487605 5.16702172561975 4.49893482314075 A:G A G 10 0.516702172561975 0.142649534990553 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 17943770 C/T 0 0 9 9 0 4.65031955305778 -4.65031955305778 T C T 10 0.516702172561975 0.00143857856770658 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 39 50 89 18.848615270083 25.8351086280988 -6.98649335801578 T:C:G T G 10 0.516702172561975 0.167609013220035 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18170384 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18187128 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18187107_18187137:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18187107_18187137:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18187107_18187137:IL12RB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18191664 C/G 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 C:G C G 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18191642_18191811:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18191642_18191811:IL12RB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18561420 C/T 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18561473 G/A 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 0 56 1 57 27.0646783365294 0.516702172561975 26.5479761639674 A:C C A 10 0.516702172561975 4.33979659330114e-15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19010736 G/A 1 294 378 672 142.089561266779 195.313421228427 -53.2238599616472 A:G G A 10 0.516702172561975 4.17003119290023e-05 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19010682_19010756:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19010682_19010756:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19010682_19010756:COPE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19032680 T/C 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19032652_19032773:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19032652_19032773:DDX49 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19115078 G/A 1 14 15 29 6.76616958413235 7.75053258842963 -0.984363004297276 A:G G A 10 0.516702172561975 0.715533472379847 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19114977_19115082:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19114977_19115082:SUGP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19136541 C/T 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 T:C C T 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19390185 G/A 1 27 16 43 13.0490413408267 8.2672347609916 4.78180657983507 A:G G A 10 0.516702172561975 0.169956210615501 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19416695 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19416658_19416885:SUGP1;ENSG00000105705:ENST00000334782:exon_19416658_19416885:SUGP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 19741160 G/T 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 21720616 T/C 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 T:C T C 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 21909512 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 T:C T C 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 23837365 A/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:C A C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 30164797 A/G 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33075916 G/A 1 81 92 173 39.14712402248 47.5365998757017 -8.38947585322168 A:G G A 10 0.516702172561975 0.223500649782876 ENSG00000105185:ENST00000221784:exon_33075856_33075917:PDCD5;ENSG00000105185:ENST00000419343:exon_33075856_33075917:PDCD5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33131227 C/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33131213_33131291:ANKRD27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33370084 T/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33370143 G/A 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33370161 A/C 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:C A C 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33369908_33370284:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33369908_33370284:CCDC123 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33493262 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000131941:ENST00000254260:exon_33493153_33493309:RHPN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 33870574 A/C 1 66 50 116 31.8976566109096 25.8351086280988 6.06254798281089 A:C:G A C 10 0.516702172561975 0.266504837996385 ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 34859508 G/A 1 93 93 186 44.9466979517363 48.0533020482637 -3.10660409652736 A:G G A 10 0.516702172561975 0.660404911493983 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34859488_34859607:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34859488_34859607:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34859488_34859607:GPI;ENSG00000105220:ENST00000392234:exon_34857688_34860072:GPI HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 34890981 C/G 1 1133 1010 2143 547.576438487282 521.869194287595 25.7072441996875 T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.270366282227038 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34890806_34891210:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34890806_34891236:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34890806_34891210:GPI HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 34942901 C/T 1 7 15 22 3.38308479206617 7.75053258842963 -4.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 0.086085110143936 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34942886_34943052:UBA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 24 11 35 11.5991478585126 5.68372389818173 5.91542396033087 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0613679261503642 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 35516949 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 95 108 203 45.9132936066124 55.8038346366933 -9.89054103008093 A:G A G 10 0.516702172561975 0.182016103049770 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 36033460 C/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000105679:ENST00000222286:exon_36033392_36033510:GAPDHS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 157 203 360 75.8777589077699 104.890541030081 -29.012782122311 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00259975089791376 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 36233713 A/G 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.597726529086425 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 36595436 A/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:C A C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36595420_36595577:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36595420_36595577:WDR62 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 T:G G T 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 47 72 119 22.7149978895872 37.2025564244622 -14.487558534875 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0099253779792689 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 25 39 64 12.0824456859506 20.151384729917 -8.0689390439664 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0458250358444074 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 38897664 G/A 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38897550_38897717:FAM98C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39336703 T/C 1 43 42 85 20.7818065798351 21.701491247603 -0.919684667767878 T:C T C 10 0.516702172561975 0.913671173343735 ENSG00000104824:ENST00000221419:exon_39336493_39336730:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388750:exon_39336493_39336730:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000388749:exon_39336493_39336730:HNRNPL;ENSG00000104824:ENST00000423415:exon_39336493_39336730:HNRNPL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39913558 A/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39913634 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39914028 G/A 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39914644 G/A 1 11 13 24 5.31627610181827 6.71712824330568 -1.4008521414874 A:G G A 10 0.516702172561975 0.68401647134037 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 15 14 29 7.24946741157037 7.23383041586765 0.0156369957027236 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 18 13 31 8.69936089388445 6.71712824330568 1.98223265057877 A:G G A 10 0.516702172561975 0.590584117684727 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 19 24 43 9.18265872132247 12.4008521414874 -3.21819342016493 C:G C G 10 0.516702172561975 0.361716926834595 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 39923985 G/A 1 2685 2450 5135 1297.6546666711 1265.92032277684 31.734343894258 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.379061888984927 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40029986 C/T 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 T:C C T 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000176396:ENST00000390658:exon_40028890_40030870:EID2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40224986 A/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105205:ENST00000221804:exon_40224923_40225133:CLC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40739482 C/A 1 31 36 67 14.9822326505788 18.6012782122311 -3.61904556165233 A:C C A 10 0.516702172561975 0.394257011772369 ENSG00000105221:ENST00000392038:exon_40736224_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000486368:exon_40738241_40739590:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000483166:exon_40738242_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000476266:exon_40738244_40739858:AKT2;ENSG00000105221:ENST00000358335:exon_40738870_40739596:AKT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40828238 C/T 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000160392:ENST00000357884:exon_40826973_40828283:C19orf47;ENSG00000160392:ENST00000392035:exon_40826973_40828283:C19orf47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40947448 A/G 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40947751 G/A 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 40947907 C/T 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000167565:ENST00000322354:exon_40946749_40947993:SERTAD3;ENSG00000167565:ENST00000392028:exon_40946749_40947993:SERTAD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41086309 G/C 1 13 26 39 6.28287175669432 13.4342564866114 -7.15138472991703 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0245987891547716 ENSG00000160410:ENST00000291842:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000428635:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000418276:exon_41086230_41086391:SHKBP1;ENSG00000160410:ENST00000446701:exon_41086230_41086391:SHKBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41263403 A/G 1 64 58 122 30.9310609560336 29.9687260085946 0.962334947439047 A:G A G 10 0.516702172561975 0.927873912465226 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41263237_41263409:SNRPA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41292601 A/T 1 42 55 97 20.298508752397 28.4186194909086 -8.12011073851158 A:T A T 10 0.516702172561975 0.104597795244476 ENSG00000167578:ENST00000357052:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000378307:exon_41292570_41292665:RAB4B;ENSG00000167578:ENST00000419646:exon_41292570_41292665:RAB4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41884327 T/C 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 T:C T C 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000342187:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000413014:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000436170:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000447302:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41884186_41884424:TMEM91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41892607 G/A 1 22 23 45 10.6325522036365 11.8841499689254 -1.25159776528888 A:G G A 10 0.516702172561975 0.766399085730726 ENSG00000077348:ENST00000221233:exon_41892281_41892630:EXOSC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41916547 C/T 1 20 16 36 9.6659565487605 8.2672347609916 1.3987217877689 T:C C T 10 0.516702172561975 0.739470758601549 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41925194 C/T 1 49 49 98 23.6815935444632 25.3184064555368 -1.63681291107356 T:C C T 10 0.516702172561975 0.762469904740306 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41925040_41925201:BCKDHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 41939248 C/T 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 T:C C T 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 42906914 G/T 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 T:G G T 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42906759_42907183:LIPE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 44058851 C/T 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44058798_44058956:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44058798_44058956:XRCC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45254629 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000069399:ENST00000164227:exon_45254484_45254637:BCL3;ENSG00000069399:ENST00000403534:exon_45254484_45254637:BCL3;ENSG00000069399:ENST00000444487:exon_45254578_45254637:BCL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45397307 C/T 1 43 44 87 20.7818065798351 22.7348955927269 -1.95308901289183 T:C C T 10 0.516702172561975 0.747811496149306 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45397218_45397323:TOMM40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 18 12 30 8.69936089388445 6.2004260707437 2.49893482314075 T:C T C 10 0.516702172561975 0.465598635369486 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45572391 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45574127 G/A 1 19 16 35 9.18265872132247 8.2672347609916 0.915423960330873 A:G G A 10 0.516702172561975 0.866093820681115 ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45574061_45574214:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45574061_45574213:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45574061_45574213:CLASRP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45575663 T/G 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 T:G T G 10 0.516702172561975 0.833864825621324 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45579549 T/C 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45579334_45579688:ZNF296 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45593763 C/A 1 49 36 85 23.6815935444632 18.6012782122311 5.08031533223212 A:C C A 10 0.516702172561975 0.279815486255821 ENSG00000142252:ENST00000414125:exon_45593365_45594782:GEMIN7;ENSG00000142252:ENST00000270257:exon_45593365_45594782:GEMIN7;ENSG00000142252:ENST00000391951:exon_45593365_45594782:GEMIN7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45911436 G/A 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 12 16 28 5.7995739292563 8.2672347609916 -2.4676608317353 A:C A C 10 0.516702172561975 0.450090452987714 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45912257 C/T 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 18 11 29 8.69936089388445 5.68372389818173 3.01563699570272 A:G A G 10 0.516702172561975 0.272663820448322 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 A:G G A 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 45923653 A/G 1 18 15 33 8.69936089388445 7.75053258842963 0.948828305454824 A:G A G 10 0.516702172561975 0.862114069790544 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 101 88 189 48.8130805712405 45.4697911854538 3.34328938578672 T:G T G 10 0.516702172561975 0.662556664519646 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46025388 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46026970 T/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:T T A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46057081 A/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46206220 G/A 1 19 12 31 9.18265872132247 6.2004260707437 2.98223265057877 A:G G A 10 0.516702172561975 0.369231919605051 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46275976 G/C 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 C:G G C 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000104936:ENST00000458663:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000447742:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000291270:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000377750:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000342805:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000343373:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000348168:exon_46275899_46276010:DMPK;ENSG00000104936:ENST00000354227:exon_46275899_46276010:DMPK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46327053 C/T 1 24 18 42 11.5991478585126 9.30063910611555 2.29850875239705 T:C C T 10 0.516702172561975 0.538287300222674 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46327025_46327133:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46327025_46327133:SYMPK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46330809 G/A 1 27 33 60 13.0490413408267 17.0511716945452 -4.0021303537185 A:G G A 10 0.516702172561975 0.305201401480351 ENSG00000125755:ENST00000245934:exon_46330768_46330881:SYMPK;ENSG00000125755:ENST00000340643:exon_46330768_46330881:SYMPK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46387792 G/C 1 21 17 38 10.1492543761985 8.78393693355358 1.36531744264495 C:G G C 10 0.516702172561975 0.746255675426388 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 46388379 C/G 1 21 14 35 10.1492543761985 7.23383041586765 2.91542396033087 C:G C G 10 0.516702172561975 0.398376363469485 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47124714 T/G 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 T:G T G 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47137459 C/T 1 26 13 39 12.5657435133886 6.71712824330568 5.84861527008297 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0770001613490039 ENSG00000167414:ENST00000300873:exon_47137333_47137461:GNG8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47226450 A/G 1 18 4 22 8.69936089388445 2.0668086902479 6.63255220363655 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00480346847647182 ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47226371_47226541:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47226371_47226541:STRN4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47278859 C/G 1 165 135 300 79.7441415272741 69.7547932958666 9.98934823140749 C:G C G 10 0.516702172561975 0.272362703212930 ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47278140_47279004:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47278142_47279004:SLC1A5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47425577 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000160007:ENST00000317082:exon_47421933_47425613:GRLF1;ENSG00000160007:ENST00000404338:exon_47421933_47425613:GRLF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47768128 G/C 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 C:G G C 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47768030_47768203:CCDC9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47770015 A/C 1 13 17 30 6.28287175669432 8.78393693355358 -2.50106517685925 A:C A C 10 0.516702172561975 0.368796400932296 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47769868_47770049:CCDC9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 14 14 28 6.76616958413235 7.23383041586765 -0.467660831735301 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 47978671 G/A 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47978400_47978801:KPTN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48255804 A/G 1 99 75 174 47.8464849163645 38.7526629421481 9.09382197421635 A:G A G 10 0.516702172561975 0.172809539285373 ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48255769_48255864:GLTSCR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48284415 C/T 1 32 35 67 15.4655304780168 18.0845760396691 -2.61904556165233 T:C C T 10 0.516702172561975 0.543004764054045 ENSG00000178980:ENST00000509570:exon_48284365_48284439:SEPW1;ENSG00000178980:ENST00000396715:exon_48284365_48284439:SEPW1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48578082 A/G 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48578024_48578131:PLA2G4C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48601512 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48631258 G/A 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 A:G G A 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48631167_48631277:LIG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48639022 T/C 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C T C 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48638937_48639036:LIG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48734036 T/C 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000377461:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48734034_48734263:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48734034_48734263:CARD8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48977189 C/T 1 7 12 19 3.38308479206617 6.2004260707437 -2.81734127867753 T:C C T 10 0.516702172561975 0.252027255956844 ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48976979_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48975978_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000474209:exon_48977162_48977266:CYTH2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 48977479 C/T 1 18 20 38 8.69936089388445 10.3340434512395 -1.63468255735505 T:C C T 10 0.516702172561975 0.629088378265371 ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48977439_48977532:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48977439_48977587:CYTH2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49131526 G/C 1 16 11 27 7.7327652390084 5.68372389818173 2.04904134082667 C:G G C 10 0.516702172561975 0.448966948977557 ENSG00000063176:ENST00000406269:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000245222:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000340932:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000426514:exon_49131419_49131534:SPHK2;ENSG00000063176:ENST00000443164:exon_49131419_49131534:SPHK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49303070 G/C 1 34 20 54 16.4321261328928 10.3340434512395 6.09808268165335 C:G G C 10 0.516702172561975 0.103481350869611 ENSG00000105552:ENST00000316273:exon_49302932_49303095:BCAT2;ENSG00000105552:ENST00000402551:exon_49302932_49303095:BCAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49377242 G/C 1 136 156 292 65.7285045315714 80.6055389196681 -14.8770343880967 T:C:G G C 10 0.516702172561975 0.0893593318777979 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49377319 A/G 1 98 131 229 47.3631870889264 67.6879846056187 -20.3247975166923 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00805691528035036 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 101 106 207 48.8130805712405 54.7704302915694 -5.95734972032884 A:G G A 10 0.516702172561975 0.444363777120168 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49377436 G/C 1 104 102 206 50.2629740535546 52.7036216013215 -2.44064754776686 C:G G C 10 0.516702172561975 0.780444735599408 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 105 128 233 50.7462718809926 66.1378780879328 -15.3916062069402 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0490363402450981 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 96 88 184 46.3965914340504 45.4697911854538 0.926800248596592 T:C C T 10 0.516702172561975 0.941231319334746 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 108 115 223 52.1961653633067 59.4207498446271 -7.22458448132043 C:G G C 10 0.516702172561975 0.348549618520090 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G A G 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49485548 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49513317 C/T 1 65 63 128 31.4143587834716 32.5522368714044 -1.1378780879328 T:C C T 10 0.516702172561975 0.859952237144892 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49949826 G/T 1 32 19 51 15.4655304780168 9.81734127867753 5.64818919933927 T:G G T 10 0.516702172561975 0.124303922129108 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949808_49949951:PIH1D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 63 25 88 30.4477631285956 12.9175543140494 17.5302088145462 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.00016541622881847 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 62 23 85 29.9644653011575 11.8841499689254 18.0803153322321 T:G T G 10 0.516702172561975 7.70501614494795e-05 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49972135 G/T 1 18 30 48 8.69936089388445 15.5010651768593 -6.8017042829748 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0597557082983579 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49972121_49972243:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49972121_49972243:ALDH16A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 49994268 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000474171:exon_49994036_49994356:RPL13A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50124798 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50124782_50124879:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50124782_50124879:PRR12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50140092 G/A 1 10 15 25 4.83297827438025 7.75053258842963 -2.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.317309137874082 ENSG00000126458:ENST00000246792:exon_50140081_50140183:RRAS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 1 137 101 238 66.2118023590094 52.1869194287595 14.0248829302499 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0696743026603512 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 25 20 45 12.0824456859506 10.3340434512395 1.74840223471112 A:T:G T G 10 0.516702172561975 0.656047506256095 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 25 20 45 12.0824456859506 10.3340434512395 1.74840223471112 T:C T C 10 0.516702172561975 0.656047506256095 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50384494 C/T 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 T:C C T 10 0.516702172561975 0.833864825621324 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 309 274 583 149.33902867835 141.576395281981 7.76263339636856 A:G A G 10 0.516702172561975 0.534340588246136 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50412516 C/T 1 87 64 151 42.0469109871082 33.0689390439664 8.97797194314177 T:C C T 10 0.516702172561975 0.166083113652871 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 51 27 78 24.6481891993393 13.9509586591733 10.6972305401659 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0170294368839127 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50482480 C/T 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50482340_50482499:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50491733 G/A 1 14 7 21 6.76616958413235 3.61691520793383 3.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.194433587736325 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50491629_50491749:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50491735 T/C 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 T:C T C 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50491629_50491749:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50498078 C/T 1 18 8 26 8.69936089388445 4.1336173804958 4.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0797299920371934 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50498071_50498176:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50498138 G/A 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 A:G G A 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50498071_50498176:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50504056 T/C 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 T:C T C 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50504047_50504111:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50504097 T/C 1 22 14 36 10.6325522036365 7.23383041586765 3.3987217877689 T:C T C 10 0.516702172561975 0.3174146376039 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50504047_50504111:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50510862 A/G 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 A:G A G 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50510826_50511083:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50511060 G/T 1 25 24 49 12.0824456859506 12.4008521414874 -0.318406455536778 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50510826_50511083:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50512606 G/A 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50512493_50512642:VRK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50550127 A/G 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549814_50550214:ZNF473 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50881585 A/C 1 22 20 42 10.6325522036365 10.3340434512395 0.29850875239705 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881406_50881696:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881406_50881696:NR1H2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50882008 A/G 1 37 44 81 17.8820196152069 22.7348955927269 -4.85287597751998 A:G A G 10 0.516702172561975 0.317265530497541 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881779_50882053:NR1H2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50902659 C/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 C:G C G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50902628_50902741:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50902628_50902741:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50902628_50902741:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50902628_50902741:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50905042 G/A,T 0 0 10 10 0 5.16702172561975 -5.16702172561975 A:T G A 10 0.516702172561975 0.000695261896371495 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50905074 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50905310 G/A 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905256_50905381:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905256_50905381:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905256_50905381:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905256_50905381:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50906785 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50906750_50906854:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50906750_50906854:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50906750_50906854:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50906750_50906854:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50910628 C/T 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50910584_50910672:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50910584_50910672:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50910584_50910672:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50910584_50910672:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50912126 G/A 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:G G A 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50912042_50912158:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50912042_50912158:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50911964_50912158:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50912042_50912158:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50916772 T/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50916683_50916778:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50916683_50916778:POLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 50983930 C/T 1 30 22 52 14.4989348231407 11.3674477963635 3.1314870267773 T:C C T 10 0.516702172561975 0.407976616699407 ENSG00000161671:ENST00000430752:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376920:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000334976:exon_50983838_50984019:C19orf63;ENSG00000161671:ENST00000376918:exon_50983838_50984019:C19orf63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 112 131 243 54.1293566730588 67.6879846056187 -13.5586279325599 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0833752967908454 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 112 119 231 54.1293566730588 61.487558534875 -7.35820186181623 A:G G A 10 0.516702172561975 0.356809262720074 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 57 84 141 27.5479761639674 43.4029824952059 -15.8550063312385 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00878693043509547 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 51738920 T/C 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000105383:ENST00000262262:exon_51738850_51738931:CD33;ENSG00000105383:ENST00000421133:exon_51738850_51738931:CD33;ENSG00000105383:ENST00000436584:exon_51738850_51739027:CD33 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 33 25 58 15.9488283054548 12.9175543140494 3.03127399140545 A:G G A 10 0.516702172561975 0.434461273925975 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 52729030 C/T 1 173 160 333 83.6105241467783 82.672347609916 0.938176536862315 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.95628620420484 ENSG00000105568:ENST00000391791:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000322088:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000423369:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000436460:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000462990:exon_52728970_52729061:PPP2R1A;ENSG00000105568:ENST00000444322:exon_52728970_52729061:PPP2R1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 52793328 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 53270623 G/C 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 53270650 G/A 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 53270830 A/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 53572494 G/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:G G T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54080144 A/G 1 9 1 10 4.34968044694222 0.516702172561975 3.83297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0221724159583656 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000514022:exon_54079951_54080314:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000505949:exon_54079951_54080346:ZNF331 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54080780 C/T 0 13 0 13 6.28287175669432 0 6.28287175669432 C C 10 0.516702172561975 0.000265607658586506 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54080698_54080944:ZNF331 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54080999 A/G 1 12 1 13 5.7995739292563 0.516702172561975 5.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00363176502686701 ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54611361 G/A 1 52 40 92 25.1314870267773 20.668086902479 4.4634001242983 A:G G A 10 0.516702172561975 0.404144850611671 ENSG00000105619:ENST00000391759:exon_54611333_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000391758:exon_54611333_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000391757:exon_54611333_54611514:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000339150:exon_54611333_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000420715:exon_54611335_54611551:TFPT;ENSG00000105619:ENST00000437524:exon_54611356_54611514:TFPT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54632673 A/G 1 30 22 52 14.4989348231407 11.3674477963635 3.1314870267773 A:G A G 10 0.516702172561975 0.407976616699407 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54632647_54632745:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54632647_54632745:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54632647_54632745:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54632432_54632745:PRPF31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54634882 G/A 1 66 49 115 31.8976566109096 25.3184064555368 6.57925015537287 A:G G A 10 0.516702172561975 0.226486035672667 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54634738_54635140:PRPF31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54649671 T/C,G 0 0 17 17 0 8.78393693355358 -8.78393693355358 C:G T C 10 0.516702172561975 4.28205586281079e-06 ENSG00000088038:ENST00000221232:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000358389:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000411507:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000445408:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000482247:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000406403:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000440571:exon_54649646_54649779:CNOT3;ENSG00000088038:ENST00000447684:exon_54649646_54649779:CNOT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54660604 G/A 1 17 10 27 8.21606306644642 5.16702172561975 3.04904134082667 A:G G A 10 0.516702172561975 0.254915967431960 ENSG00000105617:ENST00000222224:exon_54660501_54660763:LENG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54962467 G/A 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:G G A 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376514:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000443957:exon_54962467_54962559:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54962467_54962559:LENG8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 A:G G A 10 0.516702172561975 0.833864825621324 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 C:G C G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54968079 G/A 1 38 29 67 18.3653174426449 14.9843630042973 3.38095443834767 A:G G A 10 0.516702172561975 0.463799635946740 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 C:G C G 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 54973325 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 11 14 25 5.31627610181827 7.23383041586765 -1.91755431404938 T:C T C 10 0.516702172561975 0.549349590631841 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55143420 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C T C 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55144556 G/A 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55144721 C/T 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55144577_55144769:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55145093 G/C 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 C:G G C 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 41 16 57 19.815210924959 8.2672347609916 11.5479761639674 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00215684660719261 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55606944 G/A 1 21 11 32 10.1492543761985 5.68372389818173 4.4655304780168 A:G G A 10 0.516702172561975 0.156040365063729 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55606813_55606968:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55606813_55606971:PPP1R12C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55739813 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55756992 A/G 1 10 16 26 4.83297827438025 8.2672347609916 -3.43425648661135 A:G A G 10 0.516702172561975 0.238643810373624 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55857679 C/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000133247:ENST00000255613:exon_55857581_55857717:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000445196:exon_55857581_55857717:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000460956:exon_55857581_55857717:SUV420H2;ENSG00000133247:ENST00000474492:exon_55857441_55857717:SUV420H2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55899470 A/G 1 14 4 18 6.76616958413235 2.0668086902479 4.69936089388445 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0325298474148406 ENSG00000108107:ENST00000426763:exon_55899298_55903449:RPL28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55994240 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55995401 T/C 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 55998330 A/G 1 23 17 40 11.1158500310746 8.78393693355358 2.331913097521 A:G A G 10 0.516702172561975 0.528084630024931 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 56089353 C/T 1 20 15 35 9.6659565487605 7.75053258842963 1.91542396033087 T:C C T 10 0.516702172561975 0.612752742841213 ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 56103978 C/A 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:C C A 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000179943:ENST00000221665:exon_56102738_56105012:FIZ1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 15 9 24 7.24946741157037 4.65031955305778 2.5991478585126 T:C C T 10 0.516702172561975 0.313952975137877 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 25 17 42 12.0824456859506 8.78393693355358 3.29850875239705 A:G G A 10 0.516702172561975 0.355473296376327 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 56156005 C/T 1 14 16 30 6.76616958413235 8.2672347609916 -1.50106517685925 T:C C T 10 0.516702172561975 0.590174422955896 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 57134126 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58018618 A/G 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:G A G 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58232372 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58233008 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000083814:ENST00000317398:exon_58231120_58233065:ZNF671;ENSG00000083814:ENST00000335820:exon_58231855_58233065:ZNF671 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58718453 G/A 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000171606:ENST00000326804:exon_58718087_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000424679:exon_58718364_58718568:ZNF274;ENSG00000171606:ENST00000345813:exon_58718364_58718568:ZNF274 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58772579 C/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 C:G C G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58928786 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 11 3 14 5.31627610181827 1.55010651768593 3.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0592840474220576 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 58929194 A/G 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 A:G A G 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 19 59028585 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 97 100 197 46.8798892614884 51.6702172561975 -4.79032799470908 A:G A G 10 0.516702172561975 0.521410073295333 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 36 34 70 17.3987217877689 17.5678738671072 -0.169152079338254 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 9634856 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000134330:ENST00000481367:exon_9634831_9634989:IAH1;ENSG00000151694:ENST00000310823:exon_9634766_9634896:ADAM17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 10263609 C/T 1 24 27 51 11.5991478585126 13.9509586591733 -2.35181080066073 T:C C T 10 0.516702172561975 0.57589558509599 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10263514_10263657:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10263514_10263657:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498235:exon_10263551_10263657:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10263514_10263657:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10263514_10263657:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10263514_10263839:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10263514_10263657:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000474701:exon_10263298_10263657:RRM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 15735648 T/C 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 T:C T C 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000079785:ENST00000381341:exon_15735614_15735677:DDX1;ENSG00000079785:ENST00000233084:exon_15735614_15735677:DDX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 17962518 C/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 24222610 C/G 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 C:G C G 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000173960:ENST00000446425:exon_24222542_24223690:UBXN2A;ENSG00000173960:ENST00000404924:exon_24222542_24223073:UBXN2A;ENSG00000173960:ENST00000309033:exon_24222542_24227779:UBXN2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 24302463 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000115129:ENST00000335934:exon_24302314_24302510:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000238721:exon_24302314_24302510:TP53I3;ENSG00000115129:ENST00000417886:exon_24302372_24302510:TP53I3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 24493627 A/T 1 37 51 88 17.8820196152069 26.3518108006607 -8.4697911854538 A:T A T 10 0.516702172561975 0.0873320741603592 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24493540_24493637:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24493540_24493637:ITSN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 24524958 C/T 1 1 9 10 0.483297827438025 4.65031955305778 -4.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0094848757557616 ENSG00000198399:ENST00000361999:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000355123:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380868:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000380883:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000415660:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000445614:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000406921:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000449230:exon_24524834_24524971:ITSN2;ENSG00000198399:ENST00000412011:exon_24524834_24524971:ITSN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 11 17 28 5.31627610181827 8.78393693355358 -3.4676608317353 T:C T C 10 0.516702172561975 0.256235981111179 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C T C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 26432662 G/T 1 29 18 47 14.0156369957027 9.30063910611555 4.71499788958717 T:G G T 10 0.516702172561975 0.190062784331248 ENSG00000084754:ENST00000380649:exon_26432649_26432758:HADHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 26507042 T/C 1 13 26 39 6.28287175669432 13.4342564866114 -7.15138472991703 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0245987891547716 ENSG00000138029:ENST00000317799:exon_26506985_26507072:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000405867:exon_26506985_26507072:HADHB;ENSG00000138029:ENST00000494615:exon_26506985_26507072:HADHB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27016057 C/G 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 C:G C G 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000115163:ENST00000475662:exon_27016013_27016194:CENPA;ENSG00000115163:ENST00000335756:exon_27016013_27016194:CENPA;ENSG00000115163:ENST00000472719:exon_27016013_27016194:CENPA;ENSG00000115163:ENST00000233505:exon_27016013_27016194:CENPA;ENSG00000115163:ENST00000419525:exon_27016013_27016194:CENPA;ENSG00000115163:ENST00000460030:exon_27016013_27016194:CENPA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27263673 G/A 1 59 48 107 28.5145718188435 24.8017042829748 3.71286753586867 A:G G A 10 0.516702172561975 0.499257255285783 ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27263579_27263822:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27263579_27264563:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27263579_27264561:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000434544:exon_27263579_27263867:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460665:exon_27263579_27264555:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000469445:exon_27263579_27263901:TMEM214 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27355991 G/T 1 22 21 43 10.6325522036365 10.8507456238015 -0.218193420164926 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27424636 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000138074:ENST00000461757:exon_27423866_27424942:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000310574:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000488743:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000408041:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000461319:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000481751:exon_27424534_27424715:SLC5A6;ENSG00000138074:ENST00000492069:exon_27424580_27424715:SLC5A6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27435374 G/A 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000138074:ENST00000428518:exon_27435331_27435390:SLC5A6;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27435238_27435475:C2orf28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27439751 G/T 1 81 72 153 39.14712402248 37.2025564244622 1.94456759801782 T:G G T 10 0.516702172561975 0.808369754407376 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27460968 A/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460924_27461055:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460924_27461046:CAD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27461340 G/A 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461299_27461500:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461299_27461500:CAD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27462651 T/C 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27465514 C/T 1 36 28 64 17.3987217877689 14.4676608317353 2.9310609560336 T:C C T 10 0.516702172561975 0.532166195491527 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27465488_27465643:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27465488_27465643:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27465488_27465841:CAD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 28521224 C/T 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000243147:ENST00000379623:exon_28521205_28521358:MRPL33;ENSG00000158019:ENST00000344773:exon_28521205_28521358:BRE;ENSG00000158019:ENST00000379624:exon_28521205_28521358:BRE;ENSG00000158019:ENST00000342045:exon_28521205_28521358:BRE;ENSG00000158019:ENST00000379632:exon_28521205_28521358:BRE;ENSG00000158019:ENST00000361704:exon_28521205_28521358:BRE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 29073249 T/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C T C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000163806:ENST00000379579:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000334056:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000439646:exon_29072716_29073300:SPDYA;ENSG00000171103:ENST00000419999:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29073194_29073271:TRMT61B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 29092679 T/C 1 3 12 15 1.44989348231407 6.2004260707437 -4.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0180458677713663 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 29092850 G/T 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 29169612 T/C 1 54 50 104 26.0980826816533 25.8351086280988 0.262974053554597 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29169466_29171088:WDR43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 30381505 T/C 1 38 23 61 18.3653174426449 11.8841499689254 6.48116747371952 T:C T C 10 0.516702172561975 0.123523471449797 ENSG00000119801:ENST00000379520:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000379519:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470653:exon_30381296_30381739:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000261353:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000493029:exon_30381374_30381856:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402003:exon_30381485_30383399:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000408026:exon_30381485_30382422:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000402708:exon_30381485_30382417:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000470120:exon_30381485_30381832:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000492439:exon_30381485_30381613:YPEL5;ENSG00000119801:ENST00000495673:exon_30381485_30382004:YPEL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 38298105 T/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 38298150 A/G 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 A:G A G 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 39008949 G/A 1 25 26 51 12.0824456859506 13.4342564866114 -1.35181080066073 A:G G A 10 0.516702172561975 0.779790880307479 ENSG00000152147:ENST00000409011:exon_39008659_39009107:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000281950:exon_39008659_39009598:GEMIN6;ENSG00000152147:ENST00000409566:exon_39008659_39009089:GEMIN6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 A:G G A 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 39081139 T/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 39963969 C/T 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000138050:ENST00000460072:exon_39963200_39964199:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000505747:exon_39963445_39964199:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000260619:exon_39963445_39964199:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000378727:exon_39963447_39964199:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000454352:exon_39963447_39964199:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000530522:exon_39963750_39964199:THUMPD2;ENSG00000138050:ENST00000530095:exon_39963823_39964199:THUMPD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 42557124 A/T 1 17 12 29 8.21606306644642 6.2004260707437 2.01563699570272 A:T A T 10 0.516702172561975 0.465548101282052 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42556874_42557884:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42556874_42558014:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42556874_42557423:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42556874_42559688:EML4;ENSG00000143924:ENST00000453191:exon_42556874_42557423:EML4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 43451430 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000152518:ENST00000282388:exon_43449541_43452891:ZFP36L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 44175293 G/A 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.121535928231048 ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44175261_44175338:LRPPRC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 47301029 A/G 1 26 17 43 12.5657435133886 8.78393693355358 3.78180657983507 A:G A G 10 0.516702172561975 0.286542855295205 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47300841_47301062:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 47301066 C/G 1 20 12 32 9.6659565487605 6.2004260707437 3.4655304780168 C:G C G 10 0.516702172561975 0.288521126891484 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47300841_47301187:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47300841_47303274:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47300841_47302463:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47300841_47303276:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47300841_47302696:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47300841_47302463:TTC7A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 47639553 A/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000406134:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47639553_47639699:MSH2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:G A G 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 18 18 36 8.69936089388445 9.30063910611555 -0.601278212231101 T:C C T 10 0.516702172561975 0.868903889692238 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 55461991 A/C 1 24 76 100 11.5991478585126 39.2693651147101 -27.6702172561975 A:C:G A C 10 0.516702172561975 1.86585498078921e-08 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000449323:exon_55461967_55462095:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000497083:exon_55461967_55462003:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000478196:exon_55461967_55462320:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55461255_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000468810:exon_55461967_55462059:RPS27A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 58688709 C/A 0 19 0 19 9.18265872132247 0 9.18265872132247 C C 10 0.516702172561975 4.56113549286921e-06 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 61411875 G/A 1 8 13 21 3.8663826195042 6.71712824330568 -2.85074562380148 A:G G A 10 0.516702172561975 0.275577945999374 ENSG00000173209:ENST00000357022:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000489653:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000394457:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000493628:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000430934:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000389584:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000471542:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000487904:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000484217:exon_61411847_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000409615:exon_61411839_61411935:AHSA2;ENSG00000173209:ENST00000410073:exon_61411847_61411935:AHSA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 61450454 A/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000115464:ENST00000487547:exon_61450383_61450796:USP34 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 64780006 G/A 1 29 31 60 14.0156369957027 16.0177673494212 -2.0021303537185 A:G G A 10 0.516702172561975 0.608518525070599 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409183:exon_64779646_64780543:AFTPH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 25 24 49 12.0824456859506 12.4008521414874 -0.318406455536778 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 65299766 T/C 1 1 7 8 0.483297827438025 3.61691520793383 -3.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0335158533751347 ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 65482729 G/A 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 A:G G A 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65482679_65482828:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65482679_65482828:ACTR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 65495769 G/A 1 52 40 92 25.1314870267773 20.668086902479 4.4634001242983 A:G G A 10 0.516702172561975 0.404144850611671 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 67631372 A/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 68607466 G/A 1 33 35 68 15.9488283054548 18.0845760396691 -2.1357477342143 A:G G A 10 0.516702172561975 0.628982969133464 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68607460_68607615:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68607460_68607615:PLEK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 A:G G A 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 68621239 G/A 1 39 25 64 18.848615270083 12.9175543140494 5.9310609560336 A:G G A 10 0.516702172561975 0.168476478616793 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68621239_68621308:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000474788:exon_68621239_68621308:PLEK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 68622952 G/C 1 88 75 163 42.5302088145462 38.7526629421481 3.77754587239807 C:G G C 10 0.516702172561975 0.58368334578193 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 69741801 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000115977:ENST00000409068:exon_69741603_69741881:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69741603_69741881:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69741603_69741881:AAK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 69746296 C/T 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000115977:ENST00000409068:exon_69746086_69746372:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69746086_69746372:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69746086_69746372:AAK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 A:C A C 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 26 18 44 12.5657435133886 9.30063910611555 3.2651044072731 A:T:G G T 10 0.516702172561975 0.366957673909183 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 20 8 28 9.6659565487605 4.1336173804958 5.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0385515750086698 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 39 45 84 18.848615270083 23.2515977652889 -4.4029824952059 A:G G A 10 0.516702172561975 0.382665518167538 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 71654120 T/C 1 27 31 58 13.0490413408267 16.0177673494212 -2.96872600859455 T:C T C 10 0.516702172561975 0.511607542000333 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 24 30 54 11.5991478585126 15.5010651768593 -3.90191731834665 A:G G A 10 0.516702172561975 0.34074934262596 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 28 34 62 13.5323391682647 17.5678738671072 -4.03553469884245 T:C C T 10 0.516702172561975 0.312543446628974 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 137 85 222 66.2118023590094 43.9196846677679 22.2921176912416 A:C C A 10 0.516702172561975 0.00305046349129398 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 74710491 C/T 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000135637:ENST00000474681:exon_74710195_74710535:CCDC142;ENSG00000115282:ENST00000489152:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000424122:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000449459:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000464241:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000410003:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000435361:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000441635:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000433490:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000442235:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463704:exon_74710449_74710832:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000491252:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000233623:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000459957:exon_74710449_74710537:TTC31;ENSG00000115282:ENST00000463189:exon_74710449_74710690:TTC31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 C:G C G 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 75882399 G/A 1 35 25 60 16.9154239603309 12.9175543140494 3.9978696462815 A:G G A 10 0.516702172561975 0.366025777222902 ENSG00000115364:ENST00000393909:exon_75882190_75884986:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000409374:exon_75882190_75882428:MRPL19;ENSG00000115364:ENST00000453233:exon_75882190_75882428:MRPL19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85553784 C/T 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 T:C C T 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85570827 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000042445:ENST00000457495:exon_85570762_85570921:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000263854:exon_85570762_85570921:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000429806:exon_85570762_85570921:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000295802:exon_85570762_85570921:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000449375:exon_85570762_85570921:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000438611:exon_85570762_85570921:RETSAT;ENSG00000042445:ENST00000475624:exon_85570816_85570921:RETSAT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85622059 T/C 1 52 21 73 25.1314870267773 10.8507456238015 14.2807414029758 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.000917515982233775 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85621871_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85621876_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85621890_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85621951_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85622016_85622081:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85622018_85622081:CAPG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 43 21 64 20.7818065798351 10.8507456238015 9.9310609560336 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0168050141189422 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 30 28 58 14.4989348231407 14.4676608317353 0.0312739914054472 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85786074 G/A 1 19 11 30 9.18265872132247 5.68372389818173 3.49893482314075 A:G G A 10 0.516702172561975 0.272837047938000 ENSG00000115486:ENST00000233838:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000430215:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000423570:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000428479:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000421496:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000481541:exon_85785707_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000496962:exon_85785848_85786198:GGCX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85808737 A/G 1 248 222 470 119.85786120463 114.707882308758 5.14997889587174 A:G A G 10 0.516702172561975 0.64465756477273 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 85823764 C/G 1 241 203 444 116.474776412564 104.890541030081 11.5842353824831 C:G C G 10 0.516702172561975 0.275145791305203 ENSG00000168894:ENST00000461845:exon_85823642_85824139:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000414390:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85823642_85823772:RNF181 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 86385812 T/C 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 T:C T C 10 0.516702172561975 0.171565918300221 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86385715_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 86832394 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000239305:ENST00000237455:exon_86830516_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000472030:exon_86830523_86832541:RNF103;ENSG00000239305:ENST00000477307:exon_86831723_86832541:RNF103 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96789787 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000188886:ENST00000342380:exon_96789589_96790010:ASTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96809715 A/G 1 328 388 716 158.521687399672 200.480442954046 -41.9587555543741 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0018920652564857 ENSG00000158050:ENST00000288943:exon_96808905_96809776:DUSP2;ENSG00000158050:ENST00000488952:exon_96809468_96809776:DUSP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96859034 A/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G A G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000084090:ENST00000337288:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000393595:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000443962:exon_96858980_96859090:STARD7;ENSG00000084090:ENST00000495687:exon_96858869_96859090:STARD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96919642 C/T 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000135956:ENST00000258439:exon_96916312_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000432959:exon_96917398_96919853:TMEM127;ENSG00000135956:ENST00000435268:exon_96919538_96919853:TMEM127 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96944355 G/A 1 80 69 149 38.663826195042 35.6524499067763 3.01137628826572 A:G G A 10 0.516702172561975 0.682060749722647 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944285_96944449:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944285_96944449:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944285_96944449:SNRNP200 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96952833 A/G 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96952744_96952898:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000480615:exon_96952744_96952898:SNRNP200 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 11 7 18 5.31627610181827 3.61691520793383 1.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.485136060235083 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 97020049 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000477409:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435975:exon_97019921_97020126:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97019921_97020126:NCAPH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 97166204 A/G 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.583851756010686 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 99812108 T/C 1 8 14 22 3.8663826195042 7.23383041586765 -3.36744779636345 T:C T C 10 0.516702172561975 0.200185713790216 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 100022772 T/C 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 T:C T C 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 100055158 T/C 1 5 14 19 2.41648913719012 7.23383041586765 -4.81734127867753 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0366985284214880 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000450415:exon_100055063_100055189:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000482887:exon_100055063_100055239:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 100055256 T/C 1 9 13 22 4.34968044694222 6.71712824330568 -2.36744779636345 T:C T C 10 0.516702172561975 0.394703182135892 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000486117:exon_100055063_100055279:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 101009848 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000115526:ENST00000264249:exon_101008327_101010244:CHST10;ENSG00000115526:ENST00000409701:exon_101009707_101010244:CHST10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 101620766 C/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 101898314 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 101898412 G/C 1 21 27 48 10.1492543761985 13.9509586591733 -3.8017042829748 C:G G C 10 0.516702172561975 0.312754715317194 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 101924988 G/A 1 3 9 12 1.44989348231407 4.65031955305778 -3.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0834942591884686 ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101924591_101925163:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101924591_101925158:RNF149 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 102642697 C/T 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000115590:ENST00000332549:exon_102642573_102642715:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000393414:exon_102642573_102642715:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000474085:exon_102642573_102642715:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000485335:exon_102642573_102642715:IL1R2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 105956062 A/T 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:T A T 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105956040_105956206:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105956040_105956206:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105956040_105956206:C2orf49 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 109099531 C/G 1 9 2 11 4.34968044694222 1.03340434512395 3.31627610181827 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0670490889820124 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000447558:exon_109099518_109099612:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109099518_109099622:GCC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 109400267 C/T 1 80 61 141 38.663826195042 31.5188325262805 7.14499366876152 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.238905943652854 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109400052_109402267:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109400052_109400561:RANBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 111413451 C/T 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000169679:ENST00000409311:exon_111413316_111413493:BUB1;ENSG00000169679:ENST00000302759:exon_111413316_111413493:BUB1;ENSG00000169679:ENST00000466333:exon_111413316_111413493:BUB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 113950156 C/T 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 T:C C T 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113949957_113950166:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113949957_113950166:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113949957_113950166:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113949957_113950166:PSD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 114688907 C/T 1 31 22 53 14.9822326505788 11.3674477963635 3.61478485421532 T:C C T 10 0.516702172561975 0.338950235535203 ENSG00000115091:ENST00000263238:exon_114688878_114688973:ACTR3;ENSG00000115091:ENST00000443297:exon_114688878_114688946:ACTR3;ENSG00000115091:ENST00000415792:exon_114688878_114688973:ACTR3;ENSG00000115091:ENST00000446821:exon_114688878_114688973:ACTR3;ENSG00000115091:ENST00000489779:exon_114688878_114688973:ACTR3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 118677916 T/C 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000125633:ENST00000376300:exon_118673054_118677972:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000319432:exon_118673054_118677972:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000437999:exon_118677881_118677972:CCDC93 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 120078731 A/G 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 120125118 C/A 1 15 31 46 7.24946741157037 16.0177673494212 -8.76829993785085 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0115403187545086 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 128249590 G/T 1 20 8 28 9.6659565487605 4.1336173804958 5.5323391682647 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0385515750086698 ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128249547_128249664:IWS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 4 12 16 1.9331913097521 6.2004260707437 -4.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.043457652641527 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 131103159 C/T 1 51 67 118 24.6481891993393 34.6190455616523 -9.97085636231305 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0796684340972949 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131102949_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131102949_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103140_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131103140_131103334:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000456713:exon_131103140_131103259:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103140_131103272:IMP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 131103479 C/T 1 80 62 142 38.663826195042 32.0355346988425 6.62829149619954 T:C C T 10 0.516702172561975 0.275965869125675 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103140_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460100:exon_131103352_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462357:exon_131103352_131103685:IMP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 132241704 C/T 1 105 34 139 50.7462718809926 17.5678738671072 33.1783980138855 T:C C T 10 0.516702172561975 1.12600131791377e-08 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 132241731 T/C 1 164 54 218 79.2608436998361 27.9019173183467 51.3589263814894 T:C T C 10 0.516702172561975 1.16727967993239e-12 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 136519421 A/G 1 36 52 88 17.3987217877689 26.8685129732227 -9.4697911854538 A:G A G 10 0.516702172561975 0.054257241144754 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136519388_136519481:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000426921:exon_136519388_136519451:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136519388_136519481:UBXN4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 136664975 A/G 1 108 119 227 52.1961653633067 61.487558534875 -9.29139317156833 A:G A G 10 0.516702172561975 0.232033600136423 ENSG00000115866:ENST00000264161:exon_136664247_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000478212:exon_136664394_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000489964:exon_136664814_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000422708:exon_136664830_136664977:DARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 143718195 G/A 1 19 32 51 9.18265872132247 16.5344695219832 -7.35181080066073 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0489558440522392 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000392874:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000375773:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143718193_143718339:KYNU HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 144461081 G/A 1 27 13 40 13.0490413408267 6.71712824330568 6.331913097521 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0566069590792976 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144460988_144461093:ARHGAP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 41 39 80 19.815210924959 20.151384729917 -0.336173804958005 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 152132130 A/G 1 20 39 59 9.6659565487605 20.151384729917 -10.4854281811565 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00860573298047643 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 152138522 T/C 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 158272507 C/T 1 130 126 256 62.8287175669432 65.1044737428088 -2.2757561758656 T:C C T 10 0.516702172561975 0.802603659781247 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158271131_158272655:CYTIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160104896 C/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:C C A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160104883_160105023:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160104883_160105023:WDSUB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 15 8 23 7.24946741157037 4.1336173804958 3.11585003107457 T:G G T 10 0.516702172561975 0.215894266846356 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160604812 C/T 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000136536:ENST00000409175:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000259050:exon_160604316_160605414:MARCH7;ENSG00000136536:ENST00000409591:exon_160604316_160605414:MARCH7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160698826 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160698756_160698885:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160698756_160698885:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160698756_160698885:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160698756_160698885:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160698756_160698885:RP11-357L2.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160708774 A/G 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 A:G A G 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160708712_160708851:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160708712_160708851:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160708712_160708851:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160708712_160708851:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160708712_160708851:RP11-357L2.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160710153 T/G 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:G T G 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710141_160710208:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710141_160710208:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710141_160710208:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710141_160710208:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710141_160710208:RP11-357L2.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 160710922 T/C 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160710871_160711046:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160710871_160711046:RP11-357L2.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 162080435 C/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 C:G C G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000432002:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000429217:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000406287:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000402568:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000457887:exon_162080431_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000432692:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000456358:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000468831:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000470324:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162080426_162080502:TANK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 163123704 C/T 1 85 87 172 41.0803153322321 44.9530890128918 -3.87277368065971 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.593494221809353 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163123589_163123889:IFIH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 163128824 T/C 1 45 39 84 21.7484022347111 20.151384729917 1.5970175047941 T:C T C 10 0.516702172561975 0.744531771514474 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 163128883 G/A 1 55 49 104 26.5813805090914 25.3184064555368 1.2629740535546 A:G G A 10 0.516702172561975 0.844741748300873 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163128736_163128897:IFIH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 163137871 C/G 1 30 18 48 14.4989348231407 9.30063910611555 5.1982957170252 C:G C G 10 0.516702172561975 0.149530043330721 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 163137983 T/C 1 8 17 25 3.8663826195042 8.78393693355358 -4.91755431404938 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0697011547149667 ENSG00000115267:ENST00000263642:exon_163137838_163138055:IFIH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 11 2 13 5.31627610181827 1.03340434512395 4.28287175669433 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0233985038423332 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 171608449 G/A 0 515 0 515 248.898381130583 0 248.898381130583 G G 10 0.516702172561975 2.17249145869796e-148 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 172195926 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172195841_172196064:METTL8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 19 23 42 9.18265872132247 11.8841499689254 -2.70149124760295 A:C A C 10 0.516702172561975 0.442288545571072 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 176044889 T/C 1 138 141 279 66.6951001864474 72.8550063312385 -6.15990614479104 T:C T C 10 0.516702172561975 0.472652055295976 ENSG00000154518:ENST00000284727:exon_176044826_176044906:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000409194:exon_176044826_176044906:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000392541:exon_176044826_176044906:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000497075:exon_176044826_176044906:ATP5G3;ENSG00000154518:ENST00000472782:exon_176044373_176044906:ATP5G3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 54 44 98 26.0980826816533 22.7348955927269 3.36318708892645 A:T A T 10 0.516702172561975 0.544637181462005 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 182374553 A/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:T A T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 182374567 A/G 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G A G 10 0.516702172561975 0.390925099647943 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 182396444 A/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182396384_182396503:ITGA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 183640112 T/C 1 21 27 48 10.1492543761985 13.9509586591733 -3.8017042829748 T:C T C 10 0.516702172561975 0.312754715317194 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183640043_183640147:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183640043_183640147:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183640043_183640147:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183640043_183640147:DNAJC10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 191795216 C/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 C:G C G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000115419:ENST00000320717:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000338435:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409626:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000457316:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409428:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409215:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000412247:exon_191795175_191795294:GLS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 191839658 A/C 1 32 35 67 15.4655304780168 18.0845760396691 -2.61904556165233 A:C A C 10 0.516702172561975 0.543004764054045 ENSG00000115415:ENST00000415035:exon_191839556_191839661:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191839556_191839658:STAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 197954717 G/A 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000065413:ENST00000424317:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000422886:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000473081:exon_197954674_197954756:ANKRD44 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 198327314 G/A 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:G G A 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000115520:ENST00000263960:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409398:exon_198327263_198327455:COQ10B;ENSG00000115520:ENST00000409010:exon_198327263_198327455:COQ10B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 198363504 A/G 1 18 27 45 8.69936089388445 13.9509586591733 -5.25159776528888 A:G A G 10 0.516702172561975 0.135974703843030 ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000440114:exon_198363446_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 201355106 G/A 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 201736112 T/C 1 27 12 39 13.0490413408267 6.2004260707437 6.84861527008297 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0360890847610030 ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 201736166 A/C 1 17 6 23 8.21606306644642 3.10021303537185 5.11585003107457 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0369800264063616 ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 13 20 33 6.28287175669432 10.3340434512395 -4.05117169454518 T:C C T 10 0.516702172561975 0.167540858962301 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 201928671 G/T 1 76 1 77 36.7306348852899 0.516702172561975 36.2139327127279 T:G G T 10 0.516702172561975 7.7246367481781e-21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 20 92 112 9.6659565487605 47.5365998757017 -37.8706433269412 A:G G A 10 0.516702172561975 1.6295607464271e-13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 48 44 92 23.1982957170252 22.7348955927269 0.463400124298296 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 203152355 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 208478055 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 208489101 C/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:C C A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000144401:ENST00000432416:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000458426:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000425132:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000461419:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208488953_208489275:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208488953_208489124:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208488953_208489290:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208488953_208489128:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000471128:exon_208488953_208489128:FAM119A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 47 61 108 22.7149978895872 31.5188325262805 -8.8038346366933 A:G A G 10 0.516702172561975 0.101480017458353 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 217288388 G/C 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 C:G G C 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217288356_217288406:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000412913:exon_217288356_217288406:SMARCAL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 217315665 G/A 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217315569_217315787:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000486983:exon_217315569_217316324:SMARCAL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 217363597 C/T 1 831 630 1461 401.620494600999 325.522368714044 76.0981258869545 T:C C T 10 0.516702172561975 6.84338773601843e-05 ENSG00000197756:ENST00000491306:exon_217362912_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000490649:exon_217363548_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000478153:exon_217363548_217364121:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000487233:exon_217363567_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000446558:exon_217363578_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000420712:exon_217363585_217363600:RPL37A;ENSG00000197756:ENST00000359681:exon_217363590_217364121:RPL37A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219526649 G/A 1 18 22 40 8.69936089388445 11.3674477963635 -2.668086902479 A:G G A 10 0.516702172561975 0.43164377138054 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000443791:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000471576:exon_219526482_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219526389_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526574_219526676:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219526641_219526676:BCS1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219527326 C/T 1 15 21 36 7.24946741157037 10.8507456238015 -3.6012782122311 T:C C T 10 0.516702172561975 0.246676384234582 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527233_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527238_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219526920_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527238_219527402:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000436603:exon_219527233_219527402:BCS1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 24 19 43 11.5991478585126 9.81734127867753 1.78180657983507 T:C T C 10 0.516702172561975 0.648479032770358 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 27 33 60 13.0490413408267 17.0511716945452 -4.0021303537185 T:C T C 10 0.516702172561975 0.305201401480351 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219533378 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219646900 C/T 1 1 15 16 0.483297827438025 7.75053258842963 -7.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00018623285311373 ENSG00000135929:ENST00000494263:exon_219646472_219647160:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000258415:exon_219646479_219647160:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000445971:exon_219646876_219647160:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000466602:exon_219646897_219647160:CYP27A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 219674482 G/A 1 25 2 27 12.0824456859506 1.03340434512395 11.0490413408267 A:G G A 10 0.516702172561975 7.31410458362504e-06 ENSG00000135929:ENST00000494263:exon_219674300_219674490:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000258415:exon_219674300_219674490:CYP27A1;ENSG00000135929:ENST00000411688:exon_219674300_219674490:CYP27A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 220479265 G/A 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 A:G G A 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220479198_220479268:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000413891:exon_220479198_220479593:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000495941:exon_220479198_220479442:AC009955.1;ENSG00000144589:ENST00000447191:exon_220479198_220479268:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220479198_220479268:STK11IP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 223389692 C/T 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 T:C C T 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223389663_223389752:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223389663_223389752:SGPP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 223423362 A/G 1 71 30 101 34.3141457480998 15.5010651768593 18.8130805712405 A:G A G 10 0.516702172561975 0.000197110746146084 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 223436607 C/T 1 78 77 155 37.6972305401659 39.7860672872721 -2.08883674710613 T:C C T 10 0.516702172561975 0.748462714348133 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 228416712 A/G 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:G A G 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 140 128 268 67.6616958413235 66.1378780879328 1.52381775339069 A:G G A 10 0.516702172561975 0.854821560369858 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 44 42 86 21.2651044072731 21.701491247603 -0.436386840329853 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231050715 A/G 1 46 39 85 22.2317000621491 20.151384729917 2.08031533223212 A:G A G 10 0.516702172561975 0.665862679193591 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231067305 C/G 1 32 22 54 15.4655304780168 11.3674477963635 4.09808268165335 C:G C G 10 0.516702172561975 0.278924294194357 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231067295_231067438:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231067295_231067444:SP110 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 32 21 53 15.4655304780168 10.8507456238015 4.61478485421532 T:C C T 10 0.516702172561975 0.218425121915323 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231077541 G/A 1 14 26 40 6.76616958413235 13.4342564866114 -6.668086902479 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0395200824543365 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077476_231077620:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077476_231077742:SP110;ENSG00000135899:ENST00000462232:exon_231077476_231077742:SP110 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231110651 A/G 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 A:G A G 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231325944 C/G 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 C:G C G 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231326148 G/A 1 16 13 29 7.7327652390084 6.71712824330568 1.01563699570272 A:G G A 10 0.516702172561975 0.853025168370478 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 T:C T C 10 0.516702172561975 0.816383743536734 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 55 39 94 26.5813805090914 20.151384729917 6.42999577917435 A:G G A 10 0.516702172561975 0.215413770785990 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231372751 T/C 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231372708_231372861:SP100 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231740427 G/A 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 A:G G A 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231740336_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000457215:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000418408:exon_231740335_231740445:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000335005:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231740335_231740523:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000492029:exon_231740335_231740523:ITM2C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 231742214 C/T 1 20 21 41 9.6659565487605 10.8507456238015 -1.18478907504098 T:C C T 10 0.516702172561975 0.756110170705008 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000335005:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231742115_231742265:ITM2C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 232028396 A/G 1 32 35 67 15.4655304780168 18.0845760396691 -2.61904556165233 A:G A G 10 0.516702172561975 0.543004764054045 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000431051:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000467792:exon_232028349_232028424:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000477120:exon_232027807_232028441:PSMD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 234749780 G/C 1 14 26 40 6.76616958413235 13.4342564866114 -6.668086902479 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0395200824543365 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 234749871 C/T 1 29 29 58 14.0156369957027 14.9843630042973 -0.968726008594551 T:C C T 10 0.516702172561975 0.895625377248882 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 237489796 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 238668802 A/G 1 14 30 44 6.76616958413235 15.5010651768593 -8.7348955927269 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00980217472227228 ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 239006879 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 239237974 T/C 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 240951089 C/G 1 24 20 44 11.5991478585126 10.3340434512395 1.2651044072731 C:G C G 10 0.516702172561975 0.763954150963064 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240951034_240951113:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240951034_240951144:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240951034_240951113:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240951034_240954277:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240951034_240951098:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240951034_240951093:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240951034_240951113:NDUFA10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 241513972 C/T 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 T:C C T 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241513932_241514029:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513932_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241513971_241514045:RNPEPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 241536126 A/G 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G A G 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000142330:ENST00000391984:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000404753:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000270361:exon_241536098_241536359:CAPN10;ENSG00000142330:ENST00000494738:exon_241536098_241536359:CAPN10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 241538061 T/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C T C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 A:C A C 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242035757 G/A 1 21 22 43 10.1492543761985 11.3674477963635 -1.21819342016493 A:G G A 10 0.516702172561975 0.76140888237017 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242034545_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242034981_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242035284_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242035555_242035853:MTERFD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242066314 T/C 1 13 14 27 6.28287175669432 7.23383041586765 -0.950958659173327 T:C T C 10 0.516702172561975 0.847787224060471 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242066688 C/A 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 A:C C A 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242072357 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242072289_242074184:PASK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242173247 G/A 1 187 182 369 90.3766937309107 94.0397954062795 -3.66310167536878 A:G G A 10 0.516702172561975 0.715608411110435 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242173235_242173378:HDLBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242683205 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242683037_242683230:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242683037_242683230:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242683054_242683230:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242683037_242683230:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242683037_242683230:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000417686:exon_242683037_242683230:D2HGDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 T:C T C 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 69 63 132 33.3475500932237 32.5522368714044 0.795313221819299 T:C T C 10 0.516702172561975 0.930696832912312 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 2638492 G/A 1 37 34 71 17.8820196152069 17.5678738671072 0.314145748099772 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 2774797 A/C 1 121 84 205 58.479037120001 43.4029824952059 15.0760546247951 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0360987391981708 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 2775098 G/A 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.510005655959431 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 3127579 T/C 1 15 8 23 7.24946741157037 4.1336173804958 3.11585003107457 T:C T C 10 0.516702172561975 0.215894266846356 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 3129441 C/T 1 13 3 16 6.28287175669432 1.55010651768593 4.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0223902666277186 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 17 18 35 8.21606306644642 9.30063910611555 -1.08457603966913 A:G G A 10 0.516702172561975 0.738002004373168 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 49 38 87 23.6815935444632 19.6346825573551 4.04691098710817 A:G G A 10 0.516702172561975 0.393276876971329 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 3734729 G/A 1 21 23 44 10.1492543761985 11.8841499689254 -1.7348955927269 A:G G A 10 0.516702172561975 0.652310811044673 ENSG00000101220:ENST00000379772:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000217195:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000487464:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399683:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399672:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000405186:exon_3734156_3736254:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000379765:exon_3734157_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399673:exon_3734157_3734805:C20orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 3782680 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000101224:ENST00000467519:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000245960:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000439880:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000340833:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000379598:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000344256:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000480816:exon_3782571_3782747:CDC25B;ENSG00000101224:ENST00000468979:exon_3782571_3782747:CDC25B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 24 17 41 11.5991478585126 8.78393693355358 2.81521092495902 T:C T C 10 0.516702172561975 0.435889184910351 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 22 17 39 10.6325522036365 8.78393693355358 1.84861527008297 T:C T C 10 0.516702172561975 0.631830397141998 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 6194789 C/T 0 15 0 15 7.24946741157037 0 7.24946741157037 C C 10 0.516702172561975 6.82904561620311e-05 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 6751034 A/G 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G A G 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000125845:ENST00000378827:exon_6750767_6751119:BMP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 17 31 48 8.21606306644642 16.0177673494212 -7.8017042829748 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0295128565541601 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 13747441 A/G 1 19 21 40 9.18265872132247 10.8507456238015 -1.668086902479 A:G A G 10 0.516702172561975 0.63729998462501 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13747424_13747571:ESF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 13756539 C/A 1 37 39 76 17.8820196152069 20.151384729917 -2.2693651147101 A:C C A 10 0.516702172561975 0.646859639547412 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13756519_13756916:ESF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 13763449 T/C 1 68 60 128 32.8642522657857 31.0021303537185 1.86212191206719 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.79096850104893 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 15967752 C/G 1 28 26 54 13.5323391682647 13.4342564866114 0.0980826816533469 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 18296266 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 18297193 T/C 1 10 19 29 4.83297827438025 9.81734127867753 -4.98436300429728 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0927731179868357 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 18462421 A/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000132664:ENST00000377603:exon_18462263_18462454:POLR3F;ENSG00000132664:ENST00000462997:exon_18462263_18462454:POLR3F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 18535769 C/G 1 61 49 110 29.4811674737195 25.3184064555368 4.16276101818275 C:G C G 10 0.516702172561975 0.446508074205295 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18535752_18535817:SEC23B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 20006368 T/C 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 T:C T C 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000173418:ENST00000334982:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000484480:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000310450:exon_20006321_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000463154:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000480550:exon_20006313_20006411:NAA20;ENSG00000173418:ENST00000398602:exon_20006321_20006411:NAA20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 24930020 C/T 1 6 29 35 2.89978696462815 14.9843630042973 -12.0845760396691 T:C C T 10 0.516702172561975 5.17724264695675e-05 ENSG00000077984:ENST00000480798:exon_24929866_24930211:CST7;ENSG00000077984:ENST00000376835:exon_24929866_24930211:CST7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 24939590 G/C 1 6 29 35 2.89978696462815 14.9843630042973 -12.0845760396691 A:C:G G C 10 0.516702172561975 5.17724264695675e-05 ENSG00000077984:ENST00000480798:exon_24939564_24939680:CST7;ENSG00000077984:ENST00000376835:exon_24939564_24939680:CST7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 24944641 C/A 1 20 22 42 9.6659565487605 11.3674477963635 -1.70149124760295 A:C C A 10 0.516702172561975 0.645025359287535 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24943581_24944658:C20orf3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 24950835 C/T 1 16 7 23 7.7327652390084 3.61691520793383 4.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0973137836791482 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24950833_24951007:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24950833_24951007:C20orf3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 25655765 C/T 1 21 14 35 10.1492543761985 7.23383041586765 2.91542396033087 T:C C T 10 0.516702172561975 0.398376363469485 ENSG00000130684:ENST00000376436:exon_25654851_25657673:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000252979:exon_25654851_25657673:ZNF337;ENSG00000130684:ENST00000376412:exon_25655668_25655969:ZNF337 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 30371628 A/G 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30371508_30371724:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30371508_30371724:TPX2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 17 12 29 8.21606306644642 6.2004260707437 2.01563699570272 C:G G C 10 0.516702172561975 0.465548101282052 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 30449181 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000149599:ENST00000398084:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000339738:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000486996:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375966:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000398083:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375952:exon_30448870_30449478:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375953:exon_30448870_30449478:DUSP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 30662499 C/T 1 4 20 24 1.9331913097521 10.3340434512395 -8.4008521414874 T:C C T 10 0.516702172561975 0.000692340174170852 ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30662426_30662524:HCK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 31023500 C/T 1 15 12 27 7.24946741157037 6.2004260707437 1.04904134082667 T:C C T 10 0.516702172561975 0.705414871424267 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 26 20 46 12.5657435133886 10.3340434512395 2.23170006214915 T:C C T 10 0.516702172561975 0.556975774326018 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 32212549 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 32873413 G/A 1 30 16 46 14.4989348231407 8.2672347609916 6.23170006214915 A:G G A 10 0.516702172561975 0.076456393085272 ENSG00000101444:ENST00000217426:exon_32873246_32873440:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000480653:exon_32873246_32873440:AHCY HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 33329744 A/G 1 12 13 25 5.7995739292563 6.71712824330568 -0.917554314049377 A:G A G 10 0.516702172561975 0.841973379793163 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 33533858 G/A 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000100983:ENST00000216951:exon_33533756_33533901:GSS;ENSG00000100983:ENST00000451957:exon_33533756_33533901:GSS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 33703521 G/A 1 42 47 89 20.298508752397 24.2850021104128 -3.98649335801578 A:G G A 10 0.516702172561975 0.458031035396442 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34092374 G/A 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 A:G G A 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 265 133 398 128.073924271077 68.7213889507427 59.3525353203339 A:C:G A G 10 0.516702172561975 1.89701404920904e-09 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34214173 G/A 1 57 100 157 27.5479761639674 51.6702172561975 -24.1222410922301 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000117251134950110 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34213953_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000415920:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000462352:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000498814:exon_34213966_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000473373:exon_34213966_34214725:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34213968_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34213980_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34213988_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34214008_34214303:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34214081_34214303:CPNE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 15 68 83 7.24946741157037 35.1357477342143 -27.8862803226439 T:C T C 10 0.516702172561975 3.38437635333839e-10 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34220755 C/T 1 7 27 34 3.38308479206617 13.9509586591733 -10.5678738671072 T:C C T 10 0.516702172561975 0.000245411187839024 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000420363:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000434795:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000440240:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000458038:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437100:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414711:exon_34220717_34220845:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000435747:exon_34220717_34220845:CPNE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34243017 C/T 1 8 13 21 3.8663826195042 6.71712824330568 -2.85074562380148 T:C C T 10 0.516702172561975 0.275577945999374 ENSG00000244462:ENST00000374114:exon_34236847_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000359646:exon_34238064_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000374104:exon_34238248_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000424458:exon_34242372_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000431148:exon_34242815_34243266:RBM12;ENSG00000244462:ENST00000435161:exon_34242843_34243266:RBM12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34828459 T/C 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000131043:ENST00000397286:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34827743_34828547:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34827743_34828547:C20orf4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 34843689 C/T 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C C T 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 35125433 C/T 1 25 16 41 12.0824456859506 8.2672347609916 3.81521092495902 T:C C T 10 0.516702172561975 0.274752754417227 ENSG00000080845:ENST00000373913:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000373907:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000401952:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000339266:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000475894:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482872:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000495241:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000491207:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000482037:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000340491:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000479220:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000489701:exon_35125108_35125469:DLGAP4;ENSG00000080845:ENST00000479951:exon_35125398_35125469:DLGAP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 35812677 A/G 1 25 20 45 12.0824456859506 10.3340434512395 1.74840223471112 A:G A G 10 0.516702172561975 0.656047506256095 ENSG00000118705:ENST00000456102:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373632:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373623:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35812583_35812776:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000462163:exon_35812583_35812776:RPN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 142 130 272 68.6282914961996 67.1712824330568 1.45700906314279 T:C C T 10 0.516702172561975 0.903456823703448 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 36405761 T/C 1 15 16 31 7.24946741157037 8.2672347609916 -1.01776734942123 T:C T C 10 0.516702172561975 0.723612516546729 ENSG00000132792:ENST00000361383:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000405275:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000373473:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000473857:exon_36405747_36405819:CTNNBL1;ENSG00000132792:ENST00000373469:exon_36405675_36405819:CTNNBL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 42310426 C/T 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C C T 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42310424_42310495:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42310424_42310495:MYBL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 42331204 C/T 1 35 48 83 16.9154239603309 24.8017042829748 -7.88628032264393 T:C C T 10 0.516702172561975 0.098996838710988 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 42340199 C/T 1 33 24 57 15.9488283054548 12.4008521414874 3.54797616396742 T:C C T 10 0.516702172561975 0.357296164931375 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42340128_42340241:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42340128_42340241:MYBL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 42341722 C/T 1 86 57 143 41.5636131596701 29.4520238360326 12.1115893236376 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0446922514743087 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42341642_42341746:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42341642_42341746:MYBL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 42344745 G/A 1 92 127 219 44.4634001242983 65.6211759153708 -21.1577757910725 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00445778979118734 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42344599_42345136:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42344599_42345136:MYBL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 35 47 82 16.9154239603309 24.2850021104128 -7.36957815008195 A:C A C 10 0.516702172561975 0.121503842147546 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 43572217 T/C 1 18 12 30 8.69936089388445 6.2004260707437 2.49893482314075 T:C T C 10 0.516702172561975 0.465598635369486 ENSG00000025772:ENST00000372813:exon_43572094_43572220:TOMM34;ENSG00000025772:ENST00000372810:exon_43572094_43572220:TOMM34 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 44538178 G/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000100979:ENST00000372420:exon_44538155_44538310:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000372431:exon_44538155_44538310:PLTP;ENSG00000100979:ENST00000477313:exon_44538155_44538310:PLTP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 44574459 C/T 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000479348:exon_44574350_44574522:PCIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 44578991 G/A 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 A:G G A 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44578858_44579012:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44578858_44579012:ZNF335 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 44581348 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198026:ENST00000322927:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000243961:exon_44581237_44581348:ZNF335;ENSG00000198026:ENST00000426788:exon_44581237_44581348:ZNF335 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 45318042 G/A 1 6 11 17 2.89978696462815 5.68372389818173 -2.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.226390605017796 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 45318069 C/G 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 C:G C G 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47244417 C/G 1 19 9 28 9.18265872132247 4.65031955305778 4.5323391682647 T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.0920689884164405 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47244399_47244501:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47244399_47244501:PREX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47253217 C/T 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47324918 G/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47324798_47324959:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47324798_47324959:PREX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 16 19 35 7.7327652390084 9.81734127867753 -2.08457603966913 T:C C T 10 0.516702172561975 0.503196579306069 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47865011 C/T 1 21 13 34 10.1492543761985 6.71712824330568 3.43212613289285 T:C C T 10 0.516702172561975 0.303358503913172 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47872327 A/G 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 0.537244131175437 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 12 15 27 5.7995739292563 7.75053258842963 -1.95095865917333 C:G C G 10 0.516702172561975 0.564379305884164 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 48491258 T/G 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:G T G 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000197818:ENST00000417961:exon_48491242_48491358:SLC9A8;ENSG00000197818:ENST00000361573:exon_48491242_48491358:SLC9A8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 48522585 G/A 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 49197955 C/T 1 14 9 23 6.76616958413235 4.65031955305778 2.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.410933125671882 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49197802_49197997:PTPN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 50769549 A/G 1 1 7 8 0.483297827438025 3.61691520793383 -3.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0335158533751347 ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 55088404 A/G 1 14 23 37 6.76616958413235 11.8841499689254 -5.11798038479308 A:G A G 10 0.516702172561975 0.101360353639269 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55088371_55088484:C20orf43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 55948719 C/T 1 16 21 37 7.7327652390084 10.8507456238015 -3.11798038479308 T:C C T 10 0.516702172561975 0.327297418610929 ENSG00000101146:ENST00000395841:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000371242:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000527947:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000492498:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000395840:exon_55948719_55948794:RAE1;ENSG00000101146:ENST00000462438:exon_55946190_55948794:RAE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 56185208 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000124256:ENST00000371173:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000395822:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000340462:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000461547:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000357677:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000343535:exon_56185205_56185423:ZBP1;ENSG00000124256:ENST00000453793:exon_56185205_56185321:ZBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 57288422 T/C 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 T:C T C 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57287877_57289149:NPEPL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 57569260 G/A 1 31 27 58 14.9822326505788 13.9509586591733 1.03127399140545 A:G G A 10 0.516702172561975 0.794632038257804 ENSG00000101158:ENST00000344018:exon_57569165_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000460601:exon_57569165_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000477741:exon_57569165_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000474543:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000478389:exon_57568679_57569294:TH1L;ENSG00000101158:ENST00000486263:exon_57568978_57569294:TH1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 26 28 54 12.5657435133886 14.4676608317353 -1.90191731834665 A:G A G 10 0.516702172561975 0.683393924622453 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 60713196 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 60835075 G/A 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000130703:ENST00000358053:exon_60835073_60835181:OSBPL2;ENSG00000130703:ENST00000313733:exon_60835037_60835181:OSBPL2;ENSG00000130703:ENST00000439951:exon_60835037_60835181:OSBPL2;ENSG00000130703:ENST00000253000:exon_60835037_60835181:OSBPL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 60883259 T/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:C A C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 60962391 C/T 1 4268 3710 7978 2062.71512750549 1916.96506020493 145.750067300563 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.00111383139952651 ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60962353_60962444:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370592:exon_60962353_60962444:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60962353_60962444:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60962377_60962444:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000450116:exon_60962377_60962444:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000422923:exon_60962377_60962444:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962353_60962444:RPS21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 C C 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 61542374 G/A 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 A:G G A 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000101191:ENST00000266070:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395343:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395340:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000395335:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370371:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370368:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000354665:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000370366:exon_61542126_61542966:DIDO1;ENSG00000101191:ENST00000266071:exon_61542126_61542966:DIDO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 61596985 C/T 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61596962_61597077:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61596962_61597077:SLC17A9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 61598814 C/T 1 45 29 74 21.7484022347111 14.9843630042973 6.76403923041385 T:C C T 10 0.516702172561975 0.130561774357031 ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61598055_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61598689_61599949:SLC17A9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 62200734 G/A 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62200501_62201018:RP4-697K14.7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 62222015 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000101216:ENST00000266068:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370069:exon_62218955_62222082:GMEB2;ENSG00000101216:ENST00000370077:exon_62218955_62222082:GMEB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 62374066 C/T 1 28 21 49 13.5323391682647 10.8507456238015 2.68159354446322 T:C C T 10 0.516702172561975 0.477163781729564 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000496425:exon_62373881_62374143:SLC2A4RG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 20 62701134 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000171703:ENST00000395050:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000361317:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000395053:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000343484:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000487164:exon_62701118_62701562:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000339217:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000440819:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465111:exon_62701118_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000458442:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465433:exon_62701118_62701174:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000477783:exon_62701118_62701174:TCEA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 19168916 T/C 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 34120989 C/T 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 T:C C T 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000159086:ENST00000331923:exon_34120810_34121009:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000466846:exon_34120810_34121009:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000443785:exon_34120810_34121009:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000497873:exon_34120810_34121009:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000290178:exon_34120810_34121009:GCFC1;ENSG00000159086:ENST00000421049:exon_34120870_34121009:GCFC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 34922610 C/T 1 74 53 127 35.7640392304139 27.3852151457847 8.37882408462917 T:C C T 10 0.516702172561975 0.155272072483675 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34921782_34923769:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34921782_34923595:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 35757862 T/C 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000205670:ENST00000481710:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399292:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000489469:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000495363:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000474455:exon_35757776_35758931:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399295:exon_35757776_35757942:FAM165B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 38439573 T/C 1 21 25 46 10.1492543761985 12.9175543140494 -2.76829993785085 T:C T C 10 0.516702172561975 0.462053008424829 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38439562_38439680:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38439562_38439680:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38439562_38439680:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38439562_38439680:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38439562_38439680:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38439562_38439680:PIGP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 38444835 A/C 1 12 25 37 5.7995739292563 12.9175543140494 -7.11798038479308 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0211130608671727 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38444734_38445111:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000479152:exon_38444734_38445023:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000430792:exon_38444734_38445297:PIGP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 A:G G A 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 42771176 T/C 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000482953:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000496774:exon_42771123_42771264:MX2;ENSG00000183486:ENST00000493753:exon_42771123_42771693:MX2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 42811655 C/A 1 70 46 116 33.8308479206617 23.7682999378509 10.0625479828109 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0635684383487142 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42811621_42811775:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42811621_42811775:MX1;ENSG00000157601:ENST00000424365:exon_42811621_42811775:MX1;ENSG00000157601:ENST00000417963:exon_42811621_42811775:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42811621_42811775:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42811621_42811775:MX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 82 64 146 39.630421849918 33.0689390439664 6.56148280595164 T:C C T 10 0.516702172561975 0.282993524979231 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 42824661 A/G 1 126 109 235 60.8955262571911 56.3205368092553 4.57498944793586 A:G A G 10 0.516702172561975 0.557659551564284 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 43796722 G/A 1 2 17 19 0.96659565487605 8.78393693355358 -7.81734127867753 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.000283654171924963 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43796650_43796792:TMPRSS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 1 1 17 18 0.483297827438025 8.78393693355358 -8.30063910611555 T:C T C 10 0.516702172561975 4.87870456712353e-05 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 43808526 T/C 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 T T 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43808512_43808635:TMPRSS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 43808627 C/T 0 0 8 8 0 4.1336173804958 -4.1336173804958 T C T 10 0.516702172561975 0.00297658811199819 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43808512_43808635:TMPRSS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 44270309 G/A 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 22 47 69 10.6325522036365 24.2850021104128 -13.6524499067763 T:G T G 10 0.516702172561975 0.00105026736249887 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 38 23 61 18.3653174426449 11.8841499689254 6.48116747371952 A:G G A 10 0.516702172561975 0.123523471449797 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 T:C T C 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 45523416 C/T 1 14 8 22 6.76616958413235 4.1336173804958 2.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.292213820299823 ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45523174_45524614:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000459741:exon_45523174_45526433:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000468864:exon_45523174_45524932:TRAPPC10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 21 22 43 10.1492543761985 11.3674477963635 -1.21819342016493 A:C C A 10 0.516702172561975 0.76140888237017 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 45557143 C/T 1 36 19 55 17.3987217877689 9.81734127867753 7.58138050909137 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0433131798445587 ENSG00000248354:ENST00000433711:exon_45557059_45557178:AP001055.7;ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000389690:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45557059_45557259:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45557059_45557457:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45557059_45557178:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000470545:exon_45557059_45557448:C21orf33 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 45750697 G/A 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 G G 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45750346_45750799:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45750346_45751897:C21orf2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 46685550 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000186866:ENST00000331343:exon_46683843_46687628:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000334538:exon_46683843_46685550:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000349485:exon_46683843_46685550:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000471540:exon_46683843_46685550:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000485190:exon_46685289_46685550:POFUT2;ENSG00000186866:ENST00000460932:exon_46685315_46685550:POFUT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 46935834 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46933690_46936054:SLC19A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 46950880 T/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:T T A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46950684_46950885:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46950684_46950885:SLC19A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 47614555 G/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 47662769 C/T 1 23 14 37 11.1158500310746 7.23383041586765 3.88201961520692 T:C C T 10 0.516702172561975 0.249649526632086 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47662716_47662845:MCM3AP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 26 13 39 12.5657435133886 6.71712824330568 5.84861527008297 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0770001613490039 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 47836547 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 47848459 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 47851636 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 21 48063476 C/G 1 24 26 50 11.5991478585126 13.4342564866114 -1.83510862809875 C:G C G 10 0.516702172561975 0.671907498157393 ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000334494:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397628:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397634:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000451211:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48063447_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000482508:exon_48063198_48063551:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000481861:exon_48063447_48063551:PRMT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 16 9 25 7.7327652390084 4.65031955305778 3.08244568595062 T:C T C 10 0.516702172561975 0.236024485273226 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 18226612 A/G 1 23 25 48 11.1158500310746 12.9175543140494 -1.8017042829748 A:G A G 10 0.516702172561975 0.665718571958115 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 18226764 T/C 1 32 18 50 15.4655304780168 9.30063910611555 6.16489137190125 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0899547366548747 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 19127515 C/T 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C C T 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19127368_19127537:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19127368_19127537:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19127368_19127537:DGCR14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 19423210 C/G 1 73 61 134 35.2807414029758 31.5188325262805 3.76190887669534 C:G C G 10 0.516702172561975 0.545691102033398 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 73 61 134 35.2807414029758 31.5188325262805 3.76190887669534 A:G G A 10 0.516702172561975 0.545691102033398 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 T:C C T 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 17 19 36 8.21606306644642 9.81734127867753 -1.6012782122311 A:G A G 10 0.516702172561975 0.620337183008844 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 21350342 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21350252_21350401:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21350252_21350401:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21350252_21350402:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000415354:exon_21350252_21350401:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000439171:exon_21350252_21350401:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000452988:exon_21350252_21350401:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000463909:exon_21350252_21351090:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000498649:exon_21350252_21350401:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000415817:exon_21350285_21350401:LZTR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 21355704 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21355545_21356031:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21355545_21355807:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471723:exon_21355581_21356200:THAP7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 23631801 T/C 1 14 4 18 6.76616958413235 2.0668086902479 4.69936089388445 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0325298474148406 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 24108141 G/A 1 105 96 201 50.7462718809926 49.6034085659496 1.14286331504302 A:G G A 10 0.516702172561975 0.887953033136012 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108020_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000521886:exon_24108022_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108061_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108122_24108213:CHCHD10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 25010885 G/A 1 2 12 14 0.96659565487605 6.2004260707437 -5.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00591395177061578 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 26118408 C/T 1 40 41 81 19.331913097521 21.184789075041 -1.85287597751998 T:C C T 10 0.516702172561975 0.739081514840872 ENSG00000100077:ENST00000324198:exon_26118256_26118601:ADRBK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:G G A 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 29621128 C/G 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 C:G C G 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429226:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29621128_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29621122_29621205:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29621122_29621205:EMID1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 29724792 T/C 1 40 47 87 19.331913097521 24.2850021104128 -4.95308901289183 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.334374423372665 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29724727_29724884:AP1B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 29727866 C/T 1 16 19 35 7.7327652390084 9.81734127867753 -2.08457603966913 T:C C T 10 0.516702172561975 0.503196579306069 ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 83 75 158 40.1137196773561 38.7526629421481 1.36105673520795 A:G A G 10 0.516702172561975 0.873614125816756 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 30688659 C/T 1 42 39 81 20.298508752397 20.151384729917 0.147124022480021 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 30700607 T/G 1 13 16 29 6.28287175669432 8.2672347609916 -1.98436300429728 T:G T G 10 0.516702172561975 0.578060435519144 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30700520_30700640:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000393906:exon_30700520_30700619:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000490449:exon_30700520_30700619:TBC1D10A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 30733111 C/A 1 14 14 28 6.76616958413235 7.23383041586765 -0.467660831735301 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000099995:ENST00000439242:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000446990:exon_30733015_30733169:SF3A1;ENSG00000099995:ENST00000215793:exon_30733015_30733169:SF3A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 30776095 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000099999:ENST00000382363:exon_30776051_30776194:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000215798:exon_30776051_30776194:RNF215;ENSG00000099999:ENST00000463319:exon_30776051_30776194:RNF215 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 31011610 G/C 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31011588_31011774:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31011588_31011774:TCN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 31019044 G/A 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 A:G G A 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 31942877 G/T 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:G G T 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_31942847_31942957:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000486708:exon_31942847_31942957:SFI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 35661223 A/G 1 4 13 17 1.9331913097521 6.71712824330568 -4.78393693355358 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0268550497470769 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 35799457 T/C 1 16 22 38 7.7327652390084 11.3674477963635 -3.63468255735505 T:C T C 10 0.516702172561975 0.258759248885070 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000416905:exon_35799407_35799535:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35799407_35799535:MCM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 35802661 C/G 1 20 21 41 9.6659565487605 10.8507456238015 -1.18478907504098 C:G C G 10 0.516702172561975 0.756110170705008 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000416905:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35802546_35802718:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35802546_35802718:MCM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36623672 G/A 1 54 50 104 26.0980826816533 25.8351086280988 0.262974053554597 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36623931 C/T 1 61 57 118 29.4811674737195 29.4520238360326 0.0291436376869463 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36624310 G/A 1 25 23 48 12.0824456859506 11.8841499689254 0.198295717025198 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000529194:exon_36624078_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000454728:exon_36624241_36624326:APOL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36661674 C/A 1 22 32 54 10.6325522036365 16.5344695219832 -5.90191731834665 A:C C A 10 0.516702172561975 0.133579582583198 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36678816 C/A 1 252 193 445 121.791052514382 99.7235193044612 22.0675332099211 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0369258119482459 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36678699_36678831:MYH9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36697100 T/C 1 59 44 103 28.5145718188435 22.7348955927269 5.77967622611657 T:C T C 10 0.516702172561975 0.278587808167082 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36696897_36697103:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36696897_36697103:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36696897_36697103:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36696897_36697103:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000495928:exon_36696956_36697103:MYH9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36708196 G/A 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 A:G G A 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36708094_36708267:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36708094_36708267:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36708094_36708267:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36708094_36708267:MYH9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36912630 A/G 1 76 91 167 36.7306348852899 47.0198977031397 -10.2892628178498 A:G A G 10 0.516702172561975 0.121430934578807 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36912525_36912654:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462794:exon_36912110_36912654:EIF3D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 36922052 T/C 1 45 67 112 21.7484022347111 34.6190455616523 -12.8706433269412 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0177438983462047 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 37425511 C/T 1 14 77 91 6.76616958413235 39.7860672872721 -33.0198977031397 T:C C T 10 0.516702172561975 8.10979809111655e-13 ENSG00000128309:ENST00000401419:exon_37425257_37425842:MPST;ENSG00000128309:ENST00000397129:exon_37425257_37425862:MPST;ENSG00000128309:ENST00000404802:exon_37425257_37425835:MPST;ENSG00000128309:ENST00000341116:exon_37425257_37425860:MPST;ENSG00000128309:ENST00000429360:exon_37425257_37425863:MPST;ENSG00000128309:ENST00000404393:exon_37425257_37425837:MPST;ENSG00000128309:ENST00000485587:exon_37420233_37425853:MPST;ENSG00000128309:ENST00000397225:exon_37425257_37425862:MPST;ENSG00000128309:ENST00000452571:exon_37425257_37425555:MPST;ENSG00000128309:ENST00000446076:exon_37425478_37425555:MPST;ENSG00000128309:ENST00000437888:exon_37425248_37425555:MPST HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 37524351 C/A 1 24 27 51 11.5991478585126 13.9509586591733 -2.35181080066073 A:C C A 10 0.516702172561975 0.57589558509599 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 37695256 T/C 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 T:C T C 10 0.516702172561975 0.819737654598694 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 37699377 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000100055:ENST00000248901:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000422721:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000443914:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000417357:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000462927:exon_37699295_37699443:CYTH4;ENSG00000100055:ENST00000427572:exon_37699295_37699443:CYTH4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 38028073 A/G 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000325180:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38028003_38028172:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000460957:exon_38028003_38028172:GGA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 38061603 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38061562_38061878:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38061562_38062939:SH3BP1;ENSG00000241360:ENST00000215904:exon_38061562_38062941:PDXP;ENSG00000241360:ENST00000403251:exon_38061562_38062939:PDXP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 38323700 C/T 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000100139:ENST00000215957:exon_38323418_38323833:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000414653:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000454685:exon_38323418_38323827:MICALL1;ENSG00000100139:ENST00000402631:exon_38323418_38323833:MICALL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39095987 A/G 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 A:G A G 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000100221:ENST00000216039:exon_39095808_39096672:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000427389:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000412832:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000417712:exon_39095806_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000456626:exon_39095808_39096623:JOSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39122038 C/T 1 12 24 36 5.7995739292563 12.4008521414874 -6.6012782122311 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0302806260062048 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000460605:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000475959:exon_39121812_39122155:GTPBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39125529 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000462332:exon_39124261_39125667:GTPBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 13 23 36 6.28287175669432 11.8841499689254 -5.6012782122311 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0675564980780444 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39425505 G/A 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000243811:ENST00000216099:exon_39425368_39425524:APOBEC3D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39448711 C/A 1 10 14 24 4.83297827438025 7.23383041586765 -2.4008521414874 A:C C A 10 0.516702172561975 0.414865474205065 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39448750 T/C 1 8 14 22 3.8663826195042 7.23383041586765 -3.36744779636345 T:C T C 10 0.516702172561975 0.200185713790216 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39448582_39449915:APOBEC3F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39477565 C/G 1 100 32 132 48.3297827438025 16.5344695219832 31.7953132218193 C:G C G 10 0.516702172561975 2.18493279154464e-08 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39709605 G/A 1 22 16 38 10.6325522036365 8.2672347609916 2.36531744264495 A:G G A 10 0.516702172561975 0.517227849727042 ENSG00000100316:ENST00000464182:exon_39709196_39709710:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000467105:exon_39709196_39710213:RPL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39918151 C/T 1 783 741 1524 378.422198883974 382.876309868424 -4.45411098444998 A:T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.83754891783912 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917778_39918691:ATF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39918517 G/C 1 531 481 1012 256.631146369591 248.53374500231 8.09740136728126 T:C:G G C 10 0.516702172561975 0.614941785079637 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39917778_39918688:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917778_39918691:ATF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 39928738 G/A 1 21 28 49 10.1492543761985 14.4676608317353 -4.31840645553678 A:G G A 10 0.516702172561975 0.253171931793215 ENSG00000187051:ENST00000334678:exon_39928692_39928860:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000420879:exon_39928692_39928766:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000459956:exon_39928400_39928743:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000472291:exon_39928692_39928765:RPS19BP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 40803781 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100359:ENST00000478085:exon_40802442_40804433:SGSM3;ENSG00000100359:ENST00000467915:exon_40803343_40803847:SGSM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 40814594 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 40814636 C/T 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 C:G G C 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 41626240 G/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41626143_41627275:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41626143_41626658:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41626143_41627274:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41626143_41627275:L3MBTL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 12 4 16 5.7995739292563 2.0668086902479 3.7327652390084 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0794171995374525 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 41648966 A/G 1 13 16 29 6.28287175669432 8.2672347609916 -1.98436300429728 A:G A G 10 0.516702172561975 0.578060435519144 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41648876_41649036:RANGAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 41833116 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000183864:ENST00000327492:exon_41829496_41833411:TOB2;ENSG00000183864:ENST00000434408:exon_41833046_41833411:TOB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 41920912 G/A 1 49 54 103 23.6815935444632 27.9019173183467 -4.22032377388343 A:G G A 10 0.516702172561975 0.431062773640486 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41920850_41920972:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41920850_41920972:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000445344:exon_41920850_41920972:ACO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 41923945 C/T 1 55 48 103 26.5813805090914 24.8017042829748 1.77967622611657 T:C C T 10 0.516702172561975 0.767823038955125 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41923905_41924026:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41923905_41924026:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000445344:exon_41923905_41924026:ACO2;ENSG00000100413:ENST00000396504:exon_41921808_41925340:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000355209:exon_41921830_41925340:POLR3H HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 42280898 C/T 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 T:C C T 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42280846_42281015:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42280846_42281015:SREBF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 17 25 42 8.21606306644642 12.9175543140494 -4.70149124760295 A:G A G 10 0.516702172561975 0.165634916238393 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 42456271 T/G 1 13 16 29 6.28287175669432 8.2672347609916 -1.98436300429728 A:T:G T G 10 0.516702172561975 0.578060435519144 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42454358_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42455800_42456417:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42455806_42456417:NAGA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 42905023 T/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C T C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 42970820 T/C 1 12 4 16 5.7995739292563 2.0668086902479 3.7327652390084 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0794171995374525 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 32 29 61 15.4655304780168 14.9843630042973 0.481167473719523 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43193529 G/A 1 30 18 48 14.4989348231407 9.30063910611555 5.1982957170252 A:G G A 10 0.516702172561975 0.149530043330721 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43192508_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43192538_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43193420_43193611:ARFGAP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43193579 A/G 1 38 26 64 18.3653174426449 13.4342564866114 4.9310609560336 A:G A G 10 0.516702172561975 0.260257562537207 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43192508_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43192538_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43193420_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43193556_43193611:ARFGAP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43236930 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43278220 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000100266:ENST00000505238:exon_43278190_43278256:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43278190_43278310:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43278190_43278310:PACSIN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43570310 T/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:T T A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43570215_43570409:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43570215_43570409:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43570215_43570409:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000484118:exon_43570299_43570409:TTLL12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 43575941 C/T 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 T:C C T 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43575847_43576006:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43575847_43576006:TTLL12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 44368204 A/G 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 44564507 C/T 1 111 102 213 53.6460588456208 52.7036216013215 0.94243724429932 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.945366261768935 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44564482_44564803:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44564482_44565064:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477438:exon_44564482_44564807:PARVB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 44586522 C/T 1 10 16 26 4.83297827438025 8.2672347609916 -3.43425648661135 T:C C T 10 0.516702172561975 0.238643810373624 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44586431_44586546:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44586431_44586546:PARVG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 44594584 C/G 1 20 28 48 9.6659565487605 14.4676608317353 -4.8017042829748 C:G C G 10 0.516702172561975 0.193836263515035 ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44594501_44594602:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000472551:exon_44594501_44594602:PARVG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 45723807 G/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000427777:exon_45723723_45723841:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 45723842 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000442334:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405673:exon_45723723_45723944:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000477714:exon_45723723_45724122:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45723723_45723944:FAM118A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 45728370 G/A 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000100376:ENST00000216214:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000441876:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000405548:exon_45728306_45728591:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000459849:exon_45728306_45728572:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000476754:exon_45728306_45728536:FAM118A;ENSG00000100376:ENST00000487732:exon_45728306_45728591:FAM118A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 46611262 C/T 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.347762918852962 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 46685311 G/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 C:G G C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46685299_46685458:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46685299_46685458:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000451998:exon_46685299_46685458:TTC38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 46688724 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46688688_46689905:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46688688_46689903:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000451998:exon_46688688_46688830:TTC38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 46725350 T/C 1 12 23 35 5.7995739292563 11.8841499689254 -6.08457603966913 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0429813258833843 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000491863:exon_46724820_46725464:GTSE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 46751367 G/T 1 11 14 25 5.31627610181827 7.23383041586765 -1.91755431404938 T:G G T 10 0.516702172561975 0.549349590631841 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46751341_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46749414_46751485:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46750607_46751969:TRMU HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 46752743 C/T 1 20 8 28 9.6659565487605 4.1336173804958 5.5323391682647 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0385515750086698 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50280688 A/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:C A C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50315363 C/A 1 33 23 56 15.9488283054548 11.8841499689254 4.0646783365294 A:C C A 10 0.516702172561975 0.288098477199709 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000498354:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50315232_50315409:CRELD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50318061 G/C 1 44 43 87 21.2651044072731 22.2181934201649 -0.953089012891827 C:G G C 10 0.516702172561975 0.914657203750406 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50318008_50318103:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50316858_50319205:CRELD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 65 76 141 31.4143587834716 39.2693651147101 -7.85500633123848 T:C C T 10 0.516702172561975 0.206215176039627 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50354819 C/A 1 29 35 64 14.0156369957027 18.0845760396691 -4.0689390439664 A:C C A 10 0.516702172561975 0.319705017958215 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50354773_50354882:PIM3;ENSG00000198355:ENST00000467480:exon_50354416_50354882:PIM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50356302 C/T 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.289041928049243 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50356555 T/C 1 18 6 24 8.69936089388445 3.10021303537185 5.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0244372089218632 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50356693 T/C 1 94 93 187 45.4299957791743 48.0533020482637 -2.62330626908933 T:C T C 10 0.516702172561975 0.714968640870309 ENSG00000198355:ENST00000360612:exon_50356588_50357728:PIM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 68 83 151 32.8642522657857 42.8862803226439 -10.0220280568582 C:G G C 10 0.516702172561975 0.104145185170112 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50658424 T/C 1 25 11 36 12.0824456859506 5.68372389818173 6.3987217877689 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0439611966839319 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50658698 T/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658680_50658845:TUBGCP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50659347 G/A 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 A:G G A 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50704028 C/T 1 16 9 25 7.7327652390084 4.65031955305778 3.08244568595062 T:C C T 10 0.516702172561975 0.236024485273226 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704011_50704089:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704011_50704089:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704011_50704089:MAPK11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50704661 T/C 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000185386:ENST00000330651:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000395764:exon_50704655_50704734:MAPK11;ENSG00000185386:ENST00000417877:exon_50704655_50704734:MAPK11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 42 25 67 20.298508752397 12.9175543140494 7.38095443834767 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0863934703196542 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 28 30 58 13.5323391682647 15.5010651768593 -1.96872600859455 A:G A G 10 0.516702172561975 0.693842210958923 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 1 9 10 0.483297827438025 4.65031955305778 -4.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0094848757557616 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50878196 G/A 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 A:G G A 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50878130_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50878127_50878286:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50878182_50878478:PPP6R2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50885775 A/G 1 61 65 126 29.4811674737195 33.5856412165284 -4.10447374280886 A:G A G 10 0.516702172561975 0.476949004581537 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000418590:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000470434:exon_50885751_50885882:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000473724:exon_50885751_50886038:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50885751_50885882:SBF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50944128 G/A 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50944163 G/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50944200 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 90 93 183 43.4968044694222 48.0533020482637 -4.55649757884144 T:G T G 10 0.516702172561975 0.506585068569523 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 38 47 85 18.3653174426449 24.2850021104128 -5.91968466776788 C:G C G 10 0.516702172561975 0.232427165769828 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 50964862 G/A 1 124 201 325 59.9289306023151 103.857136684957 -43.9282060826419 A:C:G G A 10 0.516702172561975 1.19839523551501e-06 ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50964675_50964868:SCO2;ENSG00000025708:ENST00000395680:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395681:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000252029:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000487577:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000395678:exon_50964675_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000476284:exon_50964430_50964905:TYMP;ENSG00000025708:ENST00000425169:exon_50964675_50964905:TYMP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 51009953 C/T 1 23 30 53 11.1158500310746 15.5010651768593 -4.38521514578468 T:C C T 10 0.516702172561975 0.271604304744555 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51009804_51009968:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000497224:exon_51009587_51009968:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51009804_51009968:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51009804_51009962:CTA-384D8.32 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 51011376 G/C 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000475238:exon_51011304_51011529:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51011304_51011489:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51011304_51011489:CTA-384D8.32 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 51018579 A/G 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 A:G A G 10 0.516702172561975 0.792158057571208 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 20 16 36 9.6659565487605 8.2672347609916 1.3987217877689 C:G G C 10 0.516702172561975 0.739470758601549 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 3192538 A/G 1 17 10 27 8.21606306644642 5.16702172561975 3.04904134082667 A:G A G 10 0.516702172561975 0.254915967431960 ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3192224_3192563:TRNT1;ENSG00000113851:ENST00000491834:exon_3190676_3192729:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000231948:exon_3191695_3192729:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000432408:exon_3191695_3192729:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000424814:exon_3191695_3192729:CRBN;ENSG00000113851:ENST00000488263:exon_3191695_3192729:CRBN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 137 126 263 66.2118023590094 65.1044737428088 1.10732861620058 T:C T C 10 0.516702172561975 0.901949705697295 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 5164112 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000134108:ENST00000256496:exon_5163905_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000429403:exon_5163934_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000455168:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000444332:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000438743:exon_5164112_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000419534:exon_5163981_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000451374:exon_5163982_5164273:ARL8B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 5252814 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000134109:ENST00000419550:exon_5252805_5252901:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000256497:exon_5252805_5252901:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000465369:exon_5252805_5253091:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000445686:exon_5252805_5252983:EDEM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 9406836 T/C 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 9422210 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 9876919 G/A 1 41 30 71 19.815210924959 15.5010651768593 4.31414574809977 A:G G A 10 0.516702172561975 0.342728192048881 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 7 17 24 3.38308479206617 8.78393693355358 -5.4008521414874 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0390099403344458 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 14 9 23 6.76616958413235 4.65031955305778 2.11585003107457 A:G A G 10 0.516702172561975 0.410933125671882 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 10005828 G/A 1 53 47 100 25.6147848542153 24.2850021104128 1.3297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.841628228780984 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10004221_10005881:TMEM111 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:G T G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 10311939 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 10312534 G/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 12475557 C/T 0 0 27 27 0 13.9509586591733 -13.9509586591733 T C T 10 0.516702172561975 2.97715027954651e-09 ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 12545039 G/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:G G T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000154743:ENST00000446004:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000314571:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000402228:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000284995:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000473755:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000383797:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000444864:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000415684:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000490981:exon_12544945_12545283:TSEN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 20 10 30 9.6659565487605 5.16702172561975 4.49893482314075 T:C C T 10 0.516702172561975 0.142649534990553 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 13363214 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13363085_13363335:NUP210 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 13364876 G/T 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:G G T 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13364809_13364932:NUP210 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 13368724 G/A 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 13368844 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13368717_13368937:NUP210 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 13418998 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13418956_13419062:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13418956_13419062:NUP210 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 14180750 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14180680_14180797:TMEM43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 14180779 C/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14180680_14180797:TMEM43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 14239580 C/T 1 211 231 442 101.975841589423 119.358201861816 -17.382360272393 T:C C T 10 0.516702172561975 0.105551413279925 ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14239536_14242619:LSM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 15093984 C/T 1 47 39 86 22.7149978895872 20.151384729917 2.56361315967015 T:C C T 10 0.516702172561975 0.591577534813748 ENSG00000131368:ENST00000253686:exon_15090025_15094140:MRPS25;ENSG00000131368:ENST00000444840:exon_15093224_15094140:MRPS25;ENSG00000131368:ENST00000447299:exon_15093942_15094140:MRPS25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 24 15 39 11.5991478585126 7.75053258842963 3.84861527008297 C:G C G 10 0.516702172561975 0.262464581998278 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 16344928 G/A 1 22 4 26 10.6325522036365 2.0668086902479 8.56574351338865 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000628365733426557 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16344915_16347594:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16344915_16345490:OXNAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 23574131 G/A 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000182247:ENST00000425792:exon_23574045_23574192:UBE2E2;ENSG00000182247:ENST00000335798:exon_23574045_23574192:UBE2E2;ENSG00000182247:ENST00000396703:exon_23574045_23574192:UBE2E2;ENSG00000182247:ENST00000449994:exon_23574045_23574192:UBE2E2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 32571147 G/A 1 24 24 48 11.5991478585126 12.4008521414874 -0.801704282974804 A:G G A 10 0.516702172561975 0.885523259015994 ENSG00000144635:ENST00000273130:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000481915:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000432458:exon_32571032_32571152:DYNC1LI1;ENSG00000144635:ENST00000472985:exon_32571122_32571152:DYNC1LI1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 33174156 T/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 33174168 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33174047_33174192:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33174047_33174192:CRTAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 37367159 A/C 1 25 13 38 12.0824456859506 6.71712824330568 5.36531744264495 A:C A C 10 0.516702172561975 0.103659135684863 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 38167151 G/A 1 28 15 43 13.5323391682647 7.75053258842963 5.78180657983507 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0928440324511562 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38164207_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469600:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38167055_38167201:ACAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 38167985 C/T 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 38168114 C/A 1 20 14 34 9.6659565487605 7.23383041586765 2.43212613289285 A:C C A 10 0.516702172561975 0.493246817938414 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 2 8 10 0.96659565487605 4.1336173804958 -3.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0579335952414094 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 42251768 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 11 13 24 5.31627610181827 6.71712824330568 -1.4008521414874 T:C T C 10 0.516702172561975 0.68401647134037 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 42678821 C/T 1 32 22 54 15.4655304780168 11.3674477963635 4.09808268165335 T:C C T 10 0.516702172561975 0.278924294194357 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 37 43 80 17.8820196152069 22.2181934201649 -4.336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.371205284788677 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 58 55 113 28.0312739914054 28.4186194909086 -0.387345499503176 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 43602803 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000160746:ENST00000292246:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000350459:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000396091:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000414522:exon_43602712_43602894:ANO10;ENSG00000160746:ENST00000451430:exon_43602712_43602894:ANO10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 44881909 A/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163808:ENST00000326047:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000396031:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000438321:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000429516:exon_44881889_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000425755:exon_44881847_44881948:KIF15;ENSG00000163808:ENST00000453693:exon_44881847_44881948:KIF15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 64 56 120 30.9310609560336 28.9353216634706 1.99573929256299 C:G G C 10 0.516702172561975 0.784211545201828 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47018214 T/C 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_47018127_47018238:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_47018127_47018249:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_47018127_47018235:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_47018127_47018247:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000492819:exon_47017497_47018270:CCDC12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47047698 G/A 1 91 51 142 43.9801022968603 26.3518108006607 17.6282914961995 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00320511953817322 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000486870:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000423436:exon_47047655_47047752:NBEAL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47451707 G/A 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47451418_47451757:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47453979 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A 1 42 23 65 20.298508752397 11.8841499689254 8.41435878347162 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0462724054384567 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47456137 G/A 1 20 22 42 9.6659565487605 11.3674477963635 -1.70149124760295 A:G G A 10 0.516702172561975 0.645025359287535 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000339815:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47456062_47456142:SCAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47537515 G/A 1 34 32 66 16.4321261328928 16.5344695219832 -0.102343389090354 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47537130_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47537436_47537687:C3orf75 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47913430 G/A 1 24 24 48 11.5991478585126 12.4008521414874 -0.801704282974804 A:G G A 10 0.516702172561975 0.885523259015994 ENSG00000047849:ENST00000383737:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000264724:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000429422:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000420772:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000335271:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395730:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000441748:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000383736:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000462206:exon_47913407_47913590:MAP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 36 36 72 17.3987217877689 18.6012782122311 -1.2025564244622 T:C C T 10 0.516702172561975 0.814162084540294 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 48447201 T/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:T T A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000164050:ENST00000296440:exon_48447131_48447205:PLXNB1;ENSG00000164050:ENST00000358459:exon_48447131_48447205:PLXNB1;ENSG00000164050:ENST00000448774:exon_48447131_48447205:PLXNB1;ENSG00000164050:ENST00000485535:exon_48447131_48447205:PLXNB1;ENSG00000164050:ENST00000358536:exon_48447131_48447205:PLXNB1;ENSG00000164050:ENST00000456774:exon_48447131_48447205:PLXNB1;ENSG00000164050:ENST00000483753:exon_48447131_48447472:PLXNB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 48474292 G/A 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:G T G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 51968724 C/T 1 20 16 36 9.6659565487605 8.2672347609916 1.3987217877689 T:C C T 10 0.516702172561975 0.739470758601549 ENSG00000114767:ENST00000232888:exon_51968647_51968792:RRP9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 51978193 G/A 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000041880:ENST00000417220:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000408970:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000431474:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000447362:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000398755:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000471971:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470601:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000470749:exon_51978105_51978233:PARP3;ENSG00000041880:ENST00000498510:exon_51978105_51978233:PARP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 52022821 T/C 1 34 21 55 16.4321261328928 10.8507456238015 5.58138050909137 T:C T C 10 0.516702172561975 0.139653447328394 ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000515879:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000232907:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000243989:ENST00000491318:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000476854:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000476351:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000494103:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000404366:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000490244:exon_52022318_52022842:ACY1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 56 45 101 27.0646783365294 23.2515977652889 3.81308057124052 T:C T C 10 0.516702172561975 0.486392322940579 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 52273077 G/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C:G G C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52273008_52273177:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52273008_52273158:TWF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 52522565 G/A 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 52727749 C/T 1 169 129 298 81.6773328370262 66.6545802604948 15.0227525765314 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0823606891917078 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 52824825 C/T 1 10 20 30 4.83297827438025 10.3340434512395 -5.50106517685925 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0659201910521876 ENSG00000055957:ENST00000273283:exon_52824765_52824937:ITIH1;ENSG00000055957:ENST00000428133:exon_52824765_52824937:ITIH1;ENSG00000055957:ENST00000405128:exon_52824765_52824937:ITIH1;ENSG00000055957:ENST00000494705:exon_52824650_52824937:ITIH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 93 74 167 44.9466979517363 38.2359607695861 6.71073718215017 A:G G A 10 0.516702172561975 0.314680047527052 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 157 143 300 75.8777589077699 73.8884106763624 1.98934823140749 A:G A G 10 0.516702172561975 0.862451595049736 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53269046 T/C 1 80 67 147 38.663826195042 34.6190455616523 4.04478063338967 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510530306688322 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53268999_53269080:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53268999_53269132:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53269163 G/A 1 37 31 68 17.8820196152069 16.0177673494212 1.8642522657857 A:G G A 10 0.516702172561975 0.716330379456192 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53265373_53269623:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53268999_53269209:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000472528:exon_53268999_53269190:TKT;ENSG00000163931:ENST00000466765:exon_53268999_53269176:TKT;ENSG00000163931:ENST00000487660:exon_53268868_53269190:TKT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53321631 A/C 1 21 15 36 10.1492543761985 7.75053258842963 2.3987217877689 A:C A C 10 0.516702172561975 0.505643653771055 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53883722 C/G 1 1 10 11 0.483297827438025 5.16702172561975 -4.68372389818173 C:G C G 10 0.516702172561975 0.00498857440724258 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53883682_53883822:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53883682_53883822:IL17RB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53905449 G/A 1 15 15 30 7.24946741157037 7.75053258842963 -0.501065176859251 A:G G A 10 0.516702172561975 0.857608347222054 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53925820 T/A 1 45 43 88 21.7484022347111 22.2181934201649 -0.469791185453804 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 53925849 C/T 1 29 22 51 14.0156369957027 11.3674477963635 2.64818919933927 T:C C T 10 0.516702172561975 0.486250961597664 ENSG00000113811:ENST00000495461:exon_53925797_53926015:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000488746:exon_53925797_53925892:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000487571:exon_53925797_53925882:RP11-884K10.5;ENSG00000113811:ENST00000485414:exon_53925797_53925912:RP11-884K10.5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 56597954 C/T 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422222:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000439445:exon_56597934_56598167:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000460838:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000459746:exon_56597680_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000472582:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000434467:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000422788:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000442522:exon_56597712_56598153:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000469966:exon_56597712_56598184:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000473322:exon_56597544_56598153:CCDC66 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 13 4 17 6.28287175669432 2.0668086902479 4.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0511524645234594 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 58183616 C/T 1 11 9 20 5.31627610181827 4.65031955305778 0.6659565487605 T:C C T 10 0.516702172561975 0.825759200197332 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58183548_58183705:DNASE1L3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 66433676 A/G 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000144749:ENST00000273261:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383703:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000496559:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000383702:exon_66433406_66433825:LRIG1;ENSG00000144749:ENST00000495037:exon_66433406_66433825:LRIG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 69096790 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 69110981 C/T 1 15 16 31 7.24946741157037 8.2672347609916 -1.01776734942123 T:C C T 10 0.516702172561975 0.723612516546729 ENSG00000144744:ENST00000415609:exon_69110965_69111078:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000361055:exon_69110965_69111078:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000349511:exon_69110965_69111078:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000461934:exon_69110965_69111078:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000465627:exon_69110965_69111078:UBA3;ENSG00000144744:ENST00000461522:exon_69110734_69111078:UBA3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 73111998 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000255423:ENST00000533473:exon_73110810_73112488:AC103559.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 75471327 C/T 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.121535928231048 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C T C 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 97664725 C/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97664642_97664731:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97664182_97664731:MINA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 98237797 G/T 1 40 25 65 19.331913097521 12.9175543140494 6.41435878347162 T:G G T 10 0.516702172561975 0.135908054510495 ENSG00000080822:ENST00000502288:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000507874:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000341181:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000450069:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000437922:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000448209:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000394180:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000506885:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000503004:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000394185:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000394181:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000524557:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000510545:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000511081:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000513287:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000532558:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000511667:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000513452:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000502299:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000512147:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508902:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000510541:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508503:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000514537:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000507411:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000515620:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000507944:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508659:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000503621:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000503799:exon_98237729_98237858:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508071:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000513988:exon_98237579_98237839:CLDND1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 98307696 T/G 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:G T G 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 27 21 48 13.0490413408267 10.8507456238015 2.1982957170252 A:G G A 10 0.516702172561975 0.565565017376882 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 105389153 A/G 1 18 9 27 8.69936089388445 4.65031955305778 4.04904134082667 A:G A G 10 0.516702172561975 0.127682774617817 ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 105422844 C/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 105439026 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 112300052 C/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000138459:ENST00000492406:exon_112299393_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000261034:exon_112300026_112300173:SLC35A5;ENSG00000138459:ENST00000460713:exon_112299393_112300173:SLC35A5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 22 25 47 10.6325522036365 12.9175543140494 -2.28500211041283 T:C T C 10 0.516702172561975 0.560502979227703 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 112727118 C/T 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 T:C C T 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 112727199 G/A 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 A:G G A 10 0.516702172561975 0.833864825621324 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 113699599 C/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163617:ENST00000295878:exon_113699497_113699640:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000460813:exon_113699497_113699640:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000527855:exon_113699497_113699640:KIAA1407 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119133554 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119132703_119139561:ARHGAP31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119276577 G/A 1 25 19 44 12.0824456859506 9.81734127867753 2.2651044072731 A:G G A 10 0.516702172561975 0.547899287460427 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119276476_119276687:CD80 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119305142 G/A 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119327653 T/C 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 T:C T C 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119327617_119327794:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119327617_119327746:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119327617_119327794:PLA1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119331892 C/G 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 C:G C G 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119720980 T/A 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:T T A 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000082701:ENST00000264235:exon_119720893_119721086:GSK3B;ENSG00000082701:ENST00000316626:exon_119720893_119721086:GSK3B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 119721079 C/T 1 9 9 18 4.34968044694222 4.65031955305778 -0.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000082701:ENST00000264235:exon_119720893_119721086:GSK3B;ENSG00000082701:ENST00000316626:exon_119720893_119721086:GSK3B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 120315186 A/T 1 38 13 51 18.3653174426449 6.71712824330568 11.6481891993393 A:T A T 10 0.516702172561975 0.00110362268829918 ENSG00000065518:ENST00000184266:exon_120315156_120315386:NDUFB4;ENSG00000065518:ENST00000485064:exon_120315175_120315386:NDUFB4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 92 84 176 44.4634001242983 43.4029824952059 1.06041762909239 A:G G A 10 0.516702172561975 0.880437528667322 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121361787 G/A 1 73 72 145 35.2807414029758 37.2025564244622 -1.92181502148638 A:G G A 10 0.516702172561975 0.803262265138668 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121361774_121361828:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000464274:exon_121361774_121361828:HCLS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 127 103 230 61.3788240846292 53.2203237738834 8.15850031074574 A:G G A 10 0.516702172561975 0.291652130695623 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121412892 A/G 1 17 15 32 8.21606306644642 7.75053258842963 0.465530478016798 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 19 21 40 9.18265872132247 10.8507456238015 -1.668086902479 T:C C T 10 0.516702172561975 0.63729998462501 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121414217 C/A 1 25 19 44 12.0824456859506 9.81734127867753 2.2651044072731 A:C C A 10 0.516702172561975 0.547899287460427 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121415271 C/T 1 13 13 26 6.28287175669432 6.71712824330568 -0.434256486611352 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 18 11 29 8.69936089388445 5.68372389818173 3.01563699570272 T:C T C 10 0.516702172561975 0.272663820448322 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122259640 T/C 1 27 31 58 13.0490413408267 16.0177673494212 -2.96872600859455 T:C T C 10 0.516702172561975 0.511607542000333 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122338637 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122338628_122338690:PARP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122340433 G/A 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122340291_122340458:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122340291_122340458:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122340291_122340458:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122340291_122340458:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122340291_122340458:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000473627:exon_122340195_122340458:PARP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 67 45 112 32.3809544383477 23.2515977652889 9.12935667305879 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0891318098202567 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122354688 C/G 1 48 60 108 23.1982957170252 31.0021303537185 -7.80383463669331 C:G C G 10 0.516702172561975 0.148622455042392 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 52 52 104 25.1314870267773 26.8685129732227 -1.73702594644541 A:G G A 10 0.516702172561975 0.768927068656658 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122418750 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122423481 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122423374_122423595:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122423374_122423595:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122423374_122423595:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122423374_122423595:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000474669:exon_122423374_122423595:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398157:exon_122423374_122423595:PARP14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122446642 C/T 1 11 13 24 5.31627610181827 6.71712824330568 -1.4008521414874 T:C C T 10 0.516702172561975 0.68401647134037 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 122459477 A/G 1 14 10 24 6.76616958413235 5.16702172561975 1.5991478585126 A:G A G 10 0.516702172561975 0.546705336419487 ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 124456424 G/A 1 16 11 27 7.7327652390084 5.68372389818173 2.04904134082667 A:G G A 10 0.516702172561975 0.448966948977557 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 124458926 A/G 1 27 10 37 13.0490413408267 5.16702172561975 7.88201961520692 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.0125622213965629 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000487622:exon_124458871_124459046:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124458871_124459046:UMPS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 124462813 G/A 1 32 48 80 15.4655304780168 24.8017042829748 -9.336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0435265665690466 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 124627024 T/G 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124626994_124627195:MUC13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 124646594 A/G 1 6 14 20 2.89978696462815 7.23383041586765 -4.3340434512395 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0716012253169818 ENSG00000173702:ENST00000311075:exon_124646379_124646837:MUC13;ENSG00000173702:ENST00000490147:exon_124646379_124646618:MUC13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 124826764 C/G 1 24 27 51 11.5991478585126 13.9509586591733 -2.35181080066073 C:G C G 10 0.516702172561975 0.57589558509599 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826620_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485954:exon_124826689_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479231:exon_124826725_124826970:SLC12A8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 127295857 C/G 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490290:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000469111:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490643:exon_127295833_127295919:TPRA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 127337958 C/T 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127337870_127338121:MCM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 127411199 C/T 1 13 6 19 6.28287175669432 3.10021303537185 3.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.171565918300221 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 127872506 C/T 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 128631481 G/A 1 51 19 70 24.6481891993393 9.81734127867753 14.8308479206617 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000439256054544273 ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128631350_128631957:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128631350_128631770:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128631350_128631857:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128631350_128631857:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128631350_128631947:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128631350_128631548:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128631350_128631943:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000406840:exon_128631454_128631531:ACAD9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 122 97 219 58.962334947439 50.1201107385116 8.84222420892747 A:G G A 10 0.516702172561975 0.250456217817836 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 35 30 65 16.9154239603309 15.5010651768593 1.41435878347162 T:C T C 10 0.516702172561975 0.804269897116631 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 129112166 C/T 1 12 3 15 5.7995739292563 1.55010651768593 4.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0366469998551520 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 132394218 G/A 1 37 36 73 17.8820196152069 18.6012782122311 -0.719258597024176 A:G G A 10 0.516702172561975 0.907057135687815 ENSG00000081307:ENST00000264991:exon_132394092_132394227:UBA5;ENSG00000081307:ENST00000356232:exon_132394092_132394227:UBA5;ENSG00000081307:ENST00000493720:exon_132394092_132394227:UBA5;ENSG00000081307:ENST00000393131:exon_132394092_132394227:UBA5;ENSG00000081307:ENST00000473651:exon_132394092_132394227:UBA5;ENSG00000081307:ENST00000494238:exon_132394092_132394227:UBA5;ENSG00000081307:ENST00000468227:exon_132394092_132394227:UBA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 132400776 A/G 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132400758_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132400758_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132400758_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132400758_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000474871:exon_132399453_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000493732:exon_132400126_132401662:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000490993:exon_132400275_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000465756:exon_132400469_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000512094:exon_132400472_132400934:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000337331:exon_132400472_132400934:NPHP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 135871105 A/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000174579:ENST00000309993:exon_135867764_135871580:MSL2;ENSG00000174579:ENST00000434835:exon_135869469_135871580:MSL2;ENSG00000174579:ENST00000481989:exon_135871038_135871580:MSL2;ENSG00000174579:ENST00000491050:exon_135871054_135871580:MSL2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 138347988 T/C 1 22 24 46 10.6325522036365 12.4008521414874 -1.76829993785085 T:C T C 10 0.516702172561975 0.659196741670368 ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 139090669 C/T 1 15 25 40 7.24946741157037 12.9175543140494 -5.668086902479 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0822208269006859 ENSG00000184432:ENST00000333188:exon_139090565_139090675:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000507777:exon_139090565_139090675:COPB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 141163375 G/A 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 142840816 C/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:T:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000175040:ENST00000309575:exon_142839486_142841800:CHST2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 145788467 T/C 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C T C 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000152952:ENST00000282903:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000461497:exon_145787227_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000360060:exon_145787231_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000494950:exon_145787968_145788659:PLOD2;ENSG00000152952:ENST00000495700:exon_145788028_145788659:PLOD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 146234853 C/T 1 4 11 15 1.9331913097521 5.68372389818173 -3.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0693401729118476 ENSG00000188313:ENST00000342435:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000493432:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448205:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000463777:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000487389:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000468985:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000448787:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000488253:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000489775:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000483300:exon_146234793_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000484560:exon_146234810_146235181:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000478267:exon_146234690_146234954:PLSCR1;ENSG00000188313:ENST00000470496:exon_146234799_146234954:PLSCR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 148727133 G/A 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000163754:ENST00000345003:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000296048:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000353986:exon_148727063_148727187:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000484197:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000461191:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000497528:exon_148727063_148727176:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000479119:exon_148727063_148727189:GYG1;ENSG00000163754:ENST00000469873:exon_148726668_148727189:GYG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 150286038 A/G 1 35 43 78 16.9154239603309 22.2181934201649 -5.30276945983405 A:G A G 10 0.516702172561975 0.257542210193736 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000494558:exon_150285963_150286061:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000383043:exon_150285963_150286079:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000465535:exon_150285963_150286079:EIF2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 154024079 C/T 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 T:C C T 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154024005_154024084:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154024005_154024084:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154024005_154024084:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154024005_154024084:DHX36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 155571275 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000169359:ENST00000392845:exon_155571012_155572167:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000359479:exon_155571012_155572218:SLC33A1;ENSG00000169359:ENST00000475842:exon_155571160_155571280:SLC33A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 156241604 G/C 1 7 12 19 3.38308479206617 6.2004260707437 -2.81734127867753 C:G G C 10 0.516702172561975 0.252027255956844 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 156241605 C/A 1 7 12 19 3.38308479206617 6.2004260707437 -2.81734127867753 A:C C A 10 0.516702172561975 0.252027255956844 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 59 62 121 28.5145718188435 32.0355346988425 -3.52096287999898 T:C C T 10 0.516702172561975 0.525952706934378 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 159976365 C/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 C:G C G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_159976255_159976423:RP11-432B6.3;ENSG00000068885:ENST00000326448:exon_159974774_159976423:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000483465:exon_159974780_159976423:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000496589:exon_159975968_159976423:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000487943:exon_159975973_159976423:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000478278:exon_159976191_159976423:IFT80;ENSG00000068885:ENST00000463240:exon_159976207_159976423:IFT80 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 160130240 A/G 1 32 45 77 15.4655304780168 23.2515977652889 -7.78606728727208 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0869124509161373 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000472282:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160130114_160130637:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000497984:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000487747:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465563:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000494612:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467263:exon_160130123_160130241:SMC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 171410161 G/A 1 2 16 18 0.96659565487605 8.2672347609916 -7.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000526734989185876 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171410122_171410232:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171410122_171410232:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171410122_171410232:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171410122_171410232:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000481505:exon_171410122_171410232:PLD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 28 21 49 13.5323391682647 10.8507456238015 2.68159354446322 A:G A G 10 0.516702172561975 0.477163781729564 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 178748689 T/C 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178748668_178748787:ZMAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 178748714 T/C 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178748668_178748787:ZMAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 179051810 A/G 1 22 27 49 10.6325522036365 13.9509586591733 -3.31840645553678 A:G A G 10 0.516702172561975 0.391881288667844 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 179287989 G/A 1 9 12 21 4.34968044694222 6.2004260707437 -1.85074562380148 A:G G A 10 0.516702172561975 0.514228237115183 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000463661:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000491202:exon_179287855_179288179:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000468767:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000494843:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000490364:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000487978:exon_179287855_179288029:ACTL6A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 180334719 C/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000145075:ENST00000476379:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000273654:exon_180334614_180334754:CCDC39;ENSG00000145075:ENST00000442201:exon_180334614_180334754:CCDC39 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 2 13 15 0.96659565487605 6.71712824330568 -5.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00326341115736337 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 37 37 74 17.8820196152069 19.1179803847931 -1.23596076958615 T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.816544282575495 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 183560111 C/T 1 13 14 27 6.28287175669432 7.23383041586765 -0.950958659173327 T:C C T 10 0.516702172561975 0.847787224060471 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183560086_183560182:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183560086_183560172:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183560086_183560142:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 183560195 A/G 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 183976108 T/C 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 184039517 C/T 1 28 18 46 13.5323391682647 9.30063910611555 4.23170006214915 T:C C T 10 0.516702172561975 0.239176052276116 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000457456:exon_184039070_184039815:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 184044692 A/G 1 25 26 51 12.0824456859506 13.4342564866114 -1.35181080066073 A:G A G 10 0.516702172561975 0.779790880307479 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000448284:exon_184044669_184044771:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000466311:exon_184044669_184044696:EIF4G1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 184428647 G/A 1 10 22 32 4.83297827438025 11.3674477963635 -6.5344695219832 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0218947991099638 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 184429265 C/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 184766301 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184766267_184766347:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000492449:exon_184766267_184766347:VPS8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 185135314 G/C 0 757 1 758 365.856455370585 0.516702172561975 365.339753198023 T:G G T 10 0.516702172561975 4.08032826760997e-215 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 186505180 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000156976:ENST00000485101:exon_186503953_186507683:EIF4A2;ENSG00000156976:ENST00000494445:exon_186505103_186505373:EIF4A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 186510369 T/C 1 14 25 39 6.76616958413235 12.9175543140494 -6.15138472991703 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0546785177904694 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186510279_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186510279_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186510279_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186510279_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186510279_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186510279_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000418288:exon_186510311_186510399:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000449502:exon_186510339_186510399:RFC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 186791979 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000427315:exon_186791947_186791992:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000442023:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186791193_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186791947_186792121:ST6GAL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 55 48 103 26.5813805090914 24.8017042829748 1.77967622611657 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.767823038955125 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 191093053 T/C 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:C T C 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 191093175 T/A 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 A:T T A 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 191093310 A/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191092851_191093378:CCDC50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 193374964 T/C 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193374869_193375021:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000482865:exon_193374869_193375021:OPA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 195595405 G/A 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195594232_195596561:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195594232_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000495247:exon_195595404_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195595088_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195595094_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195595096_195597076:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195595227_195595580:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195595377_195595580:TNK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 195599248 C/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C C T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195599147_195599253:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000464041:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000439230:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000481865:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000424563:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478623:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000411741:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000489628:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000478715:exon_195599147_195599274:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000468680:exon_195599147_195599677:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000316664:exon_195599147_195599341:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000486523:exon_195599151_195599341:TNK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 196199542 T/C 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 15 14 29 7.24946741157037 7.23383041586765 0.0156369957027236 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 196387121 G/A 1 31 30 61 14.9822326505788 15.5010651768593 -0.518832526280477 A:G G A 10 0.516702172561975 0.898908704094739 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 196387855 G/C 1 29 46 75 14.0156369957027 23.7682999378509 -9.75266294214813 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0277573667413078 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 196460650 A/G 1 13 22 35 6.28287175669432 11.3674477963635 -5.08457603966913 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0925594089894135 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 196613075 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000119231:ENST00000323460:exon_196612022_196613565:SENP5;ENSG00000119231:ENST00000445299:exon_196612022_196613565:SENP5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C T C 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 675777 G/C 1 10 2 12 4.83297827438025 1.03340434512395 3.7995739292563 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0398349228801247 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 861012 C/T 1 16 18 34 7.7327652390084 9.30063910611555 -1.56787386710715 T:C C T 10 0.516702172561975 0.610984576422366 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860744_861071:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860744_861220:GAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 862361 G/A 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_862327_863745:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_862327_862473:GAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 925903 G/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 C:G G C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_925831_926161:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_925831_926086:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_925831_926174:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_925831_926174:GAK;ENSG00000178950:ENST00000505819:exon_925831_926153:GAK;ENSG00000178950:ENST00000507580:exon_925831_926105:GAK;ENSG00000178950:ENST00000502656:exon_925831_926115:GAK;ENSG00000178950:ENST00000512325:exon_925831_926105:GAK;ENSG00000178950:ENST00000513935:exon_925831_926008:GAK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 37 46 83 17.8820196152069 23.7682999378509 -5.88628032264393 A:G G A 10 0.516702172561975 0.226928579161218 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1730164 C/T 1 36 45 81 17.3987217877689 23.2515977652889 -5.85287597751998 T:C C T 10 0.516702172561975 0.221352953059329 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/T 1 37 47 84 17.8820196152069 24.2850021104128 -6.4029824952059 T:C C T 10 0.516702172561975 0.189954946403118 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1730299 A/G 1 32 47 79 15.4655304780168 24.2850021104128 -8.81947163239603 A:G A G 10 0.516702172561975 0.055174562621558 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:G G A 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1737013 C/T 1 16 18 34 7.7327652390084 9.30063910611555 -1.56787386710715 T:C C T 10 0.516702172561975 0.610984576422366 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737000_1737052:TACC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1902597 C/G 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 C:G C G 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508355:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000514045:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000515806:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382889:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000436793:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000420906:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000503128:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000509115:exon_1902346_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000398261:exon_1902353_1902978:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000512700:exon_1902377_1902978:WHSC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 1920270 A/G 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 A:G A G 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508355:exon_1919868_1920914:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000514045:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382889:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000420906:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000503128:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000398261:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000511904:exon_1920159_1920350:WHSC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2514816 A/G 1 21 8 29 10.1492543761985 4.1336173804958 6.01563699570272 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.0263805322278183 ENSG00000063978:ENST00000314289:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000502316:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000509388:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000507247:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511859:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000506706:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511600:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000508235:exon_2514810_2514858:RNF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2673892 G/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2673848_2674099:FAM193A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2702193 C/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2743983 G/A 1 99 83 182 47.8464849163645 42.8862803226439 4.96020459372055 A:G G A 10 0.516702172561975 0.50457730572762 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2744289 C/G 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 C:G C G 10 0.516702172561975 0.179184035222123 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2824696 C/T 1 2 8 10 0.96659565487605 4.1336173804958 -3.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0579335952414094 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000389838:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503219:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512131:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510074:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511237:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513020:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513095:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000502260:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000503393:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000509677:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2824662_2824764:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000506932:exon_2824662_2824764:SH3BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2828969 G/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504294:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000508385:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511663:exon_2828957_2829044:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000512014:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511185:exon_2828957_2829023:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2828957_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2828052_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2828423_2829045:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000504450:exon_2828577_2829045:SH3BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 10 21 31 4.83297827438025 10.8507456238015 -6.01776734942123 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0320375181935211 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2831512 A/C 1 17 17 34 8.21606306644642 8.78393693355358 -0.567873867107153 A:C A C 10 0.516702172561975 0.865424298335086 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 31 26 57 14.9822326505788 13.4342564866114 1.54797616396742 C:G C G 10 0.516702172561975 0.693529509499131 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 2934067 C/T 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.570576463975512 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3123074 C/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C C T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3122955_3123159:HTT;ENSG00000197386:ENST00000506137:exon_3122955_3123439:HTT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3215835 T/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3215685_3215862:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3215685_3215862:HTT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3227419 A/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3227456 T/A 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 A:T T A 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 75 60 135 36.2473370578519 31.0021303537185 5.24520670413337 T:C T C 10 0.516702172561975 0.389737972459025 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 76 56 132 36.7306348852899 28.9353216634706 7.79531322181929 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.191551669605117 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 40 26 66 19.331913097521 13.4342564866114 5.89765661090965 A:G A G 10 0.516702172561975 0.175196551168439 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 4276394 C/T 1 39 47 86 18.848615270083 24.2850021104128 -5.43638684032985 T:C C T 10 0.516702172561975 0.280578383414305 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 6055825 G/A 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000152969:ENST00000409021:exon_6055777_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409371:exon_6055777_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000282924:exon_6055484_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000473053:exon_6055484_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000409831:exon_6055486_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000429819:exon_6055486_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000410077:exon_6055529_6055875:JAKMIP1;ENSG00000152969:ENST00000418227:exon_6055702_6055875:JAKMIP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 6304087 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8229870 G/A 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8230235 T/C 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8233716 C/T 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000513495:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000507801:exon_8233703_8233883:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8232869_8233883:SH3TC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8237255 G/A 1 23 29 52 11.1158500310746 14.9843630042973 -3.8685129732227 A:G G A 10 0.516702172561975 0.331741179314814 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8237160_8237282:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8237160_8238156:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000513495:exon_8237160_8237317:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8238151 C/T 1 24 45 69 11.5991478585126 23.2515977652889 -11.6524499067763 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00540343957977887 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8238005_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8237160_8238156:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8239280 G/A 1 22 19 41 10.6325522036365 9.81734127867753 0.815210924959024 A:G G A 10 0.516702172561975 0.876318912969931 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8238005_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8239201_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 8390958 G/C 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 C:G G C 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8390900_8391013:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000508302:exon_8390900_8391013:ACOX3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 43 59 102 20.7818065798351 30.4854281811565 -9.70362160132145 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0597082454735561 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 13604117 T/G 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 T:G T G 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 41 40 81 19.815210924959 20.668086902479 -0.852875977519979 A:T A T 10 0.516702172561975 0.91160648566979 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 15640168 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000118564:ENST00000422585:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000382358:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000341285:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000412094:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000511441:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000513163:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000507700:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000504837:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000512066:exon_15640131_15640317:FBXL5;ENSG00000118564:ENST00000503196:exon_15640162_15640317:FBXL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 15780196 G/C 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 C:G G C 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15779898_15780270:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15779901_15780270:CD38;ENSG00000004468:ENST00000506191:exon_15779921_15780270:CD38;ENSG00000004468:ENST00000511430:exon_15779935_15780270:CD38 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 15964501 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000137441:ENST00000259989:exon_15964061_15964859:FGFBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 29 20 49 14.0156369957027 10.3340434512395 3.68159354446322 T:C C T 10 0.516702172561975 0.319196661076663 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 26407878 T/C 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 T:C T C 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000168214:ENST00000512351:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000510778:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000506956:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000512671:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000345843:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000342295:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000361572:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514380:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514807:exon_26407797_26407885:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000348160:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000521677:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000532341:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000509158:exon_26407797_26407887:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000355476:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000513182:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511401:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000509991:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000515023:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000507561:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514730:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000507574:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000514675:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000515573:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511546:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000504907:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000342320:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000511451:exon_26407797_26407892:RBPJ;ENSG00000168214:ENST00000504938:exon_26407797_26407892:RBPJ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 38774755 C/A 1 27 47 74 13.0490413408267 24.2850021104128 -11.2359607695862 A:T:C C A 10 0.516702172561975 0.0101818801041678 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 38775694 A/C 1 8 11 19 3.8663826195042 5.68372389818173 -1.81734127867753 A:C A C 10 0.516702172561975 0.493447778371294 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 38775889 C/T 1 6 10 16 2.89978696462815 5.16702172561975 -2.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.320150365755739 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 38879949 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000197712:ENST00000510213:exon_38879692_38880047:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38879692_38880047:FAM114A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 39510264 A/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000501493:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39510186_39510280:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39510186_39510280:UGDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 39776440 G/A 1 4 13 17 1.9331913097521 6.71712824330568 -4.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0268550497470769 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 48384619 G/A 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000109171:ENST00000264313:exon_48384585_48384944:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000512093:exon_48384585_48384944:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000505131:exon_48384585_48384656:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000388965:exon_48384585_48384944:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000506141:exon_48384528_48384944:SLAIN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 57337916 C/T 1 33 20 53 15.9488283054548 10.3340434512395 5.61478485421532 T:C C T 10 0.516702172561975 0.132019873308101 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57337886_57338009:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57337886_57338009:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57337886_57338009:SRP72 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 57796970 A/G 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 A:G A G 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 A:G G A 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 57887084 C/T 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 T:C C T 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57887065_57887161:POLR2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 32 33 65 15.4655304780168 17.0511716945452 -1.58564121652838 T:C C T 10 0.516702172561975 0.711310588892486 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 68374626 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68374532_68374823:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000507196:exon_68374532_68374637:CENPC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 68379901 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000145241:ENST00000273853:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000513216:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506882:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000510189:exon_68379792_68380405:CENPC1;ENSG00000145241:ENST00000506410:exon_68379792_68379963:CENPC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 68442968 A/G 1 16 12 28 7.7327652390084 6.2004260707437 1.5323391682647 A:G A G 10 0.516702172561975 0.5776188734531 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 76720885 T/C 1 11 15 26 5.31627610181827 7.75053258842963 -2.43425648661135 T:C T C 10 0.516702172561975 0.433246399406951 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76720775_76720885:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76720775_76720885:USO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 11 20 31 5.31627610181827 10.3340434512395 -5.01776734942123 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0749709023071801 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 76841945 C/T 1 9 2 11 4.34968044694222 1.03340434512395 3.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0670490889820124 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76841891_76841953:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76841891_76841953:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000511606:exon_76841891_76841953:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76841891_76841953:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76841891_76841953:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76841891_76841953:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76841891_76841953:NAAA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 76879020 C/A 1 26 21 47 12.5657435133886 10.8507456238015 1.71499788958717 A:C C A 10 0.516702172561975 0.663177761471479 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76879000_76879094:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76879000_76879094:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76879000_76879094:SDAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 83800034 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000436790:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000503058:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000507816:exon_83800011_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000514326:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513323:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000511975:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000507340:exon_83799883_83800071:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000507867:exon_83800011_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000506497:exon_83799883_83800081:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000510310:exon_83799929_83800081:SEC31A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 84374480 C/T 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 89199548 T/C 1 15 21 36 7.24946741157037 10.8507456238015 -3.6012782122311 T:C T C 10 0.516702172561975 0.246676384234582 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89199296_89199794:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89199296_89199794:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89199296_89199794:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89199296_89199794:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89199296_89199794:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000505022:exon_89199345_89199794:PPM1K HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 99363278 G/A 1 26 31 57 12.5657435133886 16.0177673494212 -3.45202383603258 A:G G A 10 0.516702172561975 0.426800261882654 ENSG00000138698:ENST00000380158:exon_99363141_99363524:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408927:exon_99363141_99365012:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000453712:exon_99363141_99363817:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408900:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000339360:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 99993833 A/G 1 77 81 158 37.2139327127279 41.85287597752 -4.63894326479205 A:G A G 10 0.516702172561975 0.474531205690016 ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99993724_99993862:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99993337_99993862:ADH5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 106307762 G/A 1 15 18 33 7.24946741157037 9.30063910611555 -2.05117169454518 A:G G A 10 0.516702172561975 0.491505449600174 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513605:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106307724_106307793:PPA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 108955443 C/T 1 19 21 40 9.18265872132247 10.8507456238015 -1.668086902479 T:C C T 10 0.516702172561975 0.63729998462501 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108955395_108956327:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000510728:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000515462:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000514776:exon_108955395_108955648:HADH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 113199075 A/G 1 83 61 144 40.1137196773561 31.5188325262805 8.5948871510756 A:G A G 10 0.516702172561975 0.157079385866391 ENSG00000145365:ENST00000361717:exon_113196783_113199590:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000438746:exon_113197177_113199342:TIFA;ENSG00000145365:ENST00000500655:exon_113198915_113199590:TIFA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 113335389 T/A 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 A:T T A 10 0.516702172561975 0.442857702641627 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 113460762 C/T 1 12 9 21 5.7995739292563 4.65031955305778 1.14925437619852 T:C C T 10 0.516702172561975 0.667358473103997 ENSG00000138658:ENST00000505019:exon_113460492_113460845:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000445413:exon_113460495_113460845:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000313239:exon_113460500_113460845:C4orf21;ENSG00000138658:ENST00000506675:exon_113460585_113460845:C4orf21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 113578489 A/C 1 38 56 94 18.3653174426449 28.9353216634706 -10.5700042208257 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0303576260885279 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113578403_113578742:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113578403_113578742:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113578403_113578742:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113578403_113578741:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000503898:exon_113578403_113578748:LARP7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 119665209 G/A 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.121535928231048 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119665143_119665313:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119665143_119665313:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119665143_119665313:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000505134:exon_119665143_119665313:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000511481:exon_119665143_119665313:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119665143_119665313:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119665143_119665313:SEC24D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 97 112 209 46.8798892614884 57.8706433269412 -10.9907540654528 C:G G C 10 0.516702172561975 0.145930084489925 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 129793194 C/T 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000077684:ENST00000226319:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000452328:exon_129792510_129796379:PHF17;ENSG00000077684:ENST00000512960:exon_129792510_129793489:PHF17 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 129880770 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 144467104 T/C 1 15 27 42 7.24946741157037 13.9509586591733 -6.70149124760295 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0443934905165773 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144467078_144467200:SMARCA5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 155471470 G/A 1 10 14 24 4.83297827438025 7.23383041586765 -2.4008521414874 A:G G A 10 0.516702172561975 0.414865474205065 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155471452_155471587:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155471452_155471549:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506192:exon_155471452_155471544:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000505887:exon_155471452_155471555:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000512719:exon_155471452_155471535:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000509975:exon_155471452_155471546:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503751:exon_155471452_155471552:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000515520:exon_155471452_155471548:PLRG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 156283264 T/A 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:T T A 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156283200_156283293:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156283200_156283293:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156283200_156283293:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156283200_156283293:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156283200_156283293:MAP9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 159627902 A/G 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000307738:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000506422:exon_159627781_159628002:ETFDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 159629637 G/A 1 18 13 31 8.69936089388445 6.71712824330568 1.98223265057877 A:G G A 10 0.516702172561975 0.590584117684727 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159629516_159630775:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159629516_159629842:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000307738:exon_159629516_159629751:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000506422:exon_159629516_159629720:ETFDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 14 30 44 6.76616958413235 15.5010651768593 -8.7348955927269 A:C:G A C 10 0.516702172561975 0.00980217472227228 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 23 24 47 11.1158500310746 12.4008521414874 -1.28500211041283 T:C T C 10 0.516702172561975 0.771109779196955 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 166000741 T/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C T C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_165997256_166000948:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_165999572_166000948:TMEM192 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 170634408 A/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000109572:ENST00000504131:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000513761:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000347613:exon_170634230_170634446:CLCN3;ENSG00000109572:ENST00000360642:exon_170634230_170634446:CLCN3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 170678993 T/C 1 25 13 38 12.0824456859506 6.71712824330568 5.36531744264495 T:C T C 10 0.516702172561975 0.103659135684863 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170678981_170679104:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170678981_170679055:C4orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 183815688 A/G 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 184572218 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510968:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000512740:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184572137_184572284:RWDD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 184614874 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000357207:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000505676:exon_184614742_184614890:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184614742_184614890:C4orf41 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 184629643 A/G 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000511955:exon_184629560_184629727:C4orf41 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 186274686 G/C 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 C:G G C 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186274639_186274756:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000513433:exon_186274212_186274756:SNX25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 A:G A G 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 4 190873420 C/T 1 25 31 56 12.0824456859506 16.0177673494212 -3.9353216634706 T:C C T 10 0.516702172561975 0.349456111934555 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190873317_190873442:FRG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 25 18 43 12.0824456859506 9.30063910611555 2.78180657983507 A:G G A 10 0.516702172561975 0.447033682792365 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 251565 T/C 1 52 46 98 25.1314870267773 23.7682999378509 1.36318708892644 T:C T C 10 0.516702172561975 0.840010316495735 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_251453_251979:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_251453_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_251285_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_251452_251583:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_251456_251583:SDHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 114 91 205 55.0959523279348 47.0198977031397 8.07605462479512 A:G G A 10 0.516702172561975 0.264347125493628 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 453888 G/A 1 19 26 45 9.18265872132247 13.4342564866114 -4.25159776528888 A:G G A 10 0.516702172561975 0.233617177110113 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 476510 G/A 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.390925099647943 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 1463806 G/A 1 7 20 27 3.38308479206617 10.3340434512395 -6.95095865917333 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0108771189439457 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1461955_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1461538_1463950:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1461544_1463950:LPCAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 6632843 G/A 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6632712_6632869:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6632712_6632869:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6632712_6632869:NSUN2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 6651970 A/G 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6651955_6652121:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6651955_6652121:SRD5A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 10250488 T/C 1 11 2 13 5.31627610181827 1.03340434512395 4.28287175669433 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0233985038423332 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10250033_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10250328_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000511700:exon_10250355_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000513114:exon_10250406_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10250416_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000508451:exon_10250421_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000510326:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000512975:exon_10250431_10250557:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503454:exon_10250472_10250557:CCT5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 14397238 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 14681711 A/T 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:T A T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000506417:exon_14681659_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000508678:exon_14681685_14681733:FAM105B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 20 12 32 9.6659565487605 6.2004260707437 3.4655304780168 A:G A G 10 0.516702172561975 0.288521126891484 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 31421439 T/C 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31421379_31421484:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31421431_31421484:DROSHA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 32230448 T/C 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000150712:ENST00000280285:exon_32227100_32230453:MTMR12;ENSG00000150712:ENST00000382142:exon_32227112_32230453:MTMR12;ENSG00000150712:ENST00000264934:exon_32229714_32230453:MTMR12;ENSG00000150712:ENST00000510216:exon_32230191_32230453:MTMR12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 32400266 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000056097:ENST00000265069:exon_32400112_32400308:ZFR;ENSG00000056097:ENST00000382126:exon_32400112_32400308:ZFR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 33441193 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33441152_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000514259:exon_33441152_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33440882_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33440898_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000502508:exon_33440911_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33441070_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33441071_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33441083_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33441099_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000505012:exon_33441101_33441249:TARS;ENSG00000113407:ENST00000513066:exon_33441102_33441249:TARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 33998773 G/A 1 2 11 13 0.96659565487605 5.68372389818173 -4.71712824330567 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0106291932032583 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33998746_33998887:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000426255:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000512079:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382068:exon_33998746_33998932:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33998746_33998932:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33998746_33998932:C1QTNF3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 34911899 C/T 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000113456:ENST00000382038:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000341754:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000325577:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000513914:exon_34911659_34911917:RAD1;ENSG00000113456:ENST00000511456:exon_34911723_34911917:RAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 54674296 A/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54674142_54674314:SKIV2L2;ENSG00000039123:ENST00000506750:exon_54674142_54674314:SKIV2L2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 60241163 A/G 1 15 14 29 7.24946741157037 7.23383041586765 0.0156369957027236 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000502658:exon_60241162_60241209:NDUFAF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 68425303 A/G 1 20 38 58 9.6659565487605 19.6346825573551 -9.96872600859455 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0118862188672744 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68425274_68426896:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68425274_68426892:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000511158:exon_68425274_68425953:SLC30A5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 68661539 G/A 1 30 23 53 14.4989348231407 11.8841499689254 2.61478485421532 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494921092357735 ENSG00000085231:ENST00000506736:exon_68660570_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000328663:exon_68660571_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000217893:exon_68660572_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000503245:exon_68660972_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000509462:exon_68661066_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000504109:exon_68661158_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000512152:exon_68661184_68661581:TAF9;ENSG00000085231:ENST00000508954:exon_68661259_68661581:TAF9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 70800538 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 70945075 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 72874907 A/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:C:G A C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000164338:ENST00000296792:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000509005:exon_72874842_72874975:UTP15;ENSG00000164338:ENST00000508491:exon_72874842_72874975:UTP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 73930751 C/T 1 14 18 32 6.76616958413235 9.30063910611555 -2.5344695219832 T:C C T 10 0.516702172561975 0.382851938905623 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 65 76 141 31.4143587834716 39.2693651147101 -7.85500633123848 T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.206215176039627 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 74998598 G/A 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000152359:ENST00000428202:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000514838:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000380475:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000446329:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000510798:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000282199:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000503835:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000504862:exon_74998430_74998657:POC5;ENSG00000152359:ENST00000515285:exon_74998430_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000502826:exon_74998440_74998635:POC5;ENSG00000152359:ENST00000506164:exon_74998495_74998635:POC5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 77411985 T/C 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C T C 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 77477451 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77477331_77477486:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77477331_77477486:AP3B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 94805552 C/T 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94805484_94805614:TTC37 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 94826655 C/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 81 89 170 39.14712402248 45.9864933580158 -6.83936933553576 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.318596716140076 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 28 28 56 13.5323391682647 14.4676608317353 -0.935321663470603 C:G G C 10 0.516702172561975 0.893802027564854 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 96103616 T/G 1 35 23 58 16.9154239603309 11.8841499689254 5.03127399140545 T:G T G 10 0.516702172561975 0.191920452113430 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510098:exon_96103611_96103703:CAST HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 96117555 C/T 1 4 10 14 1.9331913097521 5.16702172561975 -3.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.108891126564131 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96117397_96117558:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96117397_96117558:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96117398_96117558:ERAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 96215911 T/C 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510309:exon_96215268_96215964:ERAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 98199204 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 102363910 C/T 1 8 14 22 3.8663826195042 7.23383041586765 -3.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 0.200185713790216 ENSG00000145730:ENST00000438793:exon_102363889_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000529394:exon_102363889_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000345721:exon_102363889_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000348126:exon_102363889_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000304400:exon_102363886_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000274392:exon_102363886_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000455264:exon_102363889_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000379799:exon_102363886_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000510006:exon_102363889_102363942:PAM;ENSG00000145730:ENST00000515456:exon_102363886_102363926:PAM;ENSG00000145730:ENST00000504456:exon_102363886_102363942:PAM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 102537298 C/T 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 T:C C T 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102537223_102538910:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102537223_102538907:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102537223_102538907:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102537223_102537308:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102537223_102538907:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102537223_102538937:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000504083:exon_102537223_102537370:PPIP5K2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 110097362 G/T 1 23 22 45 11.1158500310746 11.3674477963635 -0.251597765288876 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000447245:exon_110097147_110097964:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 110456241 C/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 C:G C G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000134987:ENST00000506538:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000323652:exon_110456194_110456291:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000513710:exon_110456194_110456294:WDR36;ENSG00000134987:ENST00000505840:exon_110456194_110456291:WDR36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 111066697 T/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C T C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000513100:exon_111066629_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000504018:exon_111066651_111066743:C5orf13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 115202432 T/C 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C T C 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000177879:ENST00000316788:exon_115202367_115202458:AP3S1;ENSG00000177879:ENST00000514118:exon_115202367_115202458:AP3S1;ENSG00000177879:ENST00000515066:exon_115202367_115202458:AP3S1;ENSG00000177879:ENST00000395548:exon_115202367_115202458:AP3S1;ENSG00000177879:ENST00000509055:exon_115202367_115202458:AP3S1;ENSG00000177879:ENST00000507436:exon_115202358_115202458:AP3S1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 T:G G T 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 5 10 15 2.41648913719012 5.16702172561975 -2.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.198432184932537 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:G A G 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 118877695 A/G 1 51 47 98 24.6481891993393 24.2850021104128 0.363187088926448 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:T T A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 122139217 C/T 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 T:C C T 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122139167_122139308:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000512394:exon_122139167_122139308:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000505934:exon_122139167_122139308:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000505854:exon_122139167_122139564:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122139167_122139308:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122139167_122139308:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000511365:exon_122139189_122139308:SNX2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 46 33 79 22.2317000621491 17.0511716945452 5.18052836760397 T:C C T 10 0.516702172561975 0.261463851121929 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 122359640 T/C 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000168938:ENST00000306442:exon_122358945_122359698:PPIC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 125939612 C/T 1 17 29 46 8.21606306644642 14.9843630042973 -6.76829993785085 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0545315679451437 ENSG00000164902:ENST00000297540:exon_125939262_125939875:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000514725:exon_125939266_125939756:PHAX;ENSG00000164902:ENST00000505674:exon_125939253_125939875:PHAX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 126206364 G/T 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:G G T 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000173926:ENST00000308660:exon_126203406_126206483:MARCH3;ENSG00000173926:ENST00000506088:exon_126205883_126206483:MARCH3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 126887569 G/A 1 20 7 27 9.6659565487605 3.61691520793383 6.04904134082667 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0209403464222441 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 130500842 A/G 1 303 280 583 146.439241713722 144.676608317353 1.76263339636856 A:G A G 10 0.516702172561975 0.901100139583437 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130500788_130501178:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130500788_130500933:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130500788_130500994:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130500753_130501026:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130500753_130500913:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130500788_130501018:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130500788_130501034:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130500753_130500949:HINT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 131819800 G/A 1 21 9 30 10.1492543761985 4.65031955305778 5.49893482314075 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0462199219484625 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 131819977 C/T 1 13 5 18 6.28287175669432 2.58351086280988 3.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0995712690058681 ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 42 27 69 20.298508752397 13.9509586591733 6.34755009322372 T:C T C 10 0.516702172561975 0.148095545688908 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 131930642 C/T 1 6 12 18 2.89978696462815 6.2004260707437 -3.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.156942134254247 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000453394:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131930561_131930736:RAD50 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 132334315 C/G 1 21 21 42 10.1492543761985 10.8507456238015 -0.701491247602952 C:G C G 10 0.516702172561975 0.877997089651042 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000506403:exon_132334309_132334542:ZCCHC10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 132437531 C/T 1 54 58 112 26.0980826816533 29.9687260085946 -3.8706433269412 T:C C T 10 0.516702172561975 0.508374647468458 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 140051193 C/G 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 C:G C G 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048918_140051930:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140050854_140051929:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140050854_140051929:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140050854_140051951:WDR55;ENSG00000255017:ENST00000533480:exon_140050379_140051335:AC116353.1;ENSG00000254679:ENST00000523844:exon_140050379_140051335:DND1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 140903792 G/A 1 28 17 45 13.5323391682647 8.78393693355358 4.74840223471112 A:G G A 10 0.516702172561975 0.180130010529629 ENSG00000131504:ENST00000476339:exon_140903710_140904322:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389054:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398557:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000520569:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398566:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000398562:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000253811:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000448451:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000518047:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000468119:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000521457:exon_140903710_140903796:DIAPH1;ENSG00000131504:ENST00000389057:exon_140903710_140903796:DIAPH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 C:G G C 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 141025730 T/G 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141025654_141025758:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141025654_141025758:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141025654_141026289:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141025654_141025758:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518499:exon_141025654_141025931:FCHSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 141026718 G/A 1 7 1 8 3.38308479206617 0.516702172561975 2.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0715336412504121 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522763:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522386:exon_141026702_141026797:FCHSD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 145506100 G/A 1 20 18 38 9.6659565487605 9.30063910611555 0.365317442644949 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145505998_145506108:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145505998_145506108:LARS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 149754216 G/T 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 149755340 G/T 1 14 11 25 6.76616958413235 5.68372389818173 1.08244568595062 T:G G T 10 0.516702172561975 0.694163042854475 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 A:G A G 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 16 18 34 7.7327652390084 9.30063910611555 -1.56787386710715 T:C T C 10 0.516702172561975 0.610984576422366 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 149792109 G/A 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 A:G G A 10 0.516702172561975 0.819737654598694 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 150639439 A/G 1 12 21 33 5.7995739292563 10.8507456238015 -5.05117169454518 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0837507772974046 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 151176964 C/G 1 9 17 26 4.34968044694222 8.78393693355358 -4.43425648661135 C:G C G 10 0.516702172561975 0.114853864862358 ENSG00000145907:ENST00000394123:exon_151176788_151176989:G3BP1;ENSG00000145907:ENST00000522761:exon_151176788_151176989:G3BP1;ENSG00000145907:ENST00000356245:exon_151176788_151176989:G3BP1;ENSG00000145907:ENST00000520177:exon_151176788_151176989:G3BP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 153390848 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153390801_153390880:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153390801_153390880:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153390801_153390880:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153390801_153390880:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153390801_153390880:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153390801_153390880:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153390801_153390880:FAM114A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 153709273 A/G 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 153835561 A/G 1 11 19 30 5.31627610181827 9.81734127867753 -4.50106517685925 A:G A G 10 0.516702172561975 0.104214559707980 ENSG00000164576:ENST00000297109:exon_153835460_153835874:SAP30L;ENSG00000164576:ENST00000440364:exon_153835460_153835891:SAP30L;ENSG00000164576:ENST00000426761:exon_153835460_153835891:SAP30L;ENSG00000164576:ENST00000523029:exon_153835460_153835709:SAP30L;ENSG00000164576:ENST00000520731:exon_153835460_153835709:SAP30L;ENSG00000164576:ENST00000517926:exon_153835460_153835828:SAP30L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 154275749 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 157158553 C/T 1 9 12 21 4.34968044694222 6.2004260707437 -1.85074562380148 T:C C T 10 0.516702172561975 0.514228237115183 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157158205_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157158428_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157158428_157158639:THG1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 14 11 25 6.76616958413235 5.68372389818173 1.08244568595062 T:C T C 10 0.516702172561975 0.694163042854475 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 159437621 C/G 1 53 41 94 25.6147848542153 21.184789075041 4.42999577917434 T:C:G C G 10 0.516702172561975 0.409237331704217 ENSG00000113312:ENST00000231238:exon_159437507_159437865:TTC1;ENSG00000113312:ENST00000522793:exon_159437507_159437865:TTC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 159833529 C/T 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 T:C C T 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159833475_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000520841:exon_159833356_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000523219:exon_159833372_159833636:SLU7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 169028383 G/A 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 A:G G A 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 169141139 T/G 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 T:G T G 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169141032_169141215:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169141032_169141215:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169141032_169141215:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169141032_169141215:DOCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 169454941 C/G 1 8 27 35 3.8663826195042 13.9509586591733 -10.0845760396691 C:G C G 10 0.516702172561975 0.00060282570718246 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 169461547 C/T 1 23 23 46 11.1158500310746 11.8841499689254 -0.768299937850852 T:C C T 10 0.516702172561975 0.883160180876831 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 169469088 G/C 1 14 15 29 6.76616958413235 7.75053258842963 -0.984363004297276 C:G G C 10 0.516702172561975 0.715533472379847 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169469017_169469136:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169469017_169469136:DOCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 169472888 T/C 1 14 18 32 6.76616958413235 9.30063910611555 -2.5344695219832 T:C T C 10 0.516702172561975 0.382851938905623 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169472820_169472909:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169472820_169472909:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169472820_169472909:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169472820_169472909:DOCK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 171481606 A/G 1 28 13 41 13.5323391682647 6.71712824330568 6.81521092495902 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0412071048804667 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171481573_171481698:STK10;ENSG00000072786:ENST00000520476:exon_171481573_171481698:STK10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 172750392 G/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520593:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520648:exon_172749972_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000518455:exon_172750313_172750433:STC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 174937193 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000164466:ENST00000507017:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502393:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000513725:exon_174937112_174937315:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000506963:exon_174937112_174937210:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174937112_174937210:SFXN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 174953743 G/A 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 A:G G A 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174953641_174956745:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000421887:exon_174953641_174953886:SFXN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176370402 A/G 1 7 14 21 3.38308479206617 7.23383041586765 -3.85074562380148 A:G A G 10 0.516702172561975 0.125191054243280 ENSG00000087206:ENST00000377227:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000274827:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377219:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000511320:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000506128:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000512031:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000377220:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000323774:exon_176370336_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000510698:exon_176370328_176370489:UIMC1;ENSG00000087206:ENST00000503273:exon_176370336_176370489:UIMC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 10 17 27 4.83297827438025 8.78393693355358 -3.95095865917333 C:G G C 10 0.516702172561975 0.17668394439121 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176859279 C/T 1 29 15 44 14.0156369957027 7.75053258842963 6.2651044072731 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0697631839666694 ENSG00000198055:ENST00000506296:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000511244:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176859234_176859311:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000508705:exon_176859234_176859311:GRK6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176863519 G/C 1 64 53 117 30.9310609560336 27.3852151457847 3.54584581024892 C:G G C 10 0.516702172561975 0.519041619552186 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863394_176863686:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863394_176863531:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863394_176863531:GRK6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 37 25 62 17.8820196152069 12.9175543140494 4.96446530115755 A:G A G 10 0.516702172561975 0.252616291924485 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 24 11 35 11.5991478585126 5.68372389818173 5.91542396033087 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0613679261503642 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176886235 G/T 1 20 10 30 9.6659565487605 5.16702172561975 4.49893482314075 T:G G T 10 0.516702172561975 0.142649534990553 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176886099_176886269:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176886099_176886265:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176886099_176886269:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176886099_176886269:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176886099_176886269:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176886099_176886269:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176886099_176886269:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176886099_176886269:DBN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176894756 C/T 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176894482_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000477391:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000506117:exon_176894744_176894818:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000514833:exon_176894744_176894818:DBN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 16 7 23 7.7327652390084 3.61691520793383 4.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0973137836791482 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176931706 G/C 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 C:G G C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 176931756 G/C 1 31 35 66 14.9822326505788 18.0845760396691 -3.10234338909035 C:G G C 10 0.516702172561975 0.462186865511034 ENSG00000146094:ENST00000312943:exon_176931744_176931916:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000415534:exon_176931744_176931916:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000500323:exon_176931744_176931916:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000377112:exon_176931744_176931916:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000357198:exon_176931744_176931916:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000501403:exon_176931744_176931916:DOK3;ENSG00000146094:ENST00000510380:exon_176931748_176931916:DOK3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 957 0 957 462.51602085819 0 462.51602085819 T T 10 0.516702172561975 5.33648971416933e-275 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179048205 T/C 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179047893_179048398:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000505087:exon_179048012_179048398:HNRNPH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179226047 C/T 1 38 34 72 18.3653174426449 17.5678738671072 0.797443575537795 T:C C T 10 0.516702172561975 0.906365369436459 ENSG00000161013:ENST00000518778:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520969:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000522293:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518980:exon_179225928_179226121:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520875:exon_179225928_179226175:MGAT4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179228623 G/A 1 22 16 38 10.6325522036365 8.2672347609916 2.36531744264495 A:G G A 10 0.516702172561975 0.517227849727042 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179228893 G/C 1 9 14 23 4.34968044694222 7.23383041586765 -2.88414996892543 C:G G C 10 0.516702172561975 0.297269722271376 ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228784_179229998:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228784_179228909:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228784_179229115:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228784_179228969:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519616:exon_179228807_179228969:MGAT4B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179260613 A/G 1 262 203 465 126.624030788763 104.890541030081 21.7334897586816 A:T:C:G A G 10 0.516702172561975 0.0459693454381995 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260587_179260782:SQSTM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179260745 G/A 1 208 201 409 100.525948107109 103.857136684957 -3.3311885778478 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.766651494568661 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260587_179260782:SQSTM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179290634 G/A 1 21 21 42 10.1492543761985 10.8507456238015 -0.701491247602952 A:G G A 10 0.516702172561975 0.877997089651042 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 25 18 43 12.0824456859506 9.30063910611555 2.78180657983507 T:G T G 10 0.516702172561975 0.447033682792365 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179290918 C/T 1 15 21 36 7.24946741157037 10.8507456238015 -3.6012782122311 T:C C T 10 0.516702172561975 0.246676384234582 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 179305462 G/A 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522472:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000518459:exon_179305309_179305523:TBC1D9B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 44 34 78 21.2651044072731 17.5678738671072 3.69723054016595 A:G A G 10 0.516702172561975 0.429124690787897 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 180219855 T/C 1 14 13 27 6.76616958413235 6.71712824330568 0.0490413408266734 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180219817_180219971:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000504671:exon_180219373_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506889:exon_180219511_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514283:exon_180219590_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000512695:exon_180219625_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000506269:exon_180219638_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000514438:exon_180219658_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000502678:exon_180219662_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000513431:exon_180219686_180220097:MGAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 180651231 G/A 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000146063:ENST00000351937:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000315073:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000508930:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000438174:exon_180650290_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000451234:exon_180651000_180651293:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000503114:exon_180651058_180651812:TRIM41;ENSG00000146063:ENST00000515223:exon_180651166_180651812:TRIM41 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 5 180665065 G/C 1 11 16 27 5.31627610181827 8.2672347609916 -2.95095865917333 C:G G C 10 0.516702172561975 0.335879253897204 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 1 29 6 35 14.0156369957027 3.10021303537185 10.9154239603309 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000246823744558184 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 21 85 106 10.1492543761985 43.9196846677679 -33.7704302915694 A:G G A 10 0.516702172561975 1.71969064393415e-11 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 1742794 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000112699:ENST00000530927:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380815:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000380805:exon_1742702_1742820:GMDS;ENSG00000112699:ENST00000531690:exon_1742702_1742820:GMDS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 2892130 G/A 1 26 30 56 12.5657435133886 15.5010651768593 -2.9353216634706 A:G G A 10 0.516702172561975 0.504200622466784 ENSG00000170542:ENST00000380698:exon_2892067_2892222:SERPINB9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 3113563 G/A 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 A:G G A 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000137275:ENST00000259808:exon_3113287_3115419:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000380409:exon_3113287_3115421:RIPK1;ENSG00000137275:ENST00000453483:exon_3113287_3115421:RIPK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 4116262 G/A 1 34 12 46 16.4321261328928 6.2004260707437 10.2317000621491 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00281717156946222 ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4115923_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4115927_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4115928_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4115934_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4115936_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4115940_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4115941_4116263:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4115942_4116263:PECI HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 4892426 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000483019:exon_4891947_4892581:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4891947_4892613:CDYL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 6654833 T/G 1 81 52 133 39.14712402248 26.8685129732227 12.2786110492573 T:G T G 10 0.516702172561975 0.0370530543526903 ENSG00000112799:ENST00000379953:exon_6654777_6655216:LY86;ENSG00000112799:ENST00000230568:exon_6654777_6655214:LY86 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 12125772 A/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 12163710 A/G 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 A:G A G 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12163516_12165232:HIVEP1;ENSG00000095951:ENST00000399469:exon_12163516_12164808:HIVEP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 13365566 C/T 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000145990:ENST00000379287:exon_13358062_13365894:GFOD1;ENSG00000145990:ENST00000379284:exon_13358062_13365894:GFOD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 16 6 22 7.7327652390084 3.10021303537185 4.63255220363655 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0553424742719923 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 17637895 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17637384_17638001:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17637384_17638001:NUP153 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 24653273 G/C 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 C:G G C 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24653211_24653381:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000478507:exon_24653211_24653381:TDP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 25600827 T/C 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000079691:ENST00000399313:exon_25600542_25600948:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25600542_25600974:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25600542_25600974:LRRC16A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 25605091 G/A 1 9 2 11 4.34968044694222 1.03340434512395 3.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0670490889820124 ENSG00000079691:ENST00000329474:exon_25605040_25605121:LRRC16A;ENSG00000079691:ENST00000439347:exon_25605040_25605121:LRRC16A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 T:C T C 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26413951 C/A 1 16 10 26 7.7327652390084 5.16702172561975 2.56574351338865 A:C C A 10 0.516702172561975 0.333973774728315 ENSG00000026950:ENST00000289361:exon_26413397_26415444:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000414912:exon_26413397_26414301:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26413397_26415432:BTN3A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26452072 C/T 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000111801:ENST00000244519:exon_26451903_26453643:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000361232:exon_26451903_26453043:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000480110:exon_26451903_26453642:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000457225:exon_26451903_26453642:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000339789:exon_26451903_26453642:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000396921:exon_26451903_26453642:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000490254:exon_26451903_26452145:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000483179:exon_26451903_26452389:BTN3A3;ENSG00000111801:ENST00000497681:exon_26451903_26452143:BTN3A3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26468547 G/A 1 14 19 33 6.76616958413235 9.81734127867753 -3.05117169454518 A:G G A 10 0.516702172561975 0.301504151142572 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000265424:exon_26468176_26468635:BTN2A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26468646 A/C 1 15 11 26 7.24946741157037 5.68372389818173 1.56574351338865 A:C A C 10 0.516702172561975 0.562943803398317 ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 77 76 153 37.2139327127279 39.2693651147101 -2.05543240198218 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.746975357457165 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 26 21 47 12.5657435133886 10.8507456238015 1.71499788958717 A:G A G 10 0.516702172561975 0.663177761471479 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 28057075 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000197279:ENST00000252206:exon_28056341_28057338:ZNF165;ENSG00000197279:ENST00000377325:exon_28056341_28057341:ZNF165 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 28269782 C/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 28891423 G/A 1 18 10 28 8.69936089388445 5.16702172561975 3.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.191787589780294 ENSG00000204713:ENST00000377199:exon_28890990_28891766:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000377194:exon_28890990_28891765:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000481474:exon_28890990_28891690:TRIM27;ENSG00000204713:ENST00000444898:exon_28890990_28891768:TRIM27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 427 309 736 206.368172316037 159.66097132165 46.7072009943864 A:G A G 10 0.516702172561975 0.000595642909476612 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 29693938 G/A 1 31 47 78 14.9822326505788 24.2850021104128 -9.30276945983405 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0409508996818683 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 29693969 C/T 1 43 32 75 20.7818065798351 16.5344695219832 4.24733705785187 T:C C T 10 0.516702172561975 0.356324168215344 ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 29695713 C/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 29695854 G/A 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 A:G G A 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29695734_29695883:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000475996:exon_29695734_29697128:HLA-F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30036927 G/C 1 26 21 47 12.5657435133886 10.8507456238015 1.71499788958717 C:G G C 10 0.516702172561975 0.663177761471479 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30036881_30038110:PPP1R11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30071279 T/G 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 T T 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 ENSG00000204616:ENST00000471695:exon_30071249_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376734:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000496062:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376728:exon_30070676_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000477254:exon_30071139_30071566:TRIM31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30071330 C/T 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 C C 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000204616:ENST00000471695:exon_30071249_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376734:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000496062:exon_30070674_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000376728:exon_30070676_30071566:TRIM31;ENSG00000204616:ENST00000477254:exon_30071139_30071566:TRIM31 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 14 10 24 6.76616958413235 5.16702172561975 1.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.546705336419487 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30166266 C/T 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166206_30166301:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166206_30166301:TRIM26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30166886 C/T 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30166443_30167041:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000426696:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000416596:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000420345:exon_30166668_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000418026:exon_30166443_30166930:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000434785:exon_30166515_30166924:TRIM26 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30521137 G/A 1 22 16 38 10.6325522036365 8.2672347609916 2.36531744264495 A:G G A 10 0.516702172561975 0.517227849727042 ENSG00000204590:ENST00000376621:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000429126:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000426875:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000376602:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430946:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000430441:exon_30521127_30521334:GNL1;ENSG00000204590:ENST00000433809:exon_30521137_30521334:GNL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30552317 C/T 1 28 35 63 13.5323391682647 18.0845760396691 -4.55223687140443 T:C C T 10 0.516702172561975 0.259295097814269 ENSG00000204574:ENST00000326195:exon_30552195_30552343:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000376545:exon_30552195_30552343:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000455943:exon_30552195_30552343:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000475993:exon_30552195_30552343:ABCF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30652872 G/A 1 76 71 147 36.7306348852899 36.6858542519002 0.0447806333896708 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30867106 C/T 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30866933_30867931:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30866933_30867617:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30866933_30867930:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30866933_30867929:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30866933_30867209:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30866933_30867933:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30866933_30867195:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30866665_30867181:DDR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30877760 A/C 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 A:C A C 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000213780:ENST00000259895:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000376316:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000453897:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000213780:ENST00000487746:exon_30877709_30877840:GTF2H4;ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30877709_30877840:VARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30887972 C/T 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30887866_30887993:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30887866_30887993:VARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30888161 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30888110_30888213:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30888110_30888213:VARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30893127 G/A 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 28 29 57 13.5323391682647 14.9843630042973 -1.45202383603258 T:C C T 10 0.516702172561975 0.791258282817734 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31323353 G/A 1 436 255 691 210.717852762979 131.759054003304 78.9587987596752 A:G G A 10 0.516702172561975 1.56281515294902e-09 ENSG00000234745:ENST00000412585:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000428231:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000452596:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000463574:exon_31323094_31323579:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000426590:exon_31323094_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000498007:exon_31323168_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000434333:exon_31323284_31323369:HLA-B;ENSG00000234745:ENST00000474381:exon_31323299_31324219:HLA-B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 14 17 31 6.76616958413235 8.78393693355358 -2.01776734942123 T:C C T 10 0.516702172561975 0.479021533266739 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31503219 G/A 1 52 65 117 25.1314870267773 33.5856412165284 -8.45415418975108 A:G G A 10 0.516702172561975 0.138541948961057 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31503144_31503262:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31503144_31503252:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000482195:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000431908:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31503165_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31503172_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31503184_31503262:BAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31557749 C/T 1 18 14 32 8.69936089388445 7.23383041586765 1.4655304780168 T:C C T 10 0.516702172561975 0.72419953842133 ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376072:exon_31557559_31557903:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000478506:exon_31557614_31557903:NCR3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31584275 C/T 1 83 26 109 40.1137196773561 13.4342564866114 26.6794631907447 T:C C T 10 0.516702172561975 2.20107911790952e-07 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583447_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000487813:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376049:exon_31584121_31584283:AIF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31595882 C/A 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 A:C C A 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31598504 C/T 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 T:C C T 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31599594 A/G 1 43 26 69 20.7818065798351 13.4342564866114 7.34755009322372 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0912251953711042 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 28 32 60 13.5323391682647 16.5344695219832 -3.0021303537185 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.442139910242096 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31603189 G/A 1 54 67 121 26.0980826816533 34.6190455616523 -8.52096287999898 A:G G A 10 0.516702172561975 0.123069577924534 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469501:exon_31603171_31603486:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603153_31603242:BAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31605199 G/C 1 11 15 26 5.31627610181827 7.75053258842963 -2.43425648661135 C:G G C 10 0.516702172561975 0.433246399406951 ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31610686 A/G 1 23 24 47 11.1158500310746 12.4008521414874 -1.28500211041283 A:G A G 10 0.516702172561975 0.771109779196955 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31611746 G/A 1 19 15 34 9.18265872132247 7.75053258842963 1.43212613289285 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.732144357326082 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31611667_31611751:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000469182:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000453833:exon_31611667_31611754:BAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31615514 T/C 1 24 22 46 11.5991478585126 11.3674477963635 0.231700062149148 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31615368_31615621:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31615368_31615621:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000435080:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000434444:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000452994:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000456622:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000428326:exon_31615370_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000451898:exon_31615371_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000433828:exon_31615377_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000424480:exon_31615381_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000424176:exon_31615457_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000446826:exon_31615476_31615621:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000441054:exon_31615483_31615603:BAT3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 21 11 32 10.1492543761985 5.68372389818173 4.4655304780168 T:C C T 10 0.516702172561975 0.156040365063729 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31627654 G/A 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 21 36 57 10.1492543761985 18.6012782122311 -8.45202383603258 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0330626916905417 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31631907 G/A 1 15 27 42 7.24946741157037 13.9509586591733 -6.70149124760295 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0443934905165773 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 81 91 172 39.14712402248 47.0198977031397 -7.87277368065971 A:T:C T C 10 0.516702172561975 0.252472585115100 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31639845 C/A 1 23 19 42 11.1158500310746 9.81734127867753 1.29850875239705 A:C C A 10 0.516702172561975 0.75844748833743 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31657413 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31729359 A/G 1 3 11 14 1.44989348231407 5.68372389818173 -4.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0304842736699090 ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31934881 G/T 1 25 18 43 12.0824456859506 9.30063910611555 2.78180657983507 T:G G T 10 0.516702172561975 0.447033682792365 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31934781_31934918:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31934781_31934918:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31934781_31934918:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31934781_31934918:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461915:exon_31934781_31934918:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000494058:exon_31934798_31934918:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31934880_31934918:SKIV2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31936466 C/A 1 40 31 71 19.331913097521 16.0177673494212 3.31414574809977 A:C C A 10 0.516702172561975 0.476932542368015 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936400_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936463_31936573:SKIV2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 38 22 60 18.3653174426449 11.3674477963635 6.9978696462815 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.0922746891369328 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 A:G A G 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 31938888 C/T 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938689_31938916:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938689_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000418489:exon_31938642_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000460058:exon_31938675_31938924:DOM3Z;ENSG00000204344:ENST00000466132:exon_31938868_31939051:STK19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32086909 G/A 1 13 23 36 6.28287175669432 11.8841499689254 -5.6012782122311 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0675564980780444 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32086733_32086918:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32086733_32086918:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32086733_32086918:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000475705:exon_32086554_32086918:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000492342:exon_32086733_32086918:ATF6B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32093922 G/A 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32147478 G/T 1 11 13 24 5.31627610181827 6.71712824330568 -1.4008521414874 T:G G T 10 0.516702172561975 0.68401647134037 ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147428_32147540:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000487940:exon_32147428_32147550:RNF5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32150498 G/A 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000204305:ENST00000488669:exon_32150345_32150708:AGER;ENSG00000204305:ENST00000473619:exon_32150345_32150708:AGER HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32150993 G/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:G G T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 54 75 129 26.0980826816533 38.7526629421481 -12.6545802604948 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0275572741476798 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32410210 T/C 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C T C 10 0.516702172561975 0.755276208141038 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32410215 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32411573 C/T 1 922 863 1785 445.600596897859 445.913974920984 -0.313378023125438 A:T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 1353 1502 2855 653.901960523648 776.086663188087 -122.184702664439 A:T:C:G T G 10 0.516702172561975 4.84958561851911e-06 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32632832 A/T 1 780 95 875 376.972305401659 49.0867063933876 327.885599008272 A:T:C A T 10 0.516702172561975 5.40190135812124e-125 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32814942 C/T 1 133 118 251 64.2786110492573 60.9708563623131 3.30775468694426 T:C C T 10 0.516702172561975 0.704918392956883 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 164 139 303 79.2608436998361 71.8216019861145 7.43924171372156 T:C T C 10 0.516702172561975 0.4210383360255 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 232 197 429 112.125095965622 101.790327994709 10.3347679709127 A:C C A 10 0.516702172561975 0.334046495309460 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 124 126 250 59.9289306023151 65.1044737428088 -5.17554314049375 T:C T C 10 0.516702172561975 0.527258570921916 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 201 199 400 97.142863315043 102.823732339833 -5.68086902479001 A:G G A 10 0.516702172561975 0.582337878006109 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32946034 T/C 1 121 109 230 58.479037120001 56.3205368092553 2.15850031074574 T:C T C 10 0.516702172561975 0.792151945540348 ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 32948031 G/A 1 23 18 41 11.1158500310746 9.30063910611555 1.81521092495902 A:G G A 10 0.516702172561975 0.640424958157084 ENSG00000204256:ENST00000469132:exon_32947319_32948241:BRD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 551 491 1042 266.297102918352 253.70076672793 12.596336190422 A:T:C:G G C 10 0.516702172561975 0.438563123430048 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33239423 C/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 C:G C G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33238914_33239653:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33239363_33239671:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33239363_33239662:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000436044:exon_33239363_33239662:VPS52 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33246192 C/T 1 17 12 29 8.21606306644642 6.2004260707437 2.01563699570272 T:C C T 10 0.516702172561975 0.465548101282052 ENSG00000235863:ENST00000451237:exon_33244917_33246602:B3GALT4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33248414 T/G 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 T:G T G 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33258619 C/A 1 43 34 77 20.7818065798351 17.5678738671072 3.21393271272792 A:C C A 10 0.516702172561975 0.495144632984478 ENSG00000204220:ENST00000395131:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374606:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374610:exon_33258493_33258639:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374607:exon_33258493_33258698:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33272371 C/T 1 64 67 131 30.9310609560336 34.6190455616523 -3.68798460561873 T:C C T 10 0.516702172561975 0.541288554504495 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272045_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272045_33272415:TAPBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33272712 C/A 1 11 7 18 5.31627610181827 3.61691520793383 1.69936089388445 A:C C A 10 0.516702172561975 0.485136060235083 ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33283065 G/A 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33283766 T/C 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 T:C T C 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000236104:ENST00000418724:exon_33282183_33284762:ZBTB22;ENSG00000236104:ENST00000431845:exon_33282195_33284762:ZBTB22 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33382788 G/A 1 40 34 74 19.331913097521 17.5678738671072 1.76403923041385 A:G G A 10 0.516702172561975 0.72784572812252 ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 33382818 G/A 1 35 24 59 16.9154239603309 12.4008521414874 4.51457181884347 A:G G A 10 0.516702172561975 0.244712763738291 ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 25 28 53 12.0824456859506 14.4676608317353 -2.38521514578468 C:G C G 10 0.516702172561975 0.583058556551689 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 34574505 G/A 1 20 19 39 9.6659565487605 9.81734127867753 -0.151384729917027 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196821:ENST00000374023:exon_34574332_34574681:C6orf106;ENSG00000196821:ENST00000374026:exon_34574332_34574681:C6orf106;ENSG00000196821:ENST00000374021:exon_34574332_34574681:C6orf106 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 35436659 C/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198755:ENST00000490335:exon_35436576_35436804:RPL10A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 36651971 C/A 1 64 71 135 30.9310609560336 36.6858542519002 -5.75479329586663 A:C C A 10 0.516702172561975 0.343928619203849 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 36653597 C/T 1 104 63 167 50.2629740535546 32.5522368714044 17.7107371821502 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00660165054759448 ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36653528_36655116:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36653528_36655108:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36653528_36653701:CDKN1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 21 18 39 10.1492543761985 9.30063910611555 0.848615270082973 A:G A G 10 0.516702172561975 0.873160767498915 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 37442317 A/G 1 9 2 11 4.34968044694222 1.03340434512395 3.31627610181827 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0670490889820124 ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37442300_37442422:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37442300_37442422:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37442300_37442422:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37442300_37442422:FTSJD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 A:T T A 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 39073493 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000112167:ENST00000373249:exon_39071840_39073552:C6orf64;ENSG00000112167:ENST00000229903:exon_39071840_39073552:C6orf64 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 39158969 G/C 1 1 10 11 0.483297827438025 5.16702172561975 -4.68372389818173 C:G G C 10 0.516702172561975 0.00498857440724258 ENSG00000164626:ENST00000359534:exon_39156749_39159531:KCNK5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 41303592 T/C 1 2 27 29 0.96659565487605 13.9509586591733 -12.9843630042973 T:C T C 10 0.516702172561975 4.80813121158101e-07 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41303393_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41303527_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41303589_41303666:NCR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 41652604 T/C 1 104 95 199 50.2629740535546 49.0867063933876 1.17626766016696 T:C:G T C 10 0.516702172561975 0.887370372228407 ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 26 28 54 12.5657435133886 14.4676608317353 -1.90191731834665 T:C C T 10 0.516702172561975 0.683393924622453 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 42196212 A/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42192963_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42195866_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42195887_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42195887_42196407:TRERF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 42627434 G/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42627394_42627593:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42627394_42627593:UBR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 42658949 T/A 1 13 10 23 6.28287175669432 5.16702172561975 1.11585003107457 A:T T A 10 0.516702172561975 0.681574249107538 ENSG00000024048:ENST00000372899:exon_42658770_42661242:UBR2;ENSG00000024048:ENST00000372901:exon_42658770_42661242:UBR2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 42858238 G/T 1 8 19 27 3.8663826195042 9.81734127867753 -5.95095865917333 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0322219792657813 ENSG00000221821:ENST00000408925:exon_42858005_42858554:C6orf226 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 61 55 116 29.4811674737195 28.4186194909086 1.0625479828109 A:G A G 10 0.516702172561975 0.853218533887832 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43006392 G/A 1 14 19 33 6.76616958413235 9.81734127867753 -3.05117169454518 A:G G A 10 0.516702172561975 0.301504151142572 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43006304_43006430:CUL7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43488107 C/T 1 26 26 52 12.5657435133886 13.4342564866114 -0.868512973222703 T:C C T 10 0.516702172561975 0.88987681601677 ENSG00000171453:ENST00000372389:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372373:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000436688:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43487444_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372344:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000304004:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000488601:exon_43488013_43488165:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000455605:exon_43487444_43488786:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000495762:exon_43488054_43488165:POLR1C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43492659 G/C 1 32 27 59 15.4655304780168 13.9509586591733 1.51457181884347 C:G G C 10 0.516702172561975 0.794730395016501 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43492569_43494363:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000488195:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000486936:exon_43492569_43492706:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455285:exon_43492569_43492706:XPO5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 12 16 28 5.7995739292563 8.2672347609916 -2.4676608317353 A:C A C 10 0.516702172561975 0.450090452987714 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 14 7 21 6.76616958413235 3.61691520793383 3.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.194433587736325 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43969847 C/G 1 10 27 37 4.83297827438025 13.9509586591733 -9.11798038479307 C:G C G 10 0.516702172561975 0.00281628083479115 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43969790_43969864:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43969790_43969864:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43969790_43969864:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43969790_43969864:C6orf223 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 43970748 C/A 1 25 18 43 12.0824456859506 9.30063910611555 2.78180657983507 A:C C A 10 0.516702172561975 0.447033682792365 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 247 186 433 119.374563377192 96.1066040965274 23.2679592806648 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0268965617436368 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 10 1 11 4.83297827438025 0.516702172561975 4.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0121998219531107 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 44371690 T/C 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 T:C T C 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 49403282 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49403169_49403336:MUT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 56484758 C/T 1 7 10 17 3.38308479206617 5.16702172561975 -1.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.469884057373754 ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 56492845 A/C 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:C A C 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000520645:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56492797_56492959:DST;ENSG00000151914:ENST00000518935:exon_56492797_56492959:DST HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 8 8 0 4.1336173804958 -4.1336173804958 A G A 10 0.516702172561975 0.00297658811199819 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 T:C C T 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 74229042 A/G 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G A G 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000156508:ENST00000495333:exon_74228655_74229239:EEF1A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 76369054 A/G 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000436928:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000485497:exon_76368978_76369123:SENP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 76376552 G/A 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G G A 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76376428_76376657:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76376428_76376657:SENP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 76388322 A/G 1 10 12 22 4.83297827438025 6.2004260707437 -1.36744779636345 A:G A G 10 0.516702172561975 0.671048302810699 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000476060:exon_76386320_76388408:SENP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 79656570 G/A 1 15 10 25 7.24946741157037 5.16702172561975 2.08244568595062 A:G G A 10 0.516702172561975 0.430845709934854 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 82461520 A/G 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G A G 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000112773:ENST00000412306:exon_82461307_82461529:FAM46A;ENSG00000112773:ENST00000369754:exon_82461307_82461895:FAM46A;ENSG00000112773:ENST00000320172:exon_82461307_82461895:FAM46A;ENSG00000112773:ENST00000369756:exon_82461307_82461895:FAM46A;ENSG00000112773:ENST00000437923:exon_82461307_82461895:FAM46A;ENSG00000112773:ENST00000392940:exon_82461307_82461895:FAM46A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 87968161 G/A 1 9 5 14 4.34968044694222 2.58351086280988 1.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.427622029840295 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 87970615 T/A 1 46 41 87 22.2317000621491 21.184789075041 1.04691098710817 A:T T A 10 0.516702172561975 0.831118932858108 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 89322421 C/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 C:G C G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000111880:ENST00000369485:exon_89319985_89322601:RNGTT;ENSG00000111880:ENST00000265607:exon_89319989_89322601:RNGTT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 91226286 G/A 1 13 22 35 6.28287175669432 11.3674477963635 -5.08457603966913 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0925594089894135 ENSG00000135341:ENST00000369332:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369329:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369325:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369327:exon_91223292_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000479630:exon_91225353_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000450832:exon_91225353_91226400:MAP3K7;ENSG00000135341:ENST00000369320:exon_91225402_91226400:MAP3K7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 29 26 55 14.0156369957027 13.4342564866114 0.581380509091373 A:T:G A G 10 0.516702172561975 0.893564646129122 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 38 43 81 18.3653174426449 22.2181934201649 -3.85287597751998 T:C C T 10 0.516702172561975 0.436837748389291 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 106555107 C/T 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 T:C C T 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000057657:ENST00000369091:exon_106554786_106555383:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369096:exon_106554786_106557813:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000071246:exon_106554786_106557814:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000456278:exon_106554786_106556965:PRDM1;ENSG00000057657:ENST00000369089:exon_106554786_106557814:PRDM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 106727570 T/C 1 11 5 16 5.31627610181827 2.58351086280988 2.7327652390084 T:C T C 10 0.516702172561975 0.214197131356958 ENSG00000057663:ENST00000369076:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000343245:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000369070:exon_106727536_106727698:ATG5;ENSG00000057663:ENST00000476518:exon_106727536_106727698:ATG5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 109769036 C/G 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 C:G C G 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 111345525 C/G 1 68 60 128 32.8642522657857 31.0021303537185 1.86212191206719 C:G C G 10 0.516702172561975 0.79096850104893 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111345386_111345530:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000368864:exon_111345386_111345530:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000425871:exon_111345386_111345530:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111345386_111345530:RPF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 111887706 C/T 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 T:C C T 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000056972:ENST00000368761:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392555:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000392556:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000359831:exon_111887647_111887760:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000340026:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000368731:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000368735:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000368734:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000368730:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2;ENSG00000056972:ENST00000464903:exon_111887647_111887763:TRAF3IP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 116599899 G/A 1 8 17 25 3.8663826195042 8.78393693355358 -4.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0697011547149667 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 116600774 C/G 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 C:G C G 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 1 345 1 346 166.737750466119 0.516702172561975 166.221048293557 A:C C A 10 0.516702172561975 3.85737769344316e-97 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 126661583 C/T 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 T:C C T 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000203760:ENST00000368325:exon_126661320_126661590:CENPW HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 127797179 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000255330:ENST00000481848:exon_127796438_127797613:RP3-403A15.5;ENSG00000255330:ENST00000473298:exon_127796447_127797209:RP3-403A15.5;ENSG00000214338:ENST00000368268:exon_127796438_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000525778:exon_127796438_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000465909:exon_127796447_127797613:C6orf174;ENSG00000214338:ENST00000446168:exon_127796438_127797613:C6orf174 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 132645117 G/T 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:G G T 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000079931:ENST00000367963:exon_132645070_132645236:MOXD1;ENSG00000079931:ENST00000336749:exon_132645070_132645236:MOXD1;ENSG00000079931:ENST00000489128:exon_132645070_132645236:MOXD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 132694096 T/A 1 10 5 15 4.83297827438025 2.58351086280988 2.24946741157037 A:T T A 10 0.516702172561975 0.305839144436481 ENSG00000079931:ENST00000367963:exon_132693969_132694136:MOXD1;ENSG00000079931:ENST00000336749:exon_132693969_132694136:MOXD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 78 0 78 37.6972305401659 0 37.6972305401659 T T 10 0.516702172561975 6.26548890718622e-23 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 86 0 86 41.5636131596701 0 41.5636131596701 A A 10 0.516702172561975 2.82773881733365e-25 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 88 0 88 42.5302088145462 0 42.5302088145462 A A 10 0.516702172561975 7.36825608508841e-26 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 33 0 33 15.9488283054548 0 15.9488283054548 G G 10 0.516702172561975 3.82233373040677e-10 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 35 0 35 16.9154239603309 0 16.9154239603309 T T 10 0.516702172561975 1.00781760886432e-10 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 1 56 8 64 27.0646783365294 4.1336173804958 22.9310609560336 A:C A C 10 0.516702172561975 1.71218115692065e-09 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 139097232 C/T 1 25 13 38 12.0824456859506 6.71712824330568 5.36531744264495 T:C C T 10 0.516702172561975 0.103659135684863 ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 139266402 G/A 1 5 8 13 2.41648913719012 4.1336173804958 -1.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411436749794389 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 144183269 T/C 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 A:T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 13 4 17 6.28287175669432 2.0668086902479 4.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0511524645234594 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 151247344 T/C 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C T C 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000441122:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000428246:exon_151247258_151247431:MTHFD1L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 T:C C T 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 155606325 C/T 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 155632427 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155632322_155632473:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155632322_155632473:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000480390:exon_155631980_155632473:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000466349:exon_155632311_155632473:TFB1M HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 158330765 G/A 1 6 9 15 2.89978696462815 4.65031955305778 -1.75053258842963 A:G G A 10 0.516702172561975 0.442857702641627 ENSG00000130340:ENST00000392185:exon_158330697_158330822:SNX9;ENSG00000130340:ENST00000252631:exon_158330697_158330822:SNX9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 158438291 C/T 1 10 2 12 4.83297827438025 1.03340434512395 3.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0398349228801247 ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158438236_158438322:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158438236_158438322:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367121:exon_158438236_158438322:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367113:exon_158438236_158438322:SYNJ2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 159058767 C/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000146425:ENST00000367088:exon_159057506_159058926:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159058252_159058926:DYNLT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 159065757 C/T 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 159184507 C/T 1 38 39 77 18.3653174426449 20.151384729917 -1.78606728727208 T:C C T 10 0.516702172561975 0.732805527117911 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 159185563 T/A 1 73 86 159 35.2807414029758 44.4363868403299 -9.15564543735403 A:T T A 10 0.516702172561975 0.153579175136700 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 159188128 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 160113872 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160113693_160113895:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000452684:exon_160112027_160113895:SOD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 160198359 C/T 1 39 41 80 18.848615270083 21.184789075041 -2.336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.65499015818357 ENSG00000120437:ENST00000367048:exon_160198334_160198488:ACAT2;ENSG00000120437:ENST00000472052:exon_160198334_160198488:ACAT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 22 13 35 10.6325522036365 6.71712824330568 3.91542396033087 T:C T C 10 0.516702172561975 0.23627826686653 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 24 24 48 11.5991478585126 12.4008521414874 -0.801704282974804 T:C T C 10 0.516702172561975 0.885523259015994 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 282 336 618 136.289987337523 173.611929980824 -37.3219426433006 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00287188348002867 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 167550751 G/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 1 8 9 0.483297827438025 4.1336173804958 -3.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0179058656326308 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 170627586 G/T 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:G G T 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 2 8 10 0.96659565487605 4.1336173804958 -3.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0579335952414094 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 170627761 A/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 27 20 47 13.0490413408267 10.3340434512395 2.71499788958717 A:T A T 10 0.516702172561975 0.467625016927764 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 590199 A/G 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G A G 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 590229 T/C 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C T C 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_588835_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_589379_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_589387_590239:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_589907_590239:PRKAR1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 50 55 105 24.1648913719012 28.4186194909086 -4.25372811900738 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.435329170929055 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 934999 C/T 1 48 38 86 23.1982957170252 19.6346825573551 3.56361315967014 T:C C T 10 0.516702172561975 0.452414521747741 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_934971_936072:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_934971_936071:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_934971_936073:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_934971_935295:GET4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 938875 G/A 1 27 25 52 13.0490413408267 12.9175543140494 0.131487026777299 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_938670_938898:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_938670_938898:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_938670_938898:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_938670_938898:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_938670_938898:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_938670_938898:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_938670_938898:COX19 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 1192728 G/A 1 33 34 67 15.9488283054548 17.5678738671072 -1.61904556165233 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.715209005422043 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1192709_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1192543_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1192543_1192877:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1192544_1192860:ZFAND2A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 1522342 G/A 1 3 6 9 1.44989348231407 3.10021303537185 -1.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.329552060195184 ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1522182_1522343:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1522182_1522343:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1522182_1522343:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000468115:exon_1521914_1523489:INTS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 20 11 31 9.6659565487605 5.68372389818173 3.98223265057877 A:G G A 10 0.516702172561975 0.207752318020916 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2262273 C/A 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:C C A 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455998:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429779:exon_2262210_2262389:MAD1L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2284251 G/C 1 13 13 26 6.28287175669432 6.71712824330568 -0.434256486611352 C:G G C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2284147_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000454650:exon_2284198_2284320:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2284191_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000471348:exon_2284244_2284361:NUDT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2317738 G/A 1 60 51 111 28.9978696462815 26.3518108006607 2.64605884562077 A:G G A 10 0.516702172561975 0.635925114316787 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2317735_2317940:SNX8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2472730 G/A 1 26 31 57 12.5657435133886 16.0177673494212 -3.45202383603258 A:G G A 10 0.516702172561975 0.426800261882654 ENSG00000136213:ENST00000258711:exon_2472198_2474242:CHST12;ENSG00000136213:ENST00000432336:exon_2472198_2473010:CHST12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2577960 G/A 1 33 30 63 15.9488283054548 15.5010651768593 0.447763128595572 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2578247 G/A 1 23 11 34 11.1158500310746 5.68372389818173 5.43212613289285 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0847461952628629 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2581440 G/A 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 A:G G A 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2581352_2581470:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2581352_2581470:C7orf27 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2771000 G/A 1 3 12 15 1.44989348231407 6.2004260707437 -4.75053258842963 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0180458677713663 ENSG00000146535:ENST00000275364:exon_2767746_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000491117:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407653:exon_2768200_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000496740:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000396960:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000471281:exon_2770657_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000485329:exon_2770985_2771384:GNA12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 30 27 57 14.4989348231407 13.9509586591733 0.547976163967423 T:C T C 10 0.516702172561975 0.895516456667676 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2951824 A/G 1 15 14 29 7.24946741157037 7.23383041586765 0.0156369957027236 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2951860 G/A 1 20 13 33 9.6659565487605 6.71712824330568 2.94882830545482 A:G G A 10 0.516702172561975 0.384275391484244 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2953027 G/A 1 7 16 23 3.38308479206617 8.2672347609916 -4.88414996892543 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0583381845258903 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2952921_2953100:CARD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2979542 C/T 1 12 11 23 5.7995739292563 5.68372389818173 0.115850031074574 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2979383_2979562:CARD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 2983876 C/T 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 T:C C T 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2983846_2984171:CARD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 4815346 G/C 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 C:G G C 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4815229_4815387:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4815253_4815387:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4815264_4815387:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4815264_4815387:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000482480:exon_4815272_4815387:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4815283_4815387:KIAA0415 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 4823971 C/T 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4823834_4824002:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000491375:exon_4823834_4824002:KIAA0415 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 4830295 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 4830822 G/A 1 41 35 76 19.815210924959 18.0845760396691 1.73063488528989 A:G G A 10 0.516702172561975 0.731413810486895 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4830746_4831399:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4830746_4831399:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000477680:exon_4830746_4831386:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4830746_4833943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000469614:exon_4830746_4831381:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000490487:exon_4830746_4831358:KIAA0415 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5269245 C/T 1 22 22 44 10.6325522036365 11.3674477963635 -0.7348955927269 T:C C T 10 0.516702172561975 0.880656348233704 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5269239_5269369:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5269239_5269369:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5269239_5269336:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5269239_5269369:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5269239_5269336:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5269239_5269336:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5269239_5269336:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000471851:exon_5269239_5269369:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000479690:exon_5269039_5269369:WIPI2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5270451 G/A 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.134801312088078 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5270543 A/G 1 70 51 121 33.8308479206617 26.3518108006607 7.47903712000102 A:G A G 10 0.516702172561975 0.202676023667115 ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5270466_5273457:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5270466_5271155:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5270466_5270735:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5270466_5270578:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5270466_5271101:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5270466_5270695:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5270466_5270578:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000471851:exon_5270466_5271354:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000479690:exon_5270466_5270958:WIPI2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5352949 G/C 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 C:G G C 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5353252 G/C 1 11 7 18 5.31627610181827 3.61691520793383 1.69936089388445 C:G G C 10 0.516702172561975 0.485136060235083 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5353447 T/C 1 6 15 21 2.89978696462815 7.75053258842963 -4.85074562380148 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0472739243665474 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5399044 C/G 1 21 14 35 10.1492543761985 7.23383041586765 2.91542396033087 C:G C G 10 0.516702172561975 0.398376363469485 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5399029_5399200:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000440081:exon_5399029_5399200:TNRC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5410135 C/T 1 10 10 20 4.83297827438025 5.16702172561975 -0.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5427628 C/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 C:G C G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5427303_5428967:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000413081:exon_5427303_5427660:TNRC18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5643145 T/C 1 97 115 212 46.8798892614884 59.4207498446271 -12.5408605831387 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0861858612781902 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643127_5643248:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643127_5643248:FSCN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 5780993 C/A 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000011275:ENST00000425013:exon_5780604_5781275:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389902:exon_5780604_5781446:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389900:exon_5780604_5781275:RNF216 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6026696 T/C 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 T:C T C 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6026923 C/G 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 C:G C G 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6027042 C/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 C:G C G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6026390_6027251:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6026718_6027251:PMS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6048973 C/A 1 24 13 37 11.5991478585126 6.71712824330568 4.88201961520692 A:C C A 10 0.516702172561975 0.138030339847995 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6048876_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6048886_6049009:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6048921_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6048947_6049129:AIMP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6063283 C/T 1 51 52 103 24.6481891993393 26.8685129732227 -2.22032377388343 T:C C T 10 0.516702172561975 0.693913379359408 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6062934_6063465:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6062934_6063326:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6062934_6063378:AIMP2;ENSG00000086232:ENST00000199389:exon_6061881_6064432:EIF2AK1;ENSG00000086232:ENST00000422786:exon_6062807_6063377:EIF2AK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6189780 T/C 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:C T C 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 14 5 19 6.76616958413235 2.58351086280988 4.18265872132247 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0663429693315515 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 7 2 9 3.38308479206617 1.03340434512395 2.34968044694222 A:G G A 10 0.516702172561975 0.181883103647470 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 7646687 A/G 1 21 19 40 10.1492543761985 9.81734127867753 0.331913097520998 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000164654:ENST00000340080:exon_7646627_7647127:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000405785:exon_7646627_7646854:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000493227:exon_7646627_7648556:MIOS;ENSG00000164654:ENST00000479694:exon_7646627_7648560:MIOS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 15 18 33 7.24946741157037 9.30063910611555 -2.05117169454518 A:G A G 10 0.516702172561975 0.491505449600174 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 21940667 G/A 1 13 16 29 6.28287175669432 8.2672347609916 -1.98436300429728 A:G G A 10 0.516702172561975 0.578060435519144 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000479878:exon_21940625_21940734:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 22985234 T/G 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 T:G T G 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000122591:ENST00000432176:exon_22980878_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000440481:exon_22980888_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000242158:exon_22983260_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000409923:exon_22984128_22985782:FAM126A;ENSG00000122591:ENST00000457703:exon_22984192_22985782:FAM126A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 26217669 A/G 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000050344:ENST00000056233:exon_26217563_26217742:NFE2L3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 26224416 A/G 1 10 11 21 4.83297827438025 5.68372389818173 -0.850745623801475 A:G A G 10 0.516702172561975 0.828123400368503 ENSG00000050344:ENST00000056233:exon_26224153_26226745:NFE2L3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 9 13 22 4.34968044694222 6.71712824330568 -2.36744779636345 C:G G C 10 0.516702172561975 0.394703182135892 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 32615604 T/C 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 T:C T C 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32615567_32615684:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32615567_32615684:AVL9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 35919466 T/A 1 31 24 55 14.9822326505788 12.4008521414874 2.58138050909137 A:T T A 10 0.516702172561975 0.503205172135747 ENSG00000122545:ENST00000435235:exon_35919433_35919550:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000399034:exon_35919433_35919550:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000350320:exon_35919433_35919550:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000475109:exon_35919433_35919550:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000399035:exon_35919433_35919550:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000425198:exon_35919433_35919550:SEPT7;ENSG00000122545:ENST00000469679:exon_35919433_35919550:SEPT7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 37298800 C/T 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 37988589 C/T 1 8 8 16 3.8663826195042 4.1336173804958 -0.267234760991601 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000086289:ENST00000476620:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000199448:exon_37988442_37988650:EPDR1;ENSG00000086289:ENST00000425345:exon_37988442_37988650:EPDR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 39610177 A/G 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 42967055 C/T 1 50 32 82 24.1648913719012 16.5344695219832 7.63042184991805 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0979731839250916 ENSG00000106588:ENST00000442788:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000433579:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000223321:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000436986:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000457444:exon_42966982_42967063:PSMA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 52 35 87 25.1314870267773 18.0845760396691 7.04691098710817 T:C T C 10 0.516702172561975 0.134555898430091 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 43906513 A/G 1 98 80 178 47.3631870889264 41.336173804958 6.02701328396844 A:T:C:G A G 10 0.516702172561975 0.369460626013968 ENSG00000062582:ENST00000317534:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000083014:exon_43906157_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000418740:exon_43906161_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000483330:exon_43906377_43906581:MRPS24;ENSG00000062582:ENST00000467084:exon_43906404_43906581:MRPS24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 43916491 G/A 1 31 13 44 14.9822326505788 6.71712824330568 8.2651044072731 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0150567683580945 ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 44099664 T/C 1 44 49 93 21.2651044072731 25.3184064555368 -4.05330204826368 T:C T C 10 0.516702172561975 0.408550899176663 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099647_44099752:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099647_44099752:DBNL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 44104805 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44100376_44109055:DBNL;ENSG00000164708:ENST00000297283:exon_44104715_44105186:PGAM2;ENSG00000164708:ENST00000425387:exon_44104794_44104847:PGAM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 44153780 A/G 0 19 0 19 9.18265872132247 0 9.18265872132247 A A 10 0.516702172561975 4.56113549286921e-06 ENSG00000106624:ENST00000223357:exon_44153193_44154159:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000450684:exon_44153193_44154161:AEBP1;ENSG00000106624:ENST00000413907:exon_44153193_44154158:AEBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 44530193 T/G 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 T:G T G 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000015676:ENST00000355451:exon_44530008_44530479:NUDCD3;ENSG00000015676:ENST00000464812:exon_44530008_44530205:NUDCD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 44746975 A/G 1 35 38 73 16.9154239603309 19.6346825573551 -2.71925859702418 A:G A G 10 0.516702172561975 0.559248373817712 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44746824_44746987:OGDH HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 45009325 G/A 1 98 67 165 47.3631870889264 34.6190455616523 12.7441415272741 A:G G A 10 0.516702172561975 0.051343310976086 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 45104124 G/A 1 11 10 21 5.31627610181827 5.16702172561975 0.149254376198525 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000478582:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000482714:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000492883:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000472223:exon_45104062_45104245:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000476594:exon_45104062_45104221:CCM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 26 26 52 12.5657435133886 13.4342564866114 -0.868512973222703 A:G G A 10 0.516702172561975 0.88987681601677 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 45113937 G/A 1 33 26 59 15.9488283054548 13.4342564866114 2.51457181884347 A:G G A 10 0.516702172561975 0.518724081105516 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113869_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113869_45114007:CCM2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 45140914 C/T 1 28 29 57 13.5323391682647 14.9843630042973 -1.45202383603258 T:C C T 10 0.516702172561975 0.791258282817734 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45140857_45140971:TBRG4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 45141667 C/T 1 46 40 86 22.2317000621491 20.668086902479 1.56361315967015 T:C C T 10 0.516702172561975 0.747553458765799 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000483615:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482482:exon_45141424_45141669:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478116:exon_45141373_45141669:TBRG4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 46 44 90 22.2317000621491 22.7348955927269 -0.503195530577752 A:G A G 10 0.516702172561975 0.916506372595693 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 56140709 A/C 1 12 24 36 5.7995739292563 12.4008521414874 -6.6012782122311 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0302806260062048 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413952:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000452216:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000483327:exon_56140690_56141649:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000498777:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000451338:exon_56140690_56140804:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000529457:exon_56140690_56140804:SUMF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 65419176 C/T 1 11 11 22 5.31627610181827 5.68372389818173 -0.36744779636345 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196715:ENST00000360768:exon_65419061_65424530:VKORC1L1;ENSG00000196715:ENST00000434382:exon_65419061_65420404:VKORC1L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 87 77 164 42.0469109871082 39.7860672872721 2.26084369983609 A:G A G 10 0.516702172561975 0.754941506865496 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 65432751 C/T 1 17 19 36 8.21606306644642 9.81734127867753 -1.6012782122311 T:C C T 10 0.516702172561975 0.620337183008844 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65432718_65432895:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65432718_65432894:GUSB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 11 2 13 5.31627610181827 1.03340434512395 4.28287175669433 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0233985038423332 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 72891754 C/T 1 22 14 36 10.6325522036365 7.23383041586765 3.3987217877689 T:C C T 10 0.516702172561975 0.3174146376039 ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 73097720 G/C 1 8 13 21 3.8663826195042 6.71712824330568 -2.85074562380148 C:G G C 10 0.516702172561975 0.275577945999374 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 73151643 C/T 1 10 2 12 4.83297827438025 1.03340434512395 3.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0398349228801247 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 73152700 G/C 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 C:G G C 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73152663_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73152658_73152772:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73152663_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000322862:exon_73152658_73152772:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000458339:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000412965:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000395147:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000486114:exon_73152658_73152840:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000474130:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000468331:exon_73152658_73152713:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000480445:exon_73152658_73152793:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000468998:exon_73152658_73152793:ABHD11 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 73753025 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 73753133 C/T 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 T:C C T 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 75517435 C/T 1 13 11 24 6.28287175669432 5.68372389818173 0.599147858512599 T:C C T 10 0.516702172561975 0.840964782284327 ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 75583421 C/T 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75583394_75583498:POR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 24 13 37 11.5991478585126 6.71712824330568 4.88201961520692 A:G G A 10 0.516702172561975 0.138030339847995 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 75621768 G/A 1 17 66 83 8.21606306644642 34.1023433890904 -25.8862803226439 A:G G A 10 0.516702172561975 7.17045323649408e-09 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 75931984 C/T 1 37 13 50 17.8820196152069 6.71712824330568 11.1648913719012 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00163462311530764 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 75931999 T/C 1 36 12 48 17.3987217877689 6.2004260707437 11.1982957170252 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00127422103518816 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75931990_75932073:HSPB1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 87079406 T/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:T T A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87079284_87079408:ABCB4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 89793785 T/C 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 23 26 49 11.1158500310746 13.4342564866114 -2.31840645553678 A:G G A 10 0.516702172561975 0.568386696022871 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 91736686 C/A 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 A:C C A 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91736607_91736736:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91736607_91736736:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91736607_91736736:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91736607_91736736:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91736607_91736736:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91736607_91736736:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000463118:exon_91736607_91736826:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493976:exon_91736607_91737243:AKAP9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 92730618 C/T 1 4 8 12 1.9331913097521 4.1336173804958 -2.2004260707437 T:C C T 10 0.516702172561975 0.253714749912099 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 44 47 91 21.2651044072731 24.2850021104128 -3.01989770313973 T:G T G 10 0.516702172561975 0.53131952708267 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 99695787 T/C 1 77 75 152 37.2139327127279 38.7526629421481 -1.5387302294202 T:C T C 10 0.516702172561975 0.808229320933496 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99695764_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99695764_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99695764_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99695764_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99695764_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000477372:exon_99695764_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99695682_99695913:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99695763_99695913:MCM7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 99697669 C/T 1 34 24 58 16.4321261328928 12.4008521414874 4.03127399140545 T:C C T 10 0.516702172561975 0.296992778964665 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000467516:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000465688:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000465738:exon_99697637_99698016:MCM7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 99704839 G/A 1 22 11 33 10.6325522036365 5.68372389818173 4.94882830545482 A:G G A 10 0.516702172561975 0.115696518976053 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 99708771 G/A 1 29 21 50 14.0156369957027 10.8507456238015 3.16489137190125 A:G G A 10 0.516702172561975 0.398390633126115 ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99708762_99708944:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000487115:exon_99708762_99708947:TAF6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 99725631 G/A 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:T:G G A 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000214309:ENST00000398075:exon_99724991_99726118:MBLAC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 99818614 C/T 1 29 22 51 14.0156369957027 11.3674477963635 2.64818919933927 T:C C T 10 0.516702172561975 0.486250961597664 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99818551_99819111:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99818551_99819113:PVRIG HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100028199 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100033148 A/G 1 52 54 106 25.1314870267773 27.9019173183467 -2.77043029156935 A:G A G 10 0.516702172561975 0.627533912812256 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100151719 G/A 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.213290861679303 ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100151716_100151881:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100151716_100151881:AGFG2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100279612 G/A 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100279487_100279616:GIGYF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100459098 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100459014_100459206:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100456358_100459206:SLC12A9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100459502 T/C 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000146828:ENST00000428758:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000275729:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000415287:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100459359_100459533:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000482184:exon_100459359_100459533:SLC12A9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100463997 G/A 1 24 39 63 11.5991478585126 20.151384729917 -8.55223687140443 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0324373120799609 ENSG00000146828:ENST00000354161:exon_100463341_100464630:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000475687:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000474019:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000467972:exon_100463341_100464631:SLC12A9;ENSG00000146828:ENST00000487651:exon_100463341_100464631:SLC12A9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100482840 C/T 1 56 45 101 27.0646783365294 23.2515977652889 3.81308057124052 T:C C T 10 0.516702172561975 0.486392322940579 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100482834_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100482837_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100482837_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100482834_100482991:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000460194:exon_100482837_100483208:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100482834_100482991:SRRT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 81 93 174 39.14712402248 48.0533020482637 -8.90617802578366 T:C:G C T 10 0.516702172561975 0.197125133501326 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100490077 G/A 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100491149 C/T 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100490786_100492009:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000426415:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000454485:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000440755:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000430554:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100490786_100491525:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100490786_100491876:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100490786_100491873:ACHE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100731896 T/C 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 T:C T C 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 100888322 T/C 1 9 10 19 4.34968044694222 5.16702172561975 -0.817341278677525 T:C T C 10 0.516702172561975 0.819737654598694 ENSG00000214253:ENST00000449367:exon_100888241_100888356:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000442303:exon_100888179_100888329:FIS1;ENSG00000214253:ENST00000223136:exon_100888241_100888366:FIS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 22 13 35 10.6325522036365 6.71712824330568 3.91542396033087 A:G G A 10 0.516702172561975 0.23627826686653 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 102964980 A/G 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105821:ENST00000249270:exon_102964929_102965009:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000379263:exon_102964929_102965009:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000475065:exon_102964929_102965009:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000464253:exon_102964929_102965009:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000454277:exon_102964929_102965009:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000483637:exon_102964929_102965177:DNAJC2;ENSG00000105821:ENST00000379257:exon_102964929_102965009:DNAJC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 104741952 T/C 1 29 46 75 14.0156369957027 23.7682999378509 -9.75266294214813 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0277573667413078 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104741872_104742036:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000479838:exon_104741918_104742036:MLL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 104749508 T/G 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000478079:exon_104749389_104749675:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000473063:exon_104749487_104749675:MLL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 104751044 T/C 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 T:C T C 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104750924_104751049:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104750924_104751049:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104750924_104751049:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104750924_104751049:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104750924_104751049:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104750924_104751049:MLL5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 105182995 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000467392:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000493041:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105182939_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000477285:exon_105182855_105183003:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000493258:exon_105182687_105183096:RINT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 105207749 T/C 1 15 19 34 7.24946741157037 9.81734127867753 -2.56787386710715 T:C T C 10 0.516702172561975 0.396096284976245 ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105207566_105208124:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105207566_105208123:RINT1;ENSG00000185055:ENST00000486180:exon_105206770_105207937:EFCAB10;ENSG00000185055:ENST00000490493:exon_105207549_105207937:EFCAB10;ENSG00000185055:ENST00000460135:exon_105207642_105207937:EFCAB10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 106826381 C/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 108119692 C/T 1 8 18 26 3.8663826195042 9.30063910611555 -5.43425648661135 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0476819572702836 ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 112102355 T/G 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 T:G T G 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 112112279 G/A 1 20 18 38 9.6659565487605 9.30063910611555 0.365317442644949 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 19 33 52 9.18265872132247 17.0511716945452 -7.8685129732227 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0365183455926069 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 120428799 C/A 1 13 16 29 6.28287175669432 8.2672347609916 -1.98436300429728 A:C C A 10 0.516702172561975 0.578060435519144 ENSG00000106025:ENST00000222747:exon_120427376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000450414:exon_120428376_120428951:TSPAN12;ENSG00000106025:ENST00000415871:exon_120428428_120428951:TSPAN12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 120610901 C/T 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120610742_120610934:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120610742_120610934:ING3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 127222157 G/A 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127220672_127223363:GCC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 127224452 T/C 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 T:C T C 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000179562:ENST00000321407:exon_127224205_127225661:GCC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 127953243 T/C 1 15 17 32 7.24946741157037 8.78393693355358 -1.5344695219832 T:C T C 10 0.516702172561975 0.600958499169707 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000481788:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127953228_127953327:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000495327:exon_127953141_127953327:RBM28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 127958127 A/G 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127958010_127958159:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127958010_127958159:RBM28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 127963629 G/A 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G G A 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127963580_127963644:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127963580_127963644:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000487602:exon_127963612_127963644:RBM28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 127979347 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127979281_127979375:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000478061:exon_127979281_127979375:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000459726:exon_127979281_127979375:RBM28 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 128502947 C/T 1 27 32 59 13.0490413408267 16.5344695219832 -3.48542818115653 T:C C T 10 0.516702172561975 0.434732783468217 ENSG00000128524:ENST00000249289:exon_128502880_128503116:ATP6V1F HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 133749164 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000459626:exon_133749044_133749211:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000468932:exon_133749071_133749339:EXOC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 133979545 A/T 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 A A 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 133979552 C/T 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 C C 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 133979578 A/G 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 A A 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 134130035 G/A 1 35 28 63 16.9154239603309 14.4676608317353 2.44776312859557 A:G G A 10 0.516702172561975 0.61450625772247 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000494491:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467251:exon_134129479_134130072:AKR1B1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 134618682 C/T 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C C T 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000122786:ENST00000361675:exon_134617739_134618828:CALD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 134618710 A/G 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 A:G A G 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000122786:ENST00000361675:exon_134617739_134618828:CALD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 134849534 G/A 1 21 26 47 10.1492543761985 13.4342564866114 -3.28500211041283 A:G G A 10 0.516702172561975 0.38224725506715 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 134871059 G/A 1 36 45 81 17.3987217877689 23.2515977652889 -5.85287597751998 A:G G A 10 0.516702172561975 0.221352953059329 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134868590_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134868591_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134868591_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134870534_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871014_134871067:WDR91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 134878070 G/A 1 19 6 25 9.18265872132247 3.10021303537185 6.08244568595062 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0159853157431745 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000497853:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000462707:exon_134877983_134878310:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134877967_134878229:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000474411:exon_134877967_134878151:WDR91 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 17 14 31 8.21606306644642 7.23383041586765 0.982232650578773 T:C T C 10 0.516702172561975 0.85777700870536 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 139706959 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139706891_139706982:TBXAS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 139724358 G/A 1 13 36 49 6.28287175669432 18.6012782122311 -12.3184064555368 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0004815085435878 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 139724555 C/T 1 12 13 25 5.7995739292563 6.71712824330568 -0.917554314049377 T:C C T 10 0.516702172561975 0.841973379793163 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139723544_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139723549_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139723586_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489809:exon_139724334_139724685:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000491598:exon_139724381_139724685:PARP12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 139727135 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000059378:ENST00000263549:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000473341:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000488726:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000496624:exon_139727076_139727206:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000489383:exon_139727076_139727467:PARP12;ENSG00000059378:ENST00000466597:exon_139727076_139727206:PARP12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 19 11 30 9.18265872132247 5.68372389818173 3.49893482314075 T:C T C 10 0.516702172561975 0.272837047938000 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 1 27 33 60 13.0490413408267 17.0511716945452 -4.0021303537185 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.305201401480351 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 142498964 A/C 1 23 34 57 11.1158500310746 17.5678738671072 -6.45202383603258 A:C A C 10 0.516702172561975 0.110982718390491 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 45 15 60 21.7484022347111 7.75053258842963 13.9978696462815 T:C T C 10 0.516702172561975 0.000255158327232503 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 143085922 G/C 1 54 56 110 26.0980826816533 28.9353216634706 -2.83723898181725 C:G G C 10 0.516702172561975 0.633698159249712 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000446634:exon_143085860_143085989:ZYX HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 148515192 A/G 1 12 4 16 5.7995739292563 2.0668086902479 3.7327652390084 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0794171995374525 ENSG00000106462:ENST00000492143:exon_148513776_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000478654:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000320356:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000460911:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000350995:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000476773:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000483967:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000498186:exon_148514449_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000483012:exon_148515129_148515209:EZH2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 193 249 442 93.2764806955388 128.658840967932 -35.382360272393 T:C C T 10 0.516702172561975 0.000845594608287223 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 148921622 C/T 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 T:C C T 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000170265:ENST00000430197:exon_148921274_148921739:ZNF282;ENSG00000170265:ENST00000262085:exon_148920904_148923339:ZNF282;ENSG00000170265:ENST00000479907:exon_148921340_148921755:ZNF282 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 T:C T C 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 T:C T C 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150068605 G/A 1 22 6 28 10.6325522036365 3.10021303537185 7.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00424298820258652 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150068620 C/T 1 18 5 23 8.69936089388445 2.58351086280988 6.11585003107457 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0115960221221812 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 27 12 39 13.0490413408267 6.2004260707437 6.84861527008297 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0360890847610030 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150094851 A/G 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150095084 C/T 1 13 12 25 6.28287175669432 6.2004260707437 0.0824456859506233 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150217309 C/T 1 13 9 22 6.28287175669432 4.65031955305778 1.63255220363655 T:C C T 10 0.516702172561975 0.528603179339558 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150389593 T/C 1 22 25 47 10.6325522036365 12.9175543140494 -2.28500211041283 T:C T C 10 0.516702172561975 0.560502979227703 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 9 28 37 4.34968044694222 14.4676608317353 -10.1179803847931 A:G A G 10 0.516702172561975 0.000854511328843614 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150488616 A/G 1 1 153 154 0.483297827438025 79.0554324019822 -78.5721345745442 A:G A G 10 0.516702172561975 3.87491130377587e-47 ENSG00000106565:ENST00000492607:exon_150488373_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000447204:exon_150488375_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000326442:exon_150488375_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000223298:exon_150488375_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000528038:exon_150488375_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000434545:exon_150488380_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000424513:exon_150488380_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000429904:exon_150488389_150488711:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000450753:exon_150488390_150488711:TMEM176B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150489166 C/T 1 2 88 90 0.96659565487605 45.4697911854538 -44.5031955305777 T:C C T 10 0.516702172561975 1.93012622145347e-25 ENSG00000106565:ENST00000492607:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000447204:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000326442:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000223298:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000528038:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000434545:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000424513:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000429904:exon_150489144_150489263:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000450753:exon_150489144_150489263:TMEM176B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150491084 T/G 1 3 51 54 1.44989348231407 26.3518108006607 -24.9019173183467 T:G T G 10 0.516702172561975 3.0053593096214e-13 ENSG00000106565:ENST00000492607:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000447204:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000326442:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000223298:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000528038:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000434545:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000424513:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000429904:exon_150491049_150491159:TMEM176B;ENSG00000106565:ENST00000472929:exon_150491049_150491159:TMEM176B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150500729 A/G 1 1 191 192 0.483297827438025 98.6901149593372 -98.2068171318992 A:G A G 10 0.516702172561975 4.82710876043568e-59 ENSG00000002933:ENST00000484928:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000004103:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000494349:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000461345:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475536:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000468689:exon_150500708_150500896:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000462826:exon_150499144_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475007:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000481305:exon_150500708_150500920:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000474166:exon_150500707_150500920:TMEM176A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150501455 G/T 0 0 155 155 0 80.0888367471061 -80.0888367471061 T G T 10 0.516702172561975 1.13057829648642e-49 ENSG00000002933:ENST00000484928:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000004103:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000494349:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000461345:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475536:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475007:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000474166:exon_150501450_150501769:TMEM176A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150501516 A/G 1 3 270 273 1.44989348231407 139.509586591733 -138.059693109419 A:G A G 10 0.516702172561975 2.55730481195806e-80 ENSG00000002933:ENST00000484928:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000004103:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000494349:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000461345:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475536:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475007:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000474166:exon_150501450_150501769:TMEM176A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150553605 C/T 1 2 24 26 0.96659565487605 12.4008521414874 -11.4342564866114 T:C C T 10 0.516702172561975 3.35226544598313e-06 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000460213:exon_150553543_150554305:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000483043:exon_150553543_150554570:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000437714:exon_150553559_150554654:ABP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150554887 G/A 1 7 48 55 3.38308479206617 24.8017042829748 -21.4186194909086 A:G G A 10 0.516702172561975 2.06537510604460e-09 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150553543_150555128:ABP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150555915 A/G 1 2 57 59 0.96659565487605 29.4520238360326 -28.4854281811565 A:G A G 10 0.516702172561975 4.84094462283315e-16 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000388969:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000480582:exon_150555851_150556136:ABP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150556002 T/C 0 0 19 19 0 9.81734127867753 -9.81734127867753 C T C 10 0.516702172561975 1.00018886306306e-06 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000388969:exon_150555851_150556136:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000480582:exon_150555851_150556136:ABP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150557622 G/A 0 0 44 44 0 22.7348955927269 -22.7348955927269 A G A 10 0.516702172561975 1.27483238090009e-14 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150557532_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000437714:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000388969:exon_150557589_150557670:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000480582:exon_150557589_150557721:ABP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150557665 C/G 1 1 42 43 0.483297827438025 21.701491247603 -21.2181934201649 C:G C G 10 0.516702172561975 1.70603514221691e-12 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150557532_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000437714:exon_150557589_150557721:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000388969:exon_150557589_150557670:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000480582:exon_150557589_150557721:ABP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150742408 G/T 1 15 19 34 7.24946741157037 9.81734127867753 -2.56787386710715 T:G G T 10 0.516702172561975 0.396096284976245 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150768786 G/A 1 17 4 21 8.21606306644642 2.0668086902479 6.14925437619852 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00785221115983544 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150905101 G/C 1 8 1 9 3.8663826195042 0.516702172561975 3.34968044694222 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0400052234226814 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150904923_150905193:ABCF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150912786 T/C 1 17 14 31 8.21606306644642 7.23383041586765 0.982232650578773 T:C T C 10 0.516702172561975 0.85777700870536 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150912690_150912818:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150912690_150912818:ABCF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 150935761 C/T 1 59 62 121 28.5145718188435 32.0355346988425 -3.52096287999898 T:C C T 10 0.516702172561975 0.525952706934378 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 155094553 T/C 1 101 135 236 48.8130805712405 69.7547932958666 -20.9417127246261 T:C T C 10 0.516702172561975 0.00744928624512394 ENSG00000186480:ENST00000340368:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000344756:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000342407:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000476756:exon_155094457_155094556:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000468307:exon_155093961_155094728:INSIG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 16 2 18 7.7327652390084 1.03340434512395 6.69936089388445 A:G A G 10 0.516702172561975 0.00144923359479204 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158528254 G/A 1 12 2 14 5.7995739292563 1.03340434512395 4.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0136115374114993 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158528269 C/G 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 C:G C G 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 C:G G C 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G A G 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 7 158540933 G/A 1 11 7 18 5.31627610181827 3.61691520793383 1.69936089388445 A:G G A 10 0.516702172561975 0.485136060235083 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158540885_158540971:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158540885_158540971:ESYT2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 408379 A/G 1 11 8 19 5.31627610181827 4.1336173804958 1.18265872132247 A:G A G 10 0.516702172561975 0.651129112719795 ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_408369_408551:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_408369_408406:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_408369_408551:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_408369_408551:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_408369_408551:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000519376:exon_408369_408551:FBXO25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 642533 C/T 1 17 16 33 8.21606306644642 8.2672347609916 -0.051171694545177 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_642478_642612:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000524138:exon_642478_642612:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000518277:exon_642478_642612:ERICH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 8 3 11 3.8663826195042 1.55010651768593 2.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.229436091407765 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 6605321 G/C 1 9 3 12 4.34968044694222 1.55010651768593 2.7995739292563 C:G G C 10 0.516702172561975 0.148691587287675 ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6605191_6605349:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6605191_6605349:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000530716:exon_6605191_6605349:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000533159:exon_6605205_6605349:AGPAT5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 8175859 C/T 1 20 16 36 9.6659565487605 8.2672347609916 1.3987217877689 T:C C T 10 0.516702172561975 0.739470758601549 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 T:C C T 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 10689212 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000517607:exon_10689175_10689253:PINX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 11400835 C/T 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11400733_11400856:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11400733_11400856:BLK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 11406593 T/C 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 T:C T C 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 11412974 A/G 1 64 65 129 30.9310609560336 33.5856412165284 -2.65458026049478 A:G A G 10 0.516702172561975 0.660298455962718 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11412841_11412993:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11412841_11412993:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11412841_11412993:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11412841_11412993:BLK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 11660362 T/C 1 51 32 83 24.6481891993393 16.5344695219832 8.11371967735607 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0793322089660046 ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11660268_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11660120_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11660152_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11660248_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11660250_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11660255_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11660275_11660419:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525571:exon_11660277_11660440:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000527045:exon_11660293_11660440:FDFT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 11683653 T/C 1 62 58 120 29.9644653011575 29.9687260085946 -0.0042607074370018 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 11706581 T/C 1 12 5 17 5.7995739292563 2.58351086280988 3.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.147252563571036 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532409:exon_11706555_11707087:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533110:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11706555_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11706570_11706673:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11706571_11706673:CTSB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17094849 T/C 1 14 15 29 6.76616958413235 7.75053258842963 -0.984363004297276 T:C T C 10 0.516702172561975 0.715533472379847 ENSG00000198791:ENST00000361272:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000439921:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000523917:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000519954:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000519918:exon_17094721_17094882:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000522062:exon_17094721_17095104:CNOT7;ENSG00000198791:ENST00000524358:exon_17094751_17094882:CNOT7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17794734 A/C 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:C A C 10 0.516702172561975 0.291257287751457 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518537:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518936:exon_17794643_17794830:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523055:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17794643_17794888:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518985:exon_17794685_17794888:PCM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:T A T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17820758 G/T 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:G G T 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17918934 A/G 1 25 16 41 12.0824456859506 8.2672347609916 3.81521092495902 A:G A G 10 0.516702172561975 0.274752754417227 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 35 40 75 16.9154239603309 20.668086902479 -3.75266294214813 T:C T C 10 0.516702172561975 0.419527182134751 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 33 19 52 15.9488283054548 9.81734127867753 6.1314870267773 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0967222427534044 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 18080312 A/T 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:T A T 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000171428:ENST00000307719:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000518029:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000517492:exon_18079551_18081198:NAT1;ENSG00000171428:ENST00000520546:exon_18079286_18080731:NAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 21766900 G/A 1 18 9 27 8.69936089388445 4.65031955305778 4.04904134082667 A:G G A 10 0.516702172561975 0.127682774617817 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 21767173 C/A 1 12 6 18 5.7995739292563 3.10021303537185 2.69936089388445 A:C C A 10 0.516702172561975 0.242615152701372 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 21767275 C/G 1 10 7 17 4.83297827438025 3.61691520793383 1.21606306644642 C:G C G 10 0.516702172561975 0.632357252813595 ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 22398278 C/T 1 63 59 122 30.4477631285956 30.4854281811565 -0.037665052560957 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000120910:ENST00000240139:exon_22398128_22398638:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000289963:exon_22398128_22398652:PPP3CC;ENSG00000120910:ENST00000397775:exon_22398128_22398569:PPP3CC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 22473224 T/C 1 17 15 32 8.21606306644642 7.75053258842963 0.465530478016798 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 22473281 C/G 1 16 20 36 7.7327652390084 10.3340434512395 -2.6012782122311 C:G C G 10 0.516702172561975 0.408601526257631 ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 22880162 G/C 1 21 21 42 10.1492543761985 10.8507456238015 -0.701491247602952 C:G G C 10 0.516702172561975 0.877997089651042 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 22880269 A/T 1 38 19 57 18.3653174426449 9.81734127867753 8.54797616396742 A:T A T 10 0.516702172561975 0.0243801892086419 ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 23297290 T/C 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000197217:ENST00000356206:exon_23297262_23297428:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000358689:exon_23297262_23297428:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000417069:exon_23297262_23297428:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000523958:exon_23297262_23297428:ENTPD4;ENSG00000197217:ENST00000520936:exon_23297262_23297597:ENTPD4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 15 20 35 7.24946741157037 10.3340434512395 -3.08457603966913 A:G G A 10 0.516702172561975 0.314713211057642 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27255080 A/G 1 15 4 19 7.24946741157037 2.0668086902479 5.18265872132247 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0204537324445867 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27255128 T/C 1 13 4 17 6.28287175669432 2.0668086902479 4.21606306644642 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0511524645234594 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27255146 G/A 1 13 3 16 6.28287175669432 1.55010651768593 4.7327652390084 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0223902666277186 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27255263 A/G 1 21 11 32 10.1492543761985 5.68372389818173 4.4655304780168 A:G A G 10 0.516702172561975 0.156040365063729 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27277537 G/A 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 A:G G A 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27277412_27277590:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27277412_27277590:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27301725 C/G 1 42 37 79 20.298508752397 19.1179803847931 1.18052836760397 C:G C G 10 0.516702172561975 0.822541656192217 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27301766 T/A 1 40 48 88 19.331913097521 24.8017042829748 -5.4697911854538 A:T T A 10 0.516702172561975 0.286098470900958 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27301723_27301788:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27301723_27301788:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 61 57 118 29.4811674737195 29.4520238360326 0.0291436376869463 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27311703 T/C 1 45 55 100 21.7484022347111 28.4186194909086 -6.6702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 0.194024218088692 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000482543:exon_27311671_27311808:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27311548_27312128:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27315876 A/G 1 106 83 189 51.2295697084306 42.8862803226439 8.34328938578672 A:G A G 10 0.516702172561975 0.244293673670155 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 103 86 189 49.7796762261166 44.4363868403299 5.34328938578672 A:G A G 10 0.516702172561975 0.466966447953154 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 27667969 C/G 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 C:G C G 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000168078:ENST00000301905:exon_27667137_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000522944:exon_27667718_27668018:PBK;ENSG00000168078:ENST00000524266:exon_27667811_27668018:PBK HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 28206695 C/T 1 5 6 11 2.41648913719012 3.10021303537185 -0.683723898181726 T:C C T 10 0.516702172561975 0.768176255959594 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28206642_28206745:FBXO16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 28206719 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206642_28206745:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28206642_28206745:FBXO16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 29194957 A/C 1 12 12 24 5.7995739292563 6.2004260707437 -0.400852141487402 A:C A C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 29194959 G/A 1 12 13 25 5.7995739292563 6.71712824330568 -0.917554314049377 A:G G A 10 0.516702172561975 0.841973379793163 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 29195956 T/C 1 99 78 177 47.8464849163645 40.3027694598341 7.54371545653042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.260386292646365 ENSG00000120875:ENST00000240100:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000404690:exon_29195799_29196018:DUSP4;ENSG00000120875:ENST00000240101:exon_29195799_29196018:DUSP4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 33356702 T/C 1 6 14 20 2.89978696462815 7.23383041586765 -4.3340434512395 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0716012253169818 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33356472_33356795:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33356474_33356795:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33356596_33356795:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33356636_33356795:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33356656_33356795:C8orf41;ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 33369994 A/G 1 18 6 24 8.69936089388445 3.10021303537185 5.5991478585126 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0244372089218632 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 33370159 C/T 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 T:C C T 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 38067687 T/C 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000156735:ENST00000432471:exon_38067526_38068406:BAG4;ENSG00000156735:ENST00000287322:exon_38067526_38070819:BAG4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 38677710 A/G 1 17 6 23 8.21606306644642 3.10021303537185 5.11585003107457 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0369800264063616 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521935:exon_38677040_38677761:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 21 18 39 10.1492543761985 9.30063910611555 0.848615270082973 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.873160767498915 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 41543719 A/G 1 2 11 13 0.96659565487605 5.68372389818173 -4.71712824330567 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0106291932032583 ENSG00000029534:ENST00000347528:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000289734:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396945:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000379758:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000396942:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000352337:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000439911:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000520299:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000265709:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000524227:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000415018:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000518061:exon_41543670_41543801:ANK1;ENSG00000029534:ENST00000358820:exon_41543670_41543801:ANK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 48647845 C/A 1 6 2 8 2.89978696462815 1.03340434512395 1.8663826195042 A:C C A 10 0.516702172561975 0.291257287751457 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 48649894 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000221869:ENST00000408965:exon_48649471_48650770:CEBPD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 53569194 C/T 1 27 22 49 13.0490413408267 11.3674477963635 1.68159354446322 T:C C T 10 0.516702172561975 0.669910946839804 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 57876493 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000104331:ENST00000262644:exon_57870492_57876623:IMPAD1;ENSG00000104331:ENST00000520392:exon_57876485_57876623:IMPAD1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 61654648 C/T 1 9 11 20 4.34968044694222 5.68372389818173 -1.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.656410208379201 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61653818_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61653924_61655656:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61653992_61655656:CHD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 61707572 T/C 1 35 39 74 16.9154239603309 20.151384729917 -3.23596076958615 T:C T C 10 0.516702172561975 0.486247198456818 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61707545_61707686:CHD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 61769429 A/G 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 A:G A G 10 0.516702172561975 0.458575832902352 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61769004_61769447:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61769004_61769447:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000529472:exon_61769004_61769446:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000531695:exon_61769416_61769447:CHD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 61778512 A/C 1 30 27 57 14.4989348231407 13.9509586591733 0.547976163967423 A:C A C 10 0.516702172561975 0.895516456667676 ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61777575_61779465:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61777575_61779463:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61777575_61779033:CHD7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 66631607 C/T 1 19 13 32 9.18265872132247 6.71712824330568 2.4655304780168 T:C C T 10 0.516702172561975 0.479937631108408 ENSG00000205268:ENST00000401827:exon_66629745_66631730:PDE7A;ENSG00000205268:ENST00000379419:exon_66630614_66631730:PDE7A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 67341378 G/A 1 10 16 26 4.83297827438025 8.2672347609916 -3.43425648661135 A:G G A 10 0.516702172561975 0.238643810373624 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 22 15 37 10.6325522036365 7.75053258842963 2.88201961520692 A:G G A 10 0.516702172561975 0.411626940897304 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 67342257 G/A 1 22 20 42 10.6325522036365 10.3340434512395 0.29850875239705 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 45 30 75 21.7484022347111 15.5010651768593 6.24733705785187 T:C T C 10 0.516702172561975 0.165946574419660 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 4 9 13 1.9331913097521 4.65031955305778 -2.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.167939326589619 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 72965973 G/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 90770315 C/T 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 90802491 A/G 1 50 37 87 24.1648913719012 19.1179803847931 5.04691098710817 A:G A G 10 0.516702172561975 0.285709381416589 ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90802307_90803291:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90802307_90802836:RIPK2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 90967711 A/G 1 20 18 38 9.6659565487605 9.30063910611555 0.365317442644949 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90967511_90967783:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90967511_90967783:NBN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 94745921 A/G 1 6 8 14 2.89978696462815 4.1336173804958 -1.23383041586765 A:G A G 10 0.516702172561975 0.597726529086425 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94742492_94746416:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94745633_94746416:RBM12B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 95390538 G/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95390408_95390608:RAD54B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 T:C T C 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:C A C 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 101206391 G/A 1 12 8 20 5.7995739292563 4.1336173804958 1.6659565487605 A:G G A 10 0.516702172561975 0.508249950238173 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 101206531 G/A 1 27 20 47 13.0490413408267 10.3340434512395 2.71499788958717 A:G G A 10 0.516702172561975 0.467625016927764 ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 101252680 T/C 1 8 9 17 3.8663826195042 4.65031955305778 -0.783936933553576 T:C T C 10 0.516702172561975 0.810038193802131 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101252631_101252999:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000519424:exon_101252631_101252743:SPAG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 101253259 A/G 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 A:G A G 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 102731486 G/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104490:ENST00000395923:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000454532:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000395921:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000427074:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000311028:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000220931:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000521599:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000519508:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522951:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522448:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000520690:exon_102731480_102731876:NCALD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 103282282 T/C 1 19 19 38 9.18265872132247 9.81734127867753 -0.634682557355053 T:C T C 10 0.516702172561975 0.872142044230393 ENSG00000104517:ENST00000520539:exon_103282267_103282411:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000220959:exon_103282267_103282411:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000518205:exon_103282267_103282411:UBR5;ENSG00000104517:ENST00000521922:exon_103282267_103282411:UBR5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 15 13 28 7.24946741157037 6.71712824330568 0.532339168264699 A:G A G 10 0.516702172561975 0.85287179216023 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 117783840 A/G 1 24 21 45 11.5991478585126 10.8507456238015 0.748402234711122 A:G A G 10 0.516702172561975 0.882021193510333 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 21 31 52 10.1492543761985 16.0177673494212 -5.8685129732227 T:C C T 10 0.516702172561975 0.126369797559069 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 117864217 A/G 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000164754:ENST00000297338:exon_117864187_117864335:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000523986:exon_117862857_117864491:RAD21;ENSG00000164754:ENST00000518055:exon_117864187_117864490:RAD21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 123965567 C/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:C C T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 48 53 101 23.1982957170252 27.3852151457847 -4.18691942875948 T:C T C 10 0.516702172561975 0.426720615538972 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 124266676 G/A 1 2 9 11 0.96659565487605 4.65031955305778 -3.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0333238555970313 ENSG00000165156:ENST00000297857:exon_124265562_124268411:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000395571:exon_124265562_124268411:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000520474:exon_124265562_124267240:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000522655:exon_124265562_124268411:ZHX1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 124408448 C/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000156802:ENST00000517666:exon_124408427_124408674:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000287394:exon_124408427_124408705:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000519124:exon_124408423_124408619:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521496:exon_124408427_124408641:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000439147:exon_124408427_124408705:ATAD2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 124448804 T/A 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:T T A 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 124449466 C/T 1 13 5 18 6.28287175669432 2.58351086280988 3.69936089388445 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0995712690058681 ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 36 31 67 17.3987217877689 16.0177673494212 1.38095443834767 T:C C T 10 0.516702172561975 0.807190943771226 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 135524797 G/T 1 19 13 32 9.18265872132247 6.71712824330568 2.4655304780168 T:G G T 10 0.516702172561975 0.479937631108408 ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 140744276 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000522504:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521700:exon_140744222_140744445:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000519482:exon_140744222_140744445:TRAPPC9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 141554396 C/T 1 8 12 20 3.8663826195042 6.2004260707437 -2.3340434512395 T:C C T 10 0.516702172561975 0.372459470187605 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141554312_141554402:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141554312_141554402:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141554312_141554402:EIF2C2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 141559268 C/T 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 T:C C T 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141559213_141559397:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141559213_141559397:EIF2C2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 141568622 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141568584_141568671:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141568584_141568671:EIF2C2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 142154349 G/A 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 A:G G A 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 142204293 C/T 1 36 28 64 17.3987217877689 14.4676608317353 2.9310609560336 T:C C T 10 0.516702172561975 0.532166195491527 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 26 33 59 12.5657435133886 17.0511716945452 -4.48542818115653 C:G C G 10 0.516702172561975 0.297321295066557 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 142204351 A/G 1 16 14 30 7.7327652390084 7.23383041586765 0.498934823140749 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144550600 T/A 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:T T A 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144550552_144550710:ZC3H3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144589984 C/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144589916_144590069:ZC3H3;ENSG00000014164:ENST00000528401:exon_144589916_144590010:ZC3H3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144643146 G/A 1 10 4 14 4.83297827438025 2.0668086902479 2.76616958413235 A:G G A 10 0.516702172561975 0.182970333632859 ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144641947_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144642798_144643593:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526051:exon_144643031_144643593:GSDMD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144644085 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 51 20 71 24.6481891993393 10.3340434512395 14.3141457480998 A:G G A 10 0.516702172561975 0.000766689208821592 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144657600 G/A 1 22 31 53 10.6325522036365 16.0177673494212 -5.38521514578468 A:G G A 10 0.516702172561975 0.168924630894445 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657593_144657695:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657593_144657695:NAPRT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144873438 C/A 1 29 38 67 14.0156369957027 19.6346825573551 -5.61904556165233 A:C C A 10 0.516702172561975 0.180137007688576 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144873090_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144873090_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144873090_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531163:exon_144873095_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000525051:exon_144873095_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000526832:exon_144873095_144873478:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144873096_144873478:SCRIB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144992388 G/A 1 8 2 10 3.8663826195042 1.03340434512395 2.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.111336453279945 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144998557 C/T 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 144999642 A/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145139388 C/T 1 15 25 40 7.24946741157037 12.9175543140494 -5.668086902479 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0822208269006859 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000525087:exon_145139316_145139513:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530633:exon_145139316_145139488:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000528073:exon_145139316_145139422:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527144:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139031_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139316_145139512:GPAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145139727 C/T 1 19 24 43 9.18265872132247 12.4008521414874 -3.21819342016493 T:C C T 10 0.516702172561975 0.361716926834595 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139625_145139752:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139625_145139998:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139625_145140382:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000531593:exon_145139640_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145139696_145139778:GPAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145140472 A/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:C:G A G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145154650 C/T 1 32 24 56 15.4655304780168 12.4008521414874 3.0646783365294 T:C C T 10 0.516702172561975 0.425987000069801 ENSG00000179526:ENST00000398712:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000359551:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000361077:exon_145154606_145154682:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000530216:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000534242:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000525275:exon_145154606_145154747:SHARPIN;ENSG00000179526:ENST00000533948:exon_145154606_145154747:SHARPIN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145161823 G/A 1 144 141 285 69.5948871510756 72.8550063312385 -3.26011918016289 A:T:C:G G A 10 0.516702172561975 0.722295912285396 ENSG00000179632:ENST00000322428:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534585:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000532522:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145512926 G/A 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145541634 G/A 1 9 7 16 4.34968044694222 3.61691520793383 0.732765239008399 A:G G A 10 0.516702172561975 0.805365604430727 ENSG00000185000:ENST00000332324:exon_145541577_145541680:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524965:exon_145541577_145541680:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524844:exon_145541577_145541680:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000531896:exon_145541580_145541680:DGAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145584594 C/T 1 83 92 175 40.1137196773561 47.5365998757017 -7.42288019834563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.289646228411815 ENSG00000185803:ENST00000530047:exon_145584463_145584930:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000527078:exon_145584463_145584681:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000402965:exon_145584463_145584930:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000532887:exon_145584463_145584901:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000329994:exon_145584463_145584932:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000526752:exon_145584463_145584931:GPR172A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145617910 A/G 1 5 7 12 2.41648913719012 3.61691520793383 -1.2004260707437 A:G A G 10 0.516702172561975 0.570576463975512 ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145739679 G/A 1 5 9 14 2.41648913719012 4.65031955305778 -2.23383041586765 A:G G A 10 0.516702172561975 0.289041928049243 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145739573_145739746:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145739573_145739746:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145739573_145739746:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145739573_145739746:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534626:exon_145739573_145739746:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000533600:exon_145739573_145739746:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532846:exon_145739569_145739746:RECQL4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145741594 T/C 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:C T C 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 C:G C G 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 145748753 A/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000160959:ENST00000292524:exon_145746295_145750557:LRRC14;ENSG00000177021:ENST00000343593:exon_145747773_145748793:AC084125.1;ENSG00000254402:ENST00000529415:exon_145747788_145748793:LRRC24;ENSG00000254402:ENST00000533758:exon_145747823_145748793:LRRC24 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 146015749 C/T 1 2829 2690 5519 1367.24955382217 1389.92884419171 -22.6792903695402 A:T:C C T 10 0.516702172561975 0.544483938397079 ENSG00000161016:ENST00000534781:exon_146015740_146016257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529163:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528296:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000527914:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146015740_146015855:RPL8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 146017171 A/G 1 2897 2754 5651 1400.11380608796 1422.99778323568 -22.883977147721 A:T:C:G A G 10 0.516702172561975 0.549209839747056 ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146017158_146017257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146017158_146017344:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000444860:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146017158_146017197:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146017158_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000525232:exon_146016498_146017299:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531767:exon_146016892_146017257:RPL8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 146076735 C/T 1 13 17 30 6.28287175669432 8.78393693355358 -2.50106517685925 T:C C T 10 0.516702172561975 0.368796400932296 ENSG00000170619:ENST00000402718:exon_146075559_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000450361:exon_146075573_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000305103:exon_146075604_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000529143:exon_146076210_146076780:COMMD5;ENSG00000170619:ENST00000533270:exon_146076211_146076780:COMMD5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 0 11 0 11 5.31627610181827 0 5.31627610181827 C C 10 0.516702172561975 0.00103689775134077 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 2 9 11 0.96659565487605 4.65031955305778 -3.68372389818173 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0333238555970313 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 449874 G/C 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 C:G G C 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 463571 A/G 1 12 10 22 5.7995739292563 5.16702172561975 0.632552203636549 A:G A G 10 0.516702172561975 0.833864825621324 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_463517_463687:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000462618:exon_463555_463687:DOCK8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 2104159 A/G 1 7 13 20 3.38308479206617 6.71712824330568 -3.3340434512395 A:G A G 10 0.516702172561975 0.179184035222123 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2104003_2104169:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2104003_2104169:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2104003_2104169:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2104003_2104169:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2104003_2104169:SMARCA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 2116037 G/A 1 11 14 25 5.31627610181827 7.23383041586765 -1.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.549349590631841 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2115822_2116049:SMARCA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 29 25 54 14.0156369957027 12.9175543140494 1.09808268165335 A:G G A 10 0.516702172561975 0.787020926893852 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 32 15 47 15.4655304780168 7.75053258842963 7.71499788958717 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0280115996449272 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 5774225 T/G 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:G T G 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 5787553 C/T 1 5 5 10 2.41648913719012 2.58351086280988 -0.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000099219:ENST00000462592:exon_5787430_5787593:ERMP1;ENSG00000099219:ENST00000214893:exon_5787430_5787593:ERMP1;ENSG00000099219:ENST00000339450:exon_5787430_5787593:ERMP1;ENSG00000099219:ENST00000381506:exon_5787430_5787593:ERMP1;ENSG00000099219:ENST00000489219:exon_5787430_5787593:ERMP1;ENSG00000099219:ENST00000487088:exon_5787430_5787593:ERMP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 25 19 44 12.0824456859506 9.81734127867753 2.2651044072731 A:G A G 10 0.516702172561975 0.547899287460427 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 7477141 G/C 0 10 0 10 4.83297827438025 0 4.83297827438025 G G 10 0.516702172561975 0.00205170904241076 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 7799749 C/T 1 49 50 99 23.6815935444632 25.8351086280988 -2.15351508363553 T:C C T 10 0.516702172561975 0.6883683806887 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 15466814 A/G 1 61 37 98 29.4811674737195 19.1179803847931 10.3631870889264 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0427547070101244 ENSG00000164985:ENST00000380733:exon_15466746_15466857:PSIP1;ENSG00000164985:ENST00000380738:exon_15466746_15466857:PSIP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 19346941 A/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000137145:ENST00000380437:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000307015:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000453857:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380432:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380427:exon_19345919_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000361024:exon_19346554_19347084:DENND4C;ENSG00000137145:ENST00000380424:exon_19346726_19347084:DENND4C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 1188 1738 2926 574.157818996374 898.028375912713 -323.870556916339 A:T:C:G G C 10 0.516702172561975 3.69000072909986e-33 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 15 24 39 7.24946741157037 12.4008521414874 -5.15138472991703 A:G A G 10 0.516702172561975 0.110123975443576 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 32450187 T/C 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 33464113 T/C 1 8 6 14 3.8663826195042 3.10021303537185 0.766169584132349 T:C T C 10 0.516702172561975 0.792158057571208 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379470:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33464035_33464159:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33464035_33464159:NOL6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 34610759 C/T 1 27 13 40 13.0490413408267 6.71712824330568 6.331913097521 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0566069590792976 ENSG00000164967:ENST00000378959:exon_34610483_34611329:C9orf23;ENSG00000164967:ENST00000297613:exon_34610483_34611329:C9orf23 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 35100986 C/T 1 80 87 167 38.663826195042 44.9530890128918 -6.28926281784983 T:C C T 10 0.516702172561975 0.353095247764356 ENSG00000165283:ENST00000356493:exon_35100929_35101008:STOML2;ENSG00000165283:ENST00000488050:exon_35100595_35101008:STOML2;ENSG00000165283:ENST00000452248:exon_35100929_35101008:STOML2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 35105257 G/A 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G G A 10 0.516702172561975 0.374306268293867 ENSG00000005238:ENST00000378566:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000355521:exon_35104109_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000322813:exon_35104118_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378561:exon_35104120_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000378557:exon_35104139_35105371:KIAA1539;ENSG00000005238:ENST00000479357:exon_35104827_35105371:KIAA1539 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 35971564 C/T 0 23 0 23 11.1158500310746 0 11.1158500310746 C C 10 0.516702172561975 3.08388873994087e-07 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 37761961 A/C 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 A:C A C 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000165275:ENST00000297994:exon_37761900_37762114:RG9MTD3;ENSG00000165275:ENST00000377754:exon_37761897_37762114:RG9MTD3;ENSG00000165275:ENST00000488673:exon_37761897_37762114:RG9MTD3;ENSG00000165275:ENST00000377753:exon_37761900_37762114:RG9MTD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 37886429 G/A 1 10 1 11 4.83297827438025 0.516702172561975 4.31627610181827 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0121998219531107 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 37888101 C/T 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000122696:ENST00000377716:exon_37887601_37888589:MCART1;ENSG00000122696:ENST00000242275:exon_37887648_37888589:MCART1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 37919839 G/A 1 27 8 35 13.0490413408267 4.1336173804958 8.91542396033087 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00339927658237723 ENSG00000107338:ENST00000377707:exon_37919131_37920001:SHB HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 71835842 C/A 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000119139:ENST00000423935:exon_71835803_71836012:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71835803_71836412:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71835803_71836412:TJP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 71841018 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71840938_71841091:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71840938_71841091:TJP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 71843023 C/A 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 A:C C A 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 71851913 G/A 1 16 12 28 7.7327652390084 6.2004260707437 1.5323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.5776188734531 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71851865_71852052:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71851865_71852052:TJP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 71864353 A/C 1 21 7 28 10.1492543761985 3.61691520793383 6.5323391682647 A:C A C 10 0.516702172561975 0.0138958549876739 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71864291_71864401:TJP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 74586523 C/T 1 6 6 12 2.89978696462815 3.10021303537185 -0.200426070743701 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000155621:ENST00000479413:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000334731:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377031:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000473252:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377027:exon_74586421_74586534:C9orf85 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 74975136 T/C 1 18 6 24 8.69936089388445 3.10021303537185 5.5991478585126 T:C T C 10 0.516702172561975 0.0244372089218632 ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 77684690 A/C 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 A:C A C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000106733:ENST00000376811:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000361092:exon_77684658_77684729:C9orf95;ENSG00000106733:ENST00000494066:exon_77683912_77684958:C9orf95 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 80919756 T/G 1 9 8 17 4.34968044694222 4.1336173804958 0.216063066446424 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 82006213 C/A 0 48 0 48 23.1982957170252 0 23.1982957170252 C C 10 0.516702172561975 1.78957367648083e-14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 82006446 G/A 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 G G 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 82006453 G/A 0 9 0 9 4.34968044694222 0 4.34968044694222 G G 10 0.516702172561975 0.00406377973400625 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 A:C C A 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 88651370 T/C 1 9 4 13 4.34968044694222 2.0668086902479 2.28287175669432 T:C T C 10 0.516702172561975 0.270345939421229 ENSG00000135052:ENST00000388712:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000388711:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000376023:exon_88651263_88651422:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000464314:exon_88651263_88651728:GOLM1;ENSG00000135052:ENST00000257504:exon_88651263_88651422:GOLM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 91993615 G/A 1 28 33 61 13.5323391682647 17.0511716945452 -3.51883252628048 A:G G A 10 0.516702172561975 0.373415283696759 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 91993769 G/A 1 24 38 62 11.5991478585126 19.6346825573551 -8.03553469884245 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0426481430705332 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 95738781 C/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 95870005 C/A 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:C C A 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000495641:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466929:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000498243:exon_95869956_95870098:C9orf89 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 95875381 G/C 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 C:G G C 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 96209921 G/A 1 1 7 8 0.483297827438025 3.61691520793383 -3.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0335158533751347 ENSG00000188938:ENST00000479094:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000423591:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375412:exon_96208776_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000375409:exon_96208783_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000523407:exon_96208807_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520403:exon_96208815_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000520470:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483149:exon_96209187_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000483056:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000476484:exon_96209206_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428152:exon_96209550_96209979:FAM120AOS;ENSG00000188938:ENST00000428378:exon_96209917_96209979:FAM120AOS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 96323452 T/C 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C T C 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96323391_96323532:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96323391_96323532:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96323391_96323532:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000427765:exon_96323391_96323532:FAM120A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 99417000 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000158122:ENST00000446045:exon_99416987_99417055:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000375234:exon_99416987_99417055:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000411939:exon_99416987_99417030:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000375233:exon_99416987_99417055:C9orf21;ENSG00000158122:ENST00000464512:exon_99416987_99417254:C9orf21 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 100843194 G/A 1 46 52 98 22.2317000621491 26.8685129732227 -4.63681291107356 A:G G A 10 0.516702172561975 0.364287386240989 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100843098_100843428:NANS;ENSG00000095380:ENST00000461452:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000415280:exon_100843098_100843337:NANS;ENSG00000095380:ENST00000427646:exon_100843098_100844448:NANS;ENSG00000106785:ENST00000478530:exon_100843122_100843543:TRIM14 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 103070820 G/A 1 8 17 25 3.8663826195042 8.78393693355358 -4.91755431404938 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0697011547149667 ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103070782_103070963:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103070782_103070963:TEX10 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 106873948 T/C 1 13 15 28 6.28287175669432 7.75053258842963 -1.4676608317353 T:C T C 10 0.516702172561975 0.70606093772356 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106873862_106874095:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106873862_106874095:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106873862_106874095:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106873862_106874095:SMC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 108147763 T/G 1 6 5 11 2.89978696462815 2.58351086280988 0.316276101818274 T:G T G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000070214:ENST00000374723:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000470972:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374720:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000374724:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000361080:exon_108147703_108147783:SLC44A1;ENSG00000070214:ENST00000343170:exon_108147703_108147783:SLC44A1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 108467894 A/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000095209:ENST00000374692:exon_108467878_108468034:TMEM38B;ENSG00000095209:ENST00000434214:exon_108467878_108468034:TMEM38B;ENSG00000095209:ENST00000374689:exon_108467878_108468034:TMEM38B;ENSG00000095209:ENST00000374688:exon_108467878_108468034:TMEM38B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 111641825 G/A 1 9 6 15 4.34968044694222 3.10021303537185 1.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.610296357946016 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 113006491 T/C 1 444 548 992 214.584235382483 283.152790563962 -68.5685551814792 A:T:C T C 10 0.516702172561975 1.51239955675211e-05 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 114411945 G/T 1 13 7 20 6.28287175669432 3.61691520793383 2.6659565487605 T:G G T 10 0.516702172561975 0.268523100251555 ENSG00000059769:ENST00000313525:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000463589:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000447096:exon_114411733_114412203:DNAJC25;ENSG00000059769:ENST00000436202:exon_114411733_114412203:DNAJC25 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 115928382 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115923286_115928435:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115927800_115928435:FKBP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 115931703 G/A 1 11 12 23 5.31627610181827 6.2004260707437 -0.884149968925426 A:G G A 10 0.516702172561975 0.835468722714187 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 115931784 C/A 1 14 21 35 6.76616958413235 10.8507456238015 -4.08457603966913 A:C C A 10 0.516702172561975 0.179358249450845 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 10 21 31 4.83297827438025 10.8507456238015 -6.01776734942123 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0320375181935211 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 116136434 G/A 1 1 11 12 0.483297827438025 5.68372389818173 -5.2004260707437 A:G G A 10 0.516702172561975 0.00260800110534546 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 116346118 G/A 1 24 14 38 11.5991478585126 7.23383041586765 4.36531744264495 A:G G A 10 0.516702172561975 0.193939785933086 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 116346236 G/A 1 12 18 30 5.7995739292563 9.30063910611555 -3.50106517685925 A:G G A 10 0.516702172561975 0.207473070431477 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117099574 A/G 1 32 31 63 15.4655304780168 16.0177673494212 -0.552236871404428 A:G A G 10 0.516702172561975 0.900398486297006 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117096436_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117096436_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117096436_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117096436_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117098407_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117098411_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117098445_117099586:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117098445_117099586:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 33 19 52 15.9488283054548 9.81734127867753 6.1314870267773 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0967222427534044 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117108971 C/T 1 17 17 34 8.21606306644642 8.78393693355358 -0.567873867107153 T:C C T 10 0.516702172561975 0.865424298335086 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117108949_117109054:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117108949_117109064:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117108949_117109064:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117110180 G/A 1 22 24 46 10.6325522036365 12.4008521414874 -1.76829993785085 A:G G A 10 0.516702172561975 0.659196741670368 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000491133:exon_117110053_117110180:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117120333 G/A 1 11 6 17 5.31627610181827 3.10021303537185 2.21606306644642 A:G G A 10 0.516702172561975 0.336928838964482 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000490767:exon_117120201_117120617:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 7 4 11 3.38308479206617 2.0668086902479 1.31627610181827 T:C C T 10 0.516702172561975 0.551339714925236 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 A:G G A 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 123169302 G/A 1 6 11 17 2.89978696462815 5.68372389818173 -2.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.226390605017796 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123169290_123169526:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 123170678 C/G 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 C:G C G 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 123533628 G/T 1 14 9 23 6.76616958413235 4.65031955305778 2.11585003107457 T:G G T 10 0.516702172561975 0.410933125671882 ENSG00000119402:ENST00000493559:exon_123533626_123533795:FBXW2;ENSG00000119402:ENST00000373926:exon_123533626_123533795:FBXW2;ENSG00000119402:ENST00000444833:exon_123533626_123533795:FBXW2;ENSG00000119402:ENST00000340778:exon_123533626_123533795:FBXW2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 123605169 C/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000095261:ENST00000373915:exon_123605015_123605200:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000210313:exon_123605015_123605190:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000373904:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000435107:exon_123605015_123605206:PSMD5;ENSG00000095261:ENST00000476949:exon_123605015_123605189:PSMD5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 123933789 A/G 1 12 2 14 5.7995739292563 1.03340434512395 4.76616958413235 A:G A G 10 0.516702172561975 0.0136115374114993 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123933686_123933826:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123933686_123933826:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123933686_123933826:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123933686_123933826:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123933686_123933826:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123933686_123933826:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123933686_123933826:CEP110 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 124089722 G/A 1 3 10 13 1.44989348231407 5.16702172561975 -3.71712824330568 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0508291049431046 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000456109:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373807:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124089586_124089760:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124089586_124089760:GSN HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 125588917 G/A 1 6 11 17 2.89978696462815 5.68372389818173 -2.78393693355358 A:G G A 10 0.516702172561975 0.226390605017796 ENSG00000136940:ENST00000436632:exon_125588895_125588965:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394285:exon_125588895_125589031:PDCL HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 127101924 C/T 1 28 26 54 13.5323391682647 13.4342564866114 0.0980826816533469 T:C C T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 127177161 A/G 1 40 51 91 19.331913097521 26.3518108006607 -7.01989770313973 A:G A G 10 0.516702172561975 0.143554352074101 ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 127620203 C/T 1 1057 955 2012 510.845803601992 493.450574796686 17.3952288053062 T:C C T 10 0.516702172561975 0.448216331256675 ENSG00000136942:ENST00000373570:exon_127620159_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000493018:exon_127620162_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000487431:exon_127620162_127620346:RPL35;ENSG00000136942:ENST00000348462:exon_127620163_127620346:RPL35 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 127635986 G/C 1 70 61 131 33.8308479206617 31.5188325262805 2.31201539438127 C:G G C 10 0.516702172561975 0.726895093125149 ENSG00000136950:ENST00000353214:exon_127635971_127636043:ARPC5L;ENSG00000136950:ENST00000259477:exon_127635971_127636043:ARPC5L;ENSG00000136950:ENST00000465124:exon_127634868_127636043:ARPC5L HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 127651449 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000136935:ENST00000373555:exon_127651422_127651582:GOLGA1;ENSG00000136935:ENST00000475407:exon_127651422_127651582:GOLGA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 128201271 C/T 1 54 69 123 26.0980826816533 35.6524499067763 -9.55436722512293 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0871090312271237 ENSG00000119487:ENST00000373511:exon_128199672_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000524515:exon_128199672_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128199673_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000483937:exon_128200748_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000444226:exon_128200748_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128200934_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496658:exon_128200986_128201291:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000496063:exon_128201092_128201291:MAPKAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130206903 C/A 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 A:C C A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 14 6 20 6.76616958413235 3.10021303537185 3.6659565487605 A:G A G 10 0.516702172561975 0.119358204941810 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130536629 G/T 1 7 11 18 3.38308479206617 5.68372389818173 -2.30063910611555 T:G G T 10 0.516702172561975 0.347762918852962 ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130536534_130536746:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130536269_130536746:SH2D3C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130550819 C/T 1 8 4 12 3.8663826195042 2.0668086902479 1.7995739292563 T:C C T 10 0.516702172561975 0.390925099647943 ENSG00000136807:ENST00000498339:exon_130550701_130550971:CDK9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130572046 G/A 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 A:G G A 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488506:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000489522:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000467826:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000473536:exon_130571963_130572113:FPGS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130575835 C/T 1 44 39 83 21.2651044072731 20.151384729917 1.11371967735607 T:C C T 10 0.516702172561975 0.826971108564857 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130575474_130576343:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130575474_130576337:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130575474_130576338:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475270:exon_130575474_130575853:FPGS HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130630233 G/T 1 17 9 26 8.21606306644642 4.65031955305778 3.56574351338865 T:G G T 10 0.516702172561975 0.174806179363796 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130630749 C/G 1 17 14 31 8.21606306644642 7.23383041586765 0.982232650578773 A:C:G C G 10 0.516702172561975 0.85777700870536 ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000373156:exon_130630600_130630791:AK1;ENSG00000106992:ENST00000223836:exon_130630600_130630791:AK1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130670652 A/G 1 62 48 110 29.9644653011575 24.8017042829748 5.16276101818275 A:G A G 10 0.516702172561975 0.341189165053561 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 130885201 A/T 1 7 6 13 3.38308479206617 3.10021303537185 0.282871756694324 A:T A T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131030261 G/A 1 20 15 35 9.6659565487605 7.75053258842963 1.91542396033087 A:G G A 10 0.516702172561975 0.612752742841213 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131030213_131030276:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131030213_131030276:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000450617:exon_131030213_131030276:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000458730:exon_131030213_131030276:GOLGA2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131122809 C/T 1 6 11 17 2.89978696462815 5.68372389818173 -2.78393693355358 T:C C T 10 0.516702172561975 0.226390605017796 ENSG00000167114:ENST00000339595:exon_131122613_131123501:SLC27A4;ENSG00000167114:ENST00000372870:exon_131122613_131123496:SLC27A4;ENSG00000167114:ENST00000300456:exon_131122613_131123502:SLC27A4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131193519 G/A 1 1 7 8 0.483297827438025 3.61691520793383 -3.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0335158533751347 ENSG00000167123:ENST00000372842:exon_131193450_131193582:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000372838:exon_131193450_131193582:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000317789:exon_131193450_131193582:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000360536:exon_131193450_131193582:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000413863:exon_131193450_131193582:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000463535:exon_131193450_131193582:CERCAM;ENSG00000167123:ENST00000487001:exon_131193450_131193582:CERCAM HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 A:G A G 10 0.516702172561975 0.727780919977462 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 19 12 31 9.18265872132247 6.2004260707437 2.98223265057877 T:C C T 10 0.516702172561975 0.369231919605051 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131395024 G/A 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131398681 G/A 1 17 16 33 8.21606306644642 8.2672347609916 -0.051171694545177 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000473486:exon_131398560_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131398197_131398717:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131398363_131398717:WDR34 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131515547 G/T 1 4 5 9 1.9331913097521 2.58351086280988 -0.650319553057775 T:G G T 10 0.516702172561975 0.746818857891159 ENSG00000160445:ENST00000291900:exon_131515443_131515879:ZER1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131585069 A/G 1 6 7 13 2.89978696462815 3.61691520793383 -0.717128243305676 A:G A G 10 0.516702172561975 0.784975298222871 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131586374 G/A 1 6 4 10 2.89978696462815 2.0668086902479 0.832978274380249 A:G G A 10 0.516702172561975 0.755276208141038 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131586371_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131586351_131586453:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000480366:exon_131586351_131586453:C9orf114 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131588888 G/C 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 C:G G C 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 18 15 33 8.69936089388445 7.75053258842963 0.948828305454824 A:C A C 10 0.516702172561975 0.862114069790544 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 131768801 C/G 1 33 14 47 15.9488283054548 7.23383041586765 8.71499788958717 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0125274558635949 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131768781_131769374:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131768781_131769375:NUP188 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 132400480 G/A 1 7 8 15 3.38308479206617 4.1336173804958 -0.750532588429626 A:G G A 10 0.516702172561975 0.798639281495392 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132399171_132400736:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000450050:exon_132399173_132400736:ASB6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 132566401 G/A 1 7 3 10 3.38308479206617 1.55010651768593 1.83297827438025 A:G G A 10 0.516702172561975 0.346491954505027 ENSG00000136816:ENST00000259339:exon_132566352_132566617:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000486372:exon_132566352_132566759:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000437263:exon_132566352_132566470:TOR1B;ENSG00000136816:ENST00000427860:exon_132566352_132566617:TOR1B HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 132569442 G/A 1 2 7 9 0.96659565487605 3.61691520793383 -2.65031955305778 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0992004893689239 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 132584888 G/T 1 14 28 42 6.76616958413235 14.4676608317353 -7.70149124760295 T:G G T 10 0.516702172561975 0.0200434025242499 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132584860_132584910:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473604:exon_132584860_132585125:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000473084:exon_132583655_132585125:TOR1A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 48 58 106 23.1982957170252 29.9687260085946 -6.77043029156935 T:C C T 10 0.516702172561975 0.206663685075224 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 132678195 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 133759417 G/A 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 133761001 A/G 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G A G 10 0.516702172561975 1 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 134397540 C/T 1 4 14 18 1.9331913097521 7.23383041586765 -5.30063910611555 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0163883126972169 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000494883:exon_134397434_134397920:POMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 135153668 C/T 1 3 7 10 1.44989348231407 3.61691520793383 -2.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.213290861679303 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 135273607 C/G 1 13 8 21 6.28287175669432 4.1336173804958 2.14925437619852 C:G C G 10 0.516702172561975 0.388918558088805 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 135554566 G/A 1 2 6 8 0.96659565487605 3.10021303537185 -2.1336173804958 A:G G A 10 0.516702172561975 0.16679738916895 ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 136029138 G/A 1 4 14 18 1.9331913097521 7.23383041586765 -5.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0163883126972169 ENSG00000148288:ENST00000372040:exon_136028340_136029648:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000372043:exon_136028340_136029629:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000470431:exon_136028340_136030699:GBGT1;ENSG00000148288:ENST00000472281:exon_136028340_136030699:GBGT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 136218765 C/G 1 105 102 207 50.7462718809926 52.7036216013215 -1.95734972032883 C:G C G 10 0.516702172561975 0.834800377883269 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136218610_136218837:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136218730_136218837:SURF1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 136227974 C/T 1 19 20 39 9.18265872132247 10.3340434512395 -1.15138472991703 T:C C T 10 0.516702172561975 0.75046958380872 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227932_136228045:SURF2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 136277548 T/C 1 5 4 9 2.41648913719012 2.0668086902479 0.349680446942225 T:C T C 10 0.516702172561975 1 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136277483_136277612:REXO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 136279935 C/T 1 8 5 13 3.8663826195042 2.58351086280988 1.28287175669432 T:C C T 10 0.516702172561975 0.583851756010686 ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 136629183 G/A 1 15 17 32 7.24946741157037 8.78393693355358 -1.5344695219832 A:G G A 10 0.516702172561975 0.600958499169707 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136627016_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136627017_136629231:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136627017_136629231:VAV2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 74 75 149 35.7640392304139 38.7526629421481 -2.98862371173428 A:G A G 10 0.516702172561975 0.624142610494971 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 138703230 G/A 1 7 7 14 3.38308479206617 3.61691520793383 -0.233830415867651 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000130559:ENST00000389532:exon_138700333_138703457:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000389533:exon_138700342_138703457:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000312405:exon_138701427_138703457:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000483991:exon_138702942_138703457:CAMSAP1;ENSG00000130559:ENST00000409386:exon_138702336_138703457:CAMSAP1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 138903611 G/T 1 4 4 8 1.9331913097521 2.0668086902479 -0.1336173804958 T:G G T 10 0.516702172561975 1 ENSG00000148411:ENST00000371753:exon_138898383_138903870:NACC2;ENSG00000148411:ENST00000277554:exon_138903205_138903870:NACC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139257986 G/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:G G A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139257939_139258171:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139257939_139258241:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139257441_139258853:CARD9 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 25 17 42 12.0824456859506 8.78393693355358 3.29850875239705 A:G A G 10 0.516702172561975 0.355473296376327 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 12 7 19 5.7995739292563 3.61691520793383 2.18265872132247 T:C T C 10 0.516702172561975 0.364413840246202 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139297266 C/T 1 18 9 27 8.69936089388445 4.65031955305778 4.04904134082667 T:C C T 10 0.516702172561975 0.127682774617817 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139296932_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139297096_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139297117_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139297134_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139297240_139297339:SDCCAG3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139298560 G/A 1 12 3 15 5.7995739292563 1.55010651768593 4.24946741157037 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0366469998551520 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139298465_139298560:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139298589 T/C 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 T T 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139298590 G/A 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 G G 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 0 8 0 8 3.8663826195042 0 3.8663826195042 A A 10 0.516702172561975 0.00805727347719238 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139311471 C/T 1 24 31 55 11.5991478585126 16.0177673494212 -4.41861949090863 T:C C T 10 0.516702172561975 0.280424344282364 ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139341353 G/A 1 10 3 13 4.83297827438025 1.55010651768593 3.28287175669432 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0946229863394294 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139341307_139341401:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139341307_139341467:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139341307_139341401:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139341307_139341458:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139341307_139341401:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139341307_139341401:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139341307_139341401:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313084:exon_139341307_139341467:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000433860:exon_139341307_139341458:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139341307_139341467:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398335:exon_139340916_139343790:SEC16A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139353937 C/A 1 7 5 12 3.38308479206617 2.58351086280988 0.7995739292563 A:C C A 10 0.516702172561975 0.775920176313447 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139353896_139354007:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139353896_139354007:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139353896_139354007:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139353896_139354007:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139353896_139354007:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139353896_139354007:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139353896_139354007:SEC16A HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139390676 A/C 1 10 13 23 4.83297827438025 6.71712824330568 -1.88414996892543 A:C A C 10 0.516702172561975 0.532733020299812 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139390958 T/C 1 7 9 16 3.38308479206617 4.65031955305778 -1.2672347609916 T:C T C 10 0.516702172561975 0.620399345373 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139620522 G/C 1 8 7 15 3.8663826195042 3.61691520793383 0.249467411570374 C:G G C 10 0.516702172561975 1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139621120 A/G 1 4 7 11 1.9331913097521 3.61691520793383 -1.68372389818173 A:G A G 10 0.516702172561975 0.374306268293867 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 10 8 18 4.83297827438025 4.1336173804958 0.69936089388445 A:G A G 10 0.516702172561975 0.816383743536734 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139733490 G/T 1 42 33 75 20.298508752397 17.0511716945452 3.24733705785187 T:G G T 10 0.516702172561975 0.489258795933995 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139733361_139733573:C9orf86 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139734246 G/T 1 27 19 46 13.0490413408267 9.81734127867753 3.23170006214915 T:G G T 10 0.516702172561975 0.377914034036084 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139734146_139734317:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139734146_139734317:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139734146_139734317:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139734146_139734317:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139734146_139734317:C9orf86 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139743890 T/C 1 73 57 130 35.2807414029758 29.4520238360326 5.82871756694324 T:C T C 10 0.516702172561975 0.334664573420172 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139836505 G/A 1 26 27 53 12.5657435133886 13.9509586591733 -1.38521514578468 A:G G A 10 0.516702172561975 0.783803144424073 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139836498_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139836498_139837147:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000487794:exon_139836207_139836918:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000433269:exon_139836498_139836918:FBXW5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 139838434 G/A 1 10 9 19 4.83297827438025 4.65031955305778 0.182658721322475 A:G G A 10 0.516702172561975 1 ENSG00000159069:ENST00000325285:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000459905:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000483559:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000491246:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000480818:exon_139838343_139838607:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000428398:exon_139838343_139838558:FBXW5;ENSG00000159069:ENST00000443788:exon_139838343_139838986:FBXW5 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 159 121 280 76.844354562646 62.520962879999 14.323391682647 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0939777443841422 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140075314 C/T 1 4 6 10 1.9331913097521 3.10021303537185 -1.16702172561975 T:C C T 10 0.516702172561975 0.537244131175437 ENSG00000176248:ENST00000323927:exon_140075240_140075381:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000455910:exon_140075240_140075381:ANAPC2;ENSG00000176248:ENST00000471131:exon_140075298_140075381:ANAPC2 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140100224 A/G 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 A:G A G 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140100119_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140100147_140100364:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140100147_140100364:NDOR1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140135784 C/A 1 24 20 44 11.5991478585126 10.3340434512395 1.2651044072731 A:C C A 10 0.516702172561975 0.763954150963064 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140137291 C/G 1 225 225 450 108.742011173556 116.257988826444 -7.51597765288878 C:G C G 10 0.516702172561975 0.479726876692377 ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140136948_140138159:TUBB2C HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 19 26 45 9.18265872132247 13.4342564866114 -4.25159776528888 A:C:G G A 10 0.516702172561975 0.233617177110113 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140173316 A/G 1 6 3 9 2.89978696462815 1.55010651768593 1.34968044694222 A:G A G 10 0.516702172561975 0.510005655959431 ENSG00000198113:ENST00000357503:exon_140173105_140177093:C9orf167 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140446666 A/T 1 127 123 250 61.3788240846292 63.5543672251229 -2.17554314049376 A:T A T 10 0.516702172561975 0.800382102846374 ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140450054 G/A 1 12 15 27 5.7995739292563 7.75053258842963 -1.95095865917333 A:G G A 10 0.516702172561975 0.564379305884164 ENSG00000148399:ENST00000479650:exon_140449356_140450100:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000467243:exon_140449356_140450100:WDR85;ENSG00000148399:ENST00000277540:exon_140449361_140450100:WDR85 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140510297 C/T 1 14 12 26 6.76616958413235 6.2004260707437 0.565743513388648 T:C C T 10 0.516702172561975 0.847252155553325 ENSG00000203993:ENST00000371417:exon_140509784_140510651:C9orf37;ENSG00000203993:ENST00000496793:exon_140510201_140510651:C9orf37 HGDP00987_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 17 13 30 8.21606306644642 6.71712824330568 1.49893482314075 T:C T C 10 0.516702172561975 0.71554311359282 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 110 71 181 53.1627610181827 36.6858542519002 16.4769067662825 A:G G A 10 0.516702172561975 0.0170772051541169 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 221795 C/G 1 92 60 152 44.4634001242983 31.0021303537185 13.4612697705798 C:G C G 10 0.516702172561975 0.0345094219292185 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 295079 C/T 1 11 4 15 5.31627610181827 2.0668086902479 3.24946741157037 T:C C T 10 0.516702172561975 0.121535928231048 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 299588 G/A 1 8 10 18 3.8663826195042 5.16702172561975 -1.30063910611555 A:G G A 10 0.516702172561975 0.63970712319751 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_299513_299631:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_299348_299631:PPP2R3B HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 5 3 8 2.41648913719012 1.55010651768593 0.8663826195042 T:G G T 10 0.516702172561975 0.727780919977462 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 51 78 129 24.6481891993393 40.3027694598341 -15.6545802604948 T:C C T 10 0.516702172561975 0.00620744274444934 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1537881 C/T 1 37 42 79 17.8820196152069 21.701491247603 -3.81947163239603 T:C C T 10 0.516702172561975 0.431211423052176 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1540532 C/T 1 10 6 16 4.83297827438025 3.10021303537185 1.7327652390084 T:C C T 10 0.516702172561975 0.458575832902352 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1544569 G/A 1 41 49 90 19.815210924959 25.3184064555368 -5.50319553057776 A:G G A 10 0.516702172561975 0.248332624833569 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1544418_1544580:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1544418_1544580:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1544418_1544580:ASMTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 57 43 100 27.5479761639674 22.2181934201649 5.3297827438025 A:G A G 10 0.516702172561975 0.317361512828397 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 1 12 14 26 5.7995739292563 7.23383041586765 -1.43425648661135 T:C T C 10 0.516702172561975 0.695611430726827 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1584447 G/T 1 3 5 8 1.44989348231407 2.58351086280988 -1.1336173804958 T:G G T 10 0.516702172561975 0.494953570752923 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 1585079 C/T 1 3 8 11 1.44989348231407 4.1336173804958 -2.68372389818173 T:C C T 10 0.516702172561975 0.134801312088078 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 2408482 G/C 1 6 11 17 2.89978696462815 5.68372389818173 -2.78393693355358 C:G G C 10 0.516702172561975 0.226390605017796 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1 HGDP00987_parsed_pileup.txt . X 2644302 C/T 1 28 45 73 13.5323391682647 23.2515977652889 -9.71925859702418 T:C C T 10 0.516702172561975 0.0257490262222358 ENSG00000002586:ENST00000381192:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381187:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000381184:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000398818:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000449611:exon_2644301_2644414:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482293:exon_2644301_2644404:CD99;ENSG00000002586:ENST00000482405:exon_2644301_2644414:CD99