INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 948921 T/C 1 428 285 713 192.772701439946 156.635000209381 36.137701230565 T:C:G T C 10 0.549596491962742 0.00670442421884061 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 949444 G/A 1 506 676 1182 227.904175066853 371.527228566814 -143.623053499961 A:G G A 10 0.549596491962742 5.83277546866636e-17 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 965 772 1737 434.639385255954 424.288491795237 10.3508934607172 A:C:G A G 10 0.549596491962742 0.629651489937555 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1159228 C/T 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 T:C C T 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1159212_1159348:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1159212_1159348:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1159212_1159348:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000403997:exon_1159212_1159348:SDF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1164072 C/T 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1164090 T/C 1 8 1 9 3.60322806429806 0.549596491962742 3.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0474590365992993 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1178245 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000184163:ENST00000462849:exon_1178215_1178293:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000478606:exon_1178215_1178538:FAM132A;ENSG00000184163:ENST00000330388:exon_1178215_1178293:FAM132A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1192515 A/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G A G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1249187 G/A 1 14 16 30 6.30564911252161 8.79354387140387 -2.48789475888226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.36636204186268 ENSG00000127054:ENST00000470030:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000323275:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000411962:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000462432:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000478641:exon_1249112_1250550:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000421495:exon_1249112_1249485:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000419704:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532772:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000485710:exon_1249112_1249205:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531377:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527383:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531292:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000467408:exon_1249112_1249301:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1249125_1249301:CPSF3L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1342612 G/C 1 62 52 114 27.92501749831 28.5790175820626 -0.654000083752585 C:G G C 10 0.549596491962742 0.92517978872703 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1560330 A/G 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 A:G A G 10 0.549596491962742 0.426065193600925 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 1724719 G/A 1 13 10 23 5.85524560448435 5.49596491962742 0.359280684856935 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000078369:ENST00000378609:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000455156:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000378606:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000424622:exon_1724684_1724753:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000461893:exon_1724684_1725636:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000471354:exon_1724684_1724750:GNB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 9 12 21 4.05363157233532 6.5951579035529 -2.54152633121758 T:C C T 10 0.549596491962742 0.280840300071195 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 2125172 G/A 1 40 40 80 18.0161403214903 21.9838596785097 -3.96771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 0.371763406191481 ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 2488153 A/G 1 7 11 18 3.15282455626081 6.04556141159016 -2.89273685532936 A:G A G 10 0.549596491962742 0.235754067257629 ENSG00000157873:ENST00000426449:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000434817:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000435221:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000451778:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000409119:exon_2488024_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000355716:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000423768:exon_2487805_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000442392:exon_2487844_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000482074:exon_2487845_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000496064:exon_2487996_2488172:TNFRSF14;ENSG00000157873:ENST00000463471:exon_2488010_2488172:TNFRSF14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 3547635 C/T 1 31 35 66 13.962508749155 19.235877218696 -5.27336846954097 T:C C T 10 0.549596491962742 0.216326391572416 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3547331_3547681:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3547340_3547681:WDR8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 3548198 C/T 1 8 14 22 3.60322806429806 7.69435088747839 -4.09112282318032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.088997380247825 ENSG00000116213:ENST00000270708:exon_3548030_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378322:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378317:exon_3547331_3548221:WDR8;ENSG00000116213:ENST00000378320:exon_3548030_3548221:WDR8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 3697700 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3697699_3697900:LRRC47 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 3761485 T/A 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 A:T T A 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000116198:ENST00000378230:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378224:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494653:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000428079:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000494951:exon_3761471_3761547:KIAA0562;ENSG00000116198:ENST00000378223:exon_3761471_3761547:KIAA0562 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 32 24 56 14.4129122571923 13.1903158071058 1.22259645008645 T:C T C 10 0.549596491962742 0.789311864386877 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 6649302 C/A 1 18 27 45 8.10726314467064 14.839105282994 -6.73184213832339 A:C C A 10 0.549596491962742 0.051059738181884 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 6693152 G/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 15736598 C/T 1 15 5 20 6.75605262055887 2.74798245981371 4.00807016074516 T:C C T 10 0.549596491962742 0.076537095683099 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15736391_15736775:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15736441_15736775:EFHD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 15755248 C/T 1 118 110 228 53.1476139483964 60.4556141159016 -7.30800016750517 T:C C T 10 0.549596491962742 0.351577249565258 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 16257256 A/G 1 17 17 34 7.65685963663339 9.34314036336661 -1.68628072673323 A:G A G 10 0.549596491962742 0.607281204189121 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 16262719 T/C 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 17395521 G/A 0 0 9 9 0 4.94636842766468 -4.94636842766468 A G A 10 0.549596491962742 0.00076280912542378 ENSG00000117115:ENST00000375486:exon_17393256_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000444885:exon_17393256_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000479534:exon_17394095_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000466151:exon_17394281_17395772:PADI2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 19411129 A/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19410998_19411192:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19410998_19411192:UBR4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.672878774007803 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 37 31 68 16.6649297973785 17.037491250845 -0.372561453466453 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 20975784 G/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:G G T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 A:C A C 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 20980231 G/A 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20979991_20980267:DDOST HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 21177800 A/T 1 5 8 13 2.25201754018629 4.39677193570194 -2.14475439551565 A:T A T 10 0.549596491962742 0.271985568998683 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21177751_21177971:EIF4G3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 23395593 T/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000004487:ENST00000356634:exon_23395554_23395644:KDM1A;ENSG00000004487:ENST00000400181:exon_23395554_23395644:KDM1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 24020307 T/C 1 856 645 1501 385.545402879893 354.489737315969 31.0556655639243 A:T:C T C 10 0.549596491962742 0.107848902360707 ENSG00000142676:ENST00000374550:exon_24020297_24020403:RPL11;ENSG00000142676:ENST00000482370:exon_24020297_24020403:RPL11;ENSG00000142676:ENST00000443624:exon_24020297_24020403:RPL11;ENSG00000142676:ENST00000458455:exon_24020297_24020403:RPL11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 26497225 G/A 1 80 94 174 36.0322806429806 51.6620702444977 -15.6297896015171 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0181595535139851 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26497066_26498551:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496909_26498551:ZNF593 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 622 473 1095 280.150981999175 259.959140698377 20.1918413007976 A:G A G 10 0.549596491962742 0.224523926641395 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 620 476 1096 279.2501749831 261.607930174265 17.6422448088348 A:G A G 10 0.549596491962742 0.288157693183783 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 26786627 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000117682:ENST00000434391:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000357049:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374192:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000525682:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000236342:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000526219:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000360009:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000374194:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000430232:exon_26786528_26786635:DHDDS;ENSG00000117682:ENST00000416052:exon_26786528_26786635:DHDDS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 26888016 C/T 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374164:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531113:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26887996_26888154:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000403732:exon_26887996_26888154:RPS6KA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 26900708 G/A 1 13 13 26 5.85524560448435 7.14475439551565 -1.28950879103129 A:G G A 10 0.549596491962742 0.694832814629511 ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28128163 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28206348 T/C 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000130775:ENST00000373925:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373919:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000427466:exon_28206155_28206459:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000466068:exon_28206155_28206565:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28206242_28206565:C1orf38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28209305 A/G 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 189 163 352 85.1262630190418 89.5842281899269 -4.45796517088517 A:G A G 10 0.549596491962742 0.630291705981891 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 26 8 34 11.7104912089687 4.39677193570194 7.31371927326677 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0146555609599992 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 48 6 54 21.6193683857884 3.29757895177645 18.3217894340119 A:G A G 10 0.549596491962742 1.25863096906612e-07 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28833834 T/A 1 16 3 19 7.20645612859613 1.64878947588823 5.5576666527079 A:T T A 10 0.549596491962742 0.0104335744009062 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28906282 C/T 1 25 45 70 11.2600877009315 24.7318421383234 -13.4717544373919 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0016012181890181 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28906940 C/T 1 25 28 53 11.2600877009315 15.3887017749568 -4.12861407402533 T:C C T 10 0.549596491962742 0.271386358956406 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 28906984 T/G 1 12 12 24 5.4048420964471 6.5951579035529 -1.19031580710581 T:G T G 10 0.549596491962742 0.684179625335306 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 31744381 T/C 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 32096265 A/G 1 10 7 17 4.50403508037258 3.84717544373919 0.656859636633387 A:G A G 10 0.549596491962742 0.8116374148793 ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 32678270 C/T 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C C T 10 0.549596491962742 0.763998637860147 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 33149587 C/T 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.426065193600925 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 33149797 A/G 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 33476350 C/T 1 11 17 28 4.95443858840984 9.34314036336661 -4.38870177495677 T:C C T 10 0.549596491962742 0.127404510748569 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33473585_33476434:AK2;ENSG00000004455:ENST00000482191:exon_33476120_33476434:AK2;ENSG00000004455:ENST00000491241:exon_33476232_33476434:AK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 35320690 T/G 1 32 42 74 14.4129122571923 23.0830526624352 -8.6701404052429 T:G T G 10 0.549596491962742 0.047003425885544 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 35320783 C/G 1 56 61 117 25.2225964500864 33.5253860097273 -8.30278955964081 C:G C G 10 0.549596491962742 0.137015493882206 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 35900615 A/G 1 9 11 20 4.05363157233532 6.04556141159016 -1.99192983925484 A:G A G 10 0.549596491962742 0.379628968718832 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35899091_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35899092_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373266:exon_35899706_35900682:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35900566_35900682:KIAA0319L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 36642420 T/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 T:C T C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000474796:exon_36642298_36642435:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36642298_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36642318_36642443:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36642407_36642443:MAP7D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 36752152 C/T 1 4 10 14 1.80161403214903 5.49596491962742 -3.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0597828211497275 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 36752245 G/A 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 A:G G A 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 15 10 25 6.75605262055887 5.49596491962742 1.26008770093145 T:C C T 10 0.549596491962742 0.690466238138788 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 36787888 G/A 1 34 28 62 15.3137192732668 15.3887017749568 -0.0749825016900019 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000142694:ENST00000270824:exon_36787632_36788326:FAM176B;ENSG00000142694:ENST00000490466:exon_36787882_36788326:FAM176B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39311617 T/G 1 19 20 39 8.5576666527079 10.9919298392548 -2.43426318654694 T:G T G 10 0.549596491962742 0.520307208751202 ENSG00000116954:ENST00000373001:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000474456:exon_39311611_39313746:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000411897:exon_39311611_39311759:RRAGC;ENSG00000116954:ENST00000493015:exon_39311611_39311759:RRAGC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39466626 A/G 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39797195 G/A 1 41 28 69 18.4665438295276 15.3887017749568 3.07784205457081 A:G G A 10 0.549596491962742 0.470919148677954 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39797756 A/G 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39798303 A/T 1 10 11 21 4.50403508037258 6.04556141159016 -1.54152633121758 A:T A T 10 0.549596491962742 0.518388705412663 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39798767 A/G 1 5 8 13 2.25201754018629 4.39677193570194 -2.14475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.271985568998683 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39800299 C/T 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39796875_39802325:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39796810_39802325:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39816556 C/T 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000530262:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000476350:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39816457_39816690:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39816457_39816690:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39854156 G/C 1 19 13 32 8.5576666527079 7.14475439551565 1.41291225719226 C:G G C 10 0.549596491962742 0.723272122776592 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39852859_39854330:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39852859_39854330:MACF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 39929240 T/C 1 11 14 25 4.95443858840984 7.69435088747839 -2.73991229906855 T:C T C 10 0.549596491962742 0.316889910238764 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 40751598 A/G 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 A:G A G 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40751597_40751701:ZMPSTE24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 41475142 G/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000171793:ENST00000372621:exon_41475117_41475261:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000372616:exon_41475117_41475261:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000464283:exon_41475117_41475261:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000463423:exon_41475117_41475261:CTPS;ENSG00000171793:ENST00000498694:exon_41475117_41475261:CTPS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 41976217 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 43636484 C/G 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 C:G C G 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43636427_43636550:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43636427_43636792:EBNA1BP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 44137420 A/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000066135:ENST00000372396:exon_44137176_44137546:KDM4A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 44433361 C/A 1 62 67 129 27.92501749831 36.8229649615037 -8.89794746319372 A:C C A 10 0.549596491962742 0.132253567662083 ENSG00000117408:ENST00000372343:exon_44433258_44433694:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000483886:exon_44433258_44433641:IPO13;ENSG00000117408:ENST00000372339:exon_44433258_44433424:IPO13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 45120546 C/G 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 C:G C G 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000126106:ENST00000372237:exon_45118919_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000476724:exon_45118919_45120881:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000468117:exon_45118919_45120788:TMEM53;ENSG00000126106:ENST00000372235:exon_45120137_45120791:TMEM53 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 45795027 C/T 1 34 34 68 15.3137192732668 18.6862807267332 -3.37256145346645 T:C C T 10 0.549596491962742 0.464989668082543 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45794835_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000531105:exon_45794918_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45794944_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45794945_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45794946_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45794948_45795109:MUTYH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 46812559 G/T 1 17 13 30 7.65685963663339 7.14475439551565 0.512105241117741 T:G G T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 19 19 38 8.5576666527079 10.4423333472921 -1.88466669458419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.625449331077231 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 52266350 C/T 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52266228_52266355:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000497358:exon_52266228_52266355:NRD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 53516383 C/A 0 10 0 10 4.50403508037258 0 4.50403508037258 C C 10 0.549596491962742 0.00285800173360387 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53516281_53517375:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53516281_53517073:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53516281_53516575:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53516281_53516642:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53516281_53516932:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000430330:exon_53516281_53516798:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000484100:exon_53516281_53516690:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000533119:exon_53516281_53516734:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000435345:exon_53516281_53516785:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000488965:exon_53513530_53517282:SCP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 54387288 A/G 1 38 22 60 17.1153333054158 12.0911228231803 5.02421048223548 A:G A G 10 0.549596491962742 0.197778032147957 ENSG00000081870:ENST00000194214:exon_54387234_54387440:HSPB11;ENSG00000081870:ENST00000489675:exon_54387235_54387440:HSPB11;ENSG00000081870:ENST00000371378:exon_54387236_54387440:HSPB11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 54433353 G/T 1 12 7 19 5.4048420964471 3.84717544373919 1.5576666527079 T:G G T 10 0.549596491962742 0.500715990574539 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54433338_54433841:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54433338_54433841:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54433338_54433406:LRRC42 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 59147799 T/G 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59147457_59148217:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59147457_59148217:MYSM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 62380298 G/A 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62380259_62380336:INADL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 62582206 A/G 1 15 10 25 6.75605262055887 5.49596491962742 1.26008770093145 A:G A G 10 0.549596491962742 0.690466238138788 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62582204_62582351:INADL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 62676091 C/A 0 28 0 28 12.6112982250432 0 12.6112982250432 C C 10 0.549596491962742 5.96600427304869e-08 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 62677050 C/T 0 11 0 11 4.95443858840984 0 4.95443858840984 C C 10 0.549596491962742 0.00153666780425769 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 62677118 A/G 0 14 0 14 6.30564911252161 0 6.30564911252161 A A 10 0.549596491962742 0.000243550771275789 ENSG00000240563:ENST00000498273:exon_62675455_62678000:L1TD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 65335062 A/G 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65334994_65335157:JAK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 67891937 T/C 1 14 33 47 6.30564911252161 18.1366842347705 -11.8310351222489 T:C T C 10 0.549596491962742 0.000617038650138157 ENSG00000142864:ENST00000370994:exon_67891818_67891968:SERBP1;ENSG00000142864:ENST00000370995:exon_67891818_67891968:SERBP1;ENSG00000142864:ENST00000361219:exon_67891818_67891968:SERBP1;ENSG00000142864:ENST00000370990:exon_67891818_67891968:SERBP1;ENSG00000142864:ENST00000490406:exon_67891818_67891968:SERBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 70687239 T/A 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:T T A 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000116754:ENST00000395136:exon_70687079_70687522:SRSF11;ENSG00000116754:ENST00000473950:exon_70687152_70687522:SRSF11;ENSG00000116754:ENST00000469170:exon_70687163_70687522:SRSF11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 71538191 A/G 1 132 136 268 59.4532630609181 74.7451229069329 -15.2918598460148 A:T:G A G 10 0.549596491962742 0.0654178448688779 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71538155_71538231:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71538155_71538231:ZRANB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 76205685 T/G 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:G T G 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000117054:ENST00000370841:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526129:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526196:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000532509:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000370834:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000530953:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000534334:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000525808:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000420607:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000529059:exon_76205665_76205795:ACADM;ENSG00000117054:ENST00000526930:exon_76205665_76205795:ACADM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 16 15 31 7.20645612859613 8.24394737944113 -1.037491250845 A:G G A 10 0.549596491962742 0.721680287355976 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 28 17 45 12.6112982250432 9.34314036336661 3.26815786167661 T:C T C 10 0.549596491962742 0.370426923974077 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 79107224 C/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:C C A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79107120_79107235:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79107120_79107294:IFI44L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 86822231 A/G 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86822196_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86822127_86822285:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86822145_86822285:ODF2L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 86824516 T/C 1 25 12 37 11.2600877009315 6.5951579035529 4.66492979737855 T:C T C 10 0.549596491962742 0.138553394228805 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472144:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000463933:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000534092:exon_86824027_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86824470_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86824500_86824574:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86824502_86824574:ODF2L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 89473532 G/C 1 7 17 24 3.15282455626081 9.34314036336661 -6.19031580710581 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0131500249268837 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89472363_89473535:GBP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 89474818 A/G 1 11 16 27 4.95443858840984 8.79354387140387 -3.83910528299403 A:G A G 10 0.549596491962742 0.175288770605262 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89474630_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000461384:exon_89474527_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000445969:exon_89474618_89474823:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000493594:exon_89474782_89474823:GBP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 89522646 G/C 1 12 3 15 5.4048420964471 1.64878947588823 3.75605262055887 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0677975361334678 ENSG00000117228:ENST00000422952:exon_89522537_89522728:GBP1;ENSG00000117228:ENST00000370473:exon_89522537_89522817:GBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 89655783 T/C 1 13 6 19 5.85524560448435 3.29757895177645 2.5576666527079 T:C T C 10 0.549596491962742 0.259451987278943 ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 89655787 T/C 1 4 12 16 1.80161403214903 6.5951579035529 -4.79354387140387 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0216259683807766 ENSG00000162654:ENST00000355754:exon_89655721_89656001:GBP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 90487882 C/T 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90487809_90487904:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90487809_90487904:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90487809_90487904:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90487809_90487904:ZNF326 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 93301811 A/T 1 276 256 532 124.311368218283 140.696701942462 -16.3853337241787 A:T A T 10 0.549596491962742 0.163190945586326 ENSG00000122406:ENST00000432788:exon_93301747_93301949:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000370321:exon_93301747_93301949:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000470843:exon_93301747_93301911:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000490963:exon_93301791_93301949:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000315741:exon_93301747_93301959:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000461952:exon_93301747_93301828:RPL5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 93620393 G/A 1 9 5 14 4.05363157233532 2.74798245981371 1.30564911252161 A:G G A 10 0.549596491962742 0.595838131122828 ENSG00000117500:ENST00000370282:exon_93615299_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000370290:exon_93617415_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000483033:exon_93619753_93620445:TMED5;ENSG00000117500:ENST00000479918:exon_93619789_93620445:TMED5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 93646418 C/T 1 4 13 17 1.80161403214903 7.14475439551565 -5.34314036336661 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0127497899338613 ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93645920_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93646281_93646439:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93646326_93646439:CCDC18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 93672723 A/C 1 45 63 108 20.2681578616766 34.6245789936527 -14.3564211319761 A:C A C 10 0.549596491962742 0.00654896792517168 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 14 28 42 6.30564911252161 15.3887017749568 -9.08305266243516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00516425453658416 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 94342203 C/G 1 18 14 32 8.10726314467064 7.69435088747839 0.412912257192257 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 109466760 C/T 1 23 13 36 10.3592806848569 7.14475439551565 3.21452628934129 T:C C T 10 0.549596491962742 0.317645376030456 ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109466622_109466836:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109466622_109466836:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109466622_109466836:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000431112:exon_109466622_109466836:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000441735:exon_109466622_109466983:GPSM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 111441829 C/T 1 46 28 74 20.7185613697139 15.3887017749568 5.3298595947571 T:C C T 10 0.549596491962742 0.243001195419188 ENSG00000143119:ENST00000429072:exon_111441746_111442558:CD53;ENSG00000143119:ENST00000271324:exon_111441746_111442550:CD53;ENSG00000143119:ENST00000476408:exon_111441746_111442136:CD53;ENSG00000143119:ENST00000497404:exon_111441746_111442473:CD53;ENSG00000143119:ENST00000464329:exon_111441746_111441938:CD53 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 111726098 G/A 1 8 11 19 3.60322806429806 6.04556141159016 -2.4423333472921 A:G G A 10 0.549596491962742 0.356813968848070 ENSG00000134255:ENST00000498239:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000357172:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000478042:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000473474:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000467362:exon_111726084_111726209:CEPT1;ENSG00000134255:ENST00000483427:exon_111726084_111726173:CEPT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 111730284 T/A 1 45 36 81 20.2681578616766 19.7854737106587 0.482684151017903 A:T T A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111729796_111730303:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111729796_111730303:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111729796_111730303:DENND2D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 111730802 G/A 1 24 34 58 10.8096841928942 18.6862807267332 -7.87659653383903 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0469612059280842 ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111730753_111730992:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111730753_111730992:DENND2D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 111738589 A/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:T A T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111738538_111738678:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000473682:exon_111738538_111740611:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000463713:exon_111738536_111738678:DENND2D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 111783981 G/A 1 106 111 217 47.7427718519493 61.0052106078644 -13.262438755915 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0760141723757923 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 112269624 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 112269872 G/A 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000197852:ENST00000357260:exon_112264686_112270426:C1orf183;ENSG00000197852:ENST00000444059:exon_112269128_112270426:C1orf183 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 114437900 G/A 1 116 89 205 52.2468069323219 48.914087784684 3.3327191476379 A:G G A 10 0.549596491962742 0.673893461831577 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114437370_114438114:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114437370_114438114:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114437370_114438114:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114437677_114438114:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114437682_114438660:AP4B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 116931628 C/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000163399:ENST00000339159:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000295598:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000369496:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000445896:exon_116931524_116931641:ATP1A1;ENSG00000163399:ENST00000491156:exon_116931524_116931641:ATP1A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 117617844 A/G 1 26 20 46 11.7104912089687 10.9919298392548 0.71856136971387 A:G A G 10 0.549596491962742 0.882964947308768 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 9 9 0 4.94636842766468 -4.94636842766468 T G T 10 0.549596491962742 0.00076280912542378 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 G G 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 10 10 0 5.49596491962742 -5.49596491962742 C T C 10 0.549596491962742 0.000343571906053703 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 8 8 0 4.39677193570194 -4.39677193570194 T C T 10 0.549596491962742 0.00169361275347944 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 150129593 G/A 1 14 23 37 6.30564911252161 12.6407193151431 -6.33507020262145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0462947064235926 ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 150130983 G/T 1 12 2 14 5.4048420964471 1.09919298392548 4.30564911252161 T:C:G G T 10 0.549596491962742 0.0284046570667369 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 150131342 G/A 1 127 115 242 57.2012455207318 63.2035965757153 -6.00235105498355 A:G G A 10 0.549596491962742 0.439070798650176 ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 234 276 510 105.394420880718 151.688631781717 -46.2942109009984 T:C T C 10 0.549596491962742 4.10161008605554e-05 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 17 8 25 7.65685963663339 4.39677193570194 3.26008770093145 A:C A C 10 0.549596491962742 0.229795600292575 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 151403225 A/G 1 18 6 24 8.10726314467064 3.29757895177645 4.80968419289419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0632937192999377 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000485040:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000437847:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000467287:exon_151403142_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000533461:exon_151403148_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000533351:exon_151403182_151403317:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000450842:exon_151403190_151403317:POGZ HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 152785261 C/G 1 6 11 17 2.70242104822355 6.04556141159016 -3.34314036336661 C:G C G 10 0.549596491962742 0.142293766298503 ENSG00000196734:ENST00000360090:exon_152784837_152785366:LCE1B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 153507176 C/T 1 149 117 266 67.1101226975514 64.3027895596408 2.80733313791063 T:C C T 10 0.549596491962742 0.758181387352509 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 153516358 G/A 1 41 62 103 18.4665438295276 34.07498250169 -15.6084386721624 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00209756957653448 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153516089_153516415:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153516089_153516399:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153516097_153516399:S100A4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 153963285 G/T 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 T:G G T 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000177954:ENST00000493224:exon_153963239_153963510:RPS27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 154561925 C/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154561845_154561938:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154561845_154561938:ADAR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 154574820 T/C 1 2 11 13 0.900807016074516 6.04556141159016 -5.14475439551564 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00459266273647749 ENSG00000160710:ENST00000292205:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000443129:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000420505:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000392506:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368474:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000368471:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000529168:exon_154573517_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000471068:exon_154574572_154575102:ADAR;ENSG00000160710:ENST00000526905:exon_154574675_154575102:ADAR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 154918698 G/C 1 47 84 131 21.1689648777511 46.1661053248703 -24.9971404471192 C:G G C 10 0.549596491962742 1.37243238680361e-05 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 15 23 38 6.75605262055887 12.6407193151431 -5.88466669458419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0716986288325498 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 154987158 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000461530:exon_154987131_154987444:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000483226:exon_154987131_154987195:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 155230131 C/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 155307998 T/G 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 T:G T G 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155307880_155308181:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155307880_155308181:ASH1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 155308178 T/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155307880_155308181:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155307880_155308181:ASH1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 155448461 G/A 1 12 7 19 5.4048420964471 3.84717544373919 1.5576666527079 A:G G A 10 0.549596491962742 0.500715990574539 ENSG00000116539:ENST00000368346:exon_155447677_155452240:ASH1L;ENSG00000116539:ENST00000392403:exon_155447677_155452240:ASH1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 155885635 C/T 1 15 13 28 6.75605262055887 7.14475439551565 -0.388701774956775 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000132680:ENST00000368320:exon_155882836_155885755:KIAA0907;ENSG00000132680:ENST00000466520:exon_155885368_155885755:KIAA0907;ENSG00000132680:ENST00000465953:exon_155885455_155885755:KIAA0907 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 45 36 81 20.2681578616766 19.7854737106587 0.482684151017903 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156146218 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000196189:ENST00000355014:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368285:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368284:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368283:exon_156146196_156147535:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368286:exon_156146196_156147534:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000368282:exon_156146196_156147543:SEMA4A;ENSG00000196189:ENST00000484155:exon_156146196_156146447:SEMA4A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156563726 A/C 1 86 68 154 38.7347016912042 37.3725614534665 1.36214023773774 A:C:G A C 10 0.549596491962742 0.871458161110899 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156563813 G/A 1 51 31 82 22.9705789099002 17.037491250845 5.93308765905516 A:G G A 10 0.549596491962742 0.222023038068537 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156563852 C/T 1 93 63 156 41.887526247465 34.6245789936527 7.26294725381226 T:C C T 10 0.549596491962742 0.260331174997949 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156564998 T/G 1 71 104 175 31.9786490706453 57.1580351641252 -25.1793860934798 T:G T G 10 0.549596491962742 0.000179585002764051 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156564779_156565048:GPATCH4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156565218 C/T 1 88 74 162 39.6355087072787 40.6701404052429 -1.03463169796419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.874852356974425 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156565050_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156565005_156565641:GPATCH4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156565509 T/G 1 116 65 181 52.2468069323219 35.7237719775782 16.5230349547437 T:G T G 10 0.549596491962742 0.0136666460823809 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156564279_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156564324_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156565050_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156565005_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156565237_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000494414:exon_156565390_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156565398_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156565459_156565641:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156568252 A/G 1 24 6 30 10.8096841928942 3.29757895177645 7.51210524111774 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00553117968716896 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000497287:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156568213_156568286:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156568213_156568286:GPATCH4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/G 1 16 17 33 7.20645612859613 9.34314036336661 -2.13668423477048 A:G A G 10 0.549596491962742 0.487351784421038 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156713465 G/A 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000143321:ENST00000357325:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368209:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000465180:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000482651:exon_156713444_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000477306:exon_156713099_156713670:HDGF;ENSG00000143321:ENST00000368206:exon_156713444_156713670:HDGF HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 156756739 C/G 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 C:G C G 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000143294:ENST00000491853:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000473387:exon_156756400_156756772:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000526188:exon_156756667_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156756683_156756966:PRCC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 157516802 A/G 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368189:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000481082:exon_157516733_157516987:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368188:exon_157516733_157516987:FCRL5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 157650539 G/A 1 9 2 11 4.05363157233532 1.09919298392548 2.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.126180563142262 ENSG00000160856:ENST00000477837:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000492769:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000480682:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000494724:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000368186:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000485028:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000368184:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000292392:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000392274:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000473231:exon_157650492_157650560:FCRL3;ENSG00000160856:ENST00000468507:exon_157650492_157650560:FCRL3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 158986420 C/T 1 142 86 228 63.9572981412906 47.2652983087958 16.6919998324948 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0279529247956011 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 159002301 T/C 1 11 10 21 4.95443858840984 5.49596491962742 -0.541526331217581 T:C T C 10 0.549596491962742 0.829710755643621 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 45 45 90 20.2681578616766 24.7318421383234 -4.46368427664677 A:C C A 10 0.549596491962742 0.396853070293851 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 35 38 73 15.764122781304 20.8846666945842 -5.12054391328016 A:T T A 10 0.549596491962742 0.240898488979147 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 164 185 349 73.8661753181103 101.675351013107 -27.8091756949969 A:T A T 10 0.549596491962742 0.00304805905930741 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 159043041 C/T 1 8 1 9 3.60322806429806 0.549596491962742 3.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0474590365992993 ENSG00000163568:ENST00000368130:exon_159043028_159043309:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000481829:exon_159043028_159043055:AIM2;ENSG00000163568:ENST00000411768:exon_159043028_159043309:AIM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 160654792 C/T 1 87 65 152 39.1851051992414 35.7237719775782 3.46133322166322 T:C C T 10 0.549596491962742 0.624958870658413 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 160719757 C/T 1 14 12 26 6.30564911252161 6.5951579035529 -0.289508791031292 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000026751:ENST00000466792:exon_160719611_160719856:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160719611_160719922:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458602:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458104:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000495334:exon_160719611_160719883:SLAMF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161017556 C/T 1 30 21 51 13.5121052411177 11.5415263312176 1.97057890990016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.673382484060951 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161019040 G/C 1 32 33 65 14.4129122571923 18.1366842347705 -3.72377197757823 C:G G C 10 0.549596491962742 0.383880010735814 ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161140517 A/C 1 36 17 53 16.2145262893413 9.34314036336661 6.87138592597468 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0718649623531022 ENSG00000143224:ENST00000352210:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000432542:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000435935:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000367999:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000497522:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000495483:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000462866:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000466452:exon_161140051_161140559:PPOX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161681753 G/C 1 11 22 33 4.95443858840984 12.0911228231803 -7.13668423477048 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0140783572276664 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161681780 A/G 1 14 23 37 6.30564911252161 12.6407193151431 -6.33507020262145 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0462947064235926 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161761312 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161761198_161761327:ATF6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 13 15 28 5.85524560448435 8.24394737944113 -2.38870177495678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.448190200424548 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 180062215 T/C 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 182544687 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000135828:ENST00000367559:exon_182542769_182544713:RNASEL;ENSG00000135828:ENST00000444138:exon_182542772_182544713:RNASEL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183105534 T/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183105705 G/A 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 A:G G A 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183105521_183105720:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183105521_183105720:LAMC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183106956 A/C 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 A:C A C 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183106804_183106962:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183106804_183107040:LAMC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183596703 G/A 1 40 38 78 18.0161403214903 20.8846666945842 -2.86852637309387 A:G G A 10 0.549596491962742 0.569738212093557 ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183595329_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183595352_183596729:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183595593_183596729:ARPC5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183599638 C/T 1 22 17 39 9.90887717681968 9.34314036336661 0.565736813453064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.873917475373453 ENSG00000162704:ENST00000367534:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000462965:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000359856:exon_183599596_183599772:ARPC5;ENSG00000162704:ENST00000294742:exon_183599596_183599772:ARPC5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183604596 G/A 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 183604597 G/A 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 184764410 C/T 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 197070464 T/C 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 198721801 T/C 1 17 3 20 7.65685963663339 1.64878947588823 6.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00643249441616623 ENSG00000081237:ENST00000367366:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000352140:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367376:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000442510:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000271610:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000348564:exon_198721723_198721901:PTPRC;ENSG00000081237:ENST00000367372:exon_198721723_198721901:PTPRC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 9 12 21 4.05363157233532 6.5951579035529 -2.54152633121758 A:T A T 10 0.549596491962742 0.280840300071195 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 201842128 C/T 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 T:C C T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 201974712 G/C 1 4 11 15 1.80161403214903 6.04556141159016 -4.24394737944113 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0362224812734888 ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201974686_201975275:RNPEP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 209948711 A/C 1 24 23 47 10.8096841928942 12.6407193151431 -1.83103512224887 A:C A C 10 0.549596491962742 0.660758894831395 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209948694_209948940:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000487271:exon_209948635_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209948694_209949081:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209948694_209948834:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000480569:exon_209948635_209948786:TRAF3IP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 218458672 C/T 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 220156156 C/T 1 32 17 49 14.4129122571923 9.34314036336661 5.06977189382564 T:C C T 10 0.549596491962742 0.153705193491043 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156114_220156186:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156114_220156186:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220155852_220156186:EPRS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 77 70 147 34.6810701188689 38.4717544373919 -3.79068431852307 T:C C T 10 0.549596491962742 0.562057789551572 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 226576388 T/C 1 106 72 178 47.7427718519493 39.5709474213174 8.17182443063193 T:C T C 10 0.549596491962742 0.228681346172043 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226576357_226576456:PARP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 226589958 G/A 1 26 12 38 11.7104912089687 6.5951579035529 5.1153333054158 A:G G A 10 0.549596491962742 0.104578371032791 ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 227083181 C/T 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000143801:ENST00000366783:exon_227083125_227083799:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000340188:exon_227083125_227083806:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000422240:exon_227083125_227083504:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000366782:exon_227083125_227083799:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000391872:exon_227083125_227083806:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000496965:exon_227083125_227083232:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000472139:exon_227083125_227083392:PSEN2;ENSG00000143801:ENST00000471728:exon_227083125_227083245:PSEN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 227920103 G/A 1 29 18 47 13.0617017330805 9.89273685532936 3.16896487775113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.382052785314712 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 230410217 G/A 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230410191_230410310:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230410191_230410310:GALNT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 102 119 221 45.9411578198003 65.4019825435663 -19.460824723766 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0100485644530416 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 32 28 60 14.4129122571923 15.3887017749568 -0.975789517764518 T:C T C 10 0.549596491962742 0.797020702134447 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 235397787 A/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235397728_235397807:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235397728_235397807:ARID4B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 235945294 T/C 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 T:C T C 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000143669:ENST00000389794:exon_235945227_235945387:LYST;ENSG00000143669:ENST00000389793:exon_235945227_235945387:LYST;ENSG00000143669:ENST00000489585:exon_235945227_235945387:LYST HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 235973544 A/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000143669:ENST00000389794:exon_235971755_235973834:LYST;ENSG00000143669:ENST00000389793:exon_235971755_235973834:LYST;ENSG00000143669:ENST00000489585:exon_235971755_235973834:LYST;ENSG00000143669:ENST00000465349:exon_235971755_235973834:LYST HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 236708037 T/C 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 T:C T C 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 9 14 23 4.05363157233532 7.69435088747839 -3.64071931514307 T:C T C 10 0.549596491962742 0.144897374794713 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 236717926 T/C 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 236737933 G/C 1 1 9 10 0.450403508037258 4.94636842766468 -4.49596491962742 C:G G C 10 0.549596491962742 0.00705037392730463 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 1 247323048 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196418:ENST00000472531:exon_247322989_247323115:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000491356:exon_247322989_247323115:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000482970:exon_247322989_247323115:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000340684:exon_247322989_247323115:ZNF124;ENSG00000196418:ENST00000491848:exon_247322989_247323169:ZNF124 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 1065787 A/G 1 15 18 33 6.75605262055887 9.89273685532936 -3.13668423477048 A:G A G 10 0.549596491962742 0.296965582445111 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 3143161 G/A 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3143113_3143192:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3143113_3143192:PFKP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 7409532 T/C 1 16 15 31 7.20645612859613 8.24394737944113 -1.037491250845 T:C T C 10 0.549596491962742 0.721680287355976 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 101 86 187 45.4907543117631 47.2652983087958 -1.77454399703274 A:G A G 10 0.549596491962742 0.825633747500322 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 13154485 C/A 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13154453_13154635:OPTN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 13322989 C/T 1 5 8 13 2.25201754018629 4.39677193570194 -2.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.271985568998683 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13322976_13323110:PHYH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 13364914 C/G 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 C:G C G 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000086475:ENST00000327347:exon_13364835_13365047:SEPHS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 11 2 13 4.95443858840984 1.09919298392548 3.85524560448436 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0472186479280716 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 13736086 G/A 1 1 8 9 0.450403508037258 4.39677193570194 -3.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0137150888612322 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 15145917 A/C 1 23 22 45 10.3592806848569 12.0911228231803 -1.73184213832339 A:C A C 10 0.549596491962742 0.654296997508016 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 15177280 T/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 T:C T C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 22830790 G/T 1 14 11 25 6.30564911252161 6.04556141159016 0.260087700931451 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22830733_22830976:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22830733_22830976:PIP4K2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 24790393 A/G 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24790308_24790474:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000460373:exon_24790308_24790474:KIAA1217 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 24813417 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 27335399 C/T 1 29 11 40 13.0617017330805 6.04556141159016 7.01614032149032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0263962121073305 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27335282_27335449:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27335282_27335449:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27335282_27335452:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27335282_27335452:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27335282_27335452:ANKRD26 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 27335409 T/C 1 31 13 44 13.962508749155 7.14475439551565 6.81775435363935 T:C T C 10 0.549596491962742 0.047908233242552 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27335282_27335449:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27335282_27335449:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27335282_27335452:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27335282_27335452:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27335282_27335452:ANKRD26 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 27353007 T/C 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27352917_27353010:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27352917_27353010:ANKRD26 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 27459303 A/G 1 11 15 26 4.95443858840984 8.24394737944113 -3.28950879103129 A:G A G 10 0.549596491962742 0.237602204643593 ENSG00000120539:ENST00000375946:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000342386:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000375940:exon_27458873_27460012:MASTL;ENSG00000120539:ENST00000477034:exon_27458873_27460012:MASTL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 29754609 T/C 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 T:C T C 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000197321:ENST00000375400:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000497265:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000375398:exon_29754524_29754679:SVIL;ENSG00000197321:ENST00000355867:exon_29754524_29754679:SVIL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 32323591 G/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:G G T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 32582006 T/A 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 A:T T A 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32581916_32582122:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32581916_32582122:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32581916_32582122:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32581916_32582122:EPC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 33217110 G/A 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 A:G G A 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000150093:ENST00000396033:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000374956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000359614:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000423113:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302278:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000302252:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000426259:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000401956:exon_33217022_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000480226:exon_33217078_33217192:ITGB1;ENSG00000150093:ENST00000474568:exon_33217102_33217192:ITGB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 43326376 G/A 1 47 45 92 21.1689648777511 24.7318421383234 -3.56287726057226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.465011356221472 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43326314_43326856:BMS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 45480378 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45480261_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471941:exon_45478476_45480418:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000471808:exon_45480324_45480418:RASSF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 49414953 G/A 1 12 7 19 5.4048420964471 3.84717544373919 1.5576666527079 A:G G A 10 0.549596491962742 0.500715990574539 ENSG00000170324:ENST00000374201:exon_49414791_49414976:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000407470:exon_49414791_49414976:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000305531:exon_49414791_49414976:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000395638:exon_49414791_49414976:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000395627:exon_49414791_49414976:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000486151:exon_49414791_49414976:FRMPD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 49420008 T/C 1 13 8 21 5.85524560448435 4.39677193570194 1.45847366878242 T:C T C 10 0.549596491962742 0.662244898432161 ENSG00000170324:ENST00000374201:exon_49419997_49420152:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000407470:exon_49419997_49420152:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000305531:exon_49419997_49420149:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000395638:exon_49419997_49420152:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000395627:exon_49419997_49420152:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000486151:exon_49419997_49420149:FRMPD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 49459610 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000170324:ENST00000374201:exon_49459609_49459734:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000407470:exon_49459609_49459734:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000305531:exon_49459609_49459800:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000395638:exon_49459609_49459734:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000395627:exon_49459609_49459734:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000486151:exon_49459609_49459734:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000468556:exon_49459609_49459696:FRMPD2;ENSG00000170324:ENST00000492045:exon_49459609_49459654:FRMPD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 49654403 C/T 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000128805:ENST00000249601:exon_49654077_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374172:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374170:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000477708:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417247:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374167:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000422092:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000435790:exon_49654285_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417912:exon_49654383_49654662:ARHGAP22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 49654446 C/T 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000128805:ENST00000249601:exon_49654077_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374172:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374170:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000477708:exon_49654079_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417247:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374167:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000422092:exon_49654080_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000435790:exon_49654285_49654662:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417912:exon_49654383_49654662:ARHGAP22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 52103707 A/G 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:G A G 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000198964:ENST00000361543:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000361781:exon_52103252_52104105:SGMS1;ENSG00000198964:ENST00000492601:exon_52103252_52104094:SGMS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 58118215 A/G 1 13 8 21 5.85524560448435 4.39677193570194 1.45847366878242 A:G A G 10 0.549596491962742 0.662244898432161 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58117199_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58117206_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000478181:exon_58117948_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58118137_58118220:ZWINT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 63851181 G/A 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000150347:ENST00000279873:exon_63850621_63856703:ARID5B;ENSG00000150347:ENST00000309334:exon_63850621_63852823:ARID5B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 33 27 60 14.8633157652295 14.839105282994 0.0242104822354818 A:T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 73511040 G/A 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73507316_73511047:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000470317:exon_73510673_73511047:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73510979_73511047:C10orf54 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 73992862 C/G 1 21 15 36 9.45847366878242 8.24394737944113 1.21452628934129 C:G C G 10 0.549596491962742 0.739702466359445 ENSG00000166295:ENST00000478193:exon_73992759_73993373:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000299381:exon_73992759_73993587:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000470481:exon_73992759_73993584:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000468144:exon_73992759_73992969:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000496924:exon_73992759_73993223:ANAPC16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 74765592 T/C 1 28 36 64 12.6112982250432 19.7854737106587 -7.17417548561549 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0788078849592466 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 74767998 C/G 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 C:G C G 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000122884:ENST00000307116:exon_74766975_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000373008:exon_74766975_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000394890:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000412021:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000440381:exon_74766982_74768050:P4HA1;ENSG00000122884:ENST00000263556:exon_74766982_74768050:P4HA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 74890552 A/T 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:T A T 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000166321:ENST00000488223:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000357321:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000349051:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000372997:exon_74890461_74891586:NUDT13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75010597 A/G 1 69 130 199 31.0778420545708 71.4475439551565 -40.3697019005857 A:T:G A G 10 0.549596491962742 1.16742267246634e-08 ENSG00000182180:ENST00000372945:exon_75008601_75010749:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000479005:exon_75008601_75010749:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000471251:exon_75010499_75010749:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000473427:exon_75010502_75010749:MRPS16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75011761 A/G 1 30 51 81 13.5121052411177 28.0294210900998 -14.5173158489821 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0016016208614816 ENSG00000182180:ENST00000416782:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000372945:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000479005:exon_75011521_75011795:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000372940:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000471251:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000473427:exon_75011521_75011781:MRPS16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75135964 T/C 1 28 24 52 12.6112982250432 13.1903158071058 -0.579017582062583 T:C:G T C 10 0.549596491962742 0.889914445829184 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75135203_75135975:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75135203_75135975:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000463788:exon_75135407_75135975:ANXA7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75148116 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75148070_75148172:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75148070_75148172:ANXA7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75265136 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166348:ENST00000418501:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000424265:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000466048:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000339859:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000428547:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000408019:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000422491:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000394811:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000319786:exon_75265081_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000497106:exon_75265081_75265184:USP54 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75557175 G/A 1 10 13 23 4.50403508037258 7.14475439551565 -2.64071931514307 A:G G A 10 0.549596491962742 0.29908199719629 ENSG00000214655:ENST00000412131:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000436194:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000414462:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000398706:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000433366:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000492395:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000412198:exon_75557135_75557363:KIAA0913;ENSG00000214655:ENST00000487278:exon_75557135_75557208:KIAA0913 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 75562183 T/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 76989482 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 76990646 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 81926718 A/G 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 A:G A G 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 85908565 C/T 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000165678:ENST00000372134:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000339736:exon_85908486_85908594:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000436406:exon_85908486_85908594:GHITM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 10 14 24 4.50403508037258 7.69435088747839 -3.19031580710581 T:C T C 10 0.549596491962742 0.220679044086420 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 88213079 G/C 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000062650:ENST00000342368:exon_88212977_88213092:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000298767:exon_88212977_88213092:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372076:exon_88212977_88213092:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000420749:exon_88212977_88213092:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000263070:exon_88212977_88213092:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000372075:exon_88212977_88213092:WAPAL;ENSG00000062650:ENST00000495124:exon_88212977_88213092:WAPAL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 90695067 G/A 1 25 35 60 11.2600877009315 19.235877218696 -7.97578951776452 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0507196558491799 ENSG00000107796:ENST00000224784:exon_90694831_90695123:ACTA2;ENSG00000107796:ENST00000458208:exon_90694833_90695123:ACTA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 95276718 T/C 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C T C 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 95430585 T/G 1 27 22 49 12.160894717006 12.0911228231803 0.069771893825644 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000460752:exon_95430527_95435061:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000483229:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000462771:exon_95430532_95430605:FRA10AC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 95441268 A/G 1 40 41 81 18.0161403214903 22.5334561704724 -4.5173158489821 A:G A G 10 0.549596491962742 0.317326374223890 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95441237_95441355:FRA10AC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 21 7 28 9.45847366878242 3.84717544373919 5.61129822504323 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0365857330239782 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 22 16 38 9.90887717681968 8.79354387140387 1.11533330541581 A:G A G 10 0.549596491962742 0.747272378190228 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 96117065 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96116931_96117088:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96116931_96117088:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96116931_96117972:NOC3L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 96256902 A/G 1 11 8 19 4.95443858840984 4.39677193570194 0.557666652707903 A:G A G 10 0.549596491962742 0.822816223025556 ENSG00000108239:ENST00000225235:exon_96256812_96256929:TBC1D12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 96260023 C/T 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000108239:ENST00000225235:exon_96259978_96260084:TBC1D12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 17 15 32 7.65685963663339 8.24394737944113 -0.587087742807743 A:C A C 10 0.549596491962742 0.860479439434155 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 96333803 T/C 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C T C 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000119969:ENST00000441434:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96333717_96333863:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000466552:exon_96333717_96334205:HELLS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 97990583 A/G 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 98917637 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000187122:ENST00000266058:exon_98917575_98917646:SLIT1;ENSG00000187122:ENST00000371057:exon_98917575_98917646:SLIT1;ENSG00000187122:ENST00000371070:exon_98917575_98917646:SLIT1;ENSG00000187122:ENST00000314867:exon_98917575_98917646:SLIT1;ENSG00000187122:ENST00000371041:exon_98917575_98917646:SLIT1;ENSG00000187122:ENST00000475285:exon_98917575_98917646:SLIT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 100202987 A/G 1 13 12 25 5.85524560448435 6.5951579035529 -0.73991229906855 A:G A G 10 0.549596491962742 0.841759974130936 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000498219:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000465957:exon_100202881_100202997:HPS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 102249037 G/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 C:G G C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000075826:ENST00000370345:exon_102249009_102249155:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000485800:exon_102248615_102249063:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000492667:exon_102248615_102250313:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000479697:exon_102249009_102249155:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000462434:exon_102249009_102249155:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000482456:exon_102249009_102249155:SEC31B;ENSG00000075826:ENST00000468279:exon_102248825_102249155:SEC31B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 103339142 G/A 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 A:G G A 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103338639_103339310:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000339310:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370168:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000463515:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103338639_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000436284:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370158:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000456836:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000416979:exon_103338641_103339574:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103338641_103339574:POLL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 103344589 T/G 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166169:ENST00000299206:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370174:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370169:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370172:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370162:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370164:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000370157:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000426919:exon_103344359_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000454524:exon_103344368_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000413344:exon_103344444_103344676:POLL;ENSG00000166169:ENST00000461587:exon_103344551_103344676:POLL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 103921652 A/G 1 35 27 62 15.764122781304 14.839105282994 0.925017498309998 A:G A G 10 0.549596491962742 0.898624100868904 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000477977:exon_103921590_103921682:NOLC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 104164488 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000059915:ENST00000479172:exon_104164402_104164812:PSD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 104417130 G/C 1 12 7 19 5.4048420964471 3.84717544373919 1.5576666527079 C:G G C 10 0.549596491962742 0.500715990574539 ENSG00000171206:ENST00000302424:exon_104416504_104418074:TRIM8;ENSG00000171206:ENST00000369896:exon_104416504_104418164:TRIM8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 49 49 98 22.0697718938256 26.9302281061744 -4.86045621234872 A:C C A 10 0.549596491962742 0.361064630005259 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 106027059 G/A 1 156 161 317 70.2629472538123 88.4850352060015 -18.2220879521892 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0420977353428708 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 112266771 C/T 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 112269899 C/T 1 9 9 18 4.05363157233532 4.94636842766468 -0.892736855329355 T:C C T 10 0.549596491962742 0.813657851201133 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112269778_112271302:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112269778_112270195:DUSP5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 112349422 T/C 1 59 81 140 26.5738069741982 44.5173158489821 -17.9435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00282642893707036 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 115894782 T/G 1 11 16 27 4.95443858840984 8.79354387140387 -3.83910528299403 T:G T G 10 0.549596491962742 0.175288770605262 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115894672_115894814:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000428953:exon_115894672_115894814:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115894672_115894814:C10orf118 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 115910928 G/T 1 22 15 37 9.90887717681968 8.24394737944113 1.66492979737855 T:G G T 10 0.549596491962742 0.62346255526554 ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 120631872 G/A 0 41 0 41 18.4665438295276 0 18.4665438295276 G G 10 0.549596491962742 2.99513369837561e-11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 121591061 C/A 1 19 13 32 8.5576666527079 7.14475439551565 1.41291225719226 A:C C A 10 0.549596491962742 0.723272122776592 ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121588972_121591112:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121590709_121591112:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121590713_121591112:C10orf119 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 124 113 237 55.85003499662 62.1044035917898 -6.25436859516984 T:C T C 10 0.549596491962742 0.433645818293112 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 97 91 188 43.689140279614 50.0132807686095 -6.32414048899549 C:G G C 10 0.549596491962742 0.379253817833947 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 45 35 80 20.2681578616766 19.235877218696 1.03228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.910630231520974 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:C T C 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129901783 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C T C 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C T C 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129903592 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129906201 T/C 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C T C 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C C T 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129906903 C/T 1 19 24 43 8.5576666527079 13.1903158071058 -4.6326491543979 T:C C T 10 0.549596491962742 0.169465925473923 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 20 22 42 9.00807016074516 12.0911228231803 -3.08305266243516 C:G G C 10 0.549596491962742 0.355608922160138 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:T A T 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 18 22 40 8.10726314467064 12.0911228231803 -3.98385967850968 C:G G C 10 0.549596491962742 0.208594269325914 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 135126389 G/A 1 32 45 77 14.4129122571923 24.7318421383234 -10.3189298811311 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0215329045158141 ENSG00000198546:ENST00000361518:exon_135126292_135126662:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000359035:exon_135125220_135126666:ZNF511;ENSG00000198546:ENST00000463816:exon_135126292_135126624:ZNF511 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 40 43 83 18.0161403214903 23.6326491543979 -5.61650883290758 C:G C G 10 0.549596491962742 0.226187870134823 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 60 116 176 27.0242104822355 63.7531930676781 -36.7289825854426 A:G A G 10 0.549596491962742 3.19852940574956e-08 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 50 55 105 22.5201754018629 30.2278070579508 -7.70763165608791 C:G G C 10 0.549596491962742 0.141473296140734 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 18 10 28 8.10726314467064 5.49596491962742 2.61129822504323 T:C C T 10 0.549596491962742 0.348659115736329 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 581587 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_581492_581606:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_581492_581606:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_581492_581606:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_581492_581606:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_581492_581597:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_581492_582081:PHRF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 609451 C/T 1 11 3 14 4.95443858840984 1.64878947588823 3.30564911252161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.105743893058636 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 44 42 86 19.8177543536394 23.0830526624352 -3.26529830879581 T:C T C 10 0.549596491962742 0.516145830842379 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 42 37 79 18.9169473375648 20.3350702026215 -1.41812286505661 T:G T G 10 0.549596491962742 0.821274913381792 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 1307253 C/T 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000078902:ENST00000317204:exon_1307232_1307322:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000527886:exon_1307232_1307322:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000525159:exon_1307232_1307322:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000263646:exon_1307232_1307322:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000382211:exon_1307232_1307322:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530506:exon_1307232_1307322:TOLLIP;ENSG00000078902:ENST00000530541:exon_1307232_1307322:TOLLIP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 1775350 C/T 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000250644:ENST00000427721:exon_1775224_1775368:RP11-295K3.1;ENSG00000117984:ENST00000236671:exon_1775224_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000407742:exon_1775224_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000433655:exon_1775224_1775361:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000429746:exon_1775224_1775485:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000497544:exon_1775035_1775368:CTSD;ENSG00000117984:ENST00000438213:exon_1775254_1775368:CTSD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 1977651 C/A 1 208 216 424 93.6839296717497 118.712842263952 -25.0289125922026 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0166790947349062 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 2424541 C/G 1 41 39 80 18.4665438295276 21.4342631865469 -2.96771935701936 C:G C G 10 0.549596491962742 0.503027126333134 ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 3040489 C/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:C C A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000465240:exon_3040420_3040497:CARS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 3381057 C/G 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 C:G C G 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 5289670 A/G 1 33 21 54 14.8633157652295 11.5415263312176 3.32178943401193 A:G A G 10 0.549596491962742 0.412949486799938 ENSG00000213931:ENST00000380237:exon_5289582_5289827:HBE1;ENSG00000213931:ENST00000292896:exon_5289584_5289827:HBE1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 5289708 C/T 1 27 18 45 12.160894717006 9.89273685532936 2.26815786167661 T:C C T 10 0.549596491962742 0.550830308098605 ENSG00000213931:ENST00000380237:exon_5289582_5289827:HBE1;ENSG00000213931:ENST00000292896:exon_5289584_5289827:HBE1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 22 19 41 9.90887717681968 10.4423333472921 -0.533456170472419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.87656562238893 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 30 18 48 13.5121052411177 9.89273685532936 3.61936838578839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.31335417999186 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 55 58 113 24.7721929420492 31.876596533839 -7.10440359178984 C:G G C 10 0.549596491962742 0.186503468392006 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6340525 A/T 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:T A T 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6630833 G/A 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166333:ENST00000530016:exon_6630743_6630872:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630743_6630870:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 7 12 19 3.15282455626081 6.5951579035529 -3.4423333472921 T:C C T 10 0.549596491962742 0.164901500128328 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 186 200 386 83.77505249493 109.919298392548 -26.1442458976184 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00779324336322352 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 157 128 285 70.7133507618495 70.348350971231 0.36499979061854 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 81 53 134 36.4826841510179 29.1286140740253 7.35407007699257 A:T A T 10 0.549596491962742 0.224265216101503 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 7689029 A/C 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 A:C A C 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7688774_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689003_7689044:CYB5R2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 8435077 C/T 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 8435078 A/C 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:C A C 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 8486310 C/A 1 11 10 21 4.95443858840984 5.49596491962742 -0.541526331217581 A:C C A 10 0.549596491962742 0.829710755643621 ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 10540670 A/C 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:C A C 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000110315:ENST00000265981:exon_10540581_10540688:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000528665:exon_10539865_10540688:RNF141;ENSG00000110315:ENST00000533412:exon_10540581_10540688:RNF141 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 10800287 G/T 1 10 13 23 4.50403508037258 7.14475439551565 -2.64071931514307 T:G G T 10 0.549596491962742 0.29908199719629 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 11292751 C/T 1 1 10 11 0.450403508037258 5.49596491962742 -5.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00361375286160243 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 11314538 C/T 1 4 23 27 1.80161403214903 12.6407193151431 -10.839105282994 T:C C T 10 0.549596491962742 2.20905865426007e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 11314565 G/A 1 35 7 42 15.764122781304 3.84717544373919 11.9169473375648 A:G G A 10 0.549596491962742 0.000144544868157106 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 11314675 A/G 1 21 6 27 9.45847366878242 3.29757895177645 6.16089471700597 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0193632969814490 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11314576_11314740:GALNTL4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 11314678 A/G 1 21 6 27 9.45847366878242 3.29757895177645 6.16089471700597 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0193632969814490 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11314576_11314740:GALNTL4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 13729439 T/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:T T A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 18103014 T/C 1 22 17 39 9.90887717681968 9.34314036336661 0.565736813453064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.873917475373453 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530436:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530237:exon_18102958_18103284:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18102958_18103050:SAAL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 20112373 A/G 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 20112417 A/C 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:C A C 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000166833:ENST00000360655:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000396085:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000349880:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000396087:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000527559:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000533917:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000311043:exon_20112411_20112564:NAV2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 20112492 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000166833:ENST00000360655:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000396085:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000349880:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000396087:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000527559:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000533917:exon_20112411_20112564:NAV2;ENSG00000166833:ENST00000311043:exon_20112411_20112564:NAV2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 T:C:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 28 20 48 12.6112982250432 10.9919298392548 1.61936838578839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.666275844165524 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 27384585 G/A 1 10 20 30 4.50403508037258 10.9919298392548 -6.48789475888226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0259633071176900 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 32610101 G/A 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.302378834939156 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 35198244 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526025:exon_35198122_35198684:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000425428:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000278386:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35198122_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35198118_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35198118_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35198121_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35198175_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35198188_35198287:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35198209_35198287:CD44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 35201842 C/T 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528086:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526669:exon_35201821_35201876:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35201821_35201954:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35201826_35201954:CD44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 35211434 G/A 1 14 14 28 6.30564911252161 7.69435088747839 -1.38870177495678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.704872349520973 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000425428:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35211382_35211976:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525209:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525685:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525688:exon_35211429_35211612:CD44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 35685211 T/C 1 20 28 48 9.00807016074516 15.3887017749568 -6.38063161421161 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0808176578763303 ENSG00000166326:ENST00000299413:exon_35684353_35685328:TRIM44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 43413028 A/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:C A C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000052841:ENST00000039989:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000299240:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000534347:exon_43413015_43413126:TTC17;ENSG00000052841:ENST00000530469:exon_43413015_43413338:TTC17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 43940644 G/T 1 14 13 27 6.30564911252161 7.14475439551565 -0.839105282994034 T:G G T 10 0.549596491962742 0.847234013573527 ENSG00000166199:ENST00000532962:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530803:exon_43940592_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532410:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000532129:exon_43940588_43940686:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529434:exon_43940354_43940686:ALKBH3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 30 41 71 13.5121052411177 22.5334561704724 -9.02135092935468 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0418283454234488 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 47264386 C/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C C T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000134575:ENST00000256997:exon_47264274_47264449:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000529444:exon_47264274_47264449:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000534448:exon_47264274_47264449:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000527256:exon_47264274_47264449:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000531004:exon_47264274_47264449:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000533929:exon_47264274_47264449:ACP2;ENSG00000134575:ENST00000525230:exon_47264274_47264449:ACP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 57077464 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 57175272 A/G 1 14 6 20 6.30564911252161 3.29757895177645 3.00807016074516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.260718294227868 ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57175053_57175352:RP11-872D17.8;ENSG00000134802:ENST00000525651:exon_57174427_57176222:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57174427_57175369:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57174429_57175369:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57174429_57175369:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57174429_57175369:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57174879_57175369:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525205:exon_57175004_57175369:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57175243_57175369:SLC43A3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 57428875 C/T 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000172409:ENST00000529430:exon_57428237_57429321:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000533682:exon_57428237_57429340:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000525602:exon_57428237_57428908:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000302731:exon_57428237_57429336:CLP1;ENSG00000172409:ENST00000438099:exon_57428237_57429334:CLP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 57563991 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000198561:ENST00000524630:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529919:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399039:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361796:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000360682:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529526:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000426142:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000399050:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361391:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000361332:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532463:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529986:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000358694:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532787:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532649:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528621:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530748:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000428599:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000528232:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000529873:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532844:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526357:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530094:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000415361:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000532245:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534579:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000526938:exon_57563929_57564464:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000530068:exon_57563929_57564056:CTNND1;ENSG00000198561:ENST00000534647:exon_57563929_57564464:CTNND1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 61135435 A/G 1 8 17 25 3.60322806429806 9.34314036336661 -5.73991229906855 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0260405038180599 ENSG00000149483:ENST00000278826:exon_61135395_61135470:TMEM138;ENSG00000149483:ENST00000451389:exon_61135395_61135628:TMEM138 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 61912677 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61912641_61912761:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61912641_61912761:INCENP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 42 33 75 18.9169473375648 18.1366842347705 0.780263102794354 A:C A C 10 0.549596491962742 0.907895634051535 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 10 3 13 4.50403508037258 1.64878947588823 2.85524560448435 A:G A G 10 0.549596491962742 0.162687516850499 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 T:C C T 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62290719 A/G 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62296535 T/C 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 T T 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62296601 T/C 0 9 1 10 4.05363157233532 0.549596491962742 3.50403508037258 T:G T G 10 0.549596491962742 0.0276565464848778 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62297447 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62299945 A/C 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62296097_62301147:AHNAK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62361478 G/T 1 122 105 227 54.9492279805455 57.7076316560879 -2.75840367554243 T:G G T 10 0.549596491962742 0.7389147863646 ENSG00000149480:ENST00000278823:exon_62360686_62361512:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000524902:exon_62360687_62361512:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000527204:exon_62361314_62361512:MTA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 62439194 G/A 1 12 3 15 5.4048420964471 1.64878947588823 3.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0677975361334678 ENSG00000162194:ENST00000354588:exon_62439036_62439241:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000431002:exon_62437113_62439237:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000415855:exon_62439036_62439206:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000524759:exon_62439036_62439237:C11orf48;ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62438756_62439337:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439126_62439337:C11orf83 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 63742174 C/T 1 131 109 240 59.0028595528808 59.9060176239389 -0.903158071058073 T:C C T 10 0.549596491962742 0.948296007335107 ENSG00000176340:ENST00000314133:exon_63742079_63742266:COX8A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 64085785 A/G 1 86 106 192 38.7347016912042 58.2572281480507 -19.5225264568465 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00570921668937627 ENSG00000126432:ENST00000347941:exon_64085569_64085858:PRDX5;ENSG00000126432:ENST00000265462:exon_64085569_64085858:PRDX5;ENSG00000126432:ENST00000352435:exon_64085569_64085858:PRDX5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 64121190 C/G 1 82 49 131 36.9330876590552 26.9302281061744 10.0028595528808 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0798083294543374 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64121187_64121285:CCDC88B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 64627840 G/A 1 17 13 30 7.65685963663339 7.14475439551565 0.512105241117741 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 64854215 G/A 1 4 10 14 1.80161403214903 5.49596491962742 -3.69435088747839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0597828211497275 ENSG00000162300:ENST00000531761:exon_64854192_64854256:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000453524:exon_64854192_64854261:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000294258:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000526334:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000526945:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000532200:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530488:exon_64854178_64854261:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000530744:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000162300:ENST00000528123:exon_64854192_64854264:ZFPL1;ENSG00000187066:ENST00000528029:exon_64852451_64856579:AP003068.6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65266606 T/C 1 4167 3732 7899 1876.83141799125 2051.09410800495 -174.262690013699 A:T:C:G T C 10 0.549596491962742 8.30688333829478e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65271840 T/C 1 873 1066 1939 393.202262516526 585.869860432283 -192.667597915757 A:T:C:G T C 10 0.549596491962742 2.19509184376097e-18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65271949 A/G 1 1014 1214 2228 456.70915714978 667.210141242769 -210.500984092989 A:T:G A G 10 0.549596491962742 4.43832956851326e-19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65273866 T/C 1 670 844 1514 301.770350384963 463.859439216554 -162.089088831591 A:T:C T C 10 0.549596491962742 8.62543150847542e-17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65350458 C/T 1 27 16 43 12.160894717006 8.79354387140387 3.3673508456021 T:C C T 10 0.549596491962742 0.358593288016445 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65350632 G/A 1 12 17 29 5.4048420964471 9.34314036336661 -3.93829826691952 A:G G A 10 0.549596491962742 0.190564593482603 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65367046 C/A 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000532507:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000530153:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524848:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000534432:exon_65366922_65367239:MAP3K11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65418048 G/A 1 62 57 119 27.92501749831 31.3270000418763 -3.40198254356629 A:C:G G A 10 0.549596491962742 0.580632380995849 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65418040_65418401:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65418040_65418351:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65418040_65418389:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65418040_65418391:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000529725:exon_65418040_65418058:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000528699:exon_65418040_65418389:SIPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65487729 G/A 1 109 105 214 49.0939823760611 57.7076316560879 -8.61364928002678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.243363660028645 ENSG00000172922:ENST00000534482:exon_65487713_65487954:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000308418:exon_65487713_65487888:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000533698:exon_65487713_65487939:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000531596:exon_65487713_65487888:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000528220:exon_65487713_65488289:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000527610:exon_65487713_65487888:RNASEH2C;ENSG00000172922:ENST00000530192:exon_65487525_65487888:RNASEH2C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65635401 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000172638:ENST00000531972:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526628:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526911:exon_65635332_65635478:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531645:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528176:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000307998:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528409:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000530806:exon_65635332_65635484:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000525392:exon_65635144_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000532084:exon_65635357_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531005:exon_65635361_65635527:EFEMP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 65688377 C/G 1 110 116 226 49.5443858840984 63.7531930676781 -14.2088071835797 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0612018212387619 ENSG00000175550:ENST00000312515:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000525501:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000376991:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000531121:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000527119:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000532933:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000530791:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000534333:exon_65688355_65688443:DRAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 26 4 30 11.7104912089687 2.19838596785097 9.51210524111774 A:G G A 10 0.549596491962742 0.000335001292137477 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67068859 T/C 1 7 14 21 3.15282455626081 7.69435088747839 -4.54152633121758 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0506818319798257 ENSG00000172932:ENST00000447274:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000511455:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000308440:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000514166:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000512231:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000513750:exon_67068753_67068869:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000507915:exon_67068753_67069294:ANKRD13D;ENSG00000172932:ENST00000515828:exon_67068753_67068869:ANKRD13D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67160285 C/T 1 7 16 23 3.15282455626081 8.79354387140387 -5.64071931514307 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0208917723260816 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67166316 G/A 1 73 32 105 32.8794560867198 17.5870877428077 15.2923683439121 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00307497519514860 ENSG00000172531:ENST00000312989:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000451458:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532446:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000526510:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000376745:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000358239:exon_67166193_67166327:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000532279:exon_67166193_67166634:PPP1CA;ENSG00000172531:ENST00000527663:exon_67166211_67166327:PPP1CA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67201902 G/A 1 29 14 43 13.0617017330805 7.69435088747839 5.3673508456021 A:G G A 10 0.549596491962742 0.124733359257967 ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67201848_67201955:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67201848_67201955:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67201848_67201955:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67201848_67201955:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67201848_67201955:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000531765:exon_67201848_67202425:RPS6KB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67353896 C/T 1 1138 1150 2288 512.5591921464 632.035965757153 -119.476773610754 A:T:C:G C T 10 0.549596491962742 5.61355918576858e-07 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000495996:exon_67353860_67353910:GSTP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67377890 C/G 1 35 26 61 15.764122781304 14.2895087910313 1.47461399027274 C:G C G 10 0.549596491962742 0.797199072707292 ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532244:exon_67377852_67378053:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532343:exon_67377852_67377931:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533075:exon_67377852_67377897:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529867:exon_67377852_67377912:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000530638:exon_67377852_67377891:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67377852_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67377864_67378041:NDUFV1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67379016 T/C 1 117 129 246 52.6972104403592 70.8979474631937 -18.2007370228345 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0210028121662943 ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000453836:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67378993_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67378948_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000527355:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67395646 C/T 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 67814863 G/T 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 G G 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 68029887 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 70279759 G/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 70279766 C/T 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C C T 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 70281282 C/T 1 12 46 58 5.4048420964471 25.2814386302861 -19.876596533839 T:C C T 10 0.549596491962742 1.73281289664718e-07 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70281132_70282690:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70281132_70282681:CTTN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 71208651 G/A 1 26 34 60 11.7104912089687 18.6862807267332 -6.97578951776452 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0908216792851887 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71208529_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530831:exon_71207481_71208657:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525593:exon_71208551_71208657:NADSYN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 71724733 C/T 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 71727221 C/T 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 73120653 A/G 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 73611478 C/G 0 0 8 8 0 4.39677193570194 -4.39677193570194 G C G 10 0.549596491962742 0.00169361275347944 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 73689104 G/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73688931_73689141:UCP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 75694454 G/A 1 26 5 31 11.7104912089687 2.74798245981371 8.962508749155 A:G G A 10 0.549596491962742 0.000945032469732634 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000530501:exon_75694431_75694868:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75694431_75694557:UVRAG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 75694509 C/T 1 28 8 36 12.6112982250432 4.39677193570194 8.21452628934129 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00664023523048376 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000530501:exon_75694431_75694868:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75694431_75694557:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75694431_75694557:UVRAG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 75715049 G/A 1 16 10 26 7.20645612859613 5.49596491962742 1.71049120896871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.558546355759659 ENSG00000198382:ENST00000356136:exon_75715049_75715133:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000528420:exon_75715049_75715133:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000533454:exon_75715049_75715133:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000531818:exon_75715049_75715133:UVRAG;ENSG00000198382:ENST00000532130:exon_75715049_75715133:UVRAG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 93212161 A/G 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:G A G 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 93212254 C/T 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 93470336 A/G 1 53 75 128 23.8713859259747 41.2197368972056 -17.348350971231 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00241742073176704 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000526015:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000393259:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527169:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527068:exon_93469860_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000448108:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000534770:exon_93470255_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000532235:exon_93470322_93470405:TAF1D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 94192661 C/T 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C C T 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000020922:ENST00000323977:exon_94192574_94192747:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000323929:exon_94192574_94192747:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000393241:exon_94192574_94192747:MRE11A;ENSG00000020922:ENST00000407439:exon_94192574_94192747:MRE11A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 95562327 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 95564259 A/G 1 11 21 32 4.95443858840984 11.5415263312176 -6.58708774280774 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0210955529583173 ENSG00000166037:ENST00000325486:exon_95564190_95565854:CEP57;ENSG00000166037:ENST00000325542:exon_95564190_95565854:CEP57 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 102239234 A/G 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G A G 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000534130:exon_102239037_102239279:BIRC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 102239238 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000534130:exon_102239037_102239279:BIRC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 104825597 C/T 1 5 14 19 2.25201754018629 7.69435088747839 -5.4423333472921 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0186777927386798 ENSG00000196954:ENST00000444739:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000393150:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000421898:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000533730:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000529183:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000524843:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531333:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000417440:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000531546:exon_104825474_104825728:CASP4;ENSG00000196954:ENST00000416586:exon_104825474_104825728:CASP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 3 14 17 1.35121052411177 7.69435088747839 -6.34314036336661 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00245448828808125 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 105967644 G/A 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 A:T:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000149313:ENST00000278618:exon_105967470_105969437:AASDHPPT;ENSG00000149313:ENST00000525660:exon_105967470_105968025:AASDHPPT;ENSG00000149313:ENST00000534152:exon_105967470_105969426:AASDHPPT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 108029684 C/T 1 13 4 17 5.85524560448435 2.19838596785097 3.65685963663339 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0895144911712826 ENSG00000149308:ENST00000278612:exon_108027942_108029746:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000416540:exon_108028121_108029746:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530926:exon_108029365_108029746:NPAT;ENSG00000149308:ENST00000530859:exon_108029520_108029746:NPAT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 110118364 A/C 1 12 16 28 5.4048420964471 8.79354387140387 -3.38870177495678 A:C A C 10 0.549596491962742 0.254286596348908 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 114320685 G/A 1 30 27 57 13.5121052411177 14.839105282994 -1.32700004187629 A:G G A 10 0.549596491962742 0.790454676388292 ENSG00000076043:ENST00000265881:exon_114320568_114320998:REXO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 117691386 G/A 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000137731:ENST00000532119:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000528014:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000292079:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000260287:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000534383:exon_117691381_117691411:FXYD2;ENSG00000137731:ENST00000533281:exon_117691275_117691411:FXYD2;ENSG00000254844:ENST00000531850:exon_117691176_117691436:RP11-728F11.3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 118926256 G/A 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118926205_118926555:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532752:exon_118926205_118926283:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526354:exon_118926201_118926555:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527310:exon_118926201_118926283:HYOU1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 121495870 A/G 1 10 11 21 4.50403508037258 6.04556141159016 -1.54152633121758 A:G A G 10 0.549596491962742 0.518388705412663 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121495794_121495986:SORL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 121495970 C/T 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121495794_121495986:SORL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 170 176 346 76.5685963663339 96.7289825854426 -20.1603862191087 T:C:G T G 10 0.549596491962742 0.0306708006124305 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 126174164 C/T 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 11 126215298 C/T 1 34 19 53 15.3137192732668 10.4423333472921 4.87138592597468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.214095416805133 ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126215242_126215644:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000530860:exon_126215242_126215644:DCPS;ENSG00000110063:ENST00000529149:exon_126215242_126215611:DCPS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 406292 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_406207_406366:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_406207_406366:KDM5A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 427575 A/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_427272_427627:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_427272_427627:KDM5A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 2968748 A/G 1 17 37 54 7.65685963663339 20.3350702026215 -12.6782105659881 A:G A G 10 0.549596491962742 0.000561079731503355 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 4722717 A/T 1 29 37 66 13.0617017330805 20.3350702026215 -7.27336846954097 A:T A T 10 0.549596491962742 0.0829870445836847 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4722678_4723030:DYRK4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 6643991 C/G 1 169 161 330 76.1181928582966 88.4850352060015 -12.3668423477048 C:G C G 10 0.549596491962742 0.184219856609159 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000496049:exon_6643976_6644307:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6643982_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6643976_6644157:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6643976_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6643920_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6643958_6644027:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6643985_6644027:GAPDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 991 633 1624 446.349876464923 347.894579412416 98.455297052507 T:C T C 10 0.549596491962742 8.7261359608674e-07 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 2853 1875 4728 1285.0012084303 1030.49342243014 254.507786000156 T:C:G T C 10 0.549596491962742 8.58547377721767e-14 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 7045568 A/G 1 8 1 9 3.60322806429806 0.549596491962742 3.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0474590365992993 ENSG00000111676:ENST00000356654:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000396684:exon_7044710_7046724:ATN1;ENSG00000111676:ENST00000229279:exon_7045545_7045622:ATN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 7069126 C/T 1 73 59 132 32.8794560867198 32.4261930258018 0.453263060918061 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000111679:ENST00000399448:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000416215:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000447931:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000318974:exon_7069090_7069157:PTPN6;ENSG00000111679:ENST00000456013:exon_7069090_7069157:PTPN6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 9094993 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 9875347 C/A 1 55 63 118 24.7721929420492 34.6245789936527 -9.85238605160355 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0784467119257433 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9875094_9875409:CLECL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 9885578 G/A 1 98 56 154 44.1395437876513 30.7774035499136 13.3621402377377 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0349284186743748 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9885545_9885860:CLECL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 10853951 G/C 1 59 50 109 26.5738069741982 27.4798245981371 -0.906017623938876 C:G G C 10 0.549596491962742 0.923375294502468 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10853853_10853952:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10853853_10853952:CSDA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 10854625 G/A 1 25 14 39 11.2600877009315 7.69435088747839 3.56573681345306 A:G G A 10 0.549596491962742 0.264965577534127 ENSG00000060138:ENST00000228251:exon_10854559_10854733:CSDA;ENSG00000060138:ENST00000279550:exon_10854559_10854733:CSDA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 10999708 T/C 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 T:C T C 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000111215:ENST00000228811:exon_10999644_10999966:PRR4;ENSG00000111215:ENST00000431566:exon_10999640_10999909:PRR4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 131 165 296 59.0028595528808 90.6834211738524 -31.6805616209716 C:G C G 10 0.549596491962742 0.000226886967228406 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 21795046 C/T 1 59 37 96 26.5738069741982 20.3350702026215 6.23873677157677 T:C C T 10 0.549596491962742 0.218963865724469 ENSG00000111716:ENST00000350669:exon_21794886_21795059:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396076:exon_21794886_21795059:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000470985:exon_21794886_21795059:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396075:exon_21794886_21795059:LDHB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 25261655 C/G 1 14 7 21 6.30564911252161 3.84717544373919 2.45847366878242 C:G C G 10 0.549596491962742 0.381147637342633 ENSG00000118307:ENST00000320267:exon_25261354_25261757:CASC1;ENSG00000118307:ENST00000395990:exon_25261354_25261757:CASC1;ENSG00000118307:ENST00000395987:exon_25261354_25261757:CASC1;ENSG00000118307:ENST00000354189:exon_25261354_25261695:CASC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 26383959 G/A 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000123096:ENST00000422622:exon_26383644_26387706:SSPN;ENSG00000123096:ENST00000441067:exon_26383644_26387706:SSPN;ENSG00000123096:ENST00000242729:exon_26383644_26385867:SSPN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 27066530 T/A 1 29 26 55 13.0617017330805 14.2895087910313 -1.22780705795081 A:T T A 10 0.549596491962742 0.78704301221345 ENSG00000064102:ENST00000261191:exon_27066390_27066620:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000335745:exon_27066390_27066620:C12orf11;ENSG00000064102:ENST00000261190:exon_27066479_27066620:C12orf11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 27450647 C/T 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000211455:ENST00000389032:exon_27450643_27450787:STK38L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 27461292 A/G 1 12 16 28 5.4048420964471 8.79354387140387 -3.38870177495678 A:C:G A G 10 0.549596491962742 0.254286596348908 ENSG00000211455:ENST00000389032:exon_27461272_27461394:STK38L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 27543141 G/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 C:G G C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000029153:ENST00000261178:exon_27543029_27543172:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000266503:exon_27543029_27543172:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000311001:exon_27543029_27543172:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000457040:exon_27543029_27543172:ARNTL2;ENSG00000029153:ENST00000395901:exon_27543029_27543172:ARNTL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 27867706 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 27867714 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000061794:ENST00000081029:exon_27867713_27867753:MRPS35;ENSG00000061794:ENST00000321446:exon_27867713_27867753:MRPS35 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 32854366 A/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:C A C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32854349_32854496:DNM1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 32860302 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32860301_32860347:DNM1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 23 24 47 10.3592806848569 13.1903158071058 -2.83103512224887 C:G G C 10 0.549596491962742 0.46426203681765 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 23 24 47 10.3592806848569 13.1903158071058 -2.83103512224887 A:T:G A T 10 0.549596491962742 0.46426203681765 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 40626185 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000188906:ENST00000416796:exon_40626076_40626185:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000343742:exon_40626076_40626185:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000457959:exon_40626076_40626185:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40626076_40626185:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000474202:exon_40626076_40626585:LRRK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 40716015 C/T 1 29 13 42 13.0617017330805 7.14475439551565 5.91694733756484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0869165196713847 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 40716260 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40716121_40716312:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40716121_40716312:LRRK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 36 28 64 16.2145262893413 15.3887017749568 0.825824514384514 A:G A G 10 0.549596491962742 0.900313828567159 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 48174275 C/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000211584:ENST00000442218:exon_48173928_48176536:SLC48A1;ENSG00000211584:ENST00000390229:exon_48173928_48175452:SLC48A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 49415623 G/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000167548:ENST00000526209:exon_49415361_49415655:MLL2;ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49415563_49415655:MLL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 49437753 G/A 1 4 12 16 1.80161403214903 6.5951579035529 -4.79354387140387 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0216259683807766 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49437651_49437781:MLL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 49446040 C/T 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49444669_49446207:MLL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 49717533 A/C 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000135451:ENST00000257909:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000456139:exon_49717387_49717535:TROAP;ENSG00000135451:ENST00000380327:exon_49717387_49717535:TROAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 49952668 G/A 1 18 12 30 8.10726314467064 6.5951579035529 1.51210524111774 A:G G A 10 0.549596491962742 0.714338307739437 ENSG00000187778:ENST00000343810:exon_49952626_49952753:MCRS1;ENSG00000187778:ENST00000357123:exon_49952626_49952753:MCRS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 50869480 G/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000161813:ENST00000429001:exon_50869309_50873779:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398464:exon_50869309_50873779:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398473:exon_50869309_50873787:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000293618:exon_50869309_50873787:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518444:exon_50869309_50870246:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000441650:exon_50869309_50869716:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000520064:exon_50869309_50870239:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000347328:exon_50869309_50871280:LARP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 53421875 C/T 1 14 12 26 6.30564911252161 6.5951579035529 -0.289508791031292 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000063046:ENST00000416762:exon_53421799_53421972:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000430205:exon_53421799_53421972:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000262056:exon_53421799_53421972:EIF4B;ENSG00000063046:ENST00000438209:exon_53421799_53421972:EIF4B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 53647764 G/A 1 23 12 35 10.3592806848569 6.5951579035529 3.76412278130403 A:G G A 10 0.549596491962742 0.235793374913487 ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 53701317 C/T 1 57 47 104 25.6729999581237 25.8310351222489 -0.158035164125163 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53701241_53701497:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53701241_53701497:AAAS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 53701399 A/G 1 35 34 69 15.764122781304 18.6862807267332 -2.92215794542919 A:C:G A G 10 0.549596491962742 0.545548222758589 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53701241_53701497:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53701241_53701497:AAAS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 53703021 G/A 1 10 6 16 4.50403508037258 3.29757895177645 1.20645612859613 A:G G A 10 0.549596491962742 0.621751293599469 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53702941_53703065:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53702941_53703065:AAAS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 54744342 A/G 1 101 60 161 45.4907543117631 32.9757895177645 12.5149647939985 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0479724656169874 ENSG00000111481:ENST00000262061:exon_54744260_54745633:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000416254:exon_54744260_54744653:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000455864:exon_54744260_54744653:COPZ1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 55354987 T/G 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 56119291 C/G 1 462 578 1040 208.086420713213 317.666772354465 -109.580351641252 T:C:G C G 10 0.549596491962742 1.14638117541780e-11 ENSG00000135404:ENST00000257857:exon_56119233_56119410:CD63;ENSG00000135404:ENST00000420846:exon_56119233_56119410:CD63 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 56742997 T/C 1 12 6 18 5.4048420964471 3.29757895177645 2.10726314467064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.353463040154643 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56742947_56743045:STAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 56995362 G/A 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 A:G G A 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000076108:ENST00000379441:exon_56995330_56995976:BAZ2A;ENSG00000076108:ENST00000179765:exon_56995330_56995976:BAZ2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 57627074 G/T 1 8 14 22 3.60322806429806 7.69435088747839 -4.09112282318032 T:G G T 10 0.549596491962742 0.088997380247825 ENSG00000182199:ENST00000449049:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000393827:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000328923:exon_57626963_57627128:SHMT2;ENSG00000182199:ENST00000414700:exon_57626963_57627128:SHMT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 57868243 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000430041:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57868206_57868259:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57868206_57868259:ARHGAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 57928196 G/C 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000175203:ENST00000434715:exon_57928075_57928235:DCTN2;ENSG00000175203:ENST00000354743:exon_57928075_57928235:DCTN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 66 60 126 29.726631530459 32.9757895177645 -3.24915798730549 A:G A G 10 0.549596491962742 0.591566883300567 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 69233215 A/G 1 21 21 42 9.45847366878242 11.5415263312176 -2.08305266243516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.538263193833363 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69233054_69233629:MDM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 69652789 A/G 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:G A G 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69652370_69652874:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69652370_69652874:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69652466_69652874:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000456847:exon_69652600_69652874:CPSF6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 72176401 C/T 1 14 6 20 6.30564911252161 3.29757895177645 3.00807016074516 T:C C T 10 0.549596491962742 0.260718294227868 ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72176350_72176438:RAB21 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 169 132 301 76.1181928582966 72.5467369390819 3.57145591921467 A:C:G G A 10 0.549596491962742 0.685646667924662 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 80190582 A/G 1 51 46 97 22.9705789099002 25.2814386302861 -2.31085972038597 A:G A G 10 0.549596491962742 0.683495374193414 ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 82750974 C/G 1 38 31 69 17.1153333054158 17.037491250845 0.0778420545708052 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000133773:ENST00000256151:exon_82750739_82751048:CCDC59 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 82792787 C/A 1 3 15 18 1.35121052411177 8.24394737944113 -6.89273685532936 A:C C A 10 0.549596491962742 0.00133828970713268 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 88505078 T/C 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88504979_88505128:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88504979_88505128:CEP290 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 88510918 T/C 1 12 16 28 5.4048420964471 8.79354387140387 -3.38870177495678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.254286596348908 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88510810_88510922:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88510810_88510922:CEP290 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 88512485 A/G 1 8 13 21 3.60322806429806 7.14475439551565 -3.54152633121758 A:G A G 10 0.549596491962742 0.129995035061013 ENSG00000198707:ENST00000309041:exon_88512420_88512520:CEP290;ENSG00000198707:ENST00000397838:exon_88512420_88512520:CEP290 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 90028901 T/C 1 31 26 57 13.962508749155 14.2895087910313 -0.327000041876293 T:C:G T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 94653394 C/T 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000136040:ENST00000258526:exon_94653386_94653510:PLXNC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 96688732 C/T 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.361534421226715 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 A:T T A 10 0.549596491962742 0.154181475313390 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 12 10 22 5.4048420964471 5.49596491962742 -0.0911228231803234 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 104851112 T/C 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 T:C T C 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 104851162 C/T 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 105385557 G/T 1 57 50 107 25.6729999581237 27.4798245981371 -1.80682464001339 T:G G T 10 0.549596491962742 0.770942498754801 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105385490_105385626:C12orf45 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 108954763 A/C 1 11 4 15 4.95443858840984 2.19838596785097 2.75605262055887 A:C A C 10 0.549596491962742 0.197162377924665 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 108954823 C/T 0 10 0 10 4.50403508037258 0 4.50403508037258 C C 10 0.549596491962742 0.00285800173360387 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 109527987 G/A 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000189046:ENST00000429722:exon_109527814_109528012:ALKBH2;ENSG00000189046:ENST00000435370:exon_109527814_109528012:ALKBH2;ENSG00000189046:ENST00000343075:exon_109527814_109528012:ALKBH2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 112087805 C/T 1 18 23 41 8.10726314467064 12.6407193151431 -4.53345617047242 T:C C T 10 0.549596491962742 0.161068726188539 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112087743_112087846:BRAP;ENSG00000089234:ENST00000419234:exon_112087743_112087846:BRAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 112103589 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112103443_112103591:BRAP;ENSG00000089234:ENST00000419234:exon_112103443_112103591:BRAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 112187148 G/T 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 T:G G T 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112186977_112187149:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112186977_112187149:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000504803:exon_112186977_112187573:ACAD10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 112194237 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112194137_112194898:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112194137_112194901:ACAD10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113348870 G/A 1 21 29 50 9.45847366878242 15.9382982669195 -6.4798245981371 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0870633057691694 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113348856_113349040:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113348856_113349040:OAS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113354430 G/A 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113354314_113354543:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113354314_113354543:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113354314_113354543:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113354314_113354543:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113354314_113354543:OAS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113355370 G/A 1 34 18 52 15.3137192732668 9.89273685532936 5.42098241793742 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.162922186115750 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113355352_113355505:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000445409:exon_113355352_113355505:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113355352_113355505:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000452357:exon_113355352_113355831:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000377508:exon_113355352_113355505:OAS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113357216 A/G 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000089127:ENST00000361629:exon_113357195_113357536:OAS1;ENSG00000089127:ENST00000202917:exon_113357194_113357711:OAS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113386779 C/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113386666_113387010:OAS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113405785 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000111331:ENST00000228928:exon_113405741_113405979:OAS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113534591 C/T 1 18 13 31 8.10726314467064 7.14475439551565 0.962508749154999 T:C C T 10 0.549596491962742 0.857203754998479 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 113534633 C/T 1 16 7 23 7.20645612859613 3.84717544373919 3.35928068485693 T:C C T 10 0.549596491962742 0.208776635462957 ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 114282474 G/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 117014099 A/G 0 12 0 12 5.4048420964471 0 5.4048420964471 A A 10 0.549596491962742 0.00082919751785996 ENSG00000171471:ENST00000306985:exon_117013647_117014425:MAP1LC3B2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 117290433 G/A 1 11 4 15 4.95443858840984 2.19838596785097 2.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.197162377924665 ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117290143_117291434:RNFT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 118465820 T/C 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000111445:ENST00000229043:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000454402:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000392542:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000449641:exon_118465758_118465835:RFC5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 118473054 T/C 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:C T C 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 121840634 T/C 1 19 17 36 8.5576666527079 9.34314036336661 -0.78547371065871 T:C T C 10 0.549596491962742 0.867474879117842 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 121854064 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000170633:ENST00000361234:exon_121853962_121854180:RNF34;ENSG00000170633:ENST00000392465:exon_121853962_121854180:RNF34;ENSG00000170633:ENST00000354795:exon_121853962_121854180:RNF34;ENSG00000170633:ENST00000392464:exon_121853962_121854180:RNF34 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 122353796 A/G 1 16 14 30 7.20645612859613 7.69435088747839 -0.487894758882259 A:G A G 10 0.549596491962742 0.856820327497214 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 123011433 C/G 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 C:G C G 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000111011:ENST00000331738:exon_123011395_123011546:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000354654:exon_123011395_123011546:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000344591:exon_123011395_123011546:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000532695:exon_123011395_123011547:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000433877:exon_123011395_123011547:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000418773:exon_123011395_123011547:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000526560:exon_123011395_123011496:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527461:exon_123011395_123011506:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527399:exon_123011395_123011542:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000525387:exon_123011395_123011501:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000528279:exon_123011395_123011487:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000527796:exon_123011395_123011534:RSRC2;ENSG00000111011:ENST00000525570:exon_123011395_123011496:RSRC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 123465877 C/T 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000182196:ENST00000392433:exon_123465364_123466426:ARL6IP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 123738464 C/T 1 38 49 87 17.1153333054158 26.9302281061744 -9.81489480075855 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0402125072103703 ENSG00000130921:ENST00000253233:exon_123738194_123738503:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000425637:exon_123738194_123739580:C12orf65;ENSG00000130921:ENST00000366329:exon_123738194_123738503:C12orf65 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 123799974 A/G 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123799920_123799991:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123799920_123799991:SBNO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 123801856 T/C 1 9 14 23 4.05363157233532 7.69435088747839 -3.64071931514307 T:C T C 10 0.549596491962742 0.144897374794713 ENSG00000139697:ENST00000420886:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000267176:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000434198:exon_123801768_123801903:SBNO1;ENSG00000139697:ENST00000442601:exon_123801768_123801903:SBNO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 129293376 G/A 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 132210063 T/C 1 14 6 20 6.30564911252161 3.29757895177645 3.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.260718294227868 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132209950_132210175:SFSWAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 132624258 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132624180_132624314:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132624180_132624314:DDX51 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 133306429 G/C 1 16 13 29 7.20645612859613 7.14475439551565 0.0617017330804828 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 133306780 A/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133306265_133306856:ANKLE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 12 133438215 C/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:C C A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133438053_133438220:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000432561:exon_133438053_133438220:CHFR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 20207945 C/T 1 45 52 97 20.2681578616766 28.5790175820626 -8.31085972038597 T:C C T 10 0.549596491962742 0.102284427304232 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20207821_20208101:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20207880_20208101:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20207880_20208101:MPHOSPH8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 25043130 T/A 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 T T 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 28009031 G/C 1 46 45 91 20.7185613697139 24.7318421383234 -4.01328076860952 C:G G C 10 0.549596491962742 0.401556320976379 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28008942_28009171:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28008794_28009171:GTF3A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 68 75 143 30.6274385465335 41.2197368972056 -10.5922983506721 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0779235979154227 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 31715367 T/C 1 37 44 81 16.6649297973785 24.1822456463606 -7.5173158489821 T:C T C 10 0.549596491962742 0.095208792226783 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31715345_31715395:HSPH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 31729777 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 32906729 A/C 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 A:C A C 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32906409_32907524:BRCA2;ENSG00000139618:ENST00000530893:exon_32906409_32907428:BRCA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 33017043 T/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 T:C T C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000139617:ENST00000380121:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000510912:exon_33016525_33017553:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000503296:exon_33016525_33018261:RP11-298P3.4;ENSG00000139617:ENST00000357505:exon_33016525_33018263:RP11-298P3.4;ENSG00000244754:ENST00000504114:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000399396:exon_33016525_33018263:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000509076:exon_33016525_33018261:N4BP2L2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 36878708 C/A 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 C C 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36875775_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36875777_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36877856_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36878459_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36878588_36878769:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36878594_36878769:SPG20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 37580139 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000120699:ENST00000489088:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000389704:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000379809:exon_37580095_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000239893:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000474661:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000490537:exon_37580094_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000488779:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000464235:exon_37580057_37580162:EXOSC8;ENSG00000120699:ENST00000495092:exon_37580057_37580162:EXOSC8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 37583831 G/A 1 40 41 81 18.0161403214903 22.5334561704724 -4.5173158489821 A:G G A 10 0.549596491962742 0.317326374223890 ENSG00000102710:ENST00000490716:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000484078:exon_37583449_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000360252:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000483214:exon_37583453_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000475892:exon_37583630_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000350612:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000472948:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000356185:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000469488:exon_37583631_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000473871:exon_37583634_37583946:FAM48A;ENSG00000102710:ENST00000464744:exon_37583754_37583946:FAM48A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 41303685 G/A 1 141 109 250 63.5068946332534 59.9060176239389 3.60087700931451 A:G G A 10 0.549596491962742 0.656978796359041 ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41303432_41303737:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41303440_41303737:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41303510_41303737:MRPS31 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 26 38 64 11.7104912089687 20.8846666945842 -9.17417548561549 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0235592346733214 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 45841502 G/A 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 46705087 C/A 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 A:C C A 10 0.549596491962742 0.672878774007803 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 48655791 G/A 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000136146:ENST00000258648:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378594:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378586:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000417167:exon_48655781_48655867:MED4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 50102810 G/A 1 102 48 150 45.9411578198003 26.3806316142116 19.5605262055887 A:C:G G A 10 0.549596491962742 0.00131499340612579 ENSG00000136147:ENST00000378319:exon_50102647_50103123:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000445637:exon_50102647_50103111:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000426879:exon_50102647_50102844:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000357596:exon_50102647_50103117:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000465045:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000488958:exon_50102647_50103112:PHF11;ENSG00000136147:ENST00000486276:exon_50102647_50103112:PHF11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 50587140 G/C 1 24 23 47 10.8096841928942 12.6407193151431 -1.83103512224887 C:G G C 10 0.549596491962742 0.660758894831395 ENSG00000204977:ENST00000420995:exon_50586071_50588467:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000378182:exon_50586071_50592587:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000356017:exon_50586071_50587316:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000457662:exon_50586071_50587304:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000298772:exon_50586071_50587305:TRIM13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 52603194 G/T 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 T:G G T 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 52603775 C/T 1 45 29 74 20.2681578616766 15.9382982669195 4.3298595947571 T:C C T 10 0.549596491962742 0.350608230731942 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 52603954 A/G 1 11 6 17 4.95443858840984 3.29757895177645 1.65685963663339 A:G A G 10 0.549596491962742 0.473394380129348 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 52604082 A/G 1 16 11 27 7.20645612859613 6.04556141159016 1.16089471700597 A:G A G 10 0.549596491962742 0.702779077015229 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 52604245 C/G 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 C:G C G 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 1 7 17 24 3.15282455626081 9.34314036336661 -6.19031580710581 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0131500249268837 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 77751892 C/T 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C C T 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77751883_77752089:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77751883_77752089:MYCBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 103330648 C/T 1 10 11 21 4.50403508037258 6.04556141159016 -1.54152633121758 T:C C T 10 0.549596491962742 0.518388705412663 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103330577_103330811:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103330577_103331521:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103330577_103330713:TPP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 103484060 G/A 1 8 1 9 3.60322806429806 0.549596491962742 3.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0474590365992993 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 113964148 C/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:C C A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113963958_113964177:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113963958_113964177:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113963958_113964177:LAMP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 114150151 G/A 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114149817_114150340:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114149817_114150340:TMCO3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 115070418 G/T 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 T:G G T 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000169062:ENST00000375299:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000351487:exon_115070264_115071283:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000480362:exon_115070264_115070424:UPF3A;ENSG00000169062:ENST00000475218:exon_115070264_115071283:UPF3A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 13 115090019 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 20825965 A/C 1 18 21 39 8.10726314467064 11.5415263312176 -3.43426318654694 A:C A C 10 0.549596491962742 0.334360602075572 ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20825797_20826063:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20825555_20826062:PARP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 20837701 G/C 1 10 22 32 4.50403508037258 12.0911228231803 -7.58708774280774 C:G G C 10 0.549596491962742 0.00760347281787619 ENSG00000129566:ENST00000262715:exon_20837503_20837735:TEP1;ENSG00000129566:ENST00000359243:exon_20837634_20837713:TEP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 20940626 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000198805:ENST00000361505:exon_20940467_20940636:PNP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 23549380 G/A 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 23559786 C/T 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23559731_23559842:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23559731_23559842:ACIN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 23566915 C/G 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 C:G C G 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000179933:ENST00000319074:exon_23566867_23569671:C14orf119 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 23944514 C/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:C C A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24029438 A/T 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:T A T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 0 0 9 9 0 4.94636842766468 -4.94636842766468 G A G 10 0.549596491962742 0.00076280912542378 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24608214 C/G 1 108 57 165 48.6435788680239 31.3270000418763 17.3165788261476 T:C:G C G 10 0.549596491962742 0.0076308475699813 ENSG00000100908:ENST00000216799:exon_24608174_24608405:FAM158A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24649241 C/T 1 200 81 281 90.0807016074516 44.5173158489821 45.5633857584695 T:C C T 10 0.549596491962742 2.74677835938315e-08 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24649216_24649459:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24649216_24649462:REC8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24709351 C/T 1 25 21 46 11.2600877009315 11.5415263312176 -0.28143863028613 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000092330:ENST00000267415:exon_24709270_24709361:TINF2;ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24708853_24710081:TINF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24735688 C/T 1 29 20 49 13.0617017330805 10.9919298392548 2.06977189382564 T:C C T 10 0.549596491962742 0.56978361142114 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735636_24735723:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735636_24735723:RABGGTA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24760808 C/T 1 23 8 31 10.3592806848569 4.39677193570194 5.962508749155 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0452782923738846 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24909281 C/T 1 21 33 54 9.45847366878242 18.1366842347705 -8.67821056598807 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0198228785690618 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24909362 T/C 1 24 20 44 10.8096841928942 10.9919298392548 -0.182245646360647 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 24909475 C/G 1 9 11 20 4.05363157233532 6.04556141159016 -1.99192983925484 C:G C G 10 0.549596491962742 0.379628968718832 ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 31425437 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196792:ENST00000355683:exon_31425345_31425448:STRN3;ENSG00000196792:ENST00000357479:exon_31425345_31425448:STRN3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 34993984 C/T 1 20 9 29 9.00807016074516 4.94636842766468 4.06170173308048 T:C C T 10 0.549596491962742 0.139644316181365 ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34993903_34994013:EAPP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 35062312 C/T 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000129515:ENST00000396526:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000396534:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000355110:exon_35062251_35062356:SNX6;ENSG00000129515:ENST00000362031:exon_35062251_35062356:SNX6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 39650924 A/G 1 264 215 479 118.906526121836 118.16324577199 0.7432803498466 A:T:C:G A G 10 0.549596491962742 0.963396485979312 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39649707_39652422:PNN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 50100386 T/C 1 10 3 13 4.50403508037258 1.64878947588823 2.85524560448435 T:C T C 10 0.549596491962742 0.162687516850499 ENSG00000165506:ENST00000298292:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406043:exon_50100005_50101948:C14orf104;ENSG00000165506:ENST00000406642:exon_50100005_50101948:C14orf104 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 12 10 22 5.4048420964471 5.49596491962742 -0.0911228231803234 A:T T A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 50360943 T/C 1 78 77 155 35.1314736269061 42.3189298811311 -7.187456254225 T:C T C 10 0.549596491962742 0.258860643242780 ENSG00000165527:ENST00000298316:exon_50359974_50361490:ARF6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 50626553 C/T 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50626149_50626804:SOS2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 50801233 G/A 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 50801266 G/A 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 51208425 C/T 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 T:C C T 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51208300_51208446:NIN;ENSG00000100503:ENST00000480476:exon_51208300_51209103:NIN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 51224658 T/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:T T A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51223210_51225348:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51223210_51225348:NIN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 51230650 A/G 1 14 15 29 6.30564911252161 8.24394737944113 -1.93829826691952 A:G A G 10 0.549596491962742 0.576354220871711 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51230544_51230682:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51230544_51230682:NIN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 51237701 A/G 1 11 14 25 4.95443858840984 7.69435088747839 -2.73991229906855 A:G A G 10 0.549596491962742 0.316889910238764 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51237570_51237710:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453401:exon_51237570_51237710:NIN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 55604935 C/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55604763_55605086:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55603699_55605086:LGALS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 56094726 C/A 1 32 47 79 14.4129122571923 25.8310351222489 -11.4181228650566 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0124033384428537 ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56094630_56094746:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56094630_56094746:KTN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 59797235 A/G 1 47 31 78 21.1689648777511 17.037491250845 4.13147362690613 A:G A G 10 0.549596491962742 0.364759169327329 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59797219_59797406:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59797219_59797406:DAAM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 59830404 C/T 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000100592:ENST00000351081:exon_59830369_59830500:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000360909:exon_59830369_59830500:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000358498:exon_59830369_59830500:DAAM1;ENSG00000100592:ENST00000395125:exon_59830369_59830500:DAAM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 60611648 C/T 1 107 38 145 48.1931753599866 20.8846666945842 27.3085086654024 T:C C T 10 0.549596491962742 3.53965297118752e-06 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60610838_60611731:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60611502_60611731:DHRS7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 64449430 A/G 1 5 11 16 2.25201754018629 6.04556141159016 -3.79354387140387 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0768780905652464 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64449348_64449512:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64449348_64449512:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64449348_64449512:SYNE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 64491704 C/T 1 21 22 43 9.45847366878242 12.0911228231803 -2.6326491543979 T:C C T 10 0.549596491962742 0.446131561329435 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 64494278 C/T 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64494202_64494511:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64494202_64494511:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64494202_64494511:SYNE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 64497930 G/A 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64497734_64498075:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64497734_64498075:SYNE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 64520020 A/G 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64518275_64520375:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64518275_64520375:SYNE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 64522674 G/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 C:G G C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64522662_64522984:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64522662_64522984:SYNE2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 68117421 T/C 1 8 19 27 3.60322806429806 10.4423333472921 -6.83910528299403 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0107763266729010 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 68118132 C/T 1 64 73 137 28.8258245143845 40.1205439132802 -11.2947193988957 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0586708003774883 ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2;ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68117869_68118198:VTI1B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 68157904 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000072042:ENST00000381346:exon_68157857_68157961:RDH11;ENSG00000072042:ENST00000428130:exon_68157857_68157961:RDH11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 70839689 T/C 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 T:C T C 10 0.549596491962742 0.154181475313390 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 75248624 A/T 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 A:T A T 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75248037_75249028:YLPM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 75475894 G/C 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000119718:ENST00000266126:exon_75475734_75476292:EIF2B2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 75483812 T/C 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75480467_75483904:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75480467_75483904:MLH3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 75514138 C/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 77935577 C/T 1 122 102 224 54.9492279805455 56.0588421801997 -1.1096141996542 T:C C T 10 0.549596491962742 0.893319325607064 ENSG00000100591:ENST00000216479:exon_77935420_77935807:AHSA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 78184566 C/A 1 20 20 40 9.00807016074516 10.9919298392548 -1.98385967850968 A:C C A 10 0.549596491962742 0.530147663252099 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78183946_78184629:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78183946_78184629:SNW1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 81251255 T/C 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000100629:ENST00000281129:exon_81251239_81251889:C14orf145;ENSG00000100629:ENST00000435851:exon_81251239_81251889:C14orf145;ENSG00000100629:ENST00000393619:exon_81251239_81251889:C14orf145 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 90499510 A/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G A G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90499450_90499558:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90499450_90499558:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90499450_90499558:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90499450_90499558:TDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 91655280 T/C 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000519994:exon_91655254_91655346:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517518:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91655254_91655514:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91655254_91655514:C14orf159 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 91760522 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91760517_91760662:CCDC88C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 91773568 T/C 1 12 13 25 5.4048420964471 7.14475439551565 -1.73991229906855 T:C T C 10 0.549596491962742 0.548867312273124 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91773382_91773570:CCDC88C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 91883165 C/T 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91883082_91883182:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000389856:exon_91883082_91883182:CCDC88C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 92454633 C/T 1 10 14 24 4.50403508037258 7.69435088747839 -3.19031580710581 T:C C T 10 0.549596491962742 0.220679044086420 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92454628_92454727:TRIP11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 92465764 C/T 1 14 4 18 6.30564911252161 2.19838596785097 4.10726314467064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0592141235470723 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92465584_92465777:TRIP11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 92471014 A/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 92471669 T/C 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 92471937 C/G 1 26 17 43 11.7104912089687 9.34314036336661 2.3673508456021 C:G C G 10 0.549596491962742 0.540936699568114 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 93118038 A/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 93118565 G/A 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94417421 G/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94417586 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94519478 G/A 1 18 5 23 8.10726314467064 2.74798245981371 5.35928068485694 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0339466293572781 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94524216 T/C 1 15 11 26 6.75605262055887 6.04556141159016 0.710491208968709 T:C T C 10 0.549596491962742 0.845577630679445 ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94524168_94524243:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94524168_94524243:DDX24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94528597 T/C 1 23 21 44 10.3592806848569 11.5415263312176 -1.18224564636064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.763033574761732 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94545602 A/G 1 374 346 720 168.450912005934 190.160386219109 -21.7094742131742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.107310238840695 ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94545371_94546093:DDX24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94844843 T/G 1 13 3 16 5.85524560448435 1.64878947588823 4.20645612859613 T:G T G 10 0.549596491962742 0.0429841707002542 ENSG00000197249:ENST00000440909:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000355814:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000449399:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437397:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000426226:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000437074:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448140:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000448921:exon_94843084_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393087:exon_94844686_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000489769:exon_94844710_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000393088:exon_94844713_94844977:SERPINA1;ENSG00000197249:ENST00000404814:exon_94844726_94844977:SERPINA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94929541 G/A 1 8 15 23 3.60322806429806 8.24394737944113 -4.64071931514307 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0599393881223003 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94929060_94929633:SERPINA9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 94931105 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94931044_94931191:SERPINA9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 95906321 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95906251_95906412:C14orf49 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 95912388 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 95912426 T/C 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000176438:ENST00000334258:exon_95912246_95912428:C14orf49 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 100602266 C/G 1 26 28 54 11.7104912089687 15.3887017749568 -3.67821056598807 C:G C G 10 0.549596491962742 0.33994057226066 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100602242_100602305:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100602242_100602305:EVL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 102372767 A/G 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G A G 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102372739_102372866:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102372739_102372866:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102372739_102372866:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000445439:exon_102372739_102372866:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000422945:exon_102372739_102372983:PPP2R5C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 223 215 438 100.439982292309 118.16324577199 -17.723263479681 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.0928262260251427 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 103934484 G/A 1 26 12 38 11.7104912089687 6.5951579035529 5.1153333054158 A:G G A 10 0.549596491962742 0.104578371032791 ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103934418_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103934370_103934523:MARK3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 104381502 T/C 1 53 49 102 23.8713859259747 26.9302281061744 -3.05884218019968 T:C T C 10 0.549596491962742 0.551923227220571 ENSG00000156411:ENST00000414262:exon_104381403_104381526:C14orf2;ENSG00000156411:ENST00000286953:exon_104381403_104381526:C14orf2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 105222037 C/T 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 105518456 A/C 1 6 15 21 2.70242104822355 8.24394737944113 -5.54152633121758 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0257796507768908 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 1 359 360 0.450403508037258 197.305140614624 -196.854737106587 T:C T C 10 0.549596491962742 8.71700713420398e-123 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 107170011 C/T 1 1 372 373 0.450403508037258 204.44989501014 -203.999491502103 T:C C T 10 0.549596491962742 2.83506023250553e-127 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 107170077 C/T 0 260 0 260 117.104912089687 0 117.104912089687 C C 10 0.549596491962742 2.72974101763351e-68 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 107170128 C/T 0 160 0 160 72.0645612859613 0 72.0645612859613 C C 10 0.549596491962742 4.27852852142899e-42 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 14 107170207 C/T 0 64 0 64 28.8258245143845 0 28.8258245143845 C C 10 0.549596491962742 2.83899723682395e-17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 25222119 C/A 0 33 0 33 14.8633157652295 0 14.8633157652295 C C 10 0.549596491962742 2.79198823676445e-09 ENSG00000128739:ENST00000400098:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000444203:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400100:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400097:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000390687:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000338094:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000346403:exon_25222024_25222176:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000428674:exon_25222024_25222176:SNRPN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 34158856 G/A 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000169857:ENST00000306730:exon_34158427_34158929:AVEN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 34654383 C/T 1 16 10 26 7.20645612859613 5.49596491962742 1.71049120896871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.558546355759659 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 34654438 T/C 1 18 11 29 8.10726314467064 6.04556141159016 2.06170173308048 T:C T C 10 0.549596491962742 0.463043069829507 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34654397_34654522:LPCAT4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 34654474 A/T 1 11 10 21 4.95443858840984 5.49596491962742 -0.541526331217581 A:T A T 10 0.549596491962742 0.829710755643621 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34654397_34654522:LPCAT4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 35274351 A/G 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000198146:ENST00000356321:exon_35270542_35275691:ZNF770 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 38794566 A/G 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000172575:ENST00000450598:exon_38794513_38794622:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000310803:exon_38794513_38794622:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000431814:exon_38794513_38794622:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000415523:exon_38794513_38794622:RASGRP1;ENSG00000172575:ENST00000414708:exon_38794513_38794622:RASGRP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 60 40 100 27.0242104822355 21.9838596785097 5.0403508037258 T:G T G 10 0.549596491962742 0.317267058411109 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 58 39 97 26.123403466161 21.4342631865469 4.68914027961403 T:C C T 10 0.549596491962742 0.359692262075476 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 40512906 A/G 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:G A G 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40512765_40513378:BUB1B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 40862064 C/T 1 11 4 15 4.95443858840984 2.19838596785097 2.75605262055887 T:C C T 10 0.549596491962742 0.197162377924665 ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 41104874 G/C 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 C:G G C 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 41105926 T/G 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 41149161 G/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 41377624 C/T 1 20 24 44 9.00807016074516 13.1903158071058 -4.18224564636065 T:C C T 10 0.549596491962742 0.22688081038979 ENSG00000128908:ENST00000361937:exon_41377567_41377781:INO80;ENSG00000128908:ENST00000401393:exon_41377567_41377781:INO80;ENSG00000128908:ENST00000263793:exon_41377567_41377781:INO80 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 42734399 C/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:C C A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000103994:ENST00000263805:exon_42734271_42734612:ZFP106;ENSG00000103994:ENST00000434903:exon_42734271_42734612:ZFP106 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 44093927 T/C 1 64 38 102 28.8258245143845 20.8846666945842 7.94115781980032 T:C T C 10 0.549596491962742 0.135177827602764 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 44093983 G/A 1 56 44 100 25.2225964500864 24.1822456463606 1.0403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.92001513042118 ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 44829344 T/A 1 41 37 78 18.4665438295276 20.3350702026215 -1.86852637309387 A:T T A 10 0.549596491962742 0.733110021927415 ENSG00000104131:ENST00000261868:exon_44829255_44829435:EIF3J;ENSG00000104131:ENST00000424492:exon_44829333_44829435:EIF3J HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 14 39 53 6.30564911252161 21.4342631865469 -15.1286140740253 T:C T C 10 0.549596491962742 3.97127247003964e-05 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 52900804 A/C 1 22 8 30 9.90887717681968 4.39677193570194 5.51210524111774 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0448934555018791 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 T:C T C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 55497691 G/A 1 67 45 112 30.1770350384963 24.7318421383234 5.4451929001729 A:G G A 10 0.549596491962742 0.342411650657873 ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 55647492 C/T 1 18 23 41 8.10726314467064 12.6407193151431 -4.53345617047242 T:C C T 10 0.549596491962742 0.161068726188539 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 17 4 21 7.65685963663339 2.19838596785097 5.45847366878242 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0162560324436559 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 59179667 G/A 1 30 27 57 13.5121052411177 14.839105282994 -1.32700004187629 A:G G A 10 0.549596491962742 0.790454676388292 ENSG00000137776:ENST00000380516:exon_59179425_59179739:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000432750:exon_59179425_59179739:SLTM;ENSG00000137776:ENST00000492526:exon_59179425_59179739:SLTM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 59323675 A/G 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:G A G 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000157450:ENST00000348370:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000380504:exon_59323003_59323901:RNF111;ENSG00000157450:ENST00000434298:exon_59323003_59323901:RNF111 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 59408918 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 59409495 G/A 1 18 10 28 8.10726314467064 5.49596491962742 2.61129822504323 A:G G A 10 0.549596491962742 0.348659115736329 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 60715800 T/G 1 14 8 22 6.30564911252161 4.39677193570194 1.90887717681968 T:G T G 10 0.549596491962742 0.522024354878786 ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 62221679 T/C 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 T:C T C 10 0.549596491962742 0.201576522936109 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 63433785 G/A 1 8 13 21 3.60322806429806 7.14475439551565 -3.54152633121758 A:G G A 10 0.549596491962742 0.129995035061013 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 63433800 G/A 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:G G A 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 64005695 A/C 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:C A C 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_64005552_64005864:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_64005552_64005864:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000425434:exon_64005552_64005864:HERC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 64428564 C/T 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C C T 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000028528:ENST00000353874:exon_64428529_64428609:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000261889:exon_64428529_64428609:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000380285:exon_64428529_64428609:SNX1;ENSG00000028528:ENST00000440389:exon_64428529_64428609:SNX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 65443209 T/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:T T A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65440557_65443251:CLPX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 65871698 G/T 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:G G T 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000138614:ENST00000395644:exon_65871095_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000420799:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000442903:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000313182:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000431261:exon_65871403_65871997:C15orf44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 69747675 A/T 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:T A T 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 70351788 T/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 70960068 G/A 1 12 4 16 5.4048420964471 2.19838596785097 3.20645612859613 A:G G A 10 0.549596491962742 0.13376415246686 ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 15 15 30 6.75605262055887 8.24394737944113 -1.48789475888226 A:G A G 10 0.549596491962742 0.588157181481653 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 74328141 G/T 1 19 16 35 8.5576666527079 8.79354387140387 -0.235877218695968 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 74703929 T/C 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74703897_74704051:SEMA7A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 74706943 G/A 1 15 22 37 6.75605262055887 12.0911228231803 -5.33507020262145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0976203350755097 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74706888_74707086:SEMA7A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 74709975 G/A 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 A:G G A 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74709932_74710016:SEMA7A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 75144477 C/T 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75144410_75144527:SCAMP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 75499602 C/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:C C A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 75499861 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 75656505 T/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:T T A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75656340_75656529:MAN2C1;ENSG00000140400:ENST00000421803:exon_75656272_75656529:MAN2C1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 26 8 34 11.7104912089687 4.39677193570194 7.31371927326677 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0146555609599992 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 19 35 54 8.5576666527079 19.235877218696 -10.6782105659881 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00388901608530498 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 15 13 28 6.75605262055887 7.14475439551565 -0.388701774956775 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 80467384 C/T 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80467358_80467433:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80467358_80467433:FAH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 83502065 A/C 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 83502066 C/G 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000156232:ENST00000286760:exon_83501981_83503613:WHAMM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 83680287 A/G 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 85159553 C/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000176371:ENST00000379358:exon_85159540_85159839:ZSCAN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 86122654 T/C 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 T:C T C 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 86122779 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86122161_86125338:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86122161_86125338:AKAP13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 86262256 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 86265293 A/G 1 11 6 17 4.95443858840984 3.29757895177645 1.65685963663339 A:G A G 10 0.549596491962742 0.473394380129348 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86265222_86265347:AKAP13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 86266306 A/G 1 31 28 59 13.962508749155 15.3887017749568 -1.42619302580178 A:G A G 10 0.549596491962742 0.793842418873914 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86266303_86266551:AKAP13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 86273693 C/T 1 11 8 19 4.95443858840984 4.39677193570194 0.557666652707903 T:C C T 10 0.549596491962742 0.822816223025556 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 102 99 201 45.9411578198003 54.4100527043115 -8.46889488451114 A:G A G 10 0.549596491962742 0.256668315761544 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 53 44 97 23.8713859259747 24.1822456463606 -0.31085972038597 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 A:T:C A C 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 90617539 C/T 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 90628537 G/A 1 20 24 44 9.00807016074516 13.1903158071058 -4.18224564636065 A:G G A 10 0.549596491962742 0.22688081038979 ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 91354521 G/A 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 A:G G A 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 9 5 14 4.05363157233532 2.74798245981371 1.30564911252161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.595838131122828 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 93162649 A/G 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93160678_93162689:FAM174B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 93536197 C/T 1 35 25 60 15.764122781304 13.7399122990685 2.02421048223548 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.697453077229997 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 101109677 C/A 1 23 14 37 10.3592806848569 7.69435088747839 2.66492979737855 A:C C A 10 0.549596491962742 0.41263309038557 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 101109794 C/G 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 C:G C G 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 101109818 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 101109893 C/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:C C A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 15 102264476 C/A 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 419092 A/G 1 58 61 119 26.123403466161 33.5253860097273 -7.40198254356629 A:G A G 10 0.549596491962742 0.196963134795163 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_418501_419211:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419059_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_418501_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419068_419220:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419068_419220:MRPL28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 422013 G/A 1 45 45 90 20.2681578616766 24.7318421383234 -4.46368427664677 A:C:G G A 10 0.549596491962742 0.396853070293851 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_420773_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_421862_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_421864_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_421864_422283:TMEM8A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 449399 C/T 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 T:C C T 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000454619:exon_449379_449474:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449379_449480:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449295_449480:NME4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 70 34 104 31.5282455626081 18.6862807267332 12.8419648358748 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0133826370973347 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 633353 T/C 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 633354 G/A 1 12 7 19 5.4048420964471 3.84717544373919 1.5576666527079 A:G G A 10 0.549596491962742 0.500715990574539 ENSG00000007541:ENST00000321878:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000026218:exon_632883_634136:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000480424:exon_632883_634108:PIGQ;ENSG00000007541:ENST00000476438:exon_632883_634108:PIGQ HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 1374818 A/G 1 12 18 30 5.4048420964471 9.89273685532936 -4.48789475888226 A:G A G 10 0.549596491962742 0.140824550400342 ENSG00000103275:ENST00000325437:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000355803:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397514:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000397515:exon_1374731_1377019:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000406620:exon_1374731_1375351:UBE2I;ENSG00000103275:ENST00000403747:exon_1374731_1375215:UBE2I HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 1401412 G/C 1 8 12 20 3.60322806429806 6.5951579035529 -2.99192983925484 C:G G C 10 0.549596491962742 0.186483128440231 ENSG00000007520:ENST00000007390:exon_1401380_1401599:C16orf42 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 1412633 A/T 1 9 19 28 4.05363157233532 10.4423333472921 -6.38870177495677 A:T A T 10 0.549596491962742 0.021115326822451 ENSG00000090581:ENST00000204679:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000529957:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000527168:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000527076:exon_1412207_1412743:GNPTG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 13 9 22 5.85524560448435 4.94636842766468 0.908877176819677 T:C T C 10 0.549596491962742 0.83126247931392 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 1827299 C/T 1 13 14 27 5.85524560448435 7.69435088747839 -1.83910528299403 T:C C T 10 0.549596491962742 0.56297168975082 ENSG00000197774:ENST00000307394:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000197774:ENST00000422472:exon_1826069_1830628:EME2;ENSG00000162032:ENST00000301717:exon_1826714_1827444:SPSB3;ENSG00000162032:ENST00000360717:exon_1826721_1827444:SPSB3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 36 50 86 16.2145262893413 27.4798245981371 -11.2652983087958 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0168103315237995 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 62 56 118 27.92501749831 30.7774035499136 -2.85238605160355 T:C C T 10 0.549596491962742 0.643908931657343 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 2580429 G/A 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000162066:ENST00000413459:exon_2580258_2580760:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 2811591 G/A 1 25 28 53 11.2600877009315 15.3887017749568 -4.12861407402533 A:G G A 10 0.549596491962742 0.271386358956406 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000396975:exon_2811562_2811699:SRRM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 2815027 C/G 1 16 15 31 7.20645612859613 8.24394737944113 -1.037491250845 C:G C G 10 0.549596491962742 0.721680287355976 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 3023158 G/A 1 21 26 47 9.45847366878242 14.2895087910313 -4.83103512224887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.186879097594836 ENSG00000127564:ENST00000431515:exon_3023139_3023216:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000262300:exon_3023139_3023216:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000440027:exon_3023139_3023254:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000402679:exon_3023139_3023216:PKMYT1;ENSG00000127564:ENST00000382240:exon_3023139_3023254:PKMYT1;ENSG00000162073:ENST00000318782:exon_3021516_3023490:PAQR4;ENSG00000162073:ENST00000293978:exon_3021516_3023483:PAQR4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 3119344 A/C 1 327 317 644 147.281947128183 174.222087952189 -26.9401408240058 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0357514076458890 ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382210:exon_3119282_3119356:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3119282_3119376:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3118991_3119377:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529699:exon_3118991_3119356:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529550:exon_3118991_3119369:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3118991_3119441:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3118991_3119553:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3118991_3119541:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3118991_3119549:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3118991_3119820:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3118991_3119384:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525003:exon_3118991_3119412:IL32 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 3119367 A/G 1 263 166 429 118.456122613799 91.2330176658152 27.2231049479837 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00872745920116154 ENSG00000008517:ENST00000440815:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000534507:exon_3118991_3119552:IL32;ENSG00000008517:ENST00000382213:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000416912:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396890:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000325568:exon_3118991_3119668:IL32;ENSG00000008517:ENST00000396887:exon_3119282_3119376:IL32;ENSG00000008517:ENST00000531965:exon_3118991_3119377:IL32;ENSG00000008517:ENST00000529550:exon_3118991_3119369:IL32;ENSG00000008517:ENST00000528163:exon_3118991_3119441:IL32;ENSG00000008517:ENST00000533097:exon_3118991_3119553:IL32;ENSG00000008517:ENST00000444393:exon_3118991_3119541:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530890:exon_3118991_3119549:IL32;ENSG00000008517:ENST00000008180:exon_3118991_3119820:IL32;ENSG00000008517:ENST00000530538:exon_3118991_3119384:IL32;ENSG00000008517:ENST00000525003:exon_3118991_3119412:IL32 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 3714356 G/T 1 18 7 25 8.10726314467064 3.84717544373919 4.26008770093145 T:G G T 10 0.549596491962742 0.107691913974533 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3714275_3714460:TRAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 3722817 G/A 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3722701_3722821:TRAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 4511982 G/A 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 4513703 G/A 1 53 81 134 23.8713859259747 44.5173158489821 -20.6459299230074 A:G G A 10 0.549596491962742 0.000469516330810952 ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4513661_4513851:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4513661_4513851:NMRAL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 4748033 C/G 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 C C 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 4920569 C/T 1 13 5 18 5.85524560448435 2.74798245981371 3.10726314467064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.16116385579354 ENSG00000118900:ENST00000262376:exon_4920517_4920635:UBN1;ENSG00000118900:ENST00000396658:exon_4920517_4920635:UBN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 8738499 G/A 1 7 10 17 3.15282455626081 5.49596491962742 -2.34314036336661 A:G G A 10 0.549596491962742 0.330612084853473 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 8738579 A/G 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8738414_8738582:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8738414_8738582:C16orf68 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 8740015 A/C 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 A:C A C 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8739965_8740079:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8739965_8740072:C16orf68 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 8953081 C/G 1 4 11 15 1.80161403214903 6.04556141159016 -4.24394737944113 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0362224812734888 ENSG00000153048:ENST00000396593:exon_8953028_8953192:CARHSP1;ENSG00000153048:ENST00000311052:exon_8953028_8953192:CARHSP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 10574796 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 10574813 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000166669:ENST00000396559:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000396560:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000356427:exon_10574736_10574821:ATF7IP2;ENSG00000166669:ENST00000324570:exon_10574736_10574821:ATF7IP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 11000563 A/G 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 11769963 C/T 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C C T 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 11773360 A/G 1 36 28 64 16.2145262893413 15.3887017749568 0.825824514384514 A:G A G 10 0.549596491962742 0.900313828567159 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 11845235 A/G 1 11 12 23 4.95443858840984 6.5951579035529 -1.64071931514307 A:G A G 10 0.549596491962742 0.53401084593008 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11844442_11845362:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11844443_11845362:ZC3H7A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 12162969 A/G 1 10 15 25 4.50403508037258 8.24394737944113 -3.73991229906855 A:G A G 10 0.549596491962742 0.160033758259519 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12162914_12162989:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12162914_12162989:SNX29 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 12618727 G/A 1 13 4 17 5.85524560448435 2.19838596785097 3.65685963663339 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0895144911712826 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 12662328 C/G 1 8 20 28 3.60322806429806 10.9919298392548 -7.38870177495677 C:G C G 10 0.549596491962742 0.00682729544341553 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 12662420 C/T 1 12 19 31 5.4048420964471 10.4423333472921 -5.037491250845 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0733682530625384 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12662363_12668145:SNX29 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:C C A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 15793615 C/T 1 11 20 31 4.95443858840984 10.9919298392548 -6.037491250845 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0312555863968055 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 269 187 456 121.158543662022 102.774543997033 18.3839996649897 A:T:C:G G A 10 0.549596491962742 0.0901317988353052 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 4 14 18 1.80161403214903 7.69435088747839 -5.89273685532936 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00743657877429788 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 23404600 T/C 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 T:C T C 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23404554_23404668:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23404554_23404668:COG7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 23646786 T/C 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:C T C 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23646183_23647655:PALB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 A:T A T 10 0.549596491962742 0.154181475313390 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 23700059 C/T 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23699989_23700066:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23699989_23700066:PLK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 28 23 51 12.6112982250432 12.6407193151431 -0.0294210900998397 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 24741686 T/C 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 T:C T C 10 0.549596491962742 0.672878774007803 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 24802204 C/T 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 24802245 T/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:G T G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000090905:ENST00000315183:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395799:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000338120:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000395801:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000491718:exon_24800553_24803138:TNRC6A;ENSG00000090905:ENST00000352205:exon_24801651_24803138:TNRC6A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 24942272 T/A 1 17 19 36 7.65685963663339 10.4423333472921 -2.78547371065871 A:T T A 10 0.549596491962742 0.403458304024060 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 27373872 A/C 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:C A C 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 27373915 G/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:G G T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 27472772 C/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000077235:ENST00000170629:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000356183:exon_27471935_27472883:GTF3C1;ENSG00000077235:ENST00000388971:exon_27471935_27472883:GTF3C1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 28488943 T/C 1 17 20 37 7.65685963663339 10.9919298392548 -3.33507020262145 T:C T C 10 0.549596491962742 0.322003568193470 ENSG00000188603:ENST00000359984:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000360019:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357857:exon_28488600_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000357806:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000354630:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000355477:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000395653:exon_28488601_28488956:CLN3;ENSG00000188603:ENST00000333496:exon_28488601_28488956:CLN3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 28508447 A/G 1 10 3 13 4.50403508037258 1.64878947588823 2.85524560448435 A:G A G 10 0.549596491962742 0.162687516850499 ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28507438_28509317:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28507438_28509317:AC138894.1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 28854272 G/A 1 675 520 1195 304.022367925149 285.790175820626 18.2321921045233 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.295369185278357 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28853732_28854469:TUFM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 28857282 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28857233_28857427:TUFM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 28890362 G/C 1 11 15 26 4.95443858840984 8.24394737944113 -3.28950879103129 C:G G C 10 0.549596491962742 0.237602204643593 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 28909305 C/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 C:G C G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29811319 C/T 1 16 17 33 7.20645612859613 9.34314036336661 -2.13668423477048 T:C C T 10 0.549596491962742 0.487351784421038 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29811234_29811369:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29811234_29811369:KIF22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29814234 G/A 1 19 30 49 8.5576666527079 16.4878947588823 -7.93022810617436 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0302651079561824 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814090_29814258:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814090_29814258:KIF22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29814826 G/A 1 31 21 52 13.962508749155 11.5415263312176 2.42098241793742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.57785832962937 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814770_29814929:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814770_29814929:KIF22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29846983 G/C 1 9 12 21 4.05363157233532 6.5951579035529 -2.54152633121758 C:G G C 10 0.549596491962742 0.280840300071195 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29851558 G/A 1 21 18 39 9.45847366878242 9.89273685532936 -0.434263186546936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29851499_29851780:MVP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 29999225 G/A 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 A:G G A 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 30666367 C/T 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 30666480 A/G 1 11 14 25 4.95443858840984 7.69435088747839 -2.73991229906855 A:G A G 10 0.549596491962742 0.316889910238764 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 31049306 C/G 1 12 27 39 5.4048420964471 14.839105282994 -9.43426318654694 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0032548934922982 ENSG00000103496:ENST00000493902:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000394998:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000313843:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000454874:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000487411:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000460668:exon_31049247_31049355:STX4;ENSG00000103496:ENST00000496977:exon_31049247_31049355:STX4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 31193994 T/C 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C T C 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 31194017 A/G 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 31488916 C/G 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 C:G C G 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000140682:ENST00000394863:exon_31488631_31489281:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000361773:exon_31488631_31489279:TGFB1I1;ENSG00000140682:ENST00000394858:exon_31488631_31489281:TGFB1I1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 48396038 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196470:ENST00000356721:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000394725:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000380006:exon_48394442_48397793:SIAH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 56396486 C/T 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 56969148 G/A 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000051108:ENST00000439977:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000379792:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000300302:exon_56969147_56969224:HERPUD1;ENSG00000051108:ENST00000344114:exon_56969147_56969224:HERPUD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 57095408 C/T 1 33 27 60 14.8633157652295 14.839105282994 0.0242104822354818 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57095360_57095443:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57095360_57095443:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57095360_57095443:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57095360_57095443:NLRC5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 57394356 C/T 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C C T 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57394349_57394472:CCL22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 57493629 G/C 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 C:G G C 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000088682:ENST00000262507:exon_57493477_57493632:COQ9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 57597147 G/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:G G T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57597003_57597159:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57597003_57597159:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57597003_57597159:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57597003_57597159:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57597003_57597159:GPR114 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 11 8 19 4.95443858840984 4.39677193570194 0.557666652707903 A:G G A 10 0.549596491962742 0.822816223025556 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 58589187 G/A 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 A:G G A 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58589155_58589441:CNOT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 58616984 T/C 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58616960_58617086:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58616960_58617086:CNOT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67100635 A/G 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67100585_67100701:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67100585_67100701:CBFB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67234741 A/G 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 0.201576522936109 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67472429 C/T 1 22 12 34 9.90887717681968 6.5951579035529 3.31371927326677 T:C C T 10 0.549596491962742 0.302373245233449 ENSG00000159720:ENST00000290949:exon_67471922_67472592:ATP6V0D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67702334 C/A 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 A:C C A 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000159761:ENST00000403458:exon_67702103_67702660:C16orf86;ENSG00000159761:ENST00000459925:exon_67701199_67702660:C16orf86;ENSG00000159761:ENST00000445068:exon_67702103_67702660:C16orf86 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67862100 G/A 1 65 46 111 29.2762280224218 25.2814386302861 3.99478939213564 A:G G A 10 0.549596491962742 0.504508399917989 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67862064_67862293:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67862064_67862293:CENPT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67916652 A/G 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67916582_67916768:EDC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 61 69 130 27.4746139902727 37.9221579454292 -10.4475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0775316418484346 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 15 16 31 6.75605262055887 8.79354387140387 -2.037491250845 T:C C T 10 0.549596491962742 0.475905304824674 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 70310397 T/C 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C T C 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000090861:ENST00000261772:exon_70310389_70310534:AARS;ENSG00000090861:ENST00000418685:exon_70310389_70310534:AARS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 70358542 C/T 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000157349:ENST00000451014:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000355992:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000393657:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000288071:exon_70358488_70358590:DDX19B;ENSG00000157349:ENST00000417604:exon_70358488_70358590:DDX19B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 70422263 A/G 1 9 12 21 4.05363157233532 6.5951579035529 -2.54152633121758 A:G A G 10 0.549596491962742 0.280840300071195 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 74425569 C/T 0 34 0 34 15.3137192732668 0 15.3137192732668 C C 10 0.549596491962742 2.91547750277242e-09 ENSG00000196436:ENST00000504746:exon_74425289_74425741:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000429990:exon_74425289_74425978:NPIPL2;ENSG00000196436:ENST00000355290:exon_74425289_74426013:NPIPL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 74490556 G/A 1 19 13 32 8.5576666527079 7.14475439551565 1.41291225719226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.723272122776592 ENSG00000090863:ENST00000447066:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000205061:exon_74490547_74490653:GLG1;ENSG00000090863:ENST00000422840:exon_74490547_74490653:GLG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 74949759 A/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:T A T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 26 12 38 11.7104912089687 6.5951579035529 5.1153333054158 T:C C T 10 0.549596491962742 0.104578371032791 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 81990302 G/A 1 58 62 120 26.123403466161 34.07498250169 -7.95157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.168520925848874 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81990300_81990484:PLCG2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 0 10 0 10 4.50403508037258 0 4.50403508037258 T T 10 0.549596491962742 0.00285800173360387 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 G G 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 84513560 G/A 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84509966_84513632:KIAA1609 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 84812713 C/T 1 9 11 20 4.05363157233532 6.04556141159016 -1.99192983925484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.379628968718832 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84812501_84813525:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84812501_84813525:USP10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 87744971 G/A 1 12 14 26 5.4048420964471 7.69435088747839 -2.28950879103129 A:G G A 10 0.549596491962742 0.432085162262284 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87744841_87745049:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87744841_87745049:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87744841_87745049:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87744841_87745049:KLHDC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 87748114 G/A 1 12 15 27 5.4048420964471 8.24394737944113 -2.83910528299403 A:G G A 10 0.549596491962742 0.334201928306803 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87748104_87748179:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87748104_87748179:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87748104_87748179:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87748104_87748179:KLHDC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 88643846 G/A 1 13 15 28 5.85524560448435 8.24394737944113 -2.38870177495678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.448190200424548 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 88644026 G/A 1 18 10 28 8.10726314467064 5.49596491962742 2.61129822504323 A:G G A 10 0.549596491962742 0.348659115736329 ENSG00000158545:ENST00000301011:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000452588:exon_88643518_88644134:ZC3H18;ENSG00000158545:ENST00000289509:exon_88643518_88644134:ZC3H18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 88874655 C/T 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C C T 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 88876103 T/C 1 149 103 252 67.1101226975514 56.6084386721624 10.501684025389 T:C T C 10 0.549596491962742 0.205372299186782 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 16 89954138 G/C 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 C:G G C 10 0.549596491962742 0.442338751277527 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 970413 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_970317_970482:ABR;ENSG00000159842:ENST00000382259:exon_970317_970482:ABR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 1399622 G/A 1 9 14 23 4.05363157233532 7.69435088747839 -3.64071931514307 A:G G A 10 0.549596491962742 0.144897374794713 ENSG00000132376:ENST00000397335:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000421807:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000406424:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000350761:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000320345:exon_1399613_1399696:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000487039:exon_1399354_1399755:INPP5K HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 1456318 G/A 1 13 9 22 5.85524560448435 4.94636842766468 0.908877176819677 A:G G A 10 0.549596491962742 0.83126247931392 ENSG00000174238:ENST00000313486:exon_1456298_1456443:PITPNA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 1555074 T/A 1 15 17 32 6.75605262055887 9.34314036336661 -2.58708774280774 A:T T A 10 0.549596491962742 0.378858186559075 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1554942_1555082:PRPF8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 1556958 G/A 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1556836_1556977:PRPF8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 1579270 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1579222_1579348:PRPF8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 1684605 G/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000186532:ENST00000305513:exon_1682829_1684733:SMYD4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 2202943 T/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 2233561 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 2236404 T/C 1 7 11 18 3.15282455626081 6.04556141159016 -2.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.235754067257629 ENSG00000167721:ENST00000301364:exon_2236255_2236418:TSR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 4923365 C/T 0 19 0 19 8.5576666527079 0 8.5576666527079 C C 10 0.549596491962742 1.78418761902946e-05 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4923291_4923374:KIF1C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 15611495 T/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000187607:ENST00000421016:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000412988:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000472486:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000464847:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000439334:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395894:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000395893:exon_15611469_15611561:ZNF286A;ENSG00000187607:ENST00000481540:exon_15611469_15611738:ZNF286A;ENSG00000255104:ENST00000413242:exon_15611469_15611561:AC005324.8-001 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 15961951 A/G 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:G A G 10 0.549596491962742 0.315381028421196 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 16004577 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_16004564_16005071:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_16004564_16005119:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_16004564_16005119:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_16004564_16005119:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_16004564_16005119:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_16004564_16005071:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395848:exon_16004564_16005119:NCOR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 16285404 C/T 1 152 115 267 68.4613332216632 63.2035965757153 5.2577366459479 T:C C T 10 0.549596491962742 0.538863846411205 ENSG00000170315:ENST00000302182:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395839:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395837:exon_16285216_16286054:UBB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 16340095 G/A 1 20 16 36 9.00807016074516 8.79354387140387 0.21452628934129 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 18148485 G/A 1 53 48 101 23.8713859259747 26.3806316142116 -2.50924568823694 A:G G A 10 0.549596491962742 0.618680214825726 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 18148944 C/G 1 20 20 40 9.00807016074516 10.9919298392548 -1.98385967850968 C:G C G 10 0.549596491962742 0.530147663252099 ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000465046:exon_18148668_18149322:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487369:exon_18148668_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493600:exon_18148869_18149376:FLII;ENSG00000177731:ENST00000479175:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18148869_18148974:FLII;ENSG00000177731:ENST00000476369:exon_18148696_18148974:FLII HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 18872376 C/T 1 9 14 23 4.05363157233532 7.69435088747839 -3.64071931514307 T:C C T 10 0.549596491962742 0.144897374794713 ENSG00000154025:ENST00000317977:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395647:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000417251:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395642:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395645:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395643:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000284168:exon_18872365_18872383:SLC5A10;ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 25628820 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25628814_25628982:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25628814_25628982:WSB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 25909816 C/T 1 5 11 16 2.25201754018629 6.04556141159016 -3.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0768780905652464 ENSG00000141068:ENST00000268763:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000319524:exon_25909672_25910131:KSR1;ENSG00000141068:ENST00000398982:exon_25909672_25910131:KSR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 26676159 C/T 1 15 8 23 6.75605262055887 4.39677193570194 2.35928068485693 T:C C T 10 0.549596491962742 0.403782240071035 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 26676183 T/C 1 15 9 24 6.75605262055887 4.94636842766468 1.80968419289419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.541033255468647 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 26680014 G/C 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 C:G G C 10 0.549596491962742 0.406605284187696 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 26688278 G/T 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26688179_26690705:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000395404:exon_26688179_26688477:TMEM199 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 27047930 C/G 1 11 10 21 4.95443858840984 5.49596491962742 -0.541526331217581 C:G C G 10 0.549596491962742 0.829710755643621 ENSG00000198242:ENST00000473896:exon_27047725_27048940:RPL23A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 27075081 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27074861_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075035_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262396:exon_27075035_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000454852:exon_27075035_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000422344:exon_27075035_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000475329:exon_27075035_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075035_27075196:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075035_27075196:TRAF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 27493746 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27492960_27494039:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27492960_27494039:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27492960_27494039:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27492960_27493958:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27492960_27493958:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27492960_27493958:MYO18A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 51 61 112 22.9705789099002 33.5253860097273 -10.5548070998271 A:G G A 10 0.549596491962742 0.046480739080488 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29096004 C/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 C:G C G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29097000 A/G 1 11 4 15 4.95443858840984 2.19838596785097 2.75605262055887 A:G A G 10 0.549596491962742 0.197162377924665 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29097001 G/C 1 4 11 15 1.80161403214903 6.04556141159016 -4.24394737944113 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0362224812734888 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29111204 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29111276 C/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 C:G C G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29119559 C/G 1 2 13 15 0.900807016074516 7.14475439551565 -6.24394737944113 C:G C G 10 0.549596491962742 0.00124464989148298 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29119458_29119590:CRLF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 29187497 A/G 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29187451_29187630:ATAD5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 33591523 G/A 1 3 13 16 1.35121052411177 7.14475439551565 -5.79354387140387 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00446766776140474 ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33591202_33591922:SLFN5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 33749919 A/C 1 12 9 21 5.4048420964471 4.94636842766468 0.458473668782418 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000172123:ENST00000394562:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000452764:exon_33749009_33750089:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000304905:exon_33749009_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000447040:exon_33749664_33750087:SLFN12;ENSG00000172123:ENST00000445092:exon_33749840_33750087:SLFN12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 34151078 G/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 C:G G C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 34205582 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000161570:ENST00000293272:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000366113:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000463941:exon_34205532_34205643:CCL5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 35376351 C/T 1 19 21 40 8.5576666527079 11.5415263312176 -2.98385967850968 T:C C T 10 0.549596491962742 0.346059684000148 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35376304_35376371:AATF HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 36909061 A/G 1 37 35 72 16.6649297973785 19.235877218696 -2.57094742131742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.555653556638717 ENSG00000108294:ENST00000225426:exon_36909003_36909082:PSMB3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 36963226 G/T 1 15 11 26 6.75605262055887 6.04556141159016 0.710491208968709 T:G G T 10 0.549596491962742 0.845577630679445 ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36963018_36963229:CWC25 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 37922261 A/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:C A C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37913968_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37921198_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000394189:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377944:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377958:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377952:exon_37921537_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37922043_37922746:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37922043_37922746:IKZF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 38137364 G/A 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 A:G G A 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38137050_38137443:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38137312_38137443:PSMD3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 38545824 C/A 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38544768_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38544795_38545899:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38544795_38545899:TOP2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 38547868 C/T 1 15 8 23 6.75605262055887 4.39677193570194 2.35928068485693 T:C C T 10 0.549596491962742 0.403782240071035 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38547758_38547892:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38547758_38547892:TOP2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 38548586 T/G 1 23 14 37 10.3592806848569 7.69435088747839 2.66492979737855 T:G T G 10 0.549596491962742 0.41263309038557 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38548470_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38548466_38548593:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38548470_38548593:TOP2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 38556533 T/C 1 6 11 17 2.70242104822355 6.04556141159016 -3.34314036336661 T:C T C 10 0.549596491962742 0.142293766298503 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38556461_38556661:TOP2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 39777128 C/T 1 35 12 47 15.764122781304 6.5951579035529 9.16896487775113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0078117086431786 ENSG00000128422:ENST00000311208:exon_39776911_39777131:KRT17;ENSG00000128422:ENST00000493253:exon_39776911_39777131:KRT17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 40720505 A/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:T A T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000108788:ENST00000435881:exon_40720488_40720577:MLX;ENSG00000108788:ENST00000246912:exon_40720488_40720577:MLX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 41245466 G/A 1 23 28 51 10.3592806848569 15.3887017749568 -5.02942109009984 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.162068861094634 ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 41365921 C/G 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 C:G C G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 42158310 T/G 1 6 12 18 2.70242104822355 6.5951579035529 -3.89273685532936 T:G T G 10 0.549596491962742 0.0948720795505176 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 42266636 C/T 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 T:C C T 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000168591:ENST00000357984:exon_42266390_42266956:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000319511:exon_42266303_42266956:TMUB2;ENSG00000168591:ENST00000446571:exon_42266415_42266667:TMUB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 42284849 G/A 1 33 38 71 14.8633157652295 20.8846666945842 -6.02135092935468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.154349201085552 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42284822_42284965:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42284822_42284965:UBTF HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 42427854 C/G 1 21 23 44 9.45847366878242 12.6407193151431 -3.18224564636064 C:G C G 10 0.549596491962742 0.365214251414053 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427810_42427945:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427810_42427945:GRN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 43158902 G/A 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 A:G G A 10 0.549596491962742 0.627760665871729 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 17 12 29 7.65685963663339 6.5951579035529 1.06170173308048 T:C C T 10 0.549596491962742 0.714107421377589 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 19 13 32 8.5576666527079 7.14475439551565 1.41291225719226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.723272122776592 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 45759767 C/T 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.315381028421196 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 13 5 18 5.85524560448435 2.74798245981371 3.10726314467064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.16116385579354 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 13 7 20 5.85524560448435 3.84717544373919 2.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.501302886145313 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 46053353 C/A 1 19 22 41 8.5576666527079 12.0911228231803 -3.53345617047242 A:C C A 10 0.549596491962742 0.276180258560819 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46053235_46053379:CDK5RAP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 46136445 C/T 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C C T 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000082641:ENST00000362042:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000361665:exon_46135657_46138906:NFE2L1;ENSG00000082641:ENST00000357480:exon_46135657_46138906:NFE2L1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 46930343 C/A 1 13 22 35 5.85524560448435 12.0911228231803 -6.23587721869597 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0408756895388407 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46930288_46930397:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46930288_46930597:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46930288_46930374:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46930323_46930374:CALCOCO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 47018293 C/T 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 47300019 G/A 1 22 30 52 9.90887717681968 16.4878947588823 -6.57901758206258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0709594514625063 ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47299914_47300587:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47299914_47300398:ABI3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 48437367 C/T 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 49074092 C/T 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C C T 10 0.549596491962742 0.79130236160194 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 49248997 C/T 1 520 466 986 234.209824179374 256.111965254638 -21.9021410752636 T:C C T 10 0.549596491962742 0.168735527804107 ENSG00000011052:ENST00000376392:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393199:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393183:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000514264:exon_49248848_49249028:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393185:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000513177:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000512737:exon_49248848_49249108:NME2;ENSG00000011052:ENST00000426182:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000503064:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393190:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000445778:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000243678:ENST00000393193:exon_49248848_49249105:NME1-NME2;ENSG00000243678:ENST00000393198:exon_49248848_49249103:NME1-NME2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 49365510 T/A 1 35 15 50 15.764122781304 8.24394737944113 7.5201754018629 A:T T A 10 0.549596491962742 0.0334298233873413 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49365390_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000514174:exon_49365390_49365541:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000515179:exon_49365485_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000504660:exon_49365390_49365564:UTP18;ENSG00000011260:ENST00000506849:exon_49365390_49365564:UTP18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 60525087 C/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000087995:ENST00000311506:exon_60525062_60525127:METTL2A;ENSG00000087995:ENST00000333483:exon_60525062_60525127:METTL2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 62007498 A/G 1 20 11 31 9.00807016074516 6.04556141159016 2.962508749155 A:G A G 10 0.549596491962742 0.367215183259266 ENSG00000007312:ENST00000392795:exon_62007434_62007745:CD79B;ENSG00000007312:ENST00000006750:exon_62007434_62007745:CD79B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 70120551 A/C 1 15 11 26 6.75605262055887 6.04556141159016 0.710491208968709 A:C A C 10 0.549596491962742 0.845577630679445 ENSG00000125398:ENST00000245479:exon_70119684_70122561:SOX9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 71201675 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 71241279 C/T 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 72859078 A/G 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 A:G A G 10 0.549596491962742 0.478611850072532 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 72862593 C/T 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72862568_72862690:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72862568_72862690:FDXR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 73035107 A/G 1 338 384 722 152.236385716593 211.045052913693 -58.8086671970997 A:T:G A G 10 0.549596491962742 1.17275950925421e-05 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73034955_73035158:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73034955_73035158:ATP5H HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 73038746 T/C 1 30 26 56 13.5121052411177 14.2895087910313 -0.777403549913551 T:C T C 10 0.549596491962742 0.893436638224957 ENSG00000167863:ENST00000301587:exon_73038624_73038754:ATP5H;ENSG00000167863:ENST00000344546:exon_73038624_73038754:ATP5H HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 73827205 T/C 1 11 12 23 4.95443858840984 6.5951579035529 -1.64071931514307 T:C T C 10 0.549596491962742 0.53401084593008 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73827179_73827250:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73827203_73827250:UNC13D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 73836162 C/G 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 C:G C G 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 74077301 A/C 1 126 141 267 56.7508420126945 77.4931053667466 -20.7422633540521 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0116021672265648 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 74266322 T/C 1 38 25 63 17.1153333054158 13.7399122990685 3.37542100634726 T:C T C 10 0.549596491962742 0.448085057544896 ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 74557698 G/A 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.198962600989567 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 74729792 G/A 1 34 37 71 15.3137192732668 20.3350702026215 -5.02135092935468 A:C:G G A 10 0.549596491962742 0.235465065883429 ENSG00000181038:ENST00000317409:exon_74729603_74729961:C17orf95;ENSG00000181038:ENST00000341249:exon_74729603_74729961:C17orf95 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 A:G G A 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 75190962 C/T 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000129657:ENST00000443798:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000430767:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000413679:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000436233:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000392476:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000262775:exon_75190759_75190993:SEC14L1;ENSG00000129657:ENST00000431431:exon_75190759_75190993:SEC14L1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 75494701 C/T 1 30 5 35 13.5121052411177 2.74798245981371 10.764122781304 T:C C T 10 0.549596491962742 0.000229806380790238 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 30 5 35 13.5121052411177 2.74798245981371 10.764122781304 A:G A G 10 0.549596491962742 0.000229806380790238 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 76697803 T/C 1 13 1 14 5.85524560448435 0.549596491962742 5.30564911252161 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00503298802908089 ENSG00000108669:ENST00000446868:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000361101:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000392453:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000472366:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000262763:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000434577:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000486140:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000416418:exon_76697753_76697833:CYTH1;ENSG00000108669:ENST00000490415:exon_76697754_76697833:CYTH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 76798453 C/T 1 51 44 95 22.9705789099002 24.1822456463606 -1.21166673646049 T:C C T 10 0.549596491962742 0.836950829127636 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76798406_76798617:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76798406_76798617:USP36 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78175483 T/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78175545 T/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000141527:ENST00000344227:exon_78175543_78175669:CARD14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78261928 C/T 1 30 20 50 13.5121052411177 10.9919298392548 2.5201754018629 T:C C T 10 0.549596491962742 0.570139860881985 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78262161 T/C 1 10 16 26 4.50403508037258 8.79354387140387 -4.28950879103129 T:C T C 10 0.549596491962742 0.114226480411308 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78263486 T/C 1 66 51 117 29.726631530459 28.0294210900998 1.69721044035919 A:T:C T C 10 0.549596491962742 0.781045055989605 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78263492 C/T 1 45 63 108 20.2681578616766 34.6245789936527 -14.3564211319761 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00654896792517168 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78263514 G/A 1 71 57 128 31.9786490706453 31.3270000418763 0.651649028769029 A:G G A 10 0.549596491962742 0.929439370546545 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78263458_78263636:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78263458_78263636:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78316974 T/C 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 T:C T C 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78316932_78317125:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78316932_78317125:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78319380 G/C 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 C:G G C 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78318478_78322086:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78318478_78322086:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78335528 C/A 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:C C A 10 0.549596491962742 0.308274899302516 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79478458 G/A 1 119 133 252 53.5980174564337 73.0963334310447 -19.498315974611 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0159746104559744 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79478214_79478652:ACTG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79516190 T/C 1 2 14 16 0.900807016074516 7.69435088747839 -6.79354387140387 T:C T C 10 0.549596491962742 0.000640663821988507 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79632208 G/A 1 87 90 177 39.1851051992414 49.4636842766468 -10.2785790774053 A:G G A 10 0.549596491962742 0.130804860924139 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 12 16 28 5.4048420964471 8.79354387140387 -3.38870177495678 T:G G T 10 0.549596491962742 0.254286596348908 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 111 91 202 49.9947893921356 50.0132807686095 -0.0184913764738752 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79891022 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79892586 A/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000183010:ENST00000337943:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79892529_79892621:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000402252:exon_79892529_79892621:PYCR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 79974724 C/T 1 25 14 39 11.2600877009315 7.69435088747839 3.56573681345306 T:C C T 10 0.549596491962742 0.264965577534127 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80016034 G/A 1 119 62 181 53.5980174564337 34.07498250169 19.5230349547437 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00351552807645769 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80015754_80016130:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80015782_80016130:DUS1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80019207 G/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 C:G G C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80019219 C/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C C T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80196816 C/T 1 22 26 48 9.90887717681968 14.2895087910313 -4.38063161421161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.245736850861654 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80196578_80197369:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80196578_80197354:SLC16A3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 20 18 38 9.00807016074516 9.89273685532936 -0.884666694584194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.870800441371767 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80361822 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80361813_80361966:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80361813_80361966:C17orf101 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 10 6 16 4.50403508037258 3.29757895177645 1.20645612859613 T:C T C 10 0.549596491962742 0.621751293599469 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80445891 G/A 1 35 26 61 15.764122781304 14.2895087910313 1.47461399027274 A:G G A 10 0.549596491962742 0.797199072707292 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80445792_80446141:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80445792_80446141:NARF HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80545021 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000141568:ENST00000473637:exon_80544939_80545148:FOXK2;ENSG00000141568:ENST00000335255:exon_80544939_80545148:FOXK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 17 80887244 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 672836 A/G 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 31 31 62 13.962508749155 17.037491250845 -3.07498250169 T:C C T 10 0.549596491962742 0.446228547727176 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 8 17 25 3.60322806429806 9.34314036336661 -5.73991229906855 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0260405038180599 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:C A C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 2610782 G/A 1 9 11 20 4.05363157233532 6.04556141159016 -1.99192983925484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.379628968718832 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2610758_2610860:NDC80 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 9255572 T/C 1 246 222 468 110.799262977165 122.010421215729 -11.2111582385632 T:C T C 10 0.549596491962742 0.306914972985534 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 9255959 C/T 1 357 320 677 160.794052369301 175.870877428077 -15.0768250587763 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.246773224262274 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 295 313 608 132.869034870991 172.023701984338 -39.1546671133471 A:T:G A G 10 0.549596491962742 0.00146892133691646 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 51 29 80 22.9705789099002 15.9382982669195 7.03228064298064 C:G C G 10 0.549596491962742 0.117236761710603 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 13666602 C/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13663346_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13663350_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13663350_13666712:C18orf19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 19153494 C/T 1 9 9 18 4.05363157233532 4.94636842766468 -0.892736855329355 T:C C T 10 0.549596491962742 0.813657851201133 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 19154713 G/C 1 28 32 60 12.6112982250432 17.5870877428077 -4.97578951776452 C:G G C 10 0.549596491962742 0.242688687998023 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 20577669 G/A 1 23 14 37 10.3592806848569 7.69435088747839 2.66492979737855 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.41263309038557 ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 21107740 G/A 1 14 7 21 6.30564911252161 3.84717544373919 2.45847366878242 A:G G A 10 0.549596491962742 0.381147637342633 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 29125854 A/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 33048617 G/A 1 33 16 49 14.8633157652295 8.79354387140387 6.06977189382564 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0862605769870564 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 33751048 G/A 1 57 44 101 25.6729999581237 24.1822456463606 1.49075431176306 A:G G A 10 0.549596491962742 0.841616683008584 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33751010_33751123:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33751010_33751123:ELP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 34322850 C/T 1 12 2 14 5.4048420964471 1.09919298392548 4.30564911252161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0284046570667369 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C T C 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 9 19 28 4.05363157233532 10.4423333472921 -6.38870177495677 T:C C T 10 0.549596491962742 0.021115326822451 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 55283236 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 55342174 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000081923:ENST00000283684:exon_55342066_55342254:ATP8B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 56202418 T/C 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C T C 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 56203891 G/T 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 T:G G T 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 56204250 A/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:C A C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 56204747 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 57000449 C/G 1 25 14 39 11.2600877009315 7.69435088747839 3.56573681345306 C:G C G 10 0.549596491962742 0.264965577534127 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57000323_57000476:LMAN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 60227833 T/C 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C T C 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60227820_60227877:ZCCHC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 61621773 G/A 1 12 27 39 5.4048420964471 14.839105282994 -9.43426318654694 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0032548934922982 ENSG00000221887:ENST00000408945:exon_61621642_61621791:HMSD;ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61621642_61621791:HMSD;ENSG00000221887:ENST00000526932:exon_61621673_61621791:HMSD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 71928150 C/T 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000166347:ENST00000340533:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000494131:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000397914:exon_71928150_71928179:CYB5A;ENSG00000166347:ENST00000299438:exon_71928150_71928179:CYB5A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 8 12 20 3.60322806429806 6.5951579035529 -2.99192983925484 A:C A C 10 0.549596491962742 0.186483128440231 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 31 23 54 13.962508749155 12.6407193151431 1.32178943401193 A:C A C 10 0.549596491962742 0.785153698661463 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 617862 G/A 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617777_617870:POLRMT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 868115 C/T 1 45 35 80 20.2681578616766 19.235877218696 1.03228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.910630231520974 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 868153 G/C 1 51 41 92 22.9705789099002 22.5334561704724 0.437122739427739 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 932381 A/G 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G A G 10 0.549596491962742 0.777647678747728 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 966555 C/T 1 29 19 48 13.0617017330805 10.4423333472921 2.61936838578839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.471941712656229 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1011149 G/T 1 17 13 30 7.65685963663339 7.14475439551565 0.512105241117741 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1011095_1011194:C19orf6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1012120 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1012065_1012187:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1012065_1012187:C19orf6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1032369 C/T 1 31 16 47 13.962508749155 8.79354387140387 5.16896487775113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.143898398105197 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1032419 G/A 1 18 25 43 8.10726314467064 13.7399122990685 -5.6326491543979 A:G G A 10 0.549596491962742 0.092678135837916 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1032391_1032457:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1032391_1032457:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1032391_1032457:CNN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 30 9 39 13.5121052411177 4.94636842766468 8.56573681345306 C:G C G 10 0.549596491962742 0.00582467623619623 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 31 8 39 13.962508749155 4.39677193570194 9.56573681345306 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00193651416305345 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1036552 T/C 1 28 15 43 12.6112982250432 8.24394737944113 4.3673508456021 A:T:C T C 10 0.549596491962742 0.220254188429617 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1036575 G/A 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1037563 A/G 0 19 0 19 8.5576666527079 0 8.5576666527079 A A 10 0.549596491962742 1.78418761902946e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1037584 C/T 0 19 0 19 8.5576666527079 0 8.5576666527079 C C 10 0.549596491962742 1.78418761902946e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1037857 C/T 1 42 70 112 18.9169473375648 38.4717544373919 -19.5548070998271 T:C C T 10 0.549596491962742 0.000270947744011173 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1057863 A/T 1 22 6 28 9.90887717681968 3.29757895177645 6.61129822504323 A:T A T 10 0.549596491962742 0.0128337647719907 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1077985 A/G 1 19 14 33 8.5576666527079 7.69435088747839 0.863315765229515 A:G A G 10 0.549596491962742 0.8617507901712 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1077856_1078044:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1077856_1078044:HMHA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 70 86 156 31.5282455626081 47.2652983087958 -15.7370527461877 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0124839505046780 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 16 7 23 7.20645612859613 3.84717544373919 3.35928068485693 T:C C T 10 0.549596491962742 0.208776635462957 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1434806 C/T 1 89 69 158 40.085912215316 37.9221579454292 2.16375426988677 T:C C T 10 0.549596491962742 0.749686070870838 ENSG00000071626:ENST00000233078:exon_1434736_1435683:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000336761:exon_1434736_1435683:DAZAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1478921 G/C 1 12 6 18 5.4048420964471 3.29757895177645 2.10726314467064 C:G G C 10 0.549596491962742 0.353463040154643 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1827565 A/G 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1826877_1828630:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1826877_1828630:REXO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 1997375 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 9 9 18 4.05363157233532 4.94636842766468 -0.892736855329355 A:G A G 10 0.549596491962742 0.813657851201133 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 9 13 22 4.05363157233532 7.14475439551565 -3.09112282318032 T:C T C 10 0.549596491962742 0.203602089664758 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2102135 G/A 1 11 21 32 4.95443858840984 11.5415263312176 -6.58708774280774 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0210955529583173 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2100993_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2100994_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2100994_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2100994_2102267:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2100994_2102267:AP3D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2109157 T/C 1 12 13 25 5.4048420964471 7.14475439551565 -1.73991229906855 T:C T C 10 0.549596491962742 0.548867312273124 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2109085_2109206:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2109085_2109206:AP3D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 10 6 16 4.50403508037258 3.29757895177645 1.20645612859613 A:G A G 10 0.549596491962742 0.621751293599469 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2248020 G/A 1 20 19 39 9.00807016074516 10.4423333472921 -1.43426318654694 A:G G A 10 0.549596491962742 0.748040323408759 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2417991 C/T 1 9 10 19 4.05363157233532 5.49596491962742 -1.4423333472921 T:C C T 10 0.549596491962742 0.64592105626115 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 2732725 C/T 1 39 32 71 17.5657368134531 17.5870877428077 -0.0213509293546785 T:C:G C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3452644 G/T 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 T:G G T 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3452480_3452664:NFIC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3544812 C/T 1 17 24 41 7.65685963663339 13.1903158071058 -5.53345617047242 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0863300964569521 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3544867 C/T 1 13 16 29 5.85524560448435 8.79354387140387 -2.93829826691952 T:C C T 10 0.549596491962742 0.350982551644248 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3573792 G/A 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000064961:ENST00000416526:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000470356:exon_3573690_3574267:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000333651:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000417382:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000453933:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000435022:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000402569:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000262949:exon_3573690_3573798:HMG20B;ENSG00000064961:ENST00000488973:exon_3573690_3574584:HMG20B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3765309 G/A 1 44 38 82 19.8177543536394 20.8846666945842 -1.06691234094484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.825130943393857 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3765164_3765329:MRPL54 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3767265 C/T 1 51 55 106 22.9705789099002 30.2278070579508 -7.25722814805065 T:C C T 10 0.549596491962742 0.171871514048520 ENSG00000183617:ENST00000330133:exon_3767259_3767562:MRPL54 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3977558 G/A 1 111 88 199 49.9947893921356 48.3644912927213 1.63029809941435 A:G G A 10 0.549596491962742 0.831126201486395 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3977426_3977608:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3977426_3977608:EEF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 3983184 A/G 1 21 18 39 9.45847366878242 9.89273685532936 -0.434263186546936 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3983108_3983289:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3983108_3983289:EEF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4262036 C/T 1 12 4 16 5.4048420964471 2.19838596785097 3.20645612859613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.13376415246686 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4409511 A/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4409752 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4446385 C/G 1 25 26 51 11.2600877009315 14.2895087910313 -3.02942109009984 C:G C G 10 0.549596491962742 0.402150754110994 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4446280_4446410:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4446280_4446410:UBXN6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4447595 G/A 1 9 11 20 4.05363157233532 6.04556141159016 -1.99192983925484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.379628968718832 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4447547_4447622:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4447547_4447622:UBXN6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 10 15 25 4.50403508037258 8.24394737944113 -3.73991229906855 T:C C T 10 0.549596491962742 0.160033758259519 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4493708 A/G 1 13 6 19 5.85524560448435 3.29757895177645 2.5576666527079 A:G A G 10 0.549596491962742 0.259451987278943 ENSG00000167674:ENST00000429822:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000301284:exon_4493700_4493859:AC011498.1;ENSG00000167674:ENST00000398364:exon_4493700_4493859:AC011498.1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 33 41 74 14.8633157652295 22.5334561704724 -7.6701404052429 A:G A G 10 0.549596491962742 0.079892222414792 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 4670313 C/G 1 13 8 21 5.85524560448435 4.39677193570194 1.45847366878242 C:G C G 10 0.549596491962742 0.662244898432161 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 5914625 G/A 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914574_5914751:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914574_5914751:CAPS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6368678 T/C 1 94 72 166 42.3379297555023 39.5709474213174 2.76698233418484 T:C T C 10 0.549596491962742 0.696930145577512 ENSG00000125656:ENST00000245816:exon_6368549_6368915:CLPP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6374496 C/T 1 42 33 75 18.9169473375648 18.1366842347705 0.780263102794354 T:C C T 10 0.549596491962742 0.907895634051535 ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374476_6374600:ALKBH7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6426396 C/T 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000181240:ENST00000321510:exon_6426050_6426572:SLC25A41;ENSG00000181240:ENST00000458275:exon_6426050_6426572:SLC25A41 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6468959 C/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468857_6468964:DENND1C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6535080 T/C 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C T C 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6534611_6535939:TNFSF9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6742955 C/G 1 10 9 19 4.50403508037258 4.94636842766468 -0.442333347292097 C:G C G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6755007 T/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 6937658 C/T 0 0 15 15 0 8.24394737944113 -8.24394737944113 T C T 10 0.549596491962742 6.36834329121374e-06 ENSG00000174837:ENST00000312053:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000450315:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381407:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000381404:exon_6937555_6937659:EMR1;ENSG00000174837:ENST00000250572:exon_6937555_6937659:EMR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7703565 G/A 1 22 30 52 9.90887717681968 16.4878947588823 -6.57901758206258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0709594514625063 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7703605 C/T 1 30 17 47 13.5121052411177 9.34314036336661 4.16896487775113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.243176390958123 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 28 23 51 12.6112982250432 12.6407193151431 -0.0294210900998397 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7712109 C/G 1 42 30 72 18.9169473375648 16.4878947588823 2.42905257868258 C:G C G 10 0.549596491962742 0.636109199055036 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712048_7712133:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712048_7712133:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712048_7712133:STXBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7712364 A/G 1 101 89 190 45.4907543117631 48.914087784684 -3.42333347292097 A:G A G 10 0.549596491962742 0.661900925503135 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7712417 A/G 1 19 9 28 8.5576666527079 4.94636842766468 3.61129822504323 A:G A G 10 0.549596491962742 0.188013094487455 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 13 21 34 5.85524560448435 11.5415263312176 -5.68628072673323 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0579073974148413 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 244 220 464 109.898455961091 120.911228231803 -11.0127722707123 A:G G A 10 0.549596491962742 0.305136629930937 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7754226 G/A 1 113 75 188 50.8955964082102 41.2197368972056 9.67585951100451 A:G G A 10 0.549596491962742 0.164090060076161 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 7916620 A/G 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000142459:ENST00000270530:exon_7916567_7916656:EVI5L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 8000001 C/T 1 40 34 74 18.0161403214903 18.6862807267332 -0.670140405242904 T:C C T 10 0.549596491962742 0.907296505278292 ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7999950_8000030:TIMM44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 8468349 C/T 1 16 20 36 7.20645612859613 10.9919298392548 -3.78547371065871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.241508643015895 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 8532459 C/T 1 24 15 39 10.8096841928942 8.24394737944113 2.56573681345306 T:C C T 10 0.549596491962742 0.426715750295977 ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8532419_8532468:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8532419_8532468:HNRNPM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 8576670 C/T 1 21 9 30 9.45847366878242 4.94636842766468 4.51210524111774 T:C C T 10 0.549596491962742 0.102600097855829 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8576501_8576844:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8576501_8576844:ZNF414 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:T A T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 9771458 C/G 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000171466:ENST00000453372:exon_9771396_9771550:ZNF562;ENSG00000171466:ENST00000293648:exon_9771396_9771550:ZNF562;ENSG00000171466:ENST00000448622:exon_9771396_9771497:ZNF562 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 9869168 C/A 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:C C A 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000196605:ENST00000397902:exon_9868151_9869440:ZNF846 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10225138 G/A 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 A:G G A 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10225434 C/G 1 18 7 25 8.10726314467064 3.84717544373919 4.26008770093145 C:G C G 10 0.549596491962742 0.107691913974533 ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10395468 G/A 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10446437 G/A 1 26 15 41 11.7104912089687 8.24394737944113 3.46654382952758 A:G G A 10 0.549596491962742 0.346565159712555 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10446347_10446652:ICAM3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10463732 G/T 1 16 19 35 7.20645612859613 10.4423333472921 -3.23587721869597 T:G G T 10 0.549596491962742 0.309525234823689 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530220:exon_10463602_10463932:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529422:exon_10463698_10463813:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463602_10463774:TYK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10464687 A/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10464694 T/C 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10468634 G/A 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 A:G G A 10 0.549596491962742 0.79130236160194 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 C:G G C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 18 13 31 8.10726314467064 7.14475439551565 0.962508749154999 A:G A G 10 0.549596491962742 0.857203754998479 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10668452 A/G 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10794630 G/T 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10939792 T/C 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C T C 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 10943652 C/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000099203:ENST00000214869:exon_10943115_10943889:TMED1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 11 18 29 4.95443858840984 9.89273685532936 -4.93829826691952 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0913444319230672 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 11618526 C/T 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 11618568 C/T 1 5 8 13 2.25201754018629 4.39677193570194 -2.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.271985568998683 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 11618623 T/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 11624081 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11623871_11624094:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000252440:exon_11623871_11624094:ECSIT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 11976947 C/T 1 2 12 14 0.900807016074516 6.5951579035529 -5.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00240089535777212 ENSG00000171291:ENST00000304030:exon_11976772_11977146:ZNF439 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 12383540 G/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000197857:ENST00000397742:exon_12383302_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000356109:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000457673:exon_12382627_12384878:ZNF44;ENSG00000197857:ENST00000355684:exon_12383144_12384878:ZNF44 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 12772090 C/T 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 12779170 G/A 1 221 199 420 99.539175276234 109.369701900586 -9.83052662435162 A:G G A 10 0.549596491962742 0.351541806273889 ENSG00000105583:ENST00000222190:exon_12778881_12779239:C19orf56 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 12788003 C/T 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000095059:ENST00000210060:exon_12787922_12788025:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000441196:exon_12787922_12788025:DHPS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 12790506 C/G 1 12 5 17 5.4048420964471 2.74798245981371 2.65685963663339 C:G C G 10 0.549596491962742 0.229407484550802 ENSG00000095059:ENST00000351660:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000210060:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000393273:exon_12790437_12790533:DHPS;ENSG00000095059:ENST00000441196:exon_12790437_12790533:DHPS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 13008607 G/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:G G T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13008517_13008677:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13008517_13008677:GCDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 13059147 A/G 1 5 10 15 2.25201754018629 5.49596491962742 -3.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.119533522846197 ENSG00000179262:ENST00000316856:exon_13058991_13059172:RAD23A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 13216136 T/C 1 86 104 190 38.7347016912042 57.1580351641252 -18.423333472921 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00851200437144236 ENSG00000104907:ENST00000221504:exon_13216081_13216210:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13216081_13216210:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13216081_13216210:TRMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 13216221 G/A 1 31 46 77 13.962508749155 25.2814386302861 -11.3189298811311 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0113759332197982 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 13873187 G/A 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 A:G G A 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13873113_13873251:CCDC130 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 13873464 C/A 1 18 11 29 8.10726314467064 6.04556141159016 2.06170173308048 A:C C A 10 0.549596491962742 0.463043069829507 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13873404_13874106:CCDC130 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14038842 C/T 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14277727 T/G 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:G T G 10 0.549596491962742 0.527605575122862 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14499613 C/T 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14499514_14499630:CD97 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14512260 A/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 A:T A T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512198_14512375:CD97 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14574959 G/A 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 A:G G A 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14574872_14574965:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14574872_14574965:PKN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14589378 C/T 1 9 11 20 4.05363157233532 6.04556141159016 -1.99192983925484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.379628968718832 ENSG00000123159:ENST00000393031:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000345425:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393028:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393029:exon_14588572_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000393033:exon_14588574_14589379:GIPC1;ENSG00000123159:ENST00000351277:exon_14588574_14589379:GIPC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 14705509 T/C 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.526899495928415 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 15226970 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 15366205 G/A 1 50 48 98 22.5201754018629 26.3806316142116 -3.86045621234872 A:G G A 10 0.549596491962742 0.477586690839239 ENSG00000141867:ENST00000263377:exon_15366108_15366403:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000371835:exon_15366108_15366403:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000392878:exon_15366108_15366403:BRD4;ENSG00000141867:ENST00000360016:exon_15366108_15366403:BRD4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 15480981 G/A 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15480957_15480990:AKAP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17163775 G/A 1 3 15 18 1.35121052411177 8.24394737944113 -6.89273685532936 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00133828970713268 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17301863 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17305440 T/C 1 20 14 34 9.00807016074516 7.69435088747839 1.31371927326677 T:C T C 10 0.549596491962742 0.731714148308966 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17339112 G/A 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.672878774007803 ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17339065_17339118:OCEL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 30 41 71 13.5121052411177 22.5334561704724 -9.02135092935468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0418283454234488 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17628669 G/A 1 11 12 23 4.95443858840984 6.5951579035529 -1.64071931514307 A:G G A 10 0.549596491962742 0.53401084593008 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 17631905 G/C 1 66 103 169 29.726631530459 56.6084386721624 -26.8818071417034 C:G G C 10 0.549596491962742 3.72053444310798e-05 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17631753_17632095:PGLS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 18186575 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000096996:ENST00000430026:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000221270:exon_18186559_18186678:IL12RB1;ENSG00000096996:ENST00000322153:exon_18186559_18186678:IL12RB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 18285944 G/A 1 335 250 585 150.885175192481 137.399122990685 13.486052201796 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.279999323035192 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 18288642 A/G 1 4 24 28 1.80161403214903 13.1903158071058 -11.3887017749568 A:G A G 10 0.549596491962742 1.16446742895625e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 18305824 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 19010736 G/A 1 255 258 513 114.852894549501 141.795894926387 -26.9430003768866 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0186086273083998 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19010682_19010756:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19010682_19010756:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19010682_19010756:COPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 29 32 61 13.0617017330805 17.5870877428077 -4.52538600972726 A:G G A 10 0.549596491962742 0.249722619352875 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 19 19 38 8.5576666527079 10.4423333472921 -1.88466669458419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.625449331077231 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 19042182 G/A 0 15 0 15 6.75605262055887 0 6.75605262055887 G G 10 0.549596491962742 0.000249014924878174 ENSG00000051128:ENST00000221222:exon_19042134_19042220:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000433218:exon_19042134_19042220:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000355887:exon_19042134_19042220:HOMER3;ENSG00000051128:ENST00000392351:exon_19042134_19042220:HOMER3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 19312540 C/T 1 230 147 377 103.592806848569 80.7906843185231 22.8021225300463 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0197469884744089 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 21720616 T/C 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 23837365 A/C 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 A:C A C 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 30500017 T/C 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 T:C T C 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000105176:ENST00000360605:exon_30499912_30500260:C19orf2;ENSG00000105176:ENST00000392271:exon_30499912_30500260:C19orf2;ENSG00000105176:ENST00000312051:exon_30499912_30500260:C19orf2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 33870574 A/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 34890198 G/C 1 141 88 229 63.5068946332534 48.3644912927213 15.1424033405321 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0463236494368819 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34890112_34890240:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34890112_34890240:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34890112_34890240:GPI HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 34957860 A/G 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34957783_34957919:UBA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 35501051 T/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35500996_35501099:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35500996_35501099:GRAMD1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 35516949 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 35646513 A/C 1 32 49 81 14.4129122571923 26.9302281061744 -12.5173158489821 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0069855198644786 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35645627_35646514:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35646454_35646514:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35646454_35646514:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35646454_35646514:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35645676_35646514:FXYD5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 31 18 49 13.962508749155 9.89273685532936 4.06977189382564 A:G A G 10 0.549596491962742 0.2545734441543 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 35829381 A/G 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 A:G A G 10 0.549596491962742 0.803195989938746 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 36494297 C/T 1 3 10 13 1.35121052411177 5.49596491962742 -4.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0253520306669052 ENSG00000181392:ENST00000505054:exon_36494209_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000397428:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000503121:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000340477:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000324444:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000465425:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000490730:exon_36494212_36494422:C19orf46 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 38873867 C/A 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39090702 G/A 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39100688 G/A 1 51 40 91 22.9705789099002 21.9838596785097 0.986719231390481 A:G G A 10 0.549596491962742 0.916180835821584 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39220105 G/C 1 60 83 143 27.0242104822355 45.6165088329076 -18.5922983506721 C:G G C 10 0.549596491962742 0.00236353908045127 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219914_39222223:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39220092_39220307:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219914_39222223:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219914_39220460:ACTN4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39322027 G/A 1 36 39 75 16.2145262893413 21.4342631865469 -5.21973689720565 A:G G A 10 0.549596491962742 0.246487081373406 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39336280 C/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 C:G C G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39421928 T/C 1 3 12 15 1.35121052411177 6.5951579035529 -5.24394737944113 T:C T C 10 0.549596491962742 0.00805915500769448 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39421594_39421983:MRPS12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39423001 T/C 1 10 7 17 4.50403508037258 3.84717544373919 0.656859636633387 T:C T C 10 0.549596491962742 0.8116374148793 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39423310 G/A 1 21 12 33 9.45847366878242 6.5951579035529 2.86331576522952 A:G G A 10 0.549596491962742 0.382896406408613 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39819153 C/T 1 244 262 506 109.898455961091 143.994280894238 -34.0958249331474 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.00272405993429541 ENSG00000130755:ENST00000253054:exon_39819010_39819188:GMFG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39898667 C/T 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 44118461 G/A 1 17 6 23 7.65685963663339 3.29757895177645 4.35928068485693 A:G G A 10 0.549596491962742 0.092035408510515 ENSG00000226763:ENST00000526798:exon_44116179_44118649:SRRM5;ENSG00000226763:ENST00000417606:exon_44116253_44118649:SRRM5;ENSG00000131116:ENST00000300811:exon_44118381_44118586:ZNF428;ENSG00000131116:ENST00000391964:exon_44118381_44118586:ZNF428 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 44740716 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45496032 G/A 1 17 12 29 7.65685963663339 6.5951579035529 1.06170173308048 A:G G A 10 0.549596491962742 0.714107421377589 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45575663 T/G 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:G T G 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45911436 G/A 1 7 11 18 3.15282455626081 6.04556141159016 -2.89273685532936 A:G G A 10 0.549596491962742 0.235754067257629 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45912002 A/C 1 24 10 34 10.8096841928942 5.49596491962742 5.31371927326677 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0838951302229201 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45912257 C/T 1 16 23 39 7.20645612859613 12.6407193151431 -5.43426318654694 T:C C T 10 0.549596491962742 0.106391021516763 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45912341 C/T 1 24 24 48 10.8096841928942 13.1903158071058 -2.38063161421162 T:C C T 10 0.549596491962742 0.562305545122023 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45912343 A/G 1 24 25 49 10.8096841928942 13.7399122990685 -2.93022810617436 A:G A G 10 0.549596491962742 0.473233822817393 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 45912406 G/A 1 17 20 37 7.65685963663339 10.9919298392548 -3.33507020262145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.322003568193470 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 46005288 G/A 1 8 16 24 3.60322806429806 8.79354387140387 -5.19031580710581 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0397739056848345 ENSG00000213889:ENST00000401705:exon_46005275_46005557:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000456399:exon_46005275_46005452:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000396737:exon_46005275_46005600:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000396734:exon_46005275_46005762:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000424939:exon_46005275_46005762:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000441726:exon_46005275_46005762:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000415077:exon_46005275_46005600:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000324688:exon_46005275_46005566:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000396735:exon_46005275_46005768:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000401593:exon_46005275_46005568:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000402807:exon_46005275_46005363:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000477815:exon_46005275_46005599:PPM1N;ENSG00000213889:ENST00000396736:exon_46005275_46005568:PPM1N HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 46129999 C/A 1 16 5 21 7.20645612859613 2.74798245981371 4.45847366878242 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0768187951395257 ENSG00000125746:ENST00000245925:exon_46129963_46130097:EML2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 46206220 G/A 1 15 13 28 6.75605262055887 7.14475439551565 -0.388701774956775 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46206162_46206586:QPCTL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 46387503 T/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 47181753 G/A 1 20 12 32 9.00807016074516 6.5951579035529 2.41291225719226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.478355276538399 ENSG00000105287:ENST00000454760:exon_47181653_47181920:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000449438:exon_47181623_47181920:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000433867:exon_47181653_47181920:PRKD2;ENSG00000105287:ENST00000291281:exon_47181653_47181920:PRKD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 47673098 A/G 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000142230:ENST00000414294:exon_47673075_47673180:SAE1;ENSG00000142230:ENST00000270225:exon_47673075_47673180:SAE1;ENSG00000142230:ENST00000413379:exon_47673075_47673180:SAE1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49377120 C/T 1 26 16 42 11.7104912089687 8.79354387140387 2.91694733756484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.438825638938081 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 59 49 108 26.5738069741982 26.9302281061744 -0.356421131976134 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 109 85 194 49.0939823760611 46.7157018168331 2.37828055922806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.773032608039799 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 145 111 256 65.3085086654024 61.0052106078644 4.30329805753806 C:G G C 10 0.549596491962742 0.615576345657995 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49459104 A/G 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49469087 T/C 1 311 248 559 140.075490999587 136.29993000676 3.77556099282725 T:C T C 10 0.549596491962742 0.766147949164959 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49950356 C/G 1 52 39 91 23.4209824179374 21.4342631865469 1.98671923139048 C:G C G 10 0.549596491962742 0.752181478742311 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49950281_49950356:PIH1D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49954803 C/T 1 12 6 18 5.4048420964471 3.29757895177645 2.10726314467064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.353463040154643 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49954807 T/G 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:G T G 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49954742_49955067:PIH1D1;ENSG00000104872:ENST00000416312:exon_49954742_49955067:PIH1D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49967680 G/A 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49971749 G/A 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 A:G G A 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49971638_49971823:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49971638_49971823:ALDH16A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49983673 C/T 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49983555_49983733:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49983555_49983733:FLT3LG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49994470 T/A 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 A:T T A 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 49994476 T/C 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50189442 G/C 1 91 98 189 40.9867192313905 53.8604562123487 -12.8737369809582 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0673850678126511 ENSG00000126457:ENST00000532489:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391851:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000351853:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000419451:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000454376:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000408976:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000391849:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000530361:exon_50189350_50189500:PRMT1;ENSG00000126457:ENST00000528126:exon_50188981_50189500:PRMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50339548 G/A 1 19 17 36 8.5576666527079 9.34314036336661 -0.78547371065871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.867474879117842 ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50339483_50339663:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50339483_50339618:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50339483_50339663:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50339483_50339663:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377070:exon_50339483_50339807:MED25 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:G T G 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50368450 G/T 1 35 23 58 15.764122781304 12.6407193151431 3.12340346616097 T:G G T 10 0.549596491962742 0.431508375756721 ENSG00000039650:ENST00000322344:exon_50368384_50368683:PNKP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50393061 T/C 1 629 966 1595 283.303806555435 530.910211236009 -247.606404680573 T:C:G T C 10 0.549596491962742 1.82801280011426e-35 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50399126 G/A 1 68 88 156 30.6274385465335 48.3644912927213 -17.7370527461877 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00476586260921766 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50399072_50399310:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50399072_50399310:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50399072_50399310:IL4I1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50412295 C/A 1 14 6 20 6.30564911252161 3.29757895177645 3.00807016074516 A:C C A 10 0.549596491962742 0.260718294227868 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 184 79 263 82.8742454788555 43.4181228650566 39.4561226137989 T:C T C 10 0.549596491962742 8.16885707538204e-07 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 51323473 C/G 1 21 22 43 9.45847366878242 12.0911228231803 -2.6326491543979 C:G C G 10 0.549596491962742 0.446131561329435 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323410_51323699:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323410_51323767:KLK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 52471872 A/G 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G A G 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 52663781 G/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196267:ENST00000322146:exon_52663718_52663844:ZNF836;ENSG00000196267:ENST00000457013:exon_52663718_52663844:ZNF836 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 54611560 C/G 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 C:G C G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 54660604 G/A 1 7 15 22 3.15282455626081 8.24394737944113 -5.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0327707442946103 ENSG00000105617:ENST00000222224:exon_54660501_54660763:LENG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 54697079 C/T 1 14 6 20 6.30564911252161 3.29757895177645 3.00807016074516 T:C C T 10 0.549596491962742 0.260718294227868 ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54697030_54697521:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54697030_54697173:TSEN34 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 54966579 C/G 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54966543_54966622:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54966543_54966746:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54966543_54966746:LENG8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 54968079 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 54973280 C/G 1 5 10 15 2.25201754018629 5.49596491962742 -3.24394737944113 C:G C G 10 0.549596491962742 0.119533522846197 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 T:C T C 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 55148331 C/T 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 36 61 97 16.2145262893413 33.5253860097273 -17.310859720386 A:G G A 10 0.549596491962742 0.000473886910174408 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 56114045 C/T 1 1 8 9 0.450403508037258 4.39677193570194 -3.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0137150888612322 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 56114237 G/A 1 12 19 31 5.4048420964471 10.4423333472921 -5.037491250845 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0733682530625384 ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 56180968 C/T 1 30 37 67 13.5121052411177 20.3350702026215 -6.82296496150371 T:C C T 10 0.549596491962742 0.11007014675304 ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 19 58371175 G/A 1 17 7 24 7.65685963663339 3.84717544373919 3.80968419289419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.150952441139105 ENSG00000198466:ENST00000423137:exon_58369944_58371578:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000339656:exon_58369944_58376485:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000419854:exon_58369944_58375409:ZNF587 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 264985 G/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_264869_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_264872_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_264893_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000407983:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_264900_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000439645:exon_264916_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405364:exon_264919_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000405233:exon_264926_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000480874:exon_264936_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_264963_265007:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_264965_265007:ACP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 29 25 54 13.0617017330805 13.7399122990685 -0.678210565988067 A:G A G 10 0.549596491962742 0.891678869873845 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 3469463 G/C 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 C:G G C 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 3483181 C/T 1 78 45 123 35.1314736269061 24.7318421383234 10.3996314885827 T:C C T 10 0.549596491962742 0.069539191396339 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 61 40 101 27.4746139902727 21.9838596785097 5.49075431176306 T:C C T 10 0.549596491962742 0.31732981381158 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 3502709 A/G 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 8998971 T/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000143797:ENST00000305997:exon_8992820_8999034:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000498055:exon_8998251_8999034:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000471753:exon_8998479_8999034:MBOAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 9547660 G/A 1 21 2 23 9.45847366878242 1.09919298392548 8.35928068485694 A:G G A 10 0.549596491962742 0.000238253027145868 ENSG00000119185:ENST00000360635:exon_9547578_9547727:ITGB1BP1;ENSG00000119185:ENST00000355346:exon_9547578_9547727:ITGB1BP1;ENSG00000119185:ENST00000490426:exon_9547578_9547727:ITGB1BP1;ENSG00000119185:ENST00000464228:exon_9547578_9547727:ITGB1BP1;ENSG00000119185:ENST00000460720:exon_9547578_9547727:ITGB1BP1;ENSG00000119185:ENST00000359712:exon_9546790_9547727:ITGB1BP1;ENSG00000119185:ENST00000456913:exon_9547159_9547727:ITGB1BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 9731495 T/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 10269548 T/A 1 19 12 31 8.5576666527079 6.5951579035529 1.962508749155 A:T T A 10 0.549596491962742 0.589053190858293 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10269361_10271545:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10269361_10271545:RRM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 27290525 A/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 27439401 T/C 1 40 38 78 18.0161403214903 20.8846666945842 -2.86852637309387 T:C T C 10 0.549596491962742 0.569738212093557 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439391_27439488:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439391_27439488:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439242_27439488:C2orf28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 27464988 G/A 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27464789_27464991:CAD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 27667297 A/G 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000138002:ENST00000260570:exon_27667238_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000509128:exon_27667244_27667388:IFT172;ENSG00000138002:ENST00000507184:exon_27667265_27667388:IFT172 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 29135468 C/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 C:G C G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29135456_29135576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29135456_29135576:WDR43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 29152456 A/G 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G A G 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 30480445 A/G 1 10 6 16 4.50403508037258 3.29757895177645 1.20645612859613 A:G A G 10 0.549596491962742 0.621751293599469 ENSG00000213626:ENST00000395323:exon_30480299_30482894:LBH;ENSG00000213626:ENST00000406087:exon_30480299_30480522:LBH;ENSG00000213626:ENST00000401506:exon_30480299_30480626:LBH;ENSG00000213626:ENST00000467242:exon_30480299_30480906:LBH;ENSG00000213626:ENST00000407930:exon_30480299_30481189:LBH;ENSG00000213626:ENST00000484150:exon_30480299_30480566:LBH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C C T 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 37336403 G/C 1 23 19 42 10.3592806848569 10.4423333472921 -0.0830526624351613 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000462861:exon_37336337_37336643:EIF2AK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 37430140 T/G 1 38 31 69 17.1153333054158 17.037491250845 0.0778420545708052 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000218739:ENST00000402297:exon_37429006_37431884:AC007390.5;ENSG00000115816:ENST00000234170:exon_37430093_37430151:CEBPZ;ENSG00000115816:ENST00000489306:exon_37430093_37430151:CEBPZ HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 42508048 C/T 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42507990_42508113:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42507990_42508113:EML4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 42528515 C/G 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 C:G C G 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42528381_42528532:EML4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 12 15 27 5.4048420964471 8.24394737944113 -2.83910528299403 T:C T C 10 0.549596491962742 0.334201928306803 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 13 11 24 5.85524560448435 6.04556141159016 -0.190315807105807 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 55200287 C/T 1 18 26 44 8.10726314467064 14.2895087910313 -6.18224564636065 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0691444090043832 ENSG00000115310:ENST00000394609:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000405240:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357376:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000317610:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357732:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000394611:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000404909:exon_55199325_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000486085:exon_55199721_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000491592:exon_55199932_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000485749:exon_55199933_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000354474:exon_55199950_55200334:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000402434:exon_55199950_55200334:RTN4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 55462523 G/A 1 6 11 17 2.70242104822355 6.04556141159016 -3.34314036336661 A:G G A 10 0.549596491962742 0.142293766298503 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 58688709 C/A 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 C C 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 61175312 T/C 1 11 4 15 4.95443858840984 2.19838596785097 2.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.197162377924665 ENSG00000162927:ENST00000316752:exon_61175178_61175320:PUS10;ENSG00000162927:ENST00000407787:exon_61175178_61175320:PUS10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 61415492 A/G 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000173209:ENST00000403692:exon_61415044_61416060:AHSA2;ENSG00000115464:ENST00000434085:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398569:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000263989:exon_61414591_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000411912:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000398571:exon_61414598_61415844:USP34;ENSG00000115464:ENST00000436269:exon_61414685_61415844:USP34 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 62053619 C/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62051983_62053734:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62051989_62053734:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62051991_62053734:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62051991_62053734:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62051991_62053734:FAM161A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 62100380 G/T 1 12 18 30 5.4048420964471 9.89273685532936 -4.48789475888226 T:G G T 10 0.549596491962742 0.140824550400342 ENSG00000115484:ENST00000394440:exon_62100332_62100428:CCT4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 63826366 C/T 1 31 26 57 13.962508749155 14.2895087910313 -0.327000041876293 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000014641:ENST00000233114:exon_63826304_63826426:MDH1;ENSG00000014641:ENST00000409476:exon_63826304_63826426:MDH1;ENSG00000014641:ENST00000436321:exon_63826304_63826422:MDH1;ENSG00000014641:ENST00000432309:exon_63826304_63826426:MDH1;ENSG00000014641:ENST00000421012:exon_63826304_63826426:MDH1;ENSG00000014641:ENST00000394423:exon_63826304_63826426:MDH1;ENSG00000014641:ENST00000484538:exon_63826304_63827186:MDH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 10 12 22 4.50403508037258 6.5951579035529 -2.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.397782719259223 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 65248136 C/T 1 15 10 25 6.75605262055887 5.49596491962742 1.26008770093145 T:C C T 10 0.549596491962742 0.690466238138788 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 65248271 G/A 1 11 8 19 4.95443858840984 4.39677193570194 0.557666652707903 A:G G A 10 0.549596491962742 0.822816223025556 ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 68613710 G/A 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68613634_68613818:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68613634_68613818:PLEK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 68622990 T/C 1 16 4 20 7.20645612859613 2.19838596785097 5.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0252001527197468 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 69723160 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69723117_69723212:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000477587:exon_69723117_69723212:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000489327:exon_69723117_69723212:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69723117_69723212:AAK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 70508753 G/T 1 26 35 61 11.7104912089687 19.235877218696 -7.52538600972726 T:G G T 10 0.549596491962742 0.0545707388125765 ENSG00000143977:ENST00000272348:exon_70508494_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000429728:exon_70508499_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000482975:exon_70508636_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000438261:exon_70508637_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000454893:exon_70508639_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000413456:exon_70508639_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000449935:exon_70508640_70508816:SNRPG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 71376999 G/A 1 81 60 141 36.4826841510179 32.9757895177645 3.50689463325338 A:G G A 10 0.549596491962742 0.611754085000378 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71376996_71377230:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000493360:exon_71376996_71377231:MPHOSPH10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 71654478 G/A 1 39 43 82 17.5657368134531 23.6326491543979 -6.06691234094484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.184417134762883 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000461991:exon_71654413_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000492262:exon_71654425_71654544:ZNF638 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 73471840 C/T 1 31 41 72 13.962508749155 22.5334561704724 -8.57094742131742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0444954585923243 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73471672_73471843:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409924:exon_73471672_73471843:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73471672_73471843:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000473786:exon_73471672_73471843:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000488856:exon_73471672_73471843:CCT7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 67 38 105 30.1770350384963 20.8846666945842 9.29236834391209 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0772376042535357 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 73478461 A/T 1 98 102 200 44.1395437876513 56.0588421801997 -11.9192983925484 A:T:G A T 10 0.549596491962742 0.101945985394417 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73478354_73478560:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73478354_73478560:CCT7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 74274744 T/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000187605:ENST00000305799:exon_74273405_74275538:TET3;ENSG00000187605:ENST00000409262:exon_74273450_74275538:TET3;ENSG00000187605:ENST00000233310:exon_74273450_74275538:TET3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 74589792 G/A 1 11 10 21 4.95443858840984 5.49596491962742 -0.541526331217581 A:G G A 10 0.549596491962742 0.829710755643621 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000491465:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000492717:exon_74589777_74590056:DCTN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 74682512 C/T 0 10 0 10 4.50403508037258 0 4.50403508037258 C C 10 0.549596491962742 0.00285800173360387 ENSG00000115274:ENST00000471577:exon_74682235_74682725:INO80B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 74690039 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 74754902 T/C 1 91 82 173 40.9867192313905 45.0669123409448 -4.08019310955436 A:T:C T C 10 0.549596491962742 0.541820289360096 ENSG00000115307:ENST00000425118:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000377526:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000459792:exon_74754863_74755287:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000456927:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000258081:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000463900:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000466894:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000486234:exon_74754863_74755212:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000412627:exon_74754863_74754965:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000464887:exon_74754863_74755448:AUP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 74783977 G/A 1 24 22 46 10.8096841928942 12.0911228231803 -1.28143863028613 A:G G A 10 0.549596491962742 0.767618535428383 ENSG00000115325:ENST00000409429:exon_74783435_74784663:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000233668:exon_74783435_74784681:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000340004:exon_74783435_74784678:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000489958:exon_74783435_74784312:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000480318:exon_74783435_74784241:DOK1;ENSG00000115325:ENST00000464613:exon_74783435_74784640:DOK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85786074 G/A 1 5 12 17 2.25201754018629 6.5951579035529 -4.34314036336661 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0486303018585182 ENSG00000115486:ENST00000233838:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000430215:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000423570:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000428479:exon_85786040_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000421496:exon_85786069_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000481541:exon_85785707_85786198:GGCX;ENSG00000115486:ENST00000496962:exon_85785848_85786198:GGCX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85806266 C/T 1 177 127 304 79.7214209225947 69.7987544792682 9.92266644332645 T:C C T 10 0.549596491962742 0.2734662457946 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 280 246 526 126.112982250432 135.200737022835 -9.08775477240226 T:C C T 10 0.549596491962742 0.430542068876745 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85823764 C/G 1 163 149 312 73.4157718100731 81.8898773024486 -8.4741054923755 A:C:G C G 10 0.549596491962742 0.334199933512744 ENSG00000168894:ENST00000461845:exon_85823642_85824139:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000414390:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85823642_85823772:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85823642_85823772:RNF181 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85824251 T/C 1 261 174 435 117.555315597724 95.6297896015171 21.9255259962072 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0381516859730355 ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85836063 C/T 1 14 8 22 6.30564911252161 4.39677193570194 1.90887717681968 T:C C T 10 0.549596491962742 0.522024354878786 ENSG00000168887:ENST00000306336:exon_85833777_85836190:C2orf68;ENSG00000168887:ENST00000420686:exon_85835407_85836190:C2orf68;ENSG00000168887:ENST00000423181:exon_85835690_85836190:C2orf68 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 85925680 T/G 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 T:G T G 10 0.549596491962742 0.201576522936109 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 20 14 34 9.00807016074516 7.69435088747839 1.31371927326677 T:C T C 10 0.549596491962742 0.731714148308966 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89160366 T/C 1 12 1 13 5.4048420964471 0.549596491962742 4.85524560448435 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0090397181447119 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89160369 A/C 1 13 1 14 5.85524560448435 0.549596491962742 5.30564911252161 A:C A C 10 0.549596491962742 0.00503298802908089 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89160782 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185056 C/G 0 0 10 10 0 5.49596491962742 -5.49596491962742 G C G 10 0.549596491962742 0.000343571906053703 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185361 T/C 1 8 411 419 3.60322806429806 225.884158196687 -222.280930132389 T:C T C 10 0.549596491962742 7.95469943350479e-129 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185449 G/A 1 7 113 120 3.15282455626081 62.1044035917898 -58.951579035529 A:G G A 10 0.549596491962742 7.46168290554053e-31 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185451 G/A 1 7 111 118 3.15282455626081 61.0052106078644 -57.8523860516036 A:G G A 10 0.549596491962742 3.19507206768824e-30 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185458 A/G 1 113 4 117 50.8955964082102 2.19838596785097 48.6972104403592 A:G A G 10 0.549596491962742 1.59367659014149e-24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185474 G/A 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 G G 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185483 A/G 0 10 0 10 4.50403508037258 0 4.50403508037258 A A 10 0.549596491962742 0.00285800173360387 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185520 C/T 1 11 329 340 4.95443858840984 180.817245855742 -175.862807267332 T:C C T 10 0.549596491962742 2.29924441252613e-97 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185549 A/T 1 10 402 412 4.50403508037258 220.937789769022 -216.43375468865 A:T A T 10 0.549596491962742 4.99640426085119e-123 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 89185614 G/C 1 8 79 87 3.60322806429806 43.4181228650566 -39.8148948007586 C:G G C 10 0.549596491962742 2.90708358917576e-19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 96521640 C/T 1 25 23 48 11.2600877009315 12.6407193151431 -1.38063161421161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.772130036372717 ENSG00000174501:ENST00000456556:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000420871:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000419039:exon_96521014_96521928:AC073995.2;ENSG00000174501:ENST00000488721:exon_96521014_96521928:AC073995.2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 96993757 C/T 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 96993884 A/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000198885:ENST00000439118:exon_96992380_96994064:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000420728:exon_96992380_96994062:ITPRIPL1;ENSG00000198885:ENST00000361124:exon_96991961_96994066:ITPRIPL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 99900927 G/C 1 13 21 34 5.85524560448435 11.5415263312176 -5.68628072673323 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0579073974148413 ENSG00000144214:ENST00000308528:exon_99900701_99900974:LYG1;ENSG00000144214:ENST00000409448:exon_99900720_99900974:LYG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 100017803 T/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100016938_100017815:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100016938_100017815:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100017413_100017815:REV1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 101620766 C/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 C:G C G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 102626265 T/C 1 18 15 33 8.10726314467064 8.24394737944113 -0.136684234770485 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000115590:ENST00000332549:exon_102626024_102626288:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000464994:exon_102626024_102626430:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000493749:exon_102626024_102626647:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000393414:exon_102626024_102626288:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000457817:exon_102626024_102626288:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000441002:exon_102626024_102626288:IL1R2;ENSG00000115590:ENST00000482658:exon_102626024_102626288:IL1R2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 109099531 C/G 1 25 15 40 11.2600877009315 8.24394737944113 3.01614032149032 C:G C G 10 0.549596491962742 0.427272588762762 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000447558:exon_109099518_109099612:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109099518_109099622:GCC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 109381672 T/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109379693_109384844:RANBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 118577278 G/A 1 146 106 252 65.7589121734397 58.2572281480507 7.50168402538902 A:G G A 10 0.549596491962742 0.375494647899868 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118577225_118577368:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118577225_118577368:DDX18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 118677916 T/C 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000125633:ENST00000376300:exon_118673054_118677972:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000319432:exon_118673054_118677972:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000437999:exon_118677881_118677972:CCDC93 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 118743630 G/A 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 A:G G A 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000125633:ENST00000376300:exon_118743545_118743645:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000319432:exon_118743545_118743645:CCDC93;ENSG00000125633:ENST00000460781:exon_118743545_118743645:CCDC93 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 120125118 C/A 1 7 10 17 3.15282455626081 5.49596491962742 -2.34314036336661 A:C C A 10 0.549596491962742 0.330612084853473 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 120129887 G/A 1 804 878 1682 362.124420461955 482.545719943287 -120.421299481332 A:T:G G A 10 0.549596491962742 4.46002853220163e-09 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120129821_120130126:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120129821_120130057:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120129821_120130122:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120129821_120130030:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120129821_120129983:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120129821_120130076:DBI HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 127453543 T/C 1 10 6 16 4.50403508037258 3.29757895177645 1.20645612859613 T:C T C 10 0.549596491962742 0.621751293599469 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 17 12 29 7.65685963663339 6.5951579035529 1.06170173308048 A:C A C 10 0.549596491962742 0.714107421377589 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 131103159 C/T 1 13 4 17 5.85524560448435 2.19838596785097 3.65685963663339 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0895144911712826 ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131102949_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131102949_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131103140_131103506:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131103140_131103334:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000456713:exon_131103140_131103259:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000460766:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000428740:exon_131103140_131103272:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000452955:exon_131103140_131103272:IMP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 136519421 A/G 1 78 67 145 35.1314736269061 36.8229649615037 -1.69149133459759 A:C:G A G 10 0.549596491962742 0.802582226115851 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136519388_136519481:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000426921:exon_136519388_136519451:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136519388_136519481:UBXN4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 136664975 A/G 1 25 79 104 11.2600877009315 43.4181228650566 -32.1580351641252 A:G A G 10 0.549596491962742 2.64544420121067e-10 ENSG00000115866:ENST00000264161:exon_136664247_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000478212:exon_136664394_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000489964:exon_136664814_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000422708:exon_136664830_136664977:DARS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 152314385 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152314275_152314477:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152314275_152314477:RIF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 152317669 G/A 1 38 39 77 17.1153333054158 21.4342631865469 -4.31892988113113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.359893323565852 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152317652_152317803:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152317652_152317803:RIF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 170493741 C/G 1 304 321 625 136.922666443326 176.42047392004 -39.4978074767137 C:G C G 10 0.549596491962742 0.00169476805099823 ENSG00000138398:ENST00000260970:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000530133:exon_170492923_170497916:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000409714:exon_170492923_170494221:PPIG;ENSG00000138398:ENST00000448752:exon_170492923_170494131:PPIG HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 171822466 C/T 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 172373843 G/C 0 3087 0 3087 1390.39562931102 0 1390.39562931102 G G 10 0.549596491962742 0 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 173355958 G/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000091409:ENST00000409532:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264107:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264106:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000343713:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000375221:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000409080:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000442250:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000458358:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000416789:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000470259:exon_173355949_173355982:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000475302:exon_173355949_173356059:ITGA6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 178098739 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000116044:ENST00000397062:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000397063:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000464747:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000446151:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000448782:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000421929:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000423513:exon_178098733_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000477534:exon_178098205_178098999:NFE2L2;ENSG00000116044:ENST00000462023:exon_178098607_178098999:NFE2L2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 197002396 A/G 1 14 5 19 6.30564911252161 2.74798245981371 3.5576666527079 A:G A G 10 0.549596491962742 0.111708319689607 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_196998290_197002453:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197002171_197002453:STK17B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 A:T T A 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 198265526 A/G 1 9 10 19 4.05363157233532 5.49596491962742 -1.4423333472921 A:G A G 10 0.549596491962742 0.64592105626115 ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198265439_198265660:SF3B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:C A C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 201342782 T/G 1 6 10 16 2.70242104822355 5.49596491962742 -2.79354387140387 T:G T G 10 0.549596491962742 0.209587930614985 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201342359_201342825:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201342359_201342932:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201342359_201342869:SPATS2L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 201436555 A/G 1 29 15 44 13.0617017330805 8.24394737944113 4.81775435363935 A:G A G 10 0.549596491962742 0.172794115158474 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 201928671 G/T 1 20 1 21 9.00807016074516 0.549596491962742 8.45847366878242 T:G G T 10 0.549596491962742 8.13143420214776e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 26 67 93 11.7104912089687 36.8229649615037 -25.112473752535 A:C:G G A 10 0.549596491962742 1.7512536554711e-07 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 52 58 110 23.4209824179374 31.876596533839 -8.45561411590162 A:G A G 10 0.549596491962742 0.124856803840333 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 216191515 C/T 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.58443050081259 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 216191533 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 217012901 A/G 1 18 19 37 8.10726314467064 10.4423333472921 -2.33507020262145 A:G A G 10 0.549596491962742 0.509578196776817 ENSG00000079246:ENST00000392133:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000392132:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000328063:exon_217012806_217012999:XRCC5;ENSG00000079246:ENST00000460284:exon_217012806_217012999:XRCC5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 219103580 A/G 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000163466:ENST00000465395:exon_219103387_219103918:ARPC2;ENSG00000163466:ENST00000472753:exon_219103387_219103740:ARPC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 T:C T C 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 219528817 G/A 1 45 34 79 20.2681578616766 18.6862807267332 1.58187713494339 A:G G A 10 0.549596491962742 0.736095643277625 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 29 33 62 13.0617017330805 18.1366842347705 -5.07498250169 T:C T C 10 0.549596491962742 0.203821876494672 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 220371445 G/A 1 114 133 247 51.3459999162474 73.0963334310447 -21.7503335147973 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00589785144736944 ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220371420_220371709:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220371420_220371657:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220371420_220371710:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220371420_220371655:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220371420_220371710:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220371420_220371709:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220370976_220371709:GMPPA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 224765956 C/T 1 11 4 15 4.95443858840984 2.19838596785097 2.75605262055887 T:C C T 10 0.549596491962742 0.197162377924665 ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000429915:exon_224765900_224766050:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000483061:exon_224765572_224766050:WDFY1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 228102752 C/A 1 2 9 11 0.900807016074516 4.94636842766468 -4.04556141159016 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0287439628056961 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 231050715 A/G 1 123 116 239 55.3996314885827 63.7531930676781 -8.35356157909533 A:G A G 10 0.549596491962742 0.298333925339845 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 231077112 G/A 1 43 25 68 19.3673508456021 13.7399122990685 5.62743854653355 A:G G A 10 0.549596491962742 0.181617522735972 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000455674:exon_231077111_231077145:SP110 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 231110582 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.480592129451619 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 30 37 67 13.5121052411177 20.3350702026215 -6.82296496150371 A:G G A 10 0.549596491962742 0.11007014675304 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 232035429 G/A 1 165 174 339 74.3165788261476 95.6297896015171 -21.3132107753695 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0217793446829351 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000373635:exon_232035280_232035435:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000491229:exon_232035116_232035435:PSMD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 232196597 G/A 1 12 3 15 5.4048420964471 1.64878947588823 3.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0677975361334678 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 239079234 C/T 1 26 19 45 11.7104912089687 10.4423333472921 1.26815786167661 T:C C T 10 0.549596491962742 0.765642963882878 ENSG00000132323:ENST00000254654:exon_239079042_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000465131:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000463129:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000466468:exon_239079050_239079317:ILKAP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 239237956 C/T 1 12 13 25 5.4048420964471 7.14475439551565 -1.73991229906855 T:C C T 10 0.549596491962742 0.548867312273124 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 239307506 T/C 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239307395_239309541:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239307395_239309463:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239307395_239309537:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000483951:exon_239307395_239307612:TRAF3IP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 12 12 24 5.4048420964471 6.5951579035529 -1.19031580710581 T:C T C 10 0.549596491962742 0.684179625335306 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 242283094 A/G 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.151734919978227 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 242572699 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 242572846 A/G 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 242651445 A/T 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 A:T A T 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000168395:ENST00000492488:exon_242651393_242651795:ING5;ENSG00000168395:ENST00000313552:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000482774:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000406941:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000445620:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000489509:exon_242651393_242651486:ING5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 2 242707213 G/A 1 16 21 37 7.20645612859613 11.5415263312176 -4.33507020262145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.185990005038701 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242707128_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242707125_242707363:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242707125_242708231:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000468064:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000445308:exon_242707125_242707377:D2HGDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 485843 T/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000101266:ENST00000400227:exon_485762_485873:CSNK2A1;ENSG00000101266:ENST00000349736:exon_485762_485873:CSNK2A1;ENSG00000101266:ENST00000217244:exon_485762_485873:CSNK2A1;ENSG00000101266:ENST00000400217:exon_485762_485873:CSNK2A1;ENSG00000101266:ENST00000381973:exon_485762_485873:CSNK2A1;ENSG00000101266:ENST00000460062:exon_485762_485873:CSNK2A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 T:G T G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 1143797 T/C 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1143774_1143827:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1143774_1143827:PSMF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 1433717 T/C 1 14 8 22 6.30564911252161 4.39677193570194 1.90887717681968 T:C T C 10 0.549596491962742 0.522024354878786 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1433676_1433785:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000470376:exon_1433676_1433785:NSFL1C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 2633936 T/C 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C T C 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633925_2634466:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2633925_2634039:NOP56 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 50 54 104 22.5201754018629 29.6782105659881 -7.15803516412517 T:C T C 10 0.549596491962742 0.168246778787003 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 2637898 A/G 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637727_2638095:NOP56 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 2774797 A/C 1 8 25 33 3.60322806429806 13.7399122990685 -10.1366842347705 A:C A C 10 0.549596491962742 0.000622122390003305 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 3193978 G/A 1 10 14 24 4.50403508037258 7.69435088747839 -3.19031580710581 A:G G A 10 0.549596491962742 0.220679044086420 ENSG00000125877:ENST00000460676:exon_3193965_3194072:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3193965_3194029:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3193902_3194029:ITPA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 5753579 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000171984:ENST00000378979:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5753508_5753689:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5753508_5753689:C20orf196 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 7 11 18 3.15282455626081 6.04556141159016 -2.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.235754067257629 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 7 11 18 3.15282455626081 6.04556141159016 -2.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.235754067257629 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 6195753 T/C 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 T T 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 91 23 114 40.9867192313905 12.6407193151431 28.3459999162474 T:C C T 10 0.549596491962742 4.19349310157584e-08 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 13763449 T/C 1 111 118 229 49.9947893921356 64.8523860516035 -14.8575966594679 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0539275324219073 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13763150_13763829:ESF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 18297193 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 18535769 C/G 1 14 12 26 6.30564911252161 6.5951579035529 -0.289508791031292 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18535752_18535817:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18535752_18535817:SEC23B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 31024488 C/T 1 11 8 19 4.95443858840984 4.39677193570194 0.557666652707903 T:C C T 10 0.549596491962742 0.822816223025556 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 32295541 C/T 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 32441367 T/C 1 151 158 309 68.010929713626 86.8362457301132 -18.8253160164873 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0342795419723799 ENSG00000101421:ENST00000217402:exon_32441302_32442172:CHMP4B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 33122493 C/T 1 91 69 160 40.9867192313905 37.9221579454292 3.06456128596128 T:C C T 10 0.549596491962742 0.634700267256629 ENSG00000125971:ENST00000357156:exon_33122432_33122599:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000480759:exon_33122432_33122599:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000417166:exon_33122432_33122718:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000374846:exon_33122432_33122599:DYNLRB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 33703521 G/A 1 23 25 48 10.3592806848569 13.7399122990685 -3.38063161421161 A:G G A 10 0.549596491962742 0.384446663710337 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33703160_33703736:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33703167_33703736:EDEM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 33706509 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33706401_33706522:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33706401_33706522:EDEM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 34064394 G/T 1 18 12 30 8.10726314467064 6.5951579035529 1.51210524111774 T:G G T 10 0.549596491962742 0.714338307739437 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000461386:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000448421:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425934:exon_34064274_34064420:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000425096:exon_34064274_34064420:CEP250 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 34092374 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34090218_34092833:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34090734_34092833:CEP250 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 19 19 38 8.5576666527079 10.4423333472921 -1.88466669458419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.625449331077231 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 35521290 G/A 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000101342:ENST00000217320:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101342:ENST00000436941:exon_35521265_35522638:C20orf118;ENSG00000101347:ENST00000262878:exon_35518632_35521469:SAMHD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 35865054 C/T 1 379 382 761 170.702929546121 209.945859929767 -39.2429303836466 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00447095170514634 ENSG00000118705:ENST00000237530:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373622:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000338768:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000373628:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000397161:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000437329:exon_35864983_35865112:RPN2;ENSG00000118705:ENST00000470352:exon_35864983_35865112:RPN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 42341722 C/T 1 13 25 38 5.85524560448435 13.7399122990685 -7.8846666945842 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0135038926257749 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42341642_42341746:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42341642_42341746:MYBL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 42344745 G/A 1 39 26 65 17.5657368134531 14.2895087910313 3.27622802242177 A:G G A 10 0.549596491962742 0.455739835359003 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42344599_42345136:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42344599_42345136:MYBL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 20 20 40 9.00807016074516 10.9919298392548 -1.98385967850968 T:C C T 10 0.549596491962742 0.530147663252099 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 43837304 G/A 1 21 7 28 9.45847366878242 3.84717544373919 5.61129822504323 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0365857330239782 ENSG00000124233:ENST00000372781:exon_43836015_43837371:SEMG1;ENSG00000124233:ENST00000244069:exon_43837089_43837327:SEMG1;ENSG00000124233:ENST00000445493:exon_43837089_43837371:SEMG1;ENSG00000124233:ENST00000405932:exon_43836015_43837327:SEMG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 44747004 T/G 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:G T G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44746987_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44746990_44747033:CD40 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 46268748 C/T 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 T:C C T 10 0.549596491962742 0.154181475313390 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268669_46268795:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268669_46268795:NCOA3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 4 10 14 1.80161403214903 5.49596491962742 -3.69435088747839 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0597828211497275 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 47872327 A/G 1 19 18 37 8.5576666527079 9.89273685532936 -1.33507020262145 A:G A G 10 0.549596491962742 0.741758015746671 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 47872377 C/G 1 51 41 92 22.9705789099002 22.5334561704724 0.437122739427739 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000124201:ENST00000371754:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47872345_47872484:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000371744:exon_47872345_47872484:ZNFX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 48301146 G/A 1 10 16 26 4.50403508037258 8.79354387140387 -4.28950879103129 A:G G A 10 0.549596491962742 0.114226480411308 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 49195061 A/G 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000196396:ENST00000371621:exon_49194957_49195166:PTPN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 52561469 A/G 1 23 8 31 10.3592806848569 4.39677193570194 5.962508749155 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0452782923738846 ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52561465_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52560079_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52560080_52561535:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52561322_52561535:BCAS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 55088404 A/G 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 A:G A G 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55088371_55088484:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55088371_55088484:C20orf43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 57484241 C/T 1 39 43 82 17.5657368134531 23.6326491543979 -6.06691234094484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.184417134762883 ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57484217_57484243:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000479025:exon_57483971_57484271:GNAS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 57571763 A/G 1 15 27 42 6.75605262055887 14.839105282994 -8.08305266243516 A:G A G 10 0.549596491962742 0.01311388144425 ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 57610059 C/A 1 16 14 30 7.20645612859613 7.69435088747839 -0.487894758882259 A:C C A 10 0.549596491962742 0.856820327497214 ENSG00000101166:ENST00000355937:exon_57608200_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000371033:exon_57609689_57610181:SLMO2;ENSG00000101166:ENST00000463057:exon_57609964_57610181:SLMO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 58467101 C/T 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 C C 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 ENSG00000196074:ENST00000371001:exon_58467045_58467481:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000414481:exon_58467045_58467481:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000357552:exon_58467045_58467481:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000446834:exon_58467045_58467481:SYCP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 60712035 G/A 1 10 10 20 4.50403508037258 5.49596491962742 -0.991929839254839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.660911275578475 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 20 62153190 C/T 1 84 88 172 37.8338946751297 48.3644912927213 -10.5305966175916 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.108183698030178 ENSG00000125534:ENST00000370179:exon_62153021_62153559:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000370177:exon_62152865_62153291:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000473620:exon_62153021_62153302:PPDPF HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 30433876 C/T 1 12 29 41 5.4048420964471 15.9382982669195 -10.5334561704724 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00137237224456784 ENSG00000156261:ENST00000389159:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000286788:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000470450:exon_30433817_30433888:CCT8;ENSG00000156261:ENST00000496121:exon_30433817_30433888:CCT8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 33974228 G/C 1 33 52 85 14.8633157652295 28.5790175820626 -13.7157018168331 C:G G C 10 0.549596491962742 0.00311880938014645 ENSG00000159079:ENST00000440966:exon_33973977_33974283:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000382549:exon_33973977_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000290155:exon_33973977_33974283:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000425336:exon_33974013_33974677:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000300260:exon_33974095_33974283:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000483315:exon_33974120_33975602:C21orf59 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 34614255 T/G 1 5 8 13 2.25201754018629 4.39677193570194 -2.14475439551565 T:G T G 10 0.549596491962742 0.271985568998683 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 34926260 C/T 1 10 6 16 4.50403508037258 3.29757895177645 1.20645612859613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.621751293599469 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 34945721 T/C 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 T:C T C 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000381692:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000458557:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000457208:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000467616:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000484294:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000473102:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000470533:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000478183:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000465834:exon_34945614_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000477419:exon_34945331_34945761:SON;ENSG00000159140:ENST00000491794:exon_34945520_34945761:SON HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 35757862 T/C 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 A:T:C T C 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000205670:ENST00000481710:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399292:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000489469:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000495363:exon_35757776_35757942:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000474455:exon_35757776_35758931:FAM165B;ENSG00000205670:ENST00000399295:exon_35757776_35757942:FAM165B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 37444937 G/A 1 26 15 41 11.7104912089687 8.24394737944113 3.46654382952758 A:G G A 10 0.549596491962742 0.346565159712555 ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 42807955 C/T 1 31 34 65 13.962508749155 18.6862807267332 -4.72377197757823 T:C C T 10 0.549596491962742 0.262654423527523 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42807764_42807956:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42807764_42807956:MX1;ENSG00000157601:ENST00000424365:exon_42807764_42807956:MX1;ENSG00000157601:ENST00000417963:exon_42807764_42807956:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42807764_42807956:MX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 42812891 C/T 1 16 22 38 7.20645612859613 12.0911228231803 -4.88466669458419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.141482616709640 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42812814_42812952:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42812814_42812952:MX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 42817431 G/A 1 27 16 43 12.160894717006 8.79354387140387 3.3673508456021 A:G G A 10 0.549596491962742 0.358593288016445 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817375_42817497:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817375_42817497:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817375_42817497:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817375_42817497:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817397_42817497:MX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 42817930 G/A 1 39 30 69 17.5657368134531 16.4878947588823 1.07784205457081 A:G G A 10 0.549596491962742 0.810217801047562 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42817927_42818068:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42817927_42818068:MX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 42830529 G/T 1 170 138 308 76.5685963663339 75.8443158908584 0.724280475475467 T:G G T 10 0.549596491962742 0.95437938170374 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42830455_42831138:MX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 42830597 G/C 1 139 121 260 62.6060876171789 66.5011755274918 -3.89508791031292 C:G G C 10 0.549596491962742 0.662725439540874 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42830455_42831138:MX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 43792938 G/A 1 1 11 12 0.450403508037258 6.04556141159016 -5.5951579035529 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0018497717683907 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 43802225 G/C 1 285 26 311 128.364999790619 14.2895087910313 114.075490999587 T:C:G G C 10 0.549596491962742 6.56791061833911e-46 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43802174_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43801985_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000478680:exon_43801987_43802343:TMPRSS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 43808526 T/C 1 4 30 34 1.80161403214903 16.4878947588823 -14.6862807267332 T:C T C 10 0.549596491962742 2.33077167667803e-07 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43808512_43808635:TMPRSS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 43808627 C/T 1 21 1 22 9.45847366878242 0.549596491962742 8.90887717681968 T:C C T 10 0.549596491962742 4.52436782121832e-05 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43808512_43808635:TMPRSS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 43984879 G/C 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 C:G G C 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000160190:ENST00000398341:exon_43984818_43984903:SLC37A1;ENSG00000160190:ENST00000352133:exon_43984818_43984903:SLC37A1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:G T G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 44324164 C/T 1 18 23 41 8.10726314467064 12.6407193151431 -4.53345617047242 T:C C T 10 0.549596491962742 0.161068726188539 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 20 19 39 9.00807016074516 10.4423333472921 -1.43426318654694 A:G G A 10 0.549596491962742 0.748040323408759 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45107875 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45168884 G/A 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 A:G G A 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45194064 G/A 1 458 333 791 206.284806681064 183.015631823593 23.2691748574711 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.100228011187055 ENSG00000160208:ENST00000506281:exon_45193907_45194144:RRP1B;ENSG00000160209:ENST00000498150:exon_45193472_45194151:PDXK;ENSG00000160213:ENST00000291568:exon_45192393_45194211:CSTB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45219455 C/T 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45750051 G/A 1 33 34 67 14.8633157652295 18.6862807267332 -3.82296496150371 A:G G A 10 0.549596491962742 0.390521830538503 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 45750168 A/G 1 21 20 41 9.45847366878242 10.9919298392548 -1.53345617047242 A:G A G 10 0.549596491962742 0.641149099702937 ENSG00000160226:ENST00000339818:exon_45748827_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000380160:exon_45749773_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000325223:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000397956:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000496321:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000462742:exon_45749774_45750209:C21orf2;ENSG00000160226:ENST00000470196:exon_45749774_45750209:C21orf2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 47581423 C/T 0 0 8 8 0 4.39677193570194 -4.39677193570194 T C T 10 0.549596491962742 0.00169361275347944 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 47851753 A/G 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47851443_47852129:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47851443_47851892:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000482575:exon_47851443_47851949:PCNT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 21 47966977 C/T 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000160305:ENST00000466639:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000435722:exon_47966828_47967118:DIP2A;ENSG00000160305:ENST00000480553:exon_47966828_47967118:DIP2A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 17581224 C/T 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C C T 10 0.549596491962742 0.763998637860147 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 18075417 G/A 1 45 40 85 20.2681578616766 21.9838596785097 -1.71570181683306 A:G G A 10 0.549596491962742 0.744197306565161 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18074902_18075502:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18074935_18075502:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18075175_18075502:ATP6V1E1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 18077334 G/A 1 11 16 27 4.95443858840984 8.79354387140387 -3.83910528299403 A:G G A 10 0.549596491962742 0.175288770605262 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18077295_18077382:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000473248:exon_18077295_18078058:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18077305_18077382:ATP6V1E1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 76 79 155 34.2306666108316 43.4181228650566 -9.187456254225 A:G G A 10 0.549596491962742 0.146449255204206 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 19867744 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:C:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462330:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000487165:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000495655:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000485358:exon_19867702_19867794:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000462843:exon_19867702_19867794:TXNRD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:G T G 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 19951237 C/T 1 16 14 30 7.20645612859613 7.69435088747839 -0.487894758882259 T:C C T 10 0.549596491962742 0.856820327497214 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 20920702 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 21213416 A/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000241973:ENST00000449120:exon_21213411_21213705:PI4KA;ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 21354970 C/G 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 C:G C G 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354936_21356084:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354936_21355019:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354936_21355076:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000466670:exon_21354936_21355700:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000488975:exon_21354936_21355018:THAP7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 22550510 T/G 1 17 1 18 7.65685963663339 0.549596491962742 7.10726314467064 T:G T G 10 0.549596491962742 0.000475612187241451 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 22890492 G/A 1 14 1 15 6.30564911252161 0.549596491962742 5.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00279456656863171 ENSG00000185686:ENST00000398743:exon_22890123_22891065:PRAME;ENSG00000185686:ENST00000492657:exon_22890123_22891065:PRAME;ENSG00000185686:ENST00000398741:exon_22890124_22891065:PRAME;ENSG00000185686:ENST00000405655:exon_22890126_22891065:PRAME;ENSG00000185686:ENST00000402697:exon_22890189_22891065:PRAME;ENSG00000185686:ENST00000424204:exon_22890488_22891065:PRAME HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 24964128 T/C 1 235 201 436 105.844824388756 110.468894884511 -4.62407049575549 A:T:C:G T C 10 0.549596491962742 0.665104416095092 ENSG00000100028:ENST00000215829:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000457691:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000402849:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000404603:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000458544:exon_24963952_24964144:SNRPD3;ENSG00000100028:ENST00000448916:exon_24963952_24964144:SNRPD3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 57 46 103 25.6729999581237 25.2814386302861 0.391561327837579 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 30823346 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000407550:exon_30823227_30823390:MTFP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 32788248 T/A 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 A:T T A 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32788227_32788346:C22orf28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 32795626 T/C 1 12 5 17 5.4048420964471 2.74798245981371 2.65685963663339 T:C T C 10 0.549596491962742 0.229407484550802 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 32795641 C/T 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C C T 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 35742925 T/G 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:G T G 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000100284:ENST00000447733:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000449058:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000411850:exon_35742923_35742965:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000412456:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000425375:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000451197:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000382034:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000436462:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000404284:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000337040:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000424387:exon_35742923_35742962:TOM1;ENSG00000100284:ENST00000492723:exon_35742923_35742962:TOM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 35783150 C/T 1 6 12 18 2.70242104822355 6.5951579035529 -3.89273685532936 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0948720795505176 ENSG00000100292:ENST00000216117:exon_35782678_35783169:HMOX1;ENSG00000100292:ENST00000494998:exon_35783033_35783169:HMOX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 50 54 104 22.5201754018629 29.6782105659881 -7.15803516412517 T:C C T 10 0.549596491962742 0.168246778787003 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 36908587 C/T 1 61 65 126 27.4746139902727 35.7237719775782 -8.24915798730549 T:C C T 10 0.549596491962742 0.152077583653471 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36908507_36908649:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36908507_36908649:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000462641:exon_36908507_36908976:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36908507_36908649:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000426531:exon_36908507_36908649:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000458572:exon_36908507_36908649:EIF3D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 15 30 45 6.75605262055887 16.4878947588823 -9.73184213832339 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00411189530947996 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 37524639 C/T 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37524133_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37524562_37524888:IL2RB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 37538531 C/G 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 C:G C G 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000453962:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000429622:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000461607:exon_37538474_37538552:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000440958:exon_37538474_37538791:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445595:exon_37538490_37538552:IL2RB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38010149 C/T 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 T:C C T 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000100083:ENST00000423024:exon_38010140_38010281:GGA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38015853 G/A 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100083:ENST00000405147:exon_38015807_38016051:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000491295:exon_38015807_38016256:GGA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38028456 A/G 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38028412_38028522:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38028412_38028522:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000325180:exon_38028412_38028522:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38028412_38028522:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38028412_38028522:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000460957:exon_38028412_38028522:GGA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38039708 T/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000336738:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000495174:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38039651_38039795:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000471650:exon_38039462_38039795:SH3BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38046718 A/G 1 10 2 12 4.50403508037258 1.09919298392548 3.4048420964471 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0776931552832544 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 68 54 122 30.6274385465335 29.6782105659881 0.94922798054548 T:C C T 10 0.549596491962742 0.927564548497182 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38211728 A/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38211670_38211841:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38211670_38211841:GCAT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 38341124 T/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:G T G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000128346:ENST00000403305:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000249079:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000396889:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000403026:exon_38341049_38341180:C22orf23;ENSG00000128346:ENST00000418863:exon_38341049_38341180:C22orf23 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39125529 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000462332:exon_39124261_39125667:GTPBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39134715 T/C 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 T:C T C 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39148452 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39440149 C/T 1 28 14 42 12.6112982250432 7.69435088747839 4.91694733756484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.162215747686771 ENSG00000128394:ENST00000381565:exon_39440088_39440428:APOBEC3F HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39445436 G/A 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39445554 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000128394:ENST00000308521:exon_39445430_39445586:APOBEC3F;ENSG00000128394:ENST00000476513:exon_39445430_39445586:APOBEC3F HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 15 22 37 6.75605262055887 12.0911228231803 -5.33507020262145 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0976203350755097 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 39928738 G/A 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 A:G G A 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000187051:ENST00000334678:exon_39928692_39928860:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000420879:exon_39928692_39928766:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000459956:exon_39928400_39928743:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000472291:exon_39928692_39928765:RPS19BP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 41626240 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41626143_41627275:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41626143_41626658:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41626143_41627274:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41626143_41627275:L3MBTL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 42910142 C/T 1 23 30 53 10.3592806848569 16.4878947588823 -6.12861407402532 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.0984008479974346 ENSG00000189306:ENST00000323013:exon_42910112_42910310:RRP7A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 6 14 20 2.70242104822355 7.69435088747839 -4.99192983925484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.040303464311131 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 43455432 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000100271:ENST00000495814:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43455390_43455533:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43455390_43455533:TTLL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 43529314 G/C 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 C:G G C 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000100294:ENST00000327555:exon_43528886_43529492:MCAT;ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43528889_43529492:MCAT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 44379822 T/C 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 44514995 C/T 1 14 10 24 6.30564911252161 5.49596491962742 0.809684192894193 T:C C T 10 0.549596491962742 0.838764592237092 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 44547421 T/C 1 25 19 44 11.2600877009315 10.4423333472921 0.817754353639353 T:C T C 10 0.549596491962742 0.880088952584172 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44547363_44547431:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44547363_44547431:PARVB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 45133122 G/A 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000186654:ENST00000006251:exon_45132652_45133560:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000404016:exon_45132652_45133545:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000403581:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396141:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000336985:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000431834:exon_45132652_45133321:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000418332:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000396139:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000432916:exon_45132652_45133542:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000455389:exon_45132652_45133512:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000495017:exon_45132652_45133561:PRR5;ENSG00000186654:ENST00000475850:exon_45132652_45133561:PRR5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 45567580 C/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:C C A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000093000:ENST00000497960:exon_45567481_45568087:NUP50;ENSG00000093000:ENST00000484186:exon_45567481_45567627:NUP50 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 46611262 C/T 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.76182835055021 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 33 29 62 14.8633157652295 15.9382982669195 -1.07498250169 T:C C T 10 0.549596491962742 0.79966245862981 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50646936 G/C 1 8 11 19 3.60322806429806 6.04556141159016 -2.4423333472921 C:G G C 10 0.549596491962742 0.356813968848070 ENSG00000073169:ENST00000492092:exon_50646917_50647145:RP3-402G11.5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50647161 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50714178 C/T 1 22 16 38 9.90887717681968 8.79354387140387 1.11533330541581 T:C C T 10 0.549596491962742 0.747272378190228 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50713408_50714237:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50713414_50714237:PLXNB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50716068 C/T 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C C T 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50750540 C/G 1 41 51 92 18.4665438295276 28.0294210900998 -9.56287726057226 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0469019107505097 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50750395_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50750395_50750690:FAM116B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50962036 T/C 1 74 84 158 33.3298595947571 46.1661053248703 -12.8362457301132 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0453747789950496 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50962230 C/T 1 80 63 143 36.0322806429806 34.6245789936527 1.4077016493279 T:C C T 10 0.549596491962742 0.86663231591231 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 50962754 C/T 1 23 18 41 10.3592806848569 9.89273685532936 0.466543829527581 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 51063771 C/A 1 38 29 67 17.1153333054158 15.9382982669195 1.17703503849629 A:C C A 10 0.549596491962742 0.807031396182783 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51063450_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51063456_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51063457_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51063461_51063892:ARSA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 22 51065600 G/A 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:G G A 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51065594_51065834:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51065594_51065834:ARSA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 5255177 T/C 1 23 23 46 10.3592806848569 12.6407193151431 -2.28143863028613 T:C T C 10 0.549596491962742 0.554368671760172 ENSG00000134109:ENST00000419550:exon_5255004_5255207:EDEM1;ENSG00000134109:ENST00000256497:exon_5255004_5255207:EDEM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 9413000 A/T 1 7 13 20 3.15282455626081 7.14475439551565 -3.99192983925484 A:T:C A T 10 0.549596491962742 0.113396165026574 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9412844_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9412917_9413220:THUMPD3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 9426228 C/T 1 47 38 85 21.1689648777511 20.8846666945842 0.284298183166936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 9517763 G/A 1 52 35 87 23.4209824179374 19.235877218696 4.18510519924145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.390186625984836 ENSG00000168137:ENST00000402198:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000402466:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000406341:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000407969:exon_9517167_9519838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000302463:exon_9517167_9518162:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000493918:exon_9517167_9518143:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000413704:exon_9517167_9517838:SETD5;ENSG00000168137:ENST00000466242:exon_9517167_9518143:SETD5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 10005828 G/A 1 76 83 159 34.2306666108316 45.6165088329076 -11.385842222076 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0792538426181253 ENSG00000125037:ENST00000245046:exon_10004221_10005881:TMEM111 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 11596348 C/T 1 24 15 39 10.8096841928942 8.24394737944113 2.56573681345306 T:C C T 10 0.549596491962742 0.426715750295977 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 14170944 C/A 1 10 17 27 4.50403508037258 9.34314036336661 -4.83910528299403 A:C C A 10 0.549596491962742 0.080356104873664 ENSG00000170876:ENST00000306077:exon_14170912_14171061:TMEM43;ENSG00000170876:ENST00000432444:exon_14170912_14171061:TMEM43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 14708976 A/C 1 43 44 87 19.3673508456021 24.1822456463606 -4.81489480075855 A:C A C 10 0.549596491962742 0.33247187588871 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14708931_14709025:C3orf19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 14712473 G/A 1 19 17 36 8.5576666527079 9.34314036336661 -0.78547371065871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.867474879117842 ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14712403_14714166:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14712403_14712701:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000476763:exon_14712403_14712534:C3orf19 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 16364954 C/T 1 27 7 34 12.160894717006 3.84717544373919 8.31371927326677 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00503360814363656 ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 16535229 C/T 1 17 3 20 7.65685963663339 1.64878947588823 6.00807016074516 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00643249441616623 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 23934772 G/A 1 9 6 15 4.05363157233532 3.29757895177645 0.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.798575396170906 ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23933151_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23933552_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23933555_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23933572_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23933574_23934828:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23933588_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23933798_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23933801_23934824:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23934556_23934828:NKIRAS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 25770656 T/C 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000151092:ENST00000489271:exon_25770624_25772041:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000428257:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000422724:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280700:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000493324:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000396649:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000467224:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000308710:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000496726:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000280699:exon_25770624_25770809:NGLY1;ENSG00000151092:ENST00000417874:exon_25770624_25770809:NGLY1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 25835983 T/C 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 T:C T C 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25835583_25836025:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000448177:exon_25835583_25836014:OXSM;ENSG00000151093:ENST00000420173:exon_25835583_25836025:OXSM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 9 3 12 4.05363157233532 1.64878947588823 2.4048420964471 C:G G C 10 0.549596491962742 0.246146680042574 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 38168125 A/C 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38167317_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167653_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38168001_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000440176:exon_38167552_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000423611:exon_38167942_38168191:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000447223:exon_38167984_38168191:ACAA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 41275350 C/T 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 T:C C T 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41275020_41275358:CTNNB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 5 13 18 2.25201754018629 7.14475439551565 -4.89273685532936 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0303243716603118 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 47451263 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47451145_47451324:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451145_47451324:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451145_47451324:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000495653:exon_47450788_47451324:PTPN23 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 47537515 G/A 1 23 17 40 10.3592806848569 9.34314036336661 1.01614032149032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.874009975940807 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47537130_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47537436_47537687:C3orf75 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 47913588 G/A 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.672878774007803 ENSG00000047849:ENST00000383737:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000264724:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000429422:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000420772:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000335271:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395730:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000441748:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000383736:exon_47913407_47913590:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000462206:exon_47913407_47913590:MAP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 23 32 55 10.3592806848569 17.5870877428077 -7.22780705795081 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0575317356373403 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 48309828 C/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 C:G C G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000164048:ENST00000354698:exon_48309405_48312477:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000448461:exon_48309405_48312459:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000457782:exon_48309408_48312480:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000296437:exon_48309408_48310234:ZNF589;ENSG00000164048:ENST00000431517:exon_48309408_48310276:ZNF589 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 35 17 52 15.764122781304 9.34314036336661 6.42098241793742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.093559821165927 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 49006036 A/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000177479:ENST00000356401:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000498314:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000490095:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000449376:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000483333:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000444790:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000474936:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000452385:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000459976:exon_49005967_49006065:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000465217:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000395481:exon_49005967_49006088:ARIH2;ENSG00000177479:ENST00000482342:exon_49005767_49006088:ARIH2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 49062629 C/T 1 52 61 113 23.4209824179374 33.5253860097273 -10.1044035917898 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0589061808303305 ENSG00000178035:ENST00000429182:exon_49062559_49062702:IMPDH2;ENSG00000178035:ENST00000326739:exon_49062559_49062702:IMPDH2;ENSG00000178035:ENST00000484872:exon_49062559_49062676:IMPDH2;ENSG00000178035:ENST00000481274:exon_49062559_49062848:IMPDH2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 49314139 A/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G A G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000188315:ENST00000343010:exon_49313860_49315342:C3orf62;ENSG00000188315:ENST00000424960:exon_49314009_49314275:C3orf62;ENSG00000188315:ENST00000436325:exon_49313860_49314274:C3orf62 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 50005341 C/T 1 11 12 23 4.95443858840984 6.5951579035529 -1.64071931514307 T:C C T 10 0.549596491962742 0.53401084593008 ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50004903_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50004631_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50004631_50006181:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000425608:exon_50004903_50006181:RBM6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 70 58 128 31.5282455626081 31.876596533839 -0.348350971230971 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 16 6 22 7.20645612859613 3.29757895177645 3.90887717681968 T:C T C 10 0.549596491962742 0.132162039868580 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 51968724 C/T 1 20 15 35 9.00807016074516 8.24394737944113 0.764122781304032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.866037960151781 ENSG00000114767:ENST00000232888:exon_51968647_51968792:RRP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 52022821 T/C 1 22 11 33 9.90887717681968 6.04556141159016 3.86331576522952 T:C T C 10 0.549596491962742 0.220874091278342 ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000515879:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000232907:exon_52022782_52022842:RP11-155D18.11;ENSG00000243989:ENST00000491318:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000476854:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000476351:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000494103:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000404366:exon_52022782_52022842:ACY1;ENSG00000243989:ENST00000490244:exon_52022318_52022842:ACY1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 13 10 23 5.85524560448435 5.49596491962742 0.359280684856935 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 52668638 G/A 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52668618_52668831:PBRM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 19 23 42 8.5576666527079 12.6407193151431 -4.08305266243516 A:G G A 10 0.549596491962742 0.217648294850377 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 52727736 A/G 1 74 60 134 33.3298595947571 32.9757895177645 0.354070076992578 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 14 14 28 6.30564911252161 7.69435088747839 -1.38870177495678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.704872349520973 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 53346382 G/A 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.198962600989567 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 53899276 C/T 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53898773_53899827:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53898773_53899615:IL17RB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 10 21 31 4.50403508037258 11.5415263312176 -7.037491250845 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.0174434711233449 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 58183616 C/T 1 30 3 33 13.5121052411177 1.64878947588823 11.8633157652295 T:C C T 10 0.549596491962742 1.16900095698983e-05 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58183548_58183705:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58183548_58183705:DNASE1L3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 20 31 51 9.00807016074516 17.037491250845 -8.02942109009984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0337261760496552 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 97678077 C/T 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 60 49 109 27.0242104822355 26.9302281061744 0.093982376061124 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 112724661 T/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112721287_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112721291_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112723764_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112723801_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112723811_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112724023_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112724090_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112724169_112724851:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112724328_112724851:C3orf17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 119276577 G/A 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000121594:ENST00000264246:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383669:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000383668:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000478182:exon_119276476_119276775:CD80;ENSG00000121594:ENST00000463729:exon_119276476_119276687:CD80 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 119721079 C/T 1 7 13 20 3.15282455626081 7.14475439551565 -3.99192983925484 T:C C T 10 0.549596491962742 0.113396165026574 ENSG00000082701:ENST00000264235:exon_119720893_119721086:GSK3B;ENSG00000082701:ENST00000316626:exon_119720893_119721086:GSK3B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 120315186 A/T 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 A:T A T 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000065518:ENST00000184266:exon_120315156_120315386:NDUFB4;ENSG00000065518:ENST00000485064:exon_120315175_120315386:NDUFB4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121354583 G/A 1 36 28 64 16.2145262893413 15.3887017749568 0.825824514384514 A:T:G G A 10 0.549596491962742 0.900313828567159 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121361832 C/T 1 5 11 16 2.25201754018629 6.04556141159016 -3.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0768780905652464 ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121361774_121363030:HCLS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 103 97 200 46.3915613278376 53.310859720386 -6.91929839254839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.355624672321856 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 41 29 70 18.4665438295276 15.9382982669195 2.52824556260806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.631207417747624 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121415271 C/T 1 23 22 45 10.3592806848569 12.0911228231803 -1.73184213832339 T:C C T 10 0.549596491962742 0.654296997508016 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 34 57 91 15.3137192732668 31.3270000418763 -16.0132807686095 T:C T C 10 0.549596491962742 0.000983250862311315 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 121774358 A/G 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 A:G A G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 122259640 T/C 1 17 9 26 7.65685963663339 4.94636842766468 2.71049120896871 T:C T C 10 0.549596491962742 0.328373919960211 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 122338637 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122338628_122338690:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122338628_122338690:PARP15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 35 45 80 15.764122781304 24.7318421383234 -8.96771935701936 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0554349885166326 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 122354792 G/A 1 55 53 108 24.7721929420492 29.1286140740253 -4.35642113197613 A:G G A 10 0.549596491962742 0.439380645568117 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 124379817 T/C 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:C T C 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000160145:ENST00000360013:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000428018:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000354186:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000393496:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000291478:exon_124379770_124379820:KALRN;ENSG00000160145:ENST00000459915:exon_124379770_124379820:KALRN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 124732264 G/C 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000173706:ENST00000311127:exon_124731467_124732834:HEG1;ENSG00000173706:ENST00000451796:exon_124731384_124732834:HEG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 124802677 A/G 1 106 89 195 47.7427718519493 48.914087784684 -1.17131593273469 A:G A G 10 0.549596491962742 0.885690960044081 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 124802881 A/G 1 62 20 82 27.92501749831 10.9919298392548 16.9330876590552 A:G A G 10 0.549596491962742 0.000136619098057390 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 124802888 C/T 1 59 25 84 26.5738069741982 13.7399122990685 12.8338946751297 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00579339736963285 ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124801480_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124801482_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124801803_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124801987_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124802001_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124802494_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000483944:exon_124802655_124802896:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124802734_124802893:SLC12A8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 125176078 G/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 126676271 G/A 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126676259_126676676:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126676259_126676776:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126676268_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504084:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504973:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000510044:exon_126676259_126676394:CHCHD6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 127292362 C/T 1 19 21 40 8.5576666527079 11.5415263312176 -2.98385967850968 T:C C T 10 0.549596491962742 0.346059684000148 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127291912_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127291930_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127291936_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127291974_127292631:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127291989_127292631:TPRA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 127399132 C/T 1 10 13 23 4.50403508037258 7.14475439551565 -2.64071931514307 T:C C T 10 0.549596491962742 0.29908199719629 ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127399112_127399288:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127399112_127399762:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127399112_127399760:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127399112_127399763:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127399112_127399763:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127399112_127399756:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127399112_127399754:ABTB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 127411195 G/A 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.803195989938746 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 127439968 C/T 1 10 12 22 4.50403508037258 6.5951579035529 -2.09112282318032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.397782719259223 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000496306:exon_127439896_127440014:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398101:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000487473:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000484451:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000465597:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000479967:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000493611:exon_127439919_127440006:MGLL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 71 121 192 31.9786490706453 66.5011755274918 -34.5225264568465 A:G A G 10 0.549596491962742 6.41938285423999e-07 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 131102053 A/G 1 20 14 34 9.00807016074516 7.69435088747839 1.31371927326677 A:G A G 10 0.549596491962742 0.731714148308966 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 131102169 T/C 1 27 27 54 12.160894717006 14.839105282994 -2.67821056598807 T:C T C 10 0.549596491962742 0.495703065280434 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 141161479 G/A 1 35 26 61 15.764122781304 14.2895087910313 1.47461399027274 A:G G A 10 0.549596491962742 0.797199072707292 ENSG00000177311:ENST00000509842:exon_141161231_141161682:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000507722:exon_141161231_141161586:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000513258:exon_141161231_141161555:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000510338:exon_141161231_141161668:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000504673:exon_141161231_141161512:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000510726:exon_141161231_141161862:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000509813:exon_141161231_141161564:ZBTB38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 141164374 G/A 1 10 3 13 4.50403508037258 1.64878947588823 2.85524560448435 A:G G A 10 0.549596491962742 0.162687516850499 ENSG00000177311:ENST00000505929:exon_141164339_141164549:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 0 0 8 8 0 4.39677193570194 -4.39677193570194 A C A 10 0.549596491962742 0.00169361275347944 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 169700525 C/G 1 214 185 399 96.3863507199732 101.675351013107 -5.28900029313404 T:C:G C G 10 0.549596491962742 0.614990132042414 ENSG00000008952:ENST00000337002:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000460513:exon_169700425_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000480708:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000487736:exon_169700495_169700645:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000469515:exon_169700448_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000481435:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000497277:exon_169700495_169700647:SEC62 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 170843782 C/A 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 A:C C A 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170843701_170843940:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170843701_170843940:TNIK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 170946002 A/G 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 A:G A G 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_170945954_170946010:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_170945954_170946010:TNIK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 171320907 C/T 1 4 12 16 1.80161403214903 6.5951579035529 -4.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0216259683807766 ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 179052195 C/A 1 8 17 25 3.60322806429806 9.34314036336661 -5.73991229906855 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0260405038180599 ENSG00000121864:ENST00000496856:exon_179051057_179052402:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000326361:exon_179051057_179053323:ZNF639;ENSG00000121864:ENST00000484866:exon_179051057_179052400:ZNF639 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 182631792 C/A 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000058063:ENST00000490303:exon_182631649_182631891:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000491699:exon_182631649_182632393:ATP11B;ENSG00000058063:ENST00000484691:exon_182631649_182631884:ATP11B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 182755101 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000078070:ENST00000265594:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000492597:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000497830:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000392616:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000495767:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000476176:exon_182755006_182755222:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000489909:exon_182755006_182755143:MCCC1;ENSG00000078070:ENST00000448585:exon_182755033_182755197:MCCC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 182853670 T/C 1 15 2 17 6.75605262055887 1.09919298392548 5.65685963663339 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0059330660563916 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182853505_182853675:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182853505_182853675:LAMP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 182871701 C/T 1 37 15 52 16.6649297973785 8.24394737944113 8.42098241793742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0247979022156788 ENSG00000078081:ENST00000265598:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000466939:exon_182871470_182872179:LAMP3;ENSG00000078081:ENST00000476015:exon_182871689_182872179:LAMP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 183560111 C/T 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C C T 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183560086_183560182:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183560086_183560172:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183560086_183560142:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183560086_183560235:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183560086_183560235:PARL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 183901389 T/C 1 17 21 38 7.65685963663339 11.5415263312176 -3.88466669458419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.253649954433768 ENSG00000161203:ENST00000382456:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000411763:exon_183901270_183901450:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000292807:exon_183901270_183901879:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000439647:exon_183901270_183901836:AP2M1;ENSG00000161203:ENST00000461733:exon_183901270_183901853:AP2M1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 184039872 G/A 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000450424:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000421110:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000413967:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000426123:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000444861:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184039070_184039891:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184039070_184039891:EIF4G1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 185229318 G/A 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185229312_185229485:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185229312_185229485:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000435679:exon_185229312_185229384:LIPH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 185252801 T/C 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185252553_185252920:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185252553_185252920:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000429510:exon_185252553_185252920:LIPH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 185252811 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000163898:ENST00000296252:exon_185252553_185252920:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000424591:exon_185252553_185252920:LIPH;ENSG00000163898:ENST00000429510:exon_185252553_185252920:LIPH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 186301703 A/G 1 67 46 113 30.1770350384963 25.2814386302861 4.89559640821016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.395111248243503 ENSG00000090520:ENST00000439351:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000265028:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000495390:exon_186301654_186301765:DNAJB11;ENSG00000090520:ENST00000418776:exon_186301654_186301765:DNAJB11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 186761055 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186760442_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186760804_186761098:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000464827:exon_186760896_186761098:ST6GAL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 187088926 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 44 27 71 19.8177543536394 14.839105282994 4.97864907064532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.283027357687961 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 191100561 C/A 1 25 15 40 11.2600877009315 8.24394737944113 3.01614032149032 A:C C A 10 0.549596491962742 0.427272588762762 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191100535_191100614:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191100535_191100614:CCDC50 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 195453310 G/A 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000423938:exon_195453241_195453443:MUC20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 195453434 G/A 1 12 3 15 5.4048420964471 1.64878947588823 3.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0677975361334678 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195451551_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195451098_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195452544_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195453052_195453443:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000423938:exon_195453241_195453443:MUC20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 195456561 C/G 1 14 1 15 6.30564911252161 0.549596491962742 5.75605262055887 C:G C G 10 0.549596491962742 0.00279456656863171 ENSG00000176945:ENST00000447234:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000320736:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000436408:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000445522:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000381954:exon_195456519_195456610:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000498018:exon_195456519_195456993:MUC20;ENSG00000176945:ENST00000423938:exon_195456519_195456610:MUC20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 195965670 G/C 1 16 8 24 7.20645612859613 4.39677193570194 2.80968419289419 C:G G C 10 0.549596491962742 0.306993373373831 ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195965579_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195961239_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195965422_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000460827:exon_195965662_195965765:PCYT1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 196199204 G/T 1 11 8 19 4.95443858840984 4.39677193570194 0.557666652707903 T:G G T 10 0.549596491962742 0.822816223025556 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 196214259 C/T 1 18 15 33 8.10726314467064 8.24394737944113 -0.136684234770485 T:C C T 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 196281208 T/C 1 26 22 48 11.7104912089687 12.0911228231803 -0.380631614211614 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000185798:ENST00000332629:exon_196281056_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000429115:exon_196281059_196281678:WDR53;ENSG00000185798:ENST00000433160:exon_196281065_196281678:WDR53 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 197401952 T/C 1 13 15 28 5.85524560448435 8.24394737944113 -2.38870177495678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.448190200424548 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197398264_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197400833_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197400891_197402067:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197401889_197402067:KIAA0226 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 197403844 T/C 1 18 16 34 8.10726314467064 8.79354387140387 -0.686280726733226 T:C T C 10 0.549596491962742 0.86403349762579 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197403088_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197403711_197403909:KIAA0226 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 3 197427557 A/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 675777 G/C 1 22 27 49 9.90887717681968 14.839105282994 -4.93022810617436 A:C:G G C 10 0.549596491962742 0.195833118431503 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 1818621 C/T 1 21 25 46 9.45847366878242 13.7399122990685 -4.28143863028613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.236254849429802 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 2233709 A/G 1 8 11 19 3.60322806429806 6.04556141159016 -2.4423333472921 A:G A G 10 0.549596491962742 0.356813968848070 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 2835501 G/A 1 27 29 56 12.160894717006 15.9382982669195 -3.77740354991355 A:G G A 10 0.549596491962742 0.347865292539605 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2835424_2836020:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2835424_2836015:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2835424_2842823:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2835424_2836016:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2835424_2836014:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2835424_2842825:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2834717_2836016:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2835424_2836016:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513069:exon_2835424_2835687:SH3BP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 2941349 G/A 1 14 7 21 6.30564911252161 3.84717544373919 2.45847366878242 A:G G A 10 0.549596491962742 0.381147637342633 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000507120:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2941254_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2941262_2941372:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2941266_2941372:NOP14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 53 39 92 23.8713859259747 21.4342631865469 2.43712273942774 T:C T C 10 0.549596491962742 0.675448689905337 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 3514695 A/G 1 57 36 93 25.6729999581237 19.7854737106587 5.887526247465 A:G A G 10 0.549596491962742 0.251725846414795 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 21 22 43 9.45847366878242 12.0911228231803 -2.6326491543979 A:G A G 10 0.549596491962742 0.446131561329435 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 4276394 C/T 1 48 58 106 21.6193683857884 31.876596533839 -10.2572281480507 T:C C T 10 0.549596491962742 0.050679088641263 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 54 40 94 24.3217894340119 21.9838596785097 2.33792975550226 A:C C A 10 0.549596491962742 0.678924435618787 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 4283537 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000513174:exon_4283510_4283624:LYAR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5448429 A/G 1 14 4 18 6.30564911252161 2.19838596785097 4.10726314467064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0592141235470723 ENSG00000152953:ENST00000282908:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000512018:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000512636:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000510398:exon_5448400_5448503:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000511959:exon_5448400_5449057:STK32B;ENSG00000152953:ENST00000508728:exon_5448400_5448503:STK32B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5527998 C/T 1 17 5 22 7.65685963663339 2.74798245981371 4.90887717681968 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.0513604638116027 ENSG00000082929:ENST00000515342:exon_5527943_5528060:C4orf6;ENSG00000082929:ENST00000195455:exon_5527943_5528060:C4orf6;ENSG00000082929:ENST00000505296:exon_5527922_5528060:C4orf6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5642274 T/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000173040:ENST00000475313:exon_5642241_5642565:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000344938:exon_5642241_5642565:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000310917:exon_5642241_5642565:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000344408:exon_5642241_5642565:EVC2;ENSG00000173040:ENST00000509670:exon_5642249_5642565:EVC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5749961 G/C 1 10 10 20 4.50403508037258 5.49596491962742 -0.991929839254839 C:G G C 10 0.549596491962742 0.660911275578475 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5749875_5750033:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5749811_5750039:CRMP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5754592 G/A 1 16 16 32 7.20645612859613 8.79354387140387 -1.58708774280774 A:G G A 10 0.549596491962742 0.597826695585103 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000514919:exon_5754402_5754779:EVC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5803633 C/T 1 11 10 21 4.95443858840984 5.49596491962742 -0.541526331217581 T:C C T 10 0.549596491962742 0.829710755643621 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5803735 G/A 1 12 11 23 5.4048420964471 6.04556141159016 -0.640719315143065 A:G G A 10 0.549596491962742 0.835925874082625 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5803677_5803821:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5803677_5803821:EVC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 5803745 G/A 1 12 8 20 5.4048420964471 4.39677193570194 1.00807016074516 A:G G A 10 0.549596491962742 0.822946214076613 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5803677_5803821:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5803677_5803821:EVC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 8375322 A/T 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:T A T 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000087008:ENST00000512411:exon_8375288_8375542:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000515797:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8375288_8375355:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8375288_8375355:ACOX3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 12 7 19 5.4048420964471 3.84717544373919 1.5576666527079 T:C T C 10 0.549596491962742 0.500715990574539 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 13604182 T/C 1 13 13 26 5.85524560448435 7.14475439551565 -1.28950879103129 T:C T C 10 0.549596491962742 0.694832814629511 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 13604418 G/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 13610236 C/T 1 101 101 202 45.4907543117631 55.5092456882369 -10.0184913764739 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.158029938392246 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13610154_13610292:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13610154_13610292:BOD1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 13615174 G/A 1 66 68 134 29.726631530459 37.3725614534665 -7.64592992300742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.193375675828752 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615136_13615285:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615130_13615285:BOD1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 13616157 C/T 1 157 161 318 70.7133507618495 88.4850352060015 -17.7716844441519 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.0484704842856637 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13615820_13616434:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13615820_13616434:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000482713:exon_13615820_13616434:BOD1L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 15835844 A/C 1 9 5 14 4.05363157233532 2.74798245981371 1.30564911252161 A:C A C 10 0.549596491962742 0.595838131122828 ENSG00000004468:ENST00000502843:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000226279:exon_15835840_15835925:CD38;ENSG00000004468:ENST00000510674:exon_15835840_15835925:CD38 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 15937670 C/T 1 1 10 11 0.450403508037258 5.49596491962742 -5.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00361375286160243 ENSG00000137440:ENST00000382333:exon_15937192_15938275:FGFBP1;ENSG00000137440:ENST00000259988:exon_15937195_15938275:FGFBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 15964349 C/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:C C A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000137441:ENST00000259989:exon_15964061_15964859:FGFBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 15964485 G/A 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000137441:ENST00000259989:exon_15964061_15964859:FGFBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 37857342 G/C 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 C:G G C 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 37863238 G/A 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37863131_37864558:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37863131_37863634:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37863131_37863291:PGM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 16 3 19 7.20645612859613 1.64878947588823 5.5576666527079 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0104335744009062 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 40121562 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40121552_40123929:N4BP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 56875932 C/T 1 24 14 38 10.8096841928942 7.69435088747839 3.1153333054158 T:C C T 10 0.549596491962742 0.332515261253411 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56875901_56876069:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56875901_56876069:CEP135 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:C A C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 57354125 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57354115_57354179:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57354115_57354179:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000505314:exon_57354115_57354179:SRP72 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 68447040 C/T 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68447023_68447189:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68447023_68447189:STAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 73942702 C/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:C C A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 73991006 T/C 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000514252:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000254802:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000411811:exon_73990918_73991029:ANKRD17 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 76721584 G/A 1 10 3 13 4.50403508037258 1.64878947588823 2.85524560448435 A:G G A 10 0.549596491962742 0.162687516850499 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76721504_76721622:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76721504_76721622:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76721504_76721622:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76721504_76721622:USO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 76878716 G/C 1 17 20 37 7.65685963663339 10.9919298392548 -3.33507020262145 C:G G C 10 0.549596491962742 0.322003568193470 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76878671_76878861:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76878671_76878861:SDAD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 77082799 G/C 1 9 2 11 4.05363157233532 1.09919298392548 2.95443858840984 C:G G C 10 0.549596491962742 0.126180563142262 ENSG00000138760:ENST00000264896:exon_77079890_77082904:SCARB2;ENSG00000138760:ENST00000452464:exon_77082439_77082904:SCARB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 83348652 T/C 1 39 42 81 17.5657368134531 23.0830526624352 -5.5173158489821 T:C T C 10 0.549596491962742 0.221489022174167 ENSG00000152795:ENST00000295470:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000502762:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000349655:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000514511:exon_83348586_83348717:HNRPDL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 83765643 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000138674:ENST00000395310:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000348405:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000513858:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000509142:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000443462:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000432794:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000311785:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000448323:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000326950:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505472:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000500777:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000355196:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508502:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000264405:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000505984:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000511338:exon_83765539_83765662:SEC31A;ENSG00000138674:ENST00000508479:exon_83764838_83765662:SEC31A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 88379063 A/G 1 14 20 34 6.30564911252161 10.9919298392548 -4.68628072673323 A:G A G 10 0.549596491962742 0.121590000355605 ENSG00000170502:ENST00000302174:exon_88378995_88379497:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000358033:exon_88378995_88379497:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000473942:exon_88378995_88380606:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000440591:exon_88378995_88379070:NUDT9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 99363278 G/A 1 16 9 25 7.20645612859613 4.94636842766468 2.26008770093145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.424879567752466 ENSG00000138698:ENST00000380158:exon_99363141_99363524:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408927:exon_99363141_99365012:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000453712:exon_99363141_99363817:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408900:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000339360:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 103789810 C/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:C C A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 23 17 40 10.3592806848569 9.34314036336661 1.01614032149032 C:G C G 10 0.549596491962742 0.874009975940807 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 104066290 T/G 1 43 18 61 19.3673508456021 9.89273685532936 9.47461399027274 T:G T G 10 0.549596491962742 0.0145486591146299 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 104067086 T/C 1 24 16 40 10.8096841928942 8.79354387140387 2.01614032149032 T:C T C 10 0.549596491962742 0.634140370111527 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 104070433 T/A 1 29 14 43 13.0617017330805 7.69435088747839 5.3673508456021 A:T T A 10 0.549596491962742 0.124733359257967 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104070275_104070565:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104070275_104070565:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104070275_104070565:CENPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 104082349 C/T 1 16 13 29 7.20645612859613 7.14475439551565 0.0617017330804828 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104082243_104082408:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104082243_104082408:CENPE HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 106158193 C/A 0 0 9 9 0 4.94636842766468 -4.94636842766468 A C A 10 0.549596491962742 0.00076280912542378 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 106604190 A/G 1 20 7 27 9.00807016074516 3.84717544373919 5.16089471700597 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0529516758400742 ENSG00000236699:ENST00000503289:exon_106604079_106604203:ARHGEF38;ENSG00000138785:ENST00000394735:exon_106603784_106604474:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000340139:exon_106603784_106604474:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000451321:exon_106603784_106604474:INTS12;ENSG00000138785:ENST00000265150:exon_106603787_106604474:INTS12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 108955443 C/T 1 20 17 37 9.00807016074516 9.34314036336661 -0.335070202621452 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108955395_108956327:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000510728:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000515462:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000514776:exon_108955395_108955648:HADH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 14 15 29 6.30564911252161 8.24394737944113 -1.93829826691952 A:G G A 10 0.549596491962742 0.576354220871711 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 122602913 C/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 C:G C G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122602826_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122602826_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122602826_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122602826_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122602826_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000509016:exon_122602826_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122602517_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122602711_122602916:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122602826_122602916:ANXA5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 123160971 G/A 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123160671_123161508:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123160671_123161508:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123160671_123161508:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000441681:exon_123160671_123161508:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000455637:exon_123160671_123161508:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000423315:exon_123160671_123161508:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000424425:exon_123160671_123161084:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000495260:exon_123160671_123161084:KIAA1109 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 128861050 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000164073:ENST00000296468:exon_128861008_128861152:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000515130:exon_128861008_128861152:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000513559:exon_128861008_128861152:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000505284:exon_128861008_128861152:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000509826:exon_128861008_128861152:MFSD8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 129867280 T/A 1 15 8 23 6.75605262055887 4.39677193570194 2.35928068485693 A:T T A 10 0.549596491962742 0.403782240071035 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 129880770 G/A 1 17 10 27 7.65685963663339 5.49596491962742 2.16089471700597 A:T:C:G G A 10 0.549596491962742 0.444588455631546 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 167 8 175 75.2173858422221 4.39677193570194 70.8206139065202 A:G G A 10 0.549596491962742 1.43353213352455e-33 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 144442735 C/T 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 146479091 C/G 1 10 13 23 4.50403508037258 7.14475439551565 -2.64071931514307 C:G C G 10 0.549596491962742 0.29908199719629 ENSG00000170365:ENST00000302085:exon_146478943_146479231:SMAD1;ENSG00000170365:ENST00000394092:exon_146478943_146479106:SMAD1;ENSG00000170365:ENST00000515385:exon_146478943_146479231:SMAD1;ENSG00000170365:ENST00000511125:exon_146478943_146479231:SMAD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 154502555 A/G 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G A G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 154502566 A/G 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000446129:exon_154502559_154502712:KIAA0922 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 154502655 C/G 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154502559_154502712:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000446129:exon_154502559_154502712:KIAA0922 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 154548809 G/C 1 12 11 23 5.4048420964471 6.04556141159016 -0.640719315143065 C:G G C 10 0.549596491962742 0.835925874082625 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154548757_154548839:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154548757_154548839:KIAA0922 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 154553833 A/G 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 A:G A G 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:T A T 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 43 64 107 19.3673508456021 35.1741754856155 -15.8068246400134 A:T:C T C 10 0.549596491962742 0.0024753595017045 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 156277007 G/C 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 C:G G C 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276868_156277036:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276868_156277036:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276868_156277036:MAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 164435239 A/G 1 55 66 121 24.7721929420492 36.273368469541 -11.5011755274918 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0439836763522302 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 43 37 80 19.3673508456021 20.3350702026215 -0.967719357019355 A:C:G A C 10 0.549596491962742 0.823388795134058 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 41 22 63 18.4665438295276 12.0911228231803 6.37542100634726 T:C T C 10 0.549596491962742 0.128215375377855 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:G G T 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 A:G G A 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 169931274 G/A 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 A:G G A 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 185615764 C/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:C C A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 185615768 T/G 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:G T G 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 185634144 T/C 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C T C 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 185637663 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 185637699 A/G 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G A G 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 186097045 C/T 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 186299260 A/G 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000109771:ENST00000362004:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000328559:exon_186299235_186300152:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000510776:exon_186298063_186300172:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000505916:exon_186299235_186299361:LRP2BP;ENSG00000109771:ENST00000511404:exon_186299235_186299361:LRP2BP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 186320880 A/G 1 34 41 75 15.3137192732668 22.5334561704724 -7.21973689720565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.104299693283203 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000506424:exon_186320724_186320897:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 186320906 C/G 1 41 54 95 18.4665438295276 29.6782105659881 -11.2116667364605 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0231034941498153 ENSG00000186352:ENST00000335174:exon_186320724_186320927:ANKRD37;ENSG00000186352:ENST00000511393:exon_186320724_186321782:ANKRD37;ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186320694_186321632:UFSP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 190862126 A/G 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 A A 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 190862142 C/T 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 C C 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 190862151 A/C 0 0 10 10 0 5.49596491962742 -5.49596491962742 C A C 10 0.549596491962742 0.000343571906053703 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 4 190862154 T/C 0 11 0 11 4.95443858840984 0 4.95443858840984 T T 10 0.549596491962742 0.00153666780425769 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 10430185 T/C 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.151734919978227 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 14291259 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14290825_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14290825_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14290825_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14291086_14291337:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000504606:exon_14291086_14291337:TRIO HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 16475199 C/G 1 1 8 9 0.450403508037258 4.39677193570194 -3.94636842766468 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0137150888612322 ENSG00000154153:ENST00000510362:exon_16474758_16475343:FAM134B;ENSG00000154153:ENST00000399793:exon_16473162_16475343:FAM134B;ENSG00000154153:ENST00000306320:exon_16473163_16475343:FAM134B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 17275564 A/T 1 80 52 132 36.0322806429806 28.5790175820626 7.45326306091806 A:T A T 10 0.549596491962742 0.220610842450166 ENSG00000176788:ENST00000322611:exon_17275317_17276943:BASP1;ENSG00000176788:ENST00000447228:exon_17275326_17275588:BASP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 31409252 A/G 1 14 9 23 6.30564911252161 4.94636842766468 1.35928068485693 A:G A G 10 0.549596491962742 0.677016843277721 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31409163_31409266:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000509067:exon_31408843_31409266:DROSHA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 33881385 G/C 1 7 16 23 3.15282455626081 8.79354387140387 -5.64071931514307 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0208917723260816 ENSG00000151388:ENST00000504830:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000352040:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000515401:exon_33881224_33881585:ADAMTS12;ENSG00000151388:ENST00000509762:exon_33880969_33881585:ADAMTS12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 33988445 A/C 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33988412_33988466:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 25 9 34 11.2600877009315 4.94636842766468 6.31371927326677 A:G A G 10 0.549596491962742 0.037313013485233 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 39119723 C/A 1 56 33 89 25.2225964500864 18.1366842347705 7.08591221531596 A:C C A 10 0.549596491962742 0.137028092719313 ENSG00000082074:ENST00000351578:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000515010:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000512982:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000505428:exon_39119637_39119736:FYB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 42719561 T/C 0 0 9 9 0 4.94636842766468 -4.94636842766468 C T C 10 0.549596491962742 0.00076280912542378 ENSG00000112964:ENST00000230882:exon_42718555_42721979:GHR;ENSG00000112964:ENST00000357703:exon_42718555_42721925:GHR;ENSG00000112964:ENST00000511135:exon_42718555_42719893:GHR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 43039593 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 52157374 T/C 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000213949:ENST00000282588:exon_52157281_52157393:ITGA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 C:G G C 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 29 33 62 13.0617017330805 18.1366842347705 -5.07498250169 A:G A G 10 0.549596491962742 0.203821876494672 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 146 121 267 65.7589121734397 66.5011755274918 -0.742263354052113 T:C T C 10 0.549596491962742 0.950989866370452 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 35 46 81 15.764122781304 25.2814386302861 -9.5173158489821 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0437548178085339 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 65350332 C/T 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 65350374 A/G 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 68396580 G/A 1 10 2 12 4.50403508037258 1.09919298392548 3.4048420964471 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0776931552832544 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 68425303 A/G 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000145740:ENST00000396591:exon_68425274_68426896:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000438236:exon_68425274_68426892:SLC30A5;ENSG00000145740:ENST00000511158:exon_68425274_68425953:SLC30A5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 68599735 G/A 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000183323:ENST00000396496:exon_68599674_68599756:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000396499:exon_68599674_68599756:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000342578:exon_68599674_68599756:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000453797:exon_68599674_68599756:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000414260:exon_68599674_68599756:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000383374:exon_68599674_68599756:CCDC125;ENSG00000183323:ENST00000511257:exon_68599674_68599756:CCDC125 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70798550 C/G 1 27 34 61 12.160894717006 18.6862807267332 -6.52538600972726 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0959786989145363 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70798426_70798618:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70798426_70798618:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70800475 C/T 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70800538 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70800448_70800578:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70800448_70800578:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70806457 G/A 1 53 44 97 23.8713859259747 24.1822456463606 -0.31085972038597 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70806649 T/A 1 57 53 110 25.6729999581237 29.1286140740253 -3.45561411590162 A:T T A 10 0.549596491962742 0.565539043753586 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70809169 A/G 1 7 14 21 3.15282455626081 7.69435088747839 -4.54152633121758 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0506818319798257 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70809012_70809234:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70809012_70809234:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 70840233 C/T 1 13 11 24 5.85524560448435 6.04556141159016 -0.190315807105807 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000514903:exon_70840184_70840334:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000525844:exon_70840184_70840334:BDP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 71519664 C/T 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000431255:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71519510_71519677:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71519630_71519677:MRPS27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 8 1 9 3.60322806429806 0.549596491962742 3.05363157233532 A:T A T 10 0.549596491962742 0.0474590365992993 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 74064866 G/A 1 98 104 202 44.1395437876513 57.1580351641252 -13.0184913764739 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0663728029976407 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74064756_74064943:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74064756_74064943:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74064756_74064943:NSA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 76335525 C/T 1 15 17 32 6.75605262055887 9.34314036336661 -2.58708774280774 T:C C T 10 0.549596491962742 0.378858186559075 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76335356_76335544:AGGF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 76349900 T/C 1 25 25 50 11.2600877009315 13.7399122990685 -2.4798245981371 T:C T C 10 0.549596491962742 0.481700819021379 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76349790_76349955:AGGF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 77072076 G/T 1 104 123 227 46.8419648358748 67.6003685114173 -20.7584036755424 A:T:G G T 10 0.549596491962742 0.00616343633121558 ENSG00000171530:ENST00000380377:exon_77072029_77072185:TBCA;ENSG00000171530:ENST00000306388:exon_77072029_77072111:TBCA;ENSG00000171530:ENST00000520361:exon_77072029_77072117:TBCA;ENSG00000171530:ENST00000518338:exon_77072029_77072085:TBCA;ENSG00000171530:ENST00000520039:exon_77072029_77072098:TBCA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 77409713 G/A 1 29 43 72 13.0617017330805 23.6326491543979 -10.5709474213174 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0129143248978292 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77409576_77409747:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77409576_77409747:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77409576_77409747:AP3B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 24 36 60 10.8096841928942 19.7854737106587 -8.97578951776452 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0265741745652267 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 80168937 G/A 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 A:G G A 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80168935_80169106:MSH3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 81571896 A/G 1 947 1547 2494 426.532122111283 850.225773066362 -423.693650955079 A:T:G A G 10 0.549596491962742 6.89160265909910e-65 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81569177_81572074:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81571240_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81571697_81572337:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81571879_81571953:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000504293:exon_81571879_81572074:RPS23 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 81574182 C/T 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 87491964 C/T 1 1 8 9 0.450403508037258 4.39677193570194 -3.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0137150888612322 ENSG00000164180:ENST00000511087:exon_87490864_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000510089:exon_87490986_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000296595:exon_87491023_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000506536:exon_87491024_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000511218:exon_87491645_87492305:TMEM161B;ENSG00000164180:ENST00000512429:exon_87491934_87492305:TMEM161B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 88119579 C/T 1 175 144 319 78.8206139065202 79.1418948426348 -0.32128093611469 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000081189:ENST00000340208:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000424173:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000514028:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000437473:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000510942:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000506554:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000508569:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000514015:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000513252:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000506716:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000504921:exon_88119557_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000507984:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000502983:exon_88119552_88119747:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000508610:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000502831:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000503075:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000511086:exon_88119552_88119744:MEF2C;ENSG00000081189:ENST00000509373:exon_88119552_88120092:MEF2C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 94114827 G/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:G G T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000175471:ENST00000514040:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000515393:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312202:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000429576:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000505078:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000312216:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000395933:exon_94114815_94114868:MCTP1;ENSG00000175471:ENST00000508509:exon_94114815_94114868:MCTP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 94267716 T/G 1 5 10 15 2.25201754018629 5.49596491962742 -3.24394737944113 T:G T G 10 0.549596491962742 0.119533522846197 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 95234392 A/C 1 9 4 13 4.05363157233532 2.19838596785097 1.85524560448435 A:C A C 10 0.549596491962742 0.406605284187696 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 14 16 30 6.30564911252161 8.79354387140387 -2.48789475888226 T:G G T 10 0.549596491962742 0.36636204186268 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 12 2 14 5.4048420964471 1.09919298392548 4.30564911252161 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0284046570667369 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 25 2 27 11.2600877009315 1.09919298392548 10.160894717006 T:C C T 10 0.549596491962742 4.46646345869422e-05 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 23 12 35 10.3592806848569 6.5951579035529 3.76412278130403 A:G G A 10 0.549596491962742 0.235793374913487 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 102526673 C/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000145725:ENST00000321521:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000358359:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000451606:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000513500:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000414217:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000509597:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000507966:exon_102526543_102526701:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000511022:exon_102526543_102526683:PPIP5K2;ENSG00000145725:ENST00000510672:exon_102526543_102526759:PPIP5K2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 112177485 C/T 1 8 11 19 3.60322806429806 6.04556141159016 -2.4423333472921 T:C C T 10 0.549596491962742 0.356813968848070 ENSG00000134982:ENST00000457016:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000395617:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508624:exon_112173250_112178452:APC;ENSG00000134982:ENST00000257430:exon_112173250_112181936:APC;ENSG00000134982:ENST00000508376:exon_112173250_112181753:APC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 112238039 A/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:C A C 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 118877660 A/G 1 22 27 49 9.90887717681968 14.839105282994 -4.93022810617436 A:G A G 10 0.549596491962742 0.195833118431503 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 118877677 C/T 1 24 28 52 10.8096841928942 15.3887017749568 -4.57901758206258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.212092858985456 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 118877695 A/G 1 23 27 50 10.3592806848569 14.839105282994 -4.4798245981371 A:T:G A G 10 0.549596491962742 0.204853693668599 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:T T A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 131822055 T/C 1 10 4 14 4.50403508037258 2.19838596785097 2.30564911252161 T:C T C 10 0.549596491962742 0.285902266176585 ENSG00000125347:ENST00000245414:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000472045:exon_131818777_131822822:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000405885:exon_131821943_131822065:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000459982:exon_131821815_131822378:IRF1;ENSG00000125347:ENST00000458069:exon_131822033_131822065:IRF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 131930642 C/T 1 27 22 49 12.160894717006 12.0911228231803 0.069771893825644 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000453394:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131930561_131930736:RAD50 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 132426895 A/G 1 15 9 24 6.75605262055887 4.94636842766468 1.80968419289419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.541033255468647 ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132426885_132427066:HSPA4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 134364518 C/G 0 0 12 12 0 6.5951579035529 -6.5951579035529 G C G 10 0.549596491962742 6.96981375387401e-05 ENSG00000069011:ENST00000265340:exon_134363424_134365011:PITX1;ENSG00000069011:ENST00000506438:exon_134364243_134365011:PITX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 58 49 107 26.123403466161 26.9302281061744 -0.806824640013392 A:G A G 10 0.549596491962742 0.92269275814519 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 34 29 63 15.3137192732668 15.9382982669195 -0.624578993652744 A:G A G 10 0.549596491962742 0.899711490642365 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 138456729 T/C 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C T C 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 140051343 A/G 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 A:G A G 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048918_140051930:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140050854_140051929:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140050854_140051929:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000520764:exon_140050854_140051951:WDR55 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 140699057 G/C 1 57 51 108 25.6729999581237 28.0294210900998 -2.35642113197613 C:G G C 10 0.549596491962742 0.699129625035383 ENSG00000178913:ENST00000313368:exon_140698058_140700351:TAF7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 141001090 T/C 1 15 11 26 6.75605262055887 6.04556141159016 0.710491208968709 T:C T C 10 0.549596491962742 0.845577630679445 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141000443_141001104:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141000443_141001104:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000469207:exon_141000492_141001104:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000459727:exon_141001052_141001104:HDAC3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 141019110 C/A 1 12 14 26 5.4048420964471 7.69435088747839 -2.28950879103129 A:C C A 10 0.549596491962742 0.432085162262284 ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 142780212 A/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:C A C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000415690:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000416954:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142779221_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000510170:exon_142779969_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000508760:exon_142779969_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000502892:exon_142779969_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000514699:exon_142779969_142780417:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000502500:exon_142779973_142780417:NR3C1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 149311652 G/T 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 G G 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 149792109 G/A 1 22 15 37 9.90887717681968 8.24394737944113 1.66492979737855 A:G G A 10 0.549596491962742 0.62346255526554 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 149792113 G/A 1 16 21 37 7.20645612859613 11.5415263312176 -4.33507020262145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.185990005038701 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 149792135 G/A 1 17 17 34 7.65685963663339 9.34314036336661 -1.68628072673323 A:G G A 10 0.549596491962742 0.607281204189121 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 149827189 G/C 1 691 695 1386 311.228824053745 381.969561914106 -70.7407378603604 T:C:G G C 10 0.549596491962742 0.000140014745230852 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 150415236 C/T 1 29 34 63 13.0617017330805 18.6862807267332 -5.62457899365274 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.164881760633805 ENSG00000145901:ENST00000520931:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000389378:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000517504:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000315050:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523338:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000417127:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522574:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000522226:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000519339:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000521591:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000518977:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000524280:exon_150415143_150415268:TNIP1;ENSG00000145901:ENST00000523200:exon_150415143_150415268:TNIP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 150483095 A/G 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.480592129451619 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 153709273 A/G 1 32 7 39 14.4129122571923 3.84717544373919 10.5657368134531 A:G A G 10 0.549596491962742 0.000563097978329532 ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 154182948 T/C 1 14 14 28 6.30564911252161 7.69435088747839 -1.38870177495678 T:C T C 10 0.549596491962742 0.704872349520973 ENSG00000155506:ENST00000336314:exon_154182850_154182973:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000285894:exon_154182850_154182973:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000377643:exon_154182850_154182973:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000518297:exon_154182850_154182973:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000524248:exon_154182850_154182973:LARP1;ENSG00000155506:ENST00000518677:exon_154182850_154182973:LARP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 156816202 C/T 1 20 19 39 9.00807016074516 10.4423333472921 -1.43426318654694 T:C C T 10 0.549596491962742 0.748040323408759 ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523383:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000524058:exon_156816197_156816636:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519663:exon_156816197_156816435:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522884:exon_156816197_156816550:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522775:exon_156816197_156816435:CYFIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 159833529 C/T 1 26 22 48 11.7104912089687 12.0911228231803 -0.380631614211614 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159833475_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000520841:exon_159833356_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000523219:exon_159833372_159833636:SLU7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 19 11 30 8.5576666527079 6.04556141159016 2.51210524111774 T:C T C 10 0.549596491962742 0.463606359255542 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 167937649 A/T 1 15 14 29 6.75605262055887 7.69435088747839 -0.938298266919517 A:T A T 10 0.549596491962742 0.852373243028126 ENSG00000113643:ENST00000231572:exon_167937586_167937691:RARS;ENSG00000113643:ENST00000520013:exon_167937586_167937691:RARS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 169504802 A/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G A G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 170837598 A/G 1 1160 1116 2276 522.468069323219 613.34968503042 -90.8816157072007 A:T:C:G A G 10 0.549596491962742 0.000136542207261380 ENSG00000181163:ENST00000517671:exon_170837531_170837887:NPM1;ENSG00000181163:ENST00000296930:exon_170837531_170838141:NPM1;ENSG00000181163:ENST00000351986:exon_170837531_170837888:NPM1;ENSG00000181163:ENST00000524204:exon_170837531_170837888:NPM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 171533782 T/C 1 15 5 20 6.75605262055887 2.74798245981371 4.00807016074516 T:C T C 10 0.549596491962742 0.076537095683099 ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 176636882 C/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000165671:ENST00000354179:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000439151:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000347982:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000355783:exon_176636637_176639196:NSD1;ENSG00000165671:ENST00000361032:exon_176636637_176639196:NSD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 176734855 G/C 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 C:G G C 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000213347:ENST00000503473:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000509339:exon_176734782_176735063:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000423571:exon_176733818_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000439742:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000503782:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000303165:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513063:exon_176734782_176734965:MXD3;ENSG00000213347:ENST00000513169:exon_176734814_176734965:MXD3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 177482694 T/C 0 124 0 124 55.85003499662 0 55.85003499662 T T 10 0.549596491962742 7.53837554093165e-33 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 178309839 A/G 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000178338:ENST00000322434:exon_178309710_178312029:ZNF354B;ENSG00000178338:ENST00000520377:exon_178309710_178309855:ZNF354B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 179036357 G/A 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.125584560754853 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 179149990 C/T 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.672878774007803 ENSG00000127022:ENST00000504734:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000415618:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000247461:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000452673:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000514032:exon_179149805_179150020:CANX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 179260153 C/T 1 28 27 55 12.6112982250432 14.839105282994 -2.22780705795081 T:C C T 10 0.549596491962742 0.58888502439218 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 179264915 G/T 1 20 9 29 9.00807016074516 4.94636842766468 4.06170173308048 T:G G T 10 0.549596491962742 0.139644316181365 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000518950:exon_179264760_179265255:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 179267949 T/C 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 T:C T C 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000161010:ENST00000403396:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000522663:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518235:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520698:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179267872_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520150:exon_179267240_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520900:exon_179267590_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000519208:exon_179267713_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523737:exon_179267809_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000520995:exon_179267921_179267959:C5orf45 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 5 180486841 C/T 1 16 10 26 7.20645612859613 5.49596491962742 1.71049120896871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.558546355759659 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 13 23 36 5.85524560448435 12.6407193151431 -6.78547371065871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0285385411061063 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 2948904 G/A 1 13 1 14 5.85524560448435 0.549596491962742 5.30564911252161 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00503298802908089 ENSG00000124570:ENST00000380524:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380520:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000335686:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380529:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380539:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000380546:exon_2948393_2948933:SERPINB6;ENSG00000124570:ENST00000316782:exon_2948395_2948933:SERPINB6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 4891954 G/A 1 9 14 23 4.05363157233532 7.69435088747839 -3.64071931514307 A:G G A 10 0.549596491962742 0.144897374794713 ENSG00000153046:ENST00000474977:exon_4891947_4892337:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000491864:exon_4891947_4892346:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000483019:exon_4891947_4892581:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4891947_4892613:CDYL HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 7417658 C/T 1 80 63 143 36.0322806429806 34.6245789936527 1.4077016493279 T:C C T 10 0.549596491962742 0.86663231591231 ENSG00000124784:ENST00000379834:exon_7417564_7418270:RIOK1;ENSG00000124784:ENST00000264874:exon_7417564_7418270:RIOK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 11213548 A/G 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G A G 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 13283674 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000112137:ENST00000457702:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000415087:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000489548:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000379335:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000379329:exon_13283654_13284139:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000481706:exon_13283654_13283778:PHACTR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 26056286 C/G 1 159 145 304 71.614157777924 79.6914913345976 -8.07733355667355 C:G C G 10 0.549596491962742 0.356910930592647 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 T:C T C 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 26545532 C/T 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C:G C T 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:G G A 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 27858421 A/G 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000197153:ENST00000359303:exon_27858160_27858570:HIST1H3J;ENSG00000197153:ENST00000479986:exon_27858413_27858588:HIST1H3J HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 28057075 G/A 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000197279:ENST00000252206:exon_28056341_28057338:ZNF165;ENSG00000197279:ENST00000377325:exon_28056341_28057341:ZNF165 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 131 33 164 59.0028595528808 18.1366842347705 40.8661753181103 A:C C A 10 0.549596491962742 2.93508671556145e-11 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 130 131 261 58.5524560448435 71.9971404471192 -13.4446844022756 C:G G C 10 0.549596491962742 0.105625789606401 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 103 123 226 46.3915613278376 67.6003685114173 -21.2088071835797 A:T:G A G 10 0.549596491962742 0.00493225168652392 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 90 105 195 40.5363157233532 57.7076316560879 -17.1713159327347 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0143434797173680 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 29910679 G/A 1 132 6 138 59.4532630609181 3.29757895177645 56.1556841091416 A:G G A 10 0.549596491962742 5.18543430607901e-27 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 29912315 A/C 0 13 0 13 5.85524560448435 0 5.85524560448435 A A 10 0.549596491962742 0.00044881048072353 ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30032495 A/G 1 57 91 148 25.6729999581237 50.0132807686095 -24.3402808104858 A:G A G 10 0.549596491962742 6.56177163919156e-05 ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30036471 C/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:C C A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 34 38 72 15.3137192732668 20.8846666945842 -5.57094742131742 C:G G C 10 0.549596491962742 0.194338189116384 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 33 34 67 14.8633157652295 18.6862807267332 -3.82296496150371 A:G G A 10 0.549596491962742 0.390521830538503 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30653262 C/T 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000146112:ENST00000274853:exon_30652185_30655672:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000399199:exon_30652185_30653823:KIAA1949;ENSG00000146112:ENST00000376424:exon_30652794_30653795:KIAA1949 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30656382 A/C 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 A:C A C 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30672433 C/A 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:C C A 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30675605 T/G 1 5 8 13 2.25201754018629 4.39677193570194 -2.14475439551565 T:G T G 10 0.549596491962742 0.271985568998683 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30675343_30676134:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30675343_30676134:MDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 30893941 G/A 1 44 30 74 19.8177543536394 16.4878947588823 3.3298595947571 A:G G A 10 0.549596491962742 0.484111456389258 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893886_30894236:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893886_30894236:VARS2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31110391 G/C 1 66 130 196 29.726631530459 71.4475439551565 -41.7209124246974 C:G G C 10 0.549596491962742 2.37468166543530e-09 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31237124 T/C 1 725 44 769 326.542543327012 24.1822456463606 302.360297680651 A:T:C T C 10 0.549596491962742 3.70242604490313e-132 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31237162 C/G 1 544 18 562 245.019508372268 9.89273685532936 235.126771516939 T:C:G C G 10 0.549596491962742 9.52020728385964e-115 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31239378 T/G 0 112 0 112 50.4451929001729 0 50.4451929001729 T T 10 0.549596491962742 8.27462946156567e-30 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31239417 C/T 1 101 6 107 45.4907543117631 3.29757895177645 42.1931753599866 T:C C T 10 0.549596491962742 1.13498796078715e-19 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31239449 C/G 1 13 100 113 5.85524560448435 54.9596491962742 -49.1044035917898 C:G C G 10 0.549596491962742 6.41705375025413e-22 ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31503219 G/A 1 28 27 55 12.6112982250432 14.839105282994 -2.22780705795081 A:G G A 10 0.549596491962742 0.58888502439218 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31503144_31503262:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31503144_31503252:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000482195:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000431908:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31503165_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31503172_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31503184_31503262:BAT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31584275 C/T 1 6 44 50 2.70242104822355 24.1822456463606 -21.4798245981371 T:C C T 10 0.549596491962742 3.68093540467495e-10 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583447_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000487813:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376049:exon_31584121_31584283:AIF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31590921 T/G 1 15 14 29 6.75605262055887 7.69435088747839 -0.938298266919517 T:G T G 10 0.549596491962742 0.852373243028126 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31598489 A/G 1 4 7 11 1.80161403214903 3.84717544373919 -2.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.239395075115393 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31599594 A/G 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31603189 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469501:exon_31603171_31603486:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603153_31603242:BAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31603770 A/G 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31604591 C/T 1 20 11 31 9.00807016074516 6.04556141159016 2.962508749155 T:C C T 10 0.549596491962742 0.367215183259266 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31611746 G/A 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31611667_31611751:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000469182:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000453833:exon_31611667_31611754:BAT3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31631907 G/A 1 34 24 58 15.3137192732668 13.1903158071058 2.12340346616097 A:G G A 10 0.549596491962742 0.600233314303754 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31632134 C/A 1 32 24 56 14.4129122571923 13.1903158071058 1.22259645008645 A:C C A 10 0.549596491962742 0.789311864386877 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 26 29 55 11.7104912089687 15.9382982669195 -4.22780705795081 T:C T C 10 0.549596491962742 0.27921586895178 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31807343 C/T 1 69 181 250 31.0778420545708 99.4769650452563 -68.3991229906855 T:C C T 10 0.549596491962742 2.39805075354605e-18 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 31936466 C/A 1 13 17 30 5.85524560448435 9.34314036336661 -3.48789475888226 A:C C A 10 0.549596491962742 0.205406717572335 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936400_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936463_31936573:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936463_31936573:SKIV2L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32149260 C/T 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000204305:ENST00000469940:exon_32149128_32149412:AGER HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32159956 T/C 1 11 9 20 4.95443858840984 4.94636842766468 0.0080701607451612 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 296 312 608 133.319438379028 171.474105492375 -38.1546671133471 A:C A C 10 0.549596491962742 0.00194137739269059 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 805 603 1408 362.574823969993 331.406684653533 31.1681393164594 A:T:G T G 10 0.549596491962742 0.096833135730547 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 128 0 128 57.651649028769 0 57.651649028769 C C 10 0.549596491962742 6.17069550949683e-34 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32800412 C/T 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 T:C C T 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32805967 A/G 1 2 13 15 0.900807016074516 7.14475439551565 -6.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 0.00124464989148298 ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32805518_32806014:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32805518_32806010:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32805518_32806014:XXbac-BPG246D15.9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32806029 G/C 1 3 21 24 1.35121052411177 11.5415263312176 -10.1903158071058 C:G G C 10 0.549596491962742 3.19298432587146e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32810792 G/T 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 T:G G T 10 0.549596491962742 0.527605575122862 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374881:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000484003:exon_32810449_32810866:PSMB8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32810794 T/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:T T A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000204264:ENST00000395339:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374882:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000374881:exon_32810719_32810866:PSMB8;ENSG00000204264:ENST00000484003:exon_32810449_32810866:PSMB8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 49 37 86 22.0697718938256 20.3350702026215 1.73470169120419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.745874538337647 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33036495 C/T 1 74 92 166 33.3298595947571 50.5628772605723 -17.2330176658152 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0078934855521854 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 89 78 167 40.085912215316 42.8685263730939 -2.78261415777791 C:G G C 10 0.549596491962742 0.697619987009238 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 108 2 110 48.6435788680239 1.09919298392548 47.5443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 1.21507109470201e-25 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 110 8 118 49.5443858840984 4.39677193570194 45.1476139483964 T:C T C 10 0.549596491962742 4.30456529084774e-20 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 170 11 181 76.5685963663339 6.04556141159016 70.5230349547437 A:G G A 10 0.549596491962742 2.70890523322746e-31 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 164 7 171 73.8661753181103 3.84717544373919 70.0189998743711 T:C T C 10 0.549596491962742 9.1561079104115e-34 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 62 7 69 27.92501749831 3.84717544373919 24.0778420545708 T:C T C 10 0.549596491962742 5.01519062579378e-10 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 0 66 0 66 29.726631530459 0 29.726631530459 C C 10 0.549596491962742 8.15128973656881e-18 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 65 0 65 29.2762280224218 0 29.2762280224218 G G 10 0.549596491962742 1.51887003163001e-17 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 63 0 63 28.3754210063473 0 28.3754210063473 A A 10 0.549596491962742 5.32452719995588e-17 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 248 1 249 111.70006999324 0.549596491962742 111.150473501277 A:G A G 10 0.549596491962742 6.47705902455335e-63 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33048658 A/G 1 262 1 263 118.005719105762 0.549596491962742 117.456122613799 A:G A G 10 0.549596491962742 1.00901366929180e-66 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 220 48 268 99.0887717681968 26.3806316142116 72.7081401539851 A:T:C T C 10 0.549596491962742 9.73467844060667e-21 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 235 65 300 105.844824388756 35.7237719775782 70.1210524111774 T:C C T 10 0.549596491962742 4.30431634781736e-17 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 227 51 278 102.241596324458 28.0294210900998 74.2121752343577 T:C T C 10 0.549596491962742 9.09257385717186e-21 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33053609 G/A 1 393 151 544 177.008578658642 82.989070286374 94.0195083722684 A:G G A 10 0.549596491962742 1.34877791399663e-16 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33169895 C/G 1 8 4 12 3.60322806429806 2.19838596785097 1.4048420964471 C:G C G 10 0.549596491962742 0.565055995929006 ENSG00000112473:ENST00000444757:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33169849_33169899:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169849_33169902:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000445037:exon_33169849_33169902:SLC39A7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33258443 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33272312 C/T 1 49 59 108 22.0697718938256 32.4261930258018 -10.3564211319761 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0526994417080204 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272074_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272045_33272415:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272045_33272415:TAPBP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 33272855 G/C 1 23 37 60 10.3592806848569 20.3350702026215 -9.97578951776452 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0130340791057013 ENSG00000231925:ENST00000434618:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000475304:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000489157:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000426633:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000480730:exon_33271440_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000456592:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437116:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000449540:exon_33272766_33273164:TAPBP;ENSG00000231925:ENST00000437741:exon_33272734_33273164:TAPBP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 41 33 74 18.4665438295276 18.1366842347705 0.329859594757096 C:G C G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 35836878 G/A 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 A:G G A 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35836787_35836887:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35836787_35836887:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35836787_35836887:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35836787_35836887:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35836790_35836887:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000507292:exon_35836787_35836915:SRPK1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 36651890 G/A 1 5 15 20 2.25201754018629 8.24394737944113 -5.99192983925484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0113834608966440 ENSG00000124762:ENST00000459970:exon_36651874_36652288:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000448526:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000244741:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000405375:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000373711:exon_36651874_36652323:CDKN1A;ENSG00000124762:ENST00000478800:exon_36651874_36652275:CDKN1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 20 15 35 9.00807016074516 8.24394737944113 0.764122781304032 T:C T C 10 0.549596491962742 0.866037960151781 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 T:G T G 10 0.549596491962742 0.154181475313390 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 41309552 T/C 0 21 0 21 9.45847366878242 0 9.45847366878242 T T 10 0.549596491962742 4.89029266513743e-06 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41309532_41309667:NCR2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 41318438 A/G 0 19 0 19 8.5576666527079 0 8.5576666527079 A A 10 0.549596491962742 1.78418761902946e-05 ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41318416_41318596:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41318416_41318625:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41318416_41318602:NCR2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 42932197 C/A 1 16 8 24 7.20645612859613 4.39677193570194 2.80968419289419 A:C C A 10 0.549596491962742 0.306993373373831 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 42932200 G/T 1 8 15 23 3.60322806429806 8.24394737944113 -4.64071931514307 T:G G T 10 0.549596491962742 0.0599393881223003 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 42995211 A/G 1 22 30 52 9.90887717681968 16.4878947588823 -6.57901758206258 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0709594514625063 ENSG00000124541:ENST00000244496:exon_42995098_42995215:RRP36 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43402565 G/T 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:G G T 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000124574:ENST00000372515:exon_43402359_43402586:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43402359_43402586:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000443426:exon_43402359_43402894:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43402359_43402586:ABCC10 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43480825 C/T 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000509315:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000490447:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503147:exon_43480499_43480930:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000503972:exon_43480807_43480836:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000514627:exon_43480807_43481189:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000460547:exon_43480204_43481371:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000512713:exon_43480807_43480969:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000455768:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000416380:exon_43480807_43480938:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000372417:exon_43480807_43480938:YIPF3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43488930 G/A 1 12 15 27 5.4048420964471 8.24394737944113 -2.83910528299403 A:G G A 10 0.549596491962742 0.334201928306803 ENSG00000171453:ENST00000372389:exon_43488920_43489264:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372373:exon_43488920_43489240:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000436688:exon_43488920_43489240:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372344:exon_43488920_43489244:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000455605:exon_43488920_43489232:POLR1C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43489023 G/A 1 41 51 92 18.4665438295276 28.0294210900998 -9.56287726057226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0469019107505097 ENSG00000171453:ENST00000372389:exon_43488920_43489264:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372373:exon_43488920_43489240:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000436688:exon_43488920_43489240:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000481352:exon_43488670_43489217:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000372344:exon_43488920_43489244:POLR1C;ENSG00000171453:ENST00000455605:exon_43488920_43489232:POLR1C HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43490502 G/A 1 35 22 57 15.764122781304 12.0911228231803 3.67299995812371 A:G G A 10 0.549596491962742 0.353767630283304 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43490069_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43490072_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43490075_43491743:XPO5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43582091 A/T 1 9 18 27 4.05363157233532 9.89273685532936 -5.83910528299403 A:T A T 10 0.549596491962742 0.0318401789131033 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43588007 T/C 1 6 11 17 2.70242104822355 6.04556141159016 -3.34314036336661 T:C T C 10 0.549596491962742 0.142293766298503 ENSG00000172432:ENST00000496137:exon_43587856_43588070:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43587987_43588070:GTPBP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 43608166 C/T 1 1 8 9 0.450403508037258 4.39677193570194 -3.94636842766468 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0137150888612322 ENSG00000124688:ENST00000451025:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372173:exon_43607758_43608656:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000372171:exon_43607758_43608689:MAD2L1BP;ENSG00000124688:ENST00000426254:exon_43607758_43608686:MAD2L1BP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 44081510 C/T 1 39 19 58 17.5657368134531 10.4423333472921 7.12340346616097 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0650179540893515 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 44081769 C/T 1 48 40 88 21.6193683857884 21.9838596785097 -0.364491292721294 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 44122467 C/T 1 38 31 69 17.1153333054158 17.037491250845 0.0778420545708052 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44122429_44123256:TMEM63B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 52129381 C/T 1 23 21 44 10.3592806848569 11.5415263312176 -1.18224564636064 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.763033574761732 ENSG00000112118:ENST00000229854:exon_52128807_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000419835:exon_52128812_52129584:MCM3;ENSG00000112118:ENST00000340349:exon_52128812_52129584:MCM3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 52357109 C/T 1 9 2 11 4.05363157233532 1.09919298392548 2.95443858840984 T:C C T 10 0.549596491962742 0.126180563142262 ENSG00000096093:ENST00000371068:exon_52357068_52357344:EFHC1;ENSG00000096093:ENST00000480623:exon_52357068_52357298:EFHC1;ENSG00000096093:ENST00000481466:exon_52357068_52357344:EFHC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 56376024 G/A 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 A:G G A 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56375995_56376198:DST;ENSG00000151914:ENST00000340834:exon_56375995_56376198:DST HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 56417545 T/C 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 T T 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56416982_56418453:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56416982_56418453:DST HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 56434719 T/C 1 29 10 39 13.0617017330805 5.49596491962742 7.56573681345306 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0154838198605298 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56434654_56434810:DST HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 16 12 28 7.20645612859613 6.5951579035529 0.611298225043225 T:C C T 10 0.549596491962742 0.851801737425603 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 71571395 G/A 1 15 9 24 6.75605262055887 4.94636842766468 1.80968419289419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.541033255468647 ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71569903_71571718:SMAP1;ENSG00000112309:ENST00000230053:exon_71566382_71571452:B3GAT2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 73332040 C/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 C:G C G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 73332121 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000185760:ENST00000342056:exon_73331520_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370398:exon_73331809_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000370392:exon_73331834_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000403813:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000355635:exon_73331918_73332315:KCNQ5;ENSG00000185760:ENST00000402622:exon_73331918_73332315:KCNQ5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 76388322 A/G 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76388299_76388408:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000476060:exon_76386320_76388408:SENP6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 76423256 C/G 1 10 2 12 4.50403508037258 1.09919298392548 3.4048420964471 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0776931552832544 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76423229_76423297:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76423229_76423297:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76423229_76423297:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000503501:exon_76423229_76423297:SENP6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 3 8 11 1.35121052411177 4.39677193570194 -3.04556141159016 A:G A G 10 0.549596491962742 0.075134554902926 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 82922502 C/T 1 19 23 42 8.5576666527079 12.6407193151431 -4.08305266243516 T:C C T 10 0.549596491962742 0.217648294850377 ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82922424_82922510:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82922424_82922510:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82922424_82922510:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82922424_82922510:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82922424_82922510:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000369751:exon_82922424_82922510:IBTK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 52 48 100 23.4209824179374 26.3806316142116 -2.9596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.548712878813098 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 87971068 T/C 1 139 135 274 62.6060876171789 74.1955264149702 -11.5894387977913 T:C T C 10 0.549596491962742 0.162955063597149 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 88228383 T/G 1 18 5 23 8.10726314467064 2.74798245981371 5.35928068485694 T:G T G 10 0.549596491962742 0.0339466293572781 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88228348_88228457:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88228348_88228457:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88228348_88228457:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000497828:exon_88228194_88228457:RARS2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 90374244 A/C 1 9 16 25 4.05363157233532 8.79354387140387 -4.73991229906855 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0698583191151583 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90374206_90374347:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90374206_90374347:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90374206_90374347:MDN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 90435089 C/T 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90434918_90435115:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90434918_90435115:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90434918_90435115:MDN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 90572815 A/G 1 52 46 98 23.4209824179374 25.2814386302861 -1.86045621234871 A:G A G 10 0.549596491962742 0.760924040388493 ENSG00000118412:ENST00000237177:exon_90571845_90574090:CASP8AP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 101248251 T/C 1 11 5 16 4.95443858840984 2.74798245981371 2.20645612859613 T:C T C 10 0.549596491962742 0.321473718302210 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_101248176_101248380:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000324696:exon_101248176_101248380:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000522650:exon_101248176_101248380:ASCC3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 13 18 31 5.85524560448435 9.89273685532936 -4.037491250845 T:C C T 10 0.549596491962742 0.152832353009896 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 109764535 G/T 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:G G T 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 109767930 G/T 1 25 26 51 11.2600877009315 14.2895087910313 -3.02942109009984 T:G G T 10 0.549596491962742 0.402150754110994 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 109768295 G/A 1 10 16 26 4.50403508037258 8.79354387140387 -4.28950879103129 A:G G A 10 0.549596491962742 0.114226480411308 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 109786980 T/C 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 T:C T C 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 111345525 C/G 1 77 77 154 34.6810701188689 42.3189298811311 -7.63785976226227 A:C:G C G 10 0.549596491962742 0.225030090708753 ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111345386_111345530:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000368864:exon_111345386_111345530:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000425871:exon_111345386_111345530:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000454951:exon_111345386_111345530:RPF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 116600453 C/T 1 16 6 22 7.20645612859613 3.29757895177645 3.90887717681968 T:C C T 10 0.549596491962742 0.132162039868580 ENSG00000189241:ENST00000368608:exon_116597744_116601280:TSPYL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 118320595 C/A 1 889 1 890 400.408718645122 0.549596491962742 399.85912215316 A:C C A 10 0.549596491962742 3.43705312713618e-229 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 118887303 T/C 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 T:C T C 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000476150:exon_118887218_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000462101:exon_118887255_118887479:C6orf204 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 118887333 T/C 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:C T C 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000476150:exon_118887218_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000462101:exon_118887255_118887479:C6orf204 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 127651958 A/G 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000093144:ENST00000454859:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000531967:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000309620:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368293:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368290:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000474289:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368295:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000479525:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368291:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000430841:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368289:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368292:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000436638:exon_127651954_127652094:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000525745:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000534442:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000526299:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000474240:exon_127651954_127652045:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000531582:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368287:exon_127651954_127652175:ECHDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 130374025 C/T 1 12 1 13 5.4048420964471 0.549596491962742 4.85524560448435 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0090397181447119 ENSG00000198945:ENST00000529410:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000533560:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000361794:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000528385:exon_130374004_130374125:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368139:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000526019:exon_130374004_130374136:L3MBTL3;ENSG00000198945:ENST00000368136:exon_130374004_130374136:L3MBTL3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 16 12 28 7.20645612859613 6.5951579035529 0.611298225043225 T:C T C 10 0.549596491962742 0.851801737425603 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 435 0 435 195.925525996207 0 195.925525996207 T T 10 0.549596491962742 1.26389375406494e-113 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 503 0 503 226.552964542741 0 226.552964542741 A A 10 0.549596491962742 2.20047019325674e-131 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 490 1 491 220.697718938256 0.549596491962742 220.148122446294 A:G A G 10 0.549596491962742 1.00978016823447e-125 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:G G T 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 137113137 G/A 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_137112848_137113656:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_137112848_137113656:MAP3K5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 138196066 T/G 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:G T G 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 138413269 A/G 1 21 6 27 9.45847366878242 3.29757895177645 6.16089471700597 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0193632969814490 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 138413333 G/C 1 14 6 20 6.30564911252161 3.29757895177645 3.00807016074516 C:G G C 10 0.549596491962742 0.260718294227868 ENSG00000112378:ENST00000421351:exon_138411923_138413405:PERP;ENSG00000112378:ENST00000265603:exon_138411926_138413405:PERP HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 149699925 A/G 1 14 8 22 6.30564911252161 4.39677193570194 1.90887717681968 A:G A G 10 0.549596491962742 0.522024354878786 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 150114745 G/A 1 8 11 19 3.60322806429806 6.04556141159016 -2.4423333472921 A:G G A 10 0.549596491962742 0.356813968848070 ENSG00000120265:ENST00000367384:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000484601:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367378:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000464889:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000367380:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000486585:exon_150114685_150114805:PCMT1;ENSG00000120265:ENST00000495487:exon_150114685_150114768:PCMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 151726300 G/C 1 27 21 48 12.160894717006 11.5415263312176 0.619368385788386 C:G G C 10 0.549596491962742 0.885737232696307 ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000336451:exon_151725989_151726402:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151725990_151726402:RMND1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 151766397 G/A 1 8 1 9 3.60322806429806 0.549596491962742 3.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0474590365992993 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 153603782 G/A 1 5338 2 5340 2404.25392590288 1.09919298392548 2403.15473291896 A:T:G G T 10 0.549596491962742 0 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 154542444 A/G 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 A:G A G 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000074706:ENST00000265198:exon_154542391_154542462:IPCEF1;ENSG00000074706:ENST00000422970:exon_154542391_154542462:IPCEF1;ENSG00000074706:ENST00000367220:exon_154542391_154542462:IPCEF1;ENSG00000074706:ENST00000519344:exon_154542391_154542462:IPCEF1;ENSG00000074706:ENST00000517438:exon_154542391_154542462:IPCEF1;ENSG00000074706:ENST00000519405:exon_154542391_154542462:IPCEF1;ENSG00000074706:ENST00000519190:exon_154542391_154542462:IPCEF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 158093942 G/A 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000175048:ENST00000359775:exon_158093756_158099178:ZDHHC14;ENSG00000175048:ENST00000414563:exon_158093801_158094977:ZDHHC14;ENSG00000175048:ENST00000341375:exon_158093756_158094970:ZDHHC14;ENSG00000175048:ENST00000523706:exon_158093756_158094969:ZDHHC14;ENSG00000175048:ENST00000517432:exon_158093801_158094561:ZDHHC14;ENSG00000175048:ENST00000422910:exon_158093756_158094561:ZDHHC14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 158658450 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 158924788 T/C 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C T C 10 0.549596491962742 0.763998637860147 ENSG00000130338:ENST00000367097:exon_158922710_158925210:TULP4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 159065757 C/T 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000146425:ENST00000367089:exon_159065714_159065771:DYNLT1;ENSG00000146425:ENST00000367085:exon_159065714_159065770:DYNLT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 160103630 A/C 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 A:C A C 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160103172_160103670:SOD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 167343141 G/A 1 407 638 1045 183.314227771164 350.642561872229 -167.328334101065 A:T:G G A 10 0.549596491962742 3.17584009969177e-25 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 167344583 A/G 1 328 205 533 147.732350636221 112.667280852362 35.0650697838585 A:T:G A G 10 0.549596491962742 0.00228983554109066 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167344532_167346537:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167344532_167344606:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167344532_167344606:RNASET2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 170176647 C/T 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 6 170176648 A/G 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G A G 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170176551_170176769:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000477995:exon_170176551_170176769:C6orf70 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 1049606 C/T 1 19 15 34 8.5576666527079 8.24394737944113 0.313719273266774 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000146540:ENST00000425726:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000397100:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000357429:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000397098:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000412051:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000488073:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000444428:exon_1049586_1049779:C7orf50;ENSG00000146540:ENST00000491163:exon_1049586_1049779:C7orf50 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2290522 C/T 1 69 38 107 31.0778420545708 20.8846666945842 10.1931753599866 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.0518724654900413 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2290464_2290780:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000487426:exon_2290464_2290781:NUDT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2577781 T/C 1 48 84 132 21.6193683857884 46.1661053248703 -24.5467369390819 T:C T C 10 0.549596491962742 2.21044393469247e-05 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2577960 G/A 1 23 30 53 10.3592806848569 16.4878947588823 -6.12861407402532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0984008479974346 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2578237 T/C 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2854010 G/A 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2853946_2854023:GNA12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 T:C T C 10 0.549596491962742 0.627760665871729 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2951824 A/G 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2951806_2951930:CARD11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 2998071 A/G 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.198962600989567 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 4780514 G/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:G G T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4780469_4780654:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000460979:exon_4780490_4780654:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4780469_4780619:KIAA0415 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 5363981 G/A 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.672878774007803 ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5363845_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5363845_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000455076:exon_5363853_5363986:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000497663:exon_5363878_5363986:TNRC18 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 5568366 A/G 1 10 7 17 4.50403508037258 3.84717544373919 0.656859636633387 A:G A G 10 0.549596491962742 0.8116374148793 ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 10 14 24 4.50403508037258 7.69435088747839 -3.19031580710581 A:G G A 10 0.549596491962742 0.220679044086420 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 5643505 C/A 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 A:C C A 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5643494_5643661:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5643494_5643661:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000444748:exon_5643494_5643614:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000447103:exon_5643494_5643577:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000405801:exon_5643494_5643629:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000473330:exon_5643494_5643661:FSCN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 6048973 C/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6048876_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6048886_6049009:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6048921_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6048947_6049129:AIMP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 6054814 G/A 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6054777_6054983:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6054777_6054983:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6054777_6054882:AIMP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 6194251 C/G 1 7 10 17 3.15282455626081 5.49596491962742 -2.34314036336661 C:G C G 10 0.549596491962742 0.330612084853473 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 6 9 15 2.70242104822355 4.94636842766468 -2.24394737944113 T:C T C 10 0.549596491962742 0.302378834939156 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 6196608 G/A 1 19 23 42 8.5576666527079 12.6407193151431 -4.08305266243516 A:G G A 10 0.549596491962742 0.217648294850377 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6196385_6196686:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6196385_6196686:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6196385_6196962:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6196385_6196686:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6196385_6196686:USP42 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 8126000 G/A 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000106415:ENST00000456919:exon_8125823_8126968:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000223145:exon_8125823_8128710:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000489405:exon_8125823_8126569:GLCCI1;ENSG00000106415:ENST00000482540:exon_8125823_8128707:GLCCI1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 21940926 C/G 1 31 7 38 13.962508749155 3.84717544373919 10.1153333054158 C:G C G 10 0.549596491962742 0.00088044307481076 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 24705275 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000105926:ENST00000222644:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409761:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000396475:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000430180:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000409253:exon_24705207_24705306:MPP6;ENSG00000105926:ENST00000472674:exon_24705207_24705306:MPP6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 26236235 T/C 1 147 121 268 66.2093156814769 66.5011755274918 -0.291859846014844 A:T:C:G T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000122566:ENST00000354667:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000360787:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000463181:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000409814:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000356674:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000490912:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000495810:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 26236918 A/C 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:C A C 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 29980471 C/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C C T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000136193:ENST00000242059:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000416113:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000426154:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000425819:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000409497:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000434476:exon_29980298_29980492:SCRN1;ENSG00000136193:ENST00000421434:exon_29980300_29980492:SCRN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 30665879 C/A 1 21 32 53 9.45847366878242 17.5870877428077 -8.12861407402532 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0271914689106179 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30665850_30665935:GARS;ENSG00000106105:ENST00000470392:exon_30665850_30665935:GARS;ENSG00000106105:ENST00000444666:exon_30665850_30665935:GARS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 32529936 G/C 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 C:G G C 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000106355:ENST00000450169:exon_32529932_32530030:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000223084:exon_32529637_32530475:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000410044:exon_32529743_32529973:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409987:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000409782:exon_32529932_32529992:LSM5;ENSG00000106355:ENST00000480956:exon_32529932_32529983:LSM5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 37936530 T/C 1 10 5 15 4.50403508037258 2.74798245981371 1.75605262055887 T:C T C 10 0.549596491962742 0.442338751277527 ENSG00000086288:ENST00000199447:exon_37936472_37936709:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000440017:exon_37936472_37936694:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000476435:exon_37936419_37936709:TXNDC3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 38829465 C/T 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 T:C C T 10 0.549596491962742 0.154181475313390 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38829401_38829467:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38829401_38829467:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000466017:exon_38829401_38829467:VPS41 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 42977091 G/A 1 87 74 161 39.1851051992414 40.6701404052429 -1.48503520600146 A:G G A 10 0.549596491962742 0.812774205958183 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42976921_42977456:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42976921_42977226:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42976921_42977456:MRPL32 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 12 18 30 5.4048420964471 9.89273685532936 -4.48789475888226 T:C T C 10 0.549596491962742 0.140824550400342 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 43648040 C/T 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.526899495928415 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 44746975 A/G 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 A:G A G 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44746824_44746987:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44746824_44746987:OGDH HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 45004677 C/T 1 97 86 183 43.689140279614 47.2652983087958 -3.57615802918178 T:C C T 10 0.549596491962742 0.603736011415443 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45004544_45004688:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45004544_45004688:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45004544_45004688:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45004544_45004688:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45004544_45004688:MYO1G HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 45009242 A/G 1 1 7 8 0.450403508037258 3.84717544373919 -3.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.026550782715777 ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 45113170 G/A 1 15 10 25 6.75605262055887 5.49596491962742 1.26008770093145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.690466238138788 ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45113059_45113170:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45109425_45114007:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45113059_45113170:CCM2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 45140914 C/T 1 26 26 52 11.7104912089687 14.2895087910313 -2.57901758206258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.488675288754302 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45140857_45140971:TBRG4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 48147052 C/A 1 35 8 43 15.764122781304 4.39677193570194 11.3673508456021 A:C C A 10 0.549596491962742 0.000352560148745377 ENSG00000183696:ENST00000331803:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000457596:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000341253:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395564:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000395560:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000482015:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000417464:exon_48146958_48147104:UPP1;ENSG00000183696:ENST00000495446:exon_48146958_48147104:UPP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 54826906 G/C 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 C:G G C 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000132432:ENST00000395535:exon_54826855_54826939:SEC61G;ENSG00000132432:ENST00000352861:exon_54826851_54826939:SEC61G;ENSG00000132432:ENST00000415949:exon_54826851_54827027:SEC61G;ENSG00000132432:ENST00000480303:exon_54826851_54826934:SEC61G;ENSG00000132432:ENST00000461536:exon_54826851_54826908:SEC61G HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 55540707 G/A 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000154978:ENST00000285279:exon_55538306_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428648:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000433959:exon_55538307_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000428097:exon_55539630_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000418904:exon_55539896_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000454227:exon_55540402_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000453256:exon_55540447_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000427700:exon_55540470_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000455023:exon_55540578_55540738:VOPP1;ENSG00000154978:ENST00000414113:exon_55540610_55540738:VOPP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 56125757 A/G 1 11 36 47 4.95443858840984 19.7854737106587 -14.8310351222489 A:G A G 10 0.549596491962742 1.30266236629759e-05 ENSG00000146731:ENST00000275603:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000335503:exon_56125686_56125796:CCT6A;ENSG00000146731:ENST00000482776:exon_56125686_56125796:CCT6A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 56147312 G/A 1 5 5 10 2.25201754018629 2.74798245981371 -0.495964919627419 A:G G A 10 0.549596491962742 0.76182835055021 ENSG00000129103:ENST00000395436:exon_56147221_56147817:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000418349:exon_56147221_56147817:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000434526:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395437:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000275607:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000395435:exon_56147221_56147880:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000420966:exon_56147221_56147880:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000342190:exon_56147221_56148363:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000452216:exon_56147221_56147422:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000436782:exon_56147221_56148358:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000442826:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000437307:exon_56147221_56147525:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000413756:exon_56147221_56147429:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000423763:exon_56147221_56148331:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000438133:exon_56147221_56148362:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000447501:exon_56147046_56147568:SUMF2;ENSG00000129103:ENST00000531229:exon_56147221_56147440:SUMF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 56155415 G/A 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000164776:ENST00000297373:exon_56155291_56155469:PHKG1;ENSG00000164776:ENST00000395428:exon_56155291_56155469:PHKG1;ENSG00000164776:ENST00000489604:exon_56155291_56155469:PHKG1;ENSG00000164776:ENST00000467726:exon_56155291_56155469:PHKG1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 20 8 28 9.00807016074516 4.39677193570194 4.61129822504323 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0890664575021249 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 73752812 C/T 1 7 7 14 3.15282455626081 3.84717544373919 -0.694350887478388 T:C C T 10 0.549596491962742 0.79130236160194 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 73753025 G/A 1 13 11 24 5.85524560448435 6.04556141159016 -0.190315807105807 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 73770926 G/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 C:G G C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73770740_73770953:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73770740_73770953:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73770740_73770953:CLIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 73811479 T/C 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 T:C:G T C 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73811404_73811563:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73811404_73811563:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73811404_73811563:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000493166:exon_73811404_73811495:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000474962:exon_73811404_73811503:CLIP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 75615551 C/T 1 13 10 23 5.85524560448435 5.49596491962742 0.359280684856935 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75615535_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615477_75616173:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615477_75615559:POR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 75615724 G/T 1 21 13 34 9.45847366878242 7.14475439551565 2.31371927326677 T:G G T 10 0.549596491962742 0.492464585544579 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615655_75616173:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75615655_75616172:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615477_75616173:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75615655_75615858:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615655_75616172:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615635_75615917:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615635_75615917:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615655_75616150:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615655_75616173:POR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 75931984 C/T 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 75931999 T/C 1 11 11 22 4.95443858840984 6.04556141159016 -1.09112282318032 T:C T C 10 0.549596491962742 0.672878774007803 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75931990_75932073:HSPB1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 86988643 T/C 1 6 8 14 2.70242104822355 4.39677193570194 -1.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.426065193600925 ENSG00000005469:ENST00000419147:exon_86988522_86988646:CROT;ENSG00000005469:ENST00000412227:exon_86988522_86989432:CROT;ENSG00000005469:ENST00000331536:exon_86988522_86988646:CROT;ENSG00000005469:ENST00000442291:exon_86988522_86988646:CROT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 87092185 G/A 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87092074_87092224:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87092074_87092224:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87092074_87092224:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87092074_87092224:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000473795:exon_87092074_87092224:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000417608:exon_87092177_87092224:ABCB4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 31 11 42 13.962508749155 6.04556141159016 7.91694733756484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0189012701017346 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 96 87 183 43.2387367715768 47.8148948007586 -4.57615802918178 T:G G T 10 0.549596491962742 0.50453665784644 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 91641928 A/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G A G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91641743_91641956:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91641743_91641956:AKAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 22 13 35 9.90887717681968 7.14475439551565 2.76412278130403 T:C C T 10 0.549596491962742 0.398031827334109 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 13 21 34 5.85524560448435 11.5415263312176 -5.68628072673323 A:C A C 10 0.549596491962742 0.0579073974148413 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G A G 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 92244422 C/T 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 T:C C T 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000105810:ENST00000265734:exon_92234235_92244600:CDK6;ENSG00000105810:ENST00000467166:exon_92244028_92244600:CDK6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 31 15 46 13.962508749155 8.24394737944113 5.71856136971387 T:G T G 10 0.549596491962742 0.103312893177731 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 92764068 C/T 1 19 5 24 8.5576666527079 2.74798245981371 5.80968419289419 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0222130610878363 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 37 57 94 16.6649297973785 31.3270000418763 -14.6620702444977 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00256596318978626 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 93516575 T/C 1 7 1 8 3.15282455626081 0.549596491962742 2.60322806429806 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0811264953526921 ENSG00000105825:ENST00000222543:exon_93516573_93516743:TFPI2;ENSG00000105825:ENST00000451238:exon_93516573_93516667:TFPI2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 97911730 C/T 1 18 17 35 8.10726314467064 9.34314036336661 -1.23587721869597 T:C C T 10 0.549596491962742 0.735266212875489 ENSG00000164713:ENST00000297290:exon_97911663_97911765:BRI3;ENSG00000164713:ENST00000474291:exon_97911663_97912018:BRI3;ENSG00000164713:ENST00000473967:exon_97911663_97911765:BRI3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 98984399 C/T 1 27 19 46 12.160894717006 10.4423333472921 1.71856136971387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.65862742048743 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000508211:exon_98984308_98984412:ARPC1A;ENSG00000130429:ENST00000443222:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000414376:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000252725:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484600:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000455009:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000484375:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000418347:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000417330:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000431816:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000427217:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000458033:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451682:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000451694:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000474880:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000445924:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000432343:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000493403:exon_98984308_98984412:ARPC1B;ENSG00000130429:ENST00000461486:exon_98984375_98984437:ARPC1B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 42 16 58 18.9169473375648 8.79354387140387 10.123403466161 A:T A T 10 0.549596491962742 0.00795692133312427 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 99704839 G/A 1 26 15 41 11.7104912089687 8.24394737944113 3.46654382952758 A:G G A 10 0.549596491962742 0.346565159712555 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 104 94 198 46.8419648358748 51.6620702444977 -4.82010540862291 A:G G A 10 0.549596491962742 0.520548450031820 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 8 9 17 3.60322806429806 4.94636842766468 -1.34314036336661 A:G A G 10 0.549596491962742 0.627760665871729 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 99809497 A/G 1 26 12 38 11.7104912089687 6.5951579035529 5.1153333054158 A:G A G 10 0.549596491962742 0.104578371032791 ENSG00000066923:ENST00000426455:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000394018:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000339784:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000379577:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000317296:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000496157:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000491498:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000440830:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000412190:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99809418_99809499:STAG3;ENSG00000066923:ENST00000492674:exon_99809282_99809499:STAG3;ENSG00000160844:ENST00000436886:exon_99809017_99809617:GATS;ENSG00000160844:ENST00000292369:exon_99809017_99809617:GATS;ENSG00000160844:ENST00000435519:exon_99806559_99809654:GATS;ENSG00000160844:ENST00000328453:exon_99807417_99809617:GATS;ENSG00000229429:ENST00000448005:exon_99809287_99809625:AC005071.3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 99997218 C/T 1 15 1 16 6.75605262055887 0.549596491962742 6.20645612859613 T:C C T 10 0.549596491962742 0.00154928117515703 ENSG00000085514:ENST00000198536:exon_99997204_99997235:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000453419:exon_99997204_99997235:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000394000:exon_99997204_99997235:PILRA;ENSG00000085514:ENST00000350573:exon_99997204_99997235:PILRA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100033148 A/G 1 48 50 98 21.6193683857884 27.4798245981371 -5.86045621234872 A:G A G 10 0.549596491962742 0.264137816141896 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100064719 A/G 1 34 22 56 15.3137192732668 12.0911228231803 3.22259645008645 A:G A G 10 0.549596491962742 0.422282047249858 ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100072031 T/C 1 25 10 35 11.2600877009315 5.49596491962742 5.76412278130403 T:C T C 10 0.549596491962742 0.06087156303838 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100160264 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160217_100160305:AGFG2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100279594 G/A 1 6 2 8 2.70242104822355 1.09919298392548 1.60322806429806 A:G G A 10 0.549596491962742 0.308274899302516 ENSG00000146830:ENST00000275732:exon_100279487_100279616:GIGYF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 7 9 16 3.15282455626081 4.94636842766468 -1.79354387140387 A:G A G 10 0.549596491962742 0.453648794123726 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 14 12 26 6.30564911252161 6.5951579035529 -0.289508791031292 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100482526 C/G 1 2 7 9 0.900807016074516 3.84717544373919 -2.94636842766468 C:G C G 10 0.549596491962742 0.0883476850757175 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 39 25 64 17.5657368134531 13.7399122990685 3.82582451438451 A:C C A 10 0.549596491962742 0.380014894626739 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100486088 C/T 1 29 35 64 13.0617017330805 19.235877218696 -6.17417548561549 T:C C T 10 0.549596491962742 0.132236546852364 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100861452 T/C 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 T:C T C 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000106400:ENST00000305105:exon_100860949_100861498:ZNHIT1;ENSG00000106400:ENST00000461205:exon_100861447_100861498:ZNHIT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 100875772 T/G 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 T:G T G 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000106404:ENST00000308344:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000401528:exon_100875373_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000305064:exon_100875374_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000433833:exon_100875686_100875796:CLDN15;ENSG00000106404:ENST00000414035:exon_100875769_100875796:CLDN15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 T:C T C 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 102113191 C/T 1 23 17 40 10.3592806848569 9.34314036336661 1.01614032149032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.874009975940807 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102113139_102113251:LRWD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 102114093 C/A 1 152 10 162 68.4613332216632 5.49596491962742 62.9653683020358 A:T:C C A 10 0.549596491962742 3.6768729676659e-28 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 104783491 C/G 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 C:G C G 10 0.549596491962742 0.050677034875729 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 108119692 C/T 1 12 13 25 5.4048420964471 7.14475439551565 -1.73991229906855 T:C C T 10 0.549596491962742 0.548867312273124 ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453085:exon_108119628_108119823:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000481225:exon_108119628_108119756:PNPLA8 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 112112892 G/A 1 6 12 18 2.70242104822355 6.5951579035529 -3.89273685532936 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0948720795505176 ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112821_112112916:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112821_112112916:IFRD1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 114563054 G/A 1 13 17 30 5.85524560448435 9.34314036336661 -3.48789475888226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.205406717572335 ENSG00000135272:ENST00000257724:exon_114562982_114563182:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000393486:exon_114562982_114563182:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000448022:exon_114562982_114563182:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000423503:exon_114562909_114563182:MDFIC HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 115892014 T/C 1 13 3 16 5.85524560448435 1.64878947588823 4.20645612859613 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0429841707002542 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000393484:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115891561_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000463746:exon_115891805_115892029:TES HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 115892015 G/A 1 13 3 16 5.85524560448435 1.64878947588823 4.20645612859613 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0429841707002542 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000393484:exon_115891814_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115891561_115892029:TES;ENSG00000135269:ENST00000463746:exon_115891805_115892029:TES HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 9 5 14 4.05363157233532 2.74798245981371 1.30564911252161 C:G G C 10 0.549596491962742 0.595838131122828 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 10 18 28 4.50403508037258 9.89273685532936 -5.38870177495677 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0557860345367356 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 129479138 T/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000186591:ENST00000355621:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000473814:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000496698:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000483368:exon_129479047_129479581:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000480245:exon_129479065_129479175:UBE2H HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 133979711 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 134130035 G/A 1 8 12 20 3.60322806429806 6.5951579035529 -2.99192983925484 A:G G A 10 0.549596491962742 0.186483128440231 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000494491:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467251:exon_134129479_134130072:AKR1B1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 134851448 C/A 1 7 6 13 3.15282455626081 3.29757895177645 -0.144754395515646 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000122783:ENST00000435834:exon_134850005_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000450949:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000413261:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000422189:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000424142:exon_134850537_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000393114:exon_134850537_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000430372:exon_134850581_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000481410:exon_134851096_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000483029:exon_134851312_134851565:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000472428:exon_134851327_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000477820:exon_134851352_134851623:C7orf49 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 134871059 G/A 1 5 10 15 2.25201754018629 5.49596491962742 -3.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.119533522846197 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134868590_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134868591_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134868591_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134870534_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871014_134871067:WDR91 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 134871775 C/T 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 T:C C T 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 134879830 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 135333310 C/T 1 39 39 78 17.5657368134531 21.4342631865469 -3.86852637309387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.42599751229319 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000417116:exon_135333308_135333489:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135333152_135333472:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135333152_135333473:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000491089:exon_135333152_135333497:NUP205 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 137590543 G/A 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 A:G G A 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137590448_137590594:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137590448_137590594:CREB3L2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 138713715 G/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 C:G G C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 138732497 G/A 1 10 1 11 4.50403508037258 0.549596491962742 3.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0160713410270657 ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138728266_138732599:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138730662_138732599:ZC3HAV1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 140158959 C/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140158807_140159033:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140158891_140159033:MKRN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 140402592 A/G 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000090266:ENST00000479181:exon_140402323_140402810:NDUFB2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 142498813 G/A 0 0 14 14 0 7.69435088747839 -7.69435088747839 A G A 10 0.549596491962742 1.41391955825685e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 142498964 A/C 0 0 14 14 0 7.69435088747839 -7.69435088747839 C A C 10 0.549596491962742 1.41391955825685e-05 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 0 27 0 27 12.160894717006 0 12.160894717006 T T 10 0.549596491962742 1.10828003679683e-07 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 143085922 G/C 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 C:G G C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143085860_143086038:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000446634:exon_143085860_143085989:ZYX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 148514921 C/T 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000106462:ENST00000492143:exon_148513776_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000498186:exon_148514449_148515209:EZH2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 148514934 A/G 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G A G 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000106462:ENST00000492143:exon_148513776_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000498186:exon_148514449_148515209:EZH2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 83 86 169 37.3834911670924 47.2652983087958 -9.88180714170339 T:C C T 10 0.549596491962742 0.141705937691386 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 148964292 C/T 1 6 7 13 2.70242104822355 3.84717544373919 -1.14475439551565 T:C C T 10 0.549596491962742 0.58443050081259 ENSG00000204946:ENST00000434415:exon_148964188_148964313:ZNF783;ENSG00000204946:ENST00000378052:exon_148964188_148964313:ZNF783;ENSG00000204946:ENST00000476295:exon_148964188_148964313:ZNF783 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150217459 C/T 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150389856 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150417991 T/A 1 9 7 16 4.05363157233532 3.84717544373919 0.206456128596129 A:T T A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150437979 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196329:ENST00000498181:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000358647:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000447239:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000476324:exon_150434698_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000466347:exon_150437967_150438015:GIMAP5;ENSG00000196329:ENST00000493304:exon_150437967_150438015:GIMAP5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150501455 G/T 0 0 17 17 0 9.34314036336661 -9.34314036336661 T G T 10 0.549596491962742 1.29190326328821e-06 ENSG00000002933:ENST00000484928:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000004103:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000494349:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000461345:exon_150501450_150501560:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475536:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000475007:exon_150501450_150501573:TMEM176A;ENSG00000002933:ENST00000474166:exon_150501450_150501769:TMEM176A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150554887 G/A 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 A:G G A 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000002726:ENST00000493429:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000467291:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000487631:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000360937:exon_150553543_150555128:ABP1;ENSG00000002726:ENST00000416793:exon_150553543_150555128:ABP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150840889 C/T 1 12 9 21 5.4048420964471 4.94636842766468 0.458473668782418 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000133612:ENST00000463381:exon_150840824_150841521:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150840824_150841519:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000428334:exon_150840824_150841523:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397232:exon_150840824_150841523:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150840824_150841519:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000461065:exon_150840824_150841523:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000473633:exon_150840824_150841519:AGAP3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 150935420 G/A 1 19 11 30 8.5576666527079 6.04556141159016 2.51210524111774 A:G G A 10 0.549596491962742 0.463606359255542 ENSG00000033100:ENST00000495645:exon_150934460_150935905:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000035307:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000463723:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000511966:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000517304:exon_150934460_150935908:CHPF2;ENSG00000033100:ENST00000528939:exon_150934460_150935908:CHPF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 151818777 T/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 T:C T C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000178234:ENST00000430044:exon_151818631_151819425:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000443352:exon_151818631_151819425:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000434507:exon_151818631_151819245:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000320311:exon_151818631_151819245:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000452146:exon_151818631_151820172:GALNT11 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 151851392 C/T 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 T:C C T 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000424877:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000485241:exon_151851352_151851530:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000418061:exon_151851352_151851530:MLL3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 156762224 G/C 1 15 8 23 6.75605262055887 4.39677193570194 2.35928068485693 C:G G C 10 0.549596491962742 0.403782240071035 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 7 156762248 G/A 1 20 13 33 9.00807016074516 7.14475439551565 1.86331576522952 A:G G A 10 0.549596491962742 0.601109989504434 ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 418768 G/A 1 8 22 30 3.60322806429806 12.0911228231803 -8.48789475888226 A:G G A 10 0.549596491962742 0.00267169784830976 ENSG00000147364:ENST00000350302:exon_418715_419690:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000447233:exon_418715_419871:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000352684:exon_418715_419871:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000276326:exon_418715_419873:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000382824:exon_418715_419055:FBXO25;ENSG00000147364:ENST00000519274:exon_418715_418880:FBXO25 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 A:G A G 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 6 11 17 2.70242104822355 6.04556141159016 -3.34314036336661 A:C C A 10 0.549596491962742 0.142293766298503 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 9627791 A/G 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G A G 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 10623214 G/C 1 34 50 84 15.3137192732668 27.4798245981371 -12.1661053248703 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0083562703627452 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 10623289 A/G 1 24 24 48 10.8096841928942 13.1903158071058 -2.38063161421162 A:G A G 10 0.549596491962742 0.562305545122023 ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 11405542 C/G 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 C:G C G 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11405541_11405634:BLK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 19 14 33 8.5576666527079 7.69435088747839 0.863315765229515 T:C T C 10 0.549596491962742 0.8617507901712 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 17871563 G/C 1 7 3 10 3.15282455626081 1.64878947588823 1.50403508037258 C:G G C 10 0.549596491962742 0.527605575122862 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 7 10 17 3.15282455626081 5.49596491962742 -2.34314036336661 T:C T C 10 0.549596491962742 0.330612084853473 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 T:C C T 10 0.549596491962742 0.125584560754853 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 25364331 G/A 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 A:G G A 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 13 16 29 5.85524560448435 8.79354387140387 -2.93829826691952 A:G G A 10 0.549596491962742 0.350982551644248 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 27293865 C/T 1 14 22 36 6.30564911252161 12.0911228231803 -5.78547371065871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.064610195641344 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27293768_27293865:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27293768_27293865:PTK2B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 27294606 G/C 1 7 20 27 3.15282455626081 10.9919298392548 -7.83910528299403 C:G G C 10 0.549596491962742 0.00307523829279684 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 20 21 41 9.00807016074516 11.5415263312176 -2.53345617047242 A:C A C 10 0.549596491962742 0.437029305999376 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 28206275 G/C 1 4 9 13 1.80161403214903 4.94636842766468 -3.14475439551565 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0969806367781658 ENSG00000186918:ENST00000344423:exon_28203102_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000520535:exon_28205795_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523202:exon_28206046_28206347:ZNF395;ENSG00000186918:ENST00000523095:exon_28206076_28206347:ZNF395;ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28205804_28206347:FBXO16 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 38682866 G/T 1 9 14 23 4.05363157233532 7.69435088747839 -3.64071931514307 T:G G T 10 0.549596491962742 0.144897374794713 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38682829_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522752:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38682826_38682886:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000517336:exon_38682826_38682886:TACC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 42019967 T/C 1 4 8 12 1.80161403214903 4.39677193570194 -2.5951579035529 T:C T C 10 0.549596491962742 0.154181475313390 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 42229149 C/A 1 38 19 57 17.1153333054158 10.4423333472921 6.67299995812371 A:C C A 10 0.549596491962742 0.0838052931840154 ENSG00000070501:ENST00000265421:exon_42229081_42229326:POLB;ENSG00000070501:ENST00000522610:exon_42229081_42229283:POLB;ENSG00000070501:ENST00000521290:exon_42229081_42229326:POLB;ENSG00000070501:ENST00000518579:exon_42229081_42229270:POLB;ENSG00000070501:ENST00000517393:exon_42229081_42229326:POLB;ENSG00000070501:ENST00000521492:exon_42229081_42229326:POLB;ENSG00000070501:ENST00000521418:exon_42229081_42229326:POLB HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 53568742 C/T 1 46 61 107 20.7185613697139 33.5253860097273 -12.8068246400134 A:T:C C T 10 0.549596491962742 0.0148640745945570 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 53570009 G/A 1 10 10 20 4.50403508037258 5.49596491962742 -0.991929839254839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.660911275578475 ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 6 16 22 2.70242104822355 8.79354387140387 -6.09112282318032 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0100195231271335 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 56912068 C/A 1 11 17 28 4.95443858840984 9.34314036336661 -4.38870177495677 A:C C A 10 0.549596491962742 0.127404510748569 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56911977_56912108:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56911977_56912108:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56911977_56912108:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56911977_56912108:LYN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 56962565 T/G 0 16 1 17 7.20645612859613 0.549596491962742 6.65685963663339 T:C T C 10 0.549596491962742 0.000858368541200359 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 56986883 G/C 1 4 12 16 1.80161403214903 6.5951579035529 -4.79354387140387 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0216259683807766 ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000523936:exon_56986813_56986915:RPS20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 56986948 T/C 1 527 453 980 237.362648735635 248.967210859122 -11.6045621234871 T:C:G T C 10 0.549596491962742 0.460434225704451 ENSG00000008988:ENST00000519807:exon_56986940_56987068:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000427539:exon_56986940_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000009589:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000524349:exon_56986619_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520490:exon_56986940_56987031:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521262:exon_56986813_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000520627:exon_56986940_56987069:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519606:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000521289:exon_56986940_56987065:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000518875:exon_56986940_56987057:RPS20;ENSG00000008988:ENST00000519369:exon_56986940_56987065:RPS20 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 67342077 G/A 1 10 8 18 4.50403508037258 4.39677193570194 0.107263144670645 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 68115511 A/G 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G A G 10 0.549596491962742 0.739985622616452 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 68170030 C/T 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 T:C C T 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68169967_68170051:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68169967_68170051:ARFGEF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 74893811 T/C 1 37 8 45 16.6649297973785 4.39677193570194 12.2681578616766 T:C T C 10 0.549596491962742 0.000228570206350809 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 35 8 43 15.764122781304 4.39677193570194 11.3673508456021 A:G A G 10 0.549596491962742 0.000352560148745377 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 27 6 33 12.160894717006 3.29757895177645 8.86331576522952 A:C:G C G 10 0.549596491962742 0.00236472601468451 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 91064145 T/C 1 107 95 202 48.1931753599866 52.2116667364605 -4.01849137647388 T:C T C 10 0.549596491962742 0.572454183404026 ENSG00000104325:ENST00000519328:exon_91064066_91064148:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000220764:exon_91064066_91064236:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517597:exon_91064066_91064200:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000522161:exon_91064066_91064227:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000524332:exon_91064066_91064178:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000520148:exon_91064066_91064320:DECR1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 118817057 C/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000182197:ENST00000378204:exon_118816961_118817132:EXT1;ENSG00000182197:ENST00000437196:exon_118816961_118817132:EXT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 14 17 31 6.30564911252161 9.34314036336661 -3.037491250845 T:C T C 10 0.549596491962742 0.284375222920502 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 124027615 C/T 1 73 38 111 32.8794560867198 20.8846666945842 11.9947893921356 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0221626938216108 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 74 23 97 33.3298595947571 12.6407193151431 20.689140279614 T:C T C 10 0.549596491962742 2.16178832119074e-05 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 124408448 C/T 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000156802:ENST00000517666:exon_124408427_124408674:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000287394:exon_124408427_124408705:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000519124:exon_124408423_124408619:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521496:exon_124408427_124408641:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000439147:exon_124408427_124408705:ATAD2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 125499843 C/T 1 13 7 20 5.85524560448435 3.84717544373919 2.00807016074516 T:C C T 10 0.549596491962742 0.501302886145313 ENSG00000170881:ENST00000303545:exon_125498072_125500155:RNF139 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144103120 G/A 1 63 60 123 28.3754210063473 32.9757895177645 -4.60036851141726 A:G G A 10 0.549596491962742 0.415861498852421 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102983_144103829:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102983_144103828:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102983_144103319:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522528:exon_144102983_144103341:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102983_144103599:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102966_144103217:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521182:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102966_144103672:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102983_144103309:LY6E HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144358302 C/T 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 T:C C T 10 0.549596491962742 0.739985622616452 ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000522479:exon_144358067_144358351:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000522033:exon_144358067_144358340:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144358819 T/G 1 43 34 77 19.3673508456021 18.6862807267332 0.68107011886887 T:G T G 10 0.549596491962742 0.909236148556679 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144391638 G/A 1 12 19 31 5.4048420964471 10.4423333472921 -5.037491250845 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0733682530625384 ENSG00000184428:ENST00000519977:exon_144391585_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144391494_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000517857:exon_144391526_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144391526_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144391530_144391713:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144391547_144391713:TOP1MT HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 13 20 33 5.85524560448435 10.9919298392548 -5.13668423477048 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0810722653542051 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 11 6 17 4.95443858840984 3.29757895177645 1.65685963663339 A:G G A 10 0.549596491962742 0.473394380129348 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 144898801 A/G 1 231 183 414 104.043210356607 100.576158029182 3.46705232742482 A:G A G 10 0.549596491962742 0.767013436604773 ENSG00000179950:ENST00000526683:exon_144898514_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000453551:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000313352:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000456095:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000349157:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000527197:exon_144898690_144898989:PUF60 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 145135473 T/C 1 64 52 116 28.8258245143845 28.5790175820626 0.246806932321931 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000178896:ENST00000316052:exon_145135145_145135550:EXOSC4;ENSG00000178896:ENST00000527954:exon_145135145_145135482:EXOSC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 145150832 A/G 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000179091:ENST00000318911:exon_145150736_145150932:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000533444:exon_145149942_145150932:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000528618:exon_145150389_145150932:CYC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 145537632 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000185122:ENST00000415363:exon_145537509_145537717:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000527328:exon_145537509_145537717:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000530770:exon_145537509_145537632:HSF1;ENSG00000185122:ENST00000528842:exon_145537509_145537867:HSF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 145583905 A/C 1 2 8 10 0.900807016074516 4.39677193570194 -3.49596491962742 A:C A C 10 0.549596491962742 0.050677034875729 ENSG00000185803:ENST00000530047:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000527078:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000526338:exon_145583775_145584155:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000402965:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000532887:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000329994:exon_145583283_145584153:GPR172A;ENSG00000185803:ENST00000526779:exon_145583832_145584153:GPR172A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 145649622 G/A 1 49 44 93 22.0697718938256 24.1822456463606 -2.112473752535 A:G G A 10 0.549596491962742 0.677778712418598 ENSG00000160948:ENST00000529182:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526977:exon_145649000_145650434:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526054:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000292510:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000377348:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000526204:exon_145649598_145650202:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530983:exon_145649598_145650202:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000528142:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000530836:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000527797:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000532861:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000533806:exon_145649598_145649651:VPS28;ENSG00000160948:ENST00000531032:exon_145649598_145649651:VPS28 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 8 145736490 C/T 1 32 34 66 14.4129122571923 18.6862807267332 -4.27336846954097 T:C C T 10 0.549596491962742 0.322908421685681 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145736374_145736569:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145736374_145736564:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145736374_145736564:MFSD3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 2070462 G/A 1 10 16 26 4.50403508037258 8.79354387140387 -4.28950879103129 A:G G A 10 0.549596491962742 0.114226480411308 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2070418_2070471:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2070418_2070471:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2070418_2070471:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2070418_2070471:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2070418_2070471:SMARCA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 2115920 C/T 1 5 14 19 2.25201754018629 7.69435088747839 -5.4423333472921 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0186777927386798 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2115822_2116049:SMARCA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 2811505 G/A 1 10 11 21 4.50403508037258 6.04556141159016 -1.54152633121758 A:G G A 10 0.549596491962742 0.518388705412663 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2811361_2811583:KIAA0020 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 2828742 C/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:C C A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2828675_2828778:KIAA0020;ENSG00000080608:ENST00000469168:exon_2828475_2828778:KIAA0020 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 5742888 A/G 1 8 12 20 3.60322806429806 6.5951579035529 -2.99192983925484 A:G A G 10 0.549596491962742 0.186483128440231 ENSG00000107036:ENST00000251879:exon_5742869_5743013:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5742869_5743013:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000381532:exon_5742869_5743013:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5742869_5743013:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5742869_5743013:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000276898:exon_5742869_5743013:KIAA1432 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 5774089 C/T 1 5 6 11 2.25201754018629 3.29757895177645 -1.04556141159016 T:C C T 10 0.549596491962742 0.558301304538942 ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 5969249 A/G 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 A:G A G 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 14662260 A/G 1 3 10 13 1.35121052411177 5.49596491962742 -4.14475439551565 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0253520306669052 ENSG00000175893:ENST00000380916:exon_14662213_14662324:ZDHHC21 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 17340839 T/A 0 0 9 9 0 4.94636842766468 -4.94636842766468 A T A 10 0.549596491962742 0.00076280912542378 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17340825_17340946:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17340825_17340946:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17340825_17340946:CNTLN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 79 818 897 35.5818771349434 449.569930425523 -413.98805329058 A:T:C:G A C 10 0.549596491962742 1.01294325117379e-189 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 19376393 A/G 1 3 7 10 1.35121052411177 3.84717544373919 -2.49596491962742 A:G A G 10 0.549596491962742 0.125584560754853 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 27009095 T/C 1 4 10 14 1.80161403214903 5.49596491962742 -3.69435088747839 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0597828211497275 ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_27009018_27009156:IFT74 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 5 7 12 2.25201754018629 3.84717544373919 -1.5951579035529 T:G T G 10 0.549596491962742 0.395480196729869 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 37432041 C/T 1 23 17 40 10.3592806848569 9.34314036336661 1.01614032149032 T:C C T 10 0.549596491962742 0.874009975940807 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37432005_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37432005_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37432005_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37432005_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37432005_37432135:GRHPR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 37436755 G/A 1 139 102 241 62.6060876171789 56.0588421801997 6.54724543697918 A:G G A 10 0.549596491962742 0.401028150799859 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37436658_37436987:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37436658_37436845:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37436658_37436986:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37436658_37436984:GRHPR HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 37592452 G/A 1 52 42 94 23.4209824179374 23.0830526624352 0.337929755502255 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 71869212 G/A 1 2 6 8 0.900807016074516 3.29757895177645 -2.39677193570194 A:G G A 10 0.549596491962742 0.151734919978227 ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71869125_71870120:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71869125_71870120:TJP2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 80881589 A/C 1 22 11 33 9.90887717681968 6.04556141159016 3.86331576522952 A:C A C 10 0.549596491962742 0.220874091278342 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 84609913 C/T 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000214929:ENST00000344803:exon_84605688_84610171:FAM75D1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:C C A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 88633193 C/T 1 29 20 49 13.0617017330805 10.9919298392548 2.06977189382564 T:C C T 10 0.549596491962742 0.56978361142114 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88633170_88633310:NAA35 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 88636887 G/A 1 5 10 15 2.25201754018629 5.49596491962742 -3.24394737944113 A:G G A 10 0.549596491962742 0.119533522846197 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 91993615 G/A 1 3 6 9 1.35121052411177 3.29757895177645 -1.94636842766468 A:G G A 10 0.549596491962742 0.315381028421196 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 91993724 C/T 1 7 8 15 3.15282455626081 4.39677193570194 -1.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 0.607409579596768 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 91993769 G/A 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 100843194 G/A 1 34 49 83 15.3137192732668 26.9302281061744 -11.6165088329076 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0111099989762681 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100843098_100843428:NANS;ENSG00000095380:ENST00000461452:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000415280:exon_100843098_100843337:NANS;ENSG00000095380:ENST00000427646:exon_100843098_100844448:NANS;ENSG00000106785:ENST00000478530:exon_100843122_100843543:TRIM14 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 106874014 A/G 1 22 18 40 9.90887717681968 9.89273685532936 0.0161403214903224 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106873862_106874095:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106873862_106874095:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106873862_106874095:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106873862_106874095:SMC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 106888978 C/T 1 29 31 60 13.0617017330805 17.037491250845 -3.97578951776452 T:C C T 10 0.549596491962742 0.303159188792092 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 115931692 A/G 1 7 2 9 3.15282455626081 1.09919298392548 2.05363157233532 A:G A G 10 0.549596491962742 0.198962600989567 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 116346118 G/A 1 8 5 13 3.60322806429806 2.74798245981371 0.855245604484355 A:G G A 10 0.549596491962742 0.783012091390124 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 116346236 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 117118379 C/T 1 11 6 17 4.95443858840984 3.29757895177645 1.65685963663339 T:C C T 10 0.549596491962742 0.473394380129348 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 123688217 G/A 1 17 4 21 7.65685963663339 2.19838596785097 5.45847366878242 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0162560324436559 ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123688214_123688579:TRAF1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 124094886 G/A 1 11 34 45 4.95443858840984 18.6862807267332 -13.7318421383234 A:G G A 10 0.549596491962742 5.97268333482823e-05 ENSG00000148180:ENST00000373823:exon_124094712_124095121:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394353:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000436847:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000449733:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000412819:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373808:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000394352:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000341272:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373818:exon_124094712_124095120:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373806:exon_124094712_124094940:GSN;ENSG00000148180:ENST00000373805:exon_124094712_124095016:GSN HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 127101924 C/T 1 8 7 15 3.60322806429806 3.84717544373919 -0.24394737944113 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 128322031 G/A 1 12 5 17 5.4048420964471 2.74798245981371 2.65685963663339 A:G G A 10 0.549596491962742 0.229407484550802 ENSG00000119487:ENST00000373511:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000524515:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000350766:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373503:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373498:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000529322:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000265960:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394063:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373505:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000373497:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000497932:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000420643:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000473837:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394060:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000394057:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000427078:exon_128321912_128322088:MAPKAP1;ENSG00000119487:ENST00000437973:exon_128321393_128322088:MAPKAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 128414522 T/C 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000119487:ENST00000468896:exon_128414396_128414536:MAPKAP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 130223492 G/A 1 4 10 14 1.80161403214903 5.49596491962742 -3.69435088747839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.0597828211497275 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130223452_130223536:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130223452_130223536:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130223452_130223536:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130223452_130223536:LRSAM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 130242166 A/G 1 8 10 18 3.60322806429806 5.49596491962742 -1.89273685532936 A:G A G 10 0.549596491962742 0.478611850072532 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130242118_130242257:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130242118_130242257:LRSAM1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 130575835 C/T 1 11 14 25 4.95443858840984 7.69435088747839 -2.73991229906855 T:C C T 10 0.549596491962742 0.316889910238764 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130575474_130576343:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130575474_130576337:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130575474_130576338:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475270:exon_130575474_130575853:FPGS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 130580918 G/A 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:G G A 10 0.549596491962742 1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 130885201 A/T 1 4 6 10 1.80161403214903 3.29757895177645 -1.49596491962742 A:T A T 10 0.549596491962742 0.361534421226715 ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 131019922 C/T 1 8 16 24 3.60322806429806 8.79354387140387 -5.19031580710581 T:C C T 10 0.549596491962742 0.0397739056848345 ENSG00000167110:ENST00000421699:exon_131019880_131019986:GOLGA2;ENSG00000167110:ENST00000342583:exon_131019880_131019986:GOLGA2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 131360705 G/A 1 16 9 25 7.20645612859613 4.94636842766468 2.26008770093145 A:G G A 10 0.549596491962742 0.424879567752466 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 8 8 16 3.60322806429806 4.39677193570194 -0.793543871403871 T:C C T 10 0.549596491962742 0.803195989938746 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 5 9 14 2.25201754018629 4.94636842766468 -2.69435088747839 A:G G A 10 0.549596491962742 0.182321133672918 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 131584631 C/T 1 43 37 80 19.3673508456021 20.3350702026215 -0.967719357019355 T:C C T 10 0.549596491962742 0.823388795134058 ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 132576431 T/C 1 3 9 12 1.35121052411177 4.94636842766468 -3.5951579035529 T:C T C 10 0.549596491962742 0.0440275068148059 ENSG00000136827:ENST00000437532:exon_132575222_132576501:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000427355:exon_132575222_132576501:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000351698:exon_132575223_132576501:TOR1A;ENSG00000136827:ENST00000474192:exon_132575887_132576501:TOR1A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 69 58 127 31.0778420545708 31.876596533839 -0.798754479268229 A:G A G 10 0.549596491962742 0.929013019102747 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 132740768 C/T 1 72 68 140 32.4290525786826 37.3725614534665 -4.94350887478387 T:C C T 10 0.549596491962742 0.444729116281785 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132740744_132740891:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000491905:exon_132740626_132740891:FNBP1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 135203409 A/C 1 7 11 18 3.15282455626081 6.04556141159016 -2.89273685532936 A:C A C 10 0.549596491962742 0.235754067257629 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 135203870 T/C 1 8 6 14 3.60322806429806 3.29757895177645 0.305649112521612 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 135205006 G/C 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 C:G G C 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 135772107 T/A 1 5 12 17 2.25201754018629 6.5951579035529 -4.34314036336661 A:T T A 10 0.549596491962742 0.0486303018585182 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135766735_135772141:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135766736_135772141:TSC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 135772717 G/A 1 6 6 12 2.70242104822355 3.29757895177645 -0.595157903552904 A:G G A 10 0.549596491962742 0.777647678747728 ENSG00000165699:ENST00000298552:exon_135772571_135772732:TSC1;ENSG00000165699:ENST00000440111:exon_135772571_135772732:TSC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 135974100 G/A 1 6 5 11 2.70242104822355 2.74798245981371 -0.0455614115901617 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 136004699 G/A 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:C:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_136004526_136004705:RALGDS HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 136227260 A/G 1 62 60 122 27.92501749831 32.9757895177645 -5.05077201945452 A:G A G 10 0.549596491962742 0.36430133727994 ENSG00000148291:ENST00000371964:exon_136227141_136227310:SURF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 136324239 C/A 1 5 10 15 2.25201754018629 5.49596491962742 -3.24394737944113 A:C C A 10 0.549596491962742 0.119533522846197 ENSG00000160323:ENST00000485925:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371929:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371916:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000338351:exon_136324096_136324507:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000355699:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000356589:exon_136324096_136324508:ADAMTS13;ENSG00000160323:ENST00000371910:exon_136324096_136324508:ADAMTS13 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 136633606 G/A 1 6 3 9 2.70242104822355 1.64878947588823 1.05363157233532 A:G G A 10 0.549596491962742 0.526899495928415 ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 136635633 G/A 1 4 5 9 1.80161403214903 2.74798245981371 -0.946368427664678 A:G G A 10 0.549596491962742 0.739985622616452 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 138839672 C/T 1 9 8 17 4.05363157233532 4.39677193570194 -0.343140363366613 T:C C T 10 0.549596491962742 1 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138839644_138839751:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138839644_138839890:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138839362_138839751:UBAC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 34 23 57 15.3137192732668 12.6407193151431 2.67299995812371 A:G A G 10 0.549596491962742 0.50807649262174 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139272281 A/C 1 7 5 12 3.15282455626081 2.74798245981371 0.404842096447096 A:C A C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139342076 C/A 1 5 3 8 2.25201754018629 1.64878947588823 0.603228064298064 A:C C A 10 0.549596491962742 0.737166386626898 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313084:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000433860:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398335:exon_139340916_139343790:SEC16A HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139726239 A/G 1 5 4 9 2.25201754018629 2.19838596785097 0.0536315723353225 A:G A G 10 0.549596491962742 1 ENSG00000196642:ENST00000371673:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371675:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000432842:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000455983:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000371671:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000357466:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000436380:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000425121:exon_139726173_139726313:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000466096:exon_139726173_139726822:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000461992:exon_139726173_139726313:C9orf86 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139733490 G/T 1 21 15 36 9.45847366878242 8.24394737944113 1.21452628934129 T:G G T 10 0.549596491962742 0.739702466359445 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139733361_139733573:C9orf86 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139743890 T/C 1 33 41 74 14.8633157652295 22.5334561704724 -7.6701404052429 T:C:G T C 10 0.549596491962742 0.079892222414792 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139744555 A/G 1 77 93 170 34.6810701188689 51.112473752535 -16.4314036336661 A:G A G 10 0.549596491962742 0.0134230519632709 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139744465_139745012:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139744465_139744589:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000463215:exon_139744231_139744589:PHPT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 6 4 10 2.70242104822355 2.19838596785097 0.50403508037258 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 139934266 G/A 1 1 55 56 0.450403508037258 30.2278070579508 -29.7774035499136 A:G G A 10 0.549596491962742 2.77101279317964e-18 ENSG00000107281:ENST00000371601:exon_139933922_139934316:NPDC1;ENSG00000107281:ENST00000371600:exon_139933922_139934316:NPDC1;ENSG00000107281:ENST00000496498:exon_139934120_139934316:NPDC1;ENSG00000107281:ENST00000472668:exon_139934136_139934316:NPDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 140006491 C/T 1 7 4 11 3.15282455626081 2.19838596785097 0.954438588409838 T:C C T 10 0.549596491962742 0.763998637860147 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 140328756 C/T 1 11 7 18 4.95443858840984 3.84717544373919 1.10726314467064 T:C C T 10 0.549596491962742 0.643979512958473 ENSG00000188747:ENST00000341349:exon_140328655_140328858:NOXA1;ENSG00000188747:ENST00000392815:exon_140328655_140328857:NOXA1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 140509202 G/C 1 3 10 13 1.35121052411177 5.49596491962742 -4.14475439551565 C:G G C 10 0.549596491962742 0.0253520306669052 ENSG00000197070:ENST00000371421:exon_140509011_140509452:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000424603:exon_140509011_140509452:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000405007:exon_140509011_140509452:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000491911:exon_140509011_140509811:ARRDC1;ENSG00000197070:ENST00000475658:exon_140509011_140509350:ARRDC1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 T:C T C 10 0.549596491962742 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . 9 140638462 G/A 1 15 12 27 6.75605262055887 6.5951579035529 0.160894717005966 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 295189 C/G 1 8 2 10 3.60322806429806 1.09919298392548 2.50403508037258 C:G C G 10 0.549596491962742 0.201576522936109 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1460692 G/A 1 8 3 11 3.60322806429806 1.64878947588823 1.95443858840984 A:G G A 10 0.549596491962742 0.364894245061992 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1460621_1460722:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1460621_1460722:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000432757:exon_1460621_1460722:IL3RA HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 3 5 8 1.35121052411177 2.74798245981371 -1.39677193570194 T:C C T 10 0.549596491962742 0.480592129451619 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 12 14 26 5.4048420964471 7.69435088747839 -2.28950879103129 A:G A G 10 0.549596491962742 0.432085162262284 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1554649 T/C 0 12 0 12 5.4048420964471 0 5.4048420964471 T T 10 0.549596491962742 0.00082919751785996 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1554587_1554651:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1554587_1554651:ASMTL HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1554655 T/C 0 9 0 9 4.05363157233532 0 4.05363157233532 T T 10 0.549596491962742 0.00533785620873126 HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1554672 G/T 0 8 0 8 3.60322806429806 0 3.60322806429806 G G 10 0.549596491962742 0.0100179873632388 HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 1719848 G/A 1 4 4 8 1.80161403214903 2.19838596785097 -0.396771935701936 A:G G A 10 0.549596491962742 1 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP00992_parsed_pileup.txt . X 152037647 G/A 0 96 0 96 43.2387367715768 0 43.2387367715768 G G 10 0.549596491962742 2.07053886910174e-25 ENSG00000147383:ENST00000370274:exon_152037328_152038273:NSDHL;ENSG00000147383:ENST00000440023:exon_152037328_152037907:NSDHL