INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 949422 G/A 1 483 455 938 250.23775565891 219.268780901027 30.9689747578825 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0462014539835045 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 804 845 1649 416.544835506756 407.213450244765 9.33138526199173 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.657386884455318 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 949654 A/G 1 907 838 1745 469.908166423667 403.840084384749 66.0680820389179 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00156400633093365 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 984302 T/C 1 15 2 17 7.77135887139471 0.963818817147372 6.80754005424734 T:C T C 10 0.481909408573686 0.000954276079467135 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_984247_984439:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000492947:exon_983909_984439:AGRN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 1245176 C/T 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000169972:ENST00000379031:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000470520:exon_1245086_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000463758:exon_1244466_1245220:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000467712:exon_1245061_1245231:PUSL1;ENSG00000169972:ENST00000493657:exon_1244834_1245194:PUSL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 1337539 T/A 1 415 411 826 215.00759544192 198.064766923785 16.9428285181353 A:T:C T A 10 0.481909408573686 0.250555701722037 ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1337288_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000493287:exon_1337293_1337636:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1337293_1337636:MRPL20 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 1398064 C/T 1 16 8 24 8.28944946282102 3.85527526858949 4.43417419423154 T:C C T 10 0.481909408573686 0.100356840028341 ENSG00000215915:ENST00000378785:exon_1397980_1398088:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000435474:exon_1397980_1398088:ATAD3C;ENSG00000215915:ENST00000484537:exon_1397863_1398088:ATAD3C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 1479333 A/G 1 8 27 35 4.14472473141051 13.0115540314895 -8.86682930007901 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00341013524623669 ENSG00000160075:ENST00000291386:exon_1479249_1479367:SSU72;ENSG00000160075:ENST00000378726:exon_1479249_1479367:SSU72 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 1572125 A/G 1 12 6 18 6.21708709711577 2.89145645144212 3.32563064567365 A:G A G 10 0.481909408573686 0.156469603613933 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1572044_1572160:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000340677:exon_1572044_1572160:CDK11A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 53 35 88 27.4588013455946 16.866829300079 10.5919720455156 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0251153635494365 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 6158562 A/G 1 19 17 36 9.84372123709996 8.19245994575266 1.6512612913473 A:G A G 10 0.481909408573686 0.619600928115492 ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 6648357 C/T 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648338_6648502:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648338_6648502:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466813:exon_6648338_6648502:ZBTB48 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 6649277 T/C 1 55 52 107 28.4949825284473 25.0592892458317 3.4356932826156 T:C T C 10 0.481909408573686 0.561851596064641 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 8029446 C/T 1 31 25 56 16.0608083342157 12.0477352143422 4.01307311987358 T:C C T 10 0.481909408573686 0.288519990993266 ENSG00000116288:ENST00000493373:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000338639:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000460192:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000493678:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000465354:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377491:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000377488:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000497113:exon_8029405_8029464:PARK7;ENSG00000116288:ENST00000469225:exon_8029405_8029464:PARK7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 11082522 T/C 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000120948:ENST00000440386:exon_11082407_11082711:TARDBP;ENSG00000120948:ENST00000240185:exon_11082181_11084100:TARDBP;ENSG00000120948:ENST00000439080:exon_11082181_11084094:TARDBP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 11114940 G/T 1 333 265 598 172.524166944963 127.705993272027 44.8181736729358 A:T:G G T 10 0.481909408573686 0.000264893856849363 ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 11114978 G/A 1 12 18 30 6.21708709711577 8.67436935432635 -2.45728225721058 A:G G A 10 0.481909408573686 0.465646371681429 ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 8 12 20 4.14472473141051 5.78291290288423 -1.63818817147372 A:G G A 10 0.481909408573686 0.509077891598092 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 12034805 T/C 1 2 11 13 1.03618118285263 5.30100349431055 -4.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0235613876162475 ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 12090001 T/C 1 16 6 22 8.28944946282102 2.89145645144212 5.39799301137891 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0306569697485289 ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 12198297 T/C 1 19 5 24 9.84372123709996 2.40954704286843 7.43417419423153 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00329936713733029 ENSG00000120949:ENST00000263932:exon_12198286_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000514649:exon_12198289_12198493:TNFRSF8;ENSG00000120949:ENST00000413146:exon_12198286_12198493:TNFRSF8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 123 123 246 63.7251427454366 59.2748572545634 4.45028549087324 A:G G A 10 0.481909408573686 0.609867178493397 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:G A G 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 15752379 G/A 1 8 14 22 4.14472473141051 6.7467317200316 -2.60200698862109 A:G G A 10 0.481909408573686 0.293237542673417 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15752367_15752514:EFHD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 15755225 G/A 1 235 214 449 121.751288985184 103.128613434769 18.622675550415 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0806653761177725 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 15901301 G/A 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000116138:ENST00000375849:exon_15901255_15902587:DNAJC16;ENSG00000116138:ENST00000483270:exon_15901255_15901644:DNAJC16;ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15901252_15901336:AGMAT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 15904318 C/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C C T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000116771:ENST00000375826:exon_15904180_15904359:AGMAT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 16133904 A/C 1 202 3 205 104.654299468115 1.44572822572106 103.208571242394 A:C A C 10 0.481909408573686 1.81526914523755e-59 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 16257256 A/G 1 26 23 49 13.4703553770842 11.0839163971948 2.38643897988938 A:G A G 10 0.481909408573686 0.568062904269512 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 17312743 C/T 1 56 27 83 29.0130731198736 13.0115540314895 16.0015190883841 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000575505989548854 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17312453_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312454_17312853:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17312476_17312853:ATP13A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 17395521 G/A 1 44 17 61 22.7959860227578 8.19245994575266 14.6035260770052 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000171566718715510 ENSG00000117115:ENST00000375486:exon_17393256_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000444885:exon_17393256_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000479534:exon_17394095_17395772:PADI2;ENSG00000117115:ENST00000466151:exon_17394281_17395772:PADI2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 19447693 C/T 1 41 77 118 21.2417142484789 37.1070244601738 -15.865310211695 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00410552604909127 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19447683_19447928:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19447683_19447928:UBR4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 19510394 A/G 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 9 15 24 4.66281532283683 7.22864112860529 -2.56582580576846 A:G G A 10 0.481909408573686 0.315072835462644 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 111 74 185 57.5080556483208 35.6612962344528 21.8467594138681 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00149706453126752 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 20978832 T/C 1 65 106 171 33.6758884427104 51.0823973088107 -17.4065088661003 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00908006236829308 ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20978270_20979021:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20978685_20979021:DDOST HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 24078234 T/C 1 160 133 293 82.8944946282102 64.0939513403002 18.80054328791 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0304178953451148 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 26497225 G/A 1 272 236 508 140.920640867957 113.73062042339 27.1900204445675 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0164714430922503 ENSG00000142684:ENST00000374266:exon_26497066_26498551:ZNF593;ENSG00000142684:ENST00000270812:exon_26496909_26498551:ZNF593 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 26609259 C/T 1 31 27 58 16.0608083342157 13.0115540314895 3.04925430272621 T:C C T 10 0.481909408573686 0.433754280466438 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28206599 G/T 1 32 21 53 16.578898925642 10.1200975800474 6.45880134559464 T:G G T 10 0.481909408573686 0.0981642460245287 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28562676 A/G 1 112 143 255 58.0261462397472 68.9130454260371 -10.8868991862899 A:G A G 10 0.481909408573686 0.188141156379875 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28562620_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000417632:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000335514:exon_28562644_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000468425:exon_28562653_28562781:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562665_28562781:ATPIF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28564252 A/G 1 24 20 44 12.4341741942315 9.63818817147372 2.79598602275781 A:G A G 10 0.481909408573686 0.451808378547594 ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28564279 A/G 1 39 19 58 20.2055330656262 9.15627876290004 11.0492543027262 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00375092469359304 ENSG00000130770:ENST00000497986:exon_28564272_28564616:ATPIF1;ENSG00000130770:ENST00000465645:exon_28562872_28564609:ATPIF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28898346 T/C 0 0 8 8 0 3.85527526858949 -3.85527526858949 C T C 10 0.481909408573686 0.00809979847322851 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28906282 C/T 1 34 24 58 17.6150801084947 11.5658258057685 6.04925430272621 T:C C T 10 0.481909408573686 0.11660862730862 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 28906940 C/T 1 67 59 126 34.712069625563 28.4326551058475 6.27941451971556 T:C C T 10 0.481909408573686 0.285024077207012 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 32568149 C/T 1 35 31 66 18.133170699921 14.9391916657843 3.19397903413672 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.461298428225626 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32568032_32568464:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32568032_32568467:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32568032_32568467:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32568032_32568467:TMEM39B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 32680414 C/T 1 12 8 20 6.21708709711577 3.85527526858949 2.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 0.372034266386779 ENSG00000222046:ENST00000409358:exon_32680398_32680533:DCDC2B;ENSG00000222046:ENST00000487056:exon_32680398_32680533:DCDC2B;ENSG00000160055:ENST00000466796:exon_32680073_32680650:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000491434:exon_32680078_32680650:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000489170:exon_32680078_32680650:C1orf91;ENSG00000160055:ENST00000461402:exon_32680079_32680650:C1orf91 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 32833920 T/C 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000160058:ENST00000341071:exon_32830772_32834151:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000463967:exon_32833626_32834151:BSDC1;ENSG00000160058:ENST00000373520:exon_32833634_32834151:BSDC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 18 28 46 9.32563064567365 13.4934634400632 -4.16783279438956 A:G A G 10 0.481909408573686 0.239946232635496 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 33248058 G/T 1 19 18 37 9.84372123709996 8.67436935432635 1.16935188277362 T:G G T 10 0.481909408573686 0.743954392785624 ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33248005_33248140:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33248005_33249356:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33248005_33248140:YARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 33476350 C/T 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 T:C C T 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000004455:ENST00000373449:exon_33473585_33476434:AK2;ENSG00000004455:ENST00000482191:exon_33476120_33476434:AK2;ENSG00000004455:ENST00000491241:exon_33476232_33476434:AK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 35652770 C/G 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 C:G C G 10 0.481909408573686 0.252899248171128 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 36225948 T/C 1 16 8 24 8.28944946282102 3.85527526858949 4.43417419423154 T:C T C 10 0.481909408573686 0.100356840028341 ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 36752433 C/T 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 T:C C T 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 36859491 G/A 1 31 28 59 16.0608083342157 13.4934634400632 2.56734489415252 A:G G A 10 0.481909408573686 0.517614293648399 ENSG00000181817:ENST00000476041:exon_36859367_36859754:LSM10;ENSG00000181817:ENST00000315732:exon_36859031_36859754:LSM10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 36883746 C/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000116885:ENST00000495222:exon_36883507_36883856:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000235532:exon_36883507_36883856:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000356637:exon_36883511_36883856:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000471369:exon_36883512_36883856:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000315643:exon_36883515_36883774:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000433045:exon_36883544_36883856:OSCP1;ENSG00000116885:ENST00000445843:exon_36883661_36883856:OSCP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 40751598 A/G 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000084073:ENST00000372759:exon_40751597_40751701:ZMPSTE24 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 45323430 C/A 1 53 60 113 27.4588013455946 28.9145645144212 -1.45576316882652 A:C C A 10 0.481909408573686 0.850782846479821 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45323376_45323479:EIF2B3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 45479709 A/G 1 7 9 16 3.6266341399842 4.33718467716317 -0.710550537178976 A:G A G 10 0.481909408573686 0.805666606761275 ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479581_45480508:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479581_45479892:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479581_45479742:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 46081129 C/T 1 60 53 113 31.0854354855788 25.5411986544054 5.54423683117348 T:C C T 10 0.481909408573686 0.302110163531908 ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46080977_46081135:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46080977_46081143:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527932:exon_46080977_46081387:NASP;ENSG00000132780:ENST00000534450:exon_46080977_46081143:NASP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 46501599 G/A 1 56 63 119 29.0130731198736 30.3602927401422 -1.34721962026864 A:G G A 10 0.481909408573686 0.854605512820695 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46501486_46501896:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46501567_46501795:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 46812559 G/T 1 25 15 40 12.9522647856578 7.22864112860529 5.72362365705256 T:G G T 10 0.481909408573686 0.081667408968484 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 25 22 47 12.9522647856578 10.6020069886211 2.35025779703676 A:G A G 10 0.481909408573686 0.560098028387117 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 51912760 T/G 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:G T G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51912632_51912777:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51912632_51912777:EPS15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 53516383 C/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:C C A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53516281_53517375:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53516281_53517073:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53516281_53516575:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53516281_53516642:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53516281_53516932:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000430330:exon_53516281_53516798:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000484100:exon_53516281_53516690:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000533119:exon_53516281_53516734:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000435345:exon_53516281_53516785:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000488965:exon_53513530_53517282:SCP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 6 8 14 3.10854354855788 3.85527526858949 -0.746731720031605 A:G G A 10 0.481909408573686 0.79243933411218 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 62380298 G/A 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62380259_62380336:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62380259_62380336:INADL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 62582206 A/G 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62582204_62582351:INADL;ENSG00000132849:ENST00000465798:exon_62582204_62582351:INADL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 63974241 A/G 1 18 8 26 9.32563064567365 3.85527526858949 5.47035537708416 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0475910894690397 ENSG00000142856:ENST00000489099:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000271002:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000371092:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000432712:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000283568:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000460394:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000462285:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000465781:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000460251:exon_63974199_63974241:ITGB3BP;ENSG00000142856:ENST00000478138:exon_63974199_63974241:ITGB3BP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 71536581 T/C 1 47 31 78 24.3502577970368 14.9391916657843 9.41106613125249 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0407609948703863 ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71536510_71536679:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71536510_71536679:ZRANB2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 79095581 T/C 1 22 31 53 11.3979930113789 14.9391916657843 -3.54119865440536 T:C T C 10 0.481909408573686 0.340074899634602 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 84944983 A/G 1 37 30 67 19.1693518827736 14.4572822572106 4.71206962556304 A:G A G 10 0.481909408573686 0.272203536226225 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 85403403 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 86818568 T/C 1 46 4 50 23.8321672056104 1.92763763429474 21.9045295713157 T:C T C 10 0.481909408573686 5.27326364743688e-11 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 46 8 54 23.8321672056104 3.85527526858949 19.976891937021 T:C T C 10 0.481909408573686 2.39201380213386e-08 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 34 20 54 17.6150801084947 9.63818817147372 7.97689193702095 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0400952743292413 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 86838158 C/T 1 10 7 17 5.18090591426314 3.3733658600158 1.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.469361015930106 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000524695:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000496592:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000479890:exon_86838114_86838223:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000486557:exon_86838114_86838264:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86838114_86838223:ODF2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 89473522 A/G 1 30 25 55 15.5427177427894 12.0477352143422 3.49498252844727 A:G A G 10 0.481909408573686 0.349231005920052 ENSG00000117226:ENST00000370482:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000489444:exon_89472360_89473535:GBP3;ENSG00000117226:ENST00000370481:exon_89472363_89473535:GBP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 89579941 T/C 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.111676109980467 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89579699_89579979:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89579699_89579979:GBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 89582690 G/C 1 10 8 18 5.18090591426314 3.85527526858949 1.32563064567365 C:G G C 10 0.481909408573686 0.639350488109998 ENSG00000162645:ENST00000464839:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000370466:exon_89582675_89582917:GBP2;ENSG00000162645:ENST00000463660:exon_89582675_89582917:GBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 93300404 T/C 1 104 164 268 53.8814215083367 79.0331430060845 -25.1517214977479 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00219824695844923 ENSG00000122406:ENST00000432788:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000370321:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000470843:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000490963:exon_93300336_93300444:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000315741:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000461952:exon_93300336_93300470:RPL5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 93705262 G/A 1 23 7 30 11.9160836028052 3.3733658600158 8.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00277464806855952 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93705240_93705453:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93705240_93705453:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93705240_93705453:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93705240_93705453:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93705240_93705453:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93705240_93705453:CCDC18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 93712446 A/G 1 21 15 36 10.8799024199526 7.22864112860529 3.6512612913473 A:G A G 10 0.481909408573686 0.245665669246430 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93712395_93712511:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93712395_93712511:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93712395_93712511:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93712395_93712511:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93712395_93712511:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93712395_93712449:CCDC18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 94342203 C/G 1 40 45 85 20.7236236570526 21.6859233858159 -0.962299728763313 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0.913660945531978 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 97278804 G/A 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 100609639 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000122435:ENST00000370141:exon_100609625_100609699:CCDC76;ENSG00000122435:ENST00000482437:exon_100609625_100610123:CCDC76;ENSG00000122435:ENST00000493651:exon_100609625_100609907:CCDC76 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 109642866 G/A 1 18 10 28 9.32563064567365 4.81909408573686 4.50653655993679 A:G G A 10 0.481909408573686 0.09256953464209 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 2 84 86 1.03618118285263 40.4803903201896 -39.444209137337 T:C C T 10 0.481909408573686 9.62438014114607e-22 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 111783981 G/A 1 1 59 60 0.518090591426314 28.4326551058475 -27.9145645144212 A:G G A 10 0.481909408573686 6.16349142600018e-16 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000472825:exon_111783949_111784065:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111783949_111784065:CHI3L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 111784882 G/T 1 3 62 65 1.55427177427894 29.8783833315685 -28.3241115572896 T:G G T 10 0.481909408573686 1.24840930695992e-14 ENSG00000064886:ENST00000445067:exon_111784849_111784988:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369744:exon_111784849_111784988:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000369748:exon_111784849_111784988:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000419203:exon_111784849_111784988:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000466741:exon_111784849_111784988:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000524472:exon_111784849_111785256:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000497220:exon_111784849_111784988:CHI3L2;ENSG00000064886:ENST00000529459:exon_111784849_111784988:CHI3L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 111957097 C/G 1 17 12 29 8.80754005424734 5.78291290288423 3.0246271513631 C:G C G 10 0.481909408573686 0.271675678059475 ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 114092306 A/G 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 114249382 C/T 1 15 8 23 7.77135887139471 3.85527526858949 3.91608360280522 T:C C T 10 0.481909408573686 0.142725626727946 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 114973429 T/C 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 116933372 G/A 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G G A 10 0.481909408573686 0.746334914981833 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 117113552 T/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117113525_117113661:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117113525_117113606:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117113525_117113648:CD58;ENSG00000116815:ENST00000235461:exon_117113525_117113661:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117113525_117113661:CD58 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 119575668 T/C 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.755512817806202 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 8 8 0 3.85527526858949 -3.85527526858949 A C A 10 0.481909408573686 0.00809979847322851 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 11 0 11 5.69899650568945 0 5.69899650568945 G G 10 0.481909408573686 0.000325551318653959 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 43 43 0 20.7221045686685 -20.7221045686685 C T C 10 0.481909408573686 5.47446024856691e-13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 145112501 C/T 0 14 0 14 7.2532682799684 0 7.2532682799684 C C 10 0.481909408573686 3.64347400100298e-05 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 147119273 G/A 1 6 11 17 3.10854354855788 5.30100349431055 -2.19245994575266 A:G G A 10 0.481909408573686 0.337726755422537 ENSG00000162836:ENST00000460583:exon_147119170_147119368:ACP6;ENSG00000162836:ENST00000369238:exon_147119172_147119368:ACP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 150280550 G/A 1 640 809 1449 331.577978512841 389.864711536112 -58.286733023271 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00228317654980593 ENSG00000187145:ENST00000309092:exon_150280482_150281414:MRPS21;ENSG00000187145:ENST00000369084:exon_150280482_150281414:MRPS21 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 150300880 C/T 1 20 12 32 10.3618118285263 5.78291290288423 4.57889892564205 T:C C T 10 0.481909408573686 0.113897769266621 ENSG00000117360:ENST00000324862:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000496202:exon_150300779_150300925:PRPF3;ENSG00000117360:ENST00000467329:exon_150300234_150300925:PRPF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151139822 A/G 1 59 53 112 30.5673448941525 25.5411986544054 5.02614623974716 A:G A G 10 0.481909408573686 0.346256247857711 ENSG00000163156:ENST00000461862:exon_151139802_151140455:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368905:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000368902:exon_151139802_151139890:SCNM1;ENSG00000163156:ENST00000497147:exon_151139802_151139890:SCNM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151149487 A/G 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G A G 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000163159:ENST00000491094:exon_151146867_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000368892:exon_151148780_151149507:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000354473:exon_151148938_151149540:VPS72;ENSG00000163159:ENST00000496809:exon_151149207_151149507:VPS72 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151237908 G/A 1 15 13 28 7.77135887139471 6.26482231145792 1.50653655993679 A:G G A 10 0.481909408573686 0.577433839032379 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000462970:exon_151237870_151238064:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000437736:exon_151237870_151238085:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000491857:exon_151237720_151238085:PSMD4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151239720 G/A 1 386 271 657 199.982968290557 130.597449723469 69.3855185670883 A:G G A 10 0.481909408573686 6.45740604772062e-08 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151239649_151239955:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151239649_151239935:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151239649_151239942:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151239649_151239936:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239649_151239936:PSMD4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151315613 G/A 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151313116_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151314305_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436637:exon_151315550_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151314436_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151315550_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151314723_151315654:RFX5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151372106 G/C 1 10 8 18 5.18090591426314 3.85527526858949 1.32563064567365 C:G G C 10 0.481909408573686 0.639350488109998 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151377407 A/C 1 3 9 12 1.55427177427894 4.33718467716317 -2.78291290288423 A:C A C 10 0.481909408573686 0.149158048996249 ENSG00000143442:ENST00000392723:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000358476:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000271715:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000361398:exon_151375200_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000368863:exon_151375201_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000409503:exon_151376700_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000531094:exon_151376975_151378940:POGZ;ENSG00000143442:ENST00000491586:exon_151377278_151378940:POGZ HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151955625 C/T 1 25 27 52 12.9522647856578 13.0115540314895 -0.0592892458316729 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 151955747 A/G 1 10 12 22 5.18090591426314 5.78291290288423 -0.602006988621093 A:G A G 10 0.481909408573686 0.834217999493083 ENSG00000197747:ENST00000368811:exon_151955391_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000368809:exon_151955394_151955800:S100A10;ENSG00000197747:ENST00000478574:exon_151955708_151955800:S100A10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 152009397 A/C 1 31 68 99 16.0608083342157 32.7698397830107 -16.7090314487949 A:T:C A C 10 0.481909408573686 0.00082615656097573 ENSG00000163191:ENST00000271638:exon_152009389_152009511:S100A11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 153507176 C/T 1 609 375 984 315.517170178625 180.716028215132 134.801141963493 T:C C T 10 0.481909408573686 7.79888698175509e-18 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 154919080 C/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000163346:ENST00000368465:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000368463:exon_154918048_154919279:PBXIP1;ENSG00000163346:ENST00000351146:exon_154918455_154919279:PBXIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 155287962 G/A 1 31 37 68 16.0608083342157 17.8306481172264 -1.76983978301065 A:G G A 10 0.481909408573686 0.716606729995938 ENSG00000160752:ENST00000447866:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000468479:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000461507:exon_155287960_155288454:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000467076:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000368356:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000474345:exon_155287960_155288078:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000471117:exon_155287960_155288264:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000495308:exon_155287960_155288309:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000491013:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000356657:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000470171:exon_155287960_155288082:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000489003:exon_155287960_155288478:FDPS;ENSG00000160752:ENST00000477057:exon_155287960_155288082:FDPS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 155891143 T/G 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 T:G T G 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000132680:ENST00000483237:exon_155891030_155891318:KIAA0907 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 156105028 T/C 1 19 11 30 9.84372123709996 5.30100349431055 4.54271774278942 T:C T C 10 0.481909408573686 0.103267048539996 ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 156565656 G/A 1 11 15 26 5.69899650568945 7.22864112860529 -1.52964462291584 A:G G A 10 0.481909408573686 0.563932005021752 ENSG00000160818:ENST00000498641:exon_156565509_156565923:GPATCH4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 156704300 C/T 1 15 12 27 7.77135887139471 5.78291290288423 1.98844596851048 T:C C T 10 0.481909408573686 0.449937357779834 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 156706559 A/C,G 0 0 17 17 0 8.19245994575266 -8.19245994575266 C:G A G 10 0.481909408573686 1.80380403577510e-05 ENSG00000143303:ENST00000368218:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000368216:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000476229:exon_156706424_156706741:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000497515:exon_156706424_156706752:C1orf66;ENSG00000143303:ENST00000481920:exon_156706473_156706694:C1orf66 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 156707204 C/G 1 172 173 345 89.111581725326 83.3703276832477 5.74125404207832 C:G C G 10 0.481909408573686 0.553640950271599 ENSG00000143314:ENST00000478899:exon_156707095_156707326:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000361531:exon_156707095_156707326:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000368211:exon_156707097_156707326:MRPL24 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 156708450 G/T 1 7 13 20 3.6266341399842 6.26482231145792 -2.63818817147372 T:G G T 10 0.481909408573686 0.269446012541304 ENSG00000143314:ENST00000361531:exon_156708314_156708556:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000368211:exon_156708314_156708556:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000434558:exon_156708314_156708556:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000412846:exon_156708314_156708556:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000420938:exon_156708314_156708556:MRPL24 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 157494106 C/T 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 158812120 T/C 1 31 36 67 16.0608083342157 17.3487387086527 -1.28793037443696 T:C T C 10 0.481909408573686 0.8073654727441 ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158811924_158812208:MNDA;ENSG00000163563:ENST00000491210:exon_158811924_158812513:MNDA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 158911792 A/G 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000163564:ENST00000368140:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000368138:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000392254:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000392252:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000485134:exon_158911767_158912189:PYHIN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 158984777 C/T 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.291636936274409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 158990247 A/G 1 48 68 116 24.8683483884631 32.7698397830107 -7.90149139454758 A:G A G 10 0.481909408573686 0.163224847270247 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158990131_158990319:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_158990131_158990319:IFI16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 159889105 T/C 1 21 12 33 10.8799024199526 5.78291290288423 5.09698951706836 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0829874282597396 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159889064_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159889064_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159888541_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159889064_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159889064_159889166:TAGLN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 159889605 A/G 1 9 17 26 4.66281532283683 8.19245994575266 -3.52964462291584 A:G A G 10 0.481909408573686 0.175871569784347 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159889451_159889625:TAGLN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 160616742 A/G 1 49 32 81 25.3864389798894 15.421101074358 9.96533790553143 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0340004076356279 ENSG00000117090:ENST00000302035:exon_160616660_160617085:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000235739:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000497223:exon_160616660_160616869:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000392208:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000355199:exon_160616660_160617081:SLAMF1;ENSG00000117090:ENST00000494463:exon_160616660_160616811:SLAMF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 160648852 A/G 1 555 611 1166 287.540278241604 294.446648638522 -6.90637039691791 A:T:G A G 10 0.481909408573686 0.703256635521597 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160648536_160648921:CD48 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 160654715 C/T 1 54 46 100 27.976891937021 22.1678327943896 5.8090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.271246768467580 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 160720203 G/C 1 45 56 101 23.3140766141841 26.9869268801264 -3.67285026594229 C:G G C 10 0.481909408573686 0.487010624150998 ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160720094_160720213:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160720094_160720213:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160720094_160720213:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160720094_160720213:SLAMF7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 161090010 A/C 1 9 12 21 4.66281532283683 5.78291290288423 -1.12009758004741 A:C A C 10 0.481909408573686 0.66800138690819 ENSG00000158793:ENST00000496768:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368009:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000392190:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000453609:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000492411:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368008:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000496861:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000368007:exon_161089897_161090022:NIT1;ENSG00000158793:ENST00000485594:exon_161089897_161090022:NIT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 161140176 C/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000143224:ENST00000466452:exon_161140051_161140559:PPOX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 161140517 A/C 1 27 29 56 13.9884459685105 13.9753728486369 0.0130731198735834 A:C A C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000143224:ENST00000352210:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000432542:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000435935:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000367999:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000497522:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000495483:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000462866:exon_161140410_161140559:PPOX;ENSG00000143224:ENST00000466452:exon_161140051_161140559:PPOX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 116 80 196 60.0985086054524 38.5527526858949 21.5457559195575 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.00209151066119246 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 A:G A G 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 167666712 C/T 1 19 24 43 9.84372123709996 11.5658258057685 -1.7221045686685 T:C C T 10 0.481909408573686 0.648932612550328 ENSG00000198771:ENST00000367854:exon_167666336_167667079:RCSD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 168208308 T/C 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.111676109980467 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 169761771 C/T 1 51 47 98 26.422620162742 22.6497422029632 3.77287795977877 T:C C T 10 0.481909408573686 0.479803808549508 ENSG00000171806:ENST00000310392:exon_169761670_169763038:C1orf156;ENSG00000171806:ENST00000303469:exon_169761670_169763038:C1orf156 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 171482210 A/C 1 151 116 267 78.2316793053734 55.9014913945476 22.3301879108258 A:C:G A C 10 0.481909408573686 0.00695352125929153 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171482134_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171482140_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171482140_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171482140_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171482140_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171482140_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171482134_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171482134_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000467601:exon_171482140_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000463586:exon_171478699_171482311:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171482140_171482311:BAT2L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 104 115 219 53.8814215083367 55.4195819859739 -1.53816047763724 A:G G A 10 0.481909408573686 0.839639268948798 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 179054690 C/T 1 15 11 26 7.77135887139471 5.30100349431055 2.47035537708416 T:C C T 10 0.481909408573686 0.433113633245001 ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 179054692 T/G 1 12 15 27 6.21708709711577 7.22864112860529 -1.01155403148952 T:G T G 10 0.481909408573686 0.847761579496843 ENSG00000186283:ENST00000447595:exon_179054507_179055028:TOR3A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 179820185 A/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:T A T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000169905:ENST00000367612:exon_179819980_179820498:TOR1AIP2;ENSG00000169905:ENST00000419174:exon_179819980_179820498:TOR1AIP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 180080313 C/T 1 45 36 81 23.3140766141841 17.3487387086527 5.96533790553143 T:C C T 10 0.481909408573686 0.221095547524601 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180080132_180084015:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180080132_180084014:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180080132_180082515:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180080132_180080327:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000417046:exon_180080132_180080330:CEP350 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 18 14 32 9.32563064567365 6.7467317200316 2.57889892564205 A:G G A 10 0.481909408573686 0.381657390985064 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 182353837 C/T 1 16 18 34 8.28944946282102 8.67436935432635 -0.384919891505325 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182350839_182353858:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182351669_182353858:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182351669_182353858:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182351669_182353858:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182352029_182353858:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000463851:exon_182353331_182353858:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000461447:exon_182353550_182353858:GLUL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 182569446 T/G 1 1466 1558 3024 759.520807030976 750.814858557803 8.70594847317341 A:T:C:G T G 10 0.481909408573686 0.757077186196321 ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 184764351 G/A 1 9 26 35 4.66281532283683 12.5296446229158 -7.86682930007901 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0101602406934103 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 192547447 T/A 1 8 2 10 4.14472473141051 0.963818817147372 3.18090591426314 A:T T A 10 0.481909408573686 0.057427455776973 ENSG00000090104:ENST00000367459:exon_192547352_192547515:RGS1;ENSG00000090104:ENST00000469578:exon_192547352_192547634:RGS1;ENSG00000090104:ENST00000498352:exon_192545904_192547515:RGS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 197070464 T/C 1 16 25 41 8.28944946282102 12.0477352143422 -3.75828575152113 T:C T C 10 0.481909408573686 0.275309859301505 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 197108974 G/C 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 C:G G C 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197108897_197109001:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000294732:exon_197108897_197109001:ASPM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 200618238 T/C 1 7 9 16 3.6266341399842 4.33718467716317 -0.710550537178976 T:C T C 10 0.481909408573686 0.805666606761275 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000452560:exon_200618202_200618277:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000413408:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000429498:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000433235:exon_200618202_200618354:DDX59 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 13 7 20 6.73517768854208 3.3733658600158 3.36181182852628 A:T A T 10 0.481909408573686 0.178779737512779 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 201981218 C/G 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 C C 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 ENSG00000163435:ENST00000359651:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367284:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000367283:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000495848:exon_201981085_201981699:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000310044:exon_201981085_201981306:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000490203:exon_201981085_201981564:ELF3;ENSG00000163435:ENST00000446188:exon_201981085_201981306:ELF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 202128336 G/T 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:G G T 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000143851:ENST00000468385:exon_202127586_202128582:PTPN7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 205589237 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 22 12 34 11.3979930113789 5.78291290288423 5.61508010849468 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0597320037311792 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 206766975 T/C 1 81 78 159 41.9653379055314 37.5889338687475 4.37640403678392 T:C T C 10 0.481909408573686 0.52571254882861 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 206767029 C/T 1 62 49 111 32.1216166684315 23.6135610201106 8.50805564832085 T:C C T 10 0.481909408573686 0.107485060422197 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 209933659 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933601_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 213032568 T/A 1 8 11 19 4.14472473141051 5.30100349431055 -1.15627876290003 A:T T A 10 0.481909408573686 0.651736024435881 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 213068595 C/T 1 22 15 37 11.3979930113789 7.22864112860529 4.16935188277362 T:C C T 10 0.481909408573686 0.189939627147604 ENSG00000162769:ENST00000366971:exon_213068558_213072705:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000419102:exon_213068558_213068676:FLVCR1;ENSG00000162769:ENST00000483790:exon_213068558_213068736:FLVCR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 214820666 G/A 1 10 1 11 5.18090591426314 0.481909408573686 4.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00489735413206958 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 217787511 T/C 1 27 20 47 13.9884459685105 9.63818817147372 4.35025779703676 T:C T C 10 0.481909408573686 0.243035923908122 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217787483_217787544:GPATCH2;ENSG00000092978:ENST00000366934:exon_217787483_217787544:GPATCH2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 218475648 C/T 1 76 65 141 39.3748849483999 31.3241115572896 8.05077339111027 T:C C T 10 0.481909408573686 0.178547394206423 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218475636_218475901:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218475636_218476013:RRP15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 244 221 465 126.414104308021 106.501979294785 19.912125013236 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0702266902146528 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 223933079 C/T 0 0 11 11 0 5.30100349431055 -5.30100349431055 T C T 10 0.481909408573686 0.00104742758068161 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223933008_223933141:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223933008_223933141:CAPN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 223934720 G/A 1 11 7 18 5.69899650568945 3.3733658600158 2.32563064567365 A:G G A 10 0.481909408573686 0.347236209840515 ENSG00000162909:ENST00000434648:exon_223934699_223934765:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000295006:exon_223934699_223934867:CAPN2;ENSG00000162909:ENST00000366869:exon_223934699_223934867:CAPN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 226175743 T/C 1 16 13 29 8.28944946282102 6.26482231145792 2.0246271513631 T:C T C 10 0.481909408573686 0.464404653444286 ENSG00000143751:ENST00000272091:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366818:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366817:exon_226175597_226176089:C1orf55 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 227920357 C/T 1 25 38 63 12.9522647856578 18.3125575258001 -5.36029274014222 T:C C T 10 0.481909408573686 0.20738356383859 ENSG00000143740:ENST00000480897:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000480265:exon_227920090_227922053:SNAP47;ENSG00000081692:ENST00000485807:exon_227918126_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227918890_227920377:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227918935_227920377:JMJD4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 228335125 C/T 1 110 95 205 56.9899650568945 45.7813938145002 11.2085712423944 T:C C T 10 0.481909408573686 0.124252632583251 ENSG00000143774:ENST00000366730:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000462807:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485838:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000312726:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000492871:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366728:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366727:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000453943:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366723:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366729:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000391865:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366722:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498092:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000435153:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366721:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000460224:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000472939:exon_228335107_228335146:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000412265:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366719:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366720:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366718:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366715:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470040:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000366716:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000485168:exon_228335107_228335188:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000478725:exon_228335107_228335260:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000420445:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000495999:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000486668:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000464858:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470155:exon_228335107_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000481341:exon_228335111_228335245:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000498115:exon_228335107_228335400:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000470740:exon_228335107_228335239:GUK1;ENSG00000143774:ENST00000465025:exon_228335125_228335245:GUK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 235291190 T/C 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C T C 10 0.481909408573686 0.767778067165281 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 25 23 48 12.9522647856578 11.0839163971948 1.86834838846307 T:C T C 10 0.481909408573686 0.66542658884071 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 235383188 A/G 1 138 151 289 71.4965016168313 72.7683206946266 -1.27181907779527 A:G A G 10 0.481909408573686 0.906351836474164 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 55 36 91 28.4949825284473 17.3487387086527 11.1462438197946 T:C T C 10 0.481909408573686 0.020884380373521 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 235955205 C/T 1 8 17 25 4.14472473141051 8.19245994575266 -4.04773521434215 T:C C T 10 0.481909408573686 0.113486988626887 ENSG00000143669:ENST00000389794:exon_235954999_235955425:LYST;ENSG00000143669:ENST00000389793:exon_235954999_235955425:LYST;ENSG00000143669:ENST00000489585:exon_235954999_235955425:LYST;ENSG00000143669:ENST00000465349:exon_235954873_235955425:LYST HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 236708011 G/C 1 2 27 29 1.03618118285263 13.0115540314895 -11.9753728486369 C:G G C 10 0.481909408573686 2.30088877320576e-06 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 236708037 T/C 1 23 2 25 11.9160836028052 0.963818817147372 10.9522647856578 T:C T C 10 0.481909408573686 6.20108563678946e-06 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 236708224 A/C 1 13 1 14 6.73517768854208 0.481909408573686 6.2532682799684 A:C A C 10 0.481909408573686 0.000685205330006559 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 236711323 T/C 1 53 66 119 27.4588013455946 31.8060209658633 -4.34721962026864 T:C T C 10 0.481909408573686 0.463404271177057 ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 236737933 G/C 1 4 15 19 2.07236236570526 7.22864112860529 -5.15627876290004 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0206700820509957 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 241663789 G/A 1 98 75 173 50.7728779597788 36.1432056430265 14.6296723167523 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0273364714413265 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241663737_241663890:FH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 245027560 T/G 1 9 8 17 4.66281532283683 3.85527526858949 0.807540054247338 T:G T G 10 0.481909408573686 0.809822317241348 ENSG00000153187:ENST00000427948:exon_245027286_245027609:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000444376:exon_245026976_245027844:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000283179:exon_245026919_245027773:HNRNPU;ENSG00000153187:ENST00000476241:exon_245026976_245027793:HNRNPU HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 247006051 G/C 1 34 19 53 17.6150801084947 9.15627876290004 8.45880134559464 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0269206625943869 ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247005996_247006078:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000498601:exon_247005996_247006078:AHCTF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 1 247013549 T/G 1 30 16 46 15.5427177427894 7.71055053717898 7.83216720561044 T:G T G 10 0.481909408573686 0.0260110816556123 ENSG00000153207:ENST00000470300:exon_247012917_247014744:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000366508:exon_247012917_247014744:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000326225:exon_247012917_247014744:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000428671:exon_247012917_247014744:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000361182:exon_247012917_247014744:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000391829:exon_247012917_247014744:AHCTF1;ENSG00000153207:ENST00000483900:exon_247013173_247014744:AHCTF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 1046712 G/A 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 1065787 A/G 1 41 45 86 21.2417142484789 21.6859233858159 -0.444209137337001 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1063015_1065876:GTPBP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 3180224 C/T 1 52 40 92 26.9407107541683 19.2763763429474 7.66433441122089 T:C C T 10 0.481909408573686 0.118011871440890 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 20 22 42 10.3618118285263 10.6020069886211 -0.240195160094812 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 3181120 C/T 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3181096_3181241:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000455371:exon_3180883_3181241:PITRM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 19 18 37 9.84372123709996 8.67436935432635 1.16935188277362 T:C T C 10 0.481909408573686 0.743954392785624 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 5920244 T/C 1 31 18 49 16.0608083342157 8.67436935432635 7.38643897988938 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0443675330087494 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 50 53 103 25.9045295713157 25.5411986544054 0.363330916910339 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 11356160 C/T 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C C T 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 12292344 A/G 1 84 93 177 43.5196096798104 44.8175749973528 -1.29796531754243 A:G A G 10 0.481909408573686 0.880546684808374 ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 13178697 C/A 1 16 11 27 8.28944946282102 5.30100349431055 2.98844596851048 A:C C A 10 0.481909408573686 0.335782141208118 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 13735887 C/A 1 12 7 19 6.21708709711577 3.3733658600158 2.84372123709996 A:C C A 10 0.481909408573686 0.251548235310953 ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 15145361 G/A 1 14 22 36 7.2532682799684 10.6020069886211 -3.3487387086527 A:G G A 10 0.481909408573686 0.317743449121409 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 15177280 T/C 1 17 24 41 8.80754005424734 11.5658258057685 -2.75828575152113 T:C T C 10 0.481909408573686 0.436429687610051 ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 17276817 C/T 1 19 17 36 9.84372123709996 8.19245994575266 1.6512612913473 T:C C T 10 0.481909408573686 0.619600928115492 ENSG00000026025:ENST00000224237:exon_17276692_17276817:VIM;ENSG00000026025:ENST00000487938:exon_17276692_17276817:VIM;ENSG00000026025:ENST00000469543:exon_17276692_17276817:VIM;ENSG00000026025:ENST00000421459:exon_17276692_17277084:VIM;ENSG00000026025:ENST00000495528:exon_17276692_17277033:VIM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 22830790 G/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:G G T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22830733_22830976:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22830733_22830976:PIP4K2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 26855907 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000077420:ENST00000445780:exon_26855890_26856057:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000376236:exon_26855890_26856732:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000493857:exon_26855890_26856155:APBB1IP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 30629226 G/A 1 15 11 26 7.77135887139471 5.30100349431055 2.47035537708416 A:G G A 10 0.481909408573686 0.433113633245001 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 32323591 G/T 1 6 14 20 3.10854354855788 6.7467317200316 -3.63818817147372 T:G G T 10 0.481909408573686 0.120057313816211 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 32580219 T/C 1 17 25 42 8.80754005424734 12.0477352143422 -3.24019516009481 T:C T C 10 0.481909408573686 0.356083161496848 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32580091_32581572:EPC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 45478092 A/G 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 A:G A G 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 49791109 C/T 0 9 0 9 4.66281532283683 0 4.66281532283683 C C 10 0.481909408573686 0.00140180836789809 ENSG00000128805:ENST00000249601:exon_49790998_49791197:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000374167:exon_49790998_49791197:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000435790:exon_49790998_49791197:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000417912:exon_49790998_49791197:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000460425:exon_49790998_49791197:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000493012:exon_49790998_49791170:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000491108:exon_49790998_49791197:ARHGAP22;ENSG00000128805:ENST00000464445:exon_49790766_49791197:ARHGAP22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 58118215 A/G 1 25 8 33 12.9522647856578 3.85527526858949 9.09698951706836 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00151781392043140 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58117199_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000318387:exon_58117206_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000460654:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58118138_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000478181:exon_58117948_58118220:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58118137_58118220:ZWINT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 58120988 C/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:C C A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 64944317 T/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:T T A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 13 17 30 6.73517768854208 8.19245994575266 -1.45728225721058 A:G A G 10 0.481909408573686 0.715575731572536 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 70856821 A/T 1 138 186 324 71.4965016168313 89.6351499947056 -18.1386483778743 A:T A T 10 0.481909408573686 0.0453600355265410 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 83 112 195 43.0015190883841 53.9738537602528 -10.9723346718688 A:G G A 10 0.481909408573686 0.132162703072526 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 50 56 106 25.9045295713157 26.9869268801264 -1.08239730881072 A:G G A 10 0.481909408573686 0.846531730702175 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 71874683 G/A 1 60 43 103 31.0854354855788 20.7221045686685 10.3633309169103 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0481733611792173 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 71874734 G/A 1 29 24 53 15.0246271513631 11.5658258057685 3.45880134559464 A:G G A 10 0.481909408573686 0.409803903210193 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 71874866 T/C 1 13 13 26 6.73517768854208 6.26482231145792 0.470355377084163 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 71880791 C/G 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 C:G C G 10 0.481909408573686 0.134075613444074 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 73992862 C/G 1 49 46 95 25.3864389798894 22.1678327943896 3.21860618549983 C:G C G 10 0.481909408573686 0.538726086085953 ENSG00000166295:ENST00000478193:exon_73992759_73993373:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000299381:exon_73992759_73993587:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000470481:exon_73992759_73993584:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000468144:exon_73992759_73992969:ANAPC16;ENSG00000166295:ENST00000496924:exon_73992759_73993223:ANAPC16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 74890552 A/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:T A T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000166321:ENST00000488223:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000357321:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000349051:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000372997:exon_74890461_74891586:NUDT13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 26 32 58 13.4703553770842 15.421101074358 -1.95074569727379 T:C T C 10 0.481909408573686 0.693855529617065 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 75010597 A/G 1 57 144 201 29.5311637112999 69.3949548346108 -39.8637911233109 A:G A G 10 0.481909408573686 1.12377356559444e-08 ENSG00000182180:ENST00000372945:exon_75008601_75010749:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000479005:exon_75008601_75010749:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000471251:exon_75010499_75010749:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000473427:exon_75010502_75010749:MRPS16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 75011761 A/G 1 21 53 74 10.8799024199526 25.5411986544054 -14.6612962344528 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000656321428814142 ENSG00000182180:ENST00000416782:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000372945:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000479005:exon_75011521_75011795:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000372940:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000471251:exon_75011521_75011781:MRPS16;ENSG00000182180:ENST00000473427:exon_75011521_75011781:MRPS16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 75155603 C/T 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 75265136 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000166348:ENST00000418501:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000424265:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000466048:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000339859:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000428547:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000408019:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000422491:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000394811:exon_75265066_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000319786:exon_75265081_75265184:USP54;ENSG00000166348:ENST00000497106:exon_75265081_75265184:USP54 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 75562161 C/A 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000166507:ENST00000309979:exon_75561669_75562334:NDST2;ENSG00000166507:ENST00000299641:exon_75561669_75562334:NDST2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 76990646 G/A 1 11 1 12 5.69899650568945 0.481909408573686 5.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00255486444561599 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 85902479 A/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:T A T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000165678:ENST00000372134:exon_85902411_85902510:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000339736:exon_85902411_85902510:GHITM;ENSG00000165678:ENST00000436406:exon_85902402_85902510:GHITM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 15 20 35 7.77135887139471 9.63818817147372 -1.86682930007901 T:C T C 10 0.481909408573686 0.612967395207346 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 91099657 A/G 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 95441268 A/G 1 85 99 184 44.0377002712367 47.7090314487949 -3.67133117755823 A:G A G 10 0.481909408573686 0.606171680825091 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95441237_95441355:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95441237_95441355:FRA10AC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 96256902 A/G 1 8 12 20 4.14472473141051 5.78291290288423 -1.63818817147372 A:G A G 10 0.481909408573686 0.509077891598092 ENSG00000108239:ENST00000225235:exon_96256812_96256929:TBC1D12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 96260023 C/T 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000108239:ENST00000225235:exon_96259978_96260084:TBC1D12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 96333803 T/C 1 27 15 42 13.9884459685105 7.22864112860529 6.75980483990519 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0440428626634942 ENSG00000119969:ENST00000441434:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96333717_96333863:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96333717_96333944:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000466552:exon_96333717_96334205:HELLS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 98321837 T/C 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98321735_98321895:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000443638:exon_98321735_98321895:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000464654:exon_98321735_98321895:TM9SF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 100202971 C/G 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 C:G C G 10 0.481909408573686 0.197791501722836 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000498219:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000465957:exon_100202881_100202997:HPS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 101993025 G/A 1 11 11 22 5.69899650568945 5.30100349431055 0.397993011378908 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_101992867_101993128:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_101992055_101993128:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_101992055_101993128:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_101992055_101993128:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_101992867_101993128:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000478047:exon_101992062_101993128:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000370379:exon_101992934_101993128:CWF19L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 103609704 G/T 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 T:G G T 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 104161817 G/A 1 340 382 722 176.150801084947 184.089394075148 -7.9385929902013 A:G G A 10 0.481909408573686 0.576465810582588 ENSG00000077150:ENST00000454143:exon_104161805_104161916:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000428099:exon_104161805_104161916:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000369966:exon_104161805_104161916:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000336486:exon_104161805_104161916:NFKB2;ENSG00000077150:ENST00000189444:exon_104161805_104161916:NFKB2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 104161967 T/C 1 19 44 63 9.84372123709996 21.2040139772422 -11.3602927401422 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00513993836794864 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 104163569 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 104164488 G/A 1 10 4 14 5.18090591426314 1.92763763429474 3.2532682799684 A:G G A 10 0.481909408573686 0.108335810082199 ENSG00000059915:ENST00000479172:exon_104164402_104164812:PSD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 105205302 A/C 1 20 19 39 10.3618118285263 9.15627876290004 1.20553306562624 A:C A C 10 0.481909408573686 0.750033637404574 ENSG00000148843:ENST00000369797:exon_105205135_105206049:PDCD11;ENSG00000148843:ENST00000478543:exon_105205135_105205481:PDCD11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 105206874 T/C 1 11 2 13 5.69899650568945 0.963818817147372 4.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0104849883006144 ENSG00000138172:ENST00000369788:exon_105206543_105207325:CALHM2;ENSG00000138172:ENST00000260743:exon_105206546_105207325:CALHM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 105762591 G/A 1 78 68 146 40.4110661312525 32.7698397830107 7.64122634824184 A:G G A 10 0.481909408573686 0.214782155893587 ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 107 68 175 55.4356932826156 32.7698397830107 22.6658534996049 A:C C A 10 0.481909408573686 0.00063659450259004 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 106058901 G/T 1 10 4 14 5.18090591426314 1.92763763429474 3.2532682799684 T:G G T 10 0.481909408573686 0.108335810082199 ENSG00000065621:ENST00000369708:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000338595:exon_106058886_106059175:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000473401:exon_106058886_106059172:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000401888:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000428582:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000425926:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000429569:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000369707:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000467629:exon_106058886_106059176:GSTO2;ENSG00000065621:ENST00000498052:exon_106058886_106059169:GSTO2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 111625046 G/C 1 17 32 49 8.80754005424734 15.421101074358 -6.61356102011062 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0636099257192992 ENSG00000108039:ENST00000502895:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000488118:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000502935:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369683:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369680:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000322238:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369661:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369659:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369658:exon_111624812_111625070:XPNPEP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 112349422 T/C 1 276 299 575 142.993003233663 144.090913163532 -1.09790992986947 T:C T C 10 0.481909408573686 0.93353571232177 ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 116593175 C/T 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000151553:ENST00000369246:exon_116592992_116593224:FAM160B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129899707 C/T 1 301 326 627 155.945268019321 157.102467195022 -1.15719917570112 T:C C T 10 0.481909408573686 0.936331967325759 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 123 105 228 63.7251427454366 50.600487900237 13.1246548451996 T:C T C 10 0.481909408573686 0.085045428822282 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129901393 T/C 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 G G 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129904874 G/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G G C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129906735 T/C 1 7 16 23 3.6266341399842 7.71055053717898 -4.08391639719478 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0980365874501828 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129907167 C/T 1 235 200 435 121.751288985184 96.3818817147372 25.3694072704466 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0163572295603178 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 47 61 108 24.3502577970368 29.3964739229948 -5.04621612595809 C:G G C 10 0.481909408573686 0.337579542742791 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129913774 C/T 1 20 12 32 10.3618118285263 5.78291290288423 4.57889892564205 T:C C T 10 0.481909408573686 0.113897769266621 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 17 27 44 8.80754005424734 13.0115540314895 -4.20401397724219 A:T A T 10 0.481909408573686 0.229083626592826 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 131506192 C/T 1 16 22 38 8.28944946282102 10.6020069886211 -2.31255752580007 T:C C T 10 0.481909408573686 0.517601378393511 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 131506283 C/T 1 9 16 25 4.66281532283683 7.71055053717898 -3.04773521434215 T:C C T 10 0.481909408573686 0.237146152880217 ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 133769482 G/C 1 16 15 31 8.28944946282102 7.22864112860529 1.06080833421573 C:G G C 10 0.481909408573686 0.722924965563904 ENSG00000175470:ENST00000455566:exon_133769188_133773331:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000482010:exon_133769188_133770059:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000422256:exon_133769188_133770037:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000398018:exon_133769188_133770051:PPP2R2D;ENSG00000175470:ENST00000490777:exon_133769188_133769746:PPP2R2D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 135076523 C/A 1 10 12 22 5.18090591426314 5.78291290288423 -0.602006988621093 A:C C A 10 0.481909408573686 0.834217999493083 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 135076596 T/C 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.270950871664830 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 135094912 T/A 1 26 37 63 13.4703553770842 17.8306481172264 -4.36029274014222 A:T T A 10 0.481909408573686 0.313535034993083 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135094777_135094940:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135094777_135094940:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135094777_135094940:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000477923:exon_135094777_135095026:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135094777_135094940:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135094777_135094940:TUBGCP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 135197419 G/A 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 244 141 385 126.414104308021 67.9492266088897 58.4648776991309 C:G C G 10 0.481909408573686 2.53625488908610e-09 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 294757 C/T 1 23 77 100 11.9160836028052 37.1070244601738 -25.1909408573686 T:C C T 10 0.481909408573686 3.20677061726702e-07 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_294556_295678:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_294556_296107:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_294556_295688:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_294556_295676:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_294556_295258:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_294556_295683:ATHL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G A G 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 309127 A/G 1 117 209 326 60.6165991968787 100.7190663919 -40.1024671950216 A:G A G 10 0.481909408573686 8.47210060836477e-06 ENSG00000185201:ENST00000533141:exon_309013_309230:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_309013_309395:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000443559:exon_309063_309252:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000327366:exon_309063_309272:IFITM2;ENSG00000185201:ENST00000527146:exon_309013_309392:IFITM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 34 38 72 17.6150801084947 18.3125575258001 -0.697477417305397 T:C C T 10 0.481909408573686 0.90649676192297 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 612967 A/G 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 A:G A G 10 0.481909408573686 0.784647630659318 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 61 51 112 31.6035260770052 24.577379837258 7.02614623974717 T:C T C 10 0.481909408573686 0.187052863297278 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 39 69 108 20.2055330656262 33.2517491915843 -13.0462161259581 T:G T G 10 0.481909408573686 0.0122453773747019 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 674458 G/A 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 G G 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 674499 G/A 0 14 0 14 7.2532682799684 0 7.2532682799684 G G 10 0.481909408573686 3.64347400100298e-05 ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_674372_674783:DEAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 840367 C/T 1 197 213 410 102.063846510984 102.646704026195 -0.582857515211273 T:C C T 10 0.481909408573686 0.960629843574475 ENSG00000177700:ENST00000534030:exon_840262_840480:POLR2L;ENSG00000177700:ENST00000322028:exon_839721_840480:POLR2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 869839 C/T 1 31 40 71 16.0608083342157 19.2763763429474 -3.21556800873171 T:C C T 10 0.481909408573686 0.477504525046509 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_867860_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_867860_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_868396_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_869214_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_869762_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_869763_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_869763_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_869763_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_869767_869956:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_869780_869956:CHID1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 1874404 C/T 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 T:C C T 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1874200_1874427:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1874200_1874427:LSP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 1902781 G/C 1 12 15 27 6.21708709711577 7.22864112860529 -1.01155403148952 C:G G C 10 0.481909408573686 0.847761579496843 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 1959707 C/T 1 67 33 100 34.712069625563 15.9030104829316 18.8090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000185140659577739 ENSG00000130595:ENST00000278317:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381549:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381561:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397309:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381548:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000360603:exon_1959668_1959935:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381589:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381579:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381557:exon_1959668_1959931:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381563:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000344578:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000381558:exon_1959668_1959936:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397301:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000397304:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000446240:exon_1959668_1959722:TNNT3;ENSG00000130595:ENST00000473100:exon_1959668_1959932:TNNT3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 1972143 G/A 1 14 5 19 7.2532682799684 2.40954704286843 4.84372123709996 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0364843548286125 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 1972212 C/T 1 13 20 33 6.73517768854208 9.63818817147372 -2.90301048293164 T:C C T 10 0.481909408573686 0.384462546326118 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397297:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381514:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397294:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000486931:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1972129_1972251:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000466346:exon_1972140_1972251:MRPL23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 2417935 T/C 1 54 50 104 27.976891937021 24.0954704286843 3.88142150833665 T:C T C 10 0.481909408573686 0.492447889955114 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 3026712 C/T 1 10 18 28 5.18090591426314 8.67436935432635 -3.49346344006321 T:C C T 10 0.481909408573686 0.256181410449422 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 3038465 G/A 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 A:G G A 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3038336_3038525:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3038336_3038525:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3038336_3038525:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3038336_3038525:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3038336_3038525:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3038336_3039770:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3038336_3038525:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3038336_3038525:CARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 3040549 C/T 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.182263058918350 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 5289670 A/G 1 6 16 22 3.10854354855788 7.71055053717898 -4.60200698862109 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0558394338072884 ENSG00000213931:ENST00000380237:exon_5289582_5289827:HBE1;ENSG00000213931:ENST00000292896:exon_5289584_5289827:HBE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 5700340 T/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 5719667 T/C 1 29 37 66 15.0246271513631 17.8306481172264 -2.80602096586328 T:C T C 10 0.481909408573686 0.538852812781577 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 5719750 G/C 1 32 54 86 16.578898925642 26.023108062979 -9.444209137337 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0514822705202808 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 6340416 G/A 1 37 26 63 19.1693518827736 12.5296446229158 6.63970725985778 A:G G A 10 0.481909408573686 0.101866139913543 ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 6632450 C/T 1 339 277 616 175.63271049352 133.488906174911 42.1438043186094 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00069977314529571 ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000299424:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000527248:exon_6632420_6632534:TAF10;ENSG00000166337:ENST00000531760:exon_6632419_6632534:TAF10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 6636106 T/A 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:T T A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000429085:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6636097_6636222:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000524611:exon_6636097_6636222:TPP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 229 194 423 118.642745436626 93.4904252632951 25.1523201733308 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0149534523635619 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 7686584 A/T 1 109 47 156 56.4718744654682 22.6497422029632 33.822132262505 A:T A T 10 0.481909408573686 5.18989844137348e-08 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 8486310 C/A 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 A:C C A 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 8940989 G/A 1 25 13 38 12.9522647856578 6.26482231145792 6.68744247419993 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0344364848781411 ENSG00000166452:ENST00000299576:exon_8940884_8941631:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309377:exon_8940884_8941631:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000309357:exon_8940884_8941631:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000396648:exon_8940884_8941447:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000534147:exon_8940884_8941409:C11orf17;ENSG00000166452:ENST00000529942:exon_8940884_8941084:C11orf17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 10776550 T/C 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10776505_10776744:CTR9;ENSG00000198730:ENST00000524523:exon_10776505_10776744:CTR9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 10800287 G/T 1 21 33 54 10.8799024199526 15.9030104829316 -5.02310806297905 T:G G T 10 0.481909408573686 0.176466199391995 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 13729639 G/A 1 23 24 47 11.9160836028052 11.5658258057685 0.350257797036756 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 13729640 A/T 1 23 24 47 11.9160836028052 11.5658258057685 0.350257797036756 A:T A T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 17809877 C/G 1 120 123 243 62.1708709711577 59.2748572545634 2.8960137165943 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0.748330294754692 ENSG00000129158:ENST00000531299:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000531926:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528369:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000527494:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525422:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000265965:exon_17809595_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000528200:exon_17809596_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000524589:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529440:exon_17809599_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000529151:exon_17809702_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000532546:exon_17809743_17809960:SERGEF;ENSG00000129158:ENST00000525920:exon_17809796_17809960:SERGEF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 18103014 T/C 1 15 24 39 7.77135887139471 11.5658258057685 -3.79446693437376 T:C T C 10 0.481909408573686 0.262924790554526 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530436:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530237:exon_18102958_18103284:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18102958_18103050:SAAL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 18633971 G/A 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 G G 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 ENSG00000179119:ENST00000336349:exon_18633861_18634035:SPTY2D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 23 24 47 11.9160836028052 11.5658258057685 0.350257797036756 T:G T G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 58 25 83 30.0492543027262 12.0477352143422 18.0015190883841 T:C T C 10 0.481909408573686 9.5902178673680e-05 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 20529892 A/G 1 10 11 21 5.18090591426314 5.30100349431055 -0.120097580047406 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 27362257 T/C 1 54 56 110 27.976891937021 26.9869268801264 0.989965056894537 T:C T C 10 0.481909408573686 0.849431997513036 ENSG00000109881:ENST00000529615:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27362243_27362384:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27362243_27362384:CCDC34 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 27384585 G/A 1 32 44 76 16.578898925642 21.2040139772422 -4.62511505160014 A:G G A 10 0.481909408573686 0.30345068328859 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 32623301 T/C 1 11 2 13 5.69899650568945 0.963818817147372 4.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0104849883006144 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 32874919 C/A 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:C C A 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 32956620 A/G 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 34163364 A/G 1 28 32 60 14.5065365599368 15.421101074358 -0.914564514421162 A:G A G 10 0.481909408573686 0.897390425449839 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34163266_34163364:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34163266_34163364:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34163266_34163364:NAT10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 36680719 G/A 1 2 17 19 1.03618118285263 8.19245994575266 -7.15627876290004 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000831826359312331 ENSG00000166352:ENST00000334307:exon_36680569_36680818:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000347206:exon_36680569_36680822:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000534635:exon_36680569_36680824:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000446510:exon_36680569_36680821:C11orf74;ENSG00000166352:ENST00000528092:exon_36680569_36680834:C11orf74 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 102 136 238 52.845240325484 65.5396795660213 -12.6944392405373 A:G A G 10 0.481909408573686 0.104973512794870 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 45882364 T/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 45883684 G/A 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 ENSG00000121671:ENST00000417225:exon_45883611_45883699:CRY2;ENSG00000121671:ENST00000443527:exon_45883611_45883699:CRY2;ENSG00000121671:ENST00000263762:exon_45883611_45883699:CRY2;ENSG00000121671:ENST00000533779:exon_45883611_45883699:CRY2;ENSG00000121671:ENST00000495237:exon_45882713_45883699:CRY2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 45935384 A/G 1 73 77 150 37.8206131741209 37.1070244601738 0.713588713947097 A:G A G 10 0.481909408573686 0.9349808777679 ENSG00000121680:ENST00000241041:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45935370_45935489:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000532681:exon_45935370_45935489:PEX16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 47376967 C/G 1 24 14 38 12.4341741942315 6.7467317200316 5.68744247419993 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0742763664191172 ENSG00000066336:ENST00000227163:exon_47376409_47377097:SPI1;ENSG00000066336:ENST00000378538:exon_47376411_47377097:SPI1;ENSG00000066336:ENST00000533030:exon_47376652_47377097:SPI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 47444462 T/C 1 18 19 37 9.32563064567365 9.15627876290004 0.169351882773617 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000165916:ENST00000298852:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530912:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000524447:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000531051:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530887:exon_47444381_47444524:PSMC3;ENSG00000165916:ENST00000530651:exon_47444381_47444524:PSMC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 47600705 C/T 0 0 9 9 0 4.33718467716317 -4.33718467716317 T C T 10 0.481909408573686 0.00409118328334302 ENSG00000213619:ENST00000263774:exon_47600562_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000529276:exon_47600581_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000528192:exon_47600592_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000530295:exon_47600624_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000534208:exon_47600624_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000533142:exon_47600626_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000533105:exon_47600637_47600886:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000534716:exon_47600637_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000526871:exon_47600650_47600710:NDUFS3;ENSG00000213619:ENST00000524568:exon_47600651_47600886:NDUFS3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 58378424 A/G 1 49 51 100 25.3864389798894 24.577379837258 0.809059142631398 A:G A G 10 0.481909408573686 0.920405580699842 ENSG00000186660:ENST00000316059:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000186660:ENST00000389918:exon_58378423_58378527:ZFP91;ENSG00000255073:ENST00000389919:exon_58378423_58378527:AP001350.3;ENSG00000255073:ENST00000422974:exon_58378423_58378527:AP001350.3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 58892558 C/T 1 74 79 153 38.3387037655472 38.0708432773212 0.267860488226042 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000189057:ENST00000411426:exon_58891652_58894883:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000529618:exon_58891652_58893909:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000343597:exon_58891652_58894867:FAM111B;ENSG00000189057:ENST00000435727:exon_58891652_58894883:FAM111B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 58919813 A/G 1 66 78 144 34.1939790341367 37.5889338687475 -3.39495483461079 A:G A G 10 0.481909408573686 0.617070469688905 ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 61089037 T/C 1 27 34 61 13.9884459685105 16.3849198915053 -2.39647392299485 T:C T C 10 0.481909408573686 0.608851772554745 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 61254455 T/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C T C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000162148:ENST00000432063:exon_61254420_61254533:C11orf66;ENSG00000162148:ENST00000338608:exon_61254420_61254533:C11orf66 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 61557448 C/T 1 7 10 17 3.6266341399842 4.81909408573686 -1.19245994575266 T:C C T 10 0.481909408573686 0.632925812771296 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:C A C 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62286670 G/A 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62291388 C/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 94 72 166 48.7005155940735 34.6974774173054 14.0030381767681 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0356766659413875 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62342763 C/T 1 94 71 165 48.7005155940735 34.2155680087317 14.4849475853418 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0288598702155791 ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62342818 C/T 1 83 72 155 43.0015190883841 34.6974774173054 8.30404167107866 T:C C T 10 0.481909408573686 0.198492091387516 ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62361478 G/T 1 244 195 439 126.414104308021 93.9723346718688 32.4417696361518 T:G G T 10 0.481909408573686 0.00220372195644084 ENSG00000149480:ENST00000278823:exon_62360686_62361512:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000524902:exon_62360687_62361512:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000527204:exon_62361314_62361512:MTA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 62383981 A/C 1 32 46 78 16.578898925642 22.1678327943896 -5.58893386874751 A:C A C 10 0.481909408573686 0.214449756563613 ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 63313621 G/A 1 179 133 312 92.7382158653102 64.0939513403002 28.64426452501 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00122082151326712 ENSG00000133321:ENST00000255688:exon_63313621_63313929:RARRES3;ENSG00000133321:ENST00000354445:exon_63313621_63313929:RARRES3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 63764302 G/C 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000167770:ENST00000428192:exon_63764002_63764413:OTUB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64645595 G/C 1 44 34 78 22.7959860227578 16.3849198915053 6.41106613125249 C:G G C 10 0.481909408573686 0.173634302734141 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64645871 A/G 1 11 5 16 5.69899650568945 2.40954704286843 3.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.132948456946107 ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64662423 C/T 1 14 19 33 7.2532682799684 9.15627876290004 -1.90301048293164 T:C C T 10 0.481909408573686 0.602254039222182 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662019_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662019_64662681:ATG2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64811755 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000533017:exon_64811697_64812145:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64812029 G/A 1 40 14 54 20.7236236570526 6.7467317200316 13.976891937021 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00017416812400537 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000533017:exon_64811697_64812145:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64812173 A/G 1 23 12 35 11.9160836028052 5.78291290288423 6.13317069992099 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0425000051034133 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 64882846 C/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C C T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 65347431 G/A 1 5 13 18 2.59045295713157 6.26482231145792 -3.67436935432635 A:G G A 10 0.481909408573686 0.100145970992449 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65347407_65347460:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65347407_65347460:EHBP1L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 65389890 G/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G G C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 20 12 32 10.3618118285263 5.78291290288423 4.57889892564205 A:G G A 10 0.481909408573686 0.113897769266621 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 66330411 T/C 1 14 6 20 7.2532682799684 2.89145645144212 4.36181182852628 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0713206184786195 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 66373304 C/T 1 25 15 40 12.9522647856578 7.22864112860529 5.72362365705256 T:C C T 10 0.481909408573686 0.081667408968484 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66373173_66373490:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66373173_66373383:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66373173_66373469:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66373173_66373390:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66373173_66373488:CCS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 67257556 C/T 1 24 32 56 12.4341741942315 15.421101074358 -2.98692688012642 T:C C T 10 0.481909408573686 0.504133054536398 ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257509_67257685:AIP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 67353896 C/T 1 1246 1303 2549 645.540876917187 627.927959371513 17.6129175456743 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.487929069293650 ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000495996:exon_67353860_67353910:GSTP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 67377890 C/G 1 22 12 34 11.3979930113789 5.78291290288423 5.61508010849468 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0597320037311792 ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532244:exon_67377852_67378053:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532343:exon_67377852_67377931:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533075:exon_67377852_67377897:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529867:exon_67377852_67377912:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000530638:exon_67377852_67377891:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67377852_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67377852_67378041:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67377864_67378041:NDUFV1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 67379016 T/C 1 128 139 267 66.3155957025682 66.9854077917424 -0.669812089174172 T:C T C 10 0.481909408573686 0.951228184213473 ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000453836:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67378993_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67378948_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000527355:exon_67378874_67379040:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000527923:exon_67378619_67379040:NDUFV1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 67395646 C/T 1 35 23 58 18.133170699921 11.0839163971948 7.04925430272621 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0668403350522227 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 17 29 46 8.80754005424734 13.9753728486369 -5.16783279438956 T:C C T 10 0.481909408573686 0.141240554649784 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 68705674 C/A 1 18 12 30 9.32563064567365 5.78291290288423 3.54271774278942 A:C C A 10 0.481909408573686 0.206237508491672 ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68705650_68705822:IGHMBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 70221204 C/T 1 5 13 18 2.59045295713157 6.26482231145792 -3.67436935432635 T:C C T 10 0.481909408573686 0.100145970992449 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 70279811 C/T 1 9 10 19 4.66281532283683 4.81909408573686 -0.156278762900034 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000085733:ENST00000346329:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000301843:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000376561:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000393747:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000529736:exon_70279753_70279824:CTTN;ENSG00000085733:ENST00000533931:exon_70279731_70279824:CTTN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 C:G G C 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 73584369 C/T 1 14 19 33 7.2532682799684 9.15627876290004 -1.90301048293164 T:C C T 10 0.481909408573686 0.602254039222182 ENSG00000181924:ENST00000355693:exon_73583715_73584439:CHCHD8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 74345735 G/A 1 18 23 41 9.32563064567365 11.0839163971948 -1.75828575152113 A:G G A 10 0.481909408573686 0.640822314017757 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74345628_74345740:POLD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 74347298 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74347242_74347320:POLD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 74347299 C/G 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74347242_74347320:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74347242_74347320:POLD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 75110589 A/G 1 14 20 34 7.2532682799684 9.63818817147372 -2.38491989150532 A:G A G 10 0.481909408573686 0.493463046030381 ENSG00000149273:ENST00000531188:exon_75110530_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000529173:exon_75110559_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000531810:exon_75110561_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000528439:exon_75110562_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530164:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530689:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000530721:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000405680:exon_75110563_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000422465:exon_75110564_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000278572:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000532872:exon_75110574_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000534440:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527446:exon_75110575_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000526608:exon_75110581_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000527273:exon_75110586_75110621:RPS3;ENSG00000149273:ENST00000524851:exon_75110587_75110621:RPS3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 75511572 T/C 1 11 12 23 5.69899650568945 5.78291290288423 -0.0839163971947787 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 77378435 C/T 1 6 11 17 3.10854354855788 5.30100349431055 -2.19245994575266 T:C C T 10 0.481909408573686 0.337726755422537 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 77412851 A/G 1 14 22 36 7.2532682799684 10.6020069886211 -3.3487387086527 A:G A G 10 0.481909408573686 0.317743449121409 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77411766_77414578:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77411766_77413540:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000528095:exon_77412164_77413540:RSF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 77553638 T/C 1 26 13 39 13.4703553770842 6.26482231145792 7.20553306562624 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0243165617434897 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 77583376 G/A 1 36 37 73 18.6512612913473 17.8306481172264 0.820613174120922 A:G G A 10 0.481909408573686 0.906938163214761 ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77583221_77583407:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77583221_77583397:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77583221_77583398:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77583221_77583400:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77583221_77583398:C11orf67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 82973004 C/T 1 16 17 33 8.28944946282102 8.19245994575266 0.0969895170683603 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 85989516 T/C 1 34 56 90 17.6150801084947 26.9869268801264 -9.37184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0570945024255888 ENSG00000074266:ENST00000263360:exon_85989441_85989778:EED;ENSG00000074266:ENST00000528180:exon_85989441_85989749:EED;ENSG00000074266:ENST00000351625:exon_85989441_85989778:EED;ENSG00000074266:ENST00000327320:exon_85988960_85989777:EED;ENSG00000074266:ENST00000534564:exon_85989441_85989596:EED;ENSG00000074266:ENST00000524673:exon_85989441_85989620:EED;ENSG00000074266:ENST00000527888:exon_85989441_85989781:EED;ENSG00000074266:ENST00000528250:exon_85989441_85989781:EED HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 93469908 A/C 1 54 63 117 27.976891937021 30.3602927401422 -2.38340080312127 A:C A C 10 0.481909408573686 0.711605963121665 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000526015:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000393259:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000529794:exon_93469307_93469972:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527068:exon_93469860_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000448108:exon_93469860_93469917:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000528734:exon_93469860_93470133:TAF1D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 93470336 A/G 1 45 77 122 23.3140766141841 37.1070244601738 -13.7929478459897 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0141635367222187 ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000526015:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000393259:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527169:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000527068:exon_93469860_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000448108:exon_93470230_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000534770:exon_93470255_93470405:TAF1D;ENSG00000166012:ENST00000532235:exon_93470322_93470405:TAF1D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 102207851 G/A 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 102239272 G/A 1 12 3 15 6.21708709711577 1.44572822572106 4.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0178610337248131 ENSG00000110330:ENST00000530675:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000533742:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000227758:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000532672:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000527910:exon_102239037_102239279:BIRC2;ENSG00000110330:ENST00000534130:exon_102239037_102239279:BIRC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 107299631 G/A 1 5 9 14 2.59045295713157 4.33718467716317 -1.7467317200316 A:G G A 10 0.481909408573686 0.428255926399451 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 107673710 G/A 1 3 12 15 1.55427177427894 5.78291290288423 -4.22864112860529 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0369058189380347 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 117222592 G/A 1 45 41 86 23.3140766141841 19.7582857515211 3.555790862663 A:G G A 10 0.481909408573686 0.452181464399633 ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118415625 A/G 1 10 8 18 5.18090591426314 3.85527526858949 1.32563064567365 A:G A G 10 0.481909408573686 0.639350488109998 ENSG00000118096:ENST00000264021:exon_118415243_118415726:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000264020:exon_118415258_118415726:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000530872:exon_118415307_118415726:IFT46;ENSG00000118096:ENST00000531201:exon_118415616_118415726:IFT46 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118828942 A/G 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118886117 C/T 1 84 84 168 43.5196096798104 40.4803903201896 3.03921935962074 T:C C T 10 0.481909408573686 0.644117589483595 ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118886656 G/A 1 17 12 29 8.80754005424734 5.78291290288423 3.0246271513631 A:G G A 10 0.481909408573686 0.271675678059475 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118894000 A/G 1 10 7 17 5.18090591426314 3.3733658600158 1.80754005424734 A:G A G 10 0.481909408573686 0.469361015930106 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118895686 C/T 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C C T 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118917419 G/C 1 11 15 26 5.69899650568945 7.22864112860529 -1.52964462291584 C:G G C 10 0.481909408573686 0.563932005021752 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118917274_118917514:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118917274_118917514:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118917274_118917514:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118917274_118917514:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118917274_118917514:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118917274_118917514:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118917274_118917514:HYOU1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118919890 C/T 1 12 17 29 6.21708709711577 8.19245994575266 -1.9753728486369 T:C C T 10 0.481909408573686 0.578066628711756 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919730_118919915:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919730_118920082:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118919752_118919915:HYOU1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 118967758 T/C 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C T C 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118967213_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118967217_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000392834:exon_118967220_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000461999:exon_118967221_118969197:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118967221_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118967259_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000442480:exon_118967668_118967773:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000432443:exon_118967708_118968007:DPAGT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 119545339 T/C 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 T:C T C 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000110400:ENST00000524429:exon_119545233_119545357:PVRL1;ENSG00000110400:ENST00000340882:exon_119545302_119545357:PVRL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 121492891 G/A 1 62 37 99 32.1216166684315 17.8306481172264 14.2909685512051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00466212246167632 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121492871_121492977:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121492871_121492977:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121492871_121492977:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121492871_121492977:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121492871_121492977:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000524633:exon_121492871_121492978:SORL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 121495870 A/G 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121495794_121495986:SORL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 55 61 116 28.4949825284473 29.3964739229948 -0.901491394547577 T:G T G 10 0.481909408573686 0.926046417971316 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 124564210 G/A 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 A:G G A 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000110013:ENST00000525730:exon_124564179_124564417:SIAE;ENSG00000064199:ENST00000227135:exon_124564199_124564557:SPA17;ENSG00000064199:ENST00000532692:exon_124564199_124567414:SPA17;ENSG00000064199:ENST00000524614:exon_124564199_124564338:SPA17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 124875065 A/G 1 17 28 45 8.80754005424734 13.4934634400632 -4.68592338581587 A:G A G 10 0.481909408573686 0.180796714956258 ENSG00000149548:ENST00000529051:exon_124875005_124875108:CCDC15;ENSG00000149548:ENST00000344762:exon_124875005_124875108:CCDC15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 11 19 30 5.69899650568945 9.15627876290004 -3.45728225721058 T:C C T 10 0.481909408573686 0.272877909160472 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 547683 T/C 1 7 9 16 3.6266341399842 4.33718467716317 -0.710550537178976 T:C T C 10 0.481909408573686 0.805666606761275 ENSG00000120647:ENST00000412006:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000422000:exon_547501_547720:CCDC77;ENSG00000120647:ENST00000239830:exon_547501_547720:CCDC77 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 939302 A/G 1 43 14 57 22.2778954313315 6.7467317200316 15.5311637112999 A:G A G 10 0.481909408573686 4.66020040919267e-05 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_939169_939326:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000252477:exon_939169_939326:WNK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 988894 G/A 1 80 102 182 41.4472473141051 49.154759674516 -7.70751236041085 A:G G A 10 0.481909408573686 0.266310377160320 ENSG00000060237:ENST00000315939:exon_988739_989197:WNK1;ENSG00000060237:ENST00000340908:exon_988739_989197:WNK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 6639115 T/G 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 T:G T G 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 6639961 A/G 1 13 6 19 6.73517768854208 2.89145645144212 3.84372123709996 A:G A G 10 0.481909408573686 0.106494475373696 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6639857_6639983:NCAPD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 6709059 G/A 1 32 29 61 16.578898925642 13.9753728486369 2.60352607700515 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.524086644623582 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6708939_6709178:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6708939_6709178:CHD4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 6760367 C/T 1 5 11 16 2.59045295713157 5.30100349431055 -2.71055053717898 T:C C T 10 0.481909408573686 0.214902883771744 ENSG00000111653:ENST00000341550:exon_6759446_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000444704:exon_6759705_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000396807:exon_6759757_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000437127:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000435449:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000446105:exon_6759792_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000486287:exon_6759957_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000484795:exon_6759990_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000482489:exon_6760131_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000469749:exon_6760178_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472002:exon_6760180_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000488381:exon_6760262_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000495771:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000493144:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472810:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000466221:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000423703:exon_6760361_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000412586:exon_6760361_6760400:ING4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 6887020 T/C 1 250 161 411 129.522647856578 77.5874147803634 51.935233076215 T:C T C 10 0.481909408573686 3.23679179004348e-07 ENSG00000089692:ENST00000203629:exon_6886957_6887087:LAG3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 7053742 A/G 1 262 217 479 135.739734953694 104.57434166049 31.1653932932044 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00455946038269968 ENSG00000111678:ENST00000229281:exon_7053639_7053815:C12orf57 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 10 2 12 5.18090591426314 0.963818817147372 4.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0186970763393203 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 11338613 C/G 0 13 0 13 6.73517768854208 0 6.73517768854208 C C 10 0.481909408573686 7.56049567861026e-05 ENSG00000186136:ENST00000334266:exon_11338599_11339543:TAS2R42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 11338614 A/G 0 13 0 13 6.73517768854208 0 6.73517768854208 A A 10 0.481909408573686 7.56049567861026e-05 ENSG00000186136:ENST00000334266:exon_11338599_11339543:TAS2R42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 11338669 C/T 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000186136:ENST00000334266:exon_11338599_11339543:TAS2R42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 11338750 T/C 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 T:C T C 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000186136:ENST00000334266:exon_11338599_11339543:TAS2R42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 11338781 C/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000186136:ENST00000334266:exon_11338599_11339543:TAS2R42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 21795046 C/T 1 19 10 29 9.84372123709996 4.81909408573686 5.0246271513631 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0654953446639798 ENSG00000111716:ENST00000350669:exon_21794886_21795059:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396076:exon_21794886_21795059:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000470985:exon_21794886_21795059:LDHB;ENSG00000111716:ENST00000396075:exon_21794886_21795059:LDHB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 25242595 C/G 1 26 11 37 13.4703553770842 5.30100349431055 8.16935188277362 C:G C G 10 0.481909408573686 0.008039565704117 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242548_25242611:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242548_25242611:LRMP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 13 25 38 6.73517768854208 12.0477352143422 -5.31255752580007 C:G G C 10 0.481909408573686 0.10394430575667 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 26383834 G/A 1 7 9 16 3.6266341399842 4.33718467716317 -0.710550537178976 A:G G A 10 0.481909408573686 0.805666606761275 ENSG00000123096:ENST00000422622:exon_26383644_26387706:SSPN;ENSG00000123096:ENST00000441067:exon_26383644_26387706:SSPN;ENSG00000123096:ENST00000242729:exon_26383644_26385867:SSPN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 26383959 G/A 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000123096:ENST00000422622:exon_26383644_26387706:SSPN;ENSG00000123096:ENST00000441067:exon_26383644_26387706:SSPN;ENSG00000123096:ENST00000242729:exon_26383644_26385867:SSPN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 A:G G A 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 98 69 167 50.7728779597788 33.2517491915843 17.5211287681944 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00827486917039156 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 32854366 A/C 1 16 2 18 8.28944946282102 0.963818817147372 7.32563064567365 A:C A C 10 0.481909408573686 0.000515817670131918 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32854349_32854496:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32854349_32854496:DNM1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 32860302 G/A 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32860301_32860347:DNM1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 37 13 50 19.1693518827736 6.26482231145792 12.9045295713157 C:G G C 10 0.481909408573686 0.000307579863500646 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 37 12 49 19.1693518827736 5.78291290288423 13.3864389798894 A:T A T 10 0.481909408573686 0.000143890916542176 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 32897928 G/T 1 23 25 48 11.9160836028052 12.0477352143422 -0.131651611536929 T:G G T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000380998:exon_32897651_32898030:DNM1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 40716015 C/T 1 25 30 55 12.9522647856578 14.4572822572106 -1.50501747155273 T:C C T 10 0.481909408573686 0.787569988122739 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 40757330 A/G 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 A:G A G 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40757204_40757356:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40757204_40757356:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40757204_40757356:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40757204_40757356:LRRK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 40758652 T/C 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000188906:ENST00000298910:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000430804:exon_40758644_40758852:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000479187:exon_40758644_40763087:LRRK2;ENSG00000188906:ENST00000446130:exon_40758644_40758935:LRRK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 62 59 121 32.1216166684315 28.4326551058475 3.68896156258399 A:G A G 10 0.481909408573686 0.525035402002637 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 42717811 A/T 1 10 4 14 5.18090591426314 1.92763763429474 3.2532682799684 A:T A T 10 0.481909408573686 0.108335810082199 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 49089903 C/A 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000129315:ENST00000261900:exon_49089782_49089945:CCNT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 49446040 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000167548:ENST00000301067:exon_49444669_49446207:MLL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 49919749 G/C 1 14 17 31 7.2532682799684 8.19245994575266 -0.939191665784268 C:G G C 10 0.481909408573686 0.857808075399381 ENSG00000123352:ENST00000321898:exon_49919727_49921207:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000447889:exon_49919727_49921207:SPATS2;ENSG00000123352:ENST00000395063:exon_49919727_49921207:SPATS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 50524472 C/T 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000139624:ENST00000317551:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000422340:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000438450:exon_50523608_50524477:LASS5;ENSG00000139624:ENST00000380189:exon_50523608_50524477:LASS5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 50571275 T/C 1 13 6 19 6.73517768854208 2.89145645144212 3.84372123709996 T:C T C 10 0.481909408573686 0.106494475373696 ENSG00000050405:ENST00000394943:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000341247:exon_50569565_50571852:LIMA1;ENSG00000050405:ENST00000420992:exon_50569573_50571852:LIMA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 51488953 T/C 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000135457:ENST00000257915:exon_51488624_51489061:TFCP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 52908872 C/T 0 13 0 13 6.73517768854208 0 6.73517768854208 C C 10 0.481909408573686 7.56049567861026e-05 ENSG00000186081:ENST00000456000:exon_52908363_52909024:KRT5;ENSG00000186081:ENST00000252242:exon_52908363_52909024:KRT5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 52914006 C/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C C T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000186081:ENST00000456000:exon_52913909_52914080:KRT5;ENSG00000186081:ENST00000252242:exon_52913526_52914243:KRT5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 53647663 A/G 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 53700860 A/G 1 250 242 492 129.522647856578 116.622076874832 12.9005709817465 A:T:G A G 10 0.481909408573686 0.259386706688243 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53700750_53700965:C12orf10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 53701357 A/G 1 81 72 153 41.9653379055314 34.6974774173054 7.26786048822604 A:G A G 10 0.481909408573686 0.257626028947699 ENSG00000094914:ENST00000394384:exon_53701241_53701497:AAAS;ENSG00000094914:ENST00000209873:exon_53701241_53701497:AAAS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 53853100 C/T 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000197111:ENST00000437231:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000455667:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000447282:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000359282:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000439930:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000359462:exon_53853056_53853187:PCBP2;ENSG00000197111:ENST00000379777:exon_53853056_53853187:PCBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 54577718 G/A 1 12 2 14 6.21708709711577 0.963818817147372 5.2532682799684 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00582458966588113 ENSG00000123415:ENST00000508340:exon_54577532_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000506595:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000514685:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505128:exon_54575241_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000337581:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000508394:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000513838:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000243112:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000505662:exon_54577549_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000401977:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000514196:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000504338:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000509078:exon_54577549_54578080:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000507904:exon_54577440_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000503447:exon_54577201_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000504797:exon_54577438_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000506169:exon_54577454_54577743:SMUG1;ENSG00000123415:ENST00000503306:exon_54577479_54577743:SMUG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 54741814 G/C 1 63 63 126 32.6397072598578 30.3602927401422 2.27941451971556 A:C:G G C 10 0.481909408573686 0.721734304722362 ENSG00000111481:ENST00000262061:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000416254:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000455864:exon_54741784_54741835:COPZ1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 54913136 T/G 1 10 7 17 5.18090591426314 3.3733658600158 1.80754005424734 T:G T G 10 0.481909408573686 0.469361015930106 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 55355015 G/A 1 12 6 18 6.21708709711577 2.89145645144212 3.32563064567365 A:G G A 10 0.481909408573686 0.156469603613933 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55354989_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 56120523 G/A 1 158 186 344 81.8583134453576 89.6351499947056 -7.77683654934799 A:G G A 10 0.481909408573686 0.418547753203216 ENSG00000135404:ENST00000257857:exon_56120484_56120579:CD63;ENSG00000135404:ENST00000420846:exon_56120484_56120579:CD63 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 56215793 G/T 1 10 11 21 5.18090591426314 5.30100349431055 -0.120097580047406 T:G G T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000135392:ENST00000317269:exon_56214744_56215971:DNAJC14;ENSG00000135392:ENST00000317287:exon_56215781_56215891:DNAJC14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 56348028 G/A 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000185664:ENST00000449260:exon_56347890_56348133:SILV;ENSG00000185664:ENST00000360714:exon_56347890_56348133:SILV HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 56510637 A/G 1 46 34 80 23.8321672056104 16.3849198915053 7.44724731410512 A:G A G 10 0.481909408573686 0.116749803989141 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 56743367 T/C 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 T:C T C 10 0.481909408573686 0.551773499311371 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 56992630 C/G 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 C:G C G 10 0.481909408573686 0.328578053219983 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 57108203 A/G 1 41 39 80 21.2417142484789 18.7944669343738 2.44724731410512 A:G A G 10 0.481909408573686 0.654792990672297 ENSG00000196531:ENST00000450688:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000435567:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000393891:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000454682:exon_57108146_57108223:NACA;ENSG00000196531:ENST00000356769:exon_57108146_57108223:NACA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 57884337 C/T 1 12 12 24 6.21708709711577 5.78291290288423 0.434174194231534 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57884321_57884427:MARS;ENSG00000166986:ENST00000315473:exon_57884321_57884357:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57884321_57884427:MARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 13 15 28 6.73517768854208 7.22864112860529 -0.493463440063209 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 58162739 A/G 1 37 25 62 19.1693518827736 12.0477352143422 7.12161666843147 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0757221739487208 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58162254_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58162365_58162934:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58162368_58162934:METTL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 48 21 69 24.8683483884631 10.1200975800474 14.7482508084157 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000410101711471499 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 69136252 T/C 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000111581:ENST00000229179:exon_69136135_69136472:NUP107;ENSG00000111581:ENST00000378905:exon_69136135_69136472:NUP107 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 69233215 A/G 1 11 7 18 5.69899650568945 3.3733658600158 2.32563064567365 A:G A G 10 0.481909408573686 0.347236209840515 ENSG00000135679:ENST00000462284:exon_69233054_69239214:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000350057:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393412:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393413:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000358483:exon_69233054_69233869:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000258148:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000311420:exon_69233054_69233647:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393417:exon_69233054_69233636:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000393410:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000496959:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000299252:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000481186:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000360430:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000348801:exon_69233054_69233629:MDM2;ENSG00000135679:ENST00000478070:exon_69233054_69233629:MDM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 69652789 A/G 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000111605:ENST00000435070:exon_69652370_69652874:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000266679:exon_69652370_69652874:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000351671:exon_69652466_69652874:CPSF6;ENSG00000111605:ENST00000456847:exon_69652600_69652874:CPSF6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 75897714 C/A 1 117 93 210 60.6165991968787 44.8175749973528 15.7990241995259 A:T:C C A 10 0.481909408573686 0.0321320946125316 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75897684_75897854:KRR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 75900168 G/A 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75900096_75900179:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75900096_75900179:KRR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 76453966 G/A 1 584 515 1099 302.564905392967 248.183345415448 54.3815599775191 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.00110563551099861 ENSG00000187109:ENST00000393263:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000261182:exon_76453918_76454059:NAP1L1;ENSG00000187109:ENST00000431879:exon_76453918_76454059:NAP1L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 79986405 C/A 1 40 35 75 20.7236236570526 16.866829300079 3.85679435697355 A:C C A 10 0.481909408573686 0.419009775498072 ENSG00000177425:ENST00000328827:exon_79985747_79986473:PAWR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 82792787 C/A 1 7 24 31 3.6266341399842 11.5658258057685 -7.93919166578427 A:C:G C A 10 0.481909408573686 0.00604522020572134 ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82792574_82793173:C12orf26 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 88589256 G/A 1 10 24 34 5.18090591426314 11.5658258057685 -6.38491989150533 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0379965639697704 ENSG00000139324:ENST00000266712:exon_88588615_88593655:TMTC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 90028901 T/C 1 15 27 42 7.77135887139471 13.0115540314895 -5.24019516009481 T:C T C 10 0.481909408573686 0.122798697969688 ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 92538232 G/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 93155535 G/A 1 8 16 24 4.14472473141051 7.71055053717898 -3.56582580576846 A:G G A 10 0.481909408573686 0.158004287758086 ENSG00000187510:ENST00000344636:exon_93155528_93155607:PLEKHG7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 93181731 T/C 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 T:C T C 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93181643_93181825:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93181643_93181825:EEA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 40 24 64 20.7236236570526 11.5658258057685 9.15779785128409 T:G T G 10 0.481909408573686 0.0241562774227441 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 93881320 T/A 1 18 18 36 9.32563064567365 8.67436935432635 0.651261291347303 A:T T A 10 0.481909408573686 0.86863117704817 ENSG00000198015:ENST00000393128:exon_93881273_93881436:MRPL42;ENSG00000198015:ENST00000358678:exon_93881273_93881436:MRPL42;ENSG00000198015:ENST00000393126:exon_93881273_93881436:MRPL42;ENSG00000198015:ENST00000361630:exon_93881273_93881436:MRPL42 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 95694095 G/A 1 17 17 34 8.80754005424734 8.19245994575266 0.615080108494674 A:G G A 10 0.481909408573686 0.865118255265439 ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95693941_95696566:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95693941_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95692870_95694944:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95693941_95694944:VEZT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 95907611 G/A 1 7 8 15 3.6266341399842 3.85527526858949 -0.228641128605291 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95907428_95909615:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95907428_95909615:METAP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 95907635 G/A 1 16 11 27 8.28944946282102 5.30100349431055 2.98844596851048 A:G G A 10 0.481909408573686 0.335782141208118 ENSG00000111142:ENST00000261220:exon_95907428_95909615:METAP2;ENSG00000111142:ENST00000323666:exon_95907428_95909615:METAP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 96252833 A/G 1 54 44 98 27.976891937021 21.2040139772422 6.77287795977877 A:G A G 10 0.481909408573686 0.188989007864299 ENSG00000139343:ENST00000266735:exon_96252709_96252854:SNRPF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 97303522 A/G 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.494047032028967 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 98992435 T/C 1 18 14 32 9.32563064567365 6.7467317200316 2.57889892564205 T:C T C 10 0.481909408573686 0.381657390985064 ENSG00000075415:ENST00000401722:exon_98992300_98992481:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000228318:exon_98992300_98992481:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000188376:exon_98992300_98992481:SLC25A3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 100441366 A/C 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 A:C A C 10 0.481909408573686 0.111676109980467 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100441308_100441416:UHRF1BP1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 100444901 T/C 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 T:C T C 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100444857_100444999:UHRF1BP1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 100451442 T/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:T T A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100451349_100451524:UHRF1BP1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 104341398 T/A 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:T T A 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 104373600 G/A 1 22 16 38 11.3979930113789 7.71055053717898 3.68744247419993 A:G G A 10 0.481909408573686 0.257833845134406 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 105385557 G/T 1 70 57 127 36.266341399842 27.4688362887001 8.79750511114187 T:G G T 10 0.481909408573686 0.131086853941970 ENSG00000151131:ENST00000280749:exon_105385490_105385626:C12orf45 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 105558017 G/A 1 50 57 107 25.9045295713157 27.4688362887001 -1.5643067173844 A:G G A 10 0.481909408573686 0.772661446674393 ENSG00000136051:ENST00000332180:exon_105557889_105558085:KIAA1033 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 108926071 G/A 1 22 30 52 11.3979930113789 14.4572822572106 -3.05928924583167 A:G G A 10 0.481909408573686 0.40902667551695 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108925998_108926110:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108925998_108926110:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108925998_108926110:SART3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 119 111 230 61.6527803797314 53.4919443516792 8.16083602805221 A:T A T 10 0.481909408573686 0.291536037877366 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 110474070 T/C 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 T:C T C 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110474066_110474133:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110474066_110474133:ANKRD13A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 110922929 G/T 1 10 9 19 5.18090591426314 4.33718467716317 0.843721237099966 T:G G T 10 0.481909408573686 0.819567710927507 ENSG00000204856:ENST00000377673:exon_110922883_110923004:C12orf24 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 112087805 C/T 1 9 19 28 4.66281532283683 9.15627876290004 -4.49346344006321 T:C C T 10 0.481909408573686 0.128850615889316 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112087743_112087846:BRAP;ENSG00000089234:ENST00000419234:exon_112087743_112087846:BRAP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 112103589 G/A 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 A:G G A 10 0.481909408573686 0.39148304783409 ENSG00000089234:ENST00000327551:exon_112103443_112103591:BRAP;ENSG00000089234:ENST00000419234:exon_112103443_112103591:BRAP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 112194237 G/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G G A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112194137_112194898:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112194137_112194901:ACAD10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 112194244 G/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G G A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000111271:ENST00000455480:exon_112194137_112194898:ACAD10;ENSG00000111271:ENST00000313698:exon_112194137_112194901:ACAD10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 C:G C G 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 114395651 T/C 1 14 16 30 7.2532682799684 7.71055053717898 -0.457282257210581 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 117014099 A/G 0 17 0 17 8.80754005424734 0 8.80754005424734 A A 10 0.481909408573686 4.07766826160364e-06 ENSG00000171471:ENST00000306985:exon_117013647_117014425:MAP1LC3B2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 117290433 G/A 1 17 4 21 8.80754005424734 1.92763763429474 6.87990241995259 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0034603333984545 ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117290143_117291434:RNFT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 118465820 T/C 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000111445:ENST00000229043:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000454402:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000392542:exon_118465758_118465835:RFC5;ENSG00000111445:ENST00000449641:exon_118465758_118465835:RFC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 121747517 C/T 1 123 147 270 63.7251427454366 70.8406830603318 -7.11554031489522 T:C C T 10 0.481909408573686 0.394492355034756 ENSG00000089053:ENST00000261819:exon_121747504_121747666:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000441917:exon_121747504_121747666:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000344395:exon_121747504_121747666:ANAPC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 121840634 T/C 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.111676109980467 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 122218783 T/G 1 22 31 53 11.3979930113789 14.9391916657843 -3.54119865440536 T:G T G 10 0.481909408573686 0.340074899634602 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122213515_122219974:TMEM120B;ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122218778_122218912:RHOF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 123109145 T/A 1 13 9 22 6.73517768854208 4.33718467716317 2.39799301137891 A:T T A 10 0.481909408573686 0.394377988213738 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123109145_123109235:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123109145_123109235:KNTC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 124102871 T/C 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.536476994604088 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 124103287 G/T 1 21 18 39 10.8799024199526 8.67436935432635 2.20553306562624 T:G G T 10 0.481909408573686 0.523754815909214 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103216_124103384:DDX55 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 124885060 C/G 1 8 12 20 4.14472473141051 5.78291290288423 -1.63818817147372 C:G C G 10 0.481909408573686 0.509077891598092 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124885047_124885221:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000458234:exon_124885047_124885219:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000460244:exon_124885047_124885100:NCOR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 125398039 G/C 1 43 51 94 22.2778954313315 24.577379837258 -2.29948440592648 C:G G C 10 0.481909408573686 0.680253082547576 ENSG00000150991:ENST00000339647:exon_125396194_125398320:UBC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 125438616 A/C 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:C A C 10 0.481909408573686 0.494047032028967 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 125441347 T/C 1 8 14 22 4.14472473141051 6.7467317200316 -2.60200698862109 T:C T C 10 0.481909408573686 0.293237542673417 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125441237_125441425:DHX37 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 129278745 G/A 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 A:G G A 10 0.481909408573686 0.597188270417829 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278574_129278759:SLC15A4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 129285445 C/T 1 2 11 13 1.03618118285263 5.30100349431055 -4.26482231145792 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0235613876162475 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129285399_129285554:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129285399_129285554:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129285399_129285554:SLC15A4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 131293247 T/C 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000111450:ENST00000261653:exon_131293176_131293249:STX2;ENSG00000111450:ENST00000344271:exon_131293176_131293249:STX2;ENSG00000111450:ENST00000392373:exon_131293176_131293249:STX2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 132396603 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000177169:ENST00000321867:exon_132396487_132396634:ULK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 132636075 C/G 1 13 36 49 6.73517768854208 17.3487387086527 -10.6135610201106 C:G C G 10 0.481909408573686 0.00244762531880453 ENSG00000184967:ENST00000330579:exon_132636029_132636189:NOC4L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133324834 C/A 1 3 8 11 1.55427177427894 3.85527526858949 -2.30100349431055 A:T:C C A 10 0.481909408573686 0.229933048608863 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133324724_133324917:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133324724_133324917:ANKLE2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133331233 G/A 1 12 9 21 6.21708709711577 4.33718467716317 1.87990241995259 A:G G A 10 0.481909408573686 0.513901958034641 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133331459 G/C 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 C:G G C 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000176915:ENST00000357997:exon_133331261_133331719:ANKLE2;ENSG00000176915:ENST00000337516:exon_133331261_133331719:ANKLE2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133349756 C/T 0 0 8 8 0 3.85527526858949 -3.85527526858949 T C T 10 0.481909408573686 0.00809979847322851 ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133345495_133349880:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133345495_133349880:GOLGA3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133390008 G/A 1 9 12 21 4.66281532283683 5.78291290288423 -1.12009758004741 A:G G A 10 0.481909408573686 0.66800138690819 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133423662 C/T 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 T:C C T 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 21751005 G/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 C:G G C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 14 9 23 7.2532682799684 4.33718467716317 2.91608360280522 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0.296978724771862 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 25466936 G/A 1 22 17 39 11.3979930113789 8.19245994575266 3.20553306562624 A:G G A 10 0.481909408573686 0.338414174443394 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 25480616 T/A 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 A:T T A 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 28004018 A/C 1 8 23 31 4.14472473141051 11.0839163971948 -6.93919166578427 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0179867272981150 ENSG00000122034:ENST00000381140:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000435781:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000419181:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000438571:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000466776:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000470606:exon_28004007_28004103:GTF3A;ENSG00000122034:ENST00000493903:exon_28004007_28004103:GTF3A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 28009851 G/A 1 68 78 146 35.2301602169893 37.5889338687475 -2.35877365175816 A:G G A 10 0.481909408573686 0.740662516461024 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 31036837 G/A 1 64 100 164 33.1577978512841 48.1909408573686 -15.0331430060845 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0190949806327204 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000432889:exon_31036709_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000426225:exon_31036709_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 32972673 C/T 1 10 6 16 5.18090591426314 2.89145645144212 2.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.319522314154991 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 37580167 G/A 1 9 21 30 4.66281532283683 10.1200975800474 -5.45728225721058 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0659235331877449 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 39430314 C/T 1 1 10 11 0.518090591426314 4.81909408573686 -4.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0122834534953750 ENSG00000150893:ENST00000454450:exon_39430263_39430393:FREM2;ENSG00000150893:ENST00000280481:exon_39430263_39430393:FREM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 11 6 17 5.69899650568945 2.89145645144212 2.80754005424734 C:G G C 10 0.481909408573686 0.225825362231512 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 39586850 A/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:T A T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586828_39586915:C13orf23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 39586977 G/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 37 66 103 19.1693518827736 31.8060209658633 -12.6366690830897 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0135311682233944 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 41533052 T/C 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41532972_41533152:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41532972_41533152:ELF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 41941601 A/G 1 12 17 29 6.21708709711577 8.19245994575266 -1.9753728486369 A:G A G 10 0.481909408573686 0.578066628711756 ENSG00000172766:ENST00000379406:exon_41941575_41941788:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000464857:exon_41941575_41941788:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000497727:exon_41941575_41941788:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000463114:exon_41941575_41941788:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000497143:exon_41941575_41941788:NAA16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 48655791 G/A 1 14 12 26 7.2532682799684 5.78291290288423 1.47035537708416 A:G G A 10 0.481909408573686 0.695532599726404 ENSG00000136146:ENST00000258648:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378594:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000378586:exon_48655781_48655867:MED4;ENSG00000136146:ENST00000417167:exon_48655781_48655867:MED4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 52603241 A/G 1 13 8 21 6.73517768854208 3.85527526858949 2.87990241995259 A:G A G 10 0.481909408573686 0.275191326302008 ENSG00000254359:ENST00000519812:exon_52602455_52603800:AL139082.3;ENSG00000253710:ENST00000523764:exon_52602455_52603793:ALG11;ENSG00000253710:ENST00000521508:exon_52602455_52603800:ALG11;ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 52603954 A/G 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 A:G A G 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 52604082 A/G 1 16 6 22 8.28944946282102 2.89145645144212 5.39799301137891 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0306569697485289 ENSG00000214320:ENST00000378124:exon_52602455_52607701:AL139082.1;ENSG00000214320:ENST00000378121:exon_52602799_52606356:AL139082.1;ENSG00000253797:ENST00000521776:exon_52602455_52607701:UTP14C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 73350079 T/C 1 6 13 19 3.10854354855788 6.26482231145792 -3.15627876290004 T:C T C 10 0.481909408573686 0.172343358369994 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73350063_73350230:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73350063_73350230:DIS3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 77632470 C/T 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77632353_77632541:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77632353_77632541:MYCBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 77817291 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77817194_77817295:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77817194_77817295:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000360084:exon_77817194_77817295:MYCBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 96638651 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000465196:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376714:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000461329:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000467305:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000397618:exon_96638587_96638686:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376712:exon_96638587_96638686:UGGT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 99100547 T/C 1 3 17 20 1.55427177427894 8.19245994575266 -6.63818817147372 A:T:C T C 10 0.481909408573686 0.00289527650715233 ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 103328660 A/G 1 14 24 38 7.2532682799684 11.5658258057685 -4.31255752580007 A:G A G 10 0.481909408573686 0.194320572708353 ENSG00000134900:ENST00000376065:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000376052:exon_103328646_103328765:TPP2;ENSG00000134900:ENST00000466153:exon_103328646_103328765:TPP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 11 9 20 5.69899650568945 4.33718467716317 1.36181182852628 A:G A G 10 0.481909408573686 0.656131834829189 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 111353876 C/T 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111353785_111353902:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000465145:exon_111353785_111353902:CARS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 13 114152755 C/T 1 25 8 33 12.9522647856578 3.85527526858949 9.09698951706836 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00151781392043140 ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000375391:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114152657_114152836:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000473287:exon_114152657_114152960:TMCO3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 20784431 G/A 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G G A 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000100814:ENST00000398160:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000437553:exon_20784386_20784731:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000358932:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000353689:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398169:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1;ENSG00000100814:ENST00000398163:exon_20784386_20784719:CCNB1IP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 5 14 19 2.59045295713157 6.7467317200316 -4.15627876290004 T:G T G 10 0.481909408573686 0.066824099895121 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 21162053 T/G 1 9 13 22 4.66281532283683 6.26482231145792 -1.60200698862109 T:G T G 10 0.481909408573686 0.529487543087445 ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 21464100 T/C 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21464060_21464110:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21464060_21464110:METT11D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 21829404 T/C 1 42 44 86 21.7598048399052 21.2040139772422 0.555790862663002 T:C T C 10 0.481909408573686 0.914513225463172 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 21831052 T/C 1 26 27 53 13.4703553770842 13.0115540314895 0.45880134559464 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 21968619 A/G 1 5 16 21 2.59045295713157 7.71055053717898 -5.12009758004741 A:G A G 10 0.481909408573686 0.028645332479146 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 22974068 T/C 1 16 8 24 8.28944946282102 3.85527526858949 4.43417419423154 T:C T C 10 0.481909408573686 0.100356840028341 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23020919 C/T 1 59 35 94 30.5673448941525 16.866829300079 13.7005155940735 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.00515371159855493 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23020970 G/T 1 129 93 222 66.8336862939945 44.8175749973528 22.0161112966417 T:G G T 10 0.481909408573686 0.00378033738997783 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23044002 G/T 1 208 42 250 107.762843016673 20.2401951600948 87.5226478565785 T:G G T 10 0.481909408573686 1.79853918767332e-30 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23044004 C/T 1 188 42 230 97.401031188147 20.2401951600948 77.1608360280522 T:C C T 10 0.481909408573686 1.23543309125237e-25 ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23239816 A/G 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 A:G A G 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23239670_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23239670_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23239402_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23239670_23239834:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23239402_23239834:OXA1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23242828 T/C 1 3 11 14 1.55427177427894 5.30100349431055 -3.7467317200316 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0596153979871713 ENSG00000155465:ENST00000397532:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000492884:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000404278:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000526098:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000514772:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000522412:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397522:exon_23242434_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000285850:exon_23242447_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397529:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000527112:exon_23242462_23242925:SLC7A7;ENSG00000155465:ENST00000397528:exon_23242499_23242925:SLC7A7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23299135 G/T 1 65 56 121 33.6758884427104 26.9869268801264 6.68896156258399 T:G G T 10 0.481909408573686 0.237547028547275 ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23528730 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 23566913 C/G 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000179933:ENST00000319074:exon_23566867_23569671:C14orf119 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24424367 G/A 0 13 0 13 6.73517768854208 0 6.73517768854208 G G 10 0.481909408573686 7.56049567861026e-05 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24424244_24424421:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24424244_24424421:DHRS4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24572780 C/G 1 6 9 15 3.10854354855788 4.33718467716317 -1.22864112860529 C:G C G 10 0.481909408573686 0.610823751460337 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 17 5 22 8.80754005424734 2.40954704286843 6.39799301137891 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00889232093346558 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24592557 A/G 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 A:G A G 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24592384_24593239:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24592384_24594448:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24592384_24593238:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24592384_24593238:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24592384_24593190:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24592384_24593210:DCAF11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24614618 G/A 1 146 148 294 75.6412263482418 71.3225924689055 4.31863387933632 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.640724677526705 ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24614588_24614674:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24614588_24614674:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24614588_24614674:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000471700:exon_24614588_24614649:PSME2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24658666 G/C 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 C:G G C 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000100926:ENST00000261789:exon_24658349_24659014:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000528669:exon_24658355_24659014:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000529332:exon_24658398_24659014:TM9SF1;ENSG00000100926:ENST00000524835:exon_24658607_24659014:TM9SF1;ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24658363_24659014:RP11-468E2.1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24679877 C/T 1 92 73 165 47.6643344112209 35.1793868258791 12.4849475853418 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0612078772170454 ENSG00000254692:ENST00000530611:exon_24679860_24679974:RP11-468E2.1;ENSG00000254505:ENST00000347519:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000530996:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533523:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000533011:exon_24679860_24679974:CHMP4A;ENSG00000254505:ENST00000524955:exon_24679860_24680067:CHMP4A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24718515 G/A 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000092295:ENST00000206765:exon_24718322_24718747:TGM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24736961 T/C 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24736866_24736982:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24736866_24736982:RABGGTA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 24805408 C/G 1 10 15 25 5.18090591426314 7.22864112860529 -2.04773521434215 C:G C G 10 0.481909408573686 0.431962859336285 ENSG00000129465:ENST00000216274:exon_24805227_24805601:RIPK3;ENSG00000129465:ENST00000382557:exon_24805228_24805601:RIPK3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 31359024 A/T 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 A:T A T 10 0.481909408573686 0.197791501722836 ENSG00000100473:ENST00000216361:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000382493:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000460581:exon_31358822_31359822:COCH;ENSG00000100473:ENST00000396618:exon_31358822_31359824:COCH;ENSG00000100473:ENST00000468826:exon_31358822_31359347:COCH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 35227880 G/T 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 T:G G T 10 0.481909408573686 0.755512817806202 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 35871217 G/A 1 1289 1439 2728 667.818772348519 693.467638937534 -25.6488665890155 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.328574457482641 ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 35871960 G/A 1 10 14 24 5.18090591426314 6.7467317200316 -1.56582580576846 A:G G A 10 0.481909408573686 0.547642984332691 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 39648629 C/T 1 194 172 366 100.509574736705 82.888418274674 17.6211564620309 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.067218998050772 ENSG00000100941:ENST00000216832:exon_39648528_39648666:PNN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 39818028 A/G 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 A:G A G 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000150527:ENST00000341749:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396165:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000396158:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000341502:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000280083:exon_39817947_39818181:CTAGE5;ENSG00000150527:ENST00000348007:exon_39817947_39818181:CTAGE5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 45644589 G/T 1 3 8 11 1.55427177427894 3.85527526858949 -2.30100349431055 T:G G T 10 0.481909408573686 0.229933048608863 ENSG00000187790:ENST00000267430:exon_45644274_45646179:FANCM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 50081221 A/C 1 28 32 60 14.5065365599368 15.421101074358 -0.914564514421162 A:C A C 10 0.481909408573686 0.897390425449839 ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50080974_50081389:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50080974_50081390:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50080974_50081390:PPIL5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 50251369 A/G 1 12 15 27 6.21708709711577 7.22864112860529 -1.01155403148952 A:G A G 10 0.481909408573686 0.847761579496843 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50249997_50251431:SDCCAG1;ENSG00000165525:ENST00000382135:exon_50250532_50251431:SDCCAG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 50295846 C/T 1 428 488 916 221.742773130462 235.171791383959 -13.4290182534964 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.390013162242232 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50295772_50295980:SDCCAG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 50298962 T/A 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 A:T T A 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000165525:ENST00000298310:exon_50298925_50298995:SDCCAG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 51204996 C/T 1 14 5 19 7.2532682799684 2.40954704286843 4.84372123709996 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0364843548286125 ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51204858_51205004:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51204858_51205004:NIN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 52433235 G/A 1 14 18 32 7.2532682799684 8.67436935432635 -1.42110107435795 A:G G A 10 0.481909408573686 0.724283009423749 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 53325090 C/T 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53323986_53325268:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53323993_53325268:FERMT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 57938097 G/A 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000100557:ENST00000216445:exon_57936019_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534126:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000530417:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000534528:exon_57937973_57938308:C14orf105;ENSG00000100557:ENST00000422976:exon_57937973_57938308:C14orf105 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 64491704 C/T 1 43 31 74 22.2778954313315 14.9391916657843 7.33870376554724 T:C C T 10 0.481909408573686 0.103003877369201 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64491630_64491749:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64491630_64491749:SYNE2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 64686125 G/T 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:G G T 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64685926_64686128:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64685926_64686128:SYNE2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 68117623 C/T 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C C T 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000081181:ENST00000261783:exon_68117432_68118437:ARG2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 69520862 G/A 1 58 34 92 30.0492543027262 16.3849198915053 13.6643344112209 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00470495583079621 ENSG00000139990:ENST00000341516:exon_69517638_69522328:DCAF5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 70246018 A/G 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 A:G A G 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000100652:ENST00000216540:exon_70245899_70246077:SLC10A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 70839735 A/C 1 14 12 26 7.2532682799684 5.78291290288423 1.47035537708416 A:C A C 10 0.481909408573686 0.695532599726404 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 71215729 G/A 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.134075613444074 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 71479831 G/T 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 T:G G T 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 ENSG00000100731:ENST00000238570:exon_71479702_71479919:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000304743:exon_71479702_71479919:PCNX;ENSG00000100731:ENST00000439984:exon_71479702_71479919:PCNX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 38 53 91 19.6874424741999 25.5411986544054 -5.85375618020543 T:C T C 10 0.481909408573686 0.248667636123859 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 73007284 C/T 1 11 5 16 5.69899650568945 2.40954704286843 3.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.132948456946107 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 12 8 20 6.21708709711577 3.85527526858949 2.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 0.372034266386779 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 75279461 G/A 1 18 12 30 9.32563064567365 5.78291290288423 3.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.206237508491672 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 76012864 A/G 1 127 58 185 65.7975051111419 27.9507456972738 37.8467594138681 A:G A G 10 0.481909408573686 2.28636333365933e-08 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 76012939 C/G 1 314 175 489 162.680445707863 84.3341465003951 78.3462992074675 A:C:G C G 10 0.481909408573686 1.12481688102687e-12 ENSG00000156127:ENST00000286639:exon_76012805_76013327:BATF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 47 30 77 24.3502577970368 14.4572822572106 9.89297553982618 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0296506252409673 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 104 152 256 53.8814215083367 73.2502301032003 -19.3688085948636 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0173155699810813 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 91633749 G/A 1 13 7 20 6.73517768854208 3.3733658600158 3.36181182852628 A:G G A 10 0.481909408573686 0.178779737512779 ENSG00000133943:ENST00000517877:exon_91633569_91634002:C14orf159 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 92454633 C/T 1 11 23 34 5.69899650568945 11.0839163971948 -5.38491989150532 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0848777855792176 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92454628_92454727:TRIP11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 92480915 G/A 1 64 87 151 33.1577978512841 41.9261185459107 -8.76832069462659 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.166356837020411 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92480559_92480921:TRIP11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 92559678 G/C 1 7 10 17 3.6266341399842 4.81909408573686 -1.19245994575266 C:G G C 10 0.481909408573686 0.632925812771296 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 92625505 C/G 1 5 8 13 2.59045295713157 3.85527526858949 -1.26482231145792 C:G C G 10 0.481909408573686 0.584334529704906 ENSG00000165934:ENST00000298875:exon_92625327_92625626:CPSF2;ENSG00000165934:ENST00000443529:exon_92625327_92625626:CPSF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 93170993 C/T 1 33 89 122 17.0969895170684 42.8899373630581 -25.7929478459897 T:C C T 10 0.481909408573686 2.75302307525077e-06 ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170985_93171052:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170985_93171052:LGMN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 95660242 A/G 1 11 2 13 5.69899650568945 0.963818817147372 4.73517768854208 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0104849883006144 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95660186_95660256:CLMN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 95662845 T/A 1 24 7 31 12.4341741942315 3.3733658600158 9.06080833421573 A:T T A 10 0.481909408573686 0.00106527449583427 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95662835_95663031:CLMN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 100563943 G/A 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000196405:ENST00000402714:exon_100563818_100563995:EVL;ENSG00000196405:ENST00000392920:exon_100563818_100563995:EVL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 102391577 G/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 C:G G C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000078304:ENST00000328724:exon_102391478_102394022:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334743:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000350249:exon_102391478_102394075:PPP2R5C;ENSG00000078304:ENST00000334756:exon_102391478_102394075:PPP2R5C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 102550803 G/A 1 776 616 1392 402.03829894682 296.856195681391 105.182103265429 A:G G A 10 0.481909408573686 1.69306167097104e-08 ENSG00000080824:ENST00000334701:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000216281:exon_102550736_102550901:HSP90AA1;ENSG00000080824:ENST00000441629:exon_102550736_102550901:HSP90AA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 103934484 G/A 1 43 16 59 22.2778954313315 7.71055053717898 14.5673448941525 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000201596013162318 ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103934418_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103934370_103934523:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103934370_103934523:MARK3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 103986255 C/T 1 10 28 38 5.18090591426314 13.4934634400632 -8.31255752580007 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00858315557775371 ENSG00000166165:ENST00000348956:exon_103985996_103986379:CKB;ENSG00000166165:ENST00000428256:exon_103985996_103986379:CKB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 104379041 G/C 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 C:G G C 10 0.481909408573686 0.270950871664830 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 4 10 14 2.07236236570526 4.81909408573686 -2.7467317200316 T:C T C 10 0.481909408573686 0.18355917459004 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 105518456 A/C 1 16 4 20 8.28944946282102 1.92763763429474 6.36181182852628 A:C A C 10 0.481909408573686 0.00584895410457532 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 14 107169948 C/T 1 35 138 173 18.133170699921 66.5034983831687 -48.3703276832477 T:C C T 10 0.481909408573686 3.26718111779251e-14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 21937964 A/G 0 12 0 12 6.21708709711577 0 6.21708709711577 A A 10 0.481909408573686 0.000156886243432913 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 25207273 C/T 0 0 21 21 0 10.1200975800474 -10.1200975800474 T C T 10 0.481909408573686 1.22574340465388e-06 ENSG00000128739:ENST00000400098:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000444203:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400100:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000400097:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000128739:ENST00000390687:exon_25207261_25207356:SNRPN;ENSG00000214265:ENST00000401453:exon_25207261_25207356:SNURF;ENSG00000214265:ENST00000403911:exon_25207261_25207356:SNURF;ENSG00000214265:ENST00000338327:exon_25207261_25207356:SNURF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 28525239 A/C 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:C A C 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000128731:ENST00000261609:exon_28525214_28525433:HERC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 34651983 T/C 1 13 5 18 6.73517768854208 2.40954704286843 4.32563064567365 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0569959852604016 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 34654383 C/T 1 22 25 47 11.3979930113789 12.0477352143422 -0.649742202963242 T:C C T 10 0.481909408573686 0.88481161008923 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 34654438 T/C 1 14 21 35 7.2532682799684 10.1200975800474 -2.86682930007901 T:C T C 10 0.481909408573686 0.398654871598448 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34654397_34654522:LPCAT4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 34654474 A/T 1 11 12 23 5.69899650568945 5.78291290288423 -0.0839163971947787 A:T A T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000176454:ENST00000314891:exon_34654397_34654522:LPCAT4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 35149048 G/A 1 33 41 74 17.0969895170684 19.7582857515211 -2.66129623445277 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.562445573458096 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 40269052 G/A 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.212405499079556 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 40330518 T/G 1 116 126 242 60.0985086054524 60.7205854802844 -0.622076874832018 T:G T G 10 0.481909408573686 0.948795604818365 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 40849408 C/T 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 41104874 G/C 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 41612024 A/G 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.165882569352599 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 15 4 19 7.77135887139471 1.92763763429474 5.84372123709996 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00979754308718647 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 15 4 19 7.77135887139471 1.92763763429474 5.84372123709996 A:C C A 10 0.481909408573686 0.00979754308718647 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 41817367 A/G 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.182263058918350 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 41826929 C/T 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000103932:ENST00000304330:exon_41826912_41827133:RPAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 42192885 G/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G G A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42190570_42193379:EHD4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 42529619 T/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 42536194 A/G 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 A:G A G 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 42614205 G/A 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G G A 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000214013:ENST00000318010:exon_42613983_42614218:GANC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 43018351 C/G 1 11 3 14 5.69899650568945 1.44572822572106 4.2532682799684 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0302077453049777 ENSG00000140326:ENST00000267892:exon_43018295_43018358:CDAN1;ENSG00000140326:ENST00000356231:exon_43018295_43018358:CDAN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 43641299 C/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000168803:ENST00000389651:exon_43641105_43641608:ADAL;ENSG00000168803:ENST00000305605:exon_43641105_43641608:ADAL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 43931102 G/A 1 23 19 42 11.9160836028052 9.15627876290004 2.75980483990519 A:G G A 10 0.481909408573686 0.441590205618852 ENSG00000166762:ENST00000396879:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000299989:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000381761:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000469461:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000321596:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000354127:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000355438:exon_43931102_43931226:CATSPER2;ENSG00000166762:ENST00000433380:exon_43931102_43931226:CATSPER2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 44829344 T/A 1 166 170 336 86.0030381767681 81.9245994575266 4.07843871924149 A:T T A 10 0.481909408573686 0.662684999853333 ENSG00000104131:ENST00000261868:exon_44829255_44829435:EIF3J;ENSG00000104131:ENST00000424492:exon_44829333_44829435:EIF3J HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 45007712 C/T 1 531 354 885 275.106104047373 170.595930635085 104.510173412288 T:C C T 10 0.481909408573686 2.10272537648988e-12 ENSG00000166710:ENST00000349264:exon_45007621_45007899:B2M;ENSG00000166710:ENST00000396754:exon_45007621_45007922:B2M HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 50776525 T/C 1 48 79 127 24.8683483884631 38.0708432773212 -13.2024948888581 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0207592184748190 ENSG00000138592:ENST00000396444:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000307179:exon_50776472_50776558:USP8;ENSG00000138592:ENST00000433963:exon_50776472_50776558:USP8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 52606016 G/A 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 52901283 T/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 52901284 T/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 55647463 T/C 1 6 13 19 3.10854354855788 6.26482231145792 -3.15627876290004 T:C T C 10 0.481909408573686 0.172343358369994 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 55647617 A/C 1 40 31 71 20.7236236570526 14.9391916657843 5.78443199126829 A:C A C 10 0.481909408573686 0.191620579170534 ENSG00000069943:ENST00000164305:exon_55647484_55647845:PIGB;ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 23 33 56 11.9160836028052 15.9030104829316 -3.98692688012642 A:T:G A G 10 0.481909408573686 0.349372883766377 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 59510219 C/T 1 19 6 25 9.84372123709996 2.89145645144212 6.95226478565785 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00790904433692777 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59510090_59510286:MYO1E HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 62221679 T/C 1 13 6 19 6.73517768854208 2.89145645144212 3.84372123709996 T:C T C 10 0.481909408573686 0.106494475373696 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 63433800 G/A 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G G A 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 65113359 G/C 1 8 11 19 4.14472473141051 5.30100349431055 -1.15627876290003 C:G G C 10 0.481909408573686 0.651736024435881 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 65114484 G/A 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 A:G G A 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65114465_65114590:PIF1;ENSG00000140451:ENST00000333425:exon_65114465_65114590:PIF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 65938035 C/T 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000074621:ENST00000399033:exon_65937950_65938041:SLC24A1;ENSG00000074621:ENST00000339868:exon_65937950_65938041:SLC24A1;ENSG00000074621:ENST00000261892:exon_65937950_65938041:SLC24A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 68583382 C/T 1 11 11 22 5.69899650568945 5.30100349431055 0.397993011378908 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 69728949 A/G 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 A:G A G 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 69732736 C/T 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 T:C C T 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 72502141 G/A 1 20 8 28 10.3618118285263 3.85527526858949 6.50653655993679 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0214956637590293 ENSG00000067225:ENST00000319622:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000335181:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000419739:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000449901:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000438234:exon_72502014_72502200:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000434220:exon_72502014_72502187:PKM2;ENSG00000067225:ENST00000389093:exon_72502014_72502200:PKM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 74328116 A/G 1 24 19 43 12.4341741942315 9.15627876290004 3.2778954313315 A:G A G 10 0.481909408573686 0.361025121692877 ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 75093395 C/T 1 15 13 28 7.77135887139471 6.26482231145792 1.50653655993679 T:C C T 10 0.481909408573686 0.577433839032379 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 75093890 A/C 1 18 16 34 9.32563064567365 7.71055053717898 1.61508010849468 A:C A C 10 0.481909408573686 0.610163507846904 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093863_75093936:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093863_75093936:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093863_75093936:CSK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 75648541 C/T 1 193 176 369 99.9914841452786 84.8160559089687 15.1754282363099 T:C C T 10 0.481909408573686 0.118194564657527 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75648451_75648560:MAN2C1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 78294014 C/T 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000167202:ENST00000465531:exon_78293961_78294026:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000418039:exon_78293961_78294082:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000409931:exon_78293961_78294082:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000300584:exon_78293961_78294082:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000491479:exon_78293961_78294296:TBC1D2B;ENSG00000167202:ENST00000420639:exon_78293961_78294082:TBC1D2B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 78458638 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78458492_78458644:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78458492_78458644:IDH3A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 7 8 15 3.6266341399842 3.85527526858949 -0.228641128605291 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 79614410 G/A 1 12 10 22 6.21708709711577 4.81909408573686 1.39799301137891 A:G G A 10 0.481909408573686 0.670841677307095 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79614320_79615189:TMED3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 80260014 T/C 1 31 88 119 16.0608083342157 42.4080279544844 -26.3472196202686 T:C T C 10 0.481909408573686 1.24567987440254e-06 ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80259979_80260034:BCL2A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 80263345 A/C 1 20 15 35 10.3618118285263 7.22864112860529 3.13317069992099 A:C A C 10 0.481909408573686 0.313635894464437 ENSG00000140379:ENST00000267953:exon_80263042_80263788:BCL2A1;ENSG00000140379:ENST00000335661:exon_80263042_80263511:BCL2A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 81271485 C/T 1 64 87 151 33.1577978512841 41.9261185459107 -8.76832069462659 T:C C T 10 0.481909408573686 0.166356837020411 ENSG00000117899:ENST00000261758:exon_81268095_81271818:MESDC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 81598416 G/A 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 86265293 A/G 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86265222_86265347:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86265222_86265347:AKAP13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 86266306 A/G 1 36 33 69 18.6512612913473 15.9030104829316 2.74825080841566 A:G A G 10 0.481909408573686 0.547915704850393 ENSG00000170776:ENST00000394518:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000361243:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394516:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000458540:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000452008:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000426424:exon_86266303_86266551:AKAP13;ENSG00000170776:ENST00000394510:exon_86266303_86266551:AKAP13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 86273693 C/T 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 T:C C T 10 0.481909408573686 0.776180131379565 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89010976 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89010684_89011013:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89010939_89011013:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89010949_89011013:MRPS11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89015930 T/C 1 11 8 19 5.69899650568945 3.85527526858949 1.84372123709997 T:C T C 10 0.481909408573686 0.493025990925298 ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89015858_89015956:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89015858_89015956:MRPS11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89182596 A/G 1 63 70 133 32.6397072598578 33.733658600158 -1.09395134030024 A:G A G 10 0.481909408573686 0.862680507917801 ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89198560 A/G 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 A:G A G 10 0.481909408573686 0.197791501722836 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 163 28 191 84.4487664024892 13.4934634400632 70.955302962426 T:C T C 10 0.481909408573686 1.01917932223478e-26 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89858603 G/A 1 164 27 191 84.9668569939155 13.0115540314895 71.955302962426 A:G G A 10 0.481909408573686 1.55574748312118e-27 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 89860786 A/C 1 11 9 20 5.69899650568945 4.33718467716317 1.36181182852628 A:C A C 10 0.481909408573686 0.656131834829189 ENSG00000140521:ENST00000526671:exon_89860607_89861059:POLG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 90293456 G/C 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 C:G G C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000166823:ENST00000300057:exon_90291892_90293458:MESP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 91136915 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91136868_91136987:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91136868_91136987:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91136868_91136987:CRTC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 91354521 G/A 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 A:G G A 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 91525093 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 91525197 C/T 1 20 18 38 10.3618118285263 8.67436935432635 1.68744247419993 T:C C T 10 0.481909408573686 0.628433498040842 ENSG00000198901:ENST00000417173:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000394249:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361188:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000442656:exon_91524978_91525211:PRC1;ENSG00000198901:ENST00000361919:exon_91524978_91525211:PRC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 93540167 G/A 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.755512817806202 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 100269635 G/C 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 C:G G C 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000183060:ENST00000409796:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000344791:exon_100267610_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000479791:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000332728:exon_100267614_100269936:LYSMD4;ENSG00000183060:ENST00000493256:exon_100269587_100269936:LYSMD4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 101464915 T/C 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C T C 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 101569467 T/C 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C T C 10 0.481909408573686 0.767778067165281 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 101718700 G/A 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 15 102264304 G/C 1 14 6 20 7.2532682799684 2.89145645144212 4.36181182852628 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0713206184786195 ENSG00000185418:ENST00000335968:exon_102264294_102264807:TARSL2;ENSG00000185418:ENST00000333018:exon_102264294_102264645:TARSL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 97610 G/A 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.134075613444074 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 417757 T/C 1 221 287 508 114.498020705215 138.308000260648 -23.8099795554325 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0368397711802561 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_416927_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_417394_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_417396_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_417398_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_417409_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_417427_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_417613_417782:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_417724_417782:MRPL28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 420189 G/A 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.111676109980467 ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 422211 C/T 1 16 13 29 8.28944946282102 6.26482231145792 2.0246271513631 T:C C T 10 0.481909408573686 0.464404653444286 ENSG00000129925:ENST00000431232:exon_420773_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000424078:exon_421862_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000250930:exon_421864_422283:TMEM8A;ENSG00000129925:ENST00000382942:exon_421864_422283:TMEM8A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 449659 G/A 0 0 9 9 0 4.33718467716317 -4.33718467716317 A G A 10 0.481909408573686 0.00409118328334302 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000444498:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000420816:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_449627_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_448410_449739:NME4;ENSG00000103202:ENST00000426167:exon_449627_449739:NME4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 450309 C/T 1 5 37 42 2.59045295713157 17.8306481172264 -15.2401951600948 T:C C T 10 0.481909408573686 1.15294685296239e-06 ENSG00000103202:ENST00000397722:exon_450219_450746:NME4;ENSG00000103202:ENST00000448828:exon_450219_450734:NME4;ENSG00000103202:ENST00000460297:exon_450219_450633:NME4;ENSG00000103202:ENST00000219479:exon_450219_450759:NME4;ENSG00000103202:ENST00000382940:exon_450219_450506:NME4;ENSG00000103202:ENST00000433358:exon_450109_450648:NME4;ENSG00000103202:ENST00000450036:exon_450219_450416:NME4;ENSG00000103202:ENST00000468031:exon_450219_450749:NME4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 723647 C/G 1 25 26 51 12.9522647856578 12.5296446229158 0.422620162742012 C:G C G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 772061 C/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 845797 G/C 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 C:G G C 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 1559838 T/C 1 5 12 17 2.59045295713157 5.78291290288423 -3.19245994575266 T:C T C 10 0.481909408573686 0.147908044689494 ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1559831_1560453:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1559831_1560458:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1559831_1560455:TELO2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 83 72 155 43.0015190883841 34.6974774173054 8.30404167107866 A:T T A 10 0.481909408573686 0.198492091387516 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 1822159 T/C 1 216 228 444 111.907567748084 109.8753451548 2.03222259328341 T:C T C 10 0.481909408573686 0.84950610844327 ENSG00000074071:ENST00000397375:exon_1821891_1822514:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000177742:exon_1821891_1822535:MRPS34;ENSG00000074071:ENST00000432952:exon_1821891_1822535:MRPS34 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 1838037 C/G 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 C:G C G 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 1877913 C/G 1 20 21 41 10.3618118285263 10.1200975800474 0.241714248478873 C:G C G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2012469 T/C 1 40 41 81 20.7236236570526 19.7582857515211 0.965337905531431 T:C T C 10 0.481909408573686 0.911561800950939 ENSG00000140988:ENST00000526586:exon_2012062_2012657:RPS2;ENSG00000140988:ENST00000534461:exon_2012375_2012910:RPS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 141 115 256 73.0507733911103 55.4195819859739 17.6311914051364 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0285840855146819 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2028677 A/G 1 71 71 142 36.7844319912683 34.2155680087317 2.56886398253658 A:T:G A G 10 0.481909408573686 0.675470267957717 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028553_2028751:TBL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2137899 G/A 1 23 19 42 11.9160836028052 9.15627876290004 2.75980483990519 A:G G A 10 0.481909408573686 0.441590205618852 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2137864_2137942:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2137864_2137942:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2137864_2137942:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2137864_2137942:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2137864_2137942:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2137864_2137942:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2137864_2137942:TSC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2305539 A/G 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:G A G 10 0.481909408573686 0.328578053219983 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2314578 T/C 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000205937:ENST00000320225:exon_2314574_2314761:RNPS1;ENSG00000205937:ENST00000397086:exon_2314574_2314761:RNPS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2580912 T/C 1 10 10 20 5.18090591426314 4.81909408573686 0.36181182852628 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2581049 T/C 1 27 35 62 13.9884459685105 16.866829300079 -2.87838333156853 T:C T C 10 0.481909408573686 0.525749591350961 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2647779 G/A 1 96 97 193 49.7366967769261 46.7452126316475 2.99148414527859 A:G G A 10 0.481909408573686 0.66651052438413 ENSG00000140992:ENST00000342085:exon_2647652_2653189:PDPK1;ENSG00000140992:ENST00000441549:exon_2647652_2647913:PDPK1;ENSG00000140992:ENST00000268673:exon_2647652_2653189:PDPK1;ENSG00000140992:ENST00000354836:exon_2647652_2647913:PDPK1;ENSG00000140992:ENST00000389224:exon_2647652_2653189:PDPK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2762637 A/G 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 A:G A G 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000172382:ENST00000302641:exon_2762419_2762815:PRSS27 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2806637 C/T 1 8 2 10 4.14472473141051 0.963818817147372 3.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.057427455776973 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 6 9 15 3.10854354855788 4.33718467716317 -1.22864112860529 T:C C T 10 0.481909408573686 0.610823751460337 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 11 11 22 5.69899650568945 5.30100349431055 0.397993011378908 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2813639 C/G 1 14 5 19 7.2532682799684 2.40954704286843 4.84372123709996 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0364843548286125 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2815027 C/G 1 8 2 10 4.14472473141051 0.963818817147372 3.18090591426314 C:G C G 10 0.481909408573686 0.057427455776973 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 189 155 344 97.9191217795733 74.6959583289213 23.223163450652 T:G G T 10 0.481909408573686 0.013005037507549 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 3707747 G/A 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 4407901 C/T 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C C T 10 0.481909408573686 0.767778067165281 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 4700525 G/A 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 A:G G A 10 0.481909408573686 0.776180131379565 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 4707187 A/C 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:C A C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 4855279 A/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G A G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4853204_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4855102_4855311:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4855102_4855311:GLYR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 8740015 A/C,T 0 0 33 33 0 15.9030104829316 -15.9030104829316 T:C A C 10 0.481909408573686 4.10676693905879e-10 ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8739965_8740079:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8739965_8740072:C16orf68 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 11260440 A/G 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 11773662 C/G 1 8 11 19 4.14472473141051 5.30100349431055 -1.15627876290003 C:G C G 10 0.481909408573686 0.651736024435881 ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 11855825 G/A 1 6 10 16 3.10854354855788 4.81909408573686 -1.71055053717898 A:G G A 10 0.481909408573686 0.459279308448497 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11855766_11855899:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11855766_11855899:ZC3H7A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 12060163 A/G 1 20 20 40 10.3618118285263 9.63818817147372 0.72362365705256 A:G A G 10 0.481909408573686 0.874954216215969 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12060052_12060198:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12060052_12060198:TNFRSF17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 12061515 G/A 1 92 86 178 47.6643344112209 41.444209137337 6.22012527388389 A:G G A 10 0.481909408573686 0.36853103025695 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 163 200 363 84.4487664024892 96.3818817147372 -11.933115312248 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.227021288567825 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 12371875 C/T 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000048471:ENST00000306030:exon_12371790_12371893:SNX29;ENSG00000048471:ENST00000323433:exon_12371790_12371893:SNX29 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:C C A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 15793615 C/T 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 ENSG00000072864:ENST00000396353:exon_15793586_15793679:NDE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 62 42 104 32.1216166684315 20.2401951600948 11.8814215083367 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0235995908096869 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 16219729 C/T 1 25 14 39 12.9522647856578 6.7467317200316 6.20553306562624 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0542127047867447 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16219667_16219768:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16219667_16219768:ABCC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 21272591 G/C 1 2 17 19 1.03618118285263 8.19245994575266 -7.15627876290004 C:G G C 10 0.481909408573686 0.000831826359312331 ENSG00000103316:ENST00000219599:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000396023:exon_21272575_21272659:CRYM;ENSG00000103316:ENST00000415987:exon_21272575_21272659:CRYM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 22277660 G/A 1 18 33 51 9.32563064567365 15.9030104829316 -6.57737983725799 A:G G A 10 0.481909408573686 0.069407193424109 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 3 15 18 1.55427177427894 7.22864112860529 -5.67436935432635 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0082154794282254 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 24581626 A/G 1 806 1001 1807 417.581016689609 482.39131798226 -64.8103012926506 A:T:C:G A G 10 0.481909408573686 0.00238367734171501 ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24580066_24581820:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24580066_24581820:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24580066_24581820:RBBP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 24582299 C/G 1 19 31 50 9.84372123709996 14.9391916657843 -5.0954704286843 C:G C G 10 0.481909408573686 0.159151336124218 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 24741686 T/C 1 22 8 30 11.3979930113789 3.85527526858949 7.54271774278942 A:T:C T C 10 0.481909408573686 0.00599466029639988 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 27238110 C/T 1 34 37 71 17.6150801084947 17.8306481172264 -0.215568008731708 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27238041_27238157:NSMCE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 21 13 34 10.8799024199526 6.26482231145792 4.61508010849467 A:C:G A G 10 0.481909408573686 0.124422465090189 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 28854272 G/A 1 757 690 1447 392.19457770972 332.517491915843 59.6770857938763 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.0017397637770647 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28853732_28854469:TUFM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 28898793 T/C 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000196296:ENST00000357084:exon_28898746_28899043:ATP2A1;ENSG00000196296:ENST00000395503:exon_28898746_28899043:ATP2A1;ENSG00000196296:ENST00000395498:exon_28898746_28899043:ATP2A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 29811319 C/T 1 15 10 25 7.77135887139471 4.81909408573686 2.95226478565785 T:C C T 10 0.481909408573686 0.317115061744928 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29811234_29811369:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29811234_29811369:KIF22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 29814234 G/A 1 26 18 44 13.4703553770842 8.67436935432635 4.79598602275781 A:G G A 10 0.481909408573686 0.174644144938150 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814090_29814258:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814090_29814258:KIF22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 29814826 G/A 1 19 33 52 9.84372123709996 15.9030104829316 -6.05928924583167 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0974471259243442 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814770_29814929:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814770_29814929:KIF22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 29846983 G/C 1 32 37 69 16.578898925642 17.8306481172264 -1.25174919158433 C:G G C 10 0.481909408573686 0.810205259377177 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 29851558 G/A 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29851499_29851780:MVP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 29856006 G/A 1 33 52 85 17.0969895170684 25.0592892458317 -7.96229972876331 A:G G A 10 0.481909408573686 0.102966663581813 ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29855814_29856200:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29855814_29856200:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29855814_29856200:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29855814_29856200:MVP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 30078907 A/G 1 70 56 126 36.266341399842 26.9869268801264 9.27941451971556 A:G A G 10 0.481909408573686 0.108475617269647 ENSG00000149925:ENST00000395248:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000338110:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000436540:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000412304:exon_30078771_30078982:ALDOA;ENSG00000149925:ENST00000395240:exon_30078771_30078982:ALDOA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 31095171 C/T 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 ENSG00000151006:ENST00000486499:exon_31094758_31096581:PRSS53 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 31102589 G/A 1 150 123 273 77.7135887139471 59.2748572545634 18.4387314593837 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0290592820689772 ENSG00000167397:ENST00000533518:exon_31102413_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000300851:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000319788:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000354895:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000394975:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000420057:exon_31102163_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000394971:exon_31102425_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000498155:exon_31102496_31102663:VKORC1;ENSG00000167397:ENST00000472468:exon_31102503_31102663:VKORC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 31193994 T/C 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 56396398 C/G 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G C G 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000159461:ENST00000290649:exon_56395364_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000492830:exon_56395472_56396968:AMFR;ENSG00000159461:ENST00000314566:exon_56396337_56396528:AMFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 57016092 G/A 1 34 9 43 17.6150801084947 4.33718467716317 13.2778954313315 A:G G A 10 0.481909408573686 4.5401338720637e-05 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 57095408 C/T 1 134 152 286 69.4241392511261 73.2502301032003 -3.8260908520742 A:T:C:G C T 10 0.481909408573686 0.67888555306093 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57095360_57095443:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57095360_57095443:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57095360_57095443:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57095360_57095443:NLRC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 57507242 C/G 1 10 8 18 5.18090591426314 3.85527526858949 1.32563064567365 C:G C G 10 0.481909408573686 0.639350488109998 ENSG00000125170:ENST00000340099:exon_57505834_57507407:DOK4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 58552921 G/A 1 10 6 16 5.18090591426314 2.89145645144212 2.28944946282102 A:G G A 10 0.481909408573686 0.319522314154991 ENSG00000103037:ENST00000310682:exon_58552628_58553566:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000394266:exon_58552628_58554431:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000219315:exon_58552628_58553014:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000427443:exon_58552628_58553419:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000443717:exon_58552628_58553001:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000422445:exon_58552628_58553407:SETD6;ENSG00000103037:ENST00000463954:exon_58552628_58552980:SETD6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 58589187 G/A 0 10 0 10 5.18090591426314 0 5.18090591426314 G G 10 0.481909408573686 0.000675544641507412 ENSG00000125107:ENST00000317147:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000422872:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000245138:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000394200:exon_58589155_58589441:CNOT1;ENSG00000125107:ENST00000441024:exon_58589155_58589441:CNOT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 67100635 A/G 1 20 13 33 10.3618118285263 6.26482231145792 4.09698951706836 A:G A G 10 0.481909408573686 0.166503345114812 ENSG00000067955:ENST00000290858:exon_67100585_67100701:CBFB;ENSG00000067955:ENST00000412916:exon_67100585_67100701:CBFB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 67262775 C/T 1 112 93 205 58.0261462397472 44.8175749973528 13.2085712423944 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.0691730250969296 ENSG00000168701:ENST00000304800:exon_67262700_67262784:TMEM208;ENSG00000168701:ENST00000404299:exon_67262741_67262784:TMEM208 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 67696365 G/A 1 13 12 25 6.73517768854208 5.78291290288423 0.952264785657849 A:G G A 10 0.481909408573686 0.841916175422466 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 67862100 G/A 1 160 159 319 82.8944946282102 76.6235959632161 6.27089866499416 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.501569221313539 ENSG00000102901:ENST00000219172:exon_67862064_67862293:CENPT;ENSG00000102901:ENST00000440851:exon_67862064_67862293:CENPT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 50 2 52 25.9045295713157 0.963818817147372 24.9407107541683 A:G A G 10 0.481909408573686 5.33443712262215e-14 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 20 23 43 10.3618118285263 11.0839163971948 -0.722104568668499 A:G G A 10 0.481909408573686 0.87943112719001 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 68055449 T/C 1 53 28 81 27.4588013455946 13.4934634400632 13.9653379055314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00246686671046309 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 69745145 G/A 1 53 59 112 27.4588013455946 28.4326551058475 -0.973853760252837 A:G G A 10 0.481909408573686 0.924728278827504 ENSG00000181019:ENST00000320623:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379047:exon_69743304_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000379046:exon_69743307_69745184:NQO1;ENSG00000181019:ENST00000439109:exon_69744745_69745184:NQO1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 69786207 T/A 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 A:T T A 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000141101:ENST00000268802:exon_69786144_69786274:NOB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 70515355 C/T 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70515262_70515390:COG4;ENSG00000103051:ENST00000526700:exon_70515262_70515390:COG4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 70543111 T/C 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C T C 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70542309_70543291:COG4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 72130815 C/A 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 A:C C A 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130721_72130908:DHX38 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 77 72 149 39.8929755398262 34.6974774173054 5.19549812252078 A:G A G 10 0.481909408573686 0.412963014408423 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 75575299 T/C 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000205084:ENST00000258173:exon_75575248_75575353:TMEM231;ENSG00000205084:ENST00000398114:exon_75575248_75575353:TMEM231 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 75661803 G/C 1 198 180 378 102.58193710241 86.7436935432635 15.8382435591467 C:G G C 10 0.481909408573686 0.110523371848866 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75661628_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75661628_75661891:KARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 75690471 C/G 1 571 588 1159 295.829727704425 283.362732241327 12.4669954630979 C:G C G 10 0.481909408573686 0.480558587724184 ENSG00000166848:ENST00000300086:exon_75690105_75691328:TERF2IP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 81888237 G/C 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 C:G G C 10 0.481909408573686 0.291636936274409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 81929488 C/T 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 81929527 C/G 1 8 9 17 4.14472473141051 4.33718467716317 -0.192459945752662 C:G C G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 81941319 C/T 1 18 10 28 9.32563064567365 4.81909408573686 4.50653655993679 T:C C T 10 0.481909408573686 0.09256953464209 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 84212779 G/A 1 14 7 21 7.2532682799684 3.3733658600158 3.87990241995259 A:G G A 10 0.481909408573686 0.124869530263863 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 84212785 G/A 1 15 8 23 7.77135887139471 3.85527526858949 3.91608360280522 A:G G A 10 0.481909408573686 0.142725626727946 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 84212928 G/A 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 85711927 A/G 1 18 21 39 9.32563064567365 10.1200975800474 -0.794466934373755 A:G A G 10 0.481909408573686 0.873286568849121 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 85711934 A/G 1 17 18 35 8.80754005424734 8.67436935432635 0.133170699920989 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85709804_85711943:GINS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 85952201 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000140968:ENST00000268638:exon_85952023_85952409:IRF8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 88709828 A/G 1 286 149 435 148.173909147926 71.8045018774792 76.3694072704466 A:T:C:G A G 10 0.481909408573686 1.81122128528316e-13 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88709698_88709979:CYBA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 88876103 T/C 1 196 113 309 101.545755919558 54.4557631688265 47.089992750731 T:C T C 10 0.481909408573686 9.614719915264e-08 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 89294184 G/A 1 2 10 12 1.03618118285263 4.81909408573686 -3.78291290288423 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0400536609943421 ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 89623408 C/T 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89623295_89624174:SPG7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 89627689 T/G 1 877 362 1239 454.365448680877 174.451205903674 279.914242777203 T:G T G 10 0.481909408573686 2.92590018306334e-58 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 16 89782835 C/T 1 11 9 20 5.69899650568945 4.33718467716317 1.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 0.656131834829189 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 1370542 C/A 1 12 24 36 6.21708709711577 11.5658258057685 -5.3487387086527 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0944208048546669 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 1383798 G/A 1 23 17 40 11.9160836028052 8.19245994575266 3.72362365705256 A:G G A 10 0.481909408573686 0.269548611597909 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 1383893 G/A 1 12 7 19 6.21708709711577 3.3733658600158 2.84372123709996 A:G G A 10 0.481909408573686 0.251548235310953 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 2203109 T/C 1 14 3 17 7.2532682799684 1.44572822572106 5.80754005424734 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00604238120300802 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 4442801 T/C 1 34 27 61 17.6150801084947 13.0115540314895 4.60352607700515 T:C T C 10 0.481909408573686 0.250982978304442 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 4443016 C/T 1 21 13 34 10.8799024199526 6.26482231145792 4.61508010849467 T:C C T 10 0.481909408573686 0.124422465090189 ENSG00000183018:ENST00000329078:exon_4440748_4443228:SPNS2;ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4442734_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4442199_4443262:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4442938_4443122:MYBBP1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 269 255 524 139.366369093678 122.88689918629 16.4794699073885 A:T:G A G 10 0.481909408573686 0.161796346256962 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 4858911 G/A 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000108515:ENST00000521659:exon_4858702_4859157:ENO3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 5280440 T/C 1 5 9 14 2.59045295713157 4.33718467716317 -1.7467317200316 A:T:C T C 10 0.481909408573686 0.428255926399451 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5280411_5280600:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5280411_5280600:RABEP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 7 15 22 3.6266341399842 7.22864112860529 -3.60200698862109 A:G A G 10 0.481909408573686 0.139382119866570 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 5 10 15 2.59045295713157 4.81909408573686 -2.22864112860529 T:C T C 10 0.481909408573686 0.306544043025527 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 5289580 A/G 1 191 125 316 98.955302962426 60.2386760717108 38.7166268907152 A:G A G 10 0.481909408573686 1.35420878338033e-05 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 166 121 287 86.0030381767681 58.311038437416 27.6919997393521 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00113418012596457 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 6663895 C/G 1 38 44 82 19.6874424741999 21.2040139772422 -1.51657150304225 C:G C G 10 0.481909408573686 0.825254874343087 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000438512:exon_6663725_6663920:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6663725_6663920:XAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 6918461 C/T 1 19 41 60 9.84372123709996 19.7582857515211 -9.91456451442116 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0134401307621825 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6918381_6918475:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000455303:exon_6918381_6918475:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6918381_6918475:C17orf49 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 6945085 G/T 1 7 16 23 3.6266341399842 7.71055053717898 -4.08391639719478 T:G G T 10 0.481909408573686 0.0980365874501828 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6944949_6945227:SLC16A11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 6945178 A/G 1 19 51 70 9.84372123709996 24.577379837258 -14.733658600158 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000444096477889566 ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6944949_6945227:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6944949_6945227:SLC16A11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 7126064 G/A 1 12 9 21 6.21708709711577 4.33718467716317 1.87990241995259 A:G G A 10 0.481909408573686 0.513901958034641 ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7125986_7126184:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7125986_7126184:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7125986_7126184:ACADVL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 7217463 T/C 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 7606350 T/C 1 31 43 74 16.0608083342157 20.7221045686685 -4.66129623445277 T:C T C 10 0.481909408573686 0.296692427026974 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 7606401 C/T 1 49 49 98 25.3864389798894 23.6135610201106 1.77287795977877 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.762089609295495 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000463804:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606311_7606445:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606199_7606445:WRAP53 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 7606722 C/G 1 26 12 38 13.4703553770842 5.78291290288423 7.68744247419993 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0143712217062143 ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 7760714 C/T 1 66 76 142 34.1939790341367 36.6251150516001 -2.43113601746342 T:C C T 10 0.481909408573686 0.73711107455265 ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 8706609 G/A 1 17 33 50 8.80754005424734 15.9030104829316 -7.0954704286843 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0479043614738653 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 8790810 C/T 1 7 9 16 3.6266341399842 4.33718467716317 -0.710550537178976 T:C C T 10 0.481909408573686 0.805666606761275 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 8809075 G/A 1 64 52 116 33.1577978512841 25.0592892458317 8.09850860545242 A:G G A 10 0.481909408573686 0.137864306472829 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 9395231 G/A 1 63 48 111 32.6397072598578 23.1316516115369 9.50805564832085 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0719054888480105 ENSG00000170310:ENST00000306357:exon_9395146_9395238:STX8;ENSG00000170310:ENST00000415554:exon_9395146_9395238:STX8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 11881961 A/G 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 A:G A G 10 0.481909408573686 0.111676109980467 ENSG00000154957:ENST00000446124:exon_11880762_11882061:ZNF18;ENSG00000154957:ENST00000322748:exon_11880762_11882061:ZNF18;ENSG00000154957:ENST00000454073:exon_11880762_11882061:ZNF18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 16062110 G/A 1 16 8 24 8.28944946282102 3.85527526858949 4.43417419423154 A:G G A 10 0.481909408573686 0.100356840028341 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395848:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000437142:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000411510:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000436828:exon_16062074_16062187:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000460276:exon_16062074_16062187:NCOR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 16344600 T/C 1 10 19 29 5.18090591426314 9.15627876290004 -3.9753728486369 T:C T C 10 0.481909408573686 0.192532461278873 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 16456614 T/G 1 7 8 15 3.6266341399842 3.85527526858949 -0.228641128605291 T:G T G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000141040:ENST00000268727:exon_16453631_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395825:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000395824:exon_16454701_16456740:ZNF287;ENSG00000141040:ENST00000498796:exon_16456424_16456740:ZNF287 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 16852027 T/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:G T G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 17380635 C/T 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 17921913 G/A 1 23 14 37 11.9160836028052 6.7467317200316 5.16935188277362 A:G G A 10 0.481909408573686 0.100648656796357 ENSG00000171953:ENST00000302530:exon_17921379_17922000:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000474627:exon_17921576_17922000:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000496852:exon_17921576_17922000:ATPAF2;ENSG00000171953:ENST00000467560:exon_17921576_17922000:ATPAF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 18872376 C/T 1 21 18 39 10.8799024199526 8.67436935432635 2.20553306562624 T:C C T 10 0.481909408573686 0.523754815909214 ENSG00000154025:ENST00000317977:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395647:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000417251:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395642:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395645:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000395643:exon_18872365_18872470:SLC5A10;ENSG00000154025:ENST00000284168:exon_18872365_18872383:SLC5A10;ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 19871746 T/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:G T G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000108599:ENST00000225737:exon_19871727_19871774:AKAP10;ENSG00000108599:ENST00000395536:exon_19871727_19871774:AKAP10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 25973583 T/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:T T A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000481514:exon_25973573_25973614:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000486774:exon_25973573_25973614:LGALS9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 26906207 T/C 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 T:C T C 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000076382:ENST00000321765:exon_26906159_26906270:SPAG5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 27975188 T/C 1 10 11 21 5.18090591426314 5.30100349431055 -0.120097580047406 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27975162_27975362:SSH2;ENSG00000141298:ENST00000394848:exon_27974712_27975362:SSH2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G A G 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 29631832 G/A 1 10 15 25 5.18090591426314 7.22864112860529 -2.04773521434215 A:G G A 10 0.481909408573686 0.431962859336285 ENSG00000185862:ENST00000330927:exon_29630790_29632648:EVI2B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 29632471 C/T 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 T:C C T 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000185862:ENST00000330927:exon_29630790_29632648:EVI2B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 30179314 G/A 1 39 31 70 20.2055330656262 14.9391916657843 5.26634139984198 A:G G A 10 0.481909408573686 0.232127707023948 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30178883_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30178890_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30178890_30179327:C17orf79 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 31322631 G/A 1 10 1 11 5.18090591426314 0.481909408573686 4.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00489735413206958 ENSG00000141316:ENST00000269053:exon_31322427_31322735:SPACA3;ENSG00000141316:ENST00000485015:exon_31322464_31322735:SPACA3;ENSG00000141316:ENST00000394637:exon_31322427_31322735:SPACA3;ENSG00000141316:ENST00000411740:exon_31322427_31322735:SPACA3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 34942595 G/A 1 226 320 546 117.088473662347 154.21101074358 -37.1225370812326 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00151351874267406 ENSG00000005955:ENST00000304718:exon_34942480_34942628:GGNBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 36977303 C/T 1 54 53 107 27.976891937021 25.5411986544054 2.4356932826156 T:C C T 10 0.481909408573686 0.698998053067205 ENSG00000108296:ENST00000225428:exon_36977154_36977326:CWC25 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 38062139 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000486560:exon_38062100_38062191:GSDMB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 38457151 G/A 1 16 7 23 8.28944946282102 3.3733658600158 4.91608360280522 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0581622551212325 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 38556533 T/C 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38556461_38556661:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38556461_38556661:TOP2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 38572690 G/A 1 20 21 41 10.3618118285263 10.1200975800474 0.241714248478873 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000131747:ENST00000423485:exon_38572674_38572764:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000269577:exon_38572674_38572764:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000348049:exon_38572674_38572764:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000357601:exon_38572674_38572764:TOP2A;ENSG00000131747:ENST00000446047:exon_38572674_38572764:TOP2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 39925925 A/G 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000449889:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437187:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000420370:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000424457:exon_39925670_39925929:JUP;ENSG00000173801:ENST00000437369:exon_39925878_39925929:JUP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 41365921 C/G 1 5 15 20 2.59045295713157 7.22864112860529 -4.63818817147372 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0440098653575110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 42928699 A/G 1 72 67 139 37.3025225826946 32.287930374437 5.01459220825765 A:G A G 10 0.481909408573686 0.397612118209901 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42927655_42928737:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42927655_42928737:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42928279_42928737:EFTUD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 43138741 C/T 1 117 114 231 60.6165991968787 54.9376725774002 5.67892661947853 T:C C T 10 0.481909408573686 0.469366703747976 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43138680_43138828:NMT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 43311620 A/G 1 18 15 33 9.32563064567365 7.22864112860529 2.09698951706836 A:G A G 10 0.481909408573686 0.490463051436731 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 45219800 C/T 0 264 0 264 136.775916136547 0 136.775916136547 C C 10 0.481909408573686 2.00847768717711e-84 ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45219595_45219802:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45219595_45219802:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45219595_45219802:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45219595_45219802:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45219595_45219802:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45219595_45219802:CDC27 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 20 23 43 10.3618118285263 11.0839163971948 -0.722104568668499 T:C T C 10 0.481909408573686 0.87943112719001 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 46053353 C/A 1 18 16 34 9.32563064567365 7.71055053717898 1.61508010849468 A:C C A 10 0.481909408573686 0.610163507846904 ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46053235_46053379:CDK5RAP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 46939658 C/G 1 21 24 45 10.8799024199526 11.5658258057685 -0.685923385815872 A:C:G C G 10 0.481909408573686 0.882206592525217 ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000507306:exon_46939638_46939666:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509784:exon_46939638_46939666:CALCOCO2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 47000251 C/T 1 15 22 37 7.77135887139471 10.6020069886211 -2.83064811722638 T:C C T 10 0.481909408573686 0.411994822111382 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 47018293 C/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 48216944 C/T 1 10 4 14 5.18090591426314 1.92763763429474 3.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.108335810082199 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 48437670 C/T 1 18 21 39 9.32563064567365 10.1200975800474 -0.794466934373755 T:C C T 10 0.481909408573686 0.873286568849121 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48437330_48438512:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48437330_48438512:XYLT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 48450523 C/G 1 11 4 15 5.69899650568945 1.92763763429474 3.77135887139471 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0689223984537358 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 48460340 G/A 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000108829:ENST00000225972:exon_48458599_48460596:LRRC59 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 48744953 G/C 1 13 4 17 6.73517768854208 1.92763763429474 4.80754005424734 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0266465634185576 ENSG00000108846:ENST00000427699:exon_48744915_48745284:ABCC3;ENSG00000108846:ENST00000285238:exon_48744915_48745118:ABCC3;ENSG00000108846:ENST00000427959:exon_48744915_48745118:ABCC3;ENSG00000108846:ENST00000502426:exon_48744915_48745118:ABCC3;ENSG00000108846:ENST00000505699:exon_48744915_48745118:ABCC3;ENSG00000108846:ENST00000513589:exon_48744915_48744955:ABCC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 55027769 C/T 1 33 30 63 17.0969895170684 14.4572822572106 2.63970725985778 T:C C T 10 0.481909408573686 0.530341669541124 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 56285244 C/T 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 T:C C T 10 0.481909408573686 0.755512817806202 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 58525018 C/T 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000062725:ENST00000083182:exon_58520520_58525195:APPBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 60030292 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 62532819 C/T 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000141325:ENST00000269064:exon_62532720_62532866:CCDC45;ENSG00000141325:ENST00000397727:exon_62532720_62532866:CCDC45 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 65907503 A/G 1 21 19 40 10.8799024199526 9.15627876290004 1.72362365705256 A:G A G 10 0.481909408573686 0.636723273892659 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 65908190 A/G 1 75 72 147 38.8567943569735 34.6974774173054 4.15931693966815 A:C:G A G 10 0.481909408573686 0.509830533901844 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 66253019 A/G 1 80 106 186 41.4472473141051 51.0823973088107 -9.6351499947056 A:G A G 10 0.481909408573686 0.163746121243839 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 71228360 G/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G G C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71228225_71228510:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71228225_71228506:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71228225_71228533:FAM104A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 72443192 G/T 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 T:G G T 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 72840613 T/G 1 3 9 12 1.55427177427894 4.33718467716317 -2.78291290288423 T:G T G 10 0.481909408573686 0.149158048996249 ENSG00000161509:ENST00000293190:exon_72840415_72840647:GRIN2C;ENSG00000161509:ENST00000347612:exon_72840376_72840647:GRIN2C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 73017061 T/C 1 66 60 126 34.1939790341367 28.9145645144212 5.27941451971556 T:C T C 10 0.481909408573686 0.373077293352942 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73017016_73017355:ICT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 73823982 G/A 1 17 27 44 8.80754005424734 13.0115540314895 -4.20401397724219 A:G G A 10 0.481909408573686 0.229083626592826 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 73945957 A/G 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 A:G A G 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73945799_73945978:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73945799_73945978:ACOX1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 73949510 C/T 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 T:C C T 10 0.481909408573686 0.111676109980467 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 74477475 C/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C:G C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74477457_74477627:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74477457_74477791:RHBDF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 74557698 G/A 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 74733099 G/A 1 5 9 14 2.59045295713157 4.33718467716317 -1.7467317200316 A:G G A 10 0.481909408573686 0.428255926399451 ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 A:G G A 10 0.481909408573686 0.597188270417829 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 7 10 17 3.6266341399842 4.81909408573686 -1.19245994575266 T:C T C 10 0.481909408573686 0.632925812771296 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 76424812 G/A 1 5 14 19 2.59045295713157 6.7467317200316 -4.15627876290004 A:G G A 10 0.481909408573686 0.066824099895121 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 76799795 G/A 1 36 56 92 18.6512612913473 26.9869268801264 -8.33566558877911 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0947362733994842 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 76809020 G/A 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76808942_76809083:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76808942_76809083:USP36 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 78113961 C/T 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C C T 10 0.481909408573686 0.767778067165281 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 78261730 G/A 1 9 18 27 4.66281532283683 8.67436935432635 -4.01155403148952 A:G G A 10 0.481909408573686 0.128652019727975 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 78261805 A/G 1 8 14 22 4.14472473141051 6.7467317200316 -2.60200698862109 A:G A G 10 0.481909408573686 0.293237542673417 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 78261854 G/A 1 9 10 19 4.66281532283683 4.81909408573686 -0.156278762900034 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000411702:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000456466:exon_78261614_78262162:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000319921:exon_78261614_78262162:RNF213 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 78333840 T/C 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C T C 10 0.481909408573686 0.784647630659318 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79224985 C/T 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79225000 A/G 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 A:G A G 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79226083 C/T 1 5 8 13 2.59045295713157 3.85527526858949 -1.26482231145792 T:C C T 10 0.481909408573686 0.584334529704906 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79477827 C/G 1 298 333 631 154.390996245042 160.475833055037 -6.08483680999586 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0.632867784423848 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79497131 C/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79596811 C/T 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79596751_79596831:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79596751_79596831:NPLOC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79632592 G/T 1 37 15 52 19.1693518827736 7.22864112860529 11.9407107541683 T:G G T 10 0.481909408573686 0.00119189790320659 ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 7 11 18 3.6266341399842 5.30100349431055 -1.67436935432635 C:G C G 10 0.481909408573686 0.485903926383751 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79638805 C/T 1 14 16 30 7.2532682799684 7.71055053717898 -0.457282257210581 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79638774_79638856:CCDC137 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79668135 G/T 1 23 23 46 11.9160836028052 11.0839163971948 0.832167205610443 T:G G T 10 0.481909408573686 0.883030325722599 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79668075_79668161:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79668075_79668161:HGS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79671714 T/C 1 174 168 342 90.1477629081786 80.9607806403793 9.18698226779938 T:C T C 10 0.481909408573686 0.330334819583996 ENSG00000183093:ENST00000333676:exon_79671663_79671746:MRPL12;ENSG00000183093:ENST00000332396:exon_79671663_79671746:MRPL12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79803101 A/G 1 33 27 60 17.0969895170684 13.0115540314895 4.08543548557884 A:G A G 10 0.481909408573686 0.303953636941373 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000450722:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000436463:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000415593:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000473021:exon_79803020_79803332:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000476482:exon_79803020_79803106:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000439918:exon_79803043_79803106:P4HB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79954544 T/A 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 A:T T A 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79954296_79954722:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79954296_79954722:ASPSCR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 79974724 C/T 1 67 48 115 34.712069625563 23.1316516115369 11.5804180140261 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0319609359586022 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 17 80014196 G/A 1 3 14 17 1.55427177427894 6.7467317200316 -5.19245994575266 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0136822342709536 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80014162_80014267:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80014162_80014267:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80014162_80014267:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80014162_80014267:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80012774_80014267:GPS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 2802557 A/G 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G A G 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2802526_2805015:SMCHD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 9255889 C/T 1 1049 1120 2169 543.477030406203 539.738537602528 3.73849280367494 A:T:C:G C T 10 0.481909408573686 0.880458639291481 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000400020:exon_9255875_9255900:ANKRD12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 9255982 A/G 1 1091 1125 2216 565.236835246109 542.148084645397 23.0887506007117 A:T:C:G A G 10 0.481909408573686 0.328235294850526 ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 21059294 G/C 1 14 16 30 7.2532682799684 7.71055053717898 -0.457282257210581 C:G G C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000101782:ENST00000339486:exon_21059281_21059388:RIOK3;ENSG00000101782:ENST00000424813:exon_21059290_21059388:RIOK3;ENSG00000101782:ENST00000453294:exon_21059281_21059388:RIOK3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 29410919 T/C 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000153339:ENST00000283351:exon_29409136_29410952:TRAPPC8;ENSG00000153339:ENST00000451747:exon_29409137_29410952:TRAPPC8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 33048617 G/A 1 98 58 156 50.7728779597788 27.9507456972738 22.822132262505 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.000287470664026817 ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 33266945 T/C 1 14 9 23 7.2532682799684 4.33718467716317 2.91608360280522 T:C T C 10 0.481909408573686 0.296978724771862 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 33557466 A/G 1 16 13 29 8.28944946282102 6.26482231145792 2.0246271513631 A:G A G 10 0.481909408573686 0.464404653444286 ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 33747154 A/T 1 19 32 51 9.84372123709996 15.421101074358 -5.57737983725799 A:T A T 10 0.481909408573686 0.125090643218218 ENSG00000134759:ENST00000358232:exon_33747064_33747185:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000351393:exon_33747064_33747185:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000350494:exon_33747064_33747185:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000442325:exon_33747064_33747185:ELP2;ENSG00000134759:ENST00000423854:exon_33747064_33747185:ELP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 34322850 C/T 1 12 38 50 6.21708709711577 18.3125575258001 -12.0954704286843 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000575015398536471 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 43667349 A/G 1 11 21 32 5.69899650568945 10.1200975800474 -4.42110107435795 A:G A G 10 0.481909408573686 0.156146278810144 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43667307_43667458:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43667307_43667458:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43667307_43667458:ATP5A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 43671821 T/C 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.410693953677878 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 43698193 C/T 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43698147_43698282:HAUS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 56202418 T/C 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 60227833 T/C 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 ENSG00000141664:ENST00000269499:exon_60227820_60227877:ZCCHC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 A:G A G 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 61654463 A/G 1 48 34 82 24.8683483884631 16.3849198915053 8.48342849695774 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0764089314271782 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 77107934 C/T 1 13 9 22 6.73517768854208 4.33718467716317 2.39799301137891 T:C C T 10 0.481909408573686 0.394377988213738 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 23 33 56 11.9160836028052 15.9030104829316 -3.98692688012642 A:G G A 10 0.481909408573686 0.349372883766377 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 21 28 49 10.8799024199526 13.4934634400632 -2.61356102011062 A:C A C 10 0.481909408573686 0.47802545583202 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 183 200 383 94.8105782310155 96.3818817147372 -1.57130348372175 A:G G A 10 0.481909408573686 0.878239683725872 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 617862 G/A 1 21 9 30 10.8799024199526 4.33718467716317 6.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0177743583270523 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617777_617870:POLRMT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 871987 G/A 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 897433 G/A 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000198858:ENST00000361574:exon_896503_897540:C19orf22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 966831 G/A 1 50 41 91 25.9045295713157 19.7582857515211 6.14624381979457 A:G G A 10 0.481909408573686 0.209065350931507 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 C:G C G 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 13 3 16 6.73517768854208 1.44572822572106 5.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0104410209556111 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1037563 A/G 1 14 1 15 7.2532682799684 0.481909408573686 6.77135887139471 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000352715531823600 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1037584 C/T 1 14 3 17 7.2532682799684 1.44572822572106 5.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00604238120300802 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1057863 A/T 1 11 6 17 5.69899650568945 2.89145645144212 2.80754005424734 A:T A T 10 0.481909408573686 0.225825362231512 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1085849 C/T 1 32 30 62 16.578898925642 14.4572822572106 2.12161666843147 T:C C T 10 0.481909408573686 0.613072599656223 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1085659_1086627:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1085659_1086627:HMHA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1106210 G/A 1 30 45 75 15.5427177427894 21.6859233858159 -6.14320564302645 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.166642125052401 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1106477 G/C 1 13 26 39 6.73517768854208 12.5296446229158 -5.79446693437376 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0772687251434339 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1272040 T/C 1 64 63 127 33.1577978512841 30.3602927401422 2.79750511114187 T:C T C 10 0.481909408573686 0.657408703392894 ENSG00000099622:ENST00000320936:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000413636:exon_1271980_1272442:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000427032:exon_1271980_1272050:CIRBP;ENSG00000099622:ENST00000444172:exon_1271980_1272442:CIRBP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1388538 C/T 1 5 10 15 2.59045295713157 4.81909408573686 -2.22864112860529 T:C C T 10 0.481909408573686 0.306544043025527 ENSG00000115286:ENST00000313408:exon_1388524_1388937:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000233627:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000450862:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000414651:exon_1388524_1388592:NDUFS7;ENSG00000115286:ENST00000382445:exon_1388524_1388592:NDUFS7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1430303 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000071626:ENST00000233078:exon_1430221_1430361:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000395533:exon_1430221_1430361:DAZAP1;ENSG00000071626:ENST00000336761:exon_1430221_1430361:DAZAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1481919 G/A 1 11 1 12 5.69899650568945 0.481909408573686 5.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00255486444561599 ENSG00000115257:ENST00000300954:exon_1481427_1482206:PCSK4;ENSG00000115257:ENST00000441747:exon_1481427_1482206:PCSK4;ENSG00000115257:ENST00000433740:exon_1481427_1482206:PCSK4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 1912986 C/T 1 2 9 11 1.03618118285263 4.33718467716317 -3.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0673297579948189 ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2073354 C/A 1 28 21 49 14.5065365599368 10.1200975800474 4.38643897988938 A:C C A 10 0.481909408573686 0.252758389425746 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2078455 C/T 1 8 2 10 4.14472473141051 0.963818817147372 3.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.057427455776973 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2099051 G/A 1 36 51 87 18.6512612913473 24.577379837258 -5.92611854591068 A:G G A 10 0.481909408573686 0.23786371154679 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2098975_2099109:IZUMO4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2110746 G/A 1 10 9 19 5.18090591426314 4.33718467716317 0.843721237099966 A:G G A 10 0.481909408573686 0.819567710927507 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2114834 A/G 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.510384690986528 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2248020 G/A 1 64 41 105 33.1577978512841 19.7582857515211 13.399512099763 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0107877642263736 ENSG00000104897:ENST00000221494:exon_2247766_2248677:SF3A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2418031 C/T 1 12 8 20 6.21708709711577 3.85527526858949 2.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 0.372034266386779 ENSG00000178297:ENST00000332578:exon_2418000_2418136:TMPRSS9;ENSG00000178297:ENST00000425079:exon_2418000_2418136:TMPRSS9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2432450 C/G 1 11 3 14 5.69899650568945 1.44572822572106 4.2532682799684 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0302077453049777 ENSG00000176619:ENST00000532465:exon_2432414_2432521:LMNB2;ENSG00000176619:ENST00000325327:exon_2432414_2432521:LMNB2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2438119 C/T 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 T:C C T 10 0.481909408573686 0.373447157732848 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2732741 G/A 1 29 39 68 15.0246271513631 18.7944669343738 -3.76983978301065 A:G G A 10 0.481909408573686 0.396636010328185 ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2918133 A/C 0 0 9 9 0 4.33718467716317 -4.33718467716317 C A C 10 0.481909408573686 0.00409118328334302 ENSG00000171970:ENST00000306908:exon_2916922_2918474:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000395204:exon_2916922_2918465:ZNF57;ENSG00000171970:ENST00000523428:exon_2916922_2918344:ZNF57 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2994903 T/C 1 13 11 24 6.73517768854208 5.30100349431055 1.43417419423154 T:C T C 10 0.481909408573686 0.683876092776092 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 2994921 G/A 1 14 9 23 7.2532682799684 4.33718467716317 2.91608360280522 A:G G A 10 0.481909408573686 0.296978724771862 ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3207398 G/A 1 26 30 56 13.4703553770842 14.4572822572106 -0.986926880126418 A:G G A 10 0.481909408573686 0.8937867906614 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3207422 T/C 1 20 23 43 10.3618118285263 11.0839163971948 -0.722104568668499 T:C T C 10 0.481909408573686 0.87943112719001 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207389_3207467:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207389_3207467:NCLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3207646 A/G 1 39 33 72 20.2055330656262 15.9030104829316 4.30252258269461 A:G A G 10 0.481909408573686 0.345986731030034 ENSG00000125912:ENST00000442843:exon_3207627_3209572:NCLN;ENSG00000125912:ENST00000246117:exon_3207627_3209572:NCLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3462684 A/C 1 18 5 23 9.32563064567365 2.40954704286843 6.91608360280522 A:C A C 10 0.481909408573686 0.00544054166268848 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3976549 C/T 1 204 212 416 105.690480650968 102.164794617621 3.52568603334662 T:C C T 10 0.481909408573686 0.731581052476458 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3976055_3976745:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3976055_3976745:EEF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3977922 G/A 1 52 32 84 26.9407107541683 15.421101074358 11.5196096798104 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.0157945674124152 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3977817_3978170:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3977817_3978170:EEF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 3979372 G/T 1 34 38 72 17.6150801084947 18.3125575258001 -0.697477417305397 T:G G T 10 0.481909408573686 0.90649676192297 ENSG00000167658:ENST00000309311:exon_3979327_3979434:EEF2;ENSG00000167658:ENST00000445244:exon_3979327_3979386:EEF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4231323 C/T 1 99 78 177 51.2909685512051 37.5889338687475 13.7020346824576 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0421901523900511 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4234811 G/A 1 108 135 243 55.9537838740419 65.0577701574476 -9.1039862834057 A:G G A 10 0.481909408573686 0.248491142988515 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4234664_4234821:EBI3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 381 485 866 197.392515333426 233.726063158238 -36.3335478248121 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0143126476236102 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4262036 C/T 1 13 10 23 6.73517768854208 4.81909408573686 1.91608360280522 T:C C T 10 0.481909408573686 0.53249686462684 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4409752 G/A 1 21 20 41 10.8799024199526 9.63818817147372 1.24171424847887 A:G G A 10 0.481909408573686 0.755729719638726 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4446385 C/G 1 53 38 91 27.4588013455946 18.3125575258001 9.14624381979457 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0591212950507954 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4446280_4446410:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4446280_4446410:UBXN6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4454083 C/T 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 T:C C T 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4658047 A/G 1 31 26 57 16.0608083342157 12.5296446229158 3.53116371129989 A:G A G 10 0.481909408573686 0.357120969300966 ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 4839183 G/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G G A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4838346_4839548:PLIN3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 5587251 G/A 1 56 59 115 29.0130731198736 28.4326551058475 0.580418014026105 A:G G A 10 0.481909408573686 0.92591609829554 ENSG00000130254:ENST00000252542:exon_5587011_5587410:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000434962:exon_5587011_5587410:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000394625:exon_5587011_5587410:SAFB2;ENSG00000130254:ENST00000415313:exon_5587011_5587410:SAFB2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 5783161 G/A 1 11 8 19 5.69899650568945 3.85527526858949 1.84372123709997 A:G G A 10 0.481909408573686 0.493025990925298 ENSG00000212123:ENST00000390672:exon_5782971_5784610:PRR22;ENSG00000212123:ENST00000419421:exon_5782971_5784064:PRR22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 5786815 G/A 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 A:G G A 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5786760_5786856:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5786760_5786856:DUS3L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 6368678 T/C 1 156 166 322 80.822132262505 79.9969618232319 0.825170439273094 T:C T C 10 0.481909408573686 0.955547770553323 ENSG00000125656:ENST00000245816:exon_6368549_6368915:CLPP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 6452326 G/A 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 A:G G A 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6452323_6452490:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6452323_6452490:SLC25A23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 6468331 T/C 1 10 16 26 5.18090591426314 7.71055053717898 -2.52964462291584 T:C T C 10 0.481909408573686 0.335185485833609 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 6730998 A/G 1 27 40 67 13.9884459685105 19.2763763429474 -5.28793037443696 A:G A G 10 0.481909408573686 0.221917985852889 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6730998_6731122:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6730998_6731122:GPR108 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 6742955 C/G 1 36 14 50 18.6512612913473 6.7467317200316 11.9045295713157 C:G C G 10 0.481909408573686 0.000938566815080377 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 6828395 G/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G G A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 7132218 C/T 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7132169_7132328:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7132169_7132328:INSR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 7132333 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 7696655 G/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:G G T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000174788:ENST00000311069:exon_7696509_7696694:PCP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 7747445 G/A 1 427 371 798 221.224682539036 178.788390580838 42.4362919581985 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00290234186700687 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 7747475 G/A 1 519 538 1057 268.889016950257 259.267261812643 9.62175513761389 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.558806332201203 ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 32 36 68 16.578898925642 17.3487387086527 -0.769839783010649 A:G G A 10 0.481909408573686 0.90370635206207 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 8466991 C/T 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8466970_8467163:RAB11B;ENSG00000185236:ENST00000449488:exon_8466970_8467163:RAB11B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 9415754 T/C 0 0 9 9 0 4.33718467716317 -4.33718467716317 C T C 10 0.481909408573686 0.00409118328334302 ENSG00000196110:ENST00000308650:exon_9415748_9415795:ZNF699 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 9721401 A/T 1 7 11 18 3.6266341399842 5.30100349431055 -1.67436935432635 A:T A T 10 0.481909408573686 0.485903926383751 ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 10370490 T/A 1 253 211 464 131.076919630857 101.682885209048 29.3940344218097 A:T T A 10 0.481909408573686 0.00699264483737312 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 1079 935 2014 559.019748148993 450.585297016396 108.434451132596 T:C:G C G 10 0.481909408573686 1.43183793937614e-06 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 10468634 G/A 1 13 18 31 6.73517768854208 8.67436935432635 -1.93919166578427 A:G G A 10 0.481909408573686 0.590663103599587 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 10600442 G/C 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 C:G G C 10 0.481909408573686 0.755512817806202 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 10664632 A/G 1 33 38 71 17.0969895170684 18.3125575258001 -1.21556800873171 A:G A G 10 0.481909408573686 0.812936590906881 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11105608 T/C 1 106 118 224 54.9176026911893 56.865310211695 -1.94770752050567 T:C T C 10 0.481909408573686 0.841092098182547 ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11113651 T/C 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11114081 T/G 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 T:G T G 10 0.481909408573686 0.165882569352599 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11222108 G/C 1 14 21 35 7.2532682799684 10.1200975800474 -2.86682930007901 C:G G C 10 0.481909408573686 0.398654871598448 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11222182 T/C 1 7 16 23 3.6266341399842 7.71055053717898 -4.08391639719478 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0980365874501828 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11223929 C/T 1 2 8 10 1.03618118285263 3.85527526858949 -2.81909408573686 T:C C T 10 0.481909408573686 0.111676109980467 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 44 39 83 22.7959860227578 18.7944669343738 4.00151908838406 T:C:G G C 10 0.481909408573686 0.382372811847262 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 12763199 G/A 1 39 31 70 20.2055330656262 14.9391916657843 5.26634139984198 A:G G A 10 0.481909408573686 0.232127707023948 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12763177_12763274:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12763177_12763274:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12763177_12763274:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000433513:exon_12763177_12763274:MAN2B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 12800851 G/A 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000132004:ENST00000393261:exon_12800776_12800924:FBXW9;ENSG00000132004:ENST00000380339:exon_12800776_12801014:FBXW9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13010516 G/A 1 49 26 75 25.3864389798894 12.5296446229158 12.8567943569735 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00360624144229568 ENSG00000105607:ENST00000457854:exon_13010514_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000222214:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000421816:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000422947:exon_13010282_13010782:GCDH;ENSG00000105607:ENST00000426001:exon_13010282_13010782:GCDH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13067792 G/C 1 68 52 120 35.2301602169893 25.0592892458317 10.1708709711577 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0677649528612156 ENSG00000179271:ENST00000316939:exon_13067677_13068050:GADD45GIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13216136 T/C 1 141 125 266 73.0507733911103 60.2386760717108 12.8120973193995 T:C T C 10 0.481909408573686 0.125001467478988 ENSG00000104907:ENST00000221504:exon_13216081_13216210:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13216081_13216210:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13216081_13216210:TRMT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13216221 G/A 1 31 37 68 16.0608083342157 17.8306481172264 -1.76983978301065 A:G G A 10 0.481909408573686 0.716606729995938 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13915556 C/T 1 23 6 29 11.9160836028052 2.89145645144212 9.02462715136311 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00114371793396652 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13915578 G/A 1 16 6 22 8.28944946282102 2.89145645144212 5.39799301137891 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0306569697485289 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 13919645 G/T 1 12 11 23 6.21708709711577 5.30100349431055 0.916083602805221 T:G G T 10 0.481909408573686 0.83537731850994 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 14065488 A/G 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 A:G A G 10 0.481909408573686 0.755512817806202 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 14512489 G/A 1 12 6 18 6.21708709711577 2.89145645144212 3.32563064567365 A:G G A 10 0.481909408573686 0.156469603613933 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512465_14512572:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512465_14512572:CD97 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 14580328 A/G 1 24 12 36 12.4341741942315 5.78291290288423 6.6512612913473 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0299109339016288 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 14581063 A/G 1 61 55 116 31.6035260770052 26.5050174715527 5.09850860545242 A:G A G 10 0.481909408573686 0.354145180428987 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 15226084 G/A 1 75 64 139 38.8567943569735 30.8422021487159 8.01459220825764 A:G G A 10 0.481909408573686 0.175669533340949 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15225795_15226732:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15225798_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15225827_15226241:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000269733:exon_15225965_15226133:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226083_15226241:ILVBL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 15569378 G/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 C:G G C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15569340_15569466:RASAL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 16197320 T/C 1 104 66 170 53.8814215083367 31.8060209658633 22.0754005424734 T:C T C 10 0.481909408573686 0.000711013825660263 ENSG00000167460:ENST00000344824:exon_16197233_16197350:TPM4;ENSG00000167460:ENST00000300933:exon_16197233_16197350:TPM4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17212992 C/T 1 9 6 15 4.66281532283683 2.89145645144212 1.77135887139471 T:C C T 10 0.481909408573686 0.442227519683632 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17212466_17213367:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17212466_17213367:MYO9B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17273753 C/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C C T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17316782 T/C 1 5 11 16 2.59045295713157 5.30100349431055 -2.71055053717898 T:C T C 10 0.481909408573686 0.214902883771744 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17321487 A/G 1 16 6 22 8.28944946282102 2.89145645144212 5.39799301137891 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0306569697485289 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17321669 A/G 1 22 10 32 11.3979930113789 4.81909408573686 6.57889892564205 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0215507011638415 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17322742 A/G 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17322704_17324103:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17322704_17324103:MYO9B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17389704 G/A 1 60 53 113 31.0854354855788 25.5411986544054 5.54423683117348 A:G G A 10 0.481909408573686 0.302110163531908 ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17516142 A/G 1 117 124 241 60.6165991968787 59.7567666631371 0.859832533741674 A:G A G 10 0.481909408573686 0.948629672899058 ENSG00000130303:ENST00000416178:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000252593:exon_17516100_17516457:BST2;ENSG00000130303:ENST00000446020:exon_17516100_17516427:BST2;ENSG00000130303:ENST00000527220:exon_17516100_17516339:BST2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17628669 G/A 1 13 7 20 6.73517768854208 3.3733658600158 3.36181182852628 A:G G A 10 0.481909408573686 0.178779737512779 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17631905 G/C 1 191 141 332 98.955302962426 67.9492266088897 31.0060763535362 A:C:G G C 10 0.481909408573686 0.000783162113054049 ENSG00000130313:ENST00000252603:exon_17631753_17632095:PGLS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 17937533 A/G 1 32 29 61 16.578898925642 13.9753728486369 2.60352607700515 A:G A G 10 0.481909408573686 0.524086644623582 ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17935595_17937719:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17936961_17937719:JAK3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 18652521 G/A 1 47 29 76 24.3502577970368 13.9753728486369 10.3748849483999 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.0211398079213069 ENSG00000105701:ENST00000222308:exon_18652489_18652805:FKBP8;ENSG00000105701:ENST00000453489:exon_18652489_18652805:FKBP8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 18684563 C/T 1 35 2 37 18.133170699921 0.963818817147372 17.1693518827736 T:C C T 10 0.481909408573686 2.46818599912089e-09 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 18685653 C/T 1 13 13 26 6.73517768854208 6.26482231145792 0.470355377084163 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19010565 G/C 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 C:G G C 10 0.481909408573686 0.165882569352599 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 6 14 20 3.10854354855788 6.7467317200316 -3.63818817147372 T:C T C 10 0.481909408573686 0.120057313816211 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19035488 C/T 1 2 11 13 1.03618118285263 5.30100349431055 -4.26482231145792 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0235613876162475 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19035432_19035508:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19035432_19035508:DDX49 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19039030 C/T 1 39 38 77 20.2055330656262 18.3125575258001 1.89297553982617 T:C C T 10 0.481909408573686 0.732574231960067 ENSG00000105671:ENST00000247003:exon_19038937_19039436:DDX49;ENSG00000105671:ENST00000438170:exon_19038937_19039438:DDX49 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19312510 G/A 1 266 269 535 137.8120973194 129.633630906322 8.17846641307798 A:G G A 10 0.481909408573686 0.489003360298141 ENSG00000064490:ENST00000353145:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000303088:exon_19312458_19312678:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000456252:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000407360:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000064490:ENST00000392324:exon_19312458_19312675:RFXANK;ENSG00000184162:ENST00000331552:exon_19312226_19312850:NR2C2AP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19390185 G/A 1 15 6 21 7.77135887139471 2.89145645144212 4.87990241995259 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0470711649171596 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19576310 G/A 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G G A 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000167491:ENST00000417582:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000360315:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000252577:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429563:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000494516:exon_19576154_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000457895:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000432704:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000404158:exon_19576154_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000429242:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000358713:exon_19576149_19576423:GATAD2A;ENSG00000167491:ENST00000444839:exon_19576154_19576423:GATAD2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 19740976 C/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000089639:ENST00000203556:exon_19740288_19741145:GMIP;ENSG00000089639:ENST00000445806:exon_19740288_19741145:GMIP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 21720616 T/C 1 12 2 14 6.21708709711577 0.963818817147372 5.2532682799684 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00582458966588113 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 23837321 A/C 1 7 12 19 3.6266341399842 5.78291290288423 -2.15627876290004 A:C A C 10 0.481909408573686 0.365298764164019 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 33096816 C/T 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 T:C C T 10 0.481909408573686 0.134075613444074 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33096741_33096860:ANKRD27 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 33106621 C/T 1 8 2 10 4.14472473141051 0.963818817147372 3.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.057427455776973 ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 33137322 A/G 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:G A G 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 33372814 G/A 1 11 7 18 5.69899650568945 3.3733658600158 2.32563064567365 A:G G A 10 0.481909408573686 0.347236209840515 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33372750_33372919:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33372750_33372919:CCDC123 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 33467576 G/A 1 8 13 21 4.14472473141051 6.26482231145792 -2.12009758004741 A:G G A 10 0.481909408573686 0.389885270115520 ENSG00000131944:ENST00000254262:exon_33467337_33467946:C19orf40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 23 13 36 11.9160836028052 6.26482231145792 5.6512612913473 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0669536097907766 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 34706531 A/G 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 A:G A G 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 34868642 A/G 1 9 14 23 4.66281532283683 6.7467317200316 -2.08391639719478 A:G A G 10 0.481909408573686 0.411977064158497 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 34872382 G/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34872371_34872424:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34872371_34872424:GPI HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 34935914 C/T 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34935905_34936026:UBA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 34959979 A/G 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34959945_34960795:UBA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35512675 C/T 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35512595_35512768:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35512595_35512768:GRAMD1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 12 19 31 6.21708709711577 9.15627876290004 -2.93919166578427 T:G T G 10 0.481909408573686 0.369325859176407 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 59 33 92 30.5673448941525 15.9030104829316 14.6643344112209 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00237310502287122 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35769908 C/G 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 C:G C G 10 0.481909408573686 0.39148304783409 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35769849_35769977:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35769873_35769977:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35769849_35769977:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35769849_35769977:USF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35770174 A/G 1 14 8 22 7.2532682799684 3.85527526858949 3.39799301137891 A:G A G 10 0.481909408573686 0.199860344813854 ENSG00000105698:ENST00000222305:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000434131:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000343550:exon_35770070_35770718:USF2;ENSG00000105698:ENST00000379134:exon_35770070_35770718:USF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35822959 C/T 1 27 60 87 13.9884459685105 28.9145645144212 -14.9261185459107 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00170059090122916 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35822922_35822977:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35822944_35822977:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35822944_35822977:CD22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35826894 G/A 1 20 13 33 10.3618118285263 6.26482231145792 4.09698951706836 A:G G A 10 0.481909408573686 0.166503345114812 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35832639 G/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000012124:ENST00000085219:exon_35832605_35832868:CD22;ENSG00000012124:ENST00000341773:exon_35832605_35832868:CD22;ENSG00000012124:ENST00000419549:exon_35832605_35832868:CD22;ENSG00000012124:ENST00000270311:exon_35832605_35832868:CD22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 35835940 C/T 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.291636936274409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 36142187 C/T 1 206 245 451 106.726661833821 118.067805100553 -11.3411432667324 T:C C T 10 0.481909408573686 0.299969194925914 ENSG00000126267:ENST00000246554:exon_36142135_36142251:COX6B1;ENSG00000126267:ENST00000392201:exon_36142135_36142251:COX6B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 36210896 C/G 1 22 15 37 11.3979930113789 7.22864112860529 4.16935188277362 C:G C G 10 0.481909408573686 0.189939627147604 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36210686_36212706:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000341701:exon_36210686_36211842:AD000671.3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 36213461 C/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 36494297 C/T 1 18 12 30 9.32563064567365 5.78291290288423 3.54271774278942 T:C C T 10 0.481909408573686 0.206237508491672 ENSG00000181392:ENST00000505054:exon_36494209_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000397428:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000503121:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000340477:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000324444:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000465425:exon_36494212_36494422:C19orf46;ENSG00000181392:ENST00000490730:exon_36494212_36494422:C19orf46 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 37210529 A/G 1 19 11 30 9.84372123709996 5.30100349431055 4.54271774278942 A:G A G 10 0.481909408573686 0.103267048539996 ENSG00000189042:ENST00000360729:exon_37209850_37212223:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000392163:exon_37209850_37211363:ZNF567;ENSG00000189042:ENST00000423498:exon_37209850_37212223:ZNF567 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 37853113 T/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:G T G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853011_37853489:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 38798086 T/C 1 123 198 321 63.7251427454366 95.4180628975898 -31.6929201521532 T:C T C 10 0.481909408573686 0.000419056774528596 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 38798287 G/A 1 16 16 32 8.28944946282102 7.71055053717898 0.578898925642047 A:G G A 10 0.481909408573686 0.861330262000225 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798237_38798392:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798237_38798392:YIF1B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 38873867 C/A 1 13 24 37 6.73517768854208 11.5658258057685 -4.83064811722638 A:C C A 10 0.481909408573686 0.138322340638776 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 38897664 G/A 1 5 23 28 2.59045295713157 11.0839163971948 -8.49346344006321 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00110394500493502 ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38897550_38897717:FAM98C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39219780 T/C 1 14 21 35 7.2532682799684 10.1200975800474 -2.86682930007901 A:T:C T C 10 0.481909408573686 0.398654871598448 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219636_39219794:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000477174:exon_39219636_39219794:ACTN4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39322087 T/G 1 8 9 17 4.14472473141051 4.33718467716317 -0.192459945752662 T:G T G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39321949_39322156:ECH1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39359980 G/A 1 17 13 30 8.80754005424734 6.26482231145792 2.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.367501038366417 ENSG00000187994:ENST00000340740:exon_39359887_39360050:RINL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39899139 G/A 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.134075613444074 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39899177 T/C 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39899234 G/A 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.134075613444074 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 16 8 24 8.28944946282102 3.85527526858949 4.43417419423154 A:G G A 10 0.481909408573686 0.100356840028341 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 26 40 66 13.4703553770842 19.2763763429474 -5.80602096586328 A:C:G C G 10 0.481909408573686 0.175529596398460 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 40199856 G/C 1 27 51 78 13.9884459685105 24.577379837258 -10.5889338687475 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0172301694183338 ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40199837_40200087:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40199837_40200087:LGALS14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 40325254 G/A 1 11 4 15 5.69899650568945 1.92763763429474 3.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0689223984537358 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 40486606 T/C 1 158 114 272 81.8583134453576 54.9376725774002 26.9206408679574 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00126115760773986 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40486569_40486624:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40486569_40486624:PSMC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 41096554 C/T 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 43979632 G/A 1 3 8 11 1.55427177427894 3.85527526858949 -2.30100349431055 A:G G A 10 0.481909408573686 0.229933048608863 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 44153003 C/T 0 11 0 11 5.69899650568945 0 5.69899650568945 C C 10 0.481909408573686 0.000325551318653959 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 44768445 T/C 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 T:C T C 10 0.481909408573686 0.597188270417829 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45496032 G/A 1 17 12 29 8.80754005424734 5.78291290288423 3.0246271513631 A:G G A 10 0.481909408573686 0.271675678059475 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45496430 G/C 1 27 26 53 13.9884459685105 12.5296446229158 1.45880134559464 C:G G C 10 0.481909408573686 0.78371071951198 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45593763 C/A 1 33 46 79 17.0969895170684 22.1678327943896 -5.0708432773212 A:C C A 10 0.481909408573686 0.262441171952213 ENSG00000142252:ENST00000414125:exon_45593365_45594782:GEMIN7;ENSG00000142252:ENST00000270257:exon_45593365_45594782:GEMIN7;ENSG00000142252:ENST00000391951:exon_45593365_45594782:GEMIN7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45864924 C/G 1 12 16 28 6.21708709711577 7.71055053717898 -1.49346344006321 C:G C G 10 0.481909408573686 0.706039598102527 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45912341 C/T 1 89 74 163 46.1100626369419 35.6612962344528 10.4487664024892 T:C C T 10 0.481909408573686 0.116723120148483 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 10 24 34 5.18090591426314 11.5658258057685 -6.38491989150533 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0379965639697704 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 45923632 G/A 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 46024584 T/G 1 7 18 25 3.6266341399842 8.67436935432635 -5.04773521434215 T:G T G 10 0.481909408573686 0.0466719131406287 ENSG00000125753:ENST00000245932:exon_46024580_46024664:VASP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 46025400 G/C 1 17 18 35 8.80754005424734 8.67436935432635 0.133170699920989 C:G G C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 46320041 G/T 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 T:G G T 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 46387344 G/A 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.134075613444074 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 47774706 C/T 1 23 24 47 11.9160836028052 11.5658258057685 0.350257797036756 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 47774772 T/C 1 29 15 44 15.0246271513631 7.22864112860529 7.79598602275782 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0228390627553837 ENSG00000105321:ENST00000221922:exon_47774531_47775208:CCDC9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48248834 T/C 1 18 8 26 9.32563064567365 3.85527526858949 5.47035537708416 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0475910894690397 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48248907 G/C 1 26 8 34 13.4703553770842 3.85527526858949 9.61508010849467 C:G G C 10 0.481909408573686 0.000944872032294519 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48248808_48249040:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48248808_48249040:GLTSCR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48254799 T/C 1 67 54 121 34.712069625563 26.023108062979 8.68896156258399 T:C T C 10 0.481909408573686 0.122217477835687 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48254777_48254847:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48254777_48254847:GLTSCR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48259200 A/G 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G A G 10 0.481909408573686 0.727991494992515 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48259787 C/T 1 830 967 1797 430.015190883841 466.006398090754 -35.9912072069138 A:T:C:G C T 10 0.481909408573686 0.0937145418773211 ENSG00000105373:ENST00000446535:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000246802:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000422743:exon_48259785_48259861:GLTSCR2;ENSG00000105373:ENST00000325566:exon_48259785_48259861:GLTSCR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48601350 T/C 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48601454 T/C 0 9 0 9 4.66281532283683 0 4.66281532283683 T T 10 0.481909408573686 0.00140180836789809 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48601483 G/C 0 0 8 8 0 3.85527526858949 -3.85527526858949 C G C 10 0.481909408573686 0.00809979847322851 ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48601396_48601516:PLA2G4C;ENSG00000105499:ENST00000413144:exon_48601364_48601516:PLA2G4C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48660403 A/C 1 3 11 14 1.55427177427894 5.30100349431055 -3.7467317200316 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0596153979871713 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 48734901 C/T 1 7 14 21 3.6266341399842 6.7467317200316 -3.12009758004741 T:C C T 10 0.481909408573686 0.195329546341787 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49377086 T/C 1 18 30 48 9.32563064567365 14.4572822572106 -5.13165161153693 T:C T C 10 0.481909408573686 0.150267384931082 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49377424 G/A 1 25 20 45 12.9522647856578 9.63818817147372 3.31407661418413 A:G G A 10 0.481909408573686 0.371607026237782 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49378994 A/G 1 123 86 209 63.7251427454366 41.444209137337 22.2809336080996 A:G A G 10 0.481909408573686 0.002259686172856 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49379167 C/T 1 133 111 244 68.9060486596998 53.4919443516792 15.4141043080206 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.054421899326943 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49379182 G/C 1 162 108 270 83.9306758110629 52.0462161259581 31.8844596851048 C:G G C 10 0.481909408573686 0.000117090680573435 ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49469603 A/G 1 4303 3522 7825 2229.34381490743 1697.28493699652 532.058877910907 A:T:G A G 10 0.481909408573686 2.42343570118079e-33 ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469538_49469663:FTL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49507542 A/G 1 7 8 15 3.6266341399842 3.85527526858949 -0.228641128605291 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49514320 C/T 1 20 26 46 10.3618118285263 12.5296446229158 -2.16783279438956 T:C C T 10 0.481909408573686 0.557634564094642 ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49514256_49514350:RUVBL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 49839015 T/C 1 18 24 42 9.32563064567365 11.5658258057685 -2.24019516009481 T:C T C 10 0.481909408573686 0.538807997754212 ENSG00000104894:ENST00000323906:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000391859:exon_49838971_49839043:CD37;ENSG00000104894:ENST00000426897:exon_49838971_49839043:CD37 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50162909 C/G 0 0 1267 1267 0 610.57922066286 -610.57922066286 T:G C G 10 0.481909408573686 0 ENSG00000126456:ENST00000377139:exon_50162829_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000377135:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000309877:exon_50162830_50163090:IRF3;ENSG00000126456:ENST00000442265:exon_50162830_50163090:IRF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50310466 G/A 1 10 11 21 5.18090591426314 5.30100349431055 -0.120097580047406 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50358133 T/G 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:G T G 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50361874 A/G 1 116 85 201 60.0985086054524 40.9622997287633 19.1362088766891 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00725398268610478 ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361806_50361910:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361806_50361910:PTOV1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50383636 T/C 1 20 18 38 10.3618118285263 8.67436935432635 1.68744247419993 T:C T C 10 0.481909408573686 0.628433498040842 ENSG00000104946:ENST00000221543:exon_50383536_50383659:TBC1D17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50393269 A/G 1 365 765 1130 189.103065870605 368.66069755887 -179.557631688265 A:G A G 10 0.481909408573686 3.13214660713721e-27 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50393743 A/G 1 23 60 83 11.9160836028052 28.9145645144212 -16.9984809116159 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000164448170221749 ENSG00000104951:ENST00000341114:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000391826:exon_50392916_50393857:IL4I1;ENSG00000104951:ENST00000319225:exon_50392917_50393857:IL4I1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50412309 C/G 0 12 0 12 6.21708709711577 0 6.21708709711577 C C 10 0.481909408573686 0.000156886243432913 ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50435747 T/C 1 47 45 92 24.3502577970368 21.6859233858159 2.66433441122089 T:C T C 10 0.481909408573686 0.602971932566769 ENSG00000169136:ENST00000423777:exon_50435679_50437192:ATF5;ENSG00000169136:ENST00000306139:exon_50435679_50437191:ATF5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50885823 G/A 1 28 28 56 14.5065365599368 13.4934634400632 1.01307311987358 A:G G A 10 0.481909408573686 0.791017977440359 ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50885713_50886266:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50885713_50886218:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50885713_50885859:NR1H2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 50921137 G/A 1 77 81 158 39.8929755398262 39.0346620944686 0.858313445357609 A:G G A 10 0.481909408573686 0.936594653042192 ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50921099_50921270:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50921099_50921270:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50921099_50921270:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50921099_50921270:POLD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 51301395 C/T 1 317 323 640 164.234717482142 155.656738969301 8.57797851284093 T:C C T 10 0.481909408573686 0.501565198262151 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 51301456 G/A 1 197 175 372 102.063846510984 84.3341465003951 17.7297000105888 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0693598518652066 ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 51323232 T/C 1 182 202 384 94.2924876395891 97.3457005318846 -3.05321289229543 T:C T C 10 0.481909408573686 0.759617584701931 ENSG00000167748:ENST00000301420:exon_51323155_51323291:KLK1;ENSG00000167748:ENST00000448701:exon_51323155_51323291:KLK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 51850290 G/A 1 135 139 274 69.9422298425524 66.9854077917424 2.95682205081003 A:G G A 10 0.481909408573686 0.762519435955598 ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51850154_51850312:ETFB;ENSG00000105379:ENST00000354232:exon_51850154_51850312:ETFB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 52471863 A/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G A G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52471831_52471926:ZNF615 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 53268917 C/T 1 17 36 53 8.80754005424734 17.3487387086527 -8.54119865440536 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0195041929510653 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 54610150 G/A 1 451 284 735 233.658856733268 136.862272034927 96.7965846983408 A:G G A 10 0.481909408573686 8.07325156740767e-13 ENSG00000170906:ENST00000417903:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000419113:exon_54610118_54610285:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000485876:exon_54610118_54610875:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391762:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000451517:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000391763:exon_54610118_54610272:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000484103:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000303553:exon_54610118_54610268:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000422029:exon_54610118_54610277:NDUFA3;ENSG00000170906:ENST00000420296:exon_54610071_54610268:NDUFA3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 54660654 G/A 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000105617:ENST00000222224:exon_54660501_54660763:LENG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 54711258 T/G 1 55 137 192 28.4949825284473 66.021588974595 -37.5266064461477 T:G T G 10 0.481909408573686 4.22674795605825e-08 ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 54968079 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54967815_54968100:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54967815_54968100:LENG8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 54973451 C/T 1 4 18 22 2.07236236570526 8.67436935432635 -6.60200698862109 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00488404833515878 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 55964720 G/A 1 136 134 270 70.4603204339787 64.5758607488739 5.88445968510477 A:G G A 10 0.481909408573686 0.503040344548646 ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55964345_55964755:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55964345_55964755:ISOC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 55995401 T/C 1 14 6 20 7.2532682799684 2.89145645144212 4.36181182852628 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0713206184786195 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 55998281 C/T 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 56156447 A/G 1 31 10 41 16.0608083342157 4.81909408573686 11.2417142484789 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000459084026102149 ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 19 59061384 C/T 1 144 117 261 74.6050451653892 56.3834008031213 18.221644362268 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.0256676025717738 ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59061316_59061402:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59061316_59061402:TRIM28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 81 76 157 41.9653379055314 36.6251150516001 5.34022285393129 T:C C T 10 0.481909408573686 0.424731301575841 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 3502803 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 9991654 G/A 1 2 9 11 1.03618118285263 4.33718467716317 -3.30100349431055 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0673297579948189 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 10712278 C/T 1 12 26 38 6.21708709711577 12.5296446229158 -6.31255752580007 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0503841712734799 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10710892_10712316:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10711781_10712316:NOL10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 10924343 T/A 1 103 81 184 53.3633309169103 39.0346620944686 14.3286688224418 A:T T A 10 0.481909408573686 0.0386495867417218 ENSG00000143882:ENST00000381661:exon_10923300_10925236:ATP6V1C2;ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10923517_10924452:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10923519_10924452:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10923987_10924452:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10923987_10924452:PDIA6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 10924344 C/T 1 101 81 182 52.3271497340577 39.0346620944686 13.2924876395891 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0536101216421364 ENSG00000143882:ENST00000381661:exon_10923300_10925236:ATP6V1C2;ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10923517_10924452:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10923519_10924452:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10923987_10924452:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10923987_10924452:PDIA6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 10927418 G/A 1 26 27 53 13.4703553770842 13.0115540314895 0.45880134559464 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10927407_10927565:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10927407_10927565:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10927407_10927565:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10927407_10927565:PDIA6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 10 6 16 5.18090591426314 2.89145645144212 2.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.319522314154991 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 17884495 C/T 1 6 11 17 3.10854354855788 5.30100349431055 -2.19245994575266 T:C C T 10 0.481909408573686 0.337726755422537 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17884424_17884559:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17884424_17884559:SMC6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 30480445 A/G 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000213626:ENST00000395323:exon_30480299_30482894:LBH;ENSG00000213626:ENST00000406087:exon_30480299_30480522:LBH;ENSG00000213626:ENST00000401506:exon_30480299_30480626:LBH;ENSG00000213626:ENST00000467242:exon_30480299_30480906:LBH;ENSG00000213626:ENST00000407930:exon_30480299_30481189:LBH;ENSG00000213626:ENST00000484150:exon_30480299_30480566:LBH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 32800213 C/T 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C C T 10 0.481909408573686 0.784647630659318 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 33740192 G/A 1 15 21 36 7.77135887139471 10.1200975800474 -2.3487387086527 A:G G A 10 0.481909408573686 0.505939866442977 ENSG00000152689:ENST00000447683:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000479528:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000437184:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000482857:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000442390:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000425210:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000423159:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000444784:exon_33740077_33740273:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33740077_33740273:RASGRP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 33759395 C/T 1 14 10 24 7.2532682799684 4.81909408573686 2.43417419423154 T:C C T 10 0.481909408573686 0.414637908202845 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000490150:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000419772:exon_33759390_33759467:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000468856:exon_33756792_33759467:RASGRP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 33783917 G/A 1 9 19 28 4.66281532283683 9.15627876290004 -4.49346344006321 A:G G A 10 0.481909408573686 0.128850615889316 ENSG00000152689:ENST00000402538:exon_33783739_33784097:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000337416:exon_33783739_33784097:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000403687:exon_33783739_33784097:RASGRP3;ENSG00000152689:ENST00000407811:exon_33783739_33784097:RASGRP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 37336403 G/C 1 29 28 57 15.0246271513631 13.4934634400632 1.5311637112999 C:G G C 10 0.481909408573686 0.693348906631379 ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37336337_37336438:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000462861:exon_37336337_37336643:EIF2AK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 37873289 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000163171:ENST00000295324:exon_37869032_37873965:CDC42EP3;ENSG00000163171:ENST00000457889:exon_37873084_37873965:CDC42EP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 46850981 C/T 1 20 10 30 10.3618118285263 4.81909408573686 5.54271774278942 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0457509463026155 ENSG00000119878:ENST00000486447:exon_46850903_46851006:CRIPT;ENSG00000119878:ENST00000238892:exon_46850903_46851006:CRIPT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 4 10 14 2.07236236570526 4.81909408573686 -2.7467317200316 T:C T C 10 0.481909408573686 0.18355917459004 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 54858664 C/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 55254060 C/T 1 76 67 143 39.3748849483999 32.287930374437 7.0869545739629 T:C C T 10 0.481909408573686 0.242364242681601 ENSG00000115310:ENST00000405240:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000357376:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000337526:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000394611:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000404909:exon_55252222_55254621:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000354474:exon_55252222_55254363:RTN4;ENSG00000115310:ENST00000402434:exon_55252222_55254616:RTN4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 55573323 C/T 1 27 11 38 13.9884459685105 5.30100349431055 8.68744247419993 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00536482669419219 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55573311_55573469:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55573311_55573469:CCDC88A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 62067197 G/A 1 9 18 27 4.66281532283683 8.67436935432635 -4.01155403148952 A:G G A 10 0.481909408573686 0.128652019727975 ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 62362995 T/C 1 339 341 680 175.63271049352 164.331108323627 11.3016021698935 T:C T C 10 0.481909408573686 0.398613391153402 ENSG00000173163:ENST00000472729:exon_62362966_62363193:COMMD1;ENSG00000173163:ENST00000311832:exon_62362966_62363382:COMMD1;ENSG00000173163:ENST00000458337:exon_62362966_62363114:COMMD1;ENSG00000173163:ENST00000427417:exon_62362966_62363114:COMMD1;ENSG00000173163:ENST00000444166:exon_62362980_62363114:COMMD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 10 12 22 5.18090591426314 5.78291290288423 -0.602006988621093 A:G G A 10 0.481909408573686 0.834217999493083 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 65298839 A/G 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 65495887 G/A 1 21 7 28 10.8799024199526 3.3733658600158 7.50653655993679 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00694415956812882 ENSG00000138071:ENST00000260641:exon_65495698_65498387:ACTR2;ENSG00000138071:ENST00000377982:exon_65495698_65497280:ACTR2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 67632397 A/G 1 5 21 26 2.59045295713157 10.1200975800474 -7.52964462291584 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00290482778333336 ENSG00000143971:ENST00000272342:exon_67630357_67632467:ETAA1;ENSG00000143971:ENST00000462772:exon_67632129_67632467:ETAA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 68621239 G/A 1 12 11 23 6.21708709711577 5.30100349431055 0.916083602805221 A:G G A 10 0.481909408573686 0.83537731850994 ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68621239_68621308:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000474788:exon_68621239_68621308:PLEK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 70508753 G/T 1 17 28 45 8.80754005424734 13.4934634400632 -4.68592338581587 T:G G T 10 0.481909408573686 0.180796714956258 ENSG00000143977:ENST00000272348:exon_70508494_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000429728:exon_70508499_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000482975:exon_70508636_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000438261:exon_70508637_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000454893:exon_70508639_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000413456:exon_70508639_70508816:SNRPG;ENSG00000143977:ENST00000449935:exon_70508640_70508816:SNRPG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 17 4 21 8.80754005424734 1.92763763429474 6.87990241995259 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0034603333984545 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 73477527 C/T 1 46 39 85 23.8321672056104 18.7944669343738 5.03770027123669 T:C C T 10 0.481909408573686 0.279979806255904 ENSG00000135624:ENST00000258091:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000398422:exon_73477434_73477566:CCT7;ENSG00000135624:ENST00000409081:exon_73477434_73477566:CCT7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 65 50 115 33.6758884427104 24.0954704286843 9.58041801402611 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0766909077628636 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 74754071 C/T 1 494 490 984 255.936752164599 236.135610201106 19.801141963493 T:C C T 10 0.481909408573686 0.213478963293490 ENSG00000115307:ENST00000425118:exon_74754068_74754248:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000377526:exon_74754068_74754186:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000459792:exon_74754068_74754186:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000456927:exon_74754068_74754186:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000258081:exon_74754068_74754186:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000463900:exon_74754068_74754186:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000466894:exon_74754068_74754248:AUP1;ENSG00000115307:ENST00000486234:exon_74754068_74754490:AUP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 74761949 A/G 1 8 11 19 4.14472473141051 5.30100349431055 -1.15627876290003 A:G A G 10 0.481909408573686 0.651736024435881 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 38 25 63 19.6874424741999 12.0477352143422 7.63970725985778 T:G T G 10 0.481909408573686 0.0588178038969845 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85628745 C/T 1 19 17 36 9.84372123709996 8.19245994575266 1.6512612913473 T:C C T 10 0.481909408573686 0.619600928115492 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85628652_85628794:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628652_85628806:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628652_85628806:CAPG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85628983 C/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000439385:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000449030:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000447219:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000459793:exon_85628908_85629281:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409275:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000415012:exon_85628908_85629080:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000491267:exon_85628768_85629281:CAPG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85769711 C/G 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000168906:ENST00000306434:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000424323:exon_85769688_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000481412:exon_85769278_85769870:MAT2A;ENSG00000168906:ENST00000409017:exon_85769688_85769870:MAT2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85808871 C/T 1 224 268 492 116.052292479494 129.151721497748 -13.0994290182535 T:C C T 10 0.481909408573686 0.241112603401762 ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85818886 C/T 1 16 11 27 8.28944946282102 5.30100349431055 2.98844596851048 T:C C T 10 0.481909408573686 0.335782141208118 ENSG00000168899:ENST00000306384:exon_85818848_85818985:VAMP5;ENSG00000168899:ENST00000462451:exon_85818720_85818987:VAMP5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 85820027 A/G 1 10 20 30 5.18090591426314 9.63818817147372 -4.45728225721058 A:G A G 10 0.481909408573686 0.142671073839408 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 10 6 16 5.18090591426314 2.89145645144212 2.28944946282102 T:C T C 10 0.481909408573686 0.319522314154991 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 570 7298 7868 295.311637112999 3516.97486377076 -3221.66322665776 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 89160131 T/C 1 23 48 71 11.9160836028052 23.1316516115369 -11.2155680087317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00864133141433769 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 89160423 G/A 1 21 3 24 10.8799024199526 1.44572822572106 9.43417419423153 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.000107076670410088 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 99804642 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99804640_99804720:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000410042:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000473743:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000449429:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409145:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99804640_99804720:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000476721:exon_99804640_99804720:MRPL30 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 99812070 G/A 1 21 16 37 10.8799024199526 7.71055053717898 3.16935188277362 A:G G A 10 0.481909408573686 0.326315253443273 ENSG00000241962:ENST00000424491:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000512183:exon_99812036_99814089:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308656:exon_99812036_99812219:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000308644:exon_99812036_99813896:C2orf15;ENSG00000241962:ENST00000509871:exon_99812036_99812286:C2orf15;ENSG00000185414:ENST00000338148:exon_99812036_99814089:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000465432:exon_99812036_99812485:MRPL30;ENSG00000185414:ENST00000409841:exon_99812036_99812286:MRPL30 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 99936186 T/G 1 9 14 23 4.66281532283683 6.7467317200316 -2.08391639719478 T:G T G 10 0.481909408573686 0.411977064158497 ENSG00000115514:ENST00000264255:exon_99935445_99936262:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000422767:exon_99935971_99936262:TXNDC9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 99938565 T/C 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 T:C T C 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000115514:ENST00000264255:exon_99938418_99938672:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000422767:exon_99938418_99938672:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000409434:exon_99937997_99938672:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000463385:exon_99938024_99938672:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000438680:exon_99938407_99938672:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000434323:exon_99938526_99938672:TXNDC9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 100011243 A/G 1 32 10 42 16.578898925642 4.81909408573686 11.7598048399052 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000288463233158267 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_100011182_100011346:EIF5B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 100022421 C/A 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 A:C C A 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100022372_100022568:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100022372_100022568:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100022372_100022568:REV1;ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100022372_100022568:REV1;ENSG00000135945:ENST00000438366:exon_100022390_100022568:REV1;ENSG00000135945:ENST00000472000:exon_100022395_100022568:REV1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 105912880 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000135966:ENST00000393359:exon_105912813_105912967:TGFBRAP1;ENSG00000135966:ENST00000258449:exon_105912813_105912967:TGFBRAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 105959592 G/A 1 15 10 25 7.77135887139471 4.81909408573686 2.95226478565785 A:G G A 10 0.481909408573686 0.317115061744928 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105959305_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105959558_105959680:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105959558_105959680:C2orf49 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 105977761 G/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000115641:ENST00000409177:exon_105974169_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000344213:exon_105977269_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393353:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000530340:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000393352:exon_105977283_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000322142:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000336660:exon_105977285_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000358129:exon_105977287_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000409807:exon_105977314_105977891:FHL2;ENSG00000115641:ENST00000408995:exon_105977318_105977891:FHL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 106509407 C/G 1 5 13 18 2.59045295713157 6.26482231145792 -3.67436935432635 C:G C G 10 0.481909408573686 0.100145970992449 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 109099531 C/G 1 33 44 77 17.0969895170684 21.2040139772422 -4.10702446017382 C:G C G 10 0.481909408573686 0.363763820687093 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000447558:exon_109099518_109099612:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109099518_109099622:GCC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 469 315 784 242.984487378941 151.801463700711 91.1830236782301 C:G C G 10 0.481909408573686 8.1862928972126e-11 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 118577278 G/A 1 451 574 1025 233.658856733268 276.616000521296 -42.9571437880282 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.00786045482876786 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118577225_118577368:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118577225_118577368:DDX18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 120129887 G/A 1 560 417 977 290.130731198736 200.956223375227 89.1745078235087 A:G G A 10 0.481909408573686 1.33381796413907e-08 ENSG00000155368:ENST00000355857:exon_120129821_120130126:DBI;ENSG00000155368:ENST00000409094:exon_120129821_120130057:DBI;ENSG00000155368:ENST00000311521:exon_120129821_120130122:DBI;ENSG00000155368:ENST00000460901:exon_120129821_120130030:DBI;ENSG00000155368:ENST00000393103:exon_120129821_120129983:DBI;ENSG00000155368:ENST00000475783:exon_120129821_120130076:DBI HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 127453543 T/C 1 19 7 26 9.84372123709996 3.3733658600158 6.47035537708416 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0167765160454474 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 22 6 28 11.3979930113789 2.89145645144212 8.50653655993679 A:C A C 10 0.481909408573686 0.00187611848914961 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 132241704 C/T 1 349 120 469 180.813616407784 57.8291290288423 122.984487378941 A:T:C C T 10 0.481909408573686 7.391811627477e-31 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 132241731 T/C 1 472 172 644 244.53875915322 82.888418274674 161.650340878546 T:C T C 10 0.481909408573686 2.70517499635365e-38 ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 132290464 G/A 1 3 12 15 1.55427177427894 5.78291290288423 -4.22864112860529 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0369058189380347 ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290437_132290510:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000434330:exon_132290437_132290514:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290437_132290510:CCDC74A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 135711657 G/A 1 37 35 72 19.1693518827736 16.866829300079 2.30252258269461 A:G G A 10 0.481909408573686 0.63774288334513 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 136664975 A/G 1 613 766 1379 317.58953254433 369.142606967443 -51.5530744231131 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00550473902124476 ENSG00000115866:ENST00000264161:exon_136664247_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000478212:exon_136664394_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000489964:exon_136664814_136664977:DARS;ENSG00000115866:ENST00000422708:exon_136664830_136664977:DARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 152226570 A/G 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G A G 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000123610:ENST00000243347:exon_152226534_152226762:TNFAIP6;ENSG00000123610:ENST00000460812:exon_152226534_152226762:TNFAIP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 152320118 G/A 1 19 15 34 9.84372123709996 7.22864112860529 2.61508010849467 A:G G A 10 0.481909408573686 0.395002685767958 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 152322095 A/T 1 222 101 323 115.016111296642 48.6728502659423 66.3432610306994 A:T A T 10 0.481909408573686 9.65825238003837e-14 ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 153475556 T/C 1 14 18 32 7.2532682799684 8.67436935432635 -1.42110107435795 T:C T C 10 0.481909408573686 0.724283009423749 ENSG00000157827:ENST00000288670:exon_153475360_153475672:FMNL2;ENSG00000157827:ENST00000421344:exon_153475433_153475672:FMNL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 160182302 C/T 1 10 11 21 5.18090591426314 5.30100349431055 -0.120097580047406 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160182164_160182429:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000474437:exon_160182275_160182429:BAZ2B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 160229596 T/C 1 33 62 95 17.0969895170684 29.8783833315685 -12.7813938145002 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00995510410757467 ENSG00000123636:ENST00000392783:exon_160229556_160229700:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000392782:exon_160229556_160229700:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000343439:exon_160229556_160229700:BAZ2B;ENSG00000123636:ENST00000355831:exon_160229556_160229700:BAZ2B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 160708774 A/G 1 21 26 47 10.8799024199526 12.5296446229158 -1.64974220296324 A:G A G 10 0.481909408573686 0.663737805033693 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160708712_160708851:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160708712_160708851:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160708712_160708851:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160708712_160708851:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160708712_160708851:RP11-357L2.1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 160729082 A/G 1 5 9 14 2.59045295713157 4.33718467716317 -1.7467317200316 A:G A G 10 0.481909408573686 0.428255926399451 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160728962_160729104:LY75;ENSG00000054219:ENST00000484559:exon_160728330_160729104:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160728962_160729104:RP11-357L2.1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 171822569 G/A 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 A:G G A 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171822300_171823639:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171822300_171823133:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171822300_171823636:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171822300_171823111:GORASP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 172188320 G/A 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000483284:exon_172188314_172189305:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000438609:exon_172188275_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172188314_172188377:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172188318_172188377:METTL8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 179355486 C/T 1 26 26 52 13.4703553770842 12.5296446229158 0.940710754168325 T:C C T 10 0.481909408573686 0.889818392213215 ENSG00000116095:ENST00000234453:exon_179355386_179355541:PLEKHA3;ENSG00000116095:ENST00000453653:exon_179355386_179355541:PLEKHA3;ENSG00000116095:ENST00000461474:exon_179355386_179355541:PLEKHA3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 179531571 C/T 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000155657:ENST00000392423:exon_179531551_179531628:TTN;ENSG00000155657:ENST00000425332:exon_179531551_179531628:TTN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 179554050 G/A 1 12 3 15 6.21708709711577 1.44572822572106 4.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0178610337248131 ENSG00000155657:ENST00000473181:exon_179554017_179554100:TTN;ENSG00000155657:ENST00000356127:exon_179554017_179554100:TTN;ENSG00000155657:ENST00000342992:exon_179554017_179554100:TTN;ENSG00000155657:ENST00000414766:exon_179554017_179554100:TTN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 164 144 308 84.9668569939155 69.3949548346108 15.5719021593047 A:T A T 10 0.481909408573686 0.0773201854443974 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 182374534 A/G 1 21 28 49 10.8799024199526 13.4934634400632 -2.61356102011062 A:G A G 10 0.481909408573686 0.47802545583202 ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 182395345 G/A 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 182399097 T/C 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 183993043 C/T 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000163002:ENST00000409798:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000442895:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000446612:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000455063:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000295119:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000497330:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000374930:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000479162:exon_183993015_183993185:NUP35;ENSG00000163002:ENST00000452137:exon_183993015_183993185:NUP35 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 185801747 G/A 1 40 17 57 20.7236236570526 8.19245994575266 12.5311637112999 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00125372547845524 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 185802243 C/A 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 A:C C A 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 15 15 30 7.77135887139471 7.22864112860529 0.542717742789419 T:G G T 10 0.481909408573686 0.857229298831858 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 191843589 G/A 1 32 38 70 16.578898925642 18.3125575258001 -1.73365860015802 A:G G A 10 0.481909408573686 0.720637405159663 ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191843582_191843727:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191843582_191843727:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392322:exon_191843582_191843727:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000452281:exon_191843582_191843727:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000392323:exon_191843582_191843727:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000464072:exon_191843217_191843727:STAT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 196771643 T/C 1 19 1 20 9.84372123709996 0.481909408573686 9.36181182852628 T:C T C 10 0.481909408573686 1.22102278475102e-05 ENSG00000118997:ENST00000312428:exon_196771631_196771733:DNAH7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 197021372 T/A 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:T T A 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000420683:exon_197021296_197021375:STK17B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 197523583 A/C 0 0 10 10 0 4.81909408573686 -4.81909408573686 C A C 10 0.481909408573686 0.00206888448201737 ENSG00000144395:ENST00000471546:exon_197523516_197523584:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000389175:exon_197523516_197523584:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000272831:exon_197523516_197523584:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000431807:exon_197523516_197523584:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000423093:exon_197523516_197523584:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000472405:exon_197523516_197523584:CCDC150;ENSG00000144395:ENST00000495513:exon_197523516_197523584:CCDC150 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 197954717 G/A 1 6 12 18 3.10854354855788 5.78291290288423 -2.67436935432635 A:G G A 10 0.481909408573686 0.243432192083582 ENSG00000065413:ENST00000424317:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000422886:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_197954674_197954756:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000473081:exon_197954674_197954756:ANKRD44 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 201305521 C/T 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 201342616 C/T 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201342359_201342825:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201342359_201342932:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201342359_201342869:SPATS2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 201928671 G/T 0 53 0 53 27.4588013455946 0 27.4588013455946 G G 10 0.481909408573686 1.57458635397644e-17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 202245244 A/G 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000115993:ENST00000332624:exon_202241930_202245941:TRAK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 203152355 G/A 1 11 11 22 5.69899650568945 5.30100349431055 0.397993011378908 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:T A T 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 217329322 A/G 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G A G 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000138375:ENST00000357276:exon_217329320_217329390:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000358207:exon_217329320_217329390:SMARCAL1;ENSG00000138375:ENST00000392128:exon_217329320_217329390:SMARCAL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 220074999 A/G 1 109 83 192 56.4718744654682 39.9984809116159 16.4733935538523 A:G A G 10 0.481909408573686 0.020597783242818 ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000487380:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000485773:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000497882:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000295750:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000443805:exon_220074952_220075020:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220074952_220075020:ATG9A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 220112467 G/A 1 14 10 24 7.2532682799684 4.81909408573686 2.43417419423154 A:G G A 10 0.481909408573686 0.414637908202845 ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000475696:exon_220112384_220112913:STK16;ENSG00000115661:ENST00000396738:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409516:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496443:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496800:exon_220112137_220112548:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409260:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000478018:exon_220112384_220112479:STK16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 224743373 C/T 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000085449:ENST00000462702:exon_224743246_224743405:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000233055:exon_224740064_224743447:WDFY1;ENSG00000085449:ENST00000352510:exon_224740065_224743447:WDFY1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 224824695 T/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C T C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 167 105 272 86.5211287681944 50.600487900237 35.9206408679574 A:G G A 10 0.481909408573686 1.48694320652103e-05 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231035360 G/A 1 10 22 32 5.18090591426314 10.6020069886211 -5.42110107435795 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0753599851625463 ENSG00000135899:ENST00000480916:exon_231035337_231035477:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231035337_231035477:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231035337_231035477:SP110;ENSG00000135899:ENST00000463022:exon_231035337_231035631:SP110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231077110 C/T 1 59 43 102 30.5673448941525 20.7221045686685 9.84524032548402 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0593572097850761 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231110651 A/G 1 12 3 15 6.21708709711577 1.44572822572106 4.77135887139471 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0178610337248131 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231118041 A/C 1 30 64 94 15.5427177427894 30.8422021487159 -15.2994844059265 A:C A C 10 0.481909408573686 0.00181444228640874 ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231118031_231118132:SP140 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231120209 G/C 1 9 21 30 4.66281532283683 10.1200975800474 -5.45728225721058 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0659235331877449 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231120167_231120213:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231120167_231120247:SP140 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231325944 C/G 1 10 14 24 5.18090591426314 6.7467317200316 -1.56582580576846 C:G C G 10 0.481909408573686 0.547642984332691 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231326148 G/A 1 21 34 55 10.8799024199526 16.3849198915053 -5.50501747155273 A:G G A 10 0.481909408573686 0.176711751615252 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 41 37 78 21.2417142484789 17.8306481172264 3.41106613125249 A:G G A 10 0.481909408573686 0.496936654471752 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 233201328 A/G 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000144535:ENST00000325385:exon_233201179_233201907:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000390005:exon_233201179_233201908:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000433430:exon_233200924_233201687:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000409307:exon_233201179_233201340:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000429283:exon_233199079_233201686:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000418143:exon_233201020_233201684:DIS3L2;ENSG00000144535:ENST00000417808:exon_233200851_233201683:DIS3L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 234368821 T/C 1 11 11 22 5.69899650568945 5.30100349431055 0.397993011378908 T:C T C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 234386134 A/G 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234384166_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234384172_234386149:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234384172_234386149:USP40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 234394487 G/A 1 36 16 52 18.6512612913473 7.71055053717898 10.9407107541683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00317520496081432 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 234394569 A/G 1 22 17 39 11.3979930113789 8.19245994575266 3.20553306562624 A:G A G 10 0.481909408573686 0.338414174443394 ENSG00000085982:ENST00000450966:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000251722:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000483519:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000450940:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000496298:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000454354:exon_234394413_234394623:USP40;ENSG00000085982:ENST00000473191:exon_234394413_234394623:USP40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 16 10 26 8.28944946282102 4.81909408573686 3.47035537708416 A:G A G 10 0.481909408573686 0.238495445344171 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238671536 A/G 1 38 34 72 19.6874424741999 16.3849198915053 3.3025225826946 A:G A G 10 0.481909408573686 0.479877105896791 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 42 57 99 21.7598048399052 27.4688362887001 -5.70903144879492 A:G A G 10 0.481909408573686 0.269404446803053 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 1174 1244 2418 608.238354334493 599.495304265665 8.74305006882719 T:C C T 10 0.481909408573686 0.729405349048633 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238672253 A/G 1 801 563 1364 414.990563732477 271.314997026985 143.675566705492 A:T:C:G A G 10 0.481909408573686 7.42376622706568e-15 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238672290 C/T 1 795 506 1301 411.88202018392 243.846160738285 168.035859445634 A:T:C C T 10 0.481909408573686 9.40543334837202e-21 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 18 31 49 9.32563064567365 14.9391916657843 -5.61356102011061 C:G C G 10 0.481909408573686 0.117207775483678 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 239164370 T/G 1 11 2 13 5.69899650568945 0.963818817147372 4.73517768854208 T:G T G 10 0.481909408573686 0.0104849883006144 ENSG00000132326:ENST00000254657:exon_239164298_239164552:PER2;ENSG00000132326:ENST00000254658:exon_239164298_239164552:PER2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 239237974 T/C 1 12 8 20 6.21708709711577 3.85527526858949 2.36181182852628 T:C T C 10 0.481909408573686 0.372034266386779 ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 242035757 G/A 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242034545_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242034981_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242035284_242035853:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242035555_242035853:MTERFD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 242046151 G/A 1 13 4 17 6.73517768854208 1.92763763429474 4.80754005424734 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0266465634185576 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 104 60 164 53.8814215083367 28.9145645144212 24.9668569939155 A:C A C 10 0.481909408573686 0.000115385295583638 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 242173247 G/A 1 9 10 19 4.66281532283683 4.81909408573686 -0.156278762900034 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242173235_242173378:HDLBP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 2 242651445 A/T 1 21 17 38 10.8799024199526 8.19245994575266 2.68744247419993 A:T:C A T 10 0.481909408573686 0.419538126517231 ENSG00000168395:ENST00000492488:exon_242651393_242651795:ING5;ENSG00000168395:ENST00000313552:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000482774:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000406941:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000445620:exon_242651393_242651486:ING5;ENSG00000168395:ENST00000489509:exon_242651393_242651486:ING5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 391170 C/T 1 32 21 53 16.578898925642 10.1200975800474 6.45880134559464 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0981642460245287 ENSG00000125826:ENST00000475269:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400245:exon_391056_391408:RBCK1;ENSG00000125826:ENST00000400247:exon_391056_391408:RBCK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 1145102 T/C 1 17 27 44 8.80754005424734 13.0115540314895 -4.20401397724219 T:C T C 10 0.481909408573686 0.229083626592826 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000484891:exon_1144962_1145120:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000435720:exon_1144962_1145120:PSMF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 1426393 C/T 1 12 11 23 6.21708709711577 5.30100349431055 0.916083602805221 T:C C T 10 0.481909408573686 0.83537731850994 ENSG00000088833:ENST00000216879:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000353088:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381658:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000461211:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000476071:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000350991:exon_1426311_1426475:NSFL1C;ENSG00000088833:ENST00000381653:exon_1426311_1426794:NSFL1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 2633936 T/C 1 14 13 27 7.2532682799684 6.26482231145792 0.988445968510477 T:C T C 10 0.481909408573686 0.705915720106453 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633925_2634466:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2633925_2634039:NOP56 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 2635212 A/G 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635060_2635221:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2634880_2635221:NOP56 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 21 30 51 10.8799024199526 14.4572822572106 -3.57737983725799 T:C T C 10 0.481909408573686 0.330292186560248 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 2774797 A/C 1 13 67 80 6.73517768854208 32.287930374437 -25.5527526858949 A:C A C 10 0.481909408573686 3.2614550622227e-09 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 3127579 T/C 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 T:C T C 10 0.481909408573686 0.197791501722836 ENSG00000215251:ENST00000380266:exon_3127165_3129906:FASTKD5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 3204084 G/A 1 174 137 311 90.1477629081786 66.021588974595 24.1261739335836 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00642028855078446 ENSG00000125877:ENST00000483354:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000380113:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000455664:exon_3204012_3204504:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000490838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000460550:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000399838:exon_3204012_3204516:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000461029:exon_3204012_3204095:ITPA;ENSG00000125877:ENST00000472295:exon_3204012_3204516:ITPA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 7963041 C/T 1 204 185 389 105.690480650968 89.1532405861319 16.5372400648361 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0943124579639256 ENSG00000125827:ENST00000246024:exon_7957995_7963268:TMX4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 28 19 47 14.5065365599368 9.15627876290004 5.35025779703676 A:G G A 10 0.481909408573686 0.143953713434481 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 13695762 T/C 1 82 94 176 42.4834284969577 45.2994844059265 -2.81605590896874 T:C T C 10 0.481909408573686 0.706315298091682 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 13709068 A/T 1 136 108 244 70.4603204339787 52.0462161259581 18.4141043080206 A:T A T 10 0.481909408573686 0.0209204833306018 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13709025_13709112:ESF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 13797179 G/A 1 42 39 81 21.7598048399052 18.7944669343738 2.96533790553143 A:G G A 10 0.481909408573686 0.578544075366463 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000487478:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476200:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479682:exon_13796711_13797192:C20orf7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 15967752 C/G 1 49 64 113 25.3864389798894 30.8422021487159 -5.45576316882652 C:G C G 10 0.481909408573686 0.346602513048772 ENSG00000172264:ENST00000217246:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000310348:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000402914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000378058:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000486914:exon_15967711_15967803:MACROD2;ENSG00000172264:ENST00000407045:exon_15967711_15967803:MACROD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 17640898 A/T 1 15 33 48 7.77135887139471 15.9030104829316 -8.13165161153693 A:T A T 10 0.481909408573686 0.0205322781256912 ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17639241_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17639241_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17639250_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000398782:exon_17640251_17641173:RRBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 2 9 11 1.03618118285263 4.33718467716317 -3.30100349431055 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0673297579948189 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 21327141 C/G 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 C:G C G 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000088930:ENST00000377191:exon_21327053_21327188:XRN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 24939590 G/C 0 0 17 17 0 8.19245994575266 -8.19245994575266 C G C 10 0.481909408573686 1.80380403577510e-05 ENSG00000077984:ENST00000480798:exon_24939564_24939680:CST7;ENSG00000077984:ENST00000376835:exon_24939564_24939680:CST7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 30157025 C/T 1 208 68 276 107.762843016673 32.7698397830107 74.9930032336626 T:C C T 10 0.481909408573686 5.60525239324798e-20 ENSG00000101294:ENST00000335574:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000340852:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000398174:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000376127:exon_30156923_30157345:HM13;ENSG00000101294:ENST00000492709:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000469097:exon_30156923_30157221:HM13;ENSG00000101294:ENST00000460389:exon_30156923_30157111:HM13;ENSG00000101294:ENST00000468559:exon_30156923_30157370:HM13;ENSG00000101294:ENST00000493364:exon_30156923_30157055:HM13;ENSG00000101294:ENST00000487281:exon_30156923_30157370:HM13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 31024274 T/C 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 32256055 G/T 0 0 14 14 0 6.7467317200316 -6.7467317200316 T G T 10 0.481909408573686 0.000136822295141540 ENSG00000182584:ENST00000330271:exon_32254304_32256331:C20orf134 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 34144746 A/G 1 185 219 404 95.8467594138681 105.538160477637 -9.69140106376915 A:G A G 10 0.481909408573686 0.344454188173924 ENSG00000125991:ENST00000348547:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000357394:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000447986:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000355563:exon_34144744_34144830:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000279052:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000416206:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000413587:exon_34144744_34144837:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000465298:exon_34144744_34144867:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000442139:exon_34144648_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000451605:exon_34144726_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488935:exon_34144744_34144880:ERGIC3;ENSG00000125991:ENST00000488384:exon_34144381_34144880:ERGIC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 34219496 T/C 1 15 15 30 7.77135887139471 7.22864112860529 0.542717742789419 T:C T C 10 0.481909408573686 0.857229298831858 ENSG00000214078:ENST00000352393:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317677:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000349942:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000317619:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397443:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397446:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397445:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000402424:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483359:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000397442:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000483495:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000401607:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000437340:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000430570:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000412056:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000486021:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000414664:exon_34219414_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000416778:exon_34219416_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439806:exon_34219434_34219500:CPNE1;ENSG00000214078:ENST00000439669:exon_34219481_34219500:CPNE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 35240519 C/G 1 62 48 110 32.1216166684315 23.1316516115369 8.98996505689453 C:G C G 10 0.481909408573686 0.104383365145199 ENSG00000101084:ENST00000344795:exon_35240413_35240960:C20orf24;ENSG00000101084:ENST00000492721:exon_35240413_35240960:C20orf24;ENSG00000101084:ENST00000483815:exon_35240413_35240960:C20orf24;ENSG00000101084:ENST00000373852:exon_35240413_35240960:C20orf24;ENSG00000101084:ENST00000342422:exon_35240413_35240960:C20orf24;ENSG00000101084:ENST00000494506:exon_35240413_35240960:C20orf24 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 37400490 G/A 1 24 13 37 12.4341741942315 6.26482231145792 6.16935188277362 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0482749840566407 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 1 13 14 0.518090591426314 6.26482231145792 -5.7467317200316 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00199248230764399 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 42341705 G/A 1 9 19 28 4.66281532283683 9.15627876290004 -4.49346344006321 A:G G A 10 0.481909408573686 0.128850615889316 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42341642_42341746:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42341642_42341746:MYBL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 43566787 A/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G A G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000101104:ENST00000255136:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000421240:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372821:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217073:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000476056:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372824:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372819:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000217075:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000479873:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372826:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000474208:exon_43566743_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000489068:exon_43566686_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000372822:exon_43566702_43566832:PABPC1L;ENSG00000101104:ENST00000482486:exon_43566484_43566832:PABPC1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 44452697 C/A 0 11 0 11 5.69899650568945 0 5.69899650568945 C C 10 0.481909408573686 0.000325551318653959 ENSG00000101470:ENST00000372557:exon_44452630_44452766:TNNC2;ENSG00000101470:ENST00000372555:exon_44452630_44452766:TNNC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 45315351 A/G 1 29 37 66 15.0246271513631 17.8306481172264 -2.80602096586328 A:G A G 10 0.481909408573686 0.538852812781577 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 45920588 G/A 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45920540_45920632:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000435836:exon_45920540_45920632:ZMYND8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 49493003 T/A 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 A:T T A 10 0.481909408573686 0.252899248171128 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 49493004 T/C 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.252899248171128 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 49493171 G/A 1 37 21 58 19.1693518827736 10.1200975800474 9.04925430272621 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0181291149017841 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 49493195 A/G 1 39 38 77 20.2055330656262 18.3125575258001 1.89297553982617 A:G A G 10 0.481909408573686 0.732574231960067 ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 A:G G A 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 55092245 C/T 1 12 11 23 6.21708709711577 5.30100349431055 0.916083602805221 T:C C T 10 0.481909408573686 0.83537731850994 ENSG00000022277:ENST00000023939:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000395881:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000357348:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000435342:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000449062:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477485:exon_55091991_55092257:C20orf43;ENSG00000022277:ENST00000477573:exon_55092162_55092257:C20orf43;ENSG00000124103:ENST00000481560:exon_55092243_55092257:C20orf106 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 56063613 C/A 1 5 8 13 2.59045295713157 3.85527526858949 -1.26482231145792 A:C C A 10 0.481909408573686 0.584334529704906 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 56188195 C/T 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C C T 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000124256:ENST00000480037:exon_56187947_56188386:ZBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 58456533 T/C 1 6 10 16 3.10854354855788 4.81909408573686 -1.71055053717898 T:C T C 10 0.481909408573686 0.459279308448497 ENSG00000196074:ENST00000371001:exon_58456492_58456547:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000414481:exon_58456492_58456547:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000357552:exon_58456492_58456547:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000446834:exon_58456492_58456547:SYCP2;ENSG00000196074:ENST00000474749:exon_58456492_58456547:SYCP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 60883273 A/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:C A C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000130702:ENST00000492698:exon_60883011_60883502:LAMA5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 61443871 C/T 1 8 1 9 4.14472473141051 0.481909408573686 3.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0176546734771989 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 61444365 G/A 1 18 17 35 9.32563064567365 8.19245994575266 1.13317069992099 A:G G A 10 0.481909408573686 0.737446771376676 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 61444780 C/A 1 11 12 23 5.69899650568945 5.78291290288423 -0.0839163971947787 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 61444962 C/T 1 176 190 366 91.1839440910313 91.5627876290003 -0.378843537969075 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 61445022 G/A 1 242 267 509 125.377923125168 128.669812089174 -3.29188896400619 A:G G A 10 0.481909408573686 0.790219270303854 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 62374096 C/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62374052_62374143:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000496425:exon_62373881_62374143:SLC2A4RG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 62630427 C/T 1 15 8 23 7.77135887139471 3.85527526858949 3.91608360280522 T:C C T 10 0.481909408573686 0.142725626727946 ENSG00000101161:ENST00000266079:exon_62630398_62630492:PRPF6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 62663416 C/T 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.536476994604088 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 20 62701627 G/A 1 12 2 14 6.21708709711577 0.963818817147372 5.2532682799684 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00582458966588113 ENSG00000171703:ENST00000395050:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000361317:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000395053:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000343484:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000339217:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000440819:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465111:exon_62701118_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000458442:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465433:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000477783:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000495168:exon_62701567_62701988:TCEA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 19168916 T/C 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000154642:ENST00000284881:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400559:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000400558:exon_19168899_19169435:C21orf91;ENSG00000154642:ENST00000405964:exon_19168899_19169435:C21orf91 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 30339290 T/A 1 21 11 32 10.8799024199526 5.30100349431055 5.57889892564205 A:T T A 10 0.481909408573686 0.0526497465711607 ENSG00000198862:ENST00000389194:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000361371:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000446611:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000389195:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000452100:exon_30338692_30339501:LTN1;ENSG00000198862:ENST00000483326:exon_30339217_30339501:LTN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 30415727 G/A 1 1 15 16 0.518090591426314 7.22864112860529 -6.71055053717898 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00058198003214246 ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30414793_30415920:USP16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 30419116 C/G 1 40 51 91 20.7236236570526 24.577379837258 -3.85375618020543 C:G C G 10 0.481909408573686 0.463225721178431 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30418988_30419642:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30418988_30419642:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30418988_30419642:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30418988_30419642:USP16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 33039622 T/A 1 290 272 562 150.246271513631 131.079359132043 19.1669123815884 A:T T A 10 0.481909408573686 0.10877255383711 ENSG00000142168:ENST00000270142:exon_33039571_33039688:SOD1;ENSG00000142168:ENST00000389995:exon_33039571_33039688:SOD1;ENSG00000142168:ENST00000476106:exon_33039571_33039654:SOD1;ENSG00000142168:ENST00000470944:exon_33039571_33039688:SOD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 33975507 C/T 1 2 14 16 1.03618118285263 6.7467317200316 -5.71055053717898 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00455318890818168 ENSG00000159079:ENST00000431216:exon_33975471_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000431599:exon_33975471_33975547:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000440966:exon_33975471_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000382549:exon_33973977_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000290155:exon_33975471_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000425336:exon_33975471_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000300260:exon_33975471_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000483315:exon_33974120_33975602:C21orf59 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 35281393 A/G 1 86 81 167 44.555790862663 39.0346620944686 5.52112876819444 A:G A G 10 0.481909408573686 0.395633943143275 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000418933:exon_35281386_35281399:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 35281421 T/C 1 63 55 118 32.6397072598578 26.5050174715527 6.13468978830505 T:C T C 10 0.481909408573686 0.269926624721792 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 37741929 T/C 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 T:C T C 10 0.481909408573686 0.134075613444074 ENSG00000159256:ENST00000400485:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000290384:exon_37741286_37742174:MORC3;ENSG00000159256:ENST00000487909:exon_37741286_37742174:MORC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 37763793 C/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:C C A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 38437935 C/G 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 C:G C G 10 0.481909408573686 0.755512817806202 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 38438006 T/C 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C T C 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 26 37 63 13.4703553770842 17.8306481172264 -4.36029274014222 T:C T C 10 0.481909408573686 0.313535034993083 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 38593803 T/C 1 14 7 21 7.2532682799684 3.3733658600158 3.87990241995259 T:C T C 10 0.481909408573686 0.124869530263863 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 38597878 C/T 1 10 4 14 5.18090591426314 1.92763763429474 3.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.108335810082199 ENSG00000157538:ENST00000309117:exon_38595721_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399000:exon_38595721_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000497493:exon_38595721_38600107:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000288304:exon_38595728_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000399001:exon_38597600_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000476950:exon_38597773_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000488368:exon_38597817_38597927:DSCR3;ENSG00000157538:ENST00000398998:exon_38597845_38597927:DSCR3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 42813827 C/A 1 107 96 203 55.4356932826156 46.2633032230739 9.17239005954173 A:C C A 10 0.481909408573686 0.206509428894313 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42813643_42813841:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42813643_42813841:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42813643_42813841:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42813643_42813841:MX1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 12 9 21 6.21708709711577 4.33718467716317 1.87990241995259 T:C T C 10 0.481909408573686 0.513901958034641 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 42830505 C/T 1 111 122 233 57.5080556483208 58.7929478459897 -1.28489219766885 T:C C T 10 0.481909408573686 0.895772909378302 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42830455_42831141:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42830455_42831138:MX1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 43802157 T/C 1 4 63 67 2.07236236570526 30.3602927401422 -28.287930374437 T:C T C 10 0.481909408573686 5.36166165876584e-14 ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43801985_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000478680:exon_43801987_43802343:TMPRSS3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 43803167 T/C 0 0 17 17 0 8.19245994575266 -8.19245994575266 C T C 10 0.481909408573686 1.80380403577510e-05 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43802174_43803860:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43803142_43803307:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43803142_43803307:TMPRSS3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 C C 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 45168914 A/G 1 25 11 36 12.9522647856578 5.30100349431055 7.6512612913473 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0119418910047532 ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 45194064 G/A 1 200 124 324 103.618118285263 59.7567666631371 43.8613516221257 A:G G A 10 0.481909408573686 1.15633006768353e-06 ENSG00000160208:ENST00000506281:exon_45193907_45194144:RRP1B;ENSG00000160209:ENST00000498150:exon_45193472_45194151:PDXK;ENSG00000160213:ENST00000291568:exon_45192393_45194211:CSTB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 45219455 C/T 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:C C T 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45219451_45219530:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45219451_45219530:RRP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 45547913 C/A 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000494310:exon_45547813_45548031:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000476948:exon_45547680_45548031:PWP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 45651212 C/T 1 12 6 18 6.21708709711577 2.89145645144212 3.32563064567365 T:C C T 10 0.481909408573686 0.156469603613933 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45651163_45651327:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45651163_45651327:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400377:exon_45651163_45651327:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45651163_45651327:ICOSLG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 45656774 C/T 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 46271452 C/T 1 6 8 14 3.10854354855788 3.85527526858949 -0.746731720031605 T:C C T 10 0.481909408573686 0.79243933411218 ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 21 47662769 C/T 1 33 22 55 17.0969895170684 10.6020069886211 6.49498252844727 T:C C T 10 0.481909408573686 0.104556289823289 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47662716_47662845:MCM3AP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 18111431 T/C 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 18900750 G/A 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 A:G G A 10 0.481909408573686 0.39148304783409 ENSG00000183628:ENST00000483718:exon_18899053_18901751:DGCR6;ENSG00000100033:ENST00000491604:exon_18900294_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000420436:exon_18900294_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000357068:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000334029:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000482858:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000429300:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000313755:exon_18900295_18900875:PRODH;ENSG00000100033:ENST00000414267:exon_18900295_18900875:PRODH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 19422321 G/C 1 13 11 24 6.73517768854208 5.30100349431055 1.43417419423154 C:G G C 10 0.481909408573686 0.683876092776092 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19422259_19422417:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19422259_19422417:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19422259_19422417:MRPL40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 19422331 G/A 1 18 22 40 9.32563064567365 10.6020069886211 -1.27637634294744 A:G G A 10 0.481909408573686 0.752825426887444 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19422259_19422417:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19422259_19422417:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19422259_19422417:MRPL40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 19423250 G/A 1 130 144 274 67.3517768854208 69.3949548346108 -2.04317794918997 A:G G A 10 0.481909408573686 0.809290648746136 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:G T G 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 19951207 C/G 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 C:G C G 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 20050928 G/A 1 19 23 42 9.84372123709996 11.0839163971948 -1.24019516009481 A:G G A 10 0.481909408573686 0.758749337257579 ENSG00000183597:ENST00000401886:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000398042:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000399807:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000450019:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000327374:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000432883:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000430807:exon_20050861_20050944:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000401833:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000434168:exon_20050861_20050934:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000444651:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420290:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420446:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000447208:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000456048:exon_20050861_20050965:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000490583:exon_20050861_20050965:C22orf25 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 20112868 C/T 1 29 45 74 15.0246271513631 21.6859233858159 -6.66129623445277 T:C C T 10 0.481909408573686 0.131152249457857 ENSG00000099901:ENST00000435265:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000430524:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000402752:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000447917:exon_20112831_20113135:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000331821:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000411892:exon_20112831_20113011:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000423859:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000418705:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000448394:exon_20112831_20112959:RANBP1;ENSG00000099901:ENST00000486575:exon_20111662_20112959:RANBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 22048862 C/T 1 11 6 17 5.69899650568945 2.89145645144212 2.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.225825362231512 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 24108141 G/A 1 298 292 590 154.390996245042 140.717547303516 13.6734489415253 A:G G A 10 0.481909408573686 0.266154484899360 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108020_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000521886:exon_24108022_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108061_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108122_24108213:CHCHD10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 24108288 C/G 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 C:G C G 10 0.481909408573686 0.252899248171128 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 220 183 403 113.979930113789 88.1894217689845 25.7905083448045 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.0109474118039867 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 24921765 G/A 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 24981881 G/A 1 11 13 24 5.69899650568945 6.26482231145792 -0.565825805768465 A:G G A 10 0.481909408573686 0.841333561850622 ENSG00000178026:ENST00000318753:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000446942:exon_24981588_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000491910:exon_24981603_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000404045:exon_24981617_24982379:C22orf36;ENSG00000178026:ENST00000460524:exon_24981630_24982379:C22orf36 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 25010885 G/A 1 9 10 19 4.66281532283683 4.81909408573686 -0.156278762900034 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 25716017 T/C 1 125 17 142 64.7613239282892 8.19245994575266 56.5688639825366 T:C T C 10 0.481909408573686 2.56674461871339e-23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 26118408 C/T 1 100 77 177 51.8090591426314 37.1070244601738 14.7020346824576 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0290556612983686 ENSG00000100077:ENST00000324198:exon_26118256_26118601:ADRBK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 30184950 A/G 1 145 111 256 75.1231357568155 53.4919443516792 21.6311914051364 A:C:G A G 10 0.481909408573686 0.00711371322430472 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30184597_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30184600_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30184605_30185173:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30184631_30185173:ASCC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 30823344 G/A 1 9 13 22 4.66281532283683 6.26482231145792 -1.60200698862109 A:G G A 10 0.481909408573686 0.529487543087445 ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000407550:exon_30823227_30823390:MTFP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 30974977 C/A 1 48 38 86 24.8683483884631 18.3125575258001 6.555790862663 A:C C A 10 0.481909408573686 0.162172393542155 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000441668:exon_30974824_30974982:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000488719:exon_30974824_30976061:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30974824_30974985:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30974824_30974985:PES1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 31019044 G/A 1 11 4 15 5.69899650568945 1.92763763429474 3.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0689223984537358 ENSG00000185339:ENST00000215838:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000450638:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000405742:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000407817:exon_31018955_31019070:TCN2;ENSG00000185339:ENST00000493542:exon_31018955_31019283:TCN2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 31673111 A/G 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 31673116 A/G 1 3 9 12 1.55427177427894 4.33718467716317 -2.78291290288423 A:G A G 10 0.481909408573686 0.149158048996249 ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 32007264 A/T 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 A:T:C A T 10 0.481909408573686 0.597188270417829 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 32011204 C/T 0 23 0 23 11.9160836028052 0 11.9160836028052 C C 10 0.481909408573686 5.1074523428251e-08 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 32788248 T/A 1 12 15 27 6.21708709711577 7.22864112860529 -1.01155403148952 A:T T A 10 0.481909408573686 0.847761579496843 ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32788227_32788346:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32788227_32788346:C22orf28 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 35661322 G/A 1 205 168 373 106.208571242394 80.9607806403793 25.2477906020151 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0095177830836803 ENSG00000100281:ENST00000420166:exon_35660641_35661563:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000455359:exon_35660641_35661560:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35660641_35661596:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35660641_35661596:HMGXB4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 35683408 G/A 1 20 26 46 10.3618118285263 12.5296446229158 -2.16783279438956 A:G G A 10 0.481909408573686 0.557634564094642 ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000498212:exon_35682875_35683445:HMGXB4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 36537313 G/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G G C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 36684331 C/T 1 21 21 42 10.8799024199526 10.1200975800474 0.759804839905186 T:C C T 10 0.481909408573686 0.87781422873244 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 36921761 G/A 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 37524092 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 37622815 A/G 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:G A G 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 38015832 C/A 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000100083:ENST00000405147:exon_38015807_38016051:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000491295:exon_38015807_38016256:GGA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 38051628 C/A 1 25 24 49 12.9522647856578 11.5658258057685 1.38643897988938 A:C C A 10 0.481909408573686 0.775385310943612 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 93 69 162 48.1824250026472 33.2517491915843 14.9306758110629 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0223280998916407 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 38317938 A/G 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 38343278 C/T 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 T:C C T 10 0.481909408573686 0.134075613444074 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 39148483 G/A 1 12 7 19 6.21708709711577 3.3733658600158 2.84372123709996 A:G G A 10 0.481909408573686 0.251548235310953 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 39388046 G/C 1 9 10 19 4.66281532283683 4.81909408573686 -0.156278762900034 C:G G C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39388039_39388154:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39388039_39388809:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39388039_39388154:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39388039_39388154:APOBEC3B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 39411560 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 39710736 G/A 1 282 287 569 146.101546782221 138.308000260648 7.79354652157264 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.529277804236366 ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000426159:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000467105:exon_39710691_39710970:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000481985:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000471290:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39710705_39710851:RPL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 39928738 G/A 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000187051:ENST00000334678:exon_39928692_39928860:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000420879:exon_39928692_39928766:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000459956:exon_39928400_39928743:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000472291:exon_39928692_39928765:RPS19BP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 40757228 A/C 1 3 9 12 1.55427177427894 4.33718467716317 -2.78291290288423 A:C A C 10 0.481909408573686 0.149158048996249 ENSG00000239900:ENST00000480775:exon_40757092_40757346:ADSL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 41926757 G/A 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000100413:ENST00000396504:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000355209:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000337566:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000431534:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000432789:exon_41926691_41926892:POLR3H;ENSG00000100413:ENST00000407461:exon_41926691_41926892:POLR3H HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 42076330 G/A 1 28 16 44 14.5065365599368 7.71055053717898 6.79598602275781 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0490747613513774 ENSG00000100138:ENST00000355257:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000463675:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000402458:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42076248_42076368:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000469028:exon_42076250_42076368:NHP2L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 38 24 62 19.6874424741999 11.5658258057685 8.12161666843146 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0421367033914728 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 42276742 G/C 1 12 17 29 6.21708709711577 8.19245994575266 -1.9753728486369 C:G G C 10 0.481909408573686 0.578066628711756 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 42335008 T/C 1 100 138 238 51.8090591426314 66.5034983831687 -14.6944392405373 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0599374995606657 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42334725_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000472374:exon_42334741_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42334741_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42334741_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42334753_42335200:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42334760_42335200:CENPM HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 42981890 G/A 1 23 23 46 11.9160836028052 11.0839163971948 0.832167205610443 A:G G A 10 0.481909408573686 0.883030325722599 ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42979727_42981974:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42979729_42981974:POLDIP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 C:G G C 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 43435812 C/T 1 16 19 35 8.28944946282102 9.15627876290004 -0.866829300079011 T:C C T 10 0.481909408573686 0.866174860933254 ENSG00000100271:ENST00000343040:exon_43435645_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000439248:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000266254:exon_43435650_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000331018:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000443978:exon_43435652_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000440761:exon_43435675_43435911:TTLL1;ENSG00000100271:ENST00000438461:exon_43435773_43435911:TTLL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 44514995 C/T 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 46671091 T/C 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C T C 10 0.481909408573686 0.291636936274409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 46725350 T/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46725255_46725464:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000491863:exon_46724820_46725464:GTSE1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 50637597 G/C 1 115 92 207 59.5804180140261 44.3356655887791 15.244752425247 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0368031241385816 ENSG00000170638:ENST00000380909:exon_50636774_50637993:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000303434:exon_50636774_50638027:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000463233:exon_50636774_50638024:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395827:exon_50636774_50637904:TRABD;ENSG00000170638:ENST00000395829:exon_50637545_50637998:TRABD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 50716167 G/A 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479818:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000433171:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50716020_50716167:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50716020_50716167:PLXNB2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 50750540 C/G 0 0 817 817 0 393.719986804701 -393.719986804701 A:T:G C G 10 0.481909408573686 5.21861933940001e-234 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50750395_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50750395_50750690:FAM116B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 50750686 C/T 1 415 440 855 215.00759544192 212.040139772422 2.96745566949846 T:C C T 10 0.481909408573686 0.86415126013092 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50750395_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50750395_50750690:FAM116B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.252899248171128 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 22 51018776 C/T 1 8 11 19 4.14472473141051 5.30100349431055 -1.15627876290003 T:C C T 10 0.481909408573686 0.651736024435881 ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51018619_51018845:CTA-384D8.32;ENSG00000100288:ENST00000479003:exon_51018619_51018845:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000468532:exon_51018619_51018845:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000489453:exon_51018619_51018845:CHKB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 4354578 A/G 1 1 17 18 0.518090591426314 8.19245994575266 -7.67436935432635 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000168322056125249 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 5024771 T/C 1 27 17 44 13.9884459685105 8.19245994575266 5.79598602275781 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0965460468717987 ENSG00000134107:ENST00000256495:exon_5024521_5027008:BHLHE40;ENSG00000134107:ENST00000467610:exon_5024521_5024953:BHLHE40 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 12475557 C/T 1 7 15 22 3.6266341399842 7.22864112860529 -3.60200698862109 T:C C T 10 0.481909408573686 0.139382119866570 ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 12475685 G/T 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:G G T 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000132170:ENST00000397010:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000309576:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397015:exon_12475397_12475810:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397012:exon_12475397_12475843:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397026:exon_12475397_12475838:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397000:exon_12475397_12475715:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000287820:exon_12475397_12475855:PPARG;ENSG00000132170:ENST00000397023:exon_12475397_12475843:PPARG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 3 11 14 1.55427177427894 5.30100349431055 -3.7467317200316 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0596153979871713 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 12881835 C/T 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 T:C C T 10 0.481909408573686 0.197791501722836 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 13407556 T/C 1 9 12 21 4.66281532283683 5.78291290288423 -1.12009758004741 T:C T C 10 0.481909408573686 0.66800138690819 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13407446_13407591:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13407446_13407591:NUP210 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 14239580 C/T 1 504 479 983 261.117658078862 230.834606706796 30.2830513720666 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.0554669190481745 ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14239536_14242619:LSM3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 14703045 G/T 1 25 23 48 12.9522647856578 11.0839163971948 1.86834838846307 T:G G T 10 0.481909408573686 0.66542658884071 ENSG00000154781:ENST00000463438:exon_14703037_14703407:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000383794:exon_14703037_14703214:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000303688:exon_14703037_14703214:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000465759:exon_14703037_14703214:C3orf19;ENSG00000154781:ENST00000285042:exon_14703037_14703146:C3orf19 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 16535229 C/T 1 10 7 17 5.18090591426314 3.3733658600158 1.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.469361015930106 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 33093190 T/C 1 12 3 15 6.21708709711577 1.44572822572106 4.77135887139471 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0178610337248131 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 37357009 G/A 1 68 67 135 35.2301602169893 32.287930374437 2.94222984255239 A:G G A 10 0.481909408573686 0.666915647441446 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000435830:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37356911_37357089:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37356911_37357089:GOLGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 37365460 G/A 1 130 132 262 67.3517768854208 63.6120419317266 3.73973495369426 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.665423331233907 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000429018:exon_37365079_37366450:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 37366459 C/A 1 460 745 1205 238.321672056104 359.022509387396 -120.700837331292 A:C C A 10 0.481909408573686 3.16423443862306e-12 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 37367159 A/C 1 30 23 53 15.5427177427894 11.0839163971948 4.45880134559464 A:C A C 10 0.481909408573686 0.271375698065295 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 37368755 T/A 1 184 185 369 95.3286688224418 89.1532405861319 6.17542823630986 A:T T A 10 0.481909408573686 0.532170861634517 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 38167151 G/A 1 5 8 13 2.59045295713157 3.85527526858949 -1.26482231145792 A:G G A 10 0.481909408573686 0.584334529704906 ENSG00000060971:ENST00000333167:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000301810:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000411549:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000444607:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469559:exon_38164207_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000358122:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000480865:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000450296:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000452171:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000469600:exon_38167056_38167201:ACAA1;ENSG00000060971:ENST00000421218:exon_38167055_38167201:ACAA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 35 24 59 18.133170699921 11.5658258057685 6.56734489415252 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0915450153779412 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 45052775 G/C 1 113 118 231 58.5442368311735 56.865310211695 1.67892661947852 C:G G C 10 0.481909408573686 0.843601025074436 ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 46965111 C/T 1 93 63 156 48.1824250026472 30.3602927401422 17.822132262505 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00490854748188575 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46964533_46965158:CCDC12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 47454399 G/A 1 12 6 18 6.21708709711577 2.89145645144212 3.32563064567365 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.156469603613933 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 48509036 T/C 1 123 118 241 63.7251427454366 56.865310211695 6.85983253374167 A:T:C:G T C 10 0.481909408573686 0.402168242548418 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 49062629 C/T 1 95 84 179 49.2186061854998 40.4803903201896 8.7382158653102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.20375544661369 ENSG00000178035:ENST00000429182:exon_49062559_49062702:IMPDH2;ENSG00000178035:ENST00000326739:exon_49062559_49062702:IMPDH2;ENSG00000178035:ENST00000484872:exon_49062559_49062676:IMPDH2;ENSG00000178035:ENST00000481274:exon_49062559_49062848:IMPDH2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 31 16 47 16.0608083342157 7.71055053717898 8.35025779703676 A:C C A 10 0.481909408573686 0.018685709890105 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 49758780 C/G 1 14 15 29 7.2532682799684 7.22864112860529 0.0246271513631049 C:G C G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 49946812 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000455683:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49946686_49946833:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000486107:exon_49946308_49948317:MON1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 51474182 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 51737852 C/T 1 56 48 104 29.0130731198736 23.1316516115369 5.88142150833665 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.280479002116561 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 51737965 G/A 1 70 66 136 36.266341399842 31.8060209658633 4.4603204339787 A:G G A 10 0.481909408573686 0.492578626561675 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 51737995 T/C 1 88 71 159 45.5919720455156 34.2155680087317 11.3764040367839 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0805670559776285 ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52027722 G/A 1 3384 4394 7778 1753.21856138665 2117.50994127278 -364.29137988613 A:T:G G A 10 0.481909408573686 1.26137136570310e-16 ENSG00000162244:ENST00000466397:exon_52027644_52028142:RPL29;ENSG00000162244:ENST00000480306:exon_52027644_52028142:RPL29;ENSG00000162244:ENST00000294189:exon_52027644_52028142:RPL29;ENSG00000162244:ENST00000479017:exon_52027645_52028142:RPL29;ENSG00000162244:ENST00000495383:exon_52027645_52028142:RPL29 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52245522 C/T 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 T:C C T 10 0.481909408573686 0.39148304783409 ENSG00000023330:ENST00000469224:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000394965:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000441729:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000442476:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000310271:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000484952:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000493402:exon_52245299_52245567:ALAS1;ENSG00000023330:ENST00000459884:exon_52245468_52245567:ALAS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52668638 G/A 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000163939:ENST00000356770:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000394830:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296302:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000337303:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000412587:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409057:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000410007:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000296303:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409114:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000409767:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000423351:exon_52668618_52668831:PBRM1;ENSG00000163939:ENST00000446103:exon_52668618_52668831:PBRM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52727257 G/A 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G G A 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52727365 G/C 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52727485 G/C 1 12 14 26 6.21708709711577 6.7467317200316 -0.529644622915837 C:G G C 10 0.481909408573686 0.847635835185547 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727424_52727560:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52727736 A/G 1 74 69 143 38.3387037655472 33.2517491915843 5.0869545739629 A:G A G 10 0.481909408573686 0.403840084349211 ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 52941619 C/T 1 10 2 12 5.18090591426314 0.963818817147372 4.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0186970763393203 ENSG00000163935:ENST00000394752:exon_52941571_52941749:SFMBT1;ENSG00000163935:ENST00000358080:exon_52941571_52941749:SFMBT1;ENSG00000163935:ENST00000394750:exon_52941571_52941749:SFMBT1;ENSG00000163935:ENST00000296295:exon_52941571_52941749:SFMBT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 53222761 C/T 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53222736_53222874:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53222736_53222874:PRKCD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 53223927 C/G 1 12 20 32 6.21708709711577 9.63818817147372 -3.42110107435795 C:G C G 10 0.481909408573686 0.288658119091503 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53223889_53224017:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53223889_53224017:PRKCD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 53224002 T/C 1 70 76 146 36.266341399842 36.6251150516001 -0.358773651758163 A:T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53223889_53224017:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53223889_53224017:PRKCD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 53264485 A/G 1 5 11 16 2.59045295713157 5.30100349431055 -2.71055053717898 A:G A G 10 0.481909408573686 0.214902883771744 ENSG00000163931:ENST00000462138:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423525:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000424680:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000460343:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000461139:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000450814:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000423516:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000296289:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000414014:exon_53264473_53264637:TKT;ENSG00000163931:ENST00000469678:exon_53264473_53264637:TKT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 53905308 T/C 1 22 13 35 11.3979930113789 6.26482231145792 5.13317069992099 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0918167498360745 ENSG00000113812:ENST00000335754:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000231909:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000482349:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000486794:exon_53905259_53905523:ACTR8;ENSG00000113812:ENST00000495993:exon_53905185_53905523:ACTR8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 56627048 A/G 1 48 27 75 24.8683483884631 13.0115540314895 11.8567943569735 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00749534959096402 ENSG00000180376:ENST00000436465:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000394672:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000326595:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000471681:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000341455:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000484623:exon_56626998_56627129:CCDC66;ENSG00000180376:ENST00000494672:exon_56626998_56627089:CCDC66 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 58149041 C/T 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 T:C C T 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58148881_58149057:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000475487:exon_58148881_58149239:FLNB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 58178529 G/C 1 24 35 59 12.4341741942315 16.866829300079 -4.43265510584748 C:G G C 10 0.481909408573686 0.297375918415264 ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58177984_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58178354_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58178355_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58178355_58178530:DNASE1L3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 63822030 A/G 1 36 29 65 18.6512612913473 13.9753728486369 4.67588844271041 A:G A G 10 0.481909408573686 0.265273430267075 ENSG00000163634:ENST00000295899:exon_63821977_63822034:THOC7;ENSG00000163634:ENST00000469584:exon_63821977_63822034:THOC7;ENSG00000163634:ENST00000394436:exon_63821977_63822034:THOC7;ENSG00000163634:ENST00000473141:exon_63821977_63822034:THOC7;ENSG00000163634:ENST00000469153:exon_63821977_63822034:THOC7;ENSG00000163634:ENST00000498422:exon_63821977_63822034:THOC7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 9 4 13 4.66281532283683 1.92763763429474 2.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.167241258833344 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 98237797 G/T 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:G G T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000080822:ENST00000502288:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000507874:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000341181:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000450069:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000437922:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000448209:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000394180:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000506885:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000503004:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000394185:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000394181:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000524557:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000510545:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000511081:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000513287:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000532558:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000511667:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000513452:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000502299:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000512147:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508902:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000510541:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508503:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000514537:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000507411:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000515620:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000507944:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508659:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000503621:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000503799:exon_98237729_98237858:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000508071:exon_98237729_98237839:CLDND1;ENSG00000080822:ENST00000513988:exon_98237579_98237839:CLDND1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 98512540 G/A 1 74 12 86 38.3387037655472 5.78291290288423 32.555790862663 A:G G A 10 0.481909408573686 3.06998950323657e-13 ENSG00000064225:ENST00000483910:exon_98512519_98513206:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000469105:exon_98512519_98514098:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000462152:exon_98512519_98512788:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000486249:exon_98512519_98514689:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000497621:exon_98512519_98513237:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000493584:exon_98512519_98512839:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000394162:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000265261:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000474595:exon_98512519_98512609:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000491912:exon_98512519_98512636:ST3GAL6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 100042467 C/G 1 20 14 34 10.3618118285263 6.7467317200316 3.61508010849468 C:G C G 10 0.481909408573686 0.233023213454817 ENSG00000036054:ENST00000344949:exon_100042431_100044095:TBC1D23;ENSG00000036054:ENST00000394144:exon_100042431_100044082:TBC1D23;ENSG00000036054:ENST00000486274:exon_100042431_100044082:TBC1D23;ENSG00000036054:ENST00000475134:exon_100042431_100042535:TBC1D23;ENSG00000036054:ENST00000471273:exon_100042431_100044078:TBC1D23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 16 14 30 8.28944946282102 6.7467317200316 1.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.589172404006851 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 100467117 G/A 1 5 14 19 2.59045295713157 6.7467317200316 -4.15627876290004 A:G G A 10 0.481909408573686 0.066824099895121 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 100467413 A/G 1 10 10 20 5.18090591426314 4.81909408573686 0.36181182852628 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 107491443 G/A 1 12 29 41 6.21708709711577 13.9753728486369 -7.75828575152113 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.0182545367688306 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 108380982 C/A 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 A:C C A 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108380977_108381104:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108380977_108381104:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108380977_108381104:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108380977_108381104:DZIP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 112188609 T/G 1 19 14 33 9.84372123709996 6.7467317200316 3.09698951706836 T:G T G 10 0.481909408573686 0.300333661180419 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112188605_112188651:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000496584:exon_112188603_112188651:BTLA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 113392214 G/A 1 14 27 41 7.2532682799684 13.0115540314895 -5.75828575152113 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0852578342558808 ENSG00000176542:ENST00000491165:exon_113392195_113392223:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000316407:exon_113392195_113392223:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000478658:exon_113392195_113392223:KIAA2018 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 113729859 T/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C T C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000163617:ENST00000295878:exon_113729619_113729868:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000460813:exon_113729619_113729868:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000481358:exon_113729619_113729868:KIAA1407;ENSG00000163617:ENST00000491000:exon_113729619_113729868:KIAA1407 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 121353254 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 136 155 291 70.4603204339787 74.6959583289213 -4.23563789494264 A:G G A 10 0.481909408573686 0.639129567337434 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 41 68 109 21.2417142484789 32.7698397830107 -11.5281255345318 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0276392515306377 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 14 54 68 7.2532682799684 26.023108062979 -18.7698397830106 T:C T C 10 0.481909408573686 4.09174955703608e-06 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 121659818 C/T 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000163406:ENST00000489711:exon_121659678_121662949:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000295605:exon_121659678_121660099:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000436799:exon_121659678_121660457:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000469422:exon_121659678_121659829:SLC15A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 11 28 39 5.69899650568945 13.4934634400632 -7.79446693437376 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0153203339323634 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 122290579 C/T 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000163840:ENST00000296161:exon_122290525_122294050:DTX3L;ENSG00000163840:ENST00000383661:exon_122290525_122290594:DTX3L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 50 17 67 25.9045295713157 8.19245994575266 17.712069625563 A:G A G 10 0.481909408573686 1.30320688369935e-05 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 122354697 C/T 1 41 14 55 21.2417142484789 6.7467317200316 14.4949825284473 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000112779094598119 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 122354716 C/T 1 36 14 50 18.6512612913473 6.7467317200316 11.9045295713157 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000938566815080377 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122354658_122355000:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122354658_122357894:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122354658_122354886:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122354658_122355035:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122354658_122355035:PARP15 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 124462813 G/A 1 42 39 81 21.7598048399052 18.7944669343738 2.96533790553143 A:G G A 10 0.481909408573686 0.578544075366463 ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 124802898 T/C 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C C T 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 127439968 C/T 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C C T 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000074416:ENST00000434178:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000265052:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398104:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000496306:exon_127439896_127440014:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000398101:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000487473:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000453507:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000484451:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000465597:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000479967:exon_127439896_127440006:MGLL;ENSG00000074416:ENST00000493611:exon_127439919_127440006:MGLL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 127800071 A/G 1 107 105 212 55.4356932826156 50.600487900237 4.83520538237856 A:G A G 10 0.481909408573686 0.536412014066297 ENSG00000175792:ENST00000322623:exon_127799803_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000417360:exon_127799807_127800252:RUVBL1;ENSG00000175792:ENST00000478892:exon_127800025_127800252:RUVBL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 131102119 T/C 1 16 25 41 8.28944946282102 12.0477352143422 -3.75828575152113 T:C T C 10 0.481909408573686 0.275309859301505 ENSG00000198585:ENST00000521288:exon_131102006_131107674:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000502852:exon_131100890_131102283:NUDT16;ENSG00000198585:ENST00000359850:exon_131102006_131107674:NUDT16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 133185655 G/C 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 C:G G C 10 0.481909408573686 0.784647630659318 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 133185834 T/C 1 5 9 14 2.59045295713157 4.33718467716317 -1.7467317200316 T:C T C 10 0.481909408573686 0.428255926399451 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 133320092 G/A 1 7 11 18 3.6266341399842 5.30100349431055 -1.67436935432635 A:G G A 10 0.481909408573686 0.485903926383751 ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133319417_133320237:TOPBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 141161479 G/A 1 37 41 78 19.1693518827736 19.7582857515211 -0.58893386874751 A:G G A 10 0.481909408573686 0.910306962756743 ENSG00000177311:ENST00000509842:exon_141161231_141161682:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000507722:exon_141161231_141161586:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000513258:exon_141161231_141161555:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000509883:exon_141161231_141163543:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000510338:exon_141161231_141161668:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000504673:exon_141161231_141161512:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000510726:exon_141161231_141161862:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000509813:exon_141161231_141161564:ZBTB38 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C C T 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 149700768 T/C 0 12 0 12 6.21708709711577 0 6.21708709711577 T T 10 0.481909408573686 0.000156886243432913 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 156262150 C/T 1 30 20 50 15.5427177427894 9.63818817147372 5.9045295713157 T:C C T 10 0.481909408573686 0.118798129096873 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156262083_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156261743_156262228:SSR3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 156262210 A/G 1 7 12 19 3.6266341399842 5.78291290288423 -2.15627876290004 A:G A G 10 0.481909408573686 0.365298764164019 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156262083_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156262097_156262228:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156261743_156262228:SSR3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 156266765 A/G 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 A:G A G 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.291636936274409 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 156867354 T/C 1 278 201 479 144.029184416515 96.8637911233109 47.1653932932044 T:C T C 10 0.481909408573686 1.64968038217787e-05 ENSG00000163660:ENST00000461804:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000295926:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000464316:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000475298:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000474539:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000471247:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000476744:exon_156867274_156867734:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000470121:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000468977:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000467849:exon_156867274_156867422:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000476367:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000477127:exon_156867274_156867385:CCNL1;ENSG00000163660:ENST00000464679:exon_156867233_156867385:CCNL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 160130240 A/G 1 85 141 226 44.0377002712367 67.9492266088897 -23.911526337653 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00169703717256034 ENSG00000113810:ENST00000357388:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000360111:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000472282:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000468653:exon_160130114_160130637:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469762:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000469858:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000489573:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000462787:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000344722:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000392788:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000497984:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000487747:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000465563:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000494612:exon_160130114_160130241:SMC4;ENSG00000113810:ENST00000467263:exon_160130123_160130241:SMC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 160156318 A/G 1 11 10 21 5.69899650568945 4.81909408573686 0.879902419952594 A:G A G 10 0.481909408573686 0.827994642190547 ENSG00000248710:ENST00000483754:exon_160156020_160156974:RP11-432B6.3;ENSG00000213186:ENST00000309784:exon_160153291_160156974:TRIM59 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 169700461 G/T 1 14 14 28 7.2532682799684 6.7467317200316 0.506536559936791 T:G G T 10 0.481909408573686 0.852769852476262 ENSG00000008952:ENST00000460513:exon_169700425_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000469515:exon_169700448_169700699:SEC62 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 169700474 C/A 1 16 14 30 8.28944946282102 6.7467317200316 1.54271774278942 A:C C A 10 0.481909408573686 0.589172404006851 ENSG00000008952:ENST00000460513:exon_169700425_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000469515:exon_169700448_169700699:SEC62 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 10 16 26 5.18090591426314 7.71055053717898 -2.52964462291584 A:G G A 10 0.481909408573686 0.335185485833609 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 11 12 23 5.69899650568945 5.78291290288423 -0.0839163971947787 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 179306775 C/T 1 98 110 208 50.7728779597788 53.0100349431055 -2.23715698332669 T:C C T 10 0.481909408573686 0.781611540905239 ENSG00000136522:ENST00000476781:exon_179306073_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000259038:exon_179306243_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000451938:exon_179306257_179306783:MRPL47;ENSG00000136522:ENST00000392659:exon_179306619_179306783:MRPL47 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 183558402 C/G 1 39 19 58 20.2055330656262 9.15627876290004 11.0492543027262 C:G C G 10 0.481909408573686 0.00375092469359304 ENSG00000175193:ENST00000317096:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000311101:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000450375:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000417784:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000418450:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000435888:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000421484:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000449306:exon_183558358_183558428:PARL;ENSG00000175193:ENST00000488202:exon_183558358_183558428:PARL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 183910611 T/C 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000161204:ENST00000429586:exon_183910593_183910684:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000292808:exon_183910593_183910684:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000473311:exon_183910593_183910684:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000468892:exon_183910389_183910684:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000466742:exon_183910389_183910684:ABCF3;ENSG00000161204:ENST00000480562:exon_183910593_183910684:ABCF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 184566906 G/A 0 0 8 8 0 3.85527526858949 -3.85527526858949 A G A 10 0.481909408573686 0.00809979847322851 ENSG00000156931:ENST00000287546:exon_184566859_184566983:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000436792:exon_184566859_184566983:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000446204:exon_184566859_184566983:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000422105:exon_184566859_184566929:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000437079:exon_184566859_184566983:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000452666:exon_184566859_184566983:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000469479:exon_184566859_184567135:VPS8;ENSG00000156931:ENST00000465818:exon_184566817_184566983:VPS8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 186509517 G/A 1 38 43 81 19.6874424741999 20.7221045686685 -1.03466209446857 A:G G A 10 0.481909408573686 0.825186636164005 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 191074873 C/G 1 11 15 26 5.69899650568945 7.22864112860529 -1.52964462291584 C:G C G 10 0.481909408573686 0.563932005021752 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 191075902 C/T 1 183 132 315 94.8105782310155 63.6120419317266 31.1985362992889 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000459635315771596 ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 195789428 C/A 1 37 14 51 19.1693518827736 6.7467317200316 12.422620162742 A:C C A 10 0.481909408573686 0.00062133454614857 ENSG00000072274:ENST00000464368:exon_195789262_195789516:TFRC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 11 7 18 5.69899650568945 3.3733658600158 2.32563064567365 T:C C T 10 0.481909408573686 0.347236209840515 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 195965516 G/C 1 31 7 38 16.0608083342157 3.3733658600158 12.6874424741999 C:G G C 10 0.481909408573686 2.91414439397504e-05 ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195961239_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195965422_195965765:PCYT1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 195965667 G/C 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 C:G G C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000161217:ENST00000419333:exon_195965579_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000292823:exon_195961239_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000431016:exon_195965422_195965765:PCYT1A;ENSG00000161217:ENST00000460827:exon_195965662_195965765:PCYT1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 196199542 T/C 1 21 13 34 10.8799024199526 6.26482231145792 4.61508010849467 T:C T C 10 0.481909408573686 0.124422465090189 ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 196202202 A/C 1 12 18 30 6.21708709711577 8.67436935432635 -2.45728225721058 A:C A C 10 0.481909408573686 0.465646371681429 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 197403844 T/C 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197403088_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197403711_197403909:KIAA0226 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 3 197682658 C/A 1 1728 974 2702 895.260541984671 469.37976395077 425.8807780339 A:C:G C A 10 0.481909408573686 6.83557468115566e-61 ENSG00000182899:ENST00000464167:exon_197682621_197683481:RPL35A;ENSG00000182899:ENST00000448864:exon_197682621_197682722:RPL35A;ENSG00000182899:ENST00000429437:exon_197682621_197682688:RPL35A;ENSG00000182899:ENST00000439255:exon_197682621_197682688:RPL35A;ENSG00000182899:ENST00000474640:exon_197682621_197682722:RPL35A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 663916 C/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:C C A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 675777 G/C 1 9 29 38 4.66281532283683 13.9753728486369 -9.31255752580007 C:G G C 10 0.481909408573686 0.00297200319025397 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 2673892 G/A 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2673848_2674099:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2673848_2674099:FAM193A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 2702193 C/T 1 66 46 112 34.1939790341367 22.1678327943896 12.0261462397472 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0234099418266622 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 2743983 G/A 1 46 32 78 23.8321672056104 15.421101074358 8.41106613125249 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0692280661065391 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 2916762 C/G 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G C G 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000087274:ENST00000264758:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000446856:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398125:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398124:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000503455:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000355842:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398129:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000398123:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513328:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000514940:exon_2916611_2916767:ADD1;ENSG00000087274:ENST00000513762:exon_2916611_2916767:ADD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 2940980 G/A 1 23 46 69 11.9160836028052 22.1678327943896 -10.2517491915843 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0155269222649494 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2940915_2941070:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2940915_2941070:NOP14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 3117168 C/G 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3117031_3117172:HTT;ENSG00000197386:ENST00000506137:exon_3117056_3117172:HTT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 3514689 T/C 1 76 48 124 39.3748849483999 23.1316516115369 16.2432333368629 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00390193140202781 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3508103_3514763:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3514660_3514763:LRPAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 4276394 C/T 1 266 185 451 137.8120973194 89.1532405861319 48.6588567332676 T:C C T 10 0.481909408573686 4.57355535456343e-06 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 176 163 339 91.1839440910313 78.5512335975108 12.6327104935204 A:C C A 10 0.481909408573686 0.174481005450989 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 4283537 G/A 1 11 16 27 5.69899650568945 7.71055053717898 -2.01155403148952 A:G G A 10 0.481909408573686 0.56430896561031 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000513174:exon_4283510_4283624:LYAR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 4304605 G/A 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000504302:exon_4304354_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000511458:exon_4304459_4304818:ZBTB49 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 4304681 C/T 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000168826:ENST00000355834:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000515012:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000337872:exon_4303716_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000503703:exon_4304038_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000504302:exon_4304354_4304818:ZBTB49;ENSG00000168826:ENST00000511458:exon_4304459_4304818:ZBTB49 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 5754592 G/A 1 3 12 15 1.55427177427894 5.78291290288423 -4.22864112860529 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0369058189380347 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000514919:exon_5754402_5754779:EVC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 5754671 G/A 1 13 2 15 6.73517768854208 0.963818817147372 5.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00320922182310767 ENSG00000072840:ENST00000264956:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000509451:exon_5754563_5754779:EVC;ENSG00000072840:ENST00000514919:exon_5754402_5754779:EVC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 5803633 C/T 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.551773499311371 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 5803669 T/C 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.755512817806202 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 5830393 C/T 1 54 2 56 27.976891937021 0.963818817147372 27.0130731198736 T:C C T 10 0.481909408573686 3.34605079856318e-15 ENSG00000072840:ENST00000382674:exon_5830246_5830772:EVC;ENSG00000072832:ENST00000506216:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000324989:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000397890:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000511535:exon_5830216_5830395:CRMP1;ENSG00000072832:ENST00000512574:exon_5830216_5830395:CRMP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 6613023 C/A 0 0 9 9 0 4.33718467716317 -4.33718467716317 A C A 10 0.481909408573686 0.00409118328334302 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 13604927 A/G 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 17492314 G/C 1 17 21 38 8.80754005424734 10.1200975800474 -1.31255752580007 C:G G C 10 0.481909408573686 0.746476365324525 ENSG00000151552:ENST00000513615:exon_17492285_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000507439:exon_17492285_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000281243:exon_17492285_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000428702:exon_17492285_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000501943:exon_17492285_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000514300:exon_17492285_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000505710:exon_17491664_17492368:QDPR;ENSG00000151552:ENST00000511609:exon_17492062_17492368:QDPR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 37863185 A/G 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:G A G 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37863131_37864558:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37863131_37863634:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37863131_37863291:PGM2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 38933859 G/A 1 29 8 37 15.0246271513631 3.85527526858949 11.1693518827736 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000218599799255091 ENSG00000197712:ENST00000515037:exon_38933856_38933995:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38933856_38933995:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000508737:exon_38933856_38933995:FAM114A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 38933869 C/T 1 7 29 36 3.6266341399842 13.9753728486369 -10.3487387086527 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000621516833005531 ENSG00000197712:ENST00000515037:exon_38933856_38933995:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38933856_38933995:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000508737:exon_38933856_38933995:FAM114A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 38933873 C/T 1 30 7 37 15.5427177427894 3.3733658600158 12.1693518827736 T:C C T 10 0.481909408573686 4.95817609703989e-05 ENSG00000197712:ENST00000515037:exon_38933856_38933995:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000358869:exon_38933856_38933995:FAM114A1;ENSG00000197712:ENST00000508737:exon_38933856_38933995:FAM114A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 110 13 123 56.9899650568945 6.26482231145792 50.7251427454366 A:G A G 10 0.481909408573686 4.12379918966143e-22 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 40121562 G/A 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000078177:ENST00000261435:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000381804:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000511480:exon_40121552_40123929:N4BP2;ENSG00000078177:ENST00000513269:exon_40121552_40123929:N4BP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 48172266 G/A 1 6 10 16 3.10854354855788 4.81909408573686 -1.71055053717898 A:G G A 10 0.481909408573686 0.459279308448497 ENSG00000135605:ENST00000381501:exon_48172265_48172393:TEC;ENSG00000135605:ENST00000506752:exon_48172262_48172395:TEC;ENSG00000135605:ENST00000505452:exon_48172265_48172393:TEC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 57211304 A/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:C A C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 68472101 T/C 1 27 29 56 13.9884459685105 13.9753728486369 0.0130731198735834 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68472014_68472616:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68472014_68472107:STAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 73942702 C/A 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:C C A 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73942657_73942821:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73942657_73942821:ANKRD17 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 74477529 A/G 1 2 10 12 1.03618118285263 4.81909408573686 -3.78291290288423 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0400536609943421 ENSG00000169435:ENST00000307439:exon_74477448_74477546:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000342081:exon_74477448_74477546:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000395777:exon_74477448_74477546:RASSF6;ENSG00000169435:ENST00000512591:exon_74477448_74477546:RASSF6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 76722353 G/A 1 149 124 273 77.1954981225208 59.7567666631371 17.4387314593837 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0392933637977244 ENSG00000138768:ENST00000508939:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000264904:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000504414:exon_76722232_76722353:USO1;ENSG00000138768:ENST00000441296:exon_76722232_76722353:USO1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 76877166 C/T 1 122 117 239 63.2070521540103 56.3834008031213 6.82365135088904 T:C C T 10 0.481909408573686 0.400247365382869 ENSG00000198301:ENST00000502543:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76877128_76877289:SDAD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 76879020 C/A 1 22 13 35 11.3979930113789 6.26482231145792 5.13317069992099 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0918167498360745 ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76879000_76879094:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76879000_76879094:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76879000_76879094:SDAD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 77977235 T/C 1 8 3 11 4.14472473141051 1.44572822572106 2.69899650568945 T:C T C 10 0.481909408573686 0.134075613444074 ENSG00000118816:ENST00000237654:exon_77977115_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000506614:exon_77977115_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000511943:exon_77977115_77977253:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000505609:exon_77977197_77977255:CCNI;ENSG00000118816:ENST00000504697:exon_77977218_77977255:CCNI HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 83348652 T/C 1 20 21 41 10.3618118285263 10.1200975800474 0.241714248478873 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000152795:ENST00000295470:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000502762:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000349655:exon_83348586_83348717:HNRPDL;ENSG00000152795:ENST00000514511:exon_83348586_83348717:HNRPDL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 84374630 T/C 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 T:C T C 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000163312:ENST00000508591:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000295488:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000510985:exon_84374384_84375098:HELQ;ENSG00000163312:ENST00000422434:exon_84374384_84375098:HELQ HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 89198355 T/C 1 11 15 26 5.69899650568945 7.22864112860529 -1.52964462291584 T:C T C 10 0.481909408573686 0.563932005021752 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000510548:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000511506:exon_89198295_89198719:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89196297_89198395:PPM1K HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 103789810 C/A 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 A:T:C C A 10 0.481909408573686 0.569930991051848 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 93 113 206 48.1824250026472 54.4557631688265 -6.27333816617932 C:G C G 10 0.481909408573686 0.403123565999916 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 104065650 T/C 1 37 52 89 19.1693518827736 25.0592892458317 -5.88993736305806 T:C T C 10 0.481909408573686 0.243302691505705 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104065488_104065775:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104065488_104065775:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104065488_104065775:CENPE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 104067195 T/C 1 66 62 128 34.1939790341367 29.8783833315685 4.31559570256819 T:C T C 10 0.481909408573686 0.479553062166998 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 104081920 C/T 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104081782_104081936:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104081782_104081936:CENPE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 106307762 G/A 1 15 29 44 7.77135887139471 13.9753728486369 -6.20401397724218 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0701516963702033 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513605:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106307724_106307793:PPA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 107268876 G/A 1 53 34 87 27.4588013455946 16.3849198915053 11.0738814540893 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0182763540806997 ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107268683_107270377:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107268683_107269648:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107268683_107270383:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107268683_107270377:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107268683_107270377:AIMP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 108955443 C/T 1 46 41 87 23.8321672056104 19.7582857515211 4.07388145408931 T:C C T 10 0.481909408573686 0.392722722878217 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108955395_108956327:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000510728:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000515462:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000514776:exon_108955395_108955648:HADH HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 113352397 G/A 1 30 36 66 15.5427177427894 17.3487387086527 -1.80602096586328 A:G G A 10 0.481909408573686 0.712418317001956 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 119736796 A/C 1 11 7 18 5.69899650568945 3.3733658600158 2.32563064567365 A:C A C 10 0.481909408573686 0.347236209840515 ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 124323738 T/C 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 ENSG00000164056:ENST00000339241:exon_124322692_124324907:SPRY1;ENSG00000164056:ENST00000394339:exon_124322692_124324910:SPRY1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 139964337 G/A 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139964228_139964497:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000504378:exon_139964228_139965045:CCRN4L;ENSG00000151014:ENST00000515616:exon_139964226_139964497:CCRN4L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 139966502 A/T 1 22 28 50 11.3979930113789 13.4934634400632 -2.0954704286843 A:T A T 10 0.481909408573686 0.574498190222588 ENSG00000151014:ENST00000280614:exon_139965793_139966906:CCRN4L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 140036029 G/A 1 322 8 330 166.825170439273 3.85527526858949 162.969895170684 A:G G A 10 0.481909408573686 1.66672138655673e-89 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 144442611 T/C 1 4 9 13 2.07236236570526 4.33718467716317 -2.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.270950871664830 ENSG00000153147:ENST00000283131:exon_144442582_144442748:SMARCA5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 146479091 C/G 1 9 24 33 4.66281532283683 11.5658258057685 -6.90301048293164 C:G C G 10 0.481909408573686 0.0221147684438697 ENSG00000170365:ENST00000302085:exon_146478943_146479231:SMAD1;ENSG00000170365:ENST00000394092:exon_146478943_146479106:SMAD1;ENSG00000170365:ENST00000515385:exon_146478943_146479231:SMAD1;ENSG00000170365:ENST00000511125:exon_146478943_146479231:SMAD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 153268148 T/C 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000109670:ENST00000281708:exon_153268082_153268223:FBXW7;ENSG00000109670:ENST00000296555:exon_153268082_153268223:FBXW7;ENSG00000109670:ENST00000393956:exon_153268082_153268223:FBXW7;ENSG00000109670:ENST00000263981:exon_153268082_153268223:FBXW7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 156277007 G/C 1 6 15 21 3.10854354855788 7.22864112860529 -4.12009758004741 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0824211975534233 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156276868_156277036:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156276868_156277036:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156276868_156277036:MAP9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 169911355 C/T 1 9 17 26 4.66281532283683 8.19245994575266 -3.52964462291584 T:C C T 10 0.481909408573686 0.175871569784347 ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169908741_169911479:CBR4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:G G T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 169931127 C/T 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169931099_169931231:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 170037658 G/A 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G G A 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000154447:ENST00000284637:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000511421:exon_170037420_170037781:SH3RF1;ENSG00000154447:ENST00000508685:exon_170037420_170037781:SH3RF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 170498082 T/C 1 98 76 174 50.7728779597788 36.6251150516001 14.1477629081786 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0336318998092482 ENSG00000137601:ENST00000439128:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000379072:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000511633:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000510533:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000507142:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000512193:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000509912:exon_170498079_170498230:NEK1;ENSG00000137601:ENST00000505119:exon_170497755_170498230:NEK1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 185310218 C/T 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000168310:ENST00000393593:exon_185308867_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000505067:exon_185310176_185310220:IRF2;ENSG00000168310:ENST00000502750:exon_185310194_185310220:IRF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 186379899 G/C 1 11 5 16 5.69899650568945 2.40954704286843 3.28944946282102 C:G G C 10 0.481909408573686 0.132948456946107 ENSG00000168491:ENST00000307588:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000393540:exon_186379280_186381392:CCDC110;ENSG00000168491:ENST00000510617:exon_186379280_186381392:CCDC110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 190862126 A/G 0 93 0 93 48.1824250026472 0 48.1824250026472 A A 10 0.481909408573686 3.27931169003e-30 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 190862142 C/T 0 104 0 104 53.8814215083367 0 53.8814215083367 C C 10 0.481909408573686 1.06758424496662e-33 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 190862151 A/C 1 1 98 99 0.518090591426314 47.2271220402212 -46.7090314487949 A:C A C 10 0.481909408573686 5.18978701843281e-27 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 190862154 T/C 1 93 4 97 48.1824250026472 1.92763763429474 46.2547873683525 T:C T C 10 0.481909408573686 1.66898424853695e-24 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190861943_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190862025_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190862054_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190862056_190862226:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000510140:exon_190862071_190862226:FRG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 4 190873420 C/T 1 82 52 134 42.4834284969577 25.0592892458317 17.4241392511261 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00314868629743276 ENSG00000109536:ENST00000226798:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000524583:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000533157:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000531991:exon_190873317_190873442:FRG1;ENSG00000109536:ENST00000514482:exon_190873317_190873442:FRG1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 11 10 21 5.69899650568945 4.81909408573686 0.879902419952594 A:G G A 10 0.481909408573686 0.827994642190547 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 107 86 193 55.4356932826156 41.444209137337 13.9914841452786 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0515193734858249 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 256509 G/A 1 159 144 303 82.3764040367839 69.3949548346108 12.9814492021731 A:G G A 10 0.481909408573686 0.150554597617505 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 1494909 C/T 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 1815950 T/C 1 19 8 27 9.84372123709996 3.85527526858949 5.98844596851048 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0321646718213699 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 16475199 C/G 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 C:G C G 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000154153:ENST00000510362:exon_16474758_16475343:FAM134B;ENSG00000154153:ENST00000399793:exon_16473162_16475343:FAM134B;ENSG00000154153:ENST00000306320:exon_16473163_16475343:FAM134B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 33988445 A/C 1 13 8 21 6.73517768854208 3.85527526858949 2.87990241995259 A:C A C 10 0.481909408573686 0.275191326302008 ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33988412_33988466:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 157 50 207 81.3402228539313 24.0954704286843 57.244752425247 A:G A G 10 0.481909408573686 6.78344810983777e-16 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 37396616 C/G 1 3 10 13 1.55427177427894 4.81909408573686 -3.26482231145792 C:G C G 10 0.481909408573686 0.095027905587991 ENSG00000082068:ENST00000265107:exon_37396477_37396672:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000504564:exon_37396477_37396672:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000511906:exon_37396477_37396672:WDR70 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 39119723 C/A 1 11 39 50 5.69899650568945 18.7944669343738 -13.0954704286843 A:C C A 10 0.481909408573686 0.000179626456997457 ENSG00000082074:ENST00000351578:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000515010:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000512982:exon_39119637_39119736:FYB;ENSG00000082074:ENST00000505428:exon_39119637_39119736:FYB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 42808371 T/C 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 T:C T C 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000250722:ENST00000514985:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000512980:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000511224:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506577:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000507920:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000509276:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000514218:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000513303:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000510965:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000505309:exon_42808253_42808507:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000506078:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000515626:exon_42808253_42808468:SEPP1;ENSG00000250722:ENST00000508937:exon_42807920_42808468:SEPP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 54603822 T/C 1 24 41 65 12.4341741942315 19.7582857515211 -7.32411155728959 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0817711899886163 ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 54721820 G/C 1 6 18 24 3.10854354855788 8.67436935432635 -5.56582580576846 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0247474786500535 ENSG00000067113:ENST00000264775:exon_54721691_54721867:PPAP2A;ENSG00000067113:ENST00000307259:exon_54721691_54721867:PPAP2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 60455923 C/T 1 10 6 16 5.18090591426314 2.89145645144212 2.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.319522314154991 ENSG00000188725:ENST00000339020:exon_60453536_60456026:C5orf43;ENSG00000188725:ENST00000507416:exon_60455749_60456026:C5orf43 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 313 326 639 162.162355116436 157.102467195022 5.05988792141463 T:C T C 10 0.481909408573686 0.69240894347439 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 82 95 177 42.4834284969577 45.7813938145002 -3.29796531754243 C:G C G 10 0.481909408573686 0.652083644203942 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 64859196 A/G 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000113593:ENST00000508982:exon_64859063_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64859066_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000503435:exon_64859117_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000515447:exon_64859120_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64859123_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64859126_64859333:PPWD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 68396580 G/A 1 10 10 20 5.18090591426314 4.81909408573686 0.36181182852628 A:G G A 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 70806958 G/A 1 60 51 111 31.0854354855788 24.577379837258 6.50805564832085 A:G G A 10 0.481909408573686 0.218690311665984 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 71490766 T/C 1 168 52 220 87.0392193596207 25.0592892458317 61.9799301137891 T:C T C 10 0.481909408573686 1.56724519428636e-17 ENSG00000131711:ENST00000296755:exon_71489693_71496194:MAP1B;ENSG00000131711:ENST00000513526:exon_71489693_71491249:MAP1B;ENSG00000131711:ENST00000511641:exon_71489693_71491141:MAP1B;ENSG00000131711:ENST00000504492:exon_71489693_71491267:MAP1B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 72182857 A/G 1 34 38 72 17.6150801084947 18.3125575258001 -0.697477417305397 A:G A G 10 0.481909408573686 0.90649676192297 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 35 37 72 18.133170699921 17.8306481172264 0.302522582694607 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 74063154 C/G 1 90 115 205 46.6281532283683 55.4195819859739 -8.79142875760564 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0.23492943353254 ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74062763_74063196:GFM2;ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74062817_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74063073_74063188:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74063088_74063188:NSA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 84 92 176 43.5196096798104 44.3356655887791 -0.816055908968742 A:G A G 10 0.481909408573686 0.93993088998681 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 75884734 G/A 1 5 14 19 2.59045295713157 6.7467317200316 -4.15627876290004 A:G G A 10 0.481909408573686 0.066824099895121 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75884731_75884798:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75884731_75884798:IQGAP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 76028435 C/T 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 T:C C T 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000181104:ENST00000319211:exon_76028139_76031606:F2R;ENSG00000181104:ENST00000437700:exon_76028406_76029771:F2R HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 76359024 C/A 1 15 12 27 7.77135887139471 5.78291290288423 1.98844596851048 A:C C A 10 0.481909408573686 0.449937357779834 ENSG00000164252:ENST00000312916:exon_76358877_76361059:AGGF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 77411985 T/C 1 51 33 84 26.422620162742 15.9030104829316 10.5196096798104 T:C:G T C 10 0.481909408573686 0.0220704844194028 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 77412011 A/G 1 27 40 67 13.9884459685105 19.2763763429474 -5.28793037443696 A:T:G A G 10 0.481909408573686 0.221917985852889 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 77477451 G/A 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77477331_77477486:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77477331_77477486:AP3B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 9 10 19 4.66281532283683 4.81909408573686 -0.156278762900034 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 95234377 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000118985:ENST00000237853:exon_95233944_95234514:ELL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96086334 G/C 1 25 43 68 12.9522647856578 20.7221045686685 -7.76983978301065 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0683627893966004 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96086291_96086386:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96086291_96086386:CAST HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96103616 T/G 1 40 43 83 20.7236236570526 20.7221045686685 0.00151908838406101 T:G T G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96103611_96103703:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510098:exon_96103611_96103703:CAST HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96116940 G/A 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96117555 C/T 1 13 5 18 6.73517768854208 2.40954704286843 4.32563064567365 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0569959852604016 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96117397_96117558:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96117397_96117558:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000514604:exon_96117398_96117558:ERAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96231000 G/T 1 23 27 50 11.9160836028052 13.0115540314895 -1.0954704286843 T:G G T 10 0.481909408573686 0.779019220701832 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000508077:exon_96230950_96231063:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515095:exon_96230950_96231063:ERAP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96245439 C/T 1 10 4 14 5.18090591426314 1.92763763429474 3.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.108335810082199 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96245284_96245513:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96245284_96245468:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000515387:exon_96245284_96245984:ERAP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96249115 C/T 1 35 7 42 18.133170699921 3.3733658600158 14.7598048399052 T:C C T 10 0.481909408573686 3.31887555434804e-06 ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96249021_96249161:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000512869:exon_96249042_96249161:ERAP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 12 12 24 6.21708709711577 5.78291290288423 0.434174194231534 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 96503192 T/C 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96503171_96503695:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96503171_96503281:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511012:exon_96503171_96503423:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96502450_96503695:RIOK2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 98199204 C/T 1 3 8 11 1.55427177427894 3.85527526858949 -2.30100349431055 T:C C T 10 0.481909408573686 0.229933048608863 ENSG00000153922:ENST00000514344:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000284049:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000505657:exon_98199112_98199290:CHD1;ENSG00000153922:ENST00000511067:exon_98199112_98199290:CHD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 108713982 T/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 108714298 T/C 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000198961:ENST00000361189:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000452609:exon_108713905_108714955:PJA2;ENSG00000198961:ENST00000361557:exon_108713905_108714955:PJA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 114606985 C/T 1 74 93 167 38.3387037655472 44.8175749973528 -6.47887123180556 T:C C T 10 0.481909408573686 0.352827415116278 ENSG00000164221:ENST00000379611:exon_114606910_114607323:CCDC112;ENSG00000164221:ENST00000296647:exon_114606910_114607323:CCDC112;ENSG00000164221:ENST00000512261:exon_114606910_114607323:CCDC112;ENSG00000164221:ENST00000506442:exon_114606910_114607323:CCDC112;ENSG00000164221:ENST00000395557:exon_114606910_114607323:CCDC112;ENSG00000164221:ENST00000502975:exon_114606910_114607307:CCDC112 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 118464913 A/G 1 51 56 107 26.422620162742 26.9869268801264 -0.564306717384405 A:G A G 10 0.481909408573686 0.923288498200089 ENSG00000172869:ENST00000503802:exon_118464906_118465118:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000311085:exon_118464906_118465118:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000514151:exon_118464906_118465027:DMXL1;ENSG00000172869:ENST00000504031:exon_118464904_118465118:DMXL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 118877677 C/T 1 16 28 44 8.28944946282102 13.4934634400632 -5.20401397724219 T:C C T 10 0.481909408573686 0.132080134716318 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 122165313 A/G 1 21 22 43 10.8799024199526 10.6020069886211 0.277895431331501 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 122165317 C/T 1 24 21 45 12.4341741942315 10.1200975800474 2.31407661418413 T:C C T 10 0.481909408573686 0.551723642455784 ENSG00000205302:ENST00000379516:exon_122165293_122165803:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000514949:exon_122165293_122165450:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000510372:exon_122165293_122165366:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000506847:exon_122165293_122165468:SNX2;ENSG00000205302:ENST00000507321:exon_122165293_122165450:SNX2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 130500842 A/G 1 89 78 167 46.1100626369419 37.5889338687475 8.52112876819443 A:G A G 10 0.481909408573686 0.189066878624648 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130500788_130501178:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130500788_130500933:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130500788_130500994:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130500753_130501026:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130500753_130500913:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130500788_130501018:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130500788_130501034:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130500753_130500949:HINT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 132232750 C/T 1 22 14 36 11.3979930113789 6.7467317200316 4.6512612913473 T:C C T 10 0.481909408573686 0.134811283487813 ENSG00000072364:ENST00000265343:exon_132232015_132232932:AFF4;ENSG00000072364:ENST00000378595:exon_132232015_132232932:AFF4;ENSG00000072364:ENST00000478588:exon_132232503_132232932:AFF4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 133502947 G/C 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 C:G G C 10 0.481909408573686 0.346965939773411 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 47 49 96 24.3502577970368 23.6135610201106 0.736696776926141 A:G A G 10 0.481909408573686 0.918825428023002 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 27 22 49 13.9884459685105 10.6020069886211 3.38643897988939 A:G A G 10 0.481909408573686 0.391478180241289 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 134907552 G/A 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000145824:ENST00000512158:exon_134906376_134907558:CXCL14;ENSG00000145824:ENST00000337225:exon_134906376_134907558:CXCL14;ENSG00000145824:ENST00000511614:exon_134907460_134907558:CXCL14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 141021283 G/T 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 T:G G T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141021269_141021324:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141021269_141022188:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141021269_141021324:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141021269_141021324:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141021269_141021324:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141021269_141021324:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000518160:exon_141021269_141021324:FCHSD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 142661490 A/G 1 10 10 20 5.18090591426314 4.81909408573686 0.36181182852628 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142660685_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142660703_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142660727_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142661376_142661606:NR3C1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 142680282 T/C 1 301 281 582 155.945268019321 135.416543809206 20.5287242101147 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0891714635094225 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000415690:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000416954:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504336:exon_142680126_142680328:NR3C1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 0 11 0 11 5.69899650568945 0 5.69899650568945 C C 10 0.481909408573686 0.000325551318653959 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 145547769 T/C 1 7 16 23 3.6266341399842 7.71055053717898 -4.08391639719478 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0980365874501828 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000360930:exon_145547691_145547828:LARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 145651012 T/C 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 T:C T C 10 0.481909408573686 0.510384690986528 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 149227064 G/A 1 28 16 44 14.5065365599368 7.71055053717898 6.79598602275781 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0490747613513774 ENSG00000155846:ENST00000360453:exon_149227021_149227125:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000394320:exon_149225323_149227267:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000309241:exon_149227021_149234585:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000401623:exon_149227021_149234585:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000403750:exon_149227021_149227190:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000434684:exon_149226855_149227281:PPARGC1B;ENSG00000155846:ENST00000492495:exon_149227021_149227320:PPARGC1B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 149759096 T/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149759095_149760422:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149759095_149759295:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506063:exon_149759095_149759207:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000506767:exon_149759095_149759295:TCOF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 149826526 C/T 1 2224 1824 4048 1152.23347533212 879.002761238403 273.230714093719 A:T:C C T 10 0.481909408573686 9.13942197808023e-18 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 150565008 C/T 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150565008_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150564983_150565102:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150564983_150565102:CCDC69 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 150639439 A/G 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 153709103 C/G 1 3 8 11 1.55427177427894 3.85527526858949 -2.30100349431055 C:G C G 10 0.481909408573686 0.229933048608863 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 153709273 A/G 1 36 26 62 18.6512612913473 12.5296446229158 6.12161666843147 A:G A G 10 0.481909408573686 0.128308167469425 ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 154268902 C/T 1 1 7 8 0.518090591426314 3.3733658600158 -2.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0717452397536542 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154268881_154268977:GEMIN5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 154291319 G/A 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 159520661 T/C 1 34 22 56 17.6150801084947 10.6020069886211 7.01307311987358 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0624684843204804 ENSG00000170234:ENST00000456329:exon_159520108_159521072:PWWP2A;ENSG00000170234:ENST00000523662:exon_159520108_159521072:PWWP2A;ENSG00000170234:ENST00000307063:exon_159518349_159521072:PWWP2A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 159833529 C/T 1 61 66 127 31.6035260770052 31.8060209658633 -0.202494888858126 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159833475_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000520841:exon_159833356_159833636:SLU7;ENSG00000164609:ENST00000523219:exon_159833372_159833636:SLU7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 159835658 A/G 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:G A G 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159835657_159835704:SLU7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 31 23 54 16.0608083342157 11.0839163971948 4.97689193702095 T:C T C 10 0.481909408573686 0.220023465911012 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 172396450 G/A 1 20 30 50 10.3618118285263 14.4572822572106 -4.0954704286843 A:G G A 10 0.481909408573686 0.260652786309308 ENSG00000037241:ENST00000519974:exon_172396416_172396719:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000521476:exon_172396416_172396724:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000265100:exon_172396416_172396774:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519239:exon_172396416_172396721:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519156:exon_172396416_172396490:RPL26L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 172396467 C/T 1 20 29 49 10.3618118285263 13.9753728486369 -3.61356102011061 T:C C T 10 0.481909408573686 0.320135905813921 ENSG00000037241:ENST00000519974:exon_172396416_172396719:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000521476:exon_172396416_172396724:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000265100:exon_172396416_172396774:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519239:exon_172396416_172396721:RPL26L1;ENSG00000037241:ENST00000519156:exon_172396416_172396490:RPL26L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 174940493 G/A 1 15 18 33 7.77135887139471 8.67436935432635 -0.903010482931639 A:G G A 10 0.481909408573686 0.862170856432763 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174940466_174940593:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174940466_174940593:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174940466_174940593:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000515736:exon_174940466_174940737:SFXN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 176733116 A/G 1 168 204 372 87.0392193596207 98.3095193490319 -11.2702999894112 A:G A G 10 0.481909408573686 0.253820514039423 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000511309:exon_176732872_176733148:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510797:exon_176733099_176733154:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503853:exon_176733099_176733177:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000510701:exon_176733099_176733164:PRELID1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 176733616 T/C 1 294 378 672 152.318633879336 182.161756440853 -29.843122561517 A:T:C T C 10 0.481909408573686 0.0226960155841295 ENSG00000213347:ENST00000427908:exon_176732501_176734196:MXD3;ENSG00000169230:ENST00000303204:exon_176733423_176733960:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000504594:exon_176733423_176733670:PRELID1;ENSG00000169230:ENST00000503216:exon_176733456_176733950:PRELID1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 176868676 T/C 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.212405499079556 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 179249935 G/A 1 27 12 39 13.9884459685105 5.78291290288423 8.20553306562624 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00982153613363278 ENSG00000161011:ENST00000504627:exon_179249889_179250053:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179249485_179250053:SQSTM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 179260048 C/T 1 32 22 54 16.578898925642 10.6020069886211 5.97689193702096 T:C C T 10 0.481909408573686 0.133418473087152 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 179260613 A/G 1 10 6 16 5.18090591426314 2.89145645144212 2.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.319522314154991 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260587_179260782:SQSTM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 179260745 G/A 1 17 14 31 8.80754005424734 6.7467317200316 2.06080833421573 A:G G A 10 0.481909408573686 0.477877569330722 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260587_179260782:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260587_179260782:SQSTM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 31 64 95 16.0608083342157 30.8422021487159 -14.7813938145002 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00273196217693584 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 180486247 G/T 1 14 2 16 7.2532682799684 0.963818817147372 6.28944946282102 T:G G T 10 0.481909408573686 0.00175554822936222 ENSG00000165810:ENST00000327705:exon_180486237_180488523:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000376842:exon_180486237_180488518:BTNL9;ENSG00000165810:ENST00000512570:exon_180486237_180486312:BTNL9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 180663951 T/A 1 1056 1506 2562 547.103664546188 725.755569311971 -178.651904765784 A:T:G T A 10 0.481909408573686 1.56086289423737e-12 ENSG00000204628:ENST00000511473:exon_180663909_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504325:exon_180663926_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000514455:exon_180663928_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000507756:exon_180663929_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000509148:exon_180663929_180664719:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502905:exon_180663929_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000389599:exon_180663930_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000511566:exon_180663934_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000376817:exon_180663937_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512805:exon_180663937_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504128:exon_180663937_180664319:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000508682:exon_180663937_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000507273:exon_180663937_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000509535:exon_180663937_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504726:exon_180663941_180664042:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000511900:exon_180663945_180664042:GNB2L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 5 180666047 G/A 1 13 11 24 6.73517768854208 5.30100349431055 1.43417419423154 A:G G A 10 0.481909408573686 0.683876092776092 ENSG00000204628:ENST00000514183:exon_180665206_180666177:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502548:exon_180666038_180666582:GNB2L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 1 15 4 19 7.77135887139471 1.92763763429474 5.84372123709996 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00979754308718647 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 2 36 38 1.03618118285263 17.3487387086527 -16.3125575258001 A:G G A 10 0.481909408573686 9.817208540988e-09 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 2892130 G/A 1 88 76 164 45.5919720455156 36.6251150516001 8.96685699391549 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.183896251966319 ENSG00000170542:ENST00000380698:exon_2892067_2892222:SERPINB9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 327 310 637 169.415623396405 149.391916657843 20.023706738562 A:G A G 10 0.481909408573686 0.112944820587983 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 4891954 G/A 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000153046:ENST00000474977:exon_4891947_4892337:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000491864:exon_4891947_4892346:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000483019:exon_4891947_4892581:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4891947_4892613:CDYL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 8 14 22 4.14472473141051 6.7467317200316 -2.60200698862109 A:G A G 10 0.481909408573686 0.293237542673417 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 10702575 T/G 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 T:G T G 10 0.481909408573686 0.373447157732848 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 10702690 A/G 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000111845:ENST00000379568:exon_10702602_10702722:PAK1IP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 11185533 G/A 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11183531_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11183534_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11183539_11185904:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11185051_11185904:NEDD9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 11213548 A/G 1 24 20 44 12.4341741942315 9.63818817147372 2.79598602275781 A:G A G 10 0.481909408573686 0.451808378547594 ENSG00000111859:ENST00000379446:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000432478:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000339240:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000397373:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000448183:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000504387:exon_11213514_11213960:NEDD9;ENSG00000111859:ENST00000379433:exon_11213514_11213960:NEDD9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 12120652 C/T 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C C T 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000095951:ENST00000379388:exon_12120123_12126103:HIVEP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 13283674 G/A 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000112137:ENST00000457702:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000415087:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000489548:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000379335:exon_13283654_13283794:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000379329:exon_13283654_13284139:PHACTR1;ENSG00000112137:ENST00000481706:exon_13283654_13283778:PHACTR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 17665479 G/C 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17665470_17665616:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17665470_17665616:NUP153 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 22294764 C/T 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 T:C C T 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000172179:ENST00000306482:exon_22294638_22294813:PRL;ENSG00000172179:ENST00000397199:exon_22294638_22294816:PRL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 11 13 24 5.69899650568945 6.26482231145792 -0.565825805768465 A:G G A 10 0.481909408573686 0.841333561850622 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26056286 C/G 1 302 277 579 156.463358610747 133.488906174911 22.9744524358358 T:C:G C G 10 0.481909408573686 0.0612019974773646 ENSG00000187837:ENST00000343677:exon_26055968_26056699:HIST1H1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26216575 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000187990:ENST00000339812:exon_26216491_26216871:HIST1H2BG HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26370605 T/C 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 T:C T C 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26370707 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26370748 G/A 1 14 12 26 7.2532682799684 5.78291290288423 1.47035537708416 A:G G A 10 0.481909408573686 0.695532599726404 ENSG00000186470:ENST00000532865:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000524682:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26370550_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532294:exon_26370653_26370831:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26370719_26370831:BTN3A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26373308 G/A 1 14 11 25 7.2532682799684 5.30100349431055 1.95226478565785 A:G G A 10 0.481909408573686 0.549198603475773 ENSG00000186470:ENST00000532627:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527422:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000356386:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000377708:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000396948:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000532994:exon_26373125_26373315:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000531055:exon_26373125_26373325:BTN3A2;ENSG00000186470:ENST00000527639:exon_26373116_26373325:BTN3A2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26410227 G/A 1 10 3 13 5.18090591426314 1.44572822572106 3.73517768854208 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0504295029068842 ENSG00000026950:ENST00000082468:exon_26410122_26410260:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000513047:exon_26410122_26410260:BTN3A1;ENSG00000026950:ENST00000502361:exon_26410122_26410260:BTN3A1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 9 11 20 4.66281532283683 5.30100349431055 -0.63818817147372 A:G G A 10 0.481909408573686 0.826095964570956 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 27833174 A/G 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 28057075 G/A 1 11 6 17 5.69899650568945 2.89145645144212 2.80754005424734 A:G G A 10 0.481909408573686 0.225825362231512 ENSG00000197279:ENST00000252206:exon_28056341_28057338:ZNF165;ENSG00000197279:ENST00000377325:exon_28056341_28057341:ZNF165 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 28269782 C/T 1 8 8 16 4.14472473141051 3.85527526858949 0.289449462821024 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 28270047 C/G 1 6 10 16 3.10854354855788 4.81909408573686 -1.71055053717898 C:G C G 10 0.481909408573686 0.459279308448497 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 28270064 T/A 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:T T A 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000137338:ENST00000259883:exon_28268501_28270326:PGBD1;ENSG00000137338:ENST00000405948:exon_28268501_28270325:PGBD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29523670 C/A 1 134 29 163 69.4241392511261 13.9753728486369 55.4487664024892 A:C C A 10 0.481909408573686 4.46568771068717e-19 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29523859 G/C 1 103 69 172 53.3633309169103 33.2517491915843 20.111581725326 C:G G C 10 0.481909408573686 0.00222881170716977 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29523872 A/G 1 89 61 150 46.1100626369419 29.3964739229948 16.7135887139471 A:G A G 10 0.481909408573686 0.006888454844001 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29524003 A/G 1 44 47 91 22.7959860227578 22.6497422029632 0.146243819794574 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 12 10 22 6.21708709711577 4.81909408573686 1.39799301137891 A:G G A 10 0.481909408573686 0.670841677307095 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 16 4 20 8.28944946282102 1.92763763429474 6.36181182852628 A:C A C 10 0.481909408573686 0.00584895410457532 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 16 4 20 8.28944946282102 1.92763763429474 6.36181182852628 A:T A T 10 0.481909408573686 0.00584895410457532 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 30313340 G/C 1 85 64 149 44.0377002712367 30.8422021487159 13.1954981225208 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0329393298354395 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 30314329 A/C 1 61 75 136 31.6035260770052 36.1432056430265 -4.5396795660213 A:C A C 10 0.481909408573686 0.44159353386562 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30314209_30314334:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30314209_30314334:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30314209_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000489124:exon_30314209_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30314209_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30314209_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30314209_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30314209_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30314209_30314341:RPP21 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 30668352 G/C 1 19 19 38 9.84372123709996 9.15627876290004 0.68744247419993 C:G G C 10 0.481909408573686 0.871900852507636 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30667584_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30668092_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30668172_30668409:MDC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 30672004 T/C 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C T C 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 30893728 C/T 1 33 22 55 17.0969895170684 10.6020069886211 6.49498252844727 T:C C T 10 0.481909408573686 0.104556289823289 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893657_30893785:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893657_30893785:VARS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31110786 T/A 1 91 99 190 47.1462438197946 47.7090314487949 -0.562787629000347 A:T T A 10 0.481909408573686 0.94227913936242 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110740_31110911:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110740_31110869:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110740_31110911:CCHCR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31111174 C/A 1 17 7 24 8.80754005424734 3.3733658600158 5.43417419423153 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0388877729399463 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31113052 G/A 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 A:G G A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31503219 G/A 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31503144_31503262:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31503144_31503252:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31500557_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000436533:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000482195:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000431908:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000481456:exon_31500190_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000427214:exon_31503144_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000453105:exon_31503006_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000428098:exon_31503165_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000419338:exon_31503172_31503262:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000456662:exon_31503184_31503262:BAT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31597081 G/A 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31596921_31597111:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31596921_31597111:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31596921_31597111:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31596921_31597111:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31596921_31597111:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000483470:exon_31596417_31597111:BAT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31848494 G/A 1 33 41 74 17.0969895170684 19.7582857515211 -2.66129623445277 A:G G A 10 0.481909408573686 0.562445573458096 ENSG00000204371:ENST00000478491:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000461880:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000494816:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31848450_31848625:EHMT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31936679 C/T 1 30 21 51 15.5427177427894 10.1200975800474 5.42262016274201 T:C C T 10 0.481909408573686 0.160582035667905 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31936400_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000484835:exon_31936463_31936763:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000483553:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000471818:exon_31936678_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000485349:exon_31936648_31937185:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000491994:exon_31936648_31936866:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000470453:exon_31936648_31936866:SKIV2L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 31938107 A/G 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32089142 G/T 1 7 7 14 3.6266341399842 3.3733658600158 0.253268279968395 T:G G T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32093922 G/A 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G G A 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 137 109 246 70.978411025405 52.5281255345318 18.4502854908732 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0214447489560797 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 478 345 823 247.647302701778 166.258745957922 81.3885567438564 T:G T G 10 0.481909408573686 1.44919076841628e-08 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32605295 C/T 0 55 1 56 28.4949825284473 0.481909408573686 28.0130731198736 A:C C A 10 0.481909408573686 2.09415535781441e-16 ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32605336 G/A 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 G G 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32632832 A/T 0 13 0 13 6.73517768854208 0 6.73517768854208 A A 10 0.481909408573686 7.56049567861026e-05 ENSG00000179344:ENST00000487676:exon_32629124_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399079:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000374943:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000434651:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000399084:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000484729:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1;ENSG00000179344:ENST00000529407:exon_32632575_32632844:HLA-DQB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 A:C C A 10 0.481909408573686 0.755512817806202 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 T:C T C 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33036505 G/C 1 57 49 106 29.5311637112999 23.6135610201106 5.91760269118928 C:G G C 10 0.481909408573686 0.285011918998133 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 1 19 1 20 9.84372123709996 0.481909408573686 9.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 1.22102278475102e-05 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 35 3 38 18.133170699921 1.44572822572106 16.6874424741999 T:C T C 10 0.481909408573686 1.92175336693829e-08 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 56 2 58 29.0130731198736 0.963818817147372 28.0492543027262 A:G G A 10 0.481909408573686 8.35080814110882e-16 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 52 1 53 26.9407107541683 0.481909408573686 26.4588013455946 T:C T C 10 0.481909408573686 1.64323404156317e-15 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037445 G/A 1 40 1 41 20.7236236570526 0.481909408573686 20.2417142484789 A:G G A 10 0.481909408573686 6.4769624887884e-12 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037474 A/G 1 2 25 27 1.03618118285263 12.0477352143422 -11.0115540314895 A:G A G 10 0.481909408573686 7.61538091885334e-06 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 11 1 12 5.69899650568945 0.481909408573686 5.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.00255486444561599 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037557 C/T 0 12 0 12 6.21708709711577 0 6.21708709711577 C C 10 0.481909408573686 0.000156886243432913 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 0 12 0 12 6.21708709711577 0 6.21708709711577 G G 10 0.481909408573686 0.000156886243432913 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 11 0 11 5.69899650568945 0 5.69899650568945 A A 10 0.481909408573686 0.000325551318653959 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037639 G/A 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33037640 C/T 1 9 1 10 4.66281532283683 0.481909408573686 4.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00933152174592414 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 290 55 345 150.246271513631 26.5050174715527 123.741254042078 T:C T C 10 0.481909408573686 1.00560167878281e-43 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 316 73 389 163.716626890715 35.1793868258791 128.537240064836 T:C C T 10 0.481909408573686 3.86079420345382e-41 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 338 121 459 175.114619902094 58.311038437416 116.803581464678 A:T:C T C 10 0.481909408573686 1.58393263949708e-28 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 55 49 104 28.4949825284473 23.6135610201106 4.88142150833665 C:G C G 10 0.481909408573686 0.377369956037586 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 36936771 A/G 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.494047032028967 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 38650628 T/G 1 15 23 38 7.77135887139471 11.0839163971948 -3.31255752580007 T:G T G 10 0.481909408573686 0.331173479019958 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 41903782 A/C 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:C A C 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41902671_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41902672_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41902694_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41902723_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000510503:exon_41903173_41903845:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511686:exon_41903634_41903845:CCND3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 42858238 G/T 1 26 23 49 13.4703553770842 11.0839163971948 2.38643897988938 T:G G T 10 0.481909408573686 0.568062904269512 ENSG00000221821:ENST00000408925:exon_42858005_42858554:C6orf226 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 42932202 C/T 1 17 24 41 8.80754005424734 11.5658258057685 -2.75828575152113 T:C C T 10 0.481909408573686 0.436429687610051 ENSG00000124587:ENST00000304611:exon_42931608_42932209:PEX6;ENSG00000124587:ENST00000244546:exon_42932073_42932209:PEX6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43005600 G/A 1 23 36 59 11.9160836028052 17.3487387086527 -5.43265510584748 A:G G A 10 0.481909408573686 0.192315509214855 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43005355_43005749:CUL7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43006208 C/T 1 7 8 15 3.6266341399842 3.85527526858949 -0.228641128605291 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43006005_43006210:CUL7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43012483 T/C 1 8 2 10 4.14472473141051 0.963818817147372 3.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.057427455776973 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43172935 C/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000112659:ENST00000504485:exon_43172910_43173161:CUL9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 199 100 299 103.100027693836 48.1909408573686 54.9090868364679 A:G G A 10 0.481909408573686 1.83115704387099e-10 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43417852 G/C 1 17 16 33 8.80754005424734 7.71055053717898 1.09698951706836 C:G G C 10 0.481909408573686 0.730457797715164 ENSG00000124574:ENST00000372530:exon_43417667_43418168:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000244533:exon_43417667_43418163:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000463024:exon_43417667_43418164:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000443394:exon_43417667_43418160:ABCC10;ENSG00000124574:ENST00000505344:exon_43417667_43418160:ABCC10 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43479846 T/C 1 103 145 248 53.3633309169103 69.8768642431845 -16.5135333262741 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0361351166834635 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43479565_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43479578_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43479604_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43479614_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43479666_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000509315:exon_43479829_43480053:YIPF3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43487403 G/C 1 1 10 11 0.518090591426314 4.81909408573686 -4.30100349431055 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0122834534953750 ENSG00000171453:ENST00000512472:exon_43487071_43487471:POLR1C HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43588007 T/C 1 6 10 16 3.10854354855788 4.81909408573686 -1.71055053717898 T:C T C 10 0.481909408573686 0.459279308448497 ENSG00000172432:ENST00000496137:exon_43587856_43588070:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43587987_43588070:GTPBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 43970748 C/A 1 25 12 37 12.9522647856578 5.78291290288423 7.16935188277362 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0208346007528998 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 44081769 C/T 1 41 47 88 21.2417142484789 22.6497422029632 -1.40802795448437 T:C C T 10 0.481909408573686 0.831258964448326 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 44122467 C/T 1 17 11 28 8.80754005424734 5.30100349431055 3.50653655993679 T:C C T 10 0.481909408573686 0.192061409195495 ENSG00000137216:ENST00000259746:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000323267:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371915:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000371893:exon_44122429_44123256:TMEM63B;ENSG00000137216:ENST00000533121:exon_44122429_44123256:TMEM63B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 44921076 T/C 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000196284:ENST00000475057:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000371460:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000371459:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000371458:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000413662:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000306867:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000371461:exon_44921047_44921154:SUPT3H;ENSG00000196284:ENST00000371455:exon_44921047_44921154:SUPT3H HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 47577064 G/A 1 34 27 61 17.6150801084947 13.0115540314895 4.60352607700515 A:G G A 10 0.481909408573686 0.250982978304442 ENSG00000198087:ENST00000486693:exon_47576859_47577249:CD2AP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 56434719 T/C 1 36 22 58 18.6512612913473 10.6020069886211 8.04925430272621 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0359675408769334 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56434654_56434810:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56434654_56434810:DST HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 56915611 G/A 1 16 8 24 8.28944946282102 3.85527526858949 4.43417419423154 A:G G A 10 0.481909408573686 0.100356840028341 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56915572_56915652:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56915572_56915652:KIAA1586 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 56918073 A/G 1 29 13 42 15.0246271513631 6.26482231145792 8.75980483990519 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00809561987599496 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 74135016 C/T 1 33 39 72 17.0969895170684 18.7944669343738 -1.69747741730539 T:C C T 10 0.481909408573686 0.724520158535884 ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74133432_74135301:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74134940_74135250:C6orf150 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 74138503 G/A 1 4 7 11 2.07236236570526 3.3733658600158 -1.30100349431055 A:G G A 10 0.481909408573686 0.551773499311371 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74138432_74138534:C6orf150 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 76369054 A/G 1 34 21 55 17.6150801084947 10.1200975800474 7.49498252844727 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0578953853411173 ENSG00000112701:ENST00000370010:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000370014:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000327284:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000447266:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000483859:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000424947:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000436928:exon_76368978_76369123:SENP6;ENSG00000112701:ENST00000485497:exon_76368978_76369123:SENP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 76618235 C/T 1 13 9 22 6.73517768854208 4.33718467716317 2.39799301137891 T:C C T 10 0.481909408573686 0.394377988213738 ENSG00000196586:ENST00000428345:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369981:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369985:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369977:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369978:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000369975:exon_76618213_76618344:MYO6;ENSG00000196586:ENST00000430435:exon_76618213_76618277:MYO6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 10 2 12 5.18090591426314 0.963818817147372 4.21708709711577 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0186970763393203 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 87969341 G/A 1 161 187 348 83.4125852196366 90.1170594032793 -6.70447418364273 A:G G A 10 0.481909408573686 0.485892022513438 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 87969737 C/T 1 90 73 163 46.6281532283683 35.1793868258791 11.4487664024892 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0843476644805302 ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 88224164 T/C 1 6 7 13 3.10854354855788 3.3733658600158 -0.264822311457919 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88224096_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88224098_88224217:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000493269:exon_88224125_88224217:RARS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 97339078 A/G 1 137 116 253 70.978411025405 55.9014913945476 15.0769196308574 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0592682034045983 ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 15 13 28 7.77135887139471 6.26482231145792 1.50653655993679 T:C C T 10 0.481909408573686 0.577433839032379 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 106987242 C/T 1 30 35 65 15.5427177427894 16.866829300079 -1.32411155728959 T:C C T 10 0.481909408573686 0.804409719491518 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 106987370 A/C 1 80 87 167 41.4472473141051 41.9261185459107 -0.478871231805563 A:C A C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106987278_106987404:AIM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 106987421 A/G 1 130 92 222 67.3517768854208 44.3356655887791 23.0161112966417 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00243302852883803 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 106991410 G/C 1 15 10 25 7.77135887139471 4.81909408573686 2.95226478565785 C:G G C 10 0.481909408573686 0.317115061744928 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106991315_106991472:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106991315_106991472:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106991315_106991472:AIM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 107113715 G/A 1 11 4 15 5.69899650568945 1.92763763429474 3.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0689223984537358 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107113657_107116292:QRSL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 109767931 C/T 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 109802500 C/G 1 69 77 146 35.7482508084157 37.1070244601738 -1.35877365175816 C:G C G 10 0.481909408573686 0.868566229789445 ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109802278_109803257:ZBTB24 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 111695761 T/C 1 45 43 88 23.3140766141841 20.7221045686685 2.59197204551563 T:C T C 10 0.481909408573686 0.595322162554658 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 118887303 T/C 1 3 8 11 1.55427177427894 3.85527526858949 -2.30100349431055 T:C T C 10 0.481909408573686 0.229933048608863 ENSG00000111860:ENST00000368491:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000368488:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000434604:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392500:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000360290:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000419517:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000392498:exon_118886692_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000483035:exon_118886198_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000472713:exon_118886722_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000476150:exon_118887218_118887479:C6orf204;ENSG00000111860:ENST00000462101:exon_118887255_118887479:C6orf204 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 127611451 G/T 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 T:G G T 10 0.481909408573686 0.816703170755727 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 131895381 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000112282:ENST00000354577:exon_131895106_131895435:MED23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 52 30 82 26.9407107541683 14.4572822572106 12.4834284969577 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00761287248550823 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 13 4 17 6.73517768854208 1.92763763429474 4.80754005424734 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0266465634185576 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 136597174 G/A 0 718 0 718 371.989044644093 0 371.989044644093 G G 10 0.481909408573686 2.33970465176705e-228 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 1 621 1 622 321.734257275741 0.481909408573686 321.252347867167 A:T:C T A 10 0.481909408573686 4.26935026802456e-195 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 667 1 668 345.566424481351 0.481909408573686 345.084515072778 A:G A G 10 0.481909408573686 1.19594677389976e-209 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 664 1 665 344.012152707072 0.481909408573686 343.530243298499 A:G A G 10 0.481909408573686 1.06380871231973e-208 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 136599458 C/T 0 8 0 8 4.14472473141051 0 4.14472473141051 C C 10 0.481909408573686 0.00290886283388208 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 138734029 A/C 1 1 19 20 0.518090591426314 9.15627876290004 -8.63818817147372 A:C A C 10 0.481909408573686 4.83265739396142e-05 ENSG00000051620:ENST00000448741:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000058691:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000367697:exon_138734017_138734310:HEBP2;ENSG00000051620:ENST00000453452:exon_138734017_138734291:HEBP2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 139576736 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000164440:ENST00000358430:exon_139576701_139576775:TXLNB;ENSG00000164440:ENST00000367652:exon_139576517_139576775:TXLNB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 144183376 T/C 1 5 7 12 2.59045295713157 3.3733658600158 -0.782912902884232 T:C T C 10 0.481909408573686 0.776180131379565 ENSG00000135521:ENST00000367576:exon_144183241_144183380:LTV1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 149900005 A/G 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000055211:ENST00000367423:exon_149899958_149900109:C6orf72;ENSG00000055211:ENST00000367419:exon_149899958_149900109:C6orf72 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 151766397 G/A 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.182263058918350 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 159184507 C/T 1 19 14 33 9.84372123709996 6.7467317200316 3.09698951706836 T:C C T 10 0.481909408573686 0.300333661180419 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 160103630 A/C 1 17 9 26 8.80754005424734 4.33718467716317 4.47035537708416 A:C A C 10 0.481909408573686 0.114724856106268 ENSG00000112096:ENST00000367055:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000444946:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000367054:exon_160103506_160103670:SOD2;ENSG00000112096:ENST00000337404:exon_160103172_160103670:SOD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 160482864 G/A 1 11 5 16 5.69899650568945 2.40954704286843 3.28944946282102 A:G G A 10 0.481909408573686 0.132948456946107 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160482785_160482960:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160482785_160482960:IGF2R HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C T C 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 167343141 G/A 1 817 785 1602 423.280013195299 378.298885730344 44.981127464955 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.0260460960250519 ENSG00000026297:ENST00000366855:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000508775:exon_167342992_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000421787:exon_167343004_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000510083:exon_167343006_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000428859:exon_167343013_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000476238:exon_167343028_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000028008:exon_167343033_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000478180:exon_167343086_167343279:RNASET2;ENSG00000026297:ENST00000467705:exon_167343121_167343279:RNASET2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 25 31 56 12.9522647856578 14.9391916657843 -1.98692688012642 A:T A T 10 0.481909408573686 0.688693815099866 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 5569230 C/T 1 159 115 274 82.3764040367839 55.4195819859739 26.95682205081 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00131389264530831 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000477812:exon_5568792_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000432588:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000480301:exon_5568698_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000443528:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000417101:exon_5569166_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000414620:exon_5569166_5569294:ACTB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 12728489 A/G 1 11 1 12 5.69899650568945 0.481909408573686 5.21708709711577 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00255486444561599 ENSG00000122644:ENST00000396662:exon_12727791_12728804:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000356797:exon_12727791_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396664:exon_12727794_12728801:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000396663:exon_12727791_12730559:ARL4A;ENSG00000122644:ENST00000404894:exon_12727794_12728539:ARL4A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 26236235 T/C 1 48 50 98 24.8683483884631 24.0954704286843 0.772877959778768 T:C T C 10 0.481909408573686 0.919625016990427 ENSG00000122566:ENST00000354667:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000360787:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000463181:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000409814:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000356674:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000490912:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000495810:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 27868346 G/A 1 176 133 309 91.1839440910313 64.0939513403002 27.089992750731 A:C:G G A 10 0.481909408573686 0.00209098550963451 ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27868247_27868500:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27868247_27869386:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27868247_27868500:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27868247_27868880:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000457186:exon_27868247_27868641:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000488564:exon_27868247_27868402:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000460059:exon_27868319_27868402:TAX1BP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 30673401 A/G 1 1222 1129 2351 633.106702722956 544.075722279691 89.0309804432642 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000257737013502409 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30673351_30673649:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30673351_30673527:GARS;ENSG00000106105:ENST00000496643:exon_30673351_30673649:GARS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 32910199 G/A 1 4 10 14 2.07236236570526 4.81909408573686 -2.7467317200316 A:G G A 10 0.481909408573686 0.18355917459004 ENSG00000170852:ENST00000304056:exon_32907784_32910492:KBTBD2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 37936530 T/C 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000086288:ENST00000199447:exon_37936472_37936709:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000440017:exon_37936472_37936694:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000476435:exon_37936419_37936709:TXNDC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 42974714 G/A 1 10 15 25 5.18090591426314 7.22864112860529 -2.04773521434215 A:G G A 10 0.481909408573686 0.431962859336285 ENSG00000106591:ENST00000223324:exon_42974554_42974735:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000432845:exon_42974554_42976840:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000413995:exon_42974620_42974735:MRPL32;ENSG00000106591:ENST00000496564:exon_42974642_42974735:MRPL32 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 43648040 C/T 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C C T 10 0.481909408573686 0.784647630659318 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 43663476 T/C 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.410693953677878 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43663308_43663487:STK17A;ENSG00000164543:ENST00000474211:exon_43661888_43663487:STK17A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 164 192 356 84.9668569939155 92.5266064461477 -7.55974945223224 A:T:G G A 10 0.481909408573686 0.426887904685409 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 48004962 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000136273:ENST00000436444:exon_48003783_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000258774:exon_48002885_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000458191:exon_48004897_48005035:HUS1;ENSG00000136273:ENST00000432325:exon_48004763_48005035:HUS1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 64291991 T/A 1 26 27 53 13.4703553770842 13.0115540314895 0.45880134559464 A:T T A 10 0.481909408573686 1 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 64864800 A/G 1 1 23 24 0.518090591426314 11.0839163971948 -10.5658258057685 A:G A G 10 0.481909408573686 3.92209581552657e-06 ENSG00000146757:ENST00000328747:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000431504:exon_64863254_64866038:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000357512:exon_64863254_64865997:ZNF92;ENSG00000146757:ENST00000450302:exon_64863254_64865994:ZNF92 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 65425894 A/G 1 74 66 140 38.3387037655472 31.8060209658633 6.53268279968396 A:G A G 10 0.481909408573686 0.272952300459700 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65425671_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65425675_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65425685_65426050:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65425688_65426050:GUSB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 65432751 C/T 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.597188270417829 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000466883:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65432718_65432894:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000461622:exon_65432718_65432895:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000462371:exon_65432718_65432894:GUSB HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 65552792 A/T 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:T A T 10 0.481909408573686 0.746334914981833 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 65557564 C/T 1 106 101 207 54.9176026911893 48.6728502659423 6.24475242524699 T:C C T 10 0.481909408573686 0.404262572654901 ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000493708:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000126522:ENST00000464970:exon_65557544_65557650:ASL;ENSG00000249319:ENST00000450043:exon_65557544_65557650:AC068533.7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 72717686 C/T 1 77 56 133 39.8929755398262 26.9869268801264 12.9060486596998 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.0297096652810069 ENSG00000130305:ENST00000428206:exon_72716514_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000471461:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000438747:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000252594:exon_72717227_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000446455:exon_72717597_72717737:NSUN5;ENSG00000130305:ENST00000310326:exon_72717597_72717737:NSUN5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 72984867 G/T 1 14 16 30 7.2532682799684 7.71055053717898 -0.457282257210581 T:G G T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000106638:ENST00000459913:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000424598:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000450285:exon_72983990_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000305632:exon_72983993_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000417008:exon_72984338_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000432538:exon_72984525_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000433464:exon_72984741_72985302:TBL2;ENSG00000106638:ENST00000488915:exon_72984801_72985302:TBL2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 73097082 A/G 1 6 8 14 3.10854354855788 3.85527526858949 -0.746731720031605 A:G A G 10 0.481909408573686 0.79243933411218 ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 75615287 G/A 1 1 9 10 0.518090591426314 4.33718467716317 -3.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0222918724952739 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615241_75615386:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615241_75615386:POR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 75615551 C/T 1 12 17 29 6.21708709711577 8.19245994575266 -1.9753728486369 T:C C T 10 0.481909408573686 0.578066628711756 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75615535_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615477_75616173:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615477_75615559:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615477_75615559:POR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 75615724 G/T 1 46 36 82 23.8321672056104 17.3487387086527 6.48342849695775 T:G G T 10 0.481909408573686 0.184487854847971 ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75615655_75616173:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75615655_75616172:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615477_75616173:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75615655_75615858:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75615655_75616172:POR;ENSG00000127948:ENST00000447222:exon_75615635_75615917:POR;ENSG00000127948:ENST00000450476:exon_75615635_75615917:POR;ENSG00000127948:ENST00000439269:exon_75615655_75616150:POR;ENSG00000127948:ENST00000493973:exon_75615655_75616173:POR HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 76903926 T/C 1 6 11 17 3.10854354855788 5.30100349431055 -2.19245994575266 T:C T C 10 0.481909408573686 0.337726755422537 ENSG00000135205:ENST00000285871:exon_76903799_76903969:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000431197:exon_76903799_76903969:CCDC146;ENSG00000135205:ENST00000415740:exon_76903799_76903969:CCDC146 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 87079406 T/A 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 A:T T A 10 0.481909408573686 0.755512817806202 ENSG00000005471:ENST00000359206:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000265723:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000358400:exon_87079284_87079408:ABCB4;ENSG00000005471:ENST00000453593:exon_87079284_87079408:ABCB4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 90014408 G/A 1 13 12 25 6.73517768854208 5.78291290288423 0.952264785657849 A:G G A 10 0.481909408573686 0.841916175422466 ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_90014206_90015204:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_90014206_90020769:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_90014206_90020327:GTPBP10;ENSG00000157224:ENST00000422604:exon_90014206_90014552:CLDN12;ENSG00000157224:ENST00000416322:exon_90014206_90014552:CLDN12 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 91630620 G/T 1 153 96 249 79.267860488226 46.2633032230739 33.0045572651522 T:G G T 10 0.481909408573686 3.40811142091867e-05 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000493453:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394565:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91630162_91632549:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91630162_91632549:AKAP9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 91691601 C/T 1 17 20 37 8.80754005424734 9.63818817147372 -0.830648117226383 T:C C T 10 0.481909408573686 0.869867152465094 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000491695:exon_91691588_91691800:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000265737:exon_91691588_91691800:AKAP9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 91726927 A/C 1 36 35 71 18.6512612913473 16.866829300079 1.78443199126829 A:C A C 10 0.481909408573686 0.722210455028622 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91726900_91727108:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487692:exon_91726900_91727108:AKAP9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 91743150 A/G 1 7 11 18 3.6266341399842 5.30100349431055 -1.67436935432635 A:G A G 10 0.481909408573686 0.485903926383751 ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 92734065 T/C 1 40 45 85 20.7236236570526 21.6859233858159 -0.962299728763313 T:C T C 10 0.481909408573686 0.913660945531978 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9;ENSG00000205413:ENST00000446617:exon_92731562_92735418:SAMD9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 20 29 49 10.3618118285263 13.9753728486369 -3.61356102011061 A:G G A 10 0.481909408573686 0.320135905813921 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 92764068 C/T 1 20 16 36 10.3618118285263 7.71055053717898 2.6512612913473 T:C C T 10 0.481909408573686 0.407608398471318 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 92764982 C/T 1 47 64 111 24.3502577970368 30.8422021487159 -6.49194435167915 T:C C T 10 0.481909408573686 0.254294031982138 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 92765051 C/A 1 40 45 85 20.7236236570526 21.6859233858159 -0.962299728763313 A:C C A 10 0.481909408573686 0.913660945531978 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92764833_92765284:SAMD9L HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 97599446 C/T 1 8 5 13 4.14472473141051 2.40954704286843 1.73517768854208 T:C C T 10 0.481909408573686 0.410693953677878 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 98557151 C/T 1 13 12 25 6.73517768854208 5.78291290288423 0.952264785657849 T:C C T 10 0.481909408573686 0.841916175422466 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 99017071 C/T 1 166 169 335 86.0030381767681 81.4426900489529 4.56034812781517 A:T:C:G C T 10 0.481909408573686 0.623124435504218 ENSG00000106245:ENST00000403633:exon_99017014_99017239:BUD31;ENSG00000106245:ENST00000222969:exon_99017014_99017231:BUD31;ENSG00000106245:ENST00000456893:exon_99017014_99017235:BUD31;ENSG00000106245:ENST00000431419:exon_99017014_99017200:BUD31;ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 506 370 876 262.153839261715 178.306481172264 83.8473580894511 T:C T C 10 0.481909408573686 1.50045786390434e-08 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 99097265 G/A 1 18 5 23 9.32563064567365 2.40954704286843 6.91608360280522 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00544054166268848 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99097261_99097887:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000481881:exon_99097261_99097898:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000485576:exon_99097261_99097920:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000464401:exon_99097261_99097327:ZNF394 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 99704796 A/T 1 115 71 186 59.5804180140261 34.2155680087317 25.3648500052944 A:T A T 10 0.481909408573686 0.000226016946470748 ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 99747130 G/A 1 118 84 202 61.134689788305 40.4803903201896 20.6542994681154 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00383581242793571 ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 99751017 A/G 1 21 9 30 10.8799024199526 4.33718467716317 6.54271774278942 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0177743583270523 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 100468284 A/G 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 100482026 T/C 1 42 42 84 21.7598048399052 20.2401951600948 1.51960967981037 T:C T C 10 0.481909408573686 0.744732593206387 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100481989_100482173:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000474896:exon_100481989_100482173:SRRT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 100486035 C/A 1 50 67 117 25.9045295713157 32.287930374437 -6.38340080312126 A:C C A 10 0.481909408573686 0.266999028019186 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 100486110 C/T 1 271 269 540 140.402550276531 129.633630906322 10.7689193702095 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.365940197264477 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 100849502 G/A 1 68 49 117 35.2301602169893 23.6135610201106 11.6165991968787 A:G G A 10 0.481909408573686 0.033379340010929 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100849258_100849717:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100849258_100849717:PLOD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 100849643 G/A 1 30 21 51 15.5427177427894 10.1200975800474 5.42262016274201 A:G G A 10 0.481909408573686 0.160582035667905 ENSG00000106397:ENST00000223127:exon_100849258_100849717:PLOD3;ENSG00000106397:ENST00000454310:exon_100849258_100849717:PLOD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 102087202 T/C 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 102112980 G/A 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102112901_102113056:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112901_102113056:LRWD1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 102114075 G/A 1 54 212 266 27.976891937021 102.164794617621 -74.1879026806005 A:G G A 10 0.481909408573686 5.23825198268341e-21 ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 103007949 A/C 1 29 17 46 15.0246271513631 8.19245994575266 6.83216720561044 A:C A C 10 0.481909408573686 0.0542297146819327 ENSG00000161057:ENST00000435765:exon_103007860_103008062:PSMC2;ENSG00000161057:ENST00000292644:exon_103007860_103008062:PSMC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 105182995 G/A 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 A:G G A 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000135249:ENST00000257700:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000467392:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000493041:exon_105182855_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000497979:exon_105182939_105183096:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000477285:exon_105182855_105183003:RINT1;ENSG00000135249:ENST00000493258:exon_105182687_105183096:RINT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 114619598 C/A 1 7 10 17 3.6266341399842 4.81909408573686 -1.19245994575266 A:C C A 10 0.481909408573686 0.632925812771296 ENSG00000135272:ENST00000257724:exon_114619561_114619836:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000393486:exon_114619561_114619836:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000431629:exon_114619561_114619836:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000427207:exon_114619561_114619836:MDFIC;ENSG00000135272:ENST00000498196:exon_114619561_114619836:MDFIC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 115892482 C/A 1 39 23 62 20.2055330656262 11.0839163971948 9.12161666843147 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0220649005514798 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115892372_115892530:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115892372_115892530:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115892372_115892530:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115892372_115892530:TES;ENSG00000135269:ENST00000393484:exon_115892372_115892792:TES;ENSG00000135269:ENST00000494384:exon_115892372_115892654:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115892372_115892530:TES;ENSG00000135269:ENST00000463746:exon_115892372_115892634:TES HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 31 55 86 16.0608083342157 26.5050174715527 -10.444209137337 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0303295101684178 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 128455916 G/A 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000128596:ENST00000249367:exon_128455668_128455985:CCDC136;ENSG00000128596:ENST00000297788:exon_128455668_128455985:CCDC136;ENSG00000128596:ENST00000397697:exon_128455668_128455985:CCDC136;ENSG00000128596:ENST00000480137:exon_128455668_128455985:CCDC136;ENSG00000128596:ENST00000494552:exon_128455668_128455985:CCDC136;ENSG00000128596:ENST00000471729:exon_128455849_128455985:CCDC136 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 128502947 C/T 1 13 13 26 6.73517768854208 6.26482231145792 0.470355377084163 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000128524:ENST00000249289:exon_128502880_128503116:ATP6V1F HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 128607384 G/A 1 23 28 51 11.9160836028052 13.4934634400632 -1.57737983725799 A:G G A 10 0.481909408573686 0.676942437458779 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128607334_128607446:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128607334_128607446:TNPO3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 133979711 G/A 1 10 15 25 5.18090591426314 7.22864112860529 -2.04773521434215 A:G G A 10 0.481909408573686 0.431962859336285 ENSG00000205060:ENST00000378509:exon_133974084_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000416907:exon_133979304_133979831:SLC35B4;ENSG00000205060:ENST00000466599:exon_133979358_133979713:SLC35B4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 134130035 G/A 1 16 14 30 8.28944946282102 6.7467317200316 1.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.589172404006851 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000494491:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467251:exon_134129479_134130072:AKR1B1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 138713715 G/C 1 13 4 17 6.73517768854208 1.92763763429474 4.80754005424734 C:G G C 10 0.481909408573686 0.0266465634185576 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 140159721 T/C 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 T:C T C 10 0.481909408573686 0.39148304783409 ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 30 24 54 15.5427177427894 11.5658258057685 3.97689193702095 T:C T C 10 0.481909408573686 0.340571170910398 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 143080060 A/T 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:T A T 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079894_143080328:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000477373:exon_143079894_143080333:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000436448:exon_143079943_143080415:ZYX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 148515192 A/G 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000106462:ENST00000492143:exon_148513776_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000478654:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000320356:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000460911:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000350995:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000476773:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000483967:exon_148514969_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000498186:exon_148514449_148515209:EZH2;ENSG00000106462:ENST00000483012:exon_148515129_148515209:EZH2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 150742408 G/T 1 55 68 123 28.4949825284473 32.7698397830107 -4.27485725456338 T:G G T 10 0.481909408573686 0.47097349927463 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150742296_150744869:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150742296_150742496:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150742296_150742650:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150742296_150742649:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482899:exon_150742296_150742649:ABCB8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 150840889 C/T 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 T:C C T 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000133612:ENST00000463381:exon_150840824_150841521:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150840824_150841519:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000428334:exon_150840824_150841523:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397232:exon_150840824_150841523:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150840824_150841519:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000461065:exon_150840824_150841523:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000473633:exon_150840824_150841519:AGAP3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 151064064 C/T 1 20 15 35 10.3618118285263 7.22864112860529 3.13317069992099 T:C C T 10 0.481909408573686 0.313635894464437 ENSG00000013374:ENST00000413040:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000355851:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000480907:exon_151064025_151064211:NUB1;ENSG00000013374:ENST00000497987:exon_151064025_151064211:NUB1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 151818799 G/A 1 10 7 17 5.18090591426314 3.3733658600158 1.80754005424734 A:G G A 10 0.481909408573686 0.469361015930106 ENSG00000178234:ENST00000430044:exon_151818631_151819425:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000443352:exon_151818631_151819425:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000434507:exon_151818631_151819245:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000320311:exon_151818631_151819245:GALNT11;ENSG00000178234:ENST00000452146:exon_151818631_151820172:GALNT11 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 151874498 C/T 1 6 5 11 3.10854354855788 2.40954704286843 0.698996505689454 T:C C T 10 0.481909408573686 0.767778067165281 ENSG00000055609:ENST00000360104:exon_151873276_151875053:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000262189:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000355193:exon_151873276_151875095:MLL3;ENSG00000055609:ENST00000473186:exon_151873276_151875095:MLL3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 157023721 T/C 1 14 1 15 7.2532682799684 0.481909408573686 6.77135887139471 T:C T C 10 0.481909408573686 0.000352715531823600 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 7 158672619 A/G 1 29 37 66 15.0246271513631 17.8306481172264 -2.80602096586328 A:G A G 10 0.481909408573686 0.538852812781577 ENSG00000126870:ENST00000407559:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000308978:exon_158672375_158672680:WDR60;ENSG00000126870:ENST00000444851:exon_158672471_158672680:WDR60 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 6272375 A/G 1 5 11 16 2.59045295713157 5.30100349431055 -2.71055053717898 A:G A G 10 0.481909408573686 0.214902883771744 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6272286_6272404:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6272286_6272404:MCPH1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 6389889 C/G 1 7 28 35 3.6266341399842 13.4934634400632 -9.86682930007901 C:G C G 10 0.481909408573686 0.000993002911205969 ENSG00000091879:ENST00000325203:exon_6389853_6390008:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000415216:exon_6389853_6390008:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000523120:exon_6389853_6390008:ANGPT2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 6390027 A/G 1 22 15 37 11.3979930113789 7.22864112860529 4.16935188277362 A:G A G 10 0.481909408573686 0.189939627147604 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 6390048 T/C 1 24 12 36 12.4341741942315 5.78291290288423 6.6512612913473 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0299109339016288 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 9627791 A/G 1 22 16 38 11.3979930113789 7.71055053717898 3.68744247419993 A:G A G 10 0.481909408573686 0.257833845134406 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17817540 A/G 1 35 12 47 18.133170699921 5.78291290288423 12.3502577970368 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000352731394461752 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517730:exon_17817523_17817612:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17817523_17817674:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17817523_17817674:PCM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17820714 A/T 1 18 13 31 9.32563064567365 6.26482231145792 3.06080833421573 A:T A T 10 0.481909408573686 0.286363049320085 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17820758 G/T 1 21 14 35 10.8799024199526 6.7467317200316 4.13317069992099 T:G G T 10 0.481909408573686 0.17838019999574 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17822130 A/G 1 16 10 26 8.28944946282102 4.81909408573686 3.47035537708416 A:G A G 10 0.481909408573686 0.238495445344171 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17822077_17822279:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17822077_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523247:exon_17822126_17822277:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000400012:exon_17822126_17822277:PCM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17871563 G/C 0 13 0 13 6.73517768854208 0 6.73517768854208 G G 10 0.481909408573686 7.56049567861026e-05 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17885150 G/A 1 240 244 484 124.341741942315 117.585895691979 6.75584625033596 A:G G A 10 0.481909408573686 0.554451341797172 ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17885146_17885477:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17885146_17887453:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17885146_17887453:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17885146_17887453:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17885146_17885312:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17885146_17885478:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523247:exon_17885146_17885258:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000400012:exon_17885146_17885371:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000522275:exon_17885146_17885256:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519802:exon_17885146_17885267:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523896:exon_17885146_17885267:PCM1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17927327 T/C 1 12 49 61 6.21708709711577 23.6135610201106 -17.3964739229949 T:C T C 10 0.481909408573686 4.70628499974351e-06 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 17928811 C/T 1 7 16 23 3.6266341399842 7.71055053717898 -4.08391639719478 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0980365874501828 ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 T:C T C 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 21996272 G/A 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000168476:ENST00000334530:exon_21996152_21996306:REEP4;ENSG00000168476:ENST00000306306:exon_21996152_21996306:REEP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 22105502 T/C 1 11 2 13 5.69899650568945 0.963818817147372 4.73517768854208 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0104849883006144 ENSG00000168495:ENST00000306433:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000519237:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000397802:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000518039:exon_22105370_22105521:POLR3D;ENSG00000168495:ENST00000517789:exon_22105370_22105521:POLR3D HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 22570844 G/A 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 A:G G A 10 0.481909408573686 0.197791501722836 ENSG00000134020:ENST00000256404:exon_22570769_22571049:PEBP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 22571018 A/G 1 12 4 16 6.21708709711577 1.92763763429474 4.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0431570486584821 ENSG00000134020:ENST00000256404:exon_22570769_22571049:PEBP4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 25365278 G/A 1 61 29 90 31.6035260770052 13.9753728486369 17.6281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000198665849113612 ENSG00000184661:ENST00000330560:exon_25364026_25365436:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000380665:exon_25364026_25365389:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000435898:exon_25365252_25365327:CDCA2;ENSG00000184661:ENST00000434814:exon_25364026_25365425:CDCA2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 27634072 A/G 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000519637:exon_27633879_27634224:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 27634335 G/A 1 5 25 30 2.59045295713157 12.0477352143422 -9.45728225721058 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00040994261155304 ENSG00000171320:ENST00000523566:exon_27633879_27634387:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000305188:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000397418:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000522378:exon_27633879_27634686:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000524293:exon_27633879_27637612:ESCO2;ENSG00000171320:ENST00000523910:exon_27634027_27634686:ESCO2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 29927598 A/G 1 5 13 18 2.59045295713157 6.26482231145792 -3.67436935432635 A:G A G 10 0.481909408573686 0.100145970992449 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 29961951 C/T 1 17 21 38 8.80754005424734 10.1200975800474 -1.31255752580007 T:C C T 10 0.481909408573686 0.746476365324525 ENSG00000104660:ENST00000321250:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000397339:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518001:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520682:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000442880:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000523116:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000532394:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520739:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518192:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000519466:exon_29961816_29962002:LEPROTL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 38 15 53 19.6874424741999 7.22864112860529 12.4588013455946 A:G A G 10 0.481909408573686 0.00079887312460787 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 38124745 T/C 1 12 23 35 6.21708709711577 11.0839163971948 -4.86682930007901 T:C T C 10 0.481909408573686 0.127160884006732 ENSG00000147535:ENST00000531483:exon_38124498_38124909:PPAPDC1B;ENSG00000147535:ENST00000419686:exon_38124498_38124909:PPAPDC1B;ENSG00000147535:ENST00000528814:exon_38124519_38124909:PPAPDC1B;ENSG00000147535:ENST00000527793:exon_38124699_38124909:PPAPDC1B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 38297866 C/T 1 10 1 11 5.18090591426314 0.481909408573686 4.69899650568945 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00489735413206958 ENSG00000077782:ENST00000335922:exon_38297824_38297891:FGFR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 38848850 C/T 1 12 16 28 6.21708709711577 7.71055053717898 -1.49346344006321 T:C C T 10 0.481909408573686 0.706039598102527 ENSG00000169490:ENST00000456845:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000456397:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000412303:exon_38846327_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000397070:exon_38848324_38849064:TM2D2;ENSG00000169490:ENST00000316221:exon_38848324_38849064:TM2D2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 42015638 A/G 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 A:G A G 10 0.481909408573686 0.536476994604088 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 42019967 T/C 1 8 4 12 4.14472473141051 1.92763763429474 2.21708709711577 T:C T C 10 0.481909408573686 0.252899248171128 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 54656244 G/A 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 A:G G A 10 0.481909408573686 0.39148304783409 ENSG00000047249:ENST00000355221:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000518072:exon_54656137_54656275:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520188:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000359530:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000440871:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000523899:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000396774:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524164:exon_54656137_54656250:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000523426:exon_54656147_54656250:ATP6V1H HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 56864488 G/A 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 A:G G A 10 0.481909408573686 0.569930991051848 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 2 10 12 1.03618118285263 4.81909408573686 -3.78291290288423 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0400536609943421 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 26 19 45 13.4703553770842 9.15627876290004 4.31407661418413 A:G G A 10 0.481909408573686 0.233025167341454 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 68163600 G/A 1 7 16 23 3.6266341399842 7.71055053717898 -4.08391639719478 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0980365874501828 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68163534_68163685:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68163534_68163685:ARFGEF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 74868305 T/C 1 18 12 30 9.32563064567365 5.78291290288423 3.54271774278942 T:C T C 10 0.481909408573686 0.206237508491672 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 77895682 C/T 1 15 5 20 7.77135887139471 2.40954704286843 5.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0230515500705363 ENSG00000164751:ENST00000357039:exon_77892494_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000419564:exon_77892496_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000520103:exon_77895170_77896431:PEX2;ENSG00000164751:ENST00000522527:exon_77895193_77896431:PEX2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 C:G C G 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 99055037 C/T 1 11 10 21 5.69899650568945 4.81909408573686 0.879902419952594 T:C C T 10 0.481909408573686 0.827994642190547 ENSG00000156482:ENST00000521534:exon_99054873_99055313:RPL30 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 102731486 G/A 1 8 7 15 4.14472473141051 3.3733658600158 0.771358871394709 A:G G A 10 0.481909408573686 0.798371447225012 ENSG00000104490:ENST00000395923:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000454532:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000395921:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000427074:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000311028:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000220931:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000521599:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000519508:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522951:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522448:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000520690:exon_102731480_102731876:NCALD HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 107719157 T/A 1 26 24 50 13.4703553770842 11.5658258057685 1.9045295713157 A:T T A 10 0.481909408573686 0.671680596288206 ENSG00000164830:ENST00000445937:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000452423:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000442977:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000531443:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000517566:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000497705:exon_107718610_107719918:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000336821:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000312046:exon_107718610_107719373:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000438229:exon_107718610_107719210:OXR1;ENSG00000164830:ENST00000519415:exon_107718609_107719373:OXR1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 117783840 A/G 1 372 295 667 192.729700010589 142.163275529237 50.5664244813514 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000103857042306146 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 117783975 C/T 1 396 502 898 205.16387420482 241.91852310399 -36.7546488991701 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.0147492528340761 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 120744349 T/C 1 21 18 39 10.8799024199526 8.67436935432635 2.20553306562624 T:C T C 10 0.481909408573686 0.523754815909214 ENSG00000064313:ENST00000378164:exon_120743015_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000529653:exon_120744055_120744426:TAF2;ENSG00000064313:ENST00000526969:exon_120744302_120744426:TAF2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 124027628 T/C 1 97 67 164 50.2547873683525 32.287930374437 17.9668569939155 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0060718927004974 ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 124142489 T/C 1 7 2 9 3.6266341399842 0.963818817147372 2.66281532283683 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0984960033473984 ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 7 1 8 3.6266341399842 0.481909408573686 3.14472473141051 A:T:C C A 10 0.481909408573686 0.0331178527244529 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 133844508 C/T 1 38 32 70 19.6874424741999 15.421101074358 4.26634139984198 T:C C T 10 0.481909408573686 0.339391690394585 ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133844480_133844644:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000460236:exon_133844480_133844644:PHF20L1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 0 40 1 41 20.7236236570526 0.481909408573686 20.2417142484789 A:C C A 10 0.481909408573686 6.4769624887884e-12 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 144103120 G/A 1 158 151 309 81.8583134453576 72.7683206946266 9.08999275073101 A:G G A 10 0.481909408573686 0.306015824941436 ENSG00000160932:ENST00000517503:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000292494:exon_144102983_144103829:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000429120:exon_144102983_144103827:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521699:exon_144102983_144103828:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000520466:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521003:exon_144102983_144103319:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522528:exon_144102983_144103341:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522971:exon_144102983_144103599:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519611:exon_144102966_144103217:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000521182:exon_144102983_144103826:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000519546:exon_144102966_144103672:LY6E;ENSG00000160932:ENST00000522024:exon_144102983_144103309:LY6E HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 144358819 T/G 1 107 64 171 55.4356932826156 30.8422021487159 24.5934911338997 A:T:G T G 10 0.481909408573686 0.000167209921387955 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 15 13 28 7.77135887139471 6.26482231145792 1.50653655993679 A:G G A 10 0.481909408573686 0.577433839032379 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 144996987 G/A 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 A:G G A 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 144998283 G/A 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 A:G G A 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 145135473 T/C 1 318 351 669 164.752808073568 169.150202409364 -4.39739433579595 A:T:C T C 10 0.481909408573686 0.756977399922669 ENSG00000178896:ENST00000316052:exon_145135145_145135550:EXOSC4;ENSG00000178896:ENST00000527954:exon_145135145_145135482:EXOSC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 145140472 A/G 1 5 18 23 2.59045295713157 8.67436935432635 -6.08391639719478 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0117661440314117 ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 145161823 G/A 1 57 48 105 29.5311637112999 23.1316516115369 6.39951209976297 A:G G A 10 0.481909408573686 0.241194025958471 ENSG00000179632:ENST00000322428:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534585:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000532522:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 145161896 T/C 1 4 6 10 2.07236236570526 2.89145645144212 -0.81909408573686 T:C T C 10 0.481909408573686 0.755512817806202 ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 145617910 A/G 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 A:G A G 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 145736490 C/T 1 49 26 75 25.3864389798894 12.5296446229158 12.8567943569735 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00360624144229568 ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145736374_145736569:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145736374_145736564:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145736374_145736564:MFSD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 8 146015749 C/T 1 3839 4150 7989 1988.94978048562 1999.9240455808 -10.9742650951775 A:T:C C T 10 0.481909408573686 0.814130933240638 ENSG00000161016:ENST00000534781:exon_146015740_146016257:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000531975:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529163:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000526668:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528296:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000394920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000527914:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000262584:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000528957:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000534813:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000529920:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000533397:exon_146015740_146015855:RPL8;ENSG00000161016:ENST00000532702:exon_146015740_146015855:RPL8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 4860300 A/G 1 15 13 28 7.77135887139471 6.26482231145792 1.50653655993679 A:G A G 10 0.481909408573686 0.577433839032379 ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 5466735 C/A 1 4 8 12 2.07236236570526 3.85527526858949 -1.78291290288423 A:C C A 10 0.481909408573686 0.39148304783409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 208 223 431 107.762843016673 107.465798111932 0.297044904741313 A:T:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 15571630 T/A 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 A:T T A 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15571622_15571757:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15571622_15571757:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15571622_15571757:C9orf93 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 15623377 C/G 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 C:G C G 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15623265_15623411:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15623265_15623411:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15623265_15623411:C9orf93 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 17135272 G/C 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 C:G G C 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17134980_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17135034_17135423:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17135038_17135423:CNTLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 17143294 A/G 1 15 7 22 7.77135887139471 3.3733658600158 4.39799301137891 A:G A G 10 0.481909408573686 0.085841935144048 ENSG00000044459:ENST00000484374:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17143286_17143374:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17143286_17143374:CNTLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 17273731 A/G 1 18 32 50 9.32563064567365 15.421101074358 -6.0954704286843 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0905905086242302 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17273731_17273864:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17273731_17273868:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17273731_17273868:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000380641:exon_17273731_17273864:CNTLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 17340839 T/A 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 A:T T A 10 0.481909408573686 0.597188270417829 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17340825_17340946:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17340825_17340946:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17340825_17340946:CNTLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 17484468 A/G 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000044459:ENST00000380647:exon_17484293_17484478:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000425824:exon_17484293_17484478:CNTLN;ENSG00000044459:ENST00000262360:exon_17484293_17484478:CNTLN HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 19063108 T/C 1 5 8 13 2.59045295713157 3.85527526858949 -1.26482231145792 T:C T C 10 0.481909408573686 0.584334529704906 ENSG00000147874:ENST00000380502:exon_19063006_19063191:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000428731:exon_19063006_19063191:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000380496:exon_19063006_19063191:HAUS6;ENSG00000147874:ENST00000415524:exon_19063006_19063191:HAUS6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 183 4865 5048 94.8105782310155 2344.48927271098 -2249.67869447997 A:T:C:G A C 10 0.481909408573686 4.94065645841247e-324 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 189 4877 5066 97.9191217795733 2350.27218561387 -2252.35306383429 A:C:G G C 10 0.481909408573686 4.94065645841247e-324 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 19379566 G/A 1 214 327 541 110.871386565231 157.584376603595 -46.7129900383641 A:T:G G A 10 0.481909408573686 6.07923606971501e-05 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19379485_19379616:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000380384:exon_19379485_19380204:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000315377:exon_19379485_19379616:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000380381:exon_19378772_19379616:RPS6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 19380210 G/A 1 215 50 265 111.389477156658 24.0954704286843 87.2940067279732 A:T:G G A 10 0.481909408573686 1.910930011686e-28 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19380188_19380252:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000380381:exon_19380188_19380234:RPS6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 20988426 A/G 1 6 2 8 3.10854354855788 0.963818817147372 2.14472473141051 A:G A G 10 0.481909408573686 0.165882569352599 ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20988331_20988428:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20988331_20988428:KIAA1797 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 32459450 T/G 1 5 6 11 2.59045295713157 2.89145645144212 -0.301003494310546 T:G T G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 33313619 C/T 1 21 34 55 10.8799024199526 16.3849198915053 -5.50501747155273 T:C C T 10 0.481909408573686 0.176711751615252 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 36191149 T/C 1 6 8 14 3.10854354855788 3.85527526858949 -0.746731720031605 T:C T C 10 0.481909408573686 0.79243933411218 ENSG00000122705:ENST00000433436:exon_36190892_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000345519:exon_36190920_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000464497:exon_36190928_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000470744:exon_36190929_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000242285:exon_36190934_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000396603:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000466396:exon_36190960_36191270:CLTA;ENSG00000122705:ENST00000462562:exon_36190990_36191270:CLTA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 37002654 T/G 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 T:G T G 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_37002645_37002773:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000524340:exon_37002645_37002672:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522932:exon_37002645_37002749:PAX5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 37002806 A/G 1 9 9 18 4.66281532283683 4.33718467716317 0.325630645673652 A:G A G 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 37592569 C/T 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 T:C C T 10 0.481909408573686 0.597188270417829 ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 37761961 A/C 1 15 17 32 7.77135887139471 8.19245994575266 -0.421101074357954 A:C A C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000165275:ENST00000297994:exon_37761900_37762114:RG9MTD3;ENSG00000165275:ENST00000377754:exon_37761897_37762114:RG9MTD3;ENSG00000165275:ENST00000488673:exon_37761897_37762114:RG9MTD3;ENSG00000165275:ENST00000377753:exon_37761900_37762114:RG9MTD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 37782069 A/G 1 1 8 9 0.518090591426314 3.85527526858949 -3.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.0401687199923125 ENSG00000107371:ENST00000327304:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000489414:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000482614:exon_37781983_37782134:EXOSC3;ENSG00000107371:ENST00000465860:exon_37781801_37782134:EXOSC3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 71831398 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 72897440 T/C 1 35 27 62 18.133170699921 13.0115540314895 5.12161666843147 T:C T C 10 0.481909408573686 0.205418265897491 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72897338_72897499:SMC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 72933774 A/G 1 22 26 48 11.3979930113789 12.5296446229158 -1.13165161153693 A:G A G 10 0.481909408573686 0.774397461862806 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72933710_72933879:SMC5 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 86278817 C/A 1 6 10 16 3.10854354855788 4.81909408573686 -1.71055053717898 A:C C A 10 0.481909408573686 0.459279308448497 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 95875381 G/C 1 15 4 19 7.77135887139471 1.92763763429474 5.84372123709996 C:G G C 10 0.481909408573686 0.00979754308718647 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 99525909 T/C 1 4 5 9 2.07236236570526 2.40954704286843 -0.337184677163174 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000081386:ENST00000375231:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000223428:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000449952:exon_99525788_99525914:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000472201:exon_99525788_99525975:ZNF510;ENSG00000081386:ENST00000374641:exon_99525788_99525914:ZNF510 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 100823084 T/C 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C T C 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 100843194 G/A 1 87 120 207 45.0738814540893 57.8291290288423 -12.755247574753 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0820042529175554 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100843098_100843428:NANS;ENSG00000095380:ENST00000461452:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000415280:exon_100843098_100843337:NANS;ENSG00000095380:ENST00000427646:exon_100843098_100844448:NANS;ENSG00000106785:ENST00000478530:exon_100843122_100843543:TRIM14 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 101990217 C/T 1 79 43 122 40.9291567226788 20.7221045686685 20.2070521540103 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000265116716432137 ENSG00000106803:ENST00000498603:exon_101990181_101990282:SEC61B;ENSG00000106803:ENST00000223641:exon_101990181_101990282:SEC61B HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 106877042 A/G 1 15 1 16 7.77135887139471 0.481909408573686 7.28944946282102 A:G A G 10 0.481909408573686 0.000180955472173041 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106876972_106877110:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106876972_106877110:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106876972_106877110:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106876972_106877110:SMC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 106888978 C/T 1 118 90 208 61.134689788305 43.3718467716317 17.7628430166733 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0150286081062537 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 6 4 10 3.10854354855788 1.92763763429474 1.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 0.536476994604088 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 116136091 T/C 1 6 6 12 3.10854354855788 2.89145645144212 0.217087097115767 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 116822510 G/A 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 A:G G A 10 0.481909408573686 0.212405499079556 ENSG00000106927:ENST00000265132:exon_116822407_116822550:AMBP HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 117118379 C/T 1 7 5 12 3.6266341399842 2.40954704286843 1.21708709711577 T:C C T 10 0.481909408573686 0.569930991051848 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117118205_117118416:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117118205_117118416:AKNA HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 117399263 C/T 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C C T 10 0.481909408573686 1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 123632045 A/G 1 32 25 57 16.578898925642 12.0477352143422 4.5311637112999 A:G A G 10 0.481909408573686 0.236098648860781 ENSG00000119403:ENST00000312189:exon_123631865_123632223:PHF19 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 123860689 C/T 1 8 10 18 4.14472473141051 4.81909408573686 -0.674369354326348 T:C C T 10 0.481909408573686 0.816703170755727 ENSG00000119397:ENST00000373865:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000414114:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123860664_123860850:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123860664_123860850:CEP110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 123917020 T/A 1 3 10 13 1.55427177427894 4.81909408573686 -3.26482231145792 A:T T A 10 0.481909408573686 0.095027905587991 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000439778:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123916999_123917230:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394372:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373847:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000431571:exon_123916999_123917191:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123916999_123917230:CEP110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 123935786 T/C 1 9 5 14 4.66281532283683 2.40954704286843 2.2532682799684 T:C T C 10 0.481909408573686 0.288315739486975 ENSG00000119397:ENST00000373855:exon_123935521_123935787:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000238341:exon_123935521_123935787:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394385:exon_123935521_123935787:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000454238:exon_123935521_123935787:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000394368:exon_123935521_123935787:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373850:exon_123935521_123935787:CEP110;ENSG00000119397:ENST00000373845:exon_123935521_123935787:CEP110 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 126345478 G/A 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 A:G G A 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000491650:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000497135:exon_126345448_126345496:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126345448_126345549:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000474676:exon_126345448_126345549:DENND1A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 127101924 C/T 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 T:C C T 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 128414376 C/A 1 8 6 14 4.14472473141051 2.89145645144212 1.2532682799684 A:C C A 10 0.481909408573686 0.597188270417829 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 130670643 G/A 1 36 31 67 18.6512612913473 14.9391916657843 3.71206962556304 A:G G A 10 0.481909408573686 0.393361835109241 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 130885248 C/T 1 6 13 19 3.10854354855788 6.26482231145792 -3.15627876290004 T:C C T 10 0.481909408573686 0.172343358369994 ENSG00000148334:ENST00000338961:exon_130885213_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000277462:exon_130885213_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000423319:exon_130885213_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000492057:exon_130885209_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000496594:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476811:exon_130885209_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000476655:exon_130885213_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000493205:exon_130884641_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000487063:exon_130885213_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000474124:exon_130885213_130885413:PTGES2;ENSG00000148334:ENST00000449878:exon_130885213_130885413:PTGES2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 130948018 G/A 1 6 3 9 3.10854354855788 1.44572822572106 1.66281532283683 A:G G A 10 0.481909408573686 0.328578053219983 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000474442:exon_130947826_130948055:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000420484:exon_130947908_130948055:CIZ1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 131346218 A/C 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 A:C A C 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131346067_131346248:SPTAN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 5 3 8 2.59045295713157 1.44572822572106 1.14472473141051 T:C C T 10 0.481909408573686 0.494047032028967 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 131397449 G/A 1 22 8 30 11.3979930113789 3.85527526858949 7.54271774278942 A:G G A 10 0.481909408573686 0.00599466029639988 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 3 7 10 1.55427177427894 3.3733658600158 -1.81909408573686 A:G G A 10 0.481909408573686 0.346965939773411 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 131454120 C/T 1 7 3 10 3.6266341399842 1.44572822572106 2.18090591426314 T:C C T 10 0.481909408573686 0.212405499079556 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 131479023 T/C 1 4 15 19 2.07236236570526 7.22864112860529 -5.15627876290004 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0206700820509957 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 78 71 149 40.4110661312525 34.2155680087317 6.19549812252078 T:C:G C T 10 0.481909408573686 0.325815682538279 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 132665129 C/T 1 4 10 14 2.07236236570526 4.81909408573686 -2.7467317200316 T:C C T 10 0.481909408573686 0.18355917459004 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 132678195 G/A 1 10 23 33 5.18090591426314 11.0839163971948 -5.90301048293164 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0538032956599271 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 132719648 A/G 1 65 69 134 33.6758884427104 33.2517491915843 0.424139251126071 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132719639_132719743:FNBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 35 37 72 18.133170699921 17.8306481172264 0.302522582694607 A:G A G 10 0.481909408573686 1 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 134136515 A/G 1 3 6 9 1.55427177427894 2.89145645144212 -1.33718467716317 A:G A G 10 0.481909408573686 0.510384690986528 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 134398518 C/T 1 11 12 23 5.69899650568945 5.78291290288423 -0.0839163971947787 T:C C T 10 0.481909408573686 1 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134398319_134399193:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134398319_134399185:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134398319_134399193:POMT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 135153668 C/T 1 12 5 17 6.21708709711577 2.40954704286843 3.80754005424734 T:C C T 10 0.481909408573686 0.0877566366153537 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 135205006 G/C 1 7 4 11 3.6266341399842 1.92763763429474 1.69899650568945 C:G G C 10 0.481909408573686 0.373447157732848 ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 135277341 C/A 1 210 200 410 108.799024199526 96.3818817147372 12.4171424847887 A:C C A 10 0.481909408573686 0.235574906370773 ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 135763816 C/T 1 9 7 16 4.66281532283683 3.3733658600158 1.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.619956640262385 ENSG00000165698:ENST00000372136:exon_135763677_135765418:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000356311:exon_135763677_135765418:C9orf9;ENSG00000165698:ENST00000350499:exon_135763677_135763824:C9orf9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 136218765 C/G 1 168 191 359 87.0392193596207 92.044697037574 -5.00547767795328 C:G C G 10 0.481909408573686 0.634624861332715 ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136218610_136218837:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136218730_136218837:SURF1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 45 53 98 23.3140766141841 25.5411986544054 -2.22712204022123 A:G A G 10 0.481909408573686 0.686694503181625 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139257986 G/A 1 2 7 9 1.03618118285263 3.3733658600158 -2.33718467716317 A:G G A 10 0.481909408573686 0.182263058918350 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139257939_139258171:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139257939_139258241:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139257441_139258853:CARD9 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139272057 C/G 1 26 10 36 13.4703553770842 4.81909408573686 8.6512612913473 C:G C G 10 0.481909408573686 0.00423049114683321 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139272097 C/T 1 17 3 20 8.80754005424734 1.44572822572106 7.36181182852628 T:C C T 10 0.481909408573686 0.00111413648888675 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139272281 A/C 1 7 13 20 3.6266341399842 6.26482231145792 -2.63818817147372 A:C A C 10 0.481909408573686 0.269446012541304 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139297266 C/T 1 15 1 16 7.77135887139471 0.481909408573686 7.28944946282102 T:C C T 10 0.481909408573686 0.000180955472173041 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139296377_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139296403_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139296932_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139297096_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139297117_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139297134_139297339:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139297240_139297339:SDCCAG3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139298560 G/A 1 9 2 11 4.66281532283683 0.963818817147372 3.69899650568945 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0329783256899223 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000481114:exon_139298465_139298560:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 139733490 G/T 1 14 8 22 7.2532682799684 3.85527526858949 3.39799301137891 T:G G T 10 0.481909408573686 0.199860344813854 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139733361_139733573:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139733361_139733573:C9orf86 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 140005324 C/T 1 7 11 18 3.6266341399842 5.30100349431055 -1.67436935432635 T:C C T 10 0.481909408573686 0.485903926383751 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 140006202 G/A 1 446 466 912 231.068403776136 224.569784395338 6.49861938079835 A:G G A 10 0.481909408573686 0.66683093164122 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 140201411 A/G 1 6 13 19 3.10854354855788 6.26482231145792 -3.15627876290004 A:G A G 10 0.481909408573686 0.172343358369994 ENSG00000187609:ENST00000491734:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140201357_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487745:exon_140201369_140201715:EXD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 140267455 C/A 1 7 6 13 3.6266341399842 2.89145645144212 0.735177688542081 A:C C A 10 0.481909408573686 0.784647630659318 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140267357_140267524:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140267357_140267524:EXD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 140277794 T/C 1 4 4 8 2.07236236570526 1.92763763429474 0.144724731410512 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140277765_140277829:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140277765_140277829:EXD3 HGDP01029_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 5 5 10 2.59045295713157 2.40954704286843 0.18090591426314 T:C T C 10 0.481909408573686 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 103 90 193 53.3633309169103 43.3718467716317 9.9914841452786 A:G G A 10 0.481909408573686 0.170979277744120 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 221792 G/A 1 70 35 105 36.266341399842 16.866829300079 19.399512099763 A:G G A 10 0.481909408573686 0.000178054368483489 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 224036 G/A 1 28 16 44 14.5065365599368 7.71055053717898 6.79598602275781 A:G G A 10 0.481909408573686 0.0490747613513774 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_224027_224179:GTPBP6 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 295079 C/T 1 10 5 15 5.18090591426314 2.40954704286843 2.77135887139471 T:C C T 10 0.481909408573686 0.197791501722836 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1471138 G/T 1 5 13 18 2.59045295713157 6.26482231145792 -3.67436935432635 T:G G T 10 0.481909408573686 0.100145970992449 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1500009 T/C 1 32 17 49 16.578898925642 8.19245994575266 8.38643897988938 T:C T C 10 0.481909408573686 0.0212948155613133 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1508631 C/T 1 2 6 8 1.03618118285263 2.89145645144212 -1.85527526858949 T:C C T 10 0.481909408573686 0.291636936274409 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1531569 T/G 1 11 7 18 5.69899650568945 3.3733658600158 2.32563064567365 T:G T G 10 0.481909408573686 0.347236209840515 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1531700 A/T 1 46 52 98 23.8321672056104 25.0592892458317 -1.22712204022123 A:T:G A T 10 0.481909408573686 0.84019044996643 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 5 4 9 2.59045295713157 1.92763763429474 0.662815322836826 T:C C T 10 0.481909408573686 0.746334914981833 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1546876 A/G 1 9 6 15 4.66281532283683 2.89145645144212 1.77135887139471 A:G A G 10 0.481909408573686 0.442227519683632 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1553907 G/A 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 A:G G A 10 0.481909408573686 0.727991494992515 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 1585311 C/G 1 3 5 8 1.55427177427894 2.40954704286843 -0.855275268589488 C:G C G 10 0.481909408573686 0.727991494992515 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP01029_parsed_pileup.txt . X 2326851 C/A 1 9 3 12 4.66281532283683 1.44572822572106 3.21708709711577 A:C C A 10 0.481909408573686 0.0829409352934022 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000444280:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000441131:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000478825:exon_2326786_2326854:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000430536:exon_2326786_2326854:DHRSX