INDIVIDUAL RSID CHR POS ALLELES BOTH_ALLELES_SEEN REF_COUNT NONREF_COUNT TOTAL_COUNT WEIGHTED_REF_COUNT WEIGHTED_NONREF_COUNT WRC_MINUS_WNC ALLELES_SEEN REF_ALLELE ALT_ALLELE MAQ_FILTER REF_RATIO PVALUE EXON_INFO HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 881589 G/A 1 52 55 107 24.711154025325 28.8632024732139 -4.15204844788887 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439791462035776 ENSG00000188976:ENST00000483767:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_881553_881666:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_881553_881666:NOC2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 883562 G/A 1 11 25 36 5.22735950535722 13.1196374878245 -7.89227798246728 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0113134064083739 ENSG00000188976:ENST00000327044:exon_883511_883612:NOC2L;ENSG00000188976:ENST00000477976:exon_883511_883612:NOC2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 948921 T/C 1 1384 1012 2396 657.696868674036 531.082925507136 126.6139431669 T:C T C 10 0.52478549951298 2.22451204274524e-07 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 949422 G/A 1 1062 843 1905 504.677799517215 442.394176089442 62.283623427773 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00443679531242215 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 949608 G/A 1 1696 1311 3007 805.963792825986 687.993789861517 117.970002964469 A:C:G G A 10 0.52478549951298 1.62757690094851e-05 ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 985900 C/T 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_985807_985971:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_985807_985971:AGRN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 987142 C/T 1 23 5 28 10.9299335112015 2.6239274975649 8.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00189231667463369 ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_987108_987195:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_987108_987195:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_987108_987195:AGRN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1147422 C/T 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000186827:ENST00000379236:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000497869:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000379234:exon_1147322_1147518:TNFRSF4;ENSG00000186827:ENST00000453580:exon_1147399_1147518:TNFRSF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1154156 C/A 1 115 137 252 54.6496675560073 71.8956134332783 -17.245945877271 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0318900000683417 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1154149_1154307:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1154149_1154323:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1154149_1154307:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000494748:exon_1154149_1156731:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000478938:exon_1153838_1155673:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000403997:exon_1154149_1154385:SDF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1159279 G/A 1 65 56 121 30.8889425316563 29.3879879727269 1.50095455892941 A:G G A 10 0.52478549951298 0.855646420838957 ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1159212_1159348:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1159212_1159348:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1159212_1159348:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000403997:exon_1159212_1159348:SDF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1254841 C/G 1 54 37 91 25.6615830262991 19.4170634819803 6.24451954431882 C:G C G 10 0.52478549951298 0.20832460451134 ENSG00000127054:ENST00000435064:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000294579:exon_1254713_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000458452:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000450926:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527098:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000528879:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000434694:exon_1254452_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000488042:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000526332:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000430786:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000527719:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000530031:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000525603:exon_1254676_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000429572:exon_1254059_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498173:exon_1254061_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000496353:exon_1254077_1256473:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000493534:exon_1254440_1255085:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000534345:exon_1254686_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000532952:exon_1254727_1255265:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000490853:exon_1254761_1255223:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000531019:exon_1254761_1254904:CPSF3L;ENSG00000127054:ENST00000498476:exon_1254783_1254904:CPSF3L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1262966 C/T 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000224051:ENST00000464957:exon_1262621_1263374:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262621_1264277:GLTPD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1421579 T/C 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1430915 C/T 1 32 32 64 15.2068640155846 16.7931359844154 -1.58627196883072 T:C C T 10 0.52478549951298 0.708947130415569 ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1430865_1433228:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1430865_1431581:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1430865_1431582:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1430865_1431581:ATAD3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1635565 C/T 1 19 6 25 9.02907550925338 3.14871299707788 5.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0256843423136328 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000463652:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635478_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635488_1635585:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635538_1635585:CDK11A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1635749 C/A 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1635478_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468397:exon_1635662_1635994:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000491311:exon_1635662_1636041:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000495016:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000468800:exon_1635662_1636094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000464748:exon_1635662_1635783:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000489300:exon_1635682_1635783:CDK11A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1653070 G/T 1 35 15 50 16.6325075170457 7.8717824926947 8.760725024351 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0154135552874647 ENSG00000008128:ENST00000401097:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341832:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000317673:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000407249:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356200:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000356937:exon_1653035_1653094:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000509982:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000404249:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000460465:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000357760:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000358779:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378633:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378638:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000341028:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378635:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000378630:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000479362:exon_1653035_1653150:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000498810:exon_1653035_1653318:CDK11A;ENSG00000008128:ENST00000496482:exon_1653035_1653150:CDK11A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 1724719 G/A 1 157 130 287 74.6086765764621 68.2221149366874 6.38656163977473 A:G G A 10 0.52478549951298 0.478312483054874 ENSG00000078369:ENST00000378609:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000455156:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000378606:exon_1724684_1724750:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000424622:exon_1724684_1724753:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000461893:exon_1724684_1725636:GNB1;ENSG00000078369:ENST00000471354:exon_1724684_1724750:GNB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 2121118 C/T 1 11 17 28 5.22735950535722 8.92135349172066 -3.69399398636344 T:C C T 10 0.52478549951298 0.187123821971002 ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 3649562 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000078900:ENST00000378295:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000354437:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000346387:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000357733:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378290:exon_3649311_3650467:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378288:exon_3649311_3652765:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378285:exon_3649311_3649856:TP73;ENSG00000078900:ENST00000378280:exon_3649311_3649856:TP73 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 6292070 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116237:ENST00000343813:exon_6291962_6292179:ICMT;ENSG00000116237:ENST00000489498:exon_6291962_6292179:ICMT;ENSG00000116237:ENST00000474756:exon_6291962_6292179:ICMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 6378607 G/A 1 29 42 71 13.7812205141236 22.0409909795452 -8.25977046542158 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0569295465630761 ENSG00000097021:ENST00000377855:exon_6378552_6378638:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377860:exon_6378552_6378638:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000418124:exon_6378552_6378638:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377845:exon_6378552_6378638:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000377842:exon_6378552_6378638:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000361521:exon_6378552_6378638:ACOT7;ENSG00000097021:ENST00000473466:exon_6378552_6378638:ACOT7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 6586813 G/T 1 22 13 35 10.4547190107144 6.82221149366874 3.6325075170457 T:G G T 10 0.52478549951298 0.239609814585285 ENSG00000162408:ENST00000377705:exon_6586756_6586889:NOL9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 6648357 C/T 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:C C T 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648338_6648502:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648338_6648502:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466813:exon_6648338_6648502:ZBTB48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 6705874 G/C 1 16 9 25 7.60343200779232 4.72306949561682 2.8803625121755 C:G G C 10 0.52478549951298 0.317499389351278 ENSG00000007923:ENST00000377577:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000377573:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000294401:exon_6705849_6706038:DNAJC11;ENSG00000007923:ENST00000426784:exon_6705860_6706038:DNAJC11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 9097626 A/G 1 21 30 51 9.97950451022742 15.7435649853894 -5.76406047516198 A:G A G 10 0.52478549951298 0.122961993024092 ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9095166_9097848:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000456780:exon_9097007_9097848:SLC2A5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 9784423 C/T 1 36 28 64 17.1077220175327 14.6939939863634 2.41372803116928 T:C C T 10 0.52478549951298 0.617121960983759 ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9784334_9784479:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9784334_9784479:PIK3CD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 9804693 C/T 1 13 9 22 6.17778850633126 4.72306949561682 1.45471901071444 T:C C T 10 0.52478549951298 0.670593887428144 ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 9910773 C/A 1 10 2 12 4.7521450048702 1.04957099902596 3.70257400584424 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0413560448537132 ENSG00000178585:ENST00000377263:exon_9908334_9910834:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000400904:exon_9910167_9910834:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000377258:exon_9910508_9910834:CTNNBIP1;ENSG00000178585:ENST00000377256:exon_9910717_9910834:CTNNBIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 11132217 G/A 1 69 45 114 32.7898005336044 23.6153474780841 9.17445305552028 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0915938811126142 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11132144_11132228:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000469634:exon_11130957_11133083:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000478271:exon_11132144_11132452:EXOSC10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 11134043 C/T 1 62 43 105 29.4632990301952 22.5657764790581 6.8975225511371 T:C C T 10 0.52478549951298 0.203892957428141 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11133991_11134065:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11133991_11134065:EXOSC10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 11158105 C/T 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11158077_11158213:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000460196:exon_11158077_11158213:EXOSC10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 14105298 G/A 1 30 14 44 14.2564350146106 7.34699699318172 6.90943802142888 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0485515739678003 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 14105373 G/C 1 15 12 27 7.1282175073053 6.29742599415576 0.830791513149538 C:G G C 10 0.52478549951298 0.848083276492106 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 14105508 G/T 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 14109114 A/G 1 29 22 51 13.7812205141236 11.5452809892856 2.23593952483802 A:G A G 10 0.52478549951298 0.576591657010935 ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 15752379 G/A 1 72 54 126 34.2154440350654 28.3384169737009 5.87702706136452 A:G G A 10 0.52478549951298 0.326673955511050 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15752367_15752514:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15752367_15752514:EFHD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 15755221 C/T 1 164 134 298 77.9351780798713 70.3212569347393 7.61392114513195 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.384856998509865 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 15755225 G/A 1 166 133 299 78.8856070808453 69.7964714352264 9.08913564561897 A:G G A 10 0.52478549951298 0.297873391073584 ENSG00000142634:ENST00000375980:exon_15755089_15756839:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000375975:exon_15755089_15756834:EFHD2;ENSG00000142634:ENST00000445566:exon_15755089_15755577:EFHD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 16054238 G/A 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16053509_16054327:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16053509_16054327:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16053509_16054327:PLEKHM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 16256007 T/C 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 16272250 A/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G A G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 17318983 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17318981_17319076:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000503552:exon_17318981_17319076:ATP13A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 17380497 G/C,T 0 0 92 92 0 48.2802659551942 -48.2802659551942 T:C G C 10 0.52478549951298 1.87867186882734e-30 ENSG00000117118:ENST00000375499:exon_17380443_17380665:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000485515:exon_17380443_17380502:SDHB;ENSG00000117118:ENST00000466613:exon_17380443_17380526:SDHB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 17739586 G/A 1 30 34 64 14.2564350146106 17.8427069834413 -3.58627196883072 A:G G A 10 0.52478549951298 0.383452517381646 ENSG00000179051:ENST00000375436:exon_17739569_17739674:RCC2;ENSG00000179051:ENST00000375433:exon_17739569_17739674:RCC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19413261 T/A 1 41 32 73 19.4837945199678 16.7931359844154 2.69065853555246 A:T T A 10 0.52478549951298 0.559402851626244 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19415304 C/T 1 49 63 112 23.285510523864 33.0614864693177 -9.77597594545377 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0720332090078091 ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19549989 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000486405:exon_19549890_19550000:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000494770:exon_19549890_19550063:KIAA0090 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19550037 C/T 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375197:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19549890_19550063:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000494770:exon_19549890_19550063:KIAA0090 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19570475 C/T 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19570444_19570509:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19570444_19570509:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19570444_19570509:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000475079:exon_19570444_19570509:KIAA0090 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19584004 G/A 1 83 75 158 39.4428035404227 39.3589124634735 0.0838910769491577 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19585207 G/A 1 168 127 295 79.8360360818194 66.6477584381485 13.1882776436709 A:G G A 10 0.52478549951298 0.129731150213739 ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19585175_19586622:MRTO4;ENSG00000053372:ENST00000479559:exon_19585175_19585233:MRTO4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19633543 A/G 1 17 27 44 8.07864650827934 14.1692084868505 -6.09056197857112 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0710556175251974 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19633496_19633595:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19633496_19633595:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19633496_19633595:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19633496_19633595:AKR7A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19634964 C/G 1 15 13 28 7.1282175073053 6.82221149366874 0.306006013636559 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 19653035 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000040487:ENST00000234646:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000430100:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375155:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000375153:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000469076:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000400548:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000497827:exon_19653025_19653117:PQLC2;ENSG00000040487:ENST00000432465:exon_19653025_19653117:PQLC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 20977000 A/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:C A C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 21177800 A/T 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 A:T A T 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21177751_21177971:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21177751_21177971:EIF4G3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 22109370 G/A 1 15 24 39 7.1282175073053 12.5948519883115 -5.46663448100622 A:G G A 10 0.52478549951298 0.107695702052258 ENSG00000090686:ENST00000400301:exon_22109317_22109688:USP48;ENSG00000090686:ENST00000308271:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000529637:exon_22109317_22109484:USP48;ENSG00000090686:ENST00000421625:exon_22109317_22110099:USP48;ENSG00000090686:ENST00000532737:exon_22109317_22109384:USP48;ENSG00000090686:ENST00000489108:exon_22109317_22109436:USP48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 23419806 A/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:C A C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 23420443 C/A 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:C C A 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000471849:exon_23419936_23420873:LUZP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24077512 C/T 1 30 42 72 14.2564350146106 22.0409909795452 -7.78455596493456 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0763875085210883 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24077554 T/C 1 38 40 78 18.0581510185068 20.9914199805192 -2.93326896201244 T:C T C 10 0.52478549951298 0.571128156799007 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24078234 T/C 1 47 41 88 22.3350815228899 21.5162054800322 0.81887604285776 T:C T C 10 0.52478549951298 0.915162841991795 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24083524 G/A 1 36 39 75 17.1077220175327 20.4666344810062 -3.3589124634735 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 0.488308948491095 ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24083443_24083615:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24083443_24083615:TCEB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24137259 A/G 1 50 60 110 23.760725024351 31.4871299707788 -7.72640494642781 A:G A G 10 0.52478549951298 0.152356234389675 ENSG00000117305:ENST00000374490:exon_24137226_24137289:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374487:exon_24137226_24137289:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000496907:exon_24137226_24137289:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000374483:exon_24137226_24137289:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000513148:exon_24135777_24137289:HMGCL;ENSG00000117305:ENST00000465332:exon_24136677_24137289:HMGCL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24200969 T/C 1 33 8 41 15.6820785160717 4.19828399610384 11.4837945199678 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000253300950055618 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24200983 C/T 1 36 9 45 17.1077220175327 4.72306949561682 12.3846525219159 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000242371138607209 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201094 G/C 1 23 18 41 10.9299335112015 9.44613899123364 1.48379451996782 C:G G C 10 0.52478549951298 0.754950969937368 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201109 C/T 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 T:C C T 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201262 A/G 1 32 20 52 15.2068640155846 10.4957099902596 4.71115402532504 A:G A G 10 0.52478549951298 0.212631733332244 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201357 A/G 1 24 13 37 11.4051480116885 6.82221149366874 4.58293651801974 A:G A G 10 0.52478549951298 0.141304891800387 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201448 C/T 1 24 23 47 11.4051480116885 12.0700664887985 -0.664918477110062 T:C C T 10 0.52478549951298 0.884555302742298 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201643 G/A 1 17 32 49 8.07864650827934 16.7931359844154 -8.71448947613602 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0145744346510479 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201919 T/C 1 21 7 28 9.97950451022742 3.67349849659086 6.30600601363656 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0217222718148124 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24201920 T/C 1 22 7 29 10.4547190107144 3.67349849659086 6.78122051412358 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0144293580242629 ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 24998750 G/A 1 53 48 101 25.1863685258121 25.189703976623 -0.00333545081098663 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000133226:ENST00000323848:exon_24998673_24999758:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000447431:exon_24998673_24999771:SRRM1;ENSG00000133226:ENST00000374389:exon_24998673_24999753:SRRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 25291010 A/T 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 A:T A T 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000020633:ENST00000399916:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000428150:exon_25291005_25291501:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000338888:exon_25291005_25291159:RUNX3;ENSG00000020633:ENST00000479341:exon_25291005_25291070:RUNX3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26153175 T/C 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000117640:ENST00000424294:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000336146:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374303:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000432144:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000533762:exon_26153106_26153198:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000529116:exon_26153106_26153211:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000474295:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000488327:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000472643:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526894:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000478284:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000524618:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374307:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000525713:exon_26153106_26153198:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374301:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000464008:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526158:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000530599:exon_26153106_26153297:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374300:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000466284:exon_26153106_26153317:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000497956:exon_26152123_26153317:FAM54B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26156074 T/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000117640:ENST00000336146:exon_26156000_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374303:exon_26156000_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000472643:exon_26156000_26156320:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000469815:exon_26156000_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000478284:exon_26156000_26156112:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000524618:exon_26156000_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374307:exon_26156036_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374301:exon_26156000_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000464008:exon_26156000_26156149:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374300:exon_26156000_26156321:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000531361:exon_26156000_26156288:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000497956:exon_26156000_26156321:FAM54B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26162030 G/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127423:ENST00000374298:exon_26160497_26162337:C1orf135 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26610917 G/A 1 13 8 21 6.17778850633126 4.19828399610384 1.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.513297365553358 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26610853_26612032:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26610853_26610973:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26610853_26612032:UBXN11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26612460 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374215:exon_26612314_26612528:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000452980:exon_26612367_26612528:UBXN11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26646726 A/G 1 1768 1416 3184 840.179236861051 743.09626731038 97.0829695506716 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.000575234326039414 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 26646730 A/G 1 1766 1436 3202 839.228807860077 753.591977300639 85.636830559438 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00247716607737719 ENSG00000169442:ENST00000374213:exon_26646662_26647014:CD52;ENSG00000169442:ENST00000470468:exon_26646662_26646815:CD52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 28209362 T/C 1 62 56 118 29.4632990301952 29.3879879727269 0.0753110574683546 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130775:ENST00000328928:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000467258:exon_28209024_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000373921:exon_28208482_28209554:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000482828:exon_28209024_28209455:C1orf38;ENSG00000130775:ENST00000456990:exon_28209024_28209554:C1orf38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 28527715 G/A 1 260 70 330 123.555770126625 36.7349849659086 86.8207851607166 A:G G A 10 0.52478549951298 4.72182102447295e-23 ENSG00000126698:ENST00000263697:exon_28527068_28527881:DNAJC8;ENSG00000126698:ENST00000489277:exon_28527070_28527881:DNAJC8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 28861636 G/A 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 A:G G A 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000180198:ENST00000398962:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000398958:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373834:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000427469:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000434290:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373833:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000419074:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373832:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000439292:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000373831:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000411533:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000430407:exon_28861562_28861658:RCC1;ENSG00000180198:ENST00000429051:exon_28861562_28861658:RCC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 31215364 T/C 1 237 190 427 112.625836615424 99.7092449074662 12.9165917079575 T:C T C 10 0.52478549951298 0.225748164606263 ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 31732892 G/A 1 145 158 303 68.9061025706179 82.9161089230508 -14.010006352433 A:G G A 10 0.52478549951298 0.107676145553214 ENSG00000060688:ENST00000263694:exon_31732417_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000486941:exon_31732520_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000489853:exon_31732521_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000373720:exon_31732557_31732968:SNRNP40;ENSG00000060688:ENST00000491106:exon_31732633_31732968:SNRNP40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 32568149 C/T 1 27 34 61 12.8307915131495 17.8427069834413 -5.01191547029178 T:C C T 10 0.52478549951298 0.202826447659834 ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32568032_32568464:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32568032_32568467:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32568032_32568467:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32568032_32568467:TMEM39B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 32645991 T/G 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:G T G 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000084652:ENST00000373610:exon_32645915_32646115:TXLNA;ENSG00000084652:ENST00000373609:exon_32645666_32646115:TXLNA;ENSG00000084652:ENST00000427320:exon_32645917_32646022:TXLNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 33099637 A/G 1 88 118 206 41.8188760428578 61.9246889425316 -20.1058128996739 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00522268207743111 ENSG00000176261:ENST00000468695:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373506:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473294:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000478041:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000436661:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000498691:exon_33099552_33099662:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000373501:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000476493:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000465588:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000483138:exon_33099552_33099673:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000479075:exon_33099552_33099711:ZBTB8OS;ENSG00000176261:ENST00000473383:exon_33099552_33100123:ZBTB8OS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 35320690 T/G 1 61 60 121 28.9880845297082 31.4871299707788 -2.49904544107059 T:G T G 10 0.52478549951298 0.650442912907224 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 35320783 C/G 1 172 117 289 81.7368940837674 61.3999034430187 20.3369906407488 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0183425538745211 ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000456842:exon_35320770_35321583:C1orf212 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 35452711 T/C 1 11 19 30 5.22735950535722 9.97092449074662 -4.7435649853894 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0997823336227106 ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 35452986 C/T 1 9 16 25 4.27693050438318 8.39656799220768 -4.1196374878245 T:C C T 10 0.52478549951298 0.111379558353423 ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 35864571 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000146463:ENST00000314607:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000373297:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000457946:exon_35864465_35864644:ZMYM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 35944752 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000142687:ENST00000325722:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000373258:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000426982:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000335883:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000440579:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000431916:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000482929:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000478463:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000470388:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000492888:exon_35944567_35944813:KIAA0319L;ENSG00000142687:ENST00000469892:exon_35944661_35944813:KIAA0319L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 36557619 G/A 1 27 32 59 12.8307915131495 16.7931359844154 -3.96234447126582 A:G G A 10 0.52478549951298 0.361662940646558 ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 36602943 C/T 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36602182_36603579:TRAPPC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 36643729 G/C 1 30 20 50 14.2564350146106 10.4957099902596 3.760725024351 C:G G C 10 0.52478549951298 0.322898389841764 ENSG00000116871:ENST00000316156:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373150:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373151:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000309824:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000530975:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000487131:exon_36643474_36643802:MAP7D1;ENSG00000116871:ENST00000373148:exon_36643474_36643802:MAP7D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 37941196 G/T 1 13 3 16 6.17778850633126 1.57435649853894 4.60343200779232 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0237464979222770 ENSG00000163874:ENST00000373087:exon_37941060_37941540:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000373082:exon_37941063_37941540:ZC3H12A;ENSG00000163874:ENST00000492829:exon_37941060_37941257:ZC3H12A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 38034514 C/T 1 117 114 231 55.6000965569813 59.8255469444797 -4.22545038749839 T:C C T 10 0.52478549951298 0.598483147205447 ENSG00000134697:ENST00000373062:exon_38034452_38034903:GNL2;ENSG00000134697:ENST00000462812:exon_38034452_38036494:GNL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 38465053 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000183386:ENST00000373016:exon_38464929_38465104:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000477194:exon_38464929_38465104:FHL3;ENSG00000183386:ENST00000483132:exon_38464929_38465104:FHL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 39330330 C/A 1 55 50 105 26.1367975267861 26.239274975649 -0.102477448862906 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000214114:ENST00000397572:exon_39328636_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000494695:exon_39329908_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000495043:exon_39330008_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000489803:exon_39330173_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000489575:exon_39330175_39330386:MYCBP;ENSG00000214114:ENST00000465771:exon_39330258_39330386:MYCBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 39907626 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39907624_39907725:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39907624_39907725:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39907624_39907725:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39907624_39907725:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39907624_39907725:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39907624_39907725:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000469490:exon_39907624_39907725:MACF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 39907914 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39907819_39907992:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39907819_39907992:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39907819_39907992:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39907819_39907992:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39907819_39907992:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39907819_39907992:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000469490:exon_39907819_39907961:MACF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 39908506 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39908386_39908583:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39908386_39908583:MACF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 39914363 G/C 1 14 6 20 6.65300300681828 3.14871299707788 3.5042900097404 C:G G C 10 0.52478549951298 0.177770154653337 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39914266_39914435:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39914266_39914435:MACF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 39924770 G/A 1 17 19 36 8.07864650827934 9.97092449074662 -1.89227798246728 A:G G A 10 0.52478549951298 0.617415799777466 ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000360115:exon_39924758_39924921:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000497964:exon_39922378_39924921:MACF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 40034572 T/C 1 110 89 199 52.2735950535722 46.7059094566552 5.56768559691697 T:C T C 10 0.52478549951298 0.435979582720642 ENSG00000090621:ENST00000441204:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372862:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372858:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372857:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000372856:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000421687:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000470443:exon_40034474_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000525751:exon_40034370_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000474378:exon_40034497_40034611:PABPC4;ENSG00000090621:ENST00000529216:exon_40034534_40034611:PABPC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 40424438 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000168389:ENST00000372811:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000450641:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000434861:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000420632:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000372809:exon_40424334_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000525305:exon_40424334_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000483824:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000412699:exon_40424373_40424497:MFSD2A;ENSG00000168389:ENST00000469745:exon_40424373_40424497:MFSD2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 40705726 A/T 1 15 17 32 7.1282175073053 8.92135349172066 -1.79313598441536 A:T A T 10 0.52478549951298 0.596917633265219 ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 40768344 C/T 1 15 19 34 7.1282175073053 9.97092449074662 -2.84270698344132 T:C C T 10 0.52478549951298 0.391458331329885 ENSG00000049089:ENST00000372748:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000482722:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000455952:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000466267:exon_40768293_40768481:COL9A2;ENSG00000049089:ENST00000427563:exon_40768293_40768481:COL9A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 40980559 G/A 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000164002:ENST00000358527:exon_40980187_40981708:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000372703:exon_40980187_40981709:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000420209:exon_40980187_40980894:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000296380:exon_40980187_40982228:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000418186:exon_40980187_40980888:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000415550:exon_40980187_40980699:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000443729:exon_40980187_40980958:DEM1;ENSG00000164002:ENST00000419161:exon_40980187_40980958:DEM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 41503181 G/A 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000010803:ENST00000372597:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372596:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000337495:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000372595:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000326197:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361191:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000361705:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397174:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000397171:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000456518:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000402904:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000460215:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000498793:exon_41503034_41503213:SCMH1;ENSG00000010803:ENST00000489421:exon_41503034_41503213:SCMH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 41976291 C/A 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 A:C C A 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 41976529 C/T 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 41979156 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 41979163 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41978487_41979421:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41978487_41979421:HIVEP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 42880516 T/C 1 22 10 32 10.4547190107144 5.2478549951298 5.20686401558464 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0766738262933283 ENSG00000177181:ENST00000431473:exon_42880155_42880850:RIMKLA;ENSG00000177181:ENST00000372570:exon_42880155_42880830:RIMKLA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 42922524 C/T 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C C T 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000127125:ENST00000372560:exon_42922210_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000472013:exon_42922215_42923021:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000435501:exon_42922215_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000372561:exon_42922230_42922744:PPCS;ENSG00000127125:ENST00000471420:exon_42922472_42922744:PPCS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 42965925 A/G 0 735 0 735 349.28265785796 0 349.28265785796 A A 10 0.52478549951298 2.50050748930615e-206 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 43212926 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43212046_43213083:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000462474:exon_43212924_43213083:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000472802:exon_43212924_43213247:LEPRE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 43394612 T/C 1 13 7 20 6.17778850633126 3.67349849659086 2.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.371028264701611 ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394603_43394704:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394603_43394704:SLC2A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 43632536 C/T 1 215 259 474 102.171117604709 135.919444373862 -33.7483267691525 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00203812285519943 ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43632497_43632590:EBNA1BP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 44386498 C/T 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000126091:ENST00000361392:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000361400:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000335430:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000372374:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000262915:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000372375:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000351035:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000347631:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000332628:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000372369:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000361746:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000372368:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000372372:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000490541:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000469715:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000533212:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000530581:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000372377:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000490502:exon_44386454_44386600:ST3GAL3;ENSG00000126091:ENST00000495482:exon_44386454_44386600:ST3GAL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 44446808 G/A 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000117411:ENST00000498543:exon_44446781_44446999:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000372324:exon_44446781_44447145:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000497866:exon_44446781_44447145:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000434555:exon_44446781_44447145:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000356836:exon_44446781_44447145:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000309519:exon_44446781_44447145:B4GALT2;ENSG00000117411:ENST00000485678:exon_44446781_44447145:B4GALT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 45444038 G/A 1 29 23 52 13.7812205141236 12.0700664887985 1.71115402532504 A:G G A 10 0.52478549951298 0.678560330261019 ENSG00000070785:ENST00000360403:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372183:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000480675:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000477953:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000372182:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000487532:exon_45443987_45444132:EIF2B3;ENSG00000070785:ENST00000497010:exon_45443987_45444132:EIF2B3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 45795027 C/T 1 38 44 82 18.0581510185068 23.0905619785711 -5.03241096006436 T:C C T 10 0.52478549951298 0.271154051404017 ENSG00000132781:ENST00000529984:exon_45794835_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000485271:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45794914_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000488731:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45794915_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000531105:exon_45794918_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45794944_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45794945_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000529892:exon_45794946_45795109:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45794948_45795109:MUTYH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 45797505 C/G 1 23 10 33 10.9299335112015 5.2478549951298 5.68207851607166 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0549992205507907 ENSG00000132781:ENST00000372104:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000448481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000456914:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000354383:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000475516:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000355498:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372098:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000481571:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372110:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372115:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000528332:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000525481:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000532813:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000372100:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000450313:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000426432:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000431970:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000467459:exon_45797333_45797544:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000482094:exon_45797333_45797755:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000533178:exon_45797333_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000412971:exon_45797406_45797521:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000462388:exon_45797419_45797758:MUTYH;ENSG00000132781:ENST00000466231:exon_45797442_45797521:MUTYH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46073489 G/A 1 7 12 19 3.32650150340914 6.29742599415576 -2.97092449074662 A:G G A 10 0.52478549951298 0.250216318185529 ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46072993_46074009:NASP;ENSG00000132780:ENST00000470768:exon_46072993_46073644:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46072993_46074009:NASP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46078854 A/G 1 164 128 292 77.9351780798713 67.1725439376614 10.7626341422098 A:G A G 10 0.52478549951298 0.218659037428209 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46078884 C/T 1 189 134 323 89.8155405920468 70.3212569347393 19.4942836573074 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0298914239463609 ENSG00000132780:ENST00000437901:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000437362:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000527359:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000525515:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000453748:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000402363:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000528238:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000350030:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000372052:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000351223:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000341288:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000530073:exon_46078841_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000481782:exon_46076226_46078920:NASP;ENSG00000132780:ENST00000531612:exon_46078841_46078920:NASP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46094027 A/G 1 78 61 139 37.0667310379876 32.0119154702918 5.05481556769578 A:G A G 10 0.52478549951298 0.397293223429166 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46092976_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46092978_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46093629_46094080:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46093900_46094080:GPBP1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46095272 T/C 1 102 88 190 48.471879049676 46.1811239571422 2.29075509253379 T:C T C 10 0.52478549951298 0.771613545764205 ENSG00000159592:ENST00000479235:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000290795:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000355105:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000467032:exon_46095248_46095387:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000487436:exon_46095248_46095350:GPBP1L1;ENSG00000159592:ENST00000468724:exon_46095260_46095350:GPBP1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46498375 A/G 1 4 14 18 1.90085800194808 7.34699699318172 -5.44613899123364 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0157704497564806 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46498268_46498390:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46498268_46498390:MAST2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46501599 G/A 1 53 57 110 25.1863685258121 29.9127734722399 -4.72640494642781 A:G G A 10 0.52478549951298 0.390898782924902 ENSG00000086015:ENST00000361297:exon_46500210_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372009:exon_46500501_46501738:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000468212:exon_46501486_46501896:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000498364:exon_46501171_46501796:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000372008:exon_46501567_46501795:MAST2;ENSG00000086015:ENST00000489579:exon_46500499_46501794:MAST2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46806550 C/T 1 16 8 24 7.60343200779232 4.19828399610384 3.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.219795277052229 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46805849_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46806397_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46806461_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46806474_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46806492_46806591:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000472157:exon_46806501_46806591:NSUN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46810670 T/C 1 22 11 33 10.4547190107144 5.77264049464278 4.68207851607166 T:C T C 10 0.52478549951298 0.117715879400695 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46827456 A/G 1 33 57 90 15.6820785160717 29.9127734722399 -14.2306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00297663450212397 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 46827485 C/T 1 63 34 97 29.9385135306823 17.8427069834413 12.0958065472409 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0145634538352344 ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46827242_46827863:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46827242_46827862:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46827242_46830824:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46827242_46827864:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46827242_46827862:NSUN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 47717519 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 52271205 C/T 1 36 38 74 17.1077220175327 19.9418489814932 -2.83412696396052 T:C C T 10 0.52478549951298 0.561111579267483 ENSG00000078618:ENST00000440943:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000352171:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000354831:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000485608:exon_52271182_52271233:NRD1;ENSG00000078618:ENST00000371665:exon_52271182_52271233:NRD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 52498686 C/G 1 7 12 19 3.32650150340914 6.29742599415576 -2.97092449074662 C:G C G 10 0.52478549951298 0.250216318185529 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 52498861 A/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:T A T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 52499362 C/G 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 C:G C G 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 52876825 C/T 1 26 26 52 12.3555770126625 13.6444229873375 -1.28884597467496 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78185302578904 ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52876787_52876872:PRPF38A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 52896881 G/A 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000134744:ENST00000528457:exon_52896685_52896899:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52896685_52897132:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52896685_52897132:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52896685_52897132:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000466440:exon_52896685_52900342:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000531722:exon_52896798_52896895:ZCCHC11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53072454 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000116157:ENST00000361314:exon_53072356_53072617:GPX7;ENSG00000116157:ENST00000459779:exon_53072356_53073080:GPX7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53153432 T/C 1 31 45 76 14.7316495150976 23.6153474780841 -8.88369796298648 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0502561080354927 ENSG00000162377:ENST00000371538:exon_53152508_53153840:C1orf163;ENSG00000162377:ENST00000486918:exon_53153234_53153840:C1orf163 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53364889 A/T 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 A:T A T 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000121310:ENST00000460612:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000479183:exon_53363109_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000463923:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000371522:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000371520:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000358358:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000498544:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000476477:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000479593:exon_53364846_53364896:ECHDC2;ENSG00000121310:ENST00000487866:exon_53364846_53364896:ECHDC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53453714 G/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116171:ENST00000371514:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000408941:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000478631:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000528311:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371509:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000407246:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000371513:exon_53453701_53453808:SCP2;ENSG00000116171:ENST00000473584:exon_53453701_53453752:SCP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53676448 G/A 1 26 24 50 12.3555770126625 12.5948519883115 -0.239274975649003 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53684154 A/T 1 21 24 45 9.97950451022742 12.5948519883115 -2.6153474780841 A:T A T 10 0.52478549951298 0.458522182114087 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53684086_53684167:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53684086_53684167:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53684086_53684167:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53684086_53684167:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000489755:exon_53684086_53684699:C1orf123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53685954 C/T 1 27 24 51 12.8307915131495 12.5948519883115 0.235939524838017 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53685933_53686016:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53685933_53686264:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53685933_53686016:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000474227:exon_53685207_53686016:C1orf123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 53716416 G/A 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 54331935 C/T 1 9 19 28 4.27693050438318 9.97092449074662 -5.69399398636344 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.0368587069089518 ENSG00000058799:ENST00000464950:exon_54331873_54332055:YIPF1;ENSG00000058799:ENST00000371399:exon_54331873_54332055:YIPF1;ENSG00000058799:ENST00000072644:exon_54331873_54332055:YIPF1;ENSG00000058799:ENST00000469457:exon_54331868_54332055:YIPF1;ENSG00000058799:ENST00000480151:exon_54331874_54332055:YIPF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 54432019 G/A 1 35 36 71 16.6325075170457 18.8922779824673 -2.25977046542158 A:G G A 10 0.52478549951298 0.635333865225434 ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 54681920 G/C 1 146 97 243 69.3813170711049 50.9041934527591 18.4771236183458 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0205730112818139 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 54681927 G/A 1 155 108 263 73.6582475754881 56.6768339474018 16.9814136280862 A:G G A 10 0.52478549951298 0.041407635032897 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 54683856 C/G 1 436 408 844 207.193522212341 214.112483801296 -6.91896158895517 A:T:C:G C G 10 0.52478549951298 0.65415989928657 ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54683845_54684051:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54683845_54684053:MRPL37 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 55182300 T/A 1 14 9 23 6.65300300681828 4.72306949561682 1.92993351120146 A:T T A 10 0.52478549951298 0.532391639992863 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 55188382 C/T 1 17 7 24 8.07864650827934 3.67349849659086 4.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.100311386228204 ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55188348_55188472:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55188348_55188472:TTC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 55319902 A/G 1 26 24 50 12.3555770126625 12.5948519883115 -0.239274975649003 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116133:ENST00000371269:exon_55319710_55319907:DHCR24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 58971831 G/A 1 5 10 15 2.3760725024351 5.2478549951298 -2.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.195423410463726 ENSG00000173406:ENST00000485760:exon_58971732_58971881:DAB1;ENSG00000162600:ENST00000467509:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000460671:exon_58971732_58971871:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58971732_58971881:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58971732_58971881:OMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 58999651 T/G 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 T:C:G T G 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_58999625_58999732:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_58999621_58999732:OMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 59002221 T/C 1 25 23 48 11.8803625121755 12.0700664887985 -0.189703976623042 A:T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000162600:ENST00000421528:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000358603:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000371226:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000469854:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000456980:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000467063:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000419242:exon_59002185_59002413:OMA1;ENSG00000162600:ENST00000426139:exon_59002185_59002413:OMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 59142713 T/C 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000162601:ENST00000472487:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000493821:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000401044:exon_59142598_59142728:MYSM1;ENSG00000162601:ENST00000481973:exon_59142444_59142728:MYSM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 65310489 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 65311262 G/A 1 1 10 11 0.47521450048702 5.2478549951298 -4.77264049464278 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00450105750233496 ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65311196_65311323:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65311196_65311323:JAK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 70687239 T/A 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116754:ENST00000395136:exon_70687079_70687522:SRSF11;ENSG00000116754:ENST00000473950:exon_70687152_70687522:SRSF11;ENSG00000116754:ENST00000469170:exon_70687163_70687522:SRSF11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 75175797 G/A 1 53 38 91 25.1863685258121 19.9418489814932 5.24451954431882 A:G G A 10 0.52478549951298 0.294651204202813 ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 75217990 A/T 1 44 27 71 20.9094380214289 14.1692084868505 6.74022953457842 A:T A T 10 0.52478549951298 0.122546850506547 ENSG00000162623:ENST00000370867:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000421739:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000457880:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000479111:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000483990:exon_75217976_75218078:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000485401:exon_75217976_75218109:TYW3;ENSG00000162623:ENST00000486467:exon_75217976_75218109:TYW3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 78163080 C/T 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78161672_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78161676_78163159:USP33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 78184325 A/G 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370792:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000527390:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000498328:exon_78184281_78184397:USP33;ENSG00000077254:ENST00000461986:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000531637:exon_78184281_78184326:USP33;ENSG00000077254:ENST00000462192:exon_78184281_78184326:USP33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 78408505 T/A 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 A:T T A 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000162614:ENST00000330010:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000294624:exon_78408146_78409576:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000334785:exon_78408146_78408909:NEXN;ENSG00000162614:ENST00000480732:exon_78408146_78408884:NEXN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 79095526 G/A 1 101 164 265 47.996664549189 86.0648219201287 -38.0681573709397 A:G G A 10 0.52478549951298 3.43406089623590e-06 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 79102727 G/A 1 103 66 169 48.9470935501631 34.6358429678567 14.3112505823064 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0308006149377921 ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79102717_79102846:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79102717_79102888:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000494910:exon_79102377_79102888:IFI44L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 79107224 C/A 1 101 137 238 47.996664549189 71.8956134332783 -23.8989488840893 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00222291520143786 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79107120_79107235:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79107120_79107294:IFI44L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 79107287 G/A 1 209 150 359 99.3198306017872 78.717824926947 20.6020056748402 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0302619956272906 ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79107120_79107294:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79107120_79107294:IFI44L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 79115905 T/C 1 142 76 218 67.4804590691568 39.8836979629865 27.5967611061704 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00018030828178904 ENSG00000137965:ENST00000370747:exon_79115871_79116337:IFI44;ENSG00000137965:ENST00000467790:exon_79115871_79116337:IFI44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 84945111 G/T 1 54 41 95 25.6615830262991 21.5162054800322 4.1453775462669 T:C:G G T 10 0.52478549951298 0.412703912780815 ENSG00000117133:ENST00000370656:exon_84944942_84945192:RPF1;ENSG00000117133:ENST00000370654:exon_84944950_84945192:RPF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 85029077 C/T 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 85031630 G/A 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000122432:ENST00000263717:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000361426:exon_85031544_85031875:SPATA1;ENSG00000122432:ENST00000460286:exon_85031544_85031877:SPATA1;ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85031524_85031695:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85031524_85031695:CTBS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 85113203 T/C 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000117155:ENST00000342203:exon_85109390_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000437941:exon_85109599_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000481102:exon_85113022_85113290:SSX2IP;ENSG00000117155:ENST00000476905:exon_85113024_85113290:SSX2IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 86818572 T/C 1 11 24 35 5.22735950535722 12.5948519883115 -7.3674924829543 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0166901047309963 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 86820267 C/T 1 12 32 44 5.70257400584424 16.7931359844154 -11.0905619785711 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000802087588065764 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000476054:exon_86820213_86820375:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000473792:exon_86820213_86820375:ODF2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 86847955 G/A 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G G A 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000488879:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000472368:exon_86847925_86848041:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000480440:exon_86847625_86848041:ODF2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 87570380 G/C 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 C:G G C 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000153936:ENST00000370550:exon_87570153_87575681:HS2ST1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 89426902 G/A 1 27 23 50 12.8307915131495 12.0700664887985 0.760725024350998 A:G G A 10 0.52478549951298 0.887893684366438 ENSG00000137944:ENST00000370491:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000446900:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000260508:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000394677:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370485:exon_89426850_89426970:CCBL2;ENSG00000137944:ENST00000370486:exon_89426850_89426970:CCBL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 90486412 T/G 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 91980447 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91980376_91980554:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000486509:exon_91980376_91980554:CDC7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 92712203 C/T 1 29 44 73 13.7812205141236 23.0905619785711 -9.30934146444754 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0343958968671112 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92711959_92712203:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92712047_92712203:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000471465:exon_92712049_92712203:GLMN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 92732031 T/C 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C T C 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92731976_92732049:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92731976_92732049:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495852:exon_92731976_92732049:GLMN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 92755764 A/T 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:T A T 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000174842:ENST00000370360:exon_92755755_92755863:GLMN;ENSG00000174842:ENST00000495106:exon_92755755_92755863:GLMN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 92789305 T/C 1 18 13 31 8.55386100876636 6.82221149366874 1.73164951509762 T:C T C 10 0.52478549951298 0.592301033739622 ENSG00000122484:ENST00000370343:exon_92789002_92789932:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000394482:exon_92789002_92789932:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000484158:exon_92789002_92789641:RPAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 92789431 A/G 1 31 29 60 14.7316495150976 15.2187794858764 -0.487129970778803 A:G A G 10 0.52478549951298 0.898095848078924 ENSG00000122484:ENST00000370343:exon_92789002_92789932:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000394482:exon_92789002_92789932:RPAP2;ENSG00000122484:ENST00000484158:exon_92789002_92789641:RPAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 93300404 T/C 1 2167 2753 4920 1029.78982255537 1444.73448015923 -414.944657603862 A:T:C:G T C 10 0.52478549951298 2.64869040493592e-32 ENSG00000122406:ENST00000432788:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000370321:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000470843:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000490963:exon_93300336_93300444:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000315741:exon_93300336_93300470:RPL5;ENSG00000122406:ENST00000461952:exon_93300336_93300470:RPL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 93672688 C/T 1 26 26 52 12.3555770126625 13.6444229873375 -1.28884597467496 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78185302578904 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000481180:exon_93672664_93672955:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000455267:exon_93672664_93672955:CCDC18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 93720070 C/G 1 24 17 41 11.4051480116885 8.92135349172066 2.48379451996782 A:C:G C G 10 0.52478549951298 0.532224426849765 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93720028_93720171:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93720028_93720171:CCDC18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 93722055 C/T 1 16 15 31 7.60343200779232 7.8717824926947 -0.268350484902381 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93721892_93722095:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93721892_93722095:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93721892_93722095:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93721892_93722095:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93721892_93722095:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93721892_93722095:CCDC18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 93730286 A/G 1 40 54 94 19.0085800194808 28.3384169737009 -9.32983695422012 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0626400587201122 ENSG00000122483:ENST00000343253:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000401026:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000334652:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000338949:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000370276:exon_93730258_93730458:CCDC18;ENSG00000122483:ENST00000447456:exon_93730258_93730504:CCDC18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 94341267 A/G 1 52 51 103 24.711154025325 26.764060475162 -2.05290644983695 A:G A G 10 0.52478549951298 0.694334324494165 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341201_94341339:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341222_94341339:DNTTIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 94342564 C/A 1 138 100 238 65.5796010672088 52.478549951298 13.1010511159107 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0917525345296533 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94341824_94343418:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000496672:exon_94342315_94343045:DNTTIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 94344716 C/T 1 27 33 60 12.8307915131495 17.3179214839283 -4.4871299707788 T:C C T 10 0.52478549951298 0.24838671934952 ENSG00000067334:ENST00000436063:exon_94344633_94344762:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000359208:exon_94344633_94344718:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000460191:exon_94344104_94345474:DNTTIP2;ENSG00000067334:ENST00000528680:exon_94344633_94344720:DNTTIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 95709939 T/G 1 14 6 20 6.65300300681828 3.14871299707788 3.5042900097404 T:G T G 10 0.52478549951298 0.177770154653337 ENSG00000122481:ENST00000370202:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000263893:exon_95709767_95710271:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000429514:exon_95709767_95710207:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000492639:exon_95709767_95709967:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000495272:exon_95709767_95710254:RWDD3;ENSG00000122481:ENST00000419345:exon_95709767_95710271:RWDD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 100756991 A/T 1 105 113 218 49.8975225511371 59.3007614449667 -9.40323889382965 A:T A T 10 0.52478549951298 0.222174236290926 ENSG00000137996:ENST00000370128:exon_100756959_100758325:RTCD1;ENSG00000137996:ENST00000260563:exon_100756959_100757327:RTCD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 109338861 G/C 1 19 6 25 9.02907550925338 3.14871299707788 5.8803625121755 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0256843423136328 ENSG00000116266:ENST00000370008:exon_109338856_109338994:STXBP3;ENSG00000116266:ENST00000472099:exon_109338857_109339348:STXBP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 109642847 G/C 1 28 12 40 13.3060060136366 6.29742599415576 7.0085800194808 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0271521671977264 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110170896 T/C 1 16 10 26 7.60343200779232 5.2478549951298 2.35557701266252 T:C T C 10 0.52478549951298 0.433781433833906 ENSG00000116337:ENST00000526301:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528667:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110170705_110170899:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000529299:exon_110170705_110171157:AMPD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110200289 C/T 1 16 19 35 7.60343200779232 9.97092449074662 -2.3674924829543 T:C C T 10 0.52478549951298 0.499319230855147 ENSG00000168765:ENST00000369836:exon_110200212_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000464733:exon_110199972_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000326729:exon_110200212_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000369833:exon_110199334_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000489066:exon_110200212_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000485640:exon_110200155_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000458309:exon_110200212_110200293:GSTM4;ENSG00000168765:ENST00000444299:exon_110200158_110200293:GSTM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110232928 T/C 1 136 77 213 64.6291720662347 40.4084834624995 24.2206886037353 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00095159170858705 ENSG00000134184:ENST00000369823:exon_110232893_110232988:GSTM1;ENSG00000134184:ENST00000349334:exon_110232893_110232988:GSTM1;ENSG00000134184:ENST00000481931:exon_110232893_110232988:GSTM1;ENSG00000134184:ENST00000476065:exon_110232893_110232988:GSTM1;ENSG00000134184:ENST00000309851:exon_110232893_110232988:GSTM1;ENSG00000134184:ENST00000490983:exon_110232893_110232988:GSTM1;ENSG00000134184:ENST00000495404:exon_110232349_110232988:GSTM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110279701 C/T 1 12 33 45 5.70257400584424 17.3179214839283 -11.6153474780841 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000515225374768275 ENSG00000134202:ENST00000256594:exon_110276554_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000361066:exon_110279124_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000486823:exon_110279552_110279791:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000476321:exon_110279597_110280189:GSTM3;ENSG00000134202:ENST00000488824:exon_110279598_110279791:GSTM3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110466466 T/C 1 9 13 22 4.27693050438318 6.82221149366874 -2.54528098928556 T:C T C 10 0.52478549951298 0.29401621168529 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110466555 G/A 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110466810 C/A 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000184371:ENST00000344188:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000329608:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369802:exon_110465788_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000420111:exon_110466682_110466812:CSF1;ENSG00000184371:ENST00000369801:exon_110466682_110466812:CSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110884493 T/C 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110881128_110884890:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110882058_110884890:RBM15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 110888948 G/A 1 84 65 149 39.9180180409097 34.1110574683437 5.80696057256598 A:G G A 10 0.52478549951298 0.367252834554425 ENSG00000162775:ENST00000369784:exon_110888930_110889299:RBM15;ENSG00000162775:ENST00000487146:exon_110888930_110889299:RBM15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 111992095 C/T 1 15 18 33 7.1282175073053 9.44613899123364 -2.31792148392834 T:C C T 10 0.52478549951298 0.486976610533763 ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 112237974 T/C 1 181 140 321 86.0138245881506 73.4699699318172 12.5438546563334 T:C T C 10 0.52478549951298 0.16285127987565 ENSG00000116473:ENST00000356415:exon_112237963_112238031:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000433097:exon_112237963_112238031:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000369709:exon_112237963_112238031:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000494982:exon_112237963_112238031:RAP1A;ENSG00000116473:ENST00000436150:exon_112237963_112238031:RAP1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 113234410 C/T 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113234287_113234421:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113234287_113234421:MOV10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 113235412 G/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000461226:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000285733:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113235383_113235551:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113235383_113235551:MOV10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 113241052 T/C 1 41 28 69 19.4837945199678 14.6939939863634 4.78980053360438 T:C T C 10 0.52478549951298 0.278617082169861 ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113240909_113241411:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113240909_113242432:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000488160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000482545:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000471160:exon_113240909_113241100:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000490413:exon_113240930_113241100:MOV10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 114438951 A/G 1 31 29 60 14.7316495150976 15.2187794858764 -0.487129970778803 A:G A G 10 0.52478549951298 0.898095848078924 ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 117617973 A/G 1 16 19 35 7.60343200779232 9.97092449074662 -2.3674924829543 A:G A G 10 0.52478549951298 0.499319230855147 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000464062:exon_117617492_117618481:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000470935:exon_117617492_117618066:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000469638:exon_117617917_117618481:TTF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 117629096 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117629039_117629144:TTF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 117635454 T/C 1 23 11 34 10.9299335112015 5.77264049464278 5.15729301655868 T:C T C 10 0.52478549951298 0.086653964090488 ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117635353_117635523:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000492682:exon_117635409_117635523:TTF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 118420655 A/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:C A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196505:ENST00000369443:exon_118420631_118420774:GDAP2;ENSG00000196505:ENST00000491626:exon_118420631_118420774:GDAP2;ENSG00000196505:ENST00000369442:exon_118419844_118420774:GDAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 118483460 C/T 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118483450_118483563:WDR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 118491102 G/A 1 20 10 30 9.5042900097404 5.2478549951298 4.2564350146106 A:G G A 10 0.52478549951298 0.144072345239142 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118491028_118491129:WDR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 118492397 A/G 1 21 19 40 9.97950451022742 9.97092449074662 0.00858001948079945 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118492374_118492459:WDR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 118495153 T/G 1 25 18 43 11.8803625121755 9.44613899123364 2.43422352094186 T:G T G 10 0.52478549951298 0.542022119251048 ENSG00000065183:ENST00000349139:exon_118495151_118495285:WDR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 119575818 C/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 C:G C G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000116874:ENST00000369426:exon_119573839_119576011:WARS2;ENSG00000116874:ENST00000235521:exon_119573844_119575982:WARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 120284423 G/A 1 20 23 43 9.5042900097404 12.0700664887985 -2.56577647905814 A:G G A 10 0.52478549951298 0.449185365641322 ENSG00000092621:ENST00000369409:exon_120284390_120284520:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000369407:exon_120284390_120284520:PHGDH;ENSG00000092621:ENST00000482968:exon_120284390_120284520:PHGDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 144912233 C/T 0 8 0 8 3.80171600389616 0 3.80171600389616 C C 10 0.52478549951298 0.00835333627376926 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 144916676 C/T 0 9 0 9 4.27693050438318 0 4.27693050438318 C C 10 0.52478549951298 0.00425478237298913 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 144916748 C/G 0 11 0 11 5.22735950535722 0 5.22735950535722 C C 10 0.52478549951298 0.00111049814317957 ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144916570_144916749:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000496263:exon_144916705_144916749:PDE4DIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145103947 T/C 0 0 62 62 0 32.5367009698048 -32.5367009698048 C T C 10 0.52478549951298 9.27172220245412e-21 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145109549 G/T 0 0 40 40 0 20.9914199805192 -20.9914199805192 T G T 10 0.52478549951298 1.19011070554681e-13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145109583 C/A 0 0 36 36 0 18.8922779824673 -18.8922779824673 A C A 10 0.52478549951298 2.33361187275172e-12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145109661 G/A 0 93 0 93 44.1949485452929 0 44.1949485452929 G G 10 0.52478549951298 1.38349035882992e-26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145112414 T/C 0 0 57 57 0 29.9127734722399 -29.9127734722399 C T C 10 0.52478549951298 3.82570951128676e-19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145112485 C/T 0 0 92 92 0 48.2802659551942 -48.2802659551942 T C T 10 0.52478549951298 1.87867186882734e-30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 145440096 G/A 1 20 28 48 9.5042900097404 14.6939939863634 -5.18970397662304 A:G G A 10 0.52478549951298 0.149204609872264 ENSG00000117289:ENST00000369317:exon_145440038_145440140:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000425134:exon_145440038_145440140:TXNIP;ENSG00000117289:ENST00000488537:exon_145440038_145440788:TXNIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 149858202 G/A 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000184678:ENST00000369155:exon_149856010_149858232:HIST2H2BE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 149858683 G/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:G G T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000184260:ENST00000331380:exon_149858525_149858961:HIST2H2AC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 150939279 G/A 1 26 35 61 12.3555770126625 18.3674924829543 -6.01191547029178 A:G G A 10 0.52478549951298 0.126152029245052 ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496901:exon_150939232_150939427:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496562:exon_150939272_150939678:LASS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151089888 A/C 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:C A C 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000143458:ENST00000368918:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368917:exon_151089868_151089992:GABPB2;ENSG00000143458:ENST00000368916:exon_151089868_151089992:GABPB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151209063 C/T 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151239051 T/C 1 529 557 1086 251.388470757634 292.30552322873 -40.9170524710963 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.0138216336634168 ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151260087 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151258751_151260882:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151259960_151260882:ZNF687 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151263695 C/G 1 11 26 37 5.22735950535722 13.6444229873375 -8.41706348198026 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00760059208362406 ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151263191_151264381:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000449313:exon_151263191_151264371:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151263191_151264379:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151263191_151264380:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151263191_151264379:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000436614:exon_151263171_151263813:ZNF687 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151315613 G/A 1 24 17 41 11.4051480116885 8.92135349172066 2.48379451996782 A:G G A 10 0.52478549951298 0.532224426849765 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151313116_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151314305_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436637:exon_151315550_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151314436_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151315550_151315654:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151314723_151315654:RFX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151317593 A/C 1 19 23 42 9.02907550925338 12.0700664887985 -3.04099097954516 A:C A C 10 0.52478549951298 0.358529248382525 ENSG00000143390:ENST00000290524:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000368870:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452671:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000452513:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000392746:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000422595:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000450506:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000458484:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000469513:exon_151317582_151317653:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000421986:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000430227:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000435314:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000478564:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000412774:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000437327:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000436271:exon_151317582_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000494217:exon_151317438_151317664:RFX5;ENSG00000143390:ENST00000479681:exon_151317465_151317664:RFX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 151372138 G/A 1 162 177 339 76.9847490788972 92.8870334137975 -15.9022843349002 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0917113224314847 ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 153507176 C/T 1 117 29 146 55.6000965569813 15.2187794858764 40.3813170711049 T:C C T 10 0.52478549951298 5.29952695518377e-12 ENSG00000197956:ENST00000496817:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368719:exon_153507075_153507306:S100A6;ENSG00000197956:ENST00000368720:exon_153507075_153507306:S100A6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 153517172 T/C 1 42 73 115 19.9590090204548 38.3093414644475 -18.3503324439927 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000713735139417276 ENSG00000196154:ENST00000368715:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000481009:exon_153517130_153517573:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000354332:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000468373:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368716:exon_153517130_153517285:S100A4;ENSG00000196154:ENST00000368714:exon_153517130_153517285:S100A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 153920564 A/G 1 98 103 201 46.571021047728 54.0529064498369 -7.48188540210899 A:G A G 10 0.52478549951298 0.322813780591497 ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 153926078 T/C 1 14 15 29 6.65300300681828 7.8717824926947 -1.21877948587642 T:C T C 10 0.52478549951298 0.711956673181561 ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 153947299 A/C 1 604 559 1163 287.02955829416 293.355094227756 -6.3255359335958 A:C A C 10 0.52478549951298 0.72463213300068 ENSG00000143543:ENST00000271843:exon_153946745_153947311:JTB;ENSG00000143543:ENST00000356648:exon_153946988_153947311:JTB;ENSG00000143543:ENST00000368589:exon_153946988_153947311:JTB;ENSG00000143543:ENST00000433648:exon_153946989_153947311:JTB;ENSG00000143543:ENST00000428469:exon_153947158_153947311:JTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154245263 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154744807 C/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154744852 A/G 1 2 9 11 0.95042900097404 4.72306949561682 -3.77264049464278 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0315035899085005 ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154961124 C/T 1 27 20 47 12.8307915131495 10.4957099902596 2.33508152288994 T:C C T 10 0.52478549951298 0.560154563265212 ENSG00000160688:ENST00000368433:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000315144:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368432:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368434:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368431:exon_154959942_154961488:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000292180:exon_154960581_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000405236:exon_154960506_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000295530:exon_154960533_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000368428:exon_154961017_154961325:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000489992:exon_154961061_154961325:FLAD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154965113 G/T 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:G G T 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000160688:ENST00000368434:exon_154965041_154965138:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000405236:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000295530:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000477609:exon_154965041_154965149:FLAD1;ENSG00000160688:ENST00000481758:exon_154965065_154965262:FLAD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154987526 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000487542:exon_154987131_154987785:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154987131_154988290:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154986924_154988290:ZBTB7B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 154988957 A/G 1 15 5 20 7.1282175073053 2.6239274975649 4.5042900097404 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0463202879236955 ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 155033921 C/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155033891_155034234:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155033891_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000498481:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461234:exon_155033894_155033965:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000462116:exon_155033891_155033922:ADAM15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 155630513 G/A 1 38 39 77 18.0581510185068 20.4666344810062 -2.40848346249946 A:G G A 10 0.52478549951298 0.648423663828661 ENSG00000163374:ENST00000359205:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000355499:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000311573:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000347088:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361831:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368340:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000295566:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000436865:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000354691:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000442834:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368330:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000407221:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000404643:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361140:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368339:exon_155629248_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000405763:exon_155630508_155631214:YY1AP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 155823354 A/G 1 7 12 19 3.32650150340914 6.29742599415576 -2.97092449074662 A:G A G 10 0.52478549951298 0.250216318185529 ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155823067_155823597:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155823067_155823597:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155823067_155823597:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155823067_155823597:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155823067_155823597:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368327:exon_155823067_155823597:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000488251:exon_155823067_155823600:GON4L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156263873 G/A 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:G G A 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156263940 T/C 1 6 13 19 2.85128700292212 6.82221149366874 -3.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.105409046642838 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156264000 G/A 1 26 21 47 12.3555770126625 11.0204954897726 1.33508152288994 A:G G A 10 0.52478549951298 0.770925037755545 ENSG00000198715:ENST00000362007:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000476177:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000497955:exon_156263175_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000368264:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000479084:exon_156263809_156264027:C1orf85;ENSG00000198715:ENST00000484214:exon_156263408_156264027:C1orf85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156450719 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156561651 G/C 1 36 91 127 17.1077220175327 47.7554804556812 -30.6477584381485 C:G G C 10 0.52478549951298 5.47817318012701e-08 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156561555_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156561554_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156561554_156561778:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368233:exon_156561570_156561778:APOA1BP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156563726 A/C 1 254 259 513 120.704483123703 135.919444373862 -15.2149612501588 A:C A C 10 0.52478549951298 0.184860473730916 ENSG00000163382:ENST00000446584:exon_156563674_156563926:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368234:exon_156563674_156563923:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000368235:exon_156563674_156564091:APOA1BP;ENSG00000163382:ENST00000488840:exon_156563674_156563921:APOA1BP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156571243 G/C 1 5 26 31 2.3760725024351 13.6444229873375 -11.2683504849024 C:G G C 10 0.52478549951298 3.98371872537109e-05 ENSG00000160818:ENST00000368232:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368231:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000368229:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000438976:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000415314:exon_156571201_156571282:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000463513:exon_156571201_156571254:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000473910:exon_156571201_156571263:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531129:exon_156571201_156571271:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000474904:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000498756:exon_156571201_156571258:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000506832:exon_156571201_156571271:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000527691:exon_156571201_156571288:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000334588:exon_156571201_156571275:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000531900:exon_156571201_156571262:GPATCH4;ENSG00000160818:ENST00000525375:exon_156571201_156571271:GPATCH4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156756739 C/G 1 59 72 131 28.0376555287342 37.7845559649346 -9.74690043620038 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0964419311370872 ENSG00000143294:ENST00000491853:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000353233:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000271526:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000473387:exon_156756400_156756772:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000368201:exon_156756400_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000526188:exon_156756667_156756966:PRCC;ENSG00000143294:ENST00000454659:exon_156756683_156756966:PRCC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 156784982 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000027869:ENST00000368199:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000368198:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000392306:exon_156784829_156785013:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000486350:exon_156784829_156785203:SH2D2A;ENSG00000027869:ENST00000495306:exon_156784290_156785013:SH2D2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 157494106 C/T 1 12 4 16 5.70257400584424 2.09914199805192 3.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.082551923143294 ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 158911792 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163564:ENST00000368140:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000368138:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000392254:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000392252:exon_158911767_158912189:PYHIN1;ENSG00000163564:ENST00000485134:exon_158911767_158912189:PYHIN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159002377 C/A 1 99 93 192 47.046235548215 48.8050514547071 -1.75881590649217 A:C C A 10 0.52478549951298 0.82853759282323 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159002389 T/A 1 87 79 166 41.3436615423707 41.4580544615254 -0.114392919154682 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159002314_159002481:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159002314_159002481:IFI16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159024668 A/T 1 869 790 1659 412.96140092322 414.580544615254 -1.61914369203384 A:T:C:G A T 10 0.52478549951298 0.941225221146802 ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_159024611_159024945:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_159024611_159024941:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_159024611_159024938:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000448393:exon_159024611_159024918:IFI16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159175354 G/A 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G G A 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000213088:ENST00000368122:exon_159175251_159176290:DARC;ENSG00000213088:ENST00000359381:exon_159175251_159176288:DARC;ENSG00000213088:ENST00000435307:exon_159175201_159175688:DARC;ENSG00000213088:ENST00000368121:exon_159175049_159176288:DARC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159850401 C/G 1 1 9 10 0.47521450048702 4.72306949561682 -4.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0086577597267804 ENSG00000213085:ENST00000426543:exon_159850344_159850490:CCDC19;ENSG00000213085:ENST00000368099:exon_159850344_159850490:CCDC19;ENSG00000213085:ENST00000476696:exon_159850344_159850490:CCDC19;ENSG00000213085:ENST00000475911:exon_159850344_159850490:CCDC19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159889105 T/C 1 274 206 480 130.208773133443 108.105812899674 22.1029602337696 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.0443688996734838 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159889064_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159889064_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159888541_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159889064_159889166:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159889064_159889166:TAGLN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 159889605 A/G 1 673 723 1396 319.819358827764 379.419916147885 -59.6005573201201 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00142434842894681 ENSG00000158710:ENST00000368097:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000368096:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000478033:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000320307:exon_159889451_159889625:TAGLN2;ENSG00000158710:ENST00000397334:exon_159889451_159889625:TAGLN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 160318835 G/A 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000162736:ENST00000368065:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000437169:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000421914:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000438008:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000467837:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000491332:exon_160318789_160318912:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160318789_160318912:NCSTN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 160321065 A/G 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:G A G 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000162736:ENST00000368067:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000294785:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000368063:exon_160321012_160321162:NCSTN;ENSG00000162736:ENST00000392212:exon_160321012_160321162:NCSTN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 160654715 C/T 1 1713 1254 2967 814.042439334265 658.081016389277 155.961422944988 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 9.4791933255368e-09 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 160654786 G/A 1 1152 542 1694 547.447104561047 284.433740736035 263.013363825012 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 2.29647531492388e-38 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 160654792 C/T 1 1147 590 1737 545.071032058612 309.623444712658 235.447587345954 T:C C T 10 0.52478549951298 2.9023171217457e-30 ENSG00000117091:ENST00000368046:exon_160654677_160654979:CD48;ENSG00000117091:ENST00000368045:exon_160653309_160654979:CD48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 160969985 C/T 1 27 10 37 12.8307915131495 5.2478549951298 7.58293651801974 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0132291508311839 ENSG00000158769:ENST00000368026:exon_160969936_160970138:F11R;ENSG00000158769:ENST00000436182:exon_160969936_160970138:F11R;ENSG00000158769:ENST00000335772:exon_160969936_160970138:F11R;ENSG00000158769:ENST00000289779:exon_160969936_160970138:F11R;ENSG00000158769:ENST00000472573:exon_160969936_160970138:F11R;ENSG00000158769:ENST00000470694:exon_160969936_160970138:F11R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161070042 C/T 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000162755:ENST00000490724:exon_161069851_161070088:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000469647:exon_161069851_161070133:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000452810:exon_161069851_161070134:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000368011:exon_161069851_161070136:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000392192:exon_161069851_161070136:KLHDC9;ENSG00000162755:ENST00000475934:exon_161069851_161070136:KLHDC9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161183516 C/T 1 218 206 424 103.59676110617 108.105812899674 -4.50905179350355 T:C C T 10 0.52478549951298 0.662041772232802 ENSG00000158864:ENST00000367993:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000392179:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000483804:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000465923:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000493849:exon_161183439_161184086:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000468828:exon_161183439_161183522:NDUFS2;ENSG00000158864:ENST00000492153:exon_161183439_161183522:NDUFS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161681775 C/T 1 117 89 206 55.6000965569813 46.7059094566552 8.89418710032611 T:C C T 10 0.52478549951298 0.235646473517408 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161683136 G/A 1 236 258 494 112.150622114937 135.394658874349 -23.2440367594122 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0381959372593565 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161683155 G/C 1 263 227 490 124.981413628086 119.126308389446 5.85510523863978 C:G G C 10 0.52478549951298 0.61889233293781 ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367949:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000350710:exon_161682875_161684141:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161682875_161683242:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161682875_161683258:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161682875_161684138:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367950:exon_161682875_161683495:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161682875_161684142:FCRLA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161721707 C/T 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161722204 C/T 1 14 22 36 6.65300300681828 11.5452809892856 -4.89227798246728 T:C C T 10 0.52478549951298 0.132227924925165 ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 161928327 A/G 1 80 50 130 38.0171600389616 26.239274975649 11.7778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0431422922612507 ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161928236_161933860:ATF6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 163306602 A/G 1 19 10 29 9.02907550925338 5.2478549951298 3.78122051412358 A:G A G 10 0.52478549951298 0.193868828897936 ENSG00000143228:ENST00000450453:exon_163306541_163306638:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163306541_163306638:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163306541_163306638:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163306541_163306638:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163306541_163306638:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000490881:exon_163306541_163306638:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163306541_163306638:NUF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 163309219 A/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:T A T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000143228:ENST00000524800:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000442820:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000367900:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000271452:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000497990:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527439:exon_163309171_163309267:NUF2;ENSG00000143228:ENST00000527120:exon_163309071_163309267:NUF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 165652273 A/G 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:G A G 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000143149:ENST00000354775:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000461664:exon_165652218_165652347:ALDH9A1;ENSG00000143149:ENST00000471457:exon_165652062_165652347:ALDH9A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 166826773 C/T 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166825747_166826956:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166825747_166826956:TADA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 167893759 G/A 1 53 56 109 25.1863685258121 29.3879879727269 -4.20161944691483 A:G G A 10 0.52478549951298 0.443751511040263 ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 171486912 G/A 1 41 46 87 19.4837945199678 24.1401329775971 -4.65633845762926 A:G G A 10 0.52478549951298 0.335215396611133 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000476522:exon_171486730_171486953:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171486730_171486953:BAT2L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 171509150 T/C 1 28 36 64 13.3060060136366 18.8922779824673 -5.58627196883072 T:C T C 10 0.52478549951298 0.170295695006267 ENSG00000117523:ENST00000392078:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000392080:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000451306:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000338920:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000345788:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000426496:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000367742:exon_171509110_171511368:BAT2L2;ENSG00000117523:ENST00000483654:exon_171509110_171511368:BAT2L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 171751236 T/C 1 19 25 44 9.02907550925338 13.1196374878245 -4.09056197857112 T:C T C 10 0.52478549951298 0.230158067512139 ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 173835758 C/A 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:C C A 10 0.52478549951298 0.554344236023915 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 174188285 G/A 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 174979089 T/C 1 58 104 162 27.5624410282472 54.5776919493499 -27.0152509211028 T:C T C 10 0.52478549951298 2.60813951464277e-05 ENSG00000116161:ENST00000367681:exon_174979059_174980851:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000367679:exon_174979059_174980846:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000450101:exon_174979059_174979499:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000392063:exon_174979059_174979499:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000405362:exon_174979059_174979215:CACYBP;ENSG00000116161:ENST00000425017:exon_174979059_174979215:CACYBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 179312752 C/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179312725_179312770:SOAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 180062215 T/C 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000135837:ENST00000367607:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000419991:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000429851:exon_180061749_180063751:CEP350;ENSG00000135837:ENST00000490141:exon_180061749_180063751:CEP350 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 180165814 A/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G A G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000116260:ENST00000367602:exon_180165397_180173165:QSOX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 181019202 C/T 1 21 19 40 9.97950451022742 9.97092449074662 0.00858001948079945 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181019147_181019481:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181019147_181020409:MR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 181019253 T/C 1 21 27 48 9.97950451022742 14.1692084868505 -4.18970397662304 T:C T C 10 0.52478549951298 0.249094896965865 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000434571:exon_181019147_181019481:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181019147_181019422:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367578:exon_181019147_181020409:MR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 181024404 G/A 1 43 26 69 20.4342235209419 13.6444229873375 6.78980053360438 A:G G A 10 0.52478549951298 0.116972609272295 ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 182356399 A/G 1 15 26 41 7.1282175073053 13.6444229873375 -6.51620548003218 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0432244494510204 ENSG00000135821:ENST00000331872:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000417584:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000311223:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000435013:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000339526:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000491322:exon_182352029_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000484996:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000489818:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000475808:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000480604:exon_182356266_182356427:GLUL;ENSG00000135821:ENST00000462444:exon_182355910_182356427:GLUL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 182571117 C/T 1 41 35 76 19.4837945199678 18.3674924829543 1.11630203701352 T:C C T 10 0.52478549951298 0.819289086785524 ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182571101_182571267:RGS16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 182844020 C/T 1 43 33 76 20.4342235209419 17.3179214839283 3.11630203701352 T:C C T 10 0.52478549951298 0.492876962361058 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 182845346 C/T 1 34 26 60 16.1572930165587 13.6444229873375 2.5128700292212 T:C C T 10 0.52478549951298 0.605508409828295 ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182845185_182845398:DHX9;ENSG00000135829:ENST00000490519:exon_182845264_182845398:DHX9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 183101582 A/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183101535_183101672:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183101535_183101672:LAMC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 183101625 G/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183101535_183101672:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000478064:exon_183101535_183101672:LAMC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 184764681 G/A 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G G A 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 184764964 G/A 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 184765072 A/G 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 184801065 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184800981_184801096:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000461167:exon_184800981_184801096:FAM129A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 185267114 A/G 1 56 77 133 26.6120120272731 40.4084834624995 -13.7964714352263 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0188243770265361 ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 197070464 T/C 1 15 6 21 7.1282175073053 3.14871299707788 3.97950451022742 T:C T C 10 0.52478549951298 0.124172620753308 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000445725:exon_197069561_197070645:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 197070815 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 197071028 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 200618238 T/C 1 24 32 56 11.4051480116885 16.7931359844154 -5.38798797272688 T:C T C 10 0.52478549951298 0.180562152400288 ENSG00000118197:ENST00000447706:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000452560:exon_200618202_200618277:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000413408:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367349:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367348:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000367346:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000331314:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000429498:exon_200618202_200618354:DDX59;ENSG00000118197:ENST00000433235:exon_200618202_200618354:DDX59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 201112981 A/G 1 16 16 32 7.60343200779232 8.39656799220768 -0.793135984415361 A:G A G 10 0.52478549951298 0.860157258043716 ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 201437477 A/T 1 32 25 57 15.2068640155846 13.1196374878245 2.08722652776014 A:T A T 10 0.52478549951298 0.598604585441619 ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 201969035 G/A 1 9 26 35 4.27693050438318 13.6444229873375 -9.3674924829543 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00189683142179771 ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000479726:exon_201969030_201969073:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 202104616 T/C 1 23 26 49 10.9299335112015 13.6444229873375 -2.71448947613602 T:C T C 10 0.52478549951298 0.476141911014325 ENSG00000143862:ENST00000272217:exon_202104587_202104654:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000491358:exon_202104587_202104736:ARL8A;ENSG00000143862:ENST00000486225:exon_202104587_202104928:ARL8A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 202710776 C/T 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000117139:ENST00000367265:exon_202710495_202710850:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000367264:exon_202710495_202710850:KDM5B;ENSG00000117139:ENST00000235790:exon_202710495_202710850:KDM5B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 202917539 C/G 1 25 20 45 11.8803625121755 10.4957099902596 1.3846525219159 C:G C G 10 0.52478549951298 0.765903037098423 ENSG00000159346:ENST00000340990:exon_202917432_202917548:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000436244:exon_202917432_202917548:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000417068:exon_202917432_202917548:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000367254:exon_202917432_202917548:ADIPOR1;ENSG00000159346:ENST00000426229:exon_202917432_202917548:ADIPOR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 205589237 C/T 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 205589574 C/T 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C C T 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 206648378 G/A 1 18 18 36 8.55386100876636 9.44613899123364 -0.892277982467281 A:G G A 10 0.52478549951298 0.86782438382635 ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206648208_206648471:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000476449:exon_206648298_206648478:IKBKE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 206765173 C/A 1 159 152 311 75.5591055774362 79.767395925973 -4.20829034853679 A:C C A 10 0.52478549951298 0.649907925021613 ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206764974_206765177:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206764977_206765177:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206764977_206765177:LGTN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 206905043 C/T 1 38 37 75 18.0581510185068 19.4170634819803 -1.3589124634735 T:C C T 10 0.52478549951298 0.817395817470756 ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 209936914 C/T 1 17 13 30 8.07864650827934 6.82221149366874 1.2564350146106 T:C C T 10 0.52478549951298 0.716625660711107 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 209950760 C/G 1 60 70 130 28.5128700292212 36.7349849659086 -8.2221149366874 C:G C G 10 0.52478549951298 0.160220135224722 ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 210024673 A/G 1 22 21 43 10.4547190107144 11.0204954897726 -0.56577647905814 A:G A G 10 0.52478549951298 0.879800319218863 ENSG00000117597:ENST00000491415:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000504913:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000521799:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000532360:exon_210024549_210025558:C1orf107;ENSG00000117597:ENST00000367020:exon_210024549_210030910:C1orf107 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 212273639 C/T 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 T:C C T 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 212538572 C/T 1 33 34 67 15.6820785160717 17.8427069834413 -2.16062846736966 T:C C T 10 0.52478549951298 0.626003226995912 ENSG00000065600:ENST00000261455:exon_212537273_212538718:TMEM206 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 212560300 A/G 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G A G 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000065600:ENST00000261455:exon_212560233_212560442:TMEM206;ENSG00000065600:ENST00000467822:exon_212560233_212560442:TMEM206;ENSG00000065600:ENST00000471937:exon_212560233_212560442:TMEM206 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 212619375 G/A 1 226 201 427 107.398477110067 105.481885402109 1.91659170795752 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.884455587403194 ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214813487 A/G 1 22 12 34 10.4547190107144 6.29742599415576 4.15729301655868 A:G A G 10 0.52478549951298 0.171759996829177 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214814778 G/A 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 A:G G A 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214814804 A/G 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214815116 A/T 1 10 2 12 4.7521450048702 1.04957099902596 3.70257400584424 A:T A T 10 0.52478549951298 0.0413560448537132 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214818021 A/G 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 A:G A G 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214818232 A/G 1 16 11 27 7.60343200779232 5.77264049464278 1.83079151314954 A:G A G 10 0.52478549951298 0.5651214206051 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 214820666 G/A 1 29 30 59 13.7812205141236 15.7435649853894 -1.96234447126582 A:G G A 10 0.52478549951298 0.696115773062589 ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 217604492 C/T 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C C T 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217600334_217604707:GPATCH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 217604495 A/G 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:G A G 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217600334_217604707:GPATCH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 217787511 T/C 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000092978:ENST00000366935:exon_217787483_217787544:GPATCH2;ENSG00000092978:ENST00000366934:exon_217787483_217787544:GPATCH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 218458672 C/T 1 20 14 34 9.5042900097404 7.34699699318172 2.15729301655868 T:C C T 10 0.52478549951298 0.496104598259199 ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 220154768 C/T 1 32 45 77 15.2068640155846 23.6153474780841 -8.40848346249946 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0672691723424001 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220154720_220154799:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220154720_220154799:EPRS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 220156729 C/T 1 112 107 219 53.2240240545462 56.1520484478889 -2.92802439334263 T:C C T 10 0.52478549951298 0.735239684976027 ENSG00000136628:ENST00000366923:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000435048:exon_220156531_220156740:EPRS;ENSG00000136628:ENST00000485821:exon_220156531_220156740:EPRS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 220356252 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000118873:ENST00000358951:exon_220356060_220356273:RAB3GAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 224345455 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000143756:ENST00000366862:exon_224345054_224349749:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000424254:exon_224345054_224345852:FBXO28;ENSG00000143756:ENST00000523990:exon_224345054_224345884:FBXO28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 224544665 T/C 1 26 20 46 12.3555770126625 10.4957099902596 1.85986702240292 T:C T C 10 0.52478549951298 0.658707192376296 ENSG00000143771:ENST00000465271:exon_224544552_224544695:CNIH4;ENSG00000143771:ENST00000366858:exon_224544560_224544695:CNIH4;ENSG00000143771:ENST00000366857:exon_224544573_224544695:CNIH4;ENSG00000143771:ENST00000366860:exon_224544589_224544695:CNIH4;ENSG00000143771:ENST00000468318:exon_224544590_224544770:CNIH4;ENSG00000143771:ENST00000366856:exon_224544595_224544695:CNIH4;ENSG00000143771:ENST00000477413:exon_224544623_224545314:CNIH4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 225600169 C/T 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225600156_225600347:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225600156_225600347:LBR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 225607144 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000143815:ENST00000272163:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000338179:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000458267:exon_225606965_225607154:LBR;ENSG00000143815:ENST00000425080:exon_225606965_225607154:LBR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 226032928 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000143819:ENST00000272167:exon_226032847_226033260:EPHX1;ENSG00000143819:ENST00000366837:exon_226032847_226033260:EPHX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 226175743 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000143751:ENST00000272091:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366818:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366817:exon_226175597_226176089:C1orf55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 226352498 T/G 1 4 14 18 1.90085800194808 7.34699699318172 -5.44613899123364 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0157704497564806 ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 226923264 G/A 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 227172290 C/T 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227172249_227172356:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227172249_227172356:ADCK3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 227174210 T/C 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000163050:ENST00000366779:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366778:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366777:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366776:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000478406:exon_227174154_227175244:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000458507:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000446154:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000433743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000366775:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000442168:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000405743:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000455944:exon_227174154_227175246:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000485462:exon_227174154_227175245:ADCK3;ENSG00000163050:ENST00000479852:exon_227174154_227175245:ADCK3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 227935762 G/A 1 19 11 30 9.02907550925338 5.77264049464278 3.2564350146106 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274640281251531 ENSG00000143740:ENST00000475930:exon_227935393_227935887:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000366759:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000426344:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000315781:exon_227935393_227935934:SNAP47;ENSG00000143740:ENST00000470038:exon_227935393_227935816:SNAP47 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 229730782 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000135801:ENST00000366676:exon_229728858_229730841:TAF5L;ENSG00000135801:ENST00000258281:exon_229728868_229730841:TAF5L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 229772693 T/G 1 10 3 13 4.7521450048702 1.57435649853894 3.17778850633126 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0974345402312698 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 229773368 C/T 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C C T 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229770664_229773994:URB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 229790048 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135763:ENST00000258243:exon_229789996_229790135:URB2;ENSG00000135763:ENST00000434387:exon_229789996_229790135:URB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 230379080 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000143641:ENST00000494106:exon_230379052_230379173:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230379052_230379173:GALNT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 230415212 C/T 1 31 20 51 14.7316495150976 10.4957099902596 4.23593952483802 T:C C T 10 0.52478549951298 0.263293667381194 ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230415049_230417870:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230415049_230417866:GALNT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 231042732 T/A 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:T T A 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000143643:ENST00000366661:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000366662:exon_231041989_231042765:TTC13;ENSG00000143643:ENST00000414259:exon_231041990_231042765:TTC13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 231377081 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231376919_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000436239:exon_231376953_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231376956_231377202:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231376962_231377202:GNPAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 231406707 G/A 1 40 26 66 19.0085800194808 13.6444229873375 5.36415703214332 A:G G A 10 0.52478549951298 0.217796243788989 ENSG00000116906:ENST00000366646:exon_231406504_231406746:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000366647:exon_231406504_231406746:GNPAT;ENSG00000116906:ENST00000416000:exon_231406504_231406746:GNPAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 231700659 C/T 1 21 18 39 9.97950451022742 9.44613899123364 0.533365518993779 T:C C T 10 0.52478549951298 0.874424081275866 ENSG00000116918:ENST00000366639:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000420593:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000475168:exon_231700274_231702270:TSNAX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 231700685 G/A 1 22 19 41 10.4547190107144 9.97092449074662 0.48379451996782 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000116918:ENST00000366639:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000420593:exon_231700274_231702270:TSNAX;ENSG00000116918:ENST00000475168:exon_231700274_231702270:TSNAX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 233091357 G/C 1 36 25 61 17.1077220175327 13.1196374878245 3.98808452970822 C:G G C 10 0.52478549951298 0.369675483332825 ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233091303_233091465:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000479125:exon_233091303_233091465:C1orf57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 234509586 G/A 1 17 2 19 8.07864650827934 1.04957099902596 7.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000925014473806806 ENSG00000168275:ENST00000366613:exon_234509429_234509586:C1orf31;ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 234546245 C/T 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000481183:exon_234546191_234546277:TARBP1;ENSG00000059588:ENST00000463793:exon_234546150_234546277:TARBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 234565029 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000059588:ENST00000040877:exon_234564882_234565070:TARBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 234744413 C/A 1 20 16 36 9.5042900097404 8.39656799220768 1.10772201753272 A:C C A 10 0.52478549951298 0.741484551221566 ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235295250 G/C 1 283 272 555 134.485703637827 142.741655867531 -8.25595222970392 C:G G C 10 0.52478549951298 0.496617179890346 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235294498_235295312:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235294950_235295312:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000495224:exon_235294964_235295312:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235294981_235295312:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235294981_235295312:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235294982_235295312:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235294949_235295312:ARID4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235324298 T/C 1 51 45 96 24.235939524838 23.6153474780841 0.620592046753917 T:C T C 10 0.52478549951298 0.91895189361173 ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235392546 T/C 1 17 15 32 8.07864650827934 7.8717824926947 0.206864015584639 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000418304:exon_235392546_235392700:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000466653:exon_235391626_235392700:ARID4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235594073 T/C 1 1 10 11 0.47521450048702 5.2478549951298 -4.77264049464278 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00450105750233496 ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000482230:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235594020_235594119:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000461651:exon_235594020_235594119:TBCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235599869 G/A 1 14 17 31 6.65300300681828 8.92135349172066 -2.26835048490238 A:G G A 10 0.52478549951298 0.473822628331597 ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235599859_235599923:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235599859_235599923:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235599859_235599923:TBCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235600741 A/G 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G A G 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235600637_235600789:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235600637_235600789:TBCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 235602193 A/G 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 A:G A G 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000116957:ENST00000366601:exon_235602084_235602237:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000406207:exon_235602084_235602237:TBCE;ENSG00000116957:ENST00000472011:exon_235602084_235602237:TBCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 236347224 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 236413230 T/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:T T A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000086619:ENST00000354619:exon_236413185_236413267:ERO1LB;ENSG00000086619:ENST00000366589:exon_236413185_236413267:ERO1LB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 236729956 T/C 1 11 14 25 5.22735950535722 7.34699699318172 -2.1196374878245 T:C T C 10 0.52478549951298 0.428503043615975 ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236729946_236730176:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236729946_236730176:HEATR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 237058744 C/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:C C A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 237058828 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000116984:ENST00000417743:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366577:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000366576:exon_237058658_237058850:MTR;ENSG00000116984:ENST00000470570:exon_237057641_237058850:MTR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 241663789 G/A 1 346 304 650 164.424217168509 159.534791851946 4.88942531656298 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.723800122083856 ENSG00000091483:ENST00000366560:exon_241663737_241663890:FH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 241695792 T/C 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241695434_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241695434_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241695638_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241695669_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241695679_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000477907:exon_241695701_241695798:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241695705_241695798:KMO HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 241712134 C/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000117009:ENST00000366559:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366558:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484628:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000480967:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000484229:exon_241712129_241712198:KMO;ENSG00000117009:ENST00000366557:exon_241712129_241712198:KMO HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 242035433 C/A 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242035334_242035580:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242035334_242035580:EXO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 242042169 C/G 1 24 23 47 11.4051480116885 12.0700664887985 -0.664918477110062 C:G C G 10 0.52478549951298 0.884555302742298 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 242045275 C/T 1 18 14 32 8.55386100876636 7.34699699318172 1.20686401558464 T:C C T 10 0.52478549951298 0.725609418966872 ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242045218_242045319:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242045218_242045319:EXO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 245850506 G/C 1 14 3 17 6.65300300681828 1.57435649853894 5.07864650827934 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0145303079071958 ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 246755124 T/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000162852:ENST00000483271:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366513:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366512:exon_246754814_246755243:CNST;ENSG00000162852:ENST00000366511:exon_246754814_246755243:CNST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 247163303 C/T 0 0 8 8 0 4.19828399610384 -4.19828399610384 T C T 10 0.52478549951298 0.00260086297581477 ENSG00000135747:ENST00000465049:exon_247163250_247163376:ZNF670;ENSG00000135747:ENST00000474541:exon_247163250_247163376:ZNF670;ENSG00000197472:ENST00000479214:exon_247163250_247163376:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000366504:exon_247163214_247163376:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000491337:exon_247163214_247163376:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000487338:exon_247163214_247163376:ZNF695;ENSG00000197472:ENST00000339986:exon_247163214_247163376:ZNF695 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 1 248756474 A/G 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000184022:ENST00000330500:exon_248756131_248757069:OR2T10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 294953 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000015171:ENST00000509513:exon_294843_295201:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000397962:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381607:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000309776:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381604:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381602:exon_294843_295201:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000397959:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381591:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000403354:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000402736:exon_294843_295028:ZMYND11;ENSG00000015171:ENST00000381584:exon_294843_295028:ZMYND11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 858836 G/A 1 22 11 33 10.4547190107144 5.77264049464278 4.68207851607166 A:G G A 10 0.52478549951298 0.117715879400695 ENSG00000107929:ENST00000316157:exon_855484_859153:LARP4B;ENSG00000107929:ENST00000448368:exon_858446_859153:LARP4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 1088565 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000067064:ENST00000427898:exon_1088489_1088702:IDI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3155620 A/G 1 53 50 103 25.1863685258121 26.239274975649 -1.05290644983695 A:G A G 10 0.52478549951298 0.844238598016007 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3172121 C/T 1 83 64 147 39.4428035404227 33.5862719688307 5.85653157159194 T:C C T 10 0.52478549951298 0.363894223848294 ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3172011_3172175:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000413079:exon_3172011_3172133:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3171199_3172175:PFKP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3180298 C/T 1 30 26 56 14.2564350146106 13.6444229873375 0.612012027273117 T:C C T 10 0.52478549951298 0.894356796392045 ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3189380 C/T 1 12 17 29 5.70257400584424 8.92135349172066 -3.21877948587642 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.266653493804166 ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3193452 G/A 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3193439_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3193439_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3193439_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3193439_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3193439_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3193439_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3193368_3193555:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3193386_3193555:PITRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3212304 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3212296_3212398:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3212296_3212398:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3212296_3212398:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3212296_3212398:PITRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 3823894 G/A 1 24 18 42 11.4051480116885 9.44613899123364 1.95900902045484 A:G G A 10 0.52478549951298 0.643618900836449 ENSG00000067082:ENST00000497571:exon_3823833_3824406:KLF6;ENSG00000067082:ENST00000469435:exon_3822519_3824406:KLF6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 5920121 T/C 1 17 22 39 8.07864650827934 11.5452809892856 -3.46663448100622 T:C T C 10 0.52478549951298 0.336181221409151 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 5920244 T/C 1 27 25 52 12.8307915131495 13.1196374878245 -0.288845974674963 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000134461:ENST00000380094:exon_5920060_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000463862:exon_5920025_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000380092:exon_5920050_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000437663:exon_5920053_5920250:ANKRD16;ENSG00000134461:ENST00000191063:exon_5920085_5920250:ANKRD16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 5979117 T/C 1 55 39 94 26.1367975267861 20.4666344810062 5.67016304577988 T:C T C 10 0.52478549951298 0.257050670226230 ENSG00000134452:ENST00000362091:exon_5979073_5979556:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000397269:exon_5979073_5979555:FBXO18;ENSG00000134452:ENST00000379999:exon_5979073_5979556:FBXO18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 7841138 A/G 1 430 423 853 204.342235209419 221.984266293991 -17.642031084572 A:C:G A G 10 0.52478549951298 0.230306629488087 ENSG00000165629:ENST00000356708:exon_7840953_7841157:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000493053:exon_7840953_7841157:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000335698:exon_7840953_7841157:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000460820:exon_7840953_7841157:ATP5C1;ENSG00000165629:ENST00000472202:exon_7840953_7841513:ATP5C1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 8006798 A/G 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 A:G A G 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000165632:ENST00000344293:exon_8005883_8007705:TAF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 12071397 G/A 1 57 58 115 27.0872265277601 30.4375589717528 -3.35033244399271 A:G G A 10 0.52478549951298 0.575646877359685 ENSG00000151461:ENST00000356352:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000357604:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000379172:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313999:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000397053:exon_12070744_12071523:UPF2;ENSG00000151461:ENST00000313977:exon_12070744_12071523:UPF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 12259410 C/T 1 87 63 150 41.3436615423707 33.0614864693177 8.282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.191005511092787 ENSG00000151465:ENST00000429258:exon_12259360_12259466:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12259360_12259466:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12259360_12259466:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000442050:exon_12259360_12259466:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12259360_12259466:CDC123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 12292286 C/G 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000151465:ENST00000497963:exon_12291580_12292318:CDC123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 13154485 C/A 1 109 94 203 51.7983805530852 49.3298369542201 2.46854359886505 A:C:G C A 10 0.52478549951298 0.778728794361801 ENSG00000123240:ENST00000263036:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378764:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000396951:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000482140:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378757:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000430081:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378752:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378748:exon_13154453_13154635:OPTN;ENSG00000123240:ENST00000378747:exon_13154453_13154635:OPTN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 13322989 C/T 1 8 16 24 3.80171600389616 8.39656799220768 -4.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0674167221169488 ENSG00000107537:ENST00000396913:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000263038:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000378659:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000437577:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000396920:exon_13322976_13323110:PHYH;ENSG00000107537:ENST00000534344:exon_13322976_13323110:PHYH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 13653653 A/G 1 12 25 37 5.70257400584424 13.1196374878245 -7.41706348198026 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0199865293761962 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 13658436 G/A 1 24 18 42 11.4051480116885 9.44613899123364 1.95900902045484 A:G G A 10 0.52478549951298 0.643618900836449 ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13658398_13658553:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000298451:exon_13658398_13658553:PRPF18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 13708245 G/A 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13708097_13708325:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13708224_13708325:FRMD4A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 13735947 A/G 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 A:G A G 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000151474:ENST00000358621:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378502:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000357447:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000378503:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000264546:exon_13735898_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 15145855 C/G 1 63 67 130 29.9385135306823 35.1606284673697 -5.2221149366874 C:G C G 10 0.52478549951298 0.38043183776844 ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 16547058 A/G 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:G A G 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000165983:ENST00000343656:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000378000:exon_16547019_16547159:PTER;ENSG00000165983:ENST00000298942:exon_16547019_16547159:PTER HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 16794635 G/A 1 24 23 47 11.4051480116885 12.0700664887985 -0.664918477110062 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.884555302742298 ENSG00000148484:ENST00000345264:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377921:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000396726:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000464074:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377911:exon_16794538_16794652:RSU1;ENSG00000148484:ENST00000377903:exon_16794533_16794652:RSU1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 24813417 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000120549:ENST00000376462:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376456:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376452:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000447159:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000458595:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000323059:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000450158:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000442879:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376454:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000430453:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000438429:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000307544:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396445:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000376451:exon_24813252_24813693:KIAA1217;ENSG00000120549:ENST00000396446:exon_24813252_24813693:KIAA1217 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 26855907 C/T 1 40 54 94 19.0085800194808 28.3384169737009 -9.32983695422012 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.0626400587201122 ENSG00000077420:ENST00000445780:exon_26855890_26856057:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000376236:exon_26855890_26856732:APBB1IP;ENSG00000077420:ENST00000493857:exon_26855890_26856155:APBB1IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 27037496 A/G 1 99 55 154 47.046235548215 28.8632024732139 18.1830330750011 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00357242941833808 ENSG00000136754:ENST00000376138:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376170:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376166:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376160:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376142:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000359188:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376139:exon_27035522_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000346832:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376134:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000355394:exon_27035525_27037674:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376137:exon_27035525_27037674:ABI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 27057906 A/G 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000136754:ENST00000376138:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376170:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376166:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376160:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376142:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000359188:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376139:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000346832:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376134:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000355394:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376137:exon_27057781_27057921:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376140:exon_27057781_27057921:ABI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 27059237 G/A 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000136754:ENST00000376138:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376170:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376166:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376160:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376142:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000359188:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376139:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000346832:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376134:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000355394:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376137:exon_27059174_27059274:ABI1;ENSG00000136754:ENST00000376140:exon_27059174_27059274:ABI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 27306508 G/C 1 8 12 20 3.80171600389616 6.29742599415576 -2.4957099902596 C:G G C 10 0.52478549951298 0.273886654959245 ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27306431_27306721:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27306431_27306721:ANKRD26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 27403528 A/G 1 114 129 243 54.1744530555203 67.6973294371744 -13.5228763816542 A:G A G 10 0.52478549951298 0.083251043862526 ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27403450_27403536:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27403450_27403536:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27403450_27403536:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27403450_27403536:YME1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 30629254 C/T 1 26 32 58 12.3555770126625 16.7931359844154 -4.43755897175284 T:C C T 10 0.52478549951298 0.292886124584315 ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 32573963 T/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000479380:exon_32573626_32573978:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32570787_32575943:EPC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 35302705 C/T 1 43 38 81 20.4342235209419 19.9418489814932 0.492374539448619 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35302627_35302728:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35302627_35302728:CUL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 35324157 C/G 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 C:G C G 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000108094:ENST00000374751:exon_35324100_35324224:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374748:exon_35324100_35324224:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374746:exon_35324100_35324224:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374749:exon_35324100_35324224:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374754:exon_35324100_35324224:CUL2;ENSG00000108094:ENST00000374742:exon_35324100_35324224:CUL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 35772402 G/A 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 35854954 C/T 1 44 26 70 20.9094380214289 13.6444229873375 7.2650150340914 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0936760965708017 ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35854951_35855113:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35854951_35855113:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000339497:exon_35854951_35855113:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35854951_35855113:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35854951_35855113:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000465416:exon_35854951_35855056:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000497692:exon_35854951_35855213:CCNY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 38407123 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000075407:ENST00000361085:exon_38406318_38411511:ZNF37A;ENSG00000075407:ENST00000351773:exon_38406318_38412276:ZNF37A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 43088026 G/A 1 22 13 35 10.4547190107144 6.82221149366874 3.6325075170457 A:G G A 10 0.52478549951298 0.239609814585285 ENSG00000196693:ENST00000416780:exon_43084555_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000359467:exon_43084563_43090147:ZNF33B;ENSG00000196693:ENST00000395836:exon_43087991_43090135:ZNF33B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 43288490 T/A 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:T T A 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43288405_43288592:BMS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 43289407 G/A 1 17 23 40 8.07864650827934 12.0700664887985 -3.9914199805192 A:G G A 10 0.52478549951298 0.210385291888679 ENSG00000165733:ENST00000374518:exon_43289300_43289439:BMS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 44111800 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198298:ENST00000361807:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374437:exon_44111739_44113351:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000430885:exon_44111739_44111843:ZNF485;ENSG00000198298:ENST00000374435:exon_44111739_44113351:ZNF485 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 45478053 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000107551:ENST00000489171:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000334940:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374417:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374414:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000340258:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000427758:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000483709:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000462822:exon_45477973_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000428466:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000374411:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000472561:exon_45477969_45478111:RASSF4;ENSG00000107551:ENST00000465735:exon_45476487_45478111:RASSF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 45953767 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000165406:ENST00000453424:exon_45950035_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000319836:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395771:exon_45952817_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000395769:exon_45952954_45953991:MARCH8;ENSG00000165406:ENST00000476962:exon_45952959_45953991:MARCH8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 46224381 C/T 1 1 10 11 0.47521450048702 5.2478549951298 -4.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00450105750233496 ENSG00000172661:ENST00000374362:exon_46224310_46224474:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000336378:exon_46224310_46224474:FAM21C;ENSG00000172661:ENST00000399588:exon_46224310_46224474:FAM21C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 50678683 C/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:C C A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50678228_50678935:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000374129:exon_50678228_50678935:ERCC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 50732283 T/A 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:T T A 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000225830:ENST00000355832:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000447839:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000515869:exon_50732079_50732823:ERCC6;ENSG00000225830:ENST00000342592:exon_50732079_50732823:ERCC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 52025057 G/A 0 144 0 144 68.4308880701309 0 68.4308880701309 G G 10 0.52478549951298 6.74163219310952e-41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 53458047 A/G 1 33 37 70 15.6820785160717 19.4170634819803 -3.7349849659086 A:G A G 10 0.52478549951298 0.403187171582861 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 53458998 A/G 1 23 15 38 10.9299335112015 7.8717824926947 3.05815101850676 A:G A G 10 0.52478549951298 0.335204857431247 ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 62553763 A/G 1 35 44 79 16.6325075170457 23.0905619785711 -6.45805446152542 A:G A G 10 0.52478549951298 0.176081843319891 ENSG00000170312:ENST00000395284:exon_62553635_62554610:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000316629:exon_62553635_62554601:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000448257:exon_62553635_62554586:CDK1;ENSG00000170312:ENST00000373809:exon_62553635_62554610:CDK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 64911911 A/G 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70502288 G/A 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70502133_70502326:CCAR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70513684 A/G 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G A G 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70513609_70513834:CCAR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70700944 A/G 1 59 74 133 28.0376555287342 38.8341269639605 -10.7964714352263 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0680489788655923 ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70775329 G/A 1 14 11 25 6.65300300681828 5.77264049464278 0.880362512175499 A:G G A 10 0.52478549951298 0.842068649003874 ENSG00000198954:ENST00000361983:exon_70775297_70776738:KIAA1279 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70856821 A/T 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:T A T 10 0.52478549951298 0.293890374522633 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70856852 G/A 1 617 592 1209 293.207346800491 310.673015711684 -17.4656689111928 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 0.327561966435492 ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70856840_70856987:SRGN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70863699 C/T 1 663 616 1279 315.067213822894 323.267867699996 -8.20065387710144 T:C C T 10 0.52478549951298 0.654252447230412 ENSG00000122862:ENST00000462445:exon_70863627_70864297:SRGN;ENSG00000122862:ENST00000242465:exon_70863627_70864567:SRGN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70892791 C/T 1 23 25 48 10.9299335112015 13.1196374878245 -2.18970397662304 T:C C T 10 0.52478549951298 0.565022196294074 ENSG00000122958:ENST00000373382:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000477667:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000263559:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000395098:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489656:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000490696:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000467852:exon_70892654_70892803:VPS26A;ENSG00000122958:ENST00000489794:exon_70892654_70892803:VPS26A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 70940191 C/T 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000156502:ENST00000359655:exon_70939988_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000395093:exon_70939993_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000471069:exon_70940006_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000483572:exon_70940037_70940318:SUPV3L1;ENSG00000156502:ENST00000422378:exon_70940044_70940318:SUPV3L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 71103597 C/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 C:G C G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000464803:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000480047:exon_71103583_71103599:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 71142420 G/A 1 33 29 62 15.6820785160717 15.2187794858764 0.463299030195238 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 71874048 G/A 1 36 26 62 17.1077220175327 13.6444229873375 3.46329903019524 A:G G A 10 0.52478549951298 0.445810664594608 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71873901_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71872030_71874085:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71872030_71874085:AIFM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 71874773 C/T 1 33 25 58 15.6820785160717 13.1196374878245 2.56244102824716 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.514358224872506 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 71876382 C/T 1 48 35 83 22.810296023377 18.3674924829543 4.44280354042266 T:C C T 10 0.52478549951298 0.379472883309920 ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 72643671 C/T 1 61 48 109 28.9880845297082 25.189703976623 3.79838055308517 T:C C T 10 0.52478549951298 0.502596262589377 ENSG00000166228:ENST00000299299:exon_72643267_72643805:PCBD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 73511040 G/A 1 11 20 31 5.22735950535722 10.4957099902596 -5.26835048490238 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0714123808507927 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73507316_73511047:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000470317:exon_73510673_73511047:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73510979_73511047:C10orf54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 73521578 G/A 1 19 12 31 9.02907550925338 6.29742599415576 2.73164951509762 A:G G A 10 0.52478549951298 0.371395475613226 ENSG00000107738:ENST00000394957:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000263569:exon_73521355_73521783:C10orf54;ENSG00000107738:ENST00000481568:exon_73521355_73521701:C10orf54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 73578839 G/A 1 238 176 414 113.101051115911 92.3622479142845 20.7388032016263 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0435752959529026 ENSG00000197746:ENST00000394936:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000373120:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000357471:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394934:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394940:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000402059:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000394929:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000404083:exon_73578788_73578868:PSAP;ENSG00000197746:ENST00000495196:exon_73578788_73579028:PSAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 74890653 C/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:C C A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000166321:ENST00000488223:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000357321:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000349051:exon_74890461_74891586:NUDT13;ENSG00000166321:ENST00000372997:exon_74890461_74891586:NUDT13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 74894375 T/C 1 116 119 235 55.1248820564943 62.4494744420446 -7.32459238555031 T:C T C 10 0.52478549951298 0.360643875437371 ENSG00000122882:ENST00000494307:exon_74894361_74894512:ECD;ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74893414_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74894283_74894571:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74894283_74894571:ECD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 74896664 T/C 1 51 54 105 24.235939524838 28.3384169737009 -4.10247744886291 T:C T C 10 0.52478549951298 0.435790430955465 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74896462_74896676:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74896462_74896676:ECD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 74908082 T/A 1 20 21 41 9.5042900097404 11.0204954897726 -1.51620548003218 A:T T A 10 0.52478549951298 0.64295824884652 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74908034_74908162:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74908034_74908162:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74908034_74908162:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74908034_74908162:ECD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 74916173 T/A 1 37 25 62 17.5829365180197 13.1196374878245 4.46329903019524 A:T T A 10 0.52478549951298 0.309061364314416 ENSG00000122882:ENST00000372979:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000430082:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000454759:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000484976:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000453402:exon_74916033_74916211:ECD;ENSG00000122882:ENST00000413026:exon_74916033_74916211:ECD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 75135964 T/C 1 255 163 418 121.17969762419 85.5400364206157 35.6396612035743 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000495055014773815 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75135203_75135975:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75135203_75135975:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000463788:exon_75135407_75135975:ANXA7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 75143371 C/T 1 179 198 377 85.0633955871766 103.90752890357 -18.8441333163935 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0562877517957715 ENSG00000138279:ENST00000372921:exon_75143335_75143448:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000372919:exon_75143335_75143448:ANXA7;ENSG00000138279:ENST00000492380:exon_75143335_75143448:ANXA7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 75394321 A/G 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000177791:ENST00000359322:exon_75394242_75394491:MYOZ1;ENSG00000177791:ENST00000457639:exon_75394242_75394491:MYOZ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 76790809 C/T 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000156650:ENST00000372725:exon_76788247_76792051:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372724:exon_76788247_76792050:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000287239:exon_76788247_76792380:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372714:exon_76788247_76790948:MYST4;ENSG00000156650:ENST00000372711:exon_76788247_76792380:MYST4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 81926702 G/A 1 62 55 117 29.4632990301952 28.8632024732139 0.600096556981335 A:G G A 10 0.52478549951298 0.926527650380144 ENSG00000122359:ENST00000372231:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000422982:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000438331:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372234:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000360615:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000265447:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000424188:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000372219:exon_81926646_81926740:ANXA11;ENSG00000122359:ENST00000481805:exon_81926155_81926740:ANXA11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 82180264 T/C 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000122378:ENST00000372188:exon_82180222_82180401:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000372187:exon_82180222_82180401:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000372185:exon_82180239_82180401:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000372181:exon_82179754_82180401:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000394504:exon_82180222_82180401:C10orf58;ENSG00000122378:ENST00000418757:exon_82180239_82180401:C10orf58 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 82280387 G/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000108219:ENST00000429989:exon_82277661_82282387:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372160:exon_82280347_82281515:TSPAN14;ENSG00000108219:ENST00000372164:exon_82277661_82282387:TSPAN14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 86273249 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 90762788 T/A 1 32 26 58 15.2068640155846 13.6444229873375 1.56244102824716 A:T T A 10 0.52478549951298 0.695751943213381 ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 91087805 G/C 1 48 30 78 22.810296023377 15.7435649853894 7.06673103798756 C:G G C 10 0.52478549951298 0.113668416471869 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91087651_91087835:IFIT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 91099435 G/A 1 145 141 286 68.9061025706179 73.9947554313302 -5.0886528607123 A:G G A 10 0.52478549951298 0.554318510969649 ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 91162182 C/T 1 75 53 128 35.6410875365265 27.8136314741879 7.82745606233856 T:C C T 10 0.52478549951298 0.184368000719543 ENSG00000185745:ENST00000371804:exon_91162038_91163745:IFIT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 91178000 C/T 1 21 15 36 9.97950451022742 7.8717824926947 2.10772201753272 T:C C T 10 0.52478549951298 0.509031329613737 ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 91498730 C/T 1 10 15 25 4.7521450048702 7.8717824926947 -3.1196374878245 T:C C T 10 0.52478549951298 0.233943044921702 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91498715_91498853:KIF20B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 91528142 A/G 1 8 15 23 3.80171600389616 7.8717824926947 -4.07006648879854 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0980805846777547 ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91528047_91528148:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91528047_91528148:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91528047_91528148:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91528047_91528148:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91528047_91528148:KIF20B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 94818158 G/A 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000138190:ENST00000371552:exon_94817980_94819250:EXOC6;ENSG00000138190:ENST00000443748:exon_94817980_94819250:EXOC6;ENSG00000138190:ENST00000260762:exon_94817980_94819247:EXOC6;ENSG00000138190:ENST00000495132:exon_94817980_94818281:EXOC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 95259979 C/G 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 C:G C G 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 95259983 C/T 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95259797_95259991:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95259797_95259991:CEP55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 95430585 T/G 1 23 22 45 10.9299335112015 11.5452809892856 -0.6153474780841 T:G T G 10 0.52478549951298 0.882236832465206 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000460752:exon_95430527_95435061:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000483229:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000462771:exon_95430532_95430605:FRA10AC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 95454681 G/C 1 20 34 54 9.5042900097404 17.8427069834413 -8.33841697370092 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0284923723473116 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 95458141 A/G 1 15 26 41 7.1282175073053 13.6444229873375 -6.51620548003218 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0432244494510204 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 95459817 C/T 1 13 22 35 6.17778850633126 11.5452809892856 -5.3674924829543 T:C C T 10 0.52478549951298 0.089442093634637 ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 96114835 G/A 1 15 13 28 7.1282175073053 6.82221149366874 0.306006013636559 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96114720_96114850:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96114720_96114850:NOC3L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 96313960 A/C 1 14 18 32 6.65300300681828 9.44613899123364 -2.79313598441536 A:C A C 10 0.52478549951298 0.377529041769322 ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 96997670 A/G 1 1952 1958 3910 927.618704950663 1027.53000804641 -99.9113030957519 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 0.00143767540205720 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 96997820 A/G 1 1209 1257 2466 574.534331088807 659.655372887816 -85.1210417990088 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000607476304069254 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_96997329_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000492511:exon_96997697_96997868:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_96997767_96997868:PDLIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 97023630 T/C 1 630 502 1132 299.385135306823 263.442320755516 35.9428145513066 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.0345675705835252 ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 97413047 G/A 1 27 14 41 12.8307915131495 7.34699699318172 5.48379451996782 A:G G A 10 0.52478549951298 0.116817433145742 ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97413047_97413162:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97413047_97413162:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000483788:exon_97413047_97413162:ALDH18A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 97515949 G/A 1 29 86 115 13.7812205141236 45.1315529581163 -31.3503324439927 A:T:G G A 10 0.52478549951298 3.19450349615885e-09 ENSG00000138185:ENST00000371205:exon_97515714_97516012:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000371203:exon_97515916_97516012:ENTPD1;ENSG00000138185:ENST00000483213:exon_97515935_97516012:ENTPD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 98006805 C/T 1 59 48 107 28.0376555287342 25.189703976623 2.84795155211113 T:C C T 10 0.52478549951298 0.628813800785321 ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_98006740_98006809:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98006740_98006805:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000495266:exon_98006740_98006805:BLNK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 98031160 T/C 1 33 33 66 15.6820785160717 17.3179214839283 -1.63584296785668 T:C T C 10 0.52478549951298 0.712846770198214 ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_98031109_98031297:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_98031109_98031297:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_98031109_98031333:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393898:exon_98031109_98031333:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_98031109_98031265:BLNK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 98287792 G/T 1 17 5 22 8.07864650827934 2.6239274975649 5.45471901071444 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0303633281468115 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 98321837 T/C 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98321735_98321895:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000443638:exon_98321735_98321895:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000464654:exon_98321735_98321895:TM9SF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 98380277 C/T 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 99141205 A/G 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 99148298 A/G 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:G A G 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99148246_99148381:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99148246_99148381:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99148246_99148381:RRP12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 99155984 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99155975_99156058:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99155975_99156058:RRP12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 99203050 C/T 1 46 39 85 21.8598670224029 20.4666344810062 1.3932325413967 T:C C T 10 0.52478549951298 0.82828200276305 ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000477692:exon_99202994_99203063:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000471049:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000472345:exon_99202994_99203068:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99202994_99203068:EXOSC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 99236467 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000437002:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000441194:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000483626:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422685:exon_99236440_99236501:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000448660:exon_99236440_99236501:MMS19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 99969475 A/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:C A C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000166024:ENST00000298999:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000314594:exon_99967858_99969656:C10orf28;ENSG00000166024:ENST00000370584:exon_99967858_99969656:C10orf28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 100185398 C/A 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:C C A 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000478087:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000359632:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000470095:exon_100185298_100185477:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000497527:exon_100185298_100185477:HPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 100202971 C/G 1 15 22 37 7.1282175073053 11.5452809892856 -4.41706348198026 C:G C G 10 0.52478549951298 0.187306298784188 ENSG00000107521:ENST00000325103:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000361490:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000467246:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000249092:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000407891:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000498219:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000338546:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000480020:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000474873:exon_100202881_100202997:HPS1;ENSG00000107521:ENST00000465957:exon_100202881_100202997:HPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 101636898 C/G 1 19 21 40 9.02907550925338 11.0204954897726 -1.9914199805192 C:G C G 10 0.52478549951298 0.531944581397645 ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101635334_101637093:DNMBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 102016230 C/T 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102016019_102016233:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000473842:exon_102016019_102016233:CWF19L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 103348131 C/T 1 7 13 20 3.32650150340914 6.82221149366874 -3.4957099902596 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.124132788642938 ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103348045_103348157:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103348082_103348157:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103348089_103348157:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370149:exon_103348089_103348157:DPCD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 103920475 T/C 1 76 77 153 36.1163020370135 40.4084834624995 -4.29218142548594 T:C T C 10 0.52478549951298 0.517593388333801 ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 104140355 C/T 1 20 18 38 9.5042900097404 9.44613899123364 0.0581510185067593 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 104849468 G/A 1 19 30 49 9.02907550925338 15.7435649853894 -6.71448947613602 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0627597853163554 ENSG00000076685:ENST00000343289:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000423468:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369871:exon_104845940_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000404739:exon_104847774_104849665:NT5C2;ENSG00000076685:ENST00000369857:exon_104847942_104849665:NT5C2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 105362308 G/T 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:G G T 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 105362914 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000107957:ENST00000369774:exon_105353784_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000355946:exon_105353786_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000315994:exon_105359277_105363546:SH3PXD2A;ENSG00000107957:ENST00000420222:exon_105361503_105363546:SH3PXD2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 105882765 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000156384:ENST00000369729:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000463224:exon_105882723_105883121:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000369727:exon_105882723_105882844:C10orf78;ENSG00000156384:ENST00000336358:exon_105882524_105882844:C10orf78 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 106022789 C/A 1 401 338 739 190.561014695295 177.377498835387 13.1835158599077 A:T:C C A 10 0.52478549951298 0.338413014727971 ENSG00000148834:ENST00000493946:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106022737_106022835:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106022737_106022835:GSTO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 106027165 G/A 1 194 268 462 92.1916130944819 140.642513869479 -48.4509007749968 A:C:G G A 10 0.52478549951298 7.23349995902141e-06 ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 111625041 G/C 1 59 67 126 28.0376555287342 35.1606284673697 -7.12297293863548 C:G G C 10 0.52478549951298 0.212553115997834 ENSG00000108039:ENST00000502895:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000488118:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000502935:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369683:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369680:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000322238:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369661:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369659:exon_111624524_111625070:XPNPEP1;ENSG00000108039:ENST00000369658:exon_111624812_111625070:XPNPEP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 112266722 C/T 1 24 23 47 11.4051480116885 12.0700664887985 -0.664918477110062 T:C C T 10 0.52478549951298 0.884555302742298 ENSG00000138166:ENST00000369583:exon_112266693_112266912:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000476681:exon_112266693_112266864:DUSP5;ENSG00000138166:ENST00000468749:exon_112266693_112266912:DUSP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 112641053 A/G 1 84 88 172 39.9180180409097 46.1811239571422 -6.26310591623256 A:G A G 10 0.52478549951298 0.359909846365041 ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112641033_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112640991_112641293:PDCD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 115609915 C/G 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000198924:ENST00000369305:exon_115608739_115610403:DCLRE1A;ENSG00000198924:ENST00000361384:exon_115608739_115610403:DCLRE1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 119027240 T/C 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:C T C 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000165646:ENST00000298472:exon_119027184_119027247:SLC18A2;ENSG00000165646:ENST00000497497:exon_119027184_119027247:SLC18A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 120795626 A/T 1 353 294 647 167.750718671918 154.286936856816 13.4637818151019 A:T A T 10 0.52478549951298 0.306108133075678 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120794356_120795780:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000486248:exon_120795334_120795780:EIF3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 120840191 T/C 1 18 16 34 8.55386100876636 8.39656799220768 0.157293016558679 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120840140_120840316:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000478852:exon_120840140_120840396:EIF3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 120920588 T/C 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:C T C 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 120933324 G/A 1 54 27 81 25.6615830262991 14.1692084868505 11.4923745394486 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0104982853543312 ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120933249_120933384:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000463322:exon_120933257_120933384:PRDX3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 121337166 C/T 1 67 58 125 31.8393715326303 30.4375589717528 1.4018125608775 T:C C T 10 0.52478549951298 0.857979489107779 ENSG00000151923:ENST00000369093:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000489822:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000497671:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000470781:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000436547:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000369087:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000369092:exon_121337153_121337248:TIAL1;ENSG00000151923:ENST00000495821:exon_121337153_121337248:TIAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 121602830 G/A 1 36 25 61 17.1077220175327 13.1196374878245 3.98808452970822 A:G G A 10 0.52478549951298 0.369675483332825 ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121602760_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000495407:exon_121602294_121602938:C10orf119 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 121679013 A/G 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 A:G A G 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000107651:ENST00000369075:exon_121678956_121679108:SEC23IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 123662086 G/C 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000107669:ENST00000369043:exon_123661906_123662135:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000369040:exon_123661906_123662135:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000224652:exon_123661906_123662135:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000423243:exon_123661906_123662135:ATE1;ENSG00000107669:ENST00000455628:exon_123662032_123662135:ATE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 124609989 G/A 0 10 0 10 4.7521450048702 0 4.7521450048702 G G 10 0.52478549951298 0.00217157993432381 ENSG00000138161:ENST00000368904:exon_124609940_124610309:CUZD1;ENSG00000213185:ENST00000368898:exon_124609940_124610066:FAM24B;ENSG00000213185:ENST00000368896:exon_124609940_124610036:FAM24B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 124742792 G/A 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 124742895 G/C 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 124806770 A/G 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124806725_124806814:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124806725_124806814:ACADSB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 126631865 A/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126630692_126631876:ZRANB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 127530325 T/C 1 27 30 57 12.8307915131495 15.7435649853894 -2.91277347223986 T:C T C 10 0.52478549951298 0.507699806565219 ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 127548346 G/T 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 T:G G T 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127548172_127548544:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127548172_127548544:DHX32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129899578 T/C 1 245 274 519 116.42755261932 143.791226866557 -27.3636742472366 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.0175583111972953 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129899778 G/C 1 228 243 471 108.348906111041 127.522876381654 -19.1739702706136 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0796098901871753 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000464771:exon_129899748_129899889:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129899922 T/C 1 146 131 277 69.3813170711049 68.7469004362004 0.634416634904525 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.952096661431342 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129899522_129899965:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129899522_129899965:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129901722 G/A 1 92 46 138 43.7197340448058 24.1401329775971 19.5796010672088 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.000841991591312205 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129901825 T/C 1 87 107 194 41.3436615423707 56.1520484478889 -14.8083869055181 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0369080563850356 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129902281 G/A 1 99 110 209 47.046235548215 57.7264049464278 -10.6801693982128 A:G G A 10 0.52478549951298 0.146035523614761 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129903016 T/C 1 69 62 131 32.7898005336044 32.5367009698048 0.253099563799616 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129904519 G/A 1 30 26 56 14.2564350146106 13.6444229873375 0.612012027273117 A:G G A 10 0.52478549951298 0.894356796392045 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129906468 C/T 1 13 13 26 6.17778850633126 6.82221149366874 -0.644422987337482 T:C C T 10 0.52478549951298 0.846079846003371 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129907544 G/C 1 11 17 28 5.22735950535722 8.92135349172066 -3.69399398636344 C:G G C 10 0.52478549951298 0.187123821971002 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129910475 T/G 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:G T G 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129910397_129910709:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000484853:exon_129910397_129910713:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129911856 C/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 C:G C G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129911691_129911866:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129911691_129911866:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 129913960 A/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:T A T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129913192_129914271:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129913774_129914271:MKI67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 134145288 C/A 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 134540331 T/C 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000487614:exon_134540325_134540853:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000498337:exon_134540325_134540409:INPP5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 134540388 G/A 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000068383:ENST00000368594:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000368593:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000432898:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000342652:exon_134540325_134540409:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000487614:exon_134540325_134540853:INPP5A;ENSG00000068383:ENST00000498337:exon_134540325_134540409:INPP5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135082279 C/T 1 30 13 43 14.2564350146106 6.82221149366874 7.43422352094186 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0313432271712144 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135084524 G/A 1 23 24 47 10.9299335112015 12.5948519883115 -1.66491847711006 A:G G A 10 0.52478549951298 0.663051365227157 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135085321 C/T 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.68398706969559 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135085965 C/T 1 17 18 35 8.07864650827934 9.44613899123364 -1.3674924829543 T:C C T 10 0.52478549951298 0.735727383388347 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135098672 G/A 1 33 23 56 15.6820785160717 12.0700664887985 3.61201202727312 A:G G A 10 0.52478549951298 0.351903015987098 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098589_135098717:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098589_135098717:TUBGCP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135099001 G/A 1 33 39 72 15.6820785160717 20.4666344810062 -4.78455596493456 A:G G A 10 0.52478549951298 0.288717687821764 ENSG00000130640:ENST00000252936:exon_135098960_135099132:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000417178:exon_135098960_135099132:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368563:exon_135098960_135099132:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000368562:exon_135098960_135099132:TUBGCP2;ENSG00000130640:ENST00000482278:exon_135098960_135099132:TUBGCP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135204950 C/G 1 42 44 86 19.9590090204548 23.0905619785711 -3.13155295811628 C:G C G 10 0.52478549951298 0.518525085119544 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368534:exon_135204866_135204999:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135205009 C/G 1 37 32 69 17.5829365180197 16.7931359844154 0.789800533604378 C:G C G 10 0.52478549951298 0.90432653908294 ENSG00000148832:ENST00000368542:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368538:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000278060:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000357296:exon_135204816_135205158:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000356306:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000483211:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000476834:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000529585:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000480071:exon_135204816_135205128:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368544:exon_135204816_135205195:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000368535:exon_135204816_135205198:PAOX;ENSG00000148832:ENST00000530555:exon_135204816_135205167:PAOX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 10 135233612 C/T 1 22 30 52 10.4547190107144 15.7435649853894 -5.28884597467496 T:C C T 10 0.52478549951298 0.165036423876340 ENSG00000254536:ENST00000468317:exon_135233530_135233999:RP11-108K14.8;ENSG00000148824:ENST00000317502:exon_135233530_135234174:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000432508:exon_135233530_135233986:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000460848:exon_135233530_135234811:MTG1;ENSG00000148824:ENST00000473735:exon_135233530_135234022:MTG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 293188 T/C 1 19 10 29 9.02907550925338 5.2478549951298 3.78122051412358 T:C T C 10 0.52478549951298 0.193868828897936 ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 308180 A/G 1 108 170 278 51.3231660525982 89.2135349172066 -37.8903688646084 A:G A G 10 0.52478549951298 5.94470949319767e-06 ENSG00000185201:ENST00000399817:exon_308163_308438:IFITM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 320772 A/G 1 89 44 133 42.2940905433448 23.0905619785711 19.2035285647737 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000908407868007101 ENSG00000142089:ENST00000399808:exon_320565_321050:IFITM3;ENSG00000142089:ENST00000526811:exon_320565_320772:IFITM3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 419516 C/G 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 C:G C G 10 0.52478549951298 0.187053491515587 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 419765 C/T 1 11 2 13 5.22735950535722 1.04957099902596 4.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0245324962404463 ENSG00000185101:ENST00000526142:exon_419582_420615:ANO9;ENSG00000185101:ENST00000532094:exon_419582_420860:ANO9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 494942 G/C 1 163 153 316 77.4599635793843 80.2921814254859 -2.8322178461017 T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.778316605956785 ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 562421 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 563257 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563189_563317:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563189_563478:RASSF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 563649 C/T 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 605627 C/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_605608_605724:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_605605_605724:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_605605_605724:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_605605_605724:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_605605_605724:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_605608_605724:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000532550:exon_605605_605724:PHRF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 613165 G/C 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 C:G G C 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 613208 T/C 1 176 155 331 83.6377520857155 81.3417524245119 2.29599966120361 T:C T C 10 0.52478549951298 0.825864400296138 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 613297 T/G 1 139 176 315 66.0548155676958 92.3622479142845 -26.3074323465887 T:G T G 10 0.52478549951298 0.00329941720852060 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 614318 T/C 1 86 83 169 40.8684470418837 43.5571964595773 -2.68874941769362 T:C T C 10 0.52478549951298 0.700569984081177 ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 678742 T/C 1 19 20 39 9.02907550925338 10.4957099902596 -1.46663448100622 T:C T C 10 0.52478549951298 0.748956128215546 ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000388804:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000525904:exon_678694_678822:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000526790:exon_678694_678779:DEAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 747577 C/T 1 183 160 343 86.9642535891247 83.9656799220768 2.99857366704785 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78697146384097 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_747329_747578:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528070:exon_747415_747578:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000532685:exon_747417_747578:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_747428_747578:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530440:exon_747454_747578:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530119:exon_747464_747578:TALDO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 764854 T/C 1 371 345 716 176.304579680684 181.050997331978 -4.74641765129371 T:C T C 10 0.52478549951298 0.736361413942218 ENSG00000177156:ENST00000319006:exon_764813_765024:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000528097:exon_764813_765012:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000530666:exon_764813_764947:TALDO1;ENSG00000177156:ENST00000532202:exon_764813_765005:TALDO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 864505 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000214063:ENST00000397397:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397411:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000399778:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397396:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000421676:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397408:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525334:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397406:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409543:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000525201:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000397404:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000524895:exon_864437_864653:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000532375:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000346501:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000464987:exon_864437_865825:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000409531:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000527644:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000468468:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000529566:exon_864437_864511:TSPAN4;ENSG00000214063:ENST00000494815:exon_863272_864511:TSPAN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 870446 G/A 1 39 35 74 18.5333655189938 18.3674924829543 0.165873036039478 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000177830:ENST00000449825:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000454838:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000532909:exon_870419_870486:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000529539:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323578:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000534207:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000429789:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528581:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000323541:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000336845:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000436108:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000524538:exon_870419_870751:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000528521:exon_870419_870499:CHID1;ENSG00000177830:ENST00000526714:exon_870419_870489:CHID1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 985547 C/T 1 13 6 19 6.17778850633126 3.14871299707788 3.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.176954766259946 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000417081:exon_985435_985586:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000329626:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000534328:exon_985435_985597:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_985435_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_985432_985582:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527007:exon_983146_987654:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000527917:exon_985384_985582:AP2A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 993964 C/T 1 18 19 37 8.55386100876636 9.97092449074662 -1.41706348198026 T:C C T 10 0.52478549951298 0.742563801920906 ENSG00000183020:ENST00000332231:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000452310:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448757:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000448903:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528815:exon_993754_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000528195:exon_993863_993985:AP2A2;ENSG00000183020:ENST00000529125:exon_993754_993985:AP2A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 1902768 G/A 1 311 291 602 147.791709651463 152.712580358277 -4.92087070681399 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.71345732181528 ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 1977651 C/A 1 194 201 395 92.1916130944819 105.481885402109 -13.2902723076271 A:C C A 10 0.52478549951298 0.190280636551041 ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 2356846 C/T 0 220 0 220 104.547190107144 0 104.547190107144 C C 10 0.52478549951298 2.60715820299199e-62 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 2356908 G/A 0 202 0 202 95.993329098378 0 95.993329098378 G G 10 0.52478549951298 3.28089556611629e-57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 2417935 T/C 1 210 236 446 99.7950451022742 123.849377885063 -24.0543327827891 T:C T C 10 0.52478549951298 0.022891008833731 ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 2924591 G/A 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 2924610 G/A 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000110628:ENST00000347936:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000312221:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000449793:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000380574:exon_2924444_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000485423:exon_2924344_2924719:SLC22A18;ENSG00000110628:ENST00000492567:exon_2924606_2924719:SLC22A18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 3040489 C/A 1 31 24 55 14.7316495150976 12.5948519883115 2.1367975267861 A:C C A 10 0.52478549951298 0.591584730894599 ENSG00000110619:ENST00000380525:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000531387:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397111:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000397114:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000278224:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000526890:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000529772:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000401769:exon_3040369_3040497:CARS;ENSG00000110619:ENST00000465240:exon_3040420_3040497:CARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 3381057 C/G 1 40 26 66 19.0085800194808 13.6444229873375 5.36415703214332 C:G C G 10 0.52478549951298 0.217796243788989 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 3381369 G/C 1 20 17 37 9.5042900097404 8.92135349172066 0.582936518019739 C:G G C 10 0.52478549951298 0.870886918421587 ENSG00000005801:ENST00000354599:exon_3379157_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000399602:exon_3379996_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000429541:exon_3380175_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000005082:exon_3380224_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000526601:exon_3380347_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000343338:exon_3381174_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000438262:exon_3381227_3381795:ZNF195;ENSG00000005801:ENST00000528410:exon_3381269_3381795:ZNF195 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 4148476 T/G 1 50 52 102 23.760725024351 27.288845974675 -3.52812095032397 T:G T G 10 0.52478549951298 0.489624219632352 ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4148265_4148486:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4148265_4148486:RRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 4411241 C/T 1 50 39 89 23.760725024351 20.4666344810062 3.29409054334478 T:C C T 10 0.52478549951298 0.524981216504728 ENSG00000132109:ENST00000254436:exon_4411232_4411688:TRIM21 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 4621485 C/G 1 24 2 26 11.4051480116885 1.04957099902596 10.3555770126625 C:G C G 10 0.52478549951298 3.08621587517220e-05 ENSG00000167333:ENST00000300747:exon_4619902_4622056:TRIM68;ENSG00000167333:ENST00000531101:exon_4620010_4622056:TRIM68 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 5664831 C/A 1 32 32 64 15.2068640155846 16.7931359844154 -1.58627196883072 A:C C A 10 0.52478549951298 0.708947130415569 ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 5687226 G/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5687211_5687319:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5687211_5687311:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5687110_5687311:TRIM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 5717762 T/C 1 137 85 222 65.1043865667217 44.6067674586033 20.4976191081184 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00584004308773443 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 5718517 G/A 1 118 100 218 56.0753110574684 52.478549951298 3.59676110617035 A:G G A 10 0.52478549951298 0.635675764073915 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 5719649 T/C 1 101 84 185 47.996664549189 44.0819819590903 3.91468259009869 T:C T C 10 0.52478549951298 0.606518869790869 ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5719545_5719706:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6238844 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000051009:ENST00000449352:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000442917:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000265978:exon_6238601_6239380:FAM160A2;ENSG00000051009:ENST00000524416:exon_6237800_6239380:FAM160A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6413009 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000166311:ENST00000299397:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000356761:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000342245:exon_6412614_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000534405:exon_6412614_6413426:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000527275:exon_6412617_6413386:SMPD1;ENSG00000166311:ENST00000533123:exon_6412614_6413386:SMPD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6432200 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000166313:ENST00000299402:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000389907:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000311051:exon_6431857_6432591:APBB1;ENSG00000166313:ENST00000389906:exon_6431857_6432591:APBB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6501613 C/T 1 17 17 34 8.07864650827934 8.92135349172066 -0.842706983441321 T:C C T 10 0.52478549951298 0.864133680655555 ENSG00000132254:ENST00000254584:exon_6501553_6501653:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000396777:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000423813:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000445086:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000531037:exon_6501553_6501653:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000525235:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000530410:exon_6501553_6501693:ARFIP2;ENSG00000132254:ENST00000529847:exon_6500887_6501693:ARFIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6593198 C/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6591239_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6592866_6593249:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000532467:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525889:exon_6592866_6593257:DNHD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6622714 G/A 1 26 17 43 12.3555770126625 8.92135349172066 3.43422352094186 A:G G A 10 0.52478549951298 0.359931530335296 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6624660 G/A 1 23 20 43 10.9299335112015 10.4957099902596 0.43422352094186 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6624634_6624850:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000534343:exon_6624634_6624809:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6624634_6624834:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6624634_6624827:RRP8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6624676 G/C 1 16 12 28 7.60343200779232 6.29742599415576 1.30600601363656 C:G G C 10 0.52478549951298 0.706796378801608 ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6624634_6624850:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000534343:exon_6624634_6624809:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6624634_6624834:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6624634_6624827:RRP8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6629665 C/T 1 100 70 170 47.521450048702 36.7349849659086 10.7864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.106746856742440 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526114:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527121:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526318:exon_6629624_6629719:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6629496_6629719:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6631016 C/T 1 164 147 311 77.9351780798713 77.1434684284081 0.791709651463208 T:C C T 10 0.52478549951298 0.9547525673737 ENSG00000166333:ENST00000299421:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000532063:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527327:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000420936:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000527394:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528995:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000396751:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000528784:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166333:ENST00000534706:exon_6630955_6631046:ILK;ENSG00000166333:ENST00000526711:exon_6630955_6631076:ILK;ENSG00000166337:ENST00000526743:exon_6627526_6632242:TAF10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6638599 T/C 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 T:C T C 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000166340:ENST00000453338:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000436873:exon_6638532_6638646:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000299427:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000533371:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000379840:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000528571:exon_6638532_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000428886:exon_6638221_6638659:TPP1;ENSG00000166340:ENST00000534644:exon_6638532_6638659:TPP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 6703334 A/G 1 385 344 729 182.957582687503 180.526211832465 2.43137085503756 A:G A G 10 0.52478549951298 0.882097719228452 ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7662732 C/T 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7673029 T/C 1 38 33 71 18.0581510185068 17.3179214839283 0.740229534578418 T:C T C 10 0.52478549951298 0.905737545833374 ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7686596 G/A 1 83 82 165 39.4428035404227 43.0324109600644 -3.5896074196417 A:G G A 10 0.52478549951298 0.586143220738205 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7686674 T/C 1 59 50 109 28.0376555287342 26.239274975649 1.79838055308517 T:C T C 10 0.52478549951298 0.77393542416048 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7687715 T/C 1 62 43 105 29.4632990301952 22.5657764790581 6.8975225511371 T:C T C 10 0.52478549951298 0.203892957428141 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7689029 A/C 1 66 30 96 31.3641570321433 15.7435649853894 15.6205920467539 A:C A C 10 0.52478549951298 0.00143936716822042 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7688959_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7688774_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689003_7689044:CYB5R2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7689722 A/T 1 61 33 94 28.9880845297082 17.3179214839283 11.6701630457799 A:T A T 10 0.52478549951298 0.017298694547745 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7689709_7693754:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7689709_7689792:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7689709_7689792:CYB5R2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 7694030 G/T 1 60 28 88 28.5128700292212 14.6939939863634 13.8188760428578 A:T:G G T 10 0.52478549951298 0.00371763678997468 ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7693979_7694686:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534443:exon_7693979_7694121:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000531096:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000527542:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532920:exon_7693979_7694037:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000524608:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000436351:exon_7693979_7694122:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000525307:exon_7693859_7694122:CYB5R2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 8435077 C/T 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 8435078 A/C 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 A:C A C 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000130413:ENST00000473980:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8435042_8435239:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8435042_8435239:STK33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 8486310 C/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:C C A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000130413:ENST00000486305:exon_8486256_8489201:STK33;ENSG00000130413:ENST00000447869:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000315204:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396672:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000358872:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000396673:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000534493:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000418597:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000422559:exon_8486256_8486369:STK33;ENSG00000130413:ENST00000457885:exon_8486256_8486369:STK33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 9628064 C/G 0 30 0 30 14.2564350146106 0 14.2564350146106 C C 10 0.52478549951298 4.17870089057852e-09 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 9749645 A/C 1 26 17 43 12.3555770126625 8.92135349172066 3.43422352094186 A:C A C 10 0.52478549951298 0.359931530335296 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9749600_9749746:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9749600_9749746:SWAP70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 9754221 C/T 1 18 28 46 8.55386100876636 14.6939939863634 -6.14013297759708 T:C C T 10 0.52478549951298 0.07701319616571 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000524817:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534662:exon_9754076_9754257:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000534562:exon_9754076_9754257:SWAP70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 9769483 C/T 1 32 21 53 15.2068640155846 11.0204954897726 4.18636852581206 T:C C T 10 0.52478549951298 0.273032313333668 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 9769562 C/G 1 29 49 78 13.7812205141236 25.714489476136 -11.9332689620124 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00870366160533719 ENSG00000133789:ENST00000447399:exon_9769405_9769603:SWAP70;ENSG00000133789:ENST00000318950:exon_9769405_9769603:SWAP70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 10800287 G/T 1 32 37 69 15.2068640155846 19.4170634819803 -4.21019946639562 T:G G T 10 0.52478549951298 0.335993724631084 ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 11292671 C/T 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000110328:ENST00000227756:exon_11292423_11292837:GALNTL4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 13750350 A/G 1 16 26 42 7.60343200779232 13.6444229873375 -6.04099097954516 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0651913441591426 ENSG00000197601:ENST00000354817:exon_13750159_13753893:FAR1;ENSG00000197601:ENST00000532502:exon_13750159_13753893:FAR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 14504625 G/A 1 25 28 53 11.8803625121755 14.6939939863634 -2.81363147418794 A:G G A 10 0.52478549951298 0.492487893161155 ENSG00000129083:ENST00000437479:exon_14504578_14504697:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000249923:exon_14504578_14504697:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000439561:exon_14504578_14504697:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000534234:exon_14504578_14504697:COPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 14902031 A/G 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000186104:ENST00000532805:exon_14901926_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000530609:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000534686:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000334636:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000526489:exon_14901681_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000526276:exon_14901861_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000532641:exon_14901883_14902314:CYP2R1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 17098991 T/C 1 2251 2103 4354 1069.70784059628 1103.6239054758 -33.916064879515 A:T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.309327946014553 ENSG00000110700:ENST00000228140:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000526895:exon_17098976_17099020:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525634:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000525828:exon_17098976_17099215:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000533969:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000527571:exon_17098976_17099214:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000534329:exon_17098976_17099024:RPS13;ENSG00000110700:ENST00000528074:exon_17098502_17099024:RPS13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 18103014 T/C 1 78 71 149 37.0667310379876 37.2597704654216 -0.193039427434023 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000534721:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530436:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000530237:exon_18102958_18103284:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000532452:exon_18102958_18103050:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18102958_18103050:SAAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 18108512 T/C 1 32 21 53 15.2068640155846 11.0204954897726 4.18636852581206 T:C T C 10 0.52478549951298 0.273032313333668 ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 18308245 A/C 1 18 22 40 8.55386100876636 11.5452809892856 -2.9914199805192 A:C A C 10 0.52478549951298 0.34808227301894 ENSG00000110756:ENST00000438420:exon_18308138_18308257:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000349215:exon_18308138_18308257:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000396253:exon_18308138_18308257:HPS5;ENSG00000110756:ENST00000352460:exon_18308138_18308257:HPS5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 20404613 T/G 1 70 41 111 33.2650150340914 21.5162054800322 11.7488095540592 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0285371604018782 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 20404757 T/C 1 99 96 195 47.046235548215 50.3794079532461 -3.33317240503111 T:C T C 10 0.52478549951298 0.667226395392414 ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 27384585 G/A 1 26 31 57 12.3555770126625 16.2683504849024 -3.91277347223986 A:G G A 10 0.52478549951298 0.353431913685013 ENSG00000109881:ENST00000343895:exon_27384383_27384678:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000328697:exon_27384383_27385415:CCDC34;ENSG00000109881:ENST00000317945:exon_27384383_27384781:CCDC34 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 28057790 T/C 1 17 8 25 8.07864650827934 4.19828399610384 3.8803625121755 T:C T C 10 0.52478549951298 0.160229625148168 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 28057957 T/C 1 16 12 28 7.60343200779232 6.29742599415576 1.30600601363656 T:C T C 10 0.52478549951298 0.706796378801608 ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 32124978 T/C 1 3 13 16 1.42564350146106 6.82221149366874 -5.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0099864222361544 ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 32605400 C/T 1 274 225 499 130.208773133443 118.076737390421 12.132035743023 T:C C T 10 0.52478549951298 0.282327441081097 ENSG00000149100:ENST00000531921:exon_32605344_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000531120:exon_32605371_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000531186:exon_32605378_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000525782:exon_32605378_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000524896:exon_32605380_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000532444:exon_32605384_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000323213:exon_32605385_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000524711:exon_32605394_32605475:EIF3M;ENSG00000149100:ENST00000416409:exon_32605394_32605475:EIF3M HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 32852172 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32852054_32852178:PRRG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 33065394 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000176148:ENST00000532687:exon_33065296_33065658:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000530171:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33065301_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33065296_33065482:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528898:exon_33065296_33065482:TCP11L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 33076191 T/C 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000176148:ENST00000530419:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000334274:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000528107:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000531632:exon_33076139_33076271:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000432887:exon_33076139_33076271:TCP11L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 33738959 G/C 1 100 97 197 47.521450048702 50.9041934527591 -3.38274340405707 C:G G C 10 0.52478549951298 0.668780118788604 ENSG00000085063:ENST00000534312:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000527926:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000525763:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000418830:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000395850:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000533403:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000351554:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000528987:exon_33738916_33741157:CD59;ENSG00000085063:ENST00000415002:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000445143:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000426650:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000437761:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000527577:exon_33738916_33739017:CD59;ENSG00000085063:ENST00000528700:exon_33738916_33739017:CD59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 33880896 T/A 1 55 46 101 26.1367975267861 24.1401329775971 1.99666454918902 A:T T A 10 0.52478549951298 0.76520826034723 ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 34144062 T/G 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34144006_34144139:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34144006_34144139:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34144013_34144139:NAT10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 34162707 G/C 1 66 73 139 31.3641570321433 38.3093414644475 -6.94518443230422 C:G G C 10 0.52478549951298 0.269539141370197 ENSG00000135372:ENST00000452756:exon_34162636_34162755:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000257829:exon_34162636_34162755:NAT10;ENSG00000135372:ENST00000531159:exon_34162636_34162755:NAT10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 34910397 C/T 1 35 45 80 16.6325075170457 23.6153474780841 -6.9828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.145133391051544 ENSG00000149089:ENST00000532428:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395787:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000278359:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000395786:exon_34910299_34910416:APIP;ENSG00000149089:ENST00000527830:exon_34910299_34910416:APIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 34938265 C/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000110435:ENST00000227868:exon_34938119_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000430469:exon_34938179_34938362:PDHX;ENSG00000110435:ENST00000533262:exon_34938188_34938362:PDHX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 35211434 G/A 1 186 276 462 88.3898970905857 144.840797865582 -56.4509007749968 A:G G A 10 0.52478549951298 1.59791436911423e-07 ENSG00000026508:ENST00000263398:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000360158:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437706:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000449691:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000423360:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433354:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000437835:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000415148:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000428726:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000425428:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000433892:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000434472:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000352818:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000442151:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525211:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000526000:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000279452:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000527889:exon_35211382_35211519:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531118:exon_35211382_35211976:CD44;ENSG00000026508:ENST00000528455:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531873:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525209:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000531110:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525685:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000534296:exon_35211382_35211612:CD44;ENSG00000026508:ENST00000525688:exon_35211429_35211612:CD44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 43913604 G/A 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000166199:ENST00000302708:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000529366:exon_43913591_43913679:ALKBH3;ENSG00000166199:ENST00000530754:exon_43913591_43913679:ALKBH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 44104981 C/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000110455:ENST00000448099:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000432284:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000263776:exon_44104974_44105127:ACCS;ENSG00000110455:ENST00000527346:exon_44104974_44105127:ACCS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 44640268 A/G 1 182 160 342 86.4890390886376 83.9656799220768 2.52335916656084 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.828589081597868 ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000529277:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44640190_44640273:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44640190_44640273:CD82 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 45931740 A/G 1 28 19 47 13.3060060136366 9.97092449074662 3.33508152288994 A:G A G 10 0.52478549951298 0.381777744637033 ENSG00000121680:ENST00000523721:exon_45931721_45931863:PEX16;ENSG00000121680:ENST00000378750:exon_45931725_45931863:PEX16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 45935527 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 45955693 G/A 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G G A 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000135365:ENST00000257821:exon_45950871_45955776:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000527401:exon_45950874_45957290:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000323180:exon_45954117_45955776:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000530587:exon_45954898_45955776:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000418153:exon_45955032_45955776:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000525676:exon_45955382_45955776:PHF21A;ENSG00000135365:ENST00000532028:exon_45955536_45955776:PHF21A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46338957 T/G 1 42 9 51 19.9590090204548 4.72306949561682 15.235939524838 T:G T G 10 0.52478549951298 1.45535649061469e-05 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46338977 C/T 1 28 26 54 13.3060060136366 13.6444229873375 -0.338416973700923 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000534616:exon_46338912_46339038:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46338912_46339038:CREB3L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46564091 C/T 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000110497:ENST00000314845:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000533727:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000534300:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000426438:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000314823:exon_46563495_46564531:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000298834:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000458649:exon_46563495_46564948:AMBRA1;ENSG00000110497:ENST00000528950:exon_46563495_46564948:AMBRA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46689353 T/C 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 T:C T C 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000175224:ENST00000395549:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000434074:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000312040:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000451945:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000343175:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000529655:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000530500:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000526508:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000524625:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000359513:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000528494:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000527907:exon_46689323_46689415:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000533316:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000525009:exon_46689323_46689437:ATG13;ENSG00000175224:ENST00000529395:exon_46689323_46689437:ATG13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46701244 C/A 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 A:C C A 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46701198_46701326:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000443332:exon_46701198_46701326:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46701198_46701381:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000528837:exon_46701198_46701326:ARHGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46726260 G/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000175213:ENST00000311764:exon_46725903_46727462:ZNF408 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 46784565 C/T 1 19 28 47 9.02907550925338 14.6939939863634 -5.66491847711006 T:C C T 10 0.52478549951298 0.108834005341341 ENSG00000175216:ENST00000529230:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000415402:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000312055:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000378629:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000354558:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000533413:exon_46784526_46784729:CKAP5;ENSG00000175216:ENST00000526876:exon_46784526_46784585:CKAP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 47188411 C/T 1 45 56 101 21.3846525219159 29.3879879727269 -8.00333545081098 T:C C T 10 0.52478549951298 0.112200435459278 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 47196622 C/T 1 28 23 51 13.3060060136366 12.0700664887985 1.23593952483802 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78019325006684 ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000532478:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000525398:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000531750:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000525314:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527097:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528444:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000524727:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000529599:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528041:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000530596:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533939:exon_47196566_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526185:exon_47195958_47197474:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000528708:exon_47196577_47196649:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000524586:exon_47196612_47196649:ARFGAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 47435028 C/T 0 0 8 8 0 4.19828399610384 -4.19828399610384 T C T 10 0.52478549951298 0.00260086297581477 ENSG00000165915:ENST00000533076:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000441589:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000362021:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000354884:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000526614:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000524928:exon_47434951_47435058:SLC39A13;ENSG00000165915:ENST00000529740:exon_47434951_47435058:SLC39A13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 57068462 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57068358_57068515:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57068358_57068515:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000427750:exon_57068358_57068515:TNKS1BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 57081197 G/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57080008_57081363:TNKS1BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 57157405 A/G 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000186652:ENST00000311862:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000533605:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000525955:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000186652:ENST00000530105:exon_57157360_57157429:PRG2;ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000529411:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8;ENSG00000254979:ENST00000528835:exon_57157360_57157429:RP11-872D17.8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 57259280 G/A 1 14 2 16 6.65300300681828 1.04957099902596 5.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00488490452325773 ENSG00000149150:ENST00000278426:exon_57259189_57259335:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000528450:exon_57259189_57259335:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000529452:exon_57259189_57259335:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000533515:exon_57259189_57259335:SLC43A1;ENSG00000149150:ENST00000530159:exon_57259276_57259335:SLC43A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 57319826 A/G 1 181 221 402 86.0138245881506 115.977595392369 -29.963770804218 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00316835840943266 ENSG00000156587:ENST00000340573:exon_57319129_57319982:UBE2L6;ENSG00000156587:ENST00000287156:exon_57319135_57319982:UBE2L6;ENSG00000156587:ENST00000395113:exon_57319137_57319982:UBE2L6;ENSG00000156587:ENST00000528275:exon_57319745_57319982:UBE2L6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 58318619 C/G 1 40 51 91 19.0085800194808 26.764060475162 -7.75548045568118 C:G C G 10 0.52478549951298 0.115370414458367 ENSG00000110031:ENST00000530561:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000395074:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528954:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000263845:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000412226:exon_58318538_58318705:LPXN;ENSG00000110031:ENST00000528489:exon_58318538_58318705:LPXN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 58980301 G/A 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 A:G G A 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000197629:ENST00000361050:exon_58975983_58980424:MPEG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 59377858 C/T 1 2 9 11 0.95042900097404 4.72306949561682 -3.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0315035899085005 ENSG00000110048:ENST00000263847:exon_59377854_59378062:OSBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 60610056 G/C 1 41 35 76 19.4837945199678 18.3674924829543 1.11630203701352 C:G G C 10 0.52478549951298 0.819289086785524 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 60617834 C/A 1 44 63 107 20.9094380214289 33.0614864693177 -12.1520484478889 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0200637917409682 ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61106642 G/A 1 17 8 25 8.07864650827934 4.19828399610384 3.8803625121755 A:G G A 10 0.52478549951298 0.160229625148168 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106538_61106648:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106538_61106648:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106538_61106648:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106538_61106648:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106590_61106648:DAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61106892 G/C 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61108974 G/A 1 9 19 28 4.27693050438318 9.97092449074662 -5.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0368587069089518 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61108908_61108986:DAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61112802 C/T 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61179285 G/A 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61560081 G/A 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000134825:ENST00000257262:exon_61560028_61560085:C11orf10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61895741 A/G 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 A:G A G 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000533896:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61895623_61895773:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61895623_61895773:INCENP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 61906455 A/T 1 16 11 27 7.60343200779232 5.77264049464278 1.83079151314954 A:T A T 10 0.52478549951298 0.5651214206051 ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62284468 A/C 1 77 82 159 36.5915165375005 43.0324109600644 -6.44089442256382 A:C A C 10 0.52478549951298 0.340707690444839 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62285441 A/G 1 34 25 59 16.1572930165587 13.1196374878245 3.03765552873418 A:G A G 10 0.52478549951298 0.43801794669336 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62285665 C/T 1 27 39 66 12.8307915131495 20.4666344810062 -7.63584296785668 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0647882796401266 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62287828 T/C 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62290719 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62292616 G/T 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:G G T 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62334908 G/C 1 1156 480 1636 549.347962562995 251.89703976623 297.450922796765 A:C:G G C 10 0.52478549951298 1.06411276042800e-50 ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62342818 C/T 1 47 27 74 22.3350815228899 14.1692084868505 8.16587303603948 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0626107566345678 ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62342520_62343716:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000469480:exon_62342530_62344489:TUT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62346420 G/A 1 16 9 25 7.60343200779232 4.72306949561682 2.8803625121755 A:G G A 10 0.52478549951298 0.317499389351278 ENSG00000149016:ENST00000308436:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000476907:exon_62346033_62346502:TUT1;ENSG00000149016:ENST00000278279:exon_62346281_62346502:TUT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62365581 G/A 1 67 72 139 31.8393715326303 37.7845559649346 -5.94518443230422 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.350269197022287 ENSG00000149480:ENST00000278823:exon_62365496_62365613:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000524902:exon_62365496_62365613:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000527204:exon_62365496_62365613:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000531261:exon_62365496_62365601:MTA2;ENSG00000149480:ENST00000526844:exon_62365581_62365862:MTA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62378801 T/C 1 7 14 21 3.32650150340914 7.34699699318172 -4.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0847652640732487 ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62397079 G/A 1 40 25 65 19.0085800194808 13.1196374878245 5.8889425316563 A:G G A 10 0.52478549951298 0.171635314954248 ENSG00000089597:ENST00000532402:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000346178:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000356638:exon_62397060_62397156:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534779:exon_62397060_62397156:GANAB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62430659 T/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:T T A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000162194:ENST00000525675:exon_62430587_62430805:C11orf48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62437425 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000162194:ENST00000354588:exon_62437354_62437513:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000431002:exon_62437113_62439237:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000532208:exon_62437354_62437637:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000415855:exon_62437354_62437487:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000527679:exon_62437354_62437513:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000528115:exon_62437354_62437486:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000377954:exon_62437354_62437487:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000526490:exon_62437354_62438157:C11orf48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62439532 G/T 1 69 79 148 32.7898005336044 41.4580544615254 -8.66825392792104 T:G G T 10 0.52478549951298 0.162145044748055 ENSG00000204922:ENST00000531323:exon_62439425_62441049:C11orf83;ENSG00000204922:ENST00000377953:exon_62439425_62439848:C11orf83 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 62558063 C/T 1 46 49 95 21.8598670224029 25.714489476136 -3.8546224537331 T:C C T 10 0.52478549951298 0.472432657857485 ENSG00000168569:ENST00000307366:exon_62557443_62558387:TMEM223 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 63357620 G/A 1 70 66 136 33.2650150340914 34.6358429678567 -1.37082793376528 A:G G A 10 0.52478549951298 0.863767726605984 ENSG00000176485:ENST00000323646:exon_63357572_63357840:PLA2G16;ENSG00000176485:ENST00000415826:exon_63357572_63357840:PLA2G16;ENSG00000176485:ENST00000394613:exon_63357572_63357840:PLA2G16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 63519992 G/A 1 11 14 25 5.22735950535722 7.34699699318172 -2.1196374878245 A:G G A 10 0.52478549951298 0.428503043615975 ENSG00000133318:ENST00000341307:exon_63519979_63520117:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000339997:exon_63519979_63520117:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000356000:exon_63519979_63520117:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000377819:exon_63519979_63520117:RTN3;ENSG00000133318:ENST00000354497:exon_63519979_63520117:RTN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 63585445 G/A 1 20 30 50 9.5042900097404 15.7435649853894 -6.239274975649 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0891458588577209 ENSG00000168005:ENST00000294244:exon_63585277_63585606:C11orf84 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 63742174 C/T 1 513 459 972 243.785038749841 240.876544276458 2.9084944733834 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.872444115655108 ENSG00000176340:ENST00000314133:exon_63742079_63742266:COX8A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 63988045 G/A 1 144 173 317 68.4308880701309 90.7878914157455 -22.3570033456147 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0132401144072426 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 63990598 C/T 1 245 233 478 116.42755261932 122.275021386524 -5.84746876720445 T:C C T 10 0.52478549951298 0.614509363613161 ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63990520_63990661:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63990520_63990661:FERMT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64054218 C/A 1 5 13 18 2.3760725024351 6.82221149366874 -4.44613899123364 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0560173488896552 ENSG00000173264:ENST00000411458:exon_64053982_64054353:GPR137;ENSG00000173264:ENST00000377702:exon_64053982_64054353:GPR137;ENSG00000173264:ENST00000438980:exon_64053982_64054353:GPR137;ENSG00000173264:ENST00000313074:exon_64053892_64054353:GPR137 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64107735 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64107695_64107798:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64107695_64107798:CCDC88B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64109118 T/G 1 1 9 10 0.47521450048702 4.72306949561682 -4.2478549951298 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0086577597267804 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64111928 T/C 1 22 19 41 10.4547190107144 9.97092449074662 0.48379451996782 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64119060 G/A 1 21 31 52 9.97950451022742 16.2683504849024 -6.28884597467496 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0952928718443773 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64118632_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64118948_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64118632_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64118948_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64118948_64119088:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64118948_64119088:CCDC88B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64121190 C/G 1 68 50 118 32.3145860331174 26.239274975649 6.07531105746835 C:G C G 10 0.52478549951298 0.270197797564341 ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000491320:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000479965:exon_64121187_64121285:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000473405:exon_64121187_64121285:CCDC88B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64566899 A/G 1 11 22 33 5.22735950535722 11.5452809892856 -6.31792148392834 A:C:G A G 10 0.52478549951298 0.0352792131345572 ENSG00000168067:ENST00000435926:exon_64566893_64566951:MAP4K2;ENSG00000168067:ENST00000294066:exon_64566893_64566951:MAP4K2;ENSG00000168067:ENST00000377350:exon_64566893_64566951:MAP4K2;ENSG00000168067:ENST00000433890:exon_64566893_64566951:MAP4K2;ENSG00000168067:ENST00000489952:exon_64566893_64566951:MAP4K2;ENSG00000168067:ENST00000467689:exon_64566893_64566951:MAP4K2;ENSG00000168067:ENST00000439069:exon_64566893_64566951:MAP4K2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64662415 A/C 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:C A C 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662018_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662019_64662681:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662019_64662681:ATG2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64806270 C/T 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64806044_64806301:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64802992_64806301:SNX15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64807235 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000110025:ENST00000301886:exon_64807158_64808042:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000377244:exon_64807158_64808044:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000352068:exon_64807158_64807264:SNX15;ENSG00000110025:ENST00000526702:exon_64807158_64808042:SNX15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64811755 G/A 1 13 8 21 6.17778850633126 4.19828399610384 1.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.513297365553358 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000533017:exon_64811697_64812145:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64812173 A/G 1 22 15 37 10.4547190107144 7.8717824926947 2.58293651801974 A:G A G 10 0.52478549951298 0.415644114388946 ENSG00000168061:ENST00000531072:exon_64811697_64812271:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000398846:exon_64811697_64812299:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000528109:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000530213:exon_64811697_64812300:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000301885:exon_64811697_64812199:SAC3D1;ENSG00000168061:ENST00000529996:exon_64811697_64812300:SAC3D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64813918 C/T 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531174:exon_64813471_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64813661_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64813917_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000524445:exon_64813854_64813998:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000427272:exon_64813861_64813998:NAALADL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64814965 A/G 0 0 8 8 0 4.19828399610384 -4.19828399610384 G A G 10 0.52478549951298 0.00260086297581477 ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64814947_64815037:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000427272:exon_64814947_64815037:NAALADL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64815138 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000168060:ENST00000532450:exon_64815119_64815204:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000358658:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355369:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000339885:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526799:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529274:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528977:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000340252:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000355721:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000356632:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000526516:exon_64815119_64815409:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000532802:exon_64815119_64815358:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530995:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533842:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000533340:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531746:exon_64815119_64815328:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000528884:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000531174:exon_64815119_64815359:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000529685:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000453486:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000530139:exon_64815119_64815405:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000524445:exon_64815119_64815210:NAALADL1;ENSG00000168060:ENST00000427272:exon_64815119_64815210:NAALADL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64846898 T/G 1 24 11 35 11.4051480116885 5.77264049464278 5.6325075170457 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0631077479517689 ENSG00000146670:ENST00000275517:exon_64846825_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000524733:exon_64846825_64847021:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000404147:exon_64846560_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000479032:exon_64846825_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000531401:exon_64846825_64847259:CDCA5;ENSG00000146670:ENST00000527430:exon_64846825_64847259:CDCA5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64893365 T/A 1 32 40 72 15.2068640155846 20.9914199805192 -5.78455596493456 A:T T A 10 0.52478549951298 0.194467352367855 ENSG00000149792:ENST00000524482:exon_64893198_64894828:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000528529:exon_64893198_64893774:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000534078:exon_64893198_64893476:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000526319:exon_64893198_64893414:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000279242:exon_64893198_64894843:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000533943:exon_64893198_64893650:MRPL49;ENSG00000149792:ENST00000532671:exon_64893198_64894835:MRPL49 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 64950436 C/A 1 43 39 82 20.4342235209419 20.4666344810062 -0.0324109600643609 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000014216:ENST00000528396:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000529133:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533820:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530571:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527739:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526966:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533129:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000524773:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000530442:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000279247:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000259755:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000528739:exon_64950373_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527189:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527469:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000534373:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000526954:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000531068:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527699:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000533909:exon_64950172_64950439:CAPN1;ENSG00000014216:ENST00000527323:exon_64949933_64950439:CAPN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65144075 T/C 1 11 1 12 5.22735950535722 0.52478549951298 4.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00706766844417671 ENSG00000162241:ENST00000534338:exon_65144007_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65142663_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65142665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65142666_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65143665_65144146:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65143699_65144115:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000533629:exon_65144028_65144146:SLC25A45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65144519 A/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G A G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000162241:ENST00000534338:exon_65144289_65145496:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000527174:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000534028:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000360662:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000398802:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000417511:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000377152:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000294187:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000531791:exon_65144289_65147409:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526898:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526432:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000332723:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000533629:exon_65144289_65144547:SLC25A45;ENSG00000162241:ENST00000526259:exon_65144382_65144547:SLC25A45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65168281 C/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65266519 C/T 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.184519324149502 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65270910 A/G 1 201 199 400 95.518114597891 104.432314403083 -8.91419980519201 A:G A G 10 0.52478549951298 0.394780676505388 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65273160 G/A 1 181 186 367 86.0138245881506 97.6101029094143 -11.5962783212637 A:G G A 10 0.52478549951298 0.229677679973664 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65347431 G/A 1 12 18 30 5.70257400584424 9.44613899123364 -3.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.201719558866690 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65347407_65347460:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65347407_65347460:EHBP1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65358028 C/T 1 67 50 117 31.8393715326303 26.239274975649 5.60009655698133 T:C C T 10 0.52478549951298 0.310002235252273 ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65357964_65358063:EHBP1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65367046 C/A 1 27 24 51 12.8307915131495 12.5948519883115 0.235939524838017 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173327:ENST00000309100:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000532507:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000530153:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000524848:exon_65366865_65367239:MAP3K11;ENSG00000173327:ENST00000534432:exon_65366922_65367239:MAP3K11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65412467 G/A 1 23 22 45 10.9299335112015 11.5452809892856 -0.6153474780841 A:G G A 10 0.52478549951298 0.882236832465206 ENSG00000213445:ENST00000534313:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000527525:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394224:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000394227:exon_65412426_65412600:SIPA1;ENSG00000213445:ENST00000308755:exon_65412426_65412600:SIPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65426208 C/G 1 12 14 26 5.70257400584424 7.34699699318172 -1.64442298733748 C:G C G 10 0.52478549951298 0.559996501494547 ENSG00000173039:ENST00000406246:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000525693:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000308639:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000531484:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000526283:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000532999:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000529389:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000525658:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000533546:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000526738:exon_65426073_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000527909:exon_65426189_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000534558:exon_65426201_65426293:RELA;ENSG00000173039:ENST00000527749:exon_65426203_65426293:RELA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65545306 C/A 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 A:C C A 10 0.52478549951298 0.491891556397476 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65545913 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65546474 C/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65623519 G/A 1 2643 2811 5454 1255.99192478719 1475.17203913099 -219.180114343793 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 3.07259869183077e-09 ENSG00000172757:ENST00000525451:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530945:exon_65622303_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000308162:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000527344:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531407:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000524553:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534769:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000531413:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000532134:exon_65623406_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000534784:exon_65623428_65623713:CFL1;ENSG00000172757:ENST00000526975:exon_65623445_65623713:CFL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65631167 C/T 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631071_65631192:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631104_65631372:MUS81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65631973 G/A 1 19 16 35 9.02907550925338 8.39656799220768 0.632507517045699 A:G G A 10 0.52478549951298 0.86707073071707 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65630881_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65631968_65632084:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65631968_65632084:MUS81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65632262 G/T 1 21 21 42 9.97950451022742 11.0204954897726 -1.04099097954516 T:G G T 10 0.52478549951298 0.759841909015547 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529374:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65632191_65632794:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65632191_65632616:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525147:exon_65632191_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000525224:exon_65632215_65632286:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529786:exon_65632191_65632286:MUS81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65633460 T/G 1 46 31 77 21.8598670224029 16.2683504849024 5.59151653750054 T:G T G 10 0.52478549951298 0.211252485801427 ENSG00000172732:ENST00000533035:exon_65633457_65633911:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000437855:exon_65633457_65633912:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000308110:exon_65633457_65633910:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000524647:exon_65633457_65633888:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000531905:exon_65633282_65633909:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530928:exon_65633457_65633889:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000530282:exon_65633282_65633646:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000533519:exon_65633457_65633910:MUS81;ENSG00000172732:ENST00000529742:exon_65633282_65633910:MUS81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65688377 C/G 1 168 191 359 79.8360360818194 100.234030406979 -20.3979943251598 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0344061214105104 ENSG00000175550:ENST00000312515:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000525501:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000376991:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000531121:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000527119:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000532933:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000530791:exon_65688355_65688443:DRAP1;ENSG00000175550:ENST00000534333:exon_65688355_65688443:DRAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65733685 C/T 1 102 95 197 48.471879049676 49.8546224537331 -1.38274340405707 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.886607565969429 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733547_65733689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733547_65734027:SART1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65746136 G/T 1 107 147 254 50.8479515521111 77.1434684284081 -26.2955168762969 T:C:G G T 10 0.52478549951298 0.00105495908429038 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529580:exon_65746071_65746160:SART1;ENSG00000175467:ENST00000528137:exon_65745958_65746160:SART1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65746305 C/T 1 120 90 210 57.0257400584424 47.2306949561682 9.79504510227419 T:C C T 10 0.52478549951298 0.189338988233768 ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65746264_65746385:SART1;ENSG00000175467:ENST00000417603:exon_65746264_65746385:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529580:exon_65746264_65746428:SART1;ENSG00000175467:ENST00000528137:exon_65746264_65746385:SART1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65766092 C/T 1 23 23 46 10.9299335112015 12.0700664887985 -1.14013297759708 T:C C T 10 0.52478549951298 0.76927420528627 ENSG00000175376:ENST00000526451:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000312234:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000525767:exon_65765860_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529964:exon_65765904_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000533544:exon_65765964_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000527249:exon_65766038_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529973:exon_65766085_65766214:EIF1AD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 65826398 C/T 1 181 158 339 86.0138245881506 82.9161089230508 3.09771566509977 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744533656179701 ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826301_65826516:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826301_65826516:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000533595:exon_65826301_65826401:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826301_65826516:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000530322:exon_65826301_65826515:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826078_65826516:SF3B2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66002822 A/G 1 24 17 41 11.4051480116885 8.92135349172066 2.48379451996782 A:G A G 10 0.52478549951298 0.532224426849765 ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_66002772_66002874:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_66002772_66002874:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529795:exon_66002772_66002988:PACS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66033201 A/G 1 12 31 43 5.70257400584424 16.2683504849024 -10.5657764790581 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00124013957455354 ENSG00000174996:ENST00000417856:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000414181:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394067:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000316924:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000421552:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000452607:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000454322:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394066:exon_66033126_66033234:KLC2;ENSG00000174996:ENST00000394065:exon_66033126_66033234:KLC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66249888 G/C 1 25 37 62 11.8803625121755 19.4170634819803 -7.53670096980476 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0573568730325017 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66249651_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531272:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66249760_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66249667_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66249664_66249941:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531314:exon_66249664_66249941:DPP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66254085 G/T 1 13 8 21 6.17778850633126 4.19828399610384 1.97950451022742 T:G G T 10 0.52478549951298 0.513297365553358 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000531354:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66254011_66254148:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66254011_66254148:DPP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66255396 C/T 1 21 19 40 9.97950451022742 9.97092449074662 0.00858001948079945 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66255385_66255478:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66255385_66255478:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66255385_66255478:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66255385_66255478:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532019:exon_66255385_66255429:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000526515:exon_66255385_66255412:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66255385_66255478:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000533725:exon_66255385_66255478:DPP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66272237 G/A 1 59 58 117 28.0376555287342 30.4375589717528 -2.39990344301867 A:G G A 10 0.52478549951298 0.711389630101692 ENSG00000254986:ENST00000531863:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000532677:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000453114:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000360510:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000530165:exon_66272083_66272245:DPP3;ENSG00000254986:ENST00000347422:exon_66272083_66272245:DPP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66366714 C/T 1 35 7 42 16.6325075170457 3.67349849659086 12.9590090204548 T:C C T 10 0.52478549951298 3.81964507434317e-05 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66366587_66366724:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66366587_66367107:CCS;ENSG00000173992:ENST00000526066:exon_66366587_66367274:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66366587_66366724:CCS;ENSG00000173992:ENST00000526058:exon_66366587_66367082:CCS;ENSG00000173992:ENST00000531990:exon_66366587_66367107:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66366587_66366724:CCS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 66373001 A/G 1 38 44 82 18.0581510185068 23.0905619785711 -5.03241096006436 A:G A G 10 0.52478549951298 0.271154051404017 ENSG00000173992:ENST00000533244:exon_66372960_66373063:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530384:exon_66372960_66373063:CCS;ENSG00000173992:ENST00000530961:exon_66372960_66373063:CCS;ENSG00000173992:ENST00000310190:exon_66372960_66373063:CCS;ENSG00000173992:ENST00000534763:exon_66372960_66373063:CCS;ENSG00000173992:ENST00000525435:exon_66372960_66373063:CCS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 67173125 C/T 1 25 24 49 11.8803625121755 12.5948519883115 -0.714489476136023 T:C C T 10 0.52478549951298 0.886764752655988 ENSG00000175463:ENST00000526387:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529635:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000312390:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000530967:exon_67173066_67173219:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000533745:exon_67173066_67173172:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000529132:exon_67173066_67173559:TBC1D10C;ENSG00000175463:ENST00000526474:exon_67173066_67176604:TBC1D10C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 67266453 A/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G A G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67266411_67266472:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67266411_67266472:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67266411_67266472:PITPNM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 67395646 C/T 1 29 43 72 13.7812205141236 22.5657764790581 -8.78455596493456 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0444047711524688 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 67395714 C/T 1 31 38 69 14.7316495150976 19.9418489814932 -5.21019946639562 T:C C T 10 0.52478549951298 0.228854456732388 ENSG00000167799:ENST00000301490:exon_67395409_67395871:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000376693:exon_67395410_67395722:NUDT8;ENSG00000167799:ENST00000534054:exon_67395410_67395871:NUDT8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 67833355 G/A 1 15 15 30 7.1282175073053 7.8717824926947 -0.743564985389401 A:G G A 10 0.52478549951298 0.855855880845914 ENSG00000110721:ENST00000265689:exon_67833253_67833361:CHKA;ENSG00000110721:ENST00000525155:exon_67833253_67833361:CHKA;ENSG00000110721:ENST00000356135:exon_67833253_67833361:CHKA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 69063728 G/C 1 1 11 12 0.47521450048702 5.77264049464278 -5.29742599415576 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00232665681279723 ENSG00000172927:ENST00000308946:exon_69063059_69064753:MYEOV HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 69462856 C/T 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71146577 G/A 1 39 47 86 18.5333655189938 24.6649184771101 -6.13155295811628 A:G G A 10 0.52478549951298 0.196154000202699 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71146691 A/G 1 35 35 70 16.6325075170457 18.3674924829543 -1.7349849659086 A:G A G 10 0.52478549951298 0.7203120478924 ENSG00000172893:ENST00000407721:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000355527:exon_71145460_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000533800:exon_71146488_71146885:DHCR7;ENSG00000172893:ENST00000525137:exon_71146354_71147019:DHCR7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71169547 G/C 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 C:G G C 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71185518 T/C 1 13 16 29 6.17778850633126 8.39656799220768 -2.21877948587642 T:C T C 10 0.52478549951298 0.459765747223042 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71195379 C/T 1 44 24 68 20.9094380214289 12.5948519883115 8.31458603311736 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0514694694773412 ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529840:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530055:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000526039:exon_71195358_71195493:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000531236:exon_71195358_71196694:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524450:exon_71195358_71195438:NADSYN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71260243 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000254997:ENST00000528743:exon_71259464_71260599:KRTAP5-9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71701751 A/G 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137522:ENST00000361756:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530655:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000393713:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000490867:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000528683:exon_71701643_71701842:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000526549:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000525243:exon_71701643_71701763:RNF121;ENSG00000137522:ENST00000530137:exon_71701643_71701763:RNF121 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71712361 G/A 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000137496:ENST00000393703:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000393705:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000337131:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000531053:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000343898:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000404792:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000534583:exon_71712247_71712370:IL18BP;ENSG00000137496:ENST00000260049:exon_71712247_71712370:IL18BP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71714526 G/C 1 75 63 138 35.6410875365265 33.0614864693177 2.57960106720876 C:G G C 10 0.52478549951298 0.671033626043156 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71714528 T/G 1 71 61 132 33.7402295345784 32.0119154702918 1.72831406428664 T:G T G 10 0.52478549951298 0.794140217051587 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71714557 C/G 1 52 61 113 24.711154025325 32.0119154702918 -7.30076144496675 C:G C G 10 0.52478549951298 0.187329519581156 ENSG00000137496:ENST00000497194:exon_71712451_71714799:IL18BP;ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71713911_71714584:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71713911_71714584:NUMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71717300 C/T 1 31 31 62 14.7316495150976 16.2683504849024 -1.53670096980476 T:C C T 10 0.52478549951298 0.704929348812243 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71717081_71717309:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71717081_71717309:NUMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71718413 C/T 1 26 22 48 12.3555770126625 11.5452809892856 0.810296023376958 T:C C T 10 0.52478549951298 0.885507490487941 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71718235_71718481:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71718235_71718481:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71718235_71718481:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000351960:exon_71718235_71718481:NUMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71725612 A/G 1 14 12 26 6.65300300681828 6.29742599415576 0.355577012662518 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137497:ENST00000393695:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000359652:exon_71723941_71727306:NUMA1;ENSG00000137497:ENST00000358965:exon_71723941_71727306:NUMA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 71806515 A/G 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000241994:ENST00000289488:exon_71806425_71807941:AP000812.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 73536836 G/C 1 65 44 109 30.8889425316563 23.0905619785711 7.79838055308518 C:G G C 10 0.52478549951298 0.150283619352357 ENSG00000175581:ENST00000310614:exon_73536753_73536841:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000411840:exon_73536753_73536841:MRPL48;ENSG00000175581:ENST00000398483:exon_73536753_73536841:MRPL48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 73610250 G/T 1 20 17 37 9.5042900097404 8.92135349172066 0.582936518019739 T:G G T 10 0.52478549951298 0.870886918421587 ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73610191_73610289:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73610191_73610289:PAAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 74329615 T/C 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 75152243 C/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000158555:ENST00000526177:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000527820:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533784:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000529721:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000336898:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000533805:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000376282:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443415:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000443276:exon_75152208_75152355:GDPD5;ENSG00000158555:ENST00000534322:exon_75152208_75152355:GDPD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 77348779 A/T 1 94 84 178 44.6701630457799 44.0819819590903 0.588181086689559 A:T A T 10 0.52478549951298 0.940333847427984 ENSG00000074201:ENST00000525428:exon_77348635_77348850:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000263309:exon_77348635_77348796:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000525064:exon_77348635_77348817:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000532069:exon_77348635_77348839:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000527133:exon_77348635_77348827:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000528364:exon_77348635_77348821:CLNS1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 77404612 G/A 1 17 10 27 8.07864650827934 5.2478549951298 2.83079151314954 A:G G A 10 0.52478549951298 0.336737529516327 ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77404552_77404656:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77404552_77404656:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77404552_77404656:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77404552_77404656:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77404552_77404656:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77404552_77404656:RSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 77553674 G/A 1 31 9 40 14.7316495150976 4.72306949561682 10.0085800194808 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00137638336176844 ENSG00000087884:ENST00000532481:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526164:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000526415:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000393427:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000527134:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000304716:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000263301:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525409:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000533193:exon_77553525_77553674:C11orf67;ENSG00000087884:ENST00000525034:exon_77553525_77553674:C11orf67 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 78189715 C/T 1 14 4 18 6.65300300681828 2.09914199805192 4.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0345215058348639 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78189631_78189729:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78189631_78189729:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000525345:exon_78189631_78189729:NARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 78279744 T/C 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C T C 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 78279790 T/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:G T G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000137513:ENST00000281038:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000528850:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529880:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000529571:exon_78279678_78279798:NARS2;ENSG00000137513:ENST00000526709:exon_78279761_78279798:NARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 82564294 T/G 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 T:G T G 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000137509:ENST00000313010:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000393399:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531801:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534631:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000527444:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000531128:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534396:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000529671:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000528082:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000532809:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000533126:exon_82564219_82564320:PRCP;ENSG00000137509:ENST00000534264:exon_82564236_82564320:PRCP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 87908563 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000123892:ENST00000243662:exon_87908351_87908635:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000531138:exon_87908351_87908601:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000526372:exon_87908406_87908602:RAB38;ENSG00000123892:ENST00000441495:exon_87908351_87908635:RAB38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 88061349 T/C 1 532 646 1178 252.814114259095 339.011432685385 -86.1973184262905 T:C T C 10 0.52478549951298 5.05651740096551e-07 ENSG00000109861:ENST00000524463:exon_88061280_88061364:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000393302:exon_88061280_88061364:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000415415:exon_88061280_88061364:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000528020:exon_88061280_88061366:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000529974:exon_88061280_88061364:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000393301:exon_88061280_88061364:CTSC;ENSG00000109861:ENST00000320621:exon_88061286_88061364:CTSC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 89935586 G/T 1 18 14 32 8.55386100876636 7.34699699318172 1.20686401558464 T:G G T 10 0.52478549951298 0.725609418966872 ENSG00000110172:ENST00000320585:exon_89934328_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529987:exon_89934612_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000533724:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000457199:exon_89934617_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000529726:exon_89935117_89935719:CHORDC1;ENSG00000110172:ENST00000525317:exon_89935575_89935719:CHORDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 92881783 T/C 1 13 13 26 6.17778850633126 6.82221149366874 -0.644422987337482 T:C T C 10 0.52478549951298 0.846079846003371 ENSG00000180773:ENST00000326402:exon_92880307_92882010:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000527503:exon_92881314_92882010:SLC36A4;ENSG00000180773:ENST00000529184:exon_92881481_92882010:SLC36A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 95712897 G/T 1 3 10 13 1.42564350146106 5.2478549951298 -3.82221149366874 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0488102416519216 ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 96117590 T/C 1 27 38 65 12.8307915131495 19.9418489814932 -7.1110574683437 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0827370877345573 ENSG00000149231:ENST00000278520:exon_96117126_96117925:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000423339:exon_96117126_96118154:CCDC82;ENSG00000149231:ENST00000530106:exon_96117126_96117933:CCDC82 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 104900488 G/A 1 18 33 51 8.55386100876636 17.3179214839283 -8.76406047516198 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0165815973892448 ENSG00000137752:ENST00000532439:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000526568:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000527979:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000533400:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000436863:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000415981:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000393136:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000446369:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000525825:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000534497:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000529871:exon_104900392_104900626:CASP1;ENSG00000137752:ENST00000528974:exon_104900392_104900626:CASP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 107197606 G/C 1 14 19 33 6.65300300681828 9.97092449074662 -3.31792148392834 C:G G C 10 0.52478549951298 0.296397632638428 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107197071_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107197074_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107197086_107197779:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107197523_107197779:CWF19L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 107299966 T/G 1 7 13 20 3.32650150340914 6.82221149366874 -3.4957099902596 T:G T G 10 0.52478549951298 0.124132788642938 ENSG00000152404:ENST00000282251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000409771:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000431778:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000532251:exon_107299525_107300177:CWF19L2;ENSG00000152404:ENST00000433523:exon_107299525_107300177:CWF19L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 110118364 A/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:C A C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 111754574 A/C 1 53 191 244 25.1863685258121 100.234030406979 -75.0476618811671 A:C A C 10 0.52478549951298 9.5607442294368e-23 ENSG00000137720:ENST00000528125:exon_111754495_111754624:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000260276:exon_111754495_111756699:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000530214:exon_111754495_111754798:C11orf1;ENSG00000137720:ENST00000529270:exon_111754495_111754793:C11orf1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 111904160 C/T 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 T:C C T 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111904128_111904254:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111904128_111904254:DLAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 111909973 C/T 1 15 12 27 7.1282175073053 6.29742599415576 0.830791513149538 T:C C T 10 0.52478549951298 0.848083276492106 ENSG00000150768:ENST00000280346:exon_111909968_111910121:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000533297:exon_111909968_111910121:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000393051:exon_111909968_111910121:DLAT;ENSG00000150768:ENST00000531306:exon_111909968_111910121:DLAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 111959625 C/T 1 5 29 34 2.3760725024351 15.2187794858764 -12.8427069834413 T:C C T 10 0.52478549951298 7.01405066654656e-06 ENSG00000204370:ENST00000375549:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528182:exon_111959591_111959728:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000528021:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000526592:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000525291:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000530923:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000204370:ENST00000534010:exon_111959591_111959735:SDHD;ENSG00000255292:ENST00000531744:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000532699:exon_111959591_111959735:AP002884.2;ENSG00000255292:ENST00000525987:exon_111959591_111959735:AP002884.2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 113618283 T/C 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000086827:ENST00000200135:exon_113618253_113618435:ZW10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 116633650 G/A 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 116633825 C/T 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 116655595 C/T 1 47 58 105 22.3350815228899 30.4375589717528 -8.1024774488629 T:C C T 10 0.52478549951298 0.118628773141915 ENSG00000109917:ENST00000429220:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116655571_116655637:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000449430:exon_116655575_116655637:ZNF259 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 116658295 G/A 1 21 16 37 9.97950451022742 8.39656799220768 1.58293651801974 A:G G A 10 0.52478549951298 0.625646683163687 ENSG00000109917:ENST00000444935:exon_116658198_116658359:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000227322:exon_116658198_116658359:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000431973:exon_116658198_116658318:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000425791:exon_116658198_116658359:ZNF259;ENSG00000109917:ENST00000487030:exon_116658198_116658703:ZNF259 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 117062989 C/T 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000149577:ENST00000324225:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000278951:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529441:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000431081:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000529484:exon_117062970_117063078:SIDT2;ENSG00000149577:ENST00000525065:exon_117062970_117063078:SIDT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 117075048 C/T 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000149591:ENST00000392951:exon_117074931_117075273:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000525531:exon_117074931_117075257:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000278968:exon_117074931_117075498:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000533863:exon_117074498_117075476:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000530649:exon_117074931_117075492:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000532870:exon_117074931_117075494:TAGLN;ENSG00000149591:ENST00000529622:exon_117074931_117075121:TAGLN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 117097952 C/T 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000160613:ENST00000320934:exon_117097873_117098038:PCSK7;ENSG00000160613:ENST00000525027:exon_117097873_117098038:PCSK7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 117280517 C/G 1 3 9 12 1.42564350146106 4.72306949561682 -3.29742599415576 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0806544853661951 ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117280334_117280681:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117280334_117280681:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533675:exon_117280334_117280681:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533706:exon_117280334_117280681:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533223:exon_117280334_117281417:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000528706:exon_117279733_117280681:CEP164 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 118471423 T/C 1 15 14 29 7.1282175073053 7.34699699318172 -0.218779485876421 T:C:G T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000095139:ENST00000392859:exon_118471340_118471708:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000359415:exon_118471340_118473643:ARCN1;ENSG00000095139:ENST00000264028:exon_118471340_118473643:ARCN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 118919206 T/C 1 85 49 134 40.3932325413967 25.714489476136 14.6787430652607 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0119565536816400 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 118925953 C/T 1 27 22 49 12.8307915131495 11.5452809892856 1.28551052386398 T:C C T 10 0.52478549951298 0.775680730358209 ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526571:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531694:exon_118925897_118926130:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534233:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000526656:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000534654:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531968:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529683:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532421:exon_118925897_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000533381:exon_118925735_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530467:exon_118925867_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000527038:exon_118925896_118926051:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529174:exon_118925914_118926051:HYOU1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 118940957 C/G 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 C:G C G 10 0.52478549951298 0.490446391716001 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 118971760 T/G 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:G T G 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000172269:ENST00000409993:exon_118971728_118971848:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000354202:exon_118971728_118971848:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000481084:exon_118971728_118972852:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000414373:exon_118971728_118971848:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000525456:exon_118971340_118971838:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000460183:exon_118971728_118972570:DPAGT1;ENSG00000172269:ENST00000472016:exon_118971640_118971848:DPAGT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 119005132 C/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000172273:ENST00000437496:exon_119004794_119005764:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000350777:exon_119004794_119006752:HINFP;ENSG00000172273:ENST00000527755:exon_119004794_119005764:HINFP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 119050730 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000481860:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119050402_119050997:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119050402_119050997:NLRX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 121466468 C/T 1 14 12 26 6.65300300681828 6.29742599415576 0.355577012662518 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121466332_121466481:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121466332_121466481:SORL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 122929407 T/G 1 1839 1692 3531 873.91946639563 887.937065175962 -14.0175987803325 A:T:C:G T G 10 0.52478549951298 0.637127266448408 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122928960_122929969:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000524552:exon_122929340_122929538:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526686:exon_122929340_122929805:HSPA8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 122930227 T/C 1 1672 1658 3330 794.558644814297 870.094358192521 -75.5357133782235 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.00879494108186415 ENSG00000109971:ENST00000532636:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000533540:exon_122930181_122930556:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534624:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000453788:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000532091:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000227378:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000534319:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526110:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000392773:exon_122930181_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000526862:exon_122930181_122930470:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000527983:exon_122929941_122930736:HSPA8;ENSG00000109971:ENST00000528292:exon_122930184_122930736:HSPA8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 124623492 T/C 1 87 73 160 41.3436615423707 38.3093414644475 3.0343200779232 T:C T C 10 0.52478549951298 0.635984166106754 ENSG00000149564:ENST00000485116:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000417453:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000278927:exon_124623019_124623857:ESAM;ENSG00000149564:ENST00000464067:exon_124623095_124623857:ESAM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 124967487 T/A 1 23 21 44 10.9299335112015 11.0204954897726 -0.0905619785711202 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000150433:ENST00000455225:exon_124966398_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531909:exon_124966441_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527257:exon_124966931_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000528724:exon_124966967_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531262:exon_124967038_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532156:exon_124967139_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000532407:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000279968:exon_124967140_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000531851:exon_124967153_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000526175:exon_124967222_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527766:exon_124967235_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529609:exon_124967338_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000529583:exon_124967382_124967636:TMEM218;ENSG00000150433:ENST00000527271:exon_124967426_124967636:TMEM218 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125442423 G/A 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 A:G G A 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000529812:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534546:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531636:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000524723:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000529765:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527842:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527520:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527131:exon_125442354_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527235:exon_125442353_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125442353_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125442412_125442465:EI24;ENSG00000149547:ENST00000526081:exon_125442414_125442465:EI24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125452313 A/G 1 25 14 39 11.8803625121755 7.34699699318172 4.53336551899378 A:G A G 10 0.52478549951298 0.152832659716465 ENSG00000149547:ENST00000530985:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000531350:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000534430:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000525737:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527628:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000527675:exon_125452242_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000278903:exon_125452302_125452315:EI24;ENSG00000149547:ENST00000343678:exon_125452306_125452315:EI24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125465862 T/C 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 T:C T C 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000134910:ENST00000527606:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525652:exon_125465776_125465898:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529886:exon_125465776_125465898:STT3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125476252 C/G 1 16 13 29 7.60343200779232 6.82221149366874 0.781220514123579 C:G C G 10 0.52478549951298 0.85350802638375 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526213:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000527456:exon_125476196_125476360:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525431:exon_125476105_125476360:STT3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125479363 G/A 1 34 30 64 16.1572930165587 15.7435649853894 0.413728031169278 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000534472:exon_125479329_125479793:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000526726:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531001:exon_125479329_125479484:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000524639:exon_125479314_125479484:STT3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125488404 C/T 1 113 97 210 53.6992385550333 50.9041934527591 2.79504510227419 T:C C T 10 0.52478549951298 0.72997025843886 ENSG00000134910:ENST00000392708:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000529196:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000531491:exon_125488268_125488456:STT3A;ENSG00000134910:ENST00000525946:exon_125488268_125488456:STT3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125763746 C/G 1 77 83 160 36.5915165375005 43.5571964595773 -6.9656799220768 A:C:G C G 10 0.52478549951298 0.303463448657872 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 125766044 C/A 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000534158:exon_125765802_125766225:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000529801:exon_125765865_125766225:PUS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 130131262 C/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:C C A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000196323:ENST00000528448:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000525842:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000338191:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000397753:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000454539:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000445008:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000357899:exon_130130751_130131824:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000530205:exon_130130751_130131784:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000529982:exon_130130751_130131329:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000527478:exon_130130751_130131757:ZBTB44;ENSG00000196323:ENST00000529348:exon_130130751_130131826:ZBTB44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 134047243 T/C 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 T:C T C 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134047114_134047352:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000530396:exon_134047114_134047970:NCAPD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 11 134115394 G/A 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 A:G G A 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000151502:ENST00000281187:exon_134115338_134117686:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000525095:exon_134115338_134115623:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000531741:exon_134115338_134116181:VPS26B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 416693 T/A 1 6 12 18 2.85128700292212 6.29742599415576 -3.44613899123364 A:T T A 10 0.52478549951298 0.154993529862929 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_416620_417171:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_416620_417171:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_416620_417171:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_416620_417171:KDM5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 417010 G/A 1 21 30 51 9.97950451022742 15.7435649853894 -5.76406047516198 A:G G A 10 0.52478549951298 0.122961993024092 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_416620_417171:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_416620_417171:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_416620_417171:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_416620_417171:KDM5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 422357 C/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 C:G C G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000073614:ENST00000399788:exon_422222_422360:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000399787:exon_422222_422360:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000261253:exon_422222_422360:KDM5A;ENSG00000073614:ENST00000382815:exon_422222_422360:KDM5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 2061585 G/A 1 20 18 38 9.5042900097404 9.44613899123364 0.0581510185067593 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000151065:ENST00000280665:exon_2061582_2062454:DCP1B;ENSG00000151065:ENST00000397173:exon_2061582_2062454:DCP1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 2930027 G/A 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000111203:ENST00000228799:exon_2929890_2930038:ITFG2;ENSG00000111203:ENST00000419778:exon_2929890_2930038:ITFG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 2968748 A/G 1 28 39 67 13.3060060136366 20.4666344810062 -7.16062846736966 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0871321498727552 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2966852_2968829:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2966852_2968829:FOXM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 2973615 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 4459032 G/A 1 33 25 58 15.6820785160717 13.1196374878245 2.56244102824716 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.514358224872506 ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 4614545 A/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000047621:ENST00000261250:exon_4614472_4614546:C12orf4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 4651060 C/G 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 C:G C G 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4651050_4651099:RAD51AP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 4651098 T/C 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000111247:ENST00000321524:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000352618:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000228843:exon_4651050_4651099:RAD51AP1;ENSG00000111247:ENST00000442992:exon_4651050_4651099:RAD51AP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 4719349 C/T 1 33 23 56 15.6820785160717 12.0700664887985 3.61201202727312 T:C C T 10 0.52478549951298 0.351903015987098 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4719321_4719450:DYRK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 4722717 A/T 1 82 90 172 38.9675890399356 47.2306949561682 -8.26310591623256 A:T A T 10 0.52478549951298 0.222060018523811 ENSG00000010219:ENST00000010132:exon_4722678_4723030:DYRK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 5021891 G/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000111262:ENST00000382545:exon_5020006_5027422:KCNA1;ENSG00000111262:ENST00000228858:exon_5020507_5022080:KCNA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6450945 T/C 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000067182:ENST00000162749:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A;ENSG00000067182:ENST00000440083:exon_6450942_6451261:TNFRSF1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6562753 A/G 1 16 17 33 7.60343200779232 8.92135349172066 -1.31792148392834 A:G A G 10 0.52478549951298 0.728392300446389 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6562810 A/G 1 18 21 39 8.55386100876636 11.0204954897726 -2.46663448100622 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.521878153226038 ENSG00000139192:ENST00000266556:exon_6562613_6562882:TAPBPL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6631169 C/A 1 40 43 83 19.0085800194808 22.5657764790581 -3.55719645957734 A:C C A 10 0.52478549951298 0.4438664407163 ENSG00000010292:ENST00000382457:exon_6630964_6631203:NCAPD2;ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6630964_6631203:NCAPD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6638116 C/T 1 70 54 124 33.2650150340914 28.3384169737009 4.92659806039048 T:C C T 10 0.52478549951298 0.418562276997 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638111_6638205:NCAPD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6639037 T/C 1 41 39 80 19.4837945199678 20.4666344810062 -0.982839961038401 T:C T C 10 0.52478549951298 0.824070093000547 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6639115 T/G 1 120 105 225 57.0257400584424 55.1024774488629 1.92326260957949 T:G T G 10 0.52478549951298 0.841357784121815 ENSG00000010292:ENST00000315579:exon_6638941_6639124:NCAPD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6646320 T/C 1 4456 3385 7841 2117.55581417016 1776.39891585144 341.156898318724 A:T:C T C 10 0.52478549951298 1.09887195010855e-14 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000450282:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646267_6646382:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646267_6646382:GAPDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6646824 C/T 1 2707 3406 6113 1286.40565281836 1787.41941134121 -501.013758522847 T:C:G C T 10 0.52478549951298 1.24668616057462e-37 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000448046:exon_6646750_6647090:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000492719:exon_6646750_6646964:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6647109 T/C 1 4417 3515 7932 2099.02244865117 1844.62103078812 254.401417863042 T:C:G T C 10 0.52478549951298 1.04103697271258e-08 ENSG00000111640:ENST00000229239:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000406765:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396856:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000458000:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396861:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000474249:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466588:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396859:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000466525:exon_6645850_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000460556:exon_6646750_6647162:GAPDH;ENSG00000111640:ENST00000396858:exon_6646750_6647162:GAPDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6709059 G/A 1 29 25 54 13.7812205141236 13.1196374878245 0.661583026299077 A:G G A 10 0.52478549951298 0.892308581443854 ENSG00000111642:ENST00000309577:exon_6708939_6709178:CHD4;ENSG00000111642:ENST00000357008:exon_6708939_6709178:CHD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6760367 C/T 1 6 11 17 2.85128700292212 5.77264049464278 -2.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.223952224889739 ENSG00000111653:ENST00000341550:exon_6759446_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000444704:exon_6759705_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000396807:exon_6759757_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000437127:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000435449:exon_6759757_6760392:ING4;ENSG00000111653:ENST00000446105:exon_6759792_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000486287:exon_6759957_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000484795:exon_6759990_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000482489:exon_6760131_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000469749:exon_6760178_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472002:exon_6760180_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000488381:exon_6760262_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000495771:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000493144:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000472810:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000466221:exon_6760351_6760551:ING4;ENSG00000111653:ENST00000423703:exon_6760361_6760400:ING4;ENSG00000111653:ENST00000412586:exon_6760361_6760400:ING4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6839913 C/T 1 42 32 74 19.9590090204548 16.7931359844154 3.16587303603948 T:C C T 10 0.52478549951298 0.486698618122545 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6839835_6839986:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6839835_6839986:COPS7A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6840209 G/A 1 30 42 72 14.2564350146106 22.0409909795452 -7.78455596493456 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0763875085210883 ENSG00000111652:ENST00000229251:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000455113:exon_6840166_6841022:COPS7A;ENSG00000111652:ENST00000442593:exon_6840166_6841026:COPS7A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6954875 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000111664:ENST00000229264:exon_6954750_6954966:GNB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 6965194 A/G 1 27 15 42 12.8307915131495 7.8717824926947 4.95900902045484 A:G A G 10 0.52478549951298 0.163666562705323 ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6965181_6965314:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6965181_6965314:USP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 7015707 G/T 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 T:G G T 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7015573_7015782:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7015573_7015919:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015573_7015826:LRRC23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 7023123 A/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G A G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7023055_7023405:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7023055_7023358:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7023055_7023393:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7023055_7023392:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7023055_7023407:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7023055_7023132:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7023055_7023235:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000472633:exon_7023055_7023392:LRRC23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 7060721 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 7090193 A/G 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 A:G A G 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7090166_7090344:LPCAT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 7091918 C/T 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000111684:ENST00000261407:exon_7091837_7091943:LPCAT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 7249598 T/C 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 T:C T C 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000139178:ENST00000266542:exon_7247153_7249759:C1RL;ENSG00000139178:ENST00000396661:exon_7249181_7249759:C1RL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 8248662 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000089818:ENST00000450991:exon_8248638_8250373:NECAP1;ENSG00000089818:ENST00000339754:exon_8248638_8250373:NECAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 8756842 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000111732:ENST00000229335:exon_8754762_8756933:AICDA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 9875347 C/A 1 51 50 101 24.235939524838 26.239274975649 -2.00333545081099 A:C C A 10 0.52478549951298 0.691756781483018 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9875094_9875409:CLECL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 9885578 G/A 1 124 83 207 58.9265980603905 43.5571964595773 15.3694016008131 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0365930501622138 ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9885545_9885860:CLECL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 10659584 C/T 0 413 0 413 196.263588701139 0 196.263588701139 C C 10 0.52478549951298 2.41026372201792e-116 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 10659799 T/C 1 326 1 327 154.919927158769 0.52478549951298 154.395141659256 T:C T C 10 0.52478549951298 9.55432427897023e-90 ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 12814330 T/C 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000183150:ENST00000332427:exon_12813995_12815404:GPR19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 12871887 C/T 1 18 16 34 8.55386100876636 8.39656799220768 0.157293016558679 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000111276:ENST00000477087:exon_12871759_12871888:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000228872:exon_12871759_12871888:CDKN1B;ENSG00000111276:ENST00000442489:exon_12871759_12871888:CDKN1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 14577223 T/C 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14576843_14578407:ATF7IP;ENSG00000171681:ENST00000396279:exon_14576850_14578391:ATF7IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 15095558 C/G 1 1642 1690 3332 780.302209799687 886.887494176936 -106.585284377249 A:T:C:G C G 10 0.52478549951298 0.000234739126483858 ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 16111238 T/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000023697:ENST00000428559:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000437671:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000524480:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000531803:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000528821:exon_16111174_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000532964:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000533447:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000526530:exon_16111122_16111269:DERA;ENSG00000023697:ENST00000025429:exon_16111122_16111269:DERA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 22602796 A/G 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 A:G A G 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000111731:ENST00000333957:exon_22601541_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000446597:exon_22602479_22602825:KIAA0528;ENSG00000111731:ENST00000396028:exon_22602479_22602825:KIAA0528 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 25243115 G/C 1 42 47 89 19.9590090204548 24.6649184771101 -4.70590945665522 C:G G C 10 0.52478549951298 0.340362107593341 ENSG00000118308:ENST00000354454:exon_25242991_25243131:LRMP;ENSG00000118308:ENST00000361433:exon_25242991_25243131:LRMP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 26809316 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000123104:ENST00000381340:exon_26809230_26809481:ITPR2;ENSG00000123104:ENST00000451599:exon_26809230_26809481:ITPR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 27933986 C/T 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 ENSG00000087448:ENST00000381271:exon_27933187_27934135:KLHDC5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 28603112 A/G 1 23 14 37 10.9299335112015 7.34699699318172 3.58293651801974 A:G A G 10 0.52478549951298 0.253660996821797 ENSG00000123106:ENST00000381259:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000381256:exon_28603094_28603186:CCDC91;ENSG00000123106:ENST00000306172:exon_28603094_28603186:CCDC91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 29486745 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000064763:ENST00000182377:exon_29486565_29487005:FAR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 32136184 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000174718:ENST00000312561:exon_32133812_32138891:C12orf35;ENSG00000174718:ENST00000381054:exon_32133812_32138891:C12orf35 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 32860302 G/A 1 22 10 32 10.4547190107144 5.2478549951298 5.20686401558464 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0766738262933283 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32860301_32860347:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32860301_32860347:DNM1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 32896365 G/C 1 58 90 148 27.5624410282472 47.2306949561682 -19.668253927921 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00128142280395058 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 32896366 A/T 1 58 88 146 27.5624410282472 46.1811239571422 -18.6186829288951 A:T A T 10 0.52478549951298 0.00212028489029728 ENSG00000087470:ENST00000266479:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000452533:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000266481:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000411996:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000434676:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000381000:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000358214:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000413295:exon_32896288_32898584:DNM1L;ENSG00000087470:ENST00000414834:exon_32896288_32898584:DNM1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 39752082 G/T 1 14 5 19 6.65300300681828 2.6239274975649 4.02907550925338 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0696868086487943 ENSG00000139116:ENST00000341813:exon_39751980_39752175:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000395670:exon_39751980_39752175:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361418:exon_39751980_39752175:KIF21A;ENSG00000139116:ENST00000361961:exon_39751980_39752175:KIF21A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 42554505 A/G 1 53 34 87 25.1863685258121 17.8427069834413 7.34366154237074 A:G A G 10 0.52478549951298 0.132655266146148 ENSG00000015153:ENST00000327791:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000380790:exon_42550906_42554628:YAF2;ENSG00000015153:ENST00000442791:exon_42552837_42554628:YAF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 45567192 G/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000134297:ENST00000256692:exon_45566847_45568425:PLEKHA9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 48062730 C/T 1 20 19 39 9.5042900097404 9.97092449074662 -0.466634481006221 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000005175:ENST00000432584:exon_48062699_48062885:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000380650:exon_48062699_48062885:RPAP3;ENSG00000005175:ENST00000005386:exon_48062699_48062885:RPAP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 48527186 C/T 1 24 29 53 11.4051480116885 15.2187794858764 -3.81363147418794 T:C C T 10 0.52478549951298 0.336279970520921 ENSG00000152556:ENST00000340802:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000359794:exon_48527098_48527263:PFKM;ENSG00000152556:ENST00000395233:exon_48527098_48527263:PFKM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 49048738 G/T 1 18 14 32 8.55386100876636 7.34699699318172 1.20686401558464 T:G G T 10 0.52478549951298 0.725609418966872 ENSG00000139620:ENST00000420613:exon_49048724_49048843:C12orf41;ENSG00000139620:ENST00000324947:exon_49048724_49048843:C12orf41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 49225891 G/A 1 42 38 80 19.9590090204548 19.9418489814932 0.0171600389615989 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000174243:ENST00000398375:exon_49225861_49225969:DDX23;ENSG00000174243:ENST00000308025:exon_49225861_49225969:DDX23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 49259579 C/G 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000172602:ENST00000309739:exon_49259431_49259681:RND1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 50869480 G/A 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 A:G G A 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000161813:ENST00000429001:exon_50869309_50873779:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398464:exon_50869309_50873779:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000398473:exon_50869309_50873787:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000293618:exon_50869309_50873787:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000518444:exon_50869309_50870246:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000441650:exon_50869309_50869716:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000520064:exon_50869309_50870239:LARP4;ENSG00000161813:ENST00000347328:exon_50869309_50871280:LARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 51203371 C/T 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000123268:ENST00000262053:exon_51203239_51203372:ATF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 51442944 G/A 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000050426:ENST00000262055:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000418425:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000448283:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380135:exon_51442817_51442968:LETMD1;ENSG00000050426:ENST00000380123:exon_51442817_51442968:LETMD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 51685866 C/T 1 31 20 51 14.7316495150976 10.4957099902596 4.23593952483802 T:C C T 10 0.52478549951298 0.263293667381194 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51685375_51686128:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51685375_51686128:BIN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 51707626 C/T 1 15 5 20 7.1282175073053 2.6239274975649 4.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0463202879236955 ENSG00000110934:ENST00000452142:exon_51707607_51707687:BIN2;ENSG00000110934:ENST00000267012:exon_51707607_51707687:BIN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 53587995 C/T 1 133 147 280 63.2035285647737 77.1434684284081 -13.9399398636344 T:C C T 10 0.52478549951298 0.106031847455509 ENSG00000139626:ENST00000422257:exon_53587982_53588128:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000338737:exon_53587982_53588128:ITGB7;ENSG00000139626:ENST00000267082:exon_53587982_53588128:ITGB7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 53647286 G/C 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 C:G G C 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000182544:ENST00000328704:exon_53646602_53647536:MFSD5;ENSG00000182544:ENST00000329548:exon_53646602_53648188:MFSD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 53681883 A/T 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 A:T A T 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53681756_53682125:ESPL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 53682326 G/A 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000135476:ENST00000257934:exon_53682322_53682483:ESPL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 53694044 G/A 1 71 67 138 33.7402295345784 35.1606284673697 -1.42039893279124 A:G G A 10 0.52478549951298 0.864732185700258 ENSG00000139637:ENST00000267103:exon_53693934_53694046:C12orf10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 54109733 A/G 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G A G 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000012822:ENST00000443834:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000413257:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000454332:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000262059:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000342760:exon_54109577_54109831:CALCOCO1;ENSG00000012822:ENST00000430117:exon_54109577_54109831:CALCOCO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 54676423 G/T 1 33 57 90 15.6820785160717 29.9127734722399 -14.2306949561682 T:G G T 10 0.52478549951298 0.00297663450212397 ENSG00000135486:ENST00000330752:exon_54676357_54676449:HNRNPA1;ENSG00000135486:ENST00000340913:exon_54676357_54676449:HNRNPA1;ENSG00000135486:ENST00000420780:exon_54676357_54676449:HNRNPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 54741814 G/C 1 119 138 257 56.5505255579554 72.4203989327912 -15.8698733748359 C:G G C 10 0.52478549951298 0.052676037896324 ENSG00000111481:ENST00000262061:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000416254:exon_54741784_54741835:COPZ1;ENSG00000111481:ENST00000455864:exon_54741784_54741835:COPZ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 54911426 C/T 1 53 45 98 25.1863685258121 23.6153474780841 1.57102104772796 T:C C T 10 0.52478549951298 0.762712505231958 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54911317_54911426:NCKAP1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 54915010 C/T 1 58 58 116 27.5624410282472 30.4375589717528 -2.87511794350569 T:C C T 10 0.52478549951298 0.642314979065706 ENSG00000123338:ENST00000293373:exon_54914903_54915022:NCKAP1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 55354987 T/G 1 17 18 35 8.07864650827934 9.44613899123364 -1.3674924829543 T:G T G 10 0.52478549951298 0.735727383388347 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000528486:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55354952_55355051:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55354952_55355051:KIAA0748 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 55357602 C/T 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000135426:ENST00000524622:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524923:exon_55357569_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532804:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000449076:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000257883:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000316577:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000532757:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000531122:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000524959:exon_55357526_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000526532:exon_55357525_55357734:KIAA0748;ENSG00000135426:ENST00000533446:exon_55357585_55357734:KIAA0748 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56120523 G/A 1 310 316 626 147.316495150976 165.832217846102 -18.5157226951255 A:G G A 10 0.52478549951298 0.138928294419719 ENSG00000135404:ENST00000257857:exon_56120484_56120579:CD63;ENSG00000135404:ENST00000420846:exon_56120484_56120579:CD63 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56213148 C/T 1 187 160 347 88.8651115910727 83.9656799220768 4.89943166899593 T:C C T 10 0.52478549951298 0.628663241420756 ENSG00000123353:ENST00000243045:exon_56213126_56213277:ORMDL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56333878 C/T 1 9 13 22 4.27693050438318 6.82221149366874 -2.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.29401621168529 ENSG00000065357:ENST00000331886:exon_56333866_56333954:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394145:exon_56333866_56333954:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000394147:exon_56333866_56333954:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000402956:exon_56333866_56333954:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000415755:exon_56333866_56333954:DGKA;ENSG00000065357:ENST00000412897:exon_56333866_56333954:DGKA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56361927 A/G 1 16 16 32 7.60343200779232 8.39656799220768 -0.793135984415361 A:G A G 10 0.52478549951298 0.860157258043716 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56361833_56361953:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56361833_56361953:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56361833_56361953:CDK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56365016 A/T 1 43 30 73 20.4342235209419 15.7435649853894 4.69065853555246 A:T A T 10 0.52478549951298 0.292916460662827 ENSG00000123374:ENST00000266970:exon_56364828_56365031:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000440311:exon_56364828_56365031:CDK2;ENSG00000123374:ENST00000354056:exon_56364828_56365031:CDK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56501016 C/T 1 13 5 18 6.17778850633126 2.6239274975649 3.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.103560900526000 ENSG00000170515:ENST00000303305:exon_56500971_56501040:PA2G4;ENSG00000170515:ENST00000417031:exon_56500971_56501040:PA2G4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56571844 C/T 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000139613:ENST00000394023:exon_56571806_56571877:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000347471:exon_56571806_56571877:SMARCC2;ENSG00000139613:ENST00000267064:exon_56571806_56571877:SMARCC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56737255 C/T 1 32 39 71 15.2068640155846 20.4666344810062 -5.25977046542158 T:C C T 10 0.52478549951298 0.235193372739761 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56735384_56737315:STAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56740380 C/T 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 T:C C T 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740226_56740408:STAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 56740682 C/G 1 6 13 19 2.85128700292212 6.82221149366874 -3.97092449074662 C:G C G 10 0.52478549951298 0.105409046642838 ENSG00000170581:ENST00000314128:exon_56740603_56740739:STAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 57637593 G/A 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000185482:ENST00000332782:exon_57637242_57637693:STAC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 57649840 C/T 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000179912:ENST00000347140:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000429355:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000393811:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000402412:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000358907:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000403821:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000418182:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000438036:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000413953:exon_57649773_57649857:R3HDM2;ENSG00000179912:ENST00000441731:exon_57649773_57649857:R3HDM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 57872474 C/T 1 17 8 25 8.07864650827934 4.19828399610384 3.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.160229625148168 ENSG00000123329:ENST00000393791:exon_57872323_57872540:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000393797:exon_57872323_57872540:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000340423:exon_57872323_57872540:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000356411:exon_57872323_57872540:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000423291:exon_57872323_57872540:ARHGAP9;ENSG00000123329:ENST00000424809:exon_57872323_57872540:ARHGAP9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 57884337 C/T 1 50 41 91 23.760725024351 21.5162054800322 2.24451954431882 T:C C T 10 0.52478549951298 0.675364444004498 ENSG00000166986:ENST00000262027:exon_57884321_57884427:MARS;ENSG00000166986:ENST00000315473:exon_57884321_57884357:MARS;ENSG00000166986:ENST00000447721:exon_57884321_57884427:MARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 57910186 C/T 1 26 96 122 12.3555770126625 50.3794079532461 -38.0238309405836 T:C C T 10 0.52478549951298 2.13626539939960e-12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 57911160 G/A 1 25 14 39 11.8803625121755 7.34699699318172 4.53336551899378 A:G G A 10 0.52478549951298 0.152832659716465 ENSG00000175197:ENST00000346473:exon_57911052_57911221:DDIT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 58112189 A/G 1 167 181 348 79.3608215813323 94.9861754118494 -15.6253538305171 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.0962728738524472 ENSG00000135506:ENST00000257966:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000315970:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000413095:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000435406:exon_58111929_58112204:OS9;ENSG00000135506:ENST00000439210:exon_58111929_58112204:OS9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 58135833 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000135439:ENST00000257897:exon_58135695_58135942:AGAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 58144442 C/T 1 142 198 340 67.4804590691568 103.90752890357 -36.4270698344132 T:C C T 10 0.52478549951298 8.75347466790422e-05 ENSG00000135446:ENST00000257904:exon_58144439_58144548:CDK4;ENSG00000135446:ENST00000312990:exon_58144439_58144454:CDK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 58165810 G/C 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000037897:ENST00000324871:exon_58165757_58166335:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000257848:exon_58165757_58165902:METTL1;ENSG00000037897:ENST00000408972:exon_58165757_58165941:METTL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 58345606 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58345541_58345678:XRCC6BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 58350631 C/T 1 32 39 71 15.2068640155846 20.4666344810062 -5.25977046542158 T:C C T 10 0.52478549951298 0.235193372739761 ENSG00000166896:ENST00000300145:exon_58350470_58351051:XRCC6BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 64202890 C/G 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 C:G C G 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000118600:ENST00000261234:exon_64202455_64203300:TMEM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 64813942 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64813850_64814034:XPOT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 64819174 C/T 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000184575:ENST00000332707:exon_64819118_64819237:XPOT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 65004520 A/G 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000153179:ENST00000336061:exon_65004293_65004523:RASSF3;ENSG00000153179:ENST00000283172:exon_65004293_65004523:RASSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 66531754 C/T 1 95 102 197 45.1453775462669 53.528120950324 -8.38274340405707 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.253711166798698 ENSG00000155957:ENST00000358230:exon_66530718_66531946:TMBIM4;ENSG00000155957:ENST00000286424:exon_66531617_66531946:TMBIM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 67706466 G/A 1 214 181 395 101.695903104222 94.9861754118494 6.70972769237288 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.512785850653514 ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67706386_67708388:CAND1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 69783937 T/C 1 47 63 110 22.3350815228899 33.0614864693177 -10.7264049464278 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0448079605298235 ENSG00000127337:ENST00000247843:exon_69783927_69784575:YEATS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 69986788 A/G 1 229 208 437 108.824120611528 109.1553838987 -0.331263287172277 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000166226:ENST00000299300:exon_69986756_69986883:CCT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 69995039 C/A 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:C C A 10 0.52478549951298 0.636288491925486 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 72307616 A/G 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 A:G A G 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72307606_72307706:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000483828:exon_72307606_72307713:TBC1D15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 72314523 G/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000121749:ENST00000319106:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000393309:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000485960:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000462788:exon_72314511_72314627:TBC1D15;ENSG00000121749:ENST00000407399:exon_72314511_72314627:TBC1D15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 75889352 T/C 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.095403535700739 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 75893668 T/G 1 106 122 228 50.3727370516241 64.0238309405836 -13.6510938889595 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0734802946439459 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75892604_75895715:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75892604_75895715:GLIPR1;ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75891419_75893731:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75893333_75893731:KRR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 75893688 C/T 1 120 106 226 57.0257400584424 55.6272629483759 1.39847711006651 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.894086661664936 ENSG00000139278:ENST00000266659:exon_75892604_75895715:GLIPR1;ENSG00000139278:ENST00000456650:exon_75892604_75895715:GLIPR1;ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75891419_75893731:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75893333_75893731:KRR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 93196422 T/G 1 26 7 33 12.3555770126625 3.67349849659086 8.68207851607166 T:G T G 10 0.52478549951298 0.00258555918848495 ENSG00000102189:ENST00000322349:exon_93196180_93196510:EEA1;ENSG00000102189:ENST00000418984:exon_93196180_93196510:EEA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 98995222 C/T 1 2707 2793 5500 1286.40565281836 1465.72590013975 -179.32024732139 A:T:C C T 10 0.52478549951298 1.33385151973639e-06 ENSG00000075415:ENST00000401722:exon_98995146_98995775:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000228318:exon_98995146_98995775:SLC25A3;ENSG00000075415:ENST00000188376:exon_98995146_98995775:SLC25A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 100441366 A/C 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:C A C 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100441308_100441416:UHRF1BP1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 100444901 T/C 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 T:C T C 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000111647:ENST00000279907:exon_100444857_100444999:UHRF1BP1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 100601536 C/T 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000075089:ENST00000188312:exon_100601441_100601564:ACTR6;ENSG00000075089:ENST00000416520:exon_100601441_100601737:ACTR6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 101764940 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000120800:ENST00000261637:exon_101764836_101764946:UTP20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 102295219 C/T 1 34 5 39 16.1572930165587 2.6239274975649 13.5333655189938 T:C C T 10 0.52478549951298 6.71362363083572e-06 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 104851112 T/C 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 106633183 G/A 1 17 7 24 8.07864650827934 3.67349849659086 4.40514801168848 A:G G A 10 0.52478549951298 0.100311386228204 ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 107365188 C/T 1 9 2 11 4.27693050438318 1.04957099902596 3.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0689990334594261 ENSG00000151135:ENST00000280756:exon_107364883_107367811:C12orf23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 107372277 C/T 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000120832:ENST00000240050:exon_107371069_107372549:MTERFD3;ENSG00000120832:ENST00000392830:exon_107371069_107372549:MTERFD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 108096718 T/C 1 45 39 84 21.3846525219159 20.4666344810062 0.918018040909679 T:C T C 10 0.52478549951298 0.913118505794485 ENSG00000136045:ENST00000412830:exon_108096712_108096808:PWP1;ENSG00000136045:ENST00000258531:exon_108096712_108096808:PWP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 108145676 C/T 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000110851:ENST00000228437:exon_108145192_108145986:PRDM4;ENSG00000110851:ENST00000446655:exon_108145424_108145986:PRDM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 108942965 T/C 1 8 13 21 3.80171600389616 6.82221149366874 -3.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.197956855238699 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108942864_108942990:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108942864_108942990:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108942864_108942990:SART3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 108954787 G/A 1 17 8 25 8.07864650827934 4.19828399610384 3.8803625121755 A:G G A 10 0.52478549951298 0.160229625148168 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 108954823 C/T 1 17 8 25 8.07864650827934 4.19828399610384 3.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.160229625148168 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 108954862 G/C 1 21 11 32 9.97950451022742 5.77264049464278 4.20686401558464 T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.158091315326878 ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 109994870 A/T 1 122 141 263 57.9761690594164 73.9947554313302 -16.0185863719138 A:T A T 10 0.52478549951298 0.0483976588411559 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_109991525_109994941:MMAB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110011229 G/T 1 20 14 34 9.5042900097404 7.34699699318172 2.15729301655868 T:G G T 10 0.52478549951298 0.496104598259199 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110011230 C/T 1 21 14 35 9.97950451022742 7.34699699318172 2.6325075170457 T:C C T 10 0.52478549951298 0.401790706529317 ENSG00000139428:ENST00000266839:exon_110011152_110011358:MMAB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110013879 G/A 1 28 23 51 13.3060060136366 12.0700664887985 1.23593952483802 A:G G A 10 0.52478549951298 0.78019325006684 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110013803_110013950:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110013803_110013950:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110013803_110013950:MVK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110019233 G/A 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000110921:ENST00000392727:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000447878:exon_110019200_110019355:MVK;ENSG00000110921:ENST00000228510:exon_110019200_110019355:MVK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110340852 G/A 1 1 8 9 0.47521450048702 4.19828399610384 -3.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0165388389563391 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110340832_110341019:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110340832_110341019:TCHP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110341933 A/G 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G A G 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000139437:ENST00000405876:exon_110341742_110341952:TCHP;ENSG00000139437:ENST00000312777:exon_110341742_110341952:TCHP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110456175 A/G 1 9 2 11 4.27693050438318 1.04957099902596 3.22735950535722 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0689990334594261 ENSG00000076513:ENST00000261739:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000261738:exon_110456150_110456293:ANKRD13A;ENSG00000076513:ENST00000334689:exon_110456150_110456293:ANKRD13A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 110778691 C/T 1 27 26 53 12.8307915131495 13.6444229873375 -0.813631474187943 T:C C T 10 0.52478549951298 0.890888380518446 ENSG00000174437:ENST00000308664:exon_110778464_110778799:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000377685:exon_110778464_110778799:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000313432:exon_110778464_110778799:ATP2A2;ENSG00000174437:ENST00000395494:exon_110778464_110778799:ATP2A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 112471090 G/T 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 T:G G T 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000111300:ENST00000261745:exon_112471037_112471183:NAA25 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113357193 G/A 1 3 21 24 1.42564350146106 11.0204954897726 -9.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000101769790798798 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113424893 C/G 1 58 28 86 27.5624410282472 14.6939939863634 12.8684470418837 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00661662631673197 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113424843_113425113:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000449768:exon_113424843_113426607:OAS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113447012 G/T 1 37 59 96 17.5829365180197 30.9623444712658 -13.3794079532461 T:G G T 10 0.52478549951298 0.00758745446383297 ENSG00000111335:ENST00000342315:exon_113446892_113447045:OAS2;ENSG00000111335:ENST00000392583:exon_113446892_113448503:OAS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113607614 G/A 1 15 29 44 7.1282175073053 15.2187794858764 -8.09056197857112 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0156597300494021 ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113607575_113607709:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113607575_113607709:DDX54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113733782 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000186815:ENST00000335509:exon_113733765_113736387:TPCN1;ENSG00000186815:ENST00000392569:exon_113733765_113733933:TPCN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113826442 C/G 1 19 9 28 9.02907550925338 4.72306949561682 4.30600601363656 C:G C G 10 0.52478549951298 0.129733150157581 ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 113873174 C/T 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000139410:ENST00000345635:exon_113873134_113873361:SDSL;ENSG00000139410:ENST00000403593:exon_113873134_113873361:SDSL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 114395842 G/A 1 12 22 34 5.70257400584424 11.5452809892856 -5.84270698344132 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0576883333529612 ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114395587_114395855:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114395587_114395855:RBM19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 117014142 T/C 0 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:G T G 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000171471:ENST00000306985:exon_117013647_117014425:MAP1LC3B2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 117290433 G/A 1 21 19 40 9.97950451022742 9.97092449074662 0.00858001948079945 A:C:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117290143_117291434:RNFT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120139701 T/G 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:G T G 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120139655_120139763:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120139655_120139763:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120139655_120139763:CIT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120575729 C/T 1 17 25 42 8.07864650827934 13.1196374878245 -5.04099097954516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.125025382057908 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120575705_120575848:GCN1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120576637 G/A 1 14 21 35 6.65300300681828 11.0204954897726 -4.3674924829543 A:G G A 10 0.52478549951298 0.175288958873817 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120576499_120576660:GCN1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120589022 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000089154:ENST00000300648:exon_120588949_120589195:GCN1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120649650 C/A 1 9 2 11 4.27693050438318 1.04957099902596 3.22735950535722 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0689990334594261 ENSG00000089159:ENST00000424649:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000228307:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000267257:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000458477:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000397506:exon_120648251_120650383:PXN;ENSG00000089159:ENST00000323871:exon_120648254_120650383:PXN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120954490 C/T 1 10 16 26 4.7521450048702 8.39656799220768 -3.64442298733748 T:C C T 10 0.52478549951298 0.172045051014415 ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120954370_120954591:COQ5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 120984339 C/T 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000022840:ENST00000458409:exon_120984208_120984404:RNF10;ENSG00000022840:ENST00000325954:exon_120984208_120984404:RNF10;ENSG00000022840:ENST00000413266:exon_120984208_120984404:RNF10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 121174899 T/C 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 T:C T C 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 121442199 T/A 1 16 11 27 7.60343200779232 5.77264049464278 1.83079151314954 A:T T A 10 0.52478549951298 0.5651214206051 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121440848_121442292:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121440848_121442295:C12orf43 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 121442852 C/T 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000157895:ENST00000288757:exon_121442806_121442896:C12orf43;ENSG00000157895:ENST00000445832:exon_121442806_121442896:C12orf43 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 121660787 T/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121660750_121660846:P2RX4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 121670273 C/T 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000135124:ENST00000337233:exon_121670217_121670310:P2RX4;ENSG00000135124:ENST00000359949:exon_121670217_121670310:P2RX4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 121785610 C/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000089053:ENST00000261819:exon_121785605_121785684:ANAPC5;ENSG00000089053:ENST00000441917:exon_121785605_121785686:ANAPC5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 122079189 C/T 1 51 62 113 24.235939524838 32.5367009698048 -8.30076144496675 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131700098181892 ENSG00000182500:ENST00000330079:exon_122078947_122079946:ORAI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 122218783 T/G 1 119 118 237 56.5505255579554 61.9246889425316 -5.37416338457627 T:G T G 10 0.52478549951298 0.515576933077445 ENSG00000188735:ENST00000449592:exon_122213515_122219974:TMEM120B;ENSG00000139725:ENST00000267205:exon_122218778_122218912:RHOF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 122353817 T/C 1 80 60 140 38.0171600389616 31.4871299707788 6.5300300681828 T:C T C 10 0.52478549951298 0.272859373719445 ENSG00000110801:ENST00000261817:exon_122353762_122353850:PSMD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 123102921 T/G 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:G T G 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000184445:ENST00000333479:exon_123102890_123102944:KNTC1;ENSG00000184445:ENST00000450485:exon_123102890_123102944:KNTC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 123645803 G/A 1 8 10 18 3.80171600389616 5.2478549951298 -1.44613899123364 A:G G A 10 0.52478549951298 0.638292165920428 ENSG00000051825:ENST00000302349:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9;ENSG00000051825:ENST00000302373:exon_123645683_123645930:MPHOSPH9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124104049 A/G 1 28 35 63 13.3060060136366 18.3674924829543 -5.06148646931774 A:G A G 10 0.52478549951298 0.209430657478271 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124103979_124104271:DDX55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124104551 A/G 1 87 50 137 41.3436615423707 26.239274975649 15.1043865667217 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0101693803668626 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124104686 G/A 1 64 64 128 30.4137280311693 33.5862719688307 -3.17254393766144 A:G G A 10 0.52478549951298 0.596135958392802 ENSG00000111364:ENST00000238146:exon_124104511_124105480:DDX55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124144359 T/C 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 T:C T C 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124144395 A/G 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 A:G A G 10 0.52478549951298 0.216375415667424 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144342_124144477:GTF2H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124144793 T/C 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 T:C T C 10 0.52478549951298 0.840478250557484 ENSG00000111358:ENST00000228955:exon_124144713_124145620:GTF2H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124220123 G/A 1 4 13 17 1.90085800194808 6.82221149366874 -4.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0259084186224522 ENSG00000185344:ENST00000330342:exon_124220078_124220171:ATP6V0A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124421844 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000119242:ENST00000238156:exon_124420983_124422377:CCDC92 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124817789 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447675:exon_124817676_124817825:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440337:exon_124817676_124817802:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000461081:exon_124817676_124817825:NCOR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124821696 C/T 1 10 17 27 4.7521450048702 8.92135349172066 -4.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.124575605577622 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124821299_124821726:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000440187:exon_124821650_124821726:NCOR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 124827689 C/T 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 T:C C T 10 0.52478549951298 0.840478250557484 ENSG00000196498:ENST00000404121:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000404621:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000405201:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000397355:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000429285:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000356219:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000443451:exon_124827551_124827772:NCOR2;ENSG00000196498:ENST00000447011:exon_124827551_124827772:NCOR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 125302166 C/T 1 43 40 83 20.4342235209419 20.9914199805192 -0.557196459577341 T:C C T 10 0.52478549951298 0.912940072208519 ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125302096_125302253:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125302096_125302253:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000339570:exon_125302096_125302253:SCARB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 125448960 C/T 1 8 12 20 3.80171600389616 6.29742599415576 -2.4957099902596 T:C C T 10 0.52478549951298 0.273886654959245 ENSG00000150990:ENST00000308736:exon_125448940_125449172:DHX37 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 129278864 A/G 1 49 39 88 23.285510523864 20.4666344810062 2.81887604285776 A:G A G 10 0.52478549951298 0.594177442626596 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129277739_129278901:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129278765_129278901:SLC15A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 129285460 C/G 1 30 26 56 14.2564350146106 13.6444229873375 0.612012027273117 C:G C G 10 0.52478549951298 0.894356796392045 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129285399_129285554:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129285399_129285554:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129285399_129285554:SLC15A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 129293346 C/T 1 50 30 80 23.760725024351 15.7435649853894 8.0171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.074295267080125 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 129293376 G/A 1 39 21 60 18.5333655189938 11.0204954897726 7.5128700292212 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0534428962030016 ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 132195855 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132195635_132195992:SFSWAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 132284053 G/A 1 37 35 72 17.5829365180197 18.3674924829543 -0.784555964934562 A:G G A 10 0.52478549951298 0.906271974346026 ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132283968_132284282:SFSWAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 132625960 G/A 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 A:G G A 10 0.52478549951298 0.840478250557484 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132625820_132625965:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132625820_132625965:DDX51 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 132626425 G/A 1 6 11 17 2.85128700292212 5.77264049464278 -2.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.223952224889739 ENSG00000185163:ENST00000397333:exon_132626395_132626501:DDX51;ENSG00000185163:ENST00000329073:exon_132626395_132626501:DDX51 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 12 133778796 C/T 1 6 12 18 2.85128700292212 6.29742599415576 -3.44613899123364 T:C C T 10 0.52478549951298 0.154993529862929 ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 20207945 C/T 1 37 24 61 17.5829365180197 12.5948519883115 4.98808452970822 T:C C T 10 0.52478549951298 0.248403069926656 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20207821_20208101:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20207880_20208101:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20207880_20208101:MPHOSPH8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 20240633 G/A 1 15 15 30 7.1282175073053 7.8717824926947 -0.743564985389401 A:G G A 10 0.52478549951298 0.855855880845914 ENSG00000196199:ENST00000361479:exon_20240565_20240719:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000414242:exon_20240565_20240719:MPHOSPH8;ENSG00000196199:ENST00000360754:exon_20240565_20240719:MPHOSPH8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 20356784 C/A 1 42 50 92 19.9590090204548 26.239274975649 -6.28026595519416 A:C C A 10 0.52478549951298 0.210534916767592 ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000427943:exon_20356526_20356931:PSPC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 20411701 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20411593_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20411605_20411961:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20411605_20411961:ZMYM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 20425911 C/A 1 13 6 19 6.17778850633126 3.14871299707788 3.02907550925338 A:C C A 10 0.52478549951298 0.176954766259946 ENSG00000132950:ENST00000382909:exon_20425495_20425936:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 20425948 T/C 1 14 1 15 6.65300300681828 0.52478549951298 6.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00116958083788749 ENSG00000132950:ENST00000337963:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382907:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000382905:exon_20425829_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000467542:exon_20425495_20426330:ZMYM5;ENSG00000132950:ENST00000495534:exon_20425495_20426330:ZMYM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 21063524 A/G 1 11 10 21 5.22735950535722 5.2478549951298 -0.0204954897725802 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165475:ENST00000298248:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000382812:exon_21063509_21063635:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000480748:exon_21063509_21063575:CRYL1;ENSG00000165475:ENST00000421925:exon_21063509_21063635:CRYL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 21306113 G/A 1 23 17 40 10.9299335112015 8.92135349172066 2.0085800194808 A:G G A 10 0.52478549951298 0.635408461473433 ENSG00000150456:ENST00000473438:exon_21305980_21306260:N6AMT2;ENSG00000150456:ENST00000382758:exon_21305980_21306260:N6AMT2;ENSG00000150456:ENST00000382754:exon_21305980_21306260:N6AMT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 21751005 G/C 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 C:G G C 10 0.52478549951298 0.369865862456948 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 22141045 C/T 1 17 19 36 8.07864650827934 9.97092449074662 -1.89227798246728 T:C C T 10 0.52478549951298 0.617415799777466 ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22140936_22141083:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22140936_22141083:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000476895:exon_22140936_22141083:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22140936_22141083:EFHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 24243204 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127863:ENST00000248484:exon_24242831_24243236:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000403372:exon_24242831_24243263:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382258:exon_24242831_24243412:TNFRSF19;ENSG00000127863:ENST00000382263:exon_24242831_24243236:TNFRSF19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 24443540 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24443431_24443587:MIPEP;ENSG00000027001:ENST00000494139:exon_24443431_24443587:MIPEP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25000617 C/G 1 114 105 219 54.1744530555203 55.1024774488629 -0.928024393342632 T:C:G C G 10 0.52478549951298 0.946080172319305 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25000604_25000736:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25009297 G/T 1 44 22 66 20.9094380214289 11.5452809892856 9.36415703214332 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0258350692593261 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25009441 C/G 1 29 29 58 13.7812205141236 15.2187794858764 -1.43755897175284 C:G C G 10 0.52478549951298 0.792885155323633 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25009485 C/G 1 29 22 51 13.7812205141236 11.5452809892856 2.23593952483802 C:G C G 10 0.52478549951298 0.576591657010935 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25008533_25009612:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25023936 C/T 1 7 16 23 3.32650150340914 8.39656799220768 -5.07006648879854 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0377422762120623 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25023856_25023955:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25029218 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25029155_25029350:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000484989:exon_25029155_25029272:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25049676 G/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G G A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25049610_25049734:PARP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25466955 T/C 1 1 13 14 0.47521450048702 6.82221149366874 -6.34699699318172 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000613211119935342 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000418179:exon_25466781_25467005:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25466781_25467005:CENPJ HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25479541 A/C 1 15 3 18 7.1282175073053 1.57435649853894 5.55386100876636 A:C A C 10 0.52478549951298 0.00881853707071929 ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 25825889 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000139505:ENST00000381801:exon_25825787_25825913:MTMR6;ENSG00000139505:ENST00000319298:exon_25825787_25825913:MTMR6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 26793644 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000127870:ENST00000468480:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000346166:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381588:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000399762:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000381570:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000498039:exon_26793594_26793804:RNF6;ENSG00000127870:ENST00000476347:exon_26793433_26793804:RNF6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 28009920 G/C 1 79 85 164 37.5419455384746 44.6067674586033 -7.06482192012872 C:G G C 10 0.52478549951298 0.274693643471132 ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 28014383 G/A 1 67 64 131 31.8393715326303 33.5862719688307 -1.74690043620038 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.793268048579217 ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28014126_28014612:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000460973:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000471771:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000493719:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000485650:exon_28014126_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000484342:exon_28014343_28014586:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000485959:exon_28014126_28014586:MTIF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 29252247 C/G 1 959 1096 2055 455.730705967052 575.164907466226 -119.434201499174 T:C:G C G 10 0.52478549951298 1.42539875425525e-07 ENSG00000132963:ENST00000380842:exon_29252172_29253062:POMP;ENSG00000132963:ENST00000460403:exon_29252172_29253062:POMP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 31036681 A/G 1 67 47 114 31.8393715326303 24.6649184771101 7.17445305552028 A:G A G 10 0.52478549951298 0.189883525919553 ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 31715367 T/C 1 51 70 121 24.235939524838 36.7349849659086 -12.4990454410706 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0285047908778363 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31715259_31715396:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31715345_31715395:HSPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 31729777 T/C 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000120694:ENST00000320027:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380405:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380406:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000445273:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000429785:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000380363:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000438061:exon_31729651_31729791:HSPH1;ENSG00000120694:ENST00000439123:exon_31729651_31729791:HSPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 32972673 C/T 1 14 9 23 6.65300300681828 4.72306949561682 1.92993351120146 T:C C T 10 0.52478549951298 0.532391639992863 ENSG00000139618:ENST00000380152:exon_32972299_32973347:BRCA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 33110351 A/G 1 41 45 86 19.4837945199678 23.6153474780841 -4.13155295811628 A:G A G 10 0.52478549951298 0.389205166986317 ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000267068:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000512755:exon_33109906_33110520:N4BP2L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 33110898 A/G 1 27 42 69 12.8307915131495 22.0409909795452 -9.21019946639562 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0297340312674277 ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000267068:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000483088:exon_33110564_33111164:N4BP2L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 33110929 T/C 1 51 25 76 24.235939524838 13.1196374878245 11.1163020370135 T:C T C 10 0.52478549951298 0.011295492786171 ENSG00000244754:ENST00000446957:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000505213:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000267068:exon_33109906_33111164:N4BP2L2;ENSG00000244754:ENST00000483088:exon_33110564_33111164:N4BP2L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 33700374 T/G 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000133121:ENST00000361430:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399365:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000255486:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000336934:exon_33700218_33700377:STARD13;ENSG00000133121:ENST00000399364:exon_33700218_33700377:STARD13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 36886469 T/C 1 12 4 16 5.70257400584424 2.09914199805192 3.60343200779232 T:C T C 10 0.52478549951298 0.082551923143294 ENSG00000133104:ENST00000438666:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000355182:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000451493:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000423217:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000494062:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000491805:exon_36886456_36886721:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000460126:exon_36886456_36886548:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000475603:exon_36886456_36886614:SPG20;ENSG00000133104:ENST00000482146:exon_36886456_36886614:SPG20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 39586343 G/C 1 39 21 60 18.5333655189938 11.0204954897726 7.5128700292212 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0534428962030016 ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 39587157 C/T 1 32 25 57 15.2068640155846 13.1196374878245 2.08722652776014 T:C C T 10 0.52478549951298 0.598604585441619 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 39587166 A/G 1 34 31 65 16.1572930165587 16.2683504849024 -0.111057468343702 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 39587677 A/G 1 18 7 25 8.55386100876636 3.67349849659086 4.8803625121755 A:G A G 10 0.52478549951298 0.069660506010396 ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 41517985 A/G 1 7 11 18 3.32650150340914 5.77264049464278 -2.44613899123364 A:G A G 10 0.52478549951298 0.345641696182350 ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41517978_41518061:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41517978_41518061:ELF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 41800679 T/C 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41800568_41800704:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41800568_41800704:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000473492:exon_41800568_41800705:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41800568_41800704:MTRF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 41835039 T/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 41932605 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000172766:ENST00000379406:exon_41932440_41932609:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000379367:exon_41932440_41932609:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000403412:exon_41932440_41932854:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000476980:exon_41932440_41932854:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000464857:exon_41932440_41932609:NAA16;ENSG00000172766:ENST00000497727:exon_41932443_41932609:NAA16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 43181024 T/C 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000120659:ENST00000358545:exon_43180633_43181310:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000405262:exon_43180633_43182149:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000239849:exon_43180633_43182144:TNFSF11;ENSG00000120659:ENST00000398795:exon_43180633_43182149:TNFSF11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 43543287 C/A 1 13 2 15 6.17778850633126 1.04957099902596 5.1282175073053 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00842145328557384 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43543230_43543313:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43543230_43543313:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43543230_43543313:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000476830:exon_43543230_43543313:EPSTI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 43566291 C/T 1 26 1 27 12.3555770126625 0.52478549951298 11.8307915131495 T:C C T 10 0.52478549951298 7.58332532009502e-07 ENSG00000133106:ENST00000313624:exon_43566114_43566366:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000313640:exon_43566114_43566366:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000398762:exon_43566114_43566377:EPSTI1;ENSG00000133106:ENST00000476830:exon_43566114_43566316:EPSTI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 43597865 A/G 1 35 38 73 16.6325075170457 19.9418489814932 -3.30934146444754 A:G A G 10 0.52478549951298 0.482588416355784 ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 44543675 G/A 0 38 0 38 18.0581510185068 0 18.0581510185068 G G 10 0.52478549951298 4.55141104319533e-11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 45515395 G/A 1 18 18 36 8.55386100876636 9.44613899123364 -0.892277982467281 A:G G A 10 0.52478549951298 0.86782438382635 ENSG00000083635:ENST00000379161:exon_45513384_45515457:NUFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 46108854 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46108837_46110765:COG3;ENSG00000165837:ENST00000504261:exon_46108657_46109001:FAM194B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 46108856 T/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000136152:ENST00000349995:exon_46108837_46110765:COG3;ENSG00000165837:ENST00000504261:exon_46108657_46109001:FAM194B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 46924292 C/T 1 19 5 24 9.02907550925338 2.6239274975649 6.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0124752763925445 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000487195:exon_46924248_46925142:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46924248_46924486:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000409879:exon_46924248_46924486:C13orf18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 46946157 C/T 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C C T 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46946076_46946732:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46946076_46946345:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000417405:exon_46946076_46946213:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000439642:exon_46946076_46946732:C13orf18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 47303011 A/G 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47302982_47303119:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47302982_47303119:LRCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 50057633 A/G 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G A G 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000136169:ENST00000317257:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000354234:exon_50057600_50057699:SETDB2;ENSG00000136169:ENST00000258672:exon_50057600_50057699:SETDB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 50204880 G/A 1 13 8 21 6.17778850633126 4.19828399610384 1.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.513297365553358 ENSG00000152213:ENST00000282026:exon_50204566_50208008:ARL11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 50587140 G/C 1 35 37 72 16.6325075170457 19.4170634819803 -2.78455596493456 C:G G C 10 0.52478549951298 0.555914809673175 ENSG00000204977:ENST00000420995:exon_50586071_50588467:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000378182:exon_50586071_50592587:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000356017:exon_50586071_50587316:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000457662:exon_50586071_50587304:TRIM13;ENSG00000204977:ENST00000298772:exon_50586071_50587305:TRIM13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 52293404 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52293334_52293484:WDFY2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 52313221 G/A 1 12 5 17 5.70257400584424 2.6239274975649 3.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.151798661556102 ENSG00000139668:ENST00000298125:exon_52313185_52313311:WDFY2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 53035897 T/A 1 31 18 49 14.7316495150976 9.44613899123364 5.28551052386398 A:T T A 10 0.52478549951298 0.152727188271557 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53035193_53036061:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53035193_53036061:CKAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 53036553 A/G 1 13 22 35 6.17778850633126 11.5452809892856 -5.3674924829543 A:G A G 10 0.52478549951298 0.089442093634637 ENSG00000136108:ENST00000398044:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378034:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53036498_53036702:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53036498_53036702:CKAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 53250409 G/A 1 157 139 296 74.6086765764621 72.9451844323042 1.6634921441579 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.861562935505235 ENSG00000165416:ENST00000343788:exon_53250365_53250455:SUGT1;ENSG00000165416:ENST00000310528:exon_53250365_53250455:SUGT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 73329358 G/A 1 43 44 87 20.4342235209419 23.0905619785711 -2.65633845762926 A:G G A 10 0.52478549951298 0.592593235061029 ENSG00000136122:ENST00000377815:exon_73329289_73330328:C13orf34;ENSG00000136122:ENST00000390667:exon_73329289_73330318:C13orf34 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 73334764 G/A 1 23 30 53 10.9299335112015 15.7435649853894 -4.81363147418794 A:G G A 10 0.52478549951298 0.215948836950026 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73334667_73334789:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73334667_73334789:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73334667_73334789:DIS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 73343039 C/T 1 14 25 39 6.65300300681828 13.1196374878245 -6.46663448100622 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0529651995530018 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73342923_73343050:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73342923_73343050:DIS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 73349359 G/C 1 16 22 38 7.60343200779232 11.5452809892856 -3.94184898149324 C:G G C 10 0.52478549951298 0.255321980234543 ENSG00000083520:ENST00000377767:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000377780:exon_73349349_73349513:DIS3;ENSG00000083520:ENST00000490646:exon_73349349_73349513:DIS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 75861001 A/G 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75858808_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75858809_75861161:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75858809_75861161:TBC1D4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 75884216 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000136111:ENST00000377636:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000431480:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000425511:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000377625:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000493487:exon_75884078_75884287:TBC1D4;ENSG00000136111:ENST00000413735:exon_75884171_75884287:TBC1D4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 76134954 A/G 1 22 28 50 10.4547190107144 14.6939939863634 -4.239274975649 A:G A G 10 0.52478549951298 0.258252836912451 ENSG00000118939:ENST00000471792:exon_76134889_76135017:UCHL3;ENSG00000118939:ENST00000377595:exon_76134889_76135017:UCHL3;ENSG00000118939:ENST00000377589:exon_76134889_76135017:UCHL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 76430665 C/T 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76430642_76430744:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76430642_76430744:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76430642_76430744:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76430642_76430744:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76430642_76430744:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76430642_76430853:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000467686:exon_76430642_76430812:LMO7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 77574983 A/G 1 16 22 38 7.60343200779232 11.5452809892856 -3.94184898149324 A:G A G 10 0.52478549951298 0.255321980234543 ENSG00000102805:ENST00000377453:exon_77574593_77576652:CLN5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 77652974 C/T 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000005810:ENST00000357337:exon_77652959_77653024:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000407578:exon_77652959_77653024:MYCBP2;ENSG00000005810:ENST00000429715:exon_77652959_77653024:MYCBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 79940811 T/C 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000139746:ENST00000484573:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000267229:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438737:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000438724:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000327303:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000453752:exon_79940768_79941007:RBM26;ENSG00000139746:ENST00000461008:exon_79940768_79940845:RBM26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 80094993 C/T 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000102471:ENST00000218652:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000377116:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000415404:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000487865:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000465762:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000494647:exon_80094945_80095113:NDFIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 80095030 C/T 1 1 10 11 0.47521450048702 5.2478549951298 -4.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00450105750233496 ENSG00000102471:ENST00000218652:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000377116:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000415404:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000487865:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000465762:exon_80094945_80095110:NDFIP2;ENSG00000102471:ENST00000494647:exon_80094945_80095113:NDFIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 95863003 C/T 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95862946_95863035:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000431522:exon_95862946_95863035:ABCC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 96651499 T/G 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:G T G 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000102595:ENST00000376747:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376722:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000465196:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376714:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000461329:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000467305:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000397618:exon_96651465_96651561:UGGT2;ENSG00000102595:ENST00000376712:exon_96651465_96651561:UGGT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 99947829 T/C 1 40 68 108 19.0085800194808 35.6854139668826 -16.6768339474018 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.00140551971580899 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 99948178 C/A 1 74 61 135 35.1658730360395 32.0119154702918 3.1539575657477 A:C C A 10 0.52478549951298 0.606021139678301 ENSG00000169508:ENST00000376414:exon_99946784_99948417:GPR183 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 100204547 G/A 1 41 32 73 19.4837945199678 16.7931359844154 2.69065853555246 A:G G A 10 0.52478549951298 0.559402851626244 ENSG00000125304:ENST00000376387:exon_100204421_100204580:TM9SF2;ENSG00000125304:ENST00000419976:exon_100204421_100204580:TM9SF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 100992428 A/T 1 9 2 11 4.27693050438318 1.04957099902596 3.22735950535722 A:T A T 10 0.52478549951298 0.0689990334594261 ENSG00000175198:ENST00000376285:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376286:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376279:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376277:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000424527:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000443601:exon_100992411_100992513:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376254:exon_100992411_100992513:PCCA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 103519038 G/A 1 25 27 52 11.8803625121755 14.1692084868505 -2.28884597467496 A:G G A 10 0.52478549951298 0.57957955683438 ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103518982_103519195:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375955:exon_103518982_103519195:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103518982_103519195:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000481099:exon_103518982_103519195:ERCC5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 108861048 C/T 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000174405:ENST00000405925:exon_108859794_108863644:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000442234:exon_108859794_108863648:LIG4;ENSG00000174405:ENST00000356922:exon_108860565_108863644:LIG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 108922723 C/G 1 13 10 23 6.17778850633126 5.2478549951298 0.929933511201459 C:G C G 10 0.52478549951298 0.83534679528769 ENSG00000102524:ENST00000486502:exon_108922448_108922765:TNFSF13B;ENSG00000102524:ENST00000430559:exon_108922688_108922772:TNFSF13B;ENSG00000102524:ENST00000375887:exon_108922688_108922772:TNFSF13B;ENSG00000102524:ENST00000479435:exon_108922575_108922772:TNFSF13B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 111176393 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 111274618 T/A 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:T T A 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111274563_111274713:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000397191:exon_111274563_111274713:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111274563_111274713:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000439607:exon_111274563_111274713:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111274563_111274713:CARKD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 111298392 A/G 1 44 58 102 20.9094380214289 30.4375589717528 -9.52812095032396 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0602268502115429 ENSG00000134905:ENST00000481787:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000471986:exon_111298314_111298420:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111298314_111298437:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000487253:exon_111298314_111298643:CARS2;ENSG00000134905:ENST00000480437:exon_111298314_111298625:CARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 111319754 T/C 1 36 38 74 17.1077220175327 19.9418489814932 -2.83412696396052 T:C T C 10 0.52478549951298 0.561111579267483 ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 113209314 T/C 1 13 6 19 6.17778850633126 3.14871299707788 3.02907550925338 T:C T C 10 0.52478549951298 0.176954766259946 ENSG00000126216:ENST00000261965:exon_113209201_113209319:TUBGCP3;ENSG00000126216:ENST00000375669:exon_113209201_113209319:TUBGCP3;ENSG00000126216:ENST00000464139:exon_113209201_113209319:TUBGCP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 113834320 C/T 1 32 29 61 15.2068640155846 15.2187794858764 -0.0119154702917825 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000493650:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113834231_113834356:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000463208:exon_113834263_113834545:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000473462:exon_113834231_113834356:PCID2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 113851548 A/G 1 14 15 29 6.65300300681828 7.8717824926947 -1.21877948587642 A:G A G 10 0.52478549951298 0.711956673181561 ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113851333_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113851487_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113851486_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000475433:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000484641:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000480971:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000477095:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000491548:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000462853:exon_113851492_113851557:PCID2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 113897320 C/T 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 114290333 G/A 1 36 33 69 17.1077220175327 17.3179214839283 -0.210199466395622 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198176:ENST00000375370:exon_114290292_114290443:TFDP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 115002305 G/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000417057:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000494766:exon_115002274_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115002277_115002371:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115002277_115002371:CDC16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 13 115030714 T/C 1 141 135 276 67.0052445686698 70.8460424342523 -3.8407978655825 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.673237696578628 ENSG00000130177:ENST00000375312:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000360383:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000356221:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375310:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252457:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000375308:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000252458:exon_115030625_115030715:CDC16;ENSG00000130177:ENST00000461716:exon_115030368_115030715:CDC16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 20925154 T/G 1 284 287 571 134.960918138314 150.613438360225 -15.6525202219116 A:T:C:G T G 10 0.52478549951298 0.194107974613618 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 20925163 T/C 1 296 289 585 140.663492144158 151.663009359251 -10.9995172150933 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.362843205871381 ENSG00000100823:ENST00000442613:exon_20925150_20925925:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000216714:exon_20925150_20925933:APEX1;ENSG00000100823:ENST00000398030:exon_20925150_20925895:APEX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 20926699 A/G 1 41 32 73 19.4837945199678 16.7931359844154 2.69065853555246 A:G A G 10 0.52478549951298 0.559402851626244 ENSG00000165782:ENST00000250489:exon_20926012_20926861:TMEM55B;ENSG00000165782:ENST00000398020:exon_20926017_20926861:TMEM55B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21162053 T/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000214274:ENST00000336811:exon_21161706_21162222:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397990:exon_21161706_21162338:ANG;ENSG00000214274:ENST00000397987:exon_21161706_21162233:ANG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21250124 G/A 1 89 61 150 42.2940905433448 32.0119154702918 10.282175073053 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.101950342504473 ENSG00000169413:ENST00000304677:exon_21249854_21250626:RNASE6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21463050 G/C 1 69 46 115 32.7898005336044 24.1401329775971 8.6496675560073 C:G G C 10 0.52478549951298 0.112855468317115 ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21462953_21463060:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21462953_21463060:METT11D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21860900 G/A 1 27 28 55 12.8307915131495 14.6939939863634 -1.8632024732139 A:G G A 10 0.52478549951298 0.685985941709095 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21860666_21860968:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21860666_21860968:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21860666_21860968:CHD8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21869622 G/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000100888:ENST00000430710:exon_21869562_21869672:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000399982:exon_21869562_21869672:CHD8;ENSG00000100888:ENST00000262707:exon_21869562_21869672:CHD8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21928338 C/T 1 19 10 29 9.02907550925338 5.2478549951298 3.78122051412358 T:C C T 10 0.52478549951298 0.193868828897936 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21928383 T/C 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:C T C 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21928397 A/G 0 8 0 8 3.80171600389616 0 3.80171600389616 A A 10 0.52478549951298 0.00835333627376926 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21928398 T/C 0 8 0 8 3.80171600389616 0 3.80171600389616 T T 10 0.52478549951298 0.00835333627376926 ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 21945415 A/G 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000092203:ENST00000405508:exon_21945281_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000262709:exon_21945335_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000476180:exon_21945341_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455393:exon_21945362_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000447695:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000457430:exon_21945383_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000494242:exon_21945392_21945443:TOX4;ENSG00000092203:ENST00000455138:exon_21945397_21945443:TOX4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23020638 T/C 1 75 87 162 35.6410875365265 45.6563384576293 -10.0152509211028 T:C T C 10 0.52478549951298 0.116416447604024 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23020706 C/A 1 100 76 176 47.521450048702 39.8836979629865 7.63775208571551 A:C C A 10 0.52478549951298 0.258312965417507 ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23237212 G/A 1 77 77 154 36.5915165375005 40.4084834624995 -3.81696692499892 A:G G A 10 0.52478549951298 0.572500169853849 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23237167_23237831:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000442110:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23237167_23237380:OXA1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23240666 C/G 1 486 547 1033 230.954247236692 287.0576682336 -56.1034209969083 C:G C G 10 0.52478549951298 0.000481834204952713 ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23240643_23241007:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23240643_23240980:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23240643_23240963:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23240643_23240939:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23240643_23240970:OXA1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23341951 C/T 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23341947_23341991:LRP10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23344572 A/G 1 21 14 35 9.97950451022742 7.34699699318172 2.6325075170457 A:G A G 10 0.52478549951298 0.401790706529317 ENSG00000197324:ENST00000359591:exon_23344564_23345581:LRP10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23549319 A/G 1 25 23 48 11.8803625121755 12.0700664887985 -0.189703976623042 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23566913 C/G 1 65 63 128 30.8889425316563 33.0614864693177 -2.17254393766144 C:G C G 10 0.52478549951298 0.723879478618825 ENSG00000179933:ENST00000319074:exon_23566867_23569671:C14orf119 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 23746269 C/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 C:G C G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24423090 A/G 1 39 30 69 18.5333655189938 15.7435649853894 2.78980053360438 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.547664914432032 ENSG00000157326:ENST00000313250:exon_24422964_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000308178:exon_24422972_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000421831:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397073:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000382761:exon_24422979_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397075:exon_24422988_24423125:DHRS4;ENSG00000157326:ENST00000397074:exon_24422995_24423125:DHRS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24459475 G/T 1 13 3 16 6.17778850633126 1.57435649853894 4.60343200779232 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0237464979222770 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24459477 C/T 1 19 3 22 9.02907550925338 1.57435649853894 7.45471901071444 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00112127407872506 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24459486 C/T 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000187630:ENST00000397071:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000335125:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000348916:exon_24459391_24459568:DHRS4L2;ENSG00000187630:ENST00000382755:exon_24459391_24459568:DHRS4L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24567817 G/T 1 54 17 71 25.6615830262991 8.92135349172066 16.7402295345784 T:G G T 10 0.52478549951298 6.59198522246926e-05 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24567684_24567887:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24567684_24567887:PCK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24568346 C/T 1 15 9 24 7.1282175073053 4.72306949561682 2.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.414765733374574 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24568258_24568445:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24568258_24568445:PCK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24569408 A/T 1 98 43 141 46.571021047728 22.5657764790581 24.0052445686698 A:T A T 10 0.52478549951298 4.56115972865346e-05 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24569204_24569422:PCK2;ENSG00000100889:ENST00000396973:exon_24569204_24569758:PCK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24572812 G/A 1 69 106 175 32.7898005336044 55.6272629483759 -22.8374624147715 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000623212830974387 ENSG00000100889:ENST00000216780:exon_24572719_24573339:PCK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24586567 G/A 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24586475_24586602:DCAF11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24586589 G/A 1 14 7 21 6.65300300681828 3.67349849659086 2.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274424617526912 ENSG00000100897:ENST00000326009:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000446197:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000334688:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000434201:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396936:exon_24586475_24586602:DCAF11;ENSG00000100897:ENST00000396941:exon_24586475_24586602:DCAF11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24617238 C/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24617185_24617331:RNF31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24624497 T/C 1 13 27 40 6.17778850633126 14.1692084868505 -7.9914199805192 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0164533780057664 ENSG00000092098:ENST00000382682:exon_24624366_24624539:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000491351:exon_24624366_24624539:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000324103:exon_24624366_24624539:RNF31;ENSG00000092098:ENST00000382687:exon_24624366_24624539:RNF31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24647814 T/C 1 39 27 66 18.5333655189938 14.1692084868505 4.36415703214332 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324525244097516 ENSG00000100918:ENST00000311457:exon_24647812_24647878:REC8;ENSG00000100918:ENST00000447460:exon_24647812_24647878:REC8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24657936 G/A 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24657925_24658124:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24657925_24658003:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24657925_24658003:IPO4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24709351 C/T 1 125 143 268 59.4018125608775 75.0443264303562 -15.6425138694787 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0580086504680492 ENSG00000092330:ENST00000267415:exon_24709270_24709361:TINF2;ENSG00000092330:ENST00000399423:exon_24708853_24710081:TINF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24735688 C/T 1 67 45 112 31.8393715326303 23.6153474780841 8.22402405454624 T:C C T 10 0.52478549951298 0.130272967288825 ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735636_24735723:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735636_24735723:RABGGTA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24761456 C/G 1 33 51 84 15.6820785160717 26.764060475162 -11.0819819590903 C:G C G 10 0.52478549951298 0.016232004150582 ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24761390_24761536:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24761390_24761536:DHRS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24785884 T/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000213903:ENST00000345363:exon_24784843_24786152:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396789:exon_24784843_24787061:LTB4R;ENSG00000213903:ENST00000396782:exon_24784843_24787242:LTB4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24843620 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24843532_24843672:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000422617:exon_24843532_24843672:NFATC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 24845841 T/C 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 53133134 A/G 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 A:G A G 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000197930:ENST00000395686:exon_53133093_53133213:ERO1L;ENSG00000197930:ENST00000359133:exon_53133093_53133213:ERO1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 58831142 A/G 1 21 21 42 9.97950451022742 11.0204954897726 -1.04099097954516 A:G A G 10 0.52478549951298 0.759841909015547 ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 58953745 G/A 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_58953725_58953884:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_58953725_58953884:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_58953725_58953884:KIAA0586 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 59014522 G/A 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G G A 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000100578:ENST00000354386:exon_59014499_59014838:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000423743:exon_59014499_59014838:KIAA0586;ENSG00000100578:ENST00000261244:exon_59014499_59015546:KIAA0586 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 59965587 A/G 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000050130:ENST00000425728:exon_59965445_59965626:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000261247:exon_59965445_59965626:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000442454:exon_59965445_59965626:JKAMP;ENSG00000050130:ENST00000356057:exon_59965445_59965626:JKAMP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 60616197 T/G 1 138 87 225 65.5796010672088 45.6563384576293 19.9232626095795 T:G T G 10 0.52478549951298 0.00908600589156584 ENSG00000100612:ENST00000216500:exon_60616071_60616286:DHRS7;ENSG00000100612:ENST00000360557:exon_60616116_60616286:DHRS7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 61442412 T/G 1 22 18 40 10.4547190107144 9.44613899123364 1.0085800194808 T:G T G 10 0.52478549951298 0.874475388124865 ENSG00000126814:ENST00000261249:exon_61442193_61442844:TRMT5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 61446385 A/G 1 22 15 37 10.4547190107144 7.8717824926947 2.58293651801974 A:G A G 10 0.52478549951298 0.415644114388946 ENSG00000126814:ENST00000261249:exon_61445949_61446604:TRMT5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 64065726 T/G 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000140006:ENST00000394942:exon_64063757_64066691:WDR89;ENSG00000140006:ENST00000400511:exon_64063758_64066689:WDR89;ENSG00000140006:ENST00000267522:exon_64065220_64066691:WDR89 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 69341554 G/A 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000072110:ENST00000193403:exon_69340843_69341734:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000438964:exon_69340843_69341734:ACTN1;ENSG00000072110:ENST00000394419:exon_69340843_69341734:ACTN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 70839735 A/C 1 18 23 41 8.55386100876636 12.0700664887985 -3.51620548003218 A:C A C 10 0.52478549951298 0.278656320345785 ENSG00000213463:ENST00000256366:exon_70833217_70839848:SYNJ2BP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 71059691 A/G 1 14 25 39 6.65300300681828 13.1196374878245 -6.46663448100622 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0529651995530018 ENSG00000133997:ENST00000256379:exon_71059597_71059705:MED6;ENSG00000133997:ENST00000430055:exon_71059597_71059726:MED6;ENSG00000133997:ENST00000440435:exon_71059597_71059705:MED6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 72945012 T/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:C T C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 73440864 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 74036214 G/T 1 17 15 32 8.07864650827934 7.8717824926947 0.206864015584639 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000119673:ENST00000238651:exon_74035772_74036587:ACOT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 74061968 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000177465:ENST00000326303:exon_74061753_74062468:ACOT4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 74428000 A/T 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:T A T 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74427876_74428078:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74427876_74428078:COQ6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 74428445 G/A 1 40 36 76 19.0085800194808 18.8922779824673 0.116302037013519 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74428440_74428606:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74428440_74428606:COQ6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 74429730 T/C 1 47 53 100 22.3350815228899 27.8136314741879 -5.478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.316715036778552 ENSG00000119723:ENST00000238709:exon_74429673_74429811:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000334571:exon_74429673_74429811:COQ6;ENSG00000119723:ENST00000394026:exon_74429673_74429811:COQ6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 75265123 C/T 1 15 17 32 7.1282175073053 8.92135349172066 -1.79313598441536 T:C C T 10 0.52478549951298 0.596917633265219 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75264283_75266400:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75264283_75266400:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75264283_75266400:YLPM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 75279461 G/A 1 31 24 55 14.7316495150976 12.5948519883115 2.1367975267861 A:G G A 10 0.52478549951298 0.591584730894599 ENSG00000119596:ENST00000325680:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000238571:exon_75279331_75279485:YLPM1;ENSG00000119596:ENST00000423680:exon_75279331_75279485:YLPM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 75475894 G/C 1 104 51 155 49.4223080506501 26.764060475162 22.6582475754881 A:C:G G C 10 0.52478549951298 0.000272553240029146 ENSG00000119718:ENST00000266126:exon_75475734_75476292:EIF2B2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 75513828 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 75574087 C/T 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75574046_75574190:NEK9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 76330181 G/A 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 77794283 T/C 1 30 20 50 14.2564350146106 10.4957099902596 3.760725024351 T:C T C 10 0.52478549951298 0.322898389841764 ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77794255_77794380:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393741:exon_77794123_77794380:GSTZ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 78028803 A/G 1 17 12 29 8.07864650827934 6.29742599415576 1.78122051412358 A:G A G 10 0.52478549951298 0.579302264605088 ENSG00000100596:ENST00000216484:exon_78028739_78028832:SPTLC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 78174460 G/T 1 112 86 198 53.2240240545462 45.1315529581163 8.09247109642995 T:G G T 10 0.52478549951298 0.255718720676831 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 78174473 A/C 1 248 190 438 117.853196120781 99.7092449074662 18.1439512133148 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0850855894122117 ENSG00000119705:ENST00000238688:exon_78174425_78174551:C14orf156 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 78197365 C/T 1 45 58 103 21.3846525219159 30.4375589717528 -9.05290644983694 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0764055480753924 ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78197331_78197472:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78197331_78197472:SNW1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 81952649 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000071537:ENST00000336735:exon_81952633_81952798:SEL1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 88904567 G/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:T:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000042317:ENST00000356583:exon_88904182_88904802:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000393545:exon_88904182_88904802:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000362040:exon_88904182_88904797:SPATA7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 90398907 G/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000140025:ENST00000316738:exon_90398870_90398971:C14orf143 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 90754929 C/T 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90754561_90755489:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90754561_90755489:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90754561_90755489:C14orf102 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 91739081 A/G 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000015133:ENST00000389857:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000427583:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000334448:exon_91737669_91739997:CCDC88C;ENSG00000015133:ENST00000331194:exon_91738969_91739562:CCDC88C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 91948454 C/T 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 ENSG00000100796:ENST00000337238:exon_91947920_91948537:SMEK1;ENSG00000100796:ENST00000417427:exon_91947920_91948537:SMEK1;ENSG00000100796:ENST00000417249:exon_91947920_91948537:SMEK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92441066 C/T 1 4 15 19 1.90085800194808 7.8717824926947 -5.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00949811149698198 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92440971_92441087:TRIP11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92454633 C/T 1 13 9 22 6.17778850633126 4.72306949561682 1.45471901071444 T:C C T 10 0.52478549951298 0.670593887428144 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92454628_92454727:TRIP11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92470251 G/T 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:G G T 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92471242 T/C 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:C T C 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000100815:ENST00000267622:exon_92469763_92472792:TRIP11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92548785 C/T 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000066427:ENST00000429774:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359819:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393289:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000359366:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000393287:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000502250:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000503767:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000340660:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000532032:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000447800:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000515746:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000506466:exon_92548644_92548810:ATXN3;ENSG00000066427:ENST00000526872:exon_92548687_92548808:ATXN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92588002 T/G 1 940 646 1586 446.701630457799 339.011432685385 107.690197772414 T:G T G 10 0.52478549951298 6.18590076526696e-08 ENSG00000183648:ENST00000329559:exon_92587986_92588153:NDUFB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 92609404 G/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165934:ENST00000298875:exon_92609348_92609638:CPSF2;ENSG00000165934:ENST00000443529:exon_92609348_92609638:CPSF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 93118668 C/T 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 93170661 T/A 1 45 72 117 21.3846525219159 37.7845559649346 -16.3999034430187 A:T T A 10 0.52478549951298 0.00290343348079498 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93170157_93170706:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93170157_93170706:LGMN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 93199080 C/T 1 24 16 40 11.4051480116885 8.39656799220768 3.0085800194808 T:C C T 10 0.52478549951298 0.429013958152278 ENSG00000100600:ENST00000334864:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000393218:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000334869:exon_93198994_93199160:LGMN;ENSG00000100600:ENST00000262004:exon_93198994_93199160:LGMN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 93263982 C/G 1 14 7 21 6.65300300681828 3.67349849659086 2.97950451022742 C:G C G 10 0.52478549951298 0.274424617526912 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93263753_93264326:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93263783_93264012:GOLGA5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 93275841 A/G 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G A G 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000066455:ENST00000163416:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000355976:exon_93275645_93275864:GOLGA5;ENSG00000066455:ENST00000439315:exon_93275645_93275864:GOLGA5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 93708759 A/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:C A C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000011114:ENST00000355125:exon_93703896_93709434:BTBD7;ENSG00000011114:ENST00000334746:exon_93703896_93709434:BTBD7;ENSG00000011114:ENST00000442779:exon_93703896_93709434:BTBD7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 95670132 G/A 1 1 8 9 0.47521450048702 4.19828399610384 -3.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0165388389563391 ENSG00000165959:ENST00000298912:exon_95669175_95670800:CLMN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 95999820 T/C 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.613945050704295 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 97299853 A/G 1 56 40 96 26.6120120272731 20.9914199805192 5.62059204675392 A:G A G 10 0.52478549951298 0.26241967272041 ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 102483120 A/G 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102483103_102483336:DYNC1H1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 102805524 C/T 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102805431_102805560:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102805431_102805560:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102805431_102805566:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102805431_102805560:ZNF839 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 104026311 C/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000166170:ENST00000337322:exon_104022889_104027529:BAG5;ENSG00000166170:ENST00000445922:exon_104022889_104027529:BAG5;ENSG00000166170:ENST00000299204:exon_104022889_104027529:BAG5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 104199356 C/T 1 20 7 27 9.5042900097404 3.67349849659086 5.83079151314954 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0323842653872624 ENSG00000100711:ENST00000311141:exon_104199320_104199995:ZFYVE21;ENSG00000100711:ENST00000216602:exon_104199320_104200004:ZFYVE21 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 105477613 T/C 1 25 36 61 11.8803625121755 18.8922779824673 -7.01191547029178 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0740938792742231 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 105478102 G/A 1 44 38 82 20.9094380214289 19.9418489814932 0.967589039935639 A:G G A 10 0.52478549951298 0.912055018821511 ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 105716034 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000184887:ENST00000327471:exon_105715977_105717421:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392554:exon_105715977_105717430:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000463376:exon_105715977_105716298:BTBD6;ENSG00000184887:ENST00000392553:exon_105715977_105716633:BTBD6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 105965289 T/C 1 20 23 43 9.5042900097404 12.0700664887985 -2.56577647905814 T:C T C 10 0.52478549951298 0.449185365641322 ENSG00000185347:ENST00000329886:exon_105964954_105965516:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392527:exon_105964954_105965523:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392528:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000334656:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392523:exon_105964954_105965585:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000392522:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000334643:exon_105964954_105965584:C14orf80;ENSG00000185347:ENST00000354560:exon_105964954_105965546:C14orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 106209081 C/G 1 20 4 24 9.5042900097404 2.09914199805192 7.40514801168848 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00325409406753784 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 106209340 T/C 1 315 1732 2047 149.692567653411 908.928485156481 -759.23591750307 A:T:C:G T C 10 0.52478549951298 3.43049446425551e-268 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 106232289 T/C 1 45 1 46 21.3846525219159 0.52478549951298 20.8598670224029 T:C T C 10 0.52478549951298 7.4132055482542e-12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 106236116 A/T 1 2 50 52 0.95042900097404 26.239274975649 -25.288845974675 A:T:G A T 10 0.52478549951298 2.91970157547344e-14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 106330093 C/T 1 19 1 20 9.02907550925338 0.52478549951298 8.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 5.59283159650697e-05 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 14 107170005 T/C 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:C T C 10 0.52478549951298 0.636288491925486 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 22868879 C/T 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000153575:ENST00000283645:exon_22868841_22868966:TUBGCP5;ENSG00000153575:ENST00000453949:exon_22868841_22868966:TUBGCP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 22939192 G/A 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 22969232 G/A 1 15 16 31 7.1282175073053 8.39656799220768 -1.26835048490238 A:G G A 10 0.52478549951298 0.720494209048114 ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22969163_22969362:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22969163_22969362:CYFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 25602024 T/C 1 43 41 84 20.4342235209419 21.5162054800322 -1.08198195909032 T:C T C 10 0.52478549951298 0.827834635433068 ENSG00000114062:ENST00000232165:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000397954:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000438097:exon_25601838_25602043:UBE3A;ENSG00000114062:ENST00000428984:exon_25601838_25602043:UBE3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 34528948 G/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G G A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000140199:ENST00000290209:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397707:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000354181:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000451844:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000397702:exon_34528909_34529016:SLC12A6;ENSG00000140199:ENST00000458406:exon_34528909_34529016:SLC12A6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 34651983 T/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C T C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 35148987 G/T 1 49 72 121 23.285510523864 37.7845559649346 -14.4990454410706 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0105151301041451 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 35149048 G/A 1 75 42 117 35.6410875365265 22.0409909795452 13.6000965569813 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0123247486785106 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 35166127 T/C 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 T:C T C 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35166029_35166200:AQR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 35182441 G/A 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35182416_35182525:AQR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 35830665 C/T 1 31 29 60 14.7316495150976 15.2187794858764 -0.487129970778803 T:C C T 10 0.52478549951298 0.898095848078924 ENSG00000134146:ENST00000256538:exon_35830475_35830668:ATPBD4;ENSG00000134146:ENST00000440392:exon_35830475_35830668:ATPBD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40330564 C/T 1 249 176 425 118.328410621268 92.3622479142845 25.9661627069835 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0131594865888452 ENSG00000140319:ENST00000267884:exon_40330483_40330595:SRP14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40462780 G/A 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40462738_40462831:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40462738_40462882:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40462738_40462882:BUB1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40476002 A/G 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40475915_40476084:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40475915_40476084:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40475915_40476084:BUB1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40498503 T/C 1 23 20 43 10.9299335112015 10.4957099902596 0.43422352094186 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40498385_40498659:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40498385_40498659:BUB1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40512818 A/G 1 108 78 186 51.3231660525982 40.9332689620124 10.3898970905857 A:G A G 10 0.52478549951298 0.141879783304352 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40512765_40513378:BUB1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40512906 A/G 1 82 90 172 38.9675890399356 47.2306949561682 -8.26310591623256 A:G A G 10 0.52478549951298 0.222060018523811 ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40512765_40513378:BUB1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 40590478 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000137841:ENST00000456256:exon_40590424_40590581:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000260402:exon_40590424_40590581:PLCB2;ENSG00000137841:ENST00000389812:exon_40590424_40590581:PLCB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 41247657 T/C 1 40 46 86 19.0085800194808 24.1401329775971 -5.13155295811628 T:C T C 10 0.52478549951298 0.281615082582432 ENSG00000128965:ENST00000446533:exon_41247571_41248717:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000249798:exon_41247571_41248709:CHAC1;ENSG00000128965:ENST00000487220:exon_41247571_41248365:CHAC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 41456283 T/C 0 48 0 48 22.810296023377 0 22.810296023377 T T 10 0.52478549951298 5.29518230330421e-14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 41634587 A/G 1 48 13 61 22.810296023377 6.82221149366874 15.9880845297082 A:G A G 10 0.52478549951298 2.93707124175512e-05 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 41634588 C/A 1 50 12 62 23.760725024351 6.29742599415576 17.4632990301952 A:C C A 10 0.52478549951298 5.26426643966216e-06 ENSG00000137804:ENST00000414849:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000260359:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000432717:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000450318:exon_41634584_41634652:NUSAP1;ENSG00000137804:ENST00000443916:exon_41634584_41634652:NUSAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 42139902 G/A 1 1 7 8 0.47521450048702 3.67349849659086 -3.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0313306683969089 ENSG00000168970:ENST00000490848:exon_42139847_42140353:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000382448:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000491746:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000342159:exon_42139847_42140164:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000487292:exon_42139847_42140341:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000458483:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000168970:ENST00000446407:exon_42139847_42140345:JMJD7-PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000452633:exon_42139847_42140345:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000483748:exon_42139847_42140338:PLA2G4B;ENSG00000243708:ENST00000484140:exon_42139847_42140341:PLA2G4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 42211663 C/T 1 24 15 39 11.4051480116885 7.8717824926947 3.53336551899378 T:C C T 10 0.52478549951298 0.267155005184894 ENSG00000103966:ENST00000220325:exon_42211408_42211820:EHD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 42851600 T/C 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137814:ENST00000260372:exon_42851537_42851606:HAUS2;ENSG00000137814:ENST00000391623:exon_42851537_42851606:HAUS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 43244544 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000159459:ENST00000290650:exon_43244476_43244646:UBR1;ENSG00000159459:ENST00000382177:exon_43244476_43244646:UBR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44046013 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44066826 G/A 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000128886:ENST00000319359:exon_44066794_44066971:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000467869:exon_44066794_44066971:ELL3;ENSG00000128886:ENST00000497465:exon_44066794_44066971:ELL3;ENSG00000184716:ENST00000417761:exon_44066794_44066971:SERINC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44087612 G/A 1 14 12 26 6.65300300681828 6.29742599415576 0.355577012662518 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000184716:ENST00000417761:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000319327:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000448553:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000457418:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000299969:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000412697:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000396823:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000184716:ENST00000249714:exon_44087586_44087739:SERINC4;ENSG00000140264:ENST00000445816:exon_44086572_44088287:SERF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44102010 A/C 1 48 33 81 22.810296023377 17.3179214839283 5.49237453944862 A:C A C 10 0.52478549951298 0.265822703776816 ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44119252 G/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000092470:ENST00000263795:exon_44119161_44119290:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000381246:exon_44119178_44119316:WDR76;ENSG00000092470:ENST00000452115:exon_44119186_44119290:WDR76 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44581311 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000166734:ENST00000299957:exon_44580929_44581554:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000416522:exon_44580929_44581554:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000360824:exon_44580929_44581554:CASC4;ENSG00000166734:ENST00000345795:exon_44580958_44581554:CASC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 44877979 G/A 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 A:G G A 10 0.52478549951298 0.393947332697963 ENSG00000104133:ENST00000261866:exon_44877834_44878048:SPG11;ENSG00000104133:ENST00000427534:exon_44877834_44878048:SPG11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 45007608 C/T 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.432010905231683 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 45047402 A/G 1 14 12 26 6.65300300681828 6.29742599415576 0.355577012662518 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000185880:ENST00000329464:exon_45047098_45047574:TRIM69 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 45694610 C/T 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 45694768 G/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 45694983 G/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171763:ENST00000305560:exon_45694529_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000531970:exon_45694573_45695716:SPATA5L1;ENSG00000171763:ENST00000396655:exon_45694587_45696889:SPATA5L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 49917401 G/A 1 17 2 19 8.07864650827934 1.04957099902596 7.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000925014473806806 ENSG00000104047:ENST00000403028:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000329873:exon_49917310_49917628:DTWD1;ENSG00000104047:ENST00000251250:exon_49917310_49917628:DTWD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 50884457 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000092439:ENST00000313478:exon_50884108_50884823:TRPM7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52258697 A/G 1 41 23 64 19.4837945199678 12.0700664887985 7.41372803116928 A:G A G 10 0.52478549951298 0.078995266757886 ENSG00000166477:ENST00000299601:exon_52257946_52258701:LEO1;ENSG00000166477:ENST00000315141:exon_52257946_52258701:LEO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52350879 T/C 1 8 15 23 3.80171600389616 7.8717824926947 -4.07006648879854 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0980805846777547 ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52350830_52350994:MAPK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52356381 A/G 1 25 26 51 11.8803625121755 13.6444229873375 -1.76406047516198 A:G A G 10 0.52478549951298 0.675005862075556 ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52356099_52358462:MAPK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52416739 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000069966:ENST00000261837:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000358784:exon_52416670_52416836:GNB5;ENSG00000069966:ENST00000396335:exon_52416670_52416836:GNB5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52605861 A/G 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52606016 G/A 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52599480_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52599483_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52599485_52606045:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52599485_52606045:MYO5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52609347 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52609245_52609419:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52609245_52609419:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52609245_52609419:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52609245_52609419:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52609245_52609419:MYO5A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 52901212 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000047346:ENST00000261844:exon_52900765_52902580:KIAA1370;ENSG00000047346:ENST00000399202:exon_52900765_52902580:KIAA1370 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 54919047 A/G 1 3 15 18 1.42564350146106 7.8717824926947 -6.44613899123364 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00329666161144462 ENSG00000137766:ENST00000260323:exon_54919026_54920806:UNC13C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 55652152 T/C 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 T:C T C 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 55653031 A/G 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 58001252 A/G 1 4 12 16 1.90085800194808 6.29742599415576 -4.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0420559312099871 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 58001324 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000137878:ENST00000460962:exon_58000912_58001556:GCOM1;ENSG00000255529:ENST00000380563:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000299638:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000494490:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464277:exon_58000912_58001382:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000482852:exon_58000912_58001556:GRINL1A;ENSG00000255529:ENST00000464308:exon_58000912_58001531:GRINL1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 59407070 T/C 1 114 126 240 54.1744530555203 66.1229729386355 -11.9485198831152 T:C T C 10 0.52478549951298 0.136994505854656 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59406917_59407075:CCNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 59408918 A/G 1 134 131 265 63.6787430652607 68.7469004362004 -5.06815737093972 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.539115273742523 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59408889_59409125:CCNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 59409495 G/A 1 151 108 259 71.75738957354 56.6768339474018 15.0805556261382 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0621241479253056 ENSG00000157456:ENST00000288207:exon_59409427_59409567:CCNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 59429565 G/C 1 80 66 146 38.0171600389616 34.6358429678567 3.38131707110492 A:T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.619312459477237 ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59428169_59429655:MYO1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 59784493 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000157470:ENST00000288228:exon_59784470_59784588:FAM81A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 60641300 C/T 1 133 268 401 63.2035285647737 140.642513869479 -77.438985304705 T:C C T 10 0.52478549951298 9.43581005104826e-15 ENSG00000182718:ENST00000396024:exon_60641274_60641396:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000332680:exon_60641274_60641396:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000421017:exon_60641274_60641396:ANXA2;ENSG00000182718:ENST00000451270:exon_60641274_60641396:ANXA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 62146741 A/G 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G A G 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62144588_62146757:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62144592_62146757:VPS13C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 62146746 A/C 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 A:C A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000129003:ENST00000249837:exon_62144588_62146757:VPS13C;ENSG00000129003:ENST00000261517:exon_62144592_62146757:VPS13C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 63433766 G/A 1 107 63 170 50.8479515521111 33.0614864693177 17.7864650827934 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0070386983841867 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 63433800 G/A 1 112 65 177 53.2240240545462 34.1110574683437 19.1129665862025 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00416050407658234 ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 63548787 G/A 1 16 21 37 7.60343200779232 11.0204954897726 -3.41706348198026 A:G G A 10 0.52478549951298 0.323510923668804 ENSG00000166128:ENST00000321437:exon_63548704_63548793:RAB8B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 63597857 T/G 1 11 22 33 5.22735950535722 11.5452809892856 -6.31792148392834 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0352792131345572 ENSG00000138613:ENST00000380343:exon_63597813_63601324:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000261879:exon_63597813_63601325:APH1B;ENSG00000138613:ENST00000380340:exon_63597813_63598754:APH1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 63932513 G/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000103657:ENST00000443617:exon_63932351_63932644:HERC1;ENSG00000103657:ENST00000261887:exon_63932351_63932644:HERC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 64221761 G/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000035664:ENST00000261891:exon_64221750_64221776:DAPK2;ENSG00000035664:ENST00000457488:exon_64221750_64221776:DAPK2;ENSG00000035664:ENST00000395790:exon_64221750_64221776:DAPK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 64448365 C/T 1 16 3 19 7.60343200779232 1.57435649853894 6.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00531348852541696 ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 64737225 G/A 1 36 13 49 17.1077220175327 6.82221149366874 10.285510523864 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00379980898797623 ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 65108504 A/T 1 22 23 45 10.4547190107144 12.0700664887985 -1.6153474780841 A:T A T 10 0.52478549951298 0.656663234411555 ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 65450154 G/A 1 14 14 28 6.65300300681828 7.34699699318172 -0.693993986363441 A:G G A 10 0.52478549951298 0.851182438556464 ENSG00000166855:ENST00000300107:exon_65450084_65450248:CLPX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 65871698 G/T 1 65 75 140 30.8889425316563 39.3589124634735 -8.4699699318172 T:G G T 10 0.52478549951298 0.175550983729999 ENSG00000138614:ENST00000395644:exon_65871095_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000420799:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000442903:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000313182:exon_65871120_65871997:C15orf44;ENSG00000138614:ENST00000431261:exon_65871403_65871997:C15orf44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 65982975 T/C 1 36 32 68 17.1077220175327 16.7931359844154 0.314586033117358 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000174485:ENST00000431932:exon_65982753_65983849:DENND4A;ENSG00000174485:ENST00000308976:exon_65982753_65983849:DENND4A;ENSG00000174485:ENST00000443035:exon_65982753_65983849:DENND4A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 66641732 G/C 1 33 31 64 15.6820785160717 16.2683504849024 -0.586271968830722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.900993242299245 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66641653_66641775:TIPIN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 66644541 T/G 1 37 29 66 17.5829365180197 15.2187794858764 2.36415703214332 T:G T G 10 0.52478549951298 0.622635112931205 ENSG00000075131:ENST00000261881:exon_66644467_66644545:TIPIN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 66727499 G/A 1 26 23 49 12.3555770126625 12.0700664887985 0.285510523863978 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169032:ENST00000307102:exon_66727365_66727575:MAP2K1;ENSG00000169032:ENST00000425818:exon_66727467_66727575:MAP2K1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 71300718 G/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:G G T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000137821:ENST00000443425:exon_71300718_71300955:LRRC49;ENSG00000137821:ENST00000260382:exon_71300718_71300955:LRRC49;ENSG00000137821:ENST00000436542:exon_71300718_71300955:LRRC49 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 71633871 G/A 0 284 0 284 134.960918138314 0 134.960918138314 G G 10 0.52478549951298 5.18834256721664e-80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 72638638 A/G 1 60 65 125 28.5128700292212 34.1110574683437 -5.5981874391225 A:G A G 10 0.52478549951298 0.32574077150882 ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72638576_72638666:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72638576_72638666:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72638576_72638666:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72638576_72638666:HEXA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 74315385 C/A 1 31 24 55 14.7316495150976 12.5948519883115 2.1367975267861 A:C C A 10 0.52478549951298 0.591584730894599 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000395135:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000359928:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000395132:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74315169_74315749:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74315169_74315749:PML HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 74325743 G/A 1 54 36 90 25.6615830262991 18.8922779824673 6.7693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.170259659813357 ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000395135:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74325497_74325763:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74325497_74325755:PML HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 74703022 G/A 1 87 66 153 41.3436615423707 34.6358429678567 6.70781857451406 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293240337178792 ENSG00000138623:ENST00000261918:exon_74701630_74703326:SEMA7A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75093395 C/T 1 304 304 608 144.465208148054 159.534791851946 -15.0695837038919 T:C C T 10 0.52478549951298 0.223398942971652 ENSG00000103653:ENST00000220003:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000451345:exon_75093353_75093443:CSK;ENSG00000103653:ENST00000439220:exon_75093353_75093443:CSK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75144477 C/T 1 28 25 53 13.3060060136366 13.1196374878245 0.186368525812057 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000140497:ENST00000268099:exon_75144410_75144527:SCAMP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75189930 A/G 1 41 62 103 19.4837945199678 32.5367009698048 -13.0529064498369 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0103080995209458 ENSG00000178802:ENST00000352410:exon_75189853_75191798:MPI;ENSG00000178802:ENST00000323744:exon_75189853_75190569:MPI HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75341052 C/T 1 34 18 52 16.1572930165587 9.44613899123364 6.71115402532504 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0709438638503768 ENSG00000138621:ENST00000342932:exon_75340894_75341062:PPCDC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75499619 T/C 1 13 25 38 6.17778850633126 13.1196374878245 -6.94184898149324 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0333714465453368 ENSG00000167173:ENST00000360639:exon_75498340_75501165:C15orf39;ENSG00000167173:ENST00000394987:exon_75498340_75501165:C15orf39 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75631285 A/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75647340 C/G 1 13 28 41 6.17778850633126 14.6939939863634 -8.51620548003218 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0114001936810839 ENSG00000140398:ENST00000355059:exon_75647305_75647592:NEIL1;ENSG00000140398:ENST00000336572:exon_75647305_75647586:NEIL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75656505 T/A 1 13 5 18 6.17778850633126 2.6239274975649 3.55386100876636 A:T T A 10 0.52478549951298 0.103560900526000 ENSG00000140400:ENST00000267978:exon_75656340_75656529:MAN2C1;ENSG00000140400:ENST00000421803:exon_75656272_75656529:MAN2C1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75664404 G/A 1 21 21 42 9.97950451022742 11.0204954897726 -1.04099097954516 A:G G A 10 0.52478549951298 0.759841909015547 ENSG00000169375:ENST00000394947:exon_75661720_75664550:SIN3A;ENSG00000169375:ENST00000394949:exon_75661722_75664550:SIN3A;ENSG00000169375:ENST00000360439:exon_75663274_75664550:SIN3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 75761101 G/A 1 15 14 29 7.1282175073053 7.34699699318172 -0.218779485876421 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169410:ENST00000306726:exon_75759462_75761324:PTPN9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 77322867 C/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77322843_77322922:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77322843_77322922:PSTPIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 77344793 T/A 1 53 88 141 25.1863685258121 46.1811239571422 -20.9947554313302 A:T T A 10 0.52478549951298 0.000501626168456362 ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 77756608 G/A 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 A:G G A 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000140382:ENST00000336216:exon_77756582_77756729:HMG20A;ENSG00000140382:ENST00000435040:exon_77756582_77756729:HMG20A;ENSG00000140382:ENST00000381714:exon_77756582_77756729:HMG20A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 78458638 C/T 1 66 70 136 31.3641570321433 36.7349849659086 -5.37082793376528 T:C C T 10 0.52478549951298 0.390750698198961 ENSG00000166411:ENST00000299518:exon_78458492_78458644:IDH3A;ENSG00000166411:ENST00000441490:exon_78458492_78458644:IDH3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 79224747 C/T 1 166 163 329 78.8856070808453 85.5400364206157 -6.65442933977043 T:C C T 10 0.52478549951298 0.473344891314982 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000525807:exon_79224714_79224786:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534533:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529612:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528191:exon_79224714_79224800:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79224714_79224800:CTSH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 79229745 C/T 1 175 231 406 83.1625375852285 121.225450387498 -38.0629128022699 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000186404413499342 ENSG00000103811:ENST00000220166:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000394758:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000444399:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000533777:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529861:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000528741:exon_79229660_79229838:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534038:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530010:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000530929:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000529263:exon_79229660_79229765:CTSH;ENSG00000103811:ENST00000534268:exon_79229660_79229765:CTSH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 79603726 G/A 1 51 42 93 24.235939524838 22.0409909795452 2.19494854529286 A:G G A 10 0.52478549951298 0.678857451900338 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79603404_79603759:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79603485_79603759:TMED3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 79606137 G/A 1 51 70 121 24.235939524838 36.7349849659086 -12.4990454410706 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0285047908778363 ENSG00000166557:ENST00000299705:exon_79606099_79606347:TMED3;ENSG00000166557:ENST00000424155:exon_79606099_79606347:TMED3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 80191343 G/A 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000136371:ENST00000478497:exon_80191189_80191467:MTHFS;ENSG00000136371:ENST00000485386:exon_80191246_80191467:MTHFS;ENSG00000180953:ENST00000322484:exon_80191185_80191467:ST20;ENSG00000180953:ENST00000417278:exon_80191185_80191467:ST20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 80452172 G/C 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 C:G G C 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80452098_80452219:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80452098_80452219:FAH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 82443824 C/T 1 29 31 60 13.7812205141236 16.2683504849024 -2.4871299707788 T:C C T 10 0.52478549951298 0.521773780463185 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 82443939 G/A 1 36 25 61 17.1077220175327 13.1196374878245 3.98808452970822 A:G G A 10 0.52478549951298 0.369675483332825 ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 83218244 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000214575:ENST00000450751:exon_83218210_83218408:CPEB1;ENSG00000214575:ENST00000398593:exon_83218210_83218408:CPEB1;ENSG00000214575:ENST00000261723:exon_83218210_83218408:CPEB1;ENSG00000214575:ENST00000423133:exon_83218210_83218408:CPEB1;ENSG00000214575:ENST00000398592:exon_83218210_83218408:CPEB1;ENSG00000214575:ENST00000398591:exon_83218210_83218408:CPEB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 85341859 G/A 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85341819_85342106:ZNF592 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 89018461 C/T 1 66 72 138 31.3641570321433 37.7845559649346 -6.42039893279124 T:C C T 10 0.52478549951298 0.306432903293497 ENSG00000181991:ENST00000325844:exon_89018341_89018470:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000421647:exon_89018341_89018470:MRPS11;ENSG00000181991:ENST00000353598:exon_89018341_89018470:MRPS11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 89805073 G/A 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89805052_89805109:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89805052_89805109:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89805052_89805109:FANCI HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 89835954 C/T 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89835919_89836095:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89835919_89836095:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89835919_89836095:FANCI HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 89858602 T/C 1 144 110 254 68.4308880701309 57.7264049464278 10.7044831237031 T:C T C 10 0.52478549951298 0.187293295916068 ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89858513_89858620:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89858513_89858620:FANCI HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 90611683 C/T 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 90622953 G/C 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 C:G G C 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90622892_90625432:ZNF710 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 91017718 C/T 1 12 14 26 5.70257400584424 7.34699699318172 -1.64442298733748 T:C C T 10 0.52478549951298 0.559996501494547 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91017717_91017925:IQGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 91027543 G/A 1 15 13 28 7.1282175073053 6.82221149366874 0.306006013636559 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91027452_91027584:IQGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 91029318 A/G 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 A:G A G 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91029262_91029364:IQGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 91083353 G/A 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 A:G G A 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000140577:ENST00000437186:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000268184:exon_91083271_91083369:CRTC3;ENSG00000140577:ENST00000420329:exon_91083271_91083369:CRTC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 93162649 A/G 1 35 59 94 16.6325075170457 30.9623444712658 -14.3298369542201 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00363637576120579 ENSG00000185442:ENST00000327355:exon_93160678_93162689:FAM174B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 93540281 G/A 1 14 11 25 6.65300300681828 5.77264049464278 0.880362512175499 A:G G A 10 0.52478549951298 0.842068649003874 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93540187_93540325:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93540187_93540325:CHD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 93567864 A/C 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:C A C 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 99796151 A/T 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:T A T 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000168904:ENST00000301981:exon_99796103_99796330:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000331450:exon_99796103_99796330:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000422500:exon_99796103_99796330:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000447360:exon_99796103_99796330:LRRC28;ENSG00000168904:ENST00000442993:exon_99796103_99796330:LRRC28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 101717680 G/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:G G T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 15 101814845 G/A 1 60 70 130 28.5128700292212 36.7349849659086 -8.2221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.160220135224722 ENSG00000131871:ENST00000398226:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000531964:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526049:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000526043:exon_101814797_101815566:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000528346:exon_101814797_101814886:AC023024.1;ENSG00000131871:ENST00000527833:exon_101814373_101814886:AC023024.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 129532 G/A 1 67 96 163 31.8393715326303 50.3794079532461 -18.5400364206157 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00460440914708164 ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 249154 A/C 1 19 19 38 9.02907550925338 9.97092449074662 -0.941848981493241 A:C A C 10 0.52478549951298 0.871262321281403 ENSG00000007392:ENST00000337351:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000293872:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000426094:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397783:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000490762:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000415507:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000464711:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000419516:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000397780:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000495349:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000418978:exon_249061_249237:LUC7L;ENSG00000007392:ENST00000430864:exon_249061_249237:LUC7L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 310005 G/A 1 5 10 15 2.3760725024351 5.2478549951298 -2.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.195423410463726 ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_309995_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_309968_310008:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000421000:exon_309968_310159:ITFG3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 570557 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000090565:ENST00000262305:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000457159:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000434585:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000450428:exon_570459_570599:RAB11FIP3;ENSG00000090565:ENST00000448401:exon_570459_570599:RAB11FIP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 602511 G/C 1 17 6 23 8.07864650827934 3.14871299707788 4.92993351120146 C:G G C 10 0.52478549951298 0.057931637064092 ENSG00000103326:ENST00000219611:exon_602301_602530:SOLH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 716273 T/C 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 T:C T C 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 717523 G/T 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 T:G G T 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 722349 G/A 1 19 21 40 9.02907550925338 11.0204954897726 -1.9914199805192 A:G G A 10 0.52478549951298 0.531944581397645 ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 732820 C/T 1 17 22 39 8.07864650827934 11.5452809892856 -3.46663448100622 T:C C T 10 0.52478549951298 0.336181221409151 ENSG00000161999:ENST00000412368:exon_731667_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000454700:exon_731676_732874:JMJD8;ENSG00000161999:ENST00000293882:exon_731676_732874:JMJD8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 735921 T/C 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_735869_735990:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_735869_735990:WDR24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 737230 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000127580:ENST00000293883:exon_736744_737416:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000456065:exon_736744_737416:WDR24;ENSG00000127580:ENST00000248142:exon_736744_737416:WDR24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1004554 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_1004357_1004666:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_1004357_1004666:LMF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1412633 A/T 1 48 27 75 22.810296023377 14.1692084868505 8.64108753652649 A:T A T 10 0.52478549951298 0.0493924829197003 ENSG00000090581:ENST00000204679:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000529957:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000527168:exon_1412612_1412743:GNPTG;ENSG00000090581:ENST00000527076:exon_1412207_1412743:GNPTG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1552937 C/T 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 T:C C T 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1552314_1553003:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1552932_1553003:TELO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1818503 G/C 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 C:G G C 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1820992 T/A 1 65 55 120 30.8889425316563 28.8632024732139 2.02574005844239 A:T T A 10 0.52478549951298 0.715951933893016 ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1838050 A/G 1 43 57 100 20.4342235209419 29.9127734722399 -9.478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0709778543730035 ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 1877494 T/C 1 22 24 46 10.4547190107144 12.5948519883115 -2.14013297759708 T:C T C 10 0.52478549951298 0.55728167840293 ENSG00000180185:ENST00000382668:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000382666:exon_1876968_1877866:FAHD1;ENSG00000180185:ENST00000427358:exon_1877231_1878009:FAHD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2028402 A/C 1 92 73 165 43.7197340448058 38.3093414644475 5.4103925803583 A:C A C 10 0.52478549951298 0.435867609649732 ENSG00000183751:ENST00000332704:exon_2028314_2028472:TBL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2035868 C/T 1 117 124 241 55.6000965569813 65.0734019396095 -9.47330538262819 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.245621512660647 ENSG00000127554:ENST00000248114:exon_2035867_2037746:GFER;ENSG00000127554:ENST00000425414:exon_2035867_2037746:GFER HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2050140 C/T 1 14 19 33 6.65300300681828 9.97092449074662 -3.31792148392834 T:C C T 10 0.52478549951298 0.296397632638428 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2049497_2050257:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000425783:exon_2049497_2050358:ZNF598 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2052256 G/T 1 14 9 23 6.65300300681828 4.72306949561682 1.92993351120146 T:G G T 10 0.52478549951298 0.532391639992863 ENSG00000167962:ENST00000431526:exon_2052207_2052424:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000248125:exon_2052207_2052424:ZNF598;ENSG00000167962:ENST00000446417:exon_2052207_2052424:ZNF598 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2129192 G/C 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 C:G G C 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2129036_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000483020:exon_2129033_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000471143:exon_2129036_2129197:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2128240_2129197:TSC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2138269 T/C 1 36 39 75 17.1077220175327 20.4666344810062 -3.3589124634735 T:C T C 10 0.52478549951298 0.488308948491095 ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2140010 A/G 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:G A G 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000008710:ENST00000262304:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000423118:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000433020:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000306101:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000382481:exon_2138711_2140195:PKD1;ENSG00000008710:ENST00000472577:exon_2139528_2140195:PKD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2564095 A/G 1 25 28 53 11.8803625121755 14.6939939863634 -2.81363147418794 A:G A G 10 0.52478549951298 0.492487893161155 ENSG00000185883:ENST00000330398:exon_2563871_2564183:ATP6V0C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2580912 T/C 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C T C 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2581080 G/A 1 22 13 35 10.4547190107144 6.82221149366874 3.6325075170457 A:G G A 10 0.52478549951298 0.239609814585285 ENSG00000162066:ENST00000302956:exon_2579476_2581423:AMDHD2;ENSG00000205923:ENST00000382350:exon_2579631_2581420:CEMP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2812647 C/T 1 9 15 24 4.27693050438318 7.8717824926947 -3.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.156496947637155 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2812890 A/G 1 18 15 33 8.55386100876636 7.8717824926947 0.682078516071659 A:G A G 10 0.52478549951298 0.862935946296175 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2812939 C/A 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2814162 G/A 1 39 29 68 18.5333655189938 15.2187794858764 3.31458603311736 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.467122579284977 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2820882 G/T 1 315 270 585 149.692567653411 141.692084868505 8.00048278490667 T:G G T 10 0.52478549951298 0.534676963822887 ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2820859_2821411:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382300:exon_2820859_2821411:SRRM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2821525 G/A 1 10 3 13 4.7521450048702 1.57435649853894 3.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0974345402312698 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2821573 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000103363:ENST00000409906:exon_2821415_2822103:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000262306:exon_2821415_2821605:TCEB2;ENSG00000103363:ENST00000409477:exon_2821416_2822103:TCEB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 2882197 G/T 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 T:G G T 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 3433014 A/G 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 A:G A G 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3432483_3433711:ZNF434 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 3434742 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3434459_3434941:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3434459_3434941:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3434459_3434941:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000434416:exon_3433800_3434941:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000422427:exon_3434409_3434912:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000418960:exon_3434409_3434941:ZNF434 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 3724352 G/A 1 224 175 399 106.448048109092 91.8374624147715 14.610585694321 A:G G A 10 0.52478549951298 0.146280839974788 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 3724465 G/C 1 123 114 237 58.4513835599035 59.8255469444797 -1.37416338457627 C:G G C 10 0.52478549951298 0.896552289080007 ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3724340_3724495:TRAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 4476089 T/C 1 17 12 29 8.07864650827934 6.29742599415576 1.78122051412358 T:C T C 10 0.52478549951298 0.579302264605088 ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 4748011 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168096:ENST00000304283:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000446014:exon_4747978_4748063:ANKS3;ENSG00000168096:ENST00000450067:exon_4747978_4748063:ANKS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 4897253 C/T 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000140632:ENST00000321919:exon_4897229_4897343:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000441951:exon_4897229_4897279:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000436648:exon_4897229_4897279:GLYR1;ENSG00000140632:ENST00000381983:exon_4897229_4897279:GLYR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 5123201 A/C 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:C A C 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5123154_5123257:ALG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 5127460 T/G 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 T:G T G 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127446_5127535:ALG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 5139217 C/G 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 C:G C G 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 10868997 G/A 1 9 19 28 4.27693050438318 9.97092449074662 -5.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0368587069089518 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 10997746 A/G 1 10 3 13 4.7521450048702 1.57435649853894 3.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0974345402312698 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_10997588_10997752:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_10997588_10997752:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_10997588_10997752:CIITA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 11002927 A/G 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 A:G A G 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 11114174 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000494853:exon_11114050_11114182:CLEC16A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 11852354 A/C 1 21 31 52 9.97950451022742 16.2683504849024 -6.28884597467496 A:C:G A C 10 0.52478549951298 0.0952928718443773 ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 11969724 G/C 1 55 53 108 26.1367975267861 27.8136314741879 -1.67683394740185 C:G G C 10 0.52478549951298 0.773079332801437 ENSG00000103342:ENST00000434724:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000439887:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000420576:exon_11969618_11969786:GSPT1;ENSG00000103342:ENST00000219627:exon_11969618_11969786:GSPT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 12061626 G/A 1 200 239 439 95.042900097404 125.423734383602 -30.3808342861982 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00409449283229169 ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 12798818 G/C 1 10 1 11 4.7521450048702 0.52478549951298 4.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0127823978457661 ENSG00000103381:ENST00000261660:exon_12798481_12798906:CPPED1;ENSG00000103381:ENST00000381774:exon_12798481_12798906:CPPED1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 14015891 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000175595:ENST00000311895:exon_14015888_14016068:ERCC4;ENSG00000175595:ENST00000439007:exon_14015888_14016068:ERCC4;ENSG00000175595:ENST00000389138:exon_14015888_14016068:ERCC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 15095675 C/A 1 7 12 19 3.32650150340914 6.29742599415576 -2.97092449074662 A:C C A 10 0.52478549951298 0.250216318185529 ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15095633_15095713:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15095633_15095713:PDXDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 15098047 C/G 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15098044_15098190:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15098044_15098190:PDXDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 15818310 G/A 1 24 19 43 11.4051480116885 9.97092449074662 1.43422352094186 A:G G A 10 0.52478549951298 0.760588390841897 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 15818653 G/A 1 34 18 52 16.1572930165587 9.44613899123364 6.71115402532504 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0709438638503768 ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 16208716 G/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16208623_16208933:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16208623_16208933:ABCC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 16228242 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000103222:ENST00000399410:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000345148:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000351154:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000349029:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000399408:exon_16228207_16228365:ABCC1;ENSG00000103222:ENST00000346370:exon_16228207_16228365:ABCC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 19085298 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 19590444 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19590374_19590450:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19590307_19590450:C16orf62 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 19680546 T/C 1 2 11 13 0.95042900097404 5.77264049464278 -4.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0098880126580868 ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 19725685 G/C 1 37 33 70 17.5829365180197 17.3179214839283 0.265015034091398 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 19726093 G/C 1 81 42 123 38.4923745394486 22.0409909795452 16.4513835599035 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00285292470281882 ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 20855309 A/G 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000005189:ENST00000261377:exon_20855256_20855348:AC004381.6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 20931480 G/A 1 40 19 59 19.0085800194808 9.97092449074662 9.03765552873418 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0189864296171759 ENSG00000102897:ENST00000439021:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000412082:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000219168:exon_20931444_20931536:LYRM1;ENSG00000102897:ENST00000396052:exon_20931444_20931536:LYRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 21994411 G/A 1 1033 878 1911 490.896579003092 460.761668572396 30.1349104306952 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.169420412219903 ENSG00000140740:ENST00000268379:exon_21994409_21994981:UQCRC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23403744 A/G 1 17 10 27 8.07864650827934 5.2478549951298 2.83079151314954 A:G A G 10 0.52478549951298 0.336737529516327 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23409400 G/C 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23409367_23409450:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23409372_23409413:COG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23436179 G/A 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23436070_23436268:COG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23456405 C/T 1 11 3 14 5.22735950535722 1.57435649853894 3.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.061586959717543 ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23456369_23456485:COG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23647238 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000083093:ENST00000261584:exon_23646183_23647655:PALB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23672560 A/T 1 17 7 24 8.07864650827934 3.67349849659086 4.40514801168848 A:T A T 10 0.52478549951298 0.100311386228204 ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23700059 C/T 1 126 103 229 59.8770270613645 54.0529064498369 5.82412061152757 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.46696463254299 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23699989_23700066:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23699989_23700066:PLK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 23701458 G/A 1 161 148 309 76.5095345784102 77.668253927921 -1.15871934951083 A:G G A 10 0.52478549951298 0.909386791071874 ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 24202458 C/T 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24202411_24202551:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000466124:exon_24202411_24202909:PRKCB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 24583406 A/G 1 98 97 195 46.571021047728 50.9041934527591 -4.33317240503111 A:G A G 10 0.52478549951298 0.566434657441551 ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 24942387 G/C 1 80 81 161 38.0171600389616 42.5076254605514 -4.49046542158978 C:G G C 10 0.52478549951298 0.479015021255528 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24942105_24942725:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24942105_24942725:ARHGAP17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 24953329 C/T 1 73 82 155 34.6906585355525 43.0324109600644 -8.3417524245119 T:C C T 10 0.52478549951298 0.198153140576047 ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24953308_24953464:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24953308_24953464:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24953308_24953363:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24953308_24953464:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24953308_24953464:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24953308_24953464:ARHGAP17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27268779 G/C 1 77 47 124 36.5915165375005 24.6649184771101 11.9265980603905 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0382193341983693 ENSG00000169189:ENST00000361439:exon_27268756_27268902:NSMCE1;ENSG00000169189:ENST00000358787:exon_27268756_27268902:NSMCE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27357927 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000077238:ENST00000380925:exon_27357788_27357939:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000449195:exon_27357788_27357939:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27357788_27357939:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27357788_27357939:IL4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27373976 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27374180 T/C 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 T:C T C 10 0.52478549951298 0.216375415667424 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27374927 T/G 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:G T G 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27375157 T/C 1 21 15 36 9.97950451022742 7.8717824926947 2.10772201753272 T:C T C 10 0.52478549951298 0.509031329613737 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 27375159 T/C 1 15 22 37 7.1282175073053 11.5452809892856 -4.41706348198026 T:C T C 10 0.52478549951298 0.187306298784188 ENSG00000077238:ENST00000395762:exon_27373573_27376099:IL4R;ENSG00000077238:ENST00000170630:exon_27373573_27376098:IL4R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28145165 T/A 1 16 19 35 7.60343200779232 9.97092449074662 -2.3674924829543 A:T T A 10 0.52478549951298 0.499319230855147 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28222690 G/A 1 11 3 14 5.22735950535722 1.57435649853894 3.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.061586959717543 ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28602991 A/G 1 19 8 27 9.02907550925338 4.19828399610384 4.83079151314954 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0816126514255036 ENSG00000176476:ENST00000317058:exon_28602911_28603111:CCDC101 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28844448 C/A 1 44 36 80 20.9094380214289 18.8922779824673 2.0171600389616 A:C C A 10 0.52478549951298 0.737240796537104 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28844380_28844675:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28844380_28844675:ATXN2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28845448 G/A 1 41 35 76 19.4837945199678 18.3674924829543 1.11630203701352 A:G G A 10 0.52478549951298 0.819289086785524 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845386_28845532:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845386_28845532:ATXN2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28845993 C/T 1 80 75 155 38.0171600389616 39.3589124634735 -1.3417524245119 T:C C T 10 0.52478549951298 0.872313555622696 ENSG00000168488:ENST00000340394:exon_28845827_28846014:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000395547:exon_28845827_28846014:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000336783:exon_28845827_28846014:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325215:exon_28845827_28846014:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000382686:exon_28845827_28846014:ATXN2L;ENSG00000168488:ENST00000325200:exon_28845827_28846014:ATXN2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28854272 G/A 1 911 904 1815 432.920409943675 474.406091559734 -41.4856816160588 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.0539341138729085 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28853732_28854469:TUFM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28857282 G/A 1 170 195 365 80.7864650827934 102.333172405031 -21.5467073222377 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0242679196286366 ENSG00000178952:ENST00000313511:exon_28857233_28857427:TUFM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28883241 A/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G A G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28890397 C/T 1 13 7 20 6.17778850633126 3.67349849659086 2.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 0.371028264701611 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28917492 G/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28917340_28917517:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28917340_28917517:RABEP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28925731 G/A 1 15 19 34 7.1282175073053 9.97092449074662 -2.84270698344132 A:G G A 10 0.52478549951298 0.391458331329885 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28925752 G/A 1 15 19 34 7.1282175073053 9.97092449074662 -2.84270698344132 A:G G A 10 0.52478549951298 0.391458331329885 ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28925557_28925907:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28925557_28925907:RABEP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28993369 C/T 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993222_28993377:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993222_28993377:SPNS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 28993839 C/T 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000169682:ENST00000311008:exon_28993677_28993866:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000334536:exon_28993677_28993866:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000352260:exon_28993677_28993866:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000452515:exon_28993677_28993866:SPNS1;ENSG00000169682:ENST00000323081:exon_28993677_28993866:SPNS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29675449 A/G 1 113 90 203 53.6992385550333 47.2306949561682 6.46854359886505 A:G A G 10 0.52478549951298 0.399143529526908 ENSG00000197471:ENST00000395389:exon_29675016_29676848:SPN;ENSG00000197471:ENST00000436527:exon_29675016_29676114:SPN;ENSG00000197471:ENST00000360121:exon_29675016_29681811:SPN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29706067 C/T 1 116 76 192 55.1248820564943 39.8836979629865 15.2411840935078 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0300156062022747 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29706444 C/T 1 63 58 121 29.9385135306823 30.4375589717528 -0.499045441070585 T:C C T 10 0.52478549951298 0.927794944118654 ENSG00000103485:ENST00000449759:exon_29705985_29706465:QPRT;ENSG00000103485:ENST00000395384:exon_29705985_29706520:QPRT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29755576 A/G 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000185905:ENST00000329410:exon_29753784_29756272:C16orf54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29816305 G/A 1 152 144 296 72.232604074027 75.5691119298691 -3.33650785584209 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.727059014006832 ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29816135_29816347:KIF22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29827807 T/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000185928:ENST00000320330:exon_29827285_29828328:C16orf53 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29996590 C/T 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 T:C C T 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29996534_29996899:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29996534_29996899:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29996534_29996899:TAOK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 29998200 A/G 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G A G 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30078691 C/T 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.545574129003337 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30199584 G/A 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 A:G G A 10 0.52478549951298 0.840478250557484 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30376486 T/C 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30455828 C/T 1 51 48 99 24.235939524838 25.189703976623 -0.953764451785027 T:C C T 10 0.52478549951298 0.919913772551515 ENSG00000179918:ENST00000478753:exon_30454952_30457186:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000418751:exon_30454960_30456787:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000500504:exon_30455702_30457048:SEPHS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30456229 T/G 1 36 23 59 17.1077220175327 12.0700664887985 5.03765552873418 T:G T G 10 0.52478549951298 0.195357488191691 ENSG00000179918:ENST00000478753:exon_30454952_30457186:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000418751:exon_30454960_30456787:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000500504:exon_30455702_30457048:SEPHS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30456244 G/C 1 32 17 49 15.2068640155846 8.92135349172066 6.28551052386398 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0856372387683308 ENSG00000179918:ENST00000478753:exon_30454952_30457186:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000418751:exon_30454960_30456787:SEPHS2;ENSG00000179918:ENST00000500504:exon_30455702_30457048:SEPHS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30536918 C/G 1 12 17 29 5.70257400584424 8.92135349172066 -3.21877948587642 T:C:G C G 10 0.52478549951298 0.266653493804166 ENSG00000169957:ENST00000380412:exon_30535325_30537372:ZNF768 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30665621 T/C 1 21 12 33 9.97950451022742 6.29742599415576 3.68207851607166 T:C T C 10 0.52478549951298 0.224975587715588 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665551_30665660:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665551_30665660:PRR14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30666480 A/G 1 35 52 87 16.6325075170457 27.288845974675 -10.6563384576293 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0240501932732995 ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30665950_30666535:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30665950_30666535:PRR14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 30773822 T/C 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C T C 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000103549:ENST00000324685:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000357890:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000380329:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000452273:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000402121:exon_30773796_30773998:RNF40;ENSG00000103549:ENST00000493683:exon_30773796_30773998:RNF40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 31073100 G/A 1 8 12 20 3.80171600389616 6.29742599415576 -2.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.273886654959245 ENSG00000232748:ENST00000417110:exon_31070902_31073948:AC135050.1;ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31072171_31073601:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31072171_31073601:ZNF668 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 31075708 C/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000414399:exon_31075616_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000442862:exon_31075471_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000417935:exon_31075505_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000426488:exon_31075552_31075802:ZNF668 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 31477697 G/A 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 31926619 G/A 1 21 14 35 9.97950451022742 7.34699699318172 2.6325075170457 A:G G A 10 0.52478549951298 0.401790706529317 ENSG00000185947:ENST00000300870:exon_31925797_31928622:ZNF267;ENSG00000185947:ENST00000394846:exon_31925797_31928622:ZNF267 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 47143614 C/T 1 14 17 31 6.65300300681828 8.92135349172066 -2.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.473822628331597 ENSG00000171208:ENST00000303155:exon_47143394_47143622:NETO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 50707453 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 50707782 C/T 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50705536_50707985:SNX20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 50711334 G/A 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 53262977 T/C 1 21 2 23 9.97950451022742 1.04957099902596 8.92993351120146 T:C T C 10 0.52478549951298 9.5569496388482e-05 ENSG00000177200:ENST00000447540:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000398510:exon_53262895_53263012:CHD9;ENSG00000177200:ENST00000219084:exon_53262895_53263012:CHD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 53528079 T/C 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000166971:ENST00000394657:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000300245:exon_53528050_53528157:AKTIP;ENSG00000166971:ENST00000425875:exon_53528050_53528157:AKTIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 56545175 T/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C T C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000125124:ENST00000245157:exon_56545071_56545196:BBS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 56868050 G/A 1 55 62 117 26.1367975267861 32.5367009698048 -6.39990344301867 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.266648518009339 ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56868040_56868166:NUP93 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 57016127 G/A 1 15 16 31 7.1282175073053 8.39656799220768 -1.26835048490238 A:G G A 10 0.52478549951298 0.720494209048114 ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 57111232 C/T 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 57474687 G/C 1 40 57 97 19.0085800194808 29.9127734722399 -10.9041934527591 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0322763081913264 ENSG00000005194:ENST00000394391:exon_57474684_57474895:CIAPIN1;ENSG00000005194:ENST00000356811:exon_57474684_57474895:CIAPIN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 57601792 C/T 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000159618:ENST00000394361:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000436912:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000452947:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000340339:exon_57601768_57602036:GPR114;ENSG00000159618:ENST00000349457:exon_57601768_57602036:GPR114 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 57787027 C/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67267731 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67579364 C/T 1 13 25 38 6.17778850633126 13.1196374878245 -6.94184898149324 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0333714465453368 ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67579279_67579437:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67579279_67579437:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67579279_67579437:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67579279_67579437:FAM65A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67696346 C/T 1 12 19 31 5.70257400584424 9.97092449074662 -4.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.150419881320759 ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67911517 T/C 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 T:C T C 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000038358:ENST00000358933:exon_67911412_67911559:EDC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67969531 A/G 1 166 168 334 78.8856070808453 88.1639639181806 -9.27835683733532 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324194261292166 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969485_67969600:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969452_67969600:PSMB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67969930 A/G 1 201 251 452 95.518114597891 131.721160377758 -36.203045779867 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000685408534422298 ENSG00000205220:ENST00000358514:exon_67969866_67970006:PSMB10;ENSG00000205220:ENST00000435933:exon_67969866_67970215:PSMB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 67973953 G/A 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 68056148 A/G 1 33 39 72 15.6820785160717 20.4666344810062 -4.78455596493456 A:G A G 10 0.52478549951298 0.288717687821764 ENSG00000182810:ENST00000332395:exon_68055174_68057959:DDX28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 68072004 A/G 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 A:G A G 10 0.52478549951298 0.216375415667424 ENSG00000167264:ENST00000358896:exon_68071909_68072052:DUS2L;ENSG00000167264:ENST00000432752:exon_68071909_68072052:DUS2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 68389772 C/T 1 35 17 52 16.6325075170457 8.92135349172066 7.71115402532504 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0368162067098985 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 68390697 C/T 1 44 65 109 20.9094380214289 34.1110574683437 -13.2016194469148 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.0124672971711592 ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68390604_68390700:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68390604_68390700:PRMT7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 69362886 G/A 1 127 173 300 60.3522415618515 90.7878914157455 -30.435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000503824477069924 ENSG00000213380:ENST00000306875:exon_69360816_69363082:COG8;ENSG00000213380:ENST00000288022:exon_69362524_69363082:COG8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 70190684 C/T 0 11 0 11 5.22735950535722 0 5.22735950535722 C C 10 0.52478549951298 0.00111049814317957 ENSG00000090857:ENST00000288050:exon_70190378_70195205:PDPR;ENSG00000090857:ENST00000205055:exon_70190378_70190765:PDPR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 70513166 G/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 C:G G C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000157353:ENST00000288078:exon_70513083_70513306:FUK;ENSG00000157353:ENST00000378912:exon_70513083_70513306:FUK;ENSG00000157353:ENST00000464499:exon_70512700_70513306:FUK;ENSG00000157353:ENST00000498702:exon_70513083_70513306:FUK;ENSG00000157353:ENST00000485034:exon_70512454_70513306:FUK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 70546234 G/A 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000103051:ENST00000323786:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000219329:exon_70546142_70546321:COG4;ENSG00000103051:ENST00000338984:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530314:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000482252:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000393612:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528951:exon_70546142_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000534772:exon_70546176_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000530160:exon_70546222_70546335:COG4;ENSG00000103051:ENST00000528460:exon_70546226_70546335:COG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 70569215 A/T 1 14 22 36 6.65300300681828 11.5452809892856 -4.89227798246728 A:T A T 10 0.52478549951298 0.132227924925165 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70569211_70569323:SF3B3;ENSG00000189091:ENST00000310750:exon_70569211_70569245:SF3B3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 70602221 C/T 1 91 123 214 43.2445195443188 64.5486164400965 -21.3040968957777 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.0039605364789516 ENSG00000189091:ENST00000302516:exon_70602186_70602398:SF3B3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 71773190 G/T 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:G G T 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000166747:ENST00000299980:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000423132:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000393512:exon_71773137_71773244:AP1G1;ENSG00000166747:ENST00000425422:exon_71773137_71773244:AP1G1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 72130125 T/C 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 72130203 C/G 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 C:G C G 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72130038_72130379:DHX38;ENSG00000140829:ENST00000427670:exon_72130057_72130353:DHX38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 72135014 T/C 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 T:C T C 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000140829:ENST00000268482:exon_72134985_72135092:DHX38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 74670458 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74670244_74670475:RFWD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 74695079 G/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168411:ENST00000444004:exon_74694988_74695347:RFWD3;ENSG00000168411:ENST00000361070:exon_74694830_74695349:RFWD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 75018874 G/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G G A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000103091:ENST00000262144:exon_75018862_75019017:WDR59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 75271234 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75271081_75271242:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75271081_75271242:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75271081_75271242:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75271081_75271242:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75271081_75271242:BCAR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 75327916 A/G 1 161 122 283 76.5095345784102 64.0238309405836 12.4857036378266 A:G A G 10 0.52478549951298 0.153048638770218 ENSG00000153774:ENST00000283882:exon_75327608_75327940:CFDP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 75661803 G/C 1 370 279 649 175.829365180197 146.415154364121 29.414210816076 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0225658466361034 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75661622_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75661628_75661891:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75661628_75661891:KARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 75665486 C/A 1 327 421 748 155.395141659256 220.934695294965 -65.5395536357091 A:C:G C A 10 0.52478549951298 1.83720544529222e-06 ENSG00000065427:ENST00000302445:exon_75665314_75665487:KARS;ENSG00000065427:ENST00000319410:exon_75665314_75665487:KARS;ENSG00000065427:ENST00000378668:exon_75665483_75665487:KARS;ENSG00000065427:ENST00000393395:exon_75665314_75665487:KARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 75690471 C/G 1 307 244 551 145.890851649515 128.047661881167 17.843189768348 C:G C G 10 0.52478549951298 0.135431670351322 ENSG00000166848:ENST00000300086:exon_75690105_75691328:TERF2IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 77228866 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 78458774 C/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:C C A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000186153:ENST00000408984:exon_78458767_78458952:WWOX;ENSG00000186153:ENST00000299644:exon_78458767_78458890:WWOX;ENSG00000186153:ENST00000329729:exon_78458768_78458952:WWOX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 81056441 T/G 1 8 23 31 3.80171600389616 12.0700664887985 -8.26835048490238 T:G T G 10 0.52478549951298 0.00346270044118352 ENSG00000166451:ENST00000299572:exon_81056360_81056490:CENPN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 81062264 G/A 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000166451:ENST00000305850:exon_81062174_81062927:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000428963:exon_81062174_81065090:CENPN;ENSG00000166451:ENST00000439957:exon_81062174_81065090:CENPN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 81077204 T/A 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:T T A 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 81124275 G/A 1 2 15 17 0.95042900097404 7.8717824926947 -6.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00088140674975218 ENSG00000140905:ENST00000315467:exon_81124206_81124285:GCSH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 81888152 A/G 1 24 23 47 11.4051480116885 12.0700664887985 -0.664918477110062 A:G A G 10 0.52478549951298 0.884555302742298 ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81888049_81888192:PLCG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 82182316 C/T 1 29 21 50 13.7812205141236 11.0204954897726 2.760725024351 T:C C T 10 0.52478549951298 0.48052055421722 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 82203742 T/C 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C T C 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 82203768 G/T 0 8 0 8 3.80171600389616 0 3.80171600389616 G G 10 0.52478549951298 0.00835333627376926 ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82203730_82203831:MPHOSPH6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84088026 T/C 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84088047 C/T 1 11 12 23 5.22735950535722 6.29742599415576 -1.07006648879854 T:C C T 10 0.52478549951298 0.681491778056056 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84100173 C/T 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 T:C C T 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84100094_84100218:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84100094_84100218:MBTPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84212571 C/A 1 22 13 35 10.4547190107144 6.82221149366874 3.6325075170457 A:C C A 10 0.52478549951298 0.239609814585285 ENSG00000103168:ENST00000378541:exon_84211461_84213457:TAF1C;ENSG00000103168:ENST00000341690:exon_84211464_84213457:TAF1C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84522897 G/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84522884_84523028:KIAA1609 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84695280 A/G 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G A G 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84695490 C/T 1 28 25 53 13.3060060136366 13.1196374878245 0.186368525812057 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135686:ENST00000325279:exon_84695184_84701292:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000258157:exon_84695184_84695915:KLHL36;ENSG00000135686:ENST00000426441:exon_84695184_84695915:KLHL36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84778690 C/T 1 35 51 86 16.6325075170457 26.764060475162 -10.1315529581163 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0307985720810759 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84778762 C/T 1 53 21 74 25.1863685258121 11.0204954897726 14.1658730360395 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00100369222199192 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84779248 T/G 1 28 13 41 13.3060060136366 6.82221149366874 6.48379451996782 T:G T G 10 0.52478549951298 0.059259296391682 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 84808824 C/G 1 12 38 50 5.70257400584424 19.9418489814932 -14.239274975649 C:G C G 10 0.52478549951298 5.14125209348134e-05 ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84808766_84808831:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84808766_84808831:USP10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 85722496 A/C 1 18 20 38 8.55386100876636 10.4957099902596 -1.94184898149324 A:C A C 10 0.52478549951298 0.62669235128267 ENSG00000131153:ENST00000253462:exon_85722415_85722605:GINS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87445270 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000140948:ENST00000268616:exon_87445122_87446582:ZCCHC14;ENSG00000140948:ENST00000412336:exon_87445027_87446582:ZCCHC14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87743052 G/A 1 17 48 65 8.07864650827934 25.189703976623 -17.1110574683437 A:G G A 10 0.52478549951298 2.7851494108033e-05 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87742871_87743273:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87742871_87743273:KLHDC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87760445 T/C 1 23 35 58 10.9299335112015 18.3674924829543 -7.43755897175284 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0647881506656856 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87760371_87760530:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87760371_87760530:KLHDC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87764241 G/A 1 20 32 52 9.5042900097404 16.7931359844154 -7.28884597467496 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0512858707036394 ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87764158_87764250:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87764158_87764250:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87764158_87764250:KLHDC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87872355 G/A 1 17 10 27 8.07864650827934 5.2478549951298 2.83079151314954 A:G G A 10 0.52478549951298 0.336737529516327 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87872320_87872423:SLC7A5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87874736 G/C 1 9 13 22 4.27693050438318 6.82221149366874 -2.54528098928556 C:G G C 10 0.52478549951298 0.29401621168529 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87874656_87874761:SLC7A5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 87902684 G/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000103257:ENST00000261622:exon_87902491_87903125:SLC7A5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88066717 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88713236 A/G 1 455 788 1243 216.222597721594 413.530973616228 -197.308375894634 A:G A G 10 0.52478549951298 3.01284278603451e-29 ENSG00000051523:ENST00000261623:exon_88713163_88713246:CYBA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88773610 C/G 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 C:G C G 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88773544_88773618:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88773544_88773618:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88773544_88773618:CTU2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88874655 C/T 1 58 28 86 27.5624410282472 14.6939939863634 12.8684470418837 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00661662631673197 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88874692 G/C 1 85 42 127 40.3932325413967 22.0409909795452 18.3522415618515 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00129073144930993 ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88876103 T/C 1 469 485 954 222.875600728412 254.520967263795 -31.6453665353829 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.0411307066263454 ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 88958850 T/C 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88958652_88958893:CBFA2T3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89167395 C/T 1 24 1 25 11.4051480116885 0.52478549951298 10.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 2.60056060144677e-06 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89167404 T/C 1 24 1 25 11.4051480116885 0.52478549951298 10.8803625121755 T:C T C 10 0.52478549951298 2.60056060144677e-06 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89167431 G/C 0 22 0 22 10.4547190107144 0 10.4547190107144 G G 10 0.52478549951298 7.6910073744707e-07 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89167443 T/C 1 27 2 29 12.8307915131495 1.04957099902596 11.7812205141236 T:C:G T C 10 0.52478549951298 5.05233426250576e-06 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89167458 C/A 1 27 3 30 12.8307915131495 1.57435649853894 11.2564350146106 A:C C A 10 0.52478549951298 2.29976469420554e-05 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89180883 G/A 1 29 20 49 13.7812205141236 10.4957099902596 3.28551052386398 A:G G A 10 0.52478549951298 0.3920594903989 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89180747_89180895:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89180747_89180895:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89199651 G/A 1 41 20 61 19.4837945199678 10.4957099902596 8.98808452970822 A:G G A 10 0.52478549951298 0.021290023011849 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89199544_89199670:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89199544_89199670:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89211775 G/C 1 16 24 40 7.60343200779232 12.5948519883115 -4.9914199805192 C:G G C 10 0.52478549951298 0.153337885169514 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89211675_89211809:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89211675_89211809:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89211622_89211809:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89211675_89211809:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89220635 G/A 1 46 60 106 21.8598670224029 31.4871299707788 -9.62726294837588 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0648499731604618 ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89220498_89222171:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89220498_89220997:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89220498_89220997:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000378345:exon_89220498_89220997:ACSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89347360 C/G 1 2 10 12 0.95042900097404 5.2478549951298 -4.29742599415576 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0177435667657133 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89350038 G/A 1 18 14 32 8.55386100876636 7.34699699318172 1.20686401558464 A:G G A 10 0.52478549951298 0.725609418966872 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89350178 G/A 1 31 20 51 14.7316495150976 10.4957099902596 4.23593952483802 A:G G A 10 0.52478549951298 0.263293667381194 ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11;ENSG00000167522:ENST00000330736:exon_89350139_89351806:ANKRD11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89620328 G/A 1 25 14 39 11.8803625121755 7.34699699318172 4.53336551899378 A:G G A 10 0.52478549951298 0.152832659716465 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89620202_89620368:SPG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89623405 C/T 1 40 27 67 19.0085800194808 14.1692084868505 4.83937153263034 T:C C T 10 0.52478549951298 0.271268668984832 ENSG00000197912:ENST00000268704:exon_89623295_89624174:SPG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89627671 C/T 1 4143 3124 7267 1968.81367551772 1639.42990047855 329.383775039174 A:T:C C T 10 0.52478549951298 9.5409952386317e-15 ENSG00000167526:ENST00000311528:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000491523:exon_89627348_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000484610:exon_89627635_89628159:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000487034:exon_89627348_89627931:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000467736:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000393099:exon_89627635_89627776:RPL13;ENSG00000167526:ENST00000399461:exon_89627312_89627776:RPL13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89662990 T/C 1 9 25 34 4.27693050438318 13.1196374878245 -8.84270698344132 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00297648847223649 ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89759723 G/C 1 5 10 15 2.3760725024351 5.2478549951298 -2.8717824926947 C:G G C 10 0.52478549951298 0.195423410463726 ENSG00000185324:ENST00000505473:exon_89759682_89759734:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000331006:exon_89759682_89759734:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000511415:exon_89759682_89759810:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000353379:exon_89759682_89759734:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000437260:exon_89759682_89759734:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000505733:exon_89759682_89759875:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000507205:exon_89759682_89760448:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000472018:exon_89759682_89760640:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000393082:exon_89759682_89759734:CDK10;ENSG00000185324:ENST00000504473:exon_89759682_89759903:CDK10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89789898 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89805261 A/G 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:G A G 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89804384_89807311:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89804384_89807333:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89804384_89807333:ZNF276 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89809319 T/C 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89809208_89809346:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89809208_89809346:FANCA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 16 89836323 C/T 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89836245_89836432:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89836245_89836432:FANCA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 505129 A/C 1 10 3 13 4.7521450048702 1.57435649853894 3.17778850633126 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0974345402312698 ENSG00000141252:ENST00000437048:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000446250:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000401468:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000389040:exon_505035_505136:VPS53;ENSG00000141252:ENST00000291074:exon_505035_505136:VPS53 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 910546 G/A 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 A:G G A 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_910405_910552:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_910405_910552:ABR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 959345 A/G 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 A:G A G 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_959275_959349:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_959275_959349:ABR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 1387472 C/T 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:C C T 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1387442_1387597:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1387442_1387597:MYO1C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 1551231 C/T 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000167705:ENST00000301336:exon_1551129_1551251:RILP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 1564292 A/G 1 29 46 75 13.7812205141236 24.1401329775971 -10.3589124634735 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0202286812710511 ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1564287_1564456:PRPF8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 1636934 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000167716:ENST00000468539:exon_1636821_1636939:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000418841:exon_1636821_1636973:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 1637068 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 1640856 G/A 1 20 21 41 9.5042900097404 11.0204954897726 -1.51620548003218 A:G G A 10 0.52478549951298 0.64295824884652 ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1640659_1641879:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1640659_1641782:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1640659_1641888:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1640659_1641886:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1640659_1641878:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1640659_1641886:WDR81 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 2203167 T/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:G T G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 2203453 A/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 2278920 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000141258:ENST00000447805:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000426855:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000268989:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000424187:exon_2278786_2279169:SGSM2;ENSG00000141258:ENST00000397207:exon_2278786_2279169:SGSM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3571834 T/C 1 13 7 20 6.17778850633126 3.67349849659086 2.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.371028264701611 ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3571782_3571976:TAX1BP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3594280 G/A 1 1 12 13 0.47521450048702 6.29742599415576 -5.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00119689653822348 ENSG00000083454:ENST00000381833:exon_3594275_3594321:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000435558:exon_3594250_3594321:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000225328:exon_3594250_3594321:P2RX5;ENSG00000083454:ENST00000440619:exon_3594250_3594321:P2RX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3628362 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3628685 C/G 1 6 12 18 2.85128700292212 6.29742599415576 -3.44613899123364 C:G C G 10 0.52478549951298 0.154993529862929 ENSG00000177602:ENST00000325418:exon_3627197_3629993:GSG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3631241 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000083457:ENST00000263087:exon_3631213_3631320:ITGAE;ENSG00000083457:ENST00000397107:exon_3631213_3631320:ITGAE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3716521 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000074356:ENST00000389005:exon_3714460_3716573:C17orf85;ENSG00000074356:ENST00000158149:exon_3714460_3716573:C17orf85;ENSG00000074356:ENST00000433699:exon_3714460_3716573:C17orf85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3839685 G/A 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 A:G G A 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3839561_3839763:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3839561_3839763:ATP2A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3840928 A/G 1 24 25 49 11.4051480116885 13.1196374878245 -1.71448947613602 A:G A G 10 0.52478549951298 0.669159089591383 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3840710_3840930:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3840710_3840930:ATP2A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3844787 C/G 1 13 5 18 6.17778850633126 2.6239274975649 3.55386100876636 C:G C G 10 0.52478549951298 0.103560900526000 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3845927 A/G 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G A G 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3845900_3846025:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3845900_3846025:ATP2A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3846802 A/G 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3846685_3846816:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3846685_3846816:ATP2A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 3848013 A/C 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:C A C 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3847998_3848100:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3847998_3848100:ATP2A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4446217 C/T 1 37 38 75 17.5829365180197 19.9418489814932 -2.3589124634735 T:C C T 10 0.52478549951298 0.644174671266746 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4446208_4446460:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4446208_4446460:MYBBP1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4452661 C/T 1 21 21 42 9.97950451022742 11.0204954897726 -1.04099097954516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.759841909015547 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4452627_4452737:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4452627_4452737:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4452627_4452737:MYBBP1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4455258 G/A 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4455175_4455292:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4455175_4455292:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4455175_4455292:MYBBP1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4455920 A/T 1 14 20 34 6.65300300681828 10.4957099902596 -3.84270698344132 A:T A T 10 0.52478549951298 0.229459342212184 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4455746_4455921:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4455746_4455921:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4455746_4455921:MYBBP1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4458598 G/C 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 C:G G C 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4458422_4458681:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4458422_4458679:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000426435:exon_4458422_4458681:MYBBP1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4575283 A/G 1 161 122 283 76.5095345784102 64.0238309405836 12.4857036378266 A:G A G 10 0.52478549951298 0.153048638770218 ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4634758 C/G 1 15 24 39 7.1282175073053 12.5948519883115 -5.46663448100622 C:G C G 10 0.52478549951298 0.107695702052258 ENSG00000161920:ENST00000293777:exon_4634708_4634869:MED11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4722825 G/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000129219:ENST00000263088:exon_4722724_4722877:PLD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4844185 G/A 1 42 27 69 19.9590090204548 14.1692084868505 5.78980053360438 A:G G A 10 0.52478549951298 0.185101302228593 ENSG00000108523:ENST00000262482:exon_4843782_4844288:RNF167;ENSG00000108523:ENST00000381350:exon_4843913_4844288:RNF167 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4875566 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4875628 A/G 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G A G 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4875781 C/T 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000108509:ENST00000348066:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000381311:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000361571:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000358183:exon_4875527_4875831:CAMTA2;ENSG00000108509:ENST00000414043:exon_4875527_4875831:CAMTA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 4924125 C/T 1 37 26 63 17.5829365180197 13.6444229873375 3.93851353068226 T:C C T 10 0.52478549951298 0.377477825585621 ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4924101_4924173:KIF1C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5284698 A/G 1 16 7 23 7.60343200779232 3.67349849659086 3.92993351120146 A:G A G 10 0.52478549951298 0.142480414894919 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5284719 T/C 1 15 12 27 7.1282175073053 6.29742599415576 0.830791513149538 T:C T C 10 0.52478549951298 0.848083276492106 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5286525 C/G 1 17 31 48 8.07864650827934 16.2683504849024 -8.18970397662304 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0203694081655108 ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5286417_5286912:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5286417_5286720:RABEP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5290033 T/C 1 209 105 314 99.3198306017872 55.1024774488629 44.2173531529243 T:C T C 10 0.52478549951298 5.60886375677157e-07 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5294976 T/A 1 65 42 107 30.8889425316563 22.0409909795452 8.84795155211114 A:T T A 10 0.52478549951298 0.0995689497792586 ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5326089 C/T 1 130 132 262 61.7778850633126 69.2716859357134 -7.49380087240077 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.354386537810049 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5326145 C/G 1 127 130 257 60.3522415618515 68.2221149366874 -7.86987337483587 C:G C G 10 0.52478549951298 0.348913802760102 ENSG00000129197:ENST00000381209:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000381208:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000405578:exon_5326089_5326149:RPAIN;ENSG00000129197:ENST00000327154:exon_5326089_5326149:RPAIN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5392161 C/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5418068 G/C 1 13 28 41 6.17778850633126 14.6939939863634 -8.51620548003218 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0114001936810839 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5417439_5418393:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5417439_5418393:NLRP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5418799 G/A 1 19 21 40 9.02907550925338 11.0204954897726 -1.9914199805192 A:G G A 10 0.52478549951298 0.531944581397645 ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5418793_5418837:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5418793_5418837:NLRP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5425077 T/C 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 5442790 C/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5442735_5442905:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5442735_5442905:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5442735_5442905:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5442735_5442905:NLRP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6350923 A/G 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 A:G A G 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000129195:ENST00000250056:exon_6350783_6351078:FAM64A;ENSG00000129195:ENST00000308855:exon_6350783_6351078:FAM64A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6350946 C/T 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000129195:ENST00000250056:exon_6350783_6351078:FAM64A;ENSG00000129195:ENST00000308855:exon_6350783_6351078:FAM64A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6544354 C/G 1 12 19 31 5.70257400584424 9.97092449074662 -4.26835048490238 C:G C G 10 0.52478549951298 0.150419881320759 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6544465 G/A 1 137 172 309 65.1043865667217 90.2631059162326 -25.1587193495108 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00436253954142406 ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6665487 A/G 1 15 12 27 7.1282175073053 6.29742599415576 0.830791513149538 A:G A G 10 0.52478549951298 0.848083276492106 ENSG00000132530:ENST00000346752:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000361842:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000441631:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000348844:exon_6665474_6665559:XAF1;ENSG00000132530:ENST00000431790:exon_6665474_6665559:XAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6902743 G/A 0 0 14 14 0 7.34699699318172 -7.34699699318172 A G A 10 0.52478549951298 2.99540518116241e-05 ENSG00000108839:ENST00000251535:exon_6902625_6902785:ALOX12;ENSG00000108839:ENST00000480801:exon_6902728_6902785:ALOX12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6902760 A/G 0 0 14 14 0 7.34699699318172 -7.34699699318172 G A G 10 0.52478549951298 2.99540518116241e-05 ENSG00000108839:ENST00000251535:exon_6902625_6902785:ALOX12;ENSG00000108839:ENST00000480801:exon_6902728_6902785:ALOX12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 6919093 T/C 1 235 248 483 111.67540761445 130.146803879219 -18.4713962647694 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.100890666008653 ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 7131014 G/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7130974_7131102:DVL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 7154580 C/G 1 22 24 46 10.4547190107144 12.5948519883115 -2.14013297759708 C:G C G 10 0.52478549951298 0.55728167840293 ENSG00000175826:ENST00000380825:exon_7154514_7154995:CTDNEP1;ENSG00000175826:ENST00000318988:exon_7154514_7154920:CTDNEP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 7219577 G/C 1 15 11 26 7.1282175073053 5.77264049464278 1.35557701266252 C:G G C 10 0.52478549951298 0.695977309853642 ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7218951_7219646:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7218953_7219646:NEURL4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 7462555 G/A 0 0 22 22 0 11.5452809892856 -11.5452809892856 A G A 10 0.52478549951298 7.79063843324905e-08 ENSG00000161955:ENST00000380535:exon_7461609_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396542:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462385_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7461793_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7461914_7462614:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462104_7462614:TNFSF13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 8076778 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 8076802 T/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000179029:ENST00000449985:exon_8076555_8077590:TMEM107 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 8167178 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000178921:ENST00000314666:exon_8167093_8167254:PFAS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 8706609 G/A 1 222 181 403 105.497619108118 94.9861754118494 10.511443696269 A:G G A 10 0.52478549951298 0.318522929805244 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 8707426 G/A 1 36 58 94 17.1077220175327 30.4375589717528 -13.3298369542201 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00698144689650824 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 8732283 C/T 1 9 17 26 4.27693050438318 8.92135349172066 -4.64442298733748 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0780923127618802 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 13977679 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13977640_13977773:COX10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 13980164 A/G 1 11 16 27 5.22735950535722 8.39656799220768 -3.16920848685046 A:G A G 10 0.52478549951298 0.250689856013828 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 13980350 G/A 1 21 26 47 9.97950451022742 13.6444229873375 -3.66491847711006 A:G G A 10 0.52478549951298 0.308692914137 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 14005439 G/A 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_14005435_14005559:COX10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 15532122 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000221926:ENST00000336708:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000416464:exon_15531274_15532512:TRIM16;ENSG00000221926:ENST00000402781:exon_15531281_15532512:TRIM16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16001756 G/A 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000141027:ENST00000268712:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395851:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395849:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395857:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000455704:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000458113:exon_16001681_16001810:NCOR1;ENSG00000141027:ENST00000395848:exon_16001681_16001810:NCOR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16285404 C/T 1 1778 1424 3202 844.931381865921 747.294551306484 97.636830559438 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.000558281057821366 ENSG00000170315:ENST00000302182:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395839:exon_16285216_16286054:UBB;ENSG00000170315:ENST00000395837:exon_16285216_16286054:UBB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16320961 C/T 1 22 19 41 10.4547190107144 9.97092449074662 0.48379451996782 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16320876_16321182:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16320876_16321182:TRPV2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16325968 A/G 1 35 32 67 16.6325075170457 16.7931359844154 -0.160628467369662 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16326005 A/C 1 42 29 71 19.9590090204548 15.2187794858764 4.74022953457842 A:C A C 10 0.52478549951298 0.285832229954183 ENSG00000187688:ENST00000338560:exon_16325913_16326203:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000489668:exon_16325913_16326207:TRPV2;ENSG00000187688:ENST00000455666:exon_16325913_16326203:TRPV2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16344405 C/A 1 1110 1162 2272 527.488095540592 609.800750434083 -82.3126548934906 A:C:G C A 10 0.52478549951298 0.000568843074669193 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16344601 G/C 1 24 9 33 11.4051480116885 4.72306949561682 6.68207851607166 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0227438616392386 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 16842912 A/G 1 276 246 522 131.159202134418 129.097232880193 2.06196925422444 A:G A G 10 0.52478549951298 0.860985329654325 ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 17088163 A/G 1 16 16 32 7.60343200779232 8.39656799220768 -0.793135984415361 A:G A G 10 0.52478549951298 0.860157258043716 ENSG00000133030:ENST00000444976:exon_17088137_17088369:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000395811:exon_17088137_17088874:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000341712:exon_17088137_17088874:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000313485:exon_17088137_17088874:MPRIP;ENSG00000133030:ENST00000414263:exon_17088137_17088874:MPRIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 17409560 C/T 1 9 13 22 4.27693050438318 6.82221149366874 -2.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.29401621168529 ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 17707093 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17707070_17707163:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17707070_17707355:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17707070_17707433:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17707070_17707355:RAI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 18874720 C/G 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000188522:ENST00000388995:exon_18872102_18875061:FAM83G;ENSG00000188522:ENST00000345041:exon_18874381_18875061:FAM83G HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 20108184 C/G 1 7 11 18 3.32650150340914 5.77264049464278 -2.44613899123364 C:G C G 10 0.52478549951298 0.345641696182350 ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21203893 T/C 0 34 0 34 16.1572930165587 0 16.1572930165587 T T 10 0.52478549951298 3.11899350832963e-10 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21203934 G/A 0 32 0 32 15.2068640155846 0 15.2068640155846 G G 10 0.52478549951298 1.14076920947589e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21203949 C/T 0 36 0 36 17.1077220175327 0 17.1077220175327 C C 10 0.52478549951298 8.53847811754173e-11 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21207844 C/T 0 23 0 23 10.9299335112015 0 10.9299335112015 C C 10 0.52478549951298 3.997510173751e-07 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21207738_21207865:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21207738_21207865:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21208413 C/T 0 44 0 44 20.9094380214289 0 20.9094380214289 C C 10 0.52478549951298 7.78730001254193e-13 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21215483 C/T 0 31 0 31 14.7316495150976 0 14.7316495150976 C C 10 0.52478549951298 2.18287736846876e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21215537 C/A 0 14 0 14 6.65300300681828 0 6.65300300681828 C C 10 0.52478549951298 0.000150110081629330 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21215552 C/T 0 29 0 29 13.7812205141236 0 13.7812205141236 C C 10 0.52478549951298 8.00295963265225e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21215557 G/A 0 31 0 31 14.7316495150976 0 14.7316495150976 G G 10 0.52478549951298 2.18287736846876e-09 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 21216846 G/C 0 55 0 55 26.1367975267861 0 26.1367975267861 G G 10 0.52478549951298 5.01779424086601e-16 ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 25630401 A/G 1 16 9 25 7.60343200779232 4.72306949561682 2.8803625121755 A:G A G 10 0.52478549951298 0.317499389351278 ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25630393_25630661:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000427287:exon_25630393_25630661:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25630393_25630661:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000487603:exon_25629461_25630661:WSB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 25970633 G/A 1 21 36 57 9.97950451022742 18.8922779824673 -8.91277347223986 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0233603241006421 ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25970551_25970646:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25970551_25970646:LGALS9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 26646243 G/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000109084:ENST00000226230:exon_26646161_26646391:TMEM97 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 26685983 T/C 1 16 23 39 7.60343200779232 12.0700664887985 -4.46663448100622 T:C T C 10 0.52478549951298 0.199032769815059 ENSG00000244045:ENST00000292114:exon_26685939_26686012:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000509083:exon_26685939_26686012:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000457710:exon_26685939_26686012:TMEM199;ENSG00000244045:ENST00000483505:exon_26685938_26686012:TMEM199 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 26881884 G/A 1 44 37 81 20.9094380214289 19.4170634819803 1.49237453944862 A:G G A 10 0.52478549951298 0.824103128164606 ENSG00000087111:ENST00000487231:exon_26881869_26883847:PIGS;ENSG00000087111:ENST00000492429:exon_26881869_26882079:PIGS;ENSG00000087111:ENST00000395346:exon_26881869_26882079:PIGS;ENSG00000087111:ENST00000308360:exon_26881869_26882079:PIGS;ENSG00000087111:ENST00000268758:exon_26881869_26882079:PIGS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 26906207 T/C 1 97 99 196 46.0958065472409 51.953764451785 -5.85795790454409 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.431612649809226 ENSG00000076382:ENST00000321765:exon_26906159_26906270:SPAG5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 26975991 C/T 1 62 64 126 29.4632990301952 33.5862719688307 -4.12297293863548 T:C C T 10 0.52478549951298 0.476522186128636 ENSG00000132581:ENST00000247020:exon_26975374_26976294:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000491945:exon_26975607_26976294:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000480857:exon_26975607_26976294:SDF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 26982393 T/C 1 23 24 47 10.9299335112015 12.5948519883115 -1.66491847711006 T:C T C 10 0.52478549951298 0.663051365227157 ENSG00000132581:ENST00000247020:exon_26982305_26982501:SDF2;ENSG00000132581:ENST00000491945:exon_26982305_26982501:SDF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27014483 C/A 1 26 20 46 12.3555770126625 10.4957099902596 1.85986702240292 A:C C A 10 0.52478549951298 0.658707192376296 ENSG00000109111:ENST00000314616:exon_27014322_27014489:SUPT6H HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27042282 G/C 1 20 7 27 9.5042900097404 3.67349849659086 5.83079151314954 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0323842653872624 ENSG00000109113:ENST00000453384:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000447716:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000422028:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000301043:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000419712:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000395243:exon_27042237_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000415040:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000450529:exon_27042237_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000395242:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000474704:exon_27041317_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000395245:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000413526:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000436730:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000430132:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000412625:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000353676:exon_27042213_27042294:RAB34;ENSG00000109113:ENST00000496866:exon_27041924_27042294:RAB34 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27047930 C/G 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198242:ENST00000473896:exon_27047725_27048940:RPL23A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27068462 G/A 1 22 17 39 10.4547190107144 8.92135349172066 1.53336551899378 A:G G A 10 0.52478549951298 0.635242053522041 ENSG00000160602:ENST00000268766:exon_27068431_27068589:NEK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27075423 C/T 1 65 81 146 30.8889425316563 42.5076254605514 -11.6186829288951 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0568057176216686 ENSG00000076604:ENST00000461195:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000262395:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000473421:exon_27075280_27075441:TRAF4;ENSG00000076604:ENST00000469529:exon_27075280_27075441:TRAF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27086215 C/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000173065:ENST00000452648:exon_27082996_27086894:C17orf63;ENSG00000173065:ENST00000341217:exon_27082996_27086894:C17orf63 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27187604 G/C 1 73 103 176 34.6906585355525 54.0529064498369 -19.3622479142845 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00401741153459597 ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27187449_27188085:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000461894:exon_27187449_27188077:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000471992:exon_27187449_27188027:ERAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27422053 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27889578 T/C 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000168792:ENST00000307201:exon_27887691_27890104:ABHD15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27903138 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27903096_27903149:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000491377:exon_27903096_27903692:GIT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27904711 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000108262:ENST00000225394:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394868:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000473217:exon_27904663_27904760:GIT1;ENSG00000108262:ENST00000394869:exon_27904663_27904760:GIT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 27975188 T/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C T C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000141298:ENST00000269033:exon_27975162_27975362:SSH2;ENSG00000141298:ENST00000394848:exon_27974712_27975362:SSH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 28511978 G/A 1 76 86 162 36.1163020370135 45.1315529581163 -9.01525092110276 A:G G A 10 0.52478549951298 0.157738410407355 ENSG00000126653:ENST00000247026:exon_28511633_28513493:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000475652:exon_28511633_28512211:CCDC55;ENSG00000126653:ENST00000394826:exon_28511633_28513491:CCDC55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 29111368 A/G 1 10 13 23 4.7521450048702 6.82221149366874 -2.07006648879854 A:G A G 10 0.52478549951298 0.411031583507491 ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 29162459 A/G 1 5 11 16 2.3760725024351 5.77264049464278 -3.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.131078346897670 ENSG00000176208:ENST00000321990:exon_29161166_29163066:ATAD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 30179314 G/A 1 40 62 102 19.0085800194808 32.5367009698048 -13.528120950324 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.00960437305501356 ENSG00000172301:ENST00000302362:exon_30178883_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000378634:exon_30178890_30179327:C17orf79;ENSG00000172301:ENST00000496655:exon_30178890_30179327:C17orf79 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 30228656 G/A 1 11 12 23 5.22735950535722 6.29742599415576 -1.07006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.681491778056056 ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30228555_30228731:UTP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 30551707 A/G 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 A:G A G 10 0.52478549951298 0.216375415667424 ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30551635_30552746:RHOT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 33310068 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000005156:ENST00000378526:exon_33310021_33310571:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000262327:exon_33310021_33310571:LIG3;ENSG00000005156:ENST00000467697:exon_33310021_33310571:LIG3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 33460431 C/T 1 11 31 42 5.22735950535722 16.2683504849024 -11.0409909795452 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000926074557287914 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 33460516 A/G 1 18 44 62 8.55386100876636 23.0905619785711 -14.5367009698048 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000293784132134677 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33460358_33460517:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33460358_33460517:NLE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 33463390 G/T 1 28 9 37 13.3060060136366 4.72306949561682 8.58293651801974 T:G G T 10 0.52478549951298 0.00477640147664877 ENSG00000073536:ENST00000442241:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000360831:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000262335:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000436188:exon_33463381_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000479807:exon_33463377_33463516:NLE1;ENSG00000073536:ENST00000473567:exon_33463386_33463516:NLE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 33768199 G/A 1 7 14 21 3.32650150340914 7.34699699318172 -4.02049548977258 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0847652640732487 ENSG00000154760:ENST00000285013:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000360502:exon_33762115_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000526861:exon_33764562_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000530782:exon_33766003_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000534689:exon_33766499_33768385:SLFN13;ENSG00000154760:ENST00000533791:exon_33766517_33768385:SLFN13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 34205589 C/A 1 59 36 95 28.0376555287342 18.8922779824673 9.1453775462669 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0645791959886149 ENSG00000161570:ENST00000293272:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000366113:exon_34205532_34205643:CCL5;ENSG00000161570:ENST00000463941:exon_34205532_34205643:CCL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 34416044 C/A 1 76 120 196 36.1163020370135 62.9742599415576 -26.8579579045441 A:C C A 10 0.52478549951298 0.000138806328473915 ENSG00000006075:ENST00000225245:exon_34415602_34416108:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000470334:exon_34415602_34416108:CCL3;ENSG00000006075:ENST00000394470:exon_34415605_34416108:CCL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 35376351 C/T 1 75 74 149 35.6410875365265 38.8341269639605 -3.19303942743402 T:C C T 10 0.52478549951298 0.623140852431649 ENSG00000108270:ENST00000225402:exon_35376304_35376371:AATF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 35873022 C/T 1 14 11 25 6.65300300681828 5.77264049464278 0.880362512175499 T:C C T 10 0.52478549951298 0.842068649003874 ENSG00000161326:ENST00000394389:exon_35872283_35873603:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000292964:exon_35872283_35873588:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000394386:exon_35872283_35873589:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000487847:exon_35872283_35873603:DUSP14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 35902225 C/G 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 C:G C G 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000006114:ENST00000346661:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000345615:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000339208:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394379:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000502449:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000394378:exon_35902074_35902667:SYNRG;ENSG00000006114:ENST00000421408:exon_35900728_35902529:SYNRG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 35984410 T/C 1 13 33 46 6.17778850633126 17.3179214839283 -11.1401329775971 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00103432516794707 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35984390_35984480:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35984390_35984480:DDX52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 35988615 A/G 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 35988672 C/T 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000141141:ENST00000349699:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000437041:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000394367:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000488402:exon_35988605_35988716:DDX52;ENSG00000141141:ENST00000460080:exon_35988605_35988716:DDX52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37008938 G/A 1 4086 3863 7949 1941.72644898996 2027.24638461864 -85.5199356286785 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 0.0548247656354707 ENSG00000125691:ENST00000479035:exon_37008857_37008985:RPL23;ENSG00000125691:ENST00000394333:exon_37008857_37008985:RPL23;ENSG00000125691:ENST00000394332:exon_37008857_37008985:RPL23;ENSG00000125691:ENST00000245857:exon_37008857_37008985:RPL23;ENSG00000125691:ENST00000470646:exon_37008857_37008985:RPL23;ENSG00000125691:ENST00000378096:exon_37008857_37008985:RPL23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37070658 A/G 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G A G 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000429030:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37070578_37070728:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000419929:exon_37070578_37070728:LASP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37074869 C/T 1 26 12 38 12.3555770126625 6.29742599415576 6.05815101850676 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0521978852473833 ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37360767 T/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:T T A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37360768 C/A 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 A:C C A 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37813338 T/C 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37813261_37813338:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000460894:exon_37813151_37813338:STARD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37814080 G/A 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000484773:exon_37814028_37814105:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000443521:exon_37814028_37814105:STARD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37815749 G/A 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37815714_37815806:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37815714_37815806:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37815714_37815806:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37815714_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37815714_37816779:STARD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 37818561 T/C 1 15 15 30 7.1282175073053 7.8717824926947 -0.743564985389401 T:C T C 10 0.52478549951298 0.855855880845914 ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37818504_37818597:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37818504_37819737:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37818504_37818597:STARD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38031674 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000186075:ENST00000348931:exon_38031507_38031687:ZPBP2;ENSG00000186075:ENST00000377940:exon_38031507_38031687:ZPBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38033048 C/G 1 6 13 19 2.85128700292212 6.82221149366874 -3.97092449074662 C:G C G 10 0.52478549951298 0.105409046642838 ENSG00000186075:ENST00000348931:exon_38032935_38033335:ZPBP2;ENSG00000186075:ENST00000377940:exon_38032935_38034149:ZPBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38062217 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000523371:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000522564:exon_38062100_38062238:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000524039:exon_38062100_38062238:GSDMB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38080367 G/A 1 27 28 55 12.8307915131495 14.6939939863634 -1.8632024732139 A:G G A 10 0.52478549951298 0.685985941709095 ENSG00000172057:ENST00000304046:exon_38080283_38080478:ORMDL3;ENSG00000172057:ENST00000394169:exon_38080283_38080478:ORMDL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38447569 T/C 1 36 25 61 17.1077220175327 13.1196374878245 3.98808452970822 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.369675483332825 ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38447310_38447591:CDC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38510583 C/T 1 13 15 28 6.17778850633126 7.8717824926947 -1.69399398636344 T:C C T 10 0.52478549951298 0.573269193038738 ENSG00000131759:ENST00000254066:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000394089:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000425707:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000394086:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000394081:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000319149:exon_38510554_38510758:RARA;ENSG00000131759:ENST00000475125:exon_38510554_38510661:RARA;ENSG00000131759:ENST00000420042:exon_38510554_38510758:RARA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38711222 T/C 1 90 77 167 42.7693050438318 40.4084834624995 2.36082158133234 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756810425944381 ENSG00000126353:ENST00000246657:exon_38710021_38712070:CCR7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38786508 G/A 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000073584:ENST00000400122:exon_38786460_38786538:SMARCE1;ENSG00000073584:ENST00000264640:exon_38786460_38786538:SMARCE1;ENSG00000073584:ENST00000447024:exon_38786412_38786538:SMARCE1;ENSG00000073584:ENST00000377808:exon_38786474_38786538:SMARCE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38974663 T/C 1 133 142 275 63.2035285647737 74.5195409308432 -11.3160123660695 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.184078310977910 ENSG00000186395:ENST00000269576:exon_38974369_38974734:KRT10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38991032 T/A 1 41 4 45 19.4837945199678 2.09914199805192 17.3846525219159 A:T:C T A 10 0.52478549951298 3.44589804660023e-08 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38991052 T/G 1 36 7 43 17.1077220175327 3.67349849659086 13.4342235209419 T:G T G 10 0.52478549951298 2.34100591251239e-05 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 38991053 T/A 1 36 7 43 17.1077220175327 3.67349849659086 13.4342235209419 A:T T A 10 0.52478549951298 2.34100591251239e-05 ENSG00000167920:ENST00000436612:exon_38990634_38991337:TMEM99;ENSG00000167920:ENST00000301665:exon_38990634_38992522:TMEM99 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 39912145 T/A 1 28 19 47 13.3060060136366 9.97092449074662 3.33508152288994 A:T T A 10 0.52478549951298 0.381777744637033 ENSG00000173801:ENST00000393930:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000310706:exon_39911982_39912147:JUP;ENSG00000173801:ENST00000393931:exon_39910856_39912147:JUP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 39983808 G/C 1 111 56 167 52.7488095540592 29.3879879727269 23.3608215813323 C:G G C 10 0.52478549951298 0.000336710943509234 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 39983820 G/A 1 117 59 176 55.6000965569813 30.9623444712658 24.6377520857155 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000201026282926136 ENSG00000141698:ENST00000517701:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000469698:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000523903:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000269534:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000467970:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000470690:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393911:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000393910:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000435506:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000415460:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000476921:exon_39983678_39983878:NT5C3L;ENSG00000141698:ENST00000445655:exon_39983678_39983878:NT5C3L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40065774 T/G 1 25 27 52 11.8803625121755 14.1692084868505 -2.28884597467496 T:G T G 10 0.52478549951298 0.57957955683438 ENSG00000131473:ENST00000352035:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000401700:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000353196:exon_40065763_40065953:ACLY;ENSG00000131473:ENST00000393896:exon_40065763_40065953:ACLY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40129319 G/A 1 134 130 264 63.6787430652607 68.2221149366874 -4.54337187142673 A:G G A 10 0.52478549951298 0.579797187027592 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40129279_40129341:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40129279_40129341:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40129279_40129341:DNAJC7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40141428 G/C 1 166 172 338 78.8856070808453 90.2631059162326 -11.3774988353872 T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.230854233203076 ENSG00000168259:ENST00000457167:exon_40141422_40141575:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000426588:exon_40141422_40141575:DNAJC7;ENSG00000168259:ENST00000316603:exon_40141422_40141575:DNAJC7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40257163 T/C 1 13 7 20 6.17778850633126 3.67349849659086 2.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.371028264701611 ENSG00000108771:ENST00000251642:exon_40257036_40257185:DHX58;ENSG00000108771:ENST00000423748:exon_40257036_40257185:DHX58 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40353722 A/G 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173757:ENST00000293328:exon_40351186_40353882:STAT5B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40818451 G/A 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818341_40818502:TUBG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40818699 A/G 1 8 19 27 3.80171600389616 9.97092449074662 -6.16920848685046 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0201861719838019 ENSG00000037042:ENST00000251412:exon_40818621_40819021:TUBG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40847684 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40847539_40847892:CNTNAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 40926690 A/G 1 123 132 255 58.4513835599035 69.2716859357134 -10.8203023758099 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.187934805781218 ENSG00000131475:ENST00000253794:exon_40926664_40926717:VPS25 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 41290937 G/A 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000198496:ENST00000464237:exon_41290674_41290939:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000460115:exon_41290674_41290939:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000356906:exon_41290674_41290939:NBR2;ENSG00000198496:ENST00000467245:exon_41290674_41290939:NBR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42152103 G/A 1 22 21 43 10.4547190107144 11.0204954897726 -0.56577647905814 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.879800319218863 ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42272165 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000087152:ENST00000454077:exon_42272136_42272207:ATXN7L3;ENSG00000087152:ENST00000389384:exon_42272136_42272207:ATXN7L3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42287519 C/T 1 74 85 159 35.1658730360395 44.6067674586033 -9.44089442256382 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.152719348674993 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42287492_42287602:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529373:exon_42287492_42287602:UBTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42288661 G/A 1 44 47 91 20.9094380214289 24.6649184771101 -3.75548045568118 A:G G A 10 0.52478549951298 0.463203717907919 ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288658_42288699:UBTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42398757 C/A 1 11 1 12 5.22735950535722 0.52478549951298 4.70257400584424 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00706766844417671 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42427854 C/G 1 409 357 766 194.362730699191 187.348423326134 7.01430737305728 C:G C G 10 0.52478549951298 0.638178024000496 ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427810_42427945:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427810_42427945:GRN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42475983 G/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 C:G G C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42759379 A/G 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 A:G A G 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000180329:ENST00000315286:exon_42759371_42759506:CCDC43;ENSG00000180329:ENST00000457422:exon_42759371_42759506:CCDC43 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42927721 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000131097:ENST00000253410:exon_42927700_42927840:HIGD1B;ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42927655_42928737:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42927655_42928737:EFTUD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 42953409 A/G 1 16 24 40 7.60343200779232 12.5948519883115 -4.9914199805192 A:G A G 10 0.52478549951298 0.153337885169514 ENSG00000108883:ENST00000426333:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000402521:exon_42953302_42953468:EFTUD2;ENSG00000108883:ENST00000262414:exon_42953302_42953468:EFTUD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 43003484 T/C 1 19 11 30 9.02907550925338 5.77264049464278 3.2564350146106 T:C T C 10 0.52478549951298 0.274640281251531 ENSG00000186185:ENST00000438933:exon_43003360_43003554:KIF18B;ENSG00000186185:ENST00000339151:exon_43003448_43003554:KIF18B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 43102042 C/T 1 18 13 31 8.55386100876636 6.82221149366874 1.73164951509762 T:C C T 10 0.52478549951298 0.592301033739622 ENSG00000172992:ENST00000452796:exon_43100710_43102092:DCAKD;ENSG00000172992:ENST00000342350:exon_43100710_43102092:DCAKD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 43175906 C/T 1 70 88 158 33.2650150340914 46.1811239571422 -12.9161089230508 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0461214721973311 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43175750_43175920:NMT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 43183028 G/A 1 241 214 455 114.526694617372 112.304096895778 2.22259772159408 A:G G A 10 0.52478549951298 0.851154562921375 ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 43342141 G/C 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000006062:ENST00000344686:exon_43340488_43342167:MAP3K14;ENSG00000006062:ENST00000376926:exon_43340495_43342167:MAP3K14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45008570 G/A 1 25 38 63 11.8803625121755 19.9418489814932 -8.06148646931774 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0440454014853466 ENSG00000108433:ENST00000225567:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000393456:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000415811:exon_45008465_45008573:GOSR2;ENSG00000108433:ENST00000439730:exon_45008465_45008573:GOSR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45885756 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000006025:ENST00000007414:exon_45884733_45885765:OSBPL7;ENSG00000006025:ENST00000392507:exon_45884733_45885765:OSBPL7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45915395 T/C 1 1 8 9 0.47521450048702 4.19828399610384 -3.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0165388389563391 ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915049_45915816:SCRN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45917596 A/G 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 A:G A G 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45917557_45917738:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45917557_45917738:SCRN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45917703 C/T 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45917557_45917738:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45917557_45917738:SCRN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45994044 C/T 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45994094 T/C 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C T C 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2;ENSG00000167182:ENST00000322172:exon_45993522_45994136:SP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 45994154 G/A 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G G A 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_45993522_45994496:SP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 46002744 G/T 1 17 15 32 8.07864650827934 7.8717824926947 0.206864015584639 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167182:ENST00000376741:exon_46002714_46002907:SP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 46262171 C/T 1 38 22 60 18.0581510185068 11.5452809892856 6.5128700292212 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0946793405093407 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 46474066 C/T 1 19 14 33 9.02907550925338 7.34699699318172 1.68207851607166 T:C C T 10 0.52478549951298 0.604275254765751 ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46474042_46474147:SKAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 46998572 G/A 1 11 15 26 5.22735950535722 7.8717824926947 -2.64442298733748 A:G G A 10 0.52478549951298 0.330542748984287 ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000508468:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_46998522_46998634:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_46998564_46998634:UBE2Z HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 47018293 C/T 1 68 97 165 32.3145860331174 50.9041934527591 -18.5896074196417 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00388310166471341 ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 48433958 T/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000507602:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48433872_48434134:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48433872_48434134:XYLT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 48450523 C/G 1 54 42 96 25.6615830262991 22.0409909795452 3.62059204675392 C:G C G 10 0.52478549951298 0.476072912278111 ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 48539035 T/C 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 48551923 C/G 1 26 50 76 12.3555770126625 26.239274975649 -13.8836979629865 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00175337155467458 ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48551863_48552031:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48551863_48552196:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48551863_48552031:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48551863_48552198:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48551863_48552192:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506085:exon_48551863_48552206:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000507792:exon_48551863_48552135:ACSF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 48628160 A/G 1 1 13 14 0.47521450048702 6.82221149366874 -6.34699699318172 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000613211119935342 ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628095_48628278:SPATA20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 48774319 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000154945:ENST00000285243:exon_48774301_48774482:ANKRD40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 49248997 C/T 1 1240 1151 2391 589.265980603905 604.02810993944 -14.7621293355353 T:C C T 10 0.52478549951298 0.552668178230368 ENSG00000011052:ENST00000376392:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393199:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393183:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000514264:exon_49248848_49249028:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393185:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000513177:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000512737:exon_49248848_49249108:NME2;ENSG00000011052:ENST00000426182:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000011052:ENST00000503064:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000393190:exon_49248848_49249105:NME2;ENSG00000011052:ENST00000445778:exon_49248848_49249104:NME2;ENSG00000243678:ENST00000393193:exon_49248848_49249105:NME1-NME2;ENSG00000243678:ENST00000393198:exon_49248848_49249103:NME1-NME2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 49338275 G/A 1 16 27 43 7.60343200779232 14.1692084868505 -6.56577647905814 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0479114138108808 ENSG00000011260:ENST00000225298:exon_49337889_49338287:UTP18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 55027769 C/T 1 16 13 29 7.60343200779232 6.82221149366874 0.781220514123579 T:C C T 10 0.52478549951298 0.85350802638375 ENSG00000121058:ENST00000240316:exon_55027250_55028357:COIL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 55055527 C/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000121064:ENST00000262288:exon_55055468_55055596:SCPEP1;ENSG00000121064:ENST00000393142:exon_55055509_55055596:SCPEP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 57290383 G/A 1 21 23 44 9.97950451022742 12.0700664887985 -2.09056197857112 A:G G A 10 0.52478549951298 0.549204734734899 ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57290090_57290962:C17orf71 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 58136791 C/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000068097:ENST00000184956:exon_58136783_58136882:HEATR6;ENSG00000068097:ENST00000393017:exon_58136783_58136882:HEATR6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 59760996 A/G 1 4 11 15 1.90085800194808 5.77264049464278 -3.8717824926947 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0673444366165564 ENSG00000136492:ENST00000259008:exon_59759985_59761501:BRIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 61628017 G/T 1 14 20 34 6.65300300681828 10.4957099902596 -3.84270698344132 T:G G T 10 0.52478549951298 0.229459342212184 ENSG00000136485:ENST00000310827:exon_61627822_61628176:DCAF7;ENSG00000136485:ENST00000431926:exon_61627843_61628176:DCAF7;ENSG00000136485:ENST00000415273:exon_61627843_61628176:DCAF7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 61830141 C/T 1 19 15 34 9.02907550925338 7.8717824926947 1.15729301655868 T:C C T 10 0.52478549951298 0.733864029024378 ENSG00000108588:ENST00000225726:exon_61830101_61830159:CCDC47;ENSG00000108588:ENST00000403162:exon_61830101_61830159:CCDC47 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 61883966 C/T 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000198231:ENST00000359353:exon_61883895_61884014:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000389924:exon_61883895_61884014:DDX42;ENSG00000198231:ENST00000457800:exon_61883895_61884014:DDX42 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 61904282 C/G 1 25 24 49 11.8803625121755 12.5948519883115 -0.714489476136023 C:G C G 10 0.52478549951298 0.886764752655988 ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61904196_61904397:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61904196_61904288:FTSJ3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 61910514 A/G 1 129 109 238 61.3026705628256 57.2016194469148 4.10105111591075 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.604252746506152 ENSG00000108604:ENST00000450364:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000448276:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000225742:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000323347:exon_61910429_61910530:SMARCD2;ENSG00000108604:ENST00000228253:exon_61910429_61910530:SMARCD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65714095 C/T 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65714059_65714204:NOL11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65822320 C/G 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65821640_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65821652_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65821780_65822453:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65821780_65822453:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65907663 C/G 1 13 14 27 6.17778850633126 7.34699699318172 -1.16920848685046 C:G C G 10 0.52478549951298 0.702688159671681 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65908190 A/G 1 14 19 33 6.65300300681828 9.97092449074662 -3.31792148392834 A:G A G 10 0.52478549951298 0.296397632638428 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65906993_65909303:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65906993_65909303:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65914911 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65914830_65914954:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65914830_65914954:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65914830_65914954:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65914830_65914954:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65919092 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65918956_65919106:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65918956_65919106:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65924524 A/G 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65924471_65924717:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65924471_65924717:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65924471_65924717:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65924471_65924717:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 65941621 C/G 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171634:ENST00000306378:exon_65941525_65942441:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000335221:exon_65941525_65942012:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321892:exon_65941525_65942441:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000424123:exon_65941525_65942012:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000342579:exon_65941525_65942012:BPTF;ENSG00000171634:ENST00000321866:exon_65941525_65941803:BPTF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 66039350 A/G 1 203 219 422 96.4685435988651 114.928024393343 -18.4594807944776 A:G A G 10 0.52478549951298 0.079204247502553 ENSG00000182481:ENST00000330459:exon_66039216_66039479:KPNA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 66246476 C/T 1 46 60 106 21.8598670224029 31.4871299707788 -9.62726294837588 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0648499731604618 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392721:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66246329_66246611:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66246329_66246611:AMZ2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 66253019 A/G 1 160 175 335 76.0343200779232 91.8374624147715 -15.8031423368483 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0898472176965818 ENSG00000196704:ENST00000359904:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000359783:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000392720:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000455065:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000440663:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000445412:exon_66252955_66253305:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000402427:exon_66252955_66253214:AMZ2;ENSG00000196704:ENST00000407549:exon_66252955_66253214:AMZ2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71027833 A/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71197748 G/A 1 22 23 45 10.4547190107144 12.0700664887985 -1.6153474780841 A:G G A 10 0.52478549951298 0.656663234411555 ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71228360 G/C 1 15 24 39 7.1282175073053 12.5948519883115 -5.46663448100622 C:G G C 10 0.52478549951298 0.107695702052258 ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71228225_71228510:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000403627:exon_71228225_71228506:FAM104A;ENSG00000133193:ENST00000255557:exon_71228225_71228533:FAM104A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71232044 C/T 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71232687 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71232807 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71232881 G/C 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 C:G G C 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71233112 C/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 71233130 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 72436120 A/G 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G A G 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72435884_72436185:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72435884_72436966:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72435916_72436185:GPRC5C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 72860100 G/A 1 46 48 94 21.8598670224029 25.189703976623 -3.32983695422012 A:G G A 10 0.52478549951298 0.535926853840859 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860018_72860189:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860018_72860469:FDXR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 72860389 G/A 1 47 40 87 22.3350815228899 20.9914199805192 1.34366154237074 A:G G A 10 0.52478549951298 0.830290975511305 ENSG00000161513:ENST00000293195:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000442102:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000413947:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000420580:exon_72860270_72860469:FDXR;ENSG00000161513:ENST00000455107:exon_72860018_72860469:FDXR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73016621 C/T 1 72 64 136 34.2154440350654 33.5862719688307 0.629172066234716 T:C C T 10 0.52478549951298 0.931779798123425 ENSG00000167862:ENST00000301585:exon_73016583_73016752:ICT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73127217 G/C 1 2 10 12 0.95042900097404 5.2478549951298 -4.29742599415576 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0177435667657133 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73127683 T/C 1 47 45 92 22.3350815228899 23.6153474780841 -1.28026595519416 T:C T C 10 0.52478549951298 0.83490312873675 ENSG00000125458:ENST00000245552:exon_73127629_73127877:NT5C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73230856 C/T 1 59 57 116 28.0376555287342 29.9127734722399 -1.87511794350569 T:C C T 10 0.52478549951298 0.780511802839861 ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73279624 A/G 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 A:G A G 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73279504_73279674:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73279504_73279674:SLC25A19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73282780 C/A 1 16 16 32 7.60343200779232 8.39656799220768 -0.793135984415361 A:C C A 10 0.52478549951298 0.860157258043716 ENSG00000125454:ENST00000375261:exon_73282714_73282883:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000402418:exon_73282714_73282894:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000416858:exon_73282714_73282883:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000442286:exon_73282714_73282883:SLC25A19;ENSG00000125454:ENST00000320362:exon_73282714_73282883:SLC25A19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73513289 C/G 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 C:G C G 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73513242_73513325:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73513242_73513325:TSEN54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73517505 G/A 1 9 16 25 4.27693050438318 8.39656799220768 -4.1196374878245 A:G G A 10 0.52478549951298 0.111379558353423 ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73517490_73517591:TSEN54;ENSG00000182173:ENST00000434205:exon_73517490_73517591:TSEN54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73625059 G/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73627539 T/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73627530_73627748:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73627530_73627748:RECQL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73823982 G/A 1 24 25 49 11.4051480116885 13.1196374878245 -1.71448947613602 A:G G A 10 0.52478549951298 0.669159089591383 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73823310_73824167:UNC13D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73830426 C/T 1 30 15 45 14.2564350146106 7.8717824926947 6.3846525219159 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.0722583285880021 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73830406_73830612:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73830406_73830612:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73830406_73830612:UNC13D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73836146 G/A 1 18 6 24 8.55386100876636 3.14871299707788 5.40514801168848 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0387976789889894 ENSG00000092929:ENST00000207549:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000412096:exon_73836099_73836191:UNC13D;ENSG00000092929:ENST00000448606:exon_73836099_73836191:UNC13D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73895688 C/G 1 52 41 93 24.711154025325 21.5162054800322 3.19494854529286 C:G C G 10 0.52478549951298 0.534488860249112 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000480203:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000483393:exon_73895597_73895949:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477371:exon_73895597_73895755:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477023:exon_73895597_73895755:MRPL38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73900688 T/C 1 58 35 93 27.5624410282472 18.3674924829543 9.19494854529286 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0615727959467133 ENSG00000204316:ENST00000309352:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000409963:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000477736:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493104:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000493383:exon_73900621_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000461602:exon_73900307_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000464758:exon_73900303_73900800:MRPL38;ENSG00000204316:ENST00000410030:exon_73900621_73900800:MRPL38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 73949540 G/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000161533:ENST00000293217:exon_73949532_73949701:ACOX1;ENSG00000161533:ENST00000301608:exon_73949532_73949701:ACOX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 74039945 T/C 1 35 20 55 16.6325075170457 10.4957099902596 6.1367975267861 T:C T C 10 0.52478549951298 0.106068495944605 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74039910_74040039:SRP68 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 74060168 T/C 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74060057_74060252:SRP68 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 74077301 A/C 1 112 111 223 53.2240240545462 58.2511904459408 -5.02716639139455 A:C A C 10 0.52478549951298 0.503424610093152 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74077087_74079831:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000465252:exon_74077099_74079831:EXOC7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 74081829 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467929:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467586:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000494787:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000460476:exon_74081758_74081878:EXOC7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 75085434 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 75483528 C/T 1 91 78 169 43.2445195443188 40.9332689620124 2.31125058230638 T:C C T 10 0.52478549951298 0.758258160071866 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75483506_75483634:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75483506_75483634:SEPT9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 75494746 A/G 1 26 16 42 12.3555770126625 8.39656799220768 3.95900902045484 A:G A G 10 0.52478549951298 0.27942376279123 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000449803:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000397613:exon_75494605_75494950:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 75495397 T/C 1 139 107 246 66.0548155676958 56.1520484478889 9.9027671198069 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.225143460631571 ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76118791 G/A 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 A:G G A 10 0.52478549951298 0.393947332697963 ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76118686_76118830:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76118686_76118830:TMC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76131070 G/A 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 A:G G A 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76170830 C/T 1 95 71 166 45.1453775462669 37.2597704654216 7.88560708084532 T:C C T 10 0.52478549951298 0.243759550445831 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76170160_76171031:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76170773_76171031:TK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76178751 C/T 1 56 23 79 26.6120120272731 12.0700664887985 14.5419455384746 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00100749625235915 ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76395430 C/T 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 T:C C T 10 0.52478549951298 0.840478250557484 ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76799808 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76800018 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76799467_76800060:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76800000_76800060:USP36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76803483 C/G 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76831552 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76831362_76831583:USP36;ENSG00000055483:ENST00000432878:exon_76831362_76831583:USP36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76988785 G/A 1 26 18 44 12.3555770126625 9.44613899123364 2.90943802142888 A:G G A 10 0.52478549951298 0.451065629213044 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76987799_76990002:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76987799_76990002:CANT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 76993084 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000171302:ENST00000302345:exon_76993074_76994045:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000392446:exon_76993074_76993726:CANT1;ENSG00000171302:ENST00000339300:exon_76993074_76993431:CANT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 77082434 G/A 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000167280:ENST00000300682:exon_77082015_77084681:ENGASE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 77768696 T/C 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000141570:ENST00000269385:exon_77765931_77769357:CBX8;ENSG00000141570:ENST00000427800:exon_77768693_77769357:CBX8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 77808961 G/A 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 A:G G A 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000141582:ENST00000269397:exon_77806955_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000448310:exon_77808843_77809194:CBX4;ENSG00000141582:ENST00000495122:exon_77808942_77809319:CBX4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 78092585 C/T 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78092452_78092604:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78092452_78092604:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78092452_78092604:GAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 78184393 C/T 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000181523:ENST00000326317:exon_78183079_78184810:SGSH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 78363847 G/A 1 12 25 37 5.70257400584424 13.1196374878245 -7.41706348198026 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0199865293761962 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 78363978 G/A 1 44 25 69 20.9094380214289 13.1196374878245 7.78980053360438 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0701805695100249 ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78363812_78363996:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78363812_78363996:RNF213 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79169668 C/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79169635_79169751:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79169635_79169751:AZI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79173224 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79173181_79173349:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79173181_79173349:AZI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79202956 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000167302:ENST00000300714:exon_79202079_79203276:C17orf56;ENSG00000167302:ENST00000374769:exon_79202079_79203276:C17orf56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79219621 G/A 1 19 20 39 9.02907550925338 10.4957099902596 -1.46663448100622 A:G G A 10 0.52478549951298 0.748956128215546 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79226083 C/T 1 35 25 60 16.6325075170457 13.1196374878245 3.5128700292212 T:C C T 10 0.52478549951298 0.438277441741332 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79226362 G/A 1 24 23 47 11.4051480116885 12.0700664887985 -0.664918477110062 A:G G A 10 0.52478549951298 0.884555302742298 ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79225995_79226483:SLC38A10;ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79225995_79226483:SLC38A10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79477827 C/G 1 3855 3876 7731 1831.95189937746 2034.06859611231 -202.116696734849 A:T:C:G C G 10 0.52478549951298 4.43182105715648e-06 ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79476999_79477859:ACTG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79564304 G/T 1 8 13 21 3.80171600389616 6.82221149366874 -3.02049548977258 T:G G T 10 0.52478549951298 0.197956855238699 ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79564271_79564342:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79564271_79564342:NPLOC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79634774 A/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:T A T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79634813 T/C 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79637367 C/G 1 28 31 59 13.3060060136366 16.2683504849024 -2.96234447126582 C:G C G 10 0.52478549951298 0.51491901151511 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79637255_79637483:CCDC137 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79638805 C/T 1 27 31 58 12.8307915131495 16.2683504849024 -3.43755897175284 T:C C T 10 0.52478549951298 0.430512177361458 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79638774_79638856:CCDC137 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79639684 G/A 1 22 19 41 10.4547190107144 9.97092449074662 0.48379451996782 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79661874 C/T 1 23 29 52 10.9299335112015 15.2187794858764 -4.28884597467496 T:C C T 10 0.52478549951298 0.267207266696263 ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79661845_79661883:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79661845_79661883:HGS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79813344 G/A 1 128 95 223 60.8274560623386 49.8546224537331 10.9728336086055 A:G G A 10 0.52478549951298 0.158982590894321 ENSG00000185624:ENST00000331483:exon_79813329_79813462:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000472244:exon_79813329_79813462:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000477607:exon_79813329_79813886:P4HB;ENSG00000185624:ENST00000467086:exon_79813329_79813462:P4HB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79952700 G/A 1 13 21 34 6.17778850633126 11.0204954897726 -4.84270698344132 A:G G A 10 0.52478549951298 0.121486691773272 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79952697_79952754:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000344865:exon_79952697_79952754:ASPSCR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79974680 C/G 1 34 13 47 16.1572930165587 6.82221149366874 9.33508152288994 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00790988215016436 ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 79995538 G/A 1 30 13 43 14.2564350146106 6.82221149366874 7.43422352094186 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0313432271712144 ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79995507_79995573:DCXR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80008347 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80008278_80008431:RFNG;ENSG00000169733:ENST00000429557:exon_80007879_80008431:RFNG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80012449 G/A 1 41 29 70 19.4837945199678 15.2187794858764 4.2650150340914 A:G G A 10 0.52478549951298 0.339316562546275 ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80016096 C/T 1 140 117 257 66.5300300681828 61.3999034430187 5.13012662516413 T:C C T 10 0.52478549951298 0.532835484722208 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80015754_80016130:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80015782_80016130:DUS1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80019180 C/G 1 42 20 62 19.9590090204548 10.4957099902596 9.46329903019524 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0213203540529062 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80019219 C/T 1 60 32 92 28.5128700292212 16.7931359844154 11.7197340448058 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0160424786554387 ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80039481 G/A 1 65 57 122 30.8889425316563 29.9127734722399 0.976169059416435 A:G G A 10 0.52478549951298 0.92782461160825 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80039477_80039719:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80040895 T/C 1 27 31 58 12.8307915131495 16.2683504849024 -3.43755897175284 T:C T C 10 0.52478549951298 0.430512177361458 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80040790_80040991:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80041866 C/T 1 21 19 40 9.97950451022742 9.97092449074662 0.00858001948079945 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80041851_80042029:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80043213 G/A 1 11 14 25 5.22735950535722 7.34699699318172 -2.1196374878245 A:G G A 10 0.52478549951298 0.428503043615975 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80043114_80043278:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80045291 C/T 1 19 17 36 9.02907550925338 8.92135349172066 0.107722017532719 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80045201_80045380:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80045667 G/A 1 9 18 27 4.27693050438318 9.44613899123364 -5.16920848685046 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0539979837708187 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80045561_80045737:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80051183 A/G 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80051095_80051295:FASN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80059596 T/C 1 120 101 221 57.0257400584424 53.003335450811 4.02240460763141 T:C T C 10 0.52478549951298 0.63741728035734 ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80059566_80059742:CCDC57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80193882 G/A 1 8 12 20 3.80171600389616 6.29742599415576 -2.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.273886654959245 ENSG00000141526:ENST00000392341:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392339:exon_80193859_80194107:SLC16A3;ENSG00000141526:ENST00000392340:exon_80191563_80194107:SLC16A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80350331 G/A 1 24 18 42 11.4051480116885 9.44613899123364 1.95900902045484 A:G G A 10 0.52478549951298 0.643618900836449 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80350100_80350410:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80350100_80350410:C17orf101 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80373377 G/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:G G T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80373452 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000181396:ENST00000313056:exon_80373274_80373503:C17orf101;ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80373274_80373503:C17orf101 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80400377 G/A 1 16 18 34 7.60343200779232 9.44613899123364 -1.84270698344132 A:G G A 10 0.52478549951298 0.607515458004291 ENSG00000169660:ENST00000337014:exon_80400053_80400515:HEXDC;ENSG00000169660:ENST00000327949:exon_80400053_80400515:HEXDC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80442722 T/C 1 41 22 63 19.4837945199678 11.5452809892856 7.93851353068226 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0576244499579546 ENSG00000141562:ENST00000390006:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000345415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000374611:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000309794:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000457415:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412719:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000412079:exon_80442689_80442826:NARF;ENSG00000141562:ENST00000427631:exon_80442657_80442826:NARF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80674643 C/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80674582_80674772:FN3KRP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 80684731 G/A 1 15 16 31 7.1282175073053 8.39656799220768 -1.26835048490238 A:G G A 10 0.52478549951298 0.720494209048114 ENSG00000141560:ENST00000269373:exon_80684709_80685892:FN3KRP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 17 81006620 G/A 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000175711:ENST00000320865:exon_81006545_81006661:B3GNTL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 166819 T/C 1 25 2 27 11.8803625121755 1.04957099902596 10.8307915131495 T:C T C 10 0.52478549951298 1.69222699333958e-05 ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 673016 C/T 1 295 310 605 140.188277643671 162.683504849024 -22.4952272053529 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0731962447423364 ENSG00000176890:ENST00000323274:exon_672860_673578:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323250:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000176890:ENST00000323224:exon_672860_673492:TYMS;ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_672557_673076:ENOSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 674339 A/G 1 40 59 99 19.0085800194808 30.9623444712658 -11.953764451785 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 0.0201844306258749 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_674161_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_673859_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_673861_674406:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_674038_674406:ENOSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 691266 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_691204_691276:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_691204_691276:ENOSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 693828 A/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:C A C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 706574 G/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000132199:ENST00000383578:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000251101:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000319815:exon_706470_706578:ENOSF1;ENSG00000132199:ENST00000340116:exon_706470_706578:ENOSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 2573071 C/T 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000080986:ENST00000261597:exon_2572976_2573085:NDC80 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 2707619 G/A 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2707561_2707643:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2707561_2707643:SMCHD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 2747600 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000101596:ENST00000320876:exon_2747520_2747645:SMCHD1;ENSG00000101596:ENST00000261598:exon_2747520_2747645:SMCHD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 2920288 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000101577:ENST00000261596:exon_2916992_2920435:LPIN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 9570586 T/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000154845:ENST00000400556:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000400555:exon_9570155_9570681:PPP4R1;ENSG00000154845:ENST00000285124:exon_9570155_9570681:PPP4R1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 10681711 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000154864:ENST00000503781:exon_10681658_10681750:FAM38B;ENSG00000154864:ENST00000285141:exon_10681658_10681750:FAM38B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 12308793 G/C 1 121 182 303 57.5009545589294 95.5109609113624 -38.0100063524329 C:G G C 10 0.52478549951298 1.45806831853371e-05 ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 12329536 C/G 1 122 131 253 57.9761690594164 68.7469004362004 -10.770731376784 C:G C G 10 0.52478549951298 0.186264273214713 ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 12971245 C/T 1 19 20 39 9.02907550925338 10.4957099902596 -1.46663448100622 T:C C T 10 0.52478549951298 0.748956128215546 ENSG00000085415:ENST00000399892:exon_12971152_12971250:SEH1L;ENSG00000085415:ENST00000262124:exon_12971152_12971250:SEH1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 19153494 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000141446:ENST00000269214:exon_19153275_19155391:ESCO1;ENSG00000141446:ENST00000383276:exon_19153275_19155391:ESCO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 19283619 G/C 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 C:G G C 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000158201:ENST00000289119:exon_19283545_19283708:ABHD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 21100240 C/T 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 T:C C T 10 0.52478549951298 0.216375415667424 ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21100166_21100277:C18orf8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 21112206 C/T 1 15 14 29 7.1282175073053 7.34699699318172 -0.218779485876421 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21111401_21112248:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21111465_21112248:NPC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 21119777 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21119775_21119965:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21119775_21119965:NPC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 21739725 T/C 1 15 11 26 7.1282175073053 5.77264049464278 1.35557701266252 T:C T C 10 0.52478549951298 0.695977309853642 ENSG00000154040:ENST00000399496:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399478:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000463087:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000486759:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000327201:exon_21739436_21740033:CABYR;ENSG00000154040:ENST00000399499:exon_21739436_21740033:CABYR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 23612484 C/G 1 13 18 31 6.17778850633126 9.44613899123364 -3.26835048490238 C:G C G 10 0.52478549951298 0.281875265233125 ENSG00000141380:ENST00000415083:exon_23612363_23612496:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269137:exon_23612363_23612496:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269138:exon_23612363_23612496:SS18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 32682068 T/C 1 14 9 23 6.65300300681828 4.72306949561682 1.92993351120146 T:C T C 10 0.52478549951298 0.532391639992863 ENSG00000166974:ENST00000413393:exon_32681910_32682123:MAPRE2;ENSG00000166974:ENST00000436190:exon_32681910_32682123:MAPRE2;ENSG00000166974:ENST00000300249:exon_32681910_32682123:MAPRE2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 32917644 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000172466:ENST00000261332:exon_32912176_32917734:ZNF24;ENSG00000172466:ENST00000399061:exon_32917189_32917734:ZNF24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 33702105 C/T 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000141424:ENST00000269187:exon_33702015_33702233:SLC39A6;ENSG00000141424:ENST00000440549:exon_33702015_33702233:SLC39A6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 34324091 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34323995_34324156:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34323995_34324156:FHOD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 34340651 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34340571_34340745:FHOD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 43573589 T/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000152229:ENST00000409746:exon_43573571_43573669:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000360076:exon_43573571_43573669:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000282045:exon_43573571_43573669:PSTPIP2;ENSG00000152229:ENST00000494782:exon_43573571_43573940:PSTPIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 43667349 A/G 1 652 686 1338 309.839854317537 360.002852665904 -50.1629983483673 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 0.00618638680358862 ENSG00000152234:ENST00000282050:exon_43667307_43667458:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000398752:exon_43667307_43667458:ATP5A1;ENSG00000152234:ENST00000483666:exon_43667307_43667458:ATP5A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 47017145 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 47796415 T/C 1 3 11 14 1.42564350146106 5.77264049464278 -4.34699699318172 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0291103619486302 ENSG00000141644:ENST00000339998:exon_47796381_47796455:MBD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 47810351 A/G 1 33 35 68 15.6820785160717 18.3674924829543 -2.68541396688264 A:G A G 10 0.52478549951298 0.545119738161036 ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 47911631 A/G 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47911586_47911723:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000494518:exon_47911586_47911723:SKA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 47918536 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000154839:ENST00000285116:exon_47918469_47920543:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000398452:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000417656:exon_47918469_47920534:SKA1;ENSG00000154839:ENST00000488454:exon_47918469_47918621:SKA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 51820562 A/G 1 17 13 30 8.07864650827934 6.82221149366874 1.2564350146106 A:G A G 10 0.52478549951298 0.716625660711107 ENSG00000101751:ENST00000406285:exon_51820019_51824602:POLI;ENSG00000101751:ENST00000217800:exon_51820019_51821101:POLI HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 54293658 T/C 1 129 133 262 61.3026705628256 69.7964714352264 -8.49380087240078 T:C T C 10 0.52478549951298 0.293873597489872 ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 55268866 C/T 1 102 98 200 48.471879049676 51.428978952272 -2.95709990259601 T:C C T 10 0.52478549951298 0.723444781911328 ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 56149048 A/G 1 11 2 13 5.22735950535722 1.04957099902596 4.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0245324962404463 ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56148479_56149271:ALPK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 56824846 A/G 1 271 164 435 128.783129631982 86.0648219201287 42.7183077118537 A:T:G A G 10 0.52478549951298 4.27020983190175e-05 ENSG00000166562:ENST00000299714:exon_56824840_56824897:SEC11C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 57022754 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57022736_57022890:LMAN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 57026361 A/G 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57026263_57026503:LMAN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61570551 C/T 1 2 16 18 0.95042900097404 8.39656799220768 -7.44613899123364 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000474579255658098 ENSG00000197632:ENST00000299502:exon_61570135_61571124:SERPINB2;ENSG00000197632:ENST00000457692:exon_61570135_61571113:SERPINB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61582751 T/G 1 22 22 44 10.4547190107144 11.5452809892856 -1.09056197857112 T:G T G 10 0.52478549951298 0.764673753237629 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61582867 A/G 1 15 16 31 7.1282175073053 8.39656799220768 -1.26835048490238 A:G A G 10 0.52478549951298 0.720494209048114 ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61587067 C/T 1 9 16 25 4.27693050438318 8.39656799220768 -4.1196374878245 T:C C T 10 0.52478549951298 0.111379558353423 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61597418 C/T 1 18 24 42 8.55386100876636 12.5948519883115 -4.04099097954516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.220376193216487 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61597279_61597421:SERPINB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61600384 C/T 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61600282_61600437:SERPINB10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61647069 G/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000221887:ENST00000481726:exon_61647035_61647172:HMSD;ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000397988:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000448851:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000441827:exon_61647035_61647172:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61647042_61647172:SERPINB8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 61654297 A/G 1 56 29 85 26.6120120272731 15.2187794858764 11.3932325413967 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0163909495493426 ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 67718688 A/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000176225:ENST00000255674:exon_67718647_67718784:RTTN;ENSG00000176225:ENST00000454359:exon_67718647_67718784:RTTN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 67993519 G/A 1 3 9 12 1.42564350146106 4.72306949561682 -3.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0806544853661951 ENSG00000170677:ENST00000397942:exon_67991779_67997436:SOCS6;ENSG00000170677:ENST00000302056:exon_67991778_67994308:SOCS6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 72180828 C/T 1 55 67 122 26.1367975267861 35.1606284673697 -9.02383094058357 T:C C T 10 0.52478549951298 0.103629338181122 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72180794_72180954:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72180794_72180954:CNDP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 72183618 C/T 1 82 63 145 38.9675890399356 33.0614864693177 5.9061025706179 T:C C T 10 0.52478549951298 0.360516315358049 ENSG00000133313:ENST00000324262:exon_72183463_72183627:CNDP2;ENSG00000133313:ENST00000324301:exon_72183463_72183627:CNDP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 72999563 T/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000179981:ENST00000322038:exon_72997403_73001905:TSHZ1;ENSG00000179981:ENST00000397892:exon_72996173_73001026:TSHZ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 77137267 G/A 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000166377:ENST00000426216:exon_77137247_77138278:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000359184:exon_77137247_77137491:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000440332:exon_77137247_77138278:ATP9B;ENSG00000166377:ENST00000307671:exon_77137247_77137387:ATP9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 77227591 A/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:C A C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 77663940 G/A 1 27 26 53 12.8307915131495 13.6444229873375 -0.813631474187943 A:G G A 10 0.52478549951298 0.890888380518446 ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77662420_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77662421_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77663578_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77662488_77664183:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77662515_77664183:PQLC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 77805856 A/C 1 40 37 77 19.0085800194808 19.4170634819803 -0.408483462499461 A:C:G A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 18 77805949 A/C 1 63 63 126 29.9385135306823 33.0614864693177 -3.12297293863548 A:C A C 10 0.52478549951298 0.593436025537947 ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 334474 T/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:G T G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_334400_334542:MIER2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 617614 G/A 1 67 67 134 31.8393715326303 35.1606284673697 -3.32125693473932 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.604085180194962 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_617570_617655:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_617570_617655:POLRMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 621070 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 621567 C/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 C:G C G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 622368 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_622149_622373:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_622149_622373:POLRMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 677934 C/T 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:C C T 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000070404:ENST00000166139:exon_677792_677977:FSTL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 681417 C/T 1 15 9 24 7.1282175073053 4.72306949561682 2.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.414765733374574 ENSG00000070404:ENST00000166139:exon_681333_681560:FSTL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 804079 T/C 1 69 53 122 32.7898005336044 27.8136314741879 4.97616905941643 T:C T C 10 0.52478549951298 0.414721571861621 ENSG00000011304:ENST00000356948:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000394601:exon_804036_804208:PTBP1;ENSG00000011304:ENST00000349038:exon_804036_804208:PTBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 880066 G/A 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 885818 A/G 1 31 25 56 14.7316495150976 13.1196374878245 1.61201202727312 A:G A G 10 0.52478549951298 0.690279186689431 ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_885770_886201:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_885770_886201:MED16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 964974 C/G 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 C:G C G 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_964833_965080:ARID3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 966714 A/G 1 16 12 28 7.60343200779232 6.29742599415576 1.30600601363656 A:G A G 10 0.52478549951298 0.706796378801608 ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1010396 G/C 1 38 29 67 18.0581510185068 15.2187794858764 2.83937153263034 C:G G C 10 0.52478549951298 0.541524330751837 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1010745 C/T 1 77 43 120 36.5915165375005 22.5657764790581 14.0257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0104468957694869 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1009650_1010894:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1009650_1010894:C19orf6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1014377 A/G 1 28 23 51 13.3060060136366 12.0700664887985 1.23593952483802 A:G A G 10 0.52478549951298 0.78019325006684 ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1036456 C/G 1 186 123 309 88.3898970905857 64.5486164400965 23.8412806504892 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00733451687834138 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1036468 A/G 1 174 124 298 82.6873230847415 65.0734019396095 17.613921145132 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0423735335483191 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1037941 G/T 1 130 47 177 61.7778850633126 24.6649184771101 37.1129665862025 A:T:G G T 10 0.52478549951298 1.58626702207736e-08 ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1037624_1039060:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1037624_1039060:CNN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1068734 T/C 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1068738 G/A 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1080311 G/C 1 68 64 132 32.3145860331174 33.5862719688307 -1.27168593571336 C:G G C 10 0.52478549951298 0.86180575779895 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1084314 G/C 1 71 69 140 33.7402295345784 36.2101994663956 -2.4699699318172 A:C:G G C 10 0.52478549951298 0.735137733086082 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1084237_1084345:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1084237_1084345:HMHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1084336 G/A 1 80 86 166 38.0171600389616 45.1315529581163 -7.11439291915468 A:G G A 10 0.52478549951298 0.277368155450384 ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1084237_1084345:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1084237_1084345:HMHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1110829 G/A 1 13 13 26 6.17778850633126 6.82221149366874 -0.644422987337482 A:G G A 10 0.52478549951298 0.846079846003371 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1110744_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1110711_1110887:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1110744_1110887:SBNO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1119019 C/T 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1119010_1119163:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1119010_1119163:SBNO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1438865 C/T 1 646 1918 2564 306.988567314615 1006.5385880659 -699.550020751281 T:C C T 10 0.52478549951298 3.57688919199869e-174 ENSG00000115268:ENST00000233609:exon_1438806_1438891:RPS15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1621901 G/A 1 14 25 39 6.65300300681828 13.1196374878245 -6.46663448100622 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0529651995530018 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1621837_1621969:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1621837_1621969:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1621837_1621969:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1621837_1621969:TCF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1632065 T/C 1 14 5 19 6.65300300681828 2.6239274975649 4.02907550925338 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0696868086487943 ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1632037_1632115:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1632037_1632115:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1632037_1632115:TCF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1987573 C/G 1 19 27 46 9.02907550925338 14.1692084868505 -5.14013297759708 C:G C G 10 0.52478549951298 0.141192387384879 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1987499_1987691:BTBD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1997375 G/A 1 8 10 18 3.80171600389616 5.2478549951298 -1.44613899123364 A:G G A 10 0.52478549951298 0.638292165920428 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 1997383 G/A 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1997343_1997462:BTBD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2078409 A/G 1 17 29 46 8.07864650827934 15.2187794858764 -7.14013297759708 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0387636145816206 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2078488 T/C 1 28 19 47 13.3060060136366 9.97092449074662 3.33508152288994 T:C T C 10 0.52478549951298 0.381777744637033 ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2097016 C/A 1 6 14 20 2.85128700292212 7.34699699318172 -4.4957099902596 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0705713243302927 ENSG00000099840:ENST00000395307:exon_2096380_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000481489:exon_2096380_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2096858_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2096858_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000300960:exon_2096868_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395296:exon_2096868_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2096892_2097161:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395301:exon_2096945_2097161:IZUMO4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2097425 T/C 1 22 19 41 10.4547190107144 9.97092449074662 0.48379451996782 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000099840:ENST00000395307:exon_2097423_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000481489:exon_2097251_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2097423_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2097423_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000300960:exon_2097423_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395296:exon_2097423_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2097251_2097494:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395301:exon_2097423_2097494:IZUMO4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2098980 G/A 1 19 10 29 9.02907550925338 5.2478549951298 3.78122051412358 A:G G A 10 0.52478549951298 0.193868828897936 ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2098975_2099109:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000395301:exon_2098975_2099028:IZUMO4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2116649 A/G 1 18 14 32 8.55386100876636 7.34699699318172 1.20686401558464 A:G A G 10 0.52478549951298 0.725609418966872 ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2223327 G/A 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000440640:exon_2223280_2223485:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2223280_2223485:DOT1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2417991 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2808364 G/A 1 56 43 99 26.6120120272731 22.5657764790581 4.04623554821498 A:G G A 10 0.52478549951298 0.423043622139588 ENSG00000172009:ENST00000307741:exon_2808241_2808442:THOP1;ENSG00000172009:ENST00000395212:exon_2808241_2808442:THOP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2853803 G/A 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000186300:ENST00000334241:exon_2852378_2857682:ZNF555;ENSG00000186300:ENST00000382127:exon_2853681_2853950:ZNF555 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 2934590 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000175691:ENST00000314531:exon_2933217_2934813:ZNF77 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3148645 G/A 1 9 12 21 4.27693050438318 6.29742599415576 -2.02049548977258 A:G G A 10 0.52478549951298 0.392119223984021 ENSG00000060558:ENST00000262958:exon_3148589_3148773:GNA15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3530822 G/A 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000105325:ENST00000441788:exon_3530790_3530855:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000395095:exon_3530790_3530855:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000221926:exon_3530790_3530855:FZR1;ENSG00000105325:ENST00000313639:exon_3530790_3530855:FZR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3544865 G/A 1 38 11 49 18.0581510185068 5.77264049464278 12.285510523864 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000466688547221123 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3544867 C/T 1 38 12 50 18.0581510185068 6.29742599415576 11.760725024351 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000935935527301414 ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3751531 C/T 1 19 17 36 9.02907550925338 8.92135349172066 0.107722017532719 A:T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3751187_3751551:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3751432_3751551:APBA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3752509 G/A 1 16 21 37 7.60343200779232 11.0204954897726 -3.41706348198026 A:G G A 10 0.52478549951298 0.323510923668804 ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752506_3752718:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752506_3752718:APBA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3961054 G/A 1 16 9 25 7.60343200779232 4.72306949561682 2.8803625121755 A:G G A 10 0.52478549951298 0.317499389351278 ENSG00000167657:ENST00000301264:exon_3961007_3961159:DAPK3;ENSG00000167657:ENST00000442766:exon_3961007_3961159:DAPK3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 3969725 C/A 1 27 19 46 12.8307915131495 9.97092449074662 2.85986702240292 A:C C A 10 0.52478549951298 0.461330562759834 ENSG00000167657:ENST00000301264:exon_3969672_3969826:DAPK3;ENSG00000167657:ENST00000442766:exon_3969672_3969826:DAPK3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4028783 C/T 1 13 14 27 6.17778850633126 7.34699699318172 -1.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.702688159671681 ENSG00000105229:ENST00000262971:exon_4028718_4028846:PIAS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4101062 G/T 1 37 40 77 17.5829365180197 20.9914199805192 -3.40848346249946 T:G G T 10 0.52478549951298 0.493900949111606 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000481271:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000465472:exon_4101017_4101141:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000472395:exon_4100962_4101141:MAP2K2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4117528 G/A 1 57 46 103 27.0872265277601 24.1401329775971 2.94709355016306 A:G G A 10 0.52478549951298 0.622074343198561 ENSG00000126934:ENST00000262948:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000394867:exon_4117417_4117627:MAP2K2;ENSG00000126934:ENST00000443189:exon_4117417_4117627:MAP2K2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4174742 C/T 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000077463:ENST00000337491:exon_4174106_4174943:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000305232:exon_4174106_4174943:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000381935:exon_4174106_4174943:SIRT6;ENSG00000077463:ENST00000269860:exon_4174106_4174943:SIRT6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4231323 C/T 1 34 31 65 16.1572930165587 16.2683504849024 -0.111057468343702 T:C:G C T 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4236996 G/A 1 416 454 870 197.6892322026 238.252616778893 -40.5633845762926 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00596231476616712 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4237067 A/G 1 587 639 1226 278.950911785881 335.337934188794 -56.3870224029135 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00135296608282104 ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4254375 C/T 1 28 30 58 13.3060060136366 15.7435649853894 -2.43755897175284 T:C C T 10 0.52478549951298 0.599384342945433 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4262036 C/T 1 21 8 29 9.97950451022742 4.19828399610384 5.78122051412358 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0395624295785671 ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4325433 G/A 1 9 17 26 4.27693050438318 8.92135349172066 -4.64442298733748 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0780923127618802 ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4364217 A/C 1 17 20 37 8.07864650827934 10.4957099902596 -2.41706348198026 A:C A C 10 0.52478549951298 0.510929977310349 ENSG00000141985:ENST00000417295:exon_4364085_4364218:SH3GL1;ENSG00000141985:ENST00000269886:exon_4364085_4364218:SH3GL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4432101 C/T 1 27 23 50 12.8307915131495 12.0700664887985 0.760725024350998 T:C C T 10 0.52478549951298 0.887893684366438 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4431949_4432204:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4431949_4432126:CHAF1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4433412 A/G 1 20 20 40 9.5042900097404 10.4957099902596 -0.991419980519201 A:G A G 10 0.52478549951298 0.754759456452808 ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4433067_4433536:CHAF1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4852137 C/T 1 19 23 42 9.02907550925338 12.0700664887985 -3.04099097954516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.358529248382525 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 4859937 T/C 1 30 28 58 14.2564350146106 14.6939939863634 -0.437558971752843 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4859838_4860036:PLIN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 5915151 C/T 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6364500 G/A 1 110 116 226 52.2735950535722 60.8751179435057 -8.60152288993349 A:G G A 10 0.52478549951298 0.25811621778297 ENSG00000125656:ENST00000245816:exon_6364463_6364650:CLPP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6454651 T/C 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6454570_6454728:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6454570_6454728:SLC25A23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6458240 G/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 C:G G C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000125648:ENST00000264088:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000422102:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000441950:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000301454:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000414491:exon_6458209_6458335:SLC25A23;ENSG00000125648:ENST00000334510:exon_6458209_6458335:SLC25A23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6468959 C/A 1 40 31 71 19.0085800194808 16.2683504849024 2.74022953457842 A:C C A 10 0.52478549951298 0.553621433032812 ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468857_6468964:DENND1C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6531285 G/T 1 25 24 49 11.8803625121755 12.5948519883115 -0.714489476136023 T:G G T 10 0.52478549951298 0.886764752655988 ENSG00000125657:ENST00000245817:exon_6531010_6531314:TNFSF9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6669934 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000125735:ENST00000245912:exon_6669862_6670169:TNFSF14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6677989 G/A 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 A:G G A 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000125730:ENST00000245907:exon_6677846_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000428815:exon_6677846_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000467528:exon_6677852_6678034:C3;ENSG00000125730:ENST00000482039:exon_6677878_6678034:C3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 6732382 G/A 1 44 27 71 20.9094380214289 14.1692084868505 6.74022953457842 A:G G A 10 0.52478549951298 0.122546850506547 ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6732274_6732391:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6732274_6732391:GPR108 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7623878 G/A 1 28 36 64 13.3060060136366 18.8922779824673 -5.58627196883072 A:G G A 10 0.52478549951298 0.170295695006267 ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7623736_7624037:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7623736_7624037:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7623736_7624037:PNPLA6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7694393 G/A 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7694363_7694439:XAB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7707369 G/A 1 43 37 80 20.4342235209419 19.4170634819803 1.0171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.910962339305574 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7707315_7707422:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7707315_7707422:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7707315_7707422:STXBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7711221 T/C 1 62 53 115 29.4632990301952 27.8136314741879 1.64966755600729 T:C T C 10 0.52478549951298 0.780069751933286 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7712364 A/G 1 80 59 139 38.0171600389616 30.9623444712658 7.05481556769578 A:G A G 10 0.52478549951298 0.235768718241673 ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7712240_7712397:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7712240_7712397:STXBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7712417 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7712425 G/C 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 C:G G C 10 0.52478549951298 0.533213489784507 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7754222 G/A 1 812 782 1594 385.87417439546 410.38226061915 -24.5080862236902 A:G G A 10 0.52478549951298 0.219262277199706 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7763248 G/A 1 1784 1578 3362 847.782668868844 828.111518231482 19.6711506373612 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.500703288557999 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7763703 A/G 1 888 1117 2005 421.990476432474 586.185402955999 -164.194926523525 A:G A G 10 0.52478549951298 2.34377395249735e-13 ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763627_7763740:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763627_7763740:FCER2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 7987428 C/T 1 15 19 34 7.1282175073053 9.97092449074662 -2.84270698344132 T:C C T 10 0.52478549951298 0.391458331329885 ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7987330_7988134:SNAPC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8121360 A/G 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G A G 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121250_8121383:CCL25 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8326866 C/T 1 57 49 106 27.0872265277601 25.714489476136 1.37273705162411 T:C C T 10 0.52478549951298 0.845968901634078 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8326904 G/A 1 68 85 153 32.3145860331174 44.6067674586033 -12.2921814254859 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0518391652644729 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8326944 G/A 1 78 56 134 37.0667310379876 29.3879879727269 7.67874306526068 A:G G A 10 0.52478549951298 0.195040467290621 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8326999 C/T 1 33 16 49 15.6820785160717 8.39656799220768 7.28551052386398 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0444916005471102 ENSG00000090661:ENST00000251363:exon_8326814_8327305:LASS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8468349 C/T 1 55 60 115 26.1367975267861 31.4871299707788 -5.35033244399271 T:C C T 10 0.52478549951298 0.350673975141117 ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8495733 C/T 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 T:C C T 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000099785:ENST00000215555:exon_8495542_8495751:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000393944:exon_8495542_8495751:MARCH2;ENSG00000099785:ENST00000429675:exon_8495542_8495751:MARCH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8576670 C/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8576501_8576844:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8576501_8576844:ZNF414 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8578035 T/C 1 15 15 30 7.1282175073053 7.8717824926947 -0.743564985389401 T:C T C 10 0.52478549951298 0.855855880845914 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8578118 A/G 1 8 10 18 3.80171600389616 5.2478549951298 -1.44613899123364 A:G A G 10 0.52478549951298 0.638292165920428 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8578199 T/C 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 T:C T C 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8591778 G/T 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:G G T 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8591673_8591819:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8591673_8591819:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8591673_8591819:MYO1F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8591779 C/T 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8591673_8591819:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8591673_8591819:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8591673_8591819:MYO1F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 8591786 C/G 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 C:G C G 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8591673_8591819:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8591673_8591819:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8591673_8591819:MYO1F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 9524185 A/G 1 24 45 69 11.4051480116885 23.6153474780841 -12.2101994663956 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00361604605368661 ENSG00000174652:ENST00000361151:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000361451:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000437513:exon_9523272_9525396:ZNF266;ENSG00000174652:ENST00000393865:exon_9524180_9524218:ZNF266 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 9677546 C/T 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197961:ENST00000320451:exon_9676292_9677785:ZNF121 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 9939092 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10197631 G/A 1 19 20 39 9.02907550925338 10.4957099902596 -1.46663448100622 A:G G A 10 0.52478549951298 0.748956128215546 ENSG00000130813:ENST00000253110:exon_10197605_10197728:C19orf66 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10370444 A/C 1 300 250 550 142.564350146106 131.196374878245 11.367975267861 A:T:C A C 10 0.52478549951298 0.347655892711584 ENSG00000105364:ENST00000253099:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000307422:exon_10370293_10370719:MRPL4;ENSG00000105364:ENST00000393733:exon_10369285_10370736:MRPL4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10381827 A/C 1 26 24 50 12.3555770126625 12.5948519883115 -0.239274975649003 A:C A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10381517_10381902:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10381517_10381902:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10381517_10381902:ICAM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10426422 A/C 1 8 10 18 3.80171600389616 5.2478549951298 -1.44613899123364 A:C A C 10 0.52478549951298 0.638292165920428 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10426628 T/C 1 8 13 21 3.80171600389616 6.82221149366874 -3.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.197956855238699 ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10433379 T/C 1 13 19 32 6.17778850633126 9.97092449074662 -3.79313598441536 T:C T C 10 0.52478549951298 0.215829689406453 ENSG00000161847:ENST00000293677:exon_10433321_10433415:RAVER1;ENSG00000161847:ENST00000331131:exon_10433321_10433415:RAVER1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10444603 C/G 1 551 507 1058 261.843189768348 266.066248253081 -4.22305848473286 A:C:G C G 10 0.52478549951298 0.805523459825782 ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10464674 A/G 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 A:G A G 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10476262 G/A 1 13 14 27 6.17778850633126 7.34699699318172 -1.16920848685046 A:G G A 10 0.52478549951298 0.702688159671681 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10476193_10476574:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10476193_10476574:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10476193_10476574:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10476193_10476574:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525220:exon_10476193_10476539:TYK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10477132 C/T 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10477206 G/A 1 9 13 22 4.27693050438318 6.82221149366874 -2.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.29401621168529 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10477093_10477256:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10477093_10477256:TYK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10489072 C/T 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:C C T 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10488890_10489184:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000531836:exon_10488890_10489102:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530829:exon_10488890_10489102:TYK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10574495 C/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000065989:ENST00000380702:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000352831:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000293683:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000440014:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000419866:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000344979:exon_10574469_10574651:PDE4A;ENSG00000065989:ENST00000380686:exon_10574469_10574689:PDE4A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10599965 G/A 1 48 32 80 22.810296023377 16.7931359844154 6.0171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.181461663448587 ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10599868_10600044:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10599868_10600044:KEAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10659659 C/T 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10668383 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10668481 C/T 1 9 21 30 4.27693050438318 11.0204954897726 -6.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0165799937885591 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10670184 C/G 1 31 33 64 14.7316495150976 17.3179214839283 -2.58627196883072 C:G C G 10 0.52478549951298 0.533754258960136 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10670035_10670205:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10670035_10670205:KRI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10672493 C/T 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10672467_10672521:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000432197:exon_10672467_10672521:KRI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10676423 G/A 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10676393_10676466:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10676393_10676696:KRI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10742831 C/T 1 17 9 26 8.07864650827934 4.72306949561682 3.35557701266252 T:C C T 10 0.52478549951298 0.239108469053992 ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742720_10742832:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742720_10742832:SLC44A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 10883234 C/T 1 13 18 31 6.17778850633126 9.44613899123364 -3.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.281875265233125 ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10883155_10883304:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10883155_10883304:DNM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11031582 G/A 1 81 76 157 38.4923745394486 39.8836979629865 -1.39132342353786 A:G G A 10 0.52478549951298 0.873104068540373 ENSG00000142453:ENST00000327064:exon_11031510_11031622:CARM1;ENSG00000142453:ENST00000344150:exon_11031510_11031622:CARM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11034813 C/A 1 13 10 23 6.17778850633126 5.2478549951298 0.929933511201459 A:C C A 10 0.52478549951298 0.83534679528769 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11034837 A/G 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 A:G A G 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000130733:ENST00000393508:exon_11034752_11034868:YIPF2;ENSG00000130733:ENST00000253031:exon_11034752_11034868:YIPF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11224265 A/G 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11332901 G/A 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11332785_11332924:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11332785_11332924:DOCK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11465316 G/C 1 9 19 28 4.27693050438318 9.97092449074662 -5.69399398636344 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0368587069089518 ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11560170 C/T 1 235 249 484 111.67540761445 130.671589378732 -18.9961817642823 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0920995313357135 ENSG00000130175:ENST00000412601:exon_11560081_11560243:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000252455:exon_11560081_11560243:PRKCSH;ENSG00000130175:ENST00000436195:exon_11560081_11560243:PRKCSH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11618526 C/T 1 41 21 62 19.4837945199678 11.0204954897726 8.46329903019524 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0410271885951603 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11618568 C/T 1 29 15 44 13.7812205141236 7.8717824926947 5.90943802142888 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0958514756695464 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 11618623 T/C 1 18 18 36 8.55386100876636 9.44613899123364 -0.892277982467281 T:C T C 10 0.52478549951298 0.86782438382635 ENSG00000130159:ENST00000270517:exon_11618517_11618665:ECSIT;ENSG00000130159:ENST00000417981:exon_11618517_11618665:ECSIT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 12256358 T/G 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:G T G 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000213297:ENST00000434822:exon_12256073_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000455799:exon_12255705_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000355738:exon_12255711_12257039:ZNF625;ENSG00000213297:ENST00000439556:exon_12256080_12257039:ZNF625 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 12763199 G/A 1 87 117 204 41.3436615423707 61.3999034430187 -20.0562419006479 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.00502443097630682 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12763177_12763274:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12763177_12763274:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12763177_12763274:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000433513:exon_12763177_12763274:MAN2B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 12772165 G/A 1 50 49 99 23.760725024351 25.714489476136 -1.95376445178503 A:G G A 10 0.52478549951298 0.762920861088677 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 12774529 C/T 1 16 12 28 7.60343200779232 6.29742599415576 1.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.706796378801608 ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774517_12774649:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774517_12774649:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774517_12774649:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774517_12774649:MAN2B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 12989560 G/A 1 47 76 123 22.3350815228899 39.8836979629865 -17.5486164400965 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00201838332676949 ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13051161 T/C 1 940 1094 2034 446.701630457799 574.1153364672 -127.413706009401 T:C T C 10 0.52478549951298 1.64747081798187e-08 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13051057_13051266:CALR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13054781 G/T 1 689 812 1501 327.422790835557 426.12582560454 -98.703034768983 A:T:G G T 10 0.52478549951298 3.45880411337256e-07 ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13067829 G/A 1 122 104 226 57.9761690594164 54.5776919493499 3.39847711006651 A:G G A 10 0.52478549951298 0.689578766148726 ENSG00000179271:ENST00000316939:exon_13067677_13068050:GADD45GIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13246957 C/T 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13246014_13246967:NACC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13249244 A/G 1 20 24 44 9.5042900097404 12.5948519883115 -3.09056197857112 A:G A G 10 0.52478549951298 0.368617444093245 ENSG00000160877:ENST00000292431:exon_13248961_13251955:NACC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13260397 T/C 1 32 32 64 15.2068640155846 16.7931359844154 -1.58627196883072 T:C T C 10 0.52478549951298 0.708947130415569 ENSG00000104915:ENST00000242770:exon_13260313_13260407:STX10;ENSG00000104915:ENST00000343587:exon_13260387_13260407:STX10;ENSG00000104915:ENST00000440593:exon_13260313_13260407:STX10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13869942 G/A 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000104957:ENST00000221554:exon_13869914_13870086:CCDC130 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13883099 A/G 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 A:G A G 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 13915817 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000132003:ENST00000254323:exon_13915606_13915962:ZSWIM4;ENSG00000132003:ENST00000440752:exon_13915606_13915962:ZSWIM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 14038842 C/T 1 13 13 26 6.17778850633126 6.82221149366874 -0.644422987337482 T:C C T 10 0.52478549951298 0.846079846003371 ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000254346:exon_14038706_14038843:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14038706_14038843:CC2D1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 14499613 C/T 1 36 30 66 17.1077220175327 15.7435649853894 1.36415703214332 T:C C T 10 0.52478549951298 0.805682517620945 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14499514_14499630:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14499514_14499630:CD97 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 14512260 A/T 1 33 29 62 15.6820785160717 15.2187794858764 0.463299030195238 A:T A T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000123146:ENST00000357355:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000358600:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000242786:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000434474:exon_14512198_14512375:CD97;ENSG00000123146:ENST00000393059:exon_14512198_14512375:CD97 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 14552020 C/T 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14551955_14552255:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14551955_14552255:PKN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 14582584 C/T 1 54 77 131 25.6615830262991 40.4084834624995 -14.7469004362004 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0110009169305985 ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14582393_14582671:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14582393_14582678:PKN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 15227030 G/A 1 30 24 54 14.2564350146106 12.5948519883115 1.66158302629908 A:G G A 10 0.52478549951298 0.684555399299757 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534806:exon_15226812_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000524779:exon_15226963_15227132:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000525880:exon_15226696_15227132:ILVBL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 15229993 A/G 1 28 16 44 13.3060060136366 8.39656799220768 4.90943802142888 A:C:G A G 10 0.52478549951298 0.173825979313300 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 15230012 G/A 1 26 13 39 12.3555770126625 6.82221149366874 5.53336551899378 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0798049895442294 ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15229977_15230113:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15229977_15230113:ILVBL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 15562565 C/T 1 91 81 172 43.2445195443188 42.5076254605514 0.736894083767439 T:C C T 10 0.52478549951298 0.93923372164679 ENSG00000105122:ENST00000343625:exon_15562438_15562749:RASAL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 16197320 T/C 1 102 97 199 48.471879049676 50.9041934527591 -2.43231440308303 T:C T C 10 0.52478549951298 0.776573510441615 ENSG00000167460:ENST00000344824:exon_16197233_16197350:TPM4;ENSG00000167460:ENST00000300933:exon_16197233_16197350:TPM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 16259623 C/T 1 14 19 33 6.65300300681828 9.97092449074662 -3.31792148392834 T:C C T 10 0.52478549951298 0.296397632638428 ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 16643426 A/G 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000085872:ENST00000198939:exon_16643409_16643560:CHERP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17163661 C/T 1 21 16 37 9.97950451022742 8.39656799220768 1.58293651801974 T:C C T 10 0.52478549951298 0.625646683163687 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17170885 C/T 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17212992 C/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17212466_17213367:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17212466_17213367:MYO9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17664418 G/A 1 14 11 25 6.65300300681828 5.77264049464278 0.880362512175499 A:G G A 10 0.52478549951298 0.842068649003874 ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17692231 G/T 1 15 14 29 7.1282175073053 7.34699699318172 -0.218779485876421 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130309:ENST00000252599:exon_17691986_17693965:GLT25D1;ENSG00000130309:ENST00000379714:exon_17692228_17692260:GLT25D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17835962 G/C 1 8 16 24 3.80171600389616 8.39656799220768 -4.59485198831152 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0674167221169488 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17835858_17835998:MAP1S HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17837806 C/A 1 11 18 29 5.22735950535722 9.44613899123364 -4.21877948587642 A:C C A 10 0.52478549951298 0.137604556279207 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17837981 A/G 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17945944 G/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000105639:ENST00000458235:exon_17945892_17946024:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000527670:exon_17945892_17946024:JAK3;ENSG00000105639:ENST00000534444:exon_17945892_17946024:JAK3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17949204 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 17949240 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 18047283 T/G 1 135 157 292 64.1539575657477 82.3913234235379 -18.2373658577902 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0348297667863317 ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 18123738 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000105643:ENST00000379656:exon_18123722_18124903:ARRDC2;ENSG00000105643:ENST00000222250:exon_18123722_18124903:ARRDC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 18170680 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 18286008 G/C 1 898 879 1777 426.742621437344 461.286454071909 -34.5438326345655 A:T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.101296211136849 ENSG00000216490:ENST00000407280:exon_18285850_18286032:IFI30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 18561420 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18561287_18561785:ELL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19010736 G/A 1 392 423 815 186.284084190912 221.984266293991 -35.7001821030787 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0127469704475438 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19010682_19010756:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19010682_19010756:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19010682_19010756:COPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19017862 G/A 1 203 223 426 96.4685435988651 117.027166391395 -20.5586227925295 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0467931140960062 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19017769_19017921:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19017769_19017921:COPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19023853 T/C 1 174 176 350 82.6873230847415 92.3622479142845 -9.674924829543 T:C T C 10 0.52478549951298 0.309487476808568 ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19023793_19023855:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19023793_19023855:COPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19115078 G/A 1 20 14 34 9.5042900097404 7.34699699318172 2.15729301655868 A:G G A 10 0.52478549951298 0.496104598259199 ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19114977_19115082:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19114977_19115455:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19114977_19115082:SUGP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19241071 C/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:C C A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000064545:ENST00000162044:exon_19240965_19241116:TMEM161A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19390185 G/A 1 36 48 84 17.1077220175327 25.189703976623 -8.08198195909032 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0811309819830483 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19390022_19390199:SUGP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19416695 G/A 1 7 13 20 3.32650150340914 6.82221149366874 -3.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.124132788642938 ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19416658_19416885:SUGP1;ENSG00000105705:ENST00000334782:exon_19416658_19416885:SUGP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 19741160 G/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:G G T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 20003420 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000355095:exon_20003002_20003556:ZNF90 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 21300609 C/A 1 4 15 19 1.90085800194808 7.8717824926947 -5.97092449074662 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00949811149698198 ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 21720616 T/C 1 12 2 14 5.70257400584424 1.04957099902596 4.65300300681828 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0144267334739653 ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 21909512 T/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:C T C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000197020:ENST00000358296:exon_21906844_21910791:ZNF100;ENSG00000197020:ENST00000445015:exon_21906844_21910791:ZNF100 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 23543095 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 23545447 A/G 1 3 9 12 1.42564350146106 4.72306949561682 -3.29742599415576 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0806544853661951 ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 23837321 A/C 1 9 12 21 4.27693050438318 6.29742599415576 -2.02049548977258 A:C A C 10 0.52478549951298 0.392119223984021 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 23837365 A/C 1 7 11 18 3.32650150340914 5.77264049464278 -2.44613899123364 A:C A C 10 0.52478549951298 0.345641696182350 ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 23926708 A/G 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 30193721 G/A 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 33075916 G/A 1 332 310 642 157.771214161691 162.683504849024 -4.91229068733318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.722144346986531 ENSG00000105185:ENST00000221784:exon_33075856_33075917:PDCD5;ENSG00000105185:ENST00000419343:exon_33075856_33075917:PDCD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 33450806 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33450806_33450964:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33450806_33450964:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000427840:exon_33450806_33450964:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000415324:exon_33450806_33450964:CCDC123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 33617583 C/T 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:C C T 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33617494_33617639:GPATCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 33870574 A/C 1 68 52 120 32.3145860331174 27.288845974675 5.02574005844239 A:C A C 10 0.52478549951298 0.36271214315786 ENSG00000153879:ENST00000284000:exon_33870050_33873591:CEBPG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 33980943 G/A 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000124299:ENST00000397032:exon_33980902_33980963:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000436370:exon_33980902_33980963:PEPD;ENSG00000124299:ENST00000244137:exon_33980902_33980963:PEPD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 34890198 G/C 1 652 610 1262 309.839854317537 320.119154702918 -10.2793003853808 T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.573011281709548 ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34890112_34890240:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34890112_34890240:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34890112_34890240:GPI HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 34895649 C/T 1 35 24 59 16.6325075170457 12.5948519883115 4.03765552873418 T:C C T 10 0.52478549951298 0.300730543509844 ENSG00000126249:ENST00000246535:exon_34895554_34895720:PDCD2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 34957860 A/G 1 61 64 125 28.9880845297082 33.5862719688307 -4.5981874391225 A:G A G 10 0.52478549951298 0.421451027832743 ENSG00000126261:ENST00000246548:exon_34957783_34957919:UBA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35434986 C/T 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35435589 C/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000168661:ENST00000303586:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000439785:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000426813:exon_35434127_35436074:ZNF30;ENSG00000168661:ENST00000342559:exon_35434996_35435724:ZNF30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35506729 G/A 1 51 14 65 24.235939524838 7.34699699318172 16.8889425316563 A:G G A 10 0.52478549951298 1.78111445255862e-05 ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35506728_35506871:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35506728_35506871:GRAMD1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35648365 T/G 1 95 96 191 45.1453775462669 50.3794079532461 -5.23403040697919 T:G T G 10 0.52478549951298 0.469152170015216 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35648324_35648404:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35648324_35648404:FXYD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35649281 A/G 1 168 185 353 79.8360360818194 97.0853174099013 -17.2492813280819 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0699569663614572 ENSG00000089327:ENST00000423817:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392218:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000496493:exon_35649247_35649303:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35649247_35649303:FXYD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35660546 T/C 1 287 197 484 136.386561639775 103.382743404057 33.0038182357177 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.0026524172933134 ENSG00000089327:ENST00000392219:exon_35660469_35660786:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000342879:exon_35660469_35660783:FXYD5;ENSG00000089327:ENST00000392217:exon_35660469_35660784:FXYD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35758427 C/A 1 49 40 89 23.285510523864 20.9914199805192 2.29409054334478 A:C C A 10 0.52478549951298 0.671789325628924 ENSG00000105699:ENST00000360798:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000354900:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000361790:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000347609:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000443983:exon_35758012_35758637:LSR;ENSG00000105699:ENST00000427250:exon_35758012_35758637:LSR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 35941248 T/A 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:T:G T A 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000126262:ENST00000246549:exon_35940617_35941609:FFAR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36038221 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000105677:ENST00000392205:exon_36038021_36038299:TMEM147 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36205773 G/A 1 77 73 150 36.5915165375005 38.3093414644475 -1.717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.80652939476668 ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36229068 G/A 1 35 30 65 16.6325075170457 15.7435649853894 0.888942531656298 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.901347933907604 ENSG00000105663:ENST00000396924:exon_36228963_36229092:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000222270:exon_36228963_36229092:AD000671.3;ENSG00000105663:ENST00000420124:exon_36228963_36229092:AD000671.3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36387881 A/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000167604:ENST00000352614:exon_36387815_36387960:NFKBID;ENSG00000167604:ENST00000396901:exon_36387815_36387960:NFKBID HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36394272 T/C 1 135 73 208 64.1539575657477 38.3093414644475 25.8446161013001 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000374911427438042 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394253_36394318:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394253_36394318:HCST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36394678 T/C 1 157 99 256 74.6086765764621 51.953764451785 22.6549121246771 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00479727284514387 ENSG00000126264:ENST00000246551:exon_36394674_36394805:HCST;ENSG00000126264:ENST00000437550:exon_36394674_36394805:HCST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36435564 G/A 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G G A 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36435450_36436084:LRFN3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36501480 G/C 1 24 16 40 11.4051480116885 8.39656799220768 3.0085800194808 C:G G C 10 0.52478549951298 0.429013958152278 ENSG00000239382:ENST00000461668:exon_36501469_36501585:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000490483:exon_36501469_36501585:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000490986:exon_36501469_36501585:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000471323:exon_36501469_36504324:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000486389:exon_36501469_36501547:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000378875:exon_36501469_36501585:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000485128:exon_36501469_36501547:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000252984:exon_36501469_36501585:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000497999:exon_36501469_36501585:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000495116:exon_36501469_36501547:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000462793:exon_36501469_36501547:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000392183:exon_36501192_36501947:ALKBH6;ENSG00000239382:ENST00000468004:exon_36501446_36501979:ALKBH6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36605770 G/C 1 68 43 111 32.3145860331174 22.5657764790581 9.74880955405922 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0708115983356207 ENSG00000105258:ENST00000221859:exon_36605700_36606206:POLR2I HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 36727365 G/A 1 39 19 58 18.5333655189938 9.97092449074662 8.56244102824716 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0254712326746145 ENSG00000167635:ENST00000428827:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000456324:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000443387:exon_36726561_36729673:ZNF146;ENSG00000167635:ENST00000301233:exon_36726561_36729673:ZNF146 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 37038416 T/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000186020:ENST00000396897:exon_37034518_37039224:ZNF529;ENSG00000186020:ENST00000334116:exon_37034518_37039224:ZNF529 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 37854040 G/A 1 17 14 31 8.07864650827934 7.34699699318172 0.731649515097619 A:G G A 10 0.52478549951298 0.858434623797302 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 37854235 G/T 1 16 20 36 7.60343200779232 10.4957099902596 -2.89227798246728 T:G G T 10 0.52478549951298 0.404642208275992 ENSG00000181666:ENST00000392153:exon_37853011_37855353:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000414402:exon_37853970_37854677:HKR1;ENSG00000181666:ENST00000324411:exon_37853011_37855355:HKR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 38800165 C/T 1 38 43 81 18.0581510185068 22.5657764790581 -4.50762546055138 T:C C T 10 0.52478549951298 0.319416117245841 ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38800045_38800509:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38800045_38800283:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38800045_38800283:YIF1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39086604 T/C 1 89 97 186 42.2940905433448 50.9041934527591 -8.61010290941429 T:C T C 10 0.52478549951298 0.212606205813411 ENSG00000104814:ENST00000396857:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000423454:exon_39086579_39086641:MAP4K1;ENSG00000104814:ENST00000221409:exon_39086579_39086641:MAP4K1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39191323 C/T 1 34 29 63 16.1572930165587 15.2187794858764 0.938513530682258 T:C C T 10 0.52478549951298 0.899773640702082 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39191240_39191344:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39191240_39191354:ACTN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39220105 G/C 1 107 131 238 50.8479515521111 68.7469004362004 -17.8989488840893 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0229312177729097 ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39219914_39222223:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39220092_39220307:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000440400:exon_39219914_39222223:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000497637:exon_39219914_39220460:ACTN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39369847 G/A 1 29 26 55 13.7812205141236 13.6444229873375 0.136797526786097 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000068903:ENST00000249396:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000392081:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000462654:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000479290:exon_39369197_39371376:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000402684:exon_39369197_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000358931:exon_39369221_39369950:SIRT2;ENSG00000068903:ENST00000456703:exon_39369748_39369897:SIRT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39421274 T/C 1 8 12 20 3.80171600389616 6.29742599415576 -2.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.273886654959245 ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39421110_39421536:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39421110_39421536:FBXO17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39421928 T/C 1 111 117 228 52.7488095540592 61.3999034430187 -8.65109388895945 T:C T C 10 0.52478549951298 0.260062120348946 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39421916_39421983:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39421594_39421983:MRPS12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39423001 T/C 1 112 130 242 53.2240240545462 68.2221149366874 -14.9980908821412 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0617485714112728 ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39664596 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000130669:ENST00000358301:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000321944:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000360442:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000457838:exon_39664216_39664650:PAK4;ENSG00000130669:ENST00000435673:exon_39664216_39664650:PAK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39879071 G/A 1 86 83 169 40.8684470418837 43.5571964595773 -2.68874941769362 A:G G A 10 0.52478549951298 0.700569984081177 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39878979_39879107:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000221266:exon_39878979_39879107:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39878979_39879107:PAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39880011 G/A 1 47 43 90 22.3350815228899 22.5657764790581 -0.2306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000006712:ENST00000221265:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000221266:exon_39879922_39880023:PAF1;ENSG00000006712:ENST00000416728:exon_39879922_39880023:PAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39899139 G/A 1 32 36 68 15.2068640155846 18.8922779824673 -3.68541396688264 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.396746336705929 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39899234 G/A 1 29 33 62 13.7812205141236 17.3179214839283 -3.53670096980476 A:G G A 10 0.52478549951298 0.376592554933219 ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39914748 G/A 1 19 16 35 9.02907550925338 8.39656799220768 0.632507517045699 A:G G A 10 0.52478549951298 0.86707073071707 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39915637 G/A 1 7 18 25 3.32650150340914 9.44613899123364 -6.1196374878245 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0159296995861937 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39915758 C/G 1 12 30 42 5.70257400584424 15.7435649853894 -10.0409909795452 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00285002261094423 ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39914373_39916154:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39914373_39919054:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39914373_39916300:PLEKHG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39923952 G/A 1 4434 3445 7879 2107.10109515945 1807.88604582222 299.215049337231 A:G G A 10 0.52478549951298 1.38526034753041e-11 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39926509 A/C 1 2719 2504 5223 1292.10822682421 1314.0628907805 -21.9546639562946 A:T:C A C 10 0.52478549951298 0.551365943390568 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39926521 G/A 1 2635 2412 5047 1252.1902087833 1265.78262482531 -13.5924160420104 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 0.703577416428705 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39926548 G/A 1 2150 2246 4396 1021.71117604709 1178.66823190615 -156.95705585906 A:G G A 10 0.52478549951298 2.26250846507453e-06 ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39926488_39926618:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39926488_39926576:RPS16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 39955533 G/A 1 48 22 70 22.810296023377 11.5452809892856 11.2650150340914 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00807633285473599 ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39955438_39955689:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39955438_39955689:SUPT5H HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 40329747 C/T 1 390 317 707 185.333655189938 166.357003345615 18.9766518443231 T:C C T 10 0.52478549951298 0.163500812186356 ENSG00000105202:ENST00000221801:exon_40329675_40329845:FBL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 40486606 T/C 1 361 358 719 171.552434675814 187.873208825647 -16.3207741498327 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.232151009048756 ENSG00000013275:ENST00000157812:exon_40486569_40486624:PSMC4;ENSG00000013275:ENST00000455878:exon_40486569_40486624:PSMC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41245351 C/T 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000086544:ENST00000263370:exon_41245262_41246763:ITPKC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41248532 G/A 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000188493:ENST00000378313:exon_41246761_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000469741:exon_41248420_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000470681:exon_41246761_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000420300:exon_41248482_41248675:C19orf54;ENSG00000188493:ENST00000339153:exon_41248457_41248675:C19orf54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41271104 T/C 1 195 131 326 92.6668275949689 68.7469004362004 23.9199271587685 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00905007345360128 ENSG00000077312:ENST00000243563:exon_41270913_41271290:SNRPA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41283365 C/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000213054:ENST00000263369:exon_41283302_41283392:MIA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41884244 A/G 1 26 2 28 12.3555770126625 1.04957099902596 11.3060060136366 A:G A G 10 0.52478549951298 9.25631399149988e-06 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000342187:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000413014:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000436170:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000447302:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41884186_41884424:TMEM91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41884327 T/C 1 5 31 36 2.3760725024351 16.2683504849024 -13.8922779824673 T:C T C 10 0.52478549951298 2.15961892010501e-06 ENSG00000142046:ENST00000392002:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000342187:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000413014:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000436170:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000447302:exon_41884186_41884424:TMEM91;ENSG00000142046:ENST00000356385:exon_41884186_41884424:TMEM91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41916547 C/T 1 28 21 49 13.3060060136366 11.0204954897726 2.28551052386398 T:C C T 10 0.52478549951298 0.568568013394886 ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41931599 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000177191:ENST00000321702:exon_41931265_41932715:B3GNT8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 41944237 T/C 1 29 30 59 13.7812205141236 15.7435649853894 -1.96234447126582 T:C T C 10 0.52478549951298 0.696115773062589 ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 42364907 C/T 1 3006 2814 5820 1428.49478846398 1476.74639562953 -48.2516071655436 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.207702027198728 ENSG00000105372:ENST00000221975:exon_42364845_42364915:RPS19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 42383289 A/G 1 462 493 955 219.549099225003 258.719251259899 -39.1701520348959 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.0114831554716012 ENSG00000105369:ENST00000221972:exon_42383060_42383359:CD79A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 42463447 C/T 1 63 89 152 29.9385135306823 46.7059094566552 -16.767395925973 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0072176213036914 ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 42583226 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 42585457 C/T 1 33 33 66 15.6820785160717 17.3179214839283 -1.63584296785668 T:C C T 10 0.52478549951298 0.712846770198214 ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 42753072 C/T 1 12 5 17 5.70257400584424 2.6239274975649 3.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.151798661556102 ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 43979589 G/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:G G T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000176531:ENST00000292140:exon_43979255_43979696:PHLDB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44118461 G/A 1 53 41 94 25.1863685258121 21.5162054800322 3.67016304577988 A:G G A 10 0.52478549951298 0.471098322818887 ENSG00000226763:ENST00000526798:exon_44116179_44118649:SRRM5;ENSG00000226763:ENST00000417606:exon_44116253_44118649:SRRM5;ENSG00000131116:ENST00000300811:exon_44118381_44118586:ZNF428;ENSG00000131116:ENST00000391964:exon_44118381_44118586:ZNF428 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44153003 C/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000011422:ENST00000340093:exon_44152732_44153295:PLAUR;ENSG00000011422:ENST00000221264:exon_44152732_44153295:PLAUR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44417575 A/G 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.216375415667424 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44418077 C/T 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 T:C C T 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44417970_44418263:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44418343 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44418544 A/G 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44418693 T/C 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44418776 G/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G G A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44418877 A/T 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:T:C A T 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44501518 G/A 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 A:G G A 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44680514 G/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 44739031 G/A 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45397307 C/T 1 99 102 201 47.046235548215 53.528120950324 -6.48188540210899 T:C C T 10 0.52478549951298 0.396795056484583 ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45397218_45397323:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45397218_45397323:TOMM40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45490570 A/G 1 16 13 29 7.60343200779232 6.82221149366874 0.781220514123579 A:G A G 10 0.52478549951298 0.85350802638375 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45490636 T/C 1 16 18 34 7.60343200779232 9.44613899123364 -1.84270698344132 T:C T C 10 0.52478549951298 0.607515458004291 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45495915 C/T 1 42 34 76 19.9590090204548 17.8427069834413 2.11630203701352 T:C C T 10 0.52478549951298 0.647664395318648 ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45540886 G/C 1 94 95 189 44.6701630457799 49.8546224537331 -5.18445940795322 T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.466939367014373 ENSG00000104856:ENST00000221452:exon_45540663_45541452:RELB;ENSG00000104856:ENST00000505236:exon_45540663_45541417:RELB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45574002 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45575663 T/G 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 T:G T G 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45912736 C/A 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 A:C C A 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 45923632 G/A 1 37 34 71 17.5829365180197 17.8427069834413 -0.259770465421582 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000012061:ENST00000300853:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000340192:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000428893:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000013807:exon_45923582_45923685:ERCC1;ENSG00000012061:ENST00000391935:exon_45923582_45923685:ERCC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 46057063 C/G 1 3 10 13 1.42564350146106 5.2478549951298 -3.82221149366874 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0488102416519216 ENSG00000125741:ENST00000263275:exon_46052412_46057169:OPA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 46196682 C/T 1 9 12 21 4.27693050438318 6.29742599415576 -2.02049548977258 T:C C T 10 0.52478549951298 0.392119223984021 ENSG00000011478:ENST00000012049:exon_46196671_46196814:QPCTL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 46268714 C/T 1 16 7 23 7.60343200779232 3.67349849659086 3.92993351120146 T:C C T 10 0.52478549951298 0.142480414894919 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 46268715 G/A 1 16 7 23 7.60343200779232 3.67349849659086 3.92993351120146 A:G G A 10 0.52478549951298 0.142480414894919 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 46268806 G/A 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000177045:ENST00000317578:exon_46268044_46269369:SIX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 46387860 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 52468203 T/A 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 52468562 C/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C C T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 52468587 G/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:G G T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000197619:ENST00000243644:exon_52467594_52469467:ZNF615;ENSG00000197619:ENST00000391795:exon_52468203_52468835:ZNF615 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 52793553 A/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 A:T A T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 52887437 A/C 1 1 9 10 0.47521450048702 4.72306949561682 -4.2478549951298 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0086577597267804 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 52887904 T/C 1 1 9 10 0.47521450048702 4.72306949561682 -4.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0086577597267804 ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53116643 T/C 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C T C 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000167766:ENST00000301096:exon_53115620_53118050:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000434535:exon_53115620_53116929:ZNF83;ENSG00000167766:ENST00000391789:exon_53115620_53116929:ZNF83 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53269255 G/A 1 22 27 49 10.4547190107144 14.1692084868505 -3.71448947613602 A:G G A 10 0.52478549951298 0.318148660557787 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53270623 G/C 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 C:G G C 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53453458 G/C 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 C:G G C 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53453777 C/T 1 10 2 12 4.7521450048702 1.04957099902596 3.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0413560448537132 ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53572917 G/A 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 A:G G A 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53959336 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 53959343 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54632515 A/G 1 64 52 116 30.4137280311693 27.288845974675 3.12488205649431 A:G A G 10 0.52478549951298 0.578223218214253 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54632432_54632560:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54632432_54632560:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54632432_54632745:PRPF31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54632673 A/G 1 61 38 99 28.9880845297082 19.9418489814932 9.04623554821498 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0707150556137961 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54632647_54632745:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54632647_54632745:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54632647_54632745:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54632432_54632745:PRPF31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54634882 G/A 1 147 128 275 69.8565315715919 67.1725439376614 2.68398763393049 A:G G A 10 0.52478549951298 0.762998208044571 ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54634738_54635140:PRPF31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54695591 G/A 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000170892:ENST00000455798:exon_54695572_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000456872:exon_54695572_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000302937:exon_54695572_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000496583:exon_54694194_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396383:exon_54695572_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000396388:exon_54695572_54695815:TSEN34;ENSG00000170892:ENST00000429671:exon_54695572_54695815:TSEN34 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54965860 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000439657:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54965609_54965861:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54965609_54965861:LENG8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54969115 G/A 1 21 15 36 9.97950451022742 7.8717824926947 2.10772201753272 A:G G A 10 0.52478549951298 0.509031329613737 ENSG00000167615:ENST00000326764:exon_54969113_54969181:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000301196:exon_54969113_54969181:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000376526:exon_54969113_54969181:LENG8;ENSG00000167615:ENST00000431846:exon_54969113_54969181:LENG8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 54974386 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55085363 G/A 0 10 0 10 4.7521450048702 0 4.7521450048702 G G 10 0.52478549951298 0.00217157993432381 ENSG00000239998:ENST00000439534:exon_55085165_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55085298_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55085257_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55085259_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55085308_55085379:LILRA2;ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55085346_55085379:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55085346_55085379:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55086968 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000239998:ENST00000439534:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55086723_55087019:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55086723_55087019:LILRA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55087313 T/G 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55087274_55087576:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55087274_55087576:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55087274_55087576:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55087274_55087576:LILRA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55142739 A/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:C A C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142722_55142757:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142713_55142757:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55143083 T/C 1 11 15 26 5.22735950535722 7.8717824926947 -2.64442298733748 T:C T C 10 0.52478549951298 0.330542748984287 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55142951_55143238:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55142951_55143238:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55143452 T/C 1 18 12 30 8.55386100876636 6.29742599415576 2.2564350146106 T:C T C 10 0.52478549951298 0.467337392011984 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55143491 G/T 1 22 21 43 10.4547190107144 11.0204954897726 -0.56577647905814 T:G G T 10 0.52478549951298 0.879800319218863 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55143551 G/A 1 18 16 34 8.55386100876636 8.39656799220768 0.157293016558679 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55147042 G/T 1 68 34 102 32.3145860331174 17.8427069834413 14.471879049676 T:G G T 10 0.52478549951298 0.00398919048263386 ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55147008_55147060:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55147008_55148103:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000487425:exon_55147008_55147067:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480375:exon_55147008_55147556:LILRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55174498 T/C 1 16 25 41 7.60343200779232 13.1196374878245 -5.51620548003218 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0877770279273657 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55174271_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174124_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174407_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174447_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174450_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174472_55174519:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174479_55174519:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55175006 C/T 1 17 17 34 8.07864650827934 8.92135349172066 -0.842706983441321 T:C C T 10 0.52478549951298 0.864133680655555 ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174990_55175025:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55175740 C/T 1 26 26 52 12.3555770126625 13.6444229873375 -1.28884597467496 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78185302578904 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55176262 A/G 1 16 21 37 7.60343200779232 11.0204954897726 -3.41706348198026 A:G A G 10 0.52478549951298 0.323510923668804 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55176250_55176300:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55176250_55176300:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55178148 G/A 1 32 9 41 15.2068640155846 4.72306949561682 10.4837945199678 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000898473611689048 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55178162 A/G 1 8 37 45 3.80171600389616 19.4170634819803 -15.6153474780841 A:G A G 10 0.52478549951298 3.02676318840916e-06 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55178198 C/G 1 51 7 58 24.235939524838 3.67349849659086 20.5624410282472 C:G C G 10 0.52478549951298 1.57005379122999e-08 ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55178148_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000484241:exon_55178145_55178200:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000470943:exon_55178145_55178841:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000461262:exon_55178148_55178489:LILRB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55556573 C/T 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55555711_55556677:RDH13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55556637 G/A 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55555711_55556677:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55555711_55556677:RDH13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55606944 G/A 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G G A 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55606813_55606968:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55606813_55606971:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55606813_55606971:PPP1R12C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55614923 T/C 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55751238 A/C 1 69 88 157 32.7898005336044 46.1811239571422 -13.3913234235379 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0374428312670028 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55751194_55751279:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55751194_55751279:PPP6R1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55756992 A/G 1 23 17 40 10.9299335112015 8.92135349172066 2.0085800194808 A:G A G 10 0.52478549951298 0.635408461473433 ENSG00000105063:ENST00000443936:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000327021:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000412770:exon_55756860_55757046:PPP6R1;ENSG00000105063:ENST00000444538:exon_55756860_55757046:PPP6R1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55995148 C/G 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 55995191 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 56153868 G/A 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000213015:ENST00000325333:exon_56153863_56154835:ZNF580 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 56599914 C/T 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000142409:ENST00000270459:exon_56598732_56600461:ZNF787 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 57133333 T/C 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000197951:ENST00000328070:exon_57132636_57135540:ZNF71 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58152795 C/T 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58152817 G/C 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 C:G G C 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58153000 T/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:C T C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58153009 C/T 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000121417:ENST00000420680:exon_58152072_58153549:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58153577 T/C 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000121417:ENST00000347302:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000240731:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000299871:exon_58152072_58154147:ZNF211;ENSG00000121417:ENST00000391703:exon_58152072_58154147:ZNF211 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58290657 T/C 1 13 9 22 6.17778850633126 4.72306949561682 1.45471901071444 T:C T C 10 0.52478549951298 0.670593887428144 ENSG00000083828:ENST00000396154:exon_58290119_58291984:ZNF586;ENSG00000083828:ENST00000396150:exon_58290119_58290715:ZNF586 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58371175 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000198466:ENST00000423137:exon_58369944_58371578:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000339656:exon_58369944_58376485:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000419854:exon_58369944_58375409:ZNF587 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58755366 G/A 1 6 11 17 2.85128700292212 5.77264049464278 -2.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.223952224889739 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58755331_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58755328_58755422:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000333581:exon_58755328_58755422:ZNF544 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58774071 A/G 1 34 31 65 16.1572930165587 16.2683504849024 -0.111057468343702 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58806083 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000083842:ENST00000196548:exon_58805464_58807254:ZNF8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58928302 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58929052 G/A 1 21 13 34 9.97950451022742 6.82221149366874 3.15729301655868 A:G G A 10 0.52478549951298 0.306500823348790 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000412840:exon_58928191_58929109:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000354635:exon_58928309_58929110:ZNF584 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58929136 G/A 1 20 15 35 9.5042900097404 7.8717824926947 1.6325075170457 A:G G A 10 0.52478549951298 0.61535455227732 ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58991847 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 58991926 C/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000083838:ENST00000335841:exon_58991543_58992591:ZNF446;ENSG00000083838:ENST00000391694:exon_58991543_58992591:ZNF446 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 19 59074429 C/T 1 10 2 12 4.7521450048702 1.04957099902596 3.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0413560448537132 ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 277003 A/G 1 162 149 311 76.9847490788972 78.193039427434 -1.20829034853679 A:G A G 10 0.52478549951298 0.909660104978805 ENSG00000143727:ENST00000272067:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000272065:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000413140:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000442386:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000449425:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000453390:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000484464:exon_276980_277085:ACP1;ENSG00000143727:ENST00000463831:exon_276980_277085:ACP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 677295 C/T 1 22 15 37 10.4547190107144 7.8717824926947 2.58293651801974 T:C C T 10 0.52478549951298 0.415644114388946 ENSG00000151353:ENST00000281017:exon_677289_677439:TMEM18;ENSG00000151353:ENST00000432667:exon_677289_677406:TMEM18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 3391913 C/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 3483205 C/T 1 71 66 137 33.7402295345784 34.6358429678567 -0.895613433278264 T:C C T 10 0.52478549951298 0.931878704688077 ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3482990_3483342:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3482990_3483337:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469400:exon_3482990_3483338:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000493792:exon_3482990_3483336:TTC15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 3502803 C/T 1 32 23 55 15.2068640155846 12.0700664887985 3.1367975267861 T:C C T 10 0.52478549951298 0.420638970915365 ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 3605906 C/A 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3605723_3606206:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3605723_3605922:RNASEH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 3627648 G/C 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 C:G G C 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000171863:ENST00000481006:exon_3623407_3628508:RPS7;ENSG00000171863:ENST00000472966:exon_3627409_3627850:RPS7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 9013424 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000143797:ENST00000305997:exon_9013238_9013430:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000498055:exon_9013238_9013430:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000471753:exon_9013238_9013430:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000486484:exon_9013238_9013430:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000477073:exon_9013238_9013430:MBOAT2;ENSG00000143797:ENST00000474341:exon_9013324_9013430:MBOAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 9588338 T/C 1 107 78 185 50.8479515521111 40.9332689620124 9.91468259009869 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161782423162191 ENSG00000119203:ENST00000238112:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000427001:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000460593:exon_9588327_9588479:CPSF3;ENSG00000119203:ENST00000489629:exon_9588327_9588479:CPSF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10262920 T/G 1 64 88 152 30.4137280311693 46.1811239571422 -15.767395925973 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0116445433066364 ENSG00000171848:ENST00000304567:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000360566:exon_10262455_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000459969:exon_10262839_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000461327:exon_10262866_10263184:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000498343:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000463887:exon_10262866_10263024:RRM2;ENSG00000171848:ENST00000491447:exon_10262879_10263024:RRM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10580967 G/A 1 304 242 546 144.465208148054 126.998090882141 17.4671172659129 A:G G A 10 0.52478549951298 0.145088634664584 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10580094_10580994:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10580727_10580994:ODC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10583918 C/T 1 63 74 137 29.9385135306823 38.8341269639605 -8.89561343327826 T:C C T 10 0.52478549951298 0.145671818133061 ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10583828_10583962:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10583828_10583962:ODC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10747419 G/T 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 T:G G T 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000115761:ENST00000345985:exon_10747311_10747437:NOL10;ENSG00000115761:ENST00000381685:exon_10747311_10747437:NOL10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10927418 G/A 1 184 137 321 87.4394680896117 71.8956134332783 15.5438546563334 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0834455270753087 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10927407_10927565:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10927407_10927565:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10927407_10927565:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10927407_10927565:PDIA6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10933249 C/T 1 89 101 190 42.2940905433448 53.003335450811 -10.7092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.127268874767176 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 10942687 C/T 1 38 23 61 18.0581510185068 12.0700664887985 5.98808452970822 T:C C T 10 0.52478549951298 0.157939935492459 ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 17898403 T/C 1 26 34 60 12.3555770126625 17.8427069834413 -5.4871299707788 T:C T C 10 0.52478549951298 0.195739521769883 ENSG00000163029:ENST00000448223:exon_17898355_17898443:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000351948:exon_17898355_17898443:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000381272:exon_17898355_17898443:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000402989:exon_17898355_17898443:SMC6;ENSG00000163029:ENST00000446852:exon_17898355_17898443:SMC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 17962518 C/T 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 17962762 A/G 1 23 13 36 10.9299335112015 6.82221149366874 4.10772201753272 A:G A G 10 0.52478549951298 0.185061293889131 ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 20824498 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000118960:ENST00000446825:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000415264:exon_20824492_20824533:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000304031:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000458740:exon_20824492_20824652:HS1BP3;ENSG00000118960:ENST00000445102:exon_20824492_20824652:HS1BP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 24205836 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173960:ENST00000446425:exon_24205766_24205903:UBXN2A;ENSG00000173960:ENST00000404924:exon_24205766_24205903:UBXN2A;ENSG00000173960:ENST00000309033:exon_24205766_24205903:UBXN2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 25046090 T/C 1 30 31 61 14.2564350146106 16.2683504849024 -2.01191547029178 T:C T C 10 0.52478549951298 0.610994756512194 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 25050977 T/C 1 23 12 35 10.9299335112015 6.29742599415576 4.6325075170457 T:C T C 10 0.52478549951298 0.129589682882794 ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000455323:exon_25050771_25051030:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000450524:exon_25050771_25051030:ADCY3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27439401 T/C 1 92 62 154 43.7197340448058 32.5367009698048 11.1830330750011 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0759365784643063 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439391_27439488:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439391_27439488:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439242_27439488:C2orf28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27439751 G/T 1 85 132 217 40.3932325413967 69.2716859357134 -28.8784533943167 T:G G T 10 0.52478549951298 9.86980559149364e-05 ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27461304 G/A 1 21 17 38 9.97950451022742 8.92135349172066 1.05815101850676 A:G G A 10 0.52478549951298 0.748549504144152 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461299_27461500:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461299_27461500:CAD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27462651 T/C 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 T:C T C 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27464988 G/A 1 27 34 61 12.8307915131495 17.8427069834413 -5.01191547029178 A:G G A 10 0.52478549951298 0.202826447659834 ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27464779_27464991:CAD;ENSG00000084774:ENST00000428460:exon_27464789_27464991:CAD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27550967 A/G 1 21 26 47 9.97950451022742 13.6444229873375 -3.66491847711006 A:G A G 10 0.52478549951298 0.308692914137 ENSG00000115207:ENST00000359541:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000457098:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000264720:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000452160:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000495298:exon_27550904_27551357:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000454704:exon_27550904_27551056:GTF3C2;ENSG00000115207:ENST00000415683:exon_27550904_27551056:GTF3C2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27851980 C/T 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27851863_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000436280:exon_27851891_27852036:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000478484:exon_27851919_27852036:GPN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27865325 A/G 1 18 13 31 8.55386100876636 6.82221149366874 1.73164951509762 A:G A G 10 0.52478549951298 0.592301033739622 ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27865296_27865386:ZNF512;ENSG00000198522:ENST00000515877:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000503738:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000424214:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000407583:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000461249:exon_27865296_27865386:GPN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27883958 C/T 1 22 8 30 10.4547190107144 4.19828399610384 6.2564350146106 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0271018076086618 ENSG00000119760:ENST00000337768:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000406540:exon_27883851_27885148:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000405491:exon_27883851_27884468:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000404798:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000464789:exon_27883629_27884468:SUPT7L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 27886820 G/T 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 29001691 A/G 1 7 11 18 3.32650150340914 5.77264049464278 -2.44613899123364 A:G A G 10 0.52478549951298 0.345641696182350 ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 29073249 T/C 1 20 21 41 9.5042900097404 11.0204954897726 -1.51620548003218 T:C T C 10 0.52478549951298 0.64295824884652 ENSG00000163806:ENST00000379579:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000334056:exon_29072716_29073477:SPDYA;ENSG00000163806:ENST00000439646:exon_29072716_29073300:SPDYA;ENSG00000171103:ENST00000419999:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29073194_29073271:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29073194_29073271:TRMT61B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 36810586 T/C 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 37349690 C/T 1 28 20 48 13.3060060136366 10.4957099902596 2.81029602337696 T:C C T 10 0.52478549951298 0.471137935789645 ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37349649_37349807:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37349649_37349807:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37349649_37349807:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37349649_37349807:EIF2AK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 37365716 G/C 1 27 27 54 12.8307915131495 14.1692084868505 -1.33841697370092 C:G G C 10 0.52478549951298 0.785686148011302 ENSG00000055332:ENST00000233057:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000395127:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000343510:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000405334:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000379156:exon_37365652_37365728:EIF2AK2;ENSG00000055332:ENST00000496059:exon_37365652_37365728:EIF2AK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 38298150 A/G 1 10 1 11 4.7521450048702 0.52478549951298 4.22735950535722 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0127823978457661 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 38298203 C/G 1 15 1 16 7.1282175073053 0.52478549951298 6.60343200779232 C:G C G 10 0.52478549951298 0.000638820311406025 ENSG00000138061:ENST00000260630:exon_38294652_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000494864:exon_38297209_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000407341:exon_38297625_38298453:CYP1B1;ENSG00000138061:ENST00000492443:exon_38298130_38298453:CYP1B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 38525660 C/G 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 C:G C G 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000119787:ENST00000378954:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000406122:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000405384:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000402054:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000419554:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000452935:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000332337:exon_38525286_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000477642:exon_38525073_38525717:ATL2;ENSG00000119787:ENST00000489896:exon_38525360_38525717:ATL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 39025555 G/A 1 17 17 34 8.07864650827934 8.92135349172066 -0.842706983441321 A:G G A 10 0.52478549951298 0.864133680655555 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39024871_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000423682:exon_39025515_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39024878_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39025110_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39025422_39025584:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000477981:exon_39025494_39025584:DHX57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 39050141 A/C 1 16 7 23 7.60343200779232 3.67349849659086 3.92993351120146 A:C A C 10 0.52478549951298 0.142480414894919 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000452978:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39050135_39050411:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39050135_39050411:DHX57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 39082344 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163214:ENST00000295373:exon_39082199_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000460193:exon_39081196_39082394:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000457308:exon_39082199_39082417:DHX57;ENSG00000163214:ENST00000474104:exon_39080187_39082394:DHX57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 42528515 C/G 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000143924:ENST00000318522:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000421920:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000402711:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000401738:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000440432:exon_42528381_42528532:EML4;ENSG00000143924:ENST00000406175:exon_42528381_42528532:EML4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 44028013 A/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:T A T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44027980_44028056:DYNC2LI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 44036913 T/C 1 41 39 80 19.4837945199678 20.4666344810062 -0.982839961038401 T:C T C 10 0.52478549951298 0.824070093000547 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 44036922 T/C 1 37 35 72 17.5829365180197 18.3674924829543 -0.784555964934562 T:C T C 10 0.52478549951298 0.906271974346026 ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 44549967 T/C 1 12 4 16 5.70257400584424 2.09914199805192 3.60343200779232 T:C T C 10 0.52478549951298 0.082551923143294 ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000444696:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000260648:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409272:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000410081:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378520:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378511:exon_44549870_44549993:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000420756:exon_44549870_44549993:PREPL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 44566301 T/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000138078:ENST00000425263:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000426481:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409957:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409411:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409936:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000260648:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000409272:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000410081:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378520:exon_44566286_44566502:PREPL;ENSG00000138078:ENST00000378511:exon_44566286_44566502:PREPL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 45616581 T/C 1 26 21 47 12.3555770126625 11.0204954897726 1.33508152288994 T:C T C 10 0.52478549951298 0.770925037755545 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45615819_45616738:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45615915_45616738:SRBD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 45640374 C/A 1 8 21 29 3.80171600389616 11.0204954897726 -7.21877948587642 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00852504109828832 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 45645512 C/T 1 9 28 37 4.27693050438318 14.6939939863634 -10.4170634819803 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00075380525305805 ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 46839477 T/C 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 T:C T C 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000151665:ENST00000281382:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000306465:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000412717:exon_46839367_46839483:PIGF;ENSG00000151665:ENST00000495933:exon_46839367_46839483:PIGF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 47220622 G/A 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G G A 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000474321:exon_47220589_47220667:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47220589_47220667:TTC7A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 47639553 A/G 1 17 13 30 8.07864650827934 6.82221149366874 1.2564350146106 A:G A G 10 0.52478549951298 0.716625660711107 ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000406134:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47639553_47639699:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000413880:exon_47639553_47639699:MSH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 48023115 T/C 1 8 10 18 3.80171600389616 5.2478549951298 -1.44613899123364 T:C T C 10 0.52478549951298 0.638292165920428 ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 53955850 C/T 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000115239:ENST00000406053:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000420735:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000352846:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000263634:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406625:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000482829:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000406687:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000394717:exon_53955849_53955984:ASB3;ENSG00000115239:ENST00000498475:exon_53955849_53955984:ASB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54035447 A/G 1 18 13 31 8.55386100876636 6.82221149366874 1.73164951509762 A:G A G 10 0.52478549951298 0.592301033739622 ENSG00000068912:ENST00000405123:exon_54035436_54035597:ERLEC1;ENSG00000068912:ENST00000185150:exon_54035436_54035597:ERLEC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54115904 A/G 1 25 25 50 11.8803625121755 13.1196374878245 -1.239274975649 A:G A G 10 0.52478549951298 0.777848840218472 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54120820 G/A 1 25 22 47 11.8803625121755 11.5452809892856 0.335081522889938 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54120811_54120936:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54120811_54120936:PSME4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54127041 C/T 1 5 11 16 2.3760725024351 5.77264049464278 -3.39656799220768 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131078346897670 ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54127018_54127154:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54127018_54127154:PSME4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54858511 C/T 1 20 22 42 9.5042900097404 11.5452809892856 -2.04099097954516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.540767627697365 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54886347 G/A 1 27 23 50 12.8307915131495 12.0700664887985 0.760725024350998 A:G G A 10 0.52478549951298 0.887893684366438 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54886291_54886403:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000496323:exon_54886291_54886403:SPTBN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 54895682 C/T 1 94 92 186 44.6701630457799 48.2802659551942 -3.61010290941428 T:C C T 10 0.52478549951298 0.60796262774704 ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54895488_54896812:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000467371:exon_54895488_54896811:SPTBN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 55404794 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000162994:ENST00000428621:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000494539:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000407122:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000402516:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000401408:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000406437:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000406076:exon_55404738_55404917:C2orf63;ENSG00000162994:ENST00000411884:exon_55404738_55404917:C2orf63 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 55459953 C/T 1 50 94 144 23.760725024351 49.3298369542201 -25.5691119298691 T:C C T 10 0.52478549951298 2.5181997987617e-05 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000449323:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000497083:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55459814_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000463185:exon_55459944_55460505:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000471772:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000478196:exon_55459944_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000494756:exon_55459830_55460008:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55459931_55460008:RPS27A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 55461991 A/C 1 95 269 364 45.1453775462669 141.167299368992 -96.0219218227247 A:C A C 10 0.52478549951298 1.70898956785548e-24 ENSG00000143947:ENST00000402285:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000272317:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000449323:exon_55461967_55462095:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000497083:exon_55461967_55462003:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000404735:exon_55461967_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000478196:exon_55461967_55462320:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000495843:exon_55461255_55462098:RPS27A;ENSG00000143947:ENST00000468810:exon_55461967_55462059:RPS27A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 55462523 G/A 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 A:G G A 10 0.52478549951298 0.807446848666434 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 55490990 T/A 1 20 11 31 9.5042900097404 5.77264049464278 3.73164951509762 A:T T A 10 0.52478549951298 0.209734874789202 ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55490776_55491006:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55490776_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000366137:exon_55490777_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000441307:exon_55490783_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000404297:exon_55490784_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000420637:exon_55490916_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417363:exon_55490964_55491001:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000412530:exon_55490973_55491001:MTIF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 55549715 C/T 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000115355:ENST00000336838:exon_55549664_55549828:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000263630:exon_55549664_55549828:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000436346:exon_55549664_55549828:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000413716:exon_55549664_55549828:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000422883:exon_55549664_55549828:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000412148:exon_55549664_55549828:CCDC88A;ENSG00000115355:ENST00000426576:exon_55549664_55549828:CCDC88A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 61417617 A/G 1 13 9 22 6.17778850633126 4.72306949561682 1.45471901071444 A:G A G 10 0.52478549951298 0.670593887428144 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 61711211 C/T 1 87 96 183 41.3436615423707 50.3794079532461 -9.03574641087535 T:C C T 10 0.52478549951298 0.183615399561867 ENSG00000082898:ENST00000401558:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000428210:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000481073:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000404992:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000406957:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000492182:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000461407:exon_61711072_61713097:XPO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 64779509 G/A 1 21 14 35 9.97950451022742 7.34699699318172 2.6325075170457 A:G G A 10 0.52478549951298 0.401790706529317 ENSG00000119844:ENST00000238856:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000422803:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000238855:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000498706:exon_64778577_64780543:AFTPH;ENSG00000119844:ENST00000409933:exon_64778609_64780543:AFTPH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 69659126 A/T 1 18 15 33 8.55386100876636 7.8717824926947 0.682078516071659 A:T A T 10 0.52478549951298 0.862935946296175 ENSG00000169599:ENST00000410022:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000471185:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000303698:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000394305:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000404290:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000450796:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000484177:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000419370:exon_69659034_69659137:NFU1;ENSG00000169599:ENST00000438184:exon_69659034_69659137:NFU1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 70033604 G/A 1 15 19 34 7.1282175073053 9.97092449074662 -2.84270698344132 A:G G A 10 0.52478549951298 0.391458331329885 ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 71360144 A/C 1 39 33 72 18.5333655189938 17.3179214839283 1.21544403506544 A:C A C 10 0.52478549951298 0.814122496484705 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 71360625 G/T 1 62 65 127 29.4632990301952 34.1110574683437 -4.64775843814846 T:G G T 10 0.52478549951298 0.424856677082698 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 71365676 G/A 1 34 57 91 16.1572930165587 29.9127734722399 -13.7554804556812 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00440777329364349 ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 71633389 C/T 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71633258_71633392:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000494241:exon_71633258_71633392:ZNF638 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 71654175 G/A 1 67 41 108 31.8393715326303 21.5162054800322 10.3231660525982 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0536184504238087 ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 73115642 G/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000116096:ENST00000234454:exon_73115443_73115733:SPR;ENSG00000116096:ENST00000498749:exon_73115549_73115733:SPR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74153990 G/A 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74153953_74154179:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74153953_74154179:DGUOK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74166093 G/A 1 36 41 77 17.1077220175327 21.5162054800322 -4.40848346249946 A:G G A 10 0.52478549951298 0.361501412092545 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74166037_74166149:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74166037_74166149:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000489796:exon_74166037_74166149:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000493055:exon_74166037_74166149:DGUOK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74185876 A/T 1 263 266 529 124.981413628086 139.592942870453 -14.6115292423665 A:T:C:G A T 10 0.52478549951298 0.206998249310582 ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74589792 G/A 1 70 51 121 33.2650150340914 26.764060475162 6.50095455892941 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274659547804449 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000491465:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74589777_74589856:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000492717:exon_74589777_74590056:DCTN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74593928 T/C 1 91 61 152 43.2445195443188 32.0119154702918 11.232604074027 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.0739167365669994 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74593586_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000495643:exon_74593910_74594059:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74593910_74594059:DCTN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74596531 C/T 1 15 24 39 7.1282175073053 12.5948519883115 -5.46663448100622 T:C C T 10 0.52478549951298 0.107695702052258 ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74596427_74596618:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74596427_74596618:DCTN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74690378 C/T 1 19 18 37 9.02907550925338 9.44613899123364 -0.417063481980261 T:C:G C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 74699778 C/A 1 160 96 256 76.0343200779232 50.3794079532461 25.6549121246771 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00137874348850098 ENSG00000204822:ENST00000258105:exon_74699696_74700449:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000409710:exon_74699696_74699814:MRPL53;ENSG00000204822:ENST00000468875:exon_74699696_74699791:MRPL53;ENSG00000135637:ENST00000454193:exon_74699696_74699923:CCDC142 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 75113657 C/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 75113789 C/G 1 5 11 16 2.3760725024351 5.77264049464278 -3.39656799220768 C:G C G 10 0.52478549951298 0.131078346897670 ENSG00000159399:ENST00000290573:exon_75113617_75113800:HK2;ENSG00000159399:ENST00000409174:exon_75113617_75113800:HK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 75907351 T/C 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75907319_75907440:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75907319_75907440:C2orf3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 75921441 G/C 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 C:G G C 10 0.52478549951298 0.393947332697963 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75921367_75921553:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000486016:exon_75921367_75921605:C2orf3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 75923413 T/C 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000005436:ENST00000470197:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000472230:exon_75923326_75923441:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75923378_75923441:C2orf3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 85625222 T/G 1 76 47 123 36.1163020370135 24.6649184771101 11.4513835599035 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0465820051265877 ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 86344237 A/G 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000132300:ENST00000254630:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409326:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000465560:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409783:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000418628:exon_86344178_86344243:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000409277:exon_86344178_86344282:PTCD3;ENSG00000132300:ENST00000483925:exon_86344178_86344282:PTCD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 86371883 T/C 1 181 146 327 86.0138245881506 76.6186829288951 9.39514165925553 T:C T C 10 0.52478549951298 0.318989015640139 ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86371055_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000419070:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86371059_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86371063_86372004:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86371063_86372004:IMMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 86385668 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86385499_86385844:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000490238:exon_86385600_86385844:IMMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 86433271 G/A 1 53 105 158 25.1863685258121 55.1024774488629 -29.9161089230508 A:G G A 10 0.52478549951298 2.02566316179394e-06 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86433229_86433418:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000409180:exon_86433229_86433418:MRPL35 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 86439552 G/A 1 34 50 84 16.1572930165587 26.239274975649 -10.0819819590903 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0290125138943842 ENSG00000132313:ENST00000254644:exon_86439549_86439961:MRPL35;ENSG00000132313:ENST00000337109:exon_86437603_86440917:MRPL35 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 88327823 T/C 1 29 34 63 13.7812205141236 17.8427069834413 -4.06148646931774 T:C T C 10 0.52478549951298 0.315627728396383 ENSG00000172086:ENST00000347055:exon_88326724_88328104:KRCC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89156948 C/G 1 6558 1070 7628 3116.45669419388 561.520484478889 2554.93620971499 A:T:C:G C G 10 0.52478549951298 0 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89160423 G/A 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 A:G G A 10 0.52478549951298 0.827764729334928 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89160715 T/G 1 12 3 15 5.70257400584424 1.57435649853894 4.1282175073053 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0384478542275312 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89161069 G/C 1 1189 8 1197 565.030041079067 4.19828399610384 560.831757082963 C:G G C 10 0.52478549951298 3.70706500416663e-316 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89161083 G/C 1 14 7 21 6.65300300681828 3.67349849659086 2.97950451022742 C:G G C 10 0.52478549951298 0.274424617526912 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89185377 T/A 1 12 23 35 5.70257400584424 12.0700664887985 -6.3674924829543 A:T T A 10 0.52478549951298 0.0409399977502876 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 89246951 C/T 0 106 0 106 50.3727370516241 0 50.3727370516241 C C 10 0.52478549951298 2.46859824305802e-30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 96944553 G/A 1 82 96 178 38.9675890399356 50.3794079532461 -11.4118189133104 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.098491866125741 ENSG00000144028:ENST00000323853:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000497539:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000429650:exon_96944547_96944736:SNRNP200;ENSG00000144028:ENST00000484372:exon_96944547_96944736:SNRNP200 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 97031782 G/A 1 64 74 138 30.4137280311693 38.8341269639605 -8.42039893279124 A:G G A 10 0.52478549951298 0.172471814878793 ENSG00000121152:ENST00000240423:exon_97031614_97031796:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000427946:exon_97031614_97031796:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000455200:exon_97031614_97031796:NCAPH;ENSG00000121152:ENST00000435349:exon_97031707_97031796:NCAPH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 99227238 T/C 1 25 20 45 11.8803625121755 10.4957099902596 1.3846525219159 T:C T C 10 0.52478549951298 0.765903037098423 ENSG00000115446:ENST00000409975:exon_99227238_99227358:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000357765:exon_99227238_99227358:UNC50;ENSG00000115446:ENST00000409347:exon_99227238_99227358:UNC50 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 99779033 A/G 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 A:G A G 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000144182:ENST00000393473:exon_99778420_99779620:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000340066:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393471:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000434566:exon_99778420_99779174:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393477:exon_99778420_99779611:LIPT1;ENSG00000144182:ENST00000393474:exon_99778420_99779611:LIPT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 99936186 T/G 1 49 46 95 23.285510523864 24.1401329775971 -0.854622453733104 T:G T G 10 0.52478549951298 0.918277849396615 ENSG00000115514:ENST00000264255:exon_99935445_99936262:TXNDC9;ENSG00000115514:ENST00000422767:exon_99935971_99936262:TXNDC9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 100011243 A/G 1 99 90 189 47.046235548215 47.2306949561682 -0.184459407953227 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000158417:ENST00000289371:exon_100011182_100011346:EIF5B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 100017803 T/C 1 43 40 83 20.4342235209419 20.9914199805192 -0.557196459577341 T:C T C 10 0.52478549951298 0.912940072208519 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100016938_100017815:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100016938_100017815:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100017413_100017815:REV1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 100022585 T/C 1 10 1 11 4.7521450048702 0.52478549951298 4.22735950535722 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0127823978457661 ENSG00000135945:ENST00000485487:exon_100022372_100022815:REV1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 100055629 G/A 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465835:exon_100055063_100055772:REV1;ENSG00000135945:ENST00000473819:exon_100055036_100055772:REV1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 105956062 A/T 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:T A T 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000135974:ENST00000258457:exon_105956040_105956206:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000437250:exon_105956040_105956206:C2orf49;ENSG00000135974:ENST00000410049:exon_105956040_105956206:C2orf49 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 109099531 C/G 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 C:G C G 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109099518_109099622:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000447558:exon_109099518_109099612:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109099518_109099622:GCC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 109106381 A/G 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 A:G A G 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 109380358 G/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:G G T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109379693_109384844:RANBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 111398692 T/G 1 81 95 176 38.4923745394486 49.8546224537331 -11.3622479142845 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0966333031928063 ENSG00000169679:ENST00000409311:exon_111398611_111398769:BUB1;ENSG00000169679:ENST00000302759:exon_111398611_111398782:BUB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113309473 C/T 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000409894:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000430293:exon_113309352_113309556:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113309352_113309575:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000475318:exon_113309352_113309575:POLR1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113317045 C/A 1 19 8 27 9.02907550925338 4.19828399610384 4.83079151314954 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0816126514255036 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113316870_113317151:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113316870_113317151:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113316870_113317151:POLR1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113322053 G/A 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125630:ENST00000263331:exon_113321943_113322076:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000333990:exon_113321943_113322076:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000448770:exon_113321943_113322076:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000417433:exon_113321943_113322076:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000484574:exon_113321891_113322076:POLR1B;ENSG00000125630:ENST00000458012:exon_113321939_113322076:POLR1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113498566 A/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113498395_113498584:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113498395_113498584:CKAP2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113510000 A/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113509844_113510051:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000435431:exon_113509844_113510051:CKAP2L;ENSG00000169607:ENST00000474331:exon_113509844_113510051:CKAP2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113514159 T/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:T T A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113513554_113514791:CKAP2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113514180 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000169607:ENST00000302450:exon_113513554_113514791:CKAP2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113940681 T/C 1 21 14 35 9.97950451022742 7.34699699318172 2.6325075170457 T:C T C 10 0.52478549951298 0.401790706529317 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113940839 G/C 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 C:G G C 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113942571 G/A 1 18 6 24 8.55386100876636 3.14871299707788 5.40514801168848 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0387976789889894 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113942534_113942650:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000485525:exon_113942534_113942650:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942534_113942650:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113942534_113942750:PSD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 113943470 A/G 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 114220055 T/C 1 8 17 25 3.80171600389616 8.92135349172066 -5.1196374878245 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0456846133202058 ENSG00000136682:ENST00000259199:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000448780:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000426479:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000358604:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000456188:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000492566:exon_114219985_114220411:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000472995:exon_114219985_114220071:CBWD2;ENSG00000136682:ENST00000486174:exon_114219985_114220071:CBWD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 118575215 C/G 1 86 77 163 40.8684470418837 40.4084834624995 0.459963579384258 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 118577246 A/C 1 89 50 139 42.2940905433448 26.239274975649 16.0548155676958 A:C A C 10 0.52478549951298 0.00649831390305635 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118577225_118577368:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118577225_118577368:DDX18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 118583915 G/A 1 35 33 68 16.6325075170457 17.3179214839283 -0.685413966882642 A:G G A 10 0.52478549951298 0.903713223048511 ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000415038:exon_118583845_118583958:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000476149:exon_118583845_118587042:DDX18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 122513326 A/G 1 9 12 21 4.27693050438318 6.29742599415576 -2.02049548977258 A:G A G 10 0.52478549951298 0.392119223984021 ENSG00000211460:ENST00000389682:exon_122513109_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000467324:exon_122513235_122513529:TSN;ENSG00000211460:ENST00000498545:exon_122513236_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000483698:exon_122513236_122513419:TSN;ENSG00000211460:ENST00000490717:exon_122513236_122513529:TSN;ENSG00000211460:ENST00000478165:exon_122513236_122513529:TSN;ENSG00000211460:ENST00000490104:exon_122513239_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000495112:exon_122513261_122513421:TSN;ENSG00000211460:ENST00000481818:exon_122513279_122513529:TSN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 127453664 A/C 1 388 406 794 184.383226188964 213.06291280227 -28.6796866133062 A:T:C:G A C 10 0.52478549951298 0.0428209406915489 ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 128608184 C/T 1 13 14 27 6.17778850633126 7.34699699318172 -1.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.702688159671681 ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128608164_128608259:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128608164_128608259:POLR2D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 128707543 T/C 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000136715:ENST00000259235:exon_128707443_128707568:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000357702:exon_128707443_128707568:SAP130;ENSG00000136715:ENST00000259234:exon_128707443_128707568:SAP130 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 128939817 G/A 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000136731:ENST00000376723:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000375990:exon_128939704_128939864:UGGT1;ENSG00000136731:ENST00000259253:exon_128939704_128939864:UGGT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 130925088 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000136699:ENST00000454468:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000412570:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000433118:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000351288:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000339679:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439886:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000409031:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000443958:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000431183:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000426662:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000452225:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000430682:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000451542:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000435455:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000473720:exon_130925031_130925163:SMPD4;ENSG00000136699:ENST00000439029:exon_130925031_130925163:SMPD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 132290803 C/T 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.095403535700739 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 135711516 C/T 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 136393658 A/G 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G A G 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000048991:ENST00000422577:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409478:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000264160:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000439263:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000329971:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000448751:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000410054:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000409606:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000456040:exon_136393658_136393753:R3HDM1;ENSG00000048991:ENST00000486532:exon_136393658_136393753:R3HDM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 136519421 A/G 1 34 30 64 16.1572930165587 15.7435649853894 0.413728031169278 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000144224:ENST00000272638:exon_136519388_136519481:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000426921:exon_136519388_136519451:UBXN4;ENSG00000144224:ENST00000416538:exon_136519388_136519481:UBXN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 136624155 G/A 1 39 33 72 18.5333655189938 17.3179214839283 1.21544403506544 A:G G A 10 0.52478549951298 0.814122496484705 ENSG00000076003:ENST00000264156:exon_136624133_136624298:MCM6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 143718195 G/A 1 50 39 89 23.760725024351 20.4666344810062 3.29409054334478 A:G G A 10 0.52478549951298 0.524981216504728 ENSG00000115919:ENST00000264170:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000392874:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000375773:exon_143718193_143718339:KYNU;ENSG00000115919:ENST00000409512:exon_143718193_143718339:KYNU HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 144461081 G/A 1 74 88 162 35.1658730360395 46.1811239571422 -11.0152509211028 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0841018626942198 ENSG00000075884:ENST00000295095:exon_144460988_144461093:ARHGAP15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 144966208 T/C 1 2 9 11 0.95042900097404 4.72306949561682 -3.77264049464278 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0315035899085005 ENSG00000121964:ENST00000392869:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409214:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000344850:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000241391:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392867:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000409298:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000392871:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000415569:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000491448:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000437114:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000417450:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000484303:exon_144966170_144966371:GTDC1;ENSG00000121964:ENST00000429978:exon_144966170_144966371:GTDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 148716428 T/C 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000115947:ENST00000264169:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392858:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000392857:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000461711:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000496670:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000490200:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000416719:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000457954:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000440042:exon_148716360_148716435:ORC4;ENSG00000115947:ENST00000495601:exon_148716161_148716435:ORC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 150432976 C/T 1 173 147 320 82.2121085842545 77.1434684284081 5.06864015584638 T:C C T 10 0.52478549951298 0.576239410011908 ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 152226570 A/G 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000123610:ENST00000243347:exon_152226534_152226762:TNFAIP6;ENSG00000123610:ENST00000460812:exon_152226534_152226762:TNFAIP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 153520235 C/T 1 62 61 123 29.4632990301952 32.0119154702918 -2.54861644009654 T:C C T 10 0.52478549951298 0.652850386726408 ENSG00000196504:ENST00000410080:exon_153520169_153520285:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000440252:exon_153520169_153520285:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000359961:exon_153520169_153520285:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000356402:exon_153520169_153520285:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000472760:exon_153520169_153520369:PRPF40A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 153520719 T/C 1 56 59 115 26.6120120272731 30.9623444712658 -4.35033244399271 T:C T C 10 0.52478549951298 0.455386666649347 ENSG00000196504:ENST00000410080:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000440252:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000359961:exon_153520652_153520766:PRPF40A;ENSG00000196504:ENST00000356402:exon_153520652_153520766:PRPF40A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 158300389 C/T 1 29 32 61 13.7812205141236 16.7931359844154 -3.01191547029178 T:C C T 10 0.52478549951298 0.445312949732519 ENSG00000115165:ENST00000264192:exon_158300359_158300654:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000457793:exon_158300359_158300610:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000439355:exon_158300359_158300518:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000462109:exon_158300359_158300604:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000483929:exon_158300359_158300598:CYTIP;ENSG00000115165:ENST00000435117:exon_158300359_158300518:CYTIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 160112881 G/T 1 21 10 31 9.97950451022742 5.2478549951298 4.73164951509762 T:G G T 10 0.52478549951298 0.105723115705864 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160112707_160112886:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160112707_160112886:WDSUB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 160132089 T/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:G T G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000196151:ENST00000359774:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000358147:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000392796:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409990:exon_160132057_160132149:WDSUB1;ENSG00000196151:ENST00000409124:exon_160132057_160132149:WDSUB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 160698826 C/T 1 11 14 25 5.22735950535722 7.34699699318172 -2.1196374878245 T:C C T 10 0.52478549951298 0.428503043615975 ENSG00000054219:ENST00000409803:exon_160698756_160698885:LY75;ENSG00000054219:ENST00000409827:exon_160698756_160698885:LY75;ENSG00000054219:ENST00000263636:exon_160698756_160698885:LY75;ENSG00000248672:ENST00000504764:exon_160698756_160698885:RP11-357L2.1;ENSG00000248672:ENST00000505052:exon_160698756_160698885:RP11-357L2.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 162080435 C/G 1 14 20 34 6.65300300681828 10.4957099902596 -3.84270698344132 C:G C G 10 0.52478549951298 0.229459342212184 ENSG00000136560:ENST00000259075:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000432002:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000392749:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000429217:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000406287:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000402568:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000457887:exon_162080431_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000432692:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000405852:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000456358:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000468831:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000470324:exon_162080426_162080502:TANK;ENSG00000136560:ENST00000437623:exon_162080426_162080502:TANK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 170403030 T/C 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 170403106 G/A 1 20 12 32 9.5042900097404 6.29742599415576 3.20686401558464 A:G G A 10 0.52478549951298 0.290995942719778 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170402728_170403214:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170402728_170403214:FASTKD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 170411693 T/C 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 T:C T C 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000138399:ENST00000453153:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000453929:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000415956:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000260971:exon_170411634_170411765:FASTKD1;ENSG00000138399:ENST00000361619:exon_170411634_170411765:FASTKD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 170917648 A/G 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000144357:ENST00000272793:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000442603:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000418381:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000421104:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000430321:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392632:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000392631:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000439681:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000444475:exon_170917589_170917696:UBR3;ENSG00000144357:ENST00000474426:exon_170917589_170917696:UBR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 171608449 G/A 0 1190 1 1191 565.505255579554 0.52478549951298 564.980470080041 T:G G T 10 0.52478549951298 0 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 171813014 G/T 1 44 27 71 20.9094380214289 14.1692084868505 6.74022953457842 T:G G T 10 0.52478549951298 0.122546850506547 ENSG00000115806:ENST00000471559:exon_171812946_171813024:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000234160:exon_171812946_171813069:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000424423:exon_171812946_171813069:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000442798:exon_171812946_171813069:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000452526:exon_171812946_171813069:GORASP2;ENSG00000115806:ENST00000486498:exon_171812946_171813069:GORASP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 172196009 C/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460539:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172195694_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172195841_172196064:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172195985_172196064:METTL8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 172216969 T/C 1 3 9 12 1.42564350146106 4.72306949561682 -3.29742599415576 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0806544853661951 ENSG00000123600:ENST00000447486:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000375258:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392601:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392604:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000460188:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000428182:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000392599:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000462821:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442778:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000453846:exon_172216932_172217023:METTL8;ENSG00000123600:ENST00000442541:exon_172216932_172217023:METTL8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 172374120 G/A 1 1 226 227 0.47521450048702 118.601522889933 -118.126308389446 A:G G A 10 0.52478549951298 1.13450210010691e-71 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 172725301 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000115840:ENST00000422440:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000392592:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000263812:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000426896:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000475360:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000472748:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000484227:exon_172725191_172725333:SLC25A12;ENSG00000115840:ENST00000464063:exon_172725191_172725333:SLC25A12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 173355958 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000091409:ENST00000409532:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264107:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000264106:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000343713:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000375221:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000409080:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000442250:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000458358:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000416789:exon_173355949_173356059:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000470259:exon_173355949_173355982:ITGA6;ENSG00000091409:ENST00000475302:exon_173355949_173356059:ITGA6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 175436576 A/C 1 29 14 43 13.7812205141236 7.34699699318172 6.43422352094186 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0656994515278227 ENSG00000115935:ENST00000392547:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000272746:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000359761:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000392546:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409891:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000418906:exon_175436404_175437174:WIPF1;ENSG00000115935:ENST00000409415:exon_175435897_175437174:WIPF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 178988298 A/G 1 17 12 29 8.07864650827934 6.29742599415576 1.78122051412358 A:G A G 10 0.52478549951298 0.579302264605088 ENSG00000155636:ENST00000424000:exon_178988249_178988639:RBM45;ENSG00000155636:ENST00000286070:exon_178988249_178988378:RBM45;ENSG00000155636:ENST00000456670:exon_178988249_178988378:RBM45;ENSG00000155636:ENST00000493048:exon_178988249_178988378:RBM45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 179320876 C/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:C C A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000204311:ENST00000409117:exon_179320737_179320878:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000437056:exon_179320737_179320878:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000375129:exon_179320737_179320878:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000442710:exon_179320737_179320878:DFNB59;ENSG00000204311:ENST00000444615:exon_179320737_179320878:DFNB59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 179334410 A/G 1 1 7 8 0.47521450048702 3.67349849659086 -3.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0313306683969089 ENSG00000079150:ENST00000424785:exon_179334379_179334512:FKBP7;ENSG00000079150:ENST00000233092:exon_179334379_179334512:FKBP7;ENSG00000079150:ENST00000350591:exon_179334379_179334512:FKBP7;ENSG00000079150:ENST00000435079:exon_179334379_179334512:FKBP7;ENSG00000079150:ENST00000419184:exon_179334379_179334512:FKBP7;ENSG00000079150:ENST00000434643:exon_179334379_179334509:FKBP7;ENSG00000079150:ENST00000412612:exon_179334379_179334509:FKBP7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 180810264 A/T 1 80 85 165 38.0171600389616 44.6067674586033 -6.5896074196417 A:T A T 10 0.52478549951298 0.311823383477241 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 180810361 T/A 1 69 60 129 32.7898005336044 31.4871299707788 1.30267056282558 A:T T A 10 0.52478549951298 0.860245042718321 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180809603_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180809856_180810442:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180810348_180810442:CWC22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 180829324 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000163510:ENST00000410053:exon_180829274_180829355:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000295749:exon_180829274_180829355:CWC22;ENSG00000163510:ENST00000404136:exon_180829274_180829355:CWC22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 183627504 A/G 1 40 31 71 19.0085800194808 16.2683504849024 2.74022953457842 A:G A G 10 0.52478549951298 0.553621433032812 ENSG00000077232:ENST00000264065:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000392392:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000491074:exon_183627409_183627528:DNAJC10;ENSG00000077232:ENST00000418559:exon_183627409_183627528:DNAJC10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 185802363 A/G 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000170396:ENST00000302277:exon_185800510_185804219:ZNF804A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 190320083 C/A 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 A:C C A 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190320046_190320170:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190320046_190320170:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000472286:exon_190320046_190320347:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190320046_190320170:WDR75 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 190323530 A/G 1 20 13 33 9.5042900097404 6.82221149366874 2.68207851607166 A:G A G 10 0.52478549951298 0.387071716193697 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 190329873 A/G 1 27 12 39 12.8307915131495 6.29742599415576 6.53336551899378 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0378114984407985 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190329805_190329980:WDR75 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 190338995 C/T 1 62 56 118 29.4632990301952 29.3879879727269 0.0753110574683546 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190338912_190339058:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190338912_190339058:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190338912_190339058:WDR75 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 191161622 T/C 1 22 15 37 10.4547190107144 7.8717824926947 2.58293651801974 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.415644114388946 ENSG00000198130:ENST00000392332:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000359678:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000392331:exon_191161539_191161679:HIBCH;ENSG00000198130:ENST00000409934:exon_191161539_191161679:HIBCH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 191224981 G/T 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 T:G G T 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000413239:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000417336:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000422454:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458193:exon_191224765_191225032:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000487628:exon_191224744_191225032:INPP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 191231458 G/A 1 7 11 18 3.32650150340914 5.77264049464278 -2.44613899123364 A:G G A 10 0.52478549951298 0.345641696182350 ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000431594:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000444194:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000458647:exon_191231421_191231584:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000423767:exon_191231421_191231621:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000409027:exon_191231421_191231621:INPP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 191795216 C/G 1 6 11 17 2.85128700292212 5.77264049464278 -2.92135349172066 C:G C G 10 0.52478549951298 0.223952224889739 ENSG00000115419:ENST00000320717:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000338435:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409626:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000457316:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409428:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000409215:exon_191795163_191795294:GLS;ENSG00000115419:ENST00000412247:exon_191795175_191795294:GLS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 197183694 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000138411:ENST00000409111:exon_197183276_197184628:HECW2;ENSG00000138411:ENST00000260983:exon_197183276_197184628:HECW2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201284068 G/A 1 16 27 43 7.60343200779232 14.1692084868505 -6.56577647905814 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0479114138108808 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000439395:exon_201283973_201284120:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000451764:exon_201283973_201284136:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000423749:exon_201283973_201284193:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000457757:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000453663:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409397:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000421573:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000449647:exon_201283973_201284219:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000438761:exon_201283973_201284219:SPATS2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201337667 A/C 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 A:C A C 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201342782 T/G 1 68 40 108 32.3145860331174 20.9914199805192 11.3231660525982 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0336458960402038 ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201342359_201343252:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201342359_201343253:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201342359_201342825:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201342359_201342932:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201342359_201342869:SPATS2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201354935 C/G 1 15 16 31 7.1282175073053 8.39656799220768 -1.26835048490238 C:G C G 10 0.52478549951298 0.720494209048114 ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201435896 G/A 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201436325 A/T 1 23 26 49 10.9299335112015 13.6444229873375 -2.71448947613602 A:T A T 10 0.52478549951298 0.476141911014325 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201437310 G/T 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:G G T 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201437507 G/A 1 17 19 36 8.07864650827934 9.97092449074662 -1.89227798246728 A:G G A 10 0.52478549951298 0.617415799777466 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201438568 G/A 1 27 23 50 12.8307915131495 12.0700664887985 0.760725024350998 A:G G A 10 0.52478549951298 0.887893684366438 ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201768238 C/T 1 42 43 85 19.9590090204548 22.5657764790581 -2.6067674586033 T:C C T 10 0.52478549951298 0.588597363771997 ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 201928671 G/T 0 257 0 257 122.130126625164 0 122.130126625164 G G 10 0.52478549951298 1.22196675196711e-72 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 202006096 G/A 1 18 85 103 8.55386100876636 44.6067674586033 -36.0529064498369 A:G G A 10 0.52478549951298 2.61394678755563e-13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 202025621 A/G 1 30 38 68 14.2564350146106 19.9418489814932 -5.68541396688264 A:G A G 10 0.52478549951298 0.182458541974371 ENSG00000003402:ENST00000309955:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000443227:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000340870:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000343375:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000341582:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000423241:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000457277:exon_202025155_202025665:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000479953:exon_202025155_202025760:CFLAR;ENSG00000003402:ENST00000474842:exon_202025155_202025665:CFLAR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 204150443 T/C 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000119004:ENST00000356079:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000449301:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000429815:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000461371:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000421618:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000489360:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431118:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000443941:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000302927:exon_204150335_204150455:CYP20A1;ENSG00000119004:ENST00000431075:exon_204150335_204150455:CYP20A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 207008763 C/A 1 25 31 56 11.8803625121755 16.2683504849024 -4.38798797272688 A:C C A 10 0.52478549951298 0.284519816559594 ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 214182100 A/T 1 12 20 32 5.70257400584424 10.4957099902596 -4.79313598441536 A:T A T 10 0.52478549951298 0.110658708125437 ENSG00000144451:ENST00000432529:exon_214181943_214182702:SPAG16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 216904041 A/G 1 31 30 61 14.7316495150976 15.7435649853894 -1.01191547029178 A:G A G 10 0.52478549951298 0.799284775937672 ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219134830 A/C 1 40 60 100 19.0085800194808 31.4871299707788 -12.478549951298 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0158372605230689 ENSG00000127837:ENST00000248450:exon_219134689_219134980:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000444053:exon_219134689_219134901:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000489767:exon_219134689_219134839:AAMP;ENSG00000127837:ENST00000461911:exon_219134689_219134868:AAMP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219140288 G/C 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219138915_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000465082:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219138924_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000445635:exon_219139729_219140344:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219140155_219140344:TMBIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219146882 G/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135926:ENST00000258412:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444881:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000437694:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000439306:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000429501:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000425694:exon_219146663_219146931:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000495113:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000418569:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000440422:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444183:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453776:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000444000:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000453281:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000451181:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000434015:exon_219146663_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000413976:exon_219146727_219146904:TMBIM1;ENSG00000135926:ENST00000420341:exon_219146841_219146904:TMBIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219527866 T/C 1 36 36 72 17.1077220175327 18.8922779824673 -1.78455596493456 T:C T C 10 0.52478549951298 0.723887309779603 ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219528995 T/C 1 33 29 62 15.6820785160717 15.2187794858764 0.463299030195238 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219612374 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000135912:ENST00000457313:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000392102:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000442769:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000258398:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000417196:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000494428:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000467841:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000480472:exon_219612320_219612448:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000480929:exon_219612013_219613377:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000465558:exon_219612320_219612461:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000491899:exon_219612320_219612391:TTLL4;ENSG00000135912:ENST00000448224:exon_219612320_219612448:TTLL4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219745802 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000135925:ENST00000258411:exon_219745085_219745830:WNT10A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219757556 C/A 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:C C A 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000135925:ENST00000258411:exon_219757496_219758653:WNT10A;ENSG00000135925:ENST00000458582:exon_219757496_219757868:WNT10A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 219941063 G/A 1 20 17 37 9.5042900097404 8.92135349172066 0.582936518019739 A:G G A 10 0.52478549951298 0.870886918421587 ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220037666 A/G 1 26 13 39 12.3555770126625 6.82221149366874 5.53336551899378 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0798049895442294 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220037756 A/G 1 28 32 60 13.3060060136366 16.7931359844154 -3.4871299707788 A:G A G 10 0.52478549951298 0.369586013189469 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220036619_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220036896_220037850:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220037616_220037850:C2orf24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220040330 A/G 1 34 28 62 16.1572930165587 14.6939939863634 1.46329903019524 A:G A G 10 0.52478549951298 0.799527837784276 ENSG00000115649:ENST00000360507:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000409789:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000453038:exon_220040313_220040394:C2orf24;ENSG00000115649:ENST00000451647:exon_220040313_220040394:C2orf24 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220045454 G/A 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:G G A 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220047393 C/T 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 T:C C T 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220085845 A/G 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 A:G A G 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220097257 G/C 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 C:G G C 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000163516:ENST00000323348:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220097212_220097415:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000453432:exon_220097212_220097388:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000409849:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000475202:exon_220097212_220097692:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000474225:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000467884:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000461731:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000496346:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000435521:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000486203:exon_220097212_220097756:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000410034:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000447157:exon_220097212_220097269:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000491181:exon_220097212_220097503:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000465550:exon_220097212_220097405:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000489580:exon_220097212_220097481:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000493563:exon_220097212_220097601:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000490526:exon_220097212_220097405:ANKZF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220112467 G/A 1 52 35 87 24.711154025325 18.3674924829543 6.34366154237074 A:G G A 10 0.52478549951298 0.197710977590095 ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000475696:exon_220112384_220112913:STK16;ENSG00000115661:ENST00000396738:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409516:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496443:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496800:exon_220112137_220112548:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409260:exon_220112384_220112479:STK16;ENSG00000115661:ENST00000478018:exon_220112384_220112479:STK16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 220476443 C/T 1 5 10 15 2.3760725024351 5.2478549951298 -2.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.195423410463726 ENSG00000144589:ENST00000456909:exon_220476326_220476556:AC009955.1;ENSG00000254493:ENST00000295641:exon_220476326_220476556:STK11IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 223386557 A/G 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 A:G A G 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 223386578 C/T 1 16 6 22 7.60343200779232 3.14871299707788 4.45471901071444 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0854094802131986 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 223389692 C/T 1 18 15 33 8.55386100876636 7.8717824926947 0.682078516071659 T:C C T 10 0.52478549951298 0.862935946296175 ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223389663_223389752:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223389663_223389752:SGPP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 223498019 T/C 1 103 79 182 48.9470935501631 41.4580544615254 7.48903908863763 T:C T C 10 0.52478549951298 0.298777658527531 ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223497918_223498026:FARSB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 224822229 C/T 1 18 17 35 8.55386100876636 8.92135349172066 -0.367492482954301 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224822121_224822368:MRPL44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 224824484 C/T 1 72 48 120 34.2154440350654 25.189703976623 9.02574005844239 T:C C T 10 0.52478549951298 0.100817580804308 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 224824695 T/C 1 44 52 96 20.9094380214289 27.288845974675 -6.37940795324608 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.220013753111758 ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 225346646 T/C 1 99 110 209 47.046235548215 57.7264049464278 -10.6801693982128 T:C T C 10 0.52478549951298 0.146035523614761 ENSG00000036257:ENST00000264414:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000344951:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409096:exon_225346609_225346795:CUL3;ENSG00000036257:ENST00000409777:exon_225346609_225346795:CUL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 225672460 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000135905:ENST00000258390:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000409592:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000373702:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000422684:exon_225672385_225672501:DOCK10;ENSG00000135905:ENST00000489831:exon_225671962_225672501:DOCK10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 228221725 A/G 1 184 197 381 87.4394680896117 103.382743404057 -15.9432753144454 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 0.111689175424286 ENSG00000168958:ENST00000304593:exon_228221702_228222550:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476924:exon_228221702_228221970:MFF;ENSG00000168958:ENST00000353339:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000354503:exon_228221702_228221931:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409565:exon_228221702_228222515:MFF;ENSG00000168958:ENST00000409616:exon_228221702_228221867:MFF;ENSG00000168958:ENST00000460756:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000337110:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000524634:exon_228221702_228221847:MFF;ENSG00000168958:ENST00000349901:exon_228221702_228222528:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392059:exon_228221702_228222543:MFF;ENSG00000168958:ENST00000392058:exon_228221702_228222524:MFF;ENSG00000168958:ENST00000456345:exon_228221702_228222097:MFF;ENSG00000168958:ENST00000490857:exon_228221702_228222549:MFF;ENSG00000168958:ENST00000476262:exon_228221702_228222547:MFF;ENSG00000168958:ENST00000477362:exon_228221702_228221897:MFF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 230632268 G/A 1 303 278 581 143.989993647567 145.890368864608 -1.90037521704141 A:G G A 10 0.52478549951298 0.900844743541353 ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231042276 A/G 1 184 184 368 87.4394680896117 96.5605319103883 -9.12106382077664 A:G A G 10 0.52478549951298 0.347844336452884 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231050715 A/G 1 134 106 240 63.6787430652607 55.6272629483759 8.05148011688479 A:G A G 10 0.52478549951298 0.301962635901193 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231067305 C/G 1 96 84 180 45.6205920467539 44.0819819590903 1.53861008766359 C:G C G 10 0.52478549951298 0.823381110494227 ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231067295_231067438:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231067295_231067444:SP110 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231106180 A/G 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:C:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231106119_231106202:SP140 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231120209 G/C 1 13 16 29 6.17778850633126 8.39656799220768 -2.21877948587642 A:C:G G C 10 0.52478549951298 0.459765747223042 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231120167_231120213:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231120167_231120247:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231120167_231120247:SP140 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231134309 A/G 1 17 15 32 8.07864650827934 7.8717824926947 0.206864015584639 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231134247_231134333:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231134247_231134333:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231134247_231134333:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231134247_231134333:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231134247_231134333:SP140 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231235642 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231235638_231235682:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231235623_231235682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231235623_231235682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231235623_231235682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000458341:exon_231235623_231235682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231235623_231235682:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231235621_231235682:SP140L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231256842 G/T 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 T:G G T 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000079263:ENST00000486687:exon_231256802_231256944:SP140;ENSG00000185404:ENST00000444636:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000415673:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000396563:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000243810:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000483728:exon_231256802_231256944:SP140L;ENSG00000185404:ENST00000496870:exon_231256802_231256944:SP140L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231331799 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231331896 G/A 1 83 79 162 39.4428035404227 41.4580544615254 -2.01525092110276 A:G G A 10 0.52478549951298 0.753757302093638 ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231407663 C/T 1 10 18 28 4.7521450048702 9.44613899123364 -4.69399398636344 T:C C T 10 0.52478549951298 0.088906379726713 ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231742214 C/T 1 88 74 162 41.8188760428578 38.8341269639605 2.98474907889724 T:C C T 10 0.52478549951298 0.694214215642759 ENSG00000135916:ENST00000409704:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326427:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000335005:exon_231742115_231742265:ITM2C;ENSG00000135916:ENST00000326407:exon_231742115_231742265:ITM2C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 231973363 G/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173692:ENST00000488354:exon_231973278_231973836:PSMD1;ENSG00000135914:ENST00000258400:exon_231972944_231974123:HTR2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 232028396 A/G 1 76 64 140 36.1163020370135 33.5862719688307 2.5300300681828 A:G A G 10 0.52478549951298 0.673444506560855 ENSG00000173692:ENST00000308696:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000431051:exon_232028349_232028441:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000467792:exon_232028349_232028424:PSMD1;ENSG00000173692:ENST00000477120:exon_232027807_232028441:PSMD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 232099940 T/C 1 1 7 8 0.47521450048702 3.67349849659086 -3.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0313306683969089 ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232099937_232100094:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232099937_232100094:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232099937_232100094:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000469789:exon_232099937_232100067:ARMC9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 233925166 G/A 1 2 14 16 0.95042900097404 7.34699699318172 -6.39656799220768 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00162874117046302 ENSG00000168918:ENST00000422935:exon_233924677_233925322:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000451407:exon_233925062_233925322:INPP5D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 234202960 C/T 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000085978:ENST00000392017:exon_234202903_234204320:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000373525:exon_234202903_234204320:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392021:exon_234202903_234204320:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000479942:exon_234202903_234204312:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000347464:exon_234202903_234204315:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000474148:exon_234202903_234204312:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392020:exon_234202903_234204320:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000392018:exon_234202903_234204320:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000334050:exon_234202903_234203078:ATG16L1;ENSG00000085978:ENST00000473865:exon_234202903_234203165:ATG16L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 234367022 A/G 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000077044:ENST00000264057:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000409813:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000430834:exon_234366930_234367043:DGKD;ENSG00000077044:ENST00000471764:exon_234366885_234367043:DGKD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 234750542 G/C 1 24 25 49 11.4051480116885 13.1196374878245 -1.71448947613602 C:G G C 10 0.52478549951298 0.669159089591383 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 234750831 T/C 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:C T C 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000432087:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000441687:exon_234749255_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000414924:exon_234749461_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234750497_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000434039:exon_234750539_234750851:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000453122:exon_234750762_234750851:HJURP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238671328 A/G 1 63 83 146 29.9385135306823 43.5571964595773 -13.6186829288951 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.0252494272874594 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238671536 A/G 1 98 74 172 46.571021047728 38.8341269639605 7.73689408376743 A:G A G 10 0.52478549951298 0.252499919878474 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238671609 A/G 1 88 72 160 41.8188760428578 37.7845559649346 4.0343200779232 A:G A G 10 0.52478549951298 0.527934044022268 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238671940 C/T 1 170 150 320 80.7864650827934 78.717824926947 2.0686401558464 T:C C T 10 0.52478549951298 0.823118014550676 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238672253 A/G 1 154 120 274 73.1830330750011 62.9742599415576 10.2087731334435 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.226629270479643 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238672290 C/T 1 170 129 299 80.7864650827934 67.6973294371744 13.089135645619 T:C C T 10 0.52478549951298 0.132516851992312 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238672703 C/G 1 77 88 165 36.5915165375005 46.1811239571422 -9.5896074196417 C:G C G 10 0.52478549951298 0.139157382937594 ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 238999883 T/C 1 9 16 25 4.27693050438318 8.39656799220768 -4.1196374878245 T:C T C 10 0.52478549951298 0.111379558353423 ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238999859_238999895:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238999859_239003163:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238999859_238999928:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238999859_239000724:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238999859_239000114:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000440143:exon_238999859_239000164:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238999859_238999895:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000463433:exon_238999859_238999895:SCLY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 239353001 C/T 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 240946766 T/C 1 55 64 119 26.1367975267861 33.5862719688307 -7.44947444204463 T:C T C 10 0.52478549951298 0.198612344334851 ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 240951106 T/G 1 62 49 111 29.4632990301952 25.714489476136 3.74880955405921 T:G T G 10 0.52478549951298 0.506650963339955 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240951034_240951113:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240951034_240951144:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240951034_240951113:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240951034_240954277:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240951034_240951113:NDUFA10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 240961728 T/C 1 39 32 71 18.5333655189938 16.7931359844154 1.74022953457842 T:C T C 10 0.52478549951298 0.722363604141482 ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 241513972 C/T 1 20 13 33 9.5042900097404 6.82221149366874 2.68207851607166 T:C C T 10 0.52478549951298 0.387071716193697 ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241513932_241514029:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513932_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241513971_241514045:RNPEPL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 241570249 A/C 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:C A C 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242026893 G/A 1 21 7 28 9.97950451022742 3.67349849659086 6.30600601363656 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0217222718148124 ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242026509_242028780:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000488567:exon_242026619_242028780:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242026640_242028780:MTERFD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242046785 A/C 1 103 33 136 48.9470935501631 17.3179214839283 31.6291720662347 A:C A C 10 0.52478549951298 3.60497198301205e-08 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242051777 G/A 1 54 17 71 25.6615830262991 8.92135349172066 16.7402295345784 A:G G A 10 0.52478549951298 6.59198522246926e-05 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242062162 C/T 1 14 15 29 6.65300300681828 7.8717824926947 -1.21877948587642 T:C C T 10 0.52478549951298 0.711956673181561 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242065624 A/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G A G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242065792 G/A 1 19 14 33 9.02907550925338 7.34699699318172 1.68207851607166 A:G G A 10 0.52478549951298 0.604275254765751 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242065814 C/T 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 T:C C T 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242066830 G/A 1 14 6 20 6.65300300681828 3.14871299707788 3.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 0.177770154653337 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000459710:exon_242066401_242066866:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242072357 G/A 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242072289_242074184:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242072389 G/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242072289_242072445:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242072289_242074184:PASK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242173247 G/A 1 304 302 606 144.465208148054 158.48522085292 -14.0200127048659 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.255098299129300 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242173235_242173378:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242173235_242173378:HDLBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242192848 T/C 1 28 35 63 13.3060060136366 18.3674924829543 -5.06148646931774 T:C T C 10 0.52478549951298 0.209430657478271 ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242192808_242192912:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000467435:exon_242192808_242192912:HDLBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242572699 C/T 1 40 31 71 19.0085800194808 16.2683504849024 2.74022953457842 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.553621433032812 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242573211 T/C 1 29 43 72 13.7812205141236 22.5657764790581 -8.78455596493456 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0444047711524688 ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242674803 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242690745 C/T 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000454048:exon_242690661_242690794:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000432449:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000496252:exon_242690661_242690804:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242690661_242690803:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242690661_242690803:D2HGDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 2 242707213 G/A 1 22 18 40 10.4547190107144 9.44613899123364 1.0085800194808 A:G G A 10 0.52478549951298 0.874475388124865 ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242707128_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242707125_242707363:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242707125_242708231:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000468064:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000445308:exon_242707125_242707377:D2HGDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 256615 C/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:C C A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 256727 T/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:T T A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_256609_256727:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_256609_256727:C20orf96 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 257988 A/G 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 A:G A G 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_257867_258024:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_257867_258024:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_257867_258024:C20orf96 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 279483 T/C 1 16 13 29 7.60343200779232 6.82221149366874 0.781220514123579 T:C T C 10 0.52478549951298 0.85350802638375 ENSG00000177764:ENST00000382352:exon_278204_280961:ZCCHC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 377226 C/T 1 28 29 57 13.3060060136366 15.2187794858764 -1.91277347223986 T:C C T 10 0.52478549951298 0.69115021808619 ENSG00000101255:ENST00000217233:exon_376842_378203:TRIB3;ENSG00000101255:ENST00000422053:exon_376842_378197:TRIB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 1099523 T/G 1 45 37 82 21.3846525219159 19.4170634819803 1.96758903993564 T:G T G 10 0.52478549951298 0.740361898167437 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1099396_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1099241_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000478004:exon_1099253_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1099270_1099545:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1099295_1099545:PSMF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 1108122 C/T 1 97 74 171 46.0958065472409 38.8341269639605 7.26167958328041 T:C C T 10 0.52478549951298 0.284080966843109 ENSG00000125818:ENST00000381898:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000438768:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000333082:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000381899:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000479715:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000246015:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000335877:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000461847:exon_1108069_1108151:PSMF1;ENSG00000125818:ENST00000454500:exon_1108069_1108151:PSMF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2633936 T/C 1 50 68 118 23.760725024351 35.6854139668826 -11.9246889425316 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0335895388869461 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000470143:exon_2633925_2634466:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2633925_2634039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2633925_2634039:NOP56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2635504 T/C 1 74 101 175 35.1658730360395 53.003335450811 -17.8374624147715 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00791804487931479 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000494697:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000469588:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000445139:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000460258:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000496775:exon_2635395_2635593:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2635435_2635593:NOP56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2637071 T/C 1 231 229 460 109.774549612502 120.175879388472 -10.4013297759708 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.350507358980948 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000381169:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480992:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000484998:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000415272:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000480447:exon_2636805_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637047_2637195:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000471023:exon_2637056_2637195:NOP56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2637898 A/G 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:G A G 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000101361:ENST00000490753:exon_2637727_2638095:NOP56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2638579 T/C 1 637 663 1300 302.711636810232 347.932786177106 -45.221149366874 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.0124295847041313 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2638727 G/A 1 537 526 1063 255.19018676153 276.037172743828 -20.8469859822978 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.207999227185081 ENSG00000101361:ENST00000329276:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467196:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000492135:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000466447:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000462630:exon_2638575_2639039:NOP56;ENSG00000101361:ENST00000467857:exon_2638575_2639039:NOP56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2774797 A/C 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:C A C 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000088882:ENST00000380605:exon_2774715_2775077:CPXM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2844911 C/T 1 23 17 40 10.9299335112015 8.92135349172066 2.0085800194808 T:C C T 10 0.52478549951298 0.635408461473433 ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2844825_2844933:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2844595_2844933:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2844830_2844933:PTPRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2945759 C/T 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000455631:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000431048:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000418580:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000430705:exon_2945507_2945848:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2945507_2945848:PTPRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 2988066 C/T 1 16 6 22 7.60343200779232 3.14871299707788 4.45471901071444 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0854094802131986 ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2987990_2988066:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2987990_2988066:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2987990_2988066:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2987990_2988066:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2987990_2988066:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2987990_2988066:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2987990_2988066:PTPRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 3734729 G/A 1 59 53 112 28.0376555287342 27.8136314741879 0.224024054546234 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000101220:ENST00000379772:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000217195:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000487464:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399683:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399672:exon_3734155_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000405186:exon_3734156_3736254:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000379765:exon_3734157_3734805:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399673:exon_3734157_3734805:C20orf27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 3739276 T/C 1 43 40 83 20.4342235209419 20.9914199805192 -0.557196459577341 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.912940072208519 ENSG00000101220:ENST00000379772:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000217195:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000487464:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399683:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399672:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000405186:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000379765:exon_3739183_3739325:C20orf27;ENSG00000101220:ENST00000399673:exon_3739183_3739325:C20orf27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 4680632 A/T 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:T A T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171867:ENST00000420824:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000455665:exon_4679862_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379440:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000531860:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000430350:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000525336:exon_4679857_4682236:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000444805:exon_4680216_4682233:PRNP;ENSG00000171867:ENST00000379436:exon_4679857_4682233:PRNP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 5086915 T/C 1 9 13 22 4.27693050438318 6.82221149366874 -2.54528098928556 T:C T C 10 0.52478549951298 0.29401621168529 ENSG00000089063:ENST00000379283:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000342308:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379299:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000202834:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379286:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379279:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000492419:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379277:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379298:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379276:exon_5086834_5086956:C20orf30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 5086939 A/T 0 0 9 9 0 4.72306949561682 -4.72306949561682 T A T 10 0.52478549951298 0.00123596779988700 ENSG00000089063:ENST00000379283:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000342308:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379299:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000202834:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379286:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379279:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000492419:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379277:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379298:exon_5086834_5086956:C20orf30;ENSG00000089063:ENST00000379276:exon_5086834_5086956:C20orf30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 5556103 C/T 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125772:ENST00000378992:exon_5556059_5556191:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000379019:exon_5556059_5556191:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000481038:exon_5556059_5556191:GPCPD1;ENSG00000125772:ENST00000418646:exon_5556059_5556154:GPCPD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 5923203 T/C 1 35 34 69 16.6325075170457 17.8427069834413 -1.21019946639562 T:C T C 10 0.52478549951298 0.81009509585619 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 5923204 T/C 1 34 33 67 16.1572930165587 17.3179214839283 -1.16062846736966 T:C T C 10 0.52478549951298 0.807514988914029 ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 5953833 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000125885:ENST00000378896:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000399350:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000378886:exon_5953702_5953842:MCM8;ENSG00000125885:ENST00000265187:exon_5953702_5953842:MCM8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 13695498 G/A 1 47 44 91 22.3350815228899 23.0905619785711 -0.75548045568118 A:G G A 10 0.52478549951298 0.916573157694048 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 13709068 A/T 1 40 14 54 19.0085800194808 7.34699699318172 11.6615830262991 A:T A T 10 0.52478549951298 0.00152590966784234 ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13709025_13709112:ESF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 13797179 G/A 1 45 32 77 21.3846525219159 16.7931359844154 4.59151653750054 A:G G A 10 0.52478549951298 0.306702143138348 ENSG00000101247:ENST00000378106:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000378081:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000463598:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000475968:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000487478:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000476200:exon_13797109_13797192:C20orf7;ENSG00000101247:ENST00000479682:exon_13796711_13797192:C20orf7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 17968923 T/C 1 17 13 30 8.07864650827934 6.82221149366874 1.2564350146106 T:C T C 10 0.52478549951298 0.716625660711107 ENSG00000125871:ENST00000377710:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000377709:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000412478:exon_17968809_17968941:C20orf72;ENSG00000125871:ENST00000467391:exon_17968809_17968941:C20orf72 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 18123500 G/A 1 74 65 139 35.1658730360395 34.1110574683437 1.05481556769578 A:G G A 10 0.52478549951298 0.865630939046483 ENSG00000149474:ENST00000278816:exon_18122852_18123563:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000377681:exon_18122852_18123563:CSRP2BP;ENSG00000149474:ENST00000435364:exon_18123305_18123563:CSRP2BP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 18297193 T/C 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 24944641 C/A 1 21 22 43 9.97950451022742 11.5452809892856 -1.56577647905814 A:C C A 10 0.52478549951298 0.649973343224134 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24943561_24944658:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24943581_24944658:C20orf3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 24964547 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000101474:ENST00000217456:exon_24964539_24964655:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000451442:exon_24964539_24964655:C20orf3;ENSG00000101474:ENST00000447138:exon_24964539_24964655:C20orf3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 24994292 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 25190510 C/T 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000417467:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000427553:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000438678:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000418890:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000425813:exon_25190485_25190561:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25190485_25190561:ENTPD6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 25193949 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000197586:ENST00000354989:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000525986:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000360031:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000443525:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376652:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000439162:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433417:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376647:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000433259:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376641:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000435520:exon_25193899_25194012:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000376635:exon_25193899_25194042:ENTPD6;ENSG00000197586:ENST00000447877:exon_25193899_25194042:ENTPD6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 30381758 G/C 1 65 76 141 30.8889425316563 39.8836979629865 -8.99475543133018 C:G G C 10 0.52478549951298 0.130142548517593 ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 30659537 C/T 1 59 17 76 28.0376555287342 8.92135349172066 19.1163020370135 T:C C T 10 0.52478549951298 8.49923372180714e-06 ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30659465_30659585:HCK;ENSG00000101336:ENST00000470092:exon_30659465_30660392:HCK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 30915461 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000101350:ENST00000375712:exon_30915359_30915464:KIF3B;ENSG00000101350:ENST00000418717:exon_30915359_30915464:KIF3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 31291161 C/T 1 42 62 104 19.9590090204548 32.5367009698048 -12.5776919493499 T:C C T 10 0.52478549951298 0.014090621863526 ENSG00000149600:ENST00000278980:exon_31290493_31291260:COMMD7;ENSG00000149600:ENST00000446419:exon_31290494_31291260:COMMD7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 31427635 C/T 1 44 58 102 20.9094380214289 30.4375589717528 -9.52812095032396 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0602268502115429 ENSG00000101367:ENST00000375571:exon_31427541_31427662:MAPRE1;ENSG00000101367:ENST00000414525:exon_31427541_31427662:MAPRE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 31981849 T/C 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 32881918 C/T 1 43 43 86 20.4342235209419 22.5657764790581 -2.13155295811628 T:C C T 10 0.52478549951298 0.666954962723606 ENSG00000101444:ENST00000217426:exon_32881887_32881962:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000480653:exon_32881887_32881962:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000468908:exon_32881887_32881962:AHCY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 32883350 T/C 1 34 23 57 16.1572930165587 12.0700664887985 4.08722652776014 T:C T C 10 0.52478549951298 0.291742521561169 ENSG00000101444:ENST00000217426:exon_32883201_32883391:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000480653:exon_32883201_32883391:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000468908:exon_32883201_32883391:AHCY;ENSG00000101444:ENST00000473516:exon_32883235_32883391:AHCY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33114132 C/G 1 361 346 707 171.552434675814 181.575782831491 -10.0233481556769 C:G C G 10 0.52478549951298 0.451677722563419 ENSG00000125971:ENST00000357156:exon_33114073_33114148:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000480759:exon_33114073_33114148:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000417166:exon_33114073_33114148:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000300469:exon_33114073_33114148:DYNLRB1;ENSG00000125971:ENST00000374846:exon_33114073_33114148:DYNLRB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33329744 A/G 1 15 8 23 7.1282175073053 4.19828399610384 2.92993351120146 A:G A G 10 0.52478549951298 0.296787100662300 ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33500921 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000131069:ENST00000481971:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000488172:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000336325:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000481284:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000360596:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000484354:exon_33500899_33500991:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000480274:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000473239:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000493805:exon_33500894_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000473172:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000253382:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000464399:exon_33500899_33500990:ACSS2;ENSG00000131069:ENST00000468550:exon_33500896_33500994:ACSS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33529574 G/C 1 41 29 70 19.4837945199678 15.2187794858764 4.2650150340914 C:G G C 10 0.52478549951298 0.339316562546275 ENSG00000100983:ENST00000216951:exon_33529516_33529632:GSS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33632420 G/C 1 10 19 29 4.7521450048702 9.97092449074662 -5.21877948587642 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0625982363685659 ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33632308_33632515:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33632308_33632515:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33632308_33632515:TRPC4AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33719560 A/G 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000088298:ENST00000374491:exon_33719445_33719586:EDEM2;ENSG00000088298:ENST00000374492:exon_33719445_33719586:EDEM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 33872311 G/C 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000242372:ENST00000440766:exon_33872184_33872326:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000374436:exon_33872184_33872518:EIF6;ENSG00000242372:ENST00000462894:exon_33872184_33872505:EIF6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 34099422 C/T 1 40 27 67 19.0085800194808 14.1692084868505 4.83937153263034 T:C C T 10 0.52478549951298 0.271268668984832 ENSG00000126001:ENST00000397527:exon_34099192_34099804:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000356095:exon_34099192_34099802:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000342580:exon_34099192_34099802:CEP250;ENSG00000126001:ENST00000422671:exon_34099192_34099469:CEP250 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 34528794 A/G 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:G A G 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34528786_34528969:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000473943:exon_34528786_34528851:PHF20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 34843689 C/T 1 34 30 64 16.1572930165587 15.7435649853894 0.413728031169278 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 35399559 T/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C T C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000149636:ENST00000373745:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000426836:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000448110:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373733:exon_35399521_35399569:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373750:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000480153:exon_35399276_35399876:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000473615:exon_35399521_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000449595:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000447406:exon_35399276_35399596:DSN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 36624845 T/C 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 T:C T C 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36624777_36624864:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36624777_36624864:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36624777_36624864:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373438:exon_36624777_36624864:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000473288:exon_36624777_36624864:TTI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 36634717 T/C 1 15 11 26 7.1282175073053 5.77264049464278 1.35557701266252 T:C T C 10 0.52478549951298 0.695977309853642 ENSG00000101407:ENST00000373448:exon_36634599_36634799:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000373447:exon_36634599_36634799:TTI1;ENSG00000101407:ENST00000449821:exon_36634599_36634799:TTI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 37195761 C/T 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:C C T 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000170471:ENST00000262879:exon_37195739_37195875:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397042:exon_37195739_37195875:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397038:exon_37195739_37195875:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000397040:exon_37195739_37195875:RALGAPB;ENSG00000170471:ENST00000438490:exon_37195739_37195875:RALGAPB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 37383640 T/C 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C T C 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 40049481 C/T 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000124177:ENST00000373233:exon_40049148_40050719:CHD6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42088708 G/A 1 75 106 181 35.6410875365265 55.6272629483759 -19.9861754118494 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0035864017999699 ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42088673_42088881:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42088673_42088881:SRSF6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42225114 G/A 1 11 12 23 5.22735950535722 6.29742599415576 -1.07006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.681491778056056 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42232525 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42232400_42232529:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42232400_42232529:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000476986:exon_42232514_42232529:IFT52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42310426 C/T 1 18 22 40 8.55386100876636 11.5452809892856 -2.9914199805192 T:C C T 10 0.52478549951298 0.34808227301894 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42310424_42310495:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42310424_42310495:MYBL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42331457 A/G 1 99 89 188 47.046235548215 46.7059094566552 0.340326091559753 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42331130_42331543:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42331130_42331543:MYBL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42340114 G/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G G A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42344745 G/A 1 190 217 407 90.2907550925338 113.878453394317 -23.5876983017829 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0196716335812287 ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42344599_42345136:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42344599_42345136:MYBL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42682991 C/T 1 14 10 24 6.65300300681828 5.2478549951298 1.40514801168848 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.68398706969559 ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42682939_42683166:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000413823:exon_42682991_42683166:TOX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42695405 G/A 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42695370_42695497:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000413823:exon_42695370_42695497:TOX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42825845 G/A 1 114 106 220 54.1744530555203 55.6272629483759 -1.45280989285561 A:G G A 10 0.52478549951298 0.8926472208005 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42825929 C/T 1 94 56 150 44.6701630457799 29.3879879727269 15.282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0139627095968253 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42826350 A/C 1 55 30 85 26.1367975267861 15.7435649853894 10.3932325413967 A:C A C 10 0.52478549951298 0.029285479453677 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 42826379 C/T 1 50 31 81 23.760725024351 16.2683504849024 7.49237453944862 T:C C T 10 0.52478549951298 0.118813446428245 ENSG00000132823:ENST00000255174:exon_42825136_42826379:C20orf111;ENSG00000132823:ENST00000372970:exon_42825136_42826379:C20orf111 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 43254298 C/T 1 45 38 83 21.3846525219159 19.9418489814932 1.44280354042266 T:C C T 10 0.52478549951298 0.826220156833788 ENSG00000196839:ENST00000372874:exon_43254210_43254325:ADA;ENSG00000196839:ENST00000464097:exon_43254210_43254325:ADA;ENSG00000196839:ENST00000492931:exon_43254210_43254325:ADA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 43530234 A/C 1 112 83 195 53.2240240545462 43.5571964595773 9.66682759496889 A:C A C 10 0.52478549951298 0.173465862449913 ENSG00000166913:ENST00000353703:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000479421:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000372839:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000428262:exon_43530172_43530474:YWHAB;ENSG00000166913:ENST00000445830:exon_43530172_43530397:YWHAB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 44747004 T/G 1 151 162 313 71.75738957354 85.0152509211028 -13.2578613475628 T:C:G T G 10 0.52478549951298 0.141195084246402 ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44746987_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44746990_44747033:CD40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 45315351 A/G 1 38 55 93 18.0581510185068 28.8632024732139 -10.8050514547071 A:G A G 10 0.52478549951298 0.028840488068013 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45313004_45315870:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45314173_45315870:TP53RK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 45318031 G/A 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000172315:ENST00000372114:exon_45317771_45318418:TP53RK;ENSG00000172315:ENST00000372102:exon_45317766_45318079:TP53RK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 45905197 C/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45905058_45905539:ZMYND8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 46268423 C/G 1 3 11 14 1.42564350146106 5.77264049464278 -4.34699699318172 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0291103619486302 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 46268493 A/G 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 A:G A G 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46268366_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46268321_46268566:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46268366_46268566:NCOA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 46281250 A/G 1 11 10 21 5.22735950535722 5.2478549951298 -0.0204954897725802 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000124151:ENST00000372004:exon_46281150_46281324:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000341724:exon_46281150_46281324:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000340189:exon_46281150_46281324:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371998:exon_46281150_46281324:NCOA3;ENSG00000124151:ENST00000371997:exon_46281150_46281324:NCOA3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 47850182 C/T 1 76 49 125 36.1163020370135 25.714489476136 10.4018125608775 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0729000959876689 ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47850105_47850246:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47850105_47852768:DDX27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 47865509 G/A 1 6 20 26 2.85128700292212 10.4957099902596 -7.64442298733748 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00283562339612109 ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 48729677 C/G 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000244687:ENST00000396059:exon_48729644_48729709:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000371674:exon_48729644_48729710:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000493090:exon_48729644_48729683:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000467839:exon_48729644_48729683:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000472923:exon_48729644_48729704:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000432266:exon_48729644_48729682:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000470565:exon_48729644_48729702:UBE2V1;ENSG00000244687:ENST00000490289:exon_48729644_48729683:UBE2V1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 48746189 C/T 1 12 4 16 5.70257400584424 2.09914199805192 3.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.082551923143294 ENSG00000240849:ENST00000522930:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371650:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371656:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371652:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000453505:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000240849:ENST00000371658:exon_48746083_48746227:TMEM189;ENSG00000124208:ENST00000341698:exon_48746083_48746227:TMEM189-UBE2V1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 49508683 G/A 1 38 39 77 18.0581510185068 20.4666344810062 -2.40848346249946 A:G G A 10 0.52478549951298 0.648423663828661 ENSG00000101126:ENST00000371602:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000349014:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396029:exon_49505585_49511049:ADNP;ENSG00000101126:ENST00000396032:exon_49506883_49511049:ADNP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 52193088 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000171940:ENST00000371471:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000302342:exon_52192266_52193819:ZNF217;ENSG00000171940:ENST00000395971:exon_52192266_52193819:ZNF217 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 56063613 C/A 1 20 5 25 9.5042900097404 2.6239274975649 6.8803625121755 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0078803420192012 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 56928502 A/G 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G A G 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000124209:ENST00000244040:exon_56928488_56928594:RAB22A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 60773020 C/T 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000101181:ENST00000471352:exon_60772908_60773319:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60772908_60773023:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60772908_60773023:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000472005:exon_60772908_60773023:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466099:exon_60772908_60773023:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000461411:exon_60772271_60773023:GTPBP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 60773755 T/C 1 7 14 21 3.32650150340914 7.34699699318172 -4.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0847652640732487 ENSG00000101181:ENST00000467101:exon_60773690_60773908:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000370823:exon_60773690_60773908:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000448254:exon_60773690_60773908:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000466099:exon_60773690_60773908:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000461411:exon_60773690_60773909:GTPBP5;ENSG00000101181:ENST00000471962:exon_60773734_60773908:GTPBP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 60881330 G/A 1 40 42 82 19.0085800194808 22.0409909795452 -3.03241096006436 A:G G A 10 0.52478549951298 0.509368518992714 ENSG00000130706:ENST00000423787:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000370744:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000253003:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000462554:exon_60881253_60881376:ADRM1;ENSG00000130706:ENST00000465805:exon_60881253_60881376:ADRM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 60966374 G/C 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 C:G G C 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000149679:ENST00000370560:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000279101:exon_60966305_60966509:CABLES2;ENSG00000149679:ENST00000453274:exon_60966305_60966509:CABLES2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61287879 G/C 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 C:G G C 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000101187:ENST00000370512:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000217159:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000497209:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000370507:exon_61287711_61288602:SLCO4A1;ENSG00000101187:ENST00000342674:exon_61287807_61288563:SLCO4A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61443871 C/T 1 39 39 78 18.5333655189938 20.4666344810062 -1.93326896201244 T:C C T 10 0.52478549951298 0.734036505729746 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370468:exon_61443582_61444281:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61444365 G/A 1 71 60 131 33.7402295345784 31.4871299707788 2.25309956379962 A:G G A 10 0.52478549951298 0.726844708239401 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61444780 C/A 1 13 5 18 6.17778850633126 2.6239274975649 3.55386100876636 A:C C A 10 0.52478549951298 0.103560900526000 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61444962 C/T 1 56 73 129 26.6120120272731 38.3093414644475 -11.6973294371744 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.0425023074044053 ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61444619_61445001:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61444619_61445001:OGFR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61472073 C/A 1 14 2 16 6.65300300681828 1.04957099902596 5.60343200779232 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00488490452325773 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61472093 G/A 1 2 13 15 0.95042900097404 6.82221149366874 -5.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00299229616073049 ENSG00000092758:ENST00000343916:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000466192:exon_61471894_61472496:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000462700:exon_61471894_61472511:COL9A3;ENSG00000092758:ENST00000467819:exon_61471894_61472511:COL9A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61488785 T/C 1 5 15 20 2.3760725024351 7.8717824926947 -5.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0226273140051972 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61491494 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61491477_61491660:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61491477_61491660:TCFL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61834695 G/A 1 11 17 28 5.22735950535722 8.92135349172066 -3.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.187123821971002 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61835010 G/A 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000149658:ENST00000370339:exon_61833639_61835159:YTHDF1;ENSG00000149658:ENST00000370333:exon_61833639_61835159:YTHDF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 61916220 G/A 1 4 11 15 1.90085800194808 5.77264049464278 -3.8717824926947 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.0673444366165564 ENSG00000101199:ENST00000370283:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000353546:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000370275:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519604:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520485:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518601:exon_61916218_61916281:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519273:exon_61914825_61917794:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000395285:exon_61914825_61917794:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000519526:exon_61915476_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000520022:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518794:exon_61916218_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000518691:exon_61915787_61916274:ARFGAP1;ENSG00000101199:ENST00000468975:exon_61916158_61916274:ARFGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 62153190 C/T 1 249 253 502 118.328410621268 132.770731376784 -14.442320755516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.210807309602426 ENSG00000125534:ENST00000370179:exon_62153021_62153559:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000370177:exon_62152865_62153291:PPDPF;ENSG00000125534:ENST00000473620:exon_62153021_62153302:PPDPF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 62369605 C/T 1 19 47 66 9.02907550925338 24.6649184771101 -15.6358429678567 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000111260127730460 ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62369536_62369852:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62369536_62369852:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000496820:exon_62369536_62369794:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62369361_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000487026:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000480139:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000493265:exon_62369536_62369697:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000489212:exon_62369361_62369712:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000476183:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000494776:exon_62369558_62369720:LIME1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 62374280 G/A 1 30 20 50 14.2564350146106 10.4957099902596 3.760725024351 A:G G A 10 0.52478549951298 0.322898389841764 ENSG00000125520:ENST00000266077:exon_62374232_62374858:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000493772:exon_62374232_62374858:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000473157:exon_62374232_62374858:SLC2A4RG;ENSG00000125520:ENST00000496425:exon_62374232_62374470:SLC2A4RG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 20 62670190 A/G 1 205 36 241 97.4189725998391 18.8922779824673 78.5266946173718 A:G A G 10 0.52478549951298 2.23374597492500e-26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 15858321 C/T 1 130 82 212 61.7778850633126 43.0324109600644 18.7454741032482 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0108152969035195 ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15857549_15858435:SAMSN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 27102014 G/C 1 426 422 848 202.441377207471 221.459480794478 -19.0181035870071 T:C:G G C 10 0.52478549951298 0.191573564448178 ENSG00000154723:ENST00000400099:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000434850:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000400094:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000284971:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000457143:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000400090:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000400087:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000400093:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000400089:exon_27101942_27102112:ATP5J;ENSG00000154723:ENST00000486002:exon_27101942_27102112:ATP5J HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 30380941 T/A 1 21 8 29 9.97950451022742 4.19828399610384 5.78122051412358 A:T T A 10 0.52478549951298 0.0395624295785671 ENSG00000156253:ENST00000493196:exon_30380716_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000286777:exon_30380716_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000472184:exon_30380561_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000486719:exon_30380716_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000466746:exon_30380197_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000481411:exon_30380221_30380942:RWDD2B;ENSG00000156253:ENST00000471269:exon_30380716_30380942:RWDD2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 30419116 C/G 1 53 46 99 25.1863685258121 24.1401329775971 1.04623554821498 C:G C G 10 0.52478549951298 0.841349010392209 ENSG00000156256:ENST00000399975:exon_30418988_30419642:USP16;ENSG00000156256:ENST00000399976:exon_30418988_30419642:USP16;ENSG00000156256:ENST00000334352:exon_30418988_30419642:USP16;ENSG00000156256:ENST00000474835:exon_30418988_30419642:USP16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 33974228 G/C 1 74 97 171 35.1658730360395 50.9041934527591 -15.7383204167196 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0174672623675406 ENSG00000159079:ENST00000440966:exon_33973977_33974283:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000382549:exon_33973977_33975602:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000290155:exon_33973977_33974283:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000425336:exon_33974013_33974677:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000300260:exon_33974095_33974283:C21orf59;ENSG00000159079:ENST00000483315:exon_33974120_33975602:C21orf59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 34617324 T/C 1 18 22 40 8.55386100876636 11.5452809892856 -2.9914199805192 T:C T C 10 0.52478549951298 0.34808227301894 ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000413881:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000443073:exon_34617256_34617379:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34617256_34617379:IFNAR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 34926043 G/A 1 32 38 70 15.2068640155846 19.9418489814932 -4.7349849659086 A:G G A 10 0.52478549951298 0.282235373466502 ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381695:exon_34924554_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000436227:exon_34924554_34927697:SON HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 35281421 T/C 1 464 395 859 220.499528225977 207.290272307627 13.2092559183502 T:C T C 10 0.52478549951298 0.374548681860518 ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 36042482 G/A 1 11 1 12 5.22735950535722 0.52478549951298 4.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00706766844417671 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 36042492 A/G 1 12 1 13 5.70257400584424 0.52478549951298 5.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00389224520849133 ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36041688_36043061:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36041688_36043061:CLIC6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 38444835 A/C 1 21 48 69 9.97950451022742 25.189703976623 -15.2101994663956 A:C A C 10 0.52478549951298 0.000255620361313795 ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38444734_38445111:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000479152:exon_38444734_38445023:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000430792:exon_38444734_38445297:PIGP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 38525356 T/C 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 38538320 T/C 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 38538897 G/A 1 16 17 33 7.60343200779232 8.92135349172066 -1.31792148392834 A:G G A 10 0.52478549951298 0.728392300446389 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38537852_38538917:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000472398:exon_38537852_38538917:TTC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 38563725 G/A 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 38568308 C/T 1 3 14 17 1.42564350146106 7.34699699318172 -5.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00576184367371513 ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 40552307 A/G 1 71 76 147 33.7402295345784 39.8836979629865 -6.14346842840806 A:G A G 10 0.52478549951298 0.32246908649551 ENSG00000183527:ENST00000331573:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000440607:exon_40552211_40552364:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000411828:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000380900:exon_40552211_40552362:PSMG1;ENSG00000183527:ENST00000431628:exon_40552211_40552362:PSMG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 42748935 G/A 1 38 38 76 18.0581510185068 19.9418489814932 -1.88369796298648 A:G G A 10 0.52478549951298 0.730745406705627 ENSG00000183486:ENST00000330714:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000436410:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000435611:exon_42748763_42749082:MX2;ENSG00000183486:ENST00000418103:exon_42748763_42749082:MX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 42813827 C/A 1 511 513 1024 242.834609748867 269.214961250159 -26.3803515012916 A:T:C C A 10 0.52478549951298 0.103699547338740 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42813643_42813841:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42813643_42813841:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42813643_42813841:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42813643_42813841:MX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 42821113 T/C 1 580 590 1170 275.624410282472 309.623444712658 -33.9990344301867 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.049812107437846 ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42821064_42821222:MX1;ENSG00000157601:ENST00000486275:exon_42821064_42821712:MX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 43221646 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000141956:ENST00000433067:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447016:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000486812:exon_43220344_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000470586:exon_43221154_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000422911:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000441787:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000449395:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000398548:exon_43218385_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000269844:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000447207:exon_43221325_43221882:PRDM15;ENSG00000141956:ENST00000380489:exon_43221325_43221882:PRDM15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 43796722 G/A 1 3 19 22 1.42564350146106 9.97092449074662 -8.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000330878549411649 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000476848:exon_43796650_43796792:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43796650_43796795:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43796650_43796792:TMPRSS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 43802157 T/C 1 36 10 46 17.1077220175327 5.2478549951298 11.8598670224029 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000527653049144858 ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43801985_43802343:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000478680:exon_43801987_43802343:TMPRSS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 43805637 C/T 1 1 17 18 0.47521450048702 8.92135349172066 -8.44613899123364 T:C C T 10 0.52478549951298 4.10062546071522e-05 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43805518_43805643:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43805518_43805643:TMPRSS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 43808627 C/T 1 10 30 40 4.7521450048702 15.7435649853894 -10.9914199805192 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000671196776411095 ENSG00000160183:ENST00000291532:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000433957:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398405:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000482761:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000474596:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000380399:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000455937:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000398397:exon_43808512_43808635:TMPRSS3;ENSG00000160183:ENST00000422004:exon_43808512_43808635:TMPRSS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44273763 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44273679_44273862:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44273679_44273862:WDR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44274700 C/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44274672_44274736:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44274672_44274736:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44274672_44274736:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44274672_44274736:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44274672_44274736:WDR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44283703 G/A 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44283550_44283706:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44283550_44283706:WDR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44293744 C/G 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44323590 T/G 1 26 35 61 12.3555770126625 18.3674924829543 -6.01191547029178 T:G T G 10 0.52478549951298 0.126152029245052 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44324164 C/T 1 49 39 88 23.285510523864 20.4666344810062 2.81887604285776 T:C C T 10 0.52478549951298 0.594177442626596 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44324365 G/A 1 42 41 83 19.9590090204548 21.5162054800322 -1.55719645957734 A:G G A 10 0.52478549951298 0.742897609589921 ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 44492132 G/A 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000160200:ENST00000352178:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000359624:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398165:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398158:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000398168:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000441030:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000470912:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000465732:exon_44492095_44492311:CBS;ENSG00000160200:ENST00000488526:exon_44492095_44492311:CBS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 45194064 G/A 1 1315 680 1995 624.907068140431 356.854139668826 268.052928471605 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 6.97126798620264e-34 ENSG00000160208:ENST00000506281:exon_45193907_45194144:RRP1B;ENSG00000160209:ENST00000498150:exon_45193472_45194151:PDXK;ENSG00000160213:ENST00000291568:exon_45192393_45194211:CSTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 45217929 T/C 1 41 26 67 19.4837945199678 13.6444229873375 5.83937153263034 T:C T C 10 0.52478549951298 0.178398764748987 ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 45656784 C/T 1 2 10 12 0.95042900097404 5.2478549951298 -4.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0177435667657133 ENSG00000160223:ENST00000407780:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000344330:exon_45656750_45657100:ICOSLG;ENSG00000160223:ENST00000400379:exon_45656750_45657100:ICOSLG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 46276145 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46276108_46276279:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46276108_46276184:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46276108_46276279:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000474737:exon_46276108_46276279:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000494690:exon_46276108_46276279:PTTG1IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 46951496 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46951303_46952062:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000477688:exon_46951332_46952062:SLC19A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47581961 C/A 1 10 13 23 4.7521450048702 6.82221149366874 -2.07006648879854 A:C C A 10 0.52478549951298 0.411031583507491 ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47635627 C/G 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47662769 C/T 1 41 39 80 19.4837945199678 20.4666344810062 -0.982839961038401 T:C C T 10 0.52478549951298 0.824070093000547 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47662716_47662845:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47662716_47662845:MCM3AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47665033 C/T 1 15 21 36 7.1282175073053 11.0204954897726 -3.89227798246728 T:C C T 10 0.52478549951298 0.242618855597124 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47664721_47665111:MCM3AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47676711 G/A 1 27 32 59 12.8307915131495 16.7931359844154 -3.96234447126582 A:G G A 10 0.52478549951298 0.361662940646558 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000481113:exon_47676703_47676900:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000494755:exon_47676390_47676900:MCM3AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47685939 A/G 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G A G 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47685839_47686080:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47685839_47686866:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47685839_47686080:MCM3AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47695220 A/G 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 A:G A G 10 0.52478549951298 0.840478250557484 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47695100_47695239:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47695100_47695239:MCM3AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47695223 G/A 1 12 12 24 5.70257400584424 6.29742599415576 -0.594851988311522 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.840478250557484 ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47695100_47695239:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47695100_47695239:MCM3AP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47706904 T/C 1 76 52 128 36.1163020370135 27.288845974675 8.82745606233856 T:C T C 10 0.52478549951298 0.132338029976252 ENSG00000182362:ENST00000397701:exon_47706784_47707037:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000468924:exon_47706784_47707037:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000329319:exon_47706784_47707037:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000339195:exon_47706784_47707037:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000423005:exon_47706784_47707037:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000492864:exon_47706784_47707037:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000397691:exon_47706784_47707037:C21orf57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47711409 C/T 1 1 8 9 0.47521450048702 4.19828399610384 -3.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0165388389563391 ENSG00000182362:ENST00000468924:exon_47711248_47711844:C21orf57;ENSG00000182362:ENST00000492864:exon_47711248_47712111:C21orf57 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47787002 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47786499_47787054:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47786499_47787054:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47836122 T/C 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 T:C T C 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47836216 A/G 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47836395 T/G 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:G T G 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47836426 T/C 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47836547 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47850107 G/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47849924_47850146:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47849924_47850146:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47850484 G/C 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47850421_47850571:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47850421_47850571:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 21 47864716 T/C 1 37 38 75 17.5829365180197 19.9418489814932 -2.3589124634735 T:C T C 10 0.52478549951298 0.644174671266746 ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47864607_47864734:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47864607_47864734:PCNT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 17619076 C/G 1 44 47 91 20.9094380214289 24.6649184771101 -3.75548045568118 C:G C G 10 0.52478549951298 0.463203717907919 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17618401_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17618410_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000477157:exon_17618412_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000399852:exon_17618469_17619247:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000486462:exon_17618472_17619247:CECR5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 17622062 G/T 1 17 25 42 8.07864650827934 13.1196374878245 -5.04099097954516 T:G G T 10 0.52478549951298 0.125025382057908 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17621949_17622123:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17621949_17622123:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000477157:exon_17621949_17624537:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000399852:exon_17621949_17622123:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000486462:exon_17621949_17622123:CECR5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 17630486 C/A 1 13 3 16 6.17778850633126 1.57435649853894 4.60343200779232 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0237464979222770 ENSG00000069998:ENST00000155674:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000336737:exon_17630432_17630635:CECR5;ENSG00000069998:ENST00000480451:exon_17630432_17630635:CECR5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 18226612 A/G 1 95 136 231 45.1453775462669 71.3708279337653 -26.2254503874984 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000591602520894003 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 18226764 T/C 1 117 116 233 55.6000965569813 60.8751179435057 -5.27502138652435 T:C T C 10 0.52478549951298 0.512106027318111 ENSG00000015475:ENST00000317361:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399767:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000399774:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000337587:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000342111:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000473439:exon_18226569_18226779:BID;ENSG00000015475:ENST00000458454:exon_18226569_18226779:BID HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19132132 C/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:C C A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000100056:ENST00000252137:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000434568:exon_19132019_19132197:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000472073:exon_19131570_19132146:DGCR14;ENSG00000100056:ENST00000469466:exon_19131637_19132172:DGCR14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19423210 C/G 1 184 187 371 87.4394680896117 98.1348884089273 -10.6954203193156 C:G C G 10 0.52478549951298 0.275201465022308 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19423415 A/C 1 296 283 579 140.663492144158 148.514296362173 -7.85080421801544 A:C:G A C 10 0.52478549951298 0.532590301346829 ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19496119 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000093009:ENST00000407835:exon_19496053_19496214:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000444382:exon_19496053_19496214:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000437685:exon_19496053_19496214:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000263201:exon_19496053_19496214:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000404724:exon_19496053_19496214:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000435353:exon_19496053_19496214:CDC45;ENSG00000093009:ENST00000471470:exon_19496053_19496214:CDC45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19882984 T/G 1 28 9 37 13.3060060136366 4.72306949561682 8.58293651801974 T:G T G 10 0.52478549951298 0.00477640147664877 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000475995:exon_19882930_19883104:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19882930_19883104:TXNRD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19898963 C/T 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19898880_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19898880_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000484672:exon_19898900_19898970:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471835:exon_19898781_19898970:TXNRD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19949952 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19950235 C/T 1 74 41 115 35.1658730360395 21.5162054800322 13.6496675560073 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0115301047955995 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19950268 G/A 1 75 106 181 35.6410875365265 55.6272629483759 -19.9861754118494 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0035864017999699 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 19951271 G/A 1 191 155 346 90.7659695930208 81.3417524245119 9.4242171685089 A:G G A 10 0.52478549951298 0.332636897052095 ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000479703:exon_19951142_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000493893:exon_19951089_19951282:COMT;ENSG00000093010:ENST00000428707:exon_19951222_19951282:COMT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 20104101 C/T 1 10 13 23 4.7521450048702 6.82221149366874 -2.07006648879854 T:C C T 10 0.52478549951298 0.411031583507491 ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20103561_20104156:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20103557_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494641:exon_20103581_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000464535:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000445045:exon_20103765_20104135:TRMT2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 20800835 A/G 1 14 15 29 6.65300300681828 7.8717824926947 -1.21877948587642 A:G A G 10 0.52478549951298 0.711956673181561 ENSG00000099910:ENST00000429594:exon_20800730_20800907:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000328879:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000399308:exon_20800766_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000451094:exon_20800772_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000440659:exon_20800730_20800963:KLHL22;ENSG00000099910:ENST00000417168:exon_20800771_20800963:KLHL22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 21213380 C/T 1 14 12 26 6.65300300681828 6.29742599415576 0.355577012662518 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000099940:ENST00000215730:exon_21213271_21213635:SNAP29;ENSG00000099940:ENST00000490458:exon_21213369_21213635:SNAP29 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 21350054 C/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000099949:ENST00000479606:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000215739:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000389355:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000415354:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000495142:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000491432:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000439171:exon_21350035_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000452988:exon_21350052_21350161:LZTR1;ENSG00000099949:ENST00000463909:exon_21349378_21350161:LZTR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 21354158 C/G 1 88 94 182 41.8188760428578 49.3298369542201 -7.51096091136236 C:G C G 10 0.52478549951298 0.266734568577604 ENSG00000184436:ENST00000498406:exon_21353393_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000215742:exon_21354061_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000471073:exon_21354062_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000438917:exon_21354063_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000399133:exon_21354066_21354721:THAP7;ENSG00000184436:ENST00000476667:exon_21354091_21354721:THAP7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 23237816 A/G 1 134 78 212 63.6787430652607 40.9332689620124 22.7454741032482 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00191012781521223 ENSG00000254709:ENST00000532223:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000526893:exon_23237555_23238005:D87023.8;ENSG00000254709:ENST00000531372:exon_23237555_23238005:D87023.8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 23261998 G/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 C:G G C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 23631801 T/C 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C T C 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000186716:ENST00000305877:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000359540:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000398512:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000290956:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000292697:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000334149:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000436011:exon_23631704_23631808:BCR;ENSG00000186716:ENST00000487968:exon_23631704_23633318:BCR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 24108141 G/A 1 420 427 847 199.590090204548 224.083408292042 -24.4933180874941 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0986135502067823 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108020_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108021_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000521886:exon_24108022_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108061_24108213:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108122_24108213:CHCHD10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 24108412 G/A 1 218 179 397 103.59676110617 93.9366044128234 9.66015669334692 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.340019879564843 ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 24837301 T/C 1 30 27 57 14.2564350146106 14.1692084868505 0.0872265277601372 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 26083586 G/A 1 14 7 21 6.65300300681828 3.67349849659086 2.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274424617526912 ENSG00000100077:ENST00000324198:exon_26083504_26083634:ADRBK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 26895337 G/A 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 29629432 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000473933:exon_29627671_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000488820:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29629335_29629457:EMID1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 29629433 C/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:C C A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000186998:ENST00000334018:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404755:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000404820:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000426629:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000429415:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000448676:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000435194:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000457925:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000484039:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000433143:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000473933:exon_29627671_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000488820:exon_29629368_29629457:EMID1;ENSG00000186998:ENST00000487477:exon_29629335_29629457:EMID1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 30127336 G/A 1 20 17 37 9.5042900097404 8.92135349172066 0.582936518019739 A:G G A 10 0.52478549951298 0.870886918421587 ENSG00000100314:ENST00000216144:exon_30125431_30127828:CABP7;ENSG00000100319:ENST00000344318:exon_30126945_30127343:ZMAT5;ENSG00000100319:ENST00000397781:exon_30126948_30127343:ZMAT5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 30218376 G/A 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30218324_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30218324_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30218324_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000431535:exon_30218324_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000495967:exon_30218324_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000412689:exon_30218324_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000465667:exon_30218131_30218453:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000463203:exon_30218341_30218453:ASCC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 30688339 G/A 1 34 41 75 16.1572930165587 21.5162054800322 -5.3589124634735 A:G G A 10 0.52478549951298 0.247660143219001 ENSG00000099992:ENST00000215790:exon_30687979_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000470854:exon_30687980_30688349:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000467596:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000462073:exon_30687980_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403477:exon_30687982_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000403362:exon_30687997_30688840:TBC1D10A;ENSG00000099992:ENST00000433426:exon_30687999_30688840:TBC1D10A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 30987861 G/C 1 23 28 51 10.9299335112015 14.6939939863634 -3.76406047516198 C:G G C 10 0.52478549951298 0.327341281909214 ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30987797_30987927:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30987797_30987867:PES1;ENSG00000100029:ENST00000433575:exon_30987797_30987865:PES1;ENSG00000100029:ENST00000466614:exon_30987797_30987877:PES1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 31333631 T/C 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 31976299 T/C 1 5 10 15 2.3760725024351 5.2478549951298 -2.8717824926947 T:C T C 10 0.52478549951298 0.195423410463726 ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000484806:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_31976258_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000467357:exon_31976074_31976350:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_31976258_31976350:SFI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32007153 G/A 1 11 12 23 5.22735950535722 6.29742599415576 -1.07006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.681491778056056 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000524296:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000417682:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000466991:exon_32007129_32007289:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000491973:exon_32007129_32007289:SFI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32011204 C/T 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32011034_32011265:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32010357_32012863:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32010372_32011265:SFI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32014365 C/T 1 25 33 58 11.8803625121755 17.3179214839283 -5.43755897175284 T:C C T 10 0.52478549951298 0.188196385016547 ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32014300_32014537:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32014300_32014432:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32014300_32014572:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32014101_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32014300_32014534:SFI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32435511 G/A 0 191 0 191 90.7659695930208 0 90.7659695930208 G G 10 0.52478549951298 4.85857329363531e-54 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32875190 G/A 1 55 47 102 26.1367975267861 24.6649184771101 1.47187904967604 A:G G A 10 0.52478549951298 0.842961967109762 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32887150 C/T 1 61 56 117 28.9880845297082 29.3879879727269 -0.399903443018665 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32889096 G/A 1 69 60 129 32.7898005336044 31.4871299707788 1.30267056282558 A:G G A 10 0.52478549951298 0.860245042718321 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32889092_32889268:FBXO7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 32889203 G/A 1 43 43 86 20.4342235209419 22.5657764790581 -2.13155295811628 A:G G A 10 0.52478549951298 0.666954962723606 ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32889092_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32889092_32889268:FBXO7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 35683408 G/A 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000498212:exon_35682875_35683445:HMGXB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 35683432 C/G 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 C:G C G 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000100281:ENST00000418170:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397385:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000397384:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000216106:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000444518:exon_35683340_35683445:HMGXB4;ENSG00000100281:ENST00000498212:exon_35682875_35683445:HMGXB4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 35806815 T/C 1 53 50 103 25.1863685258121 26.239274975649 -1.05290644983695 T:C T C 10 0.52478549951298 0.844238598016007 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444778:exon_35806737_35806865:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000464908:exon_35806737_35806903:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35806402_35806903:MCM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 35815880 G/A 1 169 185 354 80.3112505823064 97.0853174099013 -16.7740668275949 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0790122438509198 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35815877_35816005:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000402457:exon_35815877_35816005:MCM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 35819256 C/T 1 99 82 181 47.046235548215 43.0324109600644 4.01382458815061 T:C C T 10 0.52478549951298 0.602525835227249 ENSG00000100297:ENST00000216122:exon_35819207_35819334:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000447561:exon_35819207_35819334:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000444582:exon_35819253_35819303:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000382011:exon_35819207_35819334:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000455261:exon_35819207_35819334:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000426383:exon_35819207_35819334:MCM5;ENSG00000100297:ENST00000493076:exon_35817311_35820494:MCM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36623931 C/T 1 44 19 63 20.9094380214289 9.97092449074662 10.9385135306823 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00756332356346791 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36624310 G/A 1 26 23 49 12.3555770126625 12.0700664887985 0.285510523863978 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000529194:exon_36624078_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000454728:exon_36624241_36624326:APOL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36661330 G/A 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000427990:exon_36661197_36661361:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36661536 C/A 1 17 26 43 8.07864650827934 13.6444229873375 -5.56577647905814 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0947585384065332 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36661566 G/A 1 12 30 42 5.70257400584424 15.7435649853894 -10.0409909795452 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00285002261094423 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36661646 G/A 1 23 14 37 10.9299335112015 7.34699699318172 3.58293651801974 A:G G A 10 0.52478549951298 0.253660996821797 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36661679 T/G 1 17 24 41 8.07864650827934 12.5948519883115 -4.51620548003218 T:C:G T G 10 0.52478549951298 0.163129931079627 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36661842 G/A 1 29 19 48 13.7812205141236 9.97092449074662 3.81029602337696 A:G G A 10 0.52478549951298 0.312577146809917 ENSG00000100342:ENST00000397278:exon_36661197_36663571:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000422706:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000426053:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000440669:exon_36661197_36663576:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000319136:exon_36661197_36663567:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000416338:exon_36661197_36662181:APOL1;ENSG00000100342:ENST00000397279:exon_36661197_36663576:APOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36678816 C/A 1 178 224 402 84.5881810866896 117.551951890908 -32.963770804218 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00114502914784109 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36677327_36678831:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36678699_36678831:MYH9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36684836 G/A 1 236 252 488 112.150622114937 132.245945877271 -20.0953237623343 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0699210332231632 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684773_36684985:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684773_36684985:MYH9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36689392 C/T 1 169 166 335 80.3112505823064 87.1143929191547 -6.80314233684831 T:C C T 10 0.52478549951298 0.477132640114574 ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36689375_36689527:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36689375_36689527:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36689375_36689527:MYH9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36900271 T/C 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000100350:ENST00000397224:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000216187:exon_36900145_36900414:FOXRED2;ENSG00000100350:ENST00000397223:exon_36900145_36900414:FOXRED2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36907098 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000100353:ENST00000478547:exon_36906903_36907215:EIF3D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 36922067 G/A 1 135 134 269 64.1539575657477 70.3212569347393 -6.16729936899164 A:G G A 10 0.52478549951298 0.464218490027860 ENSG00000100353:ENST00000397177:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000216190:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000405442:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000455547:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000457241:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000432675:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000402116:exon_36922046_36922178:EIF3D;ENSG00000100353:ENST00000496875:exon_36921711_36922178:EIF3D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 37271802 C/T 1 32 72 104 15.2068640155846 37.7845559649346 -22.5776919493499 T:C C T 10 0.52478549951298 1.15871804373071e-05 ENSG00000100365:ENST00000447071:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37271695_37271825:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37271695_37272136:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000336951:exon_37271695_37272114:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000439078:exon_37271695_37271874:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37271695_37272136:NCF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 37273742 G/A 1 50 108 158 23.760725024351 56.6768339474018 -32.9161089230508 A:G G A 10 0.52478549951298 1.54769356581396e-07 ENSG00000100365:ENST00000248899:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000397147:exon_37273670_37274057:NCF4;ENSG00000100365:ENST00000415063:exon_37273670_37273806:NCF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 37414468 T/G 1 3 10 13 1.42564350146106 5.2478549951298 -3.82221149366874 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0488102416519216 ENSG00000128311:ENST00000403892:exon_37414179_37415508:TST;ENSG00000128311:ENST00000249042:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000413912:exon_37414179_37414794:TST;ENSG00000128311:ENST00000438203:exon_37414402_37414794:TST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 37524092 G/A 0 53 0 53 25.1863685258121 0 25.1863685258121 G G 10 0.52478549951298 1.88879651034584e-15 ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37521878_37524888:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37524065_37524888:IL2RB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 37531436 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000100385:ENST00000447922:exon_37531368_37531448:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000216223:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000406505:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000445799:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000431111:exon_37531368_37531482:IL2RB;ENSG00000100385:ENST00000483573:exon_37531368_37531482:IL2RB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38046718 A/G 1 32 32 64 15.2068640155846 16.7931359844154 -1.58627196883072 A:G A G 10 0.52478549951298 0.708947130415569 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38049816 C/T 1 29 27 56 13.7812205141236 14.1692084868505 -0.387987972726883 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38049786_38049880:SH3BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38051355 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38051999 C/T 1 99 104 203 47.046235548215 54.5776919493499 -7.53145640113495 T:C C T 10 0.52478549951298 0.292795090317863 ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38168745 G/T 1 12 19 31 5.70257400584424 9.97092449074662 -4.26835048490238 T:G G T 10 0.52478549951298 0.150419881320759 ENSG00000100101:ENST00000455236:exon_38168608_38168771:NOL12;ENSG00000100106:ENST00000406386:exon_38168608_38168771:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000344404:exon_38168608_38168771:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000403663:exon_38168608_38168771:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000421615:exon_38168608_38168771:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000448466:exon_38168608_38168771:TRIOBP;ENSG00000100106:ENST00000443065:exon_38168608_38168771:TRIOBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38212302 G/C 1 21 14 35 9.97950451022742 7.34699699318172 2.6325075170457 C:G G C 10 0.52478549951298 0.401790706529317 ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38212207_38212328:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212207_38212328:GCAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38212762 A/G 1 23 22 45 10.9299335112015 11.5452809892856 -0.6153474780841 A:G A G 10 0.52478549951298 0.882236832465206 ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38212574_38212904:GCAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38470929 C/T 1 13 21 34 6.17778850633126 11.0204954897726 -4.84270698344132 T:C C T 10 0.52478549951298 0.121486691773272 ENSG00000100151:ENST00000404072:exon_38470871_38471708:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000484021:exon_38470871_38471700:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000414087:exon_38470871_38471707:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000356976:exon_38470871_38471708:PICK1;ENSG00000100151:ENST00000426823:exon_38470871_38471139:PICK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38508220 T/C 1 5 14 19 2.3760725024351 7.34699699318172 -4.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0358258684068009 ENSG00000184381:ENST00000332509:exon_38507502_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000335539:exon_38507503_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000402064:exon_38507507_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000419848:exon_38507509_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000425347:exon_38507509_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000444151:exon_38507509_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000429782:exon_38507509_38508312:PLA2G6;ENSG00000184381:ENST00000463287:exon_38507879_38508312:PLA2G6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 38694733 G/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000213923:ENST00000467976:exon_38694586_38694939:CSNK1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39069181 T/C 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39095987 A/G 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 A:G A G 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000100221:ENST00000216039:exon_39095808_39096672:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000427389:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000412832:exon_39095808_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000417712:exon_39095806_39096128:JOSD1;ENSG00000100221:ENST00000456626:exon_39095808_39096623:JOSD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39122038 C/T 1 10 21 31 4.7521450048702 11.0204954897726 -6.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0299049127585264 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000460605:exon_39122011_39122155:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000475959:exon_39121812_39122155:GTPBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39125529 G/A 1 16 9 25 7.60343200779232 4.72306949561682 2.8803625121755 A:G G A 10 0.52478549951298 0.317499389351278 ENSG00000100226:ENST00000216044:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000456823:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000458073:exon_39125467_39125667:GTPBP1;ENSG00000100226:ENST00000462332:exon_39124261_39125667:GTPBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39385527 G/A 1 21 21 42 9.97950451022742 11.0204954897726 -1.04099097954516 A:G G A 10 0.52478549951298 0.759841909015547 ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39385462_39385615:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39385462_39385615:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39385462_39385615:APOBEC3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39388046 G/C 1 68 35 103 32.3145860331174 18.3674924829543 13.9470935501631 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00742504788579247 ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39388039_39388154:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39388039_39388809:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39388039_39388154:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39388039_39388154:APOBEC3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39482371 C/G 1 163 180 343 77.4599635793843 94.4613899123364 -17.0014263329521 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0742645106515278 ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39482284_39482572:APOBEC3G HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39710736 G/A 1 2843 2589 5432 1351.0348248846 1358.66965823911 -7.63483335450746 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.83854040445946 ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000426159:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000467105:exon_39710691_39710970:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000481985:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000471290:exon_39710691_39710851:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39710705_39710851:RPL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39822851 C/T 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000100324:ENST00000216160:exon_39822708_39822930:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000331454:exon_39822708_39822930:TAB1;ENSG00000100324:ENST00000473491:exon_39822708_39822930:TAB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39917515 A/C 1 333 408 741 158.246428662178 214.112483801296 -55.8660551391182 A:T:C A C 10 0.52478549951298 4.32691979997079e-05 ENSG00000128272:ENST00000404241:exon_39917359_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000337304:exon_39916569_39917676:ATF4;ENSG00000128272:ENST00000396680:exon_39917359_39917676:ATF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 39928738 G/A 1 55 28 83 26.1367975267861 14.6939939863634 11.4428035404227 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0151063827629974 ENSG00000187051:ENST00000334678:exon_39928692_39928860:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000420879:exon_39928692_39928766:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000459956:exon_39928400_39928743:RPS19BP1;ENSG00000187051:ENST00000472291:exon_39928692_39928765:RPS19BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 40367010 C/T 1 35 25 60 16.6325075170457 13.1196374878245 3.5128700292212 T:C C T 10 0.52478549951298 0.438277441741332 ENSG00000100351:ENST00000344138:exon_40366909_40369725:GRAP2;ENSG00000100351:ENST00000407075:exon_40366909_40367109:GRAP2;ENSG00000100351:ENST00000460449:exon_40366909_40367191:GRAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 40815089 G/C 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 C:G G C 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 41173104 T/G 1 24 29 53 11.4051480116885 15.2187794858764 -3.81363147418794 T:G T G 10 0.52478549951298 0.336279970520921 ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000402844:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000447566:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000430221:exon_41173044_41173139:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000427084:exon_41173064_41173139:SLC25A17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 41626240 G/A 1 34 27 61 16.1572930165587 14.1692084868505 1.98808452970822 A:G G A 10 0.52478549951298 0.700894997775142 ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41626143_41627275:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41626143_41626658:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41626143_41627274:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41626143_41627275:L3MBTL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 41645757 C/G 1 27 40 67 12.8307915131495 20.9914199805192 -8.16062846736966 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0503448439113234 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41645733_41645821:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41645733_41645821:RANGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 41648966 A/G 1 37 30 67 17.5829365180197 15.7435649853894 1.83937153263034 A:G A G 10 0.52478549951298 0.714223854661353 ENSG00000100401:ENST00000405486:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000356244:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000405383:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000455915:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000407260:exon_41648876_41648995:RANGAP1;ENSG00000100401:ENST00000493783:exon_41648876_41649036:RANGAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 41903813 A/C 1 35 31 66 16.6325075170457 16.2683504849024 0.364157032143318 A:C A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41903795_41904053:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000471094:exon_41903795_41904053:ACO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 41920912 G/A 1 75 66 141 35.6410875365265 34.6358429678567 1.00524456866982 A:G G A 10 0.52478549951298 0.932842636933562 ENSG00000100412:ENST00000216254:exon_41920850_41920972:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000396512:exon_41920850_41920972:ACO2;ENSG00000100412:ENST00000445344:exon_41920850_41920972:ACO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42177816 C/A 1 12 11 23 5.70257400584424 5.77264049464278 -0.0700664887985409 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000462450:exon_42177689_42177828:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000498456:exon_42177689_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42177355_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42177403_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42177450_42177849:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42177739_42177849:MEI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42191540 C/T 1 28 18 46 13.3060060136366 9.44613899123364 3.85986702240292 T:C C T 10 0.52478549951298 0.301902420763787 ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000487535:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42191415_42191546:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000484966:exon_42191415_42191546:MEI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42289223 A/C 1 28 27 55 13.3060060136366 14.1692084868505 -0.863202473213903 A:C A C 10 0.52478549951298 0.892816578675393 ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42289121_42289289:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000491541:exon_42289121_42289289:SREBF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42341308 A/G 1 60 60 120 28.5128700292212 31.4871299707788 -2.97425994155761 A:G A G 10 0.52478549951298 0.647853955002656 ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42463814 C/T 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42606257 C/T 1 12 26 38 5.70257400584424 13.6444229873375 -7.94184898149324 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.0137655823673701 ENSG00000100207:ENST00000359486:exon_42605657_42611448:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000335626:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000396348:exon_42605657_42611446:TCF20;ENSG00000100207:ENST00000418801:exon_42605657_42611445:TCF20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 42905023 T/C 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43088971 C/T 1 23 22 45 10.9299335112015 11.5452809892856 -0.6153474780841 T:C C T 10 0.52478549951298 0.882236832465206 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43089055 G/C 1 17 24 41 8.07864650827934 12.5948519883115 -4.51620548003218 C:G G C 10 0.52478549951298 0.163129931079627 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43089849 T/C 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43193603 G/A 1 31 17 48 14.7316495150976 8.92135349172066 5.81029602337696 A:G G A 10 0.52478549951298 0.111517656460960 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43192508_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43192538_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43193420_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43193556_43193611:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000440262:exon_43193556_43193611:ARFGAP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43203137 C/T 1 12 18 30 5.70257400584424 9.44613899123364 -3.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.201719558866690 ENSG00000242247:ENST00000263245:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000429508:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000437119:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000452960:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453941:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000456251:exon_43203079_43203169:ARFGAP3;ENSG00000242247:ENST00000453516:exon_43203080_43203169:ARFGAP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43563209 G/A 0 216 0 216 102.646332105196 0 102.646332105196 G G 10 0.52478549951298 3.49700774465392e-61 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43562628_43564165:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000484711:exon_43562629_43564165:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43562664_43563212:TTLL12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 43579012 G/A 1 13 8 21 6.17778850633126 4.19828399610384 1.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.513297365553358 ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000357017:exon_43578986_43579155:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43578986_43579155:TTLL12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 44372632 C/T 1 83 67 150 39.4428035404227 35.1606284673697 4.282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.51356580555927 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 44386281 C/T 1 177 178 355 84.1129665862025 93.4118189133104 -9.29885232710791 T:C C T 10 0.52478549951298 0.338912183479971 ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 44489896 T/C 1 105 129 234 49.8975225511371 67.6973294371744 -17.7998068860373 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0218252512925888 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44489808_44489897:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477795:exon_44489812_44489897:PARVB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 44564507 C/T 1 231 197 428 109.774549612502 103.382743404057 6.39180620844455 T:C C T 10 0.52478549951298 0.561486042760109 ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44564482_44564803:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44564482_44565064:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477438:exon_44564482_44564807:PARVB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 46685311 G/C 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 C:G G C 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46685299_46685458:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46685299_46685458:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000451998:exon_46685299_46685458:TTC38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 46688724 C/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000075234:ENST00000381031:exon_46688688_46689905:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000445282:exon_46688688_46689903:TTC38;ENSG00000075234:ENST00000451998:exon_46688688_46688830:TTC38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 46719100 C/G 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46719087_46719159:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46719087_46719159:GTSE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 46722531 C/T 1 17 19 36 8.07864650827934 9.97092449074662 -1.89227798246728 T:C C T 10 0.52478549951298 0.617415799777466 ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46722333_46722551:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000466510:exon_46722333_46723213:GTSE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 46752743 C/T 1 27 26 53 12.8307915131495 13.6444229873375 -0.813631474187943 T:C C T 10 0.52478549951298 0.890888380518446 ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 47083012 T/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:T T A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 47083039 G/C 1 2 10 12 0.95042900097404 5.2478549951298 -4.29742599415576 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0177435667657133 ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50216754 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50216599_50216861:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000459821:exon_50216599_50216949:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000494833:exon_50216599_50216853:BRD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50216799 C/T 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50216599_50216861:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000459821:exon_50216599_50216949:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000494833:exon_50216599_50216853:BRD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50280825 G/A 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G G A 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000100426:ENST00000216268:exon_50276982_50282090:ZBED4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50298090 C/T 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297985_50298154:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297985_50298154:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297985_50298154:ALG12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50313438 T/C 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50315363 C/A 1 16 13 29 7.60343200779232 6.82221149366874 0.781220514123579 A:C C A 10 0.52478549951298 0.85350802638375 ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000498354:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000462253:exon_50315233_50315409:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000444954:exon_50315232_50315409:CRELD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50320943 C/T 1 63 44 107 29.9385135306823 23.0905619785711 6.84795155211114 T:C C T 10 0.52478549951298 0.208302818412149 ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50320903_50321188:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50320903_50321176:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50320903_50321182:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000487969:exon_50320903_50321176:CRELD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50656439 G/C 1 34 26 60 16.1572930165587 13.6444229873375 2.5128700292212 C:G G C 10 0.52478549951298 0.605508409828295 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50656347_50656831:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50656347_50656528:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50656347_50656546:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50656347_50656527:TUBGCP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50656584 G/A 1 8 15 23 3.80171600389616 7.8717824926947 -4.07006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0980805846777547 ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50656347_50656831:TUBGCP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50659293 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50659436 C/T 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50659470 G/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658680_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658621_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50684471 G/C 1 22 21 43 10.4547190107144 11.0204954897726 -0.56577647905814 C:G G C 10 0.52478549951298 0.879800319218863 ENSG00000100429:ENST00000216271:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000415993:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000440393:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000429374:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000498366:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000483222:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000448072:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000454936:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000477814:exon_50684104_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000349505:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000395791:exon_50684339_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000497952:exon_50684220_50684521:HDAC10;ENSG00000100429:ENST00000496235:exon_50684408_50684521:HDAC10;ENSG00000188130:ENST00000497036:exon_50684339_50684521:MAPK12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50719251 A/G 1 27 15 42 12.8307915131495 7.8717824926947 4.95900902045484 A:G A G 10 0.52478549951298 0.163666562705323 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50719173_50719402:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000463165:exon_50719173_50719402:PLXNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50720430 G/C 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 C:G G C 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000492578:exon_50719995_50720435:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000427829:exon_50720283_50720510:PLXNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50722134 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50722165 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50722031_50722179:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000496720:exon_50722031_50722179:PLXNB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50751529 G/C 1 62 47 109 29.4632990301952 24.6649184771101 4.79838055308518 C:G G C 10 0.52478549951298 0.388595726416685 ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50751428_50751537:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50751428_50751537:FAM116B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50900660 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50900634_50900902:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50900634_50900902:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50900634_50900902:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000356279:exon_50900634_50900902:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50900634_50900902:SBF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50942121 C/T 1 13 18 31 6.17778850633126 9.44613899123364 -3.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.281875265233125 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50942774 C/T 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942769_50942880:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50943004 C/A 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 A:C C A 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50943010 G/A 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50943101 A/G 1 7 14 21 3.32650150340914 7.34699699318172 -4.02049548977258 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0847652640732487 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50943232 G/A 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50943231_50943413:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50943231_50943413:LMF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50957115 C/T 1 22 6 28 10.4547190107144 3.14871299707788 7.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00701910064378484 ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000425199:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395698:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000523045:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50957078_50957161:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50957078_50957161:NCAPH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50957746 G/A 1 22 18 40 10.4547190107144 9.44613899123364 1.0085800194808 A:G G A 10 0.52478549951298 0.874475388124865 ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000425199:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395698:exon_50957619_50958181:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000523045:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50957619_50957749:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50957619_50957749:NCAPH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50960791 G/A 1 69 46 115 32.7898005336044 24.1401329775971 8.6496675560073 A:G G A 10 0.52478549951298 0.112855468317115 ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000425199:exon_50960784_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50960772_50960844:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520297:exon_50960772_50960847:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000522048:exon_50960772_50960844:NCAPH2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50962208 T/G 1 159 151 310 75.5591055774362 79.24261042646 -3.68350484902382 T:G T G 10 0.52478549951298 0.690812449024212 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50962514 G/A 1 57 48 105 27.0872265277601 25.189703976623 1.89752255113709 A:G G A 10 0.52478549951298 0.76965391540215 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 50962782 C/G 1 60 41 101 28.5128700292212 21.5162054800322 6.99666454918902 C:G C G 10 0.52478549951298 0.195022347445095 ENSG00000130489:ENST00000395693:exon_50961997_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000252785:exon_50962025_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000439934:exon_50962431_50962853:SCO2;ENSG00000130489:ENST00000423348:exon_50962431_50962853:SCO2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 51012775 C/T 1 13 15 28 6.17778850633126 7.8717824926947 -1.69399398636344 T:C C T 10 0.52478549951298 0.573269193038738 ENSG00000205560:ENST00000405237:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000360719:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000312108:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000457250:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000440709:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000434492:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000395650:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000205560:ENST00000423069:exon_51012764_51012848:CPT1B;ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51012764_51012848:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000453634:exon_51012764_51012848:CTA-384D8.32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 51064039 G/C 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 C:G G C 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064007_51064109:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064007_51064109:ARSA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 22 51064416 T/C 1 20 25 45 9.5042900097404 13.1196374878245 -3.6153474780841 T:C T C 10 0.52478549951298 0.298964884160847 ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51064364_51064491:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51064364_51064491:ARSA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 3189279 A/G 1 13 10 23 6.17778850633126 5.2478549951298 0.929933511201459 A:G A G 10 0.52478549951298 0.83534679528769 ENSG00000072756:ENST00000251607:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000473275:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000280591:exon_3189134_3189387:TRNT1;ENSG00000072756:ENST00000434583:exon_3189134_3189387:TRNT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 4355106 G/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000170364:ENST00000358065:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000430981:exon_4354582_4356086:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000307483:exon_4354582_4355445:SETMAR;ENSG00000170364:ENST00000406657:exon_4354582_4355445:SETMAR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 5164112 C/T 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C C T 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000134108:ENST00000256496:exon_5163905_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000429403:exon_5163934_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000455168:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000444332:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000438743:exon_5164112_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000419534:exon_5163981_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000451374:exon_5163982_5164273:ARL8B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 5164135 G/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000134108:ENST00000256496:exon_5163905_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000429403:exon_5163934_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000455168:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000444332:exon_5163977_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000438743:exon_5164112_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000419534:exon_5163981_5164273:ARL8B;ENSG00000134108:ENST00000451374:exon_5163982_5164273:ARL8B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 8590313 T/C 1 4 12 16 1.90085800194808 6.29742599415576 -4.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0420559312099871 ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 8955389 C/T 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000070950:ENST00000264926:exon_8955328_8955404:RAD18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9413000 A/T 1 35 19 54 16.6325075170457 9.97092449074662 6.66158302629908 A:T:C A T 10 0.52478549951298 0.0767910424406193 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9412744_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9412844_9413220:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9412917_9413220:THUMPD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9426209 C/T 1 72 46 118 34.2154440350654 24.1401329775971 10.0753110574684 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0656238591876205 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9426228 C/T 1 75 57 132 35.6410875365265 29.9127734722399 5.72831406428664 T:C C T 10 0.52478549951298 0.338393447987252 ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9426208_9427386:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9426208_9428475:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9426208_9426554:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9426208_9426344:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9426208_9426554:THUMPD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9798692 C/T 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C C T 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000114026:ENST00000339511:exon_9798451_9799061:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000425665:exon_9798451_9798888:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000441094:exon_9798451_9798719:OGG1;ENSG00000114026:ENST00000383825:exon_9798451_9798875:OGG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9876919 G/A 1 41 28 69 19.4837945199678 14.6939939863634 4.78980053360438 A:G G A 10 0.52478549951298 0.278617082169861 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9876778_9877016:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9877031 G/A 1 25 23 48 11.8803625121755 12.0700664887985 -0.189703976623042 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9876365_9877085:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9876778_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9876778_9877087:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9876365_9877088:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9876365_9877042:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9876778_9877087:TTLL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9877127 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9879890 A/G 1 65 55 120 30.8889425316563 28.8632024732139 2.02574005844239 A:G A G 10 0.52478549951298 0.715951933893016 ENSG00000156990:ENST00000423108:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000433535:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000383820:exon_9879533_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000287624:exon_9879534_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000464783:exon_9879566_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000466141:exon_9879578_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000424438:exon_9879704_9879891:RPUSD3;ENSG00000156990:ENST00000427174:exon_9879849_9879891:RPUSD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9990800 G/C 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 C:G G C 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9991101 C/G 1 14 17 31 6.65300300681828 8.92135349172066 -2.26835048490238 C:G C G 10 0.52478549951298 0.473822628331597 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 9991163 A/G 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G A G 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 10067797 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 10115043 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10114937_10115046:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10114937_10115046:FANCD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 10138069 T/G 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 T:G T G 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 10302172 G/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10301821_10302354:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10301870_10302354:TATDN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 11596302 T/C 1 31 24 55 14.7316495150976 12.5948519883115 2.1367975267861 T:C T C 10 0.52478549951298 0.591584730894599 ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 11606467 C/T 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000144560:ENST00000273038:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000413604:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000451674:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424529:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000426568:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000430365:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000404339:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000445411:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000418000:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000458499:exon_11606271_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417206:exon_11606240_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000417466:exon_11606322_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000424709:exon_11606326_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000419541:exon_11606366_11606493:VGLL4;ENSG00000144560:ENST00000437722:exon_11606389_11606493:VGLL4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 12545058 A/G 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000154743:ENST00000446004:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000314571:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000402228:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000284995:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000473755:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000383797:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000444864:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000415684:exon_12544761_12545283:TSEN2;ENSG00000154743:ENST00000490981:exon_12544945_12545283:TSEN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 12877704 G/A 1 779 5842 6621 370.192095879389 3065.79688815483 -2695.60479227544 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 0 ENSG00000144713:ENST00000429711:exon_12875984_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12876445_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000273223:exon_12877546_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12877549_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12877559_12877722:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12877601_12877722:RPL32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 12881757 C/T 1 22 44 66 10.4547190107144 23.0905619785711 -12.6358429678567 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00194442152758029 ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 13395097 C/A 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:C C A 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000132182:ENST00000254508:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000479519:exon_13395054_13395160:NUP210;ENSG00000132182:ENST00000420141:exon_13395054_13395160:NUP210 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 14200158 G/C 1 15 7 22 7.1282175073053 3.67349849659086 3.45471901071444 C:G G C 10 0.52478549951298 0.19936513171716 ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14199511_14200392:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14199511_14200392:XPC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 15080696 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000177463:ENST00000425241:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000323373:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000475707:exon_15079507_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000393102:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000383792:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000396874:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000478572:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000439011:exon_15080629_15080734:NR2C2;ENSG00000177463:ENST00000413194:exon_15080629_15080734:NR2C2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 15624436 C/T 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000421993:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000414979:exon_15624385_15624496:HACL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 16305674 C/G 1 23 11 34 10.9299335112015 5.77264049464278 5.15729301655868 C:G C G 10 0.52478549951298 0.086653964090488 ENSG00000154813:ENST00000488423:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000285082:exon_16305662_16305736:DPH3;ENSG00000154813:ENST00000462982:exon_16305662_16305736:DPH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 16327855 T/G 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:G T G 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 17051328 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000154822:ENST00000460467:exon_17051166_17051578:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 17053499 A/G 1 10 15 25 4.7521450048702 7.8717824926947 -3.1196374878245 A:G A G 10 0.52478549951298 0.233943044921702 ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 20212621 T/G 1 15 9 24 7.1282175073053 4.72306949561682 2.40514801168848 T:G T G 10 0.52478549951298 0.414765733374574 ENSG00000129810:ENST00000306698:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000429446:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522489:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000529155:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000452020:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000440105:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000442720:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000460637:exon_20212535_20212759:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20212535_20212724:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000427162:exon_20212535_20212724:SGOL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 25833228 T/C 1 19 12 31 9.02907550925338 6.29742599415576 2.73164951509762 T:C T C 10 0.52478549951298 0.371395475613226 ENSG00000151093:ENST00000280701:exon_25832481_25833488:OXSM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 32525514 G/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000091317:ENST00000205636:exon_32522804_32525589:CMTM6;ENSG00000091317:ENST00000478886:exon_32525231_32525589:CMTM6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33155782 G/A 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33155795 T/C 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33155471_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33155531_33156040:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33155546_33156040:CRTAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33166039 A/G 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33165900_33166071:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000423366:exon_33165916_33166068:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000449224:exon_33165900_33166071:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33165900_33166071:CRTAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33171439 G/A 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000170275:ENST00000320954:exon_33171431_33171559:CRTAP;ENSG00000170275:ENST00000485310:exon_33171431_33171559:CRTAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33863556 C/T 1 18 10 28 8.55386100876636 5.2478549951298 3.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.257367377359129 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33863447_33863574:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33863447_33863574:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000435909:exon_33863447_33863574:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000413073:exon_33863527_33863574:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000484478:exon_33863447_33863574:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000494810:exon_33863447_33863574:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000459659:exon_33863465_33863574:PDCD6IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33877626 G/A 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33885684 A/G 1 34 38 72 16.1572930165587 19.9418489814932 -3.78455596493456 A:G A G 10 0.52478549951298 0.409495319098146 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33885604_33885715:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33885604_33885715:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33885604_33885715:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33885583_33885715:PDCD6IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33905566 C/T 1 22 21 43 10.4547190107144 11.0204954897726 -0.56577647905814 T:C C T 10 0.52478549951298 0.879800319218863 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000465122:exon_33905498_33905609:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000489869:exon_33905498_33905621:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33905388_33905621:PDCD6IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 33907945 A/G 1 62 54 116 29.4632990301952 28.3384169737009 1.12488205649431 A:G A G 10 0.52478549951298 0.853005383657447 ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 37053323 C/T 1 9 16 25 4.27693050438318 8.39656799220768 -4.1196374878245 T:C C T 10 0.52478549951298 0.111379558353423 ENSG00000076242:ENST00000231790:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000457004:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000432299:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000442249:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000454028:exon_37053311_37053331:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000396438:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000456676:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000458205:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000455445:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000435176:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000441265:exon_37053311_37053353:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000492474:exon_37053311_37053331:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000485889:exon_37053311_37053327:MLH1;ENSG00000076242:ENST00000383761:exon_37053311_37053353:MLH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 37388778 T/G 1 12 22 34 5.70257400584424 11.5452809892856 -5.84270698344132 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0576883333529612 ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37388684_37388787:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37388684_37388787:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37388684_37388787:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37388684_37388787:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37388684_37388787:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37388684_37388787:GOLGA4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 38047954 G/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 C:G G C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000136059:ENST00000283713:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000383759:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000356246:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000465644:exon_38047940_38048191:VILL;ENSG00000136059:ENST00000486616:exon_38047672_38048191:VILL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 38565538 A/T 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 A:T A T 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000157036:ENST00000412107:exon_38565392_38565904:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000436414:exon_38565392_38566359:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000287675:exon_38565392_38567442:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000431472:exon_38565392_38565908:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000447573:exon_38565392_38566309:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000422077:exon_38565392_38566190:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000454803:exon_38565392_38565894:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000438992:exon_38565392_38566059:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000457367:exon_38565392_38566612:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000450732:exon_38565392_38565551:EXOG;ENSG00000157036:ENST00000483749:exon_38565392_38565737:EXOG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 39180099 T/C 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180047_39180114:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 39184510 C/A 1 14 15 29 6.65300300681828 7.8717824926947 -1.21877948587642 A:C C A 10 0.52478549951298 0.711956673181561 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 39184626 C/T 1 10 13 23 4.7521450048702 6.82221149366874 -2.07006648879854 T:C C T 10 0.52478549951298 0.411031583507491 ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 41996275 A/G 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000168038:ENST00000301831:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000420927:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000497684:exon_41996114_41996290:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000453224:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000431379:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000414606:exon_41996114_41996299:ULK4;ENSG00000168038:ENST00000460978:exon_41996114_41996299:ULK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 42251263 C/T 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42251259_42251477:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000341421:exon_42251259_42254115:TRAK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 42265166 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000182606:ENST00000487159:exon_42264434_42267381:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000327628:exon_42264434_42267260:TRAK1;ENSG00000182606:ENST00000396175:exon_42264434_42267381:TRAK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 42610374 A/G 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 A:G A G 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 42679497 C/T 1 24 19 43 11.4051480116885 9.97092449074662 1.43422352094186 T:C C T 10 0.52478549951298 0.760588390841897 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 42679777 T/G 1 27 34 61 12.8307915131495 17.8427069834413 -5.01191547029178 T:G T G 10 0.52478549951298 0.202826447659834 ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 45533224 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45533009_45533292:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45533009_45533292:LARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 45557707 G/A 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000011376:ENST00000265537:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000415258:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000414984:exon_45557586_45557768:LARS2;ENSG00000011376:ENST00000467936:exon_45557586_45557768:LARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 45779136 A/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:T A T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000433336:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45779075_45779144:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000471207:exon_45778736_45779144:SACM1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 45785126 G/T 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:G G T 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000211456:ENST00000455997:exon_45785025_45786899:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000418611:exon_45785025_45785296:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000389061:exon_45785025_45786901:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000441228:exon_45785025_45785427:SACM1L;ENSG00000211456:ENST00000464102:exon_45785025_45786900:SACM1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47018214 T/C 1 30 15 45 14.2564350146106 7.8717824926947 6.3846525219159 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0722583285880021 ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_47018127_47018238:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_47018127_47018249:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000446836:exon_47018127_47018333:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000494655:exon_47018127_47018235:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000460035:exon_47018127_47018247:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000492819:exon_47017497_47018270:CCDC12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47045739 C/G 1 34 20 54 16.1572930165587 10.4957099902596 5.66158302629908 C:G C G 10 0.52478549951298 0.134912237626992 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47045846 C/T 1 16 13 29 7.60343200779232 6.82221149366874 0.781220514123579 T:C C T 10 0.52478549951298 0.85350802638375 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47045567_47045883:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000441027:exon_47045662_47045883:NBEAL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47047698 G/A 1 49 43 92 23.285510523864 22.5657764790581 0.719734044805836 A:G G A 10 0.52478549951298 0.917104560049678 ENSG00000160796:ENST00000292309:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000383740:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000450053:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000416683:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000443829:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000486870:exon_47047655_47047752:NBEAL2;ENSG00000160796:ENST00000423436:exon_47047655_47047752:NBEAL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47125385 G/A 1 30 15 45 14.2564350146106 7.8717824926947 6.3846525219159 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0722583285880021 ENSG00000181555:ENST00000431180:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000330022:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000451092:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000409792:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000445387:exon_47125210_47125872:SETD2;ENSG00000181555:ENST00000492397:exon_47125210_47125436:SETD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47452786 G/A 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 A:G G A 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47456137 G/A 1 28 31 59 13.3060060136366 16.2683504849024 -2.96234447126582 A:G G A 10 0.52478549951298 0.51491901151511 ENSG00000114650:ENST00000360832:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000339815:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000441517:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000383739:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000320017:exon_47456062_47456142:SCAP;ENSG00000114650:ENST00000265565:exon_47456062_47456142:SCAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47537515 G/A 1 53 52 105 25.1863685258121 27.288845974675 -2.10247744886291 A:G G A 10 0.52478549951298 0.696875663129286 ENSG00000163832:ENST00000296149:exon_47537130_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000442215:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000450051:exon_47537131_47537687:C3orf75;ENSG00000163832:ENST00000446787:exon_47537436_47537687:C3orf75 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47712202 T/C 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 T:C T C 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000173473:ENST00000254480:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000425518:exon_47712148_47712207:SMARCC1;ENSG00000173473:ENST00000483847:exon_47711840_47712207:SMARCC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 47956424 C/T 1 48 59 107 22.810296023377 30.9623444712658 -8.15204844788887 T:C C T 10 0.52478549951298 0.121871850258143 ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47956307_47956429:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47956307_47956429:MAP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48473953 C/G 1 49 37 86 23.285510523864 19.4170634819803 3.86844704188372 C:G C G 10 0.52478549951298 0.450227303975646 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48474249 A/G 1 24 16 40 11.4051480116885 8.39656799220768 3.0085800194808 A:C:G A G 10 0.52478549951298 0.429013958152278 ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48491568 A/C 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:C A C 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000164053:ENST00000421175:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000454733:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48491443_48491576:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48491443_48491576:ATRIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48501819 G/A 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48501920 C/T 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C C T 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48508585 C/T 1 101 78 179 47.996664549189 40.9332689620124 7.06339558717657 T:C C T 10 0.52478549951298 0.29586054536187 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000492235:exon_48508177_48508832:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48509036 T/C 1 47 42 89 22.3350815228899 22.0409909795452 0.29409054334478 T:C:G T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48717117 G/A 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 A:G G A 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000213672:ENST00000341520:exon_48717008_48717146:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000416649:exon_48717008_48717146:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000294129:exon_48717008_48717146:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000470006:exon_48717008_48717147:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000415281:exon_48717008_48717146:NCKIPSD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 48727112 G/A 1 26 28 54 12.3555770126625 14.6939939863634 -2.33841697370092 A:G G A 10 0.52478549951298 0.586434959423221 ENSG00000068745:ENST00000328631:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395507:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000395509:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000479914:exon_48726971_48727146:IP6K2;ENSG00000068745:ENST00000491686:exon_48727043_48727146:IP6K2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49052422 G/A 1 67 57 124 31.8393715326303 29.9127734722399 1.92659806039048 A:G G A 10 0.52478549951298 0.787522031127681 ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49052258_49052791:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49052258_49052858:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49052258_49053022:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49052258_49052798:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49052258_49052780:WDR6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49135653 G/A 1 467 380 847 221.925171727438 199.418489814932 22.5066819125059 A:G G A 10 0.52478549951298 0.121760457871076 ENSG00000172053:ENST00000482248:exon_49135625_49135913:QARS;ENSG00000172053:ENST00000453392:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000306125:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000497635:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000430182:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000445471:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000494984:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000414533:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000420147:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000464962:exon_49135625_49135691:QARS;ENSG00000172053:ENST00000459870:exon_49135425_49135913:QARS;ENSG00000172053:ENST00000470113:exon_49135425_49135913:QARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49151428 C/T 1 18 20 38 8.55386100876636 10.4957099902596 -1.94184898149324 T:C C T 10 0.52478549951298 0.62669235128267 ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49712734 C/G 1 34 51 85 16.1572930165587 26.764060475162 -10.6067674586033 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0225533402611978 ENSG00000164062:ENST00000296456:exon_49712616_49712742:APEH;ENSG00000164062:ENST00000483715:exon_49712616_49713220:APEH;ENSG00000164062:ENST00000438011:exon_49712616_49712742:APEH;ENSG00000164062:ENST00000462439:exon_49712616_49712742:APEH;ENSG00000164062:ENST00000463616:exon_49712616_49712742:APEH;ENSG00000164062:ENST00000457042:exon_49712616_49712742:APEH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49721798 C/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173531:ENST00000448220:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000449682:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000383728:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000479115:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000492329:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000428801:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000488350:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000493836:exon_49721747_49721886:MST1;ENSG00000173531:ENST00000484144:exon_49721758_49721886:MST1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49751585 C/T 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49758764 A/G 1 41 29 70 19.4837945199678 15.2187794858764 4.2650150340914 A:G A G 10 0.52478549951298 0.339316562546275 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49758780 C/G 1 30 32 62 14.2564350146106 16.7931359844154 -2.53670096980476 C:G C G 10 0.52478549951298 0.527843785473291 ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49758618_49758960:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49758618_49758959:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000498376:exon_49758618_49758962:RNF123;ENSG00000173540:ENST00000480687:exon_49754277_49759316:GMPPB;ENSG00000173540:ENST00000308375:exon_49757357_49759580:GMPPB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49847737 C/T 1 22 18 40 10.4547190107144 9.44613899123364 1.0085800194808 T:C C T 10 0.52478549951298 0.874475388124865 ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49847696_49847861:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000473992:exon_49847411_49847783:UBA7;ENSG00000182179:ENST00000489826:exon_49847412_49847861:UBA7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 49949071 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000164077:ENST00000296473:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000419032:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000417270:exon_49948959_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000484985:exon_49948965_49949444:MON1A;ENSG00000164077:ENST00000483022:exon_49949054_49949444:MON1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 50114515 C/T 1 80 27 107 38.0171600389616 14.1692084868505 23.8479515521111 T:C C T 10 0.52478549951298 2.54995420836984e-06 ENSG00000004534:ENST00000442092:exon_50114441_50114682:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000266022:exon_50114441_50114683:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000443081:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000419610:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000422955:exon_50114441_50114681:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000454079:exon_50114441_50114680:RBM6;ENSG00000004534:ENST00000421682:exon_50114441_50114682:RBM6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 50144951 T/C 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:C T C 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000395174:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000496179:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000474818:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000494360:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000441812:exon_50144915_50145002:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000489437:exon_50144914_50145002:RBM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 50153356 T/C 1 57 54 111 27.0872265277601 28.3384169737009 -1.25119044594079 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.849500363402755 ENSG00000003756:ENST00000347869:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464087:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475128:exon_50153339_50153376:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000475590:exon_50153339_50153413:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000492430:exon_50153339_50153613:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000479275:exon_50153339_50153664:RBM5;ENSG00000003756:ENST00000464988:exon_50153339_50153413:RBM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 50369546 C/A 1 10 18 28 4.7521450048702 9.44613899123364 -4.69399398636344 A:C C A 10 0.52478549951298 0.088906379726713 ENSG00000068028:ENST00000362008:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000327761:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395126:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000357043:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395117:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000359365:exon_50369481_50369585:RASSF1;ENSG00000068028:ENST00000395129:exon_50369481_50369597:RASSF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 50609624 T/G 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:G T G 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50609546_50609639:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000424388:exon_50609546_50609639:HEMK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 50614965 G/A 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50614940_50615004:HEMK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52003391 G/A 1 71 52 123 33.7402295345784 27.288845974675 6.45138355990346 A:G G A 10 0.52478549951298 0.278634313596721 ENSG00000114779:ENST00000483233:exon_52002526_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000487005:exon_52002532_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000395008:exon_52002546_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000361143:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000439982:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000315877:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000461108:exon_52003100_52004200:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000525795:exon_52003289_52003621:ABHD14B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52012000 C/G 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 C:G C G 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52011963_52012098:RP11-155D18.11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52264907 T/C 1 89 82 171 42.2940905433448 43.0324109600644 -0.738320416719581 T:C T C 10 0.52478549951298 0.939038118822372 ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52521560 G/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000010322:ENST00000479054:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000345716:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000414197:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000489895:exon_52521212_52522621:NISCH;ENSG00000010322:ENST00000488243:exon_52521212_52521669:NISCH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52558877 C/T 1 64 44 108 30.4137280311693 23.0905619785711 7.32316605259816 T:C C T 10 0.52478549951298 0.177403285833541 ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000463947:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000479024:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000462261:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52558833_52558897:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000469616:exon_52558833_52559076:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000466112:exon_52558833_52558897:NT5DC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52780216 G/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52780077_52780226:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52780077_52780226:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52780077_52780226:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000487068:exon_52780166_52780226:NEK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 52786076 T/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52785948_52786352:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52785948_52786352:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52785948_52786352:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000487068:exon_52785948_52786086:NEK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 53125922 T/C 1 81 71 152 38.4923745394486 37.2597704654216 1.23260407402704 T:C T C 10 0.52478549951298 0.871185610844148 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 53126396 C/A 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:C C A 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53126385_53126634:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53126385_53126634:RFT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 53220215 G/A 1 151 131 282 71.75738957354 68.7469004362004 3.01048913733962 A:G G A 10 0.52478549951298 0.765678789078989 ENSG00000163932:ENST00000394729:exon_53220183_53220356:PRKCD;ENSG00000163932:ENST00000330452:exon_53220183_53220356:PRKCD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 53886912 C/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000056736:ENST00000288167:exon_53886898_53887024:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000475124:exon_53886898_53887024:IL17RB;ENSG00000056736:ENST00000494338:exon_53886898_53887024:IL17RB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 56658871 T/C 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 58154177 G/A 1 51 48 99 24.235939524838 25.189703976623 -0.953764451785027 A:G G A 10 0.52478549951298 0.919913772551515 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 58154327 C/T 1 41 50 91 19.4837945199678 26.239274975649 -6.75548045568118 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.172608899744439 ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 58191242 C/G 1 3 11 14 1.42564350146106 5.77264049464278 -4.34699699318172 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0291103619486302 ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000461914:exon_58191198_58191287:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000460422:exon_58191217_58191287:DNASE1L3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 63982082 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 66419942 A/G 1 11 19 30 5.22735950535722 9.97092449074662 -4.7435649853894 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0997823336227106 ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 67704954 C/T 1 17 12 29 8.07864650827934 6.29742599415576 1.78122051412358 T:C C T 10 0.52478549951298 0.579302264605088 ENSG00000172340:ENST00000493112:exon_67704927_67705034:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000307227:exon_67704927_67705038:SUCLG2;ENSG00000172340:ENST00000492795:exon_67704927_67705031:SUCLG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 69096614 G/A 1 15 8 23 7.1282175073053 4.19828399610384 2.92993351120146 A:G G A 10 0.52478549951298 0.296787100662300 ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 69151152 C/A 1 37 34 71 17.5829365180197 17.8427069834413 -0.259770465421582 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69151060_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69151110_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 75471327 C/T 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.491891556397476 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 81539565 G/A 1 97 87 184 46.0958065472409 45.6563384576293 0.439468089611672 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81538850_81539614:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81538852_81539614:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81539084_81539614:GBE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 81698119 C/T 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 81698130 T/C 1 11 16 27 5.22735950535722 8.39656799220768 -3.16920848685046 T:C T C 10 0.52478549951298 0.250689856013828 ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000498468:exon_81698007_81698142:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000486920:exon_81698118_81698142:GBE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 88199179 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 88199298 T/C 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 97666220 C/T 1 25 19 44 11.8803625121755 9.97092449074662 1.90943802142888 T:C C T 10 0.52478549951298 0.651371279246122 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503097:exon_97666205_97666245:MINA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 97666275 A/G 1 14 18 32 6.65300300681828 9.44613899123364 -2.79313598441536 A:G A G 10 0.52478549951298 0.377529041769322 ENSG00000170854:ENST00000442492:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000333396:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000394198:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000506682:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000360258:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000503517:exon_97666205_97666293:MINA;ENSG00000170854:ENST00000514314:exon_97666260_97666293:MINA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 98250862 C/A 1 65 20 85 30.8889425316563 10.4957099902596 20.3932325413967 A:C C A 10 0.52478549951298 6.23120128413351e-06 ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 98304403 G/A 1 11 10 21 5.22735950535722 5.2478549951298 -0.0204954897725802 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98304285_98304503:CPOX;ENSG00000080819:ENST00000510489:exon_98304285_98304706:CPOX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 98512540 G/A 1 43 38 81 20.4342235209419 19.9418489814932 0.492374539448619 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000064225:ENST00000483910:exon_98512519_98513206:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000469105:exon_98512519_98514098:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000462152:exon_98512519_98512788:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000486249:exon_98512519_98514689:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000497621:exon_98512519_98513237:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000493584:exon_98512519_98512839:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000394162:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000265261:exon_98512519_98513234:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000474595:exon_98512519_98512609:ST3GAL6;ENSG00000064225:ENST00000491912:exon_98512519_98512636:ST3GAL6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 100084432 G/A 1 79 71 150 37.5419455384746 37.2597704654216 0.282175073052997 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000154174:ENST00000284320:exon_100082275_100084561:TOMM70A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 100467018 T/C 1 62 49 111 29.4632990301952 25.714489476136 3.74880955405921 T:C T C 10 0.52478549951298 0.506650963339955 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 100467117 G/A 1 101 89 190 47.996664549189 46.7059094566552 1.29075509253379 A:G G A 10 0.52478549951298 0.884609744584737 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 100467413 A/G 1 185 161 346 87.9146825900987 84.4904654215898 3.4242171685089 A:G A G 10 0.52478549951298 0.746792756858742 ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 108279609 A/C 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:C A C 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000163507:ENST00000491772:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000295746:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000481530:exon_108279496_108279688:KIAA1524;ENSG00000163507:ENST00000487834:exon_108279582_108279688:KIAA1524 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 108373022 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000198919:ENST00000361582:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000495008:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000463306:exon_108372992_108373157:DZIP3;ENSG00000198919:ENST00000437062:exon_108372992_108373157:DZIP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 111312965 A/T 1 5 13 18 2.3760725024351 6.82221149366874 -4.44613899123364 A:T A T 10 0.52478549951298 0.0560173488896552 ENSG00000177494:ENST00000317012:exon_111311747_111313913:ZBED2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 112066562 G/A 1 2 10 12 0.95042900097404 5.2478549951298 -4.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0177435667657133 ENSG00000091972:ENST00000498096:exon_112066410_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000451093:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000315711:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000473539:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000393901:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000383681:exon_112066405_112066677:CD200;ENSG00000091972:ENST00000478595:exon_112066410_112066677:CD200 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 112184927 A/G 1 119 126 245 56.5505255579554 66.1229729386355 -9.57244738068011 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.224805109290864 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 112185025 G/A 1 148 154 302 70.331746072079 80.8169669249989 -10.48522085292 A:G G A 10 0.52478549951298 0.249159134401979 ENSG00000186265:ENST00000334529:exon_112182815_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000474965:exon_112184773_112185230:BTLA;ENSG00000186265:ENST00000383680:exon_112184955_112185230:BTLA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 112256630 A/G 1 61 65 126 28.9880845297082 34.1110574683437 -5.12297293863548 A:G A G 10 0.52478549951298 0.373450952753583 ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 112727184 A/T 1 28 22 50 13.3060060136366 11.5452809892856 1.760725024351 A:T A T 10 0.52478549951298 0.672271363881817 ENSG00000163608:ENST00000314400:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000383675:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000450539:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000413226:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000451323:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000431626:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000393857:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000412848:exon_112727106_112727195:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000486271:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472637:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469809:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000474311:exon_112727018_112727647:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472705:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000473284:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000469169:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000489848:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000462295:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000461381:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000482229:exon_112727018_112727277:C3orf17;ENSG00000163608:ENST00000472762:exon_112727018_112727277:C3orf17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 113172674 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113172313_113172797:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113172313_113172797:SPICE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 119120916 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000031081:ENST00000264245:exon_119120669_119121244:ARHGAP31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 119305142 G/A 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G G A 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 119720980 T/A 1 9 9 18 4.27693050438318 4.72306949561682 -0.44613899123364 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000082701:ENST00000264235:exon_119720893_119721086:GSK3B;ENSG00000082701:ENST00000316626:exon_119720893_119721086:GSK3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 121383297 G/A 1 92 78 170 43.7197340448058 40.9332689620124 2.7864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.701318915458122 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 121414061 C/T 1 17 13 30 8.07864650827934 6.82221149366874 1.2564350146106 T:C C T 10 0.52478549951298 0.716625660711107 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 121415720 T/C 1 8 13 21 3.80171600389616 6.82221149366874 -3.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.197956855238699 ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 121526204 G/A 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 121605238 A/G 1 24 7 31 11.4051480116885 3.67349849659086 7.73164951509762 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00620223753189419 ENSG00000145088:ENST00000490434:exon_121605189_121605315:EAF2;ENSG00000145088:ENST00000273668:exon_121605189_121605373:EAF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 121659818 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163406:ENST00000489711:exon_121659678_121662949:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000295605:exon_121659678_121660099:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000436799:exon_121659678_121660457:SLC15A2;ENSG00000163406:ENST00000469422:exon_121659678_121659829:SLC15A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 122134380 C/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000196981:ENST00000330689:exon_122130715_122134882:WDR5B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 122259606 T/C 1 31 37 68 14.7316495150976 19.4170634819803 -4.68541396688264 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.275657443268742 ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 122354037 A/G 1 36 40 76 17.1077220175327 20.9914199805192 -3.88369796298648 A:G A G 10 0.52478549951298 0.42172759079684 ENSG00000173200:ENST00000464300:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000483793:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000465304:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000310366:exon_122353867_122354041:PARP15;ENSG00000173200:ENST00000493645:exon_122353867_122354041:PARP15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 122864436 G/A 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000472319:exon_122864369_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122863354_122864439:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122864369_122864439:PDIA5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 124951821 C/T 1 15 14 29 7.1282175073053 7.34699699318172 -0.218779485876421 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 125725242 A/G 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 A:G A G 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125725198_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125725200_125725407:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000383598:exon_125725201_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504118:exon_125725201_125725471:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512557:exon_125725206_125725407:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000506102:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125725206_125726068:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125725216_125725407:SLC41A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 125786852 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000458524:exon_125786790_125786858:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 127295857 C/G 1 9 16 25 4.27693050438318 8.39656799220768 -4.1196374878245 C:G C G 10 0.52478549951298 0.111379558353423 ENSG00000163870:ENST00000296210:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000450633:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000355552:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000393400:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000483868:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000489960:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490290:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000469111:exon_127295833_127295919:TPRA1;ENSG00000163870:ENST00000490643:exon_127295833_127295919:TPRA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 127323830 C/T 1 29 25 54 13.7812205141236 13.1196374878245 0.661583026299077 T:C C T 10 0.52478549951298 0.892308581443854 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 127337958 C/T 1 26 39 65 12.3555770126625 20.4666344810062 -8.1110574683437 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0471573719622106 ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127337870_127338121:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468414:exon_127337870_127338121:MCM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 127379546 C/T 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000114631:ENST00000342480:exon_127379221_127380002:PODXL2;ENSG00000114631:ENST00000302192:exon_127379221_127379876:PODXL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 127872506 C/T 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C C T 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000175792:ENST00000464873:exon_127872046_127872757:RUVBL1;ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127872297_127872666:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_127872344_127872666:EEFSEC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 127983495 T/C 1 8 12 20 3.80171600389616 6.29742599415576 -2.4957099902596 T:C T C 10 0.52478549951298 0.273886654959245 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_127983460_127983624:EEFSEC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128126945 C/T 1 13 26 39 6.17778850633126 13.6444229873375 -7.46663448100622 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.0235406154965818 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_128126912_128127485:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_128126912_128127485:EEFSEC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128127036 G/A 1 22 38 60 10.4547190107144 19.9418489814932 -9.4871299707788 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0192154271412492 ENSG00000132394:ENST00000254730:exon_128126912_128127485:EEFSEC;ENSG00000132394:ENST00000483457:exon_128126912_128127485:EEFSEC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128344378 T/C 1 220 182 402 104.547190107144 95.5109609113624 9.03622919578203 T:C T C 10 0.52478549951298 0.369297715209264 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344377_128344496:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344377_128344496:RPN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128356699 C/T 1 116 117 233 55.1248820564943 61.3999034430187 -6.27502138652435 T:C C T 10 0.52478549951298 0.431443871196960 ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128614185 A/C 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 A:C A C 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128615338 C/T 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128615279_128615379:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128615279_128615379:ACAD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128890350 G/A 1 169 142 311 80.3112505823064 74.5195409308432 5.79170965146321 A:G G A 10 0.52478549951298 0.532491617702151 ENSG00000169714:ENST00000502976:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000422453:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000451728:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000446936:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000307433:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000393290:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000500450:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000504813:exon_128890289_128890351:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000441626:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000502372:exon_128889922_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000512338:exon_128890289_128890381:CNBP;ENSG00000169714:ENST00000507573:exon_128890095_128890614:CNBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128976396 T/C 1 25 18 43 11.8803625121755 9.44613899123364 2.43422352094186 T:C T C 10 0.52478549951298 0.542022119251048 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 128976451 C/G 1 34 33 67 16.1572930165587 17.3179214839283 -1.16062846736966 C:G C G 10 0.52478549951298 0.807514988914029 ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128976313_128976470:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128976313_128976470:COPG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 129238474 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000163913:ENST00000347300:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000296266:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000507564:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000512220:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000504021:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000349441:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000348417:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000431818:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000454840:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000440957:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000506507:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000511425:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000446384:exon_129238411_129238575:IFT122;ENSG00000163913:ENST00000513190:exon_129238411_129238575:IFT122 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 132345648 C/A 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:C C A 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000240303:ENST00000496418:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000355458:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000264990:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000485198:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000469042:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000487024:exon_132345535_132345918:ACAD11;ENSG00000240303:ENST00000481970:exon_132345535_132345661:ACAD11;ENSG00000113971:ENST00000471702:exon_132345535_132345661:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393156:exon_132345535_132345661:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000393144:exon_132345535_132345661:NPHP3;ENSG00000113971:ENST00000326682:exon_132345535_132345661:NPHP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 133524717 G/C 1 24 21 45 11.4051480116885 11.0204954897726 0.384652521915898 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133524520_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000484684:exon_133524459_133524846:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133524665_133524846:SRPRB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 133538615 C/T 1 90 92 182 42.7693050438318 48.2802659551942 -5.51096091136236 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.415485810207532 ENSG00000144867:ENST00000466490:exon_133538397_133539525:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000273406:exon_133538397_133539523:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000481356:exon_133538397_133538753:SRPRB;ENSG00000144867:ENST00000466636:exon_133538397_133538664:SRPRB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 134197406 T/A 1 47 53 100 22.3350815228899 27.8136314741879 -5.478549951298 A:T T A 10 0.52478549951298 0.316715036778552 ENSG00000129055:ENST00000510994:exon_134196548_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000354910:exon_134196550_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000514612:exon_134196553_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000511751:exon_134196918_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000508755:exon_134197320_134197557:ANAPC13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 136574501 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000168917:ENST00000446465:exon_136573285_136574734:TMEM22;ENSG00000168917:ENST00000448682:exon_136573285_136574732:TMEM22;ENSG00000168917:ENST00000393079:exon_136573285_136574730:TMEM22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 136664441 A/G 1 15 7 22 7.1282175073053 3.67349849659086 3.45471901071444 A:G A G 10 0.52478549951298 0.19936513171716 ENSG00000158092:ENST00000288986:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000481752:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000491539:exon_136664425_136664585:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000485096:exon_136664425_136664544:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000488930:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000496489:exon_136664425_136664594:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000469404:exon_136664425_136665137:NCK1;ENSG00000158092:ENST00000467911:exon_136664425_136664594:NCK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 137880743 G/A 1 11 12 23 5.22735950535722 6.29742599415576 -1.07006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.681491778056056 ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 139079970 T/C 1 146 136 282 69.3813170711049 71.3708279337653 -1.98951086266037 T:C T C 10 0.52478549951298 0.811862287892281 ENSG00000184432:ENST00000333188:exon_139079923_139080137:COPB2;ENSG00000184432:ENST00000507777:exon_139079923_139080137:COPB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 140692621 A/T 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:T A T 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000114120:ENST00000446041:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000324194:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502594:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000453248:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000512023:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000512506:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000502866:exon_140692558_140692831:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000511757:exon_140692558_140692847:SLC25A36;ENSG00000114120:ENST00000514629:exon_140692508_140692847:SLC25A36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 141164107 T/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:C T C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 149678534 C/T 1 11 15 26 5.22735950535722 7.8717824926947 -2.64442298733748 T:C C T 10 0.52478549951298 0.330542748984287 ENSG00000082996:ENST00000392894:exon_149678527_149679926:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000344229:exon_149678527_149679909:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000491086:exon_149678527_149678803:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467977:exon_149678527_149678552:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000474348:exon_149678527_149678620:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000467996:exon_149678527_149678537:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000361785:exon_149678527_149679913:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000482083:exon_149678527_149678672:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000468289:exon_149678527_149679161:RNF13;ENSG00000082996:ENST00000493238:exon_149678527_149679161:RNF13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 149700560 G/A 0 117 0 117 55.6000965569813 0 55.6000965569813 G G 10 0.52478549951298 1.86134284624412e-33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 150282121 C/T 1 25 26 51 11.8803625121755 13.6444229873375 -1.76406047516198 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.675005862075556 ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150282086_150282168:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150282086_150282168:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000494558:exon_150282086_150282168:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150282086_150282686:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150282086_150282168:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150282086_150282168:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150282086_150282164:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150282086_150282168:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150282086_150282168:EIF2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 154018887 G/C 1 14 21 35 6.65300300681828 11.0204954897726 -4.3674924829543 C:G G C 10 0.52478549951298 0.175288958873817 ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 156266774 C/T 1 96 100 196 45.6205920467539 52.478549951298 -6.85795790454409 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.352621864753756 ENSG00000114850:ENST00000265044:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467789:exon_156266655_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000476217:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000498205:exon_156266694_156266888:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000478842:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000464138:exon_156266594_156266786:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000463503:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000496050:exon_156266694_156266792:SSR3;ENSG00000114850:ENST00000467733:exon_156266694_156266792:SSR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 158320703 C/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000178053:ENST00000355893:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000491767:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000312827:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000484955:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000359117:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000498592:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000471745:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000497004:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392821:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392820:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000469452:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000482628:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000478894:exon_158320596_158320728:MLF1;ENSG00000178053:ENST00000392822:exon_158320596_158320728:MLF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 158376836 C/T 1 13 14 27 6.17778850633126 7.34699699318172 -1.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.702688159671681 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158376711_158376848:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478576:exon_158376711_158376848:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158376711_158376859:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158376711_158376848:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158376711_158376848:GFM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 158409262 C/T 1 58 67 125 27.5624410282472 35.1606284673697 -7.5981874391225 T:C C T 10 0.52478549951298 0.180013793669039 ENSG00000168827:ENST00000486715:exon_158409125_158410364:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000478254:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000458558:exon_158409125_158410361:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000264263:exon_158409125_158410358:GFM1;ENSG00000168827:ENST00000472383:exon_158409125_158409688:GFM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 158538056 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000118855:ENST00000415822:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000264266:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000484166:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000480292:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000392813:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000437603:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000361159:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000471500:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000477743:exon_158538004_158538115:MFSD1;ENSG00000118855:ENST00000465624:exon_158538004_158538115:MFSD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 167747022 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000173905:ENST00000470487:exon_167747011_167747090:GOLIM4;ENSG00000173905:ENST00000309027:exon_167747011_167747090:GOLIM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 169700525 C/G 1 156 193 349 74.1334620759751 101.283601406005 -27.15013933003 T:C:G C G 10 0.52478549951298 0.00377161191391049 ENSG00000008952:ENST00000337002:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000460513:exon_169700425_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000480708:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000487736:exon_169700495_169700645:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000469515:exon_169700448_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000481435:exon_169700495_169700699:SEC62;ENSG00000008952:ENST00000497277:exon_169700495_169700647:SEC62 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 171087469 G/A 1 14 22 36 6.65300300681828 11.5452809892856 -4.89227798246728 A:G G A 10 0.52478549951298 0.132227924925165 ENSG00000154310:ENST00000436636:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000341852:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000284483:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000475336:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000357327:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000460047:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000488470:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000470834:exon_171087409_171087474:TNIK;ENSG00000154310:ENST00000465393:exon_171087409_171087474:TNIK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 172224303 A/G 1 23 11 34 10.9299335112015 5.77264049464278 5.15729301655868 A:G A G 10 0.52478549951298 0.086653964090488 ENSG00000121858:ENST00000241261:exon_172223298_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000420541:exon_172223452_172224709:TNFSF10;ENSG00000121858:ENST00000382750:exon_172224300_172224709:TNFSF10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 179066687 G/A 1 19 12 31 9.02907550925338 6.29742599415576 2.73164951509762 A:G G A 10 0.52478549951298 0.371395475613226 ENSG00000171109:ENST00000471841:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000280653:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000357390:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000467174:exon_179066633_179066751:MFN1;ENSG00000171109:ENST00000263969:exon_179066549_179066751:MFN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 179287989 G/A 1 31 48 79 14.7316495150976 25.189703976623 -10.4580544615254 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0236557669199622 ENSG00000136518:ENST00000429709:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000450518:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000392662:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000463661:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000491202:exon_179287855_179288179:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000468767:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000259034:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000494843:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000490364:exon_179287855_179288029:ACTL6A;ENSG00000136518:ENST00000487978:exon_179287855_179288029:ACTL6A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 180327863 C/G 1 16 29 45 7.60343200779232 15.2187794858764 -7.6153474780841 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0251226334875337 ENSG00000163728:ENST00000296015:exon_180327418_180328766:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000412756:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465065:exon_180325436_180328762:TTC14;ENSG00000163728:ENST00000465625:exon_180327418_180327956:TTC14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 184026703 C/T 1 169 154 323 80.3112505823064 80.8169669249989 -0.505716342692551 T:C C T 10 0.52478549951298 0.955644744972257 ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 184046470 C/T 1 111 101 212 52.7488095540592 53.003335450811 -0.254525896751773 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000114867:ENST00000346169:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000414031:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392537:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000442406:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382330:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434841:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000352767:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000392534:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000350481:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000427845:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000342981:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000382362:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000319274:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000424196:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000411531:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000441154:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000434061:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000435046:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000422614:exon_184046419_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000460829:exon_184045905_184046923:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000475721:exon_184046404_184046544:EIF4G1;ENSG00000114867:ENST00000464548:exon_184046457_184046544:EIF4G1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 184428647 G/A 1 22 27 49 10.4547190107144 14.1692084868505 -3.71448947613602 A:G G A 10 0.52478549951298 0.318148660557787 ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 185783777 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000244405:ENST00000306376:exon_185783602_185783861:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000434744:exon_185783602_185783861:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000489830:exon_185783602_185783861:ETV5;ENSG00000244405:ENST00000484223:exon_185783602_185783861:ETV5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 186508009 G/A 1 160 200 360 76.0343200779232 104.957099902596 -28.9227798246728 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00258460133666578 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186507931_186508044:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186507681_186508195:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186507931_186508044:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186507931_186508044:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186507931_186508044:RFC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 186515343 C/A 1 28 17 45 13.3060060136366 8.92135349172066 4.3846525219159 A:C C A 10 0.52478549951298 0.232449792311764 ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000418288:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000449502:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000447345:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000489028:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000427785:exon_186515324_186515403:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000448497:exon_186515328_186515403:RFC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 186791979 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000427315:exon_186791947_186791992:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000442023:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186791193_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186791947_186792121:ST6GAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 186793423 C/T 1 29 21 50 13.7812205141236 11.0204954897726 2.760725024351 T:C C T 10 0.52478549951298 0.48052055421722 ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186793350_186796341:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186793350_186793640:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186793350_186796339:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186793350_186796341:ST6GAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 186839057 C/A 1 44 45 89 20.9094380214289 23.6153474780841 -2.70590945665522 A:C C A 10 0.52478549951298 0.596516156474342 ENSG00000163923:ENST00000455270:exon_186838736_186839116:RPL39L;ENSG00000163923:ENST00000296277:exon_186838736_186839116:RPL39L;ENSG00000163923:ENST00000433055:exon_186838736_186839116:RPL39L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 187088812 C/T 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 187088903 C/A 1 27 12 39 12.8307915131495 6.29742599415576 6.53336551899378 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0378114984407985 ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 189705442 T/C 1 9 17 26 4.27693050438318 8.92135349172066 -4.64442298733748 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0780923127618802 ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189705316_189705458:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189705316_189705458:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000470925:exon_189705316_189705554:LEPREL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 192516359 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000180611:ENST00000392452:exon_192514604_192517439:C3orf59;ENSG00000180611:ENST00000315470:exon_192514607_192517439:C3orf59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 193364872 A/C 1 20 19 39 9.5042900097404 9.97092449074662 -0.466634481006221 A:C A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198836:ENST00000361908:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000392438:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361150:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361828:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361715:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000361510:exon_193364854_193364969:OPA1;ENSG00000198836:ENST00000483516:exon_193364854_193364969:OPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 193855920 C/T 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000114315:ENST00000232424:exon_193855472_193856521:HES1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 194373832 T/C 1 18 8 26 8.55386100876636 4.19828399610384 4.35557701266252 T:C T C 10 0.52478549951298 0.115121811334502 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 194373833 G/A 1 18 8 26 8.55386100876636 4.19828399610384 4.35557701266252 A:G G A 10 0.52478549951298 0.115121811334502 ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 195787102 C/T 1 14 6 20 6.65300300681828 3.14871299707788 3.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 0.177770154653337 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195787051_195787118:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195787051_195787118:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195787051_195787118:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000475593:exon_195787051_195787118:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000483983:exon_195787051_195787475:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000463356:exon_195787051_195787120:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000465288:exon_195787051_195787118:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000477148:exon_195787051_195787118:TFRC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 195800811 C/T 1 17 17 34 8.07864650827934 8.92135349172066 -0.842706983441321 T:C C T 10 0.52478549951298 0.864133680655555 ENSG00000072274:ENST00000360110:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000420415:exon_195800801_195800996:TFRC;ENSG00000072274:ENST00000392396:exon_195800801_195800996:TFRC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 196386964 C/G 1 13 20 33 6.17778850633126 10.4957099902596 -4.31792148392834 C:G C G 10 0.52478549951298 0.162988765186006 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 196387975 G/A 1 64 68 132 30.4137280311693 35.6854139668826 -5.27168593571336 A:G G A 10 0.52478549951298 0.383892147906662 ENSG00000174004:ENST00000328557:exon_196386623_196388875:LRRC33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 196460680 C/T 1 24 22 46 11.4051480116885 11.5452809892856 -0.140132977597082 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163964:ENST00000392391:exon_196460630_196462878:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000314118:exon_196460630_196462855:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000296333:exon_196460630_196460773:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000453218:exon_196460630_196460911:PIGX;ENSG00000163964:ENST00000415832:exon_196460630_196461160:PIGX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 197403844 T/C 1 24 21 45 11.4051480116885 11.0204954897726 0.384652521915898 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197403756_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197403088_197403909:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197403711_197403909:KIAA0226 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 197553766 T/C 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C T C 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000186001:ENST00000443727:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197553749_197553885:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197553749_197553885:LRCH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 197566254 T/C 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197566192_197566268:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000494069:exon_197566192_197566268:LRCH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 197593040 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000186001:ENST00000438796:exon_197592983_197593090:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000441090:exon_197592983_197593090:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000414675:exon_197592983_197593090:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000334859:exon_197592983_197593090:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000425562:exon_197592983_197593090:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000461674:exon_197592983_197593090:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000481048:exon_197592983_197593050:LRCH3;ENSG00000186001:ENST00000483442:exon_197592983_197593090:LRCH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 3 197670652 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000114473:ENST00000265239:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000455191:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000453254:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000416896:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000480302:exon_197670649_197670922:IQCG;ENSG00000114473:ENST00000463651:exon_197670628_197670922:IQCG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 86798 C/T 1 1 8 9 0.47521450048702 4.19828399610384 -3.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0165388389563391 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 86836 A/G 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 155365 C/A 0 0 8 8 0 4.19828399610384 -4.19828399610384 A C A 10 0.52478549951298 0.00260086297581477 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 155761 G/A 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.113694420116144 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 660340 G/A 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G G A 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_660320_660403:PDE6B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 663916 C/A 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 A:C C A 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_663838_664571:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 675777 G/C 1 21 21 42 9.97950451022742 11.0204954897726 -1.04099097954516 C:G G C 10 0.52478549951298 0.759841909015547 ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 860192 A/G 1 10 20 30 4.7521450048702 10.4957099902596 -5.7435649853894 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0435222317341989 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000511980:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860152_860322:GAK;ENSG00000178950:ENST00000510799:exon_860152_860289:GAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 861012 C/T 1 11 12 23 5.22735950535722 6.29742599415576 -1.07006648879854 T:C C T 10 0.52478549951298 0.681491778056056 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_860744_861220:GAK;ENSG00000178950:ENST00000398567:exon_860744_861071:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_860744_861220:GAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 862361 G/A 1 20 10 30 9.5042900097404 5.2478549951298 4.2564350146106 A:G G A 10 0.52478549951298 0.144072345239142 ENSG00000178950:ENST00000511163:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000509566:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000515868:exon_862327_863745:GAK;ENSG00000178950:ENST00000314167:exon_862327_862473:GAK;ENSG00000178950:ENST00000382997:exon_862327_862473:GAK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 946226 T/C 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 T:C T C 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000514453:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515492:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000452360:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000509508:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515876:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000510493:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000504180:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_946155_946238:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000506669:exon_946199_946238:TMEM175 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 1729988 G/A 1 50 58 108 23.760725024351 30.4375589717528 -6.67683394740185 A:G G A 10 0.52478549951298 0.211019205563685 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000458173:exon_1729435_1730121:TACC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 1730164 C/T 1 79 64 143 37.5419455384746 33.5862719688307 3.95567356964386 T:C C T 10 0.52478549951298 0.557989966716075 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 1730215 C/G,T 0 0 64 64 0 33.5862719688307 -33.5862719688307 T:G C T 10 0.52478549951298 2.09382209800644e-21 ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1729435_1730514:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000470136:exon_1730131_1730514:TACC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 1732978 G/A 1 37 45 82 17.5829365180197 23.6153474780841 -6.03241096006436 A:G G A 10 0.52478549951298 0.186476382925467 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1732899_1733028:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1732899_1733028:TACC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 1737013 C/T 1 45 37 82 21.3846525219159 19.4170634819803 1.96758903993564 T:C C T 10 0.52478549951298 0.740361898167437 ENSG00000013810:ENST00000485989:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000484651:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000343760:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000313288:exon_1737000_1737052:TACC3;ENSG00000013810:ENST00000466077:exon_1737000_1737052:TACC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 1818594 C/T 1 46 47 93 21.8598670224029 24.6649184771101 -2.80505145470714 T:C C T 10 0.52478549951298 0.60414988848099 ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2233709 A/G 1 13 15 28 6.17778850633126 7.8717824926947 -1.69399398636344 A:G A G 10 0.52478549951298 0.573269193038738 ENSG00000130997:ENST00000506518:exon_2233672_2233870:POLN;ENSG00000214367:ENST00000243706:exon_2230076_2233887:HAUS3;ENSG00000214367:ENST00000443786:exon_2233568_2233887:HAUS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2252237 C/T 1 41 40 81 19.4837945199678 20.9914199805192 -1.50762546055138 T:C C T 10 0.52478549951298 0.740158058588243 ENSG00000123933:ENST00000337190:exon_2249159_2252428:MXD4;ENSG00000123933:ENST00000513372:exon_2251191_2252428:MXD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2514816 A/G 1 13 15 28 6.17778850633126 7.8717824926947 -1.69399398636344 A:G A G 10 0.52478549951298 0.573269193038738 ENSG00000063978:ENST00000314289:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000502316:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000509388:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000507247:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511859:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000506706:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000511600:exon_2514810_2514858:RNF4;ENSG00000063978:ENST00000508235:exon_2514810_2514858:RNF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2702193 C/T 1 19 9 28 9.02907550925338 4.72306949561682 4.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.129733150157581 ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2701407_2702271:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2701407_2702228:FAM193A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2743983 G/A 1 110 100 210 52.2735950535722 52.478549951298 -0.204954897725813 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2744087 G/A 1 99 57 156 47.046235548215 29.9127734722399 17.1334620759751 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00631033446328924 ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2744289 C/G 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 C:G C G 10 0.52478549951298 0.554344236023915 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2831383 T/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:G T G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515183:exon_2831220_2831461:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000505941:exon_2831220_2831532:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2831220_2831874:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2831220_2831874:SH3BP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2835603 C/T 1 63 68 131 29.9385135306823 35.6854139668826 -5.74690043620038 T:C C T 10 0.52478549951298 0.336353294547810 ENSG00000087266:ENST00000452765:exon_2835424_2836020:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000435136:exon_2835424_2836015:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000442312:exon_2835424_2842823:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000511747:exon_2835424_2836016:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515737:exon_2835424_2836014:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000356331:exon_2835424_2842825:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000510204:exon_2834717_2836016:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000515802:exon_2835424_2836016:SH3BP2;ENSG00000087266:ENST00000513069:exon_2835424_2835687:SH3BP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2933271 G/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000109736:ENST00000508276:exon_2933102_2933663:MFSD10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 2951804 A/G 1 88 23 111 41.8188760428578 12.0700664887985 29.7488095540592 A:G A G 10 0.52478549951298 5.66523611089564e-09 ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 3519762 A/G 1 45 51 96 21.3846525219159 26.764060475162 -5.37940795324608 A:G A G 10 0.52478549951298 0.306930925329067 ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 4276394 C/T 1 130 134 264 61.7778850633126 70.3212569347393 -8.54337187142673 T:C C T 10 0.52478549951298 0.295534962871786 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 4276475 C/A 1 150 130 280 71.282175073053 68.2221149366874 3.06006013636559 A:C C A 10 0.52478549951298 0.720069097350934 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 4283537 G/A 1 64 50 114 30.4137280311693 26.239274975649 4.17445305552027 A:G G A 10 0.52478549951298 0.454230711190228 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000513174:exon_4283510_4283624:LYAR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 4285383 T/C 1 76 57 133 36.1163020370135 29.9127734722399 6.20352856477366 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.298181785403697 ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4285348_4285522:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4285348_4285522:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000513174:exon_4285348_4285522:LYAR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 4543620 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4543524_4543737:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4543524_4543755:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512780:exon_4543524_4543758:STX18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 8229774 C/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C C T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 8229850 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 8416586 T/G 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 T:G T G 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000514423:exon_8416581_8416655:ACOX3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 8418148 T/G 1 14 23 37 6.65300300681828 12.0700664887985 -5.41706348198026 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0985603551695448 ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8418105_8418262:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8418105_8418262:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8418105_8418262:ACOX3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 10099340 T/C 1 109 96 205 51.7983805530852 50.3794079532461 1.41897259983909 T:C T C 10 0.52478549951298 0.888828135740474 ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 13604117 T/G 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 13606576 A/T 1 40 47 87 19.0085800194808 24.6649184771101 -5.65633845762926 A:T A T 10 0.52478549951298 0.238693264573547 ENSG00000038219:ENST00000040738:exon_13600570_13606708:BOD1L;ENSG00000038219:ENST00000382426:exon_13600570_13606708:BOD1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 17829990 G/C 1 22 25 47 10.4547190107144 13.1196374878245 -2.66491847711006 C:G G C 10 0.52478549951298 0.467500784241064 ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17829901_17830011:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000510063:exon_17829901_17830011:NCAPG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 24578097 C/T 1 76 78 154 36.1163020370135 40.9332689620124 -4.81696692499892 T:C C T 10 0.52478549951298 0.468023136278308 ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 25125579 C/G 1 12 15 27 5.70257400584424 7.8717824926947 -2.16920848685046 C:G C G 10 0.52478549951298 0.444700144114445 ENSG00000109618:ENST00000382103:exon_25121636_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000302922:exon_25122624_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000358971:exon_25123877_25125847:SEPSECS;ENSG00000109618:ENST00000514585:exon_25125472_25125847:SEPSECS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38774755 C/A 1 120 171 291 57.0257400584424 89.7383204167196 -32.7125803582772 A:C:G C A 10 0.52478549951298 0.000130128985555809 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38774785 A/G 1 165 115 280 78.4103925803583 60.3503324439927 18.0600601363656 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0312715304387247 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38775040 A/G 1 82 62 144 38.9675890399356 32.5367009698048 6.43088807013088 A:G A G 10 0.52478549951298 0.316763274433933 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38775889 C/T 1 33 35 68 15.6820785160717 18.3674924829543 -2.68541396688264 T:C C T 10 0.52478549951298 0.545119738161036 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38776180 C/A 1 20 12 32 9.5042900097404 6.29742599415576 3.20686401558464 A:C C A 10 0.52478549951298 0.290995942719778 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38776303 T/C 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 T:C T C 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 38777059 C/T 1 28 44 72 13.3060060136366 23.0905619785711 -9.78455596493456 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0245000862442566 ENSG00000174123:ENST00000308973:exon_38773860_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000506111:exon_38774234_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000361424:exon_38774263_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000508334:exon_38774746_38777273:TLR10;ENSG00000174123:ENST00000502321:exon_38776887_38777176:TLR10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 39116911 T/C 1 12 7 19 5.70257400584424 3.67349849659086 2.02907550925338 T:C T C 10 0.52478549951298 0.370536041941494 ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 39322143 G/A 1 25 23 48 11.8803625121755 12.0700664887985 -0.189703976623042 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000035928:ENST00000381897:exon_39322003_39322289:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000349703:exon_39322003_39322289:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000433278:exon_39322003_39322280:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000512881:exon_39322003_39322289:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000512726:exon_39322080_39322289:RFC1;ENSG00000035928:ENST00000418436:exon_39322085_39322289:RFC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 39458051 A/G 1 87 5 92 41.3436615423707 2.6239274975649 38.7197340448058 A:G A G 10 0.52478549951298 9.74877180985438e-19 ENSG00000163682:ENST00000295955:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503277:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000449470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000508595:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000514842:exon_39458026_39459301:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000503040:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000504470:exon_39458026_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000511075:exon_39457431_39458158:RPL9;ENSG00000163682:ENST00000437992:exon_39457948_39458158:RPL9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 39512347 T/C 1 15 9 24 7.1282175073053 4.72306949561682 2.40514801168848 T:C T C 10 0.52478549951298 0.414765733374574 ENSG00000109814:ENST00000316423:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000506179:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000507089:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000515021:exon_39512281_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000514106:exon_39512287_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000510881:exon_39512317_39512481:UGDH;ENSG00000109814:ENST00000503779:exon_39512329_39512481:UGDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 41015742 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000163697:ENST00000295974:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513140:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000513611:exon_41015600_41016402:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000508593:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000316212:exon_41015600_41016419:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000506352:exon_41015600_41016415:APBB2;ENSG00000163697:ENST00000509475:exon_41015600_41016402:APBB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 46967032 G/A 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000109158:ENST00000264318:exon_46966987_46967246:GABRA4;ENSG00000109158:ENST00000511523:exon_46966987_46967246:GABRA4;ENSG00000109158:ENST00000508560:exon_46966987_46967246:GABRA4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 48381799 A/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G A G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000109171:ENST00000264313:exon_48381707_48381865:SLAIN2;ENSG00000109171:ENST00000512093:exon_48381707_48381865:SLAIN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 48517232 T/C 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000075539:ENST00000503238:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000358350:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000264319:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000507873:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000512810:exon_48517045_48517292:FRYL;ENSG00000075539:ENST00000514617:exon_48517226_48517292:FRYL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 54218793 C/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:C C A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54218765_54218933:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54218765_54218933:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000503450:exon_54218765_54218933:SCFD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 54231870 A/G 1 8 14 22 3.80171600389616 7.34699699318172 -3.54528098928556 A:G A G 10 0.52478549951298 0.140509011567872 ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_54231271_54232242:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_54231271_54232228:SCFD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 56212672 T/C 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000128039:ENST00000264228:exon_56212276_56212724:SRD5A3;ENSG00000128039:ENST00000505210:exon_56212579_56212724:SRD5A3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 56738061 T/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56738015_56738124:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56738015_56738124:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56738015_56738124:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000515761:exon_56738015_56738124:EXOC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 56878073 A/G 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000174799:ENST00000257287:exon_56877966_56878151:CEP135;ENSG00000174799:ENST00000506202:exon_56877966_56878151:CEP135 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57204777 A/C 1 14 25 39 6.65300300681828 13.1196374878245 -6.46663448100622 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0529651995530018 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57204456_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57204459_57204957:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57204771_57204957:AASDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57211352 T/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57211293_57211456:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57211293_57211456:AASDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57215969 C/T 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57215429_57216224:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57215094_57216224:AASDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57265498 G/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000128059:ENST00000264220:exon_57265345_57265566:PPAT;ENSG00000128059:ENST00000425339:exon_57265345_57267082:PPAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57335853 G/T 1 32 23 55 15.2068640155846 12.0700664887985 3.1367975267861 T:G G T 10 0.52478549951298 0.420638970915365 ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57335819_57335939:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57335819_57335939:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000504757:exon_57335819_57335939:SRP72 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57797127 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57797359 A/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57876955 G/A 1 46 45 91 21.8598670224029 23.6153474780841 -1.75548045568118 A:G G A 10 0.52478549951298 0.753310729920197 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57876914_57877053:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57876914_57877053:POLR2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57881715 G/A 1 41 45 86 19.4837945199678 23.6153474780841 -4.13155295811628 A:G G A 10 0.52478549951298 0.389205166986317 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57881668_57881822:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000510355:exon_57881668_57881824:POLR2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 57889677 C/T 1 163 134 297 77.4599635793843 70.3212569347393 7.13870664464493 T:C C T 10 0.52478549951298 0.416509138262505 ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57889496_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000464918:exon_57889393_57889746:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000484821:exon_57889657_57889917:POLR2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 71554424 A/G 1 86 55 141 40.8684470418837 28.8632024732139 12.0052445686698 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0433233537722862 ENSG00000132467:ENST00000254803:exon_71554196_71556267:UTP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 73956736 G/A 1 26 10 36 12.3555770126625 5.2478549951298 7.10772201753272 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0191400835125176 ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76836137 A/G 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 A:G A G 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76836021_76836138:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76836021_76836138:NAAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76842157 C/T 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 T:C C T 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000511606:exon_76842104_76842180:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76842104_76842276:NAAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76842269 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76842104_76842276:NAAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76842275 G/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000513045:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76842104_76842276:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76842104_76842276:NAAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76857309 C/T 1 9 1 10 4.27693050438318 0.52478549951298 3.7521450048702 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.0230036043209770 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76857388 C/T 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:C C T 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000138744:ENST00000399497:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000286733:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507956:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000505594:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000435286:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000399490:exon_76857262_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507187:exon_76856352_76857388:NAAA;ENSG00000138744:ENST00000507940:exon_76857317_76857388:NAAA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 76877166 C/T 1 78 62 140 37.0667310379876 32.5367009698048 4.5300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.447984386657838 ENSG00000198301:ENST00000502543:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76877128_76877289:SDAD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 77941782 G/A 1 50 40 90 23.760725024351 20.9914199805192 2.7693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.598477924944469 ENSG00000138758:ENST00000264893:exon_77941655_77941823:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000502584:exon_77941655_77941823:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510641:exon_77941655_77941823:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000505788:exon_77941655_77941823:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000510515:exon_77941655_77941823:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000506047:exon_77941655_77942792:SEPT11;ENSG00000138758:ENST00000506731:exon_77941685_77941823:SEPT11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 88379063 A/G 1 68 57 125 32.3145860331174 29.9127734722399 2.4018125608775 A:G A G 10 0.52478549951298 0.720404963242713 ENSG00000170502:ENST00000302174:exon_88378995_88379497:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000358033:exon_88378995_88379497:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000473942:exon_88378995_88380606:NUDT9;ENSG00000170502:ENST00000440591:exon_88378995_88379070:NUDT9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 89198355 T/C 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000163644:ENST00000513546:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000510548:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000511506:exon_89198295_89198719:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000506423:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000315194:exon_89198295_89198395:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000514204:exon_89196297_89198395:PPM1K HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 90034686 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 95561459 A/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000163110:ENST00000437932:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000317968:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000503974:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000514743:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000380176:exon_95561427_95561601:PDLIM5;ENSG00000163110:ENST00000506632:exon_95561427_95561601:PDLIM5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 99993833 A/G 1 114 141 255 54.1744530555203 73.9947554313302 -19.8203023758099 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0143454113480327 ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99993724_99993862:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99993337_99993862:ADH5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 104061993 C/G 1 25 29 54 11.8803625121755 15.2187794858764 -3.33841697370092 C:G C G 10 0.52478549951298 0.414239359289386 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104061971_104062261:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104061971_104062261:CENPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 104066290 T/G 1 21 11 32 9.97950451022742 5.77264049464278 4.20686401558464 T:G T G 10 0.52478549951298 0.158091315326878 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 104066461 A/G 1 16 26 42 7.60343200779232 13.6444229873375 -6.04099097954516 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0651913441591426 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066207_104066491:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000515478:exon_104066460_104066491:CENPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 104067086 T/C 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 T:C T C 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104066986_104067264:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104066986_104067264:CENPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 104070433 T/A 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104070275_104070565:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104070275_104070565:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104070275_104070565:CENPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 104117191 A/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000138778:ENST00000265148:exon_104117077_104117195:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000394771:exon_104117077_104117195:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000380026:exon_104117077_104117195:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000503705:exon_104117077_104117195:CENPE;ENSG00000138778:ENST00000514974:exon_104117077_104117195:CENPE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 106157484 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000168769:ENST00000305737:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000513237:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000265149:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000380013:exon_106155054_106158508:TET2;ENSG00000168769:ENST00000394764:exon_106155054_106163928:TET2;ENSG00000168769:ENST00000413648:exon_106155054_106158508:TET2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 106307762 G/A 1 100 97 197 47.521450048702 50.9041934527591 -3.38274340405707 A:G G A 10 0.52478549951298 0.668780118788604 ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513605:exon_106307724_106307793:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106307724_106307793:PPA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 107268876 G/A 1 94 61 155 44.6701630457799 32.0119154702918 12.6582475754881 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0443315393297 ENSG00000164022:ENST00000442366:exon_107268683_107270377:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000358008:exon_107268683_107269648:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394701:exon_107268683_107270383:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000432345:exon_107268683_107270377:AIMP1;ENSG00000164022:ENST00000394699:exon_107268683_107270377:AIMP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 108575989 G/A 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108575851_108576056:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000511304:exon_108575851_108576056:PAPSS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 108955542 C/T 1 111 111 222 52.7488095540592 58.2511904459408 -5.50238089188157 T:C C T 10 0.52478549951298 0.460794014382157 ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108955395_108956331:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108955395_108956327:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108955395_108955646:HADH;ENSG00000138796:ENST00000510728:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000515462:exon_108955395_108955648:HADH;ENSG00000138796:ENST00000514776:exon_108955395_108955648:HADH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 110603784 T/C 1 53 64 117 25.1863685258121 33.5862719688307 -8.39990344301867 T:C T C 10 0.52478549951298 0.138321535775453 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110603738_110603898:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000472310:exon_110603738_110604350:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110603738_110603898:CCDC109B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 110605744 A/T 1 184 196 380 87.4394680896117 102.857957904544 -15.4184898149324 A:T A T 10 0.52478549951298 0.123247800011007 ENSG00000005059:ENST00000394650:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000344132:exon_110605599_110605802:CCDC109B;ENSG00000005059:ENST00000494604:exon_110605596_110606523:CCDC109B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 113353052 C/T 1 3 10 13 1.42564350146106 5.2478549951298 -3.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0488102416519216 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 113353285 T/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 113359703 A/G 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:G A G 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 113362316 A/G 1 10 3 13 4.7521450048702 1.57435649853894 3.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0974345402312698 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 113568478 C/T 1 194 196 390 92.1916130944819 102.857957904544 -10.6663448100622 T:C C T 10 0.52478549951298 0.287254502450685 ENSG00000174720:ENST00000344442:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509061:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000509622:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000505034:exon_113568355_113568605:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000324052:exon_113568355_113568705:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000503316:exon_113568358_113568494:LARP7;ENSG00000174720:ENST00000511529:exon_113568367_113568705:LARP7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 122617745 G/A 1 93 73 166 44.1949485452929 38.3093414644475 5.88560708084532 A:G G A 10 0.52478549951298 0.39281741934523 ENSG00000164111:ENST00000296511:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000512232:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000501272:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000506395:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000515017:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000511552:exon_122617736_122618130:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513428:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513523:exon_122617736_122617779:ANXA5;ENSG00000164111:ENST00000513728:exon_122617736_122617779:ANXA5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 122737965 G/C 1 300 283 583 142.564350146106 148.514296362173 -5.94994621606736 A:C:G G C 10 0.52478549951298 0.64833104918157 ENSG00000123737:ENST00000243498:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000379663:exon_122737927_122738064:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000513654:exon_122737927_122738176:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000512454:exon_122737927_122738066:EXOSC9;ENSG00000123737:ENST00000503236:exon_122737927_122737995:EXOSC9;ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122737599_122738841:CCNA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 122741807 C/T 1 32 33 65 15.2068640155846 17.3179214839283 -2.1110574683437 T:C C T 10 0.52478549951298 0.621141072133526 ENSG00000145386:ENST00000274026:exon_122741697_122741920:CCNA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 123268859 A/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123268677_123268934:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123268677_123268934:KIAA1109 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 123271189 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000138688:ENST00000264501:exon_123271012_123271229:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000388738:exon_123271012_123271229:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000431755:exon_123271012_123271229:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000438707:exon_123271012_123271229:KIAA1109;ENSG00000138688:ENST00000306802:exon_123271012_123271229:KIAA1109 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 123838758 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 128814957 C/T 1 13 16 29 6.17778850633126 8.39656799220768 -2.21877948587642 T:C C T 10 0.52478549951298 0.459765747223042 ENSG00000142731:ENST00000270861:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000515069:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000513090:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507249:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000514379:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000508113:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000507577:exon_128814889_128815036:PLK4;ENSG00000142731:ENST00000510192:exon_128814889_128815036:PLK4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 128863228 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000164073:ENST00000296468:exon_128863200_128863313:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000515130:exon_128863200_128863313:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000513559:exon_128863200_128863313:MFSD8;ENSG00000164073:ENST00000508441:exon_128863200_128863313:MFSD8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 128949689 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 128949929 C/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164074:ENST00000454347:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398961:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000398965:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000473040:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000444616:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000480407:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000388795:exon_128949630_128950008:C4orf29;ENSG00000164074:ENST00000437077:exon_128949630_128950008:C4orf29 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 129880770 G/A 1 21 12 33 9.97950451022742 6.29742599415576 3.68207851607166 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.224975587715588 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 129924977 C/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:C C A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129924896_129925031:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000434680:exon_129924896_129925031:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000503215:exon_129924896_129925031:SCLT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 130023759 A/T 1 18 9 27 8.55386100876636 4.72306949561682 3.83079151314954 A:T A T 10 0.52478549951298 0.177366469580042 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 130030652 A/G 1 13 16 29 6.17778850633126 8.39656799220768 -2.21877948587642 A:G A G 10 0.52478549951298 0.459765747223042 ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 139100372 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000151012:ENST00000280612:exon_139100371_139100548:SLC7A11;ENSG00000151012:ENST00000509248:exon_139100371_139100548:SLC7A11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 140262082 C/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:C C A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000482087:exon_140262066_140262227:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000480277:exon_140262066_140262223:NAA15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 151231528 T/C 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000198589:ENST00000510413:exon_151231381_151231536:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000357115:exon_151231381_151231536:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000503716:exon_151231381_151231536:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000515096:exon_151231381_151232521:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000509835:exon_151231381_151231536:LRBA;ENSG00000198589:ENST00000510157:exon_151231381_151231536:LRBA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 154514965 T/C 1 3 12 15 1.42564350146106 6.29742599415576 -4.8717824926947 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0171437947492299 ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154514951_154515023:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154514951_154515023:KIAA0922 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 154553833 A/G 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 A:G A G 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000121210:ENST00000478919:exon_154553516_154553990:KIAA0922 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 155459194 A/T 1 92 67 159 43.7197340448058 35.1606284673697 8.55910557743618 A:T A T 10 0.52478549951298 0.177986665071363 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155459121_155459234:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503251:exon_155459121_155459260:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155459121_155459260:PLRG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 155461113 T/C 1 81 67 148 38.4923745394486 35.1606284673697 3.33174607207896 T:C T C 10 0.52478549951298 0.621764885172203 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000393905:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506627:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155461103_155461205:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000507125:exon_155461103_155461424:PLRG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 155471470 G/A 1 54 51 105 25.6615830262991 26.764060475162 -1.10247744886291 A:G G A 10 0.52478549951298 0.845584108899214 ENSG00000171566:ENST00000499023:exon_155471452_155471587:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000302078:exon_155471452_155471549:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000506192:exon_155471452_155471544:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000505887:exon_155471452_155471555:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000512719:exon_155471452_155471535:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000509975:exon_155471452_155471546:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000503751:exon_155471452_155471552:PLRG1;ENSG00000171566:ENST00000515520:exon_155471452_155471548:PLRG1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 156273768 T/C 1 15 5 20 7.1282175073053 2.6239274975649 4.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0463202879236955 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 156274377 T/C 1 25 11 36 11.8803625121755 5.77264049464278 6.10772201753272 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0454999195223562 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156274331_156274492:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156274331_156274492:MAP9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 156294333 T/C 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 T:C T C 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156294288_156294608:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000481250:exon_156294148_156294608:MAP9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 159627902 A/G 1 30 19 49 14.2564350146106 9.97092449074662 4.28551052386398 A:G A G 10 0.52478549951298 0.253288632021940 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000307738:exon_159627781_159628002:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000506422:exon_159627781_159628002:ETFDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 159629637 G/A 1 35 32 67 16.6325075170457 16.7931359844154 -0.160628467369662 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171503:ENST00000511912:exon_159629516_159630775:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000355672:exon_159629516_159629842:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000307738:exon_159629516_159629751:ETFDH;ENSG00000171503:ENST00000506422:exon_159629516_159629720:ETFDH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 159631800 C/T 1 59 81 140 28.0376555287342 42.5076254605514 -14.4699699318172 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0175074249793608 ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631780_159631822:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631780_159631822:PPID;ENSG00000171497:ENST00000507213:exon_159631094_159631822:PPID HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 164085470 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000145414:ENST00000422287:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000274054:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000509232:exon_164085369_164085543:NAF1;ENSG00000145414:ENST00000502973:exon_164085369_164085543:NAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 164435265 A/C 1 58 74 132 27.5624410282472 38.8341269639605 -11.2716859357134 A:C:G A C 10 0.52478549951298 0.0549988712159862 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508652:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000511562:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513134:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000508268:exon_164435226_164435310:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164435226_164435310:C4orf43 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 164440581 T/C 1 133 127 260 63.2035285647737 66.6477584381485 -3.4442298733748 T:C T C 10 0.52478549951298 0.709552634093637 ENSG00000198498:ENST00000509657:exon_164440486_164440872:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000358572:exon_164440486_164441691:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000513272:exon_164440486_164440871:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000506214:exon_164440486_164440615:C4orf43;ENSG00000198498:ENST00000503148:exon_164440486_164440710:C4orf43 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 166263047 G/A 1 87 65 152 41.3436615423707 34.1110574683437 7.23260407402704 A:G G A 10 0.52478549951298 0.25597966747226 ENSG00000052802:ENST00000261507:exon_166262903_166264312:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000426682:exon_166262903_166264224:SC4MOL;ENSG00000052802:ENST00000393766:exon_166262903_166264181:SC4MOL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 169143015 G/A 1 14 14 28 6.65300300681828 7.34699699318172 -0.693993986363441 A:G G A 10 0.52478549951298 0.851182438556464 ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169142881_169143032:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000393739:exon_169142881_169143032:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000511317:exon_169142881_169143032:DDX60 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 169911396 T/C 1 45 32 77 21.3846525219159 16.7931359844154 4.59151653750054 T:C T C 10 0.52478549951298 0.306702143138348 ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169908741_169911479:CBR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 169928842 G/T 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 T:G G T 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 169931268 G/A 1 6 8 14 2.85128700292212 4.19828399610384 -1.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.595152146802128 ENSG00000145439:ENST00000510042:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169931099_169931406:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169931099_169931409:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169931099_169931405:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169931099_169931401:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169931099_169931426:CBR4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 170663235 C/T 1 35 36 71 16.6325075170457 18.8922779824673 -2.25977046542158 T:C C T 10 0.52478549951298 0.635333865225434 ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 178361539 C/G 1 10 23 33 4.7521450048702 12.0700664887985 -7.31792148392834 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0136700872947743 ENSG00000038002:ENST00000264595:exon_178361427_178361580:AGA;ENSG00000038002:ENST00000446519:exon_178361427_178361580:AGA;ENSG00000038002:ENST00000506853:exon_178361427_178361580:AGA;ENSG00000038002:ENST00000510955:exon_178361427_178361580:AGA;ENSG00000038002:ENST00000511231:exon_178361196_178361580:AGA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 184572218 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000182552:ENST00000326397:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000327570:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510968:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000510702:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000512740:exon_184572137_184572284:RWDD4;ENSG00000182552:ENST00000514322:exon_184572137_184572284:RWDD4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 184629643 A/G 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 A:G A G 10 0.52478549951298 0.393947332697963 ENSG00000168538:ENST00000334690:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000360109:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000512476:exon_184629560_184629727:C4orf41;ENSG00000168538:ENST00000511955:exon_184629560_184629727:C4orf41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 185615628 T/A 1 13 21 34 6.17778850633126 11.0204954897726 -4.84270698344132 A:T T A 10 0.52478549951298 0.121486691773272 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 185687863 A/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185687776_185687910:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185687776_185687910:ACSL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 185695008 G/A 1 11 17 28 5.22735950535722 8.92135349172066 -3.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.187123821971002 ENSG00000151726:ENST00000454703:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504900:exon_185694997_185695029:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000505492:exon_185694997_185695027:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000509038:exon_185694997_185695029:ACSL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 185724475 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000151726:ENST00000451433:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000515030:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000281455:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000507295:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000437665:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000506733:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504342:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000513317:exon_185724474_185724700:ACSL1;ENSG00000151726:ENST00000504900:exon_185724474_185724700:ACSL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 4 186329111 G/A 1 36 36 72 17.1077220175327 18.8922779824673 -1.78455596493456 A:G G A 10 0.52478549951298 0.723887309779603 ENSG00000109775:ENST00000514247:exon_186329090_186329214:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000264689:exon_186329090_186329214:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000510755:exon_186329090_186329214:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000511485:exon_186329090_186329214:UFSP2;ENSG00000109775:ENST00000509180:exon_186329090_186329214:UFSP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 205565 G/A 1 28 22 50 13.3060060136366 11.5452809892856 1.760725024351 A:G G A 10 0.52478549951298 0.672271363881817 ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 226093 G/A 1 51 43 94 24.235939524838 22.5657764790581 1.67016304577988 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.75752171193432 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 226160 A/C 1 58 66 124 27.5624410282472 34.6358429678567 -7.07340193960952 A:C A C 10 0.52478549951298 0.209193161539127 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 228362 T/C 1 55 51 106 26.1367975267861 26.764060475162 -0.627262948375886 T:C T C 10 0.52478549951298 0.922765062350118 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 233734 C/G 1 82 92 174 38.9675890399356 48.2802659551942 -9.31267691525852 C:G C G 10 0.52478549951298 0.171835242648709 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 256472 G/A 1 240 277 517 114.051480116885 145.365583365095 -31.3141032482107 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00628655508670802 ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 453567 G/A 1 25 23 48 11.8803625121755 12.0700664887985 -0.189703976623042 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 453888 G/A 1 33 24 57 15.6820785160717 12.5948519883115 3.08722652776014 A:G G A 10 0.52478549951298 0.429482913145764 ENSG00000180104:ENST00000512944:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000515601:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000340158:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000315013:exon_453485_454166:EXOC3;ENSG00000180104:ENST00000503889:exon_453512_454166:EXOC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 653145 C/G 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 ENSG00000112877:ENST00000264935:exon_653103_653668:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000444221:exon_653103_653664:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000512038:exon_653103_653358:CEP72;ENSG00000112877:ENST00000499639:exon_653141_653306:CEP72 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 870619 A/G 1 18 13 31 8.55386100876636 6.82221149366874 1.73164951509762 A:G A G 10 0.52478549951298 0.592301033739622 ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_870588_870668:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000523139:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518251:exon_870588_870690:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000475706:exon_870403_870690:BRD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 1467004 A/G 1 19 23 42 9.02907550925338 12.0700664887985 -3.04099097954516 A:G A G 10 0.52478549951298 0.358529248382525 ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 5463668 C/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000164151:ENST00000296564:exon_5460549_5465339:KIAA0947 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 6600064 G/T 1 159 207 366 75.5591055774362 108.630598399187 -33.0714928217507 T:G G T 10 0.52478549951298 0.00064940843208708 ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 10239353 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000150756:ENST00000280330:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000511437:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510047:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000504390:exon_10239154_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000510052:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000506108:exon_10239179_10239468:FAM173B;ENSG00000150756:ENST00000508553:exon_10239179_10239468:FAM173B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 10261687 A/G 1 231 205 436 109.774549612502 107.581027400161 2.19352221234071 A:G A G 10 0.52478549951298 0.848001059879035 ENSG00000150753:ENST00000280326:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000503026:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515390:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000440011:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000423695:exon_10261672_10262313:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000515676:exon_10261672_10261857:CCT5;ENSG00000150753:ENST00000506600:exon_10261672_10261857:CCT5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 10282396 A/G 1 11 3 14 5.22735950535722 1.57435649853894 3.65300300681828 A:G A G 10 0.52478549951298 0.061586959717543 ENSG00000164237:ENST00000503834:exon_10282309_10282400:CMBL;ENSG00000164237:ENST00000296658:exon_10282309_10282400:CMBL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 10415625 G/A 1 11 10 21 5.22735950535722 5.2478549951298 -0.0204954897725802 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000145495:ENST00000449913:exon_10415600_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000511802:exon_10415600_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000503788:exon_10415600_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000274140:exon_10415600_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000397730:exon_10415600_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000510792:exon_10415600_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000512449:exon_10415585_10415781:MARCH6;ENSG00000145495:ENST00000505253:exon_10415600_10415781:MARCH6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 16475199 C/G 0 0 38 38 0 19.9418489814932 -19.9418489814932 G C G 10 0.52478549951298 5.26996818999219e-13 ENSG00000154153:ENST00000510362:exon_16474758_16475343:FAM134B;ENSG00000154153:ENST00000399793:exon_16473162_16475343:FAM134B;ENSG00000154153:ENST00000306320:exon_16473163_16475343:FAM134B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 17353999 T/A 0 784 0 784 372.568168381824 0 372.568168381824 T T 10 0.52478549951298 4.92123154687093e-220 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 17354033 C/T 0 96 0 96 45.6205920467539 0 45.6205920467539 C C 10 0.52478549951298 1.85601795216764e-27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 31423007 T/C 1 18 15 33 8.55386100876636 7.8717824926947 0.682078516071659 T:C T C 10 0.52478549951298 0.862935946296175 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000511778:exon_31422894_31423428:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504133:exon_31422894_31423051:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000510178:exon_31422894_31423051:DROSHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 31527003 G/A 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 A:G G A 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000508905:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31526186_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000507438:exon_31526436_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000515445:exon_31526813_31527019:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504361:exon_31526862_31527013:DROSHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 31529184 T/C 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000113360:ENST00000511367:exon_31529147_31529212:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000344624:exon_31529147_31529213:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000442743:exon_31529147_31529213:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000265075:exon_31529147_31529213:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000513349:exon_31529147_31529212:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000508905:exon_31529147_31529212:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000382188:exon_31529147_31529213:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000507438:exon_31529147_31529212:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000515445:exon_31529147_31529212:DROSHA;ENSG00000113360:ENST00000504361:exon_31529147_31529212:DROSHA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 33459871 C/A 1 63 63 126 29.9385135306823 33.0614864693177 -3.12297293863548 A:C C A 10 0.52478549951298 0.593436025537947 ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33459800_33459966:TARS;ENSG00000113407:ENST00000504698:exon_33459800_33460074:TARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 36985303 A/G 1 9 15 24 4.27693050438318 7.8717824926947 -3.59485198831152 A:G A G 10 0.52478549951298 0.156496947637155 ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 37721297 C/T 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000082068:ENST00000265107:exon_37721217_37721317:WDR70;ENSG00000082068:ENST00000511906:exon_37721217_37725152:WDR70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 52856504 G/C 1 21 18 39 9.97950451022742 9.44613899123364 0.533365518993779 C:G G C 10 0.52478549951298 0.874424081275866 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52856463_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52856465_52856590:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52856477_52856590:NDUFS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 52942197 A/G 1 113 106 219 53.6992385550333 55.6272629483759 -1.92802439334263 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.839218836601546 ENSG00000164258:ENST00000507026:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000502423:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000296684:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506974:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000506765:exon_52942063_52942235:NDUFS4;ENSG00000164258:ENST00000509443:exon_52942025_52942235:NDUFS4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 54585213 C/T 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54585098_54585256:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54585098_54585256:DHX29 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 54586170 A/G 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 A:G A G 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000067248:ENST00000251636:exon_54586046_54586172:DHX29;ENSG00000067248:ENST00000504778:exon_54586046_54586172:DHX29 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 59940656 C/T 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000035499:ENST00000265036:exon_59940572_59940702:DEPDC1B;ENSG00000035499:ENST00000453022:exon_59940572_59940702:DEPDC1B;ENSG00000035499:ENST00000512078:exon_59940572_59940702:DEPDC1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 60241142 G/A 0 0 146 146 0 76.6186829288951 -76.6186829288951 A G A 10 0.52478549951298 6.69720928757329e-48 ENSG00000164182:ENST00000296597:exon_60240956_60241209:NDUFAF2;ENSG00000164182:ENST00000511107:exon_60241034_60241255:NDUFAF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 61847073 G/C 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 C:G G C 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000086200:ENST00000424533:exon_61847050_61847163:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000325324:exon_61847050_61847163:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000409296:exon_61847050_61847163:IPO11;ENSG00000086200:ENST00000511713:exon_61847050_61847163:IPO11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 64020241 T/C 1 139 142 281 66.0548155676958 74.5195409308432 -8.46472536314739 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.339259227299198 ENSG00000153006:ENST00000513458:exon_64016340_64020400:SREK1IP1;ENSG00000153006:ENST00000396708:exon_64018508_64020400:SREK1IP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 64064943 G/A 1 27 28 55 12.8307915131495 14.6939939863634 -1.8632024732139 A:G G A 10 0.52478549951298 0.685985941709095 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64064757_64065015:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64064773_64065015:CWC27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 64097145 C/G 1 59 56 115 28.0376555287342 29.3879879727269 -1.35033244399271 C:G C G 10 0.52478549951298 0.852014237279266 ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 64859196 A/G 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000113593:ENST00000508982:exon_64859063_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64859066_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000503435:exon_64859117_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000515447:exon_64859120_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64859123_64859333:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64859126_64859333:PPWD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 65350224 C/T 1 16 15 31 7.60343200779232 7.8717824926947 -0.268350484902381 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 68463014 G/T 1 41 49 90 19.4837945199678 25.714489476136 -6.2306949561682 T:G G T 10 0.52478549951298 0.205761543665492 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68462837_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68462913_68463110:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68462962_68463110:CCNB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 68471247 G/A 1 174 146 320 82.6873230847415 76.6186829288951 6.0686401558464 A:G G A 10 0.52478549951298 0.502416947579071 ENSG00000134057:ENST00000256442:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000380848:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000506572:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000505500:exon_68471224_68471364:CCNB1;ENSG00000134057:ENST00000507798:exon_68471224_68471364:CCNB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 68687792 G/A 1 16 12 28 7.60343200779232 6.29742599415576 1.30600601363656 A:G G A 10 0.52478549951298 0.706796378801608 ENSG00000152942:ENST00000361732:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000509734:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354868:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000521422:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000354312:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000345306:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000305138:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000282891:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000358030:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000380774:exon_68687658_68687840:RAD17;ENSG00000152942:ENST00000508320:exon_68687658_68687840:RAD17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 70786830 G/T 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70786811_70786958:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70786811_70786958:BDP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 70805984 G/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 70806711 C/G 1 15 8 23 7.1282175073053 4.19828399610384 2.92993351120146 C:G C G 10 0.52478549951298 0.296787100662300 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 70808068 A/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:T A T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70808068_70808255:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70808068_70808255:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70808068_70808255:BDP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 70948552 G/C 1 40 47 87 19.0085800194808 24.6649184771101 -5.65633845762926 C:G G C 10 0.52478549951298 0.238693264573547 ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70948496_70948581:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70948496_70948581:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70948496_70948581:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70948496_70948581:MCCC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 71524163 A/T 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 A:T A T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000113048:ENST00000261413:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000457646:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515226:exon_71522877_71525380:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000503239:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000513900:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000508863:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522562:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000522042:exon_71524093_71524195:MRPS27;ENSG00000113048:ENST00000515404:exon_71523590_71524195:MRPS27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 72798845 A/G 1 1017 1106 2123 483.293146995299 580.412762461356 -97.1196154660566 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 2.70914918256614e-05 ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 73930751 C/T 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 ENSG00000171617:ENST00000302351:exon_73930509_73932323:ENC1;ENSG00000171617:ENST00000510316:exon_73930509_73932187:ENC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 74064866 G/A 1 390 248 638 185.333655189938 130.146803879219 55.1868513107187 A:T:G G A 10 0.52478549951298 1.24105889469255e-05 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74064756_74064943:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000514918:exon_74064756_74064943:NSA2;ENSG00000164346:ENST00000513356:exon_74064756_74064943:NSA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 74069782 A/G 1 256 443 699 121.654912124677 232.47997628425 -110.825064159573 A:G A G 10 0.52478549951298 4.44168329063201e-17 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 74069863 A/G 1 839 517 1356 398.70496590861 271.314103248211 127.390862660399 A:T:G A G 10 0.52478549951298 3.57186220202171e-12 ENSG00000164346:ENST00000296802:exon_74069693_74069885:NSA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 74877266 C/T 1 7 1 8 3.32650150340914 0.52478549951298 2.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0730034467398974 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000425306:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000515295:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508867:exon_74877034_74878790:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000504026:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000511527:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74877034_74877273:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74877034_74877273:POLK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 74892506 A/C 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:C A C 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000122008:ENST00000241436:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000352007:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000380481:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000503479:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000506928:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000510815:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000514141:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000505975:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000508526:exon_74892047_74893003:POLK;ENSG00000122008:ENST00000509126:exon_74892047_74893003:POLK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 75932869 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000509074:exon_75932866_75932929:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000515505:exon_75932859_75932933:IQGAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 75932965 G/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 C:G G C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000145703:ENST00000274364:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514350:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000505766:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000514001:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000396234:exon_75932859_75933001:IQGAP2;ENSG00000145703:ENST00000502745:exon_75932859_75933001:IQGAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 76734084 C/T 1 32 25 57 15.2068640155846 13.1196374878245 2.08722652776014 T:C C T 10 0.52478549951298 0.598604585441619 ENSG00000164253:ENST00000296679:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000502528:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000414719:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000515253:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507029:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511630:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000507654:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000509701:exon_76734065_76734186:WDR41;ENSG00000164253:ENST00000511791:exon_76734083_76734186:WDR41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 77411985 T/C 1 28 27 55 13.3060060136366 14.1692084868505 -0.863202473213903 T:C T C 10 0.52478549951298 0.892816578675393 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77411950_77412058:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000517940:exon_77411950_77412011:AP3B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 77477451 G/A 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000132842:ENST00000255194:exon_77477331_77477486:AP3B1;ENSG00000132842:ENST00000519295:exon_77477331_77477486:AP3B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 80160658 C/G 1 10 8 18 4.7521450048702 4.19828399610384 0.55386100876636 C:G C G 10 0.52478549951298 0.818591117187341 ENSG00000113318:ENST00000265081:exon_80160632_80160761:MSH3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 81572376 T/C 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 T:C T C 10 0.52478549951298 0.393947332697963 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 81574166 C/T 1 65 42 107 30.8889425316563 22.0409909795452 8.84795155211114 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0995689497792586 ENSG00000186468:ENST00000296674:exon_81574139_81574396:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512493:exon_81574139_81574170:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000510019:exon_81574139_81574215:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000507980:exon_81574139_81574173:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000512346:exon_81574139_81574173:RPS23;ENSG00000186468:ENST00000511844:exon_81574139_81574174:RPS23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 95152313 A/G 1 184 178 362 87.4394680896117 93.4118189133104 -5.97235082369876 A:G A G 10 0.52478549951298 0.562743732203609 ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 96078360 A/T 1 32 48 80 15.2068640155846 25.189703976623 -9.9828399610384 A:T:G A T 10 0.52478549951298 0.0327761646699265 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511097:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000513666:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509259:exon_96078359_96078460:CAST;ENSG00000153113:ENST00000503828:exon_96078359_96078460:CAST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 96093192 G/A 1 27 20 47 12.8307915131495 10.4957099902596 2.33508152288994 A:G G A 10 0.52478549951298 0.560154563265212 ENSG00000153113:ENST00000338252:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508830:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395812:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000359176:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000325674:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000395813:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510756:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000512355:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508608:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000341926:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000361634:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511049:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000309190:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510156:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000509903:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000511782:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000504465:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000348386:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000510500:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000437034:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000508579:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000515663:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000283095:exon_96093148_96093198:CAST;ENSG00000153113:ENST00000484552:exon_96093148_96093198:CAST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 96139464 C/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C C T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000164307:ENST00000296754:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000443439:exon_96139106_96139646:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000503921:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000508227:exon_96139106_96139530:ERAP1;ENSG00000164307:ENST00000507154:exon_96139243_96139642:ERAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 96358060 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000113441:ENST00000231368:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000489981:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000417755:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000379870:exon_96358004_96358188:LNPEP;ENSG00000113441:ENST00000395770:exon_96358004_96358188:LNPEP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 96498783 G/A 1 47 31 78 22.3350815228899 16.2683504849024 6.06673103798756 A:G G A 10 0.52478549951298 0.175482406710555 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 96507029 T/A 1 8 17 25 3.80171600389616 8.92135349172066 -5.1196374878245 A:T T A 10 0.52478549951298 0.0456846133202058 ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96506910_96507101:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96506910_96507101:RIOK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 110096939 G/A 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509442:exon_110096904_110097147:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000502462:exon_110096904_110097355:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 110097362 G/T 1 52 44 96 24.711154025325 23.0905619785711 1.62059204675392 T:G G T 10 0.52478549951298 0.760147220062951 ENSG00000164209:ENST00000513807:exon_110096904_110097967:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000355943:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000514046:exon_110096904_110098787:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000447245:exon_110097147_110097964:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000504098:exon_110096904_110098484:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000513706:exon_110096904_110100857:SLC25A46;ENSG00000164209:ENST00000509432:exon_110096904_110097913:SLC25A46 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 111066697 T/C 1 16 6 22 7.60343200779232 3.14871299707788 4.45471901071444 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0854094802131986 ENSG00000134986:ENST00000379671:exon_111064509_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000257435:exon_111064993_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450857:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000447165:exon_111065000_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000446294:exon_111065013_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000395634:exon_111065681_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000515855:exon_111066214_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000507742:exon_111066339_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509979:exon_111066355_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000450761:exon_111066388_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000419114:exon_111066401_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000509427:exon_111066421_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000453526:exon_111066444_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000455559:exon_111066503_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000508870:exon_111066565_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000513100:exon_111066629_111066743:C5orf13;ENSG00000134986:ENST00000504018:exon_111066651_111066743:C5orf13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 112929013 T/A 1 14 15 29 6.65300300681828 7.8717824926947 -1.21877948587642 A:T T A 10 0.52478549951298 0.711956673181561 ENSG00000047188:ENST00000161863:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000511372:exon_112929000_112929087:YTHDC2;ENSG00000047188:ENST00000512600:exon_112927693_112930982:YTHDC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 115428334 G/T 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 T:G G T 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115428242_115428392:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115428242_115428397:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000506589:exon_115428242_115428397:COMMD10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 115469773 C/T 1 13 5 18 6.17778850633126 2.6239274975649 3.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.103560900526000 ENSG00000145781:ENST00000274458:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000507356:exon_115469765_115469875:COMMD10;ENSG00000145781:ENST00000515539:exon_115469765_115469875:COMMD10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 118813182 A/T 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 A:T A T 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000511186:exon_118813112_118813184:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118813169_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512841:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118813112_118813187:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503168:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515250:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000505181:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000508788:exon_118813112_118813196:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118813112_118813196:HSD17B4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 118860938 T/C 1 21 24 45 9.97950451022742 12.5948519883115 -2.6153474780841 T:C T C 10 0.52478549951298 0.458522182114087 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000520244:exon_118860911_118860980:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118860911_118860980:HSD17B4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 118861713 A/G 1 33 19 52 15.6820785160717 9.97092449074662 5.71115402532504 A:G A G 10 0.52478549951298 0.127147486297039 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000518349:exon_118861612_118861719:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118861612_118861718:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000507353:exon_118861431_118861718:HSD17B4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 118877660 A/G 1 84 91 175 39.9180180409097 47.7554804556812 -7.8374624147715 A:G A G 10 0.52478549951298 0.256307333386732 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 118877677 C/T 1 95 91 186 45.1453775462669 47.7554804556812 -2.61010290941428 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.714067376222874 ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 121356189 T/A 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 A:T T A 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 125911132 G/A 1 3 14 17 1.42564350146106 7.34699699318172 -5.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00576184367371513 ENSG00000164904:ENST00000409134:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000447989:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000437170:exon_125911112_125911140:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000297542:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000503281:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000509459:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000416117:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000433026:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000413020:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000458249:exon_125911112_125911156:ALDH7A1;ENSG00000164904:ENST00000511266:exon_125911129_125911156:ALDH7A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 126874743 A/G 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126874732_126874835:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126874732_126874835:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126874732_126874835:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126874732_126874835:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126874732_126874835:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000512535:exon_126874732_126874835:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000512635:exon_126874732_126874835:PRRC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 130500842 A/G 1 1087 966 2053 516.558162029391 506.942792529539 9.61536949985197 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 0.674655563026106 ENSG00000169567:ENST00000304043:exon_130500788_130501178:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000511475:exon_130500788_130500933:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508495:exon_130500788_130500994:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513345:exon_130500753_130501026:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000504202:exon_130500753_130500913:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000508488:exon_130500788_130501018:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000506908:exon_130500788_130501034:HINT1;ENSG00000169567:ENST00000513012:exon_130500753_130500949:HINT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 132334252 A/G 1 12 26 38 5.70257400584424 13.6444229873375 -7.94184898149324 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0137655823673701 ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 133295368 G/A 1 20 16 36 9.5042900097404 8.39656799220768 1.10772201753272 A:G G A 10 0.52478549951298 0.741484551221566 ENSG00000113583:ENST00000231512:exon_133295185_133295711:C5orf15;ENSG00000113583:ENST00000451255:exon_133295185_133295477:C5orf15;ENSG00000113583:ENST00000507191:exon_133295226_133295711:C5orf15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 133304210 G/A 1 14 4 18 6.65300300681828 2.09914199805192 4.55386100876636 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0345215058348639 ENSG00000113583:ENST00000231512:exon_133304137_133304478:C5orf15;ENSG00000113583:ENST00000509913:exon_133304137_133304316:C5orf15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 133887780 G/A 0 10 0 10 4.7521450048702 0 4.7521450048702 G G 10 0.52478549951298 0.00217157993432381 ENSG00000043143:ENST00000512386:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000433412:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000458562:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000431355:exon_133887742_133887899:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000453515:exon_133887742_133887899:PHF15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 133914674 C/T 1 20 18 38 9.5042900097404 9.44613899123364 0.0581510185067593 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000043143:ENST00000282605:exon_133914184_133915164:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000361895:exon_133914184_133915504:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000432594:exon_133914184_133915164:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000413974:exon_133914187_133915007:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000448712:exon_133914184_133915164:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000402835:exon_133914187_133915165:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000395003:exon_133914187_133918918:PHF15;ENSG00000043143:ENST00000430087:exon_133914187_133915165:PHF15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 134670656 A/G 1 189 165 354 89.8155405920468 86.5896074196417 3.22593317240506 A:G A G 10 0.52478549951298 0.7496798053246 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 134670765 A/G 1 124 131 255 58.9265980603905 68.7469004362004 -9.82030237580992 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.233576193087626 ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 134907552 G/A 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 A:G G A 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000145824:ENST00000512158:exon_134906376_134907558:CXCL14;ENSG00000145824:ENST00000337225:exon_134906376_134907558:CXCL14;ENSG00000145824:ENST00000511614:exon_134907460_134907558:CXCL14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 137519765 T/C 1 17 22 39 8.07864650827934 11.5452809892856 -3.46663448100622 T:C T C 10 0.52478549951298 0.336181221409151 ENSG00000112984:ENST00000394894:exon_137519651_137519794:KIF20A;ENSG00000112984:ENST00000508792:exon_137519651_137519794:KIF20A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 137542203 A/T 1 2 11 13 0.95042900097404 5.77264049464278 -4.82221149366874 A:T A T 10 0.52478549951298 0.0098880126580868 ENSG00000094880:ENST00000394884:exon_137541560_137542373:CDC23;ENSG00000094880:ENST00000505120:exon_137542160_137542369:CDC23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 137665323 G/A 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000158402:ENST00000323760:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000356505:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000513970:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000514555:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000503022:exon_137665242_137665336:CDC25C;ENSG00000158402:ENST00000510119:exon_137665242_137665336:CDC25C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 137902339 T/C 1 140 216 356 66.5300300681828 113.353667894804 -46.8236378266209 T:C T C 10 0.52478549951298 7.08034750428826e-07 ENSG00000113013:ENST00000297185:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000501917:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000507097:exon_137902315_137902407:HSPA9;ENSG00000113013:ENST00000523929:exon_137902315_137902400:HSPA9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 138456729 T/C 1 33 38 71 15.6820785160717 19.9418489814932 -4.25977046542158 T:C T C 10 0.52478549951298 0.342542993359648 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 138456815 T/C 1 27 36 63 12.8307915131495 18.8922779824673 -6.06148646931774 T:C T C 10 0.52478549951298 0.131732506519412 ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138456724_138456859:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000513453:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000507002:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505830:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505353:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000504666:exon_138456724_138456862:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509400:exon_138456724_138456862:SIL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 138857919 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000184584:ENST00000507297:exon_138857855_138858789:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000330794:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000509573:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000512606:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000503287:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000507034:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000511886:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000502825:exon_138857855_138858093:TMEM173;ENSG00000184584:ENST00000510817:exon_138857855_138858093:TMEM173 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139909036 C/T 1 29 23 52 13.7812205141236 12.0700664887985 1.71115402532504 T:C C T 10 0.52478549951298 0.678560330261019 ENSG00000131503:ENST00000360839:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000422011:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000253810:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000310356:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000297183:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000431508:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000433049:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000435794:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000432301:exon_139907769_139909381:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000532219:exon_139907769_139909381:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000254996:ENST00000474060:exon_139908411_139909381:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000254996:ENST00000437495:exon_139908499_139909381:ANKHD1-EIF4EBP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139928823 C/T 1 60 75 135 28.5128700292212 39.3589124634735 -10.8460424342523 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0700591733207616 ENSG00000131503:ENST00000422011:exon_139928819_139929163:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000253810:exon_139928819_139929163:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000297183:exon_139928819_139929154:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000532219:exon_139928819_139929154:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000254996:ENST00000474060:exon_139928819_139929154:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000254996:ENST00000437495:exon_139928819_139929154:ANKHD1-EIF4EBP3;ENSG00000243056:ENST00000310331:exon_139928819_139929163:EIF4EBP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139936760 G/T 1 78 61 139 37.0667310379876 32.0119154702918 5.05481556769578 T:G G T 10 0.52478549951298 0.397293223429166 ENSG00000213523:ENST00000336283:exon_139936732_139936857:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000523259:exon_139936732_139937031:SRA1;ENSG00000213523:ENST00000520427:exon_139936732_139936917:SRA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139940233 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000113108:ENST00000515056:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000509914:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000510241:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000467078:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000356738:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000354402:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000357560:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000511896:exon_139940224_139940339:APBB3;ENSG00000113108:ENST00000412920:exon_139940224_139940339:APBB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139946888 G/A 1 56 39 95 26.6120120272731 20.4666344810062 6.1453775462669 A:G G A 10 0.52478549951298 0.218789101916109 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139946988 G/T 1 55 47 102 26.1367975267861 24.6649184771101 1.47187904967604 T:G G T 10 0.52478549951298 0.842961967109762 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139947135 T/C 1 44 49 93 20.9094380214289 25.714489476136 -4.80505145470714 T:C T C 10 0.52478549951298 0.350476343745561 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 139947612 G/A 1 60 43 103 28.5128700292212 22.5657764790581 5.94709355016306 A:G G A 10 0.52478549951298 0.277808995134543 ENSG00000176087:ENST00000323146:exon_139946150_139948688:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000514199:exon_139946150_139948685:SLC35A4;ENSG00000176087:ENST00000432254:exon_139947402_139947830:SLC35A4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 140048209 T/C 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 140048267 T/C 1 6 12 18 2.85128700292212 6.29742599415576 -3.44613899123364 T:C T C 10 0.52478549951298 0.154993529862929 ENSG00000120314:ENST00000358337:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000403979:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000506393:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511232:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000504897:exon_140048197_140048376:WDR55;ENSG00000120314:ENST00000511364:exon_140048216_140048376:WDR55 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 141014494 T/C 1 23 23 46 10.9299335112015 12.0700664887985 -1.14013297759708 T:C T C 10 0.52478549951298 0.76927420528627 ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141014378_141014731:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141014378_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141014460_141014520:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141014378_141014520:HDAC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 141019569 G/C 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 141019830 C/G 1 15 9 24 7.1282175073053 4.72306949561682 2.40514801168848 C:G C G 10 0.52478549951298 0.414765733374574 ENSG00000164620:ENST00000520674:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019487_141019862:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 141307833 T/C 1 29 22 51 13.7812205141236 11.5452809892856 2.23593952483802 T:C T C 10 0.52478549951298 0.576591657010935 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141307716_141307863:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141307716_141307863:KIAA0141 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 141318165 A/G 1 18 12 30 8.55386100876636 6.29742599415576 2.2564350146106 A:G A G 10 0.52478549951298 0.467337392011984 ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141318086_141321612:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141318086_141318325:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000507481:exon_141318086_141318325:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000509110:exon_141318086_141318513:KIAA0141 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 141391532 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000113552:ENST00000513454:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000311337:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000500692:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000458112:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000508177:exon_141391477_141392359:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503794:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504139:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000505689:exon_141391414_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000510194:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000503229:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000507107:exon_141391477_141391606:GNPDA1;ENSG00000113552:ENST00000504424:exon_141391514_141391606:GNPDA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 142680282 T/C 1 21 8 29 9.97950451022742 4.19828399610384 5.78122051412358 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0395624295785671 ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000415690:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000416954:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142680050_142680328:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504336:exon_142680126_142680328:NR3C1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 143200053 C/T 1 40 10 50 19.0085800194808 5.2478549951298 13.760725024351 T:C C T 10 0.52478549951298 8.94171649594529e-05 ENSG00000158497:ENST00000289448:exon_143200045_143200284:HMHB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 145508544 C/G 1 57 38 95 27.0872265277601 19.9418489814932 7.1453775462669 C:G C G 10 0.52478549951298 0.151143749864828 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145508541_145508681:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145508541_145508681:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145508541_145508681:LARS;ENSG00000133706:ENST00000506231:exon_145508541_145508681:LARS;ENSG00000133706:ENST00000508709:exon_145508541_145508644:LARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 145547769 T/C 1 4 12 16 1.90085800194808 6.29742599415576 -4.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0420559312099871 ENSG00000133706:ENST00000394434:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000274562:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000510191:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000505223:exon_145547691_145547828:LARS;ENSG00000133706:ENST00000360930:exon_145547691_145547828:LARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 145650597 A/G 1 17 25 42 8.07864650827934 13.1196374878245 -5.04099097954516 A:C:G A G 10 0.52478549951298 0.125025382057908 ENSG00000091009:ENST00000506502:exon_145650517_145650621:RBM27;ENSG00000091009:ENST00000265271:exon_145650517_145650621:RBM27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 147805120 T/C 1 16 8 24 7.60343200779232 4.19828399610384 3.40514801168848 T:C T C 10 0.52478549951298 0.219795277052229 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147805085_147805264:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000514832:exon_147805085_147805264:FBXO38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 147813013 G/A 1 19 7 26 9.02907550925338 3.67349849659086 5.35557701266252 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0477709619313174 ENSG00000145868:ENST00000340253:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000296701:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000394370:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000513826:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000505399:exon_147812987_147813087:FBXO38;ENSG00000145868:ENST00000504447:exon_147812796_147813087:FBXO38 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 148747678 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000145882:ENST00000274569:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000511945:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000505669:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000503240:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000514349:exon_148747556_148749216:PCYOX1L;ENSG00000145882:ENST00000507621:exon_148747556_148749216:PCYOX1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 149754216 G/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:G G T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754180_149754374:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 149754991 C/T 1 12 6 18 5.70257400584424 3.14871299707788 2.55386100876636 T:C C T 10 0.52478549951298 0.248274183616306 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 149755340 G/T 1 20 16 36 9.5042900097404 8.39656799220768 1.10772201753272 T:G G T 10 0.52478549951298 0.741484551221566 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 149755421 A/G 1 22 17 39 10.4547190107144 8.92135349172066 1.53336551899378 A:G A G 10 0.52478549951298 0.635242053522041 ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149755284_149755472:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149755284_149755893:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149755284_149755472:TCOF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 149827189 G/C 1 3842 3943 7785 1825.77411087113 2069.22922457968 -243.45511370855 A:T:C:G G C 10 0.52478549951298 3.45654739159032e-08 ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149827148_149827298:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 150029076 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000171992:ENST00000394243:exon_150027506_150033794:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000522122:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000314840:exon_150027506_150031896:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000307662:exon_150027506_150029865:SYNPO;ENSG00000171992:ENST00000519664:exon_150027506_150031899:SYNPO HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 150639439 A/G 1 27 29 56 12.8307915131495 15.2187794858764 -2.38798797272688 A:G A G 10 0.52478549951298 0.593031336143429 ENSG00000196743:ENST00000523466:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150639316_150639477:GM2A;ENSG00000196743:ENST00000523004:exon_150639360_150639477:GM2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 150647040 C/T 1 27 39 66 12.8307915131495 20.4666344810062 -7.63584296785668 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.0647882796401266 ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 153372525 G/A 1 32 21 53 15.2068640155846 11.0204954897726 4.18636852581206 A:G G A 10 0.52478549951298 0.273032313333668 ENSG00000055147:ENST00000351797:exon_153369688_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000522858:exon_153371263_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000442256:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000435178:exon_153371271_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520667:exon_153372059_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000433795:exon_153372066_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518914:exon_153372248_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000518946:exon_153372274_153372670:FAM114A2;ENSG00000055147:ENST00000520313:exon_153372515_153372670:FAM114A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 154291409 C/T 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154291287_154291458:GEMIN5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 157158553 C/T 1 27 24 51 12.8307915131495 12.5948519883115 0.235939524838017 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157158205_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157158428_157158639:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157158428_157158639:THG1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 157164962 T/C 1 30 28 58 14.2564350146106 14.6939939863634 -0.437558971752843 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157164895_157165002:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157164918_157165002:THG1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 159659273 C/T 1 22 10 32 10.4547190107144 5.2478549951298 5.20686401558464 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0766738262933283 ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 159912360 C/T 1 6 11 17 2.85128700292212 5.77264049464278 -2.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.223952224889739 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 162887690 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162887372_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162887517_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162887556_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162887640_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162887640_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000521108:exon_162887659_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162887663_162887744:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000517936:exon_162887666_162887744:HMMR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 162902516 T/C 1 35 31 66 16.6325075170457 16.2683504849024 0.364157032143318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000072571:ENST00000416990:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000353866:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000434157:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000393915:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000432118:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000426586:exon_162902464_162902678:HMMR;ENSG00000072571:ENST00000358715:exon_162902464_162902678:HMMR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 169028575 C/G 1 53 24 77 25.1863685258121 12.5948519883115 12.5915165375005 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00416778485726512 ENSG00000040275:ENST00000265295:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000274631:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000446362:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000504258:exon_169028284_169028629:CCDC99;ENSG00000040275:ENST00000507232:exon_169028284_169029025:CCDC99 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 169111241 C/T 1 14 5 19 6.65300300681828 2.6239274975649 4.02907550925338 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0696868086487943 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169111200_169111354:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169111200_169111354:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169111200_169111354:DOCK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 169129364 A/G 1 16 22 38 7.60343200779232 11.5452809892856 -3.94184898149324 A:G A G 10 0.52478549951298 0.255321980234543 ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 172750392 G/A 1 9 1 10 4.27693050438318 0.52478549951298 3.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0230036043209770 ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520593:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520648:exon_172749972_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000518455:exon_172750313_172750433:STC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 174940493 G/A 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000164466:ENST00000321442:exon_174940466_174940593:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000507823:exon_174940466_174940593:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000502865:exon_174940466_174940593:SFXN1;ENSG00000164466:ENST00000515736:exon_174940466_174940737:SFXN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 175815782 G/C 1 225 105 330 106.923262609579 55.1024774488629 51.8207851607166 C:G G C 10 0.52478549951298 7.7679911929328e-09 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 175815874 T/C 1 280 190 470 133.060060136366 99.7092449074662 33.3508152288994 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00226941183271584 ENSG00000048162:ENST00000389158:exon_175815434_175815976:NOP16;ENSG00000146066:ENST00000274787:exon_175815748_175815974:HIGD2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 175819722 C/G 1 118 122 240 56.0753110574684 64.0238309405836 -7.94851988311521 C:G C G 10 0.52478549951298 0.332340762651265 ENSG00000175416:ENST00000310418:exon_175819456_175819946:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000345807:exon_175819456_175819946:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000508425:exon_175819643_175819933:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000510734:exon_175819650_175819946:CLTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 175843389 T/C 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000175416:ENST00000310418:exon_175843178_175843570:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000345807:exon_175843178_175843570:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000510734:exon_175843178_175843540:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000502877:exon_175843178_175843539:CLTB;ENSG00000175416:ENST00000428448:exon_175843178_175843540:CLTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176859748 G/A 1 49 27 76 23.285510523864 14.1692084868505 9.11630203701352 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0387198732070994 ENSG00000198055:ENST00000506296:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000511244:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176859707_176859807:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176859707_176859807:GRK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176863090 G/A 1 55 52 107 26.1367975267861 27.288845974675 -1.15204844788887 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.846909361898206 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000507633:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176863074_176863282:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000508705:exon_176863074_176863122:GRK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176867943 A/G 1 44 36 80 20.9094380214289 18.8922779824673 2.0171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.737240796537104 ENSG00000198055:ENST00000355472:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000393576:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000355958:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000528793:exon_176867920_176868054:GRK6;ENSG00000198055:ENST00000515666:exon_176867920_176868054:GRK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176885499 T/C 1 18 12 30 8.55386100876636 6.29742599415576 2.2564350146106 T:C T C 10 0.52478549951298 0.467337392011984 ENSG00000113758:ENST00000309007:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000450502:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393563:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000292385:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000472831:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000393565:exon_176885059_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000512501:exon_176884368_176885708:DBN1;ENSG00000113758:ENST00000467054:exon_176885298_176885708:DBN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176915143 C/T 1 8 22 30 3.80171600389616 11.5452809892856 -7.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00545782533752388 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176915069_176915249:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176914898_176915249:PDLIM7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176916516 C/T 1 14 9 23 6.65300300681828 4.72306949561682 1.92993351120146 T:C C T 10 0.52478549951298 0.532391639992863 ENSG00000196923:ENST00000493815:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000359895:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000356618:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000355841:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000460994:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000486828:exon_176916394_176916628:PDLIM7;ENSG00000196923:ENST00000393551:exon_176916394_176916628:PDLIM7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176940384 G/A 1 58 67 125 27.5624410282472 35.1606284673697 -7.5981874391225 A:G G A 10 0.52478549951298 0.180013793669039 ENSG00000183258:ENST00000330503:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507955:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000505081:exon_176940354_176940848:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000503078:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000507900:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000504807:exon_176940354_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000512027:exon_176940003_176940485:DDX41;ENSG00000183258:ENST00000511040:exon_176940354_176940485:DDX41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 176951276 A/G 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 A:G A G 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000146067:ENST00000514747:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505569:exon_176951186_176952488:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510479:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000506955:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000398118:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000329540:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000510163:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000524677:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000442143:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000443375:exon_176951186_176952206:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000507212:exon_176951186_176951495:FAM193B;ENSG00000146067:ENST00000505241:exon_176951186_176951422:FAM193B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 177035964 T/C 1 9 19 28 4.27693050438318 9.97092449074662 -5.69399398636344 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0368587069089518 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177035911_177036015:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177034366_177036015:B4GALT7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 177036627 C/T 1 14 20 34 6.65300300681828 10.4957099902596 -3.84270698344132 T:C C T 10 0.52478549951298 0.229459342212184 ENSG00000027847:ENST00000029410:exon_177036541_177037348:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505433:exon_177036541_177036708:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000505145:exon_177036541_177037267:B4GALT7;ENSG00000027847:ENST00000515353:exon_177036541_177037329:B4GALT7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 177482813 G/A 1 309 1 310 146.841280650489 0.52478549951298 146.316495150976 A:G G A 10 0.52478549951298 7.40544635639318e-85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 177482814 C/A 0 306 1 307 145.415637149028 0.52478549951298 144.890851649515 C:G C G 10 0.52478549951298 5.60300350049024e-84 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179036457 G/C 1 26 27 53 12.3555770126625 14.1692084868505 -1.81363147418794 C:G G C 10 0.52478549951298 0.680609418168567 ENSG00000176783:ENST00000319449:exon_179036377_179037027:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000360569:exon_179036377_179036520:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000377001:exon_179036377_179037019:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000437570:exon_179036377_179037012:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000393438:exon_179036377_179037013:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000503583:exon_179036377_179036473:RUFY1;ENSG00000176783:ENST00000508797:exon_179036377_179036971:RUFY1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179043203 G/A 1 146 149 295 69.3813170711049 78.193039427434 -8.81172235632911 A:G G A 10 0.52478549951298 0.321785453723659 ENSG00000169045:ENST00000511300:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000393432:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502904:exon_179043127_179044111:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000442819:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000356731:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000515481:exon_179041181_179044650:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000514332:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000329433:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510678:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000510411:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523449:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000524179:exon_179043127_179043288:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519033:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000521720:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000502632:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000519958:exon_179043127_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000523136:exon_179043142_179043219:HNRNPH1;ENSG00000169045:ENST00000504549:exon_179043159_179043219:HNRNPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179149990 C/T 1 145 108 253 68.9061025706179 56.6768339474018 12.229268623216 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.130928398848504 ENSG00000127022:ENST00000504734:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000415618:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000247461:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000452673:exon_179149805_179150020:CANX;ENSG00000127022:ENST00000514032:exon_179149805_179150020:CANX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179264731 T/C 1 25 38 63 11.8803625121755 19.9418489814932 -8.06148646931774 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0440454014853466 ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179263436_179265078:SQSTM1;ENSG00000161010:ENST00000376931:exon_179264266_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523267:exon_179264274_179264879:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000518219:exon_179264276_179267959:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000523084:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000292586:exon_179264276_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000376929:exon_179264277_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521299:exon_179264527_179264885:C5orf45;ENSG00000161010:ENST00000521333:exon_179264693_179264811:C5orf45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179290845 T/G 1 22 24 46 10.4547190107144 12.5948519883115 -2.14013297759708 T:G T G 10 0.52478549951298 0.55728167840293 ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179297262 T/C 1 15 7 22 7.1282175073053 3.67349849659086 3.45471901071444 T:C T C 10 0.52478549951298 0.19936513171716 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179297304 G/A 1 12 4 16 5.70257400584424 2.09914199805192 3.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.082551923143294 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179297352 A/G 1 12 4 16 5.70257400584424 2.09914199805192 3.60343200779232 A:G A G 10 0.52478549951298 0.082551923143294 ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522180:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519757:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179297255_179297495:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522921:exon_179297255_179297700:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520912:exon_179297255_179297408:TBC1D9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179300131 T/C 1 10 13 23 4.7521450048702 6.82221149366874 -2.07006648879854 T:C T C 10 0.52478549951298 0.411031583507491 ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179300119_179300248:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521669:exon_179300119_179300135:TBC1D9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179318572 C/T 1 7 10 17 3.32650150340914 5.2478549951298 -1.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.467663866314071 ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179318379_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179318379_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179318412_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179318379_179318586:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522029:exon_179318379_179318586:TBC1D9B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 179996111 C/T 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:C C T 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000113300:ENST00000261951:exon_179996110_179996340:CNOT6;ENSG00000113300:ENST00000393356:exon_179996110_179996340:CNOT6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 180218668 A/G 1 45 44 89 21.3846525219159 23.0905619785711 -1.70590945665522 A:G A G 10 0.52478549951298 0.750786282089874 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 5 180219304 C/T 1 19 15 34 9.02907550925338 7.8717824926947 1.15729301655868 T:C C T 10 0.52478549951298 0.733864029024378 ENSG00000131446:ENST00000333055:exon_180217541_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000307826:exon_180217543_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000446023:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000452920:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393340:exon_180217548_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000427865:exon_180218482_180220097:MGAT1;ENSG00000131446:ENST00000393339:exon_180218634_180219387:MGAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 348195 G/A 1 95 18 113 45.1453775462669 9.44613899123364 35.6992385550333 A:G G A 10 0.52478549951298 2.12919726555299e-12 ENSG00000112679:ENST00000457386:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_348103_348274:DUSP22;ENSG00000112679:ENST00000419235:exon_348103_348274:DUSP22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 350829 G/A 1 80 139 219 38.0171600389616 72.9451844323042 -34.9280243933426 A:G G A 10 0.52478549951298 2.54699180351834e-06 ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 599209 T/C 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 T:C T C 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000112685:ENST00000230449:exon_599080_599225:EXOC2;ENSG00000112685:ENST00000448181:exon_599080_599225:EXOC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 3850882 C/T 0 0 28 28 0 14.6939939863634 -14.6939939863634 T C T 10 0.52478549951298 8.97245219933458e-10 ENSG00000145945:ENST00000380274:exon_3849620_3851551:FAM50B;ENSG00000145945:ENST00000380272:exon_3850023_3851551:FAM50B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 4031998 A/G 1 101 72 173 47.996664549189 37.7845559649346 10.2121085842545 A:G A G 10 0.52478549951298 0.128035257892279 ENSG00000112739:ENST00000480058:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000337659:exon_4031793_4032989:PRPF4B;ENSG00000112739:ENST00000489943:exon_4031793_4032335:PRPF4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 4998963 A/G 1 17 10 27 8.07864650827934 5.2478549951298 2.83079151314954 A:G A G 10 0.52478549951298 0.336737529516327 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 4999067 T/C 1 2 14 16 0.95042900097404 7.34699699318172 -6.39656799220768 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00162874117046302 ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000479782:exon_4999062_4999075:RPP40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 5999269 C/G 0 25 0 25 11.8803625121755 0 11.8803625121755 C C 10 0.52478549951298 1.08256128832194e-07 ENSG00000124785:ENST00000244766:exon_5998232_5999437:NRN1;ENSG00000124785:ENST00000495850:exon_5998948_5999437:NRN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 7310259 A/G 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:G A G 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 12294248 C/A 1 1 7 8 0.47521450048702 3.67349849659086 -3.19828399610384 A:C C A 10 0.52478549951298 0.0313306683969089 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12294174_12294329:EDN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 12296255 G/T 1 6 13 19 2.85128700292212 6.82221149366874 -3.97092449074662 T:G G T 10 0.52478549951298 0.105409046642838 ENSG00000078401:ENST00000379375:exon_12296195_12297427:EDN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 13321179 C/T 1 50 37 87 23.760725024351 19.4170634819803 4.34366154237074 T:C C T 10 0.52478549951298 0.390936343406987 ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321140_13321301:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 13365566 C/T 1 16 11 27 7.60343200779232 5.77264049464278 1.83079151314954 T:C C T 10 0.52478549951298 0.5651214206051 ENSG00000145990:ENST00000379287:exon_13358062_13365894:GFOD1;ENSG00000145990:ENST00000379284:exon_13358062_13365894:GFOD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 15615499 T/G 1 47 45 92 22.3350815228899 23.6153474780841 -1.28026595519416 T:G T G 10 0.52478549951298 0.83490312873675 ENSG00000047579:ENST00000344537:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000510395:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000355917:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000397306:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000515875:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000513680:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000511762:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000338950:exon_15615498_15615630:DTNBP1;ENSG00000047579:ENST00000506844:exon_15615498_15615630:DTNBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 17626144 T/C 1 20 23 43 9.5042900097404 12.0700664887985 -2.56577647905814 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.449185365641322 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17626039_17626395:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17626039_17626395:NUP153 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 17629616 G/A 1 20 31 51 9.5042900097404 16.2683504849024 -6.76406047516198 A:G G A 10 0.52478549951298 0.067923813867395 ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 18215336 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000165097:ENST00000388870:exon_18215238_18215360:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000397244:exon_18215238_18215360:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000297792:exon_18215238_18215360:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000388869:exon_18215244_18215360:KDM1B;ENSG00000165097:ENST00000449850:exon_18215238_18215360:KDM1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 21065450 A/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000145996:ENST00000274695:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000397216:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378624:exon_21065279_21065459:CDKAL1;ENSG00000145996:ENST00000378610:exon_21065279_21065459:CDKAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 24651061 A/C 1 24 33 57 11.4051480116885 17.3179214839283 -5.91277347223986 A:C A C 10 0.52478549951298 0.144050475990356 ENSG00000111802:ENST00000378198:exon_24650205_24651297:TDP2;ENSG00000111802:ENST00000341060:exon_24650207_24651297:TDP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 24698215 G/A 1 60 57 117 28.5128700292212 29.9127734722399 -1.39990344301867 A:G G A 10 0.52478549951298 0.853243103230705 ENSG00000112304:ENST00000230048:exon_24698111_24698295:ACOT13;ENSG00000112304:ENST00000476436:exon_24698111_24698295:ACOT13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 24843586 T/C 1 12 5 17 5.70257400584424 2.6239274975649 3.07864650827934 T:C T C 10 0.52478549951298 0.151798661556102 ENSG00000111913:ENST00000259698:exon_24843090_24843782:FAM65B;ENSG00000111913:ENST00000378023:exon_24843090_24843782:FAM65B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26027433 G/A 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 A:G G A 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000124529:ENST00000377364:exon_26027124_26027480:HIST1H4B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26104280 T/C 1 104 100 204 49.4223080506501 52.478549951298 -3.05624190064793 T:C T C 10 0.52478549951298 0.674680711210257 ENSG00000197061:ENST00000377803:exon_26104104_26104518:HIST1H4C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26123962 G/A 1 9 21 30 4.27693050438318 11.0204954897726 -6.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0165799937885591 ENSG00000180596:ENST00000314332:exon_26123743_26124154:HIST1H2BC;ENSG00000180596:ENST00000396984:exon_26123584_26124154:HIST1H2BC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26189059 G/A 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 A:G G A 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000188987:ENST00000340756:exon_26188938_26189304:HIST1H4D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26199163 A/G 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000197409:ENST00000377831:exon_26199087_26199464:HIST1H3D;ENSG00000196866:ENST00000341023:exon_26199079_26199471:HIST1H2AD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26199822 A/G 1 11 4 15 5.22735950535722 2.09914199805192 3.1282175073053 A:G A G 10 0.52478549951298 0.125219499815076 ENSG00000197846:ENST00000359985:exon_26199748_26200942:HIST1H2BF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26251857 C/T 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.587193671721943 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26285560 A/G 1 14 11 25 6.65300300681828 5.77264049464278 0.880362512175499 A:G A G 10 0.52478549951298 0.842068649003874 ENSG00000158406:ENST00000289352:exon_26285262_26285762:HIST1H4H;ENSG00000158406:ENST00000377727:exon_26285341_26285737:HIST1H4H HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26545632 G/A 1 105 99 204 49.8975225511371 51.953764451785 -2.05624190064793 A:G G A 10 0.52478549951298 0.779621342183384 ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26597333 A/G 1 37 27 64 17.5829365180197 14.1692084868505 3.41372803116928 A:G A G 10 0.52478549951298 0.453122592737752 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 26598188 A/G 1 44 46 90 20.9094380214289 24.1401329775971 -3.2306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.527373843129987 ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26598142_26598338:ABT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29523952 A/G 1 79 102 181 37.5419455384746 53.528120950324 -15.9861754118494 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0207955666914205 ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29691303 G/A 1 272 329 601 129.258344132469 172.65442933977 -43.396085207301 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000435602416195100 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29691390 C/G 1 13 12 25 6.17778850633126 6.29742599415576 -0.119637487824502 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29691391 T/C 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 T:C T C 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29691713 A/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:C A C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29693011 C/T 1 502 626 1128 238.557679244484 328.515722695125 -89.9580434506414 A:T:C C T 10 0.52478549951298 8.96502619323119e-08 ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000489502:exon_29692897_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29692808_29693076:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000429294:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29692808_29693083:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000465459:exon_29692831_29693083:HLA-F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29694680 A/C 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:C A C 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29694681 A/T 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:T A T 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29910820 G/C 0 12 0 12 5.70257400584424 0 5.70257400584424 G G 10 0.52478549951298 0.000568937206725287 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29910834 G/C 0 9 0 9 4.27693050438318 0 4.27693050438318 G G 10 0.52478549951298 0.00425478237298913 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 29910839 C/T 0 9 0 9 4.27693050438318 0 4.27693050438318 C C 10 0.52478549951298 0.00425478237298913 ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30154199 T/C 1 25 30 55 11.8803625121755 15.7435649853894 -3.8632024732139 T:C T C 10 0.52478549951298 0.344973852800738 ENSG00000234127:ENST00000453195:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000454678:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000437089:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000480999:exon_30152232_30154335:TRIM26;ENSG00000234127:ENST00000458575:exon_30152234_30154335:TRIM26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30313268 G/A 1 18 16 34 8.55386100876636 8.39656799220768 0.157293016558679 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000204599:ENST00000412529:exon_30313268_30313350:TRIM39;ENSG00000248167:ENST00000513556:exon_30313268_30313350:XXbac-BPG283O16.8;ENSG00000241370:ENST00000433076:exon_30313244_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000466327:exon_30313268_30313706:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000498414:exon_30313075_30314334:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000491477:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000473266:exon_30313075_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000442966:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000428040:exon_30313268_30313350:RPP21;ENSG00000241370:ENST00000436442:exon_30313268_30313350:RPP21 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30457732 T/C 1 369 491 860 175.35415067971 257.669680260873 -82.3155295811628 A:T:C T C 10 0.52478549951298 1.98150084697742e-08 ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30458064 G/A 1 311 472 783 147.791709651463 247.698755770127 -99.9070461186634 A:G G A 10 0.52478549951298 8.39710182470942e-13 ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30458017_30458292:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30458017_30458292:HLA-E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30552317 C/T 1 38 61 99 18.0581510185068 32.0119154702918 -13.953764451785 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00630299860134934 ENSG00000204574:ENST00000326195:exon_30552195_30552343:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000376545:exon_30552195_30552343:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000455943:exon_30552195_30552343:ABCF1;ENSG00000204574:ENST00000475993:exon_30552195_30552343:ABCF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30593485 C/G 1 151 150 301 71.75738957354 78.717824926947 -6.96043535340699 A:C:G C G 10 0.52478549951298 0.453171328430961 ENSG00000204568:ENST00000259873:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472267:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000376508:exon_30593279_30594172:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472229:exon_30593279_30594172:MRPS18B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30596135 A/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000137343:ENST00000318999:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376485:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376478:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000319027:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000376483:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000330083:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000329992:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000468713:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000493388:exon_30596106_30596207:ATAT1;ENSG00000137343:ENST00000471782:exon_30596106_30596207:ATAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30656398 T/G 1 50 36 86 23.760725024351 18.8922779824673 4.86844704188372 T:G T G 10 0.52478549951298 0.331481856702902 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000444096:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000495946:exon_30655824_30656719:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30655829_30656719:NRM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30658673 G/A 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 A:G G A 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000137404:ENST00000259953:exon_30658619_30659058:NRM;ENSG00000137404:ENST00000470733:exon_30658619_30658779:NRM;ENSG00000137404:ENST00000482141:exon_30658619_30658744:NRM;ENSG00000137404:ENST00000462857:exon_30658619_30658763:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376420:exon_30658619_30658753:NRM;ENSG00000137404:ENST00000474864:exon_30658619_30658751:NRM;ENSG00000137404:ENST00000376421:exon_30658619_30658770:NRM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30668374 G/A 1 68 50 118 32.3145860331174 26.239274975649 6.07531105746835 A:G G A 10 0.52478549951298 0.270197797564341 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30667584_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000422104:exon_30667585_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000489540:exon_30668092_30668409:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30668172_30668409:MDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30672342 A/G 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:G A G 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000429610:exon_30671398_30672728:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000435797:exon_30671398_30672944:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000420817:exon_30672237_30672602:MDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30673013 A/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:C:G A G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30673422 A/G 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30673489 G/C 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 C:G G C 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000137337:ENST00000376406:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000376405:exon_30671398_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000417033:exon_30673225_30673875:MDC1;ENSG00000137337:ENST00000492462:exon_30673359_30673875:MDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30865204 A/C 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 A:C A C 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000204580:ENST00000324771:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000418800:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000454612:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376570:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376569:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376575:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000451954:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000446312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000361741:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376568:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000452441:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000482873:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000508312:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000376567:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000513240:exon_30865138_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000417521:exon_30865156_30865374:DDR1;ENSG00000204580:ENST00000484556:exon_30865156_30865374:DDR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30889389 T/C 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 T:C T C 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30889366_30889468:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30889366_30889468:VARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 30893105 G/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137411:ENST00000477288:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000321897:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000469358:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000476162:exon_30893051_30893162:VARS2;ENSG00000137411:ENST00000473916:exon_30893051_30893162:VARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31431508 G/A 1 17 9 26 8.07864650827934 4.72306949561682 3.35557701266252 A:G G A 10 0.52478549951298 0.239108469053992 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31431539 T/C 1 18 10 28 8.55386100876636 5.2478549951298 3.30600601363656 T:C T C 10 0.52478549951298 0.257367377359129 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31431757 A/G 1 32 23 55 15.2068640155846 12.0700664887985 3.1367975267861 A:G A G 10 0.52478549951298 0.420638970915365 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31431820 C/T 1 22 39 61 10.4547190107144 20.4666344810062 -10.0119154702918 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0141778926716557 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31473561 A/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000204516:ENST00000399150:exon_31473394_31473648:MICB;ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473394_31473648:MICB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31474000 G/A 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000204516:ENST00000252229:exon_31473920_31474207:MICB;ENSG00000204516:ENST00000494577:exon_31473712_31474207:MICB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31498275 A/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:C A C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000198563:ENST00000462421:exon_31498020_31498526:BAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31498737 G/A 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G G A 10 0.52478549951298 0.766126317290971 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31540556 T/C 1 206 219 425 97.8941871003261 114.928024393343 -17.0338372930165 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0989103460871254 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31540784 C/A 1 262 219 481 124.506199127599 114.928024393343 9.57817473425661 A:C C A 10 0.52478549951298 0.386130860615229 ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31584275 C/T 1 276 232 508 131.159202134418 121.750235887011 9.40896624740614 A:T:C C T 10 0.52478549951298 0.42398947949121 ENSG00000204472:ENST00000376059:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000337917:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376063:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000466820:exon_31583447_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000487813:exon_31584121_31584283:AIF1;ENSG00000204472:ENST00000376049:exon_31584121_31584283:AIF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31595882 C/A 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 A:C C A 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31599594 A/G 1 34 28 62 16.1572930165587 14.6939939863634 1.46329903019524 A:G A G 10 0.52478549951298 0.799527837784276 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598916_31599597:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598916_31599597:BAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31601344 T/C 1 34 30 64 16.1572930165587 15.7435649853894 0.413728031169278 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31603189 G/A 1 79 84 163 37.5419455384746 44.0819819590903 -6.54003642061574 A:G G A 10 0.52478549951298 0.309128135157714 ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603171_31603242:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000469501:exon_31603171_31603486:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603153_31603242:BAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31611746 G/A 1 29 21 50 13.7812205141236 11.0204954897726 2.760725024351 A:G G A 10 0.52478549951298 0.48052055421722 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31611667_31611751:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000469182:exon_31611667_31611754:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000453833:exon_31611667_31611754:BAT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31615514 T/C 1 28 27 55 13.3060060136366 14.1692084868505 -0.863202473213903 T:C T C 10 0.52478549951298 0.892816578675393 ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31615368_31615621:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31615368_31615621:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000439687:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000435080:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000434444:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000452994:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000456622:exon_31615368_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000428326:exon_31615370_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000451898:exon_31615371_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000433828:exon_31615377_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000424480:exon_31615381_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000424176:exon_31615457_31615603:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000446826:exon_31615476_31615621:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000441054:exon_31615483_31615603:BAT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31627523 C/T 1 16 24 40 7.60343200779232 12.5948519883115 -4.9914199805192 T:C C T 10 0.52478549951298 0.153337885169514 ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31630241 C/T 1 32 38 70 15.2068640155846 19.9418489814932 -4.7349849659086 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.282235373466502 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31631907 G/A 1 28 37 65 13.3060060136366 19.4170634819803 -6.1110574683437 A:G G A 10 0.52478549951298 0.137314731265776 ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31635710 T/C 1 205 253 458 97.4189725998391 132.770731376784 -35.3517587769448 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00103763939528558 ENSG00000204435:ENST00000375885:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375882:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000468255:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000465481:exon_31635645_31636018:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000481269:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000496869:exon_31635627_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375865:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000204435:ENST00000375866:exon_31635645_31635747:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31635645_31635747:LY6G5B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31639845 C/A 1 15 11 26 7.1282175073053 5.77264049464278 1.35557701266252 A:C C A 10 0.52478549951298 0.695977309853642 ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31657413 T/C 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C T C 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31731881 C/T 1 15 8 23 7.1282175073053 4.19828399610384 2.92993351120146 T:C C T 10 0.52478549951298 0.296787100662300 ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000476085:exon_31731841_31731936:MSH5;ENSG00000228727:ENST00000433778:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000415669:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000425424:exon_31731841_31731936:C6orf26;ENSG00000228727:ENST00000494299:exon_31731397_31731936:C6orf26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31748820 G/A 1 45 45 90 21.3846525219159 23.6153474780841 -2.2306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.673558923353639 ENSG00000204394:ENST00000375663:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000419407:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000433799:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000444930:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000428445:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000482996:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000479051:exon_31748796_31748900:VARS;ENSG00000204394:ENST00000459667:exon_31748796_31749527:VARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31807489 C/T 1 67 72 139 31.8393715326303 37.7845559649346 -5.94518443230422 T:C C T 10 0.52478549951298 0.350269197022287 ENSG00000204387:ENST00000375640:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375641:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375639:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375638:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375635:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375642:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395789:exon_31807320_31807538:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000375633:exon_31807320_31807541:C6orf48;ENSG00000204387:ENST00000395788:exon_31807320_31807541:C6orf48 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31848494 G/A 1 36 29 65 17.1077220175327 15.2187794858764 1.8889425316563 A:G G A 10 0.52478549951298 0.709939008575041 ENSG00000204371:ENST00000478491:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000461880:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000494816:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000480912:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000395728:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375528:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375530:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000375537:exon_31848450_31848625:EHMT2;ENSG00000204371:ENST00000442298:exon_31848450_31848625:EHMT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31928306 A/G 1 1 8 9 0.47521450048702 4.19828399610384 -3.72306949561682 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0165388389563391 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000488648:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928209_31928323:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31928209_31928323:SKIV2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31929328 C/T 1 11 11 22 5.22735950535722 5.77264049464278 -0.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.834291283658841 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31929324_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31929324_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000477400:exon_31929324_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31928818_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000461073:exon_31929324_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31929324_31929452:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000466290:exon_31929274_31929452:SKIV2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 31931330 C/G 1 17 24 41 8.07864650827934 12.5948519883115 -4.51620548003218 C:G C G 10 0.52478549951298 0.163129931079627 ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31931190_31931336:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31931190_31931336:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31931190_31931336:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31931190_31931336:SKIV2L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32093922 G/A 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32411035 A/C 1 1784 1828 3612 847.782668868844 959.307893109728 -111.525224240884 A:T:C A C 10 0.52478549951298 0.000216047329426749 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32411186 G/A 1 3859 3652 7511 1833.85275737941 1916.5166442214 -82.663886841993 A:T:C:G G A 10 0.52478549951298 0.0566242022266191 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411037_32411243:HLA-DRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32411523 T/C 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C T C 10 0.52478549951298 0.310721474916608 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32411646 T/G 1 4199 3320 7519 1995.425687545 1742.28785838309 253.137829161903 A:T:C:G T G 10 0.52478549951298 5.07429785299218e-09 ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32411726 G/A 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.113694420116144 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32814942 C/T 1 168 174 342 79.8360360818194 91.3126769152585 -11.4766408334392 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.233570558605977 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32814975 T/C 1 232 245 477 110.249764112989 128.57244738068 -18.3226832676915 T:C T C 10 0.52478549951298 0.098811211809399 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32816772 C/A 1 296 268 564 140.663492144158 140.642513869479 0.0209782746792655 A:T:C:G C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32818774 T/C 1 110 124 234 52.2735950535722 65.0734019396095 -12.7998068860373 A:T:C:G T C 10 0.52478549951298 0.101682395849721 ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32825090 G/A 1 387 324 711 183.908011688477 170.030501842206 13.8775098462712 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.310690174017878 ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32975163 C/T 1 24 14 38 11.4051480116885 7.34699699318172 4.05815101850676 T:C C T 10 0.52478549951298 0.197987410796594 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 32975257 C/T 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 T:C C T 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000453319:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975088_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000485901:exon_32974857_32975369:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975222_32975654:HLA-DOA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33036971 C/T 0 1291 0 1291 613.501920128743 0 613.501920128743 C C 10 0.52478549951298 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33036999 T/C 1 1422 26 1448 675.755019692542 13.6444229873375 662.110596705205 T:C T C 10 0.52478549951298 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037060 C/T 1 1916 26 1942 910.51098293313 13.6444229873375 896.866559945793 T:C C T 10 0.52478549951298 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037419 G/A 1 1921 9 1930 912.887055435565 4.72306949561682 908.163985939948 A:G G A 10 0.52478549951298 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037424 T/C 1 1846 11 1857 877.245967899039 5.77264049464278 871.473327404396 T:C:G T C 10 0.52478549951298 0 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037474 A/G 1 57 1253 1310 27.0872265277601 657.556230889764 -630.469004362004 A:T:G A G 10 0.52478549951298 1.03753785626662e-320 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037522 T/C 1 875 50 925 415.812687926142 26.239274975649 389.573412950493 A:T:C T C 10 0.52478549951298 1.57428596523054e-178 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037560 G/A 1 718 12 730 341.20401134968 6.29742599415576 334.906585355525 A:T:G G A 10 0.52478549951298 6.34433404284265e-180 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33037579 A/T 0 537 0 537 255.19018676153 0 255.19018676153 A A 10 0.52478549951298 6.53715906125734e-151 ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33048640 A/G 1 141 228 369 67.0052445686698 119.651093888959 -52.6458493202896 A:G A G 10 0.52478549951298 4.85965782455408e-08 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33052950 T/C 1 879 274 1153 417.713545928091 143.791226866557 273.922319061534 T:C T C 10 0.52478549951298 5.4751169829321e-62 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33052958 C/T 1 990 244 1234 470.46235548215 128.047661881167 342.414693600983 T:C C T 10 0.52478549951298 1.92265471015852e-91 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33052986 T/C 1 781 115 896 371.142524880363 60.3503324439927 310.79219243637 T:C:G T C 10 0.52478549951298 1.13995189874958e-108 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33052817_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33052727_33053008:HLA-DPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33053559 C/T 1 274 945 1219 130.208773133443 495.922297039766 -365.713523906323 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 6.2420181903096e-102 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33053577 G/A 1 897 277 1174 426.267406936857 145.365583365095 280.901823571761 A:G G A 10 0.52478549951298 5.41073755927856e-64 ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33162540 C/G 1 32 27 59 15.2068640155846 14.1692084868505 1.03765552873418 C:G C G 10 0.52478549951298 0.796186942708643 ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33161365_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33161997_33162606:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483821:exon_33162441_33162606:RXRB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33169281 G/A 1 25 19 44 11.8803625121755 9.97092449074662 1.90943802142888 A:G G A 10 0.52478549951298 0.651371279246122 ENSG00000112473:ENST00000374675:exon_33169019_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000374677:exon_33168650_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000496894:exon_33168702_33169433:SLC39A7;ENSG00000112473:ENST00000467504:exon_33169023_33169433:SLC39A7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33235755 G/A 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000478934:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000495755:exon_33235642_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000463486:exon_33235647_33235774:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000464425:exon_33235648_33235774:VPS52 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33248414 T/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:G T G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33248629 C/T 1 79 55 134 37.5419455384746 28.8632024732139 8.67874306526068 T:C C T 10 0.52478549951298 0.141810614721407 ENSG00000227057:ENST00000461951:exon_33248592_33248688:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000374617:exon_33248451_33248764:WDR46;ENSG00000227057:ENST00000489905:exon_33248205_33248764:WDR46 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33258619 C/A 1 91 75 166 43.2445195443188 39.3589124634735 3.88560708084532 A:C:G C A 10 0.52478549951298 0.586675671990674 ENSG00000204220:ENST00000395131:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374606:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374610:exon_33258493_33258639:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374607:exon_33258493_33258698:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33281292 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33287183 T/C 1 160 145 305 76.0343200779232 76.0938974293821 -0.0595773514589126 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33382788 G/A 1 18 6 24 8.55386100876636 3.14871299707788 5.40514801168848 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0387976789889894 ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33382818 G/A 1 13 10 23 6.17778850633126 5.2478549951298 0.929933511201459 A:G G A 10 0.52478549951298 0.83534679528769 ENSG00000112511:ENST00000487667:exon_33382732_33382858:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374512:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000374516:exon_33382732_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000439397:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000495509:exon_33382743_33382921:PHF1;ENSG00000112511:ENST00000486845:exon_33382502_33382921:PHF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33659472 C/G 1 7 19 26 3.32650150340914 9.97092449074662 -6.64442298733748 C:G C G 10 0.52478549951298 0.010169784937754 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33659392_33659496:ITPR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 33660597 C/T 1 29 26 55 13.7812205141236 13.6444229873375 0.136797526786097 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000096433:ENST00000374316:exon_33660505_33660670:ITPR3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 34214322 C/G 1 50 38 88 23.760725024351 19.9418489814932 3.81887604285776 C:G C G 10 0.52478549951298 0.45559663604908 ENSG00000186577:ENST00000476320:exon_34214157_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000335352:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000394990:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000481533:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000413013:exon_34214172_34214645:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000463083:exon_34214226_34215269:C6orf1;ENSG00000186577:ENST00000468145:exon_34214262_34214645:C6orf1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 34309720 T/G 1 32 26 58 15.2068640155846 13.6444229873375 1.56244102824716 T:G T G 10 0.52478549951298 0.695751943213381 ENSG00000112664:ENST00000358797:exon_34309639_34309749:NUDT3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35260503 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000417184:exon_35260331_35260504:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35260530 C/T 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000065029:ENST00000229405:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000373953:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000339411:exon_35260331_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000440666:exon_35260317_35260564:ZNF76;ENSG00000065029:ENST00000479226:exon_35260100_35260564:ZNF76 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35391787 C/T 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 T:C C T 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000112033:ENST00000360694:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000418635:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000444397:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000311565:exon_35391723_35391925:PPARD;ENSG00000112033:ENST00000337400:exon_35391723_35391925:PPARD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35436195 G/A 1 45 34 79 21.3846525219159 17.8427069834413 3.54194553847458 A:G G A 10 0.52478549951298 0.433227038729675 ENSG00000198755:ENST00000322203:exon_35436185_35436216:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35436185_35436216:RPL10A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35436571 C/T 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 T:C C T 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35436197_35436650:RPL10A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35438419 C/T 1 1554 1910 3464 738.483333756829 1002.34030406979 -263.856970312963 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 3.10626144700232e-19 ENSG00000198755:ENST00000322203:exon_35438357_35438562:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000467020:exon_35438357_35438562:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000464112:exon_35438357_35438562:RPL10A;ENSG00000198755:ENST00000478340:exon_35438357_35438562:RPL10A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 35803192 C/A 1 14 9 23 6.65300300681828 4.72306949561682 1.92993351120146 A:C C A 10 0.52478549951298 0.532391639992863 ENSG00000096063:ENST00000373825:exon_35800743_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000361690:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000423325:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000346162:exon_35800811_35803265:SRPK1;ENSG00000096063:ENST00000373822:exon_35800811_35803265:SRPK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 36823604 T/C 1 34 55 89 16.1572930165587 28.8632024732139 -12.7059094566552 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00776550667627449 ENSG00000137168:ENST00000373699:exon_36822603_36823809:PPIL1;ENSG00000137168:ENST00000483552:exon_36822603_36823809:PPIL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 36882353 A/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G A G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000198663:ENST00000359359:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000480824:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000355190:exon_36882330_36882469:C6orf89;ENSG00000198663:ENST00000373685:exon_36882330_36882469:C6orf89 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 36936697 T/C 1 118 115 233 56.0753110574684 60.3503324439927 -4.27502138652435 T:C T C 10 0.52478549951298 0.599984480492101 ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 36976722 G/A 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 A:G G A 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000146192:ENST00000489356:exon_36976610_36977807:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000497659:exon_36976610_36976857:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000459781:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000487975:exon_36976610_36976841:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36976610_36976841:FGD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 36988364 C/T 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 38650588 T/A 1 56 55 111 26.6120120272731 28.8632024732139 -2.25119044594079 A:T T A 10 0.52478549951298 0.704286946943964 ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41038845 C/T 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000124596:ENST00000469104:exon_41038564_41039015:C6orf130;ENSG00000124596:ENST00000471367:exon_41038780_41039015:C6orf130 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41160572 C/T 1 1 7 8 0.47521450048702 3.67349849659086 -3.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0313306683969089 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41160539_41160639:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41160539_41160639:TREML2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41162518 T/C 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 T:C T C 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000112195:ENST00000373108:exon_41162163_41162571:TREML2;ENSG00000112195:ENST00000483722:exon_41162163_41162571:TREML2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41243935 A/G 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G A G 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000124731:ENST00000244709:exon_41243712_41243968:TREM1;ENSG00000124731:ENST00000334475:exon_41243712_41243968:TREM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41250135 T/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:G T G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000124731:ENST00000244709:exon_41250133_41250489:TREM1;ENSG00000124731:ENST00000334475:exon_41250133_41250489:TREM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41658889 C/T 1 37 28 65 17.5829365180197 14.6939939863634 2.8889425316563 T:C C T 10 0.52478549951298 0.535190090874775 ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41658739_41659214:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000424495:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000445214:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419788:exon_41658739_41658973:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000425401:exon_41658854_41658973:TFEB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 41895193 C/T 1 24 25 49 11.4051480116885 13.1196374878245 -1.71448947613602 T:C C T 10 0.52478549951298 0.669159089591383 ENSG00000112578:ENST00000230340:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000494032:exon_41895112_41895382:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000489290:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000475702:exon_41895112_41895274:BYSL;ENSG00000112578:ENST00000372996:exon_41895173_41895274:BYSL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 42185564 A/C 1 33 19 52 15.6820785160717 9.97092449074662 5.71115402532504 A:C A C 10 0.52478549951298 0.127147486297039 ENSG00000048544:ENST00000053468:exon_42185540_42185603:MRPS10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 42196127 C/T 1 20 22 42 9.5042900097404 11.5452809892856 -2.04099097954516 T:C C T 10 0.52478549951298 0.540767627697365 ENSG00000124496:ENST00000372922:exon_42192963_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000372917:exon_42195866_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000340840:exon_42195887_42196407:TRERF1;ENSG00000124496:ENST00000354325:exon_42195887_42196407:TRERF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 42713568 C/G 1 22 13 35 10.4547190107144 6.82221149366874 3.6325075170457 C:G C G 10 0.52478549951298 0.239609814585285 ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43006208 C/T 1 12 17 29 5.70257400584424 8.92135349172066 -3.21877948587642 T:C C T 10 0.52478549951298 0.266653493804166 ENSG00000044090:ENST00000265348:exon_43006005_43006210:CUL7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43193613 G/A 1 286 192 478 135.911347139288 100.758815906492 35.1525312327955 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00132832944512729 ENSG00000112667:ENST00000230431:exon_43193367_43193619:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000509253:exon_43193369_43193619:C6orf108;ENSG00000112667:ENST00000393987:exon_43193373_43193881:C6orf108 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43306720 G/A 1 17 13 30 8.07864650827934 6.82221149366874 1.2564350146106 A:G G A 10 0.52478549951298 0.716625660711107 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43307861 G/A 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:G G A 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000171467:ENST00000361428:exon_43303808_43308240:ZNF318 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43479844 A/G 1 140 112 252 66.5300300681828 58.7759759454538 7.75405412272903 A:G A G 10 0.52478549951298 0.344392549999274 ENSG00000137207:ENST00000372422:exon_43479565_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000510102:exon_43479578_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000259737:exon_43479604_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000504851:exon_43479614_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000506469:exon_43479666_43480053:YIPF3;ENSG00000137207:ENST00000509315:exon_43479829_43480053:YIPF3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43491441 C/T 1 10 11 21 4.7521450048702 5.77264049464278 -1.02049548977258 T:C C T 10 0.52478549951298 0.6692633710762 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43490069_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43490072_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000455854:exon_43490075_43491743:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372252:exon_43491398_43491520:XPO5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43496662 A/C 1 34 28 62 16.1572930165587 14.6939939863634 1.46329903019524 A:C:G A C 10 0.52478549951298 0.799527837784276 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43496566_43496663:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000428117:exon_43496566_43496666:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000398835:exon_43496566_43496663:XPO5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43523589 A/G 1 15 13 28 7.1282175073053 6.82221149366874 0.306006013636559 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000124571:ENST00000439465:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000265351:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000436943:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372252:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372258:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000372250:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000496341:exon_43523573_43523701:XPO5;ENSG00000124571:ENST00000424378:exon_43523573_43523701:XPO5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43582091 A/T 1 18 24 42 8.55386100876636 12.5948519883115 -4.04099097954516 A:T A T 10 0.52478549951298 0.220376193216487 ENSG00000170734:ENST00000372236:exon_43581397_43583397:POLH;ENSG00000170734:ENST00000372226:exon_43581468_43583397:POLH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43590408 G/A 1 13 7 20 6.17778850633126 3.67349849659086 2.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 0.371028264701611 ENSG00000172432:ENST00000307114:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000416243:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000393882:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000476510:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000478872:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000419497:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000432918:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000484748:exon_43590370_43590422:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000307126:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000372177:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000434548:exon_43590370_43590541:GTPBP2;ENSG00000172432:ENST00000435398:exon_43590370_43590541:GTPBP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43968814 A/G 1 19 38 57 9.02907550925338 19.9418489814932 -10.9127734722399 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00491993999440908 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 43970827 G/A 1 7 9 16 3.32650150340914 4.72306949561682 -1.39656799220768 A:G G A 10 0.52478549951298 0.618434468686306 ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 44081718 G/A 1 529 334 863 251.388470757634 175.278356837335 76.1101139202982 A:G G A 10 0.52478549951298 2.06751999875082e-07 ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 44218817 G/A 1 849 804 1653 403.45711091348 421.927541608436 -18.470430694956 A:G G A 10 0.52478549951298 0.375329401955500 ENSG00000096384:ENST00000371646:exon_44218785_44218950:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000353801:exon_44218785_44218950:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371565:exon_44218785_44218950:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371556:exon_44218785_44218950:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371562:exon_44218785_44218950:HSP90AB1;ENSG00000096384:ENST00000371554:exon_44218785_44218950:HSP90AB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 44269193 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 44371714 C/T 1 30 40 70 14.2564350146106 20.9914199805192 -6.7349849659086 T:C C T 10 0.52478549951298 0.119866491501745 ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 52357109 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000096093:ENST00000371068:exon_52357068_52357344:EFHC1;ENSG00000096093:ENST00000480623:exon_52357068_52357298:EFHC1;ENSG00000096093:ENST00000481466:exon_52357068_52357344:EFHC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 52546712 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000096092:ENST00000211314:exon_52546611_52546712:TMEM14A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 53213728 G/A 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000012660:ENST00000370918:exon_53213615_53213947:ELOVL5;ENSG00000012660:ENST00000304434:exon_53213615_53213805:ELOVL5;ENSG00000012660:ENST00000485336:exon_53213615_53213771:ELOVL5;ENSG00000012660:ENST00000465983:exon_53213615_53213748:ELOVL5;ENSG00000012660:ENST00000486973:exon_53213615_53213748:ELOVL5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 56327849 C/T 1 10 14 24 4.7521450048702 7.34699699318172 -2.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.312864936792816 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000466429:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000482156:exon_56327844_56327954:DST;ENSG00000151914:ENST00000523597:exon_56327844_56327954:DST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 56479159 G/T 1 7 13 20 3.32650150340914 6.82221149366874 -3.4957099902596 T:G G T 10 0.52478549951298 0.124132788642938 ENSG00000151914:ENST00000244364:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000370754:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000421834:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000312431:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000370769:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000370788:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000361203:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000446842:exon_56479154_56479282:DST;ENSG00000151914:ENST00000439203:exon_56479154_56479282:DST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 56917538 G/A 1 16 15 31 7.60343200779232 7.8717824926947 -0.268350484902381 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000168116:ENST00000370733:exon_56917484_56920023:KIAA1586;ENSG00000168116:ENST00000488682:exon_56917484_56917844:KIAA1586 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57244780 G/A 0 11 0 11 5.22735950535722 0 5.22735950535722 G G 10 0.52478549951298 0.00111049814317957 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57244699_57244794:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57244745_57244794:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57246884 A/G 0 12 0 12 5.70257400584424 0 5.70257400584424 A A 10 0.52478549951298 0.000568937206725287 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57246829_57246966:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000490313:exon_57246829_57246966:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57393125 A/G 0 0 12 12 0 6.29742599415576 -6.29742599415576 G A G 10 0.52478549951298 0.000132640517787887 ENSG00000146143:ENST00000419977:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57393112_57393184:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000470638:exon_57393112_57393184:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57467175 A/G 0 0 10 10 0 5.2478549951298 -5.2478549951298 G A G 10 0.52478549951298 0.000587349820641343 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57467101_57467206:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57467080_57467206:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57472431 G/T 0 20 0 20 9.5042900097404 0 9.5042900097404 G G 10 0.52478549951298 2.85476486490576e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57472359_57472441:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57472359_57472441:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57512476 G/A 0 0 19 19 0 9.97092449074662 -9.97092449074662 A G A 10 0.52478549951298 7.25945465582105e-07 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57512510 T/G 0 0 16 16 0 8.39656799220768 -8.39656799220768 G T G 10 0.52478549951298 6.76448821896408e-06 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57512529 C/A 0 9 0 9 4.27693050438318 0 4.27693050438318 C C 10 0.52478549951298 0.00425478237298913 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 57512678 G/A 0 0 9 9 0 4.72306949561682 -4.72306949561682 A G A 10 0.52478549951298 0.00123596779988700 ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 66547243 A/C 0 11 0 11 5.22735950535722 0 5.22735950535722 A A 10 0.52478549951298 0.00111049814317957 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 71377711 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71377479_71377844:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000422334:exon_71377659_71377844:SMAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 71546702 C/T 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 T:C C T 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370442:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71546644_71546731:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000439432:exon_71546644_71546731:SMAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 71571631 T/G 1 30 31 61 14.2564350146106 16.2683504849024 -2.01191547029178 T:G T G 10 0.52478549951298 0.610994756512194 ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71569903_71571718:SMAP1;ENSG00000112309:ENST00000230053:exon_71571533_71571681:B3GAT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 72006512 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000119900:ENST00000370435:exon_72006375_72006520:OGFRL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 74138503 G/A 1 18 13 31 8.55386100876636 6.82221149366874 1.73164951509762 A:G G A 10 0.52478549951298 0.592301033739622 ENSG00000164430:ENST00000370318:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000370315:exon_74138432_74138534:C6orf150;ENSG00000164430:ENST00000296913:exon_74138432_74138534:C6orf150 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 79679577 A/G 1 15 8 23 7.1282175073053 4.19828399610384 2.92993351120146 A:G A G 10 0.52478549951298 0.296787100662300 ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 83938603 A/G 1 12 10 22 5.70257400584424 5.2478549951298 0.454719010714439 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83938545_83938650:ME1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 83949261 T/C 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000065833:ENST00000369705:exon_83949258_83949355:ME1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 84630883 T/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000065615:ENST00000369681:exon_84630801_84630894:CYB5R4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 86235944 C/T 1 22 12 34 10.4547190107144 6.29742599415576 4.15729301655868 T:C C T 10 0.52478549951298 0.171759996829177 ENSG00000135317:ENST00000346348:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000369628:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000314673:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000505648:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000508980:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000369627:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000503491:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000515216:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000418862:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000369635:exon_86235844_86235955:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000503608:exon_86235844_86235955:SNX14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 86257101 A/C 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 A:C A C 10 0.52478549951298 0.393947332697963 ENSG00000135317:ENST00000346348:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000369628:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000314673:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000513865:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000505648:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000508980:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000369627:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000503491:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000515216:exon_86257035_86257115:SNX14;ENSG00000135317:ENST00000369635:exon_86257035_86257115:SNX14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 88239266 T/C 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88239260_88239366:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88239260_88239366:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88239260_88239366:RARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 88240547 T/C 1 16 17 33 7.60343200779232 8.92135349172066 -1.31792148392834 T:C T C 10 0.52478549951298 0.728392300446389 ENSG00000146282:ENST00000369536:exon_88240502_88240660:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000392851:exon_88240502_88240660:RARS2;ENSG00000146282:ENST00000369523:exon_88240502_88240660:RARS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 90371202 G/A 1 12 5 17 5.70257400584424 2.6239274975649 3.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.151798661556102 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90371150_90371297:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90371150_90371297:MDN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 90374244 A/C 1 15 9 24 7.1282175073053 4.72306949561682 2.40514801168848 A:C A C 10 0.52478549951298 0.414765733374574 ENSG00000112159:ENST00000369393:exon_90374206_90374347:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000428876:exon_90374206_90374347:MDN1;ENSG00000112159:ENST00000369357:exon_90374206_90374347:MDN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 96999725 C/T 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000014123:ENST00000369278:exon_96999714_96999799:KIAA0776 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 97246381 G/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 C:G G C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000112218:ENST00000417980:exon_97245888_97247757:GPR63;ENSG00000112218:ENST00000229955:exon_97245888_97247757:GPR63;ENSG00000112218:ENST00000369268:exon_97245962_97247762:GPR63 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 99930627 A/G 1 5 26 31 2.3760725024351 13.6444229873375 -11.2683504849024 A:G A G 10 0.52478549951298 3.98371872537109e-05 ENSG00000123552:ENST00000329966:exon_99930137_99930759:USP45;ENSG00000123552:ENST00000472914:exon_99930390_99930759:USP45 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 100957288 A/C 1 61 53 114 28.9880845297082 27.8136314741879 1.17445305552027 A:C A C 10 0.52478549951298 0.851649882352843 ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 105726036 C/T 1 47 38 85 22.3350815228899 19.9418489814932 2.3932325413967 T:C C T 10 0.52478549951298 0.664379826269242 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105725440_105726313:PREP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 105776866 A/C 1 12 16 28 5.70257400584424 8.39656799220768 -2.69399398636344 A:C A C 10 0.52478549951298 0.347151827302284 ENSG00000085377:ENST00000369110:exon_105776704_105776901:PREP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 106967778 T/C 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106967006_106969328:AIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 106991410 G/C 1 4 20 24 1.90085800194808 10.4957099902596 -8.59485198831152 C:G G C 10 0.52478549951298 0.000379799239290585 ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_106991315_106991472:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_106991315_106991472:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_106991315_106991472:AIM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 107050773 G/A 1 11 10 21 5.22735950535722 5.2478549951298 -0.0204954897725802 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107050749_107050797:RTN4IP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 107100204 G/A 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107100084_107100259:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107100084_107100259:QRSL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 110146303 G/A 1 30 47 77 14.2564350146106 24.6649184771101 -10.4084834624995 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0219086349456898 ENSG00000112367:ENST00000230124:exon_110146291_110146631:FIG4;ENSG00000112367:ENST00000441478:exon_110146291_110146634:FIG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 111695887 G/A 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000009413:ENST00000422377:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000434009:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368802:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000368805:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000358835:exon_111693799_111697960:REV3L;ENSG00000009413:ENST00000435970:exon_111693799_111697960:REV3L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 116720487 C/T 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000111817:ENST00000430252:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000452085:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000331677:exon_116720361_116720829:DSE;ENSG00000111817:ENST00000359564:exon_116720361_116720829:DSE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 116784850 C/G 1 31 40 71 14.7316495150976 20.9914199805192 -6.25977046542158 C:G C G 10 0.52478549951298 0.154025821588021 ENSG00000188820:ENST00000368606:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000532607:exon_116784446_116784931:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368605:exon_116784446_116784934:FAM26F;ENSG00000188820:ENST00000368604:exon_116784446_116784931:FAM26F HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 116973182 T/C 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 127651958 A/G 1 89 77 166 42.2940905433448 40.4084834624995 1.88560708084532 A:G A G 10 0.52478549951298 0.815786861085404 ENSG00000093144:ENST00000454859:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000531967:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000309620:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368293:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368290:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000474289:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368295:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000479525:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368291:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000430841:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368289:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368292:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000436638:exon_127651954_127652094:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000525745:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000534442:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000526299:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000474240:exon_127651954_127652045:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000531582:exon_127651954_127652175:ECHDC1;ENSG00000093144:ENST00000368287:exon_127651954_127652175:ECHDC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 130031215 T/C 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000146376:ENST00000275189:exon_130031169_130031370:ARHGAP18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 133072650 A/G 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133072284_133072653:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133072284_133072657:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133072284_133072657:VNN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 133077063 T/C 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133076982_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133077021_133077174:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133077053_133077174:VNN2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 133135886 A/G 1 2378 1328 3706 1130.06008215813 696.915143353237 433.144938804896 A:C:G A G 10 0.52478549951298 9.3803486873215e-47 ENSG00000112306:ENST00000230050:exon_133135871_133135921:RPS12;ENSG00000112306:ENST00000484616:exon_133135871_133135921:RPS12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 133138010 T/C 1 9 14 23 4.27693050438318 7.34699699318172 -3.07006648879854 T:C T C 10 0.52478549951298 0.216375415667424 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 135287533 A/G 1 37 51 88 17.5829365180197 26.764060475162 -9.18112395714224 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0546710311034854 ENSG00000112339:ENST00000367837:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000445176:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367824:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527005:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000527578:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000415177:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000367826:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000533274:exon_135287467_135287611:HBS1L;ENSG00000112339:ENST00000526100:exon_135287467_135287611:HBS1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 135606755 C/G 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 C:G C G 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000135541:ENST00000367800:exon_135604670_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367801:exon_135605110_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000457866:exon_135605124_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000475846:exon_135606034_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000498558:exon_135606323_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000367799:exon_135606430_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000527681:exon_135606433_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000265602:exon_135606434_135606785:AHI1;ENSG00000135541:ENST00000487135:exon_135606519_135606785:AHI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136597174 G/A 0 106 0 106 50.3727370516241 0 50.3727370516241 G G 10 0.52478549951298 2.46859824305802e-30 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136597262 T/C 0 144 0 144 68.4308880701309 0 68.4308880701309 T T 10 0.52478549951298 6.74163219310952e-41 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136597281 A/T 0 155 0 155 73.6582475754881 0 73.6582475754881 A A 10 0.52478549951298 4.64605527193385e-44 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136597288 A/C 0 155 0 155 73.6582475754881 0 73.6582475754881 A A 10 0.52478549951298 4.64605527193385e-44 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136599393 G/C 0 41 0 41 19.4837945199678 0 19.4837945199678 G G 10 0.52478549951298 5.92285732352106e-12 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136599404 T/C 0 48 0 48 22.810296023377 0 22.810296023377 T T 10 0.52478549951298 5.29518230330421e-14 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136599458 C/T 0 49 0 49 23.285510523864 0 23.285510523864 C C 10 0.52478549951298 2.71221144486418e-14 ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 136944063 A/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000197442:ENST00000359015:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000355845:exon_136943986_136944119:MAP3K5;ENSG00000197442:ENST00000367768:exon_136943986_136944119:MAP3K5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 137234642 C/T 1 21 13 34 9.97950451022742 6.82221149366874 3.15729301655868 T:C C T 10 0.52478549951298 0.306500823348790 ENSG00000112357:ENST00000318471:exon_137234596_137235059:PEX7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 137519588 A/C 1 100 138 238 47.521450048702 72.4203989327912 -24.8989488840893 A:C A C 10 0.52478549951298 0.00142402157463021 ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 139097232 C/T 1 18 18 36 8.55386100876636 9.44613899123364 -0.892277982467281 T:C C T 10 0.52478549951298 0.86782438382635 ENSG00000024862:ENST00000026464:exon_139097216_139097415:CCDC28A;ENSG00000024862:ENST00000332797:exon_139097216_139097415:CCDC28A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 139229872 C/T 1 36 41 77 17.1077220175327 21.5162054800322 -4.40848346249946 T:C C T 10 0.52478549951298 0.361501412092545 ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000478483:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000484164:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139229805_139229953:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526022:exon_139229805_139229874:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000526244:exon_139229805_139230049:REPS1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 144507910 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000135604:ENST00000367568:exon_144507760_144509507:STX11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 149700491 G/A 1 11 10 21 5.22735950535722 5.2478549951298 -0.0204954897725802 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000392282:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149699154_149700654:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149699154_149700654:TAB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 149730846 G/A 1 18 11 29 8.55386100876636 5.77264049464278 2.78122051412358 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.354657305304151 ENSG00000055208:ENST00000286332:exon_149730713_149732748:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000367456:exon_149730713_149732749:TAB2;ENSG00000055208:ENST00000470466:exon_149730713_149732652:TAB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 149887586 G/A 1 12 16 28 5.70257400584424 8.39656799220768 -2.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.347151827302284 ENSG00000055211:ENST00000367423:exon_149887410_149887670:C6orf72;ENSG00000055211:ENST00000367419:exon_149887430_149887670:C6orf72 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 149953981 C/T 1 12 19 31 5.70257400584424 9.97092449074662 -4.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.150419881320759 ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 151686905 C/T 1 17 11 28 8.07864650827934 5.77264049464278 2.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.451238269218983 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 151687691 C/T 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:C C T 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000181472:ENST00000325144:exon_151685252_151688027:ZBTB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 152443761 C/T 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000131018:ENST00000478916:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000265368:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367255:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000448038:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000423061:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000347037:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000341594:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000356820:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367257:exon_152442822_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000313630:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367251:exon_152442823_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367256:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000367247:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000409694:exon_152442915_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000460912:exon_152443195_152443811:SYNE1;ENSG00000131018:ENST00000354674:exon_152443528_152443811:SYNE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 153323594 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000112031:ENST00000367233:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000464135:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367231:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000367230:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000485512:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000463251:exon_153323562_153323820:MTRF1L;ENSG00000112031:ENST00000482526:exon_153323562_153323671:MTRF1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 155131224 C/T 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155131149_155131342:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155131149_155131342:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155131149_155131342:RBM16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 155153963 C/T 1 40 49 89 19.0085800194808 25.714489476136 -6.70590945665522 T:C C T 10 0.52478549951298 0.168097731448104 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16;ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155153831_155154543:TIAM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 155154346 G/A 1 40 34 74 19.0085800194808 17.8427069834413 1.16587303603948 A:G G A 10 0.52478549951298 0.816748365486666 ENSG00000213079:ENST00000367178:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000367186:exon_155153073_155155192:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000417268:exon_155153073_155155190:RBM16;ENSG00000213079:ENST00000460692:exon_155154026_155154543:RBM16;ENSG00000146426:ENST00000461783:exon_155153831_155154543:TIAM2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 155635582 C/A 1 16 5 21 7.60343200779232 2.6239274975649 4.97950451022742 A:C C A 10 0.52478549951298 0.046585487310218 ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000470239:exon_155635430_155635618:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000475849:exon_155635430_155635627:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000480390:exon_155635430_155635584:TFB1M HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 159178345 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159178243_159178413:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159178243_159178413:SYTL3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 159192392 C/T 1 88 83 171 41.8188760428578 43.5571964595773 -1.73832041671958 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.818525886549108 ENSG00000092820:ENST00000337147:exon_159192276_159192439:EZR;ENSG00000092820:ENST00000392177:exon_159192276_159192439:EZR;ENSG00000092820:ENST00000367075:exon_159192276_159192439:EZR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 159206442 G/A 1 120 108 228 57.0257400584424 56.6768339474018 0.348906111040549 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000092820:ENST00000337147:exon_159206341_159206615:EZR;ENSG00000092820:ENST00000392177:exon_159206341_159206615:EZR;ENSG00000092820:ENST00000367075:exon_159206341_159206615:EZR;ENSG00000092820:ENST00000476189:exon_159206341_159206615:EZR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 160199687 T/C 1 74 60 134 35.1658730360395 31.4871299707788 3.67874306526068 T:C T C 10 0.52478549951298 0.545742276532391 ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 160496967 C/T 1 3 9 12 1.42564350146106 4.72306949561682 -3.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0806544853661951 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160496879_160497028:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160496879_160497028:IGF2R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 160517481 C/T 1 21 19 40 9.97950451022742 9.97092449074662 0.00858001948079945 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 161470302 A/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G A G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000085511:ENST00000366920:exon_161469648_161471011:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000392142:exon_161469648_161471011:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000348824:exon_161469648_161471011:MAP3K4;ENSG00000085511:ENST00000366919:exon_161469648_161471011:MAP3K4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 166579270 C/T 1 10 33 43 4.7521450048702 17.3179214839283 -12.5657764790581 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000166738418395421 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 166580188 G/A 1 7 17 24 3.32650150340914 8.92135349172066 -5.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0246709005628824 ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166580080_166580344:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166580080_166580344:T HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 166739646 T/C 1 92 96 188 43.7197340448058 50.3794079532461 -6.65967390844025 T:C T C 10 0.52478549951298 0.343029528410468 ENSG00000198818:ENST00000361731:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000487841:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000478705:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000488773:exon_166739620_166739655:SFT2D1;ENSG00000198818:ENST00000494682:exon_166739361_166739655:SFT2D1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 167114698 G/A 0 19 0 19 9.02907550925338 0 9.02907550925338 G G 10 0.52478549951298 5.50844241991396e-06 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 167550751 G/A 1 9 11 20 4.27693050438318 5.77264049464278 -1.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512551851973693 ENSG00000112486:ENST00000400926:exon_167549728_167552629:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000341935:exon_167549728_167553184:CCR6;ENSG00000112486:ENST00000349984:exon_167549728_167552434:CCR6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170058374 C/T 1 9 2 11 4.27693050438318 1.04957099902596 3.22735950535722 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0689990334594261 ENSG00000184465:ENST00000423258:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000401031:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000333572:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000443144:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000420344:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000448612:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000441385:exon_170058372_170058454:WDR27;ENSG00000184465:ENST00000467418:exon_170058372_170058454:WDR27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170162537 C/T 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 T:C C T 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170162525_170162627:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170162525_170162627:C6orf70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170168222 T/C 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:C T C 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000130023:ENST00000366773:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366772:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392095:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000392094:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000418781:exon_170168199_170168267:C6orf70;ENSG00000130023:ENST00000366771:exon_170167111_170168267:C6orf70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170626943 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170627470 C/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170627651 G/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170628009 T/G 1 15 13 28 7.1282175073053 6.82221149366874 0.306006013636559 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170626458_170628212:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170626458_170628212:FAM120B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 6 170713682 A/T 1 42 33 75 19.9590090204548 17.3179214839283 2.6410875365265 A:T A T 10 0.52478549951298 0.565017557108599 ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 618938 A/G 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000400758:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_618893_619014:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_618893_619014:PRKAR1B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 814702 G/A 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 913016 G/C 1 10 9 19 4.7521450048702 4.72306949561682 0.0290755092533796 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164828:ENST00000456758:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000389574:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433434:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000452783:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000297445:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000425407:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000405266:exon_912852_914537:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413171:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000401592:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000429178:exon_912852_914536:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000413514:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000433212:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000475971:exon_912852_914539:SUN1;ENSG00000164828:ENST00000497943:exon_912852_914539:SUN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 930689 C/T 1 62 56 118 29.4632990301952 29.3879879727269 0.0753110574683546 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 939086 G/A 1 34 28 62 16.1572930165587 14.6939939863634 1.46329903019524 A:G G A 10 0.52478549951298 0.799527837784276 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_939056_939127:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_939056_939127:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_939056_939127:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_939056_939127:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_939056_939127:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_939056_939127:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_939056_939127:COX19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 939798 C/G 1 19 20 39 9.02907550925338 10.4957099902596 -1.46663448100622 C:G C G 10 0.52478549951298 0.748956128215546 ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000437486:exon_939739_939801:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000454383:exon_939779_939801:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_939739_939801:COX19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 1012895 T/C 1 17 17 34 8.07864650827934 8.92135349172066 -0.842706983441321 T:C T C 10 0.52478549951298 0.864133680655555 ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_1012817_1012928:COX19;ENSG00000240230:ENST00000344111:exon_1012817_1012928:COX19;ENSG00000240230:ENST00000466146:exon_1012337_1012928:COX19;ENSG00000240230:ENST00000466853:exon_1012578_1012928:COX19 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 1192680 C/T 1 20 24 44 9.5042900097404 12.5948519883115 -3.09056197857112 T:C C T 10 0.52478549951298 0.368617444093245 ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1192543_1192860:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1192543_1192877:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1192544_1192860:ZFAND2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 1195112 G/A 1 24 24 48 11.4051480116885 12.5948519883115 -1.18970397662304 A:G G A 10 0.52478549951298 0.773660653965152 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 1195128 G/A 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:G G A 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2257612 G/A 1 23 31 54 10.9299335112015 16.2683504849024 -5.33841697370092 A:G G A 10 0.52478549951298 0.172840595289392 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000469871:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2257597_2257678:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2257597_2257678:MAD1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2262273 C/A 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:C C A 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000002822:ENST00000399654:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000402746:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000406869:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000265854:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455868:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000442131:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000445959:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429625:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000455998:exon_2262210_2262389:MAD1L1;ENSG00000002822:ENST00000429779:exon_2262210_2262389:MAD1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2284251 G/C 1 53 46 99 25.1863685258121 24.1401329775971 1.04623554821498 C:G G C 10 0.52478549951298 0.841349010392209 ENSG00000106268:ENST00000356714:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397049:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000447457:exon_2284147_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397047:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397046:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000397048:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000449983:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000454650:exon_2284198_2284320:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000343985:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000339737:exon_2284198_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000431585:exon_2284191_2284361:NUDT1;ENSG00000106268:ENST00000471348:exon_2284244_2284361:NUDT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2317738 G/A 1 87 82 169 41.3436615423707 43.0324109600644 -1.68874941769362 A:G G A 10 0.52478549951298 0.817531427588899 ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2317735_2317940:SNX8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2583475 G/A 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2583224_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2581754_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2581352_2583886:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2582838_2583596:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000421712:exon_2583224_2583596:C7orf27 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2649704 T/G 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 T:G T G 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2649678_2649796:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2649678_2649796:IQCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2649819 C/T 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2946461 T/C 1 102 59 161 48.471879049676 30.9623444712658 17.5095345784102 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00570420500620523 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2945775_2946476:CARD11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 2957005 T/C 1 17 16 33 8.07864650827934 8.39656799220768 -0.317921483928341 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 4820925 C/T 1 21 22 43 9.97950451022742 11.5452809892856 -1.56577647905814 T:C C T 10 0.52478549951298 0.649973343224134 ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4820806_4820943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000348624:exon_4820806_4820943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000401897:exon_4820806_4820943:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000482480:exon_4820806_4820931:KIAA0415;ENSG00000242802:ENST00000496303:exon_4820806_4820943:KIAA0415 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 5567677 C/T 1 4250 3772 8022 2019.66162706983 1979.49090416296 40.1707229068741 A:T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.371177129526231 ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567635_5567729:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5567635_5567816:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567635_5568350:ACTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 5569045 G/C 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 C:G G C 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000075624:ENST00000477812:exon_5568792_5569294:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000480301:exon_5568698_5569294:ACTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 5569327 G/A 1 10 16 26 4.7521450048702 8.39656799220768 -3.64442298733748 A:G G A 10 0.52478549951298 0.172045051014415 ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 5632888 G/T 1 165 178 343 78.4103925803583 93.4118189133104 -15.0014263329521 T:G G T 10 0.52478549951298 0.105197469140317 ENSG00000075618:ENST00000382361:exon_5632454_5633399:FSCN1;ENSG00000075618:ENST00000340250:exon_5632454_5633399:FSCN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6048973 C/A 1 64 45 109 30.4137280311693 23.6153474780841 6.79838055308518 A:C C A 10 0.52478549951298 0.212694287573213 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6048876_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6048886_6049009:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6048921_6049129:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000395236:exon_6048947_6049129:AIMP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6054814 G/A 1 61 50 111 28.9880845297082 26.239274975649 2.74880955405921 A:G G A 10 0.52478549951298 0.635325545782108 ENSG00000106305:ENST00000223029:exon_6054777_6054983:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000400479:exon_6054777_6054983:AIMP2;ENSG00000106305:ENST00000415999:exon_6054777_6054882:AIMP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6194274 T/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6193387_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6193813_6194826:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6193387_6194778:USP42 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6370144 G/A 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6449496 T/C 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6448757_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6448760_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6448761_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6448763_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6449148_6449666:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6449231_6449666:DAGLB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6456347 G/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164535:ENST00000462934:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000297056:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000482149:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000428902:exon_6456299_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000421761:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000425398:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000436575:exon_6456258_6456385:DAGLB;ENSG00000164535:ENST00000454738:exon_6455890_6456385:DAGLB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6513887 A/C 1 25 40 65 11.8803625121755 20.9914199805192 -9.1110574683437 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0253804064834993 ENSG00000136240:ENST00000258739:exon_6513815_6513915:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000490996:exon_6513815_6513915:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000382267:exon_6513815_6513915:KDELR2;ENSG00000136240:ENST00000462052:exon_6513711_6513915:KDELR2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 6639611 C/T 1 18 25 43 8.55386100876636 13.1196374878245 -4.56577647905814 T:C C T 10 0.52478549951298 0.172252952081899 ENSG00000146576:ENST00000344417:exon_6639460_6639987:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000472693:exon_6639460_6639987:C7orf26;ENSG00000146576:ENST00000477298:exon_6639605_6639987:C7orf26 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 8167690 A/G 1 4 15 19 1.90085800194808 7.8717824926947 -5.97092449074662 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00949811149698198 ENSG00000003147:ENST00000402384:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000406470:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000265577:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000396675:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000339809:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000455539:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000401396:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000404556:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000422063:exon_8167503_8167772:ICA1;ENSG00000003147:ENST00000486677:exon_8167503_8167772:ICA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 21940823 A/G 1 53 56 109 25.1863685258121 29.3879879727269 -4.20161944691483 A:G A G 10 0.52478549951298 0.443751511040263 ENSG00000105877:ENST00000409508:exon_21940625_21941186:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000328843:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000105877:ENST00000424253:exon_21940625_21941457:DNAH11;ENSG00000164649:ENST00000356195:exon_21940518_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000488845:exon_21940519_21941970:CDCA7L;ENSG00000164649:ENST00000406877:exon_21940519_21941970:CDCA7L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 23235483 A/G 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000487595:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000486136:exon_23235458_23235534:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23234022_23235534:NUPL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 23239133 C/T 1 24 28 52 11.4051480116885 14.6939939863634 -3.28884597467496 T:C C T 10 0.52478549951298 0.40570705741464 ENSG00000136243:ENST00000258742:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000485250:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000438012:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000413919:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000437140:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000477844:exon_23239077_23239161:NUPL2;ENSG00000136243:ENST00000489145:exon_23239043_23239161:NUPL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 26236235 T/C 1 1610 1569 3179 765.095345784102 823.388448735866 -58.2931029517636 A:T:C T C 10 0.52478549951298 0.0393967463669482 ENSG00000122566:ENST00000354667:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000360787:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000463181:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000409814:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000356674:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000490912:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000495810:exon_26236177_26236278:HNRNPA2B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 27868346 G/A 1 99 131 230 47.046235548215 68.7469004362004 -21.7006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00446526053029368 ENSG00000106052:ENST00000265393:exon_27868247_27868500:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000433216:exon_27868247_27869386:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000409980:exon_27868247_27868500:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000396319:exon_27868247_27868880:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000457186:exon_27868247_27868641:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000488564:exon_27868247_27868402:TAX1BP1;ENSG00000106052:ENST00000460059:exon_27868319_27868402:TAX1BP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 30536681 A/G 1 152 135 287 72.232604074027 70.8460424342523 1.38656163977473 A:G A G 10 0.52478549951298 0.905947072110847 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30536237_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30536237_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000497601:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000433390:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30536249_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000426081:exon_30536400_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30536593_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30536618_30536851:GGCT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 30544360 G/A 1 42 33 75 19.9590090204548 17.3179214839283 2.6410875365265 A:G G A 10 0.52478549951298 0.565017557108599 ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 30634661 C/G 1 44 84 128 20.9094380214289 44.0819819590903 -23.1725439376614 C:G C G 10 0.52478549951298 4.11243155208566e-05 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30634297_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000454308:exon_30634457_30634759:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30634500_30634759:GARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 30661069 C/A 1 364 422 786 172.978078177275 221.459480794478 -48.4814026172023 A:T:C:G C A 10 0.52478549951298 0.000598509459913245 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30661009_30661116:GARS;ENSG00000106105:ENST00000478124:exon_30661009_30661116:GARS;ENSG00000106105:ENST00000484093:exon_30661009_30661294:GARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 30673401 A/G 1 795 789 1584 377.795527887181 414.055759115741 -36.2602312285604 A:T:C:G A G 10 0.52478549951298 0.070082155019493 ENSG00000106105:ENST00000389266:exon_30673351_30673649:GARS;ENSG00000106105:ENST00000485784:exon_30673351_30673527:GARS;ENSG00000106105:ENST00000496643:exon_30673351_30673649:GARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 32615604 T/C 1 14 7 21 6.65300300681828 3.67349849659086 2.97950451022742 T:C T C 10 0.52478549951298 0.274424617526912 ENSG00000105778:ENST00000318709:exon_32615567_32615684:AVL9;ENSG00000105778:ENST00000409301:exon_32615567_32615684:AVL9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 33060946 A/G 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 A:G A G 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33060884_33060969:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33060884_33060969:NT5C3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 33066485 T/C 1 12 24 36 5.70257400584424 12.5948519883115 -6.89227798246728 T:C T C 10 0.52478549951298 0.028747947560265 ENSG00000122643:ENST00000456458:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000381626:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000396152:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000242210:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000405342:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409467:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000409787:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000461851:exon_33066429_33066645:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000464840:exon_33066429_33066527:NT5C3;ENSG00000122643:ENST00000449201:exon_33066429_33066527:NT5C3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 37936530 T/C 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000086288:ENST00000199447:exon_37936472_37936709:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000440017:exon_37936472_37936694:TXNDC3;ENSG00000086288:ENST00000476435:exon_37936419_37936709:TXNDC3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 38256857 G/A 1 19 21 40 9.02907550925338 11.0204954897726 -1.9914199805192 A:G G A 10 0.52478549951298 0.531944581397645 ENSG00000010270:ENST00000009041:exon_38256789_38256906:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000434197:exon_38256789_38256906:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000471550:exon_38254629_38256906:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000396013:exon_38256789_38256906:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000440144:exon_38256789_38256906:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000453225:exon_38256789_38256870:STARD3NL;ENSG00000010270:ENST00000429075:exon_38256789_38256906:STARD3NL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 38829465 C/T 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000006715:ENST00000310301:exon_38829401_38829467:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000395969:exon_38829401_38829467:VPS41;ENSG00000006715:ENST00000466017:exon_38829401_38829467:VPS41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 39606107 G/A 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39605975_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39605984_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39605993_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39606009_39606146:C7orf36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 39610177 A/G 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 42967055 C/T 1 165 145 310 78.4103925803583 76.0938974293821 2.31649515097618 T:C C T 10 0.52478549951298 0.820156819861854 ENSG00000106588:ENST00000442788:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000433579:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000223321:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000436986:exon_42966982_42967058:PSMA2;ENSG00000106588:ENST00000457444:exon_42966982_42967063:PSMA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 43622806 T/C 1 10 19 29 4.7521450048702 9.97092449074662 -5.21877948587642 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0625982363685659 ENSG00000164543:ENST00000319357:exon_43622664_43623048:STK17A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 43830888 T/C 1 55 42 97 26.1367975267861 22.0409909795452 4.09580654724094 T:C T C 10 0.52478549951298 0.417917306103645 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 43846603 A/G 1 149 157 306 70.806960572566 82.3913234235379 -11.5843628509719 A:G A G 10 0.52478549951298 0.188411719843841 ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43846576_43846938:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43846576_43846939:BLVRA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 44099160 C/T 1 73 78 151 34.6906585355525 40.9332689620124 -6.24261042645998 T:C C T 10 0.52478549951298 0.328580499051554 ENSG00000136279:ENST00000441840:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000448521:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000456905:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000440166:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000490734:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000498733:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452943:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000429716:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000468694:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000494774:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000411855:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000497184:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000432854:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000449997:exon_44099142_44099257:DBNL;ENSG00000136279:ENST00000452661:exon_44099142_44099257:DBNL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 44112844 G/A 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 A:G G A 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000122678:ENST00000335195:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000242248:exon_44111846_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000435068:exon_44111849_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000395831:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000458246:exon_44111855_44113029:POLM;ENSG00000122678:ENST00000430942:exon_44111861_44112976:POLM;ENSG00000122678:ENST00000467607:exon_44112817_44112976:POLM HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 44530193 T/G 1 17 9 26 8.07864650827934 4.72306949561682 3.35557701266252 T:G T G 10 0.52478549951298 0.239108469053992 ENSG00000015676:ENST00000355451:exon_44530008_44530479:NUDCD3;ENSG00000015676:ENST00000464812:exon_44530008_44530205:NUDCD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 44621114 G/A 1 10 19 29 4.7521450048702 9.97092449074662 -5.21877948587642 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0625982363685659 ENSG00000158604:ENST00000289577:exon_44621048_44621173:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000457408:exon_44621048_44621173:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000419520:exon_44621048_44621173:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000481238:exon_44621048_44621173:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000477639:exon_44621048_44621173:TMED4;ENSG00000158604:ENST00000444131:exon_44621048_44621173:TMED4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 44840864 G/A 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 A:G G A 10 0.52478549951298 0.567319353840057 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 45005795 G/A 1 173 184 357 82.2121085842545 96.5605319103883 -14.3484233261339 A:G G A 10 0.52478549951298 0.137812484432939 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45005672_45006437:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45005672_45005879:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45005672_45005879:MYO1G HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 45015107 G/A 1 99 89 188 47.046235548215 46.7059094566552 0.340326091559753 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45015083_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45015075_45015248:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45015083_45015248:MYO1G HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 45016621 C/T 1 59 66 125 28.0376555287342 34.6358429678567 -6.5981874391225 T:C C T 10 0.52478549951298 0.245374393680859 ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45016462_45016670:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000435656:exon_45016462_45016670:MYO1G HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 45139892 G/A 1 65 89 154 30.8889425316563 46.7059094566552 -15.8169669249989 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0121794437296163 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45139699_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45139700_45140025:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45139741_45140025:TBRG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 45148667 G/A 1 91 69 160 43.2445195443188 36.2101994663956 7.0343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.269117151437209 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000461363:exon_45148426_45148682:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 45148773 C/A 1 46 49 95 21.8598670224029 25.714489476136 -3.8546224537331 A:C C A 10 0.52478549951298 0.472432657857485 ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45148426_45148842:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000478532:exon_45148531_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000471142:exon_45148426_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000475893:exon_45148453_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000482285:exon_45148483_45148886:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495078:exon_45148527_45148886:TBRG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 55433880 G/C 1 10 1 11 4.7521450048702 0.52478549951298 4.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0127823978457661 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 55433884 A/C 1 10 2 12 4.7521450048702 1.04957099902596 3.70257400584424 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0413560448537132 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55433141_55433922:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55433815_55433922:LANCL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 55459563 A/G 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G A G 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000132434:ENST00000254770:exon_55459486_55459603:LANCL2;ENSG00000132434:ENST00000452107:exon_55459486_55459603:LANCL2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 55840888 A/C 1 25 14 39 11.8803625121755 7.34699699318172 4.53336551899378 A:C A C 10 0.52478549951298 0.152832659716465 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 56022810 G/C 1 337 225 562 160.147286664126 118.076737390421 42.0705492737052 A:C:G G C 10 0.52478549951298 0.000381901082996580 ENSG00000249773:ENST00000426595:exon_56022602_56022932:RP11-15K19.2;ENSG00000239789:ENST00000285298:exon_56022602_56024192:MRPS17;ENSG00000239789:ENST00000443449:exon_56022602_56022865:MRPS17 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 64291991 T/A 1 17 27 44 8.07864650827934 14.1692084868505 -6.09056197857112 A:T T A 10 0.52478549951298 0.0710556175251974 ENSG00000197008:ENST00000307355:exon_64291829_64292580:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000494380:exon_64291829_64292181:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440155:exon_64291829_64292620:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000440598:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000437743:exon_64291829_64294042:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000359735:exon_64291829_64293705:ZNF138;ENSG00000197008:ENST00000430838:exon_64291829_64294054:ZNF138 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 65447182 C/T 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65446961_65447301:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65446961_65447183:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65446961_65447202:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65446961_65447198:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000446111:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000452642:exon_65446983_65447193:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000429291:exon_65446983_65447228:GUSB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 65842545 T/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 66413580 G/A 1 29 33 62 13.7812205141236 17.3179214839283 -3.53670096980476 A:G G A 10 0.52478549951298 0.376592554933219 ENSG00000106609:ENST00000341567:exon_66413531_66413681:C7orf42;ENSG00000106609:ENST00000433271:exon_66413531_66413681:C7orf42;ENSG00000106609:ENST00000424964:exon_66413531_66413681:C7orf42;ENSG00000106609:ENST00000484751:exon_66413531_66413681:C7orf42 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 66482909 G/A 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G G A 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000198874:ENST00000359626:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000361660:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000475070:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000389196:exon_66482840_66483130:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000427620:exon_66482840_66483130:TYW1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 66785137 C/A 1 25 31 56 11.8803625121755 16.2683504849024 -4.38798797272688 A:C C A 10 0.52478549951298 0.284519816559594 ENSG00000106610:ENST00000416602:exon_66785090_66786513:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000352103:exon_66785090_66785250:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000418651:exon_66785090_66785384:STAG3L4;ENSG00000106610:ENST00000437742:exon_66785090_66785395:STAG3L4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 73097948 G/C 1 21 39 60 9.97950451022742 20.4666344810062 -10.4871299707788 C:G G C 10 0.52478549951298 0.00915269469797138 ENSG00000071462:ENST00000265758:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000420399:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000457629:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000423166:exon_73097898_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421304:exon_73097899_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000432522:exon_73097901_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000421744:exon_73097903_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000478670:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000496153:exon_73097927_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000441822:exon_73097931_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000428163:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000436944:exon_73097937_73098003:WBSCR22;ENSG00000071462:ENST00000463307:exon_73097939_73098003:WBSCR22 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 73520307 C/T 1 13 7 20 6.17778850633126 3.67349849659086 2.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 0.371028264701611 ENSG00000106683:ENST00000418310:exon_73520205_73520310:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000419043:exon_73520205_73520310:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000336180:exon_73520205_73520310:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000435201:exon_73520205_73520310:LIMK1;ENSG00000106683:ENST00000483414:exon_73520205_73520310:LIMK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 73752812 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 73753025 G/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73752778_73753334:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73752778_73753334:CLIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 73770926 G/C 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73770740_73770953:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73770740_73770953:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73770740_73770953:CLIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 73811479 T/C 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.491891556397476 ENSG00000106665:ENST00000361545:exon_73811404_73811563:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000223398:exon_73811404_73811563:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000395060:exon_73811404_73811563:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000493166:exon_73811404_73811495:CLIP2;ENSG00000106665:ENST00000474962:exon_73811404_73811503:CLIP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 74125385 T/C 1 13 11 24 6.17778850633126 5.77264049464278 0.405148011688479 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000077809:ENST00000324896:exon_74125363_74125440:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000353920:exon_74125363_74125440:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000346152:exon_74125363_74125440:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000416070:exon_74125363_74125440:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000443166:exon_74125363_74125440:GTF2I;ENSG00000077809:ENST00000490431:exon_74125363_74125440:GTF2I HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75048671 G/A 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000135213:ENST00000476072:exon_75048603_75050568:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000257665:exon_75048603_75048725:POM121C;ENSG00000135213:ENST00000453279:exon_75048603_75048725:POM121C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75155300 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:C:G G A 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75583325 A/G 1 16 25 41 7.60343200779232 13.1196374878245 -5.51620548003218 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0877770279273657 ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75616577 G/A 1 61 153 214 28.9880845297082 80.2921814254859 -51.3040968957777 A:G G A 10 0.52478549951298 1.79146567711904e-12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75621768 G/A 1 86 18 104 40.8684470418837 9.44613899123364 31.4223080506501 A:G G A 10 0.52478549951298 1.64133063178038e-10 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75623893 G/A 1 9 31 40 4.27693050438318 16.2683504849024 -11.9914199805192 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000180072903511703 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75931984 C/T 1 42 30 72 19.9590090204548 15.7435649853894 4.21544403506544 T:C C T 10 0.52478549951298 0.346472053989087 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 75931999 T/C 1 43 32 75 20.4342235209419 16.7931359844154 3.6410875365265 T:C T C 10 0.52478549951298 0.420304875105993 ENSG00000106211:ENST00000248553:exon_75931861_75932393:HSPB1;ENSG00000106211:ENST00000432276:exon_75931990_75932073:HSPB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 76111871 C/T 1 33 13 46 15.6820785160717 6.82221149366874 8.85986702240292 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0112921449696498 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 76112060 C/T 1 28 30 58 13.3060060136366 15.7435649853894 -2.43755897175284 T:C C T 10 0.52478549951298 0.599384342945433 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 76112219 C/T 1 55 15 70 26.1367975267861 7.8717824926947 18.2650150340914 T:C C T 10 0.52478549951298 1.04734530070050e-05 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 76131695 A/G 1 34 23 57 16.1572930165587 12.0700664887985 4.08722652776014 A:G A G 10 0.52478549951298 0.291742521561169 ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 76608143 C/T 1 8 1 9 3.80171600389616 0.52478549951298 3.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0411417674800103 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 77240331 A/G 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77240265_77240363:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77240265_77240363:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77240265_77240363:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000464313:exon_77240265_77240363:PTPN12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 77247821 G/A 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77247797_77247882:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77247797_77247882:PTPN12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 77408053 A/T 1 28 24 52 13.3060060136366 12.5948519883115 0.711154025325037 A:T A T 10 0.52478549951298 0.890157265212965 ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77407847_77409008:RSBN1L;ENSG00000187257:ENST00000445288:exon_77407847_77408999:RSBN1L;ENSG00000187257:ENST00000441514:exon_77407951_77408135:RSBN1L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 77423574 G/A 1 25 36 61 11.8803625121755 18.8922779824673 -7.01191547029178 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0740938792742231 ENSG00000135211:ENST00000257663:exon_77423045_77423740:TMEM60 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 91503228 C/T 1 15 20 35 7.1282175073053 10.4957099902596 -3.3674924829543 T:C C T 10 0.52478549951298 0.310262634091536 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 91503417 C/T 1 22 25 47 10.4547190107144 13.1196374878245 -2.66491847711006 T:C C T 10 0.52478549951298 0.467500784241064 ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 91730251 T/C 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000127914:ENST00000356239:exon_91730170_91730370:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000358100:exon_91730170_91730370:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000359028:exon_91730170_91730370:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000413120:exon_91730170_91730370:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000394534:exon_91730170_91730370:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000487258:exon_91730170_91730370:AKAP9;ENSG00000127914:ENST00000463118:exon_91730170_91730370:AKAP9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 91842554 T/C 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 T:C T C 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92027537 C/G 1 3 6 9 1.42564350146106 3.14871299707788 -1.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.324337254632772 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92028039 C/A 1 14 8 22 6.65300300681828 4.19828399610384 2.45471901071444 A:C C A 10 0.52478549951298 0.393947332697963 ENSG00000001629:ENST00000265742:exon_92027526_92030698:ANKIB1;ENSG00000001629:ENST00000422095:exon_92027526_92028662:ANKIB1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92730850 C/T 1 18 12 30 8.55386100876636 6.29742599415576 2.2564350146106 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.467337392011984 ENSG00000205413:ENST00000379958:exon_92728829_92735418:SAMD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92760502 G/A 1 82 90 172 38.9675890399356 47.2306949561682 -8.26310591623256 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.222060018523811 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92760738 T/G 1 57 61 118 27.0872265277601 32.0119154702918 -4.92468894253165 T:G T G 10 0.52478549951298 0.406929296809088 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000394472:exon_92760530_92761298:SAMD9L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92761875 C/T 1 24 35 59 11.4051480116885 18.3674924829543 -6.96234447126582 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0893170800525124 ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 92985252 T/C 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 T:C T C 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000004766:ENST00000305866:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000441602:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000471188:exon_92985203_92985392:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000474412:exon_92985203_92985390:CCDC132;ENSG00000004766:ENST00000443443:exon_92985203_92985498:CCDC132 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 97488569 A/T 1 102 103 205 48.471879049676 54.0529064498369 -5.58102740016091 A:T A T 10 0.52478549951298 0.44254751465868 ENSG00000070669:ENST00000394309:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000454046:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000437628:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000394308:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000175506:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000422745:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000455086:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000444334:exon_97488525_97488710:ASNS;ENSG00000070669:ENST00000442734:exon_97488554_97488710:ASNS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 98951655 C/T 1 27 24 51 12.8307915131495 12.5948519883115 0.235939524838017 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000241685:ENST00000441989:exon_98951532_98951744:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000262942:exon_98951532_98951744:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432786:exon_98951532_98951744:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000432884:exon_98951532_98951744:ARPC1A;ENSG00000241685:ENST00000471960:exon_98951558_98951744:ARPC1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99022852 G/C 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 C:G G C 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99022418_99023239:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99022418_99023239:RP5-900K19.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99047978 T/C 1 7 14 21 3.32650150340914 7.34699699318172 -4.02049548977258 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0847652640732487 ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99050039 G/A 1 15 12 27 7.1282175073053 6.29742599415576 0.830791513149538 A:G G A 10 0.52478549951298 0.848083276492106 ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99055940 T/C 1 547 274 821 259.9423317664 143.791226866557 116.151104899843 A:T:C T C 10 0.52478549951298 2.49725808859886e-16 ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99081730 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000198556:ENST00000331410:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481472:exon_99081653_99081769:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000448667:exon_99081653_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000447047:exon_99081653_99081787:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000481108:exon_99081278_99081766:ZNF789;ENSG00000198556:ENST00000494186:exon_99081653_99081766:ZNF789 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99091617 T/G 1 38 48 86 18.0581510185068 25.189703976623 -7.13155295811628 T:G T G 10 0.52478549951298 0.131355989543833 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99092152 C/T 1 32 20 52 15.2068640155846 10.4957099902596 4.71115402532504 T:C C T 10 0.52478549951298 0.212631733332244 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99092194 G/A 1 20 18 38 9.5042900097404 9.44613899123364 0.0581510185067593 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000160908:ENST00000337673:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000394177:exon_99090863_99092254:ZNF394;ENSG00000160908:ENST00000426306:exon_99090865_99092254:ZNF394 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99490242 A/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000146833:ENST00000349062:exon_99488036_99490369:TRIM4;ENSG00000146833:ENST00000355947:exon_99488036_99490369:TRIM4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99654600 A/G 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G A G 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000166529:ENST00000292450:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000456748:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000438937:exon_99654534_99655028:ZSCAN21;ENSG00000166529:ENST00000477297:exon_99654534_99655028:ZSCAN21 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99688952 G/A 1 171 195 366 81.2616795832804 102.333172405031 -21.0714928217507 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.0279752068288394 ENSG00000168090:ENST00000303904:exon_99688861_99688953:COPS6;ENSG00000168090:ENST00000418625:exon_99688861_99688953:COPS6;ENSG00000168090:ENST00000474823:exon_99688861_99688953:COPS6;ENSG00000168090:ENST00000483891:exon_99688861_99688953:COPS6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99697669 C/T 1 112 85 197 53.2240240545462 44.6067674586033 8.61725659594293 T:C C T 10 0.52478549951298 0.225892453175599 ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000343023:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000463722:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000425308:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000467516:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000465688:exon_99697637_99697716:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000465738:exon_99697637_99698016:MCM7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99704827 A/G 1 49 14 63 23.285510523864 7.34699699318172 15.9385135306823 A:G A G 10 0.52478549951298 4.14992092868588e-05 ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99725631 G/A 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000214309:ENST00000398075:exon_99724991_99726118:MBLAC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99746647 C/G 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 C:G C G 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99746601_99746676:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99746617_99746676:C7orf59 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 99818295 C/T 1 30 35 65 14.2564350146106 18.3674924829543 -4.1110574683437 T:C C T 10 0.52478549951298 0.322537968655976 ENSG00000066923:ENST00000451963:exon_99817737_99818296:STAG3;ENSG00000213413:ENST00000317271:exon_99818170_99818296:PVRIG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100028187 C/T 1 7 15 22 3.32650150340914 7.8717824926947 -4.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.056973917343431 ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100028484 T/C 1 22 14 36 10.4547190107144 7.34699699318172 3.10772201753272 T:C T C 10 0.52478549951298 0.321217664128669 ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100033148 A/G 1 75 88 163 35.6410875365265 46.1811239571422 -10.5400364206157 A:G A G 10 0.52478549951298 0.100159280823974 ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100072031 T/C 1 53 49 102 25.1863685258121 25.714489476136 -0.528120950323967 T:C T C 10 0.52478549951298 0.921400125634015 ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100479716 C/T 1 44 51 95 20.9094380214289 26.764060475162 -5.8546224537331 T:C C T 10 0.52478549951298 0.258547535942338 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100479674_100479862:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100479674_100479862:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100479674_100479862:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100479674_100479862:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000423692:exon_100479674_100479862:SRRT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100482651 G/A 1 89 100 189 42.2940905433448 52.478549951298 -10.1844594079532 A:G G A 10 0.52478549951298 0.145438316532360 ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100482544_100482661:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100482544_100482661:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100482544_100482661:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100482544_100482661:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000460194:exon_100482544_100482661:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100482613_100482661:SRRT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100490077 G/A 1 2 12 14 0.95042900097404 6.29742599415576 -5.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00546065207010748 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100491149 C/T 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 T:C C T 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100490786_100492009:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000426415:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000454485:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000440755:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000430554:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100490786_100491525:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100490786_100491876:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100490786_100491873:ACHE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 100491662 C/G 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 C:G C G 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100490786_100492009:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000426415:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000454485:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000440755:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000430554:exon_100490786_100491854:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100490786_100491876:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100490786_100491873:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000441605:exon_100491378_100491873:ACHE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 102108545 C/T 1 14 18 32 6.65300300681828 9.44613899123364 -2.79313598441536 T:C C T 10 0.52478549951298 0.377529041769322 ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102108166_102109509:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102108509_102108634:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485417:exon_102108509_102108634:LRWD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 107217020 G/A 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107216854_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000471763:exon_107216811_107217636:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107216811_107217037:DUS4L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 107258907 T/C 1 19 21 40 9.02907550925338 11.0204954897726 -1.9914199805192 T:C T C 10 0.52478549951298 0.531944581397645 ENSG00000075790:ENST00000005259:exon_107258773_107262315:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000465919:exon_107258773_107259060:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000494086:exon_107258773_107259080:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000445771:exon_107258773_107259109:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000379117:exon_107258773_107259891:BCAP29 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 108212353 G/A 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:G G A 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000128590:ENST00000249356:exon_108212161_108212387:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000491582:exon_108212161_108212507:DNAJB9;ENSG00000128590:ENST00000465725:exon_108212159_108212387:DNAJB9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 112407236 C/T 1 18 10 28 8.55386100876636 5.2478549951298 3.30600601363656 T:C C T 10 0.52478549951298 0.257367377359129 ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 115897392 G/C 1 63 39 102 29.9385135306823 20.4666344810062 9.47187904967604 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0738305156584311 ENSG00000135269:ENST00000358204:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000492891:exon_115897348_115897722:TES;ENSG00000135269:ENST00000257721:exon_115897348_115898835:TES;ENSG00000135269:ENST00000393481:exon_115897348_115898837:TES;ENSG00000135269:ENST00000496912:exon_115897348_115897630:TES HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 116830984 G/A 1 96 77 173 45.6205920467539 40.4084834624995 5.21210858425445 A:G G A 10 0.52478549951298 0.447114531676735 ENSG00000004866:ENST00000393446:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000265437:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393451:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000323984:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393449:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000443979:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000446490:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000432298:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000422922:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000487459:exon_116830888_116830986:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393443:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393447:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000393444:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000490039:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000489293:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000485394:exon_116830888_116830990:ST7;ENSG00000004866:ENST00000465641:exon_116830888_116830990:ST7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 120607593 T/C 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000071243:ENST00000315870:exon_120607583_120607702:ING3;ENSG00000071243:ENST00000427726:exon_120607583_120607702:ING3;ENSG00000071243:ENST00000431467:exon_120607583_120607702:ING3;ENSG00000071243:ENST00000497502:exon_120607550_120607702:ING3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 127013575 G/A 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 A:G G A 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000048405:ENST00000485577:exon_127013396_127013619:ZNF800;ENSG00000048405:ENST00000393313:exon_127013396_127015088:ZNF800;ENSG00000048405:ENST00000265827:exon_127013396_127015088:ZNF800;ENSG00000048405:ENST00000393312:exon_127013396_127015088:ZNF800 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 127954847 G/A 1 26 30 56 12.3555770126625 15.7435649853894 -3.38798797272688 A:G G A 10 0.52478549951298 0.422503494551386 ENSG00000106344:ENST00000223073:exon_127954817_127955073:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000481788:exon_127954817_127955073:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000415472:exon_127954817_127955073:RBM28;ENSG00000106344:ENST00000495327:exon_127954817_127955024:RBM28 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 128641226 G/C 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 C:G G C 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000064419:ENST00000393245:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000265388:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000482320:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471234:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000359305:exon_128641113_128641288:TNPO3;ENSG00000064419:ENST00000471166:exon_128641113_128641288:TNPO3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 129479138 T/C 1 16 7 23 7.60343200779232 3.67349849659086 3.92993351120146 T:C T C 10 0.52478549951298 0.142480414894919 ENSG00000186591:ENST00000355621:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000473814:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000496698:exon_129479047_129479175:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000483368:exon_129479047_129479581:UBE2H;ENSG00000186591:ENST00000480245:exon_129479065_129479175:UBE2H HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 130080812 T/G 1 3 9 12 1.42564350146106 4.72306949561682 -3.29742599415576 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0806544853661951 ENSG00000106477:ENST00000223208:exon_130080775_130081078:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000484549:exon_130080775_130080868:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000343969:exon_130080775_130080836:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000471201:exon_130080775_130080898:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000498527:exon_130080775_130080867:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000489512:exon_130080775_130080897:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000495702:exon_130080775_130080870:TSGA14;ENSG00000106477:ENST00000334451:exon_130080775_130080865:TSGA14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 130143812 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130143774_130143837:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130143774_130143837:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130143774_130143837:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130143774_130143837:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130143774_130143837:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130143774_130143837:MEST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 130144943 G/C 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 C:G G C 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000106484:ENST00000341441:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000416162:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000378576:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000393187:exon_130144780_130146127:MEST;ENSG00000106484:ENST00000223215:exon_130144780_130146133:MEST;ENSG00000106484:ENST00000437945:exon_130144780_130145194:MEST;ENSG00000106484:ENST00000463263:exon_130144780_130145139:MEST HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 133580447 G/A 1 7 8 15 3.32650150340914 4.19828399610384 -0.871782492694701 A:G G A 10 0.52478549951298 0.797403960594395 ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 134130035 G/A 1 94 120 214 44.6701630457799 62.9742599415576 -18.3040968957777 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0135974926663106 ENSG00000085662:ENST00000285930:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000434222:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000465351:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000494491:exon_134129990_134130072:AKR1B1;ENSG00000085662:ENST00000467251:exon_134129479_134130072:AKR1B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 134849534 G/A 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 134851620 G/A 1 44 19 63 20.9094380214289 9.97092449074662 10.9385135306823 A:G G A 10 0.52478549951298 0.00756332356346791 ENSG00000122783:ENST00000435834:exon_134850005_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000450949:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000413261:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000422189:exon_134850534_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000424142:exon_134850537_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000393114:exon_134850537_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000430372:exon_134850581_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000481410:exon_134851096_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000472428:exon_134851327_134851623:C7orf49;ENSG00000122783:ENST00000477820:exon_134851352_134851623:C7orf49 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 134871059 G/A 1 21 12 33 9.97950451022742 6.29742599415576 3.68207851607166 A:G G A 10 0.52478549951298 0.224975587715588 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134868590_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134868591_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134868591_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134870534_134871067:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871014_134871067:WDR91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 134878070 G/A 1 9 4 13 4.27693050438318 2.09914199805192 2.17778850633126 A:G G A 10 0.52478549951298 0.274538282128478 ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000497853:exon_134877983_134878151:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000462707:exon_134877983_134878310:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134877967_134878229:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000474411:exon_134877967_134878151:WDR91 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 135291640 G/C 1 7 11 18 3.32650150340914 5.77264049464278 -2.44613899123364 C:G G C 10 0.52478549951298 0.345641696182350 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135291499_135291663:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000472132:exon_135291499_135291663:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000463247:exon_135291619_135291663:NUP205 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 135329690 T/C 1 40 57 97 19.0085800194808 29.9127734722399 -10.9041934527591 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0322763081913264 ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 141364712 G/A 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 A:G G A 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000127359:ENST00000297761:exon_141364704_141364854:KIAA1147;ENSG00000127359:ENST00000482493:exon_141364704_141364854:KIAA1147 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 142498972 G/A 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.362785673704686 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 142499071 T/C 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 143002171 C/T 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 T:C C T 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_143002033_143004789:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_143002033_143002915:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000472067:exon_143002033_143003662:CASP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 143080060 A/T 1 94 77 171 44.6701630457799 40.4084834624995 4.26167958328042 A:T A T 10 0.52478549951298 0.540631519115902 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000468083:exon_143079894_143080328:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143079894_143080415:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000477373:exon_143079894_143080333:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000436448:exon_143079943_143080415:ZYX HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 143087691 G/A 1 172 225 397 81.7368940837674 118.076737390421 -36.3398433066531 A:G G A 10 0.52478549951298 0.000287585682892359 ENSG00000159840:ENST00000322764:exon_143087671_143088204:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000404957:exon_143087671_143088200:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000449423:exon_143087671_143088202:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000354434:exon_143087671_143088202:ZYX;ENSG00000159840:ENST00000392910:exon_143087671_143088202:ZYX;ENSG00000146904:ENST00000458129:exon_143087382_143087738:EPHA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 148700849 C/T 1 143 206 349 67.9556735696438 108.105812899674 -40.15013933003 T:C:G C T 10 0.52478549951298 1.70798188168274e-05 ENSG00000155660:ENST00000286091:exon_148700154_148701301:PDIA4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 149430875 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000133619:ENST00000466546:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000479560:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000319551:exon_149430295_149431664:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000485033:exon_149430295_149431660:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000255992:exon_149430295_149431136:KRBA1;ENSG00000133619:ENST00000496259:exon_149430295_149431660:KRBA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150034184 T/C 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150034378 A/G 1 7 7 14 3.32650150340914 3.67349849659086 -0.346996993181721 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150066900 A/G 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G A G 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150068371 T/C 1 14 14 28 6.65300300681828 7.34699699318172 -0.693993986363441 T:C T C 10 0.52478549951298 0.851182438556464 ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150068933 T/C 1 19 13 32 9.02907550925338 6.82221149366874 2.20686401558464 T:C T C 10 0.52478549951298 0.482246092992146 ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150093701 A/C 1 15 10 25 7.1282175073053 5.2478549951298 1.8803625121755 A:C A C 10 0.52478549951298 0.549564883983050 ENSG00000196456:ENST00000478789:exon_150093601_150094003:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775;ENSG00000196456:ENST00000490973:exon_150093601_150094067:ZNF775 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150269249 T/C 1 13 37 50 6.17778850633126 19.4170634819803 -13.239274975649 T:C T C 10 0.52478549951298 0.000179520265589793 ENSG00000133574:ENST00000255945:exon_150269217_150271041:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000461940:exon_150269217_150270602:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000412660:exon_150269217_150269361:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000494750:exon_150269217_150270026:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000478135:exon_150269217_150269621:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000466938:exon_150269217_150269361:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000479232:exon_150269217_150269569:GIMAP4;ENSG00000133574:ENST00000430830:exon_150269217_150271040:GIMAP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150325378 T/C 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 T:C T C 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150417160 G/A 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150730712 G/A 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G G A 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000197150:ENST00000461373:exon_150730692_150730929:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000488826:exon_150730692_150730837:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000489192:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150730692_150730773:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150730692_150731004:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000488370:exon_150730692_150730785:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000493338:exon_150730692_150731004:ABCB8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150733025 T/A 1 16 15 31 7.60343200779232 7.8717824926947 -0.268350484902381 A:T T A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150767654 T/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C T C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150767544_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000469355:exon_150767441_150767658:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494298:exon_150767604_150767658:SLC4A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150768849 C/T 1 14 16 30 6.65300300681828 8.39656799220768 -1.7435649853894 T:C C T 10 0.52478549951298 0.585536076716491 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150768776_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000493040:exon_150768564_150768924:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000460010:exon_150768752_150769223:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482697:exon_150768816_150768924:SLC4A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150771893 C/T 1 32 22 54 15.2068640155846 11.5452809892856 3.66158302629908 T:C C T 10 0.52478549951298 0.342545820010104 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150771126_150771928:SLC4A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150772384 C/T 1 16 14 30 7.60343200779232 7.34699699318172 0.256435014610599 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150772342_150772399:SLC4A2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150815630 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000133612:ENST00000463381:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335355:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000428334:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397232:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000473312:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000479901:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000397238:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000335367:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000467724:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000468796:exon_150815592_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000480106:exon_150815561_150815719:AGAP3;ENSG00000133612:ENST00000498559:exon_150815381_150815719:AGAP3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 150921950 A/G 1 25 14 39 11.8803625121755 7.34699699318172 4.53336551899378 A:G A G 10 0.52478549951298 0.152832659716465 ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 157000176 T/C 1 15 11 26 7.1282175073053 5.77264049464278 1.35557701266252 T:C T C 10 0.52478549951298 0.695977309853642 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157000092_157000249:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000435332:exon_157000092_157000249:UBE3C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 157015964 G/A 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157015948_157016045:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157013362_157016045:UBE3C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158456900 G/A 1 12 16 28 5.70257400584424 8.39656799220768 -2.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.347151827302284 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000475918:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000491792:exon_158456876_158456988:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000472591:exon_158456876_158456988:NCAPG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158457275 G/A 1 16 12 28 7.60343200779232 6.29742599415576 1.30600601363656 A:G G A 10 0.52478549951298 0.706796378801608 ENSG00000146918:ENST00000432615:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000275830:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000356309:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409423:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000441982:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000467785:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000409339:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000449727:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000474940:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000475918:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000491792:exon_158457220_158457442:NCAPG2;ENSG00000146918:ENST00000472591:exon_158457220_158457442:NCAPG2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158528233 A/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158528254 G/A 1 8 6 14 3.80171600389616 3.14871299707788 0.653003006818279 A:G G A 10 0.52478549951298 0.79410402704229 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158528269 C/G 1 15 4 19 7.1282175073053 2.09914199805192 5.02907550925338 C:G C G 10 0.52478549951298 0.021962469115603 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000471192:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158528194_158528299:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158528194_158528299:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158534372 G/A 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158534381 G/C 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158536267 T/C 1 8 2 10 3.80171600389616 1.04957099902596 2.7521450048702 T:C T C 10 0.52478549951298 0.113694420116144 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 7 158536345 A/G 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G A G 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158536220_158536399:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158536220_158536369:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158536220_158536908:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000429474:exon_158536220_158536369:ESYT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 618647 T/G 1 42 52 94 19.9590090204548 27.288845974675 -7.32983695422012 T:G T G 10 0.52478549951298 0.148076541203027 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 618728 A/G 1 28 25 53 13.3060060136366 13.1196374878245 0.186368525812057 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000104714:ENST00000522706:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523415:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000262109:exon_618598_618792:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000523053:exon_618598_619277:ERICH1;ENSG00000104714:ENST00000522893:exon_615992_618792:ERICH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 1719494 C/T 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1719098_1719763:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000520991:exon_1719098_1719733:CLN8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 1728745 G/A 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 A:G G A 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000182372:ENST00000331222:exon_1728416_1734738:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000519254:exon_1728416_1728938:CLN8;ENSG00000182372:ENST00000523237:exon_1728416_1728932:CLN8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 6296550 G/T 1 8 3 11 3.80171600389616 1.57435649853894 2.22735950535722 T:G G T 10 0.52478549951298 0.23288211786739 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6296474_6296617:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6296474_6296617:MCPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 6302671 C/T 1 15 11 26 7.1282175073053 5.77264049464278 1.35557701266252 T:C C T 10 0.52478549951298 0.695977309853642 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 6302971 C/T 1 16 19 35 7.60343200779232 9.97092449074662 -2.3674924829543 T:C C T 10 0.52478549951298 0.499319230855147 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 6357448 C/G 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521129:exon_6357373_6357450:MCPH1;ENSG00000091879:ENST00000325203:exon_6357172_6360782:ANGPT2;ENSG00000091879:ENST00000415216:exon_6357195_6360782:ANGPT2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 6479178 C/A 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 A:C C A 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6478975_6479212:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519221:exon_6478975_6479192:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6478973_6479212:MCPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 6500544 C/T 1 4 8 12 1.90085800194808 4.19828399610384 -2.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.249572991916517 ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6500515_6501144:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6500515_6506026:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000521175:exon_6500515_6500891:MCPH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 8175859 C/T 1 32 23 55 15.2068640155846 12.0700664887985 3.1367975267861 T:C C T 10 0.52478549951298 0.420638970915365 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 8176554 C/T 1 17 12 29 8.07864650827934 6.29742599415576 1.78122051412358 T:C C T 10 0.52478549951298 0.579302264605088 ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 8869199 T/G 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:G T G 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000104626:ENST00000523898:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000250263:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000519292:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520684:exon_8869052_8869262:ERI1;ENSG00000104626:ENST00000520332:exon_8869173_8869262:ERI1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 10689212 C/T 1 16 10 26 7.60343200779232 5.2478549951298 2.35557701266252 T:C C T 10 0.52478549951298 0.433781433833906 ENSG00000254093:ENST00000354846:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000524114:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000523559:exon_10689175_10689253:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000517607:exon_10689175_10689253:PINX1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 11172438 A/C 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:C A C 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000104643:ENST00000221086:exon_11172432_11172573:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000530200:exon_11172432_11172573:MTMR9;ENSG00000104643:ENST00000526292:exon_11172432_11172573:MTMR9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 11405542 C/G 1 28 54 82 13.3060060136366 28.3384169737009 -15.0324109600644 C:G C G 10 0.52478549951298 0.00120300369196795 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11405541_11405634:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11405541_11405634:BLK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 11406607 G/A 1 28 45 73 13.3060060136366 23.6153474780841 -10.3093414644475 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0186172013833423 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11406533_11406631:BLK;ENSG00000136573:ENST00000533828:exon_11406533_11406612:BLK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 11412974 A/G 1 89 70 159 42.2940905433448 36.7349849659086 5.55910557743618 A:G A G 10 0.52478549951298 0.383750278550207 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11412841_11412993:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11412841_11412993:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11412841_11412993:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11412841_11412993:BLK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 11414237 T/C 1 56 66 122 26.6120120272731 34.6358429678567 -8.02383094058357 T:C T C 10 0.52478549951298 0.148113737589832 ENSG00000136573:ENST00000259089:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000427279:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000529894:exon_11414167_11414346:BLK;ENSG00000136573:ENST00000526778:exon_11414167_11414297:BLK;ENSG00000136573:ENST00000525206:exon_11414166_11414346:BLK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 11703243 C/T 1 11 3 14 5.22735950535722 1.57435649853894 3.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.061586959717543 ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000420692:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11703170_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526481:exon_11703169_11703298:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530624:exon_11703170_11703298:CTSB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 21965113 T/C 1 16 17 33 7.60343200779232 8.92135349172066 -1.31792148392834 T:C T C 10 0.52478549951298 0.728392300446389 ENSG00000173566:ENST00000522405:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000309188:exon_21964383_21965406:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000521807:exon_21964385_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000420897:exon_21964454_21965857:NUDT18;ENSG00000173566:ENST00000522379:exon_21965024_21965406:NUDT18 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 22886020 A/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22885844_22886115:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000518531:exon_22885778_22886115:TNFRSF10B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 26240646 A/G 1 17 17 34 8.07864650827934 8.92135349172066 -0.842706983441321 A:G A G 10 0.52478549951298 0.864133680655555 ENSG00000104765:ENST00000380629:exon_26240414_26240746:BNIP3L;ENSG00000104765:ENST00000520077:exon_26240570_26240746:BNIP3L HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 27279881 C/T 1 53 25 78 25.1863685258121 13.1196374878245 12.0667310379876 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00635708659935102 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27279821_27279902:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521000:exon_27279793_27279900:PTK2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 27308585 A/C 1 109 149 258 51.7983805530852 78.193039427434 -26.3946588743489 A:C A C 10 0.52478549951298 0.00115094132821776 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27308560_27308595:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000397497:exon_27308560_27308595:PTK2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 27315900 A/G 1 172 167 339 81.7368940837674 87.6391784186677 -5.90228433490023 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.549800205486541 ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 28638503 C/T 1 13 15 28 6.17778850633126 7.8717824926947 -1.69399398636344 T:C C T 10 0.52478549951298 0.573269193038738 ENSG00000104299:ENST00000523303:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521022:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000416984:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000397363:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521777:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000522363:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000521070:exon_28638340_28638511:INTS9;ENSG00000104299:ENST00000522074:exon_28638468_28638511:INTS9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 29961951 C/T 1 59 40 99 28.0376555287342 20.9914199805192 7.04623554821498 T:C C T 10 0.52478549951298 0.160357573399729 ENSG00000104660:ENST00000321250:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000397339:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518001:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520682:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000442880:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000523116:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000532394:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000520739:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000518192:exon_29961816_29962002:LEPROTL1;ENSG00000104660:ENST00000519466:exon_29961816_29962002:LEPROTL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 30933801 G/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30933689_30933803:WRN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 33356074 A/G 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000198042:ENST00000360128:exon_33355950_33358687:MAK16;ENSG00000198042:ENST00000518389:exon_33355950_33356164:MAK16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 33369944 T/C 1 11 2 13 5.22735950535722 1.04957099902596 4.17778850633126 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0245324962404463 ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 37728017 A/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G A G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 37728019 T/G 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:G T G 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 38067568 C/T 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000156735:ENST00000432471:exon_38067526_38068406:BAG4;ENSG00000156735:ENST00000287322:exon_38067526_38070819:BAG4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 38133241 A/G 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G A G 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38132544_38133400:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38132560_38133400:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000446459:exon_38132560_38133400:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000528828:exon_38133008_38133400:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38133061_38133400:WHSC1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 38677131 A/G 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 A:G A G 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000524354:exon_38677040_38677149:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522544:exon_38677040_38677232:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521528:exon_38677040_38677438:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521935:exon_38677040_38677761:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523834:exon_38677040_38677268:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521154:exon_38677040_38677140:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000524193:exon_38677040_38677529:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 38684853 T/C 1 9 15 24 4.27693050438318 7.8717824926947 -3.59485198831152 T:C T C 10 0.52478549951298 0.156496947637155 ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521642:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521050:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000330691:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000348567:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000523239:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000276520:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38684686_38685585:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38684686_38684893:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520611:exon_38684686_38684893:TACC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 38704196 A/C 1 7 2 9 3.32650150340914 1.04957099902596 2.27693050438318 A:C A C 10 0.52478549951298 0.184519324149502 ENSG00000147526:ENST00000522548:exon_38703987_38704337:TACC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 42407702 A/G 1 96 115 211 45.6205920467539 60.3503324439927 -14.7297403972388 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0455209888190633 ENSG00000176209:ENST00000438528:exon_42407687_42408151:C8orf40;ENSG00000176209:ENST00000417410:exon_42407687_42408123:C8orf40;ENSG00000176209:ENST00000414154:exon_42407687_42408123:C8orf40;ENSG00000176209:ENST00000319946:exon_42407687_42408115:C8orf40;ENSG00000176209:ENST00000498447:exon_42407687_42407972:C8orf40;ENSG00000176209:ENST00000416469:exon_42407687_42407751:C8orf40;ENSG00000176209:ENST00000490331:exon_42407687_42407869:C8orf40 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 43054583 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165102:ENST00000458501:exon_43054531_43055093:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000379644:exon_43054531_43057998:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000521576:exon_43054531_43055698:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000297798:exon_43054531_43055093:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000519705:exon_43054531_43055001:HGSNAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 43054644 G/A 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 A:G G A 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000165102:ENST00000458501:exon_43054531_43055093:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000379644:exon_43054531_43057998:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000521576:exon_43054531_43055698:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000297798:exon_43054531_43055093:HGSNAT;ENSG00000165102:ENST00000519705:exon_43054531_43055001:HGSNAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 54727234 C/T 1 24 25 49 11.4051480116885 13.1196374878245 -1.71448947613602 T:C:G C T 10 0.52478549951298 0.669159089591383 ENSG00000047249:ENST00000355221:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000520188:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000359530:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000440871:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000396774:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000524164:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000521900:exon_54727222_54727326:ATP6V1H;ENSG00000047249:ENST00000522849:exon_54727222_54727326:ATP6V1H HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 54866657 A/G 1 15 23 38 7.1282175073053 12.0700664887985 -4.94184898149324 A:G A G 10 0.52478549951298 0.142852603818320 ENSG00000147509:ENST00000297313:exon_54866636_54866870:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000517659:exon_54866636_54866870:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000344277:exon_54866636_54866870:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000523280:exon_54866636_54866870:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000518286:exon_54866636_54866702:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000523414:exon_54866636_54866783:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000522225:exon_54866636_54866870:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000276500:exon_54866636_54866870:RGS20;ENSG00000147509:ENST00000517405:exon_54866636_54866870:RGS20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 56866452 G/A 1 35 31 66 16.6325075170457 16.2683504849024 0.364157032143318 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000254087:ENST00000519728:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000520220:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000502902:exon_56866391_56866543:LYN;ENSG00000254087:ENST00000507431:exon_56866391_56866543:LYN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 59508134 T/C 1 17 3 20 8.07864650827934 1.57435649853894 6.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 0.00318106161187815 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523177:exon_59508119_59508218:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523106:exon_59508119_59508218:NSMAF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 59512334 G/A 1 11 15 26 5.22735950535722 7.8717824926947 -2.64442298733748 A:G G A 10 0.52478549951298 0.330542748984287 ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000523982:exon_59512309_59512429:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519227:exon_59512309_59512429:NSMAF HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 63951237 C/T 1 9 8 17 4.27693050438318 4.19828399610384 0.0786465082793395 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000517622:exon_63951219_63951268:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 63951312 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000137563:ENST00000260118:exon_63951219_63951730:GGH;ENSG00000137563:ENST00000520609:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000518966:exon_63951219_63951360:GGH;ENSG00000137563:ENST00000523788:exon_63951219_63951361:GGH HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 67971452 T/C 1 75 59 134 35.6410875365265 30.9623444712658 4.67874306526068 T:C T C 10 0.52478549951298 0.437218926377569 ENSG00000121022:ENST00000357849:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521509:exon_67971446_67974259:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517736:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000521386:exon_67971446_67973864:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518374:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000523890:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000518747:exon_67971446_67971680:COPS5;ENSG00000121022:ENST00000517793:exon_67971446_67971680:COPS5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 68074137 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000104218:ENST00000262210:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000389042:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000412460:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000519668:exon_68074046_68074150:CSPP1;ENSG00000104218:ENST00000521168:exon_68074046_68074150:CSPP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 68128828 T/C 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C T C 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000066777:ENST00000520381:exon_68128825_68128897:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000262215:exon_68128825_68128897:ARFGEF1;ENSG00000066777:ENST00000518230:exon_68128825_68128897:ARFGEF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 71550058 G/C 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 C:G G C 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550050_71550138:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71549491_71550138:LACTB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 71550832 T/C 1 45 40 85 21.3846525219159 20.9914199805192 0.393232541396699 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000147592:ENST00000522447:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000276590:exon_71550783_71550864:LACTB2;ENSG00000147592:ENST00000517601:exon_71550786_71550864:LACTB2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 73921184 C/A 1 13 5 18 6.17778850633126 2.6239274975649 3.55386100876636 A:C C A 10 0.52478549951298 0.103560900526000 ENSG00000147601:ENST00000276603:exon_73921099_73921440:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000276602:exon_73921099_73921440:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000518874:exon_73921112_73921440:TERF1;ENSG00000147601:ENST00000518695:exon_73921143_73921277:TERF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 74893821 A/G 1 271 159 430 128.783129631982 83.4408944225638 45.3422352094186 A:G A G 10 0.52478549951298 1.29554540727221e-05 ENSG00000175606:ENST00000416961:exon_74893390_74893821:TMEM70;ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 74893850 C/G 1 143 100 243 67.9556735696438 52.478549951298 15.4771236183458 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0537711344873961 ENSG00000175606:ENST00000312184:exon_74893390_74895018:TMEM70 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 75276453 C/T 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C C T 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000104381:ENST00000521096:exon_75276220_75276525:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000520797:exon_75276220_75276495:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000220822:exon_75276220_75279111:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000434412:exon_75276220_75276839:GDAP1;ENSG00000104381:ENST00000522568:exon_75276220_75276976:GDAP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 82627236 C/A 1 19 4 23 9.02907550925338 2.09914199805192 6.92993351120146 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00535412144427465 ENSG00000104231:ENST00000524305:exon_82627222_82627274:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000523096:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000220669:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000522520:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000519464:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000521895:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000521287:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000523431:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000520635:exon_82627039_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000517588:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000519523:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000520604:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000523361:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000517450:exon_82627039_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000521742:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000518419:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000520076:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000524339:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000517353:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000519820:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000521885:exon_82627222_82627349:ZFAND1;ENSG00000104231:ENST00000520941:exon_82627222_82627349:ZFAND1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 86389403 T/C 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C T C 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000104267:ENST00000285379:exon_86389349_86389504:CA2;ENSG00000104267:ENST00000520127:exon_86389349_86389504:CA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 87479047 A/G 1 14 13 27 6.65300300681828 6.82221149366874 -0.169208486850462 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000123124:ENST00000517970:exon_87479023_87480732:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000349423:exon_87479023_87479705:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000341922:exon_87479023_87479705:WWP1;ENSG00000123124:ENST00000265428:exon_87479023_87479705:WWP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 87519315 T/G 1 26 43 69 12.3555770126625 22.5657764790581 -10.2101994663956 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0156040943163844 ENSG00000176623:ENST00000320306:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000406452:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523911:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000519966:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000430676:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000524172:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000522804:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000523370:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000521045:exon_87519224_87519341:FAM82B;ENSG00000176623:ENST00000518772:exon_87519224_87519341:FAM82B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 87540872 G/A 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87540754_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523072:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523001:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517771:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000523469:exon_87540764_87540905:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000522240:exon_87540764_87540905:CPNE3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 87570665 A/C 1 9 12 21 4.27693050438318 6.29742599415576 -2.02049548977258 A:C A C 10 0.52478549951298 0.392119223984021 ENSG00000085719:ENST00000198765:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000521271:exon_87570516_87573726:CPNE3;ENSG00000085719:ENST00000517490:exon_87570516_87573639:CPNE3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 90958422 T/C 1 38 33 71 18.0581510185068 17.3179214839283 0.740229534578418 T:C T C 10 0.52478549951298 0.905737545833374 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90958368_90958523:NBN;ENSG00000104320:ENST00000520325:exon_90958368_90958853:NBN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 90990479 C/G 1 25 16 41 11.8803625121755 8.39656799220768 3.48379451996782 C:G C G 10 0.52478549951298 0.348310031032752 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 90995019 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000519426:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000523444:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517337:exon_90994950_90995083:NBN;ENSG00000104320:ENST00000494804:exon_90994632_90995083:NBN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 91013711 G/A 1 12 16 28 5.70257400584424 8.39656799220768 -2.69399398636344 A:G G A 10 0.52478549951298 0.347151827302284 ENSG00000104325:ENST00000519328:exon_91013633_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000220764:exon_91013633_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517314:exon_91013674_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000521603:exon_91013686_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000523447:exon_91013691_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000519410:exon_91013704_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517597:exon_91013704_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000520859:exon_91013705_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000519007:exon_91013705_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000522161:exon_91013705_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000521668:exon_91013706_91013789:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000518725:exon_91013708_91013789:DECR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 92007917 G/T 1 26 23 49 12.3555770126625 12.0700664887985 0.285510523863978 T:G G T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000155099:ENST00000285419:exon_92006024_92008048:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000520709:exon_92007752_92008048:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518359:exon_92007821_92008048:TMEM55A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 94746963 C/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000517700:exon_94746777_94748666:RBM12B;ENSG00000183808:ENST00000329529:exon_94746777_94748638:RBM12B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 95392585 C/G 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95392373_95392634:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95392373_95392634:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000518358:exon_95392498_95392634:RAD54B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 95392610 T/C 1 9 7 16 4.27693050438318 3.67349849659086 0.603432007792319 T:C T C 10 0.52478549951298 0.807446848666434 ENSG00000197275:ENST00000336148:exon_95392373_95392634:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000517506:exon_95392373_95392634:RAD54B;ENSG00000197275:ENST00000518358:exon_95392498_95392634:RAD54B HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 95500924 A/G 1 87 74 161 41.3436615423707 38.8341269639605 2.50953457841022 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.75239385958559 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95499921_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95500600_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000521080:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95500748_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522196:exon_95500749_95501088:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000517624:exon_95500843_95501088:KIAA1429 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 95531419 T/C 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C T C 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95531213_95531704:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95531213_95531704:KIAA1429 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 95538468 T/C 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000164944:ENST00000297591:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000442835:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000437199:exon_95538451_95539591:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000522263:exon_95538451_95538530:KIAA1429;ENSG00000164944:ENST00000421249:exon_95538451_95539591:KIAA1429 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 99053990 G/C 1 3606 4233 7839 1713.62348875619 2221.41701943844 -507.793530682251 A:C:G G C 10 0.52478549951298 1.83985645257584e-30 ENSG00000156482:ENST00000521534:exon_99053947_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521291:exon_99053949_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000396070:exon_99053949_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99053949_99054078:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000287038:exon_99053949_99054078:RPL30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 99057150 C/A 1 22 17 39 10.4547190107144 8.92135349172066 1.53336551899378 A:C C A 10 0.52478549951298 0.635242053522041 ENSG00000156482:ENST00000518850:exon_99057055_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000520998:exon_99056661_99057316:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 99057526 G/A 1 11 3 14 5.22735950535722 1.57435649853894 3.65300300681828 A:G G A 10 0.52478549951298 0.061586959717543 ENSG00000156482:ENST00000517489:exon_99057171_99057627:RPL30;ENSG00000156482:ENST00000521112:exon_99057096_99057627:RPL30 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 99153088 A/C 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:C A C 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99152997_99153116:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99152997_99153116:POP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 102731486 G/A 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000104490:ENST00000395923:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000454532:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000395921:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000427074:exon_102731480_102731918:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000311028:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000220931:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000521599:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000519508:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522951:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000522448:exon_102731480_102731876:NCALD;ENSG00000104490:ENST00000520690:exon_102731480_102731876:NCALD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 104432545 A/G 1 55 60 115 26.1367975267861 31.4871299707788 -5.35033244399271 A:G A G 10 0.52478549951298 0.350673975141117 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 104438340 C/T 1 62 69 131 29.4632990301952 36.2101994663956 -6.74690043620038 T:C C T 10 0.52478549951298 0.255774316864217 ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104438284_104438373:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104438284_104438373:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521999:exon_104438284_104438373:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104438284_104438373:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104438284_104438373:DCAF13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 110539186 G/A 1 19 24 43 9.02907550925338 12.5948519883115 -3.56577647905814 A:G G A 10 0.52478549951298 0.288955575331846 ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 117783840 A/G 1 58 41 99 27.5624410282472 21.5162054800322 6.04623554821498 A:G A G 10 0.52478549951298 0.229096374004526 ENSG00000147679:ENST00000309822:exon_117783695_117786923:UTP23;ENSG00000147679:ENST00000521974:exon_117783695_117784022:UTP23 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 123964813 A/G 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 A:G A G 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 123965365 G/A 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 123965865 C/T 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 123966141 G/A 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000520211:exon_123965567_123966268:ZHX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 124357253 G/A 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000156802:ENST00000517666:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000287394:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521903:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000519124:exon_124357124_124357309:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521496:exon_124356753_124357309:ATAD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 124360487 G/A 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G G A 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000156802:ENST00000517666:exon_124360423_124360513:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000287394:exon_124360423_124360513:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521903:exon_124360427_124360513:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000519124:exon_124360423_124360513:ATAD2;ENSG00000156802:ENST00000521496:exon_124360423_124360513:ATAD2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 125463544 T/C 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 T:C T C 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 126034052 C/T 1 59 61 120 28.0376555287342 32.0119154702918 -3.97425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 0.522476350546517 ENSG00000104549:ENST00000523430:exon_126033995_126034523:SQLE;ENSG00000104549:ENST00000265896:exon_126033995_126034525:SQLE HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 126044527 C/T 1 5 7 12 2.3760725024351 3.67349849659086 -1.29742599415576 T:C C T 10 0.52478549951298 0.567319353840057 ENSG00000164961:ENST00000519042:exon_126044483_126044956:KIAA0196;ENSG00000164961:ENST00000318410:exon_126044483_126044636:KIAA0196;ENSG00000164961:ENST00000517845:exon_126044483_126044636:KIAA0196;ENSG00000164961:ENST00000377985:exon_126044483_126044636:KIAA0196 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 126370013 C/A 1 21 17 38 9.97950451022742 8.92135349172066 1.05815101850676 A:C C A 10 0.52478549951298 0.748549504144152 ENSG00000156831:ENST00000517532:exon_126369954_126370013:NSMCE2;ENSG00000156831:ENST00000287437:exon_126369954_126370060:NSMCE2;ENSG00000156831:ENST00000522563:exon_126369954_126370060:NSMCE2;ENSG00000156831:ENST00000517315:exon_126369954_126370060:NSMCE2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 135490902 C/T 1 108 55 163 51.3231660525982 28.8632024732139 22.4599635793843 T:C C T 10 0.52478549951298 0.000398835197993255 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135490031_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135490035_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135490035_135490944:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135490035_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135490035_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135490035_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135490035_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135490268_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135490268_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000521673:exon_135490465_135490964:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135490636_135490964:ZFAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 135612745 A/G 1 22 7 29 10.4547190107144 3.67349849659086 6.78122051412358 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0144293580242629 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 135613787 C/T 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135613720_135615176:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135613720_135615176:ZFAT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 141525387 T/C 1 20 30 50 9.5042900097404 15.7435649853894 -6.239274975649 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0891458588577209 ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 141554396 C/T 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000123908:ENST00000220592:exon_141554312_141554402:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000519980:exon_141554312_141554402:EIF2C2;ENSG00000123908:ENST00000523609:exon_141554312_141554402:EIF2C2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 142154349 G/A 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 142161032 A/C 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 A:C A C 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 142204293 C/T 1 68 20 88 32.3145860331174 10.4957099902596 21.8188760428578 T:C C T 10 0.52478549951298 2.79308478810384e-06 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 142204326 C/G 1 21 64 85 9.97950451022742 33.5862719688307 -23.6067674586033 C:G C G 10 0.52478549951298 2.94816721650085e-07 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 142204351 A/G 1 29 10 39 13.7812205141236 5.2478549951298 8.53336551899378 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00617603199345325 ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144358819 T/G 1 34 16 50 16.1572930165587 8.39656799220768 7.760725024351 T:G T G 10 0.52478549951298 0.0329860166015091 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144358983 G/A 1 24 15 39 11.4051480116885 7.8717824926947 3.53336551899378 A:G G A 10 0.52478549951298 0.267155005184894 ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144413416 G/A 0 0 10 10 0 5.2478549951298 -5.2478549951298 A G A 10 0.52478549951298 0.000587349820641343 ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523417:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518007:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518760:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000520950:exon_144413394_144413509:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522043:exon_144413394_144413509:TOP1MT HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144550600 T/A 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:T T A 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144550552_144550710:ZC3H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144589984 C/A 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144589916_144590069:ZC3H3;ENSG00000014164:ENST00000528401:exon_144589916_144590010:ZC3H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144590053 G/A 1 5 5 10 2.3760725024351 2.6239274975649 -0.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144589916_144590069:ZC3H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144621084 T/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:G T G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144644405 G/A 1 18 33 51 8.55386100876636 17.3179214839283 -8.76406047516198 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0165815973892448 ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144657801 G/A 1 1 20 21 0.47521450048702 10.4957099902596 -10.0204954897726 A:G G A 10 0.52478549951298 5.28288667179283e-06 ENSG00000147813:ENST00000460623:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144657792_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144657770_144657872:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144657793_144657872:NAPRT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144658637 C/A 1 17 1 18 8.07864650827934 0.52478549951298 7.55386100876636 A:C C A 10 0.52478549951298 0.000189549612943650 ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144671244 C/A 1 6 7 13 2.85128700292212 3.67349849659086 -0.822211493668741 A:C C A 10 0.52478549951298 0.78336522481248 ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144689289 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144775871 C/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:C C A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000181135:ENST00000525185:exon_144775841_144776000:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000534303:exon_144775841_144776009:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000528456:exon_144775841_144775942:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530574:exon_144775841_144775997:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531985:exon_144775841_144775893:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527293:exon_144775841_144775926:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531811:exon_144775841_144775918:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000525862:exon_144775841_144775873:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000526315:exon_144775841_144776129:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000530341:exon_144775841_144775881:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000531254:exon_144775841_144776199:ZNF707 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144776697 G/C 1 4 10 14 1.90085800194808 5.2478549951298 -3.34699699318172 C:G G C 10 0.52478549951298 0.106179090352378 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144776713 A/C 1 10 4 14 4.7521450048702 2.09914199805192 2.65300300681828 A:C A C 10 0.52478549951298 0.187053491515587 ENSG00000181135:ENST00000454097:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000418203:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000533031:exon_144775841_144777526:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000358656:exon_144775841_144777555:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532486:exon_144775841_144777554:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000527561:exon_144775841_144776869:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532158:exon_144775841_144777527:ZNF707;ENSG00000181135:ENST00000532205:exon_144775841_144777550:ZNF707 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144889172 A/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 A:G A G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144893084 G/A 1 10 6 16 4.7521450048702 3.14871299707788 1.60343200779232 A:G G A 10 0.52478549951298 0.463443652289297 ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144893076_144893242:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144893076_144893242:SCRIB HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144898801 A/G 1 359 328 687 170.60200567484 172.129643840257 -1.52763816541727 A:G A G 10 0.52478549951298 0.908827588268067 ENSG00000179950:ENST00000526683:exon_144898514_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000453551:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000313352:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000456095:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000349157:exon_144898547_144898989:PUF60;ENSG00000179950:ENST00000527197:exon_144898690_144898989:PUF60 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144992388 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 144997436 G/A 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G G A 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145139408 C/G 1 33 33 66 15.6820785160717 17.3179214839283 -1.63584296785668 C:G C G 10 0.52478549951298 0.712846770198214 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000525087:exon_145139316_145139513:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530633:exon_145139316_145139488:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000528073:exon_145139316_145139422:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527144:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139316_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139031_145139512:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139316_145139512:GPAA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145139727 C/T 1 50 40 90 23.760725024351 20.9914199805192 2.7693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 0.598477924944469 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145139625_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000526233:exon_145139625_145139752:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000527653:exon_145139625_145139998:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145139625_145140382:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000531593:exon_145139640_145139778:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145139696_145139778:GPAA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145140472 A/G 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145140501 A/G 1 92 77 169 43.7197340448058 40.4084834624995 3.31125058230638 A:G A G 10 0.52478549951298 0.644308927127963 ENSG00000197858:ENST00000355091:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000361036:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000529638:exon_145140476_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000530796:exon_145140192_145140646:GPAA1;ENSG00000197858:ENST00000534072:exon_145140476_145141087:GPAA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145150929 C/A 1 152 158 310 72.232604074027 82.9161089230508 -10.6835048490238 A:C C A 10 0.52478549951298 0.23262794039118 ENSG00000179091:ENST00000318911:exon_145150736_145150932:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000533444:exon_145149942_145150932:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000528618:exon_145150389_145150932:CYC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145151304 A/G 1 407 385 792 193.412301698217 202.042417312497 -8.63011561428019 A:G A G 10 0.52478549951298 0.545453398762951 ENSG00000179091:ENST00000318911:exon_145151240_145151397:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000533444:exon_145151240_145151397:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000528618:exon_145151240_145151418:CYC1;ENSG00000179091:ENST00000525122:exon_145151248_145151647:CYC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145161823 G/A 1 143 121 264 67.9556735696438 63.4990454410706 4.45662812857326 A:T:G G A 10 0.52478549951298 0.622126644739743 ENSG00000179632:ENST00000322428:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534585:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000532522:exon_145161738_145161866:MAF1;ENSG00000179632:ENST00000534811:exon_145161738_145162295:MAF1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145512914 C/T 1 21 16 37 9.97950451022742 8.39656799220768 1.58293651801974 T:C C T 10 0.52478549951298 0.625646683163687 ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145512926 G/A 1 22 16 38 10.4547190107144 8.39656799220768 2.05815101850676 A:G G A 10 0.52478549951298 0.521127001924343 ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145689915 G/A 1 10 10 20 4.7521450048702 5.2478549951298 -0.4957099902596 A:G G A 10 0.52478549951298 0.82741099972593 ENSG00000187954:ENST00000438911:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000292543:exon_145689843_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000403000:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000424149:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000306145:exon_145689200_145689995:CYHR1;ENSG00000187954:ENST00000533764:exon_145689658_145689995:CYHR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 145741702 C/G 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 C:G C G 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000160957:ENST00000532237:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000428558:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000301323:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000532269:exon_145741372_145742148:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000524998:exon_145741372_145741797:RECQL4;ENSG00000160957:ENST00000534538:exon_145741629_145742045:RECQL4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 146067002 A/C 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:C A C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 146067054 G/A 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 146067125 C/T 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 8 146156247 C/A 1 11 5 16 5.22735950535722 2.6239274975649 2.60343200779232 A:C C A 10 0.52478549951298 0.219088168492995 ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 286593 C/A 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 A:C C A 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000107099:ENST00000469197:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000479404:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000487230:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_286461_286636:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_286461_286636:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 312124 T/C 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 T:C T C 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000107099:ENST00000524396:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000427010:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000454469:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382341:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000478380:exon_311954_312941:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_311954_312166:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000474772:exon_311958_312166:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 371542 C/G 1 6 5 11 2.85128700292212 2.6239274975649 0.227359505357219 C:G C G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000483757:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_371428_371566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_371428_371566:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 390512 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_390471_390566:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_390471_390566:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 399255 G/A 1 6 13 19 2.85128700292212 6.82221149366874 -3.97092449074662 A:G G A 10 0.52478549951298 0.105409046642838 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 441952 G/A 1 16 26 42 7.60343200779232 13.6444229873375 -6.04099097954516 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0651913441591426 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_441875_442009:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_441875_442009:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 449874 G/C 1 13 24 37 6.17778850633126 12.5948519883115 -6.41706348198026 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0468475722730799 ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_449784_449927:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_449784_449927:DOCK8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 2029196 G/A 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 A:G G A 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 2115920 C/T 1 23 37 60 10.9299335112015 19.4170634819803 -8.4871299707788 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0377312946587336 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2115822_2116049:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2115822_2116049:SMARCA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 2191309 C/G 1 70 57 127 33.2650150340914 29.9127734722399 3.35224156185154 C:G C G 10 0.52478549951298 0.594327467101093 ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000302401:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382186:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000417599:exon_2191266_2191428:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382185:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382183:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000324954:exon_2191266_2191408:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382182:exon_2191266_2191408:SMARCA2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 5968416 A/G 1 15 27 42 7.1282175073053 14.1692084868505 -7.04099097954516 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0311125563552165 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 5968556 T/G 1 12 14 26 5.70257400584424 7.34699699318172 -1.64442298733748 T:G T G 10 0.52478549951298 0.559996501494547 ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 6984236 G/A 1 5 9 14 2.3760725024351 4.72306949561682 -2.34699699318172 A:G G A 10 0.52478549951298 0.285540821029174 ENSG00000107077:ENST00000438023:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_6984166_6984404:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_6984166_6984404:KDM4C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 7128227 G/A 1 10 12 22 4.7521450048702 6.29742599415576 -1.54528098928556 A:G G A 10 0.52478549951298 0.529829062945033 ENSG00000107077:ENST00000442236:exon_7128066_7128236:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381309:exon_7128066_7128236:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000381306:exon_7128066_7128236:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000428870:exon_7128066_7128236:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000420847:exon_7128066_7128236:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000490806:exon_7128066_7128236:KDM4C;ENSG00000107077:ENST00000466673:exon_7127907_7128236:KDM4C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 7799653 G/T 1 99 73 172 47.046235548215 38.3093414644475 8.73689408376743 T:G G T 10 0.52478549951298 0.194585790420377 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 7799723 C/T 1 123 122 245 58.4513835599035 64.0238309405836 -5.57244738068011 T:C C T 10 0.52478549951298 0.482330427527106 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 7799738 C/G 1 115 106 221 54.6496675560073 55.6272629483759 -0.977595392368592 C:G C G 10 0.52478549951298 0.893126545977151 ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 15571630 T/A 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 A:T T A 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000164989:ENST00000297641:exon_15571622_15571757:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380689:exon_15571622_15571757:C9orf93;ENSG00000164989:ENST00000380701:exon_15571622_15571757:C9orf93 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 19376255 A/C 1 3 11 14 1.42564350146106 5.77264049464278 -4.34699699318172 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0291103619486302 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 19376258 G/C 1 3 13 16 1.42564350146106 6.82221149366874 -5.39656799220768 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0099864222361544 ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 33467790 C/T 1 5 4 9 2.3760725024351 2.09914199805192 0.27693050438318 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165271:ENST00000455041:exon_33467689_33467866:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000353159:exon_33467689_33467866:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000297990:exon_33467689_33467866:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000379471:exon_33467689_33467866:NOL6;ENSG00000165271:ENST00000325914:exon_33467689_33467866:NOL6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 34635749 G/A 1 37 22 59 17.5829365180197 11.5452809892856 6.03765552873418 A:G G A 10 0.52478549951298 0.119755405782097 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34634719_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000476705:exon_34635392_34635805:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34634720_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34635480_34635855:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34635494_34635855:SIGMAR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 34637398 G/A 1 12 18 30 5.70257400584424 9.44613899123364 -3.7435649853894 A:G G A 10 0.52478549951298 0.201719558866690 ENSG00000147955:ENST00000277010:exon_34637217_34637417:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000378892:exon_34637217_34637729:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000353468:exon_34637264_34637417:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000442847:exon_34637217_34637417:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000360710:exon_34637383_34637417:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000477726:exon_34637217_34637417:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000461426:exon_34637217_34637793:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000497006:exon_34636994_34637417:SIGMAR1;ENSG00000147955:ENST00000478146:exon_34637264_34637409:SIGMAR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35091880 C/T 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000165282:ENST00000474436:exon_35088687_35093577:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000378617:exon_35091237_35092764:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000465745:exon_35091237_35094356:PIGO;ENSG00000165282:ENST00000341666:exon_35091237_35092764:PIGO HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35661057 C/G 1 64 11 75 30.4137280311693 5.77264049464278 24.6410875365265 C:G C G 10 0.52478549951298 3.64902591550388e-09 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35661088 G/A 1 70 5 75 33.2650150340914 2.6239274975649 30.6410875365265 A:G G A 10 0.52478549951298 1.38975332209303e-14 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35661094 C/T 1 66 5 71 31.3641570321433 2.6239274975649 28.7402295345784 T:C C T 10 0.52478549951298 1.47132126578924e-13 ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378409:exon_35660937_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000327351:exon_35660937_35661174:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35680752 G/A 1 25 1 26 11.8803625121755 0.52478549951298 11.3555770126625 A:G G A 10 0.52478549951298 1.40473937695034e-06 ENSG00000107159:ENST00000378357:exon_35680750_35680831:CA9;ENSG00000107159:ENST00000493245:exon_35680750_35680831:CA9;ENSG00000107159:ENST00000485665:exon_35680698_35680831:CA9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35732769 A/G 1 25 21 46 11.8803625121755 11.0204954897726 0.859867022402918 A:G A G 10 0.52478549951298 0.882986946252386 ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35732332_35732898:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35732595_35732898:CREB3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35753294 A/G 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 A:G A G 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000107185:ENST00000456972:exon_35752648_35757908:RGP1;ENSG00000107185:ENST00000378078:exon_35752648_35758572:RGP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 35971564 C/T 0 50 0 50 23.760725024351 0 23.760725024351 C C 10 0.52478549951298 1.39086359106231e-14 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 36651819 G/A 1 13 6 19 6.17778850633126 3.14871299707788 3.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.176954766259946 ENSG00000165304:ENST00000298048:exon_36651743_36651874:MELK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 36840623 G/A 1 12 8 20 5.70257400584424 4.19828399610384 1.5042900097404 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655496045532262 ENSG00000196092:ENST00000358127:exon_36833272_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377853:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377840:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377852:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523241:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520154:exon_36840169_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000520281:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000446742:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522003:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523145:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000523493:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000414447:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377847:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000377849:exon_36840548_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000524340:exon_36840555_36840633:PAX5;ENSG00000196092:ENST00000522932:exon_36840555_36840633:PAX5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37002806 A/G 1 5 10 15 2.3760725024351 5.2478549951298 -2.8717824926947 A:G A G 10 0.52478549951298 0.195423410463726 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37426590 G/A 1 118 88 206 56.0753110574684 46.1811239571422 9.89418710032611 A:G G A 10 0.52478549951298 0.18495279499005 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37426535_37426651:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000493368:exon_37426535_37426651:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37426535_37426651:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37426535_37426651:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000487399:exon_37425919_37426647:GRHPR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37429814 A/G 1 132 179 311 62.7283140642866 93.9366044128234 -31.2082903485368 A:G A G 10 0.52478549951298 0.000419040193106533 ENSG00000137106:ENST00000318158:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000377824:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000460882:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000491488:exon_37429729_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000497693:exon_37427703_37432135:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000480596:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000438860:exon_37428535_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000494290:exon_37428992_37429833:GRHPR;ENSG00000137106:ENST00000482603:exon_37429783_37429833:GRHPR HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37492679 G/T 1 44 25 69 20.9094380214289 13.1196374878245 7.78980053360438 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0701805695100249 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37493588 C/T 1 41 34 75 19.4837945199678 17.8427069834413 1.6410875365265 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729981595785773 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37498141 G/A 1 28 29 57 13.3060060136366 15.2187794858764 -1.91277347223986 A:G G A 10 0.52478549951298 0.69115021808619 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37498088_37498221:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37498132_37498209:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37498088_37498221:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37498088_37498221:POLR1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37500895 T/C 1 53 37 90 25.1863685258121 19.4170634819803 5.7693050438318 T:C T C 10 0.52478549951298 0.246147443650365 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 37503087 G/A 1 75 57 132 35.6410875365265 29.9127734722399 5.72831406428664 A:G G A 10 0.52478549951298 0.338393447987252 ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 71661335 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165060:ENST00000377270:exon_71661301_71661398:FXN;ENSG00000165060:ENST00000533967:exon_71661301_71661398:FXN;ENSG00000165060:ENST00000396366:exon_71661301_71661398:FXN;ENSG00000165060:ENST00000396364:exon_71661301_71661398:FXN;ENSG00000165060:ENST00000498653:exon_71661301_71661398:FXN;ENSG00000165060:ENST00000484259:exon_71661323_71661398:FXN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 72933805 A/G 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72933710_72933879:SMC5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 74586523 C/T 1 12 19 31 5.70257400584424 9.97092449074662 -4.26835048490238 T:C C T 10 0.52478549951298 0.150419881320759 ENSG00000155621:ENST00000479413:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000334731:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377031:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000473252:exon_74586421_74586534:C9orf85;ENSG00000155621:ENST00000377027:exon_74586421_74586534:C9orf85 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 74975136 T/C 1 20 5 25 9.5042900097404 2.6239274975649 6.8803625121755 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0078803420192012 ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 79986057 A/G 1 17 10 27 8.07864650827934 5.2478549951298 2.83079151314954 A:G A G 10 0.52478549951298 0.336737529516327 ENSG00000197969:ENST00000360280:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376646:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376636:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000355766:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000376634:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000423463:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000357409:exon_79985942_79986065:VPS13A;ENSG00000197969:ENST00000477107:exon_79985942_79986065:VPS13A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 80881519 T/C 1 30 31 61 14.2564350146106 16.2683504849024 -2.01191547029178 T:C T C 10 0.52478549951298 0.610994756512194 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 80881589 A/C 1 56 67 123 26.6120120272731 35.1606284673697 -8.54861644009654 A:C A C 10 0.52478549951298 0.125727511408979 ENSG00000148019:ENST00000415085:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000277082:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000415759:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376597:exon_80881358_80881982:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000376598:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000498582:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000424347:exon_80881358_80881769:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000447629:exon_80881358_80881619:CEP78;ENSG00000148019:ENST00000455204:exon_80881358_80881991:CEP78 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 80912115 G/C 0 0 32 32 0 16.7931359844154 -16.7931359844154 C G C 10 0.52478549951298 4.57583008645037e-11 ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80911992_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80912059_80912186:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80912059_80912186:PSAT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 82006453 G/A 0 9 0 9 4.27693050438318 0 4.27693050438318 G G 10 0.52478549951298 0.00425478237298913 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 86258685 A/C 1 40 28 68 19.0085800194808 14.6939939863634 4.31458603311736 A:C A C 10 0.52478549951298 0.332002552464559 ENSG00000148057:ENST00000533522:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000277124:exon_86258344_86259045:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000405990:exon_86258344_86259038:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000376419:exon_86258344_86258819:C9orf103;ENSG00000148057:ENST00000454393:exon_86258344_86259038:C9orf103 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 86278913 C/T 1 44 30 74 20.9094380214289 15.7435649853894 5.16587303603948 T:C C T 10 0.52478549951298 0.2458204419693 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 86284178 C/A 1 42 27 69 19.9590090204548 14.1692084868505 5.78980053360438 A:C C A 10 0.52478549951298 0.185101302228593 ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86281265_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86284100_86284242:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86284100_86284206:UBQLN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 88211363 A/G 1 13 17 30 6.17778850633126 8.92135349172066 -2.7435649853894 A:G A G 10 0.52478549951298 0.362785673704686 ENSG00000135049:ENST00000357081:exon_88211277_88211364:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000376083:exon_88211277_88211364:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000376109:exon_88211277_88211364:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000337006:exon_88211277_88211364:AGTPBP1;ENSG00000135049:ENST00000395847:exon_88211277_88211364:AGTPBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 88633193 C/T 1 17 28 45 8.07864650827934 14.6939939863634 -6.6153474780841 T:C C T 10 0.52478549951298 0.052739568384799 ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88633170_88633310:NAA35 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 90262235 G/A 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 A:G G A 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469067:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90262220_90262318:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90262220_90262318:DAPK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 90266627 C/T 1 10 7 17 4.7521450048702 3.67349849659086 1.07864650827934 T:C C T 10 0.52478549951298 0.636288491925486 ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90266442_90266639:DAPK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 91993615 G/A 1 42 37 79 19.9590090204548 19.4170634819803 0.541945538474579 A:G G A 10 0.52478549951298 0.9109259461095 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 91993724 C/T 1 52 28 80 24.711154025325 14.6939939863634 10.0171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0253498992485043 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 91993769 G/A 1 29 48 77 13.7812205141236 25.189703976623 -11.4084834624995 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0115986565641348 ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95018903 A/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 A:G A G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000196305:ENST00000472894:exon_95018639_95019082:IARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95036747 T/G 1 25 3 28 11.8803625121755 1.57435649853894 10.3060060136366 T:G T G 10 0.52478549951298 7.16980884470446e-05 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95036708_95036799:IARS;ENSG00000196305:ENST00000395554:exon_95036708_95036803:IARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95036748 T/C 1 25 3 28 11.8803625121755 1.57435649853894 10.3060060136366 T:C T C 10 0.52478549951298 7.16980884470446e-05 ENSG00000196305:ENST00000375643:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375660:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000443024:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000447699:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000451588:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000375629:exon_95036708_95036803:IARS;ENSG00000196305:ENST00000449893:exon_95036708_95036799:IARS;ENSG00000196305:ENST00000395554:exon_95036708_95036803:IARS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95378177 G/A 1 23 12 35 10.9299335112015 6.29742599415576 4.6325075170457 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.129589682882794 ENSG00000188312:ENST00000375587:exon_95375301_95382815:CENPP;ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95375466_95378339:IPPK;ENSG00000127080:ENST00000486841:exon_95376838_95378339:IPPK;ENSG00000127080:ENST00000375522:exon_95377809_95378339:IPPK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95396671 C/T 1 5 8 13 2.3760725024351 4.19828399610384 -1.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.407769240345975 ENSG00000127080:ENST00000287996:exon_95396668_95396770:IPPK;ENSG00000127080:ENST00000375522:exon_95396668_95396770:IPPK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95796861 C/T 1 12 2 14 5.70257400584424 1.04957099902596 4.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0144267334739653 ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95796823_95796963:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95796823_95796963:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95795051_95796963:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000488407:exon_95796826_95796901:FGD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95870005 C/A 1 7 12 19 3.32650150340914 6.29742599415576 -2.97092449074662 A:C C A 10 0.52478549951298 0.250216318185529 ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000495641:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466929:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95869956_95870098:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95869956_95870109:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000498243:exon_95869956_95870098:C9orf89 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 95887320 G/T 1 26 50 76 12.3555770126625 26.239274975649 -13.8836979629865 T:G G T 10 0.52478549951298 0.00175337155467458 ENSG00000131669:ENST00000375446:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000489274:exon_95887181_95888472:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000470314:exon_95887181_95887344:NINJ1;ENSG00000131669:ENST00000461162:exon_95887181_95887344:NINJ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 96320279 C/T 1 3 15 18 1.42564350146106 7.8717824926947 -6.44613899123364 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00329666161144462 ENSG00000048828:ENST00000277165:exon_96320109_96320292:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000340893:exon_96320109_96320292:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000333936:exon_96320109_96320292:FAM120A;ENSG00000048828:ENST00000427765:exon_96320109_96320292:FAM120A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 99227994 C/T 1 14 21 35 6.65300300681828 11.0204954897726 -4.3674924829543 T:C C T 10 0.52478549951298 0.175288958873817 ENSG00000130956:ENST00000375249:exon_99227992_99228060:HABP4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 99581676 G/C 1 8 5 13 3.80171600389616 2.6239274975649 1.17778850633126 C:G G C 10 0.52478549951298 0.587193671721943 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 99581811 C/T 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 100222636 A/G 1 6 2 8 2.85128700292212 1.04957099902596 1.80171600389616 A:G A G 10 0.52478549951298 0.293890374522633 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100222460_100223046:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100222460_100223046:TDRD7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 100245207 G/A 1 24 22 46 11.4051480116885 11.5452809892856 -0.140132977597082 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000196116:ENST00000355295:exon_100245131_100245633:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000422139:exon_100245131_100245633:TDRD7;ENSG00000196116:ENST00000492428:exon_100245131_100245228:TDRD7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 100823135 G/C 1 50 69 119 23.760725024351 36.2101994663956 -12.4494744420446 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0271977246051273 ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 106877042 A/G 1 7 4 11 3.32650150340914 2.09914199805192 1.22735950535722 A:G A G 10 0.52478549951298 0.554344236023915 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106876972_106877110:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106876972_106877110:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106876972_106877110:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106876972_106877110:SMC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 106888978 C/T 1 21 15 36 9.97950451022742 7.8717824926947 2.10772201753272 T:C C T 10 0.52478549951298 0.509031329613737 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 106901506 A/G 1 39 52 91 18.5333655189938 27.288845974675 -8.75548045568118 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0741811460339291 ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 111651651 C/T 1 14 14 28 6.65300300681828 7.34699699318172 -0.693993986363441 T:C C T 10 0.52478549951298 0.851182438556464 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 111656236 G/A 1 6 9 15 2.85128700292212 4.72306949561682 -1.8717824926947 A:G G A 10 0.52478549951298 0.439933280952827 ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111656223_111656346:IKBKAP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 111745555 T/A 1 19 7 26 9.02907550925338 3.67349849659086 5.35557701266252 A:T T A 10 0.52478549951298 0.0477709619313174 ENSG00000119326:ENST00000325551:exon_111745425_111745595:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000374595:exon_111745425_111745595:CTNNAL1;ENSG00000119326:ENST00000325580:exon_111745425_111745595:CTNNAL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 113006420 A/G 1 891 876 1767 423.416119933935 459.71209757337 -36.2959776394357 A:G A G 10 0.52478549951298 0.0863423374941113 ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 114131428 C/T 1 178 145 323 84.5881810866896 76.0938974293821 8.49428365730745 T:C C T 10 0.52478549951298 0.372762459486699 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114131315_114131453:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114131315_114131453:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000465499:exon_114131315_114131453:KIAA0368 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 114174415 T/C 1 12 13 25 5.70257400584424 6.82221149366874 -1.1196374878245 T:C T C 10 0.52478549951298 0.692578111567490 ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114174294_114174428:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114174294_114174428:KIAA0368 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 114359624 C/A 1 7 15 22 3.32650150340914 7.8717824926947 -4.54528098928556 A:C C A 10 0.52478549951298 0.056973917343431 ENSG00000106853:ENST00000309195:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374324:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000407693:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000333580:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000238248:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000422125:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374313:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000374308:exon_114359597_114359712:PTGR1;ENSG00000106853:ENST00000485319:exon_114359597_114359693:PTGR1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 114688725 C/T 1 3 7 10 1.42564350146106 3.67349849659086 -2.2478549951298 T:C C T 10 0.52478549951298 0.208613717250052 ENSG00000148154:ENST00000374279:exon_114688664_114688776:UGCG;ENSG00000148154:ENST00000495085:exon_114688664_114688776:UGCG HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 115961203 C/A 1 2 12 14 0.95042900097404 6.29742599415576 -5.34699699318172 A:C C A 10 0.52478549951298 0.00546065207010748 ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115961135_115961203:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115961135_115961203:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115961135_115961203:FKBP15 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 116136198 C/T 1 21 16 37 9.97950451022742 8.39656799220768 1.58293651801974 T:C C T 10 0.52478549951298 0.625646683163687 ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 116346118 G/A 1 4 6 10 1.90085800194808 3.14871299707788 -1.2478549951298 A:G G A 10 0.52478549951298 0.533213489784507 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 116346236 G/A 1 12 9 21 5.70257400584424 4.72306949561682 0.979504510227419 A:G G A 10 0.52478549951298 0.827764729334928 ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117103838 T/C 1 27 35 62 12.8307915131495 18.3674924829543 -5.53670096980476 T:C T C 10 0.52478549951298 0.164164582961793 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117103973 A/G 1 38 35 73 18.0581510185068 18.3674924829543 -0.309341464447542 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117103813_117104005:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117103813_117104005:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117110046 C/T 0 39 0 39 18.5333655189938 0 18.5333655189938 C C 10 0.52478549951298 2.30393271696794e-11 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117110112 T/C 1 12 19 31 5.70257400584424 9.97092449074662 -4.26835048490238 T:C T C 10 0.52478549951298 0.150419881320759 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117110004_117110180:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000491133:exon_117110053_117110180:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117122202 C/T 1 11 13 24 5.22735950535722 6.82221149366874 -1.59485198831152 T:C C T 10 0.52478549951298 0.545574129003337 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117122176_117122342:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117122176_117122342:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117124731 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117124686_117124813:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117124686_117124813:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117129921 G/C 1 9 2 11 4.27693050438318 1.04957099902596 3.22735950535722 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0689990334594261 ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117129823_117129977:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000312033:exon_117129823_117129977:AKNA HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 117359915 C/A 1 105 88 193 49.8975225511371 46.1811239571422 3.71639859399485 A:C C A 10 0.52478549951298 0.614374256413997 ENSG00000136888:ENST00000374050:exon_117359850_117360653:ATP6V1G1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 119461404 C/T 1 9 5 14 4.27693050438318 2.6239274975649 1.65300300681828 T:C C T 10 0.52478549951298 0.432010905231683 ENSG00000119401:ENST00000394497:exon_119459944_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000450136:exon_119459941_119463577:TRIM32;ENSG00000119401:ENST00000373983:exon_119459935_119463579:TRIM32 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123170678 C/G 1 16 20 36 7.60343200779232 10.4957099902596 -2.89227798246728 C:G C G 10 0.52478549951298 0.404642208275992 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123170733 C/G 1 19 19 38 9.02907550925338 9.97092449074662 -0.941848981493241 C:G C G 10 0.52478549951298 0.871262321281403 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123170625_123170746:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123168424_123170746:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123182202 C/T 1 18 15 33 8.55386100876636 7.8717824926947 0.682078516071659 T:C C T 10 0.52478549951298 0.862935946296175 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000425647:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123182066_123182238:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123205912 C/G 1 17 9 26 8.07864650827934 4.72306949561682 3.35557701266252 C:G C G 10 0.52478549951298 0.239108469053992 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123205981 C/T 1 10 5 15 4.7521450048702 2.6239274975649 2.1282175073053 T:C C T 10 0.52478549951298 0.310721474916608 ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000479584:exon_123205898_123206020:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123215814 C/T 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 T:C C T 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000416449:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123215734_123216151:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 123291036 C/G 1 8 9 17 3.80171600389616 4.72306949561682 -0.921353491720661 C:G C G 10 0.52478549951298 0.809129474556497 ENSG00000136861:ENST00000373938:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000359309:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360822:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000349780:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000360190:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000480112:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000473282:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000345313:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000483412:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000482047:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000472883:exon_123291022_123291075:CDK5RAP2;ENSG00000136861:ENST00000481266:exon_123291022_123291051:CDK5RAP2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 125588917 G/A 1 20 28 48 9.5042900097404 14.6939939863634 -5.18970397662304 A:C:G G A 10 0.52478549951298 0.149204609872264 ENSG00000136940:ENST00000436632:exon_125588895_125588965:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000259467:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394286:exon_125588895_125589071:PDCL;ENSG00000136940:ENST00000394285:exon_125588895_125589031:PDCL HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 125652757 G/A 1 3 5 8 1.42564350146106 2.6239274975649 -1.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 0.490037490319785 ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 125920376 G/A 1 6 10 16 2.85128700292212 5.2478549951298 -2.39656799220768 A:G G A 10 0.52478549951298 0.317333486673039 ENSG00000165209:ENST00000447404:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000348403:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000360998:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000407982:exon_125920291_125920402:STRBP;ENSG00000165209:ENST00000373638:exon_125920291_125920402:STRBP HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 126520068 T/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000119522:ENST00000373624:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000473039:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394219:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373620:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000373618:exon_126519982_126520101:DENND1A;ENSG00000119522:ENST00000394215:exon_126519982_126520101:DENND1A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 127101924 C/T 1 88 84 172 41.8188760428578 44.0819819590903 -2.26310591623256 T:C C T 10 0.52478549951298 0.760306620723318 ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 127118985 T/C 1 8 11 19 3.80171600389616 5.77264049464278 -1.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.491891556397476 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 127982839 C/A 1 35 44 79 16.6325075170457 23.0905619785711 -6.45805446152542 A:C C A 10 0.52478549951298 0.176081843319891 ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127982818_127984666:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127982818_127982979:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127982818_127982937:RABEPK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 127996046 A/G 1 121 124 245 57.5009545589294 65.0734019396095 -7.57244738068011 A:G A G 10 0.52478549951298 0.337986536797645 ENSG00000136933:ENST00000259460:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127995967_127996271:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127995967_127996334:RABEPK HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 128001463 A/G 1 562 505 1067 267.070549273705 265.016677254055 2.05387201965033 A:G A G 10 0.52478549951298 0.902466840510036 ENSG00000044574:ENST00000324460:exon_128001220_128001610:HSPA5 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130206762 C/T 1 9 3 12 4.27693050438318 1.57435649853894 2.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.151927999276565 ENSG00000196152:ENST00000342483:exon_130206308_130207651:ZNF79 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130210946 A/G 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G A G 10 0.52478549951298 1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130241758 G/A 1 13 8 21 6.17778850633126 4.19828399610384 1.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 0.513297365553358 ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130241662_130241784:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130241662_130241784:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130241662_130241784:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130241662_130241784:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000498513:exon_130241662_130241784:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130241665_130241784:LRSAM1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130509439 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130509426_130509550:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130509426_130509550:SH2D3C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130513469 A/G 1 16 9 25 7.60343200779232 4.72306949561682 2.8803625121755 A:G A G 10 0.52478549951298 0.317499389351278 ENSG00000095370:ENST00000373277:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000420366:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373276:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000373274:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000393724:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000429553:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000471939:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000440630:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000464239:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000488685:exon_130513451_130513579:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000414380:exon_130513451_130513579:SH2D3C HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130572046 G/A 1 11 6 17 5.22735950535722 3.14871299707788 2.07864650827934 A:G G A 10 0.52478549951298 0.342452264543965 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488506:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000489522:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000467826:exon_130571963_130572113:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000473536:exon_130571963_130572113:FPGS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130575554 G/A 1 42 45 87 19.9590090204548 23.6153474780841 -3.65633845762926 A:G G A 10 0.52478549951298 0.453684795578281 ENSG00000136877:ENST00000373247:exon_130575474_130576343:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373245:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000393706:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373244:exon_130575474_130576556:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373228:exon_130575474_130575703:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000460181:exon_130575474_130576337:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000373225:exon_130575474_130576338:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000488506:exon_130575474_130575563:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000467826:exon_130575474_130575602:FPGS;ENSG00000136877:ENST00000475270:exon_130575474_130575853:FPGS HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130674861 G/A 1 32 25 57 15.2068640155846 13.1196374878245 2.08722652776014 A:G G A 10 0.52478549951298 0.598604585441619 ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130674666_130674959:ST6GALNAC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130925911 A/C 1 168 179 347 79.8360360818194 93.9366044128234 -14.1005683310041 A:C A C 10 0.52478549951298 0.132559476140951 ENSG00000171159:ENST00000372994:exon_130925722_130926207:C9orf16;ENSG00000171159:ENST00000492588:exon_130925722_130926169:C9orf16;ENSG00000171159:ENST00000486420:exon_130925722_130926016:C9orf16 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130941451 C/T 1 21 23 44 9.97950451022742 12.0700664887985 -2.09056197857112 T:C C T 10 0.52478549951298 0.549204734734899 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130941352_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130941268_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130941352_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130941245_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130941268_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130940988_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130941241_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130941330_130941694:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130941396_130941694:CIZ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 130943027 C/T 1 8 8 16 3.80171600389616 4.19828399610384 -0.396567992207681 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000148337:ENST00000372954:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000393608:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325721:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000357558:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372948:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372941:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000277465:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000372938:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000415526:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476727:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000325669:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000476239:exon_130943000_130943077:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000488559:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000467178:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000494497:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000491954:exon_130943000_130943078:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000469029:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000498156:exon_130943000_130943093:CIZ1;ENSG00000148337:ENST00000324544:exon_130943000_130943093:CIZ1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131285588 A/G 1 15 12 27 7.1282175073053 6.29742599415576 0.830791513149538 A:G A G 10 0.52478549951298 0.848083276492106 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285559_131285619:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285559_131285619:GLE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131285955 A/G 1 4 7 11 1.90085800194808 3.67349849659086 -1.77264049464278 A:G A G 10 0.52478549951298 0.369865862456948 ENSG00000119392:ENST00000309971:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000372770:exon_131285871_131286125:GLE1;ENSG00000119392:ENST00000494417:exon_131285927_131286125:GLE1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131346218 A/C 1 5 11 16 2.3760725024351 5.77264049464278 -3.39656799220768 A:C A C 10 0.52478549951298 0.131078346897670 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131346067_131346248:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131346067_131346248:SPTAN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131360750 C/T 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372721:exon_131360679_131360783:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000475367:exon_131360679_131360783:SPTAN1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131397479 G/A 1 28 32 60 13.3060060136366 16.7931359844154 -3.4871299707788 A:G G A 10 0.52478549951298 0.369586013189469 ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131550655 A/G 0 31 0 31 14.7316495150976 0 14.7316495150976 A A 10 0.52478549951298 2.18287736846876e-09 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131550613_131550686:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000475097:exon_131550613_131550686:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000466056:exon_131550613_131550686:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131550613_131550686:TBC1D13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131570178 T/C 1 2 6 8 0.95042900097404 3.14871299707788 -2.19828399610384 T:C T C 10 0.52478549951298 0.161813021072665 ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 131767668 A/C 1 38 22 60 18.0581510185068 11.5452809892856 6.5128700292212 A:C A C 10 0.52478549951298 0.0946793405093407 ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131767582_131767809:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131767582_131767809:NUP188 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 132402908 C/G 1 6 3 9 2.85128700292212 1.57435649853894 1.27693050438318 C:G C G 10 0.52478549951298 0.512632475268894 ENSG00000148331:ENST00000277458:exon_132402820_132403001:ASB6;ENSG00000148331:ENST00000277459:exon_132402820_132403001:ASB6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 132638424 C/T 1 5 12 17 2.3760725024351 6.29742599415576 -3.92135349172066 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0863681007898384 ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132638409_132638517:USP20;ENSG00000136878:ENST00000496927:exon_132638409_132638517:USP20 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 132662786 C/T 1 82 89 171 38.9675890399356 46.7059094566552 -7.73832041671958 T:C C T 10 0.52478549951298 0.251031912055149 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 132719648 A/G 1 102 74 176 48.471879049676 38.8341269639605 9.63775208571551 A:G A G 10 0.52478549951298 0.152021670152049 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132719639_132719743:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132719639_132719743:FNBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 132720770 A/G 1 78 53 131 37.0667310379876 27.8136314741879 9.25309956379962 A:G A G 10 0.52478549951298 0.115355141873475 ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 133738320 G/A 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133738150_133738422:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133738150_133738422:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133738150_133738422:ABL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 133760029 C/G 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 C:G C G 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000097007:ENST00000372348:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000438426:exon_133759356_133761070:ABL1;ENSG00000097007:ENST00000318560:exon_133759356_133763062:ABL1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134020092 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134019667_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000530863:exon_134019955_134020141:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000525980:exon_134020089_134020141:NUP214 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134136719 G/A 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000126882:ENST00000247295:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372269:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000372271:exon_134133463_134136737:FAM78A;ENSG00000126882:ENST00000464831:exon_134136176_134136737:FAM78A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134350323 C/G 1 4 5 9 1.90085800194808 2.6239274975649 -0.72306949561682 C:G C G 10 0.52478549951298 0.744236590087582 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134350458 C/T 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134349841_134351922:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134349841_134351922:BAT2L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134361485 G/A 1 9 6 15 4.27693050438318 3.14871299707788 1.1282175073053 A:G G A 10 0.52478549951298 0.613945050704295 ENSG00000130723:ENST00000405995:exon_134361472_134361569:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000357304:exon_134361472_134361569:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000458550:exon_134361472_134361569:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000418650:exon_134361472_134361569:BAT2L1;ENSG00000130723:ENST00000372249:exon_134361472_134361569:BAT2L1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134386744 T/C 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C T C 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134386724_134386854:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134386724_134386859:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134386724_134386855:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134400392 C/A 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:C C A 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134400125_134400608:UCK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134400417 C/G 1 2 8 10 0.95042900097404 4.19828399610384 -3.2478549951298 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0552360781716721 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134399188_134400608:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134400125_134400608:UCK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 134401335 C/T 1 4 9 13 1.90085800194808 4.72306949561682 -2.82221149366874 T:C C T 10 0.52478549951298 0.164460108368148 ENSG00000130717:ENST00000372215:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372208:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000491309:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372211:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000372210:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000484876:exon_134401316_134401546:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000494584:exon_134401316_134401364:UCK1;ENSG00000130717:ENST00000459858:exon_134401332_134401364:UCK1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 135470281 C/T 1 24 15 39 11.4051480116885 7.8717824926947 3.53336551899378 T:C C T 10 0.52478549951298 0.267155005184894 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135468384_135470499:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135469676_135470499:DDX31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 135521303 C/T 1 7 3 10 3.32650150340914 1.57435649853894 1.7521450048702 T:C C T 10 0.52478549951298 0.349777433560672 ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 137726831 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137726817_137727050:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000371820:exon_137726817_137727050:COL5A1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 138395969 A/G 1 137 145 282 65.1043865667217 76.0938974293821 -10.9895108626604 A:T:G A G 10 0.52478549951298 0.190314647400171 ENSG00000122140:ENST00000371785:exon_138395388_138396519:MRPS2;ENSG00000122140:ENST00000241600:exon_138395388_138396516:MRPS2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 138838116 A/G 1 28 29 57 13.3060060136366 15.2187794858764 -1.91277347223986 A:G A G 10 0.52478549951298 0.69115021808619 ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138838115_138838217:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000471163:exon_138838115_138838217:UBAC1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139100961 C/T 1 2 7 9 0.95042900097404 3.67349849659086 -2.72306949561682 T:C C T 10 0.52478549951298 0.095403535700739 ENSG00000165661:ENST00000358701:exon_139098179_139101121:QSOX2;ENSG00000165661:ENST00000389471:exon_139098185_139101121:QSOX2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139256471 G/A 1 13 22 35 6.17778850633126 11.5452809892856 -5.3674924829543 A:G G A 10 0.52478549951298 0.089442093634637 ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139272058 A/G 1 29 24 53 13.7812205141236 12.5948519883115 1.18636852581206 A:G A G 10 0.52478549951298 0.784483011355785 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139272281 A/C 1 20 10 30 9.5042900097404 5.2478549951298 4.2564350146106 A:C A C 10 0.52478549951298 0.144072345239142 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139272502 T/C 1 9 10 19 4.27693050438318 5.2478549951298 -0.97092449074662 T:C T C 10 0.52478549951298 0.819118572752427 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139275294 G/C 1 4 4 8 1.90085800194808 2.09914199805192 -0.19828399610384 C:G G C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139275192_139275302:SNAPC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139278095 C/T 1 5 3 8 2.3760725024351 1.57435649853894 0.80171600389616 T:C C T 10 0.52478549951298 0.729240264038274 ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139277638_139278120:SNAPC4 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139298593 A/G 1 11 7 18 5.22735950535722 3.67349849659086 1.55386100876636 A:G A G 10 0.52478549951298 0.490446391716001 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139301729 C/T 1 16 8 24 7.60343200779232 4.19828399610384 3.40514801168848 T:C C T 10 0.52478549951298 0.219795277052229 ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139342076 C/A 1 23 12 35 10.9299335112015 6.29742599415576 4.6325075170457 A:C C A 10 0.52478549951298 0.129589682882794 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313084:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000433860:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139342021_139342132:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398335:exon_139340916_139343790:SEC16A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139369062 C/T 1 6 6 12 2.85128700292212 3.14871299707788 -0.297425994155761 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139390958 T/C 1 8 4 12 3.80171600389616 2.09914199805192 1.70257400584424 T:C T C 10 0.52478549951298 0.394790355049041 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139390982 C/T 1 3 8 11 1.42564350146106 4.19828399610384 -2.77264049464278 T:C C T 10 0.52478549951298 0.131021194723772 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139391200 C/T 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:C C T 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139391414 A/G 1 5 6 11 2.3760725024351 3.14871299707788 -0.772640494642781 A:G A G 10 0.52478549951298 0.766126317290971 ENSG00000148400:ENST00000277541:exon_139388896_139392010:NOTCH1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139733769 C/T 0 189 0 189 89.8155405920468 0 89.8155405920468 C C 10 0.52478549951298 1.86079818767250e-53 ENSG00000196642:ENST00000371663:exon_139733674_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000484471:exon_139733766_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000311502:exon_139733674_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000464941:exon_139733766_139733938:C9orf86;ENSG00000196642:ENST00000435930:exon_139733674_139733938:C9orf86 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139743890 T/C 1 93 111 204 44.1949485452929 58.2511904459408 -14.0562419006479 T:C T C 10 0.52478549951298 0.0498577411993069 ENSG00000054148:ENST00000371661:exon_139743563_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000492540:exon_139743543_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000247665:exon_139743546_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000462205:exon_139743877_139744042:PHPT1;ENSG00000054148:ENST00000497413:exon_139743878_139744042:PHPT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139820421 G/A 1 17 19 36 8.07864650827934 9.97092449074662 -1.89227798246728 A:G G A 10 0.52478549951298 0.617415799777466 ENSG00000127191:ENST00000247668:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000359662:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000432785:exon_139820135_139821059:TRAF2;ENSG00000127191:ENST00000371645:exon_139820135_139821059:TRAF2 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139990825 C/T 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139990689_139990843:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139990689_139990843:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139990689_139990843:MAN1B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 139996016 A/G 1 2 12 14 0.95042900097404 6.29742599415576 -5.34699699318172 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00546065207010748 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139995936_139996124:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139995936_139997762:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139995936_139996124:MAN1B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 140001180 A/G 1 13 13 26 6.17778850633126 6.82221149366874 -0.644422987337482 A:G A G 10 0.52478549951298 0.846079846003371 ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000392853:exon_140001141_140001261:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000480100:exon_140001141_140001261:MAN1B1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 140006425 C/G 1 167 116 283 79.3608215813323 60.8751179435057 18.4857036378266 C:G C G 10 0.52478549951298 0.027753633856889 ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006393_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006325_140006481:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000488415:exon_140006360_140006481:DPP7 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 140099675 G/A 1 29 27 56 13.7812205141236 14.1692084868505 -0.387987972726883 A:G G A 10 0.52478549951298 1 ENSG00000187713:ENST00000343666:exon_140098537_140100090:TMEM203 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 140167022 G/A 1 27 31 58 12.8307915131495 16.2683504849024 -3.43755897175284 A:G G A 10 0.52478549951298 0.430512177361458 ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140166959_140167067:COBRA1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 140262426 C/T 1 8 10 18 3.80171600389616 5.2478549951298 -1.44613899123364 T:C C T 10 0.52478549951298 0.638292165920428 ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000490886:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000479452:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487613:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000460390:exon_140262388_140262441:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000475006:exon_140262017_140262441:EXD3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . 9 140638461 T/C 1 11 9 20 5.22735950535722 4.72306949561682 0.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000181090:ENST00000462484:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000428019:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371400:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000334856:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000460843:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000371394:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000298728:exon_140638354_140638542:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000495657:exon_140638354_140638471:EHMT1;ENSG00000181090:ENST00000478940:exon_140638354_140638542:EHMT1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 200860 T/C 1 8 7 15 3.80171600389616 3.67349849659086 0.128217507305299 T:C T C 10 0.52478549951298 1 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 200951 G/A 1 11 8 19 5.22735950535722 4.19828399610384 1.02907550925338 A:G G A 10 0.52478549951298 0.655323122655948 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000445062:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000429181:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000443019:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_200834_200981:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_200401_200981:PLCXD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 207362 C/T 1 3 16 19 1.42564350146106 8.39656799220768 -6.97092449074662 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00187235082218356 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000484611:exon_207315_207459:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000430923:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000415337:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000447472:exon_207315_207443:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000448477:exon_207315_207424:PLCXD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 216003 C/T 1 10 17 27 4.7521450048702 8.92135349172066 -4.16920848685046 T:C C T 10 0.52478549951298 0.124575605577622 ENSG00000182378:ENST00000399012:exon_215764_220020:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381663:exon_215764_216059:PLCXD1;ENSG00000182378:ENST00000381657:exon_215764_220023:PLCXD1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 221705 G/A 1 124 94 218 58.9265980603905 49.3298369542201 9.59676110617036 A:G G A 10 0.52478549951298 0.198191061892724 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 221795 C/G 1 84 49 133 39.9180180409097 25.714489476136 14.2035285647737 C:G C G 10 0.52478549951298 0.0148607462140337 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 224036 G/A 1 57 50 107 27.0872265277601 26.239274975649 0.847951552111134 A:G G A 10 0.52478549951298 0.92299532612252 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_224027_224179:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_224027_224179:GTPBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 228149 G/C 1 40 30 70 19.0085800194808 15.7435649853894 3.2650150340914 C:G G C 10 0.52478549951298 0.473829250427001 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_228086_228294:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_228086_228294:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_228086_228294:GTPBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 229493 G/A 1 13 22 35 6.17778850633126 11.5452809892856 -5.3674924829543 A:G G A 10 0.52478549951298 0.089442093634637 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 229542 G/A 1 12 17 29 5.70257400584424 8.92135349172066 -3.21877948587642 A:G G A 10 0.52478549951298 0.266653493804166 ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 295079 C/T 1 24 2 26 11.4051480116885 1.04957099902596 10.3555770126625 T:C C T 10 0.52478549951298 3.08621587517220e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 295132 T/C 1 19 1 20 9.02907550925338 0.52478549951298 8.5042900097404 T:C T C 10 0.52478549951298 5.59283159650697e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 295135 G/A 1 20 1 21 9.5042900097404 0.52478549951298 8.97950451022742 A:G G A 10 0.52478549951298 3.03292979288891e-05 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 295231 A/G 1 27 2 29 12.8307915131495 1.04957099902596 11.7812205141236 A:G A G 10 0.52478549951298 5.05233426250576e-06 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 295243 G/A 1 30 3 33 14.2564350146106 1.57435649853894 12.6820785160717 A:G G A 10 0.52478549951298 4.09253604577576e-06 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_294698_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000479438:exon_294970_295252:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_294974_299445:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_294974_295252:PPP2R3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 306267 C/T 1 6 16 22 2.85128700292212 8.39656799220768 -5.54528098928556 T:C C T 10 0.52478549951298 0.0192803544957794 ENSG00000167393:ENST00000390665:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477110:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000361450:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000468169:exon_306251_306364:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000484364:exon_306251_306361:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000477636:exon_306251_306407:PPP2R3B;ENSG00000167393:ENST00000445792:exon_305631_306407:PPP2R3B HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1471102 C/T 1 43 49 92 20.4342235209419 25.714489476136 -5.28026595519416 T:C C T 10 0.52478549951298 0.296950347030934 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1470993_1471125:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1470993_1471125:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000432757:exon_1470993_1471125:IL3RA HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1497644 G/C 1 62 80 142 29.4632990301952 41.9828399610384 -12.5195409308432 C:G G C 10 0.52478549951298 0.0359426246729395 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1501298 G/T 1 93 118 211 44.1949485452929 61.9246889425316 -17.7297403972388 T:G G T 10 0.52478549951298 0.0157300046772254 ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1501284_1501578:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1501284_1501581:IL3RA HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1508147 G/A 1 1009 833 1842 479.491430991403 437.146321094312 42.3451098970908 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0500177138471931 ENSG00000169100:ENST00000381401:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000475167:exon_1508134_1508620:SLC25A6;ENSG00000169100:ENST00000484026:exon_1508134_1508620:SLC25A6 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1531648 C/T 1 27 61 88 12.8307915131495 32.0119154702918 -19.1811239571422 T:C C T 10 0.52478549951298 4.11916798136882e-05 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1536984 C/T 1 39 5 44 18.5333655189938 2.6239274975649 15.9094380214289 T:C C T 10 0.52478549951298 4.54484623393878e-07 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1536866_1537009:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1536866_1537009:ASMTL HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1537953 C/T 1 21 4 25 9.97950451022742 2.09914199805192 7.8803625121755 T:C C T 10 0.52478549951298 0.00196326067844487 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1546842 A/G 1 47 19 66 22.3350815228899 9.97092449074662 12.3641570321433 A:G A G 10 0.52478549951298 0.00281170657028579 ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1584447 G/T 1 7 5 12 3.32650150340914 2.6239274975649 0.70257400584424 T:G G T 10 0.52478549951298 0.777719669388738 ENSG00000182162:ENST00000381297:exon_1581465_1585475:P2RY8 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1713021 C/T 1 18 16 34 8.55386100876636 8.39656799220768 0.157293016558679 T:C C T 10 0.52478549951298 1 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 1719897 C/G 1 13 15 28 6.17778850633126 7.8717824926947 -1.69399398636344 C:G C G 10 0.52478549951298 0.573269193038738 ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 2139187 G/A 1 8 15 23 3.80171600389616 7.8717824926947 -4.07006648879854 A:G G A 10 0.52478549951298 0.0980805846777547 ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 2408437 G/A 1 6 4 10 2.85128700292212 2.09914199805192 0.752145004870199 A:G G A 10 0.52478549951298 0.756915037831226 ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 15474147 C/T 1 22 24 46 10.4547190107144 12.5948519883115 -2.14013297759708 T:C C T 10 0.52478549951298 0.55728167840293 ENSG00000087842:ENST00000380420:exon_15473971_15474177:PIR;ENSG00000087842:ENST00000380421:exon_15473971_15474177:PIR;ENSG00000087842:ENST00000476381:exon_15473971_15474177:PIR HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 70470347 C/T 0 10 0 10 4.7521450048702 0 4.7521450048702 C C 10 0.52478549951298 0.00217157993432381 ENSG00000147130:ENST00000373998:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000314425:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000353904:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000412202:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000431634:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373988:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373984:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000489332:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373982:exon_70470282_70470576:ZMYM3;ENSG00000147130:ENST00000373981:exon_70470282_70470576:ZMYM3 HGDP01036_parsed_pileup.txt . X 149931202 A/G 1 7 6 13 3.32650150340914 3.14871299707788 0.177788506331259 A:G A G 10 0.52478549951298 1 ENSG00000063601:ENST00000485376:exon_149931038_149931210:MTMR1;ENSG00000063601:ENST00000370390:exon_149931038_149931210:MTMR1;ENSG00000063601:ENST00000445323:exon_149931038_149933575:MTMR1