INDIVIDUAL	RSID	CHR	POS	ALLELES	BOTH_ALLELES_SEEN	REF_COUNT	NONREF_COUNT	TOTAL_COUNT	WEIGHTED_REF_COUNT	WEIGHTED_NONREF_COUNT	WRC_MINUS_WNC	ALLELES_SEEN	REF_ALLELE	ALT_ALLELE	MAQ_FILTER	REF_RATIO	PVALUE	EXON_INFO
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	900397	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000187961:ENST00000338591:exon_900343_901095:KLHL17;ENSG00000187961:ENST00000473277:exon_900343_901095:KLHL17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	948921	T/C	1	458	645	1103	218.688169557525	337.022119291258	-118.333949733732	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1.16170998158605e-12	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_948803_948956:ISG15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	949654	A/G	1	412	719	1131	196.723855584499	375.688222899867	-178.964367315368	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1.21090888179092e-26	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	949696	C/T	1	479	245	724	228.715356371298	128.016153839315	100.699202531984	T:C	C	T	10	0.522514913629857	3.99788107163259e-14	ENSG00000187608:ENST00000379389:exon_949364_949920:ISG15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	981931	A/G	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_981777_982115:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_981777_982115:AGRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	982994	T/C	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000478677:exon_982855_983067:AGRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	983006	C/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000466223:exon_982953_983067:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000478677:exon_982855_983067:AGRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	986737	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000188157:ENST00000379370:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000379364:exon_986633_986749:AGRN;ENSG00000188157:ENST00000419249:exon_986633_986749:AGRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1164031	A/G	1	64	46	110	30.5590455276892	24.0356860269734	6.52335950071573	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.216492913741487	ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1164072	C/T	1	60	36	96	28.6491051822086	18.8105368906749	9.83856829153373	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0517883176007311	ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1164090	T/C	1	57	27	84	27.2166499230981	14.1079026680061	13.108747255092	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00434955815829311	ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1164179	G/A	1	51	34	85	24.3517394048773	17.7655070634151	6.58623234146215	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.159442799877136	ENSG00000078808:ENST00000360001:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000465727:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000263741:exon_1163848_1164326:SDF4;ENSG00000078808:ENST00000459994:exon_1163848_1164326:SDF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1262262	C/T	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000224051:ENST00000343938:exon_1262216_1262412:GLTPD1;ENSG00000224051:ENST00000488011:exon_1262216_1262412:GLTPD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1309707	C/A	1	393	326	719	187.651638943466	170.339861843333	17.3117771001328	A:T:C	C	A	10	0.522514913629857	0.204360786119489	ENSG00000175756:ENST00000338370:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000338338:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000321751:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000378853:exon_1309380_1309825:AURKAIP1;ENSG00000175756:ENST00000489799:exon_1309624_1310170:AURKAIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1342612	G/C	1	339	377	716	161.867444279478	196.988122438456	-35.1206781589776	A:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.00881234680106953	ENSG00000242485:ENST00000344843:exon_1342511_1342693:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000487659:exon_1342511_1342648:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000482352:exon_1342511_1342670:MRPL20;ENSG00000242485:ENST00000477686:exon_1342511_1342615:MRPL20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1421579	T/C	1	10	1	11	4.77485086370143	0.522514913629857	4.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0125953210255273	ENSG00000160072:ENST00000360489:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000378737:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000308647:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000472194:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000401951:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000485748:exon_1421490_1421615:ATAD3B;ENSG00000160072:ENST00000474481:exon_1421162_1421615:ATAD3B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1469472	G/C	1	58	24	82	27.6941350094683	12.5403579271166	15.1537770823517	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.000823231931969816	ENSG00000197785:ENST00000378756:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378759:exon_1469306_1470064:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000378755:exon_1469306_1470065:ATAD3A;ENSG00000197785:ENST00000339113:exon_1469306_1470065:ATAD3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1551927	T/C	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000197530:ENST00000520777:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000355826:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000518681:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000505820:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000479659:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000489635:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378710:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000360522:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357210:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000357882:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000452516:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000511502:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000477990:exon_1551888_1554590:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000514363:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000487053:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000502470:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000378712:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507082:exon_1551888_1553278:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000463492:exon_1551888_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000510793:exon_1551654_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000504599:exon_1551690_1551994:MIB2;ENSG00000197530:ENST00000507229:exon_1551691_1551994:MIB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	1685616	C/T	1	40	38	78	19.0994034548057	19.8555667179346	-0.756163263128851	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.909966489005425	ENSG00000008130:ENST00000341426:exon_1685490_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000341991:exon_1685490_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000378625:exon_1685490_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000344463:exon_1685490_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000342348:exon_1685490_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000160596:exon_1685490_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000469045:exon_1685500_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000480499:exon_1685602_1685822:NADK;ENSG00000008130:ENST00000497747:exon_1685604_1685647:NADK;ENSG00000008130:ENST00000477235:exon_1685610_1685647:NADK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	2121118	C/T	1	19	35	54	9.07221664103272	18.288021977045	-9.21580533601228	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.0137869632199812	ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2120987_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2120990_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2121008_2121220:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2121019_2121220:C1orf86
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	2125172	G/A	1	94	84	178	44.8835981187934	43.891252744908	0.992345373885449	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.940219817531344	ENSG00000162585:ENST00000469733:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000428120:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000414253:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378558:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400919:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000400918:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000359030:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378543:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378546:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000401813:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000487186:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000378545:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000476803:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000440825:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000420515:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000449008:exon_2125078_2125349:C1orf86;ENSG00000162585:ENST00000497675:exon_2124864_2125349:C1orf86
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	2338169	A/T	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000157911:ENST00000288774:exon_2338159_2338394:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000447513:exon_2338159_2338334:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000507596:exon_2338159_2338334:PEX10;ENSG00000157911:ENST00000510434:exon_2338159_2338334:PEX10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	3697700	G/A	1	45	32	77	21.4868288866564	16.7204772361554	4.76635165050101	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.305318518883665	ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3696784_3697900:LRRC47;ENSG00000130764:ENST00000462356:exon_3697699_3697900:LRRC47
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	3701663	T/C	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130764:ENST00000378251:exon_3701651_3701767:LRRC47
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	3806623	C/T	1	51	41	92	24.3517394048773	21.4231114588241	2.92862794605315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.602107456634809	ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3805689_3806637:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3805689_3806637:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3805689_3806637:C1orf174
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	3806624	G/A	1	41	51	92	19.5768885411759	26.6482605951227	-7.07137205394685	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.145137451948754	ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3805689_3806637:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3805689_3806637:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3805689_3806637:C1orf174
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	3807344	C/T	1	18	33	51	8.59473155466257	17.2429921497853	-8.64826059512271	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0169224924283434	ENSG00000198912:ENST00000361605:exon_3807133_3807621:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000474140:exon_3807133_3809560:C1orf174;ENSG00000198912:ENST00000486765:exon_3807133_3807621:C1orf174
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	6157387	C/T	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6157329_6157417:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6157329_6157417:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000458166:exon_6157329_6157591:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6157329_6157417:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6157329_6157417:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6157329_6157417:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6157329_6157417:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6157329_6157417:KCNAB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	6158562	A/G	1	11	16	27	5.25233595007157	8.36023861807771	-3.10790266800614	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.252313956365784	ENSG00000069424:ENST00000378097:exon_6158545_6161253:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378092:exon_6158545_6158634:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000341524:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000352527:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000164247:exon_6158545_6161239:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000378083:exon_6158545_6160523:KCNAB2;ENSG00000069424:ENST00000481789:exon_6158545_6158870:KCNAB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	6649277	T/C	1	19	14	33	9.07221664103272	7.315208790818	1.75700785021472	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.603348110946097	ENSG00000204859:ENST00000377674:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000482360:exon_6648976_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000498342:exon_6648120_6649340:ZBTB48;ENSG00000204859:ENST00000466941:exon_6648976_6649340:ZBTB48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	6693097	A/G	1	37	27	64	17.6669481956953	14.1079026680061	3.55904552768915	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.384347784937895	ENSG00000041988:ENST00000054650:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000307896:exon_6692856_6693428:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000400912:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000484669:exon_6692856_6693625:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000487819:exon_6692856_6693181:THAP3;ENSG00000041988:ENST00000472925:exon_6692451_6693111:THAP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	8421434	C/T	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	ENSG00000142599:ENST00000337907:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000377464:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000440864:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000476556:exon_8420172_8421550:RERE;ENSG00000142599:ENST00000400908:exon_8420172_8421550:RERE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	9129620	C/T	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000142583:ENST00000377424:exon_9129563_9129775:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000456780:exon_9129563_9129887:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000377414:exon_9129563_9129663:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000474145:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000484798:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000479813:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000486632:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000487835:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000464985:exon_9129563_9129653:SLC2A5;ENSG00000142583:ENST00000473209:exon_9129563_9129653:SLC2A5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	9416127	C/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000171621:ENST00000328089:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000450402:exon_9415802_9416556:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000357898:exon_9415802_9416644:SPSB1;ENSG00000171621:ENST00000377399:exon_9415766_9416644:SPSB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	9776575	A/G	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000171608:ENST00000377346:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000361110:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000360563:exon_9776498_9776677:PIK3CD;ENSG00000171608:ENST00000479223:exon_9776334_9776677:PIK3CD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	9804558	C/T	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	9804697	C/T	1	18	6	24	8.59473155466257	3.13508948177914	5.45964207288343	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0387356274734953	ENSG00000171603:ENST00000377298:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000361311:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000435891:exon_9804453_9804701:CLSTN1;ENSG00000171603:ENST00000377288:exon_9804453_9804701:CLSTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	10221260	C/G	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130939:ENST00000253251:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000377157:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000343090:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000414346:exon_10221200_10221344:UBE4B;ENSG00000130939:ENST00000488228:exon_10221200_10221344:UBE4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	10463146	G/T	1	79	81	160	37.7213218232413	42.3237080040184	-4.60238618077712	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.477222448558797	ENSG00000142657:ENST00000491493:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000377062:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000477958:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10463128_10463193:PGD;ENSG00000142657:ENST00000465632:exon_10463128_10463193:PGD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	10473196	C/T	1	99	74	173	47.2710235506442	38.6661036086094	8.60491994203473	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.196438896958213	ENSG00000142657:ENST00000490057:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000270776:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000483936:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000460189:exon_10473119_10473308:PGD;ENSG00000142657:ENST00000493288:exon_10472891_10473308:PGD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	11114940	G/T	1	517	489	1006	246.859789653364	255.509792765	-8.65000311163615	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.591696985257041	ENSG00000116649:ENST00000475189:exon_11114641_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000376957:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000489073:exon_11114646_11114942:SRM;ENSG00000116649:ENST00000490101:exon_11114721_11115141:SRM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	11141187	C/G	1	30	24	54	14.3245525911043	12.5403579271166	1.78419466398772	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.683800171013328	ENSG00000171824:ENST00000376936:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000304457:exon_11141139_11141295:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000474216:exon_11141139_11141274:EXOSC10;ENSG00000171824:ENST00000485606:exon_11141139_11141295:EXOSC10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	11733791	T/C	1	51	48	99	24.3517394048773	25.0807158542331	-0.728976449355844	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.920029324633255	ENSG00000116663:ENST00000376749:exon_11733672_11734407:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000376753:exon_11733672_11734411:FBXO6;ENSG00000116663:ENST00000449067:exon_11733672_11734087:FBXO6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	12034805	T/C	1	45	42	87	21.4868288866564	21.945626372454	-0.458797485797561	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000083444:ENST00000196061:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000414311:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376369:exon_12034710_12035595:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000376383:exon_12034710_12035594:PLOD1;ENSG00000083444:ENST00000481933:exon_12034710_12035593:PLOD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	12065841	C/T	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000116688:ENST00000444836:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000235329:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376337:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000413450:exon_12065768_12065988:MFN2;ENSG00000116688:ENST00000376320:exon_12065768_12065988:MFN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	12089836	C/T	1	34	73	107	16.2344929365849	38.1435886949796	-21.9090957583947	T:C	C	T	10	0.522514913629857	2.50865957587353e-05	ENSG00000116691:ENST00000235332:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000478749:exon_12089822_12089912:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000436478:exon_12089822_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000498685:exon_12089280_12089951:MIIP;ENSG00000116691:ENST00000460823:exon_12089822_12089951:MIIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	12089973	A/G	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000116691:ENST00000466860:exon_12089280_12090181:MIIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	12248942	A/G	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12248853_12248952:TNFRSF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	12252955	T/G	1	19	23	42	9.07221664103272	12.0178430134867	-2.945626372454	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.440353997983177	ENSG00000028137:ENST00000376259:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000492361:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000400863:exon_12252920_12253155:TNFRSF1B;ENSG00000028137:ENST00000489921:exon_12252920_12253065:TNFRSF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	14106066	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	14106463	A/G	1	4	11	15	1.90994034548057	5.74766404992843	-3.83772370444786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.067798617844541	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	14108712	C/T	1	15	21	36	7.16227629555214	10.972813186227	-3.81053689067485	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.243311756234342	ENSG00000116731:ENST00000235372:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000311066:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400803:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400800:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400801:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000400802:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000470057:exon_14107414_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000413440:exon_14104913_14109326:PRDM2;ENSG00000116731:ENST00000343137:exon_14104913_14109326:PRDM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	16056364	G/A	1	7	14	21	3.342395604591	7.315208790818	-3.972813186227	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.124250428299143	ENSG00000116786:ENST00000420314:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375799:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000375793:exon_16056292_16056424:PLEKHM2;ENSG00000116786:ENST00000477849:exon_16056340_16056424:PLEKHM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	16258802	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000065526:ENST00000375759:exon_16254586_16262761:SPEN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	16271260	G/A	1	22	16	38	10.5046719001431	8.36023861807771	2.14443328206543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51961273920649	ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16271192_16271334:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16271192_16271334:ZBTB17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	16272250	A/G	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000116809:ENST00000375743:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375733:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000444654:exon_16272210_16272339:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000375729:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000448462:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000492834:exon_16272210_16272579:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000490899:exon_16272210_16272335:ZBTB17;ENSG00000116809:ENST00000464719:exon_16272216_16272335:ZBTB17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	17313391	G/C	1	50	22	72	23.8742543185071	11.4953280998569	12.3789262186503	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0043071019900607	ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17313300_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17312958_17313451:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17313300_17313451:ATP13A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	17314702	C/T	1	22	24	46	10.5046719001431	12.5403579271166	-2.03568602697342	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.558777865256432	ENSG00000159363:ENST00000326735:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000341676:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000452699:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000466561:exon_17314633_17314729:ATP13A2;ENSG00000159363:ENST00000502418:exon_17314633_17314729:ATP13A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19200988	G/A	1	1	7	8	0.477485086370143	3.657604395409	-3.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0319124571059794	ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19200957_19201075:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19200957_19201075:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19200957_19201075:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19200957_19201075:ALDH4A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19201919	T/C	1	4	13	17	1.90994034548057	6.79269387718814	-4.88275353170757	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0261093209804776	ENSG00000255275:ENST00000494072:exon_19201876_19201997:RP13-279N23.2;ENSG00000159423:ENST00000290597:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375341:exon_19201876_19201997:ALDH4A1;ENSG00000159423:ENST00000375335:exon_19201876_19201997:ALDH4A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19413261	T/A	1	38	8	46	18.1444332820654	4.18011930903886	13.9643139730266	A:T	T	A	10	0.522514913629857	2.27917560501782e-05	ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19413173_19413315:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19413173_19413315:UBR4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19415304	C/T	1	71	15	86	33.9014411322801	7.83772370444786	26.0637174278323	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	6.61866264850771e-09	ENSG00000127481:ENST00000375254:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375267:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375226:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375217:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000429347:exon_19415253_19415471:UBR4;ENSG00000127481:ENST00000375224:exon_19415253_19415471:UBR4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19566875	G/A	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000127463:ENST00000477853:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375199:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375208:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000375184:exon_19566791_19566940:KIAA0090;ENSG00000127463:ENST00000467423:exon_19566791_19567198:KIAA0090
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19584004	G/A	1	56	35	91	26.739164836728	18.288021977045	8.45114285968301	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0926284720404227	ENSG00000053372:ENST00000330263:exon_19583948_19584015:MRTO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19634747	C/T	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634652_19634756:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634233_19634756:AKR7A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19634964	C/G	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000053371:ENST00000235835:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000424403:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000330072:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000489286:exon_19634949_19635136:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000481966:exon_19634949_19634999:AKR7A2;ENSG00000053371:ENST00000492217:exon_19634949_19635136:AKR7A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19665998	G/A	1	880	831	1711	420.186876005726	434.209893226411	-14.0230172206853	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.498141626261666	ENSG00000077549:ENST00000264203:exon_19665270_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375144:exon_19665273_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401084:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375145:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000401082:exon_19665274_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000375142:exon_19665317_19666111:CAPZB;ENSG00000077549:ENST00000433834:exon_19665853_19666111:CAPZB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	19950062	T/C	1	114	147	261	54.4332998461963	76.809692303589	-22.3763924573927	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00630572651674338	ENSG00000173436:ENST00000486890:exon_19949968_19950284:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000322753:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000467029:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000481464:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000498642:exon_19949968_19950077:C1orf151;ENSG00000173436:ENST00000485362:exon_19949968_19950077:C1orf151
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	20975741	C/T	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	20977000	A/C	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	20977043	G/A	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000158828:ENST00000321556:exon_20976927_20978004:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000492302:exon_20976927_20977809:PINK1;ENSG00000158828:ENST00000400490:exon_20976927_20978003:PINK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	20980231	G/A	1	39	43	82	18.6219183684356	22.4681412860839	-3.84622291764828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.439440982999854	ENSG00000244038:ENST00000375048:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000415136:exon_20980120_20980267:DDOST;ENSG00000244038:ENST00000486473:exon_20979991_20980267:DDOST
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	21180139	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000075151:ENST00000264211:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400422:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000400415:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374935:exon_21180053_21180170:EIF4G3;ENSG00000075151:ENST00000374937:exon_21180053_21180170:EIF4G3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	21564690	G/A	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000117298:ENST00000415912:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374894:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000357071:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000374893:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000436918:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000264205:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000526194:exon_21564627_21564737:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000470394:exon_21564627_21564843:ECE1;ENSG00000117298:ENST00000528294:exon_21564642_21564737:ECE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	22413335	T/C	1	46	212	258	21.9643139730266	110.77316168953	-88.8088477165031	T:C	T	C	10	0.522514913629857	3.74698361990249e-30	ENSG00000070831:ENST00000337517:exon_22413162_22413359:CDC42;ENSG00000070831:ENST00000400259:exon_22413162_22413359:CDC42;ENSG00000070831:ENST00000421089:exon_22413162_22413359:CDC42;ENSG00000070831:ENST00000344548:exon_22413162_22413359:CDC42;ENSG00000070831:ENST00000315554:exon_22413162_22413359:CDC42;ENSG00000070831:ENST00000498236:exon_22413162_22413359:CDC42
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	23419261	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	23419383	C/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	23419855	T/C	1	4	12	16	1.90994034548057	6.27017896355828	-4.36023861807771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0423648285451732	ENSG00000169641:ENST00000374623:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000418342:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000302291:exon_23417683_23420873:LUZP1;ENSG00000169641:ENST00000314174:exon_23417683_23420873:LUZP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	23885893	C/T	1	148	145	293	70.6677927827812	75.7646624763293	-5.0968696935481	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.559149755082068	ENSG00000117318:ENST00000374561:exon_23885618_23886285:ID3;ENSG00000117318:ENST00000486541:exon_23885618_23885934:ID3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24077554	T/C	1	16	23	39	7.63976138192229	12.0178430134867	-4.37808163156442	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.19940878139177	ENSG00000011007:ENST00000418390:exon_24077335_24078520:TCEB3;ENSG00000011007:ENST00000374536:exon_24077335_24078520:TCEB3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24194505	C/T	1	6	11	17	2.86491051822086	5.74766404992843	-2.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.224428896708456	ENSG00000179163:ENST00000374479:exon_24194388_24194784:FUCA1;ENSG00000179163:ENST00000374475:exon_24194501_24194776:FUCA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24200969	T/C	1	23	3	26	10.9821569865133	1.56754474088957	9.41461224562372	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000123999049477398	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201094	G/C	1	24	3	27	11.4596420728834	1.56754474088957	9.89209733199386	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.000125667247722969	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201109	C/T	1	19	3	22	9.07221664103272	1.56754474088957	7.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00107353922133980	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201262	A/G	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201357	A/G	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201448	C/T	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201643	G/A	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201919	T/C	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24201920	T/C	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000188822:ENST00000374472:exon_24197016_24202152:CNR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	24746043	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000001461:ENST00000374399:exon_24745781_24746130:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000003912:exon_24745781_24746130:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000488155:exon_24745781_24746618:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000358028:exon_24745781_24746130:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000339255:exon_24745781_24746130:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000389489:exon_24746038_24746130:NIPAL3;ENSG00000001461:ENST00000428131:exon_24746038_24746130:NIPAL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	25551509	T/C	1	117	121	238	55.8657551053067	63.2243045492127	-7.35854944390597	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.363755304934162	ENSG00000117614:ENST00000236273:exon_25551493_25551591:SYF2;ENSG00000117614:ENST00000354361:exon_25551493_25551591:SYF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	25571666	A/G	1	13	6	19	6.20730612281186	3.13508948177914	3.07221664103272	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.175231089618151	ENSG00000117616:ENST00000498238:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000243189:exon_25571641_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000473314:exon_25571641_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000417642:exon_25570041_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000475766:exon_25571641_25571792:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000491378:exon_25571641_25571699:C1orf63;ENSG00000117616:ENST00000431849:exon_25571641_25571792:C1orf63
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	26152835	C/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000117640:ENST00000424294:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000336146:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374303:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000432144:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000533762:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000529116:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000474295:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000488327:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000472643:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526894:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000478284:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000524618:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374307:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000528624:exon_26152793_26152891:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000525713:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374301:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000464008:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000526158:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000530599:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000374300:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000466284:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000531361:exon_26152793_26152902:FAM54B;ENSG00000117640:ENST00000497956:exon_26152123_26153317:FAM54B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	26189404	C/A	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000182749:ENST00000374296:exon_26187701_26190352:PAQR7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	26190321	C/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000182749:ENST00000374296:exon_26187701_26190352:PAQR7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	26609259	C/T	1	20	16	36	9.54970172740286	8.36023861807771	1.18946310932515	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.740680249875467	ENSG00000158062:ENST00000314675:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000472155:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374223:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000475591:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000357089:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000494942:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374221:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374222:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000374217:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000389235:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000436301:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000496466:exon_26609140_26609280:UBXN11;ENSG00000158062:ENST00000486658:exon_26609140_26609280:UBXN11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	26900735	C/G	1	134	125	259	63.9830015735992	65.3143642037321	-1.33136263013296	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.901045817391521	ENSG00000117676:ENST00000374168:exon_26900570_26901516:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374166:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000526792:exon_26900570_26900922:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000530003:exon_26900570_26901505:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374163:exon_26900570_26901521:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000531382:exon_26900570_26900767:RPS6KA1;ENSG00000117676:ENST00000374162:exon_26900570_26901520:RPS6KA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	27100870	C/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000117713:ENST00000324856:exon_27100820_27101711:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000374152:exon_27100820_27101711:ARID1A;ENSG00000117713:ENST00000430799:exon_27100820_27101711:ARID1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	27268079	A/G	1	189	223	412	90.244681323957	116.520825739458	-26.2761444155011	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0102705526404916	ENSG00000090273:ENST00000435827:exon_27267948_27268151:NUDC;ENSG00000090273:ENST00000321265:exon_27267948_27268151:NUDC;ENSG00000090273:ENST00000452707:exon_27267948_27268151:NUDC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	27269463	G/A	1	223	189	412	106.479174260542	98.755318676043	7.72385558449891	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.459683245577788	ENSG00000090273:ENST00000321265:exon_27269362_27269556:NUDC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	27679797	A/G	1	17	6	23	8.11724646829243	3.13508948177914	4.98215698651329	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0578951905981726	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	27679954	G/A	1	46	15	61	21.9643139730266	7.83772370444786	14.1265902685787	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000271959218734555	ENSG00000142765:ENST00000318074:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000483926:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000494895:exon_27679555_27680421:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000490170:exon_27679774_27679979:SYTL1;ENSG00000142765:ENST00000475199:exon_27677963_27679979:SYTL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	31215364	T/C	1	94	85	179	44.8835981187934	44.4137676585379	0.469830460255587	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162511:ENST00000294507:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000424259:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000464569:exon_31215303_31215396:LAPTM5;ENSG00000162511:ENST00000476492:exon_31214536_31215396:LAPTM5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	31532267	T/C	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000134644:ENST00000424085:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000257075:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373747:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373749:exon_31532077_31532413:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000423018:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525843:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000426105:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000440538:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373741:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000373742:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000526215:exon_31532146_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000525948:exon_31532146_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000480602:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000524516:exon_31532051_31532424:PUM1;ENSG00000134644:ENST00000531867:exon_31532126_31532424:PUM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	31901869	C/T	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000168528:ENST00000373710:exon_31901825_31901915:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000373709:exon_31901825_31901915:SERINC2;ENSG00000168528:ENST00000491976:exon_31901825_31901915:SERINC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	32096265	A/G	1	81	122	203	38.6762919959816	63.7468194628426	-25.070527466861	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000543554315470902	ENSG00000162517:ENST00000373703:exon_32095463_32096443:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000461006:exon_32095941_32096333:PEF1;ENSG00000162517:ENST00000478502:exon_32096050_32096443:PEF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	32479836	G/A	1	24	31	55	11.4596420728834	16.1979623225256	-4.73832024964214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.225172802884380	ENSG00000121774:ENST00000327300:exon_32479430_32479978:KHDRBS1;ENSG00000121774:ENST00000484270:exon_32479779_32479978:KHDRBS1;ENSG00000121774:ENST00000307714:exon_32479527_32479978:KHDRBS1;ENSG00000121774:ENST00000492989:exon_32479597_32479978:KHDRBS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	32568149	C/T	1	65	67	132	31.0365306140593	35.0084992132004	-3.97196859914113	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.542095630269786	ENSG00000121775:ENST00000487305:exon_32568032_32568464:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000336294:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000456834:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373633:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000373634:exon_32568032_32568462:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000441402:exon_32568032_32568467:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000468135:exon_32568032_32568467:TMEM39B;ENSG00000121775:ENST00000476968:exon_32568032_32568467:TMEM39B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	32669457	A/G	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	33138261	A/G	1	67	86	153	31.9915007867996	44.9362825721677	-12.9447817853681	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0427110248216866	ENSG00000162521:ENST00000414241:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373493:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000492348:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000373485:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000458695:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000475321:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000463378:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000460669:exon_33138243_33138300:RBBP4;ENSG00000162521:ENST00000482190:exon_33138243_33138300:RBBP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	33246707	T/A	1	95	82	177	45.3610832051636	42.8462229176483	2.5148602875153	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.763540564807759	ENSG00000134684:ENST00000469100:exon_33246649_33247704:YARS;ENSG00000134684:ENST00000373477:exon_33246649_33246746:YARS;ENSG00000134684:ENST00000487404:exon_33246649_33246746:YARS;ENSG00000134684:ENST00000478828:exon_33246649_33246746:YARS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	35320690	T/G	1	14	15	29	6.684791209182	7.83772370444786	-1.15293249526585	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.712753772206145	ENSG00000163866:ENST00000521580:exon_35319391_35321583:C1orf212;ENSG00000163866:ENST00000446026:exon_35320651_35321583:C1orf212
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	35452986	C/T	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000163867:ENST00000493328:exon_35451766_35455912:ZMYM6;ENSG00000163867:ENST00000357182:exon_35452581_35454536:ZMYM6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	35864571	A/G	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000146463:ENST00000314607:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000373297:exon_35864465_35864644:ZMYM4;ENSG00000146463:ENST00000457946:exon_35864465_35864644:ZMYM4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36029419	A/G	1	18	19	37	8.59473155466257	9.92778335896728	-1.33305180430471	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.742850160021987	ENSG00000020129:ENST00000373253:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000356090:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000373243:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000397922:exon_36029368_36029510:NCDN;ENSG00000020129:ENST00000423723:exon_36029368_36029510:NCDN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36225948	T/C	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000092853:ENST00000251195:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000318121:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000373220:exon_36225943_36226517:CLSPN;ENSG00000092853:ENST00000520551:exon_36225943_36226517:CLSPN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36557619	G/A	1	30	33	63	14.3245525911043	17.2429921497853	-2.91843955868099	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.52870118560547	ENSG00000116863:ENST00000373178:exon_36557511_36557695:ADPRHL2;ENSG00000116863:ENST00000468594:exon_36557511_36557695:ADPRHL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36605336	C/T	1	35	23	58	16.711978022955	12.0178430134867	4.69413500946829	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.23820097770696	ENSG00000054116:ENST00000373166:exon_36605321_36605420:TRAPPC3;ENSG00000054116:ENST00000462715:exon_36605321_36605420:TRAPPC3;ENSG00000054116:ENST00000373163:exon_36605321_36605420:TRAPPC3;ENSG00000054116:ENST00000373162:exon_36605321_36605420:TRAPPC3;ENSG00000054116:ENST00000373159:exon_36605321_36605420:TRAPPC3;ENSG00000054116:ENST00000455237:exon_36605321_36605420:TRAPPC3;ENSG00000054116:ENST00000497251:exon_36605000_36605420:TRAPPC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36752433	C/T	1	24	39	63	11.4596420728834	20.3780816315644	-8.91843955868099	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0312532804034593	ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36752687	A/G	1	34	28	62	16.2344929365849	14.630417581636	1.60407535494886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.704819979290967	ENSG00000054118:ENST00000354618:exon_36751969_36752871:THRAP3;ENSG00000054118:ENST00000469141:exon_36751969_36752871:THRAP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	36786303	A/G	1	13	15	28	6.20730612281186	7.83772370444786	-1.630417581636	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.574469279427906	ENSG00000214193:ENST00000505871:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000480549:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000426732:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000453908:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000312808:exon_36785276_36786399:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000508854:exon_36785276_36786352:C1orf113;ENSG00000214193:ENST00000474766:exon_36785641_36786399:C1orf113
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	38327982	G/T	1	63	45	108	30.081560441319	23.5131711133436	6.56838932797544	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.211955372259736	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38326369_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38327740_38328102:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38327757_38328102:INPP5B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	38338795	A/G	1	15	19	34	7.16227629555214	9.92778335896728	-2.76550706341514	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.392337552161461	ENSG00000204084:ENST00000373027:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373023:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373029:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000458109:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373026:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000373024:exon_38338602_38338837:INPP5B;ENSG00000204084:ENST00000474758:exon_38338602_38339059:INPP5B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	39919502	A/G	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000127603:ENST00000372915:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000361689:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000317713:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372900:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000372925:exon_39919379_39919522:MACF1;ENSG00000127603:ENST00000289893:exon_39919379_39919522:MACF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	40525111	T/C	1	31	37	68	14.8020376774744	19.3330518043047	-4.53101412683028	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.277418491805914	ENSG00000131236:ENST00000372797:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372802:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000449311:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000421589:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000414893:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000414281:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000420216:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372792:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372798:exon_40525006_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000340450:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372805:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000435719:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000430361:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000372794:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000427843:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000417287:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000424977:exon_40525009_40525130:CAP1;ENSG00000131236:ENST00000446031:exon_40525006_40525130:CAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	40705726	A/T	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000117000:ENST00000372771:exon_40701464_40706593:RLF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	41976217	G/A	1	33	39	72	15.7570078502147	20.3780816315644	-4.62107378134971	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.290068145887442	ENSG00000127124:ENST00000372584:exon_41972036_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000372583:exon_41972036_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000247584:exon_41975684_41976937:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000429157:exon_41975684_41976934:HIVEP3;ENSG00000127124:ENST00000460604:exon_41975901_41976937:HIVEP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	42657270	C/T	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000198815:ENST00000372573:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000372572:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361346:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000361776:exon_42656974_42657390:FOXJ3;ENSG00000198815:ENST00000445886:exon_42657077_42657390:FOXJ3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	43215930	C/T	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000117385:ENST00000460031:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000236040:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000495874:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000296388:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000431412:exon_43215857_43216007:LEPRE1;ENSG00000117385:ENST00000481465:exon_43215572_43216007:LEPRE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	43394887	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000117394:ENST00000426263:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000372501:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000397019:exon_43394881_43394985:SLC2A1;ENSG00000117394:ENST00000439722:exon_43394819_43394985:SLC2A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	43630156	A/C	1	329	387	716	157.092593415777	202.213271574755	-45.1206781589776	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.000754133032600604	ENSG00000117395:ENST00000236051:exon_43629855_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000431635:exon_43629993_43630164:EBNA1BP2;ENSG00000117395:ENST00000463906:exon_43630017_43630164:EBNA1BP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	43824865	C/T	1	65	58	123	31.0365306140593	30.3058649905317	0.730665623527589	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.928229042449996	ENSG00000117399:ENST00000310955:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000437896:exon_43824838_43825067:CDC20;ENSG00000117399:ENST00000372462:exon_43824684_43825067:CDC20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	44680474	A/G	1	34	33	67	16.2344929365849	17.2429921497853	-1.00849921320042	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.808231421307066	ENSG00000178028:ENST00000361745:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000446292:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372283:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000440641:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000436069:exon_44680375_44680552:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000437511:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000475794:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000471829:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000487922:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000315913:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372289:exon_44680375_44680570:DMAP1;ENSG00000178028:ENST00000372290:exon_44680375_44680570:DMAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	45110683	G/A	1	33	24	57	15.7570078502147	12.5403579271166	3.21664992309815	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.428032341451215	ENSG00000187147:ENST00000355387:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000416840:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000361799:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000453887:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372247:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000443020:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000372248:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000440132:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000335497:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474064:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000471494:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000444372:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000497469:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000475378:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000484745:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000474394:exon_45110667_45110753:RNF220;ENSG00000187147:ENST00000480686:exon_45110667_45110753:RNF220
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	45218895	A/T	1	5	12	17	2.38742543185071	6.27017896355828	-3.88275353170757	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.086732673121093	ENSG00000142945:ENST00000372222:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372224:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372218:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000455186:exon_45218804_45218926:KIF2C;ENSG00000142945:ENST00000372217:exon_45218804_45218926:KIF2C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	45469586	G/A	1	13	18	31	6.20730612281186	9.40526844533743	-3.19796232252557	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.283100228803222	ENSG00000126107:ENST00000372172:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000372168:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486132:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000443709:exon_45469527_45469608:HECTD3;ENSG00000126107:ENST00000486296:exon_45469527_45469608:HECTD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	45479354	G/A	1	67	61	128	31.9915007867996	31.8734097314213	0.118091055378301	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000126088:ENST00000246337:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491773:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000463092:exon_45478808_45479561:UROD;ENSG00000126088:ENST00000491300:exon_45479247_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000434478:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000494399:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372135:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000372139:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460334:exon_45479247_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000462688:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000490385:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000460906:exon_45479247_45479792:UROD;ENSG00000126088:ENST00000469548:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000486699:exon_45479247_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000478467:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000428106:exon_45479266_45479463:UROD;ENSG00000126088:ENST00000496439:exon_45479266_45479810:UROD;ENSG00000126088:ENST00000473012:exon_45479247_45479463:UROD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	45809220	C/T	1	30	46	76	14.3245525911043	24.0356860269734	-9.71113343586913	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0288522042845167	ENSG00000132773:ENST00000372090:exon_45808754_45809647:TOE1;ENSG00000132773:ENST00000495703:exon_45808754_45809636:TOE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	45973928	G/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000132763:ENST00000401061:exon_45973884_45974036:MMACHC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	46033822	G/A	1	209	166	375	99.7943830513599	86.7374756625563	13.0569073888036	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.179345316842997	ENSG00000117448:ENST00000372070:exon_46033654_46033849:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000476957:exon_46033654_46033849:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000351829:exon_46033654_46033849:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000419874:exon_46033654_46033849:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000497973:exon_46033654_46033849:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000473038:exon_46033221_46033849:AKR1A1;ENSG00000117448:ENST00000487654:exon_46033819_46033849:AKR1A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	46751629	G/A	1	39	32	71	18.6219183684356	16.7204772361554	1.90144113228015	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.721929274340279	ENSG00000132128:ENST00000343304:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000371972:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000472710:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000254454:exon_46751034_46752171:LRRC41;ENSG00000132128:ENST00000498402:exon_46750675_46752171:LRRC41
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	46810530	A/G	1	13	19	32	6.20730612281186	9.92778335896728	-3.72047723615543	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.216912579895035	ENSG00000117481:ENST00000474844:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000474062:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000307089:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000486270:exon_46810454_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000469918:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000471871:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000498008:exon_46810473_46810816:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000495427:exon_46810473_46810634:NSUN4;ENSG00000117481:ENST00000475281:exon_46810473_46811046:NSUN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	47717189	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000123473:ENST00000360380:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000337817:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000243182:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371874:exon_47715811_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000371877:exon_47715814_47717594:STIL;ENSG00000123473:ENST00000396221:exon_47716294_47717594:STIL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	47799639	G/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000162368:ENST00000371873:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000445601:exon_47799469_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371871:exon_47799481_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000471289:exon_47799551_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000450808:exon_47799586_47799788:CMPK1;ENSG00000162368:ENST00000371870:exon_47799613_47799788:CMPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	51826921	T/C	1	19	15	34	9.07221664103272	7.83772370444786	1.23449293658486	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.73314906239147	ENSG00000085832:ENST00000371730:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000371733:exon_51826843_51827027:EPS15;ENSG00000085832:ENST00000396122:exon_51826843_51827027:EPS15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	52498370	C/T	1	18	20	38	8.59473155466257	10.4502982725971	-1.85556671793457	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.62701847968266	ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	52498861	A/T	1	17	25	42	8.11724646829243	13.0628728407464	-4.945626372454	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.163751952752681	ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	52499362	C/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000198841:ENST00000371614:exon_52497775_52499488:KTI12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	52876825	C/T	1	29	21	50	13.8470675047341	10.972813186227	2.87425431850715	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.479800730804379	ENSG00000134748:ENST00000257181:exon_52876787_52876872:PRPF38A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	52991569	T/C	1	21	6	27	10.027186813773	3.13508948177914	6.89209733199386	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0108495881409158	ENSG00000134744:ENST00000257177:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371544:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000433200:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000528642:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000371541:exon_52991235_52991602:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000395916:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000473856:exon_52991235_52992045:ZCCHC11;ENSG00000134744:ENST00000355809:exon_52991235_52992045:ZCCHC11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	53676448	G/A	1	38	23	61	18.1444332820654	12.0178430134867	6.12659026857872	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.125120479506517	ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53675687_53676991:CPT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	53679229	A/G	1	21	35	56	10.027186813773	18.288021977045	-8.26083516327199	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0317913805295323	ENSG00000157184:ENST00000371486:exon_53678936_53679869:CPT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	53681699	T/G	1	29	27	56	13.8470675047341	14.1079026680061	-0.260835163271993	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162384:ENST00000294360:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000483739:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000470385:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000478839:exon_53681663_53681728:C1orf123;ENSG00000162384:ENST00000371480:exon_53681663_53681728:C1orf123
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	53716416	G/A	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000157193:ENST00000306052:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000529670:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000371454:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000465675:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000354412:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000480045:exon_53716362_53716534:LRP8;ENSG00000157193:ENST00000347547:exon_53716362_53716534:LRP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	54432019	G/A	1	27	22	49	12.8920973319939	11.4953280998569	1.39676923213701	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.77536358688429	ENSG00000116212:ENST00000371370:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000319223:exon_54431969_54432053:LRRC42;ENSG00000116212:ENST00000477905:exon_54431969_54432053:LRRC42
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	54681927	G/A	1	133	132	265	63.505516487229	68.9719685991411	-5.4664521119121	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.538687913748244	ENSG00000116221:ENST00000360840:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000336230:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000329505:exon_54681814_54682017:MRPL37;ENSG00000116221:ENST00000398219:exon_54681814_54682017:MRPL37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	55182300	T/A	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55182273_55182390:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55182273_55182390:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55182273_55182390:TTC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	55183212	A/G	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55183165_55183326:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55183165_55183326:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55183165_55183326:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55183165_55183326:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000486621:exon_55183165_55183440:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55183165_55183326:TTC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	55188382	C/T	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000184313:ENST00000414150:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000425300:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000184313:ENST00000460155:exon_55188348_55188472:C1orf175;ENSG00000243725:ENST00000371281:exon_55188348_55188472:TTC4;ENSG00000243725:ENST00000371284:exon_55188348_55188472:TTC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	62456014	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000132849:ENST00000371158:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484562:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000316485:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000459752:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000395513:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000371156:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000255202:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000484937:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000494842:exon_62455840_62456036:INADL;ENSG00000132849:ENST00000490547:exon_62455840_62456108:INADL;ENSG00000132849:ENST00000307297:exon_62455840_62456036:INADL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	64120039	G/A	1	35	26	61	16.711978022955	13.5853877543763	3.12659026857872	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.444438420111823	ENSG00000079739:ENST00000371084:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000371083:exon_64120003_64120137:PGM1;ENSG00000079739:ENST00000483707:exon_64120003_64120116:PGM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	65310489	T/C	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000162434:ENST00000342505:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000465376:exon_65310437_65310572:JAK1;ENSG00000162434:ENST00000471473:exon_65310437_65310572:JAK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	71538191	A/G	1	54	54	108	25.7841946639877	28.2158053360123	-2.43161067202456	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.700222060885507	ENSG00000132485:ENST00000370920:exon_71538155_71538231:ZRANB2;ENSG00000132485:ENST00000254821:exon_71538155_71538231:ZRANB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	75175886	T/C	1	27	20	47	12.8920973319939	10.4502982725971	2.44179905939672	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.559761908794632	ENSG00000116791:ENST00000340866:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370872:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000417775:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370871:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000370870:exon_75175782_75175931:CRYZ;ENSG00000116791:ENST00000441120:exon_75175793_75175931:CRYZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	78163080	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000077254:ENST00000370794:exon_78161672_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000481579:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000370793:exon_78161676_78163159:USP33;ENSG00000077254:ENST00000357428:exon_78161676_78163159:USP33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	79093818	A/G	1	17	94	111	8.11724646829243	49.1164018812066	-40.9991554129141	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1.13704733293005e-15	ENSG00000137959:ENST00000452835:exon_79093591_79093892:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79093591_79094078:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79091355_79094684:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79093670_79094078:IFI44L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	79095581	T/C	1	43	133	176	20.5318587139161	69.494483512771	-48.9626247988548	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	6.1172782961684e-14	ENSG00000137959:ENST00000476521:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000370751:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000342282:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000459784:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000476876:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000486882:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000462041:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000450498:exon_79095405_79095600:IFI44L;ENSG00000137959:ENST00000474002:exon_79095320_79095600:IFI44L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	85029067	C/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000117151:ENST00000477677:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370630:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000370625:exon_85028940_85029101:CTBS;ENSG00000117151:ENST00000465118:exon_85028940_85029101:CTBS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	85724328	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162642:ENST00000294661:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000471115:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000493514:exon_85724207_85724405:C1orf52;ENSG00000162642:ENST00000344356:exon_85724207_85724405:C1orf52
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	85742012	G/C	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000142867:ENST00000394761:exon_85741979_85742480:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000370580:exon_85741979_85742773:BCL10;ENSG00000142867:ENST00000271015:exon_85741979_85742479:BCL10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	86818572	T/C	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000122417:ENST00000370568:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000459999:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000359242:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000460698:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370567:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000370566:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000317336:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000394731:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000457680:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000462648:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000294678:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000441121:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000449149:exon_86818542_86818667:ODF2L;ENSG00000122417:ENST00000531412:exon_86818542_86818667:ODF2L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	89732194	T/C	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000154451:ENST00000481145:exon_89732029_89732262:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89732029_89732271:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89732029_89732271:GBP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	89733200	T/C	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000154451:ENST00000343435:exon_89733100_89733209:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000417291:exon_89733100_89733209:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000370459:exon_89733100_89733209:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000490568:exon_89733136_89733209:GBP5;ENSG00000154451:ENST00000443807:exon_89733100_89733209:GBP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	90486412	T/G	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162664:ENST00000394590:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000394583:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000340281:exon_90486351_90486481:ZNF326;ENSG00000162664:ENST00000370447:exon_90486351_90486481:ZNF326
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	91977475	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000097046:ENST00000430031:exon_91977338_91977480:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000370415:exon_91977338_91977480:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000234626:exon_91977338_91977480:CDC7;ENSG00000097046:ENST00000428239:exon_91977338_91977480:CDC7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	109472569	T/C	1	15	33	48	7.16227629555214	17.2429921497853	-10.0807158542331	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00370946690481827	ENSG00000121957:ENST00000406462:exon_109472323_109473044:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000264126:exon_109472323_109473043:GPSM2;ENSG00000121957:ENST00000369987:exon_109472323_109473043:GPSM2;ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109472130_109475123:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109472130_109475123:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369969:exon_109472130_109475123:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000415331:exon_109472130_109475123:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369968:exon_109472130_109475123:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109472130_109475123:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000473062:exon_109472561_109472826:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109472561_109474107:CLCC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	109486553	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486458_109486679:CLCC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	109486557	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000121940:ENST00000356970:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000423586:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369971:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369976:exon_109486458_109486679:CLCC1;ENSG00000121940:ENST00000369972:exon_109486458_109486679:CLCC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	109642836	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	109824315	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000134222:ENST00000369909:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369904:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409267:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369907:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000438534:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000492431:exon_109824241_109825041:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000409138:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000369903:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000429031:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000418914:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000474126:exon_109824241_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000459765:exon_109824026_109824682:PSRC1;ENSG00000134222:ENST00000471740:exon_109824241_109824682:PSRC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	109944718	A/G	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.595738343773533	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	110091282	C/T	1	6	14	20	2.86491051822086	7.315208790818	-4.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0707133729520549	ENSG00000065135:ENST00000369851:exon_110091233_110091460:GNAI3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	110173775	G/T	1	42	33	75	20.054373627546	17.2429921497853	2.81138147776073	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.564051675733287	ENSG00000116337:ENST00000342115:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000256578:exon_110173565_110174673:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393689:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000358729:exon_110173565_110174163:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000369840:exon_110173565_110174320:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528454:exon_110173565_110173839:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000393688:exon_110173565_110174671:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000476688:exon_110173565_110174190:AMPD2;ENSG00000116337:ENST00000528958:exon_110173565_110174122:AMPD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	110596569	G/A	1	38	33	71	18.1444332820654	17.2429921497853	0.901441132280151	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.905583684051009	ENSG00000143093:ENST00000369796:exon_110596287_110597261:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000369795:exon_110596287_110597263:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000485775:exon_110596287_110597263:FAM40A;ENSG00000143093:ENST00000473429:exon_110596287_110597424:FAM40A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	111730284	T/A	1	32	122	154	15.2795227638446	63.7468194628426	-48.467296698998	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1.95152638190148e-15	ENSG00000162777:ENST00000468692:exon_111729796_111730303:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000357640:exon_111729796_111730303:DENND2D;ENSG00000162777:ENST00000369752:exon_111729796_111730303:DENND2D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	111957245	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000085465:ENST00000369732:exon_111956936_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000369728:exon_111956938_111957966:OVGP1;ENSG00000085465:ENST00000434331:exon_111956938_111957966:OVGP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	111992095	C/T	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	111992143	C/G	1	35	41	76	16.711978022955	21.4231114588241	-4.71113343586913	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.302331484230467	ENSG00000116459:ENST00000493119:exon_111991817_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369722:exon_111991558_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000369721:exon_111992087_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000483994:exon_111992106_111992203:ATP5F1;ENSG00000116459:ENST00000468818:exon_111992107_111992203:ATP5F1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	112308953	T/C	1	12	18	30	5.72982103644172	9.40526844533743	-3.67544740889571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.202983319347204	ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	112308970	G/T	1	18	12	30	8.59473155466257	6.27017896355828	2.32455259110429	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.466493121478826	ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	112308972	G/A	1	13	17	30	6.20730612281186	8.88275353170757	-2.67544740889571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.364098708761703	ENSG00000064703:ENST00000369702:exon_112308359_112310638:DDX20;ENSG00000064703:ENST00000475700:exon_112308359_112310196:DDX20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	113197203	A/G	1	28	23	51	13.369582418364	12.0178430134867	1.35173940487729	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.779789235512258	ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113197087_113197293:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113197087_113197293:CAPZA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	113202386	C/T	1	26	32	58	12.4146122456237	16.7204772361554	-4.30586499053171	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.293492778828356	ENSG00000116489:ENST00000263168:exon_113202323_113202401:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000393426:exon_113202323_113202401:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000476936:exon_113202323_113202401:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000498626:exon_113202323_113202401:CAPZA1;ENSG00000116489:ENST00000466066:exon_113201951_113202401:CAPZA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	113239068	G/C	1	20	13	33	9.54970172740286	6.79269387718814	2.75700785021472	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.385870755329217	ENSG00000155363:ENST00000413052:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369648:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369645:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000369644:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000496577:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000468624:exon_113239059_113239156:MOV10;ENSG00000155363:ENST00000357443:exon_113239059_113239156:MOV10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	114253086	C/T	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000116793:ENST00000474926:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000412670:exon_114252876_114253097:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114252876_114253097:PHTF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	114254637	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000116793:ENST00000474926:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369597:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369596:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000393357:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000431577:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369598:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369600:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000369604:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000357783:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000418893:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000412670:exon_114254562_114254735:PHTF1;ENSG00000116793:ENST00000447664:exon_114254562_114254735:PHTF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	114380395	T/C	1	5	16	21	2.38742543185071	8.36023861807771	-5.972813186227	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0141812305096880	ENSG00000134242:ENST00000359785:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000528414:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000532224:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000420377:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000525799:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000484147:exon_114380212_114381029:PTPN22;ENSG00000134242:ENST00000354605:exon_114380212_114381029:PTPN22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	114438951	A/G	1	15	21	36	7.16227629555214	10.972813186227	-3.81053689067485	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.243311756234342	ENSG00000134262:ENST00000369567:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369569:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000256658:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000369566:exon_114438880_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479285:exon_114437678_114439087:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000462591:exon_114438880_114440561:AP4B1;ENSG00000134262:ENST00000479801:exon_114438667_114439087:AP4B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	114973429	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000197323:ENST00000358465:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000450349:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000369543:exon_114973420_114973534:TRIM33;ENSG00000197323:ENST00000448034:exon_114973420_114973534:TRIM33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	117113552	T/C	1	29	25	54	13.8470675047341	13.0628728407464	0.784194663987721	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.892036586206937	ENSG00000116815:ENST00000369489:exon_117113525_117113661:CD58;ENSG00000116815:ENST00000464088:exon_117113525_117113606:CD58;ENSG00000116815:ENST00000457047:exon_117113525_117113648:CD58;ENSG00000116815:ENST00000235461:exon_117113525_117113661:CD58;ENSG00000116815:ENST00000369487:exon_117113525_117113661:CD58
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	117635507	T/C	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000116830:ENST00000369466:exon_117635353_117635523:TTF2;ENSG00000116830:ENST00000492682:exon_117635409_117635523:TTF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	117911090	C/G	1	17	10	27	8.11724646829243	5.22514913629857	2.89209733199386	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.336149290227447	ENSG00000198162:ENST00000356554:exon_117910071_117911107:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000369450:exon_117910071_117911107:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000413355:exon_117910085_117911107:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000329466:exon_117910286_117911107:MAN1A2;ENSG00000198162:ENST00000482811:exon_117910565_117911107:MAN1A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	144909956	G/A	0	0	8	8	0	4.18011930903886	-4.18011930903886	A	G	A	10	0.522514913629857	0.00270195736599125	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144909869_144909960:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144909869_144909960:PDE4DIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	144912233	C/T	0	9	0	9	4.29736577733129	0	4.29736577733129	C	C		10	0.522514913629857	0.00419341962025637	ENSG00000178104:ENST00000313382:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369354:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369356:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369353:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000530740:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369359:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000467859:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369351:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000369349:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000313431:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000529945:exon_144912130_144912294:PDE4DIP;ENSG00000178104:ENST00000479408:exon_144912130_144912294:PDE4DIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145103947	T/C	0	0	49	49	0	25.603230767863	-25.603230767863	C	T	C	10	0.522514913629857	1.85793605934093e-16	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145109549	G/T	0	0	28	28	0	14.630417581636	-14.630417581636	T	G	T	10	0.522514913629857	1.02535610632265e-09	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145109583	C/A	0	0	29	29	0	15.1529324952659	-15.1529324952659	A	C	A	10	0.522514913629857	4.89592248987624e-10	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145109661	G/A	0	63	0	63	30.081560441319	0	30.081560441319	G	G		10	0.522514913629857	2.15477528951815e-18	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145112414	T/C	0	0	41	41	0	21.4231114588241	-21.4231114588241	C	T	C	10	0.522514913629857	6.87625971721919e-14	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145112485	C/T	0	0	47	47	0	24.5582009406033	-24.5582009406033	T	C	T	10	0.522514913629857	8.14912802442425e-16	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	145460213	G/A	1	21	19	40	10.027186813773	9.92778335896728	0.099403454805719	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000121851:ENST00000369314:exon_145460097_145460263:POLR3GL;ENSG00000121851:ENST00000369313:exon_145460097_145460263:POLR3GL;ENSG00000121851:ENST00000471706:exon_145460097_145460263:POLR3GL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	150129593	G/A	1	197	178	375	94.0645620149182	93.0076546261145	1.05690738880362	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.917770625976058	ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000479194:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150129579_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150129566_150129680:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000485470:exon_150129211_150129680:PLEKHO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	150131342	G/A	1	403	419	822	192.426489807168	218.93374881091	-26.5072590037425	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0643406747608309	ENSG00000023902:ENST00000369126:exon_150131014_150131825:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000443480:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000025469:exon_150131014_150131790:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000369124:exon_150131014_150132260:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000466659:exon_150131014_150131823:PLEKHO1;ENSG00000023902:ENST00000441340:exon_150131014_150131519:PLEKHO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	150280550	G/A	1	469	534	1003	223.940505507597	279.022963878344	-55.0824583707466	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000504411092388844	ENSG00000187145:ENST00000309092:exon_150280482_150281414:MRPS21;ENSG00000187145:ENST00000369084:exon_150280482_150281414:MRPS21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	150460348	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000143374:ENST00000369054:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369064:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000438568:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369052:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369053:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000369051:exon_150460334_150460530:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000479372:exon_150460334_150461108:TARS2;ENSG00000143374:ENST00000467982:exon_150460346_150460530:TARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	150938616	G/A	1	53	45	98	25.3067095776176	23.5131711133436	1.79353846427401	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.762045040132473	ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150937649_150938764:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150937739_150938764:LASS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	150939318	G/A	1	21	26	47	10.027186813773	13.5853877543763	-3.55820094060328	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.310450497405497	ENSG00000143418:ENST00000482825:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368954:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000271688:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000345896:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496901:exon_150939232_150939427:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000460664:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000368949:exon_150939232_150939338:LASS2;ENSG00000143418:ENST00000496562:exon_150939272_150939678:LASS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151026815	C/T	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151209063	C/T	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000143398:ENST00000414290:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000349792:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000409426:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000441902:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368890:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000368888:exon_151209034_151209239:PIP5K1A;ENSG00000143398:ENST00000464105:exon_151209034_151209223:PIP5K1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151239051	T/C	1	505	467	972	241.129968616922	244.014464665143	-2.88449604822102	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.872470105632413	ENSG00000159352:ENST00000368884:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000368881:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000426273:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000418119:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000476855:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000445776:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000427779:exon_151238996_151239063:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000470396:exon_151238996_151239201:PSMD4;ENSG00000159352:ENST00000453615:exon_151239020_151239063:PSMD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151261920	C/T	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000143373:ENST00000336715:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000324048:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000368879:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000426871:exon_151261854_151262016:ZNF687;ENSG00000143373:ENST00000459919:exon_151261571_151262015:ZNF687
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151372131	G/A	1	111	57	168	53.0008445870859	29.7833500769019	23.217494510184	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000354584935046011	ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151372138	G/A	1	115	61	176	54.9107849325664	31.8734097314213	23.0373752011452	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000495338747022467	ENSG00000159377:ENST00000290541:exon_151372010_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372036_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000495805:exon_151372055_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372063_151372203:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372066_151372203:PSMB4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151373200	T/C	1	13	8	21	6.20730612281186	4.18011930903886	2.027186813773	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.393468965686283	ENSG00000159377:ENST00000495288:exon_151372918_151373528:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000476467:exon_151372457_151374382:PSMB4;ENSG00000159377:ENST00000493673:exon_151372918_151373831:PSMB4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151748920	T/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182134:ENST00000525790:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368827:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368825:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000440583:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368824:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368823:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000368822:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000458431:exon_151748915_151749075:TDRKH;ENSG00000182134:ENST00000526413:exon_151748915_151749075:TDRKH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	151867560	G/A	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000159445:ENST00000368814:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000471464:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000344296:exon_151867484_151867670:THEM4;ENSG00000159445:ENST00000489410:exon_151867306_151867670:THEM4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	152005146	G/C	1	221	323	544	105.524204087802	168.772317102444	-63.2481130146422	C:G	G	C	10	0.522514913629857	5.71690364701469e-08	ENSG00000163191:ENST00000271638:exon_152004982_152005299:S100A11;ENSG00000163191:ENST00000478109:exon_152004982_152005299:S100A11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	152882610	A/G	0	0	10	10	0	5.22514913629857	-5.22514913629857	G	A	G	10	0.522514913629857	0.000616024684608098	ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	152883608	G/A	1	1	8	9	0.477485086370143	4.18011930903886	-3.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0168997367977586	ENSG00000163207:ENST00000368764:exon_152882255_152884362:IVL;ENSG00000163207:ENST00000392667:exon_152882255_152884361:IVL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	153745128	G/C	1	60	58	118	28.6491051822086	30.3058649905317	-1.65675980832313	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.782708851125817	ENSG00000143624:ENST00000318967:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000428986:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000456435:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000435409:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000481797:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000512605:exon_153744816_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000476843:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000503133:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368670:exon_153745115_153745187:INTS3;ENSG00000143624:ENST00000368669:exon_153744816_153745187:INTS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	153920564	A/G	1	100	77	177	47.7485086370143	40.233648349499	7.5148602875153	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.260335664761170	ENSG00000160741:ENST00000303569:exon_153920145_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368630:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153920151_153920805:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153920154_153920805:CRTC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	153926078	T/C	1	9	12	21	4.29736577733129	6.27017896355828	-1.972813186227	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.513322230323649	ENSG00000160741:ENST00000461638:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000368633:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000487235:exon_153926014_153926082:CRTC2;ENSG00000160741:ENST00000476883:exon_153926014_153926082:CRTC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	153934813	T/C	1	30	27	57	14.3245525911043	14.1079026680061	0.216649923098149	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000143570:ENST00000356205:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000368623:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000368621:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000310483:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000429040:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000413622:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000417348:exon_153934696_153934826:SLC39A1;ENSG00000143570:ENST00000461071:exon_153934787_153934826:SLC39A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	154186406	C/T	1	78	53	131	37.2438367368712	27.6932904223824	9.55054631448873	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0972340551739388	ENSG00000143612:ENST00000350592:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368521:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368518:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000368516:exon_154186369_154186422:C1orf43;ENSG00000143612:ENST00000470180:exon_154186369_154186422:C1orf43
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	154744807	C/G	1	15	14	29	7.16227629555214	7.315208790818	-0.152932495265853	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000143603:ENST00000361147:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000271915:exon_154744451_154744869:KCNN3;ENSG00000143603:ENST00000358505:exon_154744451_154744869:KCNN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	154938662	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000160691:ENST00000368445:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000448116:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368449:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368453:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368450:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368443:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000532863:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368447:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000444664:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000368441:exon_154938638_154938707:SHC1;ENSG00000160691:ENST00000414115:exon_154938638_154938707:SHC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	154988957	A/G	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000160685:ENST00000368426:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000417934:exon_154988696_154990998:ZBTB7B;ENSG00000160685:ENST00000292176:exon_154988696_154989457:ZBTB7B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	155030557	A/C	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000143537:ENST00000527418:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000529473:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000526491:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000356955:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000449910:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000359280:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000360674:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368412:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000355956:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368410:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000271836:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000461564:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000368413:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000531455:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000447332:exon_155030327_155030631:ADAM15;ENSG00000143537:ENST00000472434:exon_155030327_155030631:ADAM15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	155230131	C/T	1	130	124	254	62.0730612281186	64.7918492901023	-2.71878806198369	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.753682331592214	ENSG00000116521:ENST00000302631:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000355379:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000472397:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000490999:exon_155230121_155230443:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000465312:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000462151:exon_155230121_155230241:SCAMP3;ENSG00000116521:ENST00000497470:exon_155230121_155230241:SCAMP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	155629982	C/T	1	105	103	208	50.135934068865	53.8190361038753	-3.68310203501026	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.627464915781627	ENSG00000163374:ENST00000359205:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000355499:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000311573:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000347088:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361831:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368340:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000295566:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000436865:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000354691:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000442834:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368330:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000407221:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000404643:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000361140:exon_155629237_155630704:YY1AP1;ENSG00000163374:ENST00000368339:exon_155629248_155630704:YY1AP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	155699032	G/T	1	62	65	127	29.6040753549489	33.9634693859407	-4.35939403099184	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.47757494938503	ENSG00000132676:ENST00000471214:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000368336:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000343043:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000421487:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000497826:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000463575:exon_155698999_155699082:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000479151:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000466384:exon_155698999_155699052:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000462978:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000477394:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000475056:exon_155698999_155699157:DAP3;ENSG00000132676:ENST00000490249:exon_155698999_155699157:DAP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	155735012	T/C	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000116580:ENST00000437809:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000368331:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000271883:exon_155734791_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000361040:exon_155734218_155736500:GON4L;ENSG00000116580:ENST00000471341:exon_155734575_155736500:GON4L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	156105028	T/C	1	225	186	411	107.434144433282	97.1877739351534	10.2463704981288	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.323555669593124	ENSG00000160789:ENST00000368301:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000347559:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000361308:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368300:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000292302:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392355:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368299:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000448611:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368297:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000473598:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000392353:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000515824:exon_156104978_156105199:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000496738:exon_156104978_156105103:LMNA;ENSG00000160789:ENST00000368298:exon_156104904_156105103:LMNA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	156450719	G/A	1	14	6	20	6.684791209182	3.13508948177914	3.54970172740286	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.122656047255994	ENSG00000116604:ENST00000348159:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000368240:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000360595:exon_156450626_156450763:MEF2D;ENSG00000116604:ENST00000475587:exon_156450626_156450763:MEF2D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	156707553	G/C	1	246	184	430	117.461331247055	96.1427441078937	21.3185871391615	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0425170491386540	ENSG00000143314:ENST00000478899:exon_156707438_156707568:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000361531:exon_156707438_156707568:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000368211:exon_156707438_156707568:MRPL24;ENSG00000143314:ENST00000434558:exon_156707438_156707568:MRPL24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	157494106	C/T	1	22	23	45	10.5046719001431	12.0178430134867	-1.51317111334357	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.657948717822165	ENSG00000143297:ENST00000361835:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000497286:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000356953:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368191:exon_157494069_157494347:FCRL5;ENSG00000143297:ENST00000368190:exon_157493601_157494347:FCRL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	158813819	A/G	1	55	68	123	26.2616797503579	35.5310141268303	-9.26933437647241	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.104142737215157	ENSG00000163563:ENST00000368141:exon_158813745_158813912:MNDA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	158984677	C/T	1	89	55	144	42.4961726869427	28.7383202496421	13.7578524373006	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0240678797680152	ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000426592:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000430894:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158984451_158984735:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158984451_158984735:IFI16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	158986477	G/C	1	130	176	306	62.0730612281186	91.9626247988548	-29.8895635707362	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.000711107128852504	ENSG00000163565:ENST00000359709:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000447473:exon_158986323_158986482:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368131:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000368132:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000493884:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000483916:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000340979:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000295809:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000392247:exon_158986323_158986490:IFI16;ENSG00000163565:ENST00000474473:exon_158986323_158986490:IFI16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	160719757	C/T	1	40	49	89	19.0994034548057	25.603230767863	-6.50382731305728	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.169692426533928	ENSG00000026751:ENST00000466792:exon_160719611_160719856:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368043:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000368042:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000435517:exon_160719611_160719922:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458602:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000458104:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000359331:exon_160719611_160719883:SLAMF7;ENSG00000026751:ENST00000495334:exon_160719611_160719883:SLAMF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	160788067	G/A	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000122224:ENST00000341032:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368041:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368040:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000263285:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000392203:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368037:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368036:exon_160788008_160788109:LY9;ENSG00000122224:ENST00000368035:exon_160788008_160788109:LY9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	160808796	G/A	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000122223:ENST00000368034:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368033:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000492063:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000322302:exon_160808729_160808839:CD244;ENSG00000122223:ENST00000481677:exon_160808610_160808955:CD244;ENSG00000122223:ENST00000368032:exon_160808729_160808839:CD244
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161013121	C/T	1	9	16	25	4.29736577733129	8.36023861807771	-4.06287284074643	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112791242289917	ENSG00000158773:ENST00000368020:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368021:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000442467:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000435396:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000368019:exon_161013058_161013149:USF1;ENSG00000158773:ENST00000473969:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000531842:exon_161013058_161013132:USF1;ENSG00000158773:ENST00000496363:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000491629:exon_161013058_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000534633:exon_161013043_161013150:USF1;ENSG00000158773:ENST00000529476:exon_161013058_161013150:USF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161017556	C/T	1	159	121	280	75.9201287328527	63.2243045492127	12.69582418364	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.134893962492031	ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161016738_161018145:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161019040	G/C	1	95	115	210	45.3610832051636	60.0892150674336	-14.72813186227	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0450552357779177	ENSG00000186517:ENST00000461003:exon_161016736_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368016:exon_161018779_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368013:exon_161016738_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368017:exon_161018962_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000368015:exon_161016739_161019124:ARHGAP30;ENSG00000186517:ENST00000490279:exon_161018580_161019124:ARHGAP30
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161126769	C/T	1	49	30	79	23.396769232137	15.6754474088957	7.7213218232413	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0911613993738533	ENSG00000143222:ENST00000467540:exon_161126740_161126807:UFC1;ENSG00000143222:ENST00000368003:exon_161126740_161126807:UFC1;ENSG00000143222:ENST00000483191:exon_161126740_161126807:UFC1;ENSG00000143222:ENST00000482672:exon_161126740_161127145:UFC1;ENSG00000143222:ENST00000473766:exon_161126740_161126807:UFC1;ENSG00000143222:ENST00000463735:exon_161126740_161126807:UFC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161337604	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161681087	A/G	1	29	25	54	13.8470675047341	13.0628728407464	0.784194663987721	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.892036586206937	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000465403:exon_161680998_161681262:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161681158	C/T	1	31	23	54	14.8020376774744	12.0178430134867	2.78419466398772	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.497049669611348	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000465403:exon_161680998_161681262:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000349527:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161680998_161681264:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161681780	A/G	1	68	68	136	32.4689858731697	35.5310141268303	-3.06202825366056	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.607621640639393	ENSG00000132185:ENST00000236938:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367959:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367957:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000309691:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000294796:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000367953:exon_161681724_161682008:FCRLA;ENSG00000132185:ENST00000470841:exon_161680998_161682008:FCRLA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161697149	G/T	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000162746:ENST00000367948:exon_161697037_161697933:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367946:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367945:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000336830:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000367944:exon_161697037_161697454:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000392158:exon_161697037_161697932:FCRLB;ENSG00000162746:ENST00000495397:exon_161697037_161697932:FCRLB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161721707	C/T	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161721656_161721774:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161721656_161721774:DUSP12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161722204	C/T	1	16	30	46	7.63976138192229	15.6754474088957	-8.03568602697342	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0184200581314368	ENSG00000081721:ENST00000484291:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000367943:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000464004:exon_161722158_161722254:DUSP12;ENSG00000081721:ENST00000463365:exon_161722189_161722254:DUSP12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	161821608	C/T	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000118217:ENST00000367942:exon_161821512_161821625:ATF6;ENSG00000118217:ENST00000476437:exon_161821512_161821625:ATF6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	162535963	A/G	1	14	6	20	6.684791209182	3.13508948177914	3.54970172740286	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.122656047255994	ENSG00000117143:ENST00000412525:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367926:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000271469:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000414807:exon_162535802_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367925:exon_162535827_162536138:UAP1;ENSG00000117143:ENST00000367924:exon_162535827_162536138:UAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	166827495	C/G	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000152382:ENST00000467021:exon_166827356_166827518:TADA1;ENSG00000152382:ENST00000367874:exon_166827356_166827518:TADA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	167893759	G/A	1	41	34	75	19.5768885411759	17.7655070634151	1.81138147776072	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.729333363736697	ENSG00000143158:ENST00000367846:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000271373:exon_167893735_167893775:BRP44;ENSG00000143158:ENST00000458574:exon_167893735_167893775:BRP44
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	168013847	A/G	1	25	26	51	11.9371271592536	13.5853877543763	-1.64826059512271	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.675833417721445	ENSG00000143164:ENST00000367843:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000324705:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000432587:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000312263:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367840:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000367839:exon_168013823_168013909:DCAF6;ENSG00000143164:ENST00000489398:exon_168013823_168013909:DCAF6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	169677709	A/G	1	12	17	29	5.72982103644172	8.88275353170757	-3.15293249526585	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.268082057749973	ENSG00000188404:ENST00000236147:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000463108:exon_169677558_169677944:SELL;ENSG00000188404:ENST00000479657:exon_169677558_169677781:SELL;ENSG00000188404:ENST00000466340:exon_169677558_169677944:SELL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	170521376	G/A	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000120370:ENST00000367763:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498166:exon_170521156_170522587:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000464798:exon_170521156_170522974:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000498600:exon_170521156_170522583:GORAB;ENSG00000120370:ENST00000475113:exon_170521156_170521417:GORAB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	171502136	T/C	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.82734324584336	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	171751236	T/C	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171751128_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171750836_171751260:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171750842_171751260:METTL13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	171755170	G/A	1	23	17	40	10.9821569865133	8.88275353170757	2.09940345480572	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.530810831784354	ENSG00000010165:ENST00000458517:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367738:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000485629:exon_171755027_171755220:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000362019:exon_171755019_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000367737:exon_171755027_171755218:METTL13;ENSG00000010165:ENST00000361735:exon_171755019_171755218:METTL13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	172411768	T/C	1	21	13	34	10.027186813773	6.79269387718814	3.23449293658486	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.30518358726519	ENSG00000135845:ENST00000344529:exon_172410597_172411970:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000367728:exon_172410597_172413226:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000258324:exon_172410598_172411993:PIGC;ENSG00000135845:ENST00000478184:exon_172411471_172411970:PIGC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	173833483	A/C	1	58	68	126	27.6941350094683	35.5310141268303	-7.83687911736198	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.180941827145994	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	173834011	T/C	1	16	22	38	7.63976138192229	11.4953280998569	-3.85556671793457	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.255810561867945	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	174188285	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000152061:ENST00000357444:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000367689:exon_174188263_174188322:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000251507:exon_174188263_174188433:RABGAP1L;ENSG00000152061:ENST00000457696:exon_174188263_174188433:RABGAP1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	175958578	T/C	1	17	10	27	8.11724646829243	5.22514913629857	2.89209733199386	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.336149290227447	ENSG00000143207:ENST00000461830:exon_175957424_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367667:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367669:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000314478:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367666:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000367665:exon_175958498_175958615:RFWD2;ENSG00000143207:ENST00000308769:exon_175958498_175958615:RFWD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	179319541	C/G	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000057252:ENST00000367619:exon_179319431_179319566:SOAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	181024404	G/A	1	28	17	45	13.369582418364	8.88275353170757	4.48682888665643	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.232221183098811	ENSG00000153029:ENST00000367580:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000282990:exon_181024361_181025689:MR1;ENSG00000153029:ENST00000367579:exon_181024361_181024659:MR1;ENSG00000153029:ENST00000438435:exon_181024361_181024420:MR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	181725110	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000198216:ENST00000367570:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000526775:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000360108:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367573:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000367567:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000358338:exon_181725092_181725229:CACNA1E;ENSG00000198216:ENST00000357570:exon_181725092_181725229:CACNA1E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	182569445	G/A	1	97	107	204	46.3160533779039	55.9090957583947	-9.59304238049083	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.183527171930516	ENSG00000143333:ENST00000367558:exon_182567758_182569648:RGS16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	182844020	C/T	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000135829:ENST00000367549:exon_182843989_182844089:DHX9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	183103848	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000135862:ENST00000258341:exon_183103795_183103944:LAMC1;ENSG00000135862:ENST00000495918:exon_183103825_183103944:LAMC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	184765072	A/G	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000135842:ENST00000367511:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000392012:exon_184760164_184765231:FAM129A;ENSG00000135842:ENST00000487074:exon_184763252_184765231:FAM129A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	185267208	A/G	1	60	45	105	28.6491051822086	23.5131711133436	5.13593406886501	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.329968136779483	ENSG00000116679:ENST00000367498:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000480769:exon_185265520_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000459929:exon_185266147_185267420:IVNS1ABP;ENSG00000116679:ENST00000475046:exon_185266903_185267420:IVNS1ABP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	192548229	G/T	1	15	10	25	7.16227629555214	5.22514913629857	1.93712715925357	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.549237439393986	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	192548245	C/T	1	12	17	29	5.72982103644172	8.88275353170757	-3.15293249526585	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.268082057749973	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	197071654	C/A	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000066279:ENST00000367409:exon_197069561_197074315:ASPM;ENSG00000066279:ENST00000367406:exon_197069561_197071777:ASPM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	200522495	A/G	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000118193:ENST00000367350:exon_200520628_200522895:KIF14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	201112981	A/G	1	34	41	75	16.2344929365849	21.4231114588241	-5.18861852223928	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.248685531921069	ENSG00000116857:ENST00000367334:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367332:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367330:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367329:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000367333:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000472411:exon_201112948_201114796:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000263947:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000421960:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000485839:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000495205:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000497582:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000455367:exon_201112948_201113079:TMEM9;ENSG00000116857:ENST00000435310:exon_201112948_201113079:TMEM9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	201437477	A/T	1	16	10	26	7.63976138192229	5.22514913629857	2.41461224562372	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.433312135919422	ENSG00000174307:ENST00000367311:exon_201437469_201438312:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000485436:exon_201437473_201437709:PHLDA3;ENSG00000174307:ENST00000367309:exon_201437469_201438076:PHLDA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	201934578	G/A	1	42	59	101	20.054373627546	30.8283799041616	-10.7740062766156	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0361470193550775	ENSG00000134375:ENST00000367287:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000478378:exon_201934561_201934671:TIMM17A;ENSG00000134375:ENST00000482943:exon_201934561_201934671:TIMM17A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	201969082	G/A	1	27	32	59	12.8920973319939	16.7204772361554	-3.82837990416157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.36215213835306	ENSG00000176393:ENST00000481780:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492587:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000447312:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000478617:exon_201969030_201969143:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000492849:exon_201969030_201969143:RNPEP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	201974712	G/C	1	63	53	116	30.081560441319	27.6932904223824	2.38827001893658	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.710322504775114	ENSG00000176393:ENST00000295640:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000367286:exon_201974686_201975275:RNPEP;ENSG00000176393:ENST00000471105:exon_201974686_201975275:RNPEP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	203148527	G/T	0	0	47	47	0	24.5582009406033	-24.5582009406033	T	G	T	10	0.522514913629857	8.14912802442425e-16	ENSG00000133048:ENST00000255409:exon_203148059_203148713:CHI3L1;ENSG00000133048:ENST00000473185:exon_203148059_203149005:CHI3L1;ENSG00000133048:ENST00000404436:exon_203148109_203148713:CHI3L1;ENSG00000133048:ENST00000478742:exon_203148262_203148713:CHI3L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	205589788	G/A	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000158711:ENST00000357992:exon_205589094_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000289703:exon_205588396_205589966:ELK4;ENSG00000158711:ENST00000468523:exon_205589742_205589966:ELK4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	205628428	C/G	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000158715:ENST00000460934:exon_205626979_205628799:SLC45A3;ENSG00000158715:ENST00000367145:exon_205626979_205628799:SLC45A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206647757	G/A	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206647674_206647814:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000463979:exon_206647674_206647814:IKBKE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206665052	C/T	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000143466:ENST00000367120:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000143466:ENST00000462698:exon_206664981_206665082:IKBKE;ENSG00000162888:ENST00000367119:exon_206664449_206666409:C1orf147
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206766975	T/C	1	229	176	405	109.344084778763	91.9626247988548	17.3814599799079	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0906991286819351	ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206767029	C/T	1	119	86	205	56.820725278047	44.9362825721677	11.8844427058793	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.107650489429465	ENSG00000143486:ENST00000367114:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206766968_206767142:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206766968_206767142:LGTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206776460	G/A	1	45	34	79	21.4868288866564	17.7655070634151	3.72132182324129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.431697824946396	ENSG00000143486:ENST00000271764:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000367111:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000437518:exon_206776305_206776558:LGTN;ENSG00000143486:ENST00000461334:exon_206776437_206776558:LGTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206821286	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000143479:ENST00000391931:exon_206820733_206822541:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367109:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367105:exon_206820733_206822538:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367108:exon_206820733_206822542:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000441486:exon_206820733_206821334:DYRK3;ENSG00000143479:ENST00000367106:exon_206820733_206822459:DYRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206905040	C/T	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	206905043	C/T	1	17	22	39	8.11724646829243	11.4953280998569	-3.37808163156442	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.336558687628760	ENSG00000162889:ENST00000294981:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000367103:exon_206904985_206905070:MAPKAPK2;ENSG00000162889:ENST00000479009:exon_206904633_206905070:MAPKAPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	207504467	G/C	1	18	20	38	8.59473155466257	10.4502982725971	-1.85556671793457	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.62701847968266	ENSG00000196352:ENST00000367064:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000367063:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000391921:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000488171:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000367065:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000391920:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000314754:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000482390:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000343420:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000367062:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000465534:exon_207504453_207504641:CD55;ENSG00000196352:ENST00000476590:exon_207504453_207504641:CD55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	207653364	A/G	1	39	14	53	18.6219183684356	7.315208790818	11.3067095776176	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00218499561473733	ENSG00000117322:ENST00000367058:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367057:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000367059:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000458541:exon_207653323_207653398:CR2;ENSG00000117322:ENST00000344994:exon_207653323_207653398:CR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	209933331	A/G	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000479796:exon_209933327_209933462:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	209933540	A/G	1	15	13	28	7.16227629555214	6.79269387718814	0.369582418364003	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000468672:exon_209933517_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209933327_209933549:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209933327_209933669:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209933327_209933729:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209933385_209933669:TRAF3IP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	209936914	C/T	1	24	17	41	11.4596420728834	8.88275353170757	2.57688854117586	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.439119018273155	ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000478359:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000458110:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209936837_209936932:TRAF3IP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	209950681	T/C	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	209950760	C/G	1	87	71	158	41.5412025142024	37.0985588677199	4.44264364648259	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.524226086850705	ENSG00000009790:ENST00000400959:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367025:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000341173:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000456166:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367026:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367024:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000010338:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000367023:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000476050:exon_209948694_209951518:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000474496:exon_209950697_209950766:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000477431:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3;ENSG00000009790:ENST00000488702:exon_209950697_209950832:TRAF3IP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	212273603	C/T	1	11	13	24	5.25233595007157	6.79269387718814	-1.54035792711657	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.547183126666461	ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	212273639	C/T	1	11	13	24	5.25233595007157	6.79269387718814	-1.54035792711657	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.547183126666461	ENSG00000143476:ENST00000366991:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000420235:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000475419:exon_212273594_212274426:DTL;ENSG00000143476:ENST00000489149:exon_212273594_212274042:DTL;ENSG00000143476:ENST00000463791:exon_212273594_212273768:DTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	212538572	C/T	1	31	28	59	14.8020376774744	14.630417581636	0.171620095838437	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000065600:ENST00000261455:exon_212537273_212538718:TMEM206
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	212619339	T/C	1	211	160	371	100.7493532241	83.6023861807771	17.146967043323	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0772873146912719	ENSG00000117691:ENST00000366988:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000479589:exon_212619172_212619714:NENF;ENSG00000117691:ENST00000473900:exon_212619172_212619714:NENF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214811244	C/G	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214811209_214811344:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214814354	C/T	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214813264_214816667:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214819420	C/T	1	22	17	39	10.5046719001431	8.88275353170757	1.62191836843558	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.6339344503811	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214819463	G/A	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214820457	A/C	1	14	14	28	6.684791209182	7.315208790818	-0.630417581635996	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.851639324049382	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214817900_214820743:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214828589	C/T	1	38	34	72	18.1444332820654	17.7655070634151	0.378926218650292	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214828584_214828746:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214828491_214828746:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	214830617	A/G	1	45	47	92	21.4868288866564	24.5582009406033	-3.07137205394685	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.532912167472699	ENSG00000117724:ENST00000366955:exon_214830276_214830752:CENPF;ENSG00000117724:ENST00000469862:exon_214830276_214830753:CENPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	218458753	C/T	0	12	0	12	5.72982103644172	0	5.72982103644172	C	C		10	0.522514913629857	0.000554624092109663	ENSG00000067533:ENST00000366932:exon_218458629_218458797:RRP15;ENSG00000067533:ENST00000491428:exon_218458684_218458797:RRP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	219384945	C/G	1	14	23	37	6.684791209182	12.0178430134867	-5.33305180430471	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.09901901360081	ENSG00000143353:ENST00000366928:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000460522:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000366927:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000477938:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000463964:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000483635:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000474379:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000469590:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000475724:exon_219384834_219386207:LYPLAL1;ENSG00000143353:ENST00000481007:exon_219384834_219385169:LYPLAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	220298664	A/G	1	17	14	31	8.11724646829243	7.315208790818	0.802037677474432	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.858133848975486	ENSG00000067704:ENST00000366922:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000302637:exon_220298579_220298681:IARS2;ENSG00000067704:ENST00000490891:exon_220298579_220298681:IARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	221912361	T/C	1	21	13	34	10.027186813773	6.79269387718814	3.23449293658486	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.30518358726519	ENSG00000143507:ENST00000366899:exon_221912276_221913129:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000418487:exon_221912276_221912783:DUSP10;ENSG00000143507:ENST00000323825:exon_221912276_221913129:DUSP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	224377560	A/G	1	38	15	53	18.1444332820654	7.83772370444786	10.3067095776176	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00548269545428210	ENSG00000143753:ENST00000415210:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000323699:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000391877:exon_224377279_224378021:DEGS1;ENSG00000143753:ENST00000465848:exon_224377279_224377754:DEGS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	224492746	C/T	1	2	10	12	0.954970172740286	5.22514913629857	-4.27017896355829	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0180411572214053	ENSG00000143748:ENST00000281701:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000391875:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469968:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000340871:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000361463:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000469075:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000482491:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000467882:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000492281:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000488718:exon_224492736_224492868:NVL;ENSG00000143748:ENST00000436927:exon_224492736_224492868:NVL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226034858	C/T	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226034909	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000196187:ENST00000366835:exon_226034735_226034914:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000496025:exon_226034735_226035166:TMEM63A;ENSG00000196187:ENST00000482753:exon_226034840_226034914:TMEM63A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226109699	T/C	1	77	99	176	36.766351650501	51.7289764493558	-14.9626247988548	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0283733303938050	ENSG00000143811:ENST00000343818:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000478402:exon_226109558_226111471:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316940:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000316918:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000446534:exon_226109558_226109779:PYCR2;ENSG00000143811:ENST00000489681:exon_226109558_226109779:PYCR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226175795	C/A	1	16	10	26	7.63976138192229	5.22514913629857	2.41461224562372	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.433312135919422	ENSG00000143751:ENST00000272091:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366818:exon_226175597_226176089:C1orf55;ENSG00000143751:ENST00000366817:exon_226175597_226176089:C1orf55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226349285	C/T	1	8	15	23	3.81988069096114	7.83772370444786	-4.01784301348671	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.099549600965852	ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226349232_226349390:ACBD3;ENSG00000182827:ENST00000464927:exon_226349232_226349333:ACBD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226352498	T/G	1	12	15	27	5.72982103644172	7.83772370444786	-2.10790266800614	T:C:G	T	G	10	0.522514913629857	0.446234170782508	ENSG00000182827:ENST00000366812:exon_226352490_226352630:ACBD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226552834	C/T	1	145	188	333	69.2353375236707	98.2328037624131	-28.9974662387424	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00172644030813661	ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226552703_226552855:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000490921:exon_226552703_226552855:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000498787:exon_226552789_226552855:PARP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226567811	C/T	1	95	74	169	45.3610832051636	38.6661036086094	6.69497959655416	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.317405662140160	ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226567623_226567865:PARP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226589958	G/A	1	102	75	177	48.7034788097546	39.1886185222393	9.51486028751531	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.153763231609682	ENSG00000143799:ENST00000366794:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366792:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366791:exon_226589915_226590080:PARP1;ENSG00000143799:ENST00000366790:exon_226589684_226590080:PARP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226923938	A/C	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	226924545	C/G	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000143772:ENST00000272117:exon_226923228_226925159:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000429204:exon_226923228_226925364:ITPKB;ENSG00000143772:ENST00000366784:exon_226923228_226925364:ITPKB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	227922410	G/A	1	16	5	21	7.63976138192229	2.61257456814929	5.027186813773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0297739253279236	ENSG00000081692:ENST00000366758:exon_227922352_227922517:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000438896:exon_227922352_227922517:JMJD4;ENSG00000081692:ENST00000480590:exon_227922352_227922517:JMJD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	228295527	G/A	1	59	60	119	28.1716200958384	31.3508948177914	-3.17927472195299	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.58267906080419	ENSG00000162910:ENST00000366747:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391866:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366746:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465397:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336300:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000295008:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000336520:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000348259:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366744:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366742:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366741:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366740:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366739:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366738:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366735:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000465268:exon_228295369_228295976:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366736:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366734:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366733:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366732:exon_228295369_228295561:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000459783:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000430433:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000391867:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000411464:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000366731:exon_228295369_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000457264:exon_228295368_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000463898:exon_228295468_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000497758:exon_228295486_228295570:MRPL55;ENSG00000162910:ENST00000464148:exon_228295525_228295570:MRPL55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	229623338	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000069248:ENST00000366681:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000261396:exon_229623213_229623360:NUP133;ENSG00000069248:ENST00000366679:exon_229623213_229623360:NUP133
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	230410217	G/A	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000143641:ENST00000366672:exon_230410191_230410310:GALNT2;ENSG00000143641:ENST00000485438:exon_230410191_230410310:GALNT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	230829139	A/G	1	25	21	46	11.9371271592536	10.972813186227	0.964313973026577	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.882893269061336	ENSG00000135775:ENST00000366669:exon_230829038_230829728:COG2;ENSG00000135775:ENST00000366668:exon_230829038_230829728:COG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	233086456	T/C	1	17	15	32	8.11724646829243	7.83772370444786	0.279522763844575	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000135778:ENST00000494689:exon_233086351_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000490807:exon_233086360_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366628:exon_233086370_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000496662:exon_233086379_233086490:C1orf57;ENSG00000135778:ENST00000366627:exon_233086386_233086490:C1orf57
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	234509586	G/A	1	12	1	13	5.72982103644172	0.522514913629857	5.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00380841345330258	ENSG00000168275:ENST00000366613:exon_234509429_234509586:C1orf31;ENSG00000168275:ENST00000366612:exon_234509447_234510135:C1orf31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	234743159	G/A	1	92	124	216	43.9286279460532	64.7918492901023	-20.8632213440491	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00512328878702629	ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	234743492	C/T	1	90	63	153	42.9736577733129	32.918439558681	10.0552182146319	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.106152585015429	ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	234743528	G/A	1	76	46	122	36.2888665641309	24.0356860269734	12.2531805371574	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0293527263476607	ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234740015_234743598:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000491430:exon_234742977_234743598:IRF2BP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	234745009	A/G	0	0	13	13	0	6.79269387718814	-6.79269387718814	C:G	A	G	10	0.522514913629857	6.70621618656986e-05	ENSG00000168264:ENST00000366610:exon_234744241_234745271:IRF2BP2;ENSG00000168264:ENST00000366609:exon_234744193_234745271:IRF2BP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	235324298	T/C	1	34	33	67	16.2344929365849	17.2429921497853	-1.00849921320042	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.808231421307066	ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000447801:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000468751:exon_235324208_235324486:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000485019:exon_235324208_235324382:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324208_235324382:ARID4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	235324545	T/A	1	9	18	27	4.29736577733129	9.40526844533743	-5.10790266800614	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0548664043239411	ENSG00000188739:ENST00000408888:exon_235324489_235324772:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000366606:exon_235324489_235324571:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000450703:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000400947:exon_235324489_235324561:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000474086:exon_235324489_235324549:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000476261:exon_235324489_235324547:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000429912:exon_235324489_235324573:RBM34;ENSG00000188739:ENST00000486751:exon_235324489_235324598:RBM34;ENSG00000054267:ENST00000474953:exon_235324489_235324772:ARID4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	235383161	T/C	1	68	47	115	32.4689858731697	24.5582009406033	7.91078493256644	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.161235726593425	ENSG00000054267:ENST00000349213:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000366603:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000264183:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000421364:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000391856:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000491632:exon_235383108_235383283:ARID4B;ENSG00000054267:ENST00000471257:exon_235383108_235383283:ARID4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	235498557	A/G	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000152904:ENST00000488594:exon_235498557_235498649:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000471812:exon_235498557_235498649:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000358966:exon_235498557_235498649:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000451121:exon_235498557_235498649:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000282841:exon_235498557_235498649:GGPS1;ENSG00000152904:ENST00000497327:exon_235498557_235498649:GGPS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236700807	T/A	1	13	3	16	6.20730612281186	1.56754474088957	4.63976138192229	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0233109282447019	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236700823	T/C	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236700857	C/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000529489:exon_236700797_236700880:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236700797_236700885:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236700797_236700885:LGALS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236702210	A/G	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000116977:ENST00000481485:exon_236702179_236702363:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236702374	G/C	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000116977:ENST00000454943:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000430527:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000406509:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000416919:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000238181:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000532826:exon_236702179_236702522:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528782:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366583:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000442397:exon_236702186_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000434231:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236702260_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236702179_236702389:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236702179_236702389:LGALS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236711323	T/C	1	29	28	57	13.8470675047341	14.630417581636	-0.783350076901849	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.894809539452338	ENSG00000116977:ENST00000527974:exon_236711312_236711581:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000352231:exon_236711312_236711583:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526589:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000341872:exon_236711312_236712563:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000493812:exon_236711312_236716281:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000450372:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000366584:exon_236711312_236714310:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000323938:exon_236711312_236712302:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000526634:exon_236711312_236712096:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000525042:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000356238:exon_236711312_236711461:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000432200:exon_236711312_236712996:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000528259:exon_236711312_236711580:LGALS8;ENSG00000116977:ENST00000489586:exon_236711312_236711595:LGALS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236716959	C/T	1	17	21	38	8.11724646829243	10.972813186227	-2.85556671793457	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.417598108706776	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236716881_236717039:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236716881_236717039:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236717926	T/C	1	33	36	69	15.7570078502147	18.8105368906749	-3.05352904046014	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.472253007430862	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236717898_236718052:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236717898_236718052:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236718620	T/C	1	34	31	65	16.2344929365849	16.1979623225256	0.0365306140592914	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236718596_236718764:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236718596_236718764:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236719193	A/G	1	25	36	61	11.9371271592536	18.8105368906749	-6.87340973142128	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0950378570270504	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236719105_236719239:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236719105_236719239:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236721610	G/A	1	12	31	43	5.72982103644172	16.1979623225256	-10.4681412860839	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00189888343230876	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236721537_236721829:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236721537_236721829:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236723080	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236723014_236723137:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236723014_236723137:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	236730149	A/G	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000119285:ENST00000366582:exon_236729946_236730176:HEATR1;ENSG00000119285:ENST00000366581:exon_236729946_236730176:HEATR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	242023998	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242023819_242024006:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000469419:exon_242023819_242024006:EXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	242042301	G/A	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	242042454	C/T	1	19	17	36	9.07221664103272	8.88275353170757	0.189463109325146	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	242042545	A/G	1	16	8	24	7.63976138192229	4.18011930903886	3.45964207288343	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.219554892199473	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	242042578	A/G	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242042051_242042645:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242042342_242042645:EXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	242048674	C/T	1	33	43	76	15.7570078502147	22.4681412860839	-6.71113343586913	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.135810304554826	ENSG00000174371:ENST00000366548:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000348581:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000445862:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000391848:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000366547:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518483:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000521202:exon_242048616_242048809:EXO1;ENSG00000174371:ENST00000518741:exon_242048659_242048809:EXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	245850303	T/G	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	245850506	G/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245848707_245852109:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000483253:exon_245848707_245850616:KIF26B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	245861571	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162849:ENST00000407071:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000366518:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000406578:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000427640:exon_245861408_245861610:KIF26B;ENSG00000162849:ENST00000413001:exon_245861408_245861610:KIF26B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	1	246021881	G/A	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000185420:ENST00000366516:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000366517:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000490107:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000483072:exon_246021798_246021949:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000470510:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000388985:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000493441:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000488153:exon_246021798_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000492487:exon_246021800_246021972:SMYD3;ENSG00000185420:ENST00000391836:exon_246021864_246021972:SMYD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	1046712	G/A	1	42	39	81	20.054373627546	20.3780816315644	-0.323708004018417	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000107937:ENST00000360803:exon_1046617_1046808:GTPBP4;ENSG00000107937:ENST00000491635:exon_1046617_1046808:GTPBP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3155620	A/G	1	23	46	69	10.9821569865133	24.0356860269734	-13.0535290404601	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00166268754610347	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3155564_3155710:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000415005:exon_3155564_3155708:PFKP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3178729	G/A	1	167	198	365	79.7400094238139	103.457952898712	-23.7179434748978	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0137321010125878	ENSG00000067057:ENST00000381125:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381085:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000397834:exon_3178642_3178997:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381075:exon_3178642_3178985:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000381072:exon_3178642_3178985:PFKP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3179738	G/A	0	0	8	8	0	4.18011930903886	-4.18011930903886	A	G	A	10	0.522514913629857	0.00270195736599125	ENSG00000067057:ENST00000381188:exon_3179735_3179762:PFKP;ENSG00000067057:ENST00000433193:exon_3179735_3179904:PFKP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3180227	T/C	1	106	106	212	50.6134191552352	55.3865808447648	-4.77316168952969	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.536344490704473	ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3180298	C/T	1	49	36	85	23.396769232137	18.8105368906749	4.58623234146215	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.330598884075453	ENSG00000107959:ENST00000480928:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000490510:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3179920_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3179922_3180316:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3179926_3180316:PITRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3189380	C/T	1	13	20	33	6.20730612281186	10.4502982725971	-4.24299214978528	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.163903616707855	ENSG00000107959:ENST00000464395:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380994:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451454:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3189342_3189442:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3189342_3189442:PITRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3200292	G/A	1	16	6	22	7.63976138192229	3.13508948177914	4.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0576903399891642	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000430362:exon_3200232_3200345:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3200232_3200345:PITRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3202065	T/C	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380978:exon_3202040_3202128:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3202040_3202128:PITRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	3206027	A/G	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000107959:ENST00000224949:exon_3205917_3206073:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000451104:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380989:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000380980:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000458418:exon_3205917_3206077:PITRM1;ENSG00000107959:ENST00000488065:exon_3205324_3206077:PITRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	6002368	T/G	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000134470:ENST00000435171:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397251:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000447291:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379974:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6002330_6002431:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397250:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379971:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000525219:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6002330_6002530:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6002358_6002530:IL15RA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	6008172	C/T	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000134470:ENST00000379977:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397253:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000425111:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397248:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000414280:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000534292:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000319465:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532948:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000379972:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000528354:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000532039:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000530685:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397255:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000397246:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000429135:exon_6008108_6008302:IL15RA;ENSG00000134470:ENST00000453922:exon_6008108_6008302:IL15RA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	6139047	C/T	1	16	21	37	7.63976138192229	10.972813186227	-3.33305180430471	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.324101869523127	ENSG00000134453:ENST00000418869:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000379888:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000429138:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000432931:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000446108:exon_6139011_6139151:RBM17;ENSG00000134453:ENST00000418631:exon_6138873_6139151:RBM17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	6262702	C/T	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170525:ENST00000379784:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379789:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379781:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000490474:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000467491:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000477914:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379785:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000461744:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000317350:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379782:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000360521:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000379775:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000358499:exon_6262621_6262828:PFKFB3;ENSG00000170525:ENST00000444592:exon_6262621_6262828:PFKFB3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	11299735	A/T	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11299701_11299835:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11299701_11299835:CELF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	11356160	C/T	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000048740:ENST00000379261:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000450189:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000399850:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000417956:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000315874:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354440:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000354897:exon_11356102_11356221:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000416382:exon_11356102_11356233:CELF2;ENSG00000048740:ENST00000427450:exon_11356102_11356221:CELF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	11805477	C/T	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000134463:ENST00000379215:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000496136:exon_11805223_11806069:ECHDC3;ENSG00000134463:ENST00000428613:exon_11805223_11806069:ECHDC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12111090	T/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12110971_12111186:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000437298:exon_12111023_12111186:DHTKD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12136196	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12136072_12136270:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000465617:exon_12136072_12136270:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000415935:exon_12136072_12136300:DHTKD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12143105	C/G	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12143041_12143180:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12143041_12143180:DHTKD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12148259	A/C	1	16	10	26	7.63976138192229	5.22514913629857	2.41461224562372	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.433312135919422	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12148245_12148395:DHTKD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12148286	T/C	1	12	4	16	5.72982103644172	2.09005965451943	3.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.081547579265419	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12148245_12148395:DHTKD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12149939	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000181192:ENST00000263035:exon_12149908_12150014:DHTKD1;ENSG00000181192:ENST00000448829:exon_12149908_12150014:DHTKD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12209752	T/C	1	96	92	188	45.8385682915337	48.0713720539468	-2.23280376241312	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.770499652330698	ENSG00000065665:ENST00000475268:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000065665:ENST00000495368:exon_12209752_12209892:SEC61A2;ENSG00000165609:ENST00000491614:exon_12207324_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378937:exon_12209575_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000378952:exon_12209671_12209810:NUDT5;ENSG00000165609:ENST00000476462:exon_12209737_12209810:NUDT5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	12292344	A/G	1	177	188	365	84.5148602875153	98.2328037624131	-13.7179434748978	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.157238528431283	ENSG00000151465:ENST00000281141:exon_12292310_12292587:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000378900:exon_12292310_12292358:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000455773:exon_12292315_12292588:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000498747:exon_12292310_12292528:CDC123;ENSG00000151465:ENST00000440613:exon_12292310_12292588:CDC123
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	13653653	A/G	1	10	15	25	4.77485086370143	7.83772370444786	-3.06287284074643	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.235750861164297	ENSG00000165630:ENST00000378572:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000417658:exon_13653615_13653683:PRPF18;ENSG00000165630:ENST00000378544:exon_13653615_13653683:PRPF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	13735887	C/A	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000151474:ENST00000492155:exon_13734169_13736039:FRMD4A;ENSG00000151474:ENST00000342409:exon_13735703_13736039:FRMD4A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	14951202	T/G	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000152457:ENST00000378275:exon_14948897_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000449101:exon_14948897_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000453695:exon_14948897_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378246:exon_14949878_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000357717:exon_14950165_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378249:exon_14950170_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000396817:exon_14950170_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378255:exon_14950170_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378254:exon_14950170_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378258:exon_14950170_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378278:exon_14950170_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000378242:exon_14950187_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000492201:exon_14950741_14951329:DCLRE1C;ENSG00000152457:ENST00000489845:exon_14951169_14951329:DCLRE1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	15145361	G/A	1	37	24	61	17.6669481956953	12.5403579271166	5.12659026857872	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.201745329822253	ENSG00000152464:ENST00000378203:exon_15145304_15146250:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378201:exon_15145304_15145714:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378202:exon_15145304_15146254:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000378197:exon_15145304_15146256:RPP38;ENSG00000152464:ENST00000441850:exon_15145304_15145819:RPP38;ENSG00000152465:ENST00000466201:exon_15144583_15145682:NMT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	15177280	T/C	1	57	55	112	27.2166499230981	28.7383202496421	-1.52167032654399	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.777546794160613	ENSG00000152465:ENST00000441445:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378165:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378150:exon_15177273_15177417:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000378143:exon_15177273_15177419:NMT2;ENSG00000152465:ENST00000478580:exon_15177273_15177417:NMT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	17271757	C/T	1	108	115	223	51.5683893279754	60.0892150674336	-8.52082573945812	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.255343471911758	ENSG00000026025:ENST00000478317:exon_17271275_17271949:VIM;ENSG00000026025:ENST00000478746:exon_17271275_17271869:VIM;ENSG00000026025:ENST00000224237:exon_17271277_17271984:VIM;ENSG00000026025:ENST00000487938:exon_17271277_17271984:VIM;ENSG00000026025:ENST00000485947:exon_17271290_17271984:VIM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	21827796	G/A	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000078403:ENST00000377100:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377072:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000307729:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377091:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000471315:exon_21827762_21827893:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000446906:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000495130:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000377059:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000396529:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000476557:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000430455:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000462999:exon_21827762_21827841:MLLT10;ENSG00000078403:ENST00000480415:exon_21827762_21827841:MLLT10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	22839628	T/C	1	14	19	33	6.684791209182	9.92778335896728	-3.24299214978528	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.297413773867439	ENSG00000150867:ENST00000323883:exon_22839588_22839701:PIP4K2A;ENSG00000150867:ENST00000376573:exon_22839588_22839701:PIP4K2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	27303605	A/T	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000107890:ENST00000445828:exon_27303423_27303608:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27303423_27303640:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27303423_27303640:ANKRD26
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	27317840	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000107890:ENST00000342931:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000419811:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000436985:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376070:exon_27317781_27317874:ANKRD26;ENSG00000107890:ENST00000376087:exon_27317781_27317874:ANKRD26
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	27434483	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000136758:ENST00000376016:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000326799:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375969:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000375972:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000491542:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000427324:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000396296:exon_27434357_27434519:YME1L1;ENSG00000136758:ENST00000477432:exon_27434348_27436597:YME1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	28897120	A/G	1	23	31	54	10.9821569865133	16.1979623225256	-5.21580533601228	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.173778935827792	ENSG00000095787:ENST00000375664:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000375646:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000347934:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000354911:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000428935:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000424454:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000439676:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000345541:exon_28897115_28897360:WAC;ENSG00000095787:ENST00000476046:exon_28897115_28897522:WAC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	30629226	G/A	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.296181191073666	ENSG00000107951:ENST00000358107:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000263063:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000488290:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000417581:exon_30629155_30629379:MTPAP;ENSG00000107951:ENST00000421701:exon_30628901_30629379:MTPAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	30728026	T/C	1	95	54	149	45.3610832051636	28.2158053360123	17.1452778691513	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00518798723111945	ENSG00000107968:ENST00000375328:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000263056:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000415139:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375322:exon_30727845_30728371:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000413724:exon_30727845_30728203:MAP3K8;ENSG00000107968:ENST00000375321:exon_30727751_30728203:MAP3K8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	31815787	G/A	1	35	32	67	16.711978022955	16.7204772361554	-0.00849921320041958	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000148516:ENST00000320985:exon_31815600_31817847:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000437844:exon_31815600_31818742:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000488625:exon_31815600_31818124:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000361642:exon_31815600_31818118:ZEB1;ENSG00000148516:ENST00000446923:exon_31815600_31818118:ZEB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	32580219	T/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000120616:ENST00000375110:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000319778:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000263062:exon_32580091_32580250:EPC1;ENSG00000120616:ENST00000495790:exon_32580091_32581572:EPC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	34558715	C/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000148498:ENST00000374789:exon_34558585_34558827:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374788:exon_34558585_34558827:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000346874:exon_34558585_34558827:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374794:exon_34558585_34558827:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000350537:exon_34558585_34558827:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000374790:exon_34558585_34558827:PARD3;ENSG00000148498:ENST00000466092:exon_34558715_34558827:PARD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	35500774	T/C	1	41	37	78	19.5768885411759	19.3330518043047	0.243836736871152	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000095794:ENST00000474362:exon_35500584_35501053:CREM;ENSG00000095794:ENST00000460270:exon_35500182_35501363:CREM;ENSG00000095794:ENST00000354759:exon_35500182_35501082:CREM;ENSG00000095794:ENST00000345491:exon_35500584_35501886:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395895:exon_35500584_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374728:exon_35500584_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000337656:exon_35500182_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374734:exon_35500182_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000395897:exon_35500182_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000439705:exon_35500182_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000333809:exon_35500182_35501883:CREM;ENSG00000095794:ENST00000348787:exon_35500584_35501886:CREM;ENSG00000095794:ENST00000374722:exon_35500584_35501886:CREM;ENSG00000095794:ENST00000464475:exon_35500584_35500788:CREM;ENSG00000095794:ENST00000361599:exon_35500584_35501878:CREM;ENSG00000095794:ENST00000342105:exon_35500584_35501424:CREM;ENSG00000095794:ENST00000463314:exon_35500584_35501088:CREM;ENSG00000095794:ENST00000473940:exon_35500182_35501082:CREM;ENSG00000095794:ENST00000488328:exon_35500584_35501393:CREM;ENSG00000095794:ENST00000356917:exon_35500182_35501851:CREM;ENSG00000095794:ENST00000468236:exon_35500584_35500781:CREM;ENSG00000095794:ENST00000344351:exon_35500182_35501423:CREM;ENSG00000095794:ENST00000490511:exon_35500584_35500804:CREM;ENSG00000095794:ENST00000469517:exon_35500182_35500793:CREM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	35772402	G/A	1	11	4	15	5.25233595007157	2.09005965451943	3.16227629555214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.124040195402654	ENSG00000108100:ENST00000374706:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000490012:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000493157:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000374704:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000265375:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000492478:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000470025:exon_35772332_35772406:CCNY;ENSG00000108100:ENST00000456784:exon_35772158_35772406:CCNY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	45920506	G/A	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000012779:ENST00000374391:exon_45920408_45920580:ALOX5;ENSG00000012779:ENST00000483623:exon_45920408_45920580:ALOX5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	53458047	A/G	1	29	29	58	13.8470675047341	15.1529324952659	-1.30586499053171	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.793123520302134	ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	53458998	A/G	1	21	20	41	10.027186813773	10.4502982725971	-0.423111458824138	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000177613:ENST00000331173:exon_53455247_53459355:CSTF2T
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	58120988	C/A	1	23	16	39	10.9821569865133	8.36023861807771	2.62191836843558	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.426944012321677	ENSG00000122952:ENST00000373944:exon_58120957_58121036:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000494312:exon_58120957_58121020:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000395405:exon_58120957_58121034:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000448380:exon_58120957_58121023:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000373940:exon_58120957_58121003:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000361148:exon_58120957_58121027:ZWINT;ENSG00000122952:ENST00000489649:exon_58120957_58121018:ZWINT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	61552762	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000108091:ENST00000263102:exon_61548521_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000491922:exon_61551510_61552869:CCDC6;ENSG00000108091:ENST00000395341:exon_61552735_61552869:CCDC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	64911911	A/G	1	16	7	23	7.63976138192229	3.657604395409	3.98215698651329	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.142379004712528	ENSG00000148572:ENST00000277746:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000435510:exon_64911910_64911950:NRBF2;ENSG00000148572:ENST00000395241:exon_64911910_64911950:NRBF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	64949062	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000171988:ENST00000399262:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000402544:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000399251:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000327520:exon_64948928_64949206:JMJD1C;ENSG00000171988:ENST00000497922:exon_64949047_64949206:JMJD1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	70508990	G/A	1	16	20	36	7.63976138192229	10.4502982725971	-2.81053689067485	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.405308064754224	ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70508893_70509022:CCAR1;ENSG00000060339:ENST00000483471:exon_70508893_70509017:CCAR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	70513684	A/G	1	7	14	21	3.342395604591	7.315208790818	-3.972813186227	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.124250428299143	ENSG00000060339:ENST00000265872:exon_70513609_70513834:CCAR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	70700944	A/G	1	45	38	83	21.4868288866564	19.8555667179346	1.63126216872186	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.7428153052439	ENSG00000107625:ENST00000373585:exon_70700816_70700950:DDX50;ENSG00000107625:ENST00000466265:exon_70700816_70700950:DDX50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71103615	C/T	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000156515:ENST00000450646:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483077:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000476368:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000483054:exon_71103583_71103646:HK1;ENSG00000156515:ENST00000421088:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000436817:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000493591:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71103583_71103745:HK1;ENSG00000156515:ENST00000450557:exon_71103583_71103745:HK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71142420	G/A	1	29	33	62	13.8470675047341	17.2429921497853	-3.39592464505113	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.445969721944002	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71142243_71142547:HK1;ENSG00000156515:ENST00000494253:exon_71142243_71142547:HK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71160828	C/T	1	25	38	63	11.9371271592536	19.8555667179346	-7.91843955868099	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0577134822093331	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1;ENSG00000156515:ENST00000470050:exon_71160747_71160874:HK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71160897	C/T	1	46	52	98	21.9643139730266	27.1707755087526	-5.20646153572599	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.312689509721477	ENSG00000156515:ENST00000356342:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000448642:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000360289:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000439900:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000404387:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000405407:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000298649:exon_71160747_71161635:HK1;ENSG00000156515:ENST00000359426:exon_71160747_71161638:HK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71874683	G/A	1	34	43	77	16.2344929365849	22.4681412860839	-6.23364834949899	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.171361605192962	ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71874734	G/A	1	27	27	54	12.8920973319939	14.1079026680061	-1.21580533601228	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.786113448389962	ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71874809	G/C	1	22	15	37	10.5046719001431	7.83772370444786	2.66694819569529	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.414059712935562	ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71874866	T/C	1	35	34	69	16.711978022955	17.7655070634151	-1.05352904046013	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.810721898176802	ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71874676_71874876:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71874531_71874876:AIFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71876382	C/T	1	35	38	73	16.711978022955	19.8555667179346	-3.14358869497956	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.483698503299197	ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	71876464	G/A	1	20	17	37	9.54970172740286	8.88275353170757	0.666948195695289	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.870445363476698	ENSG00000042286:ENST00000373248:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000307864:exon_71876378_71876530:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000395039:exon_71876378_71876539:AIFM2;ENSG00000042286:ENST00000482166:exon_71876378_71876530:AIFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	72179746	C/T	1	3	16	19	1.43245525911043	8.36023861807771	-6.92778335896728	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00189905558322989	ENSG00000148730:ENST00000373218:exon_72179670_72179855:EIF4EBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	72326470	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000107719:ENST00000263563:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000373214:exon_72326337_72328205:KIAA1274;ENSG00000107719:ENST00000426268:exon_72326337_72326644:KIAA1274
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	75234756	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000107758:ENST00000360663:exon_75234677_75234788:PPP3CB;ENSG00000107758:ENST00000394829:exon_75234677_75234788:PPP3CB;ENSG00000107758:ENST00000394828:exon_75234677_75234788:PPP3CB;ENSG00000107758:ENST00000394823:exon_75234677_75234788:PPP3CB;ENSG00000107758:ENST00000342558:exon_75234677_75234788:PPP3CB;ENSG00000107758:ENST00000394822:exon_75234677_75234788:PPP3CB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	86237331	G/A	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86237331_86237420:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86237331_86237420:FAM190B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	86273249	T/C	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000107771:ENST00000372088:exon_86273205_86278276:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000224756:exon_86273205_86278273:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000494144:exon_86273205_86274161:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000493409:exon_86273205_86273417:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000498300:exon_86273205_86273458:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000466105:exon_86273205_86273452:FAM190B;ENSG00000107771:ENST00000480006:exon_86273205_86273626:FAM190B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	90762801	G/A	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000026103:ENST00000371875:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355740:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000352159:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000484444:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000357339:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494410:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000479522:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000488877:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000492756:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000355279:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000460510:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000477270:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000313771:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000466081:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000371857:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000494799:exon_90762786_90762951:FAS;ENSG00000026103:ENST00000487314:exon_90762786_90762951:FAS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91098984	T/A	1	38	16	54	18.1444332820654	8.36023861807771	9.78419466398772	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.00909386896966064	ENSG00000119917:ENST00000371818:exon_91098418_91100728:IFIT3;ENSG00000119917:ENST00000371811:exon_91098418_91100728:IFIT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91178000	C/T	1	15	21	36	7.16227629555214	10.972813186227	-3.81053689067485	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.243311756234342	ENSG00000152778:ENST00000371795:exon_91176962_91180758:IFIT5;ENSG00000152778:ENST00000416601:exon_91177575_91178576:IFIT5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91484780	G/A	1	19	15	34	9.07221664103272	7.83772370444786	1.23449293658486	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.73314906239147	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91484777_91484915:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91484777_91484915:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91497631	T/A	1	13	19	32	6.20730612281186	9.92778335896728	-3.72047723615543	A:T:G	T	A	10	0.522514913629857	0.216912579895035	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91498254	A/G	1	12	17	29	5.72982103644172	8.88275353170757	-3.15293249526585	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.268082057749973	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91498318	A/G	1	21	35	56	10.027186813773	18.288021977045	-8.26083516327199	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0317913805295323	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91497145_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91497144_91498374:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91497144_91498374:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91498730	C/T	1	17	10	27	8.11724646829243	5.22514913629857	2.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.336149290227447	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91498715_91498853:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91498715_91498853:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91503660	A/G	1	9	17	26	4.29736577733129	8.88275353170757	-4.58538775437628	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0792174308719026	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91503565_91503684:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91503565_91503684:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91505704	A/C	1	13	16	29	6.20730612281186	8.36023861807771	-2.15293249526585	A:C:G	A	C	10	0.522514913629857	0.461080918794537	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91505656_91505716:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91505656_91505716:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91505656_91505716:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91505656_91505716:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91505656_91505716:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91505656_91505716:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	91518638	T/C	1	12	16	28	5.72982103644172	8.36023861807771	-2.630417581636	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.348683057297521	ENSG00000138182:ENST00000260753:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000416354:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000394289:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371737:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000371728:exon_91518463_91518639:KIF20B;ENSG00000138182:ENST00000478929:exon_91518463_91518639:KIF20B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95266799	A/G	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95266745_95266813:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95266767_95266813:CEP55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95276692	G/A	1	20	15	35	9.54970172740286	7.83772370444786	1.711978022955	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.614294946711019	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95276718	T/C	1	17	14	31	8.11724646829243	7.315208790818	0.802037677474432	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.858133848975486	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95276692_95277005:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000445435:exon_95276692_95277005:CEP55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95279506	A/T	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000138180:ENST00000447994:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000371485:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000358339:exon_95279439_95279564:CEP55;ENSG00000138180:ENST00000496302:exon_95279439_95280034:CEP55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95430585	T/G	1	15	21	36	7.16227629555214	10.972813186227	-3.81053689067485	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.243311756234342	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000460752:exon_95430527_95435061:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000483229:exon_95430527_95430605:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000462771:exon_95430532_95430605:FRA10AC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95454681	G/C	1	45	32	77	21.4868288866564	16.7204772361554	4.76635165050101	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.305318518883665	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95454618_95454694:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95454618_95454694:FRA10AC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95458141	A/G	1	40	25	65	19.0994034548057	13.0628728407464	6.03653061405929	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.138301227457745	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95458058_95458153:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95458058_95458153:FRA10AC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	95459817	C/T	1	36	13	49	17.1894631093251	6.79269387718814	10.396769232137	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00376973454981678	ENSG00000148690:ENST00000359204:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371426:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000371430:exon_95459787_95459863:FRA10AC1;ENSG00000148690:ENST00000394100:exon_95459787_95459863:FRA10AC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	96094425	T/C	1	14	5	19	6.684791209182	2.61257456814929	4.07221664103272	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0686149924897499	ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96094391_96094475:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96094391_96094475:NOC3L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	96117924	A/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000173145:ENST00000371361:exon_96117840_96117972:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000371350:exon_96117840_96117972:NOC3L;ENSG00000173145:ENST00000463649:exon_96116931_96117972:NOC3L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	96313960	A/C	1	10	16	26	4.77485086370143	8.36023861807771	-3.58538775437628	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.173625446444081	ENSG00000119969:ENST00000419900:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000348459:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000437940:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000371332:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394045:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394044:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000394036:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000239026:exon_96313883_96314005:HELLS;ENSG00000119969:ENST00000462057:exon_96313881_96314005:HELLS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	97023630	T/C	1	509	425	934	243.039908962403	222.068838292689	20.9710706697135	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.179266635208594	ENSG00000107438:ENST00000329399:exon_97023621_97023820:PDLIM1;ENSG00000107438:ENST00000477757:exon_97023621_97023820:PDLIM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	97413047	G/A	1	12	18	30	5.72982103644172	9.40526844533743	-3.67544740889571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.202983319347204	ENSG00000059573:ENST00000371224:exon_97413047_97413162:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000371221:exon_97413047_97413162:ALDH18A1;ENSG00000059573:ENST00000483788:exon_97413047_97413162:ALDH18A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	97447373	A/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000119977:ENST00000265993:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000343162:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371217:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000480852:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000443432:exon_97447349_97447476:TCTN3;ENSG00000119977:ENST00000371209:exon_97447349_97447476:TCTN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	97605057	C/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	97917260	C/G	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000177853:ENST00000371192:exon_97915954_97923517:ZNF518A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	97990583	A/G	1	52	55	107	24.8292244912474	28.7383202496421	-3.9090957583947	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.498374419596551	ENSG00000095585:ENST00000413476:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393894:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000428924:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000427367:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000224337:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000371176:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000393889:exon_97990550_97990590:BLNK;ENSG00000095585:ENST00000467799:exon_97990550_97990590:BLNK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	98287792	G/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000077147:ENST00000371142:exon_98287788_98287934:TM9SF3;ENSG00000077147:ENST00000485093:exon_98287788_98287930:TM9SF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	98369536	A/G	1	8	24	32	3.81988069096114	12.5403579271166	-8.72047723615542	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00224609248116276	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000467625:exon_98369469_98369624:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98369469_98369624:PIK3AP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	98380137	T/C	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000489982:exon_98380109_98380168:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000461252:exon_98380109_98380191:PIK3AP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	98380277	C/T	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000155629:ENST00000339364:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371110:exon_98380109_98380314:PIK3AP1;ENSG00000155629:ENST00000371109:exon_98380109_98380314:PIK3AP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	99129230	T/C	1	11	4	15	5.25233595007157	2.09005965451943	3.16227629555214	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.124040195402654	ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99129182_99129339:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99129182_99129339:RRP12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	99132883	C/T	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000052749:ENST00000479481:exon_99132803_99132957:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99132803_99132957:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99132803_99132957:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99132803_99132957:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000490815:exon_99132818_99132957:RRP12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	99141201	T/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000052749:ENST00000370992:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000315563:exon_99141143_99141240:RRP12;ENSG00000052749:ENST00000414986:exon_99141143_99141240:RRP12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	99205731	A/G	1	19	12	31	9.07221664103272	6.27017896355828	2.80203767747443	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.370393957183701	ENSG00000171311:ENST00000464440:exon_99205712_99205751:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370902:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370886:exon_99205712_99205743:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370885:exon_99205712_99205750:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000370884:exon_99205712_99205774:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000485122:exon_99205712_99205742:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000476234:exon_99205712_99205763:EXOSC1;ENSG00000171311:ENST00000489158:exon_99205712_99205763:EXOSC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	99227273	T/C	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000155229:ENST00000438925:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000370782:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000415383:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434538:exon_99227262_99227282:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327238:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000422291:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000355839:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000433610:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327277:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000327253:exon_99227262_99227340:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000434392:exon_99227262_99227360:MMS19;ENSG00000155229:ENST00000480280:exon_99227262_99227309:MMS19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	101636898	C/G	1	13	23	36	6.20730612281186	12.0178430134867	-5.81053689067485	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0655274267110129	ENSG00000107554:ENST00000342239:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000324109:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000393570:exon_101635334_101637093:DNMBP;ENSG00000107554:ENST00000370423:exon_101635334_101637093:DNMBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	102005620	C/T	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000095485:ENST00000472872:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000468709:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000354105:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000338048:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000482452:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000370379:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466955:exon_102005556_102005670:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000466408:exon_102005556_102005873:CWF19L1;ENSG00000095485:ENST00000496796:exon_102005557_102005670:CWF19L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	102116311	A/C	1	16	7	23	7.63976138192229	3.657604395409	3.98215698651329	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.142379004712528	ENSG00000099194:ENST00000423840:exon_102116289_102116367:SCD;ENSG00000099194:ENST00000370355:exon_102116289_102116521:SCD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	102746503	C/T	1	159	88	247	75.9201287328527	45.9813123994274	29.9388163334253	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.000126867251004263	ENSG00000055950:ENST00000370236:exon_102746444_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000493646:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000318364:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000477279:exon_102746033_102746732:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000487059:exon_102746345_102746953:MRPL43;ENSG00000055950:ENST00000338931:exon_102746376_102746576:MRPL43
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103368654	T/C	1	39	79	118	18.6219183684356	41.2786781767587	-22.6567598083231	T:C	T	C	10	0.522514913629857	2.89470687385986e-05	ENSG00000166171:ENST00000370151:exon_103368592_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370147:exon_103368624_103368694:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000370148:exon_103368624_103368659:DPCD;ENSG00000166171:ENST00000475443:exon_103368624_103368801:DPCD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103371041	C/G	1	53	76	129	25.3067095776176	39.7111334358691	-14.4044238582516	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0133056011424348	ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103370423_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000470093:exon_103370423_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103370426_103371167:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103370426_103371167:FBXW4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103384540	G/A	1	22	22	44	10.5046719001431	11.4953280998569	-0.990656199713708	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.765635035115544	ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000470093:exon_103384502_103386656:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103384502_103384567:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103384504_103384567:FBXW4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103432801	A/G	1	29	28	57	13.8470675047341	14.630417581636	-0.783350076901849	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.894809539452338	ENSG00000107829:ENST00000331272:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000389046:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000446938:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000457105:exon_103432672_103432804:FBXW4;ENSG00000107829:ENST00000431477:exon_103432672_103432804:FBXW4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103541595	A/T	1	119	107	226	56.820725278047	55.9090957583947	0.911629519652315	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.946936039534134	ENSG00000107833:ENST00000370110:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000474993:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000462391:exon_103541484_103541611:NPM3;ENSG00000107833:ENST00000468544:exon_103541484_103541611:NPM3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103920475	T/C	1	47	44	91	22.4417990593967	22.9906561997137	-0.54885714031699	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.916836881403873	ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103920209_103920850:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103920209_103920850:NOLC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	103921652	A/G	1	113	108	221	53.9558147598262	56.4316106720246	-2.47579591219841	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.787738619174274	ENSG00000166197:ENST00000405356:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000429062:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000370007:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000488254:exon_103921590_103921682:NOLC1;ENSG00000166197:ENST00000477977:exon_103921590_103921682:NOLC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	104129069	G/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104128968_104129144:GBF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	104140355	C/T	1	40	42	82	19.0994034548057	21.945626372454	-2.84622291764828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.580890523692699	ENSG00000107862:ENST00000369983:exon_104140263_104140443:GBF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	104638723	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000214435:ENST00000369880:exon_104638606_104638748:AS3MT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	104836951	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000148842:ENST00000457502:exon_104836728_104838344:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000433628:exon_104836728_104838108:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000369878:exon_104836728_104838238:CNNM2;ENSG00000148842:ENST00000345419:exon_104836728_104838238:CNNM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	105758670	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105758657_105758729:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105758657_105758729:SLK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	105763026	C/T	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000065613:ENST00000335753:exon_105761930_105763285:SLK;ENSG00000065613:ENST00000369755:exon_105761930_105763285:SLK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	106027059	G/A	1	140	96	236	66.84791209182	50.1614317084663	16.6864803833537	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0314439518483244	ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000445155:exon_106027010_106027123:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000432659:exon_106027010_106027162:GSTO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	106027165	G/A	1	104	84	188	49.6584489824949	43.891252744908	5.76719623758688	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.422315799856687	ENSG00000148834:ENST00000369713:exon_106027010_106027215:GSTO1;ENSG00000148834:ENST00000369710:exon_106027010_106027211:GSTO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	112349422	T/C	1	51	69	120	24.3517394048773	36.0535290404601	-11.7017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0354300265863982	ENSG00000108055:ENST00000361804:exon_112349363_112349466:SMC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	112641053	A/G	1	95	93	188	45.3610832051636	48.5938869675767	-3.23280376241312	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.661675627106333	ENSG00000150593:ENST00000280154:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000445683:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000393104:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000467574:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000483670:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000444997:exon_112641033_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000492932:exon_112640991_112641293:PDCD4;ENSG00000150593:ENST00000452838:exon_112640991_112641293:PDCD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	112771591	T/C	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000108061:ENST00000265277:exon_112771368_112773422:SHOC2;ENSG00000108061:ENST00000369452:exon_112771368_112773425:SHOC2;ENSG00000108061:ENST00000451838:exon_112771368_112773424:SHOC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	114176693	G/A	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000197142:ENST00000354655:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000393081:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000356116:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000433418:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000369410:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000354273:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000495539:exon_114176646_114176780:ACSL5;ENSG00000197142:ENST00000467340:exon_114176646_114176780:ACSL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	114224329	C/T	1	18	9	27	8.59473155466257	4.70263422266871	3.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.176865551934525	ENSG00000151532:ENST00000489142:exon_114224306_114224416:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000393077:exon_114224306_114224416:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000432306:exon_114224306_114224416:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000496445:exon_114224306_114224416:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000494728:exon_114224306_114224517:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000489357:exon_114224306_114224416:VTI1A;ENSG00000151532:ENST00000480057:exon_114224306_114224416:VTI1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	115457264	T/G	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000165806:ENST00000429617:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369331:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369321:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000345633:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369318:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000442393:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000393012:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369319:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369316:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000369315:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000298700:exon_115457253_115457362:CASP7;ENSG00000165806:ENST00000452490:exon_115457184_115457362:CASP7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	115910928	G/T	1	12	8	20	5.72982103644172	4.18011930903886	1.54970172740286	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.512146220497768	ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115910851_115910979:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115910851_115910979:C10orf118
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	115922774	G/A	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	ENSG00000165813:ENST00000369287:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000430353:exon_115922396_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369286:exon_115921367_115923088:C10orf118;ENSG00000165813:ENST00000369285:exon_115921367_115923088:C10orf118
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	116064528	G/A	1	3	12	15	1.43245525911043	6.27017896355828	-4.83772370444786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0173549210821596	ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116064478_116064689:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116064478_116064689:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116064478_116064689:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000486300:exon_116064478_116064892:AFAP1L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	116073801	T/C	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000169129:ENST00000369271:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000304129:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000392974:exon_116073630_116073809:AFAP1L2;ENSG00000169129:ENST00000419268:exon_116073630_116073809:AFAP1L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	120840191	T/C	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000107581:ENST00000369144:exon_120840140_120840316:EIF3A;ENSG00000107581:ENST00000478852:exon_120840140_120840396:EIF3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	120914628	C/T	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000183605:ENST00000490417:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000484960:exon_120914574_120914635:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000330036:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120914574_120914689:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000466218:exon_120914574_120914689:SFXN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	120920588	T/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000183605:ENST00000355697:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000392875:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000461438:exon_120920567_120920593:SFXN4;ENSG00000183605:ENST00000369131:exon_120920567_120920593:SFXN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	120931929	G/A	1	29	21	50	13.8470675047341	10.972813186227	2.87425431850715	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.479800730804379	ENSG00000165672:ENST00000356951:exon_120931894_120931997:PRDX3;ENSG00000165672:ENST00000298510:exon_120931894_120931997:PRDX3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	121259610	C/T	1	460	883	1343	219.643139730266	461.380668735164	-241.737529004898	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	4.09731196194808e-40	ENSG00000148908:ENST00000392865:exon_121259340_121259771:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000369103:exon_121259437_121259771:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000369101:exon_121259437_121259771:RGS10;ENSG00000148908:ENST00000469575:exon_121259592_121259771:RGS10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	121436068	T/G	1	3	12	15	1.43245525911043	6.27017896355828	-4.83772370444786	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0173549210821596	ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3;ENSG00000151929:ENST00000450186:exon_121435979_121436219:BAG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	121436513	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000151929:ENST00000369085:exon_121435976_121437331:BAG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	121551581	A/C	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000198825:ENST00000453198:exon_121551381_121551596:INPP5F;ENSG00000198825:ENST00000369081:exon_121551381_121551717:INPP5F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	121596498	C/T	1	35	25	60	16.711978022955	13.0628728407464	3.64910518220858	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.367949777876701	ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121596408_121596541:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121596408_121596541:C10orf119
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	121602830	G/A	1	14	10	24	6.684791209182	5.22514913629857	1.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.683803059873396	ENSG00000197771:ENST00000360003:exon_121602760_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000369077:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000466047:exon_121602766_121602938:C10orf119;ENSG00000197771:ENST00000495407:exon_121602294_121602938:C10orf119
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	122649482	A/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000120008:ENST00000263461:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000450132:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000497136:exon_122649407_122649521:WDR11;ENSG00000120008:ENST00000478567:exon_122649407_122649521:WDR11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	124697236	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000119965:ENST00000368891:exon_124697221_124697675:C10orf88;ENSG00000119965:ENST00000481909:exon_124697221_124697675:C10orf88;ENSG00000119965:ENST00000470158:exon_124697221_124697675:C10orf88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	124742792	G/A	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	124742895	G/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000179988:ENST00000465232:exon_124742788_124743030:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000368887:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000405485:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000406217:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483455:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000497219:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000493461:exon_124742788_124745763:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000483755:exon_124742788_124742986:PSTK;ENSG00000179988:ENST00000496079:exon_124742806_124742986:PSTK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	124800853	C/T	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000196177:ENST00000358776:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000368869:exon_124800725_124800895:ACADSB;ENSG00000196177:ENST00000496730:exon_124800725_124800895:ACADSB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	126523333	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000165660:ENST00000298492:exon_126523071_126525239:FAM175B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	126670356	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000019995:ENST00000359653:exon_126670278_126670398:ZRANB1;ENSG00000019995:ENST00000471421:exon_126669980_126670398:ZRANB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	127530325	T/C	1	25	11	36	11.9371271592536	5.74766404992843	6.18946310932515	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.044867962857342	ENSG00000107949:ENST00000299130:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000107949:ENST00000429863:exon_127529824_127531375:BCCIP;ENSG00000089876:ENST00000368721:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284690:exon_127530312_127530503:DHX32;ENSG00000089876:ENST00000284688:exon_127530312_127530503:DHX32
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129901825	T/C	1	135	160	295	64.4604866599693	83.6023861807771	-19.1418995208078	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0267559826746358	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129902281	G/A	1	111	120	231	53.0008445870859	62.7017896355828	-9.70094504849697	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.211031542047145	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129902444	G/A	1	105	84	189	50.135934068865	43.891252744908	6.24468132395702	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.382672585220473	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129903016	T/C	1	64	64	128	30.5590455276892	33.4409544723108	-2.8819089446217	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.65842174754899	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129903465	A/G	1	52	54	106	24.8292244912474	28.2158053360123	-3.38658084476485	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.559918352573668	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129904917	G/A	1	30	34	64	14.3245525911043	17.7655070634151	-3.44095447231085	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.453084144567025	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129900843_129907687:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129900843_129907687:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	129917560	T/C	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000148773:ENST00000368654:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368653:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000368652:exon_129917517_129917583:MKI67;ENSG00000148773:ENST00000478293:exon_129917517_129917583:MKI67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	131506192	C/T	1	59	66	125	28.1716200958384	34.4859842995706	-6.31436420373213	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.282820047465107	ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	131506283	C/T	1	39	37	76	18.6219183684356	19.3330518043047	-0.711133435869133	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.908852253191756	ENSG00000170430:ENST00000306010:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000440826:exon_131506159_131506307:MGMT;ENSG00000170430:ENST00000462672:exon_131506159_131506307:MGMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	131959150	C/T	1	50	56	106	23.8742543185071	29.260835163272	-5.38658084476484	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.331024561477993	ENSG00000108010:ENST00000331244:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000368644:exon_131959060_131959261:GLRX3;ENSG00000108010:ENST00000481034:exon_131959060_131959261:GLRX3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	134036193	A/G	0	10	0	10	4.77485086370143	0	4.77485086370143	A	A		10	0.522514913629857	0.00213302931363942	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368622:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000298630:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000462160:exon_134036145_134036276:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368625:exon_134036145_134036276:STK32C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	134145288	C/A	1	12	52	64	5.72982103644172	27.1707755087526	-21.4409544723108	A:C	C	A	10	0.522514913629857	4.78884109021064e-08	ENSG00000165752:ENST00000478542:exon_134145102_134145353:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368620:exon_134144940_134145351:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000368619:exon_134144940_134145335:STK32C;ENSG00000165752:ENST00000456004:exon_134144940_134145341:STK32C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	134161517	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000148814:ENST00000368615:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000392638:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000432555:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000344079:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368614:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000462656:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368613:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000356571:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368612:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000450442:exon_134161488_134161853:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000368610:exon_134161488_134161860:LRRC27;ENSG00000148814:ENST00000490055:exon_134161488_134161596:LRRC27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	10	135184126	G/A	1	56	45	101	26.739164836728	23.5131711133436	3.22599372338444	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.550981232589114	ENSG00000127884:ENST00000368547:exon_135184064_135184261:ECHS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	293188	T/C	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000142102:ENST00000474221:exon_292886_293502:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409548:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000312105:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000382625:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409655:exon_293163_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000409479:exon_293068_293235:ATHL1;ENSG00000142102:ENST00000476372:exon_293163_293727:ATHL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	494942	G/C	1	177	209	386	84.5148602875153	109.20561694864	-24.6907566611248	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0124910122256124	ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	495007	C/T	1	157	134	291	74.9651585601124	70.0169984264008	4.9481601337116	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.597501044266199	ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529768:exon_494544_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_494883_495053:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_494883_495053:RNH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	499849	C/T	1	114	96	210	54.4332998461963	50.1614317084663	4.27186813773002	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.580854797391759	ENSG00000023191:ENST00000534797:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000426245:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397614:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397615:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000397604:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525522:exon_499015_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000525701:exon_499829_499923:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000533410:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000438658:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000354420:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000356187:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529115:exon_499829_499923:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000527485:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529368:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000529306:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000524780:exon_499400_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000531149:exon_499829_499999:RNH1;ENSG00000023191:ENST00000531223:exon_499677_499923:RNH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	534242	A/G	1	11	19	30	5.25233595007157	9.92778335896728	-4.67544740889571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.100762715434031	ENSG00000174775:ENST00000397594:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000397596:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000493230:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000451590:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000417302:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000311189:exon_534212_534375:HRAS;ENSG00000174775:ENST00000468682:exon_534212_534375:HRAS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	562437	G/A	1	14	10	24	6.684791209182	5.22514913629857	1.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.683803059873396	ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_562084_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000524468:exon_562079_562456:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_562079_562776:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_562385_562776:RASSF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	563565	C/T	1	12	15	27	5.72982103644172	7.83772370444786	-2.10790266800614	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.446234170782508	ENSG00000099849:ENST00000431809:exon_563189_563993:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397582:exon_563189_564012:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000414138:exon_563189_563980:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000344375:exon_563558_563645:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000418716:exon_563558_563569:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000397583:exon_563558_564018:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000454668:exon_563558_564021:RASSF7;ENSG00000099849:ENST00000531112:exon_563558_563685:RASSF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	608991	C/T	1	24	17	41	11.4596420728834	8.88275353170757	2.57688854117586	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.439119018273155	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	609068	G/A	1	20	22	42	9.54970172740286	11.4953280998569	-1.945626372454	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.643643854965604	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	609353	G/A	1	31	26	57	14.8020376774744	13.5853877543763	1.21664992309815	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.791818201317958	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_607066_609720:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_607066_609720:PHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	610277	T/C	1	23	11	34	10.9821569865133	5.74766404992843	5.23449293658486	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0858395683032324	ENSG00000070047:ENST00000416188:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000413872:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000534320:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000264555:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000533464:exon_610196_610347:PHRF1;ENSG00000070047:ENST00000526724:exon_610196_610347:PHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	613165	G/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	613208	T/C	1	135	169	304	64.4604866599693	88.3050204034458	-23.8445337434765	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00688333707884828	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	613297	T/G	1	133	257	390	63.505516487229	134.286332802873	-70.7808163156442	T:G	T	G	10	0.522514913629857	7.24249677792644e-13	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000531912:exon_612999_613591:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_613206_613595:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_613206_613595:IRF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	614318	T/C	1	92	106	198	43.9286279460532	55.3865808447648	-11.4579528987117	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.117348740854664	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614174_614399:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614203_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000525750:exon_613785_614397:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614009_614534:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614090_614399:IRF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	614864	C/T	1	82	94	176	39.1537770823517	49.1164018812066	-9.96262479885484	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.151475139317915	ENSG00000185507:ENST00000525445:exon_614797_614984:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000348655:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397570:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397566:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397562:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000397574:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533182:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000469048:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000330243:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532326:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000534109:exon_614797_614952:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532788:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000527160:exon_614797_614887:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000532096:exon_614797_615007:IRF7;ENSG00000185507:ENST00000533190:exon_614783_615259:IRF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	644529	C/A	1	57	33	90	27.2166499230981	17.2429921497853	9.97365777331287	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0443786946367098	ENSG00000177030:ENST00000359958:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000338675:exon_644225_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527170:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000382409:exon_644233_644654:DEAF1;ENSG00000177030:ENST00000527658:exon_644234_644654:DEAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	775108	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000177225:ENST00000397472:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000319863:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000354286:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000479959:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000526325:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000524550:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000534603:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000442059:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000528602:exon_775066_775142:PDDC1;ENSG00000177225:ENST00000529362:exon_775065_775142:PDDC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	802705	G/A	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000177595:ENST00000525028:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000524486:exon_802682_803647:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000432865:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000407926:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000444618:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000411829:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000347755:exon_802682_802891:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000531286:exon_802682_802750:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000527357:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000534525:exon_802682_804463:LRDD;ENSG00000177595:ENST00000528122:exon_802682_803149:LRDD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	811853	C/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	822588	C/T	1	48	43	91	22.9192841457669	22.4681412860839	0.45114285968301	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000177666:ENST00000336615:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000525250:exon_822397_822606:PNPLA2;ENSG00000177666:ENST00000531923:exon_822016_822606:PNPLA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	1902768	G/A	1	512	419	931	244.472364221513	218.93374881091	25.5386154106031	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0943954128680541	ENSG00000130592:ENST00000311604:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381788:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000421485:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000446808:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381775:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381758:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000405957:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000451814:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000457279:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000429923:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000406638:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000418975:exon_1902662_1902782:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000417766:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000381768:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000472974:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000432093:exon_1902662_1902826:LSP1;ENSG00000130592:ENST00000485341:exon_1902662_1902826:LSP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	1977651	C/A	1	276	277	553	131.785883838159	144.73663107547	-12.9507472373109	A:C:G	C	A	10	0.522514913629857	0.287235722038012	ENSG00000214026:ENST00000228013:exon_1977486_1977825:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000397298:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000381519:exon_1977486_1977678:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000462288:exon_1977486_1977839:MRPL23;ENSG00000214026:ENST00000429295:exon_1977486_1977839:MRPL23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	2417893	C/T	1	186	192	378	88.8122260648466	100.322863416933	-11.510637352086	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.236860127950201	ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	2417935	T/C	1	208	183	391	99.3168979649897	95.6202291942638	3.69666877072589	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.723258253117538	ENSG00000110651:ENST00000263645:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492627:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000527343:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000464784:exon_2417858_2418136:CD81;ENSG00000110651:ENST00000381036:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000492252:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000526072:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000531840:exon_2416202_2418626:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481687:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000468153:exon_2417858_2417944:CD81;ENSG00000110651:ENST00000481386:exon_2417543_2417944:CD81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	2424647	G/A	1	43	49	92	20.5318587139161	25.603230767863	-5.07137205394685	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.298419084350030	ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000440813:exon_2424075_2424678:TSSC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	2424754	G/A	1	36	54	90	17.1894631093251	28.2158053360123	-11.0263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0204312127937247	ENSG00000184281:ENST00000380996:exon_2424075_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000333256:exon_2423841_2425106:TSSC4;ENSG00000184281:ENST00000467308:exon_2424747_2425106:TSSC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	4103524	A/G	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4103414_4103581:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533343:exon_4103435_4103581:STIM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	4112582	C/T	1	15	14	29	7.16227629555214	7.315208790818	-0.152932495265853	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167323:ENST00000300737:exon_4112512_4114439:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000527651:exon_4112512_4113028:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000533977:exon_4112512_4113356:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526596:exon_4112512_4112899:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000531332:exon_4112512_4112663:STIM1;ENSG00000167323:ENST00000526156:exon_4112512_4113196:STIM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	4159457	A/G	1	96	102	198	45.8385682915337	53.2965211902454	-7.45795289871169	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.319280537956186	ENSG00000167325:ENST00000423050:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000532170:exon_4159425_4160100:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000300738:exon_4159425_4160106:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533349:exon_4159425_4160105:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000534285:exon_4159425_4159676:RRM1;ENSG00000167325:ENST00000533495:exon_4159425_4160105:RRM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	5664831	C/A	1	20	20	40	9.54970172740286	10.4502982725971	-0.900596545194283	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.87453706107043	ENSG00000242885:ENST00000380091:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000337072:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000514226:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000429814:exon_5664374_5665628:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000396866:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000457787:exon_5664374_5665623:TRIM6-TRIM34;ENSG00000242885:ENST00000495668:exon_5664374_5665039:TRIM6-TRIM34;ENSG00000239456:ENST00000354852:exon_5664374_5665628:TRIM34
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	5700340	T/C	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000132256:ENST00000380034:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000305836:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380015:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000380027:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000433961:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396853:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396847:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000438025:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000483835:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000396855:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000492086:exon_5700304_5700370:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000465634:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000487241:exon_5700304_5700399:TRIM5;ENSG00000132256:ENST00000412903:exon_5700304_5700399:TRIM5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	5717762	T/C	1	68	56	124	32.4689858731697	29.260835163272	3.20815070989773	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.590397940631064	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000460454:exon_5717397_5718243:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5717397_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5717722_5717885:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5717732_5717885:TRIM22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	5718517	G/A	1	108	68	176	51.5683893279754	35.5310141268303	16.0373752011452	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0157466005904718	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000425490:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414641:exon_5718478_5718573:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5718478_5718573:TRIM22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	5719750	G/C	1	126	93	219	60.163120882638	48.5938869675767	11.5692339150613	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.120202586751019	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	5719756	C/T	1	84	70	154	40.108747255092	36.57604395409	3.53270330100202	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.57363654812894	ENSG00000132274:ENST00000379965:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000455293:exon_5719557_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000454828:exon_5719545_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000480395:exon_5718478_5719775:TRIM22;ENSG00000132274:ENST00000414897:exon_5719710_5719775:TRIM22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	6340416	G/A	0	15	0	15	7.16227629555214	0	7.16227629555214	G	G		10	0.522514913629857	7.43750612807365e-05	ENSG00000170955:ENST00000532354:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000303927:exon_6340176_6340794:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000524852:exon_6340360_6340901:PRKCDBP;ENSG00000170955:ENST00000530979:exon_6340374_6340794:PRKCDBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	6593198	C/T	1	8	17	25	3.81988069096114	8.88275353170757	-5.06287284074643	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0465610512078098	ENSG00000179532:ENST00000254579:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000527990:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000529821:exon_6592866_6593252:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000533635:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525883:exon_6591239_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000530197:exon_6592866_6593249:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000532467:exon_6592866_6593257:DNHD1;ENSG00000179532:ENST00000525889:exon_6592866_6593257:DNHD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	6622714	G/A	1	42	25	67	20.054373627546	13.0628728407464	6.99150078679958	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.111191638817956	ENSG00000132275:ENST00000254605:exon_6622379_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000533907:exon_6622156_6622832:RRP8;ENSG00000132275:ENST00000530762:exon_6622484_6622832:RRP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	6703334	A/G	1	445	401	846	212.480863434714	209.528480365573	2.95238306914095	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.863390548121518	ENSG00000158042:ENST00000288937:exon_6702013_6703633:MRPL17;ENSG00000158042:ENST00000529958:exon_6703182_6703633:MRPL17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	7662732	C/T	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534409:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530081:exon_7662710_7662851:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000532172:exon_7662710_7663387:PPFIBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	7673015	G/A	1	32	26	58	15.2795227638446	13.5853877543763	1.69413500946829	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.69476986433319	ENSG00000166387:ENST00000299492:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000533792:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000528883:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530181:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000530582:exon_7672887_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000529664:exon_7671980_7673075:PPFIBP2;ENSG00000166387:ENST00000534552:exon_7672946_7673075:PPFIBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	7686596	G/A	1	130	156	286	62.0730612281186	81.5123265262577	-19.4392652981391	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0243310108560124	ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	7686674	T/C	1	155	110	265	74.0101883873722	57.4766404992843	16.5335478880879	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0425593471659707	ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7686331_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000528585:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7686335_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000534698:exon_7686365_7686777:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7686513_7686777:CYB5R2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	7687715	T/C	1	116	118	234	55.3882700189366	61.6567598083231	-6.26848978938654	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.432542381605416	ENSG00000166394:ENST00000524790:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299498:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000533558:exon_7687682_7687781:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000526084:exon_7686336_7689044:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000532621:exon_7687682_7687915:CYB5R2;ENSG00000166394:ENST00000299497:exon_7687682_7687781:CYB5R2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	8977830	A/G	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000175348:ENST00000309134:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000534025:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000525069:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000528117:exon_8977737_8977845:TMEM9B;ENSG00000175348:ENST00000530136:exon_8977737_8977845:TMEM9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	9161201	T/C	1	32	26	58	15.2795227638446	13.5853877543763	1.69413500946829	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.69476986433319	ENSG00000184014:ENST00000328194:exon_9160372_9161401:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000529977:exon_9160377_9161401:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000530044:exon_9161006_9161401:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000528725:exon_9161050_9161401:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000527700:exon_9161051_9161401:DENND5A;ENSG00000184014:ENST00000533737:exon_9161062_9161401:DENND5A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	10786142	C/T	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10786095_10786278:CTR9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	10800287	G/T	1	59	47	106	28.1716200958384	24.5582009406033	3.61341915523515	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.497647294187142	ENSG00000198730:ENST00000361367:exon_10800226_10801290:CTR9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	10821185	G/A	1	82	67	149	39.1537770823517	35.0084992132004	4.1452778691513	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.512717360921252	ENSG00000110321:ENST00000429377:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000526148:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000525681:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000532383:exon_10821099_10821895:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000339995:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000396525:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000534272:exon_10821099_10821303:EIF4G2;ENSG00000110321:ENST00000379653:exon_10821099_10821303:EIF4G2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	11373587	A/G	0	0	53	53	0	27.6932904223824	-27.6932904223824	G	A	G	10	0.522514913629857	9.65761770052998e-18	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	11976628	G/A	1	16	23	39	7.63976138192229	12.0178430134867	-4.37808163156442	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.19940878139177	ENSG00000170242:ENST00000339865:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000527733:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000399455:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000305481:exon_11976581_11976711:USP47;ENSG00000170242:ENST00000529813:exon_11976581_11976711:USP47
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	13410371	A/G	1	18	15	33	8.59473155466257	7.83772370444786	0.757007850214718	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.862585582158515	ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13409548_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13409571_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13410230_13410688:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13410249_13410688:BTBD10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	13441126	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000148925:ENST00000278174:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000527102:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000530907:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000528120:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525864:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525661:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000525108:exon_13441007_13441292:BTBD10;ENSG00000148925:ENST00000532261:exon_13441040_13441292:BTBD10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	14482822	A/G	1	51	46	97	24.3517394048773	24.0356860269734	0.31605337790387	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129083:ENST00000437479:exon_14482732_14482877:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000249923:exon_14482732_14482877:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000439561:exon_14482732_14482877:COPB1;ENSG00000129083:ENST00000526527:exon_14482732_14482887:COPB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	14902031	A/G	1	13	8	21	6.20730612281186	4.18011930903886	2.027186813773	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.393468965686283	ENSG00000186104:ENST00000532805:exon_14901926_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000530609:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000534686:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000334636:exon_14901682_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000526489:exon_14901681_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000526276:exon_14901861_14902314:CYP2R1;ENSG00000186104:ENST00000532641:exon_14901883_14902314:CYP2R1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	18108512	T/C	1	16	12	28	7.63976138192229	6.27017896355828	1.369582418364	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.706380291404001	ENSG00000166788:ENST00000524803:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000300013:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531751:exon_18108413_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531581:exon_18108409_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000529318:exon_18108404_18108601:SAAL1;ENSG00000166788:ENST00000531216:exon_18108413_18108601:SAAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	19251085	G/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129173:ENST00000527884:exon_19251001_19251535:E2F8;ENSG00000129173:ENST00000396159:exon_19251001_19251535:E2F8;ENSG00000129173:ENST00000250024:exon_19251001_19251535:E2F8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	20404613	T/G	1	23	20	43	10.9821569865133	10.4502982725971	0.531858713916147	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.880225766123912	ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	20404757	T/C	1	49	47	96	23.396769232137	24.5582009406033	-1.16143170846627	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.83855876485376	ENSG00000109854:ENST00000421577:exon_20404526_20404880:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000443524:exon_20404526_20404914:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000419348:exon_20404526_20405328:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000338653:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000451739:exon_20404526_20405329:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000531058:exon_20404526_20405162:HTATIP2;ENSG00000109854:ENST00000533914:exon_20404526_20405324:HTATIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	20529892	A/G	1	17	3	20	8.11724646829243	1.56754474088957	6.54970172740286	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00307342600783112	ENSG00000185238:ENST00000331079:exon_20529850_20530799:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000330796:exon_20529850_20530840:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000437750:exon_20529850_20530254:PRMT3;ENSG00000185238:ENST00000529592:exon_20529850_20530828:PRMT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	28057957	T/C	1	10	18	28	4.77485086370143	9.40526844533743	-4.630417581636	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0899726052275755	ENSG00000121621:ENST00000263181:exon_28057764_28058211:KIF18A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	31805017	G/T	1	50	47	97	23.8742543185071	24.5582009406033	-0.683946622096133	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.919255640679582	ENSG00000109911:ENST00000350638:exon_31804941_31805546:ELP4;ENSG00000109911:ENST00000265650:exon_31804941_31805327:ELP4;ENSG00000109911:ENST00000379163:exon_31804941_31805319:ELP4;ENSG00000109911:ENST00000395934:exon_31804941_31805323:ELP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	32124978	T/C	1	5	11	16	2.38742543185071	5.74766404992843	-3.36023861807771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.131589504447199	ENSG00000049449:ENST00000532942:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000054950:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000533898:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000532474:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000527337:exon_32124827_32125026:RCN1;ENSG00000049449:ENST00000531345:exon_32123541_32125026:RCN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	32874926	G/A	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000135378:ENST00000257836:exon_32874842_32879669:PRRG4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	32956620	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000060749:ENST00000399302:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000078652:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000428421:exon_32953289_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000527788:exon_32954638_32956981:QSER1;ENSG00000060749:ENST00000524678:exon_32956130_32956981:QSER1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	33106616	C/T	1	45	36	81	21.4868288866564	18.8105368906749	2.67629199598158	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.579507277050173	ENSG00000176148:ENST00000324357:exon_33106496_33106666:TCP11L1;ENSG00000176148:ENST00000527661:exon_33106496_33106744:TCP11L1;ENSG00000176102:ENST00000528865:exon_33106578_33106835:CSTF3;ENSG00000176102:ENST00000323959:exon_33106130_33106835:CSTF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	33881016	T/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000135363:ENST00000257818:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000395833:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000411482:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000464025:exon_33880122_33881121:LMO2;ENSG00000135363:ENST00000456680:exon_33880125_33881121:LMO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	34485711	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000121691:ENST00000241052:exon_34485652_34485782:CAT;ENSG00000121691:ENST00000530343:exon_34485652_34485746:CAT;ENSG00000121691:ENST00000525707:exon_34485652_34485782:CAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	43876698	C/T	1	26	14	40	12.4146122456237	7.315208790818	5.09940345480572	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.115327627136801	ENSG00000149084:ENST00000278353:exon_43876694_43878160:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533090:exon_43876694_43877448:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000533802:exon_43876694_43876855:HSD17B12;ENSG00000149084:ENST00000525736:exon_43876694_43878167:HSD17B12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	44636839	C/T	1	188	154	342	89.7671962375869	80.467296698998	9.29989953858889	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.330036137479765	ENSG00000085117:ENST00000526958:exon_44636822_44636845:CD82;ENSG00000085117:ENST00000227155:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000441195:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000342935:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000525898:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530601:exon_44636822_44636923:CD82;ENSG00000085117:ENST00000530931:exon_44636822_44636923:CD82
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	46341946	C/T	1	28	45	73	13.369582418364	23.5131711133436	-10.1435886949796	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0189626285645665	ENSG00000157613:ENST00000529193:exon_46341815_46342079:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000446415:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000288400:exon_46341815_46342080:CREB3L1;ENSG00000157613:ENST00000530244:exon_46341815_46342079:CREB3L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	46700548	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000175220:ENST00000311956:exon_46698630_46700775:ARHGAP1;ENSG00000175220:ENST00000526423:exon_46700273_46700775:ARHGAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	47188411	C/T	1	38	54	92	18.1444332820654	28.2158053360123	-10.0713720539468	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0370811635890841	ENSG00000149182:ENST00000524782:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000426335:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000319543:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000419701:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000455951:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000395449:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000533243:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000527776:exon_47188311_47188437:ARFGAP2;ENSG00000149182:ENST00000526342:exon_47188311_47188437:ARFGAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	47290208	C/G	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000025434:ENST00000529540:exon_47290101_47290389:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000298843:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000395397:exon_47290101_47290363:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405576:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481020:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000481889:exon_47290101_47290382:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000532630:exon_47290101_47290367:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000407404:exon_47290101_47290332:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000441012:exon_47290101_47290335:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000467728:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000514400:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000518032:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000528825:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000405853:exon_47290101_47290394:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000344715:exon_47290101_47290396:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000527949:exon_47290101_47290368:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000462051:exon_47290101_47290395:NR1H3;ENSG00000025434:ENST00000494018:exon_47290101_47290395:NR1H3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	48145380	A/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48145165_48145422:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48145165_48145422:PTPRJ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	48146622	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000149177:ENST00000278456:exon_48146520_48146738:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000418331:exon_48146520_48146738:PTPRJ;ENSG00000149177:ENST00000440289:exon_48146520_48146738:PTPRJ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	57077738	C/G	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000149115:ENST00000528882:exon_57076366_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000358252:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000532437:exon_57075869_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000326757:exon_57076369_57078030:TNKS1BP1;ENSG00000149115:ENST00000530920:exon_57077306_57078030:TNKS1BP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	57184056	T/C	1	41	32	73	19.5768885411759	16.7204772361554	2.85641130502044	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.558597905554608	ENSG00000254979:ENST00000534081:exon_57184046_57184143:RP11-872D17.8;ENSG00000134802:ENST00000395123:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000395124:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000352187:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000428603:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000529554:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000525205:exon_57184046_57184126:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000533524:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000530005:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000528098:exon_57184046_57184143:SLC43A3;ENSG00000134802:ENST00000442654:exon_57184046_57184143:SLC43A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	58919454	T/C	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000166801:ENST00000528737:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000435774:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000423534:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000420244:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000527629:exon_58919223_58919691:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000361723:exon_58919223_58922509:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000440740:exon_58919223_58922507:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000533703:exon_58919223_58922512:FAM111A;ENSG00000166801:ENST00000531147:exon_58919223_58922509:FAM111A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60610065	G/A	1	35	37	72	16.711978022955	19.3330518043047	-2.6210737813497	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.556997301488162	ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60609429_60610355:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60610019_60610098:CCDC86
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60615418	C/T	1	30	28	58	14.3245525911043	14.630417581636	-0.305864990531706	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60615397_60615526:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60615397_60615526:CCDC86
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60617834	C/A	1	86	62	148	41.0637174278323	32.3959246450511	8.66779278278116	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.162300400231443	ENSG00000110104:ENST00000227520:exon_60617679_60618561:CCDC86;ENSG00000110104:ENST00000339492:exon_60617679_60618553:CCDC86
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60666341	G/A	1	163	115	278	77.8300690783333	60.0892150674336	17.7408540108998	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0355075843824329	ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60666334_60666403:PRPF19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60673868	T/C	1	49	53	102	23.396769232137	27.6932904223824	-4.29652119024541	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.428276399542599	ENSG00000110107:ENST00000227524:exon_60673836_60674056:PRPF19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60689445	T/C	1	25	15	40	11.9371271592536	7.83772370444786	4.09940345480572	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.208731295010776	ENSG00000110108:ENST00000227525:exon_60689246_60690913:TMEM109;ENSG00000110108:ENST00000446886:exon_60689246_60689485:TMEM109
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60701136	C/G	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60701014_60701216:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60701014_60701216:TMEM132A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	60704213	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000006118:ENST00000005286:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000453848:exon_60703336_60704631:TMEM132A;ENSG00000006118:ENST00000444690:exon_60703336_60704628:TMEM132A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61106892	G/C	1	12	2	14	5.72982103644172	1.04502982725971	4.684791209182	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0141648042661962	ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61106726_61106907:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529092:exon_61106726_61106998:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61106830_61106907:DAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61108974	G/A	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000532173:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61108908_61108986:DAK;ENSG00000149476:ENST00000448123:exon_61108908_61108986:DAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61112802	C/T	1	20	22	42	9.54970172740286	11.4953280998569	-1.945626372454	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.643643854965604	ENSG00000149476:ENST00000394900:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000311463:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000529479:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000534084:exon_61112732_61112838:DAK;ENSG00000149476:ENST00000525366:exon_61112786_61113037:DAK;ENSG00000149476:ENST00000524440:exon_61112791_61113037:DAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61165280	G/A	1	13	2	15	6.20730612281186	1.04502982725971	5.16227629555214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.008238482582775	ENSG00000187049:ENST00000334888:exon_61165246_61165447:TMEM216;ENSG00000187049:ENST00000398979:exon_61165246_61165447:TMEM216
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61179285	G/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000149532:ENST00000340437:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000394888:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000439958:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000477890:exon_61179241_61179409:CPSF7;ENSG00000149532:ENST00000448745:exon_61179241_61179409:CPSF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61897832	G/A	1	6	13	19	2.86491051822086	6.79269387718814	-3.92778335896728	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.105644804013078	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61897254_61898062:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528037:exon_61897254_61898062:INCENP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	61906374	T/C	1	11	15	26	5.25233595007157	7.83772370444786	-2.58538775437628	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.332290693598278	ENSG00000149503:ENST00000394818:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000278849:exon_61906360_61906477:INCENP;ENSG00000149503:ENST00000528375:exon_61906360_61906477:INCENP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62284468	A/C	1	63	29	92	30.081560441319	15.1529324952659	14.9286279460532	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.00229030058286876	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62285441	A/G	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62285665	C/T	1	16	17	33	7.63976138192229	8.88275353170757	-1.24299214978528	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728920287854378	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62286344	A/C	1	29	13	42	13.8470675047341	6.79269387718814	7.05437362754601	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0308564038130505	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62287828	T/C	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000124942:ENST00000378024:exon_62283377_62301546:AHNAK;ENSG00000124942:ENST00000244934:exon_62284216_62287926:AHNAK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62334908	G/C	1	1577	762	2339	752.993981205715	398.156364185951	354.837617019764	A:T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	6.50206524410693e-50	ENSG00000254772:ENST00000329251:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000525340:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000378019:exon_62334871_62335000:EEF1G;ENSG00000254772:ENST00000524420:exon_62334871_62335000:EEF1G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62378801	T/C	1	10	17	27	4.77485086370143	8.88275353170757	-4.10790266800614	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.125898035435311	ENSG00000149499:ENST00000394773:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000394776:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000278845:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494176:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000529309:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000494448:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466886:exon_62378559_62378816:EML3;ENSG00000149499:ENST00000466671:exon_62378559_62378819:EML3;ENSG00000149499:ENST00000419857:exon_62378584_62378816:EML3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62383981	A/C	1	52	54	106	24.8292244912474	28.2158053360123	-3.38658084476485	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.559918352573668	ENSG00000149541:ENST00000265471:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000531383:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000532585:exon_62383978_62384268:B3GAT3;ENSG00000149541:ENST00000534026:exon_62383978_62384268:B3GAT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62400660	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000089597:ENST00000532402:exon_62400656_62400743:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000346178:exon_62400656_62400743:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000356638:exon_62400656_62400743:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534779:exon_62400656_62400743:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000526732:exon_62400656_62400743:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534422:exon_62400656_62400739:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534613:exon_62400656_62400743:GANAB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62407167	G/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000089597:ENST00000532402:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000346178:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000356638:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000531841:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534613:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000526210:exon_62407099_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000529737:exon_62407103_62407203:GANAB;ENSG00000089597:ENST00000534419:exon_62407099_62407203:GANAB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62432973	C/T	0	26	0	26	12.4146122456237	0	12.4146122456237	C	C		10	0.522514913629857	5.13318408342684e-08	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62433029	A/G	1	8	11	19	3.81988069096114	5.74766404992843	-1.92778335896728	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.492108880387063	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62437169	G/A	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000162194:ENST00000354588:exon_62437113_62437275:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000431002:exon_62437113_62439237:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000532208:exon_62437113_62437275:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000415855:exon_62437113_62437275:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000527679:exon_62437113_62437275:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000528862:exon_62437113_62437275:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000377954:exon_62437137_62437275:C11orf48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62437425	T/C	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000162194:ENST00000354588:exon_62437354_62437513:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000431002:exon_62437113_62439237:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000532208:exon_62437354_62437637:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000415855:exon_62437354_62437487:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000527679:exon_62437354_62437513:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000528115:exon_62437354_62437486:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000377954:exon_62437354_62437487:C11orf48;ENSG00000162194:ENST00000526490:exon_62437354_62438157:C11orf48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	62439414	C/T	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.618836525385897	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	63767186	A/G	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000133315:ENST00000255681:exon_63767114_63767235:MACROD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	63970906	C/T	0	8	0	8	3.81988069096114	0	3.81988069096114	C	C		10	0.522514913629857	0.00825830647346234	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	63978171	C/T	1	44	37	81	21.0093438002863	19.3330518043047	1.67629199598158	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.739596544546832	ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63978083_63978316:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63978083_63978316:FERMT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	63979169	G/A	1	151	115	266	72.1002480418916	60.0892150674336	12.011032974458	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.141331162453250	ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63979117_63979219:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63979117_63979219:FERMT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	63988102	C/T	1	362	273	635	172.849601265992	142.646571420951	30.2030298450408	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0171097810294613	ENSG00000149781:ENST00000345728:exon_63987908_63988141:FERMT3;ENSG00000149781:ENST00000279227:exon_63987908_63988141:FERMT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	63993287	C/T	0	32	0	32	15.2795227638446	0	15.2795227638446	C	C		10	0.522514913629857	1.00644145514196e-09	ENSG00000149743:ENST00000317459:exon_63993258_63993341:TRPT1;ENSG00000149743:ENST00000394546:exon_63993258_63993341:TRPT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64109118	T/G	1	8	11	19	3.81988069096114	5.74766404992843	-1.92778335896728	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.492108880387063	ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64109071_64109214:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64109078_64109214:CCDC88B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64111928	T/C	1	24	39	63	11.4596420728834	20.3780816315644	-8.91843955868099	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0312532804034593	ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64111469_64112629:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64111646_64112629:CCDC88B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64117038	G/A	1	30	39	69	14.3245525911043	20.3780816315644	-6.05352904046013	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.149895314101879	ENSG00000168071:ENST00000463837:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000356786:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000377638:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494080:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000494566:exon_64117023_64118167:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000492980:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000301897:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000359902:exon_64117023_64117140:CCDC88B;ENSG00000168071:ENST00000443542:exon_64117023_64117140:CCDC88B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64622869	G/C	1	72	71	143	34.3789262186503	37.0985588677199	-2.71963264906956	T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.675982044478103	ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000484846:exon_64622794_64624135:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421510:exon_64622794_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000498472:exon_64622524_64622958:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64622794_64622958:EHD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64645871	A/G	1	48	34	82	22.9192841457669	17.7655070634151	5.15377708235172	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.270376426433233	ENSG00000110047:ENST00000320631:exon_64645533_64646191:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000359393:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000421303:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000433803:exon_64645533_64645959:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000466015:exon_64645533_64646013:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000457202:exon_64645533_64645956:EHD1;ENSG00000110047:ENST00000411683:exon_64645533_64645959:EHD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64662834	C/A	1	10	12	22	4.77485086370143	6.27017896355828	-1.49532809985685	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.531657196609609	ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64662762_64662914:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377262:exon_64662762_64662914:ATG2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64665585	C/G	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000110046:ENST00000418259:exon_64665558_64665642:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000377264:exon_64665558_64665642:ATG2A;ENSG00000110046:ENST00000421419:exon_64665558_64665642:ATG2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64789194	T/C	1	240	161	401	114.596420728834	84.124901094407	30.4715196344273	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00228041744584651	ENSG00000213465:ENST00000246747:exon_64789193_64789656:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529384:exon_64789193_64789360:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000533729:exon_64789193_64789632:ARL2;ENSG00000213465:ENST00000529254:exon_64788988_64789588:ARL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64882789	C/T	1	38	21	59	18.1444332820654	10.972813186227	7.17162009583843	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0681634592486742	ENSG00000149809:ENST00000526809:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000279263:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000533766:exon_64882786_64882862:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000534371:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529601:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000525385:exon_64882786_64882856:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000531321:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529292:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000530650:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000529233:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000532328:exon_64882786_64882908:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000527968:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000528802:exon_64882786_64882866:TM7SF2;ENSG00000149809:ENST00000526048:exon_64882385_64883070:TM7SF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64897798	G/T	1	19	12	31	9.07221664103272	6.27017896355828	2.80203767747443	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.370393957183701	ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64897723_64897851:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64897723_64897851:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64897723_64897851:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64897474_64897851:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64897723_64897851:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64897723_64897851:SYVN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	64898229	T/C	1	22	17	39	10.5046719001431	8.88275353170757	1.62191836843558	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.6339344503811	ENSG00000162298:ENST00000294256:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000377190:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000307289:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000449943:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526060:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000434219:exon_64898132_64898295:SYVN1;ENSG00000162298:ENST00000526121:exon_64898200_64898273:SYVN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65168281	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65168195_65168338:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65168195_65168338:FRMD8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65172473	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000126391:ENST00000317568:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000355991:exon_65172335_65172539:FRMD8;ENSG00000126391:ENST00000416776:exon_65172335_65172539:FRMD8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65337957	G/A	1	24	16	40	11.4596420728834	8.36023861807771	3.09940345480572	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.346577859987784	ENSG00000173465:ENST00000309328:exon_65337901_65337981:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000531405:exon_65337931_65338226:SSSCA1;ENSG00000173465:ENST00000527920:exon_65337956_65338226:SSSCA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65347431	G/A	1	11	17	28	5.25233595007157	8.88275353170757	-3.630417581636	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.188554810823175	ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65347407_65347460:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65347407_65347460:EHBP1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65349063	G/A	1	23	32	55	10.9821569865133	16.7204772361554	-5.73832024964214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.137831126427431	ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000533237:exon_65349010_65349487:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65349756	T/G	1	18	16	34	8.59473155466257	8.36023861807771	0.234492936584861	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000173442:ENST00000309295:exon_65349010_65351236:EHBP1L1;ENSG00000173442:ENST00000526990:exon_65348995_65352163:EHBP1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65545306	C/A	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.296181191073666	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65545913	G/A	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.340687410376918	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65623739	A/G	0	0	11	11	0	5.74766404992843	-5.74766404992843	G	A	G	10	0.522514913629857	0.000294142599736238	ENSG00000172757:ENST00000530413:exon_65623406_65623944:CFL1;ENSG00000172803:ENST00000530101:exon_65623600_65624367:SNX32
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65635401	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000172638:ENST00000531972:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526628:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000526911:exon_65635332_65635478:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531645:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528176:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000307998:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000528409:exon_65635332_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000530806:exon_65635332_65635484:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000525392:exon_65635144_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000532084:exon_65635357_65635527:EFEMP2;ENSG00000172638:ENST00000531005:exon_65635361_65635527:EFEMP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65685225	T/C	1	22	27	49	10.5046719001431	14.1079026680061	-3.60323076786299	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.319696561891813	ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65685317	G/A	1	23	20	43	10.9821569865133	10.4502982725971	0.531858713916147	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.880225766123912	ENSG00000175573:ENST00000438576:exon_65684279_65685689:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000449692:exon_65684281_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000312536:exon_65684285_65685686:C11orf68;ENSG00000175573:ENST00000530188:exon_65684304_65685831:C11orf68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65732651	G/A	1	46	42	88	21.9643139730266	21.945626372454	0.0186876005725836	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65732563_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65732522_65732689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000530251:exon_65732522_65732689:SART1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65733685	C/T	1	115	106	221	54.9107849325664	55.3865808447648	-0.4757959121984	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000175467:ENST00000312397:exon_65733547_65733689:SART1;ENSG00000175467:ENST00000529532:exon_65733547_65734027:SART1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65766092	C/T	1	10	20	30	4.77485086370143	10.4502982725971	-5.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0441535360465021	ENSG00000175376:ENST00000526451:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000312234:exon_65764016_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000525767:exon_65765860_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529964:exon_65765904_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000533544:exon_65765964_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000527249:exon_65766038_65766214:EIF1AD;ENSG00000175376:ENST00000529973:exon_65766085_65766214:EIF1AD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65826803	C/T	1	353	396	749	168.55223548866	206.915905797423	-38.3636703087629	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.00540796094692468	ENSG00000087365:ENST00000528302:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000322535:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000355456:exon_65826672_65826809:SF3B2;ENSG00000087365:ENST00000529994:exon_65826672_65826809:SF3B2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	65984043	A/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000175115:ENST00000527224:exon_65983991_65984082:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_65983991_65984082:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000531298:exon_65983991_65984082:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000524784:exon_65984014_65984082:PACS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	66001386	A/C	1	15	16	31	7.16227629555214	8.36023861807771	-1.19796232252557	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.721152952918315	ENSG00000175115:ENST00000320580:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529757:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000528935:exon_66001256_66001410:PACS1;ENSG00000175115:ENST00000529795:exon_66001291_66001410:PACS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	66136972	T/C	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000174669:ENST00000357440:exon_66136840_66137003:SLC29A2;ENSG00000174669:ENST00000311161:exon_66136840_66137003:SLC29A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	66241300	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000174516:ENST00000349459:exon_66241208_66241396:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000320740:exon_66241208_66241396:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000532970:exon_66241208_66241396:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000524466:exon_66241208_66242122:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000526296:exon_66241208_66241396:PELI3;ENSG00000174516:ENST00000528752:exon_66241208_66241396:PELI3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	66612357	C/T	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000173653:ENST00000533277:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000309657:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524506:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000524849:exon_66612340_66612507:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000532775:exon_66612340_66612479:RCE1;ENSG00000173653:ENST00000525356:exon_66612340_66612507:RCE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	67196049	G/A	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000175634:ENST00000530623:exon_67195931_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524934:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000524814:exon_67195965_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000420069:exon_67195969_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67195972_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67195975_67196094:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67195976_67196711:RPS6KB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	67200819	C/T	1	61	52	113	29.1265902685787	27.1707755087526	1.95581475982615	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.777722436691198	ENSG00000175634:ENST00000312629:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000528964:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525088:exon_67200811_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000525996:exon_67200810_67200918:RPS6KB2;ENSG00000175634:ENST00000526268:exon_67200597_67200918:RPS6KB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	67257556	C/T	1	222	223	445	106.001689174172	116.520825739458	-10.5191365652864	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.319476726885959	ENSG00000110711:ENST00000528641:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000279146:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000532745:exon_67257509_67257685:AIP;ENSG00000110711:ENST00000525341:exon_67257509_67257685:AIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	67267636	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000110697:ENST00000534749:exon_67267566_67267892:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000436757:exon_67267566_67267892:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000356404:exon_67267566_67267892:PITPNM1;ENSG00000110697:ENST00000530381:exon_67267566_67267879:PITPNM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	67353970	T/C	1	1242	1328	2570	593.036477271718	693.89980530045	-100.863328028733	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	7.16799707562111e-05	ENSG00000084207:ENST00000398606:exon_67353860_67354131:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000398603:exon_67353860_67354121:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000494593:exon_67353575_67354124:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000464930:exon_67353860_67354125:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000476137:exon_67353860_67354120:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000498765:exon_67353860_67354075:GSTP1;ENSG00000084207:ENST00000467591:exon_67353860_67354040:GSTP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	67378542	T/C	1	125	176	301	59.6856357962679	91.9626247988548	-32.276989002587	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000212655834901655	ENSG00000167792:ENST00000322776:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000532303:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000529927:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000415352:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000453836:exon_67378479_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526770:exon_67377852_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000526169:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000533919:exon_67378466_67378678:NDUFV1;ENSG00000167792:ENST00000527355:exon_67378477_67378678:NDUFV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	68030015	C/T	1	32	37	69	15.2795227638446	19.3330518043047	-4.05352904046013	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.337652308414279	ENSG00000171067:ENST00000304271:exon_68028803_68030386:C11orf24;ENSG00000171067:ENST00000530166:exon_68029931_68030386:C11orf24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	68192589	A/G	1	6	13	19	2.86491051822086	6.79269387718814	-3.92778335896728	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.105644804013078	ENSG00000162337:ENST00000294304:exon_68192570_68192760:LRP5;ENSG00000162337:ENST00000529993:exon_68192570_68192760:LRP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	68704480	G/A	1	8	18	26	3.81988069096114	9.40526844533743	-5.58538775437628	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0312010976732102	ENSG00000132740:ENST00000255078:exon_68703705_68704559:IGHMBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	69456047	C/G	1	6	11	17	2.86491051822086	5.74766404992843	-2.88275353170757	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.224428896708456	ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69455873_69456279:CCND1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	69462910	G/A	1	7	20	27	3.342395604591	10.4502982725971	-7.10790266800614	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0066312853085593	ENSG00000110092:ENST00000227507:exon_69462762_69462910:CCND1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	71169547	G/C	1	19	18	37	9.07221664103272	9.40526844533743	-0.333051804304711	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000172890:ENST00000534634:exon_71169474_71170102:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524709:exon_71169474_71169558:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000529120:exon_71169474_71169602:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000524949:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000533769:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000527538:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525245:exon_71169474_71169590:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71169474_71169590:NADSYN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	71185443	C/T	1	22	17	39	10.5046719001431	8.88275353170757	1.62191836843558	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.6339344503811	ENSG00000172890:ENST00000319023:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000528509:exon_71185441_71186668:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000525200:exon_71185441_71185572:NADSYN1;ENSG00000172890:ENST00000530534:exon_71185441_71185572:NADSYN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	72004419	T/C	1	40	49	89	19.0994034548057	25.603230767863	-6.50382731305728	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.169692426533928	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72003474_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72004347_72004659:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72004347_72004659:CLPB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	72012940	C/T	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000162129:ENST00000294053:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000340729:exon_72012847_72013008:CLPB;ENSG00000162129:ENST00000437826:exon_72012847_72013008:CLPB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	73106218	G/C	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	73106294	A/C	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.296181191073666	ENSG00000054967:ENST00000064780:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000393580:exon_73106132_73106330:RELT;ENSG00000054967:ENST00000438119:exon_73106132_73106330:RELT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	73120653	A/G	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000054965:ENST00000064778:exon_73120532_73120706:FAM168A;ENSG00000054965:ENST00000356467:exon_73120532_73120706:FAM168A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	73620537	C/G	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000175575:ENST00000310571:exon_73620444_73620638:PAAF1;ENSG00000175575:ENST00000376384:exon_73620444_73620638:PAAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	73686025	G/A	1	683	451	1134	326.122313990808	235.654226047066	90.4680879437421	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	7.0275458467675e-08	ENSG00000175567:ENST00000310473:exon_73685716_73686166:UCP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	74329615	T/C	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000077514:ENST00000528481:exon_74329582_74329639:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74329582_74329849:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530511:exon_74329582_74329815:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000531615:exon_74329582_74329720:POLD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	74345735	G/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000077514:ENST00000263681:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000527458:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000532497:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000524752:exon_74345628_74345740:POLD3;ENSG00000077514:ENST00000530163:exon_74345628_74345740:POLD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	75282876	C/T	1	49	47	96	23.396769232137	24.5582009406033	-1.16143170846627	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.83855876485376	ENSG00000149257:ENST00000533603:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000358171:exon_75282826_75283828:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000524558:exon_75282826_75283827:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000421448:exon_75282826_75283825:SERPINH1;ENSG00000149257:ENST00000525876:exon_75282826_75283827:SERPINH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	75511572	T/C	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000062282:ENST00000228027:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000376262:exon_75511399_75512579:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000532657:exon_75511399_75512572:DGAT2;ENSG00000062282:ENST00000528676:exon_75511399_75511677:DGAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	77333684	G/A	1	37	20	57	17.6669481956953	10.4502982725971	7.21664992309815	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0631992377104106	ENSG00000074201:ENST00000525428:exon_77333545_77333718:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000263309:exon_77333545_77333718:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000532069:exon_77333545_77333718:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000527133:exon_77333545_77333718:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000528364:exon_77333545_77333718:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000527299:exon_77333545_77333719:CLNS1A;ENSG00000074201:ENST00000525359:exon_77333505_77333718:CLNS1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	77378388	T/C	1	33	33	66	15.7570078502147	17.2429921497853	-1.48598429957056	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.71394940107423	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	77378505	A/G	1	35	44	79	16.711978022955	22.9906561997137	-6.2786781767587	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.176660943415048	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77371041_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77377275_77378536:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77377275_77378536:RSF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	77409568	T/C	1	14	9	23	6.684791209182	4.70263422266871	1.98215698651329	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.532235244522199	ENSG00000048649:ENST00000308488:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000480887:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000360355:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531026:exon_77409532_77409573:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000526324:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000531768:exon_77409532_77409738:RSF1;ENSG00000048649:ENST00000532556:exon_77409532_77409738:RSF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	77823732	A/G	1	21	23	44	10.027186813773	12.0178430134867	-1.99065619971371	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.550893734042124	ENSG00000159063:ENST00000530608:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000299626:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525783:exon_77823696_77823797:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000376156:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000526737:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000421284:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000532440:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000524925:exon_77823696_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000529139:exon_77823426_77823816:ALG8;ENSG00000159063:ENST00000525755:exon_77823713_77823816:ALG8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	82973004	C/T	1	51	29	80	24.3517394048773	15.1529324952659	9.19880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0437336265886022	ENSG00000137500:ENST00000529689:exon_82970139_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000455220:exon_82972359_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525504:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000525503:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000260054:exon_82972498_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529611:exon_82972504_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000527495:exon_82972772_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529745:exon_82972799_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000533761:exon_82972837_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529856:exon_82972838_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529312:exon_82972933_82973008:CCDC90B;ENSG00000137500:ENST00000529073:exon_82972971_82973008:CCDC90B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	93212161	A/G	1	59	70	129	28.1716200958384	36.57604395409	-8.40442385825155	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.158277303321597	ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	93212254	C/T	1	77	78	155	36.766351650501	40.7561632631288	-3.98981161262784	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.5215013496101	ENSG00000166002:ENST00000525141:exon_93211638_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000298966:exon_93211638_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000527149:exon_93212107_93212435:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000529714:exon_93212200_93212450:C11orf75;ENSG00000166002:ENST00000526869:exon_93212215_93212435:C11orf75
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	93463678	G/A	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000166012:ENST00000323981:exon_93463114_93464382:TAF1D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	93488481	A/C	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000182919:ENST00000528288:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000331239:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000528099:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000354421:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000530620:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000524485:exon_93488376_93488552:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000527363:exon_93488376_93488559:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000526335:exon_93488376_93488492:C11orf54;ENSG00000182919:ENST00000533154:exon_93488039_93488552:C11orf54
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	94278062	A/G	1	1	8	9	0.477485086370143	4.18011930903886	-3.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0168997367977586	ENSG00000196371:ENST00000358752:exon_94277017_94283063:FUT4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	95712897	G/T	1	12	3	15	5.72982103644172	1.56754474088957	4.16227629555214	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0378700909998812	ENSG00000184384:ENST00000524717:exon_95709762_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000331217:exon_95711440_95713127:MAML2;ENSG00000184384:ENST00000440572:exon_95712112_95713127:MAML2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	102195501	A/G	1	20	23	43	9.54970172740286	12.0178430134867	-2.46814128608385	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.541969417714209	ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102195187_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102192568_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102195192_102196093:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102195186_102196093:BIRC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	102207851	G/A	1	16	14	30	7.63976138192229	7.315208790818	0.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000023445:ENST00000393201:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000263464:exon_102207640_102208465:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532808:exon_102207640_102210134:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000439863:exon_102207640_102208448:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000532609:exon_102207640_102208162:BIRC3;ENSG00000023445:ENST00000527336:exon_102207640_102208022:BIRC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	104915300	C/G	1	60	22	82	28.6491051822086	11.4953280998569	17.1537770823517	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.000141544489320841	ENSG00000204397:ENST00000375706:exon_104915119_104915385:CARD16;ENSG00000204397:ENST00000375704:exon_104915119_104915385:CARD16;ENSG00000204397:ENST00000525374:exon_104915119_104915385:CARD16;ENSG00000204397:ENST00000528513:exon_104915119_104915385:CARD16;ENSG00000204397:ENST00000527065:exon_104914638_104915658:CARD16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	108098525	G/T	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000149311:ENST00000527805:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000278616:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000299392:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000527891:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000532931:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000530958:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000452508:exon_108098503_108098615:ATM;ENSG00000149311:ENST00000526567:exon_108098503_108098615:ATM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	108586661	C/G	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000178105:ENST00000322536:exon_108586606_108586693:DDX10;ENSG00000178105:ENST00000456020:exon_108586606_108586693:DDX10;ENSG00000178105:ENST00000526794:exon_108586606_108586693:DDX10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	116633825	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	116633862	G/A	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000137656:ENST00000375445:exon_116633671_116633982:BUD13;ENSG00000137656:ENST00000260210:exon_116633269_116633982:BUD13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	117222592	G/A	1	7	14	21	3.342395604591	7.315208790818	-3.972813186227	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.124250428299143	ENSG00000110274:ENST00000525734:exon_117222506_117222658:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533153:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000278935:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000444913:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000525416:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527324:exon_117222506_117222704:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000527609:exon_117222506_117222675:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000533570:exon_117222506_117222676:CEP164;ENSG00000110274:ENST00000529538:exon_117222506_117222704:CEP164
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118828942	A/G	1	18	35	53	8.59473155466257	18.288021977045	-9.69329042238242	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0086429380805056	ENSG00000110375:ENST00000534788:exon_118828807_118829264:UPK2;ENSG00000110375:ENST00000264031:exon_118828807_118829269:UPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118886117	C/T	1	27	19	46	12.8920973319939	9.92778335896728	2.96431397302658	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.460985691579395	ENSG00000186166:ENST00000334418:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000526463:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000532132:exon_118885998_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000527356:exon_118886017_118886149:CCDC84;ENSG00000186166:ENST00000533787:exon_118886017_118886138:CCDC84
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118886656	G/A	1	14	5	19	6.684791209182	2.61257456814929	4.07221664103272	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0686149924897499	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118889016	G/A	1	295	216	511	140.858100479192	112.863221344049	27.9948791351431	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0131512991481502	ENSG00000118181:ENST00000532567:exon_118888992_118889040:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527791:exon_118888992_118889388:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527673:exon_118888992_118889400:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000530602:exon_118888992_118889054:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000527853:exon_118888072_118889401:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000236900:exon_118888992_118889052:RPS25;ENSG00000118181:ENST00000524864:exon_118888992_118889376:RPS25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118889977	G/A	1	35	47	82	16.711978022955	24.5582009406033	-7.84622291764828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0968755483167856	ENSG00000196655:ENST00000533632:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000527680:exon_118889853_118890213:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000447216:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000531290:exon_118889476_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000359005:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118889853_118890027:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000525079:exon_118889853_118890134:TRAPPC4;ENSG00000196655:ENST00000533012:exon_118889853_118890027:TRAPPC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118895632	C/T	1	14	23	37	6.684791209182	12.0178430134867	-5.33305180430471	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.09901901360081	ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118895686	C/T	1	21	31	52	10.027186813773	16.1979623225256	-6.17077550875257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0961842536394302	ENSG00000196655:ENST00000533058:exon_118895567_118896164:TRAPPC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118919206	T/C	1	98	66	164	46.793538464274	34.4859842995706	12.3075541647035	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0604367355138879	ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531952:exon_118919188_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000531682:exon_118919069_118919275:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118919184_118919275:HYOU1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118920308	G/A	1	53	51	104	25.3067095776176	26.6482605951227	-1.34155101750513	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.844536911087823	ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000528069:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118920268_118920347:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118920268_118920347:HYOU1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118922603	C/T	1	24	26	50	11.4596420728834	13.5853877543763	-2.12574568149285	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.573572875503044	ENSG00000149428:ENST00000353883:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000404233:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530024:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529972:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000525859:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000532519:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000530473:exon_118922531_118922663:HYOU1;ENSG00000149428:ENST00000529114:exon_118922531_118922663:HYOU1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118940957	C/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118949277	C/G	1	18	5	23	8.59473155466257	2.61257456814929	5.98215698651329	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0124025931669252	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	118949331	C/T	1	12	15	27	5.72982103644172	7.83772370444786	-2.10790266800614	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.446234170782508	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	119052826	C/A	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000160703:ENST00000397884:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409991:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000292199:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409265:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000409109:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000525863:exon_119052803_119053054:NLRX1;ENSG00000160703:ENST00000469103:exon_119052803_119053054:NLRX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	119206375	G/A	1	8	18	26	3.81988069096114	9.40526844533743	-5.58538775437628	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0312010976732102	ENSG00000173456:ENST00000311413:exon_119205237_119208021:RNF26
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	119545312	C/A	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000110400:ENST00000524429:exon_119545233_119545357:PVRL1;ENSG00000110400:ENST00000340882:exon_119545302_119545357:PVRL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	121429476	C/T	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121429300_121429546:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000529445:exon_121429300_121429546:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000524873:exon_121429300_121429482:SORL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	121495870	A/G	1	28	23	51	13.369582418364	12.0178430134867	1.35173940487729	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.779789235512258	ENSG00000137642:ENST00000260197:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000525532:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000532694:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000534286:exon_121495794_121495986:SORL1;ENSG00000137642:ENST00000527934:exon_121495794_121495986:SORL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	122830085	A/C	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000109944:ENST00000227349:exon_122829956_122830429:C11orf63;ENSG00000109944:ENST00000531316:exon_122829956_122830506:C11orf63
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	125351472	A/T	1	39	26	65	18.6219183684356	13.5853877543763	5.03653061405929	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.217247896648022	ENSG00000149557:ENST00000527350:exon_125351430_125351493:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000278919:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000392709:exon_125351430_125351529:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000533294:exon_125351430_125351652:FEZ1;ENSG00000149557:ENST00000532981:exon_125351430_125351529:FEZ1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	125763746	C/G	1	50	49	99	23.8742543185071	25.603230767863	-1.72897644935584	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.763255193125066	ENSG00000110060:ENST00000227474:exon_125763381_125764181:PUS3;ENSG00000110060:ENST00000530811:exon_125763382_125764181:PUS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	125769354	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000198331:ENST00000356438:exon_125769239_125770539:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000425380:exon_125769239_125770543:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000392698:exon_125769239_125770540:HYLS1;ENSG00000198331:ENST00000526028:exon_125769239_125770512:HYLS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	126131377	G/A	1	19	16	35	9.07221664103272	8.36023861807771	0.711978022955003	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.866673542710621	ENSG00000197798:ENST00000533050:exon_126131320_126131379:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000528985:exon_126131323_126131380:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000529731:exon_126131320_126131379:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000360194:exon_126131323_126131379:FAM118B;ENSG00000197798:ENST00000531935:exon_126130294_126131379:FAM118B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	126135711	G/A	1	25	27	52	11.9371271592536	14.1079026680061	-2.17077550875257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.580525495953374	ENSG00000182934:ENST00000332118:exon_126135632_126135718:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000532259:exon_126135632_126135718:SRPR;ENSG00000182934:ENST00000527817:exon_126135632_126135718:SRPR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	126143246	G/A	1	11	16	27	5.25233595007157	8.36023861807771	-3.10790266800614	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.252313956365784	ENSG00000110074:ENST00000263578:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534011:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000442061:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525083:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000525770:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527004:exon_126143234_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000526366:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000524751:exon_126143211_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532101:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000532125:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000534315:exon_126143231_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000531257:exon_126143231_126143984:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000527875:exon_126142984_126143349:FOXRED1;ENSG00000110074:ENST00000533395:exon_126142986_126143349:FOXRED1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	126174164	C/T	1	56	57	113	26.739164836728	29.7833500769019	-3.04418524017384	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.573549179007437	ENSG00000255062:ENST00000524964:exon_126174103_126174213:RP11-712L6.5;ENSG00000110063:ENST00000263579:exon_126173647_126174176:DCPS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	128333503	T/C	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000134954:ENST00000345075:exon_128333404_128333518:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000392668:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000319397:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000526145:exon_128333404_128333522:ETS1;ENSG00000134954:ENST00000530924:exon_128333404_128333524:ETS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	128680613	C/T	1	16	22	38	7.63976138192229	11.4953280998569	-3.85556671793457	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.255810561867945	ENSG00000151702:ENST00000525560:exon_128680354_128681291:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000344954:exon_128680354_128683161:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000429175:exon_128680354_128682311:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000527786:exon_128680354_128681115:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000534087:exon_128680354_128681398:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000281428:exon_128680354_128683161:FLI1;ENSG00000151702:ENST00000528790:exon_128680354_128682311:FLI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	134029817	A/G	1	21	22	43	10.027186813773	11.4953280998569	-1.46814128608385	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.76055343814137	ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525977:exon_134029787_134029969:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000527944:exon_134029785_134029969:NCAPD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	134055337	A/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000151503:ENST00000534532:exon_134055230_134055421:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000281189:exon_134055230_134055421:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000534548:exon_134055230_134055421:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000525964:exon_134055230_134055421:NCAPD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	11	134095079	T/C	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000151503:ENST00000534227:exon_134094991_134095348:NCAPD3;ENSG00000151503:ENST00000532445:exon_134094991_134095348:NCAPD3;ENSG00000151502:ENST00000281187:exon_134094539_134095239:VPS26B;ENSG00000151502:ENST00000525095:exon_134094571_134095341:VPS26B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	1702645	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000171823:ENST00000339235:exon_1702039_1703331:FBXL14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	2973495	A/G	1	12	7	19	5.72982103644172	3.657604395409	2.07221664103272	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.368580760602116	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	2973615	T/C	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2973486_2973661:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2973486_2973661:FOXM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	2983636	A/G	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000111206:ENST00000361953:exon_2983143_2983691:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000359843:exon_2983143_2983691:FOXM1;ENSG00000111206:ENST00000342628:exon_2983143_2983691:FOXM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	2997397	G/A	1	47	30	77	22.4417990593967	15.6754474088957	6.76635165050101	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.138154414066200	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	4459032	G/A	1	4	11	15	1.90994034548057	5.74766404992843	-3.83772370444786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.067798617844541	ENSG00000078237:ENST00000179259:exon_4458985_4459062:C12orf5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	6753327	T/G	0	0	12	12	0	6.27017896355828	-6.27017896355828	G	T	G	10	0.522514913629857	0.000140448704640196	ENSG00000111644:ENST00000229243:exon_6753303_6753771:ACRBP;ENSG00000111644:ENST00000414226:exon_6753303_6753672:ACRBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	6968685	C/A	1	22	27	49	10.5046719001431	14.1079026680061	-3.60323076786299	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.319696561891813	ENSG00000111667:ENST00000229268:exon_6968634_6968705:USP5;ENSG00000111667:ENST00000389231:exon_6968634_6968705:USP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	7015707	G/T	1	31	24	55	14.8020376774744	12.5403579271166	2.26167975035786	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.59056984321055	ENSG00000010626:ENST00000433346:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000007969:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000382257:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000451681:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000428946:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000323702:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000457146:exon_7015573_7015782:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000486401:exon_7015573_7015919:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000431207:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000443597:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000436789:exon_7015573_7015826:LRRC23;ENSG00000010626:ENST00000429740:exon_7015573_7015826:LRRC23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	9875218	A/C	1	53	6	59	25.3067095776176	3.13508948177914	22.1716200958384	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1.29955885559896e-09	ENSG00000184293:ENST00000327839:exon_9875094_9875409:CLECL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	10659584	C/T	1	263	1	264	125.578577715348	0.522514913629857	125.056062801718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1.05395121033864e-72	ENSG00000180574:ENST00000322446:exon_10658502_10659809:AC068775.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	14649196	A/G	1	23	28	51	10.9821569865133	14.630417581636	-3.64826059512271	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.328677949806312	ENSG00000171681:ENST00000261168:exon_14649165_14649277:ATF7IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	15095442	A/C	1	2513	2260	4773	1199.92002204817	1180.88370480348	19.0363172446926	A:T:C:G	A	C	10	0.522514913629857	0.581956146699691	ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	15095558	C/G	1	1710	1524	3234	816.499497692944	796.312728371902	20.1867693210423	T:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.481409693214134	ENSG00000111348:ENST00000228945:exon_15094950_15095655:ARHGDIB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	22213786	C/T	1	31	21	52	14.8020376774744	10.972813186227	3.82922449124744	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.331895602862628	ENSG00000111726:ENST00000229329:exon_22213766_22213860:CMAS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	67700127	G/A	1	68	67	135	32.4689858731697	35.0084992132004	-2.5395133400307	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.667686692798302	ENSG00000111530:ENST00000299218:exon_67698884_67700377:CAND1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	70188941	A/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000127328:ENST00000378815:exon_70188921_70190424:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000247833:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000417413:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000483530:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000362025:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325555:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000378809:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000325596:exon_70188921_70189124:RAB3IP;ENSG00000127328:ENST00000526994:exon_70188921_70189124:RAB3IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	72013832	A/G	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000133858:ENST00000378743:exon_72013706_72013904:ZFC3H1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	72094627	C/G	1	10	15	25	4.77485086370143	7.83772370444786	-3.06287284074643	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.235750861164297	ENSG00000139291:ENST00000266673:exon_72094612_72097840:TMEM19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	72164395	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72164372_72164479:RAB21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	72176401	C/T	1	16	21	37	7.63976138192229	10.972813186227	-3.33305180430471	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.324101869523127	ENSG00000080371:ENST00000261263:exon_72176350_72176438:RAB21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	75902207	C/T	1	21	21	42	10.027186813773	10.972813186227	-0.945626372453994	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.877494826627993	ENSG00000111615:ENST00000229214:exon_75902054_75902226:KRR1;ENSG00000111615:ENST00000438169:exon_75902054_75902226:KRR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	80190650	C/G	1	102	86	188	48.7034788097546	44.9362825721677	3.76719623758688	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.609680202339455	ENSG00000058272:ENST00000261207:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000341878:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000312727:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000360825:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000450142:exon_80190562_80190730:PPP1R12A;ENSG00000058272:ENST00000437004:exon_80190562_80190730:PPP1R12A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	82752521	G/C	1	13	8	21	6.20730612281186	4.18011930903886	2.027186813773	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.393468965686283	ENSG00000127720:ENST00000248306:exon_82752324_82752603:C12orf26
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	89985004	C/A	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_89981828_89985072:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_89981828_89985072:ATP2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	90028901	T/C	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000070961:ENST00000428670:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000261173:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000348959:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000359142:exon_90028774_90029028:ATP2B1;ENSG00000070961:ENST00000393164:exon_90028774_90029028:ATP2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	92537810	T/C	1	262	239	501	125.101092628977	124.881064357536	0.22002827144162	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000133639:ENST00000256015:exon_92534074_92538223:BTG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	92537956	T/C	1	230	237	467	109.821569865133	123.836034530276	-14.0144646651432	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.195009038808391	ENSG00000133639:ENST00000256015:exon_92534074_92538223:BTG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	95681615	A/G	1	26	27	53	12.4146122456237	14.1079026680061	-1.69329042238242	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.681293683967935	ENSG00000028203:ENST00000436874:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000261219:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397792:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000356859:exon_95681440_95681633:VEZT;ENSG00000028203:ENST00000397796:exon_95681440_95681633:VEZT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	96252833	A/G	1	158	119	277	75.4426436464826	62.179274721953	13.2633689245296	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.117863834503545	ENSG00000139343:ENST00000266735:exon_96252709_96252854:SNRPF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	98926985	C/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000120802:ENST00000266732:exon_98926601_98928321:TMPO
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	104851112	T/C	1	11	2	13	5.25233595007157	1.04502982725971	4.20730612281186	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0241685145321443	ENSG00000171310:ENST00000303694:exon_104851048_104851307:CHST11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	106633048	G/A	1	23	24	47	10.9821569865133	12.5403579271166	-1.55820094060328	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.664179293645895	ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	106633348	G/A	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000136026:ENST00000258512:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000437873:exon_106631659_106634127:CKAP4;ENSG00000136026:ENST00000378026:exon_106631659_106634127:CKAP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	108912862	G/A	1	14	3	17	6.684791209182	1.56754474088957	5.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0142119975250009	ENSG00000198855:ENST00000361549:exon_108912177_108913380:FICD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	108918146	C/T	1	31	39	70	14.8020376774744	20.3780816315644	-5.57604395408999	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.189932861043187	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108918093_108918283:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108918093_108918283:SART3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	108923950	A/G	1	48	48	96	22.9192841457669	25.0807158542331	-2.16143170846627	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.683630871279168	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108923919_108924087:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108923919_108924087:SART3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	108941742	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108941663_108941767:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108941663_108941767:SART3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	108954823	C/T	1	12	9	21	5.72982103644172	4.70263422266871	1.027186813773	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.670382560246413	ENSG00000075856:ENST00000228284:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000431469:exon_108954619_108955165:SART3;ENSG00000075856:ENST00000412617:exon_108954777_108954944:SART3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	109017614	G/A	1	49	50	99	23.396769232137	26.1257456814929	-2.72897644935584	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.615613515165401	ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109015686_109017663:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	109017898	C/T	1	24	32	56	11.4596420728834	16.7204772361554	-5.26083516327199	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.18132271897447	ENSG00000110876:ENST00000388962:exon_109017694_109018088:SELPLG;ENSG00000110876:ENST00000228463:exon_109016768_109018088:SELPLG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	109182049	T/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000084112:ENST00000326495:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000360239:exon_109180971_109183020:SSH1;ENSG00000084112:ENST00000303438:exon_109180971_109183020:SSH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	113534591	C/T	1	30	24	54	14.3245525911043	12.5403579271166	1.78419466398772	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.683800171013328	ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	113534633	C/T	1	23	20	43	10.9821569865133	10.4502982725971	0.531858713916147	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.880225766123912	ENSG00000135144:ENST00000257600:exon_113534520_113535833:DTX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	113600940	C/T	1	64	68	132	30.5590455276892	35.5310141268303	-4.97196859914113	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.433068238498838	ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113600937_113601079:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113600937_113601079:DDX54
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	113603453	C/T	1	51	62	113	24.3517394048773	32.3959246450511	-8.04418524017385	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.132920304451763	ENSG00000123064:ENST00000314045:exon_113603449_113603522:DDX54;ENSG00000123064:ENST00000306014:exon_113603449_113603522:DDX54
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	113818559	C/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113818550_113818647:PLBD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	113826442	C/G	1	13	19	32	6.20730612281186	9.92778335896728	-3.72047723615543	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.216912579895035	ENSG00000151176:ENST00000280800:exon_113826264_113827201:PLBD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	114282496	C/T	1	20	14	34	9.54970172740286	7.315208790818	2.23449293658486	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.494912855070951	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114282473_114282593:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114282473_114282593:RBM19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	114377885	G/C	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000122965:ENST00000261741:exon_114377765_114377965:RBM19;ENSG00000122965:ENST00000392561:exon_114377765_114377965:RBM19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	117287190	C/T	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000135119:ENST00000257575:exon_117287119_117289567:RNFT2;ENSG00000135119:ENST00000392549:exon_117287119_117287289:RNFT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	118473027	T/G	1	17	8	25	8.11724646829243	4.18011930903886	3.93712715925357	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.159933770810999	ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	118473054	T/C	1	21	14	35	10.027186813773	7.315208790818	2.71197802295501	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.400395431261495	ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118473019_118473129:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118473019_118473129:WSB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	118474238	G/A	1	17	13	30	8.11724646829243	6.79269387718814	1.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.716104189045481	ENSG00000176871:ENST00000441406:exon_118474143_118474315:WSB2;ENSG00000176871:ENST00000315436:exon_118474143_118474315:WSB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	120128210	G/A	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000122966:ENST00000261833:exon_120127956_120128259:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392521:exon_120127956_120128259:CIT;ENSG00000122966:ENST00000392520:exon_120127956_120128259:CIT;ENSG00000122966:ENST00000469414:exon_120128206_120128256:CIT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	120884328	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000111780:ENST00000229384:exon_120884284_120884364:GATC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	120966921	A/G	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000110871:ENST00000288532:exon_120966743_120966964:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000445328:exon_120966743_120966953:COQ5;ENSG00000110871:ENST00000302223:exon_120966743_120966953:COQ5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	121017171	A/G	1	90	73	163	42.9736577733129	38.1435886949796	4.8300690783333	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.480710222388856	ENSG00000167272:ENST00000357500:exon_121016849_121017215:POP5;ENSG00000167272:ENST00000341039:exon_121016849_121017215:POP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	121174938	C/T	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000122971:ENST00000242592:exon_121174789_121174938:ACADS;ENSG00000122971:ENST00000411593:exon_121174789_121174938:ACADS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	125348216	C/G	0	73	0	73	34.8564113050204	0	34.8564113050204	C	C		10	0.522514913629857	2.93400842985776e-21	ENSG00000073060:ENST00000415380:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000261693:exon_125348141_125348519:SCARB1;ENSG00000073060:ENST00000376788:exon_125348141_125348393:SCARB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	129293346	C/T	1	42	27	69	20.054373627546	14.1079026680061	5.94647095953987	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.184625403824437	ENSG00000139370:ENST00000266771:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376744:exon_129293333_129293501:SLC15A4;ENSG00000139370:ENST00000376740:exon_129293333_129293501:SLC15A4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	129373247	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000151948:ENST00000442111:exon_129373184_129373289:GLT1D1;ENSG00000151948:ENST00000281703:exon_129373184_129373289:GLT1D1;ENSG00000151948:ENST00000441390:exon_129373184_129373289:GLT1D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	132210063	T/C	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000061936:ENST00000261674:exon_132209950_132210175:SFSWAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	132335592	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000198598:ENST00000360564:exon_132335470_132336316:MMP17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	132547162	G/A	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000183495:ENST00000330386:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000332482:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389561:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000333577:exon_132547011_132547246:EP400;ENSG00000183495:ENST00000389562:exon_132547011_132547246:EP400
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133208979	T/C	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000177084:ENST00000320574:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000455752:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000434528:exon_133208901_133209094:POLE;ENSG00000177084:ENST00000320557:exon_133208901_133209094:POLE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133272521	T/C	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000176894:ENST00000317479:exon_133272470_133272632:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000428960:exon_133272470_133272632:PGAM5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133294662	G/A	1	17	24	41	8.11724646829243	12.5403579271166	-4.42311145882414	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.210644474106748	ENSG00000176894:ENST00000454808:exon_133294573_133294706:PGAM5;ENSG00000176894:ENST00000317555:exon_133294573_133294706:PGAM5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133357440	C/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000090615:ENST00000450791:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000204726:exon_133357384_133357500:GOLGA3;ENSG00000090615:ENST00000456883:exon_133357384_133357500:GOLGA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133423662	C/T	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000072609:ENST00000443047:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000315585:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000450056:exon_133423629_133423716:CHFR;ENSG00000072609:ENST00000266880:exon_133423629_133423716:CHFR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133683261	T/C	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000196387:ENST00000355557:exon_133682096_133684260:ZNF140
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	12	133778796	C/T	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000090612:ENST00000416488:exon_133778730_133778955:ZNF268;ENSG00000090612:ENST00000228289:exon_133778730_133781730:ZNF268
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	20356941	T/A	1	35	38	73	16.711978022955	19.8555667179346	-3.14358869497956	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.483698503299197	ENSG00000121390:ENST00000471658:exon_20356526_20357057:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000492741:exon_20356526_20357082:PSPC1;ENSG00000121390:ENST00000338910:exon_20356526_20357057:PSPC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	21535837	T/G	0	214	2	216	102.181808483211	1.04502982725971	101.136778655951	T:C	T	C	10	0.522514913629857	2.62438156015402e-57	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	22088527	A/G	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000165487:ENST00000382374:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000480341:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000469058:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000476895:exon_22088492_22088557:EFHA1;ENSG00000165487:ENST00000468222:exon_22088492_22088557:EFHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	23909142	T/C	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23902965_23915829:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23902965_23915829:SACS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	23928912	C/T	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000151835:ENST00000382292:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000402364:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000382298:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000281578:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000455470:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000423156:exon_23928658_23929622:SACS;ENSG00000151835:ENST00000445163:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000399986:exon_23928658_23930146:SACS;ENSG00000151835:ENST00000476776:exon_23928658_23929029:SACS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	24411772	T/C	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000027001:ENST00000382172:exon_24411691_24411895:MIPEP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	25033200	T/A	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25033182_25033260:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000480576:exon_25033182_25033260:PARP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	25033227	A/G	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000102699:ENST00000381989:exon_25033182_25033260:PARP4;ENSG00000102699:ENST00000480576:exon_25033182_25033260:PARP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	25479706	T/A	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000151849:ENST00000381884:exon_25479484_25481098:CENPJ;ENSG00000151849:ENST00000445729:exon_25479484_25481098:CENPJ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	28009851	G/A	1	45	33	78	21.4868288866564	17.2429921497853	4.24383673687115	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.365551683683724	ENSG00000122034:ENST00000482655:exon_28009570_28009958:GTF3A;ENSG00000122033:ENST00000381116:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000381120:exon_28009780_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000405591:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000431572:exon_28009785_28010030:MTIF3;ENSG00000122033:ENST00000461838:exon_28009821_28010030:MTIF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	28197436	C/T	1	189	118	307	90.244681323957	61.6567598083231	28.5879215156339	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00110484200491643	ENSG00000186184:ENST00000302979:exon_28197012_28197589:POLR1D;ENSG00000186184:ENST00000399696:exon_28197012_28197583:POLR1D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	31036837	G/A	1	35	78	113	16.711978022955	40.7561632631288	-24.0441852401738	A:G	G	A	10	0.522514913629857	7.11564610989496e-06	ENSG00000189403:ENST00000405805:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000533456:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000339872:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000341423:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000525362:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000524569:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399489:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399494:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000399487:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000432889:exon_31036709_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000426225:exon_31036709_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000326004:exon_31036675_31036849:HMGB1;ENSG00000189403:ENST00000490788:exon_31036483_31036849:HMGB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	31232570	T/A	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000132952:ENST00000255304:exon_31231611_31233686:USPL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	33347435	A/G	1	21	27	48	10.027186813773	14.1079026680061	-4.08071585423314	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.250723229887618	ENSG00000083642:ENST00000315596:exon_33347327_33347462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000400481:exon_33347327_33347462:PDS5B;ENSG00000083642:ENST00000456898:exon_33347327_33347462:PDS5B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	39586343	G/C	1	30	17	47	14.3245525911043	8.88275353170757	5.44179905939672	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.143520056915599	ENSG00000120685:ENST00000484434:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000468017:exon_39586220_39586370:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000492646:exon_39586220_39586612:C13orf23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	39587166	A/G	1	30	23	53	14.3245525911043	12.0178430134867	2.30670957761758	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.583389035978202	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	39587677	A/G	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	39587865	A/C	1	35	23	58	16.711978022955	12.0178430134867	4.69413500946829	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.23820097770696	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	39587889	T/C	1	40	23	63	19.0994034548057	12.0178430134867	7.08156044131901	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0782781034640993	ENSG00000120685:ENST00000352251:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000350125:exon_39586828_39588613:C13orf23;ENSG00000120685:ENST00000379609:exon_39586828_39588613:C13orf23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	41303685	G/A	1	67	56	123	31.9915007867996	29.260835163272	2.73066562352759	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.652399337001627	ENSG00000102738:ENST00000498078:exon_41303432_41303737:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000323563:exon_41303440_41303737:MRPS31;ENSG00000102738:ENST00000461675:exon_41303510_41303737:MRPS31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	41382711	A/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000102743:ENST00000443985:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000379523:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000426521:exon_41382574_41382732:SLC25A15;ENSG00000102743:ENST00000338625:exon_41382574_41382732:SLC25A15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	41515286	T/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000120690:ENST00000442101:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000498824:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000239882:exon_41515057_41515506:ELF1;ENSG00000120690:ENST00000379498:exon_41515057_41515506:ELF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	41827134	A/G	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000480434:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41827085_41827166:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41827085_41827166:MTRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	41835039	T/C	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000120662:ENST00000430347:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379480:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000379477:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000486236:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000452359:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000497679:exon_41834629_41835051:MTRF1;ENSG00000120662:ENST00000239852:exon_41834629_41835051:MTRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	43597865	A/G	1	42	45	87	20.054373627546	23.5131711133436	-3.45879748579756	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.519868749868394	ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43597339_43597870:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43597339_43597870:DNAJC15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	43639845	A/C	1	43	41	84	20.5318587139161	21.4231114588241	-0.891252744907991	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.913129083517373	ENSG00000120675:ENST00000379221:exon_43639822_43639873:DNAJC15;ENSG00000120675:ENST00000474320:exon_43639822_43639873:DNAJC15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	45594482	G/A	1	19	19	38	9.07221664103272	9.92778335896728	-0.855566717934568	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.87138096354469	ENSG00000133114:ENST00000379151:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000497558:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000361121:exon_45594465_45594563:KIAA1704;ENSG00000133114:ENST00000357537:exon_45594465_45594563:KIAA1704
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	45841502	G/A	1	63	47	110	30.081560441319	24.5582009406033	5.52335950071572	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.295854588832004	ENSG00000188342:ENST00000340473:exon_45841368_45841511:GTF2F2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	46717449	G/A	1	129	117	246	61.5955761417484	61.1342448946933	0.46133124705517	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000136167:ENST00000323076:exon_46717425_46717539:LCP1;ENSG00000136167:ENST00000398576:exon_46717425_46717539:LCP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	46933676	C/T	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000102445:ENST00000378797:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000429979:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378781:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378787:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000441284:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000389908:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000378784:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000322896:exon_46933621_46933766:C13orf18;ENSG00000102445:ENST00000409879:exon_46933621_46933766:C13orf18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	47308109	A/G	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000136141:ENST00000311191:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000258643:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389798:exon_47308056_47308133:LRCH1;ENSG00000136141:ENST00000389797:exon_47308056_47308133:LRCH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	53048059	A/T	1	28	17	45	13.369582418364	8.88275353170757	4.48682888665643	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.232221183098811	ENSG00000136108:ENST00000258607:exon_53047964_53048219:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000378037:exon_53047964_53048219:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000490903:exon_53047964_53048219:CKAP2;ENSG00000136108:ENST00000459902:exon_53047670_53048219:CKAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	76111959	T/A	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000188243:ENST00000377615:exon_76111900_76112056:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000486516:exon_76111900_76111962:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000497707:exon_76111900_76111977:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000355801:exon_76111900_76111977:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000377612:exon_76111877_76112056:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000464050:exon_76111900_76111980:COMMD6;ENSG00000188243:ENST00000477377:exon_76111900_76111977:COMMD6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	76423258	A/C	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76423215_76423428:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76423112_76423428:LMO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	76427231	C/T	1	16	12	28	7.63976138192229	6.27017896355828	1.369582418364	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.706380291404001	ENSG00000136153:ENST00000341547:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000321797:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000526202:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000465261:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000377534:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000357063:exon_76427228_76427524:LMO7;ENSG00000136153:ENST00000482116:exon_76427228_76427524:LMO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	78335190	T/C	1	15	25	40	7.16227629555214	13.0628728407464	-5.90059654519428	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0805242805870575	ENSG00000139737:ENST00000466548:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000389459:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000418532:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000488699:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000377229:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000267219:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000436634:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000314070:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000351546:exon_78334963_78335245:SLAIN1;ENSG00000139737:ENST00000358679:exon_78334963_78335245:SLAIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	95686955	C/T	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000125257:ENST00000412704:exon_95686859_95686993:ABCC4;ENSG00000125257:ENST00000376887:exon_95686859_95686993:ABCC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	99100547	T/C	0	0	38	38	0	19.8555667179346	-19.8555667179346	C	T	C	10	0.522514913629857	6.31644672008397e-13	ENSG00000152767:ENST00000376586:exon_99100490_99102016:FARP1;ENSG00000152767:ENST00000319562:exon_99100490_99102023:FARP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	99105395	G/A	1	61	29	90	29.1265902685787	15.1529324952659	13.9736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00307029239254128	ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99102455_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99104413_99105463:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99104414_99105463:STK24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	99109508	C/T	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000102572:ENST00000397517:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376554:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376547:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376541:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000418038:exon_99107675_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000444574:exon_99109422_99109558:STK24;ENSG00000102572:ENST00000376533:exon_99109422_99109558:STK24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	100425260	A/G	1	10	19	29	4.77485086370143	9.92778335896728	-5.15293249526585	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0634305385496815	ENSG00000125246:ENST00000376360:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376355:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000444838:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000323941:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000376354:exon_100425078_100425264:CLYBL;ENSG00000125246:ENST00000339105:exon_100425078_100425264:CLYBL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	101020827	C/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000175198:ENST00000376285:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376286:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376279:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376277:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000424527:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000376254:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000458283:exon_101020726_101020828:PCCA;ENSG00000175198:ENST00000413170:exon_101020753_101020828:PCCA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	103527931	G/A	1	86	60	146	41.0637174278323	31.3508948177914	9.71282261004087	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.115591699111949	ENSG00000134899:ENST00000355739:exon_103527657_103528345:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000375954:exon_103527657_103528333:ERCC5;ENSG00000134899:ENST00000472247:exon_103527657_103528242:ERCC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	111176316	T/C	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	111176519	G/T	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000139832:ENST00000267328:exon_111175417_111176544:RAB20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	111290880	G/A	1	22	18	40	10.5046719001431	9.40526844533743	1.09940345480572	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.754153862999362	ENSG00000213995:ENST00000458711:exon_111290725_111291452:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000492889:exon_111290725_111290892:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000470164:exon_111290725_111292340:CARKD;ENSG00000213995:ENST00000309957:exon_111290589_111292340:CARKD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	111319754	T/C	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000134905:ENST00000257347:exon_111319687_111319820:CARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	113851548	A/G	1	9	14	23	4.29736577733129	7.315208790818	-3.01784301348671	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.218350140624609	ENSG00000126226:ENST00000337344:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375479:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375477:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000431904:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000446345:exon_113851489_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246505:exon_113851333_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375459:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375457:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000375462:exon_113851487_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000246506:exon_113851486_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000351317:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000475433:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000484641:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000480971:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000477095:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000491548:exon_113851492_113851557:PCID2;ENSG00000126226:ENST00000462853:exon_113851492_113851557:PCID2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	113897320	C/T	1	14	11	25	6.684791209182	5.74766404992843	0.937127159253575	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841937402628968	ENSG00000139842:ENST00000451881:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000326335:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375440:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375435:exon_113897282_113897474:CUL4A;ENSG00000139842:ENST00000375441:exon_113897282_113897474:CUL4A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	113975768	T/C	1	33	41	74	15.7570078502147	21.4231114588241	-5.66610360860942	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.201491313712153	ENSG00000185896:ENST00000332556:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000397181:exon_113975719_113975785:LAMP1;ENSG00000185896:ENST00000472564:exon_113974660_113975785:LAMP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	114174966	C/T	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000474393:exon_114174931_114175048:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000462877:exon_114174931_114174976:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000465556:exon_114174861_114175048:TMCO3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	114203902	G/A	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000150403:ENST00000434316:exon_114203740_114204510:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000460039:exon_114203740_114204230:TMCO3;ENSG00000150403:ENST00000491166:exon_114203740_114203953:TMCO3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	115090019	G/A	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	115090193	G/A	1	11	15	26	5.25233595007157	7.83772370444786	-2.58538775437628	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.332290693598278	ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	13	115091399	T/C	1	12	26	38	5.72982103644172	13.5853877543763	-7.85556671793457	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0138994772625142	ENSG00000198824:ENST00000361283:exon_115089263_115092796:ZNF828
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	20824122	T/C	1	22	24	46	10.5046719001431	12.5403579271166	-2.03568602697342	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.558777865256432	ENSG00000129484:ENST00000429687:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000446919:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000250416:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000527915:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000532299:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000530598:exon_20824056_20824190:PARP2;ENSG00000129484:ENST00000534664:exon_20824069_20824190:PARP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21464100	T/C	1	43	51	94	20.5318587139161	26.6482605951227	-6.11640188120656	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.216499003438188	ENSG00000165792:ENST00000339374:exon_21464060_21464110:METT11D1;ENSG00000165792:ENST00000382985:exon_21464060_21464110:METT11D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21829129	C/G	1	42	32	74	20.054373627546	16.7204772361554	3.33389639139058	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.485715980734392	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21829005_21829131:SUPT16H
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21829404	T/C	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.461888750754105	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21831052	T/C	1	26	36	62	12.4146122456237	18.8105368906749	-6.39592464505114	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.126560663615256	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21830953_21831106:SUPT16H
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21831419	C/T	1	40	38	78	19.0994034548057	19.8555667179346	-0.756163263128851	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.909966489005425	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21831392_21831487:SUPT16H
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21841524	A/G	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000092201:ENST00000216297:exon_21841497_21841589:SUPT16H
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21928338	C/T	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21928383	T/C	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21928397	A/G	0	8	0	8	3.81988069096114	0	3.81988069096114	A	A		10	0.522514913629857	0.00825830647346234	ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	21928398	T/C	0	8	0	8	3.81988069096114	0	3.81988069096114	T	T		10	0.522514913629857	0.00825830647346234	ENSG00000129472:ENST00000397762:exon_21927179_21929462:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000304034:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000431740:exon_21927183_21928499:RAB2B;ENSG00000129472:ENST00000250404:exon_21928326_21928430:RAB2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23000926	G/A	1	15	22	37	7.16227629555214	11.4953280998569	-4.33305180430471	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.187871758748714	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23016686	A/G	1	134	148	282	63.9830015735992	77.3322072172188	-13.3492056436197	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.121078906078353	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23016446_23016719:AE000661.28;ENSG00000229164:ENST00000480299:exon_23016446_23016719:AE000661.28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23020638	T/C	1	111	86	197	53.0008445870859	44.9362825721677	8.06456201491817	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.254732349825167	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23020706	C/A	1	165	107	272	78.7850392510736	55.9090957583947	22.8759434926789	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.00620770376410796	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23020919	C/T	1	112	123	235	53.478329673456	64.2693343764724	-10.7910047030164	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.170299777960147	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23020970	G/T	1	163	201	364	77.8300690783333	105.025497639601	-27.1954285612679	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00456820175323062	ENSG00000229164:ENST00000478163:exon_23020550_23021083:AE000661.28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23044004	C/T	1	490	69	559	233.96769232137	36.0535290404601	197.91416328091	T:C	C	T	10	0.522514913629857	3.22362374534856e-71	ENSG00000129562:ENST00000250498:exon_23043959_23044133:DAD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23236524	C/T	1	33	26	59	15.7570078502147	13.5853877543763	2.17162009583843	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.60403576486138	ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23236457_23236623:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23236457_23236618:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23236491_23236618:OXA1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23237212	G/A	1	74	85	159	35.3338963913906	44.4137676585379	-9.07987126714727	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.1536784312659	ENSG00000155463:ENST00000285848:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000483939:exon_23237167_23237831:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000473744:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000442110:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000412791:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000495424:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000431881:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000358043:exon_23237167_23237380:OXA1L;ENSG00000155463:ENST00000481218:exon_23237167_23237380:OXA1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23299135	G/T	1	117	102	219	55.8657551053067	53.2965211902454	2.56923391506131	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.735764895497924	ENSG00000172590:ENST00000355151:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000311892:exon_23299092_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000448164:exon_23299092_23299157:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397496:exon_23299092_23299319:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000432849:exon_23299103_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000382894:exon_23299113_23299149:MRPL52;ENSG00000172590:ENST00000397505:exon_23299119_23299149:MRPL52
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23371055	G/C	1	33	21	54	15.7570078502147	10.972813186227	4.78419466398772	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.220736034398937	ENSG00000100461:ENST00000359890:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000399922:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000346528:exon_23371023_23371092:RBM23;ENSG00000100461:ENST00000338980:exon_23371023_23371092:RBM23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23549319	A/G	1	16	22	38	7.63976138192229	11.4953280998569	-3.85556671793457	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.255810561867945	ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23549948	C/T	1	26	20	46	12.4146122456237	10.4502982725971	1.96431397302658	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.65845332209445	ENSG00000100813:ENST00000262710:exon_23548756_23550018:ACIN1;ENSG00000100813:ENST00000457657:exon_23548756_23550018:ACIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23744987	A/G	1	20	30	50	9.54970172740286	15.6754474088957	-6.12574568149285	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0901477274822409	ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23745533	C/T	1	20	18	38	9.54970172740286	9.40526844533743	0.144433282065432	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23746035	A/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000215271:ENST00000357460:exon_23742844_23746396:HOMEZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23777081	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000129473:ENST00000250405:exon_23776969_23777408:BCL2L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23944505	G/A	1	16	19	35	7.63976138192229	9.92778335896728	-2.288021977045	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.500012532849596	ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	23944514	C/A	1	24	28	52	11.4596420728834	14.630417581636	-3.17077550875256	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.406892828221658	ENSG00000129460:ENST00000397158:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000408901:exon_23944380_23944517:NGDN;ENSG00000129460:ENST00000397154:exon_23944380_23944517:NGDN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24615435	T/C	1	614	561	1175	293.175843031268	293.13086654635	0.0449764849179815	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100911:ENST00000216802:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000429021:exon_24615417_24615449:PSME2;ENSG00000100911:ENST00000396881:exon_24615417_24615449:PSME2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24634106	G/A	1	75	64	139	35.8113814777607	33.4409544723108	2.37042700544988	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.734362691409007	ENSG00000213928:ENST00000396864:exon_24633823_24634164:IRF9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24649669	C/T	1	74	74	148	35.3338963913906	38.6661036086094	-3.33220721721884	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.621770059943979	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24649425_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24649432_24649778:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24649432_24649778:IPO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24650967	C/T	1	46	40	86	21.9643139730266	20.9005965451943	1.06371742783229	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.830050335398316	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24650917_24651049:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24650917_24651049:IPO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24651561	C/G	1	11	18	29	5.25233595007157	9.40526844533743	-4.15293249526585	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.138811383638839	ENSG00000196497:ENST00000354464:exon_24651484_24651609:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000458132:exon_24651484_24651609:IPO4;ENSG00000196497:ENST00000399536:exon_24651484_24651609:IPO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24702789	C/T	1	22	23	45	10.5046719001431	12.0178430134867	-1.51317111334357	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.657948717822165	ENSG00000100938:ENST00000355299:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000421944:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000420554:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000399440:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000348719:exon_24702685_24702804:GMPR2;ENSG00000100938:ENST00000456667:exon_24702685_24702804:GMPR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24736027	G/A	1	59	52	111	28.1716200958384	27.1707755087526	1.00084458708587	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.924362208604799	ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24735982_24736095:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24735982_24736095:RABGGTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24737595	C/T	1	48	45	93	22.9192841457669	23.5131711133436	-0.593886967576704	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.917659919284182	ENSG00000100949:ENST00000216840:exon_24737575_24737626:RABGGTA;ENSG00000100949:ENST00000399409:exon_24737575_24737626:RABGGTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24760764	G/A	1	47	4	51	22.4417990593967	2.09005965451943	20.3517394048773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	9.7548292137873e-10	ENSG00000157379:ENST00000288111:exon_24760762_24760831:DHRS1;ENSG00000157379:ENST00000396813:exon_24760762_24760831:DHRS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24845841	T/C	1	16	22	38	7.63976138192229	11.4953280998569	-3.85556671793457	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.255810561867945	ENSG00000100968:ENST00000413692:exon_24845500_24848810:NFATC4;ENSG00000100968:ENST00000250373:exon_24845500_24846084:NFATC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24909281	C/T	1	64	80	144	30.5590455276892	41.8011930903886	-11.2421475626994	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0663590440743169	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24909362	T/C	1	76	102	178	36.2888665641309	53.2965211902454	-17.0076546261146	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0130648897587181	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24909475	C/G	1	54	82	136	25.7841946639877	42.8462229176483	-17.0620282536606	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.00347665712868238	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN;ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24908974_24909698:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000399390:exon_24908974_24909698:SDR39U1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24909731	C/T	1	51	37	88	24.3517394048773	19.3330518043047	5.01868760057258	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.288557225702367	ENSG00000100441:ENST00000251343:exon_24906242_24910545:KHNYN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24910973	T/G	1	23	17	40	10.9821569865133	8.88275353170757	2.09940345480572	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.530810831784354	ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	24910974	T/A	1	23	17	40	10.9821569865133	8.88275353170757	2.09940345480572	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.530810831784354	ENSG00000100445:ENST00000399395:exon_24910880_24911001:SDR39U1;ENSG00000100445:ENST00000336353:exon_24910880_24911001:SDR39U1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	31578762	C/T	1	17	10	27	8.11724646829243	5.22514913629857	2.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.336149290227447	ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31578603_31578804:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000399321:exon_31578603_31578806:HECTD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	31619392	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000092148:ENST00000399332:exon_31619205_31619427:HECTD1;ENSG00000092148:ENST00000261312:exon_31619205_31619427:HECTD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	34985506	G/C	1	24	23	47	11.4596420728834	12.0178430134867	-0.55820094060328	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.884962774804445	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	34985645	G/A	1	56	33	89	26.739164836728	17.2429921497853	9.49617268694273	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0443599403152021	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	34985658	C/T	1	49	24	73	23.396769232137	12.5403579271166	10.8564113050204	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0133609148193028	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34985136_34985792:EAPP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	34993982	G/C	1	24	14	38	11.4596420728834	7.315208790818	4.14443328206543	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.196404715698376	ENSG00000129518:ENST00000250454:exon_34993903_34994013:EAPP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	35871217	G/A	1	626	669	1295	298.905664067709	349.562477218374	-50.6568131506648	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0049524328791132	ENSG00000100906:ENST00000216797:exon_35870717_35871266:NFKBIA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	39870459	A/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000165355:ENST00000298097:exon_39870380_39871065:FBXO33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	45700352	T/C	1	12	13	25	5.72982103644172	6.79269387718814	-1.06287284074643	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.693678355794431	ENSG00000129534:ENST00000310806:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000454990:exon_45700344_45700501:C14orf106;ENSG00000129534:ENST00000453142:exon_45700344_45700501:C14orf106
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	50065717	G/C	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000165501:ENST00000361579:exon_50065415_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000318317:exon_50065479_50065921:PPIL5;ENSG00000165501:ENST00000298288:exon_50065672_50065921:PPIL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	50585248	C/T	1	21	9	30	10.027186813773	4.70263422266871	5.32455259110429	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.066348985130218	ENSG00000100485:ENST00000216373:exon_50583847_50585571:SOS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	50801233	G/A	1	1	10	11	0.477485086370143	5.22514913629857	-4.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00462750307604110	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	51192571	G/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51192546_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51192551_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51192558_51192784:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51192558_51192784:NIN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	51206038	G/C	1	33	23	56	15.7570078502147	12.0178430134867	3.73916483672801	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.350501729901515	ENSG00000100503:ENST00000245441:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389868:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000476352:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530997:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000311149:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389869:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382043:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324292:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000389870:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000382041:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000530853:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000324330:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000453196:exon_51206026_51206205:NIN;ENSG00000100503:ENST00000485005:exon_51206026_51206106:NIN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	51716188	T/G	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000139921:ENST00000457354:exon_51716186_51716287:TMX1;ENSG00000139921:ENST00000267434:exon_51716186_51716287:TMX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	52433339	C/T	1	34	26	60	16.2344929365849	13.5853877543763	2.64910518220858	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.520427082945467	ENSG00000186469:ENST00000335281:exon_52433277_52436517:GNG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	53348030	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000073712:ENST00000341590:exon_53347962_53348187:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000395631:exon_53347962_53348187:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000343279:exon_53347962_53348187:FERMT2;ENSG00000073712:ENST00000399304:exon_53347962_53348187:FERMT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	55310492	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000131979:ENST00000254299:exon_55308735_55310861:GCH1;ENSG00000131979:ENST00000491895:exon_55309096_55310861:GCH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	55408294	C/T	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000198554:ENST00000360586:exon_55405668_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000359167:exon_55406942_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000475379:exon_55407989_55408408:WDHD1;ENSG00000198554:ENST00000421192:exon_55408208_55408408:WDHD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	55609418	G/A	1	140	99	239	66.84791209182	51.7289764493558	15.1189356424642	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0521248298636851	ENSG00000131981:ENST00000254301:exon_55609302_55609467:LGALS3;ENSG00000131981:ENST00000399106:exon_55609302_55609467:LGALS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	55619311	A/G	1	31	30	61	14.8020376774744	15.6754474088957	-0.873409731421278	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.898190864437643	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55619308_55619365:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55619308_55619365:DLGAP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	55643908	A/G	1	21	21	42	10.027186813773	10.972813186227	-0.945626372453994	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.877494826627993	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55643780_55644054:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55643780_55644054:DLGAP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	55655692	C/T	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000126787:ENST00000341764:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000247191:exon_55655660_55655898:DLGAP5;ENSG00000126787:ENST00000395425:exon_55655660_55655898:DLGAP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	56096731	A/G	1	37	35	72	17.6669481956953	18.288021977045	-0.621073781349704	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.90652517925052	ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56096675_56096815:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56096675_56096815:KTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	56105908	C/T	1	25	16	41	11.9371271592536	8.36023861807771	3.57688854117586	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.278095397791184	ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56105903_56105940:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56105903_56105940:KTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	56107666	G/C	1	21	12	33	10.027186813773	6.27017896355828	3.75700785021472	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.223826824236475	ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56107651_56107688:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56107651_56107688:KTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	56146357	G/A	1	19	17	36	9.07221664103272	8.88275353170757	0.189463109325146	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000126777:ENST00000438792:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395314:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000459737:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395308:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395311:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000413890:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000416613:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000356229:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000334975:exon_56146283_56146403:KTN1;ENSG00000126777:ENST00000395309:exon_56146283_56146403:KTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	57741550	A/G	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000053770:ENST00000431972:exon_57740962_57741607:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000446279:exon_57740962_57741742:MUDENG;ENSG00000053770:ENST00000261558:exon_57740962_57741607:MUDENG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	58831567	A/G	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000032219:ENST00000355431:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000348476:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000431317:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000395168:exon_58830888_58832018:ARID4A;ENSG00000032219:ENST00000417477:exon_58830888_58832018:ARID4A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	61442412	T/G	1	25	17	42	11.9371271592536	8.88275353170757	3.054373627546	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.359063468630971	ENSG00000126814:ENST00000261249:exon_61442193_61442844:TRMT5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	61857969	A/G	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61857943_61858006:PRKCH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	61924237	G/C	1	18	15	33	8.59473155466257	7.83772370444786	0.757007850214718	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.862585582158515	ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61924224_61924397:PRKCH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	61995892	G/A	1	29	12	41	13.8470675047341	6.27017896355828	7.57688854117586	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0188755299676027	ENSG00000027075:ENST00000332981:exon_61995793_61995931:PRKCH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	62194239	G/A	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62194171_62194373:HIF1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	62194368	T/C	1	4	11	15	1.90994034548057	5.74766404992843	-3.83772370444786	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.067798617844541	ENSG00000100644:ENST00000337138:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394997:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000323441:exon_62194171_62194373:HIF1A;ENSG00000100644:ENST00000394988:exon_62194171_62194373:HIF1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	64688376	C/T	1	15	19	34	7.16227629555214	9.92778335896728	-2.76550706341514	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.392337552161461	ENSG00000054654:ENST00000358025:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000344113:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000357395:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000261678:exon_64688252_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000394768:exon_64688294_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000458046:exon_64688252_64688422:SYNE2;ENSG00000054654:ENST00000441438:exon_64688252_64688422:SYNE2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	64894104	C/T	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100714:ENST00000216605:exon_64894055_64894191:MTHFD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	64988279	A/G	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	64988924	T/C	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000126804:ENST00000358738:exon_64988205_64990120:ZBTB1;ENSG00000126804:ENST00000394712:exon_64988205_64991665:ZBTB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	65550943	G/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000125952:ENST00000246163:exon_65550462_65551017:MAX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	66096300	T/A	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000033170:ENST00000360689:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000342677:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394586:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394585:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000358307:exon_66096210_66096324:FUT8;ENSG00000033170:ENST00000394581:exon_66096210_66096324:FUT8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	67843176	T/C	1	34	27	61	16.2344929365849	14.1079026680061	2.12659026857872	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.610361629263706	ENSG00000134001:ENST00000256383:exon_67843156_67843307:EIF2S1;ENSG00000134001:ENST00000466499:exon_67843156_67843307:EIF2S1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	68141105	C/T	1	69	46	115	32.9464709595399	24.0356860269734	8.91078493256644	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112198323619192	ENSG00000100568:ENST00000216456:exon_68141092_68141548:VTI1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	69257187	C/G	1	36	27	63	17.1894631093251	14.1079026680061	3.08156044131901	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.452225098508024	ENSG00000185650:ENST00000439696:exon_69254375_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000336440:exon_69256244_69257209:ZFP36L1;ENSG00000185650:ENST00000435246:exon_69256691_69257209:ZFP36L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	72152139	A/G	1	8	15	23	3.81988069096114	7.83772370444786	-4.01784301348671	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.099549600965852	ENSG00000197555:ENST00000381232:exon_72152079_72152348:SIPA1L1;ENSG00000197555:ENST00000358550:exon_72152079_72152348:SIPA1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	72945012	T/C	1	5	15	20	2.38742543185071	7.83772370444786	-5.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0227180632230821	ENSG00000182732:ENST00000402788:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000404301:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000343854:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000434263:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000453330:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000407322:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000406236:exon_72944976_72945037:RGS6;ENSG00000182732:ENST00000355512:exon_72944976_72945037:RGS6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	73425364	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119599:ENST00000358377:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000353777:exon_73425320_73426300:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509320:exon_73425320_73425829:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000394234:exon_73425320_73426411:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000509153:exon_73425320_73425654:DCAF4;ENSG00000119599:ENST00000340355:exon_73425320_73426356:DCAF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	73440864	C/T	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000165861:ENST00000394207:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000318876:exon_73440788_73440901:ZFYVE1;ENSG00000165861:ENST00000446254:exon_73440788_73440901:ZFYVE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	73743367	A/G	1	38	29	67	18.1444332820654	15.1529324952659	2.99150078679958	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.54122171812474	ENSG00000133961:ENST00000355058:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000359560:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000454166:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000356296:exon_73741918_73744001:NUMB;ENSG00000133961:ENST00000326018:exon_73741918_73744001:NUMB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	74363142	C/T	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74363019_74363237:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000324593:exon_74363019_74363237:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74363019_74363237:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74363019_74363237:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000412490:exon_74363019_74363237:ZNF410
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	74388908	T/C	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119725:ENST00000334521:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000458102:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000442160:exon_74388769_74388909:ZNF410;ENSG00000119725:ENST00000398139:exon_74388769_74388909:ZNF410
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	75369064	T/C	1	48	44	92	22.9192841457669	22.9906561997137	-0.0713720539468454	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119689:ENST00000334220:exon_75368899_75370443:DLST;ENSG00000119689:ENST00000238671:exon_75368899_75370443:DLST;ENSG00000119689:ENST00000334212:exon_75368899_75370443:DLST
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	75513969	C/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000119684:ENST00000238662:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000355774:exon_75513079_75516421:MLH3;ENSG00000119684:ENST00000380968:exon_75513079_75516421:MLH3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	75551321	T/G	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000119638:ENST00000238616:exon_75548819_75551389:NEK9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	75904660	A/G	0	0	20	20	0	10.4502982725971	-10.4502982725971	G	A	G	10	0.522514913629857	3.79486412046506e-07	ENSG00000140044:ENST00000419727:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000437176:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000435893:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000267569:exon_75904601_75904824:JDP2;ENSG00000140044:ENST00000413024:exon_75904601_75904824:JDP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	76330181	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000286653:exon_76330010_76330205:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76330010_76330205:TTLL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	76368544	T/C	1	15	3	18	7.16227629555214	1.56754474088957	5.59473155466257	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00859195314607424	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	76368547	T/C	1	15	3	18	7.16227629555214	1.56754474088957	5.59473155466257	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00859195314607424	ENSG00000119685:ENST00000298832:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000393826:exon_76368485_76368567:TTLL5;ENSG00000119685:ENST00000452968:exon_76368485_76368567:TTLL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	76549762	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	76644382	T/C	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000089916:ENST00000261530:exon_76644331_76644385:C14orf118;ENSG00000089916:ENST00000336993:exon_76644331_76644385:C14orf118
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	77793207	G/A	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000100577:ENST00000216465:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000349555:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000361389:exon_77793181_77793248:GSTZ1;ENSG00000100577:ENST00000393734:exon_77793181_77793248:GSTZ1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	78221364	T/G	1	13	5	18	6.20730612281186	2.61257456814929	3.59473155466257	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.102283233688192	ENSG00000100603:ENST00000261531:exon_78221310_78221463:SNW1;ENSG00000100603:ENST00000416259:exon_78221310_78221463:SNW1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	88477413	C/T	1	19	19	38	9.07221664103272	9.92778335896728	-0.855566717934568	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.87138096354469	ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	88477882	A/C	1	24	24	48	11.4596420728834	12.5403579271166	-1.08071585423314	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.7743966401828	ENSG00000140030:ENST00000267549:exon_88476733_88478422:GPR65
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	88904221	T/C	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000042317:ENST00000045347:exon_88904182_88904247:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000356583:exon_88904182_88904802:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000393545:exon_88904182_88904802:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000362040:exon_88904182_88904797:SPATA7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	88904567	G/A	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000042317:ENST00000356583:exon_88904182_88904802:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000393545:exon_88904182_88904802:SPATA7;ENSG00000042317:ENST00000362040:exon_88904182_88904797:SPATA7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	89077198	A/G	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000100722:ENST00000302216:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000251038:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393514:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000406216:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000353091:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000380684:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393530:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000359301:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000336693:exon_89077178_89077284:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000318308:exon_89077178_89077284:ZC3H14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	89078141	A/G	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000100722:ENST00000302216:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000251038:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393514:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000406216:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000353091:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000380684:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000393530:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000359301:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000336693:exon_89078089_89079852:ZC3H14;ENSG00000100722:ENST00000318308:exon_89078089_89079852:ZC3H14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	90429749	A/G	1	25	13	38	11.9371271592536	6.79269387718814	5.14443328206543	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.105525914836872	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90429452_90430017:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90429452_90430017:TDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	90450886	G/A	1	22	17	39	10.5046719001431	8.88275353170757	1.62191836843558	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.6339344503811	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90450860_90451027:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90450860_90451027:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90450860_90451027:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90450860_90451027:TDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	90451521	A/G	1	31	29	60	14.8020376774744	15.1529324952659	-0.350894817791421	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90451476_90451554:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90451476_90451554:TDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	90459822	C/T	1	21	31	52	10.027186813773	16.1979623225256	-6.17077550875257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0961842536394302	ENSG00000042088:ENST00000335725:exon_90459720_90459827:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393454:exon_90459720_90459827:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000393452:exon_90459720_90459827:TDP1;ENSG00000042088:ENST00000357382:exon_90459720_90459827:TDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	90744672	G/A	1	12	8	20	5.72982103644172	4.18011930903886	1.54970172740286	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.512146220497768	ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90744398_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90744402_90744805:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90744402_90744805:C14orf102
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	90745422	T/C	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000119720:ENST00000357904:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000354366:exon_90745406_90745477:C14orf102;ENSG00000119720:ENST00000340745:exon_90745406_90745477:C14orf102
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	91666198	A/G	1	12	21	33	5.72982103644172	10.972813186227	-5.24299214978528	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0810640861545547	ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000457117:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000336843:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000520328:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000521077:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91666101_91666249:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91666101_91666249:C14orf159
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	91671124	G/A	1	21	10	31	10.027186813773	5.22514913629857	4.80203767747443	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.105036819554453	ENSG00000133943:ENST00000321157:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000256324:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000420339:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523837:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000518868:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523816:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000428926:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000525393:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522322:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523771:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000412671:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000435094:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000523461:exon_91671050_91671169:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000517306:exon_91671050_91671211:C14orf159;ENSG00000133943:ENST00000522816:exon_91671050_91671169:C14orf159
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	93118038	A/G	1	1	8	9	0.477485086370143	4.18011930903886	-3.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0168997367977586	ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	93119232	G/C	1	20	17	37	9.54970172740286	8.88275353170757	0.666948195695289	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.870445363476698	ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93117927_93119420:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93117927_93119420:RIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	93125514	G/A	1	23	24	47	10.9821569865133	12.5403579271166	-1.55820094060328	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.664179293645895	ENSG00000100599:ENST00000216487:exon_93125506_93125814:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000418924:exon_93125506_93125814:RIN3;ENSG00000100599:ENST00000428147:exon_93125506_93125882:RIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	93652836	A/G	1	17	26	43	8.11724646829243	13.5853877543763	-5.46814128608385	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.125905482353549	ENSG00000153485:ENST00000283534:exon_93652605_93653431:C14orf109;ENSG00000153485:ENST00000415050:exon_93652605_93653425:C14orf109
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94417447	C/T	1	3	10	13	1.43245525911043	5.22514913629857	-3.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0493024340440666	ENSG00000100628:ENST00000434324:exon_94417345_94417590:ASB2;ENSG00000100628:ENST00000315988:exon_94417345_94417590:ASB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94526719	G/A	1	184	169	353	87.8572558921063	88.3050204034458	-0.447764511339528	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000089737:ENST00000423579:exon_94526444_94526776:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94526444_94526959:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94526444_94526959:DDX24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94528836	C/T	1	114	97	211	54.4332998461963	50.6839466220961	3.74935322410017	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.629872202633302	ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94528842	C/T	1	86	103	189	41.0637174278323	53.8190361038753	-12.755318676043	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0686038924710864	ENSG00000089737:ENST00000330836:exon_94528443_94528967:DDX24;ENSG00000089737:ENST00000440370:exon_94528443_94528967:DDX24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94929541	G/A	0	0	26	26	0	13.5853877543763	-13.5853877543763	A	G	A	10	0.522514913629857	4.49733355410116e-09	ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94929060_94929633:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94929060_94929633:SERPINA9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94931105	A/G	1	1	12	13	0.477485086370143	6.27017896355828	-5.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00123750003474538	ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94931044_94931191:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94931044_94931191:SERPINA9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	94935628	G/A	0	13	0	13	6.20730612281186	0	6.20730612281186	G	G		10	0.522514913629857	0.000283474978676920	ENSG00000170054:ENST00000448305:exon_94935550_94936004:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000298845:exon_94935550_94935661:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000337425:exon_94935550_94936194:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000424550:exon_94935550_94935661:SERPINA9;ENSG00000170054:ENST00000380365:exon_94935550_94936196:SERPINA9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	96180373	C/T	1	32	20	52	15.2795227638446	10.4502982725971	4.82922449124743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.211718057281167	ENSG00000100721:ENST00000216612:exon_96180284_96180533:TCL1A;ENSG00000100721:ENST00000402399:exon_96180284_96180533:TCL1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	97299853	A/G	1	19	23	42	9.07221664103272	12.0178430134867	-2.945626372454	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.440353997983177	ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97299804_97299968:VRK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	97321689	C/T	1	51	32	83	24.3517394048773	16.7204772361554	7.63126216872187	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0998667256255077	ENSG00000100749:ENST00000216639:exon_97321561_97321693:VRK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	99876486	G/A	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99876141_99876552:SETD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	99927643	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000183576:ENST00000331768:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000329331:exon_99927529_99927677:SETD3;ENSG00000183576:ENST00000436070:exon_99927529_99927677:SETD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	99968657	T/C	1	8	16	24	3.81988069096114	8.36023861807771	-4.54035792711657	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0685696670716585	ENSG00000090061:ENST00000389879:exon_99968544_99968713:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000216279:exon_99968538_99968713:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000411691:exon_99968544_99968713:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000380246:exon_99968538_99968713:CCNK;ENSG00000090061:ENST00000437596:exon_99968544_99968713:CCNK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	100847617	C/T	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000176473:ENST00000402312:exon_100847247_100848083:WDR25;ENSG00000176473:ENST00000335290:exon_100847247_100848083:WDR25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	102500339	G/A	1	14	9	23	6.684791209182	4.70263422266871	1.98215698651329	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.532235244522199	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102500313_102500525:DYNC1H1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	102508056	C/A	1	19	22	41	9.07221664103272	11.4953280998569	-2.42311145882414	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.532349662611635	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102507911_102508071:DYNC1H1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	102516218	G/A	1	183	154	337	87.3797708057362	80.467296698998	6.91247410673817	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.478485728982075	ENSG00000197102:ENST00000360184:exon_102516051_102516219:DYNC1H1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	102675350	G/C	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000140153:ENST00000335263:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000454394:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000342702:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000299135:exon_102674940_102676866:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000401892:exon_102674940_102676199:WDR20;ENSG00000140153:ENST00000424963:exon_102674936_102676863:WDR20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	102805245	T/A	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000022976:ENST00000442396:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000398436:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000262236:exon_102805153_102805290:ZNF839;ENSG00000022976:ENST00000420933:exon_102805153_102805290:ZNF839
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	103406169	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000198752:ENST00000361246:exon_103406167_103406284:CDC42BPB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	103941379	C/A	1	37	20	57	17.6669481956953	10.4502982725971	7.21664992309815	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0631992377104106	ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103941330_103941547:MARK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	103941392	A/G	1	31	21	52	14.8020376774744	10.972813186227	3.82922449124744	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.331895602862628	ENSG00000075413:ENST00000416682:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000216288:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000335102:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000454698:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000440884:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000429436:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000303622:exon_103941330_103941547:MARK3;ENSG00000075413:ENST00000411530:exon_103941330_103941547:MARK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	103996396	G/A	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000166166:ENST00000389749:exon_103996287_103996646:TRMT61A;ENSG00000166166:ENST00000299201:exon_103996287_103996646:TRMT61A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	104166957	G/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105179184	G/A	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105179165_105179329:INF2;ENSG00000203485:ENST00000480763:exon_105179170_105179270:INF2;ENSG00000203485:ENST00000477497:exon_105179050_105179329:INF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105180633	G/A	1	13	19	32	6.20730612281186	9.92778335896728	-3.72047723615543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.216912579895035	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105180706	A/C,G	0	0	25	25	0	13.0628728407464	-13.0628728407464	C:G	A	C	10	0.522514913629857	9.4187937644085e-09	ENSG00000203485:ENST00000330634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252520:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000392634:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000252527:exon_105180540_105181193:INF2;ENSG00000203485:ENST00000339008:exon_105180540_105181193:INF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105222037	C/T	1	52	49	101	24.8292244912474	25.603230767863	-0.774006276615559	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.920787534197686	ENSG00000184990:ENST00000329967:exon_105221967_105222161:SIVA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105477507	G/A	1	62	42	104	29.6040753549489	21.945626372454	7.65844898249487	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.141477564337840	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105477613	T/C	1	36	40	76	17.1894631093251	20.9005965451943	-3.71113343586914	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.422609090970085	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105477901	T/C	1	33	21	54	15.7570078502147	10.972813186227	4.78419466398772	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.220736034398937	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105477541_105477953:CDCA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105478102	G/A	1	39	36	75	18.6219183684356	18.8105368906749	-0.188618522239278	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170779:ENST00000336219:exon_105475910_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000392590:exon_105477497_105478272:CDCA4;ENSG00000170779:ENST00000413736:exon_105478072_105478240:CDCA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	105833679	A/G	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000179364:ENST00000430725:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000325438:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000447393:exon_105833550_105833712:PACS2;ENSG00000179364:ENST00000458164:exon_105833550_105833712:PACS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	106174147	C/T	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.217523950904571	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	106174796	C/T	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	106307418	G/A	1	1174	90	1264	560.567491398548	47.0263422266871	513.541149171861	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	1.17863187188395e-220	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	106307432	T/A	1	92	1097	1189	43.9286279460532	573.198860251953	-529.2702323059	A:T:G	T	A	10	0.522514913629857	1.98072813857292e-239	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	107199046	G/A	1	9	1537	1546	4.29736577733129	803.10542224909	-798.808056471759	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	107199080	G/A	1	2	2202	2204	0.954970172740286	1150.57783981295	-1149.6228696402	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	107199149	G/C	1	1	2015	2016	0.477485086370143	1052.86755096416	-1052.39006587779	T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	14	107199166	A/G	1	2	1235	1237	0.954970172740286	645.305918332873	-644.350948160133	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	22939192	G/A	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22939175_22939266:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22939175_22939266:CYFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	22960868	G/C	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000068793:ENST00000313077:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000412127:exon_22960793_22960889:CYFIP1;ENSG00000068793:ENST00000435939:exon_22960793_22960889:CYFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	29561291	C/T	1	39	31	70	18.6219183684356	16.1979623225256	2.42395604591001	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.632648306156126	ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	29561811	C/G	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	29561840	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000185115:ENST00000332303:exon_29560353_29562033:NDNL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	34634124	C/G	1	651	6	657	310.842791226963	3.13508948177914	307.707701745184	T:C:G	C	G	10	0.522514913629857	4.48066660902825e-172	ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	34634138	G/A	1	674	34	708	321.824948213476	17.7655070634151	304.059441150061	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1.85341071977471e-143	ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	34634139	T/C	1	656	46	702	313.230216658814	24.0356860269734	289.19453063184	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	8.57254741052289e-128	ENSG00000182117:ENST00000328848:exon_34633914_34634309:NOP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	35149048	G/A	1	70	67	137	33.42395604591	35.0084992132004	-1.58454316729041	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.798071010145243	ENSG00000021776:ENST00000156471:exon_35147750_35149307:AQR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	38776495	A/G	1	42	23	65	20.054373627546	12.0178430134867	8.03653061405929	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0475555341964357	ENSG00000171262:ENST00000397609:exon_38776456_38779911:FAM98B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40226385	C/A	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40226347_40226540:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40226347_40226540:EIF2AK4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40308859	G/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000128829:ENST00000382727:exon_40308703_40308873:EIF2AK4;ENSG00000128829:ENST00000263791:exon_40308703_40308873:EIF2AK4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40453430	G/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40453210_40453456:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40453210_40453456:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40453227_40453456:BUB1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40488857	G/C	1	8	14	22	3.81988069096114	7.315208790818	-3.49532809985685	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.142312472680437	ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40488746_40488975:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40488746_40488975:BUB1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40498503	T/C	1	20	13	33	9.54970172740286	6.79269387718814	2.75700785021472	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.385870755329217	ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40498385_40498659:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40498385_40498659:BUB1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40512906	A/G	1	40	34	74	19.0994034548057	17.7655070634151	1.33389639139058	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.816336779892552	ENSG00000156970:ENST00000442874:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000412359:exon_40512765_40513335:BUB1B;ENSG00000156970:ENST00000287598:exon_40512765_40513378:BUB1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40685850	A/G	1	49	44	93	23.396769232137	22.9906561997137	0.406113032423299	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000128944:ENST00000249776:exon_40685670_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000416151:exon_40685394_40686488:C15orf23;ENSG00000128944:ENST00000448395:exon_40685670_40686488:C15orf23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40710476	C/T	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000128928:ENST00000249760:exon_40710329_40711063:IVD;ENSG00000128928:ENST00000479013:exon_40710329_40713505:IVD;ENSG00000128928:ENST00000487418:exon_40710329_40713512:IVD;ENSG00000128928:ENST00000497816:exon_40710329_40711356:IVD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40855210	T/A	1	22	13	35	10.5046719001431	6.79269387718814	3.711978022955	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.238241131396320	ENSG00000128891:ENST00000358005:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000416810:exon_40854971_40855226:C15orf57;ENSG00000128891:ENST00000360470:exon_40854971_40855226:C15orf57
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	40862064	C/T	1	12	16	28	5.72982103644172	8.36023861807771	-2.630417581636	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348683057297521	ENSG00000166133:ENST00000315616:exon_40861499_40862142:RPUSD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41105926	T/G	1	23	13	36	10.9821569865133	6.79269387718814	4.18946310932515	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.183700533925650	ENSG00000166140:ENST00000355341:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000299173:exon_41105911_41106009:ZFYVE19;ENSG00000166140:ENST00000336455:exon_41105911_41106009:ZFYVE19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41146880	T/C	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41146837_41146887:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41146837_41146887:SPINT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41148163	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148090_41148260:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148090_41148260:SPINT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41149161	G/C	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000166145:ENST00000344051:exon_41148968_41150405:SPINT1;ENSG00000166145:ENST00000431806:exon_41148968_41149852:SPINT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41624579	C/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000104147:ENST00000220514:exon_41624438_41624819:OIP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41688700	T/C	1	34	37	71	16.2344929365849	19.3330518043047	-3.09855886771985	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.478043278042488	ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	41689232	C/T	1	26	29	55	12.4146122456237	15.1529324952659	-2.73832024964214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.501023437814489	ENSG00000137806:ENST00000260361:exon_41688685_41689338:NDUFAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	43527871	C/T	1	16	15	31	7.63976138192229	7.83772370444786	-0.197962322525568	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000104055:ENST00000220420:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000349114:exon_43527667_43528035:TGM5;ENSG00000104055:ENST00000396996:exon_43527667_43528035:TGM5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	43762196	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000067369:ENST00000263801:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382044:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000382039:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000450115:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000404183:exon_43762056_43762264:TP53BP1;ENSG00000067369:ENST00000413546:exon_43762056_43762264:TP53BP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	44038899	C/T	1	26	62	88	12.4146122456237	32.3959246450511	-19.9813123994274	T:C	C	T	10	0.522514913629857	2.34404856760016e-05	ENSG00000167004:ENST00000300289:exon_44038590_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000469684:exon_44038608_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000446523:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000434494:exon_44038651_44038904:PDIA3;ENSG00000167004:ENST00000455250:exon_44038810_44038904:PDIA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	44093927	T/C	1	148	127	275	70.6677927827812	66.3593940309918	4.30839875178933	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.629352911969043	ENSG00000140264:ENST00000448830:exon_44093909_44094787:SERF2;ENSG00000140264:ENST00000409617:exon_44093909_44094071:SERF2;ENSG00000242028:ENST00000406925:exon_44093909_44094280:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000442995:exon_44093909_44094489:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000458412:exon_44093716_44095241:C15orf63;ENSG00000242028:ENST00000497142:exon_44093909_44094126:C15orf63
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	44102010	A/C	1	37	50	87	17.6669481956953	26.1257456814929	-8.45879748579756	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0853780043748146	ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44101953_44102112:MFAP1;ENSG00000140259:ENST00000484386:exon_44101953_44102330:MFAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	44107195	C/T	1	39	47	86	18.6219183684356	24.5582009406033	-5.93628257216771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.234927902108351	ENSG00000140259:ENST00000267812:exon_44107143_44107272:MFAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	45361180	A/T	0	8	0	8	3.81988069096114	0	3.81988069096114	A	A		10	0.522514913629857	0.00825830647346234	ENSG00000140263:ENST00000267814:exon_45361075_45361250:SORD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	49620200	C/T	1	15	19	34	7.16227629555214	9.92778335896728	-2.76550706341514	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.392337552161461	ENSG00000156958:ENST00000327171:exon_49620149_49622002:GALK2;ENSG00000156958:ENST00000396509:exon_49620149_49622002:GALK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	52350879	T/C	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000069956:ENST00000261845:exon_52350830_52350994:MAPK6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	52402010	T/A	1	19	20	39	9.07221664103272	10.4502982725971	-1.37808163156443	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.749130394966468	ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52401460_52402170:BCL2L10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	52404862	A/C	1	16	6	22	7.63976138192229	3.13508948177914	4.50467190014315	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0576903399891642	ENSG00000137875:ENST00000260442:exon_52404435_52404972:BCL2L10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	52652174	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000197535:ENST00000399231:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399229:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000358212:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000356338:exon_52652165_52652278:MYO5A;ENSG00000197535:ENST00000399233:exon_52652165_52652278:MYO5A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55489065	G/A	1	34	40	74	16.2344929365849	20.9005965451943	-4.66610360860942	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.296247564540499	ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55489104	A/G	1	15	21	36	7.16227629555214	10.972813186227	-3.81053689067485	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.243311756234342	ENSG00000137876:ENST00000260443:exon_55489008_55489265:RSL24D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55497691	G/A	1	91	57	148	43.451142859683	29.7833500769019	13.6677927827812	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0261777126328111	ENSG00000069974:ENST00000396307:exon_55495164_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000396304:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000423492:exon_55495802_55497903:RAB27A;ENSG00000069974:ENST00000336787:exon_55495802_55497903:RAB27A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55652719	A/G	1	28	22	50	13.369582418364	11.4953280998569	1.87425431850715	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.6717582153441	ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55652845	A/G	1	23	26	49	10.9821569865133	13.5853877543763	-2.60323076786299	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.477535634659633	ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55653031	A/G	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000452064:exon_55647438_55653142:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55651737_55653142:CCPG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	55669281	A/G	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000214882:ENST00000310958:exon_55669147_55669348:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000442196:exon_55669147_55669348:CCPG1;ENSG00000214882:ENST00000425574:exon_55669147_55669348:CCPG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	56996350	G/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000137871:ENST00000267807:exon_56996319_56996465:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000455329:exon_56996319_56996465:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396250:exon_56996319_56996465:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000260435:exon_56996319_56996465:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000396245:exon_56996319_56996465:ZNF280D;ENSG00000137871:ENST00000313282:exon_56996319_56996465:ZNF280D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	57565376	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000140262:ENST00000267811:exon_57565228_57565460:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000438423:exon_57565228_57565460:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000452095:exon_57565228_57565460:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000333725:exon_57565228_57565460:TCF12;ENSG00000140262:ENST00000343827:exon_57565228_57565460:TCF12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	59453384	T/C	1	34	36	70	16.2344929365849	18.8105368906749	-2.57604395408999	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.551850181621446	ENSG00000157483:ENST00000288235:exon_59453272_59453429:MYO1E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	60715800	T/G	1	24	23	47	11.4596420728834	12.0178430134867	-0.55820094060328	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.884962774804445	ENSG00000128915:ENST00000261520:exon_60711808_60715961:NARG2;ENSG00000128915:ENST00000439632:exon_60711808_60715961:NARG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	60797731	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000069667:ENST00000335670:exon_60797707_60797828:RORA;ENSG00000069667:ENST00000449337:exon_60797707_60797828:RORA;ENSG00000069667:ENST00000309157:exon_60797707_60797828:RORA;ENSG00000069667:ENST00000261523:exon_60797707_60797828:RORA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	63433785	G/A	1	76	65	141	36.2888665641309	33.9634693859407	2.32539717819016	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.736236062879223	ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	63433807	G/A	1	50	42	92	23.8742543185071	21.945626372454	1.92862794605315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.754453610119954	ENSG00000103642:ENST00000261893:exon_63433479_63434260:LACTB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	63882944	C/T	1	30	19	49	14.3245525911043	9.92778335896728	4.39676923213701	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.252639952759517	ENSG00000140455:ENST00000380324:exon_63882860_63883659:USP3;ENSG00000140455:ENST00000268049:exon_63882860_63883643:USP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	64448365	C/T	1	19	14	33	9.07221664103272	7.315208790818	1.75700785021472	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.603348110946097	ENSG00000157734:ENST00000325881:exon_64446586_64449680:SNX22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	64737225	G/A	1	19	16	35	9.07221664103272	8.36023861807771	0.711978022955003	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.866673542710621	ENSG00000103671:ENST00000261884:exon_64737205_64737307:TRIP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	64962630	A/C	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64962545_64962632:ZNF609
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	64967654	C/T	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000180357:ENST00000326648:exon_64966115_64968455:ZNF609
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	65108504	A/T	1	24	21	45	11.4596420728834	10.972813186227	0.486828886656435	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	65108547	C/T	1	22	27	49	10.5046719001431	14.1079026680061	-3.60323076786299	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.319696561891813	ENSG00000140451:ENST00000268043:exon_65107831_65108556:PIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	65157360	A/G	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000241839:ENST00000323544:exon_65157098_65160206:PLEKHO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	65255886	C/T	1	117	78	195	55.8657551053067	40.7561632631288	15.1095918421779	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0314989445031033	ENSG00000090487:ENST00000204566:exon_65255362_65256077:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000416889:exon_65255364_65256077:SPG21;ENSG00000090487:ENST00000433215:exon_65255364_65256077:SPG21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	66618342	A/G	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66618169_66618702:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66618169_66618702:DIS3L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	66625672	G/A	1	10	23	33	4.77485086370143	12.0178430134867	-7.24299214978528	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0139078274162245	ENSG00000166938:ENST00000319194:exon_66625342_66626236:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000319212:exon_66625342_66626082:DIS3L;ENSG00000166938:ENST00000530537:exon_66625342_66626066:DIS3L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	68583382	C/T	1	12	19	31	5.72982103644172	9.92778335896728	-4.19796232252557	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.151489511791013	ENSG00000169018:ENST00000306917:exon_68581945_68588203:FEM1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	69728949	A/G	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69728903_69729061:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69728903_69729061:KIF23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	69732736	C/T	1	14	15	29	6.684791209182	7.83772370444786	-1.15293249526585	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.712753772206145	ENSG00000137807:ENST00000352331:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000260363:exon_69732647_69732826:KIF23;ENSG00000137807:ENST00000395392:exon_69732647_69732826:KIF23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	70351788	T/C	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140332:ENST00000451782:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000317509:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000442299:exon_70351749_70351799:TLE3;ENSG00000140332:ENST00000440567:exon_70351749_70351799:TLE3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	70960068	G/A	1	14	7	21	6.684791209182	3.657604395409	3.027186813773	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.198655985278081	ENSG00000137831:ENST00000322954:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000379983:exon_70959063_70961801:UACA;ENSG00000137831:ENST00000395362:exon_70959063_70961801:UACA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	72637795	T/C	1	58	75	133	27.6941350094683	39.1886185222393	-11.494483512771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0557761195509509	ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72637787_72637891:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72637787_72637891:HEXA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	72638892	T/C	1	39	46	85	18.6219183684356	24.0356860269734	-5.41376765853785	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.277565183260126	ENSG00000213614:ENST00000268097:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000457859:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000429918:exon_72638868_72639051:HEXA;ENSG00000213614:ENST00000423001:exon_72638868_72639051:HEXA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	74325743	G/A	1	57	61	118	27.2166499230981	31.8734097314213	-4.65675980832313	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.407848679311456	ENSG00000140464:ENST00000418568:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000417341:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000395135:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000436891:exon_74325497_74325763:PML;ENSG00000140464:ENST00000268058:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74325497_74325755:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74325497_74325755:PML
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	74328141	G/T	1	64	70	134	30.5590455276892	36.57604395409	-6.01699842640084	T:C:G	G	T	10	0.522514913629857	0.300972040748762	ENSG00000140464:ENST00000435786:exon_74326819_74328734:PML;ENSG00000140464:ENST00000268059:exon_74327513_74328735:PML;ENSG00000140464:ENST00000354026:exon_74327513_74328735:PML
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	75649110	A/G	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.430260851727754	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	75761101	G/A	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000169410:ENST00000306726:exon_75759462_75761324:PTPN9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	76998276	T/C	1	14	10	24	6.684791209182	5.22514913629857	1.45964207288343	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.683803059873396	ENSG00000140386:ENST00000324767:exon_76998244_76998325:SCAPER;ENSG00000140386:ENST00000303521:exon_76998244_76998325:SCAPER
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	77241568	T/C	1	13	1	14	6.20730612281186	0.522514913629857	5.684791209182	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00208234831782030	ENSG00000117906:ENST00000394885:exon_77241411_77242601:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000320963:exon_77241411_77242201:RCN2;ENSG00000117906:ENST00000394883:exon_77241411_77242191:RCN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	77324696	A/G	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000140368:ENST00000379595:exon_77324639_77324735:PSTPIP1;ENSG00000140368:ENST00000267939:exon_77324639_77324769:PSTPIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	77344793	T/A	1	37	43	80	17.6669481956953	22.4681412860839	-4.80119309038856	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.314217816229039	ENSG00000140391:ENST00000267970:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000346495:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000424443:exon_77344727_77344810:TSPAN3;ENSG00000140391:ENST00000423920:exon_77344727_77344810:TSPAN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	80452172	G/C	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000103876:ENST00000407106:exon_80452098_80452219:FAH;ENSG00000103876:ENST00000261755:exon_80452098_80452219:FAH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	81592802	A/G	1	145	157	302	69.2353375236707	82.0348414398876	-12.7995039162168	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.149833070686097	ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81591721_81592816:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81591721_81592816:IL16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	81598269	T/G	1	188	125	313	89.7671962375869	65.3143642037321	24.4528320338547	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.00651766274090998	ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	81598416	G/A	1	166	149	315	79.2625243374437	77.8547221308487	1.40780220659504	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.910218542087458	ENSG00000172349:ENST00000394656:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000329842:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000355368:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000360547:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394660:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000302987:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394653:exon_81598249_81598507:IL16;ENSG00000172349:ENST00000394652:exon_81598249_81598507:IL16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	82443939	G/A	1	26	26	52	12.4146122456237	13.5853877543763	-1.17077550875257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.782379642624887	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	82444437	A/G	1	24	36	60	11.4596420728834	18.8105368906749	-7.35089481779142	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0697336459941093	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	82444663	T/C	1	18	18	36	8.59473155466257	9.40526844533743	-0.810536890674854	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.868003039823955	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82443806_82444764:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82443806_82444764:EFTUD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	82456227	T/C	1	12	9	21	5.72982103644172	4.70263422266871	1.027186813773	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.670382560246413	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82456194_82456325:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82456194_82456325:EFTUD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	82512429	C/G	0	0	18	18	0	9.40526844533743	-9.40526844533743	G	C	G	10	0.522514913629857	1.66447243420928e-06	ENSG00000140598:ENST00000359445:exon_82512419_82512570:EFTUD1;ENSG00000140598:ENST00000268206:exon_82512419_82512570:EFTUD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	83680287	A/G	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000169609:ENST00000514272:exon_83680238_83680356:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000510873:exon_83680238_83680343:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000512638:exon_83680238_83680301:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000513601:exon_83680249_83680391:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000304177:exon_83680249_83680358:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000508990:exon_83680238_83680337:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000505341:exon_83678989_83680346:C15orf40;ENSG00000169609:ENST00000506912:exon_83680238_83680362:C15orf40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	85345533	C/T	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000166716:ENST00000299927:exon_85345094_85349659:ZNF592
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	89169858	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000181026:ENST00000332810:exon_89169377_89169980:AEN;ENSG00000181026:ENST00000379231:exon_89169377_89169980:AEN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	89182596	A/G	1	178	124	302	84.9923453738855	64.7918492901023	20.2004960837832	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0211319469125322	ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89182574_89182825:ISG20;ENSG00000172183:ENST00000379224:exon_89182574_89182825:ISG20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	89195526	A/G	1	187	119	306	89.2897111512167	62.179274721953	27.1104364292637	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00196791766549820	ENSG00000172183:ENST00000306072:exon_89195341_89195541:ISG20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	89835954	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89835919_89836095:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89835919_89836095:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89835919_89836095:FANCI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	89837139	G/T	1	11	4	15	5.25233595007157	2.09005965451943	3.16227629555214	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.124040195402654	ENSG00000140525:ENST00000300027:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000447611:exon_89837064_89837228:FANCI;ENSG00000140525:ENST00000310775:exon_89837064_89837228:FANCI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90169216	T/C	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000140534:ENST00000268138:exon_90169167_90169292:C15orf42
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90432308	T/C	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000157823:ENST00000336418:exon_90432281_90432372:AP3S2;ENSG00000157823:ENST00000423566:exon_90432281_90432372:AP3S2;ENSG00000250021:ENST00000398333:exon_90432281_90432372:RP11-233C13.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90611599	C/T	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000140548:ENST00000268154:exon_90610342_90611827:ZNF710
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90617539	C/T	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.534238922078199	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90628594	C/T	1	137	48	185	65.4154568327096	25.0807158542331	40.3347409784765	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1.45209267611502e-09	ENSG00000182054:ENST00000330062:exon_90628507_90628619:IDH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90774357	A/G	1	193	248	441	92.1546216694376	129.583698580205	-37.429076910767	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000408114266145626	ENSG00000185043:ENST00000328649:exon_90774327_90774445:CIB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90784930	C/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000183208:ENST00000448438:exon_90784132_90785312:C15orf58;ENSG00000183208:ENST00000329600:exon_90784132_90785312:C15orf58
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90809628	A/C	1	22	37	59	10.5046719001431	19.3330518043047	-8.82837990416156	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0260564992469293	ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90808891_90809630:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90809520_90809630:NGRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90814944	A/G	1	88	79	167	42.0186876005726	41.2786781767587	0.740009423813881	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.938346211898665	ENSG00000182768:ENST00000331497:exon_90814420_90816463:NGRN;ENSG00000182768:ENST00000379095:exon_90814420_90815440:NGRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	90934057	G/A	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_90934006_90934105:IQGAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	91029318	A/G	1	20	17	37	9.54970172740286	8.88275353170757	0.666948195695289	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.870445363476698	ENSG00000140575:ENST00000268182:exon_91029262_91029364:IQGAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	91354521	G/A	1	33	22	55	15.7570078502147	11.4953280998569	4.26167975035786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.281226088551715	ENSG00000197299:ENST00000355112:exon_91354435_91354636:BLM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	91428290	C/T	0	0	8	8	0	4.18011930903886	-4.18011930903886	T	C	T	10	0.522514913629857	0.00270195736599125	ENSG00000182511:ENST00000416779:exon_91428267_91428402:FES;ENSG00000182511:ENST00000328850:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000470152:exon_91428267_91428643:FES;ENSG00000182511:ENST00000414248:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394306:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394304:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000481665:exon_91428267_91428759:FES;ENSG00000182511:ENST00000394302:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000452243:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000464684:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000443697:exon_91428267_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000444422:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000394300:exon_91428276_91428488:FES;ENSG00000182511:ENST00000450438:exon_91428276_91428488:FES
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	91474738	G/C	1	6	12	18	2.86491051822086	6.27017896355828	-3.40526844533743	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.155344968085716	ENSG00000184508:ENST00000330334:exon_91474155_91474786:HDDC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	91478544	A/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000140553:ENST00000394275:exon_91478174_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000495068:exon_91478515_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000497152:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000418476:exon_91478515_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000268159:exon_91478516_91478560:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000454296:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000439771:exon_91478532_91478605:UNC45A;ENSG00000140553:ENST00000486253:exon_91478540_91478605:UNC45A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	93536197	C/T	1	26	30	56	12.4146122456237	15.6754474088957	-3.26083516327199	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.423271321431966	ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93536089_93536228:CHD2;ENSG00000173575:ENST00000309818:exon_93536089_93536228:CHD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	93567864	A/C	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000173575:ENST00000394196:exon_93567602_93571237:CHD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101109677	C/A	1	24	29	53	11.4596420728834	15.1529324952659	-3.69329042238242	A:C:G	C	A	10	0.522514913629857	0.337404588873155	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101109794	C/G	1	20	19	39	9.54970172740286	9.92778335896728	-0.378081631564426	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101109818	G/A	1	19	17	36	9.07221664103272	8.88275353170757	0.189463109325146	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101109893	C/A	1	20	23	43	9.54970172740286	12.0178430134867	-2.46814128608385	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.541969417714209	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101110265	T/A	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101110302	C/G	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101107119_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101109435_101110322:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101109435_101110322:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101120963	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000140471:ENST00000314742:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000360903:exon_101120649_101121150:LINS;ENSG00000140471:ENST00000449654:exon_101120649_101121152:LINS;ENSG00000140471:ENST00000446841:exon_101120649_101121150:LINS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101464915	T/C	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000154237:ENST00000532029:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000534045:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000527698:exon_101464716_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101464777_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101464808_101464934:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101464808_101464934:LRRK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101608975	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000154237:ENST00000388948:exon_101608876_101610315:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000284395:exon_101608876_101610315:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000529762:exon_101608876_101609053:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000525284:exon_101608876_101609273:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000531270:exon_101608876_101609273:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000526457:exon_101608876_101610317:LRRK1;ENSG00000154237:ENST00000532145:exon_101608876_101610308:LRRK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	15	101718106	G/A	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000131873:ENST00000254190:exon_101715928_101719185:CHSY1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	129654	C/T	1	120	106	226	57.2982103644172	55.3865808447648	1.91162951965232	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841740666261993	ENSG00000103152:ENST00000436333:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397817:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000356432:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000428050:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000475280:exon_129424_129843:MPG;ENSG00000103152:ENST00000219431:exon_129424_129699:MPG;ENSG00000103152:ENST00000397818:exon_129424_129699:MPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	139784	G/C	1	26	24	50	12.4146122456237	12.5403579271166	-0.125745681492852	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000103148:ENST00000463178:exon_138697_141084:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000405960:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000445810:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000428323:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399957:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399953:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000262313:exon_139711_139900:NPRL3;ENSG00000103148:ENST00000399951:exon_139711_139900:NPRL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	310005	G/A	1	14	9	23	6.684791209182	4.70263422266871	1.98215698651329	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.532235244522199	ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_309995_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420046:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000420500:exon_309968_310008:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_309968_310159:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000421000:exon_309968_310159:ITFG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	311506	G/A	1	11	8	19	5.25233595007157	4.18011930903886	1.07221664103272	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.653984881903285	ENSG00000167930:ENST00000399932:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301679:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000453430:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000449945:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000301678:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442458:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000450082:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000442854:exon_311383_311513:ITFG3;ENSG00000167930:ENST00000468354:exon_311204_311513:ITFG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	420140	G/A	0	405	0	405	193.381459979908	0	193.381459979908	G	G		10	0.522514913629857	7.37244389433356e-115	ENSG00000086504:ENST00000397735:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000481453:exon_418501_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000483764:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000199706:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000461550:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000397734:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000469744:exon_419931_420234:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000389675:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000441883:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000447696:exon_419931_420225:MRPL28;ENSG00000086504:ENST00000450882:exon_419931_420225:MRPL28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	715990	G/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_715950_716124:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_715950_716124:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	716273	T/C	1	11	1	12	5.25233595007157	0.522514913629857	4.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00694073669620132	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	716287	C/A	1	11	1	12	5.25233595007157	0.522514913629857	4.72982103644172	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.00694073669620132	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_716220_716350:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_716220_716350:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	717485	G/A	1	10	2	12	4.77485086370143	1.04502982725971	3.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0408682426721573	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	717496	C/T	1	10	1	11	4.77485086370143	0.522514913629857	4.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0125953210255273	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	717523	G/T	1	10	2	12	4.77485086370143	1.04502982725971	3.72982103644172	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0408682426721573	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	717544	G/C	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000161996:ENST00000293879:exon_717432_717829:WDR90;ENSG00000161996:ENST00000315764:exon_717432_717829:WDR90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	719592	G/A	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_719553_719606:RHOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	720152	T/C	1	17	10	27	8.11724646829243	5.22514913629857	2.89209733199386	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.336149290227447	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720123_720175:RHOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	720960	C/T	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_720892_721000:RHOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	722331	C/T	1	24	7	31	11.4596420728834	3.657604395409	7.80203767747443	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00611825481601259	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722254_722384:RHOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	722548	A/G	1	25	12	37	11.9371271592536	6.27017896355828	5.66694819569529	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0704896932485114	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_722489_722566:RHOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	723647	C/G	1	28	23	51	13.369582418364	12.0178430134867	1.35173940487729	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.779789235512258	ENSG00000140983:ENST00000315082:exon_723480_724174:RHOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	838713	G/A	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_838165_838775:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_838622_838775:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000479976:exon_838624_838775:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_838625_838775:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_838635_838775:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_838646_838775:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_838647_838775:CHTF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	842518	C/T	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_842439_842590:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_842439_842590:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000440239:exon_842439_842590:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_842439_842590:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_842439_842590:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_842439_842590:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_842439_842590:CHTF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	845797	G/C	1	20	11	31	9.54970172740286	5.74766404992843	3.80203767747443	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.208805155249409	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_845685_845834:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000493715:exon_845685_845834:CHTF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	846798	C/T	1	18	4	22	8.59473155466257	2.09005965451943	6.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00518613542124144	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_846717_846861:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_846615_846861:CHTF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	847724	G/A	1	25	24	49	11.9371271592536	12.5403579271166	-0.603230767862994	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.887115832860749	ENSG00000127586:ENST00000317063:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000448184:exon_847694_847751:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847694_847751:CHTF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	848000	C/T	1	21	21	42	10.027186813773	10.972813186227	-0.945626372453994	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.877494826627993	ENSG00000127586:ENST00000464728:exon_847839_848063:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000471202:exon_847839_848072:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000455171:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000262315:exon_847839_848074:CHTF18;ENSG00000127586:ENST00000498439:exon_847839_848074:CHTF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	929630	G/T	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000103227:ENST00000262301:exon_929570_929737:LMF1;ENSG00000103227:ENST00000399843:exon_929570_929737:LMF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1545467	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1545347_1545624:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1545347_1545624:TELO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1547477	T/C	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1547362_1547509:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1547362_1547509:TELO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1557641	C/G	1	21	18	39	10.027186813773	9.40526844533743	0.621918368435576	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.873940358026441	ENSG00000100726:ENST00000437914:exon_1557602_1557717:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000497339:exon_1557602_1557717:TELO2;ENSG00000100726:ENST00000262319:exon_1557602_1557717:TELO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1818503	G/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000138834:ENST00000250894:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3;ENSG00000138834:ENST00000356010:exon_1818478_1818627:MAPK8IP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1820992	T/A	1	104	119	223	49.6584489824949	62.179274721953	-12.5208257394581	A:T:G	T	A	10	0.522514913629857	0.0942238502847548	ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1820882_1820994:NME3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1821107	A/C	1	84	89	173	40.108747255092	46.5038273130573	-6.39508005796526	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.361182482794003	ENSG00000103024:ENST00000219302:exon_1821071_1821172:NME3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	1838037	C/G	1	50	52	102	23.8742543185071	27.1707755087526	-3.29652119024542	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.552522900298105	ENSG00000095906:ENST00000262302:exon_1837942_1838052:NUBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2105563	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2138269	T/C	1	56	52	108	26.739164836728	27.1707755087526	-0.431610672024558	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138228_2138326:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138228_2138326:TSC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2138508	G/C	1	85	72	157	40.5862323414621	37.6210737813497	2.96515856011244	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.689705933533703	ENSG00000103197:ENST00000219476:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000401874:exon_2138447_2138703:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439673:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000353929:exon_2138447_2138712:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000350773:exon_2138447_2138713:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000439117:exon_2138447_2138721:TSC2;ENSG00000103197:ENST00000497886:exon_2138447_2138712:TSC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2257105	C/G	1	64	48	112	30.5590455276892	25.0807158542331	5.47832967345601	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.344265558064525	ENSG00000167965:ENST00000382450:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301724:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000397124:exon_2257036_2257111:MLST8;ENSG00000167965:ENST00000301725:exon_2257036_2257111:MLST8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2285357	C/T	1	35	27	62	16.711978022955	14.1079026680061	2.60407535494886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.527637363925161	ENSG00000167967:ENST00000301727:exon_2285217_2285743:E4F1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2294515	C/T	1	35	18	53	16.711978022955	9.40526844533743	7.30670957761758	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0535142226518625	ENSG00000167969:ENST00000301729:exon_2294407_2294553:DCI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2313361	T/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2757364	G/A	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000167977:ENST00000301738:exon_2757299_2759031:KCTD5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2762637	A/G	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000172382:ENST00000302641:exon_2762419_2762815:PRSS27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2813350	G/T	1	23	24	47	10.9821569865133	12.5403579271166	-1.55820094060328	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.664179293645895	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2;ENSG00000167978:ENST00000382301:exon_2811562_2816602:SRRM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2816681	G/A	1	122	147	269	58.2531805371574	76.809692303589	-18.5565117664315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0239736970105894	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2817463	A/T	1	223	215	438	106.479174260542	112.340706430419	-5.86153216987738	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.598868285750796	ENSG00000167978:ENST00000301740:exon_2811562_2818262:SRRM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2880232	T/A	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2880170_2880329:ZG16B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	2882197	G/T	1	34	8	42	16.2344929365849	4.18011930903886	12.054373627546	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.000152000078056945	ENSG00000162078:ENST00000382280:exon_2881797_2882285:ZG16B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3076393	C/T	1	33	19	52	15.7570078502147	9.92778335896728	5.82922449124743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.126408904473871	ENSG00000131652:ENST00000253952:exon_3076366_3076414:THOC6;ENSG00000131652:ENST00000326266:exon_3076366_3076414:THOC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3165425	A/G	1	1	12	13	0.477485086370143	6.27017896355828	-5.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00123750003474538	ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3165356_3165569:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3165356_3165569:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000444510:exon_3165356_3165569:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000414351:exon_3165356_3165569:ZNF205
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3170188	C/T	1	33	5	38	15.7570078502147	2.61257456814929	13.1444332820654	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1.09063914440074e-05	ENSG00000122386:ENST00000382192:exon_3169257_3170518:ZNF205;ENSG00000122386:ENST00000219091:exon_3169257_3170484:ZNF205
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3191339	C/G	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000085644:ENST00000396878:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000332670:exon_3190690_3192804:ZNF213;ENSG00000085644:ENST00000416391:exon_3190690_3192804:ZNF213
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3433146	G/A	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000140987:ENST00000304926:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396852:exon_3432085_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000396846:exon_3432483_3433711:ZNF434;ENSG00000140987:ENST00000439568:exon_3433056_3433332:ZNF434
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3707747	G/A	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000213918:ENST00000407479:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000414110:exon_3707721_3707817:DNASE1;ENSG00000213918:ENST00000246949:exon_3707721_3707817:DNASE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3708813	G/C	1	256	256	512	122.236182110757	133.763817889243	-11.5276357784868	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.30930949551004	ENSG00000126602:ENST00000246957:exon_3708794_3708866:TRAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	3778337	G/A	1	6	12	18	2.86491051822086	6.27017896355828	-3.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.155344968085716	ENSG00000005339:ENST00000262367:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000382070:exon_3775055_3779875:CREBBP;ENSG00000005339:ENST00000323508:exon_3775055_3779875:CREBBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	4476089	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4475806_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4475858_4476093:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4475882_4476093:DNAJA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	4484396	A/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4484385_4484518:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4484385_4484518:DNAJA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	4496973	T/A	1	13	19	32	6.20730612281186	9.92778335896728	-3.72047723615543	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.216912579895035	ENSG00000103423:ENST00000262375:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000355296:exon_4496887_4497015:DNAJA3;ENSG00000103423:ENST00000431375:exon_4496887_4497015:DNAJA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	4511752	T/C	1	160	145	305	76.3976138192229	75.7646624763293	0.632951342893605	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.954349690363264	ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4511695_4511960:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4511696_4511960:NMRAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	4516346	C/T	1	72	51	123	34.3789262186503	26.6482605951227	7.73066562352759	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.176075639362454	ENSG00000153406:ENST00000283429:exon_4516154_4516403:NMRAL1;ENSG00000153406:ENST00000404295:exon_4516154_4516403:NMRAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	5075542	G/A	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000103174:ENST00000312251:exon_5074845_5075686:NAGPA;ENSG00000103174:ENST00000381955:exon_5074873_5075686:NAGPA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	5128001	C/T	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000033011:ENST00000262374:exon_5127908_5128018:ALG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	5139217	C/G	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5139108_5139257:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5139108_5139257:FAM86A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	5140541	G/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000118894:ENST00000458008:exon_5140433_5140566:FAM86A;ENSG00000118894:ENST00000427587:exon_5140433_5140566:FAM86A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	8729124	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000067365:ENST00000381920:exon_8729025_8729169:C16orf68;ENSG00000067365:ENST00000163678:exon_8729025_8729169:C16orf68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	8941597	A/G	1	25	10	35	11.9371271592536	5.22514913629857	6.711978022955	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0270504322481821	ENSG00000140650:ENST00000268261:exon_8941581_8943188:PMM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	9210603	A/G	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182831:ENST00000327827:exon_9210525_9215497:C16orf72
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	10721477	G/A	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000153060:ENST00000283025:exon_10721358_10721656:TEKT5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	10855651	C/T	1	41	44	85	19.5768885411759	22.9906561997137	-3.41376765853785	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.515039284612492	ENSG00000103274:ENST00000283027:exon_10855614_10855716:NUBP1;ENSG00000103274:ENST00000433392:exon_10855614_10855716:NUBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11000848	G/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11001770	G/T	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11001914	G/A	1	5	11	16	2.38742543185071	5.74766404992843	-3.36023861807771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.131589504447199	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11000356_11002006:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000388910:exon_11000356_11002151:CIITA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11002904	G/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000179583:ENST00000324288:exon_11002886_11003044:CIITA;ENSG00000179583:ENST00000381835:exon_11002840_11003044:CIITA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11114174	A/G	1	20	15	35	9.54970172740286	7.83772370444786	1.711978022955	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.614294946711019	ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11114050_11114182:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000494853:exon_11114050_11114182:CLEC16A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11219927	C/T	1	14	14	28	6.684791209182	7.315208790818	-0.630417581635996	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.851639324049382	ENSG00000038532:ENST00000409790:exon_11219836_11220003:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000409552:exon_11219836_11220201:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000428742:exon_11219836_11220003:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000436973:exon_11219836_11220003:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000261657:exon_11219836_11220003:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000459723:exon_11219867_11220003:CLEC16A;ENSG00000038532:ENST00000381822:exon_11219925_11220003:CLEC16A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11260440	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11769948	C/T	1	28	20	48	13.369582418364	10.4502982725971	2.91928414576686	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.470603457629073	ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11769963	C/T	1	34	23	57	16.2344929365849	12.0178430134867	4.21664992309815	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.290243798339014	ENSG00000184602:ENST00000329565:exon_11769831_11773015:SNN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11773662	C/G	1	57	61	118	27.2166499230981	31.8734097314213	-4.65675980832313	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.407848679311456	ENSG00000153066:ENST00000283033:exon_11772943_11773693:TXNDC11;ENSG00000153066:ENST00000356957:exon_11772943_11773693:TXNDC11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11852354	A/C	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:T:C	A	C	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11852287_11852395:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11852287_11852395:ZC3H7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11873158	T/C	1	2	10	12	0.954970172740286	5.22514913629857	-4.27017896355829	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0180411572214053	ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11873022_11873219:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11873022_11873219:ZC3H7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	11876203	T/C	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000122299:ENST00000355758:exon_11876143_11876244:ZC3H7A;ENSG00000122299:ENST00000396516:exon_11876143_11876408:ZC3H7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	12061626	G/A	1	143	155	298	68.2803673509304	80.9898116126278	-12.7094442616974	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.147240876472221	ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	12061677	G/C	1	100	91	191	47.7485086370143	47.548857140317	0.199651496697307	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000048462:ENST00000053243:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000396495:exon_12061427_12061925:TNFRSF17;ENSG00000048462:ENST00000435355:exon_12061427_12061925:TNFRSF17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	15116625	G/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	15122812	C/G	1	9	27	36	4.29736577733129	14.1079026680061	-9.81053689067485	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.00123057371979468	ENSG00000179889:ENST00000450288:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000325823:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000447912:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000396410:exon_15122735_15122823:PDXDC1;ENSG00000179889:ENST00000455313:exon_15122735_15123657:PDXDC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	15818653	G/A	1	45	23	68	21.4868288866564	12.0178430134867	9.46898587316972	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0281353957627885	ENSG00000072864:ENST00000396355:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000396354:exon_15818048_15820210:NDE1;ENSG00000072864:ENST00000342673:exon_15818048_15818989:NDE1;ENSG00000133392:ENST00000300036:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000338282:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396320:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000396324:exon_15818504_15818656:MYH11;ENSG00000133392:ENST00000452625:exon_15818504_15818656:MYH11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	18800251	T/C	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	19083410	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19083250_19083428:COQ7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	19085298	C/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000167186:ENST00000321998:exon_19085243_19085357:COQ7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	19680546	T/C	1	13	15	28	6.20730612281186	7.83772370444786	-1.630417581636	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.574469279427906	ENSG00000103544:ENST00000438132:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000251143:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000417362:exon_19680482_19680621:C16orf62;ENSG00000103544:ENST00000448695:exon_19680482_19680621:C16orf62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	19721873	G/A	1	29	25	54	13.8470675047341	13.0628728407464	0.784194663987721	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.892036586206937	ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19721831_19721908:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19721831_19721908:C16orf88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	19726093	G/C	1	136	74	210	64.9379717463394	38.6661036086094	26.27186813773	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.000307909580110093	ENSG00000103550:ENST00000219837:exon_19725440_19726362:C16orf88;ENSG00000103550:ENST00000420899:exon_19725440_19726359:C16orf88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	22277660	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	23403744	A/G	1	26	34	60	12.4146122456237	17.7655070634151	-5.35089481779142	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.196126389633755	ENSG00000168434:ENST00000307149:exon_23403701_23403844:COG7;ENSG00000168434:ENST00000429391:exon_23403701_23403844:COG7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	23489711	C/G	1	24	31	55	11.4596420728834	16.1979623225256	-4.73832024964214	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.225172802884380	ENSG00000103365:ENST00000309859:exon_23489689_23489822:GGA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	23672560	A/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000166847:ENST00000300087:exon_23672491_23672602:DCTN5;ENSG00000166847:ENST00000446651:exon_23672491_23672563:DCTN5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	23700059	C/T	1	101	78	179	48.2259937233844	40.7561632631288	7.46983046025559	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.294870382869068	ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23699989_23700066:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23699989_23700066:PLK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	23701458	G/A	1	101	102	203	48.2259937233844	53.2965211902454	-5.07052746686097	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.483138229448014	ENSG00000166851:ENST00000300093:exon_23701181_23701688:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000330792:exon_23701452_23701541:PLK1;ENSG00000166851:ENST00000425844:exon_23701181_23701688:PLK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	24166130	T/C	1	16	14	30	7.63976138192229	7.315208790818	0.32455259110429	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000166501:ENST00000321728:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24166005_24166178:PRKCB;ENSG00000166501:ENST00000472066:exon_24166005_24166178:PRKCB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	24226026	A/T	1	50	40	90	23.8742543185071	20.9005965451943	2.97365777331287	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.598055128068994	ENSG00000166501:ENST00000303531:exon_24225979_24231932:PRKCB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	24583406	A/G	1	177	168	345	84.5148602875153	87.782505489816	-3.26764520230067	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.746540448162586	ENSG00000122257:ENST00000381039:exon_24582197_24584181:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000319715:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000348022:exon_24582197_24584184:RBBP6;ENSG00000122257:ENST00000455016:exon_24582197_24584184:RBBP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	24946807	C/T	1	133	122	255	63.505516487229	63.7468194628426	-0.241302975613543	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140750:ENST00000303665:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000289968:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000431218:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000441763:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000457275:exon_24946791_24946960:ARHGAP17;ENSG00000140750:ENST00000455311:exon_24946791_24946960:ARHGAP17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	27460437	G/A	1	90	75	165	42.9736577733129	39.1886185222393	3.78503925107359	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.585792389012767	ENSG00000103522:ENST00000337929:exon_27459855_27461879:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395755:exon_27459855_27462115:IL21R;ENSG00000103522:ENST00000395754:exon_27459855_27462115:IL21R
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28137131	G/T	1	12	17	29	5.72982103644172	8.88275353170757	-3.15293249526585	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.268082057749973	ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28137010_28137169:XPO6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28145165	T/A	1	11	20	31	5.25233595007157	10.4502982725971	-5.19796232252557	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0721830321938906	ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28145162_28145254:XPO6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28222690	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000169180:ENST00000304658:exon_28222687_28223190:XPO6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28506428	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000184730:ENST00000328423:exon_28506420_28507410:AC138894.1;ENSG00000184730:ENST00000431282:exon_28506420_28507410:AC138894.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28883241	A/G	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000178188:ENST00000359285:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000395532:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000322610:exon_28883101_28883304:SH2B1;ENSG00000178188:ENST00000337120:exon_28883101_28883304:SH2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28922249	C/T	1	18	22	40	8.59473155466257	11.4953280998569	-2.90059654519428	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.429263432801788	ENSG00000177548:ENST00000357573:exon_28922209_28922307:RABEP2;ENSG00000177548:ENST00000358201:exon_28922209_28922307:RABEP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28944303	G/A	1	65	79	144	31.0365306140593	41.2786781767587	-10.2421475626994	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0952033925204656	ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28944232_28944435:CD19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	28948783	C/T	1	322	253	575	153.750197811186	132.196273148354	21.5539246628322	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0727509356408576	ENSG00000177455:ENST00000380673:exon_28948776_28948844:CD19;ENSG00000177455:ENST00000324662:exon_28948776_28948844:CD19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	29814880	C/T	1	67	40	107	31.9915007867996	20.9005965451943	11.0909042416053	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.033290646030266	ENSG00000079616:ENST00000160827:exon_29814770_29814929:KIF22;ENSG00000079616:ENST00000400750:exon_29814770_29814929:KIF22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	29851558	G/A	1	69	66	135	32.9464709595399	34.4859842995706	-1.53951334003069	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.796731585305705	ENSG00000013364:ENST00000357402:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000395353:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000424666:exon_29851499_29851780:MVP;ENSG00000013364:ENST00000452209:exon_29851499_29851780:MVP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	29979430	T/C	1	66	97	163	31.5140157004294	50.6839466220961	-19.1699309216667	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00282263831537978	ENSG00000149932:ENST00000414689:exon_29979346_29979575:TMEM219;ENSG00000149932:ENST00000279396:exon_29979346_29979575:TMEM219
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	29996590	C/T	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000149930:ENST00000416441:exon_29996534_29996899:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29996534_29996899:TAOK2;ENSG00000149930:ENST00000279394:exon_29996534_29996899:TAOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	29999225	G/A	0	20	0	20	9.54970172740286	0	9.54970172740286	G	G		10	0.522514913629857	2.68078945654898e-06	ENSG00000149930:ENST00000308893:exon_29997586_29999719:TAOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30004990	C/T	1	34	33	67	16.2344929365849	17.2429921497853	-1.00849921320042	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.808231421307066	ENSG00000149929:ENST00000279392:exon_30004961_30005129:HIRIP3;ENSG00000149929:ENST00000352552:exon_30004961_30005129:HIRIP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30005542	A/G	1	74	58	132	35.3338963913906	30.3058649905317	5.02803140085888	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.385398039872465	ENSG00000149929:ENST00000279392:exon_30005227_30006164:HIRIP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30199584	G/A	1	16	8	24	7.63976138192229	4.18011930903886	3.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.219554892199473	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30376486	T/C	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000169221:ENST00000305663:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000409939:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000478158:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000490703:exon_30376426_30376533:TBC1D10B;ENSG00000169221:ENST00000464644:exon_30376426_30376533:TBC1D10B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30393660	G/A	1	68	44	112	32.4689858731697	22.9906561997137	9.47832967345601	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0881976444304688	ENSG00000180096:ENST00000321367:exon_30393596_30393686:SEPT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30409456	T/C	1	6	11	17	2.86491051822086	5.74766404992843	-2.88275353170757	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.224428896708456	ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30409603	C/T	1	15	13	28	7.16227629555214	6.79269387718814	0.369582418364003	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000180035:ENST00000495929:exon_30408651_30410681:ZNF48;ENSG00000180035:ENST00000320159:exon_30408651_30411429:ZNF48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30581676	C/A	1	25	27	52	11.9371271592536	14.1079026680061	-2.17077550875257	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.580525495953374	ENSG00000229809:ENST00000395219:exon_30581028_30581757:ZNF688;ENSG00000229809:ENST00000223459:exon_30581053_30581757:ZNF688
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30667461	T/G	1	147	159	306	70.190307696411	83.0798712671473	-12.8895635707363	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.152453852289672	ENSG00000156858:ENST00000287463:exon_30667353_30667733:PRR14;ENSG00000156858:ENST00000300835:exon_30667353_30667761:PRR14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	30903962	T/C	1	109	100	209	52.0458744143456	52.2514913629857	-0.20561694864012	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000099385:ENST00000380317:exon_30903907_30904068:BCL7C;ENSG00000099385:ENST00000215115:exon_30903907_30904068:BCL7C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31075708	C/G	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167394:ENST00000394983:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000300849:exon_31075134_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000414399:exon_31075616_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000442862:exon_31075471_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000417935:exon_31075505_31075802:ZNF668;ENSG00000167394:ENST00000426488:exon_31075552_31075802:ZNF668
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31091209	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000167395:ENST00000300850:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000532218:exon_31087567_31093022:ZNF646;ENSG00000167395:ENST00000394979:exon_31087223_31094826:ZNF646
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31141880	A/G	1	49	58	107	23.396769232137	30.3058649905317	-6.9090957583947	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.208227369894146	ENSG00000103510:ENST00000219797:exon_31141777_31141927:MYST1;ENSG00000103510:ENST00000448516:exon_31141777_31141927:MYST1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31193948	C/T	1	209	226	435	99.7943830513599	118.088370480348	-18.2939874289878	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0839623347109155	ENSG00000089280:ENST00000254108:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000433338:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000394533:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000380244:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000487045:exon_31193834_31194283:FUS;ENSG00000089280:ENST00000491029:exon_31193834_31193985:FUS;ENSG00000089280:ENST00000354711:exon_31193834_31193985:FUS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31212900	G/A	1	322	294	616	153.750197811186	153.619384607178	0.130813204008064	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000103490:ENST00000247470:exon_31212807_31213162:PYCARD;ENSG00000103490:ENST00000350605:exon_31212807_31213162:PYCARD;ENSG00000103490:ENST00000355986:exon_31212809_31213162:PYCARD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31332655	C/T	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000169896:ENST00000287497:exon_31332562_31332692:ITGAM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31391887	C/T	1	32	19	51	15.2795227638446	9.92778335896728	5.35173940487729	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.160748435750529	ENSG00000140678:ENST00000268296:exon_31391844_31391945:ITGAX;ENSG00000140678:ENST00000394880:exon_31391844_31391945:ITGAX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	31477460	G/A	1	12	20	32	5.72982103644172	10.4502982725971	-4.72047723615543	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.111530093823708	ENSG00000140691:ENST00000408912:exon_31477400_31478426:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000268314:exon_31477400_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000457010:exon_31475715_31478485:ARMC5;ENSG00000140691:ENST00000412665:exon_31477400_31478485:ARMC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	46696284	G/A	1	47	50	97	22.4417990593967	26.1257456814929	-3.68394662209613	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.477786128033016	ENSG00000069329:ENST00000299138:exon_46696155_46696394:VPS35
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	46708241	T/C	1	28	30	58	13.369582418364	15.6754474088957	-2.30586499053171	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.599820073617939	ENSG00000069329:ENST00000299138:exon_46708226_46708374:VPS35
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	47117344	A/T	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000171208:ENST00000303155:exon_47115548_47117712:NETO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	48395527	G/A	1	17	17	34	8.11724646829243	8.88275353170757	-0.765507063415139	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.864375732734557	ENSG00000196470:ENST00000356721:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000394725:exon_48394442_48396341:SIAH1;ENSG00000196470:ENST00000380006:exon_48394442_48397793:SIAH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	50353831	C/T	1	50	70	120	23.8742543185071	36.57604395409	-12.7017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0221688478871252	ENSG00000166164:ENST00000394688:exon_50353798_50353941:BRD7;ENSG00000166164:ENST00000394689:exon_50353798_50353941:BRD7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	50711334	G/A	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000167208:ENST00000300590:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000423026:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000330943:exon_50711308_50711446:SNX20;ENSG00000167208:ENST00000413750:exon_50711308_50711446:SNX20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	53504721	T/C	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000103479:ENST00000262133:exon_53504658_53504834:RBL2;ENSG00000103479:ENST00000379935:exon_53504658_53504834:RBL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	56857753	G/A	1	13	11	24	6.20730612281186	5.74766404992843	0.459642072883431	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000102900:ENST00000308159:exon_56857619_56857758:NUP93
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57016092	G/A	1	23	41	64	10.9821569865133	21.4231114588241	-10.4409544723108	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0117435490620587	ENSG00000087237:ENST00000200676:exon_57016077_57016149:CETP;ENSG00000087237:ENST00000379780:exon_57016077_57016149:CETP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57091977	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57091977_57092060:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000327982:exon_57091977_57092060:NLRC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57111232	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000140853:ENST00000262510:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000308149:exon_57111208_57111291:NLRC5;ENSG00000140853:ENST00000436936:exon_57111208_57111291:NLRC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57188397	G/A	1	101	138	239	48.2259937233844	72.1070580809203	-23.8810643575358	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00227734888271895	ENSG00000172775:ENST00000309137:exon_57186387_57188419:FAM192A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57394356	C/T	1	313	165	478	149.452832033855	86.2149607489264	63.2378712849283	T:C	C	T	10	0.522514913629857	6.54095334968763e-09	ENSG00000102962:ENST00000219235:exon_57394349_57394472:CCL22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57474740	G/T	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000005194:ENST00000394391:exon_57474684_57474895:CIAPIN1;ENSG00000005194:ENST00000356811:exon_57474684_57474895:CIAPIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57552088	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57551980_57552189:CCDC102A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57555076	C/T	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57554980_57555088:CCDC102A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57562529	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000135736:ENST00000258214:exon_57562505_57563236:CCDC102A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	57787027	C/T	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000140854:ENST00000379661:exon_57786989_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000394326:exon_57785852_57787179:KATNB1;ENSG00000140854:ENST00000268509:exon_57786989_57787179:KATNB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	58757668	A/C	1	14	12	26	6.684791209182	6.27017896355828	0.414612245623718	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	58757683	A/G	1	13	10	23	6.20730612281186	5.22514913629857	0.982156986513288	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.835280900229804	ENSG00000125166:ENST00000245206:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000434819:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000425685:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000496461:exon_58757650_58757806:GOT2;ENSG00000125166:ENST00000492378:exon_58757650_58757806:GOT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	66966190	A/C	1	274	256	530	130.830913665419	133.763817889243	-2.93290422382421	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.827917972458375	ENSG00000166595:ENST00000422424:exon_66965959_66966203:FAM96B;ENSG00000166595:ENST00000299761:exon_66965969_66966203:FAM96B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	66968130	G/T	1	146	114	260	69.7128226100409	59.5667001538037	10.1461224562372	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.214771518862912	ENSG00000166595:ENST00000422424:exon_66968126_66968320:FAM96B;ENSG00000166595:ENST00000299761:exon_66968124_66968267:FAM96B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	66976570	C/A	1	14	4	18	6.684791209182	2.09005965451943	4.59473155466257	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0338821528512444	ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66976551_66976640:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66976551_66976688:CES2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	66977896	G/A	1	51	11	62	24.3517394048773	5.74766404992843	18.6040753549489	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1.24382594137814e-06	ENSG00000172831:ENST00000417689:exon_66977742_66978972:CES2;ENSG00000172831:ENST00000317091:exon_66977742_66978999:CES2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67266065	T/C	1	18	25	43	8.59473155466257	13.0628728407464	-4.46814128608385	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.221580586199994	ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67265942_67266097:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67265942_67266097:FHOD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67268008	G/A	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000135723:ENST00000258201:exon_67267560_67268170:FHOD1;ENSG00000135723:ENST00000438183:exon_67267560_67268170:FHOD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67578257	C/T	1	13	11	24	6.20730612281186	5.74766404992843	0.459642072883431	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000039523:ENST00000379312:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000042381:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000422602:exon_67578202_67578334:FAM65A;ENSG00000039523:ENST00000428437:exon_67578202_67578334:FAM65A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67688761	C/T	1	71	47	118	33.9014411322801	24.5582009406033	9.34324019167687	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.09689943331686	ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67688681_67688803:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67688681_67688803:RLTPR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67691326	G/A	1	100	91	191	47.7485086370143	47.548857140317	0.199651496697307	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000159753:ENST00000334583:exon_67691309_67691456:RLTPR;ENSG00000159753:ENST00000398282:exon_67691309_67691456:RLTPR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67696346	C/T	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000102981:ENST00000458121:exon_67695799_67696680:PARD6A;ENSG00000102981:ENST00000219255:exon_67695796_67696677:PARD6A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	67974230	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000213398:ENST00000264005:exon_67973653_67974381:LCAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	68224793	C/A	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000072736:ENST00000379165:exon_68224671_68226113:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000349223:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000346183:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000329524:exon_68224671_68225678:NFATC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	68224794	T/C	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000072736:ENST00000379165:exon_68224671_68226113:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000349223:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000346183:exon_68224671_68225678:NFATC3;ENSG00000072736:ENST00000329524:exon_68224671_68225678:NFATC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	68389772	C/T	1	42	39	81	20.054373627546	20.3780816315644	-0.323708004018417	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000132600:ENST00000449359:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000348497:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000441236:exon_68389626_68389786:PRMT7;ENSG00000132600:ENST00000339507:exon_68389626_68389786:PRMT7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	68961576	C/T	1	16	10	26	7.63976138192229	5.22514913629857	2.41461224562372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.433312135919422	ENSG00000103047:ENST00000261778:exon_68961471_68961986:TMCO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	75269513	C/T	1	12	14	26	5.72982103644172	7.315208790818	-1.58538775437628	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.561396276598999	ENSG00000050820:ENST00000393422:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000162330:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000393420:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000420641:exon_75268787_75269884:BCAR1;ENSG00000050820:ENST00000418647:exon_75268787_75269884:BCAR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	77228866	T/C	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000103111:ENST00000248248:exon_77228232_77229051:MON1B;ENSG00000103111:ENST00000439557:exon_77228232_77229051:MON1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81076821	T/C	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81077204	T/A	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81077915	T/C	1	19	24	43	9.07221664103272	12.5403579271166	-3.46814128608385	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.35988510738201	ENSG00000166454:ENST00000299575:exon_81076766_81080951:ATMIN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81124275	G/A	0	0	10	10	0	5.22514913629857	-5.22514913629857	A	G	A	10	0.522514913629857	0.000616024684608098	ENSG00000140905:ENST00000315467:exon_81124206_81124285:GCSH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81929491	C/T	1	29	39	68	13.8470675047341	20.3780816315644	-6.53101412683028	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.116201438894234	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81929527	C/G	1	37	36	73	17.6669481956953	18.8105368906749	-1.14358869497956	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.815486480432418	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81929412_81929532:PLCG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81941319	C/T	1	28	43	71	13.369582418364	22.4681412860839	-9.09855886771985	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0325925639582738	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81941290_81941379:PLCG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81969847	C/T	1	108	110	218	51.5683893279754	57.4766404992843	-5.90825117130883	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.455904369699451	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81969774_81969983:PLCG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	81971403	T/C	1	87	65	152	41.5412025142024	33.9634693859407	7.57773312826173	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.224287780468968	ENSG00000197943:ENST00000359376:exon_81971363_81971508:PLCG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	82182316	C/T	1	20	14	34	9.54970172740286	7.315208790818	2.23449293658486	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.494912855070951	ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82181767_82182468:MPHOSPH6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	82182973	T/C	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000135698:ENST00000258169:exon_82182914_82183008:MPHOSPH6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	84088026	T/C	1	18	13	31	8.59473155466257	6.79269387718814	1.80203767747443	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.591512688864675	ENSG00000140943:ENST00000343411:exon_84087366_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000421130:exon_84087371_84088250:MBTPS1;ENSG00000140943:ENST00000347334:exon_84087686_84088184:MBTPS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	84529303	T/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000140950:ENST00000343629:exon_84529289_84529519:KIAA1609
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	84778762	C/T	1	18	23	41	8.59473155466257	12.0178430134867	-3.42311145882414	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348474799658273	ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	84779248	T/G	1	21	24	45	10.027186813773	12.5403579271166	-2.51317111334357	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.460331741924822	ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84778239_84779279:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84778239_84779279:USP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	84796603	A/G	1	38	34	72	18.1444332820654	17.7655070634151	0.378926218650292	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000103194:ENST00000219473:exon_84796595_84796694:USP10;ENSG00000103194:ENST00000397953:exon_84796595_84796694:USP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	85706047	A/C	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000131149:ENST00000405402:exon_85706011_85706960:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000416667:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000253458:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000393243:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412862:exon_85706011_85709812:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000412692:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000469381:exon_85706011_85709810:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000438180:exon_85706011_85706499:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000496345:exon_85706011_85706102:KIAA0182;ENSG00000131149:ENST00000471070:exon_85706011_85706254:KIAA0182
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	85834818	G/A	1	419	548	967	200.06625118909	286.338172669162	-86.2719214800717	A:G	G	A	10	0.522514913629857	2.87510556038337e-08	ENSG00000131143:ENST00000253452:exon_85834811_85834884:COX4I1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	86565882	G/C	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000103248:ENST00000381214:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000360900:exon_86563783_86566087:MTHFSD;ENSG00000103248:ENST00000322911:exon_86563783_86566087:MTHFSD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	87788864	G/A	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000104731:ENST00000270583:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000353170:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000347925:exon_87788800_87788898:KLHDC4;ENSG00000104731:ENST00000316853:exon_87788800_87788898:KLHDC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88052110	C/T	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88052161	C/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88052034_88052273:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88052034_88052273:BANP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88066717	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000172530:ENST00000355163:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000286122:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000479780:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393208:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000355022:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000393207:exon_88066715_88066851:BANP;ENSG00000172530:ENST00000497491:exon_88066715_88066825:BANP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88601231	G/A	1	12	4	16	5.72982103644172	2.09005965451943	3.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.081547579265419	ENSG00000179588:ENST00000319555:exon_88599556_88601389:ZFPM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88779077	G/A	1	22	16	38	10.5046719001431	8.36023861807771	2.14443328206543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51961273920649	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88779030_88779313:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88779030_88779313:CTU2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88780582	C/T	1	42	29	71	20.054373627546	15.1529324952659	4.90144113228015	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.285080830469181	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780544_88780635:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780544_88780635:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780544_88780635:CTU2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88781082	C/T	1	35	37	72	16.711978022955	19.3330518043047	-2.6210737813497	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.556997301488162	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88781125	T/C	1	38	41	79	18.1444332820654	21.4231114588241	-3.27867817675871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.499898842656914	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88780995_88781145:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88780995_88781145:CTU2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88781642	G/A	1	45	45	90	21.4868288866564	23.5131711133436	-2.02634222668713	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.674605034205868	ENSG00000174177:ENST00000378384:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000453996:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000174177:ENST00000312060:exon_88781590_88781784:CTU2;ENSG00000103335:ENST00000301015:exon_88781588_88782262:FAM38A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88870967	T/C	1	10	16	26	4.77485086370143	8.36023861807771	-3.58538775437628	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.173625446444081	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88870953_88871075:CDT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88871908	A/G	1	31	17	48	14.8020376774744	8.88275353170757	5.91928414576686	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.111137158745966	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88871848_88872045:CDT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88874655	C/T	1	60	10	70	28.6491051822086	5.22514913629857	23.42395604591	T:C	C	T	10	0.522514913629857	4.9020464975046e-09	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88874692	G/C	1	91	16	107	43.451142859683	8.36023861807771	35.0909042416053	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1.67788086194704e-12	ENSG00000167513:ENST00000301019:exon_88874523_88875665:CDT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88876103	T/C	1	376	296	672	179.534392475174	154.664414434438	24.8699780407361	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0584037190347313	ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88875877_88876248:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88875877_88876114:APRT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88878055	C/A	1	190	161	351	90.7221664103272	84.124901094407	6.59726531592018	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.487804547889137	ENSG00000198931:ENST00000378364:exon_88877958_88878064:APRT;ENSG00000198931:ENST00000426324:exon_88877958_88878064:APRT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	88958850	T/C	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000129993:ENST00000327483:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268679:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000268683:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000448839:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000436887:exon_88958652_88958893:CBFA2T3;ENSG00000129993:ENST00000360302:exon_88958652_88958893:CBFA2T3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89167395	C/T	1	23	4	27	10.9821569865133	2.09005965451943	8.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.000697207153171909	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89167404	T/C	1	24	2	26	11.4596420728834	1.04502982725971	10.4146122456237	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1.57531232151468e-05	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89167431	G/C	0	24	0	24	11.4596420728834	0	11.4596420728834	G	G		10	0.522514913629857	1.91267090220593e-07	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89167443	T/C	1	24	2	26	11.4596420728834	1.04502982725971	10.4146122456237	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1.57531232151468e-05	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89167458	C/A	1	22	5	27	10.5046719001431	2.61257456814929	7.89209733199386	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.00304772513014421	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89167476	T/C	1	5	15	20	2.38742543185071	7.83772370444786	-5.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0227180632230821	ENSG00000176715:ENST00000317447:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000406948:exon_89167070_89167755:ACSF3;ENSG00000176715:ENST00000393145:exon_89167070_89167755:ACSF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89294697	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170100:ENST00000433976:exon_89293102_89295363:ZNF778;ENSG00000170100:ENST00000306502:exon_89293102_89295363:ZNF778
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89347537	C/T	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89348038	G/C	1	19	18	37	9.07221664103272	9.40526844533743	-0.333051804304711	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167522:ENST00000301030:exon_89345480_89352057:ANKRD11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89662990	T/C	1	18	4	22	8.59473155466257	2.09005965451943	6.50467190014315	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00518613542124144	ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89663072	G/A	1	23	11	34	10.9821569865133	5.74766404992843	5.23449293658486	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0858395683032324	ENSG00000178773:ENST00000319518:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000268720:exon_89662892_89663654:CPNE7;ENSG00000178773:ENST00000526232:exon_89662892_89663257:CPNE7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89783187	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000075399:ENST00000389386:exon_89783138_89783230:C16orf7;ENSG00000075399:ENST00000261625:exon_89783138_89783230:C16orf7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89789898	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000158805:ENST00000289816:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000446326:exon_89789668_89790117:ZNF276;ENSG00000158805:ENST00000443381:exon_89789668_89790117:ZNF276
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89809319	T/C	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89809208_89809346:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89809208_89809346:FANCA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	89811409	C/T	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000187741:ENST00000389301:exon_89811367_89811479:FANCA;ENSG00000187741:ENST00000305699:exon_89811367_89811479:FANCA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	16	90102835	A/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000141013:ENST00000268699:exon_90102789_90102994:GAS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	648186	G/A	1	81	96	177	38.6762919959816	50.1614317084663	-11.4851397124847	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0975871556731265	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	648465	C/T	1	45	33	78	21.4868288866564	17.2429921497853	4.24383673687115	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.365551683683724	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	649239	C/T	1	35	43	78	16.711978022955	22.4681412860839	-5.75616326312885	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.212849383049397	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	649547	G/C	1	18	12	30	8.59473155466257	6.27017896355828	2.32455259110429	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.466493121478826	ENSG00000179409:ENST00000319004:exon_647661_651272:GEMIN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	674575	G/A	1	47	37	84	22.4417990593967	19.3330518043047	3.10874725509201	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.514190039592239	ENSG00000167699:ENST00000301329:exon_674565_674701:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_674565_674701:GLOD4;ENSG00000167699:ENST00000301328:exon_674565_674701:GLOD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	685846	C/T	1	19	23	42	9.07221664103272	12.0178430134867	-2.945626372454	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.440353997983177	ENSG00000167699:ENST00000397393:exon_685799_685931:GLOD4;ENSG00000171861:ENST00000304478:exon_685513_685932:RNMTL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	900550	T/C	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000177370:ENST00000327158:exon_900357_900620:TIMM22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	910546	G/A	1	8	16	24	3.81988069096114	8.36023861807771	-4.54035792711657	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0685696670716585	ENSG00000159842:ENST00000302538:exon_910405_910552:ABR;ENSG00000159842:ENST00000291107:exon_910405_910552:ABR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1370542	C/A	1	75	82	157	35.8113814777607	42.8462229176483	-7.03484143988755	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.264551493431112	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1370536_1370635:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1370536_1370635:MYO1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1373518	T/C	1	24	29	53	11.4596420728834	15.1529324952659	-3.69329042238242	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.337404588873155	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1373469_1373628:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1373469_1373628:MYO1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1383893	G/A	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000197879:ENST00000359786:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000438665:exon_1383821_1383919:MYO1C;ENSG00000197879:ENST00000361007:exon_1383821_1383919:MYO1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1401279	G/A	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000132376:ENST00000397335:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000421807:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000406424:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000350761:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000320345:exon_1401230_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000461552:exon_1401230_1401495:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000495339:exon_1401052_1401416:INPP5K;ENSG00000132376:ENST00000449479:exon_1401230_1401416:INPP5K
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1437435	G/A	1	39	42	81	18.6219183684356	21.945626372454	-3.32370800401842	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.505058079283144	ENSG00000174238:ENST00000313486:exon_1437393_1437515:PITPNA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1494568	G/A	1	6	12	18	2.86491051822086	6.27017896355828	-3.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.155344968085716	ENSG00000167703:ENST00000301335:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000382147:exon_1494563_1494765:SLC43A2;ENSG00000167703:ENST00000412517:exon_1494563_1494765:SLC43A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1538302	C/A	1	26	6	32	12.4146122456237	3.13508948177914	9.27952276384458	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.00109324845255268	ENSG00000074660:ENST00000263071:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000348987:exon_1537152_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000434376:exon_1537153_1538911:SCARF1;ENSG00000074660:ENST00000452948:exon_1537153_1538911:SCARF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1556958	G/A	1	305	268	573	145.632951342894	140.033996852802	5.59895449009193	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.645760456648844	ENSG00000174231:ENST00000304992:exon_1556836_1556977:PRPF8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1637074	A/G	1	11	8	19	5.25233595007157	4.18011930903886	1.07221664103272	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.653984881903285	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1637302	A/G	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000167716:ENST00000309182:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000446363:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000419248:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000409644:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000437219:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000464528:exon_1636821_1637510:WDR81;ENSG00000167716:ENST00000354680:exon_1636821_1637510:WDR81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	1943888	T/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000108963:ENST00000263083:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000442776:exon_1943799_1943899:DPH1;ENSG00000108963:ENST00000417873:exon_1943799_1943899:DPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	2203167	T/G	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	2203175	C/G	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	2203633	T/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000070366:ENST00000263073:exon_2202200_2203958:SMG6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	2227672	G/C	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167720:ENST00000344595:exon_2226949_2228554:SRR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	2323541	T/C	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000127804:ENST00000263092:exon_2319352_2323890:METT10D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	2605224	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000132361:ENST00000435359:exon_2605208_2605351:KIAA0664;ENSG00000132361:ENST00000322335:exon_2605208_2605351:KIAA0664
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	3568012	A/G	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000213977:ENST00000225525:exon_3567973_3568092:TAX1BP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	3844787	C/G	1	13	14	27	6.20730612281186	7.315208790818	-1.10790266800614	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.703632086597494	ENSG00000074370:ENST00000397043:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397039:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000352011:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397041:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397045:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000359983:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000397035:exon_3844730_3844948:ATP2A3;ENSG00000074370:ENST00000309890:exon_3844730_3844948:ATP2A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4391153	A/G	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4391201	A/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000182557:ENST00000355530:exon_4391101_4391498:SPNS3;ENSG00000182557:ENST00000333476:exon_4391101_4391498:SPNS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4448590	C/T	1	30	39	69	14.3245525911043	20.3780816315644	-6.05352904046013	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.149895314101879	ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448554_4448640:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448554_4448640:MYBBP1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4448940	G/A	1	21	36	57	10.027186813773	18.8105368906749	-8.78335007690185	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0236082989335899	ENSG00000132382:ENST00000381556:exon_4448905_4449056:MYBBP1A;ENSG00000132382:ENST00000254718:exon_4448905_4449056:MYBBP1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4575283	A/G	1	228	234	462	108.866599692393	122.268489789387	-13.401890096994	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.225925337278354	ENSG00000141456:ENST00000269230:exon_4574986_4576230:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000456564:exon_4574986_4576440:PELP1;ENSG00000141456:ENST00000301396:exon_4574986_4576440:PELP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4624340	G/A	1	32	28	60	15.2795227638446	14.630417581636	0.649105182208579	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.89778651341517	ENSG00000141480:ENST00000381488:exon_4624241_4624795:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000346341:exon_4624241_4624794:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000269260:exon_4624241_4624794:ARRB2;ENSG00000141480:ENST00000412477:exon_4624241_4624794:ARRB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4699552	G/A	1	62	49	111	29.6040753549489	25.603230767863	4.00084458708587	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.506178116525111	ENSG00000142507:ENST00000270586:exon_4699439_4699591:PSMB6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4796274	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4796286	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141503:ENST00000355280:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000347992:exon_4796274_4796362:MINK1;ENSG00000141503:ENST00000453408:exon_4796274_4796362:MINK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4844242	C/T	1	29	52	81	13.8470675047341	27.1707755087526	-13.3237080040184	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00360200291655298	ENSG00000108523:ENST00000262482:exon_4843782_4844288:RNF167;ENSG00000108523:ENST00000381350:exon_4843913_4844288:RNF167
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	4926882	A/G	1	41	36	77	19.5768885411759	18.8105368906749	0.766351650501008	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.909427834829657	ENSG00000129250:ENST00000320785:exon_4926763_4931696:KIF1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5126674	A/G	1	48	50	98	22.9192841457669	26.1257456814929	-3.20646153572599	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.544876977046635	ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5126689	G/A	1	52	43	95	24.8292244912474	22.4681412860839	2.36108320516358	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.681597001310925	ENSG00000161929:ENST00000315768:exon_5126628_5126772:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399600:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399594:exon_5126628_5126751:C17orf87;ENSG00000161929:ENST00000399592:exon_5126628_5126751:C17orf87
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5284698	A/G	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5284719	T/C	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000029725:ENST00000262477:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000408982:exon_5284684_5284800:RABEP1;ENSG00000029725:ENST00000341923:exon_5284684_5284800:RABEP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5289580	A/G	1	258	176	434	123.191152283497	91.9626247988548	31.2285274846421	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00285484408859213	ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5289346_5289589:NUP88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5290033	T/C	1	215	122	337	102.659293569581	63.7468194628426	38.9124741067382	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1.99149101430455e-05	ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5290028_5290146:NUP88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5294976	T/A	1	45	37	82	21.4868288866564	19.3330518043047	2.15377708235172	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.659673423512434	ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5294881_5294982:NUP88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5322952	G/C	1	6	12	18	2.86491051822086	6.27017896355828	-3.40526844533743	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.155344968085716	ENSG00000108559:ENST00000225696:exon_5322674_5323000:NUP88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5392161	C/T	0	0	12	12	0	6.27017896355828	-6.27017896355828	T	C	T	10	0.522514913629857	0.000140448704640196	ENSG00000167842:ENST00000381165:exon_5392143_5394134:MIS12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5424936	C/T	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5424844_5425106:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5424844_5425106:NLRP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	5461871	A/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000091592:ENST00000262467:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000354411:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000269280:exon_5461659_5463363:NLRP1;ENSG00000091592:ENST00000345221:exon_5461659_5463363:NLRP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6350923	A/G	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129195:ENST00000250056:exon_6350783_6351078:FAM64A;ENSG00000129195:ENST00000308855:exon_6350783_6351078:FAM64A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6544354	C/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6544465	G/A	1	64	89	153	30.5590455276892	46.5038273130573	-15.9447817853681	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0118732061187936	ENSG00000129235:ENST00000250101:exon_6544078_6544547:TXNDC17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6919093	T/C	1	278	236	514	132.7408540109	123.313519616646	9.42733439425348	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.426799600779316	ENSG00000161939:ENST00000439424:exon_6919093_6919194:C17orf49;ENSG00000161939:ENST00000293804:exon_6919093_6919194:C17orf49
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6945525	C/T	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6945315_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6945508_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6945517_6946082:SLC16A11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6945562	G/C	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6945315_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6945508_6946082:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6945517_6946082:SLC16A11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	6946287	T/C	1	4	12	16	1.90994034548057	6.27017896355828	-4.36023861807771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0423648285451732	ENSG00000174326:ENST00000308009:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000360736:exon_6946249_6946392:SLC16A11;ENSG00000174326:ENST00000447225:exon_6946249_6946392:SLC16A11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7126145	G/A	1	70	55	125	33.42395604591	28.7383202496421	4.68563579626787	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.421285403758939	ENSG00000072778:ENST00000356839:exon_7125986_7126184:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000322910:exon_7125986_7126184:ACADVL;ENSG00000072778:ENST00000350303:exon_7125986_7126184:ACADVL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7130437	G/A	1	10	12	22	4.77485086370143	6.27017896355828	-1.49532809985685	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.531657196609609	ENSG00000004975:ENST00000005340:exon_7130409_7130588:DVL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7139412	G/A	1	39	50	89	18.6219183684356	26.1257456814929	-7.50382731305728	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112917012046696	ENSG00000040633:ENST00000320316:exon_7139249_7140086:PHF23;ENSG00000040633:ENST00000454255:exon_7139249_7139885:PHF23;ENSG00000040633:ENST00000043410:exon_7139407_7139431:PHF23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7144146	C/A	1	479	553	1032	228.715356371298	288.950747237311	-60.2353908660124	A:T:C:G	C	A	10	0.522514913629857	0.000182346734014225	ENSG00000170296:ENST00000302386:exon_7143333_7144238:GABARAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7161956	G/A	1	77	89	166	36.766351650501	46.5038273130573	-9.73747566255626	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.139973101373466	ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7161907_7163250:C17orf81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7161971	C/T	1	88	78	166	42.0186876005726	40.7561632631288	1.26252433744374	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.87667510001654	ENSG00000170291:ENST00000354429:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396627:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000396628:exon_7161907_7162002:C17orf81;ENSG00000170291:ENST00000356683:exon_7161907_7163250:C17orf81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7216655	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7216763	C/T	1	83	68	151	39.6312621687219	35.5310141268303	4.10024804189159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.515710142192773	ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7216699_7216788:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7216699_7216788:GPS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7217463	T/C	1	68	31	99	32.4689858731697	16.1979623225256	16.2710235506442	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00117947070003932	ENSG00000132522:ENST00000380728:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7217399_7217478:GPS2;ENSG00000132522:ENST00000389167:exon_7217399_7217478:GPS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7220841	T/G	1	18	11	29	8.59473155466257	5.74766404992843	2.84706750473415	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.353860161100198	ENSG00000132522:ENST00000315601:exon_7220780_7220892:GPS2;ENSG00000215041:ENST00000315614:exon_7220780_7220892:NEURL4;ENSG00000215041:ENST00000399464:exon_7220780_7220892:NEURL4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7251605	G/C	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.777144691375435	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7359154	T/C	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000170175:ENST00000306071:exon_7359113_7359260:CHRNB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7400815	T/C	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7400675_7400836:POLR2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7402600	T/C	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7402600_7402810:POLR2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7404991	T/C	1	17	14	31	8.11724646829243	7.315208790818	0.802037677474432	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.858133848975486	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7404845_7405048:POLR2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7412349	G/A	1	14	7	21	6.684791209182	3.657604395409	3.027186813773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.198655985278081	ENSG00000181222:ENST00000322644:exon_7412263_7412509:POLR2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7453505	C/A	1	7	12	19	3.342395604591	6.27017896355828	-2.92778335896728	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.250486147296676	ENSG00000239697:ENST00000293825:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000322272:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462619:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000239697:ENST00000462811:exon_7453437_7453512:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7453437_7453512:TNFSF12-TNFSF13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7462969	A/G	1	12	7	19	5.72982103644172	3.657604395409	2.07221664103272	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.368580760602116	ENSG00000239697:ENST00000518220:exon_7462941_7463019:TNFSF12;ENSG00000248871:ENST00000293826:exon_7462941_7463019:TNFSF12-TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000438470:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000436057:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000349228:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000338784:exon_7462941_7463019:TNFSF13;ENSG00000161955:ENST00000396545:exon_7462941_7463019:TNFSF13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7477938	G/C	1	201	171	372	95.9745023603987	89.3500502307055	6.6244521296932	A:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.500275569527124	ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7477864_7477996:EIF4A1;ENSG00000161960:ENST00000380512:exon_7477864_7477996:EIF4A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7481485	C/T	1	293	403	696	139.903130306452	210.573510192832	-70.6703798863805	T:C	C	T	10	0.522514913629857	9.83921129384086e-08	ENSG00000161960:ENST00000293831:exon_7481483_7481562:EIF4A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7530147	G/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7579472	G/C	1	58	59	117	27.6941350094683	30.8283799041616	-3.13424489469327	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.579674479945878	ENSG00000141510:ENST00000413465:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000269305:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000455263:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000420246:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000445888:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000419024:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000359597:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000505014:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000414315:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000508793:exon_7579312_7579590:TP53;ENSG00000141510:ENST00000503591:exon_7579312_7579590:TP53
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7592110	G/A	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7589619_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7591966_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7591795_7592397:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7591966_7592397:WRAP53
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7606722	C/G	1	14	3	17	6.684791209182	1.56754474088957	5.11724646829243	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0142119975250009	ENSG00000141499:ENST00000431639:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000316024:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000457584:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498311:exon_7606561_7606819:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000396463:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000534050:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000467699:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000471973:exon_7606561_7606820:WRAP53;ENSG00000141499:ENST00000498114:exon_7606561_7606820:WRAP53
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7760397	G/A	1	256	287	543	122.236182110757	149.961780211769	-27.7255981010124	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0180988488226973	ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760333_7760516:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7760704	A/G	1	93	81	174	44.4061130324233	42.3237080040184	2.08240502840488	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.762085430847096	ENSG00000183011:ENST00000335155:exon_7760701_7760809:LSMD1;ENSG00000183011:ENST00000333775:exon_7760333_7761172:LSMD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7843053	C/T	1	11	19	30	5.25233595007157	9.92778335896728	-4.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.100762715434031	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7842831_7843067:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000419170:exon_7842831_7843067:CNTROB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7847955	C/A	1	14	16	30	6.684791209182	8.36023861807771	-1.67544740889571	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.586545503505938	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7847794_7847956:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7847794_7847956:CNTROB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	7849087	C/G	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170037:ENST00000420934:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380262:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000303707:exon_7849046_7849304:CNTROB;ENSG00000170037:ENST00000380255:exon_7849046_7849304:CNTROB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8025180	T/C	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000179111:ENST00000317814:exon_8024299_8025340:HES7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8046664	C/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000179094:ENST00000317276:exon_8046584_8047194:PER1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8108339	G/A	1	164	110	274	78.3075541647034	57.4766404992843	20.8309136654192	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0130298342668594	ENSG00000178999:ENST00000316199:exon_8108051_8108362:AURKB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8354259	C/G	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000166579:ENST00000380025:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000402554:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000334527:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000415727:exon_8354098_8354271:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000299734:exon_8354098_8354271:NDEL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8370257	C/T	1	15	16	31	7.16227629555214	8.36023861807771	-1.19796232252557	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.721152952918315	ENSG00000166579:ENST00000380025:exon_8370248_8371469:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000402554:exon_8370248_8371469:NDEL1;ENSG00000166579:ENST00000334527:exon_8370248_8371495:NDEL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8383838	G/A	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000166579:ENST00000299734:exon_8383783_8383942:NDEL1;ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8383720_8383843:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8383720_8383843:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8383720_8383843:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8383720_8383843:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000476737:exon_8383720_8383843:MYH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8390840	T/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8390751_8390912:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8390751_8390912:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8390751_8390912:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8390751_8390912:MYH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8416901	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000133026:ENST00000269243:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000360416:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000379980:exon_8416856_8416987:MYH10;ENSG00000133026:ENST00000396239:exon_8416856_8416987:MYH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8700982	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000185156:ENST00000329805:exon_8700481_8702586:MFSD6L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8770873	C/T	1	10	12	22	4.77485086370143	6.27017896355828	-1.49532809985685	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.531657196609609	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8792003	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000141506:ENST00000269300:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000447110:exon_8791488_8792208:PIK3R5;ENSG00000141506:ENST00000444598:exon_8791488_8792208:PIK3R5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	8809075	G/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	10614442	A/G	1	29	34	63	13.8470675047341	17.7655070634151	-3.91843955868099	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.377548116939781	ENSG00000170222:ENST00000379774:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000468843:exon_10614151_10614550:C17orf48;ENSG00000170222:ENST00000401658:exon_10614151_10614548:C17orf48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	12897127	G/A	1	63	51	114	30.081560441319	26.6482605951227	3.4332998461963	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.574003738141888	ENSG00000006744:ENST00000427703:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000426905:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000424152:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000338034:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000484122:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000480891:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000395962:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000487229:exon_12897004_12897148:ELAC2;ENSG00000006744:ENST00000465825:exon_12897004_12897148:ELAC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	13980350	G/A	1	15	7	22	7.16227629555214	3.657604395409	3.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.199333558675469	ENSG00000006695:ENST00000261643:exon_13980052_13980373:COX10;ENSG00000006695:ENST00000429152:exon_13980052_13980639:COX10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	16342687	T/A	1	493	497	990	235.40014758048	259.689912074039	-24.2897644935585	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.126728295666609	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	16344600	T/C	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	16842912	A/G	1	459	454	913	219.165654643896	237.221770787955	-18.0561161440594	A:T:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.233185050413926	ENSG00000240505:ENST00000261652:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B;ENSG00000240505:ENST00000343345:exon_16842399_16843111:TNFRSF13B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17168164	G/A	1	37	27	64	17.6669481956953	14.1079026680061	3.55904552768915	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.384347784937895	ENSG00000141030:ENST00000268717:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000486810:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000417352:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000439936:exon_17168116_17168295:COPS3;ENSG00000141030:ENST00000492672:exon_17168116_17168295:COPS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17409560	C/T	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000133027:ENST00000255389:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395783:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395782:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000490392:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000484838:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000435340:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000448294:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000343219:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000395781:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000477595:exon_17409541_17409615:PEMT;ENSG00000133027:ENST00000482906:exon_17409541_17409615:PEMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17700573	T/C	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17700792	C/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000108557:ENST00000353383:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000428973:exon_17696247_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000395776:exon_17696263_17701827:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000261641:exon_17696263_17701056:RAI1;ENSG00000108557:ENST00000315321:exon_17700698_17701668:RAI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17717574	G/A	1	18	9	27	8.59473155466257	4.70263422266871	3.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.176865551934525	ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17717559_17717724:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000486311:exon_17717559_17717690:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000478616:exon_17717559_17717669:SREBF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17720391	A/G	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.296181191073666	ENSG00000072310:ENST00000338854:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000355815:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000261646:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395751:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395757:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000395756:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000418712:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000423161:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000435530:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000471445:exon_17720272_17720450:SREBF1;ENSG00000072310:ENST00000469356:exon_17720272_17720450:SREBF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	17997209	G/A	1	25	8	33	11.9371271592536	4.18011930903886	7.75700785021472	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0081069886262328	ENSG00000108591:ENST00000395726:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000225729:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000473213:exon_17997127_17997594:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000467099:exon_17997127_17997287:DRG2;ENSG00000108591:ENST00000496428:exon_17997127_17997282:DRG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	18148485	G/A	1	177	180	357	84.5148602875153	94.0526844533743	-9.53782416585896	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.314664072273712	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18148150_18148586:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18148155_18148586:FLII
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	18149515	G/A	1	89	100	189	42.4961726869427	52.2514913629857	-9.75531867604298	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.166606335248692	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18149476_18149536:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18149476_18149536:FLII;ENSG00000177731:ENST00000487693:exon_18149476_18149529:FLII;ENSG00000177731:ENST00000474265:exon_18149476_18149628:FLII;ENSG00000177731:ENST00000493401:exon_18149476_18149536:FLII
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	18155793	T/A	1	19	15	34	9.07221664103272	7.83772370444786	1.23449293658486	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.73314906239147	ENSG00000177731:ENST00000327031:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000379450:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488221:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000488932:exon_18155786_18155870:FLII;ENSG00000177731:ENST00000461110:exon_18155786_18155870:FLII
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	18232096	G/A	1	32	13	45	15.2795227638446	6.79269387718814	8.48682888665643	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0112178736958029	ENSG00000176974:ENST00000316694:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395684:exon_18231187_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000352886:exon_18231195_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000354098:exon_18231842_18232233:SHMT1;ENSG00000176974:ENST00000395685:exon_18231871_18232233:SHMT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	18775900	A/G	1	21	18	39	10.027186813773	9.40526844533743	0.621918368435576	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.873940358026441	ENSG00000141127:ENST00000441887:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000395656:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000414602:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000492129:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000487101:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000432893:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000455992:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000412418:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000478622:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000419284:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000268835:exon_18775896_18775962:PRPSAP2;ENSG00000141127:ENST00000422237:exon_18775896_18775962:PRPSAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	20108547	A/G	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20107646_20109225:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20107646_20109225:SPECC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	20135075	T/G	1	16	22	38	7.63976138192229	11.4953280998569	-3.85556671793457	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.255810561867945	ENSG00000128487:ENST00000395530:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000472876:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000261503:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395529:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000467722:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395522:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395527:exon_20135071_20135144:SPECC1;ENSG00000128487:ENST00000395525:exon_20135071_20135144:SPECC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21101603	G/A	1	58	29	87	27.6941350094683	15.1529324952659	12.5412025142024	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00719074968807086	ENSG00000178307:ENST00000317635:exon_21101263_21102153:TMEM11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21203893	T/C	0	17	0	17	8.11724646829243	0	8.11724646829243	T	T		10	0.522514913629857	1.96175259969567e-05	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21203907	T/C	0	16	0	16	7.63976138192229	0	7.63976138192229	T	T		10	0.522514913629857	3.81735890117292e-05	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21203934	G/A	0	16	0	16	7.63976138192229	0	7.63976138192229	G	G		10	0.522514913629857	3.81735890117292e-05	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21203941	G/A	0	19	0	19	9.07221664103272	0	9.07221664103272	G	G		10	0.522514913629857	5.19904279400051e-06	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21203949	C/T	0	19	0	19	9.07221664103272	0	9.07221664103272	C	C		10	0.522514913629857	5.19904279400051e-06	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000479129:exon_21203857_21203960:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000526076:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21203857_21203970:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21203857_21203970:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21208413	C/T	0	40	0	40	19.0994034548057	0	19.0994034548057	C	C		10	0.522514913629857	5.44000563956428e-12	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21208363_21208440:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21208363_21208440:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21215483	C/T	0	41	0	41	19.5768885411759	0	19.5768885411759	C	C		10	0.522514913629857	2.83599933431931e-12	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000461639:exon_21215454_21215519:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21215537	C/A	0	21	0	21	10.027186813773	0	10.027186813773	C	C		10	0.522514913629857	1.38366426376666e-06	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21215552	C/T	0	37	0	37	17.6669481956953	0	17.6669481956953	C	C		10	0.522514913629857	3.84465828384213e-11	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21215557	G/A	0	41	0	41	19.5768885411759	0	19.5768885411759	G	G		10	0.522514913629857	2.83599933431931e-12	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21215454_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21214999_21215593:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21215454_21215593:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	21216846	G/C	0	66	1	67	31.5140157004294	0.522514913629857	30.9915007867996	T:G	G	T	10	0.522514913629857	8.90640064875846e-18	ENSG00000034152:ENST00000342679:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000361818:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000395491:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000496046:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000463192:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000316920:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000477540:exon_21216804_21216849:MAP2K3;ENSG00000034152:ENST00000527123:exon_21216804_21217198:MAP2K3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	25639432	A/G	1	40	16	56	19.0994034548057	8.36023861807771	10.739164836728	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00459423189823606	ENSG00000109046:ENST00000262394:exon_25639236_25640657:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000467843:exon_25639236_25640657:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000348811:exon_25639236_25639913:WSB1;ENSG00000109046:ENST00000452005:exon_25639236_25640645:WSB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	25958304	G/A	1	58	43	101	27.6941350094683	22.4681412860839	5.22599372338444	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.320032995857699	ENSG00000168961:ENST00000395473:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000302228:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000310394:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000413914:exon_25956824_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000313648:exon_25958174_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000448970:exon_25958235_25958330:LGALS9;ENSG00000168961:ENST00000467111:exon_25958240_25958330:LGALS9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	27182203	G/A	1	14	32	46	6.684791209182	16.7204772361554	-10.0356860269734	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00449020450312392	ENSG00000132591:ENST00000254928:exon_27182020_27182335:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000412138:exon_27182054_27182335:ERAL1;ENSG00000132591:ENST00000461894:exon_27182054_27182335:ERAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	27225586	A/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000167536:ENST00000378895:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000394901:exon_27224799_27225910:DHRS13;ENSG00000167536:ENST00000426464:exon_27224801_27225910:DHRS13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	27422053	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000196535:ENST00000533112:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000531253:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000527372:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000529799:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530254:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000359450:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354329:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000354682:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000458428:exon_27421954_27422077:MYO18A;ENSG00000196535:ENST00000530557:exon_27421954_27422077:MYO18A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	29097001	G/C	1	21	7	28	10.027186813773	3.657604395409	6.369582418364	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0215732773104251	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	29111204	T/C	1	14	7	21	6.684791209182	3.657604395409	3.027186813773	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.198655985278081	ENSG00000176390:ENST00000324238:exon_29109726_29111461:CRLF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	29646032	G/A	1	8	15	23	3.81988069096114	7.83772370444786	-4.01784301348671	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.099549600965852	ENSG00000126860:ENST00000462804:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000247270:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000461237:exon_29644578_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394756:exon_29644676_29646041:EVI2A;ENSG00000126860:ENST00000394755:exon_29644676_29646041:EVI2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	30190348	A/G	1	197	161	358	94.0645620149182	84.124901094407	9.93966092051119	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.314813674914349	ENSG00000108651:ENST00000261708:exon_30187923_30190535:UTP6;ENSG00000108651:ENST00000477128:exon_30190193_30190535:UTP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	30551707	A/G	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000126858:ENST00000333942:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000394692:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000358365:exon_30551635_30552746:RHOT1;ENSG00000126858:ENST00000354266:exon_30551635_30552746:RHOT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	33289046	G/C	1	22	24	46	10.5046719001431	12.5403579271166	-2.03568602697342	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.558777865256432	ENSG00000198783:ENST00000361952:exon_33288549_33290205:ZNF830
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	33592621	C/T	1	10	1	11	4.77485086370143	0.522514913629857	4.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0125953210255273	ENSG00000166750:ENST00000299977:exon_33592091_33594739:SLFN5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	34849843	G/T	1	31	34	65	14.8020376774744	17.7655070634151	-2.96346938594071	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.535061671920908	ENSG00000108278:ENST00000225410:exon_34849770_34849850:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000490126:exon_34849770_34849850:ZNHIT3;ENSG00000108278:ENST00000434102:exon_34849770_34849850:ZNHIT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	34854913	A/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	35872368	C/T	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000161326:ENST00000394389:exon_35872283_35873603:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000292964:exon_35872283_35873588:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000394386:exon_35872283_35873589:DUSP14;ENSG00000161326:ENST00000487847:exon_35872283_35873603:DUSP14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	36894839	G/A	1	45	35	80	21.4868288866564	18.288021977045	3.19880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.503242648800187	ENSG00000056661:ENST00000360797:exon_36894794_36894848:PCGF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	37074869	C/T	1	18	15	33	8.59473155466257	7.83772370444786	0.757007850214718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.862585582158515	ENSG00000002834:ENST00000318008:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000435347:exon_37074858_37078023:LASP1;ENSG00000002834:ENST00000433206:exon_37074858_37075031:LASP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	37360745	C/G	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.586125855411521	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	37682292	G/A	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000167258:ENST00000300647:exon_37682117_37682419:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000430627:exon_37682117_37682569:CDK12;ENSG00000167258:ENST00000447079:exon_37682117_37682569:CDK12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	37816702	G/C	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000131748:ENST00000336308:exon_37816684_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000394250:exon_37816684_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000488876:exon_37816684_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000481171:exon_37815714_37816779:STARD3;ENSG00000131748:ENST00000471896:exon_37815714_37816779:STARD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	37949050	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000161405:ENST00000488188:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346872:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439167:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000348427:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000293068:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000377945:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000439016:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000351680:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000346243:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000350532:exon_37948926_37949186:IKZF3;ENSG00000161405:ENST00000467757:exon_37948926_37949186:IKZF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	38061054	G/A	1	13	16	29	6.20730612281186	8.36023861807771	-2.15293249526585	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461080918794537	ENSG00000073605:ENST00000479136:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000420491:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000360317:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394175:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000309481:exon_38060848_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000477054:exon_38060849_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000520542:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000418519:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000394179:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000354894:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000433643:exon_38060850_38061217:GSDMB;ENSG00000073605:ENST00000437352:exon_38060850_38061217:GSDMB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	38142899	T/C	1	55	41	96	26.2616797503579	21.4231114588241	4.83856829153373	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.358221429966358	ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38142828_38142965:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38142828_38142965:PSMD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	38146154	T/C	1	127	104	231	60.6406059690082	54.3415510175051	6.29905495150302	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.42958046357887	ENSG00000108344:ENST00000264639:exon_38145992_38146182:PSMD3;ENSG00000108344:ENST00000415039:exon_38145992_38146182:PSMD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	38179062	C/T	1	54	35	89	25.7841946639877	18.288021977045	7.49617268694272	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.136964255804786	ENSG00000008838:ENST00000356271:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394126:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000431269:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394128:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000394127:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000422942:exon_38178898_38179079:MED24;ENSG00000008838:ENST00000492176:exon_38178898_38179079:MED24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	38447569	T/C	1	14	14	28	6.684791209182	7.315208790818	-0.630417581635996	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.851639324049382	ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38447310_38447591:CDC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	38457151	G/A	1	25	33	58	11.9371271592536	17.2429921497853	-5.30586499053171	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.188772828819087	ENSG00000094804:ENST00000209728:exon_38457080_38457282:CDC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	40706906	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000108786:ENST00000225929:exon_40706687_40707224:HSD17B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	40714804	C/A	1	15	19	34	7.16227629555214	9.92778335896728	-2.76550706341514	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.392337552161461	ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40714092_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40714374_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40714630_40715340:COASY;ENSG00000068120:ENST00000426807:exon_40714641_40714850:COASY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	40716520	A/G	1	39	31	70	18.6219183684356	16.1979623225256	2.42395604591001	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.632648306156126	ENSG00000068120:ENST00000421097:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393818:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000420359:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000412030:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000449624:exon_40716464_40716595:COASY;ENSG00000068120:ENST00000393816:exon_40716464_40716595:COASY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	40849573	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000108797:ENST00000264638:exon_40849572_40849817:CNTNAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	41245381	T/C	1	11	4	15	5.25233595007157	2.09005965451943	3.16227629555214	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.124040195402654	ENSG00000012048:ENST00000357654:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393691:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000354071:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000346315:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000353540:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000412061:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000309486:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393683:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000393680:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000471181:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000493795:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000461221:exon_41243452_41246877:BRCA1;ENSG00000012048:ENST00000467274:exon_41243115_41246877:BRCA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	41348964	A/G	1	21	14	35	10.027186813773	7.315208790818	2.71197802295501	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.400395431261495	ENSG00000188554:ENST00000389312:exon_41348959_41349123:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000422280:exon_41348959_41349123:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000341165:exon_41348959_41349123:NBR1;ENSG00000188554:ENST00000389311:exon_41348959_41349123:NBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	42152103	G/A	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000141349:ENST00000269097:exon_42152048_42152138:G6PC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	42155891	C/T	1	125	100	225	59.6856357962679	52.2514913629857	7.43414443328217	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.350209795436895	ENSG00000108840:ENST00000336057:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000393622:exon_42155868_42156033:HDAC5;ENSG00000108840:ENST00000225983:exon_42155868_42156033:HDAC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	42288661	G/A	1	39	32	71	18.6219183684356	16.7204772361554	1.90144113228015	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.721929274340279	ENSG00000108312:ENST00000343638:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000302904:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000527034:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000533177:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000436088:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000393606:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000526094:exon_42288658_42288699:UBTF;ENSG00000108312:ENST00000529383:exon_42288658_42288699:UBTF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	42426574	G/A	1	150	72	222	71.6227629555215	37.6210737813497	34.0016891741717	A:G	G	A	10	0.522514913629857	4.26056745792931e-06	ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000446061:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42426526_42426670:GRN;ENSG00000030582:ENST00000393566:exon_42426526_42426670:GRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	42427892	C/T	1	206	217	423	98.3619277922494	113.385736257679	-15.0238084654295	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.144583293024264	ENSG00000030582:ENST00000053867:exon_42427810_42427945:GRN;ENSG00000030582:ENST00000357351:exon_42427810_42427945:GRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	42475983	G/C	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000186566:ENST00000335500:exon_42472652_42478821:GPATCH8;ENSG00000186566:ENST00000434000:exon_42474784_42478821:GPATCH8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	43183028	G/A	1	169	195	364	80.6949795965542	101.890408157822	-21.195428561268	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0274991919002647	ENSG00000136448:ENST00000258960:exon_43182987_43186377:NMT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	45219354	A/G	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000004897:ENST00000066544:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000441612:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000525495:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000531206:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000533415:exon_45219219_45219391:CDC27;ENSG00000004897:ENST00000527547:exon_45219219_45219388:CDC27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	45735975	G/A	1	24	21	45	11.4596420728834	10.972813186227	0.486828886656435	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45735874_45736026:KPNB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	45750468	T/C	1	44	59	103	21.0093438002863	30.8283799041616	-9.81903610387527	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0605691352478054	ENSG00000108424:ENST00000290158:exon_45750384_45750531:KPNB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	45916018	C/G	1	43	39	82	20.5318587139161	20.3780816315644	0.153777082351723	T:C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141295:ENST00000290216:exon_45915897_45916062:SCRN2;ENSG00000141295:ENST00000407215:exon_45915897_45916062:SCRN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	46023694	G/A	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000108439:ENST00000225573:exon_46023689_46023759:PNPO;ENSG00000108439:ENST00000434554:exon_46023689_46023759:PNPO
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	46058107	T/C	1	101	102	203	48.2259937233844	53.2965211902454	-5.07052746686097	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.483138229448014	ENSG00000108465:ENST00000338399:exon_46057959_46058164:CDK5RAP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	46262171	C/T	1	29	14	43	13.8470675047341	7.315208790818	6.53185871391615	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.04814344479111	ENSG00000141293:ENST00000336915:exon_46262085_46262209:SKAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	46620688	G/C	0	0	10	10	0	5.22514913629857	-5.22514913629857	C	G	C	10	0.522514913629857	0.000616024684608098	ENSG00000173917:ENST00000504772:exon_46620317_46621070:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000330070:exon_46620017_46621109:HOXB2;ENSG00000173917:ENST00000509853:exon_46620521_46621109:HOXB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	46929908	T/C	1	47	53	100	22.4417990593967	27.6932904223824	-5.2514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.317347072907356	ENSG00000136436:ENST00000258947:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509507:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000448105:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000513119:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000416445:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000508679:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000504645:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514962:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000514006:exon_46929868_46930220:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000511816:exon_46929868_46930007:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000509112:exon_46929868_46929990:CALCOCO2;ENSG00000136436:ENST00000506971:exon_46929702_46929990:CALCOCO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	47000251	C/T	1	21	22	43	10.027186813773	11.4953280998569	-1.46814128608385	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.76055343814137	ENSG00000159202:ENST00000360943:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000389608:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000405215:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506498:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000504684:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000513342:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000506271:exon_47000209_47000299:UBE2Z;ENSG00000159202:ENST00000514948:exon_47000209_47000459:UBE2Z
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	47018293	C/T	1	60	51	111	28.6491051822086	26.6482605951227	2.00084458708587	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.77576932567042	ENSG00000159210:ENST00000502492:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000509995:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000290330:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000507302:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000514929:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510558:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000512243:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000515174:exon_47018286_47018424:SNF8;ENSG00000159210:ENST00000510195:exon_47018286_47018424:SNF8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	47284060	T/C	1	88	71	159	42.0186876005726	37.0985588677199	4.92012873285273	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.475103308567272	ENSG00000167083:ENST00000511277:exon_47283591_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000300406:exon_47283751_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000515635:exon_47283941_47284244:GNGT2;ENSG00000167083:ENST00000507680:exon_47284007_47284244:GNGT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	47295210	C/G	1	39	35	74	18.6219183684356	18.288021977045	0.333896391390581	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000108798:ENST00000225941:exon_47295101_47295277:ABI3;ENSG00000108798:ENST00000419580:exon_47295101_47295277:ABI3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48435649	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000015532:ENST00000017003:exon_48435568_48435901:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000376550:exon_48435568_48435901:XYLT2;ENSG00000015532:ENST00000511654:exon_48435568_48435678:XYLT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48450523	C/G	1	18	21	39	8.59473155466257	10.972813186227	-2.37808163156442	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.522186913819229	ENSG00000108826:ENST00000225969:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000393275:exon_48450492_48450575:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000503633:exon_48450492_48450557:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000442592:exon_48450492_48450562:MRPL27;ENSG00000108826:ENST00000514928:exon_48450492_48450536:MRPL27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48458180	G/A	1	1	9	10	0.477485086370143	4.70263422266871	-4.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0088742259302462	ENSG00000154920:ENST00000338165:exon_48458124_48458786:EME1;ENSG00000154920:ENST00000393271:exon_48458124_48458818:EME1;ENSG00000154920:ENST00000511648:exon_48458124_48458820:EME1;ENSG00000154920:ENST00000507616:exon_48458124_48458818:EME1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48539035	T/C	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000167107:ENST00000510410:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000300441:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000506582:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000504392:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000427954:exon_48538994_48539047:ACSF2;ENSG00000167107:ENST00000502667:exon_48539018_48539047:ACSF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48562277	G/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000136444:ENST00000258955:exon_48562105_48563336:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000451010:exon_48562105_48563335:RSAD1;ENSG00000136444:ENST00000506211:exon_48562105_48562359:RSAD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48625928	C/G	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505085:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000502911:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505456:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508598:exon_48625915_48625942:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515526:exon_48625644_48626064:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511845:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48625915_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505336:exon_48625915_48626175:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512416:exon_48625644_48625979:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48625915_48625979:SPATA20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48628092	A/G	1	12	3	15	5.72982103644172	1.56754474088957	4.16227629555214	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0378700909998812	ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505559:exon_48627897_48628252:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000512181:exon_48628069_48628163:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511347:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000505656:exon_48628069_48628212:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000508528:exon_48628069_48628278:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000513618:exon_48627761_48628278:SPATA20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	48628470	T/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000006282:ENST00000504334:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000006658:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000356488:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503127:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000511937:exon_48628359_48628583:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000503063:exon_48628359_48629541:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000393244:exon_48628359_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504265:exon_48628359_48628745:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000515619:exon_48628069_48628551:SPATA20;ENSG00000006282:ENST00000504271:exon_48628359_48628551:SPATA20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	49043640	T/C	1	21	14	35	10.027186813773	7.315208790818	2.71197802295501	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.400395431261495	ENSG00000008294:ENST00000262013:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357804:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000376407:exon_49039535_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000510283:exon_49042436_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000505279:exon_49042988_49043748:SPAG9;ENSG00000008294:ENST00000357122:exon_49043005_49043748:SPAG9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	53851228	C/T	1	21	12	33	10.027186813773	6.27017896355828	3.75700785021472	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.223826824236475	ENSG00000141179:ENST00000268896:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000417982:exon_53851085_53851256:PCTP;ENSG00000141179:ENST00000325214:exon_53851085_53851256:PCTP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	55191876	C/T	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000121057:ENST00000337714:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000427138:exon_55191820_55191997:AKAP1;ENSG00000121057:ENST00000481416:exon_55191820_55191997:AKAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	57288251	C/T	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000167447:ENST00000300917:exon_57287371_57289171:C17orf71
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	59147581	A/G	0	15	0	15	7.16227629555214	0	7.16227629555214	A	A		10	0.522514913629857	7.43750612807365e-05	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	61843545	A/T	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000108588:ENST00000225726:exon_61843272_61843554:CCDC47;ENSG00000108588:ENST00000403162:exon_61843272_61843554:CCDC47
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	61903932	C/T	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000108592:ENST00000336599:exon_61903927_61904032:FTSJ3;ENSG00000108592:ENST00000427159:exon_61903927_61904032:FTSJ3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	65104666	T/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000198265:ENST00000358691:exon_65104608_65104842:HELZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	65717525	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000130935:ENST00000253247:exon_65717494_65717642:NOL11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71027833	A/G	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000133195:ENST00000255559:exon_71027695_71027853:SLC39A11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71197675	T/G	1	21	22	43	10.027186813773	11.4953280998569	-1.46814128608385	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.76055343814137	ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71197748	G/A	1	29	23	52	13.8470675047341	12.0178430134867	1.82922449124744	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.67792412312658	ENSG00000166685:ENST00000299886:exon_71197248_71198039:COG1;ENSG00000166685:ENST00000438720:exon_71197248_71198039:COG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71208827	G/A	0	10	0	10	4.77485086370143	0	4.77485086370143	G	G		10	0.522514913629857	0.00213302931363942	ENSG00000133193:ENST00000405159:exon_71208817_71208879:FAM104A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71232881	G/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71233130	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000141219:ENST00000359042:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000268942:exon_71231615_71233134:C17orf80;ENSG00000141219:ENST00000426147:exon_71231615_71233134:C17orf80
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71281791	A/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000179604:ENST00000335793:exon_71279764_71282751:CDC42EP4;ENSG00000179604:ENST00000439510:exon_71281569_71282257:CDC42EP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	71282571	C/T	1	3	10	13	1.43245525911043	5.22514913629857	-3.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0493024340440666	ENSG00000179604:ENST00000335793:exon_71279764_71282751:CDC42EP4;ENSG00000179604:ENST00000439510:exon_71282468_71282639:CDC42EP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	72439967	G/A	1	7	30	37	3.342395604591	15.6754474088957	-12.3330518043047	A:G	G	A	10	0.522514913629857	4.41832824078288e-05	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000420926:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000262616:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392629:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000392628:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72439957_72440051:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000482723:exon_72439224_72440051:GPRC5C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	72443192	G/T	1	61	40	101	29.1265902685787	20.9005965451943	8.22599372338444	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.111099419162600	ENSG00000170412:ENST00000392627:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000481232:exon_72442988_72443568:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000342648:exon_72442988_72443566:GPRC5C;ENSG00000170412:ENST00000417745:exon_72442988_72443566:GPRC5C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	72462879	C/G	1	57	44	101	27.2166499230981	22.9906561997137	4.22599372338444	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.426465680125396	ENSG00000167851:ENST00000361933:exon_72462522_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000360141:exon_72462555_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000392625:exon_72462797_72462882:CD300A;ENSG00000167851:ENST00000310828:exon_72462814_72462882:CD300A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73100243	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000170190:ENST00000329783:exon_73100065_73100275:SLC16A5;ENSG00000170190:ENST00000450736:exon_73100065_73100275:SLC16A5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73125048	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000125449:ENST00000245543:exon_73124772_73126360:ARMC7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73221439	C/T	1	26	29	55	12.4146122456237	15.1529324952659	-2.73832024964214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.501023437814489	ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000449421:exon_73221437_73221559:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73221437_73221559:NUP85
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73230856	C/T	1	39	35	74	18.6219183684356	18.288021977045	0.333896391390581	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125450:ENST00000245544:exon_73230732_73230883:NUP85;ENSG00000125450:ENST00000447371:exon_73230732_73231009:NUP85
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73236010	G/A	1	6	13	19	2.86491051822086	6.79269387718814	-3.92778335896728	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.105644804013078	ENSG00000125447:ENST00000245541:exon_73235870_73236189:GGA3;ENSG00000125447:ENST00000351904:exon_73235870_73236189:GGA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73519413	C/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000182173:ENST00000333213:exon_73519356_73519416:TSEN54
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73625286	G/A	1	15	14	29	7.16227629555214	7.315208790818	-0.152932495265853	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73625430	G/A	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000108469:ENST00000423245:exon_73625014_73625555:RECQL5;ENSG00000108469:ENST00000317905:exon_73625014_73625555:RECQL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	73760144	C/T	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000108479:ENST00000225614:exon_73759978_73760167:GALK1;ENSG00000108479:ENST00000437911:exon_73759978_73760167:GALK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74039945	T/C	1	32	15	47	15.2795227638446	7.83772370444786	7.44179905939672	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0397973185443521	ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74039910_74040039:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74039910_74040039:SRP68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74060168	T/C	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74060057_74060252:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74060057_74060252:SRP68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74066476	T/C	1	7	17	24	3.342395604591	8.88275353170757	-5.54035792711657	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0252904217000775	ENSG00000167881:ENST00000307877:exon_74066459_74066525:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000304220:exon_74066459_74066525:SRP68;ENSG00000167881:ENST00000355113:exon_74066459_74066525:SRP68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74081829	C/T	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182473:ENST00000332065:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467929:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000467586:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000405575:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000335146:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000357231:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000351709:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000425372:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000411744:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000494787:exon_74081758_74081878:EXOC7;ENSG00000182473:ENST00000460476:exon_74081758_74081878:EXOC7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74266322	T/C	1	173	181	354	82.6049199420347	94.5751993670041	-11.9702794249694	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.221019940697153	ENSG00000185262:ENST00000327490:exon_74266275_74267375:FAM100B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74468920	C/G	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74468768_74468921:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74468768_74468921:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74466979_74468921:RHBDF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74475024	G/A	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389760:exon_74474888_74475091:RHBDF2;ENSG00000129667:ENST00000389762:exon_74474888_74475091:RHBDF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74475975	C/A	1	1	9	10	0.477485086370143	4.70263422266871	-4.22514913629857	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0088742259302462	ENSG00000129667:ENST00000313080:exon_74475815_74476023:RHBDF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	74733099	G/A	1	159	133	292	75.9201287328527	69.494483512771	6.42564522008175	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.482169573207614	ENSG00000161547:ENST00000392485:exon_74732881_74733412:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000359995:exon_74732969_74733413:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000358156:exon_74732881_74733242:SRSF2;ENSG00000161547:ENST00000452355:exon_74733066_74733242:SRSF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	75495397	T/C	1	358	262	620	170.939660920511	136.898907371023	34.0407535494886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00624737770690386	ENSG00000184640:ENST00000427177:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000329047:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000423034:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427674:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000431235:exon_75494605_75496674:SEPT9;ENSG00000184640:ENST00000427180:exon_75494605_75496674:SEPT9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76115097	G/A	1	52	37	89	24.8292244912474	19.3330518043047	5.49617268694272	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.28860483776183	ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76115052_76115127:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76115052_76115127:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76115052_76115127:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392466:exon_76115052_76115127:TMC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76117147	G/A	1	27	27	54	12.8920973319939	14.1079026680061	-1.21580533601228	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.786113448389962	ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76117094_76117245:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76117094_76117245:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76117094_76117245:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76117051_76117245:TMC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76121031	C/T	1	13	6	19	6.20730612281186	3.13508948177914	3.07221664103272	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.175231089618151	ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76120970_76121066:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76120970_76121066:TMC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76121864	A/G	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000141524:ENST00000322914:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000392467:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000306591:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000322933:exon_76121807_76121965:TMC6;ENSG00000141524:ENST00000441202:exon_76121807_76121965:TMC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76131070	G/A	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000167895:ENST00000318430:exon_76130951_76131090:TMC8;ENSG00000167895:ENST00000439484:exon_76130951_76131090:TMC8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76167047	C/T	1	163	161	324	77.8300690783333	84.124901094407	-6.29483201607367	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.504704029657754	ENSG00000108639:ENST00000225777:exon_76166898_76167135:SYNGR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76178748	T/C	1	33	31	64	15.7570078502147	16.1979623225256	-0.440954472310851	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76178670_76178763:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76178670_76178763:TK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76183043	A/G	1	30	32	62	14.3245525911043	16.7204772361554	-2.39592464505114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.611532974298792	ENSG00000167900:ENST00000301634:exon_76183010_76183314:TK1;ENSG00000167900:ENST00000405273:exon_76183010_76183111:TK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76203007	A/G	1	36	29	65	17.1894631093251	15.1529324952659	2.03653061405929	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.622287214558578	ENSG00000183077:ENST00000409257:exon_76202992_76203782:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000327898:exon_76202992_76203782:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000409722:exon_76202992_76203321:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000392388:exon_76202992_76203410:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000458315:exon_76202992_76203268:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000476610:exon_76202992_76203283:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000463930:exon_76202992_76203486:AFMID;ENSG00000183077:ENST00000473128:exon_76202992_76203133:AFMID
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76395430	C/T	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000087157:ENST00000262764:exon_76395429_76395618:PGS1;ENSG00000087157:ENST00000329897:exon_76395429_76395618:PGS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76449505	G/C	0	0	8	8	0	4.18011930903886	-4.18011930903886	C	G	C	10	0.522514913629857	0.00270195736599125	ENSG00000187775:ENST00000442057:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76449425_76449547:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76449425_76449547:DNAH17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76482432	A/G	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000187775:ENST00000300671:exon_76482306_76482588:DNAH17;ENSG00000187775:ENST00000389840:exon_76482306_76482588:DNAH17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76798453	C/T	1	20	27	47	9.54970172740286	14.1079026680061	-4.55820094060328	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.191764674194505	ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76798406_76798617:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76798406_76798617:USP36
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	76803197	C/T	1	20	11	31	9.54970172740286	5.74766404992843	3.80203767747443	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.208805155249409	ENSG00000055483:ENST00000312010:exon_76803041_76803718:USP36;ENSG00000055483:ENST00000449938:exon_76803041_76803718:USP36
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78079669	G/A	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78079548_78079693:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78079548_78079693:GAA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78087109	A/G	1	12	3	15	5.72982103644172	1.56754474088957	4.16227629555214	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0378700909998812	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78087017_78087165:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78087017_78087165:GAA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78091405	G/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091399_78091548:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091399_78091548:GAA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78092063	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000171298:ENST00000302262:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000390015:exon_78091992_78092156:GAA;ENSG00000171298:ENST00000414495:exon_78091992_78092156:GAA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78175483	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78348338	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78348258_78348389:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78348258_78348389:RNF213
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78363054	G/A	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78362973_78363167:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78362973_78363167:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78362973_78363167:RNF213
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	78367225	A/C	1	18	22	40	8.59473155466257	11.4953280998569	-2.90059654519428	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.429263432801788	ENSG00000173821:ENST00000508628:exon_78367145_78369112:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000336301:exon_78367145_78370085:RNF213;ENSG00000173821:ENST00000427003:exon_78367145_78370085:RNF213
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79164879	T/C	1	16	18	34	7.63976138192229	9.40526844533743	-1.76550706341514	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.608168445018122	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79164707_79164884:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79164707_79164884:AZI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79166384	C/T	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79166276_79166393:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79166276_79166393:AZI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79172746	G/A	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79172677_79172771:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79172677_79172771:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79172677_79172771:AZI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79181024	T/C	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79180925_79181039:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79180925_79181039:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79180925_79181039:AZI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79182797	T/C	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000141577:ENST00000450824:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000374782:exon_79182728_79182822:AZI1;ENSG00000141577:ENST00000269392:exon_79182728_79182822:AZI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79219621	G/A	1	35	22	57	16.711978022955	11.4953280998569	5.21664992309815	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.185723698311463	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79219645	C/G	1	30	31	61	14.3245525911043	16.1979623225256	-1.87340973142128	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.701047100766109	ENSG00000157637:ENST00000374759:exon_79218801_79220473:SLC38A10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79224985	C/T	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79225148	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000157637:ENST00000288439:exon_79224673_79225412:SLC38A10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79478007	G/A	1	4051	3954	8005	1934.29208488545	2066.02396849245	-131.731883607005	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00325405723873426	ENSG00000184009:ENST00000331925:exon_79477953_79478134:ACTG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79514112	G/T	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000185504:ENST00000361039:exon_79513935_79514112:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000443656:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000327787:exon_79513935_79514704:C17orf70;ENSG00000185504:ENST00000425898:exon_79513935_79515054:C17orf70
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79580457	C/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182446:ENST00000331134:exon_79580344_79580520:NPLOC4;ENSG00000182446:ENST00000374747:exon_79580344_79580520:NPLOC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79618059	C/T	1	41	20	61	19.5768885411759	10.4502982725971	9.12659026857872	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0208219589062157	ENSG00000185527:ENST00000331056:exon_79617489_79618180:PDE6G;ENSG00000185527:ENST00000374743:exon_79617489_79618180:PDE6G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79632363	C/T	1	187	127	314	89.2897111512167	66.3593940309918	22.9303171202249	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0109037885873178	ENSG00000204237:ENST00000374741:exon_79632067_79632614:C17orf90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79634774	A/T	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79634813	T/C	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79634759_79634892:CCDC137
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79638805	C/T	1	22	38	60	10.5046719001431	19.8555667179346	-9.35089481779142	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0193551339166271	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79638774_79638856:CCDC137
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79639550	G/A	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000185298:ENST00000329214:exon_79639525_79640937:CCDC137
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79660983	C/T	1	23	26	49	10.9821569865133	13.5853877543763	-2.60323076786299	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.477535634659633	ENSG00000185359:ENST00000329138:exon_79660900_79660995:HGS;ENSG00000185359:ENST00000442335:exon_79660900_79660995:HGS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79846216	G/A	1	304	315	619	145.155466256523	164.592197793405	-19.4367315368815	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.126224633990813	ENSG00000183684:ENST00000505490:exon_79846117_79846294:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000331204:exon_79846117_79846294:THOC4;ENSG00000183684:ENST00000504015:exon_79846161_79846294:THOC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79864754	G/A	1	33	29	62	15.7570078502147	15.1529324952659	0.604075354948865	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.899534489299659	ENSG00000185813:ENST00000331285:exon_79864636_79864774:PCYT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79880727	C/T	1	22	22	44	10.5046719001431	11.4953280998569	-0.990656199713708	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.765635035115544	ENSG00000197063:ENST00000357736:exon_79876149_79880933:MAFG;ENSG00000197063:ENST00000392366:exon_79876149_79880933:MAFG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79891022	G/A	1	153	119	272	73.0552182146319	62.179274721953	10.8759434926789	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.202421874905779	ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79891078	A/G	1	162	135	297	77.3525839919632	70.5395133400307	6.81307065193246	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.450370188711187	ENSG00000183010:ENST00000432920:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000405481:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000329875:exon_79890269_79891252:PYCR1;ENSG00000183010:ENST00000403172:exon_79890269_79891252:PYCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79968710	C/T	1	23	11	34	10.9821569865133	5.74766404992843	5.23449293658486	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0858395683032324	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79968678_79968744:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79968678_79968744:ASPSCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79974731	T/C	1	37	45	82	17.6669481956953	23.5131711133436	-5.84622291764828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.223997152910111	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974676_79974745:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974676_79974745:ASPSCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79974973	G/A	1	34	30	64	16.2344929365849	15.6754474088957	0.55904552768915	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.901208316087129	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79974817_79974989:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79974817_79974989:ASPSCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79975221	A/G	1	19	33	52	9.07221664103272	17.2429921497853	-8.17077550875256	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0260754582336751	ENSG00000169696:ENST00000306739:exon_79975185_79975280:ASPSCR1;ENSG00000169696:ENST00000306729:exon_79975185_79975280:ASPSCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79986156	C/T	1	24	15	39	11.4596420728834	7.83772370444786	3.62191836843558	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.265348265120783	ENSG00000169683:ENST00000306688:exon_79986110_79986187:LRRC45
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	79995535	G/A	1	25	20	45	11.9371271592536	10.4502982725971	1.48682888665643	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.765770141137486	ENSG00000169738:ENST00000306869:exon_79995507_79995573:DCXR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80006957	A/C	1	3	12	15	1.43245525911043	6.27017896355828	-4.83772370444786	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0173549210821596	ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80006958	T/C	1	12	3	15	5.72982103644172	1.56754474088957	4.16227629555214	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0378700909998812	ENSG00000169733:ENST00000310496:exon_80006907_80006992:RFNG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80012449	G/A	1	75	56	131	35.8113814777607	29.260835163272	6.55054631448873	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.257015345007050	ENSG00000169727:ENST00000306823:exon_80012374_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392358:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000320548:exon_80012408_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000355130:exon_80012386_80012686:GPS1;ENSG00000169727:ENST00000392357:exon_80011744_80012686:GPS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80019207	G/C	1	33	29	62	15.7570078502147	15.1529324952659	0.604075354948865	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.899534489299659	ENSG00000169718:ENST00000306796:exon_80019085_80019229:DUS1L;ENSG00000169718:ENST00000354321:exon_80019085_80019229:DUS1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80040966	A/G	1	29	22	51	13.8470675047341	11.4953280998569	2.35173940487729	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.575878835781702	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80040790_80040991:FASN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80045086	G/C	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000169710:ENST00000306749:exon_80044926_80045129:FASN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80059532	T/G	1	47	26	73	22.4417990593967	13.5853877543763	8.85641130502044	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0457638118237571	ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80059346_80059742:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80059346_80059742:CCDC57
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80085703	G/C	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000176155:ENST00000445854:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000389641:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392347:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392345:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000392346:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000419322:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000324808:exon_80085568_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000412801:exon_80085368_80085784:CCDC57;ENSG00000176155:ENST00000483145:exon_80085581_80085784:CCDC57
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80352234	G/A	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000181396:ENST00000329197:exon_80352207_80352419:C17orf101
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80885172	C/T	1	17	8	25	8.11724646829243	4.18011930903886	3.93712715925357	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.159933770810999	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80885062_80885199:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80885062_80885199:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80885062_80885199:TBCD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	17	80887244	T/C	1	60	106	166	28.6491051822086	55.3865808447648	-26.7374756625563	T:C	T	C	10	0.522514913629857	3.39860592066086e-05	ENSG00000141556:ENST00000355528:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000269368:exon_80887238_80887376:TBCD;ENSG00000141556:ENST00000334614:exon_80887238_80887376:TBCD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	166819	T/C	1	10	1	11	4.77485086370143	0.522514913629857	4.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0125953210255273	ENSG00000101557:ENST00000400266:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000261601:exon_166787_166819:USP14;ENSG00000101557:ENST00000383589:exon_166787_166819:USP14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	9117867	T/C	1	40	21	61	19.0994034548057	10.972813186227	8.12659026857872	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0402912394156473	ENSG00000178127:ENST00000318388:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000400033:exon_9117836_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000474350:exon_9117385_9117901:NDUFV2;ENSG00000178127:ENST00000483511:exon_9117836_9117901:NDUFV2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	9255982	A/G	1	241	206	447	115.073905815204	107.638072207751	7.4358336074539	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.507484030845102	ENSG00000101745:ENST00000383440:exon_9254209_9258929:ANKRD12;ENSG00000101745:ENST00000262126:exon_9254209_9258929:ANKRD12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	10550172	G/A	1	24	17	41	11.4596420728834	8.88275353170757	2.57688854117586	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.439119018273155	ENSG00000134265:ENST00000322897:exon_10550074_10552762:NAPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	12308273	G/T	1	39	66	105	18.6219183684356	34.4859842995706	-15.864065931135	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00231400711174332	ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308070_12308348:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308257_12308348:TUBB6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	12308793	G/C	1	70	157	227	33.42395604591	82.0348414398876	-48.6108853939775	C:G	G	C	10	0.522514913629857	9.4349331892672e-11	ENSG00000176014:ENST00000317702:exon_12308686_12308794:TUBB6;ENSG00000176014:ENST00000445717:exon_12308686_12308794:TUBB6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	12329548	G/A	1	116	82	198	55.3882700189366	42.8462229176483	12.5420471012883	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0756759052265978	ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12328943_12329782:AFG3L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	12348285	T/C	1	26	25	51	12.4146122456237	13.0628728407464	-0.648260595122709	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.889170159105475	ENSG00000141385:ENST00000269143:exon_12348272_12348382:AFG3L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	12718593	A/G	1	39	41	80	18.6219183684356	21.4231114588241	-2.80119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.576342236243222	ENSG00000128789:ENST00000317615:exon_12718516_12718634:PSMG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	13666602	C/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000177150:ENST00000322247:exon_13663346_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000457610:exon_13663350_13666712:C18orf19;ENSG00000177150:ENST00000402563:exon_13663350_13666712:C18orf19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	20573118	G/A	1	20	15	35	9.54970172740286	7.83772370444786	1.711978022955	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.614294946711019	ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20572711_20573602:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20572711_20573602:RBBP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	20577669	G/A	1	31	32	63	14.8020376774744	16.7204772361554	-1.91843955868099	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.705527620605572	ENSG00000101773:ENST00000327155:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000327174:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000360790:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399725:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399722:exon_20577583_20577697:RBBP8;ENSG00000101773:ENST00000399721:exon_20577583_20577697:RBBP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	21109235	T/C	1	13	22	35	6.20730612281186	11.4953280998569	-5.288021977045	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0900234042775497	ENSG00000141452:ENST00000269221:exon_21109143_21109262:C18orf8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	21120444	T/C	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21120412_21120501:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21120412_21120501:NPC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	21121306	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000141458:ENST00000269228:exon_21121270_21121397:NPC1;ENSG00000141458:ENST00000412552:exon_21121270_21121397:NPC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	23618532	T/C	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000141380:ENST00000415083:exon_23618519_23618623:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269137:exon_23618519_23618623:SS18;ENSG00000141380:ENST00000269138:exon_23618519_23618623:SS18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	29126670	T/C	1	9	26	35	4.29736577733129	13.5853877543763	-9.288021977045	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00194462024536455	ENSG00000046604:ENST00000261590:exon_29125684_29128813:DSG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	32887286	G/A	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461888750754105	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	33048617	G/A	1	47	23	70	22.4417990593967	12.0178430134867	10.42395604591	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0161035832206932	ENSG00000153391:ENST00000441607:exon_33048293_33048706:INO80C;ENSG00000153391:ENST00000334598:exon_33048297_33048706:INO80C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	33557466	A/G	1	31	44	75	14.8020376774744	22.9906561997137	-8.18861852223928	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0643851930406433	ENSG00000141428:ENST00000333234:exon_33557373_33557563:C18orf21;ENSG00000141428:ENST00000269194:exon_33557373_33557563:C18orf21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	34273279	C/G	1	5	15	20	2.38742543185071	7.83772370444786	-5.45029827259714	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0227180632230821	ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34273172_34273386:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34273172_34273386:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34273172_34273386:FHOD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	34340651	C/T	1	62	80	142	29.6040753549489	41.8011930903886	-12.1971177354397	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0436978648009087	ENSG00000134775:ENST00000445677:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000359247:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000257209:exon_34340571_34340745:FHOD3;ENSG00000134775:ENST00000432437:exon_34340571_34340745:FHOD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	43685185	T/C	1	26	20	46	12.4146122456237	10.4502982725971	1.96431397302658	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.65845332209445	ENSG00000152240:ENST00000282058:exon_43685160_43685334:HAUS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	44635048	C/T	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167220:ENST00000300605:exon_44633782_44635156:HDHD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	45371686	T/C	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.325690455653113	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	47809871	G/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	47810351	A/G	1	39	46	85	18.6219183684356	24.0356860269734	-5.41376765853785	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.277565183260126	ENSG00000154832:ENST00000285106:exon_47810264_47810471:CXXC1;ENSG00000154832:ENST00000412036:exon_47810264_47810471:CXXC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	48458662	G/A	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000082212:ENST00000321341:exon_48458628_48458730:ME2;ENSG00000082212:ENST00000382927:exon_48458628_48458730:ME2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	54293658	T/C	1	56	52	108	26.739164836728	27.1707755087526	-0.431610672024558	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000091164:ENST00000217515:exon_54293592_54293688:TXNL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	55268866	C/T	1	57	49	106	27.2166499230981	25.603230767863	1.61341915523516	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.771389609337484	ENSG00000134440:ENST00000256854:exon_55267896_55269015:NARS;ENSG00000134440:ENST00000423481:exon_55267896_55269015:NARS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56196451	C/T	1	14	27	41	6.684791209182	14.1079026680061	-7.42311145882414	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0274327827416859	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56196323_56196470:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56202120	G/A	1	66	36	102	31.5140157004294	18.8105368906749	12.7034788097546	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0129612439813369	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56202394	C/T	1	41	15	56	19.5768885411759	7.83772370444786	11.739164836728	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00185346145954122	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56202768	C/A	1	26	37	63	12.4146122456237	19.3330518043047	-6.91843955868099	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.100407012555253	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56202982	A/T	1	19	35	54	9.07221664103272	18.288021977045	-9.21580533601228	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.0137869632199812	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56203411	G/C	1	12	16	28	5.72982103644172	8.36023861807771	-2.630417581636	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.348683057297521	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56203447	A/G	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56203891	G/T	1	7	16	23	3.342395604591	8.36023861807771	-5.01784301348671	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0385964030094864	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56203898	T/G	1	8	11	19	3.81988069096114	5.74766404992843	-1.92778335896728	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.492108880387063	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56204250	A/C	1	13	11	24	6.20730612281186	5.74766404992843	0.459642072883431	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56204644	T/G	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56204747	G/A	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56204926	C/T	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56202066_56205456:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56246389	G/A	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	56246838	G/A	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000198796:ENST00000361673:exon_56246046_56247780:ALPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	57006155	C/T	1	23	18	41	10.9821569865133	9.40526844533743	1.57688854117586	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.64279311325208	ENSG00000074695:ENST00000251047:exon_57005992_57006185:LMAN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	60036404	T/G	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141655:ENST00000269485:exon_60035934_60036717:TNFRSF11A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61022791	C/T	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000119537:ENST00000406396:exon_61022731_61022796:KDSR;ENSG00000119537:ENST00000326575:exon_61022731_61022796:KDSR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61570503	C/G	0	41	0	41	19.5768885411759	0	19.5768885411759	C	C		10	0.522514913629857	2.83599933431931e-12	ENSG00000197632:ENST00000299502:exon_61570135_61571124:SERPINB2;ENSG00000197632:ENST00000457692:exon_61570135_61571113:SERPINB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61570529	C/G	1	37	1	38	17.6669481956953	0.522514913629857	17.1444332820654	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1.25163245527209e-09	ENSG00000197632:ENST00000299502:exon_61570135_61571124:SERPINB2;ENSG00000197632:ENST00000457692:exon_61570135_61571113:SERPINB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61582751	T/G	1	16	16	32	7.63976138192229	8.36023861807771	-0.720477236155425	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.860466485365508	ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61582816	G/A	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000242550:ENST00000397996:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000418725:exon_61582736_61582912:SERPINB10;ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61582736_61582912:SERPINB10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61585260	T/C	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61585199_61585336:SERPINB10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61587053	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61587022_61587139:SERPINB10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61602495	C/T	1	35	30	65	16.711978022955	15.6754474088957	1.03653061405929	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.805497238250807	ENSG00000242550:ENST00000238508:exon_61602072_61603345:SERPINB10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61654297	A/G	1	17	19	36	8.11724646829243	9.92778335896728	-1.81053689067485	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.617901916305745	ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	61654463	A/G	1	19	18	37	9.07221664103272	9.40526844533743	-0.333051804304711	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000166401:ENST00000397985:exon_61654108_61656608:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000353706:exon_61654108_61656605:SERPINB8;ENSG00000166401:ENST00000295211:exon_61654197_61654630:SERPINB8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	67531642	T/C	1	8	15	23	3.81988069096114	7.83772370444786	-4.01784301348671	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.099549600965852	ENSG00000150637:ENST00000280200:exon_67528097_67531675:CD226
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	71816278	G/A	1	33	27	60	15.7570078502147	14.1079026680061	1.64910518220858	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.699901539762741	ENSG00000075336:ENST00000169551:exon_71815746_71816344:C18orf55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77170477	C/A	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77171061	T/G	1	1	11	12	0.477485086370143	5.74766404992843	-5.27017896355828	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.00239895083326217	ENSG00000131196:ENST00000318065:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000253506:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000329101:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000427363:exon_77170403_77171501:NFATC1;ENSG00000131196:ENST00000397794:exon_77170400_77171501:NFATC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77475455	G/A	1	17	23	40	8.11724646829243	12.0178430134867	-3.90059654519428	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.267865059778909	ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77474491_77475528:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77474491_77475528:CTDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77477921	C/T	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77477810_77478016:CTDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77478011	C/T	1	18	24	42	8.59473155466257	12.5403579271166	-3.945626372454	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.279493702449161	ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77477810_77478016:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77477810_77478016:CTDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77513721	T/C	1	26	29	55	12.4146122456237	15.1529324952659	-2.73832024964214	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.501023437814489	ENSG00000060069:ENST00000299543:exon_77513652_77514510:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000075430:exon_77513652_77514503:CTDP1;ENSG00000060069:ENST00000397782:exon_77513652_77514503:CTDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77703363	G/A	1	40	36	76	19.0994034548057	18.8105368906749	0.288866564130863	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000122490:ENST00000397778:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000409073:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000466449:exon_77703329_77704324:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000351365:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000357575:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000474967:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000494607:exon_77703329_77703462:PQLC1;ENSG00000122490:ENST00000478144:exon_77703329_77703462:PQLC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	18	77805949	A/C	1	65	66	131	31.0365306140593	34.4859842995706	-3.44945368551127	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.599927514693153	ENSG00000101546:ENST00000306735:exon_77805774_77810651:RBFA;ENSG00000101546:ENST00000262197:exon_77805774_77806377:RBFA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	307282	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_307119_307536:MIER2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	334474	T/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105556:ENST00000264819:exon_334400_334542:MIER2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	571513	G/A	1	9	1	10	4.29736577733129	0.522514913629857	3.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0227369323798089	ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_571325_571579:BSG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	579636	C/T	1	246	268	514	117.461331247055	140.033996852802	-22.5726656057465	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.0469920729170626	ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_579500_579656:BSG;ENSG00000172270:ENST00000396012:exon_579500_579656:BSG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	580388	C/G	1	272	314	586	129.875943492679	164.069682879775	-34.1937393870962	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.00489977494771255	ENSG00000172270:ENST00000346916:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000353555:exon_580379_580461:BSG;ENSG00000172270:ENST00000333511:exon_580379_580461:BSG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	619664	C/T	1	7	12	19	3.342395604591	6.27017896355828	-2.92778335896728	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250486147296676	ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_619586_619765:POLRMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	621561	C/A	1	30	14	44	14.3245525911043	7.315208790818	7.00934380028629	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0353397572318827	ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	621629	G/A	1	9	15	24	4.29736577733129	7.83772370444786	-3.54035792711657	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.158203687557982	ENSG00000099821:ENST00000432652:exon_621259_621846:POLRMT;ENSG00000099821:ENST00000215591:exon_621058_621846:POLRMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	868031	C/T	0	194	0	194	92.6321067558077	0	92.6321067558077	C	C		10	0.522514913629857	2.13037498283382e-55	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_867964_868251:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_867964_868499:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_867964_868499:MED16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	871987	G/A	1	48	26	74	22.9192841457669	13.5853877543763	9.33389639139058	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0356105701531495	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_871926_872118:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_871926_872118:MED16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	880035	T/A	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	880078	G/T	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000175221:ENST00000325464:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000395808:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000312090:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000269814:exon_879937_880148:MED16;ENSG00000175221:ENST00000424039:exon_879937_880148:MED16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	929678	G/A	1	17	12	29	8.11724646829243	6.27017896355828	1.84706750473415	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.578659663491947	ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_929262_929896:ARID3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	966831	G/A	1	31	44	75	14.8020376774744	22.9906561997137	-8.18861852223928	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0643851930406433	ENSG00000116017:ENST00000263620:exon_966572_966868:ARID3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	984533	T/C	1	90	45	135	42.9736577733129	23.5131711133436	19.4604866599693	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000750570371572352	ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	984554	C/G	1	89	49	138	42.4961726869427	25.603230767863	16.8929419190797	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.00474578912488481	ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_984328_984563:WDR18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	991129	G/A	1	101	92	193	48.2259937233844	48.0713720539468	0.154621669437596	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991081_991145:WDR18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	991968	T/C	1	110	123	233	52.5233595007157	64.2693343764724	-11.7459748757567	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.131503119342359	ENSG00000065268:ENST00000251289:exon_991955_992121:WDR18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1014398	A/G	1	21	15	36	10.027186813773	7.83772370444786	2.18946310932515	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.507675377225445	ENSG00000182087:ENST00000356663:exon_1014191_1014472:C19orf6;ENSG00000182087:ENST00000333175:exon_1014191_1014472:C19orf6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1036444	G/A	1	195	157	352	93.1095918421779	82.0348414398876	11.0747504022903	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.240946736584439	ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1036552	T/C	1	303	188	491	144.677981170153	98.2328037624131	46.4451774077402	T:C	T	C	10	0.522514913629857	2.55462412900649e-05	ENSG00000064666:ENST00000263097:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000348419:exon_1036415_1036561:CNN2;ENSG00000064666:ENST00000442531:exon_1036415_1036561:CNN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1056065	A/G	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1056065_1056242:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1056065_1056242:ABCA7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1058635	C/T	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000064687:ENST00000263094:exon_1058617_1058746:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000433129:exon_1058617_1058746:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000435683:exon_1058617_1058746:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000524728:exon_1058617_1058731:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000525073:exon_1058617_1058698:ABCA7;ENSG00000064687:ENST00000532194:exon_1058617_1058746:ABCA7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1068734	T/C	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1068738	G/A	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1068413_1068743:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1068413_1068743:HMHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1079968	G/A	1	43	48	91	20.5318587139161	25.0807158542331	-4.54885714031699	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.347012234429876	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1079927_1080117:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1079927_1080117:HMHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1080311	G/C	1	54	50	104	25.7841946639877	26.1257456814929	-0.341551017505132	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1080254_1080378:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1080254_1080378:HMHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1081617	A/G	1	63	45	108	30.081560441319	23.5131711133436	6.56838932797544	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.211955372259736	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1081683	C/T	1	72	35	107	34.3789262186503	18.288021977045	16.0909042416053	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00186821055091165	ENSG00000180448:ENST00000412039:exon_1081549_1081737:HMHA1;ENSG00000180448:ENST00000313093:exon_1081549_1081737:HMHA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1109577	C/T	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1109505_1109597:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1109505_1109597:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1109505_1109597:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1109505_1109597:SBNO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1116060	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000064932:ENST00000361757:exon_1116020_1116102:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000438103:exon_1116020_1116102:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000250872:exon_1116020_1116102:SBNO2;ENSG00000064932:ENST00000319671:exon_1116020_1116102:SBNO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1360575	G/A	1	12	9	21	5.72982103644172	4.70263422266871	1.027186813773	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.670382560246413	ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000356765:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1360135_1361031:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1360135_1361031:MUM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1373118	G/T	1	26	26	52	12.4146122456237	13.5853877543763	-1.17077550875257	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.782379642624887	ENSG00000160953:ENST00000415183:exon_1373071_1373159:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000344663:exon_1373071_1373159:MUM1;ENSG00000160953:ENST00000311401:exon_1373071_1373159:MUM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1399137	T/C	1	36	45	81	17.1894631093251	23.5131711133436	-6.32370800401842	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.181928967268781	ENSG00000130005:ENST00000252288:exon_1399127_1399194:GAMT;ENSG00000130005:ENST00000455182:exon_1399127_1399146:GAMT;ENSG00000130005:ENST00000447102:exon_1399127_1399194:GAMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1438865	C/T	1	792	3168	3960	378.168188405153	1655.32724637939	-1277.15905797423	A:T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0	ENSG00000115268:ENST00000233609:exon_1438806_1438891:RPS15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1481919	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000115257:ENST00000300954:exon_1481427_1482206:PCSK4;ENSG00000115257:ENST00000441747:exon_1481427_1482206:PCSK4;ENSG00000115257:ENST00000433740:exon_1481427_1482206:PCSK4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1584671	C/T	1	41	39	80	19.5768885411759	20.3780816315644	-0.801193090388562	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.911049810053233	ENSG00000071655:ENST00000355664:exon_1584539_1584676:MBD3;ENSG00000071655:ENST00000156825:exon_1584539_1584676:MBD3;ENSG00000071655:ENST00000434436:exon_1584539_1584676:MBD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1615796	G/A	1	93	62	155	44.4061130324233	32.3959246450511	12.0101883873722	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0540216139252898	ENSG00000071564:ENST00000453954:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000344749:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000262965:exon_1615685_1615820:TCF3;ENSG00000071564:ENST00000395423:exon_1615284_1615820:TCF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1819125	T/C	1	7	13	20	3.342395604591	6.79269387718814	-3.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.177937843741256	ENSG00000079313:ENST00000170168:exon_1819017_1819130:REXO1;ENSG00000079313:ENST00000413153:exon_1819017_1819130:REXO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1854557	A/G	1	7	16	23	3.342395604591	8.36023861807771	-5.01784301348671	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0385964030094864	ENSG00000129911:ENST00000250916:exon_1852398_1854759:KLF16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1912934	T/C	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1912986	C/T	1	20	16	36	9.54970172740286	8.36023861807771	1.18946310932515	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.740680249875467	ENSG00000213638:ENST00000329478:exon_1911889_1913444:ADAT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	1986455	A/G	1	68	64	132	32.4689858731697	33.4409544723108	-0.971968599141128	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.930613937939223	ENSG00000133243:ENST00000255608:exon_1985447_1986648:BTBD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2041917	G/A	1	114	123	237	54.4332998461963	64.2693343764724	-9.83603453027612	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.216673128651598	ENSG00000099875:ENST00000309340:exon_2041839_2042033:MKNK2;ENSG00000099875:ENST00000250896:exon_2041839_2042033:MKNK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2073354	C/A	1	51	50	101	24.3517394048773	26.1257456814929	-1.77400627661556	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.765441173845507	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2071037_2073423:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2073140_2073423:MOBKL2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2078409	A/G	1	48	27	75	22.9192841457669	14.1079026680061	8.81138147776072	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0488869765626491	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2078488	T/C	1	38	37	75	18.1444332820654	19.3330518043047	-1.18861852223928	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.817767033931714	ENSG00000172081:ENST00000357066:exon_2078139_2078678:MOBKL2A;ENSG00000172081:ENST00000456030:exon_2078386_2078559:MOBKL2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2099051	G/A	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000099840:ENST00000497445:exon_2098435_2099583:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000478879:exon_2098435_2099592:IZUMO4;ENSG00000099840:ENST00000498554:exon_2098975_2099109:IZUMO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2110746	G/A	1	98	102	200	46.793538464274	53.2965211902454	-6.5029827259714	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.358624351428754	ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2110706_2110895:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2110706_2110895:AP3D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2116649	A/G	1	36	37	73	17.1894631093251	19.3330518043047	-2.14358869497956	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.640654333210753	ENSG00000065000:ENST00000356926:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000355272:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000343722:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000350812:exon_2116604_2116745:AP3D1;ENSG00000065000:ENST00000345016:exon_2116604_2116745:AP3D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2226772	G/C	1	34	38	72	16.2344929365849	19.8555667179346	-3.62107378134971	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.410790720739565	ENSG00000104885:ENST00000398665:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000221482:exon_2226182_2227126:DOT1L;ENSG00000104885:ENST00000457590:exon_2226182_2227126:DOT1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2271927	C/A	1	920	1065	1985	439.286279460532	556.478383015798	-117.192103555266	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1.42430930917276e-07	ENSG00000104904:ENST00000322297:exon_2271781_2271953:OAZ1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2344637	C/T	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2344551_2344650:AC004410.1;ENSG00000005206:ENST00000320335:exon_2344551_2344650:AC004410.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2353096	C/T	1	16	17	33	7.63976138192229	8.88275353170757	-1.24299214978528	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728920287854378	ENSG00000005206:ENST00000452401:exon_2352944_2353207:AC004410.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2418031	C/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000178297:ENST00000332578:exon_2418000_2418136:TMPRSS9;ENSG00000178297:ENST00000425079:exon_2418000_2418136:TMPRSS9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2732741	G/A	1	82	91	173	39.1537770823517	47.548857140317	-8.39508005796527	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.223279010909936	ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2732525_2733483:SLC39A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2737193	G/A	1	65	93	158	31.0365306140593	48.5938869675767	-17.5573563535174	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00528380588919257	ENSG00000141873:ENST00000269740:exon_2737046_2737377:SLC39A3;ENSG00000141873:ENST00000455372:exon_2734527_2737377:SLC39A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2762585	A/C	1	36	22	58	17.1894631093251	11.4953280998569	5.69413500946829	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.148963829005048	ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2762504_2762642:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2762504_2762642:SGTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2767192	G/T	1	17	26	43	8.11724646829243	13.5853877543763	-5.46814128608385	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.125905482353549	ENSG00000104969:ENST00000221566:exon_2767134_2767218:SGTA;ENSG00000104969:ENST00000455056:exon_2767134_2767218:SGTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2810738	G/A	1	185	159	344	88.3347409784764	83.0798712671473	5.25486971132918	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.589612251226886	ENSG00000172009:ENST00000307741:exon_2810638_2810766:THOP1;ENSG00000172009:ENST00000395212:exon_2810638_2810766:THOP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2994903	T/C	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	2994921	G/A	1	5	12	17	2.38742543185071	6.27017896355828	-3.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.086732673121093	ENSG00000104953:ENST00000447920:exon_2994898_2995121:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000441927:exon_2994898_2995182:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000246112:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000452088:exon_2994898_2995177:TLE6;ENSG00000104953:ENST00000497878:exon_2994898_2995149:TLE6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3157916	C/T	1	3	10	13	1.43245525911043	5.22514913629857	-3.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0493024340440666	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3452637	C/T	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3452480_3452664:NFIC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3452644	G/T	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000141905:ENST00000443272:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000395111:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000346156:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000341919:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000343825:exon_3452480_3452664:NFIC;ENSG00000141905:ENST00000269778:exon_3452480_3452664:NFIC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3544634	T/C	1	19	42	61	9.07221664103272	21.945626372454	-12.8734097314213	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00118022365860629	ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544198_3544730:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3544812	C/T	1	30	19	49	14.3245525911043	9.92778335896728	4.39676923213701	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.252639952759517	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3544865	G/A	0	35	0	35	16.711978022955	0	16.711978022955	G	G		10	0.522514913629857	1.41775676414010e-10	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3544867	C/T	0	36	0	36	17.1894631093251	0	17.1894631093251	C	C		10	0.522514913629857	7.38186328266576e-11	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3544871	G/A	1	16	19	35	7.63976138192229	9.92778335896728	-2.288021977045	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.500012532849596	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3544892	C/T	1	25	15	40	11.9371271592536	7.83772370444786	4.09940345480572	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.208731295010776	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3544807_3544937:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3544807_3544937:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3547955	C/T	1	25	10	35	11.9371271592536	5.22514913629857	6.711978022955	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0270504322481821	ENSG00000161091:ENST00000389395:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000442407:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000398558:exon_3547846_3548028:C19orf28;ENSG00000161091:ENST00000355415:exon_3547846_3548028:C19orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	3752874	A/G	1	14	16	30	6.684791209182	8.36023861807771	-1.67544740889571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.586545503505938	ENSG00000011132:ENST00000439726:exon_3752818_3753060:APBA3;ENSG00000011132:ENST00000316757:exon_3752818_3752988:APBA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4236996	G/A	1	605	522	1127	288.878477253937	272.752784914785	16.1256923391512	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.340127726634266	ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4237067	A/G	1	539	533	1072	257.364461553507	278.500448964714	-21.1359874112067	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.199195552076709	ENSG00000105246:ENST00000221847:exon_4236933_4237515:EBI3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4251069	T/C	1	13	25	38	6.20730612281186	13.0628728407464	-6.85556671793457	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.0335987565256697	ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4251024_4251168:CCDC94
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4254375	C/T	1	27	23	50	12.8920973319939	12.0178430134867	0.874254318507148	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.887707278549361	ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4254352_4254486:CCDC94
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4262036	C/T	1	26	29	55	12.4146122456237	15.1529324952659	-2.73832024964214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.501023437814489	ENSG00000105248:ENST00000262962:exon_4261991_4262111:CCDC94
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4325226	A/C	1	23	20	43	10.9821569865133	10.4502982725971	0.531858713916147	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.880225766123912	ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325213_4325305:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325213_4325305:STAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4325433	G/A	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4325393_4325542:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4325393_4325542:STAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4327331	C/T	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000178078:ENST00000424810:exon_4327313_4327382:STAP2;ENSG00000178078:ENST00000314714:exon_4327313_4327382:STAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4352959	A/G	1	14	12	26	6.684791209182	6.27017896355828	0.414612245623718	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4353024	C/T	1	21	20	41	10.027186813773	10.4502982725971	-0.423111458824138	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000008382:ENST00000359935:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4352894_4353026:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4352894_4353026:MPND
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4355134	C/T	1	14	11	25	6.684791209182	5.74766404992843	0.937127159253575	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841937402628968	ENSG00000008382:ENST00000262966:exon_4355094_4355170:MPND;ENSG00000008382:ENST00000262967:exon_4355094_4355170:MPND;ENSG00000008382:ENST00000429880:exon_4355094_4355170:MPND
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4409179	A/T	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4409511	A/G	1	17	12	29	8.11724646829243	6.27017896355828	1.84706750473415	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.578659663491947	ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4409756	A/G	1	13	15	28	6.20730612281186	7.83772370444786	-1.630417581636	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.574469279427906	ENSG00000167670:ENST00000301280:exon_4408900_4409756:CHAF1A;ENSG00000167670:ENST00000344143:exon_4408900_4409756:CHAF1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4454083	C/T	1	51	30	81	24.3517394048773	15.6754474088957	8.67629199598158	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0586155882639569	ENSG00000167671:ENST00000301281:exon_4453927_4454090:UBXN6;ENSG00000167671:ENST00000394765:exon_4453927_4454090:UBXN6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4658047	A/G	1	136	122	258	64.9379717463394	63.7468194628426	1.19115228349688	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.90092292168012	ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4657566_4658096:C19orf10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4670236	C/G	1	65	52	117	31.0365306140593	27.1707755087526	3.86575510530673	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.517452850559795	ENSG00000074842:ENST00000262947:exon_4670173_4670415:C19orf10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4847874	A/G	1	48	21	69	22.9192841457669	10.972813186227	11.9464709595399	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00518968533466449	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4847703_4847902:PLIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4852106	A/G	1	31	16	47	14.8020376774744	8.36023861807771	6.44179905939672	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0786701182260066	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4852137	C/T	1	37	13	50	17.6669481956953	6.79269387718814	10.8742543185071	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00258122516486073	ENSG00000105355:ENST00000221957:exon_4852028_4852313:PLIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4910889	G/T	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4910888_4911050:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4910566_4911050:UHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4929413	T/C	0	0	9	9	0	4.70263422266871	-4.70263422266871	C	T	C	10	0.522514913629857	0.00129014434626878	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	4929473	A/G	0	0	13	13	0	6.79269387718814	-6.79269387718814	G	A	G	10	0.522514913629857	6.70621618656986e-05	ENSG00000034063:ENST00000262952:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000398240:exon_4929234_4929488:UHRF1;ENSG00000034063:ENST00000455180:exon_4929234_4929488:UHRF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	5787615	G/A	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000141994:ENST00000320699:exon_5787600_5787716:DUS3L;ENSG00000141994:ENST00000309061:exon_5787600_5787716:DUS3L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	5915026	G/A	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000452990:exon_5914951_5915076:CAPS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	5915151	C/T	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000105519:ENST00000394521:exon_5914951_5915157:CAPS;ENSG00000105519:ENST00000222125:exon_5914951_5915157:CAPS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	6374229	C/A	1	133	130	263	63.505516487229	67.9269387718814	-4.42142228465239	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.621538119726141	ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374214_6374387:ALKBH7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	6375010	T/G	1	61	48	109	29.1265902685787	25.0807158542331	4.04587441434558	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.445064182754719	ENSG00000125652:ENST00000245812:exon_6374822_6375040:ALKBH7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	6468331	T/C	1	103	89	192	49.1809638961247	46.5038273130573	2.67713658306745	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.718377089061031	ENSG00000205744:ENST00000381480:exon_6468245_6468452:DENND1C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	6732382	G/A	1	22	19	41	10.5046719001431	9.92778335896728	0.576888541175862	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.877191301426372	ENSG00000125734:ENST00000264080:exon_6732274_6732391:GPR108;ENSG00000125734:ENST00000430424:exon_6732274_6732391:GPR108
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	6755155	T/C	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000125731:ENST00000245908:exon_6754842_6755326:SH2D3A;ENSG00000125731:ENST00000437152:exon_6754842_6755326:SH2D3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	6854007	C/T	1	41	30	71	19.5768885411759	15.6754474088957	3.90144113228015	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.405993870613607	ENSG00000141968:ENST00000304076:exon_6853958_6854109:VAV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7163083	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7163140	T/G	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7163154	G/A	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7163043_7163210:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7163043_7163210:INSR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7184518	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000171105:ENST00000341500:exon_7184327_7184648:INSR;ENSG00000171105:ENST00000302850:exon_7184327_7184648:INSR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7531821	G/A	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000104880:ENST00000398026:exon_7531804_7531860:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000319670:exon_7531804_7531860:ARHGEF18;ENSG00000104880:ENST00000359920:exon_7531804_7531860:ARHGEF18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7542118	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000104883:ENST00000221480:exon_7541761_7542322:PEX11G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7619522	G/A	1	18	9	27	8.59473155466257	4.70263422266871	3.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.176865551934525	ENSG00000032444:ENST00000221249:exon_7619441_7619609:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000414982:exon_7619441_7619609:PNPLA6;ENSG00000032444:ENST00000450331:exon_7619441_7619609:PNPLA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7685183	G/A	1	133	130	263	63.505516487229	67.9269387718814	-4.42142228465239	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.621538119726141	ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685161_7685332:XAB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7685547	C/T	1	86	65	151	41.0637174278323	33.9634693859407	7.10024804189159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.255087093660921	ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685433_7685555:XAB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7685861	G/A	1	51	49	100	24.3517394048773	25.603230767863	-1.2514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.841607058106266	ENSG00000076924:ENST00000358368:exon_7685732_7685922:XAB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7711221	T/C	1	118	65	183	56.3432401916769	33.9634693859407	22.3797708057362	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00107430682423365	ENSG00000076944:ENST00000221283:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000414284:exon_7711135_7711230:STXBP2;ENSG00000076944:ENST00000441779:exon_7711135_7711230:STXBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7712193	G/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7747445	G/A	1	790	962	1752	377.213218232413	502.659346911922	-125.44612867951	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	2.12253589775970e-09	ENSG00000181029:ENST00000452406:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000317378:exon_7747128_7747748:TRAPPC5;ENSG00000181029:ENST00000426877:exon_7747128_7747748:TRAPPC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7754222	G/A	1	2637	2553	5190	1259.12817275807	1333.98057449702	-74.852401738958	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0384113538045280	ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7753663_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7753667_7754316:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7753667_7754316:FCER2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7763248	G/A	1	2236	1930	4166	1067.65665312364	1008.45378330562	59.2028698180156	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.067240844413851	ENSG00000104921:ENST00000346664:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000394208:exon_7763242_7763295:FCER2;ENSG00000104921:ENST00000360067:exon_7763242_7763295:FCER2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7987058	G/A	1	19	26	45	9.07221664103272	13.5853877543763	-4.51317111334357	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.183053170290474	ENSG00000104976:ENST00000221573:exon_7986920_7987232:SNAPC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	7999004	G/A	1	42	44	86	20.054373627546	22.9906561997137	-2.9362825721677	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.589670956911801	ENSG00000104980:ENST00000270538:exon_7998974_7999123:TIMM44
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8121360	A/G	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000131142:ENST00000253451:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000405803:exon_8121250_8121383:CCL25;ENSG00000131142:ENST00000390669:exon_8121250_8121383:CCL25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8367356	C/T	1	52	52	104	24.8292244912474	27.1707755087526	-2.34155101750513	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.694894421570958	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8367359	G/C	1	50	48	98	23.8742543185071	25.0807158542331	-1.20646153572599	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.840098162664479	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367011_8367489:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367011_8367489:CD320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8367709	C/T	1	21	21	42	10.027186813773	10.972813186227	-0.945626372453994	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.877494826627993	ENSG00000167775:ENST00000323539:exon_8367661_8367722:CD320;ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8367661_8367864:CD320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8368758	G/A	1	22	11	33	10.5046719001431	5.74766404992843	4.75700785021472	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.116831908209975	ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8368794	C/A	1	25	14	39	11.9371271592536	7.315208790818	4.62191836843558	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.151310919740573	ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8368739_8368972:CD320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8373176	C/T	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000167775:ENST00000301458:exon_8373033_8373239:CD320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8381479	T/C	1	85	74	159	40.5862323414621	38.6661036086094	1.92012873285273	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.811874823333069	ENSG00000167774:ENST00000301457:exon_8381380_8381529:NDUFA7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8386998	T/C	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000233927:ENST00000445365:exon_8386540_8387376:RPS28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8468337	C/T	1	139	180	319	66.3704270054499	94.0526844533743	-27.6822574479244	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00202300613083228	ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8468349	C/T	1	167	123	290	79.7400094238139	64.2693343764724	15.4706750473415	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.07764494556318	ENSG00000185236:ENST00000328024:exon_8468297_8469313:RAB11B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8550911	G/C	1	232	212	444	110.776540037873	110.77316168953	0.00337834834348882	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8551094	T/C	1	201	215	416	95.9745023603987	112.340706430419	-16.3662040700205	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.116215245299660	ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8550487_8551289:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8550487_8551289:HNRNPM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8553630	C/T	1	246	186	432	117.461331247055	97.1877739351534	20.2735573119018	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.053975693672116	ENSG00000099783:ENST00000348943:exon_8553575_8553885:HNRNPM;ENSG00000099783:ENST00000325495:exon_8553575_8553885:HNRNPM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8578118	A/G	1	13	26	39	6.20730612281186	13.5853877543763	-7.37808163156442	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0236956254312472	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8578199	T/C	1	22	22	44	10.5046719001431	11.4953280998569	-0.990656199713708	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.765635035115544	ENSG00000133250:ENST00000393927:exon_8577913_8578225:ZNF414;ENSG00000133250:ENST00000255616:exon_8577913_8578225:ZNF414
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	8587553	T/C	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000142347:ENST00000446661:exon_8587518_8587713:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000305795:exon_8587518_8587617:MYO1F;ENSG00000142347:ENST00000338257:exon_8587518_8587713:MYO1F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	9271969	C/A	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000130803:ENST00000360385:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000247956:exon_9270790_9274089:ZNF317;ENSG00000130803:ENST00000457190:exon_9270790_9274089:ZNF317
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	9721401	A/T	1	3	14	17	1.43245525911043	7.315208790818	-5.88275353170757	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.00584113873777877	ENSG00000171469:ENST00000354661:exon_9718003_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000302851:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000424629:exon_9718008_9722012:ZNF561;ENSG00000171469:ENST00000326044:exon_9720432_9722012:ZNF561
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	9949152	G/A	1	206	167	373	98.3619277922494	87.2599905761861	11.1019372160633	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.254570388546694	ENSG00000127445:ENST00000247970:exon_9949112_9949324:PIN1;ENSG00000127445:ENST00000424497:exon_9949112_9949324:PIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10221151	C/G	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221134_10221290:PPAN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10221642	A/G	1	241	207	448	115.073905815204	108.16058712138	6.91331869382405	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.53874341641752	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10221621_10221760:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10221621_10221698:PPAN-P2RY11;ENSG00000130810:ENST00000253107:exon_10221621_10221970:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000342696:exon_10221621_10221750:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000393793:exon_10221621_10221930:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000444703:exon_10221621_10221972:PPAN;ENSG00000130810:ENST00000486482:exon_10221621_10222310:PPAN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10224526	C/T	1	30	38	68	14.3245525911043	19.8555667179346	-5.53101412683028	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.184082616554756	ENSG00000243207:ENST00000428358:exon_10224309_10225456:PPAN-P2RY11;ENSG00000243207:ENST00000393796:exon_10224309_10225414:PPAN-P2RY11;ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10225777	A/G	1	672	738	1410	320.869978040736	385.616006258834	-64.7460282180984	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000580384744478468	ENSG00000244165:ENST00000321826:exon_10224309_10226048:P2RY11;ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10225690_10225805:EIF3G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10226701	C/T	1	503	511	1014	240.174998444182	267.005120864857	-26.8301224206751	A:T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.0956659117316756	ENSG00000130811:ENST00000253108:exon_10226643_10226750:EIF3G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10385540	A/T	1	31	24	55	14.8020376774744	12.5403579271166	2.26167975035786	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.59056984321055	ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10385441_10385704:ICAM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10395468	G/A	1	32	28	60	15.2795227638446	14.630417581636	0.649105182208579	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.89778651341517	ENSG00000090339:ENST00000433023:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000264832:exon_10395459_10395704:ICAM1;ENSG00000090339:ENST00000423829:exon_10395459_10395704:ICAM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10426422	A/C	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000492239:exon_10426381_10426471:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000494368:exon_10426381_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426062_10426435:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426007_10426435:FDX1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10426628	T/C	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000167807:ENST00000452032:exon_10426528_10426685:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000393708:exon_10426528_10426691:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000460631:exon_10426528_10426672:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000343376:exon_10426381_10426689:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000453681:exon_10426381_10426686:FDX1L;ENSG00000167807:ENST00000486454:exon_10426528_10426682:FDX1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10444603	C/G	1	390	432	822	186.219183684356	225.726442688098	-39.5072590037425	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.00642815283974754	ENSG00000076662:ENST00000160262:exon_10444454_10444735:ICAM3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10461708	A/G	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000105397:ENST00000529422:exon_10461464_10461969:TYK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10463679	G/A	1	52	47	99	24.8292244912474	24.5582009406033	0.271023550644152	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000530220:exon_10463602_10463932:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000527481:exon_10463602_10463774:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10463602_10463774:TYK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10464674	A/G	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10464687	A/G	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000105397:ENST00000529739:exon_10464204_10464754:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529412:exon_10464587_10464910:TYK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10475649	C/T	1	9	11	20	4.29736577733129	5.74766404992843	-1.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.655580186809523	ENSG00000105397:ENST00000264818:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000524462:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000525621:exon_10475527_10475724:TYK2;ENSG00000105397:ENST00000529370:exon_10475527_10475724:TYK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10600442	G/C	1	11	18	29	5.25233595007157	9.40526844533743	-4.15293249526585	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.138811383638839	ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10600324_10600529:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10600324_10600529:KEAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10610236	A/G	1	16	12	28	7.63976138192229	6.27017896355828	1.369582418364	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.706380291404001	ENSG00000079999:ENST00000393623:exon_10610071_10610756:KEAP1;ENSG00000079999:ENST00000171111:exon_10610071_10610756:KEAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10659659	C/T	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130734:ENST00000309469:exon_10659580_10659710:ATG4D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10664632	A/G	1	49	30	79	23.396769232137	15.6754474088957	7.7213218232413	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0911613993738533	ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10663761_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10664252_10664957:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10664267_10664957:KRI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10665770	G/C	1	32	38	70	15.2795227638446	19.8555667179346	-4.57604395408999	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.283792115149261	ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10665763_10665861:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10665763_10665861:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10665763_10665861:KRI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10668452	A/G	1	32	36	68	15.2795227638446	18.8105368906749	-3.53101412683028	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.398461090868934	ENSG00000129347:ENST00000312962:exon_10668445_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000478863:exon_10668228_10668571:KRI1;ENSG00000129347:ENST00000361821:exon_10668445_10668571:KRI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10742831	C/T	1	13	8	21	6.20730612281186	4.18011930903886	2.027186813773	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.393468965686283	ENSG00000129353:ENST00000335757:exon_10742720_10742832:SLC44A2;ENSG00000129353:ENST00000380614:exon_10742720_10742832:SLC44A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10781760	G/A	1	26	26	52	12.4146122456237	13.5853877543763	-1.17077550875257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.782379642624887	ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10781650_10781879:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10781650_10781879:ILF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10794630	G/T	1	94	101	195	44.8835981187934	52.7740062766156	-7.89040815782212	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.282269412960012	ENSG00000129351:ENST00000336059:exon_10794593_10794652:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000449870:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000318511:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000420083:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000407004:exon_10794593_10794646:ILF3;ENSG00000129351:ENST00000250241:exon_10794593_10794646:ILF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	10939792	T/C	1	62	60	122	29.6040753549489	31.3508948177914	-1.74681946284256	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.786027015364703	ENSG00000079805:ENST00000389252:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000389253:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000359692:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000314646:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000355667:exon_10939712_10939944:DNM2;ENSG00000079805:ENST00000408974:exon_10939712_10939944:DNM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11098397	G/A	1	19	12	31	9.07221664103272	6.27017896355828	2.80203767747443	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370393957183701	ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11098342_11098600:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11098342_11098600:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11098342_11098600:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11098342_11098600:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11098342_11098600:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11098342_11098600:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11098342_11098600:SMARCA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11105608	T/C	1	67	72	139	31.9915007867996	37.6210737813497	-5.62957299455013	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.351234252241925	ENSG00000127616:ENST00000358026:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000421844:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000429416:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000344626:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000444061:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000450717:exon_11105504_11105677:SMARCA4;ENSG00000127616:ENST00000413806:exon_11105504_11105677:SMARCA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11224265	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11224211_11224438:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11224211_11224438:LDLR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11227554	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11227535_11227674:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11227535_11227674:LDLR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11230881	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000130164:ENST00000455727:exon_11230768_11230909:LDLR;ENSG00000130164:ENST00000252444:exon_11230768_11230909:LDLR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11311717	C/T	1	28	16	44	13.369582418364	8.36023861807771	5.00934380028629	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.134694778855530	ENSG00000130158:ENST00000294618:exon_11311585_11311728:DOCK6;ENSG00000130158:ENST00000319867:exon_11311585_11311728:DOCK6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11465316	G/C	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000183401:ENST00000458408:exon_11465256_11465372:CCDC159;ENSG00000183401:ENST00000427879:exon_11465256_11465374:CCDC159
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11687351	C/T	1	29	28	57	13.8470675047341	14.630417581636	-0.783350076901849	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.894809539452338	ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687058_11687403:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687058_11687403:ACP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	11687908	G/A	1	32	26	58	15.2795227638446	13.5853877543763	1.69413500946829	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.69476986433319	ENSG00000102575:ENST00000412435:exon_11687872_11688132:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000438664:exon_11687872_11688132:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000218758:exon_11687872_11688132:ACP5;ENSG00000102575:ENST00000433365:exon_11687872_11688132:ACP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12060140	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000196757:ENST00000254321:exon_12059091_12061578:ZNF700;ENSG00000196757:ENST00000482090:exon_12059091_12061588:ZNF700
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12772090	C/T	1	40	35	75	19.0994034548057	18.288021977045	0.811381477760722	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.908189226625385	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12772165	G/A	1	25	16	41	11.9371271592536	8.36023861807771	3.57688854117586	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.278095397791184	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12772074_12772190:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12771711_12772190:MAN2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12774208	G/C	1	17	7	24	8.11724646829243	3.657604395409	4.45964207288343	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.100163552529794	ENSG00000104774:ENST00000456935:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000221363:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000466794:exon_12774131_12774276:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000462144:exon_12774131_12774232:MAN2B1;ENSG00000104774:ENST00000486847:exon_12774122_12774276:MAN2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12812169	A/G	1	8	11	19	3.81988069096114	5.74766404992843	-1.92778335896728	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.492108880387063	ENSG00000105576:ENST00000425528:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000441499:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000450764:exon_12812140_12812267:TNPO2;ENSG00000105576:ENST00000356861:exon_12812140_12812267:TNPO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12917520	A/G	1	45	42	87	21.4868288866564	21.945626372454	-0.458797485797561	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12917428_12917614:RNASEH2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12920935	G/A	1	76	72	148	36.2888665641309	37.6210737813497	-1.33220721721884	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.869393621282163	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12920885_12921022:RNASEH2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12921186	T/C	1	84	89	173	40.108747255092	46.5038273130573	-6.39508005796526	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.361182482794003	ENSG00000104889:ENST00000221486:exon_12921131_12921218:RNASEH2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	12989560	G/A	1	34	24	58	16.2344929365849	12.5403579271166	3.69413500946829	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.359363477474308	ENSG00000105612:ENST00000222219:exon_12989484_12989648:DNASE2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	13035517	C/T	1	214	219	433	102.181808483211	114.430766084939	-12.2489576017281	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.248373408910489	ENSG00000179115:ENST00000314606:exon_13035453_13035621:FARSA;ENSG00000179115:ENST00000423140:exon_13035453_13035621:FARSA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	13054781	G/T	1	675	719	1394	322.302433299846	375.688222899867	-53.3857896000207	T:C:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00446833613005918	ENSG00000179218:ENST00000316448:exon_13054527_13055304:CALR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	13227058	G/A	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000104907:ENST00000221504:exon_13226960_13227463:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000437766:exon_13226960_13227463:TRMT1;ENSG00000104907:ENST00000357720:exon_13226960_13227245:TRMT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	13883099	A/G	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000037757:ENST00000040663:exon_13882935_13885096:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000319545:exon_13882935_13883361:MRI1;ENSG00000037757:ENST00000445479:exon_13882935_13883361:MRI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	13885309	C/T	1	183	102	285	87.3797708057362	53.2965211902454	34.0832496154907	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	5.17528940263153e-05	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885257_13885388:C19orf53
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	13885484	A/G	1	549	519	1068	262.139312417208	271.185240173896	-9.04592775668732	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.581547224239002	ENSG00000104979:ENST00000221576:exon_13885466_13885521:C19orf53
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14030689	T/C	1	13	3	16	6.20730612281186	1.56754474088957	4.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0233109282447019	ENSG00000132024:ENST00000318003:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000412841:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000397486:exon_14030631_14030764:CC2D1A;ENSG00000132024:ENST00000389233:exon_14030631_14030764:CC2D1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14070085	T/C	1	21	11	32	10.027186813773	5.74766404992843	4.27952276384458	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.157165565810456	ENSG00000132017:ENST00000254337:exon_14069857_14070291:DCAF15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14231243	C/T	1	65	46	111	31.0365306140593	24.0356860269734	7.00084458708587	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.216590623848401	ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14231325	C/G	1	35	32	67	16.711978022955	16.7204772361554	-0.00849921320041958	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14231330	A/G	1	33	32	65	15.7570078502147	16.7204772361554	-0.963469385940707	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.901314460818815	ENSG00000105011:ENST00000263382:exon_14230321_14231477:ASF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14277727	T/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14554346	G/A	1	19	32	51	9.07221664103272	16.7204772361554	-7.64826059512271	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0354199537241481	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14554282_14554433:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14554282_14554433:PKN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14574680	C/T	1	96	66	162	45.8385682915337	34.4859842995706	11.3525839919632	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0833516799880104	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14574640_14574781:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14574640_14574781:PKN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14580328	A/G	1	151	115	266	72.1002480418916	60.0892150674336	12.011032974458	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.141331162453250	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580153_14580329:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580153_14580329:PKN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14581063	A/G	1	161	104	265	76.875098905593	54.3415510175051	22.5335478880879	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00562161248256503	ENSG00000123143:ENST00000242783:exon_14580975_14581117:PKN1;ENSG00000123143:ENST00000342216:exon_14580975_14581117:PKN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14675072	C/A	1	120	87	207	57.2982103644172	45.4587974857976	11.8394128786196	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.109414569595921	ENSG00000099797:ENST00000215567:exon_14674994_14675099:TECR;ENSG00000099797:ENST00000436007:exon_14674994_14675099:TECR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	14676941	C/T	1	182	208	390	86.902285719366	108.68310203501	-21.7808163156442	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0292016679994426	ENSG00000099795:ENST00000215565:exon_14676892_14677077:NDUFB7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	15230240	G/A	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000105135:ENST00000533086:exon_15230229_15230326:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000263383:exon_15230229_15230326:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000534378:exon_15230229_15230326:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000533148:exon_15230229_15230326:ILVBL;ENSG00000105135:ENST00000531635:exon_15230229_15230326:ILVBL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	15483880	C/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000105127:ENST00000269701:exon_15483662_15484151:AKAP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	16259623	C/T	1	10	8	18	4.77485086370143	4.18011930903886	0.594731554662573	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.817886779949097	ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16259534_16259685:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16259534_16259685:HSH2D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	16263946	C/T	1	27	29	56	12.8920973319939	15.1529324952659	-2.26083516327199	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.593632895946727	ENSG00000196684:ENST00000253680:exon_16263853_16264018:HSH2D;ENSG00000196684:ENST00000397372:exon_16263362_16264018:HSH2D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	16337243	C/T	1	36	25	61	17.1894631093251	13.0628728407464	4.12659026857872	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.307564498275998	ENSG00000072958:ENST00000291439:exon_16337232_16337358:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000444449:exon_16337232_16337358:AP1M1;ENSG00000072958:ENST00000429941:exon_16337232_16337358:AP1M1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17163661	C/T	1	28	29	57	13.369582418364	15.1529324952659	-1.78335007690185	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.691560600888558	ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17163635_17163776:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17163635_17163776:HAUS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17170885	C/T	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000131351:ENST00000448593:exon_17170807_17170899:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000253669:exon_17170807_17170902:HAUS8;ENSG00000131351:ENST00000335009:exon_17170807_17170902:HAUS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17212992	C/T	1	15	13	28	7.16227629555214	6.79269387718814	0.369582418364003	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17212466_17213367:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17212466_17213367:MYO9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17305781	T/G	1	20	31	51	9.54970172740286	16.1979623225256	-6.64826059512271	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0687364425520171	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17305365_17306282:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17305365_17306282:MYO9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17312992	C/T	1	28	18	46	13.369582418364	9.40526844533743	3.96431397302658	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.301548248728239	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17312939_17313112:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17312939_17313112:MYO9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17316782	T/C	1	17	35	52	8.11724646829243	18.288021977045	-10.1707755087526	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0052268803064107	ENSG00000099331:ENST00000319396:exon_17316769_17316961:MYO9B;ENSG00000099331:ENST00000397274:exon_17316769_17316961:MYO9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17337555	C/A	1	20	16	36	9.54970172740286	8.36023861807771	1.18946310932515	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.740680249875467	ENSG00000099330:ENST00000215061:exon_17337502_17337678:OCEL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17389704	G/A	1	62	51	113	29.6040753549489	26.6482605951227	2.95581475982616	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.637975728344935	ENSG00000105393:ENST00000447614:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000359435:exon_17389654_17390162:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000300965:exon_17389654_17390144:C19orf62;ENSG00000105393:ENST00000442848:exon_17389654_17390144:C19orf62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17448961	A/C	0	0	9	9	0	4.70263422266871	-4.70263422266871	C	A	C	10	0.522514913629857	0.00129014434626878	ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17448817_17449064:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17448817_17449064:GTPBP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17450038	C/T	1	10	16	26	4.77485086370143	8.36023861807771	-3.58538775437628	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.173625446444081	ENSG00000130299:ENST00000358792:exon_17449763_17450075:GTPBP3;ENSG00000130299:ENST00000324894:exon_17449932_17450075:GTPBP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17534384	G/A	1	28	22	50	13.369582418364	11.4953280998569	1.87425431850715	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.6717582153441	ENSG00000141971:ENST00000528911:exon_17534307_17534426:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528604:exon_17534307_17534426:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000317040:exon_17534307_17534426:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000529939:exon_17534307_17534426:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528515:exon_17534307_17534426:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000524382:exon_17534307_17534426:FAM125A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17534545	C/T	1	22	22	44	10.5046719001431	11.4953280998569	-0.990656199713708	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.765635035115544	ENSG00000141971:ENST00000528911:exon_17534502_17534608:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528604:exon_17534502_17534608:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000317040:exon_17534502_17534608:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000392702:exon_17534502_17534608:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000529939:exon_17534502_17534608:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000528515:exon_17534502_17534608:FAM125A;ENSG00000141971:ENST00000524382:exon_17534502_17534608:FAM125A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17644434	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000352727:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000332386:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000449408:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000300971:exon_17644396_17644510:FAM129C;ENSG00000167483:ENST00000435646:exon_17644396_17644510:FAM129C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17664418	G/A	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000167483:ENST00000335393:exon_17664122_17664647:FAM129C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17837425	C/G	1	19	26	45	9.07221664103272	13.5853877543763	-4.51317111334357	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.183053170290474	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17837806	C/A	1	35	28	63	16.711978022955	14.630417581636	2.08156044131901	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.616440118046765	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17836638_17838981:MAP1S
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17844227	G/A	1	99	70	169	47.2710235506442	36.57604395409	10.6949795965542	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.105986379406587	ENSG00000130479:ENST00000324096:exon_17844002_17844237:MAP1S
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17886940	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17886792_17886970:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17886792_17886970:FCHO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17892591	A/G	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000130475:ENST00000389133:exon_17892521_17892629:FCHO1;ENSG00000130475:ENST00000252771:exon_17892521_17892629:FCHO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17949204	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	17949240	G/A	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.777144691375435	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18047283	T/G	1	201	168	369	95.9745023603987	87.782505489816	8.19199687058277	T:C:G	T	G	10	0.522514913629857	0.404710847104417	ENSG00000007080:ENST00000445755:exon_18047219_18047388:CCDC124;ENSG00000007080:ENST00000262801:exon_18047217_18047388:CCDC124
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18288498	G/C	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18288642	A/G	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.196092338065397	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18305824	C/T	1	33	20	53	15.7570078502147	10.4502982725971	5.30670957761758	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.169194891029909	ENSG00000254858:ENST00000417827:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000445735:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000533807:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000532896:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000254858:ENST00000247712:exon_18305768_18305896:AC068499.1;ENSG00000127226:ENST00000534474:exon_18305768_18305896:MPV17L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18420588	G/A	1	115	118	233	54.9107849325664	61.6567598083231	-6.74597487575669	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.394197489992814	ENSG00000130520:ENST00000252816:exon_18420488_18420671:LSM4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18499151	C/T	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000130513:ENST00000252809:exon_18499096_18499986:GDF15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18572422	G/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000105656:ENST00000262809:exon_18572388_18572662:ELL;ENSG00000105656:ENST00000392395:exon_18572388_18572662:ELL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	18679351	C/T	1	68	42	110	32.4689858731697	21.945626372454	10.5233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0454071843343434	ENSG00000105700:ENST00000222307:exon_18679212_18680176:C19orf50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	19021842	G/A	1	119	126	245	56.820725278047	65.836879117362	-9.01615383931497	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.250478700011154	ENSG00000105669:ENST00000349893:exon_19021780_19021880:COPE;ENSG00000105669:ENST00000262812:exon_19021780_19021880:COPE;ENSG00000105669:ENST00000351079:exon_19021780_19021880:COPE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	19135502	A/G	1	12	14	26	5.72982103644172	7.315208790818	-1.58538775437628	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.561396276598999	ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000456085:exon_19135428_19136265:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	19136299	T/C	1	22	10	32	10.5046719001431	5.22514913629857	5.27952276384458	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0760413454001893	ENSG00000064607:ENST00000337018:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000330854:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000452918:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000392342:exon_19135428_19137035:SUGP2;ENSG00000064607:ENST00000424153:exon_19135428_19137035:SUGP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	19416737	G/A	1	16	17	33	7.63976138192229	8.88275353170757	-1.24299214978528	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728920287854378	ENSG00000105705:ENST00000247001:exon_19416658_19416885:SUGP1;ENSG00000105705:ENST00000334782:exon_19416658_19416885:SUGP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	19735043	G/A	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000064547:ENST00000407877:exon_19734468_19735378:LPAR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	20003576	C/G	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000213988:ENST00000355650:exon_20002283_20004292:ZNF90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	20044041	G/T	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20043991_20045259:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	20045579	C/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000213988:ENST00000427325:exon_20045512_20045627:ZNF90;ENSG00000213988:ENST00000343769:exon_20043991_20045766:ZNF90
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	21300623	A/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	21300624	T/C	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000160352:ENST00000343332:exon_21299613_21301019:ZNF714;ENSG00000160352:ENST00000291770:exon_21299613_21307879:ZNF714
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	21688495	C/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21688437_21688576:ZNF429
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	21719401	T/C	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	21720616	T/C	1	6	17	23	2.86491051822086	8.88275353170757	-6.01784301348671	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0195640661198659	ENSG00000197013:ENST00000358491:exon_21719082_21721079:ZNF429
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	23543095	T/C	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	23545447	A/G	1	16	2	18	7.63976138192229	1.04502982725971	6.59473155466257	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00156342487777398	ENSG00000167232:ENST00000300619:exon_23540501_23545527:ZNF91;ENSG00000167232:ENST00000397082:exon_23540501_23545527:ZNF91
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	23837321	A/C	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	23837365	A/C	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000197372:ENST00000359788:exon_23835708_23837508:ZNF675;ENSG00000197372:ENST00000356096:exon_23837165_23837508:ZNF675
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	23926708	A/G	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	A:T:G	A	T	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000196172:ENST00000402377:exon_23921997_23928125:ZNF681;ENSG00000196172:ENST00000360204:exon_23921999_23928125:ZNF681
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	24310032	A/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000213096:ENST00000357002:exon_24309056_24312643:ZNF254
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	30165232	G/A	1	23	19	42	10.9821569865133	9.92778335896728	1.054373627546	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.760216182537127	ENSG00000166289:ENST00000299373:exon_30164731_30166364:PLEKHF1;ENSG00000166289:ENST00000436066:exon_30164731_30166364:PLEKHF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	30193721	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000131943:ENST00000323670:exon_30190483_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392276:exon_30192070_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392275:exon_30193248_30193884:C19orf12;ENSG00000131943:ENST00000392278:exon_30193310_30193884:C19orf12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	32873676	C/T	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000168813:ENST00000355898:exon_32873623_32878572:ZNF507;ENSG00000168813:ENST00000311921:exon_32873623_32878572:ZNF507
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33106621	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33106564_33106686:ANKRD27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33110204	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33110166_33110285:ANKRD27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33117657	C/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000105186:ENST00000306065:exon_33117618_33117733:ANKRD27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33372768	T/A	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33372750_33372919:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33372750_33372919:CCDC123
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33372814	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000121289:ENST00000305768:exon_33372750_33372919:CCDC123;ENSG00000121289:ENST00000449006:exon_33372750_33372919:CCDC123
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33605300	A/G	1	20	7	27	9.54970172740286	3.657604395409	5.89209733199386	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0322176896657176	ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33605159_33605325:GPATCH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	33608733	C/A	1	12	22	34	5.72982103644172	11.4953280998569	-5.76550706341514	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0582120250263391	ENSG00000076650:ENST00000170564:exon_33608731_33608947:GPATCH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	34706531	A/G	1	30	38	68	14.3245525911043	19.8555667179346	-5.53101412683028	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.184082616554756	ENSG00000105216:ENST00000324222:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000356258:exon_34706501_34706566:LSM14A;ENSG00000105216:ENST00000433627:exon_34706501_34706566:LSM14A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	34868642	A/G	1	286	260	546	136.560734701861	135.853877543763	0.706857158098074	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.965847117773124	ENSG00000105220:ENST00000415930:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000356487:exon_34868640_34868786:GPI;ENSG00000105220:ENST00000414931:exon_34868640_34868786:GPI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	34895649	C/T	1	34	17	51	16.2344929365849	8.88275353170757	7.35173940487729	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0488193183511068	ENSG00000126249:ENST00000246535:exon_34895554_34895720:PDCD2L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	35175340	C/T	1	14	5	19	6.684791209182	2.61257456814929	4.07221664103272	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0686149924897499	ENSG00000089335:ENST00000509528:exon_35175157_35175446:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505163:exon_35175157_35175369:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	35175749	C/G	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	35176256	G/A	1	10	2	12	4.77485086370143	1.04502982725971	3.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0408682426721573	ENSG00000089335:ENST00000457781:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000527499:exon_35175157_35177302:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505242:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000525595:exon_35175157_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000423823:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000221282:exon_35175157_35177296:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000446502:exon_35175157_35177237:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000505365:exon_35175098_35177297:ZNF302;ENSG00000089335:ENST00000509196:exon_35175157_35177296:ZNF302
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	35233027	C/T	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000197841:ENST00000392232:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000448715:exon_35231516_35233777:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000425140:exon_35231516_35233774:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000492450:exon_35231516_35233091:ZNF181;ENSG00000197841:ENST00000459757:exon_35231516_35233091:ZNF181
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	35510102	G/C	1	79	84	163	37.7213218232413	43.891252744908	-6.16993092166669	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.347385008752221	ENSG00000253950:ENST00000511557:exon_35510095_35510213:GRAMD1A;ENSG00000253950:ENST00000504615:exon_35510095_35510213:GRAMD1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36206050	A/C	1	136	143	279	64.9379717463394	74.7196326490696	-9.78166090273011	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.254948162561416	ENSG00000011590:ENST00000262630:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000481182:exon_36205425_36206409:ZBTB32;ENSG00000011590:ENST00000392197:exon_36205529_36206409:ZBTB32
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36207336	G/C	1	19	18	37	9.07221664103272	9.40526844533743	-0.333051804304711	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36230767	A/G	1	79	48	127	37.7213218232413	25.0807158542331	12.6406059690082	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0262667090607613	ENSG00000126246:ENST00000246532:exon_36230611_36230989:TMEM149
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36430798	A/G	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000126243:ENST00000246529:exon_36430312_36431742:LRFN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36486509	C/G	1	20	9	29	9.54970172740286	4.70263422266871	4.84706750473415	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0931652197105856	ENSG00000205138:ENST00000378887:exon_36486101_36487213:SDHAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36594659	A/T	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000075702:ENST00000270301:exon_36594245_36594883:WDR62;ENSG00000075702:ENST00000401500:exon_36594245_36594883:WDR62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36605647	T/C	1	4	11	15	1.90994034548057	5.74766404992843	-3.83772370444786	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.067798617844541	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	36853018	T/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000142065:ENST00000333201:exon_36853014_36853140:ZFP14;ENSG00000142065:ENST00000270001:exon_36853014_36853140:ZFP14;ENSG00000142065:ENST00000392172:exon_36853014_36853140:ZFP14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	38798086	T/C	1	75	74	149	35.8113814777607	38.6661036086094	-2.85472213084869	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.681984601148517	ENSG00000167645:ENST00000339413:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000329420:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000392124:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000404021:exon_38798068_38798161:YIF1B;ENSG00000167645:ENST00000337679:exon_38798068_38798161:YIF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	38899548	G/A	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000130244:ENST00000343358:exon_38899391_38899728:FAM98C;ENSG00000130244:ENST00000252530:exon_38899391_38899728:FAM98C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39191323	C/T	1	28	17	45	13.369582418364	8.88275353170757	4.48682888665643	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.232221183098811	ENSG00000130402:ENST00000252699:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000445727:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000424234:exon_39191240_39191344:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000456597:exon_39191240_39191354:ACTN4;ENSG00000130402:ENST00000495553:exon_39191240_39191354:ACTN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39306509	G/A	1	1052	891	1943	502.31431086139	465.560788044203	36.7535228171878	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0973576672648705	ENSG00000104823:ENST00000221418:exon_39306497_39306647:ECH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39416898	G/A	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000104835:ENST00000448145:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000221431:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000430193:exon_39416845_39416940:FBXO17;ENSG00000104835:ENST00000455102:exon_39416845_39416940:FBXO17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39423001	T/C	1	130	140	270	62.0730612281186	73.15208790818	-11.0790266800614	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.180608984376697	ENSG00000128626:ENST00000308018:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000402029:exon_39422973_39423657:MRPS12;ENSG00000128626:ENST00000407800:exon_39422973_39423657:MRPS12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39898667	C/T	1	74	90	164	35.3338963913906	47.0263422266871	-11.6924458352966	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0722135673271873	ENSG00000128016:ENST00000248673:exon_39898383_39900013:ZFP36
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39914247	C/A	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000090924:ENST00000409794:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000425673:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000458508:exon_39913372_39914293:PLEKHG2;ENSG00000090924:ENST00000205135:exon_39913372_39914293:PLEKHG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39923952	G/A	1	4179	3756	7935	1995.41017594083	1962.56601559374	32.8441603470844	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.46513085987258	ENSG00000105193:ENST00000251453:exon_39923852_39924058:RPS16;ENSG00000105193:ENST00000339471:exon_39923852_39924058:RPS16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	39964744	G/T	1	116	122	238	55.3882700189366	63.7468194628426	-8.35854944390597	T:C:G	G	T	10	0.522514913629857	0.299238367834164	ENSG00000196235:ENST00000402194:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000432763:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000439225:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000378524:exon_39964603_39964761:SUPT5H;ENSG00000196235:ENST00000359191:exon_39964603_39964761:SUPT5H
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	40197267	G/A	1	20	1	21	9.54970172740286	0.522514913629857	9.027186813773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	2.86232933121954e-05	ENSG00000006659:ENST00000392052:exon_40197237_40197313:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000360675:exon_40197237_40197313:LGALS14;ENSG00000006659:ENST00000392051:exon_40197237_40197313:LGALS14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	40719076	T/C	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130758:ENST00000253055:exon_40718983_40719095:MAP3K10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41129842	C/T	0	0	13	13	0	6.79269387718814	-6.79269387718814	T	C	T	10	0.522514913629857	6.70621618656986e-05	ENSG00000090006:ENST00000204005:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000308370:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000396819:exon_41129841_41129987:LTBP4;ENSG00000090006:ENST00000243562:exon_41129841_41129987:LTBP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41211056	T/C	0	28	0	28	13.369582418364	0	13.369582418364	T	T		10	0.522514913629857	1.38121992236644e-08	ENSG00000123815:ENST00000324464:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000243583:exon_41211001_41211086:ADCK4;ENSG00000123815:ENST00000450541:exon_41211001_41211086:ADCK4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41785020	A/G	1	36	40	76	17.1894631093251	20.9005965451943	-3.71113343586914	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.422609090970085	ENSG00000105323:ENST00000352456:exon_41784982_41785081:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000392006:exon_41784982_41785081:HNRNPUL1;ENSG00000105323:ENST00000263367:exon_41784982_41785081:HNRNPUL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41822617	C/T	1	13	15	28	6.20730612281186	7.83772370444786	-1.630417581636	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.574469279427906	ENSG00000142039:ENST00000269967:exon_41822289_41822744:CCDC97
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41916547	C/T	1	34	37	71	16.2344929365849	19.3330518043047	-3.09855886771985	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.478043278042488	ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41916542_41916721:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41916542_41916721:BCKDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41925140	C/T	1	67	46	113	31.9915007867996	24.0356860269734	7.95581475982616	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.157511633684294	ENSG00000248098:ENST00000269980:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000378196:exon_41925040_41925201:BCKDHA;ENSG00000248098:ENST00000457836:exon_41925040_41925201:BCKDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41939248	C/T	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41939177_41939339:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41939177_41939339:ATP5SL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	41944237	T/C	1	14	23	37	6.684791209182	12.0178430134867	-5.33305180430471	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.09901901360081	ENSG00000105341:ENST00000221943:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000417807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000438807:exon_41944123_41944319:ATP5SL;ENSG00000105341:ENST00000301183:exon_41944123_41944319:ATP5SL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42083849	C/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000426865:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42083552_42083911:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42083552_42083911:CEACAM21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42085873	A/G	1	3	11	14	1.43245525911043	5.74766404992843	-4.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0294388955576132	ENSG00000007129:ENST00000407170:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000482870:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000457737:exon_42085623_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000187608:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000401445:exon_42085706_42085981:CEACAM21;ENSG00000007129:ENST00000419449:exon_42085666_42085981:CEACAM21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42392310	C/T	1	41	40	81	19.5768885411759	20.9005965451943	-1.32370800401842	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.824236908694243	ENSG00000076928:ENST00000391981:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000347545:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000354532:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000316079:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000337665:exon_42392263_42392349:ARHGEF1;ENSG00000076928:ENST00000378152:exon_42392263_42392349:ARHGEF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42463447	C/T	1	94	95	189	44.8835981187934	49.6389167948364	-4.75531867604298	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.512595163878204	ENSG00000105404:ENST00000222008:exon_42463389_42463528:RABAC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42585344	C/T	1	26	29	55	12.4146122456237	15.1529324952659	-2.73832024964214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.501023437814489	ENSG00000105732:ENST00000222339:exon_42582739_42585717:ZNF574;ENSG00000105732:ENST00000359044:exon_42582739_42585717:ZNF574
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42719311	T/C	1	12	4	16	5.72982103644172	2.09005965451943	3.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.081547579265419	ENSG00000160570:ENST00000403271:exon_42719300_42719404:DEDD2;ENSG00000160570:ENST00000336034:exon_42719285_42719404:DEDD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42753649	G/C	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105722:ENST00000222329:exon_42751717_42753890:ERF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42906914	G/T	1	11	19	30	5.25233595007157	9.92778335896728	-4.67544740889571	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.100762715434031	ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42906759_42907183:LIPE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42910497	G/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42910313_42910540:LIPE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	42911558	C/T	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000079435:ENST00000244289:exon_42911326_42911620:LIPE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44031324	C/T	1	20	28	48	9.54970172740286	14.630417581636	-5.08071585423314	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.150627590600217	ENSG00000105755:ENST00000292147:exon_44031249_44031396:ETHE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44057227	T/C	1	29	47	76	13.8470675047341	24.5582009406033	-10.7111334358691	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0156012564491708	ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057134_44057243:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057134_44057243:XRCC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44057574	G/A	1	42	26	68	20.054373627546	13.5853877543763	6.46898587316972	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.144663134341392	ENSG00000073050:ENST00000262887:exon_44057553_44057664:XRCC1;ENSG00000073050:ENST00000458471:exon_44057553_44057664:XRCC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44237843	C/T	1	43	11	54	20.5318587139161	5.74766404992843	14.7841946639877	T:C	C	T	10	0.522514913629857	5.15605092600189e-05	ENSG00000105771:ENST00000270066:exon_44237778_44237885:C19orf61
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44418621	C/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000124459:ENST00000269973:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000418980:exon_44416783_44419352:ZNF45;ENSG00000124459:ENST00000328762:exon_44418268_44419352:ZNF45
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44501205	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000204920:ENST00000270014:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000407951:exon_44500245_44502477:ZNF155;ENSG00000204920:ENST00000425747:exon_44500245_44502477:ZNF155
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44514875	A/G	1	11	8	19	5.25233595007157	4.18011930903886	1.07221664103272	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.653984881903285	ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44515352	T/G	1	13	5	18	6.20730612281186	2.61257456814929	3.59473155466257	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.102283233688192	ENSG00000159882:ENST00000421176:exon_44515341_44515400:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44515514	C/A	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000159882:ENST00000391961:exon_44514421_44518072:ZNF230;ENSG00000159882:ENST00000429154:exon_44514421_44518072:ZNF230
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44611066	T/C	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44611162	G/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44612005	A/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44612014	A/T	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44612231	A/G	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000186019:ENST00000336976:exon_44610549_44612477:ZNF224
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44680489	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44681141	A/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000167380:ENST00000337433:exon_44679651_44681836:ZNF226;ENSG00000167380:ENST00000454662:exon_44679651_44681836:ZNF226
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44740602	G/A	1	21	21	42	10.027186813773	10.972813186227	-0.945626372453994	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.877494826627993	ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44740716	G/A	1	11	18	29	5.25233595007157	9.40526844533743	-4.15293249526585	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.138811383638839	ENSG00000131115:ENST00000313040:exon_44738855_44741420:ZNF227;ENSG00000131115:ENST00000377916:exon_44740382_44741299:ZNF227
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	44981525	G/A	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000167384:ENST00000221327:exon_44979861_44982363:ZNF180;ENSG00000167384:ENST00000391956:exon_44979861_44982363:ZNF180
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45395714	T/C	1	32	43	75	15.2795227638446	22.4681412860839	-7.18861852223928	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.105873305013885	ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45395650_45395717:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45395650_45395717:TOMM40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45396144	C/T	1	28	46	74	13.369582418364	24.0356860269734	-10.6661036086094	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0143203525842595	ENSG00000130204:ENST00000252487:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000405636:exon_45396094_45396186:TOMM40;ENSG00000130204:ENST00000426677:exon_45396094_45396186:TOMM40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45490570	A/G	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45490437_45490681:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45490437_45490681:CLPTM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45495915	C/T	1	62	46	108	29.6040753549489	24.0356860269734	5.56838932797544	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.291079171765706	ENSG00000104853:ENST00000337392:exon_45495869_45496598:CLPTM1;ENSG00000104853:ENST00000347493:exon_45495869_45496113:CLPTM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45561032	C/A	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000104859:ENST00000221455:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391953:exon_45561008_45561156:CLASRP;ENSG00000104859:ENST00000391952:exon_45561008_45561156:CLASRP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45575306	G/A	1	41	24	65	19.5768885411759	12.5403579271166	7.03653061405929	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0834084334462806	ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45575762	G/A	1	28	34	62	13.369582418364	17.7655070634151	-4.39592464505114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.309246692623646	ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45574759_45575838:ZNF296
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45579515	G/T	1	16	39	55	7.63976138192229	20.3780816315644	-12.7383202496421	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00063216683326932	ENSG00000170684:ENST00000303809:exon_45579334_45579688:ZNF296
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45668213	C/G	1	113	91	204	53.9558147598262	47.548857140317	6.40695761950916	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.400448250881608	ENSG00000007255:ENST00000006275:exon_45668111_45668228:TRAPPC6A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	45912736	C/A	1	20	27	47	9.54970172740286	14.1079026680061	-4.55820094060328	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.191764674194505	ENSG00000117877:ENST00000309424:exon_45911391_45914024:CD3EAP;ENSG00000117877:ENST00000423698:exon_45911391_45914024:CD3EAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	46387860	C/T	1	20	20	40	9.54970172740286	10.4502982725971	-0.900596545194283	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.87453706107043	ENSG00000170604:ENST00000302165:exon_46386866_46389376:IRF2BP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	46511421	C/T	1	12	16	28	5.72982103644172	8.36023861807771	-2.630417581636	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348683057297521	ENSG00000104983:ENST00000263284:exon_46511398_46511559:CCDC61
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	46850394	C/A	1	14	11	25	6.684791209182	5.74766404992843	0.937127159253575	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.841937402628968	ENSG00000011485:ENST00000012443:exon_46850251_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000451918:exon_46850354_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000478046:exon_46850358_46850474:PPP5C;ENSG00000011485:ENST00000391919:exon_46850365_46850474:PPP5C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	47124579	C/T	1	22	16	38	10.5046719001431	8.36023861807771	2.14443328206543	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51961273920649	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	47124742	G/C	1	28	13	41	13.369582418364	6.79269387718814	6.57688854117586	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0425422333230643	ENSG00000160013:ENST00000291294:exon_47123726_47124929:PTGIR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	47240145	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000090372:ENST00000391910:exon_47240080_47240158:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000263280:exon_47240080_47240158:STRN4;ENSG00000090372:ENST00000435164:exon_47240080_47240158:STRN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	47282162	G/A	1	40	45	85	19.0994034548057	23.5131711133436	-4.41376765853785	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.385235665829713	ENSG00000105281:ENST00000434726:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000412532:exon_47281932_47282165:SLC1A5;ENSG00000105281:ENST00000306894:exon_47281932_47282165:SLC1A5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	47979915	G/A	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000118162:ENST00000338134:exon_47979789_47979971:KPTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48558159	G/A	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000105499:ENST00000354276:exon_48558135_48558306:PLA2G4C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48622427	A/G	1	22	25	47	10.5046719001431	13.0628728407464	-2.55820094060328	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.469100801465948	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48622394_48622447:LIG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48626218	G/A	1	27	38	65	12.8920973319939	19.8555667179346	-6.96346938594071	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.105793813730485	ENSG00000105486:ENST00000263274:exon_48626191_48626273:LIG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48725062	C/T	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000105483:ENST00000517510:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000359009:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518622:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000518979:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520753:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522773:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520153:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000391898:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000447740:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000357778:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000522051:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519646:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000520015:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521613:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000521415:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519940:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523579:exon_48724987_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000519302:exon_48724983_48725112:CARD8;ENSG00000105483:ENST00000523668:exon_48724987_48725112:CARD8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48977189	C/T	1	18	15	33	8.59473155466257	7.83772370444786	0.757007850214718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.862585582158515	ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48976979_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977162_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48975978_48977274:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000474209:exon_48977162_48977266:CYTH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48977461	C/T	1	20	25	45	9.54970172740286	13.0628728407464	-3.51317111334357	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.300929714364236	ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48977439_48977532:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48977439_48977587:CYTH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	48977479	C/T	1	16	20	36	7.63976138192229	10.4502982725971	-2.81053689067485	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.405308064754224	ENSG00000105443:ENST00000452733:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000427476:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000460595:exon_48977439_48977532:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000391881:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000493260:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000325139:exon_48977439_48977587:CYTH2;ENSG00000105443:ENST00000467412:exon_48977439_48977587:CYTH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49377873	G/A	1	279	208	487	133.21833909727	108.68310203501	24.5352370622596	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0262625610840417	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49377918	G/T	1	257	231	488	122.713667197127	120.700945048497	2.01272214862976	A:T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.891885476325075	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49376482_49378155:PPP1R15A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49378994	A/G	1	177	163	340	84.5148602875153	85.1699309216667	-0.655070634151386	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.956742924421689	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49379167	C/T	1	171	136	307	81.6499497692945	71.0620282536606	10.5879215156339	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.230726360026058	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49379182	G/C	1	161	101	262	76.875098905593	52.7740062766156	24.1010926289775	A:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.00294860304626549	ENSG00000087074:ENST00000200453:exon_49378871_49379318:PPP1R15A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49459098	C/T	1	6	15	21	2.86491051822086	7.83772370444786	-4.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0466589274762732	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49469087	T/C	1	827	1158	1985	394.880166428108	605.072269983374	-210.192103555266	T:C	T	C	10	0.522514913629857	3.47938318878379e-21	ENSG00000087086:ENST00000331825:exon_49469027_49469173:FTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49472833	C/T	1	53	47	100	25.3067095776176	24.5582009406033	0.748508637014297	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.920448323261315	ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49471382_49472868:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49471387_49472868:GYS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49485548	G/A	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000104812:ENST00000323798:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000263276:exon_49485512_49485632:GYS1;ENSG00000104812:ENST00000484289:exon_49485512_49485632:GYS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49497155	A/G	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.744904237668794	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49507542	A/G	1	32	27	59	15.2795227638446	14.1079026680061	1.17162009583843	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.795465138198561	ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49507534_49507675:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49507534_49507675:RUVBL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49513273	C/T	1	202	149	351	96.4519874467689	77.8547221308487	18.5972653159202	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0480958601914895	ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49513317	C/T	1	193	136	329	92.1546216694376	71.0620282536606	21.092593415777	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0204317972396181	ENSG00000183207:ENST00000221413:exon_49513230_49513323:RUVBL2;ENSG00000183207:ENST00000413176:exon_49513230_49513428:RUVBL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49949652	G/A	1	36	29	65	17.1894631093251	15.1529324952659	2.03653061405929	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.622287214558578	ENSG00000104872:ENST00000262265:exon_49949556_49949680:PIH1D1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49965173	A/T	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49965141_49965293:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000433981:exon_49964876_49965225:ALDH16A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49967680	G/A	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967674_49967779:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967674_49967779:ALDH16A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49967981	T/G	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49967889_49968019:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49967889_49968019:ALDH16A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49969085	C/T	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000161618:ENST00000293350:exon_49968995_49969162:ALDH16A1;ENSG00000161618:ENST00000455361:exon_49968995_49969162:ALDH16A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49977929	A/G	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000090554:ENST00000204637:exon_49977860_49977929:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000344019:exon_49977860_49977929:FLT3LG;ENSG00000090554:ENST00000436815:exon_49977860_49977929:FLT3LG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49994470	T/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	49994476	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000142541:ENST00000488946:exon_49993107_49994804:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000472481:exon_49994036_49994485:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476268:exon_49993104_49994523:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000468655:exon_49994297_49994483:RPL13A;ENSG00000142541:ENST00000476300:exon_49994297_49994804:RPL13A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50102651	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000126464:ENST00000418929:exon_50102529_50103195:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000314734:exon_50102529_50103195:PRR12;ENSG00000126464:ENST00000246798:exon_50102529_50103195:PRR12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50170313	C/T	1	61	56	117	29.1265902685787	29.260835163272	-0.134244894693271	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000126453:ENST00000441864:exon_50170279_50170418:BCL2L12;ENSG00000126453:ENST00000246785:exon_50170276_50170418:BCL2L12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50310605	C/A	1	22	14	36	10.5046719001431	7.315208790818	3.18946310932515	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.319689840113896	ENSG00000010361:ENST00000525130:exon_50310126_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000528094:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000533418:exon_50310147_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000529634:exon_50310564_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000525370:exon_50310150_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000313777:exon_50310154_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000377092:exon_50310177_50310631:FUZ;ENSG00000010361:ENST00000445575:exon_50310562_50310631:FUZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50333815	G/A	1	22	13	35	10.5046719001431	6.79269387718814	3.711978022955	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.238241131396320	ENSG00000104973:ENST00000355584:exon_50333768_50333855:MED25;ENSG00000104973:ENST00000377077:exon_50333768_50333855:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312881:exon_50333768_50333855:MED25;ENSG00000104973:ENST00000456294:exon_50333768_50333859:MED25;ENSG00000104973:ENST00000312865:exon_50333768_50333855:MED25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50358133	T/G	1	71	69	140	33.9014411322801	36.0535290404601	-2.15208790817999	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.735578900606044	ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50358088_50358145:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50358088_50358145:PTOV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50361856	C/T	1	86	91	177	41.0637174278323	47.548857140317	-6.4851397124847	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.329381864511785	ENSG00000104960:ENST00000221557:exon_50361806_50361910:PTOV1;ENSG00000104960:ENST00000391842:exon_50361806_50361910:PTOV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50412309	C/G	1	59	72	131	28.1716200958384	37.6210737813497	-9.44945368551127	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.115093754607324	ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50412417	G/A	1	64	59	123	30.5590455276892	30.8283799041616	-0.269334376472415	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50412516	C/T	1	38	52	90	18.1444332820654	27.1707755087526	-9.02634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.058196127690078	ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50412650	C/T	1	47	65	112	22.4417990593967	33.9634693859407	-11.521670326544	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0298432346205536	ENSG00000213024:ENST00000352066:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000443569:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000422090:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000413454:exon_50410086_50413141:NUP62;ENSG00000213024:ENST00000391824:exon_50411363_50413141:NUP62
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50482480	C/T	1	25	23	48	11.9371271592536	12.0178430134867	-0.0807158542331372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50482340_50482499:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50482340_50482499:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50491733	G/A	1	23	11	34	10.9821569865133	5.74766404992843	5.23449293658486	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0858395683032324	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50491629_50491749:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50491735	T/C	1	23	13	36	10.9821569865133	6.79269387718814	4.18946310932515	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.183700533925650	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50491629_50491749:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50491629_50491749:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50498078	C/T	1	18	16	34	8.59473155466257	8.36023861807771	0.234492936584861	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50498071_50498176:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50498138	G/A	1	12	9	21	5.72982103644172	4.70263422266871	1.027186813773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.670382560246413	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50498071_50498176:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50498071_50498176:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50504056	T/C	1	17	7	24	8.11724646829243	3.657604395409	4.45964207288343	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.100163552529794	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50504047_50504111:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50504097	T/C	1	39	26	65	18.6219183684356	13.5853877543763	5.03653061405929	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.217247896648022	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50504047_50504111:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50504047_50504111:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50510862	A/G	1	49	29	78	23.396769232137	15.1529324952659	8.24383673687115	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0695332597791519	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50510826_50511083:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50511060	G/T	1	37	33	70	17.6669481956953	17.2429921497853	0.42395604591001	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000377011:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50510826_50511083:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50510826_50511083:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50512606	G/A	1	31	30	61	14.8020376774744	15.6754474088957	-0.873409731421278	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.898190864437643	ENSG00000105053:ENST00000316763:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000443401:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000457289:exon_50512493_50512642:VRK3;ENSG00000105053:ENST00000424804:exon_50512493_50512642:VRK3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50548626	A/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50548544_50548750:ZNF473
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50549661	C/T	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549627_50549729:ZNF473
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50549684	T/G	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549627_50549729:ZNF473
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50550127	A/G	1	11	2	13	5.25233595007157	1.04502982725971	4.20730612281186	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0241685145321443	ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000445728:exon_50549814_50550214:ZNF473
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50550256	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000142528:ENST00000270617:exon_50547927_50552029:ZNF473;ENSG00000142528:ENST00000391821:exon_50547927_50552029:ZNF473
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50865535	A/G	0	9	0	9	4.29736577733129	0	4.29736577733129	A	A		10	0.522514913629857	0.00419341962025637	ENSG00000131400:ENST00000253719:exon_50865429_50865570:NAPSA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50881882	C/T	1	49	47	96	23.396769232137	24.5582009406033	-1.16143170846627	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.83855876485376	ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50881779_50882053:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50881779_50882053:NR1H2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50885823	G/A	1	92	81	173	43.9286279460532	42.3237080040184	1.60491994203473	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.819836703716192	ENSG00000131408:ENST00000253727:exon_50885713_50886266:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000411902:exon_50885713_50886218:NR1H2;ENSG00000131408:ENST00000376942:exon_50885713_50885859:NR1H2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50905042	G/A	1	1	7	8	0.477485086370143	3.657604395409	-3.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0319124571059794	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50905074	G/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905035_50905181:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905035_50905181:POLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50905762	T/C	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50905711_50905792:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50905711_50905792:POLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	50910610	C/T	1	12	18	30	5.72982103644172	9.40526844533743	-3.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.202983319347204	ENSG00000062822:ENST00000440232:exon_50910584_50910672:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000376930:exon_50910584_50910672:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000391817:exon_50910584_50910672:POLD1;ENSG00000062822:ENST00000262266:exon_50910584_50910672:POLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	51301449	C/T	1	239	134	373	114.118935642464	70.0169984264008	44.1019372160633	T:C	C	T	10	0.522514913629857	4.64983582444922e-06	ENSG00000167747:ENST00000391812:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000345523:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000391811:exon_51300962_51302215:C19orf48;ENSG00000167747:ENST00000418173:exon_51300962_51302215:C19orf48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	51869563	C/G	1	100	92	192	47.7485086370143	48.0713720539468	-0.322863416932549	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105379:ENST00000309244:exon_51869524_51869672:ETFB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	52793328	G/A	1	1	7	8	0.477485086370143	3.657604395409	-3.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0319124571059794	ENSG00000196214:ENST00000439461:exon_52793319_52795976:ZNF766;ENSG00000196214:ENST00000359102:exon_52793319_52795976:ZNF766
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	52887904	T/C	0	0	17	17	0	8.88275353170757	-8.88275353170757	C	T	C	10	0.522514913629857	3.48591501959288e-06	ENSG00000221923:ENST00000422689:exon_52887102_52889044:ZNF880
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	53270346	A/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000189190:ENST00000338230:exon_53267471_53271025:ZNF600
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	53384197	A/G	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182986:ENST00000331416:exon_53379425_53385236:ZNF320;ENSG00000182986:ENST00000391781:exon_53383849_53385236:ZNF320
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	53453315	C/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000180257:ENST00000357666:exon_53452634_53454837:ZNF816;ENSG00000180257:ENST00000444460:exon_53452634_53454837:ZNF816
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	53571290	A/G	1	5	11	16	2.38742543185071	5.74766404992843	-3.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.131589504447199	ENSG00000170949:ENST00000429604:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000270457:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000418871:exon_53569867_53573515:ZNF160;ENSG00000170949:ENST00000391777:exon_53569867_53573515:ZNF160
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54080780	C/T	0	0	9	9	0	4.70263422266871	-4.70263422266871	T	C	T	10	0.522514913629857	0.00129014434626878	ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513265:exon_54080698_54080944:ZNF331
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54080999	A/G	1	3	27	30	1.43245525911043	14.1079026680061	-12.6754474088957	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1.47264343978368e-06	ENSG00000130844:ENST00000253144:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511593:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000449416:exon_54079951_54083523:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000411977:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000511154:exon_54079951_54081640:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000513999:exon_54079951_54081335:ZNF331;ENSG00000130844:ENST00000512387:exon_54079951_54081643:ZNF331
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54376927	C/T	1	2	17	19	0.954970172740286	8.88275353170757	-7.92778335896728	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.000260939331468744	ENSG00000179820:ENST00000421337:exon_54376782_54377510:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000336967:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391770:exon_54376782_54379691:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000448420:exon_54376782_54377348:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000439000:exon_54376782_54377561:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391771:exon_54376782_54379682:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391769:exon_54376782_54379689:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000391768:exon_54376782_54377873:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000414489:exon_54376782_54377223:MYADM;ENSG00000179820:ENST00000415619:exon_54376784_54377098:MYADM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54625258	C/T	1	69	73	142	32.9464709595399	38.1435886949796	-5.1971177354397	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.401511800860327	ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445811:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000445124:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000447810:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54625239_54625322:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000498612:exon_54625239_54625322:PRPF31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54634779	G/A	1	53	96	149	25.3067095776176	50.1614317084663	-24.8547221308487	A:G	G	A	10	0.522514913629857	5.11418855772154e-05	ENSG00000105618:ENST00000321030:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000263436:exon_54634769_54634867:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000419967:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000391755:exon_54634738_54635140:PRPF31;ENSG00000105618:ENST00000466404:exon_54634738_54635140:PRPF31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54711258	T/G	1	42	44	86	20.054373627546	22.9906561997137	-2.9362825721677	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.589670956911801	ENSG00000170889:ENST00000402367:exon_54710421_54711515:RPS9;ENSG00000170889:ENST00000441429:exon_54710144_54711498:RPS9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54848684	G/A	0	0	39	39	0	20.3780816315644	-20.3780816315644	A	G	A	10	0.522514913629857	3.0160091076917e-13	ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54848671_54848967:LILRA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54849463	C/T	0	23	0	23	10.9821569865133	0	10.9821569865133	C	C		10	0.522514913629857	3.69611191996786e-07	ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54849207_54849506:LILRA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54849481	T/G	0	24	0	24	11.4596420728834	0	11.4596420728834	T	T		10	0.522514913629857	1.91267090220593e-07	ENSG00000239961:ENST00000291759:exon_54849207_54849506:LILRA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	54973280	C/G	1	38	27	65	18.1444332820654	14.1079026680061	4.03653061405929	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.323988584301356	ENSG00000182909:ENST00000333834:exon_54972981_54974894:LENG9;ENSG00000182909:ENST00000426748:exon_54973270_54974709:LENG9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55085327	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000239998:ENST00000439534:exon_55085165_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251377:exon_55085298_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391738:exon_55085257_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000251376:exon_55085259_55085379:LILRA2;ENSG00000239998:ENST00000391737:exon_55085308_55085379:LILRA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55143491	G/T	1	56	86	142	26.739164836728	44.9362825721677	-18.1971177354397	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00241662248104115	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143386_55143688:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000480257:exon_55143386_55143506:LILRB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55143982	T/C	1	21	31	52	10.027186813773	16.1979623225256	-6.17077550875257	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0961842536394302	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55143915_55144211:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55143915_55144211:LILRB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55144556	G/A	1	37	71	108	17.6669481956953	37.0985588677199	-19.4316106720246	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000219532747770422	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55144467_55144769:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55144467_55144769:LILRB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55145093	G/C	1	40	48	88	19.0994034548057	25.0807158542331	-5.98131239942742	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.240310527385028	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000473412:exon_55145089_55145139:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55145089_55145139:LILRB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55148331	C/T	1	129	74	203	61.5955761417484	38.6661036086094	22.929472533139	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00150616573663398	ENSG00000104972:ENST00000396321:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000448689:exon_55148183_55148470:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396331:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396327:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000434867:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000451426:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000324602:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396332:exon_55148183_55148979:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000427581:exon_55148183_55148641:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396317:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000396315:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000421584:exon_55148183_55148527:LILRB1;ENSG00000104972:ENST00000462628:exon_55148183_55148979:LILRB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55175009	G/T	1	44	21	65	21.0093438002863	10.972813186227	10.0365306140593	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0129534026639321	ENSG00000186818:ENST00000420271:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55174990_55175025:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55174990_55175025:LILRB4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55175740	C/T	1	69	45	114	32.9464709595399	23.5131711133436	9.4332998461963	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0910792760254955	ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55175928	T/C	1	19	22	41	9.07221664103272	11.4953280998569	-2.42311145882414	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.532349662611635	ENSG00000186818:ENST00000391736:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000494796:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000270452:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391735:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000430952:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391734:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000391733:exon_55175637_55175936:LILRB4;ENSG00000186818:ENST00000434286:exon_55175637_55175936:LILRB4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55560054	C/T	1	10	2	12	4.77485086370143	1.04502982725971	3.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0408682426721573	ENSG00000160439:ENST00000415061:exon_55560027_55560131:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000396247:exon_55560027_55560131:RDH13;ENSG00000160439:ENST00000291892:exon_55560027_55560131:RDH13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55614923	T/C	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55614777_55614936:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55614777_55614936:PPP1R12C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55624113	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000125503:ENST00000438407:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000376393:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000435544:exon_55624033_55624163:PPP1R12C;ENSG00000125503:ENST00000263433:exon_55624033_55624163:PPP1R12C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55739605	C/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000180089:ENST00000327042:exon_55739559_55739805:TMEM86B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55967848	C/T	1	60	70	130	28.6491051822086	36.57604395409	-7.92693877188141	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.187682881636001	ENSG00000063241:ENST00000438389:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000085068:exon_55967716_55967856:ISOC2;ENSG00000063241:ENST00000425675:exon_55967716_55967856:ISOC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55994240	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000197483:ENST00000391718:exon_55992568_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000448160:exon_55992569_55995854:ZNF628;ENSG00000197483:ENST00000357202:exon_55992568_55995854:ZNF628
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55998262	C/T	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	55998330	A/G	1	23	13	36	10.9821569865133	6.79269387718814	4.18946310932515	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.183700533925650	ENSG00000090971:ENST00000205194:exon_55997775_55998935:NAT14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	56090493	A/C	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000218891:ENST00000325421:exon_56088893_56091007:ZNF579
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	56114045	C/T	0	41	0	41	19.5768885411759	0	19.5768885411759	C	C		10	0.522514913629857	2.83599933431931e-12	ENSG00000171443:ENST00000301073:exon_56113441_56114504:ZNF524
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	56156447	A/G	1	86	92	178	41.0637174278323	48.0713720539468	-7.00765462611455	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.294745937698911	ENSG00000171425:ENST00000270451:exon_56155919_56156988:ZNF581
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	56180968	C/T	1	102	102	204	48.7034788097546	53.2965211902454	-4.59304238049083	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.528901025396215	ENSG00000063244:ENST00000450554:exon_56180810_56181058:U2AF2;ENSG00000063244:ENST00000308924:exon_56180810_56181058:U2AF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58018618	A/G	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000152439:ENST00000282292:exon_58017726_58019508:ZNF773;ENSG00000152439:ENST00000430084:exon_58017726_58019508:ZNF773
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58131715	A/G	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58132216	A/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000213762:ENST00000396161:exon_58131528_58134372:ZNF134
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58371175	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000198466:ENST00000423137:exon_58369944_58371578:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000339656:exon_58369944_58376485:ZNF587;ENSG00000198466:ENST00000419854:exon_58369944_58375409:ZNF587
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58596701	G/T	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000176293:ENST00000515535:exon_58595587_58597677:ZNF135;ENSG00000121413:ENST00000240727:exon_58595210_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000433686:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000402070:exon_58595212_58596746:ZSCAN18;ENSG00000121413:ENST00000421612:exon_58595212_58596743:ZSCAN18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58774071	A/G	1	28	20	48	13.369582418364	10.4502982725971	2.91928414576686	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.470603457629073	ENSG00000198131:ENST00000269829:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000415203:exon_58772217_58775010:ZNF544;ENSG00000198131:ENST00000441758:exon_58773743_58774120:ZNF544
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58858814	G/A	1	49	60	109	23.396769232137	31.3508948177914	-7.95412558565441	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.150053827416886	ENSG00000121410:ENST00000263100:exon_58858719_58859006:A1BG;ENSG00000121410:ENST00000453054:exon_58858719_58859006:A1BG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	58929200	A/C	0	10	0	10	4.77485086370143	0	4.77485086370143	A	A		10	0.522514913629857	0.00213302931363942	ENSG00000171574:ENST00000306910:exon_58928178_58929690:ZNF584;ENSG00000171574:ENST00000443917:exon_58928178_58929690:ZNF584
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	59028585	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000119574:ENST00000354590:exon_59027762_59029040:ZBTB45
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	59059729	G/A	1	231	253	484	110.299054951503	132.196273148354	-21.8972181968508	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0503013098503874	ENSG00000130726:ENST00000341753:exon_59059661_59059775:TRIM28;ENSG00000130726:ENST00000253024:exon_59059661_59059775:TRIM28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	59061099	C/G	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.744904237668794	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	19	59073668	C/T	1	9	15	24	4.29736577733129	7.83772370444786	-3.54035792711657	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.158203687557982	ENSG00000099326:ENST00000215057:exon_59073285_59074871:MZF1;ENSG00000099326:ENST00000391692:exon_59073285_59074871:MZF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	3391452	C/A	1	13	24	37	6.20730612281186	12.5403579271166	-6.33305180430471	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0471691193757264	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	3392295	A/G	1	30	25	55	14.3245525911043	13.0628728407464	1.26167975035786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.787999654306163	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3391470_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3391391_3392441:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000482645:exon_3391391_3392771:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000411973:exon_3391898_3392441:TTC15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	3469463	G/C	1	32	41	73	15.2795227638446	21.4231114588241	-6.14358869497956	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.160677333837749	ENSG00000171853:ENST00000382110:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000304601:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000324266:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000417243:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000469147:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000433382:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000479897:exon_3469368_3469578:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000415624:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000497597:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000473348:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000461577:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000489032:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000437733:exon_3469368_3469466:TTC15;ENSG00000171853:ENST00000416918:exon_3469444_3469479:TTC15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	3502709	A/G	1	43	20	63	20.5318587139161	10.4502982725971	10.081560441319	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0114682433946745	ENSG00000182551:ENST00000327435:exon_3501693_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000382093:exon_3502224_3502853:ADI1;ENSG00000182551:ENST00000415131:exon_3502432_3502853:ADI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	3597974	T/C	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000171865:ENST00000436842:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000315212:exon_3597963_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000464986:exon_3597714_3598062:RNASEH1;ENSG00000171865:ENST00000454734:exon_3597964_3598062:RNASEH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	10074012	C/A	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000115750:ENST00000396242:exon_10073912_10074489:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000396240:exon_10073912_10074489:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000263663:exon_10073912_10074537:TAF1B;ENSG00000115750:ENST00000434858:exon_10073912_10074075:TAF1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	10566914	G/A	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000115756:ENST00000307845:exon_10566850_10567735:HPCAL1;ENSG00000115756:ENST00000381765:exon_10566850_10567743:HPCAL1;ENSG00000115756:ENST00000419810:exon_10566850_10567478:HPCAL1;ENSG00000115756:ENST00000422133:exon_10566850_10567126:HPCAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	10581757	A/G	1	46	51	97	21.9643139730266	26.6482605951227	-4.68394662209613	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.361286091353634	ENSG00000115758:ENST00000234111:exon_10581635_10581849:ODC1;ENSG00000115758:ENST00000405333:exon_10581635_10581849:ODC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	10933249	C/T	1	58	48	106	27.6941350094683	25.0807158542331	2.61341915523516	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.628153095577902	ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10933222_10933328:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10933222_10933328:PDIA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	10942687	C/T	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000143870:ENST00000272227:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404371:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000404824:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000381611:exon_10942625_10942766:PDIA6;ENSG00000143870:ENST00000489662:exon_10942625_10942766:PDIA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	15372562	C/T	1	12	14	26	5.72982103644172	7.315208790818	-1.58538775437628	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.561396276598999	ENSG00000151779:ENST00000441750:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000281513:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000417461:exon_15372546_15372635:NBAS;ENSG00000151779:ENST00000442506:exon_15372546_15372635:NBAS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	17962450	A/G	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000178295:ENST00000317402:exon_17961888_17966076:GEN1;ENSG00000178295:ENST00000381254:exon_17961888_17966632:GEN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	20101487	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000183891:ENST00000402414:exon_20101467_20101717:TTC32;ENSG00000183891:ENST00000333610:exon_20101467_20101747:TTC32
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	25046090	T/C	1	39	22	61	18.6219183684356	11.4953280998569	7.12659026857872	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0731932450082959	ENSG00000138031:ENST00000260600:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000405392:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000415879:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000447634:exon_25046078_25046224:ADCY3;ENSG00000138031:ENST00000485887:exon_25046078_25046232:ADCY3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	25469502	C/T	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119772:ENST00000264709:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380746:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000321117:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000380756:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000402667:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000434249:exon_25469489_25469645:DNMT3A;ENSG00000119772:ENST00000474807:exon_25469489_25469645:DNMT3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27260469	G/A	1	34	30	64	16.2344929365849	15.6754474088957	0.55904552768915	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.901208316087129	ENSG00000119777:ENST00000321326:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000238788:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000404032:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000435172:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000475258:exon_27260429_27260532:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000425720:exon_27260429_27260570:TMEM214;ENSG00000119777:ENST00000460904:exon_27260429_27260683:TMEM214
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27290410	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000084693:ENST00000487078:exon_27290362_27290514:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000360131:exon_27290362_27290514:AGBL5;ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27290525	A/G	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000084693:ENST00000441931:exon_27290362_27290703:AGBL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27355991	G/T	1	42	31	73	20.054373627546	16.1979623225256	3.85641130502044	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.412660191670234	ENSG00000138073:ENST00000468045:exon_27355985_27357497:PREB;ENSG00000138073:ENST00000260643:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000444452:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000406567:exon_27355985_27356205:PREB;ENSG00000138073:ENST00000474802:exon_27355985_27356589:PREB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27439751	G/T	1	143	148	291	68.2803673509304	77.3322072172188	-9.05183986628839	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.291462477214287	ENSG00000138085:ENST00000380171:exon_27439712_27440024:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000405489:exon_27439712_27440046:C2orf28;ENSG00000138085:ENST00000472515:exon_27439712_27440025:C2orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27459364	T/C	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27459152_27459391:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27459152_27459391:CAD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27460724	C/T	1	17	16	33	8.11724646829243	8.36023861807771	-0.242992149785282	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27460586_27460750:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27460586_27460750:CAD;ENSG00000084774:ENST00000458503:exon_27460586_27460750:CAD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27461304	G/A	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27461299_27461500:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27461299_27461500:CAD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27462651	T/C	1	29	25	54	13.8470675047341	13.0628728407464	0.784194663987721	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.892036586206937	ENSG00000084774:ENST00000264705:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000403525:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000456311:exon_27462565_27462666:CAD;ENSG00000084774:ENST00000487239:exon_27462565_27463090:CAD;ENSG00000084774:ENST00000491461:exon_27462565_27462666:CAD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27590363	C/T	1	35	28	63	16.711978022955	14.630417581636	2.08156044131901	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.616440118046765	ENSG00000115211:ENST00000347454:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000405940:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000445933:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000451130:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000493344:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000475582:exon_27588425_27591600:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000417567:exon_27590324_27590426:EIF2B4;ENSG00000115211:ENST00000414437:exon_27590222_27590426:EIF2B4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27865325	A/G	1	23	14	37	10.9821569865133	7.315208790818	3.66694819569529	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.252072691459885	ENSG00000243943:ENST00000413371:exon_27865296_27865386:ZNF512;ENSG00000198522:ENST00000515877:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000503738:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000424214:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000407583:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000264718:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000452876:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000449402:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000458167:exon_27865296_27865386:GPN1;ENSG00000198522:ENST00000461249:exon_27865296_27865386:GPN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27883958	C/T	1	34	18	52	16.2344929365849	9.40526844533743	6.82922449124743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0704145531421504	ENSG00000119760:ENST00000337768:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000406540:exon_27883851_27885148:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000405491:exon_27883851_27884468:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000404798:exon_27883851_27884255:SUPT7L;ENSG00000119760:ENST00000464789:exon_27883629_27884468:SUPT7L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27886820	G/T	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	27886835	G/T	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000163798:ENST00000326019:exon_27886338_27887444:SLC4A1AP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	29001691	A/G	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000213639:ENST00000455580:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000420282:exon_29001675_29001865:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000441461:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000427786:exon_29001675_29001797:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000358506:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395367:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000296122:exon_29001675_29001905:PPP1CB;ENSG00000213639:ENST00000395366:exon_29001675_29001905:PPP1CB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	29092679	T/C	1	5	12	17	2.38742543185071	6.27017896355828	-3.88275353170757	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.086732673121093	ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	29092850	G/T	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000171103:ENST00000306108:exon_29092445_29093167:TRMT61B;ENSG00000171103:ENST00000439947:exon_29092445_29093161:TRMT61B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	29129418	A/G	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000440983:exon_29129326_29129447:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000296126:exon_29129326_29129447:WDR43
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	29152456	A/G	1	24	27	51	11.4596420728834	14.1079026680061	-2.64826059512271	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.485655783274629	ENSG00000163811:ENST00000407426:exon_29152445_29152576:WDR43;ENSG00000163811:ENST00000466067:exon_29152445_29152576:WDR43
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	32822957	G/A	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32822818_32823035:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32822818_32823035:BIRC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	32832536	C/G	1	53	41	94	25.3067095776176	21.4231114588241	3.88359811879344	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.470209874372483	ENSG00000115760:ENST00000421745:exon_32832522_32832710:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000261359:exon_32832522_32832710:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000471232:exon_32832522_32832710:BIRC6;ENSG00000115760:ENST00000465130:exon_32832522_32832710:BIRC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	36782886	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36782805_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000414288:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000475815:exon_36782826_36786398:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000441005:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000432869:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487919:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000487282:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000484205:exon_36782432_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36782826_36782891:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36782831_36782891:FEZ2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	36810586	T/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000171055:ENST00000305852:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000413938:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000379245:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000405912:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000451623:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000464964:exon_36810496_36810612:FEZ2;ENSG00000171055:ENST00000357996:exon_36810496_36810612:FEZ2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	37474732	A/G	1	15	7	22	7.16227629555214	3.657604395409	3.50467190014315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.199333558675469	ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000419278:exon_37474599_37474772:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000441905:exon_37474599_37474772:C2orf56
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	37475489	A/G	1	25	26	51	11.9371271592536	13.5853877543763	-1.64826059512271	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.675833417721445	ENSG00000003509:ENST00000414639:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000412815:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000443335:exon_37475278_37476301:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474154:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000002125:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000336237:exon_37475278_37476303:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000474257:exon_37475278_37475563:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000419278:exon_37475278_37475530:C2orf56;ENSG00000003509:ENST00000441905:exon_37475401_37475569:C2orf56
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	43518843	A/G	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43518835_43518907:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485018:exon_43518835_43519361:THADA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	43625184	T/A	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000115970:ENST00000405975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000330266:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000356975:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000415080:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000407351:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000405006:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000398653:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000473004:exon_43625110_43625197:THADA;ENSG00000115970:ENST00000408045:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000402796:exon_43625110_43625278:THADA;ENSG00000115970:ENST00000485353:exon_43625110_43625278:THADA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	44021676	C/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000330811:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000406852:exon_44021596_44022318:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000479242:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000398823:exon_44019815_44022322:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000489222:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000462426:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000378587:exon_44021596_44021782:DYNC2LI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	44036913	T/C	1	23	21	44	10.9821569865133	10.972813186227	0.00934380028629178	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	44036922	T/C	1	19	22	41	9.07221664103272	11.4953280998569	-2.42311145882414	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.532349662611635	ENSG00000138036:ENST00000260605:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1;ENSG00000138036:ENST00000443170:exon_44036844_44037149:DYNC2LI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	44175293	G/A	1	8	14	22	3.81988069096114	7.315208790818	-3.49532809985685	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.142312472680437	ENSG00000138095:ENST00000260665:exon_44175261_44175338:LRPPRC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	45640374	C/A	1	13	4	17	6.20730612281186	2.09005965451943	4.11724646829243	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0528824530837299	ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45640253_45640432:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45640253_45640432:SRBD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	45645512	C/T	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000068784:ENST00000263736:exon_45645504_45645680:SRBD1;ENSG00000068784:ENST00000490133:exon_45645504_45645680:SRBD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	47250596	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000461601:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47250547_47250604:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000440051:exon_47250547_47250604:TTC7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	47273511	C/T	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47273454_47273570:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000496991:exon_47273453_47273570:TTC7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	47278901	G/A	1	13	2	15	6.20730612281186	1.04502982725971	5.16227629555214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.008238482582775	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47278885_47279019:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47278885_47279019:TTC7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	47287957	C/T	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000068724:ENST00000409245:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000434093:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000319190:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000263737:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000394850:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000441914:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000409825:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000491786:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484061:exon_47287908_47288110:TTC7A;ENSG00000068724:ENST00000484337:exon_47287908_47288095:TTC7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	47710120	G/C	1	26	21	47	12.4146122456237	10.972813186227	1.44179905939672	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.770698178098865	ENSG00000095002:ENST00000233146:exon_47709918_47710367:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394794:exon_47709918_47710360:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000419559:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000432737:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000453755:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000448533:exon_47709918_47710162:MSH2;ENSG00000095002:ENST00000394792:exon_47709918_47710162:MSH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	48023115	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000116062:ENST00000234420:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000446255:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000456246:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000455383:exon_48023033_48023202:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000420813:exon_48023033_48023175:MSH6;ENSG00000116062:ENST00000411819:exon_48023033_48023202:MSH6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	54093956	G/A	1	45	34	79	21.4868288866564	17.7655070634151	3.72132182324129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.431697824946396	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000476586:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000488687:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54093884_54094017:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000466539:exon_54093884_54094017:PSME4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	54115904	A/G	1	15	14	29	7.16227629555214	7.315208790818	-0.152932495265853	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000068878:ENST00000404125:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000185162:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000421748:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000389993:exon_54115858_54115949:PSME4;ENSG00000068878:ENST00000378234:exon_54115858_54115949:PSME4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	54858664	C/T	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000115306:ENST00000356805:exon_54857992_54858748:SPTBN1;ENSG00000115306:ENST00000333896:exon_54857992_54858748:SPTBN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	55489487	A/G	1	21	9	30	10.027186813773	4.70263422266871	5.32455259110429	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.066348985130218	ENSG00000085760:ENST00000403721:exon_55489452_55489563:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000263629:exon_55489452_55489563:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000394600:exon_55489452_55489563:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000417741:exon_55489452_55489563:MTIF2;ENSG00000085760:ENST00000446660:exon_55489452_55489563:MTIF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	55771169	A/T	1	74	58	132	35.3338963913906	30.3058649905317	5.02803140085888	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.385398039872465	ENSG00000163001:ENST00000339012:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000349456:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000407816:exon_55771161_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000490934:exon_55771074_55771210:CCDC104;ENSG00000163001:ENST00000481791:exon_55771156_55771505:CCDC104
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	55872538	T/C	1	12	15	27	5.72982103644172	7.83772370444786	-2.10790266800614	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.446234170782508	ENSG00000138035:ENST00000450096:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000447944:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000415374:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000260604:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000402246:exon_55872484_55872567:PNPT1;ENSG00000138035:ENST00000481066:exon_55871772_55872567:PNPT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	58350340	T/C	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000028116:ENST00000435505:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000417641:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000412104:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000423109:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000394539:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000437272:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000340157:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000432057:exon_58350236_58350368:VRK2;ENSG00000028116:ENST00000440705:exon_58350236_58350368:VRK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	61711211	C/T	1	47	33	80	22.4417990593967	17.2429921497853	5.19880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.264125902334313	ENSG00000082898:ENST00000401558:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000428210:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000481073:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000404992:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000406957:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000492182:exon_61711072_61711240:XPO1;ENSG00000082898:ENST00000461407:exon_61711072_61713097:XPO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	62067433	T/C	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000170264:ENST00000450831:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000456262:exon_62066556_62067660:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000418113:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000404929:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000405894:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000307507:exon_62066556_62067716:FAM161A;ENSG00000170264:ENST00000478822:exon_62066556_62067716:FAM161A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	63176154	C/G	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000115504:ENST00000405015:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000431489:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000263991:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000354487:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000405289:exon_63175395_63176297:EHBP1;ENSG00000115504:ENST00000454124:exon_63176068_63176297:EHBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	64124722	C/A	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000143952:ENST00000354504:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000272322:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000409558:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000416400:exon_64124630_64124724:VPS54;ENSG00000143952:ENST00000394400:exon_64124630_64124724:VPS54
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	65243589	C/T	1	16	12	28	7.63976138192229	6.27017896355828	1.369582418364	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.706380291404001	ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65243574_65243807:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000493121:exon_65243574_65243688:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65243574_65243807:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65243574_65243807:SLC1A4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	65245365	G/A	1	11	15	26	5.25233595007157	7.83772370444786	-2.58538775437628	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.332290693598278	ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65245205_65245399:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65245205_65245399:SLC1A4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	65248271	G/A	1	35	39	74	16.711978022955	20.3780816315644	-3.66610360860942	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.416761979595568	ENSG00000115902:ENST00000448784:exon_65248046_65250997:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000531327:exon_65248046_65248528:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000234256:exon_65248046_65250999:SLC1A4;ENSG00000115902:ENST00000480594:exon_65248046_65250997:SLC1A4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	65298839	A/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000011523:ENST00000475851:exon_65298588_65298978:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000377990:exon_65298588_65300114:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000260569:exon_65298588_65299703:CEP68;ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65297863_65299703:CEP68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	65301547	C/G	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000011523:ENST00000497039:exon_65301416_65301618:CEP68
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	68385240	C/G	1	33	20	53	15.7570078502147	10.4502982725971	5.30670957761758	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.169194891029909	ENSG00000221823:ENST00000406334:exon_68384928_68385254:PPP3R1;ENSG00000115946:ENST00000263657:exon_68384976_68385273:PNO1;ENSG00000115946:ENST00000430742:exon_68385049_68385273:PNO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	68592496	C/T	1	63	39	102	30.081560441319	20.3780816315644	9.70347880975458	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0595695715014949	ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68592305_68592525:PLEK;ENSG00000115956:ENST00000454941:exon_68592322_68592525:PLEK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	68622952	G/C	1	177	114	291	84.5148602875153	59.5667001538037	24.9481601337116	T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.00395905472472458	ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	68622990	T/C	1	171	101	272	81.6499497692945	52.7740062766156	28.8759434926789	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000517748372921959	ENSG00000115956:ENST00000234313:exon_68622812_68624585:PLEK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	69734560	A/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000115977:ENST00000409085:exon_69734553_69734710:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000489327:exon_69734553_69734710:AAK1;ENSG00000115977:ENST00000406297:exon_69734553_69734710:AAK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	70033584	C/T	1	18	20	38	8.59473155466257	10.4502982725971	-1.85556671793457	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.62701847968266	ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460439:exon_70033517_70033630:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70033517_70033630:ANXA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	70037739	C/G	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000460942:exon_70037726_70037752:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	70037756	G/A	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000196975:ENST00000477632:exon_70035038_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000409920:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000394295:exon_70037726_70037805:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000487351:exon_70037726_70037857:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000468815:exon_70037726_70038034:ANXA4;ENSG00000196975:ENST00000472124:exon_70037726_70037805:ANXA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	70528092	G/A	1	24	38	62	11.4596420728834	19.8555667179346	-8.39592464505114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0411522085090776	ENSG00000035141:ENST00000037869:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000460307:exon_70527972_70528735:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000450256:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000430566:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000438759:exon_70527972_70528112:FAM136A;ENSG00000035141:ENST00000498665:exon_70527640_70528112:FAM136A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71305456	C/T	1	154	127	281	73.532703301002	66.3593940309918	7.17330927001018	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.403582566886569	ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000468601:exon_71305448_71305484:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71305660	C/T	1	149	95	244	71.1452778691513	49.6389167948364	21.5063610743149	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00583228678675546	ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71305661	C/A	1	170	110	280	81.1724646829243	57.4766404992843	23.69582418364	A:T:C:G	C	A	10	0.522514913629857	0.00486198416945455	ENSG00000124357:ENST00000455662:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000244204:exon_71305448_71305998:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000418807:exon_71305448_71306935:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443872:exon_71305448_71305715:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000443938:exon_71305448_71305771:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000450272:exon_71305448_71305743:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000475709:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000472519:exon_71305448_71305750:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000489309:exon_71305448_71305766:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000524537:exon_71305448_71305763:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000490998:exon_71305448_71305769:NAGK;ENSG00000124357:ENST00000498022:exon_71305448_71305765:NAGK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71351403	C/A	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000124370:ENST00000244217:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000466481:exon_71351336_71351673:MCEE;ENSG00000124370:ENST00000486135:exon_71351336_71351673:MCEE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71360144	A/C	1	33	28	61	15.7570078502147	14.630417581636	1.12659026857872	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.798953186315004	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71360282	G/A	1	35	51	86	16.711978022955	26.6482605951227	-9.9362825721677	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0396730588077343	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000468427:exon_71360028_71360298:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71360625	G/T	1	61	42	103	29.1265902685787	21.945626372454	7.18096389612473	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.167895447304201	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71360028_71360706:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71360199_71360706:MPHOSPH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71365676	G/A	1	44	36	80	21.0093438002863	18.8105368906749	2.19880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.655499145160517	ENSG00000124383:ENST00000244230:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000498451:exon_71365620_71366343:MPHOSPH10;ENSG00000124383:ENST00000425650:exon_71365620_71365761:MPHOSPH10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	71654175	G/A	1	38	36	74	18.1444332820654	18.8105368906749	-0.666103608609422	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.907705659343558	ENSG00000075292:ENST00000394137:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000355812:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000264447:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409544:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000487638:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000409407:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000483421:exon_71653590_71654544:ZNF638;ENSG00000075292:ENST00000493576:exon_71653980_71654544:ZNF638
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	74185876	A/T	1	227	236	463	108.389114606022	123.313519616646	-14.9244050106238	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.177244433599107	ENSG00000114956:ENST00000264093:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000348222:exon_74185837_74186088:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000418996:exon_74185837_74186073:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000356837:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000440532:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000347161:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000448982:exon_74185837_74186086:DGUOK;ENSG00000114956:ENST00000462685:exon_74185837_74185915:DGUOK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	74596321	T/C	1	25	16	41	11.9371271592536	8.36023861807771	3.57688854117586	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.278095397791184	ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74596225_74596341:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74596225_74596341:DCTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	74597937	G/T	1	16	20	36	7.63976138192229	10.4502982725971	-2.81053689067485	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.405308064754224	ENSG00000204843:ENST00000361874:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409348:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000394003:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000393999:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000407639:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000434055:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409438:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409240:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409868:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000466110:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000409567:exon_74597748_74597952:DCTN1;ENSG00000204843:ENST00000362071:exon_74597748_74597952:DCTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	74688884	G/A	1	45	36	81	21.4868288866564	18.8105368906749	2.67629199598158	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.579507277050173	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	74690039	G/A	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74688184_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74688185_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000409065:exon_74688196_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74688197_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74689123_74690139:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74689902_74690139:MOGS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	74690378	C/T	1	18	15	33	8.59473155466257	7.83772370444786	0.757007850214718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.862585582158515	ENSG00000115275:ENST00000233616:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000452063:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462189:exon_74690317_74690773:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000448666:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000462443:exon_74690317_74690513:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000489655:exon_74690317_74690764:MOGS;ENSG00000115275:ENST00000414701:exon_74690317_74690513:MOGS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	75937801	C/T	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000005436:ENST00000321027:exon_75937717_75938115:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000409857:exon_75937717_75938018:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000442309:exon_75937717_75938067:C2orf3;ENSG00000005436:ENST00000470503:exon_75937717_75938025:C2orf3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85553784	C/T	1	6	12	18	2.86491051822086	6.27017896355828	-3.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.155344968085716	ENSG00000152291:ENST00000377386:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000282120:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000398263:exon_85553631_85553927:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409232:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000409015:exon_85553631_85554808:TGOLN2;ENSG00000152291:ENST00000444342:exon_85553631_85554808:TGOLN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85625222	T/G	1	139	72	211	66.3704270054499	37.6210737813497	28.7493532241002	T:G	T	G	10	0.522514913629857	7.81064528799268e-05	ENSG00000042493:ENST00000263867:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000453973:exon_85625143_85625254:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409921:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409670:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000409724:exon_85625143_85625275:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000471064:exon_85625143_85625475:CAPG;ENSG00000042493:ENST00000483659:exon_85625143_85625275:CAPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85806266	C/T	1	373	238	611	178.101937216063	124.358549443906	53.7433877721574	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1.40214699714731e-05	ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85806132_85806290:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85806132_85806290:VAMP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85808737	A/G	1	444	342	786	212.003378348343	178.700100461411	33.3032778869324	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0183991154472185	ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85808871	C/T	1	407	333	740	194.336430152648	173.997466238742	20.3389639139058	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.141019312425373	ENSG00000118640:ENST00000432071:exon_85808699_85809120:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000263864:exon_85808699_85809154:VAMP8;ENSG00000118640:ENST00000409760:exon_85808699_85809154:VAMP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85824251	T/C	1	677	548	1225	323.257403472587	286.338172669162	36.9192308034252	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0367712636097406	ENSG00000168894:ENST00000441634:exon_85824227_85824704:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000306368:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000443647:exon_85824227_85824301:RNF181;ENSG00000168894:ENST00000456023:exon_85824076_85824301:RNF181
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85843348	C/T	1	23	19	42	10.9821569865133	9.92778335896728	1.054373627546	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.760216182537127	ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85843215_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85843266_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000455732:exon_85843275_85843579:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85843275_85843435:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85843292_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85843300_85843377:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85843309_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85843310_85843586:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85843317_85843586:USP39
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	85852667	G/A	1	22	15	37	10.5046719001431	7.83772370444786	2.66694819569529	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.414059712935562	ENSG00000168883:ENST00000459775:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000448971:exon_85852662_85852712:USP39;ENSG00000168883:ENST00000442708:exon_85852662_85852740:USP39;ENSG00000168883:ENST00000450066:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409268:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409025:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000452873:exon_85852662_85852719:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409470:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000487400:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000323701:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000458268:exon_85852662_85852813:USP39;ENSG00000168883:ENST00000409766:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000493829:exon_85852662_85852814:USP39;ENSG00000168883:ENST00000467885:exon_85852662_85852814:USP39
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	86255790	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86255717_86255834:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86255717_86255834:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000471427:exon_86255717_86255922:POLR1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	86259443	C/T	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000496892:exon_86259395_86259505:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000492034:exon_86259395_86259505:POLR1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	86269163	C/T	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000068654:ENST00000263857:exon_86269012_86269226:POLR1A;ENSG00000068654:ENST00000409681:exon_86269012_86269226:POLR1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	86406556	C/T	1	53	59	112	25.3067095776176	30.8283799041616	-5.52167032654399	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.299953684644811	ENSG00000132305:ENST00000254636:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000449247:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000410111:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000442664:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409051:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409715:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000377310:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000398211:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000474969:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000409258:exon_86406556_86406745:IMMT;ENSG00000132305:ENST00000486633:exon_86406556_86406745:IMMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	86693826	T/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86693495_86694006:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000488971:exon_86693495_86693956:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000485171:exon_86693755_86693900:KDM3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	86707448	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000115548:ENST00000409556:exon_86707290_86707485:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000312912:exon_86707290_86707485:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000441719:exon_86705731_86707485:KDM3A;ENSG00000115548:ENST00000409064:exon_86707290_86707485:KDM3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	89161069	G/C	0	37	0	37	17.6669481956953	0	17.6669481956953	G	G		10	0.522514913629857	3.84465828384213e-11	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	98378531	C/T	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000075568:ENST00000485245:exon_98375356_98381780:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000186436:exon_98378498_98378663:TMEM131;ENSG00000075568:ENST00000425805:exon_98378498_98378663:TMEM131
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	100019114	T/G	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000135945:ENST00000393445:exon_100019107_100019263:REV1;ENSG00000135945:ENST00000258428:exon_100019107_100019263:REV1;ENSG00000135945:ENST00000413697:exon_100018707_100019263:REV1;ENSG00000135945:ENST00000465086:exon_100018993_100019263:REV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	101620766	C/G	1	12	4	16	5.72982103644172	2.09005965451943	3.63976138192229	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.081547579265419	ENSG00000071082:ENST00000409000:exon_101620620_101621066:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000419276:exon_101620620_101620823:RPL31;ENSG00000071082:ENST00000409711:exon_101620620_101622829:RPL31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	101898412	G/C	1	16	12	28	7.63976138192229	6.27017896355828	1.369582418364	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.706380291404001	ENSG00000163162:ENST00000424632:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000295317:exon_101898321_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000490553:exon_101897955_101898519:RNF149;ENSG00000163162:ENST00000463726:exon_101898321_101898519:RNF149
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	106497929	C/A	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000071051:ENST00000233154:exon_106497784_106498505:NCK2;ENSG00000071051:ENST00000393348:exon_106497784_106497990:NCK2;ENSG00000071051:ENST00000393349:exon_106497784_106498505:NCK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	109106381	A/G	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000135968:ENST00000409325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000309863:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000482325:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393318:exon_109106294_109106470:GCC2;ENSG00000135968:ENST00000393321:exon_109106294_109106591:GCC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	109400267	C/T	1	33	21	54	15.7570078502147	10.972813186227	4.78419466398772	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.220736034398937	ENSG00000153201:ENST00000283195:exon_109400052_109402267:RANBP2;ENSG00000153201:ENST00000409491:exon_109400052_109400561:RANBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	113940681	T/C	1	9	12	21	4.29736577733129	6.27017896355828	-1.972813186227	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.513322230323649	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	113940839	G/C	1	5	16	21	2.38742543185071	8.36023861807771	-5.972813186227	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0141812305096880	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113939923_113941089:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000441564:exon_113939923_113941089:PSD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	113943470	A/G	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000125637:ENST00000245796:exon_113943454_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000418251:exon_113942942_113943832:PSD4;ENSG00000125637:ENST00000409656:exon_113943239_113943832:PSD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	118575215	C/G	1	100	96	196	47.7485086370143	50.1614317084663	-2.41292307145198	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.774969649826296	ENSG00000088205:ENST00000263239:exon_118575020_118575304:DDX18;ENSG00000088205:ENST00000474694:exon_118575020_118575304:DDX18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	118864756	A/G	1	8	17	25	3.81988069096114	8.88275353170757	-5.06287284074643	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0465610512078098	ENSG00000125629:ENST00000411929:exon_118864666_118864765:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000245787:exon_118864666_118864765:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000485520:exon_118864666_118864765:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000467223:exon_118864666_118864765:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000340599:exon_118864666_118864765:INSIG2;ENSG00000125629:ENST00000479999:exon_118864666_118864765:INSIG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	120078731	A/G	1	11	20	31	5.25233595007157	10.4502982725971	-5.19796232252557	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0721830321938906	ENSG00000186132:ENST00000409466:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000334816:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409877:exon_120078730_120078780:C2orf76;ENSG00000186132:ENST00000409523:exon_120078730_120078780:C2orf76
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	127453664	A/C	1	444	416	860	212.003378348343	217.366204070021	-5.36282572167704	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.732874884311361	ENSG00000136732:ENST00000259254:exon_127453522_127454246:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000409836:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000356887:exon_127453522_127454240:GYPC;ENSG00000136732:ENST00000464053:exon_127453522_127454243:GYPC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	128249590	G/T	1	39	32	71	18.6219183684356	16.7204772361554	1.90144113228015	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.721929274340279	ENSG00000163166:ENST00000295321:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000433551:exon_128249547_128249664:IWS1;ENSG00000163166:ENST00000455721:exon_128249547_128249664:IWS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	128610648	T/C	1	12	8	20	5.72982103644172	4.18011930903886	1.54970172740286	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.512146220497768	ENSG00000144231:ENST00000272645:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409955:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000409698:exon_128610499_128610679:POLR2D;ENSG00000144231:ENST00000411634:exon_128610499_128610679:POLR2D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	131100484	C/T	1	15	16	31	7.16227629555214	8.36023861807771	-1.19796232252557	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.721152952918315	ENSG00000136718:ENST00000259239:exon_131099798_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409935:exon_131100450_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000462392:exon_131100467_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000464432:exon_131100467_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000490895:exon_131100467_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000473689:exon_131100469_131100508:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000470672:exon_131100470_131100767:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000477375:exon_131100470_131100535:IMP4;ENSG00000136718:ENST00000409649:exon_131100483_131100535:IMP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	132241704	C/T	1	230	135	365	109.821569865133	70.5395133400307	39.2820565251022	T:C	C	T	10	0.522514913629857	4.10509047548208e-05	ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	132241731	T/C	1	413	239	652	197.201340670869	124.881064357536	72.3202763133332	A:T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1.17105234230325e-08	ENSG00000173272:ENST00000410036:exon_132241531_132241791:MZT2A;ENSG00000173272:ENST00000309451:exon_132241533_132241791:MZT2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	132290399	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	132290948	C/T	1	201	117	318	95.9745023603987	61.1342448946933	34.8402574657055	A:T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.000101227880248751	ENSG00000163040:ENST00000295171:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000409856:exon_132290842_132291239:CCDC74A;ENSG00000163040:ENST00000467992:exon_132290842_132291239:CCDC74A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	135711516	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	135711657	G/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000082258:ENST00000419781:exon_135710800_135714413:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000452839:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000295238:exon_135710800_135711949:CCNT2;ENSG00000082258:ENST00000264157:exon_135710800_135716912:CCNT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	150432976	C/T	1	49	42	91	23.396769232137	21.945626372454	1.45114285968301	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.833931933889737	ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000436114:exon_150432951_150432992:MMADHC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	150433015	T/G	1	48	40	88	22.9192841457669	20.9005965451943	2.01868760057258	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.749081158078962	ENSG00000168288:ENST00000303319:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000428879:exon_150432951_150433056:MMADHC;ENSG00000168288:ENST00000422782:exon_150432951_150433056:MMADHC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	152132130	A/G	1	80	96	176	38.1988069096114	50.1614317084663	-11.9626247988548	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0823710651883575	ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152131998_152132184:NMI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	152138522	T/C	1	19	20	39	9.07221664103272	10.4502982725971	-1.37808163156443	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.749130394966468	ENSG00000123609:ENST00000243346:exon_152138462_152138557:NMI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	152320118	G/A	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	152322095	A/T	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152319398_152322634:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152321214_152322634:RIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	152331418	C/G	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000080345:ENST00000444746:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000453091:exon_152331371_152332136:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000428287:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000433166:exon_152331371_152332419:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000243326:exon_152331371_152333863:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000430328:exon_152331371_152331902:RIF1;ENSG00000080345:ENST00000454583:exon_152331371_152331733:RIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	182374534	A/G	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000115232:ENST00000425522:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000490435:exon_182374385_182374534:ITGA4;ENSG00000115232:ENST00000476824:exon_182374385_182374534:ITGA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	182395345	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182395251_182395376:ITGA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	182399097	T/C	1	11	8	19	5.25233595007157	4.18011930903886	1.07221664103272	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.653984881903285	ENSG00000115232:ENST00000397033:exon_182398999_182399097:ITGA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	190320083	C/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190320046_190320170:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190320046_190320170:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000472286:exon_190320046_190320347:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190320046_190320170:WDR75
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	190323530	A/G	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190323479_190323598:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190323479_190323598:WDR75
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	190329873	A/G	1	21	18	39	10.027186813773	9.40526844533743	0.621918368435576	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.873940358026441	ENSG00000115368:ENST00000314761:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000436347:exon_190329805_190329980:WDR75;ENSG00000115368:ENST00000427960:exon_190329805_190329980:WDR75
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	190531805	G/A	1	30	12	42	14.3245525911043	6.27017896355828	8.05437362754601	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0132934506275782	ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	190532159	T/C	1	13	14	27	6.20730612281186	7.315208790818	-1.10790266800614	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.703632086597494	ENSG00000138381:ENST00000260952:exon_190530767_190532322:ASNSD1;ENSG00000138381:ENST00000420250:exon_190530767_190532322:ASNSD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	190660503	T/C	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000064933:ENST00000374827:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000434338:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000456115:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000392338:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000441310:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409985:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000342075:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000409823:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000418224:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000374826:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000450931:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000421722:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424766:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000447232:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000432292:exon_190660495_190660677:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000420421:exon_190660495_190660583:PMS1;ENSG00000064933:ENST00000424059:exon_190660495_190660677:PMS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	191235901	A/C	1	10	13	23	4.77485086370143	6.79269387718814	-2.01784301348671	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.413016919605914	ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	191236053	C/T	1	16	15	31	7.63976138192229	7.83772370444786	-0.197962322525568	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000151689:ENST00000392329:exon_191235570_191236390:INPP1;ENSG00000151689:ENST00000322522:exon_191235570_191236391:INPP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	191839658	A/C	1	31	46	77	14.8020376774744	24.0356860269734	-9.23364834949899	A:T:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0397310357383257	ENSG00000115415:ENST00000415035:exon_191839556_191839661:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000361099:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000409465:exon_191839556_191839658:STAT1;ENSG00000115415:ENST00000423282:exon_191839556_191839658:STAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	197021276	T/C	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000081320:ENST00000263955:exon_197021163_197021375:STK17B;ENSG00000081320:ENST00000409228:exon_197021163_197021375:STK17B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	198001319	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000065413:ENST00000282272:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000328737:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000450567:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000337207:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409153:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000409919:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000447713:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000443014:exon_198001316_198001386:ANKRD44;ENSG00000065413:ENST00000463879:exon_197998695_198001386:ANKRD44
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	198266828	G/T	1	14	19	33	6.684791209182	9.92778335896728	-3.24299214978528	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.297413773867439	ENSG00000115524:ENST00000335508:exon_198266709_198266854:SF3B1;ENSG00000115524:ENST00000462613:exon_198266746_198266854:SF3B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	198353071	A/G	1	194	269	463	92.6321067558077	140.556511766432	-47.9244050106238	A:G	A	G	10	0.522514913629857	9.26229363566757e-06	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198353041_198353215:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198353041_198353215:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000491249:exon_198353041_198353215:HSPD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	198363429	G/A	1	302	326	628	144.200496083783	170.339861843333	-26.1393657595502	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0377886002427844	ENSG00000144381:ENST00000388968:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000345042:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000430176:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000452200:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000476746:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000461097:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000426480:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000428204:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000439605:exon_198363399_198363574:HSPD1;ENSG00000144381:ENST00000418022:exon_198363398_198363574:HSPD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201334715	G/A	1	30	33	63	14.3245525911043	17.2429921497853	-2.91843955868099	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.52870118560547	ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201334637_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201334463_201334739:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201334637_201334739:SPATS2L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201337667	A/C	1	30	37	67	14.3245525911043	19.3330518043047	-5.00849921320042	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.224252896161988	ENSG00000196141:ENST00000409718:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000358677:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409988:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409385:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000360760:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409140:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409755:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000409151:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000468832:exon_201337555_201337770:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000462190:exon_201337555_201337775:SPATS2L;ENSG00000196141:ENST00000460095:exon_201337555_201337715:SPATS2L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201354866	G/A	1	22	16	38	10.5046719001431	8.36023861807771	2.14443328206543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51961273920649	ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201355098	C/A	1	8	16	24	3.81988069096114	8.36023861807771	-4.54035792711657	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.0685696670716585	ENSG00000155729:ENST00000359878:exon_201353675_201355339:KCTD18;ENSG00000155729:ENST00000409157:exon_201353681_201355339:KCTD18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201436555	A/G	1	23	8	31	10.9821569865133	4.18011930903886	6.80203767747443	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0181799820934128	ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201437048	A/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000163535:ENST00000357799:exon_201435773_201438700:SGOL2;ENSG00000163535:ENST00000295774:exon_201435773_201438700:SGOL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201736112	T/C	1	53	14	67	25.3067095776176	7.315208790818	17.9915007867996	T:C	T	C	10	0.522514913629857	6.97372143470559e-06	ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201736166	A/C	1	63	17	80	30.081560441319	8.88275353170757	21.1988069096114	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1.48541253381416e-06	ENSG00000240344:ENST00000422134:exon_201736166_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000286175:exon_201735630_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000392283:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000465823:exon_201735679_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000234288:exon_201735680_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000415562:exon_201735875_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409264:exon_201735936_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409361:exon_201735953_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000409449:exon_201735990_201736244:PPIL3;ENSG00000240344:ENST00000463866:exon_201736097_201736244:PPIL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	201768238	C/T	1	21	29	50	10.027186813773	15.1529324952659	-5.12574568149285	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.158426150888732	ENSG00000196290:ENST00000416651:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000419903:exon_201768217_201768655:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000358515:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000403702:exon_201768217_201768646:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409020:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000359683:exon_201768217_201768653:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409357:exon_201768217_201768619:NIF3L1;ENSG00000196290:ENST00000409588:exon_201768217_201768648:NIF3L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	203155059	C/T	1	27	39	66	12.8920973319939	20.3780816315644	-7.48598429957056	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.08374004034567	ENSG00000055044:ENST00000264279:exon_203155046_203155180:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000492688:exon_203155046_203155180:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000478941:exon_203155046_203155095:NOP58;ENSG00000055044:ENST00000433543:exon_203155046_203155180:NOP58
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	207008763	C/A	1	12	14	26	5.72982103644172	7.315208790818	-1.58538775437628	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.561396276598999	ENSG00000023228:ENST00000233190:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000455934:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000423725:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000457011:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000440274:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000432169:exon_207008742_207008856:NDUFS1;ENSG00000023228:ENST00000449699:exon_207008742_207008856:NDUFS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	207026113	G/A	1	18	71	89	8.59473155466257	37.0985588677199	-28.5038273130573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	7.48740145553533e-10	ENSG00000114942:ENST00000236957:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392221:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392222:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000445505:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000429769:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000415904:exon_207026045_207026191:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000435123:exon_207026070_207026178:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000455150:exon_207026070_207026196:EEF1B2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	207026131	G/A	1	20	68	88	9.54970172740286	35.5310141268303	-25.9813123994274	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	2.10709618071187e-08	ENSG00000114942:ENST00000236957:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392221:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000392222:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000445505:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000429769:exon_207026070_207026196:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000415904:exon_207026045_207026191:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000435123:exon_207026070_207026178:EEF1B2;ENSG00000114942:ENST00000455150:exon_207026070_207026196:EEF1B2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	207631461	G/A	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000418289:exon_207631368_207631789:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207631368_207632194:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207631368_207632194:FASTKD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	207636661	G/A	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000118246:ENST00000236980:exon_207636618_207636741:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000402774:exon_207636618_207636741:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000403094:exon_207636618_207636741:FASTKD2;ENSG00000118246:ENST00000487777:exon_207636618_207636741:FASTKD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	208478055	A/G	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000144401:ENST00000411432:exon_208473839_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448007:exon_208476828_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000272839:exon_208477447_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000448823:exon_208477451_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000406927:exon_208477467_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000426075:exon_208477567_208478167:FAM119A;ENSG00000144401:ENST00000442521:exon_208477704_208478167:FAM119A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	216904019	A/T	1	12	17	29	5.72982103644172	8.88275353170757	-3.15293249526585	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.268082057749973	ENSG00000115425:ENST00000442122:exon_216903914_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000448681:exon_216903112_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216903132_216904083:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216903979_216904083:PECR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	216923679	C/T	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000115425:ENST00000265322:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000461330:exon_216923618_216923699:PECR;ENSG00000115425:ENST00000497889:exon_216923618_216923699:PECR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219414613	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000135913:ENST00000258399:exon_219414532_219414632:USP37;ENSG00000135913:ENST00000454775:exon_219414532_219414632:USP37;ENSG00000135913:ENST00000415516:exon_219414532_219414632:USP37;ENSG00000135913:ENST00000418019:exon_219414532_219414632:USP37;ENSG00000135913:ENST00000338465:exon_219414532_219414632:USP37;ENSG00000135913:ENST00000392113:exon_219414532_219414632:USP37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219503122	C/T	1	32	27	59	15.2795227638446	14.1079026680061	1.17162009583843	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.795465138198561	ENSG00000115568:ENST00000449707:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000336124:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000396788:exon_219502639_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000411696:exon_219502644_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000450765:exon_219502868_219503531:ZNF142;ENSG00000115568:ENST00000433921:exon_219502868_219503531:ZNF142
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219527866	T/C	1	22	30	52	10.5046719001431	15.6754474088957	-5.17077550875256	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.166145189594020	ENSG00000074582:ENST00000359273:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392109:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392110:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000392111:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000412366:exon_219527857_219528166:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000439945:exon_219527857_219528127:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000431802:exon_219527857_219528165:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000477422:exon_219527857_219528136:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000460579:exon_219527857_219528137:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000465706:exon_219527857_219528164:BCS1L;ENSG00000074582:ENST00000426649:exon_219527857_219528165:BCS1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219528995	T/C	1	77	75	152	36.766351650501	39.1886185222393	-2.42226687173827	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.745484239772893	ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219528587_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219528615_219529258:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000474339:exon_219528890_219529258:RNF25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219533378	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000163481:ENST00000295704:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000473034:exon_219532802_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000463188:exon_219533328_219533402:RNF25;ENSG00000163481:ENST00000423170:exon_219533328_219533402:RNF25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219941063	G/A	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	219941091	G/A	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000187736:ENST00000409720:exon_219940039_219941167:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000356853:exon_219940043_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000418099:exon_219940051_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000494211:exon_219941014_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000426304:exon_219941025_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000491159:exon_219941040_219941177:NHEJ1;ENSG00000187736:ENST00000415353:exon_219941042_219941167:NHEJ1;ENSG00000213901:ENST00000498327:exon_219940051_219941177:SLC23A3;ENSG00000213901:ENST00000318673:exon_219940695_219941177:SLC23A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220045454	G/A	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443757:exon_220045392_220045473:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452293:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430747:exon_220045392_220045472:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045392_220045476:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045390_220045476:FAM134A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220045854	G/A	1	27	14	41	12.8920973319939	7.315208790818	5.57688854117586	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.087012558289695	ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220045902	C/T	1	25	18	43	11.9371271592536	9.40526844533743	2.53185871391615	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.450647062778914	ENSG00000144567:ENST00000458520:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000452022:exon_220045784_220045927:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000481925:exon_220045784_220046185:FAM134A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220047304	T/C	1	16	12	28	7.63976138192229	6.27017896355828	1.369582418364	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.706380291404001	ENSG00000144567:ENST00000430297:exon_220046735_220050201:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000273048:exon_220046735_220048214:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000443518:exon_220047136_220047351:FAM134A;ENSG00000144567:ENST00000420189:exon_220047136_220048522:FAM134A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220074748	C/T	1	34	48	82	16.2344929365849	25.0807158542331	-8.84622291764828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0597011796986013	ENSG00000115657:ENST00000265316:exon_220074490_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000487380:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000485773:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000497882:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000295750:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000439002:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000427013:exon_220074494_220074768:ABCB6;ENSG00000115657:ENST00000443805:exon_220074498_220074768:ABCB6;ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220074494_220074768:ATG9A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220085845	A/G	1	17	14	31	8.11724646829243	7.315208790818	0.802037677474432	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.858133848975486	ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220085847	T/C	1	16	17	33	7.63976138192229	8.88275353170757	-1.24299214978528	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728920287854378	ENSG00000198925:ENST00000446716:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409033:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000396761:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409618:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000361242:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000475339:exon_220085802_220086024:ATG9A;ENSG00000198925:ENST00000409422:exon_220085802_220086024:ATG9A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220099486	G/A	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000163516:ENST00000466238:exon_220098855_220100034:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000477479:exon_220098855_220100034:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220100191	C/T	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000163516:ENST00000463792:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000419723:exon_220098855_220100597:ANKZF1;ENSG00000163516:ENST00000483188:exon_220099873_220100307:ANKZF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220112237	C/T	1	37	35	72	17.6669481956953	18.288021977045	-0.621073781349704	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.90652517925052	ENSG00000115661:ENST00000409638:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000475696:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000396738:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409516:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496443:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000496800:exon_220112137_220112548:STK16;ENSG00000115661:ENST00000475342:exon_220112137_220112353:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409260:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000478018:exon_220112137_220112257:STK16;ENSG00000115661:ENST00000486813:exon_220112137_220112256:STK16;ENSG00000115661:ENST00000409743:exon_220112137_220112257:STK16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220250782	G/A	1	92	58	150	43.9286279460532	30.3058649905317	13.6227629555214	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0272677677154712	ENSG00000123992:ENST00000273075:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373972:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000523282:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000373966:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000337010:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000457935:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000429013:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000521459:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000460963:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000322176:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000434339:exon_220250690_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000430206:exon_220250704_220250820:DNPEP;ENSG00000123992:ENST00000520694:exon_220250760_220250820:DNPEP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	220369991	G/A	1	29	31	60	13.8470675047341	16.1979623225256	-2.35089481779142	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.605782373389655	ENSG00000144591:ENST00000313597:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373917:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000358215:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000443704:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000373908:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000435316:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000341142:exon_220369950_220370084:GMPPA;ENSG00000144591:ENST00000481170:exon_220368805_220370794:GMPPA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	223386578	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223386486_223386665:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223386486_223386665:SGPP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	223423362	A/G	1	29	16	45	13.8470675047341	8.36023861807771	5.48682888665643	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.134755249643977	ENSG00000163082:ENST00000321276:exon_223423066_223425667:SGPP2;ENSG00000163082:ENST00000392068:exon_223423066_223425667:SGPP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	223436607	C/T	1	217	234	451	103.614263742321	122.268489789387	-18.6542260470655	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0812002080277962	ENSG00000116120:ENST00000281828:exon_223435255_223436741:FARSB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	223799290	G/A	1	20	22	42	9.54970172740286	11.4953280998569	-1.945626372454	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.643643854965604	ENSG00000123983:ENST00000357430:exon_223799248_223799405:ACSL3;ENSG00000123983:ENST00000392066:exon_223799248_223799405:ACSL3;ENSG00000123983:ENST00000407441:exon_223799248_223799405:ACSL3;ENSG00000123983:ENST00000495541:exon_223799248_223799405:ACSL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	224824484	C/T	1	40	40	80	19.0994034548057	20.9005965451943	-1.80119309038857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.737492313852503	ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	224824695	T/C	1	37	40	77	17.6669481956953	20.9005965451943	-3.23364834949899	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.494621939742118	ENSG00000135900:ENST00000258383:exon_224824251_224824719:MRPL44
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	228416712	A/G	1	20	24	44	9.54970172740286	12.5403579271166	-2.99065619971371	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.370657840872290	ENSG00000173744:ENST00000409979:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000310078:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409315:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000373671:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000409171:exon_228416675_228416833:AGFG1;ENSG00000173744:ENST00000458212:exon_228416675_228416833:AGFG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	230632268	G/A	1	247	191	438	117.938816333425	99.8003485033027	18.1384678301226	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0851585260902642	ENSG00000153827:ENST00000283943:exon_230631930_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389045:exon_230632157_230632466:TRIP12;ENSG00000153827:ENST00000389044:exon_230632157_230632466:TRIP12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231036866	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000135899:ENST00000477068:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231036782_231036890:SP110;ENSG00000135899:ENST00000483067:exon_231036782_231037028:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231036782_231036890:SP110
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231042276	A/G	1	104	106	210	49.6584489824949	55.3865808447648	-5.72813186226998	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.447702574614139	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231042254_231042396:SP110;ENSG00000135899:ENST00000489597:exon_231042082_231042396:SP110
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231050715	A/G	1	108	127	235	51.5683893279754	66.3593940309918	-14.7910047030164	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0581341152925811	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231050710_231050859:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231050710_231050859:SP110
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231067305	C/G	1	107	103	210	51.0909042416053	53.8190361038753	-2.72813186226998	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.730051495949779	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231067295_231067438:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231067295_231067444:SP110;ENSG00000135899:ENST00000490880:exon_231067295_231067444:SP110
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231077110	C/T	1	117	103	220	55.8657551053067	53.8190361038753	2.04671900143145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.787694208123433	ENSG00000135899:ENST00000258381:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000358662:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000392048:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000258382:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000338556:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000486146:exon_231077062_231077145:SP110;ENSG00000135899:ENST00000409815:exon_231077064_231077145:SP110
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231106180	A/G	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000343805:exon_231106119_231106202:SP140;ENSG00000079263:ENST00000420434:exon_231106119_231106202:SP140
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231110582	C/T	1	21	12	33	10.027186813773	6.27017896355828	3.75700785021472	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.223826824236475	ENSG00000079263:ENST00000350136:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392044:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000392045:exon_231110578_231110655:SP140;ENSG00000079263:ENST00000417495:exon_231110578_231110655:SP140
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231325944	C/G	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.534238922078199	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231326148	G/A	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.468085787310545	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231331799	T/C	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231331896	G/A	1	156	123	279	74.4876734737423	64.2693343764724	10.2183390972699	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.230916268541097	ENSG00000067066:ENST00000264052:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409824:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409341:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409112:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000341950:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000409897:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000427101:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000413284:exon_231331835_231331930:SP100;ENSG00000067066:ENST00000452345:exon_231331835_231331930:SP100
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	231407663	C/T	1	17	5	22	8.11724646829243	2.61257456814929	5.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0193052698299583	ENSG00000067066:ENST00000340126:exon_231407551_231407898:SP100;ENSG00000067066:ENST00000414648:exon_231407551_231410317:SP100;ENSG00000067066:ENST00000431952:exon_231407551_231408805:SP100;ENSG00000067066:ENST00000494901:exon_231407551_231407837:SP100;ENSG00000067066:ENST00000488180:exon_231407551_231408805:SP100
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	232143110	C/T	1	20	12	32	9.54970172740286	6.27017896355828	3.27952276384457	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.289892219807281	ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232143095_232143171:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232143095_232143171:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232143095_232143171:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000467698:exon_232143095_232143140:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000446447:exon_232143095_232143169:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000481520:exon_232143095_232143171:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232143095_232143171:ARMC9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	232196564	C/T	1	23	14	37	10.9821569865133	7.315208790818	3.66694819569529	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.252072691459885	ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	232196597	G/A	1	27	18	45	12.8920973319939	9.40526844533743	3.48682888665643	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370822009667527	ENSG00000135931:ENST00000349938:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000483477:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000359743:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000428662:exon_232196505_232196609:ARMC9;ENSG00000135931:ENST00000486787:exon_232196505_232196609:ARMC9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	232263127	G/A	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000156966:ENST00000287590:exon_232262442_232265875:B3GNT7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	232321777	A/T	1	668	733	1401	318.960037695255	383.003431690685	-64.0433939954297	A:T:C	A	T	10	0.522514913629857	0.000677344302536224	ENSG00000115053:ENST00000322723:exon_232321712_232321835:NCL;ENSG00000115053:ENST00000392033:exon_232321712_232321835:NCL;ENSG00000115053:ENST00000322732:exon_232321712_232321835:NCL;ENSG00000115053:ENST00000461347:exon_232321712_232321835:NCL;ENSG00000115053:ENST00000356936:exon_232321712_232321835:NCL;ENSG00000115053:ENST00000466274:exon_232321712_232322121:NCL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	234098561	C/T	1	19	24	43	9.07221664103272	12.5403579271166	-3.46814128608385	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.35988510738201	ENSG00000168918:ENST00000359570:exon_234098496_234098583:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000450745:exon_234098496_234098583:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000455936:exon_234098496_234098583:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000415617:exon_234098496_234098583:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000445964:exon_234098496_234098583:INPP5D;ENSG00000168918:ENST00000435188:exon_234098496_234098583:INPP5D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	234756072	G/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000123485:ENST00000411486:exon_234756043_234756107:HJURP;ENSG00000123485:ENST00000454020:exon_234756043_234756107:HJURP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	237489904	C/T	1	81	82	163	38.6762919959816	42.8462229176483	-4.1699309216667	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.531111771231679	ENSG00000144476:ENST00000272928:exon_237489083_237491001:CXCR7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238668802	A/G	1	59	29	88	28.1716200958384	15.1529324952659	13.0186876005726	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0054405472673853	ENSG00000124831:ENST00000308482:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000391999:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238668707_238668848:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000483443:exon_238668707_238668848:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238671328	A/G	1	99	68	167	47.2710235506442	35.5310141268303	11.7400094238139	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0747307136284823	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238671499	C/T	1	134	93	227	63.9830015735992	48.5938869675767	15.3891146060225	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0460213179390671	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238671609	A/G	1	139	91	230	66.3704270054499	47.548857140317	18.8215698651329	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0144408121520689	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238671889	G/A	1	220	165	385	105.046719001431	86.2149607489264	18.831758252505	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0589723902842471	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238671940	C/T	1	289	250	539	137.993189960971	130.628728407464	7.36446155350706	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.546161408238861	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238672253	A/G	1	183	106	289	87.3797708057362	55.3865808447648	31.9931899609713	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000157823042206322	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238672290	C/T	1	195	120	315	93.1095918421779	62.7017896355828	30.407802206595	A:T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.000689966219225197	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238672453	T/A	1	110	123	233	52.5233595007157	64.2693343764724	-11.7459748757567	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.131503119342359	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238672691	A/G	1	133	80	213	63.505516487229	41.8011930903886	21.7043233968405	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00311112292443018	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238672703	C/G	1	114	77	191	54.4332998461963	40.233648349499	14.1996514966973	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0424559202976991	ENSG00000124831:ENST00000289175:exon_238671246_238673922:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000244815:exon_238671246_238674558:LRRFIP1;ENSG00000124831:ENST00000392000:exon_238671246_238673604:LRRFIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238896627	T/C	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000184182:ENST00000440223:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000441728:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000512459:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000518380:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434002:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000272930:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433568:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000448502:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409633:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000470484:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000455999:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000417231:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000445676:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439338:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000439780:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000454786:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000449191:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000433241:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409953:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000409332:exon_238896605_238896634:UBE2F;ENSG00000184182:ENST00000434655:exon_238896605_238896634:UBE2F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	238991938	T/C	1	6	13	19	2.86491051822086	6.79269387718814	-3.92778335896728	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.105644804013078	ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_238991889_238991995:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000373332:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000409736:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000423324:exon_238991889_238991944:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000437134:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000497951:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_238991889_238991995:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000433750:exon_238991887_238991995:SCLY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	239006879	C/T	0	10	0	10	4.77485086370143	0	4.77485086370143	C	C		10	0.522514913629857	0.00213302931363942	ENSG00000184182:ENST00000449891:exon_239006843_239008053:UBE2F;ENSG00000132330:ENST00000254663:exon_239006843_239008054:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000480357:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000422984:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000429612:exon_239006843_239008053:SCLY;ENSG00000132330:ENST00000450965:exon_239006811_239008054:SCLY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	239079158	C/T	1	28	19	47	13.369582418364	9.92778335896728	3.44179905939672	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.38131550901628	ENSG00000132323:ENST00000254654:exon_239079042_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000465131:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000463129:exon_239079043_239079317:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000450411:exon_239079049_239079665:ILKAP;ENSG00000132323:ENST00000466468:exon_239079050_239079317:ILKAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	239237968	C/T	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	239237974	T/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000204104:ENST00000373327:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391993:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000409739:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1;ENSG00000204104:ENST00000391994:exon_239237567_239237983:TRAF3IP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	239353001	C/T	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000065802:ENST00000463352:exon_239352983_239353016:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000264607:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000409297:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000438264:exon_239352983_239353368:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000491653:exon_239352983_239353115:ASB1;ENSG00000065802:ENST00000468122:exon_239352983_239353368:ASB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	240946766	T/C	1	38	40	78	18.1444332820654	20.9005965451943	-2.75616326312885	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.571683159552105	ENSG00000130414:ENST00000419408:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000476216:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000422018:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000444548:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000448880:exon_240946733_240946787:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240946733_240946787:NDUFA10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	240961728	T/C	1	30	27	57	14.3245525911043	14.1079026680061	0.216649923098149	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130414:ENST00000252711:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000404554:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000485344:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000443626:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000307300:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000407129:exon_240961589_240961757:NDUFA10;ENSG00000130414:ENST00000497536:exon_240961589_240961757:NDUFA10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	241513972	C/T	1	20	17	37	9.54970172740286	8.88275353170757	0.666948195695289	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.870445363476698	ENSG00000142327:ENST00000451363:exon_241513932_241514029:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241513932_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241513192_241514045:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241513971_241514045:RNPEPL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	241514532	C/T	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000142327:ENST00000270357:exon_241514447_241514559:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000486058:exon_241514447_241514559:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000481757:exon_241513530_241516182:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000493398:exon_241514447_241515027:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000464550:exon_241514447_241514559:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000460884:exon_241514236_241514559:RNPEPL1;ENSG00000142327:ENST00000498042:exon_241514491_241514559:RNPEPL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	241569557	C/T	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	241570249	A/C	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000178623:ENST00000319838:exon_241569366_241570676:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000403859:exon_241569366_241570587:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000438013:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000407714:exon_241569366_241570299:GPR35;ENSG00000178623:ENST00000430267:exon_241568795_241570669:GPR35
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242036797	A/G	1	26	39	65	12.4146122456237	20.3780816315644	-7.96346938594071	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0617175395635476	ENSG00000122085:ENST00000241527:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000455202:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000493169:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000414146:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000391980:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000406593:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000439144:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000424798:exon_242036658_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000460915:exon_242036341_242036842:MTERFD2;ENSG00000122085:ENST00000407095:exon_242036602_242036842:MTERFD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242046785	A/C	1	83	55	138	39.6312621687219	28.7383202496421	10.8929419190797	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0732023394579902	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000472072:exon_242046768_242046914:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242046768_242046914:PASK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242051777	G/A	1	62	35	97	29.6040753549489	18.288021977045	11.3160533779039	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0249272517388899	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242051655_242051854:PASK;ENSG00000115687:ENST00000489256:exon_242051655_242052201:PASK;ENSG00000115687:ENST00000475666:exon_242051655_242051840:PASK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242062162	C/T	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242062147_242062314:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242062147_242062314:PASK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242066314	T/C	1	9	14	23	4.29736577733129	7.315208790818	-3.01784301348671	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.218350140624609	ENSG00000115687:ENST00000234040:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000405260:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000358649:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000403638:exon_242065611_242066866:PASK;ENSG00000115687:ENST00000493544:exon_242065611_242066866:PASK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242174923	C/T	1	112	139	251	53.478329673456	72.6295729945501	-19.1512433210941	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0162979084805331	ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242174536_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470482:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000479894:exon_242174905_242175009:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000483086:exon_242174905_242175044:HDLBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242189379	G/A	1	18	40	58	8.59473155466257	20.9005965451943	-12.3058649905317	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00141982413555696	ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000487169:exon_242189256_242190352:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000498595:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000476807:exon_242189256_242189395:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000477477:exon_242189256_242189395:HDLBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242195719	C/G	1	46	50	96	21.9643139730266	26.1257456814929	-4.16143170846627	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.414878802155107	ENSG00000115677:ENST00000391975:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000427183:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000447160:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000391976:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000310931:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000373292:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000453141:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000470710:exon_242195599_242195814:HDLBP;ENSG00000115677:ENST00000435952:exon_242195599_242195814:HDLBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242572829	C/T	1	56	55	111	26.739164836728	28.7383202496421	-1.99915541291413	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.705252533406493	ENSG00000176946:ENST00000407315:exon_242572332_242573494:THAP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242610172	A/G	1	48	24	72	22.9192841457669	12.5403579271166	10.3789262186503	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0177130214318458	ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000428861:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610141_242610197:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242609976_242610197:ATG4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242610794	G/T	1	53	37	90	25.3067095776176	19.3330518043047	5.97365777331287	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.245637542331986	ENSG00000168397:ENST00000405546:exon_242610727_242610840:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000337606:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000404914:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000402096:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494465:exon_242610727_242612014:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000396411:exon_242610727_242610856:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000482507:exon_242610727_242612046:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000344376:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000460211:exon_242610727_242610984:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000475693:exon_242610727_242610820:ATG4B;ENSG00000168397:ENST00000494132:exon_242610727_242611332:ATG4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242618050	A/G	1	39	52	91	18.6219183684356	27.1707755087526	-8.54885714031699	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0751704164460179	ENSG00000168393:ENST00000305784:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000400770:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000472618:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000445261:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000432348:exon_242617867_242618064:DTYMK;ENSG00000168393:ENST00000420144:exon_242617867_242618064:DTYMK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242674803	G/A	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000342518:exon_242674548_242674931:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000463932:exon_242674547_242674931:D2HGDH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	2	242707213	G/A	1	24	18	42	11.4596420728834	9.40526844533743	2.054373627546	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.541343610609833	ENSG00000180902:ENST00000321264:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000403782:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000436747:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000400769:exon_242707125_242708224:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000486953:exon_242707128_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000470343:exon_242707125_242707363:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000473126:exon_242707125_242708231:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000468064:exon_242707125_242708226:D2HGDH;ENSG00000180902:ENST00000445308:exon_242707125_242707377:D2HGDH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	259818	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000382369:exon_259813_259971:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_259813_259971:C20orf96
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	270204	T/C	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000196476:ENST00000360321:exon_270200_270317:C20orf96;ENSG00000196476:ENST00000400269:exon_270200_270317:C20orf96
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	826206	G/A	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000125898:ENST00000381941:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000304189:exon_825351_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000381939:exon_825354_826922:FAM110A;ENSG00000125898:ENST00000246100:exon_825351_826922:FAM110A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	1559101	T/G	1	12	7	19	5.72982103644172	3.657604395409	2.07221664103272	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.368580760602116	ENSG00000101307:ENST00000381605:exon_1558984_1559340:SIRPB1;ENSG00000101307:ENST00000381603:exon_1558984_1559340:SIRPB1;ENSG00000101307:ENST00000262929:exon_1558984_1559340:SIRPB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	1610894	G/A	1	35	13	48	16.711978022955	6.79269387718814	9.91928414576686	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00546871684102688	ENSG00000089012:ENST00000381580:exon_1610868_1610952:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000478145:exon_1610868_1610952:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000344103:exon_1610868_1610952:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000303415:exon_1610868_1610952:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000381583:exon_1610868_1610952:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000497407:exon_1610868_1610952:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000216927:exon_1610870_1610952:SIRPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	1616892	A/G	1	17	5	22	8.11724646829243	2.61257456814929	5.50467190014315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0193052698299583	ENSG00000089012:ENST00000381580:exon_1616834_1617151:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000303415:exon_1616834_1617151:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000381583:exon_1616834_1617151:SIRPG;ENSG00000089012:ENST00000216927:exon_1616834_1617151:SIRPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	2639162	T/C	1	137	104	241	65.4154568327096	54.3415510175051	11.0739058152045	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.156521750492271	ENSG00000101365:ENST00000474315:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000466494:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000469213:exon_2639041_2639296:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000492240:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380851:exon_2639041_2639168:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000380843:exon_2639041_2639483:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000488299:exon_2639041_2639483:IDH3B;ENSG00000101365:ENST00000435594:exon_2639043_2639483:IDH3B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	2816376	A/G	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.51179238012733	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	2845039	C/T	1	38	26	64	18.1444332820654	13.5853877543763	4.55904552768915	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.263014533295198	ENSG00000215305:ENST00000380445:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380469:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000458279:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000380443:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000215305:ENST00000487461:exon_2845011_2845108:VPS16;ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2845011_2845108:PTPRA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	2996497	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000132670:ENST00000380393:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000216877:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000425918:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000399903:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000358719:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000318266:exon_2996495_2996531:PTPRA;ENSG00000132670:ENST00000356147:exon_2996495_2996531:PTPRA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	4768282	G/A	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000101265:ENST00000379400:exon_4768279_4768400:RASSF2;ENSG00000101265:ENST00000478553:exon_4768279_4768347:RASSF2;ENSG00000101265:ENST00000474232:exon_4768279_4768400:RASSF2;ENSG00000101265:ENST00000379376:exon_4768279_4768400:RASSF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	5843812	T/C	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000378971:exon_5843670_5843920:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000445603:exon_5843670_5843854:C20orf196;ENSG00000171984:ENST00000442185:exon_5843670_5843950:C20orf196
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	5844121	C/T	1	11	19	30	5.25233595007157	9.92778335896728	-4.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.100762715434031	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	5844122	A/G	1	11	19	30	5.25233595007157	9.92778335896728	-4.67544740889571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.100762715434031	ENSG00000171984:ENST00000303142:exon_5843670_5844558:C20orf196
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	5923203	T/C	1	38	32	70	18.1444332820654	16.7204772361554	1.42395604591001	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.811143712925877	ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	5923204	T/C	1	37	32	69	17.6669481956953	16.7204772361554	0.946470959539866	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.90421162607564	ENSG00000089195:ENST00000473131:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000203001:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000466974:exon_5923074_5923432:TRMT6;ENSG00000089195:ENST00000453074:exon_5923074_5923432:TRMT6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	6194789	C/T	0	12	0	12	5.72982103644172	0	5.72982103644172	C	C		10	0.522514913629857	0.000554624092109663	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	9510483	C/G	1	14	1	15	6.684791209182	0.522514913629857	6.16227629555214	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.00113525073859650	ENSG00000125869:ENST00000246070:exon_9510289_9511171:C20orf103;ENSG00000125869:ENST00000427562:exon_9510289_9511171:C20orf103
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	10386013	C/A	1	14	6	20	6.684791209182	3.13508948177914	3.54970172740286	A:T:C	C	A	10	0.522514913629857	0.122656047255994	ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	10386059	G/A	1	22	12	34	10.5046719001431	6.27017896355828	4.23449293658486	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.170618716613916	ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10385428_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10385832_10386335:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10385832_10386335:MKKS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	10393629	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000125863:ENST00000419178:exon_10393178_10394162:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000347364:exon_10393178_10394579:MKKS;ENSG00000125863:ENST00000399054:exon_10393178_10394579:MKKS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	13695498	G/A	1	35	28	63	16.711978022955	14.630417581636	2.08156044131901	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.616440118046765	ENSG00000089048:ENST00000202816:exon_13694969_13695814:ESF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	17610536	G/A	1	22	27	49	10.5046719001431	14.1079026680061	-3.60323076786299	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.319696561891813	ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17610468_17610606:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000495501:exon_17610468_17610606:RRBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	17640898	A/T	1	15	20	35	7.16227629555214	10.4502982725971	-3.288021977045	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.311066888694314	ENSG00000125844:ENST00000360807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377813:exon_17639241_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000246043:exon_17639241_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000455029:exon_17639250_17641152:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000377807:exon_17640625_17641173:RRBP1;ENSG00000125844:ENST00000398782:exon_17640251_17641173:RRBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	18296076	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	18296473	C/T	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	18297193	T/C	1	11	9	20	5.25233595007157	4.70263422266871	0.549701727402859	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.82734324584336	ENSG00000125846:ENST00000377671:exon_18295716_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000396026:exon_18295716_18297638:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000401790:exon_18295713_18297637:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000402618:exon_18295716_18297460:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000316358:exon_18295713_18297640:ZNF133;ENSG00000125846:ENST00000462170:exon_18295713_18297640:ZNF133
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	18506558	T/C	1	35	19	54	16.711978022955	9.92778335896728	6.78419466398772	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.076108560285358	ENSG00000101310:ENST00000450074:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18506432_18506576:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18506432_18506576:SEC23B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	18523019	G/A	1	60	47	107	28.6491051822086	24.5582009406033	4.0909042416053	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.440529243577471	ENSG00000101310:ENST00000457769:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377481:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000336714:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000262544:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377475:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000377465:exon_18522940_18523046:SEC23B;ENSG00000101310:ENST00000422877:exon_18523012_18523046:SEC23B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	23350941	G/A	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125812:ENST00000338121:exon_23350728_23353700:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000377051:exon_23350728_23353682:GZF1;ENSG00000125812:ENST00000477239:exon_23350728_23351058:GZF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	24994289	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	24994293	G/A	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000154930:ENST00000323482:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000432802:exon_24994172_24994298:ACSS1;ENSG00000154930:ENST00000376727:exon_24994172_24994298:ACSS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	25288632	G/A	1	25	22	47	11.9371271592536	11.4953280998569	0.44179905939672	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100997:ENST00000376542:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000376517:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000339157:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000526543:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000491682:exon_25288602_25288681:ABHD12;ENSG00000100997:ENST00000481556:exon_25288602_25288681:ABHD12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	30371628	A/G	1	61	57	118	29.1265902685787	29.7833500769019	-0.65675980832313	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.926756550593372	ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30371508_30371724:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30371508_30371724:TPX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	30381758	G/C	1	47	48	95	22.4417990593967	25.0807158542331	-2.63891679483642	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.608700252375526	ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30381651_30381827:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30381651_30381827:TPX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	30382315	A/G	1	70	58	128	33.42395604591	30.3058649905317	3.1180910553783	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.596610083771756	ENSG00000088325:ENST00000300403:exon_30382205_30382351:TPX2;ENSG00000088325:ENST00000340513:exon_30382205_30382351:TPX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	30452782	C/T	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000149599:ENST00000278979:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000398084:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000339738:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000486996:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375966:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000398083:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375952:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000375953:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000459848:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000493115:exon_30452756_30452805:DUSP15;ENSG00000149599:ENST00000428829:exon_30452756_30452805:DUSP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	30661553	T/C	1	61	54	115	29.1265902685787	28.2158053360123	0.91078493256644	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.92569889206129	ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30661522_30661621:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30661519_30661621:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30661519_30661621:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30661519_30661621:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30661522_30661621:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30661519_30661621:HCK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	30662499	C/T	1	83	61	144	39.6312621687219	31.8734097314213	7.75785243730059	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.211092616775421	ENSG00000101336:ENST00000375862:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000486475:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000262651:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000520553:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000518730:exon_30662426_30662524:HCK;ENSG00000101336:ENST00000375852:exon_30662426_30662524:HCK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	31024274	T/C	1	17	20	37	8.11724646829243	10.4502982725971	-2.33305180430471	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.511428040721683	ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	31024329	C/T	1	44	27	71	21.0093438002863	14.1079026680061	6.90144113228015	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.121996862011644	ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000412498:exon_31022475_31025141:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	31025163	A/G	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000171456:ENST00000306058:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000358956:exon_31022235_31027121:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000375687:exon_31022235_31027122:ASXL1;ENSG00000171456:ENST00000421155:exon_31022235_31025694:ASXL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	31967273	A/G	1	19	15	34	9.07221664103272	7.83772370444786	1.23449293658486	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.73314906239147	ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000498525:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000496381:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000471264:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473791:exon_31967267_31967394:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31967267_31967497:CDK5RAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	31981849	T/C	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000101391:ENST00000481964:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000346416:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000357886:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000339269:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000473997:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000375351:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000452723:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000477105:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1;ENSG00000101391:ENST00000461356:exon_31981838_31981872:CDK5RAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	32264525	C/T	1	22	22	44	10.5046719001431	11.4953280998569	-0.990656199713708	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.765635035115544	ENSG00000101412:ENST00000343380:exon_32263489_32264785:E2F1;ENSG00000101412:ENST00000402461:exon_32263489_32264785:E2F1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	32295541	C/T	1	13	24	37	6.20730612281186	12.5403579271166	-6.33305180430471	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0471691193757264	ENSG00000101417:ENST00000409299:exon_32294512_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000344022:exon_32295075_32295775:PXMP4;ENSG00000101417:ENST00000217398:exon_32295295_32295775:PXMP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	33328339	G/A	1	15	14	29	7.16227629555214	7.315208790818	-0.152932495265853	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000198646:ENST00000397675:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000374796:exon_33328167_33331145:NCOA6;ENSG00000198646:ENST00000359003:exon_33328167_33331145:NCOA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	33657126	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000100991:ENST00000252015:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000451813:exon_33657099_33657215:TRPC4AP;ENSG00000100991:ENST00000432634:exon_33657099_33657215:TRPC4AP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	34526799	G/A	1	18	22	40	8.59473155466257	11.4953280998569	-2.90059654519428	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.429263432801788	ENSG00000025293:ENST00000374012:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000439301:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000373994:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000413965:exon_34526619_34527030:PHF20;ENSG00000025293:ENST00000473943:exon_34526554_34527030:PHF20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	34843689	C/T	1	21	34	55	10.027186813773	17.7655070634151	-7.73832024964214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0424689139522804	ENSG00000131043:ENST00000320849:exon_34843500_34844855:C20orf4;ENSG00000131043:ENST00000373932:exon_34843500_34844855:C20orf4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	35399559	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000149636:ENST00000373745:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000426836:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000448110:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373733:exon_35399521_35399569:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000373750:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000480153:exon_35399276_35399876:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000473615:exon_35399521_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000449595:exon_35399276_35399596:DSN1;ENSG00000149636:ENST00000447406:exon_35399276_35399596:DSN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	36022334	A/G	1	14	7	21	6.684791209182	3.657604395409	3.027186813773	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.198655985278081	ENSG00000197122:ENST00000445403:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373578:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000358208:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000360723:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373567:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000373558:exon_36022298_36022396:SRC;ENSG00000197122:ENST00000472968:exon_36022298_36022577:SRC;ENSG00000197122:ENST00000489153:exon_36022148_36022396:SRC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	37383640	T/C	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37383600_37383817:ACTR5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	37400490	G/A	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000101442:ENST00000243903:exon_37400202_37400834:ACTR5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	42089566	C/T	1	114	158	272	54.4332998461963	82.5573563535174	-28.1240565073211	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.000661188325508286	ENSG00000124193:ENST00000244020:exon_42089343_42092245:SRSF6;ENSG00000124193:ENST00000483871:exon_42089343_42092245:SRSF6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	42225114	G/A	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000101052:ENST00000373030:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000373039:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000436476:exon_42225075_42225162:IFT52;ENSG00000101052:ENST00000486243:exon_42225075_42225162:IFT52
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	42310426	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000101057:ENST00000217026:exon_42310424_42310495:MYBL2;ENSG00000101057:ENST00000396863:exon_42310424_42310495:MYBL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	42680074	G/A	1	60	58	118	28.6491051822086	30.3058649905317	-1.65675980832313	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.782708851125817	ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000442881:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42679946_42680185:TOX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	42680175	T/C	1	78	87	165	37.2438367368712	45.4587974857976	-8.21496074892641	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.212735974695767	ENSG00000124191:ENST00000341197:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000442881:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000423191:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372992:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000372999:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000358131:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000348077:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000421416:exon_42679946_42680185:TOX2;ENSG00000124191:ENST00000435864:exon_42679946_42680185:TOX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	44052992	G/A	1	20	16	36	9.54970172740286	8.36023861807771	1.18946310932515	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.740680249875467	ENSG00000124155:ENST00000279036:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000341555:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000279035:exon_44052856_44053021:PIGT;ENSG00000124155:ENST00000372689:exon_44052856_44053021:PIGT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	44420637	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	44420682	T/C	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000101457:ENST00000372622:exon_44420576_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372614:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000372605:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000439990:exon_44420631_44420748:DNTTIP1;ENSG00000101457:ENST00000449078:exon_44420659_44420748:DNTTIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	44574459	C/T	1	17	12	29	8.11724646829243	6.27017896355828	1.84706750473415	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.578659663491947	ENSG00000100982:ENST00000372409:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000443130:exon_44574350_44574522:PCIF1;ENSG00000100982:ENST00000479348:exon_44574350_44574522:PCIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	44747004	T/G	1	37	48	85	17.6669481956953	25.0807158542331	-7.41376765853785	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.128062285569426	ENSG00000101017:ENST00000372285:exon_44746911_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372276:exon_44746955_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000372278:exon_44746976_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000466205:exon_44746987_44747033:CD40;ENSG00000101017:ENST00000489304:exon_44746990_44747033:CD40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	45853082	G/A	1	28	19	47	13.369582418364	9.92778335896728	3.44179905939672	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.38131550901628	ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45852970_45853209:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45852970_45853209:ZMYND8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	45867852	A/G	1	11	13	24	5.25233595007157	6.79269387718814	-1.54035792711657	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.547183126666461	ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45867502_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45867640_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45866054_45867882:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45867242_45867882:ZMYND8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	45905197	C/T	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000101040:ENST00000360911:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000311275:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000458360:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000467200:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000262975:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000471951:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000352431:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000446994:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000396281:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000355972:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000461685:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000468376:exon_45905058_45905539:ZMYND8;ENSG00000101040:ENST00000372023:exon_45905058_45905539:ZMYND8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	47253196	G/A	1	17	21	38	8.11724646829243	10.972813186227	-2.85556671793457	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.417598108706776	ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47253001_47253221:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47253001_47253221:PREX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	47261017	T/C	1	14	16	30	6.684791209182	8.36023861807771	-1.67544740889571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.586545503505938	ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47260947_47261035:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47260947_47261035:PREX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	47262549	C/T	1	14	16	30	6.684791209182	8.36023861807771	-1.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.586545503505938	ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47262389_47262595:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47262389_47262595:PREX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	47269211	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000124126:ENST00000371941:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000482556:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396223:exon_47269124_47269244:PREX1;ENSG00000124126:ENST00000396220:exon_47269124_47269244:PREX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	47845262	C/T	1	58	55	113	27.6941350094683	28.7383202496421	-1.04418524017384	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.851207399533693	ENSG00000124228:ENST00000371764:exon_47845252_47845425:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000484427:exon_47845252_47845425:DDX27;ENSG00000124228:ENST00000493252:exon_47845252_47845425:DDX27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	47865011	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000124201:ENST00000371752:exon_47862434_47866248:ZNFX1;ENSG00000124201:ENST00000396105:exon_47862437_47866248:ZNFX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	48522330	G/A	1	15	18	33	7.16227629555214	9.40526844533743	-2.24299214978528	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.487871189805214	ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	48522585	G/A	1	19	16	35	9.07221664103272	8.36023861807771	0.711978022955003	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.866673542710621	ENSG00000158480:ENST00000289431:exon_48519928_48523382:SPATA2;ENSG00000158480:ENST00000422556:exon_48519931_48523382:SPATA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	49493171	G/A	1	75	53	128	35.8113814777607	27.6932904223824	8.1180910553783	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.157591771428887	ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	49493195	A/G	1	78	54	132	37.2438367368712	28.2158053360123	9.02803140085887	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.117736314281803	ENSG00000124243:ENST00000358791:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000262591:exon_49493023_49493713:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000371608:exon_49493023_49493714:BCAS4;ENSG00000124243:ENST00000463943:exon_49493023_49493714:BCAS4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	50769183	G/A	0	9	0	9	4.29736577733129	0	4.29736577733129	G	G		10	0.522514913629857	0.00419341962025637	ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	50769225	C/A	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	50769379	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	50769549	A/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50767817_50769967:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50767817_50769967:ZFP64
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	50803444	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	50803573	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000020256:ENST00000371518:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000361387:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000216923:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000346617:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371515:exon_50803371_50803604:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000371516:exon_50803371_50803610:ZFP64;ENSG00000020256:ENST00000461898:exon_50803371_50803610:ZFP64
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	52570052	C/T	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000064787:ENST00000448484:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371440:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000448710:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000434986:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000395961:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000371435:exon_52569971_52570234:BCAS1;ENSG00000064787:ENST00000422805:exon_52569971_52570234:BCAS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	56227514	T/C	1	12	13	25	5.72982103644172	6.79269387718814	-1.06287284074643	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.693678355794431	ENSG00000124225:ENST00000341744:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000347215:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395816:exon_56223448_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395821:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000265626:exon_56223454_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395814:exon_56227093_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000414037:exon_56227264_56227654:PMEPA1;ENSG00000124225:ENST00000395819:exon_56227463_56227654:PMEPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	57269495	G/A	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57269478_57269648:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371131:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000371137:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000445528:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57269478_57269648:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000533788:exon_57269477_57269648:NPEPL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	57289645	T/C	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000254995:ENST00000530122:exon_57289616_57289726:RP11-261P9.5;ENSG00000215440:ENST00000525967:exon_57289616_57289726:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525817:exon_57289616_57289726:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000356091:exon_57289616_57289726:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000529976:exon_57287535_57290900:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527587:exon_57289616_57289726:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000527081:exon_57289616_57289726:NPEPL1;ENSG00000215440:ENST00000525068:exon_57289616_57290020:NPEPL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	57478807	C/T	1	215	242	457	102.659293569581	126.448609098425	-23.7893155288447	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0276748767558008	ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000419558:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000462499:exon_57478727_57478829:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000450130:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000349036:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000485673:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000478585:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000494081:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57478727_57478846:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57478796_57478846:GNAS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	57484241	C/T	1	536	477	1013	255.932006294397	249.239613801442	6.69239249295484	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.682723666830787	ENSG00000087460:ENST00000313949:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371075:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000472183:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000482112:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000490374:exon_57484217_57484243:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467227:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371100:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371102:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464624:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488546:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000481039:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468895:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000467321:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000477931:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000470512:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000464788:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000469431:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000474497:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480975:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000480232:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371095:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371085:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000354359:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000265620:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000306090:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000371082:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000488652:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476935:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000468942:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000492907:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487862:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000496934:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000476196:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000487981:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000493958:exon_57484217_57484271:GNAS;ENSG00000087460:ENST00000479025:exon_57483971_57484271:GNAS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	57571818	G/C	1	324	231	555	154.705167983926	120.700945048497	34.0042229354293	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.00384741995632061	ENSG00000101160:ENST00000217131:exon_57571694_57571856:CTSZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	60963403	C/T	1	3403	3475	6878	1624.8817489176	1815.73932486375	-190.857575946157	A:T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	4.23065248212805e-06	ENSG00000171858:ENST00000317311:exon_60963365_60963420:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000492356:exon_60963365_60963575:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000343986:exon_60963365_60963420:RPS21;ENSG00000171858:ENST00000370562:exon_60962667_60963576:RPS21
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	61444356	G/A	1	62	55	117	29.6040753549489	28.7383202496421	0.865755105306729	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.926348807862622	ENSG00000060491:ENST00000290291:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000357163:exon_61443582_61444558:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000446814:exon_61443582_61445351:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370461:exon_61443582_61445352:OGFR;ENSG00000060491:ENST00000370469:exon_61443582_61444558:OGFR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	61488785	T/C	1	10	12	22	4.77485086370143	6.27017896355828	-1.49532809985685	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.531657196609609	ENSG00000101190:ENST00000335351:exon_61488747_61488990:TCFL5;ENSG00000101190:ENST00000217162:exon_61488747_61488990:TCFL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	61598881	C/T	1	13	18	31	6.20730612281186	9.40526844533743	-3.19796232252557	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.283100228803222	ENSG00000101194:ENST00000370351:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000370349:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000488738:exon_61598055_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000459704:exon_61598689_61599949:SLC17A9;ENSG00000101194:ENST00000483113:exon_61598689_61599949:SLC17A9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	62191321	A/G	1	13	15	28	6.20730612281186	7.83772370444786	-1.630417581636	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.574469279427906	ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62191281_62191448:RP4-697K14.7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	62192244	C/T	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130589:ENST00000427522:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000252889:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000370091:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000478861:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7;ENSG00000130589:ENST00000467148:exon_62192148_62192282:RP4-697K14.7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	62369605	C/T	1	15	25	40	7.16227629555214	13.0628728407464	-5.90059654519428	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.0805242805870575	ENSG00000197114:ENST00000490623:exon_62369536_62369852:ZGPAT;ENSG00000197114:ENST00000486025:exon_62369536_62369852:ZGPAT;ENSG00000203896:ENST00000496820:exon_62369536_62369794:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000490824:exon_62369361_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000309546:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000487026:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000480139:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000493265:exon_62369536_62369697:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000489212:exon_62369361_62369712:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000476183:exon_62369536_62369852:LIME1;ENSG00000203896:ENST00000494776:exon_62369558_62369720:LIME1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	62577613	T/C	1	3	10	13	1.43245525911043	5.22514913629857	-3.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0493024340440666	ENSG00000198276:ENST00000354216:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369892:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000369908:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000358711:exon_62577514_62577620:UCKL1;ENSG00000198276:ENST00000492660:exon_62577158_62577620:UCKL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	62701627	G/A	1	18	20	38	8.59473155466257	10.4502982725971	-1.85556671793457	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.62701847968266	ENSG00000171703:ENST00000395050:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000361317:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000395053:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000343484:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000339217:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000440819:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465111:exon_62701118_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000458442:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000465433:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000477783:exon_62701613_62701767:TCEA2;ENSG00000171703:ENST00000495168:exon_62701567_62701988:TCEA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	20	62705575	G/A	1	69	48	117	32.9464709595399	25.0807158542331	7.86575510530673	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.164955158655199	ENSG00000171700:ENST00000395042:exon_62705497_62705731:RGS19;ENSG00000171700:ENST00000332298:exon_62705497_62705731:RGS19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	15858321	C/T	1	166	151	317	79.2625243374437	78.8997519581084	0.362772379335325	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15857549_15858435:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400564:exon_15857549_15858435:SAMSN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	15889304	C/G	1	68	77	145	32.4689858731697	40.233648349499	-7.76466247632927	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.212588465277040	ENSG00000155307:ENST00000285670:exon_15889213_15889362:SAMSN1;ENSG00000155307:ENST00000400566:exon_15889213_15889362:SAMSN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	27264097	G/T	1	21	5	26	10.027186813773	2.61257456814929	7.41461224562372	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00491419691692363	ENSG00000142192:ENST00000346798:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000354192:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000348990:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000357903:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000358918:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000359726:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000452232:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000440126:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000448388:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000439274:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000456209:exon_27264030_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000464867:exon_27264034_27264180:APP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	27264121	G/A	1	19	3	22	9.07221664103272	1.56754474088957	7.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00107353922133980	ENSG00000142192:ENST00000346798:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000354192:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000348990:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000357903:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000358918:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000359726:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000452232:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000440126:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000448388:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000439274:exon_27264034_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000456209:exon_27264030_27264180:APP;ENSG00000142192:ENST00000464867:exon_27264034_27264180:APP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	33043779	G/C	1	57	47	104	27.2166499230981	24.5582009406033	2.65844898249487	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.624661442652344	ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33043313_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33043313_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33043313_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33043346_33044667:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33043346_33044667:SFRS15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	33074666	A/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000156304:ENST00000435228:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000419806:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000434667:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000286835:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000399804:exon_33074557_33074692:SFRS15;ENSG00000156304:ENST00000485790:exon_33074557_33074692:SFRS15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	34614255	T/G	1	25	21	46	11.9371271592536	10.972813186227	0.964313973026577	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.882893269061336	ENSG00000159110:ENST00000382264:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000404220:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382241:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000423152:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342136:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000420068:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000444089:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000342101:exon_34614145_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000382238:exon_34614191_34614282:IFNAR2;ENSG00000159110:ENST00000447980:exon_34614191_34614282:IFNAR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	34721782	C/T	1	10	8	18	4.77485086370143	4.18011930903886	0.594731554662573	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.817886779949097	ENSG00000142166:ENST00000270139:exon_34721695_34721849:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000442357:exon_34721695_34721849:IFNAR1;ENSG00000142166:ENST00000416947:exon_34721695_34721849:IFNAR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	34787312	A/G	1	38	32	70	18.1444332820654	16.7204772361554	1.42395604591001	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.811143712925877	ENSG00000159128:ENST00000290219:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000439213:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000381995:exon_34787195_34787327:IFNGR2;ENSG00000159128:ENST00000405436:exon_34787195_34787327:IFNGR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	34889723	G/A	1	36	30	66	17.1894631093251	15.6754474088957	1.51401570042944	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.805576971746297	ENSG00000159131:ENST00000381831:exon_34889664_34889915:GART;ENSG00000159131:ENST00000381815:exon_34889664_34889915:GART;ENSG00000159131:ENST00000381839:exon_34889664_34889915:GART;ENSG00000159131:ENST00000424203:exon_34889664_34889915:GART
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	34924351	T/G	1	3	16	19	1.43245525911043	8.36023861807771	-6.92778335896728	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.00189905558322989	ENSG00000159140:ENST00000356577:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000321758:exon_34923890_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000290239:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381729:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000300278:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000455528:exon_34921782_34927697:SON;ENSG00000159140:ENST00000381679:exon_34921782_34927697:SON
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	35281421	T/C	1	353	237	590	168.55223548866	123.836034530276	44.7162009583844	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000238986306124845	ENSG00000249209:ENST00000429238:exon_35281386_35281515:AP000304.12;ENSG00000241837:ENST00000491703:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000290299:exon_35281386_35281515:ATP5O;ENSG00000241837:ENST00000495005:exon_35281118_35281515:ATP5O
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	36081794	G/T	1	11	23	34	5.25233595007157	12.0178430134867	-6.76550706341514	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.024705298304645	ENSG00000159212:ENST00000360731:exon_36081655_36081836:CLIC6;ENSG00000159212:ENST00000349499:exon_36081655_36081836:CLIC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	37445012	C/A	0	0	14	14	0	7.315208790818	-7.315208790818	A	C	A	10	0.522514913629857	3.20211821506116e-05	ENSG00000159228:ENST00000530908:exon_37444113_37445464:CBR1;ENSG00000159228:ENST00000290349:exon_37444744_37445464:CBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	38438006	T/C	1	91	69	160	43.451142859683	36.0535290404601	7.39761381922288	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.267918943884065	ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38435146_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38436448_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38437674_38438012:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38437674_38438012:PIGP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	38444822	T/A	1	27	29	56	12.8920973319939	15.1529324952659	-2.26083516327199	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.593632895946727	ENSG00000185808:ENST00000464265:exon_38444734_38445111:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000360525:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399102:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399098:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000399103:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000329667:exon_38444734_38444837:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000479152:exon_38444734_38445023:PIGP;ENSG00000185808:ENST00000430792:exon_38444734_38445297:PIGP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	38525356	T/C	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000182670:ENST00000418766:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000485402:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000438055:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38525251_38525577:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000414818:exon_38525251_38525577:TTC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	38563725	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38563635_38563725:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38563635_38563725:TTC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	38568308	C/T	1	5	13	18	2.38742543185071	6.79269387718814	-4.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0562616570271979	ENSG00000182670:ENST00000355666:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000399017:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000354749:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000479930:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000476784:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000428693:exon_38567976_38568337:TTC3;ENSG00000182670:ENST00000488522:exon_38567976_38568337:TTC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	42824661	A/G	1	420	373	793	200.54373627546	194.898062783937	5.64567349152338	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.695912401920036	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	42824733	G/A	1	531	579	1110	253.544580862546	302.536134991687	-48.9915541291413	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00354496332536909	ENSG00000157601:ENST00000398600:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000398598:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000288383:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000455164:exon_42824548_42824796:MX1;ENSG00000157601:ENST00000491110:exon_42824548_42824747:MX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	43863455	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000160185:ENST00000291535:exon_43863422_43863528:UBASH3A;ENSG00000160185:ENST00000319294:exon_43863422_43863528:UBASH3A;ENSG00000160185:ENST00000473381:exon_43863422_43863528:UBASH3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	43863521	A/G	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000160185:ENST00000291535:exon_43863422_43863528:UBASH3A;ENSG00000160185:ENST00000319294:exon_43863422_43863528:UBASH3A;ENSG00000160185:ENST00000473381:exon_43863422_43863528:UBASH3A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	44270309	G/A	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44270151_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44269336_44270352:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44269336_44270352:WDR4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	44293744	C/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000160193:ENST00000330317:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000492742:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000476326:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000398208:exon_44293661_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000479429:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000463902:exon_44293713_44293801:WDR4;ENSG00000160193:ENST00000470658:exon_44293661_44293801:WDR4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	44323590	T/G	1	46	44	90	21.9643139730266	22.9906561997137	-1.02634222668713	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.833748175195681	ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000460740:exon_44323292_44324041:NDUFV3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	44324365	G/A	1	65	65	130	31.0365306140593	33.9634693859407	-2.92693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.660858491976497	ENSG00000160194:ENST00000460259:exon_44323292_44324386:NDUFV3;ENSG00000160194:ENST00000354250:exon_44323292_44324386:NDUFV3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	44514809	G/A	1	209	170	379	99.7943830513599	88.8275353170757	10.9668477342842	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.280221808747634	ENSG00000160201:ENST00000291552:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000380276:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000464750:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000459639:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000475639:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000478282:exon_44514765_44516500:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000471250:exon_44514765_44516053:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000398137:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000457176:exon_44514765_44514898:U2AF1;ENSG00000160201:ENST00000486519:exon_44514765_44514898:U2AF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45107875	G/A	1	18	16	34	8.59473155466257	8.36023861807771	0.234492936584861	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000160208:ENST00000340648:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000446602:exon_45107397_45108121:RRP1B;ENSG00000160208:ENST00000470886:exon_45107397_45108121:RRP1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45168884	G/A	1	82	65	147	39.1537770823517	33.9634693859407	5.19030769641102	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.409784166354664	ENSG00000160209:ENST00000468090:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000291565:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000463355:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398085:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000498040:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000481512:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000490666:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467640:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000467908:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000343528:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000398078:exon_45168876_45168961:PDXK;ENSG00000160209:ENST00000468392:exon_45168876_45168961:PDXK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45217559	T/C	1	92	104	196	43.9286279460532	54.3415510175051	-10.412923071452	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.152553695085192	ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000483896:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217512_45217576:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217512_45217576:RRP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45217929	T/C	1	38	41	79	18.1444332820654	21.4231114588241	-3.27867817675871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.499898842656914	ENSG00000160214:ENST00000497547:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000291569:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000400387:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000467112:exon_45217788_45217981:RRP1;ENSG00000160214:ENST00000471909:exon_45217788_45217981:RRP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45503121	G/A	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000160218:ENST00000291574:exon_45502669_45503183:TRAPPC10;ENSG00000160218:ENST00000422875:exon_45502669_45503183:TRAPPC10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45542123	A/G	1	6	25	31	2.86491051822086	13.0628728407464	-10.1979623225256	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000223700446715224	ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45542058_45542238:PWP2;ENSG00000241945:ENST00000471490:exon_45540833_45542238:PWP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45550493	A/G	1	69	66	135	32.9464709595399	34.4859842995706	-1.53951334003069	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.796731585305705	ENSG00000241945:ENST00000291576:exon_45550479_45551063:PWP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	45556042	G/A	1	56	54	110	26.739164836728	28.2158053360123	-1.47664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.848724521082455	ENSG00000248354:ENST00000433711:exon_45555942_45556055:AP001055.7;ENSG00000160221:ENST00000291577:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000495007:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000427803:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000493883:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000480786:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000348499:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000389690:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000449622:exon_45555942_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000488392:exon_45555989_45556055:C21orf33;ENSG00000160221:ENST00000419699:exon_45556001_45556055:C21orf33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	46271452	C/T	1	11	17	28	5.25233595007157	8.88275353170757	-3.630417581636	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.188554810823175	ENSG00000183255:ENST00000397887:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000330938:exon_46269500_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000445724:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000423073:exon_46269515_46271542:PTTG1IP;ENSG00000183255:ENST00000397886:exon_46271322_46271542:PTTG1IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	46314967	G/A	1	30	36	66	14.3245525911043	18.8105368906749	-4.48598429957056	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.324288558604661	ENSG00000160255:ENST00000397852:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397857:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397854:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000498666:exon_46312832_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000355153:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000397850:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000523323:exon_46314886_46314975:ITGB2;ENSG00000160255:ENST00000302347:exon_46314886_46314975:ITGB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	46945782	G/T	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000173638:ENST00000417954:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000485649:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46945731_46945872:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46945731_46945872:SLC19A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	46957794	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000173638:ENST00000380014:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000311124:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000380010:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000427839:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000443742:exon_46957685_46957922:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000486303:exon_46957685_46957847:SLC19A1;ENSG00000173638:ENST00000528477:exon_46957692_46957922:SLC19A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47581423	C/T	0	0	31	31	0	16.1979623225256	-16.1979623225256	T	C	T	10	0.522514913629857	1.11623119803936e-10	ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581062_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581063_47581619:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581075_47581619:C21orf56
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47581961	C/A	0	0	20	20	0	10.4502982725971	-10.4502982725971	A	C	A	10	0.522514913629857	3.79486412046506e-07	ENSG00000160284:ENST00000330205:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000416550:exon_47581830_47581981:C21orf56;ENSG00000160284:ENST00000291672:exon_47581830_47581981:C21orf56
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47614443	A/G	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000419093:exon_47614405_47614494:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47614405_47614575:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47614405_47614575:LSS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47635178	G/C	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635094_47635212:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635094_47635212:LSS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47635627	C/G	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000160285:ENST00000356396:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000457828:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000397728:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000522411:exon_47635599_47635707:LSS;ENSG00000160285:ENST00000464357:exon_47635599_47635707:LSS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47665025	G/A	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000160294:ENST00000397708:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000486937:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000496607:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000467026:exon_47664721_47665111:MCM3AP;ENSG00000160294:ENST00000291688:exon_47664721_47665111:MCM3AP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47836395	T/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47836426	T/C	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47836547	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47835983_47836753:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47835983_47836753:PCNT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	47848459	G/A	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000160299:ENST00000359568:exon_47848309_47848504:PCNT;ENSG00000160299:ENST00000480896:exon_47848309_47848504:PCNT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	21	48083338	G/A	1	2	12	14	0.954970172740286	6.27017896355828	-5.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00557179455622664	ENSG00000160310:ENST00000355680:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397638:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000397637:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000458387:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000291705:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000440086:exon_48083295_48083466:PRMT2;ENSG00000160310:ENST00000486520:exon_48083295_48083466:PRMT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	17669306	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000093072:ENST00000399839:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000449907:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000262607:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000330232:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000399837:exon_17669229_17669337:CECR1;ENSG00000093072:ENST00000469063:exon_17669229_17669617:CECR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	18111431	T/C	1	25	12	37	11.9371271592536	6.27017896355828	5.66694819569529	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0704896932485114	ENSG00000131100:ENST00000253413:exon_18111369_18111584:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399796:exon_18111369_18111513:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000399798:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000413576:exon_18111369_18111499:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000478963:exon_18111369_18111514:ATP6V1E1;ENSG00000131100:ENST00000460085:exon_18111369_18111515:ATP6V1E1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	18165995	T/G	1	12	15	27	5.72982103644172	7.83772370444786	-2.10790266800614	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.446234170782508	ENSG00000099968:ENST00000399781:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399782:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000464649:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000493680:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000337612:exon_18165980_18166087:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18165980_18166087:BCL2L13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	18209613	A/G	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000099968:ENST00000317582:exon_18209443_18211487:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000498133:exon_18209443_18211465:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000355028:exon_18209443_18213388:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000418951:exon_18209443_18210308:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000399777:exon_18209443_18211906:BCL2L13;ENSG00000099968:ENST00000485631:exon_18209443_18210436:BCL2L13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	19423250	G/A	1	254	212	466	121.281211938016	110.77316168953	10.5080502484866	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.353718659172008	ENSG00000185608:ENST00000333130:exon_19423161_19423598:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000443660:exon_19423161_19423590:MRPL40;ENSG00000185608:ENST00000471259:exon_19423161_19423533:MRPL40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	19838730	G/A	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000215012:ENST00000407472:exon_19833661_19840009:C22orf29;ENSG00000215012:ENST00000328554:exon_19833669_19840009:C22orf29;ENSG00000215012:ENST00000405640:exon_19833669_19840009:C22orf29
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	19903290	C/G	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000494454:exon_19903288_19903889:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000484672:exon_19903288_19903366:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471835:exon_19903288_19903360:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19903288_19903366:TXNRD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	19906511	G/A	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000474308:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19906383_19906527:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19906383_19906527:TXNRD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	19907099	C/A	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000184470:ENST00000400518:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000492802:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400521:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400525:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000471149:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000400519:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496545:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000491939:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000334363:exon_19907066_19907122:TXNRD2;ENSG00000184470:ENST00000496729:exon_19907066_19907122:TXNRD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	19950268	G/A	1	83	93	176	39.6312621687219	48.5938869675767	-8.96262479885483	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.199453903682986	ENSG00000093010:ENST00000361682:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403184:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000403710:exon_19949756_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000407537:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000467943:exon_19950050_19950399:COMT;ENSG00000093010:ENST00000412786:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000207636:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000406520:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000436217:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000402871:exon_19950050_19950338:COMT;ENSG00000093010:ENST00000449653:exon_19950070_19950338:COMT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	20052143	C/T	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000183597:ENST00000401886:exon_20052065_20052881:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000398042:exon_20052065_20053449:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000399807:exon_20052065_20053385:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000450019:exon_20052065_20052787:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000327374:exon_20052065_20053449:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000432883:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000401833:exon_20052065_20052887:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000444651:exon_20052065_20052430:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420290:exon_20052065_20052187:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000420446:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000447208:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000456048:exon_20052065_20053447:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000490583:exon_20052065_20052482:C22orf25;ENSG00000183597:ENST00000476940:exon_20052065_20052452:C22orf25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	20100687	G/A	1	26	13	39	12.4146122456237	6.79269387718814	5.62191836843558	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0787142364989177	ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000480339:exon_20100434_20100701:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000444845:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000487668:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000487378:exon_20100641_20100901:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494820:exon_20100641_20100757:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000492988:exon_20100641_20100757:TRMT2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	20103953	G/A	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20103561_20104156:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20103557_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000468917:exon_20103561_20104073:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494641:exon_20103581_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000464535:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000445045:exon_20103765_20104135:TRMT2A;ENSG00000099901:ENST00000432879:exon_20103461_20103953:RANBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	20104101	C/T	1	7	13	20	3.342395604591	6.79269387718814	-3.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.177937843741256	ENSG00000099899:ENST00000252136:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000403707:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000405037:exon_20103561_20104156:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000404751:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000402382:exon_20103557_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000439169:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000494641:exon_20103581_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000464535:exon_20103561_20104135:TRMT2A;ENSG00000099899:ENST00000445045:exon_20103765_20104135:TRMT2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	21982809	G/T	1	70	42	112	33.42395604591	21.945626372454	11.478329673456	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0369651337882534	ENSG00000161179:ENST00000464015:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000468686:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000292778:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000415762:exon_21982378_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000398873:exon_21982381_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000473985:exon_21982403_21983076:YDJC;ENSG00000161179:ENST00000482998:exon_21982411_21983076:YDJC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	21998219	G/A	1	120	125	245	57.2982103644172	65.3143642037321	-8.01615383931497	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.307055474720183	ENSG00000128228:ENST00000248958:exon_21998183_21998587:SDF2L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	22042374	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000100023:ENST00000412327:exon_22042362_22042395:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000335025:exon_22042362_22042395:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000398831:exon_22042362_22042395:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000456792:exon_22042362_22042395:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000417788:exon_22042362_22042395:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000406385:exon_22042362_22042395:PPIL2;ENSG00000100023:ENST00000446951:exon_22042362_22042395:PPIL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	24095337	C/T	0	9	0	9	4.29736577733129	0	4.29736577733129	C	C		10	0.522514913629857	0.00419341962025637	ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000398465:exon_24094930_24095337:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	24095355	G/A	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000128218:ENST00000398466:exon_24095082_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000248948:exon_24094930_24095385:VPREB3;ENSG00000128218:ENST00000405618:exon_24094937_24095385:VPREB3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	24108288	C/G	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.766636367306549	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	24108412	G/A	1	496	508	1004	236.832602839591	265.437576123967	-28.6049732843764	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.071781484544352	ENSG00000250479:ENST00000476831:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000520222:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000401675:exon_24108315_24108483:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000484558:exon_24108315_24108462:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000523865:exon_24108315_24108651:CHCHD10;ENSG00000250479:ENST00000517886:exon_24108315_24108462:CHCHD10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	24837301	T/C	1	24	16	40	11.4596420728834	8.36023861807771	3.09940345480572	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.346577859987784	ENSG00000100014:ENST00000358654:exon_24836551_24838324:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000513294:exon_24836551_24838328:SPECC1L;ENSG00000100014:ENST00000417596:exon_24836551_24837457:SPECC1L;ENSG00000128271:ENST00000444262:exon_24836551_24837313:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000337539:exon_24836551_24838328:ADORA2A;ENSG00000128271:ENST00000491194:exon_24836551_24838289:ADORA2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	24921706	C/T	1	11	20	31	5.25233595007157	10.4502982725971	-5.19796232252557	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0721830321938906	ENSG00000100024:ENST00000415388:exon_24921679_24922636:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000326010:exon_24921679_24922553:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000413389:exon_24921679_24922552:UPB1;ENSG00000100024:ENST00000498140:exon_24921679_24924358:UPB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	26853905	C/A	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26853825_26853933:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26853825_26853933:HPS4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	26854441	G/A	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26854411_26854543:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000485842:exon_26854411_26854543:HPS4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	26859942	C/T	1	5	11	16	2.38742543185071	5.74766404992843	-3.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.131589504447199	ENSG00000100099:ENST00000519774:exon_26859883_26859981:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000493455:exon_26859883_26860158:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398145:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000398141:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000429411:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000464362:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000402105:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000336873:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000439453:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000466781:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000496385:exon_26859883_26860792:HPS4;ENSG00000100099:ENST00000411771:exon_26859883_26860792:HPS4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	26884039	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000100104:ENST00000215917:exon_26883995_26884254:SRRD;ENSG00000100104:ENST00000477945:exon_26883948_26884254:SRRD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	26895337	G/A	1	21	17	38	10.027186813773	8.88275353170757	1.14443328206543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.747660149924728	ENSG00000100109:ENST00000407690:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407431:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000407148:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000442693:exon_26895070_26895348:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000263115:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000458588:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000405938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000448938:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000428725:exon_26895070_26895597:TFIP11;ENSG00000100109:ENST00000481357:exon_26895070_26895357:TFIP11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	29130458	T/C	1	9	2	11	4.29736577733129	1.04502982725971	3.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0683741834740758	ENSG00000183765:ENST00000416671:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000348295:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382578:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382565:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382566:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000328354:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000404276:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000405598:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000382580:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433028:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000448511:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000417588:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000433728:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000403642:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000402731:exon_29130391_29130709:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000447421:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000439200:exon_29130391_29130715:CHEK2;ENSG00000183765:ENST00000398017:exon_29130391_29130715:CHEK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	29724792	T/C	1	71	52	123	33.9014411322801	27.1707755087526	6.73066562352758	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.241138397332111	ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29723669_29726521:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29723669_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29723854_29724884:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29724727_29724884:AP1B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	29727866	C/T	1	42	42	84	20.054373627546	21.945626372454	-1.89125274490799	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.743435210540173	ENSG00000100280:ENST00000482818:exon_29727776_29728310:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000356015:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000357586:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000405198:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000317368:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000402502:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000415447:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000432560:exon_29727776_29727905:AP1B1;ENSG00000100280:ENST00000472057:exon_29727776_29727905:AP1B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	29957826	G/A	1	53	48	101	25.3067095776176	25.0807158542331	0.225993723384441	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000184117:ENST00000216121:exon_29957781_29957851:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000437094:exon_29957781_29957851:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000415100:exon_29957781_29957851:NIPSNAP1;ENSG00000184117:ENST00000455496:exon_29957781_29957851:NIPSNAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	30074189	T/C	1	7	19	26	3.342395604591	9.92778335896728	-6.58538775437628	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0104735098605544	ENSG00000186575:ENST00000413209:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000447429:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000397822:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000347330:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000338641:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000403435:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361452:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000403999:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000334961:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000353887:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000432151:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000397789:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361676:exon_30074185_30074312:NF2;ENSG00000186575:ENST00000361166:exon_30074185_30074312:NF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	30163526	A/G	1	604	614	1218	288.400992167566	320.824156968732	-32.4231648011659	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.066363468802392	ENSG00000184076:ENST00000330029:exon_30163358_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000401406:exon_30163363_30163596:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000332801:exon_30163440_30163537:UQCR10;ENSG00000184076:ENST00000406782:exon_30163388_30163558:UQCR10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	30189352	C/A	1	39	48	87	18.6219183684356	25.0807158542331	-6.45879748579756	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.197528082590309	ENSG00000100325:ENST00000307790:exon_30189349_30189479:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000487486:exon_30189349_30189665:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000458594:exon_30189349_30189479:ASCC2;ENSG00000100325:ENST00000397771:exon_30189349_30189479:ASCC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	30823196	T/C	1	26	44	70	12.4146122456237	22.9906561997137	-10.57604395409	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0119353003915473	ENSG00000249590:ENST00000439838:exon_30823158_30823390:RP4-539M6.19;ENSG00000242114:ENST00000266263:exon_30823158_30823390:MTFP1;ENSG00000242114:ENST00000412752:exon_30823109_30823390:MTFP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	30977058	G/A	1	59	50	109	28.1716200958384	26.1257456814929	2.04587441434558	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.702694148683829	ENSG00000100029:ENST00000354694:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402281:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000405677:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000402284:exon_30976999_30977088:PES1;ENSG00000100029:ENST00000335214:exon_30976999_30977088:PES1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31324162	G/A	1	29	44	73	13.8470675047341	22.9906561997137	-9.14358869497956	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0349089144765961	ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31324006_31324194:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31324006_31324194:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000445980:exon_31324015_31324194:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000429468:exon_31324015_31324215:MORC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31333631	T/C	1	10	15	25	4.77485086370143	7.83772370444786	-3.06287284074643	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.235750861164297	ENSG00000133422:ENST00000397641:exon_31333570_31333698:MORC2;ENSG00000133422:ENST00000215862:exon_31333570_31333698:MORC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31491295	G/C	1	2	10	12	0.954970172740286	5.22514913629857	-4.27017896355829	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0180411572214053	ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31491332	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31491394	G/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000183963:ENST00000463522:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000358743:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000347557:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000411418:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000329852:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31491289_31492883:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000455608:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31491289_31491441:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31491289_31491441:SMTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31496988	G/A	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000183963:ENST00000333137:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000489337:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000454496:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404496:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000458241:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000444593:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000460658:exon_31496871_31497769:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000404574:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000493335:exon_31496871_31497035:SMTN;ENSG00000183963:ENST00000403419:exon_31496871_31497035:SMTN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31673111	A/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31673116	A/G	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000182541:ENST00000436394:exon_31672775_31673126:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000406516:exon_31672775_31673624:LIMK2;ENSG00000182541:ENST00000340552:exon_31672775_31673624:LIMK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	31722886	T/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000100105:ENST00000266269:exon_31721790_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000405309:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000351933:exon_31721795_31723295:PATZ1;ENSG00000100105:ENST00000440325:exon_31721795_31723295:PATZ1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32014366	G/A	1	50	52	102	23.8742543185071	27.1707755087526	-3.29652119024542	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.552522900298105	ENSG00000198089:ENST00000432498:exon_32014300_32014537:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000421060:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443326:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000414585:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000443011:exon_32014300_32014432:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400289:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000400288:exon_32014300_32014572:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000382162:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000452250:exon_32014300_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000474741:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000476577:exon_32014300_32014534:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000464333:exon_32014101_32014533:SFI1;ENSG00000198089:ENST00000357852:exon_32014300_32014534:SFI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32795641	C/T	1	42	57	99	20.054373627546	29.7833500769019	-9.72897644935584	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0557654968114428	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000498434:exon_32795590_32795972:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000476619:exon_32795590_32795746:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000485373:exon_32795590_32795746:C22orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32804745	C/T	1	9	15	24	4.29736577733129	7.83772370444786	-3.54035792711657	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.158203687557982	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32804742_32804820:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32804742_32804820:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32804742_32804820:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32804742_32804820:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000487704:exon_32804742_32804820:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000454663:exon_32804742_32804820:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000463455:exon_32804742_32804820:C22orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32808078	G/A	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100220:ENST00000216038:exon_32808051_32808242:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000426906:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000451746:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000442204:exon_32808051_32808224:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000487704:exon_32808051_32808228:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000454663:exon_32808051_32808235:C22orf28;ENSG00000100220:ENST00000463455:exon_32808051_32808235:C22orf28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32871383	T/G	1	12	7	19	5.72982103644172	3.657604395409	2.07221664103272	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.368580760602116	ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32871224_32871385:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32871244_32871385:FBXO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32875190	G/A	1	27	37	64	12.8920973319939	19.3330518043047	-6.44095447231085	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.132617673438664	ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000452138:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32875120_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000444207:exon_32874968_32875262:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000465418:exon_32874968_32875218:FBXO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32887150	C/T	1	91	53	144	43.451142859683	27.6932904223824	15.7578524373006	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00951569988266578	ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32883732_32889268:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32887073_32887168:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32887073_32887168:FBXO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	32894362	C/T	1	199	215	414	95.0195321876585	112.340706430419	-17.3211742427608	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0943153791352555	ENSG00000100225:ENST00000266087:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000420700:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000437452:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000425028:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000492535:exon_32894131_32894816:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000382058:exon_32894131_32894818:FBXO7;ENSG00000100225:ENST00000397426:exon_32894131_32894816:FBXO7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	36538053	G/A	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000128284:ENST00000337769:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397293:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397295:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397285:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000424878:exon_36536377_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000349314:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000432700:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000422426:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397289:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000361710:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000397287:exon_36536378_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487355:exon_36537576_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000487423:exon_36537751_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000426939:exon_36537764_36538106:APOL3;ENSG00000128284:ENST00000534251:exon_36537911_36538106:APOL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	36623671	C/T	1	54	52	106	25.7841946639877	27.1707755087526	-1.38658084476485	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.845959585702056	ENSG00000128335:ENST00000358502:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000249066:exon_36622256_36624326:APOL2;ENSG00000128335:ENST00000451256:exon_36623388_36624326:APOL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	36684331	C/T	1	204	161	365	97.4069576195092	84.124901094407	13.2820565251022	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.173144613401073	ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36684298_36684459:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36684298_36684459:MYH9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	36710271	C/T	1	23	28	51	10.9821569865133	14.630417581636	-3.64826059512271	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.328677949806312	ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36710190_36710363:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36710190_36710363:MYH9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	36718564	G/A	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100345:ENST00000216181:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000337818:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000397231:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000438303:exon_36718474_36718566:MYH9;ENSG00000100345:ENST00000463027:exon_36718474_36718566:MYH9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	36921659	G/C	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.209810771129959	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	37622815	A/G	1	586	600	1186	279.806260612904	313.508948177914	-33.7026875650104	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0514673613714516	ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000481215:exon_37622711_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37622713_37622843:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37622793_37622843:RAC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	37637653	G/C	1	464	402	866	221.553080075746	210.050995279203	11.5020847965438	T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.454268426635459	ENSG00000128340:ENST00000249071:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000417990:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000406508:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000405484:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000458421:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000441619:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000469532:exon_37637627_37637698:RAC2;ENSG00000128340:ENST00000401529:exon_37637627_37637698:RAC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	37875446	A/G	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000100060:ENST00000356998:exon_37875383_37875536:MFNG;ENSG00000100060:ENST00000416983:exon_37875383_37875536:MFNG;ENSG00000100060:ENST00000431211:exon_37875383_37875536:MFNG;ENSG00000100060:ENST00000438891:exon_37875383_37875536:MFNG;ENSG00000100060:ENST00000436341:exon_37875383_37875536:MFNG;ENSG00000100060:ENST00000450946:exon_37875383_37875536:MFNG;ENSG00000100060:ENST00000430411:exon_37875383_37875536:MFNG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	38021070	C/T	1	13	26	39	6.20730612281186	13.5853877543763	-7.37808163156442	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0236956254312472	ENSG00000100083:ENST00000343632:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000381756:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000337437:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000406772:exon_38020976_38021083:GGA1;ENSG00000100083:ENST00000475445:exon_38019836_38021083:GGA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	38046718	A/G	1	63	56	119	30.081560441319	29.260835163272	0.820725278047014	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.926986913734201	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38046549_38046732:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000466097:exon_38046549_38046785:SH3BP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	38049816	C/T	1	65	51	116	31.0365306140593	26.6482605951227	4.38827001893659	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.457434590634881	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000442465:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000451997:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38049786_38049880:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38049786_38049880:SH3BP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	38051999	C/T	1	75	86	161	35.8113814777607	44.9362825721677	-9.12490109440698	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.156073536523294	ENSG00000100092:ENST00000417536:exon_38051933_38052049:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000357436:exon_38051279_38052124:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000469947:exon_38051933_38052048:SH3BP1;ENSG00000100092:ENST00000397014:exon_38051933_38052049:SH3BP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	38211728	A/G	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000100116:ENST00000323205:exon_38211670_38211841:GCAT;ENSG00000100116:ENST00000248924:exon_38211670_38211841:GCAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39069181	T/C	1	17	9	26	8.11724646829243	4.70263422266871	3.41461224562372	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.238653914429358	ENSG00000100211:ENST00000396811:exon_39069164_39069851:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000216029:exon_39069164_39069859:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000489847:exon_39069164_39069418:CBY1;ENSG00000100211:ENST00000454616:exon_39069164_39069849:CBY1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39134715	T/C	1	41	30	71	19.5768885411759	15.6754474088957	3.90144113228015	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.405993870613607	ENSG00000100242:ENST00000405510:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000216064:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000396784:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000429847:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000415416:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000405018:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000406622:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000411587:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000455125:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000414211:exon_39134592_39134759:SUN2;ENSG00000100242:ENST00000470642:exon_39134592_39134759:SUN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39381840	C/T	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39381817_39382096:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39381817_39382096:APOBEC3B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39382414	T/C	1	31	25	56	14.8020376774744	13.0628728407464	1.73916483672801	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.689408739723596	ENSG00000179750:ENST00000407298:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000402182:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000335760:exon_39382303_39382417:APOBEC3B;ENSG00000179750:ENST00000333467:exon_39382303_39382417:APOBEC3B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39414382	G/T	1	235	241	476	112.208995296984	125.926094184796	-13.7170988878119	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.215518946029316	ENSG00000244509:ENST00000396752:exon_39414274_39414392:APOBEC3C;ENSG00000244509:ENST00000361441:exon_39414274_39414848:APOBEC3C;ENSG00000244509:ENST00000396762:exon_39414274_39414821:APOBEC3C;ENSG00000244509:ENST00000428892:exon_39414274_39414931:APOBEC3C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39477566	A/G	1	64	62	126	30.5590455276892	32.3959246450511	-1.83687911736199	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.789250788958778	ENSG00000239713:ENST00000407997:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000480000:exon_39477476_39477692:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000461827:exon_39477476_39477590:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000494150:exon_39477476_39478684:APOBEC3G;ENSG00000239713:ENST00000481958:exon_39477476_39479219:APOBEC3G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	39714580	G/A	1	809	593	1402	386.285434873446	309.851343782505	76.4340910909405	A:G	G	A	10	0.522514913629857	4.25974015045509e-05	ENSG00000100316:ENST00000401609:exon_39714405_39714619:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000216146:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000465618:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000495832:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000437815:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000402527:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000453303:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000427905:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000420536:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000484615:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000460589:exon_39714405_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000461967:exon_39713860_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000498462:exon_39714117_39714597:RPL3;ENSG00000100316:ENST00000459859:exon_39714405_39714597:RPL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	40719105	G/C	1	12	14	26	5.72982103644172	7.315208790818	-1.58538775437628	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.561396276598999	ENSG00000100354:ENST00000454349:exon_40718858_40731811:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000301923:exon_40718858_40731811:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000400140:exon_40718858_40731811:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000429399:exon_40718858_40731811:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000402203:exon_40718858_40719364:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000445835:exon_40718858_40719578:TNRC6B;ENSG00000100354:ENST00000335727:exon_40718858_40731809:TNRC6B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	40814594	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	40814636	C/T	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000196588:ENST00000355630:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000402042:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000407029:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000396617:exon_40814378_40815388:MKL1;ENSG00000196588:ENST00000458423:exon_40814378_40815388:MKL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	41175065	T/C	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.296181191073666	ENSG00000100372:ENST00000263255:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000491545:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000435456:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000402844:exon_41175013_41176198:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000447566:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000420970:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000430221:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000427084:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000458600:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000443810:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000412879:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000426396:exon_41175013_41175129:SLC25A17;ENSG00000100372:ENST00000434193:exon_41175038_41175129:SLC25A17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	41569696	C/T	1	14	18	32	6.684791209182	9.40526844533743	-2.72047723615542	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.378624297386926	ENSG00000100393:ENST00000263253:exon_41569627_41569788:EP300
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	41623324	G/T	1	28	37	65	13.369582418364	19.3330518043047	-5.96346938594071	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.171546425238107	ENSG00000100395:ENST00000216237:exon_41623093_41623327:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000481902:exon_41623093_41623814:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000466589:exon_41623093_41623873:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000413732:exon_41623093_41623327:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000479978:exon_41623093_41623873:L3MBTL2;ENSG00000100395:ENST00000452106:exon_41623093_41623327:L3MBTL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	41980567	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000100417:ENST00000216259:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000482178:exon_41980531_41981406:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000472620:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000485648:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000466645:exon_41980531_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000478337:exon_41980010_41980607:PMM1;ENSG00000100417:ENST00000414636:exon_41980531_41980607:PMM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42059831	G/A	1	753	699	1452	359.546270036718	365.23792462727	-5.69165459055239	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.772642243061711	ENSG00000196419:ENST00000360079:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402580:exon_42059626_42060044:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000428575:exon_42059626_42060042:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000359308:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405878:exon_42059626_42060043:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000402409:exon_42059645_42060010:XRCC6;ENSG00000196419:ENST00000405506:exon_42059626_42060038:XRCC6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42078380	T/A	1	7	74	81	3.342395604591	38.6661036086094	-35.3237080040184	A:T	T	A	10	0.522514913629857	8.8646212836701e-17	ENSG00000100138:ENST00000215956:exon_42078360_42078626:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000401959:exon_42078360_42078591:NHP2L1;ENSG00000100138:ENST00000488571:exon_42078360_42078460:NHP2L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42180737	A/C	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000167077:ENST00000401548:exon_42180612_42180787:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000400107:exon_42180612_42180787:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000300398:exon_42180612_42180787:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000419798:exon_42180612_42180787:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000476893:exon_42180612_42180787:MEI1;ENSG00000167077:ENST00000403492:exon_42180612_42180787:MEI1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42276825	G/A	1	18	7	25	8.59473155466257	3.657604395409	4.93712715925357	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0694892127791839	ENSG00000198911:ENST00000361204:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000444813:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000457567:exon_42276720_42276996:SREBF2;ENSG00000198911:ENST00000424354:exon_42276720_42276996:SREBF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42341308	A/G	1	48	38	86	22.9192841457669	19.8555667179346	3.06371742783229	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.519460710382993	ENSG00000100162:ENST00000215980:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000404067:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402338:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000407253:exon_42341229_42341308:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000442367:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000402420:exon_42341229_42341393:CENPM;ENSG00000100162:ENST00000396437:exon_42340925_42341308:CENPM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42463814	C/T	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000198951:ENST00000396398:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000403363:exon_42463769_42463940:NAGA;ENSG00000198951:ENST00000402937:exon_42463769_42463940:NAGA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42486723	G/A	1	156	96	252	74.4876734737423	50.1614317084663	24.326241765276	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00240784516712422	ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42486765	C/T	1	12	8	20	5.72982103644172	4.18011930903886	1.54970172740286	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.512146220497768	ENSG00000184983:ENST00000498737:exon_42486610_42486959:NDUFA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42970820	T/C	1	12	8	20	5.72982103644172	4.18011930903886	1.54970172740286	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.512146220497768	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	42992222	T/C	1	9	20	29	4.29736577733129	10.4502982725971	-6.15293249526585	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0253360213489213	ENSG00000100227:ENST00000445215:exon_42992192_42992371:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000348657:exon_42992192_42992371:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000252115:exon_42992192_42992371:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000415122:exon_42992192_42992371:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000491021:exon_42992192_42992371:POLDIP3;ENSG00000100227:ENST00000452567:exon_42992192_42992371:POLDIP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	43089178	C/T	1	32	33	65	15.2795227638446	17.2429921497853	-1.96346938594071	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.709847002040628	ENSG00000128274:ENST00000401850:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000249005:exon_43088127_43090003:A4GALT;ENSG00000128274:ENST00000381278:exon_43088128_43090003:A4GALT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	43275112	C/T	1	33	35	68	15.7570078502147	18.288021977045	-2.53101412683028	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.546568823639728	ENSG00000100266:ENST00000487119:exon_43275054_43275158:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000505238:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000496919:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000473715:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000263246:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000337959:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000407585:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000403744:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000402229:exon_43275054_43275175:PACSIN2;ENSG00000100266:ENST00000436831:exon_43275054_43275175:PACSIN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	43533105	C/G	1	20	9	29	9.54970172740286	4.70263422266871	4.84706750473415	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0931652197105856	ENSG00000100294:ENST00000290429:exon_43533087_43533304:MCAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	43567876	G/A	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100304:ENST00000216129:exon_43567825_43567906:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000406379:exon_43567825_43567906:TTLL12;ENSG00000100304:ENST00000423379:exon_43567825_43567906:TTLL12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44359246	A/G	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000100344:ENST00000406117:exon_44359166_44359276:PNPLA3;ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44359166_44359276:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44359166_44359276:SAMM50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44368204	A/G	1	16	17	33	7.63976138192229	8.88275353170757	-1.24299214978528	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728920287854378	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44368116_44368222:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000493161:exon_44368116_44368222:SAMM50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44372632	C/T	1	41	54	95	19.5768885411759	28.2158053360123	-8.63891679483642	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.08111241594139	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44372630_44372701:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44372630_44372701:SAMM50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44379822	T/C	1	52	43	95	24.8292244912474	22.4681412860839	2.36108320516358	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.681597001310925	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44379813_44379880:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44379813_44379880:SAMM50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44386281	C/T	1	174	203	377	83.0824050284049	106.070527466861	-22.9881224384561	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0202207708482416	ENSG00000100347:ENST00000396202:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000350028:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000474323:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000494795:exon_44386145_44386286:SAMM50;ENSG00000100347:ENST00000465768:exon_44386208_44386286:SAMM50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44514995	C/T	1	131	126	257	62.5505463144887	65.836879117362	-3.28633280287326	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.708078424235081	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000402876:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000444029:exon_44514918_44515020:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44514918_44515020:PARVB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44564507	C/T	1	474	457	931	226.327930939448	238.789315528845	-12.4613845893969	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.431082911668952	ENSG00000188677:ENST00000406477:exon_44564482_44564803:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000360702:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000338758:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000427565:exon_44564482_44565106:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000355618:exon_44564482_44565101:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000404989:exon_44564482_44565064:PARVB;ENSG00000188677:ENST00000477438:exon_44564482_44564807:PARVB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44585131	G/A	1	27	31	58	12.8920973319939	16.1979623225256	-3.30586499053171	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.431074486023866	ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000453888:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000356909:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000475485:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44584994_44585134:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000468564:exon_44581406_44585134:PARVG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	44589693	C/T	1	55	62	117	26.2616797503579	32.3959246450511	-6.13424489469327	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.267708733894950	ENSG00000138964:ENST00000422871:exon_44589681_44589703:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000444313:exon_44589681_44589703:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000415224:exon_44589681_44589703:PARVG;ENSG00000138964:ENST00000448527:exon_44589681_44589703:PARVG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	45593765	G/A	1	17	8	25	8.11724646829243	4.18011930903886	3.93712715925357	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.159933770810999	ENSG00000100364:ENST00000336156:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000528169:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000391627:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000251993:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000423262:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000443310:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000488038:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000483374:exon_45593671_45593914:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000498418:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000474515:exon_45593671_45593829:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000493003:exon_45593671_45593829:C22orf9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	45595833	G/C	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100364:ENST00000336156:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000528169:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000391627:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000251993:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000423262:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000443310:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000488038:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000498418:exon_45595754_45596090:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000474515:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000493003:exon_45595754_45595916:C22orf9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	45595872	C/A	1	18	10	28	8.59473155466257	5.22514913629857	3.369582418364	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.256696252072731	ENSG00000100364:ENST00000336156:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000528169:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000391627:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000251993:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000423262:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000443310:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000488038:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000498418:exon_45595754_45596090:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000474515:exon_45595754_45595916:C22orf9;ENSG00000100364:ENST00000493003:exon_45595754_45595916:C22orf9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	46704337	C/T	1	10	22	32	4.77485086370143	11.4953280998569	-6.72047723615542	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0206599535421619	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46704216_46704840:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46704216_46704840:GTSE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	46724762	G/A	1	20	12	32	9.54970172740286	6.27017896355828	3.27952276384457	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.289892219807281	ENSG00000075218:ENST00000454366:exon_46724585_46724786:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000160874:exon_46724585_46724786:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000361934:exon_46724585_46724786:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000440170:exon_46724585_46724786:GTSE1;ENSG00000075218:ENST00000479645:exon_46724585_46725027:GTSE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	46742405	G/A	1	14	5	19	6.684791209182	2.61257456814929	4.07221664103272	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0686149924897499	ENSG00000100416:ENST00000486620:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000424260:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000465378:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000496831:exon_46742319_46742441:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485175:exon_46742319_46742441:TRMU
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	46746261	C/T	1	3	15	18	1.43245525911043	7.83772370444786	-6.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00334327487861849	ENSG00000100416:ENST00000486620:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46746247_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000424260:exon_46746243_46746265:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46746247_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46746243_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000496831:exon_46746243_46746317:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485175:exon_46746188_46746360:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000463785:exon_46746242_46746360:TRMU
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	46752813	G/A	1	17	14	31	8.11724646829243	7.315208790818	0.802037677474432	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.858133848975486	ENSG00000100416:ENST00000441818:exon_46752739_46753232:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000290846:exon_46752739_46753237:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000456595:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381021:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000453630:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000457572:exon_46752739_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000381019:exon_46752739_46753081:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000491612:exon_46751341_46753234:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000485559:exon_46752739_46753236:TRMU;ENSG00000100416:ENST00000470831:exon_46752739_46753235:TRMU
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	46759934	A/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000075275:ENST00000395967:exon_46759893_46760148:CELSR1;ENSG00000075275:ENST00000262738:exon_46759893_46760148:CELSR1;ENSG00000075275:ENST00000473624:exon_46757071_46760148:CELSR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	47083012	T/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47080308_47083103:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47082880_47083103:CERK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	47108189	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000100422:ENST00000216264:exon_47108065_47108190:CERK;ENSG00000100422:ENST00000443629:exon_47108065_47108190:CERK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50216754	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000100425:ENST00000404034:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000216267:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000404760:exon_50216599_50217979:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000438393:exon_50216599_50216861:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000342989:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000457780:exon_50216599_50218452:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000459821:exon_50216599_50216949:BRD1;ENSG00000100425:ENST00000494833:exon_50216599_50216853:BRD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50297888	T/C	1	16	15	31	7.63976138192229	7.83772370444786	-0.197962322525568	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000486602:exon_50297827_50297902:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000492791:exon_50297827_50297902:ALG12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50307315	C/T	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000182858:ENST00000330817:exon_50307252_50307491:ALG12;ENSG00000182858:ENST00000332276:exon_50307252_50307491:ALG12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50313438	T/C	1	28	10	38	13.369582418364	5.22514913629857	8.14443328206543	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00885630427561035	ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313378_50313488:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313378_50313488:CRELD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50313810	C/T	1	22	36	58	10.5046719001431	18.8105368906749	-8.30586499053171	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0348133545265768	ENSG00000184164:ENST00000450207:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000404488:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000457871:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000328268:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000407217:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000483652:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000403427:exon_50313804_50313895:CRELD2;ENSG00000184164:ENST00000482956:exon_50313804_50313895:CRELD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50658424	T/C	1	7	13	20	3.342395604591	6.79269387718814	-3.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.177937843741256	ENSG00000128159:ENST00000248846:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000498611:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000413101:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000439308:exon_50658386_50658444:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000491449:exon_50658386_50660303:TUBGCP6;ENSG00000128159:ENST00000425018:exon_50658386_50658444:TUBGCP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50720430	G/C	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000196576:ENST00000449103:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399991:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000479701:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000359337:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000399964:exon_50720283_50720510:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000492578:exon_50719995_50720435:PLXNB2;ENSG00000196576:ENST00000427829:exon_50720283_50720510:PLXNB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50750573	G/A	1	90	60	150	42.9736577733129	31.3508948177914	11.6227629555214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0602437677626755	ENSG00000205593:ENST00000413817:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000380836:exon_50750392_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000495607:exon_50750395_50750690:FAM116B;ENSG00000205593:ENST00000411673:exon_50750395_50750690:FAM116B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50877166	G/C	1	27	31	58	12.8920973319939	16.1979623225256	-3.30586499053171	A:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.431074486023866	ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50877028_50877191:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50877028_50877191:PPP6R2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50879447	T/G	1	25	28	53	11.9371271592536	14.630417581636	-2.69329042238242	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.493479420343237	ENSG00000100239:ENST00000359139:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395741:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395744:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000395746:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000216061:exon_50879230_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000401672:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000427222:exon_50879251_50879455:PPP6R2;ENSG00000100239:ENST00000473283:exon_50879251_50879503:PPP6R2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50895053	G/A	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50894921_50895102:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000476293:exon_50895018_50895102:SBF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50898758	G/A	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000100241:ENST00000380817:exon_50898701_50898837:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000348911:exon_50898701_50898837:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000390679:exon_50898701_50898837:SBF1;ENSG00000100241:ENST00000337034:exon_50898701_50898837:SBF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50941985	T/C	1	31	14	45	14.8020376774744	7.315208790818	7.48682888665643	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0257285507912208	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50942121	C/T	1	26	24	50	12.4146122456237	12.5403579271166	-0.125745681492852	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50941378_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50941380_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50941426_50942128:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50941690_50942128:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50943004	C/A	1	20	4	24	9.54970172740286	2.09005965451943	7.45964207288343	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.00193948600385107	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50943010	G/A	1	20	4	24	9.54970172740286	2.09005965451943	7.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00193948600385107	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50942988_50943081:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50943101	A/G	1	22	15	37	10.5046719001431	7.83772370444786	2.66694819569529	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.414059712935562	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50942988_50943156:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000504717:exon_50942769_50943156:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50944128	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50944163	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000100258:ENST00000474879:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000380796:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000216080:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000487499:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000514938:exon_50944103_50944244:LMF2;ENSG00000100258:ENST00000505981:exon_50944125_50944244:LMF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50956231	C/T	1	38	27	65	18.1444332820654	14.1079026680061	4.03653061405929	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.323988584301356	ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000425199:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50956170_50956236:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395698:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000518394:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000523045:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000418794:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50956170_50956238:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000496227:exon_50956170_50956238:NCAPH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50961536	C/T	1	80	69	149	38.1988069096114	36.0535290404601	2.1452778691513	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.74348666298119	ENSG00000025770:ENST00000420993:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000361482:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000380768:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000395701:exon_50961446_50961901:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000453005:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000299821:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000520939:exon_50961446_50961595:NCAPH2;ENSG00000025770:ENST00000522304:exon_50961509_50961595:NCAPH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50969450	C/T	1	53	64	117	25.3067095776176	33.4409544723108	-8.13424489469327	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.139224645219232	ENSG00000177989:ENST00000468249:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000401779:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000403326:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000456888:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000438960:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000424610:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000329363:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000405135:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000428989:exon_50969366_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000463472:exon_50968968_50969487:ODF3B;ENSG00000177989:ENST00000469660:exon_50969067_50969487:ODF3B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50987843	C/T	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	50988193	A/G	1	20	15	35	9.54970172740286	7.83772370444786	1.711978022955	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.614294946711019	ENSG00000130487:ENST00000395676:exon_50986462_50989451:KLHDC7B;ENSG00000130487:ENST00000252783:exon_50986462_50988541:KLHDC7B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	51019052	G/A	1	22	19	41	10.5046719001431	9.92778335896728	0.576888541175862	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.877191301426372	ENSG00000254413:ENST00000492556:exon_51018994_51019089:CTA-384D8.32;ENSG00000254413:ENST00000531456:exon_51018994_51019089:CTA-384D8.32;ENSG00000100288:ENST00000406938:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000492582:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000484266:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000481673:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000479003:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000468532:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000489453:exon_51018994_51019209:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000476289:exon_51018994_51019089:CHKB;ENSG00000100288:ENST00000463053:exon_51018994_51019089:CHKB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	51063852	G/A	1	25	11	36	11.9371271592536	5.74766404992843	6.18946310932515	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.044867962857342	ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51063446_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51063450_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51063456_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51063457_51063892:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51063461_51063892:ARSA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	22	51065382	G/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000100299:ENST00000356098:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000216124:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395624:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395621:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000453344:exon_51065262_51065480:ARSA;ENSG00000100299:ENST00000395619:exon_51065262_51065480:ARSA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	8590313	T/C	0	14	0	14	6.684791209182	0	6.684791209182	T	T		10	0.522514913629857	0.000145100106435121	ENSG00000071282:ENST00000157600:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000415597:exon_8590254_8590549:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000397386:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000454244:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000456506:exon_8590254_8590589:LMCD1;ENSG00000071282:ENST00000426878:exon_8590254_8590589:LMCD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9406836	T/C	1	7	12	19	3.342395604591	6.27017896355828	-2.92778335896728	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.250486147296676	ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000417036:exon_9406700_9406874:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000419437:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9406700_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9406705_9407004:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9406700_9407004:THUMPD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9422210	T/C	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9422187_9422302:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000441127:exon_9422187_9422316:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000461636:exon_9422187_9422572:THUMPD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9425911	G/A	1	30	25	55	14.3245525911043	13.0628728407464	1.26167975035786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.787999654306163	ENSG00000134077:ENST00000452837:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000345094:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000515662:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000404270:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000416603:exon_9425896_9426019:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000484006:exon_9425896_9426060:THUMPD3;ENSG00000134077:ENST00000464045:exon_9425896_9426019:THUMPD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9786714	C/T	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000156983:ENST00000433861:exon_9786692_9786839:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000424362:exon_9786692_9786839:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000383829:exon_9786692_9786839:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000302054:exon_9786692_9786839:BRPF1;ENSG00000156983:ENST00000457855:exon_9786692_9786839:BRPF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9867625	C/T	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9867484_9867632:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9867484_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000482269:exon_9867090_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000492440:exon_9867250_9867632:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9867545_9867632:TTLL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9870857	G/A	1	12	19	31	5.72982103644172	9.92778335896728	-4.19796232252557	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.151489511791013	ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000431204:exon_9870644_9870936:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000466245:exon_9870644_9871019:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9871030	T/G	1	11	14	25	5.25233595007157	7.315208790818	-2.06287284074642	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.430260851727754	ENSG00000250151:ENST00000397256:exon_9870644_9871079:RP11-266J6.1;ENSG00000214021:ENST00000427220:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430390:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000310252:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000496526:exon_9870363_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000443148:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000473661:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000455274:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000438141:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000430793:exon_9870644_9871079:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000471058:exon_9870847_9871079:TTLL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9877127	T/C	1	9	10	19	4.29736577733129	5.22514913629857	-0.927783358967284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.81920194045307	ENSG00000214021:ENST00000397241:exon_9876778_9878037:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000426895:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000427853:exon_9876778_9877173:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000483051:exon_9876365_9877999:TTLL3;ENSG00000214021:ENST00000383827:exon_9876365_9877999:TTLL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9990800	G/C	1	19	9	28	9.07221664103272	4.70263422266871	4.369582418364	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.129218713095071	ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9991163	A/G	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	9991429	G/A	1	18	9	27	8.59473155466257	4.70263422266871	3.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.176865551934525	ENSG00000163704:ENST00000295984:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000412055:exon_9990785_9991856:PRRT3;ENSG00000163704:ENST00000411976:exon_9990785_9991856:PRRT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	10067797	T/C	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.793482530974183	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	10138069	T/G	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000144554:ENST00000287647:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383807:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000383806:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000419585:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000421731:exon_10138010_10138156:FANCD2;ENSG00000144554:ENST00000470028:exon_10138010_10138156:FANCD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	10312113	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000157014:ENST00000287652:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000448281:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000437082:exon_10311815_10312699:TATDN2;ENSG00000157014:ENST00000450534:exon_10311815_10312699:TATDN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	11596302	T/C	1	39	32	71	18.6219183684356	16.7204772361554	1.90144113228015	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.721929274340279	ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	11596348	C/T	1	22	30	52	10.5046719001431	15.6754474088957	-5.17077550875256	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.166145189594020	ENSG00000197548:ENST00000442589:exon_11596285_11599132:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354449:exon_11596285_11599139:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000446450:exon_11596285_11596462:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000354956:exon_11596285_11596557:ATG7;ENSG00000197548:ENST00000466605:exon_11596285_11596349:ATG7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	11887991	C/G	1	13	10	23	6.20730612281186	5.22514913629857	0.982156986513288	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.835280900229804	ENSG00000144559:ENST00000273037:exon_11887976_11888393:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000455809:exon_11887976_11888246:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000457498:exon_11887976_11888355:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000444133:exon_11887976_11888253:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000411947:exon_11887976_11888366:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000417723:exon_11887976_11888359:C3orf31;ENSG00000144559:ENST00000494388:exon_11887976_11888338:C3orf31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	12881757	C/T	1	37	25	62	17.6669481956953	13.0628728407464	4.60407535494886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.254923176074710	ENSG00000144713:ENST00000396957:exon_12881641_12881840:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000435983:exon_12881641_12881852:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000396953:exon_12881641_12883028:RPL32;ENSG00000144713:ENST00000457131:exon_12881641_12881840:RPL32
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	14212050	C/T	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000154767:ENST00000285021:exon_14211938_14212050:XPC;ENSG00000154767:ENST00000449060:exon_14211945_14212050:XPC;ENSG00000154767:ENST00000476581:exon_14211938_14212050:XPC;ENSG00000154767:ENST00000452172:exon_14211938_14212114:XPC;ENSG00000154767:ENST00000511155:exon_14211938_14212050:XPC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	14223074	C/T	1	24	29	53	11.4596420728834	15.1529324952659	-3.69329042238242	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.337404588873155	ENSG00000170860:ENST00000306024:exon_14223060_14223170:LSM3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	15270564	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000131375:ENST00000253693:exon_15270481_15270566:CAPN7;ENSG00000131375:ENST00000415565:exon_15270481_15270566:CAPN7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	15624436	C/T	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000131373:ENST00000321169:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000451445:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000383779:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000456194:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000457447:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000416898:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000422591:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000421993:exon_15624384_15624496:HACL1;ENSG00000131373:ENST00000414979:exon_15624385_15624496:HACL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	15711899	C/A	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000206560:ENST00000399451:exon_15708743_15712063:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383777:exon_15708743_15712063:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000383776:exon_15708743_15712063:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000412318:exon_15711617_15712063:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000498713:exon_15711299_15712063:ANKRD28;ENSG00000206560:ENST00000497037:exon_15711617_15712063:ANKRD28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	16327909	C/T	1	8	9	17	3.81988069096114	4.70263422266871	-0.88275353170757	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.80929957264704	ENSG00000154814:ENST00000285083:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000442255:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000435829:exon_16327849_16327955:OXNAD1;ENSG00000154814:ENST00000452581:exon_16327849_16327955:OXNAD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	16364954	C/T	1	110	100	210	52.5233595007157	52.2514913629857	0.271868137730024	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000131378:ENST00000432519:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000334133:exon_16364883_16364964:RFTN1;ENSG00000131378:ENST00000483671:exon_16364883_16364964:RFTN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	17053499	A/G	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000154822:ENST00000418129:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000285094:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000396755:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000432376:exon_17051166_17053652:PLCL2;ENSG00000154822:ENST00000419842:exon_17051986_17053652:PLCL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	20216511	A/G	1	16	21	37	7.63976138192229	10.972813186227	-3.33305180430471	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.324101869523127	ENSG00000129810:ENST00000419233:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000263753:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000515745:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000509679:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000523325:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000522131:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000533388:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000534034:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000383774:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000425061:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000443724:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000472533:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000421451:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000482867:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412997:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000437051:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000412868:exon_20215741_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000417364:exon_20216497_20216547:SGOL1;ENSG00000129810:ENST00000456624:exon_20216214_20216547:SGOL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	23942440	T/C	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000197885:ENST00000388759:exon_23942299_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000443659:exon_23942299_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000421515:exon_23942299_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000425478:exon_23942299_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000418853:exon_23942299_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000437230:exon_23942295_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000412028:exon_23942295_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000415901:exon_23942295_23942540:NKIRAS1;ENSG00000197885:ENST00000416026:exon_23942299_23942540:NKIRAS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	31666442	C/T	1	33	27	60	15.7570078502147	14.1079026680061	1.64910518220858	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.699901539762741	ENSG00000163527:ENST00000295770:exon_31666406_31666577:STT3B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	33434831	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000153560:ENST00000283629:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000492136:exon_33429830_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000447368:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000466441:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000283628:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000486388:exon_33434804_33434946:UBP1;ENSG00000153560:ENST00000464787:exon_33434804_33434946:UBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	33877626	G/A	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000412887:exon_33877536_33877758:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000482561:exon_33877536_33877664:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000487821:exon_33877536_33877758:PDCD6IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	33907945	A/G	1	47	41	88	22.4417990593967	21.4231114588241	1.01868760057258	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.91510009257696	ENSG00000170248:ENST00000457054:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000307296:exon_33907843_33911194:PDCD6IP;ENSG00000170248:ENST00000473593:exon_33907843_33907960:PDCD6IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	37367635	A/G	1	38	24	62	18.1444332820654	12.5403579271166	5.60407535494886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.163667672896781	ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	37369187	G/A	1	35	35	70	16.711978022955	18.288021977045	-1.57604395408999	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.721157281428934	ENSG00000144674:ENST00000361924:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000356847:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000273176:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000431274:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437303:exon_37365079_37369316:GOLGA4;ENSG00000144674:ENST00000437131:exon_37365079_37369316:GOLGA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	38181376	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000172936:ENST00000396334:exon_38181355_38181489:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000460295:exon_38181355_38182070:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000443433:exon_38181355_38181489:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000417037:exon_38181355_38181489:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000421571:exon_38181355_38181443:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000421516:exon_38181355_38181489:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000481122:exon_38181355_38181489:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000484513:exon_38180914_38182339:MYD88;ENSG00000172936:ENST00000463956:exon_38181355_38181489:MYD88
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	39180263	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000168026:ENST00000301819:exon_39180202_39180394:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000431162:exon_39180202_39180391:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000430597:exon_39180202_39180350:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000440121:exon_39180202_39180370:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000472866:exon_39180202_39180390:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000493856:exon_39180202_39180393:TTC21A;ENSG00000168026:ENST00000460460:exon_39180047_39180394:TTC21A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	39184510	C/A	1	21	13	34	10.027186813773	6.79269387718814	3.23449293658486	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.30518358726519	ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	39185077	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39183346_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39183829_39185535:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000318290:exon_39184546_39185088:CSRNP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	39186728	C/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000144655:ENST00000273153:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000514182:exon_39186488_39186747:CSRNP1;ENSG00000144655:ENST00000444454:exon_39186488_39186747:CSRNP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	39436027	A/G	1	21	18	39	10.027186813773	9.40526844533743	0.621918368435576	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.873940358026441	ENSG00000144659:ENST00000273158:exon_39435901_39436067:SLC25A38
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	39449137	T/C	1	78	27	105	37.2438367368712	14.1079026680061	23.135934068865	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	5.05106184643399e-06	ENSG00000168028:ENST00000301821:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000477325:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000475346:exon_39449112_39449686:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000487876:exon_39449112_39449567:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000458478:exon_39449094_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000443003:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000444512:exon_39449112_39449277:RPSA;ENSG00000168028:ENST00000415859:exon_39449111_39449277:RPSA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	41275350	C/T	1	71	85	156	33.9014411322801	44.4137676585379	-10.5123265262577	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0930362174609597	ENSG00000168036:ENST00000405570:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396183:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000349496:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000447363:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000453024:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396190:exon_41275020_41275358:CTNNB1;ENSG00000168036:ENST00000396185:exon_41275020_41275358:CTNNB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	42610374	A/G	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000093183:ENST00000423701:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000273156:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000417572:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000449617:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000264454:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456515:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000493107:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000383750:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000450981:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000445388:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000454141:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000416880:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000420163:exon_42610357_42610565:SEC22C;ENSG00000093183:ENST00000456222:exon_42610357_42610565:SEC22C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	42679176	C/G	1	16	9	25	7.63976138192229	4.70263422266871	2.93712715925357	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.317123875739726	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	42679497	C/T	1	37	28	65	17.6669481956953	14.630417581636	3.03653061405929	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.459754405922039	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000468735:exon_42678360_42679718:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000465584:exon_42678360_42679711:NKTR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	42679777	T/G	1	34	37	71	16.2344929365849	19.3330518043047	-3.09855886771985	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.478043278042488	ENSG00000114857:ENST00000232978:exon_42678360_42681242:NKTR;ENSG00000114857:ENST00000429888:exon_42678360_42681242:NKTR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	45000878	T/C	1	12	22	34	5.72982103644172	11.4953280998569	-5.76550706341514	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0582120250263391	ENSG00000163812:ENST00000422526:exon_45000623_45000952:ZDHHC3;ENSG00000163812:ENST00000296127:exon_45000623_45000952:ZDHHC3;ENSG00000163812:ENST00000424952:exon_45000623_45000952:ZDHHC3;ENSG00000163812:ENST00000342790:exon_45000619_45000952:ZDHHC3;ENSG00000163812:ENST00000419642:exon_45000619_45000924:ZDHHC3;ENSG00000163812:ENST00000478669:exon_45000623_45000952:ZDHHC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	45030680	G/A	1	51	41	92	24.3517394048773	21.4231114588241	2.92862794605315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.602107456634809	ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45030632_45030733:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000477865:exon_45030636_45030734:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000482004:exon_45030632_45030733:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45030632_45030733:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000467846:exon_45030632_45030733:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45030632_45030733:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000498168:exon_45030632_45030734:EXOSC7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	45052775	G/C	1	65	82	147	31.0365306140593	42.8462229176483	-11.809692303589	T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0573308147652361	ENSG00000075914:ENST00000461361:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000265564:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000468667:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000491476:exon_45052727_45052885:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000486727:exon_45052727_45052962:EXOSC7;ENSG00000075914:ENST00000459856:exon_45052725_45052885:EXOSC7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	46007846	C/T	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000163820:ENST00000296137:exon_46007769_46010195:FYCO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	46965106	G/A	1	66	79	145	31.5140157004294	41.2786781767587	-9.76466247632927	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.114184584556029	ENSG00000160799:ENST00000425441:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000292314:exon_46965097_46965158:CCDC12;ENSG00000160799:ENST00000488069:exon_46964533_46965158:CCDC12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	47449058	T/C	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000076201:ENST00000456408:exon_47448995_47449074:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47448995_47449074:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47448995_47449074:PTPN23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	47452087	G/A	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	47452118	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47451418_47453176:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47451418_47453176:PTPN23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	47454399	G/A	1	64	35	99	30.5590455276892	18.288021977045	12.2710235506442	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0154169663210715	ENSG00000076201:ENST00000431726:exon_47454196_47454925:PTPN23;ENSG00000076201:ENST00000265562:exon_47454196_47454931:PTPN23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	47891226	C/T	1	103	118	221	49.1809638961247	61.6567598083231	-12.4757959121984	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.105870145673751	ENSG00000132153:ENST00000445061:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000395745:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000348968:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000446256:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000443212:exon_47891120_47891259:DHX30;ENSG00000132153:ENST00000457607:exon_47891120_47891259:DHX30
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	47969734	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000047849:ENST00000395734:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000426837:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000360240:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000395730:exon_47969718_47969840:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000482752:exon_47969718_47969792:MAP4;ENSG00000047849:ENST00000423088:exon_47969718_47969840:MAP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	48473953	C/G	1	36	24	60	17.1894631093251	12.5403579271166	4.64910518220858	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.24665325638958	ENSG00000164051:ENST00000447018:exon_48473574_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395694:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000412398:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000395696:exon_48473580_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000296441:exon_48473587_48474576:CCDC51;ENSG00000164051:ENST00000442740:exon_48473605_48474576:CCDC51
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	48501819	G/A	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	48501920	C/T	1	13	5	18	6.20730612281186	2.61257456814929	3.59473155466257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.102283233688192	ENSG00000164053:ENST00000320211:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000346691:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000424906:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000357105:exon_48501509_48502198:ATRIP;ENSG00000164053:ENST00000412052:exon_48501509_48502198:ATRIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	48508966	G/A	1	180	171	351	85.9473155466257	89.3500502307055	-3.40273468407982	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.748586973051175	ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	48509036	T/C	1	13	51	64	6.20730612281186	26.6482605951227	-20.4409544723108	T:C	T	C	10	0.522514913629857	2.24196578074016e-07	ENSG00000213689:ENST00000395677:exon_48506886_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000296443:exon_48508029_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000433541:exon_48508139_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000444177:exon_48508067_48509042:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000456089:exon_48508464_48509044:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000422277:exon_48507673_48509041:TREX1;ENSG00000213689:ENST00000436480:exon_48507673_48509041:TREX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	48717117	G/A	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000213672:ENST00000341520:exon_48717008_48717146:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000416649:exon_48717008_48717146:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000294129:exon_48717008_48717146:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000470006:exon_48717008_48717147:NCKIPSD;ENSG00000213672:ENST00000415281:exon_48717008_48717146:NCKIPSD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49052453	G/A	1	65	51	116	31.0365306140593	26.6482605951227	4.38827001893659	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.457434590634881	ENSG00000178252:ENST00000395474:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000420783:exon_49052258_49052791:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000315574:exon_49052258_49053386:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000415265:exon_49052258_49052858:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000452875:exon_49052258_49053022:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000471162:exon_49052258_49052798:WDR6;ENSG00000178252:ENST00000448293:exon_49052258_49052780:WDR6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49133523	G/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49151428	C/T	1	25	37	62	11.9371271592536	19.3330518043047	-7.39592464505114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0743537667367876	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49151494	A/G	1	20	13	33	9.54970172740286	6.79269387718814	2.75700785021472	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.385870755329217	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49151425_49151526:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49151425_49151526:USP19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49153490	C/T	1	10	13	23	4.77485086370143	6.79269387718814	-2.01784301348671	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.413016919605914	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49153480_49153502:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49153480_49153595:USP19;ENSG00000172046:ENST00000464931:exon_49153481_49153595:USP19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49154326	G/A	1	10	8	18	4.77485086370143	4.18011930903886	0.594731554662573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.817886779949097	ENSG00000172046:ENST00000398896:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398898:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000417901:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398909:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000423450:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000425298:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000453664:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398892:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000398888:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000434032:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000306026:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000464931:exon_49154160_49154376:USP19;ENSG00000172046:ENST00000479073:exon_49154167_49154376:USP19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49322012	G/A	1	32	29	61	15.2795227638446	15.1529324952659	0.126590268578722	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000114316:ENST00000351842:exon_49321899_49322017:USP4;ENSG00000114316:ENST00000265560:exon_49321899_49322017:USP4;ENSG00000114316:ENST00000485450:exon_49321899_49322017:USP4;ENSG00000114316:ENST00000431357:exon_49321899_49322017:USP4;ENSG00000114316:ENST00000475873:exon_49321969_49322017:USP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49751585	C/T	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000164068:ENST00000327697:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000389066:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000457726:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000486102:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000487805:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000469978:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000433785:exon_49751523_49751607:RNF123;ENSG00000164068:ENST00000444689:exon_49751523_49751607:RNF123
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49845292	C/T	1	32	24	56	15.2795227638446	12.5403579271166	2.73916483672801	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.505152652924393	ENSG00000182179:ENST00000333486:exon_49845169_49845360:UBA7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	49866539	C/T	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000183763:ENST00000331456:exon_49866034_49866658:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000491060:exon_49866054_49866941:TRAIP;ENSG00000183763:ENST00000473195:exon_49866521_49866658:TRAIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	50326020	G/A	1	43	42	85	20.5318587139161	21.945626372454	-1.41376765853785	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.828266560031285	ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000426499:exon_50326014_50326070:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000464258:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000486322:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50326014_50326142:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000492387:exon_50325943_50326142:IFRD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	50327429	A/G	1	10	11	21	4.77485086370143	5.74766404992843	-0.972813186226998	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.82776997193626	ENSG00000214706:ENST00000417626:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000429673:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000436390:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000336089:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000474556:exon_50327360_50327725:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000438296:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000414734:exon_50327360_50327517:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000483071:exon_50327143_50327501:IFRD2;ENSG00000214706:ENST00000489569:exon_50327360_50327517:IFRD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	50334231	T/A	1	15	13	28	7.16227629555214	6.79269387718814	0.369582418364003	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000243477:ENST00000354862:exon_50333833_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000417393:exon_50333835_50334958:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443094:exon_50333849_50335103:NAT6;ENSG00000243477:ENST00000443842:exon_50333883_50335514:NAT6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	50355730	T/G	1	10	5	15	4.77485086370143	2.61257456814929	2.16227629555214	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.309160750848146	ENSG00000068001:ENST00000447092:exon_50355221_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000357750:exon_50355227_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000395139:exon_50355240_50355970:HYAL2;ENSG00000068001:ENST00000442581:exon_50355243_50355970:HYAL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	50614965	G/A	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000114735:ENST00000434410:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000232854:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000448997:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000455834:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000482974:exon_50614940_50615004:HEMK1;ENSG00000114735:ENST00000443894:exon_50614940_50615004:HEMK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	51737965	G/A	1	40	59	99	19.0994034548057	30.8283799041616	-11.7289764493558	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0204162926992577	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	51737995	T/C	1	62	66	128	29.6040753549489	34.4859842995706	-4.8819089446217	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.426039470449335	ENSG00000164081:ENST00000489026:exon_51737740_51738034:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000457573:exon_51737740_51738338:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000341333:exon_51737740_51738339:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000415259:exon_51737740_51738299:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000395057:exon_51737740_51738337:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000416589:exon_51737740_51738333:TEX264;ENSG00000164081:ENST00000463857:exon_51737740_51738333:TEX264
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	51994587	T/C	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000090097:ENST00000355852:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000492809:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000497390:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000461554:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000484633:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000322099:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000471308:exon_51994542_51994653:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000498822:exon_51994542_51994914:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000395013:exon_51994542_51994694:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000395014:exon_51994542_51994694:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000428823:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000471622:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000294192:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000468324:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000466412:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000497653:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000489595:exon_51994542_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000490063:exon_51994538_51994658:PCBP4;ENSG00000090097:ENST00000483411:exon_51994573_51994658:PCBP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52003391	G/A	1	97	76	173	46.3160533779039	39.7111334358691	6.60491994203473	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.323426251592191	ENSG00000114779:ENST00000483233:exon_52002526_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000487005:exon_52002532_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000395008:exon_52002546_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000361143:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000439982:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000315877:exon_52002569_52003621:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000461108:exon_52003100_52004200:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000525795:exon_52003289_52003621:ABHD14B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52005593	G/A	1	30	20	50	14.3245525911043	10.4502982725971	3.87425431850715	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.322121123582076	ENSG00000114779:ENST00000483233:exon_52005476_52005714:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000395008:exon_52005476_52005908:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000361143:exon_52005476_52005714:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000439982:exon_52005476_52005714:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000315877:exon_52005476_52005714:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000461108:exon_52005476_52005714:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000525795:exon_52005476_52005714:ABHD14B;ENSG00000114779:ENST00000473912:exon_52005353_52005714:ABHD14B;ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52005442_52005833:ABHD14A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52012000	C/G	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000248487:ENST00000497864:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000494478:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000360889:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000452452:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000273596:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000474575:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000248487:ENST00000491470:exon_52011887_52012098:ABHD14A;ENSG00000114786:ENST00000486081:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463721:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000463937:exon_52011887_52012098:RP11-155D18.11;ENSG00000114786:ENST00000458031:exon_52011963_52012098:RP11-155D18.11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52264907	T/C	1	87	80	167	41.5412025142024	41.8011930903886	-0.259990576186127	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000173366:ENST00000494383:exon_52264886_52265011:RP11-330H6.5;ENSG00000247596:ENST00000305533:exon_52264886_52265011:TWF2;ENSG00000247596:ENST00000499914:exon_52264886_52265011:TWF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52437206	G/A	1	14	17	31	6.684791209182	8.88275353170757	-2.19796232252557	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.474924538479927	ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000478368:exon_52437154_52437314:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000466093:exon_52436795_52437314:BAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52440269	C/T	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000163930:ENST00000460680:exon_52440269_52440392:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000296288:exon_52440269_52440338:BAP1;ENSG00000163930:ENST00000471532:exon_52440269_52440923:BAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52563199	A/T	1	22	37	59	10.5046719001431	19.3330518043047	-8.82837990416156	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.0260564992469293	ENSG00000168268:ENST00000307092:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000307076:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000422318:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000459839:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000492555:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000489316:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000471522:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000487779:exon_52563166_52563350:NT5DC2;ENSG00000168268:ENST00000490681:exon_52563166_52563350:NT5DC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52720080	A/C	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52719936_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468146:exon_52720021_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52720032_52720218:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000468885:exon_52720046_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000462550:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000492349:exon_52720048_52720121:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52720065_52720121:GNL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52727257	G/A	1	177	167	344	84.5148602875153	87.2599905761861	-2.74513028867082	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.787383169203784	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727203_52727345:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727186_52727560:GNL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52727736	A/G	1	320	318	638	152.795227638446	166.159742534295	-13.3645148958488	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.302842421447545	ENSG00000163938:ENST00000418458:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000418884:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000354540:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000394799:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000496254:exon_52727648_52727823:GNL3;ENSG00000163938:ENST00000497356:exon_52727648_52727795:GNL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	52786246	G/A	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000114904:ENST00000233027:exon_52785948_52786352:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000383721:exon_52785948_52786352:NEK4;ENSG00000114904:ENST00000461689:exon_52785948_52786352:NEK4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	53125922	T/C	1	105	63	168	50.135934068865	32.918439558681	17.217494510184	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00849855702683646	ENSG00000163933:ENST00000296292:exon_53122499_53126086:RFT1;ENSG00000163933:ENST00000394738:exon_53125681_53126086:RFT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	53321631	A/C	1	27	46	73	12.8920973319939	24.0356860269734	-11.1435886949796	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.00976855758033418	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	56658871	T/C	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000163946:ENST00000459993:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000431842:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000493960:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000355628:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000447900:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000296313:exon_56658856_56659034:C3orf63;ENSG00000163946:ENST00000487036:exon_56658863_56659034:C3orf63
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	58112488	C/T	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58112329_58112489:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58112329_58112489:FLNB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	58154327	C/T	1	53	44	97	25.3067095776176	22.9906561997137	2.31605337790387	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.684812186373315	ENSG00000136068:ENST00000295956:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000490882:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000358537:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000429972:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000348383:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000357272:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000493452:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000419752:exon_58154167_58154385:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000481470:exon_58154167_58155520:FLNB;ENSG00000136068:ENST00000484981:exon_58154167_58154385:FLNB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	58178478	C/T	1	23	33	56	10.9821569865133	17.2429921497853	-6.26083516327199	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.108323243312345	ENSG00000163687:ENST00000486455:exon_58177984_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000483681:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000318316:exon_58178354_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000450710:exon_58178354_58179166:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000394549:exon_58178355_58178530:DNASE1L3;ENSG00000163687:ENST00000477209:exon_58178355_58178530:DNASE1L3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	63982082	G/A	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000163635:ENST00000474112:exon_63981181_63982312:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000398590:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000295900:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000487717:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000484332:exon_63981181_63982159:ATXN7;ENSG00000163635:ENST00000522345:exon_63981986_63982159:ATXN7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	64008036	T/C	1	57	54	111	27.2166499230981	28.2158053360123	-0.999155412914131	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.850008681300052	ENSG00000163636:ENST00000295901:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000476464:exon_64007994_64009113:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000492933:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000394431:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000482510:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000475036:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000497323:exon_64007994_64008199:PSMD6;ENSG00000163636:ENST00000478185:exon_64007994_64008199:PSMD6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	66419956	C/T	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000144741:ENST00000354883:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000336733:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000413054:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000483224:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000464350:exon_66419902_66419966:SLC25A26;ENSG00000144741:ENST00000484768:exon_66419902_66419966:SLC25A26
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	69072391	G/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69068978_69072471:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69068980_69072471:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69072228_69072471:TMF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	69096513	C/T	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000144747:ENST00000398559:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000356248:exon_69096500_69097284:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000488010:exon_69096509_69097713:TMF1;ENSG00000144747:ENST00000438636:exon_69096509_69097713:TMF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	69134184	C/G	1	20	11	31	9.54970172740286	5.74766404992843	3.80203767747443	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.208805155249409	ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69134095_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000435015:exon_69134095_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69134095_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69134166_69134374:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000478935:exon_69134172_69134374:ARL6IP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	69151014	C/A	1	34	33	67	16.2344929365849	17.2429921497853	-1.00849921320042	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.808231421307066	ENSG00000144746:ENST00000273258:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000412089:exon_69150990_69151068:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000484921:exon_69150990_69151207:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000470936:exon_69150990_69151381:ARL6IP5;ENSG00000144746:ENST00000485444:exon_69150990_69151045:ARL6IP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	78656028	T/G	1	42	9	51	20.054373627546	4.70263422266871	15.3517394048773	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1.44104789093558e-05	ENSG00000169855:ENST00000398414:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000398412:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000343019:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000436010:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000464233:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000495273:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000467549:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000466906:exon_78655883_78656191:ROBO1;ENSG00000169855:ENST00000498428:exon_78655958_78656191:ROBO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	81586152	G/A	1	27	28	55	12.8920973319939	14.630417581636	-1.73832024964214	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.686531219091789	ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81586062_81586246:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81586062_81586246:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000489715:exon_81586062_81586246:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000484687:exon_81586062_81586246:GBE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	81810551	G/T	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000114480:ENST00000429644:exon_81810526_81811312:GBE1;ENSG00000114480:ENST00000264326:exon_81810526_81811312:GBE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	88199298	T/C	1	2	11	13	0.954970172740286	5.74766404992843	-4.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0100723869343831	ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88198893_88199335:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88199137_88199335:C3orf38
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	88205454	A/G	1	27	20	47	12.8920973319939	10.4502982725971	2.44179905939672	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.559761908794632	ENSG00000179021:ENST00000318887:exon_88205171_88207118:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000383697:exon_88205171_88207111:C3orf38;ENSG00000179021:ENST00000486971:exon_88205277_88206094:C3orf38
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	98251211	A/G	1	72	117	189	34.3789262186503	61.1342448946933	-26.755318676043	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000105017445979781	ENSG00000154165:ENST00000284311:exon_98250855_98251994:GPR15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	98307696	T/G	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000080819:ENST00000264193:exon_98307557_98307698:CPOX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	100467018	T/C	1	88	72	160	42.0186876005726	37.6210737813497	4.39761381922288	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.526875767966096	ENSG00000114354:ENST00000418917:exon_100466993_100467786:TFG;ENSG00000114354:ENST00000490574:exon_100466993_100467771:TFG;ENSG00000114354:ENST00000240851:exon_100466993_100467810:TFG;ENSG00000114354:ENST00000406587:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000443578:exon_100466993_100467807:TFG;ENSG00000114354:ENST00000476228:exon_100466993_100467808:TFG;ENSG00000114354:ENST00000481203:exon_100466993_100467807:TFG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	105389153	A/G	1	37	32	69	17.6669481956953	16.7204772361554	0.946470959539866	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.90421162607564	ENSG00000114423:ENST00000394030:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105389077_105389196:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000476370:exon_105389077_105392837:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000407712:exon_105389077_105389196:CBLB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	105422844	C/T	1	13	16	29	6.20730612281186	8.36023861807771	-2.15293249526585	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.461080918794537	ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105422832_105423017:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105422832_105423017:CBLB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	105438957	T/G	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.296181191073666	ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	105439026	G/A	1	3	13	16	1.43245525911043	6.79269387718814	-5.36023861807771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0101177193368125	ENSG00000114423:ENST00000264122:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000394027:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000403724:exon_105438891_105439094:CBLB;ENSG00000114423:ENST00000405772:exon_105438891_105439094:CBLB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	111312445	A/G	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000177494:ENST00000317012:exon_111311747_111313913:ZBED2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	112256630	A/G	1	57	39	96	27.2166499230981	20.3780816315644	6.83856829153373	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.184103041579909	ENSG00000144848:ENST00000283290:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000402314:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000495756:exon_112256582_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000467275:exon_112256378_112256737:ATG3;ENSG00000144848:ENST00000496423:exon_112256582_112256737:ATG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	113164193	A/T	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113161565_113164207:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000467618:exon_113164101_113164207:SPICE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	113176122	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113175983_113176204:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113175983_113176204:SPICE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	113179485	T/C	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000163611:ENST00000295872:exon_113179464_113179611:SPICE1;ENSG00000163611:ENST00000496105:exon_113179464_113179611:SPICE1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	113392214	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000176542:ENST00000491165:exon_113392195_113392223:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000316407:exon_113392195_113392223:KIAA2018;ENSG00000176542:ENST00000478658:exon_113392195_113392223:KIAA2018
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	115571364	C/T	1	17	5	22	8.11724646829243	2.61257456814929	5.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0193052698299583	ENSG00000185565:ENST00000333617:exon_115571330_115571464:LSAMP;ENSG00000185565:ENST00000490035:exon_115571330_115571464:LSAMP;ENSG00000185565:ENST00000473171:exon_115571330_115571425:LSAMP;ENSG00000185565:ENST00000498645:exon_115571330_115571464:LSAMP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	119219573	A/G	1	22	14	36	10.5046719001431	7.315208790818	3.18946310932515	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.319689840113896	ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000463927:exon_119219542_119219707:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000469324:exon_119219221_119219707:C3orf1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	119222456	G/C	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000113845:ENST00000494664:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000264244:exon_119222379_119222467:C3orf1;ENSG00000113845:ENST00000492164:exon_119222379_119222467:C3orf1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	119236179	G/A	1	21	16	37	10.027186813773	8.36023861807771	1.66694819569529	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.624460416119285	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	119242443	C/T	1	5	13	18	2.38742543185071	6.79269387718814	-4.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0562616570271979	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	119305142	G/A	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000144843:ENST00000478399:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000481816:exon_119305132_119305210:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000471850:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000485496:exon_119305132_119305386:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000478927:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000357003:exon_119305132_119305492:ADPRH;ENSG00000144843:ENST00000465513:exon_119305132_119305492:ADPRH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	119331892	C/G	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000144837:ENST00000273371:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000488919:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000495992:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000494440:exon_119331864_119331965:PLA1A;ENSG00000144837:ENST00000475963:exon_119331864_119331965:PLA1A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121154974	T/C	1	2	9	11	0.954970172740286	4.70263422266871	-3.74766404992843	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0319683877489123	ENSG00000051341:ENST00000393672:exon_121154969_121155122:POLQ;ENSG00000051341:ENST00000264233:exon_121154969_121155122:POLQ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121353254	T/C	1	221	162	383	105.524204087802	84.6474160080368	20.8767880797648	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0358564386094711	ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121353054_121353265:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121353054_121353265:HCLS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121354583	G/A	1	224	155	379	106.956659346912	80.9898116126278	25.9668477342842	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00864522204149303	ENSG00000180353:ENST00000314583:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000473883:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000412597:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000428394:exon_121354582_121354651:HCLS1;ENSG00000180353:ENST00000495491:exon_121354582_121354651:HCLS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121383297	G/A	1	103	126	229	49.1809638961247	65.836879117362	-16.6559152212373	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0290003442990539	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121382046_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121382050_121383461:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121382948_121383461:GOLGB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121413395	C/T	1	43	43	86	20.5318587139161	22.4681412860839	-1.93628257216771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.746293778470864	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121414061	C/T	1	32	32	64	15.2795227638446	16.7204772361554	-1.44095447231085	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.802638931749084	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121415720	T/C	1	13	16	29	6.20730612281186	8.36023861807771	-2.15293249526585	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.461080918794537	ENSG00000173230:ENST00000340645:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000393667:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000482512:exon_121412588_121417776:GOLGB1;ENSG00000173230:ENST00000494517:exon_121414325_121417776:GOLGB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121526204	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000173226:ENST00000310864:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000393650:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000349820:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000460108:exon_121526191_121526290:IQCB1;ENSG00000173226:ENST00000498104:exon_121526191_121526290:IQCB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	121825319	G/A	1	88	48	136	42.0186876005726	25.0807158542331	16.9379717463394	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00444028901500399	ENSG00000114013:ENST00000469710:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000493101:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000330540:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000383662:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000264468:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000393627:exon_121825045_121825347:CD86;ENSG00000114013:ENST00000478741:exon_121825045_121825347:CD86
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	122259606	T/C	1	30	6	36	14.3245525911043	3.13508948177914	11.1894631093251	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000155628196719965	ENSG00000138496:ENST00000360356:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000492382:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000477522:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000489652:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000471785:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000452457:exon_122259319_122259699:PARP9;ENSG00000138496:ENST00000462315:exon_122259319_122259699:PARP9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	122418750	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000173193:ENST00000474629:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000398162:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000310290:exon_122418237_122420482:PARP14;ENSG00000173193:ENST00000460683:exon_122418237_122420482:PARP14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	122459477	A/G	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000169087:ENST00000383659:exon_122458846_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000471534:exon_122458850_122459722:HSPBAP1;ENSG00000169087:ENST00000306103:exon_122458850_122459722:HSPBAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	122869132	C/T	1	12	15	27	5.72982103644172	7.83772370444786	-2.10790266800614	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.446234170782508	ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122869081_122869211:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000485208:exon_122869081_122869212:PDIA5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	122880191	T/C	1	17	13	30	8.11724646829243	6.79269387718814	1.32455259110429	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.716104189045481	ENSG00000065485:ENST00000489923:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000316218:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000448706:exon_122880168_122880302:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000467157:exon_122880168_122880950:PDIA5;ENSG00000065485:ENST00000469649:exon_122880168_122880302:PDIA5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124456742	G/C	1	43	34	77	20.5318587139161	17.7655070634151	2.76635165050101	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.569349715123018	ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124456415_124457086:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124456415_124457290:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000498715:exon_124456415_124457218:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124456639_124457086:UMPS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124462808	C/T	1	49	34	83	23.396769232137	17.7655070634151	5.63126216872187	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.228213064094795	ENSG00000114491:ENST00000232607:exon_124462762_124464040:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000462091:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000467167:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000474588:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000497791:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000460034:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000479719:exon_124462762_124463604:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000413078:exon_124462762_124463138:UMPS;ENSG00000114491:ENST00000495751:exon_124462762_124462917:UMPS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124492734	T/C	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124492537_124492759:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000461306:exon_124492537_124492759:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124492537_124492759:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124492666_124492759:ITGB5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124515308	A/G	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124515314	G/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000082781:ENST00000296181:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000481591:exon_124515235_124515664:ITGB5;ENSG00000082781:ENST00000488466:exon_124515235_124515664:ITGB5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124826789	G/A	1	77	59	136	36.766351650501	30.8283799041616	5.93797174633944	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.345142857447682	ENSG00000221955:ENST00000430155:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000423114:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000332979:exon_124826620_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000393469:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000473262:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465475:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000469902:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479352:exon_124826325_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000314584:exon_124826321_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000485954:exon_124826689_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000479231:exon_124826725_124826970:SLC12A8;ENSG00000221955:ENST00000465777:exon_124826789_124826970:SLC12A8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	124951821	C/T	1	14	11	25	6.684791209182	5.74766404992843	0.937127159253575	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841937402628968	ENSG00000163848:ENST00000360647:exon_124944405_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000484491:exon_124950920_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000492394:exon_124950923_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000485866:exon_124951172_124952783:ZNF148;ENSG00000163848:ENST00000497929:exon_124951185_124952783:ZNF148
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	125786879	T/C	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000114544:ENST00000360370:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000346785:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000315921:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514677:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513723:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514023:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000513464:exon_125786790_125787023:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000512470:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000510651:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514333:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000504035:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000507280:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000514891:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509064:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000505996:exon_125786790_125787089:SLC41A3;ENSG00000114544:ENST00000509452:exon_125786806_125787089:SLC41A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	126451937	G/T	1	16	3	19	7.63976138192229	1.56754474088957	6.07221664103272	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00515578938074366	ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000514908:exon_126451921_126452065:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126451921_126452065:CHCHD6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	126676271	G/A	1	33	18	51	15.7570078502147	9.40526844533743	6.35173940487729	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0918651699940207	ENSG00000159685:ENST00000290913:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000503119:exon_126676259_126676676:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000508789:exon_126676259_126676776:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000513253:exon_126676268_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504084:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000504973:exon_126676259_126676394:CHCHD6;ENSG00000159685:ENST00000510044:exon_126676259_126676394:CHCHD6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	127323592	G/A	1	12	18	30	5.72982103644172	9.40526844533743	-3.67544740889571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.202983319347204	ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000480910:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323451_127323626:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323451_127323626:MCM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	127323830	C/T	1	10	15	25	4.77485086370143	7.83772370444786	-3.06287284074643	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.235750861164297	ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	127323902	G/C	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000073111:ENST00000265056:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000474964:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000477668:exon_127323720_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000468659:exon_127323739_127323999:MCM2;ENSG00000073111:ENST00000491422:exon_127323739_127323999:MCM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	127396042	G/C	1	19	14	33	9.07221664103272	7.315208790818	1.75700785021472	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.603348110946097	ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127395379_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127395810_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396011_127396129:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396020_127396129:ABTB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	127396588	C/T	1	15	21	36	7.16227629555214	10.972813186227	-3.81053689067485	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.243311756234342	ENSG00000114626:ENST00000361019:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000393363:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000232744:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000453791:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000475042:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000468137:exon_127396519_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000464431:exon_127396308_127399028:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000478298:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000474129:exon_127396308_127396686:ABTB1;ENSG00000114626:ENST00000497162:exon_127396519_127396686:ABTB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	128344378	T/C	1	203	178	381	96.929472533139	93.0076546261145	3.92181790702448	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.719671250979908	ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128344377_128344496:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128344377_128344496:RPN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	128356699	C/T	1	117	102	219	55.8657551053067	53.2965211902454	2.56923391506131	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.735764895497924	ENSG00000163902:ENST00000296255:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000497289:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000495462:exon_128356642_128356948:RPN1;ENSG00000163902:ENST00000479113:exon_128356663_128356948:RPN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	128614185	A/C	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000177646:ENST00000514643:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000512801:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505192:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000514336:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000453462:exon_128614153_128614191:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128614153_128614259:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128614153_128614259:ACAD9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	128627933	C/T	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000177646:ENST00000308982:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511227:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000505867:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000334167:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511526:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000508971:exon_128627816_128627942:ACAD9;ENSG00000177646:ENST00000511325:exon_128627816_128627942:ACAD9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	128971761	T/A	1	31	36	67	14.8020376774744	18.8105368906749	-4.00849921320042	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.331195184199907	ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128971719_128971798:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513965:exon_128971466_128971941:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128971466_128971798:COPG;ENSG00000181789:ENST00000504350:exon_128971719_128971798:COPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	128984583	C/T	1	78	94	172	37.2438367368712	49.1164018812066	-11.8725651443354	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.078923846768322	ENSG00000181789:ENST00000314797:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000515725:exon_128984392_128984635:COPG;ENSG00000181789:ENST00000513410:exon_128984392_128984635:COPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	129152089	G/A	1	51	35	86	24.3517394048773	18.288021977045	6.0637174278323	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.196995635379102	ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000393278:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000509828:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129151941_129152090:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000511009:exon_129151941_129152396:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000515266:exon_129151941_129152090:MBD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	129155451	C/T	1	43	51	94	20.5318587139161	26.6482605951227	-6.11640188120656	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.216499003438188	ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	129155463	A/G	1	44	45	89	21.0093438002863	23.5131711133436	-2.50382731305728	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.597846955865887	ENSG00000129071:ENST00000429544:exon_129155304_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000249910:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000503197:exon_129155286_129156151:MBD4;ENSG00000129071:ENST00000507208:exon_129155286_129156151:MBD4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	130398298	C/G	1	30	24	54	14.3245525911043	12.5403579271166	1.78419466398772	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.683800171013328	ENSG00000196455:ENST00000356763:exon_130397779_130398329:PIK3R4;ENSG00000196455:ENST00000511760:exon_130397854_130398329:PIK3R4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	133329943	G/A	1	13	10	23	6.20730612281186	5.22514913629857	0.982156986513288	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.835280900229804	ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133329848_133329985:TOPBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	133356944	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000163781:ENST00000260810:exon_133356720_133357006:TOPBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	134197406	T/A	1	59	53	112	28.1716200958384	27.6932904223824	0.478329673456013	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129055:ENST00000510994:exon_134196548_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000354910:exon_134196550_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000514612:exon_134196553_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000511751:exon_134196918_134197557:ANAPC13;ENSG00000129055:ENST00000508755:exon_134197320_134197557:ANAPC13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	137881029	C/T	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000138231:ENST00000260803:exon_137879854_137881424:DBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	138218994	T/C	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000114107:ENST00000264982:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000489254:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000484888:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000474781:exon_138218952_138219066:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000459695:exon_138218952_138219022:CEP70;ENSG00000114107:ENST00000481834:exon_138218726_138219066:CEP70
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	138347957	G/A	1	18	10	28	8.59473155466257	5.22514913629857	3.369582418364	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.256696252072731	ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	138347988	T/C	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000158234:ENST00000470889:exon_138347949_138349981:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000338446:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000360570:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000311126:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393035:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000491175:exon_138347949_138348174:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393034:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000393036:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000464668:exon_138347949_138347998:FAIM;ENSG00000158234:ENST00000479848:exon_138347949_138347993:FAIM
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	141164114	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000177311:ENST00000514251:exon_141161231_141168634:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000321464:exon_141161231_141168623:ZBTB38;ENSG00000177311:ENST00000441582:exon_141161231_141164842:ZBTB38
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	143567018	C/T	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000181804:ENST00000316549:exon_143566990_143567373:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000474727:exon_143566990_143567327:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000474151:exon_143566990_143567300:SLC9A9;ENSG00000181804:ENST00000498717:exon_143566990_143567311:SLC9A9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	148789127	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000071794:ENST00000465259:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000310053:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392912:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000494055:exon_148789039_148789230:HLTF;ENSG00000071794:ENST00000392913:exon_148789039_148789230:HLTF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	149459413	C/T	1	21	10	31	10.027186813773	5.22514913629857	4.80203767747443	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.105036819554453	ENSG00000114744:ENST00000473414:exon_149456257_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000491617:exon_149459177_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000463077:exon_149459213_149459505:COMMD2;ENSG00000114744:ENST00000483708:exon_149459362_149459505:COMMD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	149700572	C/T	0	107	0	107	51.0909042416053	0	51.0909042416053	C	C		10	0.522514913629857	9.94070295499258e-31	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	150280445	C/G	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000144895:ENST00000487799:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000460851:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000474505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000406576:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000482093:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000469331:exon_150280329_150280695:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000273435:exon_150280344_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000490505:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000462221:exon_150280329_150280447:EIF2A;ENSG00000144895:ENST00000477551:exon_150280329_150280447:EIF2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	154018887	G/C	1	18	17	35	8.59473155466257	8.88275353170757	-0.288021977044997	T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000174953:ENST00000496811:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000308361:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000329463:exon_154018776_154018916:DHX36;ENSG00000174953:ENST00000481941:exon_154018776_154018916:DHX36
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	160231937	T/C	1	16	10	26	7.63976138192229	5.22514913629857	2.41461224562372	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.433312135919422	ENSG00000186432:ENST00000334256:exon_160231865_160231969:KPNA4;ENSG00000186432:ENST00000483437:exon_160231865_160231969:KPNA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	171320907	C/T	1	20	15	35	9.54970172740286	7.83772370444786	1.711978022955	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.614294946711019	ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	171321023	C/T	1	17	6	23	8.11724646829243	3.13508948177914	4.98215698651329	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0578951905981726	ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171318195_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171318616_171321092:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171318620_171321092:PLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	171379901	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000075651:ENST00000356327:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000351298:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000342215:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000446289:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000340989:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000465816:exon_171379850_171379960:PLD1;ENSG00000075651:ENST00000471075:exon_171379850_171379960:PLD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	178748704	C/T	1	10	23	33	4.77485086370143	12.0178430134867	-7.24299214978528	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0139078274162245	ENSG00000172667:ENST00000311417:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000432729:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000441601:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000443441:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000416402:exon_178748668_178748787:ZMAT3;ENSG00000172667:ENST00000414084:exon_178748668_178748787:ZMAT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	178978078	T/G	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.586125855411521	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	180630500	C/T	1	22	19	41	10.5046719001431	9.92778335896728	0.576888541175862	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.877191301426372	ENSG00000114416:ENST00000357559:exon_180630090_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392639:exon_180630090_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000305586:exon_180630270_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000475315:exon_180630279_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491674:exon_180630326_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000392637:exon_180630452_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445400:exon_180630452_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000491062:exon_180630459_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000468861:exon_180630459_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000479176:exon_180630459_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000445140:exon_180630460_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000472339:exon_180630466_180630524:FXR1;ENSG00000114416:ENST00000484958:exon_180630473_180630524:FXR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	183508590	A/G	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000163872:ENST00000421660:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000305135:exon_183508585_183508768:YEATS2;ENSG00000163872:ENST00000432781:exon_183508585_183508768:YEATS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	183861243	A/G	1	54	38	92	25.7841946639877	19.8555667179346	5.92862794605315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.250908767120771	ENSG00000145191:ENST00000491144:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000273783:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000444495:exon_183861230_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000481054:exon_183860840_183862012:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000465218:exon_183860840_183861353:EIF2B5;ENSG00000145191:ENST00000484154:exon_183861230_183861497:EIF2B5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	183976108	T/C	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000145194:ENST00000324557:exon_183976076_183977373:ECE2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	184026703	C/T	1	85	104	189	40.5862323414621	54.3415510175051	-13.755318676043	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0491670629557954	ENSG00000175166:ENST00000310118:exon_184026496_184026842:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000435761:exon_184026496_184026788:PSMD2;ENSG00000175166:ENST00000439383:exon_184026496_184026836:PSMD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	184428800	T/C	1	41	32	73	19.5768885411759	16.7204772361554	2.85641130502044	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.558597905554608	ENSG00000177383:ENST00000317897:exon_184428156_184429836:MAGEF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	186268924	C/T	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186268918_186269068:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186268918_186269068:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186268918_186269068:TBCCD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	186272156	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000113838:ENST00000424280:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000338733:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000446782:exon_186272043_186272540:TBCCD1;ENSG00000113838:ENST00000479590:exon_186272043_186272264:TBCCD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	186509517	G/A	1	60	46	106	28.6491051822086	24.0356860269734	4.61341915523516	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.383098347197909	ENSG00000163918:ENST00000433496:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000479307:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000392481:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000296273:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000417876:exon_186509514_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000494047:exon_186509112_186509639:RFC4;ENSG00000163918:ENST00000460408:exon_186509479_186509639:RFC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	186791979	C/T	1	14	12	26	6.684791209182	6.27017896355828	0.414612245623718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000073849:ENST00000169298:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000427315:exon_186791947_186791992:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000457772:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448044:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000432152:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000448449:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000442023:exon_186791947_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000470633:exon_186791193_186792121:ST6GAL1;ENSG00000073849:ENST00000392479:exon_186791947_186792121:ST6GAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	187088812	C/T	1	6	14	20	2.86491051822086	7.315208790818	-4.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0707133729520549	ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	187088903	C/A	1	13	11	24	6.20730612281186	5.74766404992843	0.459642072883431	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	187088926	G/A	1	17	12	29	8.11724646829243	6.27017896355828	1.84706750473415	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.578659663491947	ENSG00000136514:ENST00000259030:exon_187088576_187089864:RTP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	189702346	C/T	1	18	14	32	8.59473155466257	7.315208790818	1.27952276384458	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.724988542615628	ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189702339_189702379:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189702339_189702379:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000470925:exon_189702339_189702379:LEPREL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	189713100	G/A	1	18	12	30	8.59473155466257	6.27017896355828	2.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.466493121478826	ENSG00000090530:ENST00000319332:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000427335:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000444866:exon_189713079_189713231:LEPREL1;ENSG00000090530:ENST00000426003:exon_189713079_189713231:LEPREL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	191075902	C/T	1	58	44	102	27.6941350094683	22.9906561997137	4.70347880975459	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.373372660777401	ENSG00000152492:ENST00000392455:exon_191075787_191075913:CCDC50;ENSG00000152492:ENST00000392456:exon_191075787_191075913:CCDC50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	194373832	T/C	1	13	4	17	6.20730612281186	2.09005965451943	4.11724646829243	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0528824530837299	ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	194373833	G/A	1	13	4	17	6.20730612281186	2.09005965451943	4.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0528824530837299	ENSG00000041802:ENST00000265245:exon_194373458_194373871:LSG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	194408716	G/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000185112:ENST00000329759:exon_194406622_194409762:FAM43A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	195591006	C/G	1	16	19	35	7.63976138192229	9.92778335896728	-2.288021977045	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.500012532849596	ENSG00000061938:ENST00000333602:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000381916:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000416152:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000414741:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000525400:exon_195590235_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000428187:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000420716:exon_195590236_195591058:TNK2;ENSG00000061938:ENST00000392400:exon_195590236_195591058:TNK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	196199246	T/C	1	16	9	25	7.63976138192229	4.70263422266871	2.93712715925357	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.317123875739726	ENSG00000163961:ENST00000318037:exon_196195654_196199643:RNF168;ENSG00000163961:ENST00000437070:exon_196198631_196199643:RNF168
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	196678838	G/A	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119227:ENST00000412723:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000443835:exon_196678692_196678902:PIGZ;ENSG00000119227:ENST00000238138:exon_196678409_196678902:PIGZ
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	196771487	T/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000075711:ENST00000346964:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000357674:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000381807:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000314062:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000359922:exon_196769431_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000469371:exon_196769904_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000419354:exon_196770502_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000452595:exon_196771131_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000422288:exon_196771202_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000448528:exon_196771422_196771600:DLG1;ENSG00000075711:ENST00000443183:exon_196771431_196771600:DLG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	197427557	A/G	1	7	16	23	3.342395604591	8.36023861807771	-5.01784301348671	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0385964030094864	ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000447048:exon_197427484_197427640:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	197427920	G/A	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000415452:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197427484_197428017:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197427331_197428017:KIAA0226
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	3	197432029	C/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000145016:ENST00000273582:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000455374:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000417842:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000413360:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000296343:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000389665:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000449205:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000467303:exon_197431963_197432046:KIAA0226;ENSG00000145016:ENST00000474214:exon_197431963_197432046:KIAA0226
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	86798	C/T	1	18	1	19	8.59473155466257	0.522514913629857	8.07221664103272	T:C	C	T	10	0.522514913629857	9.8193344972374e-05	ENSG00000197701:ENST00000339368:exon_85622_88099:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000507368:exon_85622_87412:ZNF595;ENSG00000197701:ENST00000512065:exon_85622_87410:ZNF595
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	520853	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000174227:ENST00000453065:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000296306:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000310340:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000453061:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000504346:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000383028:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000508669:exon_520828_521329:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000503261:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000510235:exon_520828_521019:PIGG;ENSG00000174227:ENST00000511666:exon_520739_521019:PIGG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	660382	C/T	1	17	6	23	8.11724646829243	3.13508948177914	4.98215698651329	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0578951905981726	ENSG00000133256:ENST00000255622:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_660320_660403:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_660320_660403:PDE6B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	663836	A/G	1	21	8	29	10.027186813773	4.18011930903886	5.84706750473415	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0392812416608978	ENSG00000133256:ENST00000496514:exon_663835_664542:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000429163:exon_663835_664022:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000471824:exon_663835_663982:PDE6B;ENSG00000133256:ENST00000461490:exon_663835_664103:PDE6B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	675697	C/T	1	38	22	60	18.1444332820654	11.4953280998569	6.64910518220858	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0934885830000433	ENSG00000215375:ENST00000506838:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000505477:exon_675682_675811:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503300:exon_675682_675816:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000511290:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000400159:exon_675682_675822:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000513662:exon_675682_675779:MYL5;ENSG00000215375:ENST00000503612:exon_675682_675817:MYL5;ENSG00000169026:ENST00000512400:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000347950:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000322224:exon_675618_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000404286:exon_675620_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000515118:exon_675647_676165:MFSD7;ENSG00000169026:ENST00000503156:exon_675651_676125:MFSD7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	952261	C/T	1	33	20	53	15.7570078502147	10.4502982725971	5.30670957761758	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.169194891029909	ENSG00000127419:ENST00000264771:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000513952:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000515740:exon_951612_952363:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000438836:exon_951612_952444:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000508204:exon_951612_952297:TMEM175;ENSG00000127419:ENST00000505148:exon_951612_952427:TMEM175
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	1305799	C/T	1	26	25	51	12.4146122456237	13.0628728407464	-0.648260595122709	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.889170159105475	ENSG00000090316:ENST00000303400:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505177:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000513301:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512308:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503653:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000264750:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000382947:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000452175:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509254:exon_1305767_1306026:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000502558:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000514708:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000508634:exon_1305767_1306374:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000503693:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000509531:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000510794:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000512842:exon_1305767_1305949:MAEA;ENSG00000090316:ENST00000505839:exon_1305767_1305949:MAEA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	1818594	C/T	1	34	30	64	16.2344929365849	15.6754474088957	0.55904552768915	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.901208316087129	ENSG00000168924:ENST00000302787:exon_1818454_1818641:LETM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	1920270	A/G	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000109685:ENST00000508803:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000508355:exon_1919868_1920914:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000514045:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382891:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000353275:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382892:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382889:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000420906:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000312087:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000382895:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000503128:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000398261:exon_1919868_1920350:WHSC1;ENSG00000109685:ENST00000511904:exon_1920159_1920350:WHSC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	2698230	G/A	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125386:ENST00000324666:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000382839:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000512465:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000502458:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513898:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000505311:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000513350:exon_2698090_2698320:FAM193A;ENSG00000125386:ENST00000506120:exon_2698001_2698320:FAM193A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	2743970	C/T	1	93	89	182	44.4061130324233	46.5038273130573	-2.09771428063397	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.767072563145463	ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	2743983	G/A	1	86	87	173	41.0637174278323	45.4587974857976	-4.39508005796527	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.542782381282004	ENSG00000168884:ENST00000510267:exon_2743375_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000315423:exon_2743387_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000503235:exon_2743425_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000502256:exon_2743802_2744247:TNIP2;ENSG00000168884:ENST00000505186:exon_2743857_2744247:TNIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	2949274	G/C	1	29	24	53	13.8470675047341	12.5403579271166	1.30670957761758	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.783995299431726	ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2949253_2949338:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2949253_2949338:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2949253_2949338:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2949253_2949338:NOP14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	2951788	G/A	1	48	35	83	22.9192841457669	18.288021977045	4.63126216872187	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.324452744574292	ENSG00000087269:ENST00000416614:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000314262:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000502735:exon_2951661_2951940:NOP14;ENSG00000087269:ENST00000398071:exon_2951661_2951940:NOP14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	3227419	A/G	1	16	17	33	7.63976138192229	8.88275353170757	-1.24299214978528	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.728920287854378	ENSG00000197386:ENST00000355072:exon_3227388_3227470:HTT;ENSG00000197386:ENST00000510626:exon_3227388_3227470:HTT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	3519762	A/G	1	37	34	71	17.6669481956953	17.7655070634151	-0.0985588677198486	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000163956:ENST00000500728:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000296325:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000515119:exon_3519761_3519919:LRPAP1;ENSG00000163956:ENST00000509198:exon_3519388_3519919:LRPAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	4276394	C/T	1	203	193	396	96.929472533139	100.845378330562	-3.91590579742339	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.724801590441645	ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4276094_4276496:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4276094_4276496:LYAR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	4283537	G/A	1	52	45	97	24.8292244912474	23.5131711133436	1.31605337790387	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.839190101622374	ENSG00000145220:ENST00000343470:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000452476:exon_4283510_4283624:LYAR;ENSG00000145220:ENST00000513174:exon_4283510_4283624:LYAR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	4436517	A/T	1	6	12	18	2.86491051822086	6.27017896355828	-3.40526844533743	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.155344968085716	ENSG00000168818:ENST00000505286:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000306200:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000503861:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000512195:exon_4436497_4436585:STX18;ENSG00000168818:ENST00000507908:exon_4436497_4436585:STX18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	6304242	T/C	1	13	3	16	6.20730612281186	1.56754474088957	4.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0233109282447019	ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	6304249	A/G	1	11	2	13	5.25233595007157	1.04502982725971	4.20730612281186	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0241685145321443	ENSG00000109501:ENST00000503569:exon_6302384_6304610:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000226760:exon_6302384_6304992:WFS1;ENSG00000109501:ENST00000507765:exon_6302384_6304992:WFS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	6611560	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6611525_6611777:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6611525_6611777:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6611525_6611777:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504960:exon_6611525_6611768:MAN2B2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	6615986	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000013288:ENST00000285599:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000504248:exon_6615945_6616082:MAN2B2;ENSG00000013288:ENST00000505907:exon_6615945_6616082:MAN2B2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	8229270	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000509553:exon_8228707_8229272:SH3TC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	8229452	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	8230070	T/C	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	8230235	T/C	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502669:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000382516:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8228707_8230371:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8228707_8230371:SH3TC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	8238048	C/T	1	10	24	34	4.77485086370143	12.5403579271166	-7.76550706341514	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00927124813277617	ENSG00000125089:ENST00000506360:exon_8238005_8239397:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000245105:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000515682:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000511002:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502350:exon_8238005_8238155:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000508183:exon_8237160_8238156:SH3TC1;ENSG00000125089:ENST00000502559:exon_8237160_8239397:SH3TC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	8416586	T/G	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000087008:ENST00000413009:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000356406:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000503233:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000510365:exon_8416581_8416655:ACOX3;ENSG00000087008:ENST00000514423:exon_8416581_8416655:ACOX3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	9998376	C/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	9998493	A/G	1	3	10	13	1.43245525911043	5.22514913629857	-3.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0493024340440666	ENSG00000109667:ENST00000506583:exon_9998405_9998565:SLC2A9;ENSG00000109667:ENST00000264784:exon_9998405_9998565:SLC2A9;ENSG00000109667:ENST00000309065:exon_9998405_9998565:SLC2A9;ENSG00000109667:ENST00000505104:exon_9998405_9998565:SLC2A9;ENSG00000109667:ENST00000513129:exon_9998405_9998565:SLC2A9;ENSG00000109667:ENST00000505506:exon_9998405_9998565:SLC2A9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	10099340	T/C	1	71	87	158	33.9014411322801	45.4587974857976	-11.5573563535174	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0673523281966454	ENSG00000071127:ENST00000499869:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000439733:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000382452:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000400001:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000508079:exon_10099335_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000264785:exon_10099334_10099515:WDR1;ENSG00000071127:ENST00000505851:exon_10099336_10099515:WDR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	11400746	T/C	0	0	9	9	0	4.70263422266871	-4.70263422266871	C	T	C	10	0.522514913629857	0.00129014434626878	ENSG00000002587:ENST00000002596:exon_11394774_11401737:HS3ST1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	17841339	A/G	1	36	30	66	17.1894631093251	15.6754474088957	1.51401570042944	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.805576971746297	ENSG00000109805:ENST00000251496:exon_17841299_17841460:NCAPG;ENSG00000109805:ENST00000514176:exon_17841299_17841460:NCAPG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	22729262	G/C	0	439	1	440	209.615952916493	0.522514913629857	209.093438002863	A:G	G	A	10	0.522514913629857	3.90405305671395e-122	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	24578097	C/T	1	34	30	64	16.2344929365849	15.6754474088957	0.55904552768915	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.901208316087129	ENSG00000109606:ENST00000336812:exon_24577866_24578301:DHX15;ENSG00000109606:ENST00000511553:exon_24578092_24578301:DHX15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	25419283	T/C	1	17	23	40	8.11724646829243	12.0178430134867	-3.90059654519428	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.267865059778909	ENSG00000053900:ENST00000315368:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000510092:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000504256:exon_25417088_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000515848:exon_25419238_25419361:ANAPC4;ENSG00000053900:ENST00000506973:exon_25419238_25420119:ANAPC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	25759312	G/A	1	13	8	21	6.20730612281186	4.18011930903886	2.027186813773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.393468965686283	ENSG00000091490:ENST00000399878:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000264868:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000513416:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000512286:exon_25759310_25759474:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000502949:exon_25759310_25759412:SEL1L3;ENSG00000091490:ENST00000510448:exon_25759310_25759412:SEL1L3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	37857342	G/C	1	33	28	61	15.7570078502147	14.630417581636	1.12659026857872	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.798953186315004	ENSG00000169299:ENST00000381967:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000512556:exon_37857229_37857362:PGM2;ENSG00000169299:ENST00000510084:exon_37857229_37857362:PGM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	38995413	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000121895:ENST00000381938:exon_38995358_38995618:TMEM156;ENSG00000121895:ENST00000344606:exon_38995355_38995618:TMEM156
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	39116911	T/C	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000109790:ENST00000261425:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000508137:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000504108:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000381930:exon_39116779_39117952:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000261426:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000359687:exon_39116779_39116950:KLHL5;ENSG00000109790:ENST00000515612:exon_39116779_39116950:KLHL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	40245006	G/A	1	35	39	74	16.711978022955	20.3780816315644	-3.66610360860942	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.416761979595568	ENSG00000168421:ENST00000505618:exon_40244798_40245615:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000507851:exon_40244798_40245333:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000508513:exon_40244798_40245054:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000503941:exon_40244798_40245315:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000381799:exon_40244798_40246281:RHOH;ENSG00000168421:ENST00000511121:exon_40244798_40245025:RHOH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	47887536	T/C	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170448:ENST00000381538:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000464756:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000507489:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000507131:exon_47887515_47887674:NFXL1;ENSG00000170448:ENST00000329043:exon_47887515_47887674:NFXL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	48896051	A/T	1	45	40	85	21.4868288866564	20.9005965451943	0.58623234146215	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.914005775607812	ENSG00000145247:ENST00000508632:exon_48896023_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000514576:exon_48894789_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000508069:exon_48896023_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000273860:exon_48896023_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000506226:exon_48896022_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000381464:exon_48896023_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000512087:exon_48896023_48896070:OCIAD2;ENSG00000145247:ENST00000510159:exon_48896023_48896070:OCIAD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	53751932	C/T	1	17	23	40	8.11724646829243	12.0178430134867	-3.90059654519428	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.267865059778909	ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53751914_53752033:SCFD2;ENSG00000184178:ENST00000388940:exon_53751914_53752033:SCFD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	53773676	A/G	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000184178:ENST00000401642:exon_53773624_53773758:SCFD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	56756531	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000090989:ENST00000381295:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000346134:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000349598:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000511971:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000509302:exon_56756389_56756552:EXOC1;ENSG00000090989:ENST00000504321:exon_56756389_56756552:EXOC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	57219592	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000157426:ENST00000205214:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000513376:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000514745:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000451613:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000434343:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000503808:exon_57219570_57219762:AASDH;ENSG00000157426:ENST00000502617:exon_57219570_57219762:AASDH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	57361553	A/G	1	148	109	257	70.6677927827812	56.9541255856544	13.7136671971267	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0918248028374052	ENSG00000174780:ENST00000342756:exon_57361523_57361560:SRP72;ENSG00000174780:ENST00000510663:exon_57361523_57361560:SRP72
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	57797127	G/A	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000084093:ENST00000309042:exon_57796007_57802010:REST;ENSG00000084093:ENST00000358605:exon_57796000_57798318:REST
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	57839419	A/G	1	21	20	41	10.027186813773	10.4502982725971	-0.423111458824138	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000084092:ENST00000264230:exon_57839314_57839519:C4orf14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	57887084	C/T	1	22	13	35	10.5046719001431	6.79269387718814	3.711978022955	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.238241131396320	ENSG00000047315:ENST00000381227:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000431623:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000441246:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000314595:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000396241:exon_57887065_57887161:POLR2B;ENSG00000047315:ENST00000478188:exon_57887065_57887161:POLR2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	68442968	A/G	1	17	30	47	8.11724646829243	15.6754474088957	-7.55820094060328	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0288438550714928	ENSG00000035720:ENST00000265404:exon_68442921_68442977:STAP1;ENSG00000035720:ENST00000396225:exon_68442921_68442977:STAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	69433938	A/C	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000197888:ENST00000317746:exon_69433479_69434245:UGT2B17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	73956736	G/A	1	27	34	61	12.8920973319939	17.7655070634151	-4.87340973142128	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.248697484453919	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426990:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73956384_73958017:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73956384_73958017:ANKRD17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	73991006	T/C	1	13	6	19	6.20730612281186	3.13508948177914	3.07221664103272	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.175231089618151	ENSG00000132466:ENST00000358602:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000330838:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000509867:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000426917:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000514252:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000254802:exon_73990918_73991029:ANKRD17;ENSG00000132466:ENST00000411811:exon_73990918_73991029:ANKRD17
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	76877166	C/T	1	39	42	81	18.6219183684356	21.945626372454	-3.32370800401842	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.505058079283144	ENSG00000198301:ENST00000502543:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395710:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000356260:exon_76877128_76877289:SDAD1;ENSG00000198301:ENST00000395711:exon_76877128_76877289:SDAD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	79800080	G/A	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000138756:ENST00000389010:exon_79799888_79800589:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000502871:exon_79799888_79801123:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000264889:exon_79799888_79800083:BMP2K;ENSG00000138756:ENST00000507670:exon_79799888_79800586:BMP2K
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	83381295	C/T	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000145293:ENST00000273920:exon_83381134_83382244:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000509635:exon_83381134_83382208:ENOPH1;ENSG00000145293:ENST00000505846:exon_83381134_83382240:ENOPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	84191031	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000173085:ENST00000311469:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000503915:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000439031:exon_84191013_84191146:COQ2;ENSG00000173085:ENST00000311461:exon_84191013_84191146:COQ2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	87696470	A/G	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000163629:ENST00000427191:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000436978:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000357349:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000316707:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000411767:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000511467:exon_87696324_87696495:PTPN13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	87696476	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000163629:ENST00000427191:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000436978:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000357349:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000316707:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000411767:exon_87696324_87696495:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000511467:exon_87696324_87696495:PTPN13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	87735618	A/G	1	26	11	37	12.4146122456237	5.74766404992843	6.66694819569529	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0319612161401579	ENSG00000163629:ENST00000427191:exon_87735609_87736310:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000436978:exon_87735609_87736324:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000357349:exon_87735609_87736324:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000316707:exon_87735609_87736302:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000411767:exon_87735609_87736302:PTPN13;ENSG00000163629:ENST00000511467:exon_87735609_87736302:PTPN13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	89186162	C/T	1	43	48	91	20.5318587139161	25.0807158542331	-4.54885714031699	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.347012234429876	ENSG00000163644:ENST00000295908:exon_89186153_89186287:PPM1K;ENSG00000163644:ENST00000508256:exon_89186153_89186287:PPM1K
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	90034730	G/A	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000180346:ENST00000317005:exon_90033968_90036050:TIGD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	99363278	G/A	1	23	22	45	10.9821569865133	11.4953280998569	-0.513171113343565	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.882703002524253	ENSG00000138698:ENST00000380158:exon_99363141_99363524:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408927:exon_99363141_99365012:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000453712:exon_99363141_99363817:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000408900:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1;ENSG00000138698:ENST00000339360:exon_99363141_99363485:RAP1GDS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	99997931	A/G	1	60	76	136	28.6491051822086	39.7111334358691	-11.0620282536606	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0593035416108244	ENSG00000197894:ENST00000296412:exon_99997855_99998074:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512621:exon_99997855_99998074:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512659:exon_99997855_99998074:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000508511:exon_99997855_99998074:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000503130:exon_99997855_99998074:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000502590:exon_99997855_99998074:ADH5;ENSG00000197894:ENST00000512991:exon_99997855_99998074:ADH5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	103555992	A/G	1	13	11	24	6.20730612281186	5.74766404992843	0.459642072883431	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000109323:ENST00000514430:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000226578:exon_103555945_103556202:MANBA;ENSG00000109323:ENST00000505239:exon_103555945_103556202:MANBA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	106395155	A/C	1	22	18	40	10.5046719001431	9.40526844533743	1.09940345480572	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.754153862999362	ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	106395156	G/T	1	22	18	40	10.5046719001431	9.40526844533743	1.09940345480572	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.754153862999362	ENSG00000138777:ENST00000341695:exon_106395051_106395238:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000380004:exon_106395051_106395227:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000348706:exon_106395051_106395221:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509031:exon_106395051_106395171:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000351450:exon_106395051_106395224:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000354147:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000432483:exon_106395051_106395207:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000357415:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000510015:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000509426:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000508518:exon_106395051_106395197:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000514209:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000457404:exon_106395051_106395219:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502833:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000504028:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000513649:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000499847:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000502610:exon_106395051_106395189:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000505713:exon_106395051_106395216:PPA2;ENSG00000138777:ENST00000310267:exon_106395051_106395216:PPA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	108615014	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000138801:ENST00000265174:exon_108614927_108615162:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000502431:exon_108614927_108615162:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000514489:exon_108614927_108615162:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000506544:exon_108614927_108615454:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000512641:exon_108614926_108615162:PAPSS1;ENSG00000138801:ENST00000504987:exon_108614996_108615162:PAPSS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	108911051	T/C	1	8	24	32	3.81988069096114	12.5403579271166	-8.72047723615542	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00224609248116276	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108910870_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108910912_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108910940_108911220:HADH;ENSG00000138796:ENST00000511742:exon_108911011_108911220:HADH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	108931039	T/C	1	95	56	151	45.3610832051636	29.260835163272	16.1002480418916	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00904307441480239	ENSG00000138796:ENST00000403312:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000351726:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000309522:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000505878:exon_108930915_108931043:HADH;ENSG00000138796:ENST00000454409:exon_108930915_108931043:HADH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	110448572	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000138802:ENST00000504968:exon_110448478_110448588:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000399100:exon_110448478_110448588:SEC24B;ENSG00000138802:ENST00000265175:exon_110448478_110448588:SEC24B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113352628	A/G	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113352899	G/A	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113353285	T/C	1	9	11	20	4.29736577733129	5.74766404992843	-1.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.655580186809523	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113353481	A/G	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113351604_113353737:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113353436_113353737:ALPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113359703	A/G	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000073331:ENST00000458497:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000177648:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000509722:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000505127:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504745:exon_113359640_113359802:ALPK1;ENSG00000073331:ENST00000504176:exon_113359640_113359802:ALPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113362316	A/G	1	11	15	26	5.25233595007157	7.83772370444786	-2.58538775437628	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.332290693598278	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	113436546	G/A	0	15	0	15	7.16227629555214	0	7.16227629555214	G	G		10	0.522514913629857	7.43750612807365e-05	ENSG00000178403:ENST00000313341:exon_113434672_113436632:NEUROG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	119631160	C/T	1	13	22	35	6.20730612281186	11.4953280998569	-5.288021977045	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0900234042775497	ENSG00000145388:ENST00000388822:exon_119631153_119632201:METTL14;ENSG00000145388:ENST00000506780:exon_119631153_119631758:METTL14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	119736796	A/C	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000150961:ENST00000280551:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000379735:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000429811:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000419654:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000514561:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000509818:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000506622:exon_119736606_119736881:SEC24D;ENSG00000150961:ENST00000503683:exon_119736782_119736881:SEC24D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	123838758	A/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000170917:ENST00000512116:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000304430:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000339154:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000503370:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000394344:exon_123838656_123838859:NUDT6;ENSG00000170917:ENST00000513517:exon_123838656_123843752:NUDT6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	129012638	A/G	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000394288:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000432347:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129012502_129012667:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129012502_129012667:LARP1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	129043204	C/G	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	129043286	C/T	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000138709:ENST00000326639:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000512292:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000508819:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000264584:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000441387:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000427266:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000453582:exon_129042981_129043388:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000354456:exon_129042981_129043343:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507377:exon_129042981_129043507:LARP1B;ENSG00000138709:ENST00000507259:exon_129043272_129043343:LARP1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	129867280	T/A	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129867162_129867307:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129867162_129867307:SCLT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	129880770	G/A	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000151466:ENST00000281142:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000506233:exon_129880755_129880932:SCLT1;ENSG00000151466:ENST00000502495:exon_129880755_129880932:SCLT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	130023759	A/T	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502360:exon_130023757_130024192:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130023757_130023946:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508622:exon_130023757_130023946:C4orf33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	130030644	C/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	130030652	A/G	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000502887:exon_130030628_130031121:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130030628_130030827:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000508673:exon_130030628_130030691:C4orf33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	130032907	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000151470:ENST00000281146:exon_130032841_130034487:C4orf33;ENSG00000151470:ENST00000425929:exon_130032841_130033842:C4orf33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	140262082	C/A	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000164134:ENST00000296543:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000398947:exon_140262066_140262223:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000482087:exon_140262066_140262227:NAA15;ENSG00000164134:ENST00000480277:exon_140262066_140262223:NAA15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	142155072	T/A	1	87	66	153	41.5412025142024	34.4859842995706	7.05521821463188	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.258452206580365	ENSG00000109445:ENST00000262990:exon_142154869_142155851:ZNF330;ENSG00000109445:ENST00000506302:exon_142154869_142155250:ZNF330
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	152682046	G/T	1	2	12	14	0.954970172740286	6.27017896355828	-5.315208790818	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.00557179455622664	ENSG00000059691:ENST00000263985:exon_152681959_152682175:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515812:exon_152681959_152682151:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000503160:exon_152681959_152682082:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000515884:exon_152681959_152682105:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000511538:exon_152681959_152682122:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000512306:exon_152681959_152682137:PET112L;ENSG00000059691:ENST00000508611:exon_152681959_152682142:PET112L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	154525446	A/C	1	59	53	112	28.1716200958384	27.6932904223824	0.478329673456013	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000121210:ENST00000409663:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000440693:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000425772:exon_154524954_154525534:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000361316:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000409959:exon_154524954_154525582:KIAA0922;ENSG00000121210:ENST00000240487:exon_154524954_154525582:KIAA0922
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	156273768	T/C	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156273748_156273880:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000503466:exon_156273748_156273838:MAP9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	156289803	G/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000164114:ENST00000311277:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000515654:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000424373:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000433024:exon_156289738_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393836:exon_156289738_156289964:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000379248:exon_156289318_156289961:MAP9;ENSG00000164114:ENST00000393834:exon_156289654_156289961:MAP9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	156618092	G/A	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000357469:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000512983:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511507:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515602:exon_156618087_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156617958_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000509901:exon_156617908_156618212:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000393832:exon_156618087_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000515201:exon_156617908_156618274:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156617908_156618274:GUCY1A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	156631842	T/C	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000164116:ENST00000506455:exon_156631694_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511108:exon_156631694_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000512983:exon_156631694_156632533:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000511507:exon_156631694_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000455639:exon_156631694_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000443668:exon_156631834_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000393832:exon_156631694_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000296518:exon_156631694_156632403:GUCY1A3;ENSG00000164116:ENST00000513574:exon_156631694_156632403:GUCY1A3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	159631991	G/T	1	35	41	76	16.711978022955	21.4231114588241	-4.71113343586913	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.302331484230467	ENSG00000171497:ENST00000307720:exon_159631914_159632000:PPID;ENSG00000171497:ENST00000512699:exon_159631914_159632000:PPID
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	165118796	G/A	0	0	19	19	0	9.92778335896728	-9.92778335896728	A	G	A	10	0.522514913629857	7.94760764009143e-07	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	166021811	G/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170088:ENST00000306480:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000506087:exon_166021780_166022044:TMEM192;ENSG00000170088:ENST00000505095:exon_166021780_166022044:TMEM192
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	169176996	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000137628:ENST00000393743:exon_169176862_169177020:DDX60;ENSG00000137628:ENST00000505393:exon_169176862_169177020:DDX60
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	169928842	G/T	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000145439:ENST00000419710:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000306193:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504480:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000504561:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000506808:exon_169928787_169928907:CBR4;ENSG00000145439:ENST00000507752:exon_169928792_169928907:CBR4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	170663194	T/C	1	28	23	51	13.369582418364	12.0178430134867	1.35173940487729	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.779789235512258	ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170663108_170663258:C4orf27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	170674892	G/A	1	19	11	30	9.07221664103272	5.74766404992843	3.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.273752274499903	ENSG00000056050:ENST00000393381:exon_170674827_170674986:C4orf27;ENSG00000056050:ENST00000506125:exon_170674827_170674986:C4orf27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	174253178	T/C	1	280	322	602	133.69582418364	168.249802188814	-34.5539780051739	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.00486850123340972	ENSG00000164104:ENST00000296503:exon_174252846_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000446922:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000438704:exon_174252852_174253389:HMGB2;ENSG00000164104:ENST00000511316:exon_174252856_174254365:HMGB2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	177243366	G/T	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129128:ENST00000264597:exon_177243321_177243396:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000503362:exon_177243321_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000507678:exon_177241142_177243394:SPCS3;ENSG00000129128:ENST00000513139:exon_177243321_177243394:SPCS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	178352938	G/A	1	16	14	30	7.63976138192229	7.315208790818	0.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000038002:ENST00000264595:exon_178351924_178352962:AGA;ENSG00000038002:ENST00000446519:exon_178351924_178352962:AGA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	183815688	A/G	1	17	14	31	8.11724646829243	7.315208790818	0.802037677474432	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.858133848975486	ENSG00000129187:ENST00000500813:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000357067:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000312820:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000452807:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000438320:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507543:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000507631:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510370:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000503182:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000510307:exon_183815642_183815758:DCTD;ENSG00000129187:ENST00000512766:exon_183815646_183815758:DCTD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	185615764	C/A	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	185615768	T/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000164306:ENST00000314970:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000515774:exon_185615676_185616117:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000503752:exon_185615676_185616070:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512834:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000509002:exon_185615676_185616106:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000512658:exon_185615676_185615912:CCDC111;ENSG00000164306:ENST00000510864:exon_185615676_185616106:CCDC111
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	185623529	T/C	1	15	6	21	7.16227629555214	3.13508948177914	4.027186813773	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0846560782449503	ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185623517_185623595:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185623517_185623595:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000508095:exon_185623243_185623635:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185623517_185623595:MLF1IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	185634144	T/C	1	15	23	38	7.16227629555214	12.0178430134867	-4.85556671793457	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.143290303081698	ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185634098_185634167:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000506535:exon_185634098_185634167:MLF1IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	185637699	A/G	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000151725:ENST00000281453:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000510146:exon_185637551_185637787:MLF1IP;ENSG00000151725:ENST00000514781:exon_185637551_185637787:MLF1IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	186097045	C/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186096940_186097205:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000502992:exon_186096954_186097205:KIAA1430
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	186111639	T/C	1	14	20	34	6.684791209182	10.4502982725971	-3.76550706341514	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.230351057314352	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	186112111	G/A	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000164323:ENST00000458385:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000514798:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000296775:exon_186111297_186112366:KIAA1430;ENSG00000164323:ENST00000503223:exon_186111922_186112366:KIAA1430
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	4	186244729	G/A	1	14	12	26	6.684791209182	6.27017896355828	0.414612245623718	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000109762:ENST00000504273:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264694:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000296779:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000264693:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000393554:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000512853:exon_186244682_186244954:SNX25;ENSG00000109762:ENST00000504959:exon_186244682_186244954:SNX25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	205574	G/A	1	26	13	39	12.4146122456237	6.79269387718814	5.62191836843558	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0787142364989177	ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	205896	G/A	1	18	28	46	8.59473155466257	14.630417581636	-6.03568602697342	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0781963631425816	ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	205940	G/A	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000164366:ENST00000296824:exon_204872_206073:CCDC127
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	226160	A/C	1	42	41	83	20.054373627546	21.4231114588241	-1.36873783127813	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.826278465125957	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_225998_226162:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_225748_226162:SDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	228362	T/C	1	30	31	61	14.3245525911043	16.1979623225256	-1.87340973142128	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.701047100766109	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509420:exon_228300_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_227724_228448:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_228300_228448:SDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	233734	C/G	1	91	68	159	43.451142859683	35.5310141268303	7.92012873285273	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.233684330719177	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_233718_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_233592_233760:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514233:exon_233592_233744:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512962:exon_233592_234253:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_233592_234253:SDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	235364	C/T	1	88	63	151	42.0186876005726	32.918439558681	9.10024804189159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.143185417904153	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000506138:exon_235259_235379:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000505555:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504824:exon_235259_235639:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_235259_235454:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_234536_236714:SDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	256472	G/A	1	250	120	370	119.371271592536	62.7017896355828	56.6694819569529	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	3.09584271399182e-09	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	256509	G/A	1	213	102	315	101.70432339684	53.2965211902454	48.407802206595	A:G	G	A	10	0.522514913629857	3.60976376300672e-08	ENSG00000073578:ENST00000264932:exon_256449_256815:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000504309:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000510361:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000327872:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000514027:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515752:exon_256449_256763:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000511810:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000515815:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509082:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000503674:exon_256449_256794:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000512951:exon_256466_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000509564:exon_256449_256797:SDHA;ENSG00000073578:ENST00000507522:exon_256466_256794:SDHA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	306766	G/A	1	56	59	115	26.739164836728	30.8283799041616	-4.08921506743356	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.456557213681359	ENSG00000249915:ENST00000264933:exon_306717_306875:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000513582:exon_304292_306869:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000507528:exon_306717_306869:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505717:exon_306717_306875:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000505526:exon_306717_306875:PDCD6;ENSG00000249915:ENST00000502359:exon_306717_306875:PDCD6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	442586	G/C	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	442904	C/T	0	0	12	12	0	6.27017896355828	-6.27017896355828	T	C	T	10	0.522514913629857	0.000140448704640196	ENSG00000221990:ENST00000408966:exon_441645_443258:C5orf55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	865599	G/A	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000028310:ENST00000497410:exon_865529_866616:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483234:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495794:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000490814:exon_865529_865691:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000495265:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000388890:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323510:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000323547:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000489816:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000433367:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000415990:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000435709:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000483173:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000467963:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000519112:exon_865529_865696:BRD9;ENSG00000028310:ENST00000518250:exon_865529_865696:BRD9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	1057615	A/G	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000113504:ENST00000422688:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000264930:exon_1057586_1057764:SLC12A7;ENSG00000113504:ENST00000514994:exon_1057326_1057764:SLC12A7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	1466919	G/A	1	7	18	25	3.342395604591	9.40526844533743	-6.06287284074643	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0163682246149269	ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1466864_1467005:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000503252:exon_1466864_1467005:LPCAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	1494909	C/T	1	12	9	21	5.72982103644172	4.70263422266871	1.027186813773	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.670382560246413	ENSG00000153395:ENST00000475622:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000283415:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000514484:exon_1494815_1495029:LPCAT1;ENSG00000153395:ENST00000507282:exon_1494815_1495043:LPCAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	6600064	G/T	1	160	156	316	76.3976138192229	81.5123265262577	-5.11471270703483	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.573748609395954	ENSG00000037474:ENST00000264670:exon_6599352_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000504374:exon_6599353_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000505892:exon_6599354_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000513888:exon_6599513_6600345:NSUN2;ENSG00000037474:ENST00000506139:exon_6599682_6600345:NSUN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	6633779	C/G	0	0	11	11	0	5.74766404992843	-5.74766404992843	G	C	G	10	0.522514913629857	0.000294142599736238	ENSG00000145545:ENST00000274192:exon_6633456_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000510531:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000513117:exon_6633540_6633982:SRD5A1;ENSG00000145545:ENST00000504286:exon_6633569_6633982:SRD5A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	7897283	G/T	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	7897319	G/A	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000124275:ENST00000513439:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000264668:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000511461:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000440940:exon_7897178_7897360:MTRR;ENSG00000124275:ENST00000510525:exon_7897178_7897360:MTRR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	14397238	T/C	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000038382:ENST00000344204:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000509967:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000512070:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000513206:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000515144:exon_14397152_14397263:TRIO;ENSG00000038382:ENST00000502490:exon_14397152_14397450:TRIO
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	14681711	A/T	1	14	7	21	6.684791209182	3.657604395409	3.027186813773	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.198655985278081	ENSG00000154124:ENST00000503023:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000284274:exon_14681573_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000514913:exon_14681573_14681733:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000506417:exon_14681659_14681716:FAM105B;ENSG00000154124:ENST00000508678:exon_14681685_14681733:FAM105B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	14741984	T/C	1	29	3	32	13.8470675047341	1.56754474088957	12.2795227638446	T:C	T	C	10	0.522514913629857	7.15971379433074e-06	ENSG00000154122:ENST00000284268:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000503939:exon_14741936_14742031:ANKH;ENSG00000154122:ENST00000515517:exon_14741566_14742031:ANKH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	17353999	T/A	0	841	0	841	401.56495763729	0	401.56495763729	T	T		10	0.522514913629857	1.03340675256918e-237	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	17354033	C/T	0	97	0	97	46.3160533779039	0	46.3160533779039	C	C		10	0.522514913629857	8.63279732464827e-28	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	32126441	G/A	1	26	22	48	12.4146122456237	11.4953280998569	0.919284145766863	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.885366484713152	ENSG00000113384:ENST00000265070:exon_32124810_32126742:GOLPH3;ENSG00000113384:ENST00000499354:exon_32124827_32126742:GOLPH3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	32724806	G/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000113389:ENST00000509104:exon_32724804_32724926:NPR3;ENSG00000113389:ENST00000434067:exon_32724804_32724926:NPR3;ENSG00000113389:ENST00000506712:exon_32724804_32724926:NPR3;ENSG00000113389:ENST00000415685:exon_32724804_32724926:NPR3;ENSG00000113389:ENST00000265074:exon_32724804_32724926:NPR3;ENSG00000113389:ENST00000415167:exon_32724804_32724926:NPR3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	33462034	G/A	1	59	63	122	28.1716200958384	32.918439558681	-4.74681946284256	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.415232315604739	ENSG00000113407:ENST00000502553:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000265112:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000414361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000508361:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000455217:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000507716:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509731:exon_33462011_33462111:TARS;ENSG00000113407:ENST00000509410:exon_33462011_33462111:TARS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	33989518	C/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000242110:ENST00000335606:exon_33986283_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382072:exon_33987279_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000506639:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000514195:exon_33988189_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000382085:exon_33989216_33989607:AMACR;ENSG00000242110:ENST00000502637:exon_33988789_33989607:AMACR;ENSG00000082196:ENST00000382079:exon_33987279_33989607:C1QTNF3;ENSG00000082196:ENST00000441713:exon_33987279_33989607:C1QTNF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	36985831	G/A	1	12	25	37	5.72982103644172	13.0628728407464	-7.33305180430471	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0201828239663074	ENSG00000164190:ENST00000282516:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000448238:exon_36984778_36986403:NIPBL;ENSG00000164190:ENST00000504430:exon_36984778_36986403:NIPBL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	37299049	C/T	1	15	19	34	7.16227629555214	9.92778335896728	-2.76550706341514	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.392337552161461	ENSG00000113569:ENST00000231498:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000502533:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000381843:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000434056:exon_37298970_37299080:NUP155;ENSG00000113569:ENST00000513532:exon_37298970_37299080:NUP155
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	43039593	G/A	1	24	19	43	11.4596420728834	9.92778335896728	1.53185871391615	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.6511012312944	ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	43039793	T/C	1	20	21	41	9.54970172740286	10.972813186227	-1.42311145882414	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.755018277579108	ENSG00000177721:ENST00000314890:exon_43039335_43041453:C5orf39
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	43656024	T/C	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43655942_43656175:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43655942_43656175:NNT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	43700242	A/G	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000112992:ENST00000264663:exon_43700221_43700339:NNT;ENSG00000112992:ENST00000344920:exon_43700221_43700339:NNT;ENSG00000112992:ENST00000512996:exon_43700221_43700339:NNT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	54603822	T/C	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000039123:ENST00000230640:exon_54603588_54603975:SKIV2L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	64097145	C/G	1	55	53	108	26.2616797503579	27.6932904223824	-1.43161067202456	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.847355191989964	ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000508024:exon_64097129_64097159:CWC27;ENSG00000153015:ENST00000506168:exon_64097129_64097159:CWC27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	64100009	A/G	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	64273049	G/C	1	55	40	95	26.2616797503579	20.9005965451943	5.36108320516358	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.30462994282739	ENSG00000153015:ENST00000381070:exon_64272962_64273065:CWC27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	64881936	A/G	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000113593:ENST00000261308:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000510930:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000511908:exon_64881826_64882008:PPWD1;ENSG00000113593:ENST00000513773:exon_64881826_64882008:PPWD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	65118651	T/A	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:T	T	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000123213:ENST00000380985:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000340159:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000502464:exon_65118609_65125111:NLN;ENSG00000123213:ENST00000506799:exon_65118609_65119153:NLN;ENSG00000123213:ENST00000511299:exon_65118609_65119156:NLN;ENSG00000123213:ENST00000515595:exon_65118609_65119065:NLN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	65350374	A/G	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	65350459	T/C	1	12	4	16	5.72982103644172	2.09005965451943	3.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.081547579265419	ENSG00000112851:ENST00000284037:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380943:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380939:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380935:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380936:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000380938:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000511297:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000506030:exon_65349234_65350779:ERBB2IP;ENSG00000112851:ENST00000508515:exon_65349234_65350779:ERBB2IP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	66479206	T/C	1	3	10	13	1.43245525911043	5.22514913629857	-3.79269387718814	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0493024340440666	ENSG00000134061:ENST00000256447:exon_66478103_66480413:CD180
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	70806711	C/G	1	23	17	40	10.9821569865133	8.88275353170757	2.09940345480572	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.530810831784354	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	70806958	G/A	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000145734:ENST00000358731:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000437938:exon_70805292_70807038:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000444711:exon_70805292_70807087:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000380675:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508917:exon_70805292_70806978:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000451951:exon_70805292_70807103:BDP1;ENSG00000145734:ENST00000508157:exon_70805292_70807177:BDP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	70945075	A/G	1	13	16	29	6.20730612281186	8.36023861807771	-2.15293249526585	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.461080918794537	ENSG00000131844:ENST00000512218:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000323375:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000340941:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000509539:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000505435:exon_70944924_70945080:MCCC2;ENSG00000131844:ENST00000508703:exon_70944924_70945080:MCCC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	72798845	A/G	1	629	639	1268	300.33811932682	333.887029809479	-33.5489104826587	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0596789584932397	ENSG00000145741:ENST00000335895:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514505:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000514360:exon_72798313_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000380591:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000508901:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000507081:exon_72798741_72798942:BTF3;ENSG00000145741:ENST00000509708:exon_72798741_72798942:BTF3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	74021473	C/G	1	15	17	32	7.16227629555214	8.88275353170757	-1.72047723615542	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.597744878487179	ENSG00000164347:ENST00000296805:exon_74021465_74021580:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000345239:exon_74021465_74021580:GFM2;ENSG00000164347:ENST00000509430:exon_74021465_74021580:GFM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	81549216	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	81549240	C/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000152348:ENST00000282185:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000458350:exon_81549133_81549248:ATG10;ENSG00000152348:ENST00000504770:exon_81549133_81549250:ATG10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	82648977	T/G	1	31	37	68	14.8020376774744	19.3330518043047	-4.53101412683028	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.277418491805914	ENSG00000152422:ENST00000282268:exon_82648950_82649577:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000338635:exon_82648944_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000396027:exon_82648950_82649530:XRCC4;ENSG00000152422:ENST00000511817:exon_82648944_82649606:XRCC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	94814011	C/A	1	22	27	49	10.5046719001431	14.1079026680061	-3.60323076786299	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.319696561891813	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94813994_94814146:TTC37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	94818198	T/C	1	18	23	41	8.59473155466257	12.0178430134867	-3.42311145882414	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.348474799658273	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94818177_94818335:TTC37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	94826655	C/A	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94826612_94826740:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94826612_94826740:TTC37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	94830477	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94830386_94830497:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000502768:exon_94830386_94830497:TTC37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	94852866	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000198677:ENST00000358746:exon_94852850_94853026:TTC37;ENSG00000198677:ENST00000507805:exon_94852850_94853026:TTC37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	95152247	C/T	1	203	229	432	96.929472533139	119.655915221237	-22.7264426880982	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.0301593386828039	ENSG00000173221:ENST00000508780:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507605:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000237858:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000379979:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000507412:exon_95152211_95155206:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000505427:exon_95152211_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000512469:exon_95152114_95152330:GLRX;ENSG00000173221:ENST00000448201:exon_95152217_95152329:GLRX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	96215729	G/T	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000164308:ENST00000437043:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000343361:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000414384:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510373:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000513084:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000379904:exon_96215268_96215964:ERAP2;ENSG00000164308:ENST00000510309:exon_96215268_96215964:ERAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	96498904	C/T	1	51	41	92	24.3517394048773	21.4231114588241	2.92862794605315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.602107456634809	ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96496571_96498929:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000511293:exon_96498640_96498929:RIOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	96513471	G/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000058729:ENST00000283109:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508447:exon_96513436_96513552:RIOK2;ENSG00000058729:ENST00000508991:exon_96513436_96513552:RIOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	106717043	G/A	1	20	10	30	9.54970172740286	5.22514913629857	4.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.143356315840939	ENSG00000184349:ENST00000333274:exon_106712590_106717077:EFNA5;ENSG00000184349:ENST00000510359:exon_106716685_106717077:EFNA5;ENSG00000184349:ENST00000509503:exon_106716939_106717077:EFNA5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	112227997	A/T	1	39	3	42	18.6219183684356	1.56754474088957	17.054373627546	A:T	A	T	10	0.522514913629857	1.95628212867752e-08	ENSG00000153037:ENST00000506997:exon_112227300_112228648:SRP19;ENSG00000153037:ENST00000512790:exon_112227300_112228776:SRP19;ENSG00000212643:ENST00000391338:exon_112227313_112228791:ZRSR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	118728953	G/C	1	56	46	102	26.739164836728	24.0356860269734	2.70347880975459	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.621097735436064	ENSG00000145779:ENST00000274456:exon_118728511_118729089:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000513374:exon_118728511_118729438:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504771:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000503646:exon_118728511_118730293:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000504642:exon_118728511_118729141:TNFAIP8;ENSG00000145779:ENST00000415806:exon_118728511_118730294:TNFAIP8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	118824930	C/G	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504051:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000505181:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118824887_118824978:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512644:exon_118824887_118824978:HSD17B4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	118877660	A/G	1	98	72	170	46.793538464274	37.6210737813497	9.17246468292431	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.167364482824186	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	118877677	C/T	1	104	72	176	49.6584489824949	37.6210737813497	12.0373752011452	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.070529982882007	ENSG00000133835:ENST00000256216:exon_118877600_118878028:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515320:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000515235:exon_118877600_118877787:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000510025:exon_118877600_118877964:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000504811:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000442060:exon_118877600_118877959:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000414835:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000513628:exon_118877600_118877869:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509514:exon_118877600_118877947:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000512511:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000522415:exon_118877600_118877711:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509951:exon_118877600_118878026:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000509606:exon_118877600_118878027:HSD17B4;ENSG00000133835:ENST00000503310:exon_118877600_118877947:HSD17B4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	121355961	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000151304:ENST00000339397:exon_121355783_121356497:SRFBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	122682334	C/T	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122680579_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122680697_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122681952_122682447:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122682094_122682447:CEP120
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	122714044	T/C	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000168944:ENST00000306467:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000328236:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000306481:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508138:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000510582:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000513565:exon_122714030_122714122:CEP120;ENSG00000168944:ENST00000508442:exon_122714030_122714122:CEP120
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	126887569	G/A	1	7	10	17	3.342395604591	5.22514913629857	-1.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.468085787310545	ENSG00000164244:ENST00000296666:exon_126887399_126890781:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000442138:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000330542:exon_126887399_126887569:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000420037:exon_126887399_126887570:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000337087:exon_126883511_126887843:PRRC1;ENSG00000164244:ENST00000513427:exon_126887399_126888148:PRRC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	131930687	T/C	1	34	31	65	16.2344929365849	16.1979623225256	0.0365306140592914	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000113522:ENST00000533482:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000265335:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378810:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000378823:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000453394:exon_131930561_131930736:RAD50;ENSG00000113522:ENST00000423956:exon_131930561_131930736:RAD50
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	132159393	G/A	1	1	14	15	0.477485086370143	7.315208790818	-6.83772370444786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000325348239667028	ENSG00000164403:ENST00000378679:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000440998:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000319854:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000378676:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000355404:exon_132159315_132159456:SHROOM1;ENSG00000164403:ENST00000488072:exon_132159315_132159497:SHROOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	132334252	A/G	1	2	11	13	0.954970172740286	5.74766404992843	-4.79269387718814	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0100723869343831	ENSG00000155329:ENST00000324170:exon_132332677_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000355372:exon_132332688_132334524:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509437:exon_132333792_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513848:exon_132333904_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000513541:exon_132334100_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000508080:exon_132334105_132334542:ZCCHC10;ENSG00000155329:ENST00000509008:exon_132334220_132334542:ZCCHC10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	132437531	C/T	1	129	117	246	61.5955761417484	61.1342448946933	0.46133124705517	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170606:ENST00000304858:exon_132437451_132437570:HSPA4;ENSG00000170606:ENST00000514825:exon_132437288_132437570:HSPA4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	133997033	A/G	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000113615:ENST00000398844:exon_133996809_133997276:SEC24A;ENSG00000113615:ENST00000322887:exon_133996809_133997276:SEC24A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	134670656	A/G	1	157	129	286	74.9651585601124	67.4044238582516	7.56073470186088	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.375334604528634	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	134670765	A/G	1	89	78	167	42.4961726869427	40.7561632631288	1.74000942381388	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.816497655515266	ENSG00000113648:ENST00000511689:exon_134669590_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000512507:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000451949:exon_134670071_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000304332:exon_134670073_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000312469:exon_134670100_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000360597:exon_134670107_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000511494:exon_134670125_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000506671:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000394958:exon_134670163_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000423969:exon_134670546_134670831:H2AFY;ENSG00000113648:ENST00000510038:exon_134670603_134670831:H2AFY
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	137781196	C/T	1	11	13	24	5.25233595007157	6.79269387718814	-1.54035792711657	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.547183126666461	ENSG00000132563:ENST00000378339:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000254901:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000506158:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000507635:exon_137781157_137781287:REEP2;ENSG00000132563:ENST00000504163:exon_137781157_137781287:REEP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	138378368	T/G	1	35	37	72	16.711978022955	19.3330518043047	-2.6210737813497	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.556997301488162	ENSG00000120725:ENST00000394817:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000265195:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000509534:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000503732:exon_138378309_138378408:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000505945:exon_138378309_138378371:SIL1;ENSG00000120725:ENST00000508639:exon_138378309_138378408:SIL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	139885421	G/A	1	16	11	27	7.63976138192229	5.74766404992843	1.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.564632195057288	ENSG00000131503:ENST00000360839:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000422011:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000253810:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000261805:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000310356:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000421134:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000297183:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000246149:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000412116:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000131503:ENST00000506930:exon_139885309_139885454:ANKHD1;ENSG00000254996:ENST00000532219:exon_139885309_139885454:ANKHD1-EIF4EBP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141005593	C/T	1	53	46	99	25.3067095776176	24.0356860269734	1.27102355064416	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.84086053762822	ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141005580_141005638:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141005580_141005638:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000469207:exon_141005580_141005637:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000491581:exon_141005580_141005638:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000486618:exon_141005580_141006052:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523353:exon_141005592_141005638:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000475549:exon_141005593_141005638:HDAC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141008825	G/A	1	16	7	23	7.63976138192229	3.657604395409	3.98215698651329	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.142379004712528	ENSG00000171720:ENST00000469550:exon_141008740_141008873:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000305264:exon_141008740_141008873:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000492407:exon_141008740_141008825:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000523088:exon_141008740_141008873:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000519474:exon_141008740_141008873:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000495485:exon_141008740_141008873:HDAC3;ENSG00000171720:ENST00000490808:exon_141008740_141009309:HDAC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141019110	C/A	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000164620:ENST00000444782:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518025:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000521367:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000297164:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000517794:exon_141019031_141019196:RELL2;ENSG00000164620:ENST00000518856:exon_141019031_141019216:RELL2;ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141018869_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520747:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141018870_141021130:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000520465:exon_141018875_141019410:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141018875_141021130:FCHSD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141026718	G/A	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000197948:ENST00000435817:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000354789:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000523856:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522126:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522783:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522763:exon_141026702_141026797:FCHSD1;ENSG00000197948:ENST00000522386:exon_141026702_141026797:FCHSD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141309265	C/T	1	16	5	21	7.63976138192229	2.61257456814929	5.027186813773	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0297739253279236	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141309147_141309305:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000508751:exon_141309147_141309305:KIAA0141
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141312988	T/C	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000081791:ENST00000506775:exon_141312824_141313447:KIAA0141
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141318178	C/T	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141318086_141321612:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000194118:exon_141318086_141318325:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000507481:exon_141318086_141318325:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000509110:exon_141318086_141318513:KIAA0141
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141318368	C/T	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000081791:ENST00000432126:exon_141318086_141321612:KIAA0141;ENSG00000081791:ENST00000509110:exon_141318086_141318513:KIAA0141
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	141364439	T/C	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000013561:ENST00000356143:exon_141364368_141364498:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394520:exon_141364368_141364498:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000347642:exon_141364368_141364498:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394514:exon_141364368_141364498:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394515:exon_141364368_141364498:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000512565:exon_141364368_141364498:RNF14;ENSG00000013561:ENST00000394519:exon_141364368_141364498:RNF14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	142661490	A/G	1	10	30	40	4.77485086370143	15.6754474088957	-10.9005965451943	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.000683200676408288	ENSG00000113580:ENST00000394464:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000454007:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000361001:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000343796:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000424646:exon_142657496_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000504572:exon_142660685_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000394466:exon_142660703_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000231509:exon_142660727_142661606:NR3C1;ENSG00000113580:ENST00000503201:exon_142661376_142661606:NR3C1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	145826942	G/C	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000113649:ENST00000507175:exon_145826874_145826971:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145826875_145826971:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145826895_145826971:TCERG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	145872524	C/G	1	27	23	50	12.8920973319939	12.0178430134867	0.874254318507148	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.887707278549361	ENSG00000113649:ENST00000296702:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000394421:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000515203:exon_145872483_145872528:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000506524:exon_145872483_145872601:TCERG1;ENSG00000113649:ENST00000505285:exon_145872432_145872601:TCERG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	149754991	C/T	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000070814:ENST00000377797:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323753:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000451292:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000414526:exon_149754946_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000445265:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000323668:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000439160:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000394269:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000427724:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000504761:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000513346:exon_149754902_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000515035:exon_149754180_149755117:TCOF1;ENSG00000070814:ENST00000514442:exon_149754902_149755117:TCOF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	149826526	C/T	1	4131	3840	7971	1972.49089179506	2006.45726833865	-33.9663765435903	A:T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.452530626770725	ENSG00000164587:ENST00000401695:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000407193:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000521466:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000518139:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000312037:exon_149826365_149826526:RPS14;ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	149827098	G/A	1	12	4	16	5.72982103644172	2.09005965451943	3.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.081547579265419	ENSG00000164587:ENST00000519690:exon_149826365_149829290:RPS14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	150489390	A/G	1	334	384	718	159.480018847628	200.645726833865	-41.1657079862374	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00217622086296111	ENSG00000197043:ENST00000356496:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000354546:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000523714:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000377751:exon_150489314_150489407:ANXA6;ENSG00000197043:ENST00000521512:exon_150489314_150489407:ANXA6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	150567017	A/G	1	8	14	22	3.81988069096114	7.315208790818	-3.49532809985685	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.142312472680437	ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150566947_150567020:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000522964:exon_150566947_150567020:CCDC69
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	150578574	A/G	1	15	7	22	7.16227629555214	3.657604395409	3.50467190014315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.199333558675469	ENSG00000198624:ENST00000521308:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000355417:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000518189:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000356749:exon_150578558_150578645:CCDC69;ENSG00000198624:ENST00000524344:exon_150578403_150578645:CCDC69
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	150646888	T/C	1	31	30	61	14.8020376774744	15.6754474088957	-0.873409731421278	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.898190864437643	ENSG00000196743:ENST00000357164:exon_150646857_150650001:GM2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	151054227	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000113140:ENST00000231061:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000521327:exon_151054173_151054235:SPARC;ENSG00000113140:ENST00000522348:exon_151054173_151054235:SPARC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	153709273	A/G	1	9	12	21	4.29736577733129	6.27017896355828	-1.972813186227	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.513322230323649	ENSG00000164574:ENST00000425427:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000297107:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000520647:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000377661:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000521781:exon_153709132_153709298:GALNT10;ENSG00000164574:ENST00000519571:exon_153709132_153709298:GALNT10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	154268902	C/T	1	17	19	36	8.11724646829243	9.92778335896728	-1.81053689067485	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.617901916305745	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154268881_154268977:GEMIN5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	154271948	G/A	1	24	24	48	11.4596420728834	12.5403579271166	-1.08071585423314	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.7743966401828	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154271947_154272109:GEMIN5;ENSG00000082516:ENST00000522075:exon_154271947_154272210:GEMIN5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	154275786	G/A	1	14	3	17	6.684791209182	1.56754474088957	5.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0142119975250009	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154275652_154275903:GEMIN5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	154287152	C/T	1	14	12	26	6.684791209182	6.27017896355828	0.414612245623718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000082516:ENST00000285873:exon_154287151_154287378:GEMIN5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	156531736	C/A	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000135077:ENST00000307851:exon_156531677_156531760:HAVCR2;ENSG00000135077:ENST00000524219:exon_156531677_156531760:HAVCR2;ENSG00000135077:ENST00000521665:exon_156531677_156531760:HAVCR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	156746775	C/T	1	25	18	43	11.9371271592536	9.40526844533743	2.53185871391615	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.450647062778914	ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156746770_156746936:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156746770_156746936:CYFIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	156768132	C/T	1	70	70	140	33.42395604591	36.57604395409	-3.15208790817998	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.612429562406937	ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156768078_156768165:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000398252:exon_156768096_156768165:CYFIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	156810313	C/T	1	52	43	95	24.8292244912474	22.4681412860839	2.36108320516358	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.681597001310925	ENSG00000055163:ENST00000523969:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000520759:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000318218:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000442283:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522463:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523119:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000521420:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000347377:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519153:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000377576:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000517753:exon_156810273_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000522892:exon_156810273_156810588:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000523383:exon_156810240_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000524058:exon_156810246_156810367:CYFIP2;ENSG00000055163:ENST00000519663:exon_156810264_156810367:CYFIP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	157166495	T/C	1	58	71	129	27.6941350094683	37.0985588677199	-9.40442385825156	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.112336099448990	ENSG00000113272:ENST00000231198:exon_157166329_157168456:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000521655:exon_157166329_157166586:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000448153:exon_157166329_157167443:THG1L;ENSG00000113272:ENST00000523575:exon_157166329_157166706:THG1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	159659273	C/T	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000170231:ENST00000393980:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000310650:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000393982:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000523955:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000402432:exon_159659105_159659280:FABP6;ENSG00000170231:ENST00000521362:exon_159659042_159659280:FABP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	159840598	T/A	1	20	30	50	9.54970172740286	15.6754474088957	-6.12574568149285	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.0901477274822409	ENSG00000164609:ENST00000297151:exon_159840463_159840627:SLU7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	159849400	G/A	1	315	283	598	150.407802206595	147.87172055725	2.5360816493455	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.837975436711234	ENSG00000164611:ENST00000352433:exon_159849309_159849410:PTTG1;ENSG00000164611:ENST00000524244:exon_159849309_159849410:PTTG1;ENSG00000164611:ENST00000517480:exon_159849309_159849900:PTTG1;ENSG00000164611:ENST00000523659:exon_159849309_159849410:PTTG1;ENSG00000164611:ENST00000520452:exon_159849309_159849410:PTTG1;ENSG00000164611:ENST00000393964:exon_159848917_159849410:PTTG1;ENSG00000164611:ENST00000519287:exon_159849347_159849410:PTTG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	169129422	A/G	1	9	1	10	4.29736577733129	0.522514913629857	3.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0227369323798089	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000343291:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523684:exon_169129307_169129431:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519223:exon_169129307_169129627:DOCK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	169454941	C/G	1	17	21	38	8.11724646829243	10.972813186227	-2.85556671793457	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.417598108706776	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169454867_169454952:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000433448:exon_169454867_169454952:DOCK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	169461547	C/T	1	28	38	66	13.369582418364	19.8555667179346	-6.48598429957056	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.138653508340063	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169461403_169461559:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169461403_169461559:DOCK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	169504743	T/C	1	66	56	122	31.5140157004294	29.260835163272	2.25318053715744	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.717450512748862	ENSG00000134516:ENST00000256935:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000524185:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520908:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000523351:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000520450:exon_169504714_169504841:DOCK2;ENSG00000134516:ENST00000519868:exon_169504714_169504841:DOCK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	169805956	C/G	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000145936:ENST00000274629:exon_169805168_169805977:KCNMB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	171533629	A/G	1	22	32	54	10.5046719001431	16.7204772361554	-6.21580533601228	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.102246108290936	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	171533782	T/C	1	19	23	42	9.07221664103272	12.0178430134867	-2.945626372454	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.440353997983177	ENSG00000072786:ENST00000176763:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517524:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000517527:exon_171533624_171533802:STK10;ENSG00000072786:ENST00000522936:exon_171533624_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000519710:exon_171533666_171533818:STK10;ENSG00000072786:ENST00000521322:exon_171533714_171534038:STK10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	172518112	A/G	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000164463:ENST00000522692:exon_172517318_172519333:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000296953:exon_172517318_172518404:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000520420:exon_172517318_172518539:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000520464:exon_172517318_172518404:C5orf41;ENSG00000164463:ENST00000393776:exon_172517318_172518404:C5orf41
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	172750392	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000113739:ENST00000265087:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520593:exon_172750222_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000520648:exon_172749972_172750433:STC2;ENSG00000113739:ENST00000518455:exon_172750313_172750433:STC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	175764112	G/A	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000170085:ENST00000345702:exon_175764065_175764149:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000430704:exon_175764065_175764149:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000443967:exon_175764065_175764149:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000341199:exon_175764065_175764149:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000420396:exon_175764065_175764149:C5orf25;ENSG00000170085:ENST00000332772:exon_175764065_175764149:C5orf25
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	177574561	T/C	1	29	43	72	13.8470675047341	22.4681412860839	-8.62107378134971	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0450490204577173	ENSG00000145916:ENST00000313386:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515098:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507575:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000515360:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000513162:exon_177574534_177574636:RMND5B;ENSG00000145916:ENST00000507937:exon_177572971_177574636:RMND5B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	177659519	C/G	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000175309:ENST00000308158:exon_177659493_177659786:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000489262:exon_177658670_177659792:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000474052:exon_177659493_177659791:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000493197:exon_177659493_177659769:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000494126:exon_177658672_177659774:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000323594:exon_177659493_177659631:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000511716:exon_177659493_177659542:AGXT2L2;ENSG00000175309:ENST00000476170:exon_177659493_177659572:AGXT2L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	179226518	G/A	1	38	47	85	18.1444332820654	24.5582009406033	-6.41376765853785	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.192364045644737	ENSG00000161013:ENST00000518778:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520969:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000522293:exon_179226506_179226576:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520875:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518867:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518702:exon_179226506_179226636:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520822:exon_179226506_179227068:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179226512_179226636:MGAT4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	179228623	G/A	1	20	23	43	9.54970172740286	12.0178430134867	-2.46814128608385	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.541969417714209	ENSG00000161013:ENST00000337755:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000292591:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000519836:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000429098:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523108:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520918:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000521305:exon_179228554_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000523329:exon_179228554_179228692:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000518168:exon_179228334_179228694:MGAT4B;ENSG00000161013:ENST00000520134:exon_179228554_179228719:MGAT4B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	179260153	C/T	1	187	163	350	89.2897111512167	85.1699309216667	4.11978022955005	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.668960273141254	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	179260213	G/A	1	200	235	435	95.4970172740286	122.791004703016	-27.2939874289878	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00948844861765394	ENSG00000161011:ENST00000389805:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000402874:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000454378:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000510187:exon_179260032_179260227:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000360718:exon_179260032_179260246:SQSTM1;ENSG00000161011:ENST00000466342:exon_179260032_179260386:SQSTM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	179290845	T/G	1	35	33	68	16.711978022955	17.2429921497853	-0.531014126830275	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.904055996061435	ENSG00000197226:ENST00000518085:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000519746:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179289066_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000521469:exon_179289738_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000520794:exon_179289743_179291128:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000524222:exon_179290404_179291128:TBC1D9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	179305405	G/A	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000197226:ENST00000355235:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000356834:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000522472:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000444477:exon_179305309_179305523:TBC1D9B;ENSG00000197226:ENST00000518459:exon_179305309_179305523:TBC1D9B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	180665123	G/A	1	3994	3794	7788	1907.07543496235	1982.42158231168	-75.3461473493267	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.088854039832331	ENSG00000204628:ENST00000511473:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504325:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000514455:exon_180665099_180665663:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000507756:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000509148:exon_180665099_180665195:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502905:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000389599:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000376817:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512805:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000504128:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000508682:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000509535:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000511900:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000512968:exon_180665099_180665239:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000510199:exon_180665120_180665239:GNB2L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	5	180668655	T/C	1	10	3	13	4.77485086370143	1.56754474088957	3.20730612281186	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0965340031388675	ENSG00000204628:ENST00000513060:exon_180668492_180669345:GNB2L1;ENSG00000204628:ENST00000502890:exon_180668492_180668880:GNB2L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	350829	G/A	1	125	70	195	59.6856357962679	36.57604395409	23.1095918421779	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000939937101365002	ENSG00000112679:ENST00000344450:exon_350822_351355:DUSP22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	2784571	G/A	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000124535:ENST00000380773:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380771:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380769:exon_2784558_2784637:WRNIP1;ENSG00000124535:ENST00000380764:exon_2784558_2784637:WRNIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	3015772	G/C	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000124588:ENST00000380472:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000397717:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000338130:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380455:exon_3015764_3015877:NQO2;ENSG00000124588:ENST00000380430:exon_3015764_3015877:NQO2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	3273339	C/T	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000137266:ENST00000436008:exon_3269196_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000406686:exon_3269692_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000497691:exon_3273063_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000380302:exon_3272008_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000490273:exon_3273064_3273646:SLC22A23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	3273457	A/G	1	2	7	9	0.954970172740286	3.657604395409	-2.70263422266871	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.096395810435428	ENSG00000137266:ENST00000436008:exon_3269196_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000406686:exon_3269692_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000497691:exon_3273063_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000380302:exon_3272008_3273646:SLC22A23;ENSG00000137266:ENST00000490273:exon_3273064_3273646:SLC22A23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	4119492	T/C	1	46	1	47	21.9643139730266	0.522514913629857	21.4417990593967	T:C	T	C	10	0.522514913629857	3.57273865823068e-12	ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4119420_4119509:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4117542_4119509:PECI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	4133922	G/C	1	26	1	27	12.4146122456237	0.522514913629857	11.8920973319939	C:G	G	C	10	0.522514913629857	6.93862108625617e-07	ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380125:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000478266:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464057:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4133783_4133935:PECI;ENSG00000198721:ENST00000465828:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000464583:exon_4133783_4134016:PECI;ENSG00000198721:ENST00000495548:exon_4133783_4133945:PECI;ENSG00000198721:ENST00000489086:exon_4133783_4133935:PECI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	4135812	G/C	0	8	0	8	3.81988069096114	0	3.81988069096114	G	G		10	0.522514913629857	0.00825830647346234	ENSG00000198721:ENST00000380118:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000413766:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380114:exon_4135745_4135831:PECI;ENSG00000198721:ENST00000496241:exon_4135745_4135825:PECI;ENSG00000198721:ENST00000380120:exon_4135745_4135824:PECI;ENSG00000198721:ENST00000361538:exon_4135745_4135831:PECI
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	4892381	C/T	1	14	15	29	6.684791209182	7.83772370444786	-1.15293249526585	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.712753772206145	ENSG00000153046:ENST00000328908:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000483019:exon_4891947_4892581:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000397588:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000449732:exon_4891947_4892613:CDYL;ENSG00000153046:ENST00000343762:exon_4891947_4892613:CDYL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	4996611	T/G	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4996456_4996654:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4996456_4996654:RPP40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	4998963	A/G	1	12	2	14	5.72982103644172	1.04502982725971	4.684791209182	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0141648042661962	ENSG00000124787:ENST00000380051:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000319533:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000380053:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000464646:exon_4998950_4999075:RPP40;ENSG00000124787:ENST00000468105:exon_4998922_4999075:RPP40
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	5369005	C/T	1	4	9	13	1.90994034548057	4.70263422266871	-2.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.165294516073356	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5368783_5369415:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5368783_5369415:FARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	5431340	A/G	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000145982:ENST00000274680:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000397563:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000324331:exon_5431274_5431405:FARS2;ENSG00000145982:ENST00000445533:exon_5431274_5431405:FARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	7310259	A/G	1	14	13	27	6.684791209182	6.79269387718814	-0.107902668006139	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000124783:ENST00000474597:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000244763:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000397511:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000489567:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000479365:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000462112:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000488834:exon_7310150_7310262:SSR1;ENSG00000124783:ENST00000483409:exon_7310150_7310262:SSR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	7602857	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7602856_7602977:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7602856_7602977:SNRNP48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	7609117	T/C	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000168566:ENST00000342415:exon_7609058_7612091:SNRNP48;ENSG00000168566:ENST00000496946:exon_7609058_7609439:SNRNP48
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	8413779	T/C	1	39	25	64	18.6219183684356	13.0628728407464	5.55904552768915	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.170902824296329	ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	8413890	A/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000124786:ENST00000379660:exon_8413301_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000437942:exon_8413303_8413932:SLC35B3;ENSG00000124786:ENST00000413108:exon_8413303_8413932:SLC35B3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	13307903	C/T	1	20	17	37	9.54970172740286	8.88275353170757	0.666948195695289	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.870445363476698	ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13307832_13307977:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13307832_13307977:TBC1D7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	13321321	A/C	1	23	29	52	10.9821569865133	15.1529324952659	-4.17077550875256	A:T:C	A	C	10	0.522514913629857	0.268435881328913	ENSG00000145979:ENST00000356436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379300:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000421203:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379307:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000343141:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000334971:exon_13321306_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000452989:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000450347:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000422136:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000446018:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000420456:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000428109:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000416436:exon_13321140_13321327:TBC1D7;ENSG00000145979:ENST00000379291:exon_13321140_13321327:TBC1D7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	13791073	C/T	1	18	15	33	8.59473155466257	7.83772370444786	0.757007850214718	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.862585582158515	ENSG00000050393:ENST00000379170:exon_13791020_13791096:CCDC90A;ENSG00000050393:ENST00000488770:exon_13791020_13791096:CCDC90A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	17629616	G/A	1	6	17	23	2.86491051822086	8.88275353170757	-6.01784301348671	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0195640661198659	ENSG00000124789:ENST00000262077:exon_17628886_17629770:NUP153;ENSG00000124789:ENST00000430136:exon_17628886_17629770:NUP153
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	26468660	G/A	1	4	16	20	1.90994034548057	8.36023861807771	-6.45029827259714	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00571003377944165	ENSG00000112763:ENST00000377600:exon_26468176_26469830:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000312541:exon_26468176_26469865:BTN2A1;ENSG00000112763:ENST00000429381:exon_26467947_26469865:BTN2A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	26545418	C/T	1	45	47	92	21.4868288866564	24.5582009406033	-3.07137205394685	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.532912167472699	ENSG00000182952:ENST00000328219:exon_26545355_26547160:HMGN4;ENSG00000182952:ENST00000377575:exon_26545355_26546482:HMGN4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	26597333	A/G	1	27	16	43	12.8920973319939	8.36023861807771	4.53185871391615	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.173282303390212	ENSG00000146109:ENST00000274849:exon_26597180_26597451:ABT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	27833174	A/G	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000198374:ENST00000357320:exon_27833034_27833606:HIST1H2AL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	27835272	T/C	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000184357:ENST00000331442:exon_27834570_27835359:HIST1H1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	27840049	T/C	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182572:ENST00000328488:exon_27839683_27840093:HIST1H3I
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	28200532	A/G	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000137185:ENST00000425468:exon_28200340_28201244:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000252207:exon_28200340_28201244:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000531979:exon_28200340_28201260:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000418166:exon_28200441_28200935:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000527844:exon_28200340_28200793:ZNF193;ENSG00000137185:ENST00000446731:exon_28200441_28200935:ZNF193
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29523670	C/A	1	20	2	22	9.54970172740286	1.04502982725971	8.50467190014314	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.000160563516695824	ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29523859	G/C	1	39	22	61	18.6219183684356	11.4953280998569	7.12659026857872	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0731932450082959	ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29523872	A/G	1	33	20	53	15.7570078502147	10.4502982725971	5.30670957761758	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.169194891029909	ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29524003	A/G	1	42	24	66	20.054373627546	12.5403579271166	7.51401570042944	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0656514960960162	ENSG00000213886:ENST00000377050:exon_29523292_29524127:UBD;ENSG00000204681:ENST00000355973:exon_29523406_29524127:GABBR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29691303	G/A	1	220	326	546	105.046719001431	170.339861843333	-65.2931428419019	A:G	G	A	10	0.522514913629857	2.25081302444934e-08	ENSG00000204642:ENST00000376861:exon_29691083_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000414333:exon_29691056_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000334668:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29691117_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000462777:exon_29691169_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29691185_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000482257:exon_29691211_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29691219_29691704:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000434407:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000433607:exon_29691241_29691304:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000486194:exon_29691281_29691704:HLA-F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29691713	A/C	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.440572600750004	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29691744	C/G	1	9	11	20	4.29736577733129	5.74766404992843	-1.45029827259714	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.655580186809523	ENSG00000204642:ENST00000485513:exon_29691717_29692225:HLA-F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29693938	G/A	1	13	14	27	6.20730612281186	7.315208790818	-1.10790266800614	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.703632086597494	ENSG00000204642:ENST00000484704:exon_29693788_29694303:HLA-F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29694680	A/C	1	15	4	19	7.16227629555214	2.09005965451943	5.07221664103272	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0214775672660639	ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29694681	A/T	1	15	4	19	7.16227629555214	2.09005965451943	5.07221664103272	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.0214775672660639	ENSG00000204642:ENST00000399258:exon_29694660_29694781:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000449921:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423522:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000440587:exon_29694660_29695072:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000259951:exon_29694660_29695073:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000423744:exon_29694660_29695120:HLA-F;ENSG00000204642:ENST00000444621:exon_29694660_29695073:HLA-F
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29910801	C/A	1	1322	1	1323	631.235284181329	0.522514913629857	630.712769267699	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0	ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000355767:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376802:exon_29910534_29910803:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29910816	G/A	0	17	0	17	8.11724646829243	0	8.11724646829243	G	G		10	0.522514913629857	1.96175259969567e-05	ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29910820	G/C	0	18	0	18	8.59473155466257	0	8.59473155466257	G	G		10	0.522514913629857	1.0093479750757e-05	ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29910834	G/C	0	17	0	17	8.11724646829243	0	8.11724646829243	G	G		10	0.522514913629857	1.96175259969567e-05	ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29910839	C/T	0	17	0	17	8.11724646829243	0	8.11724646829243	C	C		10	0.522514913629857	1.96175259969567e-05	ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29910534_29911320:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29910534_29911320:HLA-A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	29912315	A/C	0	24	0	24	11.4596420728834	0	11.4596420728834	A	A		10	0.522514913629857	1.91267090220593e-07	ENSG00000206503:ENST00000396634:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376806:exon_29912277_29912411:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000376809:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000496081:exon_29912277_29912868:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000495183:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000479320:exon_29912277_29912393:HLA-A;ENSG00000206503:ENST00000461903:exon_29912277_29912411:HLA-A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30032495	A/G	1	80	101	181	38.1988069096114	52.7740062766156	-14.5751993670041	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0310197446343472	ENSG00000066379:ENST00000471008:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000332435:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376782:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000359374:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000376785:exon_30032450_30032686:ZNRD1;ENSG00000066379:ENST00000463141:exon_30032450_30032686:ZNRD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30036471	C/A	1	26	32	58	12.4146122456237	16.7204772361554	-4.30586499053171	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.293492778828356	ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036367_30036475:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30035983_30036475:PPP1R11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30036927	G/C	1	35	23	58	16.711978022955	12.0178430134867	4.69413500946829	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.23820097770696	ENSG00000204619:ENST00000376773:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376772:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376769:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376765:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376763:exon_30036881_30038110:PPP1R11;ENSG00000204619:ENST00000376758:exon_30036881_30038110:PPP1R11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30457766	G/A	1	369	360	729	176.191996870583	188.105368906749	-11.9133720361658	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.393837018249366	ENSG00000204592:ENST00000447104:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376630:exon_30457503_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000484194:exon_30457503_30458142:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000493699:exon_30457289_30457772:HLA-E;ENSG00000204592:ENST00000376628:exon_30457316_30457772:HLA-E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30587514	C/T	1	119	85	204	56.820725278047	44.4137676585379	12.4069576195092	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0923436612250425	ENSG00000204568:ENST00000259873:exon_30587486_30587583:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000492316:exon_30587486_30587583:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472267:exon_30587270_30587766:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000376508:exon_30587486_30587583:MRPS18B;ENSG00000204568:ENST00000472229:exon_30587458_30587583:MRPS18B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30691490	G/A	1	1683	1236	2919	803.607400360951	645.828433246503	157.778967114447	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	4.64470066686916e-09	ENSG00000196230:ENST00000327892:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000422827:exon_30691488_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000444378:exon_30691434_30692174:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000330914:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396389:exon_30691117_30693203:TUBB;ENSG00000196230:ENST00000396384:exon_30691117_30693203:TUBB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	30697931	T/C	1	231	202	433	110.299054951503	105.548012553231	4.75104239827191	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.665204875338899	ENSG00000137312:ENST00000376389:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000487376:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000376385:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000456573:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000432446:exon_30697799_30697963:FLOT1;ENSG00000137312:ENST00000422641:exon_30697799_30697963:FLOT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31110391	G/C	1	87	63	150	41.5412025142024	32.918439558681	8.62276295552144	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.165313705701357	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31110216_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31110217_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31110221_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31110238_31110493:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31110297_31110493:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31111180	T/C	1	34	34	68	16.2344929365849	17.7655070634151	-1.53101412683028	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.717605841815193	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31111039_31111190:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509859:exon_31110915_31111190:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31112737	C/A	1	43	27	70	20.5318587139161	14.1079026680061	6.42395604591001	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.150642117513193	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112662_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112464_31112850:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000486060:exon_31112662_31112892:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112297_31112850:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31113030	A/G	1	28	19	47	13.369582418364	9.92778335896728	3.44179905939672	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.38131550901628	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31113052	G/A	1	28	18	46	13.369582418364	9.40526844533743	3.96431397302658	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.301548248728239	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31112943_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000467553:exon_31112965_31113079:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31112943_31113079:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31113239	C/G	1	22	32	54	10.5046719001431	16.7204772361554	-6.21580533601228	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.102246108290936	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31113225_31113270:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31113225_31113270:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31116246	G/A	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31116182_31116288:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31116182_31116288:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31118565	C/G	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31118502_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31118504_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31118522_31118637:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31118525_31118637:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31122315	G/C	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31122482	G/A	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31122500	G/A	1	14	7	21	6.684791209182	3.657604395409	3.027186813773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.198655985278081	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000464012:exon_31122273_31122528:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31122273_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000513222:exon_31122308_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31122320_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31122330_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31122333_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31122349_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31122371_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31122388_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31122451_31122576:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31122460_31122576:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31124849	C/T	1	14	5	19	6.684791209182	2.61257456814929	4.07221664103272	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0686149924897499	ENSG00000204536:ENST00000396268:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000376266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000445740:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396266:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000435325:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000396263:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000440185:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000451521:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000509552:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000480060:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000512418:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502672:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508852:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507459:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000505392:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448141:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000508683:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000448162:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503420:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000515274:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507751:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000455279:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000412245:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000503934:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000426967:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000502557:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507829:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000428174:exon_31124508_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507226:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000475684:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000488920:exon_31124800_31124932:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000507892:exon_31124800_31124866:CCHCR1;ENSG00000204536:ENST00000506831:exon_31124800_31125568:CCHCR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31129616	A/G	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31129642	A/C	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31129224_31129782:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31129528_31129782:TCF19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31130502	T/C	1	27	32	59	12.8920973319939	16.7204772361554	-3.82837990416157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.36215213835306	ENSG00000137310:ENST00000376257:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000376255:exon_31130254_31131992:TCF19;ENSG00000137310:ENST00000496421:exon_31130254_31130784:TCF19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31237124	T/C	1	2220	1464	3684	1060.01689174172	764.961833554111	295.055058187607	A:T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1.55144298241634e-22	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31237162	C/G	1	2561	982	3543	1222.83930619394	513.10964518452	709.729661009417	T:C:G	C	G	10	0.522514913629857	4.48496469152032e-131	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237115_31237162:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237115_31237162:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31237275	G/A	1	1062	2494	3556	507.089161725092	1303.15219459286	-796.063032867772	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	1.71166990960587e-160	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31237270_31237320:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31237270_31237302:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000470363:exon_31237270_31237862:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000466892:exon_31237115_31237443:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31237270_31237302:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31239378	T/G	1	982	71	1053	468.89035481548	37.0985588677199	431.791795947761	A:T:G	T	G	10	0.522514913629857	1.19341056669101e-188	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31239430	C/T	1	1059	122	1181	505.656706465981	63.7468194628426	441.909887003139	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	3.01867542965577e-169	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31239449	C/G	1	129	1086	1215	61.5955761417484	567.451196202025	-505.855620060276	T:C:G	C	G	10	0.522514913629857	2.49267708302135e-208	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31239518	C/T	1	937	37	974	447.403525928824	19.3330518043047	428.070474124519	T:C	C	T	10	0.522514913629857	2.58712190541316e-209	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239376_31239645:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31238876_31239645:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31239821	G/T	0	720	0	720	343.789262186503	0	343.789262186503	G	G		10	0.522514913629857	1.54286629569742e-203	ENSG00000204525:ENST00000376228:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000383329:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000396254:exon_31239776_31239863:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000487245:exon_31238850_31239827:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000376237:exon_31239776_31239882:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000458701:exon_31239776_31239850:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000415537:exon_31239776_31239846:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000495835:exon_31239376_31239907:HLA-C;ENSG00000204525:ENST00000484378:exon_31239776_31239867:HLA-C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31498203	C/A	1	454	260	714	216.778229212045	135.853877543763	80.9243516682821	A:T:C:G	C	A	10	0.522514913629857	1.10819081982476e-09	ENSG00000254870:ENST00000376185:exon_31497996_31498227:XXbac-BPG296P20.16;ENSG00000198563:ENST00000474961:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000484566:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376177:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462256:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000458640:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000396172:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376174:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000525098:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000417556:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000415382:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000449461:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000376163:exon_31497996_31498227:BAT1;ENSG00000198563:ENST00000462421:exon_31498020_31498526:BAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31498737	G/A	1	19	4	23	9.07221664103272	2.09005965451943	6.98215698651329	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0031815638252182	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31540556	T/C	1	70	106	176	33.42395604591	55.3865808447648	-21.9626247988548	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00111731047870115	ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540511_31540618:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540511_31540618:LTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31540784	C/A	1	149	127	276	71.1452778691513	66.3593940309918	4.78588383815946	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.587849248939448	ENSG00000226979:ENST00000454783:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000489638:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000418386:exon_31540705_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000471842:exon_31540511_31540810:LTA;ENSG00000226979:ENST00000436827:exon_31540705_31540810:LTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31556922	C/T	1	29	28	57	13.8470675047341	14.630417581636	-0.783350076901849	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.894809539452338	ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31556928	C/A	1	32	28	60	15.2795227638446	14.630417581636	0.649105182208579	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.89778651341517	ENSG00000204475:ENST00000495600:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000491161:exon_31556672_31557008:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000340027:exon_31556672_31556953:NCR3;ENSG00000204475:ENST00000376073:exon_31556672_31557008:NCR3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31595882	C/A	1	8	14	22	3.81988069096114	7.315208790818	-3.49532809985685	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.142312472680437	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31595542_31596016:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31595542_31596016:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31598489	A/G	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31598368_31598578:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31598368_31598578:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31600297	G/A	1	26	24	50	12.4146122456237	12.5403579271166	-0.125745681492852	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31600670	G/A	1	30	42	72	14.3245525911043	21.945626372454	-7.6210737813497	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0772577461928141	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31598916_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31599982_31600769:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31599982_31600769:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31601344	T/C	1	63	46	109	30.081560441319	24.0356860269734	6.04587441434558	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.251691959511916	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31601156_31601424:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31601156_31601424:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31602967	G/A	1	65	54	119	31.0365306140593	28.2158053360123	2.82072527804701	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.646771829957537	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31602909_31603049:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000484787:exon_31602909_31603093:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31603770	A/G	1	220	175	395	105.046719001431	91.440109885225	13.6066091162065	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.174137758368777	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31603744_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31603758_31603790:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487089:exon_31603137_31603826:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000487839:exon_31603359_31603826:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31604591	C/T	1	168	176	344	80.217494510184	91.9626247988548	-11.7451302886708	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.214579590903761	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31604707	C/T	1	240	237	477	114.596420728834	123.836034530276	-9.23961380144179	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.40951315552623	ENSG00000204469:ENST00000376007:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376033:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000376010:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000424184:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000435052:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31604510_31604722:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31604510_31604913:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000482441:exon_31604612_31604913:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31605199	G/C	1	16	10	26	7.63976138192229	5.22514913629857	2.41461224562372	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.433312135919422	ENSG00000204469:ENST00000492691:exon_31605011_31605548:BAT2;ENSG00000204469:ENST00000462617:exon_31605011_31605548:BAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31610686	A/G	1	51	57	108	24.3517394048773	29.7833500769019	-5.43161067202456	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.335486259826713	ENSG00000204463:ENST00000375976:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375964:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000211379:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000430037:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000534611:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000362049:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000404765:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375956:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375959:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000375931:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000470875:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000437771:exon_31610606_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000465348:exon_31610461_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000438149:exon_31610609_31610892:BAT3;ENSG00000204463:ENST00000436214:exon_31610647_31610892:BAT3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31627523	C/T	1	28	27	55	13.369582418364	14.1079026680061	-0.738320249642136	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.893010787557598	ENSG00000204439:ENST00000375911:exon_31626075_31628549:C6orf47
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31630241	C/T	1	52	62	114	24.8292244912474	32.3959246450511	-7.5667001538037	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.160664082725732	ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31630318	C/T	1	62	48	110	29.6040753549489	25.0807158542331	4.52335950071573	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.392538142824667	ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31629006_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31629853_31630487:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31629853_31630487:BAT4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31632134	C/A	1	45	40	85	21.4868288866564	20.9005965451943	0.58623234146215	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.914005775607812	ENSG00000204438:ENST00000375906:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375896:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375893:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375895:exon_31631630_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000375900:exon_31631630_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000440842:exon_31631660_31632354:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000458083:exon_31631762_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000445768:exon_31631800_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000432291:exon_31631935_31632357:BAT4;ENSG00000204438:ENST00000456540:exon_31631987_31632354:BAT4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31639979	C/T	1	25	17	42	11.9371271592536	8.88275353170757	3.054373627546	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.359063468630971	ENSG00000204435:ENST00000375880:exon_31639641_31641323:CSNK2B;ENSG00000240053:ENST00000375873:exon_31639641_31640059:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409691:exon_31639641_31641323:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375864:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000375875:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000519488:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000530877:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000409525:exon_31639641_31640239:LY6G5B;ENSG00000240053:ENST00000483905:exon_31639641_31641323:LY6G5B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31655438	G/A	1	22	9	31	10.5046719001431	4.70263422266871	5.80203767747443	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0467133655649168	ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000468205:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000490209:exon_31655419_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000474007:exon_31655352_31655517:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31655430_31655517:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31655419_31655517:XXbac-BPG32J3.20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31657413	T/C	1	1	7	8	0.477485086370143	3.657604395409	-3.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0319124571059794	ENSG00000204427:ENST00000395952:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000475742:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000492084:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000375842:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000495769:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000440843:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000471644:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000477016:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204427:ENST00000498420:exon_31657358_31657481:BAT5;ENSG00000204422:ENST00000461287:exon_31657358_31657481:XXbac-BPG32J3.20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31729359	A/G	1	9	18	27	4.29736577733129	9.40526844533743	-5.10790266800614	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0548664043239411	ENSG00000204410:ENST00000375755:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000534153:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375750:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528100:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375742:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395817:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000383401:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375703:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375740:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000528640:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000375696:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000423982:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000463144:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000395853:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000431848:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000484309:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000204410:ENST00000429846:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000493662:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000498473:exon_31729249_31729392:MSH5;ENSG00000255152:ENST00000491552:exon_31729249_31729392:MSH5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31829148	G/A	1	9	15	24	4.29736577733129	7.83772370444786	-3.54035792711657	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.158203687557982	ENSG00000204386:ENST00000495807:exon_31827819_31829968:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000480384:exon_31828965_31829227:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000491768:exon_31828965_31829227:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000375631:exon_31828965_31829227:NEU1;ENSG00000204386:ENST00000479533:exon_31828965_31829227:NEU1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31931696	G/A	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000204351:ENST00000433155:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000375394:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000465703:exon_31931690_31931902:SKIV2L;ENSG00000204351:ENST00000474839:exon_31931690_31931902:SKIV2L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31938107	A/G	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31938412	G/T	1	27	23	50	12.8920973319939	12.0178430134867	0.874254318507148	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.887707278549361	ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	31938451	T/C	1	19	20	39	9.07221664103272	10.4502982725971	-1.37808163156443	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.749130394966468	ENSG00000204348:ENST00000491327:exon_31938120_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000485557:exon_31938383_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000477826:exon_31938383_31940029:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000337523:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375349:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000495340:exon_31938370_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000473976:exon_31937886_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000478221:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000375356:exon_31938383_31938602:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000498357:exon_31937664_31938924:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000480240:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000474587:exon_31938383_31938529:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000492946:exon_31938219_31939458:DOM3Z;ENSG00000204348:ENST00000487914:exon_31938420_31938529:DOM3Z
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32093922	G/A	1	18	19	37	8.59473155466257	9.92778335896728	-1.33305180430471	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.742850160021987	ENSG00000213676:ENST00000375203:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000375201:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000433846:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000495579:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000485314:exon_32093894_32094029:ATF6B;ENSG00000213676:ENST00000468502:exon_32093819_32094029:ATF6B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32097290	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000204315:ENST00000375156:exon_32096484_32097631:FKBPL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32137801	G/A	1	22	15	37	10.5046719001431	7.83772370444786	2.66694819569529	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.414059712935562	ENSG00000204310:ENST00000395496:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000375107:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000395499:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000375104:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000490711:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000395497:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000336984:exon_32137743_32137815:AGPAT1;ENSG00000204310:ENST00000412465:exon_32137743_32137815:AGPAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32147696	G/A	1	48	3	51	22.9192841457669	1.56754474088957	21.3517394048773	A:G	G	A	10	0.522514913629857	8.77841261766495e-11	ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000427134:exon_32147654_32147708:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32147654_32147708:RNF5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32148031	A/G	1	111	62	173	53.0008445870859	32.3959246450511	20.6049199420347	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00175164721357939	ENSG00000204308:ENST00000375094:exon_32148006_32148570:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375085:exon_32148006_32148541:RNF5;ENSG00000204308:ENST00000375087:exon_32148006_32148541:RNF5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32159956	T/C	1	172	146	318	82.1274348556646	76.2871773899591	5.84025746570546	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.537069070451224	ENSG00000213654:ENST00000487761:exon_32159925_32160049:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000472768:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375040:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000375043:exon_32159925_32160027:GPSM3;ENSG00000213654:ENST00000402726:exon_32159925_32160027:GPSM3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32163541	A/C	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000204301:ENST00000491215:exon_32162620_32164198:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000474612:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000375023:exon_32162620_32163927:NOTCH4;ENSG00000204301:ENST00000415698:exon_32162625_32163927:NOTCH4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32407709	C/A	1	468	540	1008	223.463020421227	282.158053360123	-58.6950329388959	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.000222782060024606	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32407619_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32407647_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000462200:exon_32407649_32407809:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32407655_32407809:HLA-DRA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32411035	A/C	1	1767	1994	3761	843.716147616043	1041.89473777794	-198.178590161892	A:T:C:G	A	C	10	0.522514913629857	1.09506724681871e-10	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32410962_32411243:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000416844:exon_32410962_32411122:HLA-DRA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32411523	T/C	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150892005879831	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32411646	T/G	1	3755	3229	6984	1792.95649931989	1687.20065611081	105.755843209079	A:T:C:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0114874056577334	ENSG00000204287:ENST00000395388:exon_32411533_32411698:HLA-DRA;ENSG00000204287:ENST00000374982:exon_32411533_32411698:HLA-DRA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32605234	G/A	0	444	0	444	212.003378348343	0	212.003378348343	G	G		10	0.522514913629857	8.96345639045394e-126	ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32605295	C/T	0	1214	1	1215	579.666894853354	0.522514913629857	579.144379939724	A:C:G	C	A	10	0.522514913629857	0	ENSG00000196735:ENST00000422863:exon_32605198_32605308:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000343139:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395364:exon_32605134_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000395363:exon_32605178_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000496318:exon_32605183_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000374949:exon_32605197_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000495840:exon_32605201_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000482745:exon_32605204_32605317:HLA-DQA1;ENSG00000196735:ENST00000460633:exon_32605208_32605317:HLA-DQA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32714143	G/A	0	17	0	17	8.11724646829243	0	8.11724646829243	G	G		10	0.522514913629857	1.96175259969567e-05	ENSG00000237541:ENST00000374940:exon_32714017_32714191:HLA-DQA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32784676	C/T	1	25	30	55	11.9371271592536	15.6754474088957	-3.73832024964214	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.345886217670878	ENSG00000241106:ENST00000488325:exon_32784638_32784753:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000438763:exon_32784638_32784825:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000475235:exon_32784638_32784765:HLA-DOB;ENSG00000241106:ENST00000447394:exon_32784638_32784687:HLA-DOB;ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32784638_32784729:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32784638_32784729:XXbac-BPG246D15.9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32797297	T/C	1	35	47	82	16.711978022955	24.5582009406033	-7.84622291764828	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0968755483167856	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000464100:exon_32797177_32797313:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32797177_32797313:XXbac-BPG246D15.9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32800224	C/A	1	19	26	45	9.07221664103272	13.5853877543763	-4.51317111334357	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.183053170290474	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800110_32800238:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800072_32800238:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800110_32800238:XXbac-BPG246D15.9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32800412	C/T	1	29	20	49	13.8470675047341	10.4502982725971	3.39676923213701	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.391393348035362	ENSG00000204267:ENST00000458336:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374899:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000374897:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000428917:exon_32800404_32800601:TAP2;ENSG00000204267:ENST00000485701:exon_32800404_32800510:TAP2;ENSG00000250264:ENST00000452392:exon_32800404_32800601:XXbac-BPG246D15.9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32814942	C/T	1	121	98	219	57.7756954507873	51.206461535726	6.56923391506132	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.380123720106639	ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32814975	T/C	1	186	181	367	88.8122260648466	94.5751993670041	-5.76297330215752	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	0.565599683986922	ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32814845_32814981:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000487296:exon_32814845_32815452:TAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32816772	C/A	1	161	160	321	76.875098905593	83.6023861807771	-6.72728727518411	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.467872243446425	ENSG00000168394:ENST00000486332:exon_32816429_32817919:TAP1;ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32816767_32816895:TAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32818774	T/C	1	69	57	126	32.9464709595399	29.7833500769019	3.16312088263802	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.5935275376542	ENSG00000168394:ENST00000354258:exon_32818721_32818926:TAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32825090	G/A	1	192	208	400	91.6771365830675	108.68310203501	-17.0059654519428	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0890692265476156	ENSG00000240065:ENST00000395330:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000414474:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000464863:exon_32823915_32825911:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000374859:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000453265:exon_32825040_32825171:PSMB9;ENSG00000240065:ENST00000467593:exon_32825040_32825171:PSMB9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32904981	G/A	1	158	117	275	75.4426436464826	61.1342448946933	14.3083987517893	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0908983324544222	ENSG00000242574:ENST00000438510:exon_32904949_32905216:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000414017:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32904949_32905233:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32904949_32905233:HLA-DMB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32906601	A/G	1	95	83	178	45.3610832051636	43.3687378312781	1.99234537388545	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.821990518429742	ENSG00000242574:ENST00000498020:exon_32902406_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000446948:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000418107:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000416244:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000242574:ENST00000440643:exon_32906461_32906742:HLA-DMB;ENSG00000248993:ENST00000429234:exon_32906461_32906742:XXbac-BPG181M17.5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32946034	T/C	1	194	169	363	92.6321067558077	88.3050204034458	4.3270863523619	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.67437504948434	ENSG00000204256:ENST00000374825:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449085:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000374831:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395289:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000443797:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000482914:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000395287:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000449025:exon_32945903_32946165:BRD2;ENSG00000204256:ENST00000463639:exon_32945903_32946578:BRD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	32975896	A/G	1	9	15	24	4.29736577733129	7.83772370444786	-3.54035792711657	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.158203687557982	ENSG00000204252:ENST00000229829:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000450833:exon_32975790_32976038:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000432150:exon_32975790_32976014:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000495532:exon_32975790_32975901:HLA-DOA;ENSG00000204252:ENST00000467465:exon_32975838_32976181:HLA-DOA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33036505	G/C	1	1279	637	1916	610.703425467413	332.841999982219	277.861425485194	A:T:C:G	G	C	10	0.522514913629857	8.46164859516242e-38	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036415_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33035437_33036581:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036475_33036581:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33036971	C/T	1	993	29	1022	474.142690765552	15.1529324952659	458.989758270286	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	9.19936625105112e-234	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33036999	T/C	1	1157	82	1239	552.450244930255	42.8462229176483	509.604022012607	A:T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	2.59680004258219e-223	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000437811:exon_33036796_33037025:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33036796_33037066:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33036796_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33036881_33037077:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33036939_33037077:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037080	G/A	0	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037419	G/A	1	1570	74	1644	749.651585601124	38.6661036086094	710.985481992515	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037424	T/C	1	1511	75	1586	721.479965505286	39.1886185222393	682.291346983047	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	7.65307685408091e-321	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037497	G/A	1	827	66	893	394.880166428108	34.4859842995706	360.394182128538	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	6.17871658322317e-154	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037522	T/C	1	743	75	818	354.771419173016	39.1886185222393	315.582800650777	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	1.65851675444934e-126	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037557	C/T	0	568	1	569	271.211529058241	0.522514913629857	270.689014144611	C:G	C	G	10	0.522514913629857	3.43512742398208e-158	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037560	G/A	0	565	0	565	269.779073799131	0	269.779073799131	G	G		10	0.522514913629857	6.18272150106810e-160	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33037579	A/T	0	520	0	520	248.292244912474	0	248.292244912474	A	A		10	0.522514913629857	2.76545852060259e-147	ENSG00000231389:ENST00000419277:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000479107:exon_33032784_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000428995:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000448544:exon_33037506_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000453337:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000476642:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1;ENSG00000231389:ENST00000463066:exon_33037418_33037663:HLA-DPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33048640	A/G	1	1	119	120	0.477485086370143	62.179274721953	-61.7017896355828	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	3.95177496023382e-37	ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000469120:exon_33048449_33049009:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000488575:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000471184:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000498038:exon_33048220_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33048466_33048712:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33048449_33048712:HLA-DPB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33053609	G/A	1	402	754	1156	191.949004720797	393.976244876912	-202.027240156115	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	8.30914405297052e-33	ENSG00000223865:ENST00000418931:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000411942:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000422592:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000428835:exon_33053556_33053666:HLA-DPB1;ENSG00000223865:ENST00000416804:exon_33053556_33053683:HLA-DPB1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33163451	G/A	1	19	8	27	9.07221664103272	4.18011930903886	4.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0812857014833121	ENSG00000204231:ENST00000374685:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000374680:exon_33163347_33163479:RXRB;ENSG00000204231:ENST00000483281:exon_33163347_33163479:RXRB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33239423	C/G	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000223501:ENST00000482399:exon_33238914_33239653:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000445902:exon_33239363_33239671:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000418054:exon_33239363_33239662:VPS52;ENSG00000223501:ENST00000436044:exon_33239363_33239662:VPS52
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33258443	G/A	1	5	12	17	2.38742543185071	6.27017896355828	-3.88275353170757	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.086732673121093	ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33258619	C/A	1	92	65	157	43.9286279460532	33.9634693859407	9.96515856011245	A:C:G	C	A	10	0.522514913629857	0.128779387916359	ENSG00000204220:ENST00000395131:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374606:exon_33258493_33258710:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000395134:exon_33258103_33258652:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374610:exon_33258493_33258639:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000374607:exon_33258493_33258698:PFDN6;ENSG00000204220:ENST00000491382:exon_33257951_33258645:PFDN6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33287183	T/C	1	187	163	350	89.2897111512167	85.1699309216667	4.11978022955005	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.668960273141254	ENSG00000204209:ENST00000266000:exon_33287157_33287631:DAXX;ENSG00000204209:ENST00000374542:exon_33287157_33287631:DAXX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33359716	G/C	1	19	17	36	9.07221664103272	8.88275353170757	0.189463109325146	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33359313_33359774:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000450504:exon_33359638_33359774:KIFC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	33373341	C/T	1	25	18	43	11.9371271592536	9.40526844533743	2.53185871391615	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.450647062778914	ENSG00000237649:ENST00000428849:exon_33372629_33373408:KIFC1;ENSG00000237649:ENST00000453530:exon_33372629_33373408:KIFC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	35715097	T/C	1	10	8	18	4.77485086370143	4.18011930903886	0.594731554662573	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.817886779949097	ENSG00000157343:ENST00000373869:exon_35715038_35715211:C6orf81;ENSG00000157343:ENST00000288065:exon_35715038_35715211:C6orf81;ENSG00000157343:ENST00000373866:exon_35715038_35715211:C6orf81
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	36936697	T/C	1	112	91	203	53.478329673456	47.548857140317	5.92947253313903	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.439732166070363	ENSG00000137409:ENST00000373616:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373627:exon_36935917_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373565:exon_36935918_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000373550:exon_36936513_36936727:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000337855:exon_36936513_36936725:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000471737:exon_36936536_36936750:MTCH1;ENSG00000137409:ENST00000418541:exon_36936688_36936750:MTCH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	36988364	C/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000146192:ENST00000274963:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000373535:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000464083:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000494343:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000470273:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000493635:exon_36988317_36988396:FGD2;ENSG00000146192:ENST00000394459:exon_36988314_36988396:FGD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	37349033	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000112130:ENST00000373479:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000394443:exon_37348926_37349130:RNF8;ENSG00000112130:ENST00000229866:exon_37348926_37349130:RNF8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	37443950	G/A	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000137200:ENST00000373420:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373427:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000373451:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000475364:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000457419:exon_37443902_37443970:FTSJD2;ENSG00000137200:ENST00000452299:exon_37443902_37443970:FTSJD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	38650588	T/A	1	29	35	64	13.8470675047341	18.288021977045	-4.44095447231085	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.316854013566187	ENSG00000124767:ENST00000470973:exon_38650584_38650991:GLO1;ENSG00000124767:ENST00000373365:exon_38650584_38650651:GLO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	41303592	T/C	1	13	7	20	6.20730612281186	3.657604395409	2.54970172740286	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.272870454005015	ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41303393_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41303527_41303666:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41303589_41303666:NCR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	41309552	T/C	1	8	11	19	3.81988069096114	5.74766404992843	-1.92778335896728	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.492108880387063	ENSG00000096264:ENST00000373083:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373089:exon_41309532_41309667:NCR2;ENSG00000096264:ENST00000373086:exon_41309532_41309667:NCR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	41652604	T/C	1	170	210	380	81.1724646829243	109.72813186227	-28.5556671793457	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00340886955729449	ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41651716_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41651717_41652816:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41651718_41652816:TFEB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	41655698	G/A	1	44	46	90	21.0093438002863	24.0356860269734	-3.02634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.528785502580214	ENSG00000112561:ENST00000406563:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000343317:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000230323:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000358871:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000403298:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000420312:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000373033:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000394283:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000494822:exon_41655491_41655938:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419396:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000416140:exon_41655646_41655766:TFEB;ENSG00000112561:ENST00000419574:exon_41655648_41655766:TFEB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	41904350	T/C	1	14	9	23	6.684791209182	4.70263422266871	1.98215698651329	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.532235244522199	ENSG00000112576:ENST00000372991:exon_41904297_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000511642:exon_41904297_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372987:exon_41904297_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000372988:exon_41904297_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000415497:exon_41904297_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000414200:exon_41904297_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000512426:exon_41903934_41904433:CCND3;ENSG00000112576:ENST00000513956:exon_41904222_41904433:CCND3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	42713223	T/G	1	26	16	42	12.4146122456237	8.36023861807771	4.054373627546	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.220684751585586	ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	42713274	G/A	1	20	11	31	9.54970172740286	5.74766404992843	3.80203767747443	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.208805155249409	ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	42713307	G/A	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	42713779	G/A	1	16	16	32	7.63976138192229	8.36023861807771	-0.720477236155425	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.860466485365508	ENSG00000124659:ENST00000372876:exon_42712219_42713834:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000490059:exon_42712236_42713833:TBCC;ENSG00000124659:ENST00000244625:exon_42712239_42713838:TBCC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	43968814	A/G	1	12	17	29	5.72982103644172	8.88275353170757	-3.15293249526585	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.268082057749973	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43968317_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43968754_43968880:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43968711_43968880:C6orf223
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	43970538	A/C	1	15	5	20	7.16227629555214	2.61257456814929	4.54970172740286	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0454545404470741	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	43970539	C/T	1	19	7	26	9.07221664103272	3.657604395409	5.41461224562372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0475952011175317	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	43970658	T/A	1	17	24	41	8.11724646829243	12.5403579271166	-4.42311145882414	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.210644474106748	ENSG00000181577:ENST00000442114:exon_43970418_43972887:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000336600:exon_43970418_43972877:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000439969:exon_43970418_43972845:C6orf223;ENSG00000181577:ENST00000448947:exon_43970418_43971142:C6orf223
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44081510	C/T	1	71	42	113	33.9014411322801	21.945626372454	11.9558147598262	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0298697773602576	ENSG00000180992:ENST00000372014:exon_44081194_44081946:MRPL14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44232733	G/A	1	59	56	115	28.1716200958384	29.260835163272	-1.08921506743356	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.852388249958792	ENSG00000146232:ENST00000275015:exon_44232719_44233500:NFKBIE;ENSG00000146232:ENST00000477930:exon_44232719_44233500:NFKBIE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44269193	C/T	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269118_44269201:AARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44269847	T/C	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.163129620801833	ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44269797_44269907:AARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44270189	A/T	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000124608:ENST00000244571:exon_44270128_44270250:AARS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44371690	T/C	1	23	22	45	10.9821569865133	11.4953280998569	-0.513171113343565	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.882703002524253	ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	44371714	C/T	1	29	31	60	13.8470675047341	16.1979623225256	-2.35089481779142	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.605782373389655	ENSG00000096401:ENST00000371477:exon_44371546_44371764:CDC5L;ENSG00000096401:ENST00000423012:exon_44371546_44371764:CDC5L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	49412383	G/C	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000146085:ENST00000274813:exon_49412352_49412467:MUT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	56484758	C/T	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	ENSG00000151914:ENST00000370765:exon_56482784_56485513:DST;ENSG00000151914:ENST00000281662:exon_56482784_56485513:DST
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	57512476	G/A	0	0	14	14	0	7.315208790818	-7.315208790818	A	G	A	10	0.522514913629857	3.20211821506116e-05	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	57512529	C/A	0	11	0	11	5.25233595007157	0	5.25233595007157	C	C		10	0.522514913629857	0.00108680014245063	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	57512565	T/C	0	0	16	16	0	8.36023861807771	-8.36023861807771	C	T	C	10	0.522514913629857	7.30057360763437e-06	ENSG00000146143:ENST00000425433:exon_57512472_57513375:PRIM2;ENSG00000146143:ENST00000389488:exon_57512472_57513375:PRIM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	71289189	A/G	1	20	18	38	9.54970172740286	9.40526844533743	0.144433282065432	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000154079:ENST00000370474:exon_71289117_71289269:C6orf57
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	71569962	C/T	1	15	15	30	7.16227629555214	7.83772370444786	-0.67544740889571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.856236532311625	ENSG00000112305:ENST00000370452:exon_71569903_71570869:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000316999:exon_71569903_71570869:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000370455:exon_71569903_71571718:SMAP1;ENSG00000112305:ENST00000420229:exon_71569903_71570207:SMAP1;ENSG00000112309:ENST00000230053:exon_71566382_71571452:B3GAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	72006512	T/C	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000119900:ENST00000370435:exon_72006375_72006520:OGFRL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	79656562	A/T	1	16	8	24	7.63976138192229	4.18011930903886	3.45964207288343	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.219554892199473	ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	79656570	G/A	1	17	8	25	8.11724646829243	4.18011930903886	3.93712715925357	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.159933770810999	ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79656428_79656591:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79656428_79656591:PHIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	79675701	A/G	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79675662_79675773:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79675662_79675773:PHIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	79679577	A/G	1	18	6	24	8.59473155466257	3.13508948177914	5.45964207288343	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0387356274734953	ENSG00000146247:ENST00000275034:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000479165:exon_79679552_79679634:PHIP;ENSG00000146247:ENST00000355098:exon_79679552_79679634:PHIP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	79913328	G/A	1	306	291	597	146.110436429264	152.051839866288	-5.94140343702463	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.652274069575618	ENSG00000118418:ENST00000344726:exon_79913297_79913347:HMGN3;ENSG00000118418:ENST00000275036:exon_79913297_79913347:HMGN3;ENSG00000118418:ENST00000392966:exon_79913297_79913347:HMGN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	80736148	A/G	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80736098_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80736095_80736231:TTK;ENSG00000112742:ENST00000515751:exon_80736095_80736231:TTK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	80741243	A/T	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000112742:ENST00000509894:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000230510:exon_80741184_80741276:TTK;ENSG00000112742:ENST00000369798:exon_80741184_80741276:TTK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	82882103	C/T	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000005700:ENST00000306270:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000505222:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000508381:exon_82882097_82883295:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000445419:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000451512:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503400:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000503631:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000510291:exon_82882097_82882229:IBTK;ENSG00000005700:ENST00000471036:exon_82882097_82882229:IBTK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	87968310	A/G	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	87969341	G/A	1	23	28	51	10.9821569865133	14.630417581636	-3.64826059512271	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.328677949806312	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	87970301	C/G	1	79	95	174	37.7213218232413	49.6389167948364	-11.9175949715951	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0806400622796827	ENSG00000188994:ENST00000369577:exon_87964368_87973914:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000339907:exon_87964368_87971638:ZNF292;ENSG00000188994:ENST00000496806:exon_87969793_87970363:ZNF292
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	90039670	G/C	1	126	122	248	60.163120882638	63.7468194628426	-3.58369858020455	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.656845629854863	ENSG00000241519:ENST00000361333:exon_90039279_90039676:UBE2J1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	90090024	A/G	1	14	9	23	6.684791209182	4.70263422266871	1.98215698651329	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.532235244522199	ENSG00000025039:ENST00000369415:exon_90089887_90090086:RRAGD;ENSG00000025039:ENST00000359203:exon_90089887_90090077:RRAGD;ENSG00000025039:ENST00000492783:exon_90089887_90090086:RRAGD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	97339088	C/T	1	76	84	160	36.2888665641309	43.891252744908	-7.60238618077712	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.235975634989740	ENSG00000123545:ENST00000316149:exon_97337189_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000478382:exon_97338888_97339267:NDUFAF4;ENSG00000123545:ENST00000489477:exon_97339027_97339267:NDUFAF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	99323424	C/T	1	1	13	14	0.477485086370143	6.79269387718814	-6.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.000635673822446339	ENSG00000112234:ENST00000369244:exon_99323291_99323603:FBXL4;ENSG00000112234:ENST00000229971:exon_99323291_99323603:FBXL4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	99828072	A/G	1	10	2	12	4.77485086370143	1.04502982725971	3.72982103644172	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0408682426721573	ENSG00000132423:ENST00000254759:exon_99828065_99828217:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000369242:exon_99828065_99828217:COQ3;ENSG00000132423:ENST00000479163:exon_99828065_99828217:COQ3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	100957344	T/C	1	28	27	55	13.369582418364	14.1079026680061	-0.738320249642136	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.893010787557598	ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100956070_100957409:ASCC3;ENSG00000112249:ENST00000518006:exon_100957094_100957409:ASCC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	100966006	C/T	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000112249:ENST00000369162:exon_100965867_100966018:ASCC3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	107001414	A/T	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000112297:ENST00000369066:exon_107001330_107001442:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000457437:exon_107001330_107001442:AIM1;ENSG00000112297:ENST00000285105:exon_107001330_107001442:AIM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	107076696	G/A	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	107076783	A/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000130347:ENST00000369063:exon_107076623_107077362:RTN4IP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	107077550	G/A	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000130348:ENST00000369046:exon_107077453_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000467262:exon_107077474_107077580:QRSL1;ENSG00000130348:ENST00000369044:exon_107077489_107077580:QRSL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	108194017	A/G	1	28	36	64	13.369582418364	18.8105368906749	-5.44095447231085	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.210535872627967	ENSG00000025796:ENST00000369002:exon_108194012_108194116:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000437345:exon_108194012_108194116:SEC63;ENSG00000025796:ENST00000459782:exon_108194012_108194116:SEC63
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	109764535	G/T	1	17	26	43	8.11724646829243	13.5853877543763	-5.46814128608385	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.125905482353549	ENSG00000135587:ENST00000258052:exon_109764470_109764623:SMPD2;ENSG00000135587:ENST00000458487:exon_109764470_109764623:SMPD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	109767930	G/T	1	66	51	117	31.5140157004294	26.6482605951227	4.86575510530673	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.405191973808043	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109767339_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109767899_109767975:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109767899_109767975:MICAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	109768295	G/A	1	51	48	99	24.3517394048773	25.0807158542331	-0.728976449355844	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.920029324633255	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000465904:exon_109768276_109770986:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109768276_109768432:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368957:exon_109768276_109768432:MICAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	109775436	T/C	1	13	8	21	6.20730612281186	4.18011930903886	2.027186813773	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.393468965686283	ENSG00000135596:ENST00000456101:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358807:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000368952:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000358577:exon_109775142_109775442:MICAL1;ENSG00000135596:ENST00000431946:exon_109775142_109775442:MICAL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	109786980	T/C	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000112365:ENST00000230122:exon_109783797_109787777:ZBTB24
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	111303315	C/T	1	33	18	51	15.7570078502147	9.40526844533743	6.35173940487729	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0918651699940207	ENSG00000197498:ENST00000441448:exon_111303218_111303332:RPF2;ENSG00000197498:ENST00000368864:exon_111303218_111303332:RPF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	116575115	A/G	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000187189:ENST00000420283:exon_116571151_116575261:TSPYL4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	116973182	T/C	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000368573:exon_116973167_116973355:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116973167_116973355:ZUFSP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	116977861	T/C	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000153975:ENST00000368576:exon_116977847_116978015:ZUFSP;ENSG00000153975:ENST00000471919:exon_116977847_116978015:ZUFSP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	131190838	G/A	1	13	10	23	6.20730612281186	5.22514913629857	0.982156986513288	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.835280900229804	ENSG00000079819:ENST00000337057:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000257986:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000368128:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527411:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000524581:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000529208:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000527423:exon_131190703_131191266:EPB41L2;ENSG00000079819:ENST00000456097:exon_131190799_131191266:EPB41L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	131908855	A/C	1	17	15	32	8.11724646829243	7.83772370444786	0.279522763844575	A:C	A	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000112282:ENST00000354577:exon_131908849_131908986:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368068:exon_131907873_131908986:MED23;ENSG00000112282:ENST00000403834:exon_131907873_131908986:MED23;ENSG00000112282:ENST00000479213:exon_131907878_131908986:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368060:exon_131908849_131908986:MED23;ENSG00000112282:ENST00000368058:exon_131908385_131908982:MED23
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	132793484	A/G	1	11	15	26	5.25233595007157	7.83772370444786	-2.58538775437628	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.332290693598278	ENSG00000079950:ENST00000434788:exon_132793455_132793514:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367941:exon_132793421_132793514:STX7;ENSG00000079950:ENST00000448348:exon_132793421_132793514:STX7;ENSG00000079950:ENST00000367937:exon_132793421_132793514:STX7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	133078563	G/T	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000112303:ENST00000418593:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000326499:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000335846:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000422400:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000392389:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525270:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525674:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000525289:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000532053:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000528801:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000533835:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000531279:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526157:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000526192:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000524919:exon_133078555_133078685:VNN2;ENSG00000112303:ENST00000530536:exon_133078555_133078685:VNN2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	133138010	T/C	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.325690455653113	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	136597262	T/C	0	150	0	150	71.6227629555215	0	71.6227629555215	T	T		10	0.522514913629857	1.03242548039018e-42	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	136597281	A/T	1	171	1	172	81.6499497692945	0.522514913629857	81.1274348556646	A:T	A	T	10	0.522514913629857	5.46539342600445e-47	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	136597288	A/C	0	172	0	172	82.1274348556646	0	82.1274348556646	A	A		10	0.522514913629857	3.92859968372401e-49	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136596981_136597646:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136596981_136597646:BCLAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	136599393	G/C	0	54	0	54	25.7841946639877	0	25.7841946639877	G	G		10	0.522514913629857	8.7597432653915e-16	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	136599404	T/C	0	48	0	48	22.9192841457669	0	22.9192841457669	T	T		10	0.522514913629857	5.02541061494078e-14	ENSG00000029363:ENST00000531224:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000429704:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000353331:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000031135:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527536:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527613:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530767:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000527759:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000534269:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000532384:exon_136599003_136599914:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000530429:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000392348:exon_136599003_136599908:BCLAF1;ENSG00000029363:ENST00000529826:exon_136599003_136599914:BCLAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	137519238	A/G	1	220	215	435	105.046719001431	112.340706430419	-7.2939874289878	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.501741374658225	ENSG00000027697:ENST00000367739:exon_137518621_137519776:IFNGR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	138196066	T/G	1	2	9	11	0.954970172740286	4.70263422266871	-3.74766404992843	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0319683877489123	ENSG00000118503:ENST00000420009:exon_138195982_138196172:TNFAIP3;ENSG00000118503:ENST00000237289:exon_138195982_138196172:TNFAIP3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	139234084	G/A	1	52	33	85	24.8292244912474	17.2429921497853	7.58623234146215	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.104245686758435	ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000484164:exon_139233812_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000492787:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529423:exon_139233902_139234087:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000530255:exon_139234003_139234087:REPS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	139266402	G/A	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	139266501	T/G	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000135597:ENST00000450536:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367672:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367668:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409553:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000367663:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000529597:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000445570:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000483468:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000409812:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000258062:exon_139266356_139266509:REPS1;ENSG00000135597:ENST00000415951:exon_139266356_139266509:REPS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	139695061	G/T	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	139695070	A/G	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000164442:ENST00000367651:exon_139693393_139695089:CITED2;ENSG00000164442:ENST00000392312:exon_139694608_139695081:CITED2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	143382110	T/C	1	13	14	27	6.20730612281186	7.315208790818	-1.10790266800614	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.703632086597494	ENSG00000146416:ENST00000367601:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000419072:exon_143382084_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000447498:exon_143381990_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000357847:exon_143382013_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000344492:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367598:exon_143382023_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000367596:exon_143382038_143382203:AIG1;ENSG00000146416:ENST00000275235:exon_143382038_143382203:AIG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	143823074	A/G	1	33	48	81	15.7570078502147	25.0807158542331	-9.32370800401842	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0447883583670156	ENSG00000001036:ENST00000341946:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000002165:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000451668:exon_143823069_143823259:FUCA2;ENSG00000001036:ENST00000438118:exon_143823069_143823259:FUCA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	144508593	A/G	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000135604:ENST00000367568:exon_144507760_144509507:STX11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	149262510	C/T	1	11	17	28	5.25233595007157	8.88275353170757	-3.630417581636	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.188554810823175	ENSG00000111962:ENST00000367463:exon_149262415_149262570:UST
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	149395144	C/T	1	40	34	74	19.0994034548057	17.7655070634151	1.33389639139058	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.816336779892552	ENSG00000111962:ENST00000367463:exon_149394969_149398126:UST;ENSG00000111962:ENST00000466695:exon_149394969_149395386:UST
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	149953981	C/T	1	21	14	35	10.027186813773	7.315208790818	2.71197802295501	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.400395431261495	ENSG00000186625:ENST00000335647:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000335643:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000367411:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000444282:exon_149953895_149954052:KATNA1;ENSG00000186625:ENST00000420200:exon_149953895_149954052:KATNA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	150004779	A/G	1	12	9	21	5.72982103644172	4.70263422266871	1.027186813773	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.670382560246413	ENSG00000131023:ENST00000253339:exon_150004215_150005728:LATS1;ENSG00000131023:ENST00000441107:exon_150004215_150005728:LATS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	151247299	A/G	1	15	8	23	7.16227629555214	4.18011930903886	2.98215698651329	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.296626955366974	ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000441122:exon_151247258_151247431:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000428246:exon_151247258_151247431:MTHFD1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	151259845	G/A	1	18	6	24	8.59473155466257	3.13508948177914	5.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0387356274734953	ENSG00000120254:ENST00000367321:exon_151259835_151259881:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000367310:exon_151259835_151259881:MTHFD1L;ENSG00000120254:ENST00000392243:exon_151259835_151259881:MTHFD1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	151766552	G/A	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000155906:ENST00000367303:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000367299:exon_151766443_151766960:RMND1;ENSG00000155906:ENST00000491268:exon_151766443_151766960:RMND1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	151789912	C/T	1	14	14	28	6.684791209182	7.315208790818	-0.630417581635996	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.851639324049382	ENSG00000146476:ENST00000367294:exon_151789478_151791236:C6orf211
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	153296370	G/A	1	25	16	41	11.9371271592536	8.36023861807771	3.57688854117586	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.278095397791184	ENSG00000112029:ENST00000229758:exon_153296042_153296756:FBXO5;ENSG00000112029:ENST00000367241:exon_153296042_153296756:FBXO5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	155606325	C/T	1	26	31	57	12.4146122456237	16.1979623225256	-3.78335007690185	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.354132330523889	ENSG00000029639:ENST00000367166:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000468889:exon_155606292_155606411:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000495806:exon_155606292_155606333:TFB1M;ENSG00000029639:ENST00000489874:exon_155606292_155606411:TFB1M
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	158517308	A/G	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000078269:ENST00000355585:exon_158516650_158520208:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367122:exon_158516650_158519568:SYNJ2;ENSG00000078269:ENST00000367112:exon_158516650_158518886:SYNJ2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	159184507	C/T	1	18	26	44	8.59473155466257	13.5853877543763	-4.99065619971371	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.173722287644536	ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159184336_159184541:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159184336_159184541:SYTL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	159185563	T/A	1	49	48	97	23.396769232137	25.0807158542331	-1.68394662209613	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.76102632047976	ENSG00000164674:ENST00000360448:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000297239:exon_159185527_159185901:SYTL3;ENSG00000164674:ENST00000367081:exon_159185527_159185754:SYTL3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	160199687	T/C	1	49	50	99	23.396769232137	26.1257456814929	-2.72897644935584	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.615613515165401	ENSG00000120438:ENST00000321394:exon_160199530_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000392168:exon_160199531_160200293:TCP1;ENSG00000120438:ENST00000420894:exon_160199531_160200293:TCP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	160517481	C/T	1	14	25	39	6.684791209182	13.0628728407464	-6.37808163156442	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0532031333459127	ENSG00000197081:ENST00000356956:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000407414:exon_160517471_160517657:IGF2R;ENSG00000197081:ENST00000475584:exon_160517479_160517657:IGF2R
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	166572005	T/C	1	24	39	63	11.4596420728834	20.3780816315644	-8.91843955868099	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0312532804034593	ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166570795_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166571086_166572076:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166571086_166572076:T
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	166579270	C/T	1	77	43	120	36.766351650501	22.4681412860839	14.2982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0102472604451099	ENSG00000164458:ENST00000366876:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000296946:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000366871:exon_166579194_166579328:T;ENSG00000164458:ENST00000461348:exon_166579194_166579328:T
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	168311805	G/A	1	6	8	14	2.86491051822086	4.18011930903886	-1.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.595738343773533	ENSG00000130396:ENST00000344191:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000351017:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392108:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000392112:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366806:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000341575:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366809:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000400822:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000447894:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000366805:exon_168311781_168311842:MLLT4;ENSG00000130396:ENST00000423229:exon_168311781_168311842:MLLT4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	170639604	G/C	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000112584:ENST00000366751:exon_170639537_170639638:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170639537_170639638:FAM120B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	6	170713682	A/T	1	88	43	131	42.0186876005726	22.4681412860839	19.5505463144887	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.000610619921866382	ENSG00000112584:ENST00000476287:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000467012:exon_170713638_170713689:FAM120B;ENSG00000112584:ENST00000496635:exon_170713267_170713689:FAM120B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	751025	T/C	1	21	17	38	10.027186813773	8.88275353170757	1.14443328206543	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.747660149924728	ENSG00000188191:ENST00000406797:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000403562:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000360274:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000340920:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000430040:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000417852:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000488474:exon_750966_751164:PRKAR1B;ENSG00000188191:ENST00000456696:exon_750967_751164:PRKAR1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	796430	C/T	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_796419_796631:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_796419_796631:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_796419_796631:HEATR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	801507	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_801390_801533:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_801390_801533:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_801390_801533:HEATR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	810219	T/C	1	15	10	25	7.16227629555214	5.22514913629857	1.93712715925357	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.549237439393986	ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_810108_810255:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000491496:exon_810108_812612:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_810108_810255:HEATR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	814788	G/A	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000164818:ENST00000297440:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000313147:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000440747:exon_814643_814799:HEATR2;ENSG00000164818:ENST00000403952:exon_814643_814799:HEATR2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	925717	G/A	1	28	20	48	13.369582418364	10.4502982725971	2.91928414576686	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.470603457629073	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_925693_925771:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_925693_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_923180_925771:GET4;ENSG00000239857:ENST00000441491:exon_925693_925771:GET4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	930611	C/T	1	21	11	32	10.027186813773	5.74766404992843	4.27952276384458	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.157165565810456	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_930565_930703:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000412734:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_930565_930703:GET4;ENSG00000239857:ENST00000426056:exon_930565_930691:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_930565_930703:GET4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	931960	G/A	1	34	40	74	16.2344929365849	20.9005965451943	-4.66610360860942	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.296247564540499	ENSG00000164828:ENST00000457861:exon_931915_932055:SUN1;ENSG00000239857:ENST00000265857:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000407192:exon_931915_932055:GET4;ENSG00000239857:ENST00000483469:exon_931915_932111:GET4;ENSG00000239857:ENST00000464468:exon_931937_932055:GET4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	938555	T/C	1	55	31	86	26.2616797503579	16.1979623225256	10.0637174278323	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0309668674201368	ENSG00000105963:ENST00000449296:exon_937538_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000265846:exon_937540_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000446141:exon_937546_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000478000:exon_937547_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000495809:exon_937582_938586:ADAP1;ENSG00000105963:ENST00000453175:exon_938554_938586:ADAP1;ENSG00000240230:ENST00000457254:exon_938415_938586:COX19
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	1097952	C/T	1	2	9	11	0.954970172740286	4.70263422266871	-3.74766404992843	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0319683877489123	ENSG00000164849:ENST00000444847:exon_1097128_1098097:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000397095:exon_1097128_1098894:GPR146;ENSG00000164849:ENST00000297468:exon_1097141_1098897:GPR146
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	1131412	A/G	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000413368:exon_1131043_1131585:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER;ENSG00000164850:ENST00000354575:exon_1131365_1132285:GPER
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	1132456	C/T	1	11	3	14	5.25233595007157	1.56754474088957	3.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0608487855072873	ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	1132505	G/A	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000164850:ENST00000401670:exon_1131043_1132517:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397092:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000297469:exon_1131043_1133451:GPER;ENSG00000164850:ENST00000397088:exon_1131043_1133446:GPER
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	1195215	A/C	1	21	11	32	10.027186813773	5.74766404992843	4.27952276384458	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.157165565810456	ENSG00000178381:ENST00000401903:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000316495:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000397083:exon_1195089_1195220:ZFAND2A;ENSG00000178381:ENST00000471448:exon_1195089_1195313:ZFAND2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	1538117	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000164880:ENST00000404767:exon_1538048_1538189:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000389470:exon_1538048_1538189:INTS1;ENSG00000164880:ENST00000406111:exon_1538048_1538189:INTS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2279319	G/A	1	21	6	27	10.027186813773	3.13508948177914	6.89209733199386	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0108495881409158	ENSG00000122687:ENST00000467199:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000242257:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000486040:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000332565:exon_2279053_2279342:FTSJ2;ENSG00000122687:ENST00000440306:exon_2279053_2279342:FTSJ2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2317738	G/A	1	76	79	155	36.2888665641309	41.2786781767587	-4.98981161262784	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.422915945327263	ENSG00000106266:ENST00000222990:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435060:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000457286:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000435336:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000494722:exon_2317735_2317940:SNX8;ENSG00000106266:ENST00000447136:exon_2317735_2317940:SNX8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2577781	T/C	1	136	82	218	64.9379717463394	42.8462229176483	22.0917488286912	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.00280293761273893	ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2578237	T/C	1	27	10	37	12.8920973319939	5.22514913629857	7.66694819569529	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0129562274878654	ENSG00000106009:ENST00000340611:exon_2577511_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000469750:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000467558:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000493232:exon_2577515_2578398:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000412960:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000382467:exon_2577515_2578985:C7orf27;ENSG00000106009:ENST00000473879:exon_2578046_2578398:C7orf27
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2649704	T/G	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000438376:exon_2649678_2649796:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325979:exon_2649678_2649796:IQCE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2649819	C/T	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000106012:ENST00000402050:exon_2649678_2654368:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000404984:exon_2649678_2654367:IQCE;ENSG00000106012:ENST00000325997:exon_2649678_2649912:IQCE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2770983	G/A	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000146535:ENST00000275364:exon_2767746_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407904:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000491117:exon_2768195_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000407653:exon_2768200_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000496740:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000396960:exon_2769458_2771384:GNA12;ENSG00000146535:ENST00000471281:exon_2770657_2771384:GNA12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2957005	T/C	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.346006528950237	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2956924_2957019:CARD11;ENSG00000198286:ENST00000480332:exon_2956924_2957019:CARD11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	2985586	C/G	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000198286:ENST00000396946:exon_2985453_2985590:CARD11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	4798757	G/A	1	18	2	20	8.59473155466257	1.04502982725971	7.54970172740286	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.000504520743873523	ENSG00000164916:ENST00000446823:exon_4798682_4798848:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000328914:exon_4798682_4798848:FOXK1;ENSG00000164916:ENST00000496023:exon_4797640_4798848:FOXK1;ENSG00000242802:ENST00000450194:exon_4798682_4798848:KIAA0415
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5267774	C/T	1	64	50	114	30.5590455276892	26.1257456814929	4.4332998461963	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.453440029130649	ENSG00000157954:ENST00000288828:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000401525:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000404704:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000466014:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000382384:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000484262:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000315176:exon_5267735_5267842:WIPI2;ENSG00000157954:ENST00000471851:exon_5267735_5267842:WIPI2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5347721	G/A	1	23	21	44	10.9821569865133	10.972813186227	0.00934380028629178	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5346426_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5346431_5347943:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5346431_5347943:TNRC18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5353252	G/C	1	13	3	16	6.20730612281186	1.56754474088957	4.63976138192229	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0233109282447019	ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5352134_5353490:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5352134_5353494:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000328270:exon_5352742_5353494:TNRC18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5410187	C/T	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000182095:ENST00000399537:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000430969:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000399544:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000327499:exon_5410020_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000288841:exon_5410006_5410995:TNRC18;ENSG00000182095:ENST00000415160:exon_5410006_5410995:TNRC18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5541039	C/T	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000155034:ENST00000415009:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000382368:exon_5540119_5541662:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000458142:exon_5540119_5541550:FBXL18;ENSG00000155034:ENST00000312577:exon_5540119_5541662:FBXL18
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5567484	G/A	1	3685	3458	7143	1759.53254327398	1806.85657133205	-47.3240280580687	A:T:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.265564079838409	ENSG00000075624:ENST00000331789:exon_5566782_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000464611:exon_5567364_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000425660:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000445914:exon_5566787_5567522:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000493945:exon_5567372_5567522:ACTB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5568762	G/C	1	26	23	49	12.4146122456237	12.0178430134867	0.396769232137006	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000480301:exon_5568698_5569294:ACTB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5568776	G/A	1	22	16	38	10.5046719001431	8.36023861807771	2.14443328206543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51961273920649	ENSG00000075624:ENST00000462494:exon_5567912_5569031:ACTB;ENSG00000075624:ENST00000480301:exon_5568698_5569294:ACTB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5569327	G/A	1	13	11	24	6.20730612281186	5.74766404992843	0.459642072883431	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000075624:ENST00000484841:exon_5569166_5569364:ACTB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	5792601	T/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000011275:ENST00000425013:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000447067:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000435728:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389902:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000389900:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000458425:exon_5792477_5792610:RNF216;ENSG00000011275:ENST00000411812:exon_5792477_5792610:RNF216
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	6035238	G/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000122512:ENST00000265849:exon_6035165_6035264:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000382322:exon_6035165_6035264:PMS2;ENSG00000122512:ENST00000406569:exon_6035165_6035264:PMS2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	6189780	T/C	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000106346:ENST00000306177:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000404835:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000479544:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000521713:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000425305:exon_6189214_6189933:USP42;ENSG00000106346:ENST00000426246:exon_6189214_6189933:USP42
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	6230064	T/G	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.273197512046999	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	6370305	C/G	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	C:G	C	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	6370406	C/T	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000178397:ENST00000313324:exon_6369040_6370866:C7orf70
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	17833643	G/A	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000071189:ENST00000417048:exon_17830385_17833916:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409389:exon_17832466_17836562:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000428135:exon_17832610_17833916:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000242044:exon_17832610_17833916:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000409076:exon_17833044_17833916:SNX13;ENSG00000071189:ENST00000496855:exon_17833388_17833916:SNX13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	26233280	T/G	1	250	274	524	119.371271592536	143.169086334581	-23.7978147420451	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0397827135389088	ENSG00000122566:ENST00000354667:exon_26233195_26233314:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000360787:exon_26233195_26233314:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000463181:exon_26233195_26233314:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000356674:exon_26233195_26233314:HNRNPA2B1;ENSG00000122566:ENST00000490912:exon_26233195_26233314:HNRNPA2B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	28843830	A/G	1	5	4	9	2.38742543185071	2.09005965451943	0.297365777331287	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000146592:ENST00000396299:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000357727:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000358569:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000432860:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000396300:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000409603:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000426500:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000396298:exon_28843816_28844139:CREB5;ENSG00000146592:ENST00000431246:exon_28843816_28844139:CREB5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	30536681	A/G	1	126	153	279	60.163120882638	79.9447817853681	-19.7816609027301	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0193128527524807	ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30536237_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30536237_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000497601:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000433390:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30536239_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30536249_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000426081:exon_30536400_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30536593_30536851:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30536618_30536851:GGCT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	30544360	G/A	1	28	40	68	13.369582418364	20.9005965451943	-7.53101412683028	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0696595882901389	ENSG00000006625:ENST00000275428:exon_30544185_30544460:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000440082:exon_30544185_30544445:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000005374:exon_30544185_30544418:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409144:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000447901:exon_30544185_30544417:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409390:exon_30544185_30544415:GGCT;ENSG00000006625:ENST00000409436:exon_30544185_30544432:GGCT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	37298800	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000155849:ENST00000361912:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000310758:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442573:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000442504:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000474832:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000448602:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455119:exon_37298786_37298955:ELMO1;ENSG00000155849:ENST00000455879:exon_37298786_37298955:ELMO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	39606107	G/A	1	11	2	13	5.25233595007157	1.04502982725971	4.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0241685145321443	ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39605975_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39605984_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39605993_39606146:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39606009_39606146:C7orf36
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	39610177	A/G	1	12	2	14	5.72982103644172	1.04502982725971	4.684791209182	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0141648042661962	ENSG00000241127:ENST00000223273:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000474392:exon_39610105_39610601:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000448268:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000432096:exon_39610105_39610226:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000469737:exon_39610105_39610179:C7orf36;ENSG00000241127:ENST00000485025:exon_39609853_39610226:C7orf36
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	43830888	T/C	1	53	49	102	25.3067095776176	25.603230767863	-0.296521190245414	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000106605:ENST00000265523:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000402924:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000424330:exon_43830848_43830967:BLVRA;ENSG00000106605:ENST00000453612:exon_43830848_43831446:BLVRA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	43916413	G/A	1	19	20	39	9.07221664103272	10.4502982725971	-1.37808163156443	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.749130394966468	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	43916727	T/G	1	11	12	23	5.25233595007157	6.27017896355828	-1.01784301348671	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.682759012416601	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	43917013	G/A	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	43917256	C/A	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000106608:ENST00000497914:exon_43915493_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000223341:exon_43915505_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000443736:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000402306:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000336086:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000447717:exon_43915512_43918859:URGCP;ENSG00000106608:ENST00000453200:exon_43915514_43918859:URGCP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	44530193	T/G	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000015676:ENST00000355451:exon_44530008_44530479:NUDCD3;ENSG00000015676:ENST00000464812:exon_44530008_44530205:NUDCD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	44612229	G/A	1	51	28	79	24.3517394048773	14.630417581636	9.7213218232413	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0320206203475524	ENSG00000136271:ENST00000258772:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000446987:exon_44612162_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000421223:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000485367:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000467318:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000433257:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000431640:exon_44612173_44612343:DDX56;ENSG00000136271:ENST00000415758:exon_44612173_44612343:DDX56
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	44747499	G/A	1	54	71	125	25.7841946639877	37.0985588677199	-11.3143642037321	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0485651563365545	ENSG00000105953:ENST00000439616:exon_44747478_44747829:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000449767:exon_44747478_44747927:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000447398:exon_44747478_44747877:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000444676:exon_44747478_44747737:OGDH;ENSG00000105953:ENST00000222673:exon_44747478_44748665:OGDH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	44804062	G/C	1	22	7	29	10.5046719001431	3.657604395409	6.84706750473415	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0143019543683112	ENSG00000122515:ENST00000413916:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000439149:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000309315:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000441627:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000433667:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000265346:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000414051:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000478045:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000463056:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000480964:exon_44804018_44804085:ZMIZ2;ENSG00000122515:ENST00000492558:exon_44804018_44804085:ZMIZ2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	44840864	G/A	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	45009325	G/A	1	171	116	287	81.6499497692945	60.6117299810634	21.038219788231	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0130607119070128	ENSG00000136286:ENST00000483585:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000495831:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000463516:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000488554:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000258787:exon_45009304_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000480503:exon_45008122_45009474:MYO1G;ENSG00000136286:ENST00000464434:exon_45009304_45009474:MYO1G
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	45115670	G/T	1	122	89	211	58.2531805371574	46.5038273130573	11.7493532241002	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.112972881297711	ENSG00000136280:ENST00000461377:exon_45115376_45115951:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000258781:exon_45115376_45116066:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000488727:exon_45115376_45116013:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000475551:exon_45115376_45116050:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000381112:exon_45115376_45116068:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000474617:exon_45115376_45116030:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000481194:exon_45115376_45116052:CCM2;ENSG00000136280:ENST00000477605:exon_45115376_45116036:CCM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	45140914	C/T	1	53	38	91	25.3067095776176	19.8555667179346	5.45114285968301	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.294017054450830	ENSG00000136270:ENST00000258770:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000361278:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000395655:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000495973:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000494076:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000404564:exon_45140857_45140971:TBRG4;ENSG00000136270:ENST00000463540:exon_45140857_45140971:TBRG4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	55840888	A/C	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.317919468505289	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	65447182	C/T	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000169919:ENST00000304895:exon_65446961_65447301:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000345660:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000447929:exon_65446961_65447183:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000430730:exon_65446961_65447202:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000421103:exon_65446961_65447198:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000446111:exon_65446961_65447200:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000452642:exon_65446983_65447193:GUSB;ENSG00000169919:ENST00000429291:exon_65446983_65447228:GUSB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	65546829	G/A	1	14	12	26	6.684791209182	6.27017896355828	0.414612245623718	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000487982:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000496336:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000380839:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65546790_65546984:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65546790_65546984:ASL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	65551782	G/A	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000126522:ENST00000304874:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000487982:exon_65551731_65552147:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395332:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000362000:exon_65551731_65551808:ASL;ENSG00000126522:ENST00000395331:exon_65551731_65551808:ASL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	66459256	T/C	1	12	5	17	5.72982103644172	2.61257456814929	3.11724646829243	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.150343882101473	ENSG00000126524:ENST00000246868:exon_66459199_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000414306:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000454667:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000490953:exon_66459207_66459328:SBDS;ENSG00000126524:ENST00000463579:exon_66459207_66459353:SBDS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	66548448	C/T	1	9	3	12	4.29736577733129	1.56754474088957	2.72982103644172	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.150892005879831	ENSG00000198874:ENST00000359626:exon_66548417_66548526:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000361660:exon_66548417_66548526:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000389196:exon_66548417_66548526:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000427620:exon_66548417_66548504:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000445198:exon_66548417_66548526:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000495971:exon_66548417_66548526:TYW1;ENSG00000198874:ENST00000468566:exon_66548417_66548526:TYW1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	72891754	C/T	1	40	25	65	19.0994034548057	13.0628728407464	6.03653061405929	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.138301227457745	ENSG00000009954:ENST00000339594:exon_72891198_72892899:BAZ1B;ENSG00000009954:ENST00000404251:exon_72891198_72892899:BAZ1B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	73097555	C/T	1	46	42	88	21.9643139730266	21.945626372454	0.0186876005725836	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000176410:ENST00000395176:exon_73096601_73097783:DNAJC30;ENSG00000071462:ENST00000464615:exon_73097355_73097713:WBSCR22
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	73151643	C/T	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	73151644	A/G	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000106077:ENST00000497897:exon_73151551_73152065:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437775:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000357419:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000222800:exon_73151551_73151721:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000437891:exon_73151551_73151690:ABHD11;ENSG00000106077:ENST00000462381:exon_73151551_73151832:ABHD11
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	73634371	T/G	1	9	14	23	4.29736577733129	7.315208790818	-3.01784301348671	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.218350140624609	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	73634887	A/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000086730:ENST00000490586:exon_73634788_73634949:LAT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	73654360	T/G	1	62	68	130	29.6040753549489	35.5310141268303	-5.92693877188141	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.334218254472384	ENSG00000049541:ENST00000352131:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000055077:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000493156:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000497430:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000470266:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000494019:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000480432:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000479105:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000491206:exon_73654268_73654425:RFC2;ENSG00000049541:ENST00000463194:exon_73654268_73654425:RFC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	75517337	C/T	1	28	45	73	13.369582418364	23.5131711133436	-10.1435886949796	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0189626285645665	ENSG00000005486:ENST00000006777:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000318622:exon_75517310_75518244:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000454791:exon_75517310_75518202:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000413229:exon_75517310_75518223:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000468304:exon_75517310_75517901:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000428119:exon_75517310_75518239:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000467406:exon_75517310_75517586:RHBDD2;ENSG00000005486:ENST00000470957:exon_75517310_75517475:RHBDD2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	75583325	A/G	1	14	8	22	6.684791209182	4.18011930903886	2.50467190014315	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.393881936525059	ENSG00000127948:ENST00000453773:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000439963:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000461988:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000419840:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000448410:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000421059:exon_75583307_75583427:POR;ENSG00000127948:ENST00000471238:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412521:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000414186:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000432753:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000449920:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000418341:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000412064:exon_75583307_75583498:POR;ENSG00000127948:ENST00000454934:exon_75583307_75583498:POR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	75615562	G/A	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000127948:ENST00000394893:exon_75615477_75616173:POR
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	75616577	G/A	1	65	57	122	31.0365306140593	29.7833500769019	1.25318053715744	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.856429720265208	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	75623893	G/A	1	7	11	18	3.342395604591	5.74766404992843	-2.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.346006528950237	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	75694155	C/T	1	167	158	325	79.7400094238139	82.5573563535174	-2.81734692970353	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.781379170575072	ENSG00000146701:ENST00000315758:exon_75694120_75694271:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000443006:exon_75694120_75694271:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000432020:exon_75694120_75694271:MDH2;ENSG00000146701:ENST00000424167:exon_75694120_75694491:MDH2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	76111835	G/A	1	17	21	38	8.11724646829243	10.972813186227	-2.85556671793457	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.417598108706776	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000423646:exon_76111825_76111976:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76111825_76112464:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000429179:exon_76111825_76111880:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000472426:exon_76111825_76111932:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76111825_76112464:DTX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	76131695	A/G	1	22	26	48	10.5046719001431	13.5853877543763	-3.08071585423314	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.389394690774042	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000434948:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000467729:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000435251:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76131615_76131773:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76131206_76131773:DTX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	76134758	C/T	1	65	18	83	31.0365306140593	9.40526844533743	21.6312621687219	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1.35482577448347e-06	ENSG00000091073:ENST00000307569:exon_76134691_76135311:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000324432:exon_76134691_76135308:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446600:exon_76134691_76135305:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000413936:exon_76134691_76135311:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000430490:exon_76134691_76135308:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000446820:exon_76134691_76134960:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000479915:exon_76134691_76135312:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000468546:exon_76134691_76135308:DTX2;ENSG00000091073:ENST00000465488:exon_76134691_76135155:DTX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	76941168	G/A	1	10	8	18	4.77485086370143	4.18011930903886	0.594731554662573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.817886779949097	ENSG00000186088:ENST00000491796:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000449779:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000257626:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000455630:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000482866:exon_76940069_76941519:PION;ENSG00000186088:ENST00000441833:exon_76941158_76941257:PION;ENSG00000186088:ENST00000474686:exon_76941158_76941257:PION
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	77256713	A/G	1	17	22	39	8.11724646829243	11.4953280998569	-3.37808163156442	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.336558687628760	ENSG00000127947:ENST00000248594:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000415482:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000435495:exon_77256022_77256992:PTPN12;ENSG00000127947:ENST00000407343:exon_77256473_77256992:PTPN12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	77325886	C/A	1	28	29	57	13.369582418364	15.1529324952659	-1.78335007690185	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.691560600888558	ENSG00000187257:ENST00000334955:exon_77325760_77326372:RSBN1L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	89982132	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000105793:ENST00000426366:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000421719:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000450619:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000453512:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000493392:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000257659:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000222511:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000417207:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000477972:exon_89982130_89982546:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000380058:exon_89982130_89982323:GTPBP10;ENSG00000105793:ENST00000439832:exon_89982130_89982323:GTPBP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	91503417	C/T	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000127989:ENST00000419292:exon_91500243_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000351870:exon_91502205_91504078:MTERF;ENSG00000127989:ENST00000406735:exon_91502636_91504078:MTERF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	91743072	A/G	1	19	15	34	9.07221664103272	7.83772370444786	1.23449293658486	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.73314906239147	ENSG00000001630:ENST00000003100:exon_91741465_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000450723:exon_91742726_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000422867:exon_91742899_91743157:CYP51A1;ENSG00000001630:ENST00000482924:exon_91743008_91743157:CYP51A1;ENSG00000240720:ENST00000422722:exon_91741473_91743157:AC000120.8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	91842554	T/C	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000001631:ENST00000312763:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394507:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000340022:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000486261:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000475770:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394505:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000412043:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000394503:exon_91842509_91842715:KRIT1;ENSG00000001631:ENST00000415227:exon_91842509_91842715:KRIT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	92462572	G/A	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105810:ENST00000265734:exon_92462405_92463004:CDK6;ENSG00000105810:ENST00000424848:exon_92462405_92463004:CDK6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	92760502	G/A	1	28	37	65	13.369582418364	19.3330518043047	-5.96346938594071	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.171546425238107	ENSG00000177409:ENST00000318238:exon_92759368_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000411955:exon_92760076_92765304:SAMD9L;ENSG00000177409:ENST00000437805:exon_92760346_92765304:SAMD9L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	95034775	G/C	1	32	19	51	15.2795227638446	9.92778335896728	5.35173940487729	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.160748435750529	ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95034179_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95034185_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95034192_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95034209_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000483292:exon_95034590_95034800:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95034651_95034800:PON2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	95041016	G/C	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105854:ENST00000455123:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000355659:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000433091:exon_95040965_95041055:PON2;ENSG00000105854:ENST00000222572:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000446142:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000469926:exon_95040965_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000491069:exon_95040963_95041091:PON2;ENSG00000105854:ENST00000490778:exon_95040994_95041091:PON2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	97599515	T/C	1	2	6	8	0.954970172740286	3.13508948177914	-2.18011930903886	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.163129620801833	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	98609056	C/G	1	29	30	59	13.8470675047341	15.6754474088957	-1.82837990416156	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.696395159227841	ENSG00000196367:ENST00000359863:exon_98608964_98609158:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000355540:exon_98608964_98609158:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000446306:exon_98608964_98609158:TRRAP;ENSG00000196367:ENST00000456197:exon_98608964_98609158:TRRAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	98645517	G/A	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000198742:ENST00000468960:exon_98645278_98645710:SMURF1;ENSG00000198742:ENST00000482799:exon_98645278_98645863:SMURF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	98985636	C/T	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99017737	G/A	1	16	14	30	7.63976138192229	7.315208790818	0.32455259110429	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99014362_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99016757_99017772:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99017372_99017772:RP5-900K19.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99032517	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000106246:ENST00000292478:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000422429:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000438524:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000485746:exon_99032413_99032642:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430982:exon_99032413_99032891:PTCD1;ENSG00000106246:ENST00000430029:exon_99032433_99032891:PTCD1;ENSG00000248919:ENST00000413834:exon_99032413_99032891:RP5-900K19.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99047978	T/C	1	9	14	23	4.29736577733129	7.315208790818	-3.01784301348671	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.218350140624609	ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000430038:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000412686:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000484112:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99047899_99047994:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99047948_99047994:CPSF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99050039	G/A	1	17	17	34	8.11724646829243	8.88275353170757	-0.765507063415139	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.864375732734557	ENSG00000106246:ENST00000482251:exon_99049991_99050232:PTCD1;ENSG00000160917:ENST00000436336:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441811:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000451876:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000292476:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000441580:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000452047:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000471455:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000440514:exon_99049991_99050063:CPSF4;ENSG00000160917:ENST00000465132:exon_99049991_99050887:CPSF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99055940	T/C	1	536	280	816	255.932006294397	146.30417581636	109.627830478037	T:C:G	T	C	10	0.522514913629857	8.98138029099235e-15	ENSG00000241468:ENST00000414062:exon_99055821_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000449683:exon_99055813_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000491560:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000359832:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000292475:exon_99055818_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000488775:exon_99055820_99055978:ATP5J2;ENSG00000241468:ENST00000394186:exon_99055932_99055978:ATP5J2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99693078	G/A	1	216	204	420	103.136778655951	106.593042380491	-3.45626372453995	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.769511636785825	ENSG00000166508:ENST00000489841:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000485286:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000303887:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000362082:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000491245:exon_99693010_99693093:MCM7;ENSG00000166508:ENST00000493352:exon_99693010_99693287:MCM7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99704796	A/T	1	52	20	72	24.8292244912474	10.4502982725971	14.3789262186503	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.000828615409346924	ENSG00000221838:ENST00000433787:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000429084:exon_99704281_99704800:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000359593:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000221838:ENST00000455152:exon_99704281_99704802:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99704827	A/G	1	65	32	97	31.0365306140593	16.7204772361554	14.3160533779039	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00420299458662606	ENSG00000221838:ENST00000416938:exon_99704281_99706662:AP4M1;ENSG00000106290:ENST00000421980:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000453269:exon_99704693_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000472509:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000452041:exon_99704701_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000344095:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000418432:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000417771:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000420001:exon_99704702_99705246:TAF6;ENSG00000106290:ENST00000437822:exon_99704791_99705246:TAF6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99747130	G/A	1	191	132	323	91.1996514966973	68.9719685991411	22.2276828975562	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0141689224130277	ENSG00000188186:ENST00000341942:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000460732:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000474831:exon_99747122_99747188:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000494136:exon_99747122_99747510:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000441173:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000468582:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000488241:exon_99747122_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000473459:exon_99746980_99747202:C7orf59;ENSG00000188186:ENST00000466498:exon_99746982_99747202:C7orf59
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	99757612	G/A	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000197093:ENST00000426974:exon_99756866_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000413800:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000495882:exon_99756867_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000360039:exon_99756868_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000423751:exon_99757269_99758582:GAL3ST4;ENSG00000197093:ENST00000411994:exon_99757439_99758582:GAL3ST4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100028484	T/C	1	16	15	31	7.63976138192229	7.83772370444786	-0.197962322525568	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000146834:ENST00000414441:exon_100028238_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000425355:exon_100027901_100029312:MEPCE;ENSG00000146834:ENST00000310512:exon_100027254_100029312:MEPCE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100033148	A/G	1	105	90	195	50.135934068865	47.0263422266871	3.10959184217788	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.667770458521733	ENSG00000160813:ENST00000470295:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000487452:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000292330:exon_100032905_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000476185:exon_100032906_100033156:C7orf47;ENSG00000160813:ENST00000491407:exon_100032982_100033156:C7orf47
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100064719	A/G	1	101	101	202	48.2259937233844	52.7740062766156	-4.54801255323112	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.527025516809529	ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100064142_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000423266:exon_100064146_100064791:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100064161_100064791:TSC22D4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100072031	T/C	1	68	85	153	32.4689858731697	44.4137676585379	-11.9447817853681	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0623541980051723	ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100071897_100072063:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100071411_100072063:TSC22D4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100074969	T/C	1	36	46	82	17.1894631093251	24.0356860269734	-6.84622291764828	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.15046992189557	ENSG00000166925:ENST00000496728:exon_100074900_100075125:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000300181:exon_100074900_100075930:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000393991:exon_100074900_100075082:TSC22D4;ENSG00000166925:ENST00000493217:exon_100074900_100075930:TSC22D4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100160264	T/C	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000106351:ENST00000430857:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000300176:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000262935:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000474713:exon_100160217_100160305:AGFG2;ENSG00000106351:ENST00000429987:exon_100160217_100160305:AGFG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100468284	A/G	1	33	34	67	15.7570078502147	17.7655070634151	-2.00849921320042	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.627318928912245	ENSG00000087077:ENST00000200457:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000495763:exon_100468196_100469343:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000417475:exon_100468196_100468297:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000476870:exon_100467992_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000418466:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000463125:exon_100468196_100468365:TRIP6;ENSG00000087077:ENST00000429658:exon_100468196_100468365:TRIP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100486088	C/T	1	20	18	38	9.54970172740286	9.40526844533743	0.144433282065432	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100486110	C/T	1	180	204	384	85.9473155466257	106.593042380491	-20.6457268338651	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0362164216838802	ENSG00000087087:ENST00000457580:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000388793:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000432932:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000347433:exon_100486095_100486285:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000448764:exon_100486095_100486277:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000342198:exon_100486095_100486120:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000445337:exon_100486095_100486281:SRRT;ENSG00000087087:ENST00000477529:exon_100486095_100486285:SRRT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100490077	G/A	1	16	9	25	7.63976138192229	4.70263422266871	2.93712715925357	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.317123875739726	ENSG00000087085:ENST00000241069:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000419336:exon_100489955_100490175:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000428317:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000302913:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000447483:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000412389:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000357451:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000442452:exon_100489955_100490264:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000411582:exon_100489955_100490439:ACHE;ENSG00000087085:ENST00000422451:exon_100489955_100490439:ACHE
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	100731896	T/C	1	7	8	15	3.342395604591	4.18011930903886	-0.837723704447855	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.797671642204223	ENSG00000169871:ENST00000306085:exon_100730593_100733909:TRIM56
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	102087202	T/C	1	12	16	28	5.72982103644172	8.36023861807771	-2.630417581636	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.348683057297521	ENSG00000160991:ENST00000495936:exon_102086960_102087422:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000488996:exon_102086960_102087495:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000356387:exon_102086960_102097268:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000478730:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000468241:exon_102086960_102087371:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000403646:exon_102086960_102089163:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000473939:exon_102086960_102089179:ORAI2;ENSG00000160991:ENST00000458233:exon_102086960_102087661:ORAI2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	102106306	A/G	1	23	11	34	10.9821569865133	5.74766404992843	5.23449293658486	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0858395683032324	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000463739:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000464107:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102106264_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000476270:exon_102105979_102106498:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000485808:exon_102106264_102106498:LRWD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	102112705	G/T	1	13	22	35	6.20730612281186	11.4953280998569	-5.288021977045	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0900234042775497	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102112665_102112756:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102112665_102112756:LRWD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	102113191	C/T	1	51	33	84	24.3517394048773	17.2429921497853	7.10874725509201	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.127165117846303	ENSG00000161036:ENST00000292616:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000473880:exon_102110189_102113613:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000488689:exon_102113139_102113251:LRWD1;ENSG00000161036:ENST00000468175:exon_102113139_102113251:LRWD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	102114087	C/T	1	45	49	94	21.4868288866564	25.603230767863	-4.11640188120656	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.410285225403291	ENSG00000005075:ENST00000292614:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000306744:exon_102113565_102114131:POLR2J;ENSG00000005075:ENST00000393794:exon_102113910_102114131:POLR2J
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	102944359	A/T	1	80	86	166	38.1988069096114	44.9362825721677	-6.73747566255627	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.312837942981238	ENSG00000105819:ENST00000249269:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000428154:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000420236:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000443722:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000444457:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000498530:exon_102944289_102944487:PMPCB;ENSG00000105819:ENST00000453466:exon_102944289_102944487:PMPCB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	103767337	C/T	1	27	15	42	12.8920973319939	7.83772370444786	5.054373627546	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.125058538842446	ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103766788_103767340:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103766790_103767340:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000477223:exon_103767285_103767340:ORC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	103828705	T/C	1	5	11	16	2.38742543185071	5.74766404992843	-3.36023861807771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.131589504447199	ENSG00000164815:ENST00000297431:exon_103828699_103828829:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000422497:exon_103828699_103828829:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000447452:exon_103828699_103828829:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000463152:exon_103828699_103828829:ORC5;ENSG00000164815:ENST00000485726:exon_103828699_103828829:ORC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	104752700	T/C	1	30	23	53	14.3245525911043	12.0178430134867	2.30670957761758	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.583389035978202	ENSG00000005483:ENST00000311117:exon_104752272_104754532:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334884:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000393656:exon_104752272_104752725:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000351043:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334877:exon_104752272_104754808:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000257745:exon_104752272_104754531:MLL5;ENSG00000005483:ENST00000334914:exon_104752272_104752797:MLL5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	106826381	C/T	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000105856:ENST00000468410:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000222574:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000485846:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000463202:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000417005:exon_106826246_106826387:HBP1;ENSG00000105856:ENST00000498408:exon_106826246_106826387:HBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	107217020	G/A	1	13	13	26	6.20730612281186	6.79269387718814	-0.585387754376283	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.84661845180362	ENSG00000105865:ENST00000422290:exon_107216854_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000265720:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000431839:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000406564:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000402620:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000443233:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000436411:exon_107216811_107217037:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000471763:exon_107216811_107217636:DUS4L;ENSG00000105865:ENST00000485825:exon_107216811_107217037:DUS4L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	107258907	T/C	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000075790:ENST00000005259:exon_107258773_107262315:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000465919:exon_107258773_107259060:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000494086:exon_107258773_107259080:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000445771:exon_107258773_107259109:BCAP29;ENSG00000075790:ENST00000379117:exon_107258773_107259891:BCAP29
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	107542820	T/C	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000451081:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000453354:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000450038:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000460577:exon_107542770_107542838:DLD;ENSG00000091140:ENST00000494441:exon_107542770_107542838:DLD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	107546804	T/C	1	26	21	47	12.4146122456237	10.972813186227	1.44179905939672	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.770698178098865	ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107546712_107546813:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107546712_107546813:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107546712_107546813:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107546712_107546813:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107546712_107546813:DLD;ENSG00000091140:ENST00000451081:exon_107546716_107546813:DLD;ENSG00000091140:ENST00000489184:exon_107546712_107546814:DLD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	107556043	A/G	1	23	30	53	10.9821569865133	15.6754474088957	-4.69329042238242	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.217039607731599	ENSG00000091140:ENST00000205402:exon_107555951_107556141:DLD;ENSG00000091140:ENST00000415325:exon_107555951_107556141:DLD;ENSG00000091140:ENST00000417551:exon_107555951_107556141:DLD;ENSG00000091140:ENST00000440410:exon_107555951_107556141:DLD;ENSG00000091140:ENST00000437604:exon_107555951_107556141:DLD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	108112834	G/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000135241:ENST00000426128:exon_108110866_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000257694:exon_108111999_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000388728:exon_108112069_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000422087:exon_108112071_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000453144:exon_108112071_108113119:PNPLA8;ENSG00000135241:ENST00000436062:exon_108112105_108113119:PNPLA8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	112102355	T/G	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112102325_112102433:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112102325_112102433:IFRD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	112112279	G/A	1	23	25	48	10.9821569865133	13.0628728407464	-2.08071585423314	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.566330326155632	ENSG00000006652:ENST00000005558:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000403825:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000421296:exon_112112274_112112299:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000489994:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000470441:exon_112112274_112112402:IFRD1;ENSG00000006652:ENST00000462155:exon_112112274_112112402:IFRD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	112407236	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000146802:ENST00000312814:exon_112405787_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000454074:exon_112407140_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000447395:exon_112407191_112407799:TMEM168;ENSG00000146802:ENST00000418785:exon_112407230_112407799:TMEM168
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	116528240	C/T	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000198898:ENST00000464223:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000484325:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000361183:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000458284:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426419:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000449080:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000490693:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000426421:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000461878:exon_116528181_116528753:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000417431:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000464669:exon_116528181_116528244:CAPZA2;ENSG00000198898:ENST00000393463:exon_116528181_116528244:CAPZA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	128582267	C/T	1	36	32	68	17.1894631093251	16.7204772361554	0.468985873169721	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	128582309	C/T	1	53	48	101	25.3067095776176	25.0807158542331	0.225993723384441	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000128604:ENST00000489702:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000488569:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000357234:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000477535:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000342930:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000419641:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000430204:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000453794:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000479582:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000464557:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000461416:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000402030:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473787:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000249375:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000467002:exon_128582125_128582313:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000473745:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000412326:exon_128582125_128582330:IRF5;ENSG00000128604:ENST00000465603:exon_128582125_128582330:IRF5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	131128450	T/C	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000128585:ENST00000421797:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000352689:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000388758:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000494785:exon_131128240_131128461:MKLN1;ENSG00000128585:ENST00000458153:exon_131128240_131128461:MKLN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	133580447	G/A	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000469115:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000482089:exon_133580352_133580489:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000460346:exon_133580352_133580488:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000472020:exon_133580352_133580488:EXOC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	133749340	G/A	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000131558:ENST00000253861:exon_133749044_133750512:EXOC4;ENSG00000131558:ENST00000466000:exon_133749044_133749363:EXOC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	134849213	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140;ENSG00000146859:ENST00000456488:exon_134849194_134849481:TMEM140
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	134849577	A/C	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000146859:ENST00000275767:exon_134849170_134850650:TMEM140
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	134871775	C/T	1	17	16	33	8.11724646829243	8.36023861807771	-0.242992149785282	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134871724_134871921:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134871724_134871861:WDR91
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	134879830	G/A	1	12	19	31	5.72982103644172	9.92778335896728	-4.19796232252557	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.151489511791013	ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134879686_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134879814_134879836:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000479698:exon_134879686_134879836:WDR91
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	134889141	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000105875:ENST00000344400:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000354475:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000423565:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000466182:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000326099:exon_134889020_134889185:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000485942:exon_134889020_134889217:WDR91;ENSG00000105875:ENST00000431482:exon_134889020_134889185:WDR91
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	135329690	T/C	1	51	43	94	24.3517394048773	22.4681412860839	1.88359811879344	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.75704395120608	ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135329643_135329726:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135329643_135329766:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135329647_135329766:NUP205
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	135333310	C/T	1	38	44	82	18.1444332820654	22.9906561997137	-4.84622291764828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.320022936585818	ENSG00000155561:ENST00000285968:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000417116:exon_135333308_135333489:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000477620:exon_135333152_135333472:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000461255:exon_135333152_135333505:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000490439:exon_135333152_135333473:NUP205;ENSG00000155561:ENST00000491089:exon_135333152_135333497:NUP205
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	137686374	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000182158:ENST00000330387:exon_137686350_137686803:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000456390:exon_137686350_137686813:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000452463:exon_137686350_137686793:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000417785:exon_137686350_137686788:CREB3L2;ENSG00000182158:ENST00000468127:exon_137686350_137686793:CREB3L2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	138764534	G/A	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000105939:ENST00000242351:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000464606:exon_138763850_138764989:ZC3HAV1;ENSG00000105939:ENST00000471652:exon_138764216_138764989:ZC3HAV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	139026152	T/G	1	45	32	77	21.4868288866564	16.7204772361554	4.76635165050101	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.305318518883665	ENSG00000164898:ENST00000297534:exon_139025878_139026268:C7orf55
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	139661802	G/A	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139661718_139662032:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000469630:exon_139661718_139662850:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000494876:exon_139661718_139662035:TBXAS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	139706959	G/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000059377:ENST00000425687:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000263552:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000336425:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000448866:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000436047:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000416849:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000414508:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000422328:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000458722:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000411653:exon_139706891_139706982:TBXAS1;ENSG00000059377:ENST00000462275:exon_139706891_139706982:TBXAS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	140159721	T/C	1	9	7	16	4.29736577733129	3.657604395409	0.639761381922288	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.806782453205509	ENSG00000133606:ENST00000255977:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475010:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000474576:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000496169:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000443720:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000471104:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000467513:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000494939:exon_140159507_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000498535:exon_140159572_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000473444:exon_140159598_140159736:MKRN1;ENSG00000133606:ENST00000475180:exon_140159641_140159736:MKRN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	142495126	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	142495127	G/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	142498813	G/A	1	599	111	710	286.013566735716	57.9991554129141	228.014411322802	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1.02196318528078e-72	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	143002171	C/T	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000106144:ENST00000310447:exon_143002033_143004789:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000493642:exon_143002033_143002915:CASP2;ENSG00000106144:ENST00000472067:exon_143002033_143003662:CASP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	148496375	C/T	1	42	45	87	20.054373627546	23.5131711133436	-3.45879748579756	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.519868749868394	ENSG00000055130:ENST00000409469:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000325222:exon_148496367_148496480:CUL1;ENSG00000055130:ENST00000433865:exon_148496367_148496480:CUL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	149129893	C/G	1	18	21	39	8.59473155466257	10.972813186227	-2.37808163156442	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.522186913819229	ENSG00000196453:ENST00000247930:exon_149128454_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000314683:exon_149129360_149130023:ZNF777;ENSG00000196453:ENST00000440594:exon_149128867_149130026:ZNF777
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	149576735	C/T	1	21	15	36	10.027186813773	7.83772370444786	2.18946310932515	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.507675377225445	ENSG00000171130:ENST00000421974:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000456496:exon_149576424_149577782:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000425642:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000307445:exon_149576424_149577787:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000429743:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000479613:exon_149576424_149577778:ATP6V0E2;ENSG00000171130:ENST00000471877:exon_149576424_149577783:ATP6V0E2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150034184	T/C	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150034378	A/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000127399:ENST00000323078:exon_150033807_150035192:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000359623:exon_150033807_150035239:LRRC61;ENSG00000127399:ENST00000493307:exon_150033807_150034761:LRRC61
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150066900	A/G	1	1	9	10	0.477485086370143	4.70263422266871	-4.22514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0088742259302462	ENSG00000214022:ENST00000487455:exon_150066760_150067133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000473391:exon_150066760_150067691:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150066831_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000495535:exon_150066760_150067223:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150066765_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000469309:exon_150066760_150067500:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150066760_150066957:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150066733_150066957:REPIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150068371	T/C	1	19	9	28	9.07221664103272	4.70263422266871	4.369582418364	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.129218713095071	ENSG00000214022:ENST00000519397:exon_150068317_150068769:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000482680:exon_150068317_150068892:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000467980:exon_150068320_150068721:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000461637:exon_150068317_150068771:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518514:exon_150068317_150068631:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000522266:exon_150068317_150068481:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000518462:exon_150068317_150068646:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000486714:exon_150068269_150068744:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150068933	T/C	1	32	38	70	15.2795227638446	19.8555667179346	-4.57604395408999	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.283792115149261	ENSG00000214022:ENST00000479668:exon_150068317_150071128:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000397281:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000444957:exon_150068317_150071133:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000466559:exon_150068317_150069188:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000489432:exon_150068317_150070034:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000475514:exon_150068320_150069251:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000488943:exon_150068317_150069331:REPIN1;ENSG00000214022:ENST00000425389:exon_150068253_150071128:REPIN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150094851	A/G	1	21	14	35	10.027186813773	7.315208790818	2.71197802295501	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.400395431261495	ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150094853	G/A	1	14	21	35	6.684791209182	10.972813186227	-4.28802197704499	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.176034815380920	ENSG00000196456:ENST00000329630:exon_150093601_150095719:ZNF775
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150217089	G/A	1	14	6	20	6.684791209182	3.13508948177914	3.54970172740286	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.122656047255994	ENSG00000179144:ENST00000313543:exon_150217022_150218161:GIMAP7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150324825	C/T	1	10	10	20	4.77485086370143	5.22514913629857	-0.450298272597141	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000133561:ENST00000328902:exon_150322463_150325600:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000392862:exon_150322907_150327230:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000493969:exon_150324764_150325376:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000438845:exon_150324807_150325810:GIMAP6;ENSG00000133561:ENST00000435189:exon_150324807_150325376:GIMAP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150389856	A/G	1	24	23	47	11.4596420728834	12.0178430134867	-0.55820094060328	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.884962774804445	ENSG00000106560:ENST00000223293:exon_150389403_150390729:GIMAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150417677	G/A	1	7	25	32	3.342395604591	13.0628728407464	-9.72047723615542	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00059027501699024	ENSG00000213203:ENST00000307194:exon_150417136_150421372:GIMAP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150733025	T/A	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000197150:ENST00000358849:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000482309:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000470645:exon_150732668_150733257:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000297504:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000466514:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000498578:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000360651:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000356058:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477719:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000477092:exon_150732969_150733054:ABCB8;ENSG00000197150:ENST00000491920:exon_150732969_150733054:ABCB8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150761680	C/A	1	6	5	11	2.86491051822086	2.61257456814929	0.252335950071573	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000164889:ENST00000483786:exon_150761613_150761831:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000494125:exon_150761289_150761784:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000490898:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000482950:exon_150761613_150761778:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000463414:exon_150761613_150761847:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150761613_150761854:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150761613_150761854:SLC4A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150771893	C/T	1	13	19	32	6.20730612281186	9.92778335896728	-3.72047723615543	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.216912579895035	ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150771762_150771928:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150771126_150771928:SLC4A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150772384	C/T	1	9	12	21	4.29736577733129	6.27017896355828	-1.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.513322230323649	ENSG00000164889:ENST00000485713:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000413384:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000310317:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000392826:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000461735:exon_150772342_150772595:SLC4A2;ENSG00000164889:ENST00000472204:exon_150772342_150772399:SLC4A2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	150921950	A/G	1	21	19	40	10.027186813773	9.92778335896728	0.099403454805719	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000033050:ENST00000222388:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000287844:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000468073:exon_150921862_150922074:ABCF2;ENSG00000033050:ENST00000441774:exon_150921862_150922074:ABCF2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	154738409	T/C	1	25	25	50	11.9371271592536	13.0628728407464	-1.12574568149285	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.778478276988353	ENSG00000214106:ENST00000411526:exon_154738350_154738546:AC093726.6;ENSG00000214106:ENST00000449486:exon_154738303_154738501:AC093726.6;ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000464717:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154738389_154738523:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154738389_154738523:PAXIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	154767676	C/T	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000157212:ENST00000404141:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000457196:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000397192:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000323199:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000357094:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000473219:exon_154767406_154768041:PAXIP1;ENSG00000157212:ENST00000475066:exon_154767406_154768041:PAXIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	155100045	G/T	1	164	116	280	78.3075541647034	60.6117299810634	17.69582418364	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.0362064520519699	ENSG00000186480:ENST00000340368:exon_155099951_155101945:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000344756:exon_155099951_155101943:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000342407:exon_155099951_155100467:INSIG1;ENSG00000186480:ENST00000476756:exon_155099951_155100670:INSIG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	155511111	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000184863:ENST00000401878:exon_155511079_155511137:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000307403:exon_155511079_155511137:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000440108:exon_155511079_155511137:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000392761:exon_155511079_155511137:RBM33;ENSG00000184863:ENST00000486747:exon_155511079_155511129:RBM33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156742749	G/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156742796	A/C	1	4	6	10	1.90994034548057	3.13508948177914	-1.22514913629857	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.534238922078199	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156742965	G/C	1	4	12	16	1.90994034548057	6.27017896355828	-4.36023861807771	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0423648285451732	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156742417_156743418:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156755731	G/A	1	9	9	18	4.29736577733129	4.70263422266871	-0.405268445337427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000475176:exon_156755702_156756046:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000469271:exon_156755702_156756819:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000489850:exon_156755702_156756169:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156755824	C/T	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000475176:exon_156755702_156756046:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156755702_156755869:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000469271:exon_156755702_156756819:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000489850:exon_156755702_156756169:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156756646	A/G	1	7	9	16	3.342395604591	4.70263422266871	-1.36023861807771	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.618836525385897	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156756599_156756720:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000472491:exon_156756599_156756929:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000469271:exon_156755702_156756819:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156762224	G/C	1	14	11	25	6.684791209182	5.74766404992843	0.937127159253575	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.841937402628968	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	156762248	G/A	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000146909:ENST00000275820:exon_156762223_156765876:NOM1;ENSG00000146909:ENST00000486131:exon_156762223_156762777:NOM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	157049663	G/C	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000009335:ENST00000348165:exon_157049608_157049738:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000470408:exon_157049608_157049738:UBE3C;ENSG00000009335:ENST00000474153:exon_157049381_157049738:UBE3C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	7	158534371	C/T	1	9	12	21	4.29736577733129	6.27017896355828	-1.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.513322230323649	ENSG00000117868:ENST00000251527:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000421679:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000377650:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000275418:exon_158534214_158534587:ESYT2;ENSG00000117868:ENST00000435514:exon_158534214_158534587:ESYT2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	2092707	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000036448:ENST00000262113:exon_2092588_2093380:MYOM2;ENSG00000036448:ENST00000523438:exon_2092588_2093379:MYOM2;ENSG00000036448:ENST00000523595:exon_2092588_2092834:MYOM2;ENSG00000036448:ENST00000519268:exon_2092588_2092767:MYOM2;ENSG00000036448:ENST00000520298:exon_2092588_2093362:MYOM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	6302183	G/C	1	10	6	16	4.77485086370143	3.13508948177914	1.63976138192229	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.461888750754105	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	6302671	C/T	1	10	12	22	4.77485086370143	6.27017896355828	-1.49532809985685	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.531657196609609	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	6302959	C/T	1	21	21	42	10.027186813773	10.972813186227	-0.945626372453994	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.877494826627993	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	6302981	A/G	1	17	18	35	8.11724646829243	9.40526844533743	-1.288021977045	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.736131459533198	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000519480:exon_6301914_6304088:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6301914_6303068:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000522905:exon_6301914_6303411:MCPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	6312683	A/C	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000147316:ENST00000344683:exon_6312664_6312773:MCPH1;ENSG00000147316:ENST00000418676:exon_6312664_6312773:MCPH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	6612636	C/T	1	29	17	46	13.8470675047341	8.88275353170757	4.96431397302658	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183507806421268	ENSG00000155189:ENST00000285518:exon_6612572_6612695:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000523234:exon_6612572_6612695:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000518327:exon_6612572_6612695:AGPAT5;ENSG00000155189:ENST00000530716:exon_6612572_6612695:AGPAT5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	8175645	G/A	1	41	45	86	19.5768885411759	23.5131711133436	-3.93628257216771	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.450105023498138	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8175258_8176818:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8175259_8176818:AC068353.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	8234113	G/A	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000182319:ENST00000330777:exon_8233763_8235588:AC068353.1;ENSG00000182319:ENST00000520004:exon_8233763_8235588:AC068353.1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	10622897	C/T	1	90	63	153	42.9736577733129	32.918439558681	10.0552182146319	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.106152585015429	ENSG00000254093:ENST00000314787:exon_10622473_10623426:PINX1;ENSG00000254093:ENST00000519088:exon_10622669_10623426:PINX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11640784	A/G	1	5	10	15	2.38742543185071	5.22514913629857	-2.83772370444786	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.196092338065397	ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528113:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11640712_11640908:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11640121_11640908:NEIL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11643803	C/T	1	31	15	46	14.8020376774744	7.83772370444786	6.96431397302658	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0538329010062716	ENSG00000154328:ENST00000455213:exon_11643472_11644849:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000403422:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000528323:exon_11643472_11643883:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000436750:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000284503:exon_11643472_11644855:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000382309:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000354579:exon_11643472_11644854:NEIL2;ENSG00000154328:ENST00000524741:exon_11643472_11644165:NEIL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11667179	C/T	1	132	146	278	63.0280314008589	76.2871773899591	-13.2591459891003	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.118522221093138	ENSG00000079459:ENST00000530337:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531733:exon_11667176_11667485:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000531249:exon_11667176_11667448:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11667176_11667359:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11666765_11667359:FDFT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11683622	T/C	1	87	99	186	41.5412025142024	51.7289764493558	-10.1877739351534	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.142309516974810	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529464:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000532266:exon_11683588_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11683533_11683724:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528729:exon_11683509_11683724:FDFT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11689119	G/C	1	531	405	936	253.544580862546	211.618540020092	41.9260408424538	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.00658299018500092	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525283:exon_11689027_11689176:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11689027_11689179:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000529521:exon_11689027_11689303:FDFT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11696061	G/A	1	500	494	994	238.742543185071	258.122367333149	-19.3798241480779	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.227613592564713	ENSG00000079459:ENST00000220584:exon_11695897_11696818:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000446331:exon_11695897_11696719:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000443614:exon_11695897_11696292:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525607:exon_11695897_11696348:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525900:exon_11695897_11696414:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528812:exon_11695897_11696469:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000530664:exon_11695897_11696349:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525954:exon_11695897_11696476:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000528643:exon_11695897_11696623:FDFT1;ENSG00000079459:ENST00000525777:exon_11695897_11696122:FDFT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	11710888	G/C	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000164733:ENST00000434271:exon_11710838_11711023:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000353047:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530640:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531089:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000453527:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000415599:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531551:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000345125:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533455:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534510:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534636:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000533572:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530296:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525076:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526195:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527243:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534149:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000526645:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000525315:exon_11710838_11710971:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000530573:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532370:exon_11710838_11711328:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000505496:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524500:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000531502:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000527215:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000532656:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000534382:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000528965:exon_11710838_11710988:CTSB;ENSG00000164733:ENST00000524654:exon_11710867_11710988:CTSB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	17819572	C/T	1	8	14	22	3.81988069096114	7.315208790818	-3.49532809985685	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.142312472680437	ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17819543_17819683:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000517836:exon_17819543_17819722:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000518762:exon_17819543_17819683:PCM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	17820714	A/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000412583:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524226:exon_17820610_17820800:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524356:exon_17820462_17820800:PCM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	17872228	G/C	1	45	46	91	21.4868288866564	24.0356860269734	-2.54885714031699	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.601531353503048	ENSG00000078674:ENST00000325083:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000327578:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000325126:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519253:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000523247:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000400012:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000522275:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000519802:exon_17872093_17872349:PCM1;ENSG00000078674:ENST00000524203:exon_17872093_17872349:PCM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	17918934	A/G	1	9	12	21	4.29736577733129	6.27017896355828	-1.972813186227	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.513322230323649	ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17918886_17918967:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000521542:exon_17918886_17919383:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518746:exon_17918909_17918967:ASAH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	17927327	T/C	1	40	45	85	19.0994034548057	23.5131711133436	-4.41376765853785	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.385235665829713	ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17927301_17927387:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17927301_17927387:ASAH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	17928811	C/T	1	29	24	53	13.8470675047341	12.5403579271166	1.30670957761758	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.783995299431726	ENSG00000104763:ENST00000417108:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000262097:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000381733:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520781:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000314146:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519468:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000519545:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000518087:exon_17928809_17928899:ASAH1;ENSG00000104763:ENST00000520869:exon_17928809_17928899:ASAH1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	21766900	G/A	1	15	23	38	7.16227629555214	12.0178430134867	-4.85556671793457	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.143290303081698	ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	21766960	T/C	1	20	24	44	9.54970172740286	12.5403579271166	-2.99065619971371	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.370657840872290	ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	21767275	C/G	1	28	17	45	13.369582418364	8.88275353170757	4.48682888665643	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.232221183098811	ENSG00000147443:ENST00000276420:exon_21766384_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000524001:exon_21766975_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000517422:exon_21767126_21767442:DOK2;ENSG00000147443:ENST00000518197:exon_21767146_21767442:DOK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	22473224	T/C	1	21	49	70	10.027186813773	25.603230767863	-15.57604395409	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000268489986482525	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	22473281	C/G	1	29	41	70	13.8470675047341	21.4231114588241	-7.57604395408999	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0734369869964695	ENSG00000158941:ENST00000308511:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000389279:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520861:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000158941:ENST00000520738:exon_22473195_22473425:KIAA1967;ENSG00000253200:ENST00000521025:exon_22471421_22474170:RP11-582J16.5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	22481449	A/G	1	23	19	42	10.9821569865133	9.92778335896728	1.054373627546	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.760216182537127	ENSG00000147439:ENST00000276416:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000520489:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519513:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000399977:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519335:exon_22481428_22481562:BIN3;ENSG00000147439:ENST00000519863:exon_22481428_22481562:BIN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	22571018	A/G	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000134020:ENST00000256404:exon_22570769_22571049:PEBP4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	22880162	G/C	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000120889:ENST00000523752:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000276431:exon_22877646_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000347739:exon_22879824_22880497:TNFRSF10B;ENSG00000120889:ENST00000523504:exon_22879987_22880497:TNFRSF10B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	23429329	T/C	1	11	31	42	5.25233595007157	16.1979623225256	-10.945626372454	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000936211324782293	ENSG00000147454:ENST00000519973:exon_23428848_23432976:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000290075:exon_23428848_23429716:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000518881:exon_23428848_23429734:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523930:exon_23428988_23429371:SLC25A37;ENSG00000147454:ENST00000523883:exon_23428848_23429716:SLC25A37
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	27255079	G/A	1	26	38	64	12.4146122456237	19.8555667179346	-7.44095447231085	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0790250275767647	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	27255080	A/G	1	38	26	64	18.1444332820654	13.5853877543763	4.55904552768915	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.263014533295198	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522338:exon_27255065_27255306:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521164:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27255065_27255305:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27254969_27255305:PTK2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	27279881	C/T	1	41	25	66	19.5768885411759	13.0628728407464	6.51401570042944	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.111082727160742	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522517:exon_27279821_27279902:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000412793:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27279821_27279900:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000521000:exon_27279793_27279900:PTK2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	27315876	A/G	1	246	138	384	117.461331247055	72.1070580809203	45.3542731661349	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	3.87464104228335e-06	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	27315900	A/G	1	246	134	380	117.461331247055	70.0169984264008	47.4443328206543	A:G	A	G	10	0.522514913629857	9.62364005165455e-07	ENSG00000120899:ENST00000397501:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000338238:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000420218:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000346049:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000517339:exon_27315811_27316903:PTK2B;ENSG00000120899:ENST00000522245:exon_27315811_27315991:PTK2B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	28304769	C/T	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000214050:ENST00000521548:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000380254:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000346498:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000518734:exon_28304688_28304790:FBXO16;ENSG00000214050:ENST00000520481:exon_28304480_28304790:FBXO16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	28384731	G/A	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000104290:ENST00000240093:exon_28384664_28385681:FZD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	29921425	A/G	1	44	36	80	21.0093438002863	18.8105368906749	2.19880690961144	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.655499145160517	ENSG00000133872:ENST00000256255:exon_29920528_29921429:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000518174:exon_29920614_29921429:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000521265:exon_29920642_29921429:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000520303:exon_29920646_29921429:TMEM66;ENSG00000133872:ENST00000523127:exon_29921311_29921429:TMEM66
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	30623937	A/G	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	30999280	G/T	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000165392:ENST00000298139:exon_30999197_30999291:WRN;ENSG00000165392:ENST00000521620:exon_30999197_30999291:WRN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	33369994	A/G	1	16	13	29	7.63976138192229	6.79269387718814	0.847067504734146	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.853259978933129	ENSG00000129696:ENST00000360742:exon_33369485_33370627:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000431156:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000522668:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520636:exon_33369485_33370230:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000520397:exon_33369485_33370232:C8orf41;ENSG00000129696:ENST00000523305:exon_33369829_33370230:C8orf41
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	37620247	G/A	1	20	14	34	9.54970172740286	7.315208790818	2.23449293658486	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.494912855070951	ENSG00000147471:ENST00000328195:exon_37620111_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000520073:exon_37620113_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523358:exon_37620118_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000518036:exon_37620128_37620276:PROSC;ENSG00000147471:ENST00000523994:exon_37620173_37620276:PROSC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	37728019	T/G	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000156675:ENST00000287263:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000330843:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522727:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000523182:exon_37727938_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000522774:exon_37727938_37730796:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000524118:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1;ENSG00000156675:ENST00000343853:exon_37727905_37728046:RAB11FIP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	37963239	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000129691:ENST00000343823:exon_37962760_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000250635:exon_37963011_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517719:exon_37963018_37963256:ASH2L;ENSG00000129691:ENST00000517496:exon_37963068_37963256:ASH2L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	38205461	T/C	1	10	17	27	4.77485086370143	8.88275353170757	-4.10790266800614	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.125898035435311	ENSG00000147548:ENST00000433384:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000317025:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000527502:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000316985:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000419340:exon_38205015_38205733:WHSC1L1;ENSG00000147548:ENST00000529223:exon_38205015_38205733:WHSC1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	38677932	A/G	1	30	21	51	14.3245525911043	10.972813186227	3.35173940487729	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.401081159899136	ENSG00000147526:ENST00000519416:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520615:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443286:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520340:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518415:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522904:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000317827:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000379931:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000520973:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000522955:exon_38677040_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000443388:exon_38677348_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000521866:exon_38677439_38678153:TACC1;ENSG00000147526:ENST00000518809:exon_38677850_38678153:TACC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	42911679	G/A	1	17	23	40	8.11724646829243	12.0178430134867	-3.90059654519428	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.267865059778909	ENSG00000168522:ENST00000302279:exon_42911296_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000342116:exon_42911442_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000396837:exon_42911442_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000526755:exon_42911451_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000527153:exon_42911471_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000533383:exon_42911473_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000533998:exon_42911474_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000524546:exon_42911498_42911689:FNTA;ENSG00000168522:ENST00000533368:exon_42911558_42911689:FNTA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	48882467	T/C	1	32	28	60	15.2795227638446	14.630417581636	0.649105182208579	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.89778651341517	ENSG00000104738:ENST00000523944:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000429229:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000262105:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000396826:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000520637:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000518680:exon_48882358_48882617:MCM4;ENSG00000104738:ENST00000517709:exon_48882246_48882617:MCM4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	53569194	C/T	1	26	34	60	12.4146122456237	17.7655070634151	-5.35089481779142	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.196126389633755	ENSG00000023287:ENST00000025008:exon_53568568_53570468:RB1CC1;ENSG00000023287:ENST00000435644:exon_53568568_53570468:RB1CC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	59492255	A/G	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000137575:ENST00000260130:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000447182:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000413219:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000424270:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000523483:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000520168:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000422546:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000447267:exon_59492182_59492353:SDCBP;ENSG00000137575:ENST00000523441:exon_59492182_59492508:SDCBP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	59515933	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000035681:ENST00000038176:exon_59515769_59515945:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000427130:exon_59515769_59515945:NSMAF;ENSG00000035681:ENST00000519858:exon_59515769_59515945:NSMAF
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	61707572	T/C	1	133	115	248	63.505516487229	60.0892150674336	3.41630141979546	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.703022171868471	ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000453098:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000525508:exon_61707545_61707686:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000527900:exon_61707545_61707686:CHD7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	61778288	C/T	1	23	14	37	10.9821569865133	7.315208790818	3.66694819569529	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.252072691459885	ENSG00000171316:ENST00000307121:exon_61777575_61779465:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000423902:exon_61777575_61779463:CHD7;ENSG00000171316:ENST00000524602:exon_61777575_61779033:CHD7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	66539532	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000104442:ENST00000276569:exon_66539451_66539668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000528721:exon_66539451_66539668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000458464:exon_66539451_66539668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000518908:exon_66539451_66539668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000519352:exon_66539451_66539668:ARMC1;ENSG00000104442:ENST00000523384:exon_66539451_66539668:ARMC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	67342380	G/A	1	31	23	54	14.8020376774744	12.0178430134867	2.78419466398772	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.497049669611348	ENSG00000179041:ENST00000320270:exon_67341263_67342966:RRS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	71508553	T/C	1	24	18	42	11.4596420728834	9.40526844533743	2.054373627546	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.541343610609833	ENSG00000067167:ENST00000521425:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000262213:exon_71508498_71508556:TRAM1;ENSG00000067167:ENST00000520700:exon_71508498_71508556:TRAM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	72965973	G/A	1	2	8	10	0.954970172740286	4.18011930903886	-3.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0559331334925897	ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	72966002	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000235531:ENST00000457356:exon_72964774_72968547:RP11-383H13.1;ENSG00000104321:ENST00000523582:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000262209:exon_72965988_72966102:TRPA1;ENSG00000104321:ENST00000520788:exon_72965624_72966102:TRPA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	80942321	C/G	1	48	60	108	22.9192841457669	31.3508948177914	-8.43161067202456	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.122904312253154	ENSG00000147586:ENST00000276585:exon_80942271_80942506:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000521605:exon_80942271_80942524:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000518271:exon_80942289_80942467:MRPS28;ENSG00000147586:ENST00000522987:exon_80942289_80942489:MRPS28
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	90770315	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000104312:ENST00000220751:exon_90769975_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000522965:exon_90770034_90770461:RIPK2;ENSG00000104312:ENST00000517696:exon_90770045_90770461:RIPK2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	90990479	C/G	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000104320:ENST00000265433:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000396252:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000409330:exon_90990448_90990551:NBN;ENSG00000104320:ENST00000452387:exon_90990448_90990542:NBN;ENSG00000104320:ENST00000517772:exon_90990448_90990551:NBN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	91031349	T/C	1	24	17	41	11.4596420728834	8.88275353170757	2.57688854117586	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.439119018273155	ENSG00000104325:ENST00000519328:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000220764:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517314:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000521603:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000523447:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000519410:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517597:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000519007:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000522161:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000518725:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517761:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000520227:exon_91031314_91031400:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000524326:exon_91031314_91031400:DECR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	91064145	T/C	1	34	29	63	16.2344929365849	15.1529324952659	1.08156044131901	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.802293781952528	ENSG00000104325:ENST00000519328:exon_91064066_91064148:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000220764:exon_91064066_91064236:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000517597:exon_91064066_91064200:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000522161:exon_91064066_91064227:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000524332:exon_91064066_91064178:DECR1;ENSG00000104325:ENST00000520148:exon_91064066_91064320:DECR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	92033502	T/C	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000155099:ENST00000285419:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518359:exon_92033484_92033632:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000520014:exon_92033484_92033650:TMEM55A;ENSG00000155099:ENST00000518869:exon_92033484_92033632:TMEM55A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	94746698	G/T	1	3	6	9	1.43245525911043	3.13508948177914	-1.70263422266871	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.325690455653113	ENSG00000183808:ENST00000399300:exon_94741584_94748666:RBM12B
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	95877787	T/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000164941:ENST00000524333:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523731:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000447247:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000343161:exon_95877734_95877928:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000523206:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520526:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000520315:exon_95877734_95877918:INTS8;ENSG00000164941:ENST00000517918:exon_95877734_95877918:INTS8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	97263180	T/G	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000156469:ENST00000523821:exon_97263134_97263323:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000522822:exon_97263134_97263323:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000524341:exon_97263134_97263323:MTERFD1;ENSG00000156469:ENST00000287025:exon_97263134_97263323:MTERFD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	99148826	T/A	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99148710_99148966:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99148710_99148966:POP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	99168383	T/C	1	10	14	24	4.77485086370143	7.315208790818	-2.54035792711657	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.314825415846184	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99168278_99168640:POP1;ENSG00000104356:ENST00000517435:exon_99168186_99168640:POP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	99169923	C/T	1	10	12	22	4.77485086370143	6.27017896355828	-1.49532809985685	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.531657196609609	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	99169956	T/C	1	13	16	29	6.20730612281186	8.36023861807771	-2.15293249526585	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.461080918794537	ENSG00000104356:ENST00000401707:exon_99169845_99172062:POP1;ENSG00000104356:ENST00000349693:exon_99169845_99170640:POP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	101153242	C/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000156509:ENST00000428847:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000428185:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000388828:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000517806:exon_101152911_101154396:FBXO43;ENSG00000156509:ENST00000520987:exon_101152911_101154396:FBXO43
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	101206391	G/A	1	5	9	14	2.38742543185071	4.70263422266871	-2.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.286346548953723	ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101206340_101206496:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101206340_101206496:SPAG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	101206531	G/A	1	12	6	18	5.72982103644172	3.13508948177914	2.59473155466257	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.246465178928033	ENSG00000104450:ENST00000520643:exon_101206340_101206908:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000520508:exon_101206340_101206912:SPAG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	101253184	G/A	1	14	23	37	6.684791209182	12.0178430134867	-5.33305180430471	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.09901901360081	ENSG00000104450:ENST00000251809:exon_101253119_101254130:SPAG1;ENSG00000104450:ENST00000388798:exon_101253119_101254130:SPAG1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	104432659	G/A	1	34	31	65	16.2344929365849	16.1979623225256	0.0365306140592914	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521716:exon_104432492_104432876:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521971:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000388778:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000519682:exon_104432492_104432691:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104432492_104432691:DCAF13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	104452460	T/C	1	75	119	194	35.8113814777607	62.179274721953	-26.3678932441923	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.000172152486457467	ENSG00000164934:ENST00000297579:exon_104452364_104452499:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000521999:exon_104452364_104452504:DCAF13;ENSG00000164934:ENST00000518554:exon_104452364_104452499:DCAF13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	110539186	G/A	1	6	9	15	2.86491051822086	4.70263422266871	-1.83772370444786	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.440572600750004	ENSG00000205038:ENST00000378402:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000426474:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000526472:exon_110539013_110539249:PKHD1L1;ENSG00000205038:ENST00000534623:exon_110539013_110539256:PKHD1L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	123964080	C/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2;ENSG00000178764:ENST00000534247:exon_123963532_123964249:ZHX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	123964813	A/G	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	123965365	G/A	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000178764:ENST00000314393:exon_123963532_123966268:ZHX2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	124027628	T/C	1	75	46	121	35.8113814777607	24.0356860269734	11.7756954507873	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0360491536549077	ENSG00000136986:ENST00000259512:exon_124025458_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000524119:exon_124026389_124031545:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000405944:exon_124026389_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000419562:exon_124027405_124027825:DERL1;ENSG00000136986:ENST00000427265:exon_124027445_124027825:DERL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	124142489	T/C	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000156787:ENST00000287380:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000309336:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000327098:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000522420:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000521676:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000524307:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518805:exon_124142438_124142573:WDR67;ENSG00000156787:ENST00000518866:exon_124142438_124142573:WDR67
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	124265676	C/T	1	17	12	29	8.11724646829243	6.27017896355828	1.84706750473415	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.578659663491947	ENSG00000165156:ENST00000297857:exon_124265562_124268411:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000395571:exon_124265562_124268411:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000520474:exon_124265562_124267240:ZHX1;ENSG00000165156:ENST00000522655:exon_124265562_124268411:ZHX1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	124448736	A/G	1	8	10	18	3.81988069096114	5.22514913629857	-1.40526844533743	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.638527908759581	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	124448804	T/A	1	9	5	14	4.29736577733129	2.61257456814929	1.684791209182	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.430608348739525	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124448693_124448841:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124448693_124448841:WDYHV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	124449466	C/T	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000156795:ENST00000287387:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523984:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000524254:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000517609:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000519199:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523551:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000523356:exon_124449450_124449574:WDYHV1;ENSG00000156795:ENST00000518125:exon_124449450_124449574:WDYHV1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	125463544	T/C	1	7	6	13	3.342395604591	3.13508948177914	0.207306122811859	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000183665:ENST00000328599:exon_125463048_125465262:TRMT12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	128751201	G/A	1	119	116	235	56.820725278047	60.6117299810634	-3.7910047030164	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.647794623510091	ENSG00000136997:ENST00000259523:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000528568:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000377970:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000454617:exon_128750494_128751265:MYC;ENSG00000136997:ENST00000524013:exon_128750497_128751265:MYC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	133816891	C/G	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000129292:ENST00000395383:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395379:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000361997:exon_133816857_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395386:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000220847:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395382:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000315808:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000337920:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000449458:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395376:exon_133816857_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395390:exon_133816857_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000486199:exon_133816860_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000521038:exon_133816826_133816985:PHF20L1;ENSG00000129292:ENST00000395374:exon_133816860_133816985:PHF20L1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	135524797	G/T	1	58	71	129	27.6941350094683	37.0985588677199	-9.40442385825156	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.112336099448990	ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000518408:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135524718_135524844:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135524718_135524844:ZFAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	135602581	A/G	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000517307:exon_135602511_135602598:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135602511_135602598:ZFAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	135612745	A/G	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000066827:ENST00000520356:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520727:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000429442:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000377838:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523924:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523243:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000318135:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000520214:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000523399:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000519827:exon_135612679_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000522974:exon_135609787_135612911:ZFAT;ENSG00000066827:ENST00000398946:exon_135609787_135612911:ZFAT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	141263015	G/A	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000167632:ENST00000389328:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520857:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000438773:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000301226:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000389327:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000521667:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000520532:exon_141262876_141263028:TRAPPC9;ENSG00000167632:ENST00000518839:exon_141262876_141263028:TRAPPC9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	141525327	A/G	1	13	26	39	6.20730612281186	13.5853877543763	-7.37808163156442	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0236956254312472	ENSG00000104472:ENST00000220913:exon_141525225_141527236:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519533:exon_141525225_141526566:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000519618:exon_141525225_141525864:CHRAC1;ENSG00000104472:ENST00000523569:exon_141525225_141525640:CHRAC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	142154291	G/A	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523058:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142154247_142154358:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523015:exon_142154013_142154358:DENND3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	142161032	A/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142160933_142161052:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142160933_142161052:DENND3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	142161873	C/T	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	142161888	G/A	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000398933:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000520986:exon_142161718_142161936:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142161718_142161936:DENND3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	142204326	C/G	1	45	43	88	21.4868288866564	22.4681412860839	-0.98131239942742	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.832077263505606	ENSG00000105339:ENST00000424248:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000262585:exon_142204132_142205895:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000519811:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000518668:exon_142204132_142205907:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000517813:exon_142202625_142205906:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000523308:exon_142204132_142205901:DENND3;ENSG00000105339:ENST00000521835:exon_142204132_142205898:DENND3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144358381	G/A	1	6	18	24	2.86491051822086	9.40526844533743	-6.54035792711657	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00781452319453408	ENSG00000181638:ENST00000522452:exon_144358067_144358573:ZFP41;ENSG00000250571:ENST00000340042:exon_144358067_144359099:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523522:exon_144358067_144359101:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000517530:exon_144358173_144358581:GLI4;ENSG00000250571:ENST00000523812:exon_144356769_144359101:GLI4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144403485	G/C	1	12	2	14	5.72982103644172	1.04502982725971	4.684791209182	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0141648042661962	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144403371_144403556:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144403371_144403556:TOP1MT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144406705	C/T	1	11	7	18	5.25233595007157	3.657604395409	1.59473155466257	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.48875091693945	ENSG00000184428:ENST00000329245:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000521193:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519148:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000523676:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000413641:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000518951:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519139:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000522041:exon_144406655_144406799:TOP1MT;ENSG00000184428:ENST00000519591:exon_144406655_144406799:TOP1MT
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144550421	C/T	1	12	13	25	5.72982103644172	6.79269387718814	-1.06287284074643	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.693678355794431	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144550379_144550448:ZC3H3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144620342	T/C	1	15	9	24	7.16227629555214	4.70263422266871	2.45964207288343	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.414494780240951	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144621084	T/G	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144621091	A/T	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000014164:ENST00000262577:exon_144620173_144621490:ZC3H3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144644405	G/A	1	42	27	69	20.054373627546	14.1079026680061	5.94647095953987	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.184625403824437	ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644129_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000534602:exon_144644379_144644532:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644379_144644520:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644379_144644520:GSDMD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144644666	A/G	1	45	55	100	21.4868288866564	28.7383202496421	-7.2514913629857	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.161236828406568	ENSG00000104518:ENST00000526406:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000533063:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000262580:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531184:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000524846:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000528475:exon_144643912_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000526469:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000531173:exon_144644618_144644691:GSDMD;ENSG00000104518:ENST00000525208:exon_144644618_144644691:GSDMD
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144658711	G/A	0	0	20	20	0	10.4502982725971	-10.4502982725971	A	G	A	10	0.522514913629857	3.79486412046506e-07	ENSG00000147813:ENST00000435154:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000449291:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000464332:exon_144658248_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000340490:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000426292:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000276844:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000444928:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000525583:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000488096:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000532645:exon_144658602_144658742:NAPRT1;ENSG00000147813:ENST00000480946:exon_144658610_144658742:NAPRT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144662353	G/A	1	762	966	1728	363.843635814049	504.749406566442	-140.905770752393	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	1.20119129595797e-11	ENSG00000104529:ENST00000529576:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530109:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144662182_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144662180_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144662204_144662376:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528382:exon_144662249_144662376:EEF1D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144663287	C/T	1	617	650	1267	294.608298290378	339.634693859407	-45.0263955690289	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.0113763223665039	ENSG00000104529:ENST00000527741:exon_144663224_144666421:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526838:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000528610:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533833:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000395119:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529272:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000317198:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000419152:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529007:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531621:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524624:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000524397:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534380:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534377:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000526786:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533204:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530191:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000531218:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530848:exon_144663224_144663498:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533494:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530445:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000529516:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000534232:exon_144663224_144663324:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000533749:exon_144663249_144663324:EEF1D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144671244	C/A	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000104529:ENST00000532741:exon_144671161_144672630:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000442189:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000422753:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000423316:exon_144671161_144672262:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000414831:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000356793:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000337369:exon_144671161_144672251:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000530616:exon_144671161_144671392:EEF1D;ENSG00000104529:ENST00000525223:exon_144670998_144671486:EEF1D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144681777	G/T	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000179886:ENST00000504548:exon_144680005_144682485:TIGD5;ENSG00000179886:ENST00000321385:exon_144680075_144682075:TIGD5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144687092	T/C	1	7	13	20	3.342395604591	6.79269387718814	-3.45029827259714	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.177937843741256	ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144686083_144688052:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144687077_144687127:PYCRL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144689146	C/T	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000104524:ENST00000220966:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000437874:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000377579:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000447926:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000433751:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000495276:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000462036:exon_144689123_144689302:PYCRL;ENSG00000104524:ENST00000482616:exon_144688638_144689302:PYCRL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144696960	G/C	1	38	31	69	18.1444332820654	16.1979623225256	1.94647095953986	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.718039448191132	ENSG00000104522:ENST00000529064:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000531473:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000425753:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000360125:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000529048:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000532308:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000533817:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000530474:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000525274:exon_144696957_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000433984:exon_144696810_144697085:TSTA3;ENSG00000104522:ENST00000527549:exon_144696817_144697085:TSTA3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144886809	C/T	1	6	10	16	2.86491051822086	5.22514913629857	-2.36023861807771	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.317919468505289	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144886738_144886995:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144886738_144886995:SCRIB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144889172	A/G	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000180900:ENST00000356994:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000320476:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377539:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000377533:exon_144889094_144889183:SCRIB;ENSG00000180900:ENST00000531942:exon_144889094_144889183:SCRIB
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144995658	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144989321_144996563:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144990345_144996563:PLEC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144997523	G/A	1	7	5	12	3.342395604591	2.61257456814929	0.729821036441716	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.777144691375435	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144997641	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	144999642	A/C	1	12	3	15	5.72982103644172	1.56754474088957	4.16227629555214	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0378700909998812	ENSG00000178209:ENST00000345136:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357649:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354589:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000398774:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000322810:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000354958:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000356346:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000436759:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000357316:exon_144996672_145000052:PLEC;ENSG00000178209:ENST00000527096:exon_144996672_145000052:PLEC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145057868	A/G	1	30	34	64	14.3245525911043	17.7655070634151	-3.44095447231085	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.453084144567025	ENSG00000178685:ENST00000526007:exon_145057335_145058526:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000524918:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000313028:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000525773:exon_145057335_145057979:PARP10;ENSG00000178685:ENST00000527262:exon_145057480_145057979:PARP10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145106180	T/C	0	0	11	11	0	5.74766404992843	-5.74766404992843	C	T	C	10	0.522514913629857	0.000294142599736238	ENSG00000178814:ENST00000534424:exon_145106167_145106373:OPLAH;ENSG00000178814:ENST00000426825:exon_145106168_145106373:OPLAH;ENSG00000178814:ENST00000360660:exon_145106168_145106373:OPLAH
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145268000	G/A	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000179832:ENST00000423230:exon_145267897_145268370:HEATR7A;ENSG00000179832:ENST00000356585:exon_145267901_145268024:HEATR7A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145512914	C/T	1	9	13	22	4.29736577733129	6.79269387718814	-2.49532809985685	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.296181191073666	ENSG00000170727:ENST00000307404:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000529231:exon_145512776_145512985:BOP1;ENSG00000170727:ENST00000533125:exon_145512776_145512985:BOP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145540349	G/A	1	27	10	37	12.8920973319939	5.22514913629857	7.66694819569529	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0129562274878654	ENSG00000185000:ENST00000527438:exon_145539954_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000332324:exon_145539954_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000524965:exon_145539983_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000528718:exon_145539988_145540372:DGAT1;ENSG00000185000:ENST00000526479:exon_145539988_145540372:DGAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145580535	C/G	1	8	11	19	3.81988069096114	5.74766404992843	-1.92778335896728	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.492108880387063	ENSG00000182325:ENST00000524492:exon_145580468_145581633:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000455319:exon_145580468_145580575:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000331890:exon_145580468_145580575:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000530142:exon_145580468_145580575:FBXL6;ENSG00000182325:ENST00000526524:exon_145580468_145580575:FBXL6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145617910	A/G	1	11	4	15	5.25233595007157	2.09005965451943	3.16227629555214	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.124040195402654	ENSG00000173137:ENST00000526231:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000529654:exon_145617660_145617912:ADCK5;ENSG00000173137:ENST00000308860:exon_145617660_145617912:ADCK5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145619489	G/A	1	42	19	61	20.054373627546	9.92778335896728	10.1265902685787	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0100774365112434	ENSG00000071894:ENST00000531480:exon_145619449_145619515:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000349769:exon_145619449_145619515:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000526271:exon_145619449_145619770:CPSF1;ENSG00000071894:ENST00000532935:exon_145619449_145619515:CPSF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145661675	G/A	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000160949:ENST00000497613:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000409379:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000422691:exon_145661041_145661801:NFKBIL2;ENSG00000160949:ENST00000292520:exon_145661041_145661801:NFKBIL2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145735080	C/T	1	4	8	12	1.90994034548057	4.18011930903886	-2.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.250588171038521	ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145734457_145735398:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145734463_145735398:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735002_145735398:MFSD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145736002	G/A	1	11	5	16	5.25233595007157	2.61257456814929	2.63976138192229	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.217523950904571	ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	145736077	C/T	1	17	7	24	8.11724646829243	3.657604395409	4.45964207288343	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.100163552529794	ENSG00000167700:ENST00000301327:exon_145735981_145736105:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000528047:exon_145735981_145736286:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000526749:exon_145735743_145736197:MFSD3;ENSG00000167700:ENST00000534427:exon_145735629_145736286:MFSD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	146067054	G/A	1	5	7	12	2.38742543185071	3.657604395409	-1.27017896355828	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.568111585579146	ENSG00000147789:ENST00000532777:exon_146066740_146067216:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000530776:exon_146066740_146067121:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000532393:exon_146066740_146067167:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000170619:ENST00000530332:exon_146066427_146067128:COMMD5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	146068322	C/T	1	38	34	72	18.1444332820654	17.7655070634151	0.378926218650292	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000147789:ENST00000325241:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528857:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000446747:exon_146066740_146068605:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528372:exon_146066740_146069157:ZNF7;ENSG00000147789:ENST00000528017:exon_146066740_146068605:ZNF7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	146156247	C/A	1	13	9	22	6.20730612281186	4.70263422266871	1.50467190014315	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.670538736912219	ENSG00000170631:ENST00000276816:exon_146155744_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000394909:exon_146155771_146157976:ZNF16;ENSG00000170631:ENST00000435605:exon_146156124_146157979:ZNF16
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	8	146278127	C/T	1	49	54	103	23.396769232137	28.2158053360123	-4.81903610387527	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.375037340377010	ENSG00000182307:ENST00000331434:exon_146277972_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000444534:exon_146277972_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000524395:exon_146277851_146278322:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000534350:exon_146277853_146278283:C8orf33;ENSG00000182307:ENST00000530455:exon_146277853_146278283:C8orf33
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	399255	G/A	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000107099:ENST00000453981:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000432829:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000287364:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000414453:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000469391:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000495184:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382331:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000382329:exon_399146_399259:DOCK8;ENSG00000107099:ENST00000426054:exon_399146_399259:DOCK8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	2029196	G/A	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000457226:exon_2028987_2029221:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2028987_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2029006_2029247:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2029019_2029247:SMARCA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	2039569	G/A	1	4	10	14	1.90994034548057	5.22514913629857	-3.315208790818	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.106813752747619	ENSG00000080503:ENST00000349721:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000357248:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000450198:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000439732:exon_2039466_2039574:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382203:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000420704:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000382194:exon_2039466_2039900:SMARCA2;ENSG00000080503:ENST00000491574:exon_2039466_2039857:SMARCA2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	2837218	T/C	1	62	63	125	29.6040753549489	32.918439558681	-3.31436420373213	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.591466911546107	ENSG00000080608:ENST00000397885:exon_2837180_2837401:KIAA0020
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	4860300	A/G	1	30	27	57	14.3245525911043	14.1079026680061	0.216649923098149	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000120158:ENST00000381750:exon_4860125_4861064:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000381730:exon_4860125_4860472:RCL1;ENSG00000120158:ENST00000448872:exon_4860125_4861064:RCL1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	5774225	T/G	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000107036:ENST00000414202:exon_5773958_5776552:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000449720:exon_5773958_5774298:KIAA1432;ENSG00000107036:ENST00000418622:exon_5773958_5776557:KIAA1432
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	5968416	A/G	1	42	63	105	20.054373627546	32.918439558681	-12.864065931135	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0142511782373133	ENSG00000183354:ENST00000399933:exon_5968019_5969436:KIAA2026
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	6533010	C/G	1	18	18	36	8.59473155466257	9.40526844533743	-0.810536890674854	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.868003039823955	ENSG00000178445:ENST00000321612:exon_6532464_6533160:GLDC;ENSG00000178445:ENST00000477960:exon_6532899_6533160:GLDC
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	7799749	C/T	1	115	85	200	54.9107849325664	44.4137676585379	10.4970172740286	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.156703699241121	ENSG00000137038:ENST00000358227:exon_7799461_7800067:C9orf123
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	19376262	G/A	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000137154:ENST00000380394:exon_19375713_19376386:RPS6;ENSG00000137154:ENST00000498815:exon_19376253_19376386:RPS6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	20953049	A/G	1	15	16	31	7.16227629555214	8.36023861807771	-1.19796232252557	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.721152952918315	ENSG00000188352:ENST00000380249:exon_20952984_20953064:KIAA1797;ENSG00000188352:ENST00000338382:exon_20952984_20953064:KIAA1797
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	21816758	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000099810:ENST00000380172:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000404796:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000355696:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000419385:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000460874:exon_21816713_21816771:MTAP;ENSG00000099810:ENST00000443256:exon_21816713_21816771:MTAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	26842506	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000120159:ENST00000333916:exon_26840683_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000520187:exon_26842264_26842645:C9orf82;ENSG00000120159:ENST00000483493:exon_26842392_26842645:C9orf82
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	26923258	G/A	1	13	10	23	6.20730612281186	5.22514913629857	0.982156986513288	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.835280900229804	ENSG00000137055:ENST00000397292:exon_26923176_26923345:PLAA;ENSG00000137055:ENST00000520884:exon_26923176_26923345:PLAA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	27009100	T/C	1	7	4	11	3.342395604591	2.09005965451943	1.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.553383785598965	ENSG00000096872:ENST00000433700:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000443698:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000380062:exon_27009018_27009156:IFT74;ENSG00000096872:ENST00000429045:exon_27009018_27009156:IFT74
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32448905	C/T	1	8	12	20	3.81988069096114	6.27017896355828	-2.45029827259714	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.371175178912776	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32448894_32449079:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32448894_32449079:ACO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32448959	T/G	1	4	11	15	1.90994034548057	5.74766404992843	-3.83772370444786	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.067798617844541	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32448894_32449079:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32448894_32449079:ACO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32450043	T/C	1	10	13	23	4.77485086370143	6.79269387718814	-2.01784301348671	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.413016919605914	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32450187	T/C	1	7	12	19	3.342395604591	6.27017896355828	-2.92778335896728	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.250486147296676	ENSG00000122729:ENST00000309951:exon_32449996_32450834:ACO1;ENSG00000122729:ENST00000379923:exon_32449996_32450834:ACO1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32459450	T/G	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32459369_32459512:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32459369_32459512:DDX58
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32480254	G/A	1	8	4	12	3.81988069096114	2.09005965451943	1.72982103644172	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.3935545671872	ENSG00000107201:ENST00000379882:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379883:exon_32480217_32480352:DDX58;ENSG00000107201:ENST00000379868:exon_32480217_32480352:DDX58
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	32552373	A/C	1	72	82	154	34.3789262186503	42.8462229176483	-8.46729669899798	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.196673936631620	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	33276531	C/T	1	71	66	137	33.9014411322801	34.4859842995706	-0.584543167290413	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.93203968196176	ENSG00000086065:ENST00000223500:exon_33276454_33276562:CHMP5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	34107505	C/T	1	8	2	10	3.81988069096114	1.04502982725971	2.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.112939276976315	ENSG00000198876:ENST00000361264:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396989:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000396990:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000450964:exon_34107357_34107563:DCAF12;ENSG00000198876:ENST00000463286:exon_34107359_34107563:DCAF12
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35077021	G/A	1	10	9	19	4.77485086370143	4.70263422266871	0.0722166410327159	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000221829:ENST00000425676:exon_35076968_35077098:FANCG;ENSG00000221829:ENST00000378643:exon_35076968_35077098:FANCG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35607978	T/G	1	14	15	29	6.684791209182	7.83772370444786	-1.15293249526585	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.712753772206145	ENSG00000107140:ENST00000336395:exon_35607925_35608008:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000498522:exon_35607925_35608008:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000467424:exon_35607925_35608008:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000463897:exon_35607925_35608008:TESK1;ENSG00000107140:ENST00000480077:exon_35607663_35608008:TESK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35611821	A/G	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000137101:ENST00000396757:exon_35611801_35611916:CD72;ENSG00000137101:ENST00000396759:exon_35611801_35611916:CD72;ENSG00000137101:ENST00000259633:exon_35611801_35611916:CD72;ENSG00000137101:ENST00000490239:exon_35611801_35611916:CD72
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35650458	G/A	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000137078:ENST00000486859:exon_35650354_35650467:SIT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35660901	C/T	1	66	47	113	31.5140157004294	24.5582009406033	6.95581475982615	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.220739813024658	ENSG00000159884:ENST00000378407:exon_35660771_35661183:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000378406:exon_35660554_35661184:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000426546:exon_35660743_35661508:CCDC107;ENSG00000159884:ENST00000421582:exon_35660398_35661400:CCDC107;ENSG00000137135:ENST00000490638:exon_35660091_35660964:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000475323:exon_35660091_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378387:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378395:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000378405:exon_35659341_35661999:C9orf100;ENSG00000137135:ENST00000343259:exon_35659341_35661999:C9orf100
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35684289	G/A	1	26	414	440	12.4146122456237	216.321174242761	-203.906561997137	A:G	G	A	10	0.522514913629857	6.38480936992645e-99	ENSG00000198467:ENST00000378300:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000378292:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000329305:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000360958:exon_35684243_35684312:TPM2;ENSG00000198467:ENST00000471212:exon_35684248_35684312:TPM2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35720126	A/G	1	19	12	31	9.07221664103272	6.27017896355828	2.80203767747443	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.370393957183701	ENSG00000137076:ENST00000314888:exon_35720036_35720216:TLN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35736496	G/A	1	42	40	82	20.054373627546	20.9005965451943	-0.846222917648277	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.912103579218211	ENSG00000107175:ENST00000353704:exon_35736389_35737001:CREB3;ENSG00000107175:ENST00000486056:exon_35736389_35736857:CREB3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	35971564	C/T	0	22	0	22	10.5046719001431	0	10.5046719001431	C	C		10	0.522514913629857	7.14825849001618e-07	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37126922	A/G	1	15	32	47	7.16227629555214	16.7204772361554	-9.55820094060328	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.005422701192829	ENSG00000147905:ENST00000336755:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000322831:exon_37126309_37126939:ZCCHC7;ENSG00000147905:ENST00000461038:exon_37126309_37126939:ZCCHC7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37492679	G/T	1	26	18	44	12.4146122456237	9.40526844533743	3.00934380028629	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.450914645200904	ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000421959:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37492654_37492712:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37492654_37492712:POLR1E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37493588	C/T	1	22	19	41	10.5046719001431	9.92778335896728	0.576888541175862	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.877191301426372	ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37493556_37493700:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37493556_37493700:POLR1E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37500895	T/C	1	47	35	82	22.4417990593967	18.288021977045	4.15377708235172	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.378147306169631	ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37500837_37500918:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37500837_37500918:POLR1E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37503087	G/A	1	80	57	137	38.1988069096114	29.7833500769019	8.41545683270958	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.171025004571667	ENSG00000137054:ENST00000377798:exon_37503040_37503694:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000442009:exon_37503040_37503693:POLR1E;ENSG00000137054:ENST00000377792:exon_37503040_37503694:POLR1E
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37537373	A/G	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37537381	C/T	1	7	2	9	3.342395604591	1.04502982725971	2.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.183675452790835	ENSG00000147912:ENST00000276960:exon_37537107_37537940:FBXO10;ENSG00000147912:ENST00000432825:exon_37537107_37537940:FBXO10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	37592452	G/A	1	202	151	353	96.4519874467689	78.8997519581084	17.5522354886605	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0623554478846764	ENSG00000175768:ENST00000321301:exon_37592409_37592568:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000377773:exon_37592307_37592594:TOMM5;ENSG00000175768:ENST00000401811:exon_37592250_37592636:TOMM5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	38395928	C/T	1	19	7	26	9.07221664103272	3.657604395409	5.41461224562372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0475952011175317	ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	38396002	C/T	1	15	11	26	7.16227629555214	5.74766404992843	1.41461224562372	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.695673385888429	ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	38396303	C/T	1	35	30	65	16.711978022955	15.6754474088957	1.03653061405929	T:C:G	C	T	10	0.522514913629857	0.805497238250807	ENSG00000137124:ENST00000377698:exon_38395737_38398658:ALDH1B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	71843023	C/A	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71842897_71843030:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71842897_71843030:TJP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	71862975	C/T	1	18	23	41	8.59473155466257	12.0178430134867	-3.42311145882414	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348474799658273	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	71862987	G/A	1	19	20	39	9.07221664103272	10.4502982725971	-1.37808163156443	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.749130394966468	ENSG00000119139:ENST00000377245:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000348208:exon_71862928_71863140:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000265384:exon_71862928_71863906:TJP2;ENSG00000119139:ENST00000498204:exon_71862928_71863005:TJP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	72933774	A/G	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000198887:ENST00000361138:exon_72933710_72933879:SMC5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	74975136	T/C	1	19	1	20	9.07221664103272	0.522514913629857	8.54970172740286	T:C	T	C	10	0.522514913629857	5.30458562055797e-05	ENSG00000107372:ENST00000437241:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000237937:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000456474:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376960:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376962:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000488164:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000343431:exon_74975026_74975137:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000471197:exon_74975026_74975201:ZFAND5;ENSG00000107372:ENST00000376956:exon_74975026_74975137:ZFAND5
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	75775235	A/G	1	1	7	8	0.477485086370143	3.657604395409	-3.18011930903886	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0319124571059794	ENSG00000135046:ENST00000257497:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000456643:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000415424:exon_75775179_75775254:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000376912:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000376911:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000495713:exon_75775179_75775292:ANXA1;ENSG00000135046:ENST00000489109:exon_75775201_75775292:ANXA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	80919756	T/G	1	6	4	10	2.86491051822086	2.09005965451943	0.77485086370143	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.756391155781253	ENSG00000135069:ENST00000421149:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000376588:exon_80919651_80919856:PSAT1;ENSG00000135069:ENST00000347159:exon_80919651_80919856:PSAT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	86278817	C/A	1	24	30	54	11.4596420728834	15.6754474088957	-4.21580533601228	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.276985084932752	ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000533705:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000526134:exon_86278790_86278958:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000527373:exon_86278790_86278958:UBQLN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	86322535	G/C	1	7	12	19	3.342395604591	6.27017896355828	-2.92778335896728	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.250486147296676	ENSG00000135018:ENST00000376395:exon_86322415_86323118:UBQLN1;ENSG00000135018:ENST00000257468:exon_86322415_86322849:UBQLN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	88636887	G/A	1	10	18	28	4.77485086370143	9.40526844533743	-4.630417581636	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0899726052275755	ENSG00000135040:ENST00000361671:exon_88636816_88637213:NAA35
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	90266627	C/T	1	9	8	17	4.29736577733129	4.18011930903886	0.11724646829243	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90266442_90266639:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000494010:exon_90266442_90266639:DAPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	90321370	C/T	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	90322023	G/A	1	39	45	84	18.6219183684356	23.5131711133436	-4.89125274490799	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.325737942078033	ENSG00000196730:ENST00000358077:exon_90321047_90323546:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000472284:exon_90321047_90323545:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000408954:exon_90321047_90323543:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000491893:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000489291:exon_90321047_90322297:DAPK1;ENSG00000196730:ENST00000469640:exon_90321047_90322296:DAPK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	91934662	C/A	1	12	12	24	5.72982103644172	6.27017896355828	-0.540357927116569	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.841104887034564	ENSG00000187742:ENST00000375807:exon_91934567_91934712:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000395669:exon_91934567_91934712:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000339901:exon_91934567_91934712:SECISBP2;ENSG00000187742:ENST00000534113:exon_91934567_91934712:SECISBP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	91994016	C/T	1	42	42	84	20.054373627546	21.945626372454	-1.89125274490799	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.743435210540173	ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_91991301_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_91992152_91994544:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_91992306_91994544:SEMA4D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	92003576	G/A	1	11	6	17	5.25233595007157	3.13508948177914	2.11724646829243	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.340687410376918	ENSG00000187764:ENST00000420987:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000339861:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000429836:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000450295:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000343780:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000438547:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000356444:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000422704:exon_92003551_92003707:SEMA4D;ENSG00000187764:ENST00000474258:exon_92003551_92003641:SEMA4D
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	93637015	C/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000165025:ENST00000375754:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375751:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375747:exon_93636954_93637131:SYK;ENSG00000165025:ENST00000375746:exon_93636954_93637131:SYK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	95077810	T/C	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000198000:ENST00000360868:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000375594:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000442668:exon_95076549_95078420:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000358855:exon_95076549_95078431:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000434228:exon_95076549_95078418:NOL8;ENSG00000198000:ENST00000433029:exon_95077625_95078418:NOL8
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	95738781	C/A	1	7	7	14	3.342395604591	3.657604395409	-0.315208790817998	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000468206:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000494669:exon_95738490_95738991:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95738490_95738991:FGD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	95782667	C/T	1	3	9	12	1.43245525911043	4.70263422266871	-3.27017896355828	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0813591078150171	ENSG00000127084:ENST00000375482:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000337352:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000416701:exon_95782599_95782706:FGD3;ENSG00000127084:ENST00000467786:exon_95782599_95782706:FGD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	95875381	G/C	1	10	7	17	4.77485086370143	3.657604395409	1.11724646829243	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.635033522721515	ENSG00000165233:ENST00000375464:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000466409:exon_95875274_95875564:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000468781:exon_95875274_95875489:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000490488:exon_95875274_95875554:C9orf89;ENSG00000165233:ENST00000488630:exon_95875274_95875565:C9orf89
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	97365642	G/A	0	0	86	86	0	44.9362825721677	-44.9362825721677	A	G	A	10	0.522514913629857	2.45778443414092e-28	ENSG00000165140:ENST00000375326:exon_97365415_97365854:FBP1;ENSG00000165140:ENST00000415431:exon_97365423_97365854:FBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	99581676	G/C	1	8	6	14	3.81988069096114	3.13508948177914	0.684791209182002	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.793482530974183	ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	99581916	C/G	1	3	5	8	1.43245525911043	2.61257456814929	-1.18011930903886	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.49132970049628	ENSG00000196597:ENST00000481138:exon_99578754_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000289032:exon_99579915_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000466833:exon_99581690_99582060:ZNF782;ENSG00000196597:ENST00000478850:exon_99581690_99582060:ZNF782
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100326321	C/T	1	29	9	38	13.8470675047341	4.70263422266871	9.14443328206543	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00308432761715397	ENSG00000136842:ENST00000259365:exon_100326320_100326450:TMOD1;ENSG00000136842:ENST00000395211:exon_100326320_100326450:TMOD1;ENSG00000136842:ENST00000375175:exon_100326320_100326450:TMOD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100672338	C/T	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100672242_100672898:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375118:exon_100672242_100674753:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100672271_100672898:C9orf156
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100684719	A/C	1	7	1	8	3.342395604591	0.522514913629857	2.81988069096114	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.0725325238528269	ENSG00000136932:ENST00000375119:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000478126:exon_100684700_100684754:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000375117:exon_100684700_100684772:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000325350:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000471580:exon_100684700_100684750:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000421165:exon_100684700_100684852:C9orf156;ENSG00000136932:ENST00000455506:exon_100684700_100684769:C9orf156
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100819070	T/G	1	29	12	41	13.8470675047341	6.27017896355828	7.57688854117586	T:G	T	G	10	0.522514913629857	0.0188755299676027	ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100819192	C/T	1	29	33	62	13.8470675047341	17.2429921497853	-3.39592464505113	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.445969721944002	ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100819021_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100819050_100819222:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100819052_100819222:NANS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100823084	T/C	1	49	46	95	23.396769232137	24.0356860269734	-0.638916794836415	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.91846600333298	ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100823135	G/C	1	50	56	106	23.8742543185071	29.260835163272	-5.38658084476484	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.331024561477993	ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000495319:exon_100823064_100823279:NANS;ENSG00000095380:ENST00000480925:exon_100823064_100823541:NANS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100843178	G/A	1	75	98	173	35.8113814777607	51.206461535726	-15.3950800579653	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0221682200625481	ENSG00000095380:ENST00000210444:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000424455:exon_100843098_100843428:NANS;ENSG00000095380:ENST00000461452:exon_100843098_100843364:NANS;ENSG00000095380:ENST00000415280:exon_100843098_100843337:NANS;ENSG00000095380:ENST00000427646:exon_100843098_100844448:NANS;ENSG00000106785:ENST00000478530:exon_100843122_100843543:TRIM14
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	100887113	C/G	1	1	18	19	0.477485086370143	9.40526844533743	-8.92778335896728	C:G	C	G	10	0.522514913629857	2.17235645278032e-05	ENSG00000106789:ENST00000343933:exon_100883257_100887187:CORO2A;ENSG00000106789:ENST00000375077:exon_100883257_100887187:CORO2A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	101984147	G/C	1	9	6	15	4.29736577733129	3.13508948177914	1.16227629555214	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.612779745576594	ENSG00000119523:ENST00000238477:exon_101983829_101984224:ALG2;ENSG00000119523:ENST00000476832:exon_101983829_101984238:ALG2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	102820138	T/C	1	28	37	65	13.369582418364	19.3330518043047	-5.96346938594071	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.171546425238107	ENSG00000023318:ENST00000262455:exon_102820102_102820141:ERP44
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	103054655	A/G	1	2	12	14	0.954970172740286	6.27017896355828	-5.315208790818	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.00557179455622664	ENSG00000119509:ENST00000262457:exon_103054608_103055325:INVS;ENSG00000119509:ENST00000262456:exon_103054608_103054718:INVS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	103070820	G/A	1	25	25	50	11.9371271592536	13.0628728407464	-1.12574568149285	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.778478276988353	ENSG00000136891:ENST00000374902:exon_103070782_103070963:TEX10;ENSG00000136891:ENST00000444730:exon_103070782_103070963:TEX10
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	106888978	C/T	1	17	11	28	8.11724646829243	5.74766404992843	2.369582418364	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.450577912355210	ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000303219:exon_106888922_106889065:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106888922_106889065:SMC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	106901506	A/G	1	12	19	31	5.72982103644172	9.92778335896728	-4.19796232252557	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.151489511791013	ENSG00000136824:ENST00000286398:exon_106901420_106903690:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374793:exon_106901420_106903698:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000374787:exon_106901420_106901932:SMC2;ENSG00000136824:ENST00000493955:exon_106901420_106901933:SMC2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	111641825	G/A	1	8	8	16	3.81988069096114	4.18011930903886	-0.360238618077712	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111641726_111641837:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111641741_111641837:IKBKAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	111651620	A/T	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000070061:ENST00000374647:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000495759:exon_111651612_111651673:IKBKAP;ENSG00000070061:ENST00000467959:exon_111651612_111651673:IKBKAP
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	112900199	T/C	1	13	12	25	6.20730612281186	6.27017896355828	-0.0628728407464259	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000480388:exon_112898407_112900706:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	112900785	A/G	1	20	22	42	9.54970172740286	11.4953280998569	-1.945626372454	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.643643854965604	ENSG00000241978:ENST00000522689:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000510514:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000434623:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000374525:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000259318:exon_112898407_112900819:AKAP2;ENSG00000241978:ENST00000482335:exon_112900451_112900819:AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000374530:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2;ENSG00000157654:ENST00000302798:exon_112898407_112900819:PALM2-AKAP2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	113006491	T/C	1	592	676	1268	282.671171131125	353.220081613783	-70.5489104826587	A:T:C	T	C	10	0.522514913629857	8.17051351960426e-05	ENSG00000136810:ENST00000374517:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000374515:exon_113006091_113006499:TXN;ENSG00000136810:ENST00000487892:exon_113006299_113006499:TXN
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	113013606	C/G	1	2	10	12	0.954970172740286	5.22514913629857	-4.27017896355829	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.0180411572214053	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	114146832	C/T	1	24	25	49	11.4596420728834	13.0628728407464	-1.60323076786299	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.670134455855235	ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114146802_114146849:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000374378:exon_114146802_114146849:KIAA0368
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	114184477	C/T	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000136813:ENST00000338205:exon_114184414_114184480:KIAA0368;ENSG00000136813:ENST00000259335:exon_114184414_114184480:KIAA0368
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	115931593	G/A	1	27	42	69	12.8920973319939	21.945626372454	-9.05352904046013	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0303427607100661	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	115932012	G/T	1	23	21	44	10.9821569865133	10.972813186227	0.00934380028629178	T:G	G	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115931504_115932222:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115931504_115932222:FKBP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	115933978	G/A	1	11	10	21	5.25233595007157	5.22514913629857	0.0271868137730022	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115933861_115933986:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115933861_115933986:FKBP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	115933980	C/A	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115933861_115933986:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115933861_115933986:FKBP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	115950706	A/C	1	6	2	8	2.86491051822086	1.04502982725971	1.81988069096114	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.2930477619030	ENSG00000119321:ENST00000446284:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000238256:exon_115950669_115950771:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000489645:exon_115950669_115950841:FKBP15;ENSG00000119321:ENST00000414250:exon_115950669_115950771:FKBP15
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	116136198	C/T	1	20	38	58	9.54970172740286	19.8555667179346	-10.3058649905317	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00811303631732792	ENSG00000119431:ENST00000238379:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000374180:exon_116135699_116136809:HDHD3;ENSG00000119431:ENST00000485934:exon_116136168_116136809:HDHD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	116346515	G/A	1	33	19	52	15.7570078502147	9.92778335896728	5.82922449124743	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.126408904473871	ENSG00000138835:ENST00000374140:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000350696:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000342620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000317567:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000478599:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000343817:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000474719:exon_116346484_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000462143:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000488620:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000374134:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000485822:exon_116345730_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000487344:exon_116343916_116346707:RGS3;ENSG00000138835:ENST00000467805:exon_116346462_116346707:RGS3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	117104368	G/A	1	23	15	38	10.9821569865133	7.83772370444786	3.14443328206543	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.333469864549559	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374079:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000320310:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000492875:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117104289_117104405:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117104289_117104405:AKNA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	117120333	G/A	1	24	15	39	11.4596420728834	7.83772370444786	3.62191836843558	A:C:G	G	A	10	0.522514913629857	0.265348265120783	ENSG00000106948:ENST00000307564:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000394582:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374088:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000223791:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000374075:exon_117120201_117120447:AKNA;ENSG00000106948:ENST00000490767:exon_117120201_117120617:AKNA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	123671520	G/A	1	159	174	333	75.9201287328527	90.9175949715951	-14.9974662387424	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.111515501673132	ENSG00000056558:ENST00000373887:exon_123671508_123671656:TRAF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	125652757	G/A	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000056586:ENST00000373670:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000498479:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000357244:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000442575:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373663:exon_125652591_125652829:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000423239:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000373665:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000335387:exon_125652591_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000478216:exon_125652449_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000471874:exon_125652450_125652824:RC3H2;ENSG00000056586:ENST00000437215:exon_125652517_125652824:RC3H2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	127101924	C/T	1	127	100	227	60.6406059690082	52.2514913629857	8.38911460602245	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.287808497540543	ENSG00000119408:ENST00000373603:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373600:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000373601:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000320246:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000454453:exon_127101850_127101944:NEK6;ENSG00000119408:ENST00000394199:exon_127101850_127101944:NEK6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	127177161	A/G	1	91	69	160	43.451142859683	36.0535290404601	7.39761381922288	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.267918943884065	ENSG00000136930:ENST00000259457:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000498485:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000441097:exon_127177121_127177214:PSMB7;ENSG00000136930:ENST00000466951:exon_127177121_127177214:PSMB7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	127635986	G/C	1	120	112	232	57.2982103644172	58.521670326544	-1.22345996212682	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.895521853150258	ENSG00000136950:ENST00000353214:exon_127635971_127636043:ARPC5L;ENSG00000136950:ENST00000259477:exon_127635971_127636043:ARPC5L;ENSG00000136950:ENST00000465124:exon_127634868_127636043:ARPC5L
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	127975654	C/T	1	30	21	51	14.3245525911043	10.972813186227	3.35173940487729	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.401081159899136	ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	127975721	C/G	1	15	12	27	7.16227629555214	6.27017896355828	0.892097331993861	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.847891550132336	ENSG00000136933:ENST00000373544:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394125:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000394124:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000373538:exon_127975649_127975801:RABEPK;ENSG00000136933:ENST00000416065:exon_127975649_127975801:RABEPK
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	128099784	C/T	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000165219:ENST00000497580:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000470056:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394105:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394104:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394101:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000265956:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000418009:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000394083:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000495955:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000467750:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000297933:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000312123:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000431329:exon_128099500_128099870:GAPVD1;ENSG00000165219:ENST00000436712:exon_128099500_128099870:GAPVD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130263418	G/A	1	31	18	49	14.8020376774744	9.40526844533743	5.39676923213701	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.152187666329495	ENSG00000148356:ENST00000373324:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000323301:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000300417:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000373322:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000483302:exon_130263289_130263422:LRSAM1;ENSG00000148356:ENST00000472592:exon_130263289_130263422:LRSAM1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130540942	G/A	1	3	8	11	1.43245525911043	4.18011930903886	-2.74766404992843	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.131974387384117	ENSG00000095370:ENST00000473535:exon_130540875_130540974:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000314830:exon_130540870_130541020:SH2D3C;ENSG00000095370:ENST00000468969:exon_130540875_130540989:SH2D3C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130580501	C/T	1	10	13	23	4.77485086370143	6.79269387718814	-2.01784301348671	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.413016919605914	ENSG00000106991:ENST00000373203:exon_130580399_130580656:ENG;ENSG00000106991:ENST00000344849:exon_130580399_130580656:ENG;ENSG00000106991:ENST00000480266:exon_130580399_130580656:ENG
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130630240	G/T	1	12	14	26	5.72982103644172	7.315208790818	-1.58538775437628	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.561396276598999	ENSG00000106992:ENST00000373176:exon_130628759_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000476274:exon_130630118_130630355:AK1;ENSG00000106992:ENST00000413016:exon_130630169_130630355:AK1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130670652	A/G	1	114	101	215	54.4332998461963	52.7740062766156	1.65929356958074	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.837978712848942	ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130670165_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130670166_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000474282:exon_130670604_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130670597_130670860:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130670623_130670860:ST6GALNAC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130674948	G/T	1	32	24	56	15.2795227638446	12.5403579271166	2.73916483672801	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.505152652924393	ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000495983:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130674547_130674959:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130674666_130674959:ST6GALNAC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130677094	G/A	1	12	10	22	5.72982103644172	5.22514913629857	0.504671900143145	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000136840:ENST00000335791:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000343609:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000467674:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000361444:exon_130676935_130677120:ST6GALNAC4;ENSG00000136840:ENST00000483438:exon_130676935_130677145:ST6GALNAC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	130826037	G/A	1	12	8	20	5.72982103644172	4.18011930903886	1.54970172740286	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.512146220497768	ENSG00000171169:ENST00000373078:exon_130823512_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000488519:exon_130824269_130826179:NAIF1;ENSG00000171169:ENST00000466139:exon_130825921_130826179:NAIF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131395571	G/A	1	187	170	357	89.2897111512167	88.8275353170757	0.462175834141036	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000197694:ENST00000372731:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372739:exon_131395488_131395941:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000372719:exon_131395488_131395937:SPTAN1;ENSG00000197694:ENST00000358161:exon_131395488_131395937:SPTAN1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131397479	G/A	1	26	22	48	12.4146122456237	11.4953280998569	0.919284145766863	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.885366484713152	ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000483181:exon_131397371_131397538:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131397458_131397538:WDR34
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131403096	A/G	1	33	19	52	15.7570078502147	9.92778335896728	5.82922449124743	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.126408904473871	ENSG00000119333:ENST00000372715:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000456992:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000480613:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000451652:exon_131402970_131403218:WDR34;ENSG00000119333:ENST00000419989:exon_131402970_131403218:WDR34
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131467782	C/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000160447:ENST00000291906:exon_131467582_131467822:PKN3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131570102	A/T	1	4	5	9	1.90994034548057	2.61257456814929	-0.702634222668713	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.744904237668794	ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131570178	T/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000107021:ENST00000372648:exon_131570093_131572711:TBC1D13;ENSG00000107021:ENST00000223865:exon_131570093_131572703:TBC1D13
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131584631	C/T	1	129	88	217	61.5955761417484	45.9813123994274	15.614263742321	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0351511747398088	ENSG00000167136:ENST00000372642:exon_131584607_131584956:ENDOG;ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131585069	A/G	1	33	13	46	15.7570078502147	6.79269387718814	8.96431397302658	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0112641720390547	ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131581930_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131584346_131585112:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467582:exon_131584370_131585112:C9orf114
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131588888	G/C	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000198917:ENST00000361256:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000372618:exon_131588883_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000466556:exon_131588819_131588908:C9orf114;ENSG00000198917:ENST00000467396:exon_131588819_131588908:C9orf114
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131670901	C/T	1	5	3	8	2.38742543185071	1.56754474088957	0.819880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.728773544515184	ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131670919	T/C	1	9	4	13	4.29736577733129	2.09005965451943	2.20730612281186	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.273197512046999	ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131671246	T/C	1	3	11	14	1.43245525911043	5.74766404992843	-4.315208790818	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.0294388955576132	ENSG00000136802:ENST00000372600:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000372599:exon_131669436_131671600:LRRC8A;ENSG00000136802:ENST00000259324:exon_131669436_131671600:LRRC8A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131702891	A/G	1	11	11	22	5.25233595007157	5.74766404992843	-0.495328099856854	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.835013276563313	ENSG00000175287:ENST00000372592:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000412476:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000308941:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000353176:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000424503:exon_131702878_131702988:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000487504:exon_131702672_131702994:PHYHD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131702955	C/T	1	18	18	36	8.59473155466257	9.40526844533743	-0.810536890674854	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.868003039823955	ENSG00000175287:ENST00000372592:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000412476:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000308941:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000353176:exon_131702878_131702994:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000424503:exon_131702878_131702988:PHYHD1;ENSG00000175287:ENST00000487504:exon_131702672_131702994:PHYHD1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131749958	G/C	1	4	4	8	1.90994034548057	2.09005965451943	-0.180119309038856	C:G	G	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131749868_131749996:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000411887:exon_131749868_131749996:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131749868_131749996:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000477069:exon_131749868_131749996:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000491502:exon_131749868_131749996:NUP188
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	131768801	C/G	1	43	52	95	20.5318587139161	27.1707755087526	-6.63891679483642	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.182676288770946	ENSG00000095319:ENST00000356693:exon_131768781_131769374:NUP188;ENSG00000095319:ENST00000372577:exon_131768781_131769375:NUP188
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132590431	C/G	1	67	44	111	31.9915007867996	22.9906561997137	9.00084458708587	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.088196727458937	ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132589565_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132589569_132590531:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132590247_132590531:C9orf78
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132591509	A/G	1	89	80	169	42.4961726869427	41.8011930903886	0.694979596554163	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.938730185866068	ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132591484_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461762:exon_132590707_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000480023:exon_132590721_132591582:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132591507_132591560:C9orf78
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132597021	C/T	1	42	30	72	20.054373627546	15.6754474088957	4.3789262186503	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.345607003316013	ENSG00000136819:ENST00000435276:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000372447:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000461349:exon_132596991_132597045:C9orf78;ENSG00000136819:ENST00000316147:exon_132596986_132597045:C9orf78;ENSG00000136878:ENST00000491053:exon_132596977_132597357:USP20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132637608	A/G	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132637691	C/T	1	8	13	21	3.81988069096114	6.79269387718814	-2.972813186227	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.274480588457056	ENSG00000136878:ENST00000372429:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000315480:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000358355:exon_132637589_132637758:USP20;ENSG00000136878:ENST00000474895:exon_132637589_132637758:USP20
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132662786	C/T	1	106	134	240	50.6134191552352	70.0169984264008	-19.4035792711657	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0139160512892774	ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000443566:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000478129:exon_132662705_132662826:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000462766:exon_132662705_132662812:FNBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	132720770	A/G	1	68	65	133	32.4689858731697	33.9634693859407	-1.49448351277098	A:T:G	A	G	10	0.522514913629857	0.795377456838832	ENSG00000187239:ENST00000372416:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000420781:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000446176:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000372415:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000335141:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000422469:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000449089:exon_132720770_132720832:FNBP1;ENSG00000187239:ENST00000355681:exon_132720770_132720832:FNBP1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	133346226	C/T	1	6	3	9	2.86491051822086	1.56754474088957	1.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.51179238012733	ENSG00000130707:ENST00000334909:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000352480:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372394:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000344866:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000372393:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000422569:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000443588:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000467695:exon_133346221_133346291:ASS1;ENSG00000130707:ENST00000493984:exon_133346221_133346291:ASS1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	134073807	A/G	1	53	31	84	25.3067095776176	16.1979623225256	9.10874725509201	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.0494589367051509	ENSG00000126883:ENST00000359428:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000411637:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000451030:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000453861:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000483497:exon_134072603_134074402:NUP214;ENSG00000126883:ENST00000531600:exon_134072603_134074035:NUP214
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	134387488	T/C	1	8	3	11	3.81988069096114	1.56754474088957	2.25233595007157	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.231779526315621	ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000441334:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000415075:exon_134387428_134387514:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000462375:exon_134387428_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134387279_134387523:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134385887_134387523:POMT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	134397464	C/T	1	13	6	19	6.20730612281186	3.13508948177914	3.07221664103272	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.175231089618151	ENSG00000130714:ENST00000423007:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000354713:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000404875:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372221:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000341012:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372228:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000402686:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000419118:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000485278:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000372220:exon_134397434_134397611:POMT1;ENSG00000130714:ENST00000494883:exon_134397434_134397920:POMT1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	134458054	C/G	1	18	13	31	8.59473155466257	6.79269387718814	1.80203767747443	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.591512688864675	ENSG00000107263:ENST00000266110:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372195:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000429421:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372189:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372190:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000411834:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000337036:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000357686:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000437236:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000372191:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000431470:exon_134457992_134458089:RAPGEF1;ENSG00000107263:ENST00000398415:exon_134457992_134458089:RAPGEF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135139826	T/C	1	39	30	69	18.6219183684356	15.6754474088957	2.94647095953987	T:C	T	C	10	0.522514913629857	0.547191529284309	ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000436441:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000477049:exon_135136743_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135136827_135140372:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135136827_135140372:SETX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135203409	A/C	1	8	5	13	3.81988069096114	2.61257456814929	1.20730612281186	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.586125855411521	ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135203530	A/C	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	A:C	A	C	10	0.522514913629857	0.766636367306549	ENSG00000107290:ENST00000224140:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000393220:exon_135201711_135205886:SETX;ENSG00000107290:ENST00000372169:exon_135201711_135205886:SETX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135263573	G/T	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135263526_135263615:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135263526_135263615:TTF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135273607	C/G	1	22	13	35	10.5046719001431	6.79269387718814	3.711978022955	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.238241131396320	ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135273528_135273713:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135273528_135273713:TTF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135277130	C/A	1	39	28	67	18.6219183684356	14.630417581636	3.99150078679958	A:T:C	C	A	10	0.522514913629857	0.392141400497615	ENSG00000125482:ENST00000334270:exon_135276842_135278215:TTF1;ENSG00000125482:ENST00000245588:exon_135276842_135278215:TTF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135521416	C/T	1	5	5	10	2.38742543185071	2.61257456814929	-0.225149136298571	T:C	C	T	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125485:ENST00000372159:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372155:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000438527:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000372153:exon_135521282_135521458:DDX31;ENSG00000125485:ENST00000310532:exon_135521282_135521458:DDX31
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135554566	G/A	1	8	7	15	3.81988069096114	3.657604395409	0.162276295552145	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000125484:ENST00000372146:exon_135553364_135555190:GTF3C4;ENSG00000125484:ENST00000483873:exon_135554265_135554697:GTF3C4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	135974100	G/A	1	38	43	81	18.1444332820654	22.4681412860839	-4.32370800401842	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.373983989412796	ENSG00000160271:ENST00000372050:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372047:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393160:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000493438:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000482648:exon_135973107_135977149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000469972:exon_135973107_135977526:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000393157:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000372051:exon_135973107_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000498797:exon_135973608_135974149:RALGDS;ENSG00000160271:ENST00000495621:exon_135974025_135974149:RALGDS
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136199092	C/T	1	43	38	81	20.5318587139161	19.8555667179346	0.676291995981579	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.91178811488515	ENSG00000148296:ENST00000372022:exon_136197552_136199184:SURF6;ENSG00000148296:ENST00000468290:exon_136198642_136199184:SURF6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136219564	G/C	1	134	144	278	63.9830015735992	75.2421475626994	-11.2591459891003	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.186634794939875	ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000495952:exon_136219549_136219621:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136219549_136219585:SURF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136221557	A/G	1	35	44	79	16.711978022955	22.9906561997137	-6.2786781767587	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.176660943415048	ENSG00000148290:ENST00000371974:exon_136221514_136221596:SURF1;ENSG00000148290:ENST00000437995:exon_136221514_136221596:SURF1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136230585	A/G	1	27	27	54	12.8920973319939	14.1079026680061	-1.21580533601228	A:C:G	A	G	10	0.522514913629857	0.786113448389962	ENSG00000148248:ENST00000371989:exon_136228325_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000465565:exon_136230329_136230635:SURF4;ENSG00000148248:ENST00000467910:exon_136230431_136230635:SURF4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136277482	T/C	1	12	11	23	5.72982103644172	5.74766404992843	-0.0178430134867114	T:C	T	C	10	0.522514913629857	1	ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000494045:exon_136277419_136277612:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136277419_136277612:REXO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136279935	C/T	1	19	22	41	9.07221664103272	11.4953280998569	-2.42311145882414	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.532349662611635	ENSG00000148300:ENST00000453165:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371942:exon_136279785_136280131:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000371935:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000454825:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000478037:exon_136279785_136279953:REXO4;ENSG00000148300:ENST00000445916:exon_136279785_136280131:REXO4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136340134	C/T	1	5	8	13	2.38742543185071	4.18011930903886	-1.79269387718814	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.408638618177513	ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136340200	T/G	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	T:G	T	G	10	0.522514913629857	1	ENSG00000160326:ENST00000371897:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000485978:exon_136340083_136340235:SLC2A6;ENSG00000160326:ENST00000371899:exon_136340083_136340235:SLC2A6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136633669	G/A	1	13	17	30	6.20730612281186	8.88275353170757	-2.67544740889571	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.364098708761703	ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136633564_136633718:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136633564_136633718:VAV2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	136650966	C/T	1	8	1	9	3.81988069096114	0.522514913629857	3.29736577733129	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0407774012991101	ENSG00000160293:ENST00000371850:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000371851:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000406606:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000343203:exon_136650898_136651007:VAV2;ENSG00000160293:ENST00000325440:exon_136650898_136651007:VAV2
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	137711997	G/C	1	9	1	10	4.29736577733129	0.522514913629857	3.77485086370143	C:G	G	C	10	0.522514913629857	0.0227369323798089	ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137711962_137712069:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137711962_137712069:COL5A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	137716535	G/C	0	26	0	26	12.4146122456237	0	12.4146122456237	G	G		10	0.522514913629857	5.13318408342684e-08	ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137716446_137716701:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137716446_137716701:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000460264:exon_137716446_137716701:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000371820:exon_137716490_137716701:COL5A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	137716559	C/T	0	28	0	28	13.369582418364	0	13.369582418364	C	C		10	0.522514913629857	1.38121992236644e-08	ENSG00000130635:ENST00000371817:exon_137716446_137716701:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000355306:exon_137716446_137716701:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000460264:exon_137716446_137716701:COL5A1;ENSG00000130635:ENST00000371820:exon_137716490_137716701:COL5A1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	138852904	C/G	1	15	7	22	7.16227629555214	3.657604395409	3.50467190014315	C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.199333558675469	ENSG00000130560:ENST00000371756:exon_138852871_138853226:UBAC1;ENSG00000130560:ENST00000478485:exon_138852871_138853058:UBAC1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139256495	G/T	1	13	86	99	6.20730612281186	44.9362825721677	-38.7289764493558	T:G	G	T	10	0.522514913629857	4.86642928496771e-16	ENSG00000213221:ENST00000371739:exon_139253932_139256632:DNLZ;ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139256352_139256632:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139256355_139256632:CARD9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139257473	G/A	1	15	82	97	7.16227629555214	42.8462229176483	-35.6839466220961	A:G	G	A	10	0.522514913629857	7.0966193044337e-14	ENSG00000213221:ENST00000371738:exon_139257441_139257580:DNLZ;ENSG00000187796:ENST00000481053:exon_139257441_139258853:CARD9
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139270876	G/A	1	34	27	61	16.2344929365849	14.1079026680061	2.12659026857872	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.610361629263706	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139270801_139270933:SNAPC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139272017	G/A	1	33	33	66	15.7570078502147	17.2429921497853	-1.48598429957056	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.71394940107423	ENSG00000165684:ENST00000298532:exon_139271995_139273751:SNAPC4
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139298593	A/G	1	13	17	30	6.20730612281186	8.88275353170757	-2.67544740889571	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.364098708761703	ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000461693:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000417512:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000466579:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139298507_139298646:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000486441:exon_139298562_139298646:SDCCAG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139301664	T/A	1	28	18	46	13.369582418364	9.40526844533743	3.96431397302658	A:T	T	A	10	0.522514913629857	0.301548248728239	ENSG00000165689:ENST00000298537:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000357365:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371725:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000392926:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371722:exon_139301597_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000468963:exon_139301469_139302013:SDCCAG3;ENSG00000165689:ENST00000371723:exon_139301597_139302013:SDCCAG3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139311471	C/T	1	68	44	112	32.4689858731697	22.9906561997137	9.47832967345601	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0881976444304688	ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139311580	C/T	1	51	56	107	24.3517394048773	29.260835163272	-4.9090957583947	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.383922928689936	ENSG00000165688:ENST00000399219:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000371717:exon_139311403_139311666:PMPCA;ENSG00000165688:ENST00000462616:exon_139310519_139311666:PMPCA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139350552	C/A	1	6	6	12	2.86491051822086	3.13508948177914	-0.270178963558284	A:C	C	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000277537:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000453963:exon_139350505_139350618:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000404925:exon_139350505_139350618:SEC16A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139369062	C/T	1	7	3	10	3.342395604591	1.56754474088957	1.77485086370143	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.348726529691382	ENSG00000148396:ENST00000290037:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000313050:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000431893:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000398348:exon_139368501_139372141:SEC16A;ENSG00000148396:ENST00000371706:exon_139368501_139371567:SEC16A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	139995995	G/A	1	3	7	10	1.43245525911043	3.657604395409	-2.22514913629857	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.209810771129959	ENSG00000177239:ENST00000371589:exon_139995936_139996124:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000371587:exon_139995936_139997762:MAN1B1;ENSG00000177239:ENST00000474902:exon_139995936_139996124:MAN1B1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140006202	G/A	1	181	193	374	86.4248006329959	100.845378330562	-14.4205776975665	A:T:G	G	A	10	0.522514913629857	0.147160810074963	ENSG00000176978:ENST00000371579:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000443858:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000470766:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000473532:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000463619:exon_140006142_140006206:DPP7;ENSG00000176978:ENST00000483783:exon_140006142_140006206:DPP7
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140099675	G/A	1	27	24	51	12.8920973319939	12.5403579271166	0.351739404877291	A:G	G	A	10	0.522514913629857	1	ENSG00000187713:ENST00000343666:exon_140098537_140100090:TMEM203
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140110737	A/G	1	4	7	11	1.90994034548057	3.657604395409	-1.74766404992843	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.370975727418058	ENSG00000188566:ENST00000458322:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000427047:exon_140110724_140113813:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000371521:exon_140110724_140111461:NDOR1;ENSG00000188566:ENST00000344894:exon_140110724_140111461:NDOR1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140135784	C/A	1	54	35	89	25.7841946639877	18.288021977045	7.49617268694272	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.136964255804786	ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140135665_140135869:TUBB2C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140138011	C/T	1	427	407	834	203.886131880051	212.663569847352	-8.77743796730078	A:T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.555751636254561	ENSG00000188229:ENST00000340384:exon_140136948_140138159:TUBB2C
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140150039	G/T	1	18	14	32	8.59473155466257	7.315208790818	1.27952276384458	T:G	G	T	10	0.522514913629857	0.724988542615628	ENSG00000188986:ENST00000343053:exon_140149625_140150063:COBRA1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140201604	C/T	1	10	4	14	4.77485086370143	2.09005965451943	2.684791209182	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.185747047217818	ENSG00000187609:ENST00000491734:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000342129:exon_140201348_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000340951:exon_140201357_140201715:EXD3;ENSG00000187609:ENST00000487745:exon_140201369_140201715:EXD3
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	9	140446879	A/G	1	265	220	485	126.533547888088	114.953280998569	11.5802668895194	A:G	A	G	10	0.522514913629857	0.296188741852715	ENSG00000182154:ENST00000371443:exon_140446526_140447007:MRPL41
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	221773	A/G	1	129	47	176	61.5955761417484	24.5582009406033	37.0373752011452	A:G	A	G	10	0.522514913629857	1.46897915278544e-08	ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_221196_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_221191_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_221417_221864:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_221427_221864:GTPBP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	229542	G/A	1	33	10	43	15.7570078502147	5.22514913629857	10.5318587139161	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.00118975257815666	ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	229557	C/T	1	32	17	49	15.2795227638446	8.88275353170757	6.39676923213701	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0852458773215549	ENSG00000178605:ENST00000485332:exon_228086_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000326153:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000400701:exon_229433_229591:GTPBP6;ENSG00000178605:ENST00000429643:exon_229433_229591:GTPBP6
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1464245	C/T	1	49	31	80	23.396769232137	16.1979623225256	7.19880690961144	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.117453511117132	ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1464209_1464327:IL3RA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1471069	G/A	1	69	71	140	32.9464709595399	37.0985588677199	-4.15208790817999	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.499327293361588	ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1470993_1471125:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1470993_1471125:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000432757:exon_1470993_1471125:IL3RA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1497644	G/C	1	41	82	123	19.5768885411759	42.8462229176483	-23.2693343764724	C:G	G	C	10	0.522514913629857	2.7687454658795e-05	ENSG00000185291:ENST00000331035:exon_1497552_1497657:IL3RA;ENSG00000185291:ENST00000381469:exon_1497552_1497657:IL3RA
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1531648	C/T	1	81	104	185	38.6762919959816	54.3415510175051	-15.6652590215236	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.0224435552375495	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1531700	A/T	1	65	74	139	31.0365306140593	38.6661036086094	-7.62957299455012	A:T	A	T	10	0.522514913629857	0.203488588008416	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1531625_1531747:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1531625_1531747:ASMTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1537885	G/A	1	86	51	137	41.0637174278323	26.6482605951227	14.4154568327096	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.0163278785898292	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1537953	C/T	0	99	0	99	47.2710235506442	0	47.2710235506442	C	C		10	0.522514913629857	2.21079684939153e-28	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1537875_1538007:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1537875_1538007:ASMTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1540532	C/T	1	5	6	11	2.38742543185071	3.13508948177914	-0.747664049928427	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.766636367306549	
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1546993	C/A	1	66	50	116	31.5140157004294	26.1257456814929	5.38827001893658	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.352855476337031	ENSG00000169093:ENST00000381333:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000381317:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000416733:exon_1546627_1547014:ASMTL;ENSG00000169093:ENST00000463763:exon_1546620_1547014:ASMTL
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1713021	C/T	1	13	21	34	6.20730612281186	10.972813186227	-4.76550706341514	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.122229345404271	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1712337_1713117:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000381261:exon_1712337_1713117:AKAP17A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	1719897	C/G	1	31	25	56	14.8020376774744	13.0628728407464	1.73916483672801	A:C:G	C	G	10	0.522514913629857	0.689408739723596	ENSG00000197976:ENST00000313871:exon_1719552_1721407:AKAP17A;ENSG00000197976:ENST00000474361:exon_1719552_1721395:AKAP17A
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	2139186	C/T	1	27	9	36	12.8920973319939	4.70263422266871	8.18946310932515	T:C	C	T	10	0.522514913629857	0.00698253465719878	ENSG00000169084:ENST00000334651:exon_2137557_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381225:exon_2138809_2139270:DHRSX;ENSG00000169084:ENST00000381223:exon_2138809_2139270:DHRSX
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	2406828	C/A	1	17	17	34	8.11724646829243	8.88275353170757	-0.765507063415139	A:C	C	A	10	0.522514913629857	0.864375732734557	ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1
HGDP01081_parsed_pileup.txt	.	X	2408659	G/A	1	6	7	13	2.86491051822086	3.657604395409	-0.792693877188141	A:G	G	A	10	0.522514913629857	0.78374458708672	ENSG00000214717:ENST00000381222:exon_2404477_2408810:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000381218:exon_2406227_2408813:ZBED1;ENSG00000214717:ENST00000461691:exon_2407946_2408813:ZBED1